JP2022543138A - ダイズ植物dbn8002を検出するための核酸配列およびそのための検出方法 - Google Patents
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Abstract
Description
-核酸増幅反応において標的増幅産物を増幅するための少なくとも2つのプライマーに、検出される試料を接触させる工程と、
-前記核酸増幅反応を行う工程と、
-前記標的増幅産物の存在を検出する工程と、を含み、
前記標的増幅産物は当該核酸配列を含む。
-検出される試料をプローブに接触させる工程であって、そのプローブは当該核酸配列を含む工程と、
-ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、前記検出される試料を前記プローブとハイブリダイズさせる工程と、
-前記検出される試料の前記プローブとのハイブリダイゼーションを検出する工程と、を含む。
-検出される試料をマーカー核酸分子に接触させる工程であって、そのマーカー核酸分子は当該核酸配列を含む工程と、
-ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、前記検出される試料を前記マーカー核酸分子とハイブリダイズさせる工程と、
-前記検出される試料の前記マーカー核酸分子とのハイブリダイゼーションを検出し、さらに、マーカー支援育種解析を行って、昆虫抵抗性および/または除草剤耐性が前記マーカー核酸分子に遺伝的に関連しているかどうかを決定するために工程と、を含む。
-少なくとも1つのダイズ種子を栽植する工程であって、前記ダイズ種子は、そのゲノム中に、昆虫抵抗性Vip3Aaタンパク質をコード化する核酸配列および/またはグルホシネート除草剤耐性PATタンパク質をコード化する核酸配列、ならびに特異的領域の核酸配列を含むか、または前記ダイズ種子は、そのゲノム中に配列番号5に定める核酸配列を含む、工程と、
-前記ダイズ種子をダイズ植物に生育する工程と、
-前記ダイズ植物を標的昆虫で害し、および/または前記ダイズ植物に有効量のグルホシネート除草剤を散布し、次に特異的領域の核酸配列を含まない他の植物に比べて植物損傷が低減した植物を収穫する工程と、を含み、
前記特異的領域の核酸配列は、配列番号1および/または配列番号2に定める配列であり、好ましくは、前記特異的領域の核酸配列は、配列番号3および/または配列番号4に定める配列である。
-第1のダイズ植物のゲノム中に含まれる昆虫抵抗性Vip3Aaタンパク質をコード化する核酸配列および/またはグルホシネート除草剤耐性PATタンパク質をコード化する核酸配列ならびに特異的領域の核酸配列、または第1のダイズ植物のゲノム中に含まれる配列番号5に定める核酸配列を、第2のダイズ植物に導入することによって、複数の子孫植物を作製する工程と、
-前記特異的領域の核酸配列を含む前記子孫植物を選択する工程であって、その子孫植物も昆虫抵抗性および/またはグルホシネート除草剤耐性を有する工程と、を含み、
前記特異的領域の核酸配列は、配列番号1および/または配列番号2に定める配列であり、好ましくは、前記特異的領域の核酸配列は、配列番号3および/または配列番号4に定める配列である。
-遺伝子導入ダイズイベントDBN8002を、昆虫抵抗性および/またはグルホシネート除草剤耐性形質を欠いているダイズ植物に有性的に交配することによって、複数の子孫植物を作製する工程と、
-前記特異的領域の核酸配列を含む前記子孫植物を選択する工程と、
-その子孫植物を標的昆虫で害し、および/またはグルホシネートでその子孫植物を処理する工程と、
-昆虫抵抗性および/またはグルホシネート除草剤耐性を有する前記子孫植物を選択する工程と、を含む。
配列番号1 遺伝子導入ダイズイベントDBN8002における挿入配列の5’末端の挿入接合部周辺に位置する長さが22個のヌクレオチドの配列であって、ヌクレオチド1~11およびヌクレオチド12~22がダイズゲノムの挿入部位の両側にそれぞれ位置する配列
配列番号2 遺伝子導入ダイズイベントDBN8002における挿入配列の3’末端の挿入接合部周辺に位置する長さが22個のヌクレオチドの配列であって、ヌクレオチド1~11およびヌクレオチド12~22がダイズゲノムの挿入部位の両側にそれぞれ位置する配列
配列番号3 遺伝子導入ダイズイベントDBN8002における挿入配列の5’末端の挿入接合部周辺に位置する1524個のヌクレオチドの配列
配列番号4 遺伝子導入ダイズイベントDBN8002における挿入配列の3’末端の挿入接合部周辺に位置する656個のヌクレオチドの配列
配列番号5 T-DNAの全配列、5’末端および3’末端の各ダイズゲノム隣接配列
配列番号6 配列番号3の中に位置し、pDBN4006構築物のDNA配列とprAtAct2転写起点配列とにまたがる配列
配列番号7 配列番号4の中に位置し、t35S転写ターミネーター配列とpDBN4006構築物のDNA配列とにまたがる配列
配列番号8 配列番号3を増幅するための第1のプライマー
配列番号9 配列番号3を増幅するための第2のプライマー
配列番号10 配列番号4を増幅するための第1のプライマー
配列番号11 配列番号4を増幅するための第2のプライマー
配列番号12 5’隣接ゲノム配列からのプライマー
配列番号13 T-DNAからであり、配列番号12と対であるプライマー
配列番号14 3’隣接ゲノム配列からであり、配列番号12と対で用いて、導入遺伝子がホモ接合性なのかそれともヘテロ接合性なのかを検出し得るプライマー
配列番号15 T-DNAからであり、配列番号14と対であるプライマー
配列番号16 TaqmanにおいてmVip3Aa遺伝子を検出するための第1のプライマー
配列番号17 TaqmanにおいてmVip3Aa遺伝子を検出するための第2のプライマー
配列番号18 TaqmanにおいてmVip3Aa遺伝子を検出するためのプローブ
配列番号19 TaqmanにおいてPAT遺伝子を検出するための第1のプライマー
配列番号20 TaqmanにおいてPAT遺伝子を検出するための第2のプライマー
配列番号21 TaqmanにおいてPAT遺伝子を検出するためのプローブ
配列番号22 ダイズ内在遺伝子レクチンのための第1のプライマー
配列番号23 ダイズ内在遺伝子レクチンのための第2のプライマー
配列番号24 サザンブロットアッセイにおけるmVip3Aa遺伝子のためのプローブ
配列番号25 サザンブロットアッセイにおけるPAT遺伝子のためのプローブ
配列番号26 T-DNAからであり、配列番号13と同方向を有するプライマー
配列番号27 T-DNAからであり、配列番号13と逆方向を有し、隣接配列を得るために用いられるプライマー
配列番号28 T-DNAからであり、配列番号13と逆方向を有し、隣接配列を得るために用いられるプライマー
配列番号29 T-DNAからであり、配列番号15と同方向を有するプライマー
配列番号30 T-DNAからであり、配列番号15と逆方向を有し、隣接配列を得るために用いられるプライマー
配列番号31 T-DNAからであり、配列番号15と逆方向を有し、隣接配列を得るために用いられるプライマー
本発明の技術的解決法について、さらに、添付の図面および実施例を参照して以下に詳細に述べる。
1.1 ベクタークローニング
組換え発現ベクターpDBN4006(図2に示す)を、標準的な遺伝子クローニング技術を用いて構築した。ベクターpDBN4006は、直列に配置された2つの遺伝子導入発現カセットを含む。2つの遺伝子導入発現カセットは、シロイヌナズナACTIN2プロモーター(prAtAct2)からなる第1の発現カセットであって、バチルス・チューリンゲンシス(CN103509808B)の昆虫抵抗性mVip3Aa遺伝子に作用可能に連結され、さらに、ノパリン合成酵素ターミネーター(tNos)に作用可能に連結された第1の発現カセット、およびカリフラワーモザイクウィルス35Sプロモーター(pr35S)からなる第2の発現カセットであって、ストレプトマイセスのグルホシネート耐性ホスフィノトリシン-N-アセチルトランスフェラーゼ遺伝子(cPAT)に作用可能に連結され、さらにカリフラワーモザイクウィルス35S転写ターミネーター(t35S)に作用可能に連結された第2の発現カセットである。
従来のアグロバクテリウム媒介形質転換法により形質転換を行った。その形質転換法は、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002を作製するために、無菌培養したダイズの子葉節組織を実施例1.1で述べたアグロバクテリウムと共培養して、組換え発現ベクターpDBN4006中のT-DNAをダイズ染色体に転移させる工程を含む。
総計288株の個別の遺伝子導入T0植物を作製した。最適な性能を有する遺伝子導入イベントを選別するために、上記の288株の個別の遺伝子導入T0単一植物を移植、栽培、および繁殖のために温室に移動して、遺伝子導入T1単一植物を産出した。
植物DNA抽出キット(DNeasy Plant Maxi Kit、Qiagen)を用いて、試料としての遺伝子導入ダイズイベントDBN8002の葉(約100mg)からゲノムDNAを抽出し、mVip3Aa遺伝子およびPAT遺伝子のコピー数を、Taqmanプローブを用いて蛍光定量PCR法により検出した。一方、対照としての野生型ダイズ植物を、上記の方法による検出および解析に供した。実験を3反復で実施し、平均値を計算した。
プライマー2:配列表の配列番号17に定めるcgtgaggaaggtctcagaaatgac
プローブ1:配列表の配列番号18に定めるcgacgatggcgtgtatatgcctcttgg
以下のプライマーおよびプローブを、PAT遺伝子の配列を検出するために用いる。
プライマー4:配列表の配列番号20に定めるtctcaactgtccaatcgtaagcg
プローブ2:配列表の配列番号21に定めるcttacgctgggccctggaaggctag
PCR反応系は以下を含む。
50×プライマー/プローブ混合物 1μL
ゲノムDNA 3μL
再蒸留水(ddH2O) 6μL
50×プライマー/プローブ混合物は、濃度1mMのそれぞれのプライマー45μL、濃度100μMのプローブ50μL、および1×TE緩衝液(10mMのTris-HCl、1mMのEDTA;pH8.0)860μLを含み、アンバーチューブ内に4℃で貯蔵した。
1 95℃ 5分
2 95℃ 30秒
3 60℃ 1分
4 ステップ2に戻り、40回繰り返し
高速リアルタイム蛍光定量PCRシステムソフトウェア(Applied Biosystems 7900HT Fast Real-Time PCR System SDS v2.3、Applied Biosystems)を用いてデータを解析した。その結果、得られた遺伝子導入ダイズイベントDBN8002は単一コピーであることが示された。
3.1 ゲノムDNAの抽出
従来のCTAB(セチルトリメチルアンモニウム臭化物(cetyl trimethyl ammonium bromide))法によりDNAを抽出した。すなわち、2gの遺伝子導入ダイズイベントDBN8002の若葉を液体窒素中で粉末に磨砕した後、65℃にあらかじめ加熱した0.5mLのCTABのDNA抽出緩衝液(20g/LのCTAB、1.4MのNaCl、100mMのTris-HCl、20mMのEDTA(エデト酸)、pHをNaOHでpH8.0に調整)を添加し、次にそれらをよく混合し、65℃で90分間抽出した。0.5容積のフェノールおよび0.5容積のクロロホルムを添加し、反転することによりに混合した。混合物を12,000rpm(1分間あたりの回転数)で10分間遠心した。上清をピペットで取り、2容積の無水エタノールを添加した。遠心管を穏やかに振り、次に4℃で30分間静置した。DNAが遠心管の底に集まるように、遠心管を12,000rpmで10分間再び遠心した。上清を捨て、沈渣を1mLの70%(質量濃度)エタノールで洗浄した。混合物を12,000rpmで5分間遠心した。沈渣を、減圧下で乾燥または超清浄実験台上で送風乾燥した。得られたDNA沈渣を適当な量のTE緩衝液に溶解し、-20℃で貯蔵した。
上記の抽出DNA試料の濃度を測定した。試験する試料の濃度は80~100ng/μLである。制限酵素のEcoR I(5’末端解析)およびEcoR V(3’末端解析)それぞれを用いてゲノムDNAを消化した。それぞれの酵素消化系に、26.5μLのゲノムDNA、0.5μLの上記の制限酵素、および3μLの酵素消化緩衝液(使用した全ての制限酵素は、その配合緩衝液またはNEB社からの一般的な緩衝液(現在NEBCutSmartとして知られている)有する酵素である)を添加し、1時間消化した。消化の後、酵素消化系に70μLの無水エタノールを添加し、氷浴中に30分間保持し、12,000rpmで7分間遠心した。上清を捨てた後、沈渣を送風乾燥し、次に、8.5μLの再蒸留水、1μLの10×T4-DNAリガーゼ緩衝液(NEB T4 DNAリガーゼ反応緩衝液、その具体的な配合については、NEBのウェブサイトにアクセスするか、または、https://www.neb.com/products/restriction-endonucleasesもしくはhttps://www.neb.com/products/b0202-t4-dna-ligase-reaction-bufferを参照されたい)、および0.5μLのT4-DNAリガーゼを添加し、次に4℃で一晩かけて連結させた。一連のネステッドプライマーを用いたPCR増幅により、5’末端ゲノムDNAおよび3’末端ゲノムDNAを単離した。具体的には、5’末端ゲノムDNAを単離するためのプライマーの組み合わせは、第1のプライマーとして配列番号13および配列番号26、第2のプライマーとして配列番号27および配列番号28、ならびに配列決定プライマーとして配列番号13を含む。3’末端ゲノムDNAを単離するためのプライマーの組み合わせは、第1のプライマーとして配列番号15および配列番号29、第2のプライマーとして配列番号30および配列番号31、ならびに配列決定プライマーとして配列番号15を含む。PCR反応条件を表3に示した。
接合部配列は比較的短いポリヌクレオチド分子であるが、それは、新規なDNA配列であり、ポリヌクレオチドの検出および解析において検出される場合には遺伝子導入ダイズイベントDBN8002のDNAに特徴的である。配列番号1および配列番号2の中の各接合部配列は、それぞれ、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002における遺伝子導入断片およびダイズゲノムDNAの挿入部位の両側の11個のポリヌクレオチドである。より長いまたはより短いポリヌクレオチド接合部配列を、配列番号3または配列番号4から選択することができる。接合部配列(5’接合部領域として用いられる配列番号1、および3’接合部領域として用いられる配列番号2)は、DNAプローブまたはDNAプライマー分子としてDNAを検出するための方法において有用であった。接合部配列である配列番号6および配列番号7もまた、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002の新規DNA配列であり、それらも、DNAプローブまたはDNAプライマー分子として遺伝子導入ダイズイベントDBN8002の存在を検出するために用いることが可能であった。配列番号6(配列番号3のヌクレオチド911~1129)は、pDBN4006構築物においてDNA配列とprAtAct2転写起点配列とにまたがり、配列番号7(配列番号4のヌクレオチド1~243)は、pDBN4006構築物においてt35S転写終結配列とDNA配列とにまたがる。
4.1 サザンブロットで用いるためのDNA抽出
乳鉢および乳棒を用い、およそ5gから10gの植物組織を液体窒素中で磨砕した。4gから5gの磨砕した植物組織を、20mLのCTAB溶解緩衝液(100mMのTris-HCl pH8.0、20mMのEDTA pH8.0、1.4MのNaCl、0.2%v/vのβ-メルカプトエタノール、2%w/vのCTAB)に再懸濁し、65℃の温度で60分間インキュベートした。インキュベーションの間、10分ごとに反転することによって試料を均一に混合した。インキュベーションの後、等しい容積のフェノール/クロロホルム/イソアミルアルコール(25:24:1)を添加し、抽出のために反転させることによって穏やかに混合し、次に4,000rpmの回転速度で20分間遠心した。水相を採取し、等しい容積のクロロホルム/イソアミルアルコール(24:1)で1度再抽出した。水相を再び採取し、等しい容積のイソプロパノールを添加した。その混合物を均一に混合し、-20℃の温度で1時間静置してDNAを沈殿させ、次に4,000rpmの回転速度で5分間遠心してDNA沈渣を得、続いて1mLのTE緩衝液(10mMのTris-HCl、1mMのEDTA;pH8.0)に再懸濁した。存在し得る全てのRNAを分解するために、40μLの10mg/mL RNase Aと共に37℃の温度で30分間、DNAをインキュベートし、4,000rpmの回転速度で5分間遠心し、次に、0.1倍量の3M酢酸ナトリウム(pH5.2)および2倍量の無水エタノールの存在下で、12,000rpmの回転速度で10分間遠心してDNAを沈殿させた。上清を捨てた後、1mLの70%(v/v)エタノールで沈渣を洗浄し、室温下で乾燥し、次に1mLのTE緩衝液にDNAを再溶解した。
上述の試料におけるゲノムDNAの濃度を、超微量分光光度計(NanoDrop 2000、Thermo Scientific)を用いることによって測定した。
ブロモフェノールブルーのローディングダイを実施例4.2からのそれぞれの試料に添加し、臭化エチジウムを含有する0.7%アガロースゲルにそれぞれの試料を載せ、TAE電気泳動緩衝液(40mMのトリス酢酸、2mMのEDTA、pH8.5)において単離のために電気泳動にかけた。ゲル電気泳動を20Vの電圧で一晩運転した。
プローブを準備するために適切なDNA配列をPCRにより増幅した。DNAプローブは、配列番号24もしくは配列番号25か、またはそれらの配列に部分的に相同的もしくは相補的であった。プローブのDIG標識、サザンブロット、膜洗浄、および他の操作を、DNA Labeling and Detection Starter Kit II(Roche、Cat.No.11585614910)を用いて行った。具体的な方法については、それらの製品説明書を参照されたい。最終的に、X線フィルム(Roche、Cat.No.11666916001)を用いて、プローブが結合している位置を検出した。
遺伝子導入ダイズイベントDBN8002におけるVip3Aaタンパク質およびPATタンパク質の発現範囲は、ELISAによって検出することができる。
6.1 中国でのダイズ植物DBN8002のバイオアッセイ
2種類の植物、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002および野生型ダイズ植物(非遺伝子導入、NGM)を、オオタバコガ(CBW)、ハスモンヨトウ(TCW)、シロイチモジヨトウ(BAW)、およびトビイロスズメ(BHM)を用いて、以下のバイオアッセイによって試験した。
遺伝子導入ダイズイベントDBN8002および野生型ダイズ植物(非遺伝子導入、NGM)を圃場に栽植した。3反復での乱塊法を用いた。区域は、面積が30m2(5m×6m)、条間隔が60cm、栽植間隔が10cmであった。植物を従来の方法で栽培および管理し、繁殖の全期間を通じて殺虫剤の散布を避けた。
オオタバコガの自然発生が重大である地域で、ダイズを自然寄生に供するのみとした(自然な昆虫損傷の発生条件:最も深刻な損傷は6月から7月までに発生し、害虫の成長最適温度は20℃から30℃までの範囲である)。ダイズ植物がV3段階(3枚葉)まで生育した時に、オオタバコガの幼虫に食べられたNGMの葉を調査するためにそれらのダイズ植物を追跡した。NGMの上部2枚目と3枚目の葉が食べ尽くされていない時に、オオタバコガのダイズ植物への損傷の面積率(損傷の面積率=それぞれの単一植物における葉の損傷面積の合計/植物の葉の総面積×100%)を一枚ずつ調査した。オオタバコガに対する遺伝子導入ダイズイベントDBN8002の抵抗性の結果を表9に示す。
シロイチモジヨトウの自然発生が重大である地域で、ダイズを自然寄生に供するのみとした(自然な昆虫損傷の発生条件:最も深刻な損傷は6月から7月までに発生し、害虫の成長最適温度は20℃から30℃までの範囲である)。ダイズ植物がV3段階まで生育した時に、シロイチモジヨトウの幼虫に食べられたNGMの葉を調査するためにそれらのダイズ植物を追跡した。NGMの上部2枚目と3枚目の葉が食べ尽くされていない時に、シロイチモジヨトウのダイズ植物への損傷の面積率(損傷の面積率=それぞれの単一植物における葉の損傷面積の合計/植物の葉の総面積×100%)を一枚ずつ調査した。シロイチモジヨトウに対する遺伝子導入ダイズイベントDBN8002の抵抗性の結果を表10に示す。
ダイズ植物のV3段階で人工投入を2度実施した。それぞれの区域の中心領域の近くの100株の植物を選択し、人工投入に供した。それぞれのダイズ植物の上部2枚目の葉に、人工給餌によって孵化させたばかりの約10匹の幼虫を投入した。投入の3日後に、1回目の投入と同じ幼虫密度で2回目の投入を実施した。投入の5~21日後に、幼虫に食べられた植物の葉の面積を1枚ずつ調査した。調査は、おおむね、投入の14日後に実施した。NGMにおける葉の損傷面積率(損傷面積率=それぞれの単一植物における葉の損傷面積の合計/植物の葉の総面積×100%)が15%に達すれば、有効であるとみなした。損傷面積率が15%に達しなければ調査を適宜延期し得たが、21日後に損傷面積率がなお15%に達しなければ、この投入は無効とみなした。それぞれの区域におけるダイズ植物のV3段階の間のハスモンヨトウのダイズ葉への損傷面積率の平均値を計算した。ハスモンヨトウに対する遺伝子導入ダイズイベントDBN8002の抵抗性の結果を表11に示す。
2種類の植物、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002および野生型ダイズ植物(非遺伝子導入、NGM)を、クリソデイキス・インクルデンス(Chrysodeixis includens(SBL))、ラチプルシア・ヌ(Rachiplusia nu(SFL))、ヨトウガ(FAW)、およびスポドプテラ・コスミオイデス(Spodoptera cosmioides(BLAW))を用いて、以下のバイオアッセイによって試験した。
2種類の植物、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002および野生型ダイズ植物(非遺伝子導入、NGM)を圃場に栽植し、クリソデイキス・インクルデンス(SBL)、ラチプルシア・ヌ(SFL)、アンティカルシア・ゲムマタリス(Anticarsia gemmatalis(VBC))、ヨトウガ(FAW)を用い、以下の方法に従って圃場でのin vivoバイオアッセイを実施した。
バスタ除草剤(活性成分が18%グルホシネート水溶液)を実験で散布使用するために選択した。3反復での乱塊法を用いた。区域は、面積が15m2(5m×3m)、条間隔が60cm、かつ栽植間隔が25cmであった。植物を従来の方法で栽培および管理し、各区域間に1メートルの距離を設定した。遺伝子導入ダイズイベントDBN8002を以下の2つの処理に供した。すなわち、(1)散布使用ではなく、処理(2)の間、除草剤を散布する時に等しい容積の清浄水を散布し、(2)V2~V3の葉の段階(2枚葉または3枚葉)で、バスタ除草剤を800g a.i./ha(a.i./haは「1ヘクタールあたりの活性成分」を意味する)の使用量で散布使用した。なお、グルホシネート除草剤(バスタなど)は接触型除草剤であり、その除草剤を圃場で不適切に扱うと、例えば過剰な除草剤溶液が局所的に蓄積し、植物毒性症状が発生しかねず、このことは、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002が耐性を損なったことを意味するのではなく、様々な濃度および配合のグルホシネート除草剤も、上記と等量の活性成分グルホシネートに転換すれば、以下の結論に当てはまることに留意するべきである。
Claims (13)
- 核酸配列であって、配列番号3もしくはその相補的配列の1~642番目の少なくとも11個の連続したヌクレオチド、および配列番号3もしくはその相補的配列の643~1524番目の少なくとも11個の連続したヌクレオチド、ならびに/または、配列番号4もしくはその相補的配列の1~347番目の少なくとも11個の連続したヌクレオチド、および配列番号4もしくはその相補的配列の348~656番目の少なくとも11個の連続したヌクレオチドを含み、
好ましくは、前記核酸配列は、配列番号3もしくはその相補的配列の1~642番目の22~25個の連続したヌクレオチド、および配列番号3もしくはその相補的配列の643~1524番目の22~25個の連続したヌクレオチド、および/または、配列番号4もしくはその相補的配列の1~347番目の22~25個の連続したヌクレオチド、および配列番号4もしくはその相補的配列の348~656番目の22~25個の連続したヌクレオチドを含み、
好ましくは、前記核酸配列は、配列番号1もしくはその相補的配列、および/または配列番号2もしくはその相補的配列を含み、
好ましくは、前記核酸配列は、配列番号3もしくはその相補的配列、および/または配列番号4もしくはその相補的配列を含むことを特徴とする、核酸配列。 - 前記核酸配列が配列番号5またはその相補的配列を含むことを特徴とする、請求項1に記載の核酸配列。
- 試料中の遺伝子導入ダイズイベントDBN8002に相当するDNAの存在を検出するための方法であって、
-核酸増幅反応において標的増幅産物を増幅するための少なくとも2つのプライマーに、検出される試料を接触させる工程と、
-前記核酸増幅反応を行う工程と、
-前記標的増幅産物の存在を検出する工程と、を含み、
前記標的増幅産物は請求項1または2に記載の核酸配列を含み、好ましくは、前記標的増幅産物は、配列番号1もしくはその相補的配列、配列番号2もしくはその相補的配列、配列番号6もしくはその相補的配列、および/または配列番号7もしくはその相補的配列を含むことを特徴とする、方法。 - 前記プライマーが第1のプライマーおよび第2のプライマーを含み、前記第1のプライマーは、配列番号1、配列番号8、および配列番号10から選択され、前記第2のプライマーは、配列番号2、配列番号9、および配列番号11から選択されることを特徴とする、請求項3に記載の、試料中の遺伝子導入ダイズイベントDBN8002に相当するDNAの存在を検出するための方法。
- 試料中の遺伝子導入ダイズイベントDBN8002に相当するDNAの存在を検出するための方法であって、
-検出される試料をプローブに接触させる工程であって、前記プローブは請求項1に記載の核酸配列を含み、好ましくは、前記プローブは、配列番号1もしくはその相補的配列、配列番号2もしくはその相補的配列、配列番号6もしくはその相補的配列、および/または配列番号7もしくはその相補的配列を含む、工程と、
-前記検出される試料および前記プローブをストリンジェントなハイブリダイゼーション条件に供する工程と、
-前記検出される試料の前記プローブとのハイブリダイゼーションを検出する工程と、を含むことを特徴とする、方法。
- 少なくとも1つのプローブが少なくとも1つのフルオロフォアで標識されることを特徴とする、請求項5に記載の、試料中の遺伝子導入ダイズイベントDBN8002に相当するDNAの存在を検出するための方法。
- 試料中の遺伝子導入ダイズイベントDBN8002に相当するDNAの存在を検出するための方法であって、
-検出される試料をマーカー核酸分子に接触させる工程であって、前記マーカー核酸分子は請求項1に記載の核酸配列を含み、好ましくは、前記マーカー核酸分子は、配列番号1もしくはその相補的配列、配列番号2もしくはその相補的配列、および/または配列番号6~11もしくはその相補的配列からなる群から選択される少なくとも1つの配列を含む、工程と、
-前記検出される試料および前記マーカー核酸分子をストリンジェントなハイブリダイゼーション条件に供する工程と、
-前記検出される試料の前記マーカー核酸分子とのハイブリダイゼーションを検出し、さらに、マーカー支援育種解析を行って、昆虫抵抗性および/または除草剤耐性が前記マーカー核酸分子に遺伝的に関連しているかどうかを決定する工程と、を含むことを特徴とする、方法。 - 少なくとも1つのDNA分子を含み、前記DNA分子は請求項1に記載の核酸配列を含み、前記DNA分子は、遺伝子導入ダイズイベントDBN8002またはその子孫に特異的なDNAのプライマーまたはプローブとして働くことができ、好ましくは、前記DNA分子は、配列番号1もしくはその相補的配列、配列番号2もしくはその相補的配列、配列番号6もしくはその相補的配列、および/または配列番号7もしくはその相補的配列を含むことを特徴とする、DNA検出キット。
- 昆虫の害からダイズ植物を保護するための方法であって、標的昆虫の餌の中に少なくとも1つの遺伝子導入ダイズ植物の細胞を供給する工程を含み、前記遺伝子導入ダイズ植物の細胞は、そのゲノム中に配列番号1および/または配列番号2に定める配列を含み、前記遺伝子導入ダイズ植物の細胞の摂取は、前記標的昆虫がさらに前記遺伝子導入ダイズ植物を餌にすることを阻害し、
好ましくは、前記遺伝子導入ダイズ植物の細胞は、そのゲノム中に配列番号3および/または配列番号4に定める配列を含み、
好ましくは、前記遺伝子導入ダイズ植物の細胞は、そのゲノム中に、配列番号1、配列番号5の1032~6444番目の核酸配列、および配列番号2を連続して含むか、または配列番号5に定める配列を含むことを特徴とする、方法。 - ダイズ植物を栽植する圃場において除草剤または雑草防除が引き起こす損傷からダイズ植物を保護するための方法であって、少なくとも1つの遺伝子導入ダイズ植物を栽植した前記圃場に有効量のグルホシネート除草剤を使用する工程を含み、前記遺伝子導入ダイズ植物は、そのゲノム中に、配列番号1および/または配列番号2に定める配列を含み、前記遺伝子導入ダイズ植物はグルホシネート除草剤耐性を有し、
好ましくは、前記遺伝子導入ダイズ植物は、そのゲノム中に配列番号3および/または配列番号4に定める配列を含み、
好ましくは、前記遺伝子導入ダイズ植物は、そのゲノム中に、配列番号1、配列番号5の1032~6444番目の核酸配列、および配列番号2を連続して含むか、または配列番号5に定める配列を含むことを特徴とする、方法。 - 昆虫抵抗性および/またはグルホシネート除草剤耐性のダイズ植物を育種するための方法であって、
-少なくとも1つのダイズ種子を栽植する工程であって、前記ダイズ種子は、そのゲノム中に、昆虫抵抗性Vip3Aaタンパク質をコード化する核酸配列および/またはグルホシネート除草剤耐性PATタンパク質をコード化する核酸配列、ならびに特異的領域の核酸配列を含むか、または前記ダイズ種子は、そのゲノム中に配列番号5に定める核酸配列を含む、工程と、
-前記ダイズ種子をダイズ植物に生育する工程と、
-前記ダイズ植物を標的昆虫で害し、および/または前記ダイズ植物に有効量のグルホシネート除草剤を散布し、次に前記特異的領域の核酸配列を含まない他の植物に比べて植物損傷が低減した植物を収穫する工程と、を含み、
前記特異的領域の核酸配列は、配列番号1および/または配列番号2に定める配列であり、好ましくは、前記特異的領域の核酸配列は、配列番号3および/または配列番号4に定める配列であることを特徴とする、方法。 - 昆虫抵抗性および/またはグルホシネート除草剤耐性のダイズ植物を作製するための方法であって、
-第1のダイズ植物のゲノム中の昆虫抵抗性Vip3Aaタンパク質をコード化する核酸配列および/またはグルホシネート除草剤耐性PATタンパク質をコード化する核酸配列ならびに特異的領域の核酸配列、または前記第1のダイズ植物のゲノム中の配列番号5に定める核酸配列を、第2のダイズ植物に導入することによって複数の子孫植物を作製する工程と、
-前記特異的領域の核酸配列を含む前記子孫植物を選択する工程であって、前記子孫植物も昆虫抵抗性および/またはグルホシネート除草剤耐性を有する工程と、を含み、
前記特異的領域の核酸配列は、配列番号1および/または配列番号2に定める配列であり、好ましくは、前記特異的領域の核酸配列は、配列番号3および/または配列番号4に定める配列であり、
好ましくは、前記方法は、
-遺伝子導入ダイズイベントDBN8002を、昆虫抵抗性および/またはグルホシネート耐性を欠いているダイズ植物に有性的に交配することによって、複数の子孫植物を作製する工程と、
-前記特異的領域の核酸配列を含む前記子孫植物を選択する工程と、
-前記子孫植物を標的昆虫で害し、および/またはグルホシネートで前記子孫植物を処理する工程と、
-昆虫抵抗性および/またはグルホシネート除草剤耐性を有する前記子孫植物を選択する工程と、を含むことを特徴とする方法。 - 遺伝子導入ダイズイベントDBN8002に由来する農産物または商品であって、前記農産物または商品は、レシチン、脂肪酸、グリセロール、ステロール、ダイズフレーク、ダイズ粉、ダイズタンパク質もしくはその濃縮物、ダイズ油、ダイズタンパク質繊維、豆乳凝固物、または豆腐であることを特徴とする、農産物または商品。
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