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JP2024501856A - ベータ細胞の分化の向上 - Google Patents

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JP2024501856A
JP2024501856A JP2023540066A JP2023540066A JP2024501856A JP 2024501856 A JP2024501856 A JP 2024501856A JP 2023540066 A JP2023540066 A JP 2023540066A JP 2023540066 A JP2023540066 A JP 2023540066A JP 2024501856 A JP2024501856 A JP 2024501856A
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キャリー,ブライス
シマニアク,アレクサンダー
サノス,クリストファー
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Vertex Pharmaceuticals Inc
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Abstract

本明細書では、とりわけ、in vitroでのSC-β細胞の向上した生成のための組成物および方法が提供される。例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、ならびに移植後の生存率、機能の向上、および免疫原性の低減をもたらす、新規の製剤および分化の方法が提供される。本開示の組成物および方法は、ヒト治療用途のためのSC島の製造で用いることができる。

Description

関連出願の相互参照
[0001]本出願は、2020年12月29日に出願された米国仮特許出願第63/131,471号の利益を主張するものであり、同仮特許出願は、全体としてこれにより参照により本明細書に組み込まれる。
[0002]膵臓または膵島の移植は、I型糖尿病などの糖尿病の処置に使用されてきた。膵島移植は大手術を必要とせず、膵島移植片の機能はレシピエントにおいて長期にわたり維持され得る。しかしながら、膵島ドナーの不足により、この療法が効果的に実施されることが妨げられている。人工の膵臓または膵島は、移植可能な膵島の代替的供給源となる。
[0003]膵島移植は、糖尿病の対象、例えば、I型糖尿病を有する対象にとって、著しい臨床上の利益を達成し得る有望な療法である。ドナー膵臓組織からの膵島源の供給は限られているため、幹細胞などの代替的な供給源から移植可能な島を生成するための向上した技術が必要とされている。島成分(例えば、SC-β細胞)を生成する向上した方法は、より有効な治療用生成物(例えば、機能性が向上したSC-β細胞)、ヒト治療用途のためのSC島を製造する方法の向上(例えば、より高い細胞収率)、またはそれらの組合せをもたらし得る。
[0004]本明細書では、とりわけ、in vitroでのSC-β細胞の向上した生成のための組成物および方法が提供される。例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、ならびに移植後の生存率、機能の向上、および免疫原性の低減をもたらす、新規の製剤および分化の方法が提供される。本開示の組成物および方法は、ヒト治療用途のためのSC島の大規模製造で用いることができる。
[0005]一部の態様では、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、または一炭素代謝経路中間体のうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0006]一部の態様では、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセチルCoA関連代謝産物を含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0007]一部の態様では、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0008]一部の態様では、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセテートを含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0009]一部の場合では、本開示の組成物は、0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、グルタミンをさらに含む。一部の場合では、本開示の組成物は、0.5~20mM、0.5~10mM、0.5~5mM、1~5mM、2~5mM、または1mM~10mMのグルタミンを含む。
[0010]一部の態様では、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、および3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0011]一部の場合では、グルタミンは、3.8~4.2mMの濃度である。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、ジペプチド型ではない。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、アラニン-グルタミンジペプチド型ではない。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、5mM、5.5mM、6mM、6.5mM、7mM、7.5mM、8mM、8.5mM、9mM、9.5mM、または10mMは、遊離グルタミン型である。一部の場合では、本開示の組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞をさらに含む。
[0012]一部の態様では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、および0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセチルCoA関連代謝産物を含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0013]一部の態様では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、および0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0014]一部の場合では、本開示の組成物は、約1mMのアセテートを含む。
[0015]一部の態様では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、および3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含むin vitro組成物が本明細書に開示される。一部の場合では、本開示の組成物は、約4mMのグルタミンを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、グルタミンおよびアセテートを含む。
[0016]一部の態様では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、およびアセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、またはL-カルニチンのうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0017]一部の態様では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、およびグルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、L-カルニチン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物が本明細書に開示される。
[0018]一部の場合では、本開示の組成物は、50~1000nM、50~800nM、50~500nM、50~300nM、50~250nM、100~200nM、または125~175nMのアセテートを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、β-ヒドロキシブチレートを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、タウリンを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、ホルメートを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、ビタミンを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、ビオチンを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、グルタミン、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、およびビオチンを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、L-カルニチンをさらに含む。一部の場合では、本開示の組成物は、L-カルニチンを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、BMPシグナル伝達経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189もしくはDMH-1またはそれらの誘導体である。一部の場合では、本開示の組成物は、ROCK阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、本開示の組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩、Bix-01294、UNC0638、BRDD4770、EPZ004777、AZ505、PDB4e47、バルプロ酸(alproic acid)、ボリノスタット、ロミデプシン、エンチノスタットアベキシノスタット、ギビノスタット、およびモセチノスタット、ブチレート、セリンプロテアーゼ阻害剤、セルピン、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、本開示の組成物は、TGF-β経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、TGF-β経路阻害剤は、ALK5阻害剤II、A83-01、431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB525334、SB505124、SD208、GW6604、もしくはGW788388、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、本開示の組成物は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤をさらに含む。一部の場合では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1、T3、T1AM、T0AM、Triprop、L-940901、CGS 23425、KB-141、もしくはDITPA、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、本開示の組成物は、タンパク質キナーゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンもしくはRo-31-8220またはそれらの誘導体である。一部の場合では、本開示の組成物は、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤は、Sant1、Sant2、Sant 4、Sant4、Cur61414、フォルスコリン、トマチジン、AY9944、トリパラノール、シクロパミン、またはそれらの誘導体を含む。一部の場合では、本開示の組成物は、上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの増殖因子をさらに含む。一部の場合では、EGFファミリーからの増殖因子は、ベータセルリンまたはEGFを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、ガンマセクレターゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ガンマセクレターゼ阻害剤は、XXI、DAPT、またはそれらの誘導体を含む。一部の場合では、本開示の組成物は、亜鉛をさらに含む。一部の場合では、亜鉛は、ZnSO4の形態にある。一部の場合では、本開示の組成物は、血清アルブミンタンパク質をさらに含む。一部の場合では、血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である。一部の場合では、本開示の組成物は、0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む。一部の場合では、本開示の組成物は、DMEMをさらに含む。一部の場合では、DMEMは、DMEM/F12である。一部の場合では、本開示の組成物は、ビタミンCを含まない。
[0019]一部の場合では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞は解離している。一部の場合では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞の少なくとも50%、60%、65%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%は、細胞クラスターになっていない。一部の場合では、組成物中の細胞の90%未満、85%未満、80%未満、75%未満、70%未満、65%未満、60%未満、55%未満、50%未満、45%未満、40%未満、35%未満、30%未満、35%未満、30%未満、25%未満、20%未満、15%未満、10%未満、5%未満、または1%未満は、細胞クラスターになっている。一部の場合では、インスリン陽性内分泌前駆細胞は、以前に凍結されたものである。
[0020]一部の場合では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞の少なくとも30%、40%、50%、60%、65%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%は、細胞クラスターになっている。一部の場合では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞は、細胞クラスターになっている。一部の場合では、細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約50μm~約250μm、約75μm~約250μm、または約100μm~約200μmの直径を有する。一部の場合では、細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの直径を有する。一部の場合では、細胞クラスターは、最大120、最大130、最大140、最大150、最大160、または最大170μmの平均直径または直径中央値を有する。一部の場合では、細胞クラスターは、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの平均直径または直径中央値を有する。一部の場合では、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、150μm未満の直径を有する。一部の場合では、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、または少なくとも約70%は、130μm未満の直径を有する。一部の場合では、本開示の組成物は、少なくとも35%、少なくとも38%、少なくとも40%、少なくとも42%、少なくとも44%、または少なくとも46%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を含む。一部の場合では、本開示の組成物は、最大2%、最大4%、最大6%、最大8%、最大10%、最大12%、最大14%、最大16%、最大18%、最大20%、最大22%、または最大22%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を含む。
[0021]一部の場合では、本開示の組成物は、少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含むように操作されている細胞を含み、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる。一部の場合では、少なくとも1つの遺伝子配列は、ベータ-2-ミクログロブリン(B2M)、HLA-A、HLA-B、またはCIITAのうちのいずれか1つまたは複数である。一部の場合では、本開示の組成物は、PD-L1および/またはCD47の発現が増加するように操作されている細胞を含む。一部の場合では、細胞は、CRISPR/Casシステムを使用して操作されている。
[0022]一部の態様では、アセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤または一炭素代謝経路中間体のうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。
[0023]一部の態様では、アセチルCoA関連代謝産物を含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。
[0024]一部の態様では、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。
[0025]一部の態様では、アセテートを含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。
[0026]一部の場合では、本開示の方法は、0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートと細胞を接触させるステップを含む。一部の場合では、第1の組成物は、グルタミンをさらに含む。一部の場合では、第1の組成物は、0.5~20mM、0.5~10mM、0.5~5mM、1~5mM、2~5mM、または1mM~10mMのグルタミンをさらに含む。
[0027]一部の態様では、3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。
[0028]一部の場合では、グルタミンは、3.8~4.2mMの濃度である。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、ジペプチド型ではない。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、アラニン-グルタミンジペプチド型ではない。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、5mM、5.5mM、6mM、6.5mM、7mM、7.5mM、8mM、8.5mM、9mM、9.5mM、または10mMは、遊離グルタミン型である。一部の場合では、第1の組成物は、約4mMのグルタミンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、グルタミンおよびアセテートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、β-ヒドロキシブチレートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、タウリンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、ホルメートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、ビタミンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、ビオチンをさらに含む。一部の場合では、第1の組成物は、グルタミン、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、およびビオチンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、BMPシグナル伝達経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189もしくはDMH-1またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、ROCK阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩、Bix-01294、UNC0638、BRDD4770、EPZ004777、AZ505、PDB4e47、バルプロ酸、ボリノスタット、ロミデプシン、エンチノスタットアベキシノスタット、ギビノスタット、およびモセチノスタット、ブチレート、セリンプロテアーゼ阻害剤、セルピン、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、亜鉛をさらに含む。一部の場合では、亜鉛は、ZnSO4の形態にある。一部の場合では、第1の組成物は、血清アルブミンタンパク質をさらに含む。一部の場合では、血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である。一部の場合では、第1の組成物は、0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む。一部の場合では、第1の組成物は、TGF-β経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、TGF-β経路阻害剤は、Alk5阻害剤II、A83-01、431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB525334、SB505124、SD208、GW6604、もしくはGW788388、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤をさらに含む。一部の場合では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1もしくはT3、T1AM、T0AM、Triprop、L-940901、CGS 23425、KB-141、もしくはDITPA、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、タンパク質キナーゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンもしくはRo-31-8220またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、ガンマ-セクレターゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ガンマ-セクレターゼ阻害剤は、XXI、DAPT、またはそれらの誘導体である。
[0029]一部の場合では、第1の組成物は、L-カルニチンをさらに含む。一部の場合では、本開示の方法は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性細胞を第1の組成物と1~3日間にわたって接触させ、次いでアセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含む第2の組成物と3~7日間にわたって接触させるステップを含む。
[0030]一部の場合では、本開示の方法は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性細胞を第1の組成物と1~3日間にわたって接触させ、次いでTGF-β経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、ROCK阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、またはタンパク質キナーゼ阻害剤のうちの1つまたは複数を含む第2の組成物と2~7日間にわたって接触させるステップを含む。一部の場合では、本開示の方法は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性細胞を第1の組成物と1~3日間にわたって接触させ、次いでAlk5i、GC-1、LDN193189、チアゾビビン、SSP、またはDZNEPのうちの1つまたは複数を含む第2の組成物と2~7日間にわたって接触させるステップを含む。一部の場合では、第1の組成物は、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤は、Sant1、Sant2、Sant 4、Sant4、Cur61414、フォルスコリン、トマチジン、AY9944、トリパラノール、シクロパミン、またはそれらの誘導体を含む。一部の場合では、第1の組成物は、上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの増殖因子をさらに含む。一部の場合では、EGFファミリーからの増殖因子は、ベータセルリンまたはEGFを含む。一部の場合では、第2の組成物は、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤および上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの増殖因子を欠いており、それ以外は第1の組成物と同じである。
[0031]一部の場合では、接触させるステップは、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞の少なくとも一部をインスリン陽性内分泌前駆細胞へと分化させる。一部の場合では、インスリン陽性内分泌前駆細胞は、ISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を含む。一部の場合では、接触させるステップは、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を欠いていること以外は第1の組成物と同じである組成物と複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を接触させるステップと比較して、より高い割合のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす。一部の場合では、接触させるステップは、少なくとも35%、少なくとも38%、少なくとも40%、少なくとも42%、少なくとも44%、または少なくとも46%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす。一部の場合では、接触させるステップは、約35%、約38%、約40%、約41%、約42%、または約47%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす。一部の場合では、接触させるステップは、4日間、7日間、または10日間の培養後に、少なくとも35%、少なくとも38%、または少なくとも40%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団をもたらす。一部の場合では、接触させるステップは、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を欠いていること以外は第1の組成物と同じである組成物と複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を接触させるステップと比較して、より低い割合のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす。一部の場合では、接触させるステップは、最大22%、最大20%、または最大18%、最大16%、最大14%、最大12%、最大10%、最大8%、最大6%、または最大4%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす。一部の場合では、接触させるステップは、約2%、11%、22%、20%、または18%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす。
[0032]一部の態様では、アセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、ビタミン、一炭素代謝経路中間体、L-カルニチン、またはグルタメートのうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。
[0033]一部の態様では、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。
[0034]一部の場合では、第1の組成物は、グルタメートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、アセテートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、50~1000nM、50~800nM、50~500nM、50~300nM、50~250nM、100~200nM、または125~175nMのアセテートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、β-ヒドロキシブチレートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、タウリンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、ホルメートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、ビオチンをさらに含む。一部の場合では、第1の組成物は、L-カルニチンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、L-カルニチン、およびビオチンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、BMPシグナル伝達経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189もしくはDMH-1またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、ROCK阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩、Bix-01294、UNC0638、BRDD4770、EPZ004777、AZ505、PDB4e47、バルプロ酸、ボリノスタット、ロミデプシン、エンチノスタットアベキシノスタット、ギビノスタット、およびモセチノスタット、ブチレート、セリンプロテアーゼ阻害剤、セルピン、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、TGF-β経路阻害剤をさらに含む。一部の場合では、TGF-β経路阻害剤は、ALK5阻害剤II、A83-01、431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB525334、SB505124、SD208、GW6604、もしくはGW788388、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤をさらに含む。一部の場合では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1、T3、T1AM、T0AM、Triprop、L-940901、CGS 23425、KB-141、もしくはDITPA、またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、タンパク質キナーゼ阻害剤をさらに含む。一部の場合では、タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンもしくはRo-31-8220またはそれらの誘導体である。一部の場合では、第1の組成物は、ビタミンCをさらに含む。一部の場合では、第1の組成物は、ビタミンCを含まない。一部の場合では、第1の組成物は、亜鉛をさらに含む。一部の場合では、亜鉛は、ZnSO4の形態にある。一部の場合では、第1の組成物は、血清アルブミンタンパク質をさらに含む。一部の場合では、血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である。一部の場合では、第1の組成物は、0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む。一部の場合では、本開示の組成物は、DMEMを含む。一部の場合では、DMEMは、DMEM/F12である。
[0035]一部の場合では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞は解離している。一部の場合では、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞は、以前に凍結されたものである。一部の場合では、本開示の方法は、解離した細胞を複数の細胞クラスターへと再凝集させる。一部の場合では、複数の細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約50μm~約250μm、約75μm~約250μm、または約100μm~約200μmの直径を有する。一部の場合では、複数の細胞クラスターの細胞の少なくとも約40%、50%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、95%、または99%は、生存可能である。一部の場合では、本開示の方法は、解離した細胞を少なくとも2、3、4、5、10、50、100、1000、10000、100000、または1000000個の細胞クラスターへと再凝集させる。一部の場合では、細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの直径を有する。一部の場合では、細胞クラスターは、最大120、最大130、最大140、最大150、最大160、または最大170μmの平均直径または直径中央値を有する。一部の場合では、細胞クラスターは、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの平均直径または直径中央値を有する。一部の場合では、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、150ミクロン未満の直径を有する。一部の場合では、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、または少なくとも約70%は、130μm未満の直径を有する。一部の場合では、本開示の方法は、1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって行われる。一部の場合では、本開示の方法は、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって行われる。
[0036]一部の場合では、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を第1の組成物と約3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、または8日間にわたって接触させ、それにより、第2の細胞集団を生成する。一部の場合では、本開示の方法は、第1の組成物とは異なる第2の組成物と第2の細胞集団を接触させ、それにより、前記第2のインスリン陽性細胞集団の少なくとも一部を、複数のβ細胞を含む第3の細胞集団へと分化させるステップをさらに含む。一部の場合では、第2の細胞集団を第2の組成物と1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。一部の場合では、第2の細胞集団を第2の組成物と約3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、または8日間にわたって接触させる。一部の場合では、第2の組成物は、BMPシグナル伝達経路阻害剤、ROCK阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、TGF-β経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路阻害剤、またはタンパク質キナーゼ阻害剤を含まない。一部の場合では、第2の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートを含まない。
[0037]一部の態様では、(a)複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、第1の組成物とin vitroで接触させ、それにより、インスリン陽性内分泌前駆細胞を含む複数の細胞クラスターを含む第1の細胞集団を生成するステップであって、第1の組成物は、アセテート、グルタミン、およびβ-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、またはビオチンのうちの1つまたは複数を含むステップと、(b)第1の細胞集団中の複数の細胞クラスターの少なくとも一部をin vitroで解離させるステップと、(c)解離した細胞クラスターの少なくとも一部を含む第1の細胞集団を、第2の組成物とin vitroで接触させ、それにより、複数のインスリン陽性細胞を含む複数の細胞クラスターを含む第2の細胞集団を生成するステップであって、第2の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含むステップとを含む方法が本明細書に開示される。一部の場合では、本開示の方法は、第2のインスリン陽性細胞集団を第3の組成物とin vitroで接触させ、それにより、前記第2のインスリン陽性細胞集団の少なくとも一部を、複数のβ細胞を含む第3の細胞集団へと分化させるステップであって、第3の組成物は、第2の組成物とは異なるステップをさらに含む。
[0038]一部の場合では、第3の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートを含まない。一部の場合では、第1の組成物は、3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、約4mMのグルタミンを含む。一部の場合では、第1の組成物は、0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含む。一部の場合では、第1の組成物は、約1mMのアセテートを含む。一部の場合では、第2の組成物は、50~1000nM、50~800nM、50~500nM、50~300nM、50~250nM、100~200nM、または125~175nMのアセテートを含む。一部の場合では、第2の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、L-カルニチン、およびビオチンを含む。
[0039]一部の場合では、第1の組成物は、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、EGFファミリーからの増殖因子、レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤、骨形成タンパク質(BMP)1型受容体阻害剤、γ-セクレターゼ阻害剤、またはヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤のうちの少なくとも1つの薬剤をさらに含む。
[0040]一部の場合では、第2の組成物は、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、またはヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤のうちの少なくとも1つの薬剤をさらに含む。一部の場合では、(A)前記ソニックヘッジホッグ経路阻害剤は、SANT1を含むか、(B)前記レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤は、レチノイン酸を含むか、(C)前記γ-セクレターゼ阻害剤は、XXIを含むか、(D)前記EGFファミリーからの増殖因子は、ベータセルリンまたはEGFを含むか、(E)前記BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189またはその誘導体を含むか、(F)前記TGF-βシグナル伝達経路阻害剤は、ALK5阻害剤IIまたはその誘導体を含むか、(G)前記甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1もしくはT3、またはそれらの誘導体を含むか、(H)前記タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンを含むか、(I)前記ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体を含むか、または(J)前記ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩またはその誘導体を含む。
[0041]一部の態様では、NKX6.1陽性、ISL1陽性、インスリン陽性細胞集団を、血清アルブミンタンパク質、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、THシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、エピジェネティック修飾化合物、アセチルCoA関連代謝産物、ビタミン、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、および/またはカルニチンのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、または7日(例えば、4日)の第1の期間にわたって接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。一部の場合では、本開示の方法は、第1の期間の後、細胞集団を、血清アルブミンタンパク質、アセチルCoA関連代謝産物、ビタミン、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、および/またはカルニチンのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、もしくは7日(例えば、3日)またはそれ以上の第2の期間にわたって、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、THシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、および/またはエピジェネティック修飾化合物の非存在下で接触させるステップをさらに含む。
[0042]一部の態様では、NKX6.1陽性、ISL1陽性、インスリン陽性細胞集団を、HSA、Alk5阻害剤II、GC-1、スタウロスポリン、チアゾビビン、LDN193189、DZNEP、タウリン、アセテート、ベータヒドロキシブチレート、ビオチン、カルニチン、グルタメート、およびホルメートのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、または7日(例えば、4日)の第1の期間にわたって接触させるステップを含む方法が本明細書に開示される。一部の場合では、本開示の方法は、第1の期間の後、細胞集団を、HSA、タウリン、アセテート、ベータヒドロキシブチレート、ビオチン、カルニチン、グルタメート、およびホルメートのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、もしくは7日(例えば、3日)またはそれ以上の第2の期間にわたって、Alk5阻害剤II、GC-1、スタウロスポリン、チアゾビビン、LDN193189、およびDZNEPの非存在下で接触させるステップをさらに含む。
[0043]一部の場合では、本開示の方法は、第1および/または第2の期間において、細胞集団をZnSO4と接触させるステップをさらに含む。一部の場合では、本開示の方法は、第1および/または第2の期間において、細胞集団をDMEMと接触させるステップをさらに含む。一部の場合では、DMEMは、DMEM/F12である。一部の場合では、第2の期間において、第1の期間と比較して同じ濃度の血清アルブミン(例えば、約0.05%のHSA)と細胞を接触させる。一部の場合では、第2の期間において、第1の期間(例えば、約0.05%)と比較して高い濃度のHSA(例えば、約1.0%)と細胞を接触させる。一部の場合では、細胞は、少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含むように操作されており、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる。一部の場合では、少なくとも1つの遺伝子配列は、ベータ-2-ミクログロブリン(B2M)、HLA-A、HLA-B、またはCIITAのうちのいずれか1つまたは複数である。一部の場合では、本開示の組成物は、PD-L1および/またはCD47の発現が増加するように操作されている細胞を含む。一部の場合では、細胞は、CRISPR/Casシステムを使用して操作されている。
[0044]一部の態様では、本明細書に開示されるインスリン陽性内分泌前駆細胞を含む組成物が本明細書に開示される。
[0045]一部の態様では、本明細書に開示されるβ細胞の第3の細胞集団の少なくとも一部を含む組成物が本明細書に開示される。
[0046]一部の態様では、本明細書に開示される細胞を含むデバイスが本明細書に開示される。一部の場合では、デバイスは、対象に埋め込まれる場合にインスリンを産生および放出するように構成されている。一部の場合では、細胞が封入されている。一部の場合では、デバイスは、半透膜をさらに含み、半透膜は、細胞をデバイスに保持し、かつインスリンの通過を可能にするように構成されている。
[0047]一部の態様では、長期間にわたる高い血糖レベルによって特徴付けられる疾患(例えば、糖尿病)を有する対象を処置する方法であって、本明細書に開示される細胞を投与するステップ、または本明細書に開示されるデバイスを埋め込むステップを含む方法が本明細書に開示される。一部の場合では、疾患は糖尿病である。
[0048]一部の態様では、複数のインスリン陽性細胞および凍結保存剤、およびアセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、ビタミン、またはL-グルタミンのうちの1つまたは複数を含む組成物が本明細書に開示される。
[0049]一部の場合では、本開示の組成物は凍結保存されている。一部の場合では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物を含む。一部の場合では、アセチルCoA関連代謝産物は、アセテートである。一部の場合では、本開示の組成物は、0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、グルタミンを含む。一部の場合では、本開示の組成物は、0.5~20mM、0.5~10mM、0.5~5mM、1~5mM、2~5mM、3.8~4.2または1mM~10mMのグルタミンを含む。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、アラニン-グルタミンジペプチド型ではない。一部の場合では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、5mM、5.5mM、6mM、6.5mM、7mM、7.5mM、8mM、8.5mM、9mM、9.5mM、または10mMは、遊離グルタミン型である。一部の場合では、本開示の組成物は、レドックス恒常性調節剤を含む。一部の場合では、レドックス恒常性調節剤は、タウリンである。一部の場合では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体を含む。一部の場合では、一炭素代謝経路中間体は、ホルメートである。一部の場合では、本開示の組成物は、ビタミンを含む。一部の場合では、ビタミンは、ビオチンである。
参照による組込み
[0050]本明細書で言及される全ての刊行物、特許、および特許出願は、個々の各刊行物、特許、または特許出願が参照により組み込まれることが具体的かつ個別的に指示される場合と同じ程度に、参照により本明細書に組み込まれる。参照により組み込まれる刊行物および特許または特許出願が本明細書に含まれる本開示と矛盾する範囲においては、本明細書があらゆるそのような矛盾する材料に取って代わるおよび/または優先することが意図される。
図面の簡単な説明
[0051]本開示の新規な特色は添付の特許請求の範囲に詳細に記載される。本開示の特色および利点に対するより良好な理解は、本開示の原理が利用される例示的な実施形態を記載する以下の詳細な説明、ならびに添付の図面(さらに本明細書の「図(Figure)および「図(FIG.)」)を参照することによって得られるだろう。
[0052]図1Aおよび1Bは、本明細書で開示されるMQ培地添加物と共に、またはそれを伴わずに48時間インキュベートしたヒト胚性幹細胞に対して実施したSeahorseアッセイの結果を提供する。MQは、ホルメート、アセテート、ビオチン、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、およびグルタミンを含む培地を指す。図1Aは、アッセイの複数のステージにわたる酸素消費速度(OCR)を示す。図1Bは、アッセイに基づいて算出されたATP関連酸素消費を示す。CTLは、MQの非存在下でインキュベートした対照細胞を示す。+MQまたはMet*は、MQの存在下でインキュベートした細胞を示す。MQの存在下で培養したhESCは、基礎代謝速度(basal metabolic rage)の増加(図1A、例えば、グラフの左側を参照されたい)、およびATP関連酸素消費の増加(図1B)を呈し、MQが細胞内代謝を変更し得ることを示した。 図1Bは、アッセイに基づいて算出されたATP関連酸素消費を示す。CTLは、MQの非存在下でインキュベートした対照細胞を示す。+MQまたはMet*は、MQの存在下でインキュベートした細胞を示す。MQの存在下で培養したhESCは、基礎代謝速度(basal metabolic rage)の増加(図1A、例えば、グラフの左側を参照されたい)、およびATP関連酸素消費の増加(図1B)を呈し、MQが細胞内代謝を変更し得ることを示した。 [0053]図1Cは、本明細書で開示されるMQ培地添加物と共に(MQ)もしくはそれを伴わずに(CTL)48時間インキュベートしたか、またはグルタミンとアセテートとを除くMQ添加物と共にインキュベートしたヒト胚性幹細胞の培養の明視野顕微鏡画像である。MQと共にインキュベートした培養は、細胞密度の増加を呈し、成長の増強を示唆した。グルタミンおよびアセテートをMQカクテルから除去した場合、細胞密度は添加物の完全セットと比較して低下し、グルタミンおよびアセテートが、細胞に対するMQの観察された効果に寄与することを示唆した。 [0054]図2Aは、MQと共に(+代謝産物)またはMQの非存在下(対照)でインキュベートした培養の、ステージ5の終了時に評価した試料からの例示的な分散プロットである。SC-β細胞は、右上の象限に示される(Nkx6.1+/Isl1+を参照されたい)。ステージ5全体にわたるMQの培地への添加は、SC-β細胞のパーセントを、対照培養における25.9%からMQを伴う培養における38.1%まで、実質的に増大させた。図2Bは、MQを伴わずに実施した繰り返しからの、ステージ5の最後に取得されたNkx6.1+/Isl1+SC-β細胞のパーセンテージを定量するグラフであり、MQの非存在下で達成されたSC-β%が、図2AにおいてMQを用いて観察されたものよりも再現性よく低いことを示す。これらのデータは、ステージ5の間のMQの添加がSC-β細胞分化を増強し得ることを示唆する。 [0056]図3は、MQがステージ5全体にわたって存在しない(対照)、ステージ5全体にわたって存在する(+MQ)、またはアセテートおよびグルタミンを除いたMQ添加物を添加した(+MQ*-アセテート-Q)実験の例示的なフローサイトメトリー結果を提供する図である。Nkx6.1+/Isl1+SC-β細胞のパーセントは、対照条件で29.8%、MQの存在下で41.6%、およびアセテートとグルタミンとを除いたMQ添加物で34.3%であった。 [0057]図4は、ステージ5全体にわたるMQの存在下または非存在下でのインキュベーション後の、ステージ5の最後に存在するSC-β細胞のパーセントを比較する2つの実験の要約データを提供するグラフである。 [0058]図5は、ステージ6の4日目からの例示的なフローサイトメトリーデータを提供する図であり、対照培養における37%と比較して、MQがステージ5に存在した培養(+代謝産物)では、細胞の47.3%がNkx6.1+/Isl1+であったことを示す。 [0059]図6Aは、ステージ6の開始時に播種した生存可能細胞の数に対する、ステージ6の4および10日目における全ての細胞の回収パーセントを実証するグラフである。総細胞の収率は、MQがステージ5に存在した培養においてより高かった。図6Bは、総細胞収率とSC-β細胞であった細胞のパーセントとの積から算出した、ステージ6の4日目におけるSC-β細胞の数を定量するグラフである。SC-β細胞の収率は、MQがステージ5に存在した培養においてより高かった。 [0061]図7Aは、ステージ5の間、MQの存在下または非存在下で培養した、ステージ6の7日目に分析した細胞の例示的なフロープロットを示す図である。MQと共にインキュベートしなかった細胞における34.3%と比較して、MQがステージ5に存在した培養では、細胞の45.1%がNkx6.1+/Isl1+であったことが見出された。図7Bは、ステージ5の間、MQの存在下または非存在下で培養した細胞に関する、ステージ6の4、7、および10日目におけるNkx6.1+/Isl1+細胞のパーセンテージを示すグラフであり、ステージ5のMQ処理の場合に観察されたSC-β細胞の高いパーセントが経時的に維持されていることを実証する(MQ St5)。 [0063]図8は、ステージ6の開始時に播種した生存可能細胞の数に対する、ステージ6の4、7、および10日目における全ての細胞の回収パーセント(収率)を例示するグラフである。細胞は、MQの存在下(MQ)または非存在下(対照)で培養し、ステージ6において培地Aまたは対照培地1に解凍した。ステージ5においてMQと共にインキュベートした細胞(MQ St5)において、より高い収率が観察された。 [0064]図9Aは、ステージ5の間、MQの存在下または非存在下(対照)でインキュベートし、次いでステージ6において培地Aまたは対照培地1に解凍した細胞の明視野顕微鏡画像である。画像は、ステージ6の4日目に撮影した。ステージ5の間、MQと共にインキュベートし、次いで培地Aに解凍した細胞は、より小さいクラスターを形成した。図9Bは、ステージ5の間、MQの存在下または非存在下(対照)でインキュベートし、次いでステージ6において培地Aまたは対照培地1に解凍した細胞の明視野顕微鏡画像を提供する図である。画像は、ステージ6の7日目に撮影した。ステージ5の間、MQと共にインキュベートし、次いで培地Aに解凍した細胞は、より小さいクラスターを形成した。 [0066]図10は、ステージ6の7日目におけるクラスターサイズ度数を定量するグラフであり、クラスターサイズが、ステージ5においてMQと共にインキュベートし、次いでステージ6において培地Aに解凍した細胞においてより小さいことを示す。ステージ5の間、MQと共にインキュベートし、次いで培地Aに解凍した細胞は、より小さいクラスターを形成した。 [0067]図11は、ステージ6培地(「培地A」)およびその成分を対照培地1および対照培地2と比較して示す図である。ステージ6の1~4日目の間、S5d6因子は、Alk5i(10μM)、GC-1(1μM)、LDN-193189(100nM)、チアゾビビン(thiazovinin)(2.5μM)、SSP(3nM)、およびDZNEP(100nM)を含む。 [0068]図12Aは、対照培地1、対照培地2、培地A(代謝産物を含有しない)、または培地A(代謝産物を含有する)培養からS6d7およびS6d11に回収した生存可能細胞の数を示す棒グラフである。データは、DMEM/F12を使用する培地Aの培地がステージ6全体にわたって生存可能細胞数をさらに向上させることを示す。図12Bは、対照培地1、対照培地2、培地A(代謝産物を含有しない)、または培地A(代謝産物を含有する)培養からS6d7およびS6d11に回収した細胞のパーセントを示す棒グラフである。データは、DMEM/F12を使用する培地Aの培地がステージ6全体にわたって細胞回収率をさらに向上させることを示す。 [0070]図13は、対照培地1、対照培地2、または培地A(代謝産物を含有する)培養由来のS6d7およびS6d11におけるSC島クラスターの顕微鏡画像である。画像は、培地Aクラスターがステージ6全体にわたってより高い均一性を呈することを示す。 [0071]図14は、対照培地1、対照培地2、および培地A培養由来のS6d4、S6d7、およびS6d11における細胞クラスターの度数およびクラスターサイズを示す一連の面グラフである。結果は、培地Aクラスターが、より小さく、S6d11でより大きな均一性を呈することを示す。 [0072]図15は、対照培地1培養由来のS6d11細胞のGSIS機能を示す棒グラフである。 [0073]図16は、対照培地2培養由来のS6d11細胞のGSIS機能を示す棒グラフである。結果は、対照培地2のSC島が対照培地1ほどのGSIS機能を呈しないことを示す(図15と比較されたい)。 [0074]図17は、培地A(代謝産物を含有しない)培養由来のS6d11細胞のGSIS機能を示す棒グラフである。結果は、培地A(代謝産物を含有しない)の培地のSC島が向上したGSIS機能を呈することを示す(図15と比較されたい)。 [0075]図18は、培地A(代謝産物を含有する)培養由来のS6d11細胞のGSIS機能を示す棒グラフである。結果は、培地Aの培地のSC島が対照培地1培養と類似したGSIS機能を呈することを示す(図15と比較されたい)。 [0076]図19は、培地Aの効果を示す表である。培地Aは、対照培地2と比較して向上したS6d11の細胞回収率、および対照培地1と比較して向上したGSIS機能を示す。 [0077]図20Aは、ヌードラットへの移植の6週間後のSC島細胞の生存率を示すグラフであり、分化のステージ6においてレジメン1によって生成した細胞を、ステージ6においてレジメン2によって生成した細胞と比較する。ステージ6にレジメン1を使用して生成した細胞は、埋込の6週間後に評価した場合、レジメン2を使用して生成した細胞と比較してより高い生存率を呈した。図20Bは、ヌードラットへの移植の6および13週間後の、ステージ6においてレジメン2によって生成した分化のステージ6のSC島細胞の生存率を示すグラフである。 [0078]図21は、ヌードラット(rates)への移植の6週間後にデバイスの組織病理学的評価において検出された多核巨細胞(MNG)の数を定量するグラフである。分化のステージ6においてレジメン1によって生成したSC島を、ステージ6においてレジメン2によって生成したSC島と比較する。埋込の6週間後に、レジメン1を使用して生成した細胞においてより少ない多核巨細胞(MNG)が観察された。 [0079]図22は、分化のステージ6においてレジメン2またはレジメン1を含む方法によって生成したSC島を含有する本開示のデバイスの埋込の6週間後における、ヌードラットからのH&E染色切片の例示的な組織病理画像である。埋込の6週間後に、レジメン1を使用して生成した細胞において減少した免疫浸潤物およびより少ない多核巨細胞(MNG)が観察された。 [0080]図23は、分化のステージ6の間にレジメン2またはレジメン1を使用して生成したSC島が充填された1つ(1×)または2つ(2×)のデバイスを投与された糖尿病NOD Scidガンマ(NSG)マウスの非空腹時血中グルコースレベルを例示するグラフである。2つのデバイス(2×)を投与された動物は、埋込の約8週間後まで正常血糖を維持した。 [0081]図24Aは、分化のステージ6の間にレジメン2またはレジメン1を使用して生成したSC島が充填された1つ(1×)または2つ(2×)のデバイスを投与された糖尿病NOD Scidガンマ(NSG)マウスにおける非空腹時ヒトCペプチドレベルを経時的に例示するグラフである。Cペプチドレベルが検出不能であったナイーブ対照および糖尿病対照マウスと対照的に、埋込後の全ての実験群においてCペプチドの増加が観察され、2つのデバイスを投与された動物においてレベルの持続が観察された。CADは、細胞収容デバイスを指す。図24Bは、分化のステージ6の間にレジメン2またはレジメン1を使用して生成したSC島が充填された1つ(1×)または2つ(2×)のデバイスを投与された糖尿病NOD Scidガンマ(NSG)マウスにおいて、移植後153日目に測定したヒトCペプチドの空腹時レベルと移植後112日目に測定したCペプチドの非空腹時レベルとを比較するグラフである。データは、レジメン2およびレジメン1を含む本開示の組成物および方法を使用して生み出された方法によって生成したSC島が、糖尿病対象への移植後のインスリン産生の増加における有効性を呈し得ることを示す。 [0083]図25は、糖尿病NSGマウスへの埋込の5か月(1つのデバイス)または6か月(2つのデバイス)後に評価したSC島の生存率データを提供するグラフである。SC島は、分化のステージ6の間にレジメン2またはレジメン1を使用して生成した。分化のステージ6においてレジメン2またはレジメン1のいずれによって生成した細胞を有するデバイスにおいても高い生存率が観察される。 [0084]図26は、SC島の糖尿病NSGマウスへの埋込の6か月後の、Cペプチドおよびグルカゴンについて染色した(左側のパネル)かまたはH&E染色した(右側のパネル)切片の例示的な組織学画像である。これらの結果は、レジメン2およびレジメン1を含む本開示の組成物および方法を使用して生成したSC島が、埋込後も生存可能なままであり得、インスリンおよびグルカゴンを産生できることを示す。
[0085]膵島の移植は、糖尿病対象、例えば、I型糖尿病を有する対象に対して著しい臨床上の利益を達成し得る有望な療法である。ドナー膵組織からの膵島源の供給は限定的であるため、幹細胞等の代替供給源から埋込可能な島を生成する技法の改良が必要とされている。島成分(例えば、SC-β細胞)を生成する方法の改良は、より効果的な治療産物(例えば、機能性が向上したSC-β細胞)、ヒト治療用途のためのSC島の改良された製造方法(例えば、より高い細胞収率)、またはそれらの組合せをもたらし得る。
[0086]本明細書では、とりわけ、in vitroでのSC-β細胞の生成の改良のための組成物および方法が提供される。ここで開示される薬剤のある特定の組成および組合せは、細胞の代謝の特定の態様を標的とすることによって、分化細胞および結果として得られるSC-β細胞の適応度および代謝柔軟性(metabolic flexibility)を向上させる。例えば、本開示は、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の増加した数および相対的パーセンテージ、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、サイズの減少および一様性の増加等の有利な特徴を有するSC島クラスター、SC-β細胞のin vitroでの向上した機能、ならびに向上した生存率、機能、ならびに低下した免疫原性を移植後にもたらす、新規な製剤および分化方法を提供する。開示される組成物および方法は、ヒト治療用途のためのSC島の大規模製造で用いることができる。
[0087]本明細書で開示される組成物によって標的とすることができる代謝経路としては、例えば、一炭素代謝、脂質の生成およびタンパク質のアセチル化のためのアセチルCoA合成、ミトコンドリア酸化的リン酸化およびTCA回路の促進、ならびにレドックス恒常性を維持する中間体の生成が挙げられる。SC-β細胞の生成の改良に有用な本開示の組成物は、例えば、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタミン、グルタメート、カルニチン、またはそれらの任意の組合せを含み得る。
[0088]本開示の様々な実施形態が本明細書に示され、記載されるが、そのような実施形態が例としてのみ提供されるということは、当業者には明らかだろう。数多くの変形例、変更例、および代用例が、本開示から逸脱することなく当業者には思い浮かぶだろう。本明細書に記載される本開示の実施形態の様々な代替形態が用いられてもよいということが理解されるべきである。
定義
[0089]本出願において、単数形の使用は、別段の記述が具体的にない限り、複数形を含む。本明細書で使用される場合、単数形の「1つの(a)」、「1つの(an)」、および「その(the)」は、文脈上別段の指示が明確にない限り、複数の指示対象を含むことに留意しなければならない。
[0090]本出願において、「または」の使用は、別段の記述がない限り、「および/または」を意味する。「および/または」および「それらの任意の組合せ」という用語、ならびにそれらの文法上の同義語は、本明細書で使用される場合、交換可能に使用することができる。これらの用語は、任意の組合せが具体的に企図されることを伝達することができる。単に例示的な目的として、以下の語句、「A、B、および/またはC」または「A、B、C、またはそれらの任意の組合せ」は、「Aのみ、Bのみ、Cのみ、AとB、BとC、AとC、およびAとBとC」を意味することができる。「または」という用語は、選言的な使用への言及が文脈上明確にない限り、連言的にも選言的にも使用することができる。
[0091]さらに、「含む(including)」という用語ならびに他の語形、例えば「含む(include)」、「含む(includes)」、および「含まれる(included)」の使用は限定的ではない。
[0092]本明細書での「一部の実施形態」、「ある実施形態」、「一実施形態」、または「他の実施形態」への言及は、実施形態と共に記載される特定の特色、構造、または特徴が本開示の少なくとも一部の実施形態に含まれるが、必ずしも全ての実施形態に含まれるわけではないことを意味する。
[0093]本明細書および特許請求の範囲で使用される場合、「含む(comprising)」(ならびに含む(comprising)の任意の語形、例えば「含む(comprise)」および「含む(comprises)」)、「有する(having)」(ならびに有する(having)の任意の語形、例えば「有する(have)」および「有する(has)」)、「含む(including)」(ならびに含む(including)の任意の語形、例えば「含む(includes)」および「含む(include)」)、または「含有する(containing)」(ならびに含有する(containing)の任意の語形、例えば「含有する(contains)」および「含有する(contain)」)という単語は、非排他的または非限定的であり、追加の記載されていない要素または方法ステップを排除しない。本明細書で論じられる任意の実施形態が本開示の任意の方法または組成物に関して実施することができ、逆もまた同様であることが企図される。さらに、本開示の組成物は本開示の方法を達成するために使用することができる。
[0094]基準数値に関する「約」という用語およびその文法上の同義語は、本明細書で使用される場合、その数値それ自体とその数値からプラスまたはマイナス10%の範囲の値とを含むことができる。
[0095]「約」または「およそ」という用語は、当業者によって決定される特定の値の許容誤差範囲内であることを意味し、部分的には、その値が測定または決定される方法、例えば測定系の制限に依存する。例えば、「約」は当技術分野の慣例通りに1以内または1を超える標準偏差を意味し得る。あるいは、「約」は、所与の値の最大20%、最大10%、最大5%、または最大1%の範囲を意味し得る。別の例では、「約10」という量は10および9~11の任意の量を含む。さらに別の例では、基準数値に関する「約」という用語はまた、その値からプラスまたはマイナス10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、または1%の範囲の値を含み得る。あるいは、特に生物システムまたはプロセスに関して、「約」という用語は、ある値の10倍以内、好ましくは5倍以内、より好ましくは2倍以内であることを意味し得る。特定の値が本出願および特許請求の範囲に記載される場合、別段の記述がない限り、特定の値の許容誤差範囲内であることを意味する「約」という用語が想定されるべきである。
[0096]「糖尿病」という用語およびその文法上の同義語は、本明細書で使用される場合、長期にわたる高い血糖レベルによって特徴付けられる疾患を指すことができる。例えば、「糖尿病」という用語およびその文法上の同義語は、本明細書で使用される場合、全てまたは任意の種類の糖尿病、例えば、これらに限定されないが、1型、2型、嚢胞性線維症関連、外科的、妊娠糖尿病、およびミトコンドリア糖尿病を指すことができる。一部の場合では、糖尿病は遺伝性糖尿病の形態であり得る。
[0097]「内分泌細胞」という用語は、特に指定されない場合、生物の膵臓に存在するホルモン産生細胞、例えば、「島」、「島細胞」、「島等価物」、「島様細胞」、「膵島」、およびそれらの文法上の同義語を指すことができる。ある実施形態では、内分泌細胞は膵臓前駆細胞または先駆体から分化させてもよい。島細胞は、膵α細胞、膵β細胞、膵δ細胞、膵F細胞、および/または膵ε細胞を含むがこれらに限定されない、多様な型の細胞を含むことができる。島細胞は細胞群、細胞クラスター等を指すこともできる。
[0098]「前駆」および「先駆」細胞という用語は、本明細書で交換可能に使用され、分化によって生じ得る細胞よりも原始的である(例えば、発生経路または進行において完全に分化した細胞よりも早期のステップにある)細胞表現型を有する細胞を指す。多くの場合、前駆細胞はまた、有意なまたは非常に高い増殖能を有し得る。前駆細胞は、発生経路ならびに細胞が発生および分化する環境に応じて複数の別個の分化細胞型または単一の分化細胞型を生じ得る。
[0099]インスリン陽性内分泌細胞に関連する用語としての「その先駆体」とは、先駆細胞をインスリン陽性内分泌細胞へと分化させるのに好適な条件下で培養した場合にインスリン陽性内分泌細胞へと分化させることができる、例えば、多能性幹細胞、胚体内胚葉細胞、原始腸管細胞、膵臓前駆細胞、または内分泌前駆細胞を含むあらゆる細胞を指すことができる。
[0100]「外分泌細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、外分泌腺、すなわち管を介してその分泌物を排出する腺の細胞を指すことができる。特定の実施形態では、外分泌細胞は、小腸に分泌される酵素を産生することができる膵細胞である膵外分泌細胞を指すことができる。これらの酵素は、胃腸管を通過する食物を消化するのに役立ち得る。膵外分泌細胞は、2つのホルモン、すなわちインスリンおよびグルカゴンを分泌することができるランゲルハンス島としても公知である。膵外分泌細胞はいくつかの細胞型、例えば、α-2細胞(ホルモンであるグルカゴンを産生することができる)、またはβ細胞(ホルモンであるインスリンを生成することができる)、およびα-1細胞(調節物質であるソマトスタチンを産生することができる)のうちの1つであり得る。インスリン非産生外分泌細胞とは、この用語が本明細書で使用される場合、α-2細胞またはα-1細胞を指すことができる。膵外分泌細胞という用語は、血流に分泌されるホルモン(例えば、インスリン(β細胞から産生される)、グルカゴン(アルファ-2細胞によって産生される)、ソマトスタチン(デルタ細胞によって産生される)、および膵ポリペプチド(F細胞によって産生される)を産生する膵細胞を指すことができる「膵内分泌細胞」を包含する。
[0101]「幹細胞由来β細胞」、「SC-β細胞」、「機能性β細胞」、「機能性膵β細胞」、「成熟SC-β細胞」という用語、およびそれらの文法上の同義語は、膵β細胞を示す少なくとも1つのマーカー(例えば、PDX-1またはNKX6.1)を示し、インスリンを発現し、内因性成熟β細胞に特徴的なグルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)応答を示す細胞(例えば、非天然膵β細胞)を指すことができる。一部の実施形態では、「SC-β細胞」および「非天然β細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、交換可能である。一部の実施形態では、「SC-β細胞」は成熟膵細胞を含む。本開示の方法が、任意の細胞を出発点として使用して(例えば、本発明はこの様式に限定されることが意図されるものではないが、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞、前駆細胞、部分初期化体細胞(例えば、人工多能性幹細胞とそれが由来する体細胞との間の中間状態に部分的に初期化された体細胞)、多分化能性細胞、全能性細胞、前出の細胞のうちのいずれかの分化転換形態等を使用することができる)、任意のインスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体からSC-β細胞を得ることができるので、SC-β細胞は幹細胞に(例えば、直接)由来する必要はないことが理解されるべきである。一部の実施形態では、SC-β細胞は複数回のグルコース負荷(例えば、少なくとも1回、少なくとも2回、または少なくとも3回以上の逐次グルコース負荷)に対する応答を呈する。一部の実施形態では、応答は内因性島(例えば、ヒト島)の複数回のグルコース負荷に対する応答に類似する。一部の実施形態では、SC-β細胞の形態は内因性β細胞の形態に類似する。一部の実施形態では、SC-β細胞は、内因性β細胞のGSIS応答に類似するin vitro GSIS応答を呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞は、内因性β細胞のGSIS応答に類似するin vivo GSIS応答を呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞は、内因性β細胞のGSIS応答に類似するin vitro GSIS応答とin vivo GSIS応答の両方を呈する。SC-β細胞のGSIS応答は、SC-β細胞の宿主(例えば、ヒトまたは動物)への移植から2週間以内に観察することができる。一部の実施形態では、SC-β細胞はインスリンを分泌顆粒に内包する。一部の実施形態では、SC-β細胞は封入された結晶インスリン顆粒を呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞は1超の刺激指数を呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞は1.1超の刺激指数を呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞は2超の刺激指数を呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞はサイトカインに応答してサイトカイン誘導アポトーシスを呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞からのインスリン分泌は公知の抗糖尿病薬(例えば、分泌促進薬)に応答して増強する。一部の実施形態では、SC-β細胞は単ホルモンである。一部の実施形態では、SC-β細胞は他のホルモン、例えば、グルカゴン、ソマトスタチン、または膵ポリペプチドを異常には共発現しない。一部の実施形態では、SC-β細胞は低い複製速度を呈する。一部の実施形態では、SC-β細胞はグルコースに応答して細胞内Ca2+を増加する。
[0102]本明細書で使用される場合、「インスリン産生細胞」という用語およびその文法上の同義語は、膵臓前駆体またはその先駆体から分化したインスリンを分泌する細胞を指す。インスリン産生細胞としては、その用語が本明細書に記載される膵β細胞、およびインスリンを恒常的または誘導的に合成する(例えば、インスリン遺伝子を転写し、プロインスリンmRNAを翻訳し、プロインスリンmRNAを修飾してインスリンタンパク質にする)か、発現する(例えば、インスリン遺伝子によって保有される表現形質を表す)か、または分泌する(インスリンを細胞外空間に放出する)膵β様細胞(例えば、インスリン陽性内分泌細胞)を挙げることができる。例えばインスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体を本開示の方法に従ってSC-β細胞へと分化させることによって生成されるインスリン産生細胞集団は、膵β細胞または(β様細胞(例えば、内因性β細胞の特徴を少なくとも1つまたは少なくとも2つ有する細胞)であり得、内因性成体β細胞に類似するグルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)応答を呈する。例えば本明細書に開示される方法によって生成されるインスリン産生細胞集団は、成熟膵β細胞またはSC-β細胞を含むことができ、インスリン非産生細胞(例えば、インスリンを産生することも分泌することもしないこと以外は細胞様表現型の細胞)を含有することもできる。
[0103]「インスリン陽性β様細胞」、「インスリン陽性内分泌細胞」という用語、およびそれらの文法上の同義語は、膵β細胞を示す少なくとも1つのマーカーを示し、さらにインスリンを発現するが、内因性β細胞に特徴的なグルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)応答を欠く細胞(例えば、膵内分泌細胞)を指すことができる。
[0104]「β細胞マーカー」という用語は、限定されないが、膵β細胞に特異的に発現するかまたは存在するタンパク質、ペプチド、核酸、タンパク質および核酸多型、スプライスバリアント、タンパク質または核酸の断片、エレメント、ならびに他の分析物を指す。例示的なβ細胞マーカーとしては、これらに限定されないが、膵および十二指腸ホメオボックス1(Pdx1)ポリペプチド、インスリン、Cペプチド、アミリン、E-カドヘリン、Hnf3β、PCI/3、B2、Nkx2.2、GLUT2、PC2、ZnT-8、ISL1、Pax6、Pax4、NeuroD、1 Inf1b、Hnf-6、Hnf-3ベータ、およびMafA、ならびにZhangら、Diabetes.50(10):2231~6(2001)に記載されているものが挙げられる。一部の実施形態では、β細胞マーカーは核3-細胞マーカーである。一部の実施形態では、β細胞マーカーはPdx1またはPH3である。
[0105]「膵内分泌マーカー」という用語は、限定されないが、膵内分泌細胞に特異的に発現するかまたは存在するタンパク質、ペプチド、核酸、タンパク質および核酸多型、スプライスバリアント、タンパク質または核酸の断片、エレメント、ならびに他の分析物を指すことができる。例示的な膵内分泌細胞マーカーとしては、これらに限定されないが、Ngn-3、NeuroD、およびIslet-1が挙げられる。
[0106]「膵臓前駆体」、「膵内分泌前駆体」、「膵先駆体」、「膵内分泌先駆体」という用語、およびそれらの文法上の同義語は、本明細書で交換可能に使用され、膵内分泌細胞、膵外分泌細胞、または膵管細胞を形成することができる膵ホルモン発現細胞になることができる幹細胞を指すことができる。これらの細胞は、少なくとも1種の膵細胞、例えば、インスリンを産生するβ細胞、グルカゴンを産生するα細胞、ソマトスタチンを産生するδ細胞(もしくはD細胞)、および/または膵ポリペプチドを産生するF細胞へ分化することが決定付けられる。そのような細胞は、NGN3、NKX2.2、NeuroD、ISL-1、Pax4、Pax6、またはARXのうちの少なくとも1つのマーカーを発現することができる。
[0107]「Pdx1陽性膵臓前駆体」という用語は、本明細書で使用される場合、SC-β細胞、例えば膵β細胞へと分化する能力を有する膵内胚葉(PE)細胞である細胞を指すことができる。Pdx1陽性膵臓前駆体はマーカーPdx1を発現する。他のマーカーとしては、これらに限定されないが、Cdcp1、またはPtf1a、またはHNF6、またはNRx2.2が挙げられる。Pdx1の発現は、抗Pdx1抗体を使用する免疫化学または定量RT-PCR等の当業者によって公知のあらゆる方法によって評価することができる。一部の場合では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞はNKX6.1の発現を欠く。一部の場合では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、NKX6.1の発現の欠如のためにPdx1陽性NKX6.1陰性膵臓前駆細胞とも称され得る。一部の場合では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は「膵前腸内胚葉細胞」と称される場合もある。
[0108]「Pdx1陽性NKX6-1陽性膵臓前駆体」という用語は、本明細書で使用される場合、インスリン産生細胞、例えば膵β細胞へと分化する能力を有する膵内胚葉(PE)細胞である細胞を指すことができる。Pdx1陽性NKX6-1陽性膵臓前駆体はマーカーPdx1およびNKX6-1を発現する。他のマーカーとしては、これらに限定されないが、Cdcp1、またはPtf1a、またはHNF6、またはNRx2.2を挙げることができる。NKX6-1の発現は、抗NKX6-1抗体を使用する免疫化学または定量RT-PCR等の当業者によって公知のあらゆる方法によって評価することができる。本明細書で使用される場合、「NKX6.1」および「NKX6-1」という用語は同義であり交換可能である。一部の場合では、Pdx1陽性NKX6-1陽性膵臓前駆細胞は「膵前腸先駆細胞」と称される場合もある。
[0109]「Ngn3陽性内分泌前駆体」という用語は、本明細書で使用される場合、転写因子Neurogenin-3(Ngn3)を発現する膵内分泌細胞の先駆体を指すことができる。前駆細胞は、多分化能性幹細胞よりも分化しており、数少ない細胞型にのみ分化することができる。特に、Ngn3陽性内分泌前駆細胞は5つの膵内分泌細胞型(α、β、δ、ε、およびPP)へと分化する能力を有する。Ngn3の発現は、抗Ngn3抗体を使用する免疫化学または定量RT-PCR等の当業者によって公知のあらゆる方法によって評価することができる。
[0110]「NeuroD」および「NeuroD1」という用語は、交換可能に使用され、膵内分泌前駆細胞に発現するタンパク質およびそれをコードする遺伝子を同定する。
[0111]「選択マーカー」という用語は、発現した場合に、選択可能な表現型、例えば、細胞毒性剤もしくは細胞分裂阻害剤に対する耐性(例えば、抗生物質耐性)、栄養原栄養性、またはタンパク質を発現する細胞と発現しない細胞とを区別する基準として使用することができる特定のタンパク質の発現を細胞に付与する、遺伝子、RNA、またはタンパク質を指す。「選択マーカー」という用語は、本明細書で使用される場合、遺伝子または遺伝子の発現産物、例えばコードされるタンパク質を指すことができる。一部の実施形態では、選択マーカーは、それを発現しないかまたは著しく低いレベルで発現する細胞と比して、それを発現する細胞に増殖および/または生存上の利点を付与する。そのような増殖および/または生存上の利点は、典型的には、細胞がある特定の条件、すなわち「選択条件」下に維持される場合に生じる。効果的な選択を保証するために、細胞集団は、マーカーを発現しない細胞が増殖および/または生存せず、かつ集団から取り除かれるかまたはそのような細胞の数が集団の非常に少ない割合のみに減少するような条件下で十分な期間維持され得る。マーカーを発現しない細胞を大部分または完全に取り除く選択条件下で細胞集団を維持することによって増殖および/または生存上の利点を付与するマーカーを発現する細胞を選択する方法は、本明細書では「ポジティブセレクション」と称され、マーカーは「ポジティブセレクションに有用」であると記載される。ネガティブセレクションおよびネガティブセレクションに有用なマーカーもまた、本明細書に記載されるいくつかの方法の対象である。そのようなマーカーの発現は、マーカーを発現しないかもしくは著しく低いレベルで発現する細胞と比して、マーカーを発現する細胞に、増殖および/もしくは生存上、不都合を生じさせる(または、別の点から考えると、マーカーを発現しない細胞は、マーカーを発現する細胞と比して、増殖および/もしくは生存上の利点を有する)。したがって、このマーカーを発現する細胞は、選択条件で十分な期間維持される場合、細胞集団から大部分または完全に取り除かれ得る。
[0112]「エピジェネティクス」という用語は、DNA配列の変化を伴わない遺伝子機能の遺伝的変化を指す。エピジェネティクスとは、大半の場合、遺伝子活性および発現に影響を及ぼす染色体の変化を表すが、ゲノムの修飾に由来しない任意の遺伝的表現型変化を説明するために使用することもできる。細胞の表現形質および生理的な表現形質に対するそのような効果は、外的もしくは環境要因に起因し得るか、または正常な発生プログラムの一部であり得る。エピジェネティクスはまた、ヌクレオチド配列の変化を伴わないゲノムに機能的に関連する変化を指すことができる。そのような変化を生じる機構の例はDNAメチル化およびヒストン修飾であり、それぞれは、根底にあるDNA配列を変更せずに遺伝子が発現する方法を変更する。遺伝子発現は、DNAのサイレンサー領域に結合するリプレッサータンパク質の作用を介して制御され得る。これらのエピジェネティック変化は細胞分裂を介して細胞の寿命が尽きるまで継続する可能性があり、根底にある生物のDNA配列の変化を伴わないにもかかわらず、複数の世代にわたって継続する可能性もある。真核生物の生物学におけるエピジェネティック変化の一例は細胞の分化のプロセスである。形態形成の間、全能性幹細胞は様々な多能性細胞になり、多能性細胞は完全に分化した細胞になることができる。
[0113]「エピジェネティック修飾化合物」という用語は、エピジェネティック変化を遺伝子に起こすことができる、すなわちDNA配列を変化させずに遺伝子発現を変化させることができる化学化合物を指す。エピジェネティック変化は、遺伝子がオンになっているかまたはオフになっているかを決定する役に立つことができ、ある特定の細胞、例えばベータ細胞のタンパク質の産生に影響を与えることができる。DNAメチル化およびヒストン修飾等のエピジェネティック修飾は、DNAアクセシビリティおよびクロマチン構造を変更し、それにより遺伝子発現のパターンを調節する。これらのプロセスは、成体生物の別個の細胞系列の正常な発生および分化に極めて重要である。これらのプロセスは、外的影響によって変更することができ、したがって、環境による表現型または病態表現型の変更の結果に寄与し得るかまたはそのような変更の結果であり得る。重要なことに、エピジェネティック修飾は分化の間に不活性化する多能性遺伝子の調節における極めて重要な役割を有する。非限定的で例示的なエピジェネティック修飾化合物としては、DNAメチル化阻害剤、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ阻害剤、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、ブロモドメイン阻害剤、またはそれらの任意の組合せが挙げられる。
[0114]「分化細胞」という用語またはその文法上の同義語は、天然形態において本明細書で定義される多能性ではないあらゆる初代細胞を意味する。別の点から記述すると、「分化細胞」という用語は、細胞の分化プロセスにおいてより特殊化していない細胞型(例えば、幹細胞、例えば、人工多能性幹細胞)の細胞から得られる、より特殊化した細胞型の細胞を指すことができる。理論に限定されることを望むものではないが、正常な個体発生の過程における多能性幹細胞は、初めに、膵細胞および他の内胚葉細胞型を形成することができる内胚葉細胞に分化し得る。内胚葉細胞のさらなる分化は膵臓経路に至り、ここで、約98%の細胞は外分泌、小管、または基質細胞になり、約2%は内分泌細胞になる。初期内分泌細胞は島前駆体であり、これは、次いで、インスリン、グルカゴン、ソマトスタチン、または膵ポリペプチドを分泌するインスリン産生細胞(例えば、機能性内分泌細胞)へとさらに分化することができる。内胚葉細胞はまた、内胚葉起源の他の細胞、例えば、肺、肝臓、腸、胸腺等へと分化することができる。
[0115]本明細書で使用される場合、「体細胞」という用語は、生殖細胞系列細胞とは異なり、生物の身体を形成するあらゆる細胞を指すことができる。哺乳動物では、生殖細胞系列細胞(「配偶子」としても公知)は、受精中に融合して、哺乳動物胚全体が発生する接合子と呼ばれる細胞を生じる精子および卵子である。哺乳動物の身体における他のあらゆる細胞型-精子および卵子、それらを産生する元となる細胞(生殖母細胞)、ならびに未分化幹細胞を除く-は体細胞であり、内臓、皮膚、骨、血液、および結合組織は全て体細胞から構成される。一部の実施形態では、体細胞は「非胚体細胞」であり、これは、胚に存在することも胚から取得されることもなく、そのような細胞のin vitroでの増殖に起因しない体細胞を意味する。一部の実施形態では、体細胞は「成体体細胞」であり、これは、胚もしくは胎児以外の生物に存在するかもしくはそれから取得されるか、またはそのような細胞のin vitroでの増殖に起因する細胞を意味する。別段の指示がない限り、少なくとも1個のインスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体をインスリン産生グルコース応答性細胞に変換するための方法は、in vivoとin vitroの両方で行うことができる(ここで、in vivoは、少なくとも1個のインスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体が対象の体内に存在する場合に実施され、in vitroは、培養で維持される単離された少なくとも1個のインスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体を使用して実施される)。
[0116]本明細書で使用される場合、「成体細胞」という用語は、胚発生後に身体全体にわたって見出される細胞を指すことができる。
[0117]「内胚葉細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、非常に初期の胚における3つの一次生殖細胞層のうちの1つに由来する細胞を指すことができる(他の2つの生殖細胞層は中胚葉および外胚葉である)。内胚葉は3つの層のうち最も内側にある。内胚葉細胞は、初めに胚腸を生じ、次いで気道および消化管(例えば、腸)の内面、肝臓、ならびに膵臓を生じるように分化する。
[0118]「内胚葉起源の細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、内胚葉細胞から発生または分化したあらゆる細胞を指すことができる。例えば、内胚葉起源の細胞としては、肝臓、肺、膵臓、胸腺、腸、胃、および甲状腺の細胞が挙げられる。理論に拘束されることを望むものではないが、肝臓および膵臓前駆体(膵臓前駆体とも称される)は胚前腸の内胚葉細胞から発生する。特異化(specification)の直後、肝臓および膵臓前駆体は著しく異なる細胞機能および再生能を急速に獲得する。これらの変化は、脊椎動物間で高度に保存されている誘導シグナルおよび遺伝子調節因子によって誘発される。臓器の発生および再生に対する関心は、肝不全およびI型糖尿病の治療処置における肝細胞および膵β細胞の強い必要性によって高まっている。多様なモデル生物およびヒトにおける研究は、肝および膵細胞の分化を誘発する進化的に保存されている誘導シグナルおよび転写因子ネットワークを明らかにし、多様な幹および前駆細胞型からの肝細胞およびβ細胞分化を促進する方法の手引きを提供する。
[0119]「胚体内胚葉」という用語は、本明細書で使用される場合、内胚葉細胞から分化し、SC-β細胞(例えば、膵β細胞)へと分化することができる細胞を指すことができる。胚体内胚葉細胞はマーカーSox17を発現する。胚体内胚葉細胞に特徴的な他のマーカーとしては、これらに限定されないが、MIXL2、GATA4、HNF3b、GSC、FGF17、VWF、CALCR、FOXQ1、CXCR4、Cerberus、OTX2、goosecoid、C-Kit、CD99、CMKOR1、およびCRIP1が挙げられる。特に、本明細書での胚体内胚葉細胞はSox17を発現し、一部の実施形態ではSox17およびHNF3Bを発現し、有意なレベルのGATA4も、SPARCも、APFも、DABも発現しない。胚体内胚葉細胞はマーカーPdx1に対して陽性ではない(例えば、これらはPdx1陰性である)。胚体内胚葉細胞は、肝臓、肺、膵臓、胸腺、腸、胃、および甲状腺の細胞を含む細胞へと分化する能力を有する。Sox17および胚体内胚葉の他のマーカーの発現は、例えば抗Sox17抗体を使用する免疫化学または定量RT-PCR等の当業者によって公知のあらゆる方法によって評価することができる。
[0120]「膵内胚葉」という用語は、膵β細胞を含む複数の膵臓系統へと分化することができるが、非膵臓系統へと分化する能力をもはや有しない内胚葉起源の細胞を指すことができる。
[0121]「原始腸管細胞」または「腸管細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、内胚葉細胞から分化し、SC-β細胞(例えば、膵β細胞)へと分化することができる細胞を指すことができる。原始腸管細胞は、HNP1-β、HNF3-β、またはHNF4-αのうちの少なくとも1つのマーカーを発現する。原始腸管細胞は、肺、肝臓、膵臓、胃、および腸の細胞を含む細胞へと分化する能力を有する。HNF1-βおよび原始腸管の他のマーカーの発現は、例えば抗HNF1-β抗体を使用する免疫化学等の当業者によって公知のあらゆる方法によって評価することができる。
[0122]「幹細胞」という用語は、本明細書で使用される場合、増殖可能であり、分化したかまたは分化可能な娘細胞を生じることができる多数の母細胞を生成する能力を有するより多くの前駆細胞を生じることができる未分化細胞を指すことができる。娘細胞それ自体は、親としての発生能を有する1個または複数の細胞を保持すると同時に、1つまたは複数の成熟細胞型へと後に分化する後代を増殖および産生するように誘導することができる。「幹細胞」という用語は、特定の状況下で、より特殊化しているかまたはより分化している表現型へと分化する能力または可能性を有し、ある特定の状況下で、実質的に分化することなく増殖する能力を保持する、前駆体のサブセットを指すことができる。一実施形態では、幹細胞という用語は、全体として、その子孫(後代)が分化によって、例えば、生殖細胞および組織の段階的な多様化において生じる完全に個別的な特質を獲得することによって、多くの場合異なる方向に特殊化する、天然に存在する母細胞を指す。細胞の分化は、典型的には多くの細胞分裂を介して行われる複雑なプロセスである。分化細胞は多分化能性細胞から得ることができ、多分化能性細胞それ自体は多分化能性細胞等から得られる。これらの多分化能性細胞のそれぞれは幹細胞と考えることができるが、それぞれが生じ得る細胞型の範囲は大きく異なり得る。一部の分化細胞はより高い発生能の細胞を生じる能力も有する。そのような能力は、天然であっても、様々な因子を用いた処置に基づいて人工的に誘導されてもよい。多くの生物学的事例では、幹細胞は、2つ以上の別個の細胞型の後代を産生することができるため、「多分化能性」でもあるが、これは「幹細胞性」に必要ではない。自己複製は、幹細胞の定義の他の古典的な部分であり、本文書で使用される場合、不可欠である。理論上、自己複製は2つの主要な機構のいずれかによって行われ得る。幹細胞は、一方の娘が幹細胞状態を保持し、他方の娘が何らかの別個の他の特異的機能および表現型を発現するように、非対称に分裂し得る。あるいは、集団中の幹細胞の一部は2個の幹細胞に対称に分裂し、したがって、集団中の一部の幹細胞を全体として維持すると同時に、集団中の他の細胞は分化した後代のみを生じることができる。形式上、幹細胞として開始する細胞が分化した表現型へ進むが、その後、「逆行」して幹細胞表現型を再発現する可能性があり、この用語は多くの場合、当業者によって「脱分化」または「初期化」または「逆分化」と称される。本明細書で使用される場合、「多能性幹細胞」という用語には、胚性幹細胞、人工多能性幹細胞、胎盤幹細胞等が含まれる。
[0123]「多能性」という用語は、本明細書で使用される場合、多様な条件下で2つ以上の分化細胞型に分化する、好ましくは3つ全ての生殖細胞層に特徴的な細胞型に分化する能力を有する細胞を指すことができる。多能性細胞は、例えばヌードマウス奇形腫形成アッセイを使用して、2つ以上の細胞型、好ましくは3つ全ての胚葉に分化する能力によって主に特徴付けられる。多能性は胚性幹(ES)細胞マーカーの発現によっても証明されるが、多能性に関する好ましい試験は、3つの胚葉のそれぞれの細胞へと分化する能力の実証である。そのような細胞を単に培養することは、単独では細胞を多能性にしないことに留意するべきである。初期化多能性細胞(例えば、本明細書で用語として定義されるiPS細胞)もまた、一般に培養中で限られた回数のみの分裂の能力を有する初代細胞親と比して、成長能の喪失を伴わない長期の継代の能力という特徴を有する。
[0124]本明細書で使用される場合、「iPS細胞」および「人工多能性幹細胞」という用語は、交換可能に使用され、例えば1つまたは複数の遺伝子の強制発現を誘導することによって非多能性細胞、典型的には成体体細胞から人工的に得られる(例えば、誘導されるかまたは完全な逆転による)多能性幹細胞を指すことができる。
[0125]「表現型」という用語は、実際の遺伝子型とは無関係に、特定の一連の環境条件および要因下の細胞または生物を定義する1つまたはいくつかの総合的な生物学的特徴を指すことができる。
[0126]「対象」、「患者」、または「個体」という用語は、本明細書で交換可能に使用され、細胞が取得され得る、および/または本明細書に記載される細胞を用いる予防的処置を含む処置が提供される動物、例えばヒトを指すことができる。ヒト対象等の特定の動物に特異的な感染症、状態、または疾患状態の処置の場合、対象という用語は、その特定の動物を指すことができる。本明細書で交換可能に使用される「非ヒト動物」および「非ヒト哺乳動物」には、哺乳動物、例えば、ラット、マウス、ウサギ、ヒツジ、ネコ、イヌ、ウシ、ブタ、および非ヒト霊長類が挙げられる。「対象」という用語はまた、哺乳動物、爬虫類、両生類、および魚類を含むがこれらに限定されないあらゆる脊椎動物を包含する。しかしながら、有利には、対象は、ヒト等の哺乳動物、または他の哺乳動物、例えば、飼育哺乳動物、例えば、イヌ、ネコ、ウマ等、もしくは生産哺乳動物、例えば、ウシ、ヒツジ、ブタ等である。「それを必要とする患者」または「それを必要とする対象」とは、本明細書では、疾患または障害、例えば、これに制限されないが、糖尿病を有すると診断されたかまたは有する疑いがある患者を意味する。
[0127]本明細書で使用される「投与すること」とは、本明細書に記載される1つまたは複数の組成物を患者または対象に提供することを指すことができる。例として、限定されないが、組成物投与、例えば注射は、静脈内(i.v.)注射、皮下(s.c.)注射、皮内(i.d.)注射、腹腔内(i.p.)注射、または筋肉内(i.m.)注射によって行うことができる。1つまたは複数のそのような経路が用いられ得る。非経口投与は、例えばボーラス注射または経時的な漸進的灌流によって行うことができる。代替的にまたは同時に、投与は経口経路によって行うことができる。加えて、投与はまた、細胞のボーラスもしくはペレットの外科的堆積(surgical deposition)、または医療デバイスの留置によって行うことができる。ある実施形態では、本開示の組成物は、増殖障害を処置または防止するのに効果的な量の、本明細書に記載される核酸配列を発現する操作された細胞もしくは宿主細胞、または本明細書に記載される少なくとも1つの核酸配列を含むベクターを含むことができる。医薬組成物は、本明細書に記載される細胞集団を1つまたは複数の薬学的または生理学的に許容される担体、希釈剤、または賦形剤と組み合わせて含むことができる。そのような組成物は、緩衝液、例えば、中性緩衝食塩水、リン酸緩衝食塩水等;炭水化物、例えば、グルコース、マンノース、スクロースまたはデキストラン、マンニトール;タンパク質;ポリペプチドまたはアミノ酸、例えばグリシン;抗酸化剤;キレート剤、例えばEDTAまたはグルタチオン;アジュバント(例えば、水酸化アルミニウム);および保存剤を含むことができる。
[0128]「処置する」、「処置すること」、「処置」という用語、およびそれらの文法上の同義語には、単離された細胞に適用される場合、細胞を任意の種類のプロセスもしくは条件に供すること、または任意の種類の操作もしくは手順を細胞に対して行うことが含まれる。対象に適用される場合、これらの用語は、内科的または外科的治療、看護、または管理を個体に提供することを指す。個体は通例、病気かもしくは健康を損なっているか、または集団の平均的な成員と比して病気になるリスクが増加しており、そのような治療、看護、または管理を必要とする。
[0129]本明細書で使用される場合、「処置すること」および「処置」という用語は、対象に有効量の組成物を投与し、その結果、対象が疾患の少なくとも1つの症状の低減または疾患の改善、例えば有益なまたは所望の臨床結果を得ることを指すことができる。本発明の目的の場合、有益なまたは所望の臨床結果としては、これらに限定されないが、検出可能か検出不能かにかかわらず、1つまたは複数の症状の軽減、疾患の程度の減少、疾患の安定した(例えば、悪化しない)状態、疾患進行の遅延または緩徐化、疾患状態の改善または緩和、および寛解(部分的であれ完全であれ)が挙げられる。処置することは、生存期間を、処置を受けない場合に予期される生存期間と比較して延長することを指すことができる。したがって、当業者は、処置は疾患の状態を向上し得るが疾患の完全な治癒でなくてもよいことを認識する。本明細書で使用される場合、「処置」という用語には予防が含まれる。あるいは、処置は、疾患の進行が低下または停止する場合、「効果的」である。「処置」はまた、生存期間を、処置を受けない場合に予期される生存期間と比較して延長することを意味し得る。処置を必要とするものとしては、心臓病とすでに診断されたもの、ならびに遺伝子感受性または他の因子、例えば、体重、食事、および健康状態のために心臓病を発症する可能性が高いものが挙げられる。
[0130]「治療有効量」、「治療量」という用語、またはその文法上の同義語は、所望の治療結果を達成するのに必要な投薬量および期間で効果的な量を指すことができる。治療有効量は、疾患状態、個体の年齢、性別、および体重、ならびに本明細書に記載される組成物の1個体または複数個体の対象に所望の応答を誘発する能力等の因子に応じて変動し得る。投与される本開示の組成物の正確な量は、患者(対象)の年齢、体重、腫瘍サイズ、感染または転移の程度、および状態における個々の差を考慮した医師によって決定することができる。
[0131]あるいは、本明細書に記載される1つまたは複数の組成物の患者または対象への投与の薬理学的および/または生理学的効果は「予防的」であってもよく、例えば、効果は患者または対象の疾患または症状を完全にまたは部分的に防止する。「予防有効量」とは、所望の予防結果(例えば、疾患開始の防止)を達成するのに必要な投薬量および期間で効果的な量を指すことができる。
[0132]全体にわたって開示される一部の数値は、例えば、「Xは少なくともまたは少なくとも約100、または200[もしくは任意の数字]である」と称される。この数値には、その数それ自体ならびに
a.Xは少なくとも100である、
b.Xは少なくとも200である、
c.Xは少なくとも約100である、および
d.Xは少なくとも約200である
のうちの全てが含まれる。
[0133]これらの異なる組合せの全てが、全体にわたって開示される数値によって企図される。開示される数値の全ては、治療剤の投与を指す場合であれ日数、月数、年数、体重、投薬量等を指す場合であれ、反対のことが別段具体的に指示されない限り、このように解釈されるべきである。
[0134]全体にわたって開示される範囲は、例えば、「Xは1~2日目または約1~2日目、あるいは2~3[もしくは任意の数値範囲]日目または約2~3[もしくは任意の数値範囲]日目に投与される」と称される場合がある。この範囲には、その数それ自体(例えば、範囲の端点)ならびに
i)Xは1日目と2日目との間に投与される、
ii)Xは2日目と3日目との間に投与される、
iii)Xは約1日目と2日目との間に投与される、
iv)Xは約2日目と3日目との間に投与される、
v)Xは1日目と約2日目との間に投与される、
vi)Xは2日目と約3日目との間に投与される、
vii)Xは約1日目と約2日目との間に投与される、および
viii)Xは約2日目と約3日目との間に投与される
のうちの全てが含まれる。
[0135]これらの異なる組合せの全てが、全体にわたって開示される範囲によって企図される。開示される範囲の全ては、治療剤の投与を指す場合であれ日数、月数、年数、体重、投薬量等を指す場合であれ、反対のことが別段具体的に指示されない限り、このように解釈されるべきである。
分化のステージ
[0136]一部の実施形態では、本明細書に開示される膵分化は段階的に実行される。段階的進行において、「ステージ1」または「S1」とは、分化プロセスの第1のステップ、すなわち、多能性幹細胞の、胚体内胚葉細胞(「DE」)に特徴的なマーカーを発現する細胞(「ステージ1細胞」または「S1細胞」)への分化を指す。「ステージ2」とは、第2のステップ、すなわち、胚体内胚葉細胞に特徴的なマーカーを発現する細胞の、腸管細胞(「GT」)に特徴的なマーカーを発現する細胞(「ステージ2細胞」または「S2細胞」)への分化を指す。「ステージ3」とは、第3のステップ、すなわち、腸管細胞に特徴的なマーカーを発現する細胞の、膵臓前駆1細胞(「PP1」)に特徴的なマーカーを発現する細胞(「ステージ3細胞」または「S3細胞」)への分化を指す。「ステージ4」とは、第4のステップ、すなわち、膵臓前駆1細胞に特徴的なマーカーを発現する細胞の、膵臓前駆2細胞(「PP2」)に特徴的なマーカーを発現する細胞(「ステージ4細胞」または「S4細胞」)への分化を指す。「ステージ5」とは、第5のステップ、すなわち、膵臓前駆2細胞(例えば、PDX.1、NKX6.1)に特徴的なマーカーを発現する細胞の、膵内胚葉細胞および/または膵内分泌前駆細胞(例えば、インスリン)(「EN」)に特徴的なマーカーを発現する細胞(「ステージ5細胞」、または「S5細胞」)への分化を指す。「ステージ6」とは、膵内分泌前駆細胞(例えば、インスリン)に特徴的なマーカーを発現する細胞の、膵内分泌β細胞(「SC-β細胞」)または膵内分泌α細胞(「SC-α細胞」)に特徴的なマーカーを発現する細胞への分化を指す。しかしながら、特定の集団中の全ての細胞がこれらのステージを同じ速度で進行するわけではない、すなわち、一部の細胞は集団に存在する細胞の大多数よりも少なくまたは多く分化経路を進んでいてもよいことが理解されるべきである。例えば、いくつかの実施形態では、SC-β細胞は、ステージ5中、ステージ5の終わり、ステージ6の始めなどで同定することができる。ステージ1~6のいずれか1つの細胞を作製する方法の例は、例えば、それぞれの全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第10,030,229号、米国特許第10,443,042号、米国公開出願第20200332262号、および米国特許係属出願第17/010,346号に提供されている。
培養培地および薬剤
アセチルCoA関連代謝産物
[0137]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、アセチルCoA関連代謝産物を含む。アセチル補酵素A(アセチルCoA)の代謝は、エネルギー生産、脂質合成、およびタンパク質アセチル化を含む多数の代謝機能を付与し得る。
[0138]一部の実施形態では、アセチル補酵素A関連代謝産物(例えば、アセテート)と細胞を接触させるステップは、例えば、アセチル補酵素A関連代謝産物を欠いている、またはより低い濃度でそれを含む組成物と比較して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0139]例示的なアセチルCoA関連代謝産物としては、アセテート、ピルベート、ケト原性アミノ酸、バリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、チロシン、リシン、トリプトファン、脂肪酸、CoA、イソバレリルCoA、およびβ-ヒドロキシブチレートが挙げられるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、アセテートである。一部の実施形態では、本開示の組成物は、2つ以上の異なるアセチルCoA関連代謝産物、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上の異なるアセチルCoA関連代謝産物を含む。一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、アセテートである。
[0140]一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、少なくとも0.1nM、少なくとも1nM、少なくとも10nM、少なくとも50nM、少なくとも80nM、少なくとも100nM、少なくとも120nM、少なくとも140nM、少なくとも150nM、少なくとも200nM、少なくとも300nM、少なくとも500nM、少なくとも800nM、少なくとも1μM、少なくとも10μM、少なくとも100μM、少なくとも500μM、少なくとも800μM、少なくとも900μM、少なくとも1mM、少なくとも2mM、少なくとも3mM、少なくとも5mM、または少なくとも10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0141]一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、最大200nM、最大300nM、最大500nM、最大800nM、最大1μM、最大10μM、最大100μM、最大500μM、最大800μM、最大900μM、最大1mM、最大2mM、最大3mM、最大5mM、または最大10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0142]一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、約10nM、約50nM、約80nM、約100nM、約120nM、約140nM、約150nM、約200nM、約300nM、約500nM、約800nM、約1μM、約10μM、約100μM、約500μM、約800μM、約900μM、約1mM、約2mM、約3mM、約5mM、または約10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0143]一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、約0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、約1mMの濃度で存在するアセテートである。
[0144]一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、約50~1000nM、50~800nM、50~500nM、50~300nM、50~250nM、100~200nM、または125~175nMの濃度で存在するアセテートである。一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、約160nMの濃度で存在するアセテートである。
[0145]一部の実施形態では、本開示の方法においてアセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)と細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0146]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)と、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0147]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)と、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0148]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)と、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0149]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)と、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0150]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、アセチルCoA関連代謝産物を含まない(例えば、アセテートを含まない)。
ビタミン
[0151]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、1つまたは複数のビタミンを含む。一部の実施形態では、ビタミン(例えば、ビオチン)と細胞を接触させるステップは、例えば、ビタミンを含まない、またはより低い濃度でそれを含む組成物と比して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0152]例示的なビタミンとしては、ビオチン、ビタミンB1(チアミン)、ビタミンB2(リボフラビン)、ビタミンB3(ナイアシン)、ビタミンB6(ピリドキシン)、およびビタミンB12(シアノコバラミン)が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ビタミンは、脂肪酸の合成を調整する。いくつかの実施形態では、ビタミンは、分岐鎖アミノ酸の代謝を調整する。いくつかの実施形態では、ビタミンは、TCAサイクルの補因子として、例えば、ピルベートカルボキシラーゼの補因子として、調整または関与する。一部の実施形態では、ビタミンは、ビオチンである。一部の実施形態では、本開示の組成物は、2つ以上の異なるビタミン、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上の異なるビタミンを含む。
[0153]一部の実施形態では、ビタミンは、少なくとも0.1nM、少なくとも1nM、少なくとも10nM、少なくとも50nM、少なくとも80nM、少なくとも100nM、少なくとも120nM、少なくとも140nM、少なくとも150nM、少なくとも200nM、少なくとも300nM、少なくとも500nM、少なくとも600nM、少なくとも700nM、少なくとも800nM、少なくとも900nM、少なくとも1μM、少なくとも10μM、少なくとも100μM、少なくとも500μM、少なくとも800μM、少なくとも900μM、少なくとも1mM、少なくとも2mM、少なくとも3mM、少なくとも5mM、または少なくとも10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0154]一部の実施形態では、ビタミンは、最大200nM、最大300nM、最大500nM、最大600nM、最大700nM、最大800nM、最大900nM、最大1μM、最大1.5μM、最大3μM、最大5μM、最大10μM、最大100μM、最大500μM、最大800μM、最大1mM、または最大10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0155]一部の実施形態では、ビタミンは、約100nM、約300nM、約500nM、約600nM、約700nM、約800nM、約900nM、約1μM、約1.5μM、約3μM、約5μM、約10μM、または約100μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、ビタミンは、約800nMの濃度で存在するビオチンである。
[0156]一部の実施形態では、ビタミンは、約1nM~500μM、1nM~100μM、1nM~10μM、1nM~1μM、1nM~800nM、1nM~600nM、1nM~400nM、1nM~300nM、1nM~200nM、25nM~500μM、25nM~100μM、25nM~10μM、25nM~1μM、25nM~800nM、25nM~600nM、25nM~400nM、25nM~300nM、25nM~200nM、50nM~500μM、50nM~100μM、50nM~10μM、50nM~1μM、50nM~800nM、50nM~600nM、50nM~400nM、50nM~300nM、50nM~200nM、100nM~500μM、100nM~100μM、100nM~10μM、100nM~1μM、100nM~800nM、100nM~600nM、100nM~400nM、100nM~300nM、または100nM~200nMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0157]一部の実施形態では、本開示の方法においてビタミン(例えば、ビオチン)と細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0158]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、ビタミン(例えば、ビオチン)と、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0159]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、ビタミン(例えば、ビオチン)と、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0160]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、ビタミン(例えば、ビオチン)と、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0161]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、ビタミン(例えば、ビオチン)と、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0162]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、ビタミンを含まない(例えば、ビオチンを含まない)。
ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)
[0163]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)を含む。ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)は、HDAC酵素の活性を阻害することにより、ヒストンタンパク質および他のヒストン以外のタンパク質におけるリシン残基のアセチル化を増加させる化合物のクラスである。
[0164]一部の実施形態では、HDACiと細胞を接触させるステップは、例えば、HDACiを欠いている、またはより低い濃度でそれを含む組成物と比して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0165]例示的なヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)としては、β-ヒドロキシブチレート、酪酸、クラスI HDACi、クラスIIA HDACi、クラスIIB HDACi、クラスIII HDACi、クラスIV HDACi、HDAC-1、HDAC-2、HDAC-3、HDAC-4、HDAC-5、HDAC-6、HDAC-7、HDAC-8、HDAC-9、HDAC-10、HDAC-11、サーチュイン、SIRT1、SIRT2、SIRT3、SIRT4、SIRT5、SIRT6、SIRT7、ボリノスタット(スベロイルアニリドヒドロキサム酸、SAHA、MK0683)、エンチノスタット(MS-275、SNDX-275)、パノビノスタット(LBH589、NVP-LBH589)、トリコスタチンA(TSA)、モセチノスタット(MGCD0103、MG0103)、GSK3117391(GSK3117391A、HDAC-IN-3)、BRD3308、BRD3308、ツバスタチンA TFA(ツバスタチンAトリフルオロ酢酸塩)、ツバスタチンA、SIS17、NKL 22、BML-210(CAY10433)、TC-H 106、SR-4370、ベリノスタット(PXD101、NSC726630、PX-105684)、ロミデプシン(FK228、デプシペプチド、FR 901228、NSC 630176)、MC1568、ギビノスタット(ITF2357)、ダシノスタット(LAQ824、NVP-LAQ824)、CUDC-101、キシノスタット(JNJ-26481585)、プラシノスタット(SB939)、PCI-34051、ドロキシノスタット(NS 41080)、アベキシノスタット(PCI-24781)、アベキシノスタット(PCI-24781、CRA-024781)、RGFP966、AR-42(HDAC-42)、リコリノスタット(ACY-1215、ロシリノスタット)、バルプロ酸ナトリウム塩(バルプロ酸ナトリウム)、タセジナリン(CI994、PD-123654、GOE-5549、アセチルジナリン)、フィメピノスタット(CUDC-907)、酪酸ナトリウム(NaB)、クルクミン、ジフェルロイルメタン、M344、ツバシン、RG2833(RGFP109)、RG2833(RGFP109)、レスミノスタット(RAS2410)、ジバルプロエクスナトリウム、スクリプタイド(GCK 1026)、フェニル酪酸ナトリウム、シナピン酸(シナプ酸)、TMP269、サンタクルザメートA(CAY10683)、TMP195(TFMO 2)、バルプロ酸(VPA)、UF010、タスキニモド(ABR-215050)、SKLB-23bb、イソグアノシン、スルホラファン、BRD73954、シタリノスタット(ACY-241、HDAC-IN-2)、スベロヒドロキサム酸、スプリトマイシン、HPOB、LMK-235、ビフェニル-4-スルホニルクロリド(p-フェニルベンゼンスルホニル、4-フェニルベンゼンスルホニル、p-ビフェニルスルホニル)、ネクスツラスタットA、TH34、ツシジノスタット(チダミド、HBI-8000、CS-055)、(-)-パルテノリド、WT161、CAY10603、CAY10603、ACY-738、ラデアニンA、チノスタムスチン(EDO-S101)、ドマチノスタット(4SC-202)、およびBG45が挙げられるが、これらに限定されない。
[0166]一部の実施形態では、HDACiは、β-ヒドロキシブチレートである。β-ヒドロキシ酪酸は、酪酸と共に、ヒドロキシカルボン酸受容体2(HCA2)、Gi/o共役型GPCRのアゴニストであるケトン体である。一部の実施形態では、HDACi阻害剤は、ヒドロキシカルボン酸受容体2のアゴニストである。
[0167]一部の実施形態では、本開示の組成物は、2つ以上の異なるHDACi、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上の異なるHDACiを含む。
[0168]一部の実施形態では、HDACiは、少なくとも0.1nM、少なくとも1nM、少なくとも10nM、少なくとも50nM、少なくとも80nM、少なくとも100nM、少なくとも120nM、少なくとも140nM、少なくとも150nM、少なくとも200nM、少なくとも300nM、少なくとも500nM、少なくとも600nM、少なくとも700nM、少なくとも800nM、少なくとも900nM、少なくとも1μM、少なくとも1.2μM、少なくとも1.5μM、少なくとも1.8μM、少なくとも2μM、少なくとも3μM、少なくとも5μM、少なくとも10μM、少なくとも100μM、少なくとも500μM、少なくとも800μM、少なくとも900μM、少なくとも1mM、少なくとも2mM、少なくとも3mM、少なくとも5mM、または少なくとも10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0169]一部の実施形態では、HDACiは、最大150nM、最大200nM、最大300nM、最大500nM、最大600nM、最大700nM、最大800nM、最大900nM、最大1μM、最大1.2μM、最大1.5μM、最大1.8μM、最大2μM、最大3μM、最大5μM、最大10μM、最大100μM、最大500μM、最大800μM、最大1mM、または最大10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0170]一部の実施形態では、HDACiは、約100nM、約300nM、約500nM、約600nM、約700nM、約800nM、約900nM、約1μM、約1.5μM、約3μM、約5μM、約10μM、または約100μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、HDACiは、約200nMの濃度で存在するβ-ヒドロキシブチレートである。
[0171]一部の実施形態では、HDACiは、約1nM~500μM、1nM~100μM、1nM~10μM、1nM~1μM、1nM~800nM、1nM~600nM、1nM~400nM、1nM~300nM、1nM~200nM、25nM~500μM、25nM~100μM、25nM~10μM、25nM~1μM、25nM~800nM、25nM~600nM、25nM~400nM、25nM~300nM、25nM~200nM、50nM~500μM、50nM~100μM、50nM~10μM、50nM~1μM、50nM~800nM、50nM~600nM、50nM~400nM、50nM~300nM、50nM~200nM、100nM~500μM、100nM~100μM、100nM~10μM、100nM~1μM、100nM~800nM、100nM~600nM、100nM~400nM、100nM~300nM、または100nM~200nMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0172]一部の実施形態では、本開示の方法においてHDACi(例えば、β-ヒドロキシブチレート)と細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0173]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、HDACi(例えば、β-ヒドロキシブチレート)と、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0174]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、HDACi(例えば、β-ヒドロキシブチレート)と、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0175]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、HDACi(例えば、β-ヒドロキシブチレート)と、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0176]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、HDACi(例えば、β-ヒドロキシブチレート)と、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0177]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、HDACiを含まない(例えば、β-ヒドロキシブチレートを含まない)。
レドックス恒常性調節剤
[0178]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、レドックス恒常性調節剤を含む。レドックス恒常性阻害剤は、例えば、細胞の酸化的損傷を最小限に抑えることによって生存率および細胞機能を向上させる、または生物学的プロセスの一環として基質の適切な酸化を促進することができる。
[0179]一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)と細胞を接触させるステップは、例えば、レドックス恒常性調節剤を欠いている、またはより低い濃度でそれを含む組成物と比して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0180]例示的なレドックス恒常性調節剤としては、タウリン、呼吸鎖調節剤、フリーラジカルスカベンジャー、ミトコンドリアタンパク質合成の調節剤、ネギ属硫黄化合物、アントシアニン、ベータカロテン、カテキン、銅、クリプトキサンチン、フラボノイド、インドール、イソフラボノイド、リグナン、ルテイン、リコペン、アルファリポ酸、エラグ酸、マンガン、ポリフェノール、セレン、グルタチオン、ビタミンA、ビタミンC、ビタミンE、亜鉛、スーパーオキシドジスターゼ、GSHPx、Prx-I、カタラーゼ、および補酵素Q10が挙げられるが、これらに限定されない。
[0181]一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤は、タウリンである。
[0182]タウリンは、メチオニンおよびシステインの代謝に由来し得る非タンパク質原性β-アミノスルホン酸である。一部の実施形態では、タウリンは、呼吸鎖におけるROS生成を阻害することができる。
[0183]一部の実施形態では、本開示の組成物は、2つ以上の異なるレドックス恒常性調節剤、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上の異なるレドックス恒常性調節剤を含む。
[0184]一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤は、少なくとも100nM、少なくとも500nM、1μM、少なくとも10μM、少なくとも20μM、少なくとも30μM、少なくとも40μM、少なくとも50μM、少なくとも60μM、少なくとも70μM、少なくとも80μM、少なくとも90μM、少なくとも100μM、少なくとも110μM、少なくとも110μM、少なくとも150μM、少なくとも200μM、または少なくとも500μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0185]一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤は、最大10μM、最大20μM、最大30μM、最大40μM、最大50μM、最大60μM、最大70μM、最大80μM、最大90μM、最大100μM、最大110μM、最大110μM、最大150μM、最大200μM、または最大500μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0186]一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤は、約100nM、約500nM、1μM、約10μM、約20μM、約30μM、約40μM、約50μM、約60μM、約70μM、約80μM、約90μM、約100μM、約110μM、約110μM、約150μM、または約200μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤は、タウリンである。一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤は、約90μMの濃度で存在するタウリンである。
[0187]一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤中間体は、約100nM~1mM、500nM~1mM、1μM~1mM、10μM~1mM、20μM~1mM、30μM~1mM、30μM~1mM、40μM~1mM、50μM~1mM、60μM~1mM、70μM~1mM、80μM~1mM、100nM~250μM、500nM~250μM、1μM~250μM、10μM~250μM、20μM~250μM、30μM~250μM、30μM~250μM、40μM~250μM、50μM~250μM、60μM~250μM、70μM~250μM、100nM~100μM、500nM~100μM、1μM~100μM、10μM~100μM、20μM~100μM、30μM~100μM、40μM~100μM、50μM~100μM、60μM~100μM、70μM~100μM、または80μM~100μMの濃度で存在するか、または添加される。
[0188]一部の実施形態では、本開示の方法においてレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)と細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0189]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)と、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0190]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)と、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0191]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)と、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0192]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)と、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0193]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、レドックス恒常性調節剤を含まない(例えば、タウリンを含まない)。
一炭素代謝経路中間体
[0194]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、一炭素代謝経路中間体を含む。葉酸補因子によって媒介される一炭素代謝は、アミノ酸恒常性(メチオニン、グリシン、およびセリン)、ヌクレオチド(プリン、チミジン)の生合成、エピジェネティクス維持、およびレドックス防御を含む複数の生理学的プロセスをサポートする。
[0195]一部の実施形態では、一炭素代謝経路中間体と細胞を接触させるステップは、例えば、一炭素代謝経路中間体を欠いている、またはより低い濃度でそれを含む組成物と比して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0196]例示的な一炭素代謝経路中間体としては、ホルメート、テトラヒドロフォレート(THF)、10-ホルミルTHF、5,10-meTHF、5,10-meTHF、および10-ホルミルTHFが挙げられるが、これらに限定されない。
[0197]一部の実施形態では、本開示の組成物は、2つ以上の異なる一炭素代謝経路中間体、例えば、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上の異なる一炭素代謝経路中間体を含む。
[0198]一部の実施形態では、一炭素代謝経路中間体は、少なくとも100nM、少なくとも500nM、少なくとも1μM、少なくとも10μM、少なくとも20μM、少なくとも30μM、少なくとも40μM、少なくとも50μM、少なくとも75μM、または少なくとも100μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0199]一部の実施形態では、一炭素代謝経路中間体は、最大10μM、最大20μM、最大30μM、最大40μM、最大50μM、最大75μM、最大100μM、最大200μM、最大300μM、最大400μM、最大500μM、最大1mM、または最大10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0200]一部の実施形態では、一炭素代謝経路中間体は、約100nM、約500nM、1μM、約10μM、約20μM、約30μM、約40μM、約50μM、約75μM、または約100μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0201]一部の実施形態では、一炭素代謝経路中間体は、約50μMの濃度で存在するホルメートである。
[0202]一部の実施形態では、一炭素代謝経路中間体は、約100nM~1mM、500nM~1mM、1μM~1mM、10μM~1mM、20μM~1mM、30μM~1mM、100nM~250μM、500nM~250μM、1μM~250μM、10μM~250μM、20μM~250μM、30μM~250μM、100nM~100μM、500nM~100μM、1μM~100μM、10μM~100μM、20μM~100μM、30μM~100μM、100nM~60μM、500nM~60μM、1μM~60μM、10μM~60μM、20μM~60μM、30μM~60μM、40μM~60μM、または45μM~55μMの濃度で存在するか、または添加される。
[0203]一部の実施形態では、本開示の方法において一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)と細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0204]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)と、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0205]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)と、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0206]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)と、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0207]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)と、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0208]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、一炭素代謝経路中間体を含まない(例えば、ホルメートを含まない)。
グルタミン
[0209]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、グルタミンを含む。
[0210]一部の実施形態では、本明細書に開示されるようなグルタミンと細胞を接触させるステップは、例えば、グルタミンを欠いている、より少ないグルタミンを含む、または異なる(例えば、生体利用可能性の低い)形態のグルタミンを含む組成物と比して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0211]グルタミン(GlnまたはQ)は、アルファ-アミノ酸である。グルタミンは、in vitro細胞培養物中の必須アミノ酸であり得る。グルタミンは、高いエネルギー需要を有し大量のタンパク質および核酸を合成する細胞を含む細胞の増殖をサポートする。グルタミンは、急速に分裂する細胞およびグルコースを非効率的に使用する細胞の代替的エネルギー源である。
[0212]一部の実施形態では、本開示の組成物および方法は、生体利用可能性が増加した形態のグルタミンを利用する。L-グルタミンは、化学的に不安定であり、細胞の増殖および機能に重要であることから、その送達を各固有の細胞培養プロセスに合わせることが重要である。遊離型のグルタミン(例えば、L-グルタミン)は、生理学的pHの液体培地中で不安定であり、多くの細胞培養およびバイオマニュファクチャリング用途において問題となる速度でアンモニウムおよびピログルタメートに分解され得る。したがって、多くの細胞培養培地は、アラニル-l-グルタミンおよびグリシル-l-グルタミンなどのジペプチド型を含む、安定化された形態のグルタミンを含有する。しかしながら、これらのより安定な形態のL-グルタミンは、例えば、細胞表面ペプチダーゼなどの酵素によるプロセシングの要件により、生体利用可能性が限られる場合もある。したがって、いくつかの実施形態では、本開示の組成物および方法は、生体利用可能性が増加した形態、例えば遊離グルタミン型、例えば非ジペプチド型、非アラニン-グルタミンジペプチド型(例えば、非アラニル-l-グルタミン型)、非グリシン-グルタミンジペプチド型(例えば、非グリシル-l-グルタミン型)、グルタミンが別のアミノ酸もしくは安定化部分にコンジュゲートされていない形態、単量体型、遊離型、またはそれらの組合せのグルタミンを利用する。一部の実施形態では、グルタミンは、タンパク質加水分解産物として提供される。
[0213]一部の実施形態では、基礎培地は、グルタミンを含む。一部の実施形態では、本明細書に開示されるような形態のグルタミンが、グルタミンを既に含む培地に添加される。一部の実施形態では、本明細書に開示されるような形態のグルタミンが、グルタミンの生体利用可能性を増加させるために、グルタミンを含まない、または低いレベルのグルタミンしか含まない基礎培地に添加される。
[0214]グルタミンは、本開示の諸態様にとって重要な複数の細胞代謝プロセス、例えば、レドックス調節、NADリサイクリング、TCAサイクル補充反応、および窒素代謝に寄与し得る。グルタミンは、アミドとして窒素原子を1つ、アミンとして窒素原子をもう1つ含み、遊離アンモニウムとして有毒な量で窒素を細胞に輸送および送達する。グルタミンアミド窒素は、NADおよびNADP、プリンヌクレオチド、UTPからのCTP、ならびにアスパラギンの合成に使用され得る。グルタミンとして最初に貯蔵された窒素は、ピリミジンの合成のためにリン酸カルバミルを生成するためにも使用され得る。グルタミンは、他のアルファアミノ酸を形成するためのアルファケト酸のアミノ基転移に使用される主要なアミノ酸であるグルタメートの前駆体である。グルコースレベルが低く、エネルギー需要が高いとき、細胞はエネルギーのためにアミノ酸を代謝し得る。グルタミンは、エネルギー源として使用されるアミノ酸で最も容易に利用可能なものの1つであり、in vitroで多くの急速に分裂する細胞型の主要なエネルギー源である。
[0215]細胞は、ヌクレオチド、アミノ酸、アミノ-糖、およびビタミンなどの分子を構築するために窒素原子を必要とする。アンモニウムは、生理学的pHで正に荷電したカチオンNH4+として主に存在する無機窒素源である。細胞によって使用されるアンモニウム窒素は、最初に、グルタメートのアミンまたはグルタミンのアミドとして有機窒素に組み込まれる。これら2つのアミノ酸は、タンパク質、核酸、および他の窒素性化合物を合成するための窒素の一次貯蔵所を提供する。グルタメートおよびグルタミンに窒素を固定する反応は、エネルギー等量を消費する。グルタメートは、アンモニウム、およびトリカルボン酸(TCA)サイクル中間体であるアルファケトグルタル酸から合成され得る。その合成は、NADHまたはNADPHのいずれかの酸化を必要とし得る。グルタミンはアンモニウムおよびグルタメートから形成され、その合成はATPを消費する。グルタメート合成に関与する酵素であるグルタメートデヒドロゲナーゼ(EC1.4.1.4)およびグルタメートシンターゼ(EC1.4.1.13)は、可逆性である。グルタミン合成を担う酵素であるグルタミンシンテターゼ(EC6.3.1.2)は、グルタミンの産生を細胞の要件に制限するように高度に調節される。グルタミンからグルタメートおよびアンモニウムへの異化作用は、グルタミナーゼ(EC3.5.1.2)と呼ばれるミトコンドリア酵素によって媒介される。in vivoで産生されたアンモニウムは、尿素に代謝され得る。in vitroでは、アンモニウムは尿素に代謝されない。いくつかのin vitro条件下では、アンモニアはアンモニウムイオンとして細胞外培地に蓄積する。
[0216]細胞のグルタミン需要は、ストレス性条件によって増加し得る。一部の実施形態では、グルタミンは、条件付き必須アミノ酸であり、例えば、ストレス条件において十分なレベルで提供されなければならい。他のアミノ酸と同様に、グルタミンは、タンパク質の構成要素として生化学的に重要である。グルタミンは、窒素代謝においてもきわめて重要であり得る。アンモニア(窒素固定によって形成される)は、グルタミン酸をグルタミンに変換することにより、有機化合物に同化され得る。これを行う酵素はグルタミンシンテターゼと呼ばれる。グルタミンは、他のアミノ酸、プリン、およびピリミジンを含む多くの化合物の生合成において、窒素ドナーとして使用され得る。L-グルタミンは、ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド(NAD)レドックス電位を向上させ得る。
[0217]一部の実施形態では、グルタミンは、本開示の組成物中に、少なくとも100μM、少なくとも250μM、少なくとも500μM、少なくとも750μM、少なくとも1mM、少なくとも1.5mM、少なくとも2mM、少なくとも2.5mM、少なくとも2.6mM、少なくとも2.7mM、少なくとも2.8mM、少なくとも2.9mM、少なくとも3mM、少なくとも3.1mM、少なくとも3.2mM、少なくとも3.3mM、少なくとも3.4mM、少なくとも3.5mM、少なくとも3.6mM、少なくとも3.7mM、少なくとも3.8mM、少なくとも3.9mM、少なくとも4mM、または少なくとも5mMの濃度で存在し得る。
[0218]一部の実施形態では、グルタミンは、本開示の組成物中に、最大2mM、最大3mM、最大3.1mM、最大3.2mM、最大3.3mM、最大3.4mM、最大3.5mM、最大3.6mM、最大3.7mM、最大3.8mM、最大3.9mM、最大4mM、最大4.1mM、最大4.2mM、最大4.2mM、最大4.4mM、最大4.5mM、最大4.75mM、最大5mM、最大6mM、最大7mM、最大8mM、最大9mM、最大10mM、最大15mM、最大20mM、最大30mM、最大40mM、または最大50mMの濃度で存在し得る。
[0219]一部の実施形態では、グルタミンは、本開示の組成物中に、約100μM、約250μM、約500μM、約750μM、約1mM、約1.5mM、約2mM、約2.5mM、約2.6mM、約2.7mM、約2.8mM、約2.9mM、約3mM、約3.1mM、約3.2mM、約3.3mM、約3.4mM、約3.5mM、約3.6mM、約3.7mM、約3.8mM、約3.9mM、約4mM、または約5mMの濃度で存在し得る。
[0220]一部の実施形態では、グルタミンは、0.5~20mM、0.5~10mM、0.5~5mM、1~5mM、2~5mM、または1mM~10mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、グルタミンは、3.8~4.2mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、グルタミンは、1~10、1~7、1~8、1~6、1~5、1~4、2~10、2~7、2~8、2~6、2~5、2~4、3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、グルタミンは、約4mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0221]一部の実施形態では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、ジペプチド型ではない。
[0222]一部の実施形態では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、アラニン-グルタミンジペプチド型ではない。
[0223]一部の実施形態では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、グリシン-グルタミンジペプチド型ではない。
[0224]一部の実施形態では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、多量体型ではない。
[0225]一部の実施形態では、グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、別のアミノ酸または安定化部分にコンジュゲートされていない。
[0226]一部の実施形態では、グルタミンのうち少なくとも500μM、少なくとも750μM、少なくとも1mM、少なくとも1.5mM、少なくとも2mM、少なくとも2.5mM、少なくとも2.6mM、少なくとも2.7mM、少なくとも2.8mM、少なくとも2.9mM、少なくとも3mM、少なくとも3.1mM、少なくとも3.2mM、少なくとも3.3mM、少なくとも3.4mM、少なくとも3.5mM、少なくとも3.6mM、少なくとも3.7mM、少なくとも3.8mM、少なくとも3.9mM、少なくとも4mM、または少なくとも5mMは、単量体型である。
[0227]一部の実施形態では、グルタミンのうち少なくとも500μM、少なくとも750μM、少なくとも1mM、少なくとも1.5mM、少なくとも2mM、少なくとも2.5mM、少なくとも2.6mM、少なくとも2.7mM、少なくとも2.8mM、少なくとも2.9mM、少なくとも3mM、少なくとも3.1mM、少なくとも3.2mM、少なくとも3.3mM、少なくとも3.4mM、少なくとも3.5mM、少なくとも3.6mM、少なくとも3.7mM、少なくとも3.8mM、少なくとも3.9mM、少なくとも4mM、少なくとも5mM、少なくとも5.5mM、少なくとも6mM、少なくとも6.5mM、少なくとも7mM、少なくとも7.5mM、少なくとも8mM、少なくとも8.5mM、少なくとも9mM、少なくとも9.5mM、または少なくとも10mMは、遊離型である。
[0228]一部の実施形態では、本開示の方法においてグルタミンと細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0229]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタミンと、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0230]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタミンと、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0231]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタミンと、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0232]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタミンと、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0233]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、グルタミンを含まない。
グルタメート
[0234]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、グルタメート(例えば、L-グルタメート)を含む。グルタメートは例えば、g-アミノ酪酸(GABA)、オルニチン、2-オキソグルタル酸、グルコース、またはグルタチオンに変換され得る。グルタメートおよびそれから生成される代謝産物は、例えば、レドックス恒常性、細胞シグナル伝達、窒素同化、アミン異化作用、アミノ酸生合成、ヌクレオシド生合成、および補因子産生に寄与し得る。
[0235]一部の実施形態では、グルタメートと細胞を接触させるステップは、例えば、グルタメートを欠いている、またはより低い濃度のグルタメートを含む組成物と比して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0236]一部の実施形態では、グルタメートは、本開示の組成物中に、少なくとも100μM、少なくとも200μM、少なくとも300μM、少なくとも400μM、少なくとも450μM、少なくとも500μM、少なくとも600μM、少なくとも700μM、少なくとも800μM、少なくとも900μM、少なくとも1mM、少なくとも1.5mM、少なくとも2mM、少なくとも2.5mM、少なくとも3mM、少なくとも4mM、または少なくとも5mMの濃度で存在し得る。
[0237]一部の実施形態では、グルタメートは、本開示の組成物中に、最大500μM、最大600μM、最大700μM、最大800μM、最大900μM、最大1mM、最大2mM、最大3mM、最大4mM、最大5mM、最大6mM、最大7mM、最大8mM、最大9mM、最大10mM、最大15mM、最大20mM、最大30mM、最大40mM、または最大50mMの濃度で存在し得る。
[0238]一部の実施形態では、グルタメートは、本開示の組成物中に、約100μM、約200μM、約300μM、約400μM、約450μM、約500μM、約550μM、約600μM、約700μM、約800μM、約900μM、約1mM、約1.5mM、約2mM、約2.5mM、約3mM、約4mM、または約5mMの濃度で存在し得る。一部の実施形態では、グルタメートは、約500μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0239]一部の実施形態では、グルタメートは、約100μM~5mM、200μM~5mM、300μM~5mM、400μM~5mM、100μM~3mM、200μM~3mM、300μM~3mM、400μM~3mM、100μM~2mM、200μM~2mM、300μM~2mM、400μM~2mM、100μM~1mM、200μM~1mM、300μM~1mM、400μM~1mM、100μM~700μM、200μM~700μM、300μM~700μM、
[0240]400μM~700μM、100μM~600μM、200μM~600μM、300μM~600μM、または400μM~600μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0241]一部の実施形態では、本開示の方法においてグルタメートと細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0242]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタメートと、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0243]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタメートと、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0244]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタメートと、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0245]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、グルタメートと、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0246]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、グルタメートを含まない。
カルニチン
[0247]一部の実施形態では、本開示の組成物(例えば、培地)は、カルニチンを含む。カルニチンは、長鎖脂肪酸をミトコンドリア内に輸送してエネルギー生産のために酸化させ、細胞適合性をサポートすることができる。
[0248]一部の実施形態では、カルニチンと細胞を接触させるステップは、例えば、カルニチンを欠いている、またはより低い濃度のカルニチンを含む組成物と比して、in vitroのSC-β細胞の生成を向上させる、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、移植後の細胞生存率の向上、細胞機能の向上、免疫原性の低減、またはそれらの組合せをもたらすことができる。
[0249]一部の実施形態では、カルニチンは、少なくとも100nM、少なくとも500nM、少なくとも1μM、少なくとも10μM、少なくとも15μM、少なくとも20μM、少なくとも25μM、少なくとも30μM、少なくとも35μM、少なくとも40μM、少なくとも50μM、少なくとも75μM、または少なくとも100μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0250]一部の実施形態では、カルニチンは、最大20μM、最大30μM、最大40μM、最大50μM、最大60μM、70μM、最大80μM、最大90μM、最大100μM、最大200μM、最大300μM、最大400μM、最大500μM、または最大1mMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0251]一部の実施形態では、カルニチンは、約100nM、約500nM、約1μM、約10μM、約15μM、約20μM、約25μM、約30μM、約35μM、約40μM、約45μM、約50μM、約55μM、約60μM、約75μM、または約100μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。一部の実施形態では、カルニチンは、約40μMの濃度で存在するか、または添加される。
[0252]一部の実施形態では、カルニチンは、約100nM~1mM、500nM~1mM、1μM~1mM、10μM~1mM、20μM~1mM、30μM~1mM、100nM~250μM、500nM~250μM、1μM~250μM、10μM~250μM、20μM~250μM、30μM~250μM、100nM~100μM、500nM~100μM、1μM~100μM、10μM~100μM、20μM~100μM、30μM~100μM、100nM~60μM、500nM~60μM、1μM~60μM、10μM~60μM、20μM~60μM、30μM~60μM、35μM~60μM、または30μM~50μMの濃度で本開示の組成物に存在するか、または添加される。
[0253]一部の実施形態では、本開示の方法においてカルニチンと細胞を接触させる。細胞は、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞であり得る。細胞は、インスリン陽性内分泌前駆細胞であり得る。細胞は、SC-β細胞であり得る。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、細胞は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞は、解離している。
[0254]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、カルニチンと、約12時間、24時間、36時間、48時間、60時間、72時間、84時間、4日間、5日間、6日間、7日間、8日間、9日間、10日間、11日間、12日間、13日間、または14日間にわたって接触させる。
[0255]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、カルニチンと、少なくとも12時間、少なくとも24時間、少なくとも36時間、少なくとも48時間、少なくとも60時間、少なくとも72時間、少なくとも84時間、少なくとも4日間、少なくとも5日間、少なくとも6日間、少なくとも7日間、少なくとも8日間、少なくとも9日間、少なくとも10日間、少なくとも11日間、少なくとも12日間、少なくとも13日間、少なくともまたは少なくとも14日間にわたって接触させる。
[0256]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、カルニチンと、最長12時間、最長24時間、最長36時間、最長48時間、最長60時間、最長72時間、最長84時間、最長4日間、最長5日間、最長6日間、最長7日間、最長8日間、最長9日間、最長10日間、最長11日間、最長12日間、最長13日間、最長または最長14日間にわたって接触させる。
[0257]一部の実施形態では、細胞(例えば、PDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、またはインスリン陽性内分泌前駆細胞)を、カルニチンと、約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる。
[0258]一部の実施形態では、本開示の組成物または方法は、カルニチンを含まない。
TGF-βシグナル伝達経路阻害剤
[0259]例示的なTGF-βシグナル伝達経路阻害剤としては、ALK5阻害剤II(CAS 446859-33-2、TGF-B RiキナーゼのATP競合阻害剤、別称RepSox、IIJPAC名:2-[5-(6-メチルピリジン-2-イル)-1H-ピラゾール-4-イル]-1,5-ナフチリジン、ALK5阻害剤IIのアナログまたは誘導体、例えば米国特許公開第2012/0021519号に記載されているALK5阻害剤IIのアナログまたは誘導体、米国特許公開第2010/0267731号に記載されているTGF-β受容体阻害剤、米国特許公開第2009/0186076号および同第2007/0142376号に記載されているALK5阻害剤(例えば、A83-01、431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB525334、SB505124、SD208、GW6604、またはGW788388を含む)が挙げられるが、これらに限定されない。
[0260]一部の実施形態では、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤は、以下の構造を有し得る。
Figure 2024501856000001
[0261]一部の実施形態では、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤の濃度は、約0.1~110μΜ、0.1~50μM、0.1~25μM、または0.1~10μMであり得る。一部の実施形態では、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤の濃度は、約10μMであり得る。一部の実施形態では、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤はAlk5阻害剤IIであり、阻害剤の濃度は約10μMである。
甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤
[0262]例示的な甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤としては、トリヨードチロニン(T3)、T3のアナログまたは誘導体、例えば、選択的および非選択的チロミメティック(thyromimetics)、TRJ選択的アゴニストGC-1、GC-24,4-ヒドロキシ-PCB 106、MB0781 1、MB07344,3,5-ジヨードチロプロピオン酸(DITPA);選択的TR-βアゴニストGC-1;3-ヨードチロナミン(T(l)AM)および3,3’,5-トリヨードチロ酢酸(Triac)(ホルモンチロキシン(T(4))の生物活性代謝産物;KB-21 15およびKB-141;チロナミン;SKF L-94901;DIBIT;3’-AC-T2;テトラヨードチロ酢酸(Tetrac)およびトリヨードチロ酢酸(Triac)(チロキシン[T4]およびトリヨードチロニン[T3]アラニン鎖の酸化的脱アミノ化および脱カルボキシル化による)、3,3’,5’-トリヨードチロニン(rT3)(T4およびT3の脱ヨウ素化による)、3,3’-ジヨードチロニン(3,3’-T2)および3,5-ジヨードチロニン(T2)(T4、T3、およびrT3の脱ヨウ素化による)、ならびに3-ヨードチロナミン(T1AM)およびチロナミン(T0AM)(T4およびT3の脱ヨウ素化ならびにアミノ酸の脱カルボキシル化による)、ならびにTH構造的アナログ、例えば3,5,3’-トリヨードチロプロピオン酸(Triprop)、3,5-ジブロモ-3-ピリダジノン-1-チロニン(L-940901)、N-[3,5-ジメチル-4-(4’-ヒドロキシ-3-イソプロピルフェノキシ)-フェニル]-オキサミン酸(CGS 23425)、3,5-ジメチル-4-[(4’-ヒドロキシ-3’-イソプロピルベンジル)-フェノキシ]酢酸(GC-1)、3,5-ジクロロ-4-[(4-ヒドロキシ-3-イソプロピルフェノキシ)フェニル]酢酸(KB-141)、および3,5-ジヨードチロプロピオン酸(DITPA)が挙げられるが、これらに限定されない。
[0263]一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、T4甲状腺ホルモン(例えば、チロキシンまたはL-3,5,3’,5’-テトラヨードチロニン)などのT3のプロドラッグまたはプロホルモンを含み得る。一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、米国特許第7,163,918号に記載されているヨードチロニン組成物であり得る。一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、2-[4-[[4-ヒドロキシ-3-(1-メチルエチル)フェニル]メチル]-3,5-ジメチルフェノキシ]酢酸(GC-1)であり得る。GC-1は、チロミメティックで、甲状腺ホルモン受容体(TR)βおよびTRoc受容体の高親和性アゴニストである(K値はそれぞれ67pおよび440pである)。GC-1は、in vitroでTRoti受容体およびTRi受容体の内因性アゴニストT3よりもそれぞれ5倍および100倍高い効力を示す。
[0264]一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、以下の構造を有し得る。
Figure 2024501856000002
[0265]一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤の濃度は、約0.1~110μΜ、0.1~50μM、0.1~25μM、または0.1~10μMであり得る。一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤の濃度は、約1μMであり得る。一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤はGC-1であり、活性化剤の濃度は約1μMである。
タンパク質キナーゼ阻害剤
[0266]例示的なタンパク質キナーゼ阻害剤としては、スタウロスポリン、スタウロスポリンのアナログ、例えばRo-31-8220、ビスインドリルマレイミド(Bis)化合物、10’-{5”-[(メトキシカルボニル)アミノ]-2”-メチル}-フェニルアミノカルボニルスタウロスポリン、スタラログ(例えば、Lopezら、「Staurosporine-derived inhibitors broaden the scope of analog-sensitive kinase technology」、J.Am.Chem.Soc.2013;i 35(48):1 8153-18159を参照のこと)、およびcgp4125 1が挙げられるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンであり得る。
[0267]一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤の濃度は、約0.1~110nΜ、0.1~50nM、0.1~25nM、0.1~10nM、または0.1~5nMであり得る。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤の濃度は、約3nMであり得る。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤はスタウロスポリン(SSP)であり、活性化剤の濃度は約3nMである。
[0268]一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤は、以下の構造を有し得る。
Figure 2024501856000003
骨形成タンパク質(BMP)シグナル伝達経路阻害剤
[0269]例示的なBMPシグナル伝達経路阻害剤としては、限定されないが、4-[6-(4-ピペラジン-1-イルフェニル)ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-3-イル]キノロン(LDN 193 189;LDN1931 89、1062368-24-4、LDN-193189、DM 3189、DM-3189としても公知であり、本明細書ではLDNと称される)、LDN193189のアナログもしくは誘導体、例えばLDN193189の塩(例えば、LDN193189塩酸塩)、水和物、溶媒、エステル、もしくはプロドラッグ、または米国特許出願公開第2011/0053930号の式Iの化合物が挙げられる。本発明の複数の態様においては、BMPシグナル伝達経路阻害剤はLDN193189を含む。一部の実施形態では、BMPシグナル伝達経路阻害剤は、DMH-1またはそのアナログもしくは誘導体を含む。
[0270]一部の実施形態では、BMPシグナル伝達経路阻害剤は以下の構造:
Figure 2024501856000004
を有することができる。
[0271]一部の実施形態では、BMPシグナル伝達経路阻害剤の濃度は、約0.1~110nΜ、0.1~100nM、または0.1~50nMであり得る。一部の実施形態では、BMPシグナル伝達経路阻害剤の濃度は約100nMであり得る。一部の実施形態では、タンパク質BMPシグナル伝達経路阻害剤はLDN193189であり、活性化剤の濃度は約100nMである。
Rho関連タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤
[0272]例示的なROCK阻害剤としては、これらに限定されないが、N-[(1S)-2-ヒドロキシ-1-フェニルエチル]-N’-[4-(4-ピリジニル)フェニル]-尿素(AS 1892802)、ファスジル塩酸塩(HA 1077としても公知)、N-[3-[[2-(4-アミノ-1,2,5-オキサジアゾール-3-イル)-1-エチル-1H-イミダゾ[4,5-c]ピリジン-6-イル]オキシ]フェニル]-4-[2-(4-モルホリニル)エトキシ]ベンズアミド(GS 269962)、4-[4-(トリフルオロメチル)フェニル]-N-(6-フルオロ-1H-インダゾール-5-イル)-2-メチル-6-オキソ-1,4,5,6-テトラヒドロ-3-ピリジンカルボキサミド(GSK 429286)、(S)-(+)-2-メチル-1-[(4-メチル-5-イソキノリニル)スルホニル]-ヘキサヒドロ-1H-1,4-ジアゼピン二塩酸塩(Η 1 152二塩酸塩)、(S)-(+)-4-グリシル-2-メチル-1-[(4-メチル-5-イソキノリニル)スルホニル]-ヘキサヒドロ-1H-1,4-ジアゼピン二塩酸塩(グリシル-M 1 152二塩酸塩)、N-[(3-ヒドロキシフェニル)メチル]-N’-[4-(4-ピリジニル)-2-チアゾリル]尿素二塩酸塩(RKI 1447二塩酸塩)、(3S)-1-[[2-(4-アミノ-1,2,5-オキサジアゾール-3-イル)-1-エチル-1H-イミダゾ[4,5-c]ピリジン-7-イル]カルボニル]-3-ピロリジンアミン二塩酸塩(SB772077B二塩酸塩)、N-[2-[2-(ジメチルアミノ)エトキシ]-4-(1H-ピラゾール-4-イル)フェニル-2,3-ジヒドロ-1,4-ベンゾジオキシン-2-カルボキサミド二塩酸塩(SR 3677二塩酸塩)、およびtrans-4-[(1R)-1-アミノエチル]-N-4-ピリジニルシクロヘキサンカルボキサミド二塩酸塩(Y-27632二塩酸塩)、N-ベンジル-[2-(ピリミジン-4-イル)アミノ]チアゾール-4-カルボキサミド(チアゾビビン)、ROCK阻害剤、イソキノリンスルホンアミド化合物(Rhoキナーゼ阻害剤)、N-(4-ピリジル)-N’-(2,4,6-トリクロロフェニル)尿素(Rhoキナーゼ阻害剤II)、3-(4-ピリジル)-1H-インドール(Rhoキナーゼ阻害剤III、Rockout)、および4-ピラゾールボロン酸ピナコールエステルからなる群から選択される有機低分子ROCK阻害剤;Rock-1(B1)、Rock-1(C-19)、Rock-1(H-11)、Rock-1(G-6)、Rock-1(H-85)、Rock-1(K-18)、Rock-2(C-20)、Rock-2(D-2)、Rock-2(D-11)、Rock-2(N-19)、Rock-2(H-85)、Rock-2(30-J)からなる群から選択されるSanta Cruz Biotechnologyから市販されているRock抗体;Rock-1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド(h)、Rock-2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド(h)、Rock-1 CR1SPR/Cas9 KOプラスミド(m)、Rock-2 CRISPR/Cas9 KOプラスミド(m)からなる群から選択されるROCK CRISPR/Cas9ノックアウトプラスミド;Rock-1 siRNA(h):sc-29473、Rock-1 siRNA(m):sc-36432、Rock-1 siRNA(r):sc-72179、Rock-2 siRNA(h):sc-29474、Rock-2 siRNA(m):sc-36433、Rock-2 siRNA(r):sc-108088からなる群から選択されるROCK siRNA、shRNAプラスミド、および/またはshRNAレンチウイルス粒子遺伝子サイレンサーが挙げられる。
[0273]一部の実施形態では、ROCK阻害剤はY-27632を含む。一部の実施形態では、ROCK阻害剤はチアゾビビンである。
[0274]一部の実施形態では、ROCK阻害剤は以下の構造:
Figure 2024501856000005
を有することができる。
[0275]一部の実施形態では、ROCK阻害剤の濃度は、約0.1~110μΜ、0.1~50μM、0.1~25μM、または0.1~10μMであり得る。一部の実施形態では、ROCK阻害剤の濃度は約2.5μMであり得る。一部の実施形態では、ROCK阻害剤はチアゾビビンであり、阻害剤の濃度は約2.5μMである。
[0276]一部の実施形態では、ROCK阻害剤(例えば、Y-27632またはチアゾビビン)の濃度は、約0.2μM、約0.5μM、約0.75μM、約1μM、約2μM、約3μM、約4μM、約5μM、約6μM、約7μM、約7.5μM、約8μM、約9μM、約10μM、約11μM、約12μM、約13μM、約14μM、約15μM、約16μM、約17μM、約18μM、約19μM、約20μM、約21μM、約22μM、約23μM、約24μM、約25μM、約26μM、約27μM、約28μM、約29μM、約30μM、約35μM、約40μM、約50μM、または約100μMであり得る。
ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤
[0277]一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤はエピジェネティック修飾剤として使用することができる。例示的なヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤としては、これらに限定されないが、例えば、3-デアザネプラノシンA塩酸塩(DZNep-(1S,2R,5R)-5-(4-アミノ-1H-イミダゾ[4,5-c]ピリジン-1-イル)-3-(ヒドロキシメチル)シクロペンタ-3-エン-1,2-ジオール);Bix-01294、UNC0638、BRDD4770、EPZ004777、AZ505、PDB4e47、バルプロ酸(alproic acid)、ボリノスタット、ロミデプシン、エンチノスタットアベキシノスタット、ギビノスタット、およびモセチノスタット、ブチレート、セリンプロテアーゼ阻害剤(セルピン)ファミリーメンバーを挙げることができる。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤はDZNepであり得る。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は以下の構造:
Figure 2024501856000006
を有することができる。
[0278]一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤の濃度は、約0.1~110nΜ、0.1~100nM、または0.1~50nMであり得る。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤の濃度は約100nMであり得る。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤はDZNepであり、阻害剤の濃度は約100nMである。
[0279]一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤の濃度は、約0.01μM、約0.025μM、約0.05μM、約0.075μM、約0.1μM、約0.15μM、約0.2μM、約0.5μM、約0.75μM、約1μM、約2μM、約3μM、約4μM、約5μM、約6μM、約7μM、約7.5μM、約8μM、約9μM、約10μM、約15μM、約20μM、約25μM、約30μM、約35μM、約40μM、約50μM、または約100μMであり得る。
MGLL阻害剤
[0280]例示的なMGLL(モノグリセリドリパーゼ)阻害剤としては、例えば、JJKK048、KML29、NF1819、JW642、JZL184、JZL195、JZP361、プリスチメリン、またはURB602が挙げられるが、これらに限定されない。
[0281]一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、JJKK048であり得る。一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、KML29であり得る。一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、NF1819であり得る。
[0282]一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、以下の構造を有し得る。
Figure 2024501856000007
[0283]一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、以下の構造を有し得る。
Figure 2024501856000008
[0284]一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、以下の構造を有し得る。
Figure 2024501856000009
[0285]一部の実施形態では、MGLL阻害剤の濃度は、約0.1μM~100μMである。一部の実施形態では、MGLL阻害剤の濃度は、約0.1μM、1μM、10μM、20μM、30μM、40μM、50μM、60μM、70μM、80μM、90μM、100μMである。
[0286]一部の実施形態では、MGLL阻害剤はJJKK048であり、濃度は約0.1μM~100μMである。一部の実施形態では、MGLL阻害剤はKML29であり、濃度は約0.1μM~100μMである。一部の実施形態では、MGLL阻害剤はNF1819であり、濃度は約0.1μM~100μMである。
[0287]一部の実施形態では、MGLL阻害剤はJJKK048であり、濃度は1μMである。一部の実施形態では、MGLL阻害剤はKML29であり、濃度は10μMである。一部の実施形態では、MGLL阻害剤はNF1819であり、濃度は10μMである。
脂質
[0288]例示的な脂質としては、脂肪酸、例えば、飽和脂肪酸または不飽和脂肪酸が挙げられるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、脂質は、飽和脂肪酸である。一部の実施形態では、脂質は、不飽和脂肪酸である。例示的な飽和脂肪酸としては、例えば、パルミテート、パルミチン酸、酪酸、吉草酸、カプロン酸、エナント酸、カプリル酸、ペラルゴン酸、カプリン酸、ウンデシル酸、ラウリン酸、トリデシル酸、ミリスチン酸、ペンタデシル酸、マルガリン酸、ステアリン酸、ノナデシル酸、アラキジン酸、ヘンイコシル酸、ベヘン酸、トリコシル酸、リグノセリン酸、ペンタコシル酸、セロチン酸、ヘプタコシル酸、モンタン酸、ノナコシル酸、メリシン酸、ヘントリアコンチル酸、ラッセル酸、シリル酸、ゲジン酸、セロプラスチック酸、ヘキサトリアコンチル酸、ヘプタトリアコンタン酸、オクタトリアコンタン酸、ノナトリアコンタン酸、もしくはテトラコンタン酸、またはそれらの塩もしくはエステルが挙げられるが、これらに限定されない。
[0289]一部の実施形態では、飽和脂肪酸は、パルミチン酸またはその塩もしくはエステルである。一部の実施形態では、飽和脂肪酸は、パルミテートである。
[0290]例示的な不飽和脂肪酸としては、例えば、オレイン酸、リノール酸、パルミトレイン酸、ステアリドン酸、エイコサペンタエン酸、ドコサヘキサエン酸、リノレライド酸、γ-リノレン酸、ジホモ-γ-リノレン酸、アラキドン酸、ドコサテトラエン酸、バクセン酸、パウリン酸、エライジン酸、ゴンドイン酸、エルカ酸、ネルボン酸、もしくはミード酸、またはそれらの塩もしくはエステルが挙げられるが、これらに限定されない。
[0291]一部の実施形態では、不飽和脂肪酸は、オレイン酸である。一部の実施形態では、不飽和脂肪酸は、リノール酸である。一部の実施形態では、不飽和脂肪酸は、パルミトレイン酸である。
追加の試薬
[0292]一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、グリシン(例えば、0.25mMの濃度)、L-アラニン(例えば、0.049999997mMの濃度)、L-アルギニン塩酸塩(例えば、0.69905216mMの濃度)、L-アスパラギン-H20(0.05mM)、L-アスパラギン酸(例えば、0.05mMの濃度)、L-システイン塩酸塩-H2O(例えば、0.09977272mMの濃度)、L-シスチン2HCl(例えば、0.09996805mMの濃度)、L-グルタミン酸(例えば、0.05mMの濃度)、L-グルタミン(例えば、2.5mMの濃度)、L-ヒスチジン塩酸塩-H2O(例えば、0.14990476mMの濃度)、L-イソロイシン(例えば、0.41580153mMの濃度)、L-ロイシン(例えば、0.45076334mMの濃度)、L-リジン塩酸塩(例えば、0.4986339mMの濃度)、L-メチオニン(例えば、0.11570469mMの濃度)、L-フェニルアラニン(例えば、0.2150303mMの濃度)、L-プロリン(例えば、0.15mMの濃度)、L-セリン(例えば、0.25mMの濃度)、L-スレオニン(例えば、0.44915968mMの濃度)、L-トリプトファン(例えば、0.04421569mMの濃度)、L-チロシン(例えば、0.21375479mMの濃度)、またはL-バリン(例えば、0.4517094mMの濃度)のうちのいずれか1つまたは複数のアミノ酸を含む。一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、ビオチン(例えば、1.4344263E-5mMの濃度)、塩化コリン(例えば、0.06414285mMの濃度)、D-パントテン酸カルシウム(例えば、0.0046960167mMの濃度)、葉酸(例えば、0.0060090707mMの濃度)、ナイアシンアミド(例えば、0.016557377mMの濃度)、ピリドキシン塩酸塩(例えば、0.009771844mMの濃度)、リボフラビン(例えば、5.824468E-4mMの濃度)、チアミン塩酸塩(例えば、0.0064391694mMの濃度)、ビタミンB12(例えば、5.0184503E-4mMの濃度)、またはi-イノシトール(例えば、0.07mMの濃度)のうちのいずれかのビタミンを含む。一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、デキストロース(17.505556mM)、ヒポキサンチンNa(0.015031448mM)、リノール酸(1.4999999E-4mM)、リポ酸(5.097087E-4mM)、フェノールレッド(0.021519661mM)、プトレシン2HCl(5.031056E-4mM)、ピルビン酸ナトリウム(0.5mM)、またはチミジン(0.0015082645mM)のうちのいずれかの成分を含む。
[0293]一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、約0.01%、約0.05%、約0.1%、約1%、約2%、約3%、約4%、約5%、約10%、または約15%のヒト血清アルブミン(HSA)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、0.01~1%、0.01~0.08%、0.02~0.07%、0.03~0.06%、0.04~0.06%、0.045~0.055%、0.8~1.2%、または0.9~1.1%のHSAを含む。
[0294]一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、亜鉛(ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、1~100μM、1~50μM、1~20μM、1~12μM、5~15μM、8~12μMまたは9~11μMのZnSOを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、約10μMのZnSOを含む。
[0295]一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、アスコルビン酸を含まない。
例示的な薬剤の組合せ
[0296]一部の実施形態では、本開示の組成物は、本明細書で開示される2つ以上の薬剤を組み合わせて含む。2つ以上の薬剤は、細胞培養培地、必要に応じて本開示の分化または初期化方法を受けている細胞を含有する培地に存在し得る。本明細書で開示される薬剤の組合せは、in vitroでのSC-β細胞の生成に関する驚くべきかつ予期せぬ利益を呈し、例えば、より高い細胞収率および回収率、SC-β細胞(例えば、NKX6.1陽性および/またはISL1陽性細胞)の数および相対的パーセンテージの増加、SC-β細胞の安定性および貯蔵寿命の増強、縮小されたサイズおよび増加した均一性などの有利な特徴を有するSC島クラスター、in vitroのSC-β細胞の機能の向上、ならびに移植後の生存率、機能の向上、および免疫原性の低減をもたらす。
[0297]一部の実施形態では、薬剤の組合せは、細胞の代謝の特定の態様を標的とすることによって、分化細胞および結果として得られるSC-β細胞の適応度および代謝柔軟性を向上させる。薬剤の組合せによって調節することができる代謝の非限定的な経路および態様としては、一炭素代謝、脂質の生成およびタンパク質のアセチル化のためのアセチルCoA合成、ミトコンドリア酸化的リン酸化およびTCA回路の促進が挙げられ、これらは、レドックス恒常性を維持する中間体を生成する。
[0298]一部の実施形態では、細胞集団を薬剤の組合せと接触させるステップは、細胞集団の成長を増加させる。一部の実施形態では、細胞集団を薬剤の組合せと接触させるステップは、細胞集団の代謝を変更または増加させる。例えば、一部の場合では、細胞集団を薬剤の組合せと接触させるステップは、細胞集団の酸素消費速度(OCR)を、例えばSeahorseアッセイによって決定される場合、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも50%増加させる。一部の場合では、細胞集団を薬剤の組合せと接触させるステップは、細胞集団のATP関連酸素消費速度を少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、または少なくとも50%増加させる。
[0299]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。アセテート、βヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、ビオチン、およびグルタミンを含む薬剤の組合せは、本明細書ではまとめて「MQ」と称される場合がある。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0300]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンのうちの少なくとも1つを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0301]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンのうちの2つを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0302]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンのうちの3つを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0303]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンのうちの4つを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0304]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンのうちの5つを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0305]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0306]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、およびHDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0307]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0308]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの少なくとも1つを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0309]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの2つを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0310]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの3つを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0311]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの4つを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0312]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの5つを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0313]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの6つを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0314]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタメートを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0315]一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびグルタメートを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタメートを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタメートを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタメートを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタメートを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、亜鉛(例えば、ZnSO)を含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒト血清アルブミンを含む。組成物は、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。組成物は、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を、例えば本明細書で開示される細胞培養培地中に含み得る。一部の実施形態では、本開示の組成物は、細胞クラスターを含む。一部の実施形態では、本開示の培養の細胞は、解離した細胞であるか、または大部分が解離した細胞である。一部の実施形態では、細胞は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物の細胞は、以前に凍結されたものである。
[0316]薬剤の組合せを含む組成物は、本明細書で開示される追加の因子、例えば、BMPシグナル伝達経路阻害剤、LDN193189、ROCK阻害剤、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、3-デアザネプラノシンA塩酸塩、TGF-β経路阻害剤、ALK5阻害剤II、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、GC-1、T3、タンパク質キナーゼ阻害剤、スタウロスポリン、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤、Sant1、Sant2、Sant 4、Sant4、Cur61414、フォルスコリン、トマチジン、AY9944、トリパラノール、シクロパミン、上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの増殖因子、ガンマセクレターゼ阻害剤、XXI、DAPT、亜鉛、ZnSO4、血清アルブミンタンパク質、またはそれらの誘導体のうちのいずれか1つまたは複数をさらに含み得る。
[0317]一部の実施形態では、本開示は、凍結保存剤(例えば、DMSO)、本明細書で開示されるいずれかの細胞、および本明細書で開示されるいずれかの培地成分(例えば、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、ビオチン、L-グルタミン、L-カルニチン、またはL-グルタメート)の任意の組合せを含む組成物を提供する。一部の実施形態では、組成物中の細胞の少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%は、解離している(クラスターになっていない)。一部の実施形態では、本開示の組成物は、凍結されている。一部の実施形態では、本開示の組成物は、以前に凍結されたものである。
初期化
[0318]「初期化(reprogramming)」という用語は、本明細書で使用される場合、体細胞の分化状態を変更または逆行するプロセスを指す。細胞は、部分分化した後に初期化しても、最終分化した後に初期化してもよい。初期化は体細胞の分化状態の多能性細胞への完全な逆行を包含する。そのような分化の完全な逆転は人工多能性(iPS)細胞をもたらす。初期化はまた、本明細書で使用される場合、細胞分化状態の、例えば多分化能性状態への、または多能性でも多分化能性でもないが、それが起因する分化細胞に特異的な1つもしくは複数の特徴を喪失している細胞である体細胞への部分的逆行、例えば分化細胞の異なる体細胞型への直接初期化を包含する。初期化は、全体として、接合子が成体へ発達する際の細胞の分化の間に生じる核酸修飾(例えば、メチル化)、クロマチン凝縮、エピジェネティック変化、ゲノムインプリンティング等の遺伝パターンのうちの少なくとも一部の変更、例えば逆転を伴う。
[0319]本明細書で使用される場合、「初期化因子」という用語は、細胞「初期化」、すなわち、細胞が異なる細胞型または表現型に変換するような分化および/または脱分化および/または分化転換と関連する分子を指すことが意図される。初期化因子は、全体として、細胞分化、脱分化、および/または分化転換と関連する遺伝子の発現に影響を及ぼす。転写因子は初期化因子の例である。
[0320]「分化」という用語およびそれらの文法上の同義語は、本明細書で使用される場合、より特殊化していない細胞(すなわち、より高い分化能を有するよりナイーブな細胞)がより特殊化した細胞型(すなわち、より低い分化能を有するよりナイーブでない細胞)になるプロセスを指し、「脱分化」という用語は、より特殊化した細胞がより特殊化していない細胞型(すなわち、より高い分化能を有するよりナイーブな細胞)になるプロセスを指し、「分化転換」という用語は、特定の細胞型の細胞がその「分化能」レベルも「ナイーブ性」レベルも有意に変化させずに別の細胞型に変換するプロセスを指す。理論に拘束されることを望むものではないが、細胞は、その「分化能」レベルも「ナイーブ性」レベルも有意に変化させずにある系統決定細胞型または最終分化細胞型から別の系統決定細胞型または最終分化細胞型に変換する場合、「分化転換」すると考えられる。
[0321]本明細書で使用される場合、「分化能」という用語は、細胞の異なる系統の細胞へと分化する能力を指すと理解されるべきである。例えば、多能性細胞(例えば、幹細胞)は、3つの胚葉、すなわち、内胚葉(胃の内面、胃腸管、肺)、中胚葉(筋肉、骨、血液、泌尿生殖器)、または外胚葉(表皮組織および神経系)のいずれかの細胞へと分化する可能性を有し、したがって高分化能を有し、多分化能性細胞(例えば、幹細胞またはある特定の型の人工幹細胞)は、複数だが限定された数の系統由来の細胞(例えば、造血幹細胞、心臓幹細胞、または神経幹細胞等)を生じる能力を有し、比較的、多能性細胞よりも低い分化能を有する。特定の系統に決定付けられるかまたは最終分化する細胞はさらに低い分化能を有し得る。当技術分野で公知の分化転換の具体例としては、例えば、線維芽細胞のベータ細胞への、または膵外分泌細胞からベータ細胞への変換等が挙げられる。
[0322]したがって、細胞はよりナイーブな細胞へと分化させることができる(例えば、最終分化細胞は多分化能性もしくは多能性となるように分化することができる)か、または細胞はよりナイーブでない細胞に脱分化させることができる(例えば、多分化能性もしくは多能性細胞は系統決定細胞もしくは最終分化細胞へと分化する可能性がある)。しかしながら、ある実施形態では、細胞はある細胞型(または表現型)から、例えば類似した分化能レベルを有する別の細胞型(または表現型)に変換または分化転換させることができる。したがって、本開示のある実施形態では、本開示の誘導ステップは分化、脱分化、および/または分化転換するように本開示の細胞を初期化することができる。本開示のある実施形態では、本開示の誘導ステップは分化転換するように細胞を初期化し得る。
[0323]例えば、1つまたは複数の外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチド初期化因子を使用する分化、脱分化、および/または分化転換によって特定の型の細胞を初期化または誘導して別の型の細胞にする方法は当業者に公知である。そのような方法は、細胞初期化と関連する1つまたは複数の転写因子または他のポリペプチドをコードする遺伝子材料の導入に依存し得る。例えば、Pdx1、Ngn3、およびMafA、またはそれらの機能的断片は全て、本開示の細胞の細胞分化、脱分化、および/または分化転換を誘導することができるペプチドをコードすることが公知である。当業者に公知の一部の方法では、初期化遺伝子(例えば、上記の遺伝子)によってコードされる外因性ポリペプチド(例えば、組換えポリペプチド)は、細胞と接触して、例えば本開示の細胞を誘導する。当業者は、他の遺伝子が細胞の初期化と関連してもよく、そのような遺伝子(またはその機能的断片)をコードする外因性分子およびコードされるポリペプチドもまたポリヌクレオチドまたはポリペプチド初期化因子(例えば、細胞初期化と関連する別の遺伝子の発現レベルに影響を及ぼすポリヌクレオチドまたはポリペプチド)と考えられることを理解するだろう。例えば、p53不活性化を低下する外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチドエピジェネティック遺伝子サイレンサーの導入は人工多能性幹細胞(iPSC)を誘導する効率を高めることが示されている。したがって、エピジェネティックサイレンサーおよび細胞初期化または細胞プログラミング効率を高めることに直接または間接的に関与し得る他の遺伝子またはタンパク質をコードする外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチドは、外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチド初期化因子を構成すると考えることができる。当業者は、細胞初期化に影響を与える他の方法、例えば細胞初期化を阻害することに関与する遺伝子の発現をノックダウンすることができるRNAi分子(またはRNAi分子をコードする遺伝子材料)を導入する方法が存在することを理解するだろう。したがって、細胞初期化と関連するかまたは細胞初期化を増強するいかなる外因性ポリヌクレオチド分子またはポリペプチド分子も、本明細書に記載される外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチド初期化因子であると理解されるべきである。
[0324]本開示の一部の実施形態では、方法は低分子ではない初期化因子の使用を除外する。しかしながら、方法は組織培養成分、例えば、培養培地、血清、血清代替物質、補充物質、抗生物質等、例えば、RPMI、腎上皮基礎培地(REBM)、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、MCDB 131培地、CMRL 1066培地、F12、ウシ胎仔血清(FCS)、ウシ胎児血清(FBS)、ウシ血清アルブミン(BSA)、D-グルコース、L-グルタミン、GlutaMAX(商標)-1(L-アラニン-L-グルタミンのジペプチド)、B27、ヘパリン、プロゲステロン、プトレシン、ラミニン、ニコチンアミド、インスリン、トランスフェリン、亜セレン酸ナトリウム、セレン、エタノールアミン、ヒト上皮成長因子(hEGF)、塩基性線維芽細胞増殖因子(bFGF)、ヒドロコルチゾン、エピネフリン、ノルモシン(normacin)、ペニシリン、ストレプトマイシン、ゲンタマイシン、およびアムホテリシン等を利用してもよいことが理解されるだろう。これらの組織培養成分(および組織培養で慣例的に使用される他の類似した組織培養成分)は本開示の目的のための低分子初期化分子ではないことが理解されるべきである。実際、これらの成分は、本明細書で定義される低分子ではない、および/または本明細書で定義される初期化因子ではない。しかしながら、本明細書で開示される細胞培養成分および代謝産物は、本明細書で開示される細胞初期化および分化方法を増強するために使用することができる。例えば、本明細書で開示される細胞培養成分/添加物と代謝産物との組合せは、SC-β細胞の生成の効率、およびそれらの機能を向上させることができる。
[0325]したがって、ある実施形態では、本開示は、1つまたは複数の外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチド初期化因子を用いる細胞の培養ステップを伴わない。したがって、ある実施形態では、本開示の方法は、例えば、人工ベータ細胞を産生すること、またはそうでなければ分化、脱分化、および/もしくは分化転換するように本開示の細胞を誘導することに関与するトランスポゾン、ウイルストランスジェニックベクター(例えば、レトロウイルスベクター)、プラスミド、mRNA、miRNA、ペプチド、またはこれらの分子のうちのいずれかの断片を導入することによる1つまたは複数の外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチド初期化因子の導入を伴わない。
[0326]すなわち、ある実施形態では、方法は1つまたは複数の外因性ポリヌクレオチドまたはポリペプチド初期化因子の非存在下で行われる。したがって、ある実施形態では、本開示の方法は、ポリペプチド転写因子;分化、脱分化、および/または分化転換を誘導することと特異的に関連する他のポリペプチド因子;ポリペプチド転写因子をコードするポリヌクレオチド配列、分化、脱分化、および/または分化転換を誘導することと特異的に関連する他のポリペプチド因子をコードするポリヌクレオチド配列;mRNA;干渉RNA;マイクロRNA、ならびにそれらの断片の付加を伴わずに、細胞を初期化する低分子を利用することが理解されるべきである。
幹細胞
[0327]「幹細胞」という用語は、本明細書では、自己複製することと分化細胞型を生成することの両方の能力を有する細胞(例えば、植物幹細胞、脊椎動物幹細胞)を指すために使用される(Morrisonら(1997)Cell 88:287~298)。細胞個体発生の文脈では、「分化した」または「分化する」という形容詞は相対語である。「分化細胞」とは、比較されている細胞よりもさらに発生経路を進んだ細胞である。したがって、多能性幹細胞は系統制限前駆細胞(例えば、中胚葉幹細胞)へと分化することができ、系統制限前駆細胞はさらに制限された細胞(例えば、ベータ細胞前駆体)へと分化することができ、この制限された細胞は、ある特定の組織型において特徴的な役割を果たし、さらに増殖する能力を保持していてもしていなくてもよい最終ステージ細胞(すなわち、最終分化細胞、例えば、ベータ細胞等)へと分化することができる。幹細胞は、特異的マーカー(例えば、タンパク質、RNA等)の存在と特異的マーカーの非存在の両方によって特徴付けることができる。幹細胞はまた、機能アッセイ、特に幹細胞の複数の分化した後代を生じる能力に関するアッセイによってin vitroとin vivoの両方で同定することができる。ある実施形態では、宿主細胞は、成体幹細胞、体性幹細胞、非胚性幹細胞、胚性幹細胞、造血幹細胞、人工多能性幹細胞(include pluripotent stem cell)、および栄養膜幹細胞である。
[0328]目的の幹細胞には多能性幹細胞(PSC)が含まれる。「多能性幹細胞」または「PSC」という用語は、本明細書では、生物の全ての細胞型を産生することができる幹細胞を意味するために使用される。したがって、PSCは、生物の全ての胚葉(例えば、脊椎動物の内胚葉、中胚葉、および外胚葉)の細胞を生じることができる。多能性細胞は、奇形腫を形成することができ、生きている生物の外胚葉、中胚葉、または内胚葉組織に寄与することができる。植物の多能性幹細胞は、植物の全ての細胞型(例えば、根、茎、葉等の細胞)を生じることができる。
[0329]動物のPSCはいくつかの異なる方法で得ることができる。例えば、胚性幹細胞(ESC)は胚の内部細胞塊から得られ(Thomsonら、Science.1998年11月6日;282(5391):1145~7)、人工多能性幹細胞(iPSC)は体細胞から得られる(Takahashiら、Cell.2007年11月30日;131(5):861~72;Takahashiら、Nat Protoc.2007;2(12):3081~9;Yuら、Science.2007年12月21日;318(5858):1917~20.電子公開2007年11月20日)。PSCという用語はその由来とは無関係に多能性幹細胞を指すため、PSCという用語は、ESCおよびiPSCという用語、ならびにPSCの別の例である胚性生殖幹細胞(EGSC)という用語を包含する。PSCは、樹立細胞系の形態にあっても、初代胚組織から直接取得されても、体細胞から得られてもよい。
[0330]「胚性幹細胞」(ESC)とは、胚から、典型的には胚盤胞の内部細胞塊から単離されるPSCを意味する。ESC系、例えば、hESBGN-01、hESBGN-02、hESBGN-03、hESBGN-04(BresaGen,Inc.);HES-1、HES-2、HES-3、HES-4、HES-5、HES-6(ES Cell International);Miz-hES1(MizMedi Hospital-Seoul National University);HSF-1、HSF-6(San FranciscoのUniversity of California);およびH1、H7、H9、H13、H14(Wisconsin Alumni Research Foundation(WiCell Research Institute))は、NIH Human Embryonic Stem Cell Registryに列挙される。目的の幹細胞としては、他の霊長類由来の胚性幹細胞、例えばアカゲザル幹細胞およびマーモセット幹細胞も挙げられる。幹細胞は、任意の哺乳動物種、例えば、ヒト、ウマ科、ウシ亜科、ブタ、イヌ科、ネコ科、げっ歯類、例えば、マウス、ラット、ハムスター、霊長類等から取得することができる(Thomsonら、(1998)Science 282:1145;Thomsonら、(1995)Proc.Natl.Acad.Sci USA 92:7844;Thomsonら、(1996)Biol.Reprod.55:254;Shamblottら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95:13726、1998)。培養中、ESCは、典型的には、大きな核細胞質比、明確な境界、および顕著な核小体を有する扁平コロニーとして成長する。加えて、ESCは、SSEA-3、SSEA-4、TRA-1-60、TRA-1-81、およびアルカリホスファターゼを発現するが、SSEA-1を発現しない。ESCを生成および特徴付ける方法の例は、例えば、米国特許第7,029,913号、同第5,843,780号、および同第6,200,806号に見出すことができ、それぞれは全体が本明細書に組み込まれる。未分化形態のhESCを増殖するための方法は、WO99/20741、WO01/51616、およびWO03/020920に記載されており、それぞれは全体が本明細書に組み込まれる。
[0331]「胚性生殖幹細胞」(EGSC)または「胚性生殖細胞」または「EG細胞」とは、生殖細胞ならびに/または生殖細胞前駆体、例えば始原生殖細胞、すなわち精子および卵になり得る細胞から得られるPSCを意味する。胚性生殖細胞(EG細胞)は、上に記載した胚性幹細胞と類似した特性を有すると考えられる。EG細胞を生成および特徴付ける方法の例は、例えば、米国特許第7,153,684号、Matsui,Y.ら、(1992)Cell 70:841;Shamblott,M.ら(2001)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 98:113;Shamblott,M.ら(1998)Proc.Natl.Acad.Sci.USA、95:13726;およびKoshimizu,U.ら(1996)Development、122:1235に見出すことができ、それぞれは全体が本明細書に組み込まれる。
[0332]「人工多能性幹細胞」または「iPSC」とは、PSCではない細胞から(すなわち、PSCと比して分化した細胞から)得られるPSCを意味する。iPSCは、最終分化細胞を含む複数の異なる細胞型から得ることができる。iPSCは、大きな核細胞質比、明確な境界、および顕著な核を有する扁平コロニーとして成長するES細胞様形態を有する。加えて、iPSCは、アルカリホスファターゼ、SSEA3、SSEA4、Sox2、Oct3/4、Nanog、TRA160、TRA181、TDGF1、Dnmt3b、FoxD3、GDF3、Cyp26a1、TERT、およびzfp42を含むがこれらに限定されない当業者によって公知の1つまたは複数の重要な多能性マーカーを発現する。iPSCを生成および特徴付ける方法の例は、例えば、米国特許出願公開第20090047263号、同第20090068742号、同第20090191159号、同第20090227032号、同第20090246875号、および同第20090304646号に見出すことができ、それぞれは全体が本明細書に組み込まれる。全体として、iPSCを生成するために、体細胞に、体細胞を初期化して多能性幹細胞にすることが当技術分野で公知の初期化因子(例えば、Oct4、SOX2、KLF4、MYC、Nanog、Lin28等)が提供される。
[0333]「体細胞」とは、実験操作の非存在下で生物の全ての型の細胞を通常生じるわけではない、生物のあらゆる細胞を意味する。換言すれば、体細胞は、身体の3つの胚葉、すなわち、外胚葉、中胚葉、および内胚葉の全ての細胞を天然に生成するわけではない、十分に分化した細胞である。例えば、体細胞としては、ニューロンと神経前駆体の両方を挙げることができ、後者は、中枢神経系の全てまたは一部の細胞型を天然に生じることができるが、中胚葉系統の細胞も内胚葉系統の細胞も生じることができない。
[0334]ある特定の例では、幹細胞は、本明細書に開示される方法に従った少なくとも1つのβ細胞成熟因子への曝露前に未分化(例えば、特定の系統に決定付けられていない細胞)であり得るが、他の例では、本明細書に記載される少なくとも1つの細胞成熟因子の曝露前に幹細胞を1つまたは複数の中間細胞型に分化させることが望ましい場合がある。例えば、幹細胞は、幹細胞を胚または成体起源の分化細胞と区別するために使用することができる未分化細胞の形態的、生物学的、または物理的特徴を示し得る。一部の例では、未分化細胞は、二次元の顕微鏡像において、高い核/細胞質比および顕著な核小体を有する細胞のコロニーに現れ得る。幹細胞はそれ自体によっても(例えば、実質的にいかなる未分化細胞も存在しない)、分化細胞の存在下で使用されてもよい。ある特定の例では、幹細胞は、好適な栄養素、および必要に応じて、幹細胞が成長し必要に応じて分化することができるような他の細胞の存在下)で培養され得る。例えば、胚性線維芽細胞または線維芽細胞様細胞は、幹細胞の成長を補助するために培養に存在し得る。線維芽細胞は幹細胞成長の1つの段階の間に存在し得るが、必ずしも全ての段階に存在しなくてもよい。例えば、線維芽細胞は第1の培養段階で幹細胞培養に添加され、1つまたは複数のその後の培養段階では幹細胞培養に添加されなくてもよい。
[0335]本発明の全ての態様で使用される幹細胞は、いかなる種類の組織(例えば、胚組織、例えば胎児もしくは胎児前組織または成体組織)から得られるいかなる細胞であってもよく、適切な条件下で、多様な細胞型、例えば、3つの胚芽層(内胚葉、中胚葉、および外胚葉)のうちの少なくとも1つの全ての誘導体の後代を産生することができるという特徴を有する。これらの細胞型は、樹立細胞系の形態で提供されても、初代胚組織から直接取得され、直ちに分化のために使用されてもよい。NIH Human Embryonic Stem Cell Registryに列挙される細胞は、例えば、hESBGN-01、hESBGN-02、hESBGN-03、hESBGN-04(BresaGen,Inc.);HES-1、HES-2、HES-3、HES-4、HES-5、HES-6(ES Cell International);Miz-hES1(MizMedi Hospital-Seoul National University);HSF-1、HSF-6(San FranciscoのUniversity of California);およびH1、H7、H9、H13、H14(Wisconsin Alumni Research Foundation(WiCell Research Institute))が挙げられる。一部の実施形態では、成熟インスリン陽性細胞への化学誘導分化のために使用されるヒト幹細胞または多能性幹細胞の供給源には、ヒト胚を破壊することは含まれなかった。
[0336]別の実施形態では、幹細胞は固形組織を含む組織から単離することができる。一部の実施形態では、組織は、皮膚、脂肪組織(例えば、脂肪性組織)、筋組織、心臓または心組織である。他の実施形態では、組織は、例えば、これらに限定されないが、臍帯血、胎盤、骨髄、または軟骨である。
[0337]目的の幹細胞としては、Thomsonら(1998)Science 282:1145によって記載されているヒト胚性幹(hES)細胞;他の霊長類由来の胚性幹細胞、例えばアカゲザル幹細胞(Thomsonら、(1995)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92:7844);マーモセット幹細胞(Thomsonら、(1996)Biol.Reprod.55:254);およびヒト胚性生殖(hEG)細胞(Shambloftら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95:13726、1998)によって例示される様々な型の胚細胞も挙げられる。また、系統決定幹細胞、例えば中胚葉幹細胞および他の初期心原細胞も目的の幹細胞である(Reyesら、(2001)Blood 98:2615~2625;EisenbergおよびBader(1996)Circ Res.78(2):205~16等を参照されたい)。幹細胞は、任意の哺乳動物種、例えば、ヒト、ウマ科、ウシ亜科、ブタ、イヌ科、ネコ科、げっ歯類、例えば、マウス、ラット、ハムスター、霊長類等から取得され得る。一部の実施形態では、ヒト胚は、本明細書に開示される方法および組成物で使用される多能性細胞の供給源のために破壊されない。
[0338]内皮幹細胞、筋幹細胞、および/または神経幹細胞の好適な供給源からの細胞の混合物は、当技術分野で公知の方法によって哺乳動物ドナーから採取することができる。好適な供給源は造血微小環境である。例えば、好ましくは結集された(すなわち、動員された)循環末梢血が対象から取り出され得る。ある実施形態では、幹細胞は初期化幹細胞、例えば体細胞または分化細胞から得た幹細胞であってもよい。そのような実施形態では、脱分化幹細胞は、例えば、これらに限定されないが、新生物細胞、腫瘍細胞、およびがん細胞、または代替的に人工初期化細胞、例えば人工多能性幹細胞もしくはiPS細胞であってもよい。
[0339]一部の実施形態では、SC-β細胞は、毛胞、角化細胞、性腺刺激ホルモン産生細胞、副腎皮質刺激ホルモン産生細胞、甲状腺刺激ホルモン産生細胞、成長ホルモン産生細胞、プロラクチン産生細胞、クロム親和性細胞、傍濾胞細胞、グロムス細胞 メラニン細胞、母斑細胞、メルケル細胞、象牙芽細胞、セメント芽細胞 角膜実質細胞、網膜ミュラー細胞、網膜色素上皮細胞、ニューロン、膠細胞(例えば、乏突起膠細胞 星細胞)、上衣細胞、松果体細胞、肺細胞(例えば、I型肺細胞およびII型肺細胞)、クララ細胞、杯細胞、G細胞、D細胞、ECL細胞、胃主細胞、胃壁細胞、小窩細胞、K細胞、D細胞、I細胞、杯細胞、パネート細胞、腸細胞、小襞細胞、肝細胞、肝星細胞(例えば、中胚葉由来のクッパー細胞)、胆嚢細胞、腺房中心細胞、膵星細胞、膵α細胞、膵β細胞、膵δ細胞、膵F細胞(例えば、PP細胞)、膵ε細胞、甲状腺(例えば、濾胞細胞)、副甲状腺(例えば、副甲状腺主細胞)、好酸性細胞、尿路上皮細胞、骨芽細胞、骨細胞、軟骨芽細胞、軟骨細胞、線維芽細胞、線維細胞、筋芽細胞、筋細胞、筋衛星細胞、腱細胞、心筋細胞、脂肪芽細胞、脂肪細胞、カハール介在細胞、血管芽細胞、内皮細胞、メサンギウム細胞(例えば、糸球体内メサンギウム細胞および糸球体外メサンギウム細胞)、傍糸球体細胞、緻密斑細胞、間質細胞、間細胞、テロサイト 単層上皮細胞、足細胞、腎近位尿細管刷子縁細胞、セルトリ細胞、ライディッヒ細胞、顆粒膜細胞、栓細胞、生殖細胞、精子 卵子、リンパ球、骨髄性細胞、内皮前駆細胞、内皮幹細胞、血管芽細胞、メソ血管芽細胞(mesoangioblast)、周皮細胞 壁細胞、脾臓細胞(例えば、Tリンパ球、Bリンパ球、樹状細胞、ミクロファージ、白血球)、栄養膜幹細胞、またはそれらの任意の組合せのうちの1つまたは複数から得ることができる。
膵臓前駆細胞または先駆体
[0340]一部の態様では、本開示は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞からNKX6.1陽性膵臓前駆細胞を生成する方法であって、Pdx1陽性膵臓前駆細胞または先駆体を含む細胞集団を、細胞クラスター形成を促進する条件下で、a)線維芽細胞増殖因子(FGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、b)ソニックヘッジホッグ経路阻害剤、および必要に応じてc)低濃度のレチノイン酸(RA)シグナル伝達経路活性化剤を含む少なくとも2つのβ細胞成熟因子と少なくとも5日の期間にわたって接触させて、集団中の少なくとも1個のPdx1陽性膵臓前駆細胞のNKX6.1陽性膵臓前駆細胞への分化を誘導するステップであって、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、NKX6.1を発現するステップを含む方法を提供する。
[0341]一部の実施形態では、集団中のPdx1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも10%は、NKX6-1陽性膵臓前駆細胞へと分化するように誘導される。一部の実施形態では、集団中のPdx1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも95%は、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞へと分化するように誘導される。一部の実施形態では、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1、NKX6.1、およびFoxA2を発現する。一部の実施形態では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、胚性幹細胞および人工多能性幹細胞からなる群から選択される多能性幹細胞集団から生成される。
幹細胞由来ベータ細胞
[0342]本明細書において、一部の実施形態では、幹細胞を使用してSC-ベータ細胞(例えば、成熟膵β細胞もしくはβ様細胞)またはその先駆体を生成する方法が提供される。ある実施形態では、生殖細胞は、それぞれの全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第20150240212号および同第20150218522号に記載されている類似したプロトコールを使用して、少なくとも1個のSC-β細胞を提供するために、幹細胞の代わりにまたは幹細胞と共に使用され得る。好適な生殖細胞は、例えば、最後の月経期の約8~11週間後に得られるヒト胎児材料に存在する始原生殖細胞から調製することができる。例示的な生殖細胞調製法は、例えば、Shamblottら、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95:13726、1998、および米国特許第6,090,622号に記載されている。
[0343]本明細書において、一部の実施形態では、SC-β細胞(例えば、膵β細胞)を生成する組成物および方法が提供される。全体として、少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体、例えば本明細書に開示される方法に従って生成される膵臓前駆体は、異なる細胞の混合物または組合せ、例えば、Pdx1陽性膵臓前駆体、Pdx1とNKX6.1とを共発現する膵臓前駆体、Ngn3陽性内分泌前駆細胞、インスリン陽性内分泌細胞(例えば、β様細胞)、およびインスリン陽性内分泌細胞、ならびに/または他の多能性もしくは幹細胞等の細胞の混合物等を含むことができる。
[0344]少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体は、幹細胞または多能性細胞を所望の分化のステージに分化させるのに好適な任意の培養プロトコールに従って生成することができる。一部の実施形態では、少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体は、少なくとも1個の多能性細胞を、少なくとも1個の多能性細胞が少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体へと分化するのに好適な期間および条件下で培養することによって生成される。一部の実施形態では、SC-β細胞またはその先駆体の生成は、本明細書で開示される1つまたは複数の薬剤(例えば、グルタミン、グルタメート、カルニチン、タウリン、β-ヒドロキシブチレート、ビオチン、アセテート、およびホルメートのうちの1つまたは複数)と細胞を接触させることによって増強される。
[0345]一部の実施形態では、少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体は、SC-β細胞またはその先駆体の実質的に純粋な集団である。一部の実施形態では、SC-β細胞またはその先駆体の集団は、多能性細胞または分化細胞の混合物を含む。一部の実施形態では、SC-β細胞またはその先駆体の集団は、胚性幹細胞も、多能性細胞も、iPS細胞も実質的に含まないかまたはそれらを欠く。
[0346]一部の実施形態では、体細胞、例えば線維芽細胞は、例えば組織生検、例えば皮膚生検等として対象から単離することができ、さらなる分化のために人工多能性幹細胞に初期化して、本明細書に記載される組成物および方法での使用のための少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体を生成することができる。一部の実施形態では、体細胞、例えば線維芽細胞は、当業者によって公知の方法によって培養に維持され、一部の実施形態では、増幅された後に、本明細書に開示される方法によってSC-β細胞に変換される。
[0347]一部の実施形態では、少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体は、当業者に公知の方法によって培養に維持され、一部の実施形態では、増幅された後に、本明細書に開示される方法によってSC-β細胞に変換される。
[0348]さらに、少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体、例えば、膵臓前駆体は、任意の哺乳動物種由来であることができ、非限定的な例としては、マウス、ウシ、類人猿、ブタ、ウマ、ヒツジ、またはヒト細胞が挙げられる。説明を明確かつ簡単にするために、本明細書の方法の記載は哺乳動物の少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体に言及するが、本明細書に記載される全ての方法は他の細胞型の少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体に容易に適用できることが理解されるべきである。一部の実施形態では、少なくとも1個のSC-β細胞またはその先駆体はヒト個体に由来する。
[0349]一部の実施形態では、本開示の細胞集団は、NKX6.1とISL1の両方を発現する複数の細胞を含む。例えば、少なくとも約10%、20%、30%、35%、38%、40%、42%、44%、46%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の細胞はISL1を発現することができる。一部の場合では、少なくとも約35%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現する。一部の場合では、少なくとも約38%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現する。一部の場合では、少なくとも約40%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現する。一部の場合では、少なくとも約42%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現する。一部の場合では、少なくとも約44%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現する。一部の場合では、少なくとも約46%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現する。一部の場合では、少なくとも約50%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現する。本開示の組成物および方法は、NKX6.1とISL1の両方を発現する細胞のパーセンテージを増加させるのに有用であり得る。例えば、本開示の方法に従ってSC-β細胞への分化を受けた細胞を接触させた後、NKX6.1およびISL1を発現する細胞のパーセンテージは、1つもしくは複数の薬剤を欠くか、または異なる(例えば、より低い)濃度の薬剤を含有する方法と比して増加し得る。
[0350]一部の場合では、本開示の細胞集団は、NKX6.1とISL1の両方に対して陰性の、限定された割合の細胞を含有する。例えば、細胞集団は、最大2%、最大4%、最大6%、最大8%、最大10%、最大12%、最大14%、最大16%、最大18%、最大20%、最大22%、最大22%、最大25%、または最大30%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を含み得る。
幹細胞由来ベータ細胞の細胞クラスター
[0351]本明細書において、一部の態様では、内因性膵島の機能および特徴に類似する細胞クラスターが提供される。そのような細胞クラスターは、対象の代謝、例えばグルコース代謝を調節するという内因性膵島の機能を模倣することができる。したがって、細胞クラスターは、不十分な膵島機能に起因する疾患、例えば、糖尿病を処置するために対象に移植することができる。「クラスター」および「凝集体」という用語は、交換可能に使用することができ、密接な細胞間接触を有する細胞群、一部の場合では、互いに接着することができるクラスター中の細胞を指す。
[0352]細胞クラスターは複数の細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは、少なくとも10、少なくとも50、少なくとも200、少なくとも500、少なくとも750、少なくとも1000、少なくとも1500、少なくとも2000、少なくとも2500、少なくとも3000、少なくとも3500、少なくとも4000、少なくとも4500、少なくとも5000、少なくとも6000、少なくとも7000、少なくとも8000、少なくとも9000、少なくとも10,000、少なくとも20,000、少なくとも30,000、または少なくとも50,000個の細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは、10~10,000個の間の細胞、50~10,000個の間、100~10,000個の間、100~10,000個の間、1,000~10,000個の間、500~10,000個の間、500~5,000個の間、500~2,500個の間、500~2,000個の間、1,000~100,000個の間、1,000~50,000個の間、1,000~40,000個の間、1,000~20,000個の間、1,000~10,000個の間、1,000~5,000個の間、および1,000~3,000個の間の細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは少なくとも500個の細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは少なくとも1,000個の細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは少なくとも2,000個の細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは少なくとも5,000個の細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは、100,000個以下、90,000個以下、80,000個以下、70,000個以下、60,000個以下、50,000個以下、40,000個以下、30,000個以下、20,000個以下、10,000個以下、7,000個以下、5,000個以下、3,000個以下、2,000個以下の細胞、または1,000個以下の細胞を含む。
[0353]本明細書の細胞クラスターは、少なくとも1個の非天然細胞、例えば非天然膵β細胞を含むことができる。非天然細胞(例えば、非天然膵β細胞)は、内因性細胞(例えば、内因性成熟膵β細胞)の特徴を共有することができるが、ある特定の態様(例えば、遺伝子発現プロファイル)の点で異なる。非天然細胞は遺伝子修飾細胞であり得る。非天然細胞は、前駆細胞、例えば幹細胞から分化した細胞であり得る。幹細胞は胚性幹細胞(ESC)または人工多能性幹細胞(iPSC)であり得る。一部の場合では、非天然細胞は前駆細胞からin vitroで分化した細胞であり得る。一部の場合では、非天然細胞は前駆細胞からin vivoで分化した細胞であり得る。例えば、細胞クラスターは少なくとも1個の非天然膵β細胞を含むことができる。非天然膵β細胞は、全体が本明細書に組み込まれる米国特許出願第14/684,129号および同第14/684,101号に記載されているものであり得る。細胞クラスターは複数の非天然膵β細胞を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、99%の細胞は非天然膵β細胞である。細胞クラスターは1個または複数の天然細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスターは1個または複数の初代細胞、例えば内因性膵島由来の初代細胞を含むことができる。
[0354]細胞クラスターは、内因性細胞、例えば内因性成熟膵β細胞の少なくとも1つのマーカーを発現する1個または複数の細胞を含むことができる。「マーカー」という用語は、観察または検出することができる分子を指すことができる。例えば、マーカーとしては、これらに限定されないが、核酸、例えば特定の遺伝子の転写物、遺伝子のポリペプチド産物、非遺伝子産物ポリペプチド、糖タンパク質、炭水化物、糖脂質、脂質、リポタンパク質、または低分子を挙げることができる。多くの場合、マーカーは、特定の細胞型に特徴的であり得る分子を指すことができ、したがって、マーカーは細胞型のマーカーと呼ぶことができる。例えば、インスリン遺伝子はβ細胞のマーカーと称すことができる。一部の場合では、マーカーは遺伝子である。内因性成熟膵β細胞のマーカーの非限定的なものとしては、インスリン、Cペプチド、PDX1、NKX6.1、CHGA、MAFA、ZNT8、PAX6、NEUROD1、グルコキナーゼ(GCK)、SLC2A、PCSK1、KCNJ11、ABCC8、SLC30A8、SNAP25、RAB3A、GAD2、およびPTPRNが挙げられる。
[0355]細胞クラスターは、内因性細胞、例えば内因性成熟膵β細胞の1つまたは複数のマーカーを発現する1個または複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスターは、内因性細胞、例えば内因性成熟膵β細胞の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、または20のマーカーを共発現する1個または複数の細胞を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターは、いずれもβ細胞のマーカーであり得るNKX6.1およびCペプチドを発現する細胞を含む。
[0356]細胞クラスターは、内因性細胞の少なくとも1つのマーカーを発現する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約1%、5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%の細胞は、内因性細胞の少なくとも1つのマーカーを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の全ての細胞は内因性細胞のマーカーを発現することができる。一部の場合では、内因性細胞は膵細胞、例えば、膵β細胞、膵α細胞、膵β細胞、膵Δ細胞、または膵γ細胞であり得る。本明細書で提供される細胞クラスターは異種細胞群、例えば多様な型の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスターは、膵β細胞のマーカーであり得るインスリン/Cペプチドを発現する細胞、膵α細胞のマーカーであり得るグルカゴンを発現する細胞、膵Δ細胞のマーカーであり得るソマトスタチンを発現する細胞、膵ポリペプチドを発現する細胞、またはそれらの任意の組合せを含むことができる。
[0357]例えば、本明細書の細胞クラスターは内因性成熟膵β細胞の1つまたは複数のマーカーを発現する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の細胞は、内因性成熟膵β細胞の1つまたは複数のマーカーを発現することができる。
[0358]細胞クラスターはCHGAを発現する複数の細胞を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の細胞はCHGAを発現する。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約85%の細胞はCHGAを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスターはCHGAを発現する細胞を約90%含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターはCHGAを発現する細胞を約95%含むことができる。ある特定の場合では、細胞クラスター中の全ての細胞はCHGAを発現することができる。
[0359]細胞クラスターはNKX6.1を発現する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%の細胞はNKX6.1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約50%の細胞はNKX6.1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の全ての細胞はNKX6.1を発現することができる。
[0360]細胞クラスターはISL1を発現する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%の細胞はNKX6.1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約50%の細胞はISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の全ての細胞はISL1を発現することができる。
[0361]細胞クラスターはCペプチドを発現する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の細胞はCペプチドを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約60%の細胞はCペプチドを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の全ての細胞はCペプチドを発現することができる。
[0362]細胞クラスターはNKX6.1とCペプチドの両方を発現する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の細胞はCペプチドを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約35%の細胞はNKX6.1およびCペプチドを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約40%の細胞はNKX6.1およびCペプチドを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約35%の細胞はNKX6.1およびCペプチドを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスターは、NKX6.1およびCペプチドを発現する細胞を約60%含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターは、NKX6.1およびCペプチドを発現する細胞を約75%含むことができる。一部の場合では、細胞クラスター中の全ての細胞はNKX6.1およびCペプチドを発現することができる。
[0363]細胞クラスターはNKX6.1とISL1の両方を発現する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約10%、20%、30%、35%、38%、40%、42%、44%、46%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約35%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約40%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約35%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスターはNKX6.1およびISL1を発現する約60%の細胞を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターはNKX6.1およびISL1を発現する約75%の細胞を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスター中の全ての細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。
[0364]細胞クラスターは、NKX6.1とISL1の両方に対して陰性の、限定された割合の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスターは、最大2%、最大4%、最大6%、最大8%、最大10%、最大12%、最大14%、最大16%、最大18%、最大20%、最大22%、最大22%、最大25%、または最大30%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を含むことができる。
[0365]細胞クラスターは、幹細胞も、前駆細胞、例えば膵臓前駆細胞もほとんど含まないか、または全く含まない可能性がある。例えば、本明細書で提供される細胞クラスターは、LIN28を発現する細胞を最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。一部の例では、本明細書で提供される細胞クラスターは、Ki67を発現する細胞を最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。
[0366]一部の場合では、細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を最大3%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。一部の場合では、細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約1%含み得る。一部の場合では、細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約0.6%含み得る。一部の場合では、細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約0.3%含み得る。一部の場合では、細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約0.1%含み得る。
[0367]一部の例では、細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を最大10%、最大約8%、最大約6%、最大約5%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。一部の場合では、細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を約2%含み得る。一部の場合では、細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を約6%含み得る。一部の場合では、細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を約1.2%含み得る。
[0368]本明細書の細胞クラスターは、グルコース負荷(複数可)に曝露された場合、in vitroで1つまたは複数のグルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)応答を呈することができる。このGSIS応答は内因性膵島のGSIS応答に類似する場合がある。一部の場合では、細胞クラスターは、グルコース負荷に対するin vitro GSIS応答を呈する。一部の場合では、細胞クラスターは、複数回のグルコース負荷、例えば逐次グルコース負荷に対するin vitro GSIS応答を呈する。例えば、細胞クラスターは、少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10回の逐次グルコース負荷に対するin vitro GSIS応答を呈することができる。
[0369]本明細書で提供される細胞クラスターは、in vitro GSISを呈する少なくとも1個の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも1個の細胞は成熟膵β細胞と称される場合がある。一部の場合では、少なくとも1個の細胞は非天然膵β細胞である。一部の場合では、少なくとも1個の細胞は天然/内因性β細胞に類似する膵β細胞である。一部の場合では、細胞はin vitroグルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)応答を呈する。一部の場合では、少なくとも1個の細胞は少なくとも1回のグルコース負荷に対するGSIS応答を呈する。一部の場合では、細胞は少なくとも2回の逐次グルコース負荷に対するGSIS応答を呈する。一部の場合では、細胞は少なくとも3回の逐次グルコース負荷に対するGSIS応答を呈する。
[0370]本明細書で提供されるように、細胞クラスターは、内因性膵島と類似したGSIS刺激指数を呈することができる。細胞クラスターまたは細胞の刺激指数は、高グルコース濃度に応答して分泌されるインスリンの低グルコース濃度と比較した比によって特徴付けることができる。例えば、本明細書で提供される細胞クラスターまたは細胞の刺激指数は、20mMグルコース刺激に応答して分泌されるインスリンの2.8mMグルコース刺激に応答して分泌されるインスリンに対する比として算出することができる。一部の例では、本明細書で提供される細胞クラスターまたは細胞の刺激指数は、1以上、または1.1以上、または1.3以上、または2以上、または2.3以上、または2.6以上である。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は、サイトカインに応答してサイトカイン誘導アポトーシスを呈する。一部の場合では、サイトカインは、インターロイキン-β(IL-β)、インターフェロン-γ(INF-γ)、腫瘍壊死因子-α(TNF-α)、またはそれらの任意の組合せを含む。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞からのインスリン分泌は抗糖尿病剤に応答して増強する。一部の場合では、抗糖尿病剤は、インクレチン模倣薬、スルホニル尿素、メグリチニド、およびそれらの組合せからなる群から選択される分泌促進薬を含む。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は単ホルモンである。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は、内因性成熟膵β細胞の形態に類似する形態を呈する。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は、電子顕微鏡下で内因性成熟膵β細胞のインスリン顆粒に類似する封入された結晶インスリン顆粒を呈する。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は低い複製速度を呈する。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は、内因性成熟膵β細胞のグルコース刺激性Ca2+流(GSCF)に類似するGSCFを呈する。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は、少なくとも1回のグルコース負荷に対するGSCF応答を呈する。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は、少なくとも2回のグルコース負荷に対するGSCF応答を呈する。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は、少なくとも3回のグルコース負荷に対するGSCF応答を呈する。一部の場合では、細胞クラスターまたは細胞は増加したカルシウム流を呈する。一部の場合では、増加したカルシウム流は、増加した流入量または低グルコース濃度の高グルコース濃度に対する流入の比を含む。
[0371]本明細書で提供される細胞クラスターは、内因性膵島、例えばヒト膵島と類似した、高グルコース濃度刺激に応答した二相性インスリン分泌を呈することができる。二相性インスリン分泌は、内因性膵島、例えばヒト島に特徴的な現象であり得る。一部の実施形態では、本明細書で提供される細胞クラスター、例えば再凝集膵細胞クラスターの高グルコース濃度負荷、例えば、10mM、15mM、20mM、または30mMに対する応答は、インスリン分泌のピーク値への一過性の増加と、それに続く比較的上昇したインスリン分泌レベル、例えばより低いグルコース濃度、例えば2.8mMグルコースに応答したインスリン分泌レベルよりも高いレベルへの急速な低下とを呈することができる。そのような一過性の増加および低下プロセスは、二相性インスリン分泌パターンの第1相と称される場合がある。したがって、永続的な高グルコース負荷では、第1相の後に、細胞クラスターによるインスリン分泌が比較的上昇したレベルで維持され得る第2相が続くことができる。第2相は長期間、例えば、高グルコース濃度負荷が継続する限り、または第1相よりも比較的長く継続し得る。そのような二相性インスリン分泌パターンは、成熟天然膵β細胞に特徴的な固有の細胞シグナル伝達変化に起因する可能性がある。
[0372]対象に移植される場合、細胞クラスターは、グルコース負荷(複数可)に曝露された場合に1つまたは複数のin vivo GSIS応答を呈することができる。本明細書の細胞クラスターは、対象に移植されてから短い期間以内にin vivo GSIS応答を呈することができる可能性がある。例えば、細胞クラスターは、移植後約6、12、または24時間以内にin vivo GSISを呈することができる。一部の場合では、細胞クラスターは、移植後約2日、4日、6日、8日、10日、12日、14日、21日、28日、35日、または42日以内にin vivo GSISを呈する。細胞クラスターによって分泌されるインスリンの量は、内因性膵島と類似するかまたはそれよりも高い可能性がある。基準数値に関する「約」という用語は、本出願を通じて使用される場合、その値からプラスまたはマイナス10%の範囲の値を含み得る。例えば、「約10」という量は9~11の量を含む。例えば、基準数値に関する「約」という用語はまた、その値からプラスまたはマイナス10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、または1%の範囲の値を含み得る。
[0373]細胞クラスターは、対象へ移植された後の期間、in vivo GSIS応答を呈する能力を維持することができる。例えば、細胞クラスターのin vivo GSIS応答は、細胞クラスターの対象(例えば、ヒト)への移植後少なくとも2週間、3週間、4週間、5週間、10週間、15週間、20週間、6か月、7か月、8か月、9か月、10か月、11か月、1年、2年、3年、4年、5年、10年、20年、30年、40年、60年、80年、または100年まで観察することができる。
[0374]細胞クラスターのGSISは刺激指数によって測定することができる。細胞クラスターの刺激指数は、高グルコース濃度に応答して分泌されるインスリンの低グルコース濃度に応答して分泌されるインスリンと比較した比と等しい可能性がある。細胞クラスターは内因性膵島と類似した刺激指数を有し得る。一部の場合では、細胞クラスターは、少なくとも1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3.0、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4.0、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、または5.0の刺激指数を有する。
[0375]グルコース負荷(例えば、高濃度、例えば20mMのグルコース)に応答して細胞クラスターによって分泌されるインスリンの量は、約0.1μIU/10細胞~約5μIU/10細胞、約0.2μIU/10細胞~約4μIU/10細胞、約0.2μIU/10細胞~約3μIU/10細胞、または約0.23μIU/10細胞~約2.7μIU/10細胞の範囲であり得る。一部の場合では、グルコース負荷(例えば、高濃度、例えば20mMのグルコース)に応答して細胞クラスターによって分泌されるインスリンの量は、少なくとも0.05、0.1、0.15、0.2、0.21、0.22、0.23、0.24、0.25、0.26、0.27、0.28、0.29、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3μIU/10細胞である。
[0376]細胞クラスターはプロインスリンとインスリンの両方を分泌することができる。例えば、細胞クラスターは、内因性膵島によって分泌されるプロインスリンのインスリンに対する比と実質的に同じプロインスリン対インスリン比でプロインスリンおよびインスリンを分泌することができる。一部の場合では、細胞クラスターは、約0.01~約0.05、約0.02~約0.04、約0.02~約0.03、または0.029~約0.031のプロインスリン対インスリン比でプロインスリンおよびインスリンを分泌する。一部の場合では、細胞クラスターは、約0.02、0.021、0.022、0.023、0.024、0.025、0.026、0.027、0.028、0.029、0.03、0.031、0.032、0.033、0.034、0.035、0.036、0.037、0.038、0.039、または0.04のプロインスリン対インスリン比でプロインスリンおよびインスリンを分泌する。
[0377]細胞クラスターは、内因性膵島と類似したサイズであり得る。例えば、細胞クラスターは内因性膵島と類似した直径を有し得る。細胞クラスターの直径とは、細胞クラスターの表面の2点間の最大の直線距離を指すことができる。一部の場合では、細胞クラスターの直径は、最大300μm、200μm、150μm、100μm、90μm、80μm、70μm、60μm、50μm、または40μmである。細胞クラスターの直径は約75μm~約250μmであり得る。細胞クラスターの直径は最大100μmであり得る。
[0378]一部の実施形態では、細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約50μm~約250μm、約75μm~約250μm、または約100μm~約200μmの直径を有する。
[0379]一部の実施形態では、細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの直径を有する。
[0380]一部の実施形態では、細胞クラスターは、最大120、最大130、最大140、最大150、最大160、または最大170μmの平均直径または直径中央値を有する。
[0381]一部の実施形態では、細胞クラスターは、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの平均直径または直径中央値を有する。
[0382]一部の実施形態では、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、150μm未満の直径を有する。
[0383]一部の実施形態では、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、または少なくとも約70%は、140μm未満の直径を有する。
[0384]一部の実施形態では、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、または少なくとも約70%は、130μm未満の直径を有する。
[0385]細胞クラスターは、死細胞をほとんど含まないか、または全く含まない可能性がある。細胞クラスターは、周囲環境から細胞クラスターの中心への分子(例えば、栄養および気体)の効果的な拡散を可能にするサイズであり得る。拡散した分子は、中心の細胞の生存および機能に重要であり得る。一部の場合では、細胞クラスターは、約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%未満の死細胞、例えば中心における死細胞を有し得る。一部の場合では、細胞クラスターは死細胞を全く有しない可能性がある。死細胞は、アポトーシス細胞、麻薬細胞(narcotic cell)、またはそれらの任意の組合せであり得る。
[0386]細胞クラスターは1つまたは複数の型の細胞を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターは1つまたは複数の型の膵細胞を含む。例えば、細胞クラスターは、1個または複数の膵β細胞、膵α細胞、膵Δ細胞、膵γ細胞、およびそれらの任意の組合せを含むことができる。一部の場合では、膵細胞は非天然膵細胞、例えばESCおよび/またはiPSC等の幹細胞に由来する細胞であり得る。一部の場合では、細胞クラスターはまた、iPSC、ESC、胚体内胚葉細胞、原始腸管細胞、Pdx1陽性膵臓前駆細胞、Pdx1陽性/NKX6.1陽性膵臓前駆細胞、Ngn3陽性内分泌前駆細胞、およびそれらの任意の組合せを含む成熟膵細胞の1個または複数の前駆細胞を含むことができる。
[0387]細胞クラスターは、サイトカインに応答してサイトカイン誘導アポトーシスを呈することができる。例えば、細胞クラスターは、インターロイキン-1β(IL-β)、インターフェロン-γ(INF-γ)、腫瘍壊死因子-α(TNF-α)、およびそれらの組合せ等のサイトカインに応答してサイトカイン誘導アポトーシスを呈することができる。
[0388]本明細書の細胞クラスターからのインスリン分泌は、抗糖尿病薬(例えば、ex vivo、in vitro、および/またはin vivoで膵β細胞に作用する抗糖尿病薬)によって増強し得る。本開示はいかなる公知の抗糖尿病薬も企図することができる。一部の場合では、細胞クラスターからのインスリン分泌は分泌促進薬によって増強し得る。分泌促進薬は、インクレチン模倣薬、スルホニル尿素、メグリチニド、およびそれらの組合せであり得る。
[0389]細胞クラスターは単ホルモンを含むことができる。例えば、細胞クラスターは、単ホルモンである膵細胞(例えば、膵β細胞、膵α細胞、膵β細胞、膵Δ細胞、または膵γ細胞)を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターは、単ホルモンであるインスリン分泌非天然膵細胞を含む。細胞クラスターは多ホルモンを含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターは単ホルモン細胞および多ホルモン細胞を含む。
[0390]細胞クラスターは、内因性成熟膵β細胞の形態に類似する形態を有する細胞(例えば、非天然膵細胞)を含むことができる。一部の場合では、細胞クラスターは、例えば電子顕微鏡によって検出される、内因性成熟膵β細胞のインスリン顆粒に類似する結晶インスリン顆粒を封入する細胞を含むことができる。細胞クラスターは、内因性成熟膵β細胞の形態に類似する形態を有する複数の細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%の細胞は、内因性成熟膵β細胞のインスリン顆粒に類似する結晶インスリン顆粒を封入することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の100%の細胞は、内因性成熟膵β細胞のインスリン顆粒に類似する結晶インスリン顆粒を封入する。
[0391]細胞クラスターは、1回または複数回のグルコース負荷に対するグルコース刺激性カルシウム(Ca2+)流を呈することができる。一部の場合では、細胞クラスターは、内因性膵島のグルコース刺激性Ca2+流(GSCF)に類似するGSCFを呈する。一部の場合では、細胞クラスターは、内因性膵島の複数回のグルコース負荷に対するGSCF応答に類似する様式で少なくとも1、2、3、4、5、6、8、または10回の逐次グルコース負荷に対するGSCF応答を呈する。細胞クラスターは、グルコース負荷に曝露された場合、in vitroおよび/またはin vivo GSCF応答を呈することができる。
[0392]細胞クラスターは、任意の種を起源とする細胞を含むことができる。例えば、細胞クラスターは、哺乳動物種由来の細胞を含むことができ、非限定的な例としては、マウス、ウシ、類人猿、ブタ、ウマ、ヒツジ、またはヒト細胞が挙げられる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも1個の細胞はヒト細胞である。
[0393]本明細書で提供されるものには、本出願を通じて開示される細胞クラスターを含む組成物も含まれる。細胞クラスターに加えて、組成物は、細胞クラスターを対象に移植するために使用することができる足場またはマトリックスをさらに含むことができる。足場は細胞クラスターが接着する構造体を提供することができる。細胞クラスターは足場と共に対象に移植することができる。足場は生分解性であり得る。一部の場合では、足場は生分解性ポリマーを含む。生分解性ポリマーは合成ポリマー、例えば、ポリ(ラクチド)(PLA)、ポリ(グリコール酸)(PGA)、ポリ(ラクチド-co-グリコリド)(PLGA)、および他のポリヒドロキシ酸、ポリ(カプロラクトン)、ポリカーボネート、ポリアミド、ポリ無水物、ポリホスファゼン、ポリアミノ酸、ポリオルトエステル、ポリアセタール、ポリシアノアクリレート、および生分解性ポリウレタンであり得る。生分解性ポリマーはまた、天然ポリマー、例えば、アルブミン、コラーゲン、フィブリン、ポリアミノ酸、プロラミン、ならびに多糖(例えば、アルギネート、ヘパリン、および他の天然に存在する糖単位の生分解性ポリマー)であり得る。あるいは、足場は非生分解性であり得る。例えば、足場は非生分解性ポリマー、例えば、ポリアクリレート、エチレン-酢酸ビニルポリマー、および他のアシル置換酢酸セルロース、ならびにそれらの誘導体、ポリウレタン、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリフッ化ビニル、ポリ(ビニルイミダゾール)、クロロスルホン化ポリオレフィン、およびポリ酸化エチレンを含み得る。
解離した細胞の組成物および幹細胞由来ベータ細胞の細胞クラスターを作製する方法
[0394]本明細書ではさらに、内因性組織または細胞クラスター、例えば、内因性膵島の機能および特徴に類似する細胞クラスターを作製する方法が開示される。
[0395]本開示の方法は、第1の細胞クラスターを解離させるステップと、解離した細胞を第2の細胞クラスターに再凝集させるステップを含み得、ここで、第2の細胞クラスターは、第1の細胞クラスターと比較して、内因性組織または細胞クラスター、例えば、内因性膵島の機能および特徴に、より密接に類似する。「再凝集」という用語およびその文法的均等物は、本明細書で使用される場合、クラスターが解離してより小さなクラスターまたは単一細胞になり、解離した細胞が次いで新たな細胞間接点を形成し、新たなクラスターを形成することを意味し得る。本開示の方法は、a)第1の細胞クラスターから複数の細胞を解離させるステップ、およびb)培地中でa)の複数の細胞を培養し、それにより、複数の細胞に第2の細胞クラスターを形成させるステップによって、細胞クラスターをin vitroで生成するために使用され得る。場合により、第2の細胞クラスターは、in vitro細胞クラスターである。第1の細胞クラスターは、in vitro細胞クラスター、例えば、培養培地におけるin vitroの単一細胞の懸濁液によって形成されたクラスターであり得る。場合により、第1の細胞クラスターは、ex vivo細胞クラスター、例えば、生きた生物の体内で形成され、前記生物から単離された細胞クラスターであってもよい。例えば、本明細書で提供される方法が適用可能である第1の細胞クラスターは、ヒトの膵島であり得る。場合により、第1の細胞クラスターは、死体の膵島であってもよい。一部の実施形態では、解離した細胞は、以前に凍結されたものである。
[0396]本明細書で提供される方法は、細胞クラスター内の膵臓細胞、例えば、膵臓β細胞、内分泌細胞、または内分泌前駆細胞を濃縮することができる。一部の例では、本開示の方法は、幹細胞または膵臓前駆細胞を細胞クラスターから低減させるまたは排除することができる。場合により、第2の細胞クラスターは、クロモグラニンAを発現する細胞を、第1の細胞クラスターと比較してより高いパーセンテージで含む。場合により、第2の細胞クラスターは、NKX6.1およびCペプチドを発現する細胞を、第1の細胞クラスターと比較してより高いパーセンテージで含む。場合により、第2の細胞クラスターは、NKX6.1およびISL1を発現する細胞を、第1の細胞クラスターと比較してより高いパーセンテージで含む。場合により、第2の細胞クラスターは、NKX6.1およびCペプチドに対して陰性の細胞を、第1の細胞クラスターと比較してより低いパーセンテージで含む。場合により、第2の細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を、第1の細胞クラスターと比較してより低いパーセンテージで含む。場合により、第2のin vitro細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を、第1の細胞クラスターと比較してより低いパーセンテージで含む。
[0397]場合により、培地は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤およびトランスフォーミング増殖因子β(TGF-β)シグナル伝達経路阻害剤を含む。場合により、培地は、a)血清、ならびにb)甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤およびTGF-βシグナル伝達経路阻害剤のうちの一方または両方を含む。場合により、本明細書で提供されるような再凝集のための培地(再凝集培地)は、小分子化合物を含まなくてもよい。例えば、再凝集培地は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤を含まなくてもよい。場合により、再凝集培地は、トリヨードチロニン(T3)を含まないか、または微量のT3しか含まない。再凝集培地は、TGFβシグナル伝達経路阻害剤を含まなくてもよい。場合により、再凝集培地は、Alk5阻害剤(Alk5i)を含まないか、または微量のAlk5iしか含まない。
[0398]場合により、再凝集培地は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの1つまたは複数を含む。
[0399]場合により、再凝集培地は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンのうちの2つ、3つ、4つ、5つ、または6つを含む。
[0400]場合により、再凝集培地は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタメート、およびカルニチンを含む。
[0401]一部の実施形態では、本開示の方法は、細胞集団(例えば、NKX6.1陽性、ISL1陽性、インスリン陽性細胞)を、血清アルブミンタンパク質、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、THシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、エピジェネティック修飾化合物、アセチルCoA関連代謝産物、ビタミン、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、および/またはカルニチンのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、または7日(例えば、4日)の第1の期間にわたって接触させるステップを含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、第1の期間の後の細胞集団を、血清アルブミンタンパク質、アセチルCoA関連代謝産物、ビタミン、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、および/またはカルニチンのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、もしくは7日(例えば、3日)またはそれ以上の第2の期間にわたって、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、THシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、および/またはエピジェネティック修飾化合物の非存在下で接触させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、第2の期間において、第1の期間と比較して同じ濃度の血清アルブミン(例えば、0.05%のHSA)と細胞を接触させる。一部の実施形態では、第2の期間において、第1の期間と比較して高い濃度の血清アルブミンと細胞を接触させる。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ZnSOをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12をさらに含む。
[0402]一部の実施形態では、本開示の方法は、細胞集団(例えば、NKX6.1陽性、ISL1陽性、インスリン陽性細胞)を、HSA、Alk5阻害剤II、GC-1、スタウロスポリン、チアゾビビン、LDN193189、DZNEP、タウリン、アセテート、ベータヒドロキシブチレート、ビオチン、カルニチン、グルタメート、およびホルメートのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、または7日(例えば、4日)の第1の期間にわたって接触させるステップを含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、第1の期間の後の細胞集団を、HSA、タウリン、アセテート、ベータヒドロキシブチレート、ビオチン、カルニチン、グルタメート、およびホルメートのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、もしくは7日(例えば、3日)またはそれ以上の第2の期間にわたって、Alk5阻害剤II、GC-1、スタウロスポリン、チアゾビビン、LDN193189、およびDZNEPの非存在下で接触させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ZnSOをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の組成物は、DMEM/F12をさらに含む。一部の実施形態では、第2の期間において、第1の期間と比較して同じ濃度の血清アルブミン(例えば、0.05%のHSA)と細胞を接触させる。一部の実施形態では、第2の期間において、第1の期間(例えば、約0.05%)と比較して高い濃度のHSA(例えば、約1.0%)と細胞を接触させる。
[0403]一部の実施形態では、本明細書で開示される組成物および方法は、細胞が解離し、その後再凝集した後の細胞回収率または収率を向上させる。細胞回収率の増加は、生存可能細胞の数またはパーセンテージの増加を含み得る。細胞回収率の増加は、目的の集団(例えば、ISL1陽性およびNKX6.1陽性細胞、または本明細書で開示される別の集団)の数またはパーセンテージの増加を含み得る。一部の実施形態では、細胞回収率の増加は、細胞を本明細書で開示される薬剤の組合せと接触させた後に達成される。例えば、一部の実施形態では、本明細書で開示される一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタミン、グルタメート、および/またはカルニチンのうちのいずれか1つまたは複数と細胞を接触させるステップは、細胞回収率を増加させる。一部の実施形態では、細胞回収率は、薬剤と細胞を解離前に接触させる場合に増加する。一部の実施形態では、細胞回収率は、薬剤と細胞を解離後に接触させる場合に増加する。
[0404]一部の実施形態では、解離前に存在する総生存可能細胞の少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、または少なくとも60%は、再凝集後に評価される場合、例えば、解離の約1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後、または解離および凍結保存された細胞の解凍の約1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後に評価される場合、生存可能細胞として回収される。
[0405]一部の実施形態では、本開示の方法によって取得される総生存可能細胞の収率は、本明細書で開示される薬剤または薬剤の組合せを利用しない方法と比較して、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、または少なくとも5倍高い。
[0406]一部の実施形態では、本開示の方法によって取得される総生存可能細胞の収率は、例えば、解離の約1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後、または解離および凍結保存された細胞の解凍の1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後に評価される場合、再凝集後、本明細書で開示される薬剤または薬剤の組合せを利用しない方法と比較して、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、または少なくとも5倍高い。一部の実施形態では、総生存可能細胞の収率は、本開示の薬剤または薬剤の組合せと細胞をより早期のクラスターの解離前に接触させる場合に増加する。一部の実施形態では、総生存可能細胞の収率は、本開示の薬剤または薬剤の組合せと細胞をより早期のクラスターの解離後に接触させる場合に増加する。
[0407]一部の実施形態では、解離前に存在する本開示の集団の細胞(例えば、NKX6.1陽性(opositive)およびISL1陽性細胞、または本明細書で開示される別の集団)の少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、または少なくとも60%は、再凝集後に評価される場合、例えば、解離の約1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後、または解離および凍結保存された細胞の解凍の1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後に評価される場合、生存可能細胞として回収される。
[0408]一部の実施形態では、本開示の方法によって取得される本開示の集団の細胞(例えば、NKX6.1陽性(poositive)およびISL1陽性細胞、または本明細書で開示される別の集団)の収率は、本明細書で開示される薬剤または薬剤の組合せを利用しない方法と比較して、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、または少なくとも5倍高い。
[0409]一部の実施形態では、本開示の方法によって取得される本開示の集団の細胞(例えば、NKX6.1陽性およびISL1陽性細胞、または本明細書で開示される別の集団)の収率は、例えば、解離の約1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後、または解離および凍結保存された細胞の解凍の1日後、2日後、3日後、4日後、5日後、6日後、7日後、8日後、9日後、10日後、11日後、12日後、13日後、もしくは14日後に評価される場合、再凝集後、本明細書で開示される薬剤または薬剤の組合せを利用しない方法と比較して、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも2倍、少なくとも2.5倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、または少なくとも5倍高い。一部の実施形態では、収率は、薬剤または薬剤の組合せと細胞をより早期のクラスターの解離前に接触させる場合に増加する。一部の実施形態では、収率は、薬剤または薬剤の組合せと細胞をより早期のクラスターの解離後に接触させる場合に増加する。
[0410]一部の実施形態では、本明細書で開示される組成物および方法は、解離および再凝集後、NKX6.1とISL1の両方を発現するクラスター中の細胞のパーセントを増加させる。例えば、細胞クラスター中の少なくとも約10%、20%、30%、35%、38%、40%、42%、44%、46%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または99%の細胞は、本明細書で開示される解離および再凝集後、NKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約35%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約38%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約40%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約45%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の場合では、細胞クラスター中の少なくとも約50%の細胞はNKX6.1およびISL1を発現することができる。一部の実施形態では、NKX6.1とISL1の両方を発現する再凝集したクラスター中の細胞のパーセントは、本開示の薬剤または薬剤の組合せと細胞をより早期のクラスターの解離前に接触させる場合に増加する。一部の実施形態では、再凝集したクラスター中の細胞のパーセントは、本開示の薬剤または薬剤の組合せと細胞をより早期のクラスターの解離後に接触させる場合に増加する。
[0411]第1の細胞クラスターの解離は、当技術分野で知られる方法を使用して行われ得る。細胞クラスターを解離させるための非限定的で例示的な方法は、物理的な力(例えば、セルスクレーパー、ナローボアピペットによる粉砕、細針吸引、ボルテックス脱凝集、および細目ナイロンまたはステンレス鋼メッシュを通した強制濾過などの機械的解離)、トリプシン、コラゲナーゼ、TrypLE(商標)のような酵素を使用した酵素的解離など、またはそれらの組合せを含む。解離後、第1の細胞クラスターの細胞は、細胞懸濁液、例えば、単一細胞懸濁液中に存在し得る。「懸濁液」という用語は、本明細書で使用される場合、細胞が固体支持体に結合していない細胞培養条件を意味し得る。懸濁液中で増殖する細胞は、当業者に周知の装置を使用して増殖中に撹拌され得る。
[0412]一部の実施形態では、本開示は、解離した細胞を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、解離した細胞は、Ngn3陽性である。一部の実施形態では、解離した細胞は、PDX.1陽性である。一部の実施形態では、解離した細胞は、NKX6.1陽性である。一部の実施形態では、本開示は、解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびBMPシグナル伝達経路阻害剤を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189またはその誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびROCK阻害剤を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩またはその誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)および亜鉛を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、亜鉛は、ZnSOの形態にある。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびモノグリセリドリパーゼ(MGLL)阻害剤を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、JJKK048、KML29、NF1819、JW642、JZL184、JZL195、JZP361、プリスチメリン、もしくはURB602、または前出のもののうちのいずれかの誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)および脂質を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、脂質は、飽和脂肪酸である。一部の実施形態では、飽和脂肪酸は、パルミテートである。一部の実施形態では、脂質は、不飽和脂肪酸である。一部の実施形態では、不飽和脂肪酸は、オレイン酸、リノール酸、またはパルミトレイン酸である。
[0413]本明細書では、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことがあり、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことのない対応する単離されたインスリン陽性内分泌細胞集団と比較して、モノグリセリドの遊離脂肪酸に対する比の増加を呈する、単離されたインスリン陽性内分泌細胞を含む組成物が提供される。
[0414]本明細書では、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことがあり、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことのない対応する単離されたインスリン陽性内分泌細胞集団と比較して、遊離脂肪酸のモノグリセリドに対する比の減少を呈する、単離されたインスリン陽性内分泌細胞を含む組成物が提供される。
[0415]本明細書では、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことがあり、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことのない対応する単離されたインスリン陽性内分泌細胞集団と比較して、遊離脂肪酸のレベル低下を呈する、単離されたインスリン陽性内分泌細胞を含む組成物が提供される。
[0416]本明細書では、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことがあり、in vitroでモノグリセリドリパーゼ(MGLL)の発現または機能を阻害する薬剤と接触したことのない対応する単離されたインスリン陽性内分泌細胞集団と比較して、モノグリセリドのレベル上昇を呈する、単離されたインスリン陽性内分泌細胞を含む組成物が提供される。
[0417]本明細書では、インスリン陽性内分泌細胞集団およびモノグリセリドの遊離脂肪酸への変換を阻害する薬剤を含む組成物が提供される。
[0418]一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびグルタメートを含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびアセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi;例えば、β-ヒドロキシブチレート)を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびL-カルニチンを含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびグルタミン(例えば、L-グルタミン)を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびレドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)および一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびビタミン(例えば、ビオチン)を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)およびDMEM/F12を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離した細胞(例えば、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞)および亜鉛(例えば、ZnSO)を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示の組成物は、血清アルブミンタンパク質をさらに含む。一部の実施形態では、血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である。一部の実施形態では、本開示の組成物は、0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む。一部の実施形態では、組成物中の細胞の90%未満、85%未満、80%未満、75%未満、70%未満、65%未満、60%未満、55%未満、50%未満、45%未満、40%未満、35%未満、30%未満、35%未満、30%未満、25%未満、20%未満、15%未満、10%未満、5%未満、または1%未満は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、本開示の組成物は、TGF-β経路阻害剤を含む。一部の実施形態では、TGF-β経路阻害剤は、Alk5i(SB505124)またはその誘導体である。一部の実施形態では、本開示の組成物は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤を含む。一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1もしくはT3、またはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ROCK阻害剤を含む。一部の実施形態では、ROCK阻害剤は、チアゾビビンである。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤を含む。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩である。一部の実施形態では、本開示の組成物は、タンパク質キナーゼ阻害剤を含む。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンである。一部の実施形態では、本開示の組成物は、ビタミンCを含む。特定の実施形態では、本開示の組成物は、in vitroである。一部の実施形態では、本開示の組成物は、γセクレターゼ阻害剤(例えば、XXI)を含まない。一部の実施形態では、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞は、以前に凍結されたものである。
[0419]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、組成物中の細胞の少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、または少なくとも65%は、11日間のin vitro培養後に生存可能である、組成物を提供する。
[0420]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、組成物中の細胞クラスターの少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%は、直径90~140μm、90~130μm、90~120μm、90~110μm、100~140μm、100~130μm、100~120μm、100~110μmである、組成物を提供する。
[0421]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの直径を有する、組成物を提供する。
[0422]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、細胞クラスターは、最大120、最大130、最大140、最大150、最大160、または最大170μmの平均直径または直径中央値を有する、組成物を提供する。
[0423]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、細胞クラスターは、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの平均直径または直径中央値を有する、組成物を提供する。
[0424]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、150μm未満の直径を有する、組成物を提供する。
[0425]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、140μm未満の直径を有する、組成物を提供する。
[0426]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、150μm未満の直径を有する、組成物を提供する。
[0427]一部の実施形態では、本開示は、複数の細胞クラスターを含む組成物であって、細胞クラスターは、インスリン陽性細胞を含み、組成物中の細胞クラスターの少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%は、1.5~4.5、1.5~4.0、1.5~3.5、1.5~3.0、1.5~2.5、1.5~2.5、1.5~2.0、2.0~4.5、2.0~4.0、2.0~3.5、2.0~3.0、2.0~2.5、2.5~4.5、2.5~4.0、2.5~3.5、2.5~3.0、3.0~4.5、3.0~4.0、3.0~3.5、3.5~4.5、3.5~4.0、もしくは4.0~4.5のグルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)刺激指数を呈する、組成物を提供する。一部の実施形態では、細胞クラスターは、Cペプチド陽性細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは、ソマトスタチン陽性細胞を含む。一部の実施形態では、細胞クラスターは、グルカゴン陽性細胞を含む。一部の実施形態では、組成物中の細胞の少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、もしくは少なくとも65%は、11日間のin vitro培養後に生存可能である。
[0428]一部の実施形態では、組成物中の細胞クラスターの少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%は、直径90~140μm、90~130μm、90~120μm、90~110μm、100~140μm、100~130μm、100~120μm、100~110μmである。
[0429]一部の実施形態では、組成物中の細胞クラスターの少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%は、1.5~4.5、1.5~4.0、1.5~3.5、1.5~3.0、1.5~2.5、1.5~2.5、1.5~2.0、2.0~4.5、2.0~4.0、2.0~3.5、2.0~3.0、2.0~2.5、2.5~4.5、2.5~4.0、2.5~3.5、2.5~3.0、3.0~4.5、3.0~4.0、3.0~3.5、3.5~4.5、3.5~4.0、または4.0~4.5のグルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)刺激指数を呈する。一部の実施形態では、少なくとも2、3、4、5、10、50、100、1000、10000、100000、または1000000個の細胞クラスターが存在する。一部の実施形態では、本開示の組成物は、本明細書で開示されるいずれかの方法に従って調製される。一部の実施形態では、本開示は、本明細書で開示されるいずれかの細胞組成物を含むデバイスを提供する。一部の実施形態では、本開示は、長期間にわたる高い血糖レベルによって特徴付けられる疾患(例えば、糖尿病)を有する対象を処置する方法であって、本明細書で開示されるいずれかの組成物または本明細書で開示されるいずれかのデバイスを対象に投与するステップを含む方法を提供する。
[0430]一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、BMPシグナル伝達経路阻害剤と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189またはその誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、ROCK阻害剤と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩またはその誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、亜鉛と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、亜鉛は、ZnSOの形態にある。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、モノグリセリドリパーゼ(MGLL)阻害剤と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、MGLL阻害剤は、JJKK048、KML29、NF1819、JW642、JZL184、JZL195、JZP361、プリスチメリン、もしくはURB602、または前出のもののうちのいずれかの誘導体である。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、脂質と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、脂質は、飽和脂肪酸である。一部の実施形態では、飽和脂肪酸は、パルミテートである。一部の実施形態では、脂質は、不飽和脂肪酸である。一部の実施形態では、不飽和脂肪酸は、オレイン酸、リノール酸、またはパルミトレイン酸である。
[0431]一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、グルタメートと接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、L-カルニチンと接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、L-グルタミンと接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、ビタミン(例えば、ビオチン)と接触させるステップを含む方法を提供する。一部の実施形態では、本開示の方法は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、血清アルブミンタンパク質と接触させるステップを含む。一部の実施形態では、血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である。一部の実施形態では、本開示の組成物は、0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む。一部の実施形態では、組成物中の細胞の90%未満、85%未満、80%未満、75%未満、70%未満、65%未満、60%未満、55%未満、50%未満、45%未満、40%未満、35%未満、30%未満、35%未満、30%未満、25%未満、20%未満、15%未満、10%未満、5%未満、または1%未満は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、本開示の方法は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、TGF-β経路阻害剤と接触させるステップを含む。一部の実施形態では、TGF-β経路阻害剤は、Alk5i(SB505124)またはその誘導体である。一部の実施形態では、本開示の方法は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤と接触させるステップを含む。一部の実施形態では、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1もしくはT3、またはそれらの誘導体である。一部の実施形態では、本開示の方法は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、タンパク質キナーゼ阻害剤と接触させるステップを含む。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンである。一部の実施形態では、本開示の方法は、複数の解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞を、ビタミンCと接触させるステップを含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、複数の解離したインスリン陽性内分泌細胞を、γセクレターゼ阻害剤(例えば、XXI)と接触させるステップを含まない。一部の実施形態では、解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞は、以前に凍結されたものである。一部の実施形態では、本開示の方法は、1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって行われる。一部の実施形態では、本開示の方法は、解離した細胞を複数の細胞クラスターへと再凝集させる。一部の実施形態では、複数の細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約50μm~約250μm、約75μm~約250μm、または約100μm~約200μmの直径を有する。一部の実施形態では、第2の細胞集団の複数の細胞クラスターの細胞の少なくとも約40%、50%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、95%、または99%は、生存可能である。一部の実施形態では、本開示の方法は、解離した細胞を少なくとも2、3、4、5、10、50、100、1000、10000、100000、または1000000個の細胞クラスターへと再凝集させる。
[0432]一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの細胞は、少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含み、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる。一部の実施形態では、前記細胞は、少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含み、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる。一部の実施形態では、前記細胞は、少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含み、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる。一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの細胞(例えば、SC由来ベータ細胞または本明細書で開示されるいずれかのクラスターにおける細胞のいずれか)は、少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含み、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる。一部の実施形態では、前記少なくとも1つの遺伝子配列は、MHCクラスI遺伝子をコードする。一部の実施形態では、前記MHCクラスI遺伝子は、ベータ-2ミクログロブリン(B2M)、HLA-A、HLA-B、またはHLA-Cをコードする。一部の実施形態では、前記少なくとも1つの遺伝子配列は、CIITAをコードする。一部の実施形態では、本開示の細胞は、HLA-AおよびHLABをコードする遺伝子にはゲノム破壊を含むが、HLA-Cをコードする遺伝子にはゲノム破壊を含まない。一部の実施形態では、前記細胞は、ナチュラルキラー細胞活性化リガンド遺伝子にゲノム破壊を含む。一部の実施形態では、前記ナチュラルキラー細胞活性化リガンド遺伝子は、細胞間接着分子1(ICAM1)、CD58、CD155、癌胎児性抗原関連細胞接着分子1(CEACAM1)、細胞接着分子1(CADM1)、MHCクラスIポリペプチド関連配列A(MICA)、またはMHCクラスIポリペプチド関連配列B(MICB)をコードする。一部の実施形態では、本開示の細胞は、遺伝子修飾されていない細胞と比して、ベータ-2ミクログロブリン、CIITA、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DP、HLA-DQ、およびHLADRのうちの1つまたは複数の低減した発現を有する。一部の実施形態では、本開示の細胞は、遺伝子修飾されていない細胞と比して、CD47、PDL1、HLA-G、CD46、CD55、CD59およびCTLAの増加した発現を有する。特定の実施形態では、本明細書で開示される膵島細胞(例えば、SC-ベータ細胞)は、健康な対照対象からの内因性膵島細胞と比較して、PDL1の増加した発現を有する。特定の実施形態では、本明細書で開示される膵島細胞(例えば、SC-ベータ細胞)は、健康な対照対象からの内因性膵島細胞と比較して、CD47の増加した発現を有する。一部の実施形態では、ゲノム破壊は、遺伝子編集システム、例えば、CRISPR Cas技術の使用によって誘導される。
[0433]場合により、本明細書で提供される方法は、活性細胞選別プロセス、例えば、フローサイトメトリーを含まない。場合により、本明細書に記載される細胞クラスターは、未選別の細胞クラスターであり得る。場合により、本明細書で提供される方法は、第1の細胞クラスター内の特定の細胞型の濃縮または排除のために活性細胞選別に依存しない。場合により、ある方法は、第1の細胞クラスターを解離させるステップと、第1の細胞クラスターから解離した複数の細胞を培地中で培養し、それにより、第2の細胞クラスターの形成を可能にするステップとを必要とするに過ぎない。
[0434]場合により、本明細書で提供される方法は、細胞クラスターを解離させ、2回以上再凝集させるために適用され得る。例えば、本明細書で提供される方法によれば、第1の細胞クラスターを解離および再凝集させて第2の細胞クラスターを形成させることができ、第2の細胞クラスターをさらに解離および再凝集させて第3の細胞クラスターを形成させることができる、などということである。本明細書で提供されるような再凝集は、細胞クラスターに対して少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10回連続して行われ得る。
[0435]本明細書に記載される細胞選別は、細胞のサイズ、形状(形態)、表面タンパク質発現、内因性シグナルタンパク質発現の差異、またはそれらの任意の組合せに依存することにより、複数の細胞から細胞群を単離するプロセスを意味し得る。場合により、細胞選別は、細胞をフローサイトメトリーに供することを含む。フローサイトメトリーは、レーザーまたはインピーダンスに基づく生物物理学的技術であり得る。フローサイトメトリーでは、流体の流れに細胞を懸濁し、それらを電子検出装置に通すことができる。フローサイトメトリーの一種である蛍光活性化細胞選別(FACS)では、細胞の光学的特性の1つまたは複数のパラメーター(例えば、レーザー励起時の発光波長)に基づいて、フローサイトメトリーを使用し、目的の細胞を物理的に分離することによって精製することができる。本明細書に記載されるように、未選別の細胞クラスターは、活性細胞選別プロセス、例えば、フローサイトメトリーに供されていない複数の細胞によって形成された細胞クラスターであり得る。場合により「再凝集した細胞クラスター」と呼ばれる未選別の細胞クラスターは、既存の細胞クラスターから解離した複数の細胞によって形成され得、それらが新たな細胞クラスターに再凝集する前に、本明細書で提供されるような再凝集のための1つまたは複数の特定の細胞型を単離するための、活性細胞選別プロセス、例えば、フローサイトメトリーまたは他の方法は存在しない場合がある。場合により、本明細書に記述されるフローサイトメトリーは、細胞において発現される1つまたは複数のシグナルペプチドに基づき得る。例えば、細胞クラスターは、シグナルペプチド(例えば、蛍光タンパク質、例えば、緑色蛍光タンパク質(GFP)またはtdTomato)を発現する細胞を含み得る。場合により、シグナルペプチドは、細胞におけるインスリン発現を示すものとして発現される。例えば、細胞クラスターは、インスリンプロモーターの制御下のGFPをコードする外因性核酸配列を有する細胞を含み得る。インスリンプロモーターは、内因性または外因性プロモーターであり得る。場合により、これらの細胞におけるGFPの発現は、前記細胞におけるインスリンの発現を示し得る。したがって、GFPシグナルは、膵臓β細胞のマーカーであり得る。場合により、本明細書に記載される細胞選別は、異なる種類の細胞を標識するために磁性抗体または他のリガンドが使用され、磁気特性の差異が細胞選別のために使用され得る、磁気活性化フローサイトメトリーを含み得る。
[0436]第1の細胞クラスターから解離した細胞は、第2の細胞クラスターへの再凝集のための培地中で培養され得る。培地は、Connought Medical Research Laboratories 1066補充膵島培地(CMRLS)を含み得る。場合により、好適な培養培地は、CMRLSの成分(例えば、補助的な亜鉛)を含む。CMRLSには、例えば、血清(例えば、ヒト血清、ヒト血小板溶解物、ウシ胎仔血清、またはKnockout Serum Replacementなどの血清代替物)が補充されていてもよい。
[0437]培地は、細胞におけるある特定のシグナル伝達経路を調節する1つまたは複数の化合物を含み得る。例えば、培地は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、トランスフォーミング増殖因子β(TGF-β)シグナル伝達経路阻害剤、またはそれらの両方を含み得る。
[0438]本明細書で使用される培地中の甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、トリヨードチロニン(T3)であり得る。場合により、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、T3のアナログまたは誘導体であり得る。T3の非限定的で例示的なアナログとしては、選択的および非選択的チロミメティック、TRβ選択的アゴニストGC-1、GC-24,4-ヒドロキシ-PCB 106、MB07811、MB07344,3,5-ジヨードチロプロピオン酸(DITPA);選択的TR-βアゴニストGC-1;3-ヨードチロナミン(T(1)AM)および3,3’,5-トリヨードチロ酢酸(Triac)(ホルモンチロキシン(T(4))の生物活性代謝産物;KB-2115およびKB-141;チロナミン;SKF L-94901;DIBIT;3’-AC-T2;テトラヨードチロ酢酸(Tetrac)およびトリヨードチロ酢酸(Triac)(チロキシン(T4)およびトリヨードチロニン(T3)アラニン鎖の酸化的脱アミノ化および脱カルボキシル化による)、3,3’,5’-トリヨードチロニン(rT3)(T4およびT3の脱ヨウ素化による)、3,3’-ジヨードチロニン(3,3’-T2)および3,5-ジヨードチロニン(T2)(T4、T3、およびrT3の脱ヨウ素化による)、ならびに3-ヨードチロナミン(T1AM)およびチロナミン(T0AM)(T4およびT3の脱ヨウ素化ならびにアミノ酸の脱カルボキシル化による)、ならびにTH構造的アナログ、例えば3,5,3’-トリヨードチロプロピオン酸(Triprop)、3,5-ジブロモ-3-ピリダジノン-1-チロニン(L-940901)、N-[3,5-ジメチル-4-(4’-ヒドロキシ-3’-イソプロピルフェノキシ)-フェニル]-オキサミン酸(CGS 23425)、3,5-ジメチル-4-[(4’-ヒドロキシ-3’-イソプロピルベンジル)-フェノキシ]酢酸(GC-1)、3,5-ジクロロ-4-[(4-ヒドロキシ-3-イソプロピルフェノキシ)フェニル]酢酸(KB-141)、および3,5-ジヨードチロプロピオン酸(DITPA)が挙げられる。場合により、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、T4甲状腺ホルモン(例えば、チロキシンまたはL-3,5,3’,5’-テトラヨードチロニン)などのT3のプロドラッグまたはプロホルモンである。甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,163,918号に記載されているヨードチロニン組成物であってもよい。
[0439]培地中の甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤の濃度は、細胞凝集に好適な範囲内であり得る。場合により、培地中の甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤の濃度は、約0.1μM~約10μM、例えば約0.5μM~約2μM、約0.8μM~約1.5μM、約0.9μM~約1.5μM、約0.9μM~約1.2μM、または約0.9μM~約1.2μMである。場合により、培地中の甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤の濃度は、少なくとも約0.1μM、0.2μM、0.4μM、0.8μM、0.9μM、1μM、1.1μM、1.2μM、1.3μM、1.4μM、1.5μM、2μM、3μM、4μM、5μM、6μM、7μM、8μM、9μM、または10μMである。場合により、培地中の甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤(例えば、T3)の濃度は、約1μMである。
[0440]本明細書における培地中で使用されるTGF-βシグナル伝達経路阻害剤は、TGF-β受容体I型キナーゼ(TGF-β RI)シグナル伝達阻害剤であり得る。TGF-βシグナル伝達経路阻害剤は、アクチビン受容体様キナーゼ-5(Alk5)阻害剤、例えば、ALK5阻害剤II(CAS 446859-33-2、TGF-β RIキナーゼのATP競合阻害剤、別称RepSox、IUPAC名:2-[5-(6-メチルピリジン-2-イル)-1H-ピラゾール-4-イル]-1,5-ナフチリジン)であり得る。場合により、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤は、ALK5阻害剤IIのアナログまたは誘導体であり、全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第2012/0021519号、同第2010/0267731号、同第2009/0186076号、および同第2007/0142376号に記載されているものを含む。場合により、本明細書における培地中で使用され得るTGF-βシグナル伝達経路阻害剤の例としては、D 4476、SB431542、A-83-01、別称3-(6-メチル-2-ピリジニル)-N-フェニル-4-(4-キノリニル)-1H-ピラゾール-1-カルボチオアミド;2-(3-(6-メチルピリジン-2-イル)-1H-ピラゾール-4-イル)-1,5-ナフチリジン、Wnt3a/BIO、BMP4、GW788388(-(4-[3-(ピリジン-2-イル)-1H-ピラゾール-4-イル]ピリジン(pyridm)-2-イル}-N-(テトラヒドロ-2H-ピラン-4-イル)ベンズアミド)、SMI 6、ΓΝ-1130(3-((5-(6-メチルピリジン-2-イル)-4-(キノキサリン-6-イル)-1H-イミダゾール-2-イル)メチル)ベンズアミド、GW6604(2-フェニル-4-(3-ピリジン-2-イル-1H-ピラゾール-4-イル)ピリジン)、SB-505124(2-(5-ベンゾ[1,3]ジオキソール-5-イル-2-tert-ブチル-3H-イミダゾール-4-イル)-6-メチルピリジン塩酸塩)、SU5416、レルデリムマブ(CAT-152)、メテリムマブ(CAT-192)、GC-1008、ID1 1、AP-12009、AP-1 1014、LY550410、LY580276、LY364947、LY2109761、SD-208、SM16、NPC-30345、ΚI26894、SB-203580、SD-093、ALX-270-448、EW-7195、SB-525334、ΓΝ-1233、SKI2162、Gleevec、3,5,7,2’,4’-ペンタヒドロキシフラボン(pentahydroxyfiavone)(Morin)、アクチビン-M108A、P144、可溶性TBR2-Fc、ピリミジン誘導体およびインドリノンも挙げられる。TGF-β/アクチビン経路の阻害は同様の効果を有し得る。したがって、TGF-β/アクチビン経路の任意の阻害剤(例えば、上流または下流)が、本明細書に記載されるTGF-β/ALK5阻害剤との組合せで、またはその代わりに使用され得る。例示的なTGF-β/アクチビン経路阻害剤としては、TGF-β受容体阻害剤、SMAD 2/3リン酸化の阻害剤、SMAD 2/3とSMAD 4との相互作用の阻害剤、ならびにSMAD 6およびSMAD 7の活性化剤/アゴニストが挙げられるが、これらに限定されない。さらに、本明細書に記載されるカテゴリー分類は、体系化を目的とするものに過ぎず、当業者には、化合物が経路内の1つまたは複数の点で作用し得るため、化合物が定義されたカテゴリーのうちの2つ以上で機能し得ることが分かるであろう。TGF-β受容体阻害剤は、任意の一般的なTGFシグナル伝達阻害剤またはTGF-β受容体(例えば、ALK5)阻害剤に特異的な阻害剤を含み得、これは、TGF-β受容体に対する抗体、TGF-β受容体のドミナントネガティブバリアント、ならびにTGF-β受容体の発現を抑制するsiRNAおよびアンチセンス核酸を含み得る。
[0441]培地中のTGF-βシグナル伝達経路阻害剤の濃度は、細胞凝集に好適な範囲内であり得る。場合により、培地中のTGF-βシグナル伝達経路阻害剤の濃度は、約1μM~約50μM、例えば約5μM~約15μM、約8μM~約12μM、または約9μM~約11μMである。場合により、培地中のTGF-βシグナル伝達経路阻害剤の濃度は、少なくとも約1μM、5μM、8μM、9μM、10μM、11μM、12μM、13μM、14μM、15μM、20μM、25μM、30μM、35μM、40μM、45μM、または50μMである。場合により、培地中のTGF-βシグナル伝達経路阻害剤(例えば、Alk5阻害剤II)の濃度は、約10μMである。
[0442]第1の細胞クラスターから解離した細胞を培養するために使用される培地は、ゼノフリーであり得る。動物に起源を有する細胞および/または細胞クラスターを培養するためのゼノフリー培地は、他の動物に由来する生成物を有し得ない。場合により、ヒト細胞および/または細胞クラスターを培養するためのゼノフリー培地は、いかなる非ヒト動物由来の生成物も有し得ない。例えば、ヒト細胞および/または細胞クラスターを培養するためのゼノフリー培地は、ウシ胎仔血清(FBS)の代わりにヒト血小板溶解物(PLT)を含み得る。例えば、培地は、約1%~約20%、約5%~約15%、約8%~約12%、約9~約11%の血清を含み得る。場合により、培地は、約10%の血清を含み得る。場合により、培地は、小分子および/またはFBSを含まなくてもよい。例えば、培地は、2%のBSAが補充されたMCDB131基礎培地を含み得る。場合により、培地は血清を含まない。一部の例では、培地は、外因性小分子またはシグナル伝達経路アゴニストもしくはアンタゴニスト、例えば、線維芽細胞増殖因子ファミリーからの増殖因子(FGF、例えばFGF2、FGF8B、FGF 10、またはFGF21)、ソニックヘッジホッグアンタゴニスト(例えばSant1、Sant2、Sant 4、Sant4、Cur61414、フォルスコリン、トマチジン、AY9944、トリパラノール、シクロパミン、またはそれらの誘導体)、レチノイン酸シグナル伝達アゴニスト(例えば、レチノイン酸、CD1530、AM580、TTHPB、CD437、Ch55、BMS961、AC261066、AC55649、AM80、BMS753、タザロテン、アダパレン、またはCD2314)、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)の阻害剤(例えば、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、または14-1152)、タンパク質キナーゼC(PKC)の活性化剤(例えば、ホルボール12,13-ジブチレート(PDBU)、TPB、ホルボール12-ミリステート13-アセテート、ブリオスタチン1、またはそれらの誘導体)、TGFベータスーパーファミリーのアンタゴニスト(例えば、Alk5阻害剤II(CAS 446859-33-2)、A83-01、SB431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB505124、GW6604、SB-525334、SD-208、SB-505124、またはそれらの誘導体)、骨形成タンパク質(BMP)1型受容体の阻害剤(例えば、LDN193189またはそれらの誘導体)、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤(例えば、T3またはそれらの誘導体)、ガンマ-セクレターゼ阻害剤(例えば、XXI、DAPT、またはそれらの誘導体)、上皮増殖因子(EGF)ファミリー(例えば、ベータセルリンまたはEGF)からのTGF-βシグナル伝達経路(例えば、WNT3aまたはアクチビンA)増殖因子の活性化剤、広域キナーゼ(例えば、スタウロスポリンまたはその誘導体)、非必須アミノ酸、ビタミンもしくは抗酸化剤(例えば、シクロパミン、ビタミンD、ビタミンC、ビタミンA、またはそれらの誘導体)、またはN-アセチルシステイン、硫酸亜鉛、もしくはヘパリンのような他の添加物を含まなくてもよい。場合により、再凝集培地は、外因性細胞外基質分子を含まなくてもよい。場合により、再凝集培地は、Matrigel(商標)を含まない。場合により、再凝集培地は、他の細胞外基質分子または物質、例えば、コラーゲン、ゼラチン、ポリ-L-リシン、ポリ-D-リシン、ビトロネクチン、ラミニン、フィブロネクチン、PLOラミニン、フィブリン、トロンビン、およびRetroNectin、ならびにそれらの混合物など、または溶解細胞膜調製物を含まない。
[0443]当業者は、培地に補充されるBSAの濃度が様々であり得ることを理解するであろう。例えば、培地(例えば、MCDB131)は、約0.01%、0.05%、0.1%、1%、約2%、約3%、約4%、約5%、約10%、または約15%のBSAを含み得る。使用される培地(例えば、MCDB131培地)は、微量元素、プトレッシン、アデニン、チミジン、ならびにより高いレベルのいくつかのアミノ酸およびビタミンなど、従来の基礎培地には見出されない成分を含み得る。これらの添加は、培地に非常に低いレベルの血清または規定の成分が補充されることを可能にし得る。培地は、タンパク質および/または増殖因子を含まなくてもよく、EGF、ヒドロコルチゾン、および/またはグルタミンが補充されていてもよい。
[0444]培地は、1つまたは複数の細胞外基質分子(例えば、細胞外タンパク質)を含み得る。培地中で使用される非限定的で例示的な細胞外基質分子は、コラーゲン、胎盤マトリックス、フィブロネクチン、ラミニン、メロシン、テネイシン、ヘパリン、ヘパリン硫酸、コンドロイチン硫酸、デルマタン硫酸、アグレカン、バイグリカン、トロンボスポンジン、ビトロネクチン、およびデコリンを含み得る。場合により、培地は、LN-332などのラミニンを含む。場合により、培地は、ヘパリンを含む。
[0445]培地は、例えば、培地中の細胞に最適な環境を提供するために、培養中定期的に変更され得る。再凝集のために第1の細胞クラスターから解離した細胞を培養する場合、培地は、少なくともまたは約4時間、12時間、24時間、48時間、3日または4日おきに変更され得る。例えば、培地は、約48時間おきに変更され得る。
[0446]第1の細胞クラスターから解離した細胞は再凝集のために容器に播種することができる。播種密度は、再凝集する第2の細胞クラスターのサイズと相関し得る。播種密度は、第2の細胞クラスターのサイズが内因性膵島と類似し得るように制御することができる。一部の場合では、播種密度は、第2の細胞クラスターのサイズが約75μm~約250μmとなり得るように制御される。第1の細胞クラスターから解離した細胞は、1mL当たり約10万個~1mL当たり約1000万個、例えば、1mL当たり約50万個~1mL当たり約150万個、1mL当たり約80万個~1mL当たり約120万個、1mL当たり約90万個~1mL当たり約110万個、1mL当たり約200万個~1mL当たり約300万個の密度で播種することができる。一部の場合では、第1の細胞クラスターから解離した細胞は1mL当たり約100万個の密度で播種することができる。一部の場合では、第1の細胞クラスターから解離した細胞は1mL当たり約150万個の密度で播種することができる。一部の場合では、第1の細胞クラスターから解離した細胞は1mL当たり約200万個の密度で播種することができる。一部の場合では、第1の細胞クラスターから解離した細胞は1mL当たり約250万個の密度で播種することができる。一部の場合では、第1の細胞クラスターから解離した細胞は1mL当たり約300万個の密度で播種することができる。
[0447]第1の細胞クラスターから解離した細胞は培養容器で培養することができる。培養容器は、細胞の培養の懸濁液を培養するのに好適であり得る。本明細書の細胞または細胞クラスターを培養するために使用される培養容器としては、これらに限定されないが、内部で細胞を培養することができる限り、フラスコ、組織培養フラスコ、皿、ペトリ皿、組織培養皿、マルチディッシュ、マイクロプレート、マイクロウェルプレート、マルチプレート、マルチウェルプレート、マイクロスライド、チャンバースライド、管、トレイ、培養バッグ、およびローラーボトル、撹拌槽バイオリアクター、またはポリマー(例えば、バイオポリマーもしくはゲル)封入を挙げることができる。細胞および/または細胞クラスターは、培養の必要に応じて、少なくとももしくは約0.2ml、0.5ml、1ml、5ml、10ml、20ml、30ml、40ml、50ml、100ml、150ml、200ml、250ml、300ml、350ml、400ml、450ml、500ml、600ml、800ml、1000ml、1500ml、2000ml、3000ml、またはこれらにおける導出可能な任意の範囲の容量で培養することができる。
[0448]一部の場合では、細胞は、動的条件下(例えば、細胞が、浮遊培養の間、一定の運動または撹拌を受ける条件下)で培養することができる。細胞の動的培養においては、細胞は、制御装置に接続することができ、したがって制御された培養系をもたらすことができる容器(例えば、非接着容器、例えばスピナーフラスコ(例えば、200ml~3000ml、例えば250ml;100ml;または125mlエルレンマイヤーの)で培養することができる。一部の場合では、細胞は、その増殖能力を保存すると同時に、非動的条件下(例えば、静置培養)で培養することができる。細胞の非動的培養においては、細胞は接着培養容器で培養することができる。接着培養容器は、細胞外基質(ECM)等の、細胞に対する容器表面の接着性を向上させる細胞接着のための任意の基質を用いてコーティングすることができる。細胞接着のための基質は、幹細胞またはフィーダー細胞(使用される場合)を付着させることが意図される任意の材料であり得る。細胞接着のための基質としては、コラーゲン、ゼラチン、ポリ-L-リシン、ポリ-D-リシン、ビトロネクチン、ラミニン、フィブロネクチン、PLOラミニン、フィブリン、トロンビン、およびRetroNectin、ならびにそれらの混合物、例えばMatrigel(商標)および溶解細胞膜調製物が挙げられる。
[0449]動的細胞培養容器(例えば、スピナーフラスコ)中の培地は撹拌することができる(例えば、撹拌機によって)。回転速度は、再凝集する第2の細胞クラスターのサイズと相関し得る。回転速度は、第2の細胞クラスターのサイズが内因性膵島と類似し得るように制御することができる。一部の場合では、回転速度は、第2の細胞クラスターのサイズが約75μm~約250μmとなり得るように制御される。動的細胞培養容器(例えば、スピナーフラスコ)の回転速度は、約20回転毎分(rpm)~約100rpm、例えば、約30rpm~約90rpm、約40rpm~約60rpm、約45rpm~約50rpmであり得る。一部の場合では、回転速度は約50rpmであり得る。
[0450]第1の細胞クラスターから解離した細胞は、細胞が再凝集することを可能にする期間にわたって培養することができる。第1の細胞クラスターから解離した細胞は、少なくとも12時間、24時間、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日 8日、9日 10日、15日、20日、25日、または30日間にわたって培養することができる。一部の場合では、第1の細胞クラスターから解離した細胞は少なくとも4日間にわたって培養することができる。
[0451]本明細書の方法はまた、内因性細胞に類似する細胞、例えば細胞クラスター中の内因性成熟膵β細胞を濃縮するために使用することができる。方法は、第1の細胞クラスターを解離させるステップ、および第1のクラスターからの細胞を第2のクラスターに再凝集させるステップを含むことができる。第2のクラスターは、第1のクラスターと比較して、内因性成熟膵β細胞に類似する細胞をより多く含むことができる。解離させるステップおよび再凝集させるステップは、本出願を通じて開示される任意の方法および試薬を使用して行うことができる。
[0452]再凝集後、第2の細胞クラスターは、第1の細胞クラスターと比較して、内因性細胞の1つまたは複数のマーカーを発現する細胞をより多く含むことができる。例えば、第2のクラスターは、第1の細胞クラスターと比較して、内因性成熟膵β細胞の1つまたは複数のマーカー、すなわち、インスリン、Cペプチド、PDX1、NKX6.1、CHGA、MAFA、ZNT8、PAX6、NEUROD1、グルコキナーゼ(GCK)、SLC2A、PCSK1、KCNJ11、ABCC8、SLC30A8、SNAP25、RAB3A、GAD2、およびPTPRNを含むマーカーを発現する細胞をより多く含むことができる。一部の場合では、第2のクラスターはCHGAを発現する細胞をより多く含むことができる。一部の場合では、第2のクラスターはNKX6.1を発現する細胞をより多く含むことができる。一部の場合では、第2のクラスターはCペプチドを発現する細胞をより多く含むことができる。一部の場合では、第2のクラスターはNKX6.1およびCペプチドを発現する細胞をより多く含むことができる。一部の場合では、第2のクラスターはCHGA、NKX6.1、およびCペプチドを発現する細胞をより多く含むことができる。
[0453]再凝集後、第2の細胞クラスターは、第1の細胞クラスターと比較して、より小さいサイズ(例えば、より小さい直径)を有し得る。より小さいサイズは、細胞クラスターと周囲環境との間のより良好な分子交換を可能にし得る。例えば、より小さいサイズは、培地から細胞クラスター中の細胞への分子(例えば、試薬、気体、および/または栄養)のより良好な拡散を可能にし得る。したがって、より小さいサイズである場合、第2の細胞クラスターは、第1の細胞クラスターと比較して、より効率的に分子を周囲環境と交換することができる。したがって、第2の細胞クラスターは、第1の細胞クラスターと比較して、より少ない死細胞(例えば、不十分な栄養および/または気体のために死んだ細胞)を有し得る。
[0454]本明細書で提供される方法は、内分泌細胞、例えばクロモグラニンA(CHGA)を発現する細胞を濃縮することができる。例えば、クロモグラニンAを発現する第2の細胞クラスター中の細胞のパーセンテージは、クロモグラニンAを発現する第1の細胞クラスター中の細胞のパーセンテージの少なくとも1.2、少なくとも1.3、少なくとも1.4、または少なくとも1.5倍である。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、CHGAを発現する細胞を少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約99%、または100%含む。一部の場合では、第2の細胞クラスター中の少なくとも約85%の細胞はCHGAを発現することができる。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、CHGAを発現する細胞を約90%含むことができる。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、CHGAを発現する細胞を約95%含むことができる。ある特定の場合では、第2の細胞クラスター中の全ての細胞はCHGAを発現することができる。
[0455]本明細書で提供される方法は膵β細胞を生成または濃縮することができる。例えば、第2の細胞クラスターは少なくとも1個の膵β細胞、例えば少なくとも1個の非天然膵β細胞を含む。例えば、NKX6.1とCペプチドの両方を発現する第2の細胞クラスター中の細胞のパーセンテージは、NKX6.1とCペプチドの両方を発現する第1の細胞クラスター中の細胞のパーセンテージの少なくとも1.5、少なくとも1.75、または少なくとも2倍である。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、NKX6.1およびCペプチドを発現する細胞を少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約99%、または100%含む。一部の場合では、第2の細胞クラスター中の少なくとも約35%の細胞はNKX6.1およびCペプチドを発現することができる。一部の場合では、細胞クラスターは、NKX6.1およびCペプチドを発現する細胞を約60%含むことができる。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、NKX6.1およびCペプチドを発現する細胞を約75%含むことができる。一部の場合では、第2の細胞クラスター中の全ての細胞はNKX6.1およびCペプチドを発現することができる。一部の場合では、第2の細胞クラスター中の少なくとも1個の非天然膵β細胞の少なくとも約70%は、フローサイトメトリーによって測定されるクロモグラニンAを発現する。一部の場合では、第2の細胞クラスター中の少なくとも1個の非天然膵β細胞の少なくとも約25%はフローサイトメトリーによって測定されるNKX6.1およびCペプチドを発現する。
[0456]本明細書で提供される方法は、膵内分泌細胞の幹細胞または先駆細胞を減少するかまたは取り除くことができる。一部の場合では、SOX2を発現する第2の細胞クラスター中の細胞のパーセンテージは、LIN28、Ki67、SOX2、またはSOX9を発現する第1の細胞クラスター中の細胞のパーセンテージの2分の1、3分の1、5分の1、または10分の1以下である。例えば、第2の細胞クラスターは、LIN28を発現する細胞を最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。一部の例では、本明細書で提供される第2の細胞クラスターは、Ki67を発現する細胞を最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約5%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。例えば、第2の細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を最大3%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約1%含み得る。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約0.6%含み得る。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約0.3%含み得る。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、SOX2を発現する細胞を約0.1%含み得る。例えば、第2の細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を最大10%、最大約8%、最大約6%、最大約5%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、最大約0.1%、最大約0.05%、最大約0.01%含むか、または全く含まない可能性がある。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を約2%含み得る。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を約6%含み得る。一部の場合では、第2の細胞クラスターは、SOX9を発現する細胞を約1.2%含み得る。
[0457]第2の細胞クラスターはまた、第1の細胞クラスターと比較して、内因性膵島とより類似して機能し得る。第2の細胞クラスターは、第1の細胞クラスターよりも高いインスリン含量、例えば第1の細胞クラスターと比較して少なくとも1.1、少なくとも1.25、または少なくとも1.5倍のインスリン含量を有し得る。第2のクラスターは、刺激指数によって測定されるように、第1の細胞クラスターよりも大きいin vitro GSISを呈することができる。第2のクラスターはまた、刺激指数によって測定されるように、第1の細胞クラスターよりも大きいin vivo GSISを呈することができる。一部の場合では、第2のクラスターは、刺激指数によって測定されるように、第1の細胞クラスターと比較してより大きいin vitro GSISおよびより大きいin vivo GSISを呈することができる。例えば、第2の細胞クラスターは、同じ刺激条件下で第1の細胞クラスターよりも多いインスリンを分泌することができる。第2の細胞クラスターはまた、カリウム負荷(K)、例えばKClの濃度、例えば30mMのKClに対するインスリン分泌応答を呈することができる。
[0458]一部の場合では、本明細書で提供される方法は、第1の細胞クラスター由来の細胞、例えば、膵β細胞または内分泌細胞の大部分を第2の細胞クラスター中に保持することができる。例えば、第1の細胞クラスター中の、NKX6.1とCペプチドの両方を発現する細胞の少なくとも約95%、少なくとも約98%、または少なくとも約99%は、第2のin vitro細胞クラスター中に保持され得る。一部の場合では、第1の細胞クラスター中のNKX6.1とCペプチドの両方を発現する細胞の最大約5%、最大約2%、最大約1%、最大約0.5%、または最大約0.1%は、解離および再凝集プロセスの間に失われる。
[0459]一部の実施形態では、本明細書で提供される方法は、安定性または貯蔵寿命が増加したSC-β細胞集団を提供する。例えば、一部の実施形態では、本開示の方法は、4日間、7日間、または10日間の培養後に、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも20%、少なくとも35%、少なくとも38%、少なくとも40%、少なくとも45%、または少なくとも50%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団を提供する。
[0460]一部の実施形態では、本明細書で開示される薬剤の組合せと細胞を接触させることに基づいて達成される安定性の増加。例えば、一部の実施形態では、本明細書で開示される一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタミン、グルタメート、および/またはカルニチンのうちのいずれか1つまたは複数と細胞を接触させるステップは、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、または14日後に、細胞培養培地中のISL1陽性およびNKX6.1陽性の細胞の数または相対的割合を増加させる。
[0461]一部の場合では、本明細書に記載される細胞クラスターは任意の出発細胞集団からin vitroで生成される。例えば、出発細胞としては、限定されないが、インスリン陽性内分泌細胞(例えば、クロモグラニンA陽性細胞)またはその任意の先駆体、例えば、Nkx6.1陽性膵臓前駆細胞、Pdx1陽性膵臓前駆細胞、および多能性幹細胞、胚性幹細胞、および人工多能性幹細胞(stern cell)を挙げることができる。一部の場合では、方法は、初期化細胞、部分初期化細胞(例えば、人工多能性細胞とそれが由来する体細胞との間の中間状態で存在するような部分的に初期化された体細胞、例えば線維芽細胞)、分化転換細胞の分化を含む。一部の場合では、本明細書に開示される膵β細胞を含む細胞クラスターは、インスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体からin vitroで分化することができる。一部の場合では、膵β細胞を含む細胞クラスターは、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞、Pdx1陽性膵臓前駆細胞、および多能性幹細胞からなる群から選択される先駆体からin vitroで分化する。一部の場合では、多能性幹細胞は、胚性幹細胞および人工多能性幹細胞からなる群から選択される。上で論じたように、非天然膵β細胞はまた、幹細胞からin vitroで得ることができる場合、幹細胞由来β細胞(SC-β細胞)と称される場合がある。一部の場合では、SC-β細胞またはSC-β細胞が由来する多能性幹細胞はヒト細胞である。一部の場合では、SC-β細胞はヒト細胞である。
[0462]本開示の一態様は非天然膵β細胞を生成する方法を提供する。一部の場合では、方法は、任意の現在利用可能なプロトコール、例えば、それぞれの全体が本明細書に組み込まれる米国特許出願第14/684,129号、同第14/684,101号、同第17/390,839号、および同第17/390,839号(例えば、実施例1のバージョンA)に記載されているものであり得る。本開示の複数の態様は胚体内胚葉細胞を伴う。本明細書で使用される胚体内胚葉細胞は、任意の供給源から得ることも、任意の好適なプロトコールに従って生成することもできる。一部の態様では、多能性幹細胞、例えばiPSCまたはhESCは内胚葉細胞に分化する。一部の態様では、内胚葉細胞(ステージ1)は、例えば、原始腸管細胞(ステージ2)、Pdx1陽性膵臓前駆細胞(ステージ3)、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞(ステージ4)、またはNgn3陽性内分泌前駆細胞もしくはインスリン陽性内分泌細胞(ステージ5)にさらに分化し、続いて、SC-β細胞(ステージ6)に誘導されるかまたは成熟する。
[0463]一部の場合では、胚体内胚葉細胞は、集団中の少なくとも一部の多能性細胞を胚体内胚葉細胞へと分化させることによって、例えば、多能性細胞集団を、i)TGF-βスーパーファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、およびii)WNTシグナル伝達経路活性化剤と接触させて、少なくとも一部の多能性細胞の胚体内胚葉細胞への分化を誘導することによって取得することができ、ここで、胚体内胚葉細胞は胚体内胚葉に特徴的な少なくとも1つのマーカーを発現する。
[0464]多能性幹細胞を誘導して胚体内胚葉細胞へと分化させることができる(例えば、単独で、またはWNTシグナル伝達経路活性化剤と組み合わせて)、TGF-βスーパーファミリーからの任意の増殖因子を本明細書で提供される方法に使用することができる。一部の場合では、TGF-βスーパーファミリーからの少なくとも1つの増殖因子はアクチビンAを含む。一部の場合では、TGF-βスーパーファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は増殖分化因子8(GDF8)を含む。多能性幹細胞を誘導して胚体内胚葉細胞へと分化させることができる(例えば、単独で、またはTGF-βスーパーファミリーからの増殖因子と組み合わせて)、いかなるWNTシグナル伝達経路活性化剤も本明細書で提供される方法に使用することができる。一部の場合では、WNTシグナル伝達経路活性化剤はCHIR99021を含む。一部の場合では、WNTシグナル伝達経路活性化剤はWnt3a組換えタンパク質を含む。
[0465]一部の場合では、集団中の少なくとも一部の多能性細胞を胚体内胚葉細胞へと分化させることは、多能性細胞集団を、i)アクチビンA、およびii)CHIR99021と3日の期間にわたって接触させて、集団中の少なくとも一部の多能性細胞の胚体内胚葉細胞への分化を誘導するプロセスによって達成され、ここで、胚体内胚葉細胞は胚体内胚葉に特徴的な少なくとも1つのマーカーを発現する。一部の場合では、集団中の少なくとも一部の多能性細胞を胚体内胚葉細胞へと分化させるステップは、多能性細胞集団を、i)アクチビンA、およびii)CHIR99021と1日間接触させ、続いて、集団をアクチビンA(CHIR99021の非存在下で)と2日間接触させるプロセスによって達成される。
[0466]一部の場合では、本明細書に開示される方法によって生成される胚体内胚葉細胞は、Nodal、Tmprss2、Tmem30b、St14、Spink3、Sh3g12、Ripk4、Rab1S、Npnt、Clic6、CldnS、Cacna1b、Bnip1、Anxa4、Emb、FoxA1、Sox17、およびRbm35aからなる群から選択される少なくとも1つのマーカーを発現し、ここで、少なくとも1つのマーカーの発現は、胚体内胚葉細胞において、それが由来する多能性幹細胞と比して統計的に有意な量だけ上方調節される。一部の場合では、本明細書に開示される方法によって生成される胚体内胚葉細胞は、Gata4、SPARC、AFP、およびDab2からなる群から選択される少なくとも1つのマーカーを、胚体内胚葉細胞が由来する多能性幹細胞と比して統計的に有意な量ほどは発現しない。一部の場合では、本明細書に開示される方法によって生成される胚体内胚葉細胞は、Zic1、Pax6、Flk1、およびCD31からなる群から選択される少なくとも1つのマーカーを、胚体内胚葉細胞が由来する多能性幹細胞と比して統計的に有意な量ほどは発現しない。一部の場合では、本明細書に開示される方法によって生成される胚体内胚葉細胞は、それが由来する多能性幹細胞と比して統計的に有意な量だけ高いレベルのSmad2のリン酸化を有する。一部の場合では、本明細書に開示される方法によって生成される胚体内胚葉細胞はin vivoで腸管を形成する能力を有する。一部の場合では、本明細書に開示される方法によって生成される胚体内胚葉細胞は、腸細胞に特徴的な形態を有する細胞へと分化することができ、ここで、腸細胞に特徴的な形態を有する細胞はFoxA2および/またはClaudin6を発現する。一部の場合では、本明細書に開示される方法によって生成される胚体内胚葉細胞は内胚葉起源の細胞へとさらに分化することができる。
[0467]一部の場合では、多能性幹細胞集団は、任意の分化前または分化の第1のステージの間に少なくとも1つのβ細胞成熟因子の存在下で培養される。任意の多能性幹細胞、例えば、ヒト多能性幹細胞、またはヒトiPS細胞、または本明細書で論じられる多能性幹細胞もしくは他の好適な多能性幹細胞のいずれかを使用することができる。一部の場合では、本明細書に記載されるβ細胞成熟因子は、多能性幹細胞集団の培養培地に存在し得るか、または多能性幹細胞集団の成長(例えば、複製もしくは増幅)中にボーラスでもしくは定期的に添加されてもよい。ある特定の例では、多能性幹細胞集団は、任意の分化前に少なくとも1つのβ細胞成熟因子に曝露され得る。他の例では、多能性幹細胞集団は、分化の第1のステージの間に少なくとも1つのβ細胞成熟因子に曝露されてもよい。
[0468]本開示の複数の態様は原始腸管細胞を伴う。本明細書で使用される原始腸管細胞は、任意の供給源から得ることも、任意の好適なプロトコールに従って生成することもできる。一部の態様では、胚体内胚葉細胞は原始腸管細胞に分化する。一部の態様では、原始腸管細胞は、例えば、Pdx1陽性膵臓前駆細胞、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞、Ngn3陽性内分泌前駆細胞、インスリン陽性内分泌細胞にさらに分化し、続いて、SC-β細胞に誘導されるかまたは成熟する。
[0469]一部の場合では、原始腸管細胞は、集団中の少なくとも一部の胚体内胚葉細胞を原始腸管細胞へと分化させることによって、例えば、胚体内胚葉細胞を線維芽細胞増殖因子(FGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子と接触させて、少なくとも一部の胚体内胚葉細胞の原始腸管細胞への分化を誘導することによって取得することができ、ここで、原始腸管細胞は原始腸管細胞に特徴的な少なくとも1つのマーカーを発現する。
[0470]胚体内胚葉細胞を誘導して原始腸管細胞へと分化することができる(例えば、単独で、または他の因子と組み合わせて)、FGFファミリーからの任意の増殖因子を本明細書で提供される方法に使用することができる。一部の場合では、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は角化細胞増殖因子(KGF)を含む。一部の場合では、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子はFGF2を含む。一部の場合では、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子はFGF8Bを含む。一部の場合では、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子はFGF10を含む。一部の場合では、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子はFGF21を含む。
[0471]一部の場合では、原始腸管細胞は、集団中の少なくとも一部の胚体内胚葉細胞を原始腸管細胞へと分化させることによって、例えば、胚体内胚葉細胞をKGFと2または3日間にわたって接触させて、少なくとも一部の胚体内胚葉細胞の原始腸管細胞への分化を誘導することによって取得することができる。
[0472]本開示の複数の態様はPdx1陽性膵臓前駆細胞を伴う。本明細書で使用されるPdx1陽性膵臓前駆細胞は、任意の供給源から得ることも、任意の好適なプロトコールに従って生成することもできる。一部の態様では、原始腸管細胞はPdx1陽性膵臓前駆細胞に分化する。一部の態様では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞はさらに分化した細胞、例えば、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞、Ngn3陽性内分泌前駆細胞、インスリン陽性内分泌細胞であり、続いて、SC-β細胞に誘導されるかまたは成熟する。
[0473]一部の態様では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、集団中の少なくとも一部の原始腸管細胞をPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることによって、例えば、原始腸管細胞を、i)少なくとも1つの骨形態形成タンパク質(BMP)シグナル伝達経路阻害剤、ii)FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、in)少なくとも1つのSHH経路阻害剤、iv)少なくとも1つのレチノイン酸(RA)シグナル伝達経路活性化剤、およびv)少なくとも1つのタンパク質キナーゼC活性化剤と接触させて、少なくとも一部の原始腸管細胞のPdx1陽性膵臓前駆細胞への分化を誘導することによって取得することができ、ここで、Pdx1陽性膵臓前駆細胞はPdx1を発現する。一部の場合では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、集団中の少なくとも一部の原始腸管細胞をPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることによって、例えば、原始腸管細胞を、i)FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、およびii)少なくとも1つのレチノイン酸(RA)シグナル伝達経路活性化剤と接触させて、少なくとも一部の原始腸管細胞のPdx1陽性膵臓前駆細胞への分化を誘導することによって取得することができ、ここで、Pdx1陽性膵臓前駆細胞はPdx1を発現する。
[0474]原始腸管細胞を誘導してPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることができる(例えば、単独で、またはFGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのSHH経路阻害剤、少なくとも1つのレチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、および少なくとも1つのタンパク質キナーゼC活性化剤の任意の組合せと共に)、いかなるBMPシグナル伝達経路阻害剤も本明細書で提供される方法に使用することができる。一部の場合では、BMPシグナル伝達経路阻害剤はLDN193189を含む。
[0475]原始腸管細胞を誘導してPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化することができる(例えば、単独で、または少なくとも1つのBMPシグナル伝達経路阻害剤、少なくとも1つのSHH経路阻害剤、少なくとも1つのレチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、および少なくとも1つのタンパク質キナーゼC活性化剤の任意の組合せと共に)、FGFファミリーからの任意の増殖因子を使用することができる。一部の場合では、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は角化細胞増殖因子(KGF)を含む。一部の場合では、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は、FGF2、FGF8B、FGF10、およびFGF21からなる群から選択される。
[0476]原始腸管細胞を誘導してPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることができる(例えば、単独で、または少なくとも1つのBMPシグナル伝達経路阻害剤、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのレチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、および少なくとも1つのタンパク質キナーゼC活性化剤の任意の組合せと共に)、いかなるSHH経路阻害剤も使用することができる。一部の場合では、SHH経路阻害剤はSant1を含む。
[0477]原始腸管細胞を誘導してPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることができる(例えば、単独で、または少なくとも1つのBMPシグナル伝達経路阻害剤、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのSHH経路阻害剤、および少なくとも1つのタンパク質キナーゼC活性化剤の任意の組合せと共に)、いかなるRAシグナル伝達経路活性化剤も使用することができる。一部の場合では、RAシグナル伝達経路活性化剤はレチノイン酸を含む。
[0478]原始腸管細胞を誘導してPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることができる(例えば、単独で、または少なくとも1つのBMPシグナル伝達経路阻害剤、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのSHH経路阻害剤、および少なくとも1つのRAシグナル伝達経路活性化剤の任意の組合せと共に)、いかなるPKC活性化剤も使用することができる。一部の場合では、PKC活性化剤はPdbUを含む。一部の場合では、PKC活性化剤はTPBを含む。
[0479]場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、例えば、原始腸管細胞をアクチビンA、レチノイン酸、KGF、Sant1、LDN193189、PdBUと2日間にわたって接触させることにより、集団中の少なくとも一部の原始腸管細胞をPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることによって取得され得る。場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、例えば、原始腸管細胞を、1日目はDMH-1、アクチビンA、レチノイン酸、KGF、Sant1、LDN193189、PdBU、2日目はアクチビンA、レチノイン酸、KGF、Sant1、LDN193189、PdBUと接触させることにより、集団中の少なくとも一部の原始腸管細胞をPdx1陽性膵臓前駆細胞へと分化させることによって取得され得る。場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、例えば、原始腸管細胞をレチノイン酸およびKGFと2日間にわたって接触させることにより、集団中の少なくとも一部の原始腸管細胞をPdx1陽性膵臓前駆細胞に分化させることによって取得され得る。場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、S3培地中の少なくとも一部の原始腸管細胞を分化させることによって取得され得る。
[0480]本開示の諸態様は、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を用いる。本明細書で使用されるNKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、任意の供給源から得ることも、任意の好適なプロトコールに従って生成することもできる。一部の態様では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化される。一部の態様では、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、例えば、Ngn3陽性内分泌前駆細胞、またはインスリン陽性内分泌細胞にさらに分化され、その後、SC-β細胞へ誘導または成熟される。
[0481]一部の態様では、Pdx1陽性膵臓前駆細胞からNKX6.1陽性膵臓前駆細胞を生成する方法は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞を含む細胞集団を(例えば、細胞クラスター化を促進する条件下で)、a)線維芽細胞増殖因子(FGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、b)ソニックヘッジホッグ経路阻害剤、および必要に応じてc)低濃度のレチノイン酸(RA)シグナル伝達経路活性化剤を含む少なくとも2つのβ細胞成熟因子と接触させて、集団中の少なくとも1つのPdx1陽性膵臓前駆細胞のNKX6.1陽性膵臓前駆細胞への分化を誘導するステップであって、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、NKX6.1を発現するステップを含む。
[0482]場合により、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、i)FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、ii)少なくとも1つのSHH経路阻害剤、および必要に応じてiii)低濃度のRAシグナル伝達経路活性化剤と接触させて、Pdx1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部のPdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞への分化を誘導することによって取得され、ここで、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1およびNKX6.1を発現する。場合により、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、i)FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、ii)少なくとも1つのSHH経路阻害剤、および必要に応じてiii)低濃度のRAシグナル伝達経路活性化剤、iv)ROCK阻害剤、およびv)TGF-βスーパーファミリーからの少なくとも1つの増殖因子と接触させて、Pdx1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部のPdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞への分化を誘導することによって取得される。場合により、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子と接触させることによって取得される。
[0483]場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、多能性細胞集団から生成される。場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、iPS細胞集団から生成される。場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、ESC細胞集団から生成される。場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、胚体内胚葉細胞集団から生成される。場合により、Pdx1陽性膵臓前駆細胞は、原始腸管細胞集団から生成される。
[0484]Pdx1陽性膵臓前駆細胞を誘導してNKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させることができるFGFファミリーからの任意の増殖因子(例えば、単独、または少なくとも1つのSHH経路阻害剤、もしくは必要に応じて少なくとも1つのレチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤との任意の組合せ)が、本明細書で提供される方法において使用され得る。場合により、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は、ケラチノサイト増殖因子(KGF)を含む。場合により、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は、FGF2、FGF8B、FGF 10、およびFGF21からなる群から選択される。
[0485]Pdx1陽性膵臓前駆細胞を誘導してNKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させることができる任意のSHH経路阻害剤(例えば、単独、またはFGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのレチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、ROCK阻害剤、およびTGF-βスーパーファミリーからの少なくとも1つの増殖因子との任意の組合せ)が、本明細書で提供される方法において使用され得る。場合により、SHH経路阻害剤は、Sant-1を含む。
[0486]Pdx1陽性膵臓前駆細胞を誘導してNKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させることができる任意のRAシグナル伝達経路活性化剤(例えば、単独、またはFGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのSHH経路阻害剤、ROCK阻害剤、およびTGF-βスーパーファミリーからの少なくとも1つの増殖因子との任意の組合せ)が使用され得る。場合により、RAシグナル伝達経路活性化剤は、レチノイン酸を含む。
[0487]Pdx1陽性膵臓前駆細胞を誘導してNKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させることができる任意のROCK阻害剤(例えば、単独、またはFGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのSHH経路阻害剤、RAシグナル伝達経路活性化剤、およびTGF-βスーパーファミリーからの少なくとも1つの増殖因子との任意の組合せ)が使用され得る。場合により、ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、または14-1152を含む。
[0488]Pdx1陽性膵臓前駆細胞を誘導してNKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させることができるTGF-βスーパーファミリーからの任意の活性化剤(例えば、単独、またはFGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、少なくとも1つのSHH経路阻害剤、RAシグナル伝達経路活性化剤、およびROCK阻害剤との任意の組合せ)が使用され得る。場合により、TGF-βスーパーファミリーからの活性化剤は、アクチビンAまたはGDF8を含む。
[0489]場合により、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、KGF、Sant1、およびRAと5または6日間にわたって接触させることによって取得される。場合により、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、KGF、Sant1、RA、チアゾビビン、およびアクチビンAと5または6日間にわたって接触させることによって取得される。場合により、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、KGFと5または6日間にわたって接触させることによって取得される。
[0490]本開示の諸態様は、インスリン陽性内分泌細胞を用いる。本明細書で使用されるインスリン陽性内分泌細胞は、任意の供給源から得ることも、または任意の好適なプロトコールに従って生成することもできる。一部の態様では、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、インスリン陽性内分泌細胞に分化される。一部の態様では、インスリン陽性内分泌細胞は、例えば、SC-β細胞への誘導または成熟により、さらに分化される。
[0491]一部の態様では、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞からインスリン陽性内分泌細胞を生成する方法は、NKX6-1陽性膵臓前駆細胞を含む細胞集団を(例えば、細胞クラスター化を促進する条件下で)、a)TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、b)甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、c)タンパク質キナーゼ阻害剤、および/またはソニックヘッジホッグ阻害剤と接触させて、集団中の少なくとも1つのNKX6.1陽性膵臓前駆細胞のインスリン陽性内分泌細胞への分化を誘導するステップであって、インスリン陽性内分泌細胞は、インスリンを発現するステップを含む。場合により、インスリン陽性内分泌細胞は、Pdx1、NKX6.1、NKX2.2、Mafb、glis3、Sur1、Kir6.2、Znt8、SLC2A1、SLC2A3および/またはインスリンを発現する。
[0492]NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の分化を誘導してインスリン陽性内分泌細胞に分化させることができる任意のTGF-βシグナル伝達経路阻害剤(例えば、単独、または他のβ細胞成熟因子、例えば、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤との組合せ)が使用され得る。場合により、TGF-βシグナル伝達経路は、TGF-β受容体I型キナーゼシグナル伝達を含む。場合により、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤は、Alk5阻害剤IIを含む。一部の実施形態では、TGFβ-R1キナーゼ阻害剤(例えば、ALK5i)は、1μM~50μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、TGFβ-R1キナーゼ阻害剤(例えば、ALK5i)は、1μM~50μM、1μM~40μM、1μM~30μM、1μM~20μM、1μM~10μM、10μM~50μM、10μM~40μM、10μM~30μM、10μM~20μM、20μM~50μM、20μM~40μM、20μM~30μM、30μM~50μM、30μM~40μM、または40μM~50μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、TGFβ-R1キナーゼ阻害剤(例えば、ALK5i)は、5μM~20μM(例えば、5μM、10μM、15μM、または20μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、TGFβ-R1キナーゼ阻害剤(例えば、ALK5i)は、10μMの濃度で培地に存在する。
[0493]NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の分化を誘導してインスリン陽性内分泌細胞に分化させることができる任意の甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤(例えば、単独、または他のβ細胞成熟因子、例えば、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤との組合せ)が使用され得る。場合により、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、トリヨードチロニン(T3)またはGC-1を含む。一部の実施形態では、甲状腺ホルモン(例えば、GC-1)は、0.1μM~10μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、甲状腺ホルモン(例えば、GC-1)は、0.1μM~10μM、0.1μM~9μM、0.1μM~8μM、0.1μM~7μM、0.1μM~6μM、0.1μM~5μM、0.1μM~4μM、0.1μM~3μM、0.1μM~2μM、0.1μM~1μM、0.1μM~0.5μM、0.5μM~10μM、0.5μM~9μM、0.5μM~8μM、0.5μM~7μM、0.5μM~6μM、0.5μM~5μM、0.5μM~4μM、0.5μM~3μM、0.5μM~2μM、0.5μM~1μM、1μM~10μM、1μM~9μM、1μM~8μM、1μM~7μM、1μM~6μM、1μM~5μM、1μM~4μM、1μM~3μM、1μM~2μM、2μM~10μM、2μM~9μM、2μM~8μM、2μM~7μM、2μM~6μM、2μM~5μM、2μM~4μM、2μM~3μM、3μM~10μM、3μM~9μM、3μM~8μM、3μM~7μM、3μM~6μM、3μM~5μM、3μM~4μM、4μM~10μM、4μM~9μM、4μM~8μM、4μM~7μM、4μM~6μM、4μM~5μM、5μM~10μM、5μM~9μM、5μM~8μM、5μM~7μM、5μM~6μM、6μM~10μM、6μM~9μM、6μM~8μM、6μM~7μM、7μM~10μM、7μM~9μM、7μM~8μM、8μM~10μM、8μM~9μM、または9μM~10μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、甲状腺ホルモン(例えば、GC-1)は、0.5μM~5μM(例えば、0.5μM、1μM、1.5μM、2μM、2.5μM、3μM、3.5μM、4μM、4.5μM、または5μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、甲状腺ホルモン(例えば、GC-1)は、1μMの濃度で培地に存在する。
[0494]場合により、本開示の方法は、細胞集団(例えば、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞)を、少なくとも1つの追加の因子と接触させるステップを含む。場合により、本開示の方法は、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を、i)SHH経路阻害剤、ii)RAシグナル伝達経路活性化剤、iii)γ-セクレターゼ阻害剤、iv)上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、および必要に応じてv)タンパク質キナーゼ阻害剤のうちの少なくとも1つと接触させるステップを含む。
[0495]場合により、本開示の方法は、細胞集団(例えば、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞)を、少なくとも1つの追加の因子と接触させるステップを含む。場合により、本開示の方法は、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を、i)SHH経路阻害剤、ii)RAシグナル伝達経路活性化剤、iii)γ-セクレターゼ阻害剤、iv)上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、v)ROCK阻害剤、vi)ヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2阻害剤(例えば、DZNEP)、およびvii)少なくとも1つの骨形成タンパク質(BMP)シグナル伝達経路阻害剤のうちの少なくとも1つと接触させるステップを含む。
[0496]一部の実施形態では、本開示のいずれかの組成物は、ROCK阻害剤を含む。一部の実施形態では、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤(例えば、チアゾビビン)は、1μM~10μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤(例えば、チアゾビビン)は、1μM~10μM、1μM~9μM、1μM~8μM、1μM~7μM、1μM~6μM、1μM~5μM、1μM~4μM、1μM~3μM、1μM~2μM、2μM~10μM、2μM~9μM、2μM~8μM、2μM~7μM、2μM~6μM、2μM~5μM、2μM~4μM、2μM~3μM、3μM~10μM、3μM~9μM、3μM~8μM、3μM~7μM、3μM~6μM、3μM~5μM、3μM~4μM、4μM~10μM、4μM~9μM、4μM~8μM、4μM~7μM、4μM~6μM、4μM~5μM、5μM~10μM、5μM~9μM、5μM~8μM、5μM~7μM、5μM~6μM、6μM~10μM、6μM~9μM、6μM~8μM、6μM~7μM、7μM~10μM、7μM~9μM、7μM~8μM、8μM~10μM、8μM~9μM、または9μM~10μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤(例えば、チアゾビビン)は、1μM~5μM(例えば、1μM、1.5μM、2μM、2.5μM、3μM、3.5μM、4μM、4.5μM、または5μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤(例えば、チアゾビビン)は、2.5μMの濃度で培地に存在する。
[0497]集団中のNKX6.1陽性膵臓前駆細胞のインスリン陽性内分泌細胞への分化を誘導することができる任意のγ-セクレターゼ阻害剤(例えば、単独、またはTGF-βシグナル伝達経路阻害剤および/もしくは甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤のいずれかとの組合せ)。場合により、γ-セクレターゼ阻害剤は、XXIを含む。場合により、γ-セクレターゼ阻害剤は、DAPTを含む。一部の実施形態では、notchシグナル伝達経路阻害剤(例えば、γ-セクレターゼ阻害剤、例えばXXI)は、0.1μM~10μM、0.1μM~9μM、0.1μM~8μM、0.1μM~7μM、0.1μM~6μM、0.1μM~5μM、0.1μM~4μM、0.1μM~3μM、0.1μM~2μM、0.1μM~1μM、0.1μM~0.5μM、0.5μM~10μM、0.5μM~9μM、0.5μM~8μM、0.5μM~7μM、0.5μM~6μM、0.5μM~5μM、0.5μM~4μM、0.5μM~3μM、0.5μM~2μM、0.5μM~1μM、1μM~10μM、1μM~9μM、1μM~8μM、1μM~7μM、1μM~6μM、1μM~5μM、1μM~4μM、1μM~3μM、1μM~2μM、2μM~10μM、2μM~9μM、2μM~8μM、2μM~7μM、2μM~6μM、2μM~5μM、2μM~4μM、2μM~3μM、3μM~10μM、3μM~9μM、3μM~8μM、3μM~7μM、3μM~6μM、3μM~5μM、3μM~4μM、4μM~10μM、4μM~9μM、4μM~8μM、4μM~7μM、4μM~6μM、4μM~5μM、5μM~10μM、5μM~9μM、5μM~8μM、5μM~7μM、5μM~6μM、6μM~10μM、6μM~9μM、6μM~8μM、6μM~7μM、7μM~10μM、7μM~9μM、7μM~8μM、8μM~10μM、8μM~9μM、または9μM~10μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、notchシグナル伝達経路阻害剤(例えば、γ-セクレターゼ阻害剤、例えばXXI)は、0.5μM~5μM(例えば、0.5μM、1μM、1.5μM、2μM、2.5μM、3μM、3.5μM、4μM、4.5μM、または5μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、notchシグナル伝達経路阻害剤(例えば、γ-セクレターゼ阻害剤、例えばXXI)は、2μMの濃度で培地に存在する。
[0498]集団中のNKX6.1陽性膵臓前駆細胞のインスリン陽性内分泌細胞への分化を誘導することができるEGFファミリーからの任意の増殖因子(例えば、単独、またはTGF-βシグナル伝達経路阻害剤および/もしくは甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤のいずれかとの組合せ)が使用され得る。場合により、EGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は、ベータセルリンを含む。場合により、EGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子は、EGFを含む。一部の実施形態では、上皮増殖因子(例えば、ベータセルリン)は、10ng/ml~50ng/mlの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、上皮増殖因子(例えば、ベータセルリン)は、10ng/ml~50ng/ml、10ng/ml~40ng/ml、10ng/ml~30ng/ml、10ng/ml~20ng/ml、20ng/ml~50ng/ml、20ng/ml~40ng/ml、20ng/ml~30ng/ml、30ng/ml~50ng/ml、30ng/ml~40ng/ml、または40ng/ml~50ng/mlの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、上皮増殖因子(例えば、ベータセルリン)は、10ng/ml~30ng/ml(例えば、10ng/ml、20ng/ml、20ng/ml)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、上皮増殖因子(例えば、ベータセルリン)は、20ng/mlの濃度で培地に存在する。
[0499]NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の分化を誘導してインスリン陽性内分泌細胞に分化させることができる任意のRAシグナル伝達経路活性化剤(例えば、単独、またはTGF-βシグナル伝達経路阻害剤および/もしくは甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤のいずれかとの組合せ)が使用され得る。場合により、RAシグナル伝達経路活性化剤は、RAを含む。一部の実施形態では、レチノイン酸は、0.02μM~0.5μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、レチノイン酸は、0.02μM~0.5μM、0.05μM~0.5μM、0.1μM~0.5μM、0.15μM~0.5μM、0.2μM~0.5μM、0.25μM~0.5μM、0.3μM~0.5μM、0.35μM~0.5μM、0.4μM~0.5μM、0.45μM~0.5μM、0.02μM~0.4μM、0.05μM~0.4μM、0.1μM~0.4μM、0.15μM~0.4μM、0.2μM~0.4μM、0.25μM~0.4μM、0.3μM~0.4μM、0.35μM~0.4μM、0.02μM~0.3μM、0.05μM~0.3μM、0.1μM~0.3μM、0.15μM~0.3μM、0.2μM~0.3μM、0.25μM~0.3μM、0.02μM~0.2μM、0.05μM~0.2μM、0.1μM~0.2μM、0.15μM~0.2μM、0.02μM~0.1μM、0.05μM~0.1μM、または0.02μM~0.05μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、レチノイン酸は、0.02μM~0.2μM(例えば、0.02μM、0.05μM、0.1μM、0.15μM、または0.2μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、レチノイン酸は、0.05μMの濃度で培地に存在する。
[0500]NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の分化を誘導してインスリン陽性内分泌細胞に分化させることができる任意のSHH経路阻害剤(例えば、単独、またはTGF-βシグナル伝達経路阻害剤および/もしくは甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤のいずれかとの組合せ)が、本明細書で提供される方法において使用され得る。場合により、SHH経路阻害剤は、Sant1を含む。一部の実施形態では、ソニックヘッジホッグ(SHH)シグナル伝達経路阻害剤(例えば、SANT-1)は、0.1μM~10μM、0.1μM~9μM、0.1μM~8μM、0.1μM~7μM、0.1μM~6μM、0.1μM~5μM、0.1μM~4μM、0.1μM~3μM、0.1μM~2μM、0.1μM~1μM、0.1μM~0.5μM、0.5μM~10μM、0.5μM~9μM、0.5μM~8μM、0.5μM~7μM、0.5μM~6μM、0.5μM~5μM、0.5μM~4μM、0.5μM~3μM、0.5μM~2μM、0.5μM~1μM、1μM~10μM、1μM~9μM、1μM~8μM、1μM~7μM、1μM~6μM、1μM~5μM、1μM~4μM、1μM~3μM、1μM~2μM、2μM~10μM、2μM~9μM、2μM~8μM、2μM~7μM、2μM~6μM、2μM~5μM、2μM~4μM、2μM~3μM、3μM~10μM、3μM~9μM、3μM~8μM、3μM~7μM、3μM~6μM、3μM~5μM、3μM~4μM、4μM~10μM、4μM~9μM、4μM~8μM、4μM~7μM、4μM~6μM、4μM~5μM、5μM~10μM、5μM~9μM、5μM~8μM、5μM~7μM、5μM~6μM、6μM~10μM、6μM~9μM、6μM~8μM、6μM~7μM、7μM~10μM、7μM~9μM、7μM~8μM、8μM~10μM、8μM~9μM、または9μM~10μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、ソニックヘッジホッグ(SHH)シグナル伝達経路阻害剤(例えば、SANT-1)は、0.1μM~0.5μM(例えば、0.1μM、0.15μM、0.2μM、0.25μM、0.3μM、0.35μM、0.4μM、0.45μM、または0.5μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、ソニックヘッジホッグ(SHH)シグナル伝達経路阻害剤(例えば、SANT-1)は、0.25μMの濃度で培地に存在する。
[0501]NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の分化を誘導してインスリン陽性内分泌細胞に分化させることができる任意のBMPシグナル伝達経路阻害剤(例えば、単独、またはTGF-βシグナル伝達経路阻害剤および/もしくは甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤のいずれかとの組合せ)が使用され得る。場合により、BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189を含む。一部の実施形態では、骨形成(BMP)シグナル伝達経路阻害剤(例えば、LDN-193189)は、0.05μM~0.5μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、骨形成(BMP)シグナル伝達経路阻害剤(例えば、LDN-193189)は、0.05μM~0.5μM、0.1μM~0.5μM、0.15μM~0.5μM、0.2μM~0.5μM、0.25μM~0.5μM、0.3μM~0.5μM、0.35μM~0.5μM、0.4μM~0.5μM、0.45μM~0.5μM、0.05μM~0.4μM、0.1μM~0.4μM、0.15μM~0.4μM、0.2μM~0.4μM、0.25μM~0.4μM、0.3μM~0.4μM、0.35μM~0.4μM、0.05μM~0.3μM、0.1μM~0.3μM、0.15μM~0.3μM、0.2μM~0.3μM、0.25μM~0.3μM、0.05μM~0.2μM、0.1μM~0.2μM、0.15μM~0.2μM、または0.05μM~0.1μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、骨形成(BMP)シグナル伝達経路阻害剤(例えば、LDN-193189)は、0.05μM~0.2μM(例えば、0.05μM、0.1μM、0.15μM、または0.2μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、骨形成(BMP)シグナル伝達経路阻害剤(例えば、LDN-193189)は、0.1μMの濃度で培地に存在する。
[0502]場合により、細胞集団は、必要に応じてタンパク質キナーゼ阻害剤と接触させられる。場合により、細胞集団は、タンパク質キナーゼ阻害剤と接触させられない。場合により、細胞集団は、タンパク質キナーゼ阻害剤と接触させられる。集団中のNKX6.1陽性膵臓前駆細胞のインスリン陽性内分泌細胞への分化を誘導することができる任意のタンパク質キナーゼ阻害剤(例えば、単独、またはTGF-βシグナル伝達経路阻害剤および/もしくは甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤のいずれかとの組合せ)。場合により、タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンを含む。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤(例えば、スタウロスポリン)は、0.5nM~10nMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤(例えば、スタウロスポリン)は、0.5nM~10nM、0.5nM~9nM、0.5nM~8nM、0.5nM~7nM、0.5nM~6nM、0.5nM~5nM、0.5nM~4nM、0.5nM~3nM、0.5nM~2nM、0.5nM~1nM、1nM~10nM、1nM~9nM、1nM~8nM、1nM~7nM、1nM~6nM、1nM~5nM、1nM~4nM、1nM~3nM、1nM~2nM、2nM~10nM、2nM~9nM、2nM~8nM、2nM~7nM、2nM~6nM、2nM~5nM、2nM~4nM、2nM~3nM、3nM~10nM、3nM~9nM、3nM~8nM、3nM~7nM、3nM~6nM、3nM~5nM、3nM~4nM、4nM~10nM、4nM~9nM、4nM~8nM、4nM~7nM、4nM~6nM、4nM~5nM、5nM~10nM、5nM~9nM、5nM~8nM、5nM~7nM、5nM~6nM、6nM~10nM、6nM~9nM、6nM~8nM、6nM~7nM、7nM~10nM、7nM~9nM、7nM~8nM、8nM~10nM、8nM~9nM、または9nM~10nMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤(例えば、スタウロスポリン)は、1nM~5nM(例えば、1nM、2nM、3nM、4nM、または5nM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、タンパク質キナーゼ阻害剤(例えば、スタウロスポリン)は、3nMの濃度で培地に存在する。
[0503]一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2阻害剤(例えば、DZNEP)を含む。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2阻害剤(例えば、DZNEP)は、0.05μM~0.5μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2阻害剤(例えば、DZNEP)は、0.05μM~0.5μM、0.1μM~0.5μM、0.15μM~0.5μM、0.2μM~0.5μM、0.25μM~0.5μM、0.3μM~0.5μM、0.35μM~0.5μM、0.4μM~0.5μM、0.45μM~0.5μM、0.05μM~0.4μM、0.1μM~0.4μM、0.15μM~0.4μM、0.2μM~0.4μM、0.25μM~0.4μM、0.3μM~0.4μM、0.35μM~0.4μM、0.05μM~0.3μM、0.1μM~0.3μM、0.15μM~0.3μM、0.2μM~0.3μM、0.25μM~0.3μM、0.05μM~0.2μM、0.1μM~0.2μM、0.15μM~0.2μM、または0.05μM~0.1μMの濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2阻害剤(例えば、DZNEP)は、0.05μM~0.2μM(例えば、0.05μM、0.1μM、0.15μM、または0.2μM)の濃度で培地に存在する。一部の実施形態では、ヒストンメチルトランスフェラーゼEZH2阻害剤(例えば、DZNEP)は、0.1μMの濃度で培地に存在する。
[0504]場合により、本開示の方法は、細胞集団(例えば、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞)を、XXI、Alk5i、T3、RA、Sant1、およびベータセルリンと7日間にわたって接触させて、集団中の少なくとも1つのNKX6.1陽性膵臓前駆細胞のインスリン陽性内分泌細胞への分化を誘導するステップであって、インスリン陽性内分泌細胞は、インスリンを発現するステップを含む。場合により、本開示の方法は、細胞集団(例えば、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞)を、XXI、Alk5i、T3、RA、Sant1、ベータセルリン、およびLDN193189と7日間にわたって接触させて、集団中の少なくとも1つのNKX6.1陽性膵臓前駆細胞のインスリン陽性内分泌細胞への分化を誘導するステップであって、インスリン陽性内分泌細胞は、インスリンを発現するステップを含む。
[0505]場合により、本開示の方法は、細胞集団(例えば、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞)をBE5培地中で培養して、集団中の少なくとも1つのNKX6.1陽性膵臓前駆細胞のインスリン陽性内分泌細胞への分化を誘導するステップであって、インスリン陽性内分泌細胞は、インスリンを発現するステップを含む。
[0506]本開示の諸態様は、内因性成熟β細胞に形態および機能が類似するにもかかわらず天然β細胞とは明確に異なる非天然膵臓β細胞を生成することを含む。
[0507]場合により、本明細書で提供される方法を使用して生成されたインスリン陽性内分泌細胞は、単独で、または他の細胞型、例えば、その前駆体、例えば、幹細胞、胚体内胚葉細胞、原始腸管細胞、Pdx1陽性膵臓前駆細胞、またはNKX6.1陽性膵臓前駆細胞と共に、細胞クラスターを形成することができる。場合により、インスリン陽性内分泌細胞を含む細胞クラスターは、本明細書で提供される方法を使用して再凝集され得る。細胞クラスターの再凝集は、インスリン陽性内分泌細胞を濃縮し得る。場合により、細胞クラスター内のインスリン陽性内分泌細胞は、膵臓β細胞へとさらに成熟させることができる。例えば、再凝集後、第2の細胞クラスターは、天然の膵島に類似したin vitroのGSISを呈し得る。例えば、再凝集後、第2の細胞クラスターは、in vitroのGSISを呈する非天然膵臓β細胞を含み得る。
[0508]本明細書で提供されるステージ6細胞は、本明細書に記載される解離および再凝集プロセスに供されても供されなくてもよい。場合により、インスリン陽性内分泌細胞を含む細胞集団は、Sc-β細胞に成熟するように直接誘導され得る。場合により、成熟因子は、本明細書に記載される少なくとも1つのTGF-βシグナル伝達経路阻害剤および甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤を含み得る。場合により、Sc-β細胞は、インスリン陽性内分泌細胞を含む細胞集団をAlk5iおよびT3と接触させることによって取得され得る。場合により、インスリン陽性内分泌細胞は、10%のFBSが補充されたCMRL培地中で成熟させられ得る。他の場合では、Sc-β細胞は、インスリン陽性内分泌細胞を含む細胞集団を、2%のBSAが補充されてもよいMCDB131培地中で培養することによって取得され得る。場合により、インスリン陽性内分泌細胞をSc-β細胞に成熟させるための2%のBSAを含むMCDB131培地は、本明細書に記載される小分子因子を含まなくてもよい。場合により、インスリン陽性内分泌細胞をSc-β細胞に成熟させるための2%のBSAを含むMCDB131培地は、血清(例えば、FBS)を含まなくてもよい。
[0509]本開示の一態様は、凍結保存の方法を提供する。本明細書で提供されるように、非天然膵臓β細胞を含む細胞集団は、凍結保存によって貯蔵され得る。例えば、非天然β細胞、例えば、場合によりステージ6細胞を含む細胞集団は、細胞懸濁液、例えば、単一細胞懸濁液に解離され得、細胞懸濁液は、凍結保存、例えば、凍結保存溶液中で凍結され得る。細胞の解離は、本明細書で提供されるいずれかの技術によって、例えば、酵素処置によって実行され得る。細胞は、最高-20℃、最高-30℃、最高-40℃、最高-50℃、最高-60℃、最高-70℃、最高-80℃、最高-90℃、最高-100℃、最高-110℃、最高-120℃、最高-130℃、最高-140℃、最高-150℃、最高-160℃、最高-170℃、最高-180℃、最高-190℃、または最高-200℃の温度で凍結され得る。場合により、細胞は、約-80℃の温度で凍結される。場合により、細胞は、約-195℃の温度で凍結される。凍結保存に必要な低い温度をもたらすためには、電気冷凍庫、固体二酸化炭素、および液体窒素などだがこれらに限定されない任意の冷却方法が使用され得る。場合により、特注と市販の両方の溶液を含め、当業者が利用可能な任意の凍結保存溶液が、細胞を低温でインキュベートして貯蔵するために使用され得る。例えば、抗凍結剤を含む溶液が使用され得る。抗凍結剤は、凍結による損傷から細胞を保護するように構成された薬剤であり得る。例えば、抗凍結剤は、凍結保存溶液のガラス転移温度を低下させることができる物質であり得る。使用され得る例示的な抗凍結剤としては、DMSO(ジメチルスルホキシド)、グリコール(例えば、エチレングリコール、プロピレングリコール、およびグリセロール)、デキストラン(例えば、デキストラン-40)、およびトレハロースが挙げられる。追加の薬剤が他の効果のために凍結保存溶液に添加されてもよい。場合により、市販の凍結保存溶液、例えば、FrostaLife(商標)、pZerve(商標)、Prime-XV(登録商標)、Gibco Synth-a-Freeze Cryopreservation Medium、STEM-CELLBANKER(登録商標)、CryoStor(登録商標)Freezing Media、HypoThermosol(登録商標)FRS Preservation Media、およびCryoDefend(登録商標)Stem Cells Mediaが、本明細書で提供される方法において使用され得る。
[0510]場合により、細胞クラスターは、本明細書で提供される方法を使用した再凝集に供される前に凍結保存され得る。場合により、細胞クラスターは、本明細書で提供されるように細胞懸濁液に解離され、次いで凍結保存されてもよい。ある特定の期間にわたる凍結保存の後、凍結保存された細胞は、本明細書で提供される方法を使用した再凝集のために解凍および培養され得る。本明細書で提供される凍結保存は、膵臓β細胞またはその前駆体の利用可能性を延長し得る。場合により、非天然膵臓β細胞が、例えば、ヒト患者への移植のために所望されるまで、非天然膵臓β細胞のその前駆体または幹細胞からの分化中、中間体細胞集団が本明細書で提供される方法に従って保存され得る。場合により、細胞は、そのさらなる使用または細胞のさらなる処理、例えば、再凝集前に、任意の所望の期間にわたって凍結保存され得る。例えば、細胞は、少なくとも1日間、少なくとも5日間、少なくとも10日間、少なくとも1か月間、少なくとも2か月間、少なくとも3か月間、少なくとも4か月間、少なくとも5か月間、少なくとも6か月間、少なくとも7か月間、少なくとも8か月間、少なくとも9か月間、少なくとも10か月間、少なくとも11か月間、少なくとも1年間、少なくとも2年間、少なくとも3年間、少なくとも4年間、少なくとも5年間、または少なくとも10年間にわたって凍結保存され得る。
[0511]一部の実施形態では、本明細書で開示される組成物および方法は、それらが凍結保存され、その後解凍された後、細胞回収率または収率を向上させる。細胞回収率の増加は、生存可能細胞の数またはパーセンテージの増加を含み得る。細胞回収率の増加は、目的の集団(例えば、ISL1陽性およびNKX6.1陽性細胞)の数またはパーセンテージの増加を含み得る。一部の実施形態では、細胞回収率の増加は、本明細書で開示される薬剤の組合せと細胞を接触させた後に達成される。例えば、一部の実施形態では、本明細書で開示される一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタミン、グルタメート、および/またはカルニチンのうちのいずれか1つまたは複数と細胞を接触させるステップは、細胞回収率を増加させる。一部の実施形態では、細胞回収率は、薬剤と細胞を凍結保存前に接触させる場合に増加する。一部の実施形態では、細胞回収率は、薬剤と細胞を凍結保存後に接触させる場合に増加する。
[0512]Sc-β細胞は、少なくとも1回のグルコース負荷に対する応答を呈し得る。場合により、SC-β細胞は、少なくとも2回連続したグルコース負荷に対する応答を呈する。場合により、SC-β細胞は、少なくとも3回連続したグルコース負荷に対する応答を呈する。場合により、SC-β細胞は、複数のグルコース負荷に対する内因性ヒト膵島の応答に類似する複数の(例えば、連続した)グルコース負荷に対する応答を呈す。場合により、SC-β細胞は、2回連続するグルコース負荷に応答してインスリンを放出または分泌することができる。場合により、SC-β細胞は、3回連続するグルコース負荷に応答してインスリンを放出または分泌することができる。場合により、SC-β細胞は、4回連続するグルコース負荷に応答してインスリンを放出または分泌することができる。場合により、SC-β細胞は、5回連続するグルコース負荷に応答してインスリンを放出または分泌することができる。場合により、SC-β細胞は、恒久的な連続するグルコース負荷に応答してインスリンを放出または分泌する。場合により、本明細書の実施例に記載されるように、細胞をアッセイして、細胞が細胞内Ca2+を繰り返し増加させるかどうかを決定することにより、細胞が連続したグルコース負荷に応答するかどうかを決定することができる。
[0513]場合により、本明細書で提供される方法は、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を含む細胞集団から開始し得る。NKX6.1陽性細胞は、EGFスーパーファミリーからの少なくとも1つの因子、例えば、ベータセルリンとNKX6.1陽性細胞を接触させることにより、NKX6.1陽性およびCペプチド陽性内分泌細胞に分化され得る。場合により、NKX6.1陽性およびCペプチド陽性内分泌細胞は、インスリン陽性内分泌細胞とも呼ばれ得る。場合により、インスリン陽性内分泌細胞の1つの特徴は、クロモグラニンAの発現であり得る。場合により、インスリン内分泌細胞を含む集団は、上記のように解離され、細胞クラスターへと再凝集され得る。
[0514]場合により、細胞クラスター化を促進する条件は、懸濁培養を含む。場合により、期間は、CペプチドおよびNkx6-1を共発現する細胞の数を最大にするのに充分な期間を含む。場合により、期間は、少なくとも5日間である。場合により、期間は、5日間から7日間の間である。場合により、期間は、少なくとも7日間である。場合により、懸濁培養液は、毎日(例えば、β細胞成熟因子を)補給される。場合により、5日間から7日間の間の期間は、CペプチドおよびNKX6.1を共発現する細胞の数を最大にする。
[0515]場合により、集団中のNKX6.1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも15%は、インスリン陽性内分泌細胞に分化するように誘導される。場合により、集団中のNKX6.1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも99%は、インスリン陽性内分泌細胞に分化するように誘導される。
[0516]一部の態様では、本開示は、多能性細胞からSC-β細胞を生成する方法であって、a)多能性幹細胞をTGFβスーパーファミリーからの少なくとも1つの因子およびWNTシグナル伝達経路活性化剤と3日間にわたって接触させることにより、集団中の多能性幹細胞を胚体内胚葉細胞に分化させるステップと、b)胚体内胚葉細胞をFGFファミリーからの少なくとも1つの因子と3日間にわたって接触させるプロセスにより、胚体内胚葉細胞の少なくとも一部を原始腸管細胞に分化させるステップと、c)原始腸管細胞を、i)レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、ii)FGFファミリーからの少なくとも1つの因子、iii)SHH経路阻害剤、iv)BMPシグナル伝達経路阻害剤、v)PKC活性化剤、および必要に応じてvi)ROCK阻害剤と、2日間にわたって接触させるプロセスにより、原始腸管細胞の少なくとも一部をPdx1陽性膵臓前駆細胞に分化させるステップと、d)Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、i)FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、ii)少なくとも1つのSHH経路阻害剤、および必要に応じてiii)RAシグナル伝達経路活性化剤、および必要に応じてiv)ROCK阻害剤、およびv)TGFβスーパーファミリーからの少なくとも1つの因子と、5日間にわたって1日おきに接触させるプロセスにより、Pdx1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部をPdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させるステップであって、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1およびNKX6.1を発現するステップと、e)Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、i)TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、ii)THシグナル伝達経路活性化剤、iii)少なくとも1つのSHH経路阻害剤、iv)RAシグナル伝達経路活性化剤、v)γ-セクレターゼ阻害剤、およびvi)上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子と、5日間から7日間の間の期間にわたって1日おきに接触させるプロセスにより、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部をPdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞に分化させるステップであって、Pdx1陽性NKX6.1インスリン陽性内分泌細胞は、Pdx1、NKX6.1、NKX2.2、Mafb、glis3、Sur1、Kir6.2、Znt8、SLC2A1、SLC2A3および/またはインスリンを発現するステップと、f)Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、i)トランスフォーミング増殖因子β(TGF-β)シグナル伝達経路阻害剤、ii)甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、および必要に応じてiii)タンパク質キナーゼ阻害剤と、7日間から14日間の間の期間にわたって1日おきに接触させて、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部のSC-β細胞へのin vitro成熟を誘導するプロセスにより、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部をSC-β細胞に分化させるステップであって、SC-β細胞は、in vitroおよび/またはin vivoでGSIS応答を呈するステップとを含む方法を提供する。場合により、GSIS応答は、内因性成熟β細胞のGSIS応答に類似する。
[0517]一部の態様では、本開示は、多能性細胞からSC-β細胞を生成する方法であって、a)多能性幹細胞をTGFβスーパーファミリーからの少なくとも1つの因子およびWNTシグナル伝達経路活性化剤と3日間にわたって接触させることにより、集団中の多能性幹細胞を胚体内胚葉細胞に分化させるステップと、b)胚体内胚葉細胞をFGFファミリーからの少なくとも1つの因子と3日間にわたって接触させるプロセスにより、胚体内胚葉細胞の少なくとも一部を原始腸管細胞に分化させるステップと、c)原始腸管細胞を、i)レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、およびii)FGFファミリーからの少なくとも1つの因子と2日間にわたって接触させるプロセスにより、原始腸管細胞の少なくとも一部をPdx1陽性膵臓前駆細胞に分化させるステップと、d)Pdx1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、FGFファミリーからの少なくとも1つの増殖因子と5日間にわたって1日おきに接触させるプロセスにより、Pdx1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部をPdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させるステップであって、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞は、Pdx1およびNKX6.1を発現するステップと、e)Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、i)TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、ii)THシグナル伝達経路活性化剤、iii)少なくとも1つのSHH経路阻害剤、iv)RAシグナル伝達経路活性化剤、v)γ-セクレターゼ阻害剤、vi)上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、およびvii)BMPシグナル伝達経路阻害剤と、5日間から7日間の間の期間にわたって1日おきに接触させるプロセスにより、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部をPdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞に分化させるステップであって、Pdx1陽性NKX6.1インスリン陽性内分泌細胞は、Pdx1、NKX6.1、NKX2.2、Mafb、glis3、Sur1、Kir6.2、Znt8、SLC2A1、SLC2A3および/またはインスリンを発現するステップと、f)Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞を、2%のBSAが補充されたMCBD131培地中で培養して、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部のSC-β細胞へのin vitro成熟を誘導することにより、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部をSC-β細胞に分化させるステップであって、SC-β細胞は、in vitroおよび/またはin vivoでGSIS応答を呈するステップとを含む方法を提供する。場合により、GSIS応答は、内因性成熟β細胞のGSIS応答に類似する。
[0518]一部の態様では、本開示は、多能性細胞からSC-β細胞を生成する方法であって、a)集団中の多能性幹細胞を好適な条件下でPdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞に分化させるステップと、b)Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を、細胞クラスター化を促進する条件下で、i)TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、ii)THシグナル伝達経路活性化剤、iii)少なくとも1つのSHH経路阻害剤、iv)RAシグナル伝達経路活性化剤、v)γ-セクレターゼ阻害剤、vi)上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子、およびvii)BMPシグナル伝達経路阻害剤と、5日間から7日間の間の期間にわたって1日おきに接触させるプロセスにより、Pdx1陽性NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部をPdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞に分化させるステップであって、Pdx1陽性NKX6.1インスリン陽性内分泌細胞は、Pdx1、NKX6.1、NKX2.2、Mafb、glis3、Sur1、Kir6.2、Znt8、SLC2A1、SLC2A3および/またはインスリンを発現するステップと、c)Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞を、2%のBSAが補充されたMCBD131培地中で培養して、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部のSC-β細胞へのin vitro成熟を誘導することにより、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部をSC-β細胞に分化させるステップであって、SC-β細胞は、in vitroおよび/またはin vivoでGSIS応答を呈するステップとを含む方法を提供する。場合により、GSIS応答は、内因性成熟β細胞のGSIS応答に類似する。
[0519]一部の態様では、本開示は、膵臓β細胞を含む細胞クラスターを生成する方法であって、a)NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を含む細胞集団を取得するステップと、b)NKX6.1陽性膵臓前駆細胞を上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの少なくとも1つの増殖因子と接触させるプロセスにより、NKX6.1陽性膵臓前駆細胞の少なくとも一部をNKX6.1陽性インスリン陽性(またはCペプチド陽性)内分泌細胞に分化させるステップであって、Pdx1陽性NKX6.1インスリン陽性内分泌細胞は、Pdx1、NKX6.1、NKX2.2、Mafb、glis3、Sur1、Kir6.2、Znt8、SLC2A1、SLC2A3および/またはインスリンを発現するステップと、c)Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞を、2%のBSAが補充されたMCBD131培地中で培養して、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部の膵臓β細胞へのin vitro成熟を誘導することにより、Pdx1陽性NKX6.1陽性インスリン陽性内分泌細胞の少なくとも一部を膵臓β細胞に分化させるステップであって、膵臓β細胞は、in vitroおよび/またはin vivoでGSIS応答を呈するステップとを含む方法を提供する。場合により、GSIS応答は、内因性成熟β細胞のGSIS応答に類似する。
[0520]一部の実施形態では、本開示は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタミン、グルタメート、およびカルニチンからなる群から選択される少なくとも1つの薬剤とin vitroで接触したことのあるβ細胞集団を含む組成物であって、前記β細胞集団は、前記少なくとも1つの薬剤と接触したことのない対応するβ細胞集団と比較して、増加したグルコース刺激性インスリン分泌を呈する、組成物を提供する。一部の実施形態では、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、L-カルニチン、タウリン、ホルメート、およびビオチンからなる群から選択される薬剤のうちの少なくとも2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、または7つと接触したことのある前記細胞集団。一部の実施形態では、この細胞集団は、亜鉛(例えば、ZnSO)とさらに接触する。
[0521]一部の実施形態では、本開示は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンからなる群から選択される少なくとも1つの薬剤とin vitroで接触したことのあるβ細胞集団を含む組成物であって、前記β細胞集団は、前記少なくとも1つの薬剤と接触したことのない対応するβ細胞集団と比較して、増加したグルコース刺激性インスリン分泌を呈する、組成物を提供する。一部の実施形態では、ホルメート、アセテート、ビオチン、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、およびグルタミンからなる群から選択される薬剤のうちの少なくとも2つ、3つ、4つ、5つ、または6つと接触したことのある前記細胞集団。
[0522]一部の態様では、本開示は、(a)インスリン陽性細胞を含む複数の細胞クラスターを含む第1の細胞集団を取得するステップと、(b)第1の細胞集団中の複数の細胞クラスターの少なくとも一部をin vitroで解離させるステップと、(c)解離した細胞クラスターの少なくとも一部を含む第1の細胞集団を、第1の組成物とin vitroで接触させて、複数のインスリン陽性細胞を含む複数の細胞クラスターを含む第2の細胞集団を取得するステップと、(d)第2のインスリン陽性細胞集団を第2の組成物とin vitroで接触させ、それにより、前記第2のインスリン陽性細胞集団の少なくとも一部を、複数のβ細胞を含む第3の細胞集団へと分化させるステップであって、第2の組成物は、第1の組成物とは異なり、第3の細胞集団は、第1の組成物と接触していない第1の細胞集団に由来するβ細胞を含む対応するβ細胞集団と比較して、より高いパーセンテージの生存可能なβ細胞を含むステップとを含む方法を提供する。
[0523]一部の実施形態では、第2の細胞集団は、第1の細胞集団と第1の組成物の約1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間の接触の後、第1の組成物と接触していないインスリン陽性内分泌細胞を含む対応する細胞集団と比較して、少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、または90%多くの生存可能なインスリン陽性内分泌細胞を含む。
[0524]一部の実施形態では、第3の細胞集団は、第1の組成物と接触していない第1の細胞集団に由来するβ細胞を含む対応する細胞集団と比較して、少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、または90%多くの生存可能なβ細胞を含む。一部の実施形態では、第3の細胞集団は、第1の細胞集団と第1の組成物の約1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10日間の接触の後、第1の組成物と接触していない第1の細胞集団に由来するβ細胞を含む対応する細胞集団と比較して、少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、または90%多くの生存可能なβ細胞を含む。
[0525]一部の実施形態では、第1の組成物は、本明細書で開示される薬剤のうちの2つ、3つ、4つ、または5つを損なう。一部の実施形態では、第1の組成物は、本明細書で開示される薬剤のうちの3つ、4つ、5つ、6つ、または7つを損なう。
[0526]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、およびグルタミンからなる群から選択される少なくとも1つの薬剤を含む。
[0527]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、一炭素代謝経路中間体(例えば、ホルメート)、アセチルCoA関連代謝産物(例えば、アセテート)、ビタミン(例えば、ビオチン)、HDAC阻害剤(例えば、β-ヒドロキシブチレート)、レドックス恒常性調節剤(例えば、タウリン)、グルタミン、グルタメート、およびカルニチンからなる群から選択される少なくとも1つの薬剤を含む。
[0528]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、一炭素代謝経路中間体を含む。一部の実施形態では、一炭素代謝経路中間体は、ホルメートである。
[0529]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、アセチルCoA関連代謝産物を含む。一部の実施形態では、アセチルCoA関連代謝産物は、アセテートである。
[0530]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、HDAC阻害剤を含む。一部の実施形態では、HDAC阻害剤は、β-ヒドロキシブチレートである。
[0531]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、レドックス恒常性調節剤を含む。一部の実施形態では、レドックス恒常性調節剤は、タウリンである。
[0532]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、グルタミンを含む。
[0533]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、グルタメートを含む。
[0534]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、カルニチンを含む。
[0535]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、少なくとも1つのビタミンを含む。一部の実施形態では、少なくとも1つのビタミンは、ビオチンまたはリボフラビンである。
[0536]一部の実施形態では、第1の組成物は、モノグリセリドリパーゼ(MGLL)阻害剤、骨形成タンパク質(BMP)1型受容体阻害剤、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、またはタンパク質キナーゼ阻害剤のうちの少なくとも1つの薬剤を含む。
[0537]一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、MGLL阻害剤、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、骨形成タンパク質(BMP)1型受容体阻害剤、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、またはタンパク質キナーゼ阻害剤のうちの1つまたは複数を含まない。一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、MGLL阻害剤を含まない。一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤を含まない。一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤を含まない。一部の実施形態では、第2の組成物は、骨形成タンパク質(BMP)1型受容体阻害剤を含まない。一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤を含まない。一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤を含まない。一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、タンパク質キナーゼ阻害剤を含まない。一部の実施形態では、第1の組成物または第2の組成物は、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、骨形成タンパク質(BMP)1型受容体阻害剤、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、およびタンパク質キナーゼ阻害剤を含まない。
[0538]一部の実施形態では、第1の組成物および/または第2の組成物は、少なくとも1つのアミノ酸を含む。一部の実施形態では、少なくとも1つのアミノ酸は、アラニン、グルタメート、グルタミン、グリシン、プロリン、スレオニン、またはトリプトファンである。一部の実施形態では、少なくとも1つのアミノ酸は、アルギニン、ヒスチジン、リシン、アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セレノシステイン、アラニン、バリン、イソロイシン、ロイシン、メチオニン、フェニルアラニン、チロシン、グルタメート、グリシン、プロリン、トレオニン、またはトリプトファンである。
[0539]一部の実施形態では、本開示の方法は、選択ステップの非存在下で行われる。例えば、生存可能細胞、本明細書で開示される細胞集団のパーセンテージ、細胞クラスターの直径、および本明細書で開示される他のパラメーターは、選択ステップを伴わずに評価され得る。
幹細胞由来ベータ細胞を濃縮する方法
[0540]本明細書では、β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)集団を細胞の異種集団、例えば、β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)またはβ細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)が由来するその先駆体を含む細胞の混合集団から単離または濃縮(enriching)する方法が提供される。上記のプロセスのいずれかによって生成されるβ細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)集団は、インスリン陽性内分泌細胞もしくはそれが由来するその先駆体、腸クロム親和性細胞(EC細胞)、および/またはα細胞(例えば、幹細胞由来α細胞)に存在しない、β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)に存在する細胞表面マーカー(例えば、CD49a、CD29、CD99、CD10、CD59、CD141、CD165、G46-2.6、CD44、CD57)を使用することによって濃縮、単離、および/または精製することができる。そのような細胞表面マーカーは、β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)に特異的な親和性タグとも称される。一部の実施形態では、細胞表面マーカーは誘導性細胞表面マーカーである。例えば、CD49aは、ある特定のシグナルによって表面に誘導され得る。
[0541]一部の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、α細胞および内分泌細胞を含む他の細胞から選別および濃縮することができる。一部の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、細胞集団をCD49aと結合する薬剤と接触させることによって、α細胞、EC細胞、および未熟インスリン陽性内分泌細胞を含む他の細胞から選別および濃縮することができる。一部の実施形態では、薬剤は、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)の表面に発現するCD49aと結合する抗体またはその抗原結合断片である。
[0542]一部の実施形態では、薬剤は、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)の細胞表面に存在するCD49aと特異的に結合するリガンドまたは他の結合剤である。一部の実施形態では、SC-β細胞(例えば、ヒトSC-β細胞)の表面に存在するCD49aに結合する抗体は、本明細書に記載される方法によって生成される、化学的に誘導される(例えば、本明細書に記載される少なくとも1つのβ細胞成熟因子と接触させることによって)SC-β細胞の濃縮、単離、または精製のための親和性タグとして使用される。そのような抗体は公知であり、市販されている。
[0543]当業者は、SC-β細胞の濃縮、単離、および/または精製のための抗体を使用するための方法を容易に理解するだろう。例えば、一部の実施形態では、抗体等の試薬は、SC-β細胞を含む細胞集団であって、細胞間接着および基質接着を低下するために処理されている細胞集団と共にインキュベートされる。次いで、細胞集団は、洗浄され、遠心分離され、再懸濁される。一部の実施形態では、抗体がその時点で標識により標識されていない場合、細胞懸濁液は次いで二次抗体、例えば一次抗体に結合することができるFACSコンジュゲート抗体と共にインキュベートされる。次いで、SC-β細胞は、洗浄され、遠心分離され、緩衝液に再懸濁される。次いで、SC-β細胞懸濁液は、蛍光活性化細胞選別機(FACS)を使用して分析および選別される。抗体結合蛍光初期化細胞は、非結合非蛍光細胞(例えば、未熟インスリン産生細胞、α細胞、および内分泌細胞)と別々に収集され、それにより、SC-β細胞を、細胞懸濁液に存在する他の細胞、例えば、インスリン陽性内分泌細胞もしくはその先駆体、または未熟インスリン産生細胞(例えば、他の分化細胞型)から単離する。
[0544]一部の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)を含む単離された細胞組成物は、親和性に基づく代替法を使用することによって、または分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)に特異的な同じもしくは異なるマーカーを使用する追加のラウンドの選別によってさらに精製することができる。例えば、一部の実施形態では、FACS選別は、NKX6-1を単独でもしくはCペプチドの発現と共に、または代替的に本明細書に開示されるβ細胞マーカーと共に発現するSC-β細胞を、細胞集団中のそれらのマーカーのうちの1つを発現しない細胞(例えば、陰性細胞)から初めに単離するために使用される。第2のFACS選別、例えば、FACSを使用して陽性細胞を再び選別して、第1の選別とは異なるマーカーに対して陽性の細胞を単離することは、細胞集団を初期化細胞に関して濃縮する。代替的な実施形態では、FACS選別は、大半のインスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体に存在するがSC-β細胞に存在しないマーカーをネガティブ選別することによって細胞を分離するために使用される。
[0545]一部の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、抗体の使用を伴わずに蛍光標識され、次いで蛍光活性化細胞選別機(FACS)を使用することによって非標識細胞から単離される。そのような実施形態では、GFP、YFPをコードする核酸、または発現可能な蛍光マーカー遺伝子、例えばルシフェラーゼをコードする遺伝子をコードする別の核酸は、上に記載した方法を使用して初期化細胞を標識するために使用される。例えば、一部の実施形態では、GFPをコードする少なくとも1コピーの核酸またはその生物学的に活性な断片は、SC-β細胞へと初めに化学的に誘導される少なくとも1個のインスリン陽性内分泌細胞に、GFP遺伝子産物またはその生物学的に活性な断片の発現がインスリンプロモーターの制御下となるように、インスリンプロモーター等のSC-β細胞に発現するプロモーターの下流において導入される。
[0546]直前に記載した手順に加えて、化学的に誘導されるSC-β細胞はまた、細胞単離のための他の技法によって単離され得る。加えて、SC-β細胞はまた、SC-β細胞の選択的生存または選択的増大を促進する成長条件での連続継代培養の方法によって濃縮または単離され得る。そのような方法は、当業者に公知であり、例えば、とりわけ、インスリン、TGF-ベータファミリーのメンバー、例えば、アクチビンA、TGFベータ1、2、および3、骨形態形成タンパク質(BMP-2、-3、-4、-5、-6、-7、-11、-12、および-13)、線維芽細胞増殖因子-1および-2、血小板由来増殖因子-AAおよび-BB、多血小板血漿、インスリン様成長因子(IGF-I、II) 増殖分化因子(GDF-5、-6、-7、-8、-10、-11、-15)、血管内皮細胞由来増殖因子(VEGF)、肝細胞増殖因子(HGF)、プレイオトロフィン、エンドセリン、上皮成長因子(EGF)、ベータセルリン等の薬剤の使用を含み得る。他の医薬化合物としては、例えば、ニコチンアミド、グルカゴン様ペプチド-1(GLP-1)およびII、GLP-1および2模倣体、Exendin-4、レチノイン酸、副甲状腺ホルモンを挙げることができる。
[0547]濃縮、単離、および/または精製された分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)集団は、本明細書に記載される方法を使用して、インスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体(本明細書に記載される方法によって多能性幹細胞から分化した)からin vitroで生成することができる。一部の実施形態では、好ましい濃縮、単離、および/または精製方法は、ヒト多能性幹細胞またはヒト人工多能性幹(iPS)細胞から分化したヒトインスリン陽性内分泌細胞またはその先駆体からのヒト分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)のin vitro生成に関する。SC-β細胞が、iPS細胞から予め得られた胚体内胚葉細胞から予め得られたインスリン陽性内分泌細胞から分化するそのような実施形態では、SC-β細胞は、iPS細胞を生成するために細胞が取得された対象に対して自家であり得る。
[0548]分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)の単離された細胞集団は、本明細書に記載される方法を使用して、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)含量の点でインスリン陽性内分泌細胞または先駆体集団の化学誘導前の細胞集団と比較して少なくとも約2~約1000倍濃縮される。一部の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、インスリン陽性内分泌細胞または先駆体集団の化学誘導前の集団と比較して少なくとも約5~約500倍濃縮され得る。他の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、インスリン陽性内分泌細胞または先駆体集団の化学誘導前の集団と比較して少なくとも約10~約200倍濃縮され得る。さらに他の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、インスリン陽性内分泌細胞または先駆体集団の化学誘導前の集団と比較して少なくとも約20~約100倍濃縮され得る。さらに他の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、インスリン陽性内分泌細胞または先駆体集団の化学誘導前の集団と比較して少なくとも約40~約80倍濃縮され得る。ある特定の実施形態では、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞)は、インスリン陽性内分泌細胞または先駆体集団の化学誘導前の集団と比較して少なくとも約2~約20倍濃縮され得る。
[0549]本明細書では、細胞集団から標的細胞(例えば、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞))を選択する方法であって、標的細胞を刺激化合物と接触させるステップであって、標的細胞の選択マーカー(例えば、CD49a)を誘導して標的細胞の細胞表面に局在化させるステップ、および細胞表面の選択マーカー(例えば、CD49a)の局在化に基づいて標的細胞(例えば、分化β細胞(例えば、幹細胞由来β細胞))を選択するステップを含む方法が提供される。一部の実施形態では、選択マーカーはCD49aを含む。一部の実施形態では、標的細胞を選択するステップは細胞選別によって行われる。一部の実施形態では、選択するステップは、選択マーカーが標的細胞の表面に局在化する場合、標的細胞の選択マーカーを抗原結合ポリペプチドと接触させるステップを含む。一部の実施形態では、抗原結合ポリペプチドは抗体を含む。一部の実施形態では、抗原結合ポリペプチドはCD49aに結合する。一部の実施形態では、方法は、選択マーカーを標的細胞集団の少なくとも1個の細胞の細胞表面から除去する化合物(例えば、酵素)を用いて細胞集団を処理するステップをさらに含む。一部の実施形態では、標的細胞集団は、標的細胞と刺激化合物との接触前に化合物を用いて処理される。一部の実施形態では、化合物は、選択マーカーを少なくとも1個の細胞の細胞表面から切断する。一部の実施形態では、標的細胞は内分泌細胞である。一部の実施形態では、刺激化合物はグルコースを含む。一部の実施形態では、内分泌細胞はβ細胞である。一部の実施形態では、β細胞はSC-β細胞である。一部の実施形態では、標的細胞を選択するステップは、標的細胞を細胞集団の1個または複数の細胞から分離する。
医薬組成物
[0550]一部の実施形態では、本開示は、非天然膵ベータ細胞集団ならびに細胞成分および産物を疾患(例えば、糖尿病)の処置のための様々な方法に利用することができる医薬組成物を提供する。ある特定の場合は、生細胞(例えば、単独または他の細胞型と混合した非天然膵ベータ細胞)を含む医薬組成物を包含する。他の場合は、非天然膵ベータ細胞成分(例えば、細胞溶解物、可溶性細胞画分、条件培地、ECM、もしくは前出のもののうちのいずれかの成分)、または産物(例えば、非天然膵ベータ細胞によって、もしくは遺伝子修飾、非天然膵ベータ細胞培養由来の条件培地を介して産生される栄養因子および他の生物学的因子)を含む医薬組成物を包含する。いずれの場合でも、医薬組成物は、当業者に公知の他の活性剤、例えば、抗炎症剤、外因性低分子アゴニスト、外因性低分子アンタゴニスト、抗アポトーシス剤、抗酸化剤、および/または増殖因子をさらに含み得る。
[0551]本開示の医薬組成物は、薬学的に許容される担体(例えば、培地または賦形剤)と共に製剤化される非天然膵ベータ細胞またはその成分もしくは産物を含むことができる。生体適合性担体または培地という用語と交換可能に使用され得る薬学的に許容される担体(または培地)という用語は、治療的に投与される細胞および他の薬剤と適合性があるだけでなく、過剰な毒性も、刺激も、アレルギー応答も、他の合併症も伴わずにヒトおよび動物の組織と接触させる使用に好適でもある試薬、細胞、化合物、材料、組成物、および/または剤形を指す。好適な薬学的に許容される担体としては、水、塩溶液(例えば、リンガー液)、アルコール、油、ゼラチン、および炭水化物、例えば、ラクトース、アミロース、またはデンプン、脂肪酸エステル、ヒドロキシメチルセルロース、ならびにポリビニルピロリジン(polyvinyl pyrolidine)を挙げることができる。そのような調製物は、滅菌することができ、所望される場合、補助剤、例えば、滑沢剤、保存剤、安定剤、湿潤剤、乳化剤、浸透圧に影響を与えるための塩、緩衝液、および着色剤と混合することができる。細胞の成分または産物を含むが生細胞を含まない医薬組成物は液体として製剤化することができる。生きている非天然膵ベータ細胞を含む医薬組成物は、液体、半固体(例えば、ゲル、ゲルカプセル、もしくはリポソーム)、または固体(例えば、マトリックス、足場等)として製剤化することができる。
[0552]医薬組成物は当業者に知られている補助成分を含み得る。例えば、医薬組成物は抗酸化剤を、使用される抗酸化剤の種類に応じて変動する範囲で含有し得る。一般的に使用される抗酸化剤の合理的な範囲は、EDTAでは約0.01質量/容量%~約0.15質量/容量%、亜硫酸ナトリウムでは約0.01質量容量%~約2.0質量容量%、メタ重亜硫酸ナトリウムでは約0.01質量/容量%~約2.0質量/容量%である。当業者は、上記のそれぞれに対して約0.1質量/容量%の濃度を使用することができる。他の代表的な化合物としては、メルカプトプロピオニルグリシン、N-アセチルシステイン、ベータ-メルカプトエチルアミン、グルタチオン、および類似した種が挙げられるが、腎投与に好適な他の酸化防止剤、例えば、アスコルビン酸およびその塩、または亜硫酸塩、またはメタ重亜硫酸ナトリウムもまた用いられ得る。
[0553]緩衝剤は、製剤のpHを約4.0~約8.0の範囲に維持して、標的組織での刺激を最小化するために使用され得る。直接腹腔内注射の場合、製剤は7.2~7.5のpH、好ましくは7.35~7.45のpHであるべきである。組成物はまた、腎臓への投与に好適な等張化剤を含み得る。等張化剤のうち、塩化ナトリウムは製剤を血液とほぼ等張にするのに好適である。
[0554]ある特定の場合では、医薬組成物は粘度増強剤と共に製剤化される。例示的な薬剤は、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、メチルセルロース、およびポリビニルピロリドンである。医薬組成物は、必要とされる場合、共溶媒が添加されてもよい。好適な共溶媒としては、グリセリン、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリソルベート、プロピレングリコール、およびポリビニルアルコールを挙げることができる。保存剤、例えば、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、クロロブタノール、酢酸もしくは硝酸フェニル水銀、チメロサール、またはメチルもしくはプロピルパラベンもまた含まれ得る。
[0555]細胞、細胞成分、または細胞産物を含む医薬組成物は、当技術分野で公知のいくつかの送達の方法のうちの1つまたは複数で患者の腎臓に送達することができる。一部の場合では、組成物は腎臓(例えば、腎被膜上および/または腎被膜の真下)に送達される。別の実施形態では、組成物は、定期的な腹腔内または腎内注射を介して腎臓内の様々な位置に送達され得る。あるいは、組成物は、当業者に公知の他の剤形、例えば、予め形成されたかまたはin situで形成されたゲルまたはリポソームで適用され得る。
[0556]生細胞を半固体または固体担体中に含む医薬組成物は、腎被膜の上または下への外科的埋込のために製剤化することができる。液体組成物もまた外科的手順によって投与できることが理解されるべきである。特定の場合では、半固体または固体医薬組成物は、非生分解性であっても生分解性であってもよい半透過性ゲル、格子、細胞足場等を含み得る。例えば、ある特定の場合では、外来細胞を周囲から隔離するが、外来細胞が生体分子(例えば、インスリン)を分泌して周囲細胞または血流に送達することは可能とすることが望ましいかまたは適切である場合がある。これらの場合では、細胞は、移植細胞を宿主組織から物理的に分離する非分解性の選択的透過性障壁によって囲まれる、生きている非天然膵ベータ細胞または非天然膵ベータ細胞を含む細胞集団を含む自律型埋込剤として製剤化され得る。そのような埋込剤は、薬理学的に誘導される免疫抑制の非存在下で免疫細胞および高分子が移植細胞を死滅させることを防止する能力を有するため、「免疫保護的」と称される場合がある。
[0557]他の場合では、様々な分解性ゲルおよびネットワークが本開示の医薬組成物のために使用され得る。例えば、徐放性製剤に特に好適な分解性材料としては、生体適合性ポリマー、例えば、ポリ(乳酸)、ポリ(乳酸-co-グリコール酸)、メチルセルロース、ヒアルロン酸、コラーゲン等が挙げられる。
[0558]他の場合では、生分解性、好ましくは生体吸収型または生体吸収性の足場またはマトリックス上または中の細胞を送達することが望ましいかまたは適切である場合がある。これらの典型的には三次元の生体材料は、足場に付着するか、足場内に分散するか、または足場に捕捉された細胞外基質に取り込まれる、生きている細胞を含有する。身体の標的領域に埋め込まれると、これらの埋込剤は宿主組織と一体化し、移植細胞はそこで漸進的に定着していく。
[0559]本開示で使用され得る足場またはマトリックス(まとめて「枠組み」と称される場合がある)材料の例としては、不織マット、多孔性フォーム、または自己組織化ペプチドが挙げられる。不織マットは、例えば、グリコール酸と乳酸との合成吸収性コポリマー(PGA/PLA)、フォーム、および/またはポリ(イプシロン-カプロラクトン)/ポリ(グリコール酸)(PCL/PGA)コポリマーを含む繊維を使用して形成され得る。
[0560]別の実施形態では、枠組みは、生体吸収性材料、例えば、PGA、PLA、PCLコポリマーもしくはブレンド、またはヒアルロン酸から作製されるマルチフィラメント糸から構成され得るフェルトである。糸は、捲縮、裁断、梳綿、およびニードリングからなる標準的な織物加工技法を使用してフェルトとなる。別の実施形態では、細胞は、複数の材料からなる構造体であり得るフォーム足場に播種される。上述の場合のうちの多くでは、枠組みは有用な形状に成形することができる。さらに、非天然膵ベータ細胞は予め形成された非分解性の外科的または埋込可能デバイス上で培養できることが理解されるだろう。
[0561]マトリックス、足場、またはデバイスは、細胞付着性を増強するために細胞の接種前に処理されてもよい。例えば、接種前に、ナイロンマトリックスは、0.1モルの酢酸を用いて処理し、ポリリシン、PBS、および/またはコラーゲン中でインキュベートして、ナイロンをコーティングすることができる。ポリスチレンは硫酸を使用して同様に処理することができる。枠組みの外面はまた、細胞の付着性または成長、および組織の分化を向上させるために、例えば、枠組みをプラズマコーティングすることによって、あるいは1つもしくは複数のタンパク質(例えば、コラーゲン、弾性線維、細網線維)、糖タンパク質、グリコサミノグリカン(例えば、ヘパリン硫酸、コンドロイチン-4-硫酸、コンドロイチン-6-硫酸、デルマタン硫酸、ケラチン硫酸)、細胞基質、ならびに/または他の材料、例えば、これらに限定されないが、とりわけ、ゼラチン、アルギネート、寒天、アガロース、および植物ゴムの添加によって修飾してもよい。
[0562]一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの細胞組成物(例えば、in vitroで分化した島細胞を含む組成物)は、培地をさらに含む。一部の実施形態では、培地は、糖を含む。一部の実施形態では、糖は、スクロースまたはグルコースである。一部の実施形態では、培地は、約0.05%~約1.5%の濃度の糖を含む。一部の実施形態では、培地はCMRL培地であるか、または培地はHypoThermosol(登録商標)FRS Preservation Mediaである。
[0563]一部の実施形態では、本開示の細胞集団は、細胞クラスターになっている。一部の実施形態では、細胞クラスターは、直径125~225ミクロン、130~160、170~225、140~200、140~170、160~220、170~215、または170~200ミクロンである。
[0564]一部の実施形態では、本開示は、健康な対照成体対象の膵臓由来のNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞よりも低いレベルのMAFAを発現するNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞を含む組成物を提供する。一部の実施形態では、本開示の集団は、健康な対照成体対象の膵臓由来のNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞よりも高いレベルのMAFBを発現するNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞を含む。一部の実施形態では、本開示の集団は、健康な対照成体対象の膵臓由来のNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞よりも高いレベルのSIX2、HOPX、IAPPおよび/またはUCN3を発現するNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞を含む。一部の実施形態では、本開示の集団は、MAFAを発現しないNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞を含む。一部の実施形態では、本開示の集団は、MAFBを発現するNKX6.1陽性、ISL1陽性細胞を含む。一部の実施形態では、本開示の細胞集団は、幹細胞からin vitroで得られる。一部の実施形態では、幹細胞は、遺伝子修飾されている。一部の実施形態では、幹細胞は、遺伝子修飾されていない幹細胞と比して、ベータ-2ミクログロブリン、CIITA、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DP、HLA-DQ、およびHLADRのうちの1つまたは複数の低減した発現を有する。一部の実施形態では、幹細胞は、遺伝子修飾されていない幹細胞と比して、CD47、PDL1、HLA-G、CD46、CD55、CD59およびCTLAの増加した発現を有する。一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの細胞マーカー(例えば、NKX6.1、PDX1、MAFA、MAFB、SIX2、HOPX、IAPPおよび/またはUCN3)は、フローサイトメトリーによって検出される。
[0565]一態様では、本開示は、少なくとも1個の膵β細胞を含む細胞クラスターを含むデバイスを提供した。本明細書で提供されるデバイスは、対象に埋め込まれる場合にインスリンを産生および放出するように構成することができる。デバイスは、少なくとも1個の膵β細胞、例えば、非天然膵β細胞を含む細胞クラスターを含むことができる。デバイス中の細胞クラスターはin vitro GSISを呈することができる。デバイスは、半透膜をさらに含むことができる。半透膜は、細胞クラスターをデバイスに保持し、かつ細胞クラスターによって分泌されるインスリンの通過を可能にするように構成することができる。一部の場合のデバイスでは、細胞クラスターは半透膜によって封入され得る。封入は、当業者に利用可能なあらゆる技法によって行うことができる。半透膜はまた、当業者であれば理解および立証し得るように、任意の好適な材料から作製することができる。例えば、半透膜は、多糖またはポリカチオンから作製することができる。一部の場合では、半透膜は、ポリ(ラクチド)(PLA)、ポリ(グリコール酸)(PGA)、ポリ(ラクチド-co-グリコリド)(PLGA)、および他のポリヒドロキシ酸、ポリ(カプロラクトン)、ポリカーボネート、ポリアミド、ポリ無水物、ポリホスファゼン、ポリアミノ酸、ポリオルトエステル、ポリアセタール、ポリシアノアクリレート、生分解性ポリウレタン、アルブミン、コラーゲン、フィブリン、ポリアミノ酸、プロラミン、アルギネート、アガロース、ゼラチンを含有するアガロース、デキストラン、ポリアクリレート、エチレン-酢酸ビニルポリマー、および他のアシル置換酢酸セルロース、ならびにそれらの誘導体、ポリウレタン、ポリスチレン、ポリ塩化ビニル、ポリフッ化ビニル、ポリ(ビニルイミダゾール)、クロロスルホン化ポリオレフィン、ポリ酸化エチレン、またはそれらの任意の組合せから作製することができる。一部の場合では、半透膜はアルギネートを含む。一部の場合では、細胞クラスターは、半透膜によって囲まれるアルギネートコアを含むマイクロカプセルに封入される。一部の場合では、アルギネートコアは、例えば、RGD配列(アルギニン、グリシン、アスパラギン酸)を有するオリゴペプチドを共有結合によりコンジュゲートさせたアルギネートコアを含む足場を生成するように修飾される。一部の場合では、アルギネートコアは、例えば、増強した安定性を有する化学酵素的に操作されたアルギネートを有する、共有結合により強化されたマイクロカプセルを生成するように修飾される。一部の場合では、アルギネートコアは、例えば、アクリレート官能化リン脂質のin situ重合によって組織化される膜模倣フィルムを生成するように修飾される。一部の場合では、マイクロカプセルは、エピメラーゼを使用して酵素的に修飾されたアルギネートから構成される。一部の場合では、マイクロカプセルは、マイクロカプセル膜の隣接層間に共有結合を含む。一部の実施形態では、マイクロカプセルは、フェノール部分と結合したアルギネートを含むサブシーブサイズのカプセルを含む。一部の場合では、マイクロカプセルはアルギネート-アガロースを含む足場を含む。一部の場合では、SC-β細胞は、PEGを用いて修飾された後にアルギネート内に封入される。一部の場合では、細胞、例えばSC-β細胞の単離された集団は光反応性リポソームおよびアルギネートに封入される。マイクロカプセルに用いられるアルギネートは、限定されないが、ポリエチレングリコール(PEG)、キトサン、ポリエステルホローファイバー、コラーゲン、ヒアルロン酸、ROD、BHD、およびポリエチレングリコール-ジアクリレート(PEGDA)を含むデキストラン、ポリ(MPC-co-n-ブチルメタクリレート-co-4-ビニルフェニルボロン酸)(PMBV)およびポリ(ビニルアルコール)(PVA)、アガロース、ゼラチンを含有するアガロース、ならびにこれらが多層になったものを含む他の好適な生体材料と置き換え可能であることが理解されるべきである。
処置の方法
[0566]本明細書では、対象の疾患を処置(treating)または防止(preventing)するための方法がさらに提供される。内因性膵島に類似する細胞クラスターを含む組成物は、対象の膵機能の程度を回復するために対象に投与することができる。例えば、内因性膵島に類似する細胞クラスターは、糖尿病を処置するために対象に移植することができる。
[0567]一部の実施形態では、本明細書で開示される方法に従って調製される細胞クラスターを含む組成物は、対象に投与した場合、臨床転帰の改善を達成する。例えば、一部の場合では、移植膵島の生存率は、代替組成物(例えば、代替法によって調製)と比較して増加する。一部の実施形態では、移植に応答して、代替組成物(例えば、代替法によって調製)と比較した免疫浸潤の減少が観察される。一部の実施形態では、本明細書で開示されるいずれかの細胞は、デバイス(例えば、本明細書で開示されるいずれかのデバイス)において投与される。
[0568]方法は、本出願に開示される細胞クラスターを対象、例えばそれを必要とする対象に移植するステップを含むことができる。「移植すること」および「投与すること」という用語は、交換可能に使用することができ、導入される細胞または細胞クラスターを所望の部位に少なくとも部分的に局在化させる方法または経路による、細胞もしくは細胞クラスター、その細胞もしくは細胞クラスターの任意の部分、または細胞、細胞クラスター、もしくはそれらの任意の部分を含む任意の組成物の対象への留置を指すことができる。細胞または細胞クラスターは、膵臓に直接埋め込むことも、あるいは埋め込まれる細胞の少なくとも一部または1個の細胞が生存可能なままとなる対象の所望の位置に送達させる任意の適切な経路によって投与することもできる。対象への投与後の細胞または細胞クラスターの生存の期間は、短い場合には数時間、例えば24時間~数日、長い場合には数年までであり得る。一部の場合では、細胞もしくは細胞クラスター、またはその細胞もしくは細胞クラスターの任意の部分はまた、例えば、埋め込まれる細胞または細胞クラスターを埋込位置に維持して遊走を回避するためのカプセル(例えば、マイクロカプセル)において、肝臓中または皮下等の膵臓の位置ではない別の部位に投与(transadminister)することができる。
[0569]本明細書の方法によって処置することができる対象はヒトであっても非ヒト動物であってもよい。一部の場合では、対象は哺乳動物であり得る。対象の例としては、これらに限定されないが、霊長類、例えば、サル、チンパンジー、バンブー(bamboo)、またはヒトが挙げられる。一部の場合では、対象はヒトである。対象は、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、ウサギ等を含むがこれらに限定されない非霊長類動物であり得る。一部の場合では、処置を受ける対象はそれを必要とする対象、例えばそれを必要とするヒトである。
[0570]本明細書で使用される場合、「処置すること」および「処置」という用語は、対象に有効量の組成物(例えば、細胞クラスターまたはその一部)を投与し、その結果、対象が疾患の少なくとも1つの症状の低減または疾患の改善、例えば有益なまたは所望の臨床結果を得ることを指すことができる。本開示の目的の場合、有益なまたは所望の臨床結果としては、これらに限定されないが、検出可能か検出不能かにかかわらず、1つまたは複数の症状の軽減、疾患の程度の減少、疾患の安定した(例えば、悪化しない)状態、疾患進行の遅延または緩徐化、疾患状態の改善または緩和、および寛解(例えば、部分的または完全)が挙げられる。処置することは、生存期間を、処置を受けない場合に予期される生存期間と比較して延長することを指すことができる。したがって、当業者は、処置は疾患の状態を向上し得るが疾患の完全な治癒でなくてもよいことを認識する。本明細書で使用される場合、「処置」という用語には予防が含まれる。
[0571]本明細書で提供される方法および組成物は、疾患を有するかまたは疾患を発症するリスク(例えば、増加したリスク)を有する対象を処置するために使用され得る。一部の場合では、疾患は、I型糖尿病、II型糖尿病、1.5型糖尿病、境界型糖尿病、嚢胞性線維症関連糖尿病、外科的糖尿病、妊娠糖尿病、およびミトコンドリア糖尿病を含むがこれらに限定されない糖尿病である。疾患はまた、心血管疾患、糖尿病性腎症、糖尿病性神経障害、糖尿病網膜症、足損傷、および聴覚損傷を含む糖尿病合併症であってもよい。
[0572]方法は、当技術分野の任意の手段を使用して細胞クラスターを対象に移植するステップを含むことができる。例えば、方法は、腹腔内空間、腎被膜下、腎被膜、網、皮下空間を介するか、または膵床注入を介して細胞クラスターを移植するステップを含むことができる。例えば、移植するステップは、被膜下移植、筋肉内移植、または門脈内移植、例えば門脈内注入であり得る。免疫保護封入は細胞クラスターに対する免疫保護を実現するために実施することができる。
[0573]一部の実施形態では、本明細書で開示される細胞、クラスター、または組成物のいずれかは、処置の方法以外の方法に利用されてもよい。一部の実施形態では、細胞、クラスターまたは組成物は、幹細胞、多能性細胞、多分化能性細胞、または単能性細胞のin vitroまたはin vivoでの発生の評価における有用性を有する。例えば、一部の実施形態では、本開示は、試薬に応答した細胞における効果(例えば、特定の遺伝子の発現)を研究するための、細胞(例えば、PDX.1;NKX6.1膵臓前駆細胞またはインスリン膵臓内分泌前駆細胞)と、本明細書で開示される試薬のうちのいずれか1つまたは複数(例えば、本明細書で開示される代謝産物のうちのいずれか1つまたは複数)とを含む組成物を提供する。
デバイス
[0574]一部の実施形態では、本開示は、本明細書で開示される細胞、クラスターまたは組成物のいずれかを含むデバイスを提供する。例示的なデバイスは、WO2019068059A1、WO2020206150、WO2020/206150、およびWO2020/206157に記載されており、それぞれは全体が参照により本明細書に組み込まれる。
[0575]一部の実施形態では、本開示のデバイスは、対象に埋め込まれる場合にインスリンを産生および放出するように構成されている。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、半透膜であり、半透膜は、本明細書で開示されるいずれかの細胞をデバイスに保持し、かつ細胞によって産生されたインスリンがデバイスを通過することを可能にするように構成されている。
[0576]ある特定の態様では、複数のチャネルを含む第1の表面および第1の表面に対向する複数の第2の表面を有する第1の膜と、第1の膜の複数の第2の表面に対向し、それに付着した第2の膜とを備える細胞収容デバイスであって、第1の膜および第2の膜は、少なくとも約40cm-1の表面積対体積比を有する囲まれた区画を形成し、囲まれた区画は、細胞をデバイス内に収容するための容積を提供する細胞収容デバイスが本明細書に記載される。
[0577]一部の実施形態では、区画は、単一の連続開放空間を含む。一部の実施形態では、容積は、約8μL~約1,000μLである。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、長さおよび幅のうちの少なくとも一方が約0.25cm~約3cmである。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、少なくとも約300μmの厚さを有する。一部の実施形態では、複数のチャネルは、第1の膜に対して略垂直である。一部の実施形態では、複数のチャネルは、直線配列で配置される。一部の実施形態では、複数のチャネルは、極性配列で配置される。一部の実施形態では、チャネルは、約400μm~約3,000μmの平均直径を有する。一部の実施形態では、直径は、チャネルの最も狭い点で測定される。一部の実施形態では、各チャネルの中心は、別のチャネルの中心から約75μm~約500μmの距離だけ離れている。一部の実施形態では、チャネルは、少なくとも約0.2の高さ対直径比を有する。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、横断面の面積当たりいくつかのチャネルを有し、これは約50個/cm超である。一部の実施形態では、第1の膜および第2の膜のうちの少なくとも一方は、複数のフィブリルによって相互接続された複数のノードを含む。一部の実施形態では、第1の膜および第2の膜のうちの少なくとも一方は、PVDF、PTFE、ePTFE、PCL、PE/PES、PP、PS、PMMA、PLGA、PLLA、またはそれらの任意の組合せを含む。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、チャネル内に第1の膜および第2の膜を貫通する開口部をさらに備える。一部の実施形態では、開口部は、チャネルに対してチャネルの直径の最大25%の同心度を有する。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、デバイスを受けるように構成されているフレームをさらに備える。一部の実施形態では、フレームは、複数の細胞収容デバイスを受けるように構成されている。一部の実施形態では、フレームは、細胞収容デバイスの座屈を防止するように構成されている屈曲機構を備える。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、細胞集団をさらに含む。一部の実施形態では、細胞集団は、インスリン分泌集団である。一部の実施形態では、細胞集団は、グルコース刺激性インスリン分泌(GSIS)が可能な幹細胞由来細胞である。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、親水性ポリマーを含むコーティングをさらに含む。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、約2×10-6cm/s~約1×10-5cm/sのインスリン拡散係数を有する。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、約150μm未満の最大インスリン拡散距離を有する。一部の実施形態では、第1の膜および第2の膜は、少なくとも約0.4Nの融合剥離力(fusion peel force)で融合される。一部の実施形態では、第1の膜および第2の膜のうちの少なくとも一方は、半透過性である。一部の実施形態では、第1の膜、第2の膜、またはそれらの両方の半透過性は、細胞を免疫攻撃から保護するように構成されている。一部の実施形態では、第1の膜、第2の膜、またはそれらの両方の半透過性は、免疫抑制療法の非存在下で、細胞を免疫攻撃から保護するように構成されている。一部の実施形態では、第1の膜および第2の膜のうちの少なくとも一方は、デバイス内の細胞の血管新生を可能にするように構成されている。一部の実施形態では、第1の膜および第2の膜のうちの少なくとも一方は、免疫抑制療法の非存在で、デバイス内の細胞の血管新生を可能にするように構成されている。
[0578]本明細書で提供される別の態様は、複数のチャネルを含む第1の表面および第1の表面に対向する複数の第2の表面を有する第1の膜と、第1の膜の複数の第2の表面に対向し、それに付着した第2の膜とを備える細胞収容デバイスであって、第1の膜および第2の膜は、囲まれた区画を形成し、囲まれた区画は、100万~10億個のインスリン産生細胞をデバイス内に収容するための容積を提供し、前記膜は、インスリン産生細胞をデバイス内に保持すると同時に、インスリンのデバイスからの拡散を可能にする細胞収容デバイスである。
[0579]一部の実施形態では、本開示のデバイスは、埋込可能なマイクロカプセル化デバイスである。一部の実施形態では、埋込可能なマクロカプセル化デバイスは、第1の外膜、第2の外膜、および第1の外膜と第2の外膜との間に取り付けられた第1の半透膜を備え、第1の半透膜および第1の外膜は、接続されて、細胞集団を収容するための一次区画を提供するように構成された一次区画を形成し、第1の半透膜および第2の外膜は、接続されて、二次区画を形成し、細胞集団は、膵臓前駆細胞、内分泌細胞、もしくはベータ細胞、またはそれらの任意の組合せを含み、デバイスは、第1の外膜、第2の外膜、および第1の半透膜を貫通する複数の貫通孔を備える。一部の実施形態では、第1の外膜、第2の外膜、および第1の半透膜は、前記細胞集団がデバイスを通過することを阻止するように構成されている。
[0580]一部の実施形態では、本開示のデバイスは、第1の半透膜と第2の外膜との間に取り付けられて、一次区画と二次区画との間に三次区画を形成する第2の半透膜をさらに備える。一部の実施形態では、第1の半透膜の透水率は、第1の外膜の透水率、第2の外膜の透水率、またはそれらの両方よりも大きい。一部の実施形態では、第1の半透膜の透水率は、第1の外膜の透水率、第2の外膜の透水率、またはそれらの両方よりも少なくとも約25%大きい。一部の実施形態では、第1の半透膜の透水率は、第2の半透膜の透水率よりも大きい。一部の実施形態では、第1の半透膜の透水率は、第2の半透膜の透水率よりも小さい。一部の実施形態では、第1の半透膜の気孔率は、第1の外膜の気孔率、第2の外膜の気孔率、またはそれらの両方よりも大きい。一部の実施形態では、第1の半透膜の気孔率は、第1の外膜の気孔率、第2の外膜の気孔率、またはそれらの両方よりも少なくとも約25%大きい。一部の実施形態では、第1の半透膜の気孔率は、第2の半透膜の気孔率よりも大きい。一部の実施形態では、第1の半透膜の気孔率は、第2の半透膜の気孔率よりも小さい。一部の実施形態では、所与の物質および偏向(例えば濃度勾配および/または圧力差)に対する第1の半透膜の流束は、同じ物質および偏向に対する第1の外膜の流束、第2の外膜の流束、またはそれらの両方よりも大きい。一部の実施形態では、所与の物質および偏向(例えば濃度勾配および/または圧力差)に対する第1の半透膜の流束は、同じ物質および偏向に対する第1の外膜の流束、第2の外膜の流束、またはそれらの両方よりも少なくとも約25%大きい。一部の実施形態では、所与の物質および偏向(例えば濃度勾配および/または圧力差)に対する第1の半透膜の流束は、同じ物質および偏向に対する第2の半透膜の流束よりも大きい。一部の実施形態では、所与の物質および偏向(例えば濃度勾配および/または圧力差)に対する第1の半透膜の流束は、同じ物質および偏向に対する第2の半透膜の流束よりも小さい。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、一次区画と流体連通する一次ポート、二次区画と流体連通する二次ポート、またはそれらの任意の組合せをさらに備える。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、一次区画と流体連通する一次ポート、二次区画と流体連通する二次ポート、三次区画と流体連通する三次ポート、またはそれらの任意の組合せをさらに備える。一部の実施形態では、一次ポート、二次ポート、または三次ポートのうちの少なくとも1つは、シール可能または再シール可能である。
[0581]本明細書で提供される別の態様は、1個または複数の細胞を収容するように構成されている一次区画と、二次区画とを備える埋込可能なマクロカプセル化デバイスであって、一次区画および二次区画は、第1の半透膜によって分離されており、二次区画および第1の半透膜は、i)一次区画から濾液を濾過するように構成されているか、またはii)一次区画内の1個もしくは複数の細胞に助剤を提供するように構成されているか、あるいはi)とii)の両方であり、前記1個または複数の細胞は、前記デバイス内に容量1μL当たり約10~約10個の範囲で封入されている埋込可能なマクロカプセル化デバイスである。
[0582]一部の実施形態では、本開示のデバイスは、三次区画をさらに備え、三次区画および二次区画は、第2の半透膜によって分離されており、第2の半透膜は、i)三次区画から濾液を濾過するように構成されているか、またはii)三次区画内の1個もしくは複数の細胞に助剤を提供するように構成されているか、あるいはi)とii)の両方である。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、一次区画と流体連通する一次ポート、または二次区画と流体連通する二次ポートのうちの少なくとも1つをさらに備える。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、一次区画と流体連通する一次ポート、二次区画と流体連通する二次ポート、または三次区画と流体連通する三次ポートのうちの少なくとも1つをさらに備える。一部の実施形態では、一次ポート、二次ポート、または三次ポートのうちの少なくとも1つは、シール可能または再シール可能である。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、デバイスの一方の側からデバイスの反対側まで層状の膜を貫通して延びる複数の貫通孔を備える。
[0583]一部の実施形態では、貫通孔のうちの1つまたは複数は、シールを形成する膜の接合部分によって囲まれている。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、3つ以上のシールを備える。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、2つ以上の自己交差シール(self-intersecting seal)を備える。一部の実施形態では、本開示のデバイスは、2つ以上の楕円形シールを備える。一部の実施形態では、シールは、接着剤、エポキシ、溶接、それらの任意の組合せ、および/または任意の他の適切な接合方法によって形成される。一部の実施形態では、第1の半透膜は、前記1個または複数の細胞の通過を阻止するように構成されている。一部の実施形態では、一次区画および二次区画は、前記1個または複数の細胞の通過を阻止するように構成されている。一部の実施形態では一次区画、二次区画、および三次区画は、前記1個または複数の細胞の通過を阻止するように構成されている。
[0584]本明細書で提供される別の態様は、1個または複数の細胞を収容するように構成されている一次区画と、二次区画とを備えるマクロカプセル化デバイスを用意するステップであって、一次区画および二次区画は、第1の半透膜によって分離されており、二次区画および半透膜は、i)一次区画から濾液を濾過するように構成されているか、またはii)一次区画内の1個もしくは複数の細胞に助剤を提供するように構成されているか、あるいはi)とii)の両方であるステップと、マクロカプセル化デバイスに事前に血管新生誘導処理を施す(pre-vascularize)ステップと、1個または複数の細胞を一次区画に充填するステップと、二次区画に圧力を印加して、一次区画から濾液を除去するステップとを含む方法である。
[0585]一部の実施形態では、濾液は、一次区画から除去される。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、またはそれらの両方に助剤を投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、助剤は、薬物、酸素生成物質、抗凝固剤、栄養素、またはそれらの任意の組合せを含む。一部の実施形態では、助剤を投与するステップは、二次区画に負圧を印加した後に行われるが、二次区画の、マクロカプセル化デバイスの別の区画に対する所望の圧力差を実現するあらゆる方法もまた使用され得る。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、またはそれらの両方を膨張させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、一次区画、二次区画、またはそれらの両方を膨張させるステップは、マクロカプセル化デバイスの事前の血管新生誘導処理の前に行われる。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、またはそれらの両方をシールするステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次ポート、二次ポート、またはそれらの両方を再シールするステップをさらに含む。一部の実施形態では、収容部は、第2の半透膜によって二次区画から分離されている三次区画をさらに含み、本開示の方法は、1個または複数の細胞を三次区画に充填するステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、または三次区画、またはそれらの任意の組合せに助剤を投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、もしくは三次区画、またはそれらの任意の組合せを膨張させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、もしくは三次区画、またはそれらの任意の組合せをシールするステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次ポート、二次ポート、三次区画、またはそれらの任意の組合せを再シールするステップをさらに含む。
[0586]本明細書で提供される別の態様は、第1の外膜、第2の外膜、および第1の外膜と第2の外膜との間に取り付けられた第1の半透膜を備えるマクロカプセル化デバイスを用意するステップであって、第1の半透膜および第1の外膜は、接続されて、細胞集団を収容するために構成された一次区画を形成し、第1の半透膜および第2の外膜は、接続されて、二次区画を形成するステップと、マクロカプセル化デバイスに事前に血管新生誘導処理を施すステップと、1個または複数の細胞を一次区画に充填するステップと、二次区画に圧力差を印加して、一次区画から濾液を除去するステップとを含む方法である。
[0587]一部の実施形態では、濾液は、一次区画から除去される。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、もしくは二次区画、またはそれらの両方に助剤を投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、助剤は、薬物、酸素生成物質、抗凝固剤、栄養素、またはそれらの任意の組合せを含む。一部の実施形態では、助剤を投与するステップは、二次区画に負圧または他の圧力差を印加した後に行われる。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、もしくは二次区画、またはそれらの両方を膨張させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、一次区画、もしくは二次区画、またはそれらの両方を膨張させるステップは、マクロカプセル化デバイスの事前の血管新生誘導処理の前に行われる。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、もしくは二次区画、またはそれらの両方をシールするステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次ポート、二次ポート、またはそれらの両方を再シールするステップをさらに含む。一部の実施形態では、マクロカプセル化デバイスは、第2の半透膜によって二次区画から分離されている三次区画をさらに含み、本開示の方法は、1個または複数の細胞を三次区画に充填するステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、もしくは三次区画、またはそれらの任意の組合せに助剤を投与するステップをさらに含む。一部の実施形態では、濾液は、一次区画、三次区画、またはそれらの両方から除去される。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、三次区画、またはそれらの任意の組合せを膨張させるステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次区画、二次区画、もしくは三次区画、またはそれらの任意の組合せをシールするステップをさらに含む。一部の実施形態では、本開示の方法は、一次ポート、二次ポート、三次区画、またはそれらの任意の組合せを再シールするステップをさらに含む。
実施例
[0588]以下の実施例は、記載された実施形態を、本開示の範囲を限定することなくさらに例示する。
実施例1.ステージ5培養条件の変更
[0589]SC-β細胞を生成する方法の改良は、より効果的な治療産物(例えば、機能性が向上したSC-β細胞)、ヒト治療用途のためのSC島の改良された製造方法(例えば、より高い細胞収率)、またはそれらの組合せをもたらし得る。結果として得られるSC-β細胞に有益な効果をもたらすステージ5培養条件に対する変更を同定する研究を実施した。
[0590]ステージ5細胞は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願第17/390,839号の実施例1に記載されているバージョンAのプロトコールに従って取得され得る。本明細書で開示される分化プロトコールのステージ5(PDX.1;NKX6.1膵臓前駆体)の間に添加するための培地添加物のセットを考案した。添加物のセットは、細胞の代謝の特定の態様を標的とすることによって、分化細胞および結果として得られるSC-β細胞の適応度および代謝柔軟性を向上させるように設計した。培地添加物には、アセテート、βヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、ビオチン、およびグルタミンが含まれ、本明細書ではまとめて「MQ」と称される場合がある。利用したグルタミンは、バイオアベイラビリティを増加する、例えば、細胞ペプチダーゼによる処理の必要性を回避する非ジペプチド型であった。この実施例におけるMQ培地は、1mMのアセテート、200nMのβヒドロキシブチレート、90μMのタウリン、50μMのホルメート、800nMのビオチン、および4mMのL-グルタミンを含み、全て、本開示のステージ5培地に添加され、ステージ5培地は、Sant1、レチノイン酸およびベータセルリンを初めの2日間含有し、XXI、Alk5i、GC-1、LDN-193189、チアゾビビン、スタウロスポリン、およびDZNEPを7日間含有した。MQの添加後、培地を濾過し、4℃で保存し、2~4日の最大保存期間の後に使用した。
[0591]初期研究では、ヒト胚性幹細胞(hESC)代謝に対するMQの効果をSeahorseアッセイ(Agilent)において評価した。hESCをMQと共に、またはそれを伴わずに48時間培養した。MQの存在下で培養したhESCは、基礎代謝速度(basal metabolic rage)の増加(図1A、例えば、グラフの左側を参照されたい)、およびATP関連酸素消費の増加(図1B)を呈し、MQが細胞内代謝を変更し得ることを示した。加えて、MQと共にインキュベートした培養は、細胞密度の増加を呈し、成長の増強を示唆した(図1C)。グルタミンおよびアセテートをMQカクテルから除去した場合、細胞密度は添加物の完全セットと比較して低下し(図1C)、グルタミンおよびアセテートが、細胞に対するMQの観察された効果に寄与することを示唆した。
[0592]次に、MQのSC-β細胞分化および機能性を増強する能力を評価した。ステージ4膵臓前駆体2細胞を、本明細書に記載したように、幹細胞から分化させた。ステージ5の間、膵臓前駆体2細胞を、とりわけ、膵臓内分泌β細胞(「SC-β細胞」)へとさらに分化させた。
[0593]MQをステージ5全体にわたって培地に添加し、SC-β細胞分化に対する影響を評価した。図2Aは、MQと共に(+代謝産物)またはMQの非存在下(対照)でインキュベートした培養の、ステージ5の終了時に評価した試料からの例示的な分散プロットを提供する。SC-β細胞は、右上の象限に示される(Nkx6.1+/Isl1+)。図に示すように、ステージ5全体にわたるMQの培地への添加は、SC-β細胞のパーセントを、対照培養における25.9%からMQを伴う培養における38.1%まで、実質的に増大させた。図2Bは、対照条件(MQを伴わない)において実施した繰り返しからの、ステージ5の最後に取得されたNkx6.1+/Isl1+SC-β細胞のパーセンテージを定量し、MQの非存在下で達成されたSC-β%が、図2AにおいてMQを用いて観察されたものよりも再現性よく低いことを示す。これらのデータは、ステージ5の間のMQの添加がSC-β細胞分化を増強し得ることを示唆する。
[0594]図3は、MQがステージ5全体にわたって添加された(かまたは存在しない)別々の実験の例示的なフローサイトメトリー結果を提供する。この場合において、Nkx6.1+/Isl1+SC-β細胞のパーセントは、対照条件における29.8%からMQの存在下における41.6%まで増加した。加えて、Nkx6.1-/Isl1-(二重陰性)細胞のパーセンテージは、対照における26.4%からMQの存在下における18.4%まで減少し、より多くの細胞が分化を受けていることと一致した。このアッセイにおいて、アセテートとグルタミンとを除いたMQ添加物が培地に存在する第3の条件を評価した(-アセテート、-Q)。この条件における細胞の34.3%はNkx6.1+/Isl1+であり、アセテートおよびグルタミンが、MQを用いて観察されたSC-β細胞分化の増加に寄与することを示唆した。
[0595]図4は、ステージ5全体にわたるMQの存在下または非存在下でのインキュベーション後の、ステージ5の最後に存在するSC-β細胞のパーセントを比較する2つの実験の要約データを提供する。
[0596]追加の研究は、ステージ5の間のMQの添加が下流のステージ6における細胞特徴に影響を及ぼすかどうかに焦点を当てた。上記のようにMQの存在下または非存在下で生成した細胞を個々の細胞に解離し、凍結保存し、解凍した。次いで、解凍した個々の細胞を、ステージ6分化を介してβ細胞クラスターへと分化させた。ステージ6培地および条件は同じであったため、観察される差異は、ステージ5におけるMQの存在に起因することになる。
[0597]Nkx6.1+/Isl1+SC-β細胞のパーセンテージをステージ6の4日目に評価した際、ステージ5にMQを用いて処理した培養において、より高い割合のSC-β細胞が観察された。図5は、ステージ6の4日目からの例示的なフローサイトメトリーデータを提供し、対照培養における37%と比較して、MQがステージ5に存在した培養(+代謝産物)では、細胞の47.3%がNkx6.1+/Isl1+であったことを示す。
[0598]総細胞およびSC-β細胞の収率もまた、MQがステージ5に存在した培養においてより高かった。図6Aは、ステージ6の開始時に播種した生存可能細胞の数に対する、ステージ6の4および10日目における全ての細胞の回収パーセントを実証する。2回の計数を各日(4日目および10日目)に行い、各条件について平均した。点は平均を表す。図6Bは、総細胞収率とSC-β細胞であった細胞のパーセントとの積から算出した、ステージ6の4日目におけるSC-β細胞の数を定量する。
[0599]ステージ6の間の細胞に対するMQ添加の効果をさらに特徴付ける同様の研究を実施した。この研究では、解凍後、ステージ6の間、細胞を対照培地1または培地A(例えば、図11において特徴付けられる対照培地1または培地A)のいずれかで培養した。この場合もまた、ステージ5の間にMQを用いて培養した細胞において、より高いパーセンテージのSC-β細胞が観察された。図7Aは、ステージ6の7日目に分析した細胞の例示的なフロープロットを示し、MQと共にインキュベートしなかった細胞における34.3%と比較して、MQがステージ5に存在した培養では、細胞の45.1%がNkx6.1+/Isl1+であったことを示す。図7Bは、ステージ6の4、7、および10日目におけるNkx6.1+/Isl1+細胞のパーセンテージを示し、ステージ5のMQ処理の場合に観察されたSC-β細胞の高いパーセントが経時的に維持されていることを示す(MQ St5)。図8は、ステージ6の開始時に播種した生存可能細胞の数に対する、ステージ6の4、7、および10日目における全ての細胞の回収パーセント(収率)を例示する。より早期の研究と同様に、ステージ5においてMQと共にインキュベートした細胞(MQ St5)において、より高い収率が観察された。
[0600]ステージ5において、MQと共にインキュベートし、次いでステージ6において培地Aに解凍した細胞は、ステージ6の4日目(図9A)および7日目(図9B)に観察した際、より小さいクラスターを形成した。図10は、ステージ6の7日目におけるクラスターサイズを定量し、クラスターサイズが、ステージ5においてMQと共にインキュベートし、次いでステージ6において培地Aに解凍した細胞においてより小さいことを示す。より小さいクラスター直径は、例えば、周囲環境から細胞クラスターの中心への分子(例えば、栄養および気体)の効果的な拡散を可能にする、本開示のSC-β細胞クラスターの望ましい特徴であり得る。
[0601]これらのデータは、本開示の分化プロトコールのステージ5の間のMQの存在が、本開示の方法のステージ5およびステージ6にわたって複数の有益な効果、例えば、SC-β細胞のより高い割合、ステージ6における総細胞およびSC-β細胞のより高い収率、SC-β細胞および総細胞の収率の経時的な維持、ならびにより小さいクラスター直径をもたらし得ることを示す。
実施例2.代謝産物の添加を伴うステージ6培養条件
[0602]インスリン陽性内分泌細胞クラスターを幹細胞から分化させた。インスリン陽性内分泌細胞クラスターを個々の細胞に解離し、凍結保存し、解凍した。次いで、解凍した個々の細胞を、ステージ6分化を介してβ細胞クラスターへと分化させ、ステージ6の間、異なる培地の比較を行った。
[0603]DMEM/F12基本培地、10μMの亜鉛、代謝産物、S5d6因子(ステージ6の1~4日目の間のみ)(Alk5i(10μM)、GC-1(1μM)、LDN-193189(100nM)、チアゾビビン(thiazovinin)(2.5μM)、SSP(3nM)、DZNEP(100nM))、およびHSA(1~4日目の間は0.05%、5~11日目の間は1%)を含む改変ステージ6培地(「培地A」)を作製した(図11)。グルタメート、アセテート、βヒドロキシブチレート、L-カルニチン、タウリン、ホルメート、およびビオチンを含む選択数の代謝産物が培地Aに含まれた。代謝産物を欠く(グルタメート、アセテート、βヒドロキシブチレート、L-カルニチン、タウリン、ホルメート、およびビオチンを欠く)対照培地Aもまた配合した。
[0604]ステージ6インキュベーションを、図11に示すような、代謝産物を含有する培地A、代謝産物を欠く培地A、対照培地1、または対照培地2を使用して実施した。
[0605]図12Bに示すように、培地Aはステージ6細胞回収率を向上させる(S6d11で40%の回収率)。さらに、培地A細胞クラスターは、対照培地1または対照培地2と比較して、より小さく(S6d11までに110ミクロン)、ステージ6にわたりより高い均一性を呈する(図13、図14)。対照培地2で分化させたSC島は、対照培地1で分化させたSC島に観察されるようなGSISを呈しないが(図15、図16)、代謝産物を含有しない培地Aで培養したSC島はS6d11で向上したGSISを呈する(図17、図15)。しかしながら、代謝産物を含有する培地Aで培養したSC島は、対照培地1で培養したSC島と類似したGSISを呈する(図18、図15)。結果は、ステージ6での培地Aの使用が、より小さくより均一性の高いSC島、より高い細胞回収率、S6d11にわたるより高い細胞収率、およびステージ6全体にわたるより良好なGSISプロファイルをもたらすことを示す(図19)。
実施例3.1~4日目の間に代謝産物を添加する変更されたステージ6培養条件
[0606]代謝産物をステージ6の1~4日目の間のみ細胞に添加した実施例2のプロトコールの変種を試験した。このレジメンは「レジメン1」と称される場合がある。ステージ6の間、レジメン1に使用した培地の配合を表1に示す。培地は、ステージ6の4日目、7日目、および10日目に交換した。代謝産物および低分子は、1~4日目の培地には含まれたが、4日目の培地交換以降の培地には含まれなかった。
Figure 2024501856000010
[0607]レジメン1によって生成した細胞を、表2に示すレジメン2を使用して生成した細胞と比較した。レジメン2は、レジメン1において1~4日目の間培地に添加した代謝産物を欠く。
Figure 2024501856000011
[0608]レジメン1またはレジメン2のいずれかを使用して生成したSC島を採取し、それらの全体が本明細書に組み込まれるWO2019068059A1およびWO2020206150に記載されている細胞収容デバイスと類似した膜結合カプセル化デバイスに製剤化した。デバイスをRNUラット(異物反応のモデル)および糖尿病マウスに埋め込み、SC島の安定性および有効性をin vivoで評価した。
[0609]ヌードラットモデルを使用して、移植後のSC島細胞の生存率、ならびにデバイスおよび埋め込まれた細胞に対するある特定の免疫反応を評価した。ステージ6にレジメン1を使用して生成した細胞は、埋込の6週間後に評価した場合、レジメン2を使用して生成した細胞と比較してより高い生存率を呈した(図20A)。レジメン2について、埋込の13週間後に評価した場合、同様の生存率結果が観察された(図20B)。これらの結果は、レジメン1が、SC島のレシピエント対象へのin vivo投与において細胞生存の向上をもたらすことができ、治療有効性を増強し得ることを示唆する。
[0610]加えて、埋込の6週間後に、レジメン1を使用して生成した細胞において減少した免疫浸潤物およびより少ない多核巨細胞(MNG)が観察された(図21および図22)。チャンバーは封入された細胞の近くの領域を表し、チャネルは血管形成を支持する横断血管新生要素(transvascularizing element)である。理論に拘束されることを望むものではないが、これらの結果は、ステージ6におけるレジメン1またはレジメン1において利用した培地に存在する要素を含む方法によって生成したSC島の免疫原性の低下を示し得る。
[0611]有効性を研究するために、糖尿病NOD Scidガンマ(NSG)マウスモデルを使用した。動物に、分化のステージ6の間にレジメン1またはレジメン2を使用して生成したSC島が充填された1つ(1×)または2つ(2×)のデバイスを投与した。各デバイスには4.75×10個の細胞が充填されており、1つまたは2つのデバイスを埋め込んだ動物に対して、それぞれ4.75×10個または9.5×10個の細胞の用量をもたらす。図23は、複数のマウス群の非空腹時血中グルコースレベルを経時的に例示する。2つのデバイス(2×)を投与された動物は、埋込の約8週間後まで正常血糖を維持した。1つのデバイス(1×)を投与された動物は、埋込の約3週間後まで低減した血中グルコースレベルを呈したが、この実験では180mg/dL未満の血中グルコースレベルを維持しなかった。しかしながら、レジメン2を使用して生成したSC島が充填された1つのデバイスを投与された動物では、後期の時点においてより低い血中グルコースレベルが観察された。これらの結果は、本開示の方法によって生成したSC島が、in vivoでの糖尿病対象の血中グルコースレベルの低減における有効性を呈し得ることを示す。
[0612]ヒトCペプチドレベルもまた、インスリン産生の指標として経時的にモニタリングした。図24Aは、動物における非空腹時ヒトCペプチドレベルを経時的に例示する。Cペプチドレベルが検出不能であったナイーブ対照および糖尿病対照マウスと対照的に、埋込後の全ての実験群においてCペプチドの増加が観察され、1つまたは2つのデバイスを投与された動物においてレベルの持続が観察された(CADは、細胞収容デバイスを指す)。図24Bは、移植後153日目に測定したヒトCペプチドの空腹時レベルと移植後112日目に測定したCペプチドの非空腹時レベルとを比較し、1つまたは2つのデバイスを投与された動物のデータを含む。これらの結果は、レジメン2およびレジメン1を含む本開示の組成物および方法を使用して生み出された方法によって生成したSC島が、糖尿病対象への移植後のインスリン産生の増加における有効性を呈し得ることを示す。
[0613]SC島を、埋込の5か月(1つのデバイス)または6か月(2つのデバイス)後に細胞生存率ならびにCペプチドおよびグルカゴン産生について評価した。図25は、生存率データを提供し、分化のステージ6においてレジメン2またはレジメン1のいずれによって生成した細胞を有するデバイスにおいても高い細胞生存率を示す。図26は、Cペプチドおよびグルカゴンについて染色した(左側のパネル)かまたはH&E染色した(右側のパネル)切片の例示的な組織学画像を提供する。これらの結果は、レジメン2およびレジメン1を含む本開示の組成物および方法を使用して生成したSC島が、埋込後も生存可能なままであり得、インスリンおよびグルカゴンを産生できることを示す。

Claims (230)

  1. 複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、または一炭素代謝経路中間体のうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物。
  2. 複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセチルCoA関連代謝産物を含むin vitro組成物。
  3. 複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物。
  4. 複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、およびアセテートを含むin vitro組成物。
  5. 0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含む、請求項3または4に記載の組成物。
  6. グルタミンをさらに含む、請求項1から5のいずれか1項に記載の組成物。
  7. 0.5~20mM、0.5~10mM、0.5~5mM、1~5mM、2~5mM、または1mM~10mMのグルタミンを含む、請求項6に記載の組成物。
  8. 複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞、および3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含むin vitro組成物。
  9. 前記グルタミンは、3.8~4.2mMの濃度である、請求項8に記載の組成物。
  10. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、ジペプチド型ではない、請求項6から9のいずれか1項に記載の組成物。
  11. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、アラニン-グルタミンジペプチド型ではない、請求項10に記載の組成物。
  12. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、5mM、5.5mM、6mM、6.5mM、7mM、7.5mM、8mM、8.5mM、9mM、9.5mM、または10mMは、遊離グルタミン型である、請求項6から11のいずれか1項に記載の組成物。
  13. 複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞をさらに含む、請求項1から12のいずれか1項に記載の組成物。
  14. 複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、および0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセチルCoA関連代謝産物を含むin vitro組成物。
  15. 複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、および0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含むin vitro組成物。
  16. 約1mMのアセテートを含む、請求項1から15のいずれか1項に記載の組成物。
  17. 複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、および3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含むin vitro組成物。
  18. 約4mMのグルタミンを含む、請求項1から17のいずれか1項に記載の組成物。
  19. グルタミンおよびアセテートを含む、請求項1から18のいずれか1項に記載の組成物。
  20. 複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、およびアセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、またはL-カルニチンのうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物。
  21. 複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞、およびグルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、L-カルニチン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含むin vitro組成物。
  22. 50~1000nM、50~800nM、50~500nM、50~300nM、50~250nM、100~200nM、または125~175nMのアセテートを含む、請求項21に記載の組成物。
  23. β-ヒドロキシブチレートを含む、請求項1から22のいずれか1項に記載の組成物。
  24. タウリンを含む、請求項1から23のいずれか1項に記載の組成物。
  25. ホルメートを含む、請求項1から24のいずれか1項に記載の組成物。
  26. ビタミンを含む、請求項1から25のいずれか1項に記載の組成物。
  27. ビオチンを含む、請求項1から26のいずれか1項に記載の組成物。
  28. グルタミン、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、およびビオチンを含む、請求項1から27のいずれか1項に記載の組成物。
  29. L-カルニチンをさらに含む、請求項1から19または22から28のいずれか1項に記載の組成物。
  30. L-カルニチンを含む、請求項20から28のいずれか1項に記載の組成物。
  31. BMPシグナル伝達経路阻害剤をさらに含む、請求項1から30のいずれか1項に記載の組成物。
  32. 前記BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189もしくはDMH-1またはそれらの誘導体である、請求項31に記載の組成物。
  33. ROCK阻害剤をさらに含む、請求項1から32のいずれか1項に記載の組成物。
  34. 前記ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である、請求項33に記載の組成物。
  35. ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤をさらに含む、請求項1から34のいずれか1項に記載の組成物。
  36. 前記ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩、Bix-01294、UNC0638、BRDD4770、EPZ004777、AZ505、PDB4e47、バルプロ酸、ボリノスタット、ロミデプシン、エンチノスタットアベキシノスタット、ギビノスタット、およびモセチノスタット、ブチレート、セリンプロテアーゼ阻害剤、セルピン、またはそれらの誘導体である、請求項35に記載の組成物。
  37. TGF-β経路阻害剤をさらに含む、請求項1から36のいずれか1項に記載の組成物。
  38. 前記TGF-β経路阻害剤は、ALK5阻害剤II、A83-01、431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB525334、SB505124、SD208、GW6604、もしくはGW788388、またはそれらの誘導体である、請求項37に記載の組成物。
  39. 甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤をさらに含む、請求項1から38のいずれか1項に記載の組成物。
  40. 前記甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1、T3、T1AM、T0AM、Triprop、L-940901、CGS 23425、KB-141、もしくはDITPA、またはそれらの誘導体である、請求項39に記載の組成物。
  41. タンパク質キナーゼ阻害剤をさらに含む、請求項1から40のいずれか1項に記載の組成物。
  42. 前記タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンもしくはRo-31-8220またはそれらの誘導体である、請求項41に記載の組成物。
  43. ソニックヘッジホッグ経路阻害剤をさらに含む、請求項1から42のいずれか1項に記載の組成物。
  44. 前記ソニックヘッジホッグ経路阻害剤は、Sant1、Sant2、Sant 4、Sant4、Cur61414、フォルスコリン、トマチジン、AY9944、トリパラノール、シクロパミン、またはそれらの誘導体を含む、請求項43に記載の組成物。
  45. 上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの増殖因子をさらに含む、請求項1から44のいずれか1項に記載の組成物。
  46. 前記EGFファミリーからの増殖因子は、ベータセルリンまたはEGFを含む、請求項45に記載の組成物。
  47. ガンマセクレターゼ阻害剤をさらに含む、請求項1から20または22から46のいずれか1項に記載の組成物。
  48. 前記ガンマセクレターゼ阻害剤は、XXI、DAPT、またはそれらの誘導体を含む、請求項47に記載の組成物。
  49. 亜鉛をさらに含む、請求項1から48のいずれか1項に記載の組成物。
  50. 前記亜鉛は、ZnSOの形態にある、請求項49に記載の組成物。
  51. 血清アルブミンタンパク質をさらに含む、請求項1から50のいずれか1項に記載の組成物。
  52. 前記血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である、請求項51に記載の組成物。
  53. 0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む、請求項51または52に記載の組成物。
  54. DMEMをさらに含む、請求項1から53のいずれか1項に記載の組成物。
  55. 前記DMEMは、DMEM/F12である、請求項54に記載の組成物。
  56. ビタミンCを含まない、請求項1から54のいずれか1項に記載の組成物。
  57. 前記複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞は解離している、請求項14から56のいずれか1項に記載の組成物。
  58. 前記複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞の少なくとも50%、60%、65%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%は、細胞クラスターになっていない、請求項14から57のいずれか1項に記載の組成物。
  59. 前記組成物中の前記細胞の90%未満、85%未満、80%未満、75%未満、70%未満、65%未満、60%未満、55%未満、50%未満、45%未満、40%未満、35%未満、30%未満、35%未満、30%未満、25%未満、20%未満、15%未満、10%未満、5%未満、または1%未満は、細胞クラスターになっている、請求項1から58のいずれか1項に記載の組成物。
  60. 前記インスリン陽性内分泌前駆細胞は、以前に凍結されたものである、請求項57から59のいずれか1項に記載の組成物。
  61. 前記複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞の少なくとも30%、40%、50%、60%、65%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%または100%は、細胞クラスターになっている、請求項14から56のいずれか1項に記載の組成物。
  62. 前記複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞は、細胞クラスターになっている、請求項14から56のいずれか1項に記載の組成物。
  63. 前記細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約50μm~約250μm、約75μm~約250μm、または約100μm~約200μmの直径を有する、請求項62に記載の組成物。
  64. 前記細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの直径を有する、請求項62に記載の組成物。
  65. 前記細胞クラスターは、最大120、最大130、最大140、最大150、最大160、または最大170μmの平均直径または直径中央値を有する、請求項62から64のいずれか1項に記載の組成物。
  66. 前記細胞クラスターは、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの平均直径または直径中央値を有する、請求項62から64のいずれか1項に記載の組成物。
  67. 前記細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、150μm未満の直径を有する、請求項62から66のいずれか1項に記載の組成物。
  68. 前記細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、または少なくとも約70%は、130μm未満の直径を有する、請求項62から66のいずれか1項に記載の組成物。
  69. 少なくとも35%、少なくとも38%、少なくとも40%、少なくとも42%、少なくとも44%、または少なくとも46%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を含む、請求項1から68のいずれか1項に記載の組成物。
  70. 最大2%、最大4%、最大6%、最大8%、最大10%、最大12%、最大14%、最大16%、最大18%、最大20%、最大22%、または最大22%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を含む、請求項1から69のいずれか1項に記載の組成物。
  71. 少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含むように操作されている細胞を含み、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる、請求項1から70のいずれか1項に記載の組成物。
  72. 前記少なくとも1つの遺伝子配列は、ベータ-2-ミクログロブリン(B2M)、HLA-A、HLA-B、またはCIITAのうちのいずれか1つまたは複数である、請求項71に記載の組成物。
  73. PD-L1および/またはCD47の発現が増加するように操作されている細胞を含む、請求項1から72のいずれか1項に記載の組成物。
  74. 前記細胞は、CRISPR/Casシステムを使用して操作されている、請求項71から73のいずれか1項に記載の組成物。
  75. アセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤または一炭素代謝経路中間体のうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法。
  76. アセチルCoA関連代謝産物を含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法。
  77. アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法。
  78. アセテートを含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法。
  79. 0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートと前記細胞を接触させるステップを含む、請求項75から78のいずれか1項に記載の方法。
  80. 前記第1の組成物は、グルタミンをさらに含む、請求項75から78のいずれか1項に記載の方法。
  81. 前記第1の組成物は、0.5~20mM、0.5~10mM、0.5~5mM、1~5mM、2~5mM、または1mM~10mMのグルタミンをさらに含む、請求項75から78のいずれか1項に記載の方法。
  82. 3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含む第1の組成物と、複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を接触させるステップを含む方法。
  83. 前記グルタミンは、3.8~4.2mMの濃度である、請求項82に記載の方法。
  84. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、ジペプチド型ではない、請求項80から83のいずれか1項に記載の方法。
  85. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、アラニン-グルタミンジペプチド型ではない、請求項84に記載の方法。
  86. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、5mM、5.5mM、6mM、6.5mM、7mM、7.5mM、8mM、8.5mM、9mM、9.5mM、または10mMは、遊離グルタミン型である、請求項80から85のいずれか1項に記載の方法。
  87. 前記第1の組成物は、約4mMのグルタミンを含む、請求項75から86のいずれか1項に記載の方法。
  88. 前記第1の組成物は、グルタミンおよびアセテートを含む、請求項75から87のいずれか1項に記載の方法。
  89. 前記第1の組成物は、β-ヒドロキシブチレートを含む、請求項75から88のいずれか1項に記載の方法。
  90. 前記第1の組成物は、タウリンを含む、請求項75から89のいずれか1項に記載の方法。
  91. 前記第1の組成物は、ホルメートを含む、請求項75から90のいずれか1項に記載の方法。
  92. 前記第1の組成物は、ビタミンを含む、請求項75から91のいずれか1項に記載の方法。
  93. 前記第1の組成物は、ビオチンをさらに含む、請求項75から92のいずれか1項に記載の方法。
  94. 前記第1の組成物は、グルタミン、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、およびビオチンを含む、請求項75から93のいずれか1項に記載の方法。
  95. 前記第1の組成物は、BMPシグナル伝達経路阻害剤をさらに含む、請求項75から94のいずれか1項に記載の方法。
  96. 前記BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189もしくはDMH-1またはそれらの誘導体である、請求項95に記載の方法。
  97. 前記第1の組成物は、ROCK阻害剤をさらに含む、請求項75から96のいずれか1項に記載の方法。
  98. 前記ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である、請求項97に記載の組成物。
  99. 前記第1の組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤をさらに含む、請求項75から98のいずれか1項に記載の方法。
  100. 前記ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩、Bix-01294、UNC0638、BRDD4770、EPZ004777、AZ505、PDB4e47、バルプロ酸、ボリノスタット、ロミデプシン、エンチノスタットアベキシノスタット、ギビノスタット、およびモセチノスタット、ブチレート、セリンプロテアーゼ阻害剤、セルピン、またはそれらの誘導体である、請求項99に記載の方法。
  101. 前記第1の組成物は、亜鉛をさらに含む、請求項75から100のいずれか1項に記載の方法。
  102. 前記亜鉛は、ZnSOの形態にある、請求項101に記載の方法。
  103. 前記第1の組成物は、血清アルブミンタンパク質をさらに含む、請求項75から102のいずれか1項に記載の方法。
  104. 前記血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である、請求項103に記載の方法。
  105. 前記第1の組成物は、0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む、請求項103または104に記載の方法。
  106. 前記第1の組成物は、TGF-β経路阻害剤をさらに含む、請求項75から105のいずれか1項に記載の方法。
  107. 前記TGF-β経路阻害剤は、Alk5阻害剤II、A83-01、431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB525334、SB505124、SD208、GW6604、もしくはGW788388、またはそれらの誘導体である、請求項106に記載の方法。
  108. 前記第1の組成物は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤をさらに含む、請求項75から107のいずれか1項に記載の方法。
  109. 前記甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1もしくはT3、T1AM、T0AM、Triprop、L-940901、CGS 23425、KB-141、もしくはDITPA、またはそれらの誘導体である、請求項108に記載の方法。
  110. 前記第1の組成物は、タンパク質キナーゼ阻害剤をさらに含む、請求項75から109のいずれか1項に記載の方法。
  111. 前記タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンもしくはRo-31-8220またはそれらの誘導体である、請求項110に記載の方法。
  112. 前記第1の組成物は、ガンマ-セクレターゼ阻害剤をさらに含む、請求項75から111のいずれか1項に記載の方法。
  113. 前記ガンマ-セクレターゼ阻害剤は、XXI、DAPT、またはそれらの誘導体である、請求項112に記載の方法。
  114. 前記第1の組成物は、L-カルニチンをさらに含む、請求項75から113のいずれか1項に記載の方法。
  115. 前記複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性細胞を前記第1の組成物と1~3日間にわたって接触させ、次いでアセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含む第2の組成物と3~7日間にわたって接触させるステップを含む、請求項75から114のいずれか1項に記載の方法。
  116. 前記複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性細胞を前記第1の組成物と1~3日間にわたって接触させ、次いでTGF-β経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、ROCK阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、またはタンパク質キナーゼ阻害剤のうちの1つまたは複数を含む第2の組成物と2~7日間にわたって接触させるステップを含む、請求項75から114のいずれか1項に記載の方法。
  117. 前記複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性細胞を前記第1の組成物と1~3日間にわたって接触させ、次いでAlk5i、GC-1、LDN193189、チアゾビビン、SSP、またはDZNEPのうちの1つまたは複数を含む第2の組成物と2~7日間にわたって接触させるステップを含む、請求項75から114のいずれか1項に記載の方法。
  118. 前記第1の組成物は、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤をさらに含む、請求項115から117のいずれか1項に記載の方法。
  119. 前記ソニックヘッジホッグ経路阻害剤は、Sant1、Sant2、Sant 4、Sant4、Cur61414、フォルスコリン、トマチジン、AY9944、トリパラノール、シクロパミン、またはそれらの誘導体を含む、請求項118に記載の方法。
  120. 前記第1の組成物は、上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの増殖因子をさらに含む、請求項115から119のいずれか1項に記載の方法。
  121. 前記EGFファミリーからの増殖因子は、ベータセルリンまたはEGFを含む、請求項120に記載の方法。
  122. 前記第2の組成物は、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤および上皮増殖因子(EGF)ファミリーからの増殖因子を欠いており、それ以外は前記第1の組成物と同じである、請求項115から121のいずれか1項に記載の方法。
  123. 前記接触させるステップは、前記複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞の少なくとも一部をインスリン陽性内分泌前駆細胞へと分化させる、請求項115から122のいずれか1項に記載の方法。
  124. 前記インスリン陽性内分泌前駆細胞は、ISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を含む、請求項123に記載の方法。
  125. 前記接触させるステップは、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を欠いていること以外は前記第1の組成物と同じである組成物と前記複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を接触させるステップと比較して、より高い割合のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす、請求項75から124のいずれか1項に記載の方法。
  126. 前記接触させるステップは、少なくとも35%、少なくとも38%、少なくとも40%、少なくとも42%、少なくとも44%、または少なくとも46%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす、請求項75から124のいずれか1項に記載の方法。
  127. 前記接触させるステップは、約35%、約38%、約40%、約41%、約42%、または約47%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす、請求項75から124のいずれか1項に記載の方法。
  128. 前記接触させるステップは、4日間、7日間、または10日間の培養後に、少なくとも35%、少なくとも38%、または少なくとも40%のISL1陽性、NKX6.1陽性細胞を有する細胞集団をもたらす、請求項75から127のいずれか1項に記載の方法。
  129. 前記接触させるステップは、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を欠いていること以外は前記第1の組成物と同じである組成物と前記複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を接触させるステップと比較して、より低い割合のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす、請求項75から128のいずれか1項に記載の方法。
  130. 前記接触させるステップは、最大22%、最大20%、最大18%、最大16%、最大14%、最大12%、最大10%、最大8%、最大6%、または最大4%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす、請求項75から127のいずれか1項に記載の方法。
  131. 前記接触させるステップは、約2%、11%、22%、20%、または18%のISL1陰性、NKX6.1陰性細胞を有する細胞集団の生成をもたらす、請求項75から127のいずれか1項に記載の方法。
  132. アセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、ビタミン、一炭素代謝経路中間体、L-カルニチン、またはグルタメートのうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法。
  133. グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含む第1の組成物と、複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞をin vitroで接触させるステップを含む方法。
  134. 前記第1の組成物は、グルタメートを含む、請求項132または133に記載の方法。
  135. 前記第1の組成物は、アセテートを含む、請求項132から134のいずれか1項に記載の方法。
  136. 前記第1の組成物は、50~1000nM、50~800nM、50~500nM、50~300nM、50~250nM、100~200nM、または125~175nMのアセテートを含む、請求項132から135のいずれか1項に記載の方法。
  137. 前記第1の組成物は、β-ヒドロキシブチレートを含む、請求項132から136のいずれか1項に記載の方法。
  138. 前記第1の組成物は、タウリンを含む、請求項132から137のいずれか1項に記載の方法。
  139. 前記第1の組成物は、ホルメートを含む、請求項132から138のいずれか1項に記載の方法。
  140. 前記第1の組成物は、ビオチンをさらに含む、請求項132から139のいずれか1項に記載の方法。
  141. 前記第1の組成物は、L-カルニチンを含む、請求項132から140のいずれか1項に記載の方法。
  142. 前記第1の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、L-カルニチン、およびビオチンを含む、請求項132から141のいずれか1項に記載の方法。
  143. 前記第1の組成物は、BMPシグナル伝達経路阻害剤をさらに含む、請求項132から142のいずれか1項に記載の方法。
  144. 前記BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189もしくはDMH-1またはそれらの誘導体である、請求項143に記載の方法。
  145. 前記第1の組成物は、ROCK阻害剤をさらに含む、請求項132から144のいずれか1項に記載の方法。
  146. 前記ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体である、請求項145に記載の組成物。
  147. 前記第1の組成物は、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤をさらに含む、請求項132から146のいずれか1項に記載の方法。
  148. 前記ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩、Bix-01294、UNC0638、BRDD4770、EPZ004777、AZ505、PDB4e47、バルプロ酸、ボリノスタット、ロミデプシン、エンチノスタットアベキシノスタット、ギビノスタット、およびモセチノスタット、ブチレート、セリンプロテアーゼ阻害剤、セルピン、またはそれらの誘導体である、請求項147に記載の方法。
  149. 前記第1の組成物は、TGF-β経路阻害剤をさらに含む、請求項132から148のいずれか1項に記載の方法。
  150. 前記TGF-β経路阻害剤は、ALK5阻害剤II、A83-01、431542、D4476、GW788388、LY364947、LY580276、SB525334、SB505124、SD208、GW6604、もしくはGW788388、またはそれらの誘導体である、請求項149に記載の方法。
  151. 前記第1の組成物は、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤をさらに含む、請求項132から150のいずれか1項に記載の方法。
  152. 前記甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1、T3、T1AM、T0AM、Triprop、L-940901、CGS 23425、KB-141、もしくはDITPA、またはそれらの誘導体である、請求項151に記載の方法。
  153. 前記第1の組成物は、タンパク質キナーゼ阻害剤をさらに含む、請求項132から152のいずれか1項に記載の方法。
  154. 前記タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンもしくはRo-31-8220またはそれらの誘導体である、請求項153に記載の方法。
  155. 前記第1の組成物は、ビタミンCをさらに含む、請求項132から154のいずれか1項に記載の方法。
  156. 前記第1の組成物は、ビタミンCを含まない、請求項132から154のいずれか1項に記載の方法。
  157. 前記第1の組成物は、亜鉛をさらに含む、請求項132から156のいずれか1項に記載の方法。
  158. 前記亜鉛は、ZnSOの形態にある、請求項157に記載の方法。
  159. 前記第1の組成物は、血清アルブミンタンパク質をさらに含む、請求項132から158のいずれか1項に記載の方法。
  160. 前記血清アルブミンタンパク質は、ヒト血清アルブミンタンパク質である、請求項159に記載の方法。
  161. 前記第1の組成物は、0.01%~1%、0.03~1%、0.03~0.9%、0.03~0.08%、0.03~0.06%、0.03~0.05%、0.04~0.8%、0.04~0.7%、0.04~0.6%、0.04~0.5%、0.04~0.4%、0.04~0.3%、0.04~0.2%、0.04~0.1%、0.04~0.09%、0.04~0.8%、0.04~0.07%、0.04~0.06%、0.04~0.05%、0.05~1%、0.05~0.9%、0.05~0.8%、0.05~0.7%、0.05~0.6%、0.05~0.5%、0.05~0.4%、0.05~0.3%、0.05~0.2%、0.05~0.1%、0.05~0.09%、0.05~0.8%、0.05~0.07%、または0.05~0.06%の血清アルブミンタンパク質を含む、請求項159または160に記載の方法。
  162. 前記組成物は、DMEMを含む、請求項132から161のいずれか1項に記載の方法。
  163. 前記DMEMは、DMEM/F12である、請求項162に記載の方法。
  164. 前記複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞は解離している、請求項132から163のいずれか1項に記載の方法。
  165. 前記解離したインスリン陽性内分泌前駆細胞は、以前に凍結されたものである、請求項164に記載の方法。
  166. 前記解離した細胞を複数の細胞クラスターへと再凝集させる、請求項164または165に記載の方法。
  167. 前記複数の細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約50μm~約250μm、約75μm~約250μm、または約100μm~約200μmの直径を有する、請求項166に記載の方法。
  168. 前記複数の細胞クラスターの前記細胞の少なくとも約40%、50%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、95%、または99%は、生存可能である、請求項166または167に記載の方法。
  169. 前記解離した細胞を少なくとも2、3、4、5、10、50、100、1000、10000、100000、または1000000個の細胞クラスターへと再凝集させる、請求項164から168のいずれか1項に記載の方法。
  170. 前記細胞クラスターの少なくとも約40%、50%、60%、70%、80%、または90%は、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの直径を有する、請求項164から169のいずれか1項に記載の方法。
  171. 前記細胞クラスターは、最大120、最大130、最大140、最大150、最大160、または最大170μmの平均直径または直径中央値を有する、請求項164から170のいずれか1項に記載の方法。
  172. 前記細胞クラスターは、約80~150、約100~150、約120~150、約140~150、約80~130、約100~130、約120~130、約80~120、約90~120、または約100~120μmの平均直径または直径中央値を有する、請求項164から171のいずれか1項に記載の方法。
  173. 前記細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、または少なくとも約80%は、150μm未満の直径を有する、請求項164から172のいずれか1項に記載の方法。
  174. 前記細胞クラスターの少なくとも約50%、少なくとも約60%、または少なくとも約70%は、130μm未満の直径を有する、請求項164から173のいずれか1項に記載の方法。
  175. 1~10日間、1~9日間、1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~10日間、2~9日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~10日間、3~9日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~10日間、4~9日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって行われる、請求項132から174のいずれか1項に記載の方法。
  176. 1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって行われる、請求項132から175のいずれか1項に記載の方法。
  177. 前記複数のインスリン陽性内分泌前駆細胞を前記第1の組成物と約3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、または8日間にわたって接触させ、それにより、第2の細胞集団を生成する、請求項132から176のいずれか1項に記載の方法。
  178. 前記第1の組成物とは異なる第2の組成物と前記第2の細胞集団を接触させ、それにより、前記第2のインスリン陽性細胞集団の少なくとも一部を、複数のβ細胞を含む第3の細胞集団へと分化させるステップをさらに含む、請求項177に記載の方法。
  179. 前記第2の細胞集団を前記第2の組成物と1~8日間、1~7日間、1~6日間、1~5日間、1~4日間、1~3日間、1~2日間、2~8日間、2~7日間、2~6日間、2~5日間、2~4日間、2~3日間、3~8日間、3~7日間、3~6日間、3~5日間、3~4日間、4~8日間、4~7日間、4~6日間、または4~5日間にわたって接触させる、請求項178に記載の方法。
  180. 前記第2の細胞集団を前記第2の組成物と約3日間、4日間、5日間、6日間、7日間、または8日間にわたって接触させる、請求項179に記載の方法。
  181. 前記第2の組成物は、BMPシグナル伝達経路阻害剤、ROCK阻害剤、ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤、TGF-β経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路阻害剤、またはタンパク質キナーゼ阻害剤を含まない、請求項178から180のいずれか1項に記載の方法。
  182. 前記第2の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートを含まない、請求項178から181のいずれか1項に記載の方法。
  183. (a)複数のPDX1陽性、NKX6.1陽性、インスリン陰性細胞を、第1の組成物とin vitroで接触させ、それにより、インスリン陽性内分泌前駆細胞を含む複数の細胞クラスターを含む第1の細胞集団を生成するステップであって、前記第1の組成物は、アセテート、グルタミン、およびβ-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、またはビオチンのうちの1つまたは複数を含むステップと、
    (b)前記第1の細胞集団中の前記複数の細胞クラスターの少なくとも一部をin vitroで解離させるステップと、
    (c)前記解離した細胞クラスターの少なくとも一部を含む前記第1の細胞集団を、第2の組成物とin vitroで接触させ、それにより、複数のインスリン陽性細胞を含む複数の細胞クラスターを含む第2の細胞集団を生成するステップであって、前記第2の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートのうちの1つまたは複数を含むステップと
    を含む方法。
  184. 前記第2のインスリン陽性細胞集団を第3の組成物とin vitroで接触させ、それにより、前記第2のインスリン陽性細胞集団の少なくとも一部を、複数のβ細胞を含む第3の細胞集団へと分化させるステップであって、前記第3の組成物は、前記第2の組成物とは異なるステップ
    をさらに含む、請求項183に記載の方法。
  185. 前記第3の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ビオチン、L-カルニチン、またはホルメートを含まない、請求項184に記載の方法。
  186. 前記第1の組成物は、3~10、3~7、3~8、3~6、3~5、3~4、3.5~4.5、3.8~4.2、または3.9~4.1mMのグルタミンを含む、請求項183から185のいずれか1項に記載の方法。
  187. 前記第1の組成物は、約4mMのグルタミンを含む、請求項183から185のいずれか1項に記載の方法。
  188. 前記第1の組成物は、0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含む、請求項183から187のいずれか1項に記載の方法。
  189. 前記第1の組成物は、約1mMのアセテートを含む、請求項183から187のいずれか1項に記載の方法。
  190. 前記第2の組成物は、50~1000nM、50~800nM、50~500nM、50~300nM、50~250nM、100~200nM、または125~175nMのアセテートを含む、請求項183から189のいずれか1項に記載の方法。
  191. 前記第2の組成物は、グルタメート、アセテート、β-ヒドロキシブチレート、タウリン、ホルメート、L-カルニチン、およびビオチンを含む、請求項183から190のいずれか1項に記載の方法。
  192. 前記第1の組成物は、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、EGFファミリーからの増殖因子、レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、Rho関連コイルドコイル含有タンパク質キナーゼ(ROCK)阻害剤、骨形成タンパク質(BMP)1型受容体阻害剤、γ-セクレターゼ阻害剤、またはヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤のうちの少なくとも1つの薬剤をさらに含む、請求項183から191のいずれか1項に記載の方法。
  193. 前記第2の組成物は、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤、ソニックヘッジホッグ経路阻害剤、甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、またはヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤のうちの少なくとも1つの薬剤をさらに含む、請求項183から192のいずれか1項に記載の方法。
  194. (A)前記ソニックヘッジホッグ経路阻害剤は、SANT1を含むか、
    (B)前記レチノイン酸シグナル伝達経路活性化剤は、レチノイン酸を含むか、
    (C)前記γ-セクレターゼ阻害剤は、XXIを含むか、
    (D)前記EGFファミリーからの増殖因子は、ベータセルリンまたはEGFを含むか、
    (E)前記BMPシグナル伝達経路阻害剤は、LDN193189またはその誘導体を含むか、
    (F)前記TGF-βシグナル伝達経路阻害剤は、ALK5阻害剤IIまたはその誘導体を含むか、
    (G)前記甲状腺ホルモンシグナル伝達経路活性化剤は、GC-1もしくはT3、またはそれらの誘導体を含むか、
    (H)前記タンパク質キナーゼ阻害剤は、スタウロスポリンを含むか、
    (I)前記ROCK阻害剤は、チアゾビビン、Y-27632、ファスジル/HA1077、もしくは14-1152、またはそれらの誘導体を含むか、または
    (J)前記ヒストンメチルトランスフェラーゼ阻害剤は、3-デアザネプラノシンA塩酸塩またはその誘導体を含む、
    請求項192または193に記載の方法。
  195. NKX6.1陽性、ISL1陽性、インスリン陽性細胞集団を、血清アルブミンタンパク質、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、THシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、エピジェネティック修飾化合物、アセチルCoA関連代謝産物、ビタミン、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、および/またはカルニチンのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、または7日(例えば、4日)の第1の期間にわたって接触させるステップを含む方法。
  196. 前記第1の期間の後、前記細胞集団を、血清アルブミンタンパク質、アセチルCoA関連代謝産物、ビタミン、ヒストンデアセチラーゼ阻害剤(HDACi)、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、グルタメート、および/またはカルニチンのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、もしくは7日(例えば、3日)またはそれ以上の第2の期間にわたって、TGF-βシグナル伝達経路阻害剤、THシグナル伝達経路活性化剤、タンパク質キナーゼ阻害剤、ROCK阻害剤、BMPシグナル伝達経路阻害剤、および/またはエピジェネティック修飾化合物の非存在下で接触させるステップをさらに含む、請求項195に記載の方法。
  197. NKX6.1陽性、ISL1陽性、インスリン陽性細胞集団を、HSA、Alk5阻害剤II、GC-1、スタウロスポリン、チアゾビビン、LDN193189、DZNEP、タウリン、アセテート、ベータヒドロキシブチレート、ビオチン、カルニチン、グルタメート、およびホルメートのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、または7日(例えば、4日)の第1の期間にわたって接触させるステップを含む方法。
  198. 前記第1の期間の後、前記細胞集団を、HSA、タウリン、アセテート、ベータヒドロキシブチレート、ビオチン、カルニチン、グルタメート、およびホルメートのうちの1つまたは複数と、1、2、3、4、5、6、もしくは7日(例えば、3日)またはそれ以上の第2の期間にわたって、Alk5阻害剤II、GC-1、スタウロスポリン、チアゾビビン、LDN193189、およびDZNEPの非存在下で接触させるステップをさらに含む、請求項197に記載の方法。
  199. 前記第1および/または第2の期間において、前記細胞集団をZnSO4と接触させるステップをさらに含む、請求項195から198のいずれか1項に記載の方法。
  200. 前記第1および/または第2の期間において、前記細胞集団をDMEMと接触させるステップをさらに含む、請求項195から199のいずれか1項に記載の方法。
  201. 前記DMEMは、DMEM/F12である、請求項200に記載の方法。
  202. 前記第2の期間において、前記第1の期間と比較して同じ濃度の前記血清アルブミン(例えば、約0.05%のHSA)と前記細胞を接触させる、請求項196または198から200のいずれか1項に記載の方法。
  203. 前記第2の期間において、前記第1の期間(例えば、約0.05%)と比較して高い濃度の前記HSA(例えば、約1.0%)と前記細胞を接触させる、請求項196または198から200のいずれか1項に記載の方法。
  204. 前記細胞は、少なくとも1つの遺伝子配列にゲノム破壊を含むように操作されており、前記破壊は、前記遺伝子配列によってコードされるタンパク質の発現を低減または消失させる、請求項68から203のいずれか1項に記載の方法。
  205. 前記少なくとも1つの遺伝子配列は、ベータ-2-ミクログロブリン(B2M)、HLA-A、HLA-B、またはCIITAのうちのいずれか1つまたは複数である、請求項204に記載の方法。
  206. 前記組成物は、PD-L1および/またはCD47の発現が増加するように操作されている細胞を含む、請求項68から203のいずれか1項に記載の方法。
  207. 前記細胞は、CRISPR/Casシステムを使用して操作されている、請求項204から206のいずれかに記載の方法。
  208. 請求項14から74または123から182のいずれか1項に記載のインスリン陽性内分泌前駆細胞を含む組成物。
  209. 請求項184から194のいずれか1項に記載の第3の細胞集団の少なくとも一部を含む組成物。
  210. 請求項1から74、208、209、または193から207のいずれか1項に記載の細胞を含むデバイス。
  211. 対象に埋め込まれる場合にインスリンを産生および放出するように構成されている、請求項210に記載のデバイス。
  212. 前記細胞が封入されている、請求項210または211に記載のデバイス。
  213. 半透膜をさらに含み、前記半透膜は、前記細胞を前記デバイスに保持し、かつインスリンの通過を可能にするように構成されている、請求項210から212のいずれか1項に記載のデバイス。
  214. 長期間にわたる高い血糖レベルによって特徴付けられる疾患(例えば、糖尿病)を有する対象を処置する方法であって、前記対象に、請求項1から74、208、209、もしくは193から207のいずれか1項に記載の細胞を投与するステップ、または請求項187から190のいずれか1項に記載のデバイスを埋め込むステップを含む方法。
  215. 前記疾患は糖尿病である、請求項214に記載の方法。
  216. 複数のインスリン陽性細胞および凍結保存剤、およびアセチルCoA関連代謝産物、HDAC阻害剤、レドックス恒常性調節剤、一炭素代謝経路中間体、ビタミン、またはL-グルタミンのうちの1つまたは複数を含む組成物。
  217. 凍結保存されている、請求項216に記載の組成物。
  218. アセチルCoA関連代謝産物を含む、請求項216または217に記載の組成物。
  219. 前記アセチルCoA関連代謝産物は、アセテートである、請求項218に記載の組成物。
  220. 0.01~50mM、0.1~50mM、0.5~50mM、0.01~20mM、0.1~20mM、0.5~20mM、0.01~10mM、0.1~10mM、0.5~10mM、0.8~25mM、0.8~10mM、0.8~5mM、0.8~2mM、0.8~1.5mM、0.8~1.2mM、0.9~1.1mM、または0.95~1.05mMのアセテートを含む、請求項219に記載の組成物。
  221. グルタミンを含む、請求項216から220のいずれか1項に記載の組成物。
  222. 0.5~20mM、0.5~10mM、0.5~5mM、1~5mM、2~5mM、3.8~4.2または1mM~10mMのグルタミンを含む、請求項221に記載の組成物。
  223. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、または5mMは、アラニン-グルタミンジペプチド型ではない、請求項221または222に記載の組成物。
  224. 前記グルタミンのうち少なくとも0.5mM、0.6mM、0.7mM、0.8mM、0.9mM、1mM、1.5mM、2mM、2.5mM、3mM、3.5mM、4mM、4.5mM、5mM、5.5mM、6mM、6.5mM、7mM、7.5mM、8mM、8.5mM、9mM、9.5mM、または10mMは、遊離グルタミン型である、請求項221から223のいずれか1項に記載の組成物。
  225. レドックス恒常性調節剤を含む、請求項216から224のいずれか1項に記載の組成物。
  226. 前記レドックス恒常性調節剤は、タウリンである、請求項225に記載の組成物。
  227. 一炭素代謝経路中間体を含む、請求項216から226のいずれか1項に記載の組成物。
  228. 前記一炭素代謝経路中間体は、ホルメートである、請求項227に記載の組成物。
  229. ビタミンを含む、請求項216から228のいずれか1項に記載の組成物。
  230. 前記ビタミンは、ビオチンである、請求項229に記載の組成物。
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