HU228695B1 - Nucleotide sequence mediating male fertility and method of using same - Google Patents
Nucleotide sequence mediating male fertility and method of using same Download PDFInfo
- Publication number
- HU228695B1 HU228695B1 HU0303517A HUP0303517A HU228695B1 HU 228695 B1 HU228695 B1 HU 228695B1 HU 0303517 A HU0303517 A HU 0303517A HU P0303517 A HUP0303517 A HU P0303517A HU 228695 B1 HU228695 B1 HU 228695B1
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- ser
- gene
- promoter
- lys
- gly
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 44
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 title claims description 29
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 title claims description 29
- 230000035558 fertility Effects 0.000 title description 17
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 70
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 claims description 32
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 32
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 claims description 30
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 20
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 17
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims description 17
- 230000009466 transformation Effects 0.000 claims description 14
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 11
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 claims description 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 claims description 7
- 240000006394 Sorghum bicolor Species 0.000 claims description 5
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 claims description 5
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 claims description 5
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 claims description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 4
- 238000001890 transfection Methods 0.000 claims description 4
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims description 3
- 235000006008 Brassica napus var napus Nutrition 0.000 claims description 2
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 claims description 2
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 claims description 2
- 235000014698 Brassica juncea var multisecta Nutrition 0.000 claims 1
- 240000000385 Brassica napus var. napus Species 0.000 claims 1
- 235000006618 Brassica rapa subsp oleifera Nutrition 0.000 claims 1
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 claims 1
- DPUOLQHDNGRHBS-UHFFFAOYSA-N Brassidinsaeure Natural products CCCCCCCCC=CCCCCCCCCCCCC(O)=O DPUOLQHDNGRHBS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- URXZXNYJPAJJOQ-UHFFFAOYSA-N Erucic acid Natural products CCCCCCC=CCCCCCCCCCCCC(O)=O URXZXNYJPAJJOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 241000209140 Triticum Species 0.000 claims 1
- DPUOLQHDNGRHBS-KTKRTIGZSA-N erucic acid Chemical compound CCCCCCCC\C=C/CCCCCCCCCCCC(O)=O DPUOLQHDNGRHBS-KTKRTIGZSA-N 0.000 claims 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 102
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 29
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 29
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 25
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 25
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 description 19
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 description 19
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 17
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 16
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 15
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 13
- 206010021929 Infertility male Diseases 0.000 description 12
- 208000007466 Male Infertility Diseases 0.000 description 12
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 12
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 12
- 108700026226 TATA Box Proteins 0.000 description 11
- 101150052580 dam gene Proteins 0.000 description 11
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 10
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 10
- 208000000509 infertility Diseases 0.000 description 10
- 208000021267 infertility disease Diseases 0.000 description 10
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 9
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 9
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 9
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 9
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 8
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 8
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 8
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 8
- 230000006870 function Effects 0.000 description 7
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 7
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 7
- 230000023409 microsporogenesis Effects 0.000 description 7
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 6
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 6
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 6
- WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N Ser-Pro Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 6
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 6
- 244000269722 Thea sinensis Species 0.000 description 6
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 6
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 6
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 6
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- 101710159129 DNA adenine methylase Proteins 0.000 description 5
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 5
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 5
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 5
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 5
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 5
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 5
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 5
- 230000010152 pollination Effects 0.000 description 5
- MFAMTAVAFBPXDC-LPEHRKFASA-N Arg-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O MFAMTAVAFBPXDC-LPEHRKFASA-N 0.000 description 4
- RAQMSGVCGSJKCL-FOHZUACHSA-N Asn-Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O RAQMSGVCGSJKCL-FOHZUACHSA-N 0.000 description 4
- 102000053187 Glucuronidase Human genes 0.000 description 4
- 108010060309 Glucuronidase Proteins 0.000 description 4
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 4
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 4
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 4
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N Thr-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 238000011161 development Methods 0.000 description 4
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 4
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 4
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 4
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 4
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 3
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 3
- NTAZNGWBXRVEDJ-FXQIFTODSA-N Arg-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O NTAZNGWBXRVEDJ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- AOHKLEBWKMKITA-IHRRRGAJSA-N Arg-Phe-Ser Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N AOHKLEBWKMKITA-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 3
- 108010016529 Bacillus amyloliquefaciens ribonuclease Proteins 0.000 description 3
- 241000701489 Cauliflower mosaic virus Species 0.000 description 3
- 241000283153 Cetacea Species 0.000 description 3
- KGIHMGPYGXBYJJ-SRVKXCTJSA-N Cys-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CS KGIHMGPYGXBYJJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- PMNHJLASAAWELO-FOHZUACHSA-N Gly-Asp-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PMNHJLASAAWELO-FOHZUACHSA-N 0.000 description 3
- HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ser Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 3
- NZGTYCMLUGYMCV-XUXIUFHCSA-N Ile-Lys-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N NZGTYCMLUGYMCV-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 3
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 3
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N Phe-Pro Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N1[C@@H](CCC1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 3
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N Ser-Gly-Tyr Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)N NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N Ser-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(O)=O)=CNC2=C1 LZLREEUGSYITMX-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 3
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 3
- IJKNKFJZOJCKRR-GBALPHGKSA-N Thr-Trp-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 IJKNKFJZOJCKRR-GBALPHGKSA-N 0.000 description 3
- 108700009124 Transcription Initiation Site Proteins 0.000 description 3
- DZHDVYLBNKMLMB-ZFWWWQNUSA-N Trp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 DZHDVYLBNKMLMB-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 3
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 3
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 3
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 3
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 3
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 3
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 3
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 3
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 241000589158 Agrobacterium Species 0.000 description 2
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N Arg-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- NVUIWHJLPSZZQC-CYDGBPFRSA-N Arg-Ile-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NVUIWHJLPSZZQC-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 2
- RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- QRULNKJGYQQZMW-ZLUOBGJFSA-N Asp-Asn-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QRULNKJGYQQZMW-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N Asp-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O YIDFBWRHIYOYAA-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 2
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 2
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 2
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 2
- 108010031746 Dam methyltransferase Proteins 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 2
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007096 Glaser coupling reaction Methods 0.000 description 2
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- XUORRGAFUQIMLC-STQMWFEESA-N Gly-Arg-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)CN)O XUORRGAFUQIMLC-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- DUYYPIRFTLOAJQ-YUMQZZPRSA-N Gly-Asn-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)CN DUYYPIRFTLOAJQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- FSPVILZGHUJOHS-QWRGUYRKSA-N Gly-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CNC=N1 FSPVILZGHUJOHS-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 244000116484 Inula helenium Species 0.000 description 2
- TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N L-tryptophan-L-tyrosine Natural products C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N Leu-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C HYIFFZAQXPUEAU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- RIJCHEVHFWMDKD-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RIJCHEVHFWMDKD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 2
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 2
- QKDIHFHGHBYTKB-IHRRRGAJSA-N Pro-Ser-Phe Chemical compound N([C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 QKDIHFHGHBYTKB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- 206010057190 Respiratory tract infections Diseases 0.000 description 2
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 2
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 2
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N Ser-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N Ser-Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CO XUDRHBPSPAPDJP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O BMKNXTJLHFIAAH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N Trp-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 2
- PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N Tyr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 2
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 2
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 2
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 101150113864 pat gene Proteins 0.000 description 2
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 2
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 2
- 230000010153 self-pollination Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 108010072986 threonyl-seryl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 108010044292 tryptophyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 2
- ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N (2s)-2-amino-3-phenylpropanoic acid;(2s)-2,6-diaminohexanoic acid Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O.OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ALBODLTZUXKBGZ-JUUVMNCLSA-N 0.000 description 1
- 101150025032 13 gene Proteins 0.000 description 1
- QRBLKGHRWFGINE-UGWAGOLRSA-N 2-[2-[2-[[2-[[4-[[2-[[6-amino-2-[3-amino-1-[(2,3-diamino-3-oxopropyl)amino]-3-oxopropyl]-5-methylpyrimidine-4-carbonyl]amino]-3-[(2r,3s,4s,5s,6s)-3-[(2s,3r,4r,5s)-4-carbamoyl-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)- Chemical compound N=1C(C=2SC=C(N=2)C(N)=O)CSC=1CCNC(=O)C(C(C)=O)NC(=O)C(C)C(O)C(C)NC(=O)C(C(O[C@H]1[C@@]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)(C)O[C@H]1[C@@H]([C@](O)([C@@H](O)C(CO)O1)C(N)=O)O)C=1NC=NC=1)NC(=O)C1=NC(C(CC(N)=O)NCC(N)C(N)=O)=NC(N)=C1C QRBLKGHRWFGINE-UGWAGOLRSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 101150044182 8 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 244000208874 Althaea officinalis Species 0.000 description 1
- 235000006576 Althaea officinalis Nutrition 0.000 description 1
- 235000009051 Ambrosia paniculata var. peruviana Nutrition 0.000 description 1
- SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N Arg-Asp Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- UHFUZWSZQKMDSX-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UHFUZWSZQKMDSX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- AUIJUTGLPVHIRT-FXQIFTODSA-N Arg-Ser-Cys Chemical compound C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)CN=C(N)N AUIJUTGLPVHIRT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- CGWVCWFQGXOUSJ-ULQDDVLXSA-N Arg-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O CGWVCWFQGXOUSJ-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 235000003097 Artemisia absinthium Nutrition 0.000 description 1
- 240000001851 Artemisia dracunculus Species 0.000 description 1
- 235000017731 Artemisia dracunculus ssp. dracunculus Nutrition 0.000 description 1
- 235000003261 Artemisia vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- SEKBHZJLARBNPB-GHCJXIJMSA-N Asn-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SEKBHZJLARBNPB-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- SZNGQSBRHFMZLT-IHRRRGAJSA-N Asn-Pro-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SZNGQSBRHFMZLT-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VBKIFHUVGLOJKT-FKZODXBYSA-N Asn-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N)O VBKIFHUVGLOJKT-FKZODXBYSA-N 0.000 description 1
- AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N Asn-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- MJKBOVWWADWLHV-ZLUOBGJFSA-N Asp-Cys-Asp Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N)C(=O)O MJKBOVWWADWLHV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- XDGBFDYXZCMYEX-NUMRIWBASA-N Asp-Glu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O XDGBFDYXZCMYEX-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 229930192334 Auxin Natural products 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000132028 Bellis Species 0.000 description 1
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 1
- 108091028026 C-DNA Proteins 0.000 description 1
- 108090000994 Catalytic RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053642 Catalytic RNA Human genes 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 108700010070 Codon Usage Proteins 0.000 description 1
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 1
- VZKXOWRNJDEGLZ-WHFBIAKZSA-N Cys-Asp-Gly Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O VZKXOWRNJDEGLZ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108010044229 Dihydroflavanol 4-reductase Proteins 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N Epihygromycin Natural products OC1C(O)C(C(=O)C)OC1OC(C(=C1)O)=CC=C1C=C(C)C(=O)NC1C(O)C(O)C2OCOC2C1O YQYJSBFKSSDGFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283074 Equus asinus Species 0.000 description 1
- 101000658543 Escherichia coli Type I restriction enzyme EcoAI endonuclease subunit Proteins 0.000 description 1
- 108700039887 Essential Genes Proteins 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- PSOMSSVRNYTXII-OQFSXRIOSA-N FC1([C@H]([C@H]([C@H](C(O)O1)O)O)O)F Chemical compound FC1([C@H]([C@H]([C@H](C(O)O1)O)O)O)F PSOMSSVRNYTXII-OQFSXRIOSA-N 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 108700007698 Genetic Terminator Regions Proteins 0.000 description 1
- 208000034951 Genetic Translocation Diseases 0.000 description 1
- LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N Glu-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LSPKYLAFTPBWIL-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- XEKAJTCACGEBOK-KKUMJFAQSA-N Glu-Met-Phe Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N XEKAJTCACGEBOK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N Gly-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- UTYGDAHJBBDPBA-BYULHYEWSA-N Gly-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CN UTYGDAHJBBDPBA-BYULHYEWSA-N 0.000 description 1
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- YLEIWGJJBFBFHC-KBPBESRZSA-N Gly-Phe-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 YLEIWGJJBFBFHC-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 239000005562 Glyphosate Substances 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- VGYOLSOFODKLSP-IHPCNDPISA-N His-Leu-Trp Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 VGYOLSOFODKLSP-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- 101000657326 Homo sapiens Protein TANC2 Proteins 0.000 description 1
- 241000257303 Hymenoptera Species 0.000 description 1
- 206010020649 Hyperkeratosis Diseases 0.000 description 1
- 101150062179 II gene Proteins 0.000 description 1
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N L-leucyl-L-phenylalanine Natural products CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 101150118523 LYS4 gene Proteins 0.000 description 1
- UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N Leu-Arg-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UCOCBWDBHCUPQP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- FIJMQLGQLBLBOL-HJGDQZAQSA-N Leu-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FIJMQLGQLBLBOL-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- HIZYETOZLYFUFF-BQBZGAKWSA-N Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O HIZYETOZLYFUFF-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KWURTLAFFDOTEQ-GUBZILKMSA-N Leu-Cys-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N KWURTLAFFDOTEQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N Leu-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O WIDZHJTYKYBLSR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N Leu-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N Leu-Pro-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O UCBPDSYUVAAHCD-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ILDSIMPXNFWKLH-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- LXGSOEPHQJONMG-PMVMPFDFSA-N Leu-Trp-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)N LXGSOEPHQJONMG-PMVMPFDFSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 241000209510 Liliopsida Species 0.000 description 1
- GGAPIOORBXHMNY-ULQDDVLXSA-N Lys-Arg-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O GGAPIOORBXHMNY-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- ZXEUFAVXODIPHC-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Asn Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O ZXEUFAVXODIPHC-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WGILOYIKJVQUPT-DCAQKATOSA-N Lys-Pro-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O WGILOYIKJVQUPT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MGKFCQFVPKOWOL-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Asp Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N MGKFCQFVPKOWOL-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- TXTZMVNJIRZABH-ULQDDVLXSA-N Lys-Val-Phe Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 TXTZMVNJIRZABH-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- IILAGWCGKJSBGB-IHRRRGAJSA-N Met-Phe-Asp Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N IILAGWCGKJSBGB-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000475481 Nebula Species 0.000 description 1
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 1
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 101150084044 P gene Proteins 0.000 description 1
- 101150003018 Patj gene Proteins 0.000 description 1
- 241000288047 Phasianus colchicus Species 0.000 description 1
- HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- WMGVYPPIMZPWPN-SRVKXCTJSA-N Phe-Asp-Asn Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N WMGVYPPIMZPWPN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZENDEDYRYVHBEG-SRVKXCTJSA-N Phe-Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ZENDEDYRYVHBEG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OJUMUUXGSXUZJZ-SRVKXCTJSA-N Phe-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OJUMUUXGSXUZJZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- BVHFFNYBKRTSIU-MEYUZBJRSA-N Phe-His-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O BVHFFNYBKRTSIU-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- LTQCLFMNABRKSH-UHFFFAOYSA-N Phleomycin Natural products N=1C(C=2SC=C(N=2)C(N)=O)CSC=1CCNC(=O)C(C(O)C)NC(=O)C(C)C(O)C(C)NC(=O)C(C(OC1C(C(O)C(O)C(CO)O1)OC1C(C(OC(N)=O)C(O)C(CO)O1)O)C=1NC=NC=1)NC(=O)C1=NC(C(CC(N)=O)NCC(N)C(N)=O)=NC(N)=C1C LTQCLFMNABRKSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010035235 Phleomycins Proteins 0.000 description 1
- 108020005120 Plant DNA Proteins 0.000 description 1
- 108700001094 Plant Genes Proteins 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N Pro-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LNLNHXIQPGKRJQ-SRVKXCTJSA-N Pro-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 LNLNHXIQPGKRJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NFLNBHLMLYALOO-DCAQKATOSA-N Pro-Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 NFLNBHLMLYALOO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- LNICFEXCAHIJOR-DCAQKATOSA-N Pro-Ser-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LNICFEXCAHIJOR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- OIDKVWTWGDWMHY-RYUDHWBXSA-N Pro-Tyr Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=C(O)C=C1 OIDKVWTWGDWMHY-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- 102000055027 Protein Methyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 244000018633 Prunus armeniaca Species 0.000 description 1
- 235000009827 Prunus armeniaca Nutrition 0.000 description 1
- 230000006819 RNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 101150071661 SLC25A20 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- JFWDJFULOLKQFY-QWRGUYRKSA-N Ser-Gly-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O JFWDJFULOLKQFY-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- HMRAQFJFTOLDKW-GUBZILKMSA-N Ser-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HMRAQFJFTOLDKW-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WEQAYODCJHZSJZ-KKUMJFAQSA-N Ser-His-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 WEQAYODCJHZSJZ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- UBRMZSHOOIVJPW-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-Lys Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O UBRMZSHOOIVJPW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XGQKSRGHEZNWIS-IHRRRGAJSA-N Ser-Pro-Tyr Chemical compound N[C@@H](CO)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(O)=O XGQKSRGHEZNWIS-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CO OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N Ser-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N Ser-Tyr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O QYBRQMLZDDJBSW-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 description 1
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 1
- 108091027544 Subgenomic mRNA Proteins 0.000 description 1
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 1
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 1
- CSZFFQBUTMGHAH-UAXMHLISSA-N Thr-Thr-Trp Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)N)O CSZFFQBUTMGHAH-UAXMHLISSA-N 0.000 description 1
- 108091036066 Three prime untranslated region Proteins 0.000 description 1
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 description 1
- OKAMOYTUQMIFJO-JBACZVJFSA-N Trp-Glu-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OKAMOYTUQMIFJO-JBACZVJFSA-N 0.000 description 1
- ARKBYVBCEOWRNR-UBHSHLNASA-N Trp-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ARKBYVBCEOWRNR-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- PMDWYLVWHRTJIW-STQMWFEESA-N Tyr-Gly-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PMDWYLVWHRTJIW-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- JKUZFODWJGEQAP-KBPBESRZSA-N Tyr-Gly-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O JKUZFODWJGEQAP-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- ZQOOYCZQENFIMC-STQMWFEESA-N Tyr-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZQOOYCZQENFIMC-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N Tyr-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- 241000209149 Zea Species 0.000 description 1
- 235000007244 Zea mays Nutrition 0.000 description 1
- 108700042569 Zea mays P Proteins 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- FKNHDDTXBWMZIR-GEMLJDPKSA-N acetic acid;(2s)-1-[(2r)-2-amino-3-sulfanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound CC(O)=O.SC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O FKNHDDTXBWMZIR-GEMLJDPKSA-N 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 238000001994 activation Methods 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 101150115889 al gene Proteins 0.000 description 1
- ZVDPYSVOZFINEE-BQBZGAKWSA-N alpha-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O ZVDPYSVOZFINEE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 229930002877 anthocyanin Natural products 0.000 description 1
- 235000010208 anthocyanin Nutrition 0.000 description 1
- 239000004410 anthocyanin Substances 0.000 description 1
- 150000004636 anthocyanins Chemical class 0.000 description 1
- 239000001138 artemisia absinthium Substances 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000010165 autogamy Effects 0.000 description 1
- 239000002363 auxin Substances 0.000 description 1
- 238000009412 basement excavation Methods 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 1
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 1
- 101150102633 cact gene Proteins 0.000 description 1
- 206010061592 cardiac fibrillation Diseases 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 1
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 1
- 238000012272 crop production Methods 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 description 1
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000004049 embossing Methods 0.000 description 1
- 230000000408 embryogenic effect Effects 0.000 description 1
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 241001233957 eudicotyledons Species 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000000802 evaporation-induced self-assembly Methods 0.000 description 1
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 230000002600 fibrillogenic effect Effects 0.000 description 1
- 244000037666 field crops Species 0.000 description 1
- 235000011389 fruit/vegetable juice Nutrition 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 238000001476 gene delivery Methods 0.000 description 1
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 1
- 238000010363 gene targeting Methods 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 1
- XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N glyphosate Chemical compound OC(=O)CNCP(O)(O)=O XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940097068 glyphosate Drugs 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 235000012907 honey Nutrition 0.000 description 1
- WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N hydroxyacetaldehyde Natural products OCC=O WGCNASOHLSPBMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000009399 inbreeding Methods 0.000 description 1
- SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N indole-3-acetic acid Chemical compound C1=CC=C2C(CC(=O)O)=CNC2=C1 SEOVTRFCIGRIMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 210000000260 male genitalia Anatomy 0.000 description 1
- 235000001035 marshmallow Nutrition 0.000 description 1
- 230000008774 maternal effect Effects 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 230000021121 meiosis Effects 0.000 description 1
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 239000003471 mutagenic agent Substances 0.000 description 1
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 230000008775 paternal effect Effects 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000008121 plant development Effects 0.000 description 1
- 239000010773 plant oil Substances 0.000 description 1
- 150000004291 polyenes Chemical class 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010079317 prolyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 1
- 230000022532 regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 230000009711 regulatory function Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 108091092562 ribozyme Proteins 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N succinic acid Chemical compound OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 1
- 230000002477 vacuolizing effect Effects 0.000 description 1
- 230000009105 vegetative growth Effects 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 108010027345 wheylin-1 peptide Proteins 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
- C12N15/8222—Developmentally regulated expression systems, tissue, organ specific, temporal or spatial regulation
- C12N15/823—Reproductive tissue-specific promoters
- C12N15/8231—Male-specific, e.g. anther, tapetum, pollen
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8287—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for fertility modification, e.g. apomixis
- C12N15/8289—Male sterility
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Reproductive Health (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Pregnancy & Childbirth (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Botany (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
Description
A hibrid növények termesztésének fejlődése számottevő előnyöket eredményezhet a termesztett növények minőségében és menynylségében. A hibridizációs eljárások lehetővé teszik a hozamok növelését és a kívánatos tulajdonságok kombinálását, mint amilyenek a betegség- és rovarrezisztencia, a hő- és szárazságtörés, vagy a növények összetételének megváltoztatása. Ezek az eljárások gyakran a hímivarú szüiönövényre vannak alapozva, amelyek a pollent szolgáltatják a nőivarú szülőnövény száméra, hogy létrejöjjön a hibrid.
A szántóföldi növényeket olyan technikákkal termesztik, amelyek előnyt biztosítanak a növény megpcrzásí módjának, önmegporzó egy növény, ha az egyik virág virágpora ugyanazt a virágot vagy ugyanazon növényen egy másik virágot termékenyít meg. idegenmegporzás akkor történik, ha egy növény virágait egy másik növényről származó virágpor termékenyíti meg.
A káposzta (Brassioa) nemzetség növényei rendesen önsterilek és csak idegen megporzással terméksnyülnek. Az önbeporző növényeken — mint amilyen a szója vagy a gyapot - a no- és hímivarszervek anatómiailag egymás mellett helyezkednek el. A természetes beporzás során egy adott virág hímivarszerve által szolgáltatott virágpor (pollen) termékenyíti meg ugyanazon virág nőivé rszervét .
A kukorica (őea maya L.) egyedülálló helyzetet képvisel, mert mind önbeporzó, mind idegenheporzó technikákkal termeszthető. A kukoricának ugyanazon a növényen vannak hímvirágai, ameΛ 4
Ivek a címerben helyezkednek el, és vannak nővirá-gai, amelyek a kukorícacsőben helyezkednek el. A kukorica ön- vagy idegenbeporzéssel tsrmékenynihet meg. A kukorica természetes beporzása ügy történik meg, hegy a címerekből a virágport a szél viszi e csövek csúcsán kitüremfcedö „haj-ra, arai a bibeszálak tömege,
Sgy megbízható eljárás, amellyel a növények fertilitása szabályozható lenne, lehetőséget kínálna a. nővé.nynem.esítés javítására. Ez különösen igaz a kukoricahibridek nemesítésére, amelyek valamilyen hímsteril rendszeren alapulnak, és ahol egy nösteril rendszer csökkenthetné a termelési költségeket.
A knkorícahíbridek kifejlesztéséhez homozigóta, beltenyésztett vonalak kifejlesztésére, majd ezeknek a vonalaknak a keresztezésére és a hibridek kiértékelésére van szükség, A leszármazási vonalak termesztése és az ismételt kiválogatás az a két eljárás, amivel beitenyésztett vonalakat hozhatunk létre egy populációból, A nemesítő programokban a kívánatos tulajdonságokat kombinálják két vagy több beitenyésztett vonalból vagy különböző, széles alapú forrásokból egy memesitési „tulajdonság-készlet-be, amelyből új beitenyésztett vonalakat indítanak Önmegtermékenyítéssel és a kívánt fenotipusok kiválogatásával. Egy hibrid kukorica-változat két ilyen beltenyésztett vonal keresztezésének eredménye, amelyek mindegyikének egy vagy több olyan kívánatos tulajdonsága van, ami a másikból hiányzik, vagy amelyek kiegészítik egymást. Az új beltenyésztett vonalak más beltenyésztett vonalakkal keresztezhetők, majd as Így kapott hibridek megvizsgálhatok, hogy van-e gazdasági jelentőségük. Az első generációs hibrid leszármazottak jele Ey, A hibridek létrehozó.SSI/BZ • »‘»*V φ* £ ζ. 4 Λ * V *
Φ ν ».*·* . Φ'·χ > φ * $ φ \ y
Φ φ w *φ
ΓΥ k\ Υ Υ ‘Υ
X.· sk. \.χ.
aában csak az Εχ növényeknek van jelentőségük. Az Εχ életképesebb, mint a beltenyésztett szülők. Ez a hibridvigor vagy heterózis-hatás számos módón, Így példán! a fokozott vegetatív növekedésben vagy a nagyobb terméshozamban is megnyilvánulhat .
A hibrid kukorica-vetőmag hímsteril rendszerben állítható elő, ami magában foglalja a kézi címertelenitést í„címerezés) . A hibrid vetőmag termelése érdekében a elmert eltávolítják a beltenyésztett anyavonal· fejlődő növényeiről, amelyek a szintén beltenyésztett apavonal növényeivel váltakozó sorokba vannak elvetve. Ennek következtében — feltéve, hogy az ültetvény kellően izolált a kukorinapollen más forrásaitól - az anyavonal csöveit csak az apavonal virágpora termékenyítheti mag. Az így kapott magvak tehát hibridek, amelyekből hibrid növények fejlődnek.
A növények fejlődésének környezeti variációi miatt előfordulhat, hogy egyes növényeken a címer az anyavonal címerteienitése után jelenik csak meg, vagy a címeresük nem távolitják el teljesen a elmert. Sármi legyen is az ok, a következmény az, hogy az anyanövényeknek sikerül virágport termelniük és néhány közülük önbeporzássai fog megtermékenyülni, aminek következtében a beltenyésztett anyavonal magva! keverednek a termelni kívánt hibrid vetőmagvakkal. Ezek a magok nem olyan termöképesek, mint az Fy magvak, ráadásul a beltenyésztett anyavonal magyalnak jelenléte az eladott vetőmagban biztonsági kockázatot jelent a hibridet előállító cég számára.
Más megoldásként a beltenyésztett anyanövények géppel is címerezhetök. A gépi cimerezés körülbelül annyira megbízható, 7?. 381/SE * ‘ί* * * VAKv ** ΨΛ * X * < 5 V *
Ζ ν - :
Λ « *> ϊ *ν mint a kézzel végzett, de gyorsabb és olcsóbb, viszont a legtöbb cimerező gép több kárt tesz a növényekben, mint a kézi címerezés. így tehát jelenleg a címerteienitésnek nincs teljesen kielégítő módja, és folyamatosan szükség van olyan megoldásokra, amelyekkel tovább csökkenthetők a termelési költségek és megszüntethető az anyavonal önbeporzása a hibridvetőmag' termelése során.
A genetikai hímsteriiitás egy megbízható rendszere előnyös lehetne, A munkaigényes címerezés néhány genotípus esetében elkerülhető a citoplazmás hímsterii (CMS) beltenyésztett vonalak használatával, A fertilitást helyreállító gén hiányában egy CMS beltenyésztett vonal növényei a citopiazmában lévő faktorok miatt hímsterilek, Ezt a tulajdonságot kizárólag az anyanövények örökítik a kukoricában, mivel csak az anyanövény ad cit©plazmát a megtermékenyített maghoz. A CMS növények más, nem hímsterii vonalak pollenjével termékenyithetök meg, S másik beltenyésztett vonal pollenje tartalmazhatja azokat a géneket, amelyek a hibrid növényeket hímfértilíssé teszik, de hiányozhatnak is belőlük. Rendszerint ugyanazon hibrid cimertelenített normái kukoricával, illetve CMS vonallal termelt magvait keverik össze, hogy biztosítva legyen a megfelelő virágpor-mennyiség, amikor a hibrid növényeket termesztik és biztosítva legyen a díverzítás is.
A CMS vonalaknak azonban másféle hátrányaik is vannak. Az egyik egy már régen megfigyelt összefüggés a CMS egy meghatározott változata és bizonyos növénybetegségekre való érzékenység között. Ez a probléma elriasztölag hatott a CMS változatok széleskörű alkalmazására a hibrid kukoricák előállításában és negatívan befő77.Z8i.ZSS lyásoita a CMS általában vett használatát a kukoricában.
A genetikai sterilitás egyik típusa az US 4, 654,465: és
4,727,219 számú szabadalmi iratokban van leírva. A genetikai himsteriiitás ezen formája azonban több mutáns gén fenntartását követeli meg a genom különböző helyein, és egy bonyolult markerrendszert is igényel a gének nyomon követésére és a rendszer használatának megkönnyítésére. Az. US 3,861,705 és 3,710,511 számú szabadalmi iratokban is egy kromoszőma-transziokációs genetikai rendszer van leírva, ami hatásos lehetne, de bonyolult.
Számos próbálkozás történt az Ilyen hátrányok kiküszöbölésére.
így példán! Fabijanski és munkatársai több módszert fejlesztettek ki, amelyekkel növények himsteriils tehetők (EP-Q 85/3010153,8,
PCT/CA90/00037 és WO 90/08828 számé szabadalmi iratok). Az egyik módszer szerint egy hámszövet-spéciiikus promoterral kapcsolt gént juttatunk a növénybe, amely gén egy citotoxikus anyagot kódol. Fgy másik módszer egy antiszensz rendszeren alapul, ahol először azonosítanak egy, a fértintáshoz nélkülözhetetlen gént, majd annak antiszensz párját inszertálják a növénybe, Maríani és munkatársai is több, citotoxikus ás antiszensz rendszert írtak le (EP 89/401,194 számú szabadalmi írat), Más rendszerekben „represszor géneket alkalmaznak, amelyek gátolják más, a hímfertilitás szempontjából kritikus gének működését [FCT/GBSO/OöiOz (WO 90/08829) számú szabadalmi irat).
E rendszer egy még további javítása az US 5,478,369 számú
77.381/SSZa&Zíj>2 δ
« »««φ ΦΧ ΧΧΦΦ ί»*»
ΦΧ ♦ φ κ * * ♦ * χ φ χ χ χ φ * * χ χ φ φ χ *·* ΦΦ φφ Η Φφ szabadalmi iratban van leírva. A módszer ellenőrizhető hímsterílitást. hoz létre azáltal, hogy elnémítja a növény egyik, a hímfertilitáshoz nélkülözhetetlen, eredeti génjét, majd a natív
-DNS-t ugyanazon génnel helyettesíti, de most már egy indukálható prometerrai összekapcsolva, ami a gén kifejeződését szabályozza.
Ez a növény tehát konstitutívan steril, és csak akkor válik fér··· bilissé, ha promoter indukálódik és a hozzá kapcsolt hímfertilitási gén kifejeződik.
Észrevehető, hogy a himsterilitási rendszerekhez vezető munkák egyik esszenciális lépése a hímfertilitást befolyásoló gének azonosítása.
Egy ilyen gén különböző rendszerekben — köztük az itt leírtban is — arra lenne használható, hogy a hímfertilitást szabályozza. Korábban egy hi.mfértiUtas-gént azonosítottak az Arabzáopsis thaliana-ban és felhasználták hímstörli növények létrehozására [Aarts et al., Natúré 363, 715-717 (1933)j. áz egyik ilyen, a hímfertilitás befolyásoló gént az US S,473,369 számú szabadalmi iratban írták le. Jelen találmányban a feltalálok űj DNSmolekulákat és az általuk kódolt aminosav-szekvsnciskst írnak re, amelyek nélkülözhetetlenek a növények himfartiiítása szempontjából, valamint biztosítják a gén promoterát és: annak eszszeneiális szekvenciáit ís. Ezek minden olyan rendszerben alkalmazhatok, ahol a fertíiitás szabályozása hasznos lehet, köztük az alább leírtakban is.
«4 « XX r?. 3Si/:;s/Rft2ip2
Találmányunk egy olyan izolált nukleinsav—szekvenciát biztosít, amely az 5. száma szekvenciát (SSQ ID No. 5) tartalmazza, vagy amely az 5. számú szekvenciával nagyon szigorú körülmények között hibridizál, és egy hímszövet preferáló szabályozó régió funkciójával rendel kézi k.
A találmány biztosít egy elvan transzformációs vektort is, amely az említett szekvenciát egy expresszi ós kazettában egy heterológ nukleotid-szekvenciához működőképesen kapcsolódva tartalmazza .
A találmány egy olyan izolált nukieinsavat is biztosit, amely a ü. számú nukleotíd-szekveneiát tartalmazó hámszövet preferáló szabályzó régió, vagy amely a 6, számú szekvenciával (SEQ
ID No. 6} nagyon szigorú körülmények között hibridizál,
As ábrák rövid leírása
1. ábra, A B592--7 himsteriiitás-gén lékusztérkepe.
2. ábra. Egy Scuthern-blot gél képe, amelyen egy himster Oltásra szegregált Mu gáncsaIádból származó DNS EccAi-vel emésztett és egy Múl próbával hibrtdizált fragmentumai láthatók.
3. ábra. Egy Northern-blot gél képe, amelyen a különböző szövetekből származó teljes RNS és egy, a 3S92-7 kiónból származó PatJ/Egiil fragmentum hibrid!zálásának eredménye látható.
4. ábra. A BS92-7 oDNS-ének nukleotíd- és fehérje—szekvenciaja (a cDNS szekvenciáját az 1. számú szekvenciavázlatban, a fehérje szekvenciáját a .2. számú szekvenoiavázlatban mutatjuk be.
o, ábra, A BS92-7 genomiális szekvenciája (a nukleotid-s.zekve.n~ ciát 3. szarná szekvencíavázlatban, a fehérje-szekvenciát a 4.
7?.3*l/3£/f8i2ip2 számú szekvencíavázlatban Kiutat juk be) 6. ábra, A SS9.2-7 genomiális szekvenciájának és cDNS-e szekvenciájának összehasonlítása,
7, ábra. Egy Northern-blot gél, amelyen a SS92-7 gén kifejeződése látható a mikrosporogenezís folyamatában.
S, ábra, A 8S92-7 teljes hosszúságú promctera (5. számú szekvenciavázlat ) ,
9, ábra,. Az oszlopdiagram, a BS92-7 esszenciális promoter kis (9-10 bp) szakaszainak restrikciós helyre irányított linker-szkenning szubsztitúciója utáni lueizeráz-aktivításokat mutatja be.
10, ábra, A BS92--7 promoter egyik esszenciális területe (6, számú szekvenciaváziat).
11, ábra, A 8S92-7 cirokcimer és a SS92-7 kukorica cDNS szekvenciáinak összehasonlítása (a cirok DNS-t a 7,, a fehérjéjét a 8.
számú szekvenciáváziaton mutatjuk be).
Hacsak másként nem definiáljuk, a találmányunkban előforduló összes technikai és tudományos fogaimat a szakemberek — akikre ez a találmány tartozik - által közönségesen használt értelemben alkalmazzuk. Hacsak mást nem állítunk, az alkalmazott vagy figyelembe vett technikák standard módszerek, amelyeket jól ismernek a szakemberek. Az anyagok, eljárások és példák csak bemutatásra és nem korlátozásra szolgálnak,
A genetikai hímsteriiitás egv mutáció, szupresszió vagy bármilyen más, a mikrosporogenezís egy adott lépésében nélkülözhe7. 331 rtm /mmi pz * * * »·»·'♦♦ * φ* φ i ♦ Φ * Φ * ΦΦ 4» * » » φ Φ ΦΦ» χ- «
Φ · X Φ Φ Φ Φ Λ .„
Χ*Φ ΦΦ ΦΦ X <·χ Φ φ φ; φ; χ
tétlen | génre irányuló hatás következménye lehet; a mikrosporoge- |
nezís f Ezeket megkötő | egálom, alatt a pollenképződés teljes folyamatát értjük, a géneket együttesen hímíerttiltásé géneknek (vagy más ütésből hímsterilitási géneknek) nevezzük. Az egész fo~ |
lyamato. | ? belül számos olyan lépés van, amelyben a gének működése |
befóivá | sorja a fertilitást. Ezt megfelelően alátámasztani lát- |
szik a | genetikai hímsteriiitás gyakorisága a kukoricában, A hím- |
steril | mutánsok űj alléijelt fedezik fel az elit beltsnyésztstt |
V 0 í ; Cl .1. (¾ K í a.inkíq | tél az adaptálatlan populációkig terjedő anyagokban. Nap- a genetikai hímsteriiitás kutatása főleg leíró jellegű |
maradt, | Történtek erőfeszítések a kukorica sterilitási mechaniz- |
nem is | meglepő, ha figyelembe vesszük a gének számát, amelyek a |
himster | 1 látásért felelősnek bizonyulhatnak,. Nem valószínű, hogy |
egv mse. Az | ha.ni.zmus lenne alkalmazható az összes mutációra. US 5,478,369 számú szabadalmi iratban szerepel egy mód- |
szer, i: | imrvel egy hímsterilitási gén ragasztható a kukorica 9, |
egyetle | n hímsterílátási gén az MS2 volt, amit sohasem klónoztak |
és szel | Evenáltak ÍAlbertsen és Phillips, Canad, J. Génét, Cyioi. |
23, 195 | -208 <1.931) J .. Az egyetlen fertílitás-gén, amit eddig kló- |
noztak, | az Azabidopsís Aarts és munkatársai (lő. közi.) által |
leírt, génje volt,
A teli
77.381/8S/OM»2 * Αίφφφ Φ X * * X * * « * * · * X Φ ΧΦ» « φ ν X Φ Φ
ΦΦΦ ΦΧ «χ φ φφ β χ ♦ '·' ΦΦ
Φ φ » Φ
ΦΦΦ φφ ián helyezkedik el és nélkülözhetetlen a hímfertilitáshoz. A lökasztérkép az 1. ábrán látható. A gén a fent leirt vagy másféle rendszerekben használható a hímfertilitás befolyásolására.
A sterilitásra szegregéit kukorica-család neve BS92-7, és azt találtuk, hogy van egy körülbelül 7,0 kbp méretű ScoRI-fragment urna, ami hibrid!záródik egy Múl próbával. A családból izoláltak egy genomlális kiönt, ami egy Múl transzpozont tartalmaz.
Egy próbát készítettünk a transzpozont határoló DMS-höl, és azt találtak, hogy az hibridizálódík a körülbelül 7,7 kbp öcoAl-fragmentummal. Ezt a próbát használtuk a cDNS-klőnok izolálására egy elmer oDNS-könyvtárból. Az BS92-7 cDNS-e 1230 bp méretű, és a Mu inszerciö a gén 2. exonjában fordul elő. A Northern-analízissel feltárt expressziós mintázatok cimerspeelfikus kifejeződést mutatnak, aminek csúcsa körülbelül a mikrosporogenezie kvartett stádiuma és kvartett-szétválási stádiuma között van.
A „szelektíven hibridizái kifejezés egy olyan nukleotid-szekvenciára utal, amely szigorú körülmények között kimutathatóan nagyobb (azaz a hátteret legalább kétszeresen meghaladó) mértékben hibrid!zálódik egy meghatározott nukieotid-szekvenciávai, mint egy nem célzott nukleinsavval.
A „szigorú körülmények vagy „szigorú hibridizációs körülmények kifejezések azokra a körülményekre utalnak, amelyek között egy próba kimutathatóan nagyobb (azaz a hátteret legalább kétszeresen meghaladó; mértékben bibrioixáiödik a céiszekvenciájá7; ο&ηνκ/κΑΚΑρζ *>'<·' val, mint más szekvenciákkal. A szigorú körülmények a célszekvenciától függenek és a polinukleotíd szerkezetétől függően különbözőek lesznek. A hibridizáiás és/vagy mosás szigorúságának szabályozásával olyan eslszskvenciák azonosíthatók, amelyek 100 %-ban komplementerek a próbával (homoiógía-vizsgáiat). Másrészt a szigorú körülmények úgy is beáliízhatók, hogy lehetővé tegyék a szekvenciák bizonyos fokú keveredését, amivel alacsonyabb fokú hasonlóságok is kimutathatók (heterolögía-vizsgáiat). Általában az ilyen típusú próbák hosszúsága körülbelül 1000-250 nukleotíd.
A nukleinsavak hibridizálásához részletes útmutatást találunk Tijssen; „Laboré tory Techrignes in Siocnejaistry and
Molecuiar Bioíogy - Bybrídiza tion wíth ttiscleic Ágid Brobes' (Elsevier, hév York, 1993), Ausufoel és munkatársai (eds.); „Current
Arotocois ín Eoíecoier Bioíogy (Wiley - intersoience, New York,
1995) és Samforook és munkatársai: „Abiecüiar Cloníng; A Laboratory bánnal (2. kiadás, Cold Spring Barbor Laboratory, Cola Spring
Harbor, 1939) kézikönyveiben.
A specifíoitás tipikusan a hibridizáiás utáni mosás függvénye, ahol a kritikus tényezők az utolsó mosőolöat íonerössége és hőmérséklete. A szigorú mosási körülmények között a hőmérsékletet általában körülbelül 5-2 *C~kal alacsonyabbra állítjuk be, mint az adott szekvencia olvadáspontja (¾) egy meghatározott ionerősség és pH esetében. A DKS „megolvadása (denaturálödása) egy keskeny hőmérséklet-tartományban következik be, és tulajdonképpen a kettős spirál szétválását jelenti a komplementer egyes . 3íU/'SS/KA3;ip2
Λ * ** szálakra. A folyamatot az átmenet középpontjának hőmérsékletével jellemezzük <TB}, amit olvadási hőmérsékletnek is neveznek. Az olvadási hőmérséklet meghatározására számos képletet ismer a szakterület.
A találmány szerinti nukleotid-szekvenciák számára előnyös hibridizációs körülmények közé tartozik a 42 °C-onf 500 g/1 formamid, 6X SSC-ben, ö g/i SDS és 100 μ-g/ml iazscsperma-DNS jelenlétében végzett hibridizáiás. Példaszerűen gyenge szigorűságú mosási körülményeket jelent a 42' °0--οη, 2X SSC-ben, 5 g/1 SDS jelenlétében, 30 percen át, majd ezt megismételve végzett hibridlzálás, Példaszerűen mérsékelt szigorűságú körülményeket jelent az 5-0 vC~on, 2X SSC-ben., 5 g/1 SDS jelenlétében, 30 percen át végzett és megismételt mosás. Példaszerűen erős szigorúsága. körülményeket jelent a 65 eC~on, 2X SSC-ben, 5 g/1 SDS jelenlétében, 30 percen át végzett és megismételt mosás, A találmány szerinti promoternak megfelelő szekvenciák a fenti körülmények bármelyike között nyerhetők. Találmányunkban az erősen szigorú körülményeket használjuk.
A promoter-teruieteket a szakemberek könnyen azonosíthatjak. Megkeressük az ATG motívumot tartalmazó, vélelmezett start-kodont, és a start-kodontői felfelé eső terület a vélhető promoter, A „promoter a DNS egy szabályozó területe, amely rendszerint tartalmaz egy TATA-boxot, ami az RNS-polimeráz-21-t irányítva megindítja az RNS szintézisét az adott kódoló szekvencia megfelelő transzkripciós kezdőhelyén. Egy promoter tartalmazhat még járulékos felismerő szekvenciákat is, amelyek általában a TATA-boxtői felfelé (5'irányban) helyezkednek el és a transz77,381/ss « *«#* ♦» »*«* ·, *« β * « > * « * ♦** * * « « 9 « ♦ * * * * *♦« «» ** * ♦* *·« ·♦ kripció megindulásának sebességét szabályozzák (ezeket nevezzük felső promoter-elemeknefc). Nyilvánvaló, hogy ha azonosítottuk a találmány szerinti promoter naklsotíd-szekvencíáját, akkor a szakembereknek nem okoz nehézséget a további szabályozó elemek azonosítása az adott promoter TATA-boxtói felfelé eső területén, így tehát a találmány szerinti promoter-terüietst általában tovább azonosíthatjuk a felső szabályozó elemek jelenléte alapján, amelyek a kódoló szekvencia szövetbeli vagy időbeni kifejeződéséért felelősek, fokozok vagy hasonlók lehetnek. Hasonlóképpen azok a promoter-elemek, amelyek lehetővé teszik a kifejeződést a kívánt szövetben, például hímszövetben, azonosíthatok, izolálhatok és más mag-promoterokkal a hímszövet preferáló kifejeződés megerősítésére alkalmazhatók,
A találmány szerinti, izolált promoter-szekvencia módosítható, hogy megfelelő mértékű kifejeződést biztosítson idegen (heterolőg) nukleotíd-szekvenciák számára. A teljes promoter-területnél kisebb szakaszok is használhatók és megőrizhetik a portok-specifikus kifejeződés vezérlésének képességét, Felismertük azonban, hogy a mRNS expressziójának szintje csökkenhet, ha részeket távolítunk el a promoter-szekvenciáből. Eszerint egy promotert mödosithatunk úgy, hogy gyenge vagy erős promoter legyen. Általában a „gyenge promoter kifejezés alatt egy olyan prοποί ért értünk, amely alacsony szinten működteti a kódoló szekvencia expressziéját. Az „alacsony színt körülbelül 1/10,OüO-tol körülbelül 1/iöO. OOO-íg, vagy körülbelül 1/500. OClQ-íg terjedő transzkriptumot jelent. Ezzel szemben egy erős promoter magas szinten működteti egy kódoló szekvencia expresszi-óját, ami körülbelül 1/10-töI körülbelül 1/100-ig, vagy körülbelül l/1000~ig
7?,3Sl/SE/KASi.pZ terjedő transzkriptumot jelent. Általában egy izolált promoter-szekvenciából legalább körülbelül 30 nukleotidot használunk sgy nukleotid-szekvencia expressziéjának működtetésére. Felismertük, hogy a transzkripció szintjének emeléséhez fokozok használhatók a találmány szerinti promcter-terüietekkei kombinálva. A. fokozó (enhancer) egy olyan nukleotid-szekvencia, amely serkenti egy promoter-terület kifejeződését, A fokozók ···· mint amilyen az SV40 fokozd terület, a 3SS .fokozó elem és a hasonlók — jói ismertek a szakterületen.
.A kisebb fragmentumok még mindig birtokolhatják a promoter szabályozó tulajdonságait, igy a deléciós analízis lehet az egyik módja az esszenciális területek azonosításának. A deléciós analízis a szabályozó terület mindkét, 5'- és 3'-végén végrehajtható, Fragmentumokat helyre irányított mutagenezissei, poiimeráz láncreakcióval végzett mutagenezissei és hasonlókkal nyerhetünk („Ddrected éíutagenesis; Λ .Fracticai Approaoh, IRL Press,
1391}, A 3'-öeléoiőkkal körülhatárolható az esszenciális terület és megtalálható a 3f-vége, amellyel ez a terület működőképes módon kapcsolható egy tetszőleges promoter-raaghoz. Ha az esszenciális területet egyszer meghatároztuk, akkor egy exogén gén transzkripcióját szabályozhatjuk az esszenciális terület és egy promoter-mag együttesével, A promoter-mag bármely ismert promoter-mag lehet, mint amilyen a karfiol mozaik vírus 355 vagy 195 promotera (US 5,352,305), az ubíkvítin promoter (US 5,510,474), az IN2 promoter-mag (US 5,364,780) vagy a görvélyfu mozaik vírus promotera (Gruber et al., in: „Methods in Plánt AJoiecular Biology and Biotechclogy, pp. 89-119., CRC Press, 1993).
77.3Si/HE/RR2ÍpZ ♦·*·*
Az BS92-7 szabályozó területét 3 vélelmezett TATA-boxtól felfelé elhelyezkedő, körülbelül 270 bp hosszúságú területként azonosítottuk (S. ábra). A fent körvonalazott módszerrel megállapítottuk azt is, hogy a promoter egyik esszenciális területe a TATA-boxtól felfelé elhelyezkedő, a -112. bázispártéi a -93.-ig terjedő szakasz,
Promoter-szekvenoiák más növényekből Is izolálhatok jói ismert technikákkal a találmány szerinti promoter-szekvenciával matatott homolögíájuk alapján. Ezekben az eljárásokban az ismert promoter·- szekvencia egészét vagy egy részét használjak próbaként, ami szelektíven hibridizálódik más szekvenciákkal, amelyek egy adott szervezetből származó, klónozott genom-DNS fragmentumok populációjában (azaz egy genom-könyvtárban) vannak jelen. A nukleínsav-szekvenciák hibridizálásának módszerei jól ismertek a szakterületen,
A teljes promoter-szekvencia vagy annak egy része használható olyan próbaként, amely képes specifikusan hibridizálödni a megfelelő proraoter-szekvenciákkal. Ahhoz, hogy különböző körülmények között is elérjük a specifikus hibridizálödást, az ilyen próbáknak egyedi szekvenciákat kell. tartalmazniuk, amelyek előnyösen legalább körülbelül 10, és legelőnyösebben legalább körülbelül 20 nukleotíd hosszúságúak. Az ilyen próbák felhasználhatók a megfelelő promoter-szekvenolák sokszorozására egy kiválasztott szervezetből a poiimeráz láncreakció (PCR) jól ismert eljárásával, Ez a technika használható járulékos promoter-szekvenciáfc izolálására egy kívánt szervezetből vagy annak megállapítására, hogy a promoter-szekvencia jelen van-e a szervezetben.
7.331/SS * »φφχ χ·Φ »«»κ ♦ *
X» » Φ φ X ♦ ♦* »♦ « < « X * «Φ» « φ
Φ φ Φ » Φ X Φ φ Φ κ«« φφ χ« Φ «« ΦΦΧ X *
A szélesztett DNS-könyvtárak hibridizációs szűrővizsgálatára akár tarfoltokból, akár telepekből Innia és munkatársai (eds,):
„PüR Protocois, A Gulde to áfethoda and Applications (Acad,
Press, 1990) kézikönyvében találunk módszereket,
Továbbá, a találmány szerinti promoter a BS92-7 géntől eltérő nukleotid-szekvenciához is kapcsolható, hogy más heterológ nukleotid-szekvenciák is kifejeződhessenek. A találmány szerinti promoter nukieotíd-szekvenciája, valamint annak fragmentumai, és változatai expressziős keretekbe foglalhatok a heterológ nukleotíd-szekveneiákkai együtt, hogy kifejeződhessenek az adott növényben, pontosabban a növény hámszövetében. Egy ilyen expreszsziós keret a restrikciós helyek sokaságát kínálja a nukleotid~ szekvencia inszertálása száriéra, amely a promoter transzkripciós szabályozó hatása alá kerül. Ezek az expressziós keretek alkalmasak. bármely növény genetikai módosítására a kívánt fenotipuscs válasz elérése érdekében, A BS92-7 promotert tartalmazó expressziós vektorban idegen génként alkalmazható nuklectid-szekvenciákrs példaként említjük a komplementer nukleotid-egy~ ségeket, például az antíszensz molekulákat (kaliáz antiszensz
RNS, barnáz antiszensz RNS, kaikon-szintetáz antiszensz RNS,
MsáS antiszensz RNS), a ribozimeket és külső vezető szekvenciákat, egy sptamert vagy egyszáiű nukleotidokat, Az idegen nukleotid~szekvencia kódolhat auxinckat, rol.B-t, oitotoxinokat, difté17 ♦ ♦ X* φψ ♦ ♦χ X* * ««« »Χ9 ria-toxint, DAM-metiiézt, avidint, vagy egy prokariöta szabályozó rendszerből származhat. így például Marian! és munkatársai [badaré 347, 737' (1990}.]· kimutatták, hogy akár az AspergiJlus oryzae TI RNáza, akár a Baciilna anyio.Ligusiac.iens RNáza (amelyeket „barnáz-nak neveztek; a tapétámban kifejeződve a sejtek pusztulását és ezzel, hímsterílitást okoznak. Quaas és munkatársai [£vr. <7- .Sz ocdem. 173, 617 (1986)] leírták a TI P.Náz kémiai szintézisét, míg a barnáz-gén nukleotid-szekvenciáját Hartley derítette fel («7. Mól. Siói. 202, 913 {1988)). Az Agrobacterium rolS génje eqv enzimet kódol, amely megzavarja az mzopenes rc auxin-anyagcserét azáltal, hogy indulókat szabadit indoxil-p-glükozidokbél. Estrach és munkatársai [.EMBö J. 11, 3125 (1991) ], valamint Spena és munkatársai [Tbeor. Appl. 2e.net. 84,
520 (1992)1 kimutatták, hogy a ro.13 gén portok-specifikus kifejeződése dohányban zsugorodott porzókat eredményez, amelyekben nagy mértékben lecsökken a pollen képződés, így a rol.8 gén egy másik olyan gén, amely alkalmas a polientermelődés szabályozására. Slighfcon és munkatársai pi. Siói, Chem, 261, 108 (1985)] írták le a roIS gén nukleotid-szekveneiájéfc. A diftéria-toxínt kódoló gén DdS-molekuiáit az ATCC-től lehet megkapni (No. 39359 és
No. 67011; lásd még az EP-A 9079927 54.2 számú szabadalmi iratot) . A Dád-metiiáz génjét sterilitás okozására használták az
US 5,792,853 és 5,639,049, valamint a PCT/US95/15229 számú s
L / ;>£. ? i ki.·:
♦ φ * *
ΦΦ ΦφΦν X « Φ « φ φ
Φ V Φ ΦΦ κχ
Jf * * * * *»♦ φ φ φ φ ♦ φ Φ « » Κ Φ
ΦΦΦ φ* ΦΦ Φ ΦΦ *ΚΦ ΦΦΦ badalmi .iratokban leírt -eljárásokban. Az avidin gén alkalmazását sterilitás okozására az US 5,562,769 .számú szabadalmi iratban írtak le.
Amint említettük.., találmányunk biztosít olyan vektorokat, amelyek képesek a szóban forgó géneket kifejeztetni egy promoter szabályozó hatása alatt. A vektoroknak általában növényi sejtekben kell működniük. Idővel előnyösek lehetnek az olyan vektorok, amelyek ooli-ban is működőképesek (például fehérje termelése antitestek indukálásához, DNS szekvencia-analízise, inszertumok szerkesztése, mennyiségek előállítása nnkleinsavakbői}. Az zi coli-ban kifejeződő vektorokat és elkészítésük módját S-ambro-ok és munkatársai (id. aús kézikönyvében találhatjuk meg.
A transzformációs vektor, amely a találmány szerinti promoter-szekvenciát tartalmazza működőképes módon összekapcsolva egy idegen szekvenciával egy expressz ió-s keretben, tartalmazhatja még legalább egy gén nukleotíd-szekvemeiáját a gazdaszervezet kotranszformálása céljából. Más megoldásként a járulékos szekvencia egy másik transzformációs vektorban ís bejuttatható.
A transzformációs vektorban riporter-gének lehetnek jelen; as alkalmas riportergénekre számos példa van a szakirodalomban (Jefferson et ai., in: „Plánt Moiscular Síoiogy Hanual, pp.·'1-,33.,
Gelvin et ai.z (sds.), Kluwer Academic Publíshers, 1991; DsWet ez al., Hol. Celi. Bioi. y, 725-737 (1987); Goff et aí.z EMSO J.
77. 7S7. .C ?AOp * *·«» «* * ** β * tf * χ * « · »:« ♦ ♦ β * ♦ « « * *« ν «♦ Φ * * X * Φ Μ * ♦ Φ* «Κ «« » β» *«» »»*
9, 2517-2522 {1990); Kain et al. ? BíoTecnníqaee 19, 650-655 (15955 és Chili et al., Current Bioi. 5, 325-3-30 (1996)).
A transzformált sejtek vagy szövetek szelektálására alkalmas markergének is lehetnek a transzfomáciő-s vektorban. Az ilyen gének közé tartoznak az antibiotikum- és herbícid-rezisztencfát kölcsönző gének, A szelektálható markergénekre nem korlátozó példaként említjük az alábbiakat: kioramfenikol-rezisztencla.
(Herrera-Estrelia. et al., 137B7 J, 987-992 {1983·} j, metotrexát-
-rezisztencia [Herrera-Estrelia et | al. ? | ,Ma t ur e | 303, | 209-213 |
(1983); Meijer et ai.> Alant Mól. | Szol < | 16, 8C | (7-820 | (1991)], |
higromícin-rezisztencia .('Waldron- et | a .·(.,· | Alant | Mól. | Szol, 5, |
103-108 (1985); Ohijian et al.? Plánt Sci. | 108, 2 | 19-227 | (1995)3, |
sztreptomiein-rszisztencia (Jones et al,, Mól, Gén, Génét, 210,
86-31 (1987} j, szpektinomioin-rezisztencia íBretagne-Sanard et al,, Transganie Rés. 5, 131-137 (1596)3, fcleomicin-rezí sztencia.
[Bilié et al., Alant Mól, Blol, 7, 171-176 (1990) szül fonalaidrezisztencia [Guerineau st al. , Alant Mól. Bioi, 15, 127-136 (1990)3 , bromoxiní 1-rezisztenc.ia [Stalker et al,? Science 242,
419-423 (1988)3, giifozát-rezisztencia [Shaw et al,? Science
233, 478-481 (1986)3 és fios-zfinotriein-reziszteneía (DeBiook et al.? EfflOJ. 6, 2513-2518 (1987)].
A transzformáció és/vagy traeszfekciö módja nem kritikus a találmányunk szempontjából; mindkét módszerhez számos eljárás áll rendelkezésünkre. Amint újabb eljárások válnak elérhetővé a
7?. 38*/&E/M2ip2
J»*««» növények, és más gazda sejtek transzformálására, azonnal közvetlenül alkalmazhatók. Ennek megfelelően a módszerek széles választékát fejlesztették ki egy DNS-szekvenciának egy gazdasejtbe juttatására, hegy elérjék a szekvencia transzkripcióját vagy transzkripcióját és transzlációját, ami a szervezet fenotipusa··· nak megváltozásához vezet. így tehát bármely eljárás alkalmazható, ha hatásos transzformációt érhetünk el általa.
Azok az eljárások, amelyekkel expresszién vektorok juttathatók növényi szövetekbe, széles választékban állnak rendelkezésre, és a megcélzott növénynek megfelelően választhatók meg. A növények széles körének transzformálására alkalmas eljárások a szaki r oda lomban vannak I.e írva (Miki et ai ., „Procednres tor Introducing Fóréi gn DNS intő Plancs, ín: „M&thc-ds in Plánt dólecnlar Biotechnology^ (már idézve) / Elein et al., Bi o/Technoloyy 10,- 268 (1932) és Neising et al,, Anna, név. Génét. 22,
421-477 (1933)3. így például a DNS-szerkezetet olyan technikákkal juttathatjuk be a növényi sejt genomjába, mint a mikrobáiövéses szállítás (Klein et ai.. Natúré 327, '70-73 (1987)3, az elektrcporáció [Fromm et al,, Proc, Páti. Arad. Sri. USA 82,
5824 (19853), a polletiiéngiikoios (2EG3 kicsapás [Paszkcwski et al., ΕΜΒΌ J. 3, 2717-2722 (1984)], a közvetlen génbevitel (WO 85/01856 és EP 8 275 069), az in vítro protoplaszt-transztcrmáció (US 4,634, 644) és a növényi protoplasstok vagy embriógén kallusz mikroinjekció-zása [Crossway, áfci. Gén. Génét. 202,
77.SSl/ES/FAZipZ «Φχ ***
179-185 (1985)] . Egy másik lehetőség a növényi -szövet közös tenyésztése az Agrobacferiü® tumefacíens-szel, ahol a DNS-szerketetet egy kettős vektor-rendszerben helyezzük el [US 5,591,616;
Ishída et aL, Natúré Biotechncicgy 14, 745-750 (1926; 1 . Ekkor ez A. tumefseiens virölenc.1.a~f.unk-cióí iránvitják a szerkezet mézére mát a növényi sejt DNS-ébe, miután a baktérium megfertőzte a sejtet (Horsoh et si,, Science 233, 496-498 (1984) ;
Fraley er al, , Proc. Nsii. ácsű. Ser. USA 8b, 4803 (i988) ] .
Az olaj repce transzformálásának standard módszereit Mcioney és munkatársai Írtak ie [Elánt Ceil Peports 8, 238-242 (1989)],
Gabona transzformálását Eromm és munkatársai fSio/Technology 8,
838 (1990)1 és Gordon-Ksmm és munkatársai (id. közi.) Írtak le.
Az Acrobacterrum elsősorban kétszíküeken alkalmazható, de néhány egyszikűt, igy a kukoricát is transzformáltak vele (lásd fent és az 08 5,550,318 számú szabadalmi iratot). A rizs transzformálását Hisi és munkatársai [Plánt J. 6, 271-282 (1994)], Christon és munkatársai [Trends Sictee.hr. 10, 239 (1292)] és Lee és munuatársas (Proc. Natl. Acad. Ser. USA 38, 6389 (r99r)] írtak le.
A búza a kukorica vagy a rizs transzformálására, használt eljáráshoz hasonló módon transzformálható, A cirok transzformálásé;
Casas és munkatársai (id. köri.}, illetve Wan és munkatársai [Plánt Physiol, 104, 37 (1924)] Írták le. A szója transzformálásáról számos közlemény szól, köztük az US 5, 015, 580 számú -szál:
>adalmi irat.
vmSi/BS/RASip;
ésé* j? L
Μ ♦♦
Az alábbi példák az útmutatást és illusztrálást szolgálják, de nem korlátozzák találmányunk oltalmi körét.
A BSS2-7 azonosítása ás kossegsegálása
Egy mutator (Mu) populációból olyan növénycsaládokat válogatunk ki, amelyek növényei zömmel himsterilek, egynek sem voltak porzói, vagy csak néhányon jelentek meg abnormális porzók, de egyben sem volt pollen. A hímsterilitás okául feltételezzük, hogy egy Mu elem integrálódott véletlenszerű módon egy génbe, ami a mikrosporogenezís bizonyos lépéseiért felelős, és megzavarta annak expressziéját. Sgy szegregálódő Fg család — amit SS92-7-ként jelölünk — növényeit felneveljük és a hímfertilitás vagy sterilitás szerint osztályozzuk:. Osztályonként körülbelül 20 növényről levélmintákat veszünk és izoláljuk belőlük a DNS-t.
A Mu és a sterilitás kapcsolatának igazolására Söuthern-analízist végzünk, ami a szakemberek által jól ismert technika. Ez a mindennapos eljárás magában foglalja a növényi DNS izolálását, restrikciós endonukieázokkal való feldarabolását, a DNS-darabok molekulatömeg szerinti frakcionáiásáf agarózgélen, majd átvitelüket nejlonmembránokra, hogy rögzítsük a szétválogatott DNS-t. Ezután, ezeket a membránokat egy radioaktív jelöléssel ellátott (a32y~ciCTp~t tartalmazó) próba-fragmentummal hibridizáljuk és SDS-oldattal mossuk [Southern, J. Moi. Siói. SS, 503-517 (1975)]. Egy szegregálódő Fg BS92-7 család növényeit felneveljük és hímfertilitás vagy sterilitás szerint osztályozzuk. Osztályonként körülbelül 20 növényről levélmintákat veszünk, amelyekből izoláljuk a DNS-t. Az 5 fertllis és 12 steril növényből
77.Z81/3Z w 23 «0 ΰυΛ-' ♦ 00 *0* gálódása látható a. steril fenotípussaí származó DES-t (körülbelül 7 μη) FooPl-vel emésztjük, majd a fragmentumokat 0,75 %~os agarőzgélen. szétválasztjuk. Az emésztett DNS-t nejionmembránra visszük át, a membránt a Mu transzpozon egy belső fragmentumával hibridizáljuk, A membrán autórádiógramján (2. ábra) egy 7 kbp méretű EcoAI fragmentum kőszegreEz az EooEl sáv szegregéi ódott a fertiiis növényben, ami arra utal, hogy az alléi heterozioóta vad típusú.
A í | rs > , v. | és ( | 5,0 kbp közötti mé~ |
a | DNS | iektroelúciöval ki- | |
DNS- | -t a | Lambda Zap vektor- | |
ut | así | fása | szerint. A ligáit |
Go | Id ( | Strataoene) készlet |
Könyvtár készítés® és szűrővizsgálata
Ά oDNS-könyvtárak készítésének módja közismert a szakemberek körében és Sambrook és munkatársai már idézett kézikönyvében van leírva, A könyvtárakat az alábbi módon készítettük el.
Egy steríiis növényből származó DNS-t EooPI-uel emésztünk és egy preparativ gélen megfuttatunk, A retű DNS-sávokat kivágjuk a gélből, « nyerjük és etanoilal kicsapjuk. Ezt s ba {Stratagene™; ligáljuk a gyártó i DNS-t fágokba „csomagoljuk''' a Gigapac alkalmazásával. Körülbelül 500.000 tarfoltképzö egységet (PFU) szélesítünk, majd emelünk fel nitro-cellulóz membránokra. A membránokat a fiái próbával hibridizáljuk. A szűrővizsgálat harmadik körében egy tiszta kiónt kapunk. Az inszertumot plazmidként kivágjuk a fágból és BS327-0,1-nek neveztük el. A kiónból izolálunk egy határoló fragmentumot és ellenőrző próbaként alkalmazzuk az eredeti EcoAI fragmentum kos2egregáei6s vizsgálatához. A 7,0 kbp EooAl fragmentum homozigóta az összes steríiis
77.381/3S fi
X β Φ * φφ φ $ φ S S φ * φ *Μ «* ** novenyren, ami. megerősíti, ί megfelelő Mu fragmentumot izoláltuk
U Λ x rX fertiiís növények közül nyolc bizonyult heterozigötának a 7,0 kbp és egy 6,2 kbp EcoRI sávokra. A fertilis növények közül kettő volt homozigóta. a 6,2 kbp rcoPJ- sávra, ami feltételezhetően a vad típusú alléi.
3.
Expressziős analízis és a cDNS izolálása
A portok fejlődésére jellemző gének kifejeződését Northern-analizíssei mutatjuk ki a mikrosporogenezis különböző fázisaiban. A Northern~an.alízbs .is jól ismert eljárás a szakemberek körében; hasonlít a Southern-analizishez azzal az eltéréssel, hogy nem DNS-t, hanem mSdS-t izolálunk és viszünk fei a gélre. Ezután a mRNS-t híbridízáljuk a jelölt próbával [Potter et ad,, Proc.
lead. Scí, EISA 78, 6662-6666 (1981); Leonéit et ai., Mól.
219, 225-234 (1939)1. A BS927-8.1 klónből egy
Δ?ί3 í | 1. Aca |
r χ.. .·. | u Gém |
Psi | ;l/3gfj. |
gáláiban, amit magból, éretlen csőből, csíranövényből és címerből származó RRS-sei végzünk. Csak egyetlen jelet találtunk a eimer-RNS-ben, körülbelül a mikrosporogenezis kvartett stádiumában (3. ábra), A transzkriptura körülbelül. 1,4 kbp hosszúságé. Ugyanezt a próbát használjuk egy másik cDNS-konyvtár szűrővizsgálatához, amely a meiotíkuntól a késői egymagvúig terjedő stádiumú portokokböl származó mRNS-röl készült. S könyvtárból két kiónt — BS927-4.1 és 3.39-27-9.1 -· izoláltunk.
S zekvéneia-anali zis
A BS927-8.1 genom-kiönt és a két, BS927-4.1 és BS927-9.1
w* V <4 X*-* « * * * »» « < X * * If ad* Φ* cDNS-klónt a Lofstrand Labs Ltö. szekvenálta Sanger és munkatársai módszerével ÍRroo. Esti, Acad. Sói. USA 74, 5463-5467 (1977)1, A két cDNS-klón a molekulák 5' végénél, különbözik egymástól; a BS927-4.X tartalmaz egy TCTC ismétlődést, míg a BS9279,1 ne®. Ha ezeket a szekvenciákat Összehasonlítjuk a genom-DKSsel, akkor kitűnik, hogy a TCTC ismétlődés nincs jelen, és valószínűleg csk egy klónozás! műtermék a BS927-4.1 cDNS-ben. A. cDNS és a genom-DNS összehasonlítása hat exon és Öt íntron jelenlétét, fedte fel a genom-kiónban. A cDNS-szekvenciát a 4. ábrán, a genom- DNS-ét az 5, ábrán mutatjuk be. A cDCS/genom összevetés a 6. ábrán látható, és 95,95 %-os azonosságot mutat. A Múl inszertum a 2. exonban van. Sgy vélelmezett Met startkodon van a genom— klón 320. pozíciójában. A két cDNS-ből hiányzik ez a Met kodon, ezért azok nem. teljes hosszúságú gének. A BS927-4.1 cDNS további vizsgálata lehetővé tette a BS927-I1.1 klón izolálását. Ennek a kiónnak csak az 5'-végét szekvenáltuk, hogy meghatározzuk a kezdőpontját. Azt találtuk, hogy a BS927-11.1-ben két bázis hiány-
zik a MET k | ódonból | (A | ; i Ό ; , SS e 2 | a leghosszabb izolált cDNS. A |
további expo | ressziös | vi | zsgáiatokat | a BS927-4.1 cONS-próbávai vé- |
geztúk egy | Ν Ο Γ’ a ’ r Ϊ | i-b; | Lofc-on, ami | a mikrosporogenezís különböző |
stádiumaiból | szárma' | zó | mRHS-eket fc | artaimazott. Jeleket a meíózis |
11/kvartett | Ο ·ί— ·Α a -j s ·; tó’ x> Öl .\U. ÍX.ÍU V OaU | a középső | egymagvű stádiumig kaptunk; a | |
legnagyobb ’ | íelek a | kv | ártott és ) | c va r t e t1 - s z é t vá 1 á s s t á d i umo kb an |
jelentek meg | (7. ábra) . |
és esszenciális területeinek ezonosikése
A BS927-8.1 genom-klón összehasonlítása a BS927-T1.1, BS927-4 Ϊ81/ΚΕ '•dir 2 G ϊ·’
és BS327-9.1 cDNS-kl-ónokkai lehetővé tette a BS92.7 intronjalnak és exonjainak azonosítását, Ezzel lehetővé vált a nyílt leolvasási keretek meghatározása, amelyek egyike végignyúlik a cDNS.....
“Szekvenciák többségén, és legnagyobb valószínűséggel ez a BS927 gén fehérjekódoló szekvenciája. Megvizsgálva ennek kodonpreferenciáját és kizárva, az egyes ködötök harmadik pozíciójának véletlenszerű voltát, megerősítettük, hogy ez a szekvencia a fehér je-kódolo nyílt leovasásí keret. Az általa kódolt fehérje 5-2 %-os hasonlóságot (42 %-os azonosságot) mutatna a kukorica Al génjének fehérjéjével, ami a dihídroflavanol-reduktáz enzim, amire az antociánok és flofoafének bioszintézisében van szükség.
A portok-gének szabályozó területei, például· a promoterok, genom-alklónokban azonosíthatok funkció-analízissel, amit rendszerint a ríportsrgén expresszíójának a portok-szövetekben való megfígyelhefősege, illetve a portoktól eltérő szövetekben megfigyelhető hiánya vagy csökkent megjelenése erősít meg. Annak lehetőségét, hogy a szabályozó területek a transzláció kezdő helyétől „felfelé, azaz 5-irányban helyezkednek el, úgy vizsgáljuk, hogy egy, a területet magában foglaló QNS-fragmentumot expresszíös vektorokba alklőnozunk átmeneti expresszi ős kí sérletek céljára. Várható, hogy a kisebb szubgenom-fragmentumok fogják tartalmazni azokat a szakaszokat, amelyek elengedhetetlenek a hámszövet-preferáló kifejeződéshez. így például a CaMVISS és 35S promoterok esszenciális területeit nagyobb geuom-darabokból származó, viszonylag kis fragmentumokban azonosították (US 5,352, 605).
A megfelelő expressziős vektor — amellyel a funkcionális kifejeződés vizsgálható — és az eljárás, — amellyel, a vektor a
77.3S1/3E
A.
♦»-V ·»* *·'*’ gazdaszervezetbe juttatható — kiválasztása a gazdaszervezettől függ; az ilyen vektorok és eljárások jól ismertek a szakterületen. A vektorban lévő területek magukban foglalják azokat a szakaszokat, amelyek szabályozzák a transzkripció megindulását és folyamatát az eukariótákban. Ezekhez a területekhez működőképes módon kapcsolódik egy riportergén, például az UidA, amely β-glukuronídázt (GUS) vagy iucíferázt kódol. A növényi expressziós vektorok és riportergének leírását Gruber és munkatársai (iá. ííiü'i kézikönyvében találhatjuk meg. A GUS expressziős vektorok és génkeretek megvásárolhatók a Clonetech-től (Palo Alto, Ca.)., míg a luciferáz expressziós vektorokat és génkereteket a Prómega Corp. '{Madison, (ki. ) árusítja. A Ti plazmidokat és más Agzobacteríum-vektorokat Ishida és munkatársai (iá. közi.) írták le, illetve az US 5,591,616 számú, szabadalmi iratban szerepelnek.
Az expressziős vektorok, amelyek a feltételezett szabályozó területeket tartalmazzák a genom-fragmentumokban, bejuttathatók ép szövetekbe, például kifejlődött portokokba, illetve embriókba vagy kai!aszókba. A DNS bejuttatása történhet mikroszemcsés bombázással, injektálással, elektroporáciéval vagy Apróba Cheri um-közvetitésü génátviteliéi (Gruber et aí. , íd. hő Ishida et al., .iá. közi.; US 5,591,616). A növényi szövetek tenyésztésének általános módszereit ís a fentiekben találjuk meg.
Az átmeneti kifejeződés vizsgálatához kifejlődött, izolált portokokat helyezünk cimertenyésztő tápközegre (Pareddy és Petelinó, Crop Sói. J. 29, 1564-1566 (1989)], amit 0,5 % Phytagellei CSigma, St. Louís) vagy más szilárdító adalékkal szilárdítunk meg. Az expressziós vektor DNS-ét 5 órán belül juttatjuk be 77.3S1/SS
!$ * * * mikroszemcsés bombázással (1,2 pm átmérőjű szemcsék, 6880-7568 kPa nyomás) < A DBS bejuttatása után a portokokat 26 °C—-on inkubáljuk ugyanazon a tápközegen, 17 órán át, majd teljesszövet-homogenizátumot készítünk belőlük, aminek megmerjük a GUS- vagy
1uci£erá z-akt i vi tá sá t.
A BS227 valószínűsíthető transzlációs startkodonjától felfelé csak 319 bp DNS van jelen a 83927-8,1 genom-kiónban. Sgy kialakított Ncol restrikciós hely segítségévei az utóbbit a Xuciferázt és ^-gíukurcnidázt kódoló riportergénskhez kapcsoljuk megvizsgálandó, hogy van-e ennek a DNS-fragmentumnak promoterakt ivitása a növényi szövetben. Az aktivitást kimutattuk a portokokban, de nem a sziklevelekben, gyökerekben és kailuszokban, ami portok-preferálő vagy -specifikus promoter-aktivitást jelez.
Egy valószínű TATA-boxot figyeltünk meg a transzlációs startködömtől felfelé eső területen. Így tehát a »6927-8.1 genom- ki ón csak körülbelül 266 bázispárt foglal magában a lehetséges T.ATA-boxtól felfelé. A tipikus növényi génekben a transzkripció kezdchelye 26-36 bázíspárraí a TATA-box alatt van, ami a 36927 mENS-hez egy csak körülbelül 17-27 bp hosszúságú, nem lefordítható, 5’'-vezető szakaszt ad. A teljes, csak 319 bp hosszúságú BS927 sznbgenom-fragmentum — amely magában foglalja a nem. lefordítható vezető szakaszt, a transzkripció kezdőhelyét, a TATA-boxot és a TATA-boxtói felfelé eső szekvenciákat — elégségesnek bizonyult a promoter-aktívitáshoz (8. ábra, 5, számú szekvenciavázlat). A szakemberek tudják, hogy a promoter fúziója génekkel, nyílt leolvasási keretekkel, RNS-t kódoló szekvenciákkal, és hasonlókkal történhet akár a transzkripció, akár a transzlá77.3.gl/3Z
Ο (λ ció természetes kezdőhelyénél. vagy annak közelében, vagy a startkodontől lefelé. Az ábrán a vélelmezett TATA-boxot (TTTATAA) aláhúzással jelöljük. így tehát találmányunkhoz tartozik egy, az 5. számú szekvenoiavázlatban megadott (vagy azzal azonos, vagy azzal híbridízálódó) szekvenciájú DNS-molekula, aminek hámszövet-preferáló szabályozó funkciója van.
A szabályozó terület mindkét, 5' és 3' végén deléciés analízist végzünk: a fragmentumokat helyre irányított vagy PÜA-matagenezissel és hasonlókkal nyerjük („Direozed óíutagenesis; A
Rraoticai Approsoh''1RL Press, 1991) . A hámszövet-preferáló szabályozó terület 3'-vége meghatározható a TATA-box közelségéből vagy szükség esetén 3'-kivágásokkal, Ezután az esszenciális terület működőképes módon egy tetszőleges promoter-maghoz kapcsolható olyan restrikciós helyekre való klónozással, amelyeket közvetlenül a TATA-box feletti területen hoztunk létre klónozással, vagy a 3' deléciós analízissel ismertünk fel. Ha az esszenciális területet egyszer azonosítottuk, akkor egy idegen gén kifejeződését már vezérelhetjük a BS927 hámszövet-preferáló területével és egy promoter-msggai. A promoter-mag bármely ismert promoter-mag lehet, mint amilyen a karfiol mozaik vírus 35S vagy 19S promotera (US 5,352,605), az ubikvitín promoter-mag (US 5,510,474), az IN-2 promoter-mag (ÜS 5,510,474) vagy a görvélyfű mozaik vírus promotera (Órabér et el., id. mű). A promoter előnyösen egy hámszövet-preferáló gén promoter-mag ja vagy a CaMVuoS promoter-mag. Előnyösebben a promoter egy hámszövet-preferáló gén promotera, még előnyösebben a 3S927 promoter-mag.
A további — például linker-szkenníng-gel, egy jói ismert 77.3S2/SE· további módszerrel végzett ···· mutációs analízissel kisebb szakaszok azonosíthatók, amelyek a portok-preferáló kifejeződéshez szükséges szekvenciákat tartalmazzák. Szék a mutációk a működést módoséthatják, például a kifejeződés szintjét, időziteffcségét vagy a szövetet, ahol történik. A mutációk azonban némák is lehetnek, amelyeknek nincs megfigyelhető hatása.
A fenti eljárásokat használjuk a BS927 promoter esszenciális területeinek azonosítására. Miután a promotert a lu.ciferáz markergénhez kapcsoltuk, mutációs analízist, végzünk. A SS7 genomklón 319 bp hosszúságú promoter/nem lefordítható vezető területe 266 bp-t tartalmaz a feltételezett TATA-boxtól felfelé. Ha ennek a felfelé eső szakasznak a felső (körülbelül) felét egy fÜuJ restrikciós helyig kivágjuk, akkor az átmeneti promoter-aktivitás körülbelül az egytizedére csökken a portokokhan, de nem szűnik meg teljesen. Sgy Belli restrikciós hely beépítése a feltételezett TATA-boxtól számolt -15-től -10-ig terjedő pozíciókba nem befolyásolja különösebben az aktivitást, de ha ezt a klőnozóhely-módositást deléciöval kombináljuk, az aktivitás megszűnik.
Linker-szkenning analízist végzünk a feltételezett TATAboxtól számított -ló-tői a -261 pozícióig terjedő területen,, zömmel 10 bp-os lépésekben, a 9. ábrán látható módon. Az oszlopdiagram x-tengelyén az egyes, 7-10 helyettesített bázispárt tartalmazó szegmentumok vannak feltüntetve. Az y-tengelyen a normalízálfc iuciferáz-aktivitás van megadva a vad típusú promoter aktivitásának százalékában. A 1inker-szkennig szerkezetek és a vad típusú kontroli egyaránt magukban foglalják a SglH klónozó helyet. A minimális promoter a 10. ábrán látható (a TATA-boxot
77.33VBS «33— Jjif // ♦ ΦΦ κ»' aláhúzás jelöli). Egyetlen kritikus területet azonosítottunk a -112 és -9.3 pozíciók között, mig további, jelentős hatású területek vannak a -161 és-152, a -141 és -132, valamint a -92 és -83 pozíciók között. A körülbelül -102 és -93 pozíciók közé eső szakasz a P-motivum két, egymást átfedő másolatát tartalmazza, amiről tudjuk, hogy részt vesz más portok-specifikus promoterok felső területének működésében, valamint olyan oromoterokéban is, amelyeket a kukorica P génjének terméke aktivál. A myb-homológ P gén szabályozza a kukorica virágzatában a flobafén-pígmentáciöt azáltal, hogy közvetlenül aktiválja a .£lavonoid-foioszintézis génjeinek sorát tGrotewald et al ., Ceii 7 6, 543-553' (1994)1.
A BS92-7 promoter felhasználása az MS4S gén működtetésére
Az M.S45 gén egy himfertilítás-gén a kukoricában, amelynek mutációi megszakítják a mikrosporogenezist a mikrospörák vakuolizálásával, amitől a növény hímsterillé válik. Ha a klónozott kukorica MS45 gént bejuttatjuk egy ilyen .hímsteril növénybe, akkor a gén pótolhatja a mutánst és helyreállítja a hímfertílátást , Az MS45 gén és promotere teljes leírását az US .5,478, 369 és 6,037,523 számú szabadalmi iratokban találjuk meg, amelyeket referenciaként tartunk számon. A PHF6641 egy pUC8 plazmid, ami az MS45 gén promoterát és kódoló területét — az íntronokkal együtt — tartalmazza, ahol a 1-3335. nukleotidok egy Adói DNSfragmentumként vannak klónozva a 35S::PAT szelektálható markergén fölé (lásd a fenti leírásokat). Helyre irányított mutagenezissel egy Nóol restrikciós enzim felismerő helyet hozunk létre az MS45 gén transzlációs start-kodoniánál (az 1389. nukleotid).
77.3SVBS
Λ» Α Λ »* φ* X* bgy 4,7 kbp BindlTI-BcoRI fragmentumot ···· ami az MS45-35S::BAT mutagenízált változatát tartalmazza — klónozunk a pSBll plazmádba, amiből hiányzik a 35S GúS és 35S BAR géneket hordozó ScoRI DNS-fragmentum: igy kapjuk meg a PHPlö890 plazmidot. A ΡΗΡΪ2025 plazmidot úgy készítjük el, hogy az MS45 promotert kicseréljük a B.S92-7 prcmct orral. Ezt a plazmidot Agrobseteríum segítségével, juttatjuk be olyan kukorica-növényekbe, amelyek az MS4 5 gén mutációja következtében hlmsterilek. Mind a 22 transzformációs esemény a himfertilis fenotípus halyreáÍrását eredményezte, Fehér jekivonatokat készítettünk a mikrospőra-fejlödés tetrád-felszabadulástól a korai vskuolizálödásig terjedő stádiumaiban lévő portokokból. Az ímmonbiot-analízis azt mutatta, hogy az MS45-fehérje csaknem a vad típus szintjén fejeződik ki, ha a kukori-
ca | BS92-7 promctera műi | didteti a gént | . Kontrollként egy | vad tipu- |
sú | MS45 génnel rendelk | ezo, beitényé5 | sztett vonal MS-45 | fehérjéje |
szó | Igáit. így tehát a | BS92-7 p r omol | :.e.r képes egy gén | megfelelő |
szí | ntű kifejeztetésére | és ezzel egy | hlmsteríi mutáns | vonal hím- |
fsriiitásának helyreállítására. Az eredményeket az 1, táblázatban foglaljak össze.
a. BS7 promotex aXkalmazásávaX ,38I/£
A BS92-7 promoter emellett képes egy citotoxikus gén k.ifejeztetésére is, amivel egy hímfertilis genotípus, hímsteríilé tehető. A. hímsterll növényeket létrehozó szerkezetek az alábbiak szerint készíthetők el. Ehhez az £. coli DNS-adenín-metüáz (DAM) génjét használjuk fel (US 5, 792, 853; MS45::DAM-35SPA7 PHPI2634) .
A ÓAM gént helyre irányított mutagenezíssel [Su és El-Gewley, Gene 69, 81-89 (1988;) módosítjuk és egy nmei restrikciós helyet viszünk he a 186, nukleotídnái, a DAM gén Indító ATG kohonjától kilenc nukleotid távolságra 5' irányban. Egy 1,4 kbp Híndlll-Ncol fragmentum - ami a PHPG054 plazmádban a kukorica MS4 5 promcterát tartalmazza — Ncol helyét dKTP-vel feltöltjük T4 DNS-polimeráz segítségével, majd a fragmentumot ligáljuk a Szsal helyre, ami a DAM gén 5* végét tartalmazza. A gén transzkripcióját a burgonya proteinéz-inhibitor II gén (Pínl.15 3' -szekvenciájának (2-31-0. nukleotídok; An et ai. , Plánt Celi 1, 115-122 (1589/1 hozzáadásával termináljuk.
A PHP12634 ÍMS45::DAM-35SPAT) kukorica transzformációs vektor megszerkesztéséhez a 2,5 kbp kimére gént — ami az MS45 promotert, a DAM gént és a Pi.nll 3' nem lefordítható területet tartalmazza -- egy HindIJI~.NöoI fragmentumként klónozzuk a pSBll vektorba, a 35S::PAT géntől felfelé (a pSBH a pBB31-ből származik; hiányzik belőle az az EccPi fragmentum, ami. a 35SGUS és 353BAP géneket tartalmazza) . A. PAT gén a Strepfcosryces virídccbromaganes fosztinctríoin-aoetii-transzferáz génjét kódolja (6557. nukleotídok; lásd EB 0 275 957 A; génbanki azonosító száma A02774). A gén a karfiol mozaikvírus (CaMV) 35S promoterának és ‘UZSÁ/SS
Franck et a 1.. , Cél 1 21, 2:85-294 (1980>j A 35S:
terminátor szakaszának transzkripciós szabályozó hatása alatt áll (a 6906-743:9. és 7439-7632. nukleotidok; US 5,352,605;
komponenst egy xVcoJ-Kpnl fragmentum foglalja magában, ahogy az a pDfí.51 expreszsziós keret leírásában szerepel [Píetrzak et al., Náci. Acids kés. IV 5857-5663 (1986) j,
A PHP12635 vektort (SS7::D6M/35S;:PAT) úgy készítjük el, hogy a PHP12634 MS45 promoterát kicseréljük a BS7 proaoterra.
A következő kísérletben a BS92-7 promotert használjak a DAMmetiláz sterilitás-gén {DAM} transzkripciódának vezérlésére. A vad típusú kukoricát agy olyan vektorral is transzformáljuk, amiben a DAM gént az MS45 promoter működteti. A 2. táblázatban látható, hogy a SS92-7: :.DAM' transzformánsok 100 %-a. himeter.il, szemben az HS45::DAM transzforvánsokkal, amelyek közül csak 25 % bizonyult hlmsteríinek.
l
Allélizmus
A SS927-8.1 kiónt térképezzük egy ECS RFLP populációban az EcoPÍ restrikciós enzimmel. A. klón a 7. kromoszóma hosszú karján helyezkedik el a bnll5.40 és az umcllOa markerek között. Az ms7 hímsteril mutáns az egyetlen ismert hímsteríiitás-gén, ami a 7,
3SÍ/3S w/·
ÍZ kromoszómán található. Az allélek keresztezését a SS92-7 mutáns és az ? törzsvonal között végeztük el. A keresztezésből származó utódok szegregáiódtak a bim.steriiitásra, ami azt jelzi, hogy ugyanazon gén felelős a mutáns fenotipusért mind a BS92-7, mind az ms7 családban.
Az sis7 izolálása
Az ms7-5.1 kiónt megtisztítjuk és olyan belső primerek segítségével szekvenáljuk, amelyeket a SSS'2-7 szekvenáiásához már elkészítettünk. Az m.s 7-bői levezetett fehérje csak egyetlen szeri nnel tartalmaz több aminosavat, mint a BS92-7-ból levezethető
különbség a két | gén kbz |
romoter-szakasza | .bán. Az |
ifejesődécsel va | ló vizsgí |
okokban aktiv. | |
: említettük, a | SS92-7 |
orica hímsteril | mutáció |
Ltás lén fel. A | gén nővé |
rilitás befolyásolása céljából.
10, példa:
A BS92-7 cirokcbisr RT-PCR ás a BS92-7 kukorica cDNS összehasonlítása
A cirokban azonosítottuk a BS92-? egy homológját. A cirokBS92-7 cDhS-t izoláltuk a kukorica BSS2-7 gén primőrjeinek alkalmazásával egy polímeráz láncreakcióban, ahol a eirokeímer c DNS·-ét használtuk terápiát ként. Az Így kapott cDNS~fragmentumot a fent leírt módon szekvenáltuk, majd összehasonlítottuk a kuko77.. 381/BE bk.
ζ rica BS92-7 cDNS-ével, A nukletid-szekvencíák összehasonlítását a 11. ábrán mutatjuk be, ahol látható, hogy a nukleotíd-szekvenclák azonossága 89,.1 %-os, míg a belőlük levezethető fehérjeszekvenciák azonossága 94 %-os,
A fentiekből nyilvánvaló, hogy a BS92-7 gén nélkülözhetetlen a növények himfertilitásához.
Látható tehát, hogy találmányunk végül minden célját elérte.
77-.3S1Z8S / '?
: .... ....
{.SZEKVENCIÁK JEGYZÉKE) SEQGEEGE LTSTTNG <110> Pioneer Hi-Hred Ihtex-natioaal, Inc.
<120:> Kncieotide S-equences Mediating Maié Particity and Method cr 2sing: Satóe <130> 1147~PCT <1.10 ÜS 60/2 67,527 <14 0· 2001-02-00 <160 S
<17 0 | EastSSQ fór | ííirídows | Versien | 4.0 | |||||
<210> | 1 | ||||||||
<21.1> | 119 7 | ||||||||
<21.2> | aa | ||||||||
<2:13> | Zea | maya | |||||||
7,;,; ? > | |||||||||
<221 > | COS | ||||||||
<222> | (2) . | ..(934) | |||||||
<400> | 1 | ||||||||
2 2 tg | 3. £ £ | lÉ'Ö1· ülOo | aag | 20' | aae gta | tgc | gta aco geo geo | tca ggc | 11t |
Var | Thr | Sex· Sex | Lys | Gry | Lys Val. | Cys | Vai Thr Giv Aia | Ser Gly | Phe |
1 | 5 | :w | 15 |
gt 1 Val | geo Alá | tét Ser | tgg Trp 20 | ett Let | a Lé He | aaa Lys | «99 Arg | ctc Len 25 | ctc Let | gag Gin | tet Ser | gga Gly | tat Tyr 30 | est his | g7g Val | 97 |
gta | 222 | aet | gtc | agg | gac | cca | gga | aat | CSC | eaa | a a a | aea | gcc | cac | ott | 14 5 |
Val | Giy | Thr 35 | Val | Arg | Asp | Pro | Gly 40 | Asn | P 3.8 | Gin | Lys | Thr 15 | A.ia | his | Len | |
t-22 | 333 | tta | cet. | 22« | got | aaa | gag | agg | ctg | caa | ate | gtg | cga | get | aat | 193 |
Trp | Lys 50 | Len | Pro | Giy | Aia | Lys 55 | Gin | Arg | Let | Gin | He 60 | Vai | Arg | Aia | Asn | |
ctg | ttg | gaa | gaa | 772 | a go | ttc | gae | agc | gcc | 27 0 | a tg | geo | tgt | gag | 29 < | 211. |
Lea 65 | Let | Gin | Sít | Gly | Ír 7ö: | Phe | Asp | Ser· | Aia | Var 7.5 | bet | Aia | Cys | Gin | (ily 80 | |
gta | ttc | cac | de r | gca | tcc | ccc | gtc | ere | get | aaa | ccc | gac | tet | aet | agc | 28 3 |
Val | Phe | His | Thr | Aia 85 | Ser | Pro | Vai | Let | Ara 20 | Lys | Pre | Asp | Ser | Thr 95 | Ser | |
aag | gag | gac | a~g | ct c | gtc | cet. | 2«9 | gtg | aac | 227 | aet | ctg | a.ac | gtg | ctg | 037 |
Lys | Gla | Asp | Thr 100 | Let | Val | Pre | Aia | Val 105 | Asn | Giy | Thr | Len | Asn 110 | Val | Len | |
aga | te g | tgc | aag | aag | aae | ccc | ttc | ctg | aaa | agg | gtc | gtc | Ctt | aeg | tet | 385 |
Arg | Ser | Cys 115 | Lys | Lys | Asn | Pro | Phe 120 | Let | Lys | Arg | Val | vai 125 | Len | Thr | Ser |
teg | teg | tet | gcc | <?tg | agg | atc | agg | gac | gac | ggt | ggc | cag | tcc; | agt | acc | 43 | c |
Ser | •Sár | Síi r | Alá | Val | arg | He | Arg | Asp | Asp | Gny | Giy | Gin | Ser | Ser | Asn | ||
130 | .13.3 | 140 | |||||||||||||||
arc | 'Γ.Γ’.'ίί | ctg | gac | gaa | a cg | aca | tgg | aqc | tcc | gtg | CCS | A-.· U- | tcc | gag | aag | 48 | |
11c | Sex | Lee | Asp | Glu | Thr | Thr | Trp | Ser | Ser | Val | Pro | Leu | Gys | Gin | Lys | ||
143 | ISO | 155 | 160 | ||||||||||||||
ctg | cat | eta | tgg | £ at | •gcc | cta | gcc | aag | gta | ttt | gag | aaa | gcc | gcg | C | 9 | |
Met | Kis | Leu | Trp | Tyr | Alá | Lee | Alá | Lys | Vai | Phe | Alá | Giu | lys | Ara | Alá | ||
’ r\ | 170 | 175 | |||||||||||||||
tg g | gag | ttc | gcc | aa_g | gag | aac | ggc | atc | C & c | ett | gtg | act | gtc | ctc | ccg | b / | |
Trp | Sic | Phe | Alá | Lys | Glu | Asn | Gly | He | Asp | Leu | Var | Thr | Var | Leu | Pro | ||
ISO | 105 | 150 | |||||||||||||||
reg | ttc | gtg | atc | A? | ccc | agt | ttg | t CC | CCC | gag | C13 | ege: | gt t | <iCC | get | ή 3 | 9 |
Se?c | Phe | Val | lie | G £ V | Pro | Ser | Leu | Ser | His | Glu | Leu | Gys | Vai | Thr | Alá | ||
193 | 200 | 205 | |||||||||||||||
tea | gac | g te | cta | ege | eta | ttc | C$& | ggc | gac | acg | gca | sgg | ttc | acc | tcc | 57 | 3 |
Ser | Asp | Val | Leu | Oly | Leu | Phe | GFi. | Gly | A.sp | Thr | Alá | Arg | Phe | Ser | Ser | ||
210 | 215 | 220 | |||||||||||||||
t a c | gga | ag a | atg | 900 | tac | gtc | cac | atc | gac | gac | gtt | gtg | agc | agc | cac | 72 | 3 |
Tyr | Oly | A ·: g | Met: | Oly | Tyr | Val | His | He | Asp | Asp | Vai | Alá | Ser | Ser | His | ||
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||||
atc | ctg | gtg | tac. | cag | gcc | CCC | cac | gcc | gcc | ggg | 3. C 0' | tac | ctg | tgc | agc | ~i Z' / o | 13 |
He | Leu | Val | Tyr | Glu | Val | Pro | G JLFt | Alá | Gly | .Arg | Tyr | Leu | Cys | Ser | |||
24 3 | 250 | 255 | |||||||||||||||
tea | ctg | ctg | ctg | g&e | 3,<aC | gac | gsg | ctg | gt c | •CCC | teg | c£c | gcg | £ a 3: | ccc | 3 3. | 7 |
Ser | Val | Val | iea | Asp | Asn | Asp | Glu. | Leu | VH. | Ser | Ser | Leu | Alá | Lys | Atg | ||
260 | 265 | 270 | |||||||||||||||
tac. | ctg | ata | ttc | ccc | ata. | ccc | egg | agg | ctg | aac | agc | ccc | tac | ggc | aag | 86 | |
Tyr | arc | He | Phe | Pro | He | Pro | Arg | Arg | Len | Ara | Ser | Pro | Tyr | Giy | Lys | ||
2? 5 | 230 | 205 | |||||||||||||||
cag | tcc | tac | cag | ctg | aac | acg | ::cg | «.ag | ctg | cag | 999 | ctg | ggc | ttc | aag | 91 | 3 |
G-ΐΓί | Ser | Tyr | Gin | Leu | Asn | Thr | Ser | Lys | Leu | <7 in | Gly | Leu | Giy | Phe | Lys | ||
230 | 2 35 | 300 | |||||||||||||||
ttc | aga | ggg | gtg | cag | gag | atg | ttc | gac | ca c | tmJC | gtg | cag | tcc | eto | aaa | 88 | •t .L |
Phe | Arc | Gly | Vai | Gin | Glu | Met | Phe | Asp | Asp | Gys | Vai | Gin | Ser | Len | Lys | ||
303 | 310 | 515 | 320 | ||||||||||||||
gac | cag | 99* | C£C | ctg | ctg | gag | t gt: | CCC | ctg | tga | aotgcgstgg gggtgcctcc 10 | 14 | |||||
Asp | Gin | Gly | Kis | Leu | Leu | Glu | Gys | Pro | Leu | *· | |||||||
325 | 330 |
tgtgaacgce -cgttt-t-tttt tttcffccaat sattocacgt catgteaegg tgtcctcgcg 1074 cagactgcta ctgteaggtg t-oagggcg-tc atagotca-cg ggctotacgg ct.acatgaat 1134 aaaatgtcac -gctagctcgt catttgcttt gccatttaaa aaaaaaaaaa aaaaaaactc 1194 gag 1137 <2r0> 2 <211> 330 <212> PAP <213> Les maya
Λ « ** »»
<4 0C Val | ;> 2 Thr | Ser | Ser | Lys | Giy | i,y:s | Val | Gys: | Var. | Thr | Gry | Ai 3 | Ser | Οίν- | Phe |
1 Val | Aj. a | Ser | Trp | 5 Len | ile | Lys | Arg | Leu | 10 Leu | Gls | Ser | Gly | Tyr | Ιο' His | Val |
Val | Giy | Tar | 20* Val. | Arg | Asp | Pro | Giy | 25 Asn | isis | Gin | Lys | Thr | 30 Ara | his | Leu |
Trp | Lys | 35 Leu | Pro | Giy | Alá | Lys | 4 0 Gla | Arg | Lea | Gin | lie | 45 Val | Arg | Alá | Asn |
Len | 50 Leu | Glu | Glu | Giy | Ser | 55 Phe | Asp | Ser | Alá | Val | SO Met | Alá | Gys | Glu | Giy |
65 Val | Phe | Kis | Thr | Alá | 70 Ser | Pro | Val | Leu | Al a | 75 Lys | Pro | Asp | Ser | Thr | 80 Ser |
Lys | Gin | Asp | Thr | 35 Leu | Val | Pro | Alá | Val | 90 Asn | Gly | Thr | 2,eu. | Asn | 95 Val | Leu |
Arg | Ser' | Gye | 100 Lys | Lys | Asn | Pro | Phe | 105 Len | Lys | Arg | Var | Val | 210 Leu | Thr | Ser |
Ser | Ser | 115 Ser | Alá | Val | Arg | 2 la | 1:20' Arg | Asp | Asp | Ο .ί. y | Gly | 125 Gin | Ser | Ser | Asn |
Ha | 130 Ser | Leu. | Asp | Gla | Thr | 2 35 Thr | Trp | Ser | Ser | Va.i. | 140 Pro | Leu | Cys | Gin | l,ys |
145 Mát | mis | Len | T rp | Ty.r | 150 Al a | Leu | Ál a | Lys | Val | 1.55 Phe | Ara | Glu | Lys | Alá | 160 Alá |
Trp | Glu | Phe | Ál a | 165 Lys | Gin | .Asa | Gly | lie | 170: Asp | Len | Val | Thr | Val | 175 Len. | Pro |
Ser | Phe | Val | 180 Tle | Giy | Pro | Ser | Leu | 185 Ser | His | Grr | Leu | Cys | 190 Val | Thr | Ara |
Ser | Asp | 195 Val | Leu | Giy | Leu | Phe | 200 Gin | Gly | Asp | Thr | Ara | 205 Arg | Phe | Ser | Ser |
Tyr | 210 Giy | Arg | Mát | Giy | Tyr | 215 Val | His | lie | Asp | Asp | 220 Vei | Alá | Ser | Ser | His |
225 Ile | Leu | Val | Tyr | G Te | 230 Val | Pro | Gin | Alá | Alá | 235 Gly | Arg | Tyr: | 2,ea | Gys | 240 Ser |
Ser | Vei | Val. | Lea | 245 Asp | As n | Asp | Glu | Lea | 250 Val | Ser | Ser | Leu | Alá | 255 Lys | Arg |
Tyr | Pro | Tle | 200 Phe | Pro | 2:1.«· | Pr o | Arg | 265 Arg | lu-u | Aon | Ser | Pro | 270 Tyr | Gly | Lys |
Gin | Ser | 275 Tyr | Gla | Asn | Thr | 2S0 Ser | Lys | Leu | Gin | Gly | 285 Lea | Gly | Phe | Lys | |
Phe | 290 Arg | Giy | Val | Gin | Glu | 295 Két | Phe | Asp | Asp | Cys | 300 Val | Gin | Ser | Leu | Lys |
305 Asp | Gin | Giy | His | Leu 325 | 31G Lea | Gin | Gys | Pro | Le»· 330 | 315 | 320 |
<21ö> 3 <2U> 2541 <212> LKA <2I3> Sea xnays < 4 0 0 > 3 gaattctcgfc ctctgcaatc cacctagaaa tgtaictgot cttctctaga ccagtgtcta ci «aggot:: r agggactgtc attacsttaa
C CSCC&S ctcggcggtc cgtgccgtgg agcgacgcgt t.actgt.g.at.c atgttccfcgc gctgagaaca grtgcctott agggacoocg taartettga aagacagecc a&ctgaaecg taaaoagtgg aaagtggafca ctctttctch •asgcaaatgg cgcsgtcgcc tacttatcac aooaacttat cciggafcga ttgcaaatct acctccsacc aacccagcfcfc sccaaagthg tgctgahasy argz.gcgatt attgctctt't cgatgcttta taagagaagg ttggtcagca t cgatctctg tggtgacctc aagcaaggg-c aaggtatgcg Laacoggggc cgotta ·: caa «cggctcctc gagtctggat atcat-gtggt gtatf. fcgcga aatatcatta ctatcgtatc agtcct-cttt tteocaattt tttotttttt ttttttggta acccacaa-gg sec 1tt ggaa a11a cetggo getaaegaga ggctgcaa a t
120 ISO 24 0 300 360 420 400 54 0 600
Χ ν*« 40X0 ί '· *>« * * 0 X * ». Μ
X 0-40 0 00 X 0
0X0 * * X 4 cgtgcgagcfc tgfcatteeac •fccgccgcata aagcgcgttg tgeatggtgc tegtgcasga aggateaggg tccgtgccac ctctctgfcca tegtegtcce agaa-agcggc cgfc fcngtgat gccfcattcca agafcgactgg cccaccccca cgacgacgtt cctgtgcagn cccgatafctc ttttaagatc cccctacggc gttcag-aggg cctgct-ggag gggtfc.gcgtc tcacggtctc fcacatgaata cgaacttccg afcgatggtga. ggtttggatg tttgtccact aaa-gccacaa tagtgsgcat. tacact;:: rgfc. aaaccgtacg gatcfcgttgg actgcatccc tatatatgca catcfcaccgfc aggaggacac agaacccgtt aogacggtgg tccgcgagaa tcgatctcaa ttttgttgfct gtgggagtfec cggg ccca gt aggtatteát aaacaagagg ggcgacaagg gcgágcagcc tcagtggtgc cceataccce tcfcgaaeggg aagcagtcgt gtgcaggsga tgccecctgfc ccgaacccgc ct-cgcgcaga aaaacgtcac fctegc·; gtgt tcggaggcag gacgaatggc gg.acgg.cact agagagaatg gcacacctgt ssaecascca tggctggcgc aagaagggsg ecgtcetcgc i. a ί.·..· -..gga a c acgtgaagct gctcgtccct cctgaaaagg ccagtccagt g-atgcatgtg aecgtgátét cacccgaagc gccaaggaga ttgtcccacg etcaatoatt tatacatata caaggttcag acatcctggt c gg λ c a a c g a ggaggtcagt agagccgtgt a ce>~ g c t g a .c fc gtt agat giga siC i. g g ::í .fc tgttaatfccg ctgctactgt geregteatt gtgettótgg gca eegg fc gt tccaccafccg agenfc eaa ga aatgtacagt atttacatgc accaaccaac c cfctcgaeagc a a«a eccg & c atgcatccta agetatetaa gcggtgaacg gtegteetta aacatétege agatártáét gaaaaacaeg fcatggtatgc a cggcat cga aactstgcgt cgtaegtgfcfc· tatactetet et- cg t a c gga gtacgaggcc egagetggte egt cgtegeg gcatggtccg caagtcgaag c <. g e gt <jt-.ag g g ggt g cc .. c fcfc. tttttfcte cagggcgfcca tgctttgect ctgccggtcg gtgcgtgcga atefegagtea fctcagtctca g <. ζ. *v eangcc afcgcatgfcac casgcaagea gccgtgatgg tctacfcagca ctgeagcctt getaagetgt gtaetetgaa egterecgtc tggacgaasc gaacagfcgtc catgegegca Ce t ctgCC-a-ctCí ccttgfcgaet taccgcttea etggtfctfceg gttccfcecte agaatgeggt ccccaggccg tccfccgctcg tegtetggat fctetgetgca etgcaggggc fcegeteaaag cgcc.tgt.gaa ttcsafcaatt: t ag et cacgg tttttfcfcfcgg ccttgtcggt tcaaecgaae treggatttt aateeeaaat acagctcact seecccsccc afceaageaaa cctgfcgsggg aggcatgcca ttcfcatacgg tt fcfccatgca cgtgctgaga gtctgcggtg gaeatggage fcacfcctetet caegttgceg gtatttgeag gtceteeegt gsegteetag tatgttaaat cccccccccc acgtccacat ccgggaggta cgaaacgcta gfcgegfcgcca •ggctgaacag tgggctteaa aceagggaca egegeeggtt ecaegteatg gctctccggc gttcgttcfc.g gtggcgacfcg gccatgtggc gaaeegctgs e e e fc e a e ge age-tcaaaag eeactsefctg eaeaeagage
660 720 780 840 300 360 1020 1080 1140 1200 1260 1320 1300 1440 1800 1560 1820 1 €80 1740 10 00 1060 1020 1580 2040 2100 2160 2220 2280 2340 24 00: 24 60 2520 2541 <210.> 4 <211> 330 <212> FF.T <213> 2«a maya <40C> 4
Val 1 | Thr | Ser | Ser | Lys s | Gly | Lys | Val | eys: | Val 10: | Thr Gly Aia | Ser | Gly 15* | Phe | ||
Val | Aia | Ser | Trp | Lett | lle | Lys | Arg | Lea | Len | Gla | Ser | Gly | Tyr | His | Val |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Val | G.:.y | Thr | Val | Arg | Asp | Pro | Gly | Asn | His | Gla | Lys | Thr | Alá | His | Len. |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Trp | Lys | Le a | F re | Gly | Alá. | Lys | Gla | .Arg | Lea | G in | Tie | Val | Arg | Aia | Asn |
50 | 55 | 6 0 | |||||||||||||
est; | Lee | Glt | Gin | Gly | Ser | Fhs | Asp | Ser | .Alá | Val | fcíet | Aia | Cys | Gl.ti | Gly |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Val | The | His | Tar | Alá | Ser | Pro | Val | Le a | A.ls | Lya | Pro | .Asp | Ser | Thr | Ser |
SS | 50 | 95 | |||||||||||||
Lys | Gla | Asp | Tar | Lett | Val | Pro | Aia | Val | Asn | Gly | Thr | Len | Asa | Val | Lee. |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Arg | 3-ar | Cys | Lys | Lys | Asn | Pro | Phe | Let; | .Lys | Arg | Val | Val | Lan | Thr | Ser |
125 | 120 | 125 | |||||||||||||
Ser | Ser | Ser | Alá | Val | Arg | lle | Arg | Asp | .Asp | Gly | GI y | Gin | Ser | Ser | Asa |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
11« | Ser | Lea | Asp | Gin | Tar | Thr | Trp | Ser | Ser | Val | Pro- | Leu | Cys | Giu | nys |
140 | 150 | 155 | 160 |
>« ~
Met | His | Lee | Trp | Tyr Alá Leu Alá Lys Val | Phe | Alá | Giu Lys Ara 175 | Ara | |||||||
IS 5 | 170 | ||||||||||||||
Trp | Gla | Phe | Alá | Lys | Glu | ASU. | Gly | Ile | Asp | Lee | Vai | Thr | Vai | Le e | Pro |
180 | 185 | 180 | |||||||||||||
Ser | Phe | Val | Ile | Gl y | Pro | Ser | Lee | Ser- | His | Gle | Leu | Gys | Vai | Thr | Aia |
ISO | 200 | 205 | |||||||||||||
Ser | Asp | Val | leu | Gly | Leu | Phe | Gin | Giy | Asp | Or | Alá | Arg | Phe | Ser | Ser |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Tyr | Gly | Arg | Két | Giy | Tyr | Val. | His | lie | Asp | Asp | Val. | AJ. a | Ser | Ser | His |
Ó '> - V. ¢. ..· | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Ile | Leu | Val | Tyr | Glu | Val | Pro | Gle | Alá | Alá | Gly | Arg | Tyr | Lee | Gys | Ser |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Ser | Vai | Vai | Lee | Asp | Asn | Asp | Glu | Lee | Vai | Ser | Ser | Lee | Als | tys | .Arg |
2 80 | 2S5 | 270 | |||||||||||||
Tyr | Pro | lie | Phe | Pro | lie | Pro | Arg | .Arg | Leu | Asn | Ser | Pro | Tyr | eo. y | Lys |
275 | 2 8(5 | 285 | |||||||||||||
Gin | Ser | Tyr | Glu | Lee | Asn | Thr | Ser | Lys | Lee | Gin | Giy | Leu | Gi y | Phe | Lys |
230 | 2 85 | 300 | |||||||||||||
8 te | Arg | Gly | Vai | Gin | Gle | Met | Phe | Asp | Asp | Gys | Vai | Gin | Sex- | Leu | Lys |
385 | 310 | 313 | 320 | ||||||||||||
Age | Sin | Gly | His | leu | Lee | Glu | Gys | Pro | Leu | ||||||
325 | 330 |
<210 5 <210 322 <212> LNA <213> Zea mays <400 5 gaattcfccgt ctcggcggte aactgaaccg taaacagtgg aaagtggata ctctttctct 60 ctctgcaatc cgtgccgt-gg aagcaaatgg cgcagtcgcc tacttatcsc. accas-cttst 120 cacctagaaa agcgacgcgt cctggatcga ttgcaaatct acctccaacc aacccagctt 18G tgtatctgct tactgtgatc accaaagttg tgctgatacg atgtgcgafcfc attgctcttt 240 cttctctaga atgt'tcctgc cgatgctfcta t-aagagaagg fctggtcagca tcga-tctctg 300 ecagtgtcta gctgagaaca tg 322 < 2 a 0 > 6 <210 187 <212> DNA <213> Zea maya <400> 0 cgcgtcctgg atcgattgca aatctacctc caacceaces agctttgtat ctgcttactg SO tgatcsccaa agtfcgtgcüg atscgatgtg cgattattga tctttcfcfcct ctagaatgtt 120 cctgccgatg ctttataaga gaaggttggt cagcatcgat ctctgccagt gtctagctga 180 gaacatg 187
<210 <210 <212> <218> | 7 537 LKA Scrghnxa bicéior | |
<220> | ||
<220 | GLS | |
<222> | ír; . .. | .(535) |
<4Ö0> 7
gta | acc | ggg | get | to& | GG'V | ttt | att | gee | tet | tgg | ett | atc | aaa | egg | ctg | Z, C; |
Val | Thr | Gl. y | -A.Ü. 3 | Ser | Gi y | The | He | Aia | Ser | Trp | let | He | Lys | Arg | Let | |
1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||||
ctc | gsg | tet | gga | tat | 03 0 | gtg | gta | GGG | act | gr c | aga | esc | 003 | gga | aat | Q (7 |
Leó | Gla | Ser | Gly | Tyr | Kis | Vai | Vai | Gly | Thr | Val | Arg | Asp | Pre | Gly | Asn | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
CSC | caa | sas | aca | gca | C&C | ett | tgg | 3 3 iíi | t c a | cet | OGt | gee | 3 3 3 | gag | agg | 144 |
Kis | Gin | Lys | Thr | Aia | His | hat | Trp | Lys | Lee | Pro | Gly | Aia | Lys | Git | Arg | |
35 | 4 0 | 4 5 | ||||||||||||||
ctg | c« 3 | att | gtg | oga | get | gat | ctg | ttg | gaa | gaa | GGG | agc | ttt | gsc | aat | j. y.z |
Let | Gin | He | Vs I | Arg | Al a | Asp | Let | Len | Gin | Et r y | Se r | Phe | Asp | Asn | ||
SG | 55 | 60 | ||||||||||||||
<jCt | gtc | atg | gae | tgt | gat | ggc | gtc | ttc | cac | act | gca | tcc | cet | gtc | O-t'C | ο λ o |
A ia | Val | Me | A.sp | Cys | Asp | Gly | Vai | The | Kis | Thr | Aia | Ser | Pro | Vai | Len | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
get | & 3 3 | tet | gat | tet | agt | agc | sae | gsg | gaa | acg | ett | t:gt | cca | gca | gta | Z 6 <*! |
Aia | Lys | Ser | Asp | Ser | Ser | Ser | Lys | G.ls | GI n | Thr | Len | 'Cys | Pre | Alá | Val | |
85 | 90 | 95 | ||||||||||||||
&&c | GG | act | et g | aat | gtg | cts | aga | Ccg | tgc | 3.3 CJ | aag | 330 | Ο O 3 | ttt | ctg | 33 6 |
ASn | Gly | Thr | Le a | .Áss | Vai | Le e. | Arg | Sor | Cys | Lys | Lys | Asn. | Pro | .Phe· | Let | |
100 | 105 | ne | ||||||||||||||
SS 3. | agg | gtt | gtt | ett | acg | tet | tea | tea | tet | gca | gtg | agg | att | agg | gat | 384 |
Lys | Arg | Val | Vai | Let | Thr | Sár | Ser | Ser | Ser | Aia | Vaí | Arg | Iie | Arg | Asp | |
115 | 120 | 125 | ||||||||||||||
gat | gat | eag | cet | aat | atc | tea | ctg | gat | 033 | 3.03 | 3C3 | tgc | agc | tet | gtg | •i: O Z |
Asp | Asp | Gin | Pre | Asn | iie | Ser | Let | Asp | Git | Thr | Thr | Trp | Ser | Ser | Vai | |
130 | 135 | 140 | ||||||||||||||
CCS | ctc | tgt | gaa | aag | atg | eag | cts | tgg | tat | gee | cts | gcg | aag | gta | ttt | 480 |
Pre | LSU | Cys | Git | Lys | Tet | Gin | Lee | Trp | Tyr | A.r.3 | Let | Al.a | Lys | Val | The | |
145 | 150 | 155 | 160 | |||||||||||||
go& | gog | aaa | gtg | gee | tgg | gaa | ttc | gee | aag | eag | aac | aac | atc | aac | ett | 528 |
.Alá | G.ls | Lys | Als | Aia | Trp | G.ls | Phe | Als | T-:V O | Gl.: | Asn | Asn | He | Asp | Let | |
165 | 170 | ·· '*· c *. ; O | ||||||||||||||
gtg | act | gtc | ctc | cca | tea | ttt | gtg | atc | egg | ccc | agt | tta | tcc | eat | gaa | st, s ' \· |
VS 1 | Thr | Vs 1 | Let | Pre | Ser | Phe | Vs 1 | He | Gly | Pro | Ser | Len | Ser | Kis | Gin | |
18 Q | 185 | 190 | ||||||||||||||
cta | tgt | gtt | &ce | get | tea | gat | gtc | cta | GGC | tta | t te | O síd | GG | gae | acg | 624 |
Lsu | Cys | Vai | Thr | Aia | Ser | Asp | Vai | Len | Gly | Len | Phe | Gin | Gly | Asp | Thr | |
195 | 200 | 205 | ||||||||||||||
CCS | agg | ttc | agt | tet | tac | gga | aga | atg | gga | tac | gtt | CSC | atc | g a c | gat | 67 2. |
A.Is | Arg | The | Ser | Ser | Tyr | Gly | Arg | Est | tr y | Tyr | Vai | Kis^ | He | Asp | Asp | |
210 | 215 | 220 | ||||||||||||||
gtt | gvg | sec | agc | cac | atc | ctg | G tg | t | 637 | |||||||
Vai | Aia | Thr | Ser | Kis | ne | Lee | Val | |||||||||
225 | 230 |
: ί ί *
<210> 3 <2'Π.> 232 <212> ΡΕΤ <213> Sorgham hiaoiot <4Q0> 8
Vai 1 | T Ár- | Giy | Aia | Ser 5 | Giy | Phe | il®: | Aia | Ser 10 | Trp | Lee | Ile | Lys | Arg 15 | Lee |
Lea | tói a | Ser | Giy 241 | Tyr | His | Val. | Vai | Giy 2.5 | Thr | Vai | Arg | Asp | Pro 30 | Giy | Asn |
His | G in | Lys 35 | Thr | ALa | His | Len | Trp 40 | Lys | Lea | Pro | Giy | Aia 45 | Lys | Gia | Arg |
Leu | Gin 50 | lie | Vai | Arg | Aia | Asp Sa' | Lea | Lee | Gia | Gin | Giy 60- | Ser | Phe | Asp | Asa |
Aia 55 | Vai | Met. | Asp | Cys | Asp H | Giy | Vai | Phe | 8 is | Thr 75 | Aia | Ser | Pro | Val | Lea 8Ö |
.Aia | Lys | Cser | Asp | Ser 35 | Ser | Ser | Lys | Gia | Gli): 90 | Tar | Lea | Cys | Pro | Aia 95 | Vei |
Ase | Giy | Thr | Len 100 | Asn | Val | Lea | Arg | Ser 105 | Cys | Lys | Lys | Asn | Pre 110 | Phe | Lee |
Lys | Arg | Vai US | Val | Len | Thr | Ser- | Ser 120 | Ser | Ser- | Aia | Vei | Arg 125 | lie | Arg | Asp |
Asp | Asp 130 | Gin | Pro | Aaa | lie | Ser 135 | Lea | Asp | tó.i a | Thr | Thr 14 0 | Trp | Ser | Ser | Val |
Pro 145 | Lea | Cys | Gin | Lys | Aet 150 | Gin | Laa | Trp | Tyr | Als 155 | Lea | Aia | Lys | Vai | Phe ICO |
Aia | Gis | Lys | Aia | Aia 165 | Trp | GTa | Phe | Alá | Lys 170 | Gia | Asn | Asn | Ha | Asp 175 | Lea |
Vai | Thr | Val | Len 180 | Pro | Ser | Phe | Vai | lie 185 | Giy | Pro | Ser | Lea | Ser 190 | Kis | Gia |
Lea | Cys | Vai 135 | Thr | Aia | Ser | ASp: | Val 200: | Lea | Giy | Lea | Phe | Gin 205 | Giy | Asp | Thr |
A.La Val 225 | Arg 210 Aia | The Thr | Ser Ser | Ser His | Tyr lie 230 | Giy 215 Lea | Arg Vai | Met | Giy | Tyr | Val 220 | His | lie | Asp | Asp |
Claims (5)
1. Izolált nukleinsav-szekvenoia, amely az 5. számú szekvenciát (SEQ ID NO: 5} tartalmazza, vagy amely nagyon szigorú körülmények között hi.bridizál az 5. számú szekvenciával, és egy hámszövet preferáló szabályozó régió funkciójával rendelkezik,
2. Transzformációs vektor, amely az I. igénypont szerinti szekvenciát egy heterolőg nukleotid-szekvenoiához működőképesen kapcsolódva egy expressziős kazettában tartalmazza.
Izolált nukleinsav, amely -egy, a 6, számú nukleotid-szekvenciát ÍSE-Q ID NO; 6) tartalmazó hímszövet preferáló szabályozó régió, vagy amely a 6, számú szekvenciával nagyon szigorú körülmények között hibridizál.
4, Eljárás gazdasejt transzformálására vagy transzfektálására egy 2, igénypont szerinti vektorral végzett transzformációval vagy transzfekciöval.
5, A 4, igénypont szerinti eljárás, amelyben a gazdasejt egy növényi gazdasejt,
6, Az 5, igénypont szerinti eljárás, amelyben a növény alacsony erukasav-tarfalmü olajrepce tcanola), kukorica, búza, cirok vagy szója.
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US26752701P | 2001-02-08 | 2001-02-08 | |
PCT/US2002/002713 WO2002063021A2 (en) | 2001-02-08 | 2002-01-30 | Nucleotide sequence mediating male fertility and method of using same |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HUP0303517A2 HUP0303517A2 (hu) | 2004-01-28 |
HUP0303517A3 HUP0303517A3 (en) | 2010-01-28 |
HU228695B1 true HU228695B1 (en) | 2013-05-28 |
Family
ID=23019159
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU0303517A HU228695B1 (en) | 2001-02-08 | 2002-01-30 | Nucleotide sequence mediating male fertility and method of using same |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US6956118B2 (hu) |
EP (1) | EP1358335B1 (hu) |
AT (1) | ATE505549T1 (hu) |
AU (1) | AU2002251839B2 (hu) |
CA (1) | CA2437318C (hu) |
DE (1) | DE60239729D1 (hu) |
HU (1) | HU228695B1 (hu) |
MX (1) | MXPA03006984A (hu) |
WO (1) | WO2002063021A2 (hu) |
Families Citing this family (18)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7517975B2 (en) | 2000-09-26 | 2009-04-14 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Nucleotide sequences mediating male fertility and method of using same |
AUPR811301A0 (en) | 2001-10-05 | 2001-10-25 | Agresearch Limited | Manipulation of flavonoid biosynthesis |
AU2013202736B2 (en) * | 2001-10-05 | 2015-03-12 | Agresearch Limited | Manipulation of flavonoid biosynthesis in plants (5) |
US7154027B2 (en) | 2001-11-07 | 2006-12-26 | Jeroen Demmer | Compositions isolated from forage grasses and methods for their use |
CA2971538A1 (en) | 2003-12-16 | 2005-06-30 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Dominant gene suppression transgenes and methods of using same |
US20070169227A1 (en) | 2003-12-16 | 2007-07-19 | Pioneer Hi-Bred International Inc. | Dominant Gene Suppression Transgenes and Methods of Using Same |
CN101802201A (zh) | 2007-08-03 | 2010-08-11 | 先锋高级育种国际公司 | 影响植物雄性生育力的msca1核苷酸序列以及使用其的方法 |
AU2012333207A1 (en) | 2011-06-21 | 2014-01-23 | E.I. Du Pont De Nemours And Company | Methods and compositions for producing male sterile plants |
CA2867377A1 (en) | 2012-03-13 | 2013-09-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Genetic reduction of male fertility in plants |
EP2825656A1 (en) | 2012-03-13 | 2015-01-21 | Pioneer Hi-Bred International Inc. | Genetic reduction of male fertility in plants |
WO2013138358A1 (en) | 2012-03-13 | 2013-09-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Genetic reduction of male fertility in plants |
WO2013138309A1 (en) | 2012-03-13 | 2013-09-19 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Genetic reduction of male fertility in plants |
CN105602952B (zh) * | 2012-11-09 | 2019-11-19 | 深圳市作物分子设计育种研究院 | 一种育性基因及其应用 |
US9803214B2 (en) | 2013-03-12 | 2017-10-31 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Breeding pair of wheat plants comprising an MS45 promoter inverted repeat that confers male sterility and a construct that restores fertility |
BR112015023304A2 (pt) | 2013-03-14 | 2017-07-18 | Pioneer Hi Bred Int | método para melhorar a tolerância ao estresse abiótico de uma planta, planta e semente |
WO2014143996A2 (en) | 2013-03-15 | 2014-09-18 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Compositions and methods of use of acc oxidase polynucleotides and polypeptides |
US10317578B2 (en) * | 2014-07-01 | 2019-06-11 | Honeywell International Inc. | Self-cleaning smudge-resistant structure and related fabrication methods |
WO2016100309A1 (en) | 2014-12-16 | 2016-06-23 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Restoration of male fertility in wheat |
Family Cites Families (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5478369A (en) * | 1990-06-12 | 1995-12-26 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Nucleotide sequences mediating male fertility and method of using same |
IE921206A1 (en) * | 1991-04-16 | 1992-10-21 | Mogen Int | Male-sterile plants, method for obtaining male-sterile¹plants and recombinant dna for use therein |
JP3418396B2 (ja) | 1992-03-09 | 2003-06-23 | ワシントン ステート ユニバーシティ リサーチ ファンデーション | 植物稔性の調節方法 |
CA2234557C (en) * | 1995-10-13 | 2007-01-09 | Purdue Research Foundation | Method for the production of hybrid plants |
US6037523A (en) * | 1997-06-23 | 2000-03-14 | Pioneer Hi-Bred International | Male tissue-preferred regulatory region and method of using same |
US7154024B2 (en) * | 1997-06-23 | 2006-12-26 | Pioneer Hi-Bred, Inc. | Male tissue-preferred regulatory sequences of Ms45 gene and method of using same |
-
2002
- 2002-01-28 US US10/058,566 patent/US6956118B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2002-01-30 DE DE60239729T patent/DE60239729D1/de not_active Expired - Lifetime
- 2002-01-30 WO PCT/US2002/002713 patent/WO2002063021A2/en not_active Application Discontinuation
- 2002-01-30 AU AU2002251839A patent/AU2002251839B2/en not_active Ceased
- 2002-01-30 EP EP02720868A patent/EP1358335B1/en not_active Expired - Lifetime
- 2002-01-30 AT AT02720868T patent/ATE505549T1/de not_active IP Right Cessation
- 2002-01-30 HU HU0303517A patent/HU228695B1/hu not_active IP Right Cessation
- 2002-01-30 CA CA2437318A patent/CA2437318C/en not_active Expired - Fee Related
- 2002-01-30 MX MXPA03006984A patent/MXPA03006984A/es active IP Right Grant
-
2005
- 2005-08-08 US US11/200,283 patent/US7317137B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-11-14 US US11/940,138 patent/US7973152B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US7317137B2 (en) | 2008-01-08 |
US6956118B2 (en) | 2005-10-18 |
EP1358335A2 (en) | 2003-11-05 |
DE60239729D1 (de) | 2011-05-26 |
US7973152B2 (en) | 2011-07-05 |
MXPA03006984A (es) | 2004-01-29 |
US20080086783A1 (en) | 2008-04-10 |
WO2002063021A3 (en) | 2002-10-17 |
ATE505549T1 (de) | 2011-04-15 |
HUP0303517A2 (hu) | 2004-01-28 |
AU2002251839B2 (en) | 2006-10-26 |
CA2437318A1 (en) | 2002-08-15 |
WO2002063021A2 (en) | 2002-08-15 |
CA2437318C (en) | 2013-06-18 |
HUP0303517A3 (en) | 2010-01-28 |
US20060021079A1 (en) | 2006-01-26 |
EP1358335B1 (en) | 2011-04-13 |
US20020183274A1 (en) | 2002-12-05 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2007201072C1 (en) | Nucleotide sequences mediating male fertility and method of using same | |
JP3727492B2 (ja) | 改変雄蕊細胞を有する植物 | |
EP0644943B1 (en) | Maintenance of male-sterile plants | |
CA2613336C (en) | Nucleotide sequences mediating plant male fertility and method of using same | |
JP3143120B2 (ja) | 変更された花、種又は胚芽をもつ植物 | |
US7973152B2 (en) | Nucleotide sequences mediating male fertility and method of using same | |
US5750867A (en) | Maintenance of male-sterile plants | |
EP1702508A1 (en) | Method of producing sterile plant, plant obtained by using the same and use thereof | |
CA2099482C (en) | Anther-specific cdna sequences, genomic dna sequences and recombinant dna sequences | |
AU642454B2 (en) | Expression of S-locus specific glycoprotein gene in transgenic plants | |
JPH10504706A (ja) | 雄性不稔植物の維持のためのアントシアニン遺伝子の使用 | |
WO1998039462A1 (en) | Method of hybrid seed production using conditional female sterility | |
AU2002251839A1 (en) | Nucleotide sequence mediating male fertility and method of using same | |
US6215045B1 (en) | Developmental regulation in anther tissue of plants | |
US6207883B1 (en) | DNA sequences coding for a protein conferring male sterility | |
US7728194B2 (en) | DNA fragment specific to cytoplasmic male sterile pepper and use thereof | |
US6815577B1 (en) | Method of hybrid seed production using conditional female sterility | |
AU724493B2 (en) | Developmental regulation in anther tissue of plants | |
CA2567357A1 (en) | Anther-specific cdna sequences, genomic dna sequences and recombinant dna sequences | |
BR122014029560B1 (pt) | Vector of expression |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | Lapse of definitive patent protection due to non-payment of fees |