JP2003265184A - 被検者におけるグルココルチコイド製剤の有効性の検査方法 - Google Patents
被検者におけるグルココルチコイド製剤の有効性の検査方法Info
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Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
(57)【要約】
【課題】 被検者におけるグルココルチコイド製剤の有
効性の検査方法および検査試薬を提供することを課題と
する。 【解決手段】 本発明者らにより、グルココルチコイド
受容体(GR)において、643番目のアミノ酸残基がシス
テインからアルギニン、ロイシン-772からリジン-777ま
でのアミノ酸残基が、別の26アミノ酸残基に置換したGR
が見出された(それぞれ、「C643R変異型GR」および「2
314 ins-a変異型GR」)。また、該C643R変異型GRおよび
該2314 ins-a変異型GRの転写活性は抑制されていること
が判明した。さらに、該C643R変異型GRのデキサメサゾ
ンに対する結合親和性は低いことが判明した。従って、
これら変異について検査することにより、グルココルチ
コイド製剤の有効性を予測することができる。
効性の検査方法および検査試薬を提供することを課題と
する。 【解決手段】 本発明者らにより、グルココルチコイド
受容体(GR)において、643番目のアミノ酸残基がシス
テインからアルギニン、ロイシン-772からリジン-777ま
でのアミノ酸残基が、別の26アミノ酸残基に置換したGR
が見出された(それぞれ、「C643R変異型GR」および「2
314 ins-a変異型GR」)。また、該C643R変異型GRおよび
該2314 ins-a変異型GRの転写活性は抑制されていること
が判明した。さらに、該C643R変異型GRのデキサメサゾ
ンに対する結合親和性は低いことが判明した。従って、
これら変異について検査することにより、グルココルチ
コイド製剤の有効性を予測することができる。
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、被検者におけるグ
ルココルチコイド製剤の有効性の検査方法に関する。
ルココルチコイド製剤の有効性の検査方法に関する。
【0002】
【従来の技術】グルココルチコイド受容体(GR)は、グル
ココルチコイドで活性化される転写因子である。GRは、
最初に、いくつかの熱ショックタンパク質および他のタ
ンパク質に会合した細胞質タンパク質として存在する
(W. B. Pratt, D. O. Toft, Steroid receptor interac
tions with heat shock protein and immunophilin cha
perones. Endocr. Rev. 18 (1997) 306-360)。グルココ
ルチコイドは、細胞質においてGRに結合し、これはGRの
核内移行を誘導する(J. C. Webster, J. A. Cidlowski,
Mechanisms of Glucocorticoid-receptor-mediated Re
pression of Gene Expression. Trends Endocrinol. Me
tab. 10 (1999) 396-402)。その転写活性の誘導または
減少は、組織または細胞の型に応じて異なり、従って異
なる組織上の多様なそして時には相反する生理作用に関
係している。すなわち、GRは、リンパ球におけるグルコ
コルチコイドが誘導したアポトーシスに関与しているこ
とが知られている(A. H. Wyllie, Glucocorticoid-indu
ced thymocyte apoptosis is associated with endogen
ous endonuclease activation. Nature 284 (1980) 555
-556; R. Schwartzman, J. Cidlowski, Glucocorticoid
-induced apoptosis oflymphoid cells. Int. Arch. Al
lergy Immunol. 105 (1994) 347-354)。しかし、ヒト乳
房上皮細胞(MEC)は、GR活性化によりむしろアポトーシ
スから保護されている(T.J. Moran, S. Gray, C.A. Mik
osz, S.D. Conzen.The glucocorticoidreceptor mediat
es a survival signal in human mammary epithelial c
ells. Cancer Res. 60 (2000) 867-72)。最近になっ
て、リンパ球系細胞のグルココルチコイド依存型アポト
ーシスに対する感受性が、標的細胞分化の状態および外
来細胞支持因子(supporting factor)の有無に強く左右
されることが示された(E.B. Thompson, Mechanisms of
T-cell Apoptosis Induced by Glucocorticoids. Trend
s Endocrinol Metab. 10 (1999) 353-358.)。様々なプ
ロテインキナーゼC(PKC)、NF-κBおよびPKA経路の基本
レベルは、グルココルチコイド依存型アポトーシスに対
するリンパ球系細胞の固有の感受性の決定因子とみなさ
れた。しかし、これらのGRが媒介した作用の機序につい
てはごくわずかしかわかっていない。
ココルチコイドで活性化される転写因子である。GRは、
最初に、いくつかの熱ショックタンパク質および他のタ
ンパク質に会合した細胞質タンパク質として存在する
(W. B. Pratt, D. O. Toft, Steroid receptor interac
tions with heat shock protein and immunophilin cha
perones. Endocr. Rev. 18 (1997) 306-360)。グルココ
ルチコイドは、細胞質においてGRに結合し、これはGRの
核内移行を誘導する(J. C. Webster, J. A. Cidlowski,
Mechanisms of Glucocorticoid-receptor-mediated Re
pression of Gene Expression. Trends Endocrinol. Me
tab. 10 (1999) 396-402)。その転写活性の誘導または
減少は、組織または細胞の型に応じて異なり、従って異
なる組織上の多様なそして時には相反する生理作用に関
係している。すなわち、GRは、リンパ球におけるグルコ
コルチコイドが誘導したアポトーシスに関与しているこ
とが知られている(A. H. Wyllie, Glucocorticoid-indu
ced thymocyte apoptosis is associated with endogen
ous endonuclease activation. Nature 284 (1980) 555
-556; R. Schwartzman, J. Cidlowski, Glucocorticoid
-induced apoptosis oflymphoid cells. Int. Arch. Al
lergy Immunol. 105 (1994) 347-354)。しかし、ヒト乳
房上皮細胞(MEC)は、GR活性化によりむしろアポトーシ
スから保護されている(T.J. Moran, S. Gray, C.A. Mik
osz, S.D. Conzen.The glucocorticoidreceptor mediat
es a survival signal in human mammary epithelial c
ells. Cancer Res. 60 (2000) 867-72)。最近になっ
て、リンパ球系細胞のグルココルチコイド依存型アポト
ーシスに対する感受性が、標的細胞分化の状態および外
来細胞支持因子(supporting factor)の有無に強く左右
されることが示された(E.B. Thompson, Mechanisms of
T-cell Apoptosis Induced by Glucocorticoids. Trend
s Endocrinol Metab. 10 (1999) 353-358.)。様々なプ
ロテインキナーゼC(PKC)、NF-κBおよびPKA経路の基本
レベルは、グルココルチコイド依存型アポトーシスに対
するリンパ球系細胞の固有の感受性の決定因子とみなさ
れた。しかし、これらのGRが媒介した作用の機序につい
てはごくわずかしかわかっていない。
【0003】グルココルチコイドは、小児急性リンパ芽
球性白血病の治療に使用される最も強力な物質のひとつ
であり、全ての標準の寛解導入療法に含まれている(C.-
H. Pui, Childhood leukemias. N. Engl. J. Med. 332
(1995) 1618-1630; G. J. L.Kaspers, R. Pieters, E.
Klumper, F. C. DeWaal, A. J. P. Veerman, Glucocort
icoid resistance in childhood leukemia. Leukemia L
ymphoma 13 (1994) 187-201)。先行する研究は、ヒト白
血病性CEM-C1細胞は、グルココルチコイド耐性であり、
かつGR遺伝子のリガンド結合ドメイン(LBD)中のヘテロ
接合性変異(L753F)を有することを示している(M. Hanad
a, M. Shimoyama, Potential limitation of growth-in
hibitory action of recombinant human tumor necrosi
s factor (PAC-4D) due to easy induction of resista
nce: evidence in vitro. Jpn.J. Cancer Res. 78 (198
7) 1266-1273; E. M. Strasser-Wozak, R. Hattmannsto
rfer, M. Hala, B. L. Hartmann, M. Fiegl, S. Geley,
R. Kofler, Splice site mutation in the glucocorti
coid receptor gene causes resistance to glucocorti
coid-induced apoptosis in a human acute leukemic c
ell line. CancerRes. 55 (1995) 348-353; A. G. Hill
mann, J. Ramdas, K. Multanen, M. R. Norman, J. M.
Harmon, Glucocorticoid receptor gene mutations in
leukemiccells acquired in vitro and in vivo. Cance
r Res. 60 (2000) 2056-2062; S.Geley, B. L. Hartman
n, M. Hala, E. M. Strasser-Wozak, K. Kapelari, R.
Kofler, Resistance to glucocorticoid-induced apopt
osis in human T-cell acute lymphoblastic leukemia
CEM-C1 cells is due to insufficient glucocorticoid
receptor expression. Cancer Res. 56 (1996) 5033-5
038)。これらの細胞において、グルココルチコイド結合
親和性および転写活性化は顕著に低下された。これらの
報告は、変異L753FがCEM-C1細胞におけるグルココルチ
コイド耐性に影響を及ぼすこと、およびこの変異がグル
ココルチコイドにより誘導されたアポトーシスを阻害し
得ることを示唆している。従って、CEM-C1細胞のグルコ
コルチコイド耐性は、GR遠位のシグナル伝達経路の欠損
よりもむしろ、機能GRの閾値発現に起因すると考えられ
た。
球性白血病の治療に使用される最も強力な物質のひとつ
であり、全ての標準の寛解導入療法に含まれている(C.-
H. Pui, Childhood leukemias. N. Engl. J. Med. 332
(1995) 1618-1630; G. J. L.Kaspers, R. Pieters, E.
Klumper, F. C. DeWaal, A. J. P. Veerman, Glucocort
icoid resistance in childhood leukemia. Leukemia L
ymphoma 13 (1994) 187-201)。先行する研究は、ヒト白
血病性CEM-C1細胞は、グルココルチコイド耐性であり、
かつGR遺伝子のリガンド結合ドメイン(LBD)中のヘテロ
接合性変異(L753F)を有することを示している(M. Hanad
a, M. Shimoyama, Potential limitation of growth-in
hibitory action of recombinant human tumor necrosi
s factor (PAC-4D) due to easy induction of resista
nce: evidence in vitro. Jpn.J. Cancer Res. 78 (198
7) 1266-1273; E. M. Strasser-Wozak, R. Hattmannsto
rfer, M. Hala, B. L. Hartmann, M. Fiegl, S. Geley,
R. Kofler, Splice site mutation in the glucocorti
coid receptor gene causes resistance to glucocorti
coid-induced apoptosis in a human acute leukemic c
ell line. CancerRes. 55 (1995) 348-353; A. G. Hill
mann, J. Ramdas, K. Multanen, M. R. Norman, J. M.
Harmon, Glucocorticoid receptor gene mutations in
leukemiccells acquired in vitro and in vivo. Cance
r Res. 60 (2000) 2056-2062; S.Geley, B. L. Hartman
n, M. Hala, E. M. Strasser-Wozak, K. Kapelari, R.
Kofler, Resistance to glucocorticoid-induced apopt
osis in human T-cell acute lymphoblastic leukemia
CEM-C1 cells is due to insufficient glucocorticoid
receptor expression. Cancer Res. 56 (1996) 5033-5
038)。これらの細胞において、グルココルチコイド結合
親和性および転写活性化は顕著に低下された。これらの
報告は、変異L753FがCEM-C1細胞におけるグルココルチ
コイド耐性に影響を及ぼすこと、およびこの変異がグル
ココルチコイドにより誘導されたアポトーシスを阻害し
得ることを示唆している。従って、CEM-C1細胞のグルコ
コルチコイド耐性は、GR遠位のシグナル伝達経路の欠損
よりもむしろ、機能GRの閾値発現に起因すると考えられ
た。
【0004】グルココルチコイド遺伝子における変異
と、GRのグルココルチコイド結合能の低下との関連性が
明らかになれば、GR遺伝子における変異を検出すること
によりグルココルチコイド製剤の有効性を評価すること
が可能であるものと期待される。
と、GRのグルココルチコイド結合能の低下との関連性が
明らかになれば、GR遺伝子における変異を検出すること
によりグルココルチコイド製剤の有効性を評価すること
が可能であるものと期待される。
【0005】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、このような
状況に鑑みてなされたものであり、その目的は、被検者
におけるグルココルチコイド製剤の有効性の検査方法を
提供することにある。さらに、グルココルチコイド製剤
の有効性を検査するための試薬を提供することを目的と
する。
状況に鑑みてなされたものであり、その目的は、被検者
におけるグルココルチコイド製剤の有効性の検査方法を
提供することにある。さらに、グルココルチコイド製剤
の有効性を検査するための試薬を提供することを目的と
する。
【0006】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、上記の課
題を解決するために鋭意研究を行った。まず、日本人10
名の個別の白血病細胞株および1種の日本人由来結腸ガ
ン細胞株のGR遺伝子コード領域の塩基配列を決定し、GR
遺伝子にある種の変異が存在するか否かを検討した。そ
の結果、GR遺伝子において、システイン-643をアルギニ
ンに置換する変異C643R、およびロイシン-772からリジ
ン-777を別の26アミノ酸に置換する変異2314 ins-aを見
出した。
題を解決するために鋭意研究を行った。まず、日本人10
名の個別の白血病細胞株および1種の日本人由来結腸ガ
ン細胞株のGR遺伝子コード領域の塩基配列を決定し、GR
遺伝子にある種の変異が存在するか否かを検討した。そ
の結果、GR遺伝子において、システイン-643をアルギニ
ンに置換する変異C643R、およびロイシン-772からリジ
ン-777を別の26アミノ酸に置換する変異2314 ins-aを見
出した。
【0007】また、本発明者らは、C643R変異型GRおよ
び2314 ins-a変異型GRが有する転写活性を調べるため
に、野生型GRプラスミド、C643R変異型GRプラスミドま
たは2314 ins-a変異型GRプラスミドを、マウスの乳がん
ウイルス(MMTV)プロモーター-ルシフェラーゼレポータ
ー構築体(pHH-Luc)を用いて、COS-7細胞中にトランスフ
ェクションした。検討の結果、野生型GRでトランスフェ
クションした細胞において、ルシフェラーゼ活性は、用
量依存的に増加した。しかしC643R変異型GRは、デキサ
メサゾン反応性ルシフェラーゼレポーター遺伝子の発現
を誘導しなかった。また、2314 ins-a変異型GRにおいて
も同様の結果が得られた。よって、C643R変異型GRおよ
び2314 ins-a変異型GRの転写活性は抑制されていること
が判明した。
び2314 ins-a変異型GRが有する転写活性を調べるため
に、野生型GRプラスミド、C643R変異型GRプラスミドま
たは2314 ins-a変異型GRプラスミドを、マウスの乳がん
ウイルス(MMTV)プロモーター-ルシフェラーゼレポータ
ー構築体(pHH-Luc)を用いて、COS-7細胞中にトランスフ
ェクションした。検討の結果、野生型GRでトランスフェ
クションした細胞において、ルシフェラーゼ活性は、用
量依存的に増加した。しかしC643R変異型GRは、デキサ
メサゾン反応性ルシフェラーゼレポーター遺伝子の発現
を誘導しなかった。また、2314 ins-a変異型GRにおいて
も同様の結果が得られた。よって、C643R変異型GRおよ
び2314 ins-a変異型GRの転写活性は抑制されていること
が判明した。
【0008】さらに、本発明者らは、デキサメサゾンに
対するC643R変異型GRの親和性を調べるために、Scatcha
rdプロット解析に従い、野生型またはC643R変異型GRプ
ラスミドでトランスフェクションしたCOS-7細胞の細胞
質画分における[3H]デキサメサゾンへの結合親和性を
測定した。その結果、特異的な高親和性結合が、野生型
GRでトランスフェクションしたCOS-7細胞から調製した
細胞質画分中で明らかになった。この結合能は、864fmo
l/mg細胞質タンパク質であり、解離定数Kdは7.4nMであ
った。C643R変異型GRでトランスフェクションしたCOS-7
細胞からの細胞質画分の結合能(921fmol/mg細胞質タン
パク質)は、野生型の値と同等であったが、Kd値(44.6n
M)は6倍高かった。よって、C643R変異型GRのデキサメサ
ゾンに対する結合親和性は低いことが判明した。
対するC643R変異型GRの親和性を調べるために、Scatcha
rdプロット解析に従い、野生型またはC643R変異型GRプ
ラスミドでトランスフェクションしたCOS-7細胞の細胞
質画分における[3H]デキサメサゾンへの結合親和性を
測定した。その結果、特異的な高親和性結合が、野生型
GRでトランスフェクションしたCOS-7細胞から調製した
細胞質画分中で明らかになった。この結合能は、864fmo
l/mg細胞質タンパク質であり、解離定数Kdは7.4nMであ
った。C643R変異型GRでトランスフェクションしたCOS-7
細胞からの細胞質画分の結合能(921fmol/mg細胞質タン
パク質)は、野生型の値と同等であったが、Kd値(44.6n
M)は6倍高かった。よって、C643R変異型GRのデキサメサ
ゾンに対する結合親和性は低いことが判明した。
【0009】上記の如く本発明者らは、GRにおけるシス
テイン-643をアルギニンに置換する変異C643R、または
ロイシン-772からリジン-777を別の26アミノ酸に置換す
る変異2314 ins-aが、グルココルチコイド結合能を低下
させる、またはGRの転写活性化能を低下させることを初
めて実証し、本発明を完成させた。GRのグルココルチコ
イド結合能を低下させる、またはGRの有する転写活性化
能を低下させるGR遺伝子の多型を検出することで、被検
者についてグルココルチコイド製剤の有効性を判定する
ことが可能となった。
テイン-643をアルギニンに置換する変異C643R、または
ロイシン-772からリジン-777を別の26アミノ酸に置換す
る変異2314 ins-aが、グルココルチコイド結合能を低下
させる、またはGRの転写活性化能を低下させることを初
めて実証し、本発明を完成させた。GRのグルココルチコ
イド結合能を低下させる、またはGRの有する転写活性化
能を低下させるGR遺伝子の多型を検出することで、被検
者についてグルココルチコイド製剤の有効性を判定する
ことが可能となった。
【0010】即ち、本発明は、被検者におけるグルココ
ルチコイド製剤の有効性の検査方法、および、グルココ
ルチコイド製剤の有効性を検査するための試薬に関し、
より具体的には、〔1〕 被検者におけるグルココルチ
コイド製剤の有効性の検査方法であって、グルココルチ
コイド受容体のグルココルチコイド結合能を低下させ
る、または該受容体の有する転写活性化能を低下させる
グルココルチコイド受容体遺伝子の多型を検出する工程
を含み、多型が検出された場合に、被検者はグルココル
チコイド製剤に対して耐性であると判定される検査方
法、〔2〕 多型が一塩基多型である、〔1〕に記載の
検査方法、〔3〕 グルココルチコイド受容体遺伝子の
多型が、グルココルチコイド受容体の643番目のアミ
ノ酸変異をもたらすものである、〔1〕に記載の検査方
法、〔4〕 グルココルチコイド受容体遺伝子の多型
が、グルココルチコイド受容体の643番目のアミノ酸
変異をもたらす多型、および該受容体の772〜777
番目のアミノ酸変異をもたらす多型である、〔1〕に記
載の検査方法、〔5〕 グルココルチコイド受容体の6
43番目のアミノ酸変異が、システインからアルギニン
への変異である、〔3〕または〔4〕に記載の検査方
法、〔6〕 グルココルチコイド受容体の643番目の
アミノ酸変異をもたらす該受容体遺伝子の多型が、該遺
伝子のcDNA配列において1927番目の塩基部位の
多型である、〔3〕または〔4〕に記載の検査方法、
〔7〕 グルココルチコイド受容体遺伝子のcDNA配
列において1927番目の塩基部位の多型が、チミンか
らシトシンへの変異である、〔6〕に記載の検査方法、
〔8〕 グルココルチコイド受容体の772〜777番
目のアミノ酸変異をもたらす該受容体遺伝子の多型が、
該遺伝子のcDNA配列において2314番目の塩基部
位の多型である、〔4〕に記載の検査方法、
ルチコイド製剤の有効性の検査方法、および、グルココ
ルチコイド製剤の有効性を検査するための試薬に関し、
より具体的には、〔1〕 被検者におけるグルココルチ
コイド製剤の有効性の検査方法であって、グルココルチ
コイド受容体のグルココルチコイド結合能を低下させ
る、または該受容体の有する転写活性化能を低下させる
グルココルチコイド受容体遺伝子の多型を検出する工程
を含み、多型が検出された場合に、被検者はグルココル
チコイド製剤に対して耐性であると判定される検査方
法、〔2〕 多型が一塩基多型である、〔1〕に記載の
検査方法、〔3〕 グルココルチコイド受容体遺伝子の
多型が、グルココルチコイド受容体の643番目のアミ
ノ酸変異をもたらすものである、〔1〕に記載の検査方
法、〔4〕 グルココルチコイド受容体遺伝子の多型
が、グルココルチコイド受容体の643番目のアミノ酸
変異をもたらす多型、および該受容体の772〜777
番目のアミノ酸変異をもたらす多型である、〔1〕に記
載の検査方法、〔5〕 グルココルチコイド受容体の6
43番目のアミノ酸変異が、システインからアルギニン
への変異である、〔3〕または〔4〕に記載の検査方
法、〔6〕 グルココルチコイド受容体の643番目の
アミノ酸変異をもたらす該受容体遺伝子の多型が、該遺
伝子のcDNA配列において1927番目の塩基部位の
多型である、〔3〕または〔4〕に記載の検査方法、
〔7〕 グルココルチコイド受容体遺伝子のcDNA配
列において1927番目の塩基部位の多型が、チミンか
らシトシンへの変異である、〔6〕に記載の検査方法、
〔8〕 グルココルチコイド受容体の772〜777番
目のアミノ酸変異をもたらす該受容体遺伝子の多型が、
該遺伝子のcDNA配列において2314番目の塩基部
位の多型である、〔4〕に記載の検査方法、
〔9〕 グ
ルココルチコイド受容体遺伝子のcDNA配列において
2314番目の塩基部位の多型が、該部位への一塩基挿
入変異である、〔8〕に記載の検査方法、〔10〕 グ
ルココルチコイド結合能が、デキサメゾン結合能であ
る、〔1〕〜
ルココルチコイド受容体遺伝子のcDNA配列において
2314番目の塩基部位の多型が、該部位への一塩基挿
入変異である、〔8〕に記載の検査方法、〔10〕 グ
ルココルチコイド結合能が、デキサメゾン結合能であ
る、〔1〕〜
〔9〕のいずれかに記載の検査方法、〔1
1〕 以下の(a)〜(d)の工程を含む、〔1〕〜
〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを単離する工程 (c)単離したDNAの塩基配列を決定する工程 (d)工程(c)により決定したDNAの塩基配列を、
対照と比較する工程 〔12〕 以下の(a)〜(d)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)調製したDNA試料を制限酵素により切断する工
程 (c)DNA断片をその大きさに応じて分離する工程 (d)検出されたDNA断片の大きさを、対照と比較す
る工程 〔13〕 以下の(a)〜(e)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを制限酵素により切断する工程 (d)DNA断片をその大きさに応じて分離する工程 (e)検出されたDNA断片の大きさを、対照と比較す
る工程 〔14〕 以下の(a)〜(e)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを一本鎖DNAに解離させる工程 (d)解離させた一本鎖DNAを非変性ゲル上で分離す
る工程 (e)分離した一本鎖DNAのゲル上での移動度を対照
と比較する工程 〔15〕 以下の(a)〜(d)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを、DNA変性剤の濃度が次第に
高まるゲル上で分離する工程 (d)分離したDNAのゲル上での移動度を対照と比較
する工程 〔16〕 以下の(a)〜(c)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)(i)被検者から調製したグルココルチコイド受
容体遺伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子
のcDNA配列において1927番目の塩基部位を含
む、または1927番目および2314番目の塩基部位
を含むDNA、および (ii)ヌクレオチドプローブが固定された基板、を提
供する工程 (b)工程(a)(i)のDNAと工程(a)(ii)
の基板を接触させる工程 (c)該DNAと該基板に固定されたヌクレオチドプロ
ーブとのハイブリダイズの強度を検出することにより、
グルココルチコイド受容体をコードする遺伝子における
多型を検出する工程 〔17〕 グルココルチコイド受容体遺伝子における多
型部位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列におい
て1927番目の多型部位を含む、少なくとも15ヌク
レオチドの鎖長を有するポリヌクレオチド、〔18〕
多型部位の塩基がシトシン(C)である、〔17〕記載
のポリヌクレオチド、〔19〕 グルココルチコイド受
容体遺伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子
のcDNA配列において1927番目の塩基部位を含む
DNAにハイブリダイズし、少なくとも15ヌクレオチ
ドの鎖長を有するポリヌクレオチドを含む、グルココル
チコイド製剤の有効性を検査するための試薬、〔20〕
さらに、グルココルチコイド受容体遺伝子における塩
基部位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列におい
て2314番目の塩基部位を含むDNAにハイブリダイ
ズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長を有するポリ
ヌクレオチドを含む、〔19〕に記載の試薬、〔21〕
グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部位で
あって、該受容体遺伝子のcDNA配列において192
7番目の塩基部位を含むDNAを増幅するように設計さ
れたフォワードプライマー、およびリバースプライマー
を含む、グルココルチコイド製剤の有効性を検査するた
めの試薬、〔22〕 さらに、グルココルチコイド受容
体遺伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子の
cDNA配列において2314番目の塩基部位を含むD
NAを増幅するように設計されたフォワードプライマー
およびリバースプライマーを含む、〔21〕に記載の試
薬、を提供するものである。
1〕 以下の(a)〜(d)の工程を含む、〔1〕〜
〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを単離する工程 (c)単離したDNAの塩基配列を決定する工程 (d)工程(c)により決定したDNAの塩基配列を、
対照と比較する工程 〔12〕 以下の(a)〜(d)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)調製したDNA試料を制限酵素により切断する工
程 (c)DNA断片をその大きさに応じて分離する工程 (d)検出されたDNA断片の大きさを、対照と比較す
る工程 〔13〕 以下の(a)〜(e)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを制限酵素により切断する工程 (d)DNA断片をその大きさに応じて分離する工程 (e)検出されたDNA断片の大きさを、対照と比較す
る工程 〔14〕 以下の(a)〜(e)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを一本鎖DNAに解離させる工程 (d)解離させた一本鎖DNAを非変性ゲル上で分離す
る工程 (e)分離した一本鎖DNAのゲル上での移動度を対照
と比較する工程 〔15〕 以下の(a)〜(d)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを、DNA変性剤の濃度が次第に
高まるゲル上で分離する工程 (d)分離したDNAのゲル上での移動度を対照と比較
する工程 〔16〕 以下の(a)〜(c)の工程を含む、〔1〕
〜〔10〕のいずれかに記載の検査方法、 (a)(i)被検者から調製したグルココルチコイド受
容体遺伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子
のcDNA配列において1927番目の塩基部位を含
む、または1927番目および2314番目の塩基部位
を含むDNA、および (ii)ヌクレオチドプローブが固定された基板、を提
供する工程 (b)工程(a)(i)のDNAと工程(a)(ii)
の基板を接触させる工程 (c)該DNAと該基板に固定されたヌクレオチドプロ
ーブとのハイブリダイズの強度を検出することにより、
グルココルチコイド受容体をコードする遺伝子における
多型を検出する工程 〔17〕 グルココルチコイド受容体遺伝子における多
型部位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列におい
て1927番目の多型部位を含む、少なくとも15ヌク
レオチドの鎖長を有するポリヌクレオチド、〔18〕
多型部位の塩基がシトシン(C)である、〔17〕記載
のポリヌクレオチド、〔19〕 グルココルチコイド受
容体遺伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子
のcDNA配列において1927番目の塩基部位を含む
DNAにハイブリダイズし、少なくとも15ヌクレオチ
ドの鎖長を有するポリヌクレオチドを含む、グルココル
チコイド製剤の有効性を検査するための試薬、〔20〕
さらに、グルココルチコイド受容体遺伝子における塩
基部位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列におい
て2314番目の塩基部位を含むDNAにハイブリダイ
ズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長を有するポリ
ヌクレオチドを含む、〔19〕に記載の試薬、〔21〕
グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部位で
あって、該受容体遺伝子のcDNA配列において192
7番目の塩基部位を含むDNAを増幅するように設計さ
れたフォワードプライマー、およびリバースプライマー
を含む、グルココルチコイド製剤の有効性を検査するた
めの試薬、〔22〕 さらに、グルココルチコイド受容
体遺伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子の
cDNA配列において2314番目の塩基部位を含むD
NAを増幅するように設計されたフォワードプライマー
およびリバースプライマーを含む、〔21〕に記載の試
薬、を提供するものである。
【0011】
【発明の実施の形態】本発明者らにより、グルココルチ
コイド受容体(GR)のグルココルチコイド結合能を低下
させる、またはGRの転写活性可能を低下させる、GRにお
けるアミノ酸変異が見出された。より具体的には、本発
明者らは、グルココルチコイド受容体(GR)遺伝子(Ge
nBank Accession番号: NM 000176)のcDNA配列におい
て、1927番目の塩基TがCへ置換された、または、2313番
目の塩基と2314番目の塩基の間にAが挿入されたことに
より、それぞれ、643番目のアミノ酸残基がシステイン
からアルギニンへアミノ酸残基が置換された、または、
ロイシン-772からリジン-777までのアミノ酸残基が別の
26アミノ酸残基に置換されたGRを見出した(それぞれ、
「C643R変異型GR」および「2314 ins-a変異型GR」と記
載する)。該C643R変異型GRおよび該2314 ins-a変異型G
Rの転写活性は抑制されており、さらに、該C643R変異型
GRのグルココルチコイドに対する結合親和性は低いこと
が判明した。従って、上記変異について検査することに
より、グルココルチコイド製剤を投与する前に、グルコ
コルチコイド製剤の有効性を予測することが可能であ
る。本発明は、このような知見に基づくものである。な
お、本発明においては、野生型GR遺伝子、C643R変異型G
R遺伝子および2314 ins-a変異型GR遺伝子のcDNA配列
を、それぞれ配列番号:1、配列番号:3および配列番
号:5に記載する。また、野生型GR、C643R変異型GRお
よび2314 ins-a変異型GRのアミノ酸配列を、それぞれ配
列番号:2、配列番号:4および配列番号:6に記載す
る。
コイド受容体(GR)のグルココルチコイド結合能を低下
させる、またはGRの転写活性可能を低下させる、GRにお
けるアミノ酸変異が見出された。より具体的には、本発
明者らは、グルココルチコイド受容体(GR)遺伝子(Ge
nBank Accession番号: NM 000176)のcDNA配列におい
て、1927番目の塩基TがCへ置換された、または、2313番
目の塩基と2314番目の塩基の間にAが挿入されたことに
より、それぞれ、643番目のアミノ酸残基がシステイン
からアルギニンへアミノ酸残基が置換された、または、
ロイシン-772からリジン-777までのアミノ酸残基が別の
26アミノ酸残基に置換されたGRを見出した(それぞれ、
「C643R変異型GR」および「2314 ins-a変異型GR」と記
載する)。該C643R変異型GRおよび該2314 ins-a変異型G
Rの転写活性は抑制されており、さらに、該C643R変異型
GRのグルココルチコイドに対する結合親和性は低いこと
が判明した。従って、上記変異について検査することに
より、グルココルチコイド製剤を投与する前に、グルコ
コルチコイド製剤の有効性を予測することが可能であ
る。本発明は、このような知見に基づくものである。な
お、本発明においては、野生型GR遺伝子、C643R変異型G
R遺伝子および2314 ins-a変異型GR遺伝子のcDNA配列
を、それぞれ配列番号:1、配列番号:3および配列番
号:5に記載する。また、野生型GR、C643R変異型GRお
よび2314 ins-a変異型GRのアミノ酸配列を、それぞれ配
列番号:2、配列番号:4および配列番号:6に記載す
る。
【0012】本発明は、被検者におけるグルココルチコ
イド製剤の有効性の検査方法であって、GRのグルココル
チコイド結合能を低下させる、または該GRの有する転写
活性化能を低下させるGR遺伝子の多型を検出する工程を
含み、多型が検出された場合に、被検者はグルココルチ
コイド製剤に対して耐性であると判定される検査方法を
提供する。
イド製剤の有効性の検査方法であって、GRのグルココル
チコイド結合能を低下させる、または該GRの有する転写
活性化能を低下させるGR遺伝子の多型を検出する工程を
含み、多型が検出された場合に、被検者はグルココルチ
コイド製剤に対して耐性であると判定される検査方法を
提供する。
【0013】本発明において、グルココルチコイド受容
体(GR)とは、グルココルチコイドをリガンドとする核内
スーパーファミリーに属する受容体であり、リガンドに
依存的に転写を促進または抑制する転写制御因子であ
る。
体(GR)とは、グルココルチコイドをリガンドとする核内
スーパーファミリーに属する受容体であり、リガンドに
依存的に転写を促進または抑制する転写制御因子であ
る。
【0014】多型とは、遺伝学的には、人口中1%以上
の頻度で存在している1遺伝子におけるある塩基の変化
と一般的に定義される。しかしながら、本発明の「多
型」はこの定義に制限されず、1%未満の塩基の変化で
あっても本発明の「多型」に含まれる。本発明における
多型の種類としては、例えば、一塩基多型(SNP)から
数十塩基が欠失、置換あるいは挿入されている多型等が
挙げられるが、これらに制限されるものではない。
の頻度で存在している1遺伝子におけるある塩基の変化
と一般的に定義される。しかしながら、本発明の「多
型」はこの定義に制限されず、1%未満の塩基の変化で
あっても本発明の「多型」に含まれる。本発明における
多型の種類としては、例えば、一塩基多型(SNP)から
数十塩基が欠失、置換あるいは挿入されている多型等が
挙げられるが、これらに制限されるものではない。
【0015】本発明における多型として、例えば、GRの
643番目のアミノ酸変異(好ましくはシステインからア
ルギニンへの変異)をもたらす多型であり、具体的に
は、GR遺伝子のcDNA配列において1927番目の塩基変異
(好ましくはチミンからシトシンへの変異)を示すこと
ができるが、GRの643番目のアミノ酸変異を引き起こす
ような変異であれば、上記の変異に必ずしも限定されな
い。また、本発明の多型として、GRの772〜777番目のア
ミノ酸変異(好ましくは別のアミノ酸残基への置換変
異)をもたらす多型を挙げることができる。具体的には
GR遺伝子のcDNA配列において2314番目の塩基変異(好ま
しくは2313番目と2314番目の塩基の間への一塩基挿入変
異、より好ましくは2313番目と2314番目の塩基の間への
アデニンの挿入変異)を示すことができるが、野生型GR
の772〜777番目のアミノ酸を欠失もしくは別のアミノ酸
へ置換し得るようなGR遺伝子上の変異であれば、上記の
変異に特に制限されない。また本発明においては、上記
の多型に加えて、GR遺伝子上に別の多型(遺伝子変異)
が存在していてもよい。
643番目のアミノ酸変異(好ましくはシステインからア
ルギニンへの変異)をもたらす多型であり、具体的に
は、GR遺伝子のcDNA配列において1927番目の塩基変異
(好ましくはチミンからシトシンへの変異)を示すこと
ができるが、GRの643番目のアミノ酸変異を引き起こす
ような変異であれば、上記の変異に必ずしも限定されな
い。また、本発明の多型として、GRの772〜777番目のア
ミノ酸変異(好ましくは別のアミノ酸残基への置換変
異)をもたらす多型を挙げることができる。具体的には
GR遺伝子のcDNA配列において2314番目の塩基変異(好ま
しくは2313番目と2314番目の塩基の間への一塩基挿入変
異、より好ましくは2313番目と2314番目の塩基の間への
アデニンの挿入変異)を示すことができるが、野生型GR
の772〜777番目のアミノ酸を欠失もしくは別のアミノ酸
へ置換し得るようなGR遺伝子上の変異であれば、上記の
変異に特に制限されない。また本発明においては、上記
の多型に加えて、GR遺伝子上に別の多型(遺伝子変異)
が存在していてもよい。
【0016】本発明においては、GRの643番目のアミノ
酸変異をもたらす多型、またはGRの772〜777番目のアミ
ノ酸変異をもたらす多型を検出することにより、グルコ
コルチコイド製剤の有効性の検査を行うが、より好まし
い態様においては、GRの643番目のアミノ酸変異をもた
らす多型および772〜777番目のアミノ酸変異をもたらす
多型の両方について検出を行うことにより、より精度の
高い、グルココルチコイド製剤の有効性の検査が可能で
ある。
酸変異をもたらす多型、またはGRの772〜777番目のアミ
ノ酸変異をもたらす多型を検出することにより、グルコ
コルチコイド製剤の有効性の検査を行うが、より好まし
い態様においては、GRの643番目のアミノ酸変異をもた
らす多型および772〜777番目のアミノ酸変異をもたらす
多型の両方について検出を行うことにより、より精度の
高い、グルココルチコイド製剤の有効性の検査が可能で
ある。
【0017】本発明において「グルココルチコイド結合
能」とは、GRとグルココルチコイドとの結合活性を指
す。この結合活性は、当業者においては、受容体とリガ
ンドとの結合活性を測定できる一般的な方法により行う
ことができる。例えば、上記結合活性の測定は、GRとデ
キサメサゾンとの結合活性を調べることにより行うこと
ができる。デキサメサゾンとはグルココルチコイドの一
種で、皮膚炎や血管炎等の炎症、リンパ腫、白血病等の
治療に一般的に用いられる化合物である。デキサメサゾ
ンとの結合活性は、例えば、被検GR遺伝子でトランスフ
ェクションしたCOS-7細胞の細胞質画分における3H-デキ
サメサゾンへの結合親和性をスキャッチャードプロット
解析することにより行うことができる。より具体的に
は、後述の実施例で示される方法により行うことができ
るが、特にこの方法に制限されない。
能」とは、GRとグルココルチコイドとの結合活性を指
す。この結合活性は、当業者においては、受容体とリガ
ンドとの結合活性を測定できる一般的な方法により行う
ことができる。例えば、上記結合活性の測定は、GRとデ
キサメサゾンとの結合活性を調べることにより行うこと
ができる。デキサメサゾンとはグルココルチコイドの一
種で、皮膚炎や血管炎等の炎症、リンパ腫、白血病等の
治療に一般的に用いられる化合物である。デキサメサゾ
ンとの結合活性は、例えば、被検GR遺伝子でトランスフ
ェクションしたCOS-7細胞の細胞質画分における3H-デキ
サメサゾンへの結合親和性をスキャッチャードプロット
解析することにより行うことができる。より具体的に
は、後述の実施例で示される方法により行うことができ
るが、特にこの方法に制限されない。
【0018】また、GRの有する転写活性化能は、当業者
においては、一般的なレポーターアッセイにより測定す
ることができる。例えば、GRに対する結合配列を有する
レポーター遺伝子を細胞へ導入し、GRの結合によって発
現されるレポーター産物の量を測定することにより行う
ことができる。より具体的には、後述の実施例で示され
る方法により行うことが可能である。
においては、一般的なレポーターアッセイにより測定す
ることができる。例えば、GRに対する結合配列を有する
レポーター遺伝子を細胞へ導入し、GRの結合によって発
現されるレポーター産物の量を測定することにより行う
ことができる。より具体的には、後述の実施例で示され
る方法により行うことが可能である。
【0019】本発明において、グルココルチコイド製剤
とは、グルココルチコイドを有効成分として含む医薬組
成物を意味する。通常、上記グルココルチコイド製剤
は、炎症抑制や白血病細胞死などの薬理作用を有する。
該製剤の作用機序は、まず、細胞質にあるGRに結合し、
次いで、グルココルチコイド製剤が結合したGRが遺伝子
の上流領域または他の転写因子タンパク質に結合する。
これにより、遺伝子群の転写活性化または転写の抑制が
起こり薬理作用がもたらされる。
とは、グルココルチコイドを有効成分として含む医薬組
成物を意味する。通常、上記グルココルチコイド製剤
は、炎症抑制や白血病細胞死などの薬理作用を有する。
該製剤の作用機序は、まず、細胞質にあるGRに結合し、
次いで、グルココルチコイド製剤が結合したGRが遺伝子
の上流領域または他の転写因子タンパク質に結合する。
これにより、遺伝子群の転写活性化または転写の抑制が
起こり薬理作用がもたらされる。
【0020】本発明において、「グルココルチコイド製
剤に対して耐性である」とは、被検者においてグルココ
ルチコイド製剤の薬理効果が見られない、もしくは抑制
された状態をいう。本発明において「抑制」とは、完全
な抑制に限定されず、対照(通常、健常人)と比較して
抑制されていれば、上記「抑制」の意味に解される。例
えば、本発明の検査方法によって、ある被検者について
グルココルチコイド製剤に対して耐性であると判定され
た場合には、該被検者へのグルココルチコイド製剤の投
与による治療効果は見られない、もしくは低いものと予
想することができる。本発明の方法によって得られた被
検者についてのグルココルチコイド製剤の有効性に関す
る情報によって、該被検者に対する治療方針等を適宜決
定することが可能である。
剤に対して耐性である」とは、被検者においてグルココ
ルチコイド製剤の薬理効果が見られない、もしくは抑制
された状態をいう。本発明において「抑制」とは、完全
な抑制に限定されず、対照(通常、健常人)と比較して
抑制されていれば、上記「抑制」の意味に解される。例
えば、本発明の検査方法によって、ある被検者について
グルココルチコイド製剤に対して耐性であると判定され
た場合には、該被検者へのグルココルチコイド製剤の投
与による治療効果は見られない、もしくは低いものと予
想することができる。本発明の方法によって得られた被
検者についてのグルココルチコイド製剤の有効性に関す
る情報によって、該被検者に対する治療方針等を適宜決
定することが可能である。
【0021】本発明の検査方法において、GR遺伝子に生
じた多型の検出は、例えば、被検者のGR遺伝子の塩基配
列を直接決定することにより行うことができる。この方
法においてはまず、被検者からDNA試料を調製する。DNA
試料は、例えば被検者の末梢血白血球、皮膚、口腔粘膜
等の組織または細胞、涙、唾液、尿、糞便または毛髪か
ら抽出した染色体DNA、あるいはRNAを基に調製すること
ができる。
じた多型の検出は、例えば、被検者のGR遺伝子の塩基配
列を直接決定することにより行うことができる。この方
法においてはまず、被検者からDNA試料を調製する。DNA
試料は、例えば被検者の末梢血白血球、皮膚、口腔粘膜
等の組織または細胞、涙、唾液、尿、糞便または毛髪か
ら抽出した染色体DNA、あるいはRNAを基に調製すること
ができる。
【0022】本方法においては、次いで、GR遺伝子にお
ける塩基部位であって、該遺伝子のcDNA配列において19
27番目の塩基部位または1927番目および2314番目の塩基
部位を含むDNAを単離する。該DNAの単離は、例えば、GR
遺伝子にハイブリダイズするプライマーを用いて、染色
体DNA、あるいはRNAを鋳型としたPCR等によって行うこ
とができる。本方法においては、次いで、単離したDNA
の塩基配列を決定する。単離したDNAの塩基配列の決定
は、当業者においては周知の方法により実施することが
できる。
ける塩基部位であって、該遺伝子のcDNA配列において19
27番目の塩基部位または1927番目および2314番目の塩基
部位を含むDNAを単離する。該DNAの単離は、例えば、GR
遺伝子にハイブリダイズするプライマーを用いて、染色
体DNA、あるいはRNAを鋳型としたPCR等によって行うこ
とができる。本方法においては、次いで、単離したDNA
の塩基配列を決定する。単離したDNAの塩基配列の決定
は、当業者においては周知の方法により実施することが
できる。
【0023】本方法においては、次いで、決定したDNA
の塩基配列を、対照と比較する。本方法における対照と
は、通常、正常な(野生型)GR遺伝子の配列を言う。一
般に健常人のGR遺伝子の配列は正常であるものと考えら
れることから、上記工程の「対照と比較する」とは、通
常、健常人のGR遺伝子の配列と比較することを意味する
が、GenBankに野生型として登録されているGR遺伝子の
配列(GenBank Accession番号: NM 000176)と比較して
もよい。
の塩基配列を、対照と比較する。本方法における対照と
は、通常、正常な(野生型)GR遺伝子の配列を言う。一
般に健常人のGR遺伝子の配列は正常であるものと考えら
れることから、上記工程の「対照と比較する」とは、通
常、健常人のGR遺伝子の配列と比較することを意味する
が、GenBankに野生型として登録されているGR遺伝子の
配列(GenBank Accession番号: NM 000176)と比較して
もよい。
【0024】本発明の検査方法は、上記のように直接被
検者由来のDNAの塩基配列を決定する方法以外に、多型
の検出が可能な種々の方法によって行うことができる。
検者由来のDNAの塩基配列を決定する方法以外に、多型
の検出が可能な種々の方法によって行うことができる。
【0025】例えば、本発明における多型の検出は、以
下のような方法によっても行うことができる。まず、被
検者からDNA試料を調製する。次いで、調製したDNA試料
を制限酵素により切断する。次いで、DNA断片をその大
きさに応じて分離する。次いで、検出されたDNA断片の
大きさを、対照と比較する。また、他の一つの態様にお
いては、まず、被検者からDNA試料を調製する。次い
で、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcD
NA配列において1927番目の塩基部位、または1927番目お
よび2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する。さら
に、増幅したDNAを制限酵素により切断する。次いで、D
NA断片をその大きさに応じて分離する。次いで、検出さ
れたDNA断片の大きさを、対照と比較する。
下のような方法によっても行うことができる。まず、被
検者からDNA試料を調製する。次いで、調製したDNA試料
を制限酵素により切断する。次いで、DNA断片をその大
きさに応じて分離する。次いで、検出されたDNA断片の
大きさを、対照と比較する。また、他の一つの態様にお
いては、まず、被検者からDNA試料を調製する。次い
で、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcD
NA配列において1927番目の塩基部位、または1927番目お
よび2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する。さら
に、増幅したDNAを制限酵素により切断する。次いで、D
NA断片をその大きさに応じて分離する。次いで、検出さ
れたDNA断片の大きさを、対照と比較する。
【0026】このような方法としては、例えば、制限酵
素断片長多型(Restriction Fragment Length Polymorp
hism/RFLP)を利用した方法やPCR-RFLP法等が挙げられ
る。具体的には、制限酵素の認識部位に変異が存在する
場合、あるいは制限酵素処理によって生じるDNA断片内
に塩基挿入または欠失がある場合、制限酵素処理後に生
じる断片の大きさが対照と比較して変化する。この変異
を含む部分をPCR法によって増幅し、それぞれの制限酵
素で処理することによって、これらの変異を電気泳動後
のバンドの移動度の差として検出することができる。あ
るいは、染色体DNAをこれらの制限酵素によって処理
し、電気泳動した後、本発明のプローブDNAを用いてサ
ザンブロッティングを行うことにより、変異の有無を検
出することができる。用いられる制限酵素は、それぞれ
の変異に応じて適宜選択することができる。この方法で
は、ゲノムDNA以外にも被検者から調製したRNAを逆転写
酵素でcDNAにし、これをそのまま制限酵素で切断した
後、サザンブロッティングを行うことも可能である。ま
た、このcDNAを鋳型としてPCRでGR遺伝子を含むDNAを増
幅し、それを制限酵素で切断した後、移動度の差を調べ
ることも可能である。
素断片長多型(Restriction Fragment Length Polymorp
hism/RFLP)を利用した方法やPCR-RFLP法等が挙げられ
る。具体的には、制限酵素の認識部位に変異が存在する
場合、あるいは制限酵素処理によって生じるDNA断片内
に塩基挿入または欠失がある場合、制限酵素処理後に生
じる断片の大きさが対照と比較して変化する。この変異
を含む部分をPCR法によって増幅し、それぞれの制限酵
素で処理することによって、これらの変異を電気泳動後
のバンドの移動度の差として検出することができる。あ
るいは、染色体DNAをこれらの制限酵素によって処理
し、電気泳動した後、本発明のプローブDNAを用いてサ
ザンブロッティングを行うことにより、変異の有無を検
出することができる。用いられる制限酵素は、それぞれ
の変異に応じて適宜選択することができる。この方法で
は、ゲノムDNA以外にも被検者から調製したRNAを逆転写
酵素でcDNAにし、これをそのまま制限酵素で切断した
後、サザンブロッティングを行うことも可能である。ま
た、このcDNAを鋳型としてPCRでGR遺伝子を含むDNAを増
幅し、それを制限酵素で切断した後、移動度の差を調べ
ることも可能である。
【0027】さらに別の方法においては、まず、被検者
からDNA試料を調製する。次いで、GR遺伝子における塩
基部位であって、該遺伝子のcDNA配列において1927番目
の塩基部位、または1927番目および2314番目の塩基部位
を含むDNAを増幅する。さらに、増幅したDNAを一本鎖DN
Aに解離させる。次いで、解離させた一本鎖DNAを非変性
ゲル上で分離する。分離した一本鎖DNAのゲル上での移
動度を対照と比較する。
からDNA試料を調製する。次いで、GR遺伝子における塩
基部位であって、該遺伝子のcDNA配列において1927番目
の塩基部位、または1927番目および2314番目の塩基部位
を含むDNAを増幅する。さらに、増幅したDNAを一本鎖DN
Aに解離させる。次いで、解離させた一本鎖DNAを非変性
ゲル上で分離する。分離した一本鎖DNAのゲル上での移
動度を対照と比較する。
【0028】該方法としては、例えばPCR-SSCP(single-
strand conformation polymorphism、一本鎖高次構造多
型)法(Cloning and polymerase chain reaction-single
-strand conformation polymorphism analysis of anon
ymous Alu repeats on chromosome 11. Genomics. 1992
Jan 1; 12(1): 139-146.、Detection of p53 gene mut
ations in human brain tumors by single-strand conf
ormation polymorphism analysis of polymerase chain
reaction products. Oncogene. 1991 Aug 1;6(8): 131
3-1318.、Multiple fluorescence-based PCR-SSCP anal
ysis with postlabeling.、PCR Methods Appl. 1995 Ap
r 1; 4(5): 275-282.)が挙げられる。この方法は操作が
比較的簡便であり、また被検試料の量も少なくて済む等
の利点を有するため、特に多数のDNA試料をスクリーニ
ングするのに好適である。その原理は次の通りである。
二本鎖DNA断片を一本鎖に解離すると、各鎖はその塩基
配列に依存した独自の高次構造を形成する。この解離し
たDNA鎖を、変性剤を含まないポリアクリルアミドゲル
中で電気泳動すると、それぞれの高次構造の差に応じ
て、相補的な同じ鎖長の一本鎖DNAが異なる位置に移動
する。一塩基の置換によってもこの一本鎖DNAの高次構
造は変化し、ポリアクリルアミドゲル電気泳動において
異なる移動度を示す。従って、この移動度の変化を検出
することによりDNA断片に点突然変異や欠失、あるいは
挿入等による変異が存在することを検出することができ
る。
strand conformation polymorphism、一本鎖高次構造多
型)法(Cloning and polymerase chain reaction-single
-strand conformation polymorphism analysis of anon
ymous Alu repeats on chromosome 11. Genomics. 1992
Jan 1; 12(1): 139-146.、Detection of p53 gene mut
ations in human brain tumors by single-strand conf
ormation polymorphism analysis of polymerase chain
reaction products. Oncogene. 1991 Aug 1;6(8): 131
3-1318.、Multiple fluorescence-based PCR-SSCP anal
ysis with postlabeling.、PCR Methods Appl. 1995 Ap
r 1; 4(5): 275-282.)が挙げられる。この方法は操作が
比較的簡便であり、また被検試料の量も少なくて済む等
の利点を有するため、特に多数のDNA試料をスクリーニ
ングするのに好適である。その原理は次の通りである。
二本鎖DNA断片を一本鎖に解離すると、各鎖はその塩基
配列に依存した独自の高次構造を形成する。この解離し
たDNA鎖を、変性剤を含まないポリアクリルアミドゲル
中で電気泳動すると、それぞれの高次構造の差に応じ
て、相補的な同じ鎖長の一本鎖DNAが異なる位置に移動
する。一塩基の置換によってもこの一本鎖DNAの高次構
造は変化し、ポリアクリルアミドゲル電気泳動において
異なる移動度を示す。従って、この移動度の変化を検出
することによりDNA断片に点突然変異や欠失、あるいは
挿入等による変異が存在することを検出することができ
る。
【0029】具体的には、まず、GR遺伝子を含むDNAをP
CR法等によって増幅する。増幅される範囲としては、通
常200〜400bp程度の長さが好ましい。PCRは、当業者に
おいては反応条件等を適宜選択して行うことができる。
PCRの際に、32P等のアイソトープ、蛍光色素、またはビ
オチン等によって標識したプライマーを用いることによ
り、増幅DNA産物を標識することができる。あるいはPCR
反応液に32P等のアイソトープ、蛍光色素、またはビオ
チン等によって標識された基質塩基を加えてPCRを行う
ことにより、増幅DNA産物を標識することも可能であ
る。さらに、PCR反応後にクレノウ酵素等を用いて、32P
等のアイソトープ、蛍光色素、またはビオチン等によっ
て標識された基質塩基を、増幅DNA断片に付加すること
によっても標識を行うことができる。こうして得られた
標識DNA断片を、熱を加えること等により変性させ、尿
素などの変性剤を含まないポリアクリルアミドゲルによ
って電気泳動を行う。この際、ポリアクリルアミドゲル
に適量(5から10%程度)のグリセロールを添加するこ
とにより、DNA断片の分離の条件を改善することができ
る。また、泳動条件は各DNA断片の性質により変動する
が、通常、室温(20から25℃)で行い、好ましい分離が
得られないときには4から30℃までの温度で最適の移動
度を与える温度の検討を行う。電気泳動後、DNA断片の
移動度を、X線フィルムを用いたオートラジオグラフィ
ーや、蛍光を検出するスキャナー等で検出し、解析を行
う。移動度に差があるバンドが検出された場合、このバ
ンドを直接ゲルから切り出し、PCRによって再度増幅
し、それを直接シークエンシングすることにより、変異
の存在を確認することができる。また、標識したDNAを
使わない場合においても、電気泳動後のゲルをエチジウ
ムブロマイドや銀染色法などによって染色することによ
って、バンドを検出することができる。
CR法等によって増幅する。増幅される範囲としては、通
常200〜400bp程度の長さが好ましい。PCRは、当業者に
おいては反応条件等を適宜選択して行うことができる。
PCRの際に、32P等のアイソトープ、蛍光色素、またはビ
オチン等によって標識したプライマーを用いることによ
り、増幅DNA産物を標識することができる。あるいはPCR
反応液に32P等のアイソトープ、蛍光色素、またはビオ
チン等によって標識された基質塩基を加えてPCRを行う
ことにより、増幅DNA産物を標識することも可能であ
る。さらに、PCR反応後にクレノウ酵素等を用いて、32P
等のアイソトープ、蛍光色素、またはビオチン等によっ
て標識された基質塩基を、増幅DNA断片に付加すること
によっても標識を行うことができる。こうして得られた
標識DNA断片を、熱を加えること等により変性させ、尿
素などの変性剤を含まないポリアクリルアミドゲルによ
って電気泳動を行う。この際、ポリアクリルアミドゲル
に適量(5から10%程度)のグリセロールを添加するこ
とにより、DNA断片の分離の条件を改善することができ
る。また、泳動条件は各DNA断片の性質により変動する
が、通常、室温(20から25℃)で行い、好ましい分離が
得られないときには4から30℃までの温度で最適の移動
度を与える温度の検討を行う。電気泳動後、DNA断片の
移動度を、X線フィルムを用いたオートラジオグラフィ
ーや、蛍光を検出するスキャナー等で検出し、解析を行
う。移動度に差があるバンドが検出された場合、このバ
ンドを直接ゲルから切り出し、PCRによって再度増幅
し、それを直接シークエンシングすることにより、変異
の存在を確認することができる。また、標識したDNAを
使わない場合においても、電気泳動後のゲルをエチジウ
ムブロマイドや銀染色法などによって染色することによ
って、バンドを検出することができる。
【0030】さらに別の方法は、まず、被検者からDNA
試料を調製する。次いで、GR遺伝子における塩基部位で
あって、該遺伝子のcDNA配列において1927番目の塩基部
位、または1927番目および2314番目の塩基部位を含むDN
Aを増幅する。さらに、増幅したDNAを、DNA変性剤の濃
度が次第に高まるゲル上で分離する。次いで、分離した
DNAのゲル上での移動度を対照と比較する。
試料を調製する。次いで、GR遺伝子における塩基部位で
あって、該遺伝子のcDNA配列において1927番目の塩基部
位、または1927番目および2314番目の塩基部位を含むDN
Aを増幅する。さらに、増幅したDNAを、DNA変性剤の濃
度が次第に高まるゲル上で分離する。次いで、分離した
DNAのゲル上での移動度を対照と比較する。
【0031】このような方法としては、例えば、変性剤
濃度勾配ゲル(denaturant gradient gel electrophore
sis: DGGE法)等を例示することができる。DGGE法は、
変性剤の濃度勾配のあるポリアクリルアミドゲル中で、
DNA断片の混合物を泳動し、それぞれの不安定性の違い
によってDNA断片を分離する方法である。ミスマッチの
ある不安定なDNA断片が、ゲル中のある変性剤濃度の部
分まで移動すると、ミスマッチ周辺のDNA配列はその不
安定さのために、部分的に1本鎖へと解離する。この部
分的に解離したDNA断片の移動度は、非常に遅くなり、
解離部分のない完全な二本鎖DNAの移動度と差がつくこ
とから、両者を分離することができる。具体的には、GR
遺伝子を含むDNAを本発明のプライマー等を用いたPCR法
等によって増幅し、これを尿素などの変性剤の濃度が移
動するに従って徐々に高くなっているポリアクリルアミ
ドゲル中で電気泳動し、対照と比較する。変異が存在す
るDNA断片の場合、より低い変性剤濃度位置でDNA断片が
一本鎖になり、極端に移動速度が遅くなるため、この移
動度の差を検出することにより変異の有無を検出するこ
とができる。
濃度勾配ゲル(denaturant gradient gel electrophore
sis: DGGE法)等を例示することができる。DGGE法は、
変性剤の濃度勾配のあるポリアクリルアミドゲル中で、
DNA断片の混合物を泳動し、それぞれの不安定性の違い
によってDNA断片を分離する方法である。ミスマッチの
ある不安定なDNA断片が、ゲル中のある変性剤濃度の部
分まで移動すると、ミスマッチ周辺のDNA配列はその不
安定さのために、部分的に1本鎖へと解離する。この部
分的に解離したDNA断片の移動度は、非常に遅くなり、
解離部分のない完全な二本鎖DNAの移動度と差がつくこ
とから、両者を分離することができる。具体的には、GR
遺伝子を含むDNAを本発明のプライマー等を用いたPCR法
等によって増幅し、これを尿素などの変性剤の濃度が移
動するに従って徐々に高くなっているポリアクリルアミ
ドゲル中で電気泳動し、対照と比較する。変異が存在す
るDNA断片の場合、より低い変性剤濃度位置でDNA断片が
一本鎖になり、極端に移動速度が遅くなるため、この移
動度の差を検出することにより変異の有無を検出するこ
とができる。
【0032】さらに別の方法は、まず、被検者から調製
したGR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcD
NA配列において1927番目の塩基部位、または1927番目お
よび2314番目の塩基部位を含むDNA、および該DNAとハイ
ブリダイズするヌクレオチドプローブが固定された基
板、を提供する。次いで、該DNAと該基板を接触させ
る。さらに、基板に固定されたヌクレオチドプローブに
ハイブリダイズしたDNAを検出することにより、GR遺伝
子多型を検出する。
したGR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcD
NA配列において1927番目の塩基部位、または1927番目お
よび2314番目の塩基部位を含むDNA、および該DNAとハイ
ブリダイズするヌクレオチドプローブが固定された基
板、を提供する。次いで、該DNAと該基板を接触させ
る。さらに、基板に固定されたヌクレオチドプローブに
ハイブリダイズしたDNAを検出することにより、GR遺伝
子多型を検出する。
【0033】このような方法としては、DNAアレイ法(S
NP遺伝子多型の戦略、松原謙一・榊佳之、中山書店、p1
28-135)が例示できる。被検者からのGR遺伝子を含むDN
A試料の調製は、当業者に周知の方法で行うことができ
る。該DNA試料の調製の好ましい態様においては、例え
ば被検者の末梢血白血球、皮膚、口腔粘膜等の組織また
は細胞、涙、唾液、尿、糞便または毛髪から抽出した染
色体DNAを基に調製することができる。染色体DNAから本
方法のDNA試料を調製するには、例えばGR遺伝子を含むD
NAにハイブリダイズするプライマーを用いて、染色体DN
Aを鋳型としたPCR等によってGR遺伝子を含むDNAを調製
することも可能である。調製したDNA試料には、必要に
応じて、当業者に周知の方法によって検出のための標識
を施すことができる。
NP遺伝子多型の戦略、松原謙一・榊佳之、中山書店、p1
28-135)が例示できる。被検者からのGR遺伝子を含むDN
A試料の調製は、当業者に周知の方法で行うことができ
る。該DNA試料の調製の好ましい態様においては、例え
ば被検者の末梢血白血球、皮膚、口腔粘膜等の組織また
は細胞、涙、唾液、尿、糞便または毛髪から抽出した染
色体DNAを基に調製することができる。染色体DNAから本
方法のDNA試料を調製するには、例えばGR遺伝子を含むD
NAにハイブリダイズするプライマーを用いて、染色体DN
Aを鋳型としたPCR等によってGR遺伝子を含むDNAを調製
することも可能である。調製したDNA試料には、必要に
応じて、当業者に周知の方法によって検出のための標識
を施すことができる。
【0034】本発明において「基板」とは、ヌクレオチ
ドを固定することが可能な板状の材料を意味する。本発
明においてヌクレオチドには、オリゴヌクレオチドおよ
びポリヌクレオチドが含まれる。本発明の基板は、ヌク
レオチドを固定することが可能であれば特に制限はない
が、一般にDNAアレイ技術で使用される基板を好適に用
いることができる。
ドを固定することが可能な板状の材料を意味する。本発
明においてヌクレオチドには、オリゴヌクレオチドおよ
びポリヌクレオチドが含まれる。本発明の基板は、ヌク
レオチドを固定することが可能であれば特に制限はない
が、一般にDNAアレイ技術で使用される基板を好適に用
いることができる。
【0035】一般にDNAアレイは、高密度に基板にプリ
ントされた何千ものヌクレオチドで構成されている。通
常これらのDNAは非透過性(non- porous)の基板の表層に
プリントされる。基板の表層は、一般的にはガラスであ
るが、透過性(porous)の膜、例えばニトロセルロースメ
ンブレムを使用することができる。
ントされた何千ものヌクレオチドで構成されている。通
常これらのDNAは非透過性(non- porous)の基板の表層に
プリントされる。基板の表層は、一般的にはガラスであ
るが、透過性(porous)の膜、例えばニトロセルロースメ
ンブレムを使用することができる。
【0036】本発明において、ヌクレオチドの固定(ア
レイ)方法として、Affymetrix社開発によるオリゴヌク
レオチドを基本としたアレイが例示できる。オリゴヌク
レオチドのアレイにおいて、オリゴヌクレオチドは通常
インサイチュ(in situ)で合成される。例えば、photoli
thographicの技術(Affymetrix社)、および化学物質を
固定させるためのインクジェット(Rosetta Inpharmatic
s社)技術等によるオリゴヌクレオチドのインサイチュ合
成法が既に知られており、いずれの技術も本発明の基板
の作製に利用することができる。
レイ)方法として、Affymetrix社開発によるオリゴヌク
レオチドを基本としたアレイが例示できる。オリゴヌク
レオチドのアレイにおいて、オリゴヌクレオチドは通常
インサイチュ(in situ)で合成される。例えば、photoli
thographicの技術(Affymetrix社)、および化学物質を
固定させるためのインクジェット(Rosetta Inpharmatic
s社)技術等によるオリゴヌクレオチドのインサイチュ合
成法が既に知られており、いずれの技術も本発明の基板
の作製に利用することができる。
【0037】基板に固定するヌクレオチドプローブは、
GR遺伝子の多型を検出することができるものであれば、
特に制限されない。即ち該プローブは、例えば、野生型
のGR遺伝子、あるいは多型を有するGR遺伝子と特異的に
ハイブリダイズするようなプローブである。特異的なハ
イブリダイズが可能であれば、ヌクレオチドプローブ
は、検出するGR遺伝子を含むDNA、または多型を有するG
R遺伝子に対し、完全に相補的である必要はない。
GR遺伝子の多型を検出することができるものであれば、
特に制限されない。即ち該プローブは、例えば、野生型
のGR遺伝子、あるいは多型を有するGR遺伝子と特異的に
ハイブリダイズするようなプローブである。特異的なハ
イブリダイズが可能であれば、ヌクレオチドプローブ
は、検出するGR遺伝子を含むDNA、または多型を有するG
R遺伝子に対し、完全に相補的である必要はない。
【0038】本発明において基板に結合させるヌクレオ
チドプローブの長さは、オリゴヌクレオチドを固定する
場合は、通常10〜100ベースであり、好ましくは10〜50
ベースであり、さらに好ましくは15〜25ベースである。
チドプローブの長さは、オリゴヌクレオチドを固定する
場合は、通常10〜100ベースであり、好ましくは10〜50
ベースであり、さらに好ましくは15〜25ベースである。
【0039】本発明においては、次いで、該cDNA試料と
該基板を接触させる。本工程により、上記ヌクレオチド
プローブに対し、DNA試料をハイブリダイズさせる。ハ
イブリダイゼーションの反応液および反応条件は、基板
に固定するヌクレオチドプローブの長さ等の諸要因によ
り変動しうるが、一般的に当業者に周知の方法により行
うことができる。
該基板を接触させる。本工程により、上記ヌクレオチド
プローブに対し、DNA試料をハイブリダイズさせる。ハ
イブリダイゼーションの反応液および反応条件は、基板
に固定するヌクレオチドプローブの長さ等の諸要因によ
り変動しうるが、一般的に当業者に周知の方法により行
うことができる。
【0040】本発明においては、次いで、該DNA試料と
基板に固定されたヌクレオチドプローブとのハイブリダ
イズの有無または強度を検出する。この検出は、例え
ば、蛍光シグナルをスキャナー等によって読み取ること
によって行うことができる。尚、DNAアレイにおいて
は、一般的にスライドガラスに固定したDNAをプローブ
といい、一方溶液中のラベルしたDNAをターゲットとい
う。従って、基板に固定された上記ヌクレオチドを、本
明細書においてヌクレオチドプローブと記載する。
基板に固定されたヌクレオチドプローブとのハイブリダ
イズの有無または強度を検出する。この検出は、例え
ば、蛍光シグナルをスキャナー等によって読み取ること
によって行うことができる。尚、DNAアレイにおいて
は、一般的にスライドガラスに固定したDNAをプローブ
といい、一方溶液中のラベルしたDNAをターゲットとい
う。従って、基板に固定された上記ヌクレオチドを、本
明細書においてヌクレオチドプローブと記載する。
【0041】上記の方法以外にも、特定位置の変異のみ
を検出する目的にはアレル特異的オリゴヌクレオチド
(Allele Specific Oligonucleotide/ASO)ハイブリダ
イゼーション法が利用できる。変異が存在すると考えら
れる塩基配列を含むオリゴヌクレオチドを作製し、これ
と試料DNAでハイブリダイゼーションを行わせると、変
異が存在する場合、ハイブリッド形成の効率が低下す
る。それをサザンブロット法や、特殊な蛍光試薬がハイ
ブリッドのギャップにインターカレーションすることに
より消光する性質を利用した方法、等により検出するこ
とができる。また、リボヌクレアーゼAミスマッチ切断
法による検出も可能である。具体的には、GR遺伝子を含
むDNAをPCR法等によって増幅し、これをプラスミドベク
ター等に組み込んだGR遺伝子cDNA等から調製した標識RN
Aとハイブリダイゼーションを行う。変異が存在する部
分においてはハイブリッドが一本鎖構造となるので、こ
の部分をリボヌクレアーゼAによって切断し、これをオ
ートラジオグラフィー等で検出することによって変異の
存在を検出することができる。
を検出する目的にはアレル特異的オリゴヌクレオチド
(Allele Specific Oligonucleotide/ASO)ハイブリダ
イゼーション法が利用できる。変異が存在すると考えら
れる塩基配列を含むオリゴヌクレオチドを作製し、これ
と試料DNAでハイブリダイゼーションを行わせると、変
異が存在する場合、ハイブリッド形成の効率が低下す
る。それをサザンブロット法や、特殊な蛍光試薬がハイ
ブリッドのギャップにインターカレーションすることに
より消光する性質を利用した方法、等により検出するこ
とができる。また、リボヌクレアーゼAミスマッチ切断
法による検出も可能である。具体的には、GR遺伝子を含
むDNAをPCR法等によって増幅し、これをプラスミドベク
ター等に組み込んだGR遺伝子cDNA等から調製した標識RN
Aとハイブリダイゼーションを行う。変異が存在する部
分においてはハイブリッドが一本鎖構造となるので、こ
の部分をリボヌクレアーゼAによって切断し、これをオ
ートラジオグラフィー等で検出することによって変異の
存在を検出することができる。
【0042】その他の本発明の多型の検出が可能な方法
としては、(1)質量分析法による方法(Griffin TJ a
nd Smith LM, Trends Biotechnol.vol. 18, pp77-84,
(2000))、(2)Taq-Man PCRによる方法(Livak KJ. G
enet. Anal. vol.14, pp143-149, (1999))、(3)Pyr
osequencingによる方法(Ahmadian A et al., Anal. Bi
ochem. vol. 280, pp103-110, (2000))、(4)Invade
r法による方法(Lyamichev V et al., Nat. Biotechno
l. vol. 17,pp292-296, (1999)、メディカルドゥ社発行
「遺伝子医学」 vol.4, No.1, pp44-51およびpp68-7
2 (2000))等、を挙げることができる。以上、種々の検
出方法を例示したが、これらに限らず、GRのグルココル
チコイド結合能を低下させる上記多型、または該GRの有
する転写活性化能を低下させる上記多型の検出を可能に
する方法であれば、任意の方法を用いることができる。
としては、(1)質量分析法による方法(Griffin TJ a
nd Smith LM, Trends Biotechnol.vol. 18, pp77-84,
(2000))、(2)Taq-Man PCRによる方法(Livak KJ. G
enet. Anal. vol.14, pp143-149, (1999))、(3)Pyr
osequencingによる方法(Ahmadian A et al., Anal. Bi
ochem. vol. 280, pp103-110, (2000))、(4)Invade
r法による方法(Lyamichev V et al., Nat. Biotechno
l. vol. 17,pp292-296, (1999)、メディカルドゥ社発行
「遺伝子医学」 vol.4, No.1, pp44-51およびpp68-7
2 (2000))等、を挙げることができる。以上、種々の検
出方法を例示したが、これらに限らず、GRのグルココル
チコイド結合能を低下させる上記多型、または該GRの有
する転写活性化能を低下させる上記多型の検出を可能に
する方法であれば、任意の方法を用いることができる。
【0043】本発明はまた、本発明の検査方法等に使用
できる、GR遺伝子における多型部位であって、該遺伝子
のcDNA配列において1927番目の多型部位を含む、少なく
とも15ヌクレオチドの鎖長を有するポリヌクレオチドを
提供する。該多型部位における塩基は、好ましくはシト
シンである。
できる、GR遺伝子における多型部位であって、該遺伝子
のcDNA配列において1927番目の多型部位を含む、少なく
とも15ヌクレオチドの鎖長を有するポリヌクレオチドを
提供する。該多型部位における塩基は、好ましくはシト
シンである。
【0044】本発明はまた、グルココルチコイド製剤の
有効性を検査するための試薬を提供する。その一つの態
様としては、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺
伝子のcDNA配列において1927番目の塩基部位を含むDNA
にハイブリダイズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長
を有するポリヌクレオチドを含む、グルココルチコイド
製剤の有効性を検査するための試薬である。該試薬は、
さらに、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子
のcDNA配列において2314番目の塩基部位を含むDNAにハ
イブリダイズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長を有
するポリヌクレオチドを含むものであってもよい。
有効性を検査するための試薬を提供する。その一つの態
様としては、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺
伝子のcDNA配列において1927番目の塩基部位を含むDNA
にハイブリダイズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長
を有するポリヌクレオチドを含む、グルココルチコイド
製剤の有効性を検査するための試薬である。該試薬は、
さらに、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子
のcDNA配列において2314番目の塩基部位を含むDNAにハ
イブリダイズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長を有
するポリヌクレオチドを含むものであってもよい。
【0045】該オリゴヌクレオチドは、GR遺伝子を含む
DNAに特異的にハイブリダイズするものである。ここで
「特異的にハイブリダイズする」とは、通常のハイブリ
ダイゼーション条件下、好ましくはストリンジェントな
ハイブリダイゼーション条件下(例えば、サムブルック
ら,Molecular Cloning,Cold Spring Harbour Laborator
y Press,New York,USA,第2版1989に記載の条件)にお
いて、他のタンパク質をコードするDNAとクロスハイブ
リダイゼーションを有意に生じないことを意味する。特
異的なハイブリダイズが可能であれば、該オリゴヌクレ
オチドは、検出するGR遺伝子の塩基配列に対し、完全に
相補的である必要はない。
DNAに特異的にハイブリダイズするものである。ここで
「特異的にハイブリダイズする」とは、通常のハイブリ
ダイゼーション条件下、好ましくはストリンジェントな
ハイブリダイゼーション条件下(例えば、サムブルック
ら,Molecular Cloning,Cold Spring Harbour Laborator
y Press,New York,USA,第2版1989に記載の条件)にお
いて、他のタンパク質をコードするDNAとクロスハイブ
リダイゼーションを有意に生じないことを意味する。特
異的なハイブリダイズが可能であれば、該オリゴヌクレ
オチドは、検出するGR遺伝子の塩基配列に対し、完全に
相補的である必要はない。
【0046】該オリゴヌクレオチドは、上記本発明の検
査方法におけるプローブやプライマーとして用いること
ができる。該オリゴヌクレオチドをプライマーとして用
いる場合、その長さは、通常15bp〜100bpであり、好ま
しくは17bp〜30bpである。プライマーは、多型部分を含
むGR遺伝子の少なくとも一部を増幅しうるものであれ
ば、特に制限されない。
査方法におけるプローブやプライマーとして用いること
ができる。該オリゴヌクレオチドをプライマーとして用
いる場合、その長さは、通常15bp〜100bpであり、好ま
しくは17bp〜30bpである。プライマーは、多型部分を含
むGR遺伝子の少なくとも一部を増幅しうるものであれ
ば、特に制限されない。
【0047】また、上記オリゴヌクレオチドをプローブ
として使用する場合、該プローブは、GR遺伝子における
塩基部位であって、該遺伝子のcDNA配列において1927番
目の塩基部位または2314番目の塩基部位を含むDNAに特
異的にハイブリダイズするものであれば、特に制限され
ない。該プローブは、合成オリゴヌクレオチドであって
もよく、通常少なくとも15bp以上の鎖長を有する。
として使用する場合、該プローブは、GR遺伝子における
塩基部位であって、該遺伝子のcDNA配列において1927番
目の塩基部位または2314番目の塩基部位を含むDNAに特
異的にハイブリダイズするものであれば、特に制限され
ない。該プローブは、合成オリゴヌクレオチドであって
もよく、通常少なくとも15bp以上の鎖長を有する。
【0048】本発明のオリゴヌクレオチドは、例えば市
販のオリゴヌクレオチド合成機により作製することがで
きる。プローブは、制限酵素処理等によって取得される
二本鎖DNA断片として作製することもできる。
販のオリゴヌクレオチド合成機により作製することがで
きる。プローブは、制限酵素処理等によって取得される
二本鎖DNA断片として作製することもできる。
【0049】本発明のオリゴヌクレオチドをプローブと
して用いる場合は、適宜標識して用いることが好まし
い。標識する方法としては、T4ポリヌクレオチドキナー
ゼを用いて、オリゴヌクレオチドの5'端を32Pでリン酸
化することにより標識する方法、およびクレノウ酵素等
のDNAポリメラーゼを用い、ランダムヘキサマーオリゴ
ヌクレオチド等をプライマーとして32P等のアイソトー
プ、蛍光色素、またはビオチン等によって標識された基
質塩基を取り込ませる方法(ランダムプライム法等)を
例示することができる。
して用いる場合は、適宜標識して用いることが好まし
い。標識する方法としては、T4ポリヌクレオチドキナー
ゼを用いて、オリゴヌクレオチドの5'端を32Pでリン酸
化することにより標識する方法、およびクレノウ酵素等
のDNAポリメラーゼを用い、ランダムヘキサマーオリゴ
ヌクレオチド等をプライマーとして32P等のアイソトー
プ、蛍光色素、またはビオチン等によって標識された基
質塩基を取り込ませる方法(ランダムプライム法等)を
例示することができる。
【0050】また、本発明における検査薬の別の態様
は、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcD
NA配列において1927番目の塩基部位を含むDNAを増幅す
るように設計されたフォワードプライマー、およびリバ
ースプライマーを含む、グルココルチコイド製剤の有効
性を検査するための試薬である。該試薬は、さらに、GR
遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcDNA配列
において2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅するよう
に設計されたフォワードプライマーおよびリバースプラ
イマーを含むものであってもよい。プライマーの長さ
は、通常15bp〜100bpであり、好ましくは17bp〜30bpで
ある。プライマーは、多型部分を含むGR遺伝子の少なく
とも一部を増幅しうるものであれば、特に制限されな
い。
は、GR遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcD
NA配列において1927番目の塩基部位を含むDNAを増幅す
るように設計されたフォワードプライマー、およびリバ
ースプライマーを含む、グルココルチコイド製剤の有効
性を検査するための試薬である。該試薬は、さらに、GR
遺伝子における塩基部位であって、該遺伝子のcDNA配列
において2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅するよう
に設計されたフォワードプライマーおよびリバースプラ
イマーを含むものであってもよい。プライマーの長さ
は、通常15bp〜100bpであり、好ましくは17bp〜30bpで
ある。プライマーは、多型部分を含むGR遺伝子の少なく
とも一部を増幅しうるものであれば、特に制限されな
い。
【0051】本発明の試薬においては、有効成分である
オリゴヌクレオチド以外に、例えば、滅菌水、生理食塩
水、植物油、界面活性剤、脂質、溶解補助剤、緩衝剤、
タンパク質安定剤(BSAやゼラチンなど)、保存剤等が
必要に応じて混合されていてもよい。
オリゴヌクレオチド以外に、例えば、滅菌水、生理食塩
水、植物油、界面活性剤、脂質、溶解補助剤、緩衝剤、
タンパク質安定剤(BSAやゼラチンなど)、保存剤等が
必要に応じて混合されていてもよい。
【0052】
【実施例】以下、本発明を実施例により、さらに具体的
に説明するが本発明はこれら実施例に制限されるもので
はない。
に説明するが本発明はこれら実施例に制限されるもので
はない。
【0053】(1)GR遺伝子のDNA供給源および配列決
定 10名の異なる個別の日本人(JCRB0071、0086、0091、009
2、0094、0104、0105、0112、0114および0122)に由来し
た確立された白血病細胞株および1種の日本人由来結腸
ガン細胞株(JCRB0208)はヒューマンサイエンス研究資源
バンク(HealthScience Research Resources Bank(HSRR
B))(大阪、日本)から、もしくは、直接国立医薬品食品
衛生研究所(NIHS)の厚生労働省研究資源バンク(Japanes
e Collection of Research Bioresources(JCRB))(東
京、日本)から入手した。
定 10名の異なる個別の日本人(JCRB0071、0086、0091、009
2、0094、0104、0105、0112、0114および0122)に由来し
た確立された白血病細胞株および1種の日本人由来結腸
ガン細胞株(JCRB0208)はヒューマンサイエンス研究資源
バンク(HealthScience Research Resources Bank(HSRR
B))(大阪、日本)から、もしくは、直接国立医薬品食品
衛生研究所(NIHS)の厚生労働省研究資源バンク(Japanes
e Collection of Research Bioresources(JCRB))(東
京、日本)から入手した。
【0054】ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)用のプライマ
ーデザインおよびコード領域の配列決定は、NCBIデータ
ベースから得た配列(M78506、M78507、U78508、AC00478
2)を基にした。本試験に使用した全てのプライマー(配
列番号:7〜30)を、表1に列記した。
ーデザインおよびコード領域の配列決定は、NCBIデータ
ベースから得た配列(M78506、M78507、U78508、AC00478
2)を基にした。本試験に使用した全てのプライマー(配
列番号:7〜30)を、表1に列記した。
【0055】
【表1】
【0056】PCR条件は下記のものであった。Ex-Taqポ
リメラーゼ(TaKaRa社、京都、日本)を使用し、熱変性95
℃5分、それに続く95℃30秒、55℃1分および72℃2分の
反応を30サイクル、ならびに72℃7分の最終反応を1回行
った。その後PCR産物を、ABIPrism 3700 DNA分析装置(A
pplied Biosystems社、CA、米国)を使用するABI BigDye
Terminater Cycle Sequencing Kit (Applied Biosyste
ms社、CA、米国)を用いて直接配列決定した。
リメラーゼ(TaKaRa社、京都、日本)を使用し、熱変性95
℃5分、それに続く95℃30秒、55℃1分および72℃2分の
反応を30サイクル、ならびに72℃7分の最終反応を1回行
った。その後PCR産物を、ABIPrism 3700 DNA分析装置(A
pplied Biosystems社、CA、米国)を使用するABI BigDye
Terminater Cycle Sequencing Kit (Applied Biosyste
ms社、CA、米国)を用いて直接配列決定した。
【0057】(2)プラスミド
アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(ATC
C、VA、米国)から入手したpRShGRαは、ヒトGRαの完全
長コード領域および構成的に活性のあるラウス肉腫ウイ
ルスプロモーターを含んでいる(V. Giguere, S. M. Hol
lenberg, M. G. Rosenfeld, R. M. Evans, Functional
domains of the human glucocorticoid receptor. Cell
46 (1986) 645-652)。変異型C643R GRおよび変異型231
4 ins-a GRのための発現ベクターは、鋳型として野生型
pRShGRαプラスミドを用い、QuickChange位置指定突然
変異導入キット(Stratagene社、CA、米国)で構築した。
対照としてのベクタープラスミドはpRShGRαプラスミド
からhGRα領域を取り除くことにより構築した。
C、VA、米国)から入手したpRShGRαは、ヒトGRαの完全
長コード領域および構成的に活性のあるラウス肉腫ウイ
ルスプロモーターを含んでいる(V. Giguere, S. M. Hol
lenberg, M. G. Rosenfeld, R. M. Evans, Functional
domains of the human glucocorticoid receptor. Cell
46 (1986) 645-652)。変異型C643R GRおよび変異型231
4 ins-a GRのための発現ベクターは、鋳型として野生型
pRShGRαプラスミドを用い、QuickChange位置指定突然
変異導入キット(Stratagene社、CA、米国)で構築した。
対照としてのベクタープラスミドはpRShGRαプラスミド
からhGRα領域を取り除くことにより構築した。
【0058】(3)細胞培養
COS-7細胞は、厚生労働省研究資源バンク(JCRB)(東京、
日本)から入手した。この細胞を、10%FBS、100U/mlペ
ニシリンおよびストレプトマイシンを補充したダルベッ
コの変更イーグル培地(DMEM)において、5%CO2大気
下、37℃で増殖した。
日本)から入手した。この細胞を、10%FBS、100U/mlペ
ニシリンおよびストレプトマイシンを補充したダルベッ
コの変更イーグル培地(DMEM)において、5%CO2大気
下、37℃で増殖した。
【0059】(4)一過性トランスフェクション
COS-7細胞を、ウェスタンブロットおよびデキサメサゾ
ン結合アッセイのために10cm組織培養皿(1.6 X 106細胞
/皿)上に、またはルシフェラーゼアッセイのために6ウ
ェル組織培養皿(1.4 X 1O5細胞/ウェル)に播種し、かつ
一晩増殖した。血清および抗生物質を含まないDMEM中の
野生型GR(pRShGRα)、C643R GRまたは2314 ins-a GRの
いずれかをコードしている発現ベクター4μg(10cm培養
皿について、皿1個当たり)または1.5μg(6ウェル皿につ
いて、ウェル1個当たり)を、PolyFectトランスフェクシ
ョン試薬(Qiagen社、ヒルデン、独国)と混合した。この
混合液を、10%FBS-DMEMで希釈し、かつ直ぐに該細胞に
滴下した。細胞質画分を調製するために、トランスフェ
クションし48時間培養した後、細胞をリン酸緩衝生理食
塩水(PBS)で洗浄し、かつトリプシン処理により分散し
た。培地を遠心分離によりSET緩衝液(0.25Mショ糖、1mM
EDTA、100mM Tris-HCl(pH7.4))と交換した後、細胞を
音波処理により破壊し、かつ105,000 X gで遠心した。
上清のタンパク質濃度を、BCAタンパク質アッセイキッ
ト(Pierce社、IL、米国)により測定した。
ン結合アッセイのために10cm組織培養皿(1.6 X 106細胞
/皿)上に、またはルシフェラーゼアッセイのために6ウ
ェル組織培養皿(1.4 X 1O5細胞/ウェル)に播種し、かつ
一晩増殖した。血清および抗生物質を含まないDMEM中の
野生型GR(pRShGRα)、C643R GRまたは2314 ins-a GRの
いずれかをコードしている発現ベクター4μg(10cm培養
皿について、皿1個当たり)または1.5μg(6ウェル皿につ
いて、ウェル1個当たり)を、PolyFectトランスフェクシ
ョン試薬(Qiagen社、ヒルデン、独国)と混合した。この
混合液を、10%FBS-DMEMで希釈し、かつ直ぐに該細胞に
滴下した。細胞質画分を調製するために、トランスフェ
クションし48時間培養した後、細胞をリン酸緩衝生理食
塩水(PBS)で洗浄し、かつトリプシン処理により分散し
た。培地を遠心分離によりSET緩衝液(0.25Mショ糖、1mM
EDTA、100mM Tris-HCl(pH7.4))と交換した後、細胞を
音波処理により破壊し、かつ105,000 X gで遠心した。
上清のタンパク質濃度を、BCAタンパク質アッセイキッ
ト(Pierce社、IL、米国)により測定した。
【0060】(5)ウェスタンブロット分析
細胞質画分(50μgタンパク質)を、6%SDS-ポロアクリル
アミドゲル(Tefuco社、東京、日本)上で電気泳動し、か
つPVDF膜(Bio-Rad社、CA、米国)上に移した。これらの
膜を、一次抗体としてポリクローナルウサギ抗ヒトGR抗
体(Affinity Bioreagents社、CO、米国)、および二次抗
体としてアルカリホスファターゼに複合したヤギ抗ウサ
ギIgG抗体(Promega社、WI、米国)で染色した。これらの
シグナルを、ニトロブルーテトラゾリウムクロリド(NB
T)および5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリルリン酸p-トル
イジン塩(BCIP) (Promega社、WI、米国)で処理すること
により視認した。
アミドゲル(Tefuco社、東京、日本)上で電気泳動し、か
つPVDF膜(Bio-Rad社、CA、米国)上に移した。これらの
膜を、一次抗体としてポリクローナルウサギ抗ヒトGR抗
体(Affinity Bioreagents社、CO、米国)、および二次抗
体としてアルカリホスファターゼに複合したヤギ抗ウサ
ギIgG抗体(Promega社、WI、米国)で染色した。これらの
シグナルを、ニトロブルーテトラゾリウムクロリド(NB
T)および5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリルリン酸p-トル
イジン塩(BCIP) (Promega社、WI、米国)で処理すること
により視認した。
【0061】(6)デキサメサゾン結合アッセイ
少量の細胞質画分のを、500倍過剰量の標識していない
デキサメサゾンの存在または非存在下の各々で、[3H]
デキサメサゾン(Amersham Pharmacia Biotech社、英国)
と共にインキュベーションし、各々、総結合および非特
異的結合を測定した。チャコール吸着法を用い、細胞質
画分における[3H]デキサメサゾン結合を測定した。ウ
シ胎仔血清アルブミン(BSA)を、この溶液に添加し、GR
のチャコールへの非特異的吸着を阻害した(Niimi et. a
l., Regulation of glucocorticoid receptor by the t
yrosine kinase inhibitor herbimycin A in the cytos
olic fraction of primary cultured rat hepatocytes.
J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 61:65-71 (1997);N
iimi et. al., Effect of dexamethasone pretreatment
on the dexamethasone-dependent induction of tyros
ine aminotransferase activity in primary cultured
rat hepatocytes. Biol. Pharm. Bull. 21:1009-1012
(1998))。遠心分離後、上清の放射能を、シンチレーシ
ョンスペクトロメーターにおいてACSIIで計測した。
デキサメサゾンの存在または非存在下の各々で、[3H]
デキサメサゾン(Amersham Pharmacia Biotech社、英国)
と共にインキュベーションし、各々、総結合および非特
異的結合を測定した。チャコール吸着法を用い、細胞質
画分における[3H]デキサメサゾン結合を測定した。ウ
シ胎仔血清アルブミン(BSA)を、この溶液に添加し、GR
のチャコールへの非特異的吸着を阻害した(Niimi et. a
l., Regulation of glucocorticoid receptor by the t
yrosine kinase inhibitor herbimycin A in the cytos
olic fraction of primary cultured rat hepatocytes.
J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 61:65-71 (1997);N
iimi et. al., Effect of dexamethasone pretreatment
on the dexamethasone-dependent induction of tyros
ine aminotransferase activity in primary cultured
rat hepatocytes. Biol. Pharm. Bull. 21:1009-1012
(1998))。遠心分離後、上清の放射能を、シンチレーシ
ョンスペクトロメーターにおいてACSIIで計測した。
【0062】(7)ルシフェラーゼ活性
COS-7細胞を、野生型GR発現ベクターpRShGRα、変異型G
R発現ベクターであるpRShGRα-C643RまたはpRShGRα-23
14 ins-aに、マウスの乳がんウイルス(MMTV)プロモータ
ー-ルシフェラーゼレポーター構築体(pHH-Luc)(ATCC、V
A、米国)と一緒に、同時トランスフェクションした。30
時間インキュベーションした後、デキサメサゾンをこれ
らの細胞に添加し、その後これを更に18時間インキュベ
ーションした。これらの細胞を、PBSで洗浄し、かつ溶
解液をPicaGene Dual SeaPansy Luminescence Kit (Nip
pongene社、東京、日本)を用いて調製し、その後ルシフ
ェラーゼ活性を、ARVOルミノメーター(Wallac社、Turk
u、フィンランド)において測定した。phRL-TKベクター
(Promega社、WI、米国)を内部対照として使用した。
R発現ベクターであるpRShGRα-C643RまたはpRShGRα-23
14 ins-aに、マウスの乳がんウイルス(MMTV)プロモータ
ー-ルシフェラーゼレポーター構築体(pHH-Luc)(ATCC、V
A、米国)と一緒に、同時トランスフェクションした。30
時間インキュベーションした後、デキサメサゾンをこれ
らの細胞に添加し、その後これを更に18時間インキュベ
ーションした。これらの細胞を、PBSで洗浄し、かつ溶
解液をPicaGene Dual SeaPansy Luminescence Kit (Nip
pongene社、東京、日本)を用いて調製し、その後ルシフ
ェラーゼ活性を、ARVOルミノメーター(Wallac社、Turk
u、フィンランド)において測定した。phRL-TKベクター
(Promega社、WI、米国)を内部対照として使用した。
【0063】[実施例1] GR遺伝子のエクソン7におけ
る変異C643Rおよびエクソン9αにおける変異2314 ins-a 本発明者らは、日本人10名の白血病細胞のGR遺伝子コー
ド領域を配列決定したが、ヒト白血病性CEM-1細胞にお
いてグルココルチコイドに対する感受性に対し影響を及
ぼすことが報告(S. Geley, B. L. Hartmann, M. Hala,
E. M. Strasser-Wozak, K. Kapelari, R. Kofler, Resi
stance to glucocorticoid-induced apoptosis in huma
n T-cell acute lymphoblastic leukemia CEM-C1 cells
is dueto insufficient glucocorticoid receptor exp
ression. Cancer Res. 56 (1996) 5033-5038)されてい
るL753F変異は、認められなかった。しかし、参照配列
(NCBI受託番号;AC004782)(周辺配列(surrounding sequ
ence);tacgaccaaTgtaaacacat(配列番号:31))を基
に番号付けし、GR遺伝子のエクソン7においてシステイ
ン-643がアルギニンへ置換されている変異t5618c (C643
R)を検出した。これは、5618番目のチミンがシトシンに
置換した変異(GR遺伝子のcDNA配列(配列番号:1)に
おいては、1927番目のチミンがシトシンに置換した変
異)であった。この変異は、日本人の急性リンパ芽球性
白血病から得た末梢血であるP30/OHK細胞株(HSRRB受託
番号;JCRBOO94)において検出された(M. Hanada, M. Sh
imoyama, Potential limitation of growth-inhibitory
action of recombinant human tumor necrosis factor
(PAC-4D) due to easy induction of resistance: evi
dence in vitro. Jpn. J. Cancer Res. 78 (1987) 1266
-1273; M. Hirose, K. Minato, K. Tobinai, M. Ohira,
T. Ise, S. Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki,T.
Abe, A novel pre-T cell line derived from acute l
ymphoblastic leukemia. Gann 73 (1982) 600-605; M.
Hirose, K. Tobinai, K. Minato, M. Ohira,T. Ise, S.
Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki, T. Abe, A no
vel culturedcell line (P30/Ohkubo) of pre-T cell
(C/T hybrid) phenotype derived from an acute lymph
oblastic leukemia with some phenotypic change duri
ng clinical course. Nippon Ketsueki Gakkai Zasshi
46 (1983) 729-736)。また、日本人由来結腸ガン細胞株
CCK-81(HSRRB受託番号;JCRBO208)において、GR遺伝子
のエクソン9α上に、ロイシン-772からリジン-777を別
の26アミノ酸に置換する変異2314 ins-a(GR遺伝子のcD
NA配列(配列番号:1)において2313番目の塩基と2314
番目の塩基の間にアデニンが挿入された変異)を検出し
た。
る変異C643Rおよびエクソン9αにおける変異2314 ins-a 本発明者らは、日本人10名の白血病細胞のGR遺伝子コー
ド領域を配列決定したが、ヒト白血病性CEM-1細胞にお
いてグルココルチコイドに対する感受性に対し影響を及
ぼすことが報告(S. Geley, B. L. Hartmann, M. Hala,
E. M. Strasser-Wozak, K. Kapelari, R. Kofler, Resi
stance to glucocorticoid-induced apoptosis in huma
n T-cell acute lymphoblastic leukemia CEM-C1 cells
is dueto insufficient glucocorticoid receptor exp
ression. Cancer Res. 56 (1996) 5033-5038)されてい
るL753F変異は、認められなかった。しかし、参照配列
(NCBI受託番号;AC004782)(周辺配列(surrounding sequ
ence);tacgaccaaTgtaaacacat(配列番号:31))を基
に番号付けし、GR遺伝子のエクソン7においてシステイ
ン-643がアルギニンへ置換されている変異t5618c (C643
R)を検出した。これは、5618番目のチミンがシトシンに
置換した変異(GR遺伝子のcDNA配列(配列番号:1)に
おいては、1927番目のチミンがシトシンに置換した変
異)であった。この変異は、日本人の急性リンパ芽球性
白血病から得た末梢血であるP30/OHK細胞株(HSRRB受託
番号;JCRBOO94)において検出された(M. Hanada, M. Sh
imoyama, Potential limitation of growth-inhibitory
action of recombinant human tumor necrosis factor
(PAC-4D) due to easy induction of resistance: evi
dence in vitro. Jpn. J. Cancer Res. 78 (1987) 1266
-1273; M. Hirose, K. Minato, K. Tobinai, M. Ohira,
T. Ise, S. Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki,T.
Abe, A novel pre-T cell line derived from acute l
ymphoblastic leukemia. Gann 73 (1982) 600-605; M.
Hirose, K. Tobinai, K. Minato, M. Ohira,T. Ise, S.
Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki, T. Abe, A no
vel culturedcell line (P30/Ohkubo) of pre-T cell
(C/T hybrid) phenotype derived from an acute lymph
oblastic leukemia with some phenotypic change duri
ng clinical course. Nippon Ketsueki Gakkai Zasshi
46 (1983) 729-736)。また、日本人由来結腸ガン細胞株
CCK-81(HSRRB受託番号;JCRBO208)において、GR遺伝子
のエクソン9α上に、ロイシン-772からリジン-777を別
の26アミノ酸に置換する変異2314 ins-a(GR遺伝子のcD
NA配列(配列番号:1)において2313番目の塩基と2314
番目の塩基の間にアデニンが挿入された変異)を検出し
た。
【0064】次に、COS-7細胞に、野生型GRプラスミ
ド、C643R変異型GRプラスミドまたは2314 ins-a変異型G
Rプラスミドをトランスフェクションし、抗GR抗体を用
い、細胞質画分のウェスタンブロット分析を行った。そ
の結果、トランスフェクションしたCOS-7細胞における
野生型GRおよびC643R変異型GRの両方が同様のレベルで
発現することが示された(図1)。一方、トランスフェ
クションしたCOS-7細胞の細胞質画分における2314 ins-
a変異型GRの発現レベルは、野生型GRのものに比べて低
下が認められた(図2)。しかし、細胞全体のライゼート
では、2314 ins-a 変異GRでも発現レベルの低下は認め
られなかった(図3)。これらの結果から、C643R変異
および2314 ins-a変異が、GRの発現を変化させないこ
と、しかし2314 ins-a 変異では発現細胞内局在が変化
していることが示された。また、C643R変異型GRおよび2
314 ins-a変異型GRの安定性が野生型GRに類似している
ことが示された。
ド、C643R変異型GRプラスミドまたは2314 ins-a変異型G
Rプラスミドをトランスフェクションし、抗GR抗体を用
い、細胞質画分のウェスタンブロット分析を行った。そ
の結果、トランスフェクションしたCOS-7細胞における
野生型GRおよびC643R変異型GRの両方が同様のレベルで
発現することが示された(図1)。一方、トランスフェ
クションしたCOS-7細胞の細胞質画分における2314 ins-
a変異型GRの発現レベルは、野生型GRのものに比べて低
下が認められた(図2)。しかし、細胞全体のライゼート
では、2314 ins-a 変異GRでも発現レベルの低下は認め
られなかった(図3)。これらの結果から、C643R変異
および2314 ins-a変異が、GRの発現を変化させないこ
と、しかし2314 ins-a 変異では発現細胞内局在が変化
していることが示された。また、C643R変異型GRおよび2
314 ins-a変異型GRの安定性が野生型GRに類似している
ことが示された。
【0065】[実施例2] C643R変異型GRおよび2314 in
s-a変異型GRにおける転写活性の喪失 本発明者らは、C643R変異型GRおよび2314 ins-a変異型G
Rが有する転写活性を調べるために、野生型GRプラスミ
ド、C643R変異型GRプラスミドまたは2314 ins-a変異型G
Rプラスミドを、マウスの乳がんウイルス(MMTV)プロモ
ーター-ルシフェラーゼレポーター構築体(pHH-Luc)(Ge
nBank;寄託番号AF093686)を用いて、COS-7細胞中にト
ランスフェクションした。MMTVプロモーターは、グルコ
コルチコイドが媒介した遺伝子調節機構を研究するため
のモデルシステムとして広く使用されており(R. D. Med
h, T. J. Schmidt, Trans-retinoic acid and glucocor
ticoids synergistically induce transcription from
the mouse mammary tumorvirus promoter in human emb
ryonic kidney cells. J. Steroid Biochem. Mol.Biol.
62 (1997) 129-142)、かつホルモン誘導を媒介するよ
く特徴付けられたGR結合配列(GRE)を含んでいる。レポ
ーター遺伝子実験の結果を図4に示す。
s-a変異型GRにおける転写活性の喪失 本発明者らは、C643R変異型GRおよび2314 ins-a変異型G
Rが有する転写活性を調べるために、野生型GRプラスミ
ド、C643R変異型GRプラスミドまたは2314 ins-a変異型G
Rプラスミドを、マウスの乳がんウイルス(MMTV)プロモ
ーター-ルシフェラーゼレポーター構築体(pHH-Luc)(Ge
nBank;寄託番号AF093686)を用いて、COS-7細胞中にト
ランスフェクションした。MMTVプロモーターは、グルコ
コルチコイドが媒介した遺伝子調節機構を研究するため
のモデルシステムとして広く使用されており(R. D. Med
h, T. J. Schmidt, Trans-retinoic acid and glucocor
ticoids synergistically induce transcription from
the mouse mammary tumorvirus promoter in human emb
ryonic kidney cells. J. Steroid Biochem. Mol.Biol.
62 (1997) 129-142)、かつホルモン誘導を媒介するよ
く特徴付けられたGR結合配列(GRE)を含んでいる。レポ
ーター遺伝子実験の結果を図4に示す。
【0066】COS-7細胞のレポータープラスミド単独に
よるトランスフェクションは、デキサメサゾンに反応し
たルシフェラーゼ活性の増加を示さず、このことはこれ
らの細胞が顕著な量の機能GRを含まないことを示してい
る。野生型GRでトランスフェクションした細胞におい
て、ルシフェラーゼ活性は、用量依存的に増加した。し
かしC643R変異型GRは、デキサメサゾン反応性ルシフェ
ラーゼレポーター遺伝子の発現を誘導しなかった(図
4)。2314 ins-a変異型GRにおいても同様の結果が得ら
れた。これらの結果から、C643R変異型GRおよび2314 in
s-a変異型GRの転写活性は抑制されていることが示され
た。
よるトランスフェクションは、デキサメサゾンに反応し
たルシフェラーゼ活性の増加を示さず、このことはこれ
らの細胞が顕著な量の機能GRを含まないことを示してい
る。野生型GRでトランスフェクションした細胞におい
て、ルシフェラーゼ活性は、用量依存的に増加した。し
かしC643R変異型GRは、デキサメサゾン反応性ルシフェ
ラーゼレポーター遺伝子の発現を誘導しなかった(図
4)。2314 ins-a変異型GRにおいても同様の結果が得ら
れた。これらの結果から、C643R変異型GRおよび2314 in
s-a変異型GRの転写活性は抑制されていることが示され
た。
【0067】[実施例3] C643R変異型GRのデキサメサ
ゾン結合能(結合親和性)の低下 システイン-643残基は、GRのリガンド結合ドメイン(LB
D)に位置している。デキサメサゾンに対するC643R変異
型GRの親和性を調べるために、本発明者らは、Scatchar
dプロット解析に従い、野生型またはC643R変異型GRプラ
スミドでトランスフェクションしたCOS-7細胞の細胞質
画分における[3H]デキサメサゾンへの結合親和性を測
定した(G. Scatchard, The aggregation of proteins f
or small molecules, ions. Ann. N. Y. Acad. Sci. 51
(1949) 660-672)。放射性リガンド結合アッセイの結果
を図5に示すと同時に、Kd値および結合能を表2に示
す。特異的な高親和性結合が、野生型GRでトランスフェ
クションしたCOS-7細胞から調製した細胞質画分中で明
らかになった。この結合能は、864fmol/mg細胞質タンパ
ク質であり、解離定数Kdは7.4nMであった。C643R変異型
GRでトランスフェクションしたCOS-7細胞からの細胞質
画分の結合能(921fmol/mg細胞質タンパク質)は、野生型
の値と同等であったが、Kd値(44.6nM)は6倍高かった。
この結果から、C643R変異型GRのデキサメサゾンに対す
る結合親和性は低いことが示された。
ゾン結合能(結合親和性)の低下 システイン-643残基は、GRのリガンド結合ドメイン(LB
D)に位置している。デキサメサゾンに対するC643R変異
型GRの親和性を調べるために、本発明者らは、Scatchar
dプロット解析に従い、野生型またはC643R変異型GRプラ
スミドでトランスフェクションしたCOS-7細胞の細胞質
画分における[3H]デキサメサゾンへの結合親和性を測
定した(G. Scatchard, The aggregation of proteins f
or small molecules, ions. Ann. N. Y. Acad. Sci. 51
(1949) 660-672)。放射性リガンド結合アッセイの結果
を図5に示すと同時に、Kd値および結合能を表2に示
す。特異的な高親和性結合が、野生型GRでトランスフェ
クションしたCOS-7細胞から調製した細胞質画分中で明
らかになった。この結合能は、864fmol/mg細胞質タンパ
ク質であり、解離定数Kdは7.4nMであった。C643R変異型
GRでトランスフェクションしたCOS-7細胞からの細胞質
画分の結合能(921fmol/mg細胞質タンパク質)は、野生型
の値と同等であったが、Kd値(44.6nM)は6倍高かった。
この結果から、C643R変異型GRのデキサメサゾンに対す
る結合親和性は低いことが示された。
【0068】
【表2】
【0069】グルココルチコイド耐性は、急性リンパ性
白血病の治療における大きい問題点であり、その原因と
なる機序に関するいくつかの報告が示されているが、ま
だごくわずかしかわかっていない。変異L753Fが、ヒト
ステロイド耐性白血病性CEM-C1細胞およびICR27TK.3細
胞において検出されることは報告されており、かつこの
変異と耐性の間の相関について考察されている(S. Gele
y, B. L. Hartmann, M.Hala, E. M. Strasser-Wozak,
K. Kapelari, R. Kofler, Resistance to glucocortico
id-induced apoptosis in human T-cell acute lymphob
lastic leukemiaCEM-C1 cells is due to insufficient
glucocorticoid receptor expression.Cancer Res. 56
(1996) 5033-5038)。
白血病の治療における大きい問題点であり、その原因と
なる機序に関するいくつかの報告が示されているが、ま
だごくわずかしかわかっていない。変異L753Fが、ヒト
ステロイド耐性白血病性CEM-C1細胞およびICR27TK.3細
胞において検出されることは報告されており、かつこの
変異と耐性の間の相関について考察されている(S. Gele
y, B. L. Hartmann, M.Hala, E. M. Strasser-Wozak,
K. Kapelari, R. Kofler, Resistance to glucocortico
id-induced apoptosis in human T-cell acute lymphob
lastic leukemiaCEM-C1 cells is due to insufficient
glucocorticoid receptor expression.Cancer Res. 56
(1996) 5033-5038)。
【0070】本発明者らは、変異L753Fが他の白血病細
胞中に存在するかどうかを調べるために、日本人10名の
個別の白血病細胞中のGR遺伝子のエクソン9αを配列決
定したが、これらの細胞において変異L753Fは検出され
なかった。本発明者らは、別の変異がこれらの細胞のGR
遺伝子中に存在すると仮定し、従ってGR遺伝子の他のコ
ード領域の配列を決定した。その中で、本発明者らは、
P30/OHK細胞のGR遺伝子エキソン7中のリガンド結合ドメ
イン(LBD)およびhsp90結合部位において別の変異C643R
を同定した。このP30/OHK細胞は、急性リンパ芽球性白
血病に罹患した日本人の骨髄性白血病細胞から樹立され
ている(M. Hirose, K. Minato, K. Tobinai, M. Ohira,
T. Ise, S. Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki,
T. Abe, Anovel pre-T cell line derived from acute
lymphoblastic leukemia. Gann 73 (1982) 600-605; M.
Hirose, K. Tobinai, K. Minato, M. Ohira, T. Ise,
S.Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki, T. Abe, A n
ovel cultured cell line(P30/Ohkubo) of pre-T cell
(C/T hybrid) phenotype derived from an acutelympho
blastic leukemia with some phenotypic change durin
g clinical course. Nippon Ketsueki Gakkai Zasshi 4
6 (1983) 729-736)。C643R変異型GRの作用を調べるため
に、リガンド結合親和性および転写活性を試験した。そ
の結果、C643R変異型GRは、野生型GRの1/6のデキサメサ
ゾン結合親和性を有し(図5、表2)、かつ転写活性が
ほとんどない、もしくは全くないこと(図4)が示され
た。
胞中に存在するかどうかを調べるために、日本人10名の
個別の白血病細胞中のGR遺伝子のエクソン9αを配列決
定したが、これらの細胞において変異L753Fは検出され
なかった。本発明者らは、別の変異がこれらの細胞のGR
遺伝子中に存在すると仮定し、従ってGR遺伝子の他のコ
ード領域の配列を決定した。その中で、本発明者らは、
P30/OHK細胞のGR遺伝子エキソン7中のリガンド結合ドメ
イン(LBD)およびhsp90結合部位において別の変異C643R
を同定した。このP30/OHK細胞は、急性リンパ芽球性白
血病に罹患した日本人の骨髄性白血病細胞から樹立され
ている(M. Hirose, K. Minato, K. Tobinai, M. Ohira,
T. Ise, S. Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki,
T. Abe, Anovel pre-T cell line derived from acute
lymphoblastic leukemia. Gann 73 (1982) 600-605; M.
Hirose, K. Tobinai, K. Minato, M. Ohira, T. Ise,
S.Watanabe, M. Shimoyama, M. Taniwaki, T. Abe, A n
ovel cultured cell line(P30/Ohkubo) of pre-T cell
(C/T hybrid) phenotype derived from an acutelympho
blastic leukemia with some phenotypic change durin
g clinical course. Nippon Ketsueki Gakkai Zasshi 4
6 (1983) 729-736)。C643R変異型GRの作用を調べるため
に、リガンド結合親和性および転写活性を試験した。そ
の結果、C643R変異型GRは、野生型GRの1/6のデキサメサ
ゾン結合親和性を有し(図5、表2)、かつ転写活性が
ほとんどない、もしくは全くないこと(図4)が示され
た。
【0071】システインは、ヒト、ラットおよびマウス
のGR中の特異的リガンドの相互作用を促進することによ
り、重要な機能を果たしていることが報告されている。
ヒトGRのLBDは、5個のシステイン残基を、622番、638
番、643番、665番および736番に含み、かつこれらの5個
のシステインは、ヒト、ラットおよびマウスのGRにおい
て保存されている。更に、各々、ヒトGRのCys-622、-63
8、-643に相同であるラットGRのCys-640、-656、および
-661は、GRの柔軟なステロイド結合洞(binding cavity)
に関与し、かつCys-643は、結合ポケット(binding pock
et)の入り口付近に位置している(P. K. Chakraborti,
M. L. Garabedian, K. R. Yamamoto, S.S. Simons Jr.,
Role of cysteines 640, 656, and 661 in steroid bi
nding to rat glucocorticoid receptors. J. Biol. Ch
em. 267 (1992) 11366-11373; S. S. Simons Jr., W.
B. Pratt, Glucocorticoid receptor thiols and stero
id-binding activity. Methods Enzymol. 251 (1995) 4
06-422)。このうち、システイン643のセリンとの置換
は、野生型の親和性および生体活性を本質的に維持して
おり、このことはC643のチオールが重要ではないことを
示唆している(C. Yu, N. Warriar, M. V. Govindan, Cy
steines 638 and 665 in the hormone binding domain
of human glucocorticoid receptor define the specif
icity to glucocorticoids. Biochemistry 34 (1995) 1
4163-14173)。しかしながら、本実施例において、シス
テイン643のアルギニンへの置換は、低いグルココルチ
コイド結合親和性を引き起こした。これらの結果は、Ar
g-643が、その長い側鎖により、GRのステロイド結合ポ
ケットとデキサメサゾンの間の結合を妨害することを示
唆している。従って本発明者らは、システイン643のア
ルギニンへの変化は、グルココルチコイド結合洞の立体
配置の変化を惹起し、かつグルココルチコイドとの結合
の機能を低下するであろうと考えた。
のGR中の特異的リガンドの相互作用を促進することによ
り、重要な機能を果たしていることが報告されている。
ヒトGRのLBDは、5個のシステイン残基を、622番、638
番、643番、665番および736番に含み、かつこれらの5個
のシステインは、ヒト、ラットおよびマウスのGRにおい
て保存されている。更に、各々、ヒトGRのCys-622、-63
8、-643に相同であるラットGRのCys-640、-656、および
-661は、GRの柔軟なステロイド結合洞(binding cavity)
に関与し、かつCys-643は、結合ポケット(binding pock
et)の入り口付近に位置している(P. K. Chakraborti,
M. L. Garabedian, K. R. Yamamoto, S.S. Simons Jr.,
Role of cysteines 640, 656, and 661 in steroid bi
nding to rat glucocorticoid receptors. J. Biol. Ch
em. 267 (1992) 11366-11373; S. S. Simons Jr., W.
B. Pratt, Glucocorticoid receptor thiols and stero
id-binding activity. Methods Enzymol. 251 (1995) 4
06-422)。このうち、システイン643のセリンとの置換
は、野生型の親和性および生体活性を本質的に維持して
おり、このことはC643のチオールが重要ではないことを
示唆している(C. Yu, N. Warriar, M. V. Govindan, Cy
steines 638 and 665 in the hormone binding domain
of human glucocorticoid receptor define the specif
icity to glucocorticoids. Biochemistry 34 (1995) 1
4163-14173)。しかしながら、本実施例において、シス
テイン643のアルギニンへの置換は、低いグルココルチ
コイド結合親和性を引き起こした。これらの結果は、Ar
g-643が、その長い側鎖により、GRのステロイド結合ポ
ケットとデキサメサゾンの間の結合を妨害することを示
唆している。従って本発明者らは、システイン643のア
ルギニンへの変化は、グルココルチコイド結合洞の立体
配置の変化を惹起し、かつグルココルチコイドとの結合
の機能を低下するであろうと考えた。
【0072】GRは2種のタンパク質アイソフォームGRα
およびGRβを有しており、これらはGRmRNA前駆体の一次
転写産物の選択的スプライシングから生じる。GRβは、
グルココルチコイドに結合せず、かつGRα活性のインヒ
ビターである。最近、Stricklandら (Strickland et. a
l., High constitutive glucocorticoid receptor beta
in human neutrophils enables them to reduce their
spontaneous rate ofcell death in response to cort
icosteroids. J Exp Med. 193:585-94. (2001))が、ス
プライシング変異体GRβの構成的発現が、ヒト好中球に
おいて細胞死を減少することを示した。P30/OHK細胞に
おいて、野生型およびC643R変異型GR遺伝子はヘテロ接
合性で存在する。本発明者らは、C643R変異型GRが、選
択的スプライス変異体GRβのように作用し、その結果C6
43R変異型GRが、それ自身より少ない転写活性を有する
のみでなはく、GRα活性のインヒビターとしても作用す
ることを示した。従って本発明者らは、変異C643Rが、
グルココルチコイドに対する反応に影響を及ぼし、かつ
P30/OHK細胞においてアポトーシスを抑制することがで
きることを示唆する。
およびGRβを有しており、これらはGRmRNA前駆体の一次
転写産物の選択的スプライシングから生じる。GRβは、
グルココルチコイドに結合せず、かつGRα活性のインヒ
ビターである。最近、Stricklandら (Strickland et. a
l., High constitutive glucocorticoid receptor beta
in human neutrophils enables them to reduce their
spontaneous rate ofcell death in response to cort
icosteroids. J Exp Med. 193:585-94. (2001))が、ス
プライシング変異体GRβの構成的発現が、ヒト好中球に
おいて細胞死を減少することを示した。P30/OHK細胞に
おいて、野生型およびC643R変異型GR遺伝子はヘテロ接
合性で存在する。本発明者らは、C643R変異型GRが、選
択的スプライス変異体GRβのように作用し、その結果C6
43R変異型GRが、それ自身より少ない転写活性を有する
のみでなはく、GRα活性のインヒビターとしても作用す
ることを示した。従って本発明者らは、変異C643Rが、
グルココルチコイドに対する反応に影響を及ぼし、かつ
P30/OHK細胞においてアポトーシスを抑制することがで
きることを示唆する。
【0073】本発明者らは、他の9種の白血病細胞のコ
ード領域において、アミノ酸の非同義性(non-synonymou
s)変化を引き起こすようないかなる変異も検出しなかっ
た。これらの9種の細胞においては、いくつかの別の可
能性が考慮された。ひとつの可能性は、GRのmRNA発現に
影響を及ぼすある種の変異が、GRの転写調節部位に存在
し得ることである。更に別の可能性は、GR遺伝子のイン
トロン領域のある種の変異が、GRのスプライシング変異
体を生じ得ることである。従ってこれらの可能性を検討
するには、これらの9種の細胞のGR遺伝子の転写調節部
位およびイントロン領域の配列が興味深いように考えら
れた。
ード領域において、アミノ酸の非同義性(non-synonymou
s)変化を引き起こすようないかなる変異も検出しなかっ
た。これらの9種の細胞においては、いくつかの別の可
能性が考慮された。ひとつの可能性は、GRのmRNA発現に
影響を及ぼすある種の変異が、GRの転写調節部位に存在
し得ることである。更に別の可能性は、GR遺伝子のイン
トロン領域のある種の変異が、GRのスプライシング変異
体を生じ得ることである。従ってこれらの可能性を検討
するには、これらの9種の細胞のGR遺伝子の転写調節部
位およびイントロン領域の配列が興味深いように考えら
れた。
【0074】以上の知見は、ヒト白血病性P30/OHK細胞
のGR遺伝子のエクソン7において変異C643Rが存在し、か
つこの変異型C643Rがより少ないグルココルチコイド結
合親和性および転写活性を有することを示している。ま
た、アミノ酸残基643がGRのグルココルチコイド結合能
において重要であること、および変異C643Rが転写活性
に影響を及ぼしかつP30/OHK細胞においてグルココルチ
コイド耐性を惹起するすることを示すものである。
のGR遺伝子のエクソン7において変異C643Rが存在し、か
つこの変異型C643Rがより少ないグルココルチコイド結
合親和性および転写活性を有することを示している。ま
た、アミノ酸残基643がGRのグルココルチコイド結合能
において重要であること、および変異C643Rが転写活性
に影響を及ぼしかつP30/OHK細胞においてグルココルチ
コイド耐性を惹起するすることを示すものである。
【0075】一方、2314 ins-a 変異GRでは、細胞内局
在が変化することおよび転写活性化能が喪失することが
発明者らにより示された。本遺伝子変異は既に中国人狼
瘡(ループス)性腎炎の患者39名中8名で認められて
いる(Jiang T et al., Thephase-shift mutation in t
he glucocorticoid receptor gene: potential etiolog
ic significance of neuroendocrine mechanisms in lu
pus nephritis. ClinChim Acta. 313:113-117 (200
1))。この報告では、変異が認められた8名の患者でデ
キサメサゾン結合量は低下が認められているが、本変異
を持たない患者でもデキサメサゾン結合量の低下が認め
られたので、本変異とGR機能変化との相関は不明であっ
た。発明者らは本2314 ins-a 変異GRでは、転写活性可
能が喪失することを示し、本変異がGR機能の喪失をもた
らすことを初めて見出した(図4)。
在が変化することおよび転写活性化能が喪失することが
発明者らにより示された。本遺伝子変異は既に中国人狼
瘡(ループス)性腎炎の患者39名中8名で認められて
いる(Jiang T et al., Thephase-shift mutation in t
he glucocorticoid receptor gene: potential etiolog
ic significance of neuroendocrine mechanisms in lu
pus nephritis. ClinChim Acta. 313:113-117 (200
1))。この報告では、変異が認められた8名の患者でデ
キサメサゾン結合量は低下が認められているが、本変異
を持たない患者でもデキサメサゾン結合量の低下が認め
られたので、本変異とGR機能変化との相関は不明であっ
た。発明者らは本2314 ins-a 変異GRでは、転写活性可
能が喪失することを示し、本変異がGR機能の喪失をもた
らすことを初めて見出した(図4)。
【0076】GR蛋白質上には2カ所の核移行信号が存在
しているが、本2314 ins-a 変異により変異を起こす7
72〜777番目のアミノ酸は、2番目の核移行信号部
分に相当する。GRは通常、細胞質に局在し、リガンドで
あるグルココルチコイドの結合により細胞質から核に移
行して転写活性を発揮するが、本2314 ins-a変異ではグ
ルココルチコイドが結合していなくても核に移行してい
る可能性が考えられる。細胞全体のライゼートでは、GR
発現レベルが野生型GRと2314 ins-a 変異GRとで変化は
認められない(図3)が、細胞質では2314 ins-a 変異G
Rの発現レベルが低下している(図2)という結果は、
この考えを支持するものである。
しているが、本2314 ins-a 変異により変異を起こす7
72〜777番目のアミノ酸は、2番目の核移行信号部
分に相当する。GRは通常、細胞質に局在し、リガンドで
あるグルココルチコイドの結合により細胞質から核に移
行して転写活性を発揮するが、本2314 ins-a変異ではグ
ルココルチコイドが結合していなくても核に移行してい
る可能性が考えられる。細胞全体のライゼートでは、GR
発現レベルが野生型GRと2314 ins-a 変異GRとで変化は
認められない(図3)が、細胞質では2314 ins-a 変異G
Rの発現レベルが低下している(図2)という結果は、
この考えを支持するものである。
【0077】
【発明の効果】本発明者らによって、GRのグルココルチ
コイド結合能を低下させる、または該GRの有する転写活
性化能を低下させるGR遺伝子の多型とグルココルチコイ
ド製剤の有効性との関連が見出された。このことから、
本発明により、被検者におけるグルココルチコイド製剤
の有効性の検査方法および該検査方法に使用できる検査
試薬が提供された。本発明によって、グルココルチコイ
ド製剤の有効性を予測することができ、グルココルチコ
イド製剤に対して耐性を示す患者に対する適切な治療法
の開発が可能になるものと大いに期待される。
コイド結合能を低下させる、または該GRの有する転写活
性化能を低下させるGR遺伝子の多型とグルココルチコイ
ド製剤の有効性との関連が見出された。このことから、
本発明により、被検者におけるグルココルチコイド製剤
の有効性の検査方法および該検査方法に使用できる検査
試薬が提供された。本発明によって、グルココルチコイ
ド製剤の有効性を予測することができ、グルココルチコ
イド製剤に対して耐性を示す患者に対する適切な治療法
の開発が可能になるものと大いに期待される。
【0078】
【配列表】
SEQUENCE LISTING
<110> National Institute of Health Sciences
The Organization for Pharmaceutical Safety and Research
Genox Research, Inc.
<120> Methods for evaluating the effectiveness of glucocorticoid on a pa
tient
<130> G1-A0116
<140>
<141>
<160> 31
<170> PatentIn Ver. 2.1
<210> 1
<211> 2334
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2331)
<400> 1
atg gac tcc aaa gaa tca tta act cct ggt aga gaa gaa aac ccc agc 48
Met Asp Ser Lys Glu Ser Leu Thr Pro Gly Arg Glu Glu Asn Pro Ser
1 5 10 15
agt gtg ctt gct cag gag agg gga gat gtg atg gac ttc tat aaa acc 96
Ser Val Leu Ala Gln Glu Arg Gly Asp Val Met Asp Phe Tyr Lys Thr
20 25 30
cta aga gga gga gct act gtg aag gtt tct gcg tct tca ccc tca ctg 144
Leu Arg Gly Gly Ala Thr Val Lys Val Ser Ala Ser Ser Pro Ser Leu
35 40 45
gct gtc gct tct caa tca gac tcc aag cag cga aga ctt ttg gtt gat 192
Ala Val Ala Ser Gln Ser Asp Ser Lys Gln Arg Arg Leu Leu Val Asp
50 55 60
ttt cca aaa ggc tca gta agc aat gcg cag cag cca gat ctg tcc aaa 240
Phe Pro Lys Gly Ser Val Ser Asn Ala Gln Gln Pro Asp Leu Ser Lys
65 70 75 80
gca gtt tca ctc tca atg gga ctg tat atg gga gag aca gaa aca aaa 288
Ala Val Ser Leu Ser Met Gly Leu Tyr Met Gly Glu Thr Glu Thr Lys
85 90 95
gtg atg gga aat gac ctg gga ttc cca cag cag ggc caa atc agc ctt 336
Val Met Gly Asn Asp Leu Gly Phe Pro Gln Gln Gly Gln Ile Ser Leu
100 105 110
tcc tcg ggg gaa aca gac tta aag ctt ttg gaa gaa agc att gca aac 384
Ser Ser Gly Glu Thr Asp Leu Lys Leu Leu Glu Glu Ser Ile Ala Asn
115 120 125
ctc aat agg tcg acc agt gtt cca gag aac ccc aag agt tca gca tcc 432
Leu Asn Arg Ser Thr Ser Val Pro Glu Asn Pro Lys Ser Ser Ala Ser
130 135 140
act gct gtg tct gct gcc ccc aca gag aag gag ttt cca aaa act cac 480
Thr Ala Val Ser Ala Ala Pro Thr Glu Lys Glu Phe Pro Lys Thr His
145 150 155 160
tct gat gta tct tca gaa cag caa cat ttg aag ggc cag act ggc acc 528
Ser Asp Val Ser Ser Glu Gln Gln His Leu Lys Gly Gln Thr Gly Thr
165 170 175
aac ggt ggc aat gtg aaa ttg tat acc aca gac caa agc acc ttt gac 576
Asn Gly Gly Asn Val Lys Leu Tyr Thr Thr Asp Gln Ser Thr Phe Asp
180 185 190
att ttg cag gat ttg gag ttt tct tct ggg tcc cca ggt aaa gag acg 624
Ile Leu Gln Asp Leu Glu Phe Ser Ser Gly Ser Pro Gly Lys Glu Thr
195 200 205
aat gag agt cct tgg aga tca gac ctg ttg ata gat gaa aac tgt ttg 672
Asn Glu Ser Pro Trp Arg Ser Asp Leu Leu Ile Asp Glu Asn Cys Leu
210 215 220
ctt tct cct ctg gcg gga gaa gac gat tca ttc ctt ttg gaa gga aac 720
Leu Ser Pro Leu Ala Gly Glu Asp Asp Ser Phe Leu Leu Glu Gly Asn
225 230 235 240
tcg aat gag gac tgc aag cct ctc att tta ccg gac act aaa ccc aaa 768
Ser Asn Glu Asp Cys Lys Pro Leu Ile Leu Pro Asp Thr Lys Pro Lys
245 250 255
att aag gat aat gga gat ctg gtt ttg tca agc ccc agt aat gta aca 816
Ile Lys Asp Asn Gly Asp Leu Val Leu Ser Ser Pro Ser Asn Val Thr
260 265 270
ctg ccc caa gtg aaa aca gaa aaa gaa gat ttc atc gaa ctc tgc acc 864
Leu Pro Gln Val Lys Thr Glu Lys Glu Asp Phe Ile Glu Leu Cys Thr
275 280 285
cct ggg gta att aag caa gag aaa ctg ggc aca gtt tac tgt cag gca 912
Pro Gly Val Ile Lys Gln Glu Lys Leu Gly Thr Val Tyr Cys Gln Ala
290 295 300
agc ttt cct gga gca aat ata att ggt aat aaa atg tct gcc att tct 960
Ser Phe Pro Gly Ala Asn Ile Ile Gly Asn Lys Met Ser Ala Ile Ser
305 310 315 320
gtt cat ggt gtg agt acc tct gga gga cag atg tac cac tat gac atg 1008
Val His Gly Val Ser Thr Ser Gly Gly Gln Met Tyr His Tyr Asp Met
325 330 335
aat aca gca tcc ctt tct caa cag cag gat cag aag cct att ttt aat 1056
Asn Thr Ala Ser Leu Ser Gln Gln Gln Asp Gln Lys Pro Ile Phe Asn
340 345 350
gtc att cca cca att ccc gtt ggt tcc gaa aat tgg aat agg tgc caa 1104
Val Ile Pro Pro Ile Pro Val Gly Ser Glu Asn Trp Asn Arg Cys Gln
355 360 365
gga tct gga gat gac aac ttg act tct ctg ggg act ctg aac ttc cct 1152
Gly Ser Gly Asp Asp Asn Leu Thr Ser Leu Gly Thr Leu Asn Phe Pro
370 375 380
ggt cga aca gtt ttt tct aat ggc tat tca agc ccc agc atg aga cca 1200
Gly Arg Thr Val Phe Ser Asn Gly Tyr Ser Ser Pro Ser Met Arg Pro
385 390 395 400
gat gta agc tct cct cca tcc agc tcc tca aca gca aca aca gga cca 1248
Asp Val Ser Ser Pro Pro Ser Ser Ser Ser Thr Ala Thr Thr Gly Pro
405 410 415
cct ccc aaa ctc tgc ctg gtg tgc tct gat gaa gct tca gga tgt cat 1296
Pro Pro Lys Leu Cys Leu Val Cys Ser Asp Glu Ala Ser Gly Cys His
420 425 430
tat gga gtc tta act tgt gga agc tgt aaa gtt ttc ttc aaa aga gca 1344
Tyr Gly Val Leu Thr Cys Gly Ser Cys Lys Val Phe Phe Lys Arg Ala
435 440 445
gtg gaa gga cag cac aat tac cta tgt gct gga agg aat gat tgc atc 1392
Val Glu Gly Gln His Asn Tyr Leu Cys Ala Gly Arg Asn Asp Cys Ile
450 455 460
atc gat aaa att cga aga aaa aac tgc cca gca tgc cgc tat cga aaa 1440
Ile Asp Lys Ile Arg Arg Lys Asn Cys Pro Ala Cys Arg Tyr Arg Lys
465 470 475 480
tgt ctt cag gct gga atg aac ctg gaa gct cga aaa aca aag aaa aaa 1488
Cys Leu Gln Ala Gly Met Asn Leu Glu Ala Arg Lys Thr Lys Lys Lys
485 490 495
ata aaa gga att cag cag gcc act aca gga gtc tca caa gaa acc tct 1536
Ile Lys Gly Ile Gln Gln Ala Thr Thr Gly Val Ser Gln Glu Thr Ser
500 505 510
gaa aat cct ggt aac aaa aca ata gtt cct gca acg tta cca caa ctc 1584
Glu Asn Pro Gly Asn Lys Thr Ile Val Pro Ala Thr Leu Pro Gln Leu
515 520 525
acc cct acc ctg gtg tca ctg ttg gag gtt att gaa cct gaa gtg tta 1632
Thr Pro Thr Leu Val Ser Leu Leu Glu Val Ile Glu Pro Glu Val Leu
530 535 540
tat gca gga tat gat agc tct gtt cca gac tca act tgg agg atc atg 1680
Tyr Ala Gly Tyr Asp Ser Ser Val Pro Asp Ser Thr Trp Arg Ile Met
545 550 555 560
act acg ctc aac atg tta gga ggg cgg caa gtg att gca gca gtg aaa 1728
Thr Thr Leu Asn Met Leu Gly Gly Arg Gln Val Ile Ala Ala Val Lys
565 570 575
tgg gca aag gca ata cca ggt ttc agg aac tta cac ctg gat gac caa 1776
Trp Ala Lys Ala Ile Pro Gly Phe Arg Asn Leu His Leu Asp Asp Gln
580 585 590
atg acc cta ctg cag tac tcc tgg atg ttt ctt atg gca ttt gct ctg 1824
Met Thr Leu Leu Gln Tyr Ser Trp Met Phe Leu Met Ala Phe Ala Leu
595 600 605
ggg tgg aga tca tat aga caa tca agt gca aac ctg ctg tgt ttt gct 1872
Gly Trp Arg Ser Tyr Arg Gln Ser Ser Ala Asn Leu Leu Cys Phe Ala
610 615 620
cct gat ctg att att aat gag cag aga atg act cta ccc tgc atg tac 1920
Pro Asp Leu Ile Ile Asn Glu Gln Arg Met Thr Leu Pro Cys Met Tyr
625 630 635 640
gac caa tgt aaa cac atg ctg tat gtt tcc tct gag tta cac agg ctt 1968
Asp Gln Cys Lys His Met Leu Tyr Val Ser Ser Glu Leu His Arg Leu
645 650 655
cag gta tct tat gaa gag tat ctc tgt atg aaa acc tta ctg ctt ctc 2016
Gln Val Ser Tyr Glu Glu Tyr Leu Cys Met Lys Thr Leu Leu Leu Leu
660 665 670
tct tca gtt cct aag gac ggt ctg aag agc caa gag cta ttt gat gaa 2064
Ser Ser Val Pro Lys Asp Gly Leu Lys Ser Gln Glu Leu Phe Asp Glu
675 680 685
att aga atg acc tac atc aaa gag cta gga aaa gcc att gtc aag agg 2112
Ile Arg Met Thr Tyr Ile Lys Glu Leu Gly Lys Ala Ile Val Lys Arg
690 695 700
gaa gga aac tcc agc cag aac tgg cag cgg ttt tat caa ctg aca aaa 2160
Glu Gly Asn Ser Ser Gln Asn Trp Gln Arg Phe Tyr Gln Leu Thr Lys
705 710 715 720
ctc ttg gat tct atg cat gaa gtg gtt gaa aat ctc ctt aac tat tgc 2208
Leu Leu Asp Ser Met His Glu Val Val Glu Asn Leu Leu Asn Tyr Cys
725 730 735
ttc caa aca ttt ttg gat aag acc atg agt att gaa ttc ccc gag atg 2256
Phe Gln Thr Phe Leu Asp Lys Thr Met Ser Ile Glu Phe Pro Glu Met
740 745 750
tta gct gaa atc atc acc aat cag ata cca aaa tat tca aat gga aat 2304
Leu Ala Glu Ile Ile Thr Asn Gln Ile Pro Lys Tyr Ser Asn Gly Asn
755 760 765
atc aaa aaa ctt ctg ttt cat caa aag tga 2334
Ile Lys Lys Leu Leu Phe His Gln Lys
770 775
<210> 2
<211> 777
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 2
Met Asp Ser Lys Glu Ser Leu Thr Pro Gly Arg Glu Glu Asn Pro Ser
1 5 10 15
Ser Val Leu Ala Gln Glu Arg Gly Asp Val Met Asp Phe Tyr Lys Thr
20 25 30
Leu Arg Gly Gly Ala Thr Val Lys Val Ser Ala Ser Ser Pro Ser Leu
35 40 45
Ala Val Ala Ser Gln Ser Asp Ser Lys Gln Arg Arg Leu Leu Val Asp
50 55 60
Phe Pro Lys Gly Ser Val Ser Asn Ala Gln Gln Pro Asp Leu Ser Lys
65 70 75 80
Ala Val Ser Leu Ser Met Gly Leu Tyr Met Gly Glu Thr Glu Thr Lys
85 90 95
Val Met Gly Asn Asp Leu Gly Phe Pro Gln Gln Gly Gln Ile Ser Leu
100 105 110
Ser Ser Gly Glu Thr Asp Leu Lys Leu Leu Glu Glu Ser Ile Ala Asn
115 120 125
Leu Asn Arg Ser Thr Ser Val Pro Glu Asn Pro Lys Ser Ser Ala Ser
130 135 140
Thr Ala Val Ser Ala Ala Pro Thr Glu Lys Glu Phe Pro Lys Thr His
145 150 155 160
Ser Asp Val Ser Ser Glu Gln Gln His Leu Lys Gly Gln Thr Gly Thr
165 170 175
Asn Gly Gly Asn Val Lys Leu Tyr Thr Thr Asp Gln Ser Thr Phe Asp
180 185 190
Ile Leu Gln Asp Leu Glu Phe Ser Ser Gly Ser Pro Gly Lys Glu Thr
195 200 205
Asn Glu Ser Pro Trp Arg Ser Asp Leu Leu Ile Asp Glu Asn Cys Leu
210 215 220
Leu Ser Pro Leu Ala Gly Glu Asp Asp Ser Phe Leu Leu Glu Gly Asn
225 230 235 240
Ser Asn Glu Asp Cys Lys Pro Leu Ile Leu Pro Asp Thr Lys Pro Lys
245 250 255
Ile Lys Asp Asn Gly Asp Leu Val Leu Ser Ser Pro Ser Asn Val Thr
260 265 270
Leu Pro Gln Val Lys Thr Glu Lys Glu Asp Phe Ile Glu Leu Cys Thr
275 280 285
Pro Gly Val Ile Lys Gln Glu Lys Leu Gly Thr Val Tyr Cys Gln Ala
290 295 300
Ser Phe Pro Gly Ala Asn Ile Ile Gly Asn Lys Met Ser Ala Ile Ser
305 310 315 320
Val His Gly Val Ser Thr Ser Gly Gly Gln Met Tyr His Tyr Asp Met
325 330 335
Asn Thr Ala Ser Leu Ser Gln Gln Gln Asp Gln Lys Pro Ile Phe Asn
340 345 350
Val Ile Pro Pro Ile Pro Val Gly Ser Glu Asn Trp Asn Arg Cys Gln
355 360 365
Gly Ser Gly Asp Asp Asn Leu Thr Ser Leu Gly Thr Leu Asn Phe Pro
370 375 380
Gly Arg Thr Val Phe Ser Asn Gly Tyr Ser Ser Pro Ser Met Arg Pro
385 390 395 400
Asp Val Ser Ser Pro Pro Ser Ser Ser Ser Thr Ala Thr Thr Gly Pro
405 410 415
Pro Pro Lys Leu Cys Leu Val Cys Ser Asp Glu Ala Ser Gly Cys His
420 425 430
Tyr Gly Val Leu Thr Cys Gly Ser Cys Lys Val Phe Phe Lys Arg Ala
435 440 445
Val Glu Gly Gln His Asn Tyr Leu Cys Ala Gly Arg Asn Asp Cys Ile
450 455 460
Ile Asp Lys Ile Arg Arg Lys Asn Cys Pro Ala Cys Arg Tyr Arg Lys
465 470 475 480
Cys Leu Gln Ala Gly Met Asn Leu Glu Ala Arg Lys Thr Lys Lys Lys
485 490 495
Ile Lys Gly Ile Gln Gln Ala Thr Thr Gly Val Ser Gln Glu Thr Ser
500 505 510
Glu Asn Pro Gly Asn Lys Thr Ile Val Pro Ala Thr Leu Pro Gln Leu
515 520 525
Thr Pro Thr Leu Val Ser Leu Leu Glu Val Ile Glu Pro Glu Val Leu
530 535 540
Tyr Ala Gly Tyr Asp Ser Ser Val Pro Asp Ser Thr Trp Arg Ile Met
545 550 555 560
Thr Thr Leu Asn Met Leu Gly Gly Arg Gln Val Ile Ala Ala Val Lys
565 570 575
Trp Ala Lys Ala Ile Pro Gly Phe Arg Asn Leu His Leu Asp Asp Gln
580 585 590
Met Thr Leu Leu Gln Tyr Ser Trp Met Phe Leu Met Ala Phe Ala Leu
595 600 605
Gly Trp Arg Ser Tyr Arg Gln Ser Ser Ala Asn Leu Leu Cys Phe Ala
610 615 620
Pro Asp Leu Ile Ile Asn Glu Gln Arg Met Thr Leu Pro Cys Met Tyr
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Asp Gln Cys Lys His Met Leu Tyr Val Ser Ser Glu Leu His Arg Leu
645 650 655
Gln Val Ser Tyr Glu Glu Tyr Leu Cys Met Lys Thr Leu Leu Leu Leu
660 665 670
Ser Ser Val Pro Lys Asp Gly Leu Lys Ser Gln Glu Leu Phe Asp Glu
675 680 685
Ile Arg Met Thr Tyr Ile Lys Glu Leu Gly Lys Ala Ile Val Lys Arg
690 695 700
Glu Gly Asn Ser Ser Gln Asn Trp Gln Arg Phe Tyr Gln Leu Thr Lys
705 710 715 720
Leu Leu Asp Ser Met His Glu Val Val Glu Asn Leu Leu Asn Tyr Cys
725 730 735
Phe Gln Thr Phe Leu Asp Lys Thr Met Ser Ile Glu Phe Pro Glu Met
740 745 750
Leu Ala Glu Ile Ile Thr Asn Gln Ile Pro Lys Tyr Ser Asn Gly Asn
755 760 765
Ile Lys Lys Leu Leu Phe His Gln Lys
770 775
<210> 3
<211> 2334
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(2331)
<400> 3
atg gac tcc aaa gaa tca tta act cct ggt aga gaa gaa aac ccc agc 48
Met Asp Ser Lys Glu Ser Leu Thr Pro Gly Arg Glu Glu Asn Pro Ser
1 5 10 15
agt gtg ctt gct cag gag agg gga gat gtg atg gac ttc tat aaa acc 96
Ser Val Leu Ala Gln Glu Arg Gly Asp Val Met Asp Phe Tyr Lys Thr
20 25 30
cta aga gga gga gct act gtg aag gtt tct gcg tct tca ccc tca ctg 144
Leu Arg Gly Gly Ala Thr Val Lys Val Ser Ala Ser Ser Pro Ser Leu
35 40 45
gct gtc gct tct caa tca gac tcc aag cag cga aga ctt ttg gtt gat 192
Ala Val Ala Ser Gln Ser Asp Ser Lys Gln Arg Arg Leu Leu Val Asp
50 55 60
ttt cca aaa ggc tca gta agc aat gcg cag cag cca gat ctg tcc aaa 240
Phe Pro Lys Gly Ser Val Ser Asn Ala Gln Gln Pro Asp Leu Ser Lys
65 70 75 80
gca gtt tca ctc tca atg gga ctg tat atg gga gag aca gaa aca aaa 288
Ala Val Ser Leu Ser Met Gly Leu Tyr Met Gly Glu Thr Glu Thr Lys
85 90 95
gtg atg gga aat gac ctg gga ttc cca cag cag ggc caa atc agc ctt 336
Val Met Gly Asn Asp Leu Gly Phe Pro Gln Gln Gly Gln Ile Ser Leu
100 105 110
tcc tcg ggg gaa aca gac tta aag ctt ttg gaa gaa agc att gca aac 384
Ser Ser Gly Glu Thr Asp Leu Lys Leu Leu Glu Glu Ser Ile Ala Asn
115 120 125
ctc aat agg tcg acc agt gtt cca gag aac ccc aag agt tca gca tcc 432
Leu Asn Arg Ser Thr Ser Val Pro Glu Asn Pro Lys Ser Ser Ala Ser
130 135 140
act gct gtg tct gct gcc ccc aca gag aag gag ttt cca aaa act cac 480
Thr Ala Val Ser Ala Ala Pro Thr Glu Lys Glu Phe Pro Lys Thr His
145 150 155 160
tct gat gta tct tca gaa cag caa cat ttg aag ggc cag act ggc acc 528
Ser Asp Val Ser Ser Glu Gln Gln His Leu Lys Gly Gln Thr Gly Thr
165 170 175
aac ggt ggc aat gtg aaa ttg tat acc aca gac caa agc acc ttt gac 576
Asn Gly Gly Asn Val Lys Leu Tyr Thr Thr Asp Gln Ser Thr Phe Asp
180 185 190
att ttg cag gat ttg gag ttt tct tct ggg tcc cca ggt aaa gag acg 624
Ile Leu Gln Asp Leu Glu Phe Ser Ser Gly Ser Pro Gly Lys Glu Thr
195 200 205
aat gag agt cct tgg aga tca gac ctg ttg ata gat gaa aac tgt ttg 672
Asn Glu Ser Pro Trp Arg Ser Asp Leu Leu Ile Asp Glu Asn Cys Leu
210 215 220
ctt tct cct ctg gcg gga gaa gac gat tca ttc ctt ttg gaa gga aac 720
Leu Ser Pro Leu Ala Gly Glu Asp Asp Ser Phe Leu Leu Glu Gly Asn
225 230 235 240
tcg aat gag gac tgc aag cct ctc att tta ccg gac act aaa ccc aaa 768
Ser Asn Glu Asp Cys Lys Pro Leu Ile Leu Pro Asp Thr Lys Pro Lys
245 250 255
att aag gat aat gga gat ctg gtt ttg tca agc ccc agt aat gta aca 816
Ile Lys Asp Asn Gly Asp Leu Val Leu Ser Ser Pro Ser Asn Val Thr
260 265 270
ctg ccc caa gtg aaa aca gaa aaa gaa gat ttc atc gaa ctc tgc acc 864
Leu Pro Gln Val Lys Thr Glu Lys Glu Asp Phe Ile Glu Leu Cys Thr
275 280 285
cct ggg gta att aag caa gag aaa ctg ggc aca gtt tac tgt cag gca 912
Pro Gly Val Ile Lys Gln Glu Lys Leu Gly Thr Val Tyr Cys Gln Ala
290 295 300
agc ttt cct gga gca aat ata att ggt aat aaa atg tct gcc att tct 960
Ser Phe Pro Gly Ala Asn Ile Ile Gly Asn Lys Met Ser Ala Ile Ser
305 310 315 320
gtt cat ggt gtg agt acc tct gga gga cag atg tac cac tat gac atg 1008
Val His Gly Val Ser Thr Ser Gly Gly Gln Met Tyr His Tyr Asp Met
325 330 335
aat aca gca tcc ctt tct caa cag cag gat cag aag cct att ttt aat 1056
Asn Thr Ala Ser Leu Ser Gln Gln Gln Asp Gln Lys Pro Ile Phe Asn
340 345 350
gtc att cca cca att ccc gtt ggt tcc gaa aat tgg aat agg tgc caa 1104
Val Ile Pro Pro Ile Pro Val Gly Ser Glu Asn Trp Asn Arg Cys Gln
355 360 365
gga tct gga gat gac aac ttg act tct ctg ggg act ctg aac ttc cct 1152
Gly Ser Gly Asp Asp Asn Leu Thr Ser Leu Gly Thr Leu Asn Phe Pro
370 375 380
ggt cga aca gtt ttt tct aat ggc tat tca agc ccc agc atg aga cca 1200
Gly Arg Thr Val Phe Ser Asn Gly Tyr Ser Ser Pro Ser Met Arg Pro
385 390 395 400
gat gta agc tct cct cca tcc agc tcc tca aca gca aca aca gga cca 1248
Asp Val Ser Ser Pro Pro Ser Ser Ser Ser Thr Ala Thr Thr Gly Pro
405 410 415
cct ccc aaa ctc tgc ctg gtg tgc tct gat gaa gct tca gga tgt cat 1296
Pro Pro Lys Leu Cys Leu Val Cys Ser Asp Glu Ala Ser Gly Cys His
420 425 430
tat gga gtc tta act tgt gga agc tgt aaa gtt ttc ttc aaa aga gca 1344
Tyr Gly Val Leu Thr Cys Gly Ser Cys Lys Val Phe Phe Lys Arg Ala
435 440 445
gtg gaa gga cag cac aat tac cta tgt gct gga agg aat gat tgc atc 1392
Val Glu Gly Gln His Asn Tyr Leu Cys Ala Gly Arg Asn Asp Cys Ile
450 455 460
atc gat aaa att cga aga aaa aac tgc cca gca tgc cgc tat cga aaa 1440
Ile Asp Lys Ile Arg Arg Lys Asn Cys Pro Ala Cys Arg Tyr Arg Lys
465 470 475 480
tgt ctt cag gct gga atg aac ctg gaa gct cga aaa aca aag aaa aaa 1488
Cys Leu Gln Ala Gly Met Asn Leu Glu Ala Arg Lys Thr Lys Lys Lys
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ata aaa gga att cag cag gcc act aca gga gtc tca caa gaa acc tct 1536
Ile Lys Gly Ile Gln Gln Ala Thr Thr Gly Val Ser Gln Glu Thr Ser
500 505 510
gaa aat cct ggt aac aaa aca ata gtt cct gca acg tta cca caa ctc 1584
Glu Asn Pro Gly Asn Lys Thr Ile Val Pro Ala Thr Leu Pro Gln Leu
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acc cct acc ctg gtg tca ctg ttg gag gtt att gaa cct gaa gtg tta 1632
Thr Pro Thr Leu Val Ser Leu Leu Glu Val Ile Glu Pro Glu Val Leu
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tat gca gga tat gat agc tct gtt cca gac tca act tgg agg atc atg 1680
Tyr Ala Gly Tyr Asp Ser Ser Val Pro Asp Ser Thr Trp Arg Ile Met
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act acg ctc aac atg tta gga ggg cgg caa gtg att gca gca gtg aaa 1728
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att aga atg acc tac atc aaa gag cta gga aaa gcc att gtc aag agg 2112
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<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
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<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 10
aacaaaagtg atgggaaatg ac 22
<210> 11
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 11
aactgtttgc tttctcctct gg 22
<210> 12
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 12
gcaagcctct cattttaccg 20
<210> 13
<211> 26
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 13
ttctttttct gttttcactt ggggca 26
<210> 14
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 14
acatctatta atctccttaa atgtccattc 30
<210> 15
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 15
tgaagtgaga agctaagaga actg 24
<210> 16
<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 16
cgtgagaaat aaaaccaagt agagg 25
<210> 17
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 17
gacagaaggc tgtccttata a 21
<210> 18
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 18
catctgctta cgtgtatctt ca 22
<210> 19
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 19
tcttgaataa actgtgtagc gc 22
<210> 20
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 20
tccctatcac ctgtattcac c 21
<210> 21
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 21
tttccatttt ctgttagggg tg 22
<210> 22
<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 22
agtcaatcag gaaaacatca gc 22
<210> 23
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 23
tttttggggg gaagtagcag 20
<210> 24
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
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<400> 24
aacagagatc cctatgcagc 20
<210> 25
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 25
gacacagtga gaccctatct 20
<210> 26
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 26
caccaacatc cacaaactgg 20
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<211> 22
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 27
tgagatgttc ccactgacca at 22
<210> 28
<211> 23
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
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<400> 28
caccatctac tctcccatca ctg 23
<210> 29
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 29
cagaatctca taggttgcca ataat 25
<210> 30
<211> 21
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: An
Artificially Synthesized Primer Sequence
<400> 30
aacagcacca ccatatagca c 21
<210> 31
<211> 20
<212> DNA
<213> Homo sapiens
<400> 31
tacgaccaat gtaaacacat 20
【図面の簡単な説明】
【図1】 野生型GRおよびC643R変異型GRのウェスタン
ブロット分析結果を示す写真である。細胞質画分は、ベ
クター、野生型又はC643R変異型GR発現プラスミドのい
ずれかでトランスフェクションしたCOS-7細胞から調製
した。この細胞質画分(50μg)を、電気泳動しかつブロ
ットした。
ブロット分析結果を示す写真である。細胞質画分は、ベ
クター、野生型又はC643R変異型GR発現プラスミドのい
ずれかでトランスフェクションしたCOS-7細胞から調製
した。この細胞質画分(50μg)を、電気泳動しかつブロ
ットした。
【図2】 細胞質画分を用いた野生型GRおよび2314 ins
-a変異型GRのウェスタンブロット分析結果を示す写真で
ある。細胞質画分は、ベクター、野生型又は2314 ins-a
変異型GR発現プラスミドのいずれかでトランスフェクシ
ョンしたCOS-7細胞から調製した。この細胞質画分(50μ
g)を、電気泳動しかつブロットした。
-a変異型GRのウェスタンブロット分析結果を示す写真で
ある。細胞質画分は、ベクター、野生型又は2314 ins-a
変異型GR発現プラスミドのいずれかでトランスフェクシ
ョンしたCOS-7細胞から調製した。この細胞質画分(50μ
g)を、電気泳動しかつブロットした。
【図3】 細胞全体のライゼートを用いた野生型GRおよ
び2314 ins-a変異型GRのウェスタンブロット分析結果を
示す写真である。細胞全体のライゼートは、ベクター、
野生型又は2314 ins-a変異型GR発現プラスミドのいずれ
かでトランスフェクションしたCOS-7細胞から調製し
た。この細胞全体のライゼート(80μg)を、電気泳動し
かつブロットした。
び2314 ins-a変異型GRのウェスタンブロット分析結果を
示す写真である。細胞全体のライゼートは、ベクター、
野生型又は2314 ins-a変異型GR発現プラスミドのいずれ
かでトランスフェクションしたCOS-7細胞から調製し
た。この細胞全体のライゼート(80μg)を、電気泳動し
かつブロットした。
【図4】 野生型、C643R変異型GRおよび2314 ins-a 変
異GRが有する転写活性の測定結果を示す図である。COS-
7細胞は、ベクター、野生型GR、C643R変異型GR、または
2314 ins-a 変異GRのいずれかにより、MMTVプロモータ
ー-ルシフェラーゼレポーター構築体(pHH-Luc)と一緒に
トランスフェクションした。デキサメサゾンと18時間イ
ンキュベーションした後、ルシフェラーゼ活性を測定し
た。
異GRが有する転写活性の測定結果を示す図である。COS-
7細胞は、ベクター、野生型GR、C643R変異型GR、または
2314 ins-a 変異GRのいずれかにより、MMTVプロモータ
ー-ルシフェラーゼレポーター構築体(pHH-Luc)と一緒に
トランスフェクションした。デキサメサゾンと18時間イ
ンキュベーションした後、ルシフェラーゼ活性を測定し
た。
【図5】 野生型およびC643R変異型GRのデキサメサゾ
ンへの結合親和性の分析結果を示す図である。代表的実
験のひとつを表している。野生型およびC643R変異型GR
は、COS-7細胞内で一過性に発現した。細胞を、トラン
スフェクション後48時間で収集し、かつ[3H]デキサメ
サゾンへの特異的結合を、細胞質画分のインキュベーシ
ョンにより分析した。この結合データは、Scatchardプ
ロット解析に従い分析した。3回個別の結合アッセイを
行った。変異型GRの親和性は、野生型の値の 1/6であっ
た。
ンへの結合親和性の分析結果を示す図である。代表的実
験のひとつを表している。野生型およびC643R変異型GR
は、COS-7細胞内で一過性に発現した。細胞を、トラン
スフェクション後48時間で収集し、かつ[3H]デキサメ
サゾンへの特異的結合を、細胞質画分のインキュベーシ
ョンにより分析した。この結合データは、Scatchardプ
ロット解析に従い分析した。3回個別の結合アッセイを
行った。変異型GRの親和性は、野生型の値の 1/6であっ
た。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(72)発明者 澤田 純一
東京都世田谷区上用賀1−18−1 国立医
薬品食品衛生研究所内
(72)発明者 小澤 正吾
東京都世田谷区上用賀1−18−1 国立医
薬品食品衛生研究所内
(72)発明者 齋藤 嘉朗
東京都世田谷区上用賀1−18−1 国立医
薬品食品衛生研究所内
Fターム(参考) 4B024 AA11 BA63 CA01 CA04 CA06
CA11 DA02 EA02 EA04 FA02
FA10 GA11 GA18 HA01 HA12
HA19
4B063 QA05 QA13 QA17 QQ12 QQ42
QR08 QR55 QR62 QS16 QS25
QS39
Claims (22)
- 【請求項1】 被検者におけるグルココルチコイド製剤
の有効性の検査方法であって、グルココルチコイド受容
体のグルココルチコイド結合能を低下させる、または該
受容体の有する転写活性化能を低下させるグルココルチ
コイド受容体遺伝子の多型を検出する工程を含み、多型
が検出された場合に、被検者はグルココルチコイド製剤
に対して耐性であると判定される検査方法。 - 【請求項2】 多型が一塩基多型である、請求項1に記
載の検査方法。 - 【請求項3】 グルココルチコイド受容体遺伝子の多型
が、グルココルチコイド受容体の643番目のアミノ酸
変異をもたらすものである、請求項1に記載の検査方
法。 - 【請求項4】 グルココルチコイド受容体遺伝子の多型
が、グルココルチコイド受容体の643番目のアミノ酸
変異をもたらす多型、および該受容体の772〜777
番目のアミノ酸変異をもたらす多型である、請求項1に
記載の検査方法。 - 【請求項5】 グルココルチコイド受容体の643番目
のアミノ酸変異が、システインからアルギニンへの変異
である、請求項3または4に記載の検査方法。 - 【請求項6】 グルココルチコイド受容体の643番目
のアミノ酸変異をもたらす該受容体遺伝子の多型が、該
遺伝子のcDNA配列において1927番目の塩基部位
の多型である、請求項3または4に記載の検査方法。 - 【請求項7】 グルココルチコイド受容体遺伝子のcD
NA配列において1927番目の塩基部位の多型が、チ
ミンからシトシンへの変異である、請求項6に記載の検
査方法。 - 【請求項8】 グルココルチコイド受容体の772〜7
77番目のアミノ酸変異をもたらす該受容体遺伝子の多
型が、該遺伝子のcDNA配列において2314番目の
塩基部位の多型である、請求項4に記載の検査方法。 - 【請求項9】 グルココルチコイド受容体遺伝子のcD
NA配列において2314番目の塩基部位の多型が、該
部位への一塩基挿入変異である、請求項8に記載の検査
方法。 - 【請求項10】 グルココルチコイド結合能が、デキサ
メゾン結合能である、請求項1〜9のいずれかに記載の
検査方法。 - 【請求項11】 以下の(a)〜(d)の工程を含む、
請求項1〜10のいずれかに記載の検査方法。 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを単離する工程 (c)単離したDNAの塩基配列を決定する工程 (d)工程(c)により決定したDNAの塩基配列を、
対照と比較する工程 - 【請求項12】 以下の(a)〜(d)の工程を含む、
請求項1〜10のいずれかに記載の検査方法。 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)調製したDNA試料を制限酵素により切断する工
程 (c)DNA断片をその大きさに応じて分離する工程 (d)検出されたDNA断片の大きさを、対照と比較す
る工程 - 【請求項13】 以下の(a)〜(e)の工程を含む、
請求項1〜10のいずれかに記載の検査方法。 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを制限酵素により切断する工程 (d)DNA断片をその大きさに応じて分離する工程 (e)検出されたDNA断片の大きさを、対照と比較す
る工程 - 【請求項14】 以下の(a)〜(e)の工程を含む、
請求項1〜10のいずれかに記載の検査方法。 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを一本鎖DNAに解離させる工程 (d)解離させた一本鎖DNAを非変性ゲル上で分離す
る工程 (e)分離した一本鎖DNAのゲル上での移動度を対照
と比較する工程 - 【請求項15】 以下の(a)〜(d)の工程を含む、
請求項1〜10のいずれかに記載の検査方法。 (a)被検者からDNA試料を調製する工程 (b)グルココルチコイド受容体遺伝子における塩基部
位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列において1
927番目の塩基部位を含む、または1927番目およ
び2314番目の塩基部位を含むDNAを増幅する工程 (c)増幅したDNAを、DNA変性剤の濃度が次第に
高まるゲル上で分離する工程 (d)分離したDNAのゲル上での移動度を対照と比較
する工程 - 【請求項16】 以下の(a)〜(c)の工程を含む、
請求項1〜10のいずれかに記載の検査方法。 (a)(i)被検者から調製したグルココルチコイド受
容体遺伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子
のcDNA配列において1927番目の塩基部位を含
む、または1927番目および2314番目の塩基部位
を含むDNA、および (ii)ヌクレオチドプローブが固定された基板、を提
供する工程 (b)工程(a)(i)のDNAと工程(a)(ii)
の基板を接触させる工程 (c)該DNAと該基板に固定されたヌクレオチドプロ
ーブとのハイブリダイズの強度を検出することにより、
グルココルチコイド受容体をコードする遺伝子における
多型を検出する工程 - 【請求項17】 グルココルチコイド受容体遺伝子にお
ける多型部位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列
において1927番目の多型部位を含む、少なくとも1
5ヌクレオチドの鎖長を有するポリヌクレオチド。 - 【請求項18】 多型部位の塩基がシトシン(C)であ
る、請求項17記載のポリヌクレオチド。 - 【請求項19】 グルココルチコイド受容体遺伝子にお
ける塩基部位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列
において1927番目の塩基部位を含むDNAにハイブ
リダイズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長を有す
るポリヌクレオチドを含む、グルココルチコイド製剤の
有効性を検査するための試薬。 - 【請求項20】 さらに、グルココルチコイド受容体遺
伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子のcD
NA配列において2314番目の塩基部位を含むDNA
にハイブリダイズし、少なくとも15ヌクレオチドの鎖
長を有するポリヌクレオチドを含む、請求項19に記載
の試薬。 - 【請求項21】 グルココルチコイド受容体遺伝子にお
ける塩基部位であって、該受容体遺伝子のcDNA配列
において1927番目の塩基部位を含むDNAを増幅す
るように設計されたフォワードプライマー、およびリバ
ースプライマーを含む、グルココルチコイド製剤の有効
性を検査するための試薬。 - 【請求項22】 さらに、グルココルチコイド受容体遺
伝子における塩基部位であって、該受容体遺伝子のcD
NA配列において2314番目の塩基部位を含むDNA
を増幅するように設計されたフォワードプライマーおよ
びリバースプライマーを含む、請求項21に記載の試
薬。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2002074171A JP2003265184A (ja) | 2002-03-18 | 2002-03-18 | 被検者におけるグルココルチコイド製剤の有効性の検査方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2002074171A JP2003265184A (ja) | 2002-03-18 | 2002-03-18 | 被検者におけるグルココルチコイド製剤の有効性の検査方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2003265184A true JP2003265184A (ja) | 2003-09-24 |
Family
ID=29203634
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2002074171A Withdrawn JP2003265184A (ja) | 2002-03-18 | 2002-03-18 | 被検者におけるグルココルチコイド製剤の有効性の検査方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP2003265184A (ja) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2009103081A2 (en) * | 2008-02-15 | 2009-08-20 | Shriners Hospitals For Children | Glucocorticoid receptor polymorphisms |
US8901098B2 (en) | 2011-10-25 | 2014-12-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense modulation of GCCR expression |
-
2002
- 2002-03-18 JP JP2002074171A patent/JP2003265184A/ja not_active Withdrawn
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2009103081A2 (en) * | 2008-02-15 | 2009-08-20 | Shriners Hospitals For Children | Glucocorticoid receptor polymorphisms |
WO2009103081A3 (en) * | 2008-02-15 | 2009-12-30 | Shriners Hospitals For Children | Glucocorticoid receptor polymorphisms |
US20120149668A1 (en) * | 2008-02-15 | 2012-06-14 | Shriners Hospital For Children | Glucocorticoid receptor alleles and uses thereof |
US8901098B2 (en) | 2011-10-25 | 2014-12-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense modulation of GCCR expression |
US9567587B2 (en) | 2011-10-25 | 2017-02-14 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense modulation of GCCR expression |
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