ES2885476T3

ES2885476T3 - Firmas moleculares para uso en diagnóstico y análisis de respuesta al tratamiento de enfermedades autoinmunes

Info

Publication number: ES2885476T3
Application number: ES16787742T
Authority: ES
Inventors: Geoffrey Johnston; Carrie G Wager; Huo Li; Ann Ranger
Original assignee: UCB Biopharma SRL; Biogen MA Inc
Current assignee: UCB Biopharma SRL; Biogen MA Inc
Priority date: 2015-10-05
Filing date: 2016-10-04
Publication date: 2021-12-13
Anticipated expiration: 2036-10-04
Also published as: EP3359688B1; DK3359688T3; US20180265925A1; EP3359688A1; WO2017060242A1; US11142794B2

Abstract

Método para monitorizar el tratamiento del lupus eritematoso sistémico (LES) en un paciente con un antagonista CD40 o CD40L que comprende al menos los pasos de a) determinar la expresión de al menos 2 biomarcadores como se definen en la Tabla 2 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con LES, b) determinar la expresión de dichos al menos 2 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y c) decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en las etapas a) y b).

Description

DESCRIPCIÓN

Firmas moleculares para uso en diagnóstico y análisis de respuesta al tratamiento de enfermedades autoinmunes CAMPO DE LA INVENCIÓN

La presente invención se refiere a firmas moleculares que pueden usarse para identificar pacientes diagnosticados con lupus eritematoso sistémico para el tratamiento con un antagonista de CD40L tal como un anticuerpo anti-CD40L o un fragmento de unión del mismo. La presente invención se refiere además a métodos de monitorización de pacientes diagnosticados con lupus eritematoso sistémico que están sometidos a tratamiento con un antagonista de CD40L tal como un anticuerpo anti-CD40L o un fragmento de unión del mismo.

ANTECEDENTES DE LA INVENCIÓN

Las enfermedades autoinmunes comprenden clásicamente más de 80 enfermedades crónicas que afectan aproximadamente al 5% -8% de la población general. Se ha logrado un progreso considerable en la comprensión del sistema inmunológico durante las últimas décadas, lo que ha dado como resultado una mejor apreciación del papel de moléculas coestimuladoras como CD40 y su ligando CD154 / CD40L, que también se conoce como ligando CD40 (CD40L). Además, también está surgiendo un papel para tales moléculas en la patogénesis de enfermedades mucho más comunes como la aterosclerosis, lo que podría expandir en gran medida la aplicabilidad de las terapias dirigidas a esta molécula.

CD154 / CD40L se expresa en linfocitos T activados y, a través de interacciones con su receptor CD40, desempeña un papel fundamental en la regulación de la interacción entre las células T y otros tipos de células. Se sabe que el par CD154 / CD40L-CD40 interviene en la ayuda de las células T afines a las células B, lo que da como resultado una mayor proliferación y diferenciación de células B, producción de anticuerpos y cambio de clase de isotipo. CD154 / CD40L también promueve la formación de centros germinales en los ganglios linfáticos y la supervivencia de las células B. CD154 / CD40L, por lo tanto, contribuye a la potenciación de enfermedades autoinmunes y es muy prometedor como objetivo terapéutico en enfermedades autoinmunes como el lupus eritematoso sistémico (LES), artritis reumatoide, espondilitis anquilosante, nefritis lúpica, enfermedad de Goodpasture, síndrome de Sjogren, polimiositis, dermatomiositis, psoriasis, arteritis temporal, síndrome de Churg-Strauss, esclerosis múltiple, síndrome de Guillain-Barré, mielitis transversa, miastenia gravis, enfermedad de Addison, tiroiditis, enfermedad celíaca, colitis ulcerosa, sarcoidosis, anemia hemolítica, púrpura trombocitopénica idiopática, enfermedad de Behget, cirrosis biliar primaria y diabetes autoinmune, y se ha demostrado que el bloqueo de CD154 / CD40L es muy eficaz en varios sistemas modelo inflamatorios y autoinmunitarios. También se ha sugerido que CD154 / CD40L desempeña un papel en los aspectos inflamatorios de la aterosclerosis y los trastornos neurodegenerativos.

CD154 / CD40L, anteriormente denominado gp39, TRAP o TBAM, es una glicoproteína de membrana de 39 kDa de tipo II de la familia TNF. CD154 / CD40L es un polipéptido de 261 aminoácidos, que consta de un dominio extracelular de 215 aminoácidos, una región transmembrana de 24 aminoácidos y una cola citoplasmática de 22 aminoácidos. Como otros miembros de la familia TNF, CD154 / CD40L forma una estructura trimérica y promueve como tal la trimerización del receptor, esto es, CD40. La interacción CD154 / CD40L-CD40 se estabiliza mediante residuos cargados, es decir, las cadenas básicas en CD154 / CD40L y las ácidas en CD40.

Hu5c8 (también conocido como BG-9588 o replizumab), un anticuerpo IgG1 monoclonal humanizado contra CD154 / CD40L humano, se evaluó en ensayos clínicos para una variedad de enfermedades autoinmunes. Los resultados de un estudio de fase 2 en pacientes con lupus eritematoso sistémico (LES) fueron alentadores, con reducciones significativas en los biomarcadores de la enfermedad, incluidos los niveles circulantes de autoanticuerpos, así como aumentos marcados en los niveles de C3. Sin embargo, a pesar de esta prometedora evidencia de efecto clínico, se interrumpió el desarrollo adicional de hu5c8 debido a una mayor incidencia de eventos trombóticos cardiovasculares emergentes del tratamiento. Hu5c8 se administró por vía intravenosa a una dosis de 20 mg / kg administrada cada 2 semanas durante tres dosis, y luego cada 4 semanas durante otras cuatro dosis (siete dosis en total) (Boumpas y col., Arthritis Rheum. Marzo de 2003; 48 (3): 719-27) El mecanismo por el cual hu5c8 induce efectos trombóticos en humanos sigue sin estar claro, aunque se ha demostrado un aumento de la activación plaquetaria tras la exposición a hu5c8 in vitro (Meyer et al., Blood (ASH Annual Meeting Abstracts) 2006 108: Abstract 1516).

El lupus eritematoso sistémico (LES) se ha clasificado como una enfermedad autoinmune que puede afectar a muchos sistemas orgánicos, como un trastorno reumático inflamatorio multisistémico o como una enfermedad vascular del colágeno. En Europa y los Estados Unidos de América, las estimaciones del número de personas afectadas oscilan entre 24 y 65 casos por 100.000 habitantes en algunos estudios. Los factores predisponentes para el lupus incluyen la raza asiática o africana y el género femenino. El 90% de los pacientes con lupus son mujeres y la aparición de los síntomas suele ocurrir entre los 15 y los 50 años. El lupus eritematoso sistémico no parece ser una enfermedad homogénea, sino un grupo de síndromes relacionados, con presentaciones, grados de afectación del sistema corporal y curso clínico muy variables. Las características clínicas que se observan comúnmente en el LES son trastornos sanguíneos y linfáticos (linfadenopatía), trastornos cardíacos (p. ej., miocardiopatía, derrame pericárdico, pericarditis), trastornos oculares (p. ej. queratoconjuntivitis seca), trastornos gastrointestinales (p. ej., ulceración de la boca, pancreatitis, peritonitis, faringitis), trastornos (por ejemplo, malestar, fatiga, pirexia, pérdida de peso), trastornos del sistema nervioso (por ejemplo, accidente cerebrovascular, trastorno cognitivo, migraña, dolor de cabeza, neuropatía periférica), trastornos musculoesqueléticos y del tejido conjuntivo (por ejemplo, artralgia, artritis (no erosiva ni destructiva), fibromialgia , fractura, miositis, osteonecrosis, osteoporosis, osteopenia), trastornos psiquiátricos (p. ej., trastorno afectivo, ansiedad, depresión, psicosis, neurosis, trastorno mental debido a una enfermedad médica, trastorno psicótico), trastornos renales y urinarios (p. ej. Nefritis lupus, síndrome nefrótico), respiratorios, torácicos y mediastínicos (p. ej., pleuresía, neumonitis, hipertensión arterial pulmonar), trastornos de la piel y del tejido subcutáneo (p. ej. alopecia, lupus eritematoso cutáneo, dermatitis, eritema generalizado, livedo reticularis, paniculitis, erupción maculopapular, lupus eritematoso sistémico, urticaria) y trastornos vasculares (por ejemplo, hipertensión, fenómeno de Raynaud, telangiectasia, trombocitopenia, tromboflebitis, vasculitis). Además, la mayoría de los pacientes con LES presentan patrones de anticuerpos anormales, incluida la presencia de anticuerpos antinucleares (ANA) y anti-ADN bicatenario (anti-dsDNA).

El curso clínico del LES es episódico, con brotes recurrentes al aumentar la discapacidad subyacente y el daño orgánico. Los corticosteroides son el pilar del tratamiento, pero están asociados con una gran cantidad de efectos secundarios que se observan con mayor frecuencia durante el uso a largo plazo. Otros fármacos utilizados en el contexto de una actividad de bajo nivel incluyen analgésicos, fármacos antiinflamatorios no esteroideos (AINE), esteroides locales y fármacos antipalúdicos (p. ej., cloroquina o hidroxicloroquina), con medicamentos de apoyo habituales que incluyen vasodilatadores (bloqueantes de los canales de calcio, inhibidores de la enzima convertidora de angiotensina [IECA]) para la hipertensión renal o el síndrome de Raynaud, tratamientos locales para erupciones o síndromes de la mucosa seca, transfusiones, globulina intravenosa (iv) para citopenias, anticonvulsivos, medicamentos antimigraña, anticoagulantes para trombosis recurrentes, y antidepresivos. Corticosteroides en dosis altas, p. ej., De 0,5 a 1,0 mg / kg / día de prednisona oral (o equivalente) o de 500 mg a 1 g de metilprednisolona en pulsos diarios i.v., se utilizan para tratar los brotes agudos de LES, e inmunosupresores (p. ej., azatioprina, ciclofosfamida, metotrexato, micofenolato de mofetilo, leflunomida) generalmente utilizados en casos moderados y graves cuando otros tratamientos son ineficaces o para limitar o prevenir el daño orgánico importante a largo plazo por la enfermedad o el uso de corticosteroides ('reducción de esteroides'). Este arsenal terapéutico actual es inadecuado debido a la eficacia limitada y / o el perfil de eventos adversos. A pesar de la gran necesidad médica de nuevas terapias eficaces para el LES con un buen perfil de seguridad, el desarrollo de dichas terapias ha demostrado ser particularmente difícil y muchos candidatos terapéuticos han fracasado. En 2011 belimumab, el primer fármaco para el tratamiento del LES en 50 años, fue aprobado por la FDA, sin embargo, la proporción de pacientes que responden a este tratamiento es relativamente baja. Además, a principios de este año, otro candidato, epratuzumab, fracasó en un ensayo clínico de fase III en lEs .

La vía coestimuladora CD40-CD154 / CD40L también se ha implicado en la patogénesis de trastornos neurodegenerativos y neuromusculares y el tratamiento con compuestos que interfieren con la vía parece ser útil para el tratamiento de trastornos neurodegenerativos y neuromusculares (WO 2010/065819). Los trastornos neurodegenerativos y neuromusculares incluyen enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, esclerosis lateral amiotrófica, miastenia grave, neuropatía motora multifocal, esclerosis lateral primaria, atrofia muscular espinal, enfermedad de Kennedy y ataxia espinocerebelosa. La esclerosis lateral amiotrófica (ELA), a veces llamada enfermedad de Lou Gehrig, es un trastorno neurológico progresivo y fatal caracterizado por atrofia de las fibras musculares que resulta de la degeneración de las neuronas motoras en la columna vertebral y el cerebro. La ELA afecta a aproximadamente 30,000 ciudadanos estadounidenses y solo alrededor del 10% de los casos se clasifican como la forma familiar de ELA. Aunque la ELA se caracteriza por la pérdida de neuronas motoras en la médula espinal que produce atrofia muscular, la enfermedad también se manifiesta con cambios en el transporte de axones, agregación de proteínas, excitotoxicidad, astrocitosis, disfunción mitocondrial, activación microglial y remodelación sináptica. La activación microglial, la astrocitosis y la presencia de células inflamatorias infiltrantes desde la periferia están bien descritas. Hay acumulación de depósitos inmunorreactivos de 1gG en la médula espinal de pacientes con ELA, infiltración de linfocitos, células dendríticas, monocitos y macrófagos en la médula espinal en la e La . Aunque el papel de la infiltración de células inmunitarias no se comprende bien, trabajos recientes sugerirían que las poblaciones de células T infiltrantes son neuroprotectoras y no citotóxicas. Aunque la ELA tiene un componente inmune mediado por la activación de microglia y astrocitos, no se considera un trastorno autoinmune.

WO 2006/125117 A2 describe un método para identificar un sujeto que tiene una enfermedad inflamatoria o una enfermedad autoinmune (por ejemplo, LES) que responde al tratamiento con un agente terapéutico anti-CD40. En dicho método, el nivel de al menos un biomarcador se determina seleccionado de CD40 de superficie celular, CD40L de superficie celular, CD40 circulante y CD40L circulante.

Existe una necesidad en la técnica de nuevos tratamientos eficaces de trastornos autoinmunitarios, inflamatorios, neurodegenerativos y neuromusculares. Se ha demostrado que la vía de interacción CD40-CD40L (CD154) es relevante para la fisiopatología de los trastornos autoinmunitarios, inflamatorios, neurodegenerativos y neuromusculares. Actualmente se está desarrollando un fragmento Fab' de anticuerpo PEGilado anti-CD40L (CDP7657, también conocido como dapirolizumab pegol (DZP) para afecciones inflamatorias y autoinmunes como el lupus eritematoso sistémico. Se ha probado en ensayos de fase I en individuos y pacientes sanos (Tocoian, A et al., Lupus (2015) Vol 24: páginas 1045-56).

Existe la necesidad de nuevos tratamientos de trastornos autoinmunitarios, inflamatorios, neurodegenerativos y neuromusculares que bloqueen la vía de interacción CD40 / CD40L, como con anticuerpos o fragmentos de anticuerpos que se unen específicamente a CD154 / CD40L o CD40 administrados en una dosis segura y eficaz. También existe la necesidad de métodos para identificar pacientes que padecen trastornos autoinmunitarios, inflamatorios, neurodegenerativos y neuromusculares que respondan a un tratamiento que se dirija a la ruta CD40 / CD40L.

OBJETIVOS Y RESUMEN

Es un objetivo de la presente invención proporcionar métodos inter alia para identificar pacientes diagnosticados con LES que mostrarán una mayor probabilidad de responder a un tratamiento que se dirige a la vía CD40 / CD40L. Otro objetivo de la presente invención es proporcionar métodos para la monitorización de pacientes diagnosticados con LES y que se someten a un tratamiento que se dirige a la vía CD40 / CD40L con la intención de que los resultados obtenidos mediante dicha monitorización se puedan utilizar, por ejemplo, para decidir sobre más desarrollo de un fármaco candidato o intervención terapéutica y / o para indicar una respuesta temprana al tratamiento y, por lo tanto, si el tratamiento con una terapia modificadora de la enfermedad, por ejemplo, un bloqueador de la vía CD40 / CD40L está indicado y / o debe continuarse porque es de beneficio para ese sujeto.

La invención se refiere a las realizaciones expuestas en las reivindicaciones.

En este documento también se describen los siguientes aspectos:

En un primer aspecto, la divulgación se refiere a un método para controlar el tratamiento de una enfermedad autoinmune en un paciente con un antagonista de CD40 o CD40L que comprende al menos las etapas de

a) determinar la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2; la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3; o la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 4 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con dicha enfermedad autoinmune,

b) determinar la expresión de dichos al menos 2 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b),

donde si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2 o Tabla 4 está en el rango de control después del tratamiento con el CD40 del antagonista de CD40L, indica que el paciente responde a la terapia y donde si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3 aumenta transitoriamente en comparación con el nivel de control en el paciente antes de la terapia, lo que indica que el paciente responde a la terapia.

En un segundo aspecto, la divulgación se refiere a un método para controlar el tratamiento de una enfermedad autoinmune en un paciente con un antagonista de CD40 o CD40L que comprende al menos las etapas de

a) determinar la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2; y la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con dicha enfermedad autoinmune,

b) determinar la expresión de dichos al menos 4 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b) donde si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2 está en el rango de control después del tratamiento con el CD40 del antagonista de CD40L indica que el paciente responde a la terapia y en el que si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3 aumenta transitoriamente en comparación con el nivel de control en el paciente antes de la terapia, indica que el paciente responde a la terapia.

En un tercer aspecto, la divulgación se refiere a un método para controlar el tratamiento de una enfermedad autoinmune en un paciente con un antagonista de CD40 o CD40L que comprende al menos las etapas de

a) determinar la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3; y la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 4 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con dicha enfermedad autoinmune,

b) determinar la expresión de dichos al menos 4 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b) en donde si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 4 está en el rango de control después del tratamiento con el CD40 del antagonista de CD40L indica que el paciente responde a la terapia y en el que si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3 aumenta transitoriamente en comparación con el nivel de control en el paciente antes de la terapia, indica que el paciente responde a la terapia.

En un cuarto aspecto, la divulgación se refiere a un método para controlar el tratamiento de una enfermedad autoinmune en un paciente con un antagonista de CD40 o CD40L que comprende al menos las etapas de

a) determinar la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2; y la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 4 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con dicha enfermedad autoinmune,

b) determinar la expresión de dichos al menos 4 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b) en donde si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2 o Tabla 4 está en el rango de control posterior al tratamiento con el antagonista CD40 de CD40L indica que el paciente responde a la terapia.

En un quinto aspecto, la divulgación se refiere a un método para controlar el tratamiento de una enfermedad autoinmune en un paciente con un antagonista de CD40 o CD40L que comprende al menos las etapas de

a) determinar la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2; y la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3; y la expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 4 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con dicha enfermedad autoinmune,

b) determinar la expresión de dichos al menos 6 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b) en donde si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 2 o Tabla 4 está en el rango de control posterior al tratamiento con el CD40 del antagonista de CD40L indica que el paciente responde a la terapia y en el que si el nivel de expresión de al menos 2 biomarcadores como se define en la Tabla 3 aumenta transitoriamente en comparación con el nivel de control en el paciente antes de la terapia indica que el paciente responde a la terapia.

En una realización de estos aspectos, la divulgación contempla determinar preferiblemente la expresión de al menos 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se define en la Tabla 2; la expresión de al menos 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 3; y / o la expresión de al menos 3 o 4 biomarcadores como se define en la Tabla 4 dependiendo de a qué aspecto se refiere el método respectivo.

Para todas las realizaciones del primer al quinto aspecto, la divulgación considera que una disminución al menos transitoria de la expresión de al menos 2, 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se define en la Tabla 2 es indicativa de una respuesta al tratamiento por el antagonista de CD40 o CD40L; que un aumento al menos transitorio de la expresión de al menos 2, 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 3 es indicativo de una respuesta favorable al tratamiento (es decir, participación de la diana) por parte del antagonista de CD40 o CD40L; y que una disminución al menos transitoria de la expresión de al menos 2, 3 o 4 biomarcadores como se define en la Tabla 4 es indicativa de una respuesta al tratamiento por el antagonista de CD40 o CD40L. Tal expresión aumentada o disminuida transitoria, es decir, expresión que aumenta o disminuye durante una duración de entre 1 a 20 semanas, puede medirse en cualquier punto dentro de aproximadamente 1 a aproximadamente 20 semanas después del inicio del tratamiento.

En un sexto aspecto, la presente divulgación contempla el uso de métodos para monitorizar de acuerdo con el primer al quinto aspecto, incluidas las realizaciones del mismo, para guiar el tratamiento de una enfermedad autoinmune en un paciente con un antagonista de CD40 o CD40L. Durante el tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L, la expresión de los biomarcadores de la Tabla 2, Tabla 3 y / o Tabla 4 se puede controlar como se describe para el primer al quinto aspecto a continuación y, en base a los resultados, se puede decidir si el tratamiento con el antagonista de CD40 o CD40L se continúa o se interrumpe.

En un séptimo aspecto, la divulgación se refiere a un método para identificar a un paciente que padece una enfermedad autoinmune que probablemente se beneficie de la terapia con un antagonista de CD40 o CD40L, que comprende al menos los pasos:

a) determinar la expresión de al menos un biomarcador como se define en la Tabla 1; o la expresión de al menos un biomarcador como se define en la Tabla 5; en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente al que se le ha diagnosticado dicha enfermedad autoinmune,

b) determinar la expresión de dicho al menos un biomarcador en una muestra de ácido nucleico de control, y decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b) en donde si el nivel de expresión de al menos 1 biomarcador como se define en la Tabla 1 o Tabla 5 es mayor que el de un control (por ejemplo, un paciente que no responde) antes de la terapia indica que es probable que el paciente responda a la terapia.

En un octavo aspecto, la divulgación se refiere a un método para identificar a un paciente que padece una enfermedad autoinmune que probablemente se beneficie de una terapia con un antagonista de CD40 o CD40L, que comprende al menos los pasos:

a) determinar la expresión de al menos un biomarcador como se define en la Tabla 1; y la expresión de al menos un biomarcador como se define en la Tabla 5 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con dicha enfermedad autoinmune,

b) determinar la expresión de dicho al menos un biomarcador en una muestra de ácido nucleico de control, y c) decidir si dicho paciente responderá con una mayor probabilidad al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b) donde si el nivel de expresión de al menos 1 biomarcador como se define en la Tabla 1 o la Tabla 5 es más alta que la de un control (por ejemplo, un paciente que no responde) antes de la terapia, indica que es probable que el paciente responda a la terapia.

En una realización de este séptimo y octavo aspecto, la divulgación contempla determinar preferiblemente la expresión de al menos 1, 2, 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 1; y / o la expresión de al menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 o 10 biomarcadores como se define en la Tabla 5 dependiendo de a qué aspecto se refiere el método respectivo.

Para todas las realizaciones del séptimo y octavo aspecto, la divulgación considera que un mayor o mayor nivel de expresión en la base de referencia (antes del tratamiento) de al menos 1, 2, 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 1 en comparación con una muestra de control que no responde o una muestra de voluntarios sanos indica que un paciente mostrará una respuesta clínica al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L con una probabilidad más alta que un paciente que muestra un nivel de expresión esencialmente el mismo que el observado en un paciente control sin respuesta; de manera similar, la divulgación considera que un nivel de expresión aumentado o más alto en la base de referencia de al menos 1,2, 3, 4, 6, 7, 8, 9 o 10 biomarcadores como se define en la Tabla 5 en comparación con un control no respondedor o con una muestra de voluntarios sanos indica que un paciente mostrará una respuesta clínica al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L con una probabilidad más alta que un paciente que muestra un nivel de expresión esencialmente igual al de un control sano o que un control no-respondedor.

Para todas las realizaciones del primero al octavo, la divulgación considera preferiblemente a los pacientes que padecen lupus eritematoso sistémico. El lupus eritematoso sistémico puede haberse diagnosticado en estos pacientes según los criterios de clasificación del American College of Rheumatology (Ines, L. et al., Arthritis Care & Research (2015), 67 (8), 1180-1185).

Otro noveno aspecto de la divulgación se refiere a un grupo de biomarcadores para su uso en la identificación de pacientes que padecen lupus eritematoso sistémico elegibles para tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L que comprende 1, 2, 3, 4 o 5 biomarcadores de la Tabla 1; y / o 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 o 10 biomarcadores de la Tabla 5. Es posible que se haya diagnosticado lupus eritematoso sistémico en dichos pacientes de acuerdo con los criterios de clasificación del American College of Rheumatology.

Para todas las realizaciones del primer al noveno aspecto, el cambio en la expresión de la muestra se refiere a la expresión de los respectivos biomarcadores en las muestras de control. Tales muestras de control pueden reflejar los niveles de expresión de los respectivos biomarcadores en sujetos sanos o en pacientes que también han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune como el LES y se sabe que responden al tratamiento con antagonistas de la vía anti-CD40 (controles de respuesta conocidos) o se sabe que no responden al tratamiento con antagonistas anti-CD40 (controles no-respondedores conocidos). Tales muestras son particularmente útiles cuando se mide el nivel de expresión de un biomarcador en un paciente antes del tratamiento para determinar si sus niveles de expresión son más altos o bajos que un control adecuado.

En otra realización, las muestras de control reflejan los niveles de expresión de los respectivos biomarcadores en pacientes que también han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune como el LES pero que muestran un perfil de expresión diferente antes del inicio del tratamiento o que no reciben tratamiento con una sustancia terapéuticamente activa o que reciben placebo. Dichas muestras de control son particularmente adecuadas para la medición de biomarcadores en las Tablas 2 y 3 y se usan como controles cuando se analizan muestras de pacientes para determinar la capacidad de un antagonista para inhibir la ruta.

Se puede considerar que ocurre un cambio en la expresión si la diferencia en la expresión frente a la muestra de control es al menos aproximadamente 30%, al menos aproximadamente 40%, al menos aproximadamente 50%, al menos aproximadamente 60%, al menos aproximadamente 80%, en al menos aproximadamente el 100%, al menos aproximadamente el 200%, al menos aproximadamente el 300% o incluso más pronunciado. Entre los valores mencionados anteriormente, se prefieren cambios de al menos aproximadamente 200% o más.

En un décimo aspecto, la presente divulgación se refiere a un antagonista de CD40 o CD40L para su uso en el tratamiento de un paciente que padece una enfermedad autoinmune administrando a dicho paciente un antagonista de CD40 o CD40L y

a) en el que dicho paciente ha sido sometido a cualquiera de los métodos de acuerdo con el séptimo u octavo aspecto y sus realizaciones, o

b) en el que dicho paciente se somete a cualquiera de los métodos según el primer al quinto aspecto y sus realizaciones.

En un undécimo aspecto, la presente divulgación se refiere a un antagonista de CD40 o CD40L para su uso en el tratamiento de un paciente que padece una enfermedad autoinmune administrando a dicho paciente un antagonista de CD40 o CD40L y

a) en el que dicho paciente ha sido sometido a cualquiera de los métodos de acuerdo con el séptimo u octavo aspecto y sus realizaciones, y

En un duodécimo aspecto, la presente divulgación se refiere a un kit, composición de diagnóstico o dispositivo para realizar cualquiera de los métodos del primer al octavo aspecto y sus realizaciones que comprenden al menos cebadores y / o sondas selectivas para determinar la expresión de cualquiera de los biomarcadores de las Tablas 1, 2, 3, 4 o 5 y opcionalmente un antagonista de CD40 o CD40L.

Para todas las realizaciones del primer al duodécimo aspecto, la divulgación considera preferiblemente anticuerpos anti-CD40L o fragmentos de unión de los mismos como antagonista de CD40L y más preferiblemente el fragmento de anticuerpo anti-CD40L PEGilado CDP7657.

Para todas las realizaciones del primer al duodécimo aspecto, la divulgación considera preferiblemente anticuerpos anti-CD40 o fragmentos de unión de los mismos como antagonistas de CD40.

En todas las realizaciones de todos los aspectos descritos en este documento, la muestra puede estar fuera del cuerpo humano o animal.

LEYENDA DE LAS FIGURAS

Figura 1: Ilustración de cómo se identificaron la importancia de los cambios en las firmas moleculares. Los genes individuales se agruparon en un 'nivel funcional' en función de su célula de origen o su función biológica, por ejemplo, células plasmáticas, células B, genes que responden al interferón (IFN). Este enfoque se utilizó luego para permitir la identificación de "patrones consistentes" en los perfiles y para ignorar efectos aislados, pero estadísticamente significativos. Los niveles de expresión para cada gen después del tratamiento con CDP7657 o placebo se compararon en cada punto de tiempo con la base de referencia. Luego, la diferencia en el cambio de veces (FC) entre los grupos tratados y placebo se evaluó para determinar la significación estadística. Se destacaron valores de p nominalmente estadísticamente significativos de <0,0894. El valor de P de 0,0894 se derivó para lograr una tasa de falsos positivos del 5% en cada uno de los grupos funcionales. Los valores p coloreados indican un cambio estadísticamente significativo en la expresión como se describe en el Ejemplo 1.

Figura 2: Genes de células plasmáticas: representación de la media aritmética (+/- SEM) del cambio logarítmico de la expresión desde el valor inicial durante el período de tratamiento de 12 semanas. La línea superior es el grupo placebo, la línea inferior es el grupo tratado con CDP7657.

Figura 3: La firma de células plasmáticas (Tabla 2) se determinó mediante agrupación por consenso: ilustración del cambio de veces (FC) promedio log2 de la expresión de la línea base predicha para 7 genes de células plasmáticas durante 12 semanas de tratamiento. La línea continua gruesa indica CDP7657. La línea punteada gruesa indica placebo. Los sujetos individuales se indican con líneas estrechas sólidas (tratadas) y discontinuas (placebo).

Figura 4: Genes de células B: representación de la media aritmética (+/- SEM) del cambio logarítmico de la expresión desde el valor inicial durante el período de tratamiento de 12 semanas. La línea inferior es placebo, la línea superior es CDP7657.

Figura 5: Números de células B: representa el cambio de veces (FC) desde el valor inicial en el número absoluto de células B en sangre en las semanas 1, 2, 4 y 8.

Figura 6: Correlación de los cambios en el número de células B con el ARN de CD20 (MS4A1): representa el cambio de veces (FC) en el número absoluto de células B (#) en la semana 2 y 4 y el cambio de veces (FC) del nivel de transcripción de CD20 (ARNm de CD20) en las semanas 2 y 4 en relación con la base de referencia.

Figura 7: Correlación de los cambios en el número de células B con el ARN de CD19: representa el cambio de veces (FC) en el número absoluto de células B (#) y el cambio de veces (FC) del nivel de transcripción de CD19 (CD19) en las semanas 2 y 4 con respecto a la base de referencia.

Figura 8: Genes de respuesta al interferón: representa los cambios de expresión desde la base de referencia de los genes que responden al interferón para cada individuo estratificado por criterios de respuesta clínica durante el período de tratamiento de 12 semanas. La línea continua oscura es Placebo y la línea clara está tratada con CDP7657. En algunos pacientes no fue posible determinar una puntuación BICLA (sin clasificar).

Figura 9: Predictores basales de respuesta clínica: representa la diferencia en los niveles de expresión antes del tratamiento en pacientes que fueron tratados con CDP7657 y que fueron clasificados como respondedores o no respondedores a BICLA. En algunos pacientes no fue posible determinar una puntuación BICLA (sin clasificar) Figura 10: Elevación de genes de células plasmáticas en sujetos con LES al inicio del estudio en relación con HV: representa la diferencia en los niveles de expresión antes del tratamiento en pacientes (LES) frente a voluntarios sanos (HV). Valor de p derivado de la prueba t para datos no apareados.

Figura 11: categorización esquemática de los efectos observados.

DESCRIPCION DETALLADA DE LA INVENCION

El siguiente resumen no pretende definir todos los aspectos de la invención, y los aspectos adicionales se describen en otras secciones, como la Descripción Detallada. El documento completo está destinado a relacionarse como una divulgación unificada, y debe entenderse que se contemplan todas las combinaciones de características descritas en este documento, incluso si la combinación de características no se encuentran juntas en la misma oración, párrafo o sección de este documento. La presente divulgación, como se describe ilustrativamente a continuación, puede practicarse de manera adecuada en ausencia de cualquier elemento o elementos, limitación o limitaciones, que no se divulguen específicamente en el presente documento.

Los términos técnicos se utilizan por su sentido común a menos que se indique lo contrario. Si se transmite un significado específico a ciertos términos, las definiciones de los términos se darán a continuación en el contexto en el que se utilizan los términos.

Cuando el término "que comprende" se usa en la presente descripción y reivindicaciones, no excluye otros elementos. Para los propósitos de la presente divulgación, el término "que consiste de" se considera que es una realización preferida del término "que comprende de". Si en lo sucesivo se define que un grupo comprende al menos un cierto número de realizaciones, también debe entenderse que describe un grupo que preferiblemente consta sólo de estas realizaciones.

Donde se usa un artículo indefinido o definido cuando se hace referencia a un sustantivo singular, por ejemplo, “un", "una" o "el", esto incluye un plural de ese sustantivo a menos que se indique específicamente algo más.

El término "aproximadamente" denota un intervalo de precisión que el experto en la técnica comprenderá para garantizar aún el efecto técnico de la característica en cuestión. El término típicamente indica una desviación del valor numérico indicado de ± 10%, y preferiblemente de ± 5%. Cuando se usa el término "aproximadamente", la solicitud también describe el empleo del valor exacto especificado. Cuando se hace referencia a valores de puntos, la solicitud también informa sobre dichos valores que se emplean, lo mismo ocurre con los puntos finales de los rangos.

Como se usa en este documento, los términos "tratamiento", "tratar" y similares, se refieren a la obtención de un efecto farmacológico y / o fisiológico deseado. El efecto puede ser terapéutico en términos de curación parcial o completa de una enfermedad y / o efecto adverso atribuible a la enfermedad. Por tanto, el tratamiento cubre cualquier tratamiento de una enfermedad en un mamífero, particularmente en un ser humano, e incluye inhibir la enfermedad, es decir, detener su desarrollo; y aliviar la enfermedad, es decir, provocar la regresión de la enfermedad.

Una "cantidad terapéuticamente eficaz" se refiere a la cantidad de un antagonista de CD40 o CD40L tal como anticuerpos anti-CD40 o anti-CD40L o fragmentos de unión de los mismos que, cuando se administra a un mamífero u otro sujeto para tratar una enfermedad, es suficiente para efectuar tal efecto en el tratamiento para la enfermedad. La cantidad terapéuticamente eficaz variará dependiendo del antagonista de CD40 o CD40L tal como anticuerpos anti-CD40 o anti-CD40L o fragmentos de unión de los mismos, la enfermedad y su gravedad y la edad, peso, etc., del sujeto a tratar.

El término "anticuerpo" o "anticuerpos" como se usa en este documento, se refiere a moléculas de inmunoglobulina típicamente compuestas por cuatro cadenas polipeptídicas, dos cadenas pesadas (H) y dos cadenas ligeras (L) interconectadas por enlaces disulfuro. Cada cadena pesada está compuesta por una región variable de cadena pesada (abreviada aquí como HCVR o VH) y una región constante de cadena pesada. La región constante de la cadena pesada se compone de tres dominios, CHI, CH2 y CH3. Una región constante de cadena pesada también puede tener un cuarto dominio constante, CH4. Cada cadena ligera está compuesta por una región variable de cadena ligera (abreviada aquí como LCVR o VL) y una región constante de cadena ligera. La región constante de la cadena ligera está compuesta por un dominio, c L. Las regiones VH y VL pueden subdividirse además en regiones de hipervariabilidad, denominadas regiones determinantes de complementariedad (CDR), intercaladas con regiones que están más conservadas, denominadas regiones marco (FR). Cada VH y VL se compone de tres CDR y cuatro Fr , dispuestos desde el extremo amino al extremo carboxi en el siguiente orden: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. Los límites exactos de estos CDR se han definido de manera diferente según los diferentes sistemas. El sistema descrito por Kabat no solo proporciona un sistema de numeración de residuos inequívoco aplicable a cualquier región variable de un anticuerpo, sino que también proporciona límites de residuos precisos que definen las tres CDR. Estas CDR pueden denominarse ^cD^rde Kabat. Chothia y col. encontraron que ciertas sub-porciones dentro de las CDR de Kabat adoptan conformaciones del esqueleto peptídico casi idénticas, a pesar de tener una gran diversidad a nivel de secuencia de aminoácidos (Chothia et al. (1987) Mol. Biol. 196: 901-917; Chothia et al. (1989) Nature 342: 877-883.). Estas regiones pueden denominarse CDR de Chothia, que tienen límites que se superponen con las CDR de Kabat. Otros límites que definen los CDR que se superponen con los CDR de Kabat han sido descritos por Padlan (1995) FASEB J. 9: 133-139 y MacCallum (1996) J. Mol. Biol. 62 (5): 732-45. Aún otras definiciones de límites de CDR pueden no seguir estrictamente uno de los sistemas descritos en este documento, pero no obstante se superpondrán con las CDR de Kabat, aunque pueden acortarse o alargarse a la luz de predicciones o hallazgos experimentales de que determinados residuos o grupos de residuos o incluso CDR completos no impactan significativamente en la unión del antígeno. Los métodos usados en este documento pueden utilizar CDR definidas de acuerdo con cualquiera de estos sistemas, aunque ciertas realizaciones usan CDR definidas por Kabat o Chothia. El término inmunoglobulina o inmunoglobulinas se usa como sinónimo de "anticuerpo" o "anticuerpos", respectivamente. El término "anticuerpo" o "anticuerpos" como se usa en este documento incluye, pero no se limita a, anticuerpos recombinantes que se generan mediante tecnologías recombinantes como se conoce en la técnica. Un "anticuerpo" o "anticuerpos" puede ser de cualquier origen, incluso de especies de mamíferos como humanos, primates no humanos (p. ej., humanos tal como de chimpancés, babuinos, rhesus o monos cinomolgos), roedores (p. ej. o conejillo de indias), especies caprinas, bovinas o equinas; o de especies de aves como anticuerpos de pollo o de especies de peces como anticuerpos de tiburón. "Anticuerpo" o "anticuerpos" incluyen anticuerpos de cualquier isotipo, incluidos los isotipos humanos IgA1, IgA2, IgD, IgG1, IgG2a, IgG2b, IgG3, IgG4, IgE e IgM y variantes modificadas de los mismos. El anticuerpo de la presente está dirigido contra un "antígeno" de interés. Preferiblemente, el antígeno es un polipéptido biológicamente importante y la administración del anticuerpo a un mamífero que padece una enfermedad o trastorno puede resultar en un beneficio terapéutico en ese mamífero. Sin embargo, también se contemplan los anticuerpos dirigidos contra antígenos no polipeptídicos. Cuando el antígeno es un polipéptido, puede ser una molécula transmembrana (por ejemplo, un receptor) o un ligando como un factor de crecimiento o una citocina.

El término "fragmento de anticuerpo" o "fragmentos de anticuerpo" como se usa en este documento, se refiere a un anticuerpo de origen natural que carece de uno o más dominios o uno o más aminoácidos. Normalmente, el fragmento de anticuerpo contiene la unión de antígeno completa o la región variable de la misma de tal anticuerpo de origen natural. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpos incluyen cualquier anticuerpo que no tenga porción Fc. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpos también incluyen Fab, Fab ', F(ab')², Fragmentos Fv y scFv, Fab-Fv, Fab-dsFv, Fab-scFv, Fab-scFc, Fab-scFv estabilizado con disulfuro, scFv, scFv-scFc, dsscFv, dsscFv-scFc; diacuerpos; triacuerpos; tetracuerpos; minicuerpos; anticuerpos que consisten esencialmente en uno, dos o tres dominios de inmunoglobulina tales como Domain Antibodies ™; anticuerpos monocatenarios, fragmentos VHH y VNAR; variantes biespecíficas, triespecíficas, tetraespecíficas o multiespecíficas de cualquiera de las anteriores (ver por ejemplo Holliger y Hudson, 2005, Nature Biotech. 23 (9): 1126-1136; Adair y Lawson, 2005, Drug Design Reviews - Online 2 (3), 209-217). El término "fragmento de anticuerpo" o "fragmentos de anticuerpo" como se usa en este documento también se refiere a anticuerpos de camélidos (por ejemplo, de camellos o llamas tales como Nanobodies ™ ) y derivados de los mismos. Los fragmentos de anticuerpos son bien conocidos en la técnica (Holliger y Hudson, 2005). Se han desarrollado varias técnicas para la producción de fragmentos de anticuerpos y se conocen en la técnica (Glover y Humphreys, 2004). El formato Fab-Fv se dio a conocer por primera vez en WO2009/040562 y las versiones estabilizadas con disulfuro del mismo, el Fab-dsFv se dio a conocer por primera vez en WO2010/035012. Una forma estabilizada con disulfuro de Fab-scFv se describió en WO2013/068571. Los formatos de anticuerpos que comprenden formatos scFc se describieron por primera vez en WO2008/012543. Otros fragmentos de anticuerpos para usar en la presente invención incluyen los fragmentos Fab y Fab' descritos en las solicitudes de patentes internacionales WO2005/003169, WO2005/003170 y WO2005/003171. Los anticuerpos multivalentes pueden comprender múltiples especificidades, p. ej. biespecífica o puede ser monoespecífica (ver por ejemplo WO92/22583 y WO05/113605). Un ejemplo de este último es un Tri-Fab (o TFM) como se describe en WO92/22583.

El término "fragmento de anticuerpo" o "fragmentos de anticuerpo" como se usa en este documento, comprende fragmentos de anticuerpos humanos, humanizados, primatizados y quiméricos.

El término "antagonista de CD40", como se usa en este documento, se refiere a un compuesto que puede interferir con la ruta de señalización de CD40L-CD40. Puede incluir pequeñas moléculas inhibidoras, ARNip, ARN antisentido, etc. Los anticuerpos anti-CD40 o fragmentos de unión de los mismos son antagonistas de CD40 preferidos.

El término "anticuerpo anti-CD40", como se usa en el presente documento (o un "anticuerpo que neutralizó la actividad de CD40"), pretende hacer referencia a un anticuerpo cuya unión a CD40 da como resultado una atenuación, como por ejemplo una reducción del 50% de la actividad, o inhibición de la actividad biológica de CD40. Esta inhibición de la actividad biológica de CD40 se puede evaluar midiendo uno o más indicadores de la actividad biológica de CD40. Estos indicadores de la actividad biológica de CD40 pueden evaluarse mediante uno o más ensayos de varios estándares in vitro o in vivo conocidos en la técnica. En la técnica se encuentran disponibles ejemplos de anticuerpos anti-CD40, tales como, por ejemplo, lucatumumab actualmente en desarrollo clínico en mieloma múltiple.

El término "antagonista de CD40L", como se usa en este documento, se refiere a un compuesto que puede interferir con la ruta de señalización de CD40L-CD40. Puede incluir pequeñas moléculas inhibidoras, ARNip, ARN antisentido, etc. Los anticuerpos anti-CD40L o fragmentos de unión de los mismos son antagonistas de CD40L preferidos.

El término "anticuerpo anti-CD40L", como se usa en el presente documento (o un "anticuerpo que neutralizó la actividad de CD40L"), pretende hacer referencia a un anticuerpo cuya unión a CD40L da como resultado una atenuación, como por ejemplo una reducción del 50% de la actividad, o inhibición de la actividad biológica de CD40L. Esta inhibición de la actividad biológica de CD40L se puede evaluar midiendo uno o más indicadores de la actividad biológica de CD40L. Estos indicadores de la actividad biológica de CD40L pueden evaluarse mediante uno o más ensayos de varios estándares in vitro o in vivo conocidos en la técnica. Por ejemplo, los ensayos in vitro podrían medir la capacidad de los anticuerpos para inhibir la unión de una proteína CD40 purificada a células o líneas celulares que expresan CD40L o un ensayo de activación de células B dependientes de células T, que implica el cocultivo de células T que expresan CD40L o una línea de células T con células B o una línea de células B y control de la expresión de la molécula de adhesión intercelular 1 (ICAM-1) en estas últimas células. Los ensayos in vivo podrían incluir investigar la respuesta inmune a un antígeno como la toxina del tétanos o la hemocianina de lapa californiana en una especie adecuada como el primate no humano si el anticuerpo reconoce esta especie o en ratones si el anticuerpo reconoce esta especie. Si el anticuerpo reconoce CD40L de ratón, entonces podría evaluarse en un modelo de ratón de LES como los ratones NZB / W o MRL / 1pr. Dichos anticuerpos también se denominan anticuerpos neutralizantes.

Un anticuerpo anti-CD40L o un fragmento de unión del mismo puede tener una constante de disociación para la unión monovalente a CD40L de K^d<4.55 pM o menos como <4 pM, <3 pM o <2 pM. El término "KD", como se usa en este documento, pretende hacer referencia a la constante de disociación de una interacción anticuerpo-antígeno particular. La constante de disociación puede referirse a unión monovalente o unión bivalente. Preferiblemente, la constante de disociación se determina mediante resonancia de plasmón superficial. El término "resonancia de plasmón de superficie", como se usa en este documento, se refiere a un fenómeno óptico que permite el análisis de interacciones bioespecíficas en tiempo real mediante la detección de alteraciones en las concentraciones de proteínas dentro de una matriz de biosensor, por ejemplo, utilizando el sistema BIAcore (Pharmacia Biosensor AB, Uppsala, Suecia y Piscataway, Nueva Jersey). Para obtener más descripciones, consulte el Ejemplo 1 y Jonsson, U., et al. (1993) Ann. Biol. Clin. 51:19-26; Jonsson, U., et al. (1991) Biotechniques 11:620-627; Johnsson, B., et al. (1995) J. Mol. Recognit. 8:125-131; y Johnsson, B., et al. (1991) Anal. Biochem. 198:268-277.

Un anticuerpo anti-CD40L que es el más preferido en todos los aspectos y realizaciones que se describen a continuación, a menos que se indique lo contrario, es CDP7657, que también se designa como dapirolizumab pegol o DZP. Debe entenderse que CD7657 es un fragmento de anticuerpo Fab 'PEGilado.

El término "PEGilación", "polietilenglicol" o "PEG", como se usa en este documento, se refiere a la unión, p. ej. mediante enlace covalente, de un compuesto de polialquilenglicol o un derivado del mismo, con o sin agentes de acoplamiento o derivatización con restos de acoplamiento o activación (por ejemplo, con tiol, triflato, tresilato, azirdina, oxirano, o preferiblemente con un resto maleimida, por ejemplo, PEG -maleimida). Otros compuestos de polialquilenglicol apropiados incluyen, pero no se limitan a, maleimido monometoxi PEG, polipropilenglicol de PEG activado, pero también polímeros cargados o neutros de los siguientes tipos: dextrano, ácidos colomínicos u otros polímeros basados en carbohidratos, polímeros de aminoácidos y biotina y otros derivados de reactivos de afinidad. CDP7657 se divulga en WO 2008/118356. CDP7657 tiene una región variable de cadena ligera (LCVR) con CDR1, CDR2 y CDR3 que tienen la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 47, 48 y 49, respectivamente, y una región variable de cadena pesada (HCVR) con CDR1, CDR2 y CDR3 que tiene la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NO: 50, 51 y 52, respectivamente. CDP7657 tiene la secuencia de cadena VL mostrada en SEQ ID NO: 53 y la secuencia de cadena VH mostrada en SEQ ID NO: 54 CDP7657 tiene la secuencia de cadena ligera mostrada en SEQ ID NO: 55 y las secuencias de cadena pesada mostradas en SEQ ID NO: 56. CDP7657 está PEGilado en una cisteína en la región de bisagra modificada como se describe en WO 2008/118356. Un grupo maleimida está unido covalentemente a un solo grupo tiol en una cisteína en la región de bisagra modificada; un residuo de lisina está unido covalentemente al grupo maleimida; y un polímero de metoxipoli (etilenglicol) que tiene un peso molecular de aproximadamente 20 KDa se une a cada uno de los grupos amina en el residuo de lisina. El peso molecular total de todo el PEG unido covalentemente al Fab 'monovalente es por tanto de aproximadamente 40 KDa.

Alternativamente, dicho fragmento de anticuerpo anti-CD40L es un formato Fab-Fv, en el que dicho Fab se une a CD40L y tiene una región variable de cadena ligera (LCVR) con CDR1, CDR2 y CDR3 que tienen la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 47, 48 y 49, respectivamente, y una región variable de cadena pesada (HCVR) con CDR1, CDR2 y CDR3 que tienen la secuencia de aminoácidos de las SEQ ID NO: 50, 51 y 52, respectivamente. En una realización adicional, dicho Fab se une a CD40L y tiene la secuencia de cadena VL mostrada en SEQ ID NO: 53 y la secuencia de cadena VH mostrada en SEQ ID NO: 54, alternativamente dicho Fab se une a CD40L y tiene la secuencia de cadena ligera mostrada en SEQ ID NO: 55 y las secuencias de cadena pesada mostradas en SEQ ID NO: 56. En una realización particular adicional, dicho FabFv anti-CD40L tiene una región Fv que se une a la albúmina de suero.

Siempre que se haga referencia a un anticuerpo anti-CD40L o fragmento de unión del mismo, esto se refiere preferiblemente a un anticuerpo anti-CD40L aislado o fragmento de unión del mismo, en el que dicho anticuerpo anti-CD40L o fragmento de unión del mismo comprende

una región variable de cadena ligera que comprende una CDR1 seleccionada de SEQ ID No .: 47 o secuencias al menos 90% idénticas a la misma, una CDR2 seleccionada de SEQ ID No .: 48 o secuencias al menos 90% idénticas a la misma, y una CDR3 seleccionada de SEQ ID No .: 49 o secuencias al menos 90% idénticas a las mismas; y / o una región variable de cadena pesada que comprende una CDR1 seleccionada de SEQ ID No .: 50 o secuencias al menos 90% idénticas a la misma, una CDR2 seleccionada de SEQ ID No .: 51 o secuencias al menos 90% idénticas a la misma, y / o una CDR3 seleccionada de SEQ ID No .: 52 o secuencias al menos 90% idénticas a las mismas. "Identidad", como se usa en este documento, indica que en cualquier posición particular en las secuencias alineadas, el residuo de aminoácido es idéntico entre las secuencias. Grados de La identidad se puede calcular fácilmente, p. ej. utilizando el software BLAST ™ disponible de NCBI (Altschul, S.F. et al. 1990, J. Mol. Biol. 215: 403-410;Gish, W & States, D.J. 1993, Nature Genet. 3: 266-272. Madden, T.L. et al., 1996, Meth. Enzymol. 266: 131-141; Altschul, S.F. et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25: 3389-3402; Zhang, J. k Madden, T.L. 1997, Genome Res. 7: 649-656).

La identidad de CDRL1, CDRL2, CDRL3, CDRH1, CDRH2 y CDRH3 con las SEQ ID Nos .: 47, 48, 49, 50, 51 y 52 respectivamente puede ser al menos del 90%, pero también puede ser mayor, como al menos 95%, 96%, 97%, 98% o 99% con una preferencia opcional por identidades superiores. Pueden seleccionarse posiciones de diferente identidad de acuerdo con consideraciones de similitud.

Un anticuerpo anti-CD40L o un fragmento de unión del mismo también puede comprender

una región variable de cadena ligera que comprende SEQ ID No .: 53 o secuencias al menos 80% idénticas a la misma, y / o

una región variable de cadena pesada que comprende SEQ ID No .: 54 o secuencias al menos 80% idénticas a la misma.

La identidad de VL y VH con las SEQ ID Nos .: 53 y 54, respectivamente, puede ser al menos del 80%, pero también puede ser mayor, como al menos el 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% o 99% con una preferencia opcional por identidades superiores. Pueden seleccionarse posiciones de diferente identidad de acuerdo con consideraciones de similitud. Se apreciará que en términos de identidad puede haber más flexibilidad para las regiones marco frente a las CDR.

una cadena ligera que comprende SEQ ID No .: 55 o secuencias al menos 70% idénticas a la misma, y / o una cadena pesada que comprende SEQ ID No .: 56 o secuencias al menos 70% idénticas a la misma.

La identidad de la cadena ligera y la cadena pesada con las SEQ ID Nos.: 55 y 56, respectivamente, puede ser al menos del 70%, pero también puede ser mayor, como al menos el 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% o 99% con una preferencia opcional por identidades superiores. Pueden seleccionarse posiciones de diferente identidad de acuerdo con consideraciones de similitud. Se apreciará que en términos de identidad puede haber más flexibilidad para las regiones marco frente a las CDR e incluso más flexibilidad para las regiones constantes.

Los anticuerpos anti-CD40L descritos anteriormente o los fragmentos de unión de los mismos pueden pegilarse (como se define por CDR, regiones variables o secuencias de cadena completa) en una cisteína en la región de bisagra modificada, como se describe en WO 2008/118356. Por ejemplo, un grupo maleimida puede unirse covalentemente a un solo grupo tiol en una cisteína en la región de bisagra modificada; a continuación, un residuo de lisina puede unirse covalentemente al grupo maleimida; y se puede unir un polímero de metoxipoli (etilenglicol) que tiene un peso molecular de aproximadamente 20 KDa a cada uno de los grupos amina en el residuo de lisina. El peso molecular total del PEG completo unido covalentemente al anticuerpo anti-CD40L o al fragmento de unión del mismo es por tanto de aproximadamente 40 KDa.

Los anticuerpos serán preferiblemente anticuerpos monoclonales o fragmentos de unión de los mismos.

El término "índice BILAG" o "puntuación BILAG" como se usa en este documento, se refiere a la puntuación e índice del Grupo de Evaluación del Lupus de las Islas Británicas, respectivamente (Symmons DP y col. Q J Med. Noviembre de 1988; 69 (259): 927-37). El índice BILAG se utilizó para evaluar la eficacia del tratamiento en pacientes con LES en el estudio SL0007. Es un índice completo para medir la actividad de la enfermedad del LES. Para los estudios se utilizó la versión de 2004 del índice BILAG. Esta versión consta de 86 preguntas en 8 sistemas corporales (general, mucocutáneo, neurológico, musculoesquelético, cardiovascular y respiratorio, vasculitis, renal y hematológico). Algunas de las preguntas se basaron en la historia del paciente, algunas en los hallazgos del examen y otras en los resultados de laboratorio. La puntuación de cada sistema corporal varía de E a A, siendo A la actividad de enfermedad más grave. La interpretación de las puntuaciones del sistema corporal es la siguiente: A ("Active") = enfermedad gravemente activa (suficiente para requerir un tratamiento modificador de la enfermedad, por ejemplo, más de 20 mg / día de prednisona, inmunosupresores, citoxicos); B ("Beware") = enfermedad moderadamente activa (solo requiere terapia sintomática, por ejemplo, menos de o igual a 20 mg / día de prednisona o medicamentos antipalúdicos; C ("Contentment") = enfermedad leve estable (sin indicación de cambios en tratamiento); D = enfermedad previamente activa, pero ninguna actualmente; E = sin actividad previa de la enfermedad. Cuando las puntuaciones del sistema alfabético de órganos y cuerpos de BILAG se convierten en valores numéricos y se suman (utilizando la regla donde cada BILAG A = 9, cada BIlAg B = 3, cada BILAG C = 1, y cada BILAG D o E vale 0), esto se conoce como puntaje total de BILAG.

El término "puntuación SLEDAI" o índice "SLEDAI" se refiere a la puntuación / índice de actividad de la enfermedad de lupus eritematoso sistémico, respectivamente (Hawker y col., J Rheumatol. 1993).

El término "puntuación SRI" o índice "SRI" se refiere a la puntuación / índice del índice de respuesta al lupus eritematoso sistémico (Furie RA y col., Arthritis Rheum. 2009).

El término "BICLA" es un criterio de valoración combinado de la Evaluación combinada del lupus (BICLA) basada en BILAG (Wallace y col., Arthritis Rheum 2011; 63 (S10): S885).

BICLA se desarrolló sobre la base de los aportes de un panel de expertos que evaluó las características de los índices de actividad de la enfermedad (IAD) que se utilizan comúnmente en los ensayos de LES y la experiencia previa con IAD.

Requiere que los pacientes cumplan con los criterios de respuesta a través de tres herramientas de evaluación:

(1) el índice BILAG-2004

(2) el índice SLEDAI y

(3) una evaluación global del médico (PGA).

Los que responden a BICLA deben lograr una mejora en la actividad de la enfermedad BILAG en los ocho sistemas corporales sin empeoramiento en BILAG u otros índices de actividad de la enfermedad en el mismo momento, y sin falla del tratamiento en ningún momento.

Se realizó un estudio de fase clínica I (SL0014) con CDP7657 en pacientes serológicamente positivos afectados por lupus eritematoso sistémico (LES), véase el Ejemplo 1 para más detalles. Durante el estudio, se tomaron muestras de ácido ribonucleico de sangre completa y se analizó la expresión de genes.

Este análisis reveló que el siguiente grupo de genes muestra un aumento al inicio del estudio en pacientes con LES que se clasificaron como respondedores clínicos BICLA al tratamiento con CDP7657 después de 12 semanas (ver también la Figura 9) en comparación con los no respondedores BICLA al tratamiento con CDP7657:

Tabla 1

Por lo tanto, en una realización, la divulgación pertenece a un método para predecir la capacidad de un sujeto que tiene una enfermedad autoinmune (p. Ej., LES) para responder al tratamiento con un agente que bloquea la vía CD40 / CD40L (p. Ej., CDP7657) midiendo la expresión de al menos uno de ANKYF1, SRRM2, SPG11, NAAA o NAA20 y comparar ese nivel de expresión con un control adecuado. Si el nivel de expresión de uno o más de estos genes en el sujeto es más alto que el nivel en la muestra de control, el sujeto se identifica como uno que probablemente responda al tratamiento con el agente que bloquea la vía CD40 / CD40L. En una realización, el paciente así identificado se trata con el agente (por ejemplo, CDP7657) a una dosis eficaz, por ejemplo, como se describe en el presente documento.

El análisis también reveló que el siguiente grupo de genes relacionados con las células plasmáticas muestra una expresión disminuida en los pacientes con LES tratados con CDP7657 frente a Placebo (ver también las Figuras 2 y 3):

Tabla 2

Se señala que el enfoque de RT-PCR basado en cebadores que se eligió para detectar cambios en la expresión después de la administración de CDP7657 (ver sección de ejemplos) no diferenciaba entre secretores de IGHA1 (ver Tabla 2, SEQ ID No: 11 y 12) o Secretora de IGHA2 (símbolo de Genbank: CHR_HSCHR14_3_CTG1, SEQ ID No: 63 y 64). Por lo tanto, un cambio en la expresión del secretor de IGHA1 también puede indicar un cambio en la expresión del secretor de IGHA2 y siempre que se haga referencia en el contexto de esta descripción a un cambio en la expresión de secretor de IGHA1, se entiende que se refiere también a un cambio en la expresión de secretor de IGHA2.

De manera similar, el enfoque de RT-PCR basado en cebadores que se eligió para detectar cambios en la expresión después de la administración de CDP7657 (ver sección de ejemplos) con cebadores IGHG1_total se diseñó para detectar niveles de transcripción de IGHG1, IGHG2 e IGHG3. Por lo tanto, no diferencia entre secretor de IGHG1 (ver Tabla 2, SEQ ID No: 13 y 14) o secretor de IGHG2 (símbolo de Genbank: CHR_HSCHR14_3_CTG1, SEQ ID No: 57 y 58), secretor de IGHG3 (SEQ ID No: 65 y 66), o formas unidas a la membrana del mismo. Por lo tanto, un cambio en la expresión de, por ejemplo, el IGHG1 secretor también puede resultar en un cambio en la expresión del IGHG1 total, aunque un cambio en el IGHG1 total no necesariamente indicaría un cambio en el IGHG1 secretor y siempre que se haga referencia en el contexto de esta divulgación a un cambio en la expresión de IGHG1 total, se entiende que se refiere a un cambio en la expresión de IGHG1 total, de IGHG2 total y también de IGHG3 total. Las secuencias proporcionadas en SEQ ID No. 21, SEQ ID No.: 59 y SEQ ID No.: 61 abarcan el exón del que se seleccionaron conjuntos de cebadores para la amplificación de ARN que representan el total de IGHG1, el total de IGHG2 y el total de IGHG3, respectivamente.

De manera similar, el enfoque de RT-PCR basado en cebadores que se eligió para detectar cambios en la expresión después de la administración de CDP7657 (ver sección de ejemplos) con cebadores IGHG1_Secretor no diferenciaba entre IGHG1 secretor (ver Tabla 2, SEC ID No: 13 y 14) y IGHG2 secretor (símbolo de Genbank: CHR_HSCHR14_3_CTG1, SEQ ID No: 57 y 58. Por tanto, un cambio en la expresión de IGHG1 secretor también puede indicar un cambio en la expresión de IGHG2 secretor.

El análisis también reveló que el siguiente grupo de genes relacionados con las células B muestra un aumento transitorio de la expresión en pacientes con LES tratados con CDP7657 frente a Placebo (consulte también la Figura 4):

Tabla 3

El análisis también reveló que el siguiente grupo de genes relacionados con el interferón (IFN) muestra una expresión disminuida en los pacientes con LES tratados con CDP7657 frente a placebo y que muestran alguna respuesta clínica (ver también la Figura 8):

Tabla 4

El análisis también reveló que el siguiente grupo de genes relacionados con las células plasmáticas muestra una expresión aumentada en pacientes con LES frente a voluntarios sanos antes del tratamiento (ver también la Figura 10):

Tabla 5

Estos hallazgos abren la puerta a diversas aplicaciones en el contexto del tratamiento de enfermedades autoinmunes como el lupus eritematoso sistémico (LES).

Por ejemplo, el grupo de genes que también pueden denominarse firmas de biomarcadores que se muestran en la Tabla 2, 3 y 4 muestran un cambio de expresión como consecuencia del tratamiento con un anticuerpo anti-CD40L o fragmento de unión del mismo, esto es, CDP7657. Por ejemplo, los genes de la firma de las células plasmáticas, es decir, los genes de la Tabla 2, se regulan negativamente entre dos y cuatro semanas después del tratamiento. Los genes de la firma de las células B, es decir, los genes de la Tabla 3, se regulan positivamente de forma transitoria entre dos y cuatro semanas después de que comienza el tratamiento. Los genes de la firma que responde a IFN, es decir, los genes de la Tabla 4, muestran una expresión disminuida durante las doce semanas posteriores al inicio del tratamiento.

Estos datos también muestran que el grupo de genes que también pueden denominarse firmas de biomarcadores que se muestran en la Tabla 1 y 5 se expresan a un nivel más alto al inicio del tratamiento (antes del tratamiento) en pacientes que probablemente respondan al tratamiento con un anticuerpo anti-CD40L o un fragmento de unión del mismo, esto es, CDP7657 que en el caso de sujetos que no responden al tratamiento con un anticuerpo anti-CD40L. Si uno está desarrollando un antagonista de CD40 o CD40L para su uso en el tratamiento de enfermedades autoinmunes como el LES, por lo tanto, puede usar estos biomarcadores para probar temprano si el compuesto en cuestión realmente ataca al objetivo, CD40 o CD40L, de una manera que sugiera una eficacia potencial. Por tanto, se puede iniciar un ensayo con dicho antagonista de CD40 o CD40L putativo y comprobar si alguno o todos los biomarcadores de la firma de células plasmáticas, es decir, la Tabla 2, están regulados a la baja dentro de las primeras cuatro semanas después de que comienza el tratamiento. De manera similar, se puede iniciar un ensayo con dicho antagonista de CD40 o CD40L putativo y comprobar si alguno o todos los biomarcadores de la firma de células B, es decir, la Tabla 3 se regulan transitoriamente durante las primeras cuatro semanas después de que comienza el tratamiento. Si se producen tales efectos, esto puede tomarse como una indicación de un compromiso adecuado con el objetivo y el ensayo puede continuar y el antagonista de CD40 o CD40L y el compuesto pueden desarrollarse más. Si no es así, se puede detener el ensayo desde el principio. Dado que los genes de la firma de IFN, es decir, la Tabla 4, parecen estar regulados negativamente durante el tratamiento en pacientes que muestran una respuesta clínica, algunos o todos estos genes pueden usarse para verificar si un antagonista de CD40 o CD40L es efectivo en pacientes. Dependiendo del resultado del análisis, se puede continuar el tratamiento (si hay una expresión reducida de los genes de la Tabla 4) o interrumpir el tratamiento si este no es el caso.

b) determinar la expresión de dichos al menos 2 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y c) decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en las etapas a) y b).

Los resultados de dicha monitorización se pueden utilizar para realizar y evaluar ensayos clínicos de antagonistas de CD40 o CD40L como los anticuerpos anti-CD40 o anti-CD40L o fragmentos de unión de éstos o guiar el tratamiento con antagonistas de CD40 o CD40L como anticuerpos anti-CD40 o anti-CD40L o fragmentos de unión de los mismos como se describe más arriba.

La fiabilidad de los resultados de tales métodos de seguimiento y orientación de la terapia aumentará generalmente con el número de genes analizados dentro de una firma de biomarcador. Por tanto, se prefiere determinar la expresión de al menos 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se define en la Tabla 2; la expresión de al menos 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 3; y / o la expresión de al menos 3 o 4 biomarcadores como se define en la Tabla 4. En general, se prefiere determinar la expresión de todos los genes dentro de las firmas de las Tablas 2, 3 o 4. Sin embargo, en lo que respecta a la firma de la célula plasmática que determina la expresión para el no. 1 a 5 de la Tabla 2 puede que ya sea suficiente. De manera similar para la expresión determinante de firma de IFN para el no. 1 a 3 de la Tabla 4 puede que ya sea suficiente.

La divulgación considera que una disminución al menos transitoria de la expresión de al menos 2, 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se define en la Tabla 2 es indicativa de una respuesta al tratamiento por el antagonista de CD40 o CD40L; que un aumento al menos transitorio de la expresión de al menos 2, 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 3 es indicativo de una respuesta al tratamiento por el antagonista de CD40 o CD40L; y que una disminución al menos transitoria de la expresión de al menos 2, 3 o 4 biomarcadores como se define en la Tabla 4 es indicativa de una respuesta al tratamiento por el antagonista de CD40 o CD40L.

Tal expresión aumentada o disminuida debe medirse dentro de aproximadamente 1 a aproximadamente 20 semanas después del inicio del tratamiento, tal como dentro de aproximadamente 1 a aproximadamente 16 semanas después del inicio del tratamiento. Dependiendo de qué biomarcadores se analicen, la medición puede tener lugar preferiblemente dentro de aproximadamente 1 a aproximadamente 12 semanas después del inicio del tratamiento.

Si se consideran los biomarcadores de la Tabla 2, una disminución en la expresión podría indicar el compromiso del objetivo desde aproximadamente 1 a aproximadamente 6 semanas, tal como aproximadamente 2 a aproximadamente 4 semanas. De manera similar, si se consideran los biomarcadores de la Tabla 3, un aumento transitorio en la expresión podría indicar el compromiso del objetivo desde aproximadamente 1 a aproximadamente 6 semanas, tal como aproximadamente 2 a aproximadamente 4 semanas. Por lo tanto, estos biomarcadores podrían usarse para decidir temprano y mucho antes de que se detecte una respuesta clínica si el tratamiento debe continuar o no. Alternativa o adicionalmente, una disminución en la expresión de los biomarcadores de la Tabla 4 podría indicar el compromiso del objetivo e incluso los primeros signos de respuesta clínica durante un período de tratamiento de aproximadamente 12 semanas o más.

Dicho control puede tener lugar en puntos de tiempo seleccionados después de que comience el tratamiento, como 2 semanas, 4 semanas, 6 semanas, 8 semanas, 12 semanas, 16 semanas o 20 semanas, o puede realizarse en partes o durante toda la administración.

El cambio en la expresión en un sujeto antes y después del tratamiento o la diferencia en la expresión entre la que se ve en una muestra de paciente y la que se ve en un control adecuado se refieren ambos a la expresión de los biomarcadores respectivos en las muestras de control. Para todos los aspectos y realizaciones de los mismos, ya que forman parte de la presente divulgación, tales muestras de control pueden reflejar los niveles de expresión de los respectivos biomarcadores en sujetos sanos o en pacientes que también han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune tal como LES y para quienes el estatus de respuesta o de falta de respuesta se ha determinado. En una realización, las muestras de control reflejan los niveles de expresión de los respectivos biomarcadores en pacientes que también han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune como el LES pero que muestran un perfil de expresión diferente antes del inicio del tratamiento o que no reciben sustancias sustancias terapéuticamente activas, por ejemplo, que reciben placebo.

En una realización, relativa al primer al quinto aspecto, los niveles de expresión se refieren a los niveles de expresión de muestras de control de pacientes que han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune tal como LES y que no reciben ningún tratamiento o reciben tratamiento con placebo.

Las fortalezas analíticas o predictivas de los métodos de seguimiento y terapia de guía como se mencionó anteriormente no solo determinan las firmas de la Tabla 2, Tabla 3 o Tabla 4, sino que miden los niveles de expresión para estas firmas en combinación, p. Ej. las firmas de la Tabla 2 y 3, de la Tabla 2 y 4, de la Tabla 3 y 4, o de la Tabla 2, 3 y 4. En general, se centrará en las firmas de la Tabla 2 (marcadores de células plasmáticas) y / o la Tabla 3 (marcadores de células B) si uno está particularmente interesado en una lectura temprana, mientras que uno puede considerar la firma de la Tabla 4 (marcadores de respuesta a IFN) si desea monitorear todo el ensayo y / o está adicionalmente interesado en los efectos de la respuesta clínica.

Como ejemplo, el quinto aspecto mencionado anteriormente se refiere a un método para controlar el tratamiento de una enfermedad autoinmune en un paciente con un antagonista de CD40 o CD40L que comprende al menos las etapas de

b) determinar la expresión de dichos al menos 6 biomarcadores en una muestra de ácido nucleico de control, y c) decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en las etapas a) y b).

Las muestras pueden ser de pacientes que han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune y que no reciben ningún tratamiento o reciben un tratamiento con placebo. La respectiva enfermedad autoinmune puede ser LES.

Como se señaló en el contexto del primer aspecto, la fuerza analítica o predictiva de los resultados puede aumentar cuantos más genes se analizan para cada grupo con una realización considerando que todos los genes dentro de cada grupo, es decir, se analizan todos los genes de las Tablas 2, 3 y 4. Sin embargo, en lo que respecta a la expresión que determina la firma de células plasmáticas para no. 1 a 5 de la Tabla 2 puede que ya sea suficiente. De manera similar para la expresión determinante de firma de IFN para el no. 1 a 3 de la Tabla 4 puede que ya sea suficiente.

Como se ha mencionado anteriormente, estas lecturas se pueden utilizar para guiar la terapia. Si, por ejemplo, a un paciente se le ha diagnosticado una enfermedad autoinmune como LES y si se trata con un antagonista de CD40 o CD40L como un anticuerpo anti-CD40 o anti-CD40L o un fragmento de unión, por ejemplo, se considera el CDP7657 del mismo, la medición de los biomarcadores de las Tablas 2, 3 y / o 4 como se describe anteriormente puede ayudar a ayudar a determinar si la terapia debe continuarse o no. Por ejemplo, si el análisis revela que los al menos dos marcadores de células plasmáticas de la Tabla 2 no están regulados a la baja y / o que los al menos dos marcadores de células B de la Tabla 3 no están regulados al alza, se puede interrumpir el tratamiento tan pronto como dos a cuatro semanas porque es entonces cuando los efectos deberían ser observables. Sin embargo, si el análisis revela que los al menos dos marcadores de células plasmáticas de la Tabla 2 están regulados a la baja y / o que los al menos dos marcadores de células B de la Tabla 3 están regulados al alza de forma transitoria, se puede continuar el tratamiento, ya que estas reacciones tempranas indicarán interacción con el objetivo. Luego, se puede continuar monitoreando la firma de IFN de la Tabla 4, que puede considerarse indicativa de una respuesta clínica temprana. Si no se produce una regulación a la baja, se puede interrumpir la terapia y no es necesario esperar un análisis de respuesta clínica completo. Sin embargo, si se produce una regulación a la baja, se puede continuar con la terapia.

Las mismas consideraciones se aplican correspondientemente al primer, segundo, tercer y cuarto aspecto.

Para el sexto aspecto, se puede preferir que los niveles de expresión hagan referencia a los niveles de expresión de muestras de control de pacientes que han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune tal como LES y que no reciben ningún tratamiento o reciben tratamiento con placebo.

Los resultados presentados en los ejemplos revelan además que los pacientes con una enfermedad autoinmune diagnosticada que reciben terapia con anticuerpos anti-CD40L y que muestran respuestas clínicas parecen mostrar un nivel aumentado de expresión de los biomarcadores de la Tabla 1 antes de que comience el tratamiento. Si a un paciente se le diagnostica una enfermedad autoinmune tal como LES y terapia con antagonistas de CD40L tal como terapia con un anticuerpo anti-CD40L o un fragmento de unión del mismo, p. ej. si se considera CDP7657, se puede determinar la expresión de estos marcadores y administrar los anticuerpos a los pacientes que muestran una expresión aumentada de estos marcadores en comparación con otros pacientes o voluntarios sanos, por ejemplo, con aquellos pacientes que se encuentran en el 25% superior de expresores de uno o más de estos genes.

Curiosamente, los resultados también revelan que los pacientes diagnosticados con una enfermedad autoinmune como LES y que reciben terapia con anticuerpos anti-CD40L muestran una mayor expresión de los marcadores de células plasmáticas de la Tabla 2 y de algunos marcadores adicionales relacionados con células plasmáticas en comparación con voluntarios sanos antes de que comience el tratamiento. Estos biomarcadores de células plasmáticas adicionales se enumeran en la Tabla 5 como números 8, 9 y 10. Un análisis adicional puede revelar que no todos los pacientes diagnosticados con una enfermedad autoinmune como LES mostrarán una mayor expresión de estos marcadores, por lo tanto, de manera similar a los biomarcadores de la Tabla 1, los biomarcadores de la Tabla 5 pueden ser útiles para identificar subpoblaciones de pacientes con una enfermedad autoinmune diagnosticada como LES que pueden tener una mayor probabilidad de éxito del tratamiento con terapia con antagonistas de CD40L como anticuerpos anti-CD40L o fragmentos de unión de los mismos.

En el séptimo aspecto, como se describe en el presente documento, la divulgación se refiere a un método para identificar a un paciente que padece una enfermedad autoinmune que probablemente se beneficie de una terapia con un antagonista de CD40 o CD40L, que comprende al menos los pasos:

b) determinar la expresión de dicho al menos un biomarcador en muestras de ácido nucleico de control, y c) decidir si dicho paciente responde al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en las etapas a) y b).

En cuanto a los métodos de seguimiento y orientación de la terapia discutidos anteriormente, el poder predictivo de los métodos de identificación puede aumentar cuantos más biomarcadores se analicen. Por tanto, se prefiere determinar la expresión de al menos 1, 2, 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 1; y / o la expresión de al menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 o 10 biomarcadores como se define en la Tabla 5 dependiendo del aspecto al que se refiere el método respectivo. En una realización adicional, se determina la expresión de todos los marcadores de la Tabla 1 y / o la Tabla 5. Sin embargo, para los biomarcadores de la Tabla 5, puede ser suficiente determinar la expresión de los marcadores no 1 a 7 de la Tabla 5.

Una expresión aumentada de al menos 1, 2, 3, 4 o 5 biomarcadores como se define en la Tabla 1 indica que un paciente mostrará una respuesta clínica al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L con una probabilidad mayor que un paciente que no muestra un aumento expresión de estos biomarcadores; de manera similar, la divulgación considera que un aumento de la expresión de al menos 1, 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9 o 10 biomarcadores como se define en la Tabla 5 indica que un paciente mostrará una respuesta clínica al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L con mayor probabilidad que un paciente que no muestra un aumento de la expresión de estos biomarcadores.

Las mismas consideraciones se aplican correspondientemente al octavo aspecto.

b) determinar la expresión de dicho al menos un biomarcador en una muestra de ácido nucleico de control, y c) decidir si dicho paciente responderá con mayor probabilidad al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b), donde un nivel de expresión superior al de la muestra de control indica que es probable que el paciente responda al antagonista anti-CD40 o CD40L.

Para el séptimo y octavo aspecto, como se describe en el presente documento, se prefiere que los niveles de expresión se hagan en referencia a los niveles de expresión de muestras de control de pacientes que han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune como LES y donde los respectivos niveles de expresión se han establecido previamente para no ser indicativo de una respuesta probable a la terapia con CD40 o antagonista de CD40L. Esto se aplica en particular a los biomarcadores de la Tabla 1.

El experto en la materia comprenderá que una expresión aumentada o disminuida se determinará típicamente comparando la expresión en muestras obtenidas de pacientes frente a muestras de control que se normalizarán mediante enfoques estándar.

Se puede considerar que ocurre un cambio en la expresión si la diferencia en la expresión frente a la muestra de control es al menos aproximadamente 30%, al menos aproximadamente 40%, al menos aproximadamente 50%, al menos aproximadamente 60%, al menos aproximadamente 80%, en al menos aproximadamente el 100%, al menos aproximadamente el 200%, al menos aproximadamente el 300% o incluso más pronunciado. Entre los valores mencionados anteriormente, se prefieren cambios de al menos aproximadamente 200% o más. En aras de la claridad, dicho cambio en la expresión puede ser un aumento o una disminución en la expresión frente a la muestra de control.

El experto en la materia comprenderá que un cambio en la expresión frente a la muestra de control puede o no mantenerse durante un período de tiempo. En los casos en los que el cambio en la expresión frente a la muestra de control no se mantiene durante un período de tiempo, el cambio en la expresión se considera un aumento transitorio o una disminución transitoria en la expresión frente a la muestra de control. Se puede considerar que ocurre un cambio transitorio en la expresión si la diferencia en la expresión frente a la muestra de control ya no es observable después de al menos 2 semanas, al menos 4 semanas, al menos 6 semanas, 8 semanas, al menos 10 semanas, al menos después de 12 semanas, al menos después de 16 semanas o después de 20 semanas.

La expresión de biomarcadores en las muestras respectivas (incluidas las muestras de control) se puede determinar como se describe en los ejemplos, por ejemplo, haciendo referencia a la expresión de los biomarcadores en genes de mantenimiento tales como Ga PDH, a Ct B, YWHAZ y UBC.

Para el análisis de expresión se puede utilizar una muestra de ácido nucleico de un paciente o de individuos sanos. Se prefieren las muestras de ácido ribonucleico, como las muestras de ARN. La muestra de ácido nucleico o ARN puede ser una muestra de sangre del paciente. También se puede usar cualquier otra muestra que se pueda obtener del paciente y que contenga ácido ribonucleico o ARN de las células sanguíneas del paciente. La muestra se puede recoger del paciente mediante cualquier método conocido en la técnica. Por ejemplo, se puede tomar una muestra de sangre de un paciente mediante el uso de una aguja estéril.

Por lo general, el ácido ribonucleico o ARN se extrae, aísla o purifica de la muestra antes del análisis de transcripción génica. Se puede usar cualquier método conocido en la técnica para la extracción, el aislamiento o la purificación de ácido ribonucleico o ARN. Los métodos adecuados comprenden inter alia pasos tales como pasos de centrifugación, pasos de precipitación, pasos de cromatografía, pasos de dialización, pasos de calentamiento, pasos de enfriamiento y / o pasos de desnaturalización. Para algunas realizaciones, se puede alcanzar un cierto contenido de ácido ribonucleico o ARN en la muestra. El contenido de ácido ribonucleico o ARN se puede medir, por ejemplo, mediante espectrometría UV como se describe en la bibliografía. El ARN contenido en tales muestras se puede convertir en ADN p. Ej. transcripción inversa y posteriormente amplificada por, por ejemplo, PCR para análisis de expresión.

Como se mencionó, la divulgación considera para todos los aspectos y realizaciones de la misma que la muestra puede estar fuera del cuerpo humano o animal.

Los pacientes que pueden ser considerados para los métodos de seguimiento y guía de la terapia o los métodos de identificación de tratamiento elegibles pueden ser diagnosticados para enfermedades autoinmunes mediante métodos comunes conocidos en la técnica. Dichas enfermedades autoinmunes o enfermedades inflamatorias incluyen, pero no se limitan a, lupus eritematoso sistémico (LES), artritis reumatoide, espondilitis anquilosante, nefritis lúpica, síndrome de Sjogren, polimiositis, dermatomiositis, arteritis temporal, vasculitis asociada a ANCA, Síndrome de Churg-Strauss, síndrome antifosfolípido, glomerulonefropatía membranosa, enfermedad de Goodpasture, nefropatía por inmunoglobulina A, púrpura de Henoch-Schonlein, rechazo crónico del injerto, dermatitis atópica, pemiphigus vulgaris, psoriasis, asma, alergia, síndrome de Guilla, esclerosis sistémica mielitis transversa, polineuropatía inmune crónica, miastenia gravis, enfermedad de Addison, tiroiditis, gastritis autoinmune, anemia perniciosa, enfermedad celíaca, colitis ulcerosa, sarcoidosis, anemia hemolítica, púrpura trombocitopénica idiopática, enfermedad de Behget, cirrosis biliar primaria, diabetes autoinmune, Lyme, enfermedad pulmonar intersticial.

Además de las afecciones anteriores, para las cuales se establece como proceso patológico primario una inflamación autoinmune o inmunomediada de reacción cruzada, la inflamación también se considera una combinación de procesos contribuyentes en muchas enfermedades. Entre estas se encuentran las enfermedades neurodegenerativas que pueden tratarse con un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se une específicamente a CD40L según el método o uso descrito en este documento, tales enfermedades son afecciones hereditarias o esporádicas que se caracterizan por una disfunción progresiva del sistema nervioso. Estos trastornos a menudo se asocian con la atrofia de las estructuras centrales o periféricas del sistema nervioso afectadas. Por ejemplo, las enfermedades neurodegenerativas incluyen, pero no se limitan a, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, ataxia de Friedreich, enfermedad de Huntington, esclerosis lateral amiotrófica, miastenia gravis, neuropatía motora multifocal, esclerosis lateral primaria, atrofia muscular espinal, enfermedad de Kennedy y ataxia espinocerebelosa. De manera similar, afecciones como aterosclerosis, insuficiencia cardíaca, osteoartritis, esteatohepatitis no alcohólica, síndrome del intestino irritable, enfermedad de Crohn, complicaciones diabéticas (nefropatía, neuropatía, arteriopatía, retinopatía), asma, fibrosis quística, enfermedad obstructiva crónica de las vías respiratorias, epilepsia, glaucoma, degeneración macular relacionada con la edad, trastornos psiquiátricos (ansiedad, depresión, psicosis), síndrome de fatiga crónica, entesiopatías / tendinopatías, prematurez / infección prenatal, obesidad / síndrome metabólico, afecciones dermatológicas (acné vulgar, acné rosácea, queratosis solar), cicatrización anormal de heridas (queloide cicatrización), trastornos urogenitales (prostatismo / prostatitis, síndrome de vejiga hiperactiva) y el desarrollo de cáncer son todos susceptibles de tratamiento con un antagonista de CD40L tal como un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se une específicamente a CD40L de acuerdo con el método o uso de la divulgación.

La invención en todos los aspectos y realizaciones de la misma considera pacientes diagnosticados con lupus eritematoso sistémico. Existen diferentes criterios de clasificación para el diagnóstico de LES que se analizan en Ines, L. et al., Arthritis Care & Research (2015), 67 (8), 1180-1185 incluido el sistema de clasificación de el Systemic Lupus International Collaborating Clinics (SLICC) o el American College of Rheumatology (ACR). Los pacientes pueden ser diagnosticados con LES si cumplen, por ejemplo, con al menos 4 criterios de clasificación del American College of Rheumatology (ver también Tocoian, A et al., Lupus (2015) Vol 24: páginas 1045-56).

La invención se describe ahora con respecto a algunos ejemplos.

Experimentos

Estudio SL0014

Un estudio clínico en el que los pacientes con un diagnóstico establecido de LES fueron aleatorizados de forma doble ciego para recibir seis dosis intravenosas de CDP7657 (n = 16) o un placebo equivalente (n = 8) durante un período de 10 semanas. El régimen de dosificación bajo prueba (en aquellos que recibieron el fármaco activo) comprendió una dosis de carga única de 30 mg / kg seguida de una dosis de mantenimiento de 15 mg / kg cada 2 semanas a partir de entonces, para un total de 6 dosis de CDP7657. Además de evaluar la seguridad, la tolerabilidad y los perfiles farmacocinéticos de CDP7657 frente a placebo, el estudio exploró la inmunogenicidad (tanto los componentes anti-CD154 / CD40L como PEG), los efectos sobre varios marcadores de enfermedad y los efectos sobre los parámetros clínicos de la enfermedad durante y durante 18 semanas después del tratamiento. De esta manera se estableció la seguridad, tolerabilidad y capacidad del régimen de dosificación para producir efectos modificadores de la enfermedad.

Análisis de los datos

Se seleccionó un panel de 96 genes para su análisis. Se recogieron tubos de ARN de sangre PAXgene en SL0014 y se realizó un análisis de expresión génica en cada muestra mediante RT-PCR cuantitativa utilizando el instrumento Fluidigm. Los niveles de expresión génica sin procesar se normalizaron utilizando una combinación de genes domésticos (GAPDH, ACTB, YWHAZ y UBC) y un conjunto de estándares de oligonucleótidos.

Se determinó el cambio de veces desde la base de referencia para cada sujeto y en cada punto de tiempo. El análisis estadístico comparó los niveles de expresión génica encontrados en pacientes tratados con CDP7657 con los pacientes tratados con placebo. Los valores p resultantes se registraron como un mapa de calor y se colorearon de acuerdo con los que cumplían con los criterios de decisión preespecificados. Se generaron gráficos de espagueti individuales y el cambio de pliegue medio a partir de los gráficos de base de referencia.

Los criterios de decisión se diseñaron para identificar cambios de expresión consistentes dentro de un dominio e ignorar efectos aislados pero estadísticamente significativos (ver Figura 1). Un cambio en la expresión entre los pacientes tratados con CDP7657 y los pacientes tratados con placebo debería ser significativo en <0,0894. El valor p se derivó para lograr una tasa de falsos positivos del 5% a nivel de dominio en lugar de ajustar los valores p para comparaciones múltiples, ya que los tipos de cambios se conocían en un estudio clínico anterior (SL0013). Un cambio en el nivel del grupo funcional (por ejemplo, células plasmáticas, células B, etc.) requería 2 genes positivos, es decir, regulados hacia arriba o hacia abajo dentro de un dominio funcional. Un cambio en el nivel del dominio transcriptómico requería un solo grupo funcional positivo.

Además, se analizó a los pacientes que fueron considerados respondedores por BICLA al tratamiento con CDP7657 en cuanto a si mostraban un aumento de la expresión de ciertos genes antes del tratamiento. Los pacientes frente a voluntarios sanos también se analizaron en cuanto al patrón de expresión de los genes identificados durante el tratamiento.

Resultados

El tratamiento de pacientes con LES con CDP7657 dio como resultado cambios transcripcionales de ciertos genes proporcionales a la inhibición de la señalización de CD40L: CD40. Estos cambios en la expresión génica cumplieron con los criterios de decisión internos predefinidos para indicar una respuesta positiva en la transcripción génica en este estudio de LES.

Se encontró que los marcadores de células plasmáticas IGHA1 secretores, IGHG1 total, IGJ, IGKC e IGLC2 (ver también la Tabla 2) mostraron una expresión disminuida para los pacientes tratados con CDP7657 frente a placebo a partir de las dos semanas posteriores al tratamiento (ver Figura 2). La Figura 3 representa la disminución general de la expresión si se consideran adicionalmente los marcadores de células plasmáticas adicionales secretores de IGHG1 y TXNDC5 (véase también la Tabla 2). La firma de células plasmáticas se analizó con más detalle. Los pacientes con LES mostraron una expresión aumentada de IGHA1 secretor, IGHG1 total, IGJ, IGKC, IGLC2, IGHG1 secretor y TXNDC5 en comparación con voluntarios sanos. Esto también se aplicó a CD38, secretor de IGM y BCMA (ver Tabla 5 y Figura 10).

Además, se encontró que los marcadores de células B CD19, membrana IGHD membrana IGHM, MS4A1 y TCL1A (ver también Tabla 3) mostraron un aumento transitorio de expresión para pacientes tratados con CDP7657 frente a placebo dentro de dos a cuatro semanas después del tratamiento (ver Figura 4). Esto se reflejó en un aumento transitorio en la cantidad de células B circulantes que reflejó los aumentos de la transcripción de CD19 y CD20 para los pacientes tratados con CDP7657 frente a placebo dentro de las dos a cuatro semanas posteriores al tratamiento (ver Figuras 4, 5, 6 y 7).

Además, se encontró que los pacientes que según BICLA tuvieron una respuesta clínica mostraron una expresión disminuida de los marcadores relacionados con IFN G1P2, MX1 IFITM3 y OAS1 (ver Tabla 4) comenzando dentro de las dos semanas posteriores al tratamiento y persistiendo hasta la semana 12. Entre los que respondieron a BICLA se redujo la expresión fue más pronunciado para los pacientes tratados con CDP7657 frente a placebo (ver Figura 8).

Entre los pacientes que recibieron CDP7657 y que mostraron una respuesta clínica por BICLA, la expresión de ANKYF1, SRRM2, SPGl y NAAA (ver Tabla 1) aumentó antes del tratamiento en comparación con los pacientes que recibieron CDP7657 y no mostraron respuesta clínica (ver Figura 9).

Las mismas consideraciones se aplican correspondientemente al octavo aspecto.

Para el séptimo y octavo aspecto, como se describe en el presente documento, se prefiere que los niveles de expresión se hagan referencia a los niveles de expresión de muestras de control de pacientes que han sido diagnosticados con la respectiva enfermedad autoinmune como LES y donde los respectivos niveles de expresión se han establecido previamente para no ser indicativo de una respuesta probable a la terapia con CD40 o antagonista de CD40L. Esto se aplica en particular a los biomarcadores de la Tabla 1.

Por lo general, el ácido ribonucleico o ARN se extrae, aísla o purifica de la muestra antes del análisis de transcripción génica. Se puede usar cualquier método conocido en la técnica para la extracción, el aislamiento o la purificación de ácido ribonucleico o ARN. Los métodos adecuados comprenden inter alia pasos tales como pasos de centrifugación, pasos de precipitación, pasos de cromatografía, pasos de dialización, pasos de calentamiento, pasos de enfriamiento y / o pasos de desnaturalización. Para algunas realizaciones, se puede alcanzar un cierto contenido de ácido ribonucleico o ARN en la muestra. El contenido de ácido ribonucleico o ARN se puede medir, por ejemplo, mediante espectrometría UV como se describe en la bibliografía. El ARN contenido en tales muestras se puede convertir en ADN p. Ej. transcripción inversa y posteriormente amplificada por p. PCR para análisis de expresión. Como se mencionó, la divulgación considera para todos los aspectos y realizaciones de la misma que la muestra puede estar fuera del cuerpo humano o animal.

Además de las afecciones anteriores, para las cuales se establece como proceso patológico primario una inflamación autoinmune o inmunomediada de reacción cruzada, la inflamación también se considera una combinación de procesos contribuyentes en muchas enfermedades. Entre estas se encuentran las enfermedades neurodegenerativas que pueden tratarse con un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se une específicamente a CD40L según el método o uso descrito en este documento, tales enfermedades son afecciones hereditarias o esporádicas que se caracterizan por una disfunción progresiva del sistema nervioso. Estos trastornos a menudo se asocian con la atrofia de las estructuras centrales o periféricas del sistema nervioso afectadas. Por ejemplo, las enfermedades neurodegenerativas incluyen, pero no se limitan a, enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, ataxia de Friedreich, enfermedad de Huntington, esclerosis lateral amiotrófica, miastenia gravis, neuropatía motora multifocal, esclerosis lateral primaria, atrofia muscular espinal, enfermedad de Kennedy y ataxia espinocerebelosa. De manera similar, afecciones como aterosclerosis, insuficiencia cardíaca, osteoartritis, esteatohepatitis no alcohólica, síndrome del intestino irritable, enfermedad de Crohn, complicaciones diabéticas (nefropatía, neuropatía, arteriopatía, retinopatía), asma, fibrosis quística, enfermedad obstructiva crónica de las vías respiratorias, epilepsia, glaucoma, edad. degeneración macular relacionada, trastornos psiquiátricos (ansiedad, depresión, psicosis), síndrome de fatiga crónica, entesiopatías / tendinopatías, prematurez / infección prenatal, obesidad / síndrome metabólico, afecciones dermatológicas (acné vulgar, acné rosácea, queratosis solar), cicatrización anormal de heridas (queloide cicatrización), trastornos urogenitales (prostatismo / prostatitis, síndrome de vejiga hiperactiva) y el desarrollo de cáncer son todos susceptibles de tratamiento con un antagonista de CD40L tal como un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que se une específicamente a CD40L de acuerdo con el método o uso de la divulgación.

La invención en todos los aspectos y realizaciones de la misma considera pacientes diagnosticados con lupus eritematoso sistémico. Existen diferentes criterios de clasificación para el diagnóstico de LES que se analizan en Ines, L. et al., Arthritis Care & Research (2015), 67 (8), 1180-1185 incluido el sistema de clasificación de las Systemic Lupus International Collaborating Clinics (SLICC) o el American College of Rheumatology (ACR). Los pacientes pueden ser diagnosticados con LES si cumplen, por ejemplo, con al menos 4 criterios de clasificación del American College of Rheumatology (ver también Tocoian, A et al., Lupus (2015) Vol 24: páginas 1045-56).

La invención se describe ahora con respecto a algunos ejemplos.

Experimentos

Estudio SL0014

Un estudio clínico en el que los pacientes con un diagnóstico establecido de LES fueron aleatorizados de forma doble ciego para recibir seis dosis intravenosas de CDP7657 (n = 16) o un placebo equivalente (n = 8) durante un período de 10 semanas. El régimen de dosificación bajo prueba (en aquellos que recibieron el fármaco activo) comprendió una dosis de carga única de 30 mg / kg seguida de una dosis de mantenimiento de 15 mg / kg cada 2 semanas a partir de entonces, para un total de 6 dosis de CDP7657. Además de evaluar la seguridad, la tolerabilidad y los perfiles farmacocinéticos de CDP7657 versus placebo, el estudio exploró la inmunogenicidad (tanto los componentes anti-CD 154 / CD40L como PEG), los efectos sobre varios marcadores de enfermedad y los efectos sobre los parámetros clínicos de la enfermedad durante y durante 18 semanas después del tratamiento. De esta manera se estableció la seguridad, tolerabilidad y capacidad del régimen de dosificación para producir efectos modificadores de la enfermedad.

Análisis de los datos

Resultados

Entre los pacientes que recibieron CDP7657 y que mostraron una respuesta clínica por BICLA, la expresión de ANKYF1, SRRM2, SPG11 y NAAA (ver Tabla 1) aumentó antes del tratamiento en comparación con los pacientes que recibieron CDP7657 y no mostraron respuesta clínica (ver Figura 9).

Claims

REIVINDICACIONES

1. Método para monitorizar el tratamiento del lupus eritematoso sistémico (LES) en un paciente con un antagonista CD40 o CD40L que comprende al menos los pasos de

a) determinar la expresión de al menos 2 biomarcadores como se definen en la Tabla 2 en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con LES,

2. Método para monitorizar de acuerdo con la reivindicación 1,

en donde la expresión de al menos 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se definen en la Tabla 2 se determina en las etapas a) y b).

3. Método para monitorizar de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 o 2,

en el que una disminución al menos transitoria de la expresión de al menos 2, 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se definen en la Tabla 2 es indicativa de una respuesta al tratamiento por el antagonista de CD40 o CD40L.

4. Método para monitorizar de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1,2 o 3,

en el que una disminución al menos transitoria de la expresión de al menos 2, 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se definen en la Tabla 2 durante 1 a 12 semanas después del inicio del tratamiento es indicativa de una respuesta al tratamiento por el CD40 o CD40L antagonista.

5. Método para monitorizar de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1, 2, 3 o 4,

donde dicha muestra de control refleja los niveles de expresión de los respectivos biomarcadores en pacientes que también han sido diagnosticados con LES y que no reciben tratamiento o reciben placebo.

6. Método para monitorizar según cualquiera de las reivindicaciones 1,2, 3, 4 o 5,

en el que dicho antagonista de CD40 o CD40L es un anticuerpo anti-CD40, un anticuerpo anti-CD40L o un fragmento de unión del mismo.

7. Método para monitorizar de acuerdo con la reivindicación 1, 2, 3, 4, 5 o 6,

en el que dicho antagonista de CD40L es el anticuerpo anti-CD40L PEGilado CDP7657.

8. Método de identificación de un paciente que padece LES como elegible para una terapia con un antagonista de CD40 o CD40L, que comprende al menos los pasos:

a) determinar la expresión de al menos un biomarcador como se define en la Tabla 2; en una muestra de ácido nucleico obtenida de un paciente que ha sido diagnosticado con LES,

b) determinar la expresión de dicho al menos un biomarcador en una muestra de ácido nucleico de control, y c) decidir si dicho paciente responderá con mayor probabilidad al tratamiento con un antagonista de CD40 o CD40L comparando los niveles de expresión determinados en los pasos a) y b).

9. Método de identificación de acuerdo con la reivindicación 8,

en el que la expresión de al menos 2, 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se define en la Tabla 2 se determina en las etapas a) y b).

10. Método de identificación de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 8 o 9,

en el que una expresión aumentada de al menos 1,2, 3, 4, 5, 6 o 7 biomarcadores como se define en la Tabla 2 es indicativa de una probabilidad aumentada de una respuesta al tratamiento por el antagonista de CD40 o CD40L.

11. Método de identificación de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 8, 9 o 10

12. Método de identificación de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 8, 9, 10 u 11,

13. Método de identificación de acuerdo con la reivindicación 12, en el que dicho antagonista de CD40L es un anticuerpo anti-CD40L PEGilado o un fragmento de unión del mismo.