FR2794025A1 - COMPOSITION FOR IMPLEMENTING ANTI-TUMOR OR ANTIVIRAL TREATMENT IN A MAMMAL - Google Patents
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Abstract
Description
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La présente invention concerne une composition cytotoxique comprenant une première séquence d'acide nucléique codant pour tout ou partie de la protéine p53 et une seconde séquence d'acide nucléique codant pour tout ou partie d'un polypeptide ayant au moins une activité cytotoxique, notamment antitumorale ou antivirale. La présente invention est particulièrement utile dans le cadre de la mise en oeuvre d'un traitement par thérapie génique de maladies prolifératives ou infectieuses. The present invention relates to a cytotoxic composition comprising a first nucleic acid sequence coding for all or part of the p53 protein and a second nucleic acid sequence coding for all or part of a polypeptide having at least one cytotoxic activity, in particular anti-tumor activity or antiviral. The present invention is particularly useful in the context of the implementation of a treatment by gene therapy of proliferative or infectious diseases.
La p53 est une phosphoprotéine nucléaire intervenant notamment dans le contrôle de l'expression des protéines impliquées dans le cycle cellulaire (Ozbun et al, 1995, Adv. P53 is a nuclear phosphoprotein involved in particular in controlling the expression of proteins involved in the cell cycle (Ozbun et al, 1995, Adv.
Cancer Res. 66,71-141- Selter et al, 1994, Int. J. Biochem. Cancer Res. 66,71-141- Selter et al, 1994, Int. J. Biochem.
26,145-154) et participant à de nombreux processus cellulaires liés à la stabilité du génome et à l'apoptose cellulaire (Harris et al, 1996, J. Natl. Cancer Inst. 88, 1442-1445 ; Kastan et al, 1991, Cancer Res. 51, 6304-6311 ; Kuerbitz et al, 1992, PNAS, 89,7491-7495). 26,145-154) and participating in numerous cellular processes linked to genome stability and cell apoptosis (Harris et al, 1996, J. Natl. Cancer Inst. 88, 1442-1445; Kastan et al, 1991, Cancer Res. 51, 6304-6311; Kuerbitz et al, 1992, PNAS, 89.7491-7495).
Le gène p53 a été identifié et séquence. La séquence du cDNA est décrite dans Matlashewski et al., 1984, EMBO J., 3,3257-3262 et celle de la protéine dans Lamp , 1986, Mol. The p53 gene has been identified and sequenced. The sequence of cDNA is described in Matlashewski et al., 1984, EMBO J., 3.3257-3262 and that of the protein in Lamp, 1986, Mol.
Cell Biol., 6,1379-1385. De même, des variants polymorphiques naturels et fonctionnels ont été identifiés pour lesquels certains amino acides sont remplacés par d'autres sans toutefois affecter la fonction p53. Par ailleurs, de nombreuses mutations ont été décrites dans la littérature relative au cancer qui peuvent se traduire par une perte de la fonction de cette protéine (Holstein et al, 1991, Science, 253,49-53 ; Levine et al, 1991, Nature, 351, 453-456). Par exemple, Baker et al, (1989, Science, 244, 217) ont constaté que dans plus de 70% des tumeurs colorectales la fonction de ce gène p53 est perdue. Cell Biol., 6.1379-1385. Similarly, natural and functional polymorphic variants have been identified for which certain amino acids are replaced by others without however affecting the p53 function. In addition, many mutations have been described in the cancer literature which can result in a loss of the function of this protein (Holstein et al, 1991, Science, 253,49-53; Levine et al, 1991, Nature , 351, 453-456). For example, Baker et al, (1989, Science, 244, 217) have found that in more than 70% of colorectal tumors the function of this p53 gene is lost.
Par ailleurs, plusieurs études in vitro ont montré que la restauration de l'activité p53 dans les cellules déficientes pour cette activité permet de supprimer la croissance cellulaire ou d'induire l'apoptose des cellules Furthermore, several in vitro studies have shown that restoring p53 activity in cells deficient for this activity makes it possible to suppress cell growth or induce cell apoptosis
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(Baker et al, 1990, Science, 249,912-915 ; Shaw et al, 1992, PNAS, 89,4495-4499). De façon similaire, plusieurs études ont confirmé qu'il est possible de supprimer in vivo la croissance des cellules tumorales par l'application d'une thérapie visant à restaurer de l'activité du gène p53 défectueux (Fujiwara et al, 1994, J. Natl. Cancer Inst. 86, 1458-1462 ; Wills et al, 1994, Hum. Gene Therapy, 5,1079- 1088 ; Hamada et al, 1996, Cancer Res. 56, 3047-3054). (Baker et al, 1990, Science, 249,912-915; Shaw et al, 1992, PNAS, 89,4495-4499). Similarly, several studies have confirmed that it is possible to suppress the growth of tumor cells in vivo by applying therapy aimed at restoring the activity of the defective p53 gene (Fujiwara et al, 1994, J. Natl. Cancer Inst. 86, 1458-1462; Wills et al, 1994, Hum. Gene Therapy, 5.1079-1088; Hamada et al, 1996, Cancer Res. 56, 3047-3054).
En outre, faisant suite aux travaux de Lowe et al. In addition, following the work of Lowe et al.
(1993, Cell 74,957-967, 1994, Science 266,807-810) mettant en évidence une résistance accrue de cellules tumorales n'exprimant pas le gène p53 à l' égard de différents types d'agents cytotoxiques et radiations, l'utilisation de la protéine p53 fonctionnelle, ou de son gène, a été envisagée afin de développer une méthode de sensibilisation des cellules tumorales auxdits agents. Plus particulièrement, il a été montré que la transfection d'une cellule tumorale humaine de colon dont le gène p53 est rendu inactif par mutation avec un plasmide exprimant le gène p53 sauvage permet in vitro de sensibiliser cette cellule au 5Fluorouracile (5-FU) (Yang et al, 1996, Clin. Cancer. Res. (1993, Cell 74,957-967, 1994, Science 266,807-810) demonstrating an increased resistance of tumor cells not expressing the p53 gene with regard to different types of cytotoxic agents and radiation, the use of functional p53 protein, or its gene, has been envisaged in order to develop a method of sensitizing tumor cells to said agents. More particularly, it has been shown that the transfection of a human colon tumor cell whose p53 gene is rendered inactive by mutation with a plasmid expressing the wild-type p53 gene makes it possible in vitro to sensitize this cell to 5Fluorouracil (5-FU) ( Yang et al, 1996, Cancer Clinic, Res.
2,1649-1657). 2.1649-1657).
Nous avons maintenant mis en évidence de nouvelles compositions cytotoxiques dont les différents constituants sont choisis de façon à obtenir un effet synergique de leurs activités respectives et des propriétés améliorées desdits constituants. Plus particulièrement, de telles compositions permettent d'inhiber ou de retarder la prolifération cellulaire en induisant la mort spécifique des cellules tumorales, une meilleure présentation des antigènes et/ou une stimulation des cellules immunes de l'organisme hôte. La présente invention offre une alternative avantageuse et efficace aux techniques de l'art antérieur, notamment pour traiter le cancer de l'homme ou de l'animal. We have now highlighted new cytotoxic compositions whose various constituents are chosen so as to obtain a synergistic effect of their respective activities and of the improved properties of said constituents. More particularly, such compositions make it possible to inhibit or delay cell proliferation by inducing the specific death of tumor cells, better presentation of the antigens and / or stimulation of the immune cells of the host organism. The present invention provides an advantageous and effective alternative to the techniques of the prior art, in particular for treating human or animal cancer.
L'invention concerne en premier lieu une composition destinée à la mise en oeuvre d'un traitement antitumoral ou The invention relates firstly to a composition intended for the implementation of an anti-tumor treatment or
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antiviral, ou toute applications nécessitant la mort cellulaire, chez un mammifère comprenant : (i) une séquence d'acide nucléique codant pour tout ou partie du polypeptide p53, (ii) au moins une séquence d'acide nucléique codant pour tout ou partie d'un polypeptide ayant au moins une activité cytotoxique, lesdites séquences d'acide nucléique étant placées sous le contrôle des éléments nécessaires à leur expression dans une cellule hôte dudit mammifère. antiviral, or any application requiring cell death, in a mammal comprising: (i) a nucleic acid sequence coding for all or part of the p53 polypeptide, (ii) at least one nucleic acid sequence coding for all or part d 'a polypeptide having at least one cytotoxic activity, said nucleic acid sequences being placed under the control of the elements necessary for their expression in a host cell of said mammal.
Dans le cadre de la présente invention, il est possible d'utiliser en (i) l'intégralité de la séquence d'acide nucléique codant pour le polypeptide p53 ou une partie seulement de ce polypeptide, ou un polypeptide dérivé ou muté, dans la mesure où la fonction de p53 est conservée. In the context of the present invention, it is possible to use in (i) the entire nucleic acid sequence coding for the p53 polypeptide or only part of this polypeptide, or a derived or mutated polypeptide, in the extent that the function of p53 is preserved.
De telles séquences sont bien connues de l'homme du métier et il est possible de se référer par exemple à Matlashewski et al., 1984, EMBO J., 3,3257-3262 , Prives et al., 1994, Cell, 78,543-546 ou Chen et al., 1996, Gene et Deve., 10, 2438-2451, dont les contenus sont incorporés dans la présente demande. Such sequences are well known to those skilled in the art and it is possible to refer for example to Matlashewski et al., 1984, EMBO J., 3,3257-3262, Prives et al., 1994, Cell, 78,543- 546 or Chen et al., 1996, Gene and Deve., 10, 2438-2451, the contents of which are incorporated into the present application.
Par polypeptide ayant au moins une activité cytotoxique , on entend désigner toute substance peptidique susceptible d'induire ou d'activer une réponse immune dirigée spécifiquement contre une cellule tumorale (l'activité cytotoxique est alors appelée activité antitumorale) ou une cellule infectée par un virus (l'activité cytotoxique est alors appelée activité antivirale) ou d'inhiber la croissance et/ ou la division d'une telle cellule tumorale ou infectée. Selon un cas préféré, ladite activité cytotoxique se traduit par la mort de ladite cellule. The term “polypeptide having at least one cytotoxic activity” is intended to denote any peptide substance capable of inducing or activating an immune response directed specifically against a tumor cell (the cytotoxic activity is then called anti-tumor activity) or a cell infected with a virus. (cytotoxic activity is then called antiviral activity) or to inhibit the growth and / or division of such a tumor or infected cell. According to a preferred case, said cytotoxic activity results in the death of said cell.
Etant donné les propriétés du polypeptide p53 comme transactivateur transcriptionnel (Farmer et al., 1992, Nature, 358,83-86) ou comme polypeptide capable d'interagir avec d'autres protéines (Harris, 1996, Carcinogenesis, 17, Given the properties of the p53 polypeptide as a transcriptional transactivator (Farmer et al., 1992, Nature, 358,83-86) or as a polypeptide capable of interacting with other proteins (Harris, 1996, Carcinogenesis, 17,
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1187-1198), l'activité p53 peut être mesurée par l'analyse de l'arrêt du cycle cellulaire en phase Gl/S et G2/M, de l'induction de l'apoptose, de la suppression de la transformation cellulaire induite par les oncogènes ou de l'inhibition de l'angiogénèse. 1187-1198), p53 activity can be measured by analyzing the arrest of the cell cycle in the Gl / S and G2 / M phase, the induction of apoptosis, the suppression of the induced cell transformation by oncogenes or inhibition of angiogenesis.
L'activité cytotoxique d'un polypeptide donné, notamment une activité anti-tumorale, peut être évaluée in vitro par la mesure de la survie cellulaire soit par des tests de viabilité à court terme (tel que par exemple le test au bleu tryptan ou MTT), soit par des tests de survie clonogénique (formation de colonies) (Brown et Wouters, 1999, Cancer Research, 59,1391-1399) ou in vivo par la mesure de la croissance des tumeurs (taille et/ou volume) dans un modèle animal (Ovejera et Houchens, 1981, Semin. The cytotoxic activity of a given polypeptide, in particular an anti-tumor activity, can be evaluated in vitro by measuring cell survival either by short-term viability tests (such as for example the tryptan blue test or MTT ), either by clonogenic survival tests (colony formation) (Brown and Wouters, 1999, Cancer Research, 59, 1391-1399) or in vivo by measuring tumor growth (size and / or volume) in a animal model (Ovejera and Houchens, 1981, Semin.
Oncol., 8,386-393). Oncol., 8,386-393).
Selon une première variante, l'invention concerne une composition caractérisée en ce que ledit polypeptide ayant une activité cytotoxique est choisi parmi les cytokines, les protéines codées par un gène appelé gène suicide et les facteurs protéiques antiangiogéniques. According to a first variant, the invention relates to a composition characterized in that said polypeptide having cytotoxic activity is chosen from cytokines, proteins encoded by a gene called suicide gene and antiangiogenic protein factors.
Plus particulièrement, lorsque ledit polypeptide en (ii) est une cytokine, il s'agit préférentiellement d'une cytokine choisie parmi les interférons [alpha], ss et y, les interleukines, et notamment l'IL-2, l'IL-4 l'IL-6, l'IL-10 ou l'IL-12, les facteurs nécrosant des tumeurs (TNF) et les facteurs stimulateurs de colonies (GM-CSF, C-CSF, M-CSF...). More particularly, when said polypeptide in (ii) is a cytokine, it is preferably a cytokine chosen from interferons [alpha], ss and y, interleukins, and in particular IL-2, IL- 4 IL-6, IL-10 or IL-12, tumor necrosis factors (TNF) and colony stimulating factors (GM-CSF, C-CSF, M-CSF ...).
Selon un mode de réalisation préféré, ladite cytokine est sélectionnée parmi l'interleukine-2 (IL-2) et l'interféron gamma (IFN-y). L'interleukine-2 est notamment responsable de la prolifération des lymphocytes T activés, de la multiplication et de l'activation des cellules du système immunitaire (pour la séquence en acide nucléique voir notamment FR 85 09480). L'IFN-y active les cellules phagocytaires et accroît l'expression des antigènes de surfaces de classe I et II du complexe majeur d'histocompatibilité (pour la séquence en acide nucléique According to a preferred embodiment, said cytokine is selected from interleukin-2 (IL-2) and interferon gamma (IFN-γ). Interleukin-2 is in particular responsible for the proliferation of activated T lymphocytes, the multiplication and activation of cells of the immune system (for the nucleic acid sequence see in particular FR 85 09480). IFN-γ activates phagocytic cells and increases the expression of class I and II surface antigens of the major histocompatibility complex (for the nucleic acid sequence
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voir notamment FR 85 09225). see in particular FR 85 09225).
Selon une seconde variante, l'invention concerne également une telle composition caractérisée en ce que ledit polypeptide en (ii) présente au moins une activité enzymatique sélectionnée parmi l'activité thymidine kinase, l'activité purine nucleoside phosphorylase, l'activité guanine ou uracile ou orotate phosphoribosyl transférase et l'activité cytosine désaminase. According to a second variant, the invention also relates to such a composition characterized in that said polypeptide in (ii) has at least one enzymatic activity selected from thymidine kinase activity, purine nucleoside phosphorylase activity, guanine or uracil activity or orotate phosphoribosyl transferase and cytosine deaminase activity.
Plusieurs études ont permis d'identifier des polypeptides qui ne sont pas toxiques en tant que tels mais qui présentent des propriétés enzymatiques catalytiques capables de transformer une substance inactive (prédrogue), par exemple un nucléoside ou un analogue de nucléoside, en substance hautement toxique pour la cellule, par exemple un nucléoside modifié qui peut être incorporé dans les chaînes d'ADN ou d'ARN en élongation, avec pour conséquence, notamment, l'inhibition de la division cellulaire ou des dysfonctionnements cellulaires conduisant à la mort de la cellule renfermant de tels polypeptides. Les gènes codant pour de tels polypeptides sont dits gènes suicides . De nombreux couples gène suicide/ prédrogue sont actuellement disponibles. On peut citer plus particulièrement, les couples : - la thymidine kinase du virus herpès simplex de type 1 (TK HSV-1) et l'acyclovir ou le ganciclovir (GCV) (Caruso et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 7024-7028 ; Culver et al., 1992, Science 256, 1550-1552 ; Ram et al., 1997, Nat. Med. 3,1354-1361) ; - le cytochrome p450 de rat et la cyclophosphophamide (Wei et al., 1994, Human Gene Therapy 5, 969-978) ; - la purine nucleoside phosphorylase d'Escherichia coli (E. Coli) et la 6-methylpurine deoxyribonucleoside (Sorscher et al., 1994, Gene Therapy 1, 233-238) ; - la guanine phosphoribosyl transférase d'E. coli et la 6-thioxanthine (Mzoz et Moolten, 1993, Human Gene Therapy Several studies have made it possible to identify polypeptides which are not toxic as such but which have catalytic enzymatic properties capable of transforming an inactive substance (predrogue), for example a nucleoside or a nucleoside analog, into a substance which is highly toxic for the cell, for example a modified nucleoside which can be incorporated into the DNA or RNA chains in elongation, with the consequence, in particular, of the inhibition of cell division or of cellular dysfunctions leading to the death of the cell containing such polypeptides. The genes encoding such polypeptides are called suicide genes. Many suicide / predrug gene pairs are currently available. Mention may more particularly be made of the pairs: - herpes simplex virus type 1 thymidine kinase (TK HSV-1) and acyclovir or ganciclovir (GCV) (Caruso et al., 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 7024-7028; Culver et al., 1992, Science 256, 1550-1552; Ram et al., 1997, Nat. Med. 3.1354-1361); - rat cytochrome p450 and cyclophosphophamide (Wei et al., 1994, Human Gene Therapy 5, 969-978); - the purine nucleoside phosphorylase from Escherichia coli (E. Coli) and the 6-methylpurine deoxyribonucleoside (Sorscher et al., 1994, Gene Therapy 1, 233-238); - Guanine phosphoribosyl transferase from E. coli and 6-thioxanthine (Mzoz and Moolten, 1993, Human Gene Therapy
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4,589-595) et - la cytosine désaminase (CDase) et la 5fluorocytosine (5FC). 4,589-595) and - cytosine deaminase (CDase) and 5fluorocytosine (5FC).
Plus particulièrement, la CDase est un enzyme qui intervient dans la voie métabolique des pyrimidines par laquelle la cytosine exogène est transformée par le biais d'une désamination hydrolytique en uracile. Des activités CDases ont été mises en évidence chez les procaryotes et les eucaryotes inférieurs (Jund et Lacroute, 1970, J. Bacteriol. More particularly, CDase is an enzyme which intervenes in the metabolic pathway of pyrimidines by which the exogenous cytosine is transformed by means of hydrolytic deamination into uracil. CDase activities have been demonstrated in prokaryotes and lower eukaryotes (Jund and Lacroute, 1970, J. Bacteriol.
102,607-615 ; Beck et al., 1972, J. Bacteriol. 110, 219- 228 ; De Haan et al., 1972, Antonie van Leeuwenhoek 38,257- 263 ; Hoeprich et al., 1974, J. Inf. Dis. 130, 112-118 ; Esders et Lynn, 1985, J. Biol. Chem. 260,3915-3922) mais elles sont absentes chez les mammifères (Koechlin et al., 1966, Biochem Pharmacol. 15, 435-446 ; Polak et al., 1976, Chemotherapy 22, 137-153). Les gènes FCY1 de Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae) et codA d'E. coli codant respectivement pour la CDase de ces deux organismes sont connus et leurs séquences publiées (EP 402 108 ; et al., 1997, Curr. Genet. 31,1-6 ; W093/01281). 102.607-615; Beck et al., 1972, J. Bacteriol. 110, 219-228; De Haan et al., 1972, Antonie van Leeuwenhoek 38, 257-263; Hoeprich et al., 1974, J. Inf. Say. 130, 112-118; Esders and Lynn, 1985, J. Biol. Chem. 260.3915-3922) but they are absent in mammals (Koechlin et al., 1966, Biochem Pharmacol. 15, 435-446; Polak et al., 1976, Chemotherapy 22, 137-153). The FCY1 genes of Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae) and codA of E. coli coding respectively for the CDase of these two organisms are known and their sequences published (EP 402 108; et al., 1997, Curr. Genet. 31.1-6; WO93 / 01281).
La CDase désamine également un analogue de la cytosine, la 5-fluorocytosine (5-FC) en 5-fluorouracile (5FU) qui est un composé hautement cytotoxique notamment lorsqu' il est converti en 5-fluoro-UMP (5-FUMP). Les cellules dépourvues d'activité CDase, en raison soit d'une mutation inactivante du gène codant pour l'enzyme, soit de leur déficience naturelle pour cette enzyme (par exemple les cellules mammifères) sont résistantes au 5-FC (Jund et Lacroute, 1970, J. Bacteriol. 102, 607-615 ; Kilstrup et al., 1989, J. Bacteriol. 1989 171,2124-2127). Par contre, il a été montré qu'il est possible de transmettre la sensibilité au 5-FC à des cellules mammifères dans lesquelles la séquence codant pour une activité CDase a été transférée (Huber et al., 1993, Cancer Res. 53,4619-4626 ; Mullen et al., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89,33-37 ; WO 93/01281). De plus, dans ce cas, les cellules CDase also deaminates a cytosine analog, 5-fluorocytosine (5-FC) into 5-fluorouracil (5FU) which is a highly cytotoxic compound especially when it is converted into 5-fluoro-UMP (5-FUMP). Cells lacking CDase activity, either because of an inactivating mutation of the gene coding for the enzyme, or because of their natural deficiency for this enzyme (for example mammalian cells) are resistant to 5-FC (Jund and Lacroute, 1970, J. Bacteriol. 102, 607-615; Kilstrup et al., 1989, J. Bacteriol. 1989 171.2124-2127). On the other hand, it has been shown that it is possible to transmit sensitivity to 5-FC to mammalian cells into which the sequence coding for CDase activity has been transferred (Huber et al., 1993, Cancer Res. 53,4619 -4626; Mullen et al., 1992, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89.33-37; WO 93/01281). In addition, in this case, the cells
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avoisinantes non transformées deviennent également sensibles au 5-FC (Huber et al., 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 8302-8306). Ce phénomène, appelé effet de voisinage (bystander en anglais), est dû à l'excrétion par les cellules exprimant l'activité CDase, de 5-FU qui intoxique les cellules voisines par simple diffusion à travers la membrane cellulaire. Cette propriété de diffusion passive du 5-FU constitue un avantage par rapport au système de référence tk/GCV pour lequel l'effet de voisinage nécessite un contact avec les cellules qui expriment tk (Mesnil et al., 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93,1831-1835). Cet effet constitue par conséquent un atout supplémentaire de l'utilisation de la CDase dans le cadre de la thérapie génique, notamment anticancéreuse. neighboring untransformed people also become sensitive to 5-FC (Huber et al., 1994, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 8302-8306). This phenomenon, called bystander effect, is due to the excretion by cells expressing CDase activity, of 5-FU which intoxicates neighboring cells by simple diffusion through the cell membrane. This passive diffusion property of 5-FU constitutes an advantage compared to the tk / GCV reference system for which the neighborhood effect requires contact with the cells which express tk (Mesnil et al., 1996, Proc. Natl. Acad Sci. USA 93, 1831-1835). This effect therefore constitutes an additional advantage of the use of CDase in the context of gene therapy, in particular anti-cancer therapy.
Cependant, la sensibilité au 5-FC varie beaucoup selon les lignées cellulaires. Une faible sensibilité est observée par exemple dans des lignées tumorales humaines PANC-1 (carcinome de pancréas) et SK-BR-3 (adénocarcinome du sein) transduites par un rétrovirus exprimant le gène codA d'E. Coli (Harris et al., 1994, Gene Therapy 1, 170-175). Ce phénomène indésirable pourrait s'expliquer par l'absence ou la faible conversion endogène du 5-FU formé par l'action enzymatique de la CDase en 5-FUMP cytotoxique. Cette étape, normalement assurée dans les cellules mammifères par l'orotate phosphorybosyl transférase (Peters et al., 1991, Cancer 68,1903-1909), peut être absente dans certaines tumeurs et rendre ainsi la thérapie génique, basée sur la CDase, inopérante. However, sensitivity to 5-FC varies widely across cell lines. Low sensitivity is observed, for example, in human tumor lines PANC-1 (pancreatic carcinoma) and SK-BR-3 (breast adenocarcinoma) transduced by a retrovirus expressing the E codA gene. Coli (Harris et al., 1994, Gene Therapy 1, 170-175). This undesirable phenomenon could be explained by the absence or the weak endogenous conversion of 5-FU formed by the enzymatic action of CDase into cytotoxic 5-FUMP. This step, normally performed in mammalian cells by the orotate phosphorybosyl transferase (Peters et al., 1991, Cancer 68,1903-1909), may be absent in certain tumors and thus render gene therapy, based on CDase, inoperative .
Chez les procaryotes et eucaryotes inférieurs, l'uracile est transformée en UMP par l'action de l'uracile phosphoribosyl transférase (présentant par conséquent une activité UPRTase). Cette enzyme convertit également le 5-FU en 5-FUMP. Ainsi des mutants furl de la levure S. cerevisiae sont résistants à de fortes concentrations de 5-FU (10 mM) et de 5-FC (10 mM) car en absence d'activité UPRTase, le 5FU, provenant de la désamination du 5-FC par la CDase, n'est In prokaryotes and lower eukaryotes, uracil is transformed into UMP by the action of uracil phosphoribosyl transferase (consequently exhibiting UPRTase activity). This enzyme also converts 5-FU to 5-FUMP. Thus furl mutants of the yeast S. cerevisiae are resistant to high concentrations of 5-FU (10 mM) and 5-FC (10 mM) because in the absence of UPRTase activity, 5FU, originating from the deamination of 5 -FC by CDase, is
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pas transformé en 5-FUMP cytotoxique (Jund et Lacroute, 1970, J. Bacteriol. 102,607-615). Les gènes upp et FUR1 codant pour l'UPRTase respectivement d'E. coli et de S. cerevisiae ont été clonés et séquences (Andersen et al., 1992, Eur. J. Biochem. 204,51-56 ; Kern et al., 1990, Gene 88, 149-157). not transformed into cytotoxic 5-FUMP (Jund and Lacroute, 1970, J. Bacteriol. 102,607-615). The upp and FUR1 genes encoding UPRTase respectively from E. coli and S. cerevisiae have been cloned and sequenced (Andersen et al., 1992, Eur. J. Biochem. 204, 51-56; Kern et al., 1990, Gene 88, 149-157).
Au sens de la présente invention, un polypeptide ayant une activité UPRTase désigne un polypeptide capable de convertir l'uracile ou un de ses dérivés en un analogue monophosphaté et, en particulier la 5-FU en 5-FUMP. Par mutation , il faut entendre l'addition, la délétion et/ou la substitution d'un ou plusieurs résidus à un endroit quelconque dudit polypeptide. For the purposes of the present invention, a polypeptide having UPRTase activity denotes a polypeptide capable of converting uracil or one of its derivatives into a monophosphated analogue and, in particular 5-FU into 5-FUMP. By mutation is meant the addition, deletion and / or substitution of one or more residues at any location of said polypeptide.
L'UPRTase native dont il est question dans la présente invention peut être d'une origine quelconque, notamment procaryotique, fongique ou de levure. A titre illustratif, les séquences d'acide nucléique codant pour les UPRTases d'E. coli (Anderson et al., 1992, Eur. J. Biochem 204,51-56), de Lactococcus lactis (Martinussen et Hammer, 1994, J. Bacteriol. 176, 6457-6463), de Mycobacterium bovis (Kim et al., 1997, Biochem Mol. Biol. Int 41,1117-1124) et de Bacillus subtilis (Martinussen et al., 1995, J. The native UPRTase in question in the present invention can be of any origin, in particular prokaryotic, fungal or yeast. By way of illustration, the nucleic acid sequences coding for the UPRTases of E. coli (Anderson et al., 1992, Eur. J. Biochem 204,51-56), of Lactococcus lactis (Martinussen and Hammer, 1994, J. Bacteriol. 176, 6457-6463), of Mycobacterium bovis (Kim et al. , 1997, Biochem Mol. Biol. Int 41, 1117-1124) and Bacillus subtilis (Martinussen et al., 1995, J.
Bacteriol. 177, 271-274) peuvent être utilisées dans le cadre de l'invention. Mais on préfère tout particulièrement mettre en oeuvre une UPRTase de levure et notamment celle codée par le gène FUR1 de S. cerevisiae dont la séquence divulguée dans Kern et al. (1990, Gene 88,149-157) est introduite ici par référence. A titre indicatif, les séquences des gènes et celles des UPRTases correspondantes peuvent être trouvées dans la littérature et les banques de données spécialisées (SWISSPROT, EMBL, Genbank, Medline...). Bacteriol. 177, 271-274) can be used in the context of the invention. However, it is particularly preferred to use a yeast UPRTase and in particular that encoded by the FUR1 gene from S. cerevisiae, the sequence of which is disclosed in Kern et al. (1990, Gene 88, 149-157) is introduced here by reference. As an indication, the gene sequences and those of the corresponding UPRTases can be found in the literature and specialized databases (SWISSPROT, EMBL, Genbank, Medline ...).
Par ailleurs, la demande PCT/FR99/00904 décrit un gène FUR1 dépourvu de 105 nucléotides en 5' de la partie codante permettant la synthèse d'une UPRTase délétée des 35 premiers résidus en position N-terminale et débutant à la méthionine en position 36 dans la protéine native. Le Furthermore, application PCT / FR99 / 00904 describes a FUR1 gene devoid of 105 nucleotides 5 ′ of the coding part allowing the synthesis of a UPRTase deleted from the first 35 residues in the N-terminal position and starting with methionine in position 36 in native protein. The
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produit d'expression du gène mutant, désigné FUR1#105, est capable de complémenter un mutant furl de S. cerevisiae. En outre, le mutant tronqué présente une activité UPRTase supérieure à celle de l'enzyme native. Ainsi, selon un mode de réalisation particulièrement avantageux, le polypeptide codé selon l'invention est un mutant de délétion d'une UPRTase native. La délétion est de préférence localisée dans la région N-terminale de l'UPRTase d'origine. Elle peut être totale (concerner l'ensemble des résidus de ladite région N-terminale) ou partielle (concerner un ou plusieurs résidus continus ou non dans la structure primaire). D'une manière générale, un polypeptide est constitué de parties Nterminale, centrale et C-terminale, chacune représentant environ le tiers de la molécule. Par exemple, l'UPRTase de S. cerevisiae ayant 251 acides aminés, sa partie N-terminale est constituée des 83 premiers résidus débutant à la méthionine dite initiatrice située en première position de la forme native. Quant à l'UPRTase d'E. coli, sa partie Nterminale couvre les positions 1 à 69. mutant gene expression product, designated FUR1 # 105, is capable of complementing a furl mutant of S. cerevisiae. In addition, the truncated mutant exhibits a higher UPRTase activity than that of the native enzyme. Thus, according to a particularly advantageous embodiment, the polypeptide encoded according to the invention is a deletion mutant of a native UPRTase. The deletion is preferably located in the N-terminal region of the original UPRTase. It can be total (concern all of the residues of said N-terminal region) or partial (concern one or more residues, continuous or not, in the primary structure). Generally, a polypeptide consists of Nterminal, central and C-terminal parts, each representing approximately one third of the molecule. For example, the UPRTase of S. cerevisiae having 251 amino acids, its N-terminal part consists of the first 83 residues starting with the so-called initiator methionine located in the first position of the native form. As for UPRTase by E. coli, its Nterminal part covers positions 1 to 69.
Ainsi, d'une manière tout à fait préférée, le polypeptide selon PCT/FR99/00904 dérive d'une UPRTase native au moins par délétion de tout ou partie de la région Nterminale en amont du second codon ATG de ladite UPRTase native. La délétion totale de la région précitée est préférée. Par exemple, l'UPRTase codée par le gène FUR1 comprend un premier codon ATG (codon ATG initiateur) en position +1 suivi d'un second en position +36. Ainsi, la délétion des résidus +1 à 35 peut être envisagée dans le cadre de la présente invention, donnant un polypeptide débutant à la méthionine trouvée normalement en position +36 de la forme native. Thus, in a completely preferred manner, the polypeptide according to PCT / FR99 / 00904 derives from a native UPRTase at least by deletion of all or part of the Nterminal region upstream of the second ATG codon of said native UPRTase. Total deletion of the above region is preferred. For example, the UPRTase coded by the FUR1 gene comprises a first ATG codon (initiator ATG codon) in position +1 followed by a second in position +36. Thus, the deletion of residues +1 to 35 can be envisaged in the context of the present invention, giving a polypeptide starting with methionine normally found in position +36 of the native form.
Un polypeptide préféré selon PCT/FR99/00904 comprend une séquence en acides aminés sensiblement telle que représentée à l'identificateur de séquence IDS NO: 1, débutant au résidu Met en position 1 et se terminant au résidu Val en position 216. Le terme sensiblement fait A preferred polypeptide according to PCT / FR99 / 00904 comprises an amino acid sequence substantially as shown in the sequence identifier IDS NO: 1, starting at the Met residue in position 1 and ending at the Val residue in position 216. The term substantially fact
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référence à un degré d'identité avec ladite séquence IDS NO: 1 supérieure à 70%, avantageusement supérieur à 80%, de préférence, supérieure à 90% et, de manière tout à fait préférée, supérieur à 95%. Encore plus préférentiellement, il comprend la séquence en acides aminés représentée à l'identificateur de séquence IDS NO: 1. Comme mentionné cidessus, il peut comporter des mutations supplémentaires. On peut citer notamment la substitution du résidu sérine en position 2 (position 37 dans l'UPRTase native) par un résidu alanine. reference to a degree of identity with said IDS NO: 1 sequence greater than 70%, advantageously greater than 80%, preferably greater than 90% and, most preferably, greater than 95%. Even more preferably, it comprises the amino acid sequence represented with the sequence identifier IDS NO: 1. As mentioned above, it may contain additional mutations. Mention may in particular be made of the substitution of the serine residue in position 2 (position 37 in the native UPRTase) with an alanine residue.
En outre, les demandes de brevet W096/16183 et PCT/FR99/00904 décrivent l'utilisation d'une protéine de fusion codant pour une enzyme à deux domaines ayant les activités CDase et UPRTase et démontrent que le transfert d'un gène hybride codA::upp ou FCY1::FUR1 ou FCY1::FUR1#105 porté par un plasmide d'expression augmente la sensibilité au 5-FC de cellules B16 transfectées. Les séquences protéiques et nucléiques décrites dans ces deux demandes sont incorporées dans la description de la présente demande. In addition, patent applications WO96 / 16183 and PCT / FR99 / 00904 describe the use of a fusion protein coding for a two-domain enzyme having CDase and UPRTase activities and demonstrate that the transfer of a hybrid gene codA :: upp or FCY1 :: FUR1 or FCY1 :: FUR1 # 105 carried by an expression plasmid increases the sensitivity to 5-FC of transfected B16 cells. The protein and nucleic acid sequences described in these two applications are incorporated into the description of the present application.
Selon un autre mode de réalisation, le polypeptide selon PCT/FR99/00904 est un polypeptide de fusion dans lequel il est fusionné en phase avec au moins un second polypeptide. Bien que la fusion puisse avoir lieu à un endroit quelconque du premier polypeptide, les extrémités N ou C-terminales sont préférées et notamment l'extrémité Nterminale. Avantageusement, la fusion en phase met en oeuvre un second polypeptide présentant une activité cytosine désaminase (CDase) et dérivant d'une cytosine désaminase native, de sorte que le polypeptide de fusion selon l'invention présente les activités CDase et UPRTase. Une fusion FCY1::FUR1 est préférée. Un tel polypeptide bifonctionnel permet d'améliorer la sensibilité des cellules cibles à la 5-FC et à la 5-FU. De préférence, le second polypeptide selon l'invention est capable de métaboliser la 5-FC en 5-FU. According to another embodiment, the polypeptide according to PCT / FR99 / 00904 is a fusion polypeptide in which it is fused in phase with at least one second polypeptide. Although the fusion can take place at any location of the first polypeptide, the N or C-terminal ends are preferred and in particular the N-terminal end. Advantageously, the phase fusion implements a second polypeptide exhibiting cytosine deaminase activity (CDase) and derived from a native cytosine deaminase, so that the fusion polypeptide according to the invention exhibits CDase and UPRTase activities. An FCY1 :: FUR1 merge is preferred. Such a bifunctional polypeptide makes it possible to improve the sensitivity of the target cells to 5-FC and to 5-FU. Preferably, the second polypeptide according to the invention is capable of metabolizing 5-FC to 5-FU.
Selon PCT/FR99/00904, on a recours à une CDase According to PCT / FR99 / 00904, a CDase is used
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d'origine procaryote ou eucaryote inférieur. Encore plus préférentiellement, il s'agit d'une CDase de levure et en particulier celle codée par le gène FCY1 de Saccharomyces cerevisiae. Le clonage et la séquence des gènes codant pour les CDases de différentes sources sont disponibles dans la littérature et les banques de données spécialisées. On indique que la séquence du gène FCY1 est divulguée dans Erbs et al. (1997, Curr. Genet. 31, 1-6). Il est bien entendu possible d'utiliser un mutant de CDase ayant une capacité de conversion comparable ou supérieure à celle de l'enzyme native. L'homme de l'art est capable de cloner les séquences CDase à partir des données publiées, de procéder à d'éventuelles mutations, de tester l'activité enzymatique des formes mutantes dans un système acellulaire ou cellulaire selon la technologie de l'art ou en suivant le protocole indiqué ci-après et de fusionner en phase les polypeptides d'activité CDase et UPRTase. of prokaryotic or lower eukaryotic origin. Even more preferably, it is a yeast CDase and in particular that encoded by the FCY1 gene from Saccharomyces cerevisiae. The cloning and the sequence of genes coding for CDases from different sources are available in the literature and in specialized databases. It is indicated that the sequence of the FCY1 gene is disclosed in Erbs et al. (1997, Curr. Genet. 31, 1-6). It is of course possible to use a CDase mutant having a conversion capacity comparable to or greater than that of the native enzyme. A person skilled in the art is able to clone CDase sequences from published data, to carry out possible mutations, to test the enzymatic activity of the mutant forms in an acellular or cellular system according to the technology of the art. or by following the protocol indicated below and in phase fusing the polypeptides of CDase and UPRTase activity.
Un exemple préféré est un polypeptide comprenant une séquence en acides aminés sensiblement telle que représentée à l'identificateur de séquence IDS NO: 2, débutant au résidu Met en position 1 et se terminant au résidu Val en position 373. Le terme sensiblement a la définition donnée précédemment. Un polypeptide comprenant la séquence en acides aminés telle que représentée à l'identificateur de séquence IDS NO: 2 convient tout particulièrement à la mise en oeuvre de l'invention. A preferred example is a polypeptide comprising an amino acid sequence substantially as shown in the sequence identifier IDS NO: 2, starting at the Met residue in position 1 and ending at the Val residue in position 373. The term substantially has the definition previously given. A polypeptide comprising the amino acid sequence as shown in the sequence identifier IDS NO: 2 is very particularly suitable for the implementation of the invention.
Une fusion des activités CDase et UPRTase permet d'améliorer la sensibilité des cellules cibles à la 5-FC et à la 5-FU. A fusion of CDase and UPRTase activities improves the sensitivity of target cells to 5-FC and 5-FU.
L'homme de l'art est capable de cloner les séquences de CDase ou UPRTase à partir des données publiées, de procéder à d'éventuelles mutations, de tester les activités enzymatiques des formes mutantes dans un système acellulaire ou cellulaire selon la technologie de l'art ou en suivant le protocole indiqué dans la demande PCT/FR99/00904 et de fusionner, notamment en phase, les polypeptides d'activité A person skilled in the art is able to clone the CDase or UPRTase sequences from the published data, to carry out possible mutations, to test the enzymatic activities of the mutant forms in an acellular or cellular system according to l technology. art or by following the protocol indicated in PCT / FR99 / 00904 and to merge, in particular in phase, the activity polypeptides
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CDase et UPRTase, et par conséquent tout ou partie des gènes correspondants. CDase and UPRTase, and therefore all or part of the corresponding genes.
D'une manière générale, un polypeptide selon l'invention peut être produit par les méthodes conventionnelles de synthèse chimique ou bien par les techniques de l'ADN recombinant (voir par exemple Maniatis et al., 1989, Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY). Ainsi selon le procédé de préparation décrit dans PCT/FR99/00904 on introduit une séquence nucléotidique codant pour ledit polypeptide dans une cellule pour générer une cellule transformée, on cultive ladite cellule transformée dans des conditions appropriée pour permettre la production dudit polypeptide et on récolte ledit polypeptide à partir de la culture cellulaire. La cellule productrice peut être d'une origine quelconque et sans limitation, une bactérie, une levure ou bien une cellule de mammifère, dans la mesure où la séquence nucléotidique considérée est soit intégrée dans son génome soit intégrée dans un vecteur d'expression approprié capable de se répliquer. Bien entendu, la séquence nucléotidique est placée sous le contrôle de signaux de transcription et de traduction permettant son expression dans la cellule productrice. Vecteurs d'expression et signaux de contrôle sont connus de l'homme du métier. Quant au polypeptide, il peut être récupéré du milieu ou des cellules (après lyse de celles-ci) et soumises à des étapes de purifications classiques (par chromatographie, électrophorèse, filtration, immunopurification etc...). In general, a polypeptide according to the invention can be produced by conventional methods of chemical synthesis or else by recombinant DNA techniques (see for example Maniatis et al., 1989, Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY). Thus, according to the preparation process described in PCT / FR99 / 00904, a nucleotide sequence coding for said polypeptide is introduced into a cell to generate a transformed cell, said transformed cell is cultured under conditions suitable for allowing the production of said polypeptide and said harvest is harvested. polypeptide from cell culture. The producer cell can be of any origin and without limitation, a bacterium, a yeast or a mammalian cell, insofar as the nucleotide sequence considered is either integrated into its genome or integrated into an appropriate expression vector capable to replicate. Of course, the nucleotide sequence is placed under the control of transcription and translation signals allowing its expression in the producer cell. Expression vectors and control signals are known to those skilled in the art. As for the polypeptide, it can be recovered from the medium or from the cells (after lysis thereof) and subjected to conventional purification steps (by chromatography, electrophoresis, filtration, immunopurification, etc.).
PCT/FR99/0904 décrit également une séquence nucléotidique codant pour undit polypeptide qui peut être une séquence ADNc ou génomique ou de type mixte. Elle peut éventuellement contenir un ou plusieurs introns, ceux-ci étant d'origine native, hétérologue (par exemple l'intron du gène p-globine de lapin...) ou synthétiques afin d'augmenter l'expression dans les cellules hôtes. Comme déjà indiqué, ladite séquence peut coder pour un polypeptide dérivant de PCT / FR99 / 0904 also describes a nucleotide sequence coding for a polypeptide which may be a cDNA or genomic sequence or of a mixed type. It may optionally contain one or more introns, these being of native, heterologous origin (for example the intron of the rabbit p-globin gene, etc.) or synthetic in order to increase expression in the host cells. As already indicated, said sequence can code for a polypeptide derived from
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l'enzyme native ou un mutant présentant une activité comparable ou améliorée. Les séquences employées peuvent être obtenues par les techniques classiques de biologie moléculaire, par exemple par criblage de banque à l'aide de sondes spécifiques, par immunocriblage de banque d'expression, par PCR au moyen d'amorces adéquates ou par synthèse chimique. Les mutants peuvent être générés à partir des séquences natives par substitution, délétion et/ou addition d'un ou plusieurs nucléotides en mettant en oeuvre les techniques de mutagénèse dirigée, de PCR, de digestion par les enzymes de restriction et ligation ou encore par synthèse chimique. La fonctionnalité des mutants et des constructions peut être vérifiée par le dosage de l'activité enzymatique ou par la mesure de la sensibilité de cellules cibles aux 5-FC et/ou 5-FU. the native enzyme or a mutant exhibiting comparable or improved activity. The sequences used can be obtained by conventional molecular biology techniques, for example by bank screening using specific probes, by expression bank immuno-screening, by PCR using suitable primers or by chemical synthesis. The mutants can be generated from the native sequences by substitution, deletion and / or addition of one or more nucleotides by using the techniques of site-directed mutagenesis, PCR, digestion by restriction enzymes and ligation or by synthesis chemical. The functionality of the mutants and of the constructs can be verified by assaying the enzymatic activity or by measuring the sensitivity of target cells to 5-FC and / or 5-FU.
Par conséquent, selon un cas précis, la composition de l'invention est caractérisée en ce que la séquence d'acide nucléique (ii) est sélectionnée parmi les séquences nucléiques des gènes CodA, upp, FUR1, FCY1 et FUR1A105, ou par une combinaison de tout ou partie desdites séquences. Consequently, according to a specific case, the composition of the invention is characterized in that the nucleic acid sequence (ii) is selected from the nucleic sequences of the genes CodA, upp, FUR1, FCY1 and FUR1A105, or by a combination of all or part of said sequences.
L'invention concerne plus particulièrement une dite composition caractérisée en ce que ledit polypeptide en (ii) présente au moins une activité CDase et une activité UPRTase. The invention relates more particularly to a said composition characterized in that said polypeptide in (ii) has at least one CDase activity and one UPRTase activity.
Par combinaison de séquences d'acide nucléique on entend désigner aussi bien des séquences distinctes qui codent pour au moins deux polypeptides distincts que des séquences fusionnées qui codent pour des polypeptides de fusion, étant entendu que la production de tels polypeptides peut être réalisée sous le contrôle des mêmes éléments de régulation (cassette polycistronique) ou d'éléments indépendants, identiques ou différents, homologues ou hétérologues vis à vis du vecteur les renfermant, constitutifs ou inductibles. The term “combination of nucleic acid sequences” is intended to denote both distinct sequences which code for at least two distinct polypeptides as well as fused sequences which code for fusion polypeptides, it being understood that the production of such polypeptides can be carried out under the control of the same regulatory elements (polycistronic cassette) or of independent, identical or different elements, homologous or heterologous with respect to the vector containing them, constitutive or inducible.
Selon un mode particulier de réalisation, la composition de l'invention comprend au moins une séquence According to a particular embodiment, the composition of the invention comprises at least one sequence
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d'acide nucléique (ii) codant pour un polypeptide de fusion dans lequel un premier polypeptide présentant une activité UPRTase ou CDase est fusionné en phase avec au moins un second polypeptide, ledit second polypeptide présentant une activité CDase ou UPRTase, respectivement. Plus particulièrement, un tel polypeptide est caractérisé en ce que la fusion avec le second polypeptide est réalisée à l'extrémité N-terminale dudit premier polypeptide. nucleic acid (ii) encoding a fusion polypeptide in which a first polypeptide exhibiting UPRTase or CDase activity is fused in phase with at least one second polypeptide, said second polypeptide exhibiting CDase or UPRTase activity, respectively. More particularly, such a polypeptide is characterized in that the fusion with the second polypeptide is carried out at the N-terminal end of said first polypeptide.
Selon un cas préféré, ladite composition est caractérisée en ce que la séquence d'acide nucléique codant pour ledit polypeptide de fusion est une séquence hybride comprenant : - une première séquence d'acide nucléique codant pour un premier polypeptide présentant une activité UPRTase ou CDase, - une seconde séquence d'acide nucléique codant pour un second polypeptide présentant une activité Cdase ou UPRTase, respectivement. According to a preferred case, said composition is characterized in that the nucleic acid sequence coding for said fusion polypeptide is a hybrid sequence comprising: a first nucleic acid sequence coding for a first polypeptide exhibiting UPRTase or CDase activity, a second nucleic acid sequence coding for a second polypeptide exhibiting Cdase or UPRTase activity, respectively.
Une telle séquence d'acide nucléique hybride codant pour ledit polypeptide de fusion peut en outre renfermer une séquence de type IRES. Such a hybrid nucleic acid sequence coding for said fusion polypeptide may also contain an IRES type sequence.
L'invention concerne notamment une telle composition pour laquelle la première séquence d'acide nucléique est sélectionnée parmi upp, FUR1 et FUR1A105, et en ce que la seconde séquence d'acide nucléique est sélectionnée parmi CodA et FCY1, et vice-versa. De manière tout à fait préférée, une telle séquence d'acide nucléique hybride est choisie parmi les séquences hybrides décrites dans les demandes de brevet W096/16183 et PCT/FR99/00904. The invention relates in particular to such a composition for which the first nucleic acid sequence is selected from upp, FUR1 and FUR1A105, and in that the second nucleic acid sequence is selected from CodA and FCY1, and vice versa. Most preferably, such a hybrid nucleic acid sequence is chosen from the hybrid sequences described in patent applications WO96 / 16183 and PCT / FR99 / 00904.
Selon une troisième variante, la composition selon la présente invention est caractérisée en ce que ledit polypeptide ayant une activité cytotoxique (ii) est un facteur protéique anti-angiogénique. L'angiogénèse est le processus responsable de la formation de nouveaux capillaires à partir du réseau vasculaire déjà existant. Ce processus complexe est finement régulé dans les tissus sains According to a third variant, the composition according to the present invention is characterized in that said polypeptide having cytotoxic activity (ii) is an anti-angiogenic protein factor. Angiogenesis is the process responsible for the formation of new capillaries from the already existing vascular network. This complex process is finely regulated in healthy tissue
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par la balance des effets de nombreux facteurs angiogéniques et anti-angiogéniques. Cependant, dans certaines pathologies, et notamment lors de la formation d'une tumeur, ce processus est dérégulé : les facteurs angiogéniques prennent le pas sur les facteurs anti-angiogéniques ce qui permet une vascularisation importante des tumeurs et par voie de conséquence leur développement rapide et/ ou l'apparition de métastases. C'est pourquoi, dans le cadre de la présente invention, un facteur anti-angiogénique est considéré comme étant un agent cytotoxique, notamment antitumoral. Parmi les différents facteurs antiangiogéniques connus à l'heure actuelle on peut notamment citer l'angiostatine, l'endostatine, le facteur plaquettaire PF4, la thrombospondine-1, le PRP (pour Proliferin Related Protein), le VEGI (pour Vascular Endothelial Growth Inhibitor) et l'urokinase. by the balance of effects of many angiogenic and anti-angiogenic factors. However, in certain pathologies, and in particular during the formation of a tumor, this process is deregulated: the angiogenic factors take precedence over the anti-angiogenic factors which allows an important vascularization of the tumors and consequently their rapid development and / or the appearance of metastases. This is why, in the context of the present invention, an anti-angiogenic factor is considered to be a cytotoxic agent, in particular an anti-tumor agent. Among the various antiangiogenic factors known at the present time, there may be mentioned in particular angiostatin, endostatin, platelet factor PF4, thrombospondin-1, PRP (for Proliferin Related Protein), VEGI (for Vascular Endothelial Growth Inhibitor ) and urokinase.
Les séquences d'acide nucléique (i) ou (ii) peuvent être aisément obtenues par clonage, par PCR ou par synthèse chimique selon les techniques conventionnelles en usage. Il peut s'agir de gènes natifs ou dérivés de ces derniers par mutation, délétion, substitution et/ou addition d'un ou plusieur nucléotides. Par ailleurs, leur séquences sont largement décrites dans la littérature consultable par l'homme de l'art. The nucleic acid sequences (i) or (ii) can be easily obtained by cloning, by PCR or by chemical synthesis according to the conventional techniques in use. They may be native genes or derivatives thereof by mutation, deletion, substitution and / or addition of one or more nucleotides. Furthermore, their sequences are widely described in the literature available to those skilled in the art.
La présente invention a également trait à une composition telle que présentée ci-dessus caractérisée en ce que lesdites séquences d'acide nucléique (i) et (ii) sont insérées dans un vecteur recombinant d'origine plasmidique ou virale, ainsi qu'à un tel vecteur recombinant portant de telles séquences nucléotidiques placées sous le contrôle des éléments nécessaires à leur expression dans une cellule hôte. The present invention also relates to a composition as presented above, characterized in that said nucleic acid sequences (i) and (ii) are inserted into a recombinant vector of plasmid or viral origin, as well as to a such a recombinant vector carrying such nucleotide sequences placed under the control of the elements necessary for their expression in a host cell.
Plus particulièrement, les compositions de l'invention peuvent comprendre lesdites séquences d'acide nucléique (i) et (ii) insérées dans un même vecteur recombinant ou dans des vecteurs recombinants distincts. More particularly, the compositions of the invention can comprise said nucleic acid sequences (i) and (ii) inserted in the same recombinant vector or in separate recombinant vectors.
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Par vecteur recombinant selon l'invention, on entend désigner un vecteur d'origine plasmidique ou virale, et éventuellement un tel vecteur associé à une ou plusieurs substances améliorant l'efficacité transfectionnelle et/ ou la stabilité dudit vecteur et/ou la protection dudit vecteur in vivo à l'égard du système immunitaire de l'organisme hôte. Ces substances sont largement documentées dans la littérature accessible à l'homme de l'art (voir par exemple Felgner et al., 1987, Proc. West. Pharmacol. Soc. 32,115- 121 ; Hodgson et Solaiman , 1996, Nature Biotechnology 14, 339-342 ; Remy et al., 1994, Bioconjugate Chemistry 5, 647- 654). A titre illustratif mais non limitatif, il peut s'agir de polymères, de lipides notamment cationiques, de liposomes, de protéines nucléaires ou virales ou encore de lipides neutres. Ces substances peuvent être utilisées seules ou en combinaison. Des exemples de tels composés sont notamment disponibles dans les demandes de brevet WO 98/08489, WO 98/17693, WO 98/34910, WO 98/37916, WO 98/53853, EP 890362 ou WO 99/05183. Une combinaison envisageable est un vecteur recombinant plasmidique associé à des lipides cationiques (DOGS, DC-CHOL, spermine-chol, spermidine-chol etc...) et des lipides neutres (DOPE). The term “recombinant vector according to the invention” is intended to denote a vector of plasmid or viral origin, and optionally such a vector associated with one or more substances improving the transfection efficiency and / or the stability of said vector and / or the protection of said vector. in vivo against the host organism's immune system. These substances are widely documented in the literature accessible to those skilled in the art (see for example Felgner et al., 1987, Proc. West. Pharmacol. Soc. 32, 115-121; Hodgson and Solaiman, 1996, Nature Biotechnology 14, 339-342; Remy et al., 1994, Bioconjugate Chemistry 5, 647-654). By way of illustration but not limitation, they may be polymers, lipids in particular cationic, liposomes, nuclear or viral proteins or even neutral lipids. These substances can be used alone or in combination. Examples of such compounds are in particular available in patent applications WO 98/08489, WO 98/17693, WO 98/34910, WO 98/37916, WO 98/53853, EP 890362 or WO 99/05183. A possible combination is a recombinant plasmid vector associated with cationic lipids (DOGS, DC-CHOL, spermine-chol, spermidine-chol etc ...) and neutral lipids (DOPE).
Le choix des plasmides utilisables dans le cadre de la présente invention est vaste. Il peut s'agir de vecteurs de clonage et/ou d'expression. D'une manière générale, ils sont connus de l'homme de l'art et nombre d'entre eux sont disponibles commercialement mais il est également possible de les construire ou les modifier par les techniques de manipulation génétique. On peut citer à titre d'exemples les plasmides dérivés de pBR322 (Gibco BRL), pUC (Gibco BRL), pBluescript (Stratagène), pREP4, pCEP4 (Invitrogene) ou encore p Poly (Lathe et al., 1987, Gene 57,193-201). De préférence, un plasmide mis en oeuvre dans le cadre de la présente invention contient une origine de réplication assurant l'initiation de la réplication dans une cellule productrice et/ou une cellule hôte (par exemple, on The choice of plasmids which can be used in the context of the present invention is vast. They may be cloning and / or expression vectors. In general, they are known to those skilled in the art and many of them are commercially available, but it is also possible to construct or modify them by genetic manipulation techniques. Mention may be made, as examples, of the plasmids derived from pBR322 (Gibco BRL), pUC (Gibco BRL), pBluescript (Stratagene), pREP4, pCEP4 (Invitrogene) or also p Poly (Lathe et al., 1987, Gene 57,193- 201). Preferably, a plasmid used in the context of the present invention contains an origin of replication ensuring the initiation of replication in a producer cell and / or a host cell (for example,
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retiendra l'origine ColEl pour un plasmide destiné à être produit dans E. coli et le système oriP/EBNAl si l'on désire qu'il soit autoréplicatif dans une cellule hôte mammifère, Lupton et Levine, 1985, Mol. Cell. Biol. 5,2533-2542 ; Yates et al., Nature 313,812-815). Il peut en outre comprendre un gène de sélection permettant de sélectionner ou identifier les cellules transfectées (complémentation d'une mutation d'auxotrophie, gène codant pour la résistance à un antibiotique...). Bien entendu, il peut comprendre des éléments supplémentaires améliorant son maintien et/ou sa stabilité dans une cellule donnée (séquence cer qui favorise le maintien monomérique d'un plasmide (Summers et Sherrat, 1984, Cell 36,1097-1103, séquences d'intégration dans le génome cellulaire). will retain the ColEl origin for a plasmid intended to be produced in E. coli and the oriP / EBNAl system if it is desired to be self-replicating in a mammalian host cell, Lupton and Levine, 1985, Mol. Cell. Biol. 5.2533-2542; Yates et al., Nature 313,812-815). It can also comprise a selection gene making it possible to select or identify the transfected cells (complementation of an auxotrophy mutation, gene coding for resistance to an antibiotic, etc.). Of course, it may include additional elements improving its maintenance and / or its stability in a given cell (cer sequence which promotes the monomeric maintenance of a plasmid (Summers and Sherrat, 1984, Cell 36,1097-1103, sequences of integration into the cell genome).
S'agissant d'un vecteur viral, on peut envisager un vecteur dérivant d'un poxvirus (virus de la vaccine, notamment MVA, canaripox... etc), d'un adénovirus, d'un rétrovirus, d'un virus de l'herpès, d'un alphavirus, d'un foamyvirus ou d'un virus associé à l'adénovirus. On aura de préférence recours à un vecteur non réplicatif et non intégratif. A cet égard, les vecteurs adénoviraux conviennent tout particulièrement à la mise en oeuvre de la présente invention. Toutefois, il convient de noter ici que dans le cadre de la mise en oeuvre de la présente invention, la nature du vecteur revêt peu d'importance. Being a viral vector, one can envisage a vector deriving from a poxvirus (vaccinia virus, in particular MVA, canaripox, etc.), from an adenovirus, from a retrovirus, from a virus herpes, an alphavirus, a foamyvirus or a virus associated with the adenovirus. Preferably, a non-replicative and non-integrative vector will be used. In this respect, the adenoviral vectors are very particularly suitable for the implementation of the present invention. However, it should be noted here that in the context of the implementation of the present invention, the nature of the vector is of little importance.
Les rétrovirus ont la propriété d'infecter et de s'intégrer majoritairement dans les cellules en division et à cet égard sont particulièrement appropriés pour l'application cancer. Un rétrovirus recombinant selon l'invention comporte généralement les séquences LTR, une région d'encapsidation et la séquence nucléotidique selon l'invention placée sous le contrôle du LTR rétroviral ou d'un promoteur interne tels que ceux décrits ci-après. Il peut dériver d'un rétrovirus d'une origine quelconque (murin, primate, félin, humain, etc. ) et en particulier du MoMuLV (Moloney murine leukemia virus), MVS (Murine sarcoma Retroviruses have the property of infecting and integrating mainly in dividing cells and in this respect are particularly suitable for cancer application. A recombinant retrovirus according to the invention generally comprises the LTR sequences, an encapsidation region and the nucleotide sequence according to the invention placed under the control of the retroviral LTR or of an internal promoter such as those described below. It can be derived from a retrovirus of any origin (murine, primate, feline, human, etc.) and in particular from MoMuLV (Moloney murine leukemia virus), MVS (Murine sarcoma
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virus) ou Friend murine retrovirus (Fb29). Il est propagé dans une lignée d'encapsidation capable de fournir en trans les polypeptides viraux gag, pol et/ou env nécessaires à la constitution d'une particule virale. De telles lignées sont décrites dans la littérature (PA317, Psi CRIP GP + Am-12 etc...). Le vecteur rétroviral selon l'invention peut comporter des modifications notamment au niveau des LTR (remplacement de la région promotrice par un promoteur eucaryote) ou de la région d'encapsidation (remplacement par une région d'encapsidation hétérologue, par exemple de type VL30) (voir les demandes françaises 94 08300 et 97 05203). virus) or Friend murine retrovirus (Fb29). It is propagated in an packaging line capable of providing in trans the viral gag, pol and / or env polypeptides necessary for the constitution of a viral particle. Such lines are described in the literature (PA317, Psi CRIP GP + Am-12 etc ...). The retroviral vector according to the invention may include modifications in particular at the level of the LTRs (replacement of the promoter region with a eukaryotic promoter) or of the packaging region (replacement with a heterologous packaging region, for example of the VL30 type). (see French applications 94 08300 and 97 05203).
On pourra également avoir recours à un vecteur adénoviral défectif pour la réplication c'est à dire dépourvu de tout ou partie d'au moins une région essentielle à la réplication sélectionnée parmi les régions El, E2, E4 et. Une délétion de la région El est préférée. Mais elle peut être combinée à d'autres modification(s) / délétion(s) touchant notamment tout ou partie des régions E2, E4 et/ou L1-L5, dans la mesure où les fonctions essentielles défectives sont complémentées en trans au moyen d'une lignée de complémentation et/ou d'un virus auxiliaire afin d'assurer la production des particules virales d'intérêt. A cet égard, on peut avoir recours aux vecteurs de seconde génération de l'état de la technique (voir par exemple les demandes internationales WO 94/28152 et WO 97/04119). A titre illustratif, la délétion de la majorité de la région El et de l'unité de transcription E4 est tout particulièrement avantageuse. Dans le but d'augmenter les capacités de clonage, le vecteur adénoviral peut en outre être dépourvu de tout ou partie de la région E3 non essentielle. Selon une autre alternative, on peut mettre en oeuvre un vecteur adénoviral minimal retenant les séquences essentielles à l'encapsidation, à savoir les ITRs (Inverted Terminal Repeat) 5' et 3' et la région d'encapsidation. Par ailleurs, l'origine du vecteur adénoviral selon l'invention, peut être variée aussi bien du point de vue de l'espèce que It is also possible to use a defective adenoviral vector for replication, that is to say devoid of all or part of at least one region essential for replication selected from regions E1, E2, E4 and. A deletion from the El region is preferred. But it can be combined with other modification (s) / deletion (s) affecting in particular all or part of the regions E2, E4 and / or L1-L5, insofar as the defective essential functions are complemented in trans by means of 'a complementation line and / or a helper virus in order to ensure the production of the viral particles of interest. In this regard, use may be made of second generation vectors of the state of the art (see for example international applications WO 94/28152 and WO 97/04119). By way of illustration, the deletion of the majority of the region E1 and of the transcription unit E4 is very particularly advantageous. In order to increase the cloning capacities, the adenoviral vector can also be devoid of all or part of the non-essential E3 region. According to another alternative, it is possible to use a minimal adenoviral vector retaining the sequences essential for the packaging, namely the ITRs (Inverted Terminal Repeat) 5 'and 3' and the packaging region. Furthermore, the origin of the adenoviral vector according to the invention can be varied both from the point of view of the species and
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du sérotype. Il peut dériver du génome d'un adénovirus d'origine humaine ou animale (canine, aviaire, bovine, murine, ovine, porcine, simienne...) ou encore d'un hybride comprenant des fragments de génome adénoviral d'au moins deux origines différentes. On peut citer plus particulièrement les adénovirus CAV-1 ou CAV-2 d'origine canine, DAV d'origine aviaire ou encore Bad de type 3 d'origine bovine (Zakharchuk et al., Arch. Virol., 1993, 128 : 171-176 ; Spibey et Cavanagh, J. Gen. Virol., 1989,70: 165-172 ; Jouvenne et al., Gene, 1987,60: 21-28 ; Mittal et al., J. Gen. Virol., 1995,76: 93-102). Cependant, on préférera un vecteur adénoviral d'origine humaine dérivant de préférence d'un adénovirus de sérotype C, notamment de type 2 ou 5. Un vecteur adénoviral selon la présente invention peut être généré in vitro dans Escherichia coli (E. coli) par ligation ou recombinaison homologue (voir par exemple la demande internationale WO 96/17070) ou encore par recombinaison dans une lignée de complémentation. Les différents vecteurs adénoviraux ainsi que leurs techniques de préparation sont connus (voir par exemple Graham et Prevect, 1991, in Methods in Molecular Biology, vol 7, p 109-128 ; Ed : E.J. Murey, The Human Press Inc). of the serotype. It can be derived from the genome of an adenovirus of human or animal origin (canine, avian, bovine, murine, ovine, porcine, simian ...) or else from a hybrid comprising fragments of adenoviral genome of at least two different origins. Mention may more particularly be made of the adenoviruses CAV-1 or CAV-2 of canine origin, DAV of avian origin or else Bad of type 3 of bovine origin (Zakharchuk et al., Arch. Virol., 1993, 128: 171 -176; Spibey and Cavanagh, J. Gen. Virol., 1989.70: 165-172; Jouvenne et al., Gene, 1987.60: 21-28; Mittal et al., J. Gen. Virol., 1995 , 76: 93-102). However, an adenoviral vector of human origin preferably deriving from a serotype C adenovirus, in particular of type 2 or 5, is preferred. An adenoviral vector according to the present invention can be generated in vitro in Escherichia coli (E. coli) by homologous ligation or recombination (see for example international application WO 96/17070) or alternatively by recombination in a complementation line. The different adenoviral vectors as well as their preparation techniques are known (see for example Graham and Prevect, 1991, in Methods in Molecular Biology, vol 7, p 109-128; Ed: E.J. Murey, The Human Press Inc).
Les éléments nécessaires à l'expression sont constitués par l'ensemble des éléments permettant la transcription de la séquence nucléotidique en ARN et la traduction de l'ARNm en polypeptide, notamment les séquences promotrices et/ou des séquences de régulation efficaces dans ladite cellule, et éventuellement les séquences requises pour permettre l'excrétion ou l'expression à la surface des cellules cibles dudit polypeptide. Ces éléments peuvent être régulables ou constitutifs. Bien entendu, le promoteur est adapté au vecteur retenu et à la cellule hôte On peut citer, à titre d'exemples, les promoteurs eucaryotes des gènes PGK (Phospho Glycérate Kinase), MT (metallothioneine ; Mc Ivor et al., 1987, Mol. Cell Biol. 7,838-848), a-1 antitrypsine, CFTR, les promoteurs du gène codant pour la créatine kinase The elements necessary for expression consist of all of the elements allowing the transcription of the nucleotide sequence into RNA and the translation of the mRNA into polypeptide, in particular the promoter sequences and / or efficient regulatory sequences in said cell, and optionally the sequences required to allow excretion or expression on the surface of target cells of said polypeptide. These elements can be regulable or constitutive. Of course, the promoter is adapted to the vector selected and to the host cell. Mention may be made, by way of examples, of the eukaryotic promoters of the PGK (Phospho Glycerate Kinase), MT (metallothioneine; Mc Ivor et al., 1987, Mol . Cell Biol. 7,838-848), a-1 antitrypsin, CFTR, the promoters of the gene coding for creatine kinase
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musculaire, pour l'actine, pour le surfactant pulmonaire, immunoglobuline, p-actine (Tabin et al., 1982, Mol. Cell Biol. 2,426-436), SRa (Takebe et al., 1988, Mol. Cell. muscle, for actin, for the pulmonary surfactant, immunoglobulin, p-actin (Tabin et al., 1982, Mol. Cell Biol. 2,426-436), SRa (Takebe et al., 1988, Mol. Cell.
Biol. 8,466-472), le promoteur précoce du virus SV40 (Simian Virus), le LTR du RSV (Rous Sarcoma Virus), le promoteur de MPSV, le promoteur TK-HSV-1, le promoteur précoce du virus CMV (Cytomegalovirus), les promoteurs du virus de la vaccine p7.5K pH5R, pKlL, p28, p11 et les promoteurs adénoviraux E1A et MLP ou une combinaison desdits promoteurs. Il peut également s'agir d'un promoteur stimulant l'expression dans une cellule tumorale ou cancéreuse. On peut citer notamment les promoteurs des gènes MUC-1 surexprimé dans les cancers du sein et de la prostate (Chen et al., 1995, J. Clin. Invest. 96,2775-2782), CEA (pour carcinoma embryonic antigen) surexprimé dans les cancers du colon (Schrewe et al., 1990, Mol. Cell. Biol. 10, 2738-2748), tyrosinose surexprimé dans les mélanomes (Vile et al., 1993, Cancer Res. 53,3860-3864), ERB-2 surexprimé dans les cancers du sein et du pancréas (Harris et al., 1994, Gene Therapy 1,170-175) et a-fétoprotéine surexprimée dans les cancers du foie (Kanai et al., 1997, Cancer Res. Biol. 8,466-472), the early promoter of the SV40 virus (Simian Virus), the RSV LTR (Rous Sarcoma Virus), the MPSV promoter, the TK-HSV-1 promoter, the early promoter of the CMV virus (Cytomegalovirus), promoters of the vaccinia virus p7.5K pH5R, pKlL, p28, p11 and the adenoviral promoters E1A and MLP or a combination of said promoters. It can also be a promoter stimulating expression in a tumor or cancer cell. These include the promoters of the MUC-1 genes overexpressed in breast and prostate cancer (Chen et al., 1995, J. Clin. Invest. 96,2775-2782), CEA (for carcinoma embryonic antigen) overexpressed in colon cancers (Schrewe et al., 1990, Mol. Cell. Biol. 10, 2738-2748), tyrosinosis overexpressed in melanomas (Vile et al., 1993, Cancer Res. 53,3860-3864), ERB -2 overexpressed in breast and pancreatic cancers (Harris et al., 1994, Gene Therapy 1,170-175) and α-fetoprotein overexpressed in liver cancers (Kanai et al., 1997, Cancer Res.
57,461-465). Le promoteur précoce du Cytomégalovirus (CMV) est tout particulièrement préféré. Il est également possible d'utiliser une région promotrice tissu-spécifique, notamment lorsque la tumeur à traiter est issue d'un type cellulaire particulier, ou activable dans des conditions définies. La littérature procure un grand nombre d'informations relatives à de telles séquences promotrices. 57,461-465). The early promoter of Cytomegalovirus (CMV) is very particularly preferred. It is also possible to use a tissue-specific promoter region, in particular when the tumor to be treated originates from a particular cell type, or can be activated under defined conditions. The literature provides a great deal of information relating to such promoter sequences.
Les éléments nécessaires peuvent, en outre, inclure des éléments additionnels améliorant l'expression de la séquence nucléotidique selon l'invention ou son maintien dans la cellule hôte. On peut citer notamment les séquences introniques (WO 94/29471), séquences signal de sécrétion, séquences de localisation nucléaire, sites internes de réinitiation de la traduction de type IRES, séquences poly A de terminaison de la transcription. The necessary elements may, in addition, include additional elements improving the expression of the nucleotide sequence according to the invention or its maintenance in the host cell. Mention may in particular be made of the intronic sequences (WO 94/29471), secretion signal sequences, nuclear localization sequences, internal sites of translation initiation of IRES type, poly A sequences for transcription termination.
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Selon un mode de réalisation préféré, l'invention concerne plus particulièrement un vecteur recombinant, notamment un vecteur adénoviral défectif pour la réplication, comprenant : (i) une séquence d'acide nucléique codant pour tout ou partie du polypeptide p53, (ii) au moins une séquence d'acide nucléique codant pour tout ou partie d'un polypeptide ayant au moins une activité cytotoxique, lesdites séquences d'acide nucléique étant placées sous le contrôle des éléments nécessaires à leur expression dans une cellule hôte et étant définies comme indiqué cidessus. According to a preferred embodiment, the invention relates more particularly to a recombinant vector, in particular an adenoviral vector defective for replication, comprising: (i) a nucleic acid sequence coding for all or part of the p53 polypeptide, (ii) at at least one nucleic acid sequence coding for all or part of a polypeptide having at least one cytotoxic activity, said nucleic acid sequences being placed under the control of the elements necessary for their expression in a host cell and being defined as indicated above .
La présente invention a également pour objet une particule virale, notamment adénovirale, comprenant un vecteur viral recombinant selon l'invention. Une telle particule virale peut être générée à partir d'un vecteur viral selon toute technique conventionnelle dans le domaine de l'art. Sa propagation est effectuée notamment dans une cellule de complémentation adaptée aux déficiences du vecteur. S'agissant d'un vecteur adénoviral, on aura par exemple recours à une lignée de complémentation telle que décrite dans la demande WO 94/28152, à la lignée 293 établie à partir de cellules de rein embryonnaire humain, qui complémente efficacement la fonction El (Graham et al., 1977, J. Gen. Virol. 36,59-72), la lignée A549-E1 (Imler et al., 1996, Gene Therapy 3,75-84) ou une lignée permettant une double complémentation (Yeh et al., 1996, J. Virol. 70, 559-565 ; Krougliak et Graham, 1995, Human Gene Therapy 6, 1575-1586 ; Wang et al., 1995 Gene Therapy 2,775-783 ; demande internationale WO 97/04119). On peut également employer des virus auxiliaires pour complémenter au moins en partie les fonctions défectives. Par cellule de complémentation, on entend une cellule capable de fournir en trans les facteurs précoces et/ou tardifs nécessaires à l'encapsidation du génome viral dans une capside virale pour The present invention also relates to a viral particle, in particular adenoviral, comprising a recombinant viral vector according to the invention. Such a viral particle can be generated from a viral vector according to any conventional technique in the art. Its propagation is carried out in particular in a complementation cell adapted to the deficiencies of the vector. In the case of an adenoviral vector, use will be made, for example, of a complementation line as described in application WO 94/28152, to line 293 established from human embryonic kidney cells, which effectively complements the El function (Graham et al., 1977, J. Gen. Virol. 36,59-72), the line A549-E1 (Imler et al., 1996, Gene Therapy 3,75-84) or a line allowing a double complementation ( Yeh et al., 1996, J. Virol. 70, 559-565; Krougliak and Graham, 1995, Human Gene Therapy 6, 1575-1586; Wang et al., 1995 Gene Therapy 2,775-783; international application WO 97/04119 ). Helper viruses can also be used to at least partially complement defective functions. By complementation cell is meant a cell capable of providing in trans the early and / or late factors necessary for the packaging of the viral genome in a viral capsid for
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générer une particule virale contenant le vecteur recombinant. Ladite cellule peut ne pas complémenter à elle seule toutes les fonctions défectives du vecteur et dans ce cas peut être transfectée/ transduite par un vecteur/ virus auxiliaire apportant les fonctions complémentaires. generate a viral particle containing the recombinant vector. Said cell may not by itself complement all the defective functions of the vector and in this case may be transfected / transduced by a vector / helper virus providing the complementary functions.
L'invention concerne également un procédé de préparation d'une particule virale, selon lequel : (i) on introduit un vecteur recombinant selon l'invention dans une cellule, notamment une cellule de complémentation capable de complémenter en trans ledit vecteur, de manière à obtenir une dite cellule transfectée, (ii) on cultive ladite cellule transfectée dans des conditions appropriées pour permettre la production de ladite particule virale, et (iii) on récupère ladite particule virale dans la culture cellulaire. The invention also relates to a method for preparing a viral particle, according to which: (i) a recombinant vector according to the invention is introduced into a cell, in particular a complementation cell capable of complementing said vector in trans, so as to obtaining a said transfected cell, (ii) cultivating said transfected cell under conditions suitable for allowing the production of said viral particle, and (iii) recovering said viral particle in cell culture.
Bien entendu, la particule virale peut être récupérée du surnageant de culture mais également à partir des cellules. Une des méthodes couramment employée consiste à lyser les cellules par des cycles consécutifs de congélation/ décongélation pour recueillir les virions dans le surnageant de lyse. Ceux-ci peuvent être amplifiés et purifiés selon les techniques de l'art (procédé chromatographique, ultracentrifugation notamment à travers un gradient de chlorure de césium...). Of course, the viral particle can be recovered from the culture supernatant but also from the cells. One of the commonly used methods is to lyse the cells by consecutive freeze / thaw cycles to collect the virions in the lysis supernatant. These can be amplified and purified according to the techniques of the art (chromatographic process, ultracentrifugation in particular through a gradient of cesium chloride ...).
L'invention a également trait à une cellule hôte eucaryote comprenant les fragments d'ADN présents dans la composition selon l'invention. Ladite cellule hôte est avantageusement une cellule de mammifère et, de préférence, une cellule humaine. Il s'agira de préférence d'une cellule 293, LCA4 ou PERC6. Une telle cellule est notamment utile pour produire les particules virales à haut titre, sans générer de particules compétentes pour la réplication . L' invention concerne également une cellule hôte comprenant une séquence nucléotidique, un vecteur recombinant selon The invention also relates to a eukaryotic host cell comprising the DNA fragments present in the composition according to the invention. Said host cell is advantageously a mammalian cell and, preferably, a human cell. It will preferably be a 293 cell, LCA4 or PERC6. Such a cell is particularly useful for producing viral particles at high titer, without generating particles competent for replication. The invention also relates to a host cell comprising a nucleotide sequence, a recombinant vector according to
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l'invention ou infectée par une particule virale selon l'invention. Aux fins de la présente invention, une cellule hôte est constituée par toute cellule transfectable par un vecteur recombinant ou infectable par une particule virale, tels que définis ci-avant. Une cellule de mammifère et notamment humaine convient tout particulièrement. Elle peut comprendre ledit vecteur sous forme intégrée dans le génome ou non (épisome). Il peut s'agir d'une cellule primaire ou tumorale d'une origine quelconque, notamment hématopoïétique (cellule souche totipotente, leucocyte, lymphocyte, monocyte ou macrophage...), musculaire (cellule satellite, myocyte, myoblaste, muscle lisse...), cardiaque, pulmonaire, trachéale, hépatique, épithéliale ou fibroblaste. the invention or infected with a viral particle according to the invention. For the purposes of the present invention, a host cell consists of any cell transfectable by a recombinant vector or infectable by a viral particle, as defined above. A mammalian and in particular human cell is particularly suitable. It can comprise said vector in a form integrated into the genome or not (episome). It may be a primary or tumor cell of any origin, in particular hematopoietic (totipotent stem cell, leukocyte, lymphocyte, monocyte or macrophage ...), muscle (satellite cell, myocyte, myoblast, smooth muscle ..) .), cardiac, pulmonary, tracheal, hepatic, epithelial or fibroblast.
L'invention concerne également une composition destinée à la mise en oeuvre d'un traitement antitumoral ou antiviral, ou toute applications nécessitant la mort cellulaire, chez un mammifère comprenant : (i) tout ou partie du polypeptide p53, (ii) tout ou partie d'un polypeptide ayant au moins une activité cytotoxique, lesdits polypeptides étant définis comme indiqué précédemment. The invention also relates to a composition intended for the implementation of an antitumor or antiviral treatment, or any applications requiring cell death, in a mammal comprising: (i) all or part of the p53 polypeptide, (ii) all or part of a polypeptide having at least one cytotoxic activity, said polypeptides being defined as indicated above.
Un autre objet selon l'invention consiste en une formulation destinée à la mise en oeuvre d'un traitement antitumoral ou antiviral chez un mammifère caractérisée en ce qu'elle comporte une composition (à base d'acide nucléique ou de polypeptide telle que décrite précédemment), un vecteur adénoviral ou une particule virale selon l'invention, ainsi qu'un support acceptable d'un point de vue pharmaceutique. Un tel support est préférentiellement isotonique, hypotonique ou faiblement hypertonique et présente une force ionique relativement faible, tel que par exemple une solution de sucrose. Par ailleurs, un tel support peut renfermer tout solvant, ou liquide aqueux ou partiellement aqueux tel que de l'eau stérile non pyrogène. Another object according to the invention consists of a formulation intended for the implementation of an antitumor or antiviral treatment in a mammal, characterized in that it comprises a composition (based on nucleic acid or polypeptide as described above) ), an adenoviral vector or a viral particle according to the invention, as well as a pharmaceutically acceptable carrier. Such a support is preferably isotonic, hypotonic or weakly hypertonic and has a relatively low ionic strength, such as for example a sucrose solution. Furthermore, such a support can contain any solvent, or aqueous or partially aqueous liquid such as sterile non-pyrogenic water.
Le pH de la formulation est en outre ajusté et tamponné afin The pH of the formulation is further adjusted and buffered to
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de répondre aux exigences d'utilisation in vivo. La formulation peut également inclure un diluant, un adjuvant ou un excipient acceptable d'un point de vue pharmaceutique, de même que des agents de solubilisation, de stabilisation, de préservation. Pour une administration injectable, on préfère une formulation en solution aqueuse, non-aqueuse ou isotonique. Elle peut être présentée en dose unique ou en multidose sous forme liquide ou sèche (poudre, lyophilisat...) susceptible d'être reconstituée de manière extemporanée par un diluant approprié. meet the requirements for in vivo use. The formulation may also include a pharmaceutically acceptable diluent, adjuvant or excipient, as well as solubilizers, stabilizers, preservatives. For injectable administration, an aqueous, non-aqueous or isotonic solution formulation is preferred. It can be presented as a single dose or in multidose in liquid or dry form (powder, lyophilisate, etc.) capable of being reconstituted extemporaneously with an appropriate diluent.
Selon un mode particulier de l'invention, ladite formulation comporte en outre des quantités acceptables d'un point de vue pharmaceutique d'une prodrogue capable d'être transformée en molécule cytotoxique par un polypeptide ayant au moins une activité cytotoxique. According to a particular embodiment of the invention, said formulation also comprises pharmaceutically acceptable amounts of a prodrug capable of being transformed into a cytotoxic molecule by a polypeptide having at least one cytotoxic activity.
Une telle prodrogue sera notamment sélectionnée dans le groupe consistant en l'acyclovir ou le ganciclovir (GCV), la cyclophosphophamide, la 6-méthylpurine deoxyribonucleoside, la 6-thioxanthine, la cytosine ou un de ses dérivés ou l'uracile ou un de ses dérivés. De manière tout à fait préférée, ladite prodrogue est la 5fluorocytosine (5FC) ou la 5-fluorouracile (5-FU ). Such a prodrug will be selected in particular from the group consisting of acyclovir or ganciclovir (GCV), cyclophosphophamide, 6-methylpurine deoxyribonucleoside, 6-thioxanthine, cytosine or one of its derivatives or uracil or one of its derivatives. Most preferably, said prodrug is 5fluorocytosine (5FC) or 5-fluorouracil (5-FU).
Par ailleurs, notamment dans le cadre de formulations renfermant une composition selon la seconde variante évoquée ci-dessus, il convient de noter que ladite formulation peut également comprendre une ou plusieurs substances potentialisant l'effet cytotoxique du 5-FU. On peut citer en particulier, les drogues inhibant les enzymes de la voie de biosynthèse de novo des pyrimidines (par exemple celles citées ci-après), les drogues telles que la Leucovorin (Waxman et al., 1982, Eur. J. Cancer Clin. Oncol. Furthermore, in particular in the context of formulations containing a composition according to the second variant mentioned above, it should be noted that said formulation may also comprise one or more substances potentiating the cytotoxic effect of 5-FU. Mention may be made in particular of drugs which inhibit the enzymes of the de novo biosynthesis pathway for pyrimidines (for example those cited below), drugs such as Leucovorin (Waxman et al., 1982, Eur. J. Cancer Clin Oncol.
18, 685-692) qui en présence du produit du métabolisme du 5FU (5-FdUMP) augmente l'inhibition de la thymidylate synthase ce qui entraîne une diminution du pool de dTMP nécessaire à la réplication et enfin les drogues telles que le méthotréxate (Cadman et al., 1979, Science 250,1135- 18, 685-692) which in the presence of the product of the metabolism of 5FU (5-FdUMP) increases the inhibition of thymidylate synthase which leads to a decrease in the pool of dTMP necessary for replication and finally drugs such as methotrexate ( Cadman et al., 1979, Science 250,1135-
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1137) qui en inhibant la dihydrofolate réductase et en élevant le pool d'incorporation de PRPP (phosphoribosylpyrophosphate) provoque l'augmentation de 5FU dans l'ARN cellulaire. 1137) which by inhibiting dihydrofolate reductase and increasing the pool of incorporation of PRPP (phosphoribosylpyrophosphate) causes the increase of 5FU in cellular RNA.
Une formulation selon l'invention est plus particulièrement destinée au traitement préventif ou curatif de maladies par thérapie génique et s'adresse plus particulièrement aux maladies prolifératives (cancers, tumeurs, resténose...etc) et aux maladies d'origine infectieuse, notamment virale pour lesquelles il est nécessaire de limiter la prolifération des cellules infectées (induites par les virus de l'hépatite B ou C, le HIV, l'herpès, les rétrovirus....etc.). A formulation according to the invention is more particularly intended for the preventive or curative treatment of diseases by gene therapy and is more particularly intended for proliferative diseases (cancers, tumors, restenosis, etc.) and for diseases of infectious origin, in particular viral for which it is necessary to limit the proliferation of infected cells (induced by hepatitis B or C viruses, HIV, herpes, retroviruses, etc.).
Une formulation selon l'invention peut être fabriquée de manière conventionnelle en vue d'une administration par voie locale, parentérale ou digestive. A formulation according to the invention can be manufactured in a conventional manner for administration by the local, parenteral or digestive route.
Les voies d'administration envisageables sont multiples. On peut citer par exemple la voie intragastrique, sous-cutanée, intracardiaque, intramusculaire, intraveineuse, intrapéritonéale, intratumorale, intranasale, intrapulmonaire ou intratrachéale. Pour ces trois derniers modes de réalisation, une administration par aérosol ou instillation est avantageuse. L'administration peut avoir lieu en dose unique ou répétée une ou plusieurs fois après un certain délai d'intervalle. La voie d'administration et le dosage appropriés varient en fonction de divers paramètres, par exemple, de l'individu, de la maladie à traiter ou encore du ou des gène (s) à transférer. There are many possible routes of administration. Mention may be made, for example, of the intragastric, subcutaneous, intracardiac, intramuscular, intravenous, intraperitoneal, intratumoral, intranasal, intrapulmonary or intratracheal route. For these last three embodiments, administration by aerosol or instillation is advantageous. The administration can take place in single dose or repeated one or more times after a certain interval of interval. The appropriate route of administration and dosage vary according to various parameters, for example, the individual, the disease to be treated or the gene (s) to be transferred.
Les préparations à base de particules virales selon l'invention peuvent être formulées sous forme de doses comprises entre 104 et 1014 ufp (unités formant des plages), avantageusement 105 et 1013 ufp et, de préférence, 106 et 1012 ufp. Pour ce qui est du vecteur recombinant selon l'invention, des doses comprenant de 0,01 à 100 mg d'ADN, de préférence 0,05 à 10 mg et, de manière tout à fait préférée, 0,5 à 5 mg peuvent être envisagées. Une composition à base The preparations based on viral particles according to the invention can be formulated in the form of doses of between 104 and 1014 pfu (units forming plaques), advantageously 105 and 1013 pfu and, preferably, 106 and 1012 pfu. As regards the recombinant vector according to the invention, doses comprising from 0.01 to 100 mg of DNA, preferably 0.05 to 10 mg and, most preferably, 0.5 to 5 mg may be considered. A composition based
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de polypeptides comprend de préférence de 0,05 à 10 g et, de manière tout à fait préférée, de 0,5 à 5 g dudit polypeptide. Bien entendu, les doses peuvent être adaptées par le clinicien. of polypeptides preferably comprises from 0.05 to 10 g and, most preferably, from 0.5 to 5 g of said polypeptide. Of course, the doses can be adjusted by the clinician.
La présente invention est également relative à l'utilisation thérapeutique ou prophylactique d'une composition, d'un vecteur recombinant ou d'une particule virale selon l'invention pour la préparation d'un médicament destiné au traitement du corps humain ou animal par thérapie génique, notamment pour la préparation d'un médicament antitumoral ou antiviral destiné à inhiber la croissance ou provoquer le rejet d'une tumeur ou la mort d'une cellule infectée. Selon une première possibilité, le médicament peut être administré directement in vivo (par exemple par injection intraveineuse, dans une tumeur accessible ou à sa périphérie, dans les poumons par aérosol, dans le système vasculaire au moyen d'une sonde appropriée...). On peut également adopter l'approche ex vivo qui consiste à prélever des cellules du patient (cellules souches de la moelle osseuse, lymphocytes du sang périphérique, cellules musculaires...), de les transfecter ou infecter in vitro selon les techniques de l'art et de les réadminister au patient. Une utilisation préférée consiste à traiter ou prévenir les cancers, tumeurs et maladies résultant d'une prolifération cellulaire non désirée. Parmi les applications envisageables, on peut citer les cancers du sein, de l'utérus (notamment ceux induits par les papillomas virus), de la prostate, du poumon, de la vessie, du foie, du colon, du pancréas, de l'estomac, de l'oesophage, du larynx du système nerveux central et du sang (lymphomes, leucémie etc...). Elle est également utile dans le cadre des maladies cardiovasculaires, par exemple pour inhiber ou retarder la prolifération des cellules de muscles lisses de la paroi vasculaire (resténose). Enfin pour ce qui est des maladies infectieuses, l'application au SIDA peut être envisagée. The present invention also relates to the therapeutic or prophylactic use of a composition, of a recombinant vector or of a viral particle according to the invention for the preparation of a medicament intended for the treatment of the human or animal body by therapy gene, in particular for the preparation of an antitumor or antiviral medicament intended to inhibit the growth or cause the rejection of a tumor or the death of an infected cell. According to a first possibility, the drug can be administered directly in vivo (for example by intravenous injection, in an accessible tumor or at its periphery, in the lungs by aerosol, in the vascular system by means of an appropriate probe ...) . One can also adopt the ex vivo approach which consists in taking cells from the patient (stem cells of the bone marrow, lymphocytes in the peripheral blood, muscle cells, etc.), transfecting or infecting them in vitro according to the techniques of art and readminister them to the patient. A preferred use is to treat or prevent cancers, tumors and diseases resulting from unwanted cell proliferation. Among the possible applications, mention may be made of cancers of the breast, of the uterus (in particular those induced by papillomas virus), of the prostate, of the lung, of the bladder, of the liver, of the colon, of the pancreas, of the stomach, esophagus, larynx of the central nervous system and blood (lymphomas, leukemia etc ...). It is also useful in the context of cardiovascular diseases, for example to inhibit or delay the proliferation of smooth muscle cells of the vascular wall (restenosis). Finally, with regard to infectious diseases, application to AIDS can be considered.
Il est par ailleurs envisageable, le cas échéant et It is also conceivable, if necessary and
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sans sortir du cadre de la présente invention, de procéder à des administrations simultanées ou successives par des voies différentes des différents composants compris dans la composition ou la formulation pharmaceutique selon l'invention. without departing from the scope of the present invention, to carry out simultaneous or successive administrations by different routes of the various components included in the pharmaceutical composition or formulation according to the invention.
L'invention s'étend également à une méthode pour le traitement des maladies par thérapie génique, caractérisé en ce que l'on administre à un organisme ou à une cellule hôte ayant besoin d'un tel traitement une séquence nucléotidique, un vecteur recombinant, une particule virale ou une cellule hôte selon l'invention. The invention also extends to a method for the treatment of diseases by gene therapy, characterized in that a nucleotide sequence, a recombinant vector, is administered to an organism or to a host cell in need of such treatment. a viral particle or a host cell according to the invention.
Lorsque la méthode de traitement met en oeuvre une séquence nucléotidique, un vecteur recombinant ou une particule virale permettant l'expression d'un polypeptide selon l'invention ayant une activité UPRTase, il peut être avantageux d'administrer en outre une seconde séquence nucléotidique codant pour un second polypeptide présentant une activité CDase, ladite seconde séquence nucléotidique étant portée par ledit vecteur recombinant ou particule virale ou par un vecteur ou une particule virale indépendante. Dans ce dernier cas, l'administration des séquences UPRTase et CDase peut être simultanée ou consécutive, l'ordre d'administration étant sans importance. When the treatment method uses a nucleotide sequence, a recombinant vector or a viral particle allowing the expression of a polypeptide according to the invention having UPRTase activity, it may be advantageous to administer in addition a second nucleotide sequence encoding for a second polypeptide exhibiting CDase activity, said second nucleotide sequence being carried by said recombinant vector or viral particle or by a vector or an independent viral particle. In the latter case, the administration of the UPRTase and CDase sequences can be simultaneous or consecutive, the order of administration being unimportant.
Selon un mode de réalisation avantageux, l'utilisation thérapeutique ou la méthode de traitement comprend également une étape supplémentaire selon laquelle on administre à l'organisme ou la cellule hôte des quantités acceptables d'un point de vue pharmaceutique d'une prédrogue, avantageusement d'un analogue de cytosine et, en particulier de la 5-FC. A titre illustratif, une dose de 50 à 500 mg/kg/jour peut être employée avec une préférence pour 200 mg/kg/jour. Dans le cadre de la présente invention, la prédrogue est administrée selon les pratiques standards et ceci de manière préalable, concomittante ou encore postérieure à celle de l'agent thérapeutique selon l'invention. La voie orale est préférée. On peut administrer According to an advantageous embodiment, the therapeutic use or the method of treatment also comprises an additional step according to which the host organism or cell is administered pharmaceutically acceptable amounts of a predrogue, advantageously d analog of cytosine and, in particular of 5-FC. By way of illustration, a dose of 50 to 500 mg / kg / day can be used with a preference for 200 mg / kg / day. In the context of the present invention, the predrogue is administered according to standard practices and this in a prior, concomitant or even after that of the therapeutic agent according to the invention. The oral route is preferred. We can administer
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une dose unique de prédrogue ou des doses répétées pendant un temps suffisamment long pour permettre la production du métabolite toxique au sein de l'organisme ou de la cellule hôte. a single dose of predrogue or repeated doses for a time long enough to allow the production of the toxic metabolite within the organism or the host cell.
Selon une mode avantageux de l'invention, l'utilisation thérapeutique ou la méthode de traitement est associée à un second traitement du patient par chirurgie (notamment par ablation de la tumeur partiellement ou totalement), par radiothérapie ou chimiothérapie. Dans ce cas particulier, le traitement selon l'invention est appliqué de manière préalable, concomitante ou fait suite audit second traitement. De manière préféré, ce traitement sera appliqué suite audit second traitement. According to an advantageous embodiment of the invention, the therapeutic use or the method of treatment is associated with a second treatment of the patient by surgery (in particular by removal of the tumor partially or totally), by radiotherapy or chemotherapy. In this particular case, the treatment according to the invention is applied beforehand, concomitantly or following said second treatment. Preferably, this treatment will be applied following said second treatment.
Les exemples qui suivent ont pour but d'illustrer les différents objets de la présente invention et n'ont par conséquence aucun caractère limitatif. The examples which follow are intended to illustrate the various objects of the present invention and consequently have no limiting character.
La figure 1 montre l'effet antiprolifératif in vitro d'un tampon (Mock), d'un adénovirus vide (Ad-null), d'un adénovirus exprimant FCU1 (Ad-FCUl) ou p53 (Ad-p53) ou p53 et FCU1(Ad-p53FCU1) sur les cellules SW480 à une MOI de 1 en absence de prodrogue (100% correspond à la viabilité des cellules non infectées). FIG. 1 shows the antiproliferative effect in vitro of a buffer (Mock), of an empty adenovirus (Ad-null), of an adenovirus expressing FCU1 (Ad-FCU1) or p53 (Ad-p53) or p53 and FCU1 (Ad-p53FCU1) on SW480 cells at an MOI of 1 in the absence of prodrug (100% corresponds to the viability of uninfected cells).
La figure 2 montre l'effet antiprolifératif in vitro de Mock, d'un adénovirus vide, d'un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 sur les cellules B16FO à une MOI de 100 en absence de prodrogue (100% correspond à la viabilité des cellules non infectées). FIG. 2 shows the in vitro antiproliferative effect of Mock, of an empty adenovirus, of an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 on B16FO cells at an MOI of 100 in the absence of prodrug (100% corresponds to the viability of uninfected cells).
La figure 3 montre l'effet antiprolifératif in vitro de Mock, d'un adénovirus vide, d'un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 sur les cellules LoVo à une MOI de 1 en absence de prodrogue (100% correspond à la viabilité des cellules non infectées). FIG. 3 shows the in vitro antiproliferative effect of Mock, of an empty adenovirus, of an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 on LoVo cells at an MOI of 1 in the absence of prodrug (100% corresponds to the viability of uninfected cells).
La figure 4 montre la sensibilisation en présence de différentes concentrations de 5FU des cellules SW480 infectées par Mock, un adénovirus vide, un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 (100% correspond à la FIG. 4 shows the sensitization in the presence of different concentrations of 5FU of SW480 cells infected with Mock, an empty adenovirus, an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 (100% corresponds to the
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viabilité des cellules infectées en absence de prodrogue). viability of infected cells in the absence of prodrug).
La figure 5 montre la sensibilisation en présence de différentes concentrations de 5FU des cellules B16FO infectées par Mock, un adénovirus vide, un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 (100% correspond à la viabilité des cellules infectées en absence de prodrogue). FIG. 5 shows the sensitization in the presence of different concentrations of 5FU of the B16FO cells infected with Mock, an empty adenovirus, an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 (100% corresponds to the viability of the infected cells in the absence of prodrug).
La figure 6 montre la sensibilisation en présence de différentes concentrations de 5FU des cellules LoVo infectées par Mock, un adénovirus vide, un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 (100% correspond à la viabilité des cellules infectées en absence de prodrogue). FIG. 6 shows the sensitization in the presence of different concentrations of 5FU of LoVo cells infected with Mock, an empty adenovirus, an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 (100% corresponds to the viability of the infected cells in the absence of prodrug).
La figure 7 montre la sensibilisation en présence de différentes concentrations de 5FC des cellules SW40 infectées par Mock, un adénovirus vide, un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 (100% correspond à la viabilité des cellules infectées en absence de prodrogue). FIG. 7 shows the sensitization in the presence of different concentrations of 5FC of SW40 cells infected with Mock, an empty adenovirus, an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 (100% corresponds to the viability of the infected cells in the absence of prodrug).
La figure 8 montre la sensibilisation en présence de différentes concentrations de 5FC des cellules B16FO infectées par Mock, un adénovirus vide, un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 (100% correspond à la viabilité des cellules infectées en absence de prodrogue). FIG. 8 shows the sensitization in the presence of different concentrations of 5FC of B16FO cells infected with Mock, an empty adenovirus, an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 (100% corresponds to the viability of the infected cells in the absence of prodrug).
La figure 9 montre la sensibilisation en présence de différentes concentrations de 5FC des cellules LoVo infectées par Mock, un adénovirus vide, un adénovirus exprimant FCU1 ou p53 ou p53 et FCU1 (100% correspond à la viabilité des cellules infectées en absence de prodrogue). FIG. 9 shows the sensitization in the presence of different concentrations of 5FC of LoVo cells infected with Mock, an empty adenovirus, an adenovirus expressing FCU1 or p53 or p53 and FCU1 (100% corresponds to the viability of the infected cells in the absence of prodrug).
La figure 10 représente le taux de survie de souris B6D2 dans lesquelles ont été implantées des cellules tumorales B16FO traitées par différentes compositions adénovirales. FIG. 10 represents the survival rate of B6D2 mice in which B16FO tumor cells treated with different adenoviral compositions have been implanted.
EXEMPLES :
La présente invention est illustrée, sans pour autant être limitée, par les exemples suivants. EXAMPLES:
The present invention is illustrated, without however being limited, by the following examples.
Les constructions décrites ci-dessous sont réalisées selon les techniques générales de génie génétique et de The constructions described below are carried out according to general techniques of genetic engineering and
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clonage moléculaire, détaillées dans Maniatis et al., (1989, Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY) ou selon les recommandations du fabricant lorsqu'on utilise un kit commercial. Les étapes de recombinaison homologue sont de préférence réalisées dans la souche E. coli BJ 5183 (Hanahan, 1983, J. Mol. Biol. 166, 557-580). S'agissant de la réparation des sites de restriction, la technique employée consiste en un remplissage des extrémités 5' protubérantes à l'aide du grand fragment de l'ADN polymérase I d'E. coli (Klenow). Par ailleurs, les fragments de génome adénoviral employés dans les différentes constructions décrites ci-après, sont indiqués précisément selon leur position dans la séquence nucléotidique du génome de l'Ad5 telle que divulguée dans la banque de données Genebank sous la référence M73260. molecular cloning, detailed in Maniatis et al. (1989, Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY) or according to the manufacturer's recommendations when using a commercial kit. The homologous recombination steps are preferably carried out in the E. coli BJ 5183 strain (Hanahan, 1983, J. Mol. Biol. 166, 557-580). With regard to the repair of restriction sites, the technique used consists of filling the protruding 5 ′ ends with the large fragment of DNA polymerase I from E. coli (Klenow). Furthermore, the adenoviral genome fragments used in the various constructions described below are indicated precisely according to their position in the nucleotide sequence of the Ad5 genome as disclosed in the Genebank database under the reference M73260.
En ce qui concerne la biologie cellulaire, les cellules sont transfectées ou transduites et cultivées selon les techniques standards bien connues de l'homme du métier. With regard to cell biology, the cells are transfected or transduced and cultured according to standard techniques well known to those skilled in the art.
EXEMPLE 1 : Construction d'un adénovirus exprimant p 53 (Adp53). EXAMPLE 1 Construction of an adenovirus expressing p 53 (Adp53).
La région codante de p53 a été amplifiée par PCR à partir du plasmide pC53-SN3 (Baker et al., 1990, Science 249,912-915) utilisé comme matrice et des amorces suivantes :
En 5' terminal 5'ggcagccagaattccttccgggtcac3'
En 3' terminal 5'ggctgtcagtggggatctagaagtggag3'
Les sites EcoRI et XbaI ont été introduits respectivement en 5' et en 3' de la séquence codante de p53. le fragment PCR de p53 a été coupé par EcoRI et XbaI puis inséré dans le plamide pCI-neo (Promega Corp) pour donner le plasmide pCI-neop53. Le fragment XhoI-XbaI de pCI-neop53 renfermant le gène p53 est isolé et introduit dans le vecteur pTG6600 (Lathe et al, 1987, Gene 57,193-201) clivé par ces mêmes enzymes, pour donner le vecteur de transfert The coding region of p53 was amplified by PCR from the plasmid pC53-SN3 (Baker et al., 1990, Science 249,912-915) used as template and of the following primers:
In 5 'terminal 5'ggcagccagaattccttccgggtcac3'
In 3 'terminal 5'ggctgtcagtggggatctagaagtggag3'
The EcoRI and XbaI sites were introduced respectively 5 ′ and 3 ′ of the coding sequence of p53. the PCR fragment of p53 was cut with EcoRI and XbaI and then inserted into the pCI-neo plamide (Promega Corp) to give the plasmid pCI-neop53. The XhoI-XbaI fragment of pCI-neop53 containing the p53 gene is isolated and introduced into the vector pTG6600 (Lathe et al, 1987, Gene 57.193-201) cleaved by these same enzymes, to give the transfer vector
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pTG6600p53. Le vecteur adénoviral Adp53 est reconstitué par recombinaison homologue dans la souche E.coli BJ5183 entre le fragment PacI-BstEII de pTG6600p53 et le vecteur pTG6624 linéarisé par ClaI. La construction finale Adp53 contient le génome de l'Ad5 délété de l'essentiel des régions El (nucléotides 459 à 3328) et E3 (nucléotides 28249 à 30758) et en lieu et place de El, une cassette d'expression du gène p53 placé sous le contrôle du promoteur précoce CMV et des séquences d'épissage hybrides ss-globine/Ig. Les particules virales sont générées par transfection dans une lignée de cellules 293 (ATCC CRL1573) qui complémentent la fonction El. pTG6600p53. The adenoviral vector Adp53 is reconstituted by homologous recombination in the E.coli strain BJ5183 between the PacI-BstEII fragment of pTG6600p53 and the vector pTG6624 linearized by ClaI. The final construction Adp53 contains the genome of Ad5 deleted from most of the regions El (nucleotides 459 to 3328) and E3 (nucleotides 28249 to 30758) and in place of El, an expression cassette for the p53 gene placed under the control of the CMV early promoter and the ss-globin / Ig hybrid splicing sequences. The viral particles are generated by transfection into a 293 cell line (ATCC CRL1573) which complement the E1 function.
EXEMPLE 2 : Construction d'un adénovirus exprimant une unité bicistronique p53-IRES-FCUl (Adp53FCUl). EXAMPLE 2 Construction of an adenovirus expressing a p53-IRES-FCU1 bicistronic unit (Adp53FCUl).
Le fragment NcoI-SalI du plasmide pCI-neoFCUl décrit dans la demande de brevet française No. 98. 05054 renfermant le gène de fusion FCU1 est isolé et introduit dans le vecteur pTG4369 linéarisé par NcoI-SalI. Le plasmide pTG4369FCUl ainsi obtenu contient le gène FCU1 en aval de la séquence IRES (pour Internai Ribosome Entry Site ou site interne d'entrée des ribosomes) de EMCV (encephalomyocarditis virus). Le fragment SacI-NotI de pCIneop53 est isolé puis inséré dans le vecteur pTG4369FCUl linéarisé par SacI-NotI pour donner le vecteur pTG4369p53FCUl dans lequel le gène p53 est placé en amont de la séquence IRES. Le fragment NheI-MluI de pTG4369p53FCUl renfermant la séquence p53IRESFCUl est inséré dans le vecteur pTG6600 clivé par ces mêmes enzymes pour donner le vecteur de transfert pTG6600p53IRESFCUl. Le vecteur adénoviral Adp53FCUl est reconstitué par recombinaison homologue dans la souche E.coli BJ5183 entre le fragment PacI-BstEII de pTG6600p53IRESFCUl et le vecteur pTG6624 linéarisé par ClaI. La construction finale Adp53FCUl contient le génome de l'Ad5 délété de l'essentiel des régions El (nucléotides 459 à 3328) et E3 (nucléotides 28249 The NcoI-SalI fragment of the plasmid pCI-neoFCU1 described in French patent application No. 98. 05054 containing the FCU1 fusion gene is isolated and introduced into the vector pTG4369 linearized by NcoI-SalI. The plasmid pTG4369FCU1 thus obtained contains the FCU1 gene downstream of the IRES sequence (for Internal Ribosome Entry Site) of EMCV (encephalomyocarditis virus). The SacI-NotI fragment of pCIneop53 is isolated and then inserted into the vector pTG4369FCUl linearized by SacI-NotI to give the vector pTG4369p53FCU1 in which the p53 gene is placed upstream of the IRES sequence. The NheI-MluI fragment of pTG4369p53FCU1 containing the sequence p53IRESFCU1 is inserted into the vector pTG6600 cleaved by these same enzymes to give the transfer vector pTG6600p53IRESFCU1. The adenoviral vector Adp53FCUl is reconstituted by homologous recombination in the E.coli strain BJ5183 between the PacI-BstEII fragment of pTG6600p53IRESFCUl and the vector pTG6624 linearized by ClaI. The final construction Adp53FCUl contains the genome of Ad5 deleted from most of the regions El (nucleotides 459 to 3328) and E3 (nucleotides 28249
<Desc/Clms Page number 32><Desc / Clms Page number 32>
à 30758) et en lieu et place de El, une cassette d'expression du bicistron p53-FCUl placé sous le contrôle du promoteur précoce CMV et des séquences d'épissage hybrides -globine/Ig. Les particules adénovirales sont générées par transfection dans une lignée de cellules 293 (ATCC CRL1573) qui complémentent la fonction El. at 30758) and instead of E1, an expression cassette for the bicistron p53-FCU1 placed under the control of the CMV early promoter and of the hybrid splicing sequences -globin / Ig. The adenoviral particles are generated by transfection into a 293 cell line (ATCC CRL1573) which complement the E1 function.
EXEMPLE 3 : de l'adénovirus exprimant le gène de fusion FCU1 (AdFCUl). EXAMPLE 3 Adenovirus expressing the FCU1 fusion gene (AdFCU1).
Le fragment XhoI-MluI de pCI-neoFCUI (décrit dans la demande de brevet français No. 98. 05054) renfermant le gène de fusion FCU1 est isolé et introduit dans le vecteur pTG6600 linéairisé par XhoI-MhuI pour donner le vecteur de transfert pTG6600FCUl. Comme décrit précédemment, la recombinaison homologue entre le fragment PacI-BstEII portant FCU1 et isolé de pTG6600FCUl et le vecteur pTG6624 linéarisé par ClaI permet de générer le vecteur adénoviral pTG6624FCUl délété des régions El et E3 et comportant à la place de El le gène FCU1 placé sous le contrôle du promoteur CMV et des séquences d'épissage hybrides P-globine/Ig. Les particules adénovirales sont générées par transfection dans une lignée de cellules 293 (ATCC CRL1573) qui complémentent la fonction El. The XhoI-MluI fragment of pCI-neoFCUI (described in French patent application No. 98,05054) containing the FCU1 fusion gene is isolated and introduced into the vector pTG6600 linearized by XhoI-MhuI to give the transfer vector pTG6600FCU1. As described above, the homologous recombination between the PacI-BstEII fragment carrying FCU1 and isolated from pTG6600FCUl and the vector pTG6624 linearized by ClaI makes it possible to generate the adenoviral vector pTG6624FCUl deleted from the El and E3 regions and comprising in place of El the FCU1 gene placed under the control of the CMV promoter and the P-globin / Ig hybrid splicing sequences. The adenoviral particles are generated by transfection into a 293 cell line (ATCC CRL1573) which complement the E1 function.
EXEMPLE 4 : Infection par les adénovirus AdFCUl, Adp53 et Adp53FCU1. EXAMPLE 4 Infection with the adenoviruses AdFCUl, Adp53 and Adp53FCU1.
4. 1 Résultats in vitro. 4. 1 In vitro results.
Les constructions adénovirales des exemples précédents sont utilisées pour infecter in vitro 3 lignées cellulaires tumorales : - la lignée tumorale humaine SW480 (adénocarcinome de colon/ATCC CCL-228) dont le gène p53 n'est pas fonctionnel, - la lignée cellulaire tumorale humaine LoVo (adénocarcinome de colon/ ATCC CCL-229) dont le gène p53 est fonctionnel et The adenoviral constructs of the previous examples are used to infect in vitro 3 tumor cell lines: - the human tumor line SW480 (colon adenocarcinoma / ATCC CCL-228) whose p53 gene is not functional, - the human tumor cell line LoVo (colon adenocarcinoma / ATCC CCL-229) whose p53 gene is functional and
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- la lignée mélanome de souris B16(FO) (ATCC CRL- 6322)
Les cellules sont infectées (MOI de 1 pour SW480 et LoVo et MOI de 100 pour B16(FO)) puis cultivées en présence ou en absence de prodrogue (5-fluorocytosine (5FC) ou 5fluorouracile (5FU)) à différentes concentrations. Après trypsinisation (à J+10 pour SW480 et à J+8 pour B16(FO)), la viabilité des cellules est évaluée au bleu trypan. Les valeurs reportées correspondent aux moyennes obtenues après 4 comptages. - the mouse melanoma line B16 (FO) (ATCC CRL- 6322)
The cells are infected (MOI of 1 for SW480 and LoVo and MOI of 100 for B16 (FO)) and then cultured in the presence or absence of prodrug (5-fluorocytosine (5FC) or 5fluorouracil (5FU)) at different concentrations. After trypsinization (at D + 10 for SW480 and at D + 8 for B16 (FO)), the viability of the cells is evaluated with trypan blue. The values reported correspond to the means obtained after 4 counts.
En absence de prodrogue (Figures 1 à 3), on observe un effet antiprolifératif des cellules infectées par un adénovirus exprimant p53 (Adp53 et Adp53FCUl) dans les lignées SW480 principalement et plus faiblement dans les lignées B16FO. Toutefois, malgré l'expression de p53 qui induit l'apoptose ou la suppression de la croissance des cellules, aucun effet antiprolifératif n'est pas observé dans la lignée LoVo ; cela indique que la seule administration de p53, notamment dans des cellules tumorales dont le gène p53 est fonctionnel, est insuffisante, voire inopérante, pour permettre la mise en oeuvre d'un protocole de thérapie antitumorale efficace. In the absence of prodrug (Figures 1 to 3), an antiproliferative effect of cells infected with an adenovirus expressing p53 (Adp53 and Adp53FCU1) is observed in the lines SW480 mainly and more weakly in the lines B16FO. However, despite the expression of p53 which induces apoptosis or the suppression of cell growth, no antiproliferative effect is not observed in the LoVo line; this indicates that the only administration of p53, in particular in tumor cells in which the p53 gene is functional, is insufficient, even inoperative, to allow the implementation of an effective antitumor therapy protocol.
Au contraire, on constate qu'en présence de différentes concentrations de prodrogue 5FU (Figures 4 à 6), les cellules infectées par Adp53 sont sensibilisées par rapport aux cellules non infectées ou infectées par un adénovirus non recombinant illustrant ainsi l'action connue de p53 dans la toxicité du 5FU. Toutefois, conformément à la présente invention, on constate également que, de manière surprenante, la présence de FCU1 augmente très sensiblement la toxicité du 5FU dans les cellules (100% correspond à la viabilité des cellules infectées en absence de 5FU) traduisant ainsi un effet clairement synergique des deux types d'agent. On the contrary, it can be seen that in the presence of different concentrations of prodrug 5FU (FIGS. 4 to 6), the cells infected with Adp53 are sensitized compared to the cells not infected or infected with a non-recombinant adenovirus, thus illustrating the known action of p53. in the toxicity of 5FU. However, in accordance with the present invention, it is also found that, surprisingly, the presence of FCU1 very significantly increases the toxicity of 5FU in the cells (100% corresponds to the viability of the infected cells in the absence of 5FU) thus translating an effect clearly synergistic of the two types of agent.
Les figures 7 à 9 illustrent les résultats analogues obtenus en utilisant 5FC comme prodrogue. Figures 7 to 9 illustrate similar results obtained using 5FC as a prodrug.
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Ces résultats mettent en évidence qu'il existe une synergie entre les produits d'expression de FCU1 et de p53 pour l' induction de la mortalité lorsque le 5FC ou le 5FU sont utilisés comme prodrogues. These results demonstrate that there is a synergy between the expression products of FCU1 and of p53 for the induction of mortality when 5FC or 5FU are used as prodrugs.
4. 2 Résultats in vivo. 4.2 Results in vivo.
Des cellules B16F(0) (3.105 cellules) sont injectées par voie sous cutanée à 4 groupes de 8 souris immunocompétentes B6D2 à JO. Dès que les tumeurs deviennent palpables (environ J+9), les constructions adénovirales comprenant le gène p53 (Adp53) ou les gènes p53 et FCU1 (Adp53FCUl) ou une construction adénovirale non recombinante (Ad null) sont injectées à une dose de 5.108 UI à trois jours consécutifs (J+9, J+10 et J+ll). A partir de J+9,1 ml d'une solution saline à 0,9% ou 1 ml d'une solution de 5-FC à 1% sont injectées par voie intrapéritonéale, deux fois par jour. Les résultats présentés à la figure 10 mettent en évidence une augmentation du taux de survie des souris dans lesquelles a été injecté l'Adp53FCUl et qui ont été traitées au 5-FC . B16F (0) cells (3.105 cells) are injected subcutaneously into 4 groups of 8 immunocompetent B6D2 mice at OJ. As soon as the tumors become palpable (around D + 9), the adenoviral constructs comprising the p53 gene (Adp53) or the p53 and FCU1 genes (Adp53FCUl) or a non-recombinant adenoviral construct (Ad null) are injected at a dose of 5.108 IU to three consecutive days (D + 9, D + 10 and D + ll). From D + 9.1 ml of 0.9% saline solution or 1 ml of 1% 5-FC solution are injected intraperitoneally, twice a day. The results presented in FIG. 10 show an increase in the survival rate of the mice in which the Adp53FCU1 was injected and who were treated with 5-FC.
<Desc/Clms Page number 35> <Desc / Clms Page number 35>
LISTE DE SEQUENCES (1) INFORMATION GENERALE: (i) DEPOSANT : (A) NOM : S.A. SEQUENCE LIST (1) GENERAL INFORMATION: (i) DEPOSITOR: (A) NAME: S.A.
(B) RUE: 11 rue de Molsheim (C) VILLE : (E) PAYS : (F) CODE POSTAL : (G) TELEPHONE : 88 27 91 00 (H) TELECOPIE : 88 27 91 41 (ii) TITRE DE L'INVENTION : destinée à la mise en #uvre d'un traitement antitumoral ou antiviral chez un mammifère. (B) STREET: 11 rue de Molsheim (C) CITY: (E) COUNTRY: (F) POSTAL CODE: (G) TELEPHONE: 88 27 91 00 (H) FAX: 88 27 91 41 (ii) TITLE OF THE INVENTION: intended for the implementation of an antitumor or antiviral treatment in a mammal.
(iii) NOMBRE DE SEQUENCES : (iv) FORME LISIBLE PAR ORDINATEUR: (A) TYPE DE SUPPORT : (B) ORDINATEUR : PC compatible (C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS (D) LOGICIEL: PatentIn Release #1.0, Version #1.25 (OEB) (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 1 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : acides aminés (B) TYPE : aminé (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : protéine(iii) HYPOTHETIQUE : NON (vi) ORIGINE: (A) ORGANISME : cerevisiae (vii) SOURCE IMMEDIATE: (B) CLONE : UPRTase delta 35 (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 1 :
Met Ala Ser Glu Pro Phe Lys Asn Val Tyr Leu Leu Pro Gln Thr Asn
1 5 10 15
Gln Leu Leu Gly Leu Tyr Thr Ile Ile Arg Asn Lys Asn Thr Thr Arg
20 25 30
Pro Asp Phe Ile Phe Tyr Ser Asp Arg Ile Ile Arg Leu Leu Val Glu
35 40 45
Glu Gly Leu Asn His Leu Pro Val Gln Lys Gln Ile Val Glu Thr Asp
50 55 60
Thr Asn Glu Asn Phe Glu Gly Val Ser Phe Met Gly Lys Ile Cys Gly
65 70 75 80
Val Ser Ile Val Arg Ala Gly Glu Ser Met Glu Gln Gly Leu Arg Asp
85 90 95 (iii) NUMBER OF SEQUENCES: (iv) COMPUTER-READABLE FORM: (A) TYPE OF MEDIA: (B) COMPUTER: Compatible PC (C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS / MS-DOS (D) SOFTWARE: PatentIn Release # 1.0, Version # 1.25 (EPO) (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 1: (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: amino acids (B) TYPE: amino (D) CONFIGURATION: (ii ) TYPE OF MOLECULE: protein (iii) HYPOTHETIC: NO (vi) ORIGIN: (A) ORGANISM: cerevisiae (vii) IMMEDIATE SOURCE: (B) CLONE: UPRTase delta 35 (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: ID NO: 1:
Met Ala Ser Glu Pro Phe Lys Asn Val Tyr Leu Leu Pro Gln Thr Asn
1 5 10 15
Gln Leu Leu Gly Leu Tyr Thr Ile Ile Arg Asn Lys Asn Thr Thr Arg
20 25 30
Pro Asp Phe Ile Phe Tyr Ser Asp Arg Ile Ile Arg Leu Leu Val Glu
35 40 45
Glu Gly Leu Asn His Leu Pro Val Gln Lys Gln Ile Val Glu Thr Asp
50 55 60
Thr Asn Glu Asn Phe Glu Gly Val Ser Phe Met Gly Lys Ile Cys Gly
65 70 75 80
Val Ser Ile Val Arg Ala Gly Glu Ser Met Glu Gln Gly Leu Arg Asp
85 90 95
<Desc/Clms Page number 36> <Desc / Clms Page number 36>
Cys Cys Arg Ser Val Arg Ile Gly Lys Ile Leu Ile Gln Arg Asp Glu
100 105 110
Glu Thr Ala Leu Pro Lys Leu Phe Tyr Glu Lys Leu Pro Glu Asp Ile
115 120 125
Ser Glu Arg Tyr Val Phe Leu Leu Asp Pro Met Leu Ala Thr Gly Gly
130 135 140
Ser Ala Ile Met Ala Thr Glu Val Leu Ile Lys Arg Gly Val Lys Pro
145 150 155 160
Glu Arg Ile Tyr Phe Leu Asn Leu Ile Cys Ser Lys Glu Gly Ile Glu
165 170 175
Lys Tyr His Ala Ala Phe Pro Glu Val Arg Ile Val Thr Gly Ala Leu
180 185 190
Asp Arg Gly Leu Asp Glu Asn Lys Tyr Leu Val Pro Gly Leu Gly Asp
195 200 205
Phe Gly Asp Arg Tyr Tyr Cys Val
210 215 (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 2 : (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE: (A) LONGUEUR : 373acides aminés (B) TYPE : aminé (D) CONFIGURATION : (ii) TYPE DE MOLECULE : protéine(iii) HYPOTHETIQUE : NON (iii) ANTI-SENS : (vi) ORIGINE: (A) ORGANISME : cerevisiae (vii) SOURCE IMMEDIATE: (B) CLONE : de fusion fcyl::furl delta 35 (FCU1) (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE : ID NO: 2 :
Met Val Thr Gly Gly Met Ala Ser Lys Trp Asp Gln Lys Gly Met Asp
1 5 10 15
Ile Ala Tyr Glu Glu Ala Ala Leu Gly Tyr Lys Glu Gly Gly Val Pro
20 25 30
Ile Gly Gly Cys Leu Ile Asn Asn Lys Asp Gly Ser Val Leu Gly Arg
35 40 45
Gly His Asn Met Arg Phe Gln Lys Gly Ser Ala Thr Leu His Gly Glu
50 55 60
Ile Ser Thr Leu Glu Asn Cys Gly Arg Leu Glu Gly Lys Val Tyr Lys
65 70 75 80 Cys Cys Arg Ser Val Arg Ile Gly Lys Ile Leu Ile Gln Arg Asp Glu
100 105 110
Glu Thr Ala Leu Pro Lys Leu Phe Tyr Glu Lys Leu Pro Glu Asp Ile
115 120 125
Ser Glu Arg Tyr Val Phe Leu Leu Asp Pro Met Leu Ala Thr Gly Gly
130 135 140
Ser Ala Ile Met Ala Thr Glu Val Leu Ile Lys Arg Gly Val Lys Pro
145 150 155 160
Glu Arg Tyr Island Phe Leu Asn Leu Cys Island Ser Lys Glu Gly Glu Island
165 170 175
Lys Tyr His Ala Ala Phe Pro Glu Val Arg Ile Val Thr Gly Ala Leu
180 185 190
Asp Arg Gly Leu Asp Glu Asn Lys Tyr Leu Val Pro Gly Leu Gly Asp
195 200 205
Phe Gly Asp Arg Tyr Tyr Cys Val
210 215 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2: (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE: (A) LENGTH: 373 amino acids (B) TYPE: amino (D) CONFIGURATION: (ii) TYPE OF MOLECULE: protein (iii ) HYPOTHETICAL: NO (iii) ANTI-SENSE: (vi) ORIGIN: (A) ORGANISM: cerevisiae (vii) IMMEDIATE SOURCE: (B) CLONE: fcyl fusion: furl delta 35 (FCU1) (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: ID NO: 2:
Met Val Thr Gly Gly Met Ala Ser Lys Trp Asp Gln Lys Gly Met Asp
1 5 10 15
Ile Ala Tyr Glu Glu Ala Ala Leu Gly Tyr Lys Glu Gly Gly Val Pro
20 25 30
Ile Gly Gly Cys Leu Ile Asn Asn Lys Asp Gly Ser Val Leu Gly Arg
35 40 45
Gly His Asn Met Arg Phe Gln Lys Gly Ser Ala Thr Leu His Gly Glu
50 55 60
Ile Ser Thr Leu Glu Asn Cys Gly Arg Leu Glu Gly Lys Val Tyr Lys
65 70 75 80
<Desc/Clms Page number 37><Desc / Clms Page number 37>
Asp Thr Thr Leu Tyr Thr Thr Leu Ser Pro Cys Asp Met Cys Thr Gly
85 90 95 Ala Ile Ile Met Tyr Gly Ile Pro Arg Cys Val Val Gly Glu Asn Val
100 105 110 Asn Phe Lys Ser Lys Gly Glu Lys Tyr Leu Gln Thr Arg Gly His Glu
115 120 125 Val Val Val Val Asp Asp Glu Arg Cys Lys Lys Ile Met Lys Gln Phe
130 135 140 Ile Asp Glu Arg Pro Gln Asp Trp Phe Glu Asp Ile Gly Glu Ala Ser 145 150 155 160 Glu Pro Phe Lys Asn Val Tyr Leu Leu Pro Gln Thr Asn Gln Leu Leu
165 170 175 Gly Leu Tyr Thr Ile Ile Arg Asn Lys Asn Thr Thr Arg Pro Asp Phe
180 185 190 Ile Phe Tyr Ser Asp Arg Ile Ile Arg Leu Leu Val Glu Glu Gly Leu
195 200 205 Asn His Leu Pro Val Gln Lys Gln Ile Val Glu Thr Asp Thr Asn Glu
210 215 220 Asn Phe Glu Gly Val Ser Phe Met Gly Lys Ile Cys Gly Val Ser Ile 225 230 235 240 Val Arg Ala Gly Glu Ser Met Glu Gln Gly Leu Arg Asp Cys Cys Arg
245 250 255 Ser Val Arg Ile Gly Lys Ile Leu Ile Gln Arg Asp Glu Glu Thr Ala
260 265 270 Leu Pro Lys Leu Phe Tyr Glu Lys Leu Pro Glu Asp Ile Ser Glu Arg
275 280 285 Tyr Val Phe Leu Leu Asp Pro Met Leu Ala Thr Gly Gly Ser Ala Ile
290 295 300 Met Ala Thr Glu Val Leu Ile Lys Arg Gly Val Lys Pro Glu Arg Ile 305 310 315 320 Tyr Phe Leu Asn Leu Ile Cys Ser Lys Glu Gly Ile Glu Lys Tyr His
325 330 335 Ala Ala Phe Pro Glu Val Arg Ile Val Thr Gly Ala Leu Asp Arg Gly
340 345 350 Leu Asp Glu Asn Lys Tyr Leu Val Pro Gly Leu Gly Asp Phe Gly Asp
355 360 365 Arg Tyr Tyr Cys Val
370Asp Thr Thr Leu Tyr Thr Thr Leu Ser Pro Cys Asp Met Cys Thr Gly
85 90 95 Ala Ile Ile Met Tyr Gly Ile Pro Arg Cys Val Val Gly Glu Asn Val
100 105 110 Asn Phe Lys Ser Lys Gly Glu Lys Tyr Leu Gln Thr Arg Gly His Glu
115 120 125 Val Val Val Val Asp Asp Glu Arg Cys Lys Lys Ile Met Lys Gln Phe
130 135 140 Ile Asp Glu Arg Pro Gln Asp Trp Phe Glu Asp Ile Gly Glu Ala Ser 145 150 155 160 Glu Pro Phe Lys Asn Val Tyr Leu Leu Pro Gln Thr Asn Gln Leu Leu
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195 200 205 Asn His Leu Pro Val Gln Lys Gln Ile Val Glu Thr Asp Thr Asn Glu
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325 330 335 Ala Ala Phe Pro Glu Val Arg Ile Val Thr Gly Ala Leu Asp Arg Gly
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370
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