JP2020513754A - がん治療用に操作されたt細胞 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2016年12月21日に出願された米国特許仮出願第62/437,524号の利益を主張するものであり、該文献はその全体が本明細書において参照により援用されている。
PD−1融合タンパク質とこのニーズに対応するように設計されている修飾T細胞受容体とを具備する操作されたT細胞が、本明細書中に記載されている。
別途規定されていない限り、本明細書中に用いられている全ての技術用語及び科学用語は、本発明の属する分野の当業者に遍く理解されているのと意味が同じである。
T細胞受容体(TCR)融合タンパク質を用いた、がんなどの疾患の治療に有用な物質及び方法の組成物が、本明細書中に提供されている。本明細書において、「T細胞受容体(TCR)融合タンパク質」または「TFP」には、一般的に、i)標的細胞上の腫瘍関連抗原などの表面抗原に結合する機能を有し、且つii)典型的にはT細胞の表面内または表面上の同じ場所にあるときに、無傷のTCR複合体の他のポリペプチド成分と相互作用する機能を有する、TCRを含む種々のポリペプチドから誘導された組み換えポリペプチドが包含される。本明細書中に提供されているように、TFPはキメラ抗原受容体と比べて実質的な利益を提供する。「キメラ抗原受容体」または代替的に「CAR」という用語は、scFvの形態の細胞外抗原結合ドメインと、膜貫通ドメインと、以下に定義されるような刺激分子に由来する機能的シグナル伝達ドメインを含む、細胞質シグナル伝達ドメイン(本明細書では「細胞内シグナル伝達ドメイン」とも呼ばれる)を含む組み換えポリペプチドを指す。概して、CARの中央細胞内シグナル伝達ドメインは、通常TCR複合体に関連して見出されるCD3ζ鎖に由来する。CD3ζシグナル伝達ドメインは、4−1BB(すなわち、CD137)、CD27及び/またはCD28などの少なくとも1つの共刺激分子に由来する1つ以上の機能的シグナル伝達ドメインと融合し得る。
本発明には、TFP及びPD−1融合タンパク質をコードする組み換えDNA構築物を包含される。このTFPには、1つ以上の腫瘍関連抗原(「TAA」)、例えばヒトTAAに特異的に結合する抗体フラグメントが含まれており、抗体フラグメントの配列は、TCRサブユニットまたはその一部をコードする核酸配列と連続しており、その酸配列と同じリーディングフレーム内にある。本明細書中に提供されているTFPは、機能的TCR複合体を形成するために、1つ以上の内在性(または代替的に、1つ以上の外在性、または内在性及び外在性の組み合わせ)TCRサブユニットと会合し得る。別の態様において、TFPには、IgG1またはIgG4抗体のTc領域に特異的に結合するCD16フラグメントが含まれる。
細胞外ドメインは、天然源または組み換え源のいずれかに由来し得る。ドメインは、天然源である場合、任意のタンパク質、特に膜結合型または膜貫通型タンパク質に由来し得る。一態様において、細胞外ドメインは、膜貫通ドメインと会合し得る。本発明において特に有用な細胞外ドメインには、例えば、T細胞受容体のα鎖、β鎖もしくはζ鎖、またはCD3ε、CD3γもしくはCD3δの少なくとも細胞外領域(複数可)が含まれる場合があり、あるいは代替の実施形態では、CD28、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154の少なくとも細胞外領域(複数可)が含まれる場合がある。
概して、TFP配列には、単一のゲノム配列によってコードされる細胞外ドメイン及び膜貫通ドメインが含まれる。代替実施形態において、TFPは、TFPの細胞外ドメインに対して異種の膜貫通ドメインを含むように設計することが可能である。膜貫通ドメインには、膜貫通領域に隣接する1つ以上の追加のアミノ酸、例えば、膜貫通タンパク質(transmembrane)の誘導元となったタンパク質の細胞外領域と会合した1つ以上のアミノ酸(例えば、細胞外領域の1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個もしくは最高15個のアミノ酸)、及び/または膜貫通タンパク質の誘導元となるタンパク質の細胞内領域と会合した1つ以上の更なるアミノ酸(例えば、細胞内領域の1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個もしくは最高15個のアミノ酸)が含まれる場合がある。一態様において、膜貫通ドメインは、使用されているTFPの他のドメインのうちの1つと関連するものである。いくつかの実例では、膜貫通ドメインをアミノ酸置換によって選択または修飾することにより、そのようなドメインが同じまたは異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインに結合するのを回避し、例えば、受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小限に抑えることを可能にしている。一態様において、膜貫通ドメインは、TFP−T細胞表面上の他のTFPとホモ二量体化する機能を有する。異なる態様では、同じTFP内に存在する天然の結合パートナーの結合ドメインとの相互作用が最小限に抑えられるように、膜貫通ドメインのアミノ酸配列を修飾または置換する場合がある。
任意に、長さが2〜10アミノ酸の間の短いオリゴまたはポリペプチドリンカーを介して、膜貫通ドメインとTFPの細胞質領域との間の結合を形成することが可能である。特に好適なリンカーはグリシン−セリンダブレットによって提供される。例えば、一態様において、リンカーは、アミノ酸配列GGGGSGGGGSGGGGSLE(配列番号1)を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、ヌクレオチド配列AAAIEVMYPPPYLGGGGSGGGGSGGGGSLE(配列番号3)によってコードされる。
TFPにCD3γ、δまたはεポリペプチドが含まれていて、TCRα及びTCRβサブユニットが一般にシグナル伝達ドメインを欠いているときは、TFPの細胞質ドメインに細胞内シグナル伝達ドメインが含まれる場合がある。細胞内シグナル伝達ドメインは、概して、TFPが導入された免疫細胞の少なくとも1つの正常エフェクター機能の活性化に関与している。「エフェクター機能」という用語は、細胞の特殊機能を指す。T細胞のエフェクター機能は、例えば、細胞溶解活性である場合もあれば、またはサイトカインの分泌を含むヘルパー活性である場合もある。それゆえ、「細胞内シグナル伝達ドメイン」という用語は、エフェクター機能シグナルを伝達し、細胞に特殊機能を果たすように指示するタンパク質の部分を指す。通常は細胞内シグナル伝達ドメイン全体を使用できるが、多くの事例では、鎖全体を使用する必要はない。細胞内シグナル伝達ドメインの切断型部分が使用される限りにおいて、そのような切断型部分は、エフェクター機能シグナルを伝達する限り、無傷の鎖の代わりに使用される場合がある。それゆえ、細胞内シグナル伝達ドメインという用語は、エフェクター機能シグナルを伝達するのに十分な細胞内シグナル伝達ドメインの任意の切断部分を含むことを意味する。
本発明はまた、本明細書に記載の1つ以上のTFP構築物及び/またはPD−1融合タンパク質をコードする核酸分子を提供する。一態様において、核酸分子は、メッセンジャーRNA転写物として提供される。一態様において、核酸分子は、DNA構築物として提供される。
増殖及び遺伝的修飾に先立って、対象からT細胞源を採取する。「対象」という用語は、免疫応答を誘発できる生物(例えば、哺乳動物)を包含することを意味する。対象の例には、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラット、及びそれらのトランスジェニック種が挙げられる。T細胞の供給元としては、末梢血単核球、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位由来の組織、腹水、胸水、脾臓組織、及び腫瘍など、幾多の起源を挙げることができる。本発明の或る態様では、当該技術分野において利用可能な任意の数のT細胞株を使用する場合がある。本発明の或る態様では、Ficoll(登録商標)分離溶液のような、当業者に公知の任意の数の技法を使用して、対象から採取された血液の単位からT細胞を得る場合がある。好ましい一態様では、アフェレーシスによって、個体の循環血液由来の細胞を得る。アフェレーシス生成物には、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球、赤血球及び血小板をはじめとするリンパ球が含有されるのが、一般的である。一態様では、アフェレーシスによって採取された細胞を洗浄し、血漿画分を除去してから、後続の処理ステップ用に細胞を適切な緩衝液または培地に収容する場合がある。本発明の一態様では、細胞をリン酸緩衝食塩水(PBS)で洗浄する。代替態様において、洗浄液は、カルシウムを欠き、且つマグネシウムを欠く場合もあれば、あるいは全部ではないにしても多くの二価陽イオンを欠く場合もある。初期活性化ステップでは、カルシウムの不在下にて、活性化が増強される可能性がある。当業者に容易に理解されるように、洗浄ステップは、製造業者の指示書に従い、例えば、半自動「フロースルー」遠心分離機(例えば、Cobe 2991cell processor、Baxter CytoMate(商標)、またはHaemonetics(登録商標)Cell Saver(登録商標)5)を使用するなどの、当業者に公知の方法によって達成できる。洗浄後、細胞を、例えば、Ca不含、Mg不含PBS、Plasma−Lyte(登録商標)A、または緩衝液含有もしくは不含の他の生理食塩水などのような様々な生体適合性緩衝液中に再懸濁させてもよい。代替的に、アフェレーシス試料の望ましくない成分を除去し、細胞を直接的に培地に再懸濁させてもよい。
T細胞は概して、例えば、米国特許第6,352,694号、同第6,534,055号、同第6,905,680号、同第6,692,964号、同第5,858,358号、同第6,887,466号、同第6,905,681号、同第7,144,575号、同第7,067,318号、同第7,172,869号、同第7,232,566号、同第7,175,843号、同第5,883,223号、同第6,905,874号、同第6,797,514号、同第6,867,041号、及び同第7,572,631号に記述されているような方法を用いて活性化し、且つ膨張させることができる。
本明細書中に記載されているTFP発現細胞及び/またはPD−1融合タンパク質発現細胞(例えば、PD1CD28発現細胞)を、他の公知の薬剤及び治療剤と併用することができる。本明細書中に用いられている「併用」投与とは、対象が障害に罹患している間に、2種(もしくはそれ以上)の異なる治療薬を対象に施すこと、例えば、対象の障害が診断された後、その障害が治癒または排除される前、あるいは他の理由で治療が中断される前に、2種以上の治療を施すことを意味する。いくつかの実施形態では、或る治療薬が依然として送達されている途中に、第2の送達が開始された場合、投与に関して重複が存在する。これは、本明細書において、「同時送達」または「並行送達」と呼称されることがある。他の実施形態では、一方の治療薬の送達が終了した後で、他方の治療薬の送達が開始される。いずれかの症例のいくつかの実施形態では、併用投与によってより有効となる。例えば、第2の治療薬の方がより有効であり、例えば、第2の治療薬を減量したとしても同等の効果が認められる。すなわち、第2の治療薬が症状を軽減する度合いの方が、第1の治療薬の不在下で第2の治療薬を投与した場合に認められる度合いよりも大きく、あるいは第1の治療薬で類似の状況が見られた場合に認められる度合いよりも大きい。いくつかの実施形態では、症状軽減、または障害に関連する他のパラメータが、一方の治療薬が他方の治療薬の非存在下で送達された場合に観察されるよりも優れるように、送達が為される。2つの治療薬の効果は、幾分かは相加的である場合もあれば、全体的に相加的である場合もあれば、または相加的より優れる場合もある。第2の治療薬が送達された際に、第1の治療薬を送達した効果を依然として検出することが可能となるように、送達が為され得る。
本発明の医薬組成物には、本明細書に記載の複数のTFP発現細胞などのTFP発現細胞と、PD−1融合タンパク質発現細胞などのPD−1融合タンパク質(例えばPD1CD28スイッチ)発現細胞とが組み合わせて含まれる場合もあれば、1種以上の医薬的もしくは生理学的に許容される担体、希釈剤、または賦形剤が含まれる場合もある。そのような組成物には、中性緩衝食塩水のような緩衝剤、リン酸緩衝食塩水など、グルコース、マンノース、スクロースまたはデキストランなどの炭水化物、マンニトール、タンパク質、グリシンなどのポリペプチドまたはアミノ酸、酸化防止剤、EDTAまたはグルタチオンなどのキレート剤、補助剤(水酸化アルミニウムなど)及び防腐剤が含まれる場合がある。本発明の組成物は、一態様において、静脈内投与用に製剤化されている。
実施例1:細胞株及び細胞培養条件
別途注記のない限り、いずれの細胞株も、American Type Culture Collection(ATCC)から購入されたものである。本明細書中に開示されている方法において使用するのに適切な細胞株の代表例は、下掲の通りである。下記の腫瘍細胞株は、IFNγ曝露の非存在下で低レベルのPD−L1を発現する。ゆえに、レンチウイルスを介してPD−L1をこれらの細胞株に形質導入することによっても同様に、PD−L1の高安定発現バージョンを産生することが可能である。腫瘍関連抗原または対照抗原をこれらの細胞株に形質導入することによって、本明細書中に開示されている融合タンパク質を試験することができる。それら融合タンパク質の例としては、限定されるものではないが、メソセリン(MSLN)、BCMA、CD19、CD20、CD22、前立腺特異的がん抗原(PSCA)、及びROR−1が挙げられる。本明細書中に開示されている併用療法用の標的として使用できる表面発現腫瘍関連抗原はいずれも、置換可能である。
本明細書中に開示されているように、PD1CD28スイッチ受容体と併用するためのTFPの生成については、例えば、同時係属中の非暫定的国際特許出願第PCT/US2016/033146号(2016年5月18日出願)、ならびに同時係属中の米国特許仮出願第62/405,551号(2016年10月7日出願)、同第62/357,185号(2016年6月30日出願)、同第62/370,189号(2016年8月2日出願)、同第62/425,697号(2016年11月23日出願)、同第62/425,407号(2016年11月22日出願)、同第62/425,535号(2016年11月22日出願)、及び同第62/425,884号(2016年11月23日出願)に記載されている。これらの各文献は、本明細書において参照により援用されている。
PD−1−cDNA(Origene)由来の切断型細胞外PD−1(アミノ酸1〜155)をCD28の膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインと融合させることによって、PD1CD28スイッチ受容体が構築される(アミノ酸141−220)。また、PD1CD28スイッチ受容体の変異型(PD1CD28m)も構築される。このCD28シグナル伝達の無効化については、Liu et al.,(2016)Cancer Res.76(6)に記載されているほか、同時係属中の非暫定的国際特許出願第PCT/EP2016/064195号(2016年6月20日出願)にも更に記載されており、これらの各文献は本明細書において参照により援用されている。
下記手順または軽微な変更を加えた手順に従い、適切な構築物をコードするレンチウイルスを調製する。5×106HEK−293FT細胞を100mm皿に播種し、一晩で70〜90%コンフルエンシーに達するようにした。指示されたDNAプラスミド2.5μg及びLentivirus Packaging Mix(ALSTEM、カタログ番号VP100)20μLを、血清を含まない0.5 mLのDMEMまたはOpti−MEM(登録商標)I培地で希釈し、穏やかに混合する。別個のチューブで、NanoFect(登録商標)トランスフェクション試薬(ALSTEM、カタログ番号NF100)30μLを、血清不含のDMEMまたはOpti−MEM I培地0.5mL中で希釈し、穏やかに混合する。次いで、NanoFect/DMEM及びDNA/DMEM溶液を混合し、10〜15秒間ボルテックスした後、DMEM−プラスミド−NanoFect混合物を室温で15分間インキュベートする。前のステップからの完全なトランスフェクション複合体を細胞のプレートに滴下して加え、このプレートでトランスフェクション複合体を揺すって均一に分散させる。次いで、プレートを加湿5%CO2インキュベーター内で、37℃で一晩インキュベートする。翌日、上清を新鮮な培地10mLと交換し、ViralBoost(商標)20μLを補給する(500×、ALSTEM、カタロログ番号VB100)。その後、プレートを37℃で更に24時間インキュベートする。続いて、レンチウイルス含有の上清を、50mLの無菌キャップ付きコニカル遠心チューブ内に採取して氷上に置く。4℃で15分間3000rpmで遠心分離した後、清澄な上清を低タンパク質結合0.45μm滅菌フィルターで濾過し、続いて4℃で1.5時間、25,000rpm(Beckmann、L8−70M)で超遠心分離することによってウイルスを単離させる。ペレットを取り出し、DMEM培地中に再懸濁させてから、Lenti−X qRT−PCR滴定キットを使用して定量的RT−PCRによりレンチウイルス濃度/力価を確立する(Clontech;カタロログ番号631235)。プラスミドDNAが残留している場合、DNaseIで処理することによって除去する。ウイルスストック調製物を、感染の目的に直ちに使用するか、または等分して、今後の使用に備えて−80℃で貯蔵する。
全血またはバフィーコートから末梢血単核球(PBMC)を調製する。全血を10mLのヘパリンバキュテナーで採取し、直ちに処理するかまたは4℃で一晩保存する。全抗凝固血液約10mLを、Ca2+/Mg2+不含PBS(pH7.4)を入れた50mLコニカル遠心管中で総容量20mLになるように滅菌リン酸緩衝食塩水(PBS)緩衝液と混合する。次いで、この血液/PBS混合物20mLをFicoll−Paque(登録商標)PLUS(GE Healthcare、17−1440−03)15mLの表面上に静かに重層した後、室温で40gにて30〜40分間ブレーキなしで遠心分離する。
全血またはバフィーコートのいずれかから調製したPBMCを、抗ヒトCD28及びCD3抗体共役磁気ビーズで24時間刺激した後、ウイルスによる形質導入を行う。新たに単離したPBMCを、5%AB血清及び1.25μg/mLのアムホテリシンB(Gemini Bioproducts)、100U/mLのペニシリン及び100μg/mLのストレプトマイシン)を含有するが、但しhuIL−2不含のCAR−T培地(AIM V−AlbuMAX(BSA)(Life Technologies)中で1回洗浄した後、300IU/mLのヒトIL−2(1000×ストック;Invitrogen)含有のCAR−T培地中に、最終濃度1×106細胞/mLにて再懸濁させる。PBMCが事前に凍結されていた場合は、解凍してから、10%FBS、100U/mLペニシリン、100μg/mLストレプトマイシンの存在下、1×106細胞/mLの濃度にて予備加温した(37℃)DMEM培地(Life Technologies)9mL中に1×107細胞/mL中に再懸濁させた後、CAR−T培地で1回洗浄し、CAR−T培地中に1×106細胞/mLにて再懸濁させ、前述のIL−2を加える。
PBMCが活性化された後、細胞を37℃にて5%CO2で48時間インキュベートする。レンチウイルスを氷上で解凍し、培地1mL当たり2μLのTransPlus(商標)(Alstem)(最終希釈率1:500)と共に、1×106細胞の各ウェルに加える。細胞を更に24時間インキュベートした後、ウイルスの添加を繰り返す。代替的に、レンチウイルスを氷上で解凍し、5μg/mLのポリブレン(Sigma)の存在下、各々のウイルスを5MOIまたは50MOIで加える。室温にて細胞を100gで100分間かけて回転培養する。その後、300IU/mLのヒトIL−2を引き続き存在させて、細胞を6〜14日間増殖させる(総インキュベーション時間は、最終的なTFP−T細胞の所要数に依存する)。細胞濃度を2〜3日ごとに分析し、その時点で培地を加えて、細胞懸濁液を1×106細胞/mLに維持する。
レンチウイルスによる形質導入またはmRNAのエレクトロポレーションに続いて、TFP及びPD1CD28スイッチ受容体の発現を、フローサイトメトリーにより確証する。T細胞受容体に対するTFPの取り込みは、適切な抗標的抗体を使用することにより、検出することが可能である(例えば、CD19特異的TFPの発現は、抗CD19 scFv抗体または抗マウスFab血清を用いた検出が可能である)。一方、PD1CD28スイッチ受容体の検出は、ヒトPD−1検出用の抗PD−1抗体またはPD−L1−Fcを用いた検出が可能である。T細胞を、染色緩衝液(PBS、4%BSA)3mL中で3回洗浄し、1ウェル当たり1×106細胞にてPBS中に再懸濁させる。死細胞を排除するため、細胞をLIVE/DEAD(登録商標)Fixable Aqua Dead Cell Stain(Invitrogen)と共に、氷上で30分間インキュベートする。細胞をPBSで2回洗浄し、染色緩衝液50μL中に再懸濁させる。Fc受容体を遮断するため、1:100に希釈された正常ヤギIgG(BD Bioscience)1μLを各チューブに加えて、氷中で10分間インキュベートする。FACS緩衝液1.0mLを各チューブに加え、十分に混合して、細胞を300gにて5分間遠心分離させてペレット化する。scFv TFPの表面発現が、Zenon(登録商標)R−Phycoerythrin標識ヒト抗腫瘍抗原IgG1 Fcまたは腫瘍抗原−Fcによって検出される。抗体または可溶性腫瘍抗原1μgを各々の試料に加えて、氷上で30分間インキュベートする。次いで、細胞を2回洗浄し、BD bioscience製の抗CD3 APC(クローン、UCHT1)、抗CD4−Pacific blue(クローンRPA−T4)、抗CD8 APCCy7(クローンSK1)を用いて、T細胞の表面マーカーを染色する。LSRFortessa(登録商標)X20(BD Biosciences)を用いてフローサイトメトリーを実行し、FACSDiva(商標)ソフトウェアを用いてデータを取得し、FlowJo(登録商標)で分析する(Treestar,Inc.Ashland,OR)。
PD−1リガンド(すなわち、PD−L1及び/またはPD−L2)ならびに標的腫瘍抗原(例えば、BCMA、CD19、MSLNなど)に対して陽性または陰性の標的細胞を、蛍光色素カルボキシフルオセイン二酢酸サクシニミジルエステル(CFSE)で標識する。これらの標的細胞を、エフェクターT細胞と混合させる。このエフェクターT細胞は、形質導入されていないか、PD1CD28スイッチ受容体単独で形質導入されているか、腫瘍関連抗原に特異的なTFP(例えばCD19に特異的なTFP)であるか、変異型PD1CD28スイッチ受容体で形質導入されているか、またはTFPで形質導入され且つPD1CD28スイッチ受容体または変異型PD1CD28mスイッチ受容体の一方と組み合わせられているか、のいずれかである。指示されたインキュベーション期間の後、フローサイトメトリーによって各エフェクター/標的細胞培養物に対して、死滅から生存までのCFSE標識標的細胞と陰性対照標的細胞との割合が決定される。各T細胞の陽性標的細胞培養物中の標的細胞の生存率を、標的細胞のみを含有するウェルを基準とした相対値として計算する。
実施例1にデモンストレーションされているのと同様、抗腫瘍抗原TFP+PD1CD28スイッチ受容体で形質導入されたT細胞によってもまた、細胞毒性が秀逸であることをリアルタイム細胞毒性アッセイ(RTCA)フォーマットにてデモンストレーションできる。RTCAアッセイは、専用の96ウェルプレートの各ウェルにおける接着性標的細胞単層の電気インピーダンスをリアルタイムで測定し、最終的な読み出し値を細胞指数と呼ばれる値として提示する。細胞指数の変化は、同時インキュベートされたT細胞エフェクターによって標的細胞が死滅した結果として、標的細胞単層が破壊されたことが示す。それゆえ、エフェクターT細胞の細胞傷害性を、標的細胞単独のウェルの細胞指数の変化と比較した、標的細胞及びエフェクターT細胞の両方を含むウェルの細胞指数の変化として評価することができる。
皮下固形腫瘍または播種性もしくは皮下血液腫瘍を担持する免疫不全マウスモデルにおいて、腫瘍抗原発現ヒトがん細胞株を使用することで、本明細書中に開示されている併用療法による治療の有効性を試験することができる。ヒトTFP T細胞及びPD−1融合受容体での処置に応答した腫瘍収縮は、腫瘍サイズのキャリパー測定によって、またはffluc発現腫瘍細胞によって放出されるルシフェラーゼタンパク質(ffluc)シグナルの強度を追跡することによって評価できる。
同族抗原を有する細胞の認識に関連するエフェクターT細胞活性化及び増殖のもう1つの尺度が、インターロイキン−2(IL−2)及びインターフェロン−γ(IFN−γ)などのエフェクターサイトカインの産生である。
抗腫瘍抗原TFP、例えば抗MSLN TFPで形質導入されたエフェクターT細胞がin vivoで抗腫瘍応答を達成する能力を評価するため、1)抗MSLN TFP+PD1CD28スイッチ受容体、2)抗MSLN TFP単独、もしくは3)PD1CD28スイッチ受容体単独のいずれかで形質導入されたエフェクターT細胞、または4)形質導入されていないエフェクターT細胞を、以前にPD−L1+またはPD−L1−ヒトがん細胞株を接種したNOD/SCID/IL−2Rγ−/−(NSG−JAX)マウスに対し、養子的に導入する。
いくつかの実施形態では、併用療法は、追加的な抗体を含む。一実施形態では、PD−1スイッチ受容体を、CD16ポリペプチドと標的細胞の表面上の腫瘍抗原に対するIgG1抗体とを含むTFPと併用して投与する。例えば、T細胞は、CD16−CD3εTFP+PD1CD28スイッチ受容体で形質導入される。次いで、対象は、これらのT細胞を投与され、リツキシマブのようなIgG抗腫瘍抗体も投与される。
いくつかの実施形態において、併用療法におけるTFPは、二重特異性TFPである。そのようなTFPには2つのscFvポリペプチドが含まれており、これらのscFvポリペプチドは、単一TCRサブユニットに直列に付着して発現するか、またはそれぞれ異なるサブユニット上に発現する。例えば、TFPには、抗CD19 scFv−CD3ε構築物及び抗BCMA scFv−CD3γ構築物が含まれる場合がある。他の抗原結合対、例えば、CD20、CD22、ROR1、MSLN、BCMA、CD19などに対する抗体を含む抗原結合対を使用してもよい。二重特異性TFPは、上記のようにPD−1スイッチ受容体と併用投与される。
Claims (51)
- (a) TCRサブユニットを含む第1の融合タンパク質をコードする第1の組み換え核酸分子であって、前記TCRサブユニットが、
(i) TCR細胞外ドメインの少なくとも一部と、
(ii) CD3サブユニットの細胞内シグナル伝達ドメイン由来の刺激ドメインを備えるTCR細胞内ドメインと、
(iii) 第1の標的結合ドメインであって、前記TCRサブユニット及び前記第1の標的結合ドメインが作動可能に連結され、且つ前記第1の融合タンパク質がT細胞内で発現したときにTCR内に組み込まれる、前記第1の標的結合ドメインと、
を含む前記第1の組み換え核酸分子と、
(b) 第2の標的結合ドメインを有する第2の融合タンパク質をコードする第2の組み換え核酸分子であって、前記第2の標的結合ドメインがそのC末端を介して共刺激ポリペプチドの細胞内ドメインのN末端に作動可能に連結されているPD−1ポリペプチドを含み、前記PD−1ポリペプチドが前記細胞外ドメインとPD−1の膜貫通ドメインとを含む、前記第2の組み換え核酸分子と、
を具備する組成物。 - 前記第1の標的結合ドメインが、第1のヒトまたはヒト化抗体ドメインである、請求項1に記載の組成物。
- (a) TCRサブユニットを含む第1のT細胞受容体(TCR)融合タンパク質(TFP)をコードする第1の組み換え核酸分子であって、前記TCRサブユニットが、
(i) TCR細胞外ドメインの少なくとも一部と、
(ii) CD3サブユニットの細胞内シグナル伝達ドメイン由来の刺激ドメインを備えるTCR細胞内ドメインと、
(iii) 第1の抗原結合ドメインを備える第1のヒトまたはヒト化抗体ドメインと、任意に第2の抗原結合ドメインとを含む第2のヒトまたはヒト化抗体ドメインを有し、前記TCRサブユニット、前記第1の抗体ドメイン及び前記第2の抗体ドメインが作動可能に連結され、且つ前記第1のTFPがT細胞内に発現したときにTCR内に組み込まれる、前記第1の組み換え核酸分子と、
(b) 第2の標的結合ドメインを有する第2の融合タンパク質をコードする第2の組み換え核酸分子であって、前記第2の標的結合ドメインがそのC末端を介して共刺激ポリペプチドの細胞内ドメインのN末端に作動可能に連結されているPD−1ポリペプチドを含み、前記PD−1ポリペプチドが前記細胞外ドメインとPD−1の膜貫通ドメインとを含む、前記第2の組み換え核酸分子と、
を具備する組成物。 - 前記抗体ドメインが、ROR−1、BCMA、CD19、CD20、CD22、メソセリン、MAGE A3、EGFRvIII、MUC16、NKG2D、IL−13Rα2、L1CAM、及びNY−ESO−1、及びそれらの組み合わせを含むリストから選択される腫瘍関連抗原に特異的に結合し得る、請求項2または請求項3に記載の組成物。
- 前記共刺激ポリペプチドが、OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM−1、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、GITR、CD28、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、CD226、FcγRI、FcγRII、及びFcγRIIIを含む群から選択される請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1の組み換え核酸分子が単離されている、請求項1〜5のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第2の組み換え核酸分子が単離されている、請求項1〜6のいずれか一項に記載の組成物。
- 請求項1〜5のいずれか一項に記載の組成物の第1及び第2の核酸分子を含むウイルスベクターを具備する組成物。
- 前記第1の組み換え核酸分子及び前記第2の組み換え核酸分子が、単一のオペロン内に含有される、請求項8に記載の組成物。
- 前記第1の組み換え核酸分子及び前記第2の組み換え核酸分子が、別々に転写された2つのオペロン内に含有される、請求項8に記載の組成物。
- 前記オペロンがE1aプロモーターを具備する、請求項10に記載の組成物。
- 前記オペロンがそれぞれE1aプロモーターを具備する、請求項11に記載の組成物。
- 前記ウイルスベクターが、DNA、RNA、プラスミド、レンチウイルスベクター、アデノウイルスベクター、ラウス肉腫ウイルス(RSV)ベクター、またはレトロウイルスベクターである、請求項8〜12のいずれか一項に記載の組成物。
- 請求項1〜5のいずれか一項に記載の第1の組み換え核酸分子を含むウイルスベクターを具備する組成物。
- 請求項1〜5のいずれか一項に記載の第2の組み換え核酸分子を含むウイルスベクターを具備する組成物。
- 前記ウイルスベクターが単離されている、請求項8〜15のいずれか一項に記載の組成物。
- 請求項14及び/または15に記載のウイルスベクターの混合物を具備する組成物。
- 請求項1〜5、8〜15のいずれか一項に記載の組成物を含む形質導入T細胞を具備する、組成物。
- 形質導入T細胞を具備する組成物であって、前記形質導入T細胞が、請求項14に記載のウイルスベクターと請求項15に記載のウイルスベクターとを具備する、前記組成物。
- 前記第1の融合タンパク質及び前記第2の融合タンパク質がそれぞれ前記T細胞の表面上で検出可能である、請求項19に記載の組成物。
- 第1のポリペプチドを含むT細胞を具備する組成物であって、前記第1のポリペプチドが、
(a) TCRサブユニットであって、
(i) TCR細胞外ドメインの少なくとも一部と、
(ii) CD3εまたはCD3γの細胞内シグナル伝達ドメイン由来の刺激ドメインを備えるTCR細胞内ドメインと、
(iii) 第1の標的結合ドメインであって、前記TCRサブユニット及び前記第1の標的結合ドメインが作動可能に連結され、且つ前記第1の融合タンパク質が前記T細胞中のTCR内に組み込まれる、前記第1の標的結合ドメインと、
を含む前記TCRサブユニットと、
(b) 第2の標的結合ドメインを有する第2の融合タンパク質であって、前記第2の標的結合ドメインが、そのC末端を介して共刺激ポリペプチドの細胞内ドメインのN末端に作動可能に連結されているPD−1ポリペプチドを含み、前記PD−1ポリペプチドが前記細胞外ドメインと前記PD−1の膜貫通ドメインとを含む、前記第2の融合タンパク質と、
を具備する組成物。 - 前記第1の標的結合ドメインが、CD16、BCMA、MSLN、NKG2D、ROR1、CD19、CD20、CD22、及び前立腺特異的がん抗原(PSCA)を含む群から選択される、請求項21に記載の組成物。
- 前記共刺激ポリペプチドが、OX40、CD2、CD27、CDS、ICAM−1、ICOS(CD278)、4−1BB(CD137)、GITR、CD28、CD30、CD40、BAFFR、HVEM、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、CD226、FcγRI、FcγRII、及びFcγRIIIを含む群から選択される、請求項21または22に記載の組成物。
- 前記第2の融合タンパク質の共刺激ポリペプチドがCD28である、請求項23に記載の組成物。
- 前記コードされた第1の抗原結合ドメインが、第1のリンカー配列を介して前記第1のTFPのTCR細胞外ドメインに連接され、且つ前記コードされた第2の抗原結合ドメインが、第2のリンカー配列を介して前記第1のTFPのTCR細胞外ドメインに連接される、請求項1〜24のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のリンカー配列及び前記第2のリンカー配列が(G4S)n(式中、n=1〜4)を具備する、請求項25に記載の組成物。
- 前記第1のTFPのTCRサブユニットがTCR細胞外ドメインを具備する、請求項25または26に記載の組成物。
- 前記第1のTFPのTCRサブユニットが、TCR膜貫通ドメインを具備する、請求項25〜27のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のTFPのTCRサブユニットが、TCR細胞内ドメインを具備する、請求項25〜28のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のTFPのTCRサブユニットが、(i)TCR細胞外ドメインと(ii)TCR膜貫通ドメインと(iii)TCR細胞内ドメインとを含み、(i)、(ii)及び(iii)のうちの少なくとも2つが、前記同じTCRサブユニットに由来する、請求項25〜29のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のTFPのTCRサブユニットに、CD3ε、CD3γもしくはCD3δ、または少なくとも1つの修飾を施されたアミノ酸配列の細胞内シグナル伝達ドメインから選択される刺激ドメインを備える、TCR細胞内ドメインが含まれる、請求項25〜30のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のTFPのTCRサブユニットに刺激ドメインを備える細胞内ドメインが含まれ、前記刺激ドメインが、4−1BBの機能的シグナル伝達ドメイン及び/またはCD3ζの機能的シグナル伝達ドメイン、もしくは少なくとも1つの修飾を施されたアミノ酸配列の機能的シグナル伝達ドメインから選択される、請求項25〜31のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のヒトまたはヒト化抗体ドメイン、前記第2のヒトまたはヒト化抗体ドメインまたは両方が抗体フラグメントを具備する、請求項1〜32のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のヒトまたはヒト化抗体ドメイン、前記第2のヒトまたはヒト化抗体ドメイン、または両方が、scFvまたはVHドメインを具備する、請求項1〜33のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記コードされた第1のTFPにTCRサブユニットの細胞外ドメインが含まれ、前記細胞外ドメインに、TCRα鎖、TCRβ鎖、CD3εTCRサブユニット、CD3γTCRサブユニット、CD3δTCRサブユニットからなる群から選択されるタンパク質、その機能的フラグメント、及びそのアミノ酸配列において少なくとも1個但し20個以下の修飾を施されたアミノ酸配列の細胞外ドメインまたはその一部が含まれる、請求項1〜34のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記コードされた第1のTFPに膜貫通ドメインが含まれ、前記膜貫通ドメインに、TCRα鎖、TCRβ鎖、CD3εTCRサブユニット、CD3γTCRサブユニット、CD3δTCRサブユニットからなる群から選択されるタンパク質、その機能的フラグメント、及びそのアミノ酸配列において少なくとも1個但し20個以下の修飾を施されたアミノ酸配列の膜貫通ドメインが含まれる、請求項1〜35のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記コードされた第1のTFPに膜貫通ドメインが含まれ、前記膜貫通ドメインに、TCRα鎖、TCRβ鎖、TCRζ鎖、CD3εTCRサブユニット、CD3γTCRサブユニット、CD3δTCRサブユニット、CD45、CD4、CD5、CD8、CD9、CD16、CD22、CD33、CD28、CD37、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154からなる群から選択されるタンパク質、その機能的フラグメント、及びそのアミノ酸配列において少なくとも1個但し20個以下の修飾を施されたアミノ酸配列の膜貫通ドメインが含まれる、請求項1〜36のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1及び/または第2の核酸分子が、共刺激ドメインをコードする、請求項1〜37のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記共刺激ドメインが、OX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM−1、LFA−1(CD11a/CD18)、ICOS(CD278)及び4−1BB(CD137)からなる群から選択されるタンパク質ならびにそのアミノ酸配列において少なくとも1個但し20個以下の修飾を施されたアミノ酸配列から得られる、機能的シグナル伝達ドメインである、請求項38に記載の組成物。
- 前記第1及び/または第2の核酸分子が、細胞内シグナル伝達ドメインをコードする、請求項1〜39のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1及び/または第2の核酸分子がリーダー配列をコードする、請求項1〜40のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記少なくとも1つ但し20以下の修飾に、細胞シグナル伝達を媒介するアミノ酸の修飾、または第1のTFPに結合するリガンドに応答してリン酸化されるアミノ酸の修飾が包含される、請求項35〜41のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1及び/または第2の核酸分子がRNAである、請求項1〜42のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記第1のTFPが、CD3ζTCRサブユニット、CD3εTCRサブユニット、CD3γTCRサブユニット、CD3δTCRサブユニット、TCRζ鎖、Fcε受容体1鎖、Fcε受容体2鎖、Fcγ受容体1鎖、Fcγ受容体2a鎖、Fcγ受容体2b1鎖、Fcγ受容体2b2鎖、Fcγ受容体3a鎖、Fcγ受容体3b鎖、Fcβ受容体1鎖、TYROBP(DAP12)、CD5、CD16a、CD16b、CD22、CD23、CD32、CD64、CD79a、CD79b、CD89、CD278、CD66dからなる群から選択されるタンパク質、その機能的フラグメント、及びそのアミノ酸配列において少なくとも1個但し20個以下の修飾を施されたアミノ酸配列の免疫受容体チロシン活性化モチーフ(ITAM)またはその一部を含む、TCRサブユニットのITAMを具備する、請求項1〜43のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記ITAMが、CD3γ、CD3δ、またはCD3εのITAMを置換する、請求項44に記載の組成物。
- 前記ITAMが、CD3ζTCRサブユニット、CD3εTCRサブユニット、CD3γTCRサブユニット、及びCD3δTCRサブユニットからなる群から選択され、且つCD3ζTCRサブユニット、CD3εTCRサブユニット、CD3γTCRサブユニット、及びCD3δTCRサブユニットからなる群から選択される別のITAMを置換する、請求項44に記載の組成物。
- 請求項1〜46のいずれか一項に記載の組成物の第1及び第2の核酸分子を介してコードされる複数のポリペプチド分子。
- 前記ベクターが、in vitroで転写されたベクターである、請求項8〜17のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記ベクターが、ポリ(A)尾部をコードする配列を更に含む、請求項8〜17または請求項48のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記ベクターが、3’UTRをコードする配列を更に含む、請求項6〜14または48〜49のいずれか一項に記載の組成物。
- 請求項1〜50のいずれか一項に記載の組成物を含む医薬組成物。
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