JP2019528279A - キナーゼ阻害物質化合物、組成物、及びがんの治療方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、キナーゼ阻害物質化合物、該化合物を含有する組成物、及びがんの治療方法に関する。
がんなどの複雑な疾患において、薬物の併用は、治療が持続的に奏効し、有害事象を最小限に抑え、且つ耐性の発生を制限する可能性を有する(U.S. Department of Health and Human Services Food and Drug Administration, “Guidance for Industry. Codevelopment of Two or More New Investigational Drugs for Use in Combination,” (June 2013)(非特許文献1))。併用療法に類似した関連するものとしては、多標的キナーゼ阻害物質などの単剤多重薬理学的薬物がある。しかしながら、体系的な設計アプローチが欠如し、且つ歴史的に偶然の発見に頼ってきたことにより、新規な多重薬理学的薬物の数は限定されてきた(Anighoro et al., “Polypharmacology: Challenges and Opportunities in Drug Discovery,” J. Med. Chem. 57:7874−7887 (2014)(非特許文献2);Reddy et al., “Polypharmacology: Drug Discovery for the Future,” Expert Rev. Clin. Pharmacol. 6:41−47 (2013)(非特許文献3))。特に動物全身の状況における、多重薬理学的薬物に対する計画的で合理的な取り組みによって、複合的な治療薬を開発する能力が著しく拡大されることとなろう。更に、動物全身の状況において、「バランスのとれた多重薬理学的薬物」を達成すれば、細胞ネットワーク及び組織ネットワークに対する薬物の効果のバランスをとることによって、全体的な毒性を低減することが可能になる。
の化合物、またはその立体異性体、薬学的に許容される塩、酸化物、もしくは溶媒和物に関し、
式中、
Rは、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、−N(C1〜6アルキル)2、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルからなる群より選択され、ここで、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルは任意で、R13でn回置換されていてもよく、
R1はHであり、
R2はHであるか、
またはR1及びR2が、R1及びR2が結合しているフェニル環と結合して、
を形成し、
R3はHもしくはハロゲンであり、
R4はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R5はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R6はC1〜C6アルキルであり、
Xは、任意であり、且つ、存在する場合にはNHであり、
Yは
であり、
ZはC(R12)もしくはNであり、
R7はHもしくはMeであり、
R8はHもしくはMeであるか、
または、R7及びR8が、R7及びR8が結合している炭素原子と一緒になって、
を形成し、
R9はH、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリル、−CN、もしくは
であり、
R10はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R11はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R12はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R13は、R13のそれぞれの場合において、H、ハロゲン、C1〜C6アルキル、CH2F、CHF2、CClF2、CBrF2、CIF2、CF3、C2F5、C3F7、C4F9、OCF3、及びヘテロシクリルからなる群より独立に選択され、且つ
nは1〜5であり、
但し、
i)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
ii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
iii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
iv)R1がHであり、R2がHであり、R3がFであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
v)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、且つ
vi)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができない。
の化合物、またはその立体異性体、薬学的に許容される塩、酸化物、もしくは溶媒和物を対象に投与するステップであって、
式中、
Rは、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、−N(C1〜6アルキル)2、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルからなる群より選択され、ここで、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルは任意で、R13でn回置換されていてもよく、
R1はHであり、
R2はHであるか、
または、R1及びR2が、R1及びR2が結合しているフェニル環と結合して、
を形成し、
R3はHもしくはハロゲンであり、
R4はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R5はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R6はC1〜C6アルキルであり、
Xは、任意であり、且つ、存在する場合にはNHであり、
Yは
であり、
ZはC(R12)もしくはNであり、
R7はHもしくはMeであり、
R8はHもしくはMeであるか、
または、R7及びR8が、R7及びR8が結合している炭素原子と一緒になって、
を形成し、
R9はH、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリル、−CN、もしくは
であり、
R10はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R11はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R12はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R13は、R13のそれぞれの場合において、H、ハロゲン、C1〜C6アルキル、CH2F、CHF2、CClF2、CBrF2、CIF2、CF3、C2F5、C3F7、C4F9、OCF3、及びヘテロシクリルからなる群より独立に選択され、且つ
nは1〜5であり、
但し、
i)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
ii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
iii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
iv)R1がHであり、R2がHであり、R3がFであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
v)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、且つ
vi)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができない、前記ステップを含む。
本発明は、臨床に用いられるキナーゼ阻害物質の多重薬理学のバランスをとるための段階的アプローチに関する。このアプローチに従って、新規なキナーゼ阻害物質化合物が合成された。本発明は、かかる化合物、該化合物を含有する組成物、及びがんの治療方法を対象とする。
の化合物、またはその立体異性体、薬学的に許容される塩、酸化物、もしくは溶媒和物に関し、
式中、
Rは、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、−N(C1〜6アルキル)2、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルからなる群より選択され、ここで、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルは任意で、R13でn回置換されていてもよく、
R1はHであり、
R2はHであるか、
または、R1及びR2が、R1及びR2が結合しているフェニル環と結合して、
を形成し、
R3はHもしくはハロゲンであり、
R4はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R5はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R6はC1〜C6アルキルであり、
Xは、任意であり、且つ、存在する場合にはNHであり、
Yは
であり、
ZはC(R12)もしくはNであり、
R7はHもしくはMeであり、
R8はHもしくはMeであるか、
または、R7及びR8が、R7及びR8が結合している炭素原子と一緒になって、
を形成し、
R9はH、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリル、−CN、もしくは
であり、
R10はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R11はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R12はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R13は、R13のそれぞれの場合において、H、ハロゲン、C1〜C6アルキル、CH2F、CHF2、CClF2、CBrF2、CIF2、CF3、C2F5、C3F7、C4F9、OCF3、及びヘテロシクリルからなる群より独立に選択され、且つ
nは1〜5であり、
但し、
i)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
ii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
iii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
iv)R1がHであり、R2がHであり、R3がFであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
v)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、且つ
vi)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができない。
であってもよい。
であり、
ここで、
V1はC(R14)またはNであり、
V2はCHまたはNであり、
V3はC(R15)またはNであり、
V4はC(R16)またはNであり、
V5はCHまたはNであり、
R14はHまたはハロゲンであり、
R15はHまたはハロゲンであり、且つ
R16は、ハロゲンで2〜13回置換されたC1〜C6アルキルであり、
ここで、V1〜V5の1つのみがNである。
スキーム1
スキーム2
の化合物またはその立体異性体、薬学的に許容される塩、酸化物、もしくは溶媒和物を対象に投与するステップを含み、式中、R、R1、R2、R3、R4、R5、R6、X、Y、Z、R7、R8、R9、R10、R11、R12、及びR13は本明細書に定義されるとおりである。
全ての溶媒はSigma−Aldrichから購入し、受け入れた状態のまま使用した。化学反応には無水溶媒を使用し、水系での後処理、再結晶、及びクロマトグラフィーにはHPLCグレードの溶媒を使用した。水素化反応に用いる固体担体担持パラジウム金属は、50% w/wの水が添加された(Degussa型)、(乾燥ベースで)活性炭10% w/w担持物としてSigma−Aldrichから購入し、手順においては「活性炭5% w/w担持物」と表記した。他の試薬は様々な供給元から購入し、受け入れた状態のまま使用した。反応は、標準的なダブルマニホールド及び注射器技法を用いて、個々の手順に記載したようにして実施した。ガラス器具は使用前に130℃のオーブン中で12時間加熱することによって乾燥するか、または火炎乾燥した。水溶液のpHはpH試験紙を用いて見積もった。真空ろ過は施設に設置の真空ライン(約100トール)を用いて実施した。個々の手順において、語句「真空下での濃縮」及び「濃縮乾固した」とは、(自動真空度調整器を備えた)ダイヤフラムポンプを用い、ロータリーエバポレーターで溶媒を除去し、残存する微量の揮発分を高真空(<1トール)オイルポンプで除去したことを意味する。別段の明示がない限り、用語「フラスコ」とは丸底型をいう。反応を、EMDシリカゲル60 F254(250μm)のガラスで裏打ちされたプレートを用いたTLC(UV蛍光の消光によって可視化し、塩基性KMnO4溶液で染色)によって、及び液体クロマトグラフィー−タンデム質量分析(LC−MS)によって監視した。逆相LC−MSによる分析は、Waters Aquity I−Class UPLCシステム上で、C18カラム(2.1×30mm;1.7μm粒径)を用い、50℃に加熱し、溶離速度0.6mL/分で、水/アセトニトリル(それぞれに0.1% v/vのギ酸を添加)からなる移動相による3分間の直線勾配法、すなわち、95:5→1:99(0〜2.5分)、次いで1:99(2.5〜3分)を用いて実施した。試料分析を、交互のポジティブ/ネガティブエレクトロスプレーイオン化(50〜1000amu)及び254nmでのUV検出を用いて監視した。ろ過またはフラッシュクロマトグラフィー用のプラグ、パッド、及びカラムの寸法は、((直径×長さ)cm)として記載する。ろ過及びマイクロスケールフラッシュクロマトグラフィーに用いた53/4インチピペット(4mL)は、Fisher Scientificから購入した(製品番号22−378−893)。自動分取順相及び逆相クロマトグラフィーは、ダイオードアレイ検出器(分析を220〜400nmで監視)を備えたInterchim PuriFlash 450精製システムを用いて実施した。予め充填されたシリカゲルカートリッジ(12、25、及び40g;粒径15μm)を順相(シリカゲル)クロマトグラフィーに用い、20〜30mL/分で溶離させた。逆相クロマトグラフィーにはC18カラム(30×150mm;5μm粒径)を用い、50バールの圧力制限による15〜20mL/分で溶出させた。炭素デカップリング1H NMRスペクトルは、Bruker分光計上、400MHzで記録し、内部標準として残留溶媒シグナル(ジメチルスルホキシド−d6=2.50ppm)を用いてppm単位で報告する。データは以下、すなわち、{(シフト),[(s=シングレット、d=ダブレット、dd=ダブレットのダブレット、ddd=ダブレットのダブレットのダブレット、t=トリプレット、dt=トリプレットのダブレット、q=カルテット、m=マルチプレット、br=ブロード、ap=見掛け),(J=Hz単位での結合定数),(積分値)]}のように報告する。プロトンデカップリング13C NMRスペクトルは、Bruker分光計上、100MHzで記録し、内部標準として残留溶媒シグナル(ジメチルスルホキシド−d6=39.5ppm)を用いてppm単位で報告する。プロトンデカップリング19F NMRスペクトルは、Bruker分光計上、376MHzで記録し、内部標準として添加したCFCl3(0.00ppm)を用いてppm単位で報告する。1つのシグナルのみを有する化合物は、既知量の上記内部標準との対比で積分した。
火炎乾燥し、Ar下で冷却した250mLのフラスコに、4−クロロピコリン酸(10.0g、63.5mmol)、及びTHF(125mL)を投入した。この混合物を0℃に冷却し、塩化オキサリル(6.70mL、79.2mmol)を注射器で5分間かけて滴下により添加した後、DMF(0.1mL)を注射器で一気に加えた(注意:ガスが急激に発生)。30分後にこの反応混合物を室温まで自然に加温し、Ar入り風船下で15時間撹拌した。得られた褐色溶液をロータリーエバポレーターで濃縮し、KOHペレットを充填した乾燥管を用いて残留HClを捕捉した。残留した油状物をトルエン(3×10mL)から濃縮乾固し、次いで高真空下で更に乾燥させて固体を得た。この粗4−クロロピコリノイルクロリド塩酸塩をAr下に置き、THF(50mL)を加えた。この暗色溶液を0℃に冷却し、メチルアミン(160mL、2.0M THF溶液、320mmol)を注射器で20分間かけて滴下により添加した。5分後にこの反応混合物を室温まで自然に加温し、16時間撹拌した。この反応混合物を水(200mL)で希釈し、EtOAc(3×150mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、水(100mL)及び飽和食塩水(2×100mL)で洗浄し、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。真空下で濃縮して、約11gの赤褐色油状物を得、これを、30mL/分で溶離し、カラム容量の30倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc 100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(40gカートリッジ)によって精製した。適切な画分をプールし、濃縮乾固した。残留した無色透明な油状物(約10g)をヘキサン/CH2Cl2(4:1;150mL)の混合物に溶解し、−20℃で12時間静置した。生成した沈殿を真空ろ過により単離し、ヘキサン(2×30mL)で洗浄し、風乾して8.90g(82%)の標記化合物を白色固体として得た。
100mLの二口フラスコ(注入口アダプター及びセプタムを備えた)を真空下で火炎乾燥し、Ar下で冷却した。このフラスコに4−アミノフェノール(2.09g、19.2mmol)及びDMF(30mL)を投入した。この溶液に撹拌下でカリウムtert−ブトキシド(2.14g、19.1mmol)を1分間かけて少しずつ添加した。得られた淡褐色の混合物を2時間撹拌し、次いで4−クロロ−N−メチルピコリンアミド(2.17g、12.7mmol)を一度に添加し、この反応混合物をAr入り風船下、80℃で4時間加熱した。この反応混合物を室温まで放冷し、次いで撹拌下の氷水(100mL)に注ぎ込んだ。撹拌を15分間継続し、次いでこの混合物をEtOAc(1×100mL及び2×50mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、1M KOH(3×50mL)、水(50mL)、及び飽和食塩水(2×50mL)で洗浄し、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。真空下で濃縮して3.23gの橙色油状物を得、これを、30mL/分で溶離し、カラム容量の35倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(40gカートリッジ)によって精製した。2.69g(87%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
オーブン乾燥した100mLの二口フラスコ(注入口アダプター及びセプタムを備えた)にAr下で、4−アミノ−3−フルオロフェノール(1.12g、8.81mmol)及びDMF(18mL)を投入した。撹拌下のこの溶液にカリウムtert−ブトキシド(978mg、8.72mmol)を2分間かけて少しずつ添加した。得られた暗紫色の混合物を3時間撹拌し、次いで4−クロロ−N−メチルピコリンアミド(1.06g、6.21mmol)を一度に添加し、この反応混合物をAr入り風船下、90℃で10時間加熱した。この反応混合物を室温まで放冷し、次いで撹拌下の氷水(50mL)に注ぎ込んだ。撹拌を15分間継続し、次いでこの混合物をEtOAc(3×50mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、1M KOH(3×50mL)、水(50mL)、及び飽和食塩水(2×50mL)で洗浄し、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。真空下で濃縮して褐色固体を得、これを、30mL/分で溶離し、カラム容量の38倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(40gカートリッジ)によって精製した。882mg(54%)の標記化合物を淡褐色固体として得た。
オーブン乾燥した100mLの二口フラスコ(注入口アダプター及びセプタムを備えた)にAr下で、4−アミノナフタレン−1−オール塩酸塩(1.33g、6.80mmol)及びDMF(8mL)を投入した。撹拌下のこの溶液にカリウムtert−ブトキシド(1.52g、13.5mmol)を2分間かけて少しずつ添加した。得られた暗紫色の混合物を3時間撹拌し、次いで4−クロロ−N−メチルピコリンアミド(640mg、3.75mmol)を一度に添加し、この反応混合物をAr入り風船下、80℃で3時間加熱した。この反応混合物を室温まで放冷し、次いで撹拌下の氷水(50mL)に注ぎ込んだ。撹拌を15分間継続し、次いでこの混合物をEtOAc(3×50mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、1M KOH(3×50mL)、水(50mL)、及び飽和食塩水(2×50mL)で洗浄し、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。真空下で濃縮して褐色の半固体を得、これを、30mL/分で溶離し、カラム容量の38倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(40gカートリッジ)によって精製した。得られた固体をEtOAcで粉体化し、真空ろ過により単離し、集取した固体をEtOAc(×1)及びヘキサン(×2)で洗浄し、次いで風乾した。640mg(58%)の標記化合物を明褐色固体として得た。
火炎乾燥したバイアル中、Ar下で、撹拌下のHB/SX(X=1〜3)及びCH2Cl2の溶液(0.1〜0.5M)に、上記イソシアナート(ニートでまたはCH2Cl2溶液として)を注射器で1〜3分間かけて滴下により添加した。この反応混合物の上部のヘッドスペースをArで覆い、バイアルをねじ込み蓋で密封し(テフロンテープで包み)、この反応混合物を、MeOHで希釈した反応混合物アリコートのLC−MS分析によって完結したと判断されるまで撹拌した。生成物は一般的には溶液から沈殿し、これを真空ろ過により単離し、集取した固体をCH2Cl2(×2)及びヘキサン(×2)で洗浄し、次いで風乾し、最後に高真空下で乾燥した。この合成計画によって調製したソラフェログに関する具体的な反応の詳細及び特性決定データを以下に記載する。
8mLのバイアル中、イソシアナトベンゼン(30.0μL、0.276mmol)及びHB/S1(65.0mg、0.267mmol)のCH2Cl2(0.6mL)溶液から合成した。18時間撹拌し、真空ろ過により単離した。85.4mg(88%)の標記化合物を白色固体として得た。
4mLのバイアル中、1−イソシアナト−3−(トリフルオロメチル)ベンゼン(21.2μL、0.154mmol)及びHB/S1(36.8mg、0.151mmol)のCH2Cl2(0.5mL)溶液から合成した。24時間撹拌し、真空ろ過により生成物を単離した。53.4mg(84%)の標記化合物を白色粉末として得た。
20mLのバイアル中のHB/S1(500mg、2.06mmol)及びCH2Cl2(5mL)の溶液に、1−クロロ−4−イソシアナト−2−(トリフルオロメチル)ベンゼン(463mg、2.09mmol)及びCH2Cl2(5mL)の溶液を添加した。24時間撹拌し、生成物を真空ろ過により単離した。889mg(93%)の標記化合物を白色粉末として得た(Bankston et al., “A Scalable Synthesis of BAY 43−9006: A Potent Raf Kinase Inhibitor for the Treatment of Cancer,” Org. Process Res. Dev. 6:777−781 (2002)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)。
20mLのバイアル中、1−フルオロ−2−イソシアナト−4−(トリフルオロメチル)ベンゼン(720μL、4.98mmol)及びHB/S1(1.09g、4.48mmol)のCH2Cl2(16mL)溶液から合成した。72時間撹拌し、真空ろ過により単離した。1.92g(96%)の標記化合物を白色粉末として得た。
8mLのバイアル中、イソシアナトベンゼン(50.0μL、0.460mmol)及びHB/S2(100mg、0.383mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。24時間撹拌し、真空ろ過により単離した。115mg(79%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−イソシアナト−3−(トリフルオロメチル)ベンゼン(45.0μL、0.327mmol)及びHB/S2(78.4mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。24時間撹拌し、真空ろ過により単離した。57.4mg(43%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中のHB/S2(450mg、1.72mmol)及びCH2Cl2(2.5mL)の溶液に、1−クロロ−4−イソシアナト−2−(トリフルオロメチル)ベンゼン(384mg、1.73mmol)及びCH2Cl2(2.5mL)の溶液を添加した。24時間撹拌し、真空ろ過により生成物を単離した。720mg(87%)の標記化合物を白色粉末として得た。
4mLのバイアル中、1−フルオロ−2−イソシアナト−4−(トリフルオロメチル)ベンゼン(31.0μL、0.214mmol)及びHB/S2(52.3g、0.200mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。18時間撹拌し、真空ろ過により単離した。82.6mg(88%)の標記化合物を白色粉末として得た。
8mLのバイアル中、イソシアナトベンゼン(45.0μL、0.414mmol)及びHB/S3(100mg、0.341mmol)のCH2Cl2(2mL)溶液から合成した。72時間撹拌し、真空ろ過により単離した。135mg(96%)の標記化合物を淡紫色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−イソシアナト−3−(トリフルオロメチル)ベンゼン(55.0μL、0.399mmol)及びHB/S3(100mg、0.341mmol)のCH2Cl2(3mL)溶液から合成した。72時間撹拌し、真空ろ過により単離した。133mg(78%)の標記化合物を淡桃色固体として得た。
8mLのバイアル中のHB/S3(100mg、0.341mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、1−クロロ−4−イソシアナト−2−(トリフルオロメチル)ベンゼン(83.1mg、0.375mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液を添加した。72時間撹拌し、真空ろ過により単離した。136mg(77%)の標記化合物を淡桃色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−フルオロ−2−イソシアナト−4−(トリフルオロメチル)ベンゼン(55.0μL、0.380mmol)及びHB/S3(100mg、0.341mmol)のCH2Cl2(3mL)溶液から合成した。72時間撹拌し、真空ろ過により単離した。139mg(85%)の標記化合物を淡紫色固体として得た。
4mLのバイアル中のHB/S1(36.8mg、0.151mmol)及びCH2Cl2(0.3mL)の溶液に、1−クロロ−4−イソシアナトベンゼン(23.7mg、0.154mmol)及びCH2Cl2(0.3mL)の溶液を添加した。14時間撹拌し、沈殿を真空ろ過により単離した。わずかに不純物を含む白色固体を、20mL/分で溶離し、20分間にわたるH2O(0.1% v/vのTFAを含む)/MeCN:80:20→5:95の直線勾配を用いた逆相クロマトグラフィーにより精製した。57.4(74%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1,4−ジフルオロ−2−イソシアナトベンゼン(25.0μL、0.213mmol)及びHB/S2(52.3mg、0.200mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。24時間撹拌し、真空ろ過により単離した。75.2mg(90%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
8mLのバイアル中のHB/S1(73.0mg、0.300mmol)及びCH2Cl2(0.8mL)の溶液に、1,3−ジフルオロ−2−イソシアナトベンゼン(50.0mg、0.322mmol)及びCH2Cl2(0.3mL)の溶液を添加した。48時間撹拌し、沈殿を真空ろ過により単離した。111mg(93%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中のHB/S2(78.4mg、0.300mmol)及びCH2Cl2(0.8mL)の溶液に、1,3−ジフルオロ−2−イソシアナトベンゼン(50.0mg、0.322mmol)及びCH2Cl2(0.3mL)の溶液を添加した。48時間撹拌し、沈殿を真空ろ過により単離した。114mg(91%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1,4−ジフルオロ−2−イソシアナトベンゼン(38.0μL、0.324mmol)及びHB/S1(73.0mg、0.300mmol)CH2Cl2(1mL)溶液から合成した。24時間撹拌し、真空ろ過により単離した。113mg(94%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−フルオロ−2−イソシアナトベンゼン(40.0μL、0.357mmol)及びHB/S1(73.0mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、真空ろ過により単離した。110mg(96%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−フルオロ−3−イソシアナトベンゼン(41.0μL、0.359mmol)及びHB/S1(73.0mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、真空ろ過により単離した。111mg(97%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−フルオロ−4−イソシアナトベンゼン(41.0μL、0.359mmol)及びHB/S1(73.0mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、真空ろ過により単離した。109mg(96%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−イソシアナト−4−(トリフルオロメチル)ベンゼン(51.0μL、0.357mmol)及びHB/S1(73.0mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、真空ろ過により単離した。123mg(95%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−フルオロ−2−イソシアナトベンゼン(40.0μL、0.357mmol)及びHB/S2(78.4mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、真空ろ過により単離した。108mg(90%)の標記化合物を灰白色の固体として得た。
8mLのバイアル中、1−フルオロ−3−イソシアナトベンゼン(41.0μL、0.359mmol)及びHB/S2(78.4mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、真空ろ過により単離した。110mg(92%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−フルオロ−4−イソシアナトベンゼン(41.0μL、0.359mmol)及びHB/S2(78.4mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、沈殿を真空ろ過により単離した。わずかに不純物を含む固体をEtOAc/EtOH/ヘキサンの混合物(1:1:1、約2mL)から再結晶した。71.5mg(60%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
8mLのバイアル中、1−イソシアナト−4−(トリフルオロメチル)ベンゼン(51.0μL、0.357mmol)及びHB/S2(78.4mg、0.300mmol)のCH2Cl2(1mL)溶液から合成した。48時間撹拌し、真空ろ過により単離した。117mg(87%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中のHB/S2(100mg、0.383mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、1−クロロ−4−イソシアナトベンゼン(82.3mg、0.536mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液を添加した。24時間撹拌し、沈殿を真空ろ過により単離した。155mg(97%)の標記化合物を白色固体として得た。
4mLのバイアル中、1−クロロ−2−イソシアナト−4−(トリフルオロメチル)ベンゼン(27.0μL、0.180mmol)及びHB/S1(36.5mg、0.150mmol)のCH2Cl2(0.6mL)溶液から合成した。14時間撹拌し、真空ろ過により単離した。54.5mg(78%)の標記化合物を白色粉末として得た。
4mLのバイアル中、1−クロロ−3−イソシアナトベンゼン(22.0μL、0.181mmol)及びHB/S1(36.5mg、0.150mmol)のCH2Cl2(0.6mL)溶液から合成した。14時間撹拌した後、Et2O(3mL)で希釈した。生じた沈殿を真空ろ過により単離し、ヘキサンで洗浄した。50.7mg(85%)の標記化合物を白色粉末として得た。
火炎乾燥したバイアル(sepcapを備えた)中、Ar下で、0℃のCDI(0.2〜1.0M)及びCH2Cl2の溶液に、上記アニリン(ニートでまたはCH2Cl2溶液として)を注射器で10分間かけて滴下により添加した。2−置換アニリンについては15分後に冷浴を外した一方、他のアニリン(2−置換基をもたない)については、反応混合物を、冷浴の氷が融解するのに伴って、自然に室温まで徐々に加温した(一般的には2〜3時間)。上記アシルイミダゾール中間体の形成が完結するまで反応混合物を撹拌し、反応混合物アリコートをMeOH中でクエンチし、当該アニリンの当該カルバミン酸メチルへの転化を観測することによって進行を監視した。12〜24時間後に固体のHB/SX(X=1〜2)を一度に添加し、この反応混合物をAr下で更に1〜24時間撹拌した。一部の反応においては、生成物が溶液から沈殿し、これを真空ろ過により単離し、集取した固体をCH2Cl2(×2)及びヘキサン(×2)で洗浄し、風乾した。生成物が溶液から沈殿しなかった場合は、粗反応混合物をクロマトグラフィーにより直接精製した。全ての生成物を高真空下で≧24時間乾燥した。
4mLのバイアル中のCDI(51.6mg、0.318mmol)及びCH2Cl2(1mL)に、4−フルオロ−3−(トリフルオロメチル)アニリン(39.0μL、0.303mmol)をニートで添加した。10分後にこの反応混合物を自然に室温まで加温し、16時間撹拌し、次いでHB/S1(73.8mg、0.303mmol)を一度に添加し、撹拌を12時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の27倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(12gカートリッジ)によって精製した。105mg(77%)の標記化合物を白色固体として得た。
4mLのバイアル中のCDI(51.6mg、0.318mmol)及びCH2Cl2(1mL)に、4−フルオロ−3−(トリフルオロメチル)アニリン(39.0μL、0.303mmol)をニートで添加した。10分後にこの反応混合物を室温まで自然に加温し、16時間撹拌し、次いでHB/S2(79.1mg、0.303mmol)を一度に添加し、撹拌を12時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の27倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(12gカートリッジ)によって精製した。84.6mg(60%)の標記化合物を白色固形物として得た。
4mLのバイアル中のCDI(51.0mg、0.315mmol)及びCH2Cl2(1.0mL)に、2−フルオロ−5−メチルアニリン(34.0μL、0.301mmol)をニートで添加した。10分後にこの反応混合物を室温まで自然に加温し、16時間撹拌し、次いでHB/S1(73.0mg、0.300mmol)を一度に添加し、撹拌を12時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の27倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。73.5mg(62%)の標記化合物を白色固体として得た。
4mLのバイアル中のCDI(51.0mg、0.315mmol)及びCH2Cl2(1.0mL)に、2−フルオロ−5−メチルアニリン(34.0μL、0.301mmol)をニートで添加した。10分後にこの反応混合物を室温まで自然に加温し、16時間撹拌し、次いでHB/S2(78.4mg、0.300mmol)を一度に添加し、撹拌を12時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の27倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。68.2mg(55%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中の0℃のCDI(106mg、0.654mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液に、5−(ジフルオロメチル)−2−フルオロアニリン(APS4−53;100mg、0.621mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液を添加した。10分後にこの反応混合物を室温まで自然に加温し、22時間撹拌し、次いでHB/S1(151mg、0.621mmol)を添加し、撹拌を14時間継続した。生成物が沈殿し、これを真空ろ過により単離した。199mg(75%)の標記化合物を白色固体として得た。
50mLのフラスコに4−フルオロベンズアルデヒド(2.20mL、20.5mmol)及び濃硫酸(10mL)を投入した。この溶液を0℃に冷却し、発煙硝酸(1.10mL、90% w/w水溶液、23.3mmol)をピペットで5分間かけて滴下により添加した。この反応混合物を2.5時間撹拌し、氷浴の氷が融解するのに伴って自然に加温した。この反応混合物を素早く撹拌下の氷水(150mL)に注ぎ込み、更に15分間撹拌した。生じた沈殿を真空ろ過により集取し、この集取した固体を水(2×10mL)で洗浄した。風乾して、1.84g(53%)の標記化合物を白色固体として得た。
火炎乾燥しAr下で冷却した50mLのフラスコに、4−フルオロ−3−ニトロベンズアルデヒド(APS4−48;715mg、4.23mmol)及びCH2Cl2(12mL)を投入した。この溶液を−78℃に冷却し、(ジエチルアミノ)三フッ化硫黄(DAST;1.12mL、8.48mmol)を注射器で3分間かけて滴下により添加した。得られた明黄色の不均一な反応混合物を−78℃で3時間撹拌したところ、この間にこの反応混合物は均一且つ淡赤色となった。冷浴を外し、この溶液を室温まで自然に加温した。この反応混合物を室温で16時間撹拌し、次いで水(10mL)でクエンチした。水層のpHを飽和NaHCO3溶液で約7に調整し、この混合物をCH2Cl2(2×50mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。真空下で濃縮して790mgの橙色油状物を得、これを、20mL/分で溶離し、カラム容量の18倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。608mg(75%)の標記化合物を黄色油状物として得た。
50mLのフラスコに、4−(ジフルオロメチル)−1−フルオロ−2−ニトロベンゼン(597mg、3.12mmol)、MeOH(15mL)、及び鉄粉(871mg、15.6mmol)を逐次投入した。この混合物を室温で撹拌し、HCl水溶液(8.0mL、4.0M水溶液、32mmol)を1〜2分間かけて滴下により添加した。1時間後に、この反応混合物を未反応の鉄からデカントし、残った溶液をCH2Cl2(50mL)及び水(50mL)で希釈した。水相のpHを6N NaOH(約5.3mL)で約7に調整し、次いでこの混合物を分液ロートに移し、層を分離し、水相をCH2Cl2(2×30mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。真空下で濃縮して黄色油状物を得、これを、20mL/分で溶離し、カラム容量の20倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。257mg(51%)の標記化合物を無色透明油状物として得た。
8mLのバイアル中の0℃のCDI(122mg、0.752mmol)及びCH2Cl2(1.5mL)の溶液に、3−(ペルフルオロエチル)アニリン(APS5−9;158mg、0.748mmol)及びCH2Cl2(2mL)の溶液を添加した。この反応混合物を2時間かけて室温まで自然に加温し、20時間撹拌し、次いでHB/S1(173mg、0.711mmol)を一度に添加し、撹拌を8時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の24倍の容量にわたるCH2Cl2/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。203mg(59%)の標記化合物を白色固体として得た。
合成は公知の手法(Serizawa et al., “Direct Synthesis of Pentafluoroethyl Copper From Pentafluoropropionate as an Economical C2F5 Source: Application to Pentafluoroethylation of Arylboronic Acids and Aryl Bromides,” Org. Lett. 16:3456−3459 (2014)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)に従って実施した。25mLのシュレンクフラスコ(10mLの固体添加用ロートを備える)を真空下で火炎乾燥し、Ar下で冷却した。このフラスコに塩化銅(I)(424mg、4.28mmol;Arパージしたグローブバッグ中で移動)及びDMF(15mL)を投入した。ナトリウムtert−ブトキシド(824mg、8.57mmol;Arパージしたグローブバッグ中で移動)を上記添加用ロートによって10分間かけて少しずつ添加した。上記添加用ロートをセプタムに換装した後、この混合物を室温で2時間撹拌し、次いで50℃に加熱しながら、2,2,3,3,3−ペンタフルオロプロパン酸エチル(635μL、4.29mmol)を注射器で2分間かけて滴下により添加した。この反応混合物を50℃で3時間撹拌し、次いで0℃に冷却した。三水酸化フッ化トリエチルアミン(265μL、1.63mmol)を注射器で1〜2分間かけて滴下により添加したところ、ほぼ均一な溶液が得られた。0℃で5分間、次いで室温で20分間撹拌を継続した。固体の1−ヨード−3−ニトロベンゼン(508mg、2.04mmol)を一度に添加し、この反応混合物をAr入り風船下、80℃で12時間加熱した。この反応混合物を室温まで冷却した後に、1M HCl(約10mL)をピペットで1〜2分間かけて少しずつ添加した。この混合物を水(50mL)及びEt2O(50mL)で希釈し、次いで真空下でセライトのパッド(3×3cm)を通してろ過した。ろ過ケーキをEt2O(10mL)で洗浄し、1つにまとめたろ液を分析ロートに移した。層を分離し、水相をEt2O(2×30mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、飽和NH4Cl溶液/濃NH4OH溶液の60:40混合物(2×50mL)、半飽和NaCl溶液(2×50mL)、及び飽和食塩水(50mL)で洗浄し、脱水し(MgSO4)、ろ過した。真空下で濃縮して約500mgの橙色油状物を得、これを更に精製することなく使用した(APS5−9の合成を参照のこと)。
上記粗1−ニトロ−3−(ペルフルオロエチル)ベンゼン(APS5−4、約2.04mmol;上記の反応由来)が入った100mLのフラスコに、MeOH(30mL)及び鉄粉(570mg、10.2mmol)を添加した。この混合物を0℃に冷却し、濃HCl(2.0mL、24mmol)をピペットで1〜2分間かけて滴下により添加した。この反応混合物を3時間かけて自然に室温まで加温し、更に3時間撹拌した。この反応混合物を未反応の鉄からデカントし、水(50mL)及びCH2Cl2(50mL)で希釈し、次いで水相のpHを1M KOH(24〜25mL)で約7に調整した。この混合物をセライト/砂(50:50)のパッドを通して真空ろ過し、ろ過ケーキをCH2Cl2(30mL)で洗浄した。1つにまとめたろ液を分液ロートに移し、層を分離し、水相をCH2Cl2(2×25mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。ろ液を真空下で濃縮すると492mgの橙色液体が残留し、これを、20mL/分で溶離し、カラム容量の22倍の容量にわたるヘキサン/CH2Cl2:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。316mg(73%)の標記化合物を淡黄色液体として得た。
8mLのバイアル中の0℃のCDI(151mg、0.931mmol)及びCH2Cl2(2mL)の溶液に、2−フルオロ−5−(ペルフルオロエチル)アニリン(APS5−11;213mg、0.930mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液を添加した。10分後に、この反応混合物を室温まで自然に加温し、20時間撹拌し、次いでHB/S1(215mg、0.884mmol)を添加し、撹拌を8時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の33倍の容量にわたるCH2Cl2/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。242mg(55%)の標記化合物を白色固体として得た。
合成は公知の手法(Serizawa et al., “Direct Synthesis of Pentafluoroethyl Copper from Pentafluoropropionate as an Economical C2F5 Source: Application to Pentafluoroethylation of Arylboronic Acids and Aryl Bromides,” Org. Lett. 16:3456−3459 (2014)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)に従って実施した。25mLのシュレンクフラスコ(10mLの固体添加用ロートを備える)を真空下で火炎乾燥し、Ar下で冷却した。このフラスコに塩化銅(I)(516mg、5.21mmol;Arパージしたグローブバッグ中で移動)及びDMF(18mL)を投入した。ナトリウムtert−ブトキシド(1.01g、10.4mmol;グローブバッグ中で移動)を上記添加用ロートによって10分間かけて少しずつ添加した。上記添加用ロートをセプタムに換装した後、この混合物を室温で2.5時間撹拌し、次いで50℃に加熱しながら、2,2,3,3,3−ペンタフルオロプロパン酸エチル(770μL、5.21mmol)を注射器で2〜3分間かけて滴下により添加した。この反応混合物を50℃で3時間撹拌し、次いで0℃に冷却した。三水酸化フッ化トリエチルアミン(325μL、1.99mmol)を注射器で1〜2分間かけて滴下により添加したところ、ほぼ均一な溶液が得られた。0℃で5分間、次いで室温で15分間撹拌を継続した。固体の1−フルオロ−4−ヨード−2−ニトロベンゼン(662mg、2.48mmol)を一度に添加し、この反応混合物をAr入り風船下、80℃で12時間加熱した。この反応混合物を室温まで冷却した後に、1M HCl(約15mL)をピペットで1〜2分間かけて少しずつ添加した。この混合物を水(50mL)及びEt2O(50mL)で希釈し、次いで真空下でセライトのパッド(3×3cm)を通してろ過した。ろ過ケーキをEt2O(20mL)で洗浄し、1つにまとめたろ液を分析ロートに移した。層を分離し、水相をEt2O(2×30mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、飽和NH4Cl溶液/濃NH4OH溶液の60:40混合物(3×50mL)、半飽和NaCl溶液(2×50mL)、及び飽和食塩水(50mL)で洗浄し、脱水し(MgSO4)、ろ過した。真空下で濃縮して約670mgの橙色油状物を得、これを更に精製することなく使用した(APS5−11の合成を参照のこと)。
上記粗1−フルオロ−2−ニトロ−4−(ペルフルオロエチル)ベンゼン(APS5−7、約2.48mmol;上記の反応由来)の入った100mLのフラスコに、MeOH(40mL)及び鉄粉(693mg、12.4mmol)を添加した。この混合物を0℃に冷却し、濃HCl(2.1mL、26mmol)をピペットで1〜2分間かけて滴下により添加した。この反応混合物を3時間かけて室温まで自然に加温し、更に3時間撹拌した。この反応混合物を未反応の鉄からデカントし、水(75mL)及びCH2Cl2(75mL)で希釈し、水相のpHを6M NaOH(約4.3mL)で約7に調整した。得られた混合物をセライト/砂(50:50)のパッドを通して真空ろ過し、ろ過ケーキをCH2Cl2(30mL)で洗浄した。1つにまとめたろ液を分液ロートに移し、層を分離し、水相をCH2Cl2(2×30mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。ろ液を真空下で濃縮すると840mgの橙褐色油状物が残留し、これを、20mL/分で溶離し、カラム容量の24倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→75:25の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。426mg(75%)の標記化合物を橙色液体として得た。
8mLのバイアル中のCDI(70.0mg、0.432mmol)及びCH2Cl2(1.5mL)に、5−クロロ−2−フルオロアニリン(46.5μL、0.431mmol)をニートで添加した。この反応混合物を10分間かけて室温まで自然に加温し、12時間撹拌し、次いでHB/S1(100mg、0.411mmol)を一度に添加し、撹拌を4時間継続した。生成物が溶液から沈殿し、これを真空ろ過により単離した。60.0mg(35%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中の0℃のCDI(70.0mg、0.432mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、3,4−メチレンジオキシアニリン(59.2mg、0.432mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液を(45分間かけて)添加した。この反応混合物を2時間かけて室温まで自然に加温し、12時間撹拌し、次いでHB/S1(100mg、0.411mmol)を一度に添加し、撹拌を4時間継続した。この反応混合物を真空下で濃縮し、18mL/分で溶離し、42分間にわたるH2O(0.1% v/vのTFAを含む)/MeCN:95:5→0:100の直線勾配を用いた逆相クロマトグラフィーによって精製した。48.4mg(23%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中の0℃のCDI(40.5mg、0.250mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、3−(ペルフルオロエチル)アニリン(APS5−9;52.7mg、0.250mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液を添加した。この反応混合物を2時間かけて室温まで自然に加温し、24時間撹拌し、次いでHB/S2(58.5mg、0.227mmol)を添加し、撹拌を24時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の24倍の容量にわたるCH2Cl2/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。64.0mg(57%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中の0℃のCDI(50.3mg、0.310mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、2−フルオロ−5−(ペルフルオロエチル)アニリン(APS5−11;71.0mg、0.310mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液を添加した。10分後に、この反応混合物を室温まで自然に加温し、24時間撹拌し、次いでHB/S2(73.6mg、0.282mmol)を添加し、撹拌を24時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の24倍の容量にわたるCH2Cl2/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。47.0mg(32%)の標記化合物を白色固体として得た。
4mLのバイアル中の0℃のCDI(70.0mg、0.432mmol)及びCH2Cl2(0.4mL)の溶液に、2−フルオロ−5−(ペルフルオロプロパン−2−イル)アニリン(APS6−39;115mg、0.412mmol)及びCH2Cl2(0.6mL)の溶液を添加した。10分後に、この反応混合物を室温まで自然に加温し、24時間撹拌し、次いでHB/S1(100mg、0.411mmol)を一度に添加し、撹拌を4時間継続した。20mL/分で溶離し、カラム容量の30倍の容量にわたるCH2Cl2/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。142mg(63%)の標記化合物を白色固体として得た。
合成は公知の手法(Guin et al., “Highly Enantioselective Hetero−Diels−Alder Reaction of 1,3−Bis−(silyoxy)−1,3−dienes With Aldehydes Catalyzed by Chiral Disulfonimide,” Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 51:8859−8863 (2012)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)に従って実施した。1−フルオロ−4−ヨード−2−ニトロベンゼン(1.25g、4.68mmol)、活性化した銅粉末(1.20g、18.9mmol)、及び脱水DMF(13mL;Arを10分間バブリングすることによって脱酸素した)の混合物に、ヘプタフルオロ−2−ヨードプロパン(1.00mL、7.03mmol)を注射器で1分間かけて添加した。この混合物をAr下で撹拌し、100℃で48時間加熱した。この反応混合物を室温まで放冷し、次いで真空下でセライトのパッド(3×3cm)を通してろ過し、パッドをEt2O(2×20mL)で洗浄した。1つにまとめたろ液をEt2O(100mL)で希釈し、次いで飽和NH4Cl溶液/濃NH4OH溶液の60:40混合物(3×30mL)、水(2×30mL)、及び飽和食塩水(2×30mL)で洗浄し、脱水し(MgSO4)、ろ過した。真空下で濃縮して1.38gの橙色半固体を得、これを、20mL/分で溶離し、カラム容量の25倍の容量にわたるヘキサン/CH2Cl2:100:0→80:20の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。860mg(59%)の標記化合物を無色油状物として得た。
50mLのフラスコに、1−フルオロ−2−ニトロ−4−(ペルフルオロプロパン−2−イル)ベンゼン(APS6−36;665mg、2.15mmol)、MeOH(15mL)、及び鉄粉(720mg、12.9mmol)を投入した。この混合物を0℃に冷却し、濃HCl(2.1mL、26mmol)をピペットで5分間かけて滴下により添加した。この反応混合物を30分間かけて室温まで自然に加温し、更に3時間撹拌した。この反応混合物をセライトのパッド(2×2cm)を通して真空ろ過して未反応の鉄粉を除去し、パッドをMeOH(5mL)で洗浄した。1つにまとめたろ液を水(75mL)及びCH2Cl2(75mL)で希釈し、水相のpHを6M NaOH溶液(約4.3mL)で7〜8に調整した。得られた混合物をセライト(1×4cm)の上に重層した砂(3×4cm)のパッド(4×4cmの両方を合わせた大きさ)を通して真空ろ過し、ろ過ケーキをCH2Cl2(30mL)で洗浄した。1つにまとめたろ液を分液ロートに移し、層を分離し、水相をCH2Cl2(2×50mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、脱水し(Na2SO4)、ろ過した。このろ液を真空下で濃縮すると油状物が残留し、これを、20mL/分で溶離し、カラム容量の25倍の容量にわたるヘキサン/CH2Cl2:100:0→50:50の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。473mg(79%)の標記化合物を無色油状物として得た。
火炎乾燥した8mLのバイアルに、Ar下でHB/S1(60.0mg、0.247mmol)及びCH2Cl2(1mL)を投入し、次いで撹拌下の上記溶液に、塩化ベンゾイル(35.0μL、0.302mmol)を1分間かけて滴下により添加した。得られた混合物にピリジン(25.0μL、0.309mmol)を添加したところ、透明な溶液が生成した。この反応混合物を14時間撹拌し、次いでMeOH(1mL)を添加し、撹拌を30分間継続した。この溶液を濃縮乾固し、残留した物質を、20mL/分で溶離し、カラム容量の24倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(12gカートリッジ)によって精製した。39.6mg(46%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
火炎乾燥した8mLのバイアルに、Ar下でHB/S1(60.0mg、0.247mmol)及びCH2Cl2(1mL)を投入し、次いで撹拌下の上記溶液に、3−(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリド(45.0μL、0.298mmol)を1分間かけて滴下により添加した。得られた混合物にピリジン(25.0μL、0.309mmol)を添加したところ、透明な溶液が生成した。この反応混合物を14時間撹拌し、次いでMeOH(1mL)を添加し、撹拌を30分間継続した。この溶液を濃縮乾固し、残留した物質を、20mL/分で溶離し、カラム容量の24倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(12gカートリッジ)によって精製した。75.8mg(74%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
オーブン乾燥した8mLのバイアルに、Ar下で4−クロロ−3−(トリフルオロメチル)安息香酸(138mg、0.615mmol)及びCDI(100mg、0.617mmol)を投入し、次いで撹拌しながらTHF(1mL)を加えところ、ガスが急激に発生した。この溶液を室温で1時間撹拌し、次いで45℃で2時間加熱した。この溶液を室温に冷却した後、HB/S1(100mg、0.411mmol)を一度に添加し、撹拌を2時間継続した。この反応混合物をMeOH(3mL)で希釈し、20mL/分で溶離し、26分間にわたるH2O/MeCN:90:10→5:95の直線勾配を用いた逆相クロマトグラフィーによって精製した。177mg(96%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中の2−フルオロ−5−(トリフルオロメチル)安息香酸(75.3mg、0.364mmol)、HATU(140mg、0.368mmol)、及びDMF(1mL)の溶液に、DIPEA(70.0μL、0.402mmol)を注射器で1分間かけて滴下により添加した。この溶液を30分間撹拌し、次いでHB/S1(80.0mg、0.329mmol)を一度に添加し、撹拌を12時間継続した。この反応混合物をNaHCO3の飽和溶液(20mL)で希釈し、CH2Cl2(3×20mL)で抽出した。有機抽出液をプールし、脱水し(Na2SO4)、ろ過し、濃縮した。粗生成物を、20mL/分で溶離し、カラム容量の18倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(25gカートリッジ)によって精製した。139mg(97%)の標記化合物を黄褐色固体として得た。
火炎乾燥した8mLのバイアルに、Ar下でHB/S2(100mg、0.383mmol)及びCH2Cl2(1.5mL)を投入し、次いで撹拌下の上記溶液に、塩化ベンゾイル(65.0μL、0.560mmol)を注射器で1分間かけて滴下により添加した。得られた混合物にトリエチルアミン(80.0μL、0.574mmol)を添加したところ、透明な溶液が生成した。この反応混合物を12時間撹拌し、次いでMeOH(2mL)を添加し、撹拌を30分間継続した。この溶液を濃縮乾固し、残留した物質を、25mL/分で溶離し、カラム容量の30倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(12gカートリッジ)によって精製した。89.6mg(64%)の標記化合物を白色固体として得た。
火炎乾燥した8mLのバイアルに、Ar下でHB/S2(100mg、0.383mmol)及びCH2Cl2(1.5mL)を投入し、次いで撹拌下の上記溶液に、3−(トリフルオロメチル)ベンゾイルクロリド(85.0μL、0.564mmol)を1分間かけて滴下により添加した。得られた混合物にトリエチルアミン(80.0μL、0.574mmol)を添加したところ、透明な溶液が生成した。この反応混合物を12時間撹拌し、次いでMeOH(2mL)を添加し、撹拌を30分間継続した。この溶液を濃縮乾固し、残留した物質を、20mL/分で溶離し、カラム容量の24倍の容量にわたるヘキサン/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(12gカートリッジ)によって精製した。72.9mg(44%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中の4−クロロ−3−(トリフルオロメチル)安息香酸(52.5mg、0.234mmol)、1−[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]−1H−1,2,3−トリアゾロ[4,5−b]ピリジニウム3−オキシドヘキサフルオロホスファート(HATU;88.9mg、0.234mmol)、及びDMF(1mL)の溶液に、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA;45.0μL、0.258mmol)を注射器で1分間かけて滴下により添加した。この溶液を2時間撹拌し、次いでHB/S2(55.5mg、0.212mmol)を一度に添加し、撹拌を18時間継続した。この溶液をMeOH(5mL)で希釈し、20mL/分で溶離し、25分間にわたるH2O/MeCN:90:10→0:100の直線勾配を用いた逆相クロマトグラフィーによって精製した。クロマトグラフィーから得られた生成物はわずかに不純物を含み、MeOH(1mL)から再結晶して、57.9mg(58%)の標記化合物を白色固体として得た。
8mLのバイアル中の2−フルオロ−5−(トリフルオロメチル)安息香酸(96.0mg、0.461mmol)、HATU(175mg、0.460mmol)、及びDMF(1mL)の溶液に、DIPEA(80.0μL、0.459mmol)を1分間かけて滴下により添加した。この溶液を2時間撹拌し、次いでHB/S2(100mg、0.383mmol)を一度に添加し、撹拌を14時間継続した。この溶液をMeOH(5mL)で希釈し、20mL/分で溶離し、42分間にわたるH2O/MeCN:90:10→0:100の直線勾配を用いた逆相クロマトグラフィーによって精製した。93.0mg(54%)の標記化合物を白色固体として得た。
火炎乾燥し、Ar下で冷却した8mLのバイアルに、HB/SX(X=1〜2)及びCH2Cl2(0.5〜1mL)を投入した。撹拌下の上記溶液に、塩化スルホニル(ニートでまたは0.5mLのCH2Cl2中の溶液として)及びピリジンを逐次添加し、両者共に注射器で1分間かけて滴下により添加した。この反応混合物の上部のヘッドスペースをArで覆い、バイアルをねじ込み蓋で密封し(テフロンテープで包み)、この反応混合物を24時間撹拌した。この群の全ての反応混合物は、20mL/分で溶離し、カラム容量の20倍の容量にわたるCH2Cl2/EtOAc:100:0→0:100の直線勾配を用いたシリカゲルクロマトグラフィー(12gカートリッジ)によって精製した。全ての生成物を高真空下で≧24時間乾燥した。この合成計画によって調製したソラフェログに関する具体的な詳細及び特性決定データを以下に記載する。
HB/S1(50.0mg、0.206mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液に、ベンゼン−1−スルホニルクロリド(32.0μL、0.251mol;ニート)、次いでピリジン(25.0μL、0.309mmol)を添加した。58.1mg(74%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
HB/S1(50.0mg、0.206mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液に、3−(トリフルオロメチル)ベンゼン−1−スルホニルクロリド(40.0μL、0.250mol;ニート)、次いでピリジン(25.0μL、0.309mmol)を添加した。37.4mg(40%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
HB/S1(50.0mg、0.206mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、4−クロロ−3−(トリフルオロメチル)ベンゼン−1−スルホニルクロリド(69.0mg、0.247mmol;0.5mLのCH2Cl2中の溶液として)、次いでピリジン(25.0μL、0.309mmol)を添加した。85.7mg(86%)の標記化合物を灰白色固体として得た。
HB/S1(50.0mg、0.206mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、2−フルオロ−5−(トリフルオロメチル)ベンゼン−1−スルホニルクロリド(65.0mg、0.248mmol;0.5mLのCH2Cl2中の溶液として)、次いでピリジン(25.0μL、0.309mmol)を添加した。54.6mg(56%)の標記化合物を灰白色固形物として得た。
HB/S2(60.0mg、0.230mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液に、ベンゼン−1−スルホニルクロリド(35.0μL、0.274mol;ニート)、次いでピリジン(28.0μL、0.346mmol)を添加した。44.5mg(48%)の標記化合物を白色固体として得た。
HB/S2(60.0mg、0.230mmol)及びCH2Cl2(1mL)の溶液に、3−(トリフルオロメチル)ベンゼン−1−スルホニルクロリド(45.0μL、0.281mol;ニート)、次いでピリジン(28.0μL、0.346mmol)を添加した。23.5mg(22%)の標記化合物を白色固体として得た。
HB/S2(60.0mg、0.230mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、4−クロロ−3−(トリフルオロメチル)ベンゼン−1−スルホニルクロリド(77.0mg、0.276mmol;0.5mLのCH2Cl2中の溶液として)、次いでピリジン(28.0μL、0.346mmol)添加した。78.4mg(68%)の標記化合物を白色固体として得た。
HB/S2(60.0mg、0.230mmol)及びCH2Cl2(0.5mL)の溶液に、2−フルオロ−5−(トリフルオロメチル)ベンゼン−1−スルホニルクロリド(72.5mg、0.276mmol;0.5mLのCH2Cl2中の溶液として)、次いでピリジン(28.0μL、0.346mmol)を添加した。78.4mg(70%)の標記化合物を白色固体として得た。
ハエ系統
キナーゼ変異ハエ系統及びバランサーハエ系統はBloomington Drosophila Stock Center (BDSC;Bloomington, IN)から入手した。X染色体上に変異キナーゼ遺伝子を有するFM7aまたはFM7cのバランスがとれたハエを、FM7a−Tb−RFPのバランスがとれたハエと異系交雑し、CyOまたはSM5のバランスがとれたハエをCyO−Tb−RFPバランサーと再平衡化した(Lattao et al., “Tubby−Tagged Balancers for the Drosophila X and Second Chromosomes,” Fly 5:369−370 (2011)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)。同様に、TM3またはMKRSのバランスがとれたハエをTM6Bバランサーと再平衡化した。dRetの活性変異型(dRetM955T)は、MEN 2B型患者に見られるM918T変異に相当するM1007T変異を有する(Vidal et al., “ZD6474 Suppresses Oncogenic RET Isoforms in a Drosophila Model for Type 2 Multiple Endocrine Neoplasia Syndromes and Papillary Thyroid Carcinoma,” Cancer Res. 65:3538−3541 (2005)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)。ptc−gal4、UAS−GFP;UAS−dRetM955T/SM5(tub−gal80)−TM6Bトランスジェニックハエを標準的なプロトコールに従って調製し、薬物スクリーニング及びキノーム遺伝学的スクリーニング用に、それぞれw−及びキナーゼ変異ハエと交雑した(図62A〜H)。遺伝学的スクリーニングの結果を検証するために、プロターゲットに対する10種類の更なる対立遺伝子を無作為に選び出して試験した。得られた結果は9種類の遺伝子についての結果と本質的に類似しており、プロターゲットを決定するための上記実験設計が完全なものであることが確認された。ハエ遺伝子のヒトオルソログをDIOPT(www.flyrnai.org/cgi−bin/DRSC_orthologs.pl)により予測した。
FDA認可薬物及びソラフェログは、Selleck Chemicals(Houston,TX)、LC Laboratories(Woburn,MA)、及びTocris Bioscience(UK)から購入するか、または施設内で合成した。AD80は既報(Dar et al., “Chemical Genetic Discovery of Targets and Anti−Targets for Cancer Polypharmacology,” Nature 486:80−84 (2012)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)のとおりに合成した。全ての化合物をDMSOに溶解し、一部組成が不明なハエ用培地(BDSC)と混合して、薬物入りの餌(0.1%の最終DMSO濃度)を作製した。キナーゼ変異を有するまたは有さない約100個のptc>dRetM955T胚を、23℃で15日間(遺伝学的スクリーニング)または25℃で13日間(薬物スクリーニング及び翅脈形成アッセイ)、薬物入りの餌で成虫期まで飼育した。蛹が空の事例の数(図53AのP)を蛹の事例の総数(A)で除して、%表記の生存率を測定した。
インビボ細胞遊走アッセイのために、三齢幼虫を解剖して発生中の翅原基を採取した。4%パラホルムアルデヒドのPBS溶液で固定化した後、原基を全組織標本とし、共焦点顕微鏡下、GFPで標識したdRetM955T発現細胞を観測した。それぞれの遺伝子型または処理に対して少なくとも20の翅原基を調べた。Phospho−Srcを抗Src(pY418)抗体(Invitrogen)で染色した。翅脈形成アッセイのために、翅特異的な765−gal4ドライバ系統をUAS−dRetM955Tハエと交雑した。15を超える成虫の翅が異常な翅脈形成のスコアとなった。
TTヒトMTC細胞を、10%のウシ胎児血清、100単位/mlのペニシリン、及び0.1mg/mlのストレプトマイシンの混合物を追加したRPMI1640中、37℃で培養した。細胞を96ウェルプレート中で種々の用量のキナーゼ阻害物質と共に5日間インキュベートし、チアゾリルブルーテトラゾリウムブロミド(MTT;SIGMA, St. Louis, MO)を用い、製造元のプロトコールに従って細胞生存率を測定した。
上記ソラフェログを一連の精製ヒトキナーゼ(ThermoFisher)に対してアッセイし、阻害率の値を測定し、キノームプロファイルを導き出した(図61)。全ての化合物を、2つの生物学的レプリケートを用い、1μMでスクリーニングし、阻害率の値を測定した。キナーゼ反応の詳細な手法及びアッセイ形式は、www.thermofisher.com/kinaseprofilingに記載されている。
ビーズベースの競合アッセイ(KINOMEscan)を用い、DiscoverXによってKd値を測定した。簡単に説明すると、キナーゼをファージ上で発現させ、活性部位特異的リガンドを介してビーズ上に固定化した。試験化合物をキナーゼと予備混合し、固定化リガンドに対して競合する能力についてアッセイした。結合定数は、標準的な用量−応答曲線及びヒルの式を用いて算出し、ヒルの勾配を−1に設定した。この方法はキナーゼ阻害物質結合データを特性決定するために広く使用されてきた(Davis et al., “Comprehensive Analysis of Kinase Inhibitor Selectivity,” Nat. Biotechnol. 29:1046−51 (2011);Young et al., “Structure of the Kinase Domain of an Imatinib−Resistant Abl Mutant in Complex with the Aurora Kinase Inhibitor VX−680,” Cancer Res. 66:1007−14 (2006)、該文献は本記載をもってそれらの全体が参照により援用される)。各ソラフェログ−キナーゼ対について、3倍希釈での30,000〜0.5nMの範囲の段階希釈液11点を用いてKd値を導き出した。Kd値、及び平均値の標準誤差(SEM)は、2つの生物学的レプリケートの平均値である。
ソラフェニブ及び他の関連するキナーゼ阻害物質は、DFG−out立体配座に結合する公知のII型阻害物質であることから、ソラフェログもまたII型キナーゼ阻害物質であるとの仮説を立てた。強力なII型阻害物質を合理的に設計するためには、プロターゲット及びアンチターゲットのそれらのDFG−out立体配座における原子構造が必要であった。一部のプロターゲット/アンチターゲットについてはそれらのDFG−out立体配座における構造が判明していないが、ホモロジーモデル化を用いてそれらの構造を予測した。特に、活性なDFG−in構造または配列情報のみからDFG−out立体配座をモデル化するDFGモデルを用いた(Ung et al., “DFGmodel: Predicting Protein Kinase Structures in Inactive States for Structure−Based Discovery of Type−II Inhibitors,” ACS Chem. Biol. 10:269−278 (2015)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)。
N−置換基に対する上記尿素リンカーのねじれエネルギーを、水溶液中の分子力学OPLS_2005力場を用いたSchrodinger’s Maestro (Maestro, version 10.3, Schrodinger, LLC, New York, NY, 2015、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)によって計算した。ねじれ角は2度の間隔で走査した。相対ねじれエネルギーをねじれ角に対してプロットし、基準となるソラフェニブのX線結晶構造において観測された相当するねじれ角と比較した。
DFGモデルによって作製した上位10種類のDFG−outモデルのDFGポケットの平均体積を、POVME 2.0(Durrant et al., “POVME 2.0: An Enhanced Tool for Determining Pocket Shape and Volume Characteristics,” J. Chem. Theory Comput. 10:5047−5056 (2014)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)を用いて計算した。
治療指数と呼ばれる、腫瘍抑制と全般的な毒性の両方が関わる治療域によって、臨床に使用される抗がん剤の有効性が明らかになる。現在、31種類のキナーゼ阻害物質が患者への使用に対してFDAの認可を受けている。これらの薬物の大部分は、(i)腫瘍の複雑さ及び、(ii)(i)と結びついた、毒性を最小限にするために、正常組織中のものを含む適切な細胞ネットワークを維持することの重要性に起因して、狭い治療指数を示す。総じて、抗がん剤の治験の成功率は主要な疾患向けの薬物の中で最低のままであり、失敗の大部分は治療指数の制限によるものである(Meanwell, N. A., “Improving Drug Candidates by Design: A Focus on Physicochemical Properties as a Means of Improving Compound Disposition and Safety,” Chem. Res. Toxicol. 24:1420−1456 (2011);Hay et al., “Clinical Development Success Rates for Investigational Drugs,” Nat. Biotechnol. 32:40−51 (2014)、該文献は本記載をもってそれらの全体が参照により援用される)。標的治療薬に対する耐性が生じると、全生存期間を延ばす上での該治療薬の有効性が制限されることが多い。
ソラフェニブはRET、BRAF、及びKDR/VEGFRを含む複数のキナーゼに結合する(Wilhelm et al., “BAY 43−9006 Exhibits Broad Spectrum Oral Antitumor Activity and Targets the RAF/MEK/ERK Pathway and Receptor Tyrosine Kinases Involved in Tumor Progression and Angiogenesis,” Cancer Res. 64:7099−7109 (2004)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)。これらのキナーゼ及び他のキナーゼに結合したソラフェニブの結晶構造によって、類似の結合ポーズが明らかになった(図54A、左側の図)。構造解析に基づいて、ソラフェニブを4種類のサブユニット、すなわち、(i)標的キナーゼのATP結合部位を占めるヒンジバインダー(本発明者らの研究においては一定に保持される)、(ii)スペーサー、(iii)リンカー、及び(iv)キャップに概念的に分解した。キャップは、キナーゼ間で組成及び大きさが異なる、キナーゼドメイン内の構成要素である疎水性のDFGポケットまで延在する(図54A;(Ung et al., “DFGmodel: Predicting Protein Kinase Structures in Inactive States for Structure−Based Discovery of Type−II Inhibitors,” ACS Chem. Biol. 10:269−278 (2015)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される))。
上記ソラフェログは、上記ハエにおける動物全身の治療指数に関する定量的SARデータを提供した。特に、ソラフェログのキャップ基の微妙な構造上の変化によって、Ret駆動の致死性からのレスキューに著しい違いが生じたことが特記された。観測されたSARをよりよく理解するために、インシリコでこれらのキャップ構造の物理的特徴を調査し、構造と動物全身の機能との間の相関関係を探索した。部分電荷分布、pKa、及び分子双極子を含むいくつかのキャップの特性は、有効性と有意に相関しなかった。更に、主要なプロターゲットに対する化合物のドッキングのモデルにおける自由エネルギーの計算も、ソラフェログの有効性と強い相関はなかった。
上記リード分子の有効性を増加させるために、遺伝学的アプローチを用いて、ハエの発生の全体を通じて減少させた場合にLS1−15またはソラフェニブのptc>dRetM955Tの致死性を抑制する能力が変化するキナーゼを特定した。GAL4ドライバの活性を制御するために温度を用いて、LS1−15の存在下で約50%までのptc>dRetM955Tハエの生存率のキャリブレーションを行った。この増感アッセイを用いて、主要な「プロ(プロスペクティブ)ターゲット」遺伝子及び「アンチターゲット」遺伝子、すなわち、ヘテロ接合の場合に薬効をそれぞれ増加させるまたは減少させる遺伝子をスクリーニングした(図54B、55A、及び62B〜H)。プロターゲットはソラフェニブの有効性の正の変更因子としての役割を果たした。アンチターゲットは、腫瘍ネットワーク内における負の変更因子であって、これらの因子が阻害された場合に薬物の有効性を低下させることまたは薬物の全身毒性を促進することができる、上記変更因子としての役割を果たした。
これらの研究の過程で、ソラフェニブ及びLS1−15の状況において、ショウジョウバエ Rafに関する二重の要件、すなわち、raf−/+が高い薬物用量ではプロターゲットとして作用したが、低用量ではアンチターゲットとして作用したことを観察したのは驚くべきことであった。最近の研究では、第一世代のBRAF阻害物質が「阻害物質誘導トランス活性化」により低用量でBRAFを活性化できること、すなわち、薬物が結合したRAFプロトマーが薬物を含まないRAFプロトマーのキナーゼ活性を刺激し、下流のMAPKを活性化することができるが実証されている(Poulikakos et al., “RAF Inhibitors Transactivate RAF Dimers and ERK Signalling in Cells with Wild−Type BRAF,” Nature 464:427−430 (2010);Weeraratna, “RAF Around the Edges−The Paradox of BRAF Inhibitors,” N. Engl. J. Med. 366:271−273 (2012)、該文献は本記載をもってそれらの全体が参照により援用される)。薬物を含まないRAFプロトマーの数、延いてはBRAF/MAPK活性を低下させるためには、より高い薬物用量が必要であった。
インビトロ結合アッセイにより、ヒトBRAFに対するソラフェニブ及びLS1−15の有意な結合が明らかになった(図56C)。翅脈形成の結果に基づいて、Rafキナーゼに対するソラフェログの活性を、該ソラフェログのキャップの大きさに注目することによって低下させることに研究の焦点を絞った。
発生中の眼球上皮へのdRasG12VまたはdRetM955Tのいずれかの発現を標的化することによるRas−MAPKシグナル伝達の活性化によって、複数の態様の形質転換が生じ、ラフアイ表現型が発生する(Huang et al., “A Misexpression Screen Identifies Genes that can Modulate RAS1 Pathway Signaling in Drosophila Melanogaster,” Genetics 156:1219−1230 (2000);Read et al., “A Drosophila Model of Multiple Endocrine Neoplasia type 2,” Genetics 171:1057−1081 (2005)、該文献は本記載をもってそれらの全体が参照により援用される)。切開した瀕死の(ビヒクル処理した)ptc>dRetM955T蛹を解剖することによって、最前眼部領域においてラフアイ表現型が観測され(図57D)、これは前眼部領域内のptcの発現と整合した(Shyamala et al., “A Positive Role for Patched−Smoothened Signaling in Promoting Cell Proliferation During Normal Head Development in Drosophila,” Development 129:1839−1847 (2002)、該文献は本記載をもってその全体が参照により援用される)。APS6−45は、蛹においても及びレスキューされた成虫においてもこの前眼部のラフアイ表現型を強力に抑制したのに対して、他のソラフェログのみならずAD80でも抑制は起こらなかった(図57D)。更にこれらの結果は、APS6−45が特に高レベルで、動物全身に対する毒性が最小限でありながら、Rasシグナル伝達を阻害することを示している。
ハエのラフアイ表現型に対する化合物の効果を評価した。ptc>dRetM955Tは、成虫の前眼部に個眼領域の乱れを含む形質転換様表現型を示した。APS6−45は、ラフアイ表現型を強力にレスキューし、ptc−gal4対照と同様の滑らかに配列された個眼が生じた。ビヒクル処理した対照ハエは、成虫期まで生存しなかったことから、蛹の状態で解剖した。薬物濃度は、ソラフェニブ(400μM)、LS1−15(200μM)、APS5−16−2(100μM)、APS6−45(100μM)、及びAD80(100μM)であった(図66A)。APS5−16−2及びAPS6−45によるMTCコロニー形成の抑制を図66Bに示す。TTヒトMTC細胞を、TCIの存在下で軟寒天アッセイにおいてコロニー形成活性についてアッセイした。3週目におけるコロニーの代表的な形態を図66B(上段の写真)に示す。矢印(図66B)は増殖中のコロニーの例である。40倍で撮影した。コロニー形成効率に対するTCIの効果を図66B(下段)に示す。3週目におけるコロニー数を播種細胞数で除してコロニー形成効率を判定した。各実験において150〜200個の細胞を採点した。エラーバーは3回繰り返しの実験における標準誤差を表す。アスタリスクは、スチューデントのt検定において、ソラフェニブ(soraf)と比較してp<0.05であることを表す。#は、スチューデントのt検定において、APS5−16−2と比較してp<0.05であることを表す。
全てのマウス実験は、American Association for Accreditation of Laboratory Animal Science (AAALAC)または国立衛生研究所(NIH)の実験動物福祉局(OLAW)によって示された指針に従って実施した。
2種類の臨床上認可されたキナーゼ阻害物質ソラフェニブ及びレゴラフェニブ(1−31−1とも表示される)が最適用量で増進したレスキュー率は5%未満であった。化合物名と濃度(単位はμM)をx軸に表示する。ptc>dRetM955Tハエを用いたこのアッセイにおいて、patched(ptc)プロモーターはいくつかの組織においてショウジョウバエ Ret(dRetM955T)の発がん性変異体アイソフォームを駆動し、これによって成虫として羽化する前に致死に導かれる。幼虫は候補薬物を食べ尽くす。薬効(Y軸)は、レスキューされた成虫の数(A)を蛹の総数(P)で除することによって定量化される(図68)。
本明細書に記載の研究は、ショウジョウバエ遺伝学を薬化学及び計算化学と組み合わせて、合理的、段階的な方法で多重薬理学的薬物を開発するプラットフォームを明示している。研究は、臨床上重要であるにもかかわらず、臨床において著しい禁忌を示しているがん治療薬としてのFDA認可キナーゼ阻害物質ソラフェニブ(Hescot et al., “Pancreatic Atrophy−A New Late Toxic Effect of Sorafenib,” N. Engl. J. Med. 369:1475−1476 (2013);Hesselink et al., “Therapy of Endocrine Disease: Response and Toxicity of Small−Molecule Tyrosine Kinase Inhibitors in Patients with Thyroid Carcinoma: A Systematic Review and Meta−Analysis,” Eur. J. Endocrinol. 172:R215−25 (2015);Zhang et al., “Meta−Analysis of Dermatological Toxicities Associated with Sorafenib,” Clin. Exp. Dermatol. 36:344−350 (2011)を参照されたく、該文献は本記載をもってそれらの全体が参照により援用される)に焦点を当てた。
Claims (17)
- 以下の構造を有する式(I)
の化合物、またはその立体異性体、薬学的に許容される塩、酸化物、もしくは溶媒和物:
式中、
Rは、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、−N(C1〜6アルキル)2、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルからなる群より選択され、ここで、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルは任意で、R13でn回置換されていてもよく、
R1はHであり、
R2はHであるか、
または、R1及びR2が、R1及びR2が結合しているフェニル環と結合して、
を形成し、
R3はHもしくはハロゲンであり、
R4はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R5はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R6はC1〜C6アルキルであり、
Xは、任意であり、且つ、存在する場合にはNHであり、
Yは
であり、
ZはC(R12)もしくはNであり、
R7はHもしくはMeであり、
R8はHもしくはMeであるか、
または、R7及びR8が、R7及びR8が結合している炭素原子と一緒になって、
を形成し、
R9はH、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリル、−CN、もしくは
であり、
R10はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R11はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R12はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R13は、R13のそれぞれの場合において、H、ハロゲン、C1〜C6アルキル、CH2F、CHF2、CClF2、CBrF2、CIF2、CF3、C2F5、C3F7、C4F9、OCF3、及びヘテロシクリルからなる群より独立に選択され、且つ
nは1〜5であり、
但し、
i)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
ii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
iii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
iv)R1がHであり、R2がHであり、R3がFであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
v)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、且つ
vi)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができない。 - R16が、フッ素で2〜13回置換されたC1〜C6アルキルである、請求項2に記載の化合物。
- R16が、CH2F、CHF2、CClF2、CBrF2、CIF2、CF3、C2F5、C3F7、及びC4F9からなる群より選択される、請求項2に記載の化合物。
- R14がFである、請求項2に記載の化合物。
- R3がFである、請求項1に記載の化合物。
- 請求項1に記載の化合物及び担体を含む、組成物。
- 前記担体が薬学的に許容される担体である、請求項10に記載の組成物。
- 以下の構造を有する式(I)
の化合物、またはその立体異性体、薬学的に許容される塩、酸化物、もしくは溶媒和物を対象に投与するステップであって、
式中、
Rは、C1〜6アルキル、C1〜6アルコキシ、−N(C1〜6アルキル)2、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルからなる群より選択され、ここで、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクリルは任意で、R13でn回置換されていてもよく、
R1はHであり、
R2はHであるか、
または、R1及びR2が、R1及びR2が結合しているフェニル環と結合して、
を形成し、
R3はHもしくはハロゲンであり、
R4はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R5はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R6はC1〜C6アルキルであり、
Xは、任意であり、且つ、存在する場合にはNHであり、
Yは
であり、
ZはC(R12)もしくはNであり、
R7はHもしくはMeであり、
R8はHもしくはMeであるか、
または、R7及びR8が、R7及びR8が結合している炭素原子と一緒になって、
を形成し、
R9はH、C1〜6アルキル、C3〜6シクロアルキル、アリル、−CN、もしくは
であり、
R10はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R11はH、C1〜6アルキル、もしくはC3〜6シクロアルキルであり、
R12はH、ハロゲン、もしくはC1〜C6アルキルであり、
R13は、R13のそれぞれの場合において、H、ハロゲン、C1〜C6アルキル、CH2F、CHF2、CClF2、CBrF2、CIF2、CF3、C2F5、C3F7、C4F9、OCF3、及びヘテロシクリルからなる群より独立に選択され、且つ
nは1〜5であり、
但し、
i)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
ii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、
iii)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
iv)R1がHであり、R2がHであり、R3がFであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、Yが
であり、且つnが2である場合、Rは
であることができず、
v)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、Xが存在せず、且つYが
である場合、Rは
であることができず、且つ
vi)R1がHであり、R2がHであり、R3がHであり、R4がHであり、R5がHであり、R6がCH3であり、ZがCHであり、XがNHであり、且つYが
である場合、Rは
であることができない、前記ステップ
を含む、対象におけるがんの治療方法。 - 前記投与するステップが、経口投与、局所投与、経皮投与、非経口投与、皮下投与、静脈内投与、筋肉内投与、腹腔内投与、鼻腔内注入、腔内もしくは膀胱内注入、眼内投与、動脈内投与、病巣内投与、または粘膜への適用によって行われる、請求項12に記載の方法。
- 前記対象が哺乳動物である、請求項12に記載の方法。
- 前記対象がヒトである、請求項16に記載の方法。
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