JP4391527B2 - 関心のある複数の対象物を関心のあるフィールド内で組織化するシステム - Google Patents

Description

発明の属する技術分野
本発明の分野は、一般的に、細胞学的試料を分析するシステムに関し、特に、関心のある領域にある細胞材料を組織化して細胞学者に表示するシステムに関する。

発明の背景
医療業界では、例えば細胞検査技師など、特定の細胞型の存在を確認するための細胞試料の観察を行う研究技師が必要とされる。例えば、目下のところ、悪性細胞または前悪性細胞の存在を確認する頸膣部のパパニコロウ塗沫標本スライドを観察する必要がある。５０年前に導入されて以来、パパニコロウ塗沫標本は、癌性および前癌性の頸部疾病検査用の強力なツールであった。この間、パパニコロウ塗沫標本は子宮癌の死亡率を７０％ほど低減したと考えられている。しかしながら、この急激な死亡率の低下は緩慢になってきており、米国におけるこの防止できる疾病による死亡率は、１９８０年代半ば以来、年間約５，０００人で実質的に一定している。従って、未だに、子宮癌を患っている１５，０００人の女性のうち三分の一が、癌の発見が遅すぎたために毎年死亡している。更なる懸念は、国立癌研究所のデータが、１９８６年以来５０歳以下の白人女性の侵襲性子宮頸癌の発生率が毎年３％増加していることを示していることである。

いくつものファクタが現状のスレッシュホールドに関与しており、そのなかでもとりわけ、多くの女性、特にリスクの高い年齢の女性が、ルーチンで子宮頸癌スクリーニングを行わないという事実がある。より注目すべき別の寄与ファクタは、従来のパパニコロウ塗沫標本法の制限である。

頸部スクリーニング法の信頼性と効率は、前癌性の損傷を診断する能力（感度）で図ることができると同時に、誤った肯定的診断を防ぐこと（特異性）で測ることができる。次いで、これらの基準は、細胞学的分析の正確さに依存している。従来のパパニコロウ塗沫標本法では、１０−５０％の率で誤った否定的な評価がでていた。これは、ほとんどが、わずかな数の癌性あるいは前癌性細胞の存在を決定するのに技術者が観察しなければならない細胞と対象物の数が莫大な数である（通常、１００，０００から２００，０００ほど）ためである。従って、パパニコロウ塗沫テストは、生体材料を詳細に観察する必要がある他のテストと同様に、技術者が疲労するために誤ったネガティブ判定がなされる率が高いと言う問題があった。

この観察プロセスを容易にするために、自動システムが開発され、残りの細胞を更なる観察が不要となる可能性があるとして、技術者の注意を最も関連性の高い細胞に向けるようにした。典型的な自動システムは、イメージャと、自動光学顕微鏡を具える。簡単に言えば、イメージャは、細胞試料スライドの一連の番号をふった様々な部分を表す画像を提供する。イメージャは、これらの画像を処理して、スライド上で観察する最も関連性の高い生体対象物を決定し、そのスライド上の位置（ｘ−ｙ座標）を決定する。この情報を、技術者の観察用にｘ−ｙ座標を自動的に処理して生体対象物を中心に合わせる顕微鏡に送る。この観察プロセスの間、生体対象物のｘ−ｙ座標を通して連続的に進み、生体対象物を視野の中心に位置させる。例えば、関連のある生体対象物の数が２２である場合、技術者は、顕微鏡が視野を自動的にあるいは半自動的に規定された生体対象物のｘ−ｙ座標に移動させながら、スライド上の２２の領域を観察する。技術者は、技術者が病理学者の更なる観察が必要であると考えるスライドの上のいずれかの対象物にマークを行うことができる。この対象物は、例えば、悪性あるいは前悪性細胞と一致する特徴を有するあらゆる対象物である。

通常は、数が限定された対象物に技術者の注意が向けられているので、この自動化された手順はうまくいっていることが証明されており、技術者が試料上の膨大な数の対象物（生体、あるいは、非生体）を観察する必要を事前に除去している。しかしながら、技術者は通常一日に何百ものスライド、従って何万もの生体対象物を観察しなければならないので、技術者は疲労してしまう。さらに、考慮しなければならない経済上の問題もある。パパニコロウ塗沫試料などの、細胞試料を観察する労働コストは、少なくとも部分的に、各スライドを観察する技術者がかける時間に関連する。すなわち、技術者がスライドの観察にかける時間が長ければ長いほど、研究所の労働コストが多くなる。逆に言うと、技術者がスライドの観察にかける時間が少ないほど、研究所が節約できる金額が多くなる。

発明の概要
本発明の一実施例では、ＯＯＩｓを提供する生体スクリーニングシステムが提供されている。このシステムは、試料スライドの画像を得て、当該画像から画像データを生成するイメージングステーションを具える。このシステムは、更に、当該画像データをフィルタリング及び／又は処理を行ってＯＯＩｓを得、一又はそれ以上のＯＯＩｓを各ＦＯＩｓに割り当てるための少なくとも一のプロセッサを具える。この割り当ては、ＯＯＩｓの他のＦＯＩへの割り当てに少なくとも部分的に基づいている。このシステムは、さらに自動あるいは半自動の顕微鏡を具え、各ＦＯＩ中に一またはそれ以上のＯＯＩｓを表示するために各ＦＯＩに関連する視野（ＦＯＶ）を走査する。

実施例の詳細な説明
図２を参照して、本発明の一実施例によって構成した生体スクリーニングシステム１０を説明する。システム１０は、顕微鏡スライド１４（図１に示す）上に配置した生体試料１２を細胞検査技師などの技術者に提供するように構成されている。この技術者は、生体試料１２内に位置する関心のある対象物（ＯＯＩｓ）を観察することができる。ＯＯＩｓは、スライド１４の部分をカバーする関心のある複数のフィールド（ＦＯＩｓ）（そのうちの一つが図３に示されている）内に配置されており、細胞検査技師の注意を、関連のないスライド領域でなく、ＦＯＩｓ内のＯＯＩｓに連続的に向けることができる。スライド１４には、起点マーク１６が与えられている。このマークの機能については以下に詳細に述べる。

システム１０は、更なる観察が必要なあらゆる生体試料（あるいは、コンピュータチップなどの非生体試料でもよい）を呈示するのに使用することができるが、システム１０はパパニコロウ塗沫標本スライドに典型的に見られるような、子宮頸部または膣試料の細胞学的なプレゼンテーションに向いている。この場合、ＯＯＩｓは、悪性または前悪性といった、異常状態の存在の可能性をチェックするために観察される個々の細胞あるいは細胞クラスタの形をとる。生体試料１２は、通常薄い細胞層としてスライド１４上に配置される。好ましくは、カバースリップ（図示せず）を試料１２に貼って、これによって試料１２をスライド１４の正しい位置に固定する。試料１２は、パパニコロウ染料などの、いずれかの好適な染料で染色するようにしても良い。

システム１０は、一般的に、（１）スライド１４上に含まれる生体材料の画像を得て、この画像から電子画像データを生成するためのイメージングステーション１８と；（２）画像データをフイルタリングして処理を行い、ＯＯＩｓを同定し、各ＦＯＩに一又はそれ以上のＯＯＩｓを割り当てるためのサーバ２０と；（３）複数の観察ステーション２２（３つが示されている）であって、各々が各ＦＯＩに対して走査した視野（ＦＯＶ）を提供して細胞検査技師による観察用にＯＯＩｓを提示する（図３に示す）ステーションと；を具える。システム１０は、モニタ、キーボード、およびマウス（図示せず）などを含むユーザインターフェース（図示せず）を具え、細胞検査技師がシステム１０と相互作用できるようにしている。

イメージングステーション１８は、通常他のスライドと共にカセット（図示せず）に収納されているスライド１４の画像処理を行うように構成されている。画像処理の間、このスライドは連続的に各カセットから取り出されて、撮像され、カセットに戻される。図に示す実施例では、イメージングステーション１８は、２５のスライドを保持している各カセットを最大１０個まで、約１６時間で処理することができる。

イメージングステーション１８は、カメラ２４と、顕微鏡２６と、モータステージ２８を具える。カメラ２４は、顕微鏡２６を介してスライド１４の拡大画像をとらえる。カメラ２４は電荷転送装置（ＣＣＤ）など、様々な従来のカメラのいずれであっても良い。このカメラは単独で、又は、アナログ−デジタル（Ａ／Ｄ）コンバータなどのその他の部材と共に、十分な解像度を持つデジタル出力を生成し、とらえた画像を処理して、例えば、６４０ｘ４８０ピクセルの解像度を持つデジタル画像とする。好ましくは、各ピクセルが、その光学透過特性に応じて、ピクセルを透過する光の最小量に割り当てられた値が「００００００００」であり、ピクセルを通過する光の最大値に割当てられた値が「１１１１１１１１」である、８ビットの値（０−２５５）に変換される。

スライド１４は、モータステージ２８上に装着され、顕微鏡２６の視野領域に対してスライド１４を走査する間に、カメラ２４が生体試料１２の様々な領域の画像をとらえる。カメラ２４のシャッタスピードが比較的早く、走査速度及び／又は撮影する画像数を最大にすることができることが好ましい。モータステージ２８は、カメラ２４でとらえた画像のｘ−ｙ座標のトラックを保持する。例えば、エンコーダ（図示せず）をモータステージ２８の各モータに取り付けて、撮像中にｘおよびｙ方向に移動するネット距離を追跡することができる。これらの座標は、スライド１４（図１に示す）に付けた起点となるマーク１６に対して測定される。以下により詳細に説明するように、これらの起点マーク１６は、観察ステーション２２によって、観察プロセスの間にスライド１４のｘ−ｙ座標が、撮像プロセスで得られるスライド１４のｘ−ｙ座標に確実に関連づけられるようにすることができる。

本発明の理解に直接的には関連していないその他の処理要素のうち、サーバ２０は、（１）カメラ２４から得た画像データからＯＯＩｓを得るように構成された画像プロセッサ３０と；（２）各ＦＯＩにＯＯＩｓを割り当てるように構成されているＦＯＩプロセッサ３２と；（３）観察ステーション２２が一のＦＯＩから次のＦＯＩへ走査するのに使用するルーティングパスをマッピングするように構成されたルーティングプロセッサ３４と；（４）ＯＯＩｓとＦＯＩｓと、ＯＯＩｓのランキングとｘ−ｙ座標と、ＦＯＩｓ用のルーティングパスを保存するように構成されたメモリ３６と；を具える。各プロセッサ３０、３２、および３４で実行される機能を、単一のプロセッサで実行するか、あるいは代替的に３つ以上のプロセッサで実行することができることは自明である。同様に、メモリ３６を複数のメモリに分割できることも自明である。

画像プロセッサ３０は、カメラ２４から受信したデジタル画像を操作して、好適に生体試料１２内のＯＯＩｓを同定する。この実施例では、画像プロセッサ３０が一次分割操作と二次分割操作を行ってこれを実行する。

一次分割操作において、画像プロセッサ３０は、人工産物（アーティファクト）を更なる考慮から除去する。画像プロセッサ３０は、その明るさによって細胞の核でなさそうなデジタル画像データのピクセルをマスキングすることによって更なる考慮からはずす。デジタル画像の残りのピクセルは、形状およびサイズを有する「ブロブ」を形成する。画像プロセッサ３０は、径と、ブロブから延在するか隣り合うブロブを連結している細いひもが数ピクセルであるブロブを更なる考慮からはずすためにブロブに侵食プロセスを行う。画像プロセッサ３０は、ブロブ中のピクセル数によって、画像中の各ブロブが独立した対象であるか、クラスタ対象であるかを決定する。例えば、一のブロブに５００以上のピクセルがある場合はクラスタ対象と考えることができ、ピクセル数が５００あるいはそれ以下の場合は独立した対象物であると考えられる。独立した対象物については、全体の面積、外周部対面積比、光学濃度基準偏差、グレイスケールの平均ピクセル値に関する所定の基準に合致しないブロブは考慮されない。

二次分割操作では、画像プロセッサ２２が独立したセルあるいはクラスタセルでありそうもないブロブを除去する。独立した対象については、画像プロセッサ３０が一連の侵食作用を実行し、小さな対象を除去し、残りのブロブから突起を削除する。また、拡大動作を実行して、残りのブロブから孔を除去する。クラスタ対象については、画像プロセッサ３０が対象物の角部を鋭角にして、明確なボーダとする。画像プロセッサ３０は明確にしたクラスタ対象物から、独立した対象物、あるいは積分光学濃度が最も高い対象物を選択する。クラスタ対象物から取り出した独立対象物には、クラスタ抽出対象物であるとのフラグが付けられる。

分類操作において、画像プロセッサ３０は各独立対象物とクラスタ対象物についての様々な特徴を測定し、これらの特徴の測定値に基づいて各対象物の対象スコアを計算する。このスコアに基づいて、画像プロセッサ３０が人工産物らしい独立対象物とクラスタ対象物を除去する。残りの対象物は、関心のある対象物ＯＯＩｓ（ＩＯＯＩｓ）、すなわち独立したＯＯＩｓを表す独立対象物と、クラスタされたＯＯＩｓ（ＣＯＯＩｓ）を表すクラスタ対象物であると考えられる。画像プロセッサ３０は、核の積分光学濃度あるいは平均光学濃度についてＯＯＩｓを評価し、ＯＯＩｓをその光学濃度の値に従ってランク付けする。画像プロセッサ３０は、メモリ３６に、各デジタル画像について、そのランキングと座標と共に、フレームデータレコード（ＦＤＲ）としてＯＯＩｓを保存する。図に示す実施例では、各スライド１４について約２０００のデジタル画像が得られ、従って、各スライド１４について約２０００のＦＤＲｓがメモリ３６内に保存される。図に示す実施例では、画像プロセッサ３０は、各ＦＤＲに収納するＯＯＩｓの数を、独立ＯＯＩｓについては１０まで、クラスタＯＯＩｓについては３に制限している。

ＦＯＩプロセッサ３２は、ＯＯＩｓのランキングに基づいてＯＯＩｓを各ＦＯＩに割り当てる。ＯＯＩｓの割り当ては、すでに別のＦＯＩ内に割り当てられているＯＯＩｓをＦＯＩへ割り当てることがないように行われる。このように、ＯＯＩｓはＦＯＩｓ（この実施例では、決まった数である）内で共同作用的にグループ分けされ、ＦＯＩｓに含まれるＯＯＩｓの数を最大にすることができる。代替的に、ＦＯＩｓの数が決まっていない場合は、すべてのＯＯＩｓを含む必要のあるＦＯＩｓの数を最小にすることができる。一の実施例では、２０個のＩＯＯＩ優先ＦＯＩｓと２つのＣＯＯＩ優先ＦＯＩｓが生じる。従って、次いで行われる細胞検査技師による観察用に、ＩＯＯＩｓとＣＯＯＩｓを両方共ＦＯＩｓ内に確実に含めることができる。

図４を参照して、ＦＯＩプロセッサ３２によってＯＯＩ優先ＦＯＩｓ（この場合、２０）を発生させるのに使用されるプロセスを詳細に検討する。まず、ＦＯＩプロセッサ３２は、現スライド１４用にメモリ３６に保存されているＦＤＲｓにアクセスして、ＩＯＯＩｓとＣＯＯＩｓを抽出してＩＯＯＩリストとＣＯＯＩリストを作成する（動作ブロック５０）。代替的に、独立及びクラスタＯＯＩｓを一つのリストに組み込んでも良い。クラスタ抽出ＩＯＯＩｓ（すなわち、クラスタから抽出されたＩＯＯＩｓ）が、そのようにフラッグが付けられる。一の実施例では、このリストは、例えば各リストについて１００のＩＯＯＩｓと２０のＣＯＯＩｓといった、所定数のＯＯＩｓを含んでいる。このように、ＦＯＩプロセッサ３２と細胞検査技師による更なる考慮からリスクの低いＯＯＩｓを排除することによって、連続処理時間と人間による観察時間が最小になる。

ＦＯＩプロセッサ３２は、次いで、ＯＯＩｓのｘ−ｙ座標とランキングに基付いて、ｘ−ｙ座標をＦＯＩｓに割り当てて、所定のサイズを有するＦＯＩｓを発生する。特に、ＦＯＩプロセッサ３２は、トップにランクされているＩＯＯＩ（すなわち、リストの最初のＩＯＯＩ）を最初のＦＯＩに割り当てる（動作ブロック５２）。ＦＯＩプロセッサ３２は、次いで、次にランクされているＩＯＯＩ（この場合、２番目にランクされているＩＯＯＩ）を現ＩＯＯＩとして選択し（動作ブロック５４）、現ＩＯＯＩとすでに最初のＦＯＩに割り当てられているＩＯＯＩｓが最初のＦＯＩ内に並置できるかどうかを決定する（動作ブロック５６）。特に、第１のパスにおいては、２番目にランクされているＩＯＯＩが現ＩＯＯＩになり、すでに割り当てられているＩＯＯＩｓは、最初の（すなわち、第１番目にランクされた）ＩＯＯＩを含むだけになるであろう。

現ＩＯＯＩがすでに割り当てられているＩＯＯＩｓと並置できる場合は、現ＩＯＯＩを並置ＩＯＯＩと同定し、最初のＦＯＩに割り当てる（動作ブロック５８）。現ＩＯＯＩがすでに割り当てられているＩＯＯＩｓと並置できない場合は、現ＩＯＯＩを並置不可ＩＯＯＩと同定し、最初のＦＯＩに割り当てを行わない（アクションブロック６０）。ＦＯＩプロセッサ３２は、次いで、現ＩＯＯＩが最後のランクのＩＯＯＩであるかどうかを決定する（動作ブロック６２）。もし、最後のランクでなければ、プロセスをブロック５４に戻し、次にランクされているＩＯＯＩを現ＩＯＯＩとして選択する。このように、ＦＯＩプロセッサ３２は、全ての並置可能ＩＯＯＩｓを最初のＦＯＩに割り当てるためにブロック５４から６０を繰り返して行う。繰り返す数は、リスト中のＩＯＯＩｓの数から１を引いた数であり（すなわち、最初のＩＯＯＩを引く）、この場合は９９回となる。

現ＩＯＯＩが最後にランクされたＩＯＯＩであれば、ＦＯＩプロセッサ３２は、すべての並置可能ＣＯＯＩｓを最初のＦＯＩに割り当てるためにＣＯＯＩリストを繰り返す。特に、ＦＯＩプロセッサ３２は、次にランクされているＣＯＯＩを現ＣＯＯＩとして選択し（動作ブロック６４）、現ＣＯＯＩがすでに割り当てられているＩＯＯＩｓをＣＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定する（決定ブロック６６）。もちろん、トップにランクされているＣＯＯＩは次にランクされているＣＯＯＩであれば、最初のＦＯＩ内にすでに割り当てられたＣＯＯＩｓがないので、ＦＯＩプロセッサ３２は現ＣＯＯＩがすでに割り当てられているＩＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定するだけである。いずれの場合も、現ＣＯＯＩは、予め割り当てられているＩＯＯＩｓと並置することができれば、現ＣＯＯＩは並置可能ＩＯＯＩとして同定され、最初のＦＯＩに割り当てられる（動作ブロック６８）。現ＣＯＯＩが予め割り当てられているＩＯＯＩｓと並置できない場合は、現ＣＯＯＩは並置不可ＩＯＯＩとして同定され、最初のＦＯＩには割り当てられない（動作ブロック７０）。

ＦＯＩプロセッサ３２は、次いで、現ＣＯＯＩが最後にランクされたＣＯＯＩであるかどうかを決定する（決定ブロック７２）。最後にランクされたＣＯＯＩでない場合は、次にランクされたＣＯＯＩが現ＣＯＯＩとして選択されるブロック６４に戻る。従って、ＦＯＩプロセッサ３２は、全ての並置可能ＣＯＯＩｓを最初のＦＯＩに割り当てるために、ブロック６４−７０を繰り返して行う。繰り返しの数は、リスト中のＣＯＯＩｓの数と同じであり、この場合は２０回である。

現ＣＯＯＩが最後にランクされたＣＯＯＩであれば、ｘ−ｙ座標を、全ての並置可能ＯＯＩｓ（ＩＯＯＩｓとＣＯＯＩｓ）を含むように最初のＦＯＩに割り当てることによって最初のＦＯＩが規定される（アクションブロック７４）。以下に詳細に述べるように、ｘ−ｙ座標を最初のＦＯＩに割り当てられる方法は、大部分、ＯＯＩｓが並置可能であると決定する方法に依存する。

次に、ＦＯＩプロセッサ３２は、まだ割り当てられていない並置可能ＩＯＯＩｓを次のＦＯＩに割り当てることによって、次のＦＯＩを規定する。特に、ＦＯＩプロセッサ３２は、次のＦＯＩを現ＦＯＩとして選択し（アクションブロック７６）、最も高くランクされているまだ割り当てられていないＩＯＯＩを現ＦＯＩに割り当てる（アクションブロック７８）。例えば、第１及び第２ランクのＩＯＯＩｓがすでに割り当てられているが、第３ランクのＩＯＯＩがまだ割り当てられていない場合、第３ランクのＩＯＯＩが現ＦＯＩに割り当てられる。ＦＯＩプロセッサ３２は、次にランクされているまだ割り当てられていないＩＯＯＩを現ＩＯＯＩとして選択する（アクションブロック８０）。例えば、５番目、６番目、および７番目のＩＯＯＩｓがすでに割り当てられているが、８番目にランクされているＩＯＯＩがまだ割り当てられていない場合は、８番目のＩＯＯＩが現ＩＯＯＩとして選択される。

最初のＦＯＩに関して上述したのと同様に、ＦＯＩプロセッサ３２は、現ＩＯＯＩが現ＦＯＩにすでに割り当てらたＩＯＯＩｓと並置可能であるかを決定する（決定ブロック８２）。特に、第１のパスにおいては、すでに割り当てられたＩＯＯＩｓは、最初に現ＦＯＩに割り当てられたＩＯＯＩのみを含むものである。並置可能であれば、現ＩＯＯＩは、現ＦＯＩに割り宛てられ（アクションブロック８４）、並置不可であれば、現ＩＯＯＩは現ＦＯＩに割り当てられない（アクションブロック８６）。ＦＯＩプロセッサ３２は、次いで、現ＩＯＯＩが最後にランクされ、まだ割り当てられていないＩＯＯＩであるかどうかを決定する（決定ブロック８８）。そうでない場合は、アクションブロック８０に戻り、そこで、次にランクされていて、まだ割り当てられていないＩＯＯＩを現ＩＯＯＩとして選択する。従って、ＦＯＩプロセッサ３２が、まだ割り当てられていない並置可能な全てのＩＯＯＩを、現ＦＯＩに割り当てるために、ブロック８０−８６が繰り返される。

現ＩＯＯＩが最後にランクされたＩＯＯＩであれば、ＦＯＩプロセッサ３２は、いずれかのまだ割り当てられていない並置可能なＣＯＯＩを現ＦＯＩに割り当てるために、最初のＦＯＩに関して上述したのと同じように、ＣＯＯＩリストを繰り返す。特に、ＦＯＩプロセッサ３２は、次にランクされた未割り当てＣＯＯＩを現ＣＯＯＩとして選択し（アクションブロック９０）、現ＣＯＯＩがすでに割り当てられているＩＯＯＩｓとＣＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定する（決定ブロック９２）。再び、最も高いランクで、まだ割り当てが行われていないＣＯＯＩが次にランクされたＣＯＯＩであれば、ＦＯＩ内にすでに割り当てられたＣＯＯＩｓがないので、ＦＯＩプロセッサ３２は現ＣＯＯＩがすでに割り当てられたＩＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定する必要があるだけである。並置可能であれば、現ＣＯＯＩが現ＦＯＩに割り当てられ（アクションブロック９４）、並置不可であれば、現ＣＯＯＩが現ＦＯＩに割り当てられない（アクションブロック９６）。ＦＯＩプロセッサ３２は、次いで、現ＣＯＯＩが最後にランクされたまだ割り当てが行われていないＣＯＯＩであるかどうかを決定する（決定ブロック９８）。このＣＯＯＩでない場合は、ブロック９０に戻って、ここで、まだ割り当てられていないＣＯＯＩが現ＣＯＯＩとして選択される。したがって、ＦＯＩプロセッサ３２は、まだ割り当てられていない全てのＣＯＯＩｓを現ＦＯＩに割り当てるために、ブロック９０−９６を繰り返す。現ＣＯＯＩが最後のランクのＣＯＯＩであれば、現ＦＯＩは、全ての並置可能なＯＯＩｓ（ＩＯＯＩｓとＣＯＯＩｓ）を含むように、ｘ−ｙ座標を現ＦＯＩに割り当てることによって決定される（アクションブロック１００）。

ＦＯＩプロセッサ３２は、現ＦＯＩが最後のＩＯＯＩ優先ＦＯＩ（この場合、２０番目のＦＯＩ）であるかどうかを決定する（決定ブロック１０２）。このＦＯＩでない場合は、ブロック７６に戻って、そこで、次のＦＯＩを現ＦＯＩとして選択し、まだ割り当てられていない並置可能なＩＯＯＩｓとＣＯＯＩｓをそこに割り当てる。

現ＦＯＩが最後のＩＯＯＩ優先ＦＯＩである場合は、処理を終了し（アクションブロック１０４）、ＦＯＩプロセッサ３２はＣＯＯＩ優先ＦＯＩｓ（この場合、最後の二つのＦＯＩｓ）を、ブロック７６−１００に設定されているＦＯＩｓを生成するのに使用されているのと同様に、生成する。大きな相違は、まだ割り当てられていない並置可能ＣＯＯＩｓが、まだ割り当てられていない並置可能ＩＯＯＩｓが存在する前にＦＯＩｓに割り当てられることである。その他の相違は、２０のＩＯＯＩ優先ＦＯＩｓが発生する前に、２つ未満のまだ割り当てられていないＣＯＯＩｓがあるかもしれないという点であり、少なくとも一のＣＯＯＩ優先ＦＯＩｓは、ＣＯＯＩで初期化することができない。この場合、ＦＯＩプロセッサ３２は、まだ割り当てられていないクラスタ抽出ＩＯＯＩｓ（すなわち、クラスタから抽出されたとのフラグが付いているＩＯＯＩｓ）をＦＯＩ（ｓ）に割り当てるように試みる。まだ割り当てられていないクラスタ抽出ＩＯＯＩｓが十分な数ない場合は、ＦＯＩプロセッサ３２は、クラスタから抽出されなかったまだ割り当てられていないＩＯＯＩｓをそのＦＯＩ（ｓ）に割り当てる。

上記に簡単に説明したとおり、ＯＯＩｓを並置可能であると決定する方法と、ｘ−ｙ座標がＦＯＩｓに割り当てられる方法には、相関関係がある。例えば、そこに割り当てられた最初のＯＯＩを越えて中心が決められるような場合、ｘ−ｙ座標がそのＦＯＩに割り当てられ、ＦＯＩは正しい位置に固定され、この固定されたＦＯＩの境界線内にあるＯＯＩｓは単純に並置可能と考えられ、この固定されたＦＯＩの境界線外にあるＯＯＩｓは単純に並置不可と考えられる。ｘ−ｙ座標がＦＯＩに割り当てられ、ＯＯＩｓ群の上に最終的に中心を合わせ、最初に割り当てられたＯＯＩから移動すると、動的に移動可能なＦＯＩの境界内にあるＯＯＩ（ＦＯＩがＯＯＩと現並置可能なＯＯＩｓを受け入れるように移動すると仮定して）が、現並置可能なＯＯＩをＦＯＩの境界外に位置させることなく、並置可能と考えられ、一方で、動的に移動可能なＦＯＩの境界の外にあるＯＯＩか、ＦＯＩの境界外におくようにしたＯＯＩのいずれかが、並置されないと考えられる。より多くのＯＯＩｓを所定のＦＯＩ内に並置できるので、後者の方法は前者の方法より好ましい。

ＦＯＩは、拡大された境界ボックスを用いて、並置可能なＯＯＩｓ群（ＩＯＯＩｓとＣＯＯＩｓのいずれかあるいは双方）を越えて中心を決めることができる。特に、図５−８を参照すると、ＦＯＩｓが並置可能かどうかを繰り返して決定するのに拡大可能な境界ボックス１５０を使用することが述べられている。まず、一のポイントとして始まる境界ボックス１５０が、境界ボックス１５０のｘ−ｙ座標を、最初のＯＯＩの座標（図６に、ＯＯＩ_０として示されている）と同じにすることで開始される（アクションブロック１６０）。次のＯＯＩ（図６にＯＯＩ_１として示されている）が、現ＯＯＩとして同定され（アクションブロック１６２）、境界ボックス１５０が次いで、現ＯＯＩを含むように拡大される（アクションブロック１６４）、

有意に、現ＯＯＩを含めるために必要な境界ボックス１５０の辺のみが拡大される。言い換えると、現ＯＯＩのｘ座標が、境界ボックス１５０の最小ｘ座標より小さい場合、境界ボックス１５０の左側が拡大して、境界ボックス１５０の最小ｘ座標を、現ＯＯＩのｘ座標に合致させる。同様に、現ＯＯＩのｙ座標が、境界ボックス１５０の最小ｙ座標より小さい場合は、境界ボックス１５０の底辺が、境界ボックス１５０の最小ｙ座標が現ＯＯＩのｙ座標に合致するように拡大する。現ＯＯＩのｘ座標が、境界ボックス１５０の最大ｘ座標より大きい場合は、境界ボックス１５０の右辺が拡大して、境界ボックス１５０の最大ｘ座標が現ＯＯＩのｘ座標に合致するようにする。現ＯＯＩのｙ座標が境界ボックス１５０の最大ｙ座標より大きい場合は、境界ボックス１５０の上辺が拡大して、境界ボックス１５０の最大ｙ座標が現ＯＯＩのｙ座標に合致するように拡大する。

図６に示されている例の場合、ＯＯＩ_１のｘ座標が、境界ボックス１５０の最小ｘ座標（本質的に点である）より小さく、境界ボックス１５０の左辺が外側に拡大し、境界ボックス１５０の最小ｘ座標をＯＯＩ_１のｘ座標と一致させる。ＯＯＩ_１のｙ座標は、境界ボックス１５０の最大ｙ座標より大きく、境界ボックス１５０の上辺が外側に拡大して、境界ボックス１５０の最大ｙ座標がＯＯＩ_１のｙ座標に合致する。

次いで、拡大した後、境界ボックス１５０のすべての大きさが現ＦＯＩの大きさを越えているかどうかについての決定がなされる（決定ブロック１６６）。越えていない場合は、現ＯＯＩが並置可能であると同定され（アクションブロック１６８）、拡大された境界ボックスが次の繰り返し用に新しいボックスとしてセットされる（アクションブロック１７２）。これに対して、拡大した後、境界ブロック１５０が現ＦＯＩの大きさを越えている場合は、現ＯＯＩが並置不可として同定され（アクションブロック１７０）、拡大された境界ボックスが前の境界ボックスにもどる（すなわち、以前の境界ボックスを次の繰り返しのために新しい境界ボックスのままとする）（アクションブロック１７４）。この例示的ケースでは、ＯＯＩ_１を含むように拡大した場合、境界ボックスの大きさは２００μｍ×１００μｍである。ＦＯＩが４００μｍ×４００μｍであると仮定すると、境界ボックスの両方の大きさは現ＦＯＩの大きさより小さく、ＯＯＩ_１が並置可能と同定され、拡大した境界ボックスが、次の繰り返しの時に新しい境界ボックスとしてセットされる。

次いで、現ＯＯＩがＦＯＩに割り当てられた最後のＯＯＩであるかどうかの決定がなされる（決定ブロック１７６）。最後のＯＯＩである場合は、処理を終了する（アクションブロック１７８）。最後のＯＯＩでない場合は、アクションブロック１６２に戻って、次のＯＯＩ（図７ではＯＯＩ_２として示されている）が並置可能かどうかを決定する。例えば、図７に示す例示的ケースでは、ＯＯＩ_２のｘ座標が、新しい境界ボックス１５０の最小ｘ座標より小さく、従って、境界ボックス１５０の左辺が外側に拡大して、境界ボックス１５０の最小ｘ座標がＯＯＩ_２のｘ座標に合致する。ＯＯＩ_２のｙ座標が、境界ボックス１５０のｙ座標より小さい場合は、新しい境界ボックス１５０の底辺が外側に拡大し、境界ボックス１５０の最小ｙ座標がＯＯＩ_２のｙ座標に合致する。図７に示すように、ＯＯＩ_２を含むように拡大したときの新しい境界ボックスの大きさは、６００μｍ×３５０μm である。この場合、境界ボックスのｘ方向の大きさは、現ＦＯＩのｘ方向の大きさより大きい。従って、ＯＯＩ_２は並置不可であると認識され、以前の境界ボックスが次の繰り返しのために、新しい境界ボックスとしてとどまる。

図８に示す例示的なケースでは、次のＯＯＩがＯＯＩ_３として示されている。ＯＯＩ_３のｘ座標は、新しい境界ボックス１５０の最大ｘ座標より大きく、従って境界ボックス１５０の右辺が外側に拡大して、境界ボックス１５０の最大ｘ座標がＯＯＩ_３のｘ座標に合致する。図８に示すように、ＯＯＩ_３を含むように拡大されたときの新しい境界ボックスの大きさは、３００μｍ×１００μｍである。この場合、境界ボックスの両方の大きさが、現ＦＯＩの大きさより小さく、従って、ＯＯＩ_３が並置可能であると認識され、拡大された境界ボックスが、次の繰り返し用に新しい境界ボックスとしてセットとされる。なお、境界ボックスが最終的にセットされると、ＦＯＩプロセッサ３２は、ｘ座標をＦＯＩに割り当てて境界ボックス１５０の最小及び最大ｘ座標の平均と同じにすることによって、また同様に、ｙ座標をＦＯＩに割り当てて境界ボックス１５０の最小及び最大ｙ座標の平均と同じにすることによって、並置可能なＯＯＩの上に容易にＦＯＩを中心におくことができる。

２２のＦＯＩｓの全てが生成された後に、ＦＯＩプロセッサ３２は、後にルーティングプロセッサ３４で使用するべく、ＦＯＩｓ全部のｘ−ｙ座標をメモリ３６に保存する。特に、ルーティングプロセッサ３４は、変形「traveling salesman」アルゴリズムなどの好適なルーティングアルゴリズムを用いてＦＯＩｓのｘ−ｙ座標をマッピングして、観察ステーション２２内にＦＯＩｓを提供するための最も効率の良いビューイングルートを決定する。ルーティングプロセッサ３４は、ＦＯＩｓのｘ−ｙ座標をそのルーティングプラン（図に示す例では、単純にリスト内のＦＯＩｓを観察される順番におくことでなされる）と共にメモリ３６に保存し、観察ステーション２２が次いでアクセスできるようにする。

もう一度図２を参照すると、一実施例において、全部で３つの観察ステーション２２がサーバ２０に接続されており、最大で３人の細胞検査技師がサーバ２０内に保存されている関連する情報に同時にアクセスすることができる。特に、システム１０は通常、細胞検査技師がスライドを観察するより迅速にスライド１４を処理することができる。システム１０の試料処理スピードが細胞検査技師の試料処理スピードより遅い場合でも、細胞検査技師は一日８時間働くだけであるが、システム１０は通常２４時間稼働させることができる。従って、スクリーニング処理の問題となるものは、人間のレベル、すなわち、スライド１４上の生体材料の詳細な観察において生じる。従って、複数の観察ステーション２２の使用がこの問題を解消して、より効果的なプロセスを提供することは明らかである。

観察ステーション２２の詳細を論じる前に、各観察ステーションがＦＯＩの上に集中する例示的なＦＯＶを示す図３を参照する。図に示す実施例では、ＦＯＶは直径２．２ｍｍであり、ＦＯＩは、ＦＯＶによって外接された０．４ｍｍ×０．４ｍｍ平方によって規定されている。実際の実施例では、ＦＯＩのボーダは虚像であり見ることはできないので、ＯＯＩｓの細胞検査技師の視界は邪魔されない。細胞検査技師の注意をより迅速にＦＯＩに向けて、一般的にＦＯＩの虚ボーダによって境界付けられる実際の領域を表示する基準を提供するために、Ｌ字型のマークインディケータ１５２が設けられている。マークインディケータ１５２は、ＦＯＩをとらえる（すなわち、マークインディケータ１５２のオープンスクエア部分１５４が、ＦＯＩの左側と下側を境界づけている。）マークインディケータ１５２のボーダとＦＯＩの虚ボーダとの間に０．０５ｍｍのマージンが設けられており、ＦＯＩの左側と底側のボーダの外側に延在するＯＯＩｓの部分（ＦＯＩ内に含まれているＯＯＩの結果であるが、ＦＯＩの左側と底側のボーダ近傍で集中している）が、マークインディケータ１５２によって邪魔されないようにする。マークインディケータ１５２は、病理学者による更なる観察が要求される場合（例えば、ＯＯＩが悪性または悪性の疑いがあるような場合）に、細胞検査技師にＦＯＩを電子的にマークする手段（例えば、マークインディケータ１５２を電子的に色づけするボタンを押すなどによって）を提供するよう動作する。

図２を参照すると、各観察ステーション２２は、顕微鏡３８とモータステージ４０を具える。スライド１４は、（画像処理の後に）スライド１４をメモリ３６から得たルーティングプランとＦＯＩｓのｘ−ｙ座標の変換に基づいて顕微鏡３８の視野に対してスライド１４を移動させるモータステージ４０の上に装着される。特に、画像ステーション１８のｘ−ｙ座標システムに対して得られるこれらのｘ−ｙ軸は、スライド１４に付けられた起点マーク１６（図１を参照）を用いて観察ステーション２２のｘ−ｙ座標システム内に転送される。従って、観察プロセスにおいてスライド１４のｘ−ｙ座標が、撮像プロセスにおけるスライド１４のｘ−ｙ座標と相互に確実に関連する。次いで、モータステージ４０は、ＦＯＩｓの転送されたｘ−ｙ座標に基づいて、ルーティングプランが示すとおりに移動する。

図に示す実施例では、一のＦＯＩを別のＦＯＩに進めるために、細胞検査技師はアクティベーションスイッチ（図示せず）を押す。この意味で、観察ステーション２２は半自動である。代替的に、ＦＯＩｓを自動的に次から次へと進めるようにしていもよい。この場合、モータステージ４０は選択的に、各ＦＯＩに対して所定の時間だけ休止することができる。この意味で、観察ステーション２２は全自動である。

選択されたＦＯＩｓが顕微鏡３８のＦＯＶ内に存在する場合、細胞検査技師は、ＦＯＩｓを検査して、もしあれば、細胞の異常性のレベルについて決定を行う。細胞検査技師は、疑わしいＦＯＩｓに電子的にマークを付ける。細胞検査技師は、以前に観察したＦＯＩに戻って、ＦＯＩｓに囲まれていないスライド上の位置に手動で移動させて観察することができる。スライド１４の観察に続いて、ＦＯＩｓのいずれかが細胞検査技師にマークされている場合は、観察ステーション２２は自動的に生体試料１２を全体的に走査して、確実に１００％の観察範囲をすることが好ましい。細胞検査技師は、スライド１４の位置を代えたり、スライド１４の位置にアクセスするために、自動スキャンを停止させ、所望の場合はステージ４０を移動させることができる。

図面は、本発明の実施例のデザインとユーティリティを示すものであり、同じ要素には共通の符号が付されている。
図１は、生体試料を担持する標準顕微鏡スライドを示す平面図である。 図２は、本発明の一実施例に従って構成した生体スクリーニングシステムを示す平面図である。 図３は、図２に示すシステムに使用されている顕微鏡の視野（ＦＯＶ）を介して示した関心のあるフィールド（ＦＯＩ）とマーカインディケータを示す図である。 図４は、関心のある対象物（ＯＯＩｓ）をＦＯＩｓに割り当てるために図２に示すＦＯＩのプロセッサによって使用されるプロセスのフローチャートである。 図５は、ＦＯＩプロセッサで使用される一のプロセスのフローチャートであり、一のＯＯＩｓを予め割り当てられたＯＯＩと一緒にあるＦＯＩに配置することができるかどうかを決定する。 図６は、ＯＯＩを含むように拡張した境界ボックスを示す図である。 図７は、別のＯＯＩを含むように拡張した図６の境界ボックスを示す図である。 図８は、さらに別のＯＯＩを含むように拡張した図６に示す境界ボックスを示す図である。

Claims (19)

1. 顕微鏡スライド上に配置された対象物（ＯＯＩｓ）をスライドの部分をカバーしている関心のあるフィールド（ＦＯＩｓ）内に呈示する生体スクリーニングシステムにおいて：
   前記スライドの走査画像を得、当該走査画像から画像データを生成するイメージングステーションと；
   前記画像データをフィルタリングしてＯＯＩｓを得、一又はそれ以上のＯＯＩｓを各ＦＯＩに割り当て、このとき前記一又はそれ以上のＯＯＩｓをすでにＦＯＩに割り当てられたＯＯＩと並置できるかどうかに少なくとも部分的に基づいて割り当てる少なくとも一のプロセッサと；
   各ＦＯＩに対して視野（ＦＯＶ）を走査して各ＦＯＩの前記一又はそれ以上のＯＯＩｓを呈示する自動あるいは半自動の顕微鏡と；
   を具えることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
2. 請求項１に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記少なくとも一のプロセッサが；
   どのＦＯＩにも割り当てられていないＯＯＩｓを順次選択することと；
   最初に選択されたＯＯＩを前記ＦＯＩに割り当てることと；
   順次選択した各ＯＯＩｓをすでにＦＯＩに割り当てられたＯＯＩと並置できるかどうかを決定することと；
   この決定に基づいて、順次選択された各ＯＯＩを並置可能なＯＯＩとして認定すること；
   によって、一又はそれ以上のＯＯＩを各ＦＯＩに割り当てることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
3. 請求項１に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記ＦＯＩｓが所定の大きさを有することを特徴とする生体スクリーニングシステム。
4. 請求項１に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記ＦＯＩｓの数が固定であることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
5. 請求項１に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記少なくとも一のプロセッサが更に、最初に割り当てられたＯＯＩの上に各ＦＯＩをセンタリングすることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
6. 請求項１に記載の生体スクリーニングシステムシステムにおいて、前記少なくとも一のプロセッサが更に、並置されたＯＯＩｓ群の上に各ＦＯＩをセンタリングすることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
7. 請求項１に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記ＯＯＩｓが細胞であることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
8. 請求項２に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記少なくとも一のプロセッサが更に、前記ＯＯＩｓのランク付けを行い、前記ＯＯＩｓが当該ＯＯＩｓのランク付けによって選択されることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
9. 請求項８に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記ＯＯＩｓが細胞であることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
10. 請求項９に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記細胞が、細胞が異常状態を有するリスクの見込みによってランク付けされることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
11. 請求項１０に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記異常状態が悪性、あるいは前悪性であることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
12. 請求項２に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記少なくとも一のプロセッサが、連続して選択された各ＯＯＩがあらかじめＦＯＩに割り当てられたＯＯＩｓと並置できるかどうかを：
    まず、最初に選択されたＯＯＩを含む現境界を規定し、この境界がジオメトリックに前記ＦＯＩと同様であり；
    各連続的に選択されたＯＯＩについて、現境界を連続的に選択されたＯＯＩを含むように拡大し、拡大された境界の各大きさが、ＦＯＩの対応する大きさと同じであるか、あるいはそれより小さい場合に、連続的に選択されたＯＯＩを並置可能であると認定し前記拡大した境界を新しい現境界に設定する；
    ことによって決定することを特徴とする生体スクリーニングシステム。
13. 請求項１に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記ＦＯＩｓが一次ＦＯＩｓと二次ＦＯＩｓに分割され、前記ＯＯＩｓが一次ＯＯＩｓと二次ＯＯＩｓに分割され、前記少なくとも一のプロセッサが一又はそれ以上の一次ＯＯＩｓを各一次ＦＯＩに割り当て、このとき少なくとも部分的に一次ＯＯＩｓのその他の一次ＦＯＩｓへの割り当てに基づいて割り当てを行い、一又はそれ以上の二次ＯＯＩｓを各二次ＦＯＩに割り当て、このとき少なくとも部分的に二次ＯＯＩｓのその他の二次ＦＯＩｓへの割り当てに基づいて割り当てを行うことを特徴とする生体スクリーニングシステム。
14. 請求項１３に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記少なくとも一のプロセッサが：
    どの一次ＦＯＩにも割り当てられていない一次ＯＯＩｓを連続的に選択し；
    最初に選択した一次ＯＯＩを一次ＦＯＩに割り当て；
    連続的に選択した各一次ＯＯＩが、あらかじめ一次ＦＯＩに割り当てられている一次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    連続的に選択した各一次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な一次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各一次ＯＯＩを一次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の一次ＯＯＩｓを各一次ＦＯＩに割り当てるとともに：
    どの二次ＦＯＩにも割り当てられていない二次ＯＯＩｓを連続的に選択し；
    最初に選択した二次ＯＯＩを二次ＦＯＩに割り当て；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩが、あらかじめ二次ＦＯＩに割り当てられている二次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な二次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各二次ＯＯＩを二次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の二次ＯＯＩｓを各二次ＦＯＩに割り当てることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
15. 請求項１３に記載の生体スクリーニングシステムによって、前記少なくとも一のプロセッサが更に、一又はそれ以上の二次ＯＯＩｓを各一次ＦＯＩに割り当て、このとき二次ＯＯＩｓのその他の一次ＦＯＩｓと二次ＦＯＩｓへの割り当てに少なくとも部分的に基づいて割り当てることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
16. 請求項１５に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記少なくとも一のプロセッサが：
    どの一次ＦＯＩにも割り当てられていない一次ＯＯＩｓを連続的に選択し；
    最初に選択した一次ＯＯＩを一次ＦＯＩに割り当て；
    連続的に選択した各一次ＯＯＩが、あらかじめ一次ＦＯＩに割り当てられている一次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    連続的に選択した各一次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な一次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各一次ＯＯＩを一次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の一次ＯＯＩｓを各一次ＦＯＩに割り当てるとともに：
    どの二次ＦＯＩにも割り当てられていない二次ＯＯＩｓを連続的に選択し；
    最初に選択した二次ＯＯＩを二次ＦＯＩに割り当て；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩが、あらかじめ二次ＦＯＩに割り当てられている二次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な二次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各二次ＯＯＩを二次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の二次ＯＯＩｓを各二次ＦＯＩに割り当て：
    どの一次又は二次ＦＯＩにも割り当てられていない二次ＯＯＩｓを連続的に選択し、当該二次ＯＯＩｓが前記一次ＯＯＩｓの後に選択されており；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩが、あらかじめ一次ＦＯＩに割り当てられている一次又は二次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な二次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各二次ＯＯＩを一次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の二次ＯＯＩｓを各一次ＦＯＩに割り当てることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
17. 請求項１３に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、
    前記少なくとも一のプロセッサが更に、各二次ＦＯＩに一又はそれ以上の一次ＯＯＩｓを割り当て、このとき一次ＦＯＩｓとその他の二次ＦＯＩｓへの一次ＯＯＩｓの割り当てに少なくとも部分的に基づいて割り当てることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
18. 請求項１７に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記一又はそれ以上のプロセッサが：
    どの一次ＦＯＩにも割り当てられていない一次ＯＯＩｓを連続的に選択し；
    最初に選択した一次ＯＯＩを一次ＦＯＩに割り当て；
    連続的に選択した各一次ＯＯＩが、あらかじめ一次ＦＯＩに割り当てられている一次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    連続的に選択した各一次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な一次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各一次ＯＯＩを一次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の一次ＯＯＩｓを各一次ＦＯＩに割り当てるとともに：
    どの二次ＦＯＩにも割り当てられていない二次ＯＯＩｓを連続的に選択し；
    最初に選択した二次ＯＯＩを二次ＦＯＩに割り当て；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩが、あらかじめＦＯＩに割り当てられている二次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    連続的に選択した各二次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な二次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各二次ＯＯＩを二次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の二次ＯＯＩｓを各二次ＦＯＩに割り当て：
    どの一次又は二次ＦＯＩにも割り当てられていない一ＯＯＩｓを連続的に選択し、当該一次ＯＯＩｓが前記二次ＯＯＩｓの後に選択されており；
    連続的に選択した各一次ＯＯＩが、あらかじめ二次ＦＯＩに割り当てられている一次又は二次ＯＯＩｓと並置できるかどうかを決定し；
    選択した各一次ＯＯＩをこの決定に基づいて並置可能な一次ＯＯＩとして認識し；
    並置可能な各一次ＯＯＩを二次ＦＯＩに割り当てる；
    ことによって、一又はそれ以上の二次ＯＯＩｓを各一次ＦＯＩに割り当てることを特徴とする生体スクリーニングシステム。
19. 請求項１３に記載の生体スクリーニングシステムにおいて、前記一次ＯＯＩｓが個別細胞であり、前記二次ＯＯＩｓが細胞クラスタであることを特徴とする生体スクリーニングシステム。

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