ES2213747T3 - Plantas que tienen una respuesta modificada al etileno. - Google Patents
Plantas que tienen una respuesta modificada al etileno.Info
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Abstract
LA INVENCION INCLUYE PLANTAS TRANSFORMADAS QUE TIENEN AL MENOS UNA CELULA TRANSFORMADA CON UN ACIDO NUCLEICO ETR MODIFICADO. TALES PLANTAS TIENEN UN FENOTIPO QUE SE CARACTERIZA POR UNA MENOR RESPUESTA DE AL MENOS UNA CELULA VEGETAL TRANSFORMADA AL ETILENO EN COMPARACION A UNA PLANTA QUE NO CONTIENE LA CELULA VEGETAL TRANSFORMADA. EL TEJIDO Y/O ESPECIFICIDAD TEMPORAL PARA LA EXPRESION DEL ACIDO NUCLEICO ETR MODIFICADO SE CONTROLA SELECCIONANDO LAS SECUENCIAS DE REGULACION DE LA EXPRESION APROPIADAS PARA DETERMINAR EL LUGAR Y/O TIEMPO DE EXPRESION DEL ACIDO NUCLEICO TRANSFORMADO. LAS PLANTAS SE OBTIENEN TRANSFORMANDO AL MENOS UNA CELULA VEGETAL CON UN ACIDO NUCLEICO ETR MODIFICADO APROPIADO, REGENERANDO LAS PLANTAS A PARTIR DE UNA O MAS DE LAS CELULAS VEGETALES TRANSFORMADAS Y SELECCIONANDO AL MENOS UNA PLANTA QUE TENGA EL FENOTIPO DESEADO.
Description
Plantas que tienen una respuesta modificada al
etileno.
Esto es una continuación en parte de la solicitud
con número de serie 08/086.555, registrada el 1 de julio de
1993.
El Gobierno de los Estados Unidos tiene ciertos
derechos sobre esta invención de acuerdo con el Contrato de Energía
nº DE-FG03-88ER13873,
La invención se refiere de forma general a ácido
nucleico ETR modificado y a plantas transformadas con dicho
ácido nucleico, las cuales tienen un fenotipo caracterizado por una
modificación en la respuesta normal al etileno.
El etileno ha sido reconocido como una hormona de
plantas desde los inicios del siglo XX, cuando se describió por
primera vez su efecto sobre el desarrollo de las plántulas de
guisantes. Neljubow, Pflanzen Beith. Bot. Zentralb.
10:128-139 (1901). Desde entonces, han aparecido
numerosos informes que demuestran que el etileno es un regulador
endógeno del crecimiento y desarrollo en plantas superiores. Por
ejemplo, se ha implicado el etileno en el estado vegetativo las
semillas, en el crecimiento de las plántulas, en la floración, en la
abscisión de las hojas, en la senescencia y maduración de las
frutas. El etileno es una hormona de plantas cuya biosíntesis es
inducida por estrés medioambiental, tal como la deficiencia en
oxígeno, las lesiones, la invasión por patógenos, y las
inundaciones.
Recientemente se han clonado los genes que
codifican algunos de los enzimas implicados en la biosíntesis del
etileno, Sato et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
86:6621-6625 (1989); Nakajima et al., Plant
Cell Phys. Physiol. 29:989-996 (1990); Van Der
Straeten et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
87:4859-4963 (1991); Hamilton et al., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 88:7434-7437 (1991); y Spanu
et al., EMBO J. 10:2007-2013 (1991). Las vías
para la síntesis del etileno se muestran en la Figura 1. Como puede
observarse, el aminoácido metionina es convertido en
S-adenosil-metionina (SAM) por la
sintetasa de SAM, el cual es convertido a su vez en ácido
1-aminociclopropano-1-carboxílico
(ACC) por la sintasa de ACC. Adams et al., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 76:170-174 (1979). El ACC se convierte a
continuación en etileno por medio del enzima oxidasa del ACC. Yang
et al., Annu. Rev. Plant. Physiol. 35:155-189
(1984).
Se han adoptado una serie de aproximaciones en un
intento de controlar la biosíntesis del etileno y, de este modo,
controlar la maduración de las frutas. Oeller et al., Science
254:437-439 (1991) informaron que la expresión de un
ARN antisentido de la sintasa del ACC inhibe la maduración de los
frutos en las tomateras. Hamilton et al., Nature
346:284-287 (1990) informaron del uso de un gen
TOM13 antisentido (oxidasa del ACC) en plantas transgénicas. Picton
et al., Plant Journal 3:469-481 (1993),
informaron de la maduración alterada de frutas y de la senescencia
de las hojas en tomateras que expresaban in enzima antisentido
formador de etileno.
En una segunda estrategia, se describió la
biosíntesis modulada del etileno mediante la expresión de una
desaminasa del ACC en tejidos de plantas, disminuía el nivel de ACC
disponible para su conversión a etileno. Ver la publicación del PCT
nº WO92/12.249, publicada el 23 de julio de 1992, y Klee et
al., Plant Cell 3:1187-1193 (1991).
Mientras que se ha generado una cantidad
sustancial de información en relación a la biosíntesis del etileno,
se conoce muy poco sobre cómo el etileno control el desarrollo de
las plantas. Aunque varios informes indican que hay un sitio de
unión con alta afinidad para el etileno presente en los tejidos de
plantas, tales receptores no se han identificado. Jerie et
al., Planta 144:503 (1979); Sisler, Plant Physiol
64:538 (1979); Sisler et al., Plant Growth Reg.
9:157-164 (1990); y Sisler "Ethylene Binding
Component in Plants", The Plant Hormone Ethylene, Eds.
A.K. Mattoo y J.C. Suttle, 1990, Boston, C.R.C. Press, Inc., pp.
81-90. En Arabidopsis se han descrito varias
categorías de mutantes. En las dos primeras categorías, se informó
sobre mutantes que producían etileno en exceso o menos etileno en
comparación con el tipo salvaje. Guzman et al., The Plant
Cell 2:513-523 (1990). En una tercera categoría,
los mutantes no consiguieron responder al etileno. Id.;
Bleecker et al., Science 241:1086-1089
(1988); Harpham et al., Ann. of Botany
68:55-61 (1991). La insensibilidad observada
respecto el etileno se describió como una mutación dominante o
recesiva. Id.
En base a lo precedente, está claro que no se ha
delineado claramente la base genética y el mecanismo molecular de la
interacción del etileno con las plantas. Dado el amplio rango de
funciones reguladas por el etileno, y los intentos previos de
controlar la función del etileno regulando su síntesis, sería
deseable disponer de una estrategia alternativa para modular el
crecimiento y desarrollo de varios tejidos de plantas, tales como
los frutos, vegetales y flores, mediante la alteración de la
interacción del etileno con los tejidos de plantas.
En consecuencia, es un objeto de la invención
proporcionar ácidos nucleicos que comprenden un ácido nucleico de
respuesta al etileno (ETR).
Además, es un objeto proporcionar modificaciones
de tales ácidos nucleicos de ETR para sustituir, insertar y/o
suprimir uno o más nucleótidos con objeto de sustituir, insertar y/o
suprimir uno o más residuos de aminoácidos en la proteína codificada
por el ácido nucleico de ETR.
Aún más, es un objeto proporcionar células
vegetales transformadas con uno o más ácidos nucleicos de
ETR. Tales células vegetales transformadas pueden usarse para
producir plantas transformadas, en donde el fenotipo, en relación a
la respuesta de uno o más tejidos de la planta al etileno, esté
modulado.
De acuerdo con los objetivos anteriores, la
invención incluye plantas transformadas que tienen al menos una
célula transformada con un ácido nucleico de ETR modificado.
Tales plantas tienen un fenotipo caracterizado por una disminución
en la respuesta al etileno, de al menos una célula vegetal
transformada, en comparación con una planta que no contiene la
célula vegetal transformada.
La invención también incluye vectores capaces de
transformar una célula vegetal para alterar la respuesta al etileno.
En una realización, el vector comprende un ácido nucleico de
ETR modificado, el cual causa una disminución en la respuesta
celular al etileno. La especificidad de tejido y/o temporal de la
expresión del ácido nucleico del ETR modificado se controla
seleccionando secuencias apropiadas de regulación de la expresión,
para controlar la ubicación y/o el momento de expresión del ácido
nucleico transformado.
La invención incluye también procedimientos para
producir plantas que tienen un fenotipo caracterizado por una
disminución en la respuesta de al menos una célula vegetal
transformada, en comparación con una planta del tipo salvaje que no
contenga tal célula transformada. El procedimiento comprende
transformar al menos una célula vegetal con el ácido nucleico de
ETR modificado, regenerar las plantas a partir de una o más
de las células vegetales transformadas, y seleccionar al menos una
planta que tenga el fenotipo deseado.
La Figura 1 ilustra la vía biosintética del
etileno.
Las Figuras 2A, 2B y 2C ilustran la secuencia de
ácido nucleico genómico (SEC. Nº ID.: 1) para el gen ETR de
Arabidopsis thaliana.
Las Figuras 3A, 3B, 3C y 3D, ilustran el ácido
nucleico de cADN (SEC. Nº ID.: 2) y la secuencia de aminoácidos
deducida (SEC. Nº ID.: 3) para el gen ETR de Arabidopsis
thaliana.
Las Figuras 4A, 4B, 4C y 4D, hasta las Figuras
7A, 7B, 7C y 7D, ilustran el cADN y la secuencia de aminoácidos
deducida de cuatro mutantes de genes ETR de Arabidopsis
thaliana, los cuales confieren insensibilidad al etileno. Cada
secuencia difiere de la secuencia del tipo salvaje, detallada en la
Figura 3, por la sustitución de uno residuo de aminoácido. La
mutación etr1-3 (anteriormente
ein1-1) en la Figura 4 (SEC. Nº ID.: 8 y 9)
comprende la sustitución de la alanina-31 por
valina. La mutación etr4 en la Figura 5 (SEC. Nº ID.: 10 y
11) comprende la sustitución de la isoleucina-62 por
fenilalanina. La mutación etr1-1
(anteriormente etr) en la Figura 6 (SEC. Nº ID.: 4 y 5)
comprende la sustitución de la cisteína-65 por
treonina. La mutación etr1-2 en la Figura 7
(SEC. Nº ID.: 6 y 7) comprende la sustitución de la
alanina-102 por treonina.
La Figura 8 ilustra la estructura de un inserto
de cósmido usado para localizar el gen ETR1 en Arabidopsis
thaliana. La posición de inicio para el recorrido por el
cromosoma se indica con una barra rayada. La barra vacía indica la
ubicación y longitud de los segmentos de ADN usados como sondas para
detectar puntos de rotura de la recombinación. Se muestra el número
máximo de puntos de rotura detectados para cada sonda. Los números a
la derecha del gen ETR1 proceden de 74 recombinantes F2 entre
etr1-1 y ap-1, y
aquéllos a la izquierda del gen ETR-1
proceden de 25 recombinantes F2 entre etr1-1
y clv2. También se muestran los clones YAC solapados EG4E4 y
EG2G11.
Las Figuras 9A y 9B ilustran los alineamientos de
las secuencias de aminoácidos de la proteína de ETR1 predicha
y los dominios conservados de varias quinasas de histidina y
reguladores de respuesta bacterianos. Los aminoácidos se muestran en
negrita en las posiciones en las que hay al menos dos coincidencias
con la ETR1. En la Figura 9A, se alinea la secuencia de
aminoácidos de ETR1 deducida (SEC. Nº ID.: 12 y 27) (residuos
326 a 562) con los dominios quinasa de histidina de BarA (SEC. Nº
ID.: 13 y 28) de E. coli, LemA (SEC. Nº ID.: 14 y 29) de
P. syringae, y RpfC (SEC. Nº ID.: 15 y 30) de X.
campestris. Los recuadros enmarcan los cinco motivos conservados
característicos del dominio quinasa de histidina de bacterias, tal
como fueron compilados por Parkinson y Kofoid (Parkinson et
al., Annu. Rev. Genet. 26:71 (1992)). El residuo de
histidina conservado que es el sitio supuesto de autofosforilación
se indica mediante un asterisco. Los números y posiciones de los
aminoácidos que no se muestran se indican entre paréntesis. En la
Figura 9B se alinea la secuencia de aminoácidos de ETR1
deducida (residuos 610 a 729) (SEC. Nº ID.: 15 y 31) con los
dominios reguladores de respuesta BvgS (SEC. Nº ID.: 17 y 32) de
B. parapertussis, LemA (SEC. Nº ID.: 19 y 34) de P.
syringae, y RscC (SEC. Nº ID.: 18 y 33) de E. coli. Los
recuadros enmarcan los cuatro residuos altamente conservados en los
reguladores de respuesta. El residuo aspartato conservado que es el
sitio de fosforilación se indica mediante un asterisco. Los números
y posiciones de los aminoácidos que no se muestran se indican entre
paréntesis. Con motivo del alineamiento, se introdujo una
discontinuidad (_) en la secuencia del ETR1.
Las Figuras 10A y 10B ilustran las secuencias de
ADN específicas para los ácidos nucleicos de ETR procedentes
de tomates y Arabidopsis thaliana. La Figura 10A compara la
secuencia de ADN que codifica los residuos de aminoácidos 1 a 123
(SEC. Nº ID.: 20 y 21). La Figura 10B compara la secuencia de ácido
nucleico de ETR que codifica los aminoácidos 306 a 403 (SEC.
Nº ID.: 22 y 23). Las líneas verticales en cada figura identifican
nucleótidos homólogos.
Las Figuras 11A y 11B comparan secuencias
parciales de aminoácidos (usando la denominación de letra única)
para una proteína ETR procedente de tomates y Arabidopsis
thaliana. La Figura 11A compara la secuencia de aminoácidos de
la proteína ETR para los aminoácidos 1 a 123 (SEC. Nº ID.: 24
y 25). La Figura 11B compara la secuencia de aminoácidos de la
proteína ETR para los residuos 306 a 403 (SEC. Nº ID.: 26 y
27). Las líneas verticales indican la homología exacta de secuencia.
Dos puntos verticales indican que los residuos aminoácidos están
funcionalmente conservados, un punto indica una conservación
funcional débil entre residuos de aminoácidos.
Las Figuras 12A, 12B, 12C y 12D, ilustran la
secuencia de ácido nucleico genómico (SEC. Nº ID.: 45) y la
secuencia de aminoácidos deducida (SEC. Nº ID.: 46) para el gen QITR
ETR de Arabidopsis thaliana.
La Figura 13 ilustra la secuencia de ácido
nucleico del cADN y la secuencia proteica deducida para el gen QITR
ETR de Arabidopsis thaliana.
La Figura 14 ilustra la secuencia de ácido
nucleico genómico (SEC. Nº ID.: 41) y la secuencia de aminoácidos
deducida (SEC. Nº ID.: 42) para el gen Q8 ETR de
Arabidopsis thaliana.
La Figura 15 ilustra la secuencia de ácido
nucleico del cADN (SEC. Nº ID.: 43) y la secuencia de aminoácidos
deducida (SEC. Nº ID.: 44) para el gen Q8 ETR de
Arabidopsis thaliana.
La Figura 16 ilustra la secuencia de ácido
nucleico (SEC. Nº ID.: 35) y la secuencia de aminoácidos deducida
(SEC. Nº ID.: 36) para el ácido nucleico TETR del tomate.
La Figura 17 es un comparación de las porciones
amino-terminales de las proteínas TETR y ETR1
procedentes respectivamente del tomate y de Arabidopsis
thaliana. La línea superior es la secuencia TETR y se extiende
hasta el residuo de aminoácidos 315. La línea inferior representa la
secuencia de la proteína ETR1 y se extiende hasta el
aminoácido 316. Las líneas verticales y los puntos sencillo y doble
vertical tienen el mismo significado establecido en la descripción
de las Figuras 11A y 11B. El porcentaje de identidad entre estas
porciones de secuencias es del 73,33%. El porcentaje de similitud es
del 84,76%.
La Figura 18 ilustra la secuencia de ácido
nucleico (SEC. Nº ID.: 37) y la secuencia de aminoácidos deducida
(SEC. Nº ID.: 38) para el ácido nucleico TGETR1 ETR del
tomate.
La Figura 19 ilustra la secuencia de ácido
nucleico (SEC. Nº ID.: 39) y la secuencia de aminoácidos deducida
(SEC. Nº ID.: 40) para una secuencia parcial del ácido nucleico
TGETR2 ETR del tomate.
La Figura 20 es un comparación de las porciones
amino-terminales de las proteínas TGETR1 y
ETR1 procedentes respectivamente del tomate y de
Arabidopsis thaliana. La línea superior es la secuencia
TGETR1 hasta el residuo aminoácido 316. La línea inferior representa
la secuencia de la proteína ETR1 hasta el residuo aminoácido
316. La identidad entre estas dos secuencias es del 91,75%. El
porcentaje de similitud es del 95,87%. Las líneas verticales y los
puntos sencillo y doble vertical tienen el mismo significado que en
las Figuras 11A y 11B.
La Figura 21 es un comparación de la porción
amino-terminales de la proteína TGETR2 con la
correspondiente secuencia de ETR1. La línea superior es la
secuencia de TGETR2, desde el residuo aminoácidos 11 hasta el
residuo aminoácido 245. La línea inferior es la secuencia de la
ETR1, desde el residuo aminoácido 1 hasta el residuo
aminoácido 235. La identidad entre estas dos secuencias es del
85,11%. El porcentaje de similitud es del 92,34%. Las líneas
verticales y los puntos sencillo y doble vertical tienen el mismo
significado que en las Figuras 11A y 11B.
La Figura 22 ilustra el ácido nucleico (SEC. Nº
ID.: 50) y la secuencia deducida de aminoácidos (SEC. Nº ID.: 51)
para el ácido nucleico Nr-ETR
(Never-ripe, no madurar nunca) procedente del
tomate Never-ripe. La secuencia de
aminoácidos en la Figura 22 difiere de la secuencia TETR en la
Figura 6 en que el residuo aminoácido prolina en el residuo 36 está
remplazado con leucina.
La invención proporciona, en parte, plantas que
tienen células transformadas con un vector que comprende un ácido
nucleico de ETR o un ácido nucleico de ETR modificado.
Tales células vegetales transformadas tienen una respuesta modulada
por el etileno. En una realización preferida, la expresión de un
ácido nucleico de ETR modificado confiere a la planta un
fenotipo caracterizado por una disminución en la respuesta al
etileno en, al menos, aquellas células que expresan el ácido
nucleico de ETR modificado, en comparación con una planta no
transformada. De este modo, por ejemplo, cuando el ácido nucleico de
ETR modificado se expresa en frutos tales como el tomate, el
proceso de maduración de fruto se retarda, reduciéndose de ese modo
el deterioro, y alargándose la durabilidad antes de la venta y/o la
temporada de recolección del fruto. La invención es igualmente útil
parar impedir el deterioro del tejido vegetativo y para potenciar la
longevidad de las flores cortadas.
Tal como se usa en ésta, un "ácido nucleico de
ETR de planta" se refiere a un ácido nucleico que codifica
la totalidad o parte de un "proteína de ETR de una
planta". El ácido nucleico de ETR puede identificarse
inicialmente por homología con las secuencias de ácido nucleico de
ETR descubiertas en ésta, pero puede identificarse también
por homología con cualquier ácido nucleico o secuencia de
aminoácidos de ETR identificada. Los ejemplos de ácido
nucleico de ETR incluyen el ETR1, el QITR, y el
Q8 procedentes de Arabidopsis, y el TETR,
TGETR1 y TEGTR2 procedentes del tomate. No obstante,
los ácidos nucleicos de ETR también se definen funcionalmente
por su capacidad para conferir una respuesta modulada por el etileno
a partir de su transformación en un tejido vegetal. Por ejemplo, una
construcción antisentido de un ácido nucleico de ETR o un
ácido nucleico de ETR modificado, son capaces de reducir la
respuesta al etileno en tejidos vegetales que expresen el ácido
nucleico de ETR antisentido o modificado. Además, la
transformación con un ácido nucleico de ETR o ácido nucleico
de ETR modificado puede resultar en la
co-supresión de los alelos de ETR endógenos,
la cual, a su vez, modifica la respuesta al etileno. Más aún, los
ácidos nucleicos de ETR pueden modificarse tal como se
describe en ésta, para producir ácidos nucleicos de ETR
modificados, los cuales, cuando se usan para transformar tejidos
vegetales, resultan en diferentes grados de insensibilidad al
etileno en los tejidos que expresan tales ácidos nucleicos de
ETR modificados. Cuando se evalúa un ácido nucleico de
ETR putativo, mediante la capacidad de un ácido nucleico de
ETR de conferir insensibilidad al etileno, se prefiere que un
codón o combinación de condones que codifican los residuos de
aminoácidos equivalentes a Ala-31,
Ile-62, Cys-65 o
Tyr-102 en la proteína ETR1 de Arabidopsis
thaliana, o Pro-36 en la proteína TETR del
tomate, estén modificados con objeto de sustituirlos por un residuo
aminoácido diferente, tal como aquéllos discutidos en esta para los
residuos especificados.
Los ácidos nucleicos de ETR de plantas
incluyen el ADN genómico, el cADN, y los oligonucleótidos,
incluyendo los ácidos nucleicos con sentido y antisentido, así como
las transcripción en ARN de los mismos. La secuencia de ADN genómico
(SEC. Nº ID.: 1) del gen ETR1 de Arabidopsis thaliana
se muestra en la Figura 2. La secuencia de cADN correspondiente
(SEC. Nº ID.: 2) y la secuencia de aminoácidos deducida (SEC. Nº
ID.: 3) se muestran en la Figura 3. Un dominio
amino-terminal (es decir, los residuos 1 hasta
aproximadamente 316) de la secuencia de proteína ETR predicha
no tienen homología con secuencias de proteínas conocidas.
Aproximadamente hacia la mitad de la proteína ETR (es decir,
los residuos 295 hasta 313) es un dominio transmembrana putativo
seguida por un dominio intracelular putativo (es decir, los residuos
314 hasta 738). Una porción sustancial de este dominio intracelular
putativo tiene homología de secuencia con los dos componentes
sensor-regulador del entorno conocidos en las
bacterias. Estas dos familia forman en bacterias un sistema
sensor-regulador que permite a las bacterias
responder a una amplio rango de fluctuaciones del entorno. Se cree
que la porción amino-terminal de la proteína
ETR interacciona, bien directamente con el etileno o
indirectamente (por ejemplo, a través de una proteína unidora de
etileno u otra proteína) y que a partir de tal interacción, ocurre
la transducción de señal a través del dominio intracelular.
Un ácido nucleico de ETR o proteína
ETR puede identificarse mediante una homología sustancial de
la secuencia de ácido nucleico y/o aminoácido con una secuencia de
ETR conocida. Tal homología puede basarse en la secuencia global de
ácido nucleico o aminoácido, en cuyo caso la homología global de la
secuencia proteica es preferiblemente superior al 50%,
preferiblemente superior al 60%, todavía más preferiblemente
superior al 75%, y los más preferiblemente es homóloga en más del
90%. A pesar de la homología global de secuencia, se prefiere el uso
de la porción amino-terminal única de una secuencia
de proteína ETR, o de la secuencia de ácido nucleico que
codifica esta porción de la molécula (es decir, la porción terminal
en 5'), para identificar una proteína ETR o ácido nucleico de
ETR. Cuando se usa esta porción de secuencia
amino-terminal, se prefiere que la homología de
secuencia de aminoácidos con la secuencia ETR conocida sea superior
a aproximadamente el 55%, más preferiblemente aproximadamente el
60%, de forma todavía más preferible aproximadamente el 70%, más
preferiblemente superior al 85%, y los más preferiblemente que sea
homóloga en más del 95%. La homología basada en la secuencia de
ácido nucleico es proporcional a la homología de aminoácidos, pero
toma en consideración la degeneración del código genético y el sesgo
en codones en plantas diferentes. En consecuencia, la homología de
secuencia de ácido nucleico podría ser sustancialmente inferior a la
basada en secuencia proteica. Por tanto, una proteína ETR es
cualquier proteína que tiene una porción
amino-terminal que es sustancialmente homóloga con
el dominio amino-terminal de una proteína ETR
conocida. Una proteína ETR tal es la proteína ETR1
(ver Figura 3) procedente de Arabidopsis thaliana. Por
analogía, un ácido nucleico de ETR también codifica al menos
el dominio amino-terminal de una proteína ETR.
Un ácido nucleico de ETR procedente de una
especie de planta distinta de Arabidopsis thaliana puede
identificarse fácilmente mediante procedimientos estándares
utilizando un ácido nucleico de ETR conocido. Por ejemplo,
las sondas marcadas correspondientes a un ácido nucleico de
ETR conocido o que codifica el dominio
amino-terminal conocido, pueden usarse para la
hibridación in situ para detectar la presencia de un gen de
ETR en una especie de planta determinada. Además, tales
sondas pueden usarse para examinar las bibliotecas genómicas o de
cADN de una especie de planta diferente, o para identificar una o
más bandas que contengan la totalidad o parte de un gen de
ETR, mediante hibridación con una preparación separada
electroforéticamente de una digestión de ADN genómico con uno o más
endonucleasas de restricción.
Las condiciones de hibridación variarán
dependiendo de la sonda usada. Cuando se usa una secuencia de
nucleótidos única de un ácido nucleico de ETR, por ejemplo,
un oligonucleótido que contiene la totalidad o parte del dominio
amino-terminal, se usa una rigurosidad relativamente
elevada, por ejemplo, aproximadamente 0,1 \times SSPE a 65ºC.
Cuando la sonda de hibridación cubre una región que tiene una
homología de secuencia potencialmente inferior con ácidos nucleicos
de ETR conocidos, por ejemplo, una región que abarque una
porción del dominio amino-terminal único y una
porción que abarca un dominio transmembrana, la hibridación se lleva
a cabo preferiblemente en condiciones de rigurosidad más moderadas,
por ejemplo, aproximadamente 5 \times SSPE a 50ºC.
Por ejemplo, usando los criterios anteriores, se
examinó una biblioteca de cADN de tomate en proceso de maduración
(Stratagene, La Jolla, California, nº de catálogo 936.004) con una
sonda marcada que comprendía una secuencia de ácido nucleico que
codificaba una porción amino-terminal de la
secuencia de proteína ETR de Arabidopsis thaliana
descubierta en ésta en las Figuras 3A, B, C y D. Se identificaron
varios clones y se secuenciaron mediante técnicas estándares. Las
secuencias de ADN de este ácido nucleico de ETR procedente
del tomate (TETR) y de Arabidopsis thaliana (ETR1) que
codifican los residuos de aminoácidos 1 hasta 123 (SEC. Nº ID.: 20 y
21) y los aminoácidos 306 hasta 403 (SEC. Nº ID.: 22 y 23) se
detallan respectivamente en las Figuras 10A y 10B.
Las secuencias de aminoácidos para la proteína
ETR1 de Arabidopsis thaliana y de tomate (TETR) para
los residuos 1 a 123 (SEC. Nº ID.: 25 y 24), y 306 a 403 (SEC. Nº
ID.: 27 y 26) se detallan respectivamente en las Figuras 11A y
11B.
La secuencia completa de ácido nucleico de
ETR (SEC. Nº ID.: 35) y de aminoácidos (SEC. Nº ID.: 36) para
la TETR se muestra en la Figura 16. En la Figura 17 se muestra una
comparación directa de la secuencia de aminoácidos entre las
proteínas TETR y ETR1 para los 316 residuos
amino-terminales.
Tal como puede verse, hay una homología
sustancial entre estas secuencias ETR de tomate y
Arabidopsis, tanto a nivel de la secuencias de ADN como de la
secuencias de aminoácidos. En particular, la homología a nivel de
ADN para la secuencia que codifica los aminoácidos 1 a 45 es
ligeramente superior al 72%. La homología a nivel de aminoácidos
para los residuos de aminoácidos 1 a 123 es aproximadamente del 79%.
Para la porción amino-terminal (residuos 1 a 316),
la homología global es aproximadamente del 73%. En el caso de la
homología de secuencia de aminoácidos, cuando las diferencias entre
los aminoácidos en residuos equivalentes se compara, y tales
diferencias incluyen la sustitución de un residuo conservado, es
decir, residuos de aminoácidos que son funcionalmente equivalentes,
la similitud de secuencias de aminoácidos aumenta hasta
aproximadamente el 90% para los primeros 123 residuos. El anticuerpo
de secuencia para los 316 aminoácidos
amino-terminales aumenta hasta casi el 85%. Tal
similitud de secuencia se determinó usando un programa para ajuste
óptimo de secuencias, tal como fue descrito por Devereux et
al., Nucl. Acids Res. 12:387-395
(1984).
Los residuos funcionalmente equivalentes (es
decir, conservados) se identifican mediante datos dobles y únicos en
las secuencias de comparación. Similarmente, la homología de
secuencia de ácido nucleico entre Arabidopsis y tomate para
la secuencia que codifica los residuos de aminoácidos 306 a 403 es
aproximadamente del 75%. La homología de secuencia a nivel de
aminoácidos para aminoácidos idénticos es casi del 86%, mientras que
la similitud es casi del 96%.
Además de la ETR1 de Arabidopsis y
la TETR (denominada a veces TXTR) del tomate, se han identificado un
cierto número de otros ácidos nucleicos de ETR en
Arabidopsis y el tomate. En Arabidopsis, se han
identificado los ácidos nucleicos y proteínas QITR y Q8 ETR.
Ver las Figuras 12, 13, 14 y 15, y las secuencias con nº de ID. 41 a
48. Para la QITR, la homología global de ácido nucleico con la
ETR1 es aproximadamente idéntica en el 71% para la secuencia
de aminoácidos, y aproximadamente idéntica en el 72% en términos de
secuencia de ácido nucleico. Con respecto a Q8, la homología de
secuencia global respecto la ETR1 de Arabidopsis es
aproximadamente del 69% para la secuencia global de ácido nucleico,
en comparación con aproximadamente el 81% de homología para la
porción de la Q8 que codifica los 316 aminoácidos
amino-terminales. La homología a nivel de
aminoácidos para la porción amino-terminal entre Q8
y ETR1 es aproximadamente del 72%.
Los otros ácidos nucleicos de ETR
identificados en el tomate incluyen el TGETR1 (SEC. Nº ID.: 37) y
TGETR2 (SEC. Nº ID.: 39). Las secuencias proteicas deducidas para el
TGETR1 (SEC. Nº ID.: 38) y TGETR2 (SEC. Nº ID.: 40) se detallan
respectivamente en las Figuras 18 y 19. La secuencia del TGETR2 es
incompleta. Una comparación de la homología de secuencia para los
primeros 316 residuos aminoácidos de la proteína TGETR1 y de la
proteína ETR1 se muestran en la Figura 20. La identidad de
secuencia está justo por debajo del 92%. La similitud de secuencia
aumenta hasta casi el 96% entre esta porción de las dos proteínas.
Con respecto a la TGETR2, la Figura 21 establece una comparación de
la porción amino-terminal de esta molécula (hasta el
residuos aminoácido 245) con la porción correspondiente de la
proteína ETR1. La identidad de secuencias entre estas dos
porciones de secuencias es de aproximadamente el 85%. La similitud
de secuencia aumenta hasta justo por encima del 92%.
La clonación y secuenciación de los ácidos
nucleicos de ETR procedentes de Arabidopsis se
describen en los ejemplos en ésta. No obstante, dado el extenso
descubrimiento de las secuencias de estos ácidos nucleicos de
ETR, un especialista en la técnica puede fácilmente construir
sondas oligonucleotídicas, realizar amplificaciones mediante PCR, o
utilizar otros protocolos estándares, conocidos por los
especialistas en la técnica, para aislar los genes descubiertos, así
como otros ácidos nucleicos de ETR procedentes de otras
especies y que tengan homología con éstos. Cuando se examina la
misma especie de planta, pueden usarse condiciones de rigurosidad
desde relativamente moderadas a elevadas para la hibridación, las
cuales variarán entre 55ºC y 65ºC en 5\times SSPE. Cuando es
deseable sondear en busca de homología inferior o en otras especies
de plantas, pueden usarse condiciones de rigurosidad inferiores,
tales como 50ºC a 5\times SSPE. No obstante, las condiciones de
lavado requeridas son 0,2\times SSPE.
El aislamiento del ácido nucleico de ETR
TETR1 procedente del tomate se describe en los ejemplos. El
aislamiento de esta secuencia utilizó la porción
amino-terminal del gen ETR1 de
Arabidopsis. Los otros ácidos nucleicos de ETR del
tomate descubiertos en ésta (TGETR1 y TGETR2) se identificaron
examinando una biblioteca genómica de tomate con una sonda
ETR1. La biblioteca genómica se construyó a partir del EMBL
3, al cual se ligó un extracto de ADN genómico de tomate
parcialmente digerido con Sau3A. Las condiciones fueron 65ºC y
5\times SSC, con lavados a 2\times SSC.
Al revisar la estructura global de los diversos
ácidos nucleicos y proteínas de ETR identificados hasta la
fecha, parece que al menos una clase de proteína ETR contiene
una porción amino-terminal única, seguida por un
dominio quinasa de histidina, seguido por una región reguladora de
la respuesta. Los ejemplos de tales proteínas incluyen la QITR en
Arabidopsis y la TETR en el tomate. La importancia de esto no
se comprendió en su día. No obstante, tal como se describe de aquí
en adelante, las mutaciones en los ácidos nucleicos de ETR
que codifican miembros de cada clase pueden conferir una
insensibilidad al etileno a las plantas transgénicas que contienen
tales ácidos nucleicos.
Tal como se describe de aquí en adelante, la
sustitución de los residuos aminoácidos Ala-31,
Ile-62, Cys-65 y
Tyr-102 con un aminoácido diferente resulta en un
ácido nucleico de ETR de Arabidopsis modificado, el
cual es capa de conferir insensibilidad al etileno en una planta
transformada. Cada uno de estos residuos son idénticos entre la
proteína ETR del tomate (ETR) y de Arabidopsis thaliana
(ETR1).
Una vez se ha identificado el ácido nucleico de
ETR, éste puede clonarse y, si es necesario, sus partes
constituyentes pueden recombinarse para formar el ácido nucleico de
ETR entero. Una vez aislado a partir de su fuente natural,
por ejemplo, contenida dentro de un plásmido u otro vector, o
cortado a partir de los mismos como un segmento lineal de ácido
nucleico, el ácido nucleico de ETR puede usarse además como
una sonda para identificar y aislar otros ácidos nucleicos de
ETR. También puede usarse como ácido nucleico
"precursor" para construir ácidos nucleicos y proteínas
ETR modificados.
Tal como se usa en ésta, el término "ácido
nucleico de ETR modificado" se refiere a una ácido
nucleico de ETR que contiene la sustitución, inserción o
supresión de uno o más nucleótidos de un ácido nucleico de
ETR precursor. Los ácidos nucleicos de ETR precursores
incluyen ácidos nucleicos de ETR que ocurren de forma
natural, así como otros ácidos nucleicos de ETR modificados.
Los ácidos nucleicos de ETR que ocurren de forma natural
procedentes de Arabidopsis thaliana pueden usarse como un
ácido nucleico precursor, el cual puede modificarse mediante
técnicas estándares, tales como la mutagénesis dirigida contra un
sitio, la mutagénesis de "cassettes", y similares, para
sustituir uno o más nucleótidos en un codón, tal como el que
codifica la alanina en el residuos 31 en el ácido nucleico de
Arabidopsis thaliana. Tal modificación in vitro del
codón puede resultar en la generación de un codón en la posición 31
que codifica cualquier otro de los residuos aminoácidos que ocurren
de forma natural. Tal modificación resulta en un ácido nucleico de
ETR modificado.
Por ejemplo, la mutación responsable del fenotipo
observado en el mutante Never-ripe se
descubre en los ejemplos. Tal como se describe, una única mutación
en punto cambia a leucina la prolina presente normalmente en el
residuo 36 en la proteína TETR. Esta única mutación es suficiente
para conferir un fenotipo dominante de insensibilidad al etileno a
la planta del tipo salvaje. Se espera que la transformación de la
tomatera y otras plantas con este ácido nucleico modificado confiere
el fenotipo dominante de insensibilidad al etileno a tales células
vegetales transformadas.
Alternativamente, el ácido nucleico precursor
puede ser uno o más de los nucleótidos de un ácido nucleico de
ETR del tipo salvaje que ya ha sido modificado. De este modo,
por ejemplo, el ácido nucleico de ETR de Arabidopsis
thaliana puede modificarse en el codón 31 para formar un ácido
nucleico modificado que contiene la sustitución de ese codón con un
codón que codifica un aminoácido distinto de la alanina, por
ejemplo, la valina. Este ácido nucleico de ETR modificado
puede actuar también como un ácido nucleico precursor para
introducir una segunda modificación. Por ejemplo, puede modificarse
el codón que codifica la Ala-102 para codificar la
sustitución por treonina, en cuyo caso el ácido nucleico modificado
así formado codifica la sustitución de dos aminoácidos diferentes en
los residuos 31 y 102.
También se contemplan las supresiones en los
ácidos nucleicos de ETR. Por ejemplo, una ácido nucleico de
ETR puede modificarse para suprimir la porción que codifica
los dominios transmembrana o intracelular putativos. El ácido
nucleico de ETR modificado así formado, cuando se expresa en
una célula vegetal, produce sólo una porción
amino-terminal de la proteína ETR, la cual es
potencialmente capaz de unir el etileno, bien directa o
indirectamente, para modular el nivel efectivo de etileno en el
tejido de la planta.
Además, el ácido nucleico de ETR
modificado puede identificarse y aislarse a partir de una planta
mutante que tenga un fenotipo dominante o recesivo caracterizado por
una respuesta alterada al etileno. Tales plantas mutantes pueden
surgir espontáneamente, o inducirse mediante técnicas de mutagénesis
químicas o por radiación bien conocidas, seguidas por la
determinación de la respuesta al etileno en la progenie de tales
plantas. Los ejemplos de tales plantas mutantes que ocurren
espontáneamente incluyen el mutante
Never-ripe del tomate, y el mutante
insensible al etileno del clavel. Por tanto, los ácidos nucleicos de
ETR modificados pueden obtenerse mediante la modificación
recombinante de ácidos nucleicos de ETR del tipo salvaje, o
mediante la identificación y aislamiento de alelos ETR
modificados procedentes de especies de plantas mutantes.
Se prefiere que el ácido nucleico de ETR
modificado codifique la sustitución, inserción y/o supresión de uno
o más residuos aminoácidos en la proteína ETR precursora. A
partir de la expresión del ácido nucleico en células de la planta
huésped, la proteína ETR modificada producida de ese modo es
capaz de modular al menos la respuesta de las células huésped al
etileno. En relación con la generación de un fenotipo tal, se han
identificado un cierto número de codones en el ácido nucleico de
ETR procedente de Arabidopsis thaliana, los cuales,
cuando se modifican y reintroducen en una planta del tipo salvaje,
resultan en una disminución en la respuesta al etileno por parte de
la planta transformada. Estos codones codifican los residuos
aminoácidos Ala-31, Ile-62,
Cys-65 y Tyr-102 en la proteína
ETR de Arabidopsis thaliana. El gen ETR y cada
uno de estos residuos aminoácidos modificados concretos se
identificaron mediante la clonación del gen ETR del tipo
salvaje procedente de Arabidopsis thaliana, y de los alelos
modificados químicamente procedentes de cuatro variedades diferentes
(etr1-1, etr1-2,
etr1-3 y etr1-4) de
Arabidopsis thaliana (cada uno de los cuales presentaba un
fenotipo dominante que incluía la insensibilidad al etileno), y
comparando las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos deducidas.
No obstante, la invención, no se limita a ácidos nucleicos de
ETR modificados procedentes de Arabidopsis thaliana,
tal como se describe en los ejemplos. Más bien, la invención incluye
otros ácidos nucleicos de ETR modificados, bastante
fácilmente identificables, los cuales modulan la sensibilidad al
etileno.
Los cuatro variantes anteriores, que presentaban
una insensibilidad al etileno dominante, se generaron mediante
modificación química de plántulas de Arabidopsis thaliana, y
se identificaron observando el desarrollo de la planta a partir de
tales plántulas modificadas con la adición de etileno exógeno.
Usando una estrategia similar, bien con o sin la adición de etileno
exógeno, el especialista capacitado puede generar fácilmente otras
variantes de cualquier especie de planta seleccionada, las cuales
también presentan una respuesta modulada por el etileno. A
continuación, usando las sondas de ETR basadas en las
secuencias de ácido nucleico de ETR del tipo salvaje o
modificadas descubiertas en ésta, pueden aislarse otros ácidos
nucleicos de ETR modificados sondeando bibliotecas
apropiadas, genómicas o de cADN, de la especie de planta
seleccionada y modificada. La secuencia de nucleótidos y/o de
aminoácidos codificada de tales ácidos nucleicos de ETR
generados de nuevo se compara a continuación, preferiblemente con el
ácido nucleico de ETR del tipo salvaje procedente de la
especie de planta seleccionada, para determinar qué modificaciones,
si alguna, en el ácido nucleico de ETR son responsables del
fenotipo observado. Si la secuencia del tipo salvaje de la especie
planta seleccionada no está disponible, pueden usarse para la
comparación las secuencias de ETR del tipo salvaje o
modificadas descubiertas en ésta y procedentes de Arabidopsis
thaliana, u otras secuencias de ETR que se hayan
identificado. De esta forma, pueden identificarse otras
modificaciones de las proteínas ETR las cuales pueden
conferir el fenotipo de insensibilidad al etileno. Tales
modificaciones incluyen la identificación de aminoácidos distintos
de los descubiertos en ésta, los cuales pueden sustituirse en
residuos equivalentes al Ala-31,
Ile-62, Cys-65 y
Ala-102 en el proteína ETR de Arabidopsis
thaliana, y la identificación de otros residuos aminoácidos que
pueden modificarse mediante sustitución, inserción y/o supresión de
uno o más residuos de aminoácidos para producir el fenotipo
deseado.
deseado.
Alternativamente, un ácido nucleico de ETR
precursor clonado puede modificarse sistemáticamente, de forma que
codifique la sustitución, inserción y/o supresión de uno o más
residuos aminoácidos, y ensayarse para determinar el efecto de tal
modificación sobre la respuesta al etileno de una planta. Tales
modificaciones se hacen preferiblemente dentro de la porción del
ácido nucleico de ETR que codifica la porción
amino-terminal de la proteína ETR. No
obstante, también se contemplan las modificaciones de los dominios
carboxi-terminal o transmembrana putativo para
modular la transducción de la señal (por ejemplo, modificaciones de
la histidina conservada del dominio quinasa de histidina, la cual es
el supuesto sitio de autofosforilación, o el aspartato conservado
del dominio regulador de la respuesta, el cual es el supuesto sitio
de fosforilación). Un procedimiento que podría usarse para
identificar residuos aminoácidos concretos implicados en la
interacción directa o indirecta con el etileno, el la sustitución
secuencial de los codones de un ácido nucleico de ETR con
codones que codifican un aminoácido de barrido, tal como la glicina
o alanina (ver, por ejemplo, la publicación del PCT WO90/04.788,
publicada el 3 de mayo de 1990), seguida por transformación en una
planta de cada uno de los ácidos nucleicos así formados, para
determinar el efecto de tal sustitución secuencial sobre la
respuesta al etileno. Otras estrategias incluyen las modificaciones
aleatorias o las modificaciones apuntadas y predeterminadas de los
ácido nucleico de ETR clonados (ver la publicación del PCT nº
WOW92/07.090, publicada el 30 de abril de 1992), seguida por la
transformación de células vegetales y la identificación de la
progenie que tiene una respuesta al etileno alterada. El ácido
nucleico de ETR procedente de aquellas plantas que tengan el
fenotipo deseado se aísla y secuencia para confirmar la identidad de
la modificación responsable del fenotipo observado.
Los residuos aminoácidos equivalentes a aquéllos
identificados específicamente en una proteína ETR, los cuales
pueden modificarse para alterar la respuesta al etileno, también
pueden identificarse fácilmente en proteínas ETR de otras
especies de plantas. Por ejemplo, los residuos aminoácidos
equivalente a los identificadas en la proteína ETR de
Arabidopsis thaliana pueden identificarse fácilmente en otras
proteínas ETR. Una residuo aminoácido en una proteína
ETR precursora es equivalente a un residuo concreto en la
proteína ETR de Arabidopsis thaliana si es homólogo en
posición, en la estructura primaria o terciaria, con el residuo
especificado de la proteína ETR de Arabidopsis.
Con objeto de establecer la homología por medio
de la estructura primaria, la secuencia de aminoácidos primaria de
una proteína ETR precursora se compara directamente mediante
alineamiento con la secuencia primaria de la proteína ETR
procedente de Arabidopsis thaliana. Tal alineamiento es
preferiblemente el del dominio amino-terminal, y
tomará en consideración la inserción o supresión potencial de uno o
más residuos aminoácidos entre las dos secuencias para maximizar la
homología de secuencia de aminoácidos. Una comparación de una
multiplicidad de secuencias de proteína ETR con la de
Arabidopsis thaliana proporciona la identificación de
residuos conservados entre tales secuencias, cuya conservación se
mantiene preferiblemente para ulterior comparación de la secuencia
de aminoácidos primaria. En base al alineamiento de tales
secuencias, el especialista cualificado puede identificar fácilmente
los residuos aminoácidos en otras proteínas ETR que son
equivalentes a Ala-31, Ile-62,
Cys-65, Ala-102 y otros residuos en
la proteína ETR de Arabidopsis thaliana. Tales
residuos equivalentes se seleccionan para modificaciones análogas
aquéllas de otras proteínas ETR modificadas, las cuales
confieren el fenotipo deseado de repuesta al etileno. Tales
proteínas ETR modificadas se construyen preferiblemente
modificando un ácido nucleico de ETR precursor para codificar
la correspondiente sustitución, inserción y/o supresión en el
residuo aminoácido equivalente.
Además de la homología a nivel de secuencia
primaria, pueden identificarse residuos equivalentes en base a la
homología a nivel de estructura terciaria. La determinación de
equivalencia a este nivel generalmente requerirá estructuras
cristalinas tridimensionales para una proteína ETR o proteína
ETR modificada de Arabidopsis (o la estructura
cristalina del otra proteína ETR que tenga residuos
equivalentes definidos), y la estructura cristalina de una proteína
ETR seleccionada. Los residuos equivalentes a nivel de
estructura terciaria se definen como aquellos para los cuales las
coordenadas atómicas de dos o más de los átomos de la cadena
principal de un residuo aminoácido particular de la proteína
ETR seleccionada, en comparación con la proteína ETR
procedente de Arabidopsis, están dentro de los 0,13 nm, y
preferiblemente 0,10 nm, de alineamiento. El alineamiento se
consigue después que se haya orientado y colocado el mejor modelo
para obtener el máximo solapamiento de coordenadas atómicas de
átomos de proteína, que no son hidrógenos, de las proteínas
ETR en cuestión.
Los ácidos nucleicos de ETR pueden
derivarse a partir de cualquiera de las plantas superiores que
responden al etileno. Las plantas particularmente apropiadas
incluyen la tomatera, el bananero, el fruto del kiwi, el aguacate,
el melón, el mango, la papaya, la manzana, el melocotón, y otras
plantas de frutos climatéricos. Las especies no climatéricas a
partir de las cuales pueden aislarse ácidos nucleicos de ETR
incluyen la fresa, frambuesa, zarzamora, arándano, lechuga,
calabaza, coliflor, cebolla, brécol, coles de bruselas, algodón,
canola, uva, soja y semillas de colza. Además, los ácidos nucleicos
de ETR pueden aislarse a partir de plantas de flor dentro de
la división Magnoliofita, la cual incluye las angiospermas, las
cuales incluyen las dicotiledóneas (clases Magnoliopsida y
Dicotyledoneae) y las monocotiledóneas (clase Liliopsida). Los
órdenes de angiospermas particularmente preferidos, de acuerdo con
la "Taxonomy of Flowering Plants", by A.M. Johnson, The Century
Co., NY, 1931, incluyen los Rosales, Cucurbitales,
Rubiales, Campanulatae, Contortae,
Tubiflorae, Plantaginales, Ericales,
Primulales, Ebenales, Diapensiales,
Primulales, Plumbaginales, Opuntiales,
Sarraceniales, Ramales, Centrospermae,
Santales, Euphorbiales, Capparales,
Aristolochiales, Julianiales, Juglandales,
Fagales, Urticales, Myricales,
Polygonales, Batidales, Balanopsidales,
Proteales, Salicales, Leitneriales,
Garryales, Vriticillatae, y Piperales. Las
plantas particularmente preferidas incluyen el lirio, el clavel, el
crisantemo, la petunia, la rosa, el geranio, la violeta, los
gladiolos, las orquídeas, las lilas, el manzano silvestre,
"sweetgum", el arce, la poinsettia, el algarrobo, el fresno y
el tilo.
Además de proporcionar una fuente de ácido
nucleico de ETR que pueden modificarse o aislarse de acuerdo
con las enseñanzas en ésta, las plantas anteriores pueden usarse
como receptoras del ácido nucleico modificado para producir plantas
quiméricas o transgénicas, las cuales presentan un fenotipo de
resistencia al etileno en uno o más tipos de tejidos de la planta
transformada.
Una vez de ha clonado un ácido nucleico de
ETR modificado, éste se usa para construir vectores para
transformar las células vegetales. La construcción de tales vectores
está facilitada por el uso de un vector lanzadera, el cual es capaz
de manipulación y selección en ambos, la planta y un huésped de
clonación conveniente, tal como un procariota. Por tanto, tales
vectores pueden incluir un gen de resistencia a antibióticos para su
selección en células vegetales (por ejemplo, el de la resistencia a
la kanamicina), y un gen de resistencia a antibióticos para
selección en un huésped bacteriano (por ejemplo, el de la
resistencia a la actinomicina). Tales vectores lanzadera también
contienen un origen de replicación apropiado para el huésped
procariota usado, y, preferiblemente, al menos un único sitio de
restricción o un poliengarce que contiene sitios de restricción
únicos para facilitar la construcción del vector. Los ejemplos de
tales vectores lanzadera incluyen el pMON530 (Rogers et al.,
Methods in Enzymology 153:253-277 (1988)) y
pCGN1547 (McBride et al., Plant Molecular Biology
14:269-276 (1990)).
En las realizaciones preferidas, las cuales
incluyen el mejor modo de poner en práctica la invención, se usa un
promotor para dirigir la expresión de un ácido nucleico de
ETR o ETR modificado, en al menos una porción de los
tejidos de una planta transformada. La expresión de un ácido
nucleico de ETR es preferiblemente en la orientación
antisentido para modular la respuesta al etileno mediante la
reducción en la traducción del transcrito de ARN de ETR
endógeno. La expresión de un ácido nucleico de ETR modificado
resulta en la producción de una proteína ETR modificada, la
cual es capaz de conferir insensibilidad al etileno. Tales
promotores podrían obtenerse a partir de plantas, de bacterias
patógenas de plantas, o de virus de plantas. Los promotores
constitutivos incluyen los promotores 25S y 19S del virus del
mosaico de la coliflor (CaMV35S y CaMV19S), el promotor transcrito
de longitud completa del virus del mosaico de Figwort (FMV35S) (ver
publicación del PCT nº WO92/12.249, publicada el 23 de julio de
1992), y los promotores asociados con genes de Agrobacterium
tales como los de la sintasa de nopalina (NOS), de la sintasa de
manopina (MOS), o de la sintasa de octopina (OCS). Otros promotores
constitutivos incluyen los promotores \alpha-1 y
\beta-1 de la tubulina (Silflow et al.,
Devel. Genet. 8:435-460 (1987)), los
promotores de histona (Chaubet, Devel. Genet.
8:461-473 (1987)), y los promotores que regulan la
transcripción de los ácidos nucleicos de la ETR.
En algunas realizaciones, pueden usarse
promotores específicos de tejidos y/o temporales para controlar la
expresión de los ácidos nucleicos de ETR y modificados de
ETR. Los ejemplos de promotores específicos de frutas
incluyen los promotores E8, E4, E17 y J49 del tomate (Lincoln et
al., Mol. Gen. Genet. 212:72-75 (1988)) y
los promotores 2A11, Z130 y Z70 del tomate, tal como se describen en
las patentes estadounidenses nº 4.943.674, 5.175.095, y 5.177.307.
Además, la expresión preferente en tejido dividiéndose rápidamente
puede obtenerse utilizando el promotor EF-1\alpha
de la planta, tal como se describe en la patente estadounidense nº
5.177.011. Los ejemplos de promotores específicos de flores incluyen
los promotores leafy y los promotores procedentes de los
genes apetala, pistillata y agamous. Un sistema
promotor para apuntar la expresión a las hojas de una planta
transformada es un promotor quimérico que comprende el promotor
CaMV35S ligado a la porción del gen ssRUBISCO que reprime la
expresión del ssRUBISCO en ausencia de luz. Además, también pueden
usarse promotores específicos del polen. Tales promotores son bien
conocidos por los especialistas en la técnica y pueden adquirirse
fácilmente. Un ejemplo de un promotor tal es el ZnI3 (Hamilton et
al., Plant Mol. Biol. 18:211-218 (1992)).
Este promotor se clonó a partir de trigo (monocotiledónea), pero
funciona como un promotor fuerte y específico de polen cuando se usa
en el tabaco (dicotiledónea).
Los ejemplos de promotores inducibles que pueden
usarse para la expresión condicionada de ácidos nucleicos de
ETR incluyen aquéllos procedentes de genes de proteína de
choque térmico, tales como el gen de la proteína de choque térmico
PHS1 (Takahashi et al., Mol. Gen. Genet.
219:365-372 (1989)), y los promotores inducibles
mediante luz, incluyendo los tres promotores de las proteínas
captoras de luz clorofila a/b (Leutwiler et al., Nucl.
Acids Res. 14:4051-4064 (1986)) y el promotor
de la pre-ferrodoxina (Vorst et al., Plant
Mol. Biol. 14:491-499 (1990)).
En una realización ulterior de la invención, el
vector usado para transformar las células vegetales se construye
para apuntar la inserción del ácido nucleico de ETR en un
promotor endógeno dentro de la célula vegetal. Un tipo de vector,
que puede usarse para apuntar la integración de un ácido nucleico de
ETR modificado hacia un promotor endógeno, incluye una vector
de selección positiva-negativa análogo al detallado
por Monsour et al., Nature 336:348-352
(1988), el cual describe el apuntamiento de ADN exógeno a un locus
endógeno predeterminado en células ES de mamífero. Construcciones
similares, utilizando marcadores de selección positiva y negativo
funcionales en las células vegetales, pueden diseñarse fácilmente en
base a la identificación del promotor endógeno de la planta y las
secuencias que lo rodean. Cuando se usa tal estrategia, se prefiere
el uso de un vector del tipo de remplazo para minimizar la
posibilidad de reversión al genotipo del tipo salvaje.
Los vectores de la invención se diseñaron de tal
forma que la secuencia de promotor contenida en el vector, o la
secuencia de promotor apuntada en el genoma de la planta, estén
operativamente unidas al ácido nucleico que codifica el ácido
nucleico de ETR o de ETR modificado. Cuando se usa la
hebra positiva del ácido nucleico de ETR, el término
"operativamente unido" significa que la secuencia del promotor
está ubicada en relación a la secuencia codificante del ácido
nucleico de ETR de tal forma que la polimerasa de ARN es
capaz de iniciar la transcripción del ácido nucleico de ETR a
partir de la secuencia promotora. En tales realizaciones, también se
prefiere proporcionar sitios de unión a ribosomas, secuencias de
iniciación y terminación de la transcripción, secuencias de
iniciación y terminación de la traducción, y secuencias de
poliadenilación apropiadas para producir un transcrito de ARN
funcional, el cual puede traducirse en una proteína ETR.
Cuando se usa una orientación antisentido del ácido nucleico de
ETR, todo lo que se precisa es que el promotor esté
operativamente unido para transcribir la hebra ETR
antisentido. Por tanto, en tales realizaciones, sólo se necesitan
las secuencias de iniciación y terminación de la transcripción para
proporcionar un transcrito de ARN capaz de hibridarse con el mARN y
otros transcritos de ARN procedentes de un gen ETR endógeno o
de un ácido nucleico de ETR modificado contenido en una
célula vegetal transformada. Además de los promotores, pueden
añadirse otras secuencias de regulación de la expresión, tales como
potenciadores, para facilitar la expresión del ácido nucleico de
ETR in vivo.
Una vez se ha construido el vector, la
transformación de plantas puede realizarse de acuerdo con la
invención, mediante, esencialmente, cualquiera de los varios
procedimientos de transformación conocidos por los especialistas en
la técnica de la biología molecular de plantas. Tales procedimientos
se describen de forma general en Methods in Enzymology, Vol.
153 ("Recombinant DNA Part D"), 1987, Eds. Wu y Grossman,
Academic Press. Tal como se usa en ésta, el término
"transformación" significa la alteración del genotipo de una
célula vegetal por la introducción de ácido nucleico exógeno. Los
procedimientos particulares para la transformación de células
vegetales incluyen la microinyección directa del ácido nucleico en
una célula vegetal mediante el uso de micropipetas.
Alternativamente, el ácido nucleico puede transferirse a una células
vegetal mediante el uso de polietilenglicol (Paszkowski et
al., EMBO J 3:2712-2722 (1984)). Otros
procedimientos de transformación incluyen la electroporación de
protoplastos (Fromm et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
82:5824 (1985)); la infección con un virus específico de plantas,
por ejemplo el virus del mosaico de la coliflor (Hohn et al.,
"Molecular Biology of Plant Tumors", Academic Press, Nueva York
(1982), pp. 549-560), o el uso de secuencias de
transformación procedentes de bacterias específicas de plantas,
tales como Agrobacterium tumefaciens, por ejemplo, un
plásmido Ti transmitido a una célula vegetal a partir de su
infección por Agrobacterium tumefaciens (Horsch et
al., Science 233:496-498 (1984); Fraley
et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80:4803 (1983)).
Alternativamente, las células vegetales pueden transformarse
mediante la introducción de ácido nucleico, contenido en la matriz o
en la superficie de pequeñas cuentas o partículas, por medio de
penetración balística de alta velocidad en la célula vegetal (Klein
et al., Nature 327:70-73 (1987)).
Después de la introducción del vector en una
célula vegetal, la selección de la transformación exitosa se realiza
típicamente antes de la regeneración de una planta. Tal selección de
la transformación no es necesaria, pero facilita la selección de
plantas regeneradas que tienen el fenotipo deseado mediante la
reducción del fondo de tipo salvaje. Tal selección se basa
convenientemente en genes de resistencia a antibióticos y/o de
resistencia a herbicidas, los cuales podrían incorporarse en el
vector de transformación.
Prácticamente todas las plantas pueden
regenerarse a partir de células o tejidos cultivados. Tal como se
usa en ésta, el término "regeneración" se refiere al
crecimiento de una planta completa a partir de una célula vegetal,
un grupo de células vegetales, o de parte de una planta. Los
procedimientos para la regeneración de plantas son bien conocidos
por los especialistas en la técnica. Por ejemplo, la regeneración a
partir de protoplastos cultivados se describe en Evans et
al., "Protoplasts Isolation and Culture", Handbook of
Plant Cell Cultures 1:124-176 (MacMillan
Publishing Co., Nueva York (1983); M.R. Davey, "Recent
Developments in the Culture and Regeneration of Plant
Protoplasts", Protoplasts (1983) Lecture
Proceedings, pp. 12-29 (Birkhauser, Brasil,
1983); y H. Binding "Regeneration of Plants", Plant
Protoplasts, pp. 21-73 (CRC Press, Bocaraton,
1985). Cuando las transformación es de parte de un órgano, la
regeneración puede hacerse a partir de callos de plantas, explantes,
órganos o partes. Tales procedimientos de regeneración son conocidos
también por los especialistas en la técnica. Ver, por ejemplo,
Methods in Enzymology, más arriba; Methods in
Enzymology, Vol. 118; y Klee et al., Annual Review of
Plant Physiology 38:467-486.
Un procedimiento preferido para transformar y
regenerar petunias con los vectores de la invención fue descrito por
Horsch, R.B. et al., Science
227:1229-1231 (1985). Un procedimiento preferido
para transformar algodón con los vectores de la invención y
regenerar plantas a partir del mismo se describe en Trolinder et
al., Plant Cell Reports 6:231-234
(1987)).
Las células de tomatera se transforman
preferiblemente usando cepas de Agrobacterium mediante el
procedimiento descrito en McCormick et al., Plant Cell
Reports 5:81-84 (1986)). En concreto, se
obtienen cotiledones a partir de plántulas de 7-8
días. Las plántulas se esterilizan superficialmente durante 20
minutos en lejía Clorox al 30%, y se germinan en cajas Pantcons en
medio de germinación Davis. El medio de germinación Davis está
formado por 4,3 g/l de sales MS, 20 g/l de sacarosa, y 10 mls/l de
vitaminas Nitsch, pH 5,8. La solución de vitamina Nitsch está
formada por 100 mg/l de myo-inositol, 5 mg/l de
ácido nicotínico, 0,5 mg/l de piridoxina HCl, 0,5 mg/l de tiamina
HCl, 0,05 mg/l de ácido fólico, 0,05 mg/l de biotina, 2 mg/l de
glicina. Las plántulas se dejaron germinar durante
7-8 días en la cámara de cultivo, a 25ºC, 40% de
humedad, bajo bombillas de luz blancas fría con una intensidad de 80
einstein m^{2} s^{-1}. El fotoperiodo fue de 16 horas de luz y 8
horas de oscuridad.
Una vez ocurre la germinación, los cotiledones se
extraen usando un hoja de bisturí #15 cortando el meristemo apical y
el hipocotilo para crear un explante rectangular. Estos cortes en
los extremos cortos del cotiledón de germinación incrementan el área
de la superficie para infección. Los explantes se bañan en líquido
de regeneración Davis estéril para impedir su desecación. El medio
de regeneración Davis está formado por 1\times sales MS, 3% de
sacarosa, 1\times vitaminas Nitsch, 2,0 mg/ml de zeatina,
pH 5-8. Esta solución se autoclavó con 0,8%
de agar Noble.
Los cotiledones se pre-cultivaron
en "placas de alimentación" compuestas por medio que no
contenía antibióticos. El medio está compuesto por 4,3 g/l de sales
MS, 30 g/l de sacarosa, 0,1 g/l de myo-inositol, 0,2
g/l de KH_{2}PO_{4}, 1,45 ml/l de una solución de 0,9 mg/ml de
tiamina HCl, 0,2 ml de una solución de 0,5 mg/ml de kinetina, y 0,1
ml de una solución de 0,2 mg/ml de solución de 2,4 D. Esta solución
se ajusta a pH 6,0 con KOH. Estas placas se recubrieron con
1,5-2,0 ml de células en suspensión de tabaco (TXD)
y un filtro Whatman estéril empapado en medio 2COO5K. El medio
2COO5K está compuesto por 4,3 mg/l de mezcla de sales MS de Gibco, 1
ml de vitaminas B5 (1000\times, de reserva), 30 g/l de sacarosa, 2
ml/l de PCPA a partir de una solución de reserva 2 mg/ml, y 10
\mul/l de kinetina a partir de una solución de reserva 0,5 mg/ml.
Los cotiledones se cultivaron durante 1 día en una cámara de cultivo
a 25ºC, bajo luz blanca fría, con una intensidad de luz de
40-50 eisntein m^{2} s^{-1}, con una fotoperiodo
de luz continuo.
Los cotiledones se inoculan a continuación con
una solución en fase log de Agrobacterium conteniendo el
ácido nucleico de ETR modificado o del tipo salvaje. La
concentración de Agrobacterium es aproximadamente de 5
\times 10^{8} células/ml. Los cotiledones se dejan empapar en la
solución de bacterias durante seis minutos, y a continuación se
transfieren, para retirar la solución en exceso, a discos de filtro
Whatman estériles, y se devuelven subsiguientemente a la placa de
alimentación original, en donde se dejan co-cultivar
durante 2 días. Transcurridos los dos días, los cotiledones se
transfieren a placas de selección que contienen medio de
regeneración Davis con 2 mg/l de zeatina-ribosa,
500 \mug/ml de carbenicilina, y 100 \mug/ml de kanamicina.
Transcurridas 2-3 semanas, los cotiledones con
callos y/o formación de brotes se transfieren a placas de
regeneración Davis nuevas conteniendo carbenicilina y kanamicina a
los mismos niveles. El experimento se puntúa por los transformantes
en este momento. El tejido de callo se subcultiva a intervalos
regulares de 3 semanas, y cualesquiera estructuras anormales se
recortan, de forma que las yemas de los brotes en desarrollo
continúen regenerándose. Los brotes se desarrollan en
3-4 meses.
Una vez se desarrollan los brotes, éstos pueden
seccionarse claramente del tejido calloso y plantarse sobre placas
de selección de arraigamiento. Estas placas contienen 0,5\times
MSO que contiene 50 \mug/ml de kanamicina y 500 \mug/ml de
carbenicilina. Estos brotes forman raíces sobre el medio de
selección en dos semanas. Si no aparecen raíces transcurridas 2
semanas, los brotes se recortan y replantan sobre el medio de
selección. Los cultivos de brotes se incuban en "percivals" a
una temperatura de 22ºC. Los brotes con raíces se transfieren a
tiestos cuando las raíces tienen aproximadamente 2 cm de longitud.
Las plantas se fortalecen en una cámara de cultivo a 21ºC, con un
fotoperiodo de 18 horas de luz y 6 horas de oscuridad, durante
2-3 semanas antes de transferirlas a un invernadero.
En el invernadero, las plantas se hacen crecer a una temperatura de
26ºC durante el día, y de 21ºC durante la noche. El fotoperiodo es
de 13 horas de luz y 11 horas de oscuridad, y las plantas se dejan
madurar.
Una vez se han regenerado las plantas, se
seleccionan una o más plantas en base al cambio en la respuesta al
etileno. Por ejemplo, cuando se usa un ácido nucleico de ETR
modificado con su promotor nativo, la selección puede basarse en una
alteración de cualquiera de una de las "respuestas triples" de
las plántulas de tales plantas. Guzman et al., The Plant
Cell 2:523 (1990). Alternativamente, o cuando se usan promotores
constitutivos, pueden ensayarse otras diversas respuestas al
etileno, y compararse con las de las planta del tipo salvaje. Tales
otras respuestas al etileno incluyen la epinastia (la cual se
observa principalmente en el tomate), la escisión, la abscisión, la
senescencia de los pétalos florales, y la maduración de los frutos.
Además de los cambios evidentes en la respuesta al etileno, pueden
determinarse los niveles de varios enzimas a continuación de la
exposición a etileno para determinar el tiempo de respuesta para le
incremento o disminución típicos en el nivel de una proteína
determinada, tal como un enzima. Los ejemplos de varias respuestas
al etileno, que pueden usarse para determinar si una planta concreta
tiene una respuesta disminuida al etileno, se detallan en el
Capítulo 7, "The Mechanisms of Ethylene Action", en Ethylene
in Plant Biology, 2ª edición, Eds. F.B. Abels, P.W. Morgan, y
M.E. Salveit, San Diego, Academic Press, Inc. (1982). Cuando se usa
un promotor específico de tejido y/o temporal, o un promotor
inducible, la determinación de una modulación en la respuesta al
etileno se determina en el tejido apropiado en el momento apropiado,
y, si es necesario, en las condiciones apropiadas para
activar/desactivar un promotor inducible. En cada caso, la respuesta
al etileno se compara preferiblemente con la misma respuesta al
etileno de una respuesta del tipo salvaje.
Las que siguen son realizaciones particularmente
preferidas para modular la respuesta al etileno en los frutos. No
obstante, tales realizaciones pueden modificarse fácilmente para
modular la respuesta al etileno en tejidos vegetativos y flores.
En una estrategia, un ácido nucleico de
ETR modificado está operativamente unido a un promotor
constitutivo de fuerza moderada se usa para reducir la respuesta al
etileno. Esto resulta en un alargamiento del tiempo de maduración de
la fruta.
En una realización alternativa, se usa un ácido
nucleico de ETR modificado operativamente unido a un promotor
regulable (inducible), de forma que puede mantenerse la condición
que pone en marcha la expresión del ácido nucleico de ETR
modificado para impedir la maduración de la fruta. La condición que
apaga la expresión del ácido nucleico de ETR modificado puede
entonces mantenerse para obtener la maduración. Por ejemplo, puede
usarse un promotor inducible mediante calor, el cual es activo a
altas temperaturas (en el campo), pero no a bajas temperaturas,
tales como durante la refrigeración. Un ejemplo ulterior utiliza un
promotor inducido por auxina o giberelina, de tal como que las
plantas transformadas pueden tratarse con análogos comerciales de la
auxina, tales como el 2,4-D, o con análogos
comerciales de la giberelina, tales como el
Pro-Gibb, para impedir la maduración de la
fruta.
Alternativamente, puede unirse operativamente un
promotor constitutivo fuerte a un ácido nucleico de ETR
modificado para impedir la maduración de la fruta. Con objeto de
impedir la maduración eventual de la fruta, la planta también se
transforma con un ácido nucleico de ETR del tipo salvaje
operativamente unido a un promotor inducible. La expresión del ácido
nucleico de ETR del tipo salvaje se incrementa exponiendo la
planta a la condición apropiada a la cual responde el promotor
inducible. Cuando se incrementa la expresión del ácido nucleico de
ETR del tipo salvaje, el efecto de la expresión del ácido
nucleico de ETR modificado se reduce, de tal forma que ocurre
la maduración de la fruta.
Las construcciones particulares que son deseables
para su uso en la transformación de plantas, para conferir
insensibilidad al etileno, incluyen el promotor CMV35S unido
operativamente a cualesquier otros clones de cADN o genómicos de
ETR de Arabidopsis mutante, incluyendo la
correspondiente modificación en el residuo 36 para convertir la
prolina en leucina. Se espera que tales construcciones confieran un
fenotipo dominante de insensibilidad al etileno a células y plantas
transformadas con y expresando tales construcciones.
Además, una construcción preferida incluye el
promotor FMV operativamente unido para dirigir la expresión del cADN
de TETR del tomate, el cual se ha manipulado para contener una
mutación análoga a cualquiera de las identificadas en los genes de
ETR procedentes de Arabidopsis, así como la mutación
Nr hallada en el gen ETR del tomate. Se espera que tales
construcciones confieran un fenotipo dominante de insensibilidad al
etileno a células y plantas que se han transformado con y expresan
tales construcciones.
Otras construcciones preferidas incluyen el
promotor FMV operativamente unido a cADN de ETR antisentido,
incluyendo el TETR y ETR1. Se espera que tales construcciones
confieran un fenotipo dominante de insensibilidad al etileno a
células y plantas que se han transformado con y expresan tales
construcciones.
La invención puede practicarse en una amplia
variedad de plantas para obtener fenotipos útiles. Por ejemplo, la
invención puede usarse para retrasar o impedir la senescencia floral
y la abscisión durante el crecimiento o durante el transporte o
almacenamiento, tal como ocurre en las camas de flores o cultivos de
algodón (Hall et al., Physiol. Plant
10:306-317 (1957)) y en flores ornamentales (por
ejemplo, claveles, rosas) que, o son cortadas (Halevy et al.,
Hort. Rev. 3:59-143 (1981)) o no. Además, la
invención puede practicarse para retrasar o impedir la senescencia y
abscisión de hojas y frutas en el pepino (Jackson et al.,
Can. J. Bot. 50:1465-1471 (1972)), legumbres
y otros cultivos (Heck et al., Texas Agric. Expt. Sta.
Misc. Publ. MP 613:1-13 (1962)), y plantas
ornamentales (por ejemplo, "holly wreath") (Curtis et
al., Proc. Am. Soc. Hort. Sci.
560:104-108 (1952)). Otros usos incluyen la
reducción y prevención de compuestos fenólicos de gusto amargo
(isocoumarinos), los cuales son inducidos por el etileno, por
ejemplo, en las patatas dulces (Kitinokja "Manipulation of
Ethylene Responses in Horticulture", Ed. Reid, Acta Hort.,
Vol. 201, pp. 337-342 (1978)) y zanahorias (Coxon
et al., Phytochemistry 12:1881-1885
(1973)), chirivía (Shattuck et al., Hort. Sci. 23:912
(1988)) y Brassica. Otros [usos] incluyen el impedir o lesionar
selectivamente los tejidos reproductores, tal como ocurre en la
avena y canola (Reid et al., en "Ethylene in Plant
Development", Eds. Roberts, Tucker, Londres, Butterworths, pp.
277-286, 1985), la pérdida de aroma, firmeza y/o
textura, tal como ocurren en productos almacenados, tales como las
manzanas y sandías (Risse et al., Hort. Sci.
17:946-948 (1982)), el moteado bermejo (una
alteración posterior a la recolección), el cual es inducido por el
etileno en las lechugas de cabeza crujiente (crisphead)
(Hyodo et al. Plant Physiol. 62:31-35
(1978)), para promover la producción de flores macho (Jaiswal et
al., Proc. Indian Acad. Sci. (Plant Sci
95:453-459) (1985)), y para incrementar el tamaño de
la planta, por ejemplo, retrasando la formación de flores en
bromelias ornamentales (Mekers et al., Acta Hortic.
137:217-223 (1983)). Más aún, una disminución en la
respuesta al etileno puede usarse para retrasar el desarrollo de
enfermedades, tales como la prevención de lesiones y senescencia en
pepinos infectados por Colleototrichum lagenarium, y para
reducir las enfermedades en plantas en las que el etileno causa un
incremento en el desarrollo de enfermedades, por ejemplo, en la
cebada, los cítricos, las plántulas del abeto de Douglas, la uva,
las ciruelas, las rosas, los claveles, las fresas, el tabaco, el
tomate, el trigo, la sandía y las plantas ornamentales. Además, la
invención puede usarse para reducir el efecto del etileno hallado en
el entorno, e indirectamente el efecto de varias presiones
ambientales que resultan en la biosíntesis de etileno en el tejido
de la planta. Por ejemplo, el etileno existe con niveles biológicos
perjudiciales en atmósferas localizadas a causa de incendios, humos
de automóviles e industria. Ver, por ejemplo, el Capítulo 8,
"Ethylene in the Environment", en Ethylene in Plant
Biology, ver más arriba. Además, la invención puede usarse para
minimizar el efecto del etileno sintetizado en respuesta a presiones
ambientales tales como las inundaciones, la sequía, la deficiencia
de oxígeno, las lesiones (incluyendo la presión y las magulladuras),
las heladas, la invasión por patógenos (por virus, bacterias,
hongos, insectos, nemátodos, y similares), la exposición química
(por ejemplo, a ozono, sales, e iones de metales pesados), y la
radiación.
Lo que sigue se presenta a modo de ejemplo y no
debe considerarse como una limitación del ámbito de la
invención.
Se cruzaron plantas etr1-1
respectivamente con dos líneas portadoras de los marcadores visibles
recesivos ap1 y ap2. La progenie F_{1} se dejo
auto-polinizar. Los fenotipos de puntuaron en la
F_{2}. Los porcentajes de recombinación (usando la función de
mapado de Kosambi, D.D. Kosambi Ann. Eugen. 12:172 (1944))
se determinaron en centimorgans. El locus ETR1 se localizó en
la porción inferior del cromosoma 1, entre los marcadores genéticos
visibles ap1 y clv2 (6,5 \pm 1,0 cM desde AP1
y 2,8 \pm 1,1 cM desde CLV2).
Se cruzó etr1-1 con la
línea W100 de prueba (ecotipo Landsberg (Koorneef et al.,
Arabidopsis inf. Serv. 23:46 (1987)) y las plantas F_{1} se
dejaron auto-polinizar. Se analizó la unión de
marcadores RFLP al locus ETR1 en 56 plantas F_{2} tal como
se describe en Chang et al., Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 85:6856 (1988). Lo de los marcadores RFLP que residen en
esta región del cromosoma 1, un marcador, 1bAt315, se
co-segregó completamente con el fenotipo del mutante
etr1-1 de entre 112 cromosomas. Por tanto,
el clon 1bAt315 se usó como una sonda para iniciar un recorrido por
el cromosoma en la región del gen ETR1. Se utilizaron varias
bibliotecas de cósmidos de ADN genómico. Una biblioteca contenía
subclones de dos cromosomas artificiales de levadura (YAC EG4E4 y
EG2G11 (Grill et al., Mol. Gen. Genet. 226:484 (1991))
que se hibridan con el 1bAt315. Para subclonar los YAC, el ADN total
procedente de células de levadura que albergaban EG4E4 o EG2G11 se
digirieron parcialmente con Sau3Al, y se clonaron en el sitio BgIII
del vector de cósmido pCIT30 (Ma et al., Gene 117:161
(1992)). Se usaron procedimientos estándares de clonación y
verificación (Sambrook et al., Molecular Cloning: A
Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring
Harbor, N.Y., 1989)). Se construyó una biblioteca a partir del
mutante etr1-1 de forma similar en pCIT30. La
biblioteca del tipo salvaje se construyó previamente (Yanofsky et
al., Nature 346:35 (1990)). Mediante análisis de restricción e
hibridación secuencial con estas bibliotecas, se obtuvieron cósmidos
solapados (un "contig") que abarcaban una distancia de
aproximadamente 230 kb. Ver la Figura 8.
El gen ETR1 se localizó en una subregión
de aproximadamente 47 kb usando el mapado de RFLP de estructura
fina.
Para crear el mapa de estructura fina, se
aislaron recombinantes meióticos en base al fenotipo de la
auto-progenie de F_{2} de los cruces anteriores
entre el mutante etr1-1 (ecotipo Columbia) y
dos líneas (ambas del ecotipo Landsberg) portadoras de ap1 y
clv2. Se identificaron los recombinantes en la progenie
F_{2} como plantas que eran, o bien del tipo salvaje en ambos
loci, o mutantes en ambos loci. El ETR1 se puntuó en
plántulas creciendo a oscuras (Bleecker et al.,
Science 241:1086 (1988)). Se obtuvieron setenta y cuatro (74)
recombinantes entre ETR1 y AP1, y 25 recombinantes
entre ETR1 y CLV2. Los puntos de rotura de la
recombinación se ubicaron usando como sondas fragmentos de ADN
procedentes del recorrido del cromosoma. Dado el número de
recombinantes aislados, la distancia promedio calculada entre los
puntos de rotura fue aproximadamente de 20 kb para cada cruce. A lo
largo del contig de 230 kb, se halló que la densidad real de puntos
de rotura era consistente con la densidad calculada sobre el lado
CLV2 (con 5 puntos de rotura en aproximadamente 120 kb). Los
puntos de rotura más cercanos flanqueando el gen ETR1
definieron un segmento de ADN de aproximadamente 47 kb.
Para buscar transcritos derivados de esta región
de 47 kb, se examinaron bibliotecas de cADN usando fragmentos de
ADN. Un clon de cADN se denominó \lambdaC4, y se detectó con el
fragmento 1 de EcoRI de 4,25 kb mostrado en la Figura 8. Puesto que
\lambdaC4 potencialmente representaba el gen ETR1, este
clon se caracterizó más a fondo.
Las secuencias de nucleótidos del cADN de
\lambdaC4 y el ADN genómico correspondiente (Figura 2) (SEC. Nº
ID.: 1) se determinó usando la versión 2.0 de Sequenase (United
States Biochemical Co., Cleveland, Ohio) y cebadores de
oligonucleótidos sintéticos que tienen una longitud de 17
nucleótidos. Las secuencias cebadoras se escogieron a partir de
secuencias de ETR1 existente con objeto de extender la
secuencia hasta que se determinó la secuencia completa. La secuencia
inicial se obtuvo usando cebadores que se asociaban al vector de
clonación. Las plantillas eran plásmidos de doble hebra. Se
secuenciaron ambas hebras del ADN genómico, incluyendo 225 p.b.
cadena arriba del sitio de inicio de la transcripción presumido, y
90 p.b. cadena abajo del sitio de poliadenilación. El \lambdaC4 se
secuenció en una única hebra.
\lambdaC4 tenía 1812 p.b. de longitud,
incluyendo una cola poliA de 18 bases. A partir de las secuencias de
ADN y de transferencias de ARN (descritas más abajo) se determinó
que el \lambdaC4 carecía de aproximadamente 1000 pares de bases
del extremo 5'.
Para obtener cADN más largos, se sintetizó cADN
de la primera hebra (RiboClone cDNA Synthesis System, Promega,
Madison, Wisconsin) a partir de poliA+ARN de plántulas, usando
cebadores específicos de la secuencia internos para el \lambdaC4.
A continuación se amplificó el cADN mediante PCR (Saiki, R.K. et
al., Science 230:1350 (1985)) usando varios pares de
cebadores: se escogieron cebadores de PCR 3' para asociarse a
diferentes exones, tal como se dedujo a partir de las secuencias de
cADN y ADN genómico, y se escogieron cebadores de PCR 5' para
asociarse a varias porciones 5' de secuencias de ADN genómico. Se
usaron seis cebadores diferentes en el extremo 5'. El cebador de
cadena arriba más lejano que amplificó el cADN fue el cebador Q (5'
AGT AAG AAC GAA GAA GAA GTG) (SEC. Nº ID.: 26). Un cebador solapado,
el cual se desplazó doce bases cadena abajo, también amplificó el
cADN. El cADN no pudo amplificarse usando un cebador del extremo 5'
que estaba 98 pares de bases más lejos cadena arriba. Se usaron
plantillas de ADN genómico para controles de PCR. El cADN más largo
se consideró que se extendía hasta el extremo 5' del cebador Q. Los
cADN amplificados se secuenciaron directamente con la versión 2.0 de
Sequenase como sigue: después de la concentrar las reacciones de PCR
mediante precipitación con etanol, los productos amplificados se
separaron mediante electroforesis en geles de agarosa LMP al 0,8%.
Los fragmentos de ADN se cortaron, y se calentó a 90ºC una mezcla de
10 \mul de gel cortado (fundido a 70ºC), 1 ml de cebador 10 mM, y
1,2 ml de Nonidet P-40 al 5%, durante 2 minutos para
desnaturalizar el ADN. La mezcla se enfrió a continuación hasta 37ºC
antes de proceder con las reacciones de secuenciación.
El cADN más largo, el cual tenía 2786 bases (sin
incluir la cola de poliA) era consistente con el tamaño estimado de
2800 bases a partir de transferencias de ARN, y se presumió que era
próximo a la longitud completa. Hay una caja TATA potencial (5'
ATAATAATAA) 33 p.b. cadena arriba respecto el extremo 5' de la
secuencia genómica. En base a la comparación de las secuencias de
cADN y de ADN genómico, el gen tiene seis intrones, uno de los
cuales está en el líder no traducido en 5'. Los exones contienen una
única pauta de lectura abierta de 738 aminoácidos. Ver la
\hbox{Figura 3.}
La determinación de que este gen es, de hecho, el
ETR1 se estableció comparando las secuencias de nucleótidos
del alelo del tipo salvaje y de los cuatro alelos mutantes. Para
cada alelo mutante, se construyó una biblioteca, con tamaño
seleccionado mediante EcoRI, en el vector lambda ZAPII (Stratagene,
La Jolla, California). Los clones del fragmento de EcoRI de 4,25 kb
se aislaron mediante hibridación con el fragmento del tipo salvaje.
Estos clones se convirtieron a continuación en plásmidos (vector
pBluescript), mediante escisión in vivo de acuerdo con el
proveedor (Stratagene), y se secuenciaron. Se secuenciaron dos
clones independientes sobre una única hebra para cada alelo mutante.
Los extremos 5' (535 p.b. no contenidos en el fragmento de EcoRI de
4,25 kb) se amplificaron mediante PCR y se secuenciaron directamente
tal como se ha descrito previamente. Las diferencias de codones
fueron como sigue: codón 65 TGT a TAT en
etr1-1 (Figuras 6A, B, C y D), codón 102 GCG
a ACG en etr1-2 (Figuras 7A, B, C y D), codón
31 GCG a GTG en etr1-3 (Figuras 4A, B, C y
D), codón 62 ATC a TTC en etr1-4 (Figuras 5A,
B, C y D). Las cuatro mutaciones están agrupadas en la región
amino-terminal de la secuencia de proteína
deducida.
Se examinó el mensajero de ETR1 en
transferencias de gel de electroforesis (formaldehído) estándar de
ARN. El transcrito de 2,8 kb del ETR1 estaba presente en
todas las partes de plantas examinadas: hojas, raíces, tallos,
flores y plántulas (no se muestran los datos). Además, no se
observaron diferencias entre los transcritos de ETR1 del tipo
salvaje y los alelos mutantes (no se muestran los datos). El
tratamiento con etileno no alteró de forma detectable la cantidad de
mARN de ETR1 en plántulas del tipo salvaje creciendo a
oscuras (no se muestran los datos).
Cuando el gen ETR1 se hibridó con
transferencias de ADN genómico de Arabidopsis en rigurosidad
normal (es decir, durante la noche, en 5\times SSPE (NaCl 0,9 M,
NaH_{2}PO_{4} 50 mM, NaOH 40 mM, EDTA 4,5 mM, pH 7,4, a
65ºC, con el lavado más riguroso en 0,1\times SSPE a 65ºC, durante
30 minutos) sólo se observaron los fragmentos esperados del locus
ETR1 (no se muestran los datos). No obstante, con rigurosidad
disminuida (es decir, hibridación en 5\times SSPE a 50ºC, y
lavados en 5\times SSPE a 50ºC), se detectaron numerosos
fragmentos, lo cual sugiere que existe una familia de genes
similares en Arabidopsis.
La secuencia amino-terminal
predicha de ETR1 (residuos 1-316) no tiene
similitud con secuencias en la base de datos GenBank (versión 77,0).
Sin embargo, la porción carboxi-terminal, es muy
similar a los dominios conservados de ambos, el sensor y el
regulador de respuesta del sistema procariota de dos componentes de
transducción de señal. En las bacterias, el dominio quinasa de
proteína en histidina del sensor se caracteriza por cinco motivos de
secuencia ordenados en un orden específico con un espaciado
débilmente conservado (Parkinson, Annu. Rev. Genet. 26:71
(1992)). La secuencia de ETR1 deducida contiene la totalidad
de los cinco motivos con el mismo orden relativo y espaciado hallado
en las proteínas bacterianas (Figura 9A). La secuencia deducida es
lo más similar a las secuencias BarA de Escherichia coli
(Nagasawa et al., Mol. Microbiol. 6:3011 (1992)) y
LemA de Pseudomonas syringae (Harbak et al., J.
Bact. 174:3011 (1992)); a lo largo de todo el dominio quinasa de
histidina (los 241 aminoácidos desde el residuo 336 hasta el 566),
hay respectivamente un 43% y 41% de identidad de aminoácidos con
BarA y LemA, y respectivamente el 72% y 71% de similitudes. La
función de BarA es desconocida, aunque se clonó en base a su
capacidad para complementar una supresión en la proteína sensora
osmótica EnvZ de E. coli (Nagasawa, ver más arriba). LemA es
necesaria para la patogenicidad de P. syringae en plantas de
alubias (Hrabak, ver más arriba). Otras proteínas bacterianas con
secuencias altamente similares a este dominio ETR1 putativo
son: RpfC de Xanthomonas campestris (35% de identidad), la
cual posiblemente está implicada en el reconocimiento del huésped
para la patogenicidad en plantas de crucíferas (Tang et al.,
Mol. Gen. Genet. 226:409 (1991)), RcsC de E. coli (34%
de identidad), la cual está implicada en la regulación de la
síntesis de la cápsula (Stout et al., J. Bacteriol.
172:659 (1990)), y ArcB de E. coli (25% de identidad), la
cual es responsable de la represión de enzimas anaeróbicos (Luchi
et al., Mol. Microbiol. 4:715 (1990)).
De forma adyacente al dominio quinasa de
histidina putativo, la secuencia de ETR1 deducida presenta
características estructurales y residuos conservados de reguladores
de la respuesta bacterianos. Las características estructurales de
los reguladores de respuesta se basan en la estructura
tridimensional conocida de CheY (el regulador de la respuesta para
la quimiotaxis) en Salmonella typhimurium y E. coli,
el cual consiste en cinco hojas-\beta paralelas
rodeadas por cinco hélices-\alpha (Stock et
al., Nature 337:745 (1989); Volz et al., J.
Biol. Chem. 266:15.511 (1991)). Las secuencias de los
reguladores de respuesta bacterianos se han alineado con esta
estructura en base a residuos que son compatibles con el núcleo
hidrofóbico del CheY (Stock et al., Microbiological
Rev. 53:450 (1989)). La secuencia de ETR1 deducida puede
alinearse de forma similar (no se muestran los datos). En cuatro
posiciones específicas, los reguladores de respuesta contienen
residuos altamente conservados -tres aspartatos y una lisina
(Parkinson et al., Annu. Rev. Genet. 26:71 (1992);
Stock et al., ver más arriba); los tres aspartatos forman
bolsillo ácido en el cual se inserta la cadena lateral de la lisina
conservada (Stock et al., Nature 337:745 (1989); Volz
et al., J. Biol. Chem. 266:15.511 (1991) y el tercer
aspartato es el receptor del fosfato de la fosfohistidina (Stock
et al., (1989), ver más arriba). Excepto por la sustitución
conservadora de glutamato para el segundo aspartato, estos
aminoácidos conservados se hallan en las mismas posiciones en la
secuencia de ETR1 deducida (Figura 9B). La similitud de la
secuencia deducida en este dominio (una tirada de 121 aminoácidos,
desde el residuo 609 hasta el 729 en ETR1) es máxima con las
secuencias de Bordetella pertussis BvgS (29% de identidad,
60% de similitud), la cual controla los genes asociados con la
virulencia para la patogenicidad en humanos (Arico et al.,
Mol. Microbiol. 5:2481 (1991)), RcsC de E. coli (29%
de identidad, 64% de similitud), LemA de P. syringae (26% de
identidad, 57% de similitud), RpfC de X. campestris (25% de
identidad), y BarA de E. coli (20% de identidad). Todas las
proteínas bacterianas que son similares a ETR1 en secuencia
sonda también estructuralmente similares a ETR1 en que contienen
ambos, el dominio quinasa de histidina y el dominio regulador de la
respuesta. Aunque se comparten estas característica, las funciones
sensoras divergen
claramente.
claramente.
Existe un potencial dominio que abarca la
membrana (residuos 295-313) en la secuencia de
ETR1 deducida en base al análisis de hidropatía (Kyte et
al., J. Mol. Biol. 157:105 (1982)), pero no está claro si
la ETR1 es realmente una proteína transmembrana, puesto que no hay
una secuencia señal clara. Tampoco hay sitios de glicosilación
asociados a N. Mientras que todas las proteínas bacterianas, a las
que es similar la secuencia de ETR1 deducida, tienen dos
dominios potenciales que abarcan la membrana flanqueando el dominio
amino-terminal, unos pocos sensores bacterianos (los
que carecen de regulador de la respuesta) no los tienen.
Se confirió insensibilidad al etileno dominante a
plantas de Arabidopsis del tipo salvaje cuando el gen mutante
\hbox{ etr1-1 }se introdujo establemente usando transformación mediada por Agrobacterium. El gen era portado en un fragmento de ADN genómico de 7,3 kb (fragmentos 1 y 2 en la Figura 8, los cuales incluían aproximadamente 2,7 kb cadena arriba, del sitio de iniciación de la transformación, y aproximadamente 1 kb cadena abajo respecto el sitio de poliadenilación). Éste se clonó en un vector de transformación binaria pCGN1547, obtenido de Calgene, Inc., Davis, California. El vector también portaba un marcador seleccionable para la resistencia a la kanamicina en
plantas.
Para la construcción de
etr1-1, se linealizó el clon del plásmido de
EcoRI de 4,25 kb que contenía la mutación
\hbox{ etr1-1 }mediante digestión parcial con EcoRI, y se ligó con el fragmento de EcoRI de 3,1 kbm el cual se purificó mediante gel de agarosa a partir de clon theta8 de cósmido (un subclón del YAC EG4E4 en su camino). El plásmido resultante, que contenía los dos fragmentos de EcoRI en la orientación relativa correcta, se linealizó en el sitio de poliengarce Asp718, los extremos de rellenaron usando enzima Klenow, y los engarces para BamHI se ligaron a los extremos romos. Finalmente, se suprimió un inserto de 7,3 kb en el sitio del poliengarce de BamHI, y se ligó en el sitio BamHI del vector de transformación binario pCGN1547 (McBride, K.E. et al., Plant Molecular Biology 14:269 (1990)). Para la construcción control, el fragmento de 7,3 kb del tipo salvaje se purificó en gel de agarosa a partir del cósmido theta8 parcialmente digerido con EcoRI, y se subclonó en el sitio EcoRI del pBluescript. El fragmento se retiró a continuación usando los sitios BamHI y KpnI del poliengarce, y se ligó en pCGN1547 que se había digerido con BamHI y KpnI. Las construcciones del tipo salvaje y mutante se transformaron en Agrobacterium (Holsters et al., Mol. Gen. Genet. 163:181 (1978), cepa ASE (Monsanto) (Rogers et al., Meth. Enzymol. 153:253 (1988)). Se transformó el ecotipo Nossen de Arabidopsis (Valvekens, D. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:5536 (1988)) usando tejido de raíz cultivado en medio líquido en vez de sólido. Se obtuvieron plantas triploides que tenían una copia mutante del gen ETR1 como cruces de la progenie entre el homocigoto del etr1-1 (diploide) y un tipo salvaje tetraploide del ecotipo Bensheim, el cual tiene el mismo fenotipo de triple respuesta que el ecotipo Columbia. Las plantas del tipo salvaje triploides se obtuvieron de forma similar cruzando el tipo salvaje diploide y el tetraploide. La sensibilidad al etileno se ensayó en plántulas creciendo a oscuras y tratadas, bien con etileno (Bleecker et al., ver más arriba) o con ACC 0,5 mM. Para el tratamiento con ACC, las plantas se germinaron y cultivaron en una mezcla de sal basal de Murashige y Skoog (MS, Sigma), pH 5,7, ACC 0,5 mM (Sigma), 1% de Bacto-agar (Difco). La resistencia a la kanamicina se midió mediante la extensión de la elongación de la raíz en plántulas de una semana de edad cultivadas sobre MS, pH 5,7, 5,5 \mug/ml de kanamicina, Bacto-agar al 1%.
Se produjeron diez plantas resistentes a la
kanamicina. Ocho de las diez presentaron
auto-progenie insensible al etileno, tal como se
evaluó por la repuesta al etileno de las plántulas creciendo a
oscuras. En cada línea, la insensibilidad al etileno se
co-segregó con la resistencia a la kanamicina. Como
un control, se realizaron transformaciones usando el correspondiente
fragmento de ADN genómico de 7,3 kb del tipo salvaje, a partir del
cual se obtuvieron seis plantas resistentes a la kanamicina. Estas
líneas dieron lugar sólo a una auto-progenie
sensible al etileno que no parece ser diferente del tipo
salvaje.
Los transformantes de
etr1-1 mostraron diferentes niveles de
insensibilidad al etileno. Por tanto, el gen del tipo salvaje es
capaz de atenuar el fenotipo mutante, y la mutación
etr1-1 no es completamente dominante en las
plantas transformadas. De las diez líneas resistentes a la
kanamicina, seis dieron una insensibilidad al etileno completamente
dominante, indicando la presencia de múltiples copias del gen
mutante. Las otras dos líneas mostraron una dominancia parcial, y
dos líneas parecían ser del tipo salvaje. La insensibilidad al
etileno reducida presumiblemente se debía a niveles de expresión
bajos, los cuales pueden estar causados por efectos de posición (por
ejemplo, metilación del ADN) o posiblemente por el truncamiento del
ADN transferido.
Este ejemplo describe la construcción de un
vector de transformación de plantas que contiene e un promotor
heterólogo para controlar la expresión de los ácidos nucleicos del
ETR1 del tipo salvaje y mutante.
El promotor de la proteína 35S del virus del
mosaico de la coliflor (Guilley et al., Cell
30:763-773 (1982); Odell et al.,
Nature 313:810-812 (1985), y Sanders et
al., Nucl. Acids Res. 15:2543-2558
(1987)) y el extremo 3' del gen de la sintasa de nopalina (NOS) se
clonaron en el vector pCGN1547 para crear el pCGN18. El promotor de
35S, en un fragmento HindIII-BamHI de
aproximadamente 1,6 kb, se clonó en el único sitio
HindIII-BamHI del pCGN1547. El fragmento
BamHI-KpnI de 1 kb de NOS se clonó en el único sitio
BamHI-KpnI del pCGN1547.
El fragmento de EcoRI de 4,25 kb de ambos, el
tipo salvaje y el alelo mutante ETR1-1 se
clonaron independientemente en el único sitio BamHI del anterior
vector pCGN18 usando engarces BamHI. Este fragmento genómico de
EcoRI de 4,25 kb contiene la secuencia codificante completa,
incluyendo cinco intrones y aproximadamente 1 kb de ADN genómico
cadena abajo del sitio de poliadenilación. No contiene el promotor
del ETR1, el cual está en el fragmento 2 EcoRI de 3,1 en la
Figura 5.
Estos vectores se usaron para transformar
explantes de raíz tal como se describió en el Ejemplo 3. Se
obtuvieron plantas resistentes a la kanamicina que contenían el gen
ETR1-1 mutante, y se demostró un fenotipo de
insensibilidad al etileno similar al hallado en el Ejemplo 3. Las
plantas control transformadas con el gen ETR1 del tipo
salvaje produjeron sólo auto-progenie sensible al
etileno.
La insensibilidad al etileno se confirió a
Arabidopsis del tipo salvaje mediante la expresión de un
ácido nucleico antisentido de ETR1, el cual se introdujo
usando el procedimiento estándar de transformación de raíces con
Agrobacterium. Valvekens et al., Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 85:5536 (1988). El ácido nucleico
anti-sentido consistió en un fragmento de cADN de
ETR1 de 1,9 kb. La expresión de este fragmento, que se
extiende desde el sitio de restricción MscI en el nucleótido 220
hasta el primer sitio SmaI en el nucleótido 2176 en las Figuras 3A,
3B, 3C y 3D, se dirigió en la dirección inversa mediante el promotor
de 35S de CaMV. Para construir el ácido nucleico
anti-sentido, se ligaron engarces BamHI a los
extremos del fragmento MscI-SmaI de 1,9 kb, y el
fragmento así formado se ligó en el sito BamHI del vector de
transformación pCGN18. Jack et al., Cell 76:703
(1994). La construcción se transformó en las cepa ASE de
Agrobacterium tal como se ha descrito más arriba, y a
continuación en Arabidopsis.
Las plántulas derivadas de este experimento de
transformación se ensayaron por su sensibilidad al etileno como se
ha descrito previamente. Las plántulas que contenían la construcción
anti-sentido eran insensibles al etileno.
El ADN genómico de Arabidopsis thaliana se
digirió parcialmente con Sau3A y se clonó en un \lambdaGEM11
(brazos de medio sitio) obtenido de Promega, Madison, Wisconsin. El
digerido genómico se rellenó parcialmente en sus extremos antes de
clonarlo con \lambdaGEM11, y se sembró sobre medio tal como
sugería el fabricante.
La biblioteca clonada de ese modo se examinó con
una fragmento XbaI de cADN marcado con ^{32}P que se extendía
entre los nucleótidos 993-2308, tal como se detalla
en las Figuras 3B, 3C y 3D. Las condiciones de hibridación fueron
50ºC y 5\times SSPE. Los lavados se realizaron a 50ºC y
0,2\times SSPE. Se identificaron varios clones que se hibridaban
positivamente, se sembraron y se examinaron de nuevo. Los clones que
se hibridaban positivamente se digirieron con SacI (que corta dentro
de los brazos del fago de clonación y dentro del inserto). Los
múltiples fragmentos obtenidos del mismo se subclonaron en plásmidos
bacterianos para su secuenciación. La secuencia del ADN genómico
(SEC. Nº ID.: 45) junto con la secuencia de aminoácidos deducida
(SEC. Nº ID.: 46 y 48) se detallan en la Figura 12. Esta secuencia
de ácido nucleico y de aminoácidos de ETR se denominan
respectivamente como secuencia de ácido nucleico o de aminoácidos
QITR. La secuencia de cADN del QITR (SEC. Nº ID.: 47) y la secuencia
de aminoácidos del QITR (SEC. Nº ID.: 46 y 48) se muestran en la
Figura 13.
Por comparación con la secuencia de ácido
nucleico y de aminoácidos del ETR1 de Arabidopsis (ver
Figuras 2 y 3), la proteína QITR parece contener una porción
amino-terminal que tiene un nivel de homología
relativamente elevado con la porción amino-terminal
de la proteína ETR1, y una porción quinasa de histidina con
un nivel de homología moderado por la misma secuencia en
ETR1. La región reguladora de la respuesta hallada en
ETR1 no está presente en la proteína QITR. La homología de
ácido nucleico global es aproximadamente del 69%. Con relación a la
porción amino-terminal (es decir, entre los
residuos 1 a 316) la homología es aproximadamente el 71% idéntica en
términos de secuencia de aminoácidos y 72% idéntica en términos de
secuencia de ácido nucleico.
Se realizó una sustitución de aminoácido en un
clon genómico de QITR de 5 kb, el cual era análogo al de la mutación
ETR1-4, es decir, la sustitución de la
isoleucina en la posición 62 con fenilalanina. Comparar la Figura 3A
con la Figura 5A en el residuo 62. Como se indica además en las
Figuras 12 y 13, el residuo 62 en la proteína QITR es también una
isoleucina, como en la proteína ETR1.
La sustitución de aminoácido se realizó en el
ácido nucleico de QITR usando mutagénesis in vitro dirigida a
oligonucleótido, Kunkel et al. Methods in Enzymology
154:367-382 (1987). En relación a esta mutación
concreta Se usó un equipo "Muta-gene" de
Bio-Rad Laboratories, Hercules, California. La
secuencia del oligonucleótido usado fue 5' GGA GCC TTT TTC ATT CTC.
La sustitución del nucleótido A con T en el codón ATC cambió el
aminoácido Ile en el residuo 62 a Phe en la secuencia de proteína
deducida.
El ácido nucleico de QITR, que abarcaba
aproximadamente 5 kb desde el primer sitio HindIII hasta el segundo
sitio KpnI, contenía aproximadamente 2,4 kb de nucleótidos cadena
arriba respecto el codón de inicio. Este fragmento de 5 kb se ligó
en el vector de transformación pCGN1547 (ver más arriba). Esta
construcción se transformó a continuación en la cepa ASE de
Agrobacterium, tal como se describió más arriba, y a
continuación en Arabidopsis.
Las plántulas derivadas de este experimento de
transformación se ensayaron por su sensibilidad al etileno como se
ha descrito previamente. Las plántulas que contenían el ácido
nucleico de QITR conteniendo la modificación en el residuo 62 eran
insensibles al etileno.
El ácido nucleico Q8 de ETR (SEC. Nº ID.:
41 y 43) se identificó mediante comparación directa de la secuencia
con el ácido nucleico de ETR1 de Arabidopsis. El ácido
nucleico Q8 de Arabidopsis se identificó en relación con un
recorrido de cromosoma sobre el cromosoma 3 de Arabidopsis
thaliana.
En resumen, se generaron clones de YAC solapados,
los cuales fueron a continuación subclonados en plásmidos. Los
insertos genómicos en tales plásmidos se extrajeron mediante
digestión con endonucleasas de restricción, y se hibridaron con una
biblioteca de cADN procedente de tejido floral de
Arabidopsis.
Los insertos que se hibridaban positivamente se
secuenciaron para producir la secuencia genómica global (SEC. Nº
ID.; 41), junto con la secuencia de aminoácidos deducida (SEC. Nº
ID.: 42 y 44), tal como se detalla en la Figura 14. La secuencia de
cADN (SEC. Nº ID.; 43) y la secuencia de aminoácidos deducida (SEC.
Nº ID.: 42 y 44), se detallan en la Figura 15.
La homología global del ácido nucleico entre el
ácido nucleico de Q8 y el ácido nucleico de ETR1 es
aproximadamente del 69%. Con respecto a la porción
amino-terminal que se extiende desde el residuo 1
hasta el 316, la homología global de secuencia de cADN es
aproximadamente del 72%, mientras que el ácido nucleico que codifica
esta secuencia tiene una homología de secuencia de aproximadamente
el 71%, como entre los ácidos nucleicos de Q8 y ETR1.
Se preparó una sonda de hibridación marcada con
^{32}P mediante marcaje aleatorio con cebador de un fragmento de
PCR de 1,3 kb generado mediante la amplificación con PCR del gen
ETR1 de Arabidopsis, con los cebadores de PCR "5'
BamHI" (CCC GGA TCC ATA GTG TAA AAA ATT CAT AAT GG) y la "3'
BamHI" (CCG GAT CCG TTG AAG ACT TCC ATC TTC TAA CC).
Esta sonda se usó para examinar una biblioteca de
cADN de mARN del fruto rojo de la tomatera, clonada en el sitio
EcoRI del vector lambda ZAP II de Stratagene, La Jolla, CA. Se
identificaron veinte (20) placas positivas primarias que se
hibridaban con esta sonda (condiciones de lavado: 2\times SSC a
65ºC), y se realizaron exámenes secundarios sobre éstas para obtener
placas puras. A continuación se realizó el corte in vivo con
los fagos recombinantes resultantes y se obtuvieron 19 clones de
plásmidos independientes.
Los ADN complementarios, procedentes de clones de
plásmidos que contenían los fragmentos mayores del cADN de tomate
más largo (TETR14, también denominado TXTR), se compararon con las
secuencias ETR1 y QITR. La secuencia de nucleótidos del
TETRA14 predijo que el péptido codificado era más parecido al
péptido QITR que al péptido ETR1. Esta conclusión se basó en
el hecho de que el dominio regulador de la respuesta (el cual está
presente en ETR1) está ausente en ambos, el TETR14 y el QITR.
Se determinó la secuencia (o secuencia parcial) de varios de los
otros clones de cADN, y se halló que correspondían al mismo gen.
Se realizó un análisis de Northern con mARN
procedente de frutos en desarrollo, de tomate normal o mutante
(inhibidor de la maduración (rin), sin maduración (non) o
"Never-ripe" (Nr)). Los estadios de desarrollo
de los frutos usados fueron: verde maduro, en su punto, en su punto
más 7 días, y fruto verde maduro tratado con etileno. El ARN
mensajero que se hibridaba con la sonda del gen TETR14 no estaba
presente en el estadio verde maduro, pero estaba presente en "en
su punto", "en su punto" más 7 días, y en la fruta verde
madura tratada con etileno. Por tanto, se concluyó que la
acumulación del mARN de ETR14 estaba regulada por el etileno.
La acumulación del mARN de ETR14 estaba atenuada en los tres
mutantes de maduración, apoyando aún más el hallazgo de que la
acumulación de mARN está regulada por el etileno.
Se obtuvieron cebadores de PCR que amplificaban
específicamente la región N-terminal del gen TETR14.
La porción amplificada estaba entre Met1 e Ile214 en las Figuras 16A
y 16B. Los cebadores fueron (CCG GAT CCA TGG AAT CCT GTG ATT GCA
TTG) y TETR4A (GAT AAT AGG AAG ATT AAT TGG C). Las condiciones de
PCR (Perkin-Elmer Cetus): 1 \mug de ADN genómico
de tomate, 40 picomoles de cada cebador, 1 min a 94ºC, 2 min a 45ºC,
2 min a 72ºC, 35 ciclos. Los productos de la PCR obtenidos con estos
cebadores, que resultaron de dos reacciones de amplificación
independientes de AND de pearson y Nr, se purificaron en gel de
agarosa y se subclonaron, bien en el vector T/A (Invitrogen), o se
digirieron con BamHI y XhoI y se subclonaron en Bluescript KS- que
había sido linealizado con BamHI y SaII. Se preparó ADN de plantilla
de hebra única a partir de los plásmidos resultantes, y se
secuenció. La secuencia de los productos de la PCR del ADN de
pearson fue idéntica a la secuencia del clon TETR14A- El análisis de
la secuencia reveló que los fragmentos de la PCR que resultaban de
la PCR del ADN Nr (TETR14-Nr) no eran idénticos a
los obtenidos a partir del ADN de pearson. El nucleótido citosina en
la posición 395 del gen TETR14 es una timina en el gen amplificado a
partir del ADN de Nr. Esta sustitución de nucleótido en el
TETR14-Nr cambia la prolina en la posición del
aminoácido 36 del péptido predicho a una leucina. Ver la Figura 22 y
las SEC. Nº ID.: 49 y 50 respectivamente para las secuencias
globales de ácido nucleico y aminoácidos. Este
Pro-36 del TETR14 corresponde a la
Prot-36 del péptido ETR1 y a la
Prot-36 del péptido QITR. Este resultado indica que
una mutación en el gen TETR14 del tomate confiere una insensibilidad
al etileno dominante. Y, por tanto, es posible predecir que otros
cambios en el gen TETR14 y en otros homólogos del ETR1 del
tomate resultarán en la insensibilidad al etileno en el tomate.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Meyerowitz, Elliot M.
\hskip3.3cmChang, Caren
\hskip3.3cmBleecker, Anthony B.
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: PLANTAS QUE TIENEN UNA RESPUESTA AL ETILENO MODIFICADA
\vskip0.666000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 50
\vskip0.666000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Richard F. Trecartin
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- DIRECCIÓN: 3400 Embarcadero Center, Suite 3400
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: San Francisco
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: California
\vskip0.333000\baselineskip
- (E)
- PAIS: Estados Unidos de América
\vskip0.333000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO: 94111
\vskip0.666000\baselineskip
- (v)
- FORMATO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Compatible con PC de IBM
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: Patent In Release #1.0,
\hskip4.4cmVersión #1.25
\vskip0.666000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: PCT/US94/____
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE REGISTRO: 01-Julio-1994
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
- (viii)
- ABOGADO/AGENTE DE INFORMACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Trecartin, Richard F.
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 31.801
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA: FP57515-1RFT
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (415) 781-1989
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (415) 398-3249
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 1:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3879 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 2:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2787 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 188..2401
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 2:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 3:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 738 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2787 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 188..2401
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 5:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 738 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 6:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2787 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 188..2401
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 6:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 7:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 738 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 8:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2787 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 188..2401
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 8:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 9:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 738 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 10:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2787 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 188..2401
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 11:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 738 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 12:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 155 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 13:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 155 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 13:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 14:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 155 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 15:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 149 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 16:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 66 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 17:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 67 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 18:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 67 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 19:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 67 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 19:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 20:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 369 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 21:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 369 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 22:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 296 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 23:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 296 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 24:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 123 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 25:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 123 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 26:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.333000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGTAAGAACG AAGAAGAAGT G
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 27:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 56 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 28:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 56 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 29:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 56 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 29:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 30:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 56 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 30:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 31:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 44 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Pro Leu Leu Val Ala Leu Ser Gly Asn Thr Asp
Lys Ser Thr Lys Glu}
\sac{Lys Cys Met Ser Phe Gly Leu Asp Gly Val Leu
Leu Lys Pro Val Ser}
\sac{Leu Asp Asn Ile Arg Asp Val Leu Ser Asp Leu
Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 32:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 44 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ile Leu Phe Gly Pge Thr Ala Ser Ala Gln
Met Asp Glu Ala His}
\sac{Ala Cys Arg Ala Ala Gly Met Asp Asp Cys Leu
Pge Lys Pro Ile Gly}
\sac{Val Asp Ala Leu Arg Gln Arg Leu Asn Glu Ala
Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 33:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 44 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Pro Val Ile Gly Val Thr Ala Asn Ala Leu
Ala Glu Glu Vys Gln}
\sac{Arg Cys Leu Glu Ser Gly Met Asp Ser Cys Leu
Ser Lys Pro Val Thr}
\sac{Leu Asp Val Ile Lys Gln Ser Leu Thr Leu Tyr
Ala}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 34:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 44 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Pro Ile Val Ala Leu Thr Ala His Ala Met
Ala Asn Glu Lys Arg}
\sac{Ser Leu Leu Gln Ser Gly Met Asp Asp Tyr Leu
Thr Lys Pro Ile Ser}
\sac{Glu Arg Gln Leu Ala Gln Val Val Leu Lys Trp
Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 35:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2405 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 288..2196
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 36:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 636 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 37:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 4566 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: unión(763..1671, 3062..3433, 3572..3838, 3969..4096, 4234..4402)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 37:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 38:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 615 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 38:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 39:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 737 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 33..719
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 39:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 40:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 228 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 40:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 41:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6202 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: unión(3522..5288, 5372..5926)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 41:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 42:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 773 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 43:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2404 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..2322
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 43:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 44:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 773 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 44:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 45:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 3009 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: unión(564..1469, 1565..1933, 2014..2280, 2359..2486, 2577..2748)
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 45:
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 46:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 613 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\newpage
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 46:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 47:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2314 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 224..2065
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 47:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 48:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 613 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 48:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 49:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2405 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 288..2196
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 49:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. Nº ID: 50:
\vskip0.666000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 636 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. Nº ID: 50:
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (16)
1. Ácido nucleico aislado que codifica una
proteína ETR, la cual es una proteína (i) que tiene una secuencia de
aminoácidos tal como se detalla en la SEC. ID. Nº: 3, o es una
proteína (ii) que tiene al menos una homología de secuencia del 50%
con la secuencia de aminoácidos de la SEC. ID. Nº: 3, y tiene una
porción amino-terminal que tiene al menos un 55% de
homología de secuencia con la secuencia
amino-terminal de la SEC. ID. Nº: 3, residuos
\hbox{1-316.}
2. Ácido nucleico aislado según la reivindicación
1, que codifica una proteína ETR, dicha proteína ETR tiene una
secuencia de aminoácidos que es la secuencia de aminoácidos de la
SEC. ID. Nº: 3, con al menos un aminoácido de la región
amino-terminal de SEC. ID. Nº: 3 que está
sustituido, insertado o suprimido.
3. Ácido nucleico aislado según la reivindicación
2, que codifica una proteína ETR que tiene una secuencia de
aminoácidos de la SEC. ID. Nº: 3, con al menos un aminoácido en la
posición 31 (Ala), 36 (Pro), 62 (Ile), 65 (Cys) o 102 (Ala) que está
sustituido, insertado o suprimido.
4. Ácido nucleico recombinante que comprende un
promotor unido operativamente al ácido nucleico según cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 3, que codifica dicha proteína (ii).
5. Ácido nucleico recombinante según la
reivindicación 4, en donde el promotor es heterólogo respecto el
ácido nucleico que codifica dicha proteína (ii), y que es capaz de
causar la expresión de dicho ácido nucleico en una célula
vegetal.
6. Ácido nucleico recombinante según la
reivindicación 4 o reivindicación 5, en donde el promotor es
específico para un tejido, específico del fruto, o
específico-temporal.
7. Ácido nucleico recombinante según cualquiera
de las reivindicaciones 4 a 6, en donde el promotor es
inducible.
8. Célula vegetal transformada con el ácido
nucleico recombinante de cualquiera de las reivindicaciones 4 a
7.
9. Planta que comprende células vegetales de la
reivindicación 8.
10. Planta según la reivindicación 9, en donde la
planta tiene un fenotipo caracterizado por una disminución en
la respuesta de la planta al etileno en comparación con una planta
del tipo salvaje.
11. Planta según la reivindicación 9 o
reivindicación 10, en donde la planta es portadora de frutos y el
promotor es específico del fruto.
12. Planta según la reivindicación 11, en donde
la planta tiene un fenotipo caracterizado por una disminución
en la velocidad de maduración del fruto.
13. Fruto de la planta de la reivindicación 11 o
reivindicación 12.
14. Fruto según la reivindicación 13, en donde el
fruto es el tomate.
15. Procedimiento para producir una planta que
tiene un fenotipo caracterizado por una disminución en la
respuesta de la planta al etileno, en comparación con una planta del
tipo salvaje, comprendiendo el procedimiento los pasos de:
- a.
- transformar al menos una célula vegetal de la planta con el ácido nucleico recombinante de una cualquiera de las reivindicaciones 4 a 7.
- b.
- regenerar las plantas a partir de una o más células vegetales transformadas, y
- c.
- seleccionar al menos una planta que tenga dicho fenotipo.
16. Procedimiento según la reivindicación 15, en
donde la planta es la tomatera.
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US8655593A | 1993-07-01 | 1993-07-01 | |
US86555 | 1993-07-01 | ||
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Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
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Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
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Country | Link |
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