EA046075B1 - ANTI-CD137 ANTIGEN-BINDING MOLECULES AND THEIR APPLICATIONS - Google Patents
ANTI-CD137 ANTIGEN-BINDING MOLECULES AND THEIR APPLICATIONS Download PDFInfo
- Publication number
- EA046075B1 EA046075B1 EA202190451 EA046075B1 EA 046075 B1 EA046075 B1 EA 046075B1 EA 202190451 EA202190451 EA 202190451 EA 046075 B1 EA046075 B1 EA 046075B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- amino acid
- seq
- acid sequence
- hvr
- antigen
- Prior art date
Links
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 765
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 666
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 664
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 662
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 649
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 131
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 26
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 25
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 25
- 229940127121 immunoconjugate Drugs 0.000 claims description 18
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 13
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 12
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 12
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 3
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 3
- 101000851370 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 Proteins 0.000 description 195
- 102100036856 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 Human genes 0.000 description 181
- -1 RANK Proteins 0.000 description 163
- 230000001270 agonistic effect Effects 0.000 description 146
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 139
- 238000000034 method Methods 0.000 description 128
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 123
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 118
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 118
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 113
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 94
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 91
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 87
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 86
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 75
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 74
- ZKHQWZAMYRWXGA-UHFFFAOYSA-N Adenosine triphosphate Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1OC(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)C(O)C1O ZKHQWZAMYRWXGA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 71
- ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-J ATP(4-) Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)[C@H]1O ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-J 0.000 description 68
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 68
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 56
- 229940116741 CD137 agonist Drugs 0.000 description 55
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 55
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 52
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 39
- 230000008859 change Effects 0.000 description 38
- 108091007491 NSP3 Papain-like protease domains Proteins 0.000 description 37
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 34
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 33
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 32
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 30
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 29
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 28
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 28
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 28
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 26
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 26
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 26
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 24
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 24
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 24
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 24
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 22
- 102100029205 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Human genes 0.000 description 22
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 21
- 108010021472 Fc gamma receptor IIB Proteins 0.000 description 20
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 20
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 20
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 20
- YGPSJZOEDVAXAB-UHFFFAOYSA-N (R)-Kynurenine Natural products OC(=O)C(N)CC(=O)C1=CC=CC=C1N YGPSJZOEDVAXAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 19
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 19
- 102000050327 human TNFRSF9 Human genes 0.000 description 16
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 16
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 16
- 230000006044 T cell activation Effects 0.000 description 15
- 210000004443 dendritic cell Anatomy 0.000 description 15
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 15
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 15
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 14
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 14
- 238000003571 reporter gene assay Methods 0.000 description 14
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 13
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 13
- 101000599048 Homo sapiens Interleukin-6 receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 12
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 12
- 101710089372 Programmed cell death protein 1 Proteins 0.000 description 12
- 102100040678 Programmed cell death protein 1 Human genes 0.000 description 12
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 12
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 12
- 102000052623 human IL6R Human genes 0.000 description 12
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 12
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 12
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 12
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 12
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 12
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 11
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 11
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 229960002743 glutamine Drugs 0.000 description 11
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 11
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 11
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 11
- VCKPUUFAIGNJHC-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxykynurenine Chemical compound OC(=O)C(N)CC(=O)C1=CC=CC(O)=C1N VCKPUUFAIGNJHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 108010073807 IgG Receptors Proteins 0.000 description 10
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 10
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 10
- RWZYAGGXGHYGMB-UHFFFAOYSA-N anthranilic acid Chemical compound NC1=CC=CC=C1C(O)=O RWZYAGGXGHYGMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 10
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 10
- XTWYTFMLZFPYCI-KQYNXXCUSA-N 5'-adenylphosphoric acid Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O XTWYTFMLZFPYCI-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 9
- XTWYTFMLZFPYCI-UHFFFAOYSA-N Adenosine diphosphate Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1OC(COP(O)(=O)OP(O)(O)=O)C(O)C1O XTWYTFMLZFPYCI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 102000009490 IgG Receptors Human genes 0.000 description 9
- 102100037422 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Human genes 0.000 description 9
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 9
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 9
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 description 9
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 9
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 9
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 9
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N succinic acid Chemical compound OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 102000001398 Granzyme Human genes 0.000 description 8
- 108060005986 Granzyme Proteins 0.000 description 8
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 8
- UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N adenosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O UDMBCSSLTHHNCD-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 8
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 8
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 8
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 8
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 8
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 8
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 8
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 8
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 8
- HCZHHEIFKROPDY-UHFFFAOYSA-N kynurenic acid Chemical compound C1=CC=C2NC(C(=O)O)=CC(=O)C2=C1 HCZHHEIFKROPDY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 8
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 8
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 8
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 8
- 239000012146 running buffer Substances 0.000 description 8
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 7
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 7
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 7
- 101710138747 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 description 7
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 7
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 7
- HCIKUKNAJRJFOW-KQYNXXCUSA-N [(2r,3s,4r,5r)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl dihydroxyphosphinothioyl hydrogen phosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(O)=S)[C@@H](O)[C@H]1O HCIKUKNAJRJFOW-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 7
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 7
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 7
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 7
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 7
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 7
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 7
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 7
- 230000036470 plasma concentration Effects 0.000 description 7
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 6
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 6
- 101001120087 Homo sapiens P2Y purinoceptor 11 Proteins 0.000 description 6
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 6
- 102100029185 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Human genes 0.000 description 6
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 6
- 102100026172 P2Y purinoceptor 11 Human genes 0.000 description 6
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 6
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 6
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 6
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 6
- 239000002254 cytotoxic agent Substances 0.000 description 6
- 231100000599 cytotoxic agent Toxicity 0.000 description 6
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 6
- XEYBRNLFEZDVAW-ARSRFYASSA-N dinoprostone Chemical compound CCCCC[C@H](O)\C=C\[C@H]1[C@H](O)CC(=O)[C@@H]1C\C=C/CCCC(O)=O XEYBRNLFEZDVAW-ARSRFYASSA-N 0.000 description 6
- 229960002986 dinoprostone Drugs 0.000 description 6
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 6
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 6
- 230000006870 function Effects 0.000 description 6
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 6
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 6
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 6
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 6
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 6
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 6
- 229930010796 primary metabolite Natural products 0.000 description 6
- XEYBRNLFEZDVAW-UHFFFAOYSA-N prostaglandin E2 Natural products CCCCCC(O)C=CC1C(O)CC(=O)C1CC=CCCCC(O)=O XEYBRNLFEZDVAW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000003127 radioimmunoassay Methods 0.000 description 6
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 6
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 6
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 6
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical group N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- UDMBCSSLTHHNCD-UHFFFAOYSA-N Coenzym Q(11) Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1OC(COP(O)(O)=O)C(O)C1O UDMBCSSLTHHNCD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 5
- 229930010555 Inosine Natural products 0.000 description 5
- UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N Inosine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC(O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 5
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 5
- 101710099301 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Proteins 0.000 description 5
- 239000005089 Luciferase Substances 0.000 description 5
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Chemical compound CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- LNQVTSROQXJCDD-UHFFFAOYSA-N adenosine monophosphate Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1OC(CO)C(OP(O)(O)=O)C1O LNQVTSROQXJCDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 229960003767 alanine Drugs 0.000 description 5
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 5
- 230000004540 complement-dependent cytotoxicity Effects 0.000 description 5
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 5
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 5
- 229960003786 inosine Drugs 0.000 description 5
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 5
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 5
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 5
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 5
- 210000003289 regulatory T cell Anatomy 0.000 description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- LDHMAVIPBRSVRG-UHFFFAOYSA-O 1-methylnicotinamide Chemical compound C[N+]1=CC=CC(C(N)=O)=C1 LDHMAVIPBRSVRG-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 4
- 102100022464 5'-nucleotidase Human genes 0.000 description 4
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 4
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 4
- AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N Doxorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(=O)CO)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 AOJJSUZBOXZQNB-TZSSRYMLSA-N 0.000 description 4
- 108010021468 Fc gamma receptor IIA Proteins 0.000 description 4
- 102100026122 High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I Human genes 0.000 description 4
- 101000917839 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-B Proteins 0.000 description 4
- 108010054477 Immunoglobulin Fab Fragments Proteins 0.000 description 4
- 102000001706 Immunoglobulin Fab Fragments Human genes 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N L-norleucine Chemical compound CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 4
- 102100029204 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-a Human genes 0.000 description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 4
- DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N Nicotinamide Chemical compound NC(=O)C1=CC=CN=C1 DFPAKSUCGFBDDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 4
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 4
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 4
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 4
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 4
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 4
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 description 4
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 4
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 4
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 4
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 4
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 4
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 4
- 230000034659 glycolysis Effects 0.000 description 4
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 4
- 230000005917 in vivo anti-tumor Effects 0.000 description 4
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 4
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 4
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 238000012552 review Methods 0.000 description 4
- 210000002536 stromal cell Anatomy 0.000 description 4
- 235000011044 succinic acid Nutrition 0.000 description 4
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 4
- NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 1-methylethyl 11-methoxy-3,7,11-trimethyl-2,4-dodecadienoate Chemical compound COC(C)(C)CCCC(C)CC=CC(C)=CC(=O)OC(C)C NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 5-oxo-L-proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-N Adenosine triphosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]1O ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 3
- 229940045513 CTLA4 antagonist Drugs 0.000 description 3
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 3
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 3
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 3
- 108700022150 Designed Ankyrin Repeat Proteins Proteins 0.000 description 3
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 3
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 3
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 3
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 3
- 108060001084 Luciferase Proteins 0.000 description 3
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 3
- 102000011769 Member 9 Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Human genes 0.000 description 3
- 108010037274 Member 9 Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Proteins 0.000 description 3
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 3
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 3
- ODHCTXKNWHHXJC-GSVOUGTGSA-N Pyroglutamic acid Natural products OC(=O)[C@H]1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 3
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 3
- 108060008683 Tumor Necrosis Factor Receptor Proteins 0.000 description 3
- ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N acide pyroglutamique Natural products OC(=O)C1CCC(=O)N1 ODHCTXKNWHHXJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229960001456 adenosine triphosphate Drugs 0.000 description 3
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 3
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 3
- YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N arachidonic acid Chemical class CCCCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCC(O)=O YZXBAPSDXZZRGB-DOFZRALJSA-N 0.000 description 3
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 3
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 description 3
- 208000035269 cancer or benign tumor Diseases 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 230000000139 costimulatory effect Effects 0.000 description 3
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 3
- 229930195712 glutamate Chemical group 0.000 description 3
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-L glutamate group Chemical group N[C@@H](CCC(=O)[O-])C(=O)[O-] WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-L 0.000 description 3
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 3
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 3
- 230000001976 improved effect Effects 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 3
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 3
- 230000035800 maturation Effects 0.000 description 3
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 3
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 3
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 3
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 3
- 150000005480 nicotinamides Chemical class 0.000 description 3
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 3
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 3
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 239000001384 succinic acid Substances 0.000 description 3
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 3
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 3
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 3
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 3
- 230000004102 tricarboxylic acid cycle Effects 0.000 description 3
- 102000003298 tumor necrosis factor receptor Human genes 0.000 description 3
- KHWCHTKSEGGWEX-RRKCRQDMSA-N 2'-deoxyadenosine 5'-monophosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(O)=O)O1 KHWCHTKSEGGWEX-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 2
- BKKWZCSSYWYNDS-JEDNCBNOSA-N 2-aminoacetic acid;(2s)-2,6-diaminohexanoic acid Chemical compound NCC(O)=O.NCCCC[C@H](N)C(O)=O BKKWZCSSYWYNDS-JEDNCBNOSA-N 0.000 description 2
- WJXSWCUQABXPFS-UHFFFAOYSA-N 3-hydroxyanthranilic acid Chemical compound NC1=C(O)C=CC=C1C(O)=O WJXSWCUQABXPFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007991 ACES buffer Substances 0.000 description 2
- 108010049777 Ankyrins Proteins 0.000 description 2
- 102000008102 Ankyrins Human genes 0.000 description 2
- 108010083359 Antigen Receptors Proteins 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 description 2
- 108050005493 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Proteins 0.000 description 2
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 108010021064 CTLA-4 Antigen Proteins 0.000 description 2
- 102000008203 CTLA-4 Antigen Human genes 0.000 description 2
- 101100463133 Caenorhabditis elegans pdl-1 gene Proteins 0.000 description 2
- 201000009030 Carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 2
- IVOMOUWHDPKRLL-KQYNXXCUSA-N Cyclic adenosine monophosphate Chemical compound C([C@H]1O2)OP(O)(=O)O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H]2N1C(N=CN=C2N)=C2N=C1 IVOMOUWHDPKRLL-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N D-Luciferin Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(C=2SC3=CC=C(O)C=C3N=2)=N1 IGXWBGJHJZYPQS-SSDOTTSWSA-N 0.000 description 2
- CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N Dehydro-luciferin Natural products OC(=O)C1=CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 CYCGRDQQIOGCKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N Fivefly Luciferin Natural products OC(=O)C1CSC(C=2SC3=CC(O)=CC=C3N=2)=N1 BJGNCJDXODQBOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 206010019851 Hepatotoxicity Diseases 0.000 description 2
- 101710182312 High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I Proteins 0.000 description 2
- 101000913074 Homo sapiens High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I Proteins 0.000 description 2
- 101000917826 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-a Proteins 0.000 description 2
- 101000917824 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-b Proteins 0.000 description 2
- 101000917858 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Proteins 0.000 description 2
- 101000738771 Homo sapiens Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C Proteins 0.000 description 2
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 2
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 2
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 2
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 2
- 102000003855 L-lactate dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 108700023483 L-lactate dehydrogenases Proteins 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 108010006444 Leucine-Rich Repeat Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000013519 Lipocalin-2 Human genes 0.000 description 2
- 108010051335 Lipocalin-2 Proteins 0.000 description 2
- 101710122625 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II Proteins 0.000 description 2
- 101710177649 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III Proteins 0.000 description 2
- 102100029193 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A Human genes 0.000 description 2
- DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N Luciferin Natural products CCc1c(C)c(CC2NC(=O)C(=C2C=C)C)[nH]c1Cc3[nH]c4C(=C5/NC(CC(=O)O)C(C)C5CC(=O)O)CC(=O)c4c3C DDWFXDSYGUXRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 description 2
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 2
- NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N Mytomycin Chemical compound C1N2C(C(C(C)=C(N)C3=O)=O)=C3[C@@H](COC(N)=O)[C@@]2(OC)[C@@H]2[C@H]1N2 NWIBSHFKIJFRCO-WUDYKRTCSA-N 0.000 description 2
- 108010057466 NF-kappa B Proteins 0.000 description 2
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 102100023050 Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit Human genes 0.000 description 2
- 206010035226 Plasma cell myeloma Diseases 0.000 description 2
- 102100038280 Prostaglandin G/H synthase 2 Human genes 0.000 description 2
- 108050003267 Prostaglandin G/H synthase 2 Proteins 0.000 description 2
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 2
- 241000219061 Rheum Species 0.000 description 2
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 2
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101710136122 Tryptophan 2,3-dioxygenase Proteins 0.000 description 2
- 102000057288 Tryptophan 2,3-dioxygenases Human genes 0.000 description 2
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 2
- 102100040247 Tumor necrosis factor Human genes 0.000 description 2
- 101710165434 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 Proteins 0.000 description 2
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 2
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 2
- 230000009824 affinity maturation Effects 0.000 description 2
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 2
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 2
- 210000000612 antigen-presenting cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 description 2
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 2
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 2
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 2
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 2
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 2
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 2
- DAEAPNUQQAICNR-RRKCRQDMSA-K dADP(3-) Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)O1 DAEAPNUQQAICNR-RRKCRQDMSA-K 0.000 description 2
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-UKLRSMCWSA-N dextrose-2-13c Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[13C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-UKLRSMCWSA-N 0.000 description 2
- 230000009977 dual effect Effects 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 231100000304 hepatotoxicity Toxicity 0.000 description 2
- 230000007686 hepatotoxicity Effects 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 2
- 230000005934 immune activation Effects 0.000 description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- 230000001506 immunosuppresive effect Effects 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 102000006639 indoleamine 2,3-dioxygenase Human genes 0.000 description 2
- 108020004201 indoleamine 2,3-dioxygenase Proteins 0.000 description 2
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 2
- 210000004901 leucine-rich repeat Anatomy 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 2
- 238000002705 metabolomic analysis Methods 0.000 description 2
- 230000001431 metabolomic effect Effects 0.000 description 2
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 201000000050 myeloid neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 2
- 235000005152 nicotinamide Nutrition 0.000 description 2
- 239000011570 nicotinamide Substances 0.000 description 2
- 229960003966 nicotinamide Drugs 0.000 description 2
- 229940068977 polysorbate 20 Drugs 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 108010043671 prostatic acid phosphatase Proteins 0.000 description 2
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 229930000044 secondary metabolite Natural products 0.000 description 2
- 238000013207 serial dilution Methods 0.000 description 2
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 2
- 230000020382 suppression by virus of host antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 description 2
- DSNBHJFQCNUKMA-SCKDECHMSA-N thromboxane A2 Chemical compound OC(=O)CCC\C=C/C[C@@H]1[C@@H](/C=C/[C@@H](O)CCCCC)O[C@@H]2O[C@H]1C2 DSNBHJFQCNUKMA-SCKDECHMSA-N 0.000 description 2
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 2
- 229960004799 tryptophan Drugs 0.000 description 2
- HBZBAMXERPYTFS-SECBINFHSA-N (4S)-2-(6,7-dihydro-5H-pyrrolo[3,2-f][1,3]benzothiazol-2-yl)-4,5-dihydro-1,3-thiazole-4-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)[C@H]1CSC(=N1)c1nc2cc3CCNc3cc2s1 HBZBAMXERPYTFS-SECBINFHSA-N 0.000 description 1
- VZSRBBMJRBPUNF-UHFFFAOYSA-N 2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)-N-[3-oxo-3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)propyl]pyrimidine-5-carboxamide Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)C(=O)NCCC(N1CC2=C(CC1)NN=N2)=O VZSRBBMJRBPUNF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IVLXQGJVBGMLRR-UHFFFAOYSA-N 2-aminoacetic acid;hydron;chloride Chemical compound Cl.NCC(O)=O IVLXQGJVBGMLRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 101710169336 5'-deoxyadenosine deaminase Proteins 0.000 description 1
- STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 7-Cyan-hept-2t-en-4,6-diinsaeure Natural products C1=2C(O)=C3C(=O)C=4C(OC)=CC=CC=4C(=O)C3=C(O)C=2CC(O)(C(C)=O)CC1OC1CC(N)C(O)C(C)O1 STQGQHZAVUOBTE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091006112 ATPases Proteins 0.000 description 1
- 102000057290 Adenosine Triphosphatases Human genes 0.000 description 1
- 102100036664 Adenosine deaminase Human genes 0.000 description 1
- 102000009346 Adenosine receptors Human genes 0.000 description 1
- 108050000203 Adenosine receptors Proteins 0.000 description 1
- 101150051188 Adora2a gene Proteins 0.000 description 1
- WQVFQXXBNHHPLX-ZKWXMUAHSA-N Ala-Ala-His Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](Cc1cnc[nH]1)C(O)=O WQVFQXXBNHHPLX-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- 108010032595 Antibody Binding Sites Proteins 0.000 description 1
- 102100021569 Apoptosis regulator Bcl-2 Human genes 0.000 description 1
- 101100047785 Arabidopsis thaliana TT16 gene Proteins 0.000 description 1
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- PTNFNTOBUDWHNZ-GUBZILKMSA-N Asn-Arg-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O PTNFNTOBUDWHNZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MECFLTFREHAZLH-ACZMJKKPSA-N Asn-Glu-Cys Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N MECFLTFREHAZLH-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- KHCNTVRVAYCPQE-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O KHCNTVRVAYCPQE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 description 1
- 108010074708 B7-H1 Antigen Proteins 0.000 description 1
- 102100021663 Baculoviral IAP repeat-containing protein 5 Human genes 0.000 description 1
- 238000012492 Biacore method Methods 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101150013553 CD40 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 241001273590 Cyclostomata Species 0.000 description 1
- 201000004624 Dermatitis Diseases 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 208000004232 Enteritis Diseases 0.000 description 1
- 241000251747 Eptatretus Species 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 108010021470 Fc gamma receptor IIC Proteins 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 102100037362 Fibronectin Human genes 0.000 description 1
- 108010067306 Fibronectins Proteins 0.000 description 1
- 206010018338 Glioma Diseases 0.000 description 1
- YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N Glu-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000010956 Glypican Human genes 0.000 description 1
- 108050001154 Glypican Proteins 0.000 description 1
- 108050007237 Glypican-3 Proteins 0.000 description 1
- 102000005548 Hexokinase Human genes 0.000 description 1
- 108700040460 Hexokinases Proteins 0.000 description 1
- 101000971171 Homo sapiens Apoptosis regulator Bcl-2 Proteins 0.000 description 1
- 101000889276 Homo sapiens Cytotoxic T-lymphocyte protein 4 Proteins 0.000 description 1
- 101000935587 Homo sapiens Flavin reductase (NADPH) Proteins 0.000 description 1
- 101001057504 Homo sapiens Interferon-stimulated gene 20 kDa protein Proteins 0.000 description 1
- 101001055144 Homo sapiens Interleukin-2 receptor subunit alpha Proteins 0.000 description 1
- 101000878605 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Proteins 0.000 description 1
- 101000638251 Homo sapiens Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9 Proteins 0.000 description 1
- 101000801234 Homo sapiens Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18 Proteins 0.000 description 1
- 101000894590 Homo sapiens Uncharacterized protein C20orf85 Proteins 0.000 description 1
- 101000666856 Homo sapiens Vasoactive intestinal polypeptide receptor 1 Proteins 0.000 description 1
- 241000257303 Hymenoptera Species 0.000 description 1
- 206010021143 Hypoxia Diseases 0.000 description 1
- 102100026120 IgG receptor FcRn large subunit p51 Human genes 0.000 description 1
- 101710177940 IgG receptor FcRn large subunit p51 Proteins 0.000 description 1
- 102000037982 Immune checkpoint proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091008036 Immune checkpoint proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000006496 Immunoglobulin Heavy Chains Human genes 0.000 description 1
- 108010019476 Immunoglobulin Heavy Chains Proteins 0.000 description 1
- 102100026720 Interferon beta Human genes 0.000 description 1
- 108090000467 Interferon-beta Proteins 0.000 description 1
- 102100026878 Interleukin-2 receptor subunit alpha Human genes 0.000 description 1
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102100036091 Kynureninase Human genes 0.000 description 1
- 108010031676 Kynureninase Proteins 0.000 description 1
- 102100037652 Kynurenine 3-monooxygenase Human genes 0.000 description 1
- 108010033242 Kynurenine 3-monooxygenase Proteins 0.000 description 1
- 108010068073 Kynurenine-oxoglutarate transaminase Proteins 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- YGPSJZOEDVAXAB-QMMMGPOBSA-N L-kynurenine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(=O)C1=CC=CC=C1N YGPSJZOEDVAXAB-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- 125000000510 L-tryptophano group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C2N([H])C([H])=C(C([H])([H])[C@@]([H])(C(O[H])=O)N([H])[*])C2=C1[H] 0.000 description 1
- 241000405718 Lethenteron camtschaticum Species 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 102000019298 Lipocalin Human genes 0.000 description 1
- 108050006654 Lipocalin Proteins 0.000 description 1
- 102100038007 Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100029206 Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor II-c Human genes 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 229910052765 Lutetium Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010074338 Lymphokines Proteins 0.000 description 1
- 102000008072 Lymphokines Human genes 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- 206010028813 Nausea Diseases 0.000 description 1
- 206010028851 Necrosis Diseases 0.000 description 1
- 108010088865 Nicotinamide N-Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000009063 Nicotinamide N-methyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 241000238413 Octopus Species 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 102000043276 Oncogene Human genes 0.000 description 1
- 108010058846 Ovalbumin Proteins 0.000 description 1
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000282577 Pan troglodytes Species 0.000 description 1
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241001504519 Papio ursinus Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 1
- KIQUCMUULDXTAZ-HJOGWXRNSA-N Phe-Tyr-Tyr Chemical compound N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(O)=O KIQUCMUULDXTAZ-HJOGWXRNSA-N 0.000 description 1
- 102100024216 Programmed cell death 1 ligand 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100038277 Prostaglandin G/H synthase 1 Human genes 0.000 description 1
- 108050003243 Prostaglandin G/H synthase 1 Proteins 0.000 description 1
- 102220472147 Protein ENL_E11N_mutation Human genes 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 102000013009 Pyruvate Kinase Human genes 0.000 description 1
- 108020005115 Pyruvate Kinase Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 description 1
- QMCDMHWAKMUGJE-IHRRRGAJSA-N Ser-Phe-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O QMCDMHWAKMUGJE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- DKGRNFUXVTYRAS-UBHSHLNASA-N Ser-Ser-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O DKGRNFUXVTYRAS-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 206010041660 Splenomegaly Diseases 0.000 description 1
- 208000005718 Stomach Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 108010002687 Survivin Proteins 0.000 description 1
- 230000010782 T cell mediated cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 210000000662 T-lymphocyte subset Anatomy 0.000 description 1
- 102000004398 TNF receptor-associated factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 108090000920 TNF receptor-associated factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 108090000925 TNF receptor-associated factor 2 Proteins 0.000 description 1
- 102100034779 TRAF family member-associated NF-kappa-B activator Human genes 0.000 description 1
- 102220485195 Testis-expressed protein 30_N99A_mutation Human genes 0.000 description 1
- COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N Thr-Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O COYHRQWNJDJCNA-NUJDXYNKSA-N 0.000 description 1
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 description 1
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 description 1
- 102100032101 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9 Human genes 0.000 description 1
- 102100033728 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18 Human genes 0.000 description 1
- 102100022153 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Human genes 0.000 description 1
- 101710165473 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4 Proteins 0.000 description 1
- 102100040245 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5 Human genes 0.000 description 1
- KHPLUFDSWGDRHD-SLFFLAALSA-N Tyr-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=C(C=C3)O)N)C(=O)O KHPLUFDSWGDRHD-SLFFLAALSA-N 0.000 description 1
- 102100021442 Uncharacterized protein C20orf85 Human genes 0.000 description 1
- 101150117115 V gene Proteins 0.000 description 1
- 102100038388 Vasoactive intestinal polypeptide receptor 1 Human genes 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- JXLYSJRDGCGARV-WWYNWVTFSA-N Vinblastine Natural products O=C(O[C@H]1[C@](O)(C(=O)OC)[C@@H]2N(C)c3c(cc(c(OC)c3)[C@]3(C(=O)OC)c4[nH]c5c(c4CCN4C[C@](O)(CC)C[C@H](C3)C4)cccc5)[C@@]32[C@H]2[C@@]1(CC)C=CCN2CC3)C JXLYSJRDGCGARV-WWYNWVTFSA-N 0.000 description 1
- 229940122803 Vinca alkaloid Drugs 0.000 description 1
- 230000006682 Warburg effect Effects 0.000 description 1
- 238000001790 Welch's t-test Methods 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000006786 activation induced cell death Effects 0.000 description 1
- 231100000354 acute hepatitis Toxicity 0.000 description 1
- 210000005006 adaptive immune system Anatomy 0.000 description 1
- NLTUCYMLOPLUHL-KQYNXXCUSA-N adenosine 5'-[gamma-thio]triphosphate Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=S)[C@@H](O)[C@H]1O NLTUCYMLOPLUHL-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 1
- 150000003838 adenosines Chemical class 0.000 description 1
- 229940009456 adriamycin Drugs 0.000 description 1
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 description 1
- 238000012867 alanine scanning Methods 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 239000012491 analyte Substances 0.000 description 1
- 230000001093 anti-cancer Effects 0.000 description 1
- 238000011091 antibody purification Methods 0.000 description 1
- 230000005975 antitumor immune response Effects 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- 201000010878 atypical lipomatous tumor Diseases 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000027119 bilirubin metabolic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000008275 binding mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004204 blood vessel Anatomy 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 1
- 239000003560 cancer drug Substances 0.000 description 1
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000023852 carbohydrate metabolic process Effects 0.000 description 1
- 235000021256 carbohydrate metabolism Nutrition 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 1
- JCKYGMPEJWAADB-UHFFFAOYSA-N chlorambucil Chemical compound OC(=O)CCCC1=CC=C(N(CCCl)CCCl)C=C1 JCKYGMPEJWAADB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004630 chlorambucil Drugs 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 210000002808 connective tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 150000001945 cysteines Chemical class 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N daunorubicin Chemical compound O([C@H]1C[C@@](O)(CC=2C(O)=C3C(=O)C=4C=CC=C(C=4C(=O)C3=C(O)C=21)OC)C(C)=O)[C@H]1C[C@H](N)[C@H](O)[C@H](C)O1 STQGQHZAVUOBTE-VGBVRHCVSA-N 0.000 description 1
- 229960000975 daunorubicin Drugs 0.000 description 1
- 230000002498 deadly effect Effects 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000030609 dephosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006209 dephosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- 230000003828 downregulation Effects 0.000 description 1
- 229960004679 doxorubicin Drugs 0.000 description 1
- 238000009509 drug development Methods 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- VJJPUSNTGOMMGY-MRVIYFEKSA-N etoposide Chemical compound COC1=C(O)C(OC)=CC([C@@H]2C3=CC=4OCOC=4C=C3[C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@@H]4O[C@H](C)OC[C@H]4O3)O)[C@@H]3[C@@H]2C(OC3)=O)=C1 VJJPUSNTGOMMGY-MRVIYFEKSA-N 0.000 description 1
- 229960005420 etoposide Drugs 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 210000003722 extracellular fluid Anatomy 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 description 1
- 230000005714 functional activity Effects 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 206010017758 gastric cancer Diseases 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- 208000005017 glioblastoma Diseases 0.000 description 1
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 description 1
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 description 1
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 description 1
- 231100000334 hepatotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003082 hepatotoxic effect Effects 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000043321 human CTLA4 Human genes 0.000 description 1
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 208000036796 hyperbilirubinemia Diseases 0.000 description 1
- 230000001146 hypoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 1
- 229940126546 immune checkpoint molecule Drugs 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 230000016784 immunoglobulin production Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 1
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 150000002484 inorganic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000000138 intercalating agent Substances 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 229960005386 ipilimumab Drugs 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 description 1
- 229910052745 lead Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 1
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 208000019423 liver disease Diseases 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241001515942 marmosets Species 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- SGDBTWWWUNNDEQ-LBPRGKRZSA-N melphalan Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(N(CCCl)CCCl)C=C1 SGDBTWWWUNNDEQ-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 1
- 229960001924 melphalan Drugs 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 1
- 229960004857 mitomycin Drugs 0.000 description 1
- 210000004985 myeloid-derived suppressor cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000008693 nausea Effects 0.000 description 1
- MRWXACSTFXYYMV-FDDDBJFASA-N nebularine Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C2=NC=NC=C2N=C1 MRWXACSTFXYYMV-FDDDBJFASA-N 0.000 description 1
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 1
- 210000005170 neoplastic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000002547 new drug Substances 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 230000001293 nucleolytic effect Effects 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 230000037360 nucleotide metabolism Effects 0.000 description 1
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 229940092253 ovalbumin Drugs 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 230000036407 pain Effects 0.000 description 1
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- NRNCYVBFPDDJNE-UHFFFAOYSA-N pemoline Chemical compound O1C(N)=NC(=O)C1C1=CC=CC=C1 NRNCYVBFPDDJNE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 1
- 239000008177 pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 1
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 1
- 238000010837 poor prognosis Methods 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 230000001902 propagating effect Effects 0.000 description 1
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 239000002212 purine nucleoside Substances 0.000 description 1
- 239000002213 purine nucleotide Substances 0.000 description 1
- 150000003212 purines Chemical class 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- 102220068344 rs199989979 Human genes 0.000 description 1
- 102220123704 rs72542427 Human genes 0.000 description 1
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 229960001153 serine Drugs 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 201000011549 stomach cancer Diseases 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L succinate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC([O-])=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-I triphosphate(5-) Chemical compound [O-]P([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 230000003827 upregulation Effects 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 229960003048 vinblastine Drugs 0.000 description 1
- JXLYSJRDGCGARV-XQKSVPLYSA-N vincaleukoblastine Chemical compound C([C@@H](C[C@]1(C(=O)OC)C=2C(=CC3=C([C@]45[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]6(CC)C=CCN([C@H]56)CC4)(O)C(=O)OC)N3C)C=2)OC)C[C@@](C2)(O)CC)N2CCC2=C1NC1=CC=CC=C21 JXLYSJRDGCGARV-XQKSVPLYSA-N 0.000 description 1
- 229960004528 vincristine Drugs 0.000 description 1
- OGWKCGZFUXNPDA-XQKSVPLYSA-N vincristine Chemical compound C([N@]1C[C@@H](C[C@]2(C(=O)OC)C=3C(=CC4=C([C@]56[C@H]([C@@]([C@H](OC(C)=O)[C@]7(CC)C=CCN([C@H]67)CC5)(O)C(=O)OC)N4C=O)C=3)OC)C[C@@](C1)(O)CC)CC1=C2NC2=CC=CC=C12 OGWKCGZFUXNPDA-XQKSVPLYSA-N 0.000 description 1
- OGWKCGZFUXNPDA-UHFFFAOYSA-N vincristine Natural products C1C(CC)(O)CC(CC2(C(=O)OC)C=3C(=CC4=C(C56C(C(C(OC(C)=O)C7(CC)C=CCN(C67)CC5)(O)C(=O)OC)N4C=O)C=3)OC)CN1CCC1=C2NC2=CC=CC=C12 OGWKCGZFUXNPDA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000022752 well-differentiated liposarcoma Diseases 0.000 description 1
Description
Область техникиField of technology
Настоящее изобретение относится к aHTu-CD137 антигенсвязывающим молекулам и способам их применения.The present invention relates to aHTu-CD137 antigen binding molecules and methods of using them.
Предшествующий уровень техникиPrior Art
Рак является смертельно опасным заболеванием, которое трудно полностью вылечить, за исключением некоторых случаев. Результаты основного метода лечения, заключающегося в применении химиотерапевтических средств, нельзя признать удовлетворительными. Было высказано предположение, что не только гетерогенность самих раковых клеток, но и микроокружение опухоли играют важную роль в качестве фактора, затрудняющего лечение рака (NPL 1). Недавно было показано, что неоперабельная злокачественная меланома и другие подобные заболевания потенциально излечимы анти-CTLA-4 антителом, которое подавляет иммуносупрессивную функцию CTLA-4 и тем самым способствует активации Тклеток (NPL 2). В 2011 году моноклональное антитело против CTLA-4 человека (ипилимумаб) было одобрено Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) как первое в мире иммуноактивирующее антитело. Кроме того, сообщалось, что ингибирующие антитела против PD-1 и PD-L1, других отличных от CTLA-4 молекул иммунных контрольных точек, обладают терапевтическим действием (NPL 3) и одобрены FDA.Cancer is a deadly disease that is difficult to completely cure, except in some cases. The results of the main method of treatment, which consists in the use of chemotherapeutic agents, cannot be considered satisfactory. It has been suggested that not only the heterogeneity of the cancer cells themselves, but also the tumor microenvironment plays an important role as a complicating factor in cancer treatment (NPL 1). Recently, it was shown that inoperable malignant melanoma and other similar diseases are potentially curable with an anti-CTLA-4 antibody that inhibits the immunosuppressive function of CTLA-4 and thereby promotes T cell activation (NPL 2). In 2011, a monoclonal antibody against human CTLA-4 (ipilimumab) was approved by the US Food and Drug Administration (FDA) as the world's first immune-activating antibody. In addition, inhibitory antibodies against PD-1 and PD-L1, other immune checkpoint molecules other than CTLA-4, have been reported to be therapeutic (NPL 3) and approved by the FDA.
Известно, что Т-клетки, которые играют важную роль в опухолевом иммунитете, активируются двумя сигналами: 1) связыванием рецептора Т-клеток (TCR) с антигенным пептидом, представленным молекулами класса I главного комплекса гистосовместимости (MHC), и активацией TCR; и 2) связыванием костимулирующей молекулы на поверхности Т-клеток с ее лигандами на антигенпрезентирующих клетках и активацией костимулирующей молекулы. Кроме того, активацию костимулирующих молекул, принадлежащих к надсемейству рецепторов фактора некроза опухоли (TNFRSF, tumor necrosis factor receptor superfamily), включая CD137 (4-1BB), на поверхности Т-клеток, оценивают как важную функцию для активации Т-клеток (NPL 4).It is known that T cells, which play an important role in tumor immunity, are activated by two signals: 1) binding of the T cell receptor (TCR) to an antigenic peptide represented by class I molecules of the major histocompatibility complex (MHC), and activation of the TCR; and 2) binding of a costimulatory molecule on the surface of T cells to its ligands on antigen presenting cells and activation of the costimulatory molecule. In addition, activation of costimulatory molecules belonging to the tumor necrosis factor receptor superfamily (TNFRSF), including CD137 (4-1BB), on the surface of T cells has been implicated as an important function for T cell activation (NPL 4 ).
К надсемейству TNFRSF относят CD137, CD40, ОХ40, RANK, GITR и подобные молекулы. Установлено, что CD137 экспрессируется не только на поверхности Т-клеток, но также и на поверхности других иммунных клеток, таких как дендритные клетки (ДК), В-клетки, клетки-киллеры (NK), макрофаги и нейтрофилы (NPL 5).The TNFRSF superfamily includes CD137, CD40, OX40, RANK, GITR and similar molecules. CD137 has been found to be expressed not only on the surface of T cells, but also on the surface of other immune cells such as dendritic cells (DCs), B cells, killer (NK) cells, macrophages and neutrophils (NPL 5).
Агонистические антитела против CD137 уже продемонстрировали противоопухолевый эффект на модели мышей, и было показано, что это является результатом активации CD8-положительных Т-клеток и клеток NK в экспериментах на модели мышей (NPL 6). Однако побочные эффекты, обусловленные неспецифической гепатотоксичностью агонистического антитела против CD137, стали клиническими и неклиническими проблемами, препятствуя требуемому прогрессу при разработке лекарств (NPL 7, NPL 8). Предполагают, что побочные эффекты вызваны в основном активацией иммунных клеток в неопухолевых, неиммунных тканях, таких как печень, что включает связывание антитела с рецептором Fcy через константную область антитела (NPL 9). С другой стороны, показано, что для того, чтобы агонистические антитела, входящие в надсемейство антител против TNF рецепторов, проявляли агонистическую активность in vivo, антитело должно быть перекрестно связано клетками, экспрессирующими рецептор Fcy (клетками, экспрессирующими FcyRII) (NPL 10). То есть связывание агонистического антитела против CD137 с рецептором Fcy вовлечено как в лекарственную эффективность противоопухолевого действия антитела, так и в его побочные эффекты, такие как гепатотоксичность. Таким образом, увеличение связывания между антителом и рецептором Fcy предположительно повысит эффективность лекарственного средства, но также может усилить гепатотоксические побочные эффекты, а уменьшение связывания между антителом и рецептором Fcy может уменьшить побочные эффекты, но также понизить эффективность лекарственного средства. До сих пор не было сообщений об агонистических антителах против CD137, эффективность и побочные эффекты которых были бы разделены. Более того, противоопухолевый эффект агонистического антитела против CD137 никоим образом не является сильным клиническим средством, и желательно дальнейшее повышение эффективности лекарственного средства наряду с предотвращением токсичности. Соответственно, желательно разработать новое лекарственное средство, которое способно вызывать противоопухолевые иммунные ответы при одновременном уменьшении побочных эффектов.Agonistic antibodies against CD137 have already demonstrated antitumor effects in a mouse model, and this has been shown to result from the activation of CD8-positive T cells and NK cells in experiments in a mouse model (NPL 6). However, side effects due to nonspecific hepatotoxicity of the agonistic anti-CD137 antibody have become clinical and non-clinical problems, hindering the required progress in drug development (NPL 7, NPL 8). The side effects are believed to be caused primarily by activation of immune cells in non-tumor, non-immune tissues such as the liver, which involves antibody binding to the Fcy receptor via the antibody constant region (NPL 9). On the other hand, it has been shown that in order for agonistic antibodies belonging to the anti-TNF receptor superfamily of antibodies to exhibit agonistic activity in vivo, the antibody must be cross-linked by cells expressing the Fcy receptor (FcyRII expressing cells) (NPL 10). That is, the binding of an agonistic anti-CD137 antibody to the Fcy receptor is involved in both the drug efficacy of the antitumor effect of the antibody and its side effects, such as hepatotoxicity. Thus, increasing binding between antibody and Fcy receptor would presumably increase drug efficacy but could also increase hepatotoxic side effects, and decreasing binding between antibody and Fcy receptor might reduce side effects but also decrease drug efficacy. To date, there have been no reports of agonistic antibodies against CD137 whose efficacy and side effects have been separated. Moreover, the antitumor effect of an agonistic anti-CD137 antibody is by no means a strong clinical benefit, and further enhancement of drug efficacy along with prevention of toxicity is desirable. Accordingly, it is desirable to develop a new drug that is capable of inducing antitumor immune responses while reducing side effects.
Когда терапевтическое антитело вводят в живой организм, желательно, чтобы его антиген-мишень экспрессировался специфически только в месте поражения. Однако во многих случаях тот же антиген экспрессируется также в непораженных участках, то есть в нормальных тканях, и это может быть причиной побочных эффектов, нежелательных с точки зрения лечения. Например, хотя антитела против опухолевых антигенов могут проявлять цитотоксическую активность в отношении опухолевых клеток посредством антителозависимой клеточной цитотоксичности (ADCC) и т.д., они также могут повреждать нормальные клетки, если тот же антиген экспрессируется в нормальных клетках. Чтобы решить вышеупомянутые проблемы, основное внимание было уделено явлению, при котором определенные соединения в изобилии присутствуют в тканях-мишенях (например, в опухолевых тканях), и разработана технология поиска антигенсвязывающих молекул с различной антигенсвязывающей активностью в зависимоWhen a therapeutic antibody is administered to a living organism, it is desirable that its target antigen is expressed specifically only at the site of the lesion. However, in many cases the same antigen is also expressed in unaffected areas, that is, in normal tissues, and this may cause side effects that are undesirable from a treatment point of view. For example, although antibodies against tumor antigens can exhibit cytotoxic activity against tumor cells through antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC), etc., they can also damage normal cells if the same antigen is expressed in normal cells. To solve the above-mentioned problems, attention has been focused on the phenomenon in which certain compounds are abundantly present in target tissues (such as tumor tissues), and technology has been developed to search for antigen-binding molecules with different antigen-binding activities depending on the
- 1 046075 сти от концентрации таких соединений (например, PTL 1).- 1 046075 sti on the concentration of such compounds (for example, PTL 1).
Цитируемые источники.Sources cited.
Патентная литература:Patent Literature:
WO 2013/180200.WO 2013/180200.
Непатентная литература:Non-patent literature:
Hanahan, Cell, 144, 2011, 646-674,Hanahan, Cell, 144, 2011, 646-674,
Prieto, Clin Cancer Res. 18, 2012, 2039-2047,Prieto, Clin Cancer Res. 18, 2012, 2039-2047,
Hamid, Expert Opin. Biol. Ther., 6, 2013, 847-861,Hamid, Expert Opin. Biol. Ther., 6, 2013, 847-861,
Summers, Nat Rev Immunol, 12, 2012, 339-351,Summers, Nat Rev Immunol, 12, 2012, 339-351,
Vinay, Cellular & Molecular Immunology, 8, 2011, 281-284,Vinay, Cellular & Molecular Immunology, 8, 2011, 281-284,
Houot, Blood, 114, 2009, 3431-3438,Houot, Blood, 114, 2009, 3431-3438,
Ascierto, Semin Oncol, 37, 2010, 508-516,Ascierto, Semin Oncol, 37, 2010, 508-516,
Dubrot, Cancer Immunol Immunother, 59, 2010, 1223-1233,Dubrot, Cancer Immunol Immunother, 59, 2010, 1223-1233,
Schabowsky, Vaccine, 28, 2009, 512-522,Schabowsky, Vaccine, 28, 2009, 512-522,
Li, Proc Natl Acad Sci USA, 110(48), 2013, 19501-19506.Li, Proc Natl Acad Sci USA, 110(48), 2013, 19501-19506.
Краткое описание изобретенияBrief description of the invention
Техническая проблемаTechnical problem
Настоящее изобретение относится к анти-CD137 антигенсвязывающим молекулам и способам их применения.The present invention relates to anti-CD137 antigen-binding molecules and methods of using them.
Решение проблемыSolution
Чтобы получить анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы, которые активируют иммуноциты, обладают цитотоксической или противоопухолевой активностью и при этом проявляют пониженное действие на неопухолевые ткани, такие как нормальные ткани, и имеют меньше побочных эффектов, а также, чтобы разработать способы их применения, в настоящем изобретении получают анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы, характеризующиеся тем, что их активность связывания с CD137 варьирует в зависимости от различных соединений (например, низкомолекулярных соединений) в тканях-мишенях (например, в опухолевых тканях), а также разрабатывают способы их применения, фармацевтические составы и тому подобное. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению обладают низкими побочными эффектами, и, таким образом, дозировка может быть увеличена без опасений по поводу побочных эффектов, в результате они могут проявлять более высокую лекарственную эффективность (цитотоксическую активность или противоопухолевую активность).To obtain anti-CD137 antigen-binding molecules that activate immunocytes, have cytotoxic or antitumor activity and at the same time exhibit reduced effect on non-tumor tissues, such as normal tissues, and have fewer side effects, and also to develop methods for their use, in the present invention prepare anti-CD137 antigen-binding molecules, characterized in that their binding activity to CD137 varies depending on various compounds (eg, small molecules) in target tissues (eg, tumor tissues), and develop methods of their use, pharmaceutical compositions and things like that. In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules of the present invention have low side effects, and thus the dosage can be increased without concerns about side effects, and as a result, they can exhibit higher drug efficacy (cytotoxic activity or antitumor activity). activity).
Конкретно в настоящем изобретении предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы, способы их применения, фармацевтические составы и тому подобное, что описано в ниже приведенных примерах.Specifically, the present invention provides anti-CD137 antigen binding molecules, methods of using them, pharmaceutical compositions and the like, as described in the following examples.
[1][1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, которая обладает CD 137-связывающей активностью в зависимости от низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule, which has CD 137-binding activity depending on the small molecule compound.
[2][2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[1], причем связывающая активность с CD137 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения в два или более раз выше по сравнению со связывающей активностью с CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claim [1], wherein the binding activity to CD137 in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM low molecular weight compound is two or more times higher compared to the binding activity with CD137 in the absence of a small molecule compound.
[2.1][2.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по пп.[1] или [2], причем связывающая активность с CD137 в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два раза или более раз более чем связывающая активность с CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claims [1] or [2], wherein the CD137 binding activity in the presence of 10 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the CD137 binding activity in the absence of the small molecule compound.
[2.2][2.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[2.1], причем величина KD в отношении CD137 в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения составляет 5х10-7 М или менее.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [2.1], wherein the KD value for CD137 in the presence of 10 μM or more of the low molecular weight compound is 5x10 -7 M or less.
[2.3][2.3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[2.2], причем величина KD в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения составляет 5х10-6 М или более.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [2.2], wherein the KD value for CD137 in the absence of the small molecule compound is 5x10 -6 M or more.
[2.4][2.4]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[1], причем величина KD в отношении CD137 в растворе, который получают таким образом, что концентрация низкомолекулярного соединения составляет 10 мкМ или более, составляет 5х10-7 М или менее, и величина KD для CD137 в растворе, в который не добавляют низкомолекулярное соединение, составляет 1 х 10-6 М или более.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [1], wherein the KD value for CD137 in a solution that is prepared such that the concentration of the low molecular weight compound is 10 μM or more is 5x10 -7 M or less, and the KD value for CD137 in solution to which the low molecular weight compound is not added is 1 x 10 -6 M or more.
[2.5][2.5]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[1], причем величину KD в отношении CD137 вAhtu-CD137 antigen-binding molecule according to claim [1], wherein the KD value for CD137 is
- 2 046075 растворе, который получают таким образом, что концентрация низкомолекулярного соединения составляет 10 мкМ или более, и величину KD в отношении CD137 в растворе, в который низкомолекулярное соединение не вносят, каждую измеряют методом Biacore в течение 24 ч после контакта CD137 и антигенсвязывающей молекулы анти-CD137 в растворе.- 2 046075 solution, which is prepared in such a way that the concentration of the small molecule compound is 10 μM or more, and the KD value of CD137 in a solution in which the small molecule compound is not added, each measured by the Biacore method within 24 hours after contact of CD137 and the antigen binding molecule anti-CD137 in solution.
[2.6][2.6]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[2.5], которая образует тримолекулярный комплекс с низкомолекулярным соединением и CD137.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [2.5], which forms a trimolecular complex with a low molecular weight compound and CD137.
[2.7][2.7]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[2.6], которая связывается с молекулой CD137, происходящей от человека или обезьяны.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [2.6], which binds to a CD137 molecule derived from a human or ape.
[2.8][2.8]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[2.7], в которых низкомолекулярным соединением является аденозин-содержащее.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [2.7], in which the low molecular weight compound is adenosine-containing.
[2.9][2.9]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[2.8], в которых низкомолекулярным соединением является АТФ.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [2.8], in which the low molecular weight compound is ATP.
[3][3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[2.9], которая включает любую комбинацию гипервариабельных участков HVR-H1, HVR-H2 и HVR-H3, выбранных из представленных ниже пп.(а)-(л):Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [2.9], which includes any combination of hypervariable regions HVR-H1, HVR-H2 and HVR-H3 selected from claims (a) to (k) below:
(а) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17;(a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17;
(б) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17;(b) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17;
(в) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17;(c) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17;
(г) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18;(d) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18;
(д) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18;(e) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18;
(е) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18;(f) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18;
(ж) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18;(g) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18;
(з) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19;(h) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19;
(и) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20;(i) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20;
(к) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; и (л) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14, и HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17.(j) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20; and (k) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, and HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17.
[3.1][3.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[3], которая включает любую комбинацию гипервариабельных участков HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, выбранную из приведенных ниже пп.(а)-(ж):Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [3], which includes any combination of hypervariable regions HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 selected from the following claims (a) to (g):
(а) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(a) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(б) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную по(b) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence
- 3 046075 следовательность SEQ ID NO: 27;- 3 046075 sequence SEQ ID NO: 27;
(в) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28;(c) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 28;
(г) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29;(d) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 29;
(д) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(e) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(е) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; и (ж) HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.(f) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27; and (g) HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
[4][4]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, которая включает любую комбинацию гипервариабельных участков HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, выбранных из представленных ниже пп.(а)-(н):Ahtu-CD137 antigen binding molecule which includes any combination of hypervariable regions HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 selected from paragraphs (a) to (n) below:
(а) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(a) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(б) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(b) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(в) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(c) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(г) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(d) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(д) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(e) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(е) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28;(f) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 28;
(ж) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29;(g) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 29;
(з) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(h) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(и) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, HVR-H3, содержащий аминокислотную по(i) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15, HVR-H3 containing the amino acid sequence
- 4 046075 следовательность SEQ ID NO: 20, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;- 4 046075 sequence SEQ ID NO: 20, HVR-L1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 24, HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 27;
(к) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(j) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(л) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27;(k) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27;
(м) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27; и (н) HVR-H1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14, HVR-H3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, HVR-L1, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.(m) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27; and (n) HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17, HVR-L1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
[5][5]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, включающая:Ahtu-CD137 antigen binding molecule including:
(а) вариабельную область тяжелой цепи (VH), последовательность которой по меньшей мере на 95% идентична любой аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 43-53; или (б) вариабельную область легкой цепи (VL), последовательность которой по меньшей мере на 95% идентична любой аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 54-60.(a) a heavy chain variable region (VH) the sequence of which is at least 95% identical to any amino acid sequence of SEQ ID NO: 43-53; or (b) a light chain variable region (VL) the sequence of which is at least 95% identical to any amino acid sequence of SEQ ID NO: 54-60.
[5.1][5.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, включающая любую комбинацию вариабельных областей VH и VL, выбранных из представленных ниже пп.(а)-(н):Ahtu-CD137 antigen binding molecule comprising any combination of VH and VL variable regions selected from (a) to (n) below:
(а) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 43, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 54;(a) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
(б) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 44, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 55;(b) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 55;
(в) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 45, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 55;(c) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 55;
(г) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 46, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 54;(d) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
(д) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 47, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 54;(e) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
(е) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 48, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 56;(e) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56;
(ж) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 449, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 57;(g) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 449, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 57;
(з) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 50, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 58;(h) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(и) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 51, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 59;(i) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59;
(к) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 51, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 60;(k) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
- 5 046075 (л) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 52, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 60;- 5 046075 (l) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(м) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 50, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 59; и (н) VH, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 53, и VL, имеющей по меньшей мере 95% идентичности с аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 54.(l) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59; and (m) VH having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53, and VL having at least 95% identity with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54.
[5.2][5.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, включающая любую комбинацию вариабельных областей VH и VL, выбранных из представленных ниже пп.(а)-(н):Ahtu-CD137 antigen binding molecule comprising any combination of VH and VL variable regions selected from (a) to (n) below:
(а) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54;(a) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
(б) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 44, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 55;(b) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 44, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 55;
(в) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 45, и VL, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 55;(c) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 45, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 55;
(г) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 46, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54;(d) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 46, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
(д) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 47, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54;(e) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 47, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54;
(е) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 48, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56;(f) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 48, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 56;
(ж) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 49, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57;(g) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 49, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 57;
(з) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58;(h) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 58;
(и) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59;(i) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59;
(к) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60;(j) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(л) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60;(k) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 52, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60;
(м) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 50, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59; и (н) VH, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53, и VL, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.(l) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 50, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59; and (n) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 53, and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54.
[5.3][5.3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, значение которой [связывающая активность (связывающееся количество) с CD137 в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения]/[связывающая активность (связывающееся количество) с CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения] равно или больше, чем значение контрольной антигенсвязывающей молекулы, где контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу, содержащую комбинацию гипервариабельного участка HVR-H1, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8, HVR-H3, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, HVR-L1, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR- L2, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.Ahtu-CD137 antigen binding molecule whose value [binding activity (binding amount) to CD137 in the presence of 10 μM or more small molecule compound]/[binding activity (binding amount) to CD137 in the absence of small molecule compound] is equal to or greater than the value of the control antigen binding molecule wherein the control antigen binding molecule is an anti-CD137 antigen binding molecule comprising a combination of the hypervariable region HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8, HVR-H3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 17, HVR-L1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR-L3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
[5.4][5.4]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[5.3], причем контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу, содержащую комбинацию VH, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, и VL, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule of claim [5.3], wherein the control antigen binding molecule is an anti-CD137 antigen binding molecule comprising a combination of VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43 and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54.
[5.5][5.5]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, значение которой [связывающая активность (KD) с CD137 в присутствии 1 мкМ низкомолекулярного соединения]/[связывающая активность (KD) с CD137 в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярное соединения] равно или больше значения контрольной антигенсвязывающей молекулы, где контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу, содержащую комбинацию HVR-H1, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7, HVR-H2, содержащего аминокислотную последовательAhtu-CD137 antigen binding molecule, the value of which [binding activity (KD) with CD137 in the presence of 1 μM small molecule compound]/[binding activity (KD) with CD137 in the presence of 10 μM or more small molecule compound] is equal to or greater than the value of the control antigen binding molecule, where the control antigen binding molecule is an anti-CD137 antigen binding molecule comprising a combination of HVR-H1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, HVR-H2 containing the amino acid sequence
- 6 046075 ность SEQ ID NO: 8, HVR-H3, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, HVRL1, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, HVR-L2, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, и HVR-L3, содержащего аминокислотная последовательность SEQ ID NO: 27.- 6 046075 identity of SEQ ID NO: 8, HVR-H3 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17, HVRL1 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21, HVR-L2 containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26, and HVR- L3 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 27.
[5.6][5.6]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[5.5], причем контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу, содержащую комбинацию VH, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, и VL, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule of claim [5.5], wherein the control antigen binding molecule is an anti-CD137 antigen binding molecule comprising a combination of VH comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43 and VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54.
[5.7][5.7]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, которая обладает CD137-антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, причем анти-CD137 антигенсвязывающая молекула конкурирует с антигенсвязывающей молекулой по любому из пп.[3]-[5.2] за связывание с CD137 в присутствии 10 мкМ или более, 50 мкМ или более, 100 мкМ или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более или 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen binding molecule which has CD137 antigen binding activity dependent on a small molecule compound, wherein the anti-CD137 antigen binding molecule competes with the antigen binding molecule of any one of claims [3] to [5.2] for binding to CD137 in the presence of 10 μM or more , 50 μM or more, 100 μM or more, 150 μM or more, 200 μM or more, or 250 μM or more of a low molecular weight compound.
[5.8][5.8]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, которая обладает CD137-антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, причем анти-CD137 антигенсвязывающая молекула связывается с тем же эпитопом CD137, связанным с антигенсвязывающей молекулой по любому из пп.[3]-[5.2] в присутствии 10 мкМ или более, 50 мкМ или более, 100 мкМ или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более или 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen binding molecule which has CD137 antigen binding activity dependent on a small molecule compound, wherein the anti-CD137 antigen binding molecule binds to the same CD137 epitope associated with the antigen binding molecule of any one of claims [3] to [5.2] in the presence of 10 µM or more, 50 µM or more, 100 µM or more, 150 µM or more, 200 µM or more, or 250 µM or more of a low molecular weight compound.
[5.8А][5.8A]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[5.3]-[5.8], где низкомолекулярное соединение представляет собой аденозинсодержащее соединение.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [5.3] to [5.8], wherein the low molecular weight compound is an adenosine-containing compound.
[5.8Б][5.8B]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[5.3]-[5.8А], где низкомолекулярное соединение представляет собой АТФ.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of paragraphs [5.3] to [5.8A], wherein the low molecular weight compound is ATP.
[5.9][5.9]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[5.8Б], которая является моноклональным антителом или его антигенсвязывающим фрагментом.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [5.8B], which is a monoclonal antibody or an antigen binding fragment thereof.
[5.10][5.10]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[5.9], которая является антителом человека, гуманизированным антителом или химерным антителом, или их антигенсвязывающий фрагментом.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [5.9], which is a human antibody, a humanized antibody or a chimeric antibody, or an antigen binding fragment thereof.
[5.11][5.11]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[5.10], которая является антителом IgG1 полной длины.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [5.10], which is a full length IgG1 antibody.
[5.12][5.12]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[5.11], которая содержит измененную область Fc, в которой изменена по меньшей мере одна аминокислота, причем измененная область Fc имеет повышенную связывающую активность с FcYRIIb по сравнению с исходной областью Fc, которая не содержит изменений аминокислот.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [5.11], which contains an altered Fc region in which at least one amino acid is altered, wherein the altered Fc region has increased binding activity to FcYRIIb compared to the original Fc region, which does not contain amino acid changes.
[5.13][5.13]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[5.12], в которой связывающая активность измененной Fc с FcYRIIb равна или выше, чем у контрольной области Fc, причем контрольная область Fc является областью Fc IgG1 человека, содержащей комбинацию аминокислотных замен G236N/H268D/A330K согласно нумерации EU.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claim [5.12], in which the binding activity of the altered Fc with FcYRIIb is equal to or higher than that of the control Fc region, and the control Fc region is a human IgG1 Fc region containing a combination of amino acid substitutions G236N/H268D/A330K according to EU numbering.
[5.14][5.14]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[5.12] или [5.13], причем контрольная область Fc содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 153.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [5.12] or [5.13], wherein the Fc control region contains the amino acid sequence SEQ ID NO: 153.
[5.15][5.15]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[5.12], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой по меньшей мере одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из G236N, H268D и A330K в соответствии с нумерацией EU.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [5.12], wherein the at least one amino acid change is at least one amino acid substitution selected from the group consisting of G236N, H268D and A330K according to EU numbering.
[5.16][5.16]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по пп.[5.12] или [5.15], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой комбинацию аминокислотных замен G236N/H268D/A330K в соответствии с нумерацией EU.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claims [5.12] or [5.15], wherein at least one amino acid change is a combination of amino acid substitutions G236N/H268D/A330K in accordance with EU numbering.
[5.17][5.17]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[5.12]-[5.16], в которой исходная область Fc является производной от области Fc IgG1 человека.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [5.12] to [5.16], wherein the original Fc region is derived from the Fc region of human IgG1.
- 7 046075- 7 046075
[5.18][5.18]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[5.17], которая содержит измененную область Fc, в которой изменена по меньшей мере одна аминокислота, причем анти-CD137 антигенсвязывающая молекула имеет повышенную изоэлектрическую точку (pI) по сравнению с изоэлектрической точкой исходной анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы, содержащей исходную область Fc, которая не содержит изменения аминокислот.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [5.17], which comprises an altered Fc region in which at least one amino acid is altered, wherein the anti-CD137 antigen binding molecule has an increased isoelectric point (pI) compared to the isoelectric point of the original anti-CD137 antigen binding molecule containing the original Fc region, which does not contain amino acid changes.
[5.19][5.19]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[5.18], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой изменение аминокислотного остатка, который может быть экспонирован на поверхности исходной области Fc.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [5.18], wherein the at least one amino acid change is a change in an amino acid residue that can be exposed on the surface of the original Fc region.
[5.20][5.20]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по пп.[5.18] или [5.19], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой:Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claims [5.18] or [5.19], wherein at least one amino acid change is:
(i) замену по меньшей мере одного аминокислотного остатка, имеющего отрицательный заряд в боковой цепи в исходной области Fc, на аминокислотный остаток, не имеющий заряда в боковой цепи, (ii) замену по меньшей мере одного аминокислотного остатка, не имеющего заряда в боковой цепи в исходной области Fc, на аминокислотный остаток, имеющий положительный заряд в боковой цепи, и/или (iii) замену по меньшей мере одного аминокислотного остатка, имеющего отрицательный заряд в боковой цепи в исходной области Fc, на аминокислотный остаток, имеющий положительный заряд в боковой цепи.(i) replacing at least one amino acid residue having a negative side chain charge in the original Fc region with an amino acid residue having no side chain charge, (ii) replacing at least one amino acid residue having no side chain charge in the original Fc region, with an amino acid residue having a positive side chain charge, and/or (iii) replacing at least one amino acid residue having a negative side chain charge in the original Fc region with an amino acid residue having a positive side chain charge chains.
[5.21][5.21]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[5.18]-[5.20], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой комбинацию аминокислотных замен, и в которой аминокислотные замены расположены в положениях, конформационно близко расположенных друг к другу.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [5.18] to [5.20], wherein the at least one amino acid change is a combination of amino acid substitutions, and wherein the amino acid substitutions are located at positions that are conformationally close to each other.
[5.22][5.22]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[5.18]-[5.21], в которой связывающая активность измененной области Fc с рецептором Fcy (FcyR) существенно не снижена по сравнению со связывающей активностью у исходной области Fc.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [5.18] to [5.21], wherein the binding activity of the altered Fc region to the Fcy receptor (FcyR) is not significantly reduced compared to the binding activity of the original Fc region.
[5.23][5.23]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[5.22], в которой рецептором Fcy (FcyR) является FcYRIIb.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [5.22], wherein the Fcy receptor (FcyR) is FcYRIIb.
[5.24][5.24]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[5.18]-[5.23], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой по меньшей мере одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из Q311R, P343R и D413K в соответствии с нумерацией EU.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [5.18] to [5.23], wherein the at least one amino acid change is at least one amino acid substitution selected from the group consisting of Q311R, P343R and D413K according to numbering EU.
[5.25][5.25]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[5.18]-[5.24], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой (i) аминокислотную замену P343R, (ii) комбинацию аминокислотных замен Q311R/P343R или (iii) комбинацию аминокислотных замен Q311R/D413K, согласно нумерации EU.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [5.18] to [5.24], wherein at least one amino acid change is (i) a P343R amino acid substitution, (ii) a combination of Q311R/P343R amino acid substitutions, or (iii) a combination of amino acid substitutions replacements Q311R/D413K, according to EU numbering.
[6][6]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[5.25], которая содержит измененную область Fc, причем измененная область Fc содержит любую комбинацию аминокислотных изменений, выбранных из следующих:The Ahtu-CD137 antigen binding molecule of any one of claims [1] to [5.25], which comprises an altered Fc region, wherein the altered Fc region comprises any combination of amino acid changes selected from the following:
L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R/D413K;L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R/D413K;
K214R/L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R/D413K;K214R/L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R/D413K;
L234Y/P238D/T250V/V264I/T307P/A330K/P343R/D413K;L234Y/P238D/T250V/V264I/T307P/A330K/P343R/D413K;
L234Y/P238D/V264I/A330K/P343R/D413K;L234Y/P238D/V264I/A330K/P343R/D413K;
L234Y/G237D/P238D/T250V/T307P/A330K/P343R/D413K;L234Y/G237D/P238D/T250V/T307P/A330K/P343R/D413K;
L234Y/G237D/P238D/A330K/P343R/D413K;L234Y/G237D/P238D/A330K/P343R/D413K;
L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/Q311R/P343R;L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/Q311R/P343R;
L234Y/P238D/T250V/V264I/T307P/A330K/Q311R/P343R;L234Y/P238D/T250V/V264I/T307P/A330K/Q311R/P343R;
L234Y/P238D/V264I/A330K/Q311R/P343R;L234Y/P238D/V264I/A330K/Q311R/P343R;
L234Y/G237D/P238D/T250V/T307P/A330K/Q311R/P343R;L234Y/G237D/P238D/T250V/T307P/A330K/Q311R/P343R;
L234Y/G237D/P238D/A330K/Q311R/P343R;L234Y/G237D/P238D/A330K/Q311R/P343R;
L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R;L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R;
K214R/L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R;K214R/L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/P343R;
L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/D413K;L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K/D413K;
K214R/G236N/H268D/A330K/P343R;K214R/G236N/H268D/A330K/P343R;
- 8 046075- 8 046075
K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/P343R;K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/P343R;
K214R/G236N/H268D/A330K/D413K;K214R/G236N/H268D/A330K/D413K;
K214R/G236N/H268D/A330K/P343R/D413K;K214R/G236N/H268D/A330K/P343R/D413K;
K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/P343R/D413K;K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/P343R/D413K;
K214R/G236N/H268D/A330K/Q311R;K214R/G236N/H268D/A330K/Q311R;
K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/Q311R;K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/Q311R;
K214R/G236N/H268D/A330K/Q311R/P343R;K214R/G236N/H268D/A330K/Q311R/P343R;
K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/Q311R/P343R;K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/Q311R/P343R;
K214R/G236N/H268D/A330K/Q311R/D413K;K214R/G236N/H268D/A330K/Q311R/D413K;
K214R/L235W/G236N/H268D/A330K/Q311R/D413K; иK214R/L235W/G236N/H268D/A330K/Q311R/D413K; And
K214R/L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A33OK/Q311R.K214R/L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A33OK/Q311R.
Нумерация по EU.EU numbering.
[6.1][6.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[6], в которой измененная область Fc является производной от области Fc IgG1 человека.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [6], wherein the altered Fc region is derived from the Fc region of human IgG1.
[6.2][6.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[6.1], в которой измененная область Fc дополнительно включает делеции в положениях 446 и 447 в соответствии с нумерацией EU.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [6.1], wherein the altered Fc region further includes deletions at positions 446 and 447 in accordance with EU numbering.
[7][7]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[6.2], которая включает константную область тяжелой цепи, содержащую любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 64-85.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [6.2], which includes a heavy chain constant region containing any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 64-85.
[7.1][7.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, содержащая любую комбинацию областей VH, VL, СН и CL, выбранных из приведенных ниже пп.(1)-(хххНп):Ahtu-CD137 antigen binding molecule containing any combination of VH, VL, CH and CL regions selected from the following (1)-(xxxHn):
(i) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(i) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 64, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(ii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(ii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 66, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(iii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 67, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(iii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 67, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(iv) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(iv) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 68, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(v) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 69, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(v) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 69, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(vi) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 70, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(vi) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 70, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(vii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 71, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(vii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 71, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(viii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 73, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(viii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 73, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(ix) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 75, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(ix) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 75, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(x) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, СН, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 78, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(x) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 78, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xi) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xi) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 80, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 82, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 82, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xiii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, CH, содержащей ами(xiii) VH containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 43, CH containing ami
- 9 046075 нокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;- 9 046075 amino acid sequence SEQ ID NO: 84, VL containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 63;
(xiv) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xiv) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 85, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xv) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 65, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xv) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 65, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xvi) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xvi) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xvii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 74, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xvii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 74, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xviii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 75, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xviii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 75, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xix) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 77, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xix) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 77, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xx) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 78, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xx) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 78, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxi) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxi) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 79, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 80, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxiii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxiii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 81, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxiv) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 82, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxiv) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 82, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxv) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxv) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 83, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxvi) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 59, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxvi) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 84, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 59, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxvii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 72, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxvii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 72, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxviii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 74, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxviii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 74, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxix) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 75, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxix) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 75, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxx) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 77, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxx) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 77, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxxi) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 78, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxxi) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 78, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxxii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 79, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxxii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 79, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxxiii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 80, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxxiii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 80, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
- 10 046075 (xxxiv) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 81, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;- 10 046075 (xxxiv) VH containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 81, VL containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 63 ;
(xxxv) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 82, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxxv) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 82, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxxvi) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 83, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63;(xxxvi) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 83, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63;
(xxxvii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 84, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63; и (xxxviii) VH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 51, CH, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 85, VL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60, и CL, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63.(xxxvii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 84, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63; and (xxxviii) VH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 51, CH containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 85, VL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 60, and CL containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 63.
[8][8]
Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу по любому из пп.[1]-[7.1].An isolated nucleic acid encoding an anti-CD137 antigen-binding molecule according to any one of claims [1] to [7.1].
[9][9]
Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п.[8].A vector containing a nucleic acid according to claim [8].
[10][10]
Клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту по п. [8] или вектор по п. [9].A host cell containing a nucleic acid according to paragraph [8] or a vector according to paragraph [9].
[11][eleven]
Метод получения анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы, который включает культивирование клетки-хозяина по п.[10] таким образом, чтобы получить анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу.A method for producing an anti-CD137 antigen-binding molecule, which includes culturing a host cell according to claim [10] so as to obtain an anti-CD137 antigen-binding molecule.
[12][12]
Иммуноконъюгат, включающий анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу по любому из пп.[1][7.1] и цитотоксический агент.An immunoconjugate comprising an anti-CD137 antigen-binding molecule according to any one of claims [1][7.1] and a cytotoxic agent.
[13][13]
Фармацевтический состав, включающий анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу по любому из пп.[1]-[7.1] или иммуноконъюгат по п.[12]; и фармацевтически приемлемый носитель.A pharmaceutical composition comprising an anti-CD137 antigen-binding molecule according to any one of paragraphs [1] to [7.1] or an immunoconjugate according to paragraph [12]; and a pharmaceutically acceptable carrier.
[14][14]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1] или иммуноконъюгат по п.[12], которые предназначены для применения в качестве фармацевтического средства.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of paragraphs [1] to [7.1] or an immunoconjugate according to paragraph [12], which are intended for use as a pharmaceutical agent.
[14.1][14.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1], иммуноконъюгат по п.[12] или фармацевтический состав по п.[13], которые предназначены для применения в лечении рака.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to any one of paragraphs [1]-[7.1], immunoconjugate according to paragraph [12] or a pharmaceutical composition according to claim [13], which are intended for use in the treatment of cancer.
[14.2][14.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, иммуноконъюгат или фармацевтический состав по п.[14.1], в котором опухоль является солидной опухолью, инфильтрованной В-клетками, дендритными клетками, природными клетками-киллерами, макрофагами и/или CD8-положительными Т-клетками.Ahtu-CD137 antigen binding molecule, immunoconjugate or pharmaceutical composition according to claim [14.1], wherein the tumor is a solid tumor infiltrated by B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages and/or CD8 positive T cells.
[14.3][14.3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, иммуноконъюгат или фармацевтический состав по п.[14.1], в котором опухоль является солидной опухолью, инфильтрованной регуляторными Т-клетками (Treg).Ahtu-CD137 antigen binding molecule, immunoconjugate or pharmaceutical composition according to claim [14.1], wherein the tumor is a solid tumor infiltrated by regulatory T cells (Treg).
[15][15]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1], иммуноконъюгат по п.[12] или фармацевтический состав по п.[13], которые предназначены для применения в активации иммунных клеток.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to any one of paragraphs [1]-[7.1], immunoconjugate according to paragraph [12] or a pharmaceutical composition according to claim [13], which are intended for use in activating immune cells.
[15.1][15.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, иммуноконъюгат или фармацевтический состав по п.[15], в котором иммунные клетки являются В-клетками, дендритными клетками, природными клетками-киллерами, макрофагами и/или Т-клетками.Ahtu-CD137 antigen binding molecule, immunoconjugate or pharmaceutical composition according to claim [15], wherein the immune cells are B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages and/or T cells.
[15.2][15.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1] или фармацевтический состав по п.[13], которые предназначены для активации иммунных клеток в опухолевой ткани.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to any one of paragraphs [1] to [7.1] or a pharmaceutical composition according to paragraph [13], which are intended to activate immune cells in tumor tissue.
[15.3][15.3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула или фармацевтический состав по п.[15.2], в которых иммунными клетками являются В-клетки, дендритные клетки, природные клетки-киллеры, макрофаги и/или Т-клетки.Ahtu-CD137 antigen binding molecule or pharmaceutical composition according to claim [15.2], wherein the immune cells are B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages and/or T cells.
[15.4][15.4]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1], иммуноконъюгат по п.[12]Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to any one of paragraphs [1]-[7.1], immunoconjugate according to paragraph [12]
- 11 046075 или фармацевтический состав по п.[13], которые предназначены для применения в разрушении клеток.- 11 046075 or a pharmaceutical composition according to claim [13], which are intended for use in cell destruction.
[16][16]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1], иммуноконъюгат по п.[12] или фармацевтический состав по п.[13], чей уровень активации иммунитета в неопухолевой ткани ниже, чем уровень активации иммунитета у анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы, которая не обладает CD137-связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to any one of paragraphs [1]-[7.1], immunoconjugate according to paragraph [12] or a pharmaceutical composition according to claim [13], whose level of immune activation in non-tumor tissue is lower than the level of immune activation of an anti-CD137 antigen-binding molecule that does not have CD137-binding activity dependent on a small molecule compound.
[16.1][16.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, иммуноконъюгат или фармацевтический состав по п.[16], в котором неопухолевой тканью являются лимфоузлы, селезенка и/или печень.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule, immunoconjugate or pharmaceutical composition according to claim [16], in which the non-tumor tissue is lymph nodes, spleen and/or liver.
[16.2][16.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1] или иммуноконъюгат по п.[12], которые существенным образом не связываются с CD137, экспрессируемым в неопухолевой ткани.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule of any one of claims [1] to [7.1] or the immunoconjugate of claim [12], which does not significantly bind to CD137 expressed in non-tumor tissue.
[16.3][16.3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1] или иммуноконъюгат по п.[12], которые имеют более длительный период полужизни в крови по сравнению с анти-CD137 антигенсвязывающей молекулой, которая не обладает CD137-связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [7.1] or immunoconjugate according to claim [12], which have a longer half-life in the blood compared to an anti-CD137 antigen binding molecule that does not have CD137 binding activity , depending on the low molecular weight compound.
[17][17]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1], иммуноконъюгат по п.[12] или фармацевтический состав по п.[13], которые имеют пониженный уровень побочных эффектов по сравнению с анти-CD137 антигенсвязывающей молекулой, которая не обладает CD137-связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to any one of paragraphs [1]-[7.1], immunoconjugate according to paragraph [12] or a pharmaceutical composition according to claim [13], which have a reduced level of side effects compared to an anti-CD137 antigen binding molecule that does not have small molecule dependent CD137 binding activity.
[17.1][17.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, иммуноконъюгат или фармацевтический состав по п.[17], в котором побочные эффекты представлены повышенным AST, повышенным ALT, лихорадкой, тошнотой, острым гепатитом, гепатопатией, спленомегалией, энтеритом, гнойным воспалением кожи, уменьшением нейтрофилов, уменьшением лимфоцитов, уменьшением тромбоцитов, экспрессией трансаминазы и/или гипербилирубинемией.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule, immunoconjugate or pharmaceutical composition according to claim [17], in which the side effects are increased AST, increased ALT, fever, nausea, acute hepatitis, hepatopathy, splenomegaly, enteritis, purulent inflammation of the skin, decreased neutrophils, decreased lymphocytes , decreased platelets, transaminase expression and/or hyperbilirubinemia.
[18][18]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула, которая обладает агонистической активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 is an antigen-binding molecule that has small molecule dependent agonist activity.
[18.1][18.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[18], в котором агонистическая активность против CD137 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения в два или более раз больше по сравнению с агонистической активностью против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [18], wherein the agonist activity against CD137 in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM small molecule compound is two or more times greater than the agonist activity against CD137 in the absence of a small molecule compound.
[18.2][18.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по пп.[18] или [18.1], в которых агонистическая активность против CD137 в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз больше по сравнению с агонистической активностью против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claims [18] or [18.1], wherein the anti-CD137 agonist activity in the presence of 10 μM or more of the small molecule compound is twofold or more greater than the anti-CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
[18.3][18.3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по пп.[18] или [18.1], в которых агонистическая активность против CD137 в присутствии 50 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз больше по сравнению с агонистической активностью против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claims [18] or [18.1], wherein the anti-CD137 agonist activity in the presence of 50 μM or more of the small molecule compound is twofold or more greater than the anti-CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
[18.4][18.4]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по пп.[18] или [18.1], в которых агонистическая активность против CD137 в присутствии 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз больше по сравнению с агонистической активностью против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claims [18] or [18.1], wherein the anti-CD137 agonist activity in the presence of 250 μM or more of the small molecule compound is twofold or more greater than the anti-CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
[18.5][18.5]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[18]-[18.4], в которых агонистическую активность против CD137 оценивают по количеству IL-2 и/или IFN-γ, вырабатываемых CD137экспрессирующими клетками.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [18] to [18.4], wherein agonist activity against CD137 is assessed by the amount of IL-2 and/or IFN-γ produced by CD137 expressing cells.
[18.6][18.6]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[18.5], в котором CD137-экспрессирующими клетками являются выделенные мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК) человека или Тклетки, производные от МКПК человека.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [18.5], wherein the CD137-expressing cells are isolated human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) or human PBMC-derived T cells.
[18.7][18.7]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[18]-[18.4], в которых агонистическую активность против CD137 оценивают по анализу репортерного гена.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [18] to [18.4], wherein agonistic activity against CD137 is assessed by a reporter gene assay.
- 12 046075- 12 046075
[18.8][18.8]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[18], которая проявляет агонистическую активность в отношении CD137 в растворе, который приготовлен таким образом, что конечная концентрация низкомолекулярного соединения составляет 50 мкМ или более, и по существу не проявляет агонистической активности в отношении CD137 в растворе, в который не добавлено низкомолекулярное соединение.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [18], which exhibits CD137 agonist activity in a solution that is prepared such that the final concentration of the small molecule compound is 50 μM or more, and substantially does not exhibit CD137 agonist activity in solution , to which no low molecular weight compound is added.
[18.9][18.9]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[18.8], в котором агонистическую активность против CD137 в растворе, который приготовлен таким образом, что конечная концентрация низкомолекулярного соединения составляет 50 мкМ или более, и агонистическую активность против CD137 в растворе, в который не добавляют низкомолекулярное соединение, каждую оценивают с количеством IL-2, IFN-γ и/или IL-6 по измерениям в течение 72 ч после контакта клетки, экспрессирующей CD137, и антиCD137антигенсвязывающей молекулы в растворе.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [18.8], wherein the anti-CD137 agonist activity in a solution that is prepared such that the final concentration of the small molecule compound is 50 μM or more, and the anti-CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is not added compound, each assessed for the amount of IL-2, IFN-γ and/or IL-6 as measured within 72 hours after contact of a cell expressing CD137 and an anti-CD137 antigen-binding molecule in solution.
[18.10][18.10]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[18.8], в котором агонистическую активность против CD137 в растворе, который приготовлен таким образом, что конечная концентрация низкомолекулярного соединения составляет 50 мкМ или более, и агонистическую активность против CD137 в растворе, в который не добавляют низкомолекулярное соединение, каждую оценивают по сигналу люминесценции люциферазы, который измеряют в течение 6 ч после контакта Т-клеток, экспрессирующих NFkappaB-люцифераза репортерную конструкцию и CD137 с анти-CD137 антигенсвязывающей молекулой.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [18.8], wherein the anti-CD137 agonist activity in a solution that is prepared such that the final concentration of the small molecule compound is 50 μM or more, and the anti-CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is not added compound, each is assessed by the luciferase luminescence signal, which is measured within 6 hours after contact of T cells expressing the NFkappaB-luciferase reporter construct and CD137 with an anti-CD137 antigen-binding molecule.
[18.11][18.11]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[18]-[18.10], в которых низкомолекулярным соединением является соединение, содержащее аденозин.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [18] to [18.10], wherein the low molecular weight compound is an adenosine-containing compound.
[18.12][18.12]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[18]-[18.11], в которых низкомолекулярным соединением является АТФ.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of paragraphs. [18]-[18.11], in which the low molecular weight compound is ATP.
[19][19]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[1]-[7.1], которая обладает агонистической активностью против CD137, зависящей от низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [1] to [7.1], which has agonistic activity against CD137, dependent on a small molecule compound.
[19.1][19.1]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19], в котором агонистическая активность против CD137 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [19], wherein the agonistic activity against CD137 in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM small molecule compound is two or more times higher than the agonistic activity against CD137 in the absence of a small molecule compound.
[19.2][19.2]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по пп.[19] или [19.1], в которых агонистическая активность против CD137 в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claims [19] or [19.1], wherein the CD137 agonist activity in the presence of 10 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
[19.3][19.3]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19] или [19.1], в которых агонистическая активность против CD137 в присутствии 50 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claim [19] or [19.1], wherein the CD137 agonist activity in the presence of 50 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
[19.4][19.4]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19] или [19.1], в которых агонистическая активность против CD137 в присутствии 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность против CD137 при отсутствии низкомолекулярного соединения.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claim [19] or [19.1], wherein the CD137 agonist activity in the presence of 250 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
[19.5][19.5]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19] или [19.1], в которых агонистическую активность против CD137 оценивают по количеству IL-2 и/или IFN-γ, продуцируемых клеткой, экспрессирующей CD137.Ahtu-CD137 antigen-binding molecule according to claim [19] or [19.1], wherein CD137 agonist activity is assessed by the amount of IL-2 and/or IFN-γ produced by the CD137-expressing cell.
[19.6][19.6]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19.5], в котором CD137-эксnрессирующая клетка представляет собой выделенную мононуклеарную клетку периферической крови (МКПК) человека или Т-клетку, происходящую из МКПК человека.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule of claim [19.5], wherein the CD137-expressing cell is an isolated human peripheral blood mononuclear cell (PBMC) or a T cell derived from a human PBMC.
[19.7][19.7]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[19] или [19.4], в которых агонистическую активность CD137 оценивают с помощью анализа репортерного гена.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims[19] or [19.4], in which the agonistic activity of CD137 is assessed using a reporter gene assay.
[19.8][19.8]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19], которая проявляет агонистическую активность в отношении CD137 в растворе, который приготовлен таким образом, что конечная концентрация низкомолекулярного соединения составляет 50 мкМ или более, и по существу не проявляет агонистической активности в отношении CD137 в растворе, в который не добавлено низкомолекулярное соединение.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [19], which exhibits CD137 agonist activity in a solution that is prepared such that the final concentration of the small molecule compound is 50 μM or more, and substantially does not exhibit CD137 agonist activity in solution , to which no low molecular weight compound is added.
- 13 046075- 13 046075
[19.9][19.9]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19.8], в котором агонистическую активность против CD137 в растворе, который приготовлен таким образом, что конечная концентрация низкомолекулярного соединения составляет 50 мкМ или более, и агонистическую активность против CD137 в растворе, в который не добавляют низкомолекулярное соединение, каждую оценивают по количеству IL-2, IFNγ и/или IL-6, измеренным в течение 72 ч после контакта клетки, экспрессирующей CD137, и анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы в растворе.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [19.8], wherein the anti-CD137 agonist activity in a solution that is prepared such that the final concentration of the small molecule compound is 50 μM or more, and the anti-CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is not added compound, each assessed by the amount of IL-2, IFNγ and/or IL-6 measured within 72 hours after contact of a cell expressing CD137 and an anti-CD137 antigen-binding molecule in solution.
[19.10][19.10]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по п.[19.8], в котором агонистическую активность против CD137 в растворе, который приготовлен таким образом, что конечная концентрация низкомолекулярного соединения составляет 50 мкМ или более, и агонистическую активность против CD137 в растворе, в который не добавляют низкомолекулярное соединение, каждую оценивают по сигналу люминесценции люциферазы, который измеряют в течение 6 ч после контакта Т-клеток, экспрессирующих NFkappaB-люцифераза репортерную конструкцию и CD137 с анти-CD137 антигенсвязывающей молекулой.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to claim [19.8], wherein the anti-CD137 agonist activity in a solution that is prepared such that the final concentration of the small molecule compound is 50 μM or more, and the anti-CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is not added compound, each is assessed by a luciferase luminescence signal, which is measured within 6 hours after contact of T cells expressing the NFkappaB-luciferase reporter construct and CD137 with an anti-CD137 antigen-binding molecule.
[19.11][19.11]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[19]-[19.10], в которых низкомолекулярным соединением является соединение, содержащее аденозин.The Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of claims [19] to [19.10], wherein the low molecular weight compound is an adenosine-containing compound.
[19.12][19.12]
Ahtu-CD137 антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[19]-[19.11], в которых низкомолекулярным соединением является АТФ.Ahtu-CD137 antigen binding molecule according to any one of paragraphs. [19]-[19.11], in which the low molecular weight compound is ATP.
[20][20]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула, содержащая измененную область Fc, причем измененная область Fc содержит по меньшей мере одно аминокислотное изменение, которое приводит к увеличению изоэлектрической точки (pI) по сравнению с изоэлектрической точкой (pI) исходной агонистической антигенсвязывающей молекулой, содержащей исходную область Fc, и где агонистическая антигенсвязывающая молекула обладает повышенной агонистической активностью по сравнению с агонистической активностью исходной агонистической антигенсвязывающей молекулой.An agonistic antigen binding molecule comprising an altered Fc region, wherein the altered Fc region comprises at least one amino acid change that results in an increase in isoelectric point (pI) compared to the isoelectric point (pI) of the original agonistic antigen binding molecule containing the original Fc region, and wherein the agonistic antigen binding molecule has increased agonistic activity compared to the agonistic activity of the parent agonistic antigen binding molecule.
[20.1][20.1]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула по п.[20], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой изменение аминокислотного остатка, который может экспонироваться на поверхности исходной области Fc.The agonistic antigen-binding molecule of claim [20], wherein the at least one amino acid change is a change in an amino acid residue that can be exposed on the surface of the parent Fc region.
[20.2][20.2]
Агонистическое антигенсвязывающее антитело по пп.[20] или [20.1], в котором изменение по меньшей мере одной аминокислоты представляет собой:Agonistic antigen-binding antibody according to claims[20] or [20.1], wherein the change in at least one amino acid is:
(i) замену по меньшей мере одного аминокислотного остатка, имеющего отрицательный заряд в боковой цепи в исходной области Fc, на аминокислотный остаток, не имеющий заряда в боковой цепи, (ii) замену по меньшей мере одного аминокислотного остатка, не имеющего заряда в боковой цепи в исходной области Fc, на аминокислотный остаток, имеющий положительный заряд в боковой цепи, и/или (iii) замену по меньшей мере одного аминокислотного остатка, имеющего отрицательный заряд в боковой цепи в исходной области Fc, на аминокислотный остаток, имеющий положительный заряд в боковой цепи.(i) replacing at least one amino acid residue having a negative side chain charge in the original Fc region with an amino acid residue having no side chain charge, (ii) replacing at least one amino acid residue having no side chain charge in the original Fc region, with an amino acid residue having a positive side chain charge, and/or (iii) replacing at least one amino acid residue having a negative side chain charge in the original Fc region with an amino acid residue having a positive side chain charge chains.
[20.3][20.3]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[20]-[20.2], в которой по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой комбинацию аминокислотных замен, и где аминокислотные замены расположены в положениях, конформационно близких друг к другу.An agonistic antigen-binding molecule according to any one of claims [20] to [20.2], wherein the at least one amino acid change is a combination of amino acid substitutions, and wherein the amino acid substitutions are located at positions conformationally close to each other.
[20.4][20.4]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[20] -[20.3], в которой связывающая активность измененной области Fc с рецептором Fcy существенно не снижается по сравнению со связывающей активностью исходной области Fc.An agonistic antigen-binding molecule according to any one of claims[20] -[20.3], in which the binding activity of the altered Fc region to the Fcy receptor is not significantly reduced compared to the binding activity of the original Fc region.
[20.5][20.5]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула по п.[20.4], где рецептор Fcy представляет собой FcYRIIb.An agonistic antigen-binding molecule according to claim [20.4], wherein the Fcy receptor is FcYRIIb.
[20.6][20.6]
Антигенсвязывающая молекула-агонист по любому из пп.[20]-[20.4], где по меньшей мере одно аминокислотное изменение представляет собой по меньшей мере одну аминокислотную замену, выбранную из группы, состоящей из Q311R, P343R и D413K, в соответствии с нумерацией EU.The antigen-binding agonist molecule according to any one of claims [20] to [20.4], wherein the at least one amino acid change is at least one amino acid substitution selected from the group consisting of Q311R, P343R and D413K, in accordance with EU numbering .
[20.7][20.7]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[20] -[20.6], где по меньшей мере изменение одной аминокислоты представляет собой изменение аминокислоты (i) P343R/D413K, (ii) Q311R/P343R, (iii) P343R, (iv) D413K, (v) Q311R или (vi) Q311R/D413K или их комбинацию согласноAn agonistic antigen-binding molecule according to any one of claims[20] -[20.6], wherein at least one amino acid change is a change in amino acid (i) P343R/D413K, (ii) Q311R/P343R, (iii) P343R, (iv) D413K, (v) Q311R, or (vi) Q311R/ D413K or combination thereof according to
- 14 046075 нумерации EU.- 14 046075 EU numbering.
[20.8][20.8]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[20]-[20.7], которая является антиCD137 антигенсвязывающей молекулой.An agonistic antigen binding molecule according to any one of claims [20] to [20.7], which is an anti-CD137 antigen binding molecule.
[20.9][20.9]
Агонистическая антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[20]-[20.8], которая является антиCD137 антителом.An agonistic antigen-binding molecule according to any one of claims [20] to [20.8], which is an anti-CD137 antibody.
[21][21]
Способ получения агонистической антигенсвязывающей молекулы, содержащей измененную область Fc, включающий:A method for producing an agonistic antigen-binding molecule containing an altered Fc region, comprising:
введение в исходную Fc по меньшей мере одного изменения аминокислоты, которое приводит к увеличению изоэлектрической точки (pI) по сравнению с таковой у исходной агонистической антигенсвязывающей молекулы, содержащей исходную область Fc, причем агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы, содержащей измененную область Fc, повышена по сравнению с таковой у исходной агонистической антигенсвязывающей молекулы.introducing into the original Fc at least one amino acid change that results in an increase in the isoelectric point (pI) compared to that of the original agonistic antigen binding molecule containing the original Fc region, wherein the agonistic activity of the agonistic antigen binding molecule containing the altered Fc region is increased compared to with that of the original agonistic antigen-binding molecule.
[21.1][21.1]
Способ по п.[21], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы для антигена в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения в два раза или более выше, чем агонистическая для антигена в отсутствие низкомолекулярного соединения.The method according to claim [21], in which the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule for the antigen in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM of the low molecular weight compound is two times or more higher than the agonistic activity for the antigen in absence of low molecular weight compound.
[21.2][21.2]
Способ по пп.[21] или [21.1], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы для антигена в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения выше в два раза или более чем агонистическая для антигена в отсутствии низкомолекулярного соединения.Method according to claim [21] or [21.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule for an antigen in the presence of 10 μM or more of the small molecule compound is twice or greater than the agonistic activity for the antigen in the absence of the small molecule compound.
[21.3][21.3]
Способ по пп.[21] или [21.1], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы для антигена в присутствии 50 мкМ или более низкомолекулярного соединения выше в два раза или более чем агонистическая для антигена в отсутствие низкомолекулярного соединения.Method according to claim [21] or [21.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule for an antigen in the presence of 50 μM or more of the small molecule compound is twice or greater than that of the agonistic antigen in the absence of the small molecule compound.
[21.4][21.4]
Способ по пп.[21] или [21.1], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы для антигена в присутствии 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения выше в два раза или более, чем агонистическая для антигена в отсутствие низкомолекулярного соединения.Method according to claim [21] or [21.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen binding molecule for an antigen in the presence of 250 μM or more of the small molecule compound is two times or more greater than that of the agonistic antigen binding molecule in the absence of the small molecule compound.
[21.5][21.5]
Способ по любому из пп.[21]-[21.4], в котором агонистическую активность для антигена оценивают по количеству IL-2 и/или IFN-γ, вырабатываемых клетками, экспрессирующими антиген.The method according to any one of claims [21] to [21.4], wherein the agonistic activity for the antigen is assessed by the amount of IL-2 and/or IFN-γ produced by cells expressing the antigen.
[21.6][21.6]
Способ по п.[21.5], в котором антиген-экспрессирующая клетка представляет собой выделенную мононуклеарную клетку периферической крови человека (МКПК) или Т-клетку, происходящую от МКПК человека.The method according to claim [21.5], wherein the antigen-expressing cell is an isolated human peripheral blood mononuclear cell (PBMC) or a T cell derived from a human PBMC.
[21.7][21.7]
Способ по любому из пп.[21]-[21.4], в котором агонистическую активность в отношении антигена оценивают по анализу репортерного гена.The method according to any one of claims [21] to [21.4], wherein the agonistic activity against the antigen is assessed by reporter gene analysis.
[21.8][21.8]
Способ по любому из пп.[21]-[21.7], дополнительно включающий:The method according to any one of claims [21] to [21.7], further comprising:
(i) получение вектора экспрессии, который включает соответствующий промотор, оперативно связанный с геном, кодирующим агонистическую антигенсвязывающую молекулу, полученную способом по любому из пп.[21]-[21.7], (ii) введение вектора в клетку-хозяина и культивирование клетки-хозяина для получения агонистической антигенсвязывающей молекулы, и (iii) выделение агонистической антигенсвязывающей молекулы из культуры клеток-хозяев.(i) obtaining an expression vector that includes an appropriate promoter operatively linked to a gene encoding an agonistic antigen-binding molecule obtained by the method of any one of claims [21] to [21.7], (ii) introducing the vector into a host cell and culturing the cell host to obtain the agonistic antigen-binding molecule, and (iii) isolating the agonistic antigen-binding molecule from the host cell culture.
[21.9][21.9]
Способ по любому из пп.[21]-[21.8], в котором представлена анти-CD137 антигенсвязывающая молекула.The method according to any one of claims [21] to [21.8], wherein an anti-CD137 antigen-binding molecule is provided.
[21.10][21.10]
Способ по любому из пп.[21]-[21.9], в котором представлено анти-CD137 антитело.The method according to any one of claims [21] to [21.9], wherein an anti-CD137 antibody is provided.
[21.11][21.11]
Способ по любому из пп.[21.1]-[21.10], в котором низкомолекулярное соединение является соединением, содержащим аденозин.The method according to any one of claims [21.1] to [21.10], wherein the low molecular weight compound is an adenosine-containing compound.
[21.12][21.12]
Способ по любому из пп.[21.1]-[21.11], в котором низкомолекулярное соединение является АТФ.The method according to any one of paragraphs. [21.1]-[21.11], in which the low molecular weight compound is ATP.
- 15 046075- 15 046075
[22][22]
Способ увеличения агонистической активности агонистической антигенсвязывающей молекулы, содержащей область Fc, который включает введение в область Fc по меньшей мере одного изменения аминокислоты, которое приводит к повышению изоэлектрической точки (pI) по сравнению с агонистической активностью исходной антигенсвязывающей молекулы, содержащей исходную область Fc.A method of increasing the agonistic activity of an agonistic antigen binding molecule containing an Fc region, which includes introducing into the Fc region at least one amino acid change that results in an increase in the isoelectric point (pI) compared to the agonistic activity of the parent antigen binding molecule containing the parent Fc region.
[22.1][22.1]
Способ по п.[22], в котором агонистической активностью агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.The method according to claim [22], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule towards the antigen in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM low molecular weight compound is two or more times higher than the agonistic activity in relation to the antigen in the absence of a low molecular weight compound.
[22.2][22.2]
Способ по пп.[22] или [22.1], в котором агонистической активностью агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.Method according to claim [22] or [22.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule toward an antigen in the presence of 10 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the agonistic activity toward the antigen in the absence of the small molecule compound.
[22.3][22.3]
Способ по пп.[22] или [22.1], в котором агонистической активностью агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 50 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.Method according to claim [22] or [22.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule toward an antigen in the presence of 50 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the agonistic activity toward the antigen in the absence of the small molecule compound.
[22.4][22.4]
Способ по пп.[22] или [22.1], в котором агонистической активностью агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.Method according to claim [22] or [22.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule toward an antigen in the presence of 250 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the agonistic activity toward the antigen in the absence of the small molecule compound.
[22.5][22.5]
Способ по любому из пп.[22]-[22.4], в котором агонистическую активность по отношению к антигену оценивают по количеству IL-2 и/или IFN-γ, продуцируемых антиген-экспрессирующей клеткой.The method according to any one of claims [22] to [22.4], wherein the agonistic activity towards the antigen is assessed by the amount of IL-2 and/or IFN-γ produced by the antigen-expressing cell.
[22.6][22.6]
Способ по п.[22.5], в котором клетка, экспрессирующая антиген, представляет собой выделенную мононуклеарную клетку периферической крови (МКПК) человека или Т-клетку, производную от МКПК человека.The method according to claim [22.5], wherein the cell expressing the antigen is an isolated human peripheral blood mononuclear cell (PBMC) or a T cell derived from a human PBMC.
[22.7][22.7]
Способ по любому из пп.[22]-[22.4], в котором агонистическую активность по отношению к антигену оценивают по анализу репортерного гена.The method according to any one of claims [22] to [22.4], wherein the agonistic activity towards the antigen is assessed by reporter gene analysis.
[22.8][22.8]
Способ по любому из пп.[22]-[22.7], который включает анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу.The method according to any one of claims [22] to [22.7], which includes an anti-CD137 antigen-binding molecule.
[22.9][22.9]
Способ по любому из пп.[22]-[22.8], который включает анти-CD137 антитело.The method according to any one of claims [22] to [22.8], which includes an anti-CD137 antibody.
[22.10][22.10]
Способ по любому из пп.[22.1]-[22.9], в котором низкомолекулярное соединение является соединением, содержащим аденозин.The method according to any one of claims [22.1] to [22.9], wherein the low molecular weight compound is an adenosine-containing compound.
[21.11][21.11]
Способ по любому из пп.[22.1]-[22.10], в котором низкомолекулярным соединением является АТФ.The method according to any one of paragraphs [22.1] - [22.10], in which the low molecular weight compound is ATP.
[23][23]
Способ применения по меньшей мере одного изменения аминокислоты для увеличения агонистической активности антигенсвязывающей молекулы, содержащей область Fc, причем изменение аминокислоты приводит к увеличению изоэлектрической точки (pI) по сравнению с изоэлектрической точкой исходной агонистическои антигенсвязывающеи молекулой, содержащая исходную область Fc.A method of using at least one amino acid change to increase the agonistic activity of an antigen binding molecule containing an Fc region, wherein the amino acid change results in an increase in the isoelectric point (pI) compared to the isoelectric point of the original agonistic antigen binding molecule containing the original Fc region.
[23.1][23.1]
Способ по п.[23], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.The method according to claim [23], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule towards the antigen in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM low molecular weight compound is two or more times higher than the agonistic activity in relation to the antigen in the absence of a low molecular weight compound.
[23.2][23.2]
Способ по пп.[23] или [23.1], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.Method according to claim [23] or [23.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule toward an antigen in the presence of 10 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the agonistic activity toward the antigen in the absence of the small molecule compound.
[23.3][23.3]
Способ по пп.[23] или [23.1], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 50 мкМ или более низкомолекулярного соMethod according to claim [23] or [23.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule toward an antigen in the presence of 50 μM or more low molecular weight co
- 16 046075 единения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.- 16 046075 unity is two or more times higher than the agonist activity towards the antigen towards the antigen in the absence of the small molecule compound.
[23.4][23.4]
Способ по пп.[23] или [23.1], в котором агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену в присутствии 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения в два или более раз выше, чем агонистическая активность по отношению к антигену по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.Method according to claim [23] or [23.1], wherein the agonistic activity of the agonistic antigen-binding molecule toward an antigen in the presence of 250 μM or more of the small molecule compound is two or more times greater than the agonistic activity toward the antigen relative to the antigen in the absence of the small molecule compound.
[23.5][23.5]
Способ по любому из пп.[23]-[23.4], в котором агонистическая активность по отношению к антигену оценивают по количеству IL-2 и/или IFN-γ, продуцируемых антиген-экспрессирующей клеткой.The method according to any one of claims [23] to [23.4], wherein the agonistic activity towards the antigen is assessed by the amount of IL-2 and/or IFN-γ produced by the antigen-expressing cell.
[23.6][23.6]
Способ по п.[23.5], в котором антиген-экспрессирующая клетка представляет собой выделенную мононуклеарную клетку периферической крови (МКПК) человека или Т-клетку, происходящую от МКПК человека.The method of claim [23.5], wherein the antigen-expressing cell is an isolated human peripheral blood mononuclear cell (PBMC) or a T cell derived from a human PBMC.
[23.7][23.7]
Способ по любому из пп.[23]-[23.4], в котором агонистическая активность по отношению к антигену оценивают с помощью анализа репортерного гена.The method according to any one of claims [23] to [23.4], wherein the agonistic activity towards the antigen is assessed using a reporter gene assay.
[23.8][23.8]
Способ по любому из пп.[23]-[23.7], который включает анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу.The method according to any one of claims [23] to [23.7], which includes an anti-CD137 antigen-binding molecule.
[23.9][23.9]
Способ по любому из пп.[23]-[23.8], который включает анти-CD137 антитело.The method according to any one of claims [23] to [23.8], which includes an anti-CD137 antibody.
[23.10][23.10]
Способ по любому из пп.[23.1]-[23.9], в котором низкомолекулярным соединением является соединение, содержащее аденозин.The method according to any one of claims [23.1] to [23.9], wherein the low molecular weight compound is a compound containing adenosine.
[23.11][23.11]
Способ по любому из пп.[23.1]-[23.10], в котором низкомолекулярным соединением является АТФ.The method according to any one of paragraphs [23.1] - [23.10], in which the low molecular weight compound is ATP.
[24][24]
Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, причем указанный способ включает:A method of screening for an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has antigen binding activity dependent on a small molecule compound, the method comprising:
(а) контактирование антигенсвязывающего домена, или антигенсвязывающей молекулы, или библиотеки антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул со слитой молекулой в присутствии низкомолекулярного соединения, где в слитой молекуле две или более единицы антигена слиты с одной единицей партнера по слиянию, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанных с антигеном, внутри молекулы, слитой на стадии (а), в отсутствие или в присутствии низкой концентрации низкомолекулярного соединения, и (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированных на стадии (б).(a) contacting an antigen binding domain or antigen binding molecule or a library of antigen binding domains or antigen binding molecules with a fusion molecule in the presence of a small molecule compound where in the fusion molecule two or more antigen units are fused to one unit of a fusion partner, (b) placing the antigen binding domain, or antigen binding molecule associated with the antigen within the molecule fused in step (a), in the absence or presence of a low concentration of the small molecule compound, and (c) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b).
[24.1][24.1]
Способ по [24], в котором молекула-партнер по слиянию представляет собой димерную область Fc.The method according to [24], in which the fusion partner molecule is a dimeric Fc region.
[24.2][24.2]
Способ по [24.1], в котором область Fc содержит первую субъединицу Fc и вторую субъединицу Fc, причем одна единица антигена слита с каждой из первой и второй субъединиц Fc.The method of [24.1], wherein the Fc region comprises a first Fc subunit and a second Fc subunit, wherein one antigen unit is fused to each of the first and second Fc subunits.
[24.3][24.3]
Способ по пп.[24.1] или [24.2], в котором одна единица антигена слита с N-концом каждой из первой и второй субъединиц Fc.The method of claim [24.1] or [24.2], wherein one antigen unit is fused to the N-terminus of each of the first and second Fc subunits.
[24.4][24.4]
Способ по любому из пп.[24]-[24.3], в котором библиотека антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул представляет собой библиотеку фагов.The method according to any one of claims [24] to [24.3], wherein the library of antigen binding domains or antigen binding molecules is a library of phages.
[24.5][24.5]
Способ по любому из пп.[24]-[24.4], в котором фаги, включенные в библиотеку фагов, являются фагами, имеющими на своей поверхности два или более антигенсвязывающих домена или антигенсвязывающие молекулы.The method according to any one of claims [24] to [24.4], wherein the phages included in the phage library are phages having two or more antigen binding domains or antigen binding molecules on their surface.
[24.6][24.6]
Способ по любому из пп.[24]-[24.5], в котором фаги, включенные в библиотеку фагов, являются фагами, имеющими дефект в гене pIII, производном от фага-помощника.The method according to any one of claims [24] to [24.5], wherein the phages included in the phage library are phages having a defect in the helper phage-derived pIII gene.
[25][25]
Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от двух или более разных низкомолекулярных соединений, причем указанный способ включает следующие стадии:A method of screening for an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has antigen binding activity dependent on two or more different small molecules, the method comprising the following steps:
(а) контактирование антигенсвязывающего домена, или антигенсвязывающей молекулы, или биб(a) contacting the antigen binding domain, or antigen binding molecule, or bib
- 17 046075 лиотеки антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул с антигеном в присутствии первого низкомолекулярного соединения, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанных с антигеном со стадии (а), в отсутствие или в присутствии низкой концентрации первого низкомолекулярного соединения, и (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированных на стадии (б), (г) контактирование антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, выделенной на стадии (в), с антигеном в присутствии второго низкомолекулярного соединения, (д) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном на стадии (г) в отсутствие или в присутствии низкой концентрации второго низкомолекулярного соединения, и (е) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированных на стадии (д), причем способ не включает между стадиями (в) и (г) амплификацию гена, кодирующего антигенсвязывающий домен или антигенсвязывающую молекулу, выделенную на стадии (в).- 17 046075 libraries of antigen binding domains or antigen binding molecules with an antigen in the presence of a first small molecule compound, (b) placing the antigen binding domain or antigen binding molecule associated with the antigen from step (a), in the absence or presence of a low concentration of the first small molecule compound, and (c ) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b), (d) contacting the antigen binding domain or antigen binding molecule isolated in step (c) with the antigen in the presence of a second low molecular weight compound, (e) placing the antigen binding domain or antigen binding molecule, associated with the antigen in step (d) in the absence or presence of a low concentration of a second small molecule compound, and (e) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (e), wherein the method does not include between steps (c) and (d) amplification of a gene encoding the antigen binding domain or antigen binding molecule isolated in step (c).
[25.1][25.1]
Способ по п.[25], в котором библиотека антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул представляет собой библиотеку фагов.The method according to claim [25], wherein the library of antigen binding domains or antigen binding molecules is a library of phages.
[26][26]
Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которые обладают антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, причем указанный способ включает следующие стадии:A method for screening an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has antigen binding activity dependent on a small molecule compound, the method comprising the following steps:
(а) контактирование наивной библиотеки антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул с антигеном в присутствии низкомолекулярного соединения, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном на стадии (а) в отсутствие низкомолекулярного соединения или в его присутствии, но в низкой концентрации, и (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированных на стадии (б), причем наивная библиотека представляет собой библиотеку фагов, презентирующих на своей поверхности два или более антигенсвязывающих домена или две или более антигенсвязывающие молекулы.(a) contacting a naïve library of antigen binding domains or antigen binding molecules with an antigen in the presence of a small molecule compound, (b) placing an antigen binding domain or antigen binding molecule coupled to the antigen in step (a) in the absence of the small molecule compound or in its presence but at a low concentration, and (c) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b), wherein the naïve library is a library of phages presenting on their surface two or more antigen binding domains or two or more antigen binding molecules.
[27][27]
Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которые обладают антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, причем указанный способ включает следующие стадии:A method for screening an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has antigen binding activity dependent on a small molecule compound, the method comprising the following steps:
(а) контактирование библиотеки антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул с антигеном в присутствии низкомолекулярного соединения, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном на стадии (а) в отсутствие низкомолекулярного соединения или в его присутствии, но в низкой концентрации, и (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированных на стадии (б), причем библиотека представляет собой библиотеку фагов, имеющих дефект в гене pIII, производном от гена-помощника.(a) contacting a library of antigen binding domains or antigen binding molecules with an antigen in the presence of a small molecule compound, (b) placing an antigen binding domain or antigen binding molecule coupled to the antigen in step (a) in the absence of the small molecule compound or in its presence but at a low concentration, and (c) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b), wherein the library is a library of phages having a defect in the pIII gene derived from the helper gene.
[28][28]
Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которые обладают антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, причем указанный способ включает следующие стадии:A method for screening an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has antigen binding activity dependent on a small molecule compound, the method comprising the following steps:
(а) контактирование библиотеки антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул с антигеном в присутствии низкомолекулярного соединения, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном на стадии (а) в отсутствие низкомолекулярного соединения или в его присутствии, но в низкой концентрации, и (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированных на стадии (б), причем библиотека представляет собой библиотеку, включающую фаги, полученные путем увеличения экспрессии антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы с помощью низкомолекулярной добавки, которая увеличивает уровень экспрессии с промотора, регулирующего экспрессию антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы.(a) contacting a library of antigen binding domains or antigen binding molecules with an antigen in the presence of a small molecule compound, (b) placing an antigen binding domain or antigen binding molecule coupled to the antigen in step (a) in the absence of the small molecule compound or in its presence but at a low concentration, and (c) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b), wherein the library is a library comprising phages obtained by increasing the expression of the antigen binding domain or antigen binding molecule using a small molecule additive that increases the level of expression from a promoter that regulates the expression of the antigen binding domain or antigen-binding molecule.
[28.1][28.1]
Способ скрининга по п.[28], в котором низкомолекулярная добавка представляет собой изопропилβ-тиогалактопиранозид или арабинозу.The screening method according to claim [28], wherein the low molecular weight additive is isopropyl β-thiogalactopyranoside or arabinose.
- 18 046075- 18 046075
[28.2][28.2]
Способ по любому из пп.[24]-[28.1], в котором низкомолекулярное соединение является соединением, содержащим аденозин.The method according to any one of claims [24] to [28.1], wherein the low molecular weight compound is an adenosine-containing compound.
[28.3][28.3]
Способ по любому из пп.[24]-[28.2], в котором низкомолекулярное соединение является АТФ.The method according to any one of claims [24] to [28.2], wherein the low molecular weight compound is ATP.
[29] Анти генсвязывающая молекула, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации опухолевого тканеспецифичного соединения, причем антигенсвязывающая активность в присутствии 100 мкМ соединения выше в два раза или более, чем антигенсвязывающая активность в отсутствие соединения.[29] An antigen-binding molecule that has antigen-binding activity that is dependent on the concentration of a tumor tissue-specific compound, with antigen-binding activity in the presence of 100 μM of the compound being two times or more higher than antigen-binding activity in the absence of the compound.
[29.1] Антигенсвязывающая молекула по п.[29], величина KD которой в присутствии 100 мкМ соединения равна 5х 10-7 M или менее.[29.1] The antigen-binding molecule according to claim [29], the KD value of which in the presence of 100 μM of the compound is 5x 10 -7 M or less.
[29.2] Антигенсвязывающая молекула по пп.[29] или [29.1], величина KD которой в отсутствие соединения равна 1х 10-6 М или более.[29.2] Antigen-binding molecule according to claim [29] or [29.1], the KD value of which in the absence of a compound is 1x 10 -6 M or more.
[29.3] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[29]-[29.2], которая обладает нейтрализующей активностью в отношении антигена.[29.3] An antigen-binding molecule according to any one of claims [29] to [29.2], which has neutralizing activity against an antigen.
[29.4] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[29]-[29.3], которая обладает цитотоксической активностью в отношении клеток, экспрессирующих антиген.[29.4] An antigen-binding molecule according to any one of claims [29] to [29.3], which has cytotoxic activity against cells expressing the antigen.
[29.5] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[29]-[29.4], в которых антиген представляет собой антиген, экспрессируемый или секретируемый любой из клеток, являющихся опухолевой клеткой, иммунной клеткой или стромальной клеткой в опухолевой ткани.[29.5] The antigen-binding molecule of any one of claims [29] to [29.4], wherein the antigen is an antigen expressed or secreted by any of a tumor cell, an immune cell, or a stromal cell in a tumor tissue.
[29.6] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[29]-[29.5], в которых соединение является соединением, содержащим аденозин.[29.6] The antigen-binding molecule according to any one of claims [29] to [29.5], wherein the compound is an adenosine-containing compound.
[29.7] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[29]-[29.6], которая содержит область Fc.[29.7] An antigen-binding molecule according to any one of claims [29] to [29.6], which contains an Fc region.
[29.8] Антигенсвязывающая молекула по п.[29.7], в которой область Fc представляет собой мутировавшую область Fc, содержащую аминокислотное изменение, причем мутировавшая область Fc имеет повышенную связывающую активность по меньшей мере с одним рецептором Fcy, выбранным из группы, состоящей из FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb и FcYRIIIa, по сравнению с областью Fc дикого типа.[29.8] The antigen binding molecule of claim [29.7], wherein the Fc region is a mutated Fc region comprising an amino acid change, wherein the mutated Fc region has increased binding activity to at least one Fcy receptor selected from the group consisting of FcYRIa, FcYRIIa, FcYRIIb, and FcYRIIIa, compared with the wild-type Fc region.
[29.9] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[29]-[29.8], в которых антигенсвязывающей молекулой является антитело или фрагмент антитела.[29.9] The antigen binding molecule according to any one of claims [29] to [29.8], wherein the antigen binding molecule is an antibody or antibody fragment.
[30] Фарм ацевтический состав, включающий антигенсвязывающую молекулу по любому из пп.[29][29.9] и фармацевтически приемлемый носитель.[30] A pharmaceutical composition comprising the antigen binding molecule of any one of claims [29][29.9] and a pharmaceutically acceptable carrier.
[30.1] Фармацевтический состав по п. [30], который предназначен для лечения опухоли.[30.1] The pharmaceutical composition according to claim [30], which is intended for the treatment of a tumor.
[30.2] Фармацевтический состав по п.[30.1], который обладает пониженной цитотоксической активностью в неопухолевой ткани по сравнению с фармацевтическим составом, содержащим контрольную антигенсвязывающую молекулу.[30.2] The pharmaceutical composition of claim [30.1], which has reduced cytotoxic activity in non-tumor tissue compared to a pharmaceutical composition containing a control antigen-binding molecule.
[30.3] Фармацевтический состав по пп.[30.1] или [30.2], который обладает пониженным уровнем побочных эффектов по сравнению с фармацевтическим составом, содержащим контрольную антигенсвязывающую молекулу.[30.3] A pharmaceutical composition according to claims [30.1] or [30.2], which has a reduced level of side effects compared to a pharmaceutical composition containing a control antigen-binding molecule.
[30.4] Фармацевтический состав по пп.[30.2] или [30.3], где контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой антигенсвязывающую молекулу, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации опухолевого тканеспецифичного соединения.[30.4] The pharmaceutical composition according to claims [30.2] or [30.3], wherein the control antigen-binding molecule is an antigen-binding molecule that does not have antigen-binding activity dependent on the concentration of the tumor tissue-specific compound.
[31] Спос об получения антигенсвязывающей молекулы для применения в лечении опухоли, который включает стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии 100 мкМ тканеспецифичного для опухоли соединения выше в два раза или более, чем антигенсвязывающая активность при отсутствии соединения.[31] A method for producing an antigen-binding molecule for use in the treatment of a tumor, which includes the step of selecting an antigen-binding molecule whose antigen-binding activity in the presence of 100 μM of a tissue-specific tumor compound is two times or more higher than the antigen-binding activity in the absence of the compound.
[32] Спос об получения фармацевтического состава для применения в лечении опухоли, который включает стадию смешивания антигенсвязывающей молекулы по любому из пп.[29]-[29.9] с фармацевтически приемлемым носителем.[32] A method for preparing a pharmaceutical composition for use in the treatment of a tumor, which includes the step of mixing an antigen-binding molecule according to any one of claims [29] to [29.9] with a pharmaceutically acceptable carrier.
[33] Анти генсвязывающая молекула, обладающая антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации целевого тканеспецифичного соединения, при этом антигенсвязывающая активность в присутствии 1 мкМ такого соединения понижена в два раза или более по сравнению с антигенсвязывающеи активностью в присутствии достаточного количества соединения.[33] An antigen-binding molecule having antigen-binding activity that is dependent on the concentration of a target tissue-specific compound, wherein antigen-binding activity in the presence of 1 μM of such compound is reduced by two times or more compared to antigen-binding activity in the presence of a sufficient amount of the compound.
[33.1] Антигенсвязывающая молекула по п.[33], причем величина KD в присутствии 1 мкМ такого соединения составляет 2х 10-7 М или более.[33.1] The antigen-binding molecule according to claim [33], wherein the KD value in the presence of 1 μM of such compound is 2x 10 -7 M or more.
[33.2] Антигенсвязывающая молекула по пп.[33] или [33.1], причем величина KD в присутствии 1 мкМ такого соединения составляет 1х 10-7 М или менее.[33.2] Antigen-binding molecule according to claim [33] or [33.1], and the KD value in the presence of 1 μM of such a compound is 1x 10 -7 M or less.
[33.3] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[33]-[33.2], в которых соединение представляет собой тканеспецифичное для опухоли соединения.[33.3] The antigen-binding molecule according to any one of claims [33] to [33.2], wherein the compound is a tissue-specific tumor compound.
[33.4] Антигенсвязывающая молекула по п.[33.3], в котором соединение является соединением, содержащим аденозин.[33.4] The antigen-binding molecule of claim [33.3], wherein the compound is an adenosine-containing compound.
[33.5] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[33]-[33.4], которая обладает повышенной[33.5] An antigen-binding molecule according to any one of claims [33] to [33.4], which has an increased
- 19 046075 удерживающей способностью в плазме и/или имеет пониженную способность к накоплению антигена в плазме по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой.- 19 046075 plasma retention capacity and/or has a reduced ability to accumulate antigen in plasma compared to the control antigen binding molecule.
[33.6] Антигенсвязывающая молекула по п.[33.5], которая представляет собой антигенсвязывающую молекулу, не обладающую антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации целевого тканеспецифичного соединения.[33.6] The antigen-binding molecule of claim [33.5], which is an antigen-binding molecule that does not have antigen-binding activity dependent on the concentration of the target tissue-specific compound.
[33.7] Антигенсвязывающая молекула по любому из пп.[33]-[33.6], которая представляет собой антитело или фрагмент антитела.[33.7] An antigen-binding molecule according to any one of claims [33] to [33.6], which is an antibody or antibody fragment.
[34] Фарм ацевтический состав, содержащий антигенсвязывающую молекулу по любому из пп.[33][33.7] и фармацевтически приемлемый носитель.[34] A pharmaceutical composition comprising an antigen-binding molecule according to any one of claims [33][33.7] and a pharmaceutically acceptable carrier.
[35] Спос об получения антигенсвязывающей молекулы, которая имеет повышенную способность удерживания в плазме и/или пониженную способность к накоплению антигена в плазме по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой, причем способ включает стадии (а) получения антигенсвязывающей молекулы, чья антигенсвязывающая активность увеличивается по мере увеличения концентрации целевого тканеспецифичного соединения, и (б) измерения способности удерживания в плазме и/или способности к накоплению антигена в плазме антигенсвязывающей молекулы, полученной по п.(а).[35] A method for producing an antigen binding molecule that has an increased plasma retention capacity and/or a reduced plasma antigen accumulation capacity compared to a control antigen binding molecule, the method comprising the steps of (a) producing an antigen binding molecule whose antigen binding activity increases as increasing the concentration of the target tissue-specific compound, and (b) measuring the plasma retention ability and/or plasma antigen accumulation ability of the antigen-binding molecule obtained according to item (a).
[35 .1] Способ по п.[35], который включает стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии 1 мкМ целевого тканеспецифичного соединения в два раза или более ниже, чем антигенсвязывающая активность в присутствии достаточного количества соединения.[35.1] The method of claim [35], which includes the step of selecting an antigen-binding molecule whose antigen-binding activity in the presence of 1 μM of the target tissue-specific compound is two times or more lower than the antigen-binding activity in the presence of a sufficient amount of the compound.
[35 .2] Способ по пп.[35] или [35.1], в котором контрольной антигенсвязывающей молекулой является антигенсвязывающая молекула, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации целевого тканеспецифичного соединения.[35 .2] Method according to claims [35] or [35.1], wherein the control antigen-binding molecule is an antigen-binding molecule that does not have antigen-binding activity dependent on the concentration of the target tissue-specific compound.
[36] Способ получения фармацевтического состава, который включает стадию смешивания антигенсвязывающей молекулы по любому из пп.[33]-[33.7] с фармацевтически приемлемым носителем.[36] A method for preparing a pharmaceutical composition, which includes the step of mixing an antigen-binding molecule according to any one of claims [33] to [33.7] with a pharmaceutically acceptable carrier.
[37] Способ измерения концентрации АТФ в растворе, который включает стадии (i) контакта клетки split Luc/HEK293, экспрессирующей P2Y11, с раствором, и (ii) измерения активности люциферазы в клетке.[37] A method for measuring the concentration of ATP in a solution, which includes the steps of (i) contacting a split Luc/HEK293 cell expressing P2Y11 with the solution, and (ii) measuring luciferase activity in the cell.
[37.1] Способ по п.[37], который дополнительно включает стадию контакта раствора, содержащего субстрат люциферазы, с клеткой.[37.1] The method of claim [37], which further includes the step of contacting a solution containing a luciferase substrate with a cell.
[37.2] Способ по пп.[37] или [37.1], в котором раствор представляет собой межклеточную жидкость в ткани in vivo.[37.2] Method according to paragraphs [37] or [37.1], in which the solution is an intercellular fluid in tissue in vivo.
[37.3] Способ по п.[37.2], в котором ткань является опухолевой тканью.[37.3] The method of claim [37.2], wherein the tissue is tumor tissue.
[37.4] Способ по п.[37.2] или [37.3], в котором стадия (i) является стадией трансплантации клетки split Luc/HEK293, экспрессирующей P2Y11, в ткань in vivo.[37.4] The method of claim [37.2] or [37.3], wherein step (i) is the step of transplanting a split Luc/HEK293 cell expressing P2Y11 into tissue in vivo.
Краткое описание фигурBrief description of the figures
Фиг. 1. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных анти-CD137 антител, исследованных с применением клеток Jurkat в присутствии или в отсутствие АТФ.Fig. 1. Diagram showing the agonist activity of various anti-CD137 antibodies tested using Jurkat cells in the presence or absence of ATP.
Ось X показывает концентрацию антитела (мкг/мл), ось Y показывает относительные световые единицы.The X axis shows the antibody concentration (µg/ml), the Y axis shows the relative light units.
Фиг. 2. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных анти-CD137 антител, исследованных с применением клеток Jurkat в присутствии или в отсутствие АДФ.Fig. 2. Diagram showing the agonistic activity of various anti-CD137 antibodies tested using Jurkat cells in the presence or absence of ADP.
Ось X показывает концентрацию антитела (мкг/мл), ось Y показывает относительные световые единицы.The X axis shows the antibody concentration (µg/ml), the Y axis shows the relative light units.
Фиг. 3. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных анmи-CD137 антител, исследованных с применением Т-клеток человека в присутствии или в отсутствие АДФ-бета-S (ADP-бета-S).Fig. 3. Diagram showing the agonistic activity of various anti-CD137 antibodies tested using human T cells in the presence or absence of ADP-beta-S (ADP-beta-S).
Фиг. 4. Диаграмма, показывающая агонистическую активность dBBAT119-P253/dBBAT119LLamLib (анти-CD137 антитело, переключаемое низкомолекулярным соединением) или NS1-P253 (непереключаемое анти-CD137 антитело) исследованных с применением Т-клеток человека в присутствии или в отсутствие АДФ-бета-S.Fig. 4. Diagram showing the agonist activity of dBBAT119-P253/dBBAT119LLamLib (anti-CD137 small molecule switchable antibody) or NS1-P253 (non-switchable anti-CD137 antibody) tested using human T cells in the presence or absence of ADP-beta-S .
Ось X показывает концентрацию антитела (мкг/мл), ось Y показывает количество выработанного IFN-γ (нг/мл).The X-axis shows the antibody concentration (µg/ml), the Y-axis shows the amount of IFN-γ produced (ng/ml).
Фиг. 5. Диаграмма, показывающая АТФ-зависящую антигенсвязывающую активность различных анти-CD137 антител (переключаемое анти-CD137 антитело с улучшенной связывающей активностью), исследованную методом фагового иммуноферментного анализа (ELISA).Fig. 5. Diagram showing the ATP-dependent antigen binding activity of various anti-CD137 antibodies (switchable anti-CD137 antibody with improved binding activity) tested by phage enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA).
Ось Y показывает соотношение поглощения S/N (сигнал/шум) в присутствии/в отсутствие АТФ, а ось X показывает соотношение S/N в присутствии/в отсутствие антигена.The Y axis shows the S/N (signal to noise) absorption ratio in the presence/absence of ATP, and the X axis shows the S/N ratio in the presence/absence of antigen.
Фиг. 6. Диаграмма, показывающая связывающую активность различных вариантов анти-CD137 антитела (dBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib) с CD137 человека в присутствии или в отсутствие АТФ.Fig. 6. Diagram showing the binding activity of various anti-CD137 antibody variants (dBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib) to human CD137 in the presence or absence of ATP.
Верхний ряд показывает связывающую активность с CD137 человека в отсутствие АТФ, а нижний ряд показывает связывающую активность с CD137 человека в присутствии АТФ.The top row shows binding activity to human CD137 in the absence of ATP, and the bottom row shows binding activity to human CD137 in the presence of ATP.
Фиг. 7. Диаграмма, показывающая агонистическую активность dBBAT119H-P253/dBBAT119LLamLib, dBBATk119H024-P253/dBBATk119L020-LamLib, IC17HdK-hIgG1/IC17L-k0 (контроль) или NS1Fig. 7. Diagram showing the agonist activity of dBBAT119H-P253/dBBAT119LLamLib, dBBATk119H024-P253/dBBATk119L020-LamLib, IC17HdK-hIgG1/IC17L-k0 (control) or NS1
- 20 046075- 20 046075
P253 (не переключаемого aHTu-CD137 антитела), используя Т-клетки человека в присутствии или в отсутствие АДФ-бета-S.P253 (non-switchable aHTu-CD137 antibody) using human T cells in the presence or absence of ADP-beta-S.
Фиг. 7А показывает результаты тестирования в отсутствие АДФ-бета-S, фиг. 7Б показывает результаты тестирования в присутствии АДФ-бета-S.Fig. 7A shows the results of testing in the absence of ADP-beta-S, FIG. 7B shows the results of testing in the presence of ADP-beta-S.
Ось X показывает концентрацию антитела (мкг/мл), ось Y показывает количество выработанного IFN-γ (нг/мл).The X axis shows the antibody concentration (μg/ml), the Y axis shows the amount of IFN-γ produced (ng/ml).
Фиг. 8. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных переключаемых антиCD137 антител, протестированных с использованием анализа репортерного гена 4-1ВВ Jurkat в присутствии или в отсутствие АТФ.Fig. 8. Diagram showing the agonist activity of various switchable anti-CD137 antibodies tested using the Jurkat 4-1BB reporter gene assay in the presence or absence of ATP.
Фиг. 8А показывает результаты тестирования в отсутствие АТФ, фиг. 8Б показывает результаты тестирования в присутствии АТФ.Fig. 8A shows the test results in the absence of ATP, FIG. 8B shows the results of testing in the presence of ATP.
Фиг. 9. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных aнти-CD137 переключаемых антител в присутствии АТФ за счет увеличения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy, протестированных с использованием мононуклеарных клеток периферической крови.Fig. 9. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence of ATP due to increased binding activity of heavy chain constant regions to Fcy receptors tested using peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 9А показывает агонистическую активность, определенную с использованием результатов тестирования в отсутствие АТФ, фиг. 9Б показывает результаты тестирования в присутствии АТФ.Fig. 9A shows agonist activity determined using test results in the absence of ATP, FIG. 9B shows the results of testing in the presence of ATP.
Фиг. 9А показывает агонистическую активность, определенную с использованием количества выработанного IL-2 в качестве показателя, фиг. 9Б показывает агонистическую активность, определенную с использованием количества выработанного IFN-β в качестве показателя.Fig. 9A shows agonist activity determined using the amount of IL-2 produced as an indicator, FIG. 9B shows agonist activity determined using the amount of IFN-β produced as an indicator.
Фиг. 10. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных aнти-CD137 переключаемых антител в присутствии АТФ за счет увеличения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy или увеличения pI константных областей тяжелой цепи, по результатам анализа с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 10. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence of ATP due to increased binding activity of heavy chain constant regions to Fcy receptors or increased pI of heavy chain constant regions, as analyzed using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 10А показывает агонистическую активность, определенную с использованием количества выработанного IL-2 в качестве показателя, фигура 10Б показывает агонистическую активность, определенную с использованием количества выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 10A shows agonist activity determined using the amount of IL-2 produced as an indicator, Figure 10B shows agonist activity determined using the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 11. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых aнти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет увеличения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy, определенную с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 11. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased heavy chain constant region binding activity to Fcy receptors, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 11А показывает агонистическую активность, определенную с использованием количества выработанного IL-2 в качестве показателя, фиг. 11Б показывает агонистическую активность, определенную с использованием количества выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 11A shows agonist activity determined using the amount of IL-2 produced as an indicator, FIG. 11B shows agonist activity determined using the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 12. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых aнти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy, определенную с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 12. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased heavy chain constant region binding activity to Fcy receptors, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 12А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 12Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 12A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 12B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 13. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых aнти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 13. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased binding activity of heavy chain constant regions to Fcy receptors, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 13А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 13Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 13A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 13B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 14. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых aнти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет увеличения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy, по результатам исследования с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 14. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased binding activity of heavy chain constant regions to Fcy receptors, as determined by a study using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 14А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 14Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 14A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 14B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 15. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых aнти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет увеличения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy, по результатам исследования с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 15. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased binding activity of heavy chain constant regions to Fcy receptors, as determined by a study using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 15А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 15Б показывает агонистическую активность, определенную с применениемFig. 15A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 15B shows agonist activity determined using
- 21 046075 количества выработанного IFN-γ в качестве показателя.- 21 046075 amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 16. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения величины pI константных областей тяжелой цепи, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 16. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased pI value of heavy chain constant regions, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 16А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 16Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 16A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 16B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 17. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения величины pI константных областей тяжелой цепи, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 17. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various switchable anti-CD137 antibodies in the presence or absence of ATP due to increased pI value of heavy chain constant regions, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 17А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 17Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 17A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 17B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 18. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения величины pI константных областей тяжелой цепи, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 18. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased pI value of heavy chain constant regions, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 18А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 18Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 18A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 18B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 19. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения величины pI константных областей тяжелой цепи, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 19. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various switchable anti-CD137 antibodies in the presence or absence of ATP due to increased pI value of heavy chain constant regions, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 19А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 19Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 19A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 19B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 20. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения величины pI константных областей тяжелой цепи, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 20. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased pI value of heavy chain constant regions, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 20А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 20Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 20A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 20B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 21. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения величины pI константных областей тяжелой цепи, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 21. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased pI value of heavy chain constant regions, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 21А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 21Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 21A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 21B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 22. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет повышения величины pI константных областей тяжелой цепи, определенное с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 22. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various switchable anti-CD137 antibodies in the presence or absence of ATP by increasing the pI value of heavy chain constant regions, determined using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 22А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 22Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 22A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 22B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 23. Диаграмма, показывающая усиление агонистической активности различных переключаемых анти-CD137 антител в присутствии или в отсутствие АТФ за счет увеличения связывающей активности константных областей тяжелой цепи с рецепторами Fcy, по результатам исследования с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.Fig. 23. Diagram showing the enhancement of agonistic activity of various anti-CD137 switch antibodies in the presence or absence of ATP due to increased binding activity of heavy chain constant regions to Fcy receptors, as determined by a study using human peripheral blood mononuclear cells.
Фиг. 23А показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IL-2 в качестве показателя; фиг. 23Б показывает агонистическую активность, определенную по количеству выработанного IFN-γ в качестве показателя.Fig. 23A shows agonist activity determined by the amount of IL-2 produced as an indicator; fig. 23B shows agonist activity determined by the amount of IFN-γ produced as an indicator.
Фиг. 24. Диаграмма, показывающая концентрацию в плазме различных переключаемых и не переключаемых анти-CD137 антител, тестируемых с использованием мышей с нокином CD137 человека.Fig. 24. Graph showing plasma concentrations of various switched and non-switched anti-CD137 antibodies tested using human CD137 knockin mice.
Все Fc от mIgG1.All Fc from mIgG1.
Фиг. 25. Диаграмма, показывающая концентрацию в плазме различных переключаемых и не переFig. 25. Diagram showing plasma concentrations of various switchable and non-switchable
- 22 046075 ключаемых aHTu-CD137 антител, исследованных с использованием мышей с нокином CD137 человека.- 22 046075 aHTu-CD137-keyed antibodies studied using human CD137 knockin mice.
Все Fc от MB110.All Fc from MB110.
Фиг. 26. Диаграмма, показывающая концентрацию в плазме различных переключаемых и не переключаемых анти-CD137 антител, проанализированных с использованием мышей с нокином CD137 человека.Fig. 26. Graph showing plasma concentrations of various switched and non-switched anti-CD137 antibodies assayed using human CD137 knockin mice.
Все Fc от МВ492.All Fc from MV492.
Фиг. 27. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект А375-mIgG1/B167-mЮr на модели мышей, трансплантированных клетками МС38.Fig. 27. Diagram showing the antitumor effect of A375-mIgG1/B167-mYr on a mouse model transplanted with MC38 cells.
Каждая точка показывает среднее значение объема опухоли для группы (n=5).Each dot represents the mean tumor volume for a group (n=5).
Фиг. 28. Диаграмма, показывающая массу органов модели мыши, трансплантированной клетками МС38 после введения антител (NO1-mIgG1 или A375-mIgG1/B167-ml0r).Fig. 28. Diagram showing organ weights of a mouse model transplanted with MC38 cells after administration of antibodies (NO1-mIgG1 or A375-mIgG1/B167-ml0r).
Фиг. 28А показывает массу лимфоузла, а фиг. 28Б показывает массу селезенки.Fig. 28A shows the lymph node mass, and FIG. 28B shows the mass of the spleen.
Фиг. 29. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в лимфоузлах модели мыши, трансплантированной клетками МС38 после введения антител NO1-mIgG1 или A375-mIgG1/B167-ml0r.Fig. 29. Diagram showing the degree of T cell activation in the lymph nodes of a mouse model transplanted with MC38 cells after administration of NO1-mIgG1 or A375-mIgG1/B167-ml0r antibodies.
Фиг. 29А показывает процент PD-1-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток, фиг. 29Б показывает процент ICOS-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток, фиг. 29В показывает процент гранзим В-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток.Fig. 29A shows the percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 29B shows the percentage of ICOS positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 29B shows the percentage of granzyme B positive T cells among CD8 positive T cells.
Фиг. 30. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в селезенке модели мыши, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NO1-mIgG1 или A375-mIgG1/B167-ml0r.Fig. 30. Diagram showing the degree of T cell activation in the spleen of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NO1-mIgG1 or A375-mIgG1/B167-ml0r.
Фиг. 30А показывает процент PD-1-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток, фиг. 30Б показывает процент ICOS-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток, фиг. 30В показывает процент гранзим В-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток.Fig. 30A shows the percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 30B shows the percentage of ICOS positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 30B shows the percentage of granzyme B positive T cells among CD8 positive T cells.
Фиг. 31. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени модели мыши, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NO1-mIgG1 или A375-mIgG1/B167-ml0r.Fig. 31. Diagram showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NO1-mIgG1 or A375-mIgG1/B167-ml0r.
Фиг. 31А показывает процент PD-1-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток, фиг. 31Б показывает процент гранзим В-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток.Fig. 31A shows the percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 31B shows the percentage of granzyme B positive T cells among CD8 positive T cells.
Фиг. 32. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект A356-МВ110/B040-mЮr в модели мыши, трансплантированный клеточной линией МС38.Fig. 32. Diagram showing the antitumor effect of A356-MB110/B040-mUR in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Каждая точка показывает среднее значение объема опухоли для группы (n=5).Each dot represents the mean tumor volume for a group (n=5).
Фиг. 33. Диаграмма, показывающая массу органов в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38 после введения NS2-MB110 или Α356-ΜΒ110/Β040^0γFig. 33. Diagram showing organ mass in a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS2-MB110 or Α356-ΜΒ110/Β040^0γ
Фиг. 33А показывает массу лимфоузла, а фиг. 33Б показывает массу селезенки.Fig. 33A shows the lymph node mass, and FIG. 33B shows the mass of the spleen.
Фиг. 34. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени модели мыши, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NS2-MB110 или A3 56-MB110/B040-ml0r.Fig. 34. Diagram showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS2-MB110 or A3 56-MB110/B040-ml0r.
Фиг. 34А показывает процент PD-1-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток, фиг. 34Б показывает процент ICOS-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток.Fig. 34A shows the percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 34B shows the percentage of ICOS positive T cells among CD8 positive T cells.
Фиг. 35. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект A372-mIgG1/B040-ml0r в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38.Fig. 35. Diagram showing the antitumor effect of A372-mIgG1/B040-ml0r in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Каждая точка показывает среднее значение объема опухоли для группы (n=5).Each dot represents the mean tumor volume for a group (n=5).
Фиг. 36. Количество клеток лимфатического узла (фиг. 36А) и масса селезенки (фиг. Б) в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38, после введения A372-mIgG1/B040-ml0r.Fig. 36. Lymph node cell count (FIG. 36A) and spleen weight (FIG. B) in a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of A372-mIgG1/B040-ml0r.
Фиг. 37. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени модели мыши, транспланированной клеточной линией МС38, после введения A372-mIgG1/B040-ml0r (процент гранзим Вположительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток).Fig. 37. Diagram showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of A372-mIgG1/B040-ml0r (percentage of granzyme B positive T cells among CD8 positive T cells).
Фиг. 38. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект A372-МВ110/B040-mЮr в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38.Fig. 38. Diagram showing the antitumor effect of A372-MB110/B040-mUR in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Каждая точка показывает среднее значение объема опухоли для группы (n=5).Each dot represents the mean tumor volume for a group (n=5).
Фиг. 39. Диаграмма, показывающая массу органов модели мыши, трансплантированной клетками МС38, после введения NS2-MB110 или A372-MB110/B040-ml0r.Fig. 39. Diagram showing organ weights of a mouse model transplanted with MC38 cells after administration of NS2-MB110 or A372-MB110/B040-ml0r.
Фиг. 39А показывает массу лимфоузла, фиг. 39Б показывает массу селезенки.Fig. 39A shows the lymph node mass, FIG. 39B shows the mass of the spleen.
Фиг. 40. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени модели мыши, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NS2-MB110 или A372-MB110/B040-ml0r (процент PD-1-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток).Fig. 40. Graph showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS2-MB110 or A372-MB110/B040-ml0r (percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells ).
Фиг. 41. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект A372-МВ110/B040-mЮr в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38.Fig. 41. Diagram showing the antitumor effect of A372-MB110/B040-mUR in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Каждая точка показывает среднее значение объема опухоли для группы (n=5).Each dot represents the mean tumor volume for a group (n=5).
Фиг. 42. Диаграмма, показывающая количество клеток лимфатического узла и массу органа селезенки в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38, после введения NS1-MB492 или A372-MB492/B040-ml0r.Fig. 42. Diagram showing lymph node cell number and spleen organ weight in a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-MB492 or A372-MB492/B040-ml0r.
Фиг. 42А показывает количество клеток лимфоузла, фиг. 42Б показывает массу селезенки.Fig. 42A shows the number of lymph node cells, FIG. 42B shows the mass of the spleen.
Фиг. 43. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени модели мыши, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NS1-MB492 или A372-MB492/B040-ml0r (про- 23 046075 цент гранзим В-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток).Fig. 43. Diagram showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-MB492 or A372-MB492/B040-ml0r (percentage of granzyme B-positive T cells among CD8-positive T cells).
Фиг. 44. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект А486-MB492/B167-ml0r или A488MB492/B226-ml0r в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38.Fig. 44. Diagram showing the antitumor effect of A486-MB492/B167-ml0r or A488MB492/B226-ml0r in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Каждая точка показывает среднее значение объема опухоли для группы (n=5).Each dot represents the mean tumor volume for a group (n=5).
Фиг. 45. Диаграмма, показывающая количество клеток в лимфоузле и массу селезенки в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38, после введения NS1-MB492, A486-MB492/B167ml0r или A488-MB492/B226-ml0r.Fig. 45. Diagram showing lymph node cell number and spleen weight in a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-MB492, A486-MB492/B167ml0r, or A488-MB492/B226-ml0r.
Фиг. 45А показывает количество клеток в лимфоузле, фиг. 45Б показывает массу селезенки.Fig. 45A shows the number of cells in a lymph node, FIG. 45B shows the mass of the spleen.
Фиг. 46. Диаграмма, показывающая уровень инфильтрации эффекторных клеток в печени модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38, после введения NS1-MB492, A486-MB492/B167ml0r или А488-МВ492/В226-ml0r (процент CD3-положuтельных и CD8-положuтельных Т-клеток среди CD45-положuтельных Т-клеток).Fig. 46. Diagram showing the level of effector cell infiltration in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-MB492, A486-MB492/B167ml0r or A488-MB492/B226-ml0r (percentage of CD3-positive and CD8-positive T cells among CD45-positive T cells).
Фиг. 47. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект А489-MB492/B223-ml0r в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38.Fig. 47. Diagram showing the antitumor effect of A489-MB492/B223-ml0r in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Каждая точка показывает среднее значение объема опухоли для группы (n=5).Each dot represents the mean tumor volume for a group (n=5).
Фиг. 48. Диаграмма, показывающая количество клеток лимфатического узла и количество клеток во фракции лимфоцитов селезенки в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38, после введения NS1-MB492 или A489-MB492/B223-ml0r.Fig. 48. Diagram showing the number of lymph node cells and the number of cells in the spleen lymphocyte fraction in a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-MB492 or A489-MB492/B223-ml0r.
Фиг. 48А показывает количество клеток лимфатического узла, фигура 48Б показывает количество клеток во фракции лимфоцитов селезенки.Fig. Figure 48A shows the number of lymph node cells; Figure 48B shows the number of cells in the spleen lymphocyte fraction.
Фиг. 49. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени мышиной модели, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NS1-MB492 или A489-MB492/B223-ml0r (процент CD8-положuтельных Т-клеток среди CD45-положuтельных Т-клеток).Fig. 49. Diagram showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-MB492 or A489-MB492/B223-ml0r (percentage of CD8 positive T cells among CD45 positive T cells).
Фиг. 50. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект А548-mIgG1/B256-ml0r и A551mIgG1/B256-ml0r в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38.Fig. 50. Diagram showing the antitumor effect of A548-mIgG1/B256-ml0r and A551mIgG1/B256-ml0r in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Фиг. 50А показывает противоопухолевый эффект A548-mIgG1/B256-ml0r, фиг. 50Б показывает противоопухолевый эффект A551-mIgG1/B256-ml0r.Fig. 50A shows the antitumor effect of A548-mIgG1/B256-ml0r, FIG. 50B shows the antitumor effect of A551-mIgG1/B256-ml0r.
Фиг. 51. Диаграмма, показывающая массу органов в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38, после введения NS1-mIgG1, A548-mIgG1/B256-ml0r или A551-mIgG1/B256-ml0r.Fig. 51. Diagram showing organ weights in a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-mIgG1, A548-mIgG1/B256-ml0r, or A551-mIgG1/B256-ml0r.
Фиг. 51А показывает массу лимфоузла, фиг. 51Б показывает массу селезенки.Fig. 51A shows the lymph node mass, FIG. 51B shows the mass of the spleen.
Фиг. 52. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени мышиной модели, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NS1-mIgG1, A548-mIgG1/B256-ml0r или A551mIgG1/B256-ml0r.Fig. 52. Diagram showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-mIgG1, A548-mIgG1/B256-ml0r or A551mIgG1/B256-ml0r.
Фиг. 52А показывает процент PD-1-положительных Т-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток, фиг. 52Б показывает процент гранзим В-положительных клеток среди CD8-положительных Т-клеток.Fig. 52A shows the percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 52B shows the percentage of granzyme B positive cells among CD8 positive T cells.
Фиг. 53. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект А551-МВ110/B379-ml0r в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38.Fig. 53. Diagram showing the antitumor effect of A551-MB110/B379-ml0r in a mouse model transplanted with the MC38 cell line.
Фиг. 54. Диаграмма, показывающая массу органов в модели мыши, трансплантированной клеточной линией МС38 после введения NS1-mIgG1 или A551-MB110/B379-ml0r.Fig. 54. Diagram showing organ weights in a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-mIgG1 or A551-MB110/B379-ml0r.
Фиг. 54А показывает массу лимфатического узла, фиг. 54Б показывает массу селезенки.Fig. 54A shows a lymph node mass, FIG. 54B shows the mass of the spleen.
Фиг. 55. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в селезенке мышиной модели, трансплантированной клеточной линией МС38, после введения NS1-mIgG1 или Α551-ΜΒ110/Β379^0γFig. 55. Diagram showing the degree of T cell activation in the spleen of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-mIgG1 or Α551-ΜΒ110/Β379^0γ
Фиг. 55А показывает процент PD-1-положительныхТ-клеток среди CD8-положuтельных Т-клеток, фиг. 55Б показывает процент ICOS-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток, фиг. 55В показывает процент гранзим В-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток.Fig. 55A shows the percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 55B shows the percentage of ICOS positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 55B shows the percentage of granzyme B positive T cells among CD8 positive T cells.
Фиг. 56. Диаграмма, показывающая степень активации Т-клеток в печени мышиной модели, транспланированной клеточной линией МС38, после введения NS1-mIgG1 или А551 -MB 110/B379-ml0r.Fig. 56. Diagram showing the degree of T cell activation in the liver of a mouse model transplanted with the MC38 cell line after administration of NS1-mIgG1 or A551-MB 110/B379-ml0r.
Фиг. 56А показывает процент PD-1-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток, фиг. 56Б показывает процент ICOS-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток, фиг. 56В показывает процент гранзим В-положительных Т-клеток среди CD8-положительных Т-клеток.Fig. 56A shows the percentage of PD-1 positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 56B shows the percentage of ICOS positive T cells among CD8 positive T cells, FIG. 56B shows the percentage of granzyme B positive T cells among CD8 positive T cells.
Фиг. 57. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных анти-CD137 антител, используя клетки Jurkat в присутствии или в отсутствие L-кинуренина.Fig. 57. Diagram showing the agonistic activity of various anti-CD137 antibodies using Jurkat cells in the presence or absence of L-kynurenine.
Ось X показывает концентрацию антитела (мкг/мл), а ось Y показывает относительные световые единицы.The X-axis shows the antibody concentration (µg/ml) and the Y-axis shows the relative light units.
Фиг. 58. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных анти-CD137 антител, используя клетки 4-1ВВ Jurkat в присутствии или в отсутствие низкомолекулярного соединения (АТФ или ФДФ).Fig. 58. Diagram showing the agonist activity of various anti-CD137 antibodies using 4-1BB Jurkat cells in the presence or absence of a small molecule compound (ATP or FDP).
Ось X показывает концентрацию антитела (мкг/мл), а ось Y показывает относительные световые единицы.The X-axis shows the antibody concentration (µg/ml) and the Y-axis shows the relative light units.
Фиг. 59. Диаграмма, показывающая ответную реакцию АТФ (зависящую от концентрации АТФ люминесценцию люциферина) в клетках P2Y11 split Luc/HEK293, получаемых для определения внеклеточных уровней АТФ.Fig. 59. Diagram showing the ATP response (ATP concentration dependent luciferin luminescence) in P2Y11 split Luc/HEK293 cells obtained to determine extracellular ATP levels.
- 24 046075- 24 046075
Фиг. 60. Диаграмма, показывающая in vivo ответную реакцию АТФ (зависящую от концентрации АТФ люминесценцию люциферина) в клетках P2Y11 split Luc/HEK29, которые были трансплантированы мышам подкожно.Fig. 60. Diagram showing the in vivo ATP response (ATP concentration-dependent luciferin luminescence) in P2Y11 split Luc/HEK29 cells that were transplanted subcutaneously into mice.
Фиг. 61. Диаграмма, показывающая результаты люминесцентной визуализации мышей, подкожно трансплантированных клетками P2Y11 split Luc/HEK293 и предварительно определенными концентрациями АТФ, и мышей с опухолью FM3A, подкожно трансплантированных клетками P2Y11 split Luc/HEK293. Метки в вентральной части мышей указывают на выявленную люминесценцию.Fig. 61. Diagram showing fluorescence imaging results of mice subcutaneously transplanted with P2Y11 split Luc/HEK293 cells and predetermined concentrations of ATP, and FM3A tumor-bearing mice subcutaneously transplanted with P2Y11 split Luc/HEK293 cells. Labels in the ventral region of mice indicate detected luminescence.
Фиг. 62. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АТФ связывающую активность (величину KD) анти-hIL6R антител MRAH-G4T1/MRAL-k0 (контрольное антитело) и H0002G4T1/L1058-lam1, Н0041-G4T1/L1088-lam1, H0052-G4T1/L1083-lam1 (все являются переключаемыми антителами) против hIL6R.Fig. 62. Diagram showing the ATP concentration-dependent binding activity (KD value) of anti-hIL6R antibodies MRAH-G4T1/MRAL-k0 (control antibody) and H0002G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1, H0052-G4T1/L1083 -lam1 (all are switchable antibodies) against hIL6R.
Фиг. 63. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АДФ связывающую активность (величину KD) анти-hIL6R антител MRAH-G4T1/MRAL-k0 (контрольное антитело) и H0002G4T1/L1058-lam1, Н0041-G4T1/L1088-lam1, H0052-G4T1/L1083-lam1 (все являются переключаемыми антителами) против hIL6R.Fig. 63. Diagram showing the ADP concentration-dependent binding activity (KD value) of anti-hIL6R antibodies MRAH-G4T1/MRAL-k0 (control antibody) and H0002G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1, H0052-G4T1/L1083 -lam1 (all are switchable antibodies) against hIL6R.
Фиг. 64. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АМФ связывающую активность (величину KD) анти-hIL6R антител MRAH-G4T1/MRAL-k0 (контрольное антитело) и H0002G4T1/L1058-lam1, Н0041-G4T1/L1088-lam1, H0052-G4T1/L1083-lam1 (все являются переключаемыми антителами) против hIL6R.Fig. 64. Diagram showing AMP concentration-dependent binding activity (KD value) of anti-hIL6R antibodies MRAH-G4T1/MRAL-k0 (control antibody) and H0002G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1, H0052-G4T1/L1083 -lam1 (all are switchable antibodies) against hIL6R.
Фиг. 65. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АТФ активность ADCC антиhIL6R антител MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041mFa55/L1088-ml0, Н0052-mFa55/L1083-ml0 (все являются переключаемыми антителами).Fig. 65. Diagram showing ATP concentration-dependent ADCC activity of anti-hIL6R antibodies MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041mFa55/L1088-ml0, H0052-mFa55/L1083-ml0 (all switchable) antibodies).
Фиг. 66. Диаграмма, показывающая противоопухолевую активность in vivo анти-hIL6R антител MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и Н0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0, H0052-mFa55/L1083-ml0 (все являются переключаемыми антителами). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 является отрицательным контрольным антителом.Fig. 66. Diagram showing the in vivo antitumor activity of anti-hIL6R antibodies MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0, H0052-mFa55/L1083-ml0 (all are switchable antibodies). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 is a negative control antibody.
Фиг. 67. Диаграмма, показывающая сравнение кинетики в плазме анти-hIL6R антитела MRAHmFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) в обычных мышах и в hIL6R трансгенных мышах. Вертикальная ось графика показывает концентрацию антитела в плазме.Fig. 67. Diagram showing comparison of plasma kinetics of anti-hIL6R antibody MRAHmFa55/MRAL-mk0 (control antibody) in normal mice and in hIL6R transgenic mice. The vertical axis of the graph shows the concentration of antibody in plasma.
Фиг. 68. Диаграмма, показывающая сравнение кинетики в плазме анти-hIL6R антитела H0002mFa55/L1058-ml0 (переключаемого антитела) в обычных мышах и в hIL6R трансгенных мышах. Вертикальная ось графика показывает концентрацию антитела в плазме.Fig. 68. Diagram showing a comparison of the plasma kinetics of the anti-hIL6R antibody H0002mFa55/L1058-ml0 (switchable antibody) in normal mice and in hIL6R transgenic mice. The vertical axis of the graph shows the concentration of antibody in plasma.
Фиг. 69. Диаграмма, показывающая сравнение кинетики в плазме анти-hIL6R антитела H0041mFa55/L1088-ml0 (переключаемого антитела) в обычных мышах и в hIL6R трансгенных мышах. Вертикальная ось графика показывает концентрацию антитела в плазме.Fig. 69. Diagram showing a comparison of the plasma kinetics of the anti-hIL6R antibody H0041mFa55/L1088-ml0 (switchable antibody) in normal mice and in hIL6R transgenic mice. The vertical axis of the graph shows the concentration of antibody in plasma.
Фиг. 70. Диаграмма, показывающая сравнение кинетики в плазме анти-hIL6R антитела H0052mFa55/L1083-ml0 (переключаемого антитела) в обычных мышах и в hIL6R трансгенных мышах. Вертикальная ось графика показывает концентрацию антитела в плазме.Fig. 70. Diagram showing a comparison of the plasma kinetics of the anti-hIL6R antibody H0052mFa55/L1083-ml0 (switchable antibody) in normal mice and in hIL6R transgenic mice. The vertical axis of the graph shows the concentration of antibody in plasma.
Фиг. 71. Диаграмма, показывающая накопление антигенов у трансгенных мышей hIL6R после введения каждого из анти-hIL6R антител: не переключаемого антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и анти-hIL6R переключаемых антител H0002-mFa55/L1058-ml0, Н0041-mFa55/L1088ml0, H0052-mFa55/L1083-ml0 (все являются переключаемыми антителами). Вертикальная ось графика показывает концентрацию в плазме растворимого hIL6R. IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 (обозначенного на фигуре как KLH-mFa55) применяют в качестве антитела отрицательного контроля.Fig. 71. Diagram showing the accumulation of antigens in hIL6R transgenic mice after administration of each of the anti-hIL6R antibodies: non-switchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and anti-hIL6R switchable antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041- mFa55/L1088ml0, H0052-mFa55/L1083-ml0 (all are switchable antibodies). The vertical axis of the graph shows the plasma concentration of soluble hIL6R. IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 (indicated as KLH-mFa55 in the figure) was used as a negative control antibody.
Фиг. 72. Диаграмма, показывающая противоопухолевую активность in vivo анти-hIL6R не переключаемые антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и анти-hIL6R переключаемые антител H0002-mFa55/L1058-ml0 и H0041-mFa55/L1088-ml0 (оба являются переключаемыми антителами). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 является антителом отрицательного контроля.Fig. 72. Diagram showing in vivo antitumor activity of anti-hIL6R non-switchable antibodies MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and anti-hIL6R switchable antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0 and H0041-mFa55/L1088-ml0 (both switchable antibodies). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 is a negative control antibody.
Фиг. 73. Диаграмма, показывающая сравнение кинетики в плазме анти-hIL6R не переключаемого антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и анти-hIL6R переключаемых антител H0002-mFa55/L1058-ml0 и H0041-mFa55/L1088-ml0 (оба являются переключаемыми антителами). Вертикальная ось графика показывает концентрацию антитела в плазме.Fig. 73. Diagram showing comparison of the plasma kinetics of anti-hIL6R non-switchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and anti-hIL6R switchable antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0 and H0041-mFa55/L1088-ml0 (both switchable antibodies). The vertical axis of the graph shows the concentration of antibody in plasma.
Фиг. 74. Диаграмма, показывающая накопление антигенов после введения каждого из анти-hIL6R антител: не переключаемого антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и анти-hIL6R переключаемых антител H0002-mFa55/L1058-ml0 и H0041-mFa55/L1088-ml0 (оба являются переключаемыми антителами). Вертикальная ось графика показывает концентрацию растворимого hIL6R в плазме. IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 (обозначенное на фигуре как KLH-mFa55) применяют в качестве отрицательного контрольного антитела.Fig. 74. Diagram showing the accumulation of antigens after administration of each of the anti-hIL6R antibodies: non-switchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and anti-hIL6R switchable antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0 and H0041-mFa55/L1088- ml0 (both are switchable antibodies). The vertical axis of the graph shows the plasma concentration of soluble hIL6R. IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 (labeled KLH-mFa55 in the figure) was used as a negative control antibody.
Фиг. 75. Диаграмма, показывающая in vivo противоопухолевую активность анти-hIL6R не переключаемого антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и анти-HIL6R переключаемых антител H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 (оба являются переключаемыми антителами). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 является антителом отрицательного контроля.Fig. 75. Diagram showing in vivo antitumor activity of anti-hIL6R non-switchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and anti-HIL6R switchable antibodies H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 (both switchable antibodies). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 is a negative control antibody.
- 25 046075- 25 046075
Фиг. 76. Диаграмма, показывающая сравнение в плазме кинетики aHTu-hIL6R не переключаемого антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и анти-ЫL6R переключаемого антитела H0052-mFa55/L1083-ml0 (переключаемое антитело). Вертикальная ось графика показывает концентрацию антитела в плазме.Fig. 76. Diagram showing a comparison of the plasma kinetics of the aHTu-hIL6R non-switchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and the anti-AL6R switchable antibody H0052-mFa55/L1083-ml0 (switchable antibody). The vertical axis of the graph shows the concentration of antibody in plasma.
Фиг. 77. Диаграмма, показывающая накопление антигенов после введения каждого из анти-hIL6R антител: не переключаемого антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (контрольное антитело) и анти-ЫL6R переключаемого антитела H0052-mFa55/L1083-ml0 (переключаемое антитело). Вертикальная ось графика показывает концентрацию растворимого hIL6R в плазме. IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 (обозначенного на фигуре как KLH-mFa55) используют в качестве отрицательного контрольного антитела.Fig. 77. Diagram showing the accumulation of antigens after administration of each of the anti-hIL6R antibodies: non-switchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (control antibody) and anti-L6R switchable antibody H0052-mFa55/L1083-ml0 (switchable antibody). The vertical axis of the graph shows the plasma concentration of soluble hIL6R. IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 (labeled KLH-mFa55 in the figure) was used as a negative control antibody.
Фиг. 78. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АТФ активность анти-PD1 антител mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (контрольное антитело) и H5029-mFa31/L3021-ml0 (переключаемое антитело) по ингибированию связывания PD-1/PDL-1.Fig. 78. Diagram showing the ATP concentration-dependent activity of the anti-PD1 antibodies mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (control antibody) and H5029-mFa31/L3021-ml0 (switch antibody) to inhibit PD-1/PDL-1 binding.
Фиг. 79. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АТФ активность анти-PD1 антител mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (контрольное антитело) и H5041-mFa31/L3021-ml0 (переключаемое антитело) по ингибированию связывания PD-1/PDL-1.Fig. 79. Diagram showing the ATP concentration-dependent activity of the anti-PD1 antibodies mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (control antibody) and H5041-mFa31/L3021-ml0 (switch antibody) to inhibit PD-1/PDL-1 binding.
Фиг. 80. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АМФ нейтрализующую активность in vitro анти-PD1 антител mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (контрольное антитело), H5029mFa31/L3021-ml0 и H5041-mFa31/L3021-ml0 (оба являются переключаемыми антителами).Fig. 80. Diagram showing the AMP concentration-dependent in vitro neutralizing activity of the anti-PD1 antibodies mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (control antibody), H5029mFa31/L3021-ml0 and H5041-mFa31/L3021-ml0 (both switch antibodies).
Фиг. 81. Диаграмма, показывающая зависящую от концентрации АТФ in vitro нейтрализующую активность анти-PD1 антител mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (контрольное антитело) и H5029mFa31/L3021-ml0 и H5041-mFa31/L3021-ml0 (оба являются переключаемыми антителами).Fig. 81. Diagram showing the in vitro ATP concentration-dependent neutralizing activity of the anti-PD1 antibodies mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 (control antibody) and H5029mFa31/L3021-ml0 and H5041-mFa31/L3021-ml0 (both switch antibodies).
Фиг. 82. Диаграмма, показывающая противоопухолевую активность in vivo анти-PD1 антител mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL-mk1 (контрольное антитело) и H5041-mFa55/L3023-ml0 (переключаемое антитело). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 является отрицательным контрольным антителом.Fig. 82. Diagram showing in vivo anti-tumor activity of anti-PD1 antibodies mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL-mk1 (control antibody) and H5041-mFa55/L3023-ml0 (switch antibody). IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1 is a negative control antibody.
Фиг. 83. Диаграмма, показывающая активность анти-PD1 антител mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VLmk1 (контрольное антитело) и Н5041-mFa55/L3023-ml0 (переключаемое антитело) в элиминировании PD-1-экспрессирующих клеток из (А) опухоли и (Б) селезенки. На фигуре изотип представляет отрицательное контрольное антитело (IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1).Fig. 83. Diagram showing the activity of anti-PD1 antibodies mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VLmk1 (control antibody) and H5041-mFa55/L3023-ml0 (switch antibody) in eliminating PD-1-expressing cells from (A) tumor and (B) spleen. In the figure, the isotype represents the negative control antibody (IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1).
Фиг. 84. Диаграмма, показывающая механизм связывания АТФ и фрагментом Fab анти-hIL6R переключаемого антитела H0041L1088. На этой фигуре показывают АТФ в виде шаростержневой модели и аминокислотные остатки, взаимодействующие с АТФ, показывают в виде стержневой модели. Пунктирные линии указывают на водородные связи между антителом и АТФ.Fig. 84. Diagram showing the binding mechanism of ATP and the Fab fragment of the anti-hIL6R switch antibody H0041L1088. This figure shows ATP as a ball-and-stick model and the amino acid residues that interact with ATP are shown as a stick-and-stick model. The dotted lines indicate hydrogen bonds between the antibody and ATP.
Фиг. 85. Диаграмма, показывающая аминокислотную последовательность внеклеточного домена hIL6R (shIL6R), картированного с эпитопом анти-hIL6R переключаемого антитела H0041L1088. На фигуре аминокислотные остатки, заштрихованные серым цветом, представляют собой остатки (остатки эпитопа) shIL6R, содержащие один или несколько атомов, не являющихся водородом и расположенных на расстоянии 4,2 ангстрема или менее от АТФ или Fab H0041L1088 в кристаллической структуре.Fig. 85. Diagram showing the amino acid sequence of the extracellular domain of hIL6R (shIL6R) mapped to the anti-hIL6R epitope of the switch antibody H0041L1088. In the figure, the amino acid residues shaded in gray are residues (epitope residues) of shIL6R containing one or more non-hydrogen atoms located 4.2 angstroms or less from ATP or Fab H0041L1088 in the crystal structure.
Фиг. 86. Диаграмма, показывающая детали связывания между shIL6R и фрагмента Fab АТРсвязанного H0041L1088. На рисунке тяжелая цепь антитела показана черным цветом, легкая цепь - серым цветом, a shIL6R - белым. На фигуре АТФ показан в виде шарнирной модели, а остаток эпитопа shIL6R в пределах 4,2 ангстрем от антитела или АТФ и паратопный остаток антитела в пределах 4,2 ангстрем от остатка эпитопа показаны с помощью стержневой модели. Пунктирные линии указывают на водородные связи между антителом и shIL6R. Чтобы прояснить взаимодействие с АТФ, только F298 shIL6R показан с помощью шаровой модели.Fig. 86. Diagram showing details of binding between shIL6R and Fab fragment ATP bound H0041L1088. In the figure, the antibody's heavy chain is shown in black, the light chain in gray, and shIL6R in white. In the figure, ATP is shown as a hinge model, and the shIL6R epitope residue within 4.2 angstroms of the antibody or ATP and the antibody paratope residue within 4.2 angstroms of the epitope residue are shown using the rod model. Dashed lines indicate hydrogen bonds between the antibody and shIL6R. To clarify the interaction with ATP, only F298 shIL6R is shown using a spherical model.
Фиг. 87. Диаграмма, показывающая структуру, отличающуюся от структуры на фиг. 86 поворотом на 180° (вид сзади).Fig. 87. Diagram showing a structure different from the structure in FIG. 86 rotated 180° (rear view).
Фиг. 88. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных переключаемых антиCD137 антител, протестированных с использованием анализа репортерного гена 4-1ВВ Jurkat в присутствии АТФ.Fig. 88. Diagram showing the agonistic activity of various switchable anti-CD137 antibodies tested using the Jurkat 4-1BB reporter gene assay in the presence of ATP.
Фиг. 89. Диаграмма, показывающая сравнение в плазме показателей кинетики для каждого из антиCD137 переключаемых антител А375-SCF041aPh/B167-Lamlib и A375-MY201aPh/B167-Lamlib. Вертикальная ось графика показывает концентрацию каждого антитела в плазме.Fig. 89. Diagram showing comparison of plasma kinetics for each of the anti-CD137 switch antibodies A375-SCF041aPh/B167-Lamlib and A375-MY201aPh/B167-Lamlib. The vertical axis of the graph shows the plasma concentration of each antibody.
Фиг. 90. Диаграмма, показывающая противоопухолевый эффект каждого из A375/B167-SCF041aPh и A375/B167-MY201aPh в модели мыши, полученной путем трансплантации линии клеток LLC1/OVA/GPC3 мышам hCD137KI/mFcYR2bKO/hFcYR2bTg#90.Fig. 90. Diagram showing the antitumor effect of each of A375/B167-SCF041aPh and A375/B167-MY201aPh in a mouse model generated by transplantation of the LLC1/OVA/GPC3 cell line into hCD137KI/mFcYR2bKO/hFcYR2bTg#90 mice.
Каждая точка показывает среднюю величину объемов опухолей в группе (n=5).Each dot shows the average tumor volume in the group (n=5).
Фиг. 91. Диаграмма, показывающая агонистическую активность различных переключаемых антиCD3 антител, исследованных с помощью анализа репортерного гена, используя активацию Т-клеток Bioassay (NFAT) в присутствии АТФ.Fig. 91. Diagram showing the agonistic activity of various switchable anti-CD3 antibodies examined by reporter gene assay using T cell activation Bioassay (NFAT) in the presence of ATP.
- 26 046075- 26 046075
Формы осуществления настоящего изобретенияEmbodiments of the present invention
I. Определения.I. Definitions.
Понятие связывающая активность относится к силе общей суммы нековалентных взаимодействий между одним или несколькими сайтами связывания молекулы (например, антитела) и их связывающим партнером (например, антигеном). В настоящем изобретении связывающая активность строго не ограничивается взаимодействием 1:1 между представителями связывающейся пары (например, антителом и антигеном). Например, если представители связывающейся пары отражают одновалентное взаимодействие 1:1, связывающую активность в частности называют внутренним связывающим сродством (аффинностью). Если член связывающейся пары способен как к одновалентному связыванию, так и к поливалентному связыванию, активность связывания является суммой каждой силы связывания. Связывающая активность молекулы X в отношении ее партнера Y обычно может быть представлена константой диссоциации (KD) или связывающим количеством исследуемого соединения на единицу количества лиганда (ниже может называться связывающее количество). Специалистам очевидно, что, как правило, более низкое значение константы диссоциации (KD) означает более высокую связывающую активность, а более высокое значение количества связывания аналита на единицу количества лиганда или количества связывания означает более высокую активность связывания. Связывающую активность можно измерить обычными методами, известными в данной области, включая описанные в настоящем изобретении. Конкретные иллюстрации и примеры вариантов осуществления настоящего изобретения для измерения связывающей активности описаны ниже.The term binding activity refers to the strength of the total amount of non-covalent interactions between one or more binding sites of a molecule (eg, antibody) and its binding partner (eg, antigen). In the present invention, binding activity is not strictly limited to a 1:1 interaction between members of a binding pair (eg, antibody and antigen). For example, if members of a binding pair reflect a 1:1 monovalent interaction, the binding activity is specifically referred to as intrinsic binding affinity. If a member of a binding pair is capable of both monovalent binding and multivalent binding, the binding activity is the sum of each binding strength. The binding activity of molecule X towards its partner Y can typically be represented by the dissociation constant (KD) or the binding amount of test compound per unit amount of ligand (hereinafter may be referred to as binding amount). Those skilled in the art will appreciate that, in general, a lower dissociation constant (KD) value indicates higher binding activity, and a higher amount of analyte binding per unit amount of ligand or binding amount means higher binding activity. Binding activity can be measured by conventional methods known in the art, including those described in the present invention. Specific illustrations and examples of embodiments of the present invention for measuring binding activity are described below.
Понятие антигенсвязывающей молекулы или антитела с созревшей связывающей активностью или антигенсвязывающей молекулы или антитела с повышенной (усиленной) связывающей активностью относится к антителу с одним или несколькими изменениями в одной или нескольких гипервариабельных областях (HVR) по сравнению к исходной антигенсвязывающей молекулой или родительским антителом, которые не несут таких изменений; такие соединения приобретают улучшенную связывающую активность антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении антигена.The concept of an antigen binding molecule or antibody with matured binding activity or an antigen binding molecule or antibody with increased binding activity refers to an antibody with one or more changes in one or more hypervariable regions (HVRs) compared to the original antigen binding molecule or parent antibody that is not bear such changes; such compounds acquire improved binding activity of the antigen-binding molecule or antibody to the antigen.
Термины '^4^^:0137 антигенсвязывающая молекула против или анти-CD137-антитело и антигенсвязывающая молекула, которая связывается с CD137 или антитело, которое связывается с CD137 относятся к антигенсвязывающей молекуле или антителу, которые способны связываться с CD137 с достаточной связывающей активностью, в соответствии с чем антигенсвязывающая молекула или антитело может использоваться в качестве диагностического и/или терапевтического агента для нацеливания на CD137. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-СО137 антитело связывается с эпитопом CD137, который консервативен среди CD137 разных видов.The terms '^4^^:0137 antigen-binding molecule against or anti-CD137 antibody and antigen-binding molecule that binds to CD137 or antibody that binds to CD137 refer to an antigen-binding molecule or antibody that is capable of binding to CD137 with sufficient binding activity, in whereby an antigen binding molecule or antibody can be used as a diagnostic and/or therapeutic agent for targeting CD137. In some embodiments, the anti-CO137 antibody binds to an epitope of CD137 that is conserved among CD137 species.
Понятие анти-CD137 антигенсвязывающей активности или анти-CD137 антитела, обладающего CD137 связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, означает антигенсвязывающую молекулу или антитело, показывающее повышенную связывающую активность с CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения по сравнению со связывающей активностью с CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения наличие низкомолекулярного соединения относится к условию, при котором низкомолекулярное соединение присутствует в концентрации 10 мкМ или более, 50 мкМ или более, 100 мкМ или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более или 250 мкМ или более. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения степень связывающей активности анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела с неродственным, белком, не являющимся CD137, в присутствии низкомолекулярного соединения составляет примерно менее 10% связывания антигенсвязывающей молекулы или антитела с CD137 по данным измерения, например, с помощью радиоиммуноанализа (RIA, radioimmunoassay) или поверхностного плазмонного резонанса (SPR, surface plasmon resonance). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в присутствии низкомолекулярного соединения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело имеет константу диссоциации (KD) 1 мкМ или менее, 100 нМ или менее, 10 нМ или менее, 1 нМ или менее, 0,1 нМ или менее, 0,01 нМ или менее, или 0,001 нМ или менее (например, 10-6 М или менее, 10-7 М или менее, 10-8 М или менее, 10-9 М или менее, 10-10 М или менее, например, от 10-6 М до 10-10 М, от 10-7 М до 10-9 М, например, от 10-7 М до 10-8 М).The term anti-CD137 antigen binding activity or an anti-CD137 antibody having small molecule dependent CD137 binding activity means an antigen binding molecule or antibody exhibiting increased binding activity to CD137 in the presence of the small molecule compound compared to binding activity to CD137 in the absence of the small molecule compound. In one embodiment of the present invention, the presence of a small molecule compound refers to a condition in which the small molecule compound is present in a concentration of 10 μM or more, 50 μM or more, 100 μM or more, 150 μM or more, 200 μM or more, or 250 μM or more . In one embodiment of the present invention, the degree of binding activity of the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody to an unrelated non-CD137 protein in the presence of a small molecule compound is less than about 10% of the binding of the antigen binding molecule or antibody to CD137 as measured by, e.g. radioimmunoassay (RIA, radioimmunoassay) or surface plasmon resonance (SPR, surface plasmon resonance). In some embodiments of the present invention, in the presence of a small molecule compound, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody has a dissociation constant (KD) of 1 μM or less, 100 nM or less, 10 nM or less, 1 nM or less, 0.1 nM or less, 0.01 nM or less, or 0.001 nM or less (for example, 10 -6 M or less, 10 -7 M or less, 10 -8 M or less, 10 -9 M or less, 10 -10 M or less, for example, from 10 -6 M to 10 -10 M, from 10 -7 M to 10 -9 M, for example, from 10 -7 M to 10 -8 M).
В настоящем изобретении термин антигенсвязывающая молекула используют в самом широком смысле и он относится к молекуле, которая специфически связывается с антигенной детерминантой. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула представляет собой антитело, фрагмент антитела или производное антитела.In the present invention, the term antigen-binding molecule is used in its broadest sense and refers to a molecule that specifically binds to an antigenic determinant. In one embodiment of the present invention, the antigen binding molecule is an antibody, an antibody fragment, or an antibody derivative.
В контексте настоящего изобретения понятие агонистическая антигенсвязывающая молекула или агонистическое антитело в контексте настоящего изобретения представляет собой антигенсвязывающую молекулу или антитело, которые значительно индуцируют или усиливают биологическую активность антигена, с которым они связываются (например, CD137 и CD3).In the context of the present invention, the term agonistic antigen binding molecule or agonistic antibody in the context of the present invention is an antigen binding molecule or antibody that significantly induces or enhances the biological activity of the antigen to which it binds (eg, CD137 and CD3).
Следовательно, если антигеном является, например, CD137, такая антигенсвязывающая молекула или антитело, обладающее агонистическим действием, называется агонистической антигенсвязывающей молекулой CD137 или агонистическим антителом CD137, соответственно.Therefore, if the antigen is, for example, CD137, such an antigen binding molecule or antibody having an agonistic effect is called a CD137 agonistic antigen binding molecule or a CD137 agonistic antibody, respectively.
- 27 046075- 27 046075
В контексте настоящего изобретения понятие антитело используют в самом широком смысле и оно охватывает различные структуры антител, включая, но ими не ограничиваясь, моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела (например, биспецифические антитела) и фрагменты антител, если они проявляют необходимую антигенсвязывающую активность.In the context of the present invention, the term antibody is used in the broadest sense and includes various antibody structures, including, but not limited to, monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, multispecific antibodies (eg, bispecific antibodies) and antibody fragments, as long as they exhibit the necessary antigen-binding activity.
В контексте настоящего изобретения понятие фрагмент антитела относится к молекуле, отличной от интактного антитела, которая включает часть интактного антитела, связывающую антиген, с которым связывается интактное антитело. Примеры фрагментов антител включают, но ими перечень не ограничивают, Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; диатела; линейные антитела; молекулы одноцепочечных антител (например, scFv); и мультиспецифические антитела, образованные из фрагментов антител.In the context of the present invention, the term antibody fragment refers to a molecule, other than an intact antibody, that includes a portion of the intact antibody that binds the antigen to which the intact antibody binds. Examples of antibody fragments include, but are not limited to, Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; diabodies; linear antibodies; single chain antibody molecules (eg scFv); and multispecific antibodies formed from antibody fragments.
Антигенсвязывающая молекула, которая связывается с тем же эпитопом или антитело, которое связывается с тем же эпитопом, что и контрольная антигенсвязывающая молекула или контрольное антитело, относится к антителу или антигенсвязывающей молекуле, которые блокируют связывание контрольного антитела или контрольной антигенсвязывающей молекулы со своим антигеном в конкурентном анализе на 50% или более, и, наоборот, контрольное антитело блокирует связывание антитела с его антигеном в конкурентном анализе на 50% или более. Пример конкурентного анализа приводят в настоящем изобретении. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в случае, если контрольная антигенсвязывающая молекула или контрольное антитело проявляет антигенсвязывающую активность в зависимости от низкомолекулярного соединения, конкурентный анализ проводят в присутствии низкомолекулярного соединения.An antigen-binding molecule that binds to the same epitope or an antibody that binds to the same epitope as a control antigen-binding molecule or control antibody refers to an antibody or antigen-binding molecule that blocks the binding of a control antibody or control antigen-binding molecule to its antigen in a competition assay by 50% or more, and conversely, the control antibody blocks binding of the antibody to its antigen in the competition assay by 50% or more. An example of competitive analysis is given in the present invention. In one embodiment of the present invention, if a control antigen-binding molecule or control antibody exhibits antigen-binding activity depending on the small molecule compound, the competition assay is performed in the presence of the small molecule compound.
Понятие химерное антитело относится к антителу, в котором часть тяжелой и/или легкой цепи происходит из определенного источника или вида, в то время как остальная часть тяжелой и/или легкой цепи происходит из другого источника или вида.The term chimeric antibody refers to an antibody in which a portion of the heavy and/or light chain is derived from a particular source or species, while the remainder of the heavy and/or light chain is derived from a different source or species.
Понятие класс антитела определяется типом константного домена или константной области, которой обладает его тяжелая цепь. Существует пять основных классов антител: IgA, IgD, IgE, IgG и IgM, и некоторые из них могут быть далее разделены на подклассы (изотипы), например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2. Константные домены тяжелой цепи, которые соответствуют различным классам иммуноглобулинов, называются альфа, дельта, эпсилон, гамма и мю, соответственно.The concept of an antibody class is determined by the type of constant domain or constant region that its heavy chain possesses. There are five main classes of antibodies: IgA, IgD, IgE, IgG and IgM, and some of them can be further divided into subclasses (isotypes), such as IgG1, IgG2, IgG3, IgG4 , IgA1 and IgA2. The heavy chain constant domains that correspond to the different classes of immunoglobulins are called alpha, delta, epsilon, gamma and mu, respectively.
Понятие эффекторные функции относятся к тем биологическим активностям, приписываемым области Fc антитела, которые варьируют в зависимости от изотипа антитела. Примеры эффекторных функций антитела включают: связывание C1q и комплементзависимую цитотоксичность (CDC, complement dependent cytotoxicity); связывание с рецептором Fc; антителозависимую клеточно-опосредованную цитотоксичность (ADCC, antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity); фагоцитоз; понижающую регуляцию рецепторов на клеточной поверхности (например, рецептора В-клеток); и активацию В-клеток.The term effector functions refers to those biological activities attributable to the Fc region of an antibody that vary depending on the antibody isotype. Examples of antibody effector functions include: C1q binding and complement dependent cytotoxicity (CDC); Fc receptor binding; antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC, antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity); phagocytosis; down-regulation of cell surface receptors (eg, B cell receptor); and activation of B cells.
Понятие цитотоксичность относится к активности, которая ингибирует или препятствует клеточной функции и/или вызывает гибель или разрушение клеток. Цитотоксичность может представлять собой, например, активность антителозависимой клеточно-опосредованной цитотоксичности (ADCC), активность комплемент-зависимой цитотоксичности (CDC) и цитотоксичность, обусловленную Тклетками; также может быть цитотоксичность, вызванная цитотоксическими агентами (например, радиоизотопами и химиотерапевтическими агентами), такими как иммуноконъюгаты.The term cytotoxicity refers to an activity that inhibits or interferes with cellular function and/or causes cell death or destruction. Cytotoxicity may be, for example, antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) activity, complement-dependent cytotoxicity (CDC) activity, and T cell-mediated cytotoxicity; There may also be cytotoxicity caused by cytotoxic agents (eg, radioisotopes and chemotherapeutic agents) such as immunoconjugates.
В контексте настоящего изобретения понятие область Fc используют для определения Сконцевой области тяжелой цепи иммуноглобулина, которая содержит, по меньшей мере, часть константной области. Понятие включает области Fc с нативной последовательностью и варианты области Fc. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения область Fc тяжелой цепи IgG человека располагается от Cys226 или от Pro230 до карбоксильного конца тяжелой цепи. Однако С-концевой лизин (Lys447) или глицин-лизин (остатки 446-447) области Fc могут присутствовать или их может не быть. Если в настоящем изобретении не указано иное, нумерация аминокислотных остатков в области Fc или константной области соответствует системе нумерации EU, также называемой индексом EU, как описано в книге Kabat с соавт., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5e изд., изд-во Национальные институты здравоохранения, Бетесда, Мэриленд, 1991.In the context of the present invention, the term Fc region is used to define the C-terminal region of an immunoglobulin heavy chain that contains at least part of a constant region. The concept includes native sequence Fc regions and Fc region variants. In one embodiment of the present invention, the Fc region of the human IgG heavy chain is located from Cys226 or Pro230 to the carboxyl terminus of the heavy chain. However, the C-terminal lysine (Lys447) or glycine-lysine (residues 446-447) Fc region may or may not be present. Unless otherwise specified in the present invention, the numbering of amino acid residues in the Fc region or constant region follows the EU numbering system, also called the EU index, as described in Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., ed. National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991.
Понятие вариант области Fc в настоящем изобретении включает аминокислотную последовательность, которая отличается от нативной последовательности области Fc по меньшей мере одной модификацией аминокислоты, предпочтительно одной или несколькими аминокислотными заменами. Предпочтительно вариант области Fc имеет по меньшей мере одну аминокислотную замену по сравнению с нативной последовательностью области Fc или с областью Fc исходного полипептида, например, от примерно одной до примерно десяти аминокислотных замен, и предпочтительно от примерно одной до примерно пяти аминокислотных замен в нативной последовательности области Fc или в области Fc исходного полипептида. В настоящем изобретении вариант области Fc может предпочтительно обладать по меньшей мере примерно 80% гомологии с нативной последовательностью области Fc и/или с областью Fc исходного полипептида, и наиболее предпочтительно по меньшей мере примерно 90% гомологии, более предпочтительно по меньшей мере примерно 95% гомологии.The term Fc region variant as used herein includes an amino acid sequence that differs from the native Fc region sequence by at least one amino acid modification, preferably one or more amino acid substitutions. Preferably, the variant Fc region has at least one amino acid substitution compared to the native Fc region sequence or the Fc region of the parent polypeptide, for example, from about one to about ten amino acid substitutions, and preferably from about one to about five amino acid substitutions in the native sequence of the region Fc or in the Fc region of the parent polypeptide. In the present invention, the variant Fc region may preferably have at least about 80% homology to the native Fc region sequence and/or the Fc region of the parent polypeptide, and most preferably at least about 90% homology, more preferably at least about 95% homology .
В настоящем изобретении аминокислотные изменения или замены в области Fc или константной области могут быть представлены комбинацией аминокислот, выраженной по системе нумерации EU.In the present invention, amino acid changes or substitutions in the Fc region or constant region may be represented by a combination of amino acids expressed in the EU numbering system.
- 28 046075- 28 046075
Например, S424N обозначает замену в положении 424 по нумерации ЕС серина (Ser) на аспарагин (Asn). EU424N означает замену в положении 424 по нумерации EU от аминокислоты (любого типа) на аспарагин (Asn).For example, S424N indicates a substitution at position 424 of the EC numbering from serine (Ser) to asparagine (Asn). EU424N means a change at position 424 in EU numbering from an amino acid (any type) to asparagine (Asn).
В настоящем изобретении понятие антитело, содержащее область Fc означает антитело, которое содержит область Fc. С-концевой лизин (остаток 447 по системе нумерации EU) или С-концевой глицинлизин (остатки 446-447) области Fc можно удалить, например, во время очистки антитела или рекомбинантной инженерии нуклеиновой кислоты, кодирующей антитело. Соответственно, композиция, содержащая антитело, имеющее область Fc в соответствии с настоящим изобретением, может содержать антитело с G446-K447, с G446 и без K447, со всеми удаленными G446-K447, или смесь трех типов антител, описанных выше.In the present invention, the term Fc region-containing antibody means an antibody that contains an Fc region. The C-terminal lysine (residue 447 in the EU numbering system) or the C-terminal glycine lysine (residues 446-447) of the Fc region can be removed, for example, during antibody purification or recombinant engineering of the nucleic acid encoding the antibody. Accordingly, a composition containing an antibody having an Fc region in accordance with the present invention may contain an antibody with G446-K447, with G446 and without K447, with all G446-K447 removed, or a mixture of the three types of antibodies described above.
В настоящем изобретении понятия антитело полной длины, интактное антитело и целое антитело используют взаимозаменяемо для обозначения антитела, имеющего структуру, по существу аналогичную структуре нативного антитела, или имеющего тяжелые цепи, которые содержат область Fc или вариант области Fc согласно описанию настоящего изобретения.In the present invention, the terms full-length antibody, intact antibody, and whole antibody are used interchangeably to refer to an antibody having a structure substantially similar to that of a native antibody or having heavy chains that contain an Fc region or a variant Fc region as described herein.
Понятие антитело человека представляет собой антитело, которое обладает аминокислотной последовательностью, соответствующей последовательности антитела, вырабатываемого организмом человека, или клеткой человека, или полученного от другого источника (не от человека), в котором используют репертуары антител человека или другие последовательности, кодирующие антитела человека. Это определение антитела человека специально исключает гуманизированное антитело, содержащее антигенсвязывающие остатки, не относящиеся к антителу человека.A human antibody is an antibody that has an amino acid sequence corresponding to that of an antibody produced by a human body or a human cell, or obtained from a non-human source that uses human antibody repertoires or other human antibody-encoding sequences. This definition of human antibody specifically excludes a humanized antibody containing non-human antigen-binding moieties.
Понятие каркасный участок (FR, framework) относится к остаткам вариабельного домена, отличным от остатков гипервариабельной области (HVR). FR вариабельного домена обычно состоит из четырех доменов FR: FR1, FR2, FR3 и FR4. Соответственно, последовательности HVR и FR обычно появляются в следующем порядке в VH (или VL): FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.The term framework region (FR, framework) refers to residues of the variable domain other than the hypervariable region (HVR) residues. The FR variable domain typically consists of four FR domains: FR1, FR2, FR3 and FR4. Accordingly, HVR and FR sequences typically appear in the following order in VH (or VL): FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.
В настоящем изобретении понятие акцепторная каркасная область человека представляет собой каркас, содержащий аминокислотную последовательность каркасной области вариабельного домена легкой цепи (VL) или каркасной области вариабельного домена тяжелой цепи (VH), полученной из каркаса иммуноглобулина человека или консенсусной каркасной области человека согласно описанному ниже. Акцепторная каркасная область человека, происходящая из каркасной области иммуноглобулина человека или консенсусной каркасной области человека, может содержать такую же аминокислотную последовательность, или она может содержать изменения аминокислотной последовательности. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения количество изменений аминокислот равно 10 или менее, 9 или менее, 8 или менее, 7 или менее, 6 или менее, 5 или менее, 4 или менее, 3 или менее или 2 или менее. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения акцепторная каркасная область VL человека идентична последовательности каркасной области VL иммуноглобулина человека или последовательности консенсусной каркасной области человека.In the present invention, a human acceptor framework is a framework comprising an amino acid sequence of a light chain variable domain (VL) framework or a heavy chain variable domain (VH) framework derived from a human immunoglobulin framework or a human consensus framework as described below. A human acceptor framework derived from a human immunoglobulin framework or a human consensus framework may contain the same amino acid sequence, or it may contain changes in the amino acid sequence. In some embodiments of the present invention, the number of amino acid changes is 10 or less, 9 or less, 8 or less, 7 or less, 6 or less, 5 or less, 4 or less, 3 or less, or 2 or less. In some embodiments of the present invention, the human VL acceptor framework sequence is identical to a human immunoglobulin VL framework sequence or a human consensus framework sequence.
В настоящем изобретении понятие консенсусная каркасная область человека означает наиболее часто встречающиеся аминокислотные остатки при отборе последовательностей VL или VH каркасного участка иммуноглобулина человека. Как правило, выбор последовательностей VL или VH иммуноглобулина человека осуществляют из подгруппы последовательностей вариабельных доменов. Обычно подгруппа последовательностей является подгруппой, описанной в книге Kabat с соавт., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5e изд., изд-во NIH Publication 91-3242, 1991, тома 1-3, Бетесда, Мэриленд. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения для VL подгруппой является подгруппа каппа I, описанная в книге Kabat с соавт., supra. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения для VH подгруппой является подгруппа III, описанная в книге Kabat с соавт., supra.In the present invention, the term human consensus framework region means the most frequently occurring amino acid residues when selecting human immunoglobulin VL or VH framework sequences. Typically, the selection of human immunoglobulin VL or VH sequences is made from a subset of variable domain sequences. Typically, the subset of sequences is the subset described in Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., NIH Publication 91-3242, 1991, volumes 1-3, Bethesda, MD. In one embodiment of the present invention, the VL subgroup is kappa I, as described in Kabat et al., supra. In one embodiment of the present invention, the VH subgroup is subgroup III, as described in Kabat et al., supra.
Понятие гуманизированное антитело относится к химерному антителу, содержащему аминокислотные остатки из HVR, не относящихся к человеку, и аминокислотные остатки из FR человека. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения гуманизированное антитело может включать практически все из по меньшей мере одного, обычно двух вариабельных доменов, в которых все или практически все HVR (например, CDR) соответствуют таковым из антитела, не являющегося антителом человека, и все или практически все из FR соответствуют таковым антитела человека. Гуманизированное антитело необязательно может содержать по меньшей мере часть константной области антитела, полученной из антитела человека. Гуманизированная форма антитела, например, не являющегося антителом человека, относится к антителу, которое было гуманизировано.The term humanized antibody refers to a chimeric antibody containing amino acid residues from non-human HVR and amino acid residues from human FR. In some embodiments of the present invention, a humanized antibody may include substantially all of at least one, typically two, variable domains in which all or substantially all of the HVRs (e.g., CDRs) correspond to those of the non-human antibody, and all or substantially all from FR correspond to those of human antibodies. The humanized antibody may optionally contain at least a portion of the antibody constant region derived from a human antibody. A humanized form of an antibody, for example a non-human antibody, refers to an antibody that has been humanized.
Термин вариабельная область или вариабельный домен относится к домену тяжелой или легкой цепи антитела, который участвует в связывании антитела с антигеном. Вариабельные домены тяжелой цепи и легкой цепи (VH и VL, соответственно) нативного антитела обычно имеют сходные структуры, причем каждый домен включает четыре консервативных каркасных области (FR) и три гипервариабельные области (HVR). (См., например, Kindt с соавт. Kuby Immunology, 6th ed., изд-во W.H. Freeman and Co., 2001, с. 91). Одного домена VH или VL может быть достаточно для придания антигенсвязывающей специфичности. Кроме того, антитела, которые связывают конкретный антиген, могут быть выделены с использованием домена VH или VL из антитела, которое связывает антиген, для скрининга библиотекиThe term variable region or variable domain refers to the heavy or light chain domain of an antibody that is involved in the binding of the antibody to an antigen. The heavy chain and light chain variable domains (VH and VL, respectively) of a native antibody typically have similar structures, with each domain comprising four conserved framework regions (FR) and three hypervariable regions (HVR). (See, for example, Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., WH Freeman and Co., 2001, p. 91). A single VH or VL domain may be sufficient to confer antigen-binding specificity. Additionally, antibodies that bind a particular antigen can be isolated using the VH or VL domain from the antibody that binds the antigen for library screening
- 29 046075 комплементарных доменов VL или VH, соответственно. См., например, Portolano с соавт., J. Immunol. 150, 1993, 880-887; Clarkson с соавт., Nature 352, 1991, 624-628.- 29 046075 complementary VL or VH domains, respectively. See, for example, Portolano et al., J. Immunol. 150, 1993, 880-887; Clarkson et al., Nature 352, 1991, 624-628.
Термин гипервариабельная область или HVR (hypervariable region) в контексте настоящего изобретения относится к каждой из областей вариабельного домена антитела, которые являются гипервариабельными по последовательности (области, определяющие комплементарность или CDR (complementarity determining regions)) и/или образуют структурно определенные петли (гипервариабельные петли) и/или содержат остатки, контактирующие с антигеном (контакты антигена). Обычно антитела содержат шесть HVR: три в VH (H1, Н2, H3) и три в VL (L1, L2, L3). Примеры HVR в данном документе включают:The term hypervariable region or HVR in the context of the present invention refers to each of the regions of the variable domain of an antibody that are hypervariable in sequence (complementarity determining regions or CDRs) and/or form structurally defined loops (hypervariable loops). ) and/or contain residues in contact with the antigen (antigen contacts). Antibodies typically contain six HVRs: three in VH (H1, H2, H3) and three in VL (L1, L2, L3). Examples of HVRs in this document include:
(а) гипервариабельные петли, встречающиеся при аминокислотных остатках 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (Н2) и 96-101 (H3) (Chothia, Lesk, J. Mol. Biol. 196, 1987, 901-917);(a) hypervariable loops found at amino acid residues 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (H2) and 96-101 (H3 ) (Chothia, Lesk, J. Mol. Biol. 196, 1987, 901-917);
(б) CDR, несущие аминокислотные остатки 24-34 (L1), 50-56 (L2), 89-97 (L3), 31-35b (H1), 50-65 (Н2) и 95-102 (H3) (Kabat с соавт., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5e изд., изд-во Национальные институты здравоохранения, Бетесда, Мэриленд, 1991);(b) CDRs carrying amino acid residues 24-34 (L1), 50-56 (L2), 89-97 (L3), 31-35b (H1), 50-65 (H2) and 95-102 (H3) ( Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991);
(в) контакты антигена по аминокислотным остаткам 27с-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (Н2) и 93-101 (H3) ( MacCallum с соавт., J. Mol. Biol., 262, 1996, 732-745);(c) antigen contacts at amino acid residues 27c-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (H2) and 93-101 (H3) ( MacCallum et al., J. Mol. Biol., 262, 1996, 732-745);
(г) комбинации (а), (б) и/или (в), включающие аминокислотные остатки HVR 46-56 (L2), 47-56 (L2), 48-56 (L2), 49-56 (L2), 26-35 (H1), 26-35b (H1), 49-65 (Н2), 93-102 (H3) и 94-102 (H3).(d) combinations (a), (b) and/or (c), including amino acid residues HVR 46-56 (L2), 47-56 (L2), 48-56 (L2), 49-56 (L2), 26-35 (H1), 26-35b (H1), 49-65 (H2), 93-102 (H3) and 94-102 (H3).
Если не указано иное, остатки HVR и другие остатки в вариабельном домене (например, остатки FR) пронумерованы в настоящем изобретении согласно Kabat с соавт., supra. В настоящем изобретении остатки HVR или другие остатки в вариабельном домене (например, остатки FR) и аминокислотные изменения или замены таких остатков могут быть представлены в виде комбинации по системе нумерации Kabat. Например, N99 означает аспарагин (Asn) в позиции 99 по нумерации Kabat, a N99A означает замещение в позиции 99 по нумерации Kabat аспарагина (Asn) на аланин (Ala).Unless otherwise indicated, HVR residues and other residues in the variable domain (eg, FR residues) are numbered in the present invention according to Kabat et al., supra. In the present invention, HVR residues or other residues in a variable domain (eg, FR residues) and amino acid changes or substitutions of such residues may be represented in combination using the Kabat numbering system. For example, N99 means asparagine (Asn) at position 99 in the Kabat numbering, and N99A means a substitution at position 99 in Kabat numbering from asparagine (Asn) to alanine (Ala).
В настоящем изобретении понятие иммуноконъюгат представляет собой антитело, конъюгированное с одной или несколькими гетерологичными молекулами (молекулой), включая, но им не ограничиваясь, цитотоксический агент.As used herein, an immunoconjugate is an antibody conjugated to one or more heterologous molecules, including, but not limited to, a cytotoxic agent.
В настоящем изобретении понятие цитотоксический агент относится к веществу, которое ингибирует или препятствует проявлению клеточной функции и/или вызывает гибель или разрушение клеток. Цитотоксические агенты включают, но не ограничиваются ими, радиоактивные изотопы (например, 211At, 1311, 1251, 90Y, 186Re, 188Re, 153Sm, 212Bi, 32P, 212Pb и радиоактивные изотопы Lu); химиотерапевтические агенты или лекарства (например, метотрексат, адриамицин, алкалоиды барвинка (винкристин, винбластин, этопозид), доксорубицин, мелфалан, митомицин С, хлорамбуцил, даунорубицин или другие интеркалирующие агенты); агенты, ингибирующие рост; ферменты и их фрагменты, такие как нуклеолитические ферменты; антибиотики; токсины, такие как низкомолекулярные токсины или ферментативно активные токсины бактериального, грибкового, растительного или животного происхождения, включая их фрагменты и/или варианты; и различные противоопухолевые или противораковые агенты, описанные ниже.In the present invention, the term cytotoxic agent refers to a substance that inhibits or interferes with the expression of cellular function and/or causes cell death or destruction. Cytotoxic agents include, but are not limited to, radioactive isotopes (eg, 211 At, 131 1, 125 1, 90 Y, 186 Re, 188 Re, 153 Sm, 212 Bi, 32 P, 212 Pb and Lu radioactive isotopes); chemotherapeutic agents or drugs (eg, methotrexate, adriamycin, vinca alkaloids (vincristine, vinblastine, etoposide), doxorubicin, melphalan, mitomycin C, chlorambucil, daunorubicin or other intercalating agents); growth inhibitory agents; enzymes and fragments thereof, such as nucleolytic enzymes; antibiotics; toxins, such as low molecular weight toxins or enzymatically active toxins of bacterial, fungal, plant or animal origin, including fragments and/or variants thereof; and various antitumor or anticancer agents described below.
Понятие выделенное антитело - это антитело, которое было отделено от компонентов его естественного окружения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитело очищают до более чем 95% или 99% чистоты, что определяют, например, электрофоретическим методом (например, SDS-PAGE, изоэлектрическим фокусированием (IEF), капиллярным электрофорезом) или хроматографией (например, ионообменной или обращенно-фазовой ВЭЖХ). Для обзора методов оценки чистоты антител см., например, публикацию Flatman с соавт., J. Chromatogr. В 848, 2007, 79-87.The concept of an isolated antibody is an antibody that has been separated from components of its natural environment. In some embodiments of the present invention, the antibody is purified to greater than 95% or 99% purity, as determined, for example, by electrophoresis (e.g., SDS-PAGE, isoelectric focusing (IEF), capillary electrophoresis) or chromatography (e.g., ion exchange or reverse chromatography). phase HPLC). For a review of methods for assessing antibody purity, see, for example, Flatman et al., J. Chromatogr. In 848, 2007, 79-87.
Понятие выделенная нуклеиновая кислота относится к молекуле нуклеиновой кислоты, которая была отделена от компонентов ее естественного окружения. Выделенная нуклеиновая кислота включает молекулу нуклеиновой кислоты, содержащуюся в клетках, которые обычно содержат молекулу нуклеиновой кислоты, но молекула нуклеиновой кислоты присутствует вне хромосомы или имеет хромосомную локализацию, которая отличается от ее естественной хромосомной локализации.The term isolated nucleic acid refers to a nucleic acid molecule that has been separated from components of its natural environment. An isolated nucleic acid includes a nucleic acid molecule contained in cells that normally contain the nucleic acid molecule, but the nucleic acid molecule is present outside of a chromosome or has a chromosomal location that differs from its natural chromosomal location.
В настоящем изобретении понятие вектор относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной размножаться с другой нуклеиновой кислотой, с которой она связана. Понятие включает вектор как самореплицирующуюся структуру нуклеиновой кислоты, а также вектор, включенный в геном клеткихозяина, в которую он был введен. Некоторые векторы способны управлять экспрессией нуклеиновых кислот, с которыми они функционально связаны. Такие векторы называются в настоящем изобретении векторами экспрессии.In the present invention, the term vector refers to a nucleic acid molecule capable of propagating with another nucleic acid to which it is linked. The concept includes a vector as a self-replicating nucleic acid structure, as well as a vector included in the genome of the host cell into which it was introduced. Some vectors are capable of directing the expression of the nucleic acids to which they are operably linked. Such vectors are referred to in the present invention as expression vectors.
Понятие кодированная нуклеиновая кислота, кодирующая анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу относится к одной или более молекулам нуклеиновой кислоты, которые кодируют полипептид (полипептиды), составляющие антигенсвязывающую молекулу. Понятие выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая анти-CD137 антитело относится к одной или более молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим тяжелую и легкую цепи антитела (или их фрагменты), включая такую молекулу (молекулы) нуклеиновой кислоты в одном векторе или в отдельных векторах, и такую молекулу (молекулы) нуклеиновой кислоты, присутствующие в одном или нескольких местах локализации в клетке-хозяине.The term anti-CD137 antigen binding molecule encoded nucleic acid refers to one or more nucleic acid molecules that encode the polypeptide(s) constituting the antigen binding molecule. The term isolated nucleic acid encoding an anti-CD137 antibody refers to one or more nucleic acid molecules encoding the heavy and light chains of an antibody (or fragments thereof), including such nucleic acid molecule(s) in one vector or in separate vectors, and such molecule Nucleic acid (molecules) present at one or more sites in a host cell.
Понятия клетка-хозяин, линия клеток-хозяев и культура клеток-хозяев используются взаимоThe terms host cell, host cell line, and host cell culture are used interchangeably.
- 30 046075 заменяемо и относятся к клеткам, в которые была введена экзогенная нуклеиновая кислота, включая потомство таких клеток. К клеткам-хозяевам относятся трансформанты и трансформированные клетки, которые включают первичную трансформированную клетку и потомство, полученное от нее, независимо от количества пассажей. Потомство может не быть полностью идентичным родительской клетке по содержанию нуклеиновой кислоты, но может содержать мутации. В настоящем изобретении к данным понятиям также относятся мутантные потомки, которые обладают той же функцией или биологической активностью, что и проверенные или отобранные среди первоначально трансформированных клеток.- 30 046075 is replaceable and refers to cells into which exogenous nucleic acid has been introduced, including the progeny of such cells. Host cells include transformants and transformed cells, which include the primary transformed cell and the progeny derived from it, regardless of the number of passages. The offspring may not be completely identical to the parent cell in nucleic acid content, but may contain mutations. In the present invention, these concepts also include mutant progenies that have the same function or biological activity as those tested or selected from the originally transformed cells.
В контексте настоящего изобретения понятие моноклональное антитело относится к антителу, полученному из популяции по существу гомогенных антител, т.е. отдельные антитела, составляющие популяцию, идентичны и/или связываются с одним и тем же эпитопом, за исключением возможных вариантных антител, например, содержащих встречающиеся в природе мутации или возникающие во время получения препарата моноклонального антитела, такие варианты обычно присутствуют в незначительных количествах. В отличие от препаратов поликлональных антител, которые обычно включают разные антитела, направленные против разных детерминант (эпитопов), каждое моноклональное антитело в препарате моноклональных антител направлено против одной детерминанты на антигене. Таким образом, определение моноклональное указывает на характер антитела, как полученного по существу из гомогенной популяции антител, и не должно толковаться как требующее получения антитела какимлибо конкретным методом. Например, моноклональные антитела, которые будут использоваться в соответствии с настоящим описанием, могут быть получены различными методами, включая, но ими не ограничиваясь, гибридомный метод, методы рекомбинантной ДНК, методы фагового дисплея и методы с использованием трансгенных животных, содержащих все или часть локусов иммуноглобулина человека, а также другие методы получения моноклональных антител, примеры применения которых описаны в настоящем изобретении.In the context of the present invention, the term monoclonal antibody refers to an antibody obtained from a population of essentially homogeneous antibodies, i.e. The individual antibodies composing the population are identical and/or bind to the same epitope, with the exception of possible variant antibodies, for example those containing naturally occurring mutations or occurring during production of the monoclonal antibody preparation, such variants are usually present in minute quantities. Unlike polyclonal antibody preparations, which typically include different antibodies directed against different determinants (epitopes), each monoclonal antibody in a monoclonal antibody preparation is directed against a single determinant on an antigen. Thus, the designation monoclonal refers to the nature of the antibody as being derived from an essentially homogeneous population of antibodies and should not be construed as requiring the antibody to be produced by any particular method. For example, monoclonal antibodies to be used in accordance with the present description can be produced by various methods, including, but not limited to, hybridoma method, recombinant DNA methods, phage display methods and methods using transgenic animals containing all or part of the immunoglobulin loci human, as well as other methods for producing monoclonal antibodies, examples of the use of which are described in the present invention.
Термин голое антитело относится к антителу, которое не конъюгировано с гетерологичным фрагментом (например, с цитотоксическим фрагментом) или с радиоактивной меткой. Г олое антитело может присутствовать в фармацевтическом составе.The term naked antibody refers to an antibody that is not conjugated to a heterologous moiety (eg, a cytotoxic moiety) or to a radiolabel. The naked antibody may be present in the pharmaceutical composition.
Понятие нативные антитела относится к природным молекулам иммуноглобулинов различной структуры. Например, нативные антитела IgG представляют собой гетеротетрамерные гликопротеины массой примерно 150 000 дальтон, состоящие из двух идентичных легких цепей и двух идентичных тяжелых цепей, связанных дисульфидной связью. От N- к С-концу каждая тяжелая цепь имеет вариабельную область (VH), также называемую вариабельным тяжелым доменом или вариабельным доменом тяжелой цепи, за которой следуют три константных домена (CH1, CH2 и CH3). Аналогично, от N-до Сконца каждая легкая цепь имеет вариабельную область (VL), также называемую вариабельным легким доменом или вариабельным доменом легкой цепи, за которой следует константный домен легкой цепи (CL). Легкая цепь антитела может быть отнесена к одному из двух типов, называемых каппа (к) и лямбда (λ) на основе аминокислотной последовательности соответствующего константного домена.The concept of native antibodies refers to natural immunoglobulin molecules of various structures. For example, native IgG antibodies are approximately 150,000 dalton heterotetrameric glycoproteins consisting of two identical light chains and two identical heavy chains linked by a disulfide bond. From the N- to C-terminus, each heavy chain has a variable region (VH), also called a variable heavy domain or heavy chain variable domain, followed by three constant domains (CH1, CH2 and CH3). Likewise, from N- to C-terminus, each light chain has a variable region (VL), also called a variable light domain or light chain variable domain, followed by a light chain constant domain (CL). The light chain of an antibody can be classified into one of two types, called kappa (k) and lambda (λ), based on the amino acid sequence of the corresponding constant domain.
Понятие процент (%) идентичности аминокислотной последовательности по отношению к контрольной полипептидной последовательности определяют как процент аминокислотных остатков в последовательности-кандидате, которые идентичны аминокислотным остаткам в контрольной полипептидной последовательности, после выравнивания последовательностей и введения гэпов, если необходимо, для достижения максимального процента идентичности последовательностей, и без учета каких-либо консервативных замен как части идентичности последовательностей. Выравнивание для определения процента идентичности аминокислотной последовательности может быть достигнуто различными методами, которые известны специалистам в данной области, например, с использованием общедоступного компьютерного программного обеспечения, такого как BLAST, BLAST-2, ALIGN, Megalign (DNASTAR) или GENETYX (зарегистрированная торговая марка) (фирма Genetyx Co., Ltd.). Специалисты в данной области могут определить подходящие параметры для выравнивания последовательностей, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине сравниваемых последовательностей.The concept of percentage (%) of amino acid sequence identity with respect to a reference polypeptide sequence is defined as the percentage of amino acid residues in a candidate sequence that are identical to amino acid residues in the reference polypeptide sequence, after sequence alignment and introduction of gaps, if necessary, to achieve the maximum percentage of sequence identity, and without considering any conservative substitutions as part of sequence identity. Alignment to determine percent amino acid sequence identity can be achieved by various methods known to those skilled in the art, for example, using publicly available computer software such as BLAST, BLAST-2, ALIGN, Megalign (DNASTAR) or GENETYX (registered trademark) (Genetyx Co., Ltd.). Those skilled in the art can determine appropriate parameters for sequence alignment, including any algorithms necessary to achieve maximum alignment over the entire length of the sequences being compared.
Компьютерная программа для сравнения последовательностей ALIGN-2 была разработана фирмой Genentech, Inc., а исходный код был подан вместе с пользовательской документацией в Бюро регистрации авторских прав США, Вашингтон, округ Колумбия, 20559, где он зарегистрирован под номером регистрации авторских прав US TXU510087. Программа ALIGN-2 находится в открытом доступе от фирмы Genentech, Inc., Южный Сан-Франциско, Калифорния, или может быть скомпилирована из исходного кода. Программа ALIGN-2 может быть скомпилирована для использования в операционной системе UNIX, включая цифровую операционную систему UNIX V4.0D. Все параметры сравнения последовательностей задаются программой ALIGN-2 и не меняются. В ситуациях, когда ALIGN-2 используют для сравнения аминокислотных последовательностей, процент идентичности данной аминокислотной последовательности аминокислотной последовательности А с/против аминокислотной последовательности Б (которая альтернативно может быть сформулирована как данная аминокислота последовательность А, которая имеет или содержит определенный процент идентичности аминокисThe ALIGN-2 sequence alignment computer program was developed by Genentech, Inc., and the source code has been filed with user documentation at the United States Copyright Office, Washington, DC 20559, where it is registered under Copyright Number US TXU510087. The ALIGN-2 program is publicly available from Genentech, Inc., South San Francisco, California, or can be compiled from source code. ALIGN-2 can be compiled for use on UNIX operating systems, including UNIX Digital Operating System V4.0D. All sequence comparison parameters are set by the ALIGN-2 program and do not change. In situations where ALIGN-2 is used to compare amino acid sequences, the percentage identity of a given amino acid sequence to amino acid sequence A with/against amino acid sequence B (which can alternatively be stated as a given amino acid sequence A that has or contains a certain percentage of amino acid sequence identity
- 31 046075 лотной последовательности с данной аминокислотной последовательностью В, с ней или против нее) рассчитывают следующим образом:- 31 046075 lot sequence with, with or against a given amino acid sequence B) is calculated as follows:
100-кратная фракция X/Y, где X означает количество аминокислотных остатков, оцененных как идентичные совпадения программой выравнивания последовательностей ALIGN-2 при выравнивании А и Б этой программой, и где Y означает общее количество аминокислотных остатков в Б. Следует учитывать, что если длина аминокислотной последовательности А не равна длине аминокислотной последовательности Б, процент идентичности аминокислотной последовательности А к Б не будет равняться проценту идентичности аминокислотной последовательности Б к А. Если специально не указано иное, все значения процентов идентичности аминокислотной последовательности, используемые в настоящем изобретении, получены непосредственно по описанию в предшествующем абзаце, с использованием компьютерной программы ALIGN-2.100-fold X/Y fraction, where X is the number of amino acid residues scored as identical matches by the ALIGN-2 sequence alignment program when aligning A and B by that program, and where Y is the total number of amino acid residues in B. Note that if the length amino acid sequence A is not equal in length to amino acid sequence B, the percentage identity of the amino acid sequence A to B will not equal the percentage identity of the amino acid sequence B to A. Unless specifically stated otherwise, all percent amino acid sequence identity values used in the present invention are obtained directly from the description in the previous paragraph, using the ALIGN-2 computer program.
Понятие фармацевтический состав относится к препарату, который находится в такой форме, которая позволяет биологической активности содержащегося в нем активного ингредиента быть эффективной, и который не содержит дополнительных компонентов, которые являются неприемлемо токсичными для субъекта, которому состав будет введен.The term pharmaceutical composition refers to a preparation that is in a form that allows the biological activity of the active ingredient contained therein to be effective, and that does not contain additional components that are unacceptably toxic to the subject to whom the composition is to be administered.
Понятие фармацевтически приемлемый носитель относится к ингредиенту фармацевтического состава, отличному от активного ингредиента, который нетоксичен для субъекта. Фармацевтически приемлемый носитель включает, но ими не ограничивается, буфер, наполнитель, стабилизатор или консервант.The term pharmaceutically acceptable carrier refers to an ingredient of a pharmaceutical composition, other than the active ingredient, that is non-toxic to a subject. A pharmaceutically acceptable carrier includes, but is not limited to, a buffer, excipient, stabilizer or preservative.
Понятие эффективное количество агента, например фармацевтического состава, относится к количеству, эффективному в дозировках и в течение периодов времени, необходимых для достижения желаемого терапевтического или профилактического результата.The term effective amount of an agent, such as a pharmaceutical composition, refers to an amount effective in dosages and for periods of time necessary to achieve the desired therapeutic or prophylactic result.
Понятие индивидуум или субъект означает млекопитающее. Млекопитающие включают, но ими возможный перечень не ограничивают, домашних животных (например, коров, овец, кошек, собак и лошадей), приматов (например, людей и других приматов, таких как обезьяны), кроликов и грызунов (например, мышей и крысы). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения индивидом или субъектом является человек.The term individual or subject means a mammal. Mammals include, but are not limited to, domestic animals (e.g., cows, sheep, cats, dogs, and horses), primates (e.g., humans and other primates such as monkeys), rabbits, and rodents (e.g., mice and rats) . In some embodiments of the present invention, the individual or subject is a human.
В настоящем изобретении термин CD137 относится к любому природному CD137 от любого из позвоночных, включая млекопитающих, таких как приматы (люди) и грызуны (например, мыши и крысы), если не указано иное. Понятие охватывает необработанный CD137 полной длины, а также любую форму CD137, которая является результатом процессинга в клетке. Термин также включает встречающиеся в природе варианты CD137, например, варианты сплайсинга или аллельные варианты. Аминокислотная последовательность примера CD137 полной длины человека показана в SEQ ID NO: 1 (контрольная последовательность NCBI: NP_001552.2), а пример аминокислотной последовательности примера внеклеточного участка CD137 человека показана в SEQ ID NO: 2. Аминокислотная последовательность типичного CD137 полной длины мыши показана в SEQ ID NO: 3 (контрольная последовательность NCBI: NP_035742.1), аминокислотная последовательность типичного внеклеточного участка CD137 мыши показана в SEQ ID NO: 4. Аминокислотная последовательность примера CD137 полной длины обезьяны показана в SEQ ID NO: 5 (контрольная последовательность NCBI: ABY47575.1), аминокислотная последовательность примера внеклеточного участка CD137 обезьяны показана в SEQ ID NO: 6.As used herein, the term CD137 refers to any naturally occurring CD137 from any vertebrate, including mammals, such as primates (humans) and rodents (eg, mice and rats), unless otherwise noted. The term covers unprocessed full-length CD137 as well as any form of CD137 that results from cellular processing. The term also includes naturally occurring variants of CD137, such as splice variants or allelic variants. The amino acid sequence of exemplary human full-length CD137 is shown in SEQ ID NO: 1 (NCBI reference sequence: NP_001552.2), and the exemplary amino acid sequence of exemplary human CD137 extracellular region is shown in SEQ ID NO: 2. The amino acid sequence of exemplary full-length mouse CD137 is shown in SEQ ID NO: 3 (NCBI reference sequence: NP_035742.1), the amino acid sequence of an exemplary extracellular region of mouse CD137 is shown in SEQ ID NO: 4. The amino acid sequence of an example full-length monkey CD137 is shown in SEQ ID NO: 5 (NCBI reference sequence: ABY47575 .1), the amino acid sequence of an example extracellular region of monkey CD137 is shown in SEQ ID NO: 6.
CD137 является представителем семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNF). Его также обозначают как представитель 9 надсемейства рецепторов фактора некроза (TNFRSF9, tumor necrosis factor receptor superfamily member 9), 4-1BB и ILA. В дополнение к экспрессии на активированных CD4' и CD8+ Т-клетках, CD137 экспрессируется в В-клетках, дендритных клетках, природный клеткахкиллерах (NK) и NK-T-клетках, макрофагах, моноцитах, нейтрофилах, CD4+ CD25+ регуляторных Тклетках и эндотелиальных клетках сосудов. Экспрессия в опухолевых клетках также описана (Labiano с соавт. Oncoimmunology, 24, 2015, e1062967). Природный лиганд CD137, CD137L, представлен антигенпрезентирующими клетками, такими как В-клетки, моноциты/макрофаги и дендритные клетки (Watts с соавт., Annu. Rev. Immunol., 23, 2005, 23-68). Благодаря взаимодействию с лигандом, CD137 вызывает увеличение TCR-индуцированной пролиферации Т-клеток, выработку цитокинов, функциональное созревание, подавление апоптоза и длительное выживание CD8+ Т-клеток (Nam с соавт., Curr. Cancer Drug Targets, 5, 2005, 357-363; Watts, с соавт., Annu. Rev. Immunol., 23, 2005, 23-68).CD137 is a member of the tumor necrosis factor (TNF) receptor family. It is also designated as tumor necrosis factor receptor superfamily member 9 (TNFRSF9), 4-1BB and ILA. In addition to expression on activated CD4' and CD8+ T cells, CD137 is expressed on B cells, dendritic cells, natural killer (NK) cells and NK T cells, macrophages, monocytes, neutrophils, CD4 + CD25+ regulatory T cells, and endothelial cells vessels. Expression in tumor cells has also been described (Labiano et al. Oncoimmunology, 24, 2015, e1062967). The natural ligand of CD137, CD137L, is presented by antigen presenting cells such as B cells, monocytes/macrophages and dendritic cells (Watts et al., Annu. Rev. Immunol., 23, 2005, 23-68). Through ligand interaction, CD137 causes an increase in TCR-induced T cell proliferation, cytokine production, functional maturation, suppression of apoptosis, and long-term survival of CD8+ T cells (Nam et al., Curr. Cancer Drug Targets, 5, 2005, 357-363 ; Watts, et al., Annu. Rev. Immunol., 23, 2005, 23-68).
Термины карцинома, рак и злокачественный относятся или описывают физиологическое состояние у млекопитающих, которое обычно характеризуется нерегулируемым ростом/пролиферацией клеток.The terms carcinoma, cancer, and malignant refer to or describe a physiological condition in mammals that is typically characterized by unregulated cell growth/proliferation.
Термин опухоль относится ко всем неопластическим клеткам роста и пролиферации, злокачественным или доброкачественным, и ко всем предраковым и злокачественным клеткам и тканям. Термины карцинома, рак, злокачественный, нарушение пролиферации клеток, пролиферативное расстройство и опухоль не являются взаимоисключающими в контексте настоящего изобретения.The term tumor refers to all neoplastic cells of growth and proliferation, malignant or benign, and to all precancerous and malignant cells and tissues. The terms carcinoma, cancer, malignant, cell proliferation disorder, proliferative disorder and tumor are not mutually exclusive in the context of the present invention.
Понятия нарушение пролиферации клеток и пролиферативное расстройство относятся к нарушениям, которые связаны с некоторой степенью аномальной пролиферации клеток. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения нарушение пролиферации клеток представляет собой рак. В одном из вариThe terms cell proliferation disorder and proliferative disorder refer to disorders that involve some degree of abnormal cell proliferation. In one embodiment of the present invention, the cell proliferation disorder is cancer. In one of the
- 32 046075 антов осуществления настоящего изобретения пролиферативное расстройство является раком.- 32 046075 ants of the present invention, the proliferative disorder is cancer.
В контексте настоящего изобретения понятие лечение (и его грамматические вариации, такие как лечить) относится к клиническому вмешательству в попытке изменить состояние индивида, и может проводиться либо для профилактики, либо в ходе происходящей клинической патологии. Желательные эффекты лечения включают, но не ограничиваются ими, предотвращение возникновения или рецидива заболевания, облегчение симптомов, уменьшение любых прямых или косвенных патологических последствий заболевания, предотвращение метастазирования, снижение скорости прогрессирования заболевания, улучшение или паллиативное улучшение болезненного состояния и ремиссия или улучшенный прогноз. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антитела по настоящему изобретению применяют для отсрочки развития заболевания или медленного прогрессирования заболевания.In the context of the present invention, the concept of treatment (and its grammatical variations such as treat) refers to a clinical intervention in an attempt to change the condition of an individual, and can be carried out either for prevention or during the course of ongoing clinical pathology. Desirable effects of treatment include, but are not limited to, prevention of onset or recurrence of disease, relief of symptoms, reduction of any direct or indirect pathological consequences of the disease, prevention of metastasis, reduction in the rate of disease progression, improvement or palliation of disease state, and remission or improved prognosis. In some embodiments, the antibodies of the present invention are used to delay the onset of a disease or slow the progression of a disease.
II. Композиции и методы (анти-CD137 агонистические антигенсвязывающие молекулы).II. Compositions and methods (anti-CD137 agonistic antigen-binding molecules).
В одном из вариантов осуществления настоящее изобретение частично основано на анти-CD137 агонистических антигенсвязывающих молекулах и на их применениях. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антитела, которые связываются с CD137. Антитела в настоящем изобретении могут проявлять активирующее действие на иммунные клетки, цитотоксичность или противоопухолевую активность и, следовательно, полезны, например, для диагностики или лечения рака.In one embodiment, the present invention is based in part on anti-CD137 agonistic antigen-binding molecules and their uses. In some embodiments, the present invention provides antibodies that bind to CD137. The antibodies of the present invention may exhibit immune cell activating effects, cytotoxicity, or antitumor activity and are therefore useful, for example, in the diagnosis or treatment of cancer.
А. Типичные анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела.A. Typical anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают выделенные антигенсвязывающие молекулы или антитела, которые связываются с CD137. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела обладают CD137-связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения;In one embodiment, the present invention provides isolated antigen-binding molecules or antibodies that bind to CD137. In some embodiments of the present invention, anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies have CD137-binding activity dependent on a small molecule compound;
связываются с внеклеточной областью CD137;bind to the extracellular region of CD137;
образуют тройной комплекс вместе с низкомолекулярным соединением и CD137;form a ternary complex together with a low molecular weight compound and CD137;
связываются с происходящим от человека CD137 и с происходящим от обезьяны CD137;bind to human-derived CD137 and monkey-derived CD137;
являются агонистами по отношению к активности CD137;are agonists in relation to the activity of CD137;
проявляют агонистическую активность по отношению к CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения;exhibit agonistic activity towards CD137 in the presence of a low molecular weight compound;
обладают низкой агонистической активностью к CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения; и/или практически не проявляют агонистической активности по отношению к CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения.have low agonistic activity towards CD137 in the absence of a small molecule compound; and/or exhibit virtually no CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
Связывающая активность антигенсвязывающих молекул или антител В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения связывающая активность антигенсвязывающих молекул или антител по настоящему изобретению в присутствии низкомолекулярного соединения обладает константой диссоциации (KD) 1 мкМ или менее, 100 нМ или менее, 10 нМ или менее, 1 нМ или менее, 0,1 нМ или менее, 0,01 нМ или менее или 0,001 нМ или менее (например, 10-6 М или менее, 10-7 М или менее, 10-8 М или менее, 10-9 М или менее, 10-10 М или менее, например от 10-6 М до 10-10 М, от 10-7 М до 10-9 М, например от 10-7 М до 10-8 М).Binding Activity of Antigen-Binding Molecules or Antibodies In some embodiments of the present invention, the binding activity of antigen-binding molecules or antibodies of the present invention in the presence of a small molecule compound has a dissociation constant (KD) of 1 μM or less, 100 nM or less, 10 nM or less, 1 nM or less , 0.1 nM or less, 0.01 nM or less, or 0.001 nM or less (for example, 10 -6 M or less, 10 -7 M or less, 10 -8 M or less, 10 -9 M or less, 10 -10 M or less, for example from 10 -6 M to 10 -10 M, from 10 -7 M to 10 -9 M, for example from 10 -7 M to 10 -8 M).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающую активность антигенсвязывающих молекул или антител измеряют с помощью радиоиммуноанализа (RIA) с применением антигена с радиоактивной меткой и выражают в виде KD. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения осуществляют RIA с версией Fab исследуемого антитела и его антигена. Например, аффинность раствора Fab с антигеном измеряют путем уравновешивания Fab с минимальной концентрацией (|25[)-меченого антигена в присутствии серии титрований немеченого антигена с последующим улавливанием связанного антигена с помощью планшета, покрытого анти-Fab антителами (см., например, Chen с соавт., J. Mol. Biol. 293, 1999, 865-881). Чтобы установить условия для анализа MICROTITER (зарегистрированная торговая марка) многолуночные планшеты (фирма Thermo Scientific) в течение ночи покрывают 5 мкг/мл захватывающего анти-Fab антитела (фирма Cappel Labs) в 50 мМ карбонате натрия (рН 9,6) и затем блокируют 2% (масса/объем) раствором бычьего сывороточного альбумина в ФСБ в течение от двух до пяти часов при комнатной температуре (примерно 23°C). В планшете без адсорбента (фирма Nunc, номер в каталоге 269620), 100 пМ или 26 пМ [125[|-антигена смешивают с серийными разведениями исследуемого фрагмента Fab (например, соответствует оценке анти-VEGF антитела, Fab-12, в публикации Presta с соавт., Cancer Res. 57, 1997, 4593-4599). Исследуемый Fab затем инкубируют в течение ночи; однако инкубирование может длиться дольше (например, примерно 65 ч), чтобы убедиться, что реакция равновесия достигнута. После этого смеси переносят в планшет с захватом для инкубации при комнатной температуре (например, в течение 1 ч). Затем раствор удаляют и планшет промывают восемь раз 0,1% полисорбатом 20 (TWEEN-20 (торговая марка)) в СФБ. После того, как планшеты высохнут, добавляют 150 мкл/лунку сцинтиллятора (MICROSCINT-20 ТМ; фирма Packard) и излучение с планшетов подсчитывают на гамма-счетчике TOPCOUNT ТМ (фирма Packard) в течение десяти мин. Концентрации каждого Fab, которые проявляют показатели менее или равные 20% максимального связывания, выбирают для использования в анализах конкурентного связывания.In one embodiment of the present invention, the binding activity of antigen-binding molecules or antibodies is measured using a radioimmunoassay (RIA) using a radiolabeled antigen and is expressed as KD. In one embodiment of the present invention, an RIA is performed with a Fab version of the test antibody and its antigen. For example, the affinity of a Fab solution for an antigen is measured by equilibrating the Fab with a minimal concentration of ( |25 [)-labeled antigen in the presence of a series of titrations of unlabeled antigen, followed by capture of the bound antigen using a plate coated with anti-Fab antibodies (see, for example, Chen et al. et al., J Mol Biol 293, 1999, 865-881). To establish conditions for the MICROTITER (registered trademark) assay, multiwell plates (Thermo Scientific) are coated overnight with 5 μg/ml anti-Fab capture antibody (Capel Labs) in 50 mM sodium carbonate (pH 9.6) and then blocked 2% (w/v) bovine serum albumin solution in PBS for two to five hours at room temperature (approximately 23°C). In a non-adsorbent plate (Nunc, catalog number 269620), 100 pM or 26 pM [ 12 5[|-antigen is mixed with serial dilutions of the Fab fragment of interest (for example, corresponds to the evaluation of the anti-VEGF antibody, Fab-12, in the publication Presta et al., Cancer Res. 57, 1997, 4593-4599). The Fab to be tested is then incubated overnight; however, incubation may be longer (eg, approximately 65 hours) to ensure that equilibrium reaction is achieved. The mixtures are then transferred to a gripper plate for incubation at room temperature (eg, 1 hour). The solution is then removed and the plate is washed eight times with 0.1% polysorbate 20 (TWEEN-20 (trade name)) in SFB. After the plates are dry, 150 μl/well of scintillator (MICROSCINT-20™; Packard) is added and the emission from the plates is counted on a TOPCOUNT™ gamma counter (Packard) for ten minutes. Concentrations of each Fab that exhibit rates less than or equal to 20% of maximum binding are selected for use in competitive binding assays.
- 33 046075- 33 046075
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения для измерения связывающей активности антитела применяют методы захвата лиганда, например, используя BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200 или BIACORE (зарегистрированная торговая марка) 4000 (фирма GE Healthcare, Уппсала, Швеция), которые основаны на методах анализа поверхностного плазмонного резонанса в качестве принципа измерения. Контролирующее программное обеспечение BIACORE (зарегистрированная торговая марка) используют для работы устройств. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения используют набор для связывания аминов (фирма GE Healthcare, Уписала, Швеция), руководствуясь инструкциями производителя, чтобы молекула для захвата лиганда, например, антитело против метки, антитело против IgG, белка А и т.д., фиксировалась на сенсорном чипе (фирма GE Healthcare, Уппсала, Швеция), покрытом карбоксиметилдекстраном. Захватывающую лиганд молекулу разбавляют 10 мМ раствором ацетата натрия при соответствующем рН и вводят с соответствующей скоростью потока в течение соответствующего времени инъекции. Измерения связывающей активности осуществляют с использованием буфера, содержащего 0,05% полисорбат 20 (другое название - Tween-20 (зарегистрированная торговая марка)), в качестве буфера для измерений при скорости потока 10-30 микролитров в минуту, при измерении температуру предпочтительно поддерживают на уровне 25°C или 37°C . Для измерения, проводимого с антигеном и/или рецептором Fc, захваченным лиганд-связывающей молекулой в качестве лиганда, вводят инъекцией антиген и/или рецептор Fc, чтобы позволить захватить их целевое количество, а затем вводят инъекцией серийное разведение антитела (исследуемого соединения), приготовленное с использованием буфера для измерения.In one embodiment of the present invention, ligand capture methods are used to measure the binding activity of an antibody, for example, using BIACORE (registered trademark) T200 or BIACORE (registered trademark) 4000 (GE Healthcare, Uppsala, Sweden), which are based on assay methods surface plasmon resonance as the measurement principle. Control software BIACORE (registered trademark) is used to operate the devices. In one embodiment of the present invention, an amine coupling kit (GE Healthcare, Upisal, Sweden) is used, following the manufacturer's instructions, to ensure that the ligand capture molecule, e.g. anti-tag antibody, anti-IgG antibody, protein A, etc., is used. was recorded on a sensor chip (GE Healthcare, Uppsala, Sweden) coated with carboxymethyldextran. The ligand-capturing molecule is diluted with 10 mM sodium acetate at the appropriate pH and injected at the appropriate flow rate for the appropriate injection time. Binding activity measurements are carried out using a buffer containing 0.05% polysorbate 20 (also known as Tween-20 (registered trademark)) as the measurement buffer at a flow rate of 10-30 microliters per minute, with the measurement temperature preferably maintained at level 25°C or 37°C. For a measurement made with an antigen and/or Fc receptor captured by a ligand-binding molecule as a ligand, the antigen and/or Fc receptor is injected to allow the target amount to be captured, and then a serial dilution of the antibody (test compound) prepared is injected using a measurement buffer.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения результаты измерений анализируют с использованием программного обеспечения BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Evaluation Software. Расчет параметров кинетики выполняется путем подбора сенсограмм ассоциации и диссоциации одновременно с использованием модели связывания 1:1 и скорости ассоциации (kon или ka), скорости диссоциации (koff или kd) и константы равновесной диссоциации (KD) могут быть рассчитаны. При слабой связывающей активности, в частности, для случаев, когда диссоциация является быстрой и параметры кинетики трудно вычислить, модель стационарного состояния может использоваться для расчета константы равновесной диссоциации (KD). В качестве дополнительных параметров, касающихся связывающей активности, количество связывающего исследуемого соединения на единицу количества лиганда можно рассчитать путем деления связывающего количества исследуемого соединения (резонансная единица: RU (resonance unit)) в конкретной концентрации на количество захваченного лиганда.In one embodiment of the present invention, the measurement results are analyzed using BIACORE (registered trademark) Evaluation Software. Calculation of kinetic parameters is performed by fitting association and dissociation sensorgrams simultaneously using a 1:1 binding model and the association rate (kon or ka), dissociation rate (koff or kd) and equilibrium dissociation constant (KD) can be calculated. For weak binding activity, particularly for cases where dissociation is rapid and kinetic parameters are difficult to calculate, a steady state model can be used to calculate the equilibrium dissociation constant (KD). As additional parameters regarding binding activity, the amount of binding test compound per unit amount of ligand can be calculated by dividing the binding amount of test compound (resonance unit: RU) at a particular concentration by the amount of ligand captured.
Связывающая активность, зависящая от низкомолекулярного соединения.Small molecule dependent binding activity.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело обладает зависимой от низкомолекулярных соединений CD137-связывающей активностью. В одном варианте осуществления настоящего изобретения, не ограничивающего его области охвата, антигенсвязывающая молекула или анти-CD137 антитело имеет более высокую связывающую активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения по сравнению со связывающей активностью в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело обладает повышенной связывающей активностью с CD137 в присутствии высокой концентрации низкомолекулярного соединения по сравнению с CD137-связывающей активностью в присутствии низкомолекулярного соединения при низкой концентрации. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения больше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 15 раз или более, в 20 раз или более, в 25 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, кратно 1х 103 или более, кратно 2х 103 или более, кратно 3х 103 или более, кратно 5х103 или более, кратно 1х104 или более, кратно 2х104 или более, кратно 3х104 или более, кратно 5х104 или более или кратно 1х 105 или более по сравнению со связывающей активностью в отсутствие низкомолекулярного соединения. В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения больше чем в 2 раза, больше чем в 3 раза, больше чем в 5 раз, больше чем в 10 раз, больше чем в 15 раз, больше чем в 20 раз, больше чем в 25 раз, больше чем в 30 раз, больше чем в 50 раз, больше чем в 100 раз, больше чем в 200 раз, больше чем в 300 раз, больше чем в 500 раз, больше чем в 1000 раз, больше чем в 2000 раз, больше чем в 3000 раз, больше чем в 5000 раз, больше чем в 10000 раз, больше чем в 20000 раз, больше чем в 30000 раз, больше чем в 50000 раз или больше чем в 100000 раз по сравнению со связывающей активностью в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody has small molecule dependent CD137 binding activity. In one non-limiting embodiment of the present invention, the antigen binding molecule or anti-CD137 antibody has higher binding activity for CD137 in the presence of the small molecule compound compared to binding activity for CD137 in the absence of the small molecule compound. In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody has increased binding activity to CD137 in the presence of a high concentration of a small molecule compound compared to CD137 binding activity in the presence of a small molecule compound at a low concentration. In one preferred embodiment of the present invention, the binding activity of the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody to CD137 in the presence of a small molecule compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 15 times or more, 20 times or more, 25 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 100 times or more, 200 times or more, 300 times or more, 500 times or more more, multiple of 1x 10 3 or more, multiple of 2x 10 3 or more, multiple of 3x 10 3 or more, multiple of 5x10 3 or more, multiple of 1x10 4 or more, multiple of 2x10 4 or more, multiple of 3x10 4 or more, multiple of 5x10 4 or more or a multiple of 1x 10 5 or more compared to the binding activity in the absence of the low molecular weight compound. In another preferred embodiment of the present invention, the binding activity of the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody to CD137 in the presence of a small molecule compound is greater than 2-fold, greater than 3-fold, greater than 5-fold, greater than 10-fold, greater than 15 times, more than 20 times, more than 25 times, more than 30 times, more than 50 times, more than 100 times, more than 200 times, more than 300 times, more than 500 times , more than 1000 times, more than 2000 times, more than 3000 times, more than 5000 times, more than 10000 times, more than 20000 times, more than 30000 times, more than 50000 times or more than 100,000 times the binding activity in the absence of the low molecular weight compound.
Концентрация низкомолекулярного соединения может быть любой произвольной концентрацией при условии, что обнаруживается различие в связывающей активности анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения концентрация низкомолекулярного соединения в присутствии низкомолекулярного соединения и/или в присутствииThe concentration of the small molecule compound can be any arbitrary concentration as long as a difference in the binding activity of the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is detected. In one embodiment of the present invention, the concentration of the low molecular weight compound in the presence of the low molecular weight compound and/or in the presence of
- 34 046075 высокой концентрации низкомолекулярного соединения составляет, например, 100 нМ или более, 500 нМ или более, 1 мкМ или более, 3 мкМ или более, 5 мкМ или более, 10 мкМ или более, 50 мкМ или более, 100 мкМ или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более, 250 мкМ или более, 300 мкМ или более, 400 мкМ или более, 500 мкМ или более или 1 мМ или более. В другом варианте концентрация может быть определена как количество, достаточное для анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, чтобы продемонстрировать максимальную связывающую активность. Кроме того, в одном из вариантов осуществления настоящего изобретения концентрация низкомолекулярного соединения в присутствии низкой концентрации низкомолекулярного соединения может составлять, например, 500 мкМ или менее, 250 мкМ или менее, 200 мкМ или менее, 150 мкМ или менее, 100 мкМ или менее, 50 мкМ или менее, 10 мкМ или менее, 1 мкМ или менее, 500 нМ или менее, 100 нМ или менее, 50 нМ или менее, или 10 нМ или 1 нМ или менее. Случай, когда концентрация низкомолекулярного соединения равна нулю, или реальная концентрация равна нулю, также может быть выбран в качестве варианта осуществления настоящего изобретения при низкой концентрации.- 34 046075 high concentration of a low molecular weight compound is, for example, 100 nM or more, 500 nM or more, 1 μM or more, 3 μM or more, 5 μM or more, 10 μM or more, 50 μM or more, 100 μM or more , 150 μM or more, 200 μM or more, 250 μM or more, 300 μM or more, 400 μM or more, 500 μM or more, or 1 mM or more. Alternatively, the concentration may be defined as an amount sufficient for the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody to exhibit maximum binding activity. Additionally, in one embodiment of the present invention, the concentration of the small molecule compound in the presence of the low concentration of the small molecule compound may be, for example, 500 μM or less, 250 μM or less, 200 μM or less, 150 μM or less, 100 μM or less, 50 µM or less, 10 µM or less, 1 µM or less, 500 nM or less, 100 nM or less, 50 nM or less, or 10 nM or 1 nM or less. The case where the concentration of the low molecular weight compound is zero, or the actual concentration is zero, can also be selected as a low concentration embodiment of the present invention.
В настоящем изобретении термин реальная концентрация равна нулю означает, например, концентрацию, которая настолько мала, что ее нельзя обнаружить с помощью современных технологий, хотя низкомолекулярное соединение присутствует.In the present invention, the term real concentration equal to zero means, for example, a concentration that is so small that it cannot be detected using current technology, although the low molecular weight compound is present.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ больше в 2 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 15 раз или более, в 16 раз или более, в 17 раз или более, в 18 раз или более, в 19 раз или более, в 20 раз или более, по сравнению со связывающей активностью в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, the CD137 binding activity in the presence of a small molecule compound at a concentration of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM, or 250 μM is 2-fold or greater, 5-fold or greater, 10-fold. times or more, 15 times or more, 16 times or more, 17 times or more, 18 times or more, 19 times or more, 20 times or more, compared to CD137 binding activity in the absence of low molecular weight compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность антиCD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ или более больше в 2 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 15 раз или более, в 16 раз или более, в 17 раз или более, в 18 раз или более, в 19 раз или более, в 20 раз или более по сравнению со связывающей активностью в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 100 мкМ или более больше в 2 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 15 раз или более, в 16 раз или более, в 17 раз или более, в 18 раз или более, в 19 раз или более, в 20 раз или более по сравнению со связывающей активностью в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, the binding activity of the anti-CD137 antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody in the presence of a small molecule compound at a concentration of 10 μM or more is 2-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 15-fold or more , 16 times or more, 17 times or more, 18 times or more, 19 times or more, 20 times or more compared to CD137 binding activity in the absence of the small molecule compound. In one embodiment of the present invention, the binding activity of the anti-CD137 antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody in the presence of a small molecule compound at a concentration of 100 μM or more is 2-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 15-fold or more, 16 times or more, 17 times or more, 18 times or more, 19 times or more, 20 times or more compared to CD137 binding activity in the absence of the small molecule compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность (KD) антиCD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в количестве 10 мкМ или более является константой диссоциации (KD) равной 9х107 М или менее, 8х10-7 М или менее, 7х10-7 М или менее, 6х10-7 М или менее, 5х10-7 М или менее, или 4х10-7 М или менее, или, предпочтительно, константой диссоциации (KD) равной 5х10-7 М или менее. В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность (KD) анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения слишком большая, чтобы ее можно было подсчитать с помощью Biacore (слабая связывающая активность), или это константа диссоциации (KD) 1 х 10-7 М или более, 5х10-7 М или более, 7х10-7 М или более, 8х10-7 М или более, 9х10-7 М или более, 1 х 10-6 М или более, 2х10-6 М или более, 3х10-6 М или более, или 4х10-6 М или более, или предпочтительно, константа диссоциации (KD) 1х 10-6 М или более. В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность (KD) анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в количестве 100 мкМ или более составляет 9х10-7 М или менее, 8х10-7 М или менее, 7х10-7 М или менее, 6х 10-7 М или менее, 5х 10-7 М или менее, 4х 10-7 М или менее, 3х 10-7 М или менее, 2х 10-7 М или менее, или 1х10-7 М или менее, или предпочтительно, константа диссоциации (KD) составляет 2х10-7 М или менее. В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность (KD) анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения слишком велика для расчета с помощью Biacore (слабая связывающая активность), или представляет собой константу диссоциации (KD) 1х10-7 М или более, 5х10-7 М или более, 7х10-7 М или более, 8х10-7 М или более, 9х10-7 М или более, 1х 10-6 М или более, 2х10-6 М или более, 3х 10-6 М или более, или 4х 10-6 М или более, или предпочтительно, константа диссоциации (KD) 1х 10-6 М или более.In one embodiment of the present invention, the binding activity (KD) of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody against CD137 in the presence of a small molecule compound in an amount of 10 μM or more has a dissociation constant (KD) of 9 x 10 7 M or less, 8 x 10 -7 M or less, 7x10 -7 M or less, 6x10 -7 M or less, 5x10 -7 M or less, or 4x10 -7 M or less, or preferably a dissociation constant (KD) of 5x10 -7 M or less. In another embodiment of the present invention, the binding activity (KD) of an anti-CD137 antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody in the absence of a small molecule compound is too large to be calculated using Biacore (weak binding activity), or it has a dissociation constant (KD) of 1 x 10 -7 M or more, 5x10 -7 M or more, 7x10 -7 M or more, 8x10 -7 M or more, 9x10 -7 M or more, 1 x 10 -6 M or more, 2x10 -6 M or more than 3x10 -6 M or more, or 4x10 -6 M or more, or preferably a dissociation constant (KD) of 1x 10 -6 M or more. In another embodiment of the present invention, the binding activity (KD) of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody to CD137 in the presence of a small molecule compound in an amount of 100 μM or more is 9x10 -7 M or less, 8x10 -7 M or less, 7x10 -7 M or less, 6x 10 -7 M or less, 5x 10 -7 M or less, 4x 10 -7 M or less, 3x 10 -7 M or less, 2x 10 -7 M or less, or 1x10 -7 M or less , or preferably, the dissociation constant (KD) is 2x10 -7 M or less. In another embodiment of the present invention, the binding activity (KD) of an anti-CD137 antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody in the absence of a small molecule compound is too high to be calculated using Biacore (weak binding activity), or is a dissociation constant (KD) of 1x10 -7 M or more, 5x10 -7 M or more, 7x10 -7 M or more, 8x10 -7 M or more, 9x10 -7 M or more, 1x 10 -6 M or more, 2x10 -6 M or more, 3x 10 -6 M or more, or 4x 10 -6 M or more, or preferably, dissociation constant (KD) 1x 10 -6 M or more.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность (KD) антиCD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в количестве 10 мкМ или более представляет собой константу диссоциации (KD) 8х10-8 М или менее, и связывающая активность (KD) по отношению к CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения слишком велика, чтобы ее можно было рассчитать с помощью Biacore (слабая свяIn one embodiment of the present invention, the binding activity (KD) of an anti-CD137 antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody in the presence of a small molecule compound in an amount of 10 μM or more is a dissociation constant (KD) of 8x10 -8 M or less, and a binding activity (KD) relative to CD137 in the absence of a small molecule compound is too large to be calculated using Biacore (weak binding
- 35 046075 зывающая активность). В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность (KD) анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в количестве 100 мкМ представляет собой константу диссоциации (KD) 2х10-8 М или менее, и связывающая активность по отношению к CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения слишком велика, чтобы ее можно было рассчитать с помощью Biacore (слабая связывающая активность).- 35 046075 calling activity). In another embodiment of the present invention, the binding activity (KD) of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody against CD137 in the presence of a small molecule compound in an amount of 100 μM is a dissociation constant (KD) of 2x10 -8 M or less, and binding activity against CD137 in the absence of the small molecule compound is too large to be calculated using Biacore (weak binding activity).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, у которого значение [связывающей активности (связывающей величины) по отношению к CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ или более]/[связывающую активность (связывающее количество) по отношению к CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения)] такое же или больше, чем значение для контрольной антиCD137 антигенсвязывающую молекулы. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, у которого значение [связывающая активность (количество связывания) в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения при 100 мкМ или более]/[связывающая активность (количество связывания) в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения)] такое же или больше, чем значение контрольной анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы. В любом из приведенных выше вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула может быть выбрана из hhtu-CD137 антител, содержащих HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющих такие же аминокислотные последовательности, что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 или А549/В167, описанных в табл. 17.In one embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody having a value of [binding activity (binding amount) to CD137 in the presence of a small molecule compound at a concentration of 10 μM or more]/[binding activity (binding amount) by relative to CD137 in the absence of the small molecule compound)] is the same as or greater than the value for the control anti-CD137 antigen-binding molecule. In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody having a value of [binding activity (amount of binding) for CD137 in the presence of a small molecule compound at 100 μM or more]/[binding activity (amount of binding) for CD137 in absence of small molecule compound)] is the same as or greater than the value of the control anti-CD137 antigen-binding molecule. In any of the above embodiments of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule can be selected from hhtu-CD137 antibodies containing HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having same amino acid sequences as HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487 /B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 or A549/B167, described in table. 17.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула представляет собой антитело, содержащее аминокислотные последовательности А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 или А549/В167, описанные в табл. 17 в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой анmи-CD137 антитело, включающее HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющие такие же аминокислотные последовательности, что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А375/В167. В другом варианте осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула представляет собой анmи-CD137 антитело, содержащее А375/В167 в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой анmи-CD137 антитело, содержащее HVRH1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющие такие же аминокислотные последовательности, что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А551/В379. В другом варианте осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула представляет собой анти-CD137 антитело, содержащее А551/В379 в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула содержит константные области тяжелой и легкой цепей человеческого происхождения (например, G1T3 (SEQ ID NO: 138) в качестве константной области тяжелой цепи, λ-цепи человека Lamlib (SEQ ID NO: 63) в качестве константной области легкой цепи).In one embodiment of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule is an antibody comprising the amino acid sequences A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/ B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 or A549/B167, described in table. 17 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In a preferred embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having the same amino acid sequences as HVR -H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A375/B167. In another embodiment of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising A375/B167 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In another preferred embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising HVRH1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having the same amino acid sequences as HVR-L3. H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A551/B379. In another embodiment of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising A551/B379 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In a preferred embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule contains heavy and light chain constant regions of human origin (e.g., G1T3 (SEQ ID NO: 138) as the heavy chain constant region, human Lamlib λ chain (SEQ ID NO: 63) as light chain constant region).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, у которого связывающая активность (связанное количество) в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения такое же или ниже связывающей активности контрольной анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы, а также, связывающая активность (связанное количество) в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ или более равно или более чем связывающая активность контрольной анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы в отношении CD137 в тех же условиях. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анmи-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, у которого связывающая активность в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения такое же или меньше связывающей активности контрольного анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы, а также, связывающая активность (связанное количество) в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ или более равно или более чем связывающая активность (связанное количество) контрольной анти-CD137 связывающей активности в отношении CD137 в тех же условиях. В любом из приведенных выше вариантах осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула может быть выбрана из анти-CD137 антител, содержащих HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющие те же аминокислотныеIn one embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody that has a binding activity (bound amount) for CD137 in the absence of a small molecule compound that is the same as or lower than the binding activity of a control anti-CD137 antigen binding molecule, as well as binding activity ( bound amount) to CD137 in the presence of a small molecule compound at a concentration of 10 μM or more is equal to or greater than the binding activity of a control anti-CD137 antigen-binding molecule to CD137 under the same conditions. In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody that has binding activity for CD137 in the absence of a small molecule compound that is the same as or less than the binding activity of a control anti-CD137 antigen-binding molecule, and also has binding activity (bound amount) for CD137 in the presence of a small molecule compound at a concentration of 10 μM or more is equal to or more than the binding activity (bound amount) of control anti-CD137 binding activity to CD137 under the same conditions. In any of the above embodiments of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule can be selected from anti-CD137 antibodies comprising HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having the same amino acids
- 36 046075 последовательности, что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 или А549/В167, описанных в табл. 17.- 36 046075 sequences as HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487 /B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 or A549/B167, described in table. 17.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула является анти-CD137 антителом, содержащим аминокислотную последовательность А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 или А549/В167, описанных в табл. 17 в виде комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула является анти-CD137 антителом, содержащим области HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVRL2 и HVR-L3, имеющие те же аминокислотные последовательности, что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А375/В167. В другом варианте осуществления настоящего изобретения контрольная анmи-CD137 антигенсвязывающая молекула является анти-CD137 антителом, содержащим А375/В167 в виде комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула является анти-CD137 антителом, содержащим HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющие те же аминокислотные последовательности, что и HVR-H1, HVRH2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А551/В379. В другом варианте осуществления настоящего изобретения контрольная анти-CD137 антигенсвязывающая молекула является антиCD137 антителом, содержащим А551/В379 в виде комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула содержит константные области тяжелой и легкой цепей, происходящих от человека (например, G1T3 (SEQ ID NO: 138) как константная область тяжелой цепи, λ цепь Lamlib человека (SEQ ID NO: 63) как константная область легкой цепи.In one embodiment of the present invention, the control anti-CD137 antigen-binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising the amino acid sequence A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 or A549/B167, described in table. 17 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In another preferred embodiment of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising the HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVRL2 and HVR-L3 regions having the same amino acid sequences as and HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A375/B167. In another embodiment of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising A375/B167 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In a preferred embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having the same amino acid sequences as HVR-L3. H1, HVRH2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A551/B379. In another embodiment of the present invention, the control anti-CD137 antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising A551/B379 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In a preferred embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule contains human-derived heavy and light chain constant regions (e.g., G1T3 (SEQ ID NO: 138) as the heavy chain constant region, human Lamlib λ chain (SEQ ID NO: 63) as the constant region light chain region.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, у которого значение [связывающей активности (KD) по отношению к CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 1 мкМ]/[связывающей активности (KD) по отношению к CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ или более] такое же или больше, чем значение для контрольной анти-CD137 антигенсвязывающую молекулы. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают антиCD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, у которого значение [связывающей активности (KD) по отношению к CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 1 мкМ]/[связывающей активности (KD) по отношению к CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 100 мкМ или более] такое же или больше, чем значение для контрольной антигенсвязывающую молекулы. В любом из приведенных выше вариантах осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула может быть выбрана из анти-CD137 антител, содержащих HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющих такие же аминокислотные последовательности что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 или А549/В167, описанных в табл. 17.In one embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody having a value of [binding activity (KD) for CD137 in the presence of a small molecule compound at a concentration of 1 μM]/[binding activity (KD) for CD137 at presence of a small molecule compound at a concentration of 10 μM or more] is the same or greater than the value for the control anti-CD137 antigen-binding molecule. In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody having a value of [binding activity (KD) for CD137 in the presence of a small molecule compound at a concentration of 1 μM]/[binding activity (KD) for CD137 in the presence of a small molecule compound at a concentration of 100 μM or more] is the same or greater than the value for the control antigen-binding molecule. In any of the above embodiments of the present invention, the control antigen binding molecule can be selected from anti-CD137 antibodies containing HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having the same amino acid sequences as HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488 /B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 or A549/B167, described in table. 17.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольной антигенсвязывающей молекулой является антитело, включающее аминокислотную последовательность А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 или А549/В167, описанные в табл. 17, в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольной антигенсвязывающей молекулой является антитело, включающее HVR-H1, HVR- H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющих такие же аминокислотные последовательности что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А375/В167. В другом варианте осуществления настоящего изобретения контрольной антигенсвязывающей молекулой является антитело, включающее А375/В167 в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В другом варианте осуществления настоящего изобретения контрольной антигенсвязывающей молекулой является антитело, включающее HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющие ту же аминокислотную последовательность, что и HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-Ll, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А551/В379. В другом варианте осуществления настоящего изобретения контрольной антигенсвязывающей молекулой является антитело, включающее А551/В379 в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула включает константные области тяжелой и легкой цепей, происходящих от человека (например, G1T3 (SEQ ID NO: 138) в качестве константной области тяжелой цепи, λ цепь Lamlib человека (SEQ ID NO: 63) в качестве константной области легкой цепи.In one embodiment of the present invention, the control antigen-binding molecule is an antibody comprising the amino acid sequence A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/ B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 or A549/B167, described in table. 17, as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In a preferred embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule is an antibody comprising HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having the same amino acid sequences as HVR-H1, HVR- H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A375/B167. In another embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule is an antibody comprising A375/B167 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In another embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule is an antibody comprising HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 having the same amino acid sequence as HVR-H1, HVR -H2, HVR-H3, HVR-Ll, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A551/B379. In another embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule is an antibody comprising A551/B379 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In a preferred embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule comprises human-derived heavy and light chain constant regions (e.g., G1T3 (SEQ ID NO: 138) as the heavy chain constant region, human Lamlib λ chain (SEQ ID NO: 63) in as the light chain constant region.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающую активность антиIn one embodiment of the present invention, the binding activity of anti
- 37 046075- 37 046075
CD137 антитела в отношении CD137, при наличии, отсутствии, высокой концентрации и/или низкой концентрации низкомолекулярного соединения измеряют, например, методом захвата лиганда с использованием BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200 поверхностного плазмонного резонанса в качестве принципа измерения.CD137 antibodies against CD137, in the presence, absence, high concentration and/or low concentration of the small molecule compound are measured, for example, by a ligand capture method using BIACORE (registered trademark) T200 surface plasmon resonance as the measurement principle.
Детали примера метода измерения связывающей активности анти-CD137 антитела в отношении CD137 описаны ниже. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающую активности анти-CD137 антитела в отношении CD137 в отношении CD137 оценивают методом BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения в этом методе используют 20 мМ ACES (рН 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2 и 0,05% Tween 20 в качестве подвижного буфера и его осуществляют при 37°C. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения такое измерение осуществляют после захвата антитела в качестве лиганда на лиганд-захватывающей молекуле. Конкретно, необходимое количество (например, примерно 100 RU, 200 RU, 300 RU, 400 RU или 500 RU) антитела захватывается, взаимодействуя с раствором антитела, приготовленным с использованием подвижного буфера с чипом, приготовленным заранее путем иммобилизации Sure Protein А (фирма GE Healthcare) на сенсорном чипе Series S Sensor Chip CM3 (фирма GE Healthcare).Details of an example method for measuring the binding activity of an anti-CD137 antibody against CD137 are described below. In one embodiment of the present invention, the binding activity of an anti-CD137 antibody against CD137 against CD137 is assessed by the BIACORE (registered trademark) T200 method. In a preferred embodiment of the present invention, this method uses 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 and 0.05% Tween 20 as running buffer and is carried out at 37°C. In one embodiment of the present invention, such measurement is performed after the antibody has been captured as a ligand on the ligand-capturing molecule. Specifically, the required amount (e.g., approximately 100 RU, 200 RU, 300 RU, 400 RU, or 500 RU) of antibody is captured by reacting with an antibody solution prepared using a running buffer with a chip prepared in advance by immobilizing Sure Protein A (GE Healthcare ) on the Series S Sensor Chip CM3 (GE Healthcare).
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения примерно от 100 до 500 RU, предпочтительно примерно от 250 до 400 RU антитела захватывается. Затем связывающую активность в отношении CD137 в присутствии или в отсутствие низкомолекулярного соединения оценивают путем взаимодействия раствора CD137, приготовленного с использованием подвижного буфера, добавленного с низкомолекулярным соединением к целевой концентрации (например, 1 мкМ, 10 мкМ, 50 мкМ или 100 мкМ), или раствор CD137 приготовляют, используя подвижный буфер, который не содержит низкомолекулярного соединения. Хотя концентрация CD137 в растворе CD137 может быть определена соответствующим образом, например, когда hCD137-HisBAP (см. пример 1-1) применяют в качестве антигена, измерение осуществляют, используя концентрации антигена 0 нМ, 15,625 нМ, 62,5 нМ, 250 нМ и 1000 нМ, соответственно. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения константа диссоциации (KD) uhtu-CD137 антитела с CD137 человека рассчитывают, используя программное обеспечение Biacore Т200 Evaluation Software 2.0. Конкретно константу скорости связывания ka (л/М/сек) и константу скорости диссоциации kd (1/сек) рассчитывают путем глобальной подгонки сенсограммы, полученной измерением с использованием модели связывания Лэнгмюра 1:1. Константу диссоциации KD (М/л) рассчитывают исходя из этих величин.In a preferred embodiment of the present invention, about 100 to 500 RU, preferably about 250 to 400 RU, of the antibody is captured. CD137 binding activity in the presence or absence of the small molecule compound is then assessed by reacting a CD137 solution prepared using running buffer added with the small molecule compound to a target concentration (e.g., 1 μM, 10 μM, 50 μM, or 100 μM) or solution CD137 is prepared using a running buffer that does not contain the small molecule compound. Although the concentration of CD137 in a CD137 solution can be determined accordingly, for example, when hCD137-HisBAP (see Example 1-1) is used as an antigen, the measurement is carried out using antigen concentrations of 0 nM, 15.625 nM, 62.5 nM, 250 nM and 1000 nM, respectively. In one embodiment of the present invention, the dissociation constant (KD) of the uhtu-CD137 antibody from human CD137 is calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. Specifically, the binding rate constant ka (L/M/sec) and the dissociation rate constant kd (1/sec) are calculated by globally fitting the sensogram obtained by measurement using the 1:1 Langmuir binding model. The dissociation constant KD (M/L) is calculated from these values.
Дополнительные типичные методы анализа по измерению активности связывания анти-CD137 антитела с CD137 будут подробно описаны ниже. Связывание анти-CD137 антител с CD137 человека оценивают с помощью Biacore T200. Связывание с CD137 человека измеряют, используя 20 мМ ACES (рН 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2, 0,05% Tween 20 в качестве подвижного буфера, измерение проводят при 37°C. Во-первых, антитело примерно от 250 до 400 RU захватывают путем взаимодействия раствора антитела, приготовленного с использованием подвижного буфера, с чипом, на котором Sure Protein A (фирма GE Healthcare) иммобилизован на сенсорном чипе Series S CM3 (фирма GE Healthcare). Затем раствор CD137 человека, приготовленный с применением подвижного буфера с добавлением АТФ в целевой концентрации (например, 1 мкМ, 10 мкМ, 50 мкМ или 100 мкМ), или раствор CD137 человека, приготовленный с применением подвижного буфера, который не содержит АТФ, вступает во взаимодействие для оценки связывающей активности в отношении CD137 в присутствии или в отсутствие АТФ. hCD137-HisBAP получают методом, описанным в примере (1-1), и применяют в качестве CD137 человека, являющегося антигеном, измерение проводят при концентрации антигена 0 нМ, 15,625 нМ, 62,5 нМ, 250 нМ и 1000 нМ, соответственно. Чип регенерируют, используя 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5), измерение проводят путем повторяющегося захвата антител. Константа диссоциации каждого антитела в отношении CD137 человека рассчитывают, используя программное обеспечение Biacore T200 Evaluation Software 2.0. Конкретно константу скорости связывания ka (л/М/сек) и константу скорости диссоциации kd (1/сек) рассчитывают путем глобальной подгонки сенсограммы, полученной измерением с использованием модели связывания Лэнгмюра 1:1. Константу диссоциации KD (М/л) рассчитывают, исходя из этих величин.Additional exemplary assay methods for measuring the binding activity of an anti-CD137 antibody to CD137 will be described in detail below. Binding of anti-CD137 antibodies to human CD137 was assessed using Biacore T200. Binding to human CD137 was measured using 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.05% Tween 20 running buffer and measured at 37°C. First, an antibody of approximately 250 to 400 RU is captured by contacting an antibody solution prepared using running buffer with a chip on which Sure Protein A (GE Healthcare) is immobilized on a Series S CM3 sensor chip (GE Healthcare). Then, a solution of human CD137 prepared using a running buffer supplemented with ATP at a target concentration (e.g., 1 μM, 10 μM, 50 μM, or 100 μM), or a solution of human CD137 prepared using a running buffer that does not contain ATP, enters interaction to assess CD137 binding activity in the presence or absence of ATP. hCD137-HisBAP was prepared by the method described in Example (1-1) and used as human CD137 antigen, measured at antigen concentrations of 0 nM, 15.625 nM, 62.5 nM, 250 nM and 1000 nM, respectively. The chip is regenerated using 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) and measured by repeated antibody capture. The dissociation constant of each antibody against human CD137 was calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. Specifically, the binding rate constant ka (L/M/sec) and the dissociation rate constant kd (1/sec) are calculated by globally fitting the sensogram obtained by measurement using the 1:1 Langmuir binding model. The dissociation constant KD (M/L) is calculated from these values.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность антиCD137 антитела в отношении CD137 (предпочтительно CD137 человека) также может быть названа подругому, а именно количество связываемого CD137 на единицу антитела. В частности, используя сенсограммы, полученные с помощью вышеуказанного метода анализа с использованием BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200, количество связывания CD137 с антителом (RU) делится на количество захваченного антитела для расчета количества связывания CD137 на единицу количества антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность анти-CD137 антитела в отношении CD137 (предпочтительно CD137 человека) также может быть измерена методом, описанным в примерах 5-3 или 6-2.In one embodiment of the present invention, the binding activity of an anti-CD137 antibody against CD137 (preferably human CD137) may also be referred to by another name, namely the amount of CD137 bound per unit of antibody. Specifically, using the sensorgrams obtained by the above BIACORE (registered trademark) T200 assay method, the amount of CD137 binding to the antibody (RU) is divided by the amount of captured antibody to calculate the amount of CD137 binding per unit amount of antibody. In one embodiment of the present invention, the binding activity of an anti-CD137 antibody against CD137 (preferably human CD137) can also be measured by the method described in Examples 5-3 or 6-2.
Понятия малая молекула и низкомолекулярное соединение относятся к химическому веществу природного происхождения, отличному от биополимеров, присутствующих в живом организме, или кThe terms small molecule and small molecule compound refer to a naturally occurring chemical substance other than the biopolymers present in a living organism, or to
- 38 046075 химическому веществу неприродного происхождения. Предпочтительно, это целевое тканеспецифическое соединение или не встречающееся в природе соединение, но ими перечень не ограничивают. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения низкомолекулярное соединение по настоящему изобретению является соединением, специфичное в отношении раковой ткани или метаболитом, специфическим в отношении раковой ткани. В настоящем изобретении понятие соединение, специфичное в отношении раковой ткани относится к соединению, которое существует в опухолевой ткани, но не в неопухолевой ткани. В настоящем изобретении понятие рак применяют для описания злокачественных новообразований, которые могут быть с метастазами или без них. Термин метаболизм относится к химическим изменениям, которые происходят в ткани организма, включая ассимиляцию и катаболизм. Ассимиляция относится к биосинтезу или накоплению молекул, а катаболизм относится к разложению молекул. Метаболит - это промежуточное соединение или продукт, образующийся в результате метаболизма вещества.- 38 046075 to a chemical substance of non-natural origin. Preferably, it is a target tissue-specific compound or a non-naturally occurring compound, but is not limited to these. In one embodiment of the present invention, the small molecule compound of the present invention is a cancer tissue-specific compound or a cancer tissue-specific metabolite. In the present invention, the term cancer tissue-specific compound refers to a compound that exists in tumor tissue but not in non-tumor tissue. In the present invention, the term cancer is used to describe malignant neoplasms, which may be with or without metastases. The term metabolism refers to the chemical changes that occur in body tissue, including assimilation and catabolism. Assimilation refers to the biosynthesis or accumulation of molecules, while catabolism refers to the breakdown of molecules. A metabolite is an intermediate or product resulting from the metabolism of a substance.
В настоящем изобретении понятие целевая ткань означает любую ткань в живом организме, к которой антигенсвязывающая молекула по настоящему изобретению должна быть доставлена. Целевая ткань может быть гистологически разной, такой как ткань различных органов или патологически отличающаяся ткань, например, нормальные ткани и больные ткани. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения целевой тканью является опухолевая ткань. Напротив, нецелевой тканью (тканями) являются ткани в живом организме, отличные от целевой ткани.In the present invention, the term target tissue means any tissue in a living body to which the antigen binding molecule of the present invention is to be delivered. The target tissue may be histologically different, such as tissue from different organs, or pathologically different tissue, such as normal tissue and diseased tissue. In some embodiments of the present invention, the target tissue is tumor tissue. In contrast, non-target tissue(s) are tissues in a living organism other than the target tissue.
Понятие опухолевая ткань означает ткань, которая включает по меньшей мере одну опухолевую клетку. Обычно опухолевая ткань производит популяцию опухолевых клеток, составляющих основное тело опухоли (паренхиму) и соединительные ткани и кровеносные сосуды, существующие между опухолевыми клетками и поддерживающей опухоль тканью (стромой). В некоторых случаях они четко различимы, но есть случаи, когда они перемешаны. В некоторых случаях, есть такие клетки, как иммунные клетки, которые инфильтруются в ткань опухоли. Напротив, понятие неопухолевая ткань означает ткань живого организма, отличающуюся от опухолевой ткани (тканей). Здоровые ткани/нормальные ткани представляют такие неопухолевые ткани.The term tumor tissue means tissue that includes at least one tumor cell. Typically, tumor tissue produces a population of tumor cells that make up the main body of the tumor (parenchyma) and the connective tissues and blood vessels that exist between the tumor cells and the tumor-supporting tissue (stroma). In some cases they are clearly distinguishable, but there are cases where they are mixed up. In some cases, there are cells such as immune cells that infiltrate into the tumor tissue. In contrast, the term non-tumor tissue means tissue of a living organism that is different from the tumor tissue(s). Healthy tissue/normal tissue represents such non-tumor tissue.
Примером, который не ограничивает рамок охвата настоящего изобретения, является специфическое в отношении раковой ткани соединение или раковый тканеспецифический метаболит, применяемый в настоящем изобретении, по меньшей мере одно соединение, выбранное из соединений, подробно описанных ниже, которое можно соответствующим образом проиллюстрировать. Понятие по меньшей мере одно соединение включает, помимо случая, когда связывающая активность против антигена теми же антигенсвязывающими доменами, описанными ниже, зависит от одного типа ракового тканеспецифичного соединения или ракового тканеспецифичного метаболита, случай, когда связывающая активность зависит от нескольких типов, специфических в отношении раковой ткани соединений или раковых тканеспецифических метаболитов.An example, which does not limit the scope of the present invention, is a cancer tissue-specific compound or cancer tissue-specific metabolite used in the present invention, at least one compound selected from the compounds detailed below, which can be suitably illustrated. The term at least one compound includes, in addition to the case where the binding activity against an antigen by the same antigen-binding domains described below depends on one type of cancer tissue-specific compound or cancer tissue-specific metabolite, the case where the binding activity depends on several types specific to the cancer tissue compounds or cancer tissue-specific metabolites.
В настоящем изобретении термин тканеспецифическое соединение-мишень относится к соединению, которое специфически присутствует в ткани-мишени по сравнению с тканью, не являющейся мишенью. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения тканеспецифическое соединение-мишень может быть соединением, определяемым качественной тканевой специфичностьюмишенью, такой как присутствие в ткани-мишени, но не в тканях, не являющихся мишенями, или присутствие в ткани, не являющейся мишенью, но не в ткани-мишени. В другом варианте осуществления настоящего изобретения тканеспецифическое соединение-мишень может быть соединением, определяемым количественно тканевой специфичностью-мишенью, такой как присутствие в ткани-мишени в концентрации, которая отличается (например, более высокая концентрация или более низкая концентрация) по сравнению с тканью, не являющейся мишенью. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения тканеспецифическое соединение-мишень присутствует в ткани-мишени в концентрации, которая больше, например, в 1,05 раз или более, в 1,1 раза или более, в 1,15 раз или более, в 1,2 раза или более, в 1,25 раз или более, в 1,3 раз или более, в 1,35 раз или более, в 1,4 раз или более, в 1,45 раз или более, в 1,5 раз или более, в 1,55 раз или более, в 1,6 раз или более, в 1,65 раз или более, в 1,7 раз или более, в 1,75 раз или более, в 1,8 раз или более, в 1,85 раз или более, в 1,9 раз или более, в 1,95 раз или более, в 2 раза или более, в 2,1 раза или более, в 2,2 раз или более, в 2,3 раза или более, в 2,4 раза или более, в 2,5 раз или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 103 раз или более, в 104 раз или более, в 105 раз или более, в 106 раз или более по сравнению с тканью, не являющейся мишенью. В определенном варианте осуществления настоящего изобретения специфическое в отношении целевой ткани соединение по сравнению с нецелевой тканью, присутствует в ткани-мишени в концентрации, которая статистически значительно выше или ниже (т.е. по анализу с использованием из t-критерия Уэлча или критерия суммы рангов Вилкоксона, значение р меньше 0,05 и/или значение q меньше 0,10). В определенном варианте осуществления настоящего изобретения тканеспецифичное соединение-мишень представляет собой тканеспецифическое соединение опухоли.In the present invention, the term tissue-specific target compound refers to a compound that is specifically present in a target tissue compared to a non-target tissue. In some embodiments of the present invention, the tissue-specific target compound may be a compound defined by the qualitative tissue specificity of the target, such as being present in the target tissue but not in non-target tissues, or present in non-target tissue but not in tissue-target. targets. In another embodiment of the present invention, the tissue-specific target compound may be a compound quantified by the tissue specificity of the target, such as being present in the target tissue at a concentration that is different (eg, higher concentration or lower concentration) compared to tissue not being a target. In certain embodiments of the present invention, the tissue-specific target compound is present in the target tissue at a concentration that is greater than, for example, 1.05 times or more, 1.1 times or more, 1.15 times or more, 1. 2 times or more, 1.25 times or more, 1.3 times or more, 1.35 times or more, 1.4 times or more, 1.45 times or more, 1.5 times or more, 1.55 times or more, 1.6 times or more, 1.65 times or more, 1.7 times or more, 1.75 times or more, 1.8 times or more , 1.85 times or more, 1.9 times or more, 1.95 times or more, 2 times or more, 2.1 times or more, 2.2 times or more, 2, 3 times or more, 2.4 times or more, 2.5 times or more, 3 times or more, 5 times or more, 10 times or more, 50 times or more, 100 times or more , 10 3 times or more, 10 4 times or more, 10 5 times or more, 10 6 times or more compared to non-target tissue. In a certain embodiment of the present invention, the target tissue-specific compound, relative to the non-target tissue, is present in the target tissue at a concentration that is statistically significantly higher or lower (i.e., as analyzed using Welch's t test or rank sum test Wilcoxon, p value less than 0.05 and/or q value less than 0.10). In a certain embodiment of the present invention, the target tissue-specific compound is a tumor tissue-specific compound.
В определенном варианте осуществления настоящего изобретения тканеспецифическое соединение-мишень представляет собой метаболит, специфически вырабатываемый опухолевой клеткой. МетаIn a certain embodiment of the present invention, the tissue-specific target compound is a metabolite specifically produced by a tumor cell. Meta
- 39 046075 болит может быть продуктом, который образуется в процессе метаболизма, необходимого для жизнедеятельности (первичный метаболит), или продуктом, образующимся в результате метаболизма, необязательного для жизнедеятельности (вторичный метаболит). Примеры первичных метаболитов могут включать сахара, белки, липиды, нуклеиновые кислоты и т.п. Примеры вторичных метаболитов включают антибиотики и красители. Метаболит может быть биополимером или небольшой молекулой. В определенном варианте осуществления настоящего изобретения биополимер представляет собой молекулу с молекулярной массой около 5000 или более, которая состоит из одного или более типов повторяющихся единиц, включая, например, полисахариды, полипептиды и полинуклеотиды. В определенном варианте осуществления настоящего изобретения небольшими молекулами являются молекулы, имеющие молекулярную массу около 500 или менее, и представляют собой химические вещества, присутствующие в живом организме. В другом варианте осуществления настоящего изобретения тканеспецифическое соединение опухоли представляет собой низкомолекулярный метаболит, специфически продуцируемый в опухолевых клетках (Eva Gottfried, Katrin Peter, Marina P. Kreutz, From Molecular and Modular Tumor Therapy, 3(2), 2010, 111-132). В другом варианте осуществления настоящего изобретения тканеспецифическое соединение опухоли представляет собой представляет собой метаболит, который специфически вырабатывается клеткой, инфильтрующейся в опухолевую ткань (например, иммунной клеткой), или стромальной клеткой (например, фибробластом, связанным с раком (CAF, cancer associated fibroblast)), присутствующей в опухолевой ткани. Примерами иммунных клеток, инфильтрирующих в опухолевую ткань, являются дендритные клетки, супрессивные дендритные клетки, регуляторные Т-клетки, истощенные Т-клетки, происходящие от миеломы супрессорные клетки (MDSC, myeloma-derived suppressor cells) и т.п. В другом варианте осуществления настоящего изобретения метаболит, который продуцируется клетками, присутствующими в опухолевой ткани (например, опухолевыми клетками, иммунными клетками, стромальными клетками и т.д.), который высвобождается из клетки после их гибели в результате апоптоза или некроза или тому подобного процесса, также может быть отнесен к соединениям настоящего изобретения, специфичным для опухолевой ткани.- 39 046075 pain can be a product that is formed in the process of metabolism necessary for life (primary metabolite), or a product formed as a result of metabolism that is not necessary for life (secondary metabolite). Examples of primary metabolites may include sugars, proteins, lipids, nucleic acids, and the like. Examples of secondary metabolites include antibiotics and dyes. The metabolite may be a biopolymer or a small molecule. In a certain embodiment of the present invention, the biopolymer is a molecule with a molecular weight of about 5000 or more that is composed of one or more types of repeating units, including, for example, polysaccharides, polypeptides and polynucleotides. In a certain embodiment of the present invention, small molecules are molecules having a molecular weight of about 500 or less, and are chemical substances present in a living organism. In another embodiment of the present invention, the tissue-specific tumor compound is a small molecule metabolite specifically produced in tumor cells (Eva Gottfried, Katrin Peter, Marina P. Kreutz, From Molecular and Modular Tumor Therapy, 3(2), 2010, 111-132). In another embodiment of the present invention, the tumor tissue-specific compound is a metabolite that is specifically produced by a cell infiltrating the tumor tissue (e.g., an immune cell) or a stromal cell (e.g., a cancer associated fibroblast (CAF)) present in tumor tissue. Examples of immune cells infiltrating tumor tissue include dendritic cells, suppressive dendritic cells, regulatory T cells, exhausted T cells, myeloma-derived suppressor cells (MDSCs), and the like. In another embodiment of the present invention, a metabolite that is produced by cells present in tumor tissue (eg, tumor cells, immune cells, stromal cells, etc.) that is released from the cell after they die by apoptosis or necrosis or the like process , may also be classified as tumor tissue-specific compounds of the present invention.
Чтобы идентифицировать тканеспецифическое соединение опухоли, анализ на транскриптомном уровне (см., например, Dhanasekaran с соавт., Nature, 41 2, 2001, 822-826; Lapointe с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 2004, 811-816; Perou с соавт., Nature, 406, 2000, 747-752), анализ на протеомном уровне (см., например, Ahram с соавт., Mol. Carcinog., 33, 2002, 9-15; Hood с соавт., Mol. Cell. Proteomics, 4, 2005, 1741-1753) и анализ метаболизма, основанный на метаболомном профилировании (метаболомика), может быть использован надлежащим образом. То есть для идентификации метаболита в исследуемом образце используют высокоэффективную жидкостную хроматографию (ВЭЖХ), ядерный магнитный резонанс (ЯМР) (Brindle с соавт., J. Mol. Recognit., 10, 1997, 182-187)), масс-спектрометрию (GC/MS и LC/MS) (Gates, Sweeley, Clin. Chem., 24, 1978, 1663-1673) и метаболическое профилирование с применением метода ELISA, и тому подобные подходящие методы, которые можно применять отдельно и/или в комбинации.To identify tissue-specific tumor junctions, analysis at the transcriptomic level (see, for example, Dhanasekaran et al., Nature, 41 2, 2001, 822-826; Lapointe et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 2004 , 811-816; Perou et al., Nature, 406, 2000, 747-752), analysis at the proteomic level (see, for example, Ahram et al., Mol. Carcinog., 33, 2002, 9-15; Hood et al., Mol. Cell. Proteomics, 4, 2005, 1741-1753) and metabolism analysis based on metabolomic profiling (metabolomics) can be used appropriately. That is, to identify the metabolite in the test sample, high-performance liquid chromatography (HPLC), nuclear magnetic resonance (NMR) (Brindle et al., J. Mol. Recognit., 10, 1997, 182-187)), mass spectrometry (GC /MS and LC/MS) (Gates, Sweeley, Clin. Chem., 24, 1978, 1663-1673) and metabolic profiling using the ELISA method, and similar suitable methods, which can be used alone and/or in combination.
В определенном варианте осуществления настоящего изобретения специфическое для опухолевой ткани соединение представляет собой по крайней мере одно соединение, выбранное из группы, состоящей из: нуклеозидов, имеющих структуру пуринового кольца, аминокислот и их метаболитов, липидов и их метаболитов, первичных метаболитов углеводного обмена, а также никотинамида и его метаболитов. В другом варианте осуществления настоящего изобретения специфическое для опухолевой ткани соединение представляет собой по меньшей мере одно соединение, выбранное из пп.(1)-(6), включающих:In a certain embodiment of the present invention, the tumor tissue-specific compound is at least one compound selected from the group consisting of: nucleosides having a purine ring structure, amino acids and their metabolites, lipids and their metabolites, primary metabolites of carbohydrate metabolism, and nicotinamide and its metabolites. In another embodiment of the present invention, the tumor tissue-specific compound is at least one compound selected from paragraphs (1) to (6), including:
(1) нуклеозиды, имеющие пуриновую структуру, такие как аденозин (ADO), аденозинтрифосфат (АТФ), аденозиндифосфат (АДФ), аденозинмонофосфат (АМФ) и инозин;(1) nucleosides having a purine structure, such as adenosine (ADO), adenosine triphosphate (ATP), adenosine diphosphate (ADP), adenosine monophosphate (AMP) and inosine;
(2) аминокислоты, такие как аланин, глутаминовая кислота и аспарагиновая кислота;(2) amino acids such as alanine, glutamic acid and aspartic acid;
(3) метаболиты аминокислот, такие как кинуренин, антраниловая кислота, 3-гидроксикинуренин и кинуреновая кислота;(3) amino acid metabolites such as kynurenine, anthranilic acid, 3-hydroxykynurenine and kynurenic acid;
(4) метаболиты арахидоновой кислоты, такие как простагландин Е2;(4) arachidonic acid metabolites such as prostaglandin E2;
(5) первичные метаболиты гликолитического пути или цикла Кребса, такие как молочная кислота, янтарная кислота и лимонная кислота; и, (6) метаболиты никотинамида, такие как 1-метилникотинамид.(5) primary metabolites of the glycolytic pathway or Krebs cycle, such as lactic acid, succinic acid and citric acid; and, (6) nicotinamide metabolites such as 1-methylnicotinamide.
(1) Нуклеозиды, имеющие пуриновую структуру, такие как аденозин (ADO), аденозинтрифосфат (АТФ), аденозиндифосфат (АДФ), аденозинмонофосфат (АМФ) и инозин.(1) Nucleosides having a purine structure, such as adenosine (ADO), adenosine triphosphate (ATP), adenosine diphosphate (ADP), adenosine monophosphate (AMP) and inosine.
Известно, что при гибели опухолевых клеток происходит утечка большого количества внутриклеточного АТФ. Следовательно, концентрация АТФ в опухолевой ткани значительно выше, чем в нормальной ткани (PLoS One. (2008) 3, е2599). АМФ метаболизируется ферментами на поверхности клетки, такими как внеклеточная 5'-нуклеотидаза (эко-5'-нуклеотидаза) (CD73) (Resta, Thompson, Immunol. Rev. 161, 1998, 95-109; Sadej с соавт., Melanoma Res. 16, 2006, 213-222). Аденозин представляет собой пуриновый нуклеозид, который постоянно присутствует во внеклеточной среде в низких концентрациях, но сообщалось о заметном повышении внеклеточной концентрации аденозина в гипоксических тканях, обнаруженных в солидных опухолях (Blay, Hoskin, Cancer Res., 57, 1997, 2602-2605). CD73 экспрессируется на поверхности опухолей и иммунных клеток (Kobie с соавт., J. Immunol. 177, 2006, 6780-6786) и повыIt is known that when tumor cells die, a large amount of intracellular ATP leaks. Consequently, the concentration of ATP in tumor tissue is significantly higher than in normal tissue (PLoS One. (2008) 3, e2599). AMP is metabolized by cell surface enzymes such as extracellular 5'-nucleotidase (eco-5'-nucleotidase) (CD73) (Resta, Thompson, Immunol. Rev. 161, 1998, 95-109; Sadej et al., Melanoma Res. 16, 2006, 213-222). Adenosine is a purine nucleoside that is constantly present in the extracellular environment at low concentrations, but a marked increase in extracellular adenosine concentration has been reported in hypoxic tissues found in solid tumors (Blay, Hoskin, Cancer Res., 57, 1997, 2602-2605). CD73 is expressed on the surface of tumors and immune cells (Kobie et al., J. Immunol. 177, 2006, 6780-6786) and is increasingly
- 40 046075 шенную активность обнаруживают при раке груди (Canbolat с соавт., Breast Cancer Res. Treat. 37, 1996, 189-193), раке желудка (Durak с соавт., Cancer Lett. 84, 1994, 199-202), раке поджелудочной железы (Flocke, Mannherz, Biochim. Biophys. Acta 1076, 1991, 273-281) и глиобластоме (Bardot с соавт., Br. J. Cancer, 70, 1994, 212-218). Было высказано предположение, что накопление аденозина в опухолевой ткани является результатом увеличения дефосфорилирования АМФ цитоплазматической 5'-нуклеотидазой (Headrick, Willis, Biochem. J., 261, 1989, 541-550). Кроме того, регуляторные Т-клетки, проникающие в опухолевую ткань, также экспрессируют АТФазу и продуцируют аденозин (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103 (35), 2006, 13132-13137; Curr.Med. Chem., 18, 2011, 5217-5223). Полагают, что продуцируемый аденозин поддерживает ткани опухоли в иммуносупрессивной среде через аденозиновые рецепторы, такие как рецептор А2А (Curr. Med. Chem., 18, 2011, 5217-5223). Таким образом, АТФ, АДФ, АМФ, аденозин и т.п., которые, как считается, накапливаются в высокой концентрации в опухолевой ткани за счет метаболизма пуриновых нуклеотидов, являются примерами соединений, специфичных для опухолевой ткани, используемых в настоящем изобретении. Кроме того, поскольку аденозин разрушается до инозина под действием аденозиндезаминазы, инозин накапливается в высокой концентрации.- 40 046075 This activity is found in breast cancer (Canbolat et al., Breast Cancer Res. Treat. 37, 1996, 189-193), stomach cancer (Durak et al., Cancer Lett. 84, 1994, 199-202), pancreatic cancer (Flocke, Mannherz, Biochim. Biophys. Acta 1076, 1991, 273-281) and glioblastoma (Bardot et al., Br. J. Cancer, 70, 1994, 212-218). It has been suggested that the accumulation of adenosine in tumor tissue results from increased dephosphorylation of AMP by cytoplasmic 5'-nucleotidase (Headrick, Willis, Biochem. J., 261, 1989, 541-550). In addition, regulatory T cells infiltrating tumor tissue also express ATPase and produce adenosine (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103 (35), 2006, 13132-13137; Curr. Med. Chem., 18, 2011, 5217-5223). The adenosine produced is believed to maintain tumor tissues in an immunosuppressive environment through adenosine receptors such as the A2A receptor (Curr. Med. Chem., 18, 2011, 5217-5223). Thus, ATP, ADP, AMP, adenosine and the like, which are believed to accumulate in high concentration in tumor tissue due to purine nucleotide metabolism, are examples of tumor tissue-specific compounds used in the present invention. In addition, because adenosine is broken down into inosine by adenosine deaminase, inosine accumulates in high concentrations.
В определенном варианте осуществления настоящего изобретения нуклеозиды, имеющие структуру пуринового кольца, включают аденозинсодержащие соединения. В определенных вариантах осуществления настоящего изобретения аденозинсодержащие соединения включают, например, аденозин (АДО), аденозинтрифосфат (АТР), аденозиндифосфат (АДФ), аденозинмонофосфат (АМФ), циклический аденозинмонофосфат (цАМФ), дезоксиаденозин (дАДО), дезоксиаденозин трифосфат (дАТФ), дезоксиаденозин дифосфат (дАДФ), дезоксиаденозин монофосфат (дАМФ), аденозин[/-тио]трифосфат (АТФγS) и тому подобное. В другом варианте осуществления настоящего изобретения нуклеозиды, имеющие структуру пуринового кольца, включают инозин, который является метаболитом аденозина.In a certain embodiment of the present invention, nucleosides having a purine ring structure include adenosine-containing compounds. In certain embodiments of the present invention, adenosine-containing compounds include, for example, adenosine (ADO), adenosine triphosphate (ATP), adenosine diphosphate (ADP), adenosine monophosphate (AMP), cyclic adenosine monophosphate (cAMP), deoxyadenosine (dADO), deoxyadenosine triphosphate (dATP), deoxyadenosine diphosphate (dADP), deoxyadenosine monophosphate (dAMP), adenosine[/-thio]triphosphate (ATPγS) and the like. In another embodiment of the present invention, nucleosides having a purine ring structure include inosine, which is a metabolite of adenosine.
Более того, в определенном варианте осуществления настоящего изобретения, нуклеозиды, имеющие структуру пуринового кольца, включают коммерчески доступные нуклеозиды, имеющие структуру пуринового кольца, такие как АДФ-бета-S (фирма Sigma Inc.) и подобные.Moreover, in a certain embodiment of the present invention, nucleosides having a purine ring structure include commercially available nucleosides having a purine ring structure, such as ADP-beta-S (Sigma Inc.) and the like.
(2) Аминокислоты, такие как аланин, глутаминовая кислота и аспарагиновая кислота.(2) Amino acids such as alanine, glutamic acid and aspartic acid.
Скорость поглощения глутамина, который действует как переносчик азота в живом организме, увеличивается в опухолевых клетках, и считается, что такое включение глутамина и связанное с этим преобразование в глутаминовую кислоту и молочную кислоту (разрушение глутамина (глутаминолиз)) являются особенностями опухолевых клеток (Mazurek, Eigenbrodt, Anticancer Res. 23, 2003, 1149-1154; Mazurek с соавт., J. cell. Physiol. 181, 1999, 136-146). У онкологических больных уровень глутамина в плазме снижается, а концентрация глутаминовой кислоты повышается (Droge с соавт., Immunobiology, 174, 1987, 473-479), и исследования метаболизма меченной по 13С глюкозы в ткани рака легких показали корреляцию между концентрациями меченной по 13С янтарной кислоты, меченного по 13С аланина, меченной по 13С глутаминовой кислоты и меченного по С цитрата. По этим причинам аланин, глутаминовая кислота, аспарагиновая кислота и другие подобные соединения, которые, как считается, накапливаются в высоких концентрациях в опухолевой ткани, например, из-за разрушения глутамина, являются примерами соединений, специфичных для опухолевой ткани, используемых в настоящем изобретении.The rate of uptake of glutamine, which acts as a nitrogen carrier in vivo, is increased in tumor cells, and this incorporation of glutamine and the associated conversion to glutamic acid and lactic acid (destruction of glutamine (glutaminolysis)) is thought to be a feature of tumor cells (Mazurek, Eigenbrodt, Anticancer Res. 23, 2003, 1149-1154; Mazurek et al., J. cell Physiol. 181, 1999, 136-146). In cancer patients, plasma glutamine levels decrease and glutamic acid concentrations increase (Droge et al., Immunobiology, 174, 1987, 473-479), and studies of the metabolism of 13C -labeled glucose in lung cancer tissue have shown a correlation between concentrations of 13C -labeled glucose. C succinic acid, 13 C labeled alanine, 13 C labeled glutamic acid and C labeled citrate. For these reasons, alanine, glutamic acid, aspartic acid and other similar compounds that are believed to accumulate in high concentrations in tumor tissue, for example due to glutamine degradation, are examples of tumor tissue-specific compounds used in the present invention.
(3) Метаболиты аминокислот, такие как кинуренин, антраниловая кислота, 3-гидроксикинуренин и кинуреновая кислота.(3) Amino acid metabolites such as kynurenine, anthranilic acid, 3-hydroxykynurenine and kynurenic acid.
Индолеамин-2,3-диоксигеназа (IDO, Indoleamine 2,3-dioxygenase) является метаболизирующим триптофан ферментом, который высоко экспрессируется при многих раковых заболеваниях, таких как меланома, рак толстой кишки, рак почки и других подобных заболеваний (Uyttenhove с соавт., Nat. Med., 9, 2003, 1269-1274)). IDO катализирует превращение триптофана в кинуренин. В глиомах, которые не экспрессируют IDO, кинуренин вырабатывается из триптофана триптофан-2,3-диоксигеназой (TDO, tryptophan 2,3-dioxygenase) печени (Opitz с соавт., Nature, 478 (7368), 2011, 197-203). IDO также экспрессируется на дендритных клетках, проникающих в опухолевую ткань, и дендритные клетки также производят кинуренин (J. Immunol. 181, 2008, 5396-5404). Кроме того, IDO также экспрессируется в миелоидных супрессорных клетках (MDSC, myeloid-derived suppressor cell) опухолевых тканей, и MDSC также продуцирует кинуренин (Yu с соавт., J. Immunol., 190, 2013, 3783-3797). Кинуренин превращается в антраниловую кислоту с помощью кинурениназы и в 3-гидроксикинуренин с помощью кинуренин-3гидроксилазы. Как антраниловая кислота, так и 3-гидроксикинуренин конвертируют в 3гидроксиантраниловую кислоту, предшественник НАД. Кинуренин превращается в кинуреновую кислоту кинуренинаминотрансферазой. По этим причинам кинуренин и его метаболит, то есть антраниловая кислота, 3-гидроксикинуренин, кинурениновая кислота и т.п., являются примерами соединений, специфичных для опухолевой ткани, используемых в настоящем изобретении, в частности, метаболитов, специфичных для опухолевых клеток.Indoleamine 2,3-dioxygenase (IDO, Indoleamine 2,3-dioxygenase) is a tryptophan-metabolizing enzyme that is highly expressed in many cancers such as melanoma, colon cancer, kidney cancer and other similar diseases (Uyttenhove et al., Nat. Med., 9, 2003, 1269-1274)). IDO catalyzes the conversion of tryptophan to kynurenine. In gliomas that do not express IDO, kynurenine is produced from tryptophan by liver tryptophan 2,3-dioxygenase (TDO) (Opitz et al., Nature, 478 (7368), 2011, 197-203). IDO is also expressed on dendritic cells infiltrating tumor tissue, and dendritic cells also produce kynurenine (J. Immunol. 181, 2008, 5396-5404). In addition, IDO is also expressed in myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) of tumor tissues, and MDSCs also produce kynurenine (Yu et al., J. Immunol., 190, 2013, 3783-3797). Kynurenine is converted to anthranilic acid by kynureninase and to 3-hydroxykynurenine by kynurenine 3hydroxylase. Both anthranilic acid and 3-hydroxykynurenine are converted to 3hydroxyanthranilic acid, a precursor to NAD. Kynurenine is converted to kynurenic acid by kynurenine aminotransferase. For these reasons, kynurenine and its metabolite, that is, anthranilic acid, 3-hydroxykynurenine, kynurenic acid, etc., are examples of tumor tissue-specific compounds used in the present invention, in particular tumor cell-specific metabolites.
(4) Метаболиты арахидоновой кислоты, такие как простагландин Е2.(4) Arachidonic acid metabolites such as prostaglandin E2.
Простагландин Е2 (PGE2) способствует росту раковых клеток толстой кишки и подавляет их апоптоз (Sheng с соавт., Cancer Res., 58, 1998, 362-366). Что касается синтетаз PGE2, в основном было обнаружено, что СОХ-1 конститутивно экспрессируется почти во всех тканях, тогда как СОХ-2 индуцируется некоторыми воспалительными цитокинами и онкогенами в опухолях (Warner, Mitchell, FASEB J., 18,Prostaglandin E2 (PGE2) promotes the growth of colon cancer cells and inhibits their apoptosis (Sheng et al., Cancer Res., 58, 1998, 362-366). Regarding PGE2 synthetases, COX-1 has generally been found to be constitutively expressed in almost all tissues, while COX-2 is induced by several inflammatory cytokines and oncogenes in tumors (Warner, Mitchell, FASEB J., 18,
- 41 046075- 41 046075
2004, 790-804). Сообщалось, что сверхэкспрессия СОХ-2 связана с плохим прогнозом рака груди (Denkert с соавт., Clin. Breast Cancer, 4, 2004, 428-433) и быстрым прогрессированием рака яичников (Denker с соавт., Mod. Pathol., 19, 2006, 1261-1269). Кроме того, регуляторные Т-клетки, проникающие в опухолевую ткань, также производят PGE2 (Curr. Med. Chem., 18, 2011, 5217-5223). По этим причинам метаболиты арахидоновой кислоты, такие как PGE2, являются примерами соединений, специфичных для опухолевой ткани, в частности метаболитов, специфичных для опухолевых клеток, или метаболитов, специфичных для иммунных клеток, инфильтрирующих опухолевую ткань. Помимо PGE2, выработка тромбоксана А2 (ТХА2) повышается в опухолевых тканях, например, при раке толстой кишки (J. Lab. Clin. Med., 122, 1993, 518-523).2004, 790-804). Overexpression of COX-2 has been reported to be associated with poor prognosis in breast cancer (Denkert et al., Clin. Breast Cancer, 4, 2004, 428-433) and rapid progression of ovarian cancer (Denkert et al., Mod. Pathol., 19, 2006, 1261-1269). In addition, regulatory T cells infiltrating tumor tissue also produce PGE2 (Curr. Med. Chem., 18, 2011, 5217-5223). For these reasons, arachidonic acid metabolites such as PGE2 are examples of tumor tissue-specific compounds, particularly tumor cell-specific metabolites or metabolites specific to immune cells infiltrating tumor tissue. In addition to PGE2, the production of thromboxane A2 (TXA2) is increased in tumor tissues, such as colon cancer (J. Lab. Clin. Med., 122, 1993, 518-523).
(5) Первичные метаболиты гликолитического пути или цикла Кребса, такие как молочная кислота, янтарная кислота и лимонная кислота.(5) Primary metabolites of the glycolytic pathway or Krebs cycle, such as lactic acid, succinic acid and citric acid.
Гликолитический фенотип, характеризующийся активацией гликолитических (путь ЭмбденаМейергофа) ферментов, таких как пируваткиназа, гексокиназа и лактатдегидрогеназа (ЛДГ), традиционно известен как эффект Варбурга, характерный для солидных опухолей. Молочная кислота, которая является конечным продуктом гликолиза, а также янтарная и лимонная кислоты, образующиеся в ходе цикла Кребса, накапливаются в опухолевых тканях (Teresa с соавт., Mol. Cancer, 8, 2009, 41-59). По этим причинам молочная кислота, янтарная кислота, лимонная кислота и другие подобные соединения, которые являются первичными метаболитами, образуемыми в ходе гликолиза, являются примерами соединений, специфичных для опухолевой ткани, в частности метаболитов, специфичных для опухолевых клеток, упоминаемых в настоящем изобретении. Кроме того, известно, что из-за гибели клеток сукцинат, который присутствует в клетках в высокой концентрации, выделяется из клеток (Nature Immunology, 9, 2008, 1261-1269). Предполагают, что причиной является повышенная концентрация янтарной кислоты в опухолевых тканях, где часто происходит гибель клеток.The glycolytic phenotype, characterized by the activation of glycolytic (Embden-Meyerhoff pathway) enzymes such as pyruvate kinase, hexokinase and lactate dehydrogenase (LDH), is traditionally known as the Warburg effect, characteristic of solid tumors. Lactic acid, which is the end product of glycolysis, as well as succinic and citric acids formed during the Krebs cycle, accumulate in tumor tissues (Teresa et al., Mol. Cancer, 8, 2009, 41-59). For these reasons, lactic acid, succinic acid, citric acid and other similar compounds, which are primary metabolites formed during glycolysis, are examples of tumor tissue-specific compounds, in particular tumor cell-specific metabolites mentioned in the present invention. In addition, it is known that due to cell death, succinate, which is present in high concentrations in cells, is released from the cells (Nature Immunology, 9, 2008, 1261-1269). It is believed that the cause is an increased concentration of succinic acid in tumor tissues, where cell death often occurs.
(6) Метаболиты никотинамида, такие как 1-метилникотинамид.(6) Nicotinamide metabolites such as 1-methylnicotinamide.
Известно, что никотинамид-Ы-метилтрансфераза экспрессируется на высоком уровне во множестве опухолевых тканей человека. Также известно, что 1-метилникотинамид, который представляет собой стабильный метаболит никотинамида, продуцируемый этим ферментом, секретируется за пределы опухолевых клеток (Yamada с соавт., J. Nutr. Sci. Vitaminol., 56, 2010, 83-86). По этой причине 1метилникотинамид и другие подобные соединения, которые предположительно накапливаются в опухолевой ткани в высокой концентрации в результате метаболизма никотинамида, являются примерами соединений, специфичных для опухолевой ткани, упоминаемых в настоящем изобретении.Nicotinamide N-methyltransferase is known to be expressed at high levels in a variety of human tumor tissues. It is also known that 1-methylnicotinamide, which is a stable metabolite of nicotinamide produced by this enzyme, is secreted outside tumor cells (Yamada et al., J. Nutr. Sci. Vitaminol., 56, 2010, 83-86). For this reason, 1methylnicotinamide and other similar compounds, which are believed to accumulate in high concentrations in tumor tissue as a result of nicotinamide metabolism, are examples of tumor tissue-specific compounds mentioned in the present invention.
Антигенсвязывающая молекула в настоящем изобретении содержит антигенсвязывающий домен. В качестве антигенсвязывающего домена можно использовать домен любой структуры, если он связывается с антигеном-мишенью. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие домены по настоящему изобретению включают, например, вариабельные области тяжелых цепей и/или легких цепей антител, авимеры, содержащие модуль (домен А) примерно из 35 аминокислот, содержащихся в различных белках клеточных мембран в живом организме (WO 2004/044011 и WO 2005/040229), аднектины, содержащие домен 10Fn3 фибронектина, который представляет собой гликопротеин, экспрессируемый на клеточной мембране (WO 2002/032925), аффитела, использующие в качестве каркаса связывающий домен IgG из 58 аминокислот белка A (WO 1995/001937), сконструированные белки с анкириновым повтором (DARPin, Designed Ankyrin Repeat protein), с использованием анкиринового повтора (AR, ankyrin repeat), который представляет собой повторяющуюся последовательность из 33 аминокислот, в качестве основания (WO 2002/020565), антикалины, содержащие липокалин, такой как липокалин, связанный с желатиназой нейтрофилов (NGAL, neutrophil gelatinase-associated lipocalin) в качестве основания (WO 2003/029462), вариабельные рецепторы лимфоцитов (VLR, variable lymphocyte receptor), которые являются белками, функционирующими в адаптивных иммунных системах бесчелюстных позвоночных, таких как Lampetra japonica и Eptatretus, и содержат модуль обогащенных лейцином повторов (LRR, leucine-rich-repeat) модуль (WO 2008/016854) и другие подобные соединения. В определенном варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающий домен по настоящему изобретению содержит вариабельные области тяжелой и легкой цепей антитела. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающий домен по настоящему изобретению содержит, например, одноцепочечный домен scFv (single chain Fv), одноцепочечные антитела, Fv, scFv2 (single chain Fv2), Fab или F(ab')2.The antigen binding molecule of the present invention contains an antigen binding domain. A domain of any structure can be used as an antigen-binding domain as long as it binds to the target antigen. In one embodiment of the present invention, the antigen binding domains of the present invention include, for example, heavy chain and/or light chain variable regions of antibodies, avimers containing a module (domain A) of about 35 amino acids contained in various cell membrane proteins in a living organism ( WO 2004/044011 and WO 2005/040229), adnectins containing the 10Fn3 domain of fibronectin, which is a glycoprotein expressed on the cell membrane (WO 2002/032925), affibodies using the 58 amino acid IgG binding domain of protein A as a scaffold (WO 1995/001937), designed ankyrin repeat proteins (DARPin, Designed Ankyrin Repeat protein), using the ankyrin repeat (AR, ankyrin repeat), which is a repeating sequence of 33 amino acids, as a base (WO 2002/020565), ankylins containing lipocalin, such as neutrophil gelatinase-associated lipocalin (NGAL) as a base (WO 2003/029462), variable lymphocyte receptors (VLR, variable lymphocyte receptor), which are proteins that function in the adaptive immune systems of jawless vertebrates such as Lampetra japonica and Eptatretus, and contain a leucine-rich-repeat (LRR) module (WO 2008/016854) and other similar compounds. In a certain embodiment of the present invention, the antigen binding domain of the present invention comprises the variable regions of the heavy and light chains of an antibody. In another embodiment of the present invention, the antigen binding domain of the present invention comprises, for example, a single chain Fv domain, single chain antibodies, Fv, scFv2 (single chain Fv2), Fab or F(ab') 2 .
HVR и вариабельная область.HVR and variable region.
В одном из вариантов осуществления настоящее изобретение относится к анти-CD137 антигенсвязывающей молекуле или антителу, которые содержат по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из: (a) HVR-H1, включающей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающей любую аминокислотную последовательность, выбранную из последовательностей SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность, выбранную из последовательностей SEQ ID NO: 17, 18, 19 или 20. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включают: (a) HVR-H1, содержащую аминокислотную последовательIn one embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody that comprises at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from: (a) HVR-H1, comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or 16; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 17, 18, 19 or 20. In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody includes: (a) HVR-H1, containing an amino acid sequence
- 42 046075 ность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, содержащую любую аминокислотную последовательность, выбранную из последовательностей SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16; (в) HVR-H3, содержащую любую аминокислотную последовательность, выбранную из последовательностей SEQ ID NO: 17, 18, 19 или 20.- 42 046075 SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 containing any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or 16; (c) HVR-H3 containing any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 17, 18, 19 or 20.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула представляет собой антитело, содержащее аминокислотную последовательность из числа последовательностей А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 или А549/В167, представленных в табл. 17, как комбинацию вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающей молекулой является анtu-CD137 антитело, включающее области HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, имеющие такие же аминокислотные последовательности, как HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А375/В167. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающей молекулой является анти-CD137 антитело, содержащее А375/В167 в виде комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающей молекулой является анти-CD137 антитело, включающее области HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVRL2 и HVR-L3, содержащие такие же аминокислотные последовательности, как HVR-H1, HVR-H2, HVRH3, HVR-L1, HVR-L2 и HVR-L3, содержащиеся в А551/В379.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule is an antibody comprising an amino acid sequence of the sequences A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 or A549/B167, presented in table. 17 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In a preferred embodiment of the present invention, the antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising the HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 regions having the same amino acid sequences as HVR-H1 , HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A375/B167. In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising A375/B167 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In another preferred embodiment of the present invention, the antigen binding molecule is an anti-CD137 antibody comprising regions HVR-H1, HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1, HVRL2 and HVR-L3 containing the same amino acid sequences as HVR-H1, HVR-H2, HVRH3, HVR-L1, HVR-L2 and HVR-L3 contained in A551/B379.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 17.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 17.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 17.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 18.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 18.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 18.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 18.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 19.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 20.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 20.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает следующие области (а) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; (в) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the following regions (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; (c) HVR-H3, comprising any amino acid sequence of SEQ ID NO: 17.
- 43 046075- 43 046075
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают aHTu-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающее по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из последовательностей: (a) HVR-L1, включающую любую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 21, 22, 23, 24 или 25; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую любую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 27, 28 или 29.In another embodiment, the present invention provides an aHTu-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from: (a) HVR-L1 including any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 21, 22, 23, 24 or 25; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 27, 28 or 29.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает (a) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает (a) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает (a) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 28.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает (a) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 29.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает (a) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает (a) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает (a) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25; (б) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises (a) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25; (b) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело по настоящему изобретению включает (а) домен VH, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VH HVR, выбранные из (i) HVR-H1, включающей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (ii) HVR-H2, включающей аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16; (iii) HVR-H3, включающей любую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 17, 18, 19 или 20; (б) домен VL, содержащий по меньшей мере одну, по меньшей мере две или все три последовательности VL HVR, выбранные из (i) HVR-L1, включающей любую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 21, 22, 23, 24 и 25; (ii) HVR-L2, включающей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (iii) HVR-L3, включающей любую аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 27, 28 или 29.In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody of the present invention comprises (a) a VH domain comprising at least one, at least two, or all three HVR VH sequences selected from (i) HVR-H1, comprising amino acid sequence SEQ ID NO: 7; (ii) HVR-H2 comprising an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 or 16; (iii) HVR-H3 comprising any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 17, 18, 19 or 20; (b) a VL domain comprising at least one, at least two or all three HVR VL sequences selected from (i) HVR-L1 comprising any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 21, 22, 23, 24 and 25; (ii) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (iii) HVR-L3, comprising any amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 27, 28 or 29.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающие (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающие (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 9; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающие (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ IDIn another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID
- 44 046075- 44 046075
NO: 10; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.NO: 10; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 22; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающие (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 11; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 11; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающие (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 8; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 8; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающие (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 12; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 28.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающие (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 13; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 18; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 29.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающее (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающее (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 23; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающее (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающее (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 16; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 20; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 25; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающее (a) HVR-H1, включающую аминокислотную послеIn another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid following
- 45 046075 довательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.- 45 046075 sequence SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 19; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 24; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, включающее (a) HVR-H1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 14; (в) HVR-H3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17; (г) HVR-L1, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21; (д) HVR-L2, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (е) HVR-L3, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprising (a) HVR-H1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 14; (c) HVR-H3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17; (d) HVR-L1 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 26; (e) HVR-L3 comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 27.
В определенном варианте осуществления настоящего изобретения любая одна или несколько аминокислот вышеописанного анти-CD137 антитела заменены в следующих положениях HVR:In a certain embodiment of the present invention, any one or more amino acids of the above-described anti-CD137 antibody are replaced at the following HVR positions:
В HVR-H2 (SEQ ID NO: 30): положения 5, 6, 7, 10, 13, 14 и/или 17In HVR-H2 (SEQ ID NO: 30): positions 5, 6, 7, 10, 13, 14 and/or 17
В HVR-H3 (SEQ ID NO: 31): положение 3 и/или 6In HVR-H3 (SEQ ID NO: 31): position 3 and/or 6
В HVR-L1 (SEQ ID NO: 32): положения 4, 5, 9 и/или 11In HVR-L1 (SEQ ID NO: 32): positions 4, 5, 9 and/or 11
В HVR-L3 (SEQ ID NO: 33): положения 6, 7 и/или 8.In HVR-L3 (SEQ ID NO: 33): positions 6, 7 and/or 8.
В определенном варианте осуществления настоящего изобретения замены, предусмотренные настоящим изобретением, являются консервативными заменами. В определенном варианте осуществления настоящего изобретения любое одно или несколько приведенных ниже замен могут быть переработаны в любой комбинации:In a certain embodiment of the present invention, the substitutions provided by the present invention are conservative substitutions. In a particular embodiment of the present invention, any one or more of the following substitutions may be made in any combination:
В HVR-H2 (SEQ ID NO: 8): К5Н или S; S6G; T7S; E10Y; D13E; S14Q; V17G или L.In HVR-H2 (SEQ ID NO: 8): K5H or S; S6G; T7S; E10Y; D13E; S14Q; V17G or L.
В HVR-H3 (SEQ ID NO: 17): A3P, K или I; F6E.In HVR-H3 (SEQ ID NO: 17): A3P, K or I; F6E.
В HVR-L1 (SEQ ID NO: 21): R4S; Y5T; Y9F; E11N.In HVR-L1 (SEQ ID NO: 21): R4S; Y5T; Y9F; E11N.
В HVR-L3 (SEQ ID NO: 27): E6P; H7A; Q8I.In HVR-L3 (SEQ ID NO: 27): E6P; H7A; Q8I.
Все возможные комбинации указанных выше замен входят в консенсусные последовательности SEQ ID NO: 30, 31, 32 и 33 для HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1 и HVR-L3, соответственно.All possible combinations of the above substitutions are included in the consensus sequences SEQ ID NO: 30, 31, 32 and 33 for HVR-H2, HVR-H3, HVR-L1 and HVR-L3, respectively.
В любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD 137 антигенсвязывающая молекула или антитело являются гуманизированными. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включают области HVR согласно любому из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения, и дополнительно содержат акцепторную каркасную область человека, например, каркасную область иммуноглобулина человека или консенсусную каркасную область человека. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включают области HVR как в любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения и дополнительно содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH) или вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую последовательность каркасного участка (FR, framework). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения каркасный участок FR1 в вариабельной области тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, FR2 в вариабельной области тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, FR3 в вариабельной области тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37 и FR4 в вариабельной области тяжелой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID No: 38. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения FR1 в вариабельной области легкой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, FR2 в вариабельной области легкой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40, FR3 в вариабельной области легкой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41 и FR4 в вариабельной области легкой цепи содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42.In any of the above embodiments of the present invention, the anti-CD 137 antigen binding molecule or antibody is humanized. In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody includes HVR regions according to any of the above embodiments of the present invention, and further comprises a human acceptor framework region, for example, a human immunoglobulin framework region or a human consensus framework region. In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody includes HVR regions as in any of the above embodiments of the present invention and further comprises a heavy chain variable region (VH) or a light chain variable region (VL) containing a framework sequence ( FR, framework). In one embodiment of the present invention, the framework region FR1 in the variable heavy chain region contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 35, FR2 in the variable region of the heavy chain contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 36, FR3 in the variable heavy chain region contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 37 and FR4 in the heavy chain variable region contains the amino acid sequence of SEQ ID No: 38. In one embodiment of the present invention, FR1 in the light chain variable region contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 39, FR2 in the light chain variable region contains the amino acid sequence SEQ ID NO: 40, FR3 in the light chain variable region contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 41 and FR4 in the light chain variable region contains the amino acid sequence of SEQ ID NO: 42.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включают последовательность вариабельного домена тяжелой цепи (VH), которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52 или 53. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения последовательность VH, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентична, содержит замены (например, содержит консервативные замены), инсерции или делеции относительно контрольной последовательности, но анtu-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело, содержащее такую последовательность, сохраняют способность связываться с CD137. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот были заменены, инсертированы и/или делетированы в SEQ ID NO: 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52 или 53. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения замены, инсерции или делеции происходят в областях вне HVR (т.е. в каркасных участках (FR)). Необязательно, анти-CD137 антитело содержит последовательность VH в SEQ ID NO: 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52 или 53, включая посттрансляционные модификации этой последовательности. В одном из ваIn another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises a heavy chain variable domain (VH) sequence that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97 %, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, or 53. In some embodiments, the VH sequence that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical, contains substitutions (e.g., contains conservative substitutions), insertions, or deletions relative to the reference sequence , but an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody containing such a sequence retains the ability to bind CD137. In some embodiments, a total of 1 to 10 amino acids have been replaced, inserted, and/or deleted in SEQ ID NO: 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, or 53. In some In embodiments of the present invention, substitutions, insertions or deletions occur in regions outside the HVR (ie, frame regions (FR)). Optionally, the anti-CD137 antibody contains the VH sequence of SEQ ID NO: 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52 or 53, including post-translational modifications of this sequence. In one of the
- 46 046075 риантов осуществления настоящего изобретения VH содержит одну, две или три HVR, выбранных из: (а) HVR-H1, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 7; (б) HVR-H2, содержащей любую одну аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 и 16; и (в) HVR-H3, содержащей любую одну аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 17, 18, 19 или 20. Посттрансляционные модификации включают, но не ограничиваются ими, модификацию глутамина или глутамата на N-конце тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутаминовую кислоту путем пироглутамилирования.- 46 046075 embodiments of the present invention VH contains one, two or three HVRs selected from: (a) HVR-H1 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 7; (b) HVR-H2 comprising any one amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 and 16; and (c) HVR-H3 comprising any one amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 17, 18, 19 or 20. Post-translational modifications include, but are not limited to, modification of glutamine or glutamate at the N-terminus of the heavy chain or light chain into pyroglutamic acid by pyroglutamylation.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающая молекулу или антитело, причем антитело включают вариабельный домен легкой цепи (VL), который по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичен аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 54, 55, 56, 57, 58, 59 или 60. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения последовательность VL, которая по меньшей мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентична, содержит замены (например, содержит консервативные замены), инсерции или делеции относительно контрольной последовательности, но анtu-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело, содержащая такую последовательность, сохраняет способность связываться с CD137. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в целом от 1 до 10 аминокислот были заменены, инсертированы и/или делетированы в SEQ ID NO: 54, 55, 56, 57, 58, 59 или 60. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения замены, инсерции или делеции происходят в областях вне HVR (т.е. в каркасных участках (FR)). Необязательно, антиCD137 антигенсвязывающая молекула или антитело содержит последовательность VL в SEQ ID NO: 54, 55, 56, 57, 58, 59 или 60, включая посттрансляционные модификации этой последовательности. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения VL содержит одну, две или три HVR, выбранные из: (a) HVR-L1, содержащей аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 21, 22, 23, 24 и 25; (б) HVR-L2, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26; (в) HVR-L3, содержащей любую одну аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 27, 28 и 29. Посттрансляционные модификации включают, но не ограничиваются ими, модификацию глутамина или глутамата на N-конце тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутаминовую кислоту путем пироглутамилирования.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody, wherein the antibody comprises a light chain variable domain (VL) that is at least 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 54, 55, 56, 57, 58, 59, or 60. In some embodiments, a VL sequence that is at least 90% identical , 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identical, contains substitutions (eg, contains conservative substitutions), insertions or deletions relative to the reference sequence, but anti-CD137 an antigen-binding molecule or antibody containing such a sequence retains the ability to bind CD137. In some embodiments, a total of 1 to 10 amino acids have been substituted, inserted, and/or deleted in SEQ ID NO: 54, 55, 56, 57, 58, 59, or 60. In some embodiments, the substitutions, insertions, or deletions occur in regions outside the HVR (i.e., frame regions (FR)). Optionally, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody contains the VL sequence of SEQ ID NO: 54, 55, 56, 57, 58, 59 or 60, including post-translational modifications of this sequence. In one embodiment of the present invention, VL contains one, two or three HVRs selected from: (a) HVR-L1 containing an amino acid sequence selected from SEQ ID NO: 21, 22, 23, 24 and 25; (b) HVR-L2 containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 26; (c) HVR-L3 comprising any one amino acid sequence selected from SEQ ID NOs: 27, 28 and 29. Post-translational modifications include, but are not limited to, modification of glutamine or glutamate at the N-terminus of the heavy chain or light chain to pyroglutamic acid by pyroglutamylation.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, причем антигенсвязывающая молекула или антитело содержит VH, как в любом из вариантов осуществления настоящего изобретения, представленных выше, и VL, как в любом из вариантов осуществления настоящего изобретения, представленных выше.In another embodiment, the present invention provides an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody, wherein the antigen binding molecule or antibody comprises VH as in any of the embodiments of the present invention presented above, and VL as in any of the embodiments of the present invention presented above.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 43 и SEQ ID NO: 54, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody includes the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 43 and SEQ ID NO: 54, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 44 и SEQ ID NO: 55, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 44 and SEQ ID NO: 55, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 45 и SEQ ID NO: 55, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 45 and SEQ ID NO: 55, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 46 и SEQ ID NO: 54, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 46 and SEQ ID NO: 54, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 47 и SEQ ID NO: 54, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 47 and SEQ ID NO: 54, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 48 и SEQ ID NO: 56, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 48 and SEQ ID NO: 56, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 49 и SEQ ID NO: 57, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 49 and SEQ ID NO: 57, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 50 и SEQ ID NO: 58, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 50 and SEQ ID NO: 58, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 51 и SEQ ID NO: 59, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 51 and SEQ ID NO: 59, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 51 и SEQ ID NO: 60, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 51 and SEQ ID NO: 60, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
- 47 046075- 47 046075
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения aHTu-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 52 и SEQ ID NO: 60, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the aHTu-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 52 and SEQ ID NO: 60, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 50 и SEQ ID NO: 59, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody includes the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 50 and SEQ ID NO: 59, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело включает последовательности VH и VL в последовательностях SEQ ID NO: 53 и SEQ ID NO: 54, соответственно, включая посттрансляционные модификации этих последовательностей.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody comprises the VH and VL sequences of SEQ ID NO: 53 and SEQ ID NO: 54, respectively, including post-translational modifications of these sequences.
Вышеупомянутые посттрансляционные модификации включают, но не ограничиваются ими, модификацию глутамина или глутамата на N-конце тяжелой цепи или легкой цепи в пироглутаминовую кислоту путем пироглутамилирования.The above post-translational modifications include, but are not limited to, modification of glutamine or glutamate at the N-terminus of the heavy chain or light chain to pyroglutamic acid by pyroglutamylation.
SEQ ID NO, соответствующие аминокислотным последовательностям предпочтительной вариабельной области тяжелой цепи и вариабельной области легкой цепи и их HVR1, 2 и 3 для каждой анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела по настоящему изобретению, показаны в таблице ниже.SEQ ID NOs corresponding to the amino acid sequences of the preferred heavy chain variable region and light chain variable region and their HVR1, 2 and 3 for each anti-CD137 antigen binding molecule or antibody of the present invention are shown in the table below.
Таблица 1Table 1
Если анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело по настоящему изобретению содержит глутамин в качестве N-концевой аминокислоты тяжелой цепи или легкой цепи, эта аминокислота может быть заменена глутаминовой кислотой. Если анти-CD137 антитело, представленное в настоящем изобретении, содержит глутаминовую кислоту в качестве аминокислоты на N-конце тяжелой цепи или легкой цепи, эта аминокислота может быть заменена глутамином.If the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody of the present invention contains glutamine as the N-terminal amino acid of the heavy chain or light chain, this amino acid may be replaced by glutamic acid. If the anti-CD137 antibody provided in the present invention contains glutamic acid as an amino acid at the N-terminus of the heavy chain or light chain, this amino acid can be replaced with glutamine.
В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, содержащие описанные выше HVR, вариабельные области тяжелой цепи и/или вариабельные области легкой цепи, все обладают зависимой от низкомолекулярного соединения связывающей активностью по отношению к CD137 согласно описанному выше.In a preferred embodiment of the present invention, anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies comprising the above-described HVRs, heavy chain variable regions and/or light chain variable regions all have small molecule dependent binding activity for CD137 as described above.
Константные области.Constant regions.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела содержат константную область. Константная область может быть константной областью тяжелой цепи (включая область Fc), константной областью легкой цепи или обеими. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела содержат область Fc. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения константная область является областью с нативной последовательностью. Примеры константных областей тяжелой цепи, полученных из нативных антител, включают, например, константную область тяжелой цепи IgG1 человека (SEQ ID NO: 61, 62), IgG2 человека, IgG3 человека, IgG4 человека и другие подобные. Примеры константных областей легкой цепи, полученных из нативных антител, включают, например, каппа-цепьIn another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies comprise a constant region. The constant region may be a heavy chain constant region (including an Fc region), a light chain constant region, or both. In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies comprise an Fc region. In some embodiments of the present invention, the constant region is a native sequence region. Examples of heavy chain constant regions derived from native antibodies include, for example, human IgG1 heavy chain constant region (SEQ ID NO: 61, 62), human IgG2, human IgG3, human IgG4, and the like. Examples of light chain constant regions derived from native antibodies include, for example, the kappa chain
- 48 046075 человека, лямбда-цепь человека (например, SEQ ID NO: 63) и другие подобные.- 48 046075 human, human lambda circuit (for example, SEQ ID NO: 63) and the like.
В настоящем изобретении понятие исходная константная область или исходная область Fc относятся к константной области или области Fc до внедрения аминокислотных изменений, описанных в настоящем изобретении. Понятие исходная антигенсвязывающая молекула относится к антигенсвязывающей молекуле, которая содержит исходную константную область или исходную область Fc. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения исходная область Fc является областью Fc с нативной последовательностью (или областью Fc нативного антитела). Антитела включают, например, IgA (IgA1, IgA2), IgD, IgE, IgG (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4), IgM и др. Антитела могут происходить от человека или от обезьяны (например, макаки-крабоеда, макаки резус, мармозетки, шимпанзе или бабуина). Нативные антитела также могут иметь природные мутации. Множество аллотипов последовательностей IgG из-за генетического полиморфизма описано в публикации Sequences of proteins of immunological interest, NIH Publication No. 91-3242, каждый из которых может применяться в настоящем изобретении. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения исходная область Fc является областью Fc, происходящей от константной области IgG1 человека, представленной последовательностями SEQ ID NO: 61, 62 или 182.In the present invention, the term "original constant region" or "original Fc region" refers to the constant region or Fc region before the introduction of the amino acid changes described in the present invention. The term parent antigen binding molecule refers to an antigen binding molecule that contains a parent constant region or a parent Fc region. In some embodiments of the present invention, the original Fc region is a native sequence Fc region (or a native antibody Fc region). Antibodies include, for example, IgA (IgA1, IgA2), IgD, IgE, IgG (IgG1, IgG2, IgG3, IgG4), IgM, etc. Antibodies can be of human or monkey origin (e.g., cynomolgus, rhesus, marmoset , chimpanzee or baboon). Native antibodies can also have natural mutations. The many allotypes of IgG sequences due to genetic polymorphism are described in Sequences of proteins of immunological interest, NIH Publication No. 91-3242, each of which can be used in the present invention. In one embodiment of the present invention, the parent Fc region is an Fc region derived from the human IgG1 constant region represented by SEQ ID NO: 61, 62, or 182.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела обладают повышенной изоэлектрической точкой (pI, isoelectric point) по сравнению с анти-CD137 антигенсвязывающими молекулами или антителами, которые содержат нативную последовательность области Fc или исходной области Fc. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения варианты области Fc включают по меньшей мере одно аминокислотное изменение. В других вариантах осуществления настоящего изобретения аминокислотное изменение приводит к повышению изоэлектрической точки (pI) варианта области Fc по сравнению с исходной областью Fc. He опираясь на какую-либо теорию, предполагают, что рН биологических жидкостей (например, плазмы) находится в нейтральном диапазоне рН. В биологических жидкостях общий положительный заряд антигенсвязывающей молекулы или антитела с повышенной величиной pI увеличивается из-за увеличения pI, и в результате антигенсвязывающая молекула или антитело сильнее притягивается физико-химическим кулоновским взаимодействием к поверхности эндотелиальной клетки, которая имеет общий отрицательный заряд по сравнению с антигенсвязывающей молекулой или антителом, не имеющим повышенной величины pI. Таким образом, агонистические антигенсвязывающие молекулы (или антитела) или антигенсвязывающие агонистические антигенсвязывающие молекулы (или антитела) могут приближаться к поверхности клеток, которые экспрессируют рецептор Fc-гамма, что приводит к усилению связывания антигенсвязывающих молекул или антител с клетками, экспрессирующим Fc-гамма-рецептор. Для тех анти-CD137 агонистических антигенсвязывающих молекул или антител, которые проявляют агонистическую активность против CD137, основанную на вкладе за счет связывающей активности связывания с Fcгамма-рецептором, анти-CD137-агонистические антигенсвязывающие молекулы или антитела, имеющие повышенное связывание с экспрессирующими Fc-гамма рецептор клетками из-за повышающих pI аминокислотных изменений могут проявлять более сильную агонистическую активность против CD137 по сравнению с анти-CD137 агонистическими антигенсвязывающими молекулами или антителами, не имеющими изменений аминокислот, которые повышают изоэлектрическую точку (pI).In one embodiment of the present invention, anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies have an increased isoelectric point (pI, isoelectric point) compared to anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies that contain a native Fc region sequence or parent Fc region. In some embodiments of the present invention, Fc region variants include at least one amino acid change. In other embodiments of the present invention, the amino acid change results in an increase in the isoelectric point (pI) of the variant Fc region compared to the original Fc region. Without relying on any theory, it is assumed that the pH of biological fluids (for example, plasma) is in the neutral pH range. In biological fluids, the overall positive charge of an antigen-binding molecule or antibody with an increased pI value increases due to the increase in pI, and as a result, the antigen-binding molecule or antibody is more strongly attracted by the physicochemical Coulomb interaction to the surface of the endothelial cell, which has an overall negative charge compared to the antigen-binding molecule or an antibody that does not have an increased pI value. Thus, agonistic antigen-binding molecules (or antibodies) or antigen-binding agonistic antigen-binding molecules (or antibodies) can approach the surface of cells that express the Fc-gamma receptor, resulting in increased binding of the antigen-binding molecules or antibodies to the cells expressing the Fc-gamma receptor . For those anti-CD137 agonistic antigen-binding molecules or antibodies that exhibit anti-CD137 agonistic activity based on a contribution through Fcgamma receptor binding activity, anti-CD137 agonistic antigen-binding molecules or antibodies having increased binding to Fcgamma receptor expressing cells due to pI-increasing amino acid changes may exhibit stronger anti-CD137 agonist activity compared to anti-CD137 agonistic antigen-binding molecules or antibodies that do not have amino acid changes that increase the isoelectric point (pI).
В настоящем изобретении pI может быть теоретическим или экспериментально определенной величиной. Значение pI можно определить, например, с помощью изоэлектрического фокусирования, известного специалистам в данной области. Значение теоретической pI можно рассчитать, например, с помощью программного обеспечения для анализа генной и аминокислотной последовательности (Genetyx и т.д.). При расчете свойства антитела могут быть отражены в формуле расчета. Например, (i) обычно Cys, консервативный в антителе, образует дисульфидную связь и не несет электрического заряда в боковой цепи; поэтому такой Cys может быть исключен из расчета, и только Cys в свободной форме, который не образует дисульфидную связь, может быть включен в расчет. В другом варианте (ii) состояние заряда или изоэлектрическая точка антител может изменяться из-за посттрансляционных модификаций; поэтому формула расчета может быть изменена следующим образом с учетом таких посттрансляционных модификаций: (а) когда N-концом тяжелой цепи является Q (глутамин), N-концевая аминогруппа исключается из расчета, предполагая, что происходит пироглутамилирование, (б) когда С-концом тяжелой цепи является K (лизин), K (только один остаток) исключается из расчета, предполагая, что происходит усечение; и (в) боковые цепи всех С (цистеинов), присутствующих в обычно консервативных положениях, исключаются из расчета, предполагая, что все эти С образуют дисульфидные связи внутри молекулы. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения оба вышеописанных положения (i) и (ii) могут быть отражены в формуле расчета.In the present invention, pI may be a theoretical or experimentally determined value. The pI value can be determined, for example, using isoelectric focusing, known to those skilled in the art. The theoretical pI value can be calculated, for example, using gene and amino acid sequence analysis software (Genetyx, etc.). When calculating, the properties of the antibody can be reflected in the calculation formula. For example, (i) typically the Cys conserved in the antibody forms a disulfide bond and carries no electrical charge in the side chain; therefore, such Cys can be excluded from the calculation, and only Cys in the free form that does not form a disulfide bond can be included in the calculation. Alternatively, (ii) the charge state or isoelectric point of the antibodies may change due to post-translational modifications; therefore, the calculation formula can be modified as follows to account for such post-translational modifications: (a) when the N-terminus of the heavy chain is Q (glutamine), the N-terminal amino group is excluded from the calculation, assuming that pyroglutamylation occurs, (b) when the C-terminus the heavy chain is K (lysine), K (one residue only) is excluded from the calculation, assuming truncation occurs; and (c) the side chains of all Cs (cysteines) present in normally conserved positions are excluded from the calculation, assuming that all of these Cs form disulfide bonds within the molecule. In one preferred embodiment of the present invention, both of the above-described provisions (i) and (ii) can be reflected in the calculation formula.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения величина pI может быть увеличена, например, по меньшей мере на 0,01, 0,03, 0,05, 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5, или более, по меньшей мере на 0,6, 0,7, 0,8, 0,9, или более, по меньшей мере на 1,0, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, или более, или по меньшей мере на 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2,0, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 3,0 или более, по сравнению с величиной pI до модификации.In one embodiment of the present invention, the pI value may be increased, for example, by at least 0.01, 0.03, 0.05, 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5 , or more by at least 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, or more by at least 1.0, 1.1, 1.2, 1.3, 1.4 , 1.5 or more, or at least 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2.0, 2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2 .5, 3.0 or more, compared to the pI value before modification.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения аминокислотные изменения, относящиеся к увеличению и способы увеличения pI антигенсвязывающей молекулы или антитела, подробноIn one embodiment of the present invention, amino acid changes related to increasing and methods for increasing the pI of an antigen-binding molecule or antibody, in detail
- 49 046075 описаны в настоящем изобретении в разделе III. Композиции и способы (агонистические антигенсвязывающие молекулы, содержащие вариант области Fc с повышенной изоэлектрической точкой (pI)). Специалисты в данной области поймут, что любые аминокислотные изменения и способы увеличения pI, описанные в разделе III. Композиции и способы (агонистические антигенсвязывающие молекулы, содержащие вариант области Fc с повышенной изоэлектрической точкой (pI)) могут применяться к антиCD137 антигенсвязывающим молекулам или антителам.- 49 046075 are described in the present invention in section III. Compositions and methods (agonistic antigen-binding molecules containing a variant Fc region with an increased isoelectric point (pI)). Those skilled in the art will understand that any amino acid changes and methods for increasing pI described in section III. The compositions and methods (agonistic antigen-binding molecules containing a variant Fc region with an increased isoelectric point (pI)) can be applied to anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела имеют вариант области Fc с увеличенной величиной pI, и вариант области Fc содержит по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 285, 311, 312, 315, 318, 333, 335, 337, 341, 342, 343, 384, 385, 388, 390, 399, 400, 401, 402, 413, 420, 422 и 431 по нумерации EU. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты области Fc с повышенной величиной pI включают Arg или Lys в каждом выбранном положении.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies have a variant Fc region with an increased pI value, and the variant Fc region contains at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 285, 311, 312, 315, 318, 333, 335, 337, 341, 342, 343, 384, 385, 388, 390, 399, 400, 401, 402, 413, 420, 422 and 431 according to EU numbering. In other embodiments of the present invention, variants of the Fc region with increased pI value include Arg or Lys at each selected position.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела имеют вариант области Fc с повышенной величиной pI, а вариант области Fc содержит по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 311, 343 и 413 по нумерации EU. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты области Fc с повышенной величиной pI включают аминокислотное изменение в положении 311, 343 или 413 по нумерации EU. В другом варианте осуществления настоящего изобретения варианты области Fc с повышенной величиной pI включают Arg или Lys в каждом выбранном положении.In other embodiments of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies have a variant Fc region with an increased pI value, and the variant Fc region contains at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 311, 343 and 413 according to EU numbering. In other embodiments of the present invention, variants of the Fc region with an increased pI value include an amino acid change at position 311, 343, or 413 of the EU numbering. In another embodiment of the present invention, variants of the Fc region with increased pI value include Arg or Lys at each selected position.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, содержащие вариант области Fc с повышенной величиной pI, который содержит аминокислотные изменения любого из следующих (1)-(3): (1) в положениях 311 и 343; (2) в положениях 311 и 413; и (3) в положениях 343 и 413 в соответствии с нумерацией EU. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты области Fc с повышенной величиной pI содержат Arg или Lys в каждом выбранном положении.In another embodiment, the present invention provides anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies comprising a variant of the Fc region with an increased pI value that contains amino acid changes in any of the following (1)-(3): (1) at positions 311 and 343; (2) in provisions 311 and 413; and (3) in provisions 343 and 413 according to EU numbering. In other embodiments of the present invention, variants of the Fc region with an increased pI value contain an Arg or Lys at each selected position.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению включают вариант области Fc, которая содержит аминокислотное изменение (изменения), представленные в табл. 2 ниже.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention include a variant Fc region that contains the amino acid change(s) presented in table. 2 below.
Таблица 2table 2
Аминокислотные изменения для повышения pI области FcAmino acid changes to increase the pI of the Fc region
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, содержащие вариант области Fc, полученный путем внесения аминокислотных изменений в область Fc, имеющую нативную последовательность. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения вариантные области Fc обладают повышенной связывающей активностью по меньшей мере с одним рецептором Fc-гамма, выбранным из группы, состоящей из Fcгамма RIa, Fc-гамма RIIa, Fc-гамма RIIb, Fc-гамма RIIIa и Fc-гамма RIIIb, по сравнению с областью Fc, имеющей нативную последовательность или исходную областью Fc. Предпочтительно, вариантные области Fc обладают повышенной связывающей активностью в отношении Fc-гамма RIIb по сравнению с областью Fc, имеющей нативную последовательность или исходную область Fc. Сообщают, что антиCD137 антитело, содержащее вариант области Fc с повышенной связывающей активностью в отношении Fc-гамма RIIb, обладает повышенной агонистической активностью по сравнению с анти-CD137 антителом, содержащим область Fc с нативной последовательностью. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в качестве аминокислотных изменений для увеличения связывающей активности по отношению к Fc-гамма RIIb, например, можно использовать аминокислотные изменения, описанные в WO 2012/115241, WO 2014/030728, WO 2014/163101 и/или WO 2017/104783. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения изменения для увеличения связывающей активности по отношению к Fc-гамма RIIb представляют собой аминокислотные изменения по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 234, 235, 236, 237, 238, 264, 268, 295, 326 и 330 по нумерации EU.In one embodiment, the present invention provides anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies containing a variant Fc region obtained by introducing amino acid changes into the Fc region having a native sequence. In one embodiment of the present invention, the variant Fc regions have increased binding activity to at least one Fc-gamma receptor selected from the group consisting of Fcgamma RIa, Fc-gamma RIIa, Fc-gamma RIIb, Fc-gamma RIIIa and Fc- gamma RIIIb, compared to an Fc region having a native sequence or original Fc region. Preferably, the variant Fc regions have increased binding activity for Fc-gamma RIIb compared to an Fc region having a native sequence or original Fc region. An anti-CD137 antibody containing a variant Fc region with increased binding activity to Fc-gamma RIIb is reported to have increased agonist activity compared to an anti-CD137 antibody containing a native sequence Fc region. In one embodiment of the present invention, the amino acid changes to increase the binding activity towards Fc-gamma RIIb, for example, can use the amino acid changes described in WO 2012/115241, WO 2014/030728, WO 2014/163101 and/or WO 2017/104783. In one preferred embodiment of the present invention, the changes to increase Fc-gamma RIIb binding activity are amino acid changes at at least one position selected from the group consisting of positions 234, 235, 236, 237, 238, 264, 268 , 295, 326 and 330 according to EU numbering.
- 50 046075- 50 046075
Рецепторы Fc-гамма (называемые в настоящем изобретении рецепторами Fc-гамма, Fc гамма R или FcgR) относятся к рецепторам, которые могут связываться с областью Fc моноклональных антител IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, и практически означает любого представителя группы семейства белков, кодируемых генами рецепторов Fc-гамма. У людей это семейство включает Fc-гамма RI (CD64), включая изоформы Fc-гамма RIa, Fc-гамма RIb и Fc-гамма RIc; Fc-гамма RII (CD32), включая изоформы Fc-гамма RIIa (включая аллотипы Н131 (тип Н) и R131 (тип R)), Fc-гамма RIIb (включая Fc-гамма RIIb-1 и Fcгамма RIIb-2) и Fc-гамма RIIc; и Fc-гамма RIII (CD16), включая изоформы Fc-гамма RIIIa (включая аллотипы V158 и F158), и Fc-гамма RIIIb (включая аллотипы Fc-гамма RIIIb-NA1 и Fc-гамма RIIIb-NA2) и любые Fc-гамма Rs человека, Fc-гамма изоформы или аллотипы, которые еще предстоит открыть. Установлено, что Fc-гамма RIIb1 и Fc-гамма RIIb2 являются вариантами сплайсинга Fc-гамма RIIb человека. Кроме того, сообщалось о варианте сплайсинга под названием Fc-гамма RIIb3 (J Exp Med, 170, 1989, 1369-1385). Помимо этих вариантов сплайсинга, Fc-гамма RIIb человека включает AAI46679.1, зарегистрированный в NCBI, и все варианты сплайсинга, зарегистрированные в NCBI, а именно NP_001002273.1, NP_001002274.1, NP_001002275.1, NP_001177757.1 и NP_003992.3. Кроме того, Fc-гамма RIIb человека включает все ранее описанные генетические полиморфизмы, а также Fc-гамма RIIb (Arthritis Rheum. 48, 2003, 3242-3252; Kono с соавт., Hum. Mol. Genet. 14, 2005, 2881-2892; Kyogoju с соавт., Arthritis Rheum. 46, 2002, 1242-1254) и каждый генетический полиморфизм, о котором будет известно в будущем.Fc-gamma receptors (referred to herein as Fc-gamma, Fc-gamma R, or FcgR receptors) refer to receptors that can bind to the Fc region of monoclonal antibodies IgG1, IgG2, IgG3, and IgG4, and essentially mean any member of the family of proteins encoded by Fc-gamma receptor genes. In humans, this family includes Fc-gamma RI (CD64), including the Fc-gamma RIa, Fc-gamma RIb and Fc-gamma RIc isoforms; Fc-gamma RII (CD32), including isoforms Fc-gamma RIIa (including allotypes H131 (type H) and R131 (type R)), Fc-gamma RIIb (including Fc-gamma RIIb-1 and Fcgamma RIIb-2) and Fc -gamma RIIc; and Fc-gamma RIII (CD16), including isoforms Fc-gamma RIIIa (including allotypes V158 and F158), and Fc-gamma RIIIb (including allotypes Fc-gamma RIIIb-NA1 and Fc-gamma RIIIb-NA2) and any Fc-gamma Human Rs, Fc gamma isoforms or allotypes yet to be discovered. Fc-gamma RIIb1 and Fc-gamma RIIb2 were found to be splice variants of human Fc-gamma RIIb. In addition, a splice variant called Fc-gamma RIIb3 has been reported (J Exp Med, 170, 1989, 1369-1385). In addition to these splice variants, human Fc-gamma RIIb includes AAI46679.1, registered in NCBI, and all splice variants registered in NCBI, namely NP_001002273.1, NP_001002274.1, NP_001002275.1, NP_001177757.1 and NP_003992. 3. In addition, human Fc-gamma RIIb includes all previously described genetic polymorphisms, as well as Fc-gamma RIIb (Arthritis Rheum. 48, 2003, 3242-3252; Kono et al., Hum. Mol. Genet. 14, 2005, 2881- 2892; Kyogoju et al., Arthritis Rheum. 46, 2002, 1242-1254) and every genetic polymorphism that will be known in the future.
В Fc-гамма RIIa существует два аллотипа, в одном из которых аминокислота в положении 131 Fcгамма RIIa представляет собой гистидин (тип Н), а в другом аминокислота в положении 131 замещена аргинином (тип R) (Warrmerdam, J. Exp. Med. 172, 1990, 19-25).There are two allotypes in Fc-gamma RIIa, one in which the amino acid at position 131 of Fc-gamma RIIa is a histidine (type H), and the other in which the amino acid at position 131 is replaced by arginine (type R) (Warrmerdam, J. Exp. Med. 172 , 1990, 19-25).
Fc-гамма R включает Fc-гамма R человека, мыши, крысы, кролика и обезьяны, но ими не ограничивается и может происходить из любого организма. Fc-гамма R мыши включают Fc-гамма RI (CD64), Fcгамма RII (CD32), Fc-гамма RIII (CD16) и Fc-гамма RIII-2 (CD16-2), а также любые Fc-гамма R мыши или изоформы Fc-гамма R, но ими перечень не ограничивают.Fc-gamma R includes, but is not limited to, human, mouse, rat, rabbit and monkey Fc-gamma R and can be derived from any organism. Mouse Fc-gamma R includes Fc-gamma RI (CD64), Fc-gamma RII (CD32), Fc-gamma RIII (CD16), and Fc-gamma RIII-2 (CD16-2), as well as any mouse Fc-gamma R isoforms Fc-gamma R, but the list is not limited to them.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, содержащие вариант области Fc с повышенной связывающей активностью в отношении Fc-гамма RIIb, которая включает аминокислотные изменения любого из следующих пунктов (1)-(8): (1) в положениях 234, 238, 264 и 330; (2) в положениях 234, 238 и 330; (3) в положениях 234, 237, 238 и 330; (4) в положениях 236, 268 и 330; (5) в положениях 235, 236, 268, 295, 326 и 330; согласно нумерации EU.In another embodiment, the present invention provides anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies comprising a variant Fc region with increased binding activity for Fc-gamma RIIb, which includes amino acid changes in any of the following (1)-(8): (1) in provisions 234, 238, 264 and 330; (2) in provisions 234, 238 and 330; (3) in provisions 234, 237, 238 and 330; (4) in provisions 236, 268 and 330; (5) in provisions 235, 236, 268, 295, 326 and 330; according to EU numbering.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению содержат вариант области Fc, содержащей изменения аминокислот, представленные ниже в табл. 3. В другом варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению содержат вариант области Fc, который дополнительно включает, помимо аминокислотного изменения (изменений), описанных в табл. 2 (аминокислотные изменения, включающие увеличение pI области Fc), любую комбинацию аминокислотных изменений, указанных в табл. 3 ниже.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention comprise a variant Fc region comprising the amino acid changes set forth in Table 1 below. 3. In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention contain a variant Fc region that further includes, in addition to the amino acid change(s) described in table. 2 (amino acid changes including an increase in the pI region of the Fc), any combination of amino acid changes indicated in table. 3 below.
Таблица 3Table 3
Аминокислотные изменения для увеличения связывающей активности Fc-гамма RIIb в области FcAmino acid changes to increase Fc-gamma RIIb binding activity in the Fc region
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают варианты области Fc, которые имеют изменение по меньшей мере одной аминокислоты и обладают связывающей активностью по отношению к Fc-гамма RIIb, эквивалентной или более высокой, чем у контрольной области Fc. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная область Fc представляет собой область Fc, содержащую любую комбинацию аминокислотных изменений, указанных выше в табл. 3. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная область Fc представляет собой область Fc, содержащуюся в константной области тяжелой цепи ТТ14 (SEQ ID NO: 149), ТТ16 (SEQ ID NO: 150), MY201 (SEQ ID NO: 153) или MY518 (SEQ ID NO: 154). В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения контрольная область Fc представляет собой область Fc, содержащуюся в константной области тяжелой цепи MY201 (SEQ ID NO: 153) или MY518 (SEQ ID NO: 154).In one embodiment, the present invention provides variants of the Fc region that have at least one amino acid change and have binding activity for Fc-gamma RIIb that is equivalent to or greater than that of the control Fc region. In one embodiment of the present invention, an Fc control region is an Fc region containing any combination of amino acid changes listed in Table 1 above. 3. In one preferred embodiment of the present invention, the Fc control region is an Fc region contained in the heavy chain constant region of TT14 (SEQ ID NO: 149), TT16 (SEQ ID NO: 150), MY201 (SEQ ID NO: 153) or MY518 (SEQ ID NO: 154). In one preferred embodiment of the present invention, the Fc control region is an Fc region contained in the heavy chain constant region of MY201 (SEQ ID NO: 153) or MY518 (SEQ ID NO: 154).
В другом варианте осуществления настоящего изобретения в настоящем изобретении предусматривают выделенные агонистические антигенсвязывающие молекулы или антитела, которые содержат вариIn another embodiment of the present invention, the present invention provides isolated agonistic antigen-binding molecules or antibodies that contain var.
- 51 046075 ант области Fc с повышенной связывающей активностью в отношении рецептора Fc-гамма (предпочтительно, Fc-гамма RIIb) и увеличенной pI. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения варианты областей Fc содержат по меньшей мере два аминокислотных изменения по сравнению с исходными областями Fc. Выше описано, что антигенсвязывающая молекула или антитело с повышенной pI более сильно притягивается физико-химическим кулоновским взаимодействием к поверхности эндотелиальной клетки, которая имеет общий отрицательный заряд, по сравнению с антигенсвязывающей молекулой или антителом, не имеющим повышенной pI. Следовательно, для тех агонистических антигенсвязывающих молекул или антител, которые проявляют агонистическую активность, основанную на вкладе связывающей активности в отношении рецептора Fc-гамма (предпочтительно Fc-гамма RIIb), агонистическая активность антигенсвязывающих молекул или антител может быть увеличена путем комбинирования аминокислотного изменения (изменений) для увеличения рецептора Fc-гамма (предпочтительно Fc-гамма RIIb) и аминокислотное изменение (изменений) для увеличения pI.- 51 046075 Fc region ant with increased binding activity to the Fc gamma receptor (preferably Fc gamma RIIb) and increased pI. In one embodiment of the present invention, the variant Fc regions contain at least two amino acid changes compared to the original Fc regions. As described above, an antigen binding molecule or antibody with an elevated pI is more strongly attracted by physicochemical Coulomb interaction to the surface of the endothelial cell, which has an overall negative charge, compared to an antigen binding molecule or antibody that does not have an increased pI. Therefore, for those agonistic antigen-binding molecules or antibodies that exhibit agonistic activity based on the contribution of binding activity to the Fc-gamma receptor (preferably Fc-gamma RIIb), the agonistic activity of the antigen-binding molecules or antibodies can be increased by combining the amino acid change(s) to increase Fc-gamma receptor (preferably Fc-gamma RIIb) and amino acid change(s) to increase pI.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела содержат вариант области Fc, который включает как аминокислотные изменения для увеличения связывающей активности в отношении Fc-гамма-рецептора (например, Fc-гамма RIIb), так и аминокислотные изменения для увеличения изоэлектрической точки (pI), как описано выше. Выше описано, что антигенсвязывающая молекула или антитело с повышенной pI более сильно притягивается физико-химическим кулоновским взаимодействием к поверхности эндотелиальной клетки, которая имеет общий отрицательный заряд, по сравнению с антигенсвязывающей молекулой или антителом, не имеющим повышенной изоэлектрической точки (pI). Следовательно, для тех анти-CD137 агонистических антигенсвязывающих молекул или антител, которые проявляют агонистическую активность против CD137 на основе вклада за счет связывающей активности с рецептором Fc-гамма (предпочтительно Fcгамма RIIb), агонистическая активность анти-CD137 антигенсвязывающих молекул против или антитела могут быть увеличены путем комбинирования аминокислотных изменений для увеличения рецептора Fcгамма (предпочтительно Fc-гамма RIIb) и аминокислотных изменений для увеличения pI.In one embodiment of the present invention, anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies comprise a variant Fc region that includes both amino acid changes to increase Fc gamma receptor binding activity (e.g., Fc gamma RIIb) and amino acid changes to increase isoelectric point (pI) as described above. As described above, an antigen-binding molecule or antibody with an increased pI is more strongly attracted by physicochemical Coulomb interaction to the surface of the endothelial cell, which has an overall negative charge, compared to an antigen-binding molecule or antibody that does not have an increased isoelectric point (pI). Therefore, for those anti-CD137 agonistic antigen-binding molecules or antibodies that exhibit agonistic activity against CD137 based on the contribution of binding activity to the Fc-gamma receptor (preferably Fcgamma RIIb), the agonistic activity of the anti-CD137 antigen-binding molecules against or antibodies can be increased by combining amino acid changes to increase Fcgamma receptor (preferably Fcgamma RIIb) and amino acid changes to increase pI.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в настоящем изобретении предусматривают полипептиды, включающие вариант области Fc с повышенной связывающей активностью в отношении Fc-гамма RIIb и с повышенной величиной pI, который включает по меньшей мере три аминокислотных изменения, включая (а) по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из положений 234,235, 236, 237, 238, 264, 268, 295, 326 и 330 в соответствии с нумерацией EU, и (б) по меньшей мере два аминокислотных изменения по меньшей мере в двух положениях, выбранных из группы, состоящей из положений 311, 343 и 413, согласно нумерации EU. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают полипептиды, содержащие вариант области Fc с повышенной связывающей активностью по отношению к Fc-гамма RIIb и повышенной величиной pI, которые включают аминокислотные изменения по любому из следующих пунктов (1)-(26):In one embodiment, the present invention provides polypeptides comprising a variant Fc region with increased binding activity for Fc-gamma RIIb and an increased pI value, which includes at least three amino acid changes, including (a) at least one an amino acid change at at least one position selected from the group consisting of positions 234,235, 236, 237, 238, 264, 268, 295, 326 and 330 according to EU numbering, and (b) at least two amino acid changes according to in at least two positions selected from the group consisting of provisions 311, 343 and 413, according to EU numbering. In another embodiment, the present invention provides polypeptides containing a variant Fc region with increased binding activity for Fc-gamma RIIb and an increased pI value, which include amino acid changes according to any of the following paragraphs (1)-(26):
(1) положения 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 и 413;(1) provisions 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 and 413;
(2) положения 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 и 413;(2) provisions 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 and 413;
(3) положения 234, 238, 250, 264, 307, 330, 343 и 413;(3) provisions 234, 238, 250, 264, 307, 330, 343 and 413;
(4) положения 234, 238, 264, 330, 343 и 413;(4) provisions 234, 238, 264, 330, 343 and 413;
(5) положения 234, 237, 238, 250, 307, 330, 343 и 413;(5) provisions 234, 237, 238, 250, 307, 330, 343 and 413;
(6) положения 234, 237, 238, 330, 343 и 413;(6) provisions 234, 237, 238, 330, 343 and 413;
(7) положения 235, 236, 268, 295, 326, 330, 311 и 343;(7) provisions 235, 236, 268, 295, 326, 330, 311 and 343;
(8) положения 234, 238, 250, 264, 307, 330, 311 и 343;(8) provisions 234, 238, 250, 264, 307, 330, 311 and 343;
(9) положения 234, 238, 264, 330, 311 и 343;(9) provisions 234, 238, 264, 330, 311 and 343;
(10) положения 234, 237, 238, 250, 307, 330, 311 и 343;(10) provisions 234, 237, 238, 250, 307, 330, 311 and 343;
(11) положения 234, 237, 238, 330, 311 и 343;(11) provisions 234, 237, 238, 330, 311 and 343;
(12) положения 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 343;(12) provisions 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 343;
(13) положения 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 343;(13) provisions 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 343;
(14) положения 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 413;(14) provisions 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 413;
(15) положения 214, 236, 268, 330 и 343;(15) provisions 214, 236, 268, 330 and 343;
(16) положения 214, 235, 236, 268, 330 и 343;(16) provisions 214, 235, 236, 268, 330 and 343;
(17) положения 214, 236, 268, 330 и 413;(17) provisions 214, 236, 268, 330 and 413;
(18) положения 214, 236, 268, 330, 343 и 413;(18) provisions 214, 236, 268, 330, 343 and 413;
(19) положения 214, 235, 236, 268, 330, 343 и 413;(19) provisions 214, 235, 236, 268, 330, 343 and 413;
(20) положения 214, 236, 268, 330 и 311;(20) provisions 214, 236, 268, 330 and 311;
(21) положения 214, 235, 236, 268, 330 и 311;(21) provisions 214, 235, 236, 268, 330 and 311;
(22) положения 214, 236, 268, 330, 311 и 343;(22) provisions 214, 236, 268, 330, 311 and 343;
(23) положения 214, 235, 236, 268, 330, 311 и 343;(23) provisions 214, 235, 236, 268, 330, 311 and 343;
(24) положения 214, 236, 268, 330, 311 и 413;(24) provisions 214, 236, 268, 330, 311 and 413;
(25) положения 214, 235, 236, 268, 330, 311 и 413;(25) provisions 214, 235, 236, 268, 330, 311 and 413;
(26) положения 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 311, в соответствии с нумерацией EU.(26) provisions 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 311, according to EU numbering.
- 52 046075- 52 046075
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения вариантные области Fc по настоящему изобретению включают любую комбинацию аминокислотных изменений, представленных ниже в табл. 4.In one embodiment of the present invention, the variant Fc regions of the present invention include any combination of amino acid changes presented in Table below. 4.
Таблица 4Table 4
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения варианты области Fc, содержащие любую комбинацию аминокислотных изменений, описанных выше в табл. 4, не содержат аминокислоту в положении 447 согласно нумерации EU.In one embodiment of the present invention, Fc region variants containing any combination of amino acid changes described in table above. 4 do not contain the amino acid at position 447 according to the EU numbering.
Специалистам в данной области известно, что по крайней мере одно изменение аминокислоты для увеличения связывающей активности в отношении Fc-гамма R (включая Fc-гамма RIIb) по сравнению с исходной областью Fc, как описано или предложено, например, в WO 2013/047752, WO 2013/125667, WO 2014/030728, WO 2014/163101 или WO 2017104783, и по меньшей мере одно аминокислотное изменение для увеличения pI по сравнению с исходной областью Fc, как описано или предложено, например, в WO 2017/104783, WO 2017/046994 и любой комбинации этих аминокислотных изменений могут быть использованы в дополнение к изменениям, представленным в качестве иллюстраций выше.Those skilled in the art will recognize that at least one amino acid change to increase binding activity for Fc-gamma R (including Fc-gamma RIIb) compared to the original Fc region, as described or proposed, for example, in WO 2013/047752, WO 2013/125667, WO 2014/030728, WO 2014/163101 or WO 2017104783, and at least one amino acid change to increase pI compared to the original Fc region, as described or proposed, for example, in WO 2017/104783, WO 2017 /046994 and any combination of these amino acid changes can be used in addition to the changes presented as illustrations above.
Кроме того, аминокислотные изменения, выполненные для других целей, могут быть объединены в варианте области Fc, описанной в настоящем изобретении. Например, аминокислотные замены, повышающие FcRn-связывающую активность (Hinton с соавт., J. Immunol. 176(1), 2006, 346-356; Dall'Acqua с соавт., J. Biol. Chem. 281(33), 2006, 23514-23524; Petkova с соавт., Intl. Immunol. 18(12), 2006, 1759-1769; Zalevsky с соавт., Nat. Biotechnol. 28(2), 2010, 157-159; WO 2006/019447; WO 2006/053301; WO 2009/086320), и могут быть добавлены аминокислотные замены для улучшения гетерогенности или стабильности антител (WO 2009/041613). В другом варианте полипептиды со свойством стимулирования клиренса антигена, которые описаны в WO 2011/122011, WO 2012/132067, WO 2013/046704 или WO 2013/180201, полипептиды со свойством специфического связывания с тканью-мишенью, которые описаны в WO 2013/180200, полипептиды со свойством многократного связывания с множеством молекул антигена, которые описаны в WO 2009/125825, WO 2012/073992 или WO 2013/047752, можно комбинировать с вариантом области Fc, описанным в настоящем изобретении. В другом варианте с целью придания связывающей активности другим антигенам, аминокислотные изменения, описанные в ЕР 1752471 и ЕР 1772465, могут быть объединены в CH3 варианта области Fc, описанного в настоящем изобретении.In addition, amino acid changes made for other purposes can be combined in the variant Fc region described in the present invention. For example, amino acid substitutions that increase FcRn-binding activity (Hinton et al., J. Immunol. 176(1), 2006, 346-356; Dall'Acqua et al., J. Biol. Chem. 281(33), 2006 , 23514-23524; Petkova et al., Intl. Immunol. 18(12), 2006, 1759-1769; Zalevsky et al., Nat. Biotechnol. 28(2), 2010, 157-159; WO 2006/019447; WO 2006/053301; WO 2009/086320), and amino acid substitutions can be added to improve heterogeneity or stability of antibodies (WO 2009/041613). In another embodiment, polypeptides with the property of promoting antigen clearance, which are described in WO 2011/122011, WO 2012/132067, WO 2013/046704 or WO 2013/180201, polypeptides with the property of specifically binding to a target tissue, which are described in WO 2013/180200 , polypeptides with the property of multiple binding to multiple antigen molecules, which are described in WO 2009/125825, WO 2012/073992 or WO 2013/047752, can be combined with the Fc region variant described in the present invention. In another embodiment, for the purpose of conferring binding activity to other antigens, the amino acid changes described in EP 1752471 and EP 1772465 can be combined into the CH3 variant Fc region described in the present invention.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению содержат константную область тяжелой цепи, содержащую любую одну аминокислотную последовательность, выбранную из SEQ ID NO: 64-85. Предпочтительно анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению содержат константную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 75 или 82.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention comprise a heavy chain constant region comprising any one amino acid sequence selected from SEQ ID NOs: 64-85. Preferably, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention comprise a heavy chain constant region comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 75 or 82.
В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению содержащие описанный выше вариIn one preferred embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention containing the above-described variant
- 53 046075 ант области Fc, обладают описанной выше CD137-связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения.- 53 046075 Fc region ant, have the CD137-binding activity described above, depending on the small molecule compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению содержат следующую вариабельную область и константную область: вариабельную область, содержащую описанную выше область HVR, вариабельную область тяжелой цепи и/или вариабельную область легкой цепи; и описанный выше вариант области Fc. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению могут быть любым анти-CD137 антителом, выбранным из антител, описанных в табл. 52.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention comprise the following variable region and constant region: a variable region comprising the above-described HVR region, a heavy chain variable region and/or a light chain variable region; and the Fc region variant described above. In one preferred embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies of the present invention can be any anti-CD137 antibody selected from the antibodies described in table. 52.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающие молекулы или антитела, связывающиеся с тем же эпитопом на CD137, что и анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, представленные в настоящем изобретении, в присутствии низкомолекулярного соединения (например, в присутствии 10 мкМ или более, 50 мкМ или более, 100 мкМ или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более, или 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения). Например, в одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают те антигенсвязывающие молекулы или антитела, которые связываются с одним и тем же эпитопом с антигенсвязывающими молекулами или антителами против CD137, содержащими А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 и/или А549/В167, описанными в табл. 17, в виде комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению, обладающие CD137-связывающей активностью, которая зависит от антигенсвязывающей активности, зависящей от низкомолекулярного соединения, распознают эпитоп, образованный комплексом, сформированным из антигена (например, CD137) и низкомолекулярного соединения (например, АТФ).In another embodiment, the present invention provides antigen-binding molecules or antibodies that bind to the same epitope on CD137 as the anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies of the present invention in the presence of a low molecular weight compound (for example, in the presence of 10 μM or more, 50 µM or more, 100 µM or more, 150 µM or more, 200 µM or more, or 250 µM or more of a low molecular weight compound). For example, in one embodiment, the present invention provides those antigen binding molecules or antibodies that bind to the same epitope with anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies containing A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487 /B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 and/or A549/B167, described in table. 17, as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies of the present invention having CD137 binding activity that is dependent on the small molecule dependent antigen binding activity recognize an epitope formed by a complex formed from an antigen (eg, CD137) and low molecular weight compound (for example, ATP).
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающие молекулы или антитела, которые конкурируют за связывание с CD137 с анmи-CD137 антигенсвязывающими молекулами или антителами по настоящему изобретению в присутствии низкомолекулярного соединения (например, в присутствии 10 мкМ или более, 50 мкМ или более, 100 мкМ или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более или 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения). Например, в одном из вариантов осуществления настоящего изобретения они конкурируют за сайт связывания с CD137 с анти-CD137 антигенсвязывающими молекулами или антителами, содержащими А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 и/или А549/В167, описанные в табл. 17, в виде комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи.In another embodiment, the present invention provides antigen-binding molecules or antibodies that compete for binding to CD137 with anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies of the present invention in the presence of a low molecular weight compound (e.g., in the presence of 10 μM or more, 50 μM or more, 100 μM or more, 150 µM or more, 200 µM or more, or 250 µM or more of a low molecular weight compound). For example, in one embodiment of the present invention, they compete for the CD137 binding site with anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies containing A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 and/or A549/B167, described in table. 17, as a heavy chain variable region/light chain variable region combination.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения анmи-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело по любому из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения является моноклональным антителом, в том числе химерным, гуманизированным или антителом человека. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анmи-CD137 антитело является фрагментом антитела, например, Fv, Fab, Fab', scFv, диателом или фрагментом F(ab')2. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антитело является антителом полной длины, например, интактным антителом IgG1 или антителом другого класса или изотипа согласно настоящему описанию.In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody according to any of the above embodiments of the present invention is a monoclonal antibody, including a chimeric, humanized or human antibody. In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antibody is an antibody fragment, for example, an Fv, Fab, Fab', scFv, diabody or F(ab') 2 fragment. In another embodiment of the present invention, the antibody is a full length antibody, for example, an intact IgG1 antibody or an antibody of another class or isotype as described herein.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения анmи-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело по любому из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения может включать любую из функций, по отдельности или в комбинации, как описано в разделах 1-7 ниже:In another embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody according to any of the above embodiments of the present invention may include any of the functions, individually or in combination, as described in sections 1-7 below:
1. Агонистическая активность анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела.1. Agonistic activity of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody.
В определенном варианте осуществления настоящего изобретения анmи-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело по настоящему изобретению обладает агонистической активностью CD137. Передача сигнала CD137 не только стимулирует секрецию IFN-γ и пролиферацию клеток NK (Buechele с соавт., 2012; Lin с соавт., 2008; Melero с соавт., 1998), но также повышает их выживаемость и активацию дендритных клеток (DC), на что указывает активация костимулирующих молекул и секреции цитокинов (Choi с соавт., 2009; Futagawa с соавт., 2002; Wilcox с соавт., 2002). Однако CD137 лучше всего охарактеризовать как костимулирующую молекулу, которая регулирует TCR-индуцированную активацию как в CD4'. так и в CD8' подмножеств Т-клеток. В комбинации с активацией TCR анти-CD137 агонистические антитела усиливают пролиферацию Т-клеток, стимулируют секрецию лимфокинов и снижают чувствительность Т-лимфоцитов к гибели клеток, вызванной активацией (рассмотрено в публикации Snelc соавт., 2011). Из этих явлений физиологические явления, наблюдаемые после передачи сигнала CD137 на Т-клетки, опосредуются расположенными ниже по цепи сигналами, активируемыми передачей сигналов CD137, такими как TRAF2, TRAF1, в частности NF-kappaB, JNK, Erk, Akt, сурвивин, Bcl-XL и/или Bcl-2 (Ward-Kavanagh с соавт., Immunity, 44, 2016, 1005).In a certain embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody of the present invention has CD137 agonist activity. CD137 signaling not only stimulates IFN-γ secretion and proliferation of NK cells (Buechele et al., 2012; Lin et al., 2008; Melero et al., 1998), but also increases their survival and dendritic cell (DC) activation. as indicated by activation of co-stimulatory molecules and cytokine secretion (Choi et al., 2009; Futagawa et al., 2002; Wilcox et al., 2002). However, CD137 is best characterized as a co-stimulatory molecule that regulates TCR-induced activation as in CD4'. and in CD8' T cell subsets. When combined with TCR activation, anti-CD137 agonist antibodies enhance T cell proliferation, stimulate lymphokine secretion, and reduce the sensitivity of T cells to activation-induced cell death (reviewed in Snelc et al., 2011). Of these phenomena, the physiological phenomena observed after CD137 signaling on T cells are mediated by downstream signals activated by CD137 signaling such as TRAF2, TRAF1, particularly NF-kappaB, JNK, Erk, Akt, survivin, Bcl- XL and/or Bcl-2 (Ward-Kavanagh et al., Immunity, 44, 2016, 1005).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения понятия анти-CD137 агонистическая антигенсвязывающая молекула или анти-CD137 агонистическое антитело означают антигенсвязывающую молекулу или антитело, которое, связываясь с CD137, трансдуцирует сигнал CD137 и значиIn one embodiment of the present invention, the terms anti-CD137 agonistic antigen binding molecule or anti-CD137 agonistic antibody mean an antigen binding molecule or antibody that, upon binding to CD137, transduces the CD137 signal and thus
- 54 046075 тельно индуцирует или усиливает секрецию IFN-гамма, пролиферацию и повышение выживаемости клеток NK; активация DC указывает на повышенную регуляцию секреции цитокинов и костимулирующих молекул; индукцию TCR; пролиферацию Т-клеток; и/или секрецию лимфокинов. В другом варианте осуществления настоящего изобретения понятия анти-CD137 агонистическая антигенсвязывающая молекула или анти-CD137 агонистическое антитело означают антигенсвязывающую молекулу или антитело, которое транедуцирует сигнал CD137 путем связывания с CD137 на Т-клетках и существенно индуцирует активацию NF-kappaB Т-клеток. Кроме того, антигенсвязывающая молекула или антитело проявляет агонистическую активность против CD137 означает, что наблюдается любое из вышеупомянутых физиологических явлении, когда антигенсвязывающая молекула или антитело связывается с CD137. Метод измерения агонистической активности CD137 подробно описан ниже в разделе В. Анализы.- 54 046075 specifically induces or enhances the secretion of IFN-gamma, proliferation and increased survival of NK cells; DC activation indicates upregulation of cytokine and co-stimulatory molecule secretion; TCR induction; T cell proliferation; and/or secretion of lymphokines. In another embodiment of the present invention, the terms anti-CD137 agonistic antigen binding molecule or anti-CD137 agonistic antibody mean an antigen binding molecule or antibody that transduces the CD137 signal by binding to CD137 on T cells and significantly induces NF-kappaB T cell activation. In addition, the antigen binding molecule or antibody exhibits agonistic activity against CD137 means that any of the above physiological phenomena is observed when the antigen binding molecule or antibody binds to CD137. The method for measuring CD137 agonistic activity is described in detail below in section B. Assays.
В определенном варианте осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело по настоящему изобретению обладает зависимой от низкомолекулярных соединений агонистической активностью по отношению к CD137. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения, не ограничивающем рамок охвата настоящего изобретения, агонистическая активность CD137 анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения выше, чем агонистическая активность CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения агонистическая активность в отношении CD137 анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в присутствии высокой концентрации низкомолекулярного соединения выше по сравнению с агонистической активностью CD137 в присутствии низкой концентрации низкомолекулярного соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения агонистическая активность в отношении CD137 анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в присутствии низкомолекулярного соединения больше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1х 103 раз или более, 2х103 раз или более, в 3х103 раз или более, в 5х103 раз или более, в 1х104 раз или более, в 2х104 раз или более, в 3х104 раз или более, в 5х104 раз или более, или в 1х105 раз или более по сравнению с агонистической активностью в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения.In a certain embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody of the present invention has small molecule dependent agonist activity against CD137. In one non-limiting embodiment of the present invention, the CD137 agonist activity of an anti-CD137 antigen binding molecule or anti-CD137 antibody in the presence of a small molecule compound is greater than the CD137 agonist activity in the absence of a small molecule compound. In another embodiment of the present invention, the CD137 agonist activity of an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody in the presence of a high concentration of a small molecule compound is greater compared to the CD137 agonist activity in the presence of a low concentration of a small molecule compound. In another embodiment of the present invention, the CD137 agonistic activity of the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody in the presence of the small molecule compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold greater or more, 30 times or more, 50 times or more, 100 times or more, 200 times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1x 10 3 times or more, 2x10 3 times or more, 3x10 3 times or more, 5x10 3 times or more, 1x10 4 times or more, 2x10 4 times or more, 3x10 4 times or more, 5x10 4 times or more, or 1x10 5 times or more compared to CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
Любая подходящая концентрация может быть выбрана в качестве концентрации низкомолекулярного соединения при условии, что обнаруживают различие в связывающей активности анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело трансдуцирует сигнал CD137, связываясь с CD137 на поверхности клетки. Следовательно, специалисту в данной области очевидно, что анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело, которое обладает зависимой от низкомолекулярного соединения связывающей активностью с CD137, обладает агонистической активностью по отношению к CD137, зависящей от низкомолекулярного соединения. Однако, с другой стороны, поскольку методы измерения связывающей активности и агонистической активности различны, специалист в данной области поймет, что концентрация низкомолекулярного соединения, при которой обнаруживают различия в связывающей активности, может отличаться от концентрации низкомолекулярного соединения, для которой обнаружено различие в агонистической активности (например, для анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, чья CD137-связывающая активность в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ выше в 2 раза или более по сравнению со связывающей активностью CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения, агонистическая активность CD137 (исследуемое значение) в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 10 мкМ может быть менее чем в 2 раза по сравнению с агонистической активностью CD137 (исследуемое значение) в отсутствие низкомолекулярного соединения). Кроме того, специалистам в данной области понятно, что определение агонистической активности может варьировать в зависимости от анализа агонистической активности в отношении CD137 (см. раздел В. Анализы).Any suitable concentration may be selected as the small molecule concentration as long as a difference in the binding activity of the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is detected. In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody transduces the CD137 signal by binding to CD137 on the surface of a cell. Therefore, one skilled in the art will appreciate that an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody that has small molecule-dependent binding activity to CD137 has small-molecule-dependent CD137 agonist activity. However, on the other hand, since the methods for measuring binding activity and agonist activity are different, one of ordinary skill in the art will appreciate that the concentration of the small molecule compound at which differences in binding activity are detected may be different from the concentration of the small molecule compound at which differences in agonist activity are detected ( for example, for an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody whose CD137 binding activity in the presence of a small molecule compound at a concentration of 10 μM is 2-fold or more greater than the CD137 binding activity in the absence of the small molecule compound, the CD137 agonist activity (test value) in the presence small molecule compound at a concentration of 10 μM may be less than 2-fold compared to CD137 agonist activity (test value) in the absence of small molecule compound). In addition, those skilled in the art will appreciate that the determination of agonist activity may vary depending on the assay for CD137 agonist activity (see section B. Assays).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело (i) проявляет агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в количестве 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ, и (ii) по существу не проявляет агонистической активности в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения или имеет низкую агонистическую активность в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения (по сравнению с присутствием низкомолекулярного соединения).In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody (i) exhibits agonistic activity against CD137 in the presence of a small molecule compound in an amount of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM, or 250 μM, and (ii ) exhibits essentially no CD137 agonistic activity in the absence of the small molecule compound or has low CD137 agonistic activity in the absence of the small molecule compound (compared to the presence of the small molecule compound).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если агонистическую активность анtu-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела оценивают с помощью а) Анализа агонистической активности (МКПК), подробно описанного в разделе В. Анализы, анти-CD137 агонистическая антигенсвязывающая молекула или антитело (i) проявляет агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 250 мкМ, и (ii) имеет низкую агонистическую активность в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярное соединение (по сравнению с наличием низкомолекулярного соединения). В другом варианте осуществления настоящего изо- 55 046075 бретения aHTu-CD137 агонистическая антигенсвязывающая молекула или антитело (i) проявляет агонистическую активность по отношению к CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в концентрации 250 мкМ, и (ii) по существу не проявляет агонистической активности в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, if the agonistic activity of an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is assessed using a) Agonistic Activity Assay (AAAs), described in detail in section B. Assays, the anti-CD137 agonistic antigen binding molecule or antibody (i) exhibits agonistic activity activity against CD137 in the presence of the small molecule compound at a concentration of 250 μM, and (ii) has low agonistic activity against CD137 in the absence of the small molecule compound (compared to the presence of the small molecule compound). In another embodiment of the present invention, the aHTu-CD137 agonist antigen-binding molecule or antibody (i) exhibits CD137 agonist activity in the presence of the small molecule compound at a concentration of 250 μM, and (ii) exhibits substantially no CD137 agonist activity. in the absence of a low molecular weight compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если агонистическую активность анtu-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела оценивают с помощью пункта б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена), подробно рассмотренного в разделе В. Анализы, анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело (i) проявляют агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения, и (ii) по существу не имеет агонистической активности в отношении CD137 или имеет более пониженную агонистическую активность в отсутствие низкомолекулярного соединения (по сравнению с таковой в присутствии низкомолекулярного соединения). Концентрации антител в анализе репортерного гена могут быть выбраны произвольно, например, конечная концентрация антитела составляет 0, 0,001, 0,01, 0,1,1 или 10 мкг/мл. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения конечная концентрация антитела составляет 0,1 мкг/мл или 1 мкг/мл.In one embodiment of the present invention, if the agonistic activity of an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is assessed using item b) Agonistic activity assay (reporter gene assay) discussed in detail in section B. Assays, anti-CD137 antigen binding molecule or antibody (i) exhibit CD137 agonist activity in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM, or 250 μM small molecule compound, and (ii) have essentially no CD137 agonist activity or have reduced agonist activity in the absence of the small molecule compounds (compared to that in the presence of a low molecular weight compound). The antibody concentrations in the reporter gene assay can be selected arbitrarily, for example, the final antibody concentration is 0, 0.001, 0.01, 0.1.1 or 10 μg/ml. In a preferred embodiment of the present invention, the final concentration of the antibody is 0.1 μg/ml or 1 μg/ml.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения, когда конечная концентрация антитела составляет 0,1 мкг/мл в пункте б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена), подробно рассмотренного в разделе В. Анализы, (i) агонистическая активность (относительная световая единица (RLU)) анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в присутствии 10 мкМ низкомолекулярного соединения является 2-кратной или более, 3-кратной или более, 5кратной или более, 10-кратной или более, 20-кратной или более, 30-кратной или более, 50-кратной или более, 60-кратной или более, 70-кратной или более, 80-кратной или более или 90-кратной или более по сравнению с (ii) агонистической активностью в отношении CD137 (относительная световая единица) в отсутствие низкомолекулярного соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если конечная концентрация антитела составляет 0,1 мкг/мл в пункте б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена), подробно рассмотренного в разделе В. Анализы, (i) агонистическая активность в отношении CD137 (относительная световая единица) антигенсвязывающей молекулы или антитела в отношении CD137 в присутствии 100 мкМ низкомолекулярного соединения является 2-кратной или более, 3-кратной или более, 5-кратной или более, 10-кратной или более, 20-кратной или более, 30-кратной или более, 50-кратной или более, 60-кратной или более, 70-кратной или более, 80кратной или более или 90- кратной или более по сравнению с (ii) агонистической активностью CD137 (относительная световая единица) в отсутствие низкомолекулярного соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения, когда конечная концентрация антител составляет 0,1 мкг/мл в пункте б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена), подробно рассмотренного в разделе В. Анализы, (i) агонистическая активность в отношении CD137 (в относительных световых единицах (RLU)) анти-CD137 агонистической антигенсвязывающей молекулы или антитела в присутствии 250 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более, или в 90 раз или более по сравнению с (ii) агонистической активностью в отношении CD137 (в относительных световых единицах) в отсутствие низкомолекулярного соединения. В любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения, дополнительно, 0,1 мкг/мл анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела по существу не проявляет агонистической активности в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, when the final antibody concentration is 0.1 μg/ml in b) Agonist activity assay (reporter gene assay), discussed in detail in section B. Assays, (i) agonist activity (relative light unit ( RLU) of an anti-CD137 antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody in the presence of 10 μM small molecule compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold or more, 30-fold or more, 50-fold or more, 60-fold or more, 70-fold or more, 80-fold or more, or 90-fold or more compared to (ii) CD137 agonist activity (relative light unit) in the absence low molecular weight compound. In one embodiment of the present invention, if the final antibody concentration is 0.1 μg/ml in b) Agonist activity assay (reporter gene assay), discussed in detail in section B. Assays, (i) CD137 agonist activity (relative light unit) of antigen binding molecule or antibody against CD137 in the presence of 100 μM small molecule compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold or more, 30-fold or greater than, 50-fold or greater, 60-fold or greater, 70-fold or greater, 80-fold or greater, or 90-fold or greater than (ii) CD137 agonist activity (relative light unit) in the absence of the small molecule compound. In one embodiment of the present invention, when the final antibody concentration is 0.1 μg/ml in b) Agonist activity assay (reporter gene assay), discussed in detail in section B. Assays, (i) CD137 agonist activity (c relative light units (RLU)) of an anti-CD137 agonist antigen-binding molecule or antibody in the presence of 250 μM small molecule compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold, or more than, 30 times or more, 50 times or more, 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more compared to (ii) CD137 agonist activity ( in relative light units) in the absence of a low molecular weight compound. In any of the above embodiments of the present invention, additionally, 0.1 μg/ml of anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody exhibits substantially no CD137 agonistic activity in the absence of the small molecule compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения когда конечная концентрация антител составляет 1 мкг/мл в пункте б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена), подробно рассмотренного в разделе В. Анализы, (i) агонистическая активность в отношении CD137 (в относительных световых единицах (RLU)) анти-CD137 агонистической антигенсвязывающей молекулы или антитела в присутствии 10 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более, или в 90 раз или более по сравнению с (ii) агонистической активностью в отношении CD137 (в относительных световых единицах) в отсутствие низкомолекулярного соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если итоговая концентрация антитела составляет 0,1 мкг/мл в пункте б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена), подробно рассмотренного в разделе В. Анализы, (i) агонистическая активность в отношении CD137 (в относительных световых единицах (RLU)) анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в присутствии 100 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более, или в 90 раз или более по сравнению с (ii) агонистической активностью в отношении CD137 (в относительных световых единицах) в отсутствие низкомолекулярного соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если итоговая концентрация антитела составляет 0,1 мкг/мл в пункте б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена), подробно рассмотренного в разделе В. Анализы, (i) агонистиIn one embodiment of the present invention, when the final antibody concentration is 1 μg/ml in b) Agonist activity assay (reporter gene assay), discussed in detail in section B. Assays, (i) CD137 agonist activity (in relative light units (RLU)) anti-CD137 agonistic antigen-binding molecule or antibody in the presence of 10 μM small molecule compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more, 10-fold or more, 20-fold or more, 30 times or more, 50 times or more, 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more compared to (ii) CD137 agonist activity (in relative light units) in the absence of a low molecular weight compound. In one embodiment of the present invention, if the final antibody concentration is 0.1 μg/ml in b) Agonist activity assay (reporter gene assay), discussed in detail in section B. Assays, (i) CD137 agonist activity (in relative terms) light units (RLU)) of anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody in the presence of 100 μM small molecule compound is 2 times or more, 3 times or more, 5 times or more, 10 times or more, 20 times or more, 30-fold or more, 50-fold or more, 60-fold or more, 70-fold or more, 80-fold or more, or 90-fold or more compared to (ii) CD137 agonist activity (in relative terms) light units) in the absence of a low molecular weight compound. In one embodiment of the present invention, if the final antibody concentration is 0.1 μg/ml in b) Agonistic activity assay (reporter gene assay), discussed in detail in section B. Assays, (i) agonistic
- 56 046075 ческая активность в отношении CD137 (в относительных световых единицах (RLU)) aHmu-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в присутствии 250 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более, или в 90 раз или более по сравнению с (ii) агонистической активностью в отношении CD137 (в относительных световых единицах) в отсутствие низкомолекулярного соединения. В любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения, дополнительно, 1 мкг/мл aнти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела по существу не проявляет агонистической активности в отношении CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения.- 56 046075 ical activity against CD137 (in relative light units (RLU)) of aHmu-CD137 antigen-binding molecule or antibody in the presence of 250 μM low molecular weight compound is greater than 2 times or more, 3 times or more, 5 times or more, 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more (ii) CD137 agonist activity (in relative light units) in the absence of the small molecule compound. In any of the above embodiments of the present invention, additionally, 1 μg/ml of anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody exhibits substantially no CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound.
2. Фрагменты антител.2. Antibody fragments.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматриваемое антитело является фрагментом антитела. К фрагментам антител относятся, но ими перечень не ограничивается, фрагменты Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, Fv и scFv, а также другие фрагменты, описанные ниже. Обзор по фрагментам антител опубликован Hudson с соавт. Nat. Med. 9, 2003, 129-134. Обзор фрагментов scFv см., например, в публикации Pluckthun в The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, под ред. Rosenburg и Moore, (изд-во Springer-Verlag, Нью-Йорк), 113, 1994, 269-315; см. также WO 93/16185; US 5571894 и US 5587458. Для обсуждения фрагментов Fab и F(ab')2, содержащих остатки эпитопа, связывающего рецептор спасения, и имеющих увеличенный период полужизни in vivo, см. US 5869046.In some embodiments of the present invention, the antibody provided is an antibody fragment. Antibody fragments include, but are not limited to, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab') 2 , Fv and scFv fragments, as well as other fragments described below. A review of antibody fragments was published by Hudson et al. Nat. Med. 9, 2003, 129-134. For a review of scFv fragments, see, for example, Pluckthun in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, ed. Rosenburg and Moore, (Springer-Verlag, New York), 113, 1994, 269-315; see also WO 93/16185; US 5,571,894 and US 5,587,458. For a discussion of Fab and F(ab') 2 fragments containing salvage receptor binding epitope residues and having an increased half-life in vivo, see US 5,869,046.
Диатела и фрагменты антитела с двумя сайтами связывания антигена могут быть бивалентными или биспецифичными. См., например, ЕР 404097; WO 1993/01161; Hudson с соавт., Nat. Med. 9, 2003, 129134; Hollinger с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1993, 6444-6448. Триатела и тетратела также описаны в публикации Hudson с соавт., Nat. Med. 9, 2003, 129-134.Diabodies and antibody fragments with two antigen binding sites can be bivalent or bispecific. See, for example, EP 404097; WO 1993/01161; Hudson et al., Nat. Med. 9, 2003, 129134; Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1993, 6444-6448. Tribodies and tetrabodies are also described in Hudson et al., Nat. Med. 9, 2003, 129-134.
Однодоменные антитела представляют собой фрагменты антител, содержащие весь или часть вариабельного домена тяжелой цепи или весь или часть вариабельного домена легкой цепи антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения однодоменное антитело является однодоменным антителом человека (фирма Domantis, Inc., Уолтем, Массачусетс; см., например, US 6248516).Single domain antibodies are antibody fragments containing all or part of the heavy chain variable domain or all or part of the light chain variable domain of the antibody. In some embodiments, the single domain antibody is a human single domain antibody (Domantis, Inc., Waltham, Mass.; see, for example, US Pat. No. 6,248,516).
Фрагменты антител могут быть получены различными методами, включая, но ими не ограничиваясь, протеолитическое расщепление интактного антитела, а также выработку рекомбинантными клетками-хозяевами (например, Е. coli или фаг) по описанию настоящего изобретения.Antibody fragments can be produced by various methods, including, but not limited to, proteolytic cleavage of the intact antibody, as well as production by recombinant host cells (eg, E. coli or phage) as described herein.
3. Химерные и гуманизированные антитела.3. Chimeric and humanized antibodies.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусмотренное антитело является химерным антителом. Некоторые химерные антитела описаны, например, в US 4816567; Morrison с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 1984, 6851-6855. В одном из примеров химерное антитело содержит вариабельную область, не относящуюся к антителу человека (например, вариабельную область, производную от мыши, крысы, хомяка, кролика или приматов, но не от человека, таких как обезьяна), и константную область человека. В другом примере химерное антитело представляет собой антитело переключенного класса, в котором класс или подкласс был изменен по сравнению с классом родительского антитела. Химерные антитела включают их антигенсвязывающие фрагменты.In some embodiments of the present invention, the antibody provided is a chimeric antibody. Some chimeric antibodies are described, for example, in US 4816567; Morrison et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 1984, 6851-6855. In one example, a chimeric antibody comprises a non-human variable region (eg, a variable region derived from mouse, rat, hamster, rabbit, or a non-human primate such as a monkey) and a human constant region. In another example, a chimeric antibody is a class switched antibody in which the class or subclass has been changed from the class of the parent antibody. Chimeric antibodies include their antigen-binding fragments.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения химерное антитело представляет собой гуманизированное антитело. Обычно антитело, не являющееся антителом человека, гуманизируют для снижения иммуногенности для человека, сохраняя при этом специфичность и аффинность исходного, не являющегося антителом человека, антитела. Обычно гуманизированное антитело включает один или более вариабельных доменов, в которых HVR, например, CDR (или их части) происходят из антитела, не являющегося антителом человека, a FR (или их части) происходят из последовательностей антитела человека. Гуманизированное антитело необязательно также может содержать по меньшей мере часть константной области человека. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения некоторые остатки FR в гуманизированном антителе заменены соответствующими остатками антитела, не являющегося антителом человека (например, антитела, из которого получены остатки HVR), например, для восстановления или улучшения специфичности или аффинности антитела.In some embodiments of the present invention, the chimeric antibody is a humanized antibody. Typically, a non-human antibody is humanized to reduce immunogenicity in humans while maintaining the specificity and affinity of the original non-human antibody. Typically, a humanized antibody includes one or more variable domains in which the HVRs, eg, CDRs (or portions thereof) are derived from a non-human antibody, and the FRs (or portions thereof) are derived from human antibody sequences. The humanized antibody may also optionally contain at least a portion of a human constant region. In some embodiments of the present invention, certain FR residues in a humanized antibody are replaced with corresponding residues of a non-human antibody (eg, an antibody from which the HVR residues are derived), for example, to restore or improve the specificity or affinity of the antibody.
Гуманизированные антитела и методы их получения рассмотрены, например, Almagro и Fransson, Front. Biosci. 13, 2008, 1619-1633, а также описаны, например, в публикациях Riechmann с соавт., Nature 332, 1988, 323-329; Queen с соавт., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 86, 1989, 10029-10033; US 5821337, US 7527791, US 6982321, US 7087409; Kashmiri с соавт., Methods 36, 2005, 25-34 (описание трансплантации области, определяющей специфичность (SDR)); Padlan, Mol. Immunol. 28, 1991, 489-498 (описание перекладки); Dall'Acqua с соавт., Methods 36, 2005, 43-60 (описание перетасовки FR); Osbourn с соавт., Methods 36, 2005, 61-68; Klimka с соавт., Br. J. Cancer, 83, 2000, 252-260 (описание подхода направленного отбора к перетасовке FR).Humanized antibodies and methods for their production are discussed, for example, Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13, 2008, 1619-1633, and also described, for example, in the publications of Riechmann et al., Nature 332, 1988, 323-329; Queen et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 86, 1989, 10029-10033; US 5821337, US 7527791, US 6982321, US 7087409; Kashmiri et al., Methods 36, 2005, 25-34 (describing specificity determining region (SDR) transplantation); Padlan, Mol. Immunol. 28, 1991, 489-498 (description of translation); Dall'Acqua et al., Methods 36, 2005, 43-60 (describing FR shuffling); Osbourn et al., Methods 36, 2005, 61-68; Klimka et al., Br. J. Cancer, 83, 2000, 252-260 (describing a directed selection approach to FR shuffling).
Области каркасного участка человека, которые можно использовать для гуманизирования, включают, но ими не ограничиваются: каркасные области, выбранные с использованием метода наилучшего соответствия (см., например, Sims с соавт. J. Immunol. 151, 1993, 2296); области каркасного участка, производного от консенсуснои последовательности антител человека определенной подгруппы вариабельных областей легкой или тяжелой цепи (см., например, Carter с соавт. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89,Human framework regions that can be used for humanization include, but are not limited to: framework regions selected using the best fit method (see, for example, Sims et al. J. Immunol. 151, 1993, 2296); framework region derived from the consensus sequence of human antibodies of a certain subset of the light or heavy chain variable regions (see, for example, Carter et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89,
- 57 046075- 57 046075
1992, 4285; and Presta с соавт. J. Immunol., 151:2623 (1993)); зрелые (соматически мутировавшие) каркасные области человека или каркасные области зародышевой линии человека (см., например, Almagro и Fransson, Front. Biosci. 13, 2008, 1619-1633); и области каркасного участка, полученные из скрининговых библиотек FR (См., например, Васа с соавт., J. Biol. Chem. 272, 1997, 10678-10684; Rosok с соавт., J. Biol. Chem. 271, 1996, 22611-22618).1992, 4285; and Presta et al. J. Immunol., 151:2623 (1993)); mature (somatically mutated) human or germline human frameworks (see, for example, Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13, 2008, 1619-1633); and framework regions obtained from FR screening libraries (See, for example, Vasa et al., J. Biol. Chem. 272, 1997, 10678-10684; Rosok et al., J. Biol. Chem. 271, 1996, 1996 22611-22618).
4. Антитела человека.4. Human antibodies.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусмотренное в настоящем изобретении антитело является антителом человека. Антитела человека можно получить с использованием различных методик, известных в данной области. Антитела человека в общем описаны в публикациях van Dijk, van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5, 2001, 368-374, и Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20, 2008, 450-459.In some embodiments, the antibody provided herein is a human antibody. Human antibodies can be obtained using various techniques known in the art. Human antibodies are generally described in the publications of van Dijk, van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5, 2001, 368-374, and Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20, 2008, 450-459.
Антитела человека могут быть получены путем введения иммуногена трансгенному животному, которое было модифицировано для выработки интактных антител человека или интактных антител с вариабельными областями человека в ответ на антигенную пробу. Такие животные обычно содержат все или часть локусов иммуноглобулина человека, которые заменяют эндогенные локусы иммуноглобулина, или которые присутствуют вне хромосом или случайным образом интегрированы в хромосомы животного. У таких трансгенных мышей локусы эндогенного иммуноглобулина обычно инактивированы. Для обзора методов получения антител человека от трансгенных животных см. Lonberg, Nat. Biotech. 23, 2005, 1117-1125. См. также, например, патенты US 6075181 и US 6150584, описывающие технологию XENOMOUSE™; патент US 5770429, описывающий технологию HuMab (зарегистрированная торговая марка); патент US 7041870, описывающий технологию K-М MOUSE (зарегистрированная торговая марка), и публикацию патентной заявки US 2007/0061900, описывающую технологию VelociMouse (зарегистрированная торговая марка). Вариабельные области человека из интактных антител, вырабатываемые такими животными, можно дополнительно модифицировать, например, путем комбинирования с другой константной областью человека.Human antibodies can be produced by administering an immunogen to a transgenic animal that has been modified to produce intact human antibodies or intact human variable region antibodies in response to an antigen challenge. Such animals typically contain all or part of human immunoglobulin loci that replace endogenous immunoglobulin loci, or that are present extrachromosomally or randomly integrated into the animal's chromosomes. In such transgenic mice, endogenous immunoglobulin loci are usually inactivated. For a review of methods for producing human antibodies from transgenic animals, see Lonberg, Nat. Biotech. 23, 2005, 1117-1125. See also, for example, US 6,075,181 and US 6,150,584, which describe XENOMOUSE™ technology; US patent 5,770,429 describing HuMab technology (registered trademark); patent US 7041870 describing K-M MOUSE technology (registered trademark), and patent application publication US 2007/0061900 describing VelociMouse technology (registered trademark). Human variable regions from intact antibodies produced by such animals can be further modified, for example, by combining with another human constant region.
Антитела человека также можно получить методами на основе гибридом. Описаны клеточные линии миеломы человека и гетеромиеломы мыши-человека для выработки моноклональных антител человека. (См., например, Kozbor J. Immunol., 133, 1984, 3001); Brodeur с соавт. в кн.: Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, 1987, 51-63, изд-во Marcel Dekker, Inc., Нью-Йорк); Boerner с соавт., J. Immunol., 147, 1991, 86.) Антитела человека, полученные с помощью технологии гибридом Вклеток человека, также описаны Li с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103, 2006, 3557-3562. Дополнительные методы описаны, например, в US 7189826 (описание выработки моноклональных антител IgM человека линиями гибридомных клеток); Ni, Xiandai Mianyixue, 26(4), 2006, 265-268 (описание гибридом клеток человека с клетками человека). Технология гибридомы человека (технология Trioma) также описана в работах Vollmers, Brandlein, Histology and Histopathology, 20(3), 2005, 927-937, и Vollmers, Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 27(3), 2005, 185-191.Human antibodies can also be obtained using hybridoma-based methods. Human myeloma and mouse-human heteromyeloma cell lines have been described for the production of human monoclonal antibodies. (See, for example, Kozbor J. Immunol., 133, 1984, 3001); Brodeur et al. in: Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, 1987, 51-63, Marcel Dekker, Inc., New York); Boerner et al., J. Immunol., 147, 1991, 86.) Human antibodies produced using human B cell hybridoma technology are also described by Li et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103, 2006, 3557-3562. Additional methods are described, for example, in US 7189826 (describing the production of human IgM monoclonal antibodies by hybridoma cell lines); Ni, Xiandai Mianyixue, 26(4), 2006, 265-268 (description of human cell-human cell hybridomas). Human hybridoma technology (Trioma technology) is also described in Vollmers, Brandlein, Histology and Histopathology, 20(3), 2005, 927-937, and Vollmers, Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 27(3), 2005 , 185-191.
Антитела человека также могут быть получены путем выделения последовательностей вариабельного домена клона Fv, выбранных из полученных от человека библиотек фагового дисплея. Такие последовательности вариабельного домена затем можно комбинировать с желаемым константным доменом человека. Методы отбора человеческих антител из библиотек антител описаны ниже.Human antibodies can also be generated by isolating Fv clone variable domain sequences selected from human-derived phage display libraries. Such variable domain sequences can then be combined with the desired human constant domain. Methods for selecting human antibodies from antibody libraries are described below.
5. Антитела, производные от библиотек.5. Antibodies derived from libraries.
Антитела по настоящему изобретению могут быть выделены путем скрининга комбинаторных библиотек на антитела с требуемой активностью или активностями. Например, в данной области известны различные методы создания библиотек фагового дисплея и скрининга таких библиотек на антитела, обладающие требуемыми характеристиками связывания. Такие методы рассмотрены, например, в работе Hoogenboom с соавт., Methods in Molecular Biology 178, 2001,1-37, под ред. O'Brien с соавт., изд-во Human Press, Тотова, Нью-Джерси, а также описаны, например, McCafferty с соавт., Nature 348, 552-554; Clackson с соавт., Nature 352, 1991, 624-628; Marks с соавт., J. Mol. Biol. 222, 1992, 581-597; Marks, Bradbury, Methods in Molecular Biology 248, 2003, 161-175 (под ред. Lo, изд-во Human Press, Тотова, НьюДжерси); Sidhu с соавт., J. Mol. Biol. 338(2), 2004, 299-310; Lee с соавт., J. Mol. Biol. 340(5), 2004, 10731093; Fellouse, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34), 2004, 12467-12472; Lee с соавт., J. Immunol. Methods 284(1-2), 2004, 119-132.Antibodies of the present invention can be isolated by screening combinatorial libraries for antibodies with the desired activity or activities. For example, various methods are known in the art for constructing phage display libraries and screening such libraries for antibodies having the desired binding characteristics. Such methods are discussed, for example, in the work of Hoogenboom et al., Methods in Molecular Biology 178, 2001, 1-37, ed. O'Brien et al., Human Press, Totowa, NJ, and also described, for example, by McCafferty et al., Nature 348, 552-554; Clackson et al., Nature 352, 1991, 624-628; Marks et al., J. Mol. Biol. 222, 1992, 581-597; Marks, Bradbury, Methods in Molecular Biology 248, 2003, 161-175 (ed. Lo, Human Press, Totowa, NJ); Sidhu et al., J. Mol. Biol. 338(2), 2004, 299-310; Lee et al., J. Mol. Biol. 340(5), 2004, 10731093; Fellowes, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101(34), 2004, 12467-12472; Lee et al., J. Immunol. Methods 284(1-2), 2004, 119-132.
В некоторых методах фагового дисплея репертуары генов VH и VL отдельно клонируют с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и случайным образом рекомбинируют в фаговых библиотеках, которые затем могут быть проверены на антигенсвязывающий фаг, как описано Winter с соавт., Ann. Rev. Immunol., 12, 1994, 433-455. Фаг обычно отображает фрагменты антител либо в виде одноцепочечных фрагментов Fv (scFv), либо в виде фрагментов Fab. Библиотеки из иммунизированных источников предоставляют антитела с высоким сродством к иммуногену без необходимости конструирования гибридом. В другом варианте наивный репертуар можно клонировать (например, из человека) для обеспечения единого источника антител к широкому спектру чужеродных, а также аутоантигенов без какой-либо иммунизации, как описано Griffiths с соавт., EMBO J, 12, 1993, 725-734. Наконец, наивные библиотеки также могут быть получены синтетически путем клонирования неупорядоченных сегментов V-гена из ствоIn some phage display methods, the VH and VL gene repertoires are separately cloned by polymerase chain reaction (PCR) and randomly recombined into phage libraries, which can then be screened for antigen-binding phage, as described by Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12, 1994, 433-455. Phage typically displays antibody fragments as either single chain Fv fragments (scFv) or Fab fragments. Libraries from immunized sources provide antibodies with high affinity for the immunogen without the need to construct hybridomas. Alternatively, the naïve repertoire can be cloned (eg from humans) to provide a single source of antibodies to a wide range of foreign as well as self-antigens without any immunization, as described by Griffiths et al., EMBO J, 12, 1993, 725-734. Finally, naïve libraries can also be prepared synthetically by cloning disordered V gene segments from
- 58 046075 ловых клеток и использования праймеров ПЦР, содержащих случайную последовательность, для кодирования высоко вариабельных участков CDR3 и для выполнения реаранжировки in vitro, как описано Hoogenboom and Winter, J. Мол. Biol., 227, 1992, 381-388. Патентные публикации, описывающие фаговые библиотеки человеческих антител, включают, например, US 5750373 и публикации патентных заявок 2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/0292936 и 2009/0002360.- 58 046075 human cells and using random sequence PCR primers to encode highly variable CDR3 regions and to perform in vitro rearrangements as described by Hoogenboom and Winter, J. Mol. Biol., 227, 1992, 381-388. Patent publications describing human antibody phage libraries include, for example, US 5750373 and patent application publications 2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/02 92936 and 2009/0002360 .
Антитела или фрагменты антител, выделенные из библиотек антител человека, в настоящем изобретении расценивают как антитела человека или фрагменты антител человека.Antibodies or antibody fragments isolated from human antibody libraries are regarded as human antibodies or human antibody fragments in the present invention.
Антигенсвязывающие молекулы или антитела, обладающие антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения по настоящему изобретению, могут быть выбраны путем проведения скрининга библиотеки антигенсвязывающих молекул. В качестве такой библиотеки можно использовать описанные выше комбинаторные библиотеки.Antigen binding molecules or antibodies having antigen binding activity dependent on the small molecule compound of the present invention can be selected by screening a library of antigen binding molecules. The combinatorial libraries described above can be used as such a library.
Библиотека антигенсвязывающих молекул может быть с непредвзятым репертуаром антигенсвязывающих молекул (наивная библиотека) или может иметь необъективный репертуар антигенсвязывающих молекул. Примеры библиотеки последнего типа включают библиотеку антигенсвязывающих молекул, которым заранее придается связывающая активность по отношению к определенному соединению. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения библиотека антигенсвязывающих молекул представляет собой библиотеку антигенсвязывающих молекул, в которую заранее вносятся аминокислотные изменения для придания связывающей активности по отношению к определенному соединению. Примеры библиотек такого типа включают библиотеки, описанные, например, в публикации международной патентной заявки WO 2015/083764.A library of antigen binding molecules may have an unbiased repertoire of antigen binding molecules (naive library) or may have a biased repertoire of antigen binding molecules. Examples of the latter type of library include a library of antigen-binding molecules that are precontained with binding activity for a particular compound. In one embodiment of the present invention, the library of antigen binding molecules is a library of antigen binding molecules in which amino acid changes are previously made to impart binding activity for a particular compound. Examples of libraries of this type include those described, for example, in international patent application publication WO 2015/083764.
6. Мультиспецифические антитела.6. Multispecific antibodies.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антитело, которое является мультиспецифическим, например, биспецифическим антителом. Мультиспецифические антитела - это моноклональные антитела, которые обладают специфичностью связывания по крайней мере с двумя разными сайтами. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения одна из специфичностей связывания предназначена для CD137, а другая - для любого другого антигена. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения биспецифические антитела могут связываться с двумя разными эпитопами CD137. Биспецифические антитела также можно использовать для локализации цитотоксических агентов в клетках, экспрессирующих CD137. Биспецифические антитела можно получить в виде полноразмерных антител или фрагментов антител.In some embodiments, the present invention provides an antibody that is multispecific, such as a bispecific antibody. Multispecific antibodies are monoclonal antibodies that have binding specificity to at least two different sites. In some embodiments of the present invention, one of the binding specificities is for CD137 and the other is for any other antigen. In some embodiments of the present invention, bispecific antibodies can bind to two different epitopes of CD137. Bispecific antibodies can also be used to localize cytotoxic agents to cells expressing CD137. Bispecific antibodies can be obtained as full-length antibodies or antibody fragments.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению являются биспецифическими антителами, одна составляющая которых связывается с CD137, зависящая от низкомолекулярного соединения, а другая составляющая связывается с антигеном, отличным от CD137. Антиген, отличный от CD137, особенно не ограничен по структуре. Другими словами, антиген может быть неорганическим или органическим соединением. Типичные антигены описывают в настоящем изобретении (например, в разделе IV.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies of the present invention are bispecific antibodies, one moiety that binds to CD137, dependent on a small molecule compound, and the other moiety that binds to a non-CD137 antigen. Antigen other than CD137 is not particularly limited in structure. In other words, the antigen may be an inorganic or organic compound. Representative antigens are described in the present invention (for example, in section IV.
Композиции и способы (антигенсвязывающие молекулы, активность связывания которых с антигенами изменяется в зависимости от концентрации низкомолекулярного соединения), Б. Антиген). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигены предпочтительно представляют собой антигены, экспрессируемые в раковых клетках, иммунных клетках, стромальных клетках или подобных клетках в раковых тканях или воспалительных тканях.Compositions and methods (antigen-binding molecules, the binding activity of which to antigens varies depending on the concentration of the low molecular weight compound), B. Antigen). In one embodiment of the present invention, the antigens are preferably antigens expressed in cancer cells, immune cells, stromal cells or the like in cancerous tissues or inflammatory tissues.
Методы получения мультиспецифических антител включают, но не ограничиваются ими, рекомбинантную совместную экспрессию двух пар тяжелая цепь-легкая цепь иммуноглобулина, имеющих разные специфичности (см. Milstein, Cuello, Nature 305, 1983, 537; WO 93/08829; Traunecker с соавт., EMBO J. 10, 1991, 3655), конструирование по типу выступ-во-впадину (см., например, US 5731168). Мультиспецифические антитела также могут быть получены путем создания электростатических управляющих эффектов для создания Fc-гетеродимерных молекул антитела (WO 2009/089004 A1); перекрестным сшиванием двух или более антител или фрагментов (см., например, US 4676980; Brennan с соавт., Science, 229, 1985, 81); использованием лейциновых молний для выработки биспецифических антител (см., например, Kostelny с соавт., J. Immunol., 148(5), 1992, 1547-1553); использованием технологии диател для получения фрагментов биспецифических антител (см., например, Hollinger с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 1993, 6444-6448); использованием димеров одноцепочечных Fv (scFv) (см., например, Gruber с соавт., J. Immunol., 152, 1994, 5368); и получением триспецифических антител, как описано, например, Tutt с соавт. J. Immunol. 147, 1991, 60.Methods for producing multispecific antibodies include, but are not limited to, recombinant coexpression of two immunoglobulin heavy chain-light chain pairs having different specificities (see Milstein, Cuello, Nature 305, 1983, 537; WO 93/08829; Traunecker et al., EMBO J. 10, 1991, 3655), projection-to-recess design (see, for example, US 5731168). Multispecific antibodies can also be produced by creating electrostatic driving effects to create Fc heterodimeric antibody molecules (WO 2009/089004 A1); cross-linking two or more antibodies or fragments (see, for example, US 4676980; Brennan et al., Science, 229, 1985, 81); the use of leucine zippers to produce bispecific antibodies (see, for example, Kostelny et al., J. Immunol., 148(5), 1992, 1547-1553); using diabody technology to produce bispecific antibody fragments (see, for example, Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 1993, 6444-6448); using single chain Fv (scFv) dimers (see, for example, Gruber et al., J. Immunol., 152, 1994, 5368); and the production of trispecific antibodies, as described, for example, by Tutt et al. J. Immunol. 147, 1991, 60.
Сконструированные антитела с тремя или более функциональными антигенсвязывающими сайтами, включая мультивалентные антитела-осьминоги, также включены в настоящее изобретение (см., например US 2006/0025576 А1).Engineered antibodies with three or more functional antigen binding sites, including multivalent octopus antibodies, are also included in the present invention (see, for example, US 2006/0025576 A1).
В настоящем изобретении также предусматривают Fab двойного действия или DAF (Dual acting Fab), содержащий антигенсвязывающий сайт, который связывается с CD137, а также с другим отличающимся антигеном (см., например, US 2008/0069820).The present invention also provides a Dual Acting Fab or DAF (Dual Acting Fab) containing an antigen binding site that binds to CD137 as well as another different antigen (see, for example, US 2008/0069820).
7. Варианты антител.7. Antibody variants.
- 59 046075- 59 046075
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают варианты аминокислотной последовательности представленных антител. Например, может быть желательно улучшить аффинность и/или другие биологические свойства антитела. Варианты аминокислотной последовательности антитела могут быть получены путем внесения соответствующих модификаций в нуклеотидную последовательность, кодирующую антитело, или путем пептидного синтеза. Такие модификации включают, например, делеции и/или вставки и/или замены остатков в аминокислотных последовательностях антитела. Любая комбинация делеции, вставки и замены может быть использована для получения конечной конструкции при условии, что конечная конструкция обладает желаемыми характеристиками, например связыванием антигена.In some embodiments, the present invention provides variations in the amino acid sequence of the provided antibodies. For example, it may be desirable to improve the affinity and/or other biological properties of the antibody. Variants of the amino acid sequence of an antibody can be obtained by introducing appropriate modifications into the nucleotide sequence encoding the antibody or by peptide synthesis. Such modifications include, for example, deletions and/or insertions and/or substitutions of residues in the amino acid sequences of the antibody. Any combination of deletion, insertion and substitution can be used to produce the final construct, provided that the final construct has the desired characteristics, such as antigen binding.
а) Варианты замен, инсерций и делеций.a) Options for substitutions, insertions and deletions.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают варианты антител, содержащие одну или несколько аминокислотных замен. Сайты, представляющие интерес для замещающего мутагенеза, включают области HVR и FR. Консервативные замены показаны в табл. 1 под заголовком предпочтительные замены. Более существенные изменения представлены в табл. 1 под заголовком примеры замен и дополнительно описаны ниже со ссылкой на классы боковых цепей аминокислот. Аминокислотные замены могут быть введены в представляющее интерес антитело, и продукты могут быть проверены на желаемую активность, например, сохранение/улучшение связывания антигена, снижение иммуногенности или улучшение ADCC или CDC.In some embodiments, the present invention provides antibody variants containing one or more amino acid substitutions. Sites of interest for replacement mutagenesis include the HVR and FR regions. Conservative substitutions are shown in table. 1 under the heading Preferred Substitutions. More significant changes are presented in table. 1 under the heading Examples of Substitutions and are further described below with reference to classes of amino acid side chains. Amino acid substitutions can be introduced into the antibody of interest, and the products can be tested for the desired activity, such as maintaining/improving antigen binding, reducing immunogenicity, or improving ADCC or CDC.
Таблица 5Table 5
Аминокислоты могут быть сгруппированы в соответствии со свойствами боковой цепи:Amino acids can be grouped according to side chain properties:
(1) гидрофобные: Norleucine, Met, Ala, Val, Leu, Ile;(1) hydrophobic: Norleucine, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
(2) нейтральные гидрофильные: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;(2) neutral hydrophilic: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) кислые: Asp, Glu;(3) acidic: Asp, Glu;
(4) основные: His, Lys, Arg;(4) basic: His, Lys, Arg;
(5) остатки, влияющие на ориентацию боковой цепи: Gly, Pro;(5) residues affecting side chain orientation: Gly, Pro;
(6) ароматические: Trp, Tyr, Phe.(6) aromatic: Trp, Tyr, Phe.
Неконсервативные замены приводят к замене представителя одного из этих классов на другой класс.Non-conservative substitutions result in the replacement of a member of one of these classes with another class.
Один тип варианта замены включает замену одного или более остатков гипервариабельных областей родительского антитела (например, гуманизированного антитела или антитела человека). Как правило, полученный вариант (варианты), выбранные для дальнейшего исследования, могут иметь модификации (например, улучшения) определенных биологических свойств (например, повышенную аффинность, пониженную иммуногенность) по сравнению с исходным антителом и/или в значительной степени сохранят определенные биологические свойства родительского антитела. Типичный вариант замены представляет собой антитело с созревшей аффинностью, которое может быть легко получено, например, с использованием методов формирования аффинности на основе фагового дисплея, таких как описанные в настоящем изобретении. Вкратце, один или несколько остатков HVR мутируют, и варианты антитела отображаются на фаге и подвергаются скринингу на определенную биологическую активность (наприOne type of substitution variant involves replacing one or more hypervariable region residues of a parent antibody (eg, a humanized or human antibody). In general, the resulting variant(s) selected for further study may have modifications (e.g., improvements) in certain biological properties (e.g., increased affinity, decreased immunogenicity) compared to the parent antibody and/or will substantially retain certain biological properties of the parent antibodies. A typical replacement option is an affinity matured antibody that can be readily produced, for example, using phage display-based affinity generation methods such as those described in the present invention. Briefly, one or more HVR residues are mutated and antibody variants are displayed on phage and screened for specific biological activities (e.g.
- 60 046075 мер, аффинность).- 60 046075 measures, affinity).
Изменение (например, замены) могут быть сделаны в HVR, например, для улучшения аффинности антитела. Такие изменения могут быть сделаны в горячих точках HVR, то есть в остатках, кодируемых кодонами, которые подвергаются мутациям с высокой частотой в процессе соматического созревания (см., например, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207, 2008, 179-196), и/или в остатках, которые контактируют с антигеном, при этом полученный вариант VH или VL тестируют на аффинность. Описано созревание аффинности путем конструирования и повторного отбора из вторичных библиотек, например, в публикации Hoogenboom с соавт. в кн.: Methods in Molecular Biology 178, 2001, 1-37, под ред. O'Brien с соавт., изд-во Human Press, Тотова, Нью-Джерси. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения, связанных с созреванием аффинности, вводят разнообразие в вариабельные гены, выбранные для созревания, любым из множества методов (например, подверженной ошибкам ПЦР, перетасовкой цепей или олигонуклеотид-направленным мутагенезом). Затем создают вторичную библиотеку. Эту библиотеку подвергают скринингу для выявления любых вариантов антител с желаемой аффинностью. Другой метод введения разнообразия включает подходы, направленные на HVR, в которых несколько остатков HVR (например, 4-6 остатков за раз) рандомизируют. Остатки HVR, участвующие в связывании антигена, могут быть специфически идентифицированы, например, с использованием мутагенеза или моделирования аланинового сканирования. CDR-H3 и CDR-L3, в частности, часто становятся мишенью.Changes (eg, substitutions) can be made in the HVR, for example, to improve the affinity of the antibody. Such changes can be made at HVR hot spots, that is, at residues encoded by codons that undergo mutations at high rates during somatic maturation (see, for example, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207, 2008, 179-196), and/or in residues that contact the antigen, wherein the resulting VH or VL variant is tested for affinity. Affinity maturation by design and iterative selection from secondary libraries has been described, for example in Hoogenboom et al. in the book: Methods in Molecular Biology 178, 2001, 1-37, ed. O'Brien et al., Human Press, Totowa, NJ. In some affinity maturation embodiments of the present invention, diversity is introduced into the variable genes selected for maturation by any of a variety of methods (eg, error-prone PCR, strand shuffling, or oligonucleotide-directed mutagenesis). Then a secondary library is created. This library is screened to identify any antibody variants with the desired affinity. Another method for introducing diversity involves HVR-targeting approaches in which multiple HVR residues (e.g., 4–6 residues at a time) are randomized. HVR residues involved in antigen binding can be specifically identified, for example, using mutagenesis or alanine scanning modeling. CDR-H3 and CDR-L3 in particular are often targeted.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения замены, вставки или делеции могут происходить в одной или нескольких HVR, если такие изменения существенно не снижают способность антитела связывать антиген. Например, консервативные изменения (например, консервативные замены, как предусмотрено в данном документе), которые существенно не снижают аффинности, могут быть внесены в HVR. Такие изменения могут, например, происходить за пределами контактирующих с антигеном остатков в HVR. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения из вариантов последовательностей VH и VL, представленных выше, каждая HVR либо не изменена, либо содержит не более одной, двух или трех аминокислотных замен.In some embodiments of the present invention, substitutions, insertions or deletions may occur in one or more HVRs as long as such changes do not significantly reduce the ability of the antibody to bind antigen. For example, conservative changes (eg, conservative substitutions as provided herein) that do not significantly reduce affinity can be made to the HVR. Such changes may, for example, occur outside the antigen-contacting residues in the HVR. In some embodiments of the present invention, of the VH and VL sequence variants presented above, each HVR is either unchanged or contains no more than one, two, or three amino acid substitutions.
Полезный метод идентификации остатков или областей антитела, которые могут быть мишенью для мутагенеза, называется аланиновый сканирующий мутагенез, который описан Cunningham и Wells, Science, 244, 1989, 1081-1085. По этому методу остаток или группу целевых остатков (например, заряженных остатков, таких как arg, asp, his, lys и glu) идентифицируют и заменяют нейтральной или отрицательно заряженной аминокислотой (например, аланином или полиаланином) чтобы определить, есть ли воздействие на взаимодействие антитела с антигеном. Дальнейшие замены могут быть введены в аминокислотные положения, демонстрирующие функциональную чувствительность к начальным заменам. В другом варианте или дополнительно может быть проанализирована кристаллическая структура комплекса антиген-антитело для определения точек контакта между антителом и антигеном. Такие контактные остатки и соседние остатки могут быть нацелены или исключены как кандидаты на замену. Варианты могут быть проверены, чтобы определить, содержат ли они требуемые свойства.A useful method for identifying residues or regions of an antibody that may be targeted for mutagenesis is called alanine scanning mutagenesis, which is described by Cunningham and Wells, Science, 244, 1989, 1081-1085. In this method, a residue or group of target residues (eg, charged residues such as arg, asp, his, lys, and glu) are identified and replaced with a neutral or negatively charged amino acid (eg, alanine or polyalanine) to determine whether there is an effect on the antibody interaction with antigen. Further substitutions can be introduced at amino acid positions that demonstrate functional sensitivity to the initial substitutions. Alternatively or additionally, the crystal structure of the antigen-antibody complex may be analyzed to determine points of contact between the antibody and the antigen. Such contact residues and neighboring residues can be targeted or excluded as replacement candidates. The options can be checked to determine whether they contain the required properties.
Инсерции аминокислотной последовательности включают амино- и/или карбокси-концевые слияния длиной от одного остатка до полипептидов, содержащих сто или более остатков, а также вставки внутри последовательности одного или нескольких аминокислотных остатков. Примеры концевых вставок включают антитело с N-концевым метионильным остатком. Другие инсерционные варианты молекулы антитела включают слияние фермента (например, для ADEPT) или полипептида, который увеличивает период полужизни антитела в плазме, по N- или С-концу антитела.Amino acid sequence insertions include amino- and/or carboxy-terminal fusions ranging in length from one residue to polypeptides containing one hundred or more residues, as well as intrasequence insertions of one or more amino acid residues. Examples of terminal inserts include an antibody with an N-terminal methionyl residue. Other insertional variants of an antibody molecule include the fusion of an enzyme (eg, for ADEPT) or a polypeptide that increases the half-life of the antibody in plasma, at the N- or C-terminus of the antibody.
б) Варианты гликозилирования.b) Glycosylation options.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусмотренное антитело изменено для увеличения или уменьшения степени гликозилирования антитела. Добавление или удаление сайтов гликозилирования к антителу может быть выполнено апробированным методом изменения аминокислотной последовательности таким образом, что создают или удаляют один или несколько сайтов гликозилирования.In some embodiments of the present invention, the provided antibody is modified to increase or decrease the degree of glycosylation of the antibody. The addition or removal of glycosylation sites to an antibody can be accomplished by a proven method of altering the amino acid sequence in such a way as to create or remove one or more glycosylation sites.
Если антитело включает область Fc, присоединенный к ней углевод может быть изменен. Нативные антитела, вырабатываемые клетками млекопитающих, обычно содержат разветвленный двухантенарный олигосахарид, который обычно присоединен N-связью к Asn297 домена СН2 области Fc. См., например, Wright с соавт., TIBTECH 15, 1997, 26-32. В составе могут быть разные олигосахариды, например, манноза, N-ацетилглюкозамин (GlcNAc), галактоза и сиаловая кислота, а также фукоза, присоединенная к GlcNAc в стволе двухантенарной структуры олигосахарида. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения модификации олигосахарида в антителе по настоящему изобретению могут быть сделаны для создания вариантов антител с определенными улучшенными свойствами.If the antibody includes an Fc region, the carbohydrate attached to it may be altered. Native antibodies produced by mammalian cells typically contain a branched biantennary oligosaccharide that is typically N-linked to Asn297 of the CH2 domain of the Fc region. See, for example, Wright et al., TIBTECH 15, 1997, 26-32. The composition may contain various oligosaccharides, for example, mannose, N-acetylglucosamine (GlcNAc), galactose and sialic acid, as well as fucose attached to GlcNAc in the stem of the biantennary oligosaccharide structure. In some embodiments of the present invention, modifications to the oligosaccharide in the antibody of the present invention can be made to create antibody variants with certain improved properties.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают варианты антител, имеющие углеводную структуру, в которой отсутствует фукоза, присоединенная (прямо или опосредованно) к области Fc. Например, количество фукозы в таком антителе может составлять от 1% до 80%, от 1% до 65%, от 5% до 65% или от 20% до 40%. Количество фукозы определяют путем расчета среднего количества фукозы в цепи сахара при Asn297 относительно суммы всех гликоструктур, присоединенных к Asn297 (например, сложных, гибридных и высокоманнозных структур) по данным измерения методомIn one embodiment, the present invention provides antibody variants having a carbohydrate structure that lacks fucose attached (directly or indirectly) to the Fc region. For example, the amount of fucose in such an antibody may be from 1% to 80%, from 1% to 65%, from 5% to 65%, or from 20% to 40%. The amount of fucose is determined by calculating the average amount of fucose in the sugar chain at Asn297 relative to the sum of all glycostructures attached to Asn297 (e.g., complex, hybrid, and high-mannose structures) as measured by the method
- 61 046075 масс-спектрометрии MALDI-TOF по описанию в WO 2008/077546, например при Asn297, относится к остатку аспарагина, расположенному около положения 297 в области Fc (нумерация остатков области Fc по EU); однако Asn297 может также располагаться примерно на +/- 3 аминокислоты выше или ниже по цепи от положения 297, то есть между положениями 294 и 300, из-за незначительных вариаций последовательности в антителах. Такие фукозилированные варианты могут обладать улучшенной функцией ADCC. См., например, US 2003/0157108 (Presta, L.); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Примеры публикаций, относящихся к дефукозилированным или дефицитным по фукозе вариантам антител, включают: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO 2005/053742; WO 2002/031140; Okazaki с соавт. J. Mol. Biol. 336, 2004, 1239-1249; Yamane-Ohnuki с соавт., Biotech. Bioeng. 87, 2004, 614.- 61 046075 MALDI-TOF mass spectrometry as described in WO 2008/077546, for example at Asn297, refers to the asparagine residue located near position 297 in the Fc region (EU numbering of Fc region residues); however, Asn297 may also be located approximately +/- 3 amino acids upstream or downstream of position 297, that is, between positions 294 and 300, due to minor sequence variations in antibodies. Such fucosylated variants may have improved ADCC function. See, for example, US 2003/0157108 (Presta, L.); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd). Examples of publications related to defucosylated or fucose-deficient antibody variants include: US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; WO 2005/053742; WO 2002/031140; Okazaki et al. J. Mol. Biol. 336, 2004, 1239-1249; Yamane-Ohnuki et al., Biotech. Bioeng. 87, 2004, 614.
Примеры клеточных линий, способных вырабатывать дефукозилированные антитела, включают клетки Lec13 СНО, дефицитные по фукозилированию белка (Ripka с соавт. Arch. Biochem. Biophys. 249, 1986, 533-545; US 2003/0157108 A1; WO 2004/056312 A1, Adams с соавт., особенно в примере 11), и линии клеток с нокаутом, такие как ген альфа-1,6-фукозилтрансферазы, FUT8, клетки с нокаутом СНО (см., например, Yamane-Ohnuki с соавт. Biotech. Bioeng. 87, 2004, 614; Kanda Y. с соавт., Biotechnol. Bioeng., 94(4), 2006, 680-688; WO 2003/085107).Examples of cell lines capable of producing defucosylated antibodies include Lec13 CHO cells deficient in protein fucosylation (Ripka et al. Arch. Biochem. Biophys. 249, 1986, 533-545; US 2003/0157108 A1; WO 2004/056312 A1, Adams et al., especially in example 11), and knockout cell lines such as the alpha-1,6-fucosyltransferase gene, FUT8, CHO knockout cells (see, for example, Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87 , 2004, 614; Kanda Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 94(4), 2006, 680-688; WO 2003/085107).
Варианты антител дополнительно содержат олигосахариды, разделенные пополам, например, в которых двухантенный олигосахарид, присоединенный к области Fc антитела, разделен пополам GlcNAc. Такие варианты антител могут иметь пониженное фукозилирование и/или улучшенную функцию ADCC. Описаны примеры таких вариантов антител, например, в WO 2003/011878 (Jean-Mairet с соавт.); US 6602684 (Umana с соавт.); US 2005/0123546 (Umana с соавт.). Также предусмотрены варианты антител по крайней мере с одним остатком галактозы в олигосахариде, присоединенном к области Fc. Такие варианты антител могут иметь улучшенную функцию CDC. Такие варианты антител описаны, например, в WO 1997/30087 (Patel с соавт.); WO 1998/58964 (Raju, S.); WO 1999/22764 (Raju, S.).The antibody variants further comprise bisected oligosaccharides, for example, in which a biantennary oligosaccharide attached to the Fc region of the antibody is bisected by GlcNAc. Such antibody variants may have reduced fucosylation and/or improved ADCC function. Examples of such antibody variants are described, for example, in WO 2003/011878 (Jean-Mairet et al.); US 6602684 (Umana et al.); US 2005/0123546 (Umana et al.). Also provided are antibody variants with at least one galactose residue in the oligosaccharide attached to the Fc region. Such antibody variants may have improved CDC function. Such antibody variants are described, for example, in WO 1997/30087 (Patel et al.); WO 1998/58964 (Raju, S.); WO 1999/22764 (Raju, S.).
в) Варианты области Fc.c) Fc region variants.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения одна или более аминокислотных модификаций могут быть введены в область Fc антитела, предусмотренного в настоящем изобретении, тем самым создавая вариант области Fc (который также может называться измененной областью Fc). Вариант области Fc может содержать последовательность области Fc человека (например, области Fc IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4 человека), включающей модификацию аминокислоты (например, замену) в одном или нескольких аминокислотных положениях.In some embodiments of the present invention, one or more amino acid modifications may be introduced into the Fc region of an antibody of the present invention, thereby creating a variant Fc region (which may also be referred to as an altered Fc region). A variant Fc region may comprise a human Fc region sequence (eg, human IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 Fc region) including an amino acid modification (eg, substitution) at one or more amino acid positions.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения рассматривают вариант антитела, который обладает некоторыми, но не всеми эффекторными функциями, что делает его желательным кандидатом для применений, в которых важен период полужизни антитела in vivo, однако некоторые эффекторные функции (такие как комплемент и ADCC) являются ненужными или вредными. In vitro и/или in vivo могут быть проведены анализы цитотоксичности для подтверждения снижения/истощения активности CDC и/или ADCC. Например, анализы связывания рецептора Fc (FcR) могут быть проведены, чтобы гарантировать, что антитело утратило способность связывать Fc гамма R (следовательно, вероятно, не обладает активностью ADCC), но сохраняет связывающую активность с FcRn. Первичные клетки для опосредования ADCC, клетки NK, экспрессируют только Fc гамма RIII, тогда как моноциты экспрессируют Fc гамма RI, Fc гамма RII и Fc гамма RIII. Экспрессия FcR на гемопоэтических клетках суммирована в табл. 3 на странице 464 публикации Ravetch и Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9, 1991, 457-492. Примеры методов анализа активности ADCC in vitro, перечень которых не ограничивается данными примерами, приведены в US 5500362 (см., например, Hellstrom I. с соавт. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 83, 1986, 70597063; Hellstrom I с соавт., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82, 1985, 1499-1502; US 5821337 (см. Bruggemann M. с соавт., J. Exp. Med. 166, 1987, 1351-1361). В другом варианте можно использовать методы нерадиоактивных анализов (см., например, анализ нерадиоактивной цитотоксичности АСТ1™ методом жидкостной цитометрии (CellTechnology, Inc., Маунтин-Вью, Калифорния; и CytoTox 96 (зарегистрированная торговая марка) анализ нерадиоактивной цитотоксичности (фирма Promega, Мэдисон, Висконсин)). Эффекторные клетки, применимые для таких анализов, включают мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК) и природные клетки-киллеры (NK). В другом варианте или дополнительно активность ADCC исследуемой молекулы можно оценить in vivo, например, в животной модели, такой как описанная в публикации Clynes с соавт. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 95, 1998, 652-656. Анализы связывания C1q также могут быть выполнены для подтверждения того, что антитело неспособно связывать C1q и, следовательно, не обладает активностью CDC. См., например, связывание C1q и C3c методом ELISA в WO 2006/029879 и WO 2005/100402. Для оценки активации комплемента может быть выполнен анализ CDC (см., например, Gazzano-Santoro с соавт., J. Immunol. Methods 202, 1996, 163; Cragg M.S. с соавт., Blood 101, 2003, 1045-1052; Cragg M.S., Glennie M.J., Blood 103, 2004, 2738-2743). Связывание FcRn и определение клиренса/периода полужизни in vivo также можно проводить с использованием методов, известных в данной области (см., например, Petkova S.B. с соавт., Int'l. Immunol. 18(12), 2006, 1759-1769).In some embodiments, the present invention contemplates a variant antibody that possesses some, but not all, effector functions, making it a desirable candidate for applications in which the in vivo half-life of the antibody is important, but certain effector functions (such as complement and ADCC) are unnecessary or harmful. In vitro and/or in vivo cytotoxicity assays can be performed to confirm reduction/depletion of CDC and/or ADCC activity. For example, Fc receptor (FcR) binding assays can be performed to ensure that the antibody has lost the ability to bind Fc gamma R (thus likely lacking ADCC activity) but retains FcRn binding activity. The primary cells for mediating ADCC, NK cells, express only Fc gamma RIII, whereas monocytes express Fc gamma RI, Fc gamma RII, and Fc gamma RIII. FcR expression on hematopoietic cells is summarized in Table. 3 on page 464 of Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9, 1991, 457-492. Examples of methods for analyzing ADCC activity in vitro, the list of which is not limited to these examples, are given in US 5500362 (see, for example, Hellstrom I. et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 83, 1986, 70597063; Hellstrom I et al. al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82, 1985, 1499-1502; US 5821337 (see Bruggemann M. et al., J. Exp. Med. 166, 1987, 1351-1361). Alternatively, non-radioactive assay methods may be used (see, for example, the ACT1™ Liquid Cytometry Non-Radioactive Cytotoxicity Assay (CellTechnology, Inc., Mountain View, CA; and the CytoTox 96 (Registered Trademark) Non-Radioactive Cytotoxicity Assay (Promega, Madison, WI) Effector cells useful for such assays include peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and natural killer (NK) cells. Alternatively or additionally, the ADCC activity of the test molecule can be assessed in vivo, for example, in an animal model such as described in the publication of Clynes et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 95, 1998, 652-656. C1q binding assays can also be performed to confirm that the antibody is unable to bind C1q and therefore does not have CDC activity. See, for example, C1q and C3c binding by ELISA in WO 2006/029879 and WO 2005/100402. A CDC assay can be performed to assess complement activation (see, for example, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202, 1996, 163; Cragg M.S. et al., Blood 101, 2003, 1045-1052; Cragg M.S. , Glennie M.J., Blood 103, 2004, 2738-2743). FcRn binding and in vivo clearance/half-life determination can also be performed using methods known in the art (see, e.g., Petkova S.B. et al., Int'l. Immunol. 18(12), 2006, 1759-1769) .
- 62 046075- 62 046075
К антителам с пониженной эффекторной функцией относят антитела с заменой одного или более из остатков 238, 265, 269, 270, 297, 327 и 329 в области Fc (US 6737056). К таким мутантам Fc относятся мутанты Fc с заменами в двух или более положениях аминокислот 265, 269, 270, 297 и 327, включая так называемый мутант Fc DANA с заменой остатков 265 и 297 на аланин (US 7332581).Antibodies with reduced effector function include antibodies with a substitution of one or more of residues 238, 265, 269, 270, 297, 327 and 329 in the Fc region (US 6737056). These Fc mutants include Fc mutants with substitutions at two or more positions of amino acids 265, 269, 270, 297 and 327, including the so-called Fc DANA mutant with residues 265 and 297 replaced by alanine (US 7332581).
Описаны некоторые варианты антител с повышенным или пониженным связыванием с FcR. (См., например, US 6737056; WO 2004/056312; Shields с соавт., J. Biol. Chem. 9(2), 2001, 6591-6604).Several antibody variants with increased or decreased binding to FcR have been described. (See, for example, US 6737056; WO 2004/056312; Shields et al., J. Biol. Chem. 9(2), 2001, 6591-6604).
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант антитела включает область Fc с одной или более аминокислотными заменами, которые улучшают ADCC, например, замены в положениях 298, 333 и/или 334 области Fc (нумерация остатков по EU).In some embodiments, the antibody variant includes an Fc region with one or more amino acid substitutions that improve ADCC, such as substitutions at positions 298, 333, and/or 334 of the Fc region (EU residue numbering).
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в область Fc вносят изменения, которые приводят к изменению (т.е. к увеличению или уменьшению) связывания C1q и/или комплементзависимой цитотоксичности (CDC), например, как описано в US 6194551, WO 99/51642 и Idusogie с соавт. J. Immunol. 164, 2000, 4178-4184.In some embodiments of the present invention, changes are made to the Fc region that result in altered (i.e., increased or decreased) C1q binding and/or complement dependent cytotoxicity (CDC), for example, as described in US 6194551, WO 99/51642 and Idusogie et al. J. Immunol. 164, 2000, 4178-4184.
Антитела с увеличенной полужизнью и повышенным связыванием с неонатальным рецептором Fc (FcRn), который ответственен за передача материнских IgG плоду (Guyer с соавт., J. Immunol. 117, 1976, 587; Kim с соавт., J. Immunol. 24, 1994, 249), описаны в US 2005/0014934 A1 (Hinton с соавт.). Эти антитела содержат область Fc с одной или несколькими заменами в ней, которые увеличивают связывание области Fc с FcRn. Такие варианты Fc включают варианты с заменами в одного или нескольких остатков в области Fc: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 или 434, например, замена остатка 434 в области Fc (US 7371826).Antibodies with an extended half-life and increased binding to the neonatal Fc receptor (FcRn), which is responsible for the transfer of maternal IgG to the fetus (Guyer et al., J. Immunol. 117, 1976, 587; Kim et al., J. Immunol. 24, 1994 , 249), described in US 2005/0014934 A1 (Hinton et al.). These antibodies contain an Fc region with one or more substitutions therein that increase the binding of the Fc region to FcRn. Such Fc variants include variants with substitutions at one or more residues in the Fc region: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 or 434, for example, substitution of residue 434 in the Fc region (US 7371826).
См. также публикации Duncan, Winter, Nature 322, 1988, 738-740; US 5648260; US 5624821; WO 94/29351, касающиеся примеров других вариантов области Fc.See also Duncan, Winter, Nature 322, 1988, 738-740; US 5648260; US 5624821; WO 94/29351 regarding examples of other Fc region variants.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность по отношению к каждому рецептору Fc-гамма человека (Fc-гамма R) области Fc антитела (включая вариант области Fc (то же самое применимо и далее)) может быть измерена методом захвата лиганда с использованием, например, BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200, в основе которых лежат методы анализа поверхностного плазмонного резонанса в качестве принципа измерения.In one embodiment of the present invention, the binding activity for each human Fc-gamma receptor (Fc-gamma R) of the Fc region of an antibody (including a variant Fc region (the same applies hereinafter)) can be measured by a ligand capture method using, such as BIACORE (registered trademark) T200, which use surface plasmon resonance analysis as the measurement principle.
Подробности примера метода измерения связывающей активности области Fc антитела в отношении различных рецепторов Fc-гамма человека (Fc-гамма Rs) описаны ниже. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающей активности области Fc по отношению к Fc-гамма R оценивают с использованием BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения это измерение проводят при 25°C с использованием буфера для измерений (50 мМ фосфат, 150 мМ NaCl, P20 0,05 мас./об.%, рН 7,4. В частности, около 1000 RU антитела, содержащего вариант области Fc, сначала захватывается сенсорным чипом с помощью CaptureSelect (товарный знак) конъюгата Fab-лямбда человека-биотин (фирма ThermoFisher Scientific), иммобилизованного в качестве молекулы, захватывающей лиганд. Fc-гамма R человека разбавляют буфером для измерения до 8 нМ для Fc-гамма RIa и до 1000 нМ для других Fc-гамма R, и дают возможность связываться с захваченным антителом. Связывающую активность каждого антитела по отношению к каждому Fc-гамма R оценивают путем расчета количества связанного Fc-гамма R на единицу количества антитела (RU) с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность области Fc антитела в отношении различных рецепторов Fc-гамма человека (Fc-гамма R) может быть измерена методом, описанным в примере 7-4.Details of an example method for measuring the binding activity of the Fc region of an antibody to various human Fc-gamma receptors (Fc-gamma Rs) are described below. In one embodiment of the present invention, the binding activity of the Fc region towards Fc-gamma R is assessed using BIACORE (registered trademark) T200. In a preferred embodiment of the present invention, this measurement is carried out at 25°C using measurement buffer (50 mM phosphate, 150 mM NaCl, P20 0.05 w/v%, pH 7.4. In particular, about 1000 RU antibody containing the variant Fc region is first captured on the sensor chip using CaptureSelect (trademark) Fab-human lambda-biotin conjugate (ThermoFisher Scientific) immobilized as the ligand capture molecule. Human Fc-gamma R is diluted with measurement buffer to 8 nM for Fc-gamma RIa and up to 1000 nM for other Fc-gamma R, and allow binding to the captured antibody.The binding activity of each antibody to each Fc-gamma R is assessed by calculating the amount of bound Fc-gamma R per unit amount of antibody ( RU) using Biacore T200 Evaluation Software 2.0 In one embodiment of the present invention, the binding activity of the Fc region of an antibody to various human Fc-gamma receptors (Fc-gamma R) can be measured by the method described in Example 7-4.
В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения Fc-гамма R, используемые для описанного выше способа измерения, могут быть внеклеточным доменом Fc-гамма R, полученным методом, описанным ниже. Во-первых, синтез гена внеклеточного домена Fc-гамма R проводят методом, известным специалистам в данной области. Для этого синтеза последовательности каждого Fcгамма R готовят на основе информации, зарегистрированной в NCBI. Более конкретно, последовательность Fc-гамма RI получают на основе последовательности NCBI (номер в базе данных NM000566.3), последовательность Fc-гамма RIIa получают на основе последовательности NCBI (номер в базе данных NM_001136219.1), последовательности для Fc- гамма RIIb получают на основе последовательности NCBI (номер в базе данных NM_004001.3), последовательность для Fc-гамма RIIIa получают на основе последовательности NCBI (номер в базе данных NM_001127593.1); к С-концу добавляют His-метку. Полиморфные сайты для Fc-гамма RIIa получают со ссылкой на J. Exp. Med., 172, 1990, 19-25, и полиморфные сайты для Fc-гамма RIIIa получают со ссылкой на J. Clin. Invest., 100, 1997, 1059-1070. Полученные фрагменты генов инсертируют в вектор экспрессии для клеток животных для получения векторов экспрессии. Такие векторы экспрессии временно вводят в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen), полученные из клеток почки эмбрионального рака человека, и дают возможность экспрессироваться белку интереса. Супернатант культуры собирают и фильтруют через фильтр с диаметром пор 0,22 мкм, затем очищают в основном с помощью описанных ниже четырех этапов. На первом этапе проводят катионообменную колоночную хроматографию (SP Sepharose FF); на втором этапе - колоночная аффинная хроматография к His-меткам (HisTrap HP); на третьем этапе - гель-фильтрационная колоночная хроматографияIn one preferred embodiment of the present invention, the Fc-gamma R used for the measurement method described above may be an extracellular domain of Fc-gamma R obtained by the method described below. First, the synthesis of the Fc-gamma R extracellular domain gene is carried out by a method known to those skilled in the art. For this synthesis, the sequences of each Fcgamma R are prepared based on information registered with NCBI. More specifically, the Fc-gamma RI sequence is derived from the NCBI sequence (database number NM000566.3), the Fc-gamma RIIa sequence is derived from the NCBI sequence (database number NM_001136219.1), the sequences for Fc-gamma RIIb are derived based on the NCBI sequence (database number NM_004001.3), the sequence for Fc-gamma RIIIa is derived from the NCBI sequence (database number NM_001127593.1); A His tag is added to the C-terminus. Polymorphic sites for Fc-gamma RIIa are obtained with reference to J. Exp. Med., 172, 1990, 19-25, and polymorphic sites for Fc-gamma RIIIa are obtained with reference to J. Clin. Invest., 100, 1997, 1059-1070. The resulting gene fragments are inserted into an expression vector for animal cells to obtain expression vectors. Such expression vectors are transiently introduced into FreeStyle293 cells (Invitrogen), derived from human embryonic kidney cancer cells, and allow the protein of interest to be expressed. The culture supernatant is collected and filtered through a 0.22 μm filter, then purified essentially using the four steps described below. At the first stage, cation exchange column chromatography (SP Sepharose FF) is carried out; at the second stage - column affinity chromatography for His tags (HisTrap HP); at the third stage - gel filtration column chromatography
- 63 046075 (Superdex200); и, четвертый этап - асептическая фильтрация. Следует отметить, что для Fc-гамма RI в качестве первой стадии проводят анионообменную колоночную хроматографию с использованием Qсефарозы FF. Концентрацию очищенного белка рассчитывают на основе коэффициента поглощения, рассчитанного путем измерения поглощения при 280 нм с использованием спектрофотометра и с использованием РАСЕ или подобного метода для получения значений (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).- 63 046075 (Superdex200); and, the fourth stage - aseptic filtration. It should be noted that for Fc-gamma RI, the first step is anion exchange column chromatography using QSepharose FF. The concentration of the purified protein is calculated based on the absorbance coefficient calculated by measuring the absorbance at 280 nm using a spectrophotometer and using PACE or a similar method to obtain the values (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность области Fc антитела по отношению к FcRn человека может быть измерена методом захвата лиганда с использованием, например, BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200, принцип измерения которого основан на методах анализа поверхностного плазмонного резонанса.In one embodiment of the present invention, the binding activity of the Fc region of an antibody to human FcRn can be measured by a ligand capture method using, for example, BIACORE (registered trademark) T200, the measurement principle of which is based on surface plasmon resonance analysis methods.
Детали примера метода измерения связывающей активности области Fc антитела с FcRn человека описаны ниже. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающую активность области Fc антитела в отношении FcRn оценивают, используя BIACORE (зарегистрированная торговая марка) Т200. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения это измерение проводят при 25°C с использованием буфера для измерений (50 мМ фосфат, 150 мМ NaCl, P20 - 0,05 мас./об.%; рН 6,0). В частности, около 400 RU антитела, содержащего область Fc, сначала захватывается на сенсорном чипе, на котором CaptureSelect (торговая марка) Human Fab-lambda Kinetics Biotin Conjugate (фирма ThermoFisher Scientific) иммобилизован как молекула, захватывающая лиганд, и затем FcRn человека, разбавленный буфером для измерений, позволяется связываться с ним. Связывающую активность каждого антитела по отношению к FcRn оценивают путем расчета KD (М) с использованием модели устойчивого состояния Biacore Т200 Evaluation Software 2.0. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения белок FcRn человека, используемый в этом измерении, получают в соответствии со способом, описанным в примере 2 WO 2010107110, используемым в качестве образца. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения связывающая активность области Fc антитела в отношении различных FcRn человека может быть измерена способом, описанным в примере 7-5.Details of an example method for measuring the binding activity of the Fc region of an antibody to human FcRn are described below. In one embodiment of the present invention, the binding activity of the Fc region of an antibody to FcRn is assessed using BIACORE (registered trademark) T200. In a preferred embodiment of the present invention, this measurement is carried out at 25°C using measurement buffer (50 mM phosphate, 150 mM NaCl, P20 - 0.05 w/v%; pH 6.0). Specifically, about 400 RU of antibody containing the Fc region is first captured on a sensor chip on which CaptureSelect (trade mark) Human Fab-lambda Kinetics Biotin Conjugate (ThermoFisher Scientific) is immobilized as a ligand capture molecule, and then human FcRn is diluted buffer for measurements, it is allowed to communicate with it. The FcRn binding activity of each antibody is assessed by calculating the KD (M) using the Biacore T200 Evaluation Software 2.0 steady state model. In one preferred embodiment of the present invention, the human FcRn protein used in this measurement is obtained in accordance with the method described in example 2 of WO 2010107110, used as a sample. In one embodiment of the present invention, the binding activity of the Fc region of an antibody to various human FcRns can be measured by the method described in Example 7-5.
г) Варианты антител, разработанных на основе цистеина В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения может потребоваться разработать сконструированные на основе цистеина антитела, например, тио Mab, в которых один или несколько остатков антитела заменены остатками цистеина. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения замещенные остатки находятся в доступных сайтах антитела. За счет замены этих остатков цистеином реактивные тиоловые группы тем самым размещают в доступных сайтах антитела и их можно использоваться для конъюгирования антитела с другими фрагментами, такими как фрагменты лекарственного средства или фрагменты линкерлекарственное средство, для создания иммуноконъюгата, как описано ниже в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения любой один или несколько из следующих остатков могут быть заменены цистеином: V205 (нумерация Kabat) легкой цепи; A118 (нумерация EU) тяжелой цепи; и S400 (EU нумерация) области Fc тяжелой цепи. Сконструированные антитела с применением цистеина могут быть получены как описано, например, в US 7521541.d) Cysteine Engineered Antibody Options In some embodiments of the present invention, it may be desirable to develop cysteine engineered antibodies, eg, Thio Mab, in which one or more antibody residues are replaced with cysteine residues. In one embodiment of the present invention, the substituted residues are located at accessible sites in the antibody. By replacing these residues with cysteine, reactive thiol groups are thereby placed at accessible sites on the antibody and can be used to conjugate the antibody to other moieties, such as drug moieties or linker-drug moieties, to create an immunoconjugate, as described below in the present invention. In some embodiments of the present invention, any one or more of the following residues may be replaced by cysteine: V205 (Kabat numbering) light chain; A118 (EU numbering) heavy chain; and S400 (EU numbering) heavy chain Fc region. Engineered antibodies using cysteine can be prepared as described, for example, in US 7521541.
д) Производные антител.e) Antibody derivatives.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают антитело, которое может быть дополнительно модифицировано за счет включения дополнительных небелковых фрагментов, которые известны в данной области и легко доступны. Фрагменты, подходящие для дериватизации антитела, включают, но ими не ограничиваются, водорастворимые полимеры. Примеры водорастворимых полимеров включают, но ими перечень не ограничивается, полиэтиленгликоль (ПЭГ), сополимеры этиленгликоля/пропиленгликоля, карбоксиметилцеллюлозу, декстран, поливиниловый спирт, поливинилпирролидон, поли-1,3-диоксолан, поли-1,3,6-триоксан, сополимер этилена и малеинового ангидрида, полиаминокислоты (гомополимеры или статистические сополимеры) и декстран или поли (нвинилпирролидон) полиэтиленгликоль, гомополимеры полипропиленгликоля, сополимеры полипропиленоксида и этиленоксида, полиоксиэтилированные полиолы (например, глицерин), поливиниловый спирт и их смеси. Пропиональдегид полиэтиленгликоля может иметь преимущества при получении из-за его стабильности в воде. Полимер может иметь любую молекулярную массу и может быть разветвленным или неразветвленным. Количество полимеров, присоединенных к антителу, может варьировать, и если присоединено более одного полимера, они могут быть одинаковыми или разными молекулами. В общем, количество и/или тип полимеров, используемых для дериватизации, может быть определен с учетом ряда обстоятельств, например, конкретных свойств или функций подлежащего улучшению антитела, планируется ли использование производного антитела в терапии при определенные условия и т.д.In some embodiments, the present invention provides an antibody that can be further modified to include additional non-protein fragments that are known in the art and readily available. Fragments suitable for antibody derivatization include, but are not limited to, water-soluble polymers. Examples of water-soluble polymers include, but are not limited to, polyethylene glycol (PEG), ethylene glycol/propylene glycol copolymers, carboxymethylcellulose, dextran, polyvinyl alcohol, polyvinylpyrrolidone, poly-1,3-dioxolane, poly-1,3,6-trioxane, ethylene copolymer and maleic anhydride, polyamino acids (homopolymers or random copolymers) and dextran or poly(vinylpyrrolidone) polyethylene glycol, polypropylene glycol homopolymers, polypropylene oxide-ethylene oxide copolymers, polyoxyethylated polyols (eg glycerol), polyvinyl alcohol and mixtures thereof. Polyethylene glycol propionaldehyde may have advantages in production due to its stability in water. The polymer can have any molecular weight and can be branched or unbranched. The number of polymers attached to the antibody may vary, and if more than one polymer is attached, they may be the same or different molecules. In general, the amount and/or type of polymers used for derivatization may be determined based on a number of circumstances, such as the specific properties or functions of the antibody to be improved, whether the antibody derivative is intended to be used in therapy under certain conditions, etc.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают конъюгаты антитела и небелкового фрагмента, которые можно избирательно нагревать под воздействием излучения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения небелковый фрагмент представляет собой углеродную нанотрубку (Kam с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102, 2005, 11600-11605). Излучение может иметь любую длину волны и включает, помимо прочего, длины волн, которые не повреждают обычные клетки, но нагревают небелковый фрагмент до температуры, при которой гибнут клетки, проксимальные к небелковому фрагменту, не содержащему антитела.In another embodiment, the present invention provides conjugates of an antibody and a non-protein moiety that can be selectively heated by radiation. In one embodiment of the present invention, the non-protein moiety is a carbon nanotube (Kam et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102, 2005, 11600-11605). The radiation can be of any wavelength and includes, but is not limited to, wavelengths that do not damage normal cells but heat the non-protein moiety to a temperature that kills cells proximal to the non-protein moiety that does not contain the antibody.
Б. Методы рекомбинации и композиции.B. Recombination and composition methods.
- 64 046075- 64 046075
Антитела могут быть получены с использованием методов рекомбинации и композиции, например, описанные в US 4816567. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело, описанные в настоящем изобретении. Такая нуклеиновая кислота может кодировать аминокислотную последовательность, содержащую VL и/или аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела (например, легкую и/или тяжелую цепи антитела). В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают один или более векторов (например, векторов экспрессии), включающих такую нуклеиновую кислоту. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают клетку-хозяина, включающую такую нуклеиновую кислоту. В одном из подобных вариантов осуществления настоящего изобретения клетка-хозяин содержит (например, была трансформирована): (1) вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую аминокислотную последовательность, содержащую VL антитела, и аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела, или (2) первый вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, которая кодирует аминокислотную последовательность, содержащую VL антитела, и второй вектор, содержащий нуклеиновую кислоту, которая кодирует аминокислотную последовательность, содержащую VH антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения клетка-хозяин является эукариотической, например клеткой яичника китайского хомячка (СНО) или лимфоидной клеткой (например, клетками Y0, NS0, Sp2/0). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают способ получения анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, который включает культивирование клетки-хозяина, содержащей нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, как указано выше, в условиях, подходящих для экспрессии анmи-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, и необязательно извлечение антитела из клетки-хозяина (или среды для культивирования клеток-хозяев).Antibodies can be produced using recombination methods and compositions, for example, described in US 4816567. In one embodiment, the present invention provides an isolated nucleic acid encoding an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody described in the present invention. Such a nucleic acid may encode an amino acid sequence comprising a VL and/or an amino acid sequence containing a VH of an antibody (eg, the light and/or heavy chains of an antibody). In another embodiment, the present invention provides one or more vectors (eg, expression vectors) comprising such a nucleic acid. In another embodiment, the present invention provides a host cell comprising such a nucleic acid. In one such embodiment of the present invention, the host cell contains (eg, has been transformed): (1) a vector containing a nucleic acid encoding an amino acid sequence containing a VL antibody and an amino acid sequence containing a VH antibody, or (2) a first vector containing a nucleic acid that encodes an amino acid sequence containing a VL antibody, and a second vector containing a nucleic acid that encodes an amino acid sequence containing a VH antibody. In one embodiment of the present invention, the host cell is a eukaryotic cell, such as a Chinese hamster ovary (CHO) cell, or a lymphoid cell (eg, Y0, NS0, Sp2/0 cells). In one embodiment, the present invention provides a method for producing an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody, which comprises culturing a host cell containing a nucleic acid encoding an antibody as defined above under conditions suitable for expression of the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody, and optionally recovering the antibody from the host cell (or host cell culture medium).
Для рекомбинантного получения анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела нуклеиновую кислоту, кодирующую антитело, например, как описано выше, выделяют и вставляют в один или несколько векторов для дальнейшего клонирования и/или экспрессии в клетке-хозяине. Такую нуклеиновую кислоту можно легко выделить и секвенировать с использованием обычных процедур (например, с использованием олигонуклеотидных зондов, которые способны специфически связываться с генами, кодирующими тяжелую и легкую цепи антитела).To recombinantly produce an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody, the nucleic acid encoding the antibody, for example as described above, is isolated and inserted into one or more vectors for further cloning and/or expression in a host cell. Such nucleic acid can be easily isolated and sequenced using conventional procedures (eg, using oligonucleotide probes that are capable of specifically binding to the genes encoding the heavy and light chains of the antibody).
Подходящие клетки-хозяева для клонирования или экспрессии векторов, кодирующих антитела, включают прокариотические или эукариотические клетки, описанные в настоящем изобретении. Например, антитела могут вырабатываться в бактериях, в частности, когда гликозилирование и эффекторная функция Fc не нужны. Для экспрессии фрагментов антител и полипептидов в бактериях см., например, US 5648237, US 5789199, US 5840523 (см. также Charlton, Methods in Molecular Biology, 2003, том 248, 245-254 (под ред. B.K.C. Lo, изд-во Humana Press, Тотова, Нью-Джерси), в которых описывают экспрессию фрагментов антител в Е. coli). После экспрессии антитело может быть выделено из биомассы бактериальных клеток в растворимую фракции и может быть дополнительно очищено.Suitable host cells for cloning or expression of vectors encoding antibodies include prokaryotic or eukaryotic cells described in the present invention. For example, antibodies can be produced in bacteria, particularly when glycosylation and Fc effector function are not required. For the expression of antibody fragments and polypeptides in bacteria, see, for example, US 5648237, US 5789199, US 5840523 (see also Charlton, Methods in Molecular Biology, 2003, volume 248, 245-254 (ed. B.K.C. Lo, ed. Humana Press, Totowa, NJ), which describe the expression of antibody fragments in E. coli). Once expressed, the antibody can be isolated from the bacterial cell biomass into a soluble fraction and can be further purified.
Помимо прокариот, подходящими хозяевами для клонирования или экспрессии векторов, кодирующих антитела, являются эукариотические микроорганизмы, такие как мицелиальные грибы или дрожжи, включая штаммы грибов и дрожжей, чьи пути гликозилирования были гуманизированы, что приводит к выработке антитела с частично или полностью гликозилированным образцом человека. См. публикации Nat. Biotech., 22, 2004, 1409-1414; Li с соавт., Nat. Biotech. 24, 2006, 210-215.In addition to prokaryotes, suitable hosts for the cloning or expression of antibody-encoding vectors include eukaryotic microorganisms such as filamentous fungi or yeast, including fungal and yeast strains whose glycosylation pathways have been humanized, resulting in the production of an antibody with a partially or fully glycosylated human pattern. See publications Nat. Biotech., 22, 2004, 1409-1414; Li et al., Nat. Biotech. 24, 2006, 210-215.
Клетки-хозяева, применимые для экспрессии гликозилированного антитела, также происходят из многоклеточных организмов (беспозвоночных и позвоночных). Примеры клеток беспозвоночных включают клетки насекомых, также применимы клетки растений. Идентифицированы многочисленные штаммы бакуловирусов, которые можно использовать в сочетании с клетками насекомых, в частности, для трансфекции клеток Spodoptera frugiperda.Host cells useful for expression of the glycosylated antibody also come from multicellular organisms (invertebrates and vertebrates). Examples of invertebrate cells include insect cells, and plant cells are also applicable. Numerous strains of baculoviruses have been identified that can be used in combination with insect cells, in particular for transfection of Spodoptera frugiperda cells.
В качестве клеток-хозяев также можно использовать клетки растений. См., например, US 5959177, US 6040498, US 6420548, US 7125978 и US 6417429 (описание технологии PLANTIBODIES™ по получению антител в клетках трансгенных растений).Plant cells can also be used as host cells. See, for example, US 5959177, US 6040498, US 6420548, US 7125978 and US 6417429 (describing PLANTIBODIES™ technology for producing antibodies in transgenic plant cells).
В качестве клеток-хозяев также можно использовать клетки животных. Например, можно использовать линии клеток млекопитающих, которые адаптированы к росту в виде суспензии. К другим примерам относятся линии клеток-хозяев млекопитающих, а именно линия клеток почки обезьяны CV1, трансформированная вирусом SV40 (COS-7); линия почки эмбриона человека (293 или 293 по описанию, например, в публикации Graham с соавт., J. Gen Virol. 36, 1977, 59); клетки почки детеныша хомяка (BHK, baby hamster kidney); клетки Сертоли мыши (клетки ТМ4 по описанию, например, в публикации Mather, Biol. Reprod. 23, 1980, 243-251); клетки почки обезьяны (CV1); клетки почки африканской зеленой мартышки (VERO-76); клетки карциномы шейки матки человека (HELA); клетки почки собаки (MDCK); клетки печени буйволовой крысы (BRL 3A); клетки легкого человека (W138); клетки печени человека (Hep G2); клетки опухоли молочной железы мыши (ММТ 060562); клетки TRI согласно описанию, например, в публикации Mather с соавт., Annals N.Y. Acad. Sci. 383, 1982, 44-68; клетки MRC 5; клетки FS4. К другим применимым линиям клеток-хозяев млекопитающих относятся клетки яичника китайского хомячка (СНО, Chinese hamster ovary), включая клетки DHFR-CHO (Urlaub с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77,Animal cells can also be used as host cells. For example, mammalian cell lines that are adapted to grow in suspension can be used. Other examples include mammalian host cell lines, namely the monkey kidney cell line CV1 transformed with SV40 virus (COS-7); human embryonic kidney line (293 or 293 as described, for example, in Graham et al., J. Gen Virol. 36, 1977, 59); baby hamster kidney cells (BHK, baby hamster kidney); mouse Sertoli cells (TM4 cells as described, for example, in Mather, Biol. Reprod. 23, 1980, 243-251); monkey kidney cells (CV1); African green monkey kidney cells (VERO-76); human cervical carcinoma (HELA) cells; canine kidney cells (MDCK); buffalo rat liver cells (BRL 3A); human lung cells (W138); human liver cells (Hep G2); mouse mammary tumor cells (MMT 060562); TRI cells as described, for example, in Mather et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383, 1982, 44-68; MRC 5 cells; FS4 cells. Other useful mammalian host cell lines include Chinese hamster ovary (CHO) cells, including DHFR-CHO cells (Urlaub et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77,
- 65 046075- 65 046075
1980, 4216); клеточные линии миеломы, такие как Y0, NS0 и Sp2/0. Для обзора некоторых линий клетокхозяев млекопитающих, применимых для выработки антител, см., например, Yazaki и Wu, Methods in Molecular Biology, том 248, 2003, 255-268, под ред. B.K.C. Lo, изд-во Humana Press, Тотова, Нью-Джерси.1980, 4216); myeloma cell lines such as Y0, NS0 and Sp2/0. For a review of some mammalian host cell lines useful for antibody production, see, for example, Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, vol. 248, 2003, 255-268, ed. B.K.C. Lo, Humana Press, Totowa, New Jersey.
В. Методы исследования.B. Research methods.
Ahtu-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, предусмотренные в настоящем изобретении, могут быть идентифицированы, подвергнуты скринингу или охарактеризованы по их физическим/химическим свойствам и/или биологической активности с помощью различных методов исследования, известных в данной области.Ahtu-CD137 antigen binding molecules or antibodies provided in the present invention can be identified, screened or characterized for their physical/chemical properties and/or biological activity using various assay methods known in the art.
1. Анализ связывания и другие методы.1. Binding analysis and other methods.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула или антитело по настоящему описанию тестируют на антигенсвязывающую активность, например, известными методами, такими как ELISA, вестерн-блоттинг и т.д.In one embodiment of the present invention, an antigen binding molecule or antibody as described herein is tested for antigen binding activity, for example, by known methods such as ELISA, Western blotting, etc.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения конкурентный анализ в присутствии низкомолекулярного соединения можно использовать для идентификации антигенсвязывающей молекулы или антитела, которые конкурируют за связывание с CD137 с анти-CD137 антигенсвязывающими молекулами или антителами, включая антитела А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 и/или А549/В167, описанные в табл. 17, в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи в присутствии низкомолекулярного соединения (например, в присутствии 10 мкМ или более, 50 мкМ или более, 100 мкМ или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более или 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения такие конкурирующие антигенсвязывающие молекулы или антитела связываются с одним и тем же эпитопом (например, линейным эпитопом или конформационным эпитопом), который связывается анти-CD137 антигенсвязывающими молекулами, включая А375/В167, А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 и/или А549/В167, описанные в табл. 17 в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи. Подробное описание примеров методов картирование эпитопа, с которым связывается антигенсвязывающая молекула или антитело, представлены в работе Morris Epitope Mapping Protocols, in Methods in Molecular Biology том 66, 1966, изд-во Humana Press, Тотова, Нью-Джерси). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела в настоящем описании, обладающие CD137-связывающей активностью, которая зависит от антигенсвязывающей активности, которая в свою очередь зависящей от низкомолекулярного соединения, распознает эпитоп, образованный комплексом, сформированным из антигена (например, CD137) и низкомолекулярного соединения (например, АТФ).In another embodiment of the present invention, a competition assay in the presence of a small molecule compound can be used to identify an antigen binding molecule or antibody that competes for binding to CD137 with anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies, including antibodies A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 and/or A549/B167, described in table. 17, as a heavy chain variable region/light chain variable region combination in the presence of a small molecular compound (for example, in the presence of 10 μM or more, 50 μM or more, 100 μM or more, 150 μM or more, 200 μM or more, or 250 μM or lower molecular weight compound). In some embodiments of the present invention, such competing antigen binding molecules or antibodies bind to the same epitope (e.g., a linear epitope or conformational epitope) that is bound by anti-CD137 antigen binding molecules, including A375/B167, A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376, A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 and/or A549/B167, described in table. 17 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination. For detailed descriptions of examples of methods for mapping the epitope to which an antigen-binding molecule or antibody binds, see Morris Epitope Mapping Protocols, in Methods in Molecular Biology volume 66, 1966, Humana Press, Totowa, NJ). In one embodiment of the present invention, anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies as used herein, having CD137-binding activity that is dependent on antigen-binding activity that in turn is dependent on the small molecule compound, recognize an epitope formed by a complex formed from the antigen (eg , CD137) and a low molecular weight compound (for example, ATP).
В типичном конкурентном анализе с использованием антитела иммобилизованный CD137 инкубируют в присутствии низкомолекулярного соединения (например, в присутствии 10 мкмоль или более, 50 мкмоль или более, 100 мкмоль или более, 150 мкМ или более, 200 мкМ или более, или 250 мкМ или большего количества низкомолекулярного соединения) в растворе, содержащем первое меченое антитело, связывающееся с CD137 (например, анти-CD137 антитела, включающие А372/В040, А356/В040, А486/В167, А487/В167, А488/В226, А489/В223, А548/В376, А551/В256, А551/В379, А555/В379, А548/В256 и/или А549/В167, описанные в табл. 17, в качестве комбинации вариабельной области тяжелой цепи/вариабельной области легкой цепи), и второе немеченое антитело, которое тестируют на способность конкурировать за связывание с CD137 с первым антителом. Второе антитело может присутствовать в супернатанте гибридомы. В качестве контроля иммобилизованный CD137 инкубируют в растворе, содержащем первое меченое антитело, но не второе немеченое антитело. После инкубации в условиях, допускающих связывание первого антитела с CD137, избыток несвязавшегося антитела удаляют и измеряют количество метки, связанной с иммобилизованным CD137. Если количество метки, связанной с иммобилизованным CD137, существенно снижено в тестируемом образце по сравнению с контрольным образцом, это указывает на то, что второе антитело конкурирует с первым антителом за связывание с CD137. См. публикацию Harlow и Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, глава 14, 1988, изд-во Cold Spring Harbor Laboratory, Нью-Йорк). Специалистам в данной области очевидно, что анализ можно проводить аналогично с исследованием антигенсвязывающих молекул, отличных от антител.In a typical antibody competition assay, immobilized CD137 is incubated in the presence of a small molecule compound (e.g., in the presence of 10 μM or more, 50 μM or more, 100 μM or more, 150 μM or more, 200 μM or more, or 250 μM or more small molecule compound) in a solution containing a first labeled antibody that binds to CD137 (e.g., anti-CD137 antibodies including A372/B040, A356/B040, A486/B167, A487/B167, A488/B226, A489/B223, A548/B376 , A551/B256, A551/B379, A555/B379, A548/B256 and/or A549/B167 described in Table 17 as a heavy chain variable region/light chain variable region combination), and a second unlabeled antibody that is tested on the ability to compete for binding to CD137 with the first antibody. The second antibody may be present in the supernatant of the hybridoma. As a control, immobilized CD137 was incubated in a solution containing the first labeled antibody but not the second unlabeled antibody. After incubation under conditions allowing binding of the first antibody to CD137, excess unbound antibody is removed and the amount of label bound to immobilized CD137 is measured. If the amount of label bound to immobilized CD137 is significantly reduced in the test sample compared to the control sample, this indicates that the second antibody is competing with the first antibody for binding to CD137. See Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, chapter 14, 1988, Cold Spring Harbor Laboratory, New York). Those skilled in the art will appreciate that the assay can be performed in a similar manner to the assay of antigen-binding molecules other than antibodies.
2. Анализы активности.2. Activity analyses.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают анализы для идентификации биологической активности анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител, обладающих биологической активностью. Биологическая активность может включать, например, агонистическую активность CD137; период полужизни в плазме; противоопухолевую активность; и слабая или подавленная системная реакция в тканях, отличных от опухолей. Также предусматривают антигенсвязывающие молекулы или антитела, обладающие такой биологической активностью in vivo и/или in vitro. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула (например, анти-CD137 антигенсвязывающая молекула) или антитело по настоящему изобретению тестируют на такую биологическую активность.In one embodiment, the present invention provides assays to identify the biological activity of anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies having biological activity. Biological activity may include, for example, CD137 agonist activity; plasma half-life; antitumor activity; and weak or suppressed systemic response in tissues other than tumors. Antigen-binding molecules or antibodies having such biological activity in vivo and/or in vitro are also provided. In some embodiments, the antigen binding molecule (eg, anti-CD137 antigen binding molecule) or antibody of the present invention is tested for such biological activity.
- 66 046075- 66 046075
а) Анализ агонистической активности (МКПК) В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическую активность по отношению к CD137 измеряют путем контакта CD137экспрессирующих клеток с αнти-CD137 антигенсвязывающей молекулой или антителом в растворе, в который добавляют или не добавляют низкомолекулярное соединение. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическую активность по отношению к CD137 в растворе, в который добавлено низкомолекулярное соединение, и агонистическую активность по отношению к CD137 в растворе, в который не добавлено низкомолекулярное соединение, оценивают по количеству цитокина, вырабатываемого (например, количества вырабатываемого IL-2, IFN-γ и/или IL-6), которое измеряют в течение 18 ч, 24 ч, 36 ч, 48 ч или 72 ч после контакта в растворе CD137-эксnрессирующих клеток и антиCD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения раствор, в который добавляют низкомолекулярное соединение, регулируют таким образом, чтобы концентрация низкомолекулярного соединения после корректировки составляет 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ. В другом варианте осуществления настоящего изобретения используемые клетки, экспрессирующие CD137, представляют собой выделенные мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК) человека или Т-клетки, размноженные из выделенных МКПК человека.a) Agonist Activity Assay (AAAs) In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity is measured by contacting CD137-expressing cells with an α-anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody in a solution to which a small molecule compound is added or not. In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is added and CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is not added are assessed by the amount of cytokine produced (e.g., the amount of cytokine produced IL-2, IFN-γ and/or IL-6), which is measured for 18 hours, 24 hours, 36 hours, 48 hours or 72 hours after solution contact of CD137-expressing cells and anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In one embodiment of the present invention, the solution to which the small molecule compound is added is adjusted such that the concentration of the small molecule compound after adjustment is 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM, or 250 μM. In another embodiment of the present invention, the CD137 expressing cells used are isolated human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) or T cells expanded from isolated human PBMCs.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения используют МКПК человека, выделенные из крови здорового донора путем центрифугирования в режиме 400xg в течение 30 мин при комнатной температуре. Предпочтительно используют МКПК человека, выделенные на последующих двух этапах. На первом этапе Leucosep (Greiner Bio-One), обогащенный Ficoll-Paque PLUS (фирма GE Healthcare), центрифугируют в режиме 1000xg в течение 1 мин при комнатной температуре, затем кровь разбавляют ФСБ и центрифугируют в режиме 400xg в течение 30 мин при комнатной температуре. На втором этапе лейкоцитарную пленку из пробирки после центрифугирования собирают и промывают 60 мл ФСБ (фирма Wako).In one embodiment, the present invention uses human PBMCs isolated from the blood of a healthy donor by centrifugation at 400xg for 30 minutes at room temperature. Preferably, human PBMCs isolated in the next two steps are used. In the first step, Leucosep (Greiner Bio-One) fortified with Ficoll-Paque PLUS (GE Healthcare) is centrifuged at 1000xg for 1 min at room temperature, then the blood is diluted with PBS and centrifuged at 400xg for 30 min at room temperature. . At the second stage, the buffy coat from the tube after centrifugation is collected and washed with 60 ml of PBS (Wako).
Подробное описание примера метода измерения CD137 агонистической активности с применением МКПК человека описано ниже. Следует отметить, что даже несмотря на то, что в следующем примере для иллюстрации АТФ используют в качестве низкомолекулярного соединения, это не исключает других низкомолекулярных соединений. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения выделенные МКПК человека разводят до плотности 5х106/мл культуральной средой (5% сыворотки человека (фирма SIGMA), 95% AIM-V (фирма Thermo Fischer Scientific)). Затем выделенные МКПК человека контактируют с антителом против CD3ε человека и/или с антителом против CD28 человека, посредством чего экспрессия CD137 индуцируется в МКПК человека. Предпочтительно 50 мкл 0,04 мкг/мл антитела против CD3ε человека (фирма BD Co., клон SP34) и 20 мкг/мл антитела против CD28 человека (фирма BD, клон: CD28.2), разведенные культуральной средой, добавляют к выделенным МКПК человека (100 мкл с плотностью клеток 5х 106/мл).A detailed description of an example method for measuring CD137 agonist activity using human PBMCs is described below. It should be noted that even though the following example uses ATP as the small molecule compound for illustration, this does not exclude other small molecule compounds. In one embodiment of the present invention, isolated human PBMCs are diluted to a density of 5x10 6 /ml with culture medium (5% human serum (SIGMA), 95% AIM-V (Thermo Fischer Scientific)). The isolated human PBMCs are then contacted with an anti-human CD3ε antibody and/or an anti-human CD28 antibody, whereby CD137 expression is induced in the human PBMCs. Preferably, 50 μl of 0.04 μg/ml anti-human CD3ε antibody (BD Co., clone SP34) and 20 μg/ml anti-human CD28 antibody (BD, clone: CD28.2), diluted in culture medium, are added to the isolated PBMCs human (100 µl with a cell density of 5x 10 6 / ml).
К МКПК человека, к которым добавлены антитела против CD3ε человека и/или антитела против CD28 человека, затем дополнительно добавляют (i) культуральную среду с или без АТФ; и (ii) антиCD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело. Предпочтительно добавляют 25 мкл питательной среды с АТФ или без него. Предпочтительно добавляют 25 мкл анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела в концентрации 40 мкг/мл. Более предпочтительно, указанные выше (i) и (ii) добавляют примерно через 6 ч после контакта МКПК человека с антителом против CD3ε человека и/или антителом против CD28 человека. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения, предпочтительно количество выработанного IL-2 измеряют до выработки количества IFN-γ. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения количество выработки IL-2 измеряют в течение примерно 24 ч после контакта МКПК человека с антителом против CD3ε человека и/или антителом против CD28 человека. Предпочтительно количество выработки IL-2 измеряют примерно через 24 ч после контакта МКПК человека с антителом против CD3ε человека и/или антителом против CD28 человека и примерно через 18 ч после добавления анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела.To human PBMCs to which anti-human CD3ε antibodies and/or anti-human CD28 antibodies have been added, (i) culture medium with or without ATP is then further added; and (ii) an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. Preferably, 25 μl of culture medium with or without ATP is added. Preferably, 25 μl of anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is added at a concentration of 40 μg/ml. More preferably, (i) and (ii) above are added approximately 6 hours after contact of human PBMCs with the anti-human CD3ε antibody and/or the anti-human CD28 antibody. In one embodiment of the present invention, preferably the amount of IL-2 produced is measured before the amount of IFN-γ is produced. In one embodiment of the present invention, the amount of IL-2 production is measured for about 24 hours after contact of human PBMCs with an anti-human CD3ε antibody and/or an anti-human CD28 antibody. Preferably, the amount of IL-2 production is measured approximately 24 hours after contact of human PBMCs with an anti-human CD3ε antibody and/or an anti-human CD28 antibody and approximately 18 hours after addition of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения количество выработанного IFN-γ измеряют примерно в течение 48 ч после контакта МКПК человека с антителом против CD3ε человека и/или с антителом против CD28 человека. Предпочтительно количество выработанного IFN-γ измеряют примерно в течение 48 ч после контакта МКПК человека с антителом против CD3ε человека и/или с антителом против CD28 человека и примерно 42 ч после добавления анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения количество выработанного IL-2 и/или количество выработанного IFN-γ определяют путем измерения количества выработанного IL-2 и/или количества выработанного IFN-γ в собранном культуральном супернатанте. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения МКПК человека, добавленные с антителом против CD3ε человека и/или антителом против CD28 человека, оставляют в инкубаторе в атмосфере 5% CO2 при 37°C пока все измерения не будут завершены.In another embodiment of the present invention, the amount of IFN-γ produced is measured approximately 48 hours after exposure of human PBMCs to an anti-human CD3ε antibody and/or an anti-human CD28 antibody. Preferably, the amount of IFN-γ produced is measured within about 48 hours after contact of human PBMCs with an anti-human CD3ε antibody and/or with an anti-human CD28 antibody and about 42 hours after the addition of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In one embodiment of the present invention, the amount of IL-2 produced and/or the amount of IFN-γ produced is determined by measuring the amount of IL-2 produced and/or the amount of IFN-γ produced in the collected culture supernatant. In one embodiment of the present invention, human PBMCs spiked with anti-human CD3ε antibody and/or anti-human CD28 antibody are left in an incubator under 5% CO2 at 37°C until all measurements are completed.
Подробности еще одного примера метода измерения агонистической активности CD137 с использованием МКПК человека описаны ниже. Выделенный МКПК человека разводят до плотности клетокDetails of another example of a method for measuring CD137 agonistic activity using human PBMCs are described below. Isolated human PBMC are diluted to cell density
- 67 046075- 67 046075
5х106/мл культуральной средой (5% сыворотки человека (фирма SIGMA), 95% AIM-V (фирма Thermo Fischer Scientific)). Затем плотность МКПК человека доводят до 5х106/мл и по 100 мкл высевают в лунки 96-луночного планшета (плоскодонного с крышкой) (фирма Corning). Затем воздействуют на МКПК человека для индукции экспрессии CD137. Например, экспрессию CD137 в МКПК человека индуцируют добавлением 50 мкл антитела против CD3ε человека в концентрации 0,04 мкг/мл (фирма BD Co., клон SP34) и антитела против CD28 человека в концентрации 20 мкг/мл (фирма BD, клон CD28.2), разведенных культуральной средой.5x10 6 /ml culture medium (5% human serum (SIGMA), 95% AIM-V (Thermo Fischer Scientific)). Then the density of human PBMCs is adjusted to 5x10 6 /ml and 100 μl is seeded into the wells of a 96-well plate (flat-bottomed with a lid) (Corning). Human PBMCs are then exposed to induce CD137 expression. For example, CD137 expression in human PBMCs is induced by adding 50 μl of an anti-human CD3ε antibody at a concentration of 0.04 μg/ml (BD Co., clone SP34) and an anti-human CD28 antibody at a concentration of 20 μg/ml (BD Co., clone CD28. 2), diluted with culture medium.
Затем экспрессию CD137 индуцируют в МКПК человека, планшет встряхивают и оставляют на 6 ч при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. Затем по 25 мкл 2 мМ АТФ (фирма SIGMA), разведенной в среде, или только среду без АТФ, и 25 мкл каждого антитела в концентрации 40 мкг/мл вносят в каждую лунку, и планшет встряхивают и оставляют на 18 ч при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. Затем собирают часть культурального супернатанта, и с его помощью количество ИЛ-2, содержащегося в культуральном супернатанте, количественно определяют с помощью набора для иммуноферментного анализа Human IL-2 DuoSet ELISA (фирма R&D systems) или набора Human IL-2 ELISA Set (фирма BD Biosciences). После сбора культурального супернатанта планшет снова оставляют на 24 ч при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. Затем собирают часть культурального супернатанта и IFN-γ, содержащийся в культуральном супернатанте, количественно определяют с использованием набора для иммуноферментного анализа IFN-γ DuoSet ELISA (фирма R&D systems) или набора Human IFN-γ ELISA Development (фирма PeproTech). Метод ELISA в основном применяют в соответствии с протоколом, прилагаемым к набору. При работе с набором Human IL-2 DuoSet ELISA (фирма R&D systems) и набором Human IFN-γ ELISA Development (фирма R&D systems) появление и прекращение окрашивания выполняют в соответствии с протоколом с использованием раствора субстрата (фирма R&D systems), содержащего Н2О2, тетраметилбензидин и 1н H2SO4 (фирма Wako). При работе с набором Human IL-2 ELISA Set (фирма BD Biosciences) прекращение окрашивания выполняют с применением 1н H2SO4 (фирма Wako).CD137 expression is then induced in human PBMCs, the plate is shaken and left for 6 hours at 37°C in an incubator under 5% CO 2 atmosphere. Then 25 μl of 2 mM ATP (SIGMA) diluted in medium, or medium without ATP alone, and 25 μl of each antibody at a concentration of 40 μg/ml are added to each well, and the plate is shaken and left for 18 hours at 37°C in an incubator in an atmosphere of 5% CO2. A portion of the culture supernatant is then collected and the amount of IL-2 contained in the culture supernatant is quantified using the Human IL-2 DuoSet ELISA kit (R&D systems) or the Human IL-2 ELISA Set (BD Biosciences). After collecting the culture supernatant, the plate is again left for 24 hours at 37°C in an incubator under an atmosphere of 5% CO2. A portion of the culture supernatant is then collected and the IFN-γ contained in the culture supernatant is quantified using the IFN-γ DuoSet ELISA kit (R&D systems) or the Human IFN-γ ELISA Development kit (PeproTech). The ELISA method is generally used according to the protocol supplied with the kit. When working with the Human IL-2 DuoSet ELISA kit (R&D systems) and the Human IFN-γ ELISA Development kit (R&D systems), the appearance and cessation of staining is performed in accordance with the protocol using a substrate solution (R&D systems) containing H 2 O 2 , tetramethylbenzidine and 1 N H 2 SO 4 (Wako). When working with the Human IL-2 ELISA Set (BD Biosciences), stop staining using 1 N H2SO4 (Wako).
При работе с набором IFN-γ ELISA Development (фирма PeproTech) появление окрашивания и прекращение окрашивания проводят с использованием раствора ТМВ Chromogen Solution (фирма Thermo Fischer Scientific) и 1н H2SO4 (фирма Wako). Затем измерение абсорбции выполняют с помощью EnVision (фирма PerkinElmer), и количества (пг/мл) IL-2 и IFN-γ в культуральном супернатанте соответственно рассчитывают с использованием калибровочной кривой, построенной в соответствии с протоколом. В этом анализе МКПК агонистическую активность CD137 может быть выражена как кратное изменение количества IL-2 и IFN-γ в супернатанте культуры по сравнению с отрицательным контрольным антителом (антителом, которое не связывается с CD137). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическую активность CD137 измеряют в соответствии с методами, описанными в примерах 5-5-1 и 5-5-2.When working with the IFN-γ ELISA Development kit (PeproTech), the onset and cessation of staining is carried out using a solution of TMB Chromogen Solution (Thermo Fischer Scientific) and 1 N H 2 SO 4 (Wako). Absorbance measurement is then performed using EnVision (PerkinElmer), and the amounts (pg/ml) of IL-2 and IFN-γ in the culture supernatant are respectively calculated using a calibration curve constructed according to the protocol. In this PBMC assay, CD137 agonist activity can be expressed as the fold change in the amount of IL-2 and IFN-γ in the culture supernatant compared to a negative control antibody (an antibody that does not bind to CD137). In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity is measured in accordance with the methods described in Examples 5-5-1 and 5-5-2.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если агонистическую активность в отношении CD137 оценивают по количеству выработанного цитокина (например, по количеству выработанного IL-2, IFN-γ и/или IL-6) в МКПК человека, анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело можно расценить как проявление агонистической активности в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения, если количество выработанного цитокина в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения при добавлении анtu-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела больше в 1,01 раз или более, в 1,02 раз или более, в 1,03 раз или более, в 1,05 раз или более, в 1,06 раз или более, в 1,07 раз или более, в 1,08 раз или более, в 1,09 раз или более, в 1,1 раза или более, в 1,11 раз или более, в 1,12 раз или более, в 1,13 раз или более, в 1,14 раз или более или в 1,15 раз или более, в 1,5 раза или более, в 2 раза или более, или в 3 раза или более по сравнению с количеством выработанного цитокина при добавлении антитела - отрицательного контроля.In one embodiment of the present invention, if CD137 agonist activity is assessed by the amount of cytokine produced (e.g., the amount of IL-2, IFN-γ, and/or IL-6 produced) in human PBMCs, the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody may be regarded as a manifestation of agonistic activity against CD137 in the presence of a low molecular weight compound if the amount of cytokine produced in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM low molecular weight compound upon addition of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody is greater than 1 .01 times or more, 1.02 times or more, 1.03 times or more, 1.05 times or more, 1.06 times or more, 1.07 times or more, 1.08 times or more, 1.09 times or more, 1.1 times or more, 1.11 times or more, 1.12 times or more, 1.13 times or more, 1.14 times or more than or 1.15 times or more, 1.5 times or more, 2 times or more, or 3 times or more the amount of cytokine produced when the negative control antibody was added.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическую активность в отношении CD137 оценивают по количеству выработанного IL-2 в МКПК человека, когда анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело можно оценить как проявляющую агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения, если количество вырабатываемого IL-2 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения, если добавленные анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело больше в 1,01 раза или более, в 1,02 раза или более, в 1,03 раза или более, или в 1,05 раза или более, в 1,05 раза или более в предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения по сравнению с количеством выработанного IL-2 при добавлении антитела - отрицательного контроля.In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity is assessed by the amount of IL-2 produced in human PBMCs, where an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody can be assessed as having CD137 agonist activity in the presence of a small molecule compound if the amount of IL-2 produced 2 in the presence of 10 µM, 50 µM, 100 µM, 150 µM, 200 µM or 250 µM small molecule compound, if the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody added is 1.01 times or more, 1.02 times or more, in 1.03 times or more, or 1.05 times or more, 1.05 times or more in a preferred embodiment of the present invention compared to the amount of IL-2 produced when a negative control antibody is added.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения, когда агонистическую активность в отношении CD137 оценивают по количеству выработанного IFN-γ в анализе с МКПК человека, антиCD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело можно оценить как проявляющую агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения, когда количество вырабатываемого IFN-γ в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения при добавлении анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антителаIn one embodiment of the present invention, when CD137 agonist activity is assessed by the amount of IFN-γ produced in a human PBMC assay, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody can be assessed as having CD137 agonist activity in the presence of the small molecule compound when the amount of IFN produced -γ in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM, or 250 μM small molecule compound with the addition of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody
- 68 046075 больше в 1,1 раза или более, в 1,11 раз или более, в 1,12 раз или более, в 1,13 раз или более, в 1,14 раз или более, в 1,15 раз или более, в 1,15 раз или более в предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения по сравнению с количеством выработанного IFN-γ при добавлении антитела - отрицательного контроля.- 68 046075 1.1 times or more, 1.11 times or more, 1.12 times or more, 1.13 times or more, 1.14 times or more, 1.15 times or more more, 1.15 times or more in a preferred embodiment of the present invention compared to the amount of IFN-γ produced when adding a negative control antibody.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения среди анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител, для которых установлено, что они проявляют агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения в вышеупомянутом сравнении с отрицательным контролем, дополнительно определяют антитела, которые оценивают как не проявляющие агонистической активности в отношении CD137 или обладающие пониженной агонистической активностью CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения (по сравнению с таковой в присутствии низкомолекулярного соединения). В частности, когда указанные ниже (ii) больше, чем (i), hhtu-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело оценивают как не проявляющую активности агониста CD137 или имеющую более пониженную активность агониста CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения:In another embodiment of the present invention, among the anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies found to exhibit agonistic activity against CD137 in the presence of a small molecule compound in the above-mentioned negative control comparison, antibodies that are assessed as not exhibiting agonistic activity in against CD137 or having reduced CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound (compared to that in the presence of the small molecule compound). In particular, when (ii) below is greater than (i), the hhtu-CD137 antigen binding molecule or antibody is assessed as having no CD137 agonist activity or having more reduced CD137 agonist activity in the absence of the small molecule compound:
(i) [выработанное количество цитокина в отсутствие низкомолекулярного соединения при добавлении анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела]/[выработанное количество цитокина в отсутствие низкомолекулярного соединения при добавлении антитела - отрицательного контроля] (ii) [выработанное количество цитокина в присутствии низкомолекулярного соединения при добавлении анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела]/[ выработанное количество цитокина в присутствии низкомолекулярного соединения при добавлении антитела - отрицательного контроля].(i) [cytokine produced in the absence of small molecule when anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is added]/[cytokine produced in the absence of small molecule when antibody is added - negative control] (ii) [cytokine produced in the presence of small molecule when added anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody]/[the amount of cytokine produced in the presence of a small molecule compound with the addition of a negative control antibody].
В другом варианте осуществления настоящего изобретения когда агонистическая активность CD137 первой антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 и второй антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 сравнивают, используя количества выработанных цитокинов (например, количества IL-2, IFN-γ, и/или продуцирование IL-6) в анализе МКПК человека, первая антигенсвязывающая молекула или антитело против CD137 могут быть оценена как обладающие более высокой агонистической активностью, чем вторая антигенсвязывающая молекула или антитело против CD137, если (i) количество выработанных цитокинов при добавлении первой антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 1,01 раза или более, в 1,02 раза или более, в 1,03 раза или более, в 1,04 раз или более, в 1,05 раз или более, в 1,06 раз или более, в 1,07 раз или более, в 1,08 раза или более, в 1,09 раза или более, в 1,1 раз или более, в 1,11 раз или более, в 1,12 раз или более, в 1,13 раз или более, в 1,14 раз или более или в 1,15 раз или более, 1,5 раза или более, в 2 раза или более или в 3 раза или более по сравнению с (ii) количеством выработанных цитокинов при добавлении второй антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в тех же условиях.In another embodiment of the present invention, when the CD137 agonistic activity of the first antigen binding molecule or anti-CD137 antibody and the second antigen binding molecule or anti-CD137 antibody is compared using the amounts of cytokines produced (e.g., amounts of IL-2, IFN-γ, and/or IL-6 production ) in a human PBMC assay, the first antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody can be assessed as having higher agonistic activity than the second antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody if (i) the amount of cytokines produced when the first antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody is added in the presence 10 µM, 50 µM, 100 µM, 150 µM, 200 µM or 250 µM small molecule compound 1.01 times or more, 1.02 times or more, 1.03 times or more, 1.04 times or more more, 1.05 times or more, 1.06 times or more, 1.07 times or more, 1.08 times or more, 1.09 times or more, 1.1 times or more, 1.11 times or more, 1.12 times or more, 1.13 times or more, 1.14 times or more or 1.15 times or more, 1.5 times or more, 2 times or more or 3 times or more compared to (ii) the amount of cytokines produced when a second antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody was added under the same conditions.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если агонистическую активность в отношении CD137 оценивают по количеству выработанного IL-2 в анализе МКПК человека, первая антигенсвязывающая молекула или антитело против CD137 может быть оценена как имеющая более высокую агонистическую активность, чем вторая антигенсвязывающая анти-CD137 молекула или антитело, если (i) количество выработки цитокинов при добавлении первой антигенсвязывающей молекулы или антитела к CD137 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 1, 01 раза или более, в 1,02 раза или более, в 1,03 раза или более или в 1,04 раза или более, или в 1,04 раза или более предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения по сравнению с (ii) количеством вырабатываемого IL-2 при добавлении второй антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в тех же условиях.In one embodiment of the present invention, if CD137 agonistic activity is assessed by the amount of IL-2 produced in a human PBMC assay, the first anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody may be assessed as having higher agonistic activity than the second anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. antibody if (i) the amount of cytokine production upon addition of the first antigen binding molecule or anti-CD137 antibody in the presence of 10 µM, 50 µM, 100 µM, 150 µM, 200 µM or 250 µM small molecule compound is greater than 1.01 times or more .02 times or more, 1.03 times or more, or 1.04 times or more, or 1.04 times or more, in a preferred embodiment of the present invention compared to (ii) the amount of IL-2 produced when a second antigen binding agent is added molecules or antibodies against CD137 under the same conditions.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения если агонистическую активность в отношении CD137 оценивают по количеству выработки IFN-γ в анализе МКПК человека, первая антигенсвязывающая молекула или антитело против CD137 может быть оценена как имеющая более высокую агонистическую активность, чем вторая антигенсвязывающая анти-CD137 молекула или антитело, если (i) количество выработанных цитокинов при добавлении первой антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 1,05 раза или более, в 1,06 раза или более, в 1,07 раза или более, в 1,08 раза или более, в 1,09 раза или более или в 1,1 раза или более или в 1,1 раза или более в предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения по сравнению с (ii) добавлением второй антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 в тех же условиях. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения первая антигенсвязывающая молекула или антитело против CD137 представляет собой антигенсвязывающую молекулу или антитело, содержащее исходную область Fc, а вторая антигенсвязывающая молекула анти-CD137 представляет собой антигенсвязывающую молекулу или антитело, содержащее вариант области Fc.In one embodiment of the present invention, if CD137 agonistic activity is assessed by the amount of IFN-γ production in a human PBMC assay, the first anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody may be assessed as having higher agonistic activity than the second anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. antibody if (i) the amount of cytokines produced upon addition of the first antigen binding molecule or anti-CD137 antibody in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM or 250 μM small molecule compound is greater than 1.05 times or more, 1 .06 times or more, 1.07 times or more, 1.08 times or more, 1.09 times or more, or 1.1 times or more, or 1.1 times or more in a preferred embodiment of the present invention compared to (ii) adding a second antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody under the same conditions. In one embodiment of the present invention, the first anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody is an antigen-binding molecule or antibody containing the original Fc region, and the second anti-CD137 antigen-binding molecule is an antigen-binding molecule or antibody containing a variant Fc region.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения метод, описанный в примерах 5-5-1 и 5-5-2, может использоваться для измерения агонистической активности CD137 с использованием МКПК человека, а метод, описанный в примере 2-6, может использоваться для измерения агонистической активности CD137 с использованием Т-клеток, размноженных из выделенных МКПК человека.In one embodiment of the present invention, the method described in Examples 5-5-1 and 5-5-2 can be used to measure CD137 agonist activity using human PBMCs, and the method described in Example 2-6 can be used to measure CD137 agonist activity using T cells expanded from isolated human PBMCs.
- 69 046075- 69 046075
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическая активность в отношении CD137 может быть измерена путем контактирования CD8-положительных или CD4положительных Т-клеток, выделенных из МКПК человека, с антигенсвязывающей молекулой или антителом против CD137 в растворе, в который добавлено или не добавлено низкомолекулярное соединение. В это время к раствору могут быть дополнительно добавлены клетки, экспрессирующие FcYRIIb. В другом варианте агонистическая активность в отношении CD137 может быть измерена путем контактирования В-клеток (которые могут быть выделены из МКПК человека или может использоваться известная линия В-клеток) с антигенсвязывающей молекулой или антителом против CD137. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическая активность в отношении CD137 может быть оценена по количеству выработки цитокинов (например, по количеству IL-2, IFN-γ и/или по количеству выработанного IL-6), которое измеряют после контакта в растворе CD8-положительных Т-клеток, CD4положительных Т-клеток или В-клеток с антигенсвязывающей молекулой или антителом против CD137.In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity can be measured by contacting CD8-positive or CD4-positive T cells isolated from human PBMCs with an antigen-binding molecule or anti-CD137 antibody in a solution to which the small molecule compound is added or not. At this time, additional cells expressing FcYRIIb can be added to the solution. In another embodiment, CD137 agonist activity can be measured by contacting B cells (which can be isolated from human PBMCs or a known B cell line can be used) with an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody. In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity can be assessed by the amount of cytokine production (eg, the amount of IL-2, IFN-γ, and/or the amount of IL-6 produced), which is measured after contact in a CD8- positive T cells, CD4 positive T cells, or B cells with antigen binding molecule or anti-CD137 antibody.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анализы агонистической активности с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека (МКПК) выделяют из крови, взятой у здоровых индивидов. Таким образом, в любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения специалистам в данной области должно быть понятно, что результаты анализов с использованием анализов могут различаться для каждого донора образцов крови. Принимая во внимание это обстоятельство, антитела, агонистическая активность которых не проявляется в отношении части или большинства МКПК человека, выделенных от нескольких доноров, не могут считаться проявляющими агонистическую активность CD137, даже если критерии агонистической активности удовлетворяются у другой части МКПК человека. Кроме того, когда анализ в соответствии с описанным выше методом проводят на МКПК человека, выделенных от многих доноров, и критерии агонистической активности CD137 у большинства доноров соответствуют, можно сделать вывод, что проявляется агонистическая активность CD137. В другом варианте осуществления настоящего изобретения, когда анализ в соответствии с описанным выше методом проводят на МКПК человека, выделенных от многих доноров, среднее или медианное значение анализа (например, количества IL-2, IFN-γ, и/или IL-6) может использоваться для определения наличия или отсутствия агонистической активности CD137. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения когда анализ проводят согласно вышеуказанному методу на МКПК человека, выделенных от множества доноров, количество доноров составляет, например, 2 или более, 3 или более, 4 или более, 5 или более, 10 или более, 15 или более, или 20 или более.In one embodiment of the present invention, agonist activity assays using human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) are isolated from blood collected from healthy individuals. Thus, in any of the above embodiments of the present invention, it will be understood by those skilled in the art that the results of assays using assays may vary for each blood sample donor. Taking this into account, antibodies that do not exhibit agonistic activity on some or the majority of human PBMCs isolated from multiple donors cannot be considered to exhibit CD137 agonistic activity, even if the criteria for agonistic activity are met in another portion of human PBMCs. In addition, when the assay according to the method described above is performed on human PBMCs isolated from multiple donors and the criteria for CD137 agonist activity are met in most donors, it can be concluded that CD137 agonist activity is exhibited. In another embodiment of the present invention, when an assay in accordance with the method described above is performed on human PBMCs isolated from multiple donors, the mean or median assay value (e.g., amounts of IL-2, IFN-γ, and/or IL-6) may be used to determine the presence or absence of CD137 agonist activity. In one embodiment of the present invention, when the assay is performed according to the above method on human PBMCs isolated from multiple donors, the number of donors is, for example, 2 or more, 3 or more, 4 or more, 5 or more, 10 or more, 15 or more, or 20 or more.
б) Анализ агонистической активности (анализ репортерного гена) В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическую активность по отношению к CD137 оценивают с помощью анализа репортерного гена в растворе, в который добавляют или не добавляют низкомолекулярное соединение. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическую активность по отношению к CD137 в растворе, в который добавлено низкомолекулярное соединение, и агонистическую активность по отношению к CD137 в растворе, в который не добавлено низкомолекулярное соединение, соответственно оценивают по сигналу люминесценции люциферазы, измеренному после контакта Т-клеток, экспрессирующих репортерную конструкцию NF-каппаВ-люциферазы и CD137 с антигенсвязывающей молекулой против CD137, и оставляют на определенное время в соответствующем растворе. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения раствор, в который добавляют низкомолекулярное соединение, регулируют таким образом, чтобы концентрация низкомолекулярного соединения после корректировки составляла 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ. Т-клетки, экспрессирующие репортерную конструкцию NF-kappaB-luciferase и CD137, предпочтительно являются клетками линии GloResponse™ NF-kappaB-Luc2/4-1BB Jurkat (фирма Promega, CS196004).b) Agonist Activity Assay (Reporter Gene Assay) In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity is assessed using a reporter gene assay in a solution to which a small molecule compound is added or not. In one embodiment of the present invention, CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is added and CD137 agonist activity in a solution to which the small molecule compound is not added are respectively assessed by the luciferase luminescence signal measured after contact T -cells expressing an NF-kappaB-luciferase and CD137 reporter construct with an antigen-binding molecule against CD137, and left for a certain time in the appropriate solution. In one embodiment of the present invention, the solution to which the small molecule compound is added is adjusted such that the concentration of the small molecule compound after adjustment is 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM, or 250 μM. T cells expressing the NF-kappaB-luciferase and CD137 reporter construct are preferably GloResponse™ NF-kappaB-Luc2/4-1BB Jurkat cells (Promega, CS196004).
Подробности типичного метода измерения агонистической активности CD137 с использованием анализа репортерного гена описаны ниже. В приводимых ниже примерах АТФ используют в качестве примера низкомолекулярного соединения, но не исключаются и другие низкомолекулярные соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения сначала концентрацию FcyRIIBэкспрессирующих клеток доводят до 5х104/мл средой (культуральная среда СНО (90% Ham's F12, 10 % ФСБ)), и оставляют на ночь при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в качестве клеток, экспрессирующих FcgRIIB, можно использовать не только клетки, усиленно экспрессирующие FcgRIIB, но также клеточные линии, которые эндогенно экспрессируют FcgRIIB, такие как линии В-клеток, В-клетки, выделенные из живого организма, и т.п. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения FcYRIIB-экспрессирующими клетками являются клетки FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega). Затем, после удаления среды аспирацией, концентрацию клеток линии GloResponseTM NF-kappaB-Luc2/4-1BB Jurkat (далее 4-1ВВ Jurkat) доводят до 2ε106/мл другой средой (99% RPMI, 1% ФСБ). В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения на 200 мкл скорректированных средой FcYRIIB-экспрессирующих клеток добавляют 25 мкл GloResponse™ NF-kappaB-Luc2/4-1BB клеток линии Jurka, скорректированных средой. Затем по 25 мкл каждой антигенсвязывающей молекулы против CD137 разбавляют вышеупомянутой средой (99% RPMI, 1% ФСБ) до достижения желаемой концентрации (например, конечной концентрации 0, 0,001, 0,01, 0,1,Details of a typical method for measuring CD137 agonist activity using a reporter gene assay are described below. In the examples below, ATP is used as an example of a small molecule compound, but other small molecule compounds are not excluded. In one embodiment of the present invention, the concentration of FcyRIIB-expressing cells is first adjusted to 5x10 4 /ml with medium (CHO culture medium (90% Ham's F12, 10% PBS)), and left overnight at 37°C in an incubator under an atmosphere of 5% CO 2 . In one embodiment of the present invention, not only cells that potently express FcgRIIB, but also cell lines that endogenously express FcgRIIB, such as B cell lines, B cells isolated from a living organism, can be used as FcgRIIB-expressing cells. and so on. In a preferred embodiment of the present invention, the FcYRIIB-expressing cells are FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega). Then, after removing the medium by aspiration, the concentration of GloResponseTM NF-kappaB-Luc2/4-1BB Jurkat cells (hereinafter 4-1BB Jurkat) is adjusted to 2ε10 6 /ml with another medium (99% RPMI, 1% FSB). In a preferred embodiment of the present invention, 25 μl of GloResponse™ NF-kappaB-Luc2/4-1BB media-corrected Jurka cells are added to 200 μl of media-corrected FcYRIIB-expressing cells. Then, 25 μl of each anti-CD137 antigen binding molecule is diluted with the above medium (99% RPMI, 1% PBS) to achieve the desired concentration (e.g., final concentration 0, 0.001, 0.01, 0.1,
- 70 046075- 70 046075
1, 10 мкг/мл), а затем добавляют по 25 мкл раствора АТФ, разбавленного вышеупомянутой средой (99% RPMI, 1% ФСБ), чтобы получить желаемую концентрацию (например, конечная концентрация равна 0, 10, 50, 100, 150, 200, 250 мкМ). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения сигнал люминесценции люциферазы измеряют после пребывания в течение 2 ч или менее, 4 ч или менее, 6 ч или менее, 24 ч или менее после добавления анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы к клеткам 4-1ВВ Jurkat. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения 4-1ВВ Jurkat выдерживают при 37°C в течение 6 ч в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. После этого добавляют 75 мкл реагента BioGlo и измеряют люминесценцию с помощью планшетного ридера. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения реагентом Bio-Glo является Bio-Glo Luciferase Assay System (буфер и субстрат). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения чтобы поддерживать постоянную температуру во время реакции клетки 4-1ВВ Jurkat можно оставить при комнатной температуре в течение 5 мин, 10 мин, 15 мин или 20 мин после извлечения из инкубатора. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения 4-1ВВ Jurkat оставляют при комнатной температуре в течение 15 мин после извлечения из инкубатора. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения значение люминесценции клеток 4-1ВВ Jurkat, к которым добавлена антигенсвязывающая молекула против CD137, делят на значение люминесценции клеток 4-1ВВ Jurkat, к которым не была добавлена антигенсвязывающая молекула против CD137, и это значение принимают за показатель кратности индукции (относительная световая единица) и используют в качестве показателя для оценки агонистической активности CD137 каждой антигенсвязывающей молекулы.1, 10 μg/ml), and then add 25 μl of ATP solution diluted with the above medium (99% RPMI, 1% PBS) to obtain the desired concentration (for example, the final concentration is 0, 10, 50, 100, 150, 200, 250 µM). In one embodiment of the present invention, the luciferase luminescence signal is measured after 2 hours or less, 4 hours or less, 6 hours or less, 24 hours or less after addition of the anti-CD137 antigen binding molecule to 4-1BB Jurkat cells. In a preferred embodiment of the present invention, the 4-1BB Jurkat is maintained at 37°C for 6 hours in an incubator under an atmosphere of 5% CO 2 . After this, 75 μl of BioGlo reagent is added and luminescence is measured using a plate reader. In one preferred embodiment of the present invention, the Bio-Glo reagent is the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). In one embodiment of the present invention, to maintain a constant temperature during the reaction, the 4-1BB Jurkat cells can be left at room temperature for 5 minutes, 10 minutes, 15 minutes, or 20 minutes after removal from the incubator. In a preferred embodiment of the present invention, the 4-1BB Jurkat is left at room temperature for 15 minutes after removal from the incubator. In one embodiment of the present invention, the luminescence value of 4-1BB Jurkat cells to which anti-CD137 antigen-binding molecule has been added is divided by the luminescence value of 4-1BB Jurkat cells to which no anti-CD137 antigen-binding molecule has been added, and this value is taken as the fold index induction (relative light unit) and is used as an indicator to evaluate the CD137 agonist activity of each antigen-binding molecule.
Еще один пример способа измерения агонистической активности CD137 с использованием анализа репортерного гена описан ниже. В каждую лунку 96-луночного планшета добавляют 200 мкл клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), доведенных добавлением среды до концентрации 5х104/ мл и оставляют на ночь при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. В качестве культуральной среды применяют среду СНО (90% Ham's F12, 10% ФСБ). Затем среду полностью удаляют отсасыванием, 25 мкл GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB клеток линии Jurkat с откорректированной концентрацией 2х106/мл в среде для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ) добавляют в каждую лунку. Затем добавляют по 25 мкл каждого раствора антигена, разбавленного средой для анализа до конечной концентрации 0, 0,001, 0,01, 0,1, 1 или 10 мкг/мл, и, в итоге добавляют 25 мкл раствора АТФ, разбавленного средой для анализа до 0 или 250 мкМ. После того, как планшет оставляют на 6 ч при 37°C в инкубаторе с 5% СО2 в атмосфере, его оставляют при комнатной температуре на 15 мин и затем добавляют по 75 мкл реагента Bio-Glo в каждую лунку. В качестве реагента Bio-Glo, например, можно использовать систему анализа люциферазы Bio-Glo Luciferase Assay System (буфер и субстрат). После этого люминесценцию в каждой лунке измеряют с помощью планшет-ридера. Показатель, полученный делением значения люминесценции в каждой лунке на значение люминесценции в лунке, в которую не добавлено какое-либо антитело, определяют как показатель кратности индукции. В анализе репортерного гена агонистическая активность CD137 может быть оценена по кратному изменению (как относительная световая единица) люминесценции в лунках с каждым добавленным антителом, по сравнению с количеством люминесценции в лунках, в которые не было добавлено каких-либо антител.Another example of a method for measuring CD137 agonist activity using a reporter gene assay is described below. To each well of a 96-well plate, add 200 μl of FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega), adjusted by adding medium to a concentration of 5x10 4 / ml, and leave overnight at 37°C in an incubator in an atmosphere of 5% CO2. CHO medium (90% Ham's F12, 10% PBS) is used as a culture medium. The medium is then completely removed by suction, and 25 μl of GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cells at an adjusted concentration of 2x10 6 /ml in assay medium (99% RPMI, 1% PBS) is added to each well. Then add 25 µl of each antigen solution diluted with assay medium to a final concentration of 0, 0.001, 0.01, 0.1, 1 or 10 µg/ml, and finally add 25 µl of ATP solution diluted with assay medium to 0 or 250 µM. After the plate is left for 6 hours at 37°C in a 5% CO 2 incubator, it is left at room temperature for 15 minutes and then 75 μl of Bio-Glo reagent is added to each well. For example, the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate) can be used as a Bio-Glo reagent. Luminescence in each well is then measured using a plate reader. The value obtained by dividing the luminescence value in each well by the luminescence value in the well to which no antibody was added is determined as the induction factor. In a reporter gene assay, CD137 agonistic activity can be assessed by the fold change (as a relative light unit) in luminescence in wells with each antibody added, compared with the amount of luminescence in wells to which no antibody was added.
Еще один пример способа измерения агонистической активности CD137 с использованием анализа репортерного гена описан ниже. В каждую лунку 384-луночного планшета добавляют 10 мкл клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), доведенных до концентрации 2х106/ мл с помощью среды для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Затем в каждую лунку добавляют 10 мкл раствора антитела, содержащего АДФ, или раствора антитела, содержащего АТФ, или раствора антитела, не содержащего АТФ или АДФ. После этого в каждую лунку добавляют 10 мкл линии клеток GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat, доведенной до 2х106/мл с помощью среды для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Конечная концентрация АДФ составляет 50 мкМ и конечная концентрация АТФ составляет 50 мкМ. После того, как планшет оставляют при 37°C в течение 6 ч в инкубаторе с 5% CO2 в атмосфере, его оставляют при комнатной температуре на 15 мин, и в каждую лунку добавляют 30 мкл реагента Bio-Glo. В качестве реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат). После этого люминесценцию в каждой лунке измеряют с помощью планшет-ридера. Агонистическая активность CD137 может быть оценена как относительная световая единица (также оценку называют кратностью люминесценции или кратным изменением) люминесценции в лунках с каждым добавленным антителом, по сравнению с количеством люминесценции в лунках, в которые не было добавлено каких-либо антител.Another example of a method for measuring CD137 agonist activity using a reporter gene assay is described below. To each well of a 384-well plate, add 10 μl of FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega), adjusted to a concentration of 2x10 6 / ml using assay medium (99% RPMI, 1% PBS). Then, 10 μl of an antibody solution containing ADP, or an antibody solution containing ATP, or an antibody solution not containing ATP or ADP, is added to each well. After this, 10 μl of the GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line, adjusted to 2x10 6 /ml with assay medium (99% RPMI, 1% PBS), is added to each well. The final concentration of ADP is 50 µM and the final concentration of ATP is 50 µM. After the plate is left at 37°C for 6 hours in a 5% CO 2 incubator, it is left at room temperature for 15 minutes and 30 μl of Bio-Glo reagent is added to each well. The Bio-Glo reagent uses the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). Luminescence in each well is then measured using a plate reader. CD137 agonist activity can be assessed as the relative light unit (also called luminescence fold or fold change) of luminescence in wells with each antibody added, compared to the amount of luminescence in wells to which no antibody was added.
Другой пример метода измерения агонистической активности в отношении CD137 с использованием анализа репортерного гена приведен ниже. В каждую лунку 384-луночного планшета добавляют 10 мкл клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), доведенных до концентрации 4х105/мл с помощью среды для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Затем в каждую лунку добавляют 10 мкл раствора антитела, содержащего АДФ, или раствора антитела, содержащего АТФ, или раствора антитела, не содержащего АТФ или АДФ. После этого в каждую лунку добавляют 10 мкл линии клеток GloResponse™ NF-kBLuc2/4-1BB Jurkat, доведенной до 2х106/мл с помощью среды для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Конечная концентрация АДФ составляет 10 мкМ и конечная концентрация АТФ составляет 10 мкМ. ПослеAnother example of a method for measuring CD137 agonist activity using a reporter gene assay is provided below. Add 10 μl of FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega) to each well of a 384-well plate, adjusted to a concentration of 4x10 5 /ml using assay medium (99% RPMI, 1% PBS). Then, 10 μl of an antibody solution containing ADP, or an antibody solution containing ATP, or an antibody solution not containing ATP or ADP, is added to each well. After this, 10 μl of the GloResponse™ NF-kBLuc2/4-1BB Jurkat cell line, adjusted to 2x10 6 /ml with assay medium (99% RPMI, 1% PBS), is added to each well. The final concentration of ADP is 10 µM and the final concentration of ATP is 10 µM. After
- 71 046075 того, как планшет оставляют при 37°C в течение 6 ч в инкубаторе с 5% CO2 в атмосфере, его оставляют при комнатной температуре на 15 мин, и в каждую лунку добавляют 30 мкл реагента Bio-Glo. В качестве реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo Luciferase Assay System (буфер и субстрат). После этого люминесценцию в каждой лунке измеряют с помощью планшет-ридера. Агонистическая активность CD137 может быть оценена как относительная световая единица (также оценку называют кратностью люминесценции или кратным изменением) люминесценции в лунках с каждым добавленным антителом, по сравнению с количеством люминесценции в лунках, в которые не было добавлено каких-либо антител.- 71 046075 After the plate is left at 37°C for 6 hours in an incubator with 5% CO 2 atmosphere, it is left at room temperature for 15 minutes and 30 μl of Bio-Glo reagent is added to each well. The Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate) is used as a Bio-Glo reagent. Luminescence in each well is then measured using a plate reader. CD137 agonist activity can be assessed as the relative light unit (also called luminescence fold or fold change) of luminescence in wells with each antibody added, compared to the amount of luminescence in wells to which no antibody was added.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения когда агонистическую активность в отношении CD137 измеряют с использованием анализа репортерного гена, антигенсвязывающая молекула или антитело против CD137 может быть оценена как проявляющая агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии низкомолекулярного соединения, если (i) агонистическая активность в отношении CD137 (относительная световая единица) в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения больше в 1,1 раза или более, в 1,2 раза или более, в 1,3 раза или более, в 1,5 раз или более, в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более или в 90 раз или более по сравнению с (ii) агонистической активностью CD137 (относительная световая единица) в отсутствие низкомолекулярного соединения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения итоговая концентрация антитела в (i) и (ii), указанная выше, составляет 0, 0,001, 0,01, 0,1, 1 или 10 мкг/мл, в предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения она составляет 0,1 мкг/мл или 1 мкг/мл.In one embodiment of the present invention, when CD137 agonist activity is measured using a reporter gene assay, an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody may be assessed to exhibit CD137 agonist activity in the presence of a small molecule compound if (i) CD137 agonist activity (relative light unit) in the presence of 10 µM, 50 µM, 100 µM, 150 µM, 200 µM or 250 µM low molecular weight compound 1.1 times or more, 1.2 times or more, 1.3 times or more , 1.5 times or more, 2 times or more, 3 times or more, 5 times or more, 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more , 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more compared to (ii) CD137 agonist activity (relative light unit) in the absence of the small molecule compound. In one embodiment of the present invention, the resulting concentration of antibody in (i) and (ii) above is 0, 0.001, 0.01, 0.1, 1 or 10 μg/ml, in a preferred embodiment of the present invention it is 0.1 µg/ml or 1 µg/ml.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения если антигенсвязывающая молекула или антитело против CD137 добавляют в определенной концентрации (например, при конечной концентрации 0,001, 0,01, 0,1, 1 или 10 мкг/мл, или 0,1 мкг/мл или 1 мкг/мл), антигенсвязывающую молекулу или антитело против CD137 оценивают как по существу не проявляющую агонистической активности против CD137 в отсутствие низкомолекулярного соединения, если индукция кратности (относительная световая единица) в отсутствие низкомолекулярного соединения составляет 10 или менее, 9 или менее, 8 или менее, или 5 или менее в предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения, и существенно 1 в более предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения кратность индукции (относительная световая единица) в отсутствие низкомолекулярного соединения по существу равна 1 означает те случаи, когда кратная индукция (относительная световая единица) в отсутствие низкомолекулярного соединения составляет менее 2 раз, менее 1, 9 раз, менее 1,8 раз, менее 1,7 раз, менее 1,6 раз, менее 1,5 раз, менее 1,4 раз, менее 1,3 раз, менее 1,2 раз или менее 1,1 раза.In another embodiment of the present invention, if an antigen binding molecule or anti-CD137 antibody is added at a specific concentration (for example, at a final concentration of 0.001, 0.01, 0.1, 1 or 10 μg/ml, or 0.1 μg/ml or 1 μg /ml), an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody is assessed as having substantially no anti-CD137 agonistic activity in the absence of the small molecule compound if the fold induction (relative light unit) in the absence of the small molecule compound is 10 or less, 9 or less, 8 or less, or 5 or less in a preferred embodiment of the present invention, and substantially 1 in a more preferred embodiment of the present invention. In one embodiment of the present invention, the induction fold (relative light unit) in the absence of the small molecule compound is substantially equal to 1, meaning those cases where the induction fold (relative light unit) in the absence of the small molecule compound is less than 2 times, less than 1, 9 times, less 1.8 times, less than 1.7 times, less than 1.6 times, less than 1.5 times, less than 1.4 times, less than 1.3 times, less than 1.2 times or less than 1.1 times.
в) Концентрация в плазме.c) Concentration in plasma.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения кинетику в крови антигенсвязывающей молекулы или антитела против CD137 по настоящему раскрытию измеряют и/или сравнивают с использованием мышей с нокином CD137 человека. Мышь с нокином CD137 человека получают, например, путем замены гена CD137 мыши геном CD137 человека путем введения вектора замены с геном CD137 человека в эмбриональные стволовые клетки мыши (ES-клетки). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающую молекулу или антитело CD137 по настоящему изобретению вводят путем однократного внутривенного введения мышам с нокином CD137 человека, и кровь собирают несколько раз с течением времени, начиная сразу после введения до примерно 5 дней, 10 дней, 15 дней, 20 дней, 25 дней или 30 дней после введения. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающую молекулу или антитело против CD137 по настоящему изобретению вводят путем однократного внутривенного введения мышам с нокином CD137 человека, кровь собирают несколько раз в течение периода времени от 5 мин до 28 дней после введения. Плазму быстро отделяют от собранной крови, и концентрацию антител в плазме измеряют электрохемилюминесценцией (ECL). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения концентрацию антитела в плазме можно измерить способом, описанным в примере 6-3-2.In one embodiment of the present invention, the blood kinetics of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody of the present disclosure is measured and/or compared using human CD137 knockin mice. A human CD137 knockin mouse is generated, for example, by replacing the mouse CD137 gene with a human CD137 gene by introducing a replacement vector with the human CD137 gene into mouse embryonic stem cells (ES cells). In one embodiment of the present invention, the CD137 antigen binding molecule or antibody of the present invention is administered by a single intravenous injection to human CD137 knockin mice, and blood is collected several times over time, starting immediately after administration until about 5 days, 10 days, 15 days, 20 days, 25 days or 30 days after administration. In a preferred embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody of the present invention is administered by a single intravenous injection to human CD137 knockin mice, and blood is collected several times over a period of time from 5 minutes to 28 days after administration. The plasma is quickly separated from the collected blood, and the plasma antibody concentration is measured by electrochemiluminescence (ECL). In one embodiment of the present invention, plasma antibody concentration can be measured by the method described in Example 6-3-2.
При измерении периода полужизни в плазме с использованием мыши с нокином CD137 человека, если анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело исчезает из плазмы медленнее, чем контрольная молекула, анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело оценивают как имеющее улучшенную кинетику в крови, чем у контрольной молекулы. Кроме того, если анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело, имеющие связывающую активность, зависящую от низкомолекулярного соединения (переключаемая молекула или переключаемое антитело), исчезает из плазмы медленнее, чем анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело, не зависящие от низкомолекулярного соединения (непереключаемая молекула или непереключаемое антитело), можно прийти к заключению, что переключаемая молекула (или переключаемое антитело) не связывается с CD137, экспрессируемым в неопухолевой ткани, по сравнению с непереключаемой молекулой (непереключаемым антителом).When measuring plasma half-life using a human CD137 knockin mouse, if the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody disappears from the plasma more slowly than the control molecule, the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody is judged to have improved kinetics in the blood than the control molecule . In addition, if an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody having small molecule-dependent binding activity (switchable molecule or switchable antibody) disappears from the plasma more slowly than an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody that is independent of the small molecule (non-switchable molecule or non-switchable antibody), it can be concluded that the switchable molecule (or switchable antibody) does not bind to CD137 expressed in non-tumor tissue compared to the non-switchable molecule (non-switchable antibody).
г) Противоопухолевая активность.d) Antitumor activity.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающаяIn one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding
- 72 046075 молекула или антитело тестируют по способности ингибировать рост или пролиферацию клеток in vivo. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающая молекула или антитело тестируют по способности ингибировать рост опухоли in vivo. Системы моделей in vivo, такие как модели аллотрансплантата или модели ксенотрансплантата, могут использоваться для такого тестирования. В примере системы ксенотрансплантата опухолевые клетки человека вводят животному (не человеку) с соответствующим иммунодефицитом, например, бестимусной голой мыши. Антитело по настоящему изобретению вводят животному. Измеряют способность антитела ингибировать или уменьшать рост опухоли. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в указанной выше системе ксенотрансплантата опухолевые клетки человека представляют собой опухолевые клетки пациента-человека. Такие модели ксенотрансплантатов коммерчески доступны от фирмы Oncotest GmbH (Фрейбург, Германия). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения опухолевые клетки человека вводят животному (но не человеку) с соответствующим иммунодефицитом путем подкожной инъекции или трансплантации в подходящее место, такое как жировая прослойка молочной железы.- 72 046075 a molecule or antibody is tested for its ability to inhibit cell growth or proliferation in vivo. In some embodiments of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is tested for its ability to inhibit tumor growth in vivo. In vivo model systems, such as allograft models or xenograft models, can be used for such testing. In an example xenograft system, human tumor cells are administered to an appropriately immunocompromised non-human animal, such as an athymic nude mouse. The antibody of the present invention is administered to an animal. The ability of an antibody to inhibit or reduce tumor growth is measured. In some embodiments of the present invention, in the above xenograft system, the human tumor cells are tumor cells from a human patient. Such xenograft models are commercially available from Oncotest GmbH (Freiburg, Germany). In some embodiments of the present invention, human tumor cells are administered to an animal (not human) with a corresponding immunodeficiency by subcutaneous injection or transplantation into a suitable site, such as mammary fat pad.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения противоопухолевую активность анtu-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител по настоящему изобретению может быть измерена и/или сопоставлена с использованием модели трансплантата сингенных опухолевых клеток, основанной на вышеописанных мышах с нокином CD137 человека. Подходящим образом может быть выбрана линия раковых клеток для использования в тесте, предпочтительно линия клеток рака толстой кишки мыши МС38. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения клеточную линия МС38 трансплантируют под кожу в брюшную область мыши, и модель считают сформированной, когда объем опухоли достигает примерно 50-300 мм3. После формирования модели мышей с трансплантированными клетками МС38 распределяют по группам и затем им вводят анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения измерение объема опухоли проводят с частотой от одного до двух раз в неделю, чтобы оценить противоопухолевую активность. Объем опухоли рассчитывают с использованием следующего уравнения:In one embodiment of the present invention, the antitumor activity of the anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies of the present invention can be measured and/or compared using a syngeneic tumor cell transplant model based on the human CD137 knockin mice described above. A cancer cell line may be suitably selected for use in the test, preferably the mouse colon cancer cell line MC38. In one embodiment of the present invention, the MC38 cell line is transplanted subcutaneously into the abdominal region of the mouse, and the model is considered established when the tumor volume reaches approximately 50-300 mm 3 . Once the model is established, mice transplanted with MC38 cells are assigned to groups and then treated with an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In one embodiment of the present invention, tumor volume measurements are performed at a frequency of one to two times per week to assess antitumor activity. Tumor volume is calculated using the following equation:
объем опухоли = (большая ось х малая ось х малая ось)/2tumor volume = (major axis x minor axis x minor axis)/2
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения противоопухолевую активность анtu-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела может быть протестирована и оценена в соответствии с методом, описанным в примере 6-4.In one embodiment of the present invention, the antitumor activity of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody can be tested and evaluated in accordance with the method described in Example 6-4.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анmи-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела распознают как проявляющие противоопухолевую активность, когда объем опухоли в группе введения животным анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител меньше, чем в группе введения животным растворителя, или увеличение объема опухоли меньше в группе введения животным анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител меньше, чем в группе введения животным растворителя.In one embodiment of the present invention, anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies are recognized as having antitumor activity when the tumor volume in the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody treatment group is less than that in the vehicle group, or the increase in tumor volume is less in the group. administration of anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies to animals is less than in the group of animals receiving a solvent.
д) Системная реакция.e) Systemic reaction.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения системная реакция на анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела по настоящему изобретению измеряют и/или сравнивают с использованием модели трансплантата сингенных опухолевых клеток на основе описанных выше мышей с нокином CD137 человека. Органы для измерения системной реакции могут быть выбраны соответствующим образом, это могут быть печень, селезенка и/или лимфатические узлы. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения системную реакцию оценивают путем удаления печени, селезенки и/или лимфатических узлов у мышей с нокином CD137 человека в соответствующее время после введения анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител. В случае, если подлежащим удалению органом является селезенка и/или лимфатические узлы, этот орган взвешивают и/или подсчитывают клетки во фракции лимфоцитов. При подсчете предпочтительно фракцию лимфоцитов после гемолиза используют для селезенки, а фракция лимфоцитов, полученная путем гомогенизации, используется для лимфатических узлов. В случае, если подлежащим удалению органом является печень, подсчитываю клетки во фракции лимфоцитов, полученные с помощью набора Liver dissociation kit, mouse (Milteny Biotec). Кроме того, анализ Т-клеток с использованием жидкостной цитометрии (FCM, flowcytometry) можно проводить на фракции лимфоцитов из каждого органа (печени, селезенки и/или лимфатических узлов). В анализе FCM используют экспрессию гранзима В, или экспрессию PD-1, или экспрессию ICOS в CD8-альфа-положительных Т-клетках или соотношение CD8-альфа-положиmельных Т-клеток к CD45 положительным клеткам. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения системная реакция на анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела может быть протестирована и оценена в соответствии с методом, описанным в примере 6-4.In one embodiment of the present invention, the systemic response to anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies of the present invention is measured and/or compared using a syngeneic tumor cell transplant model based on the human CD137 knockin mice described above. The organs to measure the systemic response can be selected accordingly and may include the liver, spleen and/or lymph nodes. In one embodiment of the present invention, the systemic response is assessed by removing the liver, spleen and/or lymph nodes from human CD137 knockin mice at an appropriate time after administration of anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies. If the organ to be removed is the spleen and/or lymph nodes, this organ is weighed and/or the cells in the lymphocyte fraction are counted. When counting, preferably the lymphocyte fraction after hemolysis is used for the spleen, and the lymphocyte fraction obtained by homogenization is used for the lymph nodes. If the organ to be removed is the liver, I count the cells in the lymphocyte fraction obtained using the Liver dissociation kit, mouse (Milteny Biotec). In addition, T cell analysis using liquid cytometry (FCM, flowcytometry) can be performed on lymphocyte fractions from each organ (liver, spleen and/or lymph nodes). The FCM assay uses granzyme B expression or PD-1 expression or ICOS expression in CD8 alpha-positive T cells or the ratio of CD8 alpha-positive T cells to CD45 positive cells. In one embodiment of the present invention, the systemic response to anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies can be tested and assessed in accordance with the method described in Example 6-4.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анmи-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела распознают как вызывающие подавленную системную реакцию и/или подавленную активацию иммунных клеток в неопухолевых тканях (например, печени, селезенке и/или лимфатических узлах) по сравнению с контрольной молекулой, когда в группе, в которой мышам вводили антиCD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, отмечают более низкое значение при оценке вышеIn one embodiment of the present invention, anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies are recognized as causing a suppressed systemic response and/or suppressed immune cell activation in non-tumor tissues (eg, liver, spleen and/or lymph nodes) compared to a control molecule when group in which mice were injected with anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies noted a lower value when assessed above
- 73 046075 описанных различных показателей по сравнению с группой, в которой мышам вводили такое же количество контрольной молекулы. Кроме того, если группа, получающая введение анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, обладающего связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения (переключаемой молекулы или переключаемого антитела), показывает пониженное значение при оценке вышеописанных различных показателей, чем что для группы, в которой мышам вводили анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, которое не обладает связывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения (непереключаемая молекула или непереключаемое антитело), переключаемая молекула (или переключаемое антитело) распознаются как вызывающие подавленную системную реакцию и/или подавленную активацию иммунных клеток в неопухолевых тканях (например, в печени, селезенке и/или лимфатических узлах) по сравнению с непереключаемой молекулой (или непереключаемым антителом).- 73 046075 described different indicators compared to a group in which mice were injected with the same amount of a control molecule. In addition, if a group receiving administration of an anti-CD137 antigen-binding molecule or an antibody having binding activity dependent on a small molecule compound (switch molecule or switch antibody) shows a lower value when evaluating the various indicators described above than that of the group in which mice were administered anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies that do not have small molecule-dependent binding activity (nonswitchable molecule or nonswitchable antibody), the switchable molecule (or switchable antibody) are recognized as causing a suppressed systemic response and/or suppressed immune cell activation in non-tumor tissues ( for example, in the liver, spleen and/or lymph nodes) compared to a non-switchable molecule (or a non-switchable antibody).
Следует принять во внимание, что любой из описанных выше способов измерения может быть проведен с использованием иммуноконъюгатов по настоящему изобретению вместо или в дополнение к анtu-CD137 антигенсвязывающим молекулам или антителам.It will be appreciated that any of the measurement methods described above can be performed using the immunoconjugates of the present invention instead of or in addition to anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies.
Г. Иммуноконъюгаты.D. Immunoconjugates.
В настоящем изобретении также предусматривают иммуноконъюгаты, содержащие анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, конъюгированные с одним или несколькими цитотоксическими агентами, такими как химиотерапевтические агенты или лекарственные препараты, агенты, ингибирующие рост, токсины (например, белковые токсины, ферментативно активные токсины бактерий, а также грибкового, растительного или животного происхождения, или их фрагменты) или радиоактивные изотопы.The present invention also provides immunoconjugates containing anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies conjugated to one or more cytotoxic agents, such as chemotherapeutic agents or drugs, growth inhibitory agents, toxins (for example, protein toxins, enzymatically active bacterial toxins, and also of fungal, plant or animal origin, or fragments thereof) or radioactive isotopes.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения иммуноконъюгат представляет собой конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC, antibody-drug conjugate), где антитело конъюгировано с одним или несколькими лекарственными средствами, включая, но ими не ограничиваясь, майтансиноид (см. US 5208020, US 5416064, ЕР 0 425 235 В1); ауристатин, такой как лекарственные части монометилауристатина DE и DF (ММАЕ и MMAF) (см. US 5635483, US 5780588, US 7498298); доластатин; калихеамицин или его производное (см. US 5712374, US 5714586, US 5739116, US 5767285, US 5770701, US 5770710, US 5773001, US 5877296; Hinman с соавт., Cancer Res. 53, 1993, 3336-3342; Lode с соавт., Cancer Res. 58, 1998, 2925-2928); антрациклин, такой как дауномицин или доксорубицин (см. Kratz с соавт., Current Med. Chem. 13, 2006, 477-523; Jeffrey с соавт., Bioorganic & Med. Chem. Letters 16, 2006, 358362; Torgov с соавт., Bioconj. Chem. 16, 2005, 717-721; Nagy с соавт., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 2000, 829-834; Dubowchik с соавт., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12, 2002, 1529-1532; King с соавт., J. Med. Chem. 45, 2002, 4336-4343; US 6630579); метотрексат; виндезин; таксан, такой как доцетаксел, паклитаксел, ларотаксел, тезетаксел и ортатаксел; трихотецин; СС1065.In one embodiment of the present invention, the immunoconjugate is an antibody-drug conjugate (ADC), where the antibody is conjugated to one or more drugs, including, but not limited to, a maytansinoid (see US 5208020, US 5416064 , EP 0 425 235 B1); auristatin, such as the drug moieties of monomethyl auristatin DE and DF (MMAE and MMAF) (see US 5635483, US 5780588, US 7498298); dolastatin; calicheamicin or a derivative thereof (see US 5712374, US 5714586, US 5739116, US 5767285, US 5770701, US 5770710, US 5773001, US 5877296; Hinman et al., Cancer Res. 53, 1993, 3336-3342 ; Lode et al. ., Cancer Res. 58, 1998, 2925-2928); an anthracycline such as daunomycin or doxorubicin (see Kratz et al., Current Med. Chem. 13, 2006, 477-523; Jeffrey et al., Bioorganic & Med. Chem. Letters 16, 2006, 358362; Torgov et al. , Bioconj. Chem. 16, 2005, 717-721; Nagy et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 2000, 829-834; Dubowchik et al., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12, 2002, 1529-1532; King et al., J. Med. Chem. 45, 2002, 4336-4343; US 6630579); methotrexate; vindesine; a taxane such as docetaxel, paclitaxel, larotaxel, tesetaxel and ortataxel; trichothecin; CC1065.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения иммуноконъюгат включает антитело, как описано в настоявшем изобретении, конъюгированное с ферментативно активным токсином или его фрагментом, включая, помимо прочего, цепь А дифтерийного токсина, несвязывающие активные фрагменты дифтерийного токсина, цепь экзотоксина А (из Pseudomonas aeruginosa), цепь рицина А, цепь абрина А, цепь А модекцина, альфа-сарцин, белки Aleurites fordii, белки диантина, белки Phytolacca americana (PAPI, PAPII и PAP-S), ингибитор момордика харантии, курцин, кротин, ингибитор Saponaria officinalis, гелонин, митогеллин, рестриктоцин, феномицин, эномицин и трикотецины.In another embodiment of the present invention, the immunoconjugate comprises an antibody as described herein conjugated to an enzymatically active toxin or fragment thereof, including, but not limited to, diphtheria toxin A chain, non-binding active diphtheria toxin fragments, exotoxin A chain (from Pseudomonas aeruginosa), ricin A chain, abrin A chain, modeccin A chain, alpha-sarcin, Aleurites fordii proteins, diantine proteins, Phytolacca americana proteins (PAPI, PAPII and PAP-S), momordica charantia inhibitor, curcin, crotin, Saponaria officinalis inhibitor, gelonin, mitogellin, restrictocin, fenomycin, enomycin and tricothecins.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения иммуноконъюгат включает антитело, как описано в настоявшем изобретении, конъюгированное с радиоактивным атомом для формирования радиоактивного иммуноконъюгата. Для получения радиоконъюгатов доступны различные радиоактивные изотопы. Примерами являются 211At, 131I, 125I, 90Y, 186Re, 188Re, 153Sm, 212Bi, 32P, 212Pb и радиоактивные эпитопы Lu. Когда радиоконъюгат используют для обнаружения, он может содержать радиоактивный атом для сцинтиграфических исследований, например Тс-99ш или 123I, или спиновую метку для визуализации методом ядерно-магнитного резонанса (ЯМР) (также известного как магнитно-резонансная томография, МРТ), например, йод-123, йод-131, индий-111, фтор-19, углерод-13, азот-15, кислород-17, гадолиний, марганец или железо.In another embodiment of the present invention, the immunoconjugate includes an antibody as described in the present invention, conjugated to a radioactive atom to form a radioactive immunoconjugate. Various radioactive isotopes are available to produce radioconjugates. Examples are 211 At, 131 I, 125 I, 90 Y, 186 Re, 188 Re, 153 Sm, 212 Bi, 32 P, 212 Pb and radioactive epitopes of Lu. When a radioconjugate is used for detection, it may contain a radioactive atom for scintigraphic studies, such as Tc-99sh or 123 I, or a spin label for nuclear magnetic resonance (NMR) imaging (also known as magnetic resonance imaging, MRI), e.g. iodine-123, iodine-131, indium-111, fluorine-19, carbon-13, nitrogen-15, oxygen-17, gadolinium, manganese or iron.
Конъюгаты антитела и цитотоксического агента могут быть получены с использованием различных бифункциональных белковых связывающих агентов, таких как №сукцинимидил-3-(2пиридилдитио)пропионат (SPDP), сукцинимидил-4-(№малеимидометил) циклогексан-1-карбоксилат (SMCC), иминотиолан (IT), бифункциональные производные имидоэфиров (такие как диметиладипимидат HCl), активные сложные эфиры (такие как дисукцинимидил суберат), альдегиды (такие как глутаральдегид), бис-азидосоединения (такие как бис(п-азидобензоил)гександиамин), производные бисдиазония (такие как бис-(п-диазонийбензоил)этилендиамин), диизоцианаты (такие как толуол-2,6диизоцианат) и бис-активные соединения фтора (такие как 1,5-дифтор-2,4-динитробензол). Например, иммунотоксин рицин можно получить, как описано в публикации Vitetta с соавт., Science 238, 1987, 1098. Меченая углеродом-14 1-изотиоцианатобензил-3-метилдиэтилентриаминпентауксусная кислота (МХDTPA) является типичным хелатирующим агентом для конъюгации радионуклида с антителом. См. WO 94/11026. Линкер может быть расщепляемым линкером, способствующим высвобождению цитотоксиAntibody-cytotoxic agent conjugates can be prepared using various bifunctional protein coupling agents, such as N-succinimidyl-3-(2pyridyldithio)propionate (SPDP), succinimidyl-4-(N-maleimidomethyl) cyclohexane-1-carboxylate (SMCC), iminothiolane ( IT), bifunctional imidoester derivatives (such as dimethyladipimidate HCl), active esters (such as disuccinimidyl suberate), aldehydes (such as glutaraldehyde), bis-azido compounds (such as bis(p-azidobenzoyl)hexanediamine), bisdiazonium derivatives (such as bis(p-diazoniumbenzoyl)ethylenediamine), diisocyanates (such as toluene-2,6diisocyanate) and bis-active fluorine compounds (such as 1,5-difluoro-2,4-dinitrobenzene). For example, the immunotoxin ricin can be prepared as described in Vitetta et al., Science 238, 1987, 1098. Carbon-14 labeled 1-isothiocyanatobenzyl-3-methyldiethylenetriaminepentaacetic acid (MXDTPA) is a typical chelating agent for conjugating a radionuclide to an antibody. See WO 94/11026. The linker may be a cleavable linker that promotes the release of cytotoxins
- 74 046075 ческого лекарственного средства в клетке. Например, можно использовать кислотолабильный линкер, чувствительный к пептидазе линкер, фотолабильный линкер, диметиловый линкер или дисульфидсодержащий линкер (Chari с соавт., Cancer Res. 52, 1992, 127-131; US 5208020).- 74 046075 chemical drug in a cell. For example, an acid-labile linker, a peptidase-sensitive linker, a photolabile linker, a dimethyl linker, or a disulfide-containing linker can be used (Chari et al., Cancer Res. 52, 1992, 127-131; US 5,208,020).
Иммуноконъюгаты или ADC в настоящем изобретении явно предполагают, но не ограничиваются ими, такие конъюгаты, как полученные с помощью перекрестно-линкерных реагентов, включая, но ими не ограничиваясь, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, сульфо-EMCS, сульфо-GMBS, сульфо-KMUS, сульфо-MBS, сульфо-SIAB, сульфо-SMCC и сульфо-SMPB, а также SVSB (сукцинимидил-(4-винилсульфон)бензоат), которые являются коммерческими доступными (например, от фирмы Pierce Biotechnology, Inc., Рокфорд, Иллинойс, США).Immunoconjugates or ADCs in the present invention clearly include, but are not limited to, conjugates such as those obtained using cross-linker reagents, including, but not limited to, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP , SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, sulfo-EMCS, sulfo-GMBS, sulfo-KMUS, sulfo-MBS, sulfo-SIAB, sulfo-SMCC and sulfo-SMPB, as well as SVSB (succinimidyl-(4-vinylsulfone) benzoate), which are commercially available (eg, from Pierce Biotechnology, Inc., Rockford, IL, USA).
Е. Способы и композиции для диагностики и обнаружения.E. Methods and compositions for diagnosis and detection.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения любые из предусмотренных в настоящем изобретении анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител применимы для обнаружения присутствия анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы в биологическом образце. В настоящем изобретении термин обнаружение означает количественное или качественное обнаружение. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения биологический образец включает клетку или ткань.In some embodiments, any of the anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies provided herein are useful for detecting the presence of an anti-CD137 antigen binding molecule in a biological sample. In the present invention, the term detection means quantitative or qualitative detection. In some embodiments of the present invention, the biological sample includes a cell or tissue.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анmи-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело предусматривают для применения в способе диагностики и обнаружения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают метод обнаружения CD137 в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения способ включает приведение биологического образца в контакт с анти-CD137 антигенсвязывающей молекулой или антителом, как описано в настоящем изобретении, в условиях, допускающих связывание анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела с CD137, и выявление того, образуется ли комплекс между анtu-CD137 антигенсвязывающей молекулой или антителом с CD137. Такой метод может быть методом in vitro или in vivo. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающую молекулу или антитело против CD137 используют для отбора субъектов, пригодных для терапии антиCD137 антигенсвязывающей молекулой или антителом, например, если CD137 является био маркером для отбора пациентов.In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody is provided for use in a diagnostic and detection method. In another embodiment, the present invention provides a method for detecting CD137 in a biological sample. In some embodiments of the present invention, the method includes contacting a biological sample with an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody, as described in the present invention, under conditions allowing the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody to bind to CD137, and determining whether a complex is formed between an anti-CD137 antigen-binding molecule or an antibody with CD137. Such a method may be an in vitro or in vivo method. In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody is used to select subjects suitable for therapy with the anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody, for example, if CD137 is a biomarker for patient selection.
К типичным расстройствам, которые можно диагностировать с использованием антитела по настоящему изобретению, относят рак.Typical disorders that can be diagnosed using the antibody of the present invention include cancer.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают меченые антиCD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела. К меткам относят, но ими перечень не ограничивается, метки или фрагменты, которые обнаруживают напрямую (такие как флуоресцентные, хромофорные, электронно-плотные, хемилюминесцентные и радиоактивные метки), а также фрагменты, такие как ферменты или лиганды, которые обнаруживают опосредованно, например, через ферментативную реакцию или молекулярное взаимодействие. К примерам меток относят, но ими перечень не ограничивается, радиоизотопы 32Р, 14С, 125I, 3Н и 131I, флуорофоры, например, такие как хелаты редкоземельных элементов или флуоресцеин и его производные, родамин и его производные, дансил, умбеллиферон, люцериферазы, например, люцифераза светлячков и бактериальная люцифераза (US 4737456), люциферин, 2,3дигидрофталазиндионы, пероксидаза хрена (HRP), щелочная фосфатаза, бета-галактозидаза, глюкоамилаза, лизоцим, сахаридоксидазы, например, глюкозооксидаза, галактозооксидаза и глюкозо-6фосфатдегидрогеназа, гетероциклические оксидазы, такие как уриказа и ксантиноксидаза, соединенные с ферментом, который использует перекись водорода для окисления предшественника красителя, такого как HRP, лактопероксидаза или микропероксидаза, биотин/авидин, спиновые метки, бактериофаговые метки, стабильные свободные радикалы и др.In some embodiments, the present invention provides anti-CD137-labeled antigen-binding molecules or antibodies. Labels include, but are not limited to, tags or moieties that are detected directly (such as fluorescent, chromophore, electron dense, chemiluminescent, and radioactive tags), as well as moieties such as enzymes or ligands that are detected indirectly, e.g. through an enzymatic reaction or molecular interaction. Examples of labels include, but are not limited to, radioisotopes 32 P, 14 C, 125 I, 3 H and 131 I, fluorophores, for example, such as chelates of rare earth elements or fluorescein and its derivatives, rhodamine and its derivatives, dansyl, umbelliferone , luceriferases, e.g. firefly luciferase and bacterial luciferase (US 4737456), luciferin, 2,3dihydrophthalazinediones, horseradish peroxidase (HRP), alkaline phosphatase, beta-galactosidase, glucoamylase, lysozyme, saccharide oxidases, e.g. glucose oxidase, galactose oxidase and glu goat-6phosphate dehydrogenase, heterocyclic oxidases such as uricase and xanthine oxidase coupled to an enzyme that uses hydrogen peroxide to oxidize a dye precursor such as HRP, lactoperoxidase or microperoxidase, biotin/avidin, spin tags, bacteriophage tags, stable free radicals, etc.
Е. Фармацевтические составы.E. Pharmaceutical compounds.
Фармацевтические составы анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела по настоящему изобретению получают путем смешивания такого антитела, имеющего желаемую степень чистоты, с одним или более необязательными фармацевтически приемлемыми носителями (Remington's Pharmaceutical Sciences, 16e изд., под ред. Osol A., 1980) в виде лиофилизированных составов или водных растворов. Фармацевтически приемлемые носители обычно нетоксичны для реципиентов в используемых дозировках и концентрациях и включают, но ими не ограничиваются: буферы, такие как фосфатный, цитратный и других органических кислот; антиоксиданты, включая аскорбиновую кислоту и метионин; консерванты (такие как хлорид октадецилдиметилбензиламмония; хлорид гексаметония; хлорид бензалкония; хлорид бензетония; фенол, бутиловый или бензиловый спирт; алкилпарабены, такие как метилили пропилпарабен; катехол; резорцин; циклогексанол; 3-пентанол и м-крезол); низкомолекулярные полипептиды (менее примерно 10 остатков); белки, такие как сывороточный альбумин, желатин или иммуноглобулины; гидрофильные полимеры, такие как поливинилпирролидон; аминокислоты, такие как глицин, глутамин, аспарагин, гистидин, аргинин или лизин; моносахариды, дисахариды и другие углеводы, включая глюкозу, маннозу или декстрины; хелатирующие агенты, такие как EDTA; сахара, такие как сахароза, маннит, трегалоза или сорбит; солеобразующие противоионы, такие как натрий; комплексы металлов (например, комплексы Zn-белок); и/или неионные поверхностно-активные вещества, такие какPharmaceutical formulations of the anti-CD137 antigen binding molecule or antibody of the present invention are prepared by mixing such antibody, having the desired purity, with one or more optional pharmaceutically acceptable carriers (Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th ed., ed. Osol A., 1980) in in the form of lyophilized formulations or aqueous solutions. Pharmaceutically acceptable carriers are generally non-toxic to recipients at the dosages and concentrations used and include, but are not limited to: buffers such as phosphate, citrate and other organic acids; antioxidants including ascorbic acid and methionine; preservatives (such as octadecyldimethylbenzylammonium chloride; hexamethonium chloride; benzalkonium chloride; benzethonium chloride; phenol, butyl or benzyl alcohol; alkylparabens such as methyl or propylparaben; catechol; resorcinol; cyclohexanol; 3-pentanol and m-cresol); low molecular weight polypeptides (less than about 10 residues); proteins such as serum albumin, gelatin or immunoglobulins; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; amino acids such as glycine, glutamine, asparagine, histidine, arginine or lysine; monosaccharides, disaccharides and other carbohydrates, including glucose, mannose or dextrins; chelating agents such as EDTA; sugars such as sucrose, mannitol, trehalose or sorbitol; salt-forming counterions such as sodium; metal complexes (eg Zn-protein complexes); and/or non-ionic surfactants such as
- 75 046075 полиэтиленгликоль (PEG). Примерами фармацевтически приемлемых носителей в настоящем изобретении также являются интерстициальные агенты для диспергирования лекарственных средств, такие как растворимые нейтрально-активные гликопротеины гиалуронидазы (sHASEGP), например, растворимые гликопротеины гиалуронидазы РН-20 человека, такие как rHuPH20 (HYLENEX (зарегистрированная торговая марка), Baxter International, Inc.). Некоторые примеры sHASEGP и способы их использования, включая rHuPH20, описаны в публикациях патентов US №2005/0260186 и US №2006/0104968. В одном из вариантов осуществления sHASEGP комбинируют с одной или несколькими дополнительными гликозаминогликаназами, такими как хондроитиназы.- 75 046075 polyethylene glycol (PEG). Examples of pharmaceutically acceptable carriers in the present invention also include interstitial drug dispersing agents such as soluble neutral active hyaluronidase glycoproteins (sHASEGP), e.g. soluble human hyaluronidase PH-20 glycoproteins such as rHuPH20 (HYLENEX (registered trademark), Baxter International, Inc.). Some examples of sHASEGP and methods of their use, including rHuPH20, are described in US patent publications No. 2005/0260186 and US No. 2006/0104968. In one embodiment, sHASEGP is combined with one or more additional glycosaminoglycanases, such as chondroitinases.
Примеры составов лиофилизированных антител описаны в US 6267958. Водные составы антител включают те, которые описаны в US 6171586 и WO 2006/044908, причем последние составы включают гистидин-ацетатный буфер.Examples of lyophilized antibody formulations are described in US 6,267,958. Aqueous antibody formulations include those described in US 6,171,586 and WO 2006/044908, the latter formulations including histidine acetate buffer.
Активные ингредиенты могут быть заключены в микрокапсулы, приготовленные, например, методами коацервации или межфазной полимеризацией, например, микрокапсулы из гидроксиметилцеллюлозы или желатина и микрокапсулы из поли(метилметакрилата), соответственно, в коллоидных системах доставки лекарств (например, липосомы, микросферы альбумина, микроэмульсии, наночастицы и нанокапсулы) или в макроэмульсиях. Такие методы описаны в Remington's Pharmaceutical Sciences, 16e изд., под ред. Osol A., 1980.The active ingredients can be encapsulated in microcapsules prepared, for example, by coacervation or interfacial polymerization methods, e.g. hydroxymethylcellulose or gelatin microcapsules and poly(methyl methacrylate) microcapsules, respectively, in colloidal drug delivery systems (e.g. liposomes, albumin microspheres, microemulsions, nanoparticles and nanocapsules) or in macroemulsions. Such methods are described in Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th ed., ed. Osol A., 1980.
Могут быть получены препараты с замедленным высвобождением. Подходящие примеры препаратов с замедленным высвобождением включают полупроницаемые матрицы твердых гидрофобных полимеров, содержащие антитело, причем эти матрицы имеют форму изделий определенной формы, например пленок или микрокапсул.Sustained release formulations can be prepared. Suitable examples of sustained release formulations include semi-permeable matrices of solid hydrophobic polymers containing the antibody, these matrices being in the form of shaped articles, such as films or microcapsules.
Составы, используемые для введения in vivo, обычно стерильны. Стерильность может быть легко достигнута, например, путем фильтрации через стерильные фильтрующие мембраны.Formulations used for in vivo administration are generally sterile. Sterility can be easily achieved, for example, by filtration through sterile filter membranes.
Ж. Способы терапии и лечебные композиции.G. Methods of therapy and medicinal compositions.
Любая из антигенсвязывающих молекул или антител против CD137, представленных в настоящем изобретении, может использоваться в терапевтических способах.Any of the antigen-binding molecules or antibodies against CD137 provided in the present invention can be used in therapeutic methods.
В одном из объектов настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающие молекулы или антитела против CD137 для использования в качестве лекарственного средства. В настоящем изобретении примеры лекарственного средства, в частности, включают лекарственные средства для индукции противоопухолевого действия, например, ингибирования неоваскуляризации в опухолях, ингибирование пролиферации опухолевых клеток, истощение опухолевых В-клеток и т.д., посредством активации клеток, возникающих в результате связывания анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител с CD137, экспрессируемым на иммунных клетках, таких как Т-клетки. В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела для применения в лечении опухолей. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают некоторые анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела для применения в методе лечения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают некоторые анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела для применения в методе лечения больного раком индивида, включающего введение индивиду эффективного количества анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В других вариантах осуществления настоящего изобретения примеры опухоли включают солидную опухоль, в которую проникли В-клетки, дендритные клетки, естественные клетки-киллеры, макрофаги, CD8-положительные Т-клетки и/или регуляторные Т-клетки (Treg-клетки).In one aspect, the present invention provides antigen-binding molecules or antibodies against CD137 for use as a drug. In the present invention, examples of the drug specifically include drugs for inducing antitumor effects, such as inhibiting neovascularization in tumors, inhibiting tumor cell proliferation, depleting tumor B cells, etc., by activating cells resulting from the binding of anti -CD137 antigen-binding molecules or antibodies with CD137 expressed on immune cells such as T cells. In other embodiments, the present invention provides anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies for use in the treatment of tumors. In some embodiments, the present invention provides certain anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies for use in a treatment method. In some embodiments, the present invention provides certain anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies for use in a method of treating an individual with cancer, comprising administering to the individual an effective amount of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In other embodiments of the present invention, examples of a tumor include a solid tumor that has been infiltrated by B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages, CD8 positive T cells, and/or regulatory T cells (Treg cells).
В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают анmи-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела для применения в методе активации иммунных клеток у индивида, включающем введение индивиду эффективного количества анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела для активации иммунных клеток, таких как В-клетки, дендритные клетки, естественные клетки-киллеры, макрофаги и/или CD8-положительные Т-клетки (более конкретно, эти иммунные клетки, проникшие в опухолевую ткань).In other embodiments, the present invention provides anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies for use in a method of activating immune cells in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody to activate immune cells, such as B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages and/or CD8-positive T cells (more specifically, these immune cells that have infiltrated tumor tissue).
В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают анmи-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела для применения в методе повреждения клеток (например, опухолевых клеток) у индивида, включающем введение индивиду эффективного количества анmи-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения примеры опухолей включают солидную опухоль, в которую проникли В-клетки, дендритные клетки, природные клетки-киллеры, макрофаги, CD8-положиmельные Т-клетки и/или регуляторные Тклетки (Treg-клетки). В любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения индивидом предпочтительно является человек.In other embodiments, the present invention provides anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies for use in a method of damaging cells (eg, tumor cells) in an individual, comprising administering to the individual an effective amount of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In some embodiments of the present invention, examples of tumors include a solid tumor that has been infiltrated by B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages, CD8 positive T cells, and/or regulatory T cells (Treg cells). In any of the above embodiments of the present invention, the individual is preferably a human.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают применение антиCD137 антигенсвязывающих молекул или антител для получения лекарственного средства. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения лекарство предназначено для лечения опухоли (в зависимости от контекста может быть более подходящим называть это раком (то же самое применимо и в дальнейшем)). В других вариантах осуществления настоящего изобретения лекарственное средство предназначено для использования в способе лечения опухоли (или рака в зависимости от контекста),In other embodiments, the present invention provides for the use of anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies to produce a drug. In one embodiment of the present invention, the drug is intended to treat a tumor (depending on the context, it may be more appropriate to call this cancer (the same applies hereinafter)). In other embodiments of the present invention, the drug is for use in a method of treating a tumor (or cancer, depending on the context),
- 76 046075 причем способ включает введение индивиду с опухолью (или раком в зависимости от контекста), эффективного количества лекарственного средства. В других вариантах осуществления настоящего изобретения лекарство предназначено для индукции противоопухолевого действия, например, ингибирования неоваскуляризации в опухолях, ингибирования пролиферации опухолевых клеток, для истощения опухолевых В-клеток и т.д., посредством активации клеток, возникающих в результате связывания антиCD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела с CD137, экспрессируемым на иммунных клетках, таких как Т-клетки. В других вариантах осуществления настоящего изобретения лекарство предназначено для использования в способе, например, ингибирования неоваскуляризации в опухолях, ингибирования пролиферации опухолевых клеток, истощения опухолевых В-клеток и т.д. посредством активации клеток в результате связывания анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела с CD137, экспрессируемым на иммунных клетках, таких как Т-клетки, у индивида, причем способ включает введение для этого индивиду эффективного количества лекарственного средства. В любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения индивидом предпочтительно является человек.- 76 046075 wherein the method includes administering to an individual with a tumor (or cancer, depending on the context), an effective amount of a drug. In other embodiments of the present invention, the drug is intended to induce an antitumor effect, such as inhibiting neovascularization in tumors, inhibiting tumor cell proliferation, depleting tumor B cells, etc., by activating cells resulting from the binding of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody with CD137 expressed on immune cells such as T cells. In other embodiments of the present invention, the drug is for use in a method for, for example, inhibiting neovascularization in tumors, inhibiting tumor cell proliferation, depleting tumor B cells, etc. by activating cells by binding an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody to CD137 expressed on immune cells, such as T cells, in an individual, the method comprising administering to the individual an effective amount of a drug. In any of the above embodiments of the present invention, the individual is preferably a human.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают способ лечения рака. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способы включают введение индивиду с опухолью эффективного количества анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В других вариантах осуществления настоящего изобретения примеры опухоли включают солидную опухоль, в которую инфильтруются В-клетки, дендритные клетки, природные клетки-киллеры, макрофаги, CD8положительные Т-клетки и/или регуляторные Т-клетки (Treg-клетки).In other embodiments, the present invention provides a method for treating cancer. In one embodiment, the methods include administering to an individual with a tumor an effective amount of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In other embodiments of the present invention, examples of a tumor include a solid tumor that is infiltrated by B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages, CD8 positive T cells, and/or regulatory T cells (Treg cells).
В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают методы активации иммунных клеток у индивида. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ включает введение индивиду эффективного количества анmи-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В других вариантах осуществления настоящего изобретения к иммунным клеткам относят такие иммунные клетки, как В-клетки, дендритные клетки, природные клетки-киллеры, макрофаги и/или CD8-положительные Т-клетки (более конкретно, эти иммунные клетки, проникшие в опухолевую ткань).In other embodiments, the present invention provides methods for activating immune cells in an individual. In one embodiment of the present invention, the method includes administering to a subject an effective amount of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In other embodiments of the present invention, immune cells include immune cells such as B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages, and/or CD8 positive T cells (more specifically, these immune cells that have infiltrated tumor tissue) .
В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают методы повреждения клеток (в частности, опухолевых клеток) у индивида. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают методы, которые включают введение индивиду эффективного количества анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения примеры опухоли включают солидную опухоль, в которую инфильтруются Вклетки, дендритные клетки, природные клетки-киллеры, макрофаги, CD8-положительные Т-клетки и/или регуляторные Т-клетки (Treg-клетки). В любом из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения индивидом может быть человек.In other embodiments, the present invention provides methods for damaging cells (particularly tumor cells) in an individual. In one embodiment, the present invention provides methods that include administering to a subject an effective amount of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody. In some embodiments of the present invention, examples of a tumor include a solid tumor that is infiltrated by B cells, dendritic cells, natural killer cells, macrophages, CD8 positive T cells, and/or regulatory T cells (Treg cells). In any of the above embodiments of the present invention, the individual may be a human.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтические препараты, содержащие анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы или антитела, которые предназначены для использования в описанных выше способах лечения, применяют в лечении, и лекарственных средств могут содержать эффективное количество анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, которое имеет пониженный уровень иммунологической активации в неопухолевой ткани по сравнению с антиCD137 антигенсвязывающей молекулой, которая не обладает CD137 антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения.In other embodiments of the present invention, pharmaceutical preparations containing anti-CD137 antigen binding molecules or antibodies that are intended for use in the methods of treatment described above are used in the treatment, and the drugs may contain an effective amount of an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody that has a reduced level of immunological activation in non-tumor tissue compared to an anti-CD137 antigen-binding molecule, which does not have CD137 small-molecule dependent antigen-binding activity.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения неопухолевые ткани включают лимфатические узлы, селезенку и/или печень.In one embodiment of the present invention, non-tumor tissues include lymph nodes, spleen and/or liver.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтические препараты, содержащие анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело для применения в описанных выше способах лечения, применения в лечении и лекарственных средствах, могут содержать эффективное количество анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, которое по существу не связывается с CD137, экспрессируемым в неопухолевой ткани.In other embodiments of the present invention, pharmaceutical preparations containing an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody for use in the methods of treatment, treatment, and medicaments described above may contain an effective amount of an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody that does not substantially bind to CD137 expressed in non-tumor tissue.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтические препараты, содержащие анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело для применения в описанных выше способах лечения, применения в лечении, причем лекарственные препараты могут содержать эффективное количество анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, которое имеет увеличенный период полужизни в крови по сравнению с анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, которая не обладает связывающей активностью CD137, зависящей от низкомолекулярного соединения.In other embodiments of the present invention, pharmaceutical preparations containing an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody for use in the above-described methods of treatment, use in treatment, wherein the pharmaceutical preparations may contain an effective amount of an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody that has an increased half-life in blood compared to an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody that does not have small molecule dependent CD137 binding activity.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтические препараты, содержащие анти-CD137 антигенсвязывающую молекулу или антитело для применения в описанных выше способах лечения, применения в лечении, причем лекарственные препараты могут содержать эффективное количество анти-CD137 антигенсвязывающей молекулы или антитела, которое имеет низкий уровень побочных эффектов по сравнению с анти-CD137 антигенсвязывающей молекулой или антителом, которое не обладает связывающей активностью с CD137, зависящей от низкомолекулярного соединения.In other embodiments of the present invention, pharmaceutical preparations containing an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody for use in the above-described methods of treatment, use in treatment, wherein the pharmaceutical preparations may contain an effective amount of an anti-CD137 antigen binding molecule or antibody that has a low level of side effects compared to an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody that does not have small molecule dependent CD137 binding activity.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения к побочным явлениям относят повышенный AST, повышенный ALT, лихорадку, тошноту, острый гепатит, повреждение печени, спленомегалию, энтерит, гнойное воспаление кожи, нейтропению, лимфопению, тромбопению, экспрессию транIn other embodiments of the present invention, side effects include increased AST, increased ALT, fever, nausea, acute hepatitis, liver damage, splenomegaly, enteritis, purulent skin inflammation, neutropenia, lymphopenia, thrombopenia, trans expression
- 77 046075 саминаз и/или гипербилирубинемию.- 77 046075 saminase and/or hyperbilirubinemia.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения анти-CD137 антигенсвязывающие молекулой по настоящему изобретению имеют низкие побочные эффекты, и, таким образом, дозировка может быть увеличена без опасения по поводу побочных эффектов, поэтому в результате они могут проявлять более высокую лекарственную эффективность (цитотоксическую активность или противоопухолевую активность).In one embodiment of the present invention, the anti-CD137 antigen-binding molecule of the present invention has low side effects, and thus the dosage can be increased without concern for side effects, so as a result they can exhibit higher drug efficacy (cytotoxic activity or antitumor activity).
В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают фармацевтические составы, содержащие любую из анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител, предусмотренных в настоящем изобретении, например, для использования в любом из вышеуказанных терапевтических методов. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения фармацевтический состав содержит любую из анти-CD137 антигенсвязывающих молекул или антител, предусмотренных в настоящем изобретении, и фармацевтически приемлемый носитель.In other embodiments, the present invention provides pharmaceutical compositions containing any of the anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies provided in the present invention, for example, for use in any of the above therapeutic methods. In one embodiment of the present invention, the pharmaceutical composition contains any of the anti-CD137 antigen-binding molecules or antibodies provided in the present invention and a pharmaceutically acceptable carrier.
Антигенсвязывающую молекулу или антитело по настоящему изобретению можно вводить любыми подходящим способом, включая парентеральный, внутрилегочный и интраназальный, и, если необходимо местное лечение, внутриочаговое введение. Парентеральные инфузии включают внутримышечное, внутривенное, внутриартериальное, внутрибрюшинное или подкожное введение. Дозирование может осуществляться любым подходящим путем, например, инъекциями, такими как внутривенные или подкожные инъекции, частично в зависимости от того, является ли введение кратковременным или хроническим. В настоящем изобретении предусматривают различные схемы дозирования, включая, но не ограничиваясь ими, однократное или многократное введение в различные моменты времени, болюсное введение и пульсовую инфузию.The antigen-binding molecule or antibody of the present invention can be administered by any suitable route, including parenteral, intrapulmonary and intranasal, and, if local treatment is necessary, intralesional administration. Parenteral infusions include intramuscular, intravenous, intraarterial, intraperitoneal, or subcutaneous administration. Dosing may be accomplished by any suitable route, for example, by injection, such as intravenous or subcutaneous injection, depending in part on whether the administration is short-term or chronic. The present invention contemplates various dosing regimens, including, but not limited to, single or multiple administration at different times, bolus administration and pulse infusion.
Антитела по настоящему изобретению могут быть сформированы, дозированы и введены способом, соответствующим надлежащей медицинской практике. Факторы, которые следует учитывать в этом контексте, включают конкретное заболевание, которое лечат, конкретное млекопитающее, которое лечат, клиническое состояние отдельного пациента, причину расстройства, место доставки агента, метод введения, график введения и другие факторы, известные практикующим врачам. Антитело необязательно, но может быть составлено с одним или несколькими агентами, которые в настоящее время используются для предотвращения или лечения рассматриваемого нарушения. Эффективное количество таких других агентов зависит от количества антитела, присутствующего в составе, типа расстройства или лечения и других факторов, обсуждаемых выше. Их обычно используют в тех же дозах и вводят способами, которые описаны в настоящем изобретении, или примерно от 1 до 99% дозировок, описанных в настоящем изобретении, или в любой дозировке и любым способом, который эмпирически/клинически определен как применимый.The antibodies of the present invention can be formulated, dosed and administered in a manner consistent with good medical practice. Factors to be considered in this context include the particular disease being treated, the particular mammal being treated, the clinical condition of the individual patient, the cause of the disorder, the site of delivery of the agent, the method of administration, the schedule of administration and other factors known to the practitioner. The antibody is optional, but may be formulated with one or more agents that are currently used to prevent or treat the disorder in question. The effective amount of such other agents depends on the amount of antibody present in the formulation, the type of disorder or treatment, and other factors discussed above. They are generally used in the same dosages and administered by the methods described in the present invention, or from about 1 to 99% of the dosages described in the present invention, or in any dosage and in any manner that is empirically/clinically determined to be applicable.
Для профилактики или лечения заболевания подходящая доза антитела по настоящему изобретению может зависеть от типа заболевания, подлежащего лечению, типа антитела, тяжести и течения заболевания, от того, вводят ли антитело для профилактики или в целях терапии, от предыдущей терапии, истории болезни пациента и реакции на антитело, а также на усмотрение лечащего врача. Антитело обычно вводят пациенту за один раз или в течение ряда курсов лечения. В зависимости от типа и тяжести заболевания от 1 мкг/кг до 15 мг/кг (например, 0,1 мг/кг - 10 мг/кг) антитела может быть начальной дозой антитела-кандидата для введения пациенту, например, в виде одного или нескольких отдельных введений, или путем непрерывной инфузии. Одна типичная суточная доза может составлять примерно от 1 микрограмма/кг до 100 мг/кг или более, в зависимости от факторов, упомянутых выше. При повторных введениях в течение нескольких дней или дольше, в зависимости от состояния, лечение обычно будет продолжаться до тех пор, пока не произойдет желаемое подавление симптомов заболевания. Одна примерная дозировка антитела может находиться в диапазоне от примерно 0,05 мг/кг до примерно 10 мг/кг. Таким образом, пациенту можно вводить одну или более доз, составляющих примерно 0,5 мг/кг, 2,0 мг/кг, 4,0 мг/кг или 10 мг/кг (или любую их комбинацию). Такие дозы можно вводить с перерывами, например, каждую неделю или каждые три недели (например, когда пациент получает от примерно двух до примерно двадцати, или например, примерно шести доз антитела). Может быть введена начальная более высокая ударная доза, а затем одна или несколько более низких доз. Прогресс этой терапии легко подвергать мониторингу с помощью обычных методов и анализов.For the prevention or treatment of a disease, the appropriate dose of an antibody of the present invention may depend on the type of disease being treated, the type of antibody, the severity and course of the disease, whether the antibody is administered for prophylaxis or therapy, previous therapy, the patient's medical history and response. for the antibody, as well as at the discretion of the attending physician. The antibody is usually administered to the patient at one time or over a series of treatments. Depending on the type and severity of the disease, 1 μg/kg to 15 mg/kg (e.g., 0.1 mg/kg to 10 mg/kg) of antibody may be the starting dose of the candidate antibody to be administered to the patient, e.g., as one or several separate administrations, or by continuous infusion. One typical daily dose can range from about 1 microgram/kg to 100 mg/kg or more, depending on the factors mentioned above. With repeated administrations over several days or longer, depending on the condition, treatment will usually continue until the desired suppression of disease symptoms occurs. One exemplary antibody dosage may range from about 0.05 mg/kg to about 10 mg/kg. Thus, the patient may be administered one or more doses of about 0.5 mg/kg, 2.0 mg/kg, 4.0 mg/kg, or 10 mg/kg (or any combination thereof). Such doses may be administered intermittently, for example, every week or every three weeks (eg, when the patient receives from about two to about twenty, or for example, about six doses of the antibody). An initial higher loading dose may be administered, followed by one or more lower doses. The progress of this therapy is easily monitored using conventional methods and assays.
Очевидно, что любой из вышеуказанных составов или терапевтических методов может быть осуществлен с использованием иммуноконъюгата по настоящему описанию вместо или в дополнение к антиCD137 антигенсвязывающей молекуле или антителу.It will be appreciated that any of the above formulations or therapeutic methods can be carried out using an immunoconjugate as described herein instead of or in addition to an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody.
3. Получаемые изделия.3. Received products.
В другом аспекте настоящего раскрытия предусмотрено получение изделия, содержащего материалы, полезные для лечения, профилактики и/или диагностики нарушений, описанных выше. Изделие включает контейнер и связанную с ним этикетку или вкладыш в упаковку, связанный с контейнером. Подходящие контейнеры включают, например, бутылки, флаконы, шприцы, пакеты с раствором для внутривенного введения и т.д. Контейнеры могут быть изготовлены из различных материалов, таких как стекло или пластик. Контейнер содержит состав, который сам по себе и может иметь стерильный порт доступа (например, контейнер может быть пакетом с раствором для внутривенного введения или флакоAnother aspect of the present disclosure provides for the provision of an article containing materials useful for the treatment, prevention and/or diagnosis of the disorders described above. The article includes a container and an associated label or package insert associated with the container. Suitable containers include, for example, bottles, vials, syringes, intravenous solution bags, etc. Containers can be made from various materials such as glass or plastic. The container contains the composition itself and may have a sterile access port (for example, the container may be an intravenous solution bag or vial
- 78 046075 ном с пробкой, которую можно проткнуть иглой для подкожных инъекций). По крайней мере, один активный ингредиент в композиции представляет собой антитело по настоящему изобретению. Этикетка или вкладыш в упаковку указывает, что композицию используют для лечения выбранного состояния. Изделие в этом варианте осуществления настоящего изобретения может дополнительно содержать вкладыш в упаковку, указывающий, что композиции можно использовать для лечения определенного состояния. В другом варианте или дополнительно изделие может дополнительно содержать второй (или третий) контейнер, содержащий фармацевтически приемлемый буфер, такой как бактериостатическая вода для инъекций (BWFI, bacteriostatic water for injection), фосфатно-солевой буфер, раствор Рингера и раствор декстрозы. Он может дополнительно включать другие материалы, желательные с коммерческой точки зрения и с точки зрения пользователя, включая другие буферы, разбавители, фильтры, иглы и шприцы.- 78 046075 no. with a stopper that can be pierced with a hypodermic needle). At least one active ingredient in the composition is an antibody of the present invention. The label or package insert indicates that the composition is used to treat the selected condition. The product in this embodiment of the present invention may further include a package insert indicating that the compositions can be used to treat a particular condition. Alternatively or additionally, the product may further comprise a second (or third) container containing a pharmaceutically acceptable buffer, such as bacteriostatic water for injection (BWFI), phosphate buffered saline, Ringer's solution, and dextrose solution. It may further include other materials commercially and user-desirable, including other buffers, diluents, filters, needles and syringes.
Термин вкладыш в упаковку используют для обозначения инструкций, обычно включаемых в коммерческие упаковки терапевтических продуктов, которые содержат информацию о показаниях, применении, дозировке, введении, комбинированной терапии, противопоказаниях и/или предупреждениях относительно использования таких терапевтических продуктов.The term package insert is used to refer to instructions typically included in commercial packaging of therapeutic products that contain information regarding the indications, use, dosage, administration, combination therapy, contraindications and/or warnings regarding the use of such therapeutic products.
Понятно, что любое из вышеуказанных промышленных изделий может включать иммуноконъюгат по настоящему изобретению вместо или в дополнение к анти-CD137 антигенсвязывающей молекуле или антителу.It is understood that any of the above industrial products may include an immunoconjugate of the present invention instead of or in addition to an anti-CD137 antigen-binding molecule or antibody.
III. Композиции и способы (агонистические антигенсвязывающие молекулы и цитотоксические антигенсвязывающие молекулы, содержащие вариант области Fc с повышенной изоэлектрической точкой (pI)).III. Compositions and methods (agonistic antigen-binding molecules and cytotoxic antigen-binding molecules containing a variant Fc region with an increased isoelectric point (pI)).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают агонистические антигенсвязывающие молекулы или антитела, содержащие вариант области Fc с увеличенной изоэлектрической точкой (pI), и способы их применения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения полипептиды, содержащие вариант области Fc с увеличенной изоэлектрической точкой (pI), содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение в исходной области Fc. В других вариантах осуществления настоящего изобретения каждое такое аминокислотное изменение вызывает повышение изоэлектрической точки (pI) вариантной области Fc по сравнению с исходной областью Fc. He опираясь на какую-либо теорию, авторы изобретения высказывают предположение, что рН биологических жидкостей (например, плазмы) находится в нейтральном диапазоне рН. В биологических жидкостях суммарный положительный заряд антигенсвязывающей молекулы или антитела с повышенной pI увеличивается из-за увеличения pI, и в результате антигенсвязывающая молекула или антитело сильнее притягивается физико-химическим кулоновским взаимодействием к поверхности эндотелиальной клетке, которая имеет общий отрицательный заряд по сравнению с антигенсвязывающей молекулой или антителом, не имеющим повышенной pI. Таким образом, агонистические антигенсвязывающие молекулы (или антитела) или антигенсвязывающие агонистические антигенсвязывающие молекулы (или антитела) могут приближаться к поверхности клеток, которые экспрессируют рецептор Fc-гамма, что приводит к усилению связывания антигенсвязывающих молекул или антител с клетками, экспрессирующими рецептор Fc-гамма. Для тех агонистических антигенсвязывающих молекул или антител, которые проявляют агонистическую активность за счет связывающей активности с рецептором Fc-гамма, агонистические антигенсвязывающие молекулы или антитела, имеющие повышенное связывание с клетками, экспрессирующими рецептор Fcгамма, из-за увеличивающих pI аминокислотных изменений могут проявлять более сильную агонистическую активность по сравнению с агонистическими антигенсвязывающими молекулами или антителами, не имеющими аминокислотных изменений, повышающих pI. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистические антигенсвязывающие молекулы являются анти-CD137 антигенсвязывающими молекулами или анти-CD3 антигенсвязывающими молекулами. В другом варианте осуществления настоящего изобретения агонистические антигенсвязывающие молекулы являются антиCD137 антителами или анти-CD3 антителами.In one embodiment, the present invention provides agonistic antigen-binding molecules or antibodies containing an increased isoelectric point (pI) variant Fc region and methods of using them. In some embodiments of the present invention, polypeptides comprising a variant Fc region with an increased isoelectric point (pI) contain at least one amino acid change in the original Fc region. In other embodiments of the present invention, each such amino acid change causes an increase in the isoelectric point (pI) of the variant Fc region compared to the original Fc region. Without being bound by any theory, the inventors propose that the pH of biological fluids (eg, plasma) is in the neutral pH range. In biological fluids, the net positive charge of an antigen-binding molecule or antibody with increased pI increases due to the increase in pI, and as a result, the antigen-binding molecule or antibody is more strongly attracted by the physicochemical Coulomb interaction to the surface of the endothelial cell, which has a net negative charge compared to the antigen-binding molecule or an antibody that does not have an increased pI. Thus, agonistic antigen-binding molecules (or antibodies) or antigen-binding agonistic antigen-binding molecules (or antibodies) can approach the surface of cells that express the Fc-gamma receptor, resulting in increased binding of the antigen-binding molecules or antibodies to the cells expressing the Fc-gamma receptor. For those agonistic antigen-binding molecules or antibodies that exhibit agonistic activity due to binding activity to the Fc-gamma receptor, agonistic antigen-binding molecules or antibodies having increased binding to cells expressing the Fcgamma receptor due to pI-increasing amino acid changes may exhibit more potent agonistic activity. activity compared to agonistic antigen-binding molecules or antibodies that do not have amino acid changes that increase pI. In one embodiment of the present invention, the agonistic antigen binding molecules are anti-CD137 antigen binding molecules or anti-CD3 antigen binding molecules. In another embodiment of the present invention, the agonistic antigen binding molecules are anti-CD137 antibodies or anti-CD3 antibodies.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают цитотоксические антигенсвязывающие молекулы или антитела, содержащие вариант области Fc с повышенной изоэлектрической точкой (pI), и способы их использования. В биологических жидкостях суммарный положительный заряд антигенсвязывающей молекулы или антитела с повышенной pI увеличивается из-за увеличения pI, и в результате антигенсвязывающая молекула или антитело сильнее притягивается физикохимическим кулоновским взаимодействием к поверхности эндотелиальной клетки, которая имеет общий отрицательный заряд по сравнению с антигенсвязывающей молекулой или антителом, не имеющим повышенной pI. Таким образом, цитотоксические антигенсвязывающие молекулы (или антитела) или антиген-связанные цитотоксические антигенсвязывающие молекулы (или антитела) могут приближаться к поверхности клеток, которые экспрессируют рецептор Fc-гамма, что приводит к усилению связывания антигенсвязывающих молекул или антител с клеткам, экспрессирующим рецептор Fc-гамма. Для тех цитотоксических антигенсвязывающих молекул или антител, которые проявляют цитотоксическую активность за счет связывающей активности в отношении рецептора Fc-гамма, цитотоксические антигенсвязывающие молекулы или антитела, имеющие повышенное связывание из-за увеличения pI с клетками, экспрессирующими рецептор Fc-гамма, аминокислотные изменения могут проявлять более сильную агоIn another embodiment, the present invention provides cytotoxic antigen-binding molecules or antibodies containing an increased isoelectric point (pI) variant Fc region and methods for using them. In biological fluids, the net positive charge of an antigen-binding molecule or antibody with an increased pI increases due to the increase in pI, and as a result, the antigen-binding molecule or antibody is more strongly attracted by the physicochemical Coulomb interaction to the surface of the endothelial cell, which has a net negative charge compared to the antigen-binding molecule or antibody, without increased pI. Thus, cytotoxic antigen-binding molecules (or antibodies) or antigen-bound cytotoxic antigen-binding molecules (or antibodies) can approach the surface of cells that express the Fc-gamma receptor, resulting in increased binding of the antigen-binding molecules or antibodies to cells expressing the Fc-gamma receptor. gamma. For those cytotoxic antigen-binding molecules or antibodies that exhibit cytotoxic activity due to binding activity to the Fc-gamma receptor, cytotoxic antigen-binding molecules or antibodies having increased binding due to increased pI to cells expressing the Fc-gamma receptor, amino acid changes may exhibit stronger ago
- 79 046075 нистическую активность по сравнению с цитотоксическими антигенсвязывающими молекулами или антителами, не имеющими аминокислотных изменений, повышающих pI.- 79 046075 nistic activity compared to cytotoxic antigen-binding molecules or antibodies that do not have amino acid changes that increase pI.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения цитотоксичность, которой обладают цитотоксические антигенсвязывающие молекулы, включает, например, антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC) и антителозависимый клеточный фагоцитоз (ADCP), которые вызываются эффекторными клетками.In one embodiment of the present invention, the cytotoxicity exhibited by the cytotoxic antigen-binding molecules includes, for example, antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) and antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP), which are caused by effector cells.
В настоящем изобретении pI может быть определена теоретически или экспериментально. Значение pI можно определить, например, с помощью изоэлектрического фокусирования, известного специалистам в данной области. Теоретически значение pI можно рассчитать, например, с помощью программного обеспечения для анализа генной и аминокислотной последовательности (Genetyx и др.). В настоящем изобретении pI может быть либо теоретическим, либо экспериментально определенным. Значение pI можно определить, например, с помощью изоэлектрического фокусирования, известного специалистам в данной области. Значение теоретически pI можно рассчитать, например, с помощью программного обеспечения для анализа генной и аминокислотной последовательности (Genetyx и т.д.). При расчете свойства антитела могут быть отражены в формуле расчета. Например, (i) как правило, Cys, консервативный в антителе, образует дисульфидную связь и не несет электрического заряда в боковой цепи; поэтому такой Cys может быть исключен из расчета, и только Cys в свободной форме, который не образует дисульфидную связь, может быть включен в расчет. В другом варианте (ii) состояние заряда или изоэлектрическая точка антител могут быть изменены из-за посттрансляционных модификаций; поэтому формула расчета может быть изменена с учетом таких посттрансляционных модификаций: (а) когда N-концом тяжелой цепи является Q (глутамин), N-концевая аминогруппа исключается из расчета, предполагая, что происходит пироглутамилирование, (б) когда С-концом тяжелой цепи является K (лизин), K (только один остаток) исключают из расчета, предполагая, что происходит усечение; (в) боковые цепи всех С (цистеина), присутствующих в обычно консервативных положениях, исключают из расчета, предполагая, что все эти С образуют дисульфидные связи внутри молекулы. В одном предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения оба описанных выше пункта (i) и (ii) могут быть отражены в формуле расчета.In the present invention, pI can be determined theoretically or experimentally. The pI value can be determined, for example, using isoelectric focusing, known to those skilled in the art. Theoretically, the pI value can be calculated, for example, using software for gene and amino acid sequence analysis (Genetyx, etc.). In the present invention, pI can be either theoretical or experimentally determined. The pI value can be determined, for example, using isoelectric focusing, known to those skilled in the art. The theoretical pI value can be calculated, for example, using gene and amino acid sequence analysis software (Genetyx, etc.). When calculating, the properties of the antibody can be reflected in the calculation formula. For example, (i) typically, Cys conserved in an antibody forms a disulfide bond and carries no electrical charge in the side chain; therefore, such Cys can be excluded from the calculation, and only Cys in the free form that does not form a disulfide bond can be included in the calculation. Alternatively, (ii) the charge state or isoelectric point of the antibodies may be changed due to post-translational modifications; therefore, the calculation formula can be modified to take into account the following post-translational modifications: (a) when the N-terminus of the heavy chain is Q (glutamine), the N-terminal amino group is excluded from the calculation, assuming that pyroglutamylation occurs, (b) when the C-terminus of the heavy chain is K (lysine), K (one residue only) is excluded from the calculation, assuming truncation occurs; (c) the side chains of all C (cysteines) present in normally conserved positions are excluded from the calculation, assuming that all of these Cs form disulfide bonds within the molecule. In one preferred embodiment of the present invention, both points (i) and (ii) described above can be reflected in the calculation formula.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения величина pI может быть повышена, например, по меньшей мере на 0,01, 0,03, 0,05, 0,1, 0,2, 0,3, 0,4, 0,5 или более, по меньшей мере на 0,6, 0,7, 0,8, 0,9, или более, по меньшей мере на 1,0, 1,1, 1,2, 1,3, 1,4, 1,5, или более, или по меньшей мере на 1,6, 1,7, 1,8, 1,9, 2,0, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 3,0 или более, по сравнению с тем, что было до модификации.In one embodiment of the present invention, the pI value may be increased, for example, by at least 0.01, 0.03, 0.05, 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5 or more by at least 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, or more by at least 1.0, 1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5 or more, or at least 1.6, 1.7, 1.8, 1.9, 2.0, 2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2, 5, 3.0 or more compared to what it was before the modification.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения аминокислота для увеличения pI может быть экспонирована на поверхности вариантной области Fc. В настоящем изобретении аминокислота, которая может экспонироваться на поверхности, обычно относится к аминокислотному остатку, расположенному на поверхности полипептида, составляющего вариант области Fc. Аминокислотный остаток, расположенный на поверхности полипептида, относится к аминокислотному остатку, боковая цепь которого может контактировать с молекулами растворителя (которые, как правило, представляют собой молекулы воды). Однако боковая цепь не обязательно должна полностью контактировать с молекулами растворителя, и когда даже часть боковой цепи находится в контакте с молекулами растворителя, аминокислоту определяют как аминокислотный остаток, расположенный на поверхности. Аминокислотные остатки, расположенные на поверхности полипептида, также включают аминокислотные остатки, расположенные близко к поверхности, и, таким образом, могут подвергаться влиянию электрического заряда от другого аминокислотного остатка, боковая цепь которого, даже частично, находится в контакте с молекулами растворителя. Специалисты в данной области могут создать гомологичную модель полипептида, например, с использованием коммерчески доступного программного обеспечения. В другом варианте можно использовать методы, известные специалистам в данной области, такие как рентгенокристаллография. Аминокислотные остатки, которые могут быть обнаружены на поверхности, определяют, например, с использованием координат трехмерной модели и компьютерной программы, такой как программа InsightII (фирма Accelrys). Открытые участки могут быть определены с использованием алгоритмов, известных в этой области (например, Lee и Richards (J. Mol. Biol. 55, 1971, 379-400); Connolly (J. Appl. Cryst. 16, 1983, 548-558)). Участки на поверхности, подверженные воздействию, можно определить с помощью программного обеспечения по моделированию белков и получению информации о трехмерной структуре. Программное обеспечение, доступное для таких целей, включает, например, программное обеспечение SYBYL Biopolymer Module (фирма Tripos Associates). Когда алгоритм требует вводимого пользователем параметра размера, размер зонда, который используют в вычислении, может быть установлен примерно на 1,4 Ангстрема (А) или меньше по радиусу. Кроме того, Pacios описал методы определения открытых участков поверхности с использованием программного обеспечения для персональных компьютеров (Comput. Chem. 18(4), 1994, 377-386; J. Mol. Model. 1, 1995, 46-53). На основании такой информации, как описано выше, могут быть выбраны соответствующие аминокислотные остатки, расположенные на поверхности полипептида, который составляет вариант области Fc.In some embodiments of the present invention, the pI-increasing amino acid may be exposed on the surface of the variant Fc region. In the present invention, an amino acid that can be exposed on a surface generally refers to an amino acid residue located on the surface of a polypeptide constituting a variant Fc region. An amino acid residue located on the surface of a polypeptide refers to an amino acid residue whose side chain can be in contact with solvent molecules (which are typically water molecules). However, the side chain need not be completely in contact with the solvent molecules, and when even part of the side chain is in contact with the solvent molecules, the amino acid is defined as the amino acid residue located on the surface. Amino acid residues located on the surface of a polypeptide also include amino acid residues located close to the surface, and thus may be influenced by the electrical charge from another amino acid residue whose side chain, even partially, is in contact with the solvent molecules. Those skilled in the art can generate a homology model of the polypeptide, for example, using commercially available software. Alternatively, methods known to those skilled in the art, such as X-ray crystallography, can be used. Amino acid residues that can be detected on the surface are determined, for example, using the coordinates of a three-dimensional model and a computer program such as InsightII (Accelrys). Open regions can be determined using algorithms known in the art (eg, Lee and Richards (J. Mol. Biol. 55, 1971, 379-400); Connolly (J. Appl. Cryst. 16, 1983, 548-558 )). The affected areas on the surface can be identified using protein modeling software to obtain 3D structural information. Software available for such purposes includes, for example, SYBYL Biopolymer Module software (Tripos Associates). When the algorithm requires a user input size parameter, the probe size used in the calculation can be set to approximately 1.4 Angstroms (A) or less in radius. In addition, Pacios has described methods for determining exposed surface areas using personal computer software (Comput. Chem. 18(4), 1994, 377-386; J. Mol. Model. 1, 1995, 46-53). Based on such information, as described above, appropriate amino acid residues located on the surface of the polypeptide that constitutes the variant Fc region can be selected.
Способы увеличения pI путем введения одной замены аминокислоты в константной области антитела особенно не ограничиваются и, например, могут быть реализованы на основе методов, описанных в WO 2014/145159. В качестве аминокислотных замен для введения в константную область предпочтиMethods for increasing the pI by introducing a single amino acid substitution in the constant region of an antibody are not particularly limited and, for example, can be implemented based on the methods described in WO 2014/145159. As amino acid substitutions for introduction into the constant region, we prefer
- 80 046075 тельно вводить аминокислотные замены (замену) для уменьшения количества аминокислот, имеющих отрицательный заряд (например, аспарагиновой кислоты или глутаминовой кислоты), при увеличении количества аминокислот, имеющих положительный заряд (например, аргинин или лизин), как и в случае вариабельной области.- 80 046075 it is advisable to introduce amino acid substitutions (substitution) to reduce the number of amino acids having a negative charge (for example, aspartic acid or glutamic acid), while increasing the number of amino acids having a positive charge (for example, arginine or lysine), as in the case of the variable region .
Хотя нет особенных ограничений, в качестве сайтов для введения аминокислотных замен в константную область предпочтительны такие сайты, в которых боковые цепи аминокислот могут быть экспонированы на поверхности молекулы антитела. Предпочтительные примеры включают способы введения множества аминокислотных замен в комбинации в те сайты, которые могут экспонироваться на поверхности молекулы антитела. В другом варианте предпочтительно, чтобы множество производимых аминокислотных замен находилось в сайтах, проксимальных друг к другу в трехмерной структуре. Множественные аминокислотные замены, которые вводят, предпочтительно являются положительно заряженными аминокислотами, которые могут в некоторых случаях привести к состоянию, когда множественные положительные заряды переносятся на проксимальные участки трехмерной структуры, хотя они этим не ограничиваются. Определение проксимальные сайты в трехмерной структуре в настоящем изобретении строго не ограничивают, но, например, это может означать состояние, при котором замещение одной аминокислоты или замещение нескольких аминокислот вводят на расстоянии друг от друга 45 ангстрем или меньше, 40 ангстрем или меньше, 30 Ангстрем или меньше, 20 Ангстрем или меньше, лучше 15 Ангстрем или меньше, или более предпочтительно 10 Ангстрем или меньше. Установить, находятся ли представляющие интерес аминокислотные замены в сайтах, экспонированных на поверхности молекулы антитела, или множественные сайты аминокислотных замен расположены проксимально, может известными методами, такими как рентгенокристаллография.Although there is no particular limitation, sites at which amino acid side chains can be exposed on the surface of the antibody molecule are preferred sites for introducing amino acid substitutions into the constant region. Preferred examples include methods for introducing multiple amino acid substitutions in combination at sites that may be exposed on the surface of an antibody molecule. In another embodiment, it is preferred that the plurality of amino acid substitutions made are at sites proximal to each other in the three-dimensional structure. The multiple amino acid substitutions that are introduced are preferably positively charged amino acids, which may in some cases result in a condition where multiple positive charges are transferred to the proximal portions of the three-dimensional structure, although they are not limited to this. The definition of proximal sites in a three-dimensional structure in the present invention is not strictly limited, but, for example, it may mean a state in which a single amino acid substitution or multiple amino acid substitutions are introduced at a distance from each other of 45 angstroms or less, 40 angstroms or less, 30 angstroms or less, 20 Angstroms or less, preferably 15 Angstroms or less, or more preferably 10 Angstroms or less. Determining whether amino acid substitutions of interest are located at sites exposed on the surface of the antibody molecule or whether multiple amino acid substitution sites are located proximally can be determined by known methods such as X-ray crystallography.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения варианты областей Fc с повышенной pI содержат по меньшей мере одно положение, выбранное из группы, включающей положения 285, 311, 312, 315, 318, 333, 335, 337, 341, 342, 343, 384, 385, 388, 390, 399, 400, 401, 402, 413, 420, 422 и 431, нумерация EU. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты областей Fc с повышенной pI содержат Arg или Lys в каждом выбранном положении.In one embodiment of the present invention, variant Fc regions with increased pI contain at least one position selected from the group consisting of positions 285, 311, 312, 315, 318, 333, 335, 337, 341, 342, 343, 384, 385, 388, 390, 399, 400, 401, 402, 413, 420, 422 and 431, EU numbering. In other embodiments of the present invention, variants of the Fc regions with increased pI contain Arg or Lys at each selected position.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты областей Fc с повышенной pI содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, включающей положения 311, 343 и 413 по нумерации EU. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты областей Fc с повышенной pI содержат аминокислотное изменение в положениях 311, 343 или 413 по нумерации EU. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты областей Fc с повышенной pI содержат Arg или Lys в каждой выбранной позиции.In other embodiments of the present invention, the increased pI Fc region variants contain at least one amino acid change at at least one position selected from the group consisting of EU numbering positions 311, 343, and 413. In other embodiments of the present invention, variants of the Fc regions with increased pI contain an amino acid change at positions 311, 343, or 413 according to the EU numbering. In other embodiments of the present invention, variants of the Fc regions with increased pI contain Arg or Lys at each selected position.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают полипептиды, содержащие вариант области Fc с повышенной pI, который включает аминокислотные изменения по любому из следующих пунктов (1)-(3): (1) в позициях 311 и 343; (2) в позициях 311 и 413; (3) в позициях 343 и 413 по нумерации EU. В других вариантах осуществления настоящего изобретения варианты областей Fc с повышенной pI содержат Arg или Lys в каждой выбранной позиции.In another embodiment, the present invention provides polypeptides containing an increased pI variant Fc region that includes amino acid changes at any of the following (1)-(3): (1) at positions 311 and 343; (2) in positions 311 and 413; (3) in positions 343 and 413 according to EU numbering. In other embodiments of the present invention, variants of the Fc regions with increased pI contain Arg or Lys at each selected position.
Метод увеличения pI белка представляет, например, уменьшение количества аминокислот с отрицательно заряженной боковой цепью (например, аспарагиновой кислоты и глутаминовой кислоты) и/или увеличение количества аминокислот с положительно заряженной стороной боковой цепью (например, аргинина, лизина и гистидина) при нейтральном рН. Аминокислоты с отрицательно заряженной боковой цепью имеют отрицательный заряд, представленный как -1, в условиях рН, которые значительно выше, чем pKa их боковой цепи, что является теорией, хорошо известной специалистам в данной области. Например, теоретическое значение pKa для боковой цепи аспарагиновой кислоты составляет 3,9, а боковая цепь имеет отрицательный заряд, представленный как -1 в условиях нейтрального рН (например, в растворе с рН 7,0). И наоборот, аминокислоты с положительно заряженной боковой цепью имеют положительный заряд, представленный как +1, при условии, что рН существенно ниже, чем pKa их боковой цепи. Например, теоретическое значение pKa для боковой цепи аргинина составляет 12,5, а боковая цепь имеет положительный заряд, представленный как +1 в условиях нейтрального рН (например, в растворе с рН 7,0). Между тем известно, что аминокислоты, боковая цепь которых не имеет заряда при нейтральном рН (например, в растворе с рН 7,0), включают 15 типов природных аминокислот, то есть аланин, цистеин, фенилаланин, глицин, изолейцин, лейцин, метионин, аспарагин, пролин, глутамин, серин, треонин, валин, триптофан и тирозин. Авторы отмечают, что аминокислоты для увеличения pI могут быть неприродными аминокислотами.A method for increasing the pI of a protein is, for example, reducing the amount of amino acids with a negatively charged side chain (eg, aspartic acid and glutamic acid) and/or increasing the amount of amino acids with a positively charged side chain (eg, arginine, lysine and histidine) at neutral pH. Amino acids with a negatively charged side chain have a negative charge, represented by -1, at pH conditions that are significantly higher than the pKa of their side chain, which is a theory well known to those skilled in the art. For example, the theoretical pKa value for the side chain of aspartic acid is 3.9, and the side chain has a negative charge, represented as -1 under neutral pH conditions (e.g., in a pH 7.0 solution). Conversely, amino acids with a positively charged side chain have a positive charge, represented as +1, provided the pH is substantially lower than the pKa of their side chain. For example, the theoretical pKa value for the arginine side chain is 12.5, and the side chain has a positive charge, represented as +1 under neutral pH conditions (e.g., in a pH 7.0 solution). Meanwhile, it is known that amino acids whose side chain has no charge at neutral pH (for example, in a solution with pH 7.0) include 15 types of natural amino acids, that is, alanine, cysteine, phenylalanine, glycine, isoleucine, leucine, methionine, asparagine, proline, glutamine, serine, threonine, valine, tryptophan and tyrosine. The authors note that amino acids to increase pI may be unnatural amino acids.
Исходя из вышеизложенного, способ увеличения pI белка в условиях нейтрального рН (например, в растворе с рН 7,0) может придавать изменение заряда +1 белку интереса, например, путем замены аминокислот на незаряженные боковые цепи аспарагиновой кислоты или глутаминовой кислоты (боковая цепь которых имеет отрицательный заряд -1) в аминокислотной последовательности белка. Кроме того, изменение заряда +1 может быть придано белку, например, заменой аргинина или лизина (боковая цепь которого имеет положительный заряд +1) на аминокислоты, боковая цепь которых не имеет заряда. Более того, изменение заряда +2 может быть придано белку за один раз путем замены аргинина или лизинаBased on the above, a method of increasing the pI of a protein under neutral pH conditions (e.g., in a pH 7.0 solution) can impart a +1 charge change to the protein of interest, for example, by replacing amino acids with uncharged side chains of aspartic acid or glutamic acid (whose side chain has a negative charge -1) in the amino acid sequence of a protein. Additionally, a change in +1 charge can be imparted to a protein, for example by replacing arginine or lysine (whose side chain has a positive +1 charge) with amino acids whose side chain has no charge. Moreover, a +2 charge change can be imparted to a protein at a time by replacing arginine or lysine
- 81 046075 (чья боковая цепь имеет положительный заряд +1) на аспарагиновую кислоту или глутаминовую кислоту (чья боковая цепь имеет отрицательный заряд - 1). В другом варианте для увеличения pI белка, аминокислоты с боковой цепью, не имеющей заряда, и/или аминокислоты с положительно заряженной боковой цепью могут быть добавлены в аминокислотную последовательность белка, или аминокислоты с боковой цепью, не имеющей положительного заряда, и/или предпочтительно аминокислоты с отрицательно заряженной боковой цепью, присутствующая в аминокислотной последовательности белка, могут быть делетированы. Понятно, что, например, N-концевые и С-концевые аминокислотные остатки белка имеют заряд, производный от основной цепи (NH3+ аминогруппы на N-конце и СОО- карбонильной группы на Сконце) в дополнение к зарядам от их боковых цепей. Таким образом, pI белка также может быть увеличена путем выполнения над функциональными группами основной цепи некоторого добавления, делеции, замены или инсерции.- 81 046075 (whose side chain has a positive charge of +1) to aspartic acid or glutamic acid (whose side chain has a negative charge of -1). In another embodiment, to increase the pI of a protein, amino acids with a side chain that does not have a charge and/or amino acids with a positively charged side chain can be added to the amino acid sequence of the protein, or amino acids with a side chain that does not have a positive charge, and/or preferably amino acids with a negatively charged side chain present in the amino acid sequence of a protein can be deleted. It is understood that, for example, the N-terminal and C-terminal amino acid residues of a protein have a charge derived from the main chain (NH3+ amino group at the N-terminus and a COO carbonyl group at the C - terminus) in addition to the charges from their side chains. Thus, the pI of a protein can also be increased by performing some addition, deletion, substitution or insertion on the backbone functional groups.
Замена аминокислоты для увеличения pI включает, например, замену аминокислоты, боковая цепь которой не имеет заряда, на аминокислоту с отрицательно заряженной боковой цепью, замену аминокислоты, имеющей положительно заряженную боковую цепь, на аминокислоту, боковая цепь которой не имеет заряда, и замену аминокислоты, имеющей положительно заряженную боковую цепь, на аминокислоту с отрицательно заряженной боковой цепью в аминокислотной последовательности родительской области Fc, которые выполняют отдельно или в соответствующих комбинациях.Substituting an amino acid to increase pI includes, for example, replacing an amino acid whose side chain has no charge with an amino acid with a negatively charged side chain, replacing an amino acid with a positively charged side chain with an amino acid whose side chain has no charge, and replacing an amino acid with an uncharged side chain. having a positively charged side chain, to an amino acid with a negatively charged side chain in the amino acid sequence of the parent Fc region, which are performed alone or in appropriate combinations.
Инсерция или добавление аминокислоты для увеличения pI включает, например, инсерцию или добавление аминокислоты, боковая цепь которой не имеет заряда, и/или инсерцию или добавление аминокислоты, имеющей положительно заряженную боковую цепь в аминокислотной последовательности родительской области Fc, которые выполняются отдельно или в соответствующих комбинациях.The insertion or addition of an amino acid to increase the pI includes, for example, the insertion or addition of an amino acid whose side chain is uncharged and/or the insertion or addition of an amino acid having a positively charged side chain in the amino acid sequence of the parent Fc region, which are performed alone or in appropriate combinations .
Делеция аминокислоты для увеличения pI включает, например, делецию аминокислоты, боковая цепь которой не имеет заряда, и/или делецию аминокислоты, имеющей отрицательно заряженную боковую цепь, в аминокислотной последовательности родительской области Fc, которые выполняются по отдельности или в соответствующих комбинациях.Deletion of an amino acid to increase pI includes, for example, deletion of an amino acid having a side chain without a charge and/or deletion of an amino acid having a negatively charged side chain in the amino acid sequence of the parent Fc region, which are performed individually or in appropriate combinations.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения природные аминокислоты, используемые для увеличения pI, можно классифицировать следующим образом: (а) аминокислотой с отрицательно заряженной боковой цепью может быть Glu (E) или Asp (D); (б) аминокислотой, боковая цепь которой не имеет заряда, может быть Ala (A), Asn (N), Cys (С), Gln (Q), Gly (G), His (H), Ile (I), Leu (L), Met (M), Phe (F), Pro (P), Ser (S), Thr (T), Trp (W), Tyr (Y) или Val (V); (в) аминокислотой с положительно заряженной боковой цепью может быть His (H), Lys (K) или Arg (R). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения аминокислотной инсерцией или заменой после модификации является Lys (K) или Arg (R).In one embodiment of the present invention, natural amino acids used to increase pI can be classified as follows: (a) an amino acid with a negatively charged side chain can be Glu (E) or Asp (D); (b) an amino acid whose side chain has no charge can be Ala (A), Asn (N), Cys (C), Gln (Q), Gly (G), His (H), Ile (I), Leu (L), Met (M), Phe (F), Pro (P), Ser (S), Thr (T), Trp (W), Tyr (Y) or Val (V); (c) The amino acid with a positively charged side chain can be His (H), Lys (K) or Arg (R). In one embodiment of the present invention, the amino acid insertion or substitution after modification is Lys (K) or Arg (R).
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают выделенные агонистические антигенсвязывающие молекулы или антитела, содержащие последовательности варианта области Fc с повышенной связывающей активностью с рецептором Fc-гамма (предпочтительно, Fc gamma RIIb-связывающей активностью) и повышенной изоэлектрической точкой pI. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант области Fc по настоящему изобретению содержит по меньшей мере два аминокислотных изменения в исходной области Fc. Выше описано, что антигенсвязывающая молекула или антитело, имеющее повышенную pI, более сильно притягивается физикохимическим кулоновским взаимодействием к поверхности эндотелиальной клетки, которая имеет общий отрицательный заряд, по сравнению с антигенсвязывающей молекулой или антителом, не имеющими повышенной pI. Следовательно, для агонистических антигенсвязывающих молекул или антител, которые проявляют агонистическую активность на основе влияния связывающей активности в отношении рецептора Fc-гамма (предпочтительно Fc-гамма RIIb), можно увеличить агонистическую активность антигенсвязывающих молекул или антител путем комбинирования аминокислотных изменений для увеличения рецептора Fc-гамма (предпочтительно Fc-гамма RIIb) и аминокислотных изменений (изменения) для увеличения pI. Определение термина рецептор Fc-гамма приводят в разделе II. Композиции и методы (агонистические антигенсвязывающие молекулы против CD137) применяют сходным образом.In another embodiment, the present invention provides isolated agonistic antigen binding molecules or antibodies comprising variant Fc region sequences with increased Fc gamma receptor binding activity (preferably Fc gamma RIIb binding activity) and increased isoelectric point pI. In some embodiments of the present invention, a variant Fc region of the present invention contains at least two amino acid changes in the original Fc region. As described above, an antigen binding molecule or antibody having an elevated pI is more strongly attracted by the physicochemical Coulomb interaction to the surface of the endothelial cell, which has an overall negative charge, compared to an antigen binding molecule or antibody that does not have an elevated pI. Therefore, for agonistic antigen-binding molecules or antibodies that exhibit agonistic activity based on the influence of binding activity at the Fc-gamma receptor (preferably Fc-gamma RIIb), it is possible to increase the agonistic activity of the antigen-binding molecules or antibodies by combining amino acid changes to increase the Fc-gamma receptor (preferably Fc-gamma RIIb) and amino acid changes (changes) to increase pI. The term Fc-gamma receptor is defined in Section II. Compositions and methods (agonist antigen-binding molecules against CD137) are used in a similar manner.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают полипептиды, содержащие варианты области Fc с повышенной FcYRIIb-связывающей активностью и увеличенной pI, содержащие по меньшей мере три аминокислотных изменения, включающие: (а) по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении, выбранном из группы, состоящей из: 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 264, 266, 267, 268, 271, 295, 298, 325, 326, 327, 328, 330, 331, 332, 334 и 396, EU нумерация, и (б) по меньшей мере два аминокислотных изменения по меньшей мере в двух положениях, выбранных из группы, состоящей из: 285, 311, 312, 315, 318, 333, 335, 337, 341, 342, 343, 384, 385, 388, 390, 399, 400, 401, 402, 413, 420, 422 и 431, EU нумерация.In one embodiment, the present invention provides polypeptides comprising Fc region variants with increased FcYRIIb binding activity and increased pI, comprising at least three amino acid changes, including: (a) at least one amino acid change at at least one position, selected from the group consisting of: 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 264, 266, 267, 268, 271, 295, 298, 325, 326, 327, 328, 330, 331 , 332, 334 and 396, EU numbering, and (b) at least two amino acid changes at at least two positions selected from the group consisting of: 285, 311, 312, 315, 318, 333, 335, 337, 341, 342, 343, 384, 385, 388, 390, 399, 400, 401, 402, 413, 420, 422 and 431, EU numbering.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают полипептид, содержащий вариант области Fc, который приводит к повышенной FcYRIIb-связывающей активности и увеличению pI, причем полипептид содержит по меньшей мере 3 аминокислотных изменения, включающих (а) по меньшей мере одно аминокислотное изменение по меньшей мере в одном положении,In one embodiment, the present invention provides a polypeptide comprising a variant Fc region that results in increased FcYRIIb binding activity and increased pI, wherein the polypeptide contains at least 3 amino acid changes comprising (a) at least one amino acid change of at least in one position
- 82 046075 выбранном из группы, состоящей из положений 234, 235, 236, 237, 238, 264, 268, 295, 326 и 330 по нумерации EU, и (б) по меньшей мере 2 аминокислотные мутации по меньшей мере в 2 положениях, выбранных из группы, состоящей из положений 311, 343 и 413 по нумерации EU.- 82 046075 selected from the group consisting of positions 234, 235, 236, 237, 238, 264, 268, 295, 326 and 330 according to EU numbering, and (b) at least 2 amino acid mutations in at least 2 positions, selected from the group consisting of provisions 311, 343 and 413 by EU numbering.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают полипептид, содержащий вариант области Fc, который приводит к повышенной FcγRIIb-связывающей активности и увеличению pI, включающий по меньшей мере одно аминокислотное изменение в любом из положений от (1) до (26) (по нумерации EU):In another embodiment, the present invention provides a polypeptide comprising a variant Fc region that results in increased FcγRIIb binding activity and increased pI, comprising at least one amino acid change at any one of positions (1) to (26) (EU numbering) :
(1) положения 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 и 413;(1) provisions 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 and 413;
(2) положения 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 и 413;(2) provisions 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330, 343 and 413;
(3) положения 234, 238, 250, 264, 307, 330, 343 и 413;(3) provisions 234, 238, 250, 264, 307, 330, 343 and 413;
(4) положения 234, 238, 264, 330, 343 и 413;(4) provisions 234, 238, 264, 330, 343 and 413;
(5) положения 234, 237, 238, 250, 307, 330, 343 и 413;(5) provisions 234, 237, 238, 250, 307, 330, 343 and 413;
(6) положения 234, 237, 238, 330, 343 и 413;(6) provisions 234, 237, 238, 330, 343 and 413;
(7) положения 235, 236,268, 295, 326, 330, 311 и 343;(7) provisions 235, 236,268, 295, 326, 330, 311 and 343;
(8) положения 234, 238, 250, 264, 307, 330, 311 и 343;(8) provisions 234, 238, 250, 264, 307, 330, 311 and 343;
(9) положения 234, 238, 264, 330, 311 и 343;(9) provisions 234, 238, 264, 330, 311 and 343;
(10) положения 234, 237, 238, 250, 307, 330, 311 и 343;(10) provisions 234, 237, 238, 250, 307, 330, 311 and 343;
(11) положения 234, 237, 238, 330, 311 и 343;(11) provisions 234, 237, 238, 330, 311 and 343;
(12) положения 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 343;(12) provisions 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 343;
(13) положения 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 343;(13) provisions 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 343;
(14) положения 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 413;(14) provisions 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 413;
(15) положения 214, 236, 268, 330 и 343;(15) provisions 214, 236, 268, 330 and 343;
(16) положения 214, 235, 236, 268, 330 и 343;(16) provisions 214, 235, 236, 268, 330 and 343;
(17) положения 214, 236, 268, 330 и 413;(17) provisions 214, 236, 268, 330 and 413;
(18) положения 214, 236, 268, 330, 343 и 413;(18) provisions 214, 236, 268, 330, 343 and 413;
(19) положения 214, 235, 236, 268, 330, 343 и 413;(19) provisions 214, 235, 236, 268, 330, 343 and 413;
(20) положения 214, 236, 268, 330 и 311;(20) provisions 214, 236, 268, 330 and 311;
(21) положения 214, 235, 236, 268, 330 и 311;(21) provisions 214, 235, 236, 268, 330 and 311;
(22) положения 214, 236, 268, 330, 311 и 343;(22) provisions 214, 236, 268, 330, 311 and 343;
(23) положения 214, 235, 236, 268, 330, 311 и 343;(23) provisions 214, 235, 236, 268, 330, 311 and 343;
(24) положения 214, 236, 268, 330, 311 и 413;(24) provisions 214, 236, 268, 330, 311 and 413;
(25) положения 214, 235, 236, 268, 330, 311 и 413;(25) provisions 214, 235, 236, 268, 330, 311 and 413;
(26) положения 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 и 311.(26) provisions 214, 235, 236, 268, 295, 326, 330 and 311.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения вариант области Fc по настоящему изобретению включает аминокислотные изменения, представленные ниже в табл. 6.In one embodiment of the present invention, a variant Fc region of the present invention includes the amino acid changes presented in Table below. 6.
Таблица 6Table 6
Аминокислотные изменения для повышения pI области FcAmino acid changes to increase the pI of the Fc region
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в дополнение к аминокислотным изменениям, описанным в табл. 6 (аминокислотные изменения, которые увеличивают pI Fc), вариантная область Fc по настоящему изобретению включает аминокислотные изменения, описанные в табл. 7 ниже.In one embodiment of the present invention, in addition to the amino acid changes described in table. 6 (amino acid changes that increase Fc pI), the variant Fc region of the present invention includes the amino acid changes described in table. 7 below.
Таблица 7 Аминокислотные изменения, которые повышают FcγRIIb-связывающую активность области FcTable 7 Amino acid changes that increase FcγRIIb-binding activity of the Fc region
- 83 046075- 83 046075
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения вариант области Fc по настоящему изобретению включает аминокислотные изменения, описанные в табл. 8 ниже. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения вариант области Fc по настоящему изобретению включает аминокислотную делецию в положении 447 по нумерации EU помимо аминокислотных изменений, описанных ниже в табл. 8. В другом предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения вариант области Fc по настоящему изобретению включает аминокислотные делеции в положениях 446 и 447 по нумерации EU помимо аминокислотных изменений, описанных ниже в табл. 8.In one embodiment of the present invention, the variant Fc region of the present invention includes the amino acid changes described in table. 8 below. In a preferred embodiment of the present invention, the variant Fc region of the present invention includes an amino acid deletion at EU numbering position 447 in addition to the amino acid changes described in Table below. 8. In another preferred embodiment of the present invention, the variant Fc region of the present invention includes amino acid deletions at EU numbering positions 446 and 447 in addition to the amino acid changes described in Table below. 8.
Таблица 8Table 8
Помимо изменений, приведенных в качестве примеров выше, специалисты в данной области поймут, что по крайней мере одно аминокислотное изменение, которое увеличивает активность связывания с FcyR, включая FcyRIIb, по сравнению с исходной областью Fc, например, как описано или предложено в WO 2013/047752, WO 2013/125667, WO 2014/030728, WO 2014/163101 или WO 2017104783, можно использовать по меньшей мере одно изменение аминокислоты, которое увеличивает pI по сравнению с исходной областью Fc, например, как описано или предложено в WO 2017/104783 или WO 2017/046994, и комбинации этих аминокислотных изменений.In addition to the changes exemplified above, those skilled in the art will appreciate that at least one amino acid change that increases FcyR binding activity, including FcyRIIb, compared to the original Fc region, for example, as described or proposed in WO 2013/ 047752, WO 2013/125667, WO 2014/030728, WO 2014/163101 or WO 2017104783, at least one amino acid change that increases the pI compared to the original Fc region can be used, for example as described or proposed in WO 2017/104783 or WO 2017/046994, and combinations of these amino acid changes.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения агонистическая антигенсвязывающая молекула или антитело содержит как вариантную область Fc, так и антигенсвязывающий домен. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антиген является мембранным антигеном. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антиген представляет собой рецептор, экспрессируемый на поверхности клетки. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения родительская область Fc происходит от IgG1 человека. В другом варианте осуществления настоящего изобретения полипептид представляет собой антитело. В другом варианте осуществления настоящего изобретения полипептид представляет собой слитый белок Fc.In one embodiment of the present invention, the agonistic antigen binding molecule or antibody comprises both a variant Fc region and an antigen binding domain. In another embodiment of the present invention, the antigen is a membrane antigen. In another embodiment of the present invention, the antigen is a receptor expressed on the surface of a cell. In some embodiments of the present invention, the parent Fc region is derived from human IgG1. In another embodiment of the present invention, the polypeptide is an antibody. In another embodiment of the present invention, the polypeptide is an Fc fusion protein.
- 84 046075- 84 046075
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают способ получения агонистической антигенсвязывающей молекулы, которая включает подробно описанный выше вариант области Fc (вариант области Fc с увеличенной изоэлектрической точкой (pI)).In one embodiment, the present invention provides a method for producing an agonistic antigen-binding molecule that includes a variant Fc region (an increased isoelectric point (pI) variant Fc region) as described in detail above.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ по настоящему изобретению имеет следующие особенности: введение в исходную область Fc по меньшей мере одного аминокислотного изменения (как описано выше), которое приводит к повышению изоэлектрической точки (pI) по сравнению с изоэлектрической точкой (pI) родительской агонистической антигенсвязывающей молекулы, содержащей исходную область Fc; идентификация и выделение агонистической антигенсвязывающей молекулы, в которой агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы, включающей вариант области Fc, полученный в результате вышеуказанной интродукции, повышена по сравнению с таковой у исходной агонистической антигенсвязывающей молекулы.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention has the following features: introducing into the parent Fc region at least one amino acid change (as described above) that results in an increase in the isoelectric point (pI) compared to the isoelectric point (pI) of the parent an agonistic antigen-binding molecule containing a parent Fc region; identifying and isolating an agonistic antigen binding molecule in which the agonistic activity of the agonistic antigen binding molecule including the Fc region variant resulting from the above introduction is increased compared to that of the original agonistic antigen binding molecule.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ по настоящему изобретению имеет особенности получения вектора экспрессии, содержащего подходящий промотор, функционально связанный с геном, кодирующим вышеупомянутую агонистическую антигенсвязывающую молекулу, идентифицированную и выделенную, как указано выше, предусматривает введение вектора в клеткухозяин, культивирование клеток-хозяев для выработки агонистической антигенсвязывающей молекулы и выделения вышеупомянутой агонистической антигенсвязывающей молекулы из культуры клеток-хозяев.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention has the features of obtaining an expression vector containing a suitable promoter operably linked to a gene encoding the above-mentioned agonistic antigen-binding molecule identified and isolated as above, introducing the vector into a host cell, culturing the host cells for producing an agonistic antigen-binding molecule and isolating said agonistic antigen-binding molecule from the host cell culture.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ по настоящему изобретению позволяет получать агонистическую антигенсвязывающую молекулу, агонистическая активность которой в отношении антигена в присутствии 10 мкМ, 50 мкМ, 100 мкМ, 150 мкМ, 200 мкМ или 250 мкМ низкомолекулярного соединения выше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более или в 90 раз или более по сравнению с агонистической активностью по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention produces an agonistic antigen-binding molecule whose agonistic activity against an antigen in the presence of 10 μM, 50 μM, 100 μM, 150 μM, 200 μM, or 250 μM low molecular weight compound is 2-fold or more greater. , 3 times or more, 5 times or more, 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more, the agonistic activity against the antigen in the absence of the small molecule compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способом по настоящему изобретению можно получить агонистическую антигенсвязывающую молекулу, агонистическая активность которой по отношению к антигену в присутствии 10 мкМ или более низкомолекулярного соединения выше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более или в 90 раз или более по сравнению с агонистической активностью по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention can produce an agonistic antigen-binding molecule whose agonistic activity against an antigen in the presence of 10 μM or more of a low molecular weight compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more higher. , 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more compared with agonistic activity towards the antigen in the absence of a low molecular weight compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способом по настоящему изобретению можно получить агонистическую антигенсвязывающую молекулу, агонистическая активность которой по отношению к антигену в присутствии 50 мкМ или более низкомолекулярного соединения выше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более или в 90 раз или более по сравнению с агонистической активностью по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention can produce an agonistic antigen-binding molecule whose agonistic activity against an antigen in the presence of 50 μM or more of a low molecular weight compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more higher. , 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more compared with agonistic activity towards the antigen in the absence of a low molecular weight compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способом по настоящему изобретению можно получить агонистическую антигенсвязывающую молекулу, агонистическая активность которой по отношению к антигену в присутствии 250 мкМ или более низкомолекулярного соединения выше в 2 раза или более, в 3 раза или более, в 5 раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 60 раз или более, в 70 раз или более, в 80 раз или более или в 90 раз или более по сравнению с агонистической активностью по отношению к антигену в отсутствие низкомолекулярного соединения.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention can produce an agonistic antigen-binding molecule whose agonistic activity towards an antigen in the presence of 250 μM or more of a low molecular weight compound is 2-fold or more, 3-fold or more, 5-fold or more higher , 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 60 times or more, 70 times or more, 80 times or more, or 90 times or more compared with agonistic activity towards the antigen in the absence of a low molecular weight compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в таком способе агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену может быть оценена по количеству IL-2 и/или IFN-γ, вырабатываемых антиген-экспрессирующими клетками.In one embodiment of the present invention, in such a method, the agonistic activity of an agonistic antigen-binding molecule towards an antigen can be assessed by the amount of IL-2 and/or IFN-γ produced by the antigen-expressing cells.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в таком способе агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену может быть оценена по количеству IL-2 и/или IFN-γ, вырабатываемых выделенными мононуклеарными клетками периферической крови человека (МКПК) или Т-клетками, производными от мононуклеарных клеток периферической крови человека (МКПК).In one embodiment of the present invention, in such a method, the agonistic activity of an agonistic antigen-binding molecule towards an antigen can be assessed by the amount of IL-2 and/or IFN-γ produced by isolated human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) or T cells derived from from human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в таком способе агонистическая активность агонистической антигенсвязывающей молекулы по отношению к антигену может быть оценена путем анализа репортерного гена.In one embodiment of the present invention, in such a method, the agonistic activity of an agonistic antigen-binding molecule towards an antigen can be assessed by reporter gene assay.
IV. Композиции и способы (антигенсвязывающие молекулы, связывающая активность которых с антигенами изменяется в зависимости от концентрации низкомолекулярного соединения).IV. Compositions and methods (antigen-binding molecules, the binding activity of which to antigens varies depending on the concentration of the low molecular weight compound).
А. Антигенсвязывающие молекулы, связывающая активность которых с антигенами изменяется в зависимости от концентрации низкомолекулярного соединения.A. Antigen-binding molecules, the binding activity of which to antigens varies depending on the concentration of the low molecular weight compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязыIn one embodiment, the present invention provides antigen binding
- 85 046075 вающие молекулам, антигенсвязывающая активность которых изменяется в зависимости от концентрации низкомолекулярного соединения. Молекулы также могут называться зависимыми от низкомолекулярного соединения антигенсвязывающими молекулами (обладающими антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации низкомолекулярного соединения). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы представляют собой антитела. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению обладают антигенсвязывающей активностью, которая увеличивается по мере того, как концентрация низкомолекулярного соединения становится выше. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению обладают антигенсвязывающей активностью, которая снижается по мере того, как концентрация низкомолекулярного соединения становится выше. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения когда связывающую активность антигенсвязывающей молекулы в присутствии низкомолекулярного соединения сравнивают со связывающей активностью антигенсвязывающей молекулы в отсутствие низкомолекулярного соединения, одно из двух значений выше, чем другое значение. В другом варианте осуществления настоящего изобретения когда связывающая активность антигенсвязывающей молекулы в присутствии высокой концентрации низкомолекулярного соединения сравнивают со связывающей активностью антигенсвязывающей молекулы в присутствии низкой концентрации низкомолекулярного соединения, одно из двух значений выше чем другое значение. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения низкомолекулярное соединение в настоящем изобретении представляет собой целевое тканеспецифичное соединение. В других вариантах осуществления настоящего изобретения низкомолекулярное соединение в настоящем изобретении представляет собой соединение, специфичное для опухолевой ткани.- 85 046075 molecules whose antigen-binding activity varies depending on the concentration of the low-molecular compound. The molecules may also be referred to as small molecule dependent antigen binding molecules (having antigen binding activity dependent on the concentration of the small molecule compound). In some embodiments of the present invention, the antigen binding molecules are antibodies. In some embodiments, the antigen binding molecules of the present invention have antigen binding activity that increases as the concentration of the small molecule compound becomes higher. In some embodiments, the antigen binding molecules of the present invention have antigen binding activity that decreases as the concentration of the small molecule compound becomes higher. In one embodiment of the present invention, when the binding activity of an antigen binding molecule in the presence of a small molecule compound is compared with the binding activity of an antigen binding molecule in the absence of a small molecule compound, one of the two values is higher than the other value. In another embodiment of the present invention, when the binding activity of an antigen binding molecule in the presence of a high concentration of a small molecule compound is compared with the binding activity of an antigen binding molecule in the presence of a low concentration of a small molecule compound, one of the two values is higher than the other value. In some embodiments of the present invention, the small molecule compound of the present invention is a target tissue-specific compound. In other embodiments of the present invention, the small molecule compound of the present invention is a tumor tissue-specific compound.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающие молекулы, обладающие высокой способностью удерживания в плазме. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающие молекулы, обладающие антигенсвязывающей активностью, которая увеличивается по мере увеличения концентрации низкомолекулярного соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения низкомолекулярное соединение представляет собой тканеспецифичное соединение-мишень. В других вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы обладают повышенной антигенсвязывающей активностью в ткани-мишени по сравнению с антигенсвязывающей активностью в ткани, не являющейся мишенью. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы представляют собой антитела. Не ограничиваясь какой-либо конкретной теорией, описанное выше изменение кинетики плазмы можно объяснить следующим образом. Когда антигенсвязывающая активность антигенсвязывающей молекулы высока в зависимости от концентрации тканеспецифичного соединения-мишени, антигенсвязывающая активность этой антигенсвязывающей молекулы в тканях, отличных от ткани-мишени, будет ниже. В результате антиген-зависимая элиминация (клиренс) этой антигенсвязывающей молекулы в тканях, отличных от ткани-мишени, также станет ниже. Более низкая антигензависимая элиминация (клиренс) в большинстве тканей живого организма (то есть в тканях, отличных от ткани-мишени) в целом приводит к повышенной способности удерживать антигенсвязывающую молекулу в плазме. Определение того, обладает ли антигенсвязывающая молекула по настоящему изобретению высокой способностью удерживания в плазме, может быть выполнено путем сравнения с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы, которые обладают повышенной антигенсвязывающей активностью, когда концентрация целевого тканеспецифичного соединения становится выше, имеют более высокую способность удерживания в плазме по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации низкомолекулярного соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации низкомолекулярного соединения, означает антигенсвязывающую молекулу, для которой разница в антигенсвязывающей активности в присутствии низкомолекулярного соединения и в отсутствие низкомолекулярного соединения отличается в 2 раза или меньше, в 1,8 раза или меньше, в 1,5 раза или меньше, в 1,3 раза или меньше, в 1,2 раза или меньше, или в 1,1 раза или меньше. Для сравнения предпочтительно, чтобы антигенсвязывающая активность антигенсвязывающих молекул по настоящему изобретению и контрольных антигенсвязывающих молекул в присутствии достаточного количества низкомолекулярного соединения была по существу одинаковой.In another embodiment, the present invention provides antigen-binding molecules having high plasma retention properties. In another embodiment, the present invention provides antigen binding molecules having antigen binding activity that increases as the concentration of the small molecule compound increases. In some embodiments of the present invention, the small molecule compound is a tissue-specific target compound. In other embodiments of the present invention, the antigen binding molecules have increased antigen binding activity in the target tissue compared to antigen binding activity in the non-target tissue. In one embodiment of the present invention, the antigen binding molecules are antibodies. Without being limited to any particular theory, the change in plasma kinetics described above can be explained as follows. When the antigen-binding activity of an antigen-binding molecule is high depending on the concentration of the target tissue-specific compound, the antigen-binding activity of the antigen-binding molecule in tissues other than the target tissue will be lower. As a result, the antigen-dependent elimination (clearance) of this antigen-binding molecule in tissues other than the target tissue will also become lower. Lower antigen-dependent elimination (clearance) in most tissues of the living body (that is, in tissues other than the target tissue) generally results in an increased ability to retain the antigen-binding molecule in plasma. Determination of whether the antigen binding molecule of the present invention has a high plasma retention capacity can be made by comparison with a control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, antigen-binding molecules that have increased antigen-binding activity when the concentration of the target tissue-specific compound becomes higher have a higher plasma retention capacity compared to a control antigen-binding molecule. In one embodiment of the present invention, the control antigen-binding molecule does not have antigen-binding activity that is dependent on the concentration of the small molecule compound. In some embodiments of the present invention, an antigen binding molecule that does not have small molecule concentration dependent antigen binding activity is an antigen binding molecule for which the difference in antigen binding activity in the presence of the small molecule compound and in the absence of the small molecule compound is a factor of 2 or less than 1. 8 times or less, 1.5 times or less, 1.3 times or less, 1.2 times or less, or 1.1 times or less. For comparison, it is preferred that the antigen binding activity of the antigen binding molecules of the present invention and the control antigen binding molecules in the presence of a sufficient amount of the small molecule compound is substantially the same.
Авторы настоящего изобретения полагают, что величина антиген-зависимой элиминации антигенсвязывающей молекулы, обнаруживаемой in vivo, изменяется в соответствии с количественным балансом антигенов и антигенсвязывающих молекул, присутствующих в плазме. В целом полагают, что чем больше антигенов присутствует в плазме / чем меньше антигенсвязывающих молекул присутствует в плазме, тем более выявляемой становится антиген-зависимая элиминация антигенсвязывающей молекулы. Напротив, считают, что чем меньше антигенов присутствует в плазме / чем больше антигенсвязывающих молекул присутствует в плазме, тем менее выявляемой становится антиген-зависимая элиминаThe present inventors believe that the amount of antigen-dependent elimination of antigen-binding molecule detected in vivo varies according to the quantitative balance of antigens and antigen-binding molecules present in the plasma. In general, it is believed that the more antigens are present in the plasma/the fewer antigen-binding molecules are present in the plasma, the more detectable the antigen-dependent elimination of the antigen-binding molecule becomes. On the contrary, it is believed that the fewer antigens are present in the plasma/the more antigen-binding molecules are present in the plasma, the less detectable antigen-dependent elimination becomes.
- 86 046075 ция антигенсвязывающей молекулы. Антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению не обязательно должны проявлять высокую способность удерживания в плазме при любых условиях, но достаточно, чтобы антигенсвязывающие молекулы проявляли высокую способность удерживания в плазме при подходящих условиях, когда обнаруживают достаточную антиген-зависимую элиминацию. Если количество антигена в плазме слишком мало, способность удерживания в плазме может быть оценена после увеличения количества антигена любыми искусственными методами.- 86 046075 tion of antigen-binding molecule. The antigen-binding molecules of the present invention do not necessarily have to exhibit high plasma retention under all conditions, but it is sufficient that the antigen-binding molecules exhibit high plasma retention under suitable conditions when sufficient antigen-dependent elimination is detected. If the amount of antigen in the plasma is too small, plasma retention capacity can be assessed after increasing the amount of antigen by any artificial means.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение предусматривает антигенсвязывающие молекулы, имеющие низкую способность накапливать антиген в плазме. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы обладают антигенсвязывающей активностью, которая увеличивается по мере того, как концентрация низкомолекулярного соединения становится выше. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения низкомолекулярное соединение представляет собой целевое тканеспецифичное соединение. В других вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы обладают повышенной антигенсвязывающей активностью в ткани-мишени по сравнению с антигенсвязывающей активностью в ткани, не являющейся мишенью. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы представляют собой антитела. Не ограничиваясь какой-либо конкретной теорией, описанное выше изменение кинетики плазмы можно понять следующим образом. Когда антигенсвязывающая активность антигенсвязывающей молекулы высока в зависимости от концентрации тканеспецифичного соединениямишени, антигенсвязывающая активность этой антигенсвязывающей молекулы в тканях, отличных от ткани-мишени, будет ниже. В результате эта антигенсвязывающая молекула будет иметь пониженную способность образовывать комплекс антиген-антитело в тканях, отличных от ткани-мишени. В целом известно, что когда антиген связывается антигенсвязывающей молекулой, такой как антитело, клиренс антигена становится ниже, а концентрация антигена в плазме увеличивается (антиген накапливается). Пониженная способность образовывать комплекс антиген-антитело в большинстве тканей живого организма (то есть в тканях, отличных от ткани-мишени) в целом приводит к пониженному накоплению антигена (другими словами, к пониженной способности антигенсвязывающей молекулы к накоплению антигена). Определение того, обладает ли антигенсвязывающая молекула в настоящем изобретении пониженной способностью к накоплению антигена в плазме, может быть выполнено путем сравнения с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы, которые обладают повышенной антигенсвязывающей активностью, когда концентрация целевого тканеспецифичного соединения становится выше, имеют пониженную способность к накоплению антигена в плазме по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации низкомолекулярного соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации низкомолекулярного соединения, означает антигенсвязывающую молекулу, для которой разница в антигенсвязывающей активности в присутствии низкомолекулярного соединения и в отсутствие низкомолекулярного соединения отличается, например, в 2 раза или меньше, в 1,8 раз или меньше, в 1,5 раз или меньше, в 1,3 раза или меньше, в 1,2 раза или меньше, или в 1,1 раза или меньше. При сравнении предпочтительно, чтобы антигенсвязывающая активность антигенсвязывающих молекул по настоящему изобретению и контрольных антигенсвязывающих молекул в присутствии достаточного количества соединения были по существу одинаковыми.In another embodiment, the present invention provides antigen-binding molecules having a low ability to accumulate antigen in plasma. In another embodiment of the present invention, antigen binding molecules have antigen binding activity that increases as the concentration of the small molecule compound becomes higher. In some embodiments of the present invention, the small molecule compound is a target tissue-specific compound. In other embodiments of the present invention, the antigen binding molecules have increased antigen binding activity in the target tissue compared to antigen binding activity in the non-target tissue. In one embodiment of the present invention, the antigen binding molecules are antibodies. Without being limited to any particular theory, the change in plasma kinetics described above can be understood as follows. When the antigen-binding activity of an antigen-binding molecule is high depending on the concentration of the target tissue-specific compound, the antigen-binding activity of the antigen-binding molecule in tissues other than the target tissue will be lower. As a result, this antigen-binding molecule will have a reduced ability to form an antigen-antibody complex in tissues other than the target tissue. In general, it is known that when an antigen is bound by an antigen-binding molecule, such as an antibody, the clearance of the antigen becomes lower and the concentration of the antigen in the plasma increases (the antigen accumulates). The reduced ability to form an antigen-antibody complex in most tissues of a living organism (that is, in tissues other than the target tissue) generally results in reduced accumulation of antigen (in other words, a reduced ability of the antigen-binding molecule to accumulate antigen). Determination of whether the antigen binding molecule of the present invention has a reduced ability to accumulate antigen in plasma can be made by comparison with a control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, antigen-binding molecules that exhibit increased antigen-binding activity when the concentration of the target tissue-specific compound becomes higher have a reduced ability to accumulate antigen in plasma compared to a control antigen-binding molecule. In one embodiment of the present invention, the control antigen-binding molecule does not have antigen-binding activity that is dependent on the concentration of the small molecule compound. In some embodiments of the present invention, an antigen binding molecule that does not have small molecule concentration dependent antigen binding activity is an antigen binding molecule for which the difference in antigen binding activity in the presence of the small molecule compound and in the absence of the small molecule compound is different, for example, by a factor of 2 or less, 1.8 times or less, 1.5 times or less, 1.3 times or less, 1.2 times or less, or 1.1 times or less. When compared, it is preferred that the antigen binding activity of the antigen binding molecules of the present invention and the control antigen binding molecules in the presence of a sufficient amount of the compound are substantially the same.
В настоящем изобретении авторы отмечают, что количество комплекса антиген-антитело, образованного in vivo, зависит от количества антигена и антигенсвязывающей молекулы, присутствующих в плазме. Обычно считают, что чем больше антигенов/антител присутствует в плазме, тем больше образуется комплексов антиген-антитело. И наоборот, считают, что чем меньше антигенов/антител присутствует в плазме, тем меньше образуется комплексов антиген-антитело. Антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению не обязательно должны демонстрировать низкую способность к накоплению антигена в плазме при любых условиях, но достаточно, чтобы антигенсвязывающие молекулы проявляли низкую способность к накоплению антигена в плазме при подходящих условиях, когда формируется достаточное количество комплекса антиген-антитело. Если количество антигена в плазме слишком мало, способность к накоплению антигена в плазме можно оценить после увеличения количества антигена любыми искусственными методами.In the present invention, we note that the amount of antigen-antibody complex formed in vivo depends on the amount of antigen and antigen-binding molecule present in the plasma. It is generally believed that the more antigens/antibodies present in the plasma, the more antigen-antibody complexes are formed. Conversely, it is believed that the fewer antigens/antibodies present in the plasma, the fewer antigen-antibody complexes are formed. The antigen-binding molecules of the present invention do not necessarily need to exhibit a low ability to accumulate antigen in plasma under all conditions, but it is sufficient that the antigen-binding molecules exhibit a low ability to accumulate antigen in plasma under suitable conditions when a sufficient amount of antigen-antibody complex is formed. If the amount of antigen in the plasma is too small, the ability to accumulate antigen in the plasma can be assessed after increasing the amount of antigen by any artificial methods.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения разница в антигенсвязывающей активности, зависящая от концентрации низкомолекулярного соединения антигенсвязывающих молекул по настоящему изобретению, больше например, в два раза или более, в три раза или более, в пять раз или более, в десять раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1х 103 раз или более, в 2х103 раз или более, в 3х103 раз или более, в 5х103 раз или более, в 1 х 104 раз или более, в 2х104 раз или более, в 3х 104 раз или более, в 5х 104 раз или более или в 1х 105 раз или более.In some embodiments of the present invention, the difference in antigen binding activity depending on the concentration of the small molecule compound of the antigen binding molecules of the present invention is greater, such as two times or more, three times or more, five times or more, ten times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 100 times or more, 200 times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1x 10 3 times or more, 2x10 3 times or more, 3x10 3 times or more, 5x10 3 times or more, 1 x 10 4 times or more, 2x10 4 times or more, 3x 10 4 times or more, 5x 10 4 times or more than or 1x 10 5 times or more.
- 87 046075- 87 046075
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения связывающая активность антигенсвязывающих молекул может быть выражена значением KD (константа диссоциации). В других вариантах осуществления настоящего изобретения когда сравнивают значение KD для антигенсвязывающей молекулы в присутствии низкомолекулярного соединения и значение KD для антигенсвязывающей молекулы в отсутствие низкомолекулярного соединения, одно значение меньше, чем другое значение. В другом варианте осуществления настоящего изобретения если значение KD антигенсвязывающей молекулы в присутствии высокой концентрации низкомолекулярного соединения сравнивают со значением KD антигенсвязывающей молекулы в присутствии низкой концентрации низкомолекулярного соединения, одно значение меньше чем другое значение. В других вариантах осуществления настоящего изобретения разница в значениях KD антигенсвязывающих молекул больше, например, в два раза или более, в три раза или более, в пять раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 или более, в 100 раз или более, в раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1х 103 раз или более, в 2х 103 раз или более, в 3х 103 раз или более, в 5х 103 раз или более, в 1х 104 раз или более, в 2х 104 раз или более, в 3х104 раз или более, в 5х104 раз или более или в 1 х 105 раз или более. Величина KD может быть меньше, например, 9х10-7 М или менее, 8х10-7 М или менее, 7х10-7 М или менее, 6х10-7 М или менее, 5х10-7 М или менее, 4х10-7 М или менее, 3х10-7 М или менее, 2х10-7 М или менее, 1х 10-7 М или менее, 9х10-8 М или менее, 8х10-8 М или менее, 7х10-8 М или менее, 6х10-8 М или менее, 5х10-8 М или менее, 4х10-8 М или менее, 3х10-8 М или менее, 2х10-8 М или менее, 1х 10-8 М или менее, 9х10-9 М или менее, 8х10-9 М или менее, 7х10-9 М или менее, 6х10-9 М или менее, 5х10-9 М или менее, 4х10-9 М или менее, 3х10-9 М или менее, 2х10-9 М или менее, 1х 10-9 М или менее, 9х10-10 М или менее, 8х10-10 М или менее, 7х10-10 М или менее, 6х10-10 М или менее, 5х10-10 М или менее, 4х10-10 М или менее, 3х10-10 М или менее, 2х 10-10 М или менее, 1 х 10-10 М или менее. Величина KD может быть больше, например, 1 х 10-8 М или более, 2х10-8 М или более, 3х10-8 М или более, 4х10-8 М или более, 5х10-8 М или более, 6х10-8 М или более, 7х 10-8 М или более, 8х 10-8 М или более, 9х 10-8 М или более, 1 х 10-7 М или более, 2х 10-7 М или более, 3х 10-7 М или более, 4х 10-7 М или более, 5х 10-7 М или более, 6х 10-7 М или более, 7х 10-7 М или более, 8х 10-7 М или более, 9х 10-7 М или более, 1 х 10-6 М или более, 2х 10-6 М или более, 3х 10-6 М или более, 4х10-6 М или более, 5х10-6 М или более, 6х10-6 М или более, 7х10-6 М или более, 8х10-6 М или более, 9х 10-6 М или более.In some embodiments of the present invention, the binding activity of antigen binding molecules can be expressed by a KD (dissociation constant) value. In other embodiments of the present invention, when the KD value for an antigen binding molecule in the presence of a small molecule compound is compared with the KD value for an antigen binding molecule in the absence of a small molecule compound, one value is less than the other value. In another embodiment of the present invention, if the KD value of an antigen binding molecule in the presence of a high concentration of a small molecule compound is compared with the KD value of an antigen binding molecule in the presence of a low concentration of a small molecule compound, one value is less than the other value. In other embodiments of the present invention, the difference in KD values of the antigen-binding molecules is greater, for example, two times or more, three times or more, five times or more, 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more more, 50 times or more, 100 times or more, times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1x 10 3 times or more, 2x 103 times or more, 3x 10 3 times or more, 5x103 times or more, 1x104 times or more, 2x104 times or more, 3x104 times or more, 5x104 times or more, or 1x105 times or more. The KD value may be less, for example, 9x10 -7 M or less, 8x10 -7 M or less, 7x10 -7 M or less, 6x10 -7 M or less, 5x10 -7 M or less, 4x10 -7 M or less, 3x10 -7 M or less, 2x10 -7 M or less, 1x 10 -7 M or less, 9x10 -8 M or less, 8x10 -8 M or less, 7x10 -8 M or less, 6x10 -8 M or less, 5x10 -8 M or less, 4x10 -8 M or less, 3x10 -8 M or less, 2x10 -8 M or less, 1x 10 -8 M or less, 9x10 -9 M or less, 8x10 -9 M or less, 7x10 -9 M or less, 6x10 -9 M or less, 5x10 -9 M or less, 4x10 -9 M or less, 3x10 -9 M or less, 2x10 -9 M or less, 1x 10 -9 M or less, 9x10 -10 M or less, 8x10 -10 M or less, 7x10 -10 M or less, 6x10 -10 M or less, 5x10 -10 M or less, 4x10 -10 M or less, 3x10 -10 M or less, 2x 10 -10 M or less, 1 x 10 -10 M or less. The KD value may be greater, for example, 1 x 10 -8 M or more, 2 x 10 -8 M or more, 3 x 10 -8 M or more, 4 x 10 -8 M or more, 5 x 10 -8 M or more, 6 x 10 -8 M or more, 7x 10 -8 M or more, 8x 10 -8 M or more, 9x 10 -8 M or more, 1 x 10 -7 M or more, 2x 10 -7 M or more, 3x 10 -7 M or more , 4x 10 -7 M or more, 5x 10 -7 M or more, 6x 10 -7 M or more, 7x 10 -7 M or more, 8x 10 -7 M or more, 9x 10 -7 M or more, 1 x 10 -6 M or more, 2x 10 -6 M or more, 3x 10 -6 M or more, 4x10 -6 M or more, 5x10 -6 M or more, 6x10 -6 M or more, 7x10 -6 M or more, 8x10 -6 M or more, 9x 10 -6 M or more.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность антигенсвязывающих молекул может быть выражена значением kd (константа скорости диссоциации) вместо значения KD.In another embodiment of the present invention, the binding activity of antigen binding molecules can be expressed by a kd value (dissociation rate constant) instead of a KD value.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения связывающая активность антигенсвязывающих молекул может быть выражена количеством антигена, который связался с антигенсвязывающей молекулой. Например, методами поверхностного плазмонного резонанса связываемое количество антигенсвязывающей молекулы, иммобилизованной на сенсорном чипе, и связываемое количество антигена, которое связывается с ним, измеряют как резонансную единицу (RU). Антигенсвязывающая активность может быть выражена с использованием связываемого количества антигена, полученного из него, в качестве индикатора, или, альтернативно, может быть выражена с использованием значения, полученного путем деления количества связанного антигена на количество связанной антигенсвязывающей молекулы (т.е. количество связанного антигена на единицу количества антигенсвязывающей молекулы) в качестве индикатора. Конкретные методы измерения и расчета количества связывания описаны ниже в примерах. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения если количество связанного антигена в присутствии низкомолекулярного соединения сравнивается с количеством связанного антигена в отсутствие низкомолекулярного соединения, одно из значений больше, чем другое. В другом варианте осуществления настоящего изобретения если количество связанного антигена в присутствии высокой концентрации низкомолекулярного соединения сравнивают с количеством связанного антигена в присутствии низкой концентрации низкомолекулярного соединения, либо одно значение больше, чем другое значение. В других вариантах осуществления настоящего изобретения разница в связываемое количестве антигена больше, например, в два раза или более, в три раза или более, в пять раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1х 103 раз или более, в 2х 103 раз или более, в х 103 раз или более, в 5х 103 раз или более, в 1х 104 раз или более, в 2х 104 раз или более, в 3х 104 раз или более, в 5х 104 раз или более или в 1х 105 раз или более. Связываемое количество антигена большего значения может быть, например, 0,01 или более, 0,02 или более, 0,03 или более, 0,04 или более, 0,05 или более, 0,06 или более, 0,07 или более, 0,08 или более, 0,09 или более, 0,1 или более, 0,2 или более, 0,3 или более, 0,4 или более, 0,5 или более, 0,6 или более, 0,7 или более, 0,8 или более, 0,9 или более, 1 или более. Связываемое количество антигена меньшего значения может составлять, например, 0,5 или менее, 0,4 или менее, 0,3 или менее, 0,2 или менее, 0,1 или менее, 0,09 или менее, 0,08 или менее, 0,07 или менее, 0,06 или менее, 0,05 или менее, 0,04 или менее, 0,03 или менее, 0,02 или менее, 0,01 или менее, 0,009 или менее, 0,008 или менее, 0,007 или менее, 0,006 или менее, 0,005 или менее, 0,004 или менее, 0,003 или менее, 0,002 или менее, 0,001 или менее.In another embodiment of the present invention, the binding activity of antigen binding molecules can be expressed by the amount of antigen that has bound to the antigen binding molecule. For example, by surface plasmon resonance techniques, the binding amount of an antigen-binding molecule immobilized on a sensor chip and the binding amount of antigen that binds thereto are measured as a resonance unit (RU). Antigen-binding activity can be expressed using the bound amount of antigen derived from it as an indicator, or alternatively can be expressed using a value obtained by dividing the amount of antigen bound by the amount of antigen-binding molecule bound (i.e., the amount of antigen bound by unit amount of antigen-binding molecule) as an indicator. Specific methods for measuring and calculating the amount of binding are described in the examples below. In some embodiments of the present invention, if the amount of bound antigen in the presence of a small molecule compound is compared with the amount of bound antigen in the absence of a small molecule compound, one of the values is greater than the other. In another embodiment of the present invention, if the amount of bound antigen in the presence of a high concentration of a small molecule compound is compared with the amount of bound antigen in the presence of a low concentration of a small molecule compound, or one value is greater than the other value. In other embodiments of the present invention, the difference in the amount of antigen bound is greater, for example, two times or more, three times or more, five times or more, 10 times or more, 20 times or more, 30 times or more , 50 times or more, 100 times or more, 200 times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1x 10 3 times or more, 2x 10 3 times or more, x 10 3 times or more, 5x 10 3 times or more, 1x 10 4 times or more, 2x 10 4 times or more, 3x 10 4 times or more, 5x 10 4 times or more, or 1x 10 5 times or more. The amount of higher antigen bound may be, for example, 0.01 or more, 0.02 or more, 0.03 or more, 0.04 or more, 0.05 or more, 0.06 or more, 0.07 or more, 0.08 or more, 0.09 or more, 0.1 or more, 0.2 or more, 0.3 or more, 0.4 or more, 0.5 or more, 0.6 or more, 0.7 or more, 0.8 or more, 0.9 or more, 1 or more. The amount of lower antigen bound may be, for example, 0.5 or less, 0.4 or less, 0.3 or less, 0.2 or less, 0.1 or less, 0.09 or less, 0.08 or less than, 0.07 or less, 0.06 or less, 0.05 or less, 0.04 or less, 0.03 or less, 0.02 or less, 0.01 or less, 0.009 or less, 0.008 or less, 0.007 or less, 0.006 or less, 0.005 or less, 0.004 or less, 0.003 or less, 0.002 or less, 0.001 or less.
- 88 046075- 88 046075
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения значения KD, значения kd или значения связанных количеств, представленные в настоящем изобретении, измеряют или вычисляют путем проведения анализа поверхностного плазмонного резонанса при 25°C или 37°C (например, см. примеры в настоящем изобретении).In some embodiments of the present invention, KD values, kd values, or associated quantity values provided in the present invention are measured or calculated by performing surface plasmon resonance analysis at 25°C or 37°C (for example, see examples in the present invention).
Концентрация низкомолекулярного соединения может быть выбрана произвольно, при условии, что может быть обнаружено различие в связывающей активности в отношении антигенсвязывающей молекулы. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения высокая концентрация включает, например, 1 нМ или более высокую концентрацию, 3 нМ или более высокую концентрацию, 10 нМ или более высокую концентрацию, 30 нМ или более высокую концентрацию, 100 нМ или более высокую концентрацию, 300 нМ или более высокую концентрацию, 1 мкМ или более высокую концентрацию, 3 мкМ или более высокую концентрацию, 10 мкМ или более высокую концентрацию, 30 мкМ или более высокую концентрацию, 100 мкМ или более высокую концентрацию, 300 мкМ или более высокую концентрацию, 1 мМ или более высокую концентрацию, 3 мМ или более высокую концентрацию, 10 мМ или более высокую концентрацию, 30 мМ или более высокую концентрацию, 100 мМ или более высокую концентрацию, 300 мМ или более высокую концентрацию, 1 М или более высокую концентрацию. В другом варианте настоящего изобретения высокая концентрация может быть такой концентрацией, которая обеспечивает достаточное количество, чтобы допустить каждой антигенсвязывающей молекуле проявить максимальную связывающую активность. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения 1 микромоль, 10 мкМ, 100 мкМ, 1 мМ или количество, достаточное для того, чтобы каждая антигенсвязывающая молекула проявляла максимальную связывающую активность, в настоящем изобретении могут быть выбраны в качестве высокой концентрации. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения низкая концентрация включает, например, 1 мМ или более низкую концентрацию, 300 мкМ или более низкую концентрацию, 100 мкМ или более низкую концентрацию, 30 мкМ или более низкую концентрацию, 10 мкМ или более низкую концентрацию, 3 мкМ или более низкую концентрацию, 1 мкМ или более низкую концентрацию, 300 нМ или более низкую концентрацию, 100 нМ или более низкую концентрацию, 30 нМ или более низкую концентрацию, 10 нМ или более низкую концентрацию, 3 нМ или более низкую концентрацию, 1 нМ или более низкую концентрацию, 300 пМ или более низкую концентрацию, 100 пМ или более низкую концентрацию, 30 пМ или более низкую концентрацию, 10 пМ или более низкую концентрацию, 3 пМ или более низкую концентрацию, 1 пМ или более низкую концентрацию и т.д. В качестве альтернативы, низкая концентрация в настоящем изобретении может быть такой концентрацией, при которой каждая антигенсвязывающая молекула проявляет минимальную связывающую активность. Случай практически нулевой концентрации (т.е. отсутствие низкомолекулярного соединения) может быть выбран в качестве одного из вариантов низкой концентрации. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения концентрация 1 мМ, 100 мкМ, 10 мкМ, 1 мкМ является такой концентрацией, при которой каждая антигенсвязывающая молекула по настоящему изобретению проявляет минимальную связывающую активность, или отсутствие низкомолекулярного соединения может быть выбрано в настоящем изобретении в качестве низкой концентрации. В другом варианте осуществления настоящего изобретения может быть выбрано соотношение высокой концентрации к низкой концентрации, например, составляющее трехкратную величину или больше, 10-кратную величину или больше, 30-кратную величину или больше, 100-кратную величину или больше, 300кратную величину или больше, 1х103-кратную величину или больше, 1х104-кратную величину или больше, 3х104-кратную величину или больше, 1х105-кратную величину или больше, 3х105-кратную величину или больше, 1х106-кратную величину или больше, 3х106-кратную величину или больше, 1х107кратную величину или больше, 3х107-кратную величину или больше, 1х 108-кратную величину или больше, 3х108-кратную величину или больше, 1х109-кратную величину или больше, 3х109-кратную величину или больше, 1х1010-кратную величину или больше, 3х1010-кратную величину или больше, 1х1011кратную величину или больше, 3х 10-кратную величину или больше, 1х1012-кратную величину или больше.The concentration of the small molecule compound may be arbitrarily selected as long as a difference in binding activity to the antigen binding molecule can be detected. In some embodiments of the present invention, a high concentration includes, for example, 1 nM or higher concentration, 3 nM or higher concentration, 10 nM or higher concentration, 30 nM or higher concentration, 100 nM or higher concentration, 300 nM or higher concentration, 1 µM or higher concentration, 3 µM or higher concentration, 10 µM or higher concentration, 30 µM or higher concentration, 100 µM or higher concentration, 300 µM or higher concentration, 1 mM or more high concentration, 3 mM or higher concentration, 10 mM or higher concentration, 30 mM or higher concentration, 100 mM or higher concentration, 300 mM or higher concentration, 1 M or higher concentration. In another embodiment of the present invention, the high concentration may be a concentration that provides a sufficient amount to allow each antigen binding molecule to exhibit maximum binding activity. In one embodiment of the present invention, 1 micromolar, 10 µM, 100 µM, 1 mM, or an amount sufficient for each antigen binding molecule to exhibit maximum binding activity may be selected as the high concentration in the present invention. In some embodiments of the present invention, the low concentration includes, for example, 1 mM or lower concentration, 300 μM or lower concentration, 100 μM or lower concentration, 30 μM or lower concentration, 10 μM or lower concentration, 3 μM or lower concentration, 1 µM or lower concentration, 300 nM or lower concentration, 100 nM or lower concentration, 30 nM or lower concentration, 10 nM or lower concentration, 3 nM or lower concentration, 1 nM or more low concentration, 300 pM or lower concentration, 100 pM or lower concentration, 30 pM or lower concentration, 10 pM or lower concentration, 3 pM or lower concentration, 1 pM or lower concentration, etc. Alternatively, the low concentration in the present invention may be the concentration at which each antigen binding molecule exhibits minimal binding activity. The case of virtually zero concentration (i.e., no low molecular weight compound) can be selected as one of the low concentration options. In one embodiment of the present invention, a concentration of 1 mM, 100 μM, 10 μM, 1 μM is a concentration at which each antigen binding molecule of the present invention exhibits minimal binding activity, or the absence of a small molecule compound may be selected as the low concentration in the present invention . In another embodiment of the present invention, the ratio of high concentration to low concentration may be selected, for example, three times or more, 10 times or more, 30 times or more, 100 times or more, 300 times or more, 1x10 3 times the value or more, 1x10 4 times the value or more, 3x10 4 times the value or more, 1x10 5 times the value or more, 3x10 5 times the value or more, 1x10 6 times the value or more, 3x10 6 -fold the value or more, 1x10 7 times the value or more, 3x10 7 times the value or more, 1x 108 times the value or more, 3x10 8 times the value or more, 1x10 9 times the value or more, 3x10 9 times the value or more, 1x10 10 times or more, 3x10 10 times or more, 1x10 11 times or more, 3x 10 times or more, 1x10 12 times or more.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению проявляют цитотоксичность в отношении клеток, экспрессирующих свои антигены. Когда клетка-мишень экспрессирует антиген на своей поверхности и антигенсвязывающая молекула по настоящему изобретению связывается с ним, клетка может быть повреждена. Повреждение клеток может быть таким повреждением, вызванным эффекторными клетками, например, антителозависимой клеточной цитотоксичностью (ADCC, antibody-dependent cellular cytotoxicity) и антителозависимым клеточным фагоцитозом (ADCP, antibody-dependent cellular phagocytosis), и могут быть такие повреждения, вызванные комплементом, как, например, комплемент-зависимая цитотоксичность (CDC, complementdependent cytotoxicity). В другом варианте повреждение может быть таким, как повреждения, вызванные цитотоксическим агентом (например, радиоизотопами или химиотерапевтическими агентами) в качестве иммуноконъюгатов. Цитотоксичность в настоящем изобретении может включать действия по индукции гибели клеток, действия по подавлению пролиферации клеток, действия по повреждению функций клеток и т.д. Цитотоксичность по настоящему изобретению может включать действия по индукции гибелиIn another embodiment of the present invention, the antigen-binding molecules of the present invention exhibit cytotoxicity against cells expressing their antigens. When a target cell expresses an antigen on its surface and the antigen-binding molecule of the present invention binds to it, the cell may be damaged. The cellular damage may be that caused by effector cells, such as antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) and antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP), and there may be complement-induced damage such as, for example, complement-dependent cytotoxicity (CDC, complementdependent cytotoxicity). In another embodiment, the damage may be such as damage caused by a cytotoxic agent (eg, radioisotopes or chemotherapeutic agents) as immunoconjugates. Cytotoxicity in the present invention may include actions to induce cell death, actions to inhibit cell proliferation, actions to damage cell functions, etc. The cytotoxicity of the present invention may include death inducing actions
- 89 046075 клеток, действия по подавлению пролиферации клеток, действия по повреждению функций клеток и т.д. В присутствии достаточного количества антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению повреждение может быть вызвано, например, 10% или более, 15% или более, 20% или более, 25% или более, 30% или более, 35% или более, 40% или более, 45% или более, 50% или более, 55% или более, 60% или более, 65% или более, 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90%, или более, или 95%, или более клеток, экспрессирующих антиген. Измерение такой цитотоксической активности может быть выполнено как сравнение с измерением в отсутствие антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению или в присутствии антигенсвязывающей молекулы отрицательного контроля. В настоящем изобретении представлены примеры анализов цитотоксичности.- 89 046075 cells, actions to suppress cell proliferation, actions to damage cell functions, etc. In the presence of a sufficient amount of the antigen binding molecule of the present invention, damage may be caused by, for example, 10% or more, 15% or more, 20% or more, 25% or more, 30% or more, 35% or more, 40% or more , 45% or more, 50% or more, 55% or more, 60% or more, 65% or more, 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90%, or more than 95% or more of the cells expressing the antigen. The measurement of such cytotoxic activity can be performed as a comparison with a measurement in the absence of an antigen binding molecule of the present invention or in the presence of a negative control antigen binding molecule. The present invention provides examples of cytotoxicity assays.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению проявляют нейтрализующую активность по отношению к своим антигенам. Нейтрализующая активность означает активность по нейтрализации (или ингибированию, блокированию) биологической активности, связанной с антигенами. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения биологическая активность обеспечивается связыванием между лигандом и рецептором. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению ингибируют такое связывание между лигандом и рецептором. В присутствии достаточного количества антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению биологическая активность может подавляться, например, на 10% или более, 15% или более, 20% или более, 25% или более, 30% или более, 35%. или более, 40% или более, 45% или более, 50% или более, 55% или более, 60% или более, 65% или более, 70% или более, 75% или более, 80% или более, 85% или более, 90% или более, или 95% или более. Измерение такой ингибирующей активности может быть выполнено как сравнение с измерением в отсутствие антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению или в присутствии антигенсвязывающей молекулы отрицательного контроля. В настоящем изобретении приводят конкретные методы измерения нейтрализующей активности.In another embodiment of the present invention, the antigen-binding molecules of the present invention exhibit neutralizing activity against their antigens. Neutralizing activity means the activity of neutralizing (or inhibiting, blocking) biological activity associated with antigens. In one embodiment of the present invention, the biological activity is provided by binding between the ligand and the receptor. In some embodiments of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention inhibit such binding between a ligand and a receptor. In the presence of a sufficient amount of the antigen binding molecule of the present invention, the biological activity can be inhibited, for example, by 10% or more, 15% or more, 20% or more, 25% or more, 30% or more, 35%. or more, 40% or more, 45% or more, 50% or more, 55% or more, 60% or more, 65% or more, 70% or more, 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, or 95% or more. The measurement of such inhibitory activity can be performed as a comparison with a measurement in the absence of an antigen binding molecule of the present invention or in the presence of a negative control antigen binding molecule. The present invention provides specific methods for measuring neutralizing activity.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению включают область Fc. В других вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению включают константную область. Постоянная область может быть константной областью тяжелой цепи (включающей область Fc), константной областью легкой цепи или и тем, и другим. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения область Fc является областью с нативной последовательностью. Примеры константной области тяжелой цепи, полученной из антител с нативной последовательностью, включают, например, константную область тяжелой цепи IgG1 человека (SEQ ID NO: 219), IgG2 человека (SEQ ID NO: 220), IgG3 человека (SEQ ID NO: 221), IgG4 человека (SEQ ID NO: 222) и т.п. Другие примеры константной области тяжелой цепи включают константные области тяжелой цепи, такие как SEQ ID NO: 215, SEQ ID NO: 217. Примеры константной области легкой цепи, полученной из антител с нативной последовательностью, включают, например, константные области легкой цепи каппа-цепи человека. (SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 199, SEQ ID NO: 218), лямбда-цепь человека (SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 216) и т.п.In another embodiment of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention include an Fc region. In other embodiments of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention include a constant region. The constant region may be a heavy chain constant region (including the Fc region), a light chain constant region, or both. In some embodiments of the present invention, the Fc region is a native sequence region. Examples of a heavy chain constant region derived from native sequence antibodies include, for example, human IgG1 heavy chain constant region (SEQ ID NO: 219), human IgG2 (SEQ ID NO: 220), human IgG3 (SEQ ID NO: 221) , human IgG4 (SEQ ID NO: 222), etc. Other examples of the heavy chain constant region include heavy chain constant regions such as SEQ ID NO: 215, SEQ ID NO: 217. Examples of the light chain constant region derived from native sequence antibodies include, for example, kappa chain light chain constant regions person. (SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 199, SEQ ID NO: 218), human lambda circuit (SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 216), etc.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения область Fc может быть вариантом области Fc, полученным путем введения аминокислотного изменения (изменений) в область Fc нативной последовательностью. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант области Fc обладает повышенной связывающей активностью по меньшей мере с одним гамма-рецептором Fc, выбранным из группы, состоящей из Fc гамма RIa, Fc гамма RIIa, Fc гамма RIIb и Fc гамма RIIIa, по сравнению с областью Fc с нативной последовательностью.In another embodiment of the present invention, the Fc region may be a variant Fc region obtained by introducing amino acid change(s) into the Fc region with a native sequence. In some embodiments of the present invention, the Fc region variant has increased binding activity to at least one Fc gamma receptor selected from the group consisting of Fc gamma RIa, Fc gamma RIIa, Fc gamma RIIb, and Fc gamma RIIIa, compared to the Fc region with the native sequence.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению являются антителами. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения, антитела представляют собой моноклональные антитела, включая химерные антитела, гуманизированные антитела или антитела человека. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения, антитела представляют собой фрагменты антител, например, Fv, Fab, Fab', scFv, диатела или фрагменты F(ab')2 и т.п. В другом варианте осуществления настоящего изобретения антитела представляют собой полноразмерные антитела, например, интактные антитела IgG1, интактные антитела IgG4 или другой класс или изотип антител, как описано в настоящем изобретении.In other embodiments of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention are antibodies. In some embodiments of the present invention, the antibodies are monoclonal antibodies, including chimeric antibodies, humanized antibodies, or human antibodies. In one embodiment of the present invention, the antibodies are antibody fragments, for example, Fv, Fab, Fab', scFv, diabodies or F(ab') 2 fragments, etc. In another embodiment of the present invention, the antibodies are full-length antibodies, for example, intact IgG1 antibodies, intact IgG4 antibodies, or another class or isotype of antibodies as described in the present invention.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению образуют тройной комплекс вместе с низкомолекулярным соединением и антигеном. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающими молекулами являются антитела. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению связываются с низкомолекулярным соединением через CDR1, CDR2, CDR3 тяжелой цепи. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению имеют связывающий мотив по отношению к низкомолекулярному соединению. Связывающий мотив к низкомолекулярному соединению получают, например, по меньшей мере, из одной аминокислоты, находящейся в положении 33, в положении 52, в положении 52а, в положении 53, в положении 55, в положении 56, в положении 58, в положении 95, в положении 96, в положении 98, в положении 100а, в положении 100b, в положении 100с по нумерацииIn another embodiment of the present invention, the antigen-binding molecules of the present invention form a ternary complex together with the small molecule compound and the antigen. In some embodiments of the present invention, the antigen binding molecules are antibodies. In one embodiment of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention bind to the small molecule compound via the heavy chain CDR1, CDR2, CDR3. In one embodiment of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention have a binding motif for a small molecule compound. The binding motif for a small molecule compound is derived, for example, from at least one amino acid located at position 33, at position 52, at position 52a, at position 53, at position 55, at position 56, at position 58, at position 95, in position 96, in position 98, in position 100a, in position 100b, in position 100c according to numbering
- 90 046075- 90 046075
Kabat. В других вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению связываются с низкомолекулярным соединением через, по меньшей мере, одну аминокислоту через группу, находящуюся в положении 33, в положении 52, в положении 52а, в положении 53, в положении 55, в положении 56, в положении 58, в положении 95, в положении 96, в положении 98, в положении 100а, в положении 100b, в положении 100с по нумерации Kabat Антиген может дополнительно связываться с комплексом, образованным в результате связывания антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению и низкомолекулярного соединения. Кроме того, низкомолекулярное соединение может присутствовать на границе взаимодействия между антигенсвязывающей молекулой и антигеном и может связываться с ними обоими. Образование тройного комплекса антигенсвязывающей молекулой по настоящему изобретению вместе с низкомолекулярным соединением и антигеном может быть подтверждено, например, кристаллографией, как описано ниже, или такими методами. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения низкомолекулярное соединение является соединением, содержащим аденозин.Kabat. In other embodiments of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention bind to a small molecule compound through at least one amino acid through a group located at position 33, at position 52, at position 52a, at position 53, at position 55, at position 56 , at position 58, at position 95, at position 96, at position 98, at position 100a, at position 100b, at position 100c according to Kabat numbering The antigen can further bind to a complex formed by the binding of an antigen-binding molecule of the present invention and a small molecule compound . In addition, the small molecule compound may be present at the interface between the antigen binding molecule and the antigen and may bind to both. Formation of a ternary complex by the antigen-binding molecule of the present invention together with the small molecule compound and the antigen can be confirmed, for example, by crystallography, as described below, or such methods. In some embodiments of the present invention, the small molecule compound is an adenosine-containing compound.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения низкомолекулярное соединение по настоящему изобретению представляет собой тканеспецифичное соединение-мишень. В других вариантах осуществления настоящего изобретения тканеспецифичное соединение-мишень представляет собой тканеспецифичное соединение опухоли. Типичные тканеспецифичные соединения-мишени и опухолевые тканеспецифические соединения описывают в настоящем изобретении (например, II. Композиции и методы (агонистические антигенсвязывающие молекулы против CD137), А. Типичные антигенсвязывающие молекулы или антитела против CD137, [Связывающая активность, зависящая от низкомолекулярных соединений]).In one embodiment of the present invention, the small molecule compound of the present invention is a tissue-specific target compound. In other embodiments of the present invention, the target tissue-specific compound is a tumor tissue-specific compound. Exemplary target tissue-specific compounds and tumor tissue-specific compounds are described in the present invention (eg, II. Compositions and Methods (Agonistic Antigen-Binding Molecules Against CD137), A. Exemplary Antigen-Binding Molecules or Antibodies against CD137, [Small Molecular Compound-Dependent Binding Activity]).
Б. Антиген.B. Antigen.
В настоящем изобретении антигены существенным образом не ограничиваются по своей структуре, при условии, что они содержат эпитопы, с которыми связываются антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению. Антигены могут быть неорганическими или органическими веществами. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения к примерам антигенов относятся: 17-IA, 41BB, 4Dc, 6-кето-PGF1a, 8-roo-PGF2a, 8-оксо-dG, рецептор аденозина A1, A33, АСЕ, АСЕ-2, активин, активин А, активин АВ, активин В, активин С, активин RIA, активин RIA ALK-2, активин RIB ALK-4, активин RIIA, активин RIIB, ADAM, ADAM10, ADAM12, ADAM15, ADAM17/TACE, ADAM8, ADAM9, ADAMTS, ADAMTS4, ADAMTS5, аддрессин, aFGF, ALCAM, ALK, ALK-1, ALK-7, альфа-1антитрипсин, антагонист альфа-У/бета-1, ANG, Ang, APAF-1, APE, APJ, APP, APRIL, AR, ARC, ART, артемин, анти-Id, ASPARTIC, предсердный натрийуретический пептид, av/b3 интегрин, Axl, Ь2М, В7-1, В7-2, В7-Н, фактор стимуляции В-лимфоцитов (BlyS), ВАСЕ, ВАСЕ-1, Bad, BAFF, BAFF-R, Bag-1, BAK, Вах, ВСА-1, ВСАМ, Bcl, BCMA, BDNF, b-ECGF, bFGF, BID, Bik, BIM, BLC, BL-CAM, BLK, BMP, BMP2 BMP-2a, BMP-3 остеогенин, BMP-4 BMP-2b, BMP-5, BMP-6 Vgr-1, BMP-7 (OP-1), BMP-8 (BMP-8a, OP2), BMPR, BMPR-IA (ALK-3), BMPR-IB (ALK-6), BRK-2, RPK-1, BMPR-II (BRK-3), BMP, b-NGF, BOK, бомбезин, костный нейротрофический фактор, BPDE, BPDE-ДНК, ВТС, фактор комплемента 3 (C3), C3а, С4, С5, С5а, C10, СА125, CAD-8, кальцитонин, цАМФ, карциноэмбриональный антиген (СЕА), рак связанный антиген, катепсин А, катепсин В, катепсин С/DPPI, катепсин D, катепсин Е, катепсин Н, катепсин L, катепсин О, катепсин S, катепсин V, катепсин X/Z/Р, CBL, CCI, CCK2, CCL, CCL1, CCL11, CCL12, CCL13, CCL14, CCL15, CCL16, CCL17, CCL18, CCL19, CCL2, CCL20, CCL21, CCL22, CCL23, CCL24, CCL25, CCL26, CCL27, CCL28, CCL3, CCL4, CCL5, CCL6, CCL7, CCL8, CCL9/10, CCR, CCR1, CCR10, CCR10, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CD1, CD2, CD3, CD3E, CD4, CD5, CD6, CD7, CD8, CD10, CD11a, CD11b, CD11c, CD13, CD14, CD15, CD16, CD18, CD19, CD20, CD21, CD22, CD23, CD25, CD27L, CD28, CD29, CD30, CD30L, CD32, CD33 (белок р67), CD34, CD38, CD40, CD40L, CD44, CD45, CD46, CD49a, CD52, CD54, CD55, CD56, CD61, CD64, CD66e, CD74, CD80 (В7-1), CD89, CD95, CD123, CD137, CD138, CD140a, CD146, CD147, CD148, CD152, CD164, CEACAM5, CFTR, cGMP, CINC, ботулиновый токсин, токсин Clostridium perfringens, CKb8-1, CLC, CMV, CMV UL, CNTF, CNTN1, COX, C-Ret, CRG-2, CT-1, CTACK, CTGF, CTLA-4, PD1, PDL1, LAG3, TIM3, галектин-9, CX3CL1, CX3CR1, CXCL, CXCL1, CXCL2, CXCL3, CXCL4, CXCL5, CXCL6, CXCL7, CXCL8, CXCL9, CXCL10, CXCL11, CXCL12, CXCL13, CXCL14, CXCL15, CXCL16, CXCR, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, цитокератин, ассоциированный с опухолью антиген, DAN, DCC, DcR3, DC-SIGN, регуляторный фактор комплемента (фактор ускорения распада), des (1-3)-IGF-I (IGF-1 мозга), Dhh, дигоксин, DNAM-1, Dnase, Dpp, DPPIV/CD26, Dtk, ECAD, EDA, EDA-A1, EDA-A2, EDAR, EGF, EGFR (ErbB-1), EMA, EMMPRIN, ENA рецептор эндотелина, энкефалиназа, eNOS, Eot, эотаксин 1, EpCAM, эфрин B2/EphB4, EPO, ERCC, Е-селектин, ЕТ-1, фактор IIa, фактор VII, фактор VIIIc, фактор IX, белок активации фибробластов (FAP), Fas, FcR1, FEN-1, ферритин, FGF, FGF-19, FGF-2, FGF-3, FGF-8, FGFR, FGFR3, фибрин, FL, FLIP, Flt-3, Flt-4, фолликул стимулирующий гормон, фракталкин, FZD1, FZD2, FZD3, FZD4, FZD5, FZD6, FZD7, FZD8, FZD9, FZD10, G250, Gas6, GCP-2, GCSF, GD2, GD3, GDF, GDF-1, GDF3 (Vgr-2), GDF-5 (BMP-14, CDMP-1), GDF-6 (BMP-13, CDMP-2), GDF-7 (BMP-12, CDMP-3), GDF-8 (миостатин), GDF-9, GDF-15 (MIC-1), GDNF, GDNF, GFAP, GFRa-1, GFR-альфа1, GFR-альфа2, GFRальфа3, GITR, глюкагон, Glut4, гликопротеин Ilb/IIIa (GPIIb/IIIa), GM-CSF, gp130, gp72, GrO, гормонIn the present invention, the antigens are not significantly limited in their structure, provided that they contain epitopes to which the antigen-binding molecules of the present invention bind. Antigens can be inorganic or organic substances. In some embodiments, examples of antigens include: 17-IA, 41BB, 4Dc, 6-keto-PGF1a, 8-roo-PGF2a, 8-oxo-dG, adenosine A1 receptor, A33, ACE, ACE-2, activin , activin A, activin AB, activin B, activin C, activin RIA, activin RIA ALK-2, activin RIB ALK-4, activin RIIA, activin RIIB, ADAM, ADAM10, ADAM12, ADAM15, ADAM17/TACE, ADAM8, ADAM9, ADAMTS, ADAMTS4, ADAMTS5, addressin, aFGF, ALCAM, ALK, ALK-1, ALK-7, alpha-1antitrypsin, alpha-U/beta-1 antagonist, ANG, Ang, APAF-1, APE, APJ, APP, APRIL , AR, ARC, ART, artemin, anti-Id, ASPARTIC, atrial natriuretic peptide, av/b3 integrin, Axl, b2M, B7-1, B7-2, B7-H, B-lymphocyte stimulating factor (BlyS), BACE , BACE-1, Bad, BAFF, BAFF-R, Bag-1, BAK, Bax, BSA-1, BCAM, Bcl, BCMA, BDNF, b-ECGF, bFGF, BID, Bik, BIM, BLC, BL-CAM , BLK, BMP, BMP2 BMP-2a, BMP-3 osteogenin, BMP-4 BMP-2b, BMP-5, BMP-6 Vgr-1, BMP-7 (OP-1), BMP-8 (BMP-8a, OP2), BMPR, BMPR-IA (ALK-3), BMPR-IB (ALK-6), BRK-2, RPK-1, BMPR-II (BRK-3), BMP, b-NGF, BOK, bombesin, bone neurotrophic factor, BPDE, BPDE-DNA, BTC, complement factor 3 (C3), C3a, C4, C5, C5a, C10, CA125, CAD-8, calcitonin, cAMP, carcinoembryonic antigen (CEA), cancer associated antigen, cathepsin A, cathepsin B, cathepsin C/DPPI, cathepsin D, cathepsin E, cathepsin H, cathepsin L, cathepsin O, cathepsin S, cathepsin V, cathepsin X/Z/P, CBL, CCI, CCK2, CCL, CCL1, CCL11, CCL12, CCL13, CCL14, CCL15, CCL16, CCL17, CCL18, CCL19, CCL2, CCL20, CCL21, CCL22, CCL23, CCL24, CCL25, CCL26, CCL27, CCL28, CCL3, CCL4, CCL5, CCL6, CCL7, CCL8, CCL9/ 10, CCR, CCR1, CCR10, CCR10, CCR2, CCR3, CCR4, CCR5, CCR6, CCR7, CCR8, CCR9, CD1, CD2, CD3, CD3E, CD4, CD5, CD6, CD7, CD8, CD10, CD11a, CD11b, CD11c, CD13, CD14, CD15, CD16, CD18, CD19, CD20, CD21, CD22, CD23, CD25, CD27L, CD28, CD29, CD30, CD30L, CD32, CD33 (p67 protein), CD34, CD38, CD40, CD40L, CD44, CD45, CD46, CD49a, CD52, CD54, CD55, CD56, CD61, CD64, CD66e, CD74, CD80 (B7-1), CD89, CD95, CD123, CD137, CD138, CD140a, CD146, CD147, CD148, CD152 , CD164, CEACAM5, CFTR, cGMP, CINC, botulinum toxin, Clostridium perfringens toxin, CKb8-1, CLC, CMV, CMV UL, CNTF, CNTN1, COX, C-Ret, CRG-2, CT-1, CTACK, CTGF , CTLA-4, PD1, PDL1, LAG3, TIM3, galectin-9, CX3CL1, CX3CR1, CXCL, CXCL1, CXCL2, CXCL3, CXCL4, CXCL5, CXCL6, CXCL7, CXCL8, CXCL9, CXCL10, CXCL11, CXCL12, CXCL13, CXCL14 , CXCL15, CXCL16, CXCR, CXCR1, CXCR2, CXCR3, CXCR4, CXCR5, CXCR6, cytokeratin, tumor associated antigen, DAN, DCC, DcR3, DC-SIGN, complement regulatory factor (decay accelerating factor), des (1-3 )-IGF-I (brain IGF-1), Dhh, digoxin, DNAM-1, Dnase, Dpp, DPPIV/CD26, Dtk, ECAD, EDA, EDA-A1, EDA-A2, EDAR, EGF, EGFR (ErbB- 1), EMA, EMMPRIN, ENA endothelin receptor, enkephalinase, eNOS, Eot, eotaxin 1, EpCAM, ephrin B2/EphB4, EPO, ERCC, E-selectin, ET-1, factor IIa, factor VII, factor VIIIc, factor IX , fibroblast activation protein (FAP), Fas, FcR1, FEN-1, ferritin, FGF, FGF-19, FGF-2, FGF-3, FGF-8, FGFR, FGFR3, fibrin, FL, FLIP, Flt-3, Flt-4, follicle stimulating hormone, fractalkine, FZD1, FZD2, FZD3, FZD4, FZD5, FZD6, FZD7, FZD8, FZD9, FZD10, G250, Gas6, GCP-2, GCSF, GD2, GD3, GDF, GDF-1, GDF3 (Vgr-2), GDF-5 (BMP-14, CDMP-1), GDF-6 (BMP-13, CDMP-2), GDF-7 (BMP-12, CDMP-3), GDF-8 ( myostatin), GDF-9, GDF-15 (MIC-1), GDNF, GDNF, GFAP, GFRa-1, GFR-alpha1, GFR-alpha2, GFRalpha3, GITR, glucagon, Glut4, glycoprotein Ilb/IIIa (GPIIb/IIIa ), GM-CSF, gp130, gp72, GrO, hormone
- 91 046075 высвобождения гормона роста, гаптен (NP-cap или NIP-cap), HB-EGF, НСС, гликопротеин оболочки gB HCMV, гликопротеин оболочки gH HCMV, UL HCMV, гематопоэтический фактор роста (HGF), Hep В gp120, гепараназа, Her2, Her2/neu (ErbB-2), Her3 (ErbB-3), Her4 (ErbB-4), гликопротеин gB вируса простого герпеса (HSV), гликопротеин gD HSV, HGFA, высокомолекулярный антиген, связанный с меланомой (HMW-MAA), HIV gp120, HIV IIIB gp 120 V3 петля, HLA, HLA-DR, HM1.24, HMFG РЕМ, HRG, Hrk, сердечный миозин человека, цитомегаловирус человека (HCMV), гормон роста человека (HGH), HVEM, I-309, IAP, ICAM, ICAM-1, ICAM-3, ICE, ICOS, IFNg, Ig, IgA receptor, IgE, IGF, IGFсвязывающий белок, IGF-1R, IGFBP, IGF-I, IGF-II, IL, IL-1, IL-1R, IL-2, IL-2R, IL-4, IL-4R, IL-5, IL-5R, IL-6, IL-6R, IL-8, IL-9, IL-10, IL-12, IL-13, IL-15, IL-18, IL-18R, IL-21, IL-23, IL-27, интерферон (INF)альфа, INF-бета, INF-гамма, ингибин, iNOS, цепь А инсулина, цепь В инсулина, инсулиноподобный фактор роста 1, интегрин альфа 2, интегрин альфа 3, интегрин альфа 4, интегрин альфа4/бета1, интегрин альфа4/бета7, интегрин альфа5 (альфа V), интегрин альфа5/бета1, интегрин альфа5/бета3, интегрин альфа6, интегрин бета1, интегрин бета2, интерферон гамма, IP-10, I-TAC, JE, калликреин 2, калликреин 5, калликреин 6, калликреин 11, калликреин 12, калликреин 14, калликреин 15, калликреин L1, калликреин L2, калликреин L3, калликреин, калликреин L3, калликреин фактор роста кератиноцитов (KGF), ламинин 5, LAMP, LAP, LAP (TGF-1), латентный TGF-1, латентный TGF-1 bp1, LBP, LDGF, LECT2, левша, антиген Lewis-Y, антиген Lewis-Y, LFA-1, LFA-3, Lfo, LIF, LIGHT, липопротеин, LIX, LKN, Lptn, L-селектин, LT-a, LT-b, LTB4, LTBP-1, поверхность легких, лютеинизирующий гормон, рецептор лимфотоксина бета, Мас-1, MAdCAM, MAG, MAP2, MARC, MCAM, MCAM, MCK-2, МСР, M-CSF, MDC, Mer, METALLOPROTEASES, MGDF receptor, MGMT, MHC (HLA-DR), MIF, MIG, MIP, MIP-1-альфа, MK, ММАС1, ММР, ММР-1, ММР-10, ММР-11, ММР-12, ММР-13, ММР-14, ММР-15, ММР-2, ММР-24, ММР-3, ММР-7, ММР-8, ММР-9, MPIF, Mpo, MSK, MSP, муцин (Muc1), MUC18, вещество, ингибирующее мюллериан, Mug, MuSK, NAIP, NAP, NCAD, N-C адгерин, NCA 90, NCAM, NCAM, неприлизин, нейротрофин-3, -4 или -6, нейротрофин, фактор роста нервов (NGF), NGFR, NGF-бета, nNOS, NO, NOS, Npn, NRG-3, NT, NTN, OB, OGG1, OPG, OPN, OSM, OX40L, OX40R, p150, p95, PADPr, паратироидный гормон, PARC, PARP, PBR, PBSF, PCAD, Р-кадгерин, PCNA, PDGF, PDGF, PDK-1, PECAM, РЕМ, PF4, pGe, PGF, PGI2, PGJ2, PIN, PLA2, щелочная фосфатаза плаценты (PLAP), P1GF, PLP, PP14, проинсулин, прорелаксин, белок С, PS, PSA, PSCA, простатоспецифический мембранный антиген (PSMA), PTEN, PTHrp, Ptk, PTN, R51, RANK, RANKL, RANTES, RANTES, цепь релаксина А, цепь релаксина В, ренин, респираторный синцитиальный вирус (RSV) F, RSV Fgp, Ret, ревматоидный фактор, RLIP76, RPA2, RSK, S100, SCF/KL, SDF-1, SERINE, сывороточный альбумин, sFRP-3, Shh, SIGIRR, SK-1, SLAM, SLPI, SMAC, SMDF, SMOH, SOD, SPARC, Stat, STEAP, STEAP-II, TACE, TACI, TAG-72 (опухольассоциированный гликопротеин-72), TARC, TCA-3, рецептор Т-клеток (например, рецептор Т-клеток альфа/бета), TdT, TECK, ТЕМ1, ТЕМ5, ТЕМ7, ТЕМ8, TERT, PLAP-подобная щелочная фосфатаза семенников, TfR, TGF, TGF-альфа, TGF-бета, TGF-бета Pan специфический, TGF-бета-RI (ALK-5), TGF-бетаRII, TGF-бета-RIIb, TGF-бета-RIII, TGF-бета1, TGF-бета2, TGF-бета3, TGF-бета4, TGF-бета5, тромбин, тимус Ck-1, тиреотропный гормон, Tie, TIMP, TIQ, тканевой фактор, TMEFF2, Tmpo, TMPRSS2, TNF, TNF-альфа, TNF-альфабета, И^-бета2, TNFc, TNF-RI, TNF-RII, TNFRSF10A (TRAIL R1 Apo-2, DR4), TNFRSF10B (TRAIL R2 DR5, KILLER, TRICK-2A, TRICK-B), TNFRSF10C (TRAIL R3 DcR1, LIT, TRID), TNFRSF10D (TRAIL R4 DcR2, TRUNDD), TNFRSF11A (RANK ODF R, TRANCE R), TNFRSF11B (OPG OCIF, TR1), TNFRSF12 (TWEAK R FN14), TNFRSF13B (TACI), TNFRSF13C (BAFF R), TNFRSF14 (HVEM ATAR, HveA, LIGHT R, TR2), TNFRSF16 (NGFR p75NTR), TNFRSF17 (BCMA), TNFRSF18 (GITR AITR), TNFRSF19 (TROY TAJ, TRADE), TNFRSF19L (RELT), TNFRSF1A (TNF RI CD120a, p5560), TNFRSF1B (TNF RII CD120b, p75-80), TNFRSF26 (TNFRH3), TNFRSF3 (LTbR TNF RIII, TNFC R), TNFRSF4 (OX40 ACT35, TXGP1 R), TNFRSF5 (CD40 p50), TNFRSF6 (Fas Apo-1, APT1, CD95), TNFRSF6B (DcR3 M68, TR6), TNFRSF7 (CD27), TNFRSF8 (CD30), TNFRSF9 (4-1BB CD137, ILA), TNFRSF21 (DR6), TNFRSF22 (DcTRAIL R2 TNFRH2), TNFRST23 (DcTRAIL R1 TNFRH1), TNFRSF25 (DR3 Apo-3, LARD, TR-3, TRAMP, WSL-1), TNFSF10 (TRAIL Apo-2 лиганд, TL2), TNFSF11 (TRANCE/RANK лиганд ODF, OPG лиганд), TNFSF12 (TWEAK Apo-3 лиганд, DR3 лиганд), TNFSF13 (APRIL TALL2), TNFSF13B (BAFF BLYS, TALL1, THANK, TNFSF20), TNFSF14 (LIGHT HVEM лиганд, LTg), TNFSF15 (TL1A/VEGI), TNFSF18 (GITR лиганд AITR лиганд, TL6), TNFSF1A (TNF-а конектин, DIF, TNFSF2), TNFSF1B (TNF-b LTa, TNFSF1), TNFSF3 (LTb TNFC, p33), TNFSF4 (OX40 лиганд gp34, TXGP1), TNFSF5 (CD40 лиганд CD154, gp39, HIGM1, IMD3, TRAP), TNFSF6 (Fas лиганд Apo-1 лиганд, АРТ1 лиганд), TNFSF7 (CD27 лиганд CD70), TNFSF8 (CD30 лиганд CD153), TNFSF9 (4-1BB лиганд CD137 лиганд), ТР-1, t-PA, Tpo, TRAIL, TRAIL R, TRAIL-R1, TRAIL-R2, TRANCE, рецептор трансферрина, TRF, Trk, TROP-2, TLR1 (Толл-подобный рецептор 1), TLR2, TLR3, TLR4, TLR5, TLR6, TLR7, TLR8, TLR9, TLR10, TSG, TSLP, опухоль-ассоциированный антиген CA125, опухольассоциированный антигенэкспрессирующий Lewis-Y ассоциированные углеводы, TWEAK, TXB2, Ung, uPAR, uPAR-1, урокиназа, VCAM, VCAM-1, VECAD, VE- кадгерин, VE- кадгерин -2, VEFGR-1 (flt-1), VEGF, VEGFR, VEGFR-3 (flt-4), VEGI, VIM, вирусный антиген, VLA, VLA-1, VLA-4, VNR интегрин, фактор фон Виллебранда, WIF-1, WNT1, WNT2, WNT2B/13, WNT3, WNT3A, WNT4, WNT5A, WNT5B, WNT6, WNT7A, WNT7B, WNT8A, WNT8B, WNT9A, WNT9A, WNT9B, WNT10A, WNT10B, WNT11, WNT16, XCL1,- 91 046075 growth hormone release, hapten (NP-cap or NIP-cap), HB-EGF, HCC, HCMV gB envelope glycoprotein, HCMV gH envelope glycoprotein, HCMV UL, hematopoietic growth factor (HGF), Hep B gp120, heparanase, Her2, Her2/neu (ErbB-2), Her3 (ErbB-3), Her4 (ErbB-4), herpes simplex virus (HSV) gB glycoprotein, HSV gD glycoprotein, HGFA, high molecular weight melanoma-associated antigen (HMW-MAA) ), HIV gp120, HIV IIIB gp 120 V3 loop, HLA, HLA-DR, HM1.24, HMFG PEM, HRG, Hrk, human cardiac myosin, human cytomegalovirus (HCMV), human growth hormone (HGH), HVEM, I- 309, IAP, ICAM, ICAM-1, ICAM-3, ICE, ICOS, IFNg, Ig, IgA receptor, IgE, IGF, IGF-binding protein, IGF-1R, IGFBP, IGF-I, IGF-II, IL, IL- 1, IL-1R, IL-2, IL-2R, IL-4, IL-4R, IL-5, IL-5R, IL-6, IL-6R, IL-8, IL-9, IL-10, IL-12, IL-13, IL-15, IL-18, IL-18R, IL-21, IL-23, IL-27, interferon (INF)alpha, INF-beta, INF-gamma, inhibin, iNOS, insulin chain A, insulin chain B, insulin-like growth factor 1, integrin alpha 2, integrin alpha 3, integrin alpha 4, integrin alpha4/beta1, integrin alpha4/beta7, integrin alpha5 (alpha V), integrin alpha5/beta1, integrin alpha5/ beta3, integrin alpha6, integrin beta1, integrin beta2, interferon gamma, IP-10, I-TAC, JE, kallikrein 2, kallikrein 5, kallikrein 6, kallikrein 11, kallikrein 12, kallikrein 14, kallikrein 15, kallikrein L1, kallikrein L2 , kallikrein L3, kallikrein, kallikrein L3, kallikrein keratinocyte growth factor (KGF), laminin 5, LAMP, LAP, LAP (TGF-1), latent TGF-1, latent TGF-1 bp1, LBP, LDGF, LECT2, left-handed, Lewis-Y antigen, Lewis-Y antigen, LFA-1, LFA-3, Lfo, LIF, LIGHT, lipoprotein, LIX, LKN, Lptn, L-selectin, LT-a, LT-b, LTB4, LTBP-1, lung surface, luteinizing hormone, lymphotoxin receptor beta, Mac-1, MAdCAM, MAG, MAP2, MARC, MCAM, MCAM, MCK-2, MCP, M-CSF, MDC, Mer, METALLOPROTEASES, MGDF receptor, MGMT, MHC (HLA -DR), MIF, MIG, MIP, MIP-1-alpha, MK, MMAS1, MMP, MMP-1, MMP-10, MMP-11, MMP-12, MMP-13, MMP-14, MMP-15, MMP-2, MMP-24, MMP-3, MMP-7, MMP-8, MMP-9, MPIF, Mpo, MSK, MSP, mucin (Muc1), MUC18, mullerian inhibitory substance, Mug, MuSK, NAIP, NAP, NCAD, N-C adherin, NCA 90, NCAM, NCAM, neprilysin, neurotrophin-3, -4 or -6, neurotrophin, nerve growth factor (NGF), NGFR, NGF-beta, nNOS, NO, NOS, Npn, NRG -3, NT, NTN, OB, OGG1, OPG, OPN, OSM, OX40L, OX40R, p150, p95, PADPr, parathyroid hormone, PARC, PARP, PBR, PBSF, PCAD, P-cadherin, PCNA, PDGF, PDGF, PDK-1, PECAM, PEM, PF4, pGe, PGF, PGI2, PGJ2, PIN, PLA2, placental alkaline phosphatase (PLAP), P1GF, PLP, PP14, proinsulin, prorelaxin, protein C, PS, PSA, PSCA, prostate-specific membrane antigen (PSMA), PTEN, PTHrp, Ptk, PTN, R51, RANK, RANKL, RANTES, RANTES, relaxin A chain, relaxin B chain, renin, respiratory syncytial virus (RSV) F, RSV Fgp, Ret, rheumatoid factor, RLIP76 , RPA2, RSK, S100, SCF/KL, SDF-1, SERINE, serum albumin, sFRP-3, Shh, SIGIRR, SK-1, SLAM, SLPI, SMAC, SMDF, SMOH, SOD, SPARC, Stat, STEAP, STEAP-II, TACE, TACI, TAG-72 (tumor-associated glycoprotein-72), TARC, TCA-3, T cell receptor (e.g. T cell receptor alpha/beta), TdT, TECK, TEM1, TEM5, TEM7, TEM8, TERT, PLAP-like testicular alkaline phosphatase, TfR, TGF, TGF-alpha, TGF-beta, TGF-beta Pan specific, TGF-beta-RI (ALK-5), TGF-betaRII, TGF-beta-RIIb, TGF-beta-RIII, TGF-beta1, TGF-beta2, TGF-beta3, TGF-beta4, TGF-beta5, thrombin, thymus Ck-1, thyroid-stimulating hormone, Tie, TIMP, TIQ, tissue factor, TMEFF2, Tmpo, TMPRSS2 , TNF, TNF-alpha, TNF-alphabeta, I^-beta2, TNFc, TNF-RI, TNF-RII, TNFRSF10A (TRAIL R1 Apo-2, DR4), TNFRSF10B (TRAIL R2 DR5, KILLER, TRICK-2A, TRICK -B), TNFRSF10C (TRAIL R3 DcR1, LIT, TRID), TNFRSF10D (TRAIL R4 DcR2, TRUNDD), TNFRSF11A (RANK ODF R, TRANCE R), TNFRSF11B (OPG OCIF, TR1), TNFRSF12 (TWEAK R FN14), TNFRSF13B (TACI), TNFRSF13C (BAFF R), TNFRSF14 (HVEM ATAR, HveA, LIGHT R, TR2), TNFRSF16 (NGFR p75NTR), TNFRSF17 (BCMA), TNFRSF18 (GITR AITR), TNFRSF19 (TROY TAJ, TRADE), TNFRSF19L ( RELT), TNFRSF1A (TNF RI CD120a, p5560), TNFRSF1B (TNF RII CD120b, p75-80), TNFRSF26 (TNFRH3), TNFRSF3 (LTbR TNF RIII, TNFC R), TNFRSF4 (OX40 ACT35, TXGP1 R), TNFRSF5 (CD40 p50), TNFRSF6 (Fas Apo-1, APT1, CD95), TNFRSF6B (DcR3 M68, TR6), TNFRSF7 (CD27), TNFRSF8 (CD30), TNFRSF9 (4-1BB CD137, ILA), TNFRSF21 (DR6), TNFRSF22 ( DcTRAIL R2 TNFRH2), TNFRST23 (DcTRAIL R1 TNFRH1), TNFRSF25 (DR3 Apo-3, LARD, TR-3, TRAMP, WSL-1), TNFSF10 (TRAIL Apo-2 ligand, TL2), TNFSF11 (TRANCE/RANK ODF ligand , OPG ligand), TNFSF12 (TWEAK Apo-3 ligand, DR3 ligand), TNFSF13 (APRIL TALL2), TNFSF13B (BAFF BLYS, TALL1, THANK, TNFSF20), TNFSF14 (LIGHT HVEM ligand, LTg), TNFSF15 (TL1A/VEGI) , TNFSF18 (GITR ligand AITR ligand, TL6), TNFSF1A (TNF-a connectin, DIF, TNFSF2), TNFSF1B (TNF-b LTa, TNFSF1), TNFSF3 (LTb TNFC, p33), TNFSF4 (OX40 ligand gp34, TXGP1), TNFSF5 (CD40 ligand CD154, gp39, HIGM1, IMD3, TRAP), TNFSF6 (Fas ligand Apo-1 ligand, ART1 ligand), TNFSF7 (CD27 ligand CD70), TNFSF8 (CD30 ligand CD153), TNFSF9 (4-1BB ligand CD137 ligand ), TR-1, t-PA, Tpo, TRAIL, TRAIL R, TRAIL-R1, TRAIL-R2, TRANCE, transferrin receptor, TRF, Trk, TROP-2, TLR1 (Toll-like receptor 1), TLR2, TLR3 , TLR4, TLR5, TLR6, TLR7, TLR8, TLR9, TLR10, TSG, TSLP, tumor-associated antigen CA125, tumor-associated antigen expressing Lewis-Y associated carbohydrates, TWEAK, TXB2, Ung, uPAR, uPAR-1, urokinase, VCAM, VCAM -1, VECAD, VE-cadherin, VE-cadherin-2, VEFGR-1 (flt-1), VEGF, VEGFR, VEGFR-3 (flt-4), VEGI, VIM, viral antigen, VLA, VLA-1, VLA-4, VNR integrin, von Willebrand factor, WIF-1, WNT1, WNT2, WNT2B/13, WNT3, WNT3A, WNT4, WNT5A, WNT5B, WNT6, WNT7A, WNT7B, WNT8A, WNT8B, WNT9A, WNT9A, WNT9B, WNT10A , WNT10B, WNT11, WNT16, XCL1,
- 92 046075- 92 046075
XCL2, XCR1, XCR1, XEDAR, XIAP, XPD, HMGB1, IgA, А бета, CD81, CD97, CD98, DDR1, DKK1, EREG, Hsp90, IL-17/IL-17R, IL-20/IL-20R, окисленный LDL, PCSK9, прекалликреин, RON, TMEM16F, SOD1, хромогранин А, хромогранин В, тау, VAP1, высокомолекулярный кининоген, IL-31, IL-31R, Nav1.1, Nav1.2, Nav1.3, Nav1.4, Nav1.5, Nav1.6, Nav1.7, Nav1.8, Nav1.9, EPCR, C1, C1q, C1r, C1s, C2, C2a, C2b, C3, C3a, C3b, C4, C4a, C4b, C5, C5a, C5b, C6, C7, C8, C9, фактор В, фактор D, фактор Н, пропердин, склеростин, фибриноген, фибрин, протромбин, тромбин, тканевой фактор, фактор V, фактор Va, фактор VII, фактор VIIa, фактор VIII, фактор VIIIa, фактор IX, фактор IXa, фактор X, фактор Ха, фактор XI, фактор XIa, фактор XII, фактор XIIa, фактор XIII, фактор XIIIa, TFPI, антитромбин III, EPCR, тромбомодулин, TAPI, tPA, плазминоген, плазмин, PAI-1, PAI-2, GPC3, синдекан-1, синдекан-2, синдекан-3, синдекан-4, LPA и S1P. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения примеры антигенов включают рецепторы гормонов и факторов роста. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенами являются те антигены, которые экспрессируются или секретируются клетками, присутствующими в опухолевых тканях (например, опухолевыми клетками, иммунными клетками, стромальными клетками или тому подобными).XCL2, XCR1, XCR1, XEDAR, XIAP, XPD, HMGB1, IgA, A beta, CD81, CD97, CD98, DDR1, DKK1, EREG, Hsp90, IL-17/IL-17R, IL-20/IL-20R, oxidized LDL, PCSK9, prekallikrein, RON, TMEM16F, SOD1, chromogranin A, chromogranin B, tau, VAP1, high molecular weight kininogen, IL-31, IL-31R, Nav1.1, Nav1.2, Nav1.3, Nav1.4, Nav1 .5, Nav1.6, Nav1.7, Nav1.8, Nav1.9, EPCR, C1, C1q, C1r, C1s, C2, C2a, C2b, C3, C3a, C3b, C4, C4a, C4b, C5, C5a , C5b, C6, C7, C8, C9, factor B, factor D, factor H, properdin, sclerostin, fibrinogen, fibrin, prothrombin, thrombin, tissue factor, factor V, factor Va, factor VII, factor VIIa, factor VIII, factor VIIIa, factor IX, factor IXa, factor X, factor Xa, factor XI, factor XIa, factor XII, factor XIIa, factor XIII, factor XIIIa, TFPI, antithrombin III, EPCR, thrombomodulin, TAPI, tPA, plasminogen, plasmin, PAI-1, PAI-2, GPC3, syndecan-1, syndecan-2, syndecan-3, syndecan-4, LPA and S1P. In some embodiments of the present invention, examples of antigens include hormone and growth factor receptors. In some embodiments of the present invention, antigens are those that are expressed or secreted by cells present in tumor tissues (eg, tumor cells, immune cells, stromal cells, or the like).
В. Активности, композиции и методы.B. Activities, compositions and methods.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения цитотоксическая активность по настоящему изобретению включает, например, активность антителозависимой клеточно-опосредованной цитотоксичности (ADCC), антителозависимый клеточный фагоцитоз (ADCP), комплемент-зависимую цитотоксичность (CDC) и цитотоксическую активность Т-клеток. Активность CDC относится к цитотоксической активности системы комплемента. С другой стороны, активность ADCC относится к активности повреждения клеток-мишеней через эффекторные клетки, что происходит, когда антигенсвязывающие молекулы связываются с антигенами, присутствующими на клеточной поверхности клетокмишеней, а эффекторные клетки дополнительно связываются с антигенсвязывающими молекулами. Обладает ли представляющая интерес антигенсвязывающая молекула активностью ADCC или имеет ли она активность CDC, можно определить с помощью известных методов (например, Current Protocols in Immunology, глава 7, 1993. Immunologic studies in humans, под ред. Coligan с соавт.).In one embodiment of the present invention, the cytotoxic activity of the present invention includes, for example, antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC) activity, antibody-dependent cellular phagocytosis (ADCP), complement-dependent cytotoxicity (CDC), and T-cell cytotoxicity activity. CDC activity refers to the cytotoxic activity of the complement system. On the other hand, ADCC activity refers to the activity of damaging target cells through effector cells, which occurs when antigen binding molecules bind to antigens present on the cell surface of target cells, and effector cells further bind to antigen binding molecules. Whether an antigen binding molecule of interest has ADCC activity or whether it has CDC activity can be determined using known methods (eg, Current Protocols in Immunology, Chapter 7, 1993. Immunologic studies in humans, ed. Coligan et al.).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения нейтрализующая активность в настоящем изобретении относится к активности антигенсвязывающей молекулы по ингибированию биологической активности посредством ее связывания с молекулой, участвующей в этой биологической активности. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения биологическая активность обеспечивается связыванием лиганда с рецептором. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула связывается с лигандом или рецептором, тем самым ингибируя связывание между лигандом и рецептором. Когда антигенсвязывающая молекула представляет собой антитело, антигенсвязывающая молекула, обладающая такой нейтрализующей активностью, называется нейтрализующим антителом. Нейтрализующая активность тестируемого вещества может быть измерена путем сравнения биологической активности в присутствии лиганда при условиях, когда тестируемое вещество присутствует или отсутствует.In one embodiment of the present invention, neutralizing activity in the present invention refers to the activity of an antigen binding molecule to inhibit a biological activity by binding to a molecule involved in that biological activity. In some embodiments of the present invention, biological activity is provided by binding of a ligand to a receptor. In some embodiments of the present invention, the antigen-binding molecule binds to a ligand or receptor, thereby inhibiting binding between the ligand and the receptor. When the antigen binding molecule is an antibody, the antigen binding molecule having such neutralizing activity is called a neutralizing antibody. The neutralizing activity of a test substance can be measured by comparing the biological activity in the presence of a ligand under conditions where the test substance is present or absent.
В одном варианте осуществления настоящее изобретение обеспечивает способы получения антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой изменяется в зависимости от концентрации соединения. Когда соединение представляет собой тканеспецифичное соединение-мишень, настоящее изобретение обеспечивает способы получения антигенсвязывающей молекулы, которая специфически проявляет свое действие в ткани-мишени. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения целевая ткань представляет собой опухолевую ткань. Когда соединение представляет собой соединение, специфичное для опухолевой ткани, настоящее изобретение предусматривает способы получения антигенсвязывающей молекулы для использования при лечении опухолей. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения эти способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии соединения отличается от ее антигенсвязывающей активности в отсутствие соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения эти способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии высокой концентрации соединения отличается от ее антигенсвязывающей активности в присутствии низкой концентрации соединения.In one embodiment, the present invention provides methods for producing an antigen-binding molecule whose antigen-binding activity varies depending on the concentration of the compound. When the compound is a tissue-specific target compound, the present invention provides methods for producing an antigen-binding molecule that specifically exerts its effect in the target tissue. In some embodiments of the present invention, the target tissue is tumor tissue. When the compound is a tumor tissue specific compound, the present invention provides methods for producing an antigen binding molecule for use in the treatment of tumors. In some embodiments of the present invention, these production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a compound is different from its antigen binding activity in the absence of the compound. In some embodiments of the present invention, these production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a high concentration of the compound is different from its antigen binding activity in the presence of a low concentration of the compound.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения эти методы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии высокой концентрации соединения отличается от ее антигенсвязывающей активности в присутствии низкой концентрации соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения эти методы получения включают стадии (а) получения антигенсвязывающей активности антигенсвязывающей молекулы в присутствии соединения, (б) получения антигенсвязывающей активности антигенсвязывающей молекулы в отсутствие соединение, и (в) выбор антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии соединения отличается от ее антигенсвязывающей активности в отсутствие соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения эти методы получения включают стадии (а) получения антигенсвязывающей активности антигенсвязывающей молекулы в присутствии высокой концентрации соединения, (б) получения антигенсвязывающей активностиIn some embodiments of the present invention, these production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a high concentration of the compound is different from its antigen binding activity in the presence of a low concentration of the compound. In some embodiments of the present invention, these production methods include the steps of (a) obtaining antigen binding activity of an antigen binding molecule in the presence of a compound, (b) obtaining antigen binding activity of an antigen binding molecule in the absence of a compound, and (c) selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a compound is different. on its antigen-binding activity in the absence of the compound. In some embodiments of the present invention, these production methods include the steps of (a) obtaining antigen binding activity of an antigen binding molecule in the presence of a high concentration of the compound, (b) obtaining antigen binding activity
- 93 046075 антигенсвязывающей молекулы при наличии низкой концентрации соединения, и (в) выбор антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии высокой концентрации соединения отличается от ее антигенсвязывающей активности в присутствии низкой концентрации соединения.- 93 046075 antigen binding molecule in the presence of a low concentration of the compound, and (c) selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a high concentration of the compound is different from its antigen binding activity in the presence of a low concentration of the compound.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают методы получения антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой увеличивается по мере того, как концентрация соединения становится выше. В другом варианте настоящее изобретение предусматривает способы получения антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой снижается по мере того, как концентрация соединения становится выше. Способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии соединения выше, чем ее антигенсвязывающая активность в отсутствие соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в отсутствие соединения ниже, чем ее антигенсвязывающая активность в присутствии соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в отсутствие соединения выше, чем ее антигенсвязывающая активность в присутствии соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии соединения ниже, чем ее антигенсвязывающая активность в отсутствие соединения. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии высокой концентрации соединения выше, чем ее антигенсвязывающая активность в присутствии низкой концентрации соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии низкой концентрации соединения ниже, чем ее антигенсвязывающая активность в присутствии высокой концентрации соединения. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии низкой концентрации соединения выше, чем ее антигенсвязывающая активность в присутствии высокой концентрации соединения. В другом варианте осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии высокой концентрации соединения ниже, чем ее антигенсвязывающая активность в присутствии низкой концентрации соединения.In another embodiment, the present invention provides methods for producing an antigen binding molecule whose antigen binding activity increases as the concentration of the compound becomes higher. In another embodiment, the present invention provides methods for producing an antigen-binding molecule whose antigen-binding activity decreases as the concentration of the compound becomes higher. The production methods include the step of selecting an antigen-binding molecule whose antigen-binding activity in the presence of the compound is higher than its antigen-binding activity in the absence of the compound. In another embodiment of the present invention, the production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the absence of the compound is lower than its antigen binding activity in the presence of the compound. In another embodiment of the present invention, the production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the absence of the compound is higher than its antigen binding activity in the presence of the compound. In another embodiment of the present invention, the production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a compound is lower than its antigen binding activity in the absence of the compound. In yet another embodiment of the present invention, the production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a high concentration of the compound is higher than its antigen binding activity in the presence of a low concentration of the compound. In another embodiment of the present invention, the production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a low concentration of the compound is lower than its antigen binding activity in the presence of a high concentration of the compound. In yet another embodiment of the present invention, the production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a low concentration of the compound is greater than its antigen binding activity in the presence of a high concentration of the compound. In another embodiment of the present invention, the production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a high concentration of the compound is lower than its antigen binding activity in the presence of a low concentration of the compound.
В одном из вариантов осуществления настоящее изобретение предусматривает способы получения антигенсвязывающей молекулы, обладающей высокой способностью удерживания в плазме. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию получения антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой увеличивается по мере того, как концентрация соединения становится выше. В других вариантах осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадии (а) получения антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой увеличивается по мере того, как концентрация соединения становится выше; и (б) измерения удерживающей способности в плазме антигенсвязывающей молекулы, полученной на этапе (а). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения соединение представляет собой целевое тканеспецифичное соединение. В других вариантах осуществления настоящего изобретения соединение представляет собой соединение, специфичное для опухолевой ткани. Определение того, обладает ли антигенсвязывающая молекула в настоящем изобретении высокой способностью удерживания в плазме, может быть выполнено путем сравнения с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения те антигенсвязывающие молекулы, антигенсвязывающая активность которых увеличивается по мере того, как концентрация целевого тканеспецифичного соединения становится выше, имеют более высокую способность удерживания в плазме по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации соединения, означает антигенсвязывающую молекулу, для которой разница в антигенсвязывающей активности в присутствии соединения и в отсутствие соединения меньше, например, в 2 раза или меньше, в 1,8 раз или меньше, в 1,5 раз или меньше, в 1,3 раз или меньше, в 1,2 раза или меньше или в 1,1 раза или меньше. С точки зрения сравнения, предпочтительно, чтобы антигенсвязывающая активность антигенсвязывающих молекул по настоящему изобретению и контрольных антигенсвязывающих молекул в присутствии достаточного количества соединения была по существу одинаковой.In one embodiment, the present invention provides methods for producing an antigen-binding molecule having high plasma retention. In some embodiments of the present invention, the production methods include the step of producing an antigen binding molecule whose antigen binding activity increases as the concentration of the compound becomes higher. In other embodiments of the present invention, the production methods include the steps of (a) producing an antigen-binding molecule whose antigen-binding activity increases as the concentration of the compound becomes higher; and (b) measuring the plasma retention capacity of the antigen-binding molecule obtained in step (a). In some embodiments of the present invention, the compound is a target tissue-specific compound. In other embodiments of the present invention, the compound is a compound specific for tumor tissue. Determination of whether the antigen binding molecule of the present invention has a high plasma retention capacity can be made by comparison with a control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, those antigen-binding molecules whose antigen-binding activity increases as the concentration of the target tissue-specific compound becomes higher have a higher plasma retention capacity compared to the control antigen-binding molecule. In one embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule does not have compound concentration dependent antigen binding activity. In some embodiments of the present invention, an antigen binding molecule that does not have compound concentration dependent antigen binding activity is an antigen binding molecule for which the difference in antigen binding activity in the presence of the compound and in the absence of the compound is less, for example, 2 times or less than 1. 8 times or less, 1.5 times or less, 1.3 times or less, 1.2 times or less, or 1.1 times or less. From a comparative point of view, it is preferable that the antigen binding activity of the antigen binding molecules of the present invention and the control antigen binding molecules in the presence of a sufficient amount of the compound is substantially the same.
В другом варианте осуществления настоящее изобретение обеспечивает способы получения антигенсвязывающей молекулы, имеющей низкую способность к накоплению антигена в плазме. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадию полученияIn another embodiment, the present invention provides methods for producing an antigen-binding molecule having a low ability to accumulate antigen in plasma. In some embodiments of the present invention, the production methods include the step of producing
- 94 046075 антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой увеличивается по мере того, как концентрация соединения становится выше. В других вариантах осуществления настоящего изобретения способы получения включают стадии (а) получения антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой увеличивается по мере того, как концентрация соединения становится выше; и (б) измерение способности к накоплению антигена в плазме для антигенсвязывающей молекулы, получаемой в пункте (а). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения соединение представляет собой целевое тканеспецифичное соединение. В других вариантах осуществления настоящего изобретения соединение представляет собой соединение, специфичное для опухолевой ткани. Определение того, обладает ли антигенсвязывающая молекула в настоящем изобретении низкой способностью к накоплению антигена в плазме, может быть выполнено путем сравнения с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения те антигенсвязывающие молекулы, антигенсвязывающая активность которых увеличивается по мере повышения концентрации целевого тканеспецифичного соединения, имеют более низкую способность к накоплению антигена в плазме по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации соединения, означает антигенсвязывающую молекулу, для которой разница в антигенсвязывающей активности в присутствии соединения и в отсутствие соединения меньше, например, в 2 раза или меньше, в 1,8 раз или меньше, в 1,5 раз или меньше, в 1,3 раза или меньше, в 1,2 раза или меньше или в 1,1 раза или меньше. С точки зрения сравнения, предпочтительно, чтобы антигенсвязывающая активность антигенсвязывающих молекул по настоящему изобретению и контрольных антигенсвязывающих молекул в присутствии достаточного количества соединения была по существу одинаковой.- 94 046075 antigen-binding molecule, the antigen-binding activity of which increases as the concentration of the compound becomes higher. In other embodiments of the present invention, the production methods include the steps of (a) producing an antigen-binding molecule whose antigen-binding activity increases as the concentration of the compound becomes higher; and (b) measuring the plasma antigen storage capacity of the antigen binding molecule obtained in (a). In some embodiments of the present invention, the compound is a target tissue-specific compound. In other embodiments of the present invention, the compound is a compound specific for tumor tissue. Determination of whether the antigen binding molecule of the present invention has a low ability to accumulate antigen in plasma can be made by comparison with a control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, those antigen-binding molecules whose antigen-binding activity increases as the concentration of the target tissue-specific compound increases have a lower ability to accumulate antigen in plasma compared to the control antigen-binding molecule. In one embodiment of the present invention, the control antigen binding molecule does not have compound concentration dependent antigen binding activity. In some embodiments of the present invention, an antigen binding molecule that does not have compound concentration dependent antigen binding activity is an antigen binding molecule for which the difference in antigen binding activity in the presence of the compound and in the absence of the compound is less, for example, 2 times or less than 1. 8 times or less, 1.5 times or less, 1.3 times or less, 1.2 times or less, or 1.1 times or less. From a comparative point of view, it is preferable that the antigen binding activity of the antigen binding molecules of the present invention and the control antigen binding molecules in the presence of a sufficient amount of the compound is substantially the same.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения для антигенсвязывающих молекул, получаемых способами по настоящему изобретению, разница в антигенсвязывающей активности, зависящей от концентрации соединения, больше, например, в два раза или более, в три раза или более, в пять раз или более, в 10 раз или более, в 20 раз или более, в 30 раз или более, в 50 раз или более, в 100 раз или более, в 200 раз или более, в 300 раз или более, в 500 раз или более, в 1000 раз или более, в 2000 раз или более, в 3000 раз или более, в 5000 раз или более, в 10000 раз или более, 20000 раз или более, 30000 раз или более, 50000 раз или более или в 100000 раз или более.In some embodiments of the present invention, for antigen binding molecules produced by the methods of the present invention, the difference in antigen binding activity as a function of the concentration of the compound is greater, for example, two times or more, three times or more, five times or more, 10 times times or more, 20 times or more, 30 times or more, 50 times or more, 100 times or more, 200 times or more, 300 times or more, 500 times or more, 1000 times or more more, 2000 times or more, 3000 times or more, 5000 times or more, 10000 times or more, 20000 times or more, 30000 times or more, 50000 times or more, or 100000 times or more.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая активность может быть выражена с помощью величины константы диссоциации (KD) или величины константы скорости диссоциации (kd). В другом варианте она может быть выражена с использованием количества антигена, связавшегося с антигенсвязывающей молекулой, как описано выше. В другом варианте осуществления настоящего изобретения цитотоксическая активность или нейтрализующая активность антигенсвязывающей молекулы может быть использована в качестве альтернативного индикатора антигенсвязывающей активности.In some embodiments of the present invention, antigen binding activity can be expressed using a dissociation constant (KD) value or a dissociation rate constant (kd) value. Alternatively, it may be expressed using the amount of antigen bound to the antigen binding molecule, as described above. In another embodiment of the present invention, the cytotoxic activity or neutralizing activity of an antigen binding molecule can be used as an alternative indicator of antigen binding activity.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения повышенная антигенсвязывающая активность составляет, например, величину KD 9х10-7 М или менее, 8х10-7 М или менее, 7х10-7 М или менее, 6х10-7 М или менее, 5х10-7 М или менее, 4х10-7 М или менее, 3х10-7 М или менее, 2х10-7 М или менее, 1х 10-7 М или менее, 9х10-8 М или менее, 8х10-8 М или менее, 7х10-8 М или менее, 6х10-8 М или менее, 5х10-8 М или менее, 4х10-8 М или менее, 3х10-8 М или менее, 2х10-8 М или менее, 1 х 10-8 М или менее, 9х10-9 М или менее, 8х10-9 М или менее, 7х10-9 М или менее, 6х10-9 М или менее, 5х10-9 М или менее, 4х10-9 М или менее, 3х10-9 М или менее, 2х10-9 М или менее, 1 х 10-9 М или менее, или, например, количество связанного антигена составляет 0,01 или более, 0,02 или более, 0,03 или более, 0,04 или более, 0,05 или более, 0,06 или более, 0,07 или более, 0,08 или более, 0,09 или более, 0,1 или более, 0,2 или более, 0,3 или более, 0,4 или более, 0,5 или более, 0,6 или более, 0,7 или более, 0,8 или более, 0,9 или более, 1 или более.In some embodiments of the present invention, the increased antigen binding activity is, for example, a KD value of 9x10 -7 M or less, 8x10 -7 M or less, 7x10 -7 M or less, 6x10 -7 M or less, 5x10 -7 M or less, 4x10 -7 M or less, 3x10 -7 M or less, 2x10 -7 M or less, 1x 10 -7 M or less, 9x10 -8 M or less, 8x10 -8 M or less, 7x10 -8 M or less, 6x10 -8 M or less, 5x10 -8 M or less, 4x10 -8 M or less, 3x10 -8 M or less, 2x10 -8 M or less, 1 x 10 -8 M or less, 9x10 -9 M or less , 8x10 -9 M or less, 7x10 -9 M or less, 6x10 -9 M or less, 5x10 -9 M or less, 4x10 -9 M or less, 3x10 -9 M or less, 2x10 -9 M or less, 1 x 10 -9 M or less, or, for example, the amount of bound antigen is 0.01 or more, 0.02 or more, 0.03 or more, 0.04 or more, 0.05 or more, 0.06 or more, 0.07 or more, 0.08 or more, 0.09 or more, 0.1 or more, 0.2 or more, 0.3 or more, 0.4 or more, 0.5 or more , 0.6 or more, 0.7 or more, 0.8 or more, 0.9 or more, 1 or more.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения пониженная антигенсвязывающая активность составляет, например, величину KD 1х 10-8 М или более, 2х10-8 М или более, 3х10-8 М или более, 4х10-8 М или более, 5х10-8 М или более, 6х10-8 М или более, 7х10-8 М или более, 8х10-8 М или более, 9х 10-8 М или более, 1х 10-7 М или более, 2х 10-7 М или более, 3х 10-7 М или более, 4х 10-7 М или более, 5х10-7 М или более, 6х10-7 М или более, 7х10-7 М или более, 8х10-7 М или более, 9х10-7 М или более, 1х 10-6 M или более, 2х10-6 М или более, 3х10-6 М или более, 4х10-6 М или более, 5х10-6 М или более, 6х10-6 М или более, 7х10-6 М или более, 8х10-6 М или более, 9х10-6 М или более, или, например, количество связанного антигена составляет 0,5 или менее, 0,4 или менее, 0,3 или менее, 0,2 или менее, 0,1 или менее, 0,09 или менее, 0,08 или менее, 0,07 или менее, 0,06 или менее, 0,05 или менее, 0,04 или менее, 0,03 или менее, 0,02 или менее, 0,01 или менее, 0,009 или менее, 0,008 или менее, 0,007 или менее, 0,006 или менее, 0,005 или менее, 0,004 или менее, 0,003 или менее, 0,002 или менее, 0,001 или менее.In some embodiments of the present invention, the reduced antigen binding activity is, for example, a KD value of 1x10 -8 M or more, 2x10 -8 M or more, 3x10 -8 M or more, 4x10 -8 M or more, 5x10 -8 M or more , 6x10 -8 M or more, 7x10 -8 M or more, 8x10 -8 M or more, 9x 10 -8 M or more, 1x 10 -7 M or more, 2x 10 -7 M or more, 3x 10 -7 M or more, 4x 10 -7 M or more, 5x10 -7 M or more, 6x10 -7 M or more, 7x10 -7 M or more, 8x10 -7 M or more, 9x10 -7 M or more, 1x 10 - 6 M or more, 2x10 -6 M or more, 3x10 -6 M or more, 4x10 -6 M or more, 5x10 -6 M or more, 6x10 -6 M or more, 7x10 -6 M or more, 8x10 -6 M or more, 9x10 -6 M or more, or, for example, the amount of bound antigen is 0.5 or less, 0.4 or less, 0.3 or less, 0.2 or less, 0.1 or less, 0 .09 or less, 0.08 or less, 0.07 or less, 0.06 or less, 0.05 or less, 0.04 or less, 0.03 or less, 0.02 or less, 0.01 or less, 0.009 or less, 0.008 or less, 0.007 or less, 0.006 or less, 0.005 or less, 0.004 or less, 0.003 or less, 0.002 or less, 0.001 or less.
Концентрация соединения может быть выбрана в широком диапазоне, при условии, что различие вThe concentration of the compound can be selected over a wide range, provided that the difference in
- 95 046075 связывающей активности для антигенсвязывающей молекулы может быть обнаружено. Примеры концентрации (высокой и низкой) представлены в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения к примерам высокой концентрации относятся, например, концентрация 1 мкМ или выше, концентрация 3 мкМ или выше, концентрация 10 мкМ или выше, концентрация 30 мкМ или выше, концентрация 100 мкМ или выше, концентрация 300 мкМ или выше, концентрация 1 мМ или выше. В другом варианте по настоящему изобретению высокая концентрация может быть такой концентрацией, которая обеспечивает достаточное количество, позволяющее каждой антигенсвязывающей молекуле проявить максимальную связывающую активность. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения примерами низких концентраций являются, например, концентрация 1 мМ или ниже, концентрация 300 мкМ или ниже, концентрация 100 мкМ или ниже, концентрация 30 мкМ или ниже, концентрация 10 мкМ или ниже, концентрация 3 мкМ или ниже, концентрация 1 мкМ или ниже. В другом варианте осуществления настоящего изобретения низкая концентрация может быть такой концентрацией, при которой каждая антигенсвязывающая молекула проявляет минимальную связывающую активность. Случай по существу нулевой концентрации (т.е. отсутствие соединения) может быть одним из вариантов низкой концентрации.- 95 046075 binding activity for an antigen binding molecule can be detected. Examples of concentration (high and low) are presented in the present invention. In some embodiments of the present invention, examples of high concentration include, for example, a concentration of 1 μM or higher, a concentration of 3 μM or higher, a concentration of 10 μM or higher, a concentration of 30 μM or higher, a concentration of 100 μM or higher, a concentration of 300 μM or higher, concentration 1 mM or higher. In another embodiment of the present invention, the high concentration may be a concentration that provides a sufficient amount to allow each antigen binding molecule to exhibit maximum binding activity. In some embodiments of the present invention, examples of low concentrations include, for example, a concentration of 1 mM or lower, a concentration of 300 μM or lower, a concentration of 100 μM or lower, a concentration of 30 μM or lower, a concentration of 10 μM or lower, a concentration of 3 μM or lower, a concentration 1 µM or lower. In another embodiment of the present invention, the low concentration may be the concentration at which each antigen binding molecule exhibits minimal binding activity. The case of essentially zero concentration (ie no compound) may be one of the low concentration cases.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения эти способы получения включают стадию выбора антигенсвязывающей молекулы, антигенсвязывающая активность которой в присутствии соединения отличается от ее антигенсвязывающей активности в отсутствие соединения, из библиотеки антигенсвязывающих молекул. Библиотека антигенсвязывающих молекул с может быть со свободным репертуаром антигенсвязывающих молекул (подбор молекул не подвергавшийся воздействию) или может быть с репертуаром определенным образом отобранных антигенсвязывающих молекул. К примерам библиотек такого типа относится библиотека антигенсвязывающих молекул, которым заранее придается связывающая активность с определенным соединением. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения библиотека антигенсвязывающих молекул представляет собой библиотеку антигенсвязывающих молекул, в которые вводят аминокислотные изменения для придания связывающей активности определенному соединению заранее. Примеры библиотек такого типа включают библиотеки, описанные, например, в WO 2015/083764.In another embodiment of the present invention, these production methods include the step of selecting an antigen binding molecule whose antigen binding activity in the presence of a compound is different from its antigen binding activity in the absence of the compound from a library of antigen binding molecules. A library of antigen-binding molecules can be a free repertoire of antigen-binding molecules (an unexposed selection of molecules) or can be a repertoire of specifically selected antigen-binding molecules. Examples of libraries of this type include a library of antigen-binding molecules that are pre-conditioned to bind to a particular compound. In some embodiments of the present invention, the library of antigen binding molecules is a library of antigen binding molecules into which amino acid changes are introduced to impart binding activity to a particular compound in advance. Examples of libraries of this type include those described, for example, in WO 2015/083764.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения способы получения дополнительно включают стадии (г), на которой получают нуклеиновую кислоту, которая кодирует антигенсвязывающую молекулу, выбранную на стадии (в), стадию (е) по введению нуклеиновой кислоты со стадии (г) в клетку-хозяина, и (е) культивирование клетка-хозяин по пункту (д), так что антигенсвязывающая молекула экспрессируется. Нуклеиновая кислота по п.(г) может быть одной или несколькими нуклеиновыми кислотами и может быть включена в один или несколько векторов (например, в вектор экспрессии). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения способы получения дополнительно включают стадию по п.(ж), на которой выделяют антигенсвязывающую молекулу из культуры клеток по п.(е).In some embodiments of the present invention, the production methods further comprise step (d) of producing a nucleic acid that encodes the antigen binding molecule selected in step (c), step (e) of introducing the nucleic acid from step (d) into a host cell , and (e) culturing the host cell as in (e) such that the antigen binding molecule is expressed. The nucleic acid of claim (d) may be one or more nucleic acids and may be included in one or more vectors (eg, an expression vector). In some embodiments of the present invention, the production methods further comprise the step of claim (g) of isolating the antigen binding molecule from the cell culture of claim (e).
Антигенсвязывающие молекулы, полученные способами получения по настоящему изобретению, также включены в настоящее изобретение.Antigen binding molecules produced by the production methods of the present invention are also included in the present invention.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают фармацевтические препараты, включающие антигенсвязывающую молекулу, предусмотренную в настоящем изобретении. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения вышеупомянутые фармацевтические препараты дополнительно содержат фармацевтически приемлемый носитель. В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают фармацевтические препараты для применения в лечении опухолей.In another embodiment, the present invention provides pharmaceutical preparations comprising an antigen binding molecule provided in the present invention. In one embodiment of the present invention, the aforementioned pharmaceutical preparations further comprise a pharmaceutically acceptable carrier. In other embodiments, the present invention provides pharmaceutical preparations for use in the treatment of tumors.
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают способы получения фармацевтического препарата, включающие смешивание антигенсвязывающеи молекулы по настоящему изобретению с фармацевтически приемлемым носителем. В других вариантах осуществления настоящего изобретения предусматривают способы получения фармацевтического препарата для лечения опухолей.In another embodiment, the present invention provides methods for preparing a pharmaceutical preparation comprising admixing an antigen binding molecule of the present invention with a pharmaceutically acceptable carrier. In other embodiments, the present invention provides methods for producing a pharmaceutical preparation for the treatment of tumors.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающую молекулу, которая при введении в живой организм проявляет более сильную антигенсвязывающую активность в опухолевой ткани, чем в неопухолевой ткани. Такую разницу в ответе необязательно наблюдать для каждой дозы антигенсвязывающей молекулы, и достаточно, чтобы разница наблюдалась для определенного диапазона доз. В другом варианте осуществления настоящего изобретения, клетки-мишени (клетки, экспрессирующие антиген) более сильно повреждаются в опухолевой ткани, чем в неопухолевой ткани. В другом варианте осуществления настоящего изобретения клеткимишени повреждаются при более низкой дозе в опухолевой ткани, чем в неопухолевой ткани. В другом варианте осуществления настоящего изобретения терапевтический эффект наблюдают при более низкой дозе, чем доза, при которой наблюдают побочный эффект. В настоящем изобретении терапевтический эффект представляет собой развитие противоопухолевого эффекта (например, регресс опухоли, индукция гибели опухолевых клеток или ингибирование пролиферации опухолевых клеток и т.д.), причем побочным эффектом является возникновение нежелательного явления в нормальных тканях (например, повреждение нормальных тканей).In one embodiment, the present invention provides an antigen-binding molecule that, when administered to a living organism, exhibits stronger antigen-binding activity in tumor tissue than in non-tumor tissue. Such a difference in response need not be observed for every dose of the antigen-binding molecule, but rather that the difference be observed over a certain dose range. In another embodiment of the present invention, target cells (cells expressing the antigen) are more severely damaged in tumor tissue than in non-tumor tissue. In another embodiment of the present invention, target cells are damaged at a lower dose in tumor tissue than in non-tumor tissue. In another embodiment of the present invention, the therapeutic effect is observed at a lower dose than the dose at which the side effect is observed. In the present invention, the therapeutic effect is the development of an antitumor effect (eg, tumor regression, induction of tumor cell death or inhibition of tumor cell proliferation, etc.), and the side effect is the occurrence of an undesirable phenomenon in normal tissues (eg, damage to normal tissues).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения степень эффективности лекарственIn one embodiment of the present invention, the degree of effectiveness of the drug
- 96 046075 ного средства, обеспечиваемого антигенсвязывающей молекулой, представленной в настоящем изобретении, различна в зависимости от того, обладает ли антигенсвязывающая молекула антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации соединения (т.е. изменяющейся в зависимости от концентрации соединения). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающие молекулы по настоящему изобретению представляют собой антигенсвязывающую молекулу, антигенсвязывающая активность которой увеличивается по мере того, как концентрация соединения становится выше. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения контрольная антигенсвязывающая молекула представляет собой антигенсвязывающую молекулу, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации соединения. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения соединение представляет собой соединение, специфичное для опухолевой ткани. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения антигенсвязывающая молекула, которая не обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от концентрации соединения, означает антигенсвязывающую молекулу, для которой разница в антигенсвязывающей активности в присутствии соединения и в отсутствие соединения, например, отличается в 2 раза или меньше, в 1,8 раза или меньше, в 1,5 раза или меньше, в 1,3 раза или меньше, в 1,2 раза или меньше, или в 1,1 раза или меньше. Предпочтительно, чтобы антигенсвязывающая активность антигенсвязывающих молекул по настоящему изобретению и контрольных антигенсвязывающих молекул в присутствии достаточного количества соединения была по существу одинаковой.- 96 046075 The effective agent provided by the antigen binding molecule of the present invention is different depending on whether the antigen binding molecule has compound concentration dependent (ie, varying with compound concentration) antigen binding activity. In some embodiments of the present invention, the antigen binding molecules of the present invention are an antigen binding molecule whose antigen binding activity increases as the concentration of the compound becomes higher. In some embodiments of the present invention, the control antigen binding molecule is an antigen binding molecule that does not have compound concentration dependent antigen binding activity. In some embodiments of the present invention, the compound is a tumor tissue-specific compound. In some embodiments of the present invention, an antigen binding molecule that does not have compound concentration dependent antigen binding activity is an antigen binding molecule for which the difference in antigen binding activity in the presence of the compound and in the absence of the compound is, for example, a factor of 2 or less than 1. 8 times or less, 1.5 times or less, 1.3 times or less, 1.2 times or less, or 1.1 times or less. Preferably, the antigen binding activity of the antigen binding molecules of the present invention and the control antigen binding molecules in the presence of a sufficient amount of the compound is substantially the same.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения для антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению и контрольной антигенсвязывающей молекулы вызываемые ими эффекты лекарственного средства различны. В еще одном из вариантов осуществления настоящего изобретения эффекты в качестве лекарственного средства различны в тканях, где концентрация соединения низкая. Примеры ткани с низкой концентрацией соединения включают неопухолевые ткани, такие как нормальные ткани. Антигенсвязывающая молекула может быть представлена в виде фармацевтического препарата, содержащего антигенсвязывающую молекулу. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией соединения антигенсвязывающая молекула настоящего изобретения имеет пониженную активность по повреждению клетки-мишени (клетки, экспрессирующей антиген) по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией соединения антигенсвязывающая молекула по настоящему изобретению требует более высокой дозы для повреждения клетки по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией соединения антигенсвязывающая молекула настоящего изобретения демонстрирует пониженный уровень побочного эффекта по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с низкой концентрацией соединения доза, при которой наблюдают побочный эффект, выше для антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению по сравнению с контрольной антигенсвязывающей молекулой. Эти различия в ответе необязательно наблюдают для каждой ткани (например, для всех тканей, демонстрирующих низкую концентрацию соединения), и достаточно, чтобы различия наблюдались для некоторых тканей. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения побочный эффект является нежелательным явлением в нормальных тканях (например, повреждение нормальных тканей).In one embodiment of the present invention, the antigen binding molecule of the present invention and the control antigen binding molecule have different drug effects. In yet another embodiment of the present invention, the drug effects are different in tissues where the concentration of the compound is low. Examples of tissue with low concentrations of the compound include non-tumor tissues such as normal tissues. The antigen binding molecule may be presented in the form of a pharmaceutical preparation containing the antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of the compound, the antigen binding molecule of the present invention has reduced activity to damage a target cell (cell expressing the antigen) compared to a control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of the compound, the antigen binding molecule of the present invention requires a higher dose to damage the cell compared to the control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of the compound, the antigen binding molecule of the present invention exhibits a reduced level of side effect compared to a control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a low concentration of the compound, the dose at which a side effect is observed is higher for the antigen binding molecule of the present invention compared to the control antigen binding molecule. These differences in response are not necessarily observed for every tissue (eg, for all tissues exhibiting a low concentration of the compound), but rather for differences to be observed for some tissues. In some embodiments of the present invention, the side effect is an undesirable event in normal tissue (eg, damage to normal tissue).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения для антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению и контрольной антигенсвязывающей молекулы эффекты, вызываемые лекарственным средством, по существу одинаковы. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения эффекты в качестве лекарственного средства практически такие же в ткани, где концентрация соединения высока. Примеры ткани с высокой концентрацией соединения включают опухолевую ткань. Антигенсвязывающая молекула может быть представлена в виде фармацевтического препарата, содержащего антигенсвязывающую молекулу. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией соединения активность повреждения клетки-мишени (клетки, экспрессирующей антиген) по существу одинакова для антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению и контрольной антигенсвязывающей молекулы. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией соединения доза, необходимая для повреждения клетки, по существу одинакова для антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению и контрольной антигенсвязывающей молекулы. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией соединения уровень проявления терапевтического эффекта по существу одинаков для антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению и контрольной антигенсвязывающей молекулы. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения в ткани с высокой концентрацией соединения доза, при которой наблюдают терапевтический эффект, по существу одинакова для антигенсвязывающей молекулы по настоящему изобретению и контрольной антигенсвязывающей молекулы. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения терапевтический эффект представляет противоопухолевый эффект (например, регресс опухоли, индукцию гибели опухолевых клеток или ингибирование пролиферации опухолевых клеток и т.д.).In one embodiment of the present invention, the drug effects of the antigen binding molecule of the present invention and the control antigen binding molecule are substantially the same. In some embodiments of the present invention, the effects as a drug are substantially the same in tissue where the concentration of the compound is high. Examples of tissue with high concentrations of the compound include tumor tissue. The antigen binding molecule may be presented in the form of a pharmaceutical preparation containing the antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a high concentration of the compound, the activity of damaging the target cell (the cell expressing the antigen) is essentially the same for the antigen binding molecule of the present invention and the control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a high concentration of the compound, the dose required to damage the cell is substantially the same for the antigen binding molecule of the present invention and the control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a high concentration of the compound, the level of therapeutic effect is substantially the same for the antigen binding molecule of the present invention and the control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, in tissue with a high concentration of the compound, the dose at which a therapeutic effect is observed is substantially the same for the antigen binding molecule of the present invention and the control antigen binding molecule. In some embodiments of the present invention, the therapeutic effect is an antitumor effect (eg, tumor regression, induction of tumor cell death, or inhibition of tumor cell proliferation, etc.).
В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающуюIn another embodiment, the present invention provides an antigen-binding
- 97 046075 молекулу для использования в качестве лекарственного средства. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают антигенсвязывающую молекулу для использования при лечении опухоли. В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают использование антигенсвязывающей молекулы при получении лекарственного средства. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают использование антигенсвязывающей молекулы для лечения опухоли. В дополнительном варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают способ лечения опухоли, включающий введение эффективного количества антигенсвязывающей молекулы индивиду с опухолью. Индивидом по любому из указанных выше вариантов осуществления настоящего изобретения предпочтительно является человек.- 97 046075 molecule for use as a medicine. In yet another embodiment, the present invention provides an antigen binding molecule for use in the treatment of a tumor. In another embodiment, the present invention provides for the use of an antigen binding molecule in the preparation of a medicament. In yet another embodiment, the present invention provides for the use of an antigen binding molecule to treat a tumor. In a further embodiment, the present invention provides a method of treating a tumor, comprising administering an effective amount of an antigen binding molecule to an individual with a tumor. The individual according to any of the above embodiments of the present invention is preferably a human.
Методы измерения концентрации АТФ В другом варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают методы измерения концентрации АТФ в растворе. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вышеупомянутые методы включают стадии (а) контактирования расщепленной клетки Luc/HEK293, экспрессирующей рецептор P2Y, с раствором и (б) измерение активности люциферазы в клетке. Рецептор P2Y представляет собой рецептор на клеточной поверхности и семимембранный, связанный с G-белком (GPCR) рецептор, эндогенным лигандом которого являются внеклеточные пуриновые нуклеотиды (АТФ, АДФ), пиримидиновые нуклеотиды (УТФ, УДФ), сахара нуклеотидов и т.д. В других вариантах осуществления настоящего изобретения рецептором P2Y является P2Y1 (номер в каталоге U42029), P2Y2 (номер в каталоге U07225), P2Y4 (номер в каталоге Х91852), P2Y6 (номер в каталоге Х97058), P2Y11 (номер в каталоге AF030335), P2Y12 (номер в каталоге AJ320495), P2Y13 (номер в каталоге AF295368) или P2Y14 (номер в каталоге D13626). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения рецептором P2Y является P2Y11 (номер в каталоге AF030335). Расщепленные клетки Luc/HEK293 представляют собой рекомбинантные клетки, полученные с использованием технологии расщепленной люциферазы, принадлежащей ProbeX (Misawa с соавт., Anal. Chem., 82, 2010, 25522560), и экспрессирует следующие два белка: (i) слитый белок, в котором С-концевой фрагмент из двух фрагментов молекулы люциферазы, разделенной на два, присоединен к С-концу рецептора P2Y, и (ii) слитый белок, в котором N-концевой фрагмент из двух фрагментов молекулы люциферазы, разделенной на два, присоединены к N-концу бета-аррестина (номер в каталоге NM_004313).Methods for Measuring ATP Concentration In another embodiment, the present invention provides methods for measuring the concentration of ATP in a solution. In some embodiments of the present invention, the above methods include the steps of (a) contacting a split Luc/HEK293 cell expressing the P2Y receptor with a solution and (b) measuring luciferase activity in the cell. The P2Y receptor is a cell surface receptor and seven-membrane G protein-coupled receptor (GPCR) whose endogenous ligands are extracellular purine nucleotides (ATP, ADP), pyrimidine nucleotides (UTP, UDP), sugar nucleotides, etc. In other embodiments of the present invention, the P2Y receptor is P2Y1 (catalog number U42029), P2Y2 (catalog number U07225), P2Y4 (catalog number X91852), P2Y6 (catalog number X97058), P2Y11 (catalog number AF030335), P2Y12 (part number AJ320495), P2Y13 (part number AF295368) or P2Y14 (part number D13626). In some embodiments of the present invention, the P2Y receptor is P2Y11 (catalog number AF030335). Luc/HEK293 split cells are recombinant cells produced using split-luciferase technology owned by ProbeX (Misawa et al., Anal. Chem., 82, 2010, 25522560) and express the following two proteins: (i) a fusion protein, in in which the C-terminal fragment of two fragments of a halved luciferase molecule is attached to the C-terminus of the P2Y receptor, and (ii) a fusion protein in which the N-terminal fragment of two fragments of a halved luciferase molecule is attached to an N- end of beta-arrestin (catalog number NM_004313).
Когда АТФ добавляют к расщепленным клеткам Luc/HEK293, экспрессирующим рецептор P2Y, взаимодействие между рецептором P2Y и бета-аррестином происходит в непосредственной близости от клеточной мембраны, и в результате фрагменты расщепленной люциферазы связываются, чтобы восстановить активную молекулу люциферазы внутри клетки. Активность люциферазы можно измерить с использованием субстрата люциферазы, такого как, например, люциферина. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вышеописанные способы дополнительно включают стадию контактирования клетки с раствором, содержащим субстрат люциферазы. Раствор, содержащий субстрат люциферазы, может контактировать с клеткой до стадии (а) или после стадии (а).When ATP is added to cleaved Luc/HEK293 cells expressing the P2Y receptor, interaction between the P2Y receptor and beta-arrestin occurs in close proximity to the cell membrane, and as a result, fragments of cleaved luciferase bind to restore the active luciferase molecule inside the cell. Luciferase activity can be measured using a luciferase substrate such as, for example, luciferin. In some embodiments of the present invention, the methods described above further include the step of contacting the cell with a solution containing a luciferase substrate. The solution containing the luciferase substrate may contact the cell before step (a) or after step (a).
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения раствор, для которого измеряют концентрацию АТФ, может быть раствором in vitro или жидкостью организма в ткани in vivo. В других вариантах осуществления настоящего изобретения жидкость организма может быть выбрана из группы, состоящей из крови, лимфатической жидкости, тканевой жидкости (межтканевой жидкости, межклеточной жидкости, интерстициальной жидкости), жидкости полости тела (жидкости серозной полости, плевральной жидкости, асцитной жидкости, перикардиальной жидкости), спинномозговой жидкости, суставной жидкости (синовиальной жидкости) и внутриглазной жидкости. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения жидкость тела является межклеточной жидкостью. В другом варианте осуществления настоящего изобретения ткань может быть здоровой тканью/нормальной тканью и может быть болезненной тканью (например, опухолевой тканью). В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения когда описанными выше способами измеряют концентрацию АТФ в жидкости тела в ткани in vivo, этап (i) может быть этапом трансплантации расщепленной клетки Luc/HEK293, экспрессирующей рецептор P2Y, в ткань in vivo.In some embodiments of the present invention, the solution for which the ATP concentration is measured may be an in vitro solution or a body fluid in tissue in vivo. In other embodiments of the present invention, the body fluid may be selected from the group consisting of blood, lymph fluid, tissue fluid (interstitial fluid, interstitial fluid, interstitial fluid), body cavity fluid (serous cavity fluid, pleural fluid, ascites fluid, pericardial fluid ), cerebrospinal fluid, joint fluid (synovial fluid) and intraocular fluid. In some embodiments of the present invention, the body fluid is an intercellular fluid. In another embodiment of the present invention, the tissue may be healthy tissue/normal tissue and may be diseased tissue (eg, tumor tissue). In one embodiment of the present invention, when the concentration of ATP in body fluid in tissue in vivo is measured by the methods described above, step (i) may be the step of transplanting a cleaved Luc/HEK293 cell expressing the P2Y receptor into the tissue in vivo.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения люциферазную активность можно измерить, фиксируя свет, излучаемый, когда люцифераза реагирует со своим субстратом, таким как люциферин. В случае, если раствор представляет собой раствор in vitro, такое свечение может быть измерено с использованием устройства для обнаружения люминесценции, такого как планшет-ридер. В случае, если раствор представляет собой жидкость организма в ткани in vivo, люминесценцию можно измерить с использованием устройства формирования изображения люминесценции in vivo и т.п. Количественная оценка на основе измерений может быть проведена методами, известными в данной области, например, путем измерения растворов, содержащих известную концентрацию АТФ, и построения калибровочной кривой, показывающей корреляцию между концентрацией АТФ и интенсивностью люминесценции.In some embodiments of the present invention, luciferase activity can be measured by detecting the light emitted when the luciferase reacts with its substrate, such as luciferin. In case the solution is an in vitro solution, such luminescence can be measured using a luminescence detection device such as a plate reader. In case the solution is a body fluid in tissue in vivo, the luminescence can be measured using an in vivo luminescence imaging apparatus or the like. Measurement-based quantification can be accomplished by methods known in the art, for example, by measuring solutions containing a known concentration of ATP and constructing a calibration curve showing the correlation between ATP concentration and luminescence intensity.
V. Способы скрининга.V. Screening methods.
(1) Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от молекулярного соединения, с использованием поливалентных антигенов.(1) A method for screening an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has a molecular compound dependent antigen binding activity using multivalent antigens.
В одном варианте осуществления настоящего изобретения предусматривают способ высокоэффекIn one embodiment, the present invention provides a method for highly efficient
- 98 046075 тивного и высокоточного скрининга, идентификации и получения антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от молекулярного соединения, с использованием слитой молекулы, полученной путем слияния двух или более молекул (двух или более единиц) антигена с одной молекулой (одной единицей) молекулы-партнера слияния.- 98 046075 active and high-precision screening, identification and production of an antigen-binding domain or an antigen-binding molecule that has molecular compound-dependent antigen-binding activity, using a fusion molecule obtained by fusing two or more molecules (two or more units) of an antigen with one molecule ( one unit) of the fusion partner molecule.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению, способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от молекулярного соединения, включает:In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, a method of screening for an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has a molecular compound dependent antigen binding activity includes:
(а) контактирование, в присутствии низкомолекулярного соединения, антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы или библиотеки антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул со слитой молекулой, в которой две или более единиц антигена слиты с одной единицей партнера по слиянию, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном в составе слитой молекулы на стадии (а), в отсутствие или в присутствии низкой концентрации соединения, и (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированной на стадии (б).(a) contacting, in the presence of a small molecule compound, an antigen binding domain or an antigen binding molecule or a library of antigen binding domains or antigen binding molecules with a fusion molecule in which two or more units of an antigen are fused to one unit of a fusion partner, (b) placing an antigen binding domain or an antigen binding molecule associated with the antigen in the fusion molecule in step (a), in the absence or presence of a low concentration of the compound, and (c) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению молекула-партнер слияния, с которой слиты две или более молекул (две или более единиц) антигена, представляет собой димерную область Fc.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the fusion partner molecule to which two or more antigen molecules (two or more units) are fused is a dimeric Fc region.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению область Fc включает первую субъединицу Fc и вторую субъединицу Fc, и один антиген слит как с первой, так и со второй субъединицей Fc.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the Fc region includes a first Fc subunit and a second Fc subunit, and one antigen is fused to both the first and second Fc subunit.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению один из антигенов слит с N-концом как первой, так и второй субъединиц Fc.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, one of the antigens is fused to the N-terminus of both the first and second Fc subunits.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению библиотека антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул представляет собой фаговую библиотеку.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the library of antigen binding domains or antigen binding molecules is a phage library.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению фаги, включенные в фаговую библиотеку, являются фагами, имеющими на своей поверхности два или более антигенсвязывающих домена или антигенсвязывающие молекулы.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the phages included in the phage library are phages having two or more antigen binding domains or antigen binding molecules on their surface.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению фаги, включенные в фаговую библиотеку, являются фагами, имеющими дефект в гене pIII, производном от фага-помощника.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the phages included in the phage library are phages having a defect in the helper phage-derived pIII gene.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению антиген может быть любым антигеном, как описано выше, и примеры могут включать различные типы антигенов, описанные в разделе IV. Композиции и способы (антигенсвязывающие молекулы, связывающая активность которых с антигенами изменяется в зависимости от концентрации низкомолекулярного соединения), Б. Антиген. В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в качестве антигена предпочтительно могут быть предоставлены антигены мембранного типа (например, костимулирующие молекулы, такие как CD137, CTLA4, CD40, ОХ40, RANK, GITR и ICOS).In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the antigen may be any antigen as described above, and examples may include the various types of antigens described in section IV. Compositions and methods (antigen-binding molecules, the binding activity of which to antigens varies depending on the concentration of the low-molecular compound), B. Antigen. In one embodiment of the present invention, the antigen may preferably be membrane-type antigens (eg, co-stimulatory molecules such as CD137, CTLA4, CD40, OX40, RANK, GITR and ICOS).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению слияние области Fc (субъединицы Fc) и антигена может быть получено обычным методом с использованием технологии генетической рекомбинации, как описано выше.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the fusion of an Fc region (Fc subunit) and an antigen can be produced by a conventional method using genetic recombination technology as described above.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению предусматривают в качестве низкомолекулярного соединения различные соединения, как описано выше (например, соединения, специфичные для опухолевой ткани, такие как нуклеозиды, имеющие структуру пуринового кольца, такие как аденозин (ADO), аденозинтрифосфат (АТР), аденозиндифосфат (ADP), аденозинмонофосфат (AMP), инозин, а также коммерчески доступный АДФ-бета-S (фирма Sigma); аминокислоты, такие как аланин, глутаминовая кислота и аспарагиновая кислота; метаболиты аминокислот, такие как кинуренин, антраниловая кислота, 3-гидроксикинуренин и кинуреновая кислота; метаболиты арахидоновой кислоты, такие как простагландин Е2; первичные метаболиты гликолитического пути или цикла Кребса, такие как молочная кислота, янтарная кислота и лимонная кислота; и метаболиты никотинамида, такие как 1-метилникотинамид), могут применяться.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention provides as a small molecule compound various compounds as described above (for example, compounds specific for tumor tissue, such as nucleosides having a purine ring structure, such as adenosine (ADO), adenosine triphosphate (ATP), adenosine diphosphate (ADP), adenosine monophosphate (AMP), inosine, and commercially available ADP-beta-S (Sigma); amino acids such as alanine, glutamic acid and aspartic acid; amino acid metabolites such as kynurenine, anthranilic acid acid, 3-hydroxykynurenine and kynurenic acid; arachidonic acid metabolites such as prostaglandin E2; primary metabolites of the glycolytic pathway or Krebs cycle such as lactic acid, succinic acid and citric acid; and nicotinamide metabolites such as 1-methylnicotinamide) may be used .
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению предусматривают контакт антигена (например, слитой молекулы из области Fc и антигена) с фаговой библиотекой антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул, выделение антигенсвязывающего домена или антигена-связывающей молекулы, связанной с антигеном, анализ выделенного антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы в присутствии или в отсутствие низкомолекулярного соединения можно проводить в соответствии с описанным выше способом и способом, описанным ниже в примерах, ссылаясь на известные методы в области техники, к которой относится настоящее изобретение.In one embodiment, the method of the present invention involves contacting an antigen (e.g., a fusion molecule of an Fc region and an antigen) with a phage library of antigen-binding domains or antigen-binding molecules, isolating the antigen-binding domain or antigen-binding molecule associated with the antigen, analyzing the isolated antigen binding domain or antigen binding molecule in the presence or absence of a small molecule compound can be carried out in accordance with the method described above and the method described below in the examples, referring to known methods in the field of technology to which the present invention relates.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ по настоящему изобретениюIn one embodiment of the present invention, the method of the present invention
- 99 046075 может быть способом, описанным в примере 2.- 99 046075 may be the method described in example 2.
(2) Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от двух или более различных низкомолекулярных соединений.(2) A method for screening an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has antigen binding activity dependent on two or more different small molecules.
В одном варианте осуществления настоящего описания предусматривают способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от двух или более различных низкомолекулярных соединений.In one embodiment, the present disclosure provides a method of screening for an antigen binding domain or antigen binding molecule that has antigen binding activity dependent on two or more different small molecule compounds.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ по настоящему изобретению включает:In one embodiment of the present invention, the method of the present invention includes:
(а) контактирование антигенсвязывающего домена, или антигенсвязывающей молекулы, или библиотеки антигенсвязывающих доменов, или антигенсвязывающих молекул с антигеном в присутствии первого низкомолекулярного соединения, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном на стадии (а), в отсутствие или в присутствии низкой концентрации первого соединения, (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированных на стадии (б), (г) контактирование антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, выделенных на стадии (в), с антигеном в присутствии низкомолекулярного соединения, (д) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном на стадии (в), в отсутствие или в присутствии низкой концентрации второго соединения, и (е) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированной на стадии (д), причем способ не включает между этапами (в) и (г) амплификацию гена, кодирующего антигенсвязывающий домен или антигенсвязывающую молекулу, выделенную на этапе (в).(a) contacting the antigen binding domain or antigen binding molecule or library of antigen binding domains or antigen binding molecules with the antigen in the presence of a first small molecule compound, (b) placing the antigen binding domain or antigen binding molecule associated with the antigen in step (a), in the absence or in in the presence of a low concentration of the first compound, (c) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b), (d) contacting the antigen binding domain or antigen binding molecule isolated in step (c) with the antigen in the presence of a low molecular weight compound, (e) placing the antigen binding domain or antigen binding molecule associated with the antigen in step (c) in the absence or presence of a low concentration of a second compound, and (e) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (e), wherein the method does not include between steps (c) and (d) amplification of the gene encoding the antigen binding domain or antigen binding molecule isolated in step (c).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению библиотека антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул представляет собой фаговую библиотеку.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the library of antigen binding domains or antigen binding molecules is a phage library.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению антиген может быть любым антигеном, как описано выше, предпочтительно антигеном мембранного типа (например, костимулирующими молекулами, такими как CD137, CTLA4, CD40, ОХ40, RANK, GITR и ICOS).In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the antigen can be any antigen as described above, preferably a membrane type antigen (eg, co-stimulatory molecules such as CD137, CTLA4, CD40, OX40, RANK, GITR and ICOS).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению в качестве низкомолекулярных соединений могут применяться различные описанные выше соединения, например, соединения, специфичные для опухолевой ткани, такие как нуклеозиды, имеющие структуру пуринового кольца, такие как аденозин (ADO), аденозинтрифосфат (АТР), аденозин дифосфат (АДФ), аденозинмонофосфат (АМФ) и инозин; аминокислоты, такие как аланин, глутаминовая кислота и аспарагиновая кислота; метаболиты аминокислот, такие как кинуренин, антраниловая кислота, 3гидроксикинуренин и кинурениновая кислота; метаболиты арахидоновой кислоты, такие как простагландин Е2; первичные метаболиты гликолитического пути или цикла Кребса, такие как молочная кислота, янтарная кислота и лимонная кислота; и метаболиты никотинамида, такие как 1-метилникотинамид.In one embodiment of the present invention, various compounds described above can be used as small molecular compounds in the method of the present invention, for example, compounds specific for tumor tissue, such as nucleosides having a purine ring structure, such as adenosine (ADO), adenosine triphosphate ( ATP), adenosine diphosphate (ADP), adenosine monophosphate (AMP) and inosine; amino acids such as alanine, glutamic acid and aspartic acid; amino acid metabolites such as kynurenine, anthranilic acid, 3hydroxykynurenine and kynurenic acid; arachidonic acid metabolites such as prostaglandin E2; primary metabolites of the glycolytic pathway or Krebs cycle, such as lactic acid, succinic acid and citric acid; and nicotinamide metabolites such as 1-methylnicotinamide.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению первое низкомолекулярное соединение и второе низкомолекулярное соединение могут быть любыми двумя типами различных соединений, выбранными из вышеупомянутых различных низкомолекулярных соединений.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the first small molecule compound and the second small molecule compound may be any two types of different compounds selected from the above-mentioned various small molecule compounds.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению контакт антигена с фаговой библиотекой антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул, выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном, анализ выделенного антигенсвязывающего домена связывающий домен или антигенсвязывающая молекула в присутствии или в отсутствие первого низкомолекулярного соединения, и анализ в присутствии или отсутствие второго низкомолекулярного соединения можно проводить в соответствии с описанным выше способом и способом, описанным ниже в примерах, ссылаясь на известные методы в области, к которому относится настоящее изобретение.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention contacts an antigen with a phage library of antigen binding domains or antigen binding molecules, isolates the antigen binding domain or antigen binding molecule associated with the antigen, analyzes the isolated antigen binding domain, binding domain or antigen binding molecule in the presence or absence of a first small molecule compounds, and analysis in the presence or absence of a second small molecule compound can be carried out in accordance with the method described above and the method described below in the examples, referring to known methods in the field to which the present invention relates.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в качестве способа настоящего изобретения можно указать способ, описанный в примере 9.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention may be the method described in Example 9.
(3) Способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которая обладает антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, с использованием наивной библиотеки.(3) A method for screening an antigen binding domain or an antigen binding molecule that has a small molecule dependent antigen binding activity using a naïve library.
В одном объекте настоящего изобретения предусматривают способ скрининга антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, которые обладают антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярного соединения, с использованием наивной библиотеки, содержащей множество фагов, презентирующих антигенсвязывающие домены или антигенсвязывающие молекулы (например, домены Fab) различных последовательностей антител человека, полученных из лимфоцитовIn one aspect, the present invention provides a method for screening an antigen binding domain or antigen binding molecule that has small molecule dependent antigen binding activity using a naïve library containing a plurality of phages presenting antigen binding domains or antigen binding molecules (e.g., Fab domains) of various human antibody sequences, derived from lymphocytes
- 100 046075 человека (например, МКПК человека), которые не получили антигенной стимуляции.- 100 046075 people (for example, human PBMCs) who did not receive antigen stimulation.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения способ по настоящему изобретению включает:In one embodiment of the present invention, the method of the present invention includes:
(а) контактирование наивной библиотеки антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул с антигеном в присутствии низкомолекулярного соединения, (б) размещение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном на стадии (а), в отсутствие или в присутствии низкой концентрации соединения, и (в) выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, диссоциированной на стадии (б).(a) contacting a naïve library of antigen binding domains or antigen binding molecules with an antigen in the presence of a small molecule compound, (b) placing an antigen binding domain or antigen binding molecule coupled to the antigen in step (a) in the absence or presence of a low concentration of the compound, and (c) isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule dissociated in step (b).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе настоящего изобретения наивная библиотека представляет собой фаговую библиотеку, содержащую фаги, презентирующие на своей поверхности два или более антигенсвязывающих домена или антигенсвязывающих молекул.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the naive library is a phage library containing phages presenting two or more antigen binding domains or antigen binding molecules on their surface.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе настоящего изобретения наивная библиотека представляет собой библиотеку, содержащую фаги, имеющие дефект в гене pIII, производном от фага-помощника.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the naïve library is a library containing phages having a defect in the helper phage-derived pIII gene.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе настоящего изобретения наивная библиотека представляет собой библиотеку, содержащую фаги, полученные путем увеличения экспрессии антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы с помощью небольшой молекулярной добавки, которая увеличивает уровень экспрессии с промотора, регулирующего экспрессию антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, a naive library is a library containing phages obtained by increasing the expression of an antigen binding domain or antigen binding molecule using a small molecule additive that increases the level of expression from a promoter that regulates the expression of the antigen binding domain or antigen binding molecule.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе настоящего изобретения низкомолекулярная добавка представляет собой изопропил-в-тиогалактопиранозид (IPTG, isopropyl-βthiogalactopyranoside) или арабинозу.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the low molecular weight additive is isopropyl-β-thiogalactopyranoside (IPTG, isopropyl-βthiogalactopyranoside) or arabinose.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе настоящего изобретения антиген может быть любым антигеном, как описано выше, предпочтительно антигеном мембранного типа (например, костимулирующей молекулой, такой как CD137, CTLA4, CD40, ОХ40, RANK, GITR или ICOS).In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, the antigen can be any antigen as described above, preferably a membrane type antigen (eg, a co-stimulatory molecule such as CD137, CTLA4, CD40, OX40, RANK, GITR or ICOS).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению в качестве низкомолекулярного соединения могут применяться различные соединения согласно описанному выше (например, соединения, специфичные для опухолевой ткани, такие как нуклеозиды, имеющие структуру пуринового кольца, такие как аденозин (ADO), аденозинтрифосфат (АТФ), аденозиндифосфат (АДФ), аденозинмонофосфат (АМФ) и инозин; аминокислоты, такие как аланин, глутаминовая кислота и аспарагиновая кислота; метаболиты аминокислот, такие как кинуренин, антраниловая кислота, 3-гидроксикинуренин и кинуреновая кислота, метаболиты арахидоновой кислоты, такие как простагландин Е2; первичные метаболиты гликолитического пути или цикла Кребса, такие как молочная кислота, янтарная кислота и лимонная кислота, и метаболиты никотинамида, такие как 1метилникотинамид).In one embodiment of the present invention, the method of the present invention may use various compounds as described above as the small molecule compound (e.g., tumor tissue specific compounds such as nucleosides having a purine ring structure such as adenosine (ADO), adenosine triphosphate (ATP), adenosine diphosphate (ADP), adenosine monophosphate (AMP) and inosine; amino acids such as alanine, glutamic acid and aspartic acid; amino acid metabolites such as kynurenine, anthranilic acid, 3-hydroxykynurenine and kynurenic acid, arachidonic acid metabolites such such as prostaglandin E2; primary metabolites of the glycolytic pathway or Krebs cycle such as lactic acid, succinic acid and citric acid, and nicotinamide metabolites such as 1methylnicotinamide).
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в способе по настоящему изобретению контакт антигена с фаговой библиотекой антигенсвязывающих доменов или антигенсвязывающих молекул, выделение антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы, связанной с антигеном, анализ выделенного антигенсвязывающего домена или антигенсвязывающей молекулы в присутствии или в отсутствие низкомолекулярного соединения может быть осуществлен в соответствии с описанным выше способом и способом, описанным ниже в примерах, со ссылкой на хорошо известные методы в области техники, к которой относится настоящее изобретение.In one embodiment of the present invention, in the method of the present invention, contacting an antigen with a phage library of antigen binding domains or antigen binding molecules, isolating the antigen binding domain or antigen binding molecule associated with the antigen, analyzing the isolated antigen binding domain or antigen binding molecule in the presence or absence of a small molecule compound may be carried out in accordance with the method described above and the method described below in the examples, with reference to well-known methods in the field of technology to which the present invention relates.
В одном из вариантов осуществления настоящего изобретения в качестве способа настоящего изобретения может быть представлен способ, описанный в примере 10.In one embodiment of the present invention, the method of the present invention may be the method described in Example 10.
ПримерыExamples
Ниже приведены примеры способов и композиций по настоящему изобретению. Учитывая приведенное выше описание изобретения, очевидно, что могут быть реализованы различные другие варианты его осуществления.Below are examples of methods and compositions of the present invention. Given the above description of the invention, it is obvious that various other embodiments may be implemented.
Пример 1. Получение антигена.Example 1. Antigen production.
(1-1) Получение внеклеточной области CD137 человека.(1-1) Preparation of the extracellular region of human CD137.
Внеклеточный домен CD137 человека (также называемый hCD137) получают способами, известными специалистам в данной области. В частности, связаны расположенный ниже по цепи генный фрагмент, кодирующий внеклеточную область CD137 человека, генный фрагмент, кодирующий гистидиновую метку, и фрагмент гена, кодирующий конкретную последовательность, к которой добавлен биотин (последовательность AviTag, SEQ ID NO: 86). Фрагмент гена, кодирующий белок, в котором связаны внеклеточная область CD137 человека, гистидиновая метка и Avitag (CD137 человека или hCD137HisBAP, SEQ ID NO: 87), включают в вектор экспрессии для животных клеток. Сконструированный плазмидный вектор трансфицируют в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen), используя 293-фектин (фирма Invitrogen). Одновременно трансфицируют плазмидный вектор, содержащий ген, экспрессирующий EBNA1 (SEQ ID NO: 88). Клетки, трансфицированные генами в соответствии с вышеупомянутойThe extracellular domain of human CD137 (also called hCD137) is obtained by methods known to those skilled in the art. In particular, a downstream gene fragment encoding the extracellular region of human CD137, a gene fragment encoding a histidine tag, and a gene fragment encoding a specific sequence to which biotin is added (AviTag sequence, SEQ ID NO: 86) are linked. A gene fragment encoding a protein in which the extracellular region of human CD137, a histidine tag and Avitag (human CD137 or hCD137HisBAP, SEQ ID NO: 87) is linked is included in an animal cell expression vector. The constructed plasmid vector was transfected into FreeStyle293 cells (Invitrogen) using 293-fectin (Invitrogen). At the same time, a plasmid vector containing a gene expressing EBNA1 (SEQ ID NO: 88) is transfected. Cells transfected with genes according to the above
- 101 046075 процедурой, культивируют при 37°C, в атмосфере 8% CO2; и представляющий интерес белок (внеклеточная область CD137 человека) секретируется в супернатант культуры. Эту среду для культивирования клеток фильтруют через фильтр с порами 0,22 мкм для получения супернатанта культуры. Супернатант культуры вносят в колонку HisTrap-HP (фирма GE Healthcare) и внеклеточную область CD137 человека связывают с колонкой.- 101 046075 procedure, cultured at 37°C, in an atmosphere of 8% CO 2 ; and the protein of interest (extracellular region of human CD137) is secreted into the culture supernatant. This cell culture medium is filtered through a 0.22 μm filter to obtain the culture supernatant. The culture supernatant is applied to a HisTrap-HP column (GE Healthcare) and the extracellular region of human CD137 is bound to the column.
Внеклеточную область CD137 человека элюируют раствором 20 мМ фосфата натрия, 500 мМ хлорида натрия и 500 мМ имидазола, рН 7,5. Затем агрегаты удаляют гель-фильтрационной хроматографией с использованием колонки Superdex 200 26/600 (фирма GE Healthcare) для получения очищенной внеклеточной области CD137 человека. Концентрацию CD137 человека рассчитывают по методу Расе с соавт. на основе аминокислотной последовательности, исключая сигнальную последовательность, удаленную из SEQ ID NO: 87 (Расе C.N., с соавт. Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).The extracellular region of human CD137 is eluted with a solution of 20 mM sodium phosphate, 500 mM sodium chloride and 500 mM imidazole, pH 7.5. The aggregates are then removed by gel filtration chromatography using a Superdex 200 26/600 column (GE Healthcare) to obtain purified extracellular region of human CD137. Human CD137 concentrations were calculated using the method of Race et al. based on amino acid sequence, excluding the signal sequence deleted from SEQ ID NO: 87 (C. N. Race, et al. Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).
(1-2) Получение внеклеточного домена CD137 человека (hCD137 (расщепленный FXa)).(1-2) Preparation of the extracellular domain of human CD137 (hCD137 (cleaved FXa)).
Внеклеточный домен CD137 человека (также называемый hCD137 (расщепленный протеазой FXa)) получают способом, известным специалистам в данной области. В частности, фрагмент гена, кодирующий последовательность расщепления фактора Ха, и фрагмент гена, кодирующий константную область антитела, соединяют ниже по цепи от фрагмента гена, кодирующего внеклеточную область CD137 человека. Фрагмент гена, кодирующий белок, в котором связаны внеклеточная область CD137 человека, расщепляемая протеазой FactorXa последовательность и константная область антитела (hCD137-F-Fc, SEQ ID NO: 89), включен в вектор экспрессии животного. Сконструированный плазмидный вектор трансфицируют в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen) с использованием 293-фектина (фирма Invitrogen). Одновременно трансфицируют плазмидный вектор, содержащий ген, кодирующий EBNA1 (SEQ ID NO: 88). Клетки, трансфицированные генами в соответствии с вышеупомянутыми процедурами, культивируют при 37°C в атмосфере 8% CO2, при этом hCD137-F-Fc секретируется в супернатант культуры. Среду для культивирования клеток фильтруют через фильтр с порами 0,22 мкм и собирают культуральный супернатант.The extracellular domain of human CD137 (also called hCD137 (FXa protease-cleaved)) is prepared in a manner known to those skilled in the art. Specifically, a gene fragment encoding a factor Xa cleavage sequence and a gene fragment encoding an antibody constant region are joined downstream of a gene fragment encoding the extracellular region of human CD137. A gene fragment encoding a protein in which the human CD137 extracellular region, the FactorXa protease cleavable sequence, and the antibody constant region are linked (hCD137-F-Fc, SEQ ID NO: 89) is included in an animal expression vector. The constructed plasmid vector was transfected into FreeStyle293 cells (Invitrogen) using 293-fectin (Invitrogen). At the same time, a plasmid vector containing the gene encoding EBNA1 (SEQ ID NO: 88) is transfected. Cells transfected with genes according to the above procedures are cultured at 37°C in an atmosphere of 8% CO 2 , while hCD137-F-Fc is secreted into the culture supernatant. The cell culture medium is filtered through a 0.22 μm filter and the culture supernatant is collected.
Супернатанты культур клеток наносят на колонку, заполненную белком А (продукт MabSelect SuRe, фирма GE Healthcare). hCD137-F-Fc связывается с колонкой, после чего его элюируют 50 мМ раствором уксусной кислоты. После нейтрализации элюата с помощью 1 М трис-HCl, рН 8,0, растворитель hCD137-F-Fc заменяют раствором 20 мМ Трис, 100 мМ хлорид натрия, 2 мМ хлорид кальция, рН 8,0. Затем добавляют протеазу Factor Xa (фирма NEW ENGLAND BioLabs, номер в каталоге P8010L) и расщепляют hCD137-F-Fc. Затем добавляют ингибитор протеазы (продукт DNS-GGACK, фирма Calbiochem, номер в каталоге 251700), чтобы остановить реакцию. К раствору, в котором действует протеаза, добавляют 5М хлорида натрия и весь объем приготовленного раствора вносят в колонку HiTrap Benzamidine (фирма GE Healthcare, номер в каталоге 17-5143-01). Пропущенный через колонку раствор затем наносят на колонку с белком А (продукт Mab Select SuRe, фирма GE Healthcare) и собирают прошедшие сквозь колонку фракции. Из пропущенных фракций удаляют агрегаты с помощью гель-фильтрационной хроматографии, используя Superdex 200 Increase, 10/30 (фирма GE Healthcare, номер в каталоге 28990944), получая очищенную внеклеточную область CD137 человека.Cell culture supernatants are applied to a Protein A column (MabSelect SuRe, GE Healthcare). hCD137-F-Fc binds to the column and is then eluted with 50 mM acetic acid. After neutralizing the eluate with 1 M Tris-HCl, pH 8.0, the hCD137-F-Fc solvent was replaced with a solution of 20 mM Tris, 100 mM sodium chloride, 2 mM calcium chloride, pH 8.0. Factor Xa protease (NEW ENGLAND BioLabs, catalog number P8010L) is then added and hCD137-F-Fc is digested. A protease inhibitor (product DNS-GGACK, Calbiochem, catalog number 251700) is then added to stop the reaction. 5 M sodium chloride is added to the solution in which the protease acts, and the entire volume of the prepared solution is applied to a HiTrap Benzamidine column (GE Healthcare, catalog number 17-5143-01). The columnated solution is then applied to a Protein A column (Mab Select SuRe, GE Healthcare) and the fractions passed through the column are collected. From the skipped fractions, aggregates were removed by gel filtration chromatography using Superdex 200 Increase, 10/30 (GE Healthcare, catalog number 28990944), yielding purified extracellular region of human CD137.
(1-3) Получение биотинилированного слитого с Fc CD137 человека.(1-3) Preparation of biotinylated human Fc-fusion CD137.
Биотинилированный слитый с Fc CD137 человека (также называемый биотинилированный hCD137-Fc, или био-hCD137-Fc, или hCD137-Fc-Bio) получают способами, известными специалистам в данной области. В частности, фрагмент гена, кодирующий константную область антитела, и фрагмент гена, кодирующий специфическую последовательность, к которой добавлен биотин (последовательность AviTag, SEQ ID NO: 86), присоединяют ниже по цепи от фрагмента гена, кодирующего внеклеточную область CD137 человека. Фрагмент гена, кодирующий белок (Fc, слитый с CD137 человека, SEQ ID NO: 90), в котором связаны внеклеточная область CD137 человека, константная область антитела и Avitag, включен в вектор экспрессии животного. Сконструированный плазмидный вектор трансфицируют в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen) с использованием 293-фектина (фирма Invitrogen). Одновременно трансфицируют ген, экспрессирующий EBNA1 (SEQ ID NO: 88), и ген, экспрессирующий биотинлигазу (BirA, SEQ ID NO: 91), добавляют биотин с целью биотинилирования Fc, слитого с CD137 человека. Клетки, трансфицированные генами в соответствии с вышеупомянутыми процедурами, культивируют при 37°C в атмосфере 8% CO2; белок интереса (биотинилированный слитый с Fc CD137 человека) секретируется в супернатант культуры. Среду для культивирования клеток фильтруют через фильтр с порами 0,22 мкм и собирают культуральный супернатант.Biotinylated human Fc-fusion CD137 (also called biotinylated hCD137-Fc, or bio-hCD137-Fc, or hCD137-Fc-Bio) is prepared by methods known to those skilled in the art. Specifically, a gene fragment encoding the antibody constant region and a gene fragment encoding a specific sequence to which biotin is added (AviTag sequence, SEQ ID NO: 86) are attached downstream of the gene fragment encoding the extracellular region of human CD137. A gene fragment encoding a protein (Fc fused to human CD137, SEQ ID NO: 90) in which the extracellular region of human CD137, the antibody constant region and Avitag are linked is included in an animal expression vector. The constructed plasmid vector was transfected into FreeStyle293 cells (Invitrogen) using 293-fectin (Invitrogen). Simultaneously, the gene expressing EBNA1 (SEQ ID NO: 88) and the gene expressing biotin ligase (BirA, SEQ ID NO: 91) are transfected, and biotin is added to biotinylate the Fc fused to human CD137. Cells transfected with genes according to the above procedures are cultured at 37°C in an atmosphere of 8% CO 2 ; the protein of interest (a biotinylated human Fc CD137 fusion) is secreted into the culture supernatant. The cell culture medium is filtered through a 0.22 μm filter and the culture supernatant is collected.
Супернатант культуры вносят в колонку, заполненную белком A (MabSelect SuRe, GE Healthcare), и биотинилированный слитый с Fc CD137 человека связывается с колонкой. Биотинилированный слитый с Fc CD137 человека элюируют 50 мМ раствором уксусной кислоты. Затем агрегаты удаляют гельфильтрационной хроматографией с использованием Superdex 200, 26/600 (фирма GE Healthcare) и получают очищенный биотинилированный слитый с Fc CD137 человека.The culture supernatant is applied to a Protein A column (MabSelect SuRe, GE Healthcare) and biotinylated human Fc fusion CD137 is bound to the column. Biotinylated human Fc-fusion CD137 was eluted with 50 mM acetic acid. The aggregates are then removed by gel filtration chromatography using Superdex 200, 26/600 (GE Healthcare) to obtain purified biotinylated human Fc fusion CD137.
(1-4) Получение слитого с Fc CD137 человека.(1-4) Preparation of human Fc-fusion CD137.
Слитый с Fc CD137 человека (также называемый hCD137-Fc) получают способами, известными специалистам в данной области. В частности, фрагмент гена, кодирующий константную область антитеHuman Fc-fusion CD137 (also called hCD137-Fc) is produced by methods known to those skilled in the art. In particular, the gene fragment encoding the anti-antibody constant region
- 102 046075 ла, и фрагмент гена, кодирующий специфическую последовательность, к которой добавлен биотин (последовательность AviTag, SEQ ID NO: 86), присоединяют ниже по цепи от фрагмента гена, кодирующего внеклеточную область CD137 человека. Фрагменты гена, кодирующие белок (слитый с Fc человека CD137, SEQ ID NO: 90), в котором внеклеточная область CD137 человека, константная область антитела и Avitag включены в вектор экспрессии животного. Сконструированный плазмидный вектор трансфицируют в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen) с использованием 293-фектина (фирма Invitrogen). Одновременно трансфицируют ген, экспрессирующий EBNA1 (SEQ ID NO: 88). Клетки, трансфицированные генами в соответствии с вышеупомянутыми процедурами, культивируют при 37°C в атмосфере 8% CO2; белок интереса (слитый с Fc CD137 человека) секретируется в супернатант культуры. Среду для культивирования клеток фильтруют через фильтр с порами 0,22 мкм и собирают культуральный супернатант.- 102 046075 la, and a gene fragment encoding a specific sequence to which biotin is added (AviTag sequence, SEQ ID NO: 86) is attached downstream of the gene fragment encoding the extracellular region of human CD137. Gene fragments encoding a protein (fusion to human CD137 Fc, SEQ ID NO: 90) in which the extracellular region of human CD137, the antibody constant region and Avitag are included in an animal expression vector. The constructed plasmid vector was transfected into FreeStyle293 cells (Invitrogen) using 293-fectin (Invitrogen). At the same time, the gene expressing EBNA1 (SEQ ID NO: 88) is transfected. Cells transfected with genes according to the above procedures are cultured at 37°C in an atmosphere of 8% CO 2 ; the protein of interest (fused to human Fc CD137) is secreted into the culture supernatant. The cell culture medium is filtered through a 0.22 μm filter and the culture supernatant is collected.
Супернатант культуры вносят в колонку, заполненную белком A (MabSelect SuRe, GE Healthcare), и слитый с Fc CD137 человека связывается с колонкой. Слитый с Fc CD137 человека элюируют 50 мМ раствором уксусной кислоты. Затем агрегаты удаляют гель-фильтрационной хроматографией с использованием Superdex 200, 26/600 (фирма GE Healthcare) и получают очищенный слитый с Fc CD137 человека.The culture supernatant is applied to a Protein A column (MabSelect SuRe, GE Healthcare) and human Fc fusion CD137 is bound to the column. The human Fc-fusion CD137 was eluted with 50 mM acetic acid. The aggregates are then removed by gel filtration chromatography using Superdex 200, 26/600 (GE Healthcare) to obtain purified human Fc fusion CD137.
(1-5) Получение биотинилированного слитого с Fc CD137 обезьяны.(1-5) Preparation of biotinylated monkey Fc-fusion CD137.
Биотинилированный слитый с Fc CD137 обезьяны (также называемый cyCD137-Fc-BAP) получают способами, известными специалистам в данной области. В частности, фрагмент гена, кодирующий константную область антитела, и фрагмент гена, кодирующий специфическую последовательность, к которой добавлен биотин (последовательность AviTag, SEQ ID NO: 86), присоединяют ниже по цепи от фрагмента гена, кодирующего внеклеточную область CD137 обезьяны. Фрагмент гена, кодирующий белок, в котором внеклеточная область CD137 обезьяны, константная область антитела и Avitag связаны (слитый с Fc обезьяны CD137, SEQ ID NO: 92), включена в вектор экспрессии животного.Biotinylated monkey Fc CD137 fusion (also called cyCD137-Fc-BAP) is prepared by methods known to those skilled in the art. Specifically, a gene fragment encoding the antibody constant region and a gene fragment encoding a specific sequence to which biotin is added (AviTag sequence, SEQ ID NO: 86) are attached downstream of the gene fragment encoding the extracellular region of monkey CD137. A gene fragment encoding a protein in which the simian CD137 extracellular region, the antibody constant region, and Avitag are linked (fused to simian CD137 Fc, SEQ ID NO: 92) is included in an animal expression vector.
Сконструированный плазмидный вектор трансфицируют в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen) с использованием 293-фектина (фирма Invitrogen). Одновременно трансфицируют ген, экспрессирующий EBNA1 (SEQ ID NO: 88), и ген, экспрессирующий биотинлигазу (BirA, SEQ ID NO: 91); биотин добавляют с целью нанесения метки в виде биотина для слитого с Fc CD137 обезьяны. Клетки, трансфицированные генами в соответствии с вышеупомянутыми процедурами, культивируют при 37°C в атмосфере 8% CO2; белок интереса (биотинилированный слитый с Fc CD137 обезьяны) секретируется в супернатант культуры. Среду для культивирования клеток фильтруют через фильтр с порами 0,22 мкм и собирают культуральный супернатант.The constructed plasmid vector was transfected into FreeStyle293 cells (Invitrogen) using 293-fectin (Invitrogen). The gene expressing EBNA1 (SEQ ID NO: 88) and the gene expressing biotin ligase (BirA, SEQ ID NO: 91) are simultaneously transfected; biotin is added to provide a biotin label for the monkey CD137 Fc fusion. Cells transfected with genes according to the above procedures are cultured at 37°C in an atmosphere of 8% CO 2 ; the protein of interest (a biotinylated monkey Fc CD137 fusion) is secreted into the culture supernatant. The cell culture medium is filtered through a 0.22 μm filter and the culture supernatant is collected.
Супернатант культуры вносят в колонку, заполненную белком А (MabSelect SuRe, GE Healthcare), и биотинилированный слитый с Fc CD137 обезьяны связывается с колонкой. Биотинилированный слитый с Fc CD137 обезьяны элюируют 50 мМ раствором уксусной кислоты. Затем агрегаты удаляют гельфильтрационной хроматографией с использованием Superdex 200, 26/600 (фирма GE Healthcare) и получают очищенный биотинилированный слитый с Fc CD137 обезьяны.The culture supernatant is applied to a protein A column (MabSelect SuRe, GE Healthcare) and biotinylated monkey Fc-fusion CD137 is bound to the column. Biotinylated monkey Fc CD137 fusion was eluted with 50 mM acetic acid. Aggregates were then removed by gel filtration chromatography using Superdex 200, 26/600 (GE Healthcare) to obtain purified biotinylated monkey Fc CD137 fusion.
Пример 2. Получение АТФ-зависимых анти-CD137 антител.Example 2. Preparation of ATP-dependent anti-CD137 antibodies.
(2-1) Получение антител с антигенсвязывающей активностью, зависящей от низкомолекулярных соединений (антитела, переключаемые низкомолекулярными соединениями), из рационально разработанной библиотеки, использующей АТФ (1).(2-1) Generation of antibodies with small-molecule-dependent antigen-binding activity (small-molecule-switched antibodies) from a rationally designed library using ATP (1).
(2-1-1) Пэннинг.(2-1-1) Panning.
Антитела, которые проявляют связывающую активность по отношению к антигенам в присутствии аденозинтрифосфата (аденозин-5'-трифосфат; АТФ), были получены из рационально разработанной библиотеки фагового дисплея антител, созданной в предыдущем патенте WO 2015/083764. Следует отметить, что антитела с антигенсвязывающей активностью (антиген, например, CD137), зависящей от низкомолекулярных соединений, могут называться переключаемыми антителами или антителами, переключаемыми низкомолекулярными соединениями, и антитела с антигенсвязывающей активностью (антиген CD137), зависящей от АТФ, могут называться переключаемыми антителами или АТФпереключаемыми антителами. Для получения антител собирают фаги, презентирующие антитела, которые проявляют связывающую активность в присутствии АТФ по отношению к антигену, захваченному на гранулах. Затем фаги собирают из элюатов, элюированных с гранул в отсутствие АТФ.Antibodies that exhibit antigen binding activity in the presence of adenosine triphosphate (adenosine 5'-triphosphate; ATP) were obtained from a rationally designed antibody phage display library created in the previous patent WO 2015/083764. It should be noted that antibodies with small molecule dependent antigen binding activity (antigen, e.g. CD137) may be referred to as switchable antibodies or small molecule switchable antibodies, and antibodies with antigen binding activity (eg CD137 antigen) dependent on ATP may be referred to as switchable antibodies or ATP-switched antibodies. To produce antibodies, phages are collected that present antibodies that exhibit binding activity in the presence of ATP to the antigen captured on the beads. Phages are then collected from the eluates eluted from the beads in the absence of ATP.
Фаги получают обычным методом из бактерии Е. coli, несущей фагмиду, сконструированную методом фагового дисплея. В частности, Е. coli, несущую сконструированный фагмидный вектор, инфицируют фагом Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (обозначенным как гиперфаг) (фирма PROGEN Biotechnik), и фаги собирают из супернатантов, культивируемых в течение ночи при 30°C. Суспензию фаговой библиотеки получают путем разбавления трис-буферным физиологическим раствором (TBS, Tris-Buffered Saline) популяции фагов, которых осаждают путем добавления 2,5 М NaCl/10% PEG к культуре Е. coli, в которой вырабатывается фаг. Затем к суспензии фаговой библиотеки добавляют БСА до конечной концентрации 4%. Пэннинг проводят с использованием антигена, иммобилизованного на магнитных гранулах. В качестве магнитных гранул используют гранулы Sera-Mag NeutrAvidin (фирма Thermo Fisher Scientific) или Dynabeads M-280 StreptAvidin (фирма Life Technologies). В качестве антигена применяют биотинилированный аденозинтрифосфат (аденозин-5'-трифосфат; АТФ) от фирмы Jena Bioscience, или hCD137-Fc-Bio (SEQ ID NO: 90) или био-hCD137 (SEQ ID NO: 89), которые биотинилированы из hCD137 (расщепление FXa),Phages are obtained by the usual method from the bacterium E. coli carrying a phagemid constructed by the phage display method. Specifically, E. coli carrying the constructed phagemid vector is infected with phage Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (designated hyperphage) (PROGEN Biotechnik), and the phages are collected from supernatants cultured overnight at 30°C. A phage library suspension is prepared by diluting the phage population with Tris-Buffered Saline (TBS), which is pelleted by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to the E. coli culture in which the phage is being produced. BSA is then added to the phage library suspension to a final concentration of 4%. Panning is carried out using antigen immobilized on magnetic beads. Sera-Mag NeutrAvidin beads (Thermo Fisher Scientific) or Dynabeads M-280 StreptAvidin (Life Technologies) are used as magnetic beads. The antigen used is biotinylated adenosine triphosphate (adenosine 5'-triphosphate; ATP) from Jena Bioscience, or hCD137-Fc-Bio (SEQ ID NO: 90) or bio-hCD137 (SEQ ID NO: 89), which are biotinylated from hCD137 (FXa cleavage),
- 103 046075 с использованием предварительно измеренного NHS-PEO4-6uoTUHa без взвешивания (фирма PIERCE), полученного в примерах 1-2 и 1-3.- 103 046075 using pre-measured NHS-PEO4-6uoTUHa without weighing (PIERCE) obtained in examples 1-2 and 1-3.
Пэннинг проводят для эффективного получения небольшой молекулы, которая может играть роль переключателя в зависимых от раковых тканях переключаемых антителах. В частности, пэннинг для обогащения антителами, которые связываются с антигеном в присутствии АТФ, который представляет собой небольшую молекулу, и не связываются с антигеном в отсутствие АТФ, выполняют со ссылкой на методы, показанные в предыдущем патенте WO 2015/083764. В первом раунде для всех биотинилированных hCD137 (bio-hCD137), hCD137-Fc-Bio и биотинилированного АТФ (био-АТФ) пэннинг выполняют с использованием метода, в котором твердофазная иммобилизация биотинилированных антигенов на магнитных гранулах (называемая твердофазным методом на основе гранул) предшествует добавлению приготовленной суспензии фаговой библиотеки. Для Био-АТФ пэннинг для обогащения антителами, которые могут связываться с антигеном (Био-АТФ) в отсутствие АТФ в качестве низкомолекулярного соединения, выполняют со ссылкой на методы, описанные в предыдущем патенте WO 2015/083764, отмеченном выше. Для hCD137-Fc-Bio добавляют 4 нМ небиотинилированной области Fc IgG1 человека для удаления антител, которые связываются с областью Fc. Собранный фаг добавляют к штамму Е. coli ER2738 для заражения фагом Е. coli, затем собранные клетки Е. coli инфицируют гиперфагом и фаг собирают из супернатанта после культивирования в течение ночи при 30°C.Panning is performed to efficiently obtain a small molecule that can act as a switch in cancer tissue-dependent switchable antibodies. In particular, panning to enrich antibodies that bind to antigen in the presence of ATP, which is a small molecule, and do not bind to antigen in the absence of ATP, is performed with reference to the methods shown in the previous patent WO 2015/083764. In the first round, for all biotinylated hCD137 (bio-hCD137), hCD137-Fc-Bio, and biotinylated ATP (bio-ATP), panning is performed using a method in which solid-phase immobilization of biotinylated antigens onto magnetic beads (referred to as the solid-phase bead-based method) is preceded by adding the prepared phage library suspension. For Bio-ATP, panning to enrich antibodies that can bind to an antigen (Bio-ATP) in the absence of ATP as a small molecule compound is performed with reference to the methods described in the previous patent WO 2015/083764 noted above. For hCD137-Fc-Bio, 4 nM non-biotinylated human IgG1 Fc region is added to remove antibodies that bind to the Fc region. The collected phage is added to E. coli strain ER2738 to infect the E. coli phage, then the collected E. coli cells are infected with hyperphage and the phage is collected from the supernatant after overnight culture at 30°C.
Начиная со 2 раунда, пэннинг выполняют только на биотинилированном hCD137 (bio-hCD137) и hCD137-Fc-Bio для обогащения антител, которые связываются с антигеном в присутствии АТФ, и не связываются с антигеном в отсутствие АТФ, используя твердофазный метод с гранулами, ссылаясь на метод, показанный в предыдущем патенте WO 2015/083764. Для hCD137-Fc-Bio в обоих случаях добавляют 4 нМ небиотинилированной области Fc IgG1 человека для удаления антител, которые связываются с областью Fc. Подобный пэннинг повторяют до 5 раунда для обогащения представляющих интерес последовательностей антител.From Round 2 onwards, panning is performed on only biotinylated hCD137 (bio-hCD137) and hCD137-Fc-Bio to enrich for antibodies that bind antigen in the presence of ATP and do not bind antigen in the absence of ATP, using a solid-phase bead method, referring to the method shown in the previous patent WO 2015/083764. For hCD137-Fc-Bio, 4 nM non-biotinylated human IgG1 Fc region is added in both cases to remove antibodies that bind to the Fc region. This panning is repeated up to round 5 to enrich antibody sequences of interest.
(2-1-2) Оценка связывающей активности в присутствии и в отсутствие АТФ с помощью метода фагового иммуноферментного анализа ELISA.(2-1-2) Evaluation of binding activity in the presence and absence of ATP using the phage enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) method.
Из отдельных колоний Е. coli, полученных описанными выше методами, супернатант фагосодержащей культуры собирают обычным методом (Methods Mol Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (фирма MACHEREY-NAGEL) используют для ультрафильтрации собранного супернатанта культуры. Элюат удаляют центрифугированием (4500 g, 45 мин) планшета NucleoFast 96, в который вносили по 100 мкл супернатанта культуры в каждую лунку. NucleoFast 96 снова промывают центрифугированием (4500 g в течение 30 мин), для чего добавляют 100 мкл H2O в каждую лунку. В итоге добавляют 100 мкл TBS, и суспензию фага, содержащуюся в супернатантах в лунках планшета NucleoFast 96, которые оставляли при комнатной температуре на 5 мин, извлекают.From individual E. coli colonies obtained by the methods described above, the phage culture supernatant is collected in the usual manner (Methods Mol Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (MACHEREY-NAGEL) is used to ultrafiltrate the collected culture supernatant. The eluate is removed by centrifugation (4500 g, 45 min) of a NucleoFast 96 plate, into which 100 μl of the culture supernatant was added to each well. NucleoFast 96 is washed again by centrifugation (4500 g for 30 min), for which 100 μl of H2O is added to each well. Finally, 100 μl of TBS is added, and the phage suspension contained in the supernatants in the wells of the NucleoFast 96 plate, which were left at room temperature for 5 min, is recovered.
Очищенные фаги с добавлением TBS или АТФ/TBS подвергают иммуноферментномуанализу (ELISA) по следующей процедуре. 384-луночные микропланшеты, покрытые стрептавидином (фирма Greiner), покрывают в течение ночи 10 мкл буфера TBS, содержащего биотинилированные антигены (bio-hCD137, hCD137-Fc-Bio и bio-Fc), полученные в примере 1. После удаления биотинилированных антигенов, которые не связались с планшетом, путем промывания каждой лунки планшета трисбуферным солевым раствором с Tween-20 (TBST), лунки блокируют 80 мкл 2% обезжиренного молокаTBS в течение 1 ч или более. 2% обезжиренное молоко-TBS удаляют промывками TBST, после чего допускают, чтобы презентирующие антитела фаги связывались с биотинилированным антигеном, присутствующим в каждой лунке в отсутствие и в присутствии АТФ, оставляя планшеты с подготовленными очищенными фагами, добавленными в каждую лунку, на 1 ч при комнатной температуре. В каждую лунку, промытую TBST или АТФ/TBST, добавляют HRP-конъюгированные анти-М13 антитела (фирма GE Healthcare, номер в каталоге 27-9421-01), разведенные TBS или АТФ/TBS, и планшет инкубируют в течение одного часа. После промывки TBST или АТФ/TBST проявление цвета раствора в каждой лунке, в которую был добавлен единый раствор ТМВ (фирма ZYMED), останавливают добавлением серной кислоты, а затем проявление цвета измеряют по поглощению при 450 нм.Purified phages supplemented with TBS or ATP/TBS are subjected to enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) using the following procedure. Streptavidin-coated 384-well microplates (Greiner) are coated overnight with 10 μl of TBS buffer containing biotinylated antigens (bio-hCD137, hCD137-Fc-Bio and bio-Fc) prepared in Example 1. After removing the biotinylated antigens, that do not bind to the plate, by washing each well of the plate with Tris-buffered saline with Tween-20 (TBST), the wells are blocked with 80 μl of 2% skim milk TBS for 1 hour or more. The 2% skim milk-TBS is removed with TBST washes and then the antibody presenting phages are allowed to bind to the biotinylated antigen present in each well in the absence and presence of ATP, leaving the plates with the prepared purified phages added to each well for 1 hour at room temperature. HRP-conjugated anti-M13 antibody (GE Healthcare, catalog no. 27-9421-01) diluted in TBS or ATP/TBS is added to each well washed with TBST or ATP/TBST and the plate is incubated for one hour. After washing with TBST or ATP/TBST, the color development of the solution in each well to which a single TMB solution (ZYMED) was added was stopped by adding sulfuric acid, and then the color development was measured by absorbance at 450 nm.
В результате идентифицировано несколько антител с измененной связывающей активностью с biohCD137 или hCD137-Fc-Bio в присутствии и в отсутствие АТФ.As a result, several antibodies were identified with altered binding activity to biohCD137 or hCD137-Fc-Bio in the presence and absence of ATP.
Результаты фагового ELISA с использованием клонов после 4 и 5 раундов пэннинга показаны в табл. 9.The results of phage ELISA using clones after 4 and 5 rounds of panning are shown in Table. 9.
В настоящем изобретении клоны с абсорбцией 0,2 или более в присутствии АТФ и отношением S/N (сигнал/шум) абсорбции выше 2 в присутствии/отсутствие антигена определяют как положительные клоны. Кроме того, среди положительных клонов клоны с коэффициентом абсорбцией S/N выше 2 раза в присутствии/отсутствие АТФ считают клонами с АТФ-зависимой антигенсвязывающей активностью (переключаемые клоны).In the present invention, clones with an absorbance of 0.2 or more in the presence of ATP and an absorbance S/N ratio greater than 2 in the presence/absence of antigen are defined as positive clones. In addition, among the positive clones, clones with an S/N absorption ratio greater than 2 times in the presence/absence of ATP are considered clones with ATP-dependent antigen-binding activity (switchable clones).
- 104 046075- 104 046075
Таблица 9Table 9
(2-1-3) Анализ последовательности переключаемых антител, антигенсвязывающая активность которых изменяется в зависимости от присутствия/отсутствия АТФ.(2-1-3) Sequence analysis of switchable antibodies whose antigen-binding activity changes depending on the presence/absence of ATP.
Нуклеотидные последовательности генов, амплифицированных с использованием специфических праймеров pBAD-F, G1seq-R, из клонов с АТФ-зависимой антигенсвязывающей активностью (переключаемые клоны) анализируют на основе результатов фагового ELISA. В результате анализа получают нуклеотидные последовательности клонов, которые, как установлено, связываются с CD137 человека в присутствии АТФ, но не с CD137 человека в отсутствие АТФ.The nucleotide sequences of genes amplified using specific primers pBAD-F, G1seq-R, from clones with ATP-dependent antigen-binding activity (switch clones) are analyzed based on the results of phage ELISA. The analysis yields nucleotide sequences of clones that are found to bind to human CD137 in the presence of ATP, but not to human CD137 in the absence of ATP.
(2-2) Получение антител, которые связываются с антигенами в присутствии небольшой молекулы, из рационально разработанной библиотеки, использующей АТФ (2).(2-2) Generation of antibodies that bind to antigens in the presence of a small molecule from a rationally designed library using ATP (2).
(2-2-1) Пэннинг.(2-2-1) Panning.
Антитела, которые проявляют активность связывания с антигенами в присутствии АТФ, были получены из рационально разработанной библиотеки фагового дисплея антител, сконструированной в предыдущем патенте WO 2015/083764. Для получения антител собирают фаги, презентирующие антитела, которые проявляют связывающую активность в присутствии АТФ по отношению к антигенам, с последующим выделением фагов из элюата, элюированного с гранул в отсутствие АТФ.Antibodies that exhibit antigen binding activity in the presence of ATP were obtained from the rationally designed antibody phage display library constructed in the previous patent WO 2015/083764. To obtain antibodies, phages presenting antibodies that exhibit binding activity in the presence of ATP to antigens are collected, followed by the isolation of phages from the eluate eluted from beads in the absence of ATP.
Фаги получают обычным методом из бактерии Е. coli, несущей фагмиду, сконструированную методом фагового дисплея. В частности, Е. coli, несущую сконструированный фагмидный вектор, инфицируют фагом М13КО7ТС (WO 2015046554 A1) или Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (обозначенным как гиперфаг) (фирма PROGEN Biotechnik), и фаги выделяют из супернатантов, культивируемых в течение ночи при 30°C. Суспензию фаговой библиотеки получают путем разбавления трис-буферным физиологическим раствором (TBS, Tris-Buffered Saline) популяции фагов, которых осаждают путем добавления 2,5 М NaCl/10% PEG к культуре Е. coli, в которой вырабатывается фаг. Затем к суспензии фаговой библиотеки добавляют БСА до конечной концентрации 4%. Пэннинг проводят с использованием антигенов, иммобилизованных на магнитных гранулах. В качестве магнитных гранул используют гранулы с покрытием NeutrAvidin (Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-покрытие), гранулы NeutrAvidin (фирма TAMAGAWA SEIKI) или Dynabeads MyOne StreptAvidin T1 (фирма Thermo Fisher Scientific). В качестве антигена применяют hCD137Fc-Bio или bio-hCD137, полученные в примере 1.Phages are obtained by the usual method from the bacterium E. coli carrying a phagemid constructed by the phage display method. In particular, E. coli carrying the constructed phagemid vector is infected with phage M13KO7TC (WO 2015046554 A1) or M13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (designated hyperphage) (Progen Biotechnik), and the phages are isolated from supernatants cultured overnight at 30°C. A phage library suspension is prepared by diluting the phage population with Tris-Buffered Saline (TBS), which is pelleted by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to the E. coli culture in which the phage is being produced. BSA is then added to the phage library suspension to a final concentration of 4%. Panning is carried out using antigens immobilized on magnetic beads. The magnetic beads used are NeutrAvidin-coated beads (Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated), NeutrAvidin beads (TAMAGAWA SEIKI) or Dynabeads MyOne StreptAvidin T1 (Thermo Fisher Scientific). The antigen used is hCD137Fc-Bio or bio-hCD137, obtained in example 1.
Пэннинг проводят для эффективного получения антител, переключаемых небольшой молекулой, которая может играть роль переключателя в раковых тканях. В частности, пэннинг для обогащения антителами, которые связываются с антигеном в присутствии небольшой молекулы аденозинтрифосфата (аденозин-5'-трифосфат; АТФ) и не связываются с антигеном в отсутствие АТФ, выполняют со ссылкой на методы, описанные в предыдущем патенте WO 2015/083764. Для 6uo-HCD137 применяют метод, в котором добавляют приготовленную суспензию библиотеки фагов после заранее произведенной твердофазной иммобилизации биотинилированных антигенов на магнитных гранулах (так называемый твердофазный метод гранул), и метод, в котором добавляют магнитные гранулы после смешивания приготовленной суспензии фаговой библиотеки с заранее биотинилированными антигенами (так называемый жидкофазный метод). Для hCD137-Fc-Bio добавляют 4 нМ небиотинилированной области Fc IgG1 человека для удаления антител, которые связываются с областью Fc, и пэннинг осуществляют только жидкофазным методом. Собранный фаг добавляют к штамму Е. coli ER2738 для заражения фагом Е. coli, затем собранные клетки Е. coli инфицируют M13KO7TC (WO 2015046554 A1) или Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (гиперфагом) (фирма PROGEN Biotechnik) и после культивирования в течение ночи при 30°C фаг собирают из супернатанта. Подобный пэннинг повторяют до 5 раунда.Panning is performed to efficiently produce antibodies switched by a small molecule that can act as a switch in cancerous tissues. In particular, panning to enrich for antibodies that bind to antigen in the presence of a small molecule of adenosine triphosphate (adenosine 5'-triphosphate; ATP) and do not bind to antigen in the absence of ATP is performed with reference to the methods described in the previous patent WO 2015/083764 . For 6uo-HCD137, a method is used in which a prepared phage library suspension is added after pre-solid-phase immobilization of biotinylated antigens on magnetic beads (the so-called solid-phase bead method), and a method in which magnetic beads are added after mixing a prepared phage library suspension with pre-biotinylated antigens (the so-called liquid-phase method). For hCD137-Fc-Bio, 4 nM non-biotinylated human IgG1 Fc region is added to remove antibodies that bind to the Fc region, and panning is performed using a liquid phase method only. The collected phage is added to E. coli strain ER2738 to infect the E. coli phage, then the collected E. coli cells are infected with M13KO7TC (WO 2015046554 A1) or Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (hyperphage) (Progen Biotechnik) and after culturing overnight at 30°C the phage collected from the supernatant. This type of panning is repeated until round 5.
Пример (2-2-2). Оценка связывающей активности в присутствии и в отсутствие АТФ с помощью фагового ELISA.Example (2-2-2). Assessment of binding activity in the presence and absence of ATP using phage ELISA.
Из отдельных колоний Е. coli, полученных после каждого раунда описанными выше методами, супернатанты фагосодержащих культур собирают с использованием обычного метода (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (фирма MACHEREY-NAGEL) применяют для ультрафильтрации собранных культуральных супернатантов. Элюат удаляют центрифугированием (4500 g, 45 мин) планшетов NucleoFast 96, в которые вносили по 100 мкл супернатанта культуры в каждую лунку. NucleoFast 96 снова промывают центрифугированием (4500 g в течение 30 мин), для чего добавляют 100 мкл H2O в кажFrom individual E. coli colonies obtained after each round by the methods described above, phage culture supernatants are collected using the usual method (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (MACHEREY-NAGEL) is used for ultrafiltration of collected culture supernatants. The eluate is removed by centrifugation (4500 g, 45 min) of NucleoFast 96 plates, into which 100 μl of culture supernatant was added to each well. NucleoFast 96 is washed again by centrifugation (4500 g for 30 min), for which 100 μl of H 2 O is added to each
- 105 046075 дую лунку. В итоге добавляют 100 мкл TBS, и суспензию фага, содержащуюся в супернатантах в лунках планшета NucleoFast 96, которые оставляли при комнатной температуре на 5 мин, извлекают.- 105 046075 I’m blowing a hole. Finally, 100 μl of TBS is added, and the phage suspension contained in the supernatants in the wells of the NucleoFast 96 plate, which were left at room temperature for 5 min, is removed.
Очищенные фаги с добавлением TBS или АТФ/TBS подвергают иммуноферментному анализу (ELISA) по следующей процедуре. Планшеты для микротитрования StreptaWell 96 (фирма Roche) иммобилизуют в течение ночи 100 мкл TBS, содержащего биотинилированные антигены (hCD137-Fc-Bio или bio-hCD137), полученные в Примере 1. После удаления биотинилированных антигенов, которые не связались с планшетом, путем промывания каждой лунки планшета трис-буферным солевым раствором (TBST), лунки блокируют 250 мкл 2% обезжиренного молока-TBS в течение 1 ч или более. 2% обезжиренное молоко-TBS удаляют, после чего фаги, презентирующие антитела, связываются с биотинилированным антигеном, присутствующим в каждой лунке в отсутствие и в присутствии АТФ, оставляя планшеты с подготовленными очищенными фагами, добавленными в каждую лунку при 37°C на 1 ч. В каждую лунку, промытую TBST или АТФ/TBST, добавляют HRP-конъюгированные анти-М13 антитела (фирма GE Healthcare, номер в каталоге 27-9421-01), разведенные TBS или АТФ/TBS, и планшет инкубируют в течение одного часа. После промывки TBST или АТФ/TBST проявление цвета раствора в каждой лунке, в которую был добавлен единый раствор ТМВ (фирма ZYMED), останавливают добавлением серной кислоты, а затем проявление цвета измеряют по поглощению при 450 нм.Purified phages supplemented with TBS or ATP/TBS are subjected to enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) using the following procedure. StreptaWell 96 microtiter plates (Roche) are immobilized overnight with 100 μl of TBS containing biotinylated antigens (hCD137-Fc-Bio or bio-hCD137) obtained in Example 1. After removing biotinylated antigens that are not bound to the plate by washing each well of the plate with Tris-buffered saline (TBST), the wells are blocked with 250 μl of 2% skim milk-TBS for 1 h or more. The 2% skim milk-TBS was removed, after which the antibody-presenting phages bound to the biotinylated antigen present in each well in the absence and presence of ATP, leaving the plates with the prepared purified phages added to each well at 37°C for 1 h. HRP-conjugated anti-M13 antibody (GE Healthcare, catalog no. 27-9421-01) diluted in TBS or ATP/TBS is added to each well washed with TBST or ATP/TBST and the plate is incubated for one hour. After washing with TBST or ATP/TBST, the color development of the solution in each well to which a single TMB solution (ZYMED) was added was stopped by adding sulfuric acid, and then the color development was measured by absorbance at 450 nm.
В результате идентифицировано несколько антител с измененной связывающей активностью с biohCD137 или hCD137-Fc-Bio в присутствии и в отсутствие АТФ.As a result, several antibodies were identified with altered binding activity to biohCD137 or hCD137-Fc-Bio in the presence and absence of ATP.
В качестве примера, результаты фагового ELISA с использованием клонов после 4 и 5 раундов пэннинга показаны в табл. 10.As an example, the results of phage ELISA using clones after 4 and 5 rounds of panning are shown in Table. 10.
В настоящем изобретении клоны с абсорбцией 0,2 или более в присутствии АТ Ф и отношением S/N (сигнал/шум) абсорбции выше 2 в присутствии/отсутствие антигена определяют как положительные клоны. Кроме того, среди положительных клонов клоны с коэффициентом абсорбцией S/N выше 2 раза в присутствии/отсутствие АТФ считают клонами с АТФ-зависимой антигенсвязывающей активностью (переключаемые клоны).In the present invention, clones with an absorbance of 0.2 or more in the presence of ATP and an absorbance S/N ratio greater than 2 in the presence/absence of antigen are defined as positive clones. In addition, among the positive clones, clones with an S/N absorption ratio greater than 2 times in the presence/absence of ATP are considered clones with ATP-dependent antigen-binding activity (switchable clones).
Таблица 10Table 10
(2-2-3) Анализ последовательности переключаемых антител, антигенсвязывающая активность которых изменяется присутствием/отсутствием АТФ.(2-2-3) Analysis of the sequence of switchable antibodies, the antigen-binding activity of which is changed by the presence/absence of ATP.
Нуклеотидные последовательности генов, амплифицированных из клонов с АТФ-зависимой антигенсвязывающей активностью (переключаемые клоны) на основе результатов ELISA фага, анализируют с использованием специфических праймеров pBAD-F, G1seq-R. В результате анализа получены нуклеотидные последовательности клонов, которые, как установлено, связываются с CD137 человека в присутствии АТФ, но не с CD137 человека в отсутствие АТФ.The nucleotide sequences of genes amplified from clones with ATP-dependent antigen-binding activity (switched clones) based on phage ELISA results are analyzed using specific primers pBAD-F, G1seq-R. The analysis resulted in nucleotide sequences of clones that were found to bind to human CD137 in the presence of ATP, but not to human CD137 in the absence of ATP.
(2-3) Отбор переключаемых антител.(2-3) Selection of switchable antibodies.
Семнадцать образцов отобраны из клонов, которые, как было установлено, обладают АТФзависимой антигенсвязывающей активностью, полученной в результате анализов в примерах 2-1-3 и 2-23; названия клонов повторно присвоены, как описано в табл. 11.Seventeen samples were selected from clones that were found to have ATP-dependent antigen-binding activity from the assays in Examples 2-1-3 and 2-23; clone names were reassigned as described in Table. eleven.
- 106 046075- 106 046075
Таблица 11Table 11
(2-4) Экспрессия и очистка переключаемых антител, антигенсвязывающая активность которых изменяется присутствием/отсутствием АТФ.(2-4) Expression and purification of switchable antibodies whose antigen-binding activity is altered by the presence/absence of ATP.
Гены, кодирующие вариабельные области антител, описанных в табл. 11, которые получают из рационально разработанной фаговой библиотеки, инсертируют в плазмиды IgG1 человека/Lambda для экспрессии у животных. Антитела экспрессируют с использованием описанных ниже методов. Приготовленные плазмиды вводят методом липофекции в производную от клеток линию клеток FreeStyle 293-F, полученную от почки плода человека (фирма Invitrogen), которую суспендируют в среде для экспрессии FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) при плотности клеток 1,33х106 клеток/мл, полученную суспензию высевают по 3 мл в каждую лунку 6-луночных планшетов. Антитела очищают с использованием rProtein A Sepharose™ Fast Flow (фирма Amersham Biosciences) из супернатантов культур, культивированных в течение четырех дней в инкубаторе с CO2 (37°C, 8% CO2, 90 об/мин) методом, известным специалистам в данной области. Спектрофотометры используют для измерения абсорбции очищенных растворов антител при 280 нм. По полученным результатам измерений концентрации очищенных антител были рассчитывают с использованием коэффициентов экстинкции, рассчитанных методом РАСЕ (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).Genes encoding the variable regions of the antibodies described in table. 11, which are obtained from a rationally designed phage library, are inserted into human IgG1/Lambda plasmids for expression in animals. Antibodies are expressed using the methods described below. The prepared plasmids are introduced by lipofection into the FreeStyle 293-F cell-derived cell line obtained from a human fetal kidney (Invitrogen), which is suspended in FreeStyle 293 expression medium (Invitrogen) at a cell density of 1.33 x 10 6 cells/ml, obtained the suspension is sown 3 ml into each well of 6-well plates. Antibodies are purified using rProtein A Sepharose™ Fast Flow (Amersham Biosciences) from culture supernatants cultured for four days in a CO 2 incubator (37°C, 8% CO 2 , 90 rpm) by a method known to those skilled in the art. areas. Spectrophotometers are used to measure the absorbance of purified antibody solutions at 280 nm. From the obtained measurement results, the concentrations of purified antibodies were calculated using extinction coefficients calculated by the PACE method (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).
(2-5) Оценка анти-CD137 антител, идентифицированных методом фагового дисплея.(2-5) Evaluation of anti-CD137 antibodies identified by phage display.
(2-5-1) Экспрессия и очистка переключаемых антител, которые связываются с антигенами, в зависимости от наличия или отсутствия АТФ и его метаболитов.(2-5-1) Expression and purification of switchable antibodies that bind antigens depending on the presence or absence of ATP and its metabolites.
Гены, кодирующие вариабельные области антител, полученных из рационально сконструированной фаговой библиотеки человека, инсертируют в плазмиды экспрессии животных, имеющие константную область тяжелой цепи, слитую с геном, кодирующим Gly и Lys ниже по цепи модифицированного IgG1 человека (Р253) (SEQ ID NO: 93), и константную область легкой цепи, лямбда-цепи Lamlib (SEQ ID NO: 63). Обозначения и порядковые номера клонов перечислены в табл. 12.Genes encoding the variable regions of antibodies obtained from a rationally constructed human phage library are inserted into animal expression plasmids having a heavy chain constant region fused to a gene encoding Gly and Lys downstream of a modified human IgG1 (P253) (SEQ ID NO: 93 ), and a light chain constant region, the Lamlib lambda chain (SEQ ID NO: 63). Designations and serial numbers of clones are listed in table. 12.
- 107 046075- 107 046075
Таблица 12Table 12
Исследуемые клоныResearch clones
После экспрессирования антитела очищают методами, известными специалистам в данной области. Спектрофотометры применяют для измерения оптической плотности очищенных растворов антител при 280 нм. По установленным значениям рассчитывают концентрации очищенных антител, используя коэффициенты экстинкции, рассчитанные методом РАСЕ (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).Once expressed, the antibodies are purified by methods known to those skilled in the art. Spectrophotometers are used to measure the optical density of purified antibody solutions at 280 nm. From the established values, the concentrations of purified antibodies are calculated using extinction coefficients calculated by the PACE method (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).
(2-5-2) Оценка методом поверхностного плазмонного резонанса влияния АТФ, АДФ и АМФ на связывание CD137 человека.(2-5-2) Assessment by surface plasmon resonance of the effect of ATP, ADP and AMP on the binding of human CD137.
Biacore T200 (фирма GE Healthcare) используют для анализа взаимодействия антиген-антитело между анти-CD137 антителами и hCD137 (расщепление FXa). Ahtu-CD137 антитела захватывают на сенсорном чипе CM3 (фирма GE Healthcare), на котором был иммобилизован белок G (фирма CALBIOCHEM) в соответствующих количествах с помощью метода связывания с амином, и hCD137 (расщепление FXa), полученный в примере 1-2, может вступать в реакцию взаимодействовать. В качестве подвижного буфера используют 20 мМ ACES, 150 мМ NaCl, 2 мМ MgC12, 0,05% Tween20 (pH 7,4) и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5) в качестве раствора для регенерации.Biacore T200 (GE Healthcare) is used to analyze the antigen-antibody interaction between anti-CD137 antibodies and hCD137 (FXa cleavage). Ahtu-CD137 antibodies are captured on a CM3 sensor chip (GE Healthcare) on which Protein G (CALBIOCHEM) has been immobilized in appropriate amounts using the amine coupling method, and hCD137 (FXa cleavage) obtained in Example 1-2 can react interact. 20 mM ACES, 150 mM NaCl, 2 mM MgC12, 0.05% Tween20 (pH 7.4) and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5) are used as the running buffer.
После улавливания антител к CD137, суспендированных в TBS, в каждую проточную кювету вводят 500 нМ hCD137 (расщепление FXa) при скорости потока 10 мкл/мин в течение трех минут. Этот трехминутный период служит фазой связывания для hCD137 (расщепление FXa), а после окончания фазы связывания двухминутный период переключения на рабочий буфер служит фазой диссоциации для hCD137 (расщепление FXa). После завершения фазы диссоциации регенерирующий раствор вводят со скоростью 30 мкл/мин в течение 30 с. Выше представлен цикл измерения связывающей активности антиCD137 антител. Связывающее количество hCD137 (расщепленный FXa), которое взаимодействует с анти-CD137-антителом в фазе связывания, регулируют количеством захваченного антитела. Программное обеспечение Biacore T200 Evaluation Software Version 2,0 используют для отображения количества связывания (RU) на 1RU захватываемого лиганда, и получают значения количества захваченного антитела и количества связываемого антигена. Количество связанного антигена показано в табл. 13. Поскольку количество связанного антигена отражает связывающую активность, можно сказать, что зависимость от низкомолекулярного соединения распознается, когда значение в присутствии низкомолекулярного соединения (АТФ, АДФ или АМФ) выше, чем значение без низкомолекулярного соединения. В частности, чем больше разница, тем выше зависимость от низкомолекулярного соединения.After capturing anti-CD137 antibodies suspended in TBS, 500 nM hCD137 (FXa digestion) was injected into each flow cell at a flow rate of 10 μL/min for three minutes. This three-minute period serves as the binding phase for hCD137 (FXa cleavage), and after the end of the binding phase, a two-minute period of switching to the running buffer serves as the dissociation phase for hCD137 (FXa cleavage). After completion of the dissociation phase, the regenerating solution is administered at a rate of 30 μl/min for 30 s. Above is a cycle for measuring the binding activity of anti-CD137 antibodies. The binding amount of hCD137 (cleaved FXa) that interacts with the anti-CD137 antibody in the binding phase is controlled by the amount of antibody captured. Biacore T200 Evaluation Software Version 2.0 is used to display the binding amount (RU) per 1RU of captured ligand, and the values of the amount of antibody captured and the amount of antigen bound are obtained. The amount of bound antigen is shown in Table. 13. Since the amount of antigen bound reflects binding activity, small molecule dependence can be said to be recognized when the value in the presence of the small molecule compound (ATP, ADP or AMP) is higher than the value without the small molecule compound. In particular, the greater the difference, the greater the dependence on the small molecule compound.
Таблица 13Table 13
- 108 046075- 108 046075
(2-5-3) Оценка связывающей активности с антигеном CD137 обезьяны.(2-5-3) Evaluation of binding activity to monkey CD137 antigen.
Полученные антитела оценивают по связыванию с CD137 обезьяны методом ELISA. Полученный в примере 1 cyCD137-Fc-BAP иммобилизуют на планшетах для микротитрования Streptawell. После удаления несвязавшегося антигена из планшетов промыванием каждой лунки планшетов промывочным буфером лунки блокируют 150 мкл блокирующего буфера (TBS с 2% БСА) в течение 1 ч или более. Блокирующий буфер удаляют из каждой лунки и в каждую лунку добавляют 100 мкл очищенных антител, разведенных в TBS с конечной концентрацией 1 мМ АДФ или TBS с конечной концентрацией 1 мМ АДФ. Планшет, в который вносили антитело, встряхивают при 600 об/мин в течение 1 ч. АР-конъюгированные антитела против лямбда человека (фирма BETHYL), разведенные в TBS с конечной концентрацией 1 мМ АДФ, добавляют в каждую лунку после промывания промывочным буфером (TBS с 0,1% Tween20), содержащим конечную концентрацию 1 мМ АДФ. После инкубации в течение одного часа и промывки промывочным буфером с конечной концентрацией 1 мМ АТФ, добавляют фосфатный субстрат BluePhos (KPL). Развитие цвета измеряют по абсорбции при 600 нм. Скорость увеличения абсорбции при концентрации антитела 0 мкг/мл показана в табл. 14. Можно сказать, что образцы с зависимым от концентрации увеличением коэффициента абсорбции связаны с CD137 обезьяны.The resulting antibodies were assessed for binding to monkey CD137 by ELISA. The cyCD137-Fc-BAP obtained in Example 1 was immobilized on Streptawell microtiter plates. After removing unbound antigen from the plates by washing each well of the plates with wash buffer, the wells are blocked with 150 μl of blocking buffer (TBS with 2% BSA) for 1 hour or more. The blocking buffer is removed from each well and 100 μl of purified antibodies diluted in TBS with a final concentration of 1 mM ADP or TBS with a final concentration of 1 mM ADP is added to each well. The plate into which the antibody was added was shaken at 600 rpm for 1 hour. AP-conjugated anti-human lambda antibodies (BETHYL), diluted in TBS with a final concentration of 1 mM ADP, were added to each well after washing with wash buffer (TBS with 0.1% Tween20) containing a final concentration of 1 mM ADP. After incubation for one hour and washing with wash buffer with a final concentration of 1 mM ATP, BluePhos phosphate substrate (KPL) is added. Color development is measured by absorbance at 600 nm. The rate of increase in absorption at an antibody concentration of 0 μg/ml is shown in table. 14. Samples with a concentration-dependent increase in absorption coefficient can be said to be associated with monkey CD137.
Таблица 14Table 14
Коэффициент поглощенияAbsorption coefficient
(2-5-4) Оценка агонистической активности CD137 с использованием клеток Jurkat.(2-5-4) Evaluation of CD137 agonist activity using Jurkat cells.
Клеточную линию GloResponse™ NF-kappa B-Luc2/4-1BB Jurkat (фирма Promega) используют дляThe GloResponse™ NF-kappa B-Luc2/4-1BB Jurkat cell line (Promega) is used for
- 109 046075 измерения активности антител in vitro. В каждую лунку 384-луночных планшетов добавляют 10 мкл клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), приготовленных в концентрации 2х106/мл в среде для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Затем в каждую лунку добавляют 10 мкл раствора антитела, содержащего АДФ, или раствора антитела, содержащего АТФ, или раствора антитела, не содержащего АТФ или АДФ. Затем в каждую лунку добавляют 10 мкл клеточной линии GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat, приготовленной в концентрации 2х106/мл в среде для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Конечная концентрация АДФ составляет 50 мкМ; конечная концентрация АТФ составляет 50 мкМ. Планшеты оставляют на шесть часов при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2, затем 15 мин при комнатной температуре и добавляют 30 мкл реагента Bio-Glo в каждую лунку. Систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат) применяют для реагента Bio-Glo. Впоследствии люминесценцию каждой лунки измеряют с помощью планшет-ридера. Значение люминесценции каждой лунки, деленное на величину люминесценции лунки без добавленных антител, представляет кратность люминесценции и служит индикатором для оценки активности каждого антитела.- 109 046075 measurements of antibody activity in vitro. To each well of 384-well plates, add 10 μl of FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega), prepared at a concentration of 2x10 6 /ml in assay medium (99% RPMI, 1% PBS). Then, 10 μl of an antibody solution containing ADP, or an antibody solution containing ATP, or an antibody solution not containing ATP or ADP, is added to each well. Then 10 μl of the GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line, prepared at a concentration of 2x10 6 /ml in assay medium (99% RPMI, 1% PBS), is added to each well. The final concentration of ADP is 50 μM; the final ATP concentration is 50 µM. The plates are left for six hours at 37°C in a 5% CO 2 incubator, then 15 minutes at room temperature and 30 μl of Bio-Glo reagent is added to each well. The Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate) is used for the Bio-Glo reagent. Subsequently, the luminescence of each well is measured using a plate reader. The luminescence value of each well divided by the luminescence value of the well without added antibodies represents the luminescence fold and serves as an indicator for assessing the activity of each antibody.
Полученные результаты показаны на фиг. 1 и 2. Фиг. 1 и 2 подтверждают, что все антитела, кроме NS1-P253, которое не является переключаемым антителом, проявляют агонистическую активность CD137 человека АТФ- и АДФ-зависимым образом.The results obtained are shown in Fig. 1 and 2. FIG. 1 and 2 confirm that all antibodies except NS1-P253, which is not a switch antibody, exhibit human CD137 agonist activity in an ATP- and ADP-dependent manner.
(2-6) Оценка агонистической активности CD137 in vitro переключаемых антител, полученных методом пэннинга, с использованием Т-клеток человека.(2-6) Evaluation of CD137 agonistic activity in vitro of switchable panned antibodies using human T cells.
(2-6-1) Размножение культур Т-клеток человека.(2-6-1) Propagation of human T-cell cultures.
Используют мононуклеарные клетки периферической крови человека, выделенные из образцов крови здоровых добровольцев. 50 мл крови смешивают с 0,5 мл гепарина и дополнительно разбавляют 50 мл ФСБ. Мононуклеарные клетки периферической крови человека выделяют в два этапа, описанные ниже. На первом этапе в пробирки Leucosep (фирма greiner bio-one) вносят Ficoll-Paque PLUS (фирма GE Healthcare) и центрифугируют 1000xg в течение одной минуты при комнатной температуре с последующим добавлением крови, разбавленной ФСБ, и центрифугируют при комнатной температуре в режиме 400xg в течение 30 мин. На втором этапе лейкоцитарный слой собирают из пробирок после центрифугирования и затем промывают 60 мл ФСБ (фирма Wako). Затем используют набор для активации/размножения Т-клеток человека (фирма MACS Miltenyi biotec) для размножения культур Т-клеток.Human peripheral blood mononuclear cells isolated from blood samples of healthy volunteers are used. 50 ml of blood is mixed with 0.5 ml of heparin and further diluted with 50 ml of PBS. Human peripheral blood mononuclear cells are isolated in two steps, described below. In the first step, Ficoll-Paque PLUS (GE Healthcare) is added to Leucosep tubes (Greiner Bio-one) and centrifuged at 1000xg for one minute at room temperature, followed by the addition of blood diluted with PBS and centrifuged at room temperature at 400xg in for 30 minutes. In the second step, the buffy coat is collected from the tubes after centrifugation and then washed with 60 ml of PBS (Wako). A human T cell activation/expansion kit (MACS Miltenyi biotec) is then used to expand the T cell cultures.
(2-6-2) Оценка агонистической активности CD137 in vitro с использованием Т-клеток человека.(2-6-2) Evaluation of CD137 agonist activity in vitro using human T cells.
2х104 Т-клеток, происходящих из мононуклеарных клеток периферической крови, и 2х104 клеток REC-1 суспендируют в 100 мкл среды RPMI1640, содержащей 30 ЕД/мл IL-2 человека (фирма SIGMA), 10 нг/мл РМА (фирма SIGMA), 0,5 мкг/мл иономицина, 500 мкМ АДФ-бета-S (фирма Sigma) и 10% ФСТ (фирма Sigma), высевают в 96-луночные многолуночные планшеты с плоским дном (фирма Corning) с контрольным антителом IC17HdK-hIgG1/IC17L-k0, NS1-P253, которое является антителом с АТФнезависимой связывающей активностью в отношении CD137-человека (называемым во всех приводимых в настоящем описании примерах непереключаемым антителом или непереключаемым анmи-CD137 антителом), или с любым из клонов, описанных в табл. 12. NS1-P253, IC17HdK-hIgG1/IC17L-k0 и клоны, описанные в табл. 12, оценивают в концентрации 10 мкг/мл. Также оценивают выработку IFN-γ в АДФ-бета^-минус среде. Планшеты встряхивают и затем оставляют при 37°C в течение 72 ч в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. Затем культуральные супернатанты собирают и определяют количество IFN-γ, содержащегося в культуральных супернатантах, используя набор Human IFN-γ ELISA Development Kit (фирма PeproTech). Метод ELISA осуществляют в соответствии с инструкциями производителя (фирма PeproTech). Измерения абсорбции проводят на приборе EnVision (фирма PerkinElmer).2 x 10 4 T cells derived from peripheral blood mononuclear cells and 2 x 10 4 REC-1 cells are suspended in 100 μl of RPMI1640 medium containing 30 U/ml human IL-2 (SIGMA), 10 ng/ml PMA (SIGMA) , 0.5 μg/ml ionomycin, 500 μM ADP-beta-S (Sigma) and 10% FST (Sigma), seeded in 96-well flat-bottom multiwell plates (Corning) with control antibody IC17HdK-hIgG1/ IC17L-k0, NS1-P253, which is an antibody with ATP-independent binding activity against human CD137 (referred to in all examples herein as a non-switchable antibody or a non-switchable anti-CD137 antibody), or any of the clones described in Table 1. 12. NS1-P253, IC17HdK-hIgG1/IC17L-k0 and clones described in table. 12, evaluated at a concentration of 10 μg/ml. IFN-γ production is also assessed in ADP-beta^-minus medium. The plates are shaken and then left at 37°C for 72 hours in an incubator under 5% CO2. The culture supernatants are then collected and the amount of IFN-γ contained in the culture supernatants is determined using the Human IFN-γ ELISA Development Kit (PeproTech). The ELISA method is carried out in accordance with the manufacturer's instructions (PeproTech). Absorbance measurements are carried out using an EnVision instrument (PerkinElmer).
Результаты показаны на фиг. 3.The results are shown in Fig. 3.
Было подтверждено, что dBBAT007-P253, dBBAT013-P253, dBBAT015-Р253, dBBAT019-P253, dBBAT021-P253, dBBAT025-P253, dBBAT031-P253, dBBAT042-P253, dBBAT056-P253, dBBAT118-P253, dBBAT121-P253, dBBAT122-P253 и dBBATl 19-P253 проявляют агонистическую активность в отношении CD137 человека в АДФ-бета^-зависимым образом. АДФ-бета-S является аналогом АДФ, который менее подвержен гидролизу, чем АДФ. Это указывает на возможность того, что эти hhtu-CD137 человека переключаемые антитела проявляют агонистическую активность в отношении CD137 человека, зависящую от небольшой молекулы, такой как АТФ, АДФ или АМФ.It has been confirmed that dBBAT007-P253, dBBAT013-P253, dBBAT015-P253, dBBAT019-P253, dBBAT021-P253, dBBAT025-P253, dBBAT031-P253, dBBAT042-P253, dBBAT056-P253, dBBAT118-P253 , dBBAT121-P253, dBBAT122- P253 and dBBATl 19-P253 exhibit agonistic activity against human CD137 in an ADP-beta^-dependent manner. ADP-beta-S is an analogue of ADP that is less susceptible to hydrolysis than ADP. This raises the possibility that these human hhtu-CD137 switch antibodies exhibit agonistic activity against human CD137 dependent on a small molecule such as ATP, ADP or AMP.
(2-6-3) Оценка агонистической активности CD137 in vitro с использованием Т-клеток человека (2).(2-6-3) Evaluation of CD137 agonist activity in vitro using human T cells (2).
2х104 мононуклеарные клетки периферической крови человека, полученные из Т-клеток, и 2х104 клеток REC-1 суспендируют в 100 мкл среды RPMI1640, содержащей 30 ЕД/мл IL-2 человека (фирма SIGMA), 10 нг/мл РМА (фирма SIGMA), 0,5 мкг/мл иономицина, 500 мкМ АДФ-бета-S (фирма Sigma) и 10% ФСТ (фирма Sigma), и высевают в 96-луночные плоскодонные планшеты (фирма Corning), либо CNS1-P253 (непереключаемое антитело), либо с dBBAT119-P253. NS1-P253 и dBBAT119-P253 оценивают в концентрации 10, 2, 0,4, 0,08, 0,016, 0,0032 и 0,00064 мкг/мл. Планшеты встряхивают и оставляют при 37°C на 72 ч в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. Затем собирают культуральные супернатанты и определяют количество IFN-γ, содержащегося в культуральных супернатантах, с использованием набора для метода ELISA для IFN-γ человека (фирма PeproTech). Измерения абсорбции проводят с помощью2x10 4 human peripheral blood mononuclear cells derived from T cells and 2x10 4 REC-1 cells were suspended in 100 μl of RPMI1640 medium containing 30 U/ml human IL-2 (SIGMA), 10 ng/ml PMA (SIGMA ), 0.5 μg/ml ionomycin, 500 μM ADP-beta-S (Sigma) and 10% FST (Sigma), and seeded in 96-well flat-bottom plates (Corning), or CNS1-P253 (non-switchable antibody ), or with dBBAT119-P253. NS1-P253 and dBBAT119-P253 were evaluated at concentrations of 10, 2, 0.4, 0.08, 0.016, 0.0032, and 0.00064 μg/mL. The plates are shaken and left at 37°C for 72 hours in an incubator under 5% CO2. The culture supernatants were then collected and the amount of IFN-γ contained in the culture supernatants was determined using a human IFN-γ ELISA kit (PeproTech). Absorbance measurements are carried out using
- 110 046075- 110 046075
EnVision (фирма PerkinElmer).EnVision (PerkinElmer).
Результаты представлены на фиг. 4.The results are presented in Fig. 4.
Было подтверждено, что dBBAT119-P253 проявляет агонистическую активность в отношении CD137 человека в присутствии АДФ-бета-S. Это указывает на возможность того, что dBBAT119-P253 проявляет агонистическую активность в отношении CD137 человека в зависимости от небольшой молекулы, такой как АТФ, АДФ или АМФ.dBBAT119-P253 was confirmed to exhibit agonistic activity against human CD137 in the presence of ADP-beta-S. This raises the possibility that dBBAT119-P253 exhibits agonistic activity against human CD137 in a small molecule-dependent manner such as ATP, ADP, or AMP.
Пример 3. Повышение связывающей активности антител, связывающих антигены в присутствии малых молекул, с использованием рационально разработанных библиотек легких и тяжелых цепей.Example 3: Enhancing the binding activity of antibodies that bind antigens in the presence of small molecules using rationally designed light and heavy chain libraries.
(3-1) Создание библиотеки для повышения связывающей активности с использованием рационально разработанной библиотеки легких цепей.(3-1) Library generation to enhance binding activity using a rationally designed light chain library.
Для библиотеки антител, содержащей большое количество антител, собранных в примере 2-2-1, с АТФ-зависимой антигенсвязывающей активностью, усиление связывающей активности осуществляют путем повторной библиотекаризации легких цепей антитела.For an antibody library containing a large number of antibodies collected in Example 2-2-1 with ATP-dependent antigen-binding activity, enhancement of the binding activity is accomplished by re-librarianship of the antibody light chains.
Области легкой цепи и тяжелой цепи рационально сконструированной библиотеки фагового дисплея антитела, сконструированной в предыдущем патенте WO 2015/083764, используют для конструирования библиотеки легкой цепи антитела и библиотеки тяжелой цепи антитела для усиления связывающей активности. Их вводят в указанную выше библиотеку легких цепей или в области легкой цепи или тяжелой цепи библиотеки фагмидных векторов, собранные в примере 2-2-1, и вводят в штамм Е. coli ER2738 путем электропорации.The light chain and heavy chain regions of the rationally designed antibody phage display library constructed in the previous patent WO 2015/083764 are used to construct an antibody light chain library and an antibody heavy chain library to enhance binding activity. They are introduced into the above light chain library or into the light chain or heavy chain region of the phagemid vector library assembled in Example 2-2-1 and introduced into E. coli strain ER2738 by electroporation.
(3-2) Повышение связывающей активности антител с АТФ-зависимой антигенсвязывающей активностью с использованием рационально разработанной библиотеки.(3-2) Enhancing the binding activity of antibodies with ATP-dependent antigen-binding activity using a rationally designed library.
Фаги получают обычным способом из Е. coli, несущий сконструированную фагмиду фагового дисплея. В частности, штамм Е. coli, несущую сконструированный фагмидный вектор, инфицируют M13KO7TC (WO 2015/046554) или Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (гиперфаг) (фирма PROGEN Biotechnik), и фаги собирают из супернатантов после культивирования в течение ночи при 30°C. Суспензию фаговой библиотеки получают разбавлением TBS популяции фагов, осажденных путем добавления 2,5 М NaCl/10% PEG к культуре Е. coli, в которой осуществляли выработку фага. Затем к раствору фаговой библиотеки добавляют БСА до конечной концентрации 4%. Пэннинг проводят, используя антиген, иммобилизованный на магнитных гранулах. Покрытые NeutrAvidin гранулы (Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated), гранулы NeutrAvidin (фирма TAMAGAWA SEIKI) или гранулы Dynabeads MyOne StreptAvidin T1 (фирма Thermo Fisher Scientific) применяют в качестве магнитных гранул. В качестве антигена применяют биотинилированный hCD137-Fc.Phages are produced in the usual manner from E. coli carrying an engineered phage display phagemid. Specifically, an E. coli strain carrying the constructed phagemid vector is infected with M13KO7TC (WO 2015/046554) or Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (hyperphage) (PROGEN Biotechnik), and the phages are collected from the supernatants after overnight cultivation at 30°C. A phage library suspension is prepared by diluting the phage population with TBS, precipitated by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to the E. coli culture in which the phage was produced. BSA is then added to the phage library solution to a final concentration of 4%. Panning is carried out using antigen immobilized on magnetic beads. NeutrAvidin-coated beads (Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated), NeutrAvidin beads (TAMAGAWA SEIKI) or Dynabeads MyOne StreptAvidin T1 (Thermo Fisher Scientific) are used as magnetic beads. Biotinylated hCD137-Fc is used as an antigen.
Пэннинг проводят для эффективного получения низкомолекулярных переключаемых антител, которые зависят от малой молекулы, которая может играть роль переключателя в раковых тканях. В частности, пэннинг для обогащения антител, которые связываются с антигенами в присутствии аденозинтрифосфата (аденозин-5'-трифосфата; АТФ) - небольшую молекулы, и не связывается с антигенами в отсутствие АТФ, выполняют со ссылкой на методы, изложенные в предыдущем патенте WO 2015/083764.Panning is carried out to efficiently produce small molecule switchable antibodies that depend on a small molecule that can act as a switch in cancerous tissues. In particular, panning to enrich antibodies that bind to antigens in the presence of adenosine triphosphate (adenosine-5'-triphosphate; ATP), a small molecule, and does not bind to antigens in the absence of ATP, is performed with reference to the methods set forth in the previous WO 2015 patent. /083764.
(3-3) Оценка связывающей активности в присутствии и в отсутствие АТФ с помощью фагового ELISA.(3-3) Assessment of binding activity in the presence and absence of ATP using phage ELISA.
Из отдельных колоний Е. coli, полученных после каждого раунда описанными выше методами, супернатанты фагосодержащих культур собирают с использованием обычного метода (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145).From individual E. coli colonies obtained after each round by the methods described above, phage culture supernatants are collected using the usual method (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145).
Связывающую активность с CD137 человека в присутствии и в отсутствие АТФ затем подтверждают методами фагового ELISA, описанными в примере 2-2-2.Binding activity to human CD137 in the presence and absence of ATP was then confirmed by phage ELISA methods described in Example 2-2-2.
Результаты представлены на фиг. 5.The results are presented in Fig. 5.
Был получен ряд клонов, которые были признаны клонами, обладающими АТФ-зависимой антигенсвязывающей активностью, с отношением поглощения S/N более 2 в присутствии/в отсутствие антигена и отношением S/N поглощения более 2 в присутствии/отсутствии АТФ (переключенные клоны).A number of clones were obtained that were found to have ATP-dependent antigen-binding activity with an S/N uptake ratio greater than 2 in the presence/absence of antigen and an S/N uptake ratio greater than 2 in the presence/absence of ATP (switched clones).
Пример 4. Выработка модифицированных анти-CD137 антител и оценка их активности.Example 4. Production of modified anti-CD137 antibodies and evaluation of their activity.
(4-1) Повышение связывающей активности за счет изменения dBBAT119Н-P253/dBBAT119LLamLib.(4-1) Increased binding activity by changing dBBAT119H-P253/dBBAT119LLamLib.
Варианты вариабельной области тяжелой цепи, dBAT119H, и вариабельной области легкой цепи, dBAT119L, анти-CD137 антитела (название клона: dBBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib), полученные в примере 2-4, получают методами, известными специалистам в данной области, например ПЦР. Для вариабельной области тяжелой цепи создают варианты, в которых D10 (относится к аспарагиновой кислоте (Asp) в положении 10 (нумерация по Kabat)) и G17 (относится к глицину (Gly) в положении 17 (нумерация по Kabat)) dBBAT119H заменены глицином (Gly) и серином (Ser), соответственно, с получением dBBAT119H010; и N99 (в отношении аспарагина (Asn) в позиции 99 (нумерация по Kabat)), M100а (в отношении метионина (Met) в позиции 100а (нумерация по Kabat)) и N100b (в отношении аспарагина (Asn) в позиции 100b (нумерация по Kabat) )) dBBAT119H010 заменены другими аминокислотами. Для вариабельной области легкой цепи были созданы варианты, в которых F87 (относящийся к фенилаланиThe heavy chain variable region, dBAT119H, and light chain variable region, dBAT119L, anti-CD137 antibody variants (clone name: dBBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib) obtained in Example 2-4 are prepared by methods known to those skilled in the art, e.g. PCR. For the heavy chain variable region, variants are created in which D10 (referring to aspartic acid (Asp) at position 10 (Kabat numbering) and G17 (referring to glycine (Gly) at position 17 (Kabat numbering)) dBBAT119H are replaced with glycine ( Gly) and serine (Ser), respectively, yielding dBBAT119H010; and N99 (for asparagine (Asn) at position 99 (Kabat numbering)), M100a (for methionine (Met) at position 100a (Kabat numbering)) and N100b (for asparagine (Asn) at position 100b (numbering by Kabat) )) dBBAT119H010 are replaced by other amino acids. For the light chain variable region, variants have been created in which F87 (related to phenylalanium
- 111 046075 ну (Phe) в положении 87 (нумерация по Kabat)) dBBAT119L заменен тирозином (Tyr) с образованием dBBAT119L010; и D27b (относится к аспартату (Asp) в позиции 27b (нумерация по Kabat)), N31 (относится к аспарагину (Asn) в позиции 31 (нумерация по Kabat)) и D94 (относится к аспартату (Asp) в позиции 94 (нумерация по Kabat))) в dBBAT119L010 заменены другими аминокислотами.- 111 046075 well (Phe) at position 87 (Kabat numbering)) dBBAT119L is replaced by tyrosine (Tyr) to form dBBAT119L010; and D27b (referring to aspartate (Asp) at position 27b (Kabat numbering), N31 (referring to asparagine (Asn) at position 31 (Kabat numbering)) and D94 (referring to aspartate (Asp) at position 94 (Kabat numbering) according to Kabat))) in dBBAT119L010 are replaced by other amino acids.
Для вариантов вариабельной области тяжелой цепи связывающую активность с CD137 человека измеряют с помощью анализатора поверхностного плазмонного резонанса BiacoreT200 (фирма GE Healthcare). Антитела захвачены путем взаимодействия очищенных вариантов с иммобилизованным белком G (фирма CALBIOCHEM) на сенсорном чипе CM3 серии S (фирма GE Healthcare). Затем раствор CD137 человека (расщепленного FXa) с добавлением АТФ или раствор CD137 человека (расщепленного FXa) без АТФ взаимодействует в присутствии АТФ и в отсутствие АТФ для оценки связывающей активности вариантов по отношению к CD137 человека (расщепленного FXa). Измерения проводят при 25°C с использованием подвижного буфера, включающего 20 мМ ACES, 150 мМ NaCl, 0,05% Tween20 и 2 мМ MgCl2, pH 7,4. Результаты измерений показывают, что вариант L100а (вариант, в котором метионин (Met) в положении 100а (нумерация по Kabat) заменен лейцином (Leu)) имеет повышенную связывающую активность с CD137 человека только в присутствии АТФ (фиг. 6). Вариабельная область тяжелой цепи варианта L100а представляет собой dBATk119H024 (SEQ ID NO: 132). Связывающее количество CD137 человека выверяют по захваченному количеству каждого варианта (1000 RU).For heavy chain variable region variants, binding activity to human CD137 is measured using a BiacoreT200 Surface Plasmon Resonance Analyzer (GE Healthcare). Antibodies are captured by reacting purified variants with immobilized protein G (CALBIOCHEM) on a CM3 S series sensor chip (GE Healthcare). A solution of human CD137 (FXa digest) with ATP added or a solution of human CD137 (FXa digest) without ATP is then reacted in the presence of ATP and in the absence of ATP to evaluate the binding activity of the variants towards human CD137 (FXa digest). Measurements are carried out at 25°C using a running buffer containing 20 mM ACES, 150 mM NaCl, 0.05% Tween20 and 2 mM MgCl 2 , pH 7.4. The measurement results show that the L100a variant (a variant in which methionine (Met) at position 100a (Kabat numbering) is replaced by leucine (Leu)) has increased binding activity to human CD137 only in the presence of ATP (Fig. 6). The heavy chain variable region of the L100a variant is dBATk119H024 (SEQ ID NO: 132). The binding amount of human CD137 is calibrated against the captured amount of each variant (1000 RU).
Для вариантов вариабельной области легкой цепи связывающую активность с CD137 человека (расщепление FXa) определяют с помощью BiacoreT200 в условиях, аналогичных описанным выше. Результаты измерений показывают, что вариант Е94 (вариант, в котором аспартат (Asp) в положении 94 (нумерация по Kabat) заменен глутаматом (Glu)) имеет повышенную связывающая активность только с CD137 человека в присутствии АТФ (фиг. 6). Вариабельной областью легкой цепи варианта Е94 является dBBATk119L020 (SEQ ID NO: 133).For light chain variable region variants, binding activity to human CD137 (FXa cleavage) was determined using BiacoreT200 under conditions similar to those described above. The measurement results show that the E94 variant (a variant in which aspartate (Asp) at position 94 (Kabat numbering) is replaced by glutamate (Glu)) has increased binding activity only to human CD137 in the presence of ATP (Fig. 6). The light chain variable region of the E94 variant is dBBATk119L020 (SEQ ID NO: 133).
Такие варианты, сочетающие указанные варианты тяжелой цепи и легкой цепи, сокращенно обозначают аббревиатурами dBBATk119Н024-P253/dBATk119L020-LamLib (вариабельная область тяжелой цепи SEQ ID NO: 132; вариабельная область легкой цепи SEQ ID NO: 133; константная область тяжелой цепи SEQ ID NO: 93 и константная область легкой цепи SEQ ID NO: 63).Such variants combining these heavy chain and light chain variants are abbreviated as dBBATk119H024-P253/dBATk119L020-LamLib (heavy chain variable region SEQ ID NO: 132; light chain variable region SEQ ID NO: 133; heavy chain constant region SEQ ID NO: 133 : 93 and light chain constant region SEQ ID NO: 63).
Антитела в настоящем изобретении обозначают в соответствии со следующим правилом: (вариабельная область тяжелой цепи) - (константная область тяжелой цепи)/(вариабельная область легкой цепи) - (константная область легкой цепи).Antibodies in the present invention are designated according to the following rule: (heavy chain variable region) - (heavy chain constant region)/(light chain variable region) - (light chain constant region).
Например, название антитела dBBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib означает, что оно состоит из вариабельной области тяжелой цепи антитела - dBAT119H, константной области тяжелой цепи антитела - Р253, вариабельной области легкой цепи антитела - dBBAT119L, и константной области легкой цепи LamLib.For example, the antibody name dBBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib means that it consists of an antibody heavy chain variable region - dBAT119H, an antibody heavy chain constant region - P253, an antibody light chain variable region - dBBAT119L, and a LamLib light chain constant region.
(4-2) Оценка агонистической активности CD137 модифицированных анти-CD137 антител человека in vitro, используя Т-клетки человека.(4-2) Evaluation of the CD137 agonist activity of modified human anti-CD137 antibodies in vitro using human T cells.
(4-2-1) Размножение культур Т-клеток человека.(4-2-1) Propagation of human T-cell cultures.
Т-клетки человека размножают и культивируют согласно описанному в примерах 2-6-1.Human T cells are expanded and cultured as described in Examples 2-6-1.
(4-2-2) Оценка агонистической активности CD137 in vitro, используя Т-клетки человека.(4-2-2) Evaluation of CD137 agonist activity in vitro using human T cells.
Методами, описанными в примере 2-6-2, оценивают выработку IFN-γ в присутствии NS1-P253 (непереключаемого антитела), dBBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib, dBBATk119H024P253/dBATk119L020-LamLib или контрольного антитела, IC17HdK-hIgG1/IC17L-k0 при 10, 2, 0,4, 0,08 и 0,016 мкг/мл, соответственно. Также оценивают выработку IFN-γ в среде АДФ-бета^-минус.The methods described in Example 2-6-2 evaluate IFN-γ production in the presence of NS1-P253 (non-switchable antibody), dBBAT119H-P253/dBAT119L-LamLib, dBBATk119H024P253/dBATk119L020-LamLib or control antibody, IC17HdK-hIgG1/IC17 L-k0 at 10, 2, 0.4, 0.08 and 0.016 μg/ml, respectively. The production of IFN-γ in ADP-beta^-minus medium is also assessed.
Оба результата показаны на фиг. 7.Both results are shown in Fig. 7.
Модифицированное антитело dBBATk119H024-P253/dBBATk119L020-LamLib проявляет усиленную АДФ-бета^-зависимую агонистическую активность по сравнению с dBBAT119H-P253/dBBAT119LLamLib. Это указывает на возможность того, что dBBATk119H024-P253/dBATk119L020-LamLib проявляет более сильную АТФ-, АДФ- и АМФ-зависимую агонистическую активность в отношении CD137 человека по сравнению с dBBAT119H-P253/dBBAT119L-LamLib.The modified antibody dBBATk119H024-P253/dBBATk119L020-LamLib exhibits enhanced ADP-beta^-dependent agonist activity compared to dBBAT119H-P253/dBBAT119LLamLib. This raises the possibility that dBBATk119H024-P253/dBATk119L020-LamLib exhibits stronger ATP-, ADP-, and AMP-dependent agonist activity against human CD137 compared to dBBAT119H-P253/dBBAT119L-LamLib.
Пример 5. Дополнительные модификации анти-CD137 антител (5-1) Поиск модификаций, которые повышают связывающую активность, путем внесения комплексных модификаций.Example 5 Additional Modifications of Anti-CD137 Antibodies (5-1) Search for modifications that increase binding activity by making complex modifications.
Для получения высококачественных анти-CD137 антител аминокислотные модификации четко интродуцируют в вариабельную область тяжелой цепи, dBBATk119H024, и ввариабельную область легкой цепи, dBBATk119L020, анти-CD137 антител, полученных в примерах 4-1. С помощью методов, известных специалистам в данной области, таких как ПЦР, созданы варианты, в которых каждый из всех аминокислотных остатков, составляющих CDR dBBATk119H024 и dBBATk119L020, заменены всеми 18 аминокислотами, кроме цистеина. Измерения приблизительно 1200 вариантов, вырабатываемых для связывания CD137 человека, выполняют с использованием Biacore4000. Антитела захвачены взаимодействующими культуральными супернатантами вариантов с иммобилизованным белком G (фирма CALBIOCHEM) на сенсорном чипе CM3 серии S (фирма GE Healthcare). Затем раствор CD137 человека с добавлением малых молекул (АТФ) или раствор CD137 человека без добавления малых молекул подвергаютTo obtain high quality anti-CD137 antibodies, amino acid modifications are clearly introduced into the heavy chain variable region, dBBATk119H024, and the light chain variable region, dBBATk119L020, of the anti-CD137 antibodies obtained in Examples 4-1. Using methods known to those skilled in the art, such as PCR, variants were created in which each of all amino acid residues comprising the dBBATk119H024 and dBBATk119L020 CDRs were replaced with all 18 amino acids except cysteine. Measurements of approximately 1200 variants produced to bind human CD137 are performed using Biacore4000. Antibodies are captured by reacting culture supernatants of variants with immobilized protein G (CALBIOCHEM) on a CM3 S series sensor chip (GE Healthcare). Then, a solution of human CD137 with the addition of small molecules (ATP) or a solution of human CD137 without the addition of small molecules is subjected to
- 112 046075 взаимодействию в присутствии малой молекулы или в отсутствие малой молекулы для оценки связывающей активности антител по отношению к CD137 человека. Измерения проводят при 25°C с использованием подвижного буфера с добавлением CaCl2, содержащего 20 мМ ACES, 150 мМ NaCl, 0,02% Tween20 и 2 мМ MgCl2, pH 7,4.- 112 046075 interaction in the presence of a small molecule or in the absence of a small molecule to evaluate the binding activity of antibodies against human CD137. Measurements are carried out at 25°C using a CaCl 2 -supplemented running buffer containing 20 mM ACES, 150 mM NaCl, 0.02% Tween20 and 2 mM MgCl 2 , pH 7.4.
(5-2) Повышение связывания АТФ.(5-2) Increased ATP binding.
Ген тяжелой цепи антитела А002-Р253 (SEQ ID NO: 134) создан путем объединения модификаций, выявленных в примере 5-1, которые увеличивают связывающую активность с CD137 человека в присутствии небольшой молекулы, в гене dBBATk119H024-P253, имеющем dBBATk119H024 (SEQ ID NO: 132) в качестве вариабельной области тяжелой цепи, и Р253 (SEQ ID NO: 93) в качестве константной области тяжелой цепи, который получают путем введения модификации S267E/L328F и удалением С-концевого Gly и Lys из IgG1 человека. Ген легкой цепи антитела B040-Lamlib (SEQ ID NO: 135) также создают путем объединения модификаций, обнаруженных в примере 5-1, которые увеличивают связывающую активность с CD137 человека в присутствии небольшой молекулы, в легкой цепи антитела dBBATk119L020-Lamlib, имеющий dBBATk119L020 (SEQ ID NO: 133) в качестве вариабельной области легкой цепь λ человека Lamlib (SEQ ID NO: 63) в качестве константной области легкой цепи. Эти гены объединяют для экспрессии и очистки антител способами, известными специалистам в данной области, для получения анти-CD137 антитела интереса, A002-P253/B040-Lamlib. Вариабельная область тяжелой цепи A002-P253/B040-Lamlib - это А002 (SEQ ID NO: 136), вариабельная область легкой цепи - В040 (SEQ ID NO: 137), константная область тяжелой цепи - Р253 (SEQ ID NO: 93), а константная область легкой цепи представляет собой цепь λ Lamlib человека (SEQ ID NO: 63).The antibody heavy chain gene A002-P253 (SEQ ID NO: 134) was created by combining the modifications identified in Example 5-1, which increase binding activity to human CD137 in the presence of a small molecule, in the dBBATk119H024-P253 gene having dBBATk119H024 (SEQ ID NO : 132) as the heavy chain variable region, and P253 (SEQ ID NO: 93) as the heavy chain constant region, which is obtained by introducing the S267E/L328F modification and removing the C-terminal Gly and Lys from human IgG1. The B040-Lamlib antibody light chain gene (SEQ ID NO: 135) is also created by combining the modifications found in Example 5-1, which increase binding activity to human CD137 in the presence of a small molecule, into the dBBATk119L020-Lamlib antibody light chain having dBBATk119L020 ( SEQ ID NO: 133) as the variable region light chain human λ Lamlib (SEQ ID NO: 63) as the constant region light chain. These genes are combined to express and purify antibodies by methods known to those skilled in the art to produce the anti-CD137 antibody of interest, A002-P253/B040-Lamlib. The heavy chain variable region of A002-P253/B040-Lamlib is A002 (SEQ ID NO: 136), the light chain variable region is B040 (SEQ ID NO: 137), the heavy chain constant region is P253 (SEQ ID NO: 93), and the light chain constant region is the human λ Lamlib chain (SEQ ID NO: 63).
Для вариабельной области тяжелой цепи A002-P253/B040-Lamlib, полученной в этом разделе, создают различные варианты, в которых 53-я, 54-я или 55-я аминокислоты по нумерации Kabat заменены другими аминокислотами с целью повышения уровня АТФ-связывающей активности. Табл. 15 показывает модификации аминокислот (нумерация по Kabat) из А002 в вариабельных областях разработанных антител.For the heavy chain variable region A002-P253/B040-Lamlib obtained in this section, various variants are created in which the 53rd, 54th or 55th amino acids of the Kabat numbering are replaced with other amino acids in order to increase the level of ATP binding activity . Table 15 shows amino acid modifications (Kabat numbering) from A002 in the variable regions of the developed antibodies.
Таблица 15Table 15
Связывающую активность вырабатываемых вариантов по отношению к АТФ и CD137 человека оценивают с помощью Biacore T200.The binding activity of the produced variants towards ATP and human CD137 was assessed using Biacore T200.
Измерения АТФ-связывающей активности проводят при 37°C с использованием подвижного буфера, содержащего 20 мМ ACES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2 и 0,05% Tween20. Сначала антитела захватываются путем взаимодействия растворов антител в подвижном буфере с иммобилизованным Sure Protein А (фирма GE Healthcare) на сенсорном чипом CM3 Series S (фирма GE Healthcare). Затем связывающую активность антител оценивают по взаимодействию с раствором АТФ, приготовленным в подвижном буфере. Чип регенерируют, используя 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5), измерения проводят путем многократного захвата антител. Количество связывания АТФ для каждого антитела рассчитывают путем корректировки количества связывания АТФ при инъекции в концентрации 100 нМ на количество антитела, захваченного на поверхности чипа, как количество АТФ на единицу количества антитела.ATP binding activity measurements are performed at 37°C using running buffer containing 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 and 0.05% Tween20. First, antibodies are captured by reacting antibody solutions in running buffer with Sure Protein A (GE Healthcare) immobilized on a CM3 Series S sensor chip (GE Healthcare). The binding activity of the antibodies is then assessed by interaction with an ATP solution prepared in a running buffer. The chip was regenerated using 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5), and measurements were made by repeated antibody capture. The amount of ATP binding for each antibody is calculated by adjusting the amount of ATP binding when injected at 100 nM by the amount of antibody captured on the chip surface as the amount of ATP per unit amount of antibody.
Измерение связывающей активности по отношению к CD137 человека проводят при 37°C с использованием 20 мМ ACES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2 и 0,05% Tween20 в качестве подвижного буфера. Сначала антитела улавливают путем взаимодействия растворов антител, приготовленных в подвижном буфере, с иммобилизованным Sure Protein А (фирма GE Healthcare) на сенсорным чипе CM3 Series S (фирма GE Healthcare). Затем оценивают активность связывания с CD137 человека путем взаимодействия с раствором CD137 человека, дополненным 100 мкМ АТФ в качестве небольшой молекулы.Measurement of binding activity towards human CD137 is carried out at 37°C using 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 and 0.05% Tween20 as running buffer. First, antibodies are captured by reacting antibody solutions prepared in running buffer with Sure Protein A (GE Healthcare) immobilized on a CM3 Series S sensor chip (GE Healthcare). Human CD137 binding activity is then assessed by reacting with a solution of human CD137 supplemented with 100 μM small molecule ATP.
- 113 046075- 113 046075
Для антигена CD137 человека используют hCD137-HisBAP, полученный в примере (1-1), и измерения проводят при концентрации антигена 0, 15 625, 62,5, 250 или 1000 нМ. Чип регенерируют, используя 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5), измерения проводят путем многократного захвата антител. Константу диссоциации (KD) соответствующих антител для CD137 человека рассчитывают с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0. В частности, константу скорости ассоциации ka (л/моль/сек) и константу скорости диссоциации kd (1/с) рассчитывают путем глобальной подгонки сенсограмм, полученных путем измерения с помощью модели связывания Ленгмюра 1:1, и константу диссоциации KD (моль/л) рассчитывают по этим значениям.For the human CD137 antigen, hCD137-HisBAP obtained in Example (1-1) is used, and measurements are carried out at an antigen concentration of 0, 15,625, 62.5, 250 or 1000 nM. The chip was regenerated using 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5), and measurements were made by repeated antibody capture. The dissociation constant (KD) of the corresponding antibodies for human CD137 was calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. Specifically, the association rate constant ka (L/mol/sec) and the dissociation rate constant kd (1/sec) are calculated by globally fitting the sensorgrams obtained by measuring with the 1:1 Langmuir binding model and the dissociation constant KD (mol/L ) are calculated from these values.
В табл. 16 представлены результаты таких измерений.In table Figure 16 presents the results of such measurements.
Таблица 16Table 16
Анализ связывания с АТР и CD137 человекаBinding assay for human ATP and CD137
Как показано в табл. 16, варианты, в которых 53-я, 54-я или 55-я аминокислоты (нумерация по Kabat) вариабельной области тяжелой цепи заменены другими аминокислотами, имеют повышенную АТФсвязывающую активность по сравнению с антителом A002-P253/B040-Lamlib до модификации, за исключением A146-P253/B040-Lamlib и A160-P253/B040-Lamlib. Сравнение константы скорости ассоциации ka (л/моль/сек) также показывает, что константа скорости ассоциации для CD137 человека увеличена для антител А146-P253/B040-Lαmlib, A159-P253/B040-Lamlib, A162-P253/B040-Lamlib, A163-P253/BO4OLamlib, A164-P253/B040-Lamlib, A167-P253/B040-Lamlib и A168-P253/B040-Lamlib среди антител, оценка которым дана выше.As shown in table. 16, variants in which the 53rd, 54th or 55th amino acids (Kabat numbering) of the heavy chain variable region are replaced by other amino acids have increased ATP-binding activity compared to the A002-P253/B040-Lamlib antibody before modification, for with the exception of A146-P253/B040-Lamlib and A160-P253/B040-Lamlib. Comparison of the association rate constant ka (l/mol/sec) also shows that the association rate constant for human CD137 is increased for antibodies A146-P253/B040-Lαmlib, A159-P253/B040-Lamlib, A162-P253/B040-Lamlib, A163 -P253/BO4OLamlib, A164-P253/B040-Lamlib, A167-P253/B040-Lamlib and A168-P253/B040-Lamlib are among the antibodies rated above.
(5-3) Повышение связывающей активности путем внесения комплексных модификаций.(5-3) Increasing binding activity by introducing complex modifications.
Для создания лучших анти-CD137 антител, модификации, выявленные в примере 5-1, которые увеличивают активность связывания CD137 человека в присутствии малой молекулы и уменьшают связывание с CD137 человека в условиях, когда эта малая молекула отсутствует, и модификации, выявленные в примерах 5-2, которые увеличивают АТФ-связывающую активность и увеличивают константу скорости ассоциации для CD137 человека, были объединены для получения антител против CD137 человека, которые проявляют лучший профиль. Были разработаны гены тяжелой цепи антитела, которые объединяют модификации, обнаруженные в примерах 5-1 и 5-2 в гене тяжелой цепи антитела A002-G1T3, имеющем последовательность А002 (SEQ ID NO: 136) в качестве вариабельной области тяжелой цепи, и последовательность G1T3 (SEQ ID NO: 138) в качестве константной области тяжелой цепи, которая была получена путем введения модификации K214R/Q419E и удаления С-концевых Gly и Lys из IgG1 человека. Гены легкой цепи антитела получены путем объединения модификаций, обнаруженных в примере 5-1, в легкой цепи антитела B040-Lamlib, имеющей последовательность В040 (SEQ ID NO: 137) в качестве вариабельной области легкой цепи и Lamlib λ-цепи человека в качестве константной области легкой цепи.To create better anti-CD137 antibodies, the modifications identified in Example 5-1, which increase the binding activity of human CD137 in the presence of a small molecule and reduce binding to human CD137 in conditions where the small molecule is absent, and the modifications identified in Examples 5- 2, which increase ATP binding activity and increase the association rate constant for human CD137, were combined to produce antibodies against human CD137 that exhibit a better profile. Antibody heavy chain genes were developed that combine the modifications found in Examples 5-1 and 5-2 in the A002-G1T3 antibody heavy chain gene having the sequence A002 (SEQ ID NO: 136) as the heavy chain variable region and the sequence G1T3 (SEQ ID NO: 138) as a heavy chain constant region, which was obtained by introducing the modification K214R/Q419E and removing the C-terminal Gly and Lys from human IgG1. Antibody light chain genes are prepared by combining the modifications found in Example 5-1 in the B040-Lamlib antibody light chain having the sequence B040 (SEQ ID NO: 137) as the light chain variable region and the human Lamlib λ chain as the constant region light chain.
В качестве объекта для сравнения используют ген тяжелой цепи антитела 20Н4.9-Р253, имеющий вариабельную область тяжелой цепи 20Н4.9 (SEQ ID NO: 139) существующего анти-CD137 антитела, описанного в US 8137667 и Р253 (SEQ ID NO: 93) как константная область тяжелой цепи; и ген легкой цепи антитела, который объединяет вариабельную область легкой цепи 20H4.9LC (SEQ ID NO: 140) с цепью k человека к0 (SEQ ID NO: 141) в качестве константной области легкой цепи. В качестве другого объекта сравнения, ген тяжелой цепи антитела MOR-7480.1H-P253, имеющий вариабельную область тяжелой цепи MOR-7480.1H (SEQ ID NO: 142), который составляет существующее анти-CD137MOR7480.1 антитело, описанное в US 8337850, и Р253 (SEQ ID NO: 93) в качестве константной области тяжелой цепи; и легкая цепь антитела MOR-7480.1L-lam, объединяющая вариабельную область легкой цепи MOR-7480.1L (SEQ ID NO: 143) с lam λ-цепи человека (SEQ ID NO: 63) в качестве константной областиThe antibody heavy chain gene 20H4.9-P253 having the heavy chain variable region 20H4.9 (SEQ ID NO: 139) of the existing anti-CD137 antibody described in US 8137667 and P253 (SEQ ID NO: 93) is used as an object for comparison. as a heavy chain constant region; and an antibody light chain gene that combines the light chain variable region of 20H4.9LC (SEQ ID NO: 140) with the human k chain k0 (SEQ ID NO: 141) as the light chain constant region. As another subject of comparison, the antibody heavy chain gene MOR-7480.1H-P253 having the heavy chain variable region of MOR-7480.1H (SEQ ID NO: 142), which constitutes the existing anti-CD137MOR7480.1 antibody described in US 8337850, and P253 (SEQ ID NO: 93) as the heavy chain constant region; and a MOR-7480.1L-lam antibody light chain combining the MOR-7480.1L light chain variable region (SEQ ID NO: 143) with the human λ chain lam (SEQ ID NO: 63) as a constant region
- 114 046075 легкой цепи (примечание: и Lamlib λ-цепи человека, и lam человека имеют одинаковую аминокислотную последовательность (SEQ ID NO: 63)).- 114 046075 light chain (note: both human Lamlib λ chain and human lam have the same amino acid sequence (SEQ ID NO: 63)).
Эти гены объединяют для экспрессии и очистки антител с использованием методов, известных специалистам в данной области, для получения анти-CD137 антител интереса. Табл. 17 представляет собой список номеров последовательностей вариабельной области тяжелой цепи, вариабельной области легкой цепи, константной области тяжелой цепи, константной области легкой цепи и гипервариабельной области (гипервариабельная область; также называемая HVR или CDR) разработанных антител.These genes are combined for antibody expression and purification using methods known to those skilled in the art to produce anti-CD137 antibodies of interest. Table 17 is a list of sequence numbers of the heavy chain variable region, light chain variable region, heavy chain constant region, light chain constant region, and hypervariable region (hypervariable region; also called HVR or CDR) of the developed antibodies.
Таблица 17Table 17
Аминокислотные последовательности тяжелых цепей, легких цепей и их гипервариабельных областей (последовательности обозначены номерами (ID))______Amino acid sequences of heavy chains, light chains and their hypervariable regions (sequences are designated by numbers (ID))______
Связывание разработанных вариантов с АТФ и CD137 человека оценивают с помощью Biacore T200. Измерения связывания CD137 человека проводят при 37°C с использованием 20 мМ ACES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2 и 0,05% Tween20 в качестве подвижного буфера. Сначала 250-400 RU антител захватывают путем взаимодействия растворов антител, приготовленных в подвижном буфере, с иммобилизованным Sure Protein А (фирма GE Healthcare) на сенсорным чипе CM3 Series S (фирма GE Healthcare). Связывающую активность по отношению к CD137 человека в присутствии АТФ или в отсутствие АТФ затем оценивают путем взаимодействия с раствором CD137 человека, приготовленным в подвижном буфере, дополненном требуемой концентрацией АТФ, или с раствором CD137 человека, приготовленным в подвижном буфере без АТФ. Для антигена CD137 человека используют hCD137HisBAP, полученный в примере (1-1), и измерения значения KD проводят при концентрации антигена 0, 15 625, 62,5, 250 и 1000 нМ. Для оценки связанного количества проводят измерения при концентрации антигена 0 и 1000 нМ. Чип регенерируют с помощью 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5), и измерения проводят путем многократного захватываемых антител. Константу диссоциации соответствующих антител для CD137 человека рассчитывают с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0. В частности, константу скорости ассоциации ka (л/моль/с) и константу скорости диссоциации kd (1/с) рассчитывают путем глобальной подгонки сенсограмм, полученных путем измерения с помощью модели связывания Ленгмюра 1:1, и константу диссоциации KD (моль/л) рассчитывают по этим значениям.Binding of the designed variants to ATP and human CD137 was assessed using Biacore T200. Human CD137 binding measurements were performed at 37°C using 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 and 0.05% Tween20 as running buffer. First, 250-400 RU of antibodies are captured by reacting antibody solutions prepared in running buffer with Sure Protein A (GE Healthcare) immobilized on a CM3 Series S sensor chip (GE Healthcare). Binding activity to human CD137 in the presence or absence of ATP is then assessed by reacting with a solution of human CD137 prepared in running buffer supplemented with the desired concentration of ATP or with a solution of human CD137 prepared in running buffer without ATP. For the human CD137 antigen, hCD137HisBAP obtained in Example (1-1) is used, and KD value measurements are carried out at antigen concentrations of 0, 15,625, 62.5, 250 and 1000 nM. To estimate the bound amount, measurements are taken at 0 and 1000 nM antigen concentrations. The chip was regenerated with 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5), and measurements were made by multiple antibody capture. The dissociation constant of the corresponding antibodies for human CD137 was calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. Specifically, the association rate constant ka (l/mol/s) and the dissociation rate constant kd (1/s) are calculated by globally fitting the sensorgrams obtained by measuring with the 1:1 Langmuir binding model and the dissociation constant KD (mol/l ) are calculated from these values.
В табл. 18 представлены результаты таких измерений.In table Figure 18 presents the results of such measurements.
- 115 046075- 115 046075
Таблица 18Table 18
Анализ связывания модифицированных антител с CD137 человекаAnalysis of the binding of modified antibodies to human CD137
НД (нет данных) - активность слишком мала, чтобы определить величину KD ^Величину KD определяют по модели устойчивого состоянияND (no data) - activity is too low to determine the KD value ^KD value is determined using the steady state model
Значения связывание с CD137 человека в табл. 18 выше указывают количество связывания CD137 человека на единицу количества антитела, когда CD137 человека допускает взаимодействовать при 1000 нМ при каждой концентрации АТФ, указанной выше, и KD (M) для CD137 человека указывает константу диссоциации CD137 человека при каждой концентрации АТФ. Значения KD, отмеченные в таблице знаком *, рассчитаны с использованием модели устойчивого состояния. Количество связывания всех разработанных вариантов в присутствии 10 мкМ АТФ больше, чем при концентрации АТФ 1 мкМ, и даже больше в присутствии 100 мкМ, что позволяет предположить, что они связываются с CD137 человека в зависимости от концентрации АТФ. С другой стороны, объекты сравнения, 20H4.9P253/20H4.9LC-k0 и MOR-7480.1Н-P253/MOR-7480.1L-lam, не проявляют связывания с CD137 человека зависимым от концентрации АТФ образом.The binding values for human CD137 are in the table. 18 above indicate the amount of human CD137 binding per unit amount of antibody when human CD137 is allowed to interact at 1000 nM at each ATP concentration above, and KD(M) for human CD137 indicates the dissociation constant of human CD137 at each ATP concentration. KD values marked with * in the table were calculated using the steady state model. The amount of binding of all designed variants in the presence of 10 μM ATP is greater than in the presence of 1 μM ATP, and even greater in the presence of 100 μM, suggesting that they bind to human CD137 in an ATP concentration-dependent manner. On the other hand, the comparison objects, 20H4.9P253/20H4.9LC-k0 and MOR-7480.1H-P253/MOR-7480.1L-lam, do not exhibit binding to human CD137 in an ATP concentration-dependent manner.
(5-4) Оценка in vitro АТФ-зависимой агонистической активности в отношении CD137 модифициро(5-4) In vitro assessment of ATP-dependent agonist activity against CD137 modified
- 116 046075 ванных антител против CD137 человека с использованием анализа репортерного гена 4-1ВВ Jurkat.- 116 046075 bathed antibodies against human CD137 using the 4-1BB Jurkat reporter gene assay.
Клеточную линию GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat (фирма Promega, CS196004) используют для измерения in vitro активности разработанных вариантов. В каждую лунку 96-луночных планшетов добавляют по 200 мкл суспензии клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), приготовленных в концентрации 5х104/мл в среде, и оставляют на ночь при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2. В качестве питательной среды используют культуральную среду СНО (90% Ham's F12, 10% ФСБ). Затем, после того, как всю среду удаляют, по 25 мкл суспензии клеточной линии GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat с концентрацией 2х106/мл в среде для исследования (99% RPMI, 1% ФСБ) вносят в каждую лунку. Затем добавляют 25 мкл каждого раствора антител, разбавленного средой для исследования таким образом, чтобы конечная концентрация составляла 0, 0,001, 0,01, 0,1, 1 и 10 мкг/мл; и, наконец, добавляли 25 мкл раствора АТФ, разбавленного средой для исследования, таким образом, чтобы конечная концентрация стала 0 и 250 мкМ. Планшеты оставляют на 6 ч при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2 и на 15 мин при комнатной температуре; по 75 мкл реагента Bio-Glo вносят в каждую лунку. Для реагента BioGlo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат). Впоследствии люминесценцию каждой лунки измеряют с помощью планшет-ридера. Величина люминесценции каждой лунки, деленная на величину люминесценции лунки без добавления антител, является относительной световой единицей (кратная индукция) и служит индикатором для оценки агонистической активности в отношении CD137 каждого антитела.The GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line (Promega, CS196004) was used to measure in vitro activity of the developed variants. To each well of 96-well plates, add 200 μl of a suspension of FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega), prepared at a concentration of 5x10 4 /ml in the medium, and leave overnight at 37°C in an incubator in an atmosphere of 5% CO 2 . CHO culture medium (90% Ham's F12, 10% PBS) is used as a nutrient medium. Then, after all the medium is removed, 25 μl of a suspension of the GloResponse™ NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line with a concentration of 2x10 6 /ml in the study medium (99% RPMI, 1% PBS) is added to each hole. Then add 25 μl of each antibody solution diluted with assay medium so that the final concentration is 0, 0.001, 0.01, 0.1, 1 and 10 μg/ml; and finally, 25 μL of ATP solution diluted with the assay medium was added so that the final concentration became 0 and 250 μM. The plates are left for 6 hours at 37°C in an incubator under an atmosphere of 5% CO2 and for 15 minutes at room temperature; 75 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. For the BioGlo reagent, use the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). Subsequently, the luminescence of each well is measured using a plate reader. The luminescence value of each well divided by the luminescence value of the well without added antibody is the relative light unit (fold induction) and serves as an indicator for assessing the CD137 agonistic activity of each antibody.
Результаты показаны на фиг. 8.The results are shown in Fig. 8.
(5-5) Оценка in vitro АТФ-зависимой агонистической активности в отношении CD137 модифицированных антител против CD137 человека с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.(5-5) In vitro assessment of ATP-dependent CD137 agonist activity of modified anti-human CD137 antibodies using human peripheral blood mononuclear cells.
(5-5-1) Выделение мононуклеарных клеток периферической крови человека Мононуклеарные клетки периферической крови человека (МКПК) выделяют из образцов крови здоровых добровольцев в компании Заявителя по технологии, описанной в примере 2-6-1. Впоследствии клетки разводят в среде (5% сыворотки человека (фирма SIGMA), 95% AIM-V (фирма Thermo Fischer Scientific) до плотности клеток 5х106/мл.(5-5-1) Isolation of human peripheral blood mononuclear cells Human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) are isolated from blood samples of healthy volunteers in the Applicant's company using the technology described in Example 2-6-1. Subsequently, the cells are diluted in medium (5% human serum (SIGMA), 95% AIM-V (Thermo Fischer Scientific) to a cell density of 5x10 6 /ml.
(5-5-2) Оценка агонистической активности в отношении CD137 с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.(5-5-2) Evaluation of CD137 agonist activity using human peripheral blood mononuclear cells.
Мононуклеарные клетки периферической крови человека доводят до плотности 5х106/мл и высевают в 96-луночные планшеты с плоским дном (фирма Corning) по 100 мкл в каждую лунку. Затем добавляют по 50 мкл раствора с концентрацией 0,04 мкг/мл антитела против CD3ε человека (фирма BD, клон SP34) и по 20 мкг/мл антитела против CD28 человека (фирма BD, клон: CD28.2), разведенных в среде. Планшеты встряхивают и оставляют в инкубаторе в атмосфере 5% CO2 при 37°C на 6 ч. Затем в каждую лунку добавляют по 25 мкл среды с 2 мМ АТФ (фирма SIGMA) или среды без АТФ и по 25 мкл каждого антитела в концентрации 40 мкг/мл, и планшеты встряхивают перед тем, как оставить в инкубаторе в атмосфере с5% CO2 при 37°C на 18 ч. Затем часть культурального супернатанта собирают, и культуральный супернатант используют для подсчета содержания IL-2 в культуральном супернатанте с Human IL-2 DuoSet ELISA kit (фирма R&D systems) или Human IL-2 ELISA Set (фирма BD Biosciences). После сбора культурального супернатанта планшеты снова оставляют в инкубаторе в атмосфере с5% CO2 при 37°C на 24 ч. Затем собирают часть культурального супернатанта, и количество IFN-γ, содержащегося в культуральном супернатанте, определяют с использованием набора Human IFN-γ DuoSet ELISA kit (фирма R&D systems) или Human IFN-γ ELISA Development Kit (фирма PeproTech). Анализ ELISA осуществляют в основном по протоколу поставщика набора. Для набора Human IL-2 DuoSet ELISA (фирма R&D systems) и набора Human IFN-γ DuoSet ELISA (фирма R&D systems) появление окраски и прекращение проявления окраски выполняют в соответствии с протоколами с использованием раствора субстрата (фирма R&D systems), содержащего Н2О2 и тетраметилбензидин, и 1н H2SO4 (фирма Wako). Для набора Human IL-2 ELISA Set (фирма BD Biosciences) развитие окраски прекращают с использованием 1н H2SO4 (фирма Wako). Для набора IFN-γ ELISA Development Kit (фирма PeproTech) используют раствор хромогена ТМВ (фирма Thermo Fischer Scientific) и 1н H2SO4 (фирма Wako) для проявления окраски и ее прекращения. Затем проводят измерения поглощения с помощью ридера EnVision (фирма PerkinElmer).Human peripheral blood mononuclear cells are brought to a density of 5x10 6 /ml and seeded into 96-well flat-bottom plates (Corning) with 100 μl per well. Then add 50 μl of a solution with a concentration of 0.04 μg/ml of an antibody against human CD3ε (BD, clone SP34) and 20 μg/ml of an antibody against human CD28 (BD, clone: CD28.2), diluted in the medium. The plates are shaken and left in an incubator in an atmosphere of 5% CO2 at 37°C for 6 hours. Then 25 μl of medium with 2 mM ATP (SIGMA) or medium without ATP and 25 μl of each antibody at a concentration of 40 μg are added to each well. /ml, and the plates are shaken before leaving in an incubator at 5% CO2 at 37°C for 18 hours. A portion of the culture supernatant is then collected, and the culture supernatant is used to calculate the IL-2 content of the Human IL-2 culture supernatant DuoSet ELISA kit (R&D systems) or Human IL-2 ELISA Set (BD Biosciences). After collecting the culture supernatant, the plates are again left in the incubator under 5% CO2 at 37°C for 24 hours. A portion of the culture supernatant is then collected and the amount of IFN-γ contained in the culture supernatant is determined using the Human IFN-γ DuoSet ELISA kit (R&D systems) or Human IFN-γ ELISA Development Kit (PeproTech). The ELISA assay is performed primarily according to the protocol of the kit supplier. For the Human IL-2 DuoSet ELISA kit (R&D systems) and the Human IFN-γ DuoSet ELISA kit (R&D systems), color appearance and cessation of color development is performed in accordance with protocols using a substrate solution (R&D systems) containing H 2 O 2 and tetramethylbenzidine, and 1N H2SO4 (Wako). For the Human IL-2 ELISA Set (BD Biosciences), color development is stopped using 1N H2SO4 (Wako). The IFN-γ ELISA Development Kit (PeproTech) uses a solution of TMB chromogen (Thermo Fischer Scientific) and 1N H 2 SO 4 (Wako) to develop and stop coloring. Absorbance measurements are then taken using an EnVision reader (PerkinElmer).
Результаты подробно описаны в примере 5-5-3 и в дальнейшем описании.The results are described in detail in Example 5-5-3 and in the following description.
(5-5-3) Оценка усиления агонистической активности константной области тяжелой цепи путем увеличения связывающей активности с рецептором Fcy.(5-5-3) Assess the enhancement of agonistic activity of the heavy chain constant region by increasing binding activity to the Fcy receptor.
In vitro с применением моноцитов периферической крови человека согласно описанию в примерах 5-5-1 и 5-5-2 оценивают эффект применения Р587, MY518, ТТ14 и ТТ16, которые по-разному увеличивают FcYRIIb-связывающую активность константной области тяжелой цепи, по агонистической активности в отношении CD137.In vitro, using human peripheral blood monocytes as described in Examples 5-5-1 and 5-5-2, the effect of using P587, MY518, TT14 and TT16, which differently increase the FcYRIIb-binding activity of the heavy chain constant region, is assessed by agonistic activity against CD137.
Оцениваемые антитела представлены в табл. 19.The antibodies evaluated are presented in table. 19.
Получение антител, перечисленных в табл. 19, описано в примере 7-1. По сравнению с количествами IL-2 и IFN-γ в супернатанте культуры, когда антитело отрицательного контроля (IC17HdKObtaining antibodies listed in table. 19, described in Example 7-1. Compared to the amounts of IL-2 and IFN-γ in the culture supernatant when the negative control antibody (IC17HdK
- 117 046075- 117 046075
MY518/IC17L-k0, IC17HdK-G4d/IC17L-k0) добавляют в присутствии 250 мкМ АТФ, если добавление антитела увеличивает количество IL-2 в супернатанте культуры в 1,05 раза или более и количество IFN-γ в 1,15 раза или более, установлено, что антитело демонстрирует агонистическую активность в отношении CD137. Измерение агонистической активности с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека (МКПК) может отличаться в зависимости от доноров крови. В связи с этим было определено, что антитела, которые не проявляют агонистической активности в отношении CD137 для некоторой части или более чем для половины МКПК человека, выделенных от нескольких доноров, можно расценивать как не проявляющие агонистической активности в отношении CD137, даже если они соответствуют стандартам агонистической активности для другой части МКПК человека.MY518/IC17L-k0, IC17HdK-G4d/IC17L-k0) is added in the presence of 250 μM ATP if the addition of antibody increases the amount of IL-2 in the culture supernatant by 1.05-fold or more and the amount of IFN-γ by 1.15-fold or Moreover, the antibody was found to demonstrate agonistic activity against CD137. Measurement of agonist activity using human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) may differ among blood donors. In this regard, it was determined that antibodies that do not exhibit CD137 agonistic activity in some or more than half of human PBMCs isolated from multiple donors can be regarded as not exhibiting CD137 agonistic activity, even if they meet the standards agonistic activity for another part of human PBMC.
Антитела, которые рассматривают в качестве проявляющих агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ, показаны в табл. 19. Это указывает на то, что агонистическая активность в отношении CD137 была усилена путем комбинирования ТТ16 с Р587, который увеличивает связывающую активность с FcYRIIb константной области тяжелой цепи (фиг. 9 и 10). Предполагают, что агонистическая активность усилена за счет увеличения связывающей активности в отношении клеток, экспрессирующих FcYRIIb, которые представляют собой перекрестно-связывающие каркасы, необходимые для того, чтобы антитело проявляло агонистическую активность в отношении клеток, экспрессирующих CD137 (см. Protein Eng Des Sel, 26(10), 2013, 589-598, doi:10.1093/protein).Antibodies considered to exhibit agonistic activity against CD137 in the presence of 250 μM ATP are shown in table. 19. This indicates that agonistic activity against CD137 was enhanced by combining TT16 with P587, which increases binding activity to the FcYRIIb heavy chain constant region (FIGS. 9 and 10). The agonist activity is believed to be enhanced by increased binding activity to cells expressing FcYRIIb, which is the cross-linking scaffold required for the antibody to exhibit agonist activity to cells expressing CD137 (see Protein Eng Des Sel, 26 (10), 2013, 589-598, doi:10.1093/protein).
Таблица 19Table 19
(5-5-4) Оценка АТФ-зависимой агонистической активности в отношении CD137 вариабельных областей.(5-5-4) Assessment of ATP-dependent agonist activity against CD137 variable regions.
АТФ-зависимая агонистическая активность в отношении CD137 каждой вариабельной области путем комбинирования константных областей тяжелой цепи Р587 и Р253 с различными вариабельными областями оценена in vitro с использованием моноцитов периферической крови человека, как описано в примерах 5-5-1 и 5-5-2.The ATP-dependent CD137 agonist activity of each variable region by combining the heavy chain constant regions of P587 and P253 with different variable regions was assessed in vitro using human peripheral blood monocytes as described in Examples 5-5-1 and 5-5-2.
Оцениваемые антитела представлены в табл. 20. Выработка антител, перечисленных в таблице 20, описана в примере 7-1. По сравнению с количествами IL-2 и IFN-γ в супернатанте культуры, когда отрицательное контрольное антитело (IC17HdK-P253/IC17L-k0, IC17HdK-P587/IC17L-k0) добавляют в присутствии 250 мкМ АТФ, и когда добавление антитела увеличивает количество IL-2 в культуральном супернатанте в 1,05 раза или более и количество IFN-γ в 1,15 раза или более, делают вывод, что антитело проявляет агонистическую активность в отношении CD137. Измерение агонистической активности с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека (МКПК) может отличаться от донора к донору в зависимости от образца крови. В связи с этим определено, что антитела, которые не проявляют агонистической активности в отношении CD137 для некоторой или более половины МКПК человека, выделенного от нескольких доноров, можно расценивать как не проявляющие агонистическои активности в отношении CD137, даже если они соответствуют стандартам агонистической деятельности по другой части МКПК человека. Антитела, которые согласно оценке проявляют агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ, представлены в табл. 20 (фиг. 11, фиг. 12, фиг. 13, фиг. 14 и фиг. 15).The antibodies evaluated are presented in table. 20. The production of antibodies listed in Table 20 is described in Example 7-1. Compared to the amounts of IL-2 and IFN-γ in the culture supernatant when a negative control antibody (IC17HdK-P253/IC17L-k0, IC17HdK-P587/IC17L-k0) is added in the presence of 250 μM ATP, and when the addition of antibody increases the amount of IL -2 in the culture supernatant by 1.05 times or more and the amount of IFN-γ by 1.15 times or more, it is concluded that the antibody exhibits agonistic activity against CD137. Measurement of agonist activity using human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) may differ from donor to donor depending on the blood sample. In this regard, it has been determined that antibodies that do not exhibit CD137 agonist activity in some or more than half of human PBMCs isolated from multiple donors can be regarded as not exhibiting CD137 agonist activity, even if they meet the standards for agonist activity in another parts of human ICPC. Antibodies assessed to exhibit agonistic activity against CD137 in the presence of 250 μM ATP are presented in table. 20 (Fig. 11, Fig. 12, Fig. 13, Fig. 14 and Fig. 15).
Кроме того, среди антител, которые согласно оценке проявляют агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ, антитела, кратность которых изменяется относительно группы, в которую добавлено отрицательное контрольное антитело (IC17HdK-P253/IC17L-k0, IC17HdKP587/IC17L-k0) по отношению к количеству IL-2 и IFN-γ в супернатанте культуры в условиях отсутствия АТФ, меньше, чем кратное изменение по сравнению с отрицательным контролем в условиях в присутствии 250 мкМ АТФ, обладают пониженной агонистической активностью в отношении CD137 при отсутствии АТФ. Антитела, которые проявляют агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ и которые оценивают как имеющие агонистическую активность в отношении CD137 в отсутствие АТФ, представлены в табл. 20 (фиг. 11, фиг. 12, фиг. 13, фиг. 14 и фиг. 15). Было установлено, что эти антитела проявляют АТФ-зависимую агонистическую активность в отношении CD137.In addition, among the antibodies assessed to exhibit CD137 agonistic activity in the presence of 250 μM ATP, antibodies whose fold change relative to the group in which the negative control antibody was added (IC17HdK-P253/IC17L-k0, IC17HdKP587/IC17L-k0) relative to the amount of IL-2 and IFN-γ in the culture supernatant in the absence of ATP, less than a fold change compared to the negative control in conditions in the presence of 250 μM ATP, have reduced agonistic activity against CD137 in the absence of ATP. Antibodies that exhibit CD137 agonistic activity in the presence of 250 μM ATP and that are assessed to have CD137 agonistic activity in the absence of ATP are presented in Table 1. 20 (Fig. 11, Fig. 12, Fig. 13, Fig. 14 and Fig. 15). These antibodies were found to exhibit ATP-dependent agonist activity against CD137.
На основании вышеизложенного подтверждено, что для вариабельных областей комбинации вариабельная область тяжелой цепи/вариабельная область легкой цепи (А375/В167), (А356/В040), (А372/В040), (А486/В167), (А488/В226), (А489/В223), (А551/В256), (А548/В256) и (А551/В379) проявляют агонистическую активность в отношении CD137 АТФ-зависимым образом.Based on the above, it is confirmed that for the variable regions of the heavy chain variable region/light chain variable region combination (A375/B167), (A356/B040), (A372/B040), (A486/B167), (A488/B226), ( A489/B223), (A551/B256), (A548/B256) and (A551/B379) exhibit agonistic activity against CD137 in an ATP-dependent manner.
- 118 046075- 118 046075
Таблица 20Table 20
(5-5-5) Оценка усиливающего воздействия на агонистическую активность в отношении CD137 комбинированных изменений, которые увеличивают pI константной области тяжелой цепи с константной областью тяжелой цепи с повышенной связывающей активностью с рецептором Fcy.(5-5-5) Assess the enhancing effect on CD137 agonist activity of combined changes that increase the pI of the heavy chain constant region with a heavy chain constant region with increased Fcy receptor binding activity.
Влияние на агонистическую активность в отношении CD137 интродуцированных различных модификаций аминокислот, которые увеличивают pI константной области тяжелой цепи в константную область тяжелой цепи с различной повышенной FcyRIIb-связывающей активностью, оценивают путем оценки in vitro с использованием моноцитов периферической крови человека согласно описанному в примерах 5-5-1 и 5-5-2. Аминокислотные изменения, которые увеличивают pI, вводят в константные области тяжелой цепи ТТ16, MY518 и ТТ14 и, таким образом, в константные области тяжелой цепи TT16+P343R/D413K (SCF028), TT16+Q311R/P343R (SCF033), MY518+P343R/D413K (SCF025), MY518+Q311R/P343R (SCF030), TT14+P343R/D413K (SCF027) и TT14+Q311R/P343R (SCF032). Названия оцениваемых антител, в которые внесены аминокислотные изменения, увеличивающие pI, и названия соответствующих антител до введения аминокислотных изменений, которые увеличивают pI, показаны в табл. 21. Выработка антител, перечисленных в табл. 21 описана в примере 7-2.The effect on CD137 agonistic activity of introduced various amino acid modifications that increase the pI of the heavy chain constant region into a heavy chain constant region with various increased FcyRIIb-binding activity was assessed by in vitro assessment using human peripheral blood monocytes as described in Examples 5-5 -1 and 5-5-2. Amino acid changes that increase pI are introduced into the heavy chain constant regions of TT16, MY518 and TT14 and thus into the heavy chain constant regions TT16+P343R/D413K (SCF028), TT16+Q311R/P343R (SCF033), MY518+P343R/ D413K (SCF025), MY518+Q311R/P343R (SCF030), TT14+P343R/D413K (SCF027) and TT14+Q311R/P343R (SCF032). The names of the antibodies evaluated that had amino acid changes that increase the pI, and the names of the corresponding antibodies before the amino acid changes that increased the pI were introduced, are shown in Table 1. 21. Production of antibodies listed in table. 21 is described in Example 7-2.
Что касается оценки усиления агонистической активности путем интродукции модификаций аминокислот, повышающих pI, когда добавление антитела увеличивает количество IL-2 в 1,04 раза или более и количество IFN-y в 1,1 раза или более в супернатанте культуры, относительно групп антител, содержащих константную область тяжелой цепи, которая не содержит этих аминокислотных модификаций, A375-TT16/B167-LamLib, A375-MY518/B167-LamLib и A375-TT14/B167-LamLib, установлено, что агонистическая активность в отношении CD137 усиливается. По сравнению с антителами, содержащими константную область тяжелой цепи без повышающих pI аминокислотных модификаций, антитела, содержащие константную область тяжелой цепи, в которой модификации аминокислот, как было показано, обладают повышенной агонистической активностью в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ, показаны в табл. 22 (фиг. 10).With regard to assessing the enhancement of agonist activity by introducing amino acid modifications that increase the pI, when the addition of an antibody increases the amount of IL-2 by 1.04 times or more and the amount of IFN-γ by 1.1 times or more in the culture supernatant, relative to groups of antibodies containing heavy chain constant region, which does not contain these amino acid modifications, A375-TT16/B167-LamLib, A375-MY518/B167-LamLib and A375-TT14/B167-LamLib, the agonistic activity against CD137 was found to be enhanced. Compared to antibodies containing a heavy chain constant region without pI-increasing amino acid modifications, antibodies containing a heavy chain constant region in which amino acid modifications have been shown to have increased agonistic activity against CD137 in the presence of 250 μM ATP are shown in Table 1. 22 (Fig. 10).
Это указывает на то, что независимо от степени увеличения FcyRIIb-связывающей активности константной области тяжелой цепи, введение модификаций, которые увеличивают pI константной области тяжелой цепи, усиливает агонистическую активность в отношении CD137 антитела против CD137 человека. Было высказано предположение, что: сочетание модификаций, которые увеличивают pI константной области тяжелой цепи, с модификациями, которые увеличивают связывание FcyRIIb константной области тяжелой цепи с константной областью тяжелой цепи, усиливает взаимодействие с отрицательно заряженной FcyRIIb-экспрессирующей поверхностью клетки; иммунные комплексы антител или связанных с антигеном антител ближе подходят к поверхности клеток, экспрессирующих FcyRIIb; это дополнительно увеличивает связывание с клетками, экспрессирующими FcyRIIb, которые представляют собой перекрестно-сшивающие каркасы, необходимые для того, чтобы антитела проявляли агонистическую активность в отношении клеток, экспрессирующих CD137; и, таким образом, агонистическая активность была дополнительно усилена.This indicates that regardless of the extent to which the FcyRIIb binding activity of the heavy chain constant region is increased, introduction of modifications that increase the pI of the heavy chain constant region enhances the CD137 agonistic activity of the anti-human CD137 antibody. It has been proposed that: the combination of modifications that increase the pI of the heavy chain constant region with modifications that increase the binding of the FcyRIIb heavy chain constant region to the heavy chain constant region enhances interaction with the negatively charged FcyRIIb-expressing cell surface; immune complexes of antibodies or antigen-related antibodies come closer to the surface of cells expressing FcyRIIb; this further increases binding to cells expressing FcyRIIb, which are the cross-linking scaffolds required for the antibodies to exhibit agonistic activity against cells expressing CD137; and thus the agonistic activity was further enhanced.
Таблица 21Table 21
- 119 046075 ___________________________________________________________Таблица 22- 119 046075 ________________________________________________________________ Table 22
Антитела, выявленные как обладающие повышенной агонистической _______________________________активностью_______________________________ A375-SCF028/B167-LamLib ________________________A375-SCF033/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF025/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF030/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF027/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF032/B167-LamLib________________________ (5-5-6) Оценка воздействия на агонистическую активность путем внесения модификаций, которые увеличивают pI константной области тяжелой цепи.Antibodies identified as having increased agonistic ________________________________ activity________________________________ A375-SCF028/B167-LamLib ________________________A375-SCF033/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF025/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF030/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF027/B167-LamLib________________________ ________________________A375-SCF032/B167-LamLib________________________ (5-5-6) Assess the effect on agonist activity by introducing modifications that increase the pI of the heavy chain constant region.
Влияние на агонистическую активность в отношении CD137 введения различных модификаций аминокислот, которые увеличивают pI константных областей тяжелой цепи MY201aPh и MY518, оценивают in vitro с использованием моноцитов периферической крови человека согласно описанию в примерах 5-5-1 и 5-5-2. В константные области тяжелой цепи MY518, MY518a и MY201aPh введены аминокислотными модификациями, которые увеличивают pI; таким образом были созданы MY518+P343R/D413K (SCF025), MY518+Q311R/P343R(SCF030), MY518+P343R(SCF039),The effect on CD137 agonistic activity of the introduction of various amino acid modifications that increase the pI of the heavy chain constant regions of MY201aPh and MY518 was assessed in vitro using human peripheral blood monocytes as described in Examples 5-5-1 and 5-5-2. The heavy chain constant regions of MY518, MY518a, and MY201aPh are introduced with amino acid modifications that increase the pI; thus, MY518+P343R/D413K (SCF025), MY518+Q311R/P343R(SCF030), MY518+P343R(SCF039) were created,
MY518+D413K (SCF040), MY518a+Q311R (SCF060a), MY201aPh+P343R(SCF041aPh),MY518+D413K (SCF040), MY518a+Q311R (SCF060a), MY201aPh+P343R(SCF041aPh),
MY201aPh+P343R/D413K (SCF043aPh), MY201aPh+Q311R (SCF056aPh), MY201aPh+Q311R/P343Rb (SCF057aPh) и MY201aPh+Q311R/D413K (SCF059aPh). Названия рассматриваемых антител, в которые внесены аминокислотные изменения, которые увеличивают pI, и названия антител до внесения аминокислотных изменений, которые увеличивают соответствующую величину pI, показаны в табл. 23. Выработка антител, перечисленных в табл. 23, описана в примере 7-2.MY201aPh+P343R/D413K (SCF043aPh), MY201aPh+Q311R (SCF056aPh), MY201aPh+Q311R/P343Rb (SCF057aPh) and MY201aPh+Q311R/D413K (SCF059aPh). The names of the antibodies in question, in which amino acid changes have been made that increase the pI, and the names of the antibodies before the amino acid changes have been made, which increase the corresponding pI value, are shown in table. 23. Production of antibodies listed in table. 23 is described in Example 7-2.
Что касается оценки усиления агонистической активности путем введения модификаций аминокислот, повышающих pI, когда добавление антитела увеличивает количество IL-2 в 1,04 раза или более и количество IFN-γ в 1,1 раза или более в супернатанте культуры, относительно группы, в которую добавлены антитела, содержащие константную область тяжелой цепи, которая не содержит таких аминокислотных модификаций, A375-MY518a/B167-LamLib и A375-MY201aPh/B167-LamLib, было подтверждено, что агонистическая активность в отношении CD137 улучшена. По сравнению с антителами, содержащими константную область тяжелой цепи без повышающих pI аминокислотных модификаций, антитела, содержащие константную область тяжелой цепи, в которой аминокислотные изменения, как показано, обладают повышенной агонистической активностью в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ, показаны в табл. 24 (фиг. 16 и 17).Regarding the assessment of enhancement of agonist activity by introducing amino acid modifications that increase the pI, when the addition of antibody increases the amount of IL-2 by 1.04-fold or more and the amount of IFN-γ by 1.1-fold or more in the culture supernatant, relative to the group in which added antibodies containing a heavy chain constant region that does not contain such amino acid modifications, A375-MY518a/B167-LamLib and A375-MY201aPh/B167-LamLib, were confirmed to have improved agonistic activity against CD137. Compared to antibodies containing a heavy chain constant region without pI-increasing amino acid modifications, antibodies containing a heavy chain constant region in which amino acid changes were shown to have increased agonistic activity against CD137 in the presence of 250 μM ATP are shown in Table. 24 (Figs. 16 and 17).
Таблица 23Table 23
- 120 046075- 120 046075
Таблица 24Table 24
Антитела, выявленные как обладающие повышенной I агонистической активностью A375-SCF025/B167-LamLib_____________Antibodies identified as having increased I agonist activity A375-SCF025/B167-LamLib_____________
A375-SCF030/B167-Laml_ib______________A375-SCF030/B167-Laml_ib______________
A375-SCF039/B167-Laml_ib______________A375-SCF039/B167-Laml_ib______________
A375-SCF040/B167-Laml_ib______________A375-SCF040/B167-Laml_ib______________
A375-SCF060a/B167-Laml_ib____________A375-SCF060a/B167-Laml_ib____________
A375-SCF041aPh/B167-LamLib__________A375-SCF041aPh/B167-LamLib__________
A375-SCF043aPh/B167-LamLib__________A375-SCF043aPh/B167-LamLib__________
A375-SCF056aPh/B167-LamLib__________A375-SCF056aPh/B167-LamLib__________
A375-SCF057aPh/B167-Laml_ib__________A375-SCF057aPh/B167-Laml_ib__________
A375-SCF059aPh/B167-Laml_ib__________ (5-5-7) Оценка АТФ-зависимой агонистической активности в отношении CD137 антител против CD137 человека, которые объединяют разработанные вариабельные области и константные области.A375-SCF059aPh/B167-Laml_ib__________ (5-5-7) Evaluation of the ATP-dependent CD137 agonist activity of anti-human CD137 antibodies that combine engineered variable regions and constant regions.
АТФ-зависимая агонистическая активность в отношении CD137 антител против CD137 человека, полученных комбинированием описанных выше вариабельных областей с константными областями тяжелой цепи, повышающими pI, оценивают in vitro с использованием моноцитов периферической крови человека согласно описанию в примерах 5-5-1 и 5-5-2. Исследованные антитела представлены в табл. 25.The ATP-dependent CD137 agonist activity of anti-human CD137 antibodies prepared by combining the variable regions described above with heavy chain constant regions that increase the pI was assessed in vitro using human peripheral blood monocytes as described in Examples 5-5-1 and 5-5 -2. The antibodies studied are presented in table. 25.
По сравнению с количествами IL-2 и IFN-γ в супернатанте культуры при добавлении отрицательного контрольного антитела (IC17HdK-MY518a/IC17L-k0, IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0, IC17HdKMY201/IC17L-k0, IC17HdK-G4d/IC17L-k0, IC17HdK-MY518/IC17L-k0, или IC17HdK-TT16/IC17L-k0) в присутствии 250 мкМ АТФ, когда добавление антитела увеличивает количество IL-2 в супернатанте культуры в 1,05 раза или более и количество IFN-γ в 1,15 раза или более, согласно оценке антитело демонстрирует агонистическую активность в отношении CD137. Измерение агонистической активности с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека (МКПК) может отличаться от донора к донору по образцу крови. В связи с этим определено, что антитела, которые не проявляют агонистической активности в отношении CD137 некоторой или более половины МКПК человека, выделенного от нескольких доноров, можно расценивать как не проявляющие активности агониста CD137, даже если они соответствовали стандартам для агонистов для другой части МКПК человека. Антитела, которые, как установлено, проявляют агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ, показаны в таблице 25 (фиг. 16, фиг. 17, фиг. 18, фиг. 19, фиг. 20, фиг. 21, фиг. 22 и фиг. 23).Compared with the amounts of IL-2 and IFN-γ in the culture supernatant with the addition of a negative control antibody (IC17HdK-MY518a/IC17L-k0, IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0, IC17HdKMY201/IC17L-k0, IC17HdK-G4d/IC17L-k0, IC17HdK-MY518/IC17L-k0, or IC17HdK-TT16/IC17L-k0) in the presence of 250 μM ATP, when the addition of antibody increases the amount of IL-2 in the culture supernatant by 1.05-fold or more and the amount of IFN-γ by 1.15 times or more, the antibody is assessed to demonstrate agonistic activity against CD137. Measurement of agonist activity using human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) may vary from donor to donor per blood sample. In this regard, it has been determined that antibodies that do not exhibit agonist activity against CD137 in some or more than half of human PBMCs isolated from multiple donors can be regarded as not exhibiting CD137 agonist activity, even if they met the standards for agonists for another part of human PBMCs. . Antibodies found to exhibit CD137 agonistic activity in the presence of 250 μM ATP are shown in Table 25 (FIG. 16, FIG. 17, FIG. 18, FIG. 19, FIG. 20, FIG. 21, FIG. 22 and Fig. 23).
Кроме того, среди антител, которые, как установлено, проявляют агонистическую активность в отношении CD137 в присутствии 250 мкМ АТФ, антитела, кратность изменения которых по сравнению с группой, в которую добавлено отрицательное контрольное антитело (IC17HdK-MY518a/IC17L-k0, IC17HdK-MY201aPh/IC 17L-k0, IC17HdK-MY201/IC17L-k0, IC17HdK-G4d/IC17L-k0, IC17HdKMY518/IC17L-k0, или IC17HdK-TT16/IC17L-k0), относительно количеств IL-2 и IFN-γ в супернатанте культуры при отсутствии АТФ меньше, чем кратное изменение относительно отрицательного контроля при наличии 250 мкМ АТФ, как установлено, проявляют пониженную агонистическую активность в отношении CD137 при отсутствии АТФ. Антитела, которые, как установлено, обладают пониженной агонистической активностью в отношении CD137 в отсутствие АТФ, показаны в табл. 25 (фиг. 16-23). Показано, что эти антитела проявляют АТФ-зависимую агонистическую активность в отношении CD137.Additionally, among the antibodies found to exhibit agonistic activity against CD137 in the presence of 250 μM ATP, antibodies whose fold change compared to the group in which the negative control antibody was added (IC17HdK-MY518a/IC17L-k0, IC17HdK- MY201aPh/IC 17L-k0, IC17HdK-MY201/IC17L-k0, IC17HdK-G4d/IC17L-k0, IC17HdKMY518/IC17L-k0, or IC17HdK-TT16/IC17L-k0), relative to the amounts of IL-2 and IFN-γ in the supernatant cultures in the absence of ATP less than a fold change relative to the negative control in the presence of 250 μM ATP were found to exhibit reduced agonistic activity against CD137 in the absence of ATP. Antibodies found to have reduced agonist activity against CD137 in the absence of ATP are shown in Table 1. 25 (Fig. 16-23). These antibodies have been shown to exhibit ATP-dependent agonist activity against CD137.
- 121 046075- 121 046075
Таблица 25Table 25
Пример 6. Мыши с нокином CD137 человека в качестве теста для введения переключаемых антител против CD137 человека.Example 6: Human CD137 knockin mice as test for administration of switchable anti-human CD137 antibodies.
(6-1) Разработка антител для исследования введения мышам с нокином CD137 человека.(6-1) Development of antibodies for human CD137 knockin mice administration studies.
Переключаемые и непереключаемые антитела против CD137 человека, содержащие константную область мыши, разработаны для исследования введения мышам с нокином CD137 человека. В частности получают непереключаемые антитела против CD137 человека (20H4.9-mIgG1/20H4.9LC-mk0 аббревиатура: NS1-mIgG1, 20H4.9-MB110/20H4.9LC-mk0 аббревиатура: NS1-MB110, 20H4.9-MB492/20H4.9LCmk0 аббревиатура: NS1-MB492, MOR-7480.1H-MB110/MOR-7480.1L-ml0r аббревиатура: NS2-MB110, MOR-7480.1H-MB492/MOR-7480.1L-ml0r аббревиатура: NS2-MB492) и переключаемые антитела против CD137 человека (A375-mIgG1/B167-ml0r, A372-mIgG1/B040-ml0r, A372-MB110/B040-ml0r, A372MB492/B040-ml0r, A356-MB110/B040-ml0r, A486-MB492/B167-ml0r, A488-MB492/B226-ml0r, A489MB492/B223-ml0r, A551-mIgG1/B256-ml0r, A551-MB110/B379-ml0r и A548-mIgG1/B256-ml0r).Switchable and nonswitchable anti-human CD137 antibodies containing a mouse constant region were developed for administration studies in human CD137 knockin mice. In particular, non-switchable antibodies against human CD137 are obtained (20H4.9-mIgG1/20H4.9LC-mk0 abbreviation: NS1-mIgG1, 20H4.9-MB110/20H4.9LC-mk0 abbreviation: NS1-MB110, 20H4.9-MB492/20H4 .9LCmk0 abbreviation: NS1-MB492, MOR-7480.1H-MB110/MOR-7480.1L-ml0r abbreviation: NS2-MB110, MOR-7480.1H-MB492/MOR-7480.1L-ml0r abbreviation: NS2-MB492) and switchable antibodies against Human CD137 (A375-mIgG1/B167-ml0r, A372-mIgG1/B040-ml0r, A372-MB110/B040-ml0r, A372MB492/B040-ml0r, A356-MB110/B040-ml0r, A486-MB492/B167-ml0r, A48 8 -MB492/B226-ml0r, A489MB492/B223-ml0r, A551-mIgG1/B256-ml0r, A551-MB110/B379-ml0r and A548-mIgG1/B256-ml0r).
Для тяжелых цепей антител NS1-mIgG1, NS1-MB110 и NS1-MB492 гены тяжелых цепей антитела разрабатывают комбинированием вариабельной области тяжелой цепи 20Н4.9 (SEQ ID NO: 139) с любой из последовательностей:For the antibody heavy chains NS1-mIgG1, NS1-MB110 and NS1-MB492, the antibody heavy chain genes are designed by combining the heavy chain variable region 20H4.9 (SEQ ID NO: 139) with any of the sequences:
(i) mIgG1, константной области тяжелой цепи IgG1 мыши (SEQ ID NO: 144), (ii) MB110, описанной в WO 2014030750 (SEQ ID NO: 145), и(i) mIgG1, the mouse IgG1 heavy chain constant region (SEQ ID NO: 144), (ii) MB110, described in WO 2014030750 (SEQ ID NO: 145), and
- 122 046075 (ill) MB492, описанной в WO 2014030750 (SEQ ID NO: 146), как константной областью тяжелой цепи. То есть были разработаны гены 20H4.9-mIgG1, 20H4.9MB110 и 20Н4.9-МВ492.- 122 046075 (ill) MB492, described in WO 2014030750 (SEQ ID NO: 146), as a heavy chain constant region. That is, the genes 20H4.9-mIgG1, 20H4.9MB110 and 20H4.9-MB492 were developed.
Для легких цепей антител NS1-mIgG1, NS1-MB110 и NS1-MB492 разрабатывают ген легкой цепи антитела 20H4.9LC-mk0 путем комбинирования вариабельной области легкой цепи 20H4.9LC (SEQ ID NO: 140) с цепью к мыши mk0 (SEQ ID NO: 147) в качестве константной области легкой цепи. Комбинируя эти гены тяжелой цепи и легкой цепи, каждое антитело получают экспрессией и очищают методами, известными специалистам в данной области.For antibody light chains NS1-mIgG1, NS1-MB110 and NS1-MB492, the 20H4.9LC-mk0 antibody light chain gene is developed by combining the 20H4.9LC light chain variable region (SEQ ID NO: 140) with the anti-mouse mk0 chain (SEQ ID NO : 147) as the light chain constant region. By combining these heavy chain and light chain genes, each antibody is expressed and purified by methods known to those skilled in the art.
Для тяжелых цепей антител NS2-MB110 и NS2-MB492 гены тяжелых цепей антитела были созданы путем объединения вариабельной области тяжелой цепи MOR-7480.1H (SEQ ID NO: 142) с одной из последовательностей:For antibody heavy chains NS2-MB110 and NS2-MB492, antibody heavy chain genes were created by combining the heavy chain variable region of MOR-7480.1H (SEQ ID NO: 142) with one of the sequences:
(i) MB110 (SEQ ID NO: 145), или (ii) MB492 (SEQ ID NO: 146), в качестве константной области тяжелой цепи. То есть созданы гены MOR-7480.1H-MB110 и MOR7480.1H-MB492.(i) MB110 (SEQ ID NO: 145), or (ii) MB492 (SEQ ID NO: 146), as the heavy chain constant region. That is, the genes MOR-7480.1H-MB110 and MOR7480.1H-MB492 were created.
Для легких цепей антител NS2-MB110 и NS2-MB492 ген легкой цепи антитела MOR-7480.1L-ml0r получают путем объединения вариабельной области легкой цепи MOR-7480.1L (SEQ ID NO: 143) с цепью λ мыши ml0r (SEQ ID NO: 148) в качестве константной области легкой цепи. Комбинируя указанные гены тяжелой цепи и легкой цепи, каждое антитело экспрессируют и очищают методами, известными специалистам в данной области.For the light chains of antibodies NS2-MB110 and NS2-MB492, the antibody light chain gene MOR-7480.1L-ml0r is prepared by combining the light chain variable region of MOR-7480.1L (SEQ ID NO: 143) with the mouse λ chain ml0r (SEQ ID NO: 148 ) as the light chain constant region. By combining these heavy chain and light chain genes, each antibody is expressed and purified by methods known to those skilled in the art.
Для анти-CD137 переключаемых антител получают гены тяжелой цепи антитела и легкой цепи антитела, указанные в табл. 26 и 27; каждое антитело экспрессируют и очищают путем объединения этих генов методами, известными специалистам в данной области.For anti-CD137 switchable antibodies, the antibody heavy chain and antibody light chain genes listed in Table 1 are obtained. 26 and 27; each antibody is expressed and purified by combining these genes by methods known to those skilled in the art.
Таблица 26Table 26
Тяжелые цепи анти-CD137 переключаемых антител, имеющих константную область мышиHeavy chain anti-CD137 switchable antibodies having a mouse constant region
- 123 046075- 123 046075
Таблица 27Table 27
Легкие цепи aHTu-CD137 переключаемых антител, имеющих константную область мышиLight chains of aHTu-CD137 switchable antibodies having a mouse constant region
(6-2) Оценка связывающей активности антител против CD137 человека, приготовленных для исследования введения мышам с нокином CD137 человека.(6-2) Evaluation of binding activity of anti-human CD137 antibodies prepared for human CD137 knockin mice administration study.
Оценивают связывающую активность непереключаемого антитела против CD137 человека и переключаемого антитела против CD137, полученного в примере 6-1, по отношению к CD137 человека. Измерения связывания CD137 человека проводят при 37°C с использованием 20 мМ ACES (pH 7,4), 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2 и 0,05% Tween20 в качестве подвижного буфера. Сначала антитела улавливают с помощью взаимодействующих растворов антител, приготовленных в подвижном буфере с иммобилизованным антителом кролика против IgG мыши (фирма Thermo Scientific) на сенсорном чипе Series S Sensor Chip CM5 (фирма GE Healthcare). Затем оценивают связывающую активность в отношении CD137 человека в присутствии АТФ и в отсутствие АТФ путем взаимодействия с раствором CD137 человека в подвижном буфере без АТФ. Для антигена CD137 человека используют hCD137 (расщепленный FXa), полученный в примере (1-2), и измерения проводят при концентрации антигена 0, 15 625, 62,5, 250 и 1000 нМ. Чип регенерируют, используя 25 мМ NaOH и 10 мМ глицин-HCl (рН 1,5), измерения проводят путем многократного захвата антител.The binding activity of the non-switchable anti-human CD137 antibody and the switchable anti-CD137 antibody prepared in Example 6-1 to human CD137 was assessed. Human CD137 binding measurements were performed at 37°C using 20 mM ACES (pH 7.4), 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 and 0.05% Tween20 as running buffer. First, antibodies are captured using reacting antibody solutions prepared in running buffer with rabbit anti-mouse IgG (Thermo Scientific) on a Series S Sensor Chip CM5 (GE Healthcare). Binding activity to human CD137 is then assessed in the presence of ATP and in the absence of ATP by reacting with a solution of human CD137 in running buffer without ATP. For the human CD137 antigen, hCD137 (FXa cleaved) obtained in Example (1-2) is used, and measurements are carried out at antigen concentrations of 0, 15,625, 62.5, 250 and 1000 nM. The chip was regenerated using 25 mM NaOH and 10 mM glycine-HCl (pH 1.5), and measurements were made by repeated antibody capture.
Константу диссоциации (KD) соответствующих антител в отношении CD137 человека рассчитывают с использованием программного обеспечения Biacore T200 Evaluation Software 2.0. В частности, конThe dissociation constant (KD) of the corresponding antibodies against human CD137 was calculated using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. In particular, con
- 124 046075 станту скорости ассоциации ka (л/моль/с) и константу скорости диссоциации kd (1/с) рассчитывают путем глобальной подгонки сенсограмм, полученных путем измерения с помощью модели связывания Ленгмюра 1:1, и константы диссоциации KD (моль/л) рассчитывают по этим значениям.- 124 046075 The association rate constant ka (l/mol/s) and the dissociation rate constant kd (1/s) are calculated by globally fitting the sensorgrams obtained by measuring with the 1:1 Langmuir binding model and the dissociation constant KD (mol/l ) are calculated from these values.
В табл. 28 представлены результаты таких измерений.In table Figure 28 presents the results of such measurements.
Таблица 28Table 28
Анализ связывания CD137 человека анти-CD137 антителами, имеющими константную область мышиHuman CD137 Binding Assay by Anti-CD137 Mouse Constant Region Antibodies
НД (нет данных) - активность слишком мала, чтобы определить величину KD НО - не определялиND (no data) - activity is too low to determine the KD value NA - not determined
Было подтверждено, что как непереключаемое антитело против CD137 человека, так и полученное выше переключаемое антитело против CD137 человека, которые содержат константную область мыши, связываются с CD137 человека. Также было показано, что все переключаемые антитела против CD137 человека связываются с CD137 человека зависимым от концентрации АТФ образом. С другой стороны, для непереключаемых антител не наблюдают такого зависимого от концентрации АТФ связывания с CD137 человека, причем связывание было почти равным при любой концентрации АТФ.Both the non-switchable anti-human CD137 antibody and the above-derived switchable anti-human CD137 antibody, which contain a mouse constant region, were confirmed to bind to human CD137. All switchable anti-human CD137 antibodies were also shown to bind to human CD137 in an ATP concentration-dependent manner. On the other hand, non-switchable antibodies did not show such ATP concentration-dependent binding to human CD137, and binding was almost equal at all ATP concentrations.
(6-3) Оценка кинетики модифицированных антител в плазме мышей с нокином CD137 человека.(6-3) Evaluation of the kinetics of modified antibodies in the plasma of human CD137 knockin mice.
(6-3-1) Получение мышей с нокином CD137 человека.(6-3-1) Generation of human CD137 knockin mice.
Путем интродукции вектора для замены гена CD137 человека в эмбриональные стволовые клетки мыши (ES-клетки) получают мышь с нокином CD137 человека, у которой ген CD137 мыши заменен геном CD137 человека.By introducing a human CD137 gene replacement vector into mouse embryonic stem cells (ES cells), a human CD137 knockin mouse is generated in which the mouse CD137 gene is replaced with a human CD137 gene.
Такую мышь обозначают hCD137 KI.This mouse is designated hCD137 KI.
(6-3-2) Измерение концентрации антитела против CD137 человека в плазме модели мыши hCD137KI.(6-3-2) Measurement of the concentration of anti-human CD137 antibody in the plasma of the hCD137KI mouse model.
После создания мыши hCD137KI в примере 6-3-1, соответствующие антитела вводят внутривенно в виде однократной дозы мыши hCD137KI, как показано в табл. 29. В табл. 29 антитела NS1-mIgG1, NS1MB110 и NS1-MB492 все являются непереключаемыми антителами, а другие - переключаемыми антителами. Кровь собирают несколько раз, начиная с 5 мин до 28 дней после введения. Полученную кровь центрифугируют для отделения плазмы. Плазму хранят в морозильной камере при температуре ниже 20°C до проведения измерения.After generating the hCD137KI mouse in Example 6-3-1, the corresponding antibodies were administered intravenously as a single dose of the hCD137KI mouse, as shown in Table 1. 29. In table. 29 antibodies NS1-mIgG1, NS1MB110 and NS1-MB492 are all non-switchable antibodies, while the others are switchable antibodies. Blood is collected several times from 5 minutes to 28 days after administration. The resulting blood is centrifuged to separate the plasma. Plasma is stored in a freezer at a temperature below 20°C until measurement.
- 125 046075- 125 046075
Таблица 29Table 29
Детали групп для исследования оценке кинетики в плазмеDetails of groups for the plasma kinetics study
Концентрацию каждого переключаемого антитела в плазме измеряют методом электрохемилюминесценции (ECL, electrochemiluminescence). В частности, hCD137 (фирма Sino Biological Inc.) разводят в ФСБ (-) и вносят в MULTI-ARRAY 96-луночный планшет (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). В планшет добавляют hCD137 и встряхивают при комнатной температуре в течение 1 ч, hCD137 иммобилизуют в планшете. Затем для блокирования добавляют раствор ФСБ, содержащий 1% БСА и 0,05% Tween 20, и встряхивают при комнатной температуре в течение 1 ч. Калибровочные кривые для индивидуальных переключаемых антител построены при концентрациях в плазме 64, 32, 16, 8, 4, 2 и 1 нг/мл. После добавления раствора ФСБ, содержащего 3 мМ АДФ, 1% БСА и 0,05% Tween 20, в планшет с иммобилизованным hCD137, двукратный объем образцов плазмы разбавляют в растворе ФСБ, содержащем 1% БСА и 0,05% Tween20, а также образцы калибровочной кривой. После встряхивания планшета при комнатной температуре в течение 1 ч добавляют биотинилированное антитело против IgG мыши (фирма Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc.). Кроме того, после встряхивания планшета при комнатной температуре в течение 1 ч добавляют меченый стрептавидином SULFO-TAG (фирма Meso Scale Diagnostics, LLCs). Кроме того, после встряхивания планшета при комнатной температуре в течение 1 ч добавляют буфер Read buffer T (фирма Meso Scale Diagnostics, LLCs), разведенный в два раза раствором ФСБ, содержащим 2 мМ АДФ, 1% БСА и 0,05% Tween 20. Измерение концентраций антител в плазме мышей hCD137KI проводят путем обнаружения с использованием SULFO-TAG на SECTOR Imager (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Расчет индивидуальных концентраций антител в плазме мыши производят с помощью программы SOFTmax PRO (фирма Molecular Devices).The plasma concentration of each switched antibody is measured by electrochemiluminescence (ECL, electrochemiluminescence). Specifically, hCD137 (Sino Biological Inc.) is diluted in PBS (-) and added to a MULTI-ARRAY 96-well plate (Meso Scale Diagnostics, LLC). Add hCD137 to the plate and shake at room temperature for 1 hour, hCD137 is immobilized in the plate. A PBS solution containing 1% BSA and 0.05% Tween 20 is then added to block and shaken at room temperature for 1 hour. Calibration curves for individual switch antibodies are plotted at plasma concentrations of 64, 32, 16, 8, 4, 2 and 1 ng/ml. After adding a PBS solution containing 3 mM ADP, 1% BSA and 0.05% Tween 20 to the hCD137-immobilized plate, two times the volume of plasma samples is diluted in a PBS solution containing 1% BSA and 0.05% Tween20, as well as the samples calibration curve. After shaking the plate at room temperature for 1 hour, biotinylated anti-mouse IgG antibody (Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc.) was added. Additionally, after shaking the plate at room temperature for 1 hour, streptavidin-labeled SULFO-TAG (Meso Scale Diagnostics, LLCs) was added. In addition, after shaking the plate at room temperature for 1 hour, add Read buffer T (Meso Scale Diagnostics, LLCs), diluted twice with a PBS solution containing 2 mM ADP, 1% BSA and 0.05% Tween 20. Measurement of antibody concentrations in the plasma of hCD137KI mice is carried out by detection using SULFO-TAG on a SECTOR Imager (Meso Scale Diagnostics, LLC). Calculation of individual antibody concentrations in mouse plasma is carried out using the SOFTmax PRO program (Molecular Devices).
Концентрацию непереключаемых антител в плазме измеряют методом электрохемилюминесценции (ECL). В частности, hCD137 (фирма Sino Biological Inc.) разводят в ФСБ (-) и добавляют в 96-луночный планшет MULTI-ARRAY (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). В планшет добавляют hCD137 и встряхивают при комнатной температуре в течение одного часа для иммобилизации hCD137 в планшете. Затем для блокирования добавляют раствор ФСБ, содержащий 1% БСА и 0,05% Tween 20, встряхивают при комнатной температуре в течение одного часа. Калибровочные кривые для индивидуальных непереключаемых антител построены при концентрациях в плазме 32, 16, 8, 4, 2, 1 и 0,5 нг/мл. Образцы плазмы, разведенные в растворе ФСБ, содержащем 1% БСА, 0,05% Tween 20, а также образцы калибровочной кривой, добавляют в планшет с иммобилизованным hCD137. После встряхивания планшета при комнатной температуре в течение одного часа добавляют биотинилированное антитело против IgG мыши (фирма Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc.). Кроме того, после встряхивания планшета при комнатной температуре в течение одного часа добавляют SULFO-TAG Labeled Streptavidin (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Добавляют буфер для считывания Т (фирма Meso Scale Diagnostics, LLCs), разведенный в два раза. Измерение концентраций антител в плазме мышей hCD137KI выполняют аналогично описанному выше для переключаемых антител.The concentration of nonswitchable antibodies in plasma is measured by electrochemiluminescence (ECL). Specifically, hCD137 (Sino Biological Inc.) is diluted in PBS (-) and added to a 96-well MULTI-ARRAY plate (Meso Scale Diagnostics, LLC). hCD137 is added to the plate and shaken at room temperature for one hour to immobilize hCD137 in the plate. A PBS solution containing 1% BSA and 0.05% Tween 20 is then added to block and shaken at room temperature for one hour. Calibration curves for individual nonswitchable antibodies were constructed at plasma concentrations of 32, 16, 8, 4, 2, 1, and 0.5 ng/mL. Plasma samples diluted in PBS solution containing 1% BSA, 0.05% Tween 20, as well as calibration curve samples, are added to the plate with immobilized hCD137. After shaking the plate at room temperature for one hour, biotinylated anti-mouse IgG antibody (Jackson ImmunoResearch Laboratories, Inc.) is added. Additionally, after shaking the plate at room temperature for one hour, SULFO-TAG Labeled Streptavidin (Meso Scale Diagnostics, LLC) is added. Reading buffer T (Meso Scale Diagnostics, LLCs), diluted twofold, was added. Measurement of antibody concentrations in the plasma of hCD137KI mice is performed similarly to that described above for switchable antibodies.
Результаты показаны на фиг. 24, 25 и 26.The results are shown in Fig. 24, 25 and 26.
На фиг. 24 показана динамика средних концентраций в плазме мыши hCD137 KI антител, имеющих mIgG1 в качестве Fc (NS1-mIgG1 в качестве непереключаемого антитела и A375-mIgG1/B167-ml0r, A372-mIgG1/B040-ml0r, A548-mIgG1/B256-ml0r или A551-mIgG1/B256-ml0r в качестве переключаемого антитела) среди антител, показанных в табл. 29. На фиг. 25 показана динамика средних концентраций в плазме мыши hCD137 KI антител, имеющих MB110 в качестве Fc (NS1-MB110 в качестве не переключаемого антитела и A356-MB110/B040-ml0r, A372-MB110/B040-ml0r, и А551-МВ110/B379-ml0r в качестве переключаемых антител). На фиг. 26 показана динамика средних концентраций в плазме мыши CD137 KI антител, имеющих МВ492 в качестве Fc (NS1-MB492 в качестве непереключаемого антитела и A372MB492/B040-ml0r, A486-MB492/B167-ml0r, A488-MB492/B226-ml0r или A489-MB492/B223-ml0r в качестве переключаемого антитела). На фиг. 26, что касается А488-МВ492/В226-ml0r, резкое снижение воIn fig. Figure 24 shows the dynamics of average concentrations in mouse plasma of hCD137 KI antibodies having mIgG1 as an Fc (NS1-mIgG1 as a non-switchable antibody and A375-mIgG1/B167-ml0r, A372-mIgG1/B040-ml0r, A548-mIgG1/B256-ml0r or A551-mIgG1/B256-ml0r as a switchable antibody) among the antibodies shown in Table. 29. In FIG. Figure 25 shows the dynamics of average concentrations in mouse plasma of hCD137 KI antibodies having MB110 as an Fc (NS1-MB110 as a non-switchable antibody and A356-MB110/B040-ml0r, A372-MB110/B040-ml0r, and A551-MB110/B379- ml0r as switchable antibodies). In fig. Figure 26 shows the dynamics of average concentrations in mouse plasma of CD137 KI antibodies having MB492 as an Fc (NS1-MB492 as a non-switchable antibody and A372MB492/B040-ml0r, A486-MB492/B167-ml0r, A488-MB492/B226-ml0r or A489- MB492/B223-ml0r as a switchable antibody). In fig. 26, as for A488-MV492/B226-ml0r, a sharp decrease in
- 126 046075 времени концентрации в плазме, предположительно вызванное ADA, подтверждено у одного субъекта, а среднее значение было взято по данным двух субъектов.- 126 046075 plasma concentration time suspected to be caused by ADA was confirmed in one subject, and the average was taken from two subjects.
У мыши hCD137 KI с любым Fc переключающее антитело демонстрирует более медленное выведение из плазмы, чем непереключаемое антитело. Предполагают, что это связано с тем, что по сравнению с переключаемым антителом непереключаемое антитело связывается с CD137, экспрессируемым в организме, и быстрее элиминирует в плазме. Кроме того, высказывают предположение, что концентрация внеклеточного АТФ в нормальной ткани до такой степени низкая, что переключаемые антитела, используемые в этом исследовании, не связывались с CD137 человека. Эти результаты позволяют предположить, что связывание с антигеном, экспрессируемым системно, можно уменьшить с помощью переключаемых антител, и, таким образом, можно получить антитело с улучшенной кинетикой крови.In the hCD137 KI mouse with either Fc, the switching antibody exhibits slower clearance from plasma than the nonswitching antibody. It is believed that this is due to the fact that, compared to the switch antibody, the non-switch antibody binds to CD137 expressed in the body and is eliminated more quickly in the plasma. It is also suggested that the concentration of extracellular ATP in normal tissue is so low that the switch antibodies used in this study did not bind to human CD137. These results suggest that binding to systemically expressed antigen can be reduced by switchable antibodies, and thus an antibody with improved blood kinetics can be obtained.
(6-4) Движение маркеров эффективности лекарственного средства и системного ответа антител к CD137 на модели трансплантации сингенных опухолевых клеток с использованием мышей hCD137KI.(6-4) Movement of markers of drug efficacy and systemic antibody response to CD137 in a syngeneic tumor cell transplantation model using hCD137KI mice.
(6-4-1) Получение клеточных линий и мышиная модель трансплантации сингенной опухоли, а также метод оценки противоопухолевого эффекта и системного ответа.(6-4-1) Generation of cell lines and mouse model of syngeneic tumor transplantation, as well as a method for assessing the antitumor effect and systemic response.
Клетки линии клеток колоректального рака МС38 мыши, лицензированной Национальным институтом рака, и мышей hCD137 KI, описанных в примере 6-3-1, используют для различных исследований. Модель формируется, когда объем опухоли достигает приблизительно 50-300 мм3, путем подкожной имплантации линии клеток МС38 в брюшную полость мышей. После создания модели мышей с трансплантированной клеточной линией МС38 группируют, а затем вводят различные анти-CD137 антитела.Cells from the National Cancer Institute-licensed MC38 mouse colorectal cancer cell line and hCD137 KI mice described in Example 6-3-1 were used for various studies. The model is formed when the tumor volume reaches approximately 50-300 mm 3 by subcutaneous implantation of the MC38 cell line into the peritoneal cavity of mice. After establishing the model, mice transplanted with the MC38 cell line are grouped and then administered with various anti-CD137 antibodies.
Для оценки противоопухолевого эффекта измерение объема опухоли проводят 1-2 раза в неделю. Объем опухоли рассчитывают по следующей формуле:To assess the antitumor effect, tumor volume is measured 1-2 times a week. Tumor volume is calculated using the following formula:
Объем опухоли (мм ) = длина (мм) х ширина (мм) х ширина (мм)/2Tumor volume (mm) = length (mm) x width (mm) x width (mm)/2
Путем удаления печени и селезенки или лимфатических узлов в соответствующее время после введения антитела системные ответы оценивают по массе органа, по количеству клеток во фракциях лимфоцитов или по анализу Т-клеток с использованием жидкостной цитометрии (FCM). При оценке этих показателей установлено, что переключаемое антитело субъекта подавляет системные ответы и/или активацию Т-клеток в неопухолевых тканях (например, лимфатических узлах, селезенке и печени), когда показатель системного ответа был низким по сравнению с таким же количество непереключаемого антитела (контрольное антитело против CD137 человека без АТФ-зависимой связывающей активности в отношении CD137 человека).By removing the liver and spleen or lymph nodes at an appropriate time after antibody administration, systemic responses are assessed by organ weight, cell counts in lymphocyte fractions, or T-cell analysis using liquid cytometry (FCM). In evaluating these measures, the subject's switch antibody was found to suppress systemic responses and/or T cell activation in non-tumor tissues (eg, lymph nodes, spleen, and liver) when the systemic response rate was low compared to the same amount of non-switch antibody (control). anti-human CD137 antibody without ATP-dependent binding activity against human CD137).
Антитела, полученные в примере 6-1 (вырабатывание антител для теста по введению мышам с нокином CD137 человека), используют в различных тестах.The antibodies obtained in Example 6-1 (antibody production for the human CD137 knockin mouse test) are used in various tests.
(6-4-2) Получение различных органов от мыши с пересаженной клеточной линией МС38 и подготовка фракций лимфоцитов.(6-4-2) Obtaining various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and preparing lymphocyte fractions.
Проводят измерение массы собранных селезенок и лимфатических узлов, а также подсчет клеток фракций лимфоцитов. Фракции лимфоцитов, полученные с использованием набора для диссоциации печени, мыши (фирма Milteny Biotec), также используют для оценки активации печени. Фракции лимфоцитов после лизиса эритроцитов используют для оценки активации в селезенке, а фракции лимфоцитов, полученные путем измельчения, используют для оценки активации в лимфатических узлах.The mass of collected spleens and lymph nodes is measured, as well as cell counting of lymphocyte fractions. Lymphocyte fractions obtained using a mouse liver dissociation kit (Milteny Biotec) were also used to assess liver activation. Lymphocyte fractions from erythrocyte lysis are used to assess activation in the spleen, and crushed lymphocyte fractions are used to assess activation in lymph nodes.
(6-4-3) Анализ FCM с использованием фракций лимфоцитов из различных органов.(6-4-3) FCM analysis using lymphocyte fractions from various organs.
Для оценки активации маркеров методом FCM применяют экспрессию гранзима В или экспрессию ICOS на CD8α-положительных Т-клетках или процент CD8α-положительных Т-клеток среди CD45положительных клеток. По этой причине в анализе FCM используют флуоресцентно меченые антитела против гранзима В, PD-1, ICOS, CD8a и CD45. Измерения проводят с помощью BD LSRFortessa™ Х-20 (фирма BD Biosciences).To assess marker activation by FCM, granzyme B expression or ICOS expression on CD8α-positive T cells or the percentage of CD8α-positive T cells among CD45-positive cells are used. For this reason, fluorescently labeled antibodies against granzyme B, PD-1, ICOS, CD8a and CD45 are used in the FCM assay. Measurements are performed using a BD LSRFortessa™ X-20 (BD Biosciences).
(6-4-4) Исследования лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антитела A375mIgG1/B167-ml0r.(6-4-4) Studies of the medicinal efficacy (antitumor effect) of the antibody A375mIgG1/B167-ml0r.
После формирования у мышей опухоли в результате трансплантации раковых клеток МС38 в примерах 6-4-1, вводят растворитель и А375-mIgG1/B167-ml0r в дозах, показанных в табл. 30. Введение антител проводят дважды через хвостовую вену в день формирования групп и через четыре дня после этого. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After the formation of a tumor in mice as a result of transplantation of MC38 cancer cells in examples 6-4-1, the solvent and A375-mIgG1/B167-ml0r are administered in the doses shown in table. 30. Antibodies are administered twice through the tail vein on the day of group formation and four days after that. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Таблица 30Table 30
Подробная информация по группам исследования эффективности A375-mIgG1/B167-ml0rDetailed information on efficacy study arms A375-mIgG1/B167-ml0r
- 127 046075- 127 046075
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли, рассчитанной согласно описанию в примере 6-4-1. В результате подтверждают доза-зависимый противоопухолевый эффект антитела A375-mIgG1/B167-ml0r (фиг. 27).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume, calculated as described in example 6-4-1. The result confirms the dose-dependent antitumor effect of the antibody A375-mIgG1/B167-ml0r (Fig. 27).
(6-4-5) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов A375-mIgG1/B167-ml0r.(6-4-5) Antibody administration and sampling and FCM analysis to evaluate systemic effects of A375-mIgG1/B167-ml0r.
После создания мышиной модели после трансплантации МС38 в примере 6-4-1, вводят растворитель, NS1-mIgG1 (непереключаемое антитело) и A375-mIgG1/B167-ml0r, как показано в табл. 31. Введение антител вводят дважды в хвостовую вену в день формирования групп и через три дня после формирования групп. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After establishing the MC38 transplantation mouse model in Example 6-4-1, vehicle, NS1-mIgG1 (non-switchable antibody) and A375-mIgG1/B167-ml0r were administered as shown in Table. 31. Antibody injections are administered twice into the tail vein on the day of group formation and three days after group formation. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Через пять дней после первоначального введения собирают печень, лимфатические узлы и селезенку, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов от мыши с трансплантированной линией клеток МС38 и получение фракций лимфоцитов). Кроме того, для селезенки и лимфатических узлов органы трех мышей объединяют и проводят анализ FCM, как показано в примере 6-4-3 (анализ FCM с использованием фракций лимфоцитов из различных органов).Five days after the initial administration, the liver, lymph nodes and spleen are collected as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from a mouse transplanted with the MC38 cell line and obtaining lymphocyte fractions). In addition, for the spleen and lymph nodes, organs from three mice were pooled and FCM analysis was performed as shown in Example 6-4-3 (FCM analysis using lymphocyte fractions from different organs).
Таблица 31Table 31
Подробная информация по группам для оценки системных ответов с антителом A375-mIgG1/B167-ml0rDetailed information by group for assessing systemic responses with antibody A375-mIgG1/B167-ml0r
Оценивают системные эффекты от введения антител. В результате оценки веса органов лимфатиче- 128 046075 ских узлов и селезенок установлено увеличение веса этих органов при введении NS1-mIgG1 в дозе 0,3 мг/кг и более выраженная гипертрофия органов при 1,5 мг/кг. кг и 7,5 мг/кг. С другой стороны, увеличения органа не наблюдают при введении A375-mIgG1/B167-ml0r ни при одной из доз 1,5 мг/кг, 7,5 мг/кг или 37,5 мг/кг (фиг. 28).Systemic effects from the administration of antibodies are assessed. As a result of assessing the weight of the organs of the lymph nodes and spleens, an increase in the weight of these organs was established when NS1-mIgG1 was administered at a dose of 0.3 mg/kg and more pronounced organ hypertrophy at 1.5 mg/kg. kg and 7.5 mg/kg. On the other hand, organ enlargement was not observed with A375-mIgG1/B167-ml0r at any of the doses of 1.5 mg/kg, 7.5 mg/kg, or 37.5 mg/kg (FIG. 28).
Кроме того, в результате оценки активации Т-клеток с помощью оценки FCM наблюдают повышение экспрессии всех маркеров PD-1, ICOS и гранзима В при 0,3 мг/кг после введения NS1-mIgG1. С другой стороны, при введении А375-mIgG1/B167-ml0r наблюдают заметное ингибирование экспрессии всех маркеров PD-1, ICOS и гранзима В в дозах 1,5 мг/кг, 7,5 мг/кг и 37,5 мг/кг (фиг. 29 и фиг. 30). Поскольку результаты по A375-mIgG1/B167-ml0r показали, что вес органа коррелирует с маркерами активации Тклеток в лимфатических узлах и селезенке, вес органа используют в основном в качестве индикатора активации иммунных клеток в лимфатических узлах и селезенке при последующей оценке антител.In addition, as a result of assessing T cell activation using FCM assessment, an increase in the expression of all markers PD-1, ICOS and granzyme B was observed at 0.3 mg/kg after administration of NS1-mIgG1. On the other hand, when A375-mIgG1/B167-ml0r was administered, a significant inhibition of the expression of all markers PD-1, ICOS and granzyme B was observed at doses of 1.5 mg/kg, 7.5 mg/kg and 37.5 mg/kg ( Fig. 29 and Fig. 30). Because the results for A375-mIgG1/B167-ml0r showed that organ weight correlated with markers of T cell activation in the lymph nodes and spleen, organ weight is used primarily as an indicator of immune cell activation in the lymph nodes and spleen in subsequent antibody assessments.
В результате оценки активации Т-клеток в печени наблюдают увеличение экспрессии PD-1 и гранзима В при введении NS1-mIgG1 в дозе 0,3 мг/кг. С другой стороны, при введении A375-mIgG1/B167ml0r, экспрессии подавлялись при всех дозах 1,5 мг/кг, 7,5 мг/кг и 37,5 мг/кг (фиг. 31).As a result of assessing the activation of T cells in the liver, an increase in the expression of PD-1 and granzyme B was observed when NS1-mIgG1 was administered at a dose of 0.3 mg/kg. On the other hand, when A375-mIgG1/B167ml0r was administered, expressions were suppressed at all doses of 1.5 mg/kg, 7.5 mg/kg and 37.5 mg/kg (Fig. 31).
Таким образом, переключающее антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах, селезенке и печени по сравнению с таким же количеством непереключаемого антитела.Thus, the switching antibody inhibits T cell activation in the lymph nodes, spleen, and liver compared with the same amount of nonswitching antibody.
(6-4-6) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антитела A356MB110/B040-ml0r.(6-4-6) Study of the medicinal efficacy (antitumor effect) of the antibody A356MB110/B040-ml0r.
После формирования мышиной модели после трансплантации МС38 в примере 6-4-1 растворитель и А356-МВН()/В040-т10г вводят в дозах, показанных в табл. 32. Введение антитела проводят дважды в хвостовую вену в день формирования группы и через три дня после формирования группы. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After the formation of the mouse model after MC38 transplantation in example 6-4-1, the solvent and A356-MVN()/B040-t10g are administered in the doses shown in table. 32. The antibody is administered twice into the tail vein on the day of group formation and three days after the group is formed. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Таблица 32Table 32
Подробная информация о группах исследования эффективности А356-МВ110/В040-т10гDetailed information about the effectiveness study groups A356-MV110/V040-t10g
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли по расчетам, описанным в примере 6-4-1. Результаты подтверждают дозозависимый противоопухолевый эффект А356МВ110/В040-т10г (фиг. 32).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume according to the calculations described in example 6-4-1. The results confirm the dose-dependent antitumor effect of A356MB110/B040-t10g (Fig. 32).
(6-4-7) Введение антител и отбор образцов, а также FCM-анализ для оценки системных эффектов А3 56-МВ110/В040-т10г.(6-4-7) Antibody administration and sampling, as well as FCM analysis to assess the systemic effects of A3 56-MB110/B040-t10g.
После создания модели мышей с трансплантацией МС38 в примере 6-4-1 вводят растворитель, NS2MB110 (непереключаемое антитело) и А356-МВ110/В040-т10г, как показано в табл. 33. Введение антител проводят дважды в хвостовую вену в день формирования групп и через три дня после г формирования групп. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After establishing the MC38 transplant mouse model in Example 6-4-1, vehicle, NS2MB110 (non-switchable antibody) and A356-MB110/B040-t10g were administered as shown in Table. 33. Antibodies are administered twice into the tail vein on the day of group formation and three days after group formation. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Через семь дней после первого введения печень, лимфатические узлы и селезенку собирали, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей, трансплантированных клеточной линией МС38, и подготовка фракций лимфоцитов). Для селезенки и лимфатических узлов проводят только измерение веса органов.Seven days after the first administration, the liver, lymph nodes and spleen were collected as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and preparation of lymphocyte fractions). For the spleen and lymph nodes, only the weight of the organs is measured.
- 129 046075- 129 046075
Таблица 33Table 33
Подробная информация по группам для оценки системных ответов на антитело А356-МВ110/B040-ml0rDetailed information on groups for assessing systemic responses to antibody A356-MB110/B040-ml0r
Оценивают системные эффекты от введенных антител. Результат оценки массы органов лимфатических узлов и селезенки при введении NS2-MB110 и A356-MB110/B040-ml0r показывает, что гипертрофия наблюдается также при введении NS2-MB110 в дозе 2,5 мг/кг. С другой стороны, на момент введения А356-МВ110/В040-ml0r лимфаденопатия подавляется даже при 7,5 мг/кг, а спленомегалия подавляется при 2,5 мг/кг (фиг. 33).The systemic effects of the administered antibodies are assessed. The result of assessing the mass of organs of the lymph nodes and spleen with the administration of NS2-MB110 and A356-MB110/B040-ml0r shows that hypertrophy is also observed with the administration of NS2-MB110 at a dose of 2.5 mg/kg. On the other hand, at the time of administration of A356-MB110/B040-ml0r, lymphadenopathy was suppressed even at 7.5 mg/kg, and splenomegaly was suppressed at 2.5 mg/kg (Fig. 33).
Кроме того, результат оценки активации Т-клеток в печени показывает, что увеличение экспрессии PD-1 в CD8α-положительных клетках также наблюдают при введении NS2-MB110 в дозе 0,3 мг/кг. Между тем, когда вводят A356-MB'1'10/B040-ml0r, экспрессия PD-1 подавляется при дозе 7,5 мг/кг и существенно подавляется при 2,5 мг/кг. Небольшое увеличение экспрессии ICOS в CD8α-положительных клетках также наблюдают при введении антитела NS2-MB11O в дозе 0,3 мг/кг. С другой стороны, наблюдают, что экспрессия растворителя подавляется при 2,5 мг/кг при введении A356-MB'1'10/B040-ml0r (фиг. 34).In addition, the result of assessing the activation of T cells in the liver shows that an increase in the expression of PD-1 in CD8α-positive cells is also observed when NS2-MB110 is administered at a dose of 0.3 mg/kg. Meanwhile, when A356-MB'1'10/B040-ml0r was administered, the expression of PD-1 was suppressed at 7.5 mg/kg and significantly suppressed at 2.5 mg/kg. A slight increase in ICOS expression in CD8α-positive cells was also observed when the NS2-MB11O antibody was administered at a dose of 0.3 mg/kg. On the other hand, solvent expression was observed to be suppressed at 2.5 mg/kg upon administration of A356-MB'1'10/B040-ml0r (FIG. 34).
Таким образом, переключаемое антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах, селезенке и печени по сравнению с непереключаемым антителом.Thus, the switchable antibody inhibits T cell activation in the lymph nodes, spleen, and liver compared to the nonswitchable antibody.
(6-4-8) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антитела A372mIgG1/B040-ml0r.(6-4-8) Study of the medicinal effectiveness (antitumor effect) of the antibody A372mIgG1/B040-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией МС38 в примере 6-4-1 вводят растворитель и A372-mIgG1/B040-ml0r в дозах, показанных в табл. 34. Введение антитела проводят четыре раза в хвостовую вену в день формирования группы и через 4 дня, 7 дней и 10 дней после формирования группы. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After establishing the MC38 transplant mouse model in Example 6-4-1, vehicle and A372-mIgG1/B040-ml0r were administered at the doses shown in Table 1. 34. The antibody is administered four times into the tail vein on the day of group formation and 4 days, 7 days and 10 days after group formation. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Таблица 34Table 34
Подробная информация по группам исследования эффективности A372-mIgG1/B040-ml0rDetailed information on efficacy study groups A372-mIgG1/B040-ml0r
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли по расчетам, описанным в примере 6-4-1. Результаты подтверждают противоопухолевый эффект от введения антитела A372mIgG1/B040-ml0r (фиг. 35).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume according to the calculations described in example 6-4-1. The results confirm the antitumor effect of the administration of the antibody A372mIgG1/B040-ml0r (Fig. 35).
(6-4-9) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов A372-mIgG1/B040-ml0r.(6-4-9) Antibody administration and sampling and FCM analysis to evaluate systemic effects of A372-mIgG1/B040-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией МС38 в примере 6-4-1 вводят растворитель и A372-mIgG1/B040-ml0r, как показано в табл. 35. Введение антитела проводят три раза в хвостовую вену в день формирования группы и через 3 дня и 6 дней после формирования группы. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After establishing the MC38 transplant mouse model in Example 6-4-1, vehicle and A372-mIgG1/B040-ml0r were administered as shown in Table. 35. The antibody is administered three times into the tail vein on the day of group formation and 3 days and 6 days after group formation. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Через семь дней после первого введения печень, лимфатические узлы и селезенку собирают, какSeven days after the first injection, the liver, lymph nodes and spleen are collected as
- 130 046075 показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей, трансплантированных клеточной линией МС38, и подготовка фракций лимфоцитов). Для селезенки проводят только измерение массы органов; для лимфатических узлов проводят только подсчет клеток фракций лимфоцитов, полученных из лимфоцитов, объединенных от трех мышей.- 130 046075 is shown in example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and preparation of lymphocyte fractions). For the spleen, only the organ mass is measured; For lymph nodes, only cell counts are performed for lymphocyte fractions obtained from lymphocytes pooled from three mice.
Таблица 35Table 35
Подробная информация по группам исследования системных ответов при использовании антитела A372-mIgG1/B040-ml0rDetailed information on systemic response study groups using antibody A372-mIgG1/B040-ml0r
Оценивают системные эффекты от введения антител. В результате измерения количества клеток в лимфатических узлах и массы селезенок было подтверждено, что нет увеличения количества клеток в лимфатических узлах и увеличения массы селезенки при введении A372-mIgG1/B040-ml0r, и что масса этого органа эквивалентна массе в группе введения растворителя (фиг. 36).Systemic effects from the administration of antibodies are assessed. As a result of measuring the number of cells in the lymph nodes and the weight of the spleens, it was confirmed that there was no increase in the number of cells in the lymph nodes and an increase in the weight of the spleen with the administration of A372-mIgG1/B040-ml0r, and that the weight of this organ was equivalent to that in the vehicle group (Fig. 36).
В результате оценки активации Т-клеток в печени показано, что уровни экспрессии гранзима В подобны аналогичным уровням в группе введения растворителя когда вводили A372-mIgG1/B040-ml0r (фиг. 37).As a result of the assessment of T cell activation in the liver, granzyme B expression levels were shown to be similar to those in the vehicle group when A372-mIgG1/B040-ml0r was administered (FIG. 37).
Таким образом, подтверждено, что переключаемое антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах, селезенке и печени.Thus, the switch antibody was confirmed to inhibit T cell activation in lymph nodes, spleen and liver.
(6-4-10) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антитела A372-MB110/B040-ml0r.(6-4-10) Study of the medicinal efficacy (antitumor effect) of the antibody A372-MB110/B040-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель и А372МВ110/B040-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 36. Введение антител осуществляют дважды в хвостовую вену в день формирования группы и через четыре дня после этого. В качестве растворителя используют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After creating a mouse model with cancer transplantation MC38 in example 6-4-1, the solvent and A372MB110/B040-ml0r are administered in the doses presented in table. 36. Antibodies are administered twice into the tail vein on the day of group formation and four days after that. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Таблица 36Table 36
Подробная информация по группам по исследованию эффективности A372-mIgG1/B040-ml0rDetailed information on efficacy study arms A372-mIgG1/B040-ml0r
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли по расчетам, описанным в примере 6-4-1. Результаты подтверждают противоопухолевый эффект A372-mIgG1/B040-ml0r (фиг. 38).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume according to the calculations described in example 6-4-1. The results confirm the antitumor effect of A372-mIgG1/B040-ml0r (Fig. 38).
(6-4-11) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов Α372-ΜΒ110/Β040-^0γ(6-4-11) Antibody administration and sampling and FCM analysis to evaluate systemic effects of Α372-ΜΒ110/Β040-^0γ
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель, NS2MB110 (непереключаемое антитело) и А372-МВ110/В040-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 37. Введение антител осуществляют дважды в хвостовую вену, а именно в день формирования группы и через три дня после этого. В качестве растворителя используют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After establishing the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, vehicle, NS2MB110 (non-switchable antibody) and A372-MB110/B040-ml0r were administered at the doses shown in Table. 37. Antibodies are administered twice into the tail vein, namely on the day the group is formed and three days after that. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Через семь дней после первоначального введения собирают печень, лимфатические узлы и селезенку, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей, трансплантированных клеточной линией МС38, и получение фракций лимфоцитов). Для селезенки и лимфатических узлов проводят только измерение массы органов.Seven days after the initial administration, the liver, lymph nodes and spleen are collected as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and obtaining lymphocyte fractions). For the spleen and lymph nodes, only the organ mass is measured.
- 131 046075- 131 046075
Таблица 37Table 37
Подробная информация в группах по оценке системных ответов с антителом А372-МВ110/B040-ml0rDetailed information in groups for assessing systemic responses with antibody A372-MB110/B040-ml0r
Оценивают системные эффекты от введения антител. В результате измерения массы лимфатических узлов и селезенок подтверждено, что масса этих органов увеличивается при введении NS2-MB110 в дозах 2,5 мг/кг и 7,5 мг/кг. С другой стороны наблюдают ингибирование органомегалии при обеих дозах 2,5 мг/кг и 7,5 мг/кг при введении А372-МВ110/B040-ml0r (фиг. 39).Systemic effects from the administration of antibodies are assessed. As a result of measuring the weight of lymph nodes and spleens, it was confirmed that the weight of these organs increases with the administration of NS2-MB110 at doses of 2.5 mg/kg and 7.5 mg/kg. On the other hand, inhibition of organomegaly was observed at both doses of 2.5 mg/kg and 7.5 mg/kg with the introduction of A372-MB110/B040-ml0r (Fig. 39).
В результате оценки активации Т-клеток в печени наблюдают увеличение экспрессии PD-1 при введении NS2-MB110. Это также наблюдают при введении A372-MB110/B040-ml0r (фиг. 40).As a result of assessing T cell activation in the liver, an increase in PD-1 expression was observed upon administration of NS2-MB110. This was also observed upon administration of A372-MB110/B040-ml0r (FIG. 40).
Таким образом, переключаемое антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах и селезенке в отличие от непереключаемого антитела.Thus, the switchable antibody inhibits T cell activation in the lymph nodes and spleen, unlike the nonswitchable antibody.
(6-4-12) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антитела A372-MB492/B040-ml0r.(6-4-12) Study of the medicinal efficacy (antitumor effect) of the antibody A372-MB492/B040-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель и А372МВ110/B040-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 38. Введение антител осуществляют дважды в хвостовую вену в день формирования группы и через три дня после этого. В качестве растворителя используют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After creating a mouse model with cancer transplantation MC38 in example 6-4-1, the solvent and A372MB110/B040-ml0r are administered in the doses presented in table. 38. Antibodies are administered twice into the tail vein on the day the group is formed and three days after that. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Таблица 38Table 38
Подробная информация по группам по исследованию эффективности A372-MB492/B040-ml0rDetailed information on efficacy study groups A372-MB492/B040-ml0r
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли по расчетам, описанным в примере 6-4-1. В результате наблюдают противоопухолевый эффект антитела A372-MB492/B040ml0r для всех доз (фиг. 41).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume according to the calculations described in example 6-4-1. As a result, the antitumor effect of the antibody A372-MB492/B040ml0r is observed for all doses (Fig. 41).
(6-4-13) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов антитела A372-MB492/B040-ml0r.(6-4-13) Antibody administration and sampling and FCM analysis to evaluate systemic effects of antibody A372-MB492/B040-ml0r.
После получения модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель, NS1MB492 (непереключаемое антитело) и А372-MB492/B040-mЮr вводят в дозах, представленных вAfter obtaining the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, solvent, NS1MB492 (non-switchable antibody) and A372-MB492/B040-mYr were administered at the doses shown in
- 132 046075 табл. 39. Введение антител осуществляют дважды в хвостовую вену, а именно в день формирования группы и через три дня после этого. В качестве растворителя используют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.- 132 046075 table. 39. Antibodies are administered twice into the tail vein, namely on the day the group is formed and three days after that. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Через восемь дней после первоначального введения собирают печень, лимфатические узлы и селезенку, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей, трансплантированных клеточной линией МС38, и получение фракций лимфоцитов). Измеряют массу отобранных селезенок, а также подсчитывают лимфоциты во фракциях из лимфоузлов.Eight days after the initial administration, the liver, lymph nodes and spleen are collected as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and obtaining lymphocyte fractions). The mass of the selected spleens is measured, and lymphocytes in fractions from the lymph nodes are counted.
Таблица 39Table 39
Подробная информация по группам по исследованию системных ответов A372-MB492/B040-ml0rSystem Response Study Group Details A372-MB492/B040-ml0r
Оценивают системные эффекты от введенных антител. Наблюдают увеличение массы селезенок при введении NS1-MB492 и увеличение клеток во фракциях лимфоцитов при введении NS1-MB492. С другой стороны, при введении A372-MB492/B040-ml0r в дозах 1,5 мг/кг, 3,0 мг/кг и 7,5 мг/кг наблюдают ингибирование органомегалии по сравнению с введением NS1-MB492 (фиг. 42).The systemic effects of the administered antibodies are assessed. An increase in spleen mass was observed upon administration of NS1-MB492 and an increase in cells in the lymphocyte fractions upon administration of NS1-MB492. On the other hand, when A372-MB492/B040-ml0r was administered at doses of 1.5 mg/kg, 3.0 mg/kg and 7.5 mg/kg, inhibition of organomegaly was observed compared to the administration of NS1-MB492 (Fig. 42) .
В результате оценки активации Т-клеток в печени увеличение экспрессии гранзима В наблюдают при введении NS1-MB492 и A372-MB492/B040-ml0r по сравнению с введением растворителя (фиг. 43).As a result of assessing T cell activation in the liver, an increase in granzyme B expression was observed with the administration of NS1-MB492 and A372-MB492/B040-ml0r compared to the administration of vehicle (Fig. 43).
Таким образом, переключаемое антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах и селезенке по сравнению с непереключаемым антителом.Thus, the switched antibody inhibits T cell activation in the lymph nodes and spleen compared to the non-switched antibody.
(6-4-14) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антител А486MB492/B167-ml0r и A488-MB492/B226-ml0r.(6-4-14) Study of the medicinal efficacy (antitumor effect) of antibodies A486MB492/B167-ml0r and A488-MB492/B226-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель и антитела A486-MB492/B167-ml0r и A488-MB492/B226-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 40. Формирование групп проводят через 10 дней после трансплантации клеток, а введение антител осуществляют в хвостовую вену через 11, 15, 18 и 22 дня после трансплантации клеток, в общей сложности четыре раза.After creating the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, the solvent and antibodies A486-MB492/B167-ml0r and A488-MB492/B226-ml0r were administered in the doses shown in Table. 40. The formation of groups is carried out 10 days after cell transplantation, and the introduction of antibodies is carried out into the tail vein 11, 15, 18 and 22 days after cell transplantation, a total of four times.
Таблица 40Table 40
Подробная информация по лекарственной эффективности по антителам A486-MB492/B167-ml0r и A488-MB492/B226-ml0rDetailed information on drug efficacy for antibodies A486-MB492/B167-ml0r and A488-MB492/B226-ml0r
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли по расчетам, описанным в примере 6-4-1. Результаты подтверждают противоопухолевый эффект A486-MB492/B167-ml0r и A488-MB492/B226-ml0r (фиг. 44).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume according to the calculations described in example 6-4-1. The results confirm the antitumor effect of A486-MB492/B167-ml0r and A488-MB492/B226-ml0r (Fig. 44).
(6-4-15) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов антител A486-MB492/B167-ml0r и A488-MB492/B226-ml0r.(6-4-15) Antibody administration and sampling, and FCM analysis to evaluate the systemic effects of antibodies A486-MB492/B167-ml0r and A488-MB492/B226-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель, NS1MB492 (непереключаемое антитело), Л486-МВ492/В167-т10г и A488-MB492/B226-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 41.After establishing the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, solvent, NS1MB492 (non-switchable antibody), L486-MB492/B167-t10g and A488-MB492/B226-ml0r were administered at the doses shown in Table. 41.
- 133 046075- 133 046075
Формирование групп проводят через 10 дней после трансплантации клеток, а введение антител осуществляют в хвостовую вену через 11, 15, 18 и 22 дня после трансплантации клеток, в общей сложности четыре раза. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.The formation of groups is carried out 10 days after cell transplantation, and the introduction of antibodies is carried out into the tail vein 11, 15, 18 and 22 days after cell transplantation, a total of four times. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Печень, лимфатические узлы и селезенку собирают через 13 дней после первоначального введения, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей, трансплантированных клеточной линией МС38, и подготовка фракций лимфоцитов). Проводят измерение массы селезенок, а также подсчитывают лимфоциты для фракций из лимфоузлов.Liver, lymph nodes and spleen were collected 13 days after initial administration as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and preparation of lymphocyte fractions). The mass of the spleens is measured, and lymphocytes are counted for fractions from the lymph nodes.
Таблица 41Table 41
Подробная информация по группам по исследованию системных ответов на антителаDetails of the Systemic Antibody Response Study Groups
A486-MB492/B167-ml0r и Α488-ΜΒ492/Β226^0γA486-MB492/B167-ml0r and Α488-ΜΒ492/Β226^0γ
В результате измерения количества клеток во фракциях лимфоцитов из лимфатических узлов и измерения массы селезенки при введении NS1-MB492 наблюдают увеличение количества лимфоцитов и массы селезенки. С другой стороны, замечено, что увеличение количества лимфоцитов и массы селезенки подавляются при введении A486-MB492/B167-ml0r и A488-MB492/B226-ml0r по сравнению с таковыми при введении NS1-MB492 (фиг. 45).By measuring the number of cells in lymphocyte fractions from lymph nodes and measuring spleen weight, an increase in the number of lymphocytes and spleen weight was observed upon administration of NS1-MB492. On the other hand, it was observed that the increase in lymphocyte count and spleen weight were suppressed by administration of A486-MB492/B167-ml0r and A488-MB492/B226-ml0r compared with those by administration of NS1-MB492 (FIG. 45).
В результате оценки активации Т-клеток в печени увеличение процента CD8α-положительных клеток наблюдают при введении NS1-MB492, А486-MB492/B167-ml0r и A488-MB492/B226-ml0r по сравнению с введением растворителя (фиг. 46).As a result of assessing T cell activation in the liver, an increase in the percentage of CD8α-positive cells was observed with the administration of NS1-MB492, A486-MB492/B167-ml0r and A488-MB492/B226-ml0r compared to the administration of vehicle (Fig. 46).
На основании вышеизложенного подтверждено, что по сравнению с непереключаемым антителом переключаемое антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах и селезенке.Based on the above, it is confirmed that, compared with the non-switchable antibody, the switchable antibody inhibits the activation of T cells in the lymph nodes and spleen.
(6-4-16) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антитела A489-MB492/B223-ml0r.(6-4-16) Study of the medicinal efficacy (antitumor effect) of the antibody A489-MB492/B223-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель и антитело A489-MB492/B223-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 42. Введение антитела осуществляют четыре раза через хвостовую вену на следующий день, через четыре, семь и десять дней после формирования группы. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After creating the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, the solvent and antibody A489-MB492/B223-ml0r were administered in the doses shown in Table. 42. Antibody administration is carried out four times through the tail vein on the next day, four, seven and ten days after group formation. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Таблица 42 Подробное изучение лекарственной эффективности в группах при введении антитела A489-MB492/B223-ml0rTable 42 Detailed study of drug efficacy in groups with the introduction of the antibody A489-MB492/B223-ml0r
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли по расчетам, описанным в примере 6-4-1. Результаты подтверждают противоопухолевый эффект от введения дозы 7,5 мг/кг (фиг. 47).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume according to the calculations described in example 6-4-1. The results confirm the antitumor effect of the 7.5 mg/kg dose (Fig. 47).
(6-4-17) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов антитела A489-MB492/B223-ml0r.(6-4-17) Antibody administration and sampling and FCM analysis to evaluate systemic effects of antibody A489-MB492/B223-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель, NS1MB492 (непереключаемое антитело) и А489-МВ492/В223-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 43. Введение антител осуществляют через хвостовую вену в день формирования группы, а также через 3 дня и 6 дней после формирования группы, в общей сложности три раза. В качестве растворителя примеAfter establishing the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, vehicle, NS1MB492 (non-switchable antibody) and A489-MB492/B223-ml0r were administered at the doses shown in Table. 43. Antibodies are administered through the tail vein on the day of group formation, as well as 3 days and 6 days after group formation, a total of three times. As a solvent we use
- 134 046075 няют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.- 134 046075 nyat FSB containing 0.05% Tween-20.
Через семь дней после первоначального введения печень, лимфатические узлы и селезенку собирают, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей, трансплантированных клеточной линией МС38, и подготовка фракций лимфоцитов). В селезенках и лимфоузлах проводят только измерение количества клеток только во фракциях лимфоцитов.Seven days after the initial administration, the liver, lymph nodes and spleen are collected as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and preparation of lymphocyte fractions). In the spleens and lymph nodes, only the cell number is measured only in the lymphocyte fractions.
Таблица 43Table 43
Подробная информация по группам по исследованию системных ответов антителаDetails of the Systemic Antibody Response Study Groups
A489-MB492/B223-ml0rA489-MB492/B223-ml0r
В результате измерения количества клеток во фракциях лимфоцитов из лимфатических узлов и селезенки наблюдают увеличение количества клеток при введении NS1-MB492. С другой стороны, подавление увеличения количества лимфоцитов наблюдают при введении A489-MB492/B223-ml0r по сравнению с таковым при введении NS1-MB492 (фиг. 48).As a result of measuring the number of cells in the lymphocyte fractions from the lymph nodes and spleen, an increase in the number of cells was observed upon administration of NS1-MB492. On the other hand, suppression of the increase in the number of lymphocytes was observed with the administration of A489-MB492/B223-ml0r compared with that with the administration of NS1-MB492 (Fig. 48).
В результате оценки активации Т-клеток в печени наблюдают увеличение процента CD8aположительных клеток при введении NS1-MB492 и А489-MB492/B223-ml0r по сравнению с растворителем (фиг. 49).As a result of assessing the activation of T cells in the liver, an increase in the percentage of CD8a-positive cells was observed with the introduction of NS1-MB492 and A489-MB492/B223-ml0r compared to the solvent (Fig. 49).
На основании вышеизложенного подтверждено, что по сравнению с непереключаемым антителом переключаемое антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах и селезенке.Based on the above, it is confirmed that, compared with the non-switchable antibody, the switchable antibody inhibits the activation of T cells in the lymph nodes and spleen.
(6-4-18) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антител A548mIgG1/B256-ml0r и A551-mIgG1/B256-ml0r.(6-4-18) Study of the medicinal efficacy (antitumor effect) of antibodies A548mIgG1/B256-ml0r and A551-mIgG1/B256-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель и антитела A548-mIgG1/B256-ml0r и A551-mIgG1/B256-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 44. Введение антитела осуществляют через хвостовую вену два раза: в день формирования группы и через три дня. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After creating the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, the solvent and antibodies A548-mIgG1/B256-ml0r and A551-mIgG1/B256-ml0r are administered in the doses presented in table. 44. The antibody is administered through the tail vein twice: on the day of group formation and three days later. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Таблица 44Table 44
Подробная информация исследования по группам лекарственной эффективности антител A548-mIgG1/B256-ml0r и Α551^§Ο1/Β256^0ι·Detailed information from the study on the drug efficacy groups of antibodies A548-mIgG1/B256-ml0r and Α551^§Ο1/Β256^0ι
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли по расчетам, описанным в примере 6-4-1. Результаты подтверждают противоопухолевый эффект от введения A548mIgG1/B256-ml0r в дозах 37,5 мг/кг и 100 мг/кг. A551-mIgG1/B256-ml0r также проявляет существенный противоопухолевый эффект в дозе 100 мг/кг (фиг. 50).The antitumor effect in each group is assessed by tumor volume according to the calculations described in example 6-4-1. The results confirm the antitumor effect of administration of A548mIgG1/B256-ml0r at doses of 37.5 mg/kg and 100 mg/kg. A551-mIgG1/B256-ml0r also exhibited a significant antitumor effect at a dose of 100 mg/kg (Fig. 50).
(6-4-19) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов(6-4-19) Antibody administration and sampling, and FCM analysis to assess systemic effects
- 135 046075 антител A548-mIgG1/B256 и A551-mIgG1/B256- 135 046075 antibodies A548-mIgG1/B256 and A551-mIgG1/B256
После создания модели мышей с трансплантацией рака МС38 в примере 6-4-1 растворитель, NS1mIgG1 (непереключаемое антитело), A548-mIgG1/B256-ml0r и A551-mIgG1/B256-ml0r вводят в дозах, представленных в табл. 45. Введение антител осуществляют через хвостовую вену в день формирования группы, а также через 3 дня после формирования группы, в общей сложности два раза. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After establishing the MC38 cancer transplant mouse model in Example 6-4-1, vehicle, NS1mIgG1 (non-switchable antibody), A548-mIgG1/B256-ml0r and A551-mIgG1/B256-ml0r were administered at the doses shown in Table. 45. Antibodies are administered through the tail vein on the day the group is formed, and also 3 days after the group is formed, a total of two times. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Через семь дней после первоначального введения печень, лимфатические узлы и селезенку собирают, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей, трансплантированных клеточной линией МС38, и подготовка фракций лимфоцитов). У образцов селезенок и лимфоузлов определяют только массу органов.Seven days after the initial administration, the liver, lymph nodes and spleen are collected as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and preparation of lymphocyte fractions). In samples of spleens and lymph nodes, only organ mass is determined.
Таблица 45Table 45
Подробная информация исследования по группам системных ответов на применение антител A548-mIgG1/B256-ml0r и A551-mIgG1/B256-ml0rDetailed information from the study by groups of systemic responses to the use of antibodies A548-mIgG1/B256-ml0r and A551-mIgG1/B256-ml0r
В результате оценки массы органов лимфатических узлов и селезенки наблюдают увеличение массы органа при введении NS1-mIgG1 в дозе 0,3 мг/кг, 1,5 мг/кг и 7,5 мг/кг. С другой стороны не наблюдают гипертрофии органов при введении A548-mIgG1/B256-ml0r или A551-mIgG1/B256-ml0r в любой дозе из доз 1,5 мг/кг, 7,5 мг/кг, 37,5 мг/кг и 100 мг/кг (фиг. 51).As a result of assessing the organ weight of the lymph nodes and spleen, an increase in organ weight is observed when NS1-mIgG1 is administered at a dose of 0.3 mg/kg, 1.5 mg/kg and 7.5 mg/kg. On the other hand, organ hypertrophy is not observed when A548-mIgG1/B256-ml0r or A551-mIgG1/B256-ml0r is administered at any dose of 1.5 mg/kg, 7.5 mg/kg, 37.5 mg/kg and 100 mg/kg (Fig. 51).
В результате оценки активации Т-клеток в печени наблюдают увеличение экспрессии как гранзима В, так и PD-1 при введении NS1-mIgG1 в дозе 0,3 мг/кг. С другой стороны, экспрессия подавляется при введении A548-mIgG1/B256-ml0r и A551-mIgG1/B256-ml0r дозе из доз 1,5 мг/кг, 7,5 мг/кг, 37,5 мг/кг и 100 мг/кг (фиг. 52).As a result of assessing the activation of T cells in the liver, an increase in the expression of both granzyme B and PD-1 was observed when NS1-mIgG1 was administered at a dose of 0.3 mg/kg. On the other hand, the expression is suppressed when A548-mIgG1/B256-ml0r and A551-mIgG1/B256-ml0r are administered at a dose of 1.5 mg/kg, 7.5 mg/kg, 37.5 mg/kg and 100 mg/kg. kg (Fig. 52).
Таким образом, по сравнению с не переключаемым антителом переключаемое антитело ингибирует активацию Т-клеток в лимфатических узлах, селезенке и печени.Thus, compared to a non-switchable antibody, a switchable antibody inhibits T cell activation in the lymph nodes, spleen and liver.
(6-4-20) Исследование лекарственной эффективности (противоопухолевого эффекта) антитела А5 51 -МВ 110/B3 79-ml0r.(6-4-20) Study of the medicinal effectiveness (antitumor effect) of the antibody A5 51 -MV 110/B3 79-ml0r.
После создания модели мышей с трансплантацией МС38в примере 6-4-1, растворитель и антитело А551-МВ110/B379-ml0r вводят в дозах, указанных в табл. 46. Антитела вводят дважды в хвостовую вену и через три дня после формирования группы. В качестве растворителя используют ФСБ с 0,05% Tween-20.After creating the mouse model with MC38 transplantation in example 6-4-1, the solvent and antibody A551-MB110/B379-ml0r are administered in the doses indicated in table. 46. Antibodies are injected twice into the tail vein and three days after group formation. PBS with 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
- 136 046075- 136 046075
Таблица 46Table 46
Подробная информация по группах исследования лекарственной эффективности антителаDetailed information on antibody drug efficacy study groups
A551-MB110/B379-ml0rA551-MB110/B379-ml0r
Противоопухолевый эффект в каждой группе оценивают по объему опухоли, рассчитанной ка описано в примере 6-4-1. В результате противоопухолевый эффект подтвержден для каждой дозировки (фиг. 53).The antitumor effect in each group is assessed by the tumor volume calculated as described in example 6-4-1. As a result, the antitumor effect was confirmed for each dosage (Fig. 53).
(6-4-21) Введение антител и отбор образцов, а также анализ FCM для оценки системных эффектов(6-4-21) Antibody administration and sampling, and FCM analysis to assess systemic effects
После создания модели мышей с трансплантацией МС38 в примере 6-4-1 вводят растворитель, NS1mIgG1 (непереключаемое антитело) и А551-МВ110/B379-ml0r вводят как показано в табл. 47. Введение антитела проводят два раза в хвостовую вену в день формирования группы и через 3 дня после формирования группы. В качестве растворителя применяют ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20.After establishing the MC38 transplant mouse model in Example 6-4-1, vehicle was administered, NS1mIgG1 (non-switchable antibody) and A551-MB110/B379-ml0r were administered as shown in Table. 47. The antibody is administered twice into the tail vein on the day the group is formed and 3 days after the group is formed. PBS containing 0.05% Tween-20 is used as a solvent.
Печень, лимфатические узлы и селезенки собирают через 5 дней после первоначального введения, как показано в примере 6-4-2 (сбор различных органов у мышей с трансплантированной клеточной линией МС38 и подготовка фракций лимфоцитов) и анализ FCM выполняют, как показано в примере 6-4-3 (анализ FCM с использованием фракций лимфоцитов различных органов).Livers, lymph nodes and spleens are collected 5 days after initial administration as shown in Example 6-4-2 (collection of various organs from mice transplanted with the MC38 cell line and preparation of lymphocyte fractions) and FCM analysis is performed as shown in Example 6- 4-3 (FCM analysis using lymphocyte fractions from various organs).
Таблица 47Table 47
Подробная информация по группам для оценки системных ответов с антителом А551-МВ110/B379-ml0rDetailed information on groups for assessing systemic responses with antibody A551-MB110/B379-ml0r
В результате оценки массы органов лимфатических узлов и селезенки наблюдают увеличение массы органов при введении NS1-mIgG1 в дозе 7,5 мг/кг. С другой стороны, увеличения органов не наблюдают при введении А551-МВ110/B379-ml0r в любой дозе, а именно 0,83 мг/кг, 2,5 мг/кг, 7,5 мг/кг и 22,5 мг/кг (фиг. 54). Кроме того, при оценке активации Т-клеток в селезенке методом FCM, увеличение маркеров активации (PD-1, ICOS, гранзима В), наблюдаемое при введении NS1-mIgG1, не подтверждалось при введении А551-МВ110/В379-mЮr в любой дозе (фиг. 55).As a result of assessing the organ mass of the lymph nodes and spleen, an increase in organ mass was observed when NS1-mIgG1 was administered at a dose of 7.5 mg/kg. On the other hand, organ enlargement was not observed when A551-MB110/B379-ml0r was administered at any dose, namely 0.83 mg/kg, 2.5 mg/kg, 7.5 mg/kg and 22.5 mg/kg. (Fig. 54). In addition, when assessing the activation of T cells in the spleen using the FCM method, the increase in activation markers (PD-1, ICOS, granzyme B) observed with the administration of NS1-mIgG1 was not confirmed with the administration of A551-MB110/B379-mYr at any dose ( Fig. 55).
При оценке активации Т-клеток в печени увеличение экспрессии как PD-1, так и ICOS наблюдают при введении NS1-mIgG1 в дозе 7,5 мг/кг. С другой стороны, подавление экспрессии на уровне растворителя, когда А551-МВ110/B379-ml0r вводят в дозах 0,83 мг/кг и 2,5 мг/кг, и даже большее подавление экспрессии, чем от NS1-mIgG1, при дозе 7,5 мг/кг (фиг. 56).When assessing T cell activation in the liver, an increase in the expression of both PD-1 and ICOS was observed when NS1-mIgG1 was administered at a dose of 7.5 mg/kg. On the other hand, suppression of expression at the solvent level when A551-MB110/B379-ml0r is administered at doses of 0.83 mg/kg and 2.5 mg/kg, and even greater suppression of expression than from NS1-mIgG1 at dose 7 .5 mg/kg (Fig. 56).
Таким образом, по сравнению с непереключаемым антителом переключаемое антитело ингибируетThus, compared to a non-switchable antibody, a switchable antibody inhibits
- 137 046075 активацию Т-клеток в лимфатических узлах, селезенке и печени.- 137 046075 activation of T cells in the lymph nodes, spleen and liver.
Пример 7. Получение модифицированного Fc, способного усиливать агонистическую активность.Example 7. Preparation of a modified Fc capable of enhancing agonistic activity.
(7-1) Получение вариантов с повышенной FcyR-связывающей активностью.(7-1) Preparation of variants with increased FcyR-binding activity.
Константная область тяжелой цепи ТТ14 (SEQ ID NO: 149), которая увеличивает FcyRIIbсвязывающую активность, как описано в WO 2017104783 (константная область тяжелой цепи, содержащая T250V/T307P в качестве аминокислотных модификаций, и L234Y/P238D/V264I/A330K в качестве аминокислотных модификаций для увеличения FcγRIIb-связывающей активности в области Fc, содержащей SEQ ID NO: 182 (оба модифицированных положения приведены в соответствии с нумерацией EU)), область ТТ16 (SEQ ID NO: 150), содержащую мутацию аминокислоты G237D, введенную в константную область тяжелой цепи ТТ11, которая увеличивает FcγRIIb-связываюшую активность, как описано в WO 2017104783 (константная область тяжелой цепи, содержащую аминокислотные модификации T250V/T307P и L234Y/P238D/A330K в качестве модификаций для увеличения FcyRIIb -связывающей активности в области Fc, содержащей SEQ ID NO: 182 (оба модифицированных положения приведены в соответствии с нумерацией EU)), константную область тяжелой цепи Р587 (SEQ ID NO : 151), которая увеличивает FcyRIIb-связывающую активность, как описано в WO 2014163101; и последовательность Р253 (SEQ ID NO: 93), являющуюся предшествующим вариантом константной области тяжелой цепи с повышенной связываемостью с FcyRIIb, объединенную с вариабельной областью тяжелой цепи переключаемого антитела (А375; А372; А356; А486; А488; А489; А548; и А551) или с вариабельной областью тяжелой цепи антитела - отрицательного контрольного (IC17HdK (SEQ ID NO: 152)). В результате были созданы гены со следующими комбинациями каждой константной области и вариабельной области тяжелой цепи.TT14 heavy chain constant region (SEQ ID NO: 149), which increases FcyRIIb binding activity as described in WO 2017104783 (heavy chain constant region containing T250V/T307P as amino acid modifications, and L234Y/P238D/V264I/A330K as amino acid modifications to increase FcγRIIb-binding activity in the Fc region containing SEQ ID NO: 182 (both modified positions are given in accordance with the EU numbering)), the TT16 region (SEQ ID NO: 150) containing the amino acid mutation G237D introduced into the heavy chain constant region TT11, which increases FcγRIIb binding activity as described in WO 2017104783 (heavy chain constant region containing amino acid modifications T250V/T307P and L234Y/P238D/A330K as modifications to increase FcyRIIb binding activity in the Fc region containing SEQ ID NO: 182 (both modified positions are given in accordance with the EU numbering)), the P587 heavy chain constant region (SEQ ID NO: 151), which increases FcyRIIb-binding activity, as described in WO 2014163101; and a P253 sequence (SEQ ID NO: 93), which is a precursor variant of the heavy chain constant region with increased binding to FcyRIIb, combined with the heavy chain variable region of the switch antibody (A375; A372; A356; A486; A488; A489; A548; and A551) or with the heavy chain variable region of a negative control antibody (IC17HdK (SEQ ID NO: 152)). As a result, genes were created with the following combinations of each heavy chain constant region and variable region.
Таблица 48Table 48
Вариабельную область тяжелой цепи переключаемого антитела (A375, А356 и А551) или вариабельную область тяжелой цепи антитела - отрицательного контроля (IC17HdK (SEQ ID NO: 152)) объединяют с константной областью тяжелой цепи MY201 (SEQ ID НЕТ: 153) (константной областью тяжелой цепи, содержащей G236N/H268D/A330K в качестве аминокислотных модификаций, которые повышают связывающую активность с FcyRIIb в области Fc, включающей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 182 (все модифицированные положения указаны по нумерации EU)) или MY518 (SEQ ID NO: 154) (константной областью тяжелой цепи, содержащей L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K в качестве аминокислотных модификаций, которые повышают связывающую активность с FcyRIIb в области Fc, содержащей аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 182 (все модифицированные положения указаны по нумерации EU), которые описаны в WO 2017104783 и имеют повышенную связывающую активность с FcyR, константную область тяжелой цепи MY201a (SEQ ID NO: 155) или MY518a (SEQ ID NO: 156), в которой модификация K214R интродуцирована в MY201 или MY518, или константную область тяжелой цепи MY201aPh (SEQ ID NO: 157), в которой модификация L235W интродуцирована в MY201a. В результате созданы гены с комбинациями каждой константной области и вариабельной области тяжелой цепи, представленные ниже в табл. 49.The switchable antibody heavy chain variable region (A375, A356 and A551) or the negative control antibody heavy chain variable region (IC17HdK (SEQ ID NO: 152)) is combined with the heavy chain constant region of MY201 (SEQ ID NO: 153) (heavy chain constant region chain containing G236N/H268D/A330K as amino acid modifications that increase binding activity to FcyRIIb in the Fc region comprising the amino acid sequence SEQ ID NO: 182 (all modified positions are indicated by EU numbering)) or MY518 (SEQ ID NO: 154) (heavy chain constant region containing L235W/G236N/H268D/Q295L/K326T/A330K as amino acid modifications that increase binding activity to FcyRIIb in the Fc region containing the amino acid sequence SEQ ID NO: 182 (all modified positions are indicated by EU numbering) , which are described in WO 2017104783 and have increased binding activity to FcyR, the heavy chain constant region of MY201a (SEQ ID NO: 155) or MY518a (SEQ ID NO: 156), in which the K214R modification is introduced into MY201 or MY518, or the heavy chain constant region chain MY201aPh (SEQ ID NO: 157), in which the L235W modification is introduced into MY201a. As a result, genes were created with combinations of each constant region and variable region of the heavy chain, presented below in table. 49.
- 138 046075- 138 046075
Таблица 49Table 49
В табл. 50 показано, что представляющие интерес антитела экспрессированы и очищены методами, известными специалистам в данной области техники, путем комбинирования указанных выше генов тяжелой цепи антитела с геном легкой цепи переключаемого антитела (B040-Lamlib, В167-Lamlib , B226Lamlib, B223-Lamlib, B256-Lamlib и B379-Lamlib, полученные в примерах 5-2 и 5-3) или геном легкой цепи антитела - отрицательного контроля (IC17L-k0, полученного путем объединения легкой цепи вариабельная область IC17L (SEQ ID NO: 158) с цепью к человека k0 (SEQ ID NO: 141) в качестве константной области легкой цепи).In table 50 shows that the antibodies of interest are expressed and purified by methods known to those skilled in the art by combining the above antibody heavy chain genes with a switchable antibody light chain gene (B040-Lamlib, B167-Lamlib, B226Lamlib, B223-Lamlib, B256- Lamlib and B379-Lamlib prepared in Examples 5-2 and 5-3) or the negative control antibody light chain genome (IC17L-k0, prepared by combining the light chain variable region IC17L (SEQ ID NO: 158) with the human k chain (SEQ ID NO: 141) as the light chain constant region).
Таблица 50Table 50
Варианты с повышенной FcYR-связывающей активностьюVariants with increased FcYR-binding activity
(7-2) Получение вариантов с увеличенной pI путем аминокислотной модификации константной области.(7-2) Obtaining variants with increased pI by amino acid modification of the constant region.
Константную область тяжелой цепи получают путем объединения константной области тяжелой цепи с повышенной FcYR-связывающей активностью, полученной в примере 7-1, с Q311R, P343R и D413K, которые представляют собой аминокислотные мутации, увеличивающие pI без значительного изменения FcYR-связывающей активности, как описано в WO 2017046994.The heavy chain constant region is prepared by combining the heavy chain constant region with increased FcYR binding activity obtained in Example 7-1 with Q311R, P343R and D413K, which are amino acid mutations that increase pI without significantly changing FcYR binding activity, as described in WO 2017046994.
В частности, получают гены константной области тяжелой цепи с аминокислотными мутациями,In particular, heavy chain constant region genes with amino acid mutations are obtained,
- 139 046075 введенными в каждый из генов константной области тяжелой цепи антитела, как показано ниже.- 139 046075 introduced into each of the antibody heavy chain constant region genes, as shown below.
Введение P343R/D413K в MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF025 (SEQ ID NO: 64)Introduction of P343R/D413K into MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF025 (SEQ ID NO: 64)
Введение P343R/D413K в MY518a (SEQ ID NO: 156): SCF025a (SEQ ID NO: 65)Introduction of P343R/D413K into MY518a (SEQ ID NO: 156): SCF025a (SEQ ID NO: 65)
Введение P343R/D413K в ТТ14 (SEQ ID NO: 149): SCF027 (SEQ ID NO: 66)Introduction of P343R/D413K into TT14 (SEQ ID NO: 149): SCF027 (SEQ ID NO: 66)
Введение P343R/D413K в ТТ16 (SEQ ID NO: 150): SCF028 (SEQ ID NO: 67)Introduction of P343R/D413K into TT16 (SEQ ID NO: 150): SCF028 (SEQ ID NO: 67)
Введение Q311R/P343R в MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF030 (SEQ ID NO: 68)Introduction of Q311R/P343R into MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF030 (SEQ ID NO: 68)
Введение Q311R/P343R в ТТ14 (SEQ ID NO: 149): SCF032 (SEQ ID NO: 69)Introduction of Q311R/P343R into TT14 (SEQ ID NO: 149): SCF032 (SEQ ID NO: 69)
Введение Q311R/P343R в TT16 (SEQ ID NO: 150): SCF033 (SEQ ID NO: 70)Introduction of Q311R/P343R into TT16 (SEQ ID NO: 150): SCF033 (SEQ ID NO: 70)
Введение P343R в MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF039 (SEQ ID NO: 71)Introduction of P343R into MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF039 (SEQ ID NO: 71)
Введение P343R в MY518a (SEQ ID NO: 156): SCF039a (SEQ ID NO: 72)Introduction of P343R into MY518a (SEQ ID NO: 156): SCF039a (SEQ ID NO: 72)
Введение D413K в MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF040 (SEQ ID NO: 73)Introduction of D413K into MY518 (SEQ ID NO: 154): SCF040 (SEQ ID NO: 73)
Введение P343R в MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF041a (SEQ ID NO: 74)Introduction of P343R into MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF041a (SEQ ID NO: 74)
Введение P343R в MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF041aPh (SEQ ID NO: 75)Introduction of P343R into MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF041aPh (SEQ ID NO: 75)
Введение D413K в MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF042a (SEQ ID NO: 76)Introduction of D413K in MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF042a (SEQ ID NO: 76)
Введение P343R/D413K в MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF043a (SEQ ID NO: 77)Introduction of P343R/D413K into MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF043a (SEQ ID NO: 77)
Введение P343R/D413K в MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF043aPh (SEQ ID NO: 78)Introduction of P343R/D413K into MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF043aPh (SEQ ID NO: 78)
Введение Q311R в MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF056a (SEQ ID NO: 79)Introduction of Q311R into MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF056a (SEQ ID NO: 79)
Введение Q311R в MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF056aPh (SEQ ID NO: 80)Introduction of Q311R into MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF056aPh (SEQ ID NO: 80)
Введение Q311R/P343R в MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF057a (SEQ ID NO: 81)Introduction of Q311R/P343R into MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF057a (SEQ ID NO: 81)
Введение Q311R/P343R в MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF057aPh (SEQ ID NO: 82)Introduction of Q311R/P343R into MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF057aPh (SEQ ID NO: 82)
Введение Q311R/D413K в MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF059a (SEQ ID NO: 83)Introduction of Q311R/D413K into MY201a (SEQ ID NO: 155): SCF059a (SEQ ID NO: 83)
Введение Q311R/D413K в MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF059aPh (SEQ ID NO: 84)Introduction of Q311R/D413K into MY201aPh (SEQ ID NO: 157): SCF059aPh (SEQ ID NO: 84)
Введение Q311R в MY518a (SEQ ID NO: 156): SCF060a (SEQ ID NO: 85)Introduction of Q311R into MY518a (SEQ ID NO: 156): SCF060a (SEQ ID NO: 85)
Г ены тяжелой цепи антитела получают, как показано в табл. 51 ниже, путем комбинирования гена константной области тяжелой цепи, полученного в настоящем изобретении, с геном вариабельной области тяжелой цепи А375 (SEQ ID NO: 43) или А551 (SEQ ID NO: 51).Antibody heavy chain genes are prepared as shown in Table. 51 below by combining the heavy chain constant region gene obtained in the present invention with the heavy chain variable region gene A375 (SEQ ID NO: 43) or A551 (SEQ ID NO: 51).
Таблица 51Table 51
Кроме того, путем объединения этих генов тяжелой цепи антитела с генами B167-Lamlib, B256Lamlib и B379-Lamlib, полученными в примере 5-3 в качестве генов легкой цепи антитела, требуемое антитело было экспрессировано и очищено, как показано в табл. 52 методами, известными специалистам в данной области.In addition, by combining these antibody heavy chain genes with the B167-Lamlib, B256Lamlib and B379-Lamlib genes obtained in Example 5-3 as antibody light chain genes, the desired antibody was expressed and purified as shown in Table. 52 by methods known to those skilled in the art.
- 140 046075- 140 046075
Таблица 52Table 52
(7-3) Выработка контрольных антител для сравнения агонистической активности.(7-3) Development of control antibodies to compare agonist activity.
Получают антитела (IC17HdK-MY201/IC17L-k0; IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0; IC17HdKMY518/IC17L-k0; IC17HdK-MY518a/IC17L-k0; IC17HdK-P253/IC17L-k0; IC17HdK-P587/IC17L-k0; IC17HdK-TT16/IC17L-k0) с вариабельной областью тяжелой цепи IC17HdK (SEQ ID NO: 152), получение которых описано в примере 7-1 в качестве контрольного антитела для сравнения агонистической активAntibodies are obtained (IC17HdK-MY201/IC17L-k0; IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0; IC17HdKMY518/IC17L-k0; IC17HdK-MY518a/IC17L-k0; IC17HdK-P253/IC17L-k0; IC17HdK-P58 7/IC17L-k0;IC17HdK -TT16/IC17L-k0) with the heavy chain variable region IC17HdK (SEQ ID NO: 152), the preparation of which is described in Example 7-1 as a control antibody to compare the agonistic active
- 141 046075 ности. Кроме того, представляющее интерес антитело (IC17HdK-G4d/IC17L-k0) экспрессируют и очищают способами, известными в данной области, путем комбинирования гена легкой цепи антитела IC17L-k0 (SEQ ID NO: 158, вариабельная область; SEQ ID NO: 141, константная область) с геном тяжелой цепи антитела IC17HdK-G4d, который получают путем комбинирования гена вариабельной области тяжелой цепи IC17HdK (SEQ ID NO: 152) с геном G4d (SEQ ID NO: 159), из которого удалены Gly и Lys на С-конце константной области тяжелой цепи IgG4 человека. Эти контрольные антитела использовали в примере 5.- 141 046075 details. In addition, the antibody of interest (IC17HdK-G4d/IC17L-k0) is expressed and purified by methods known in the art by combining the IC17L-k0 antibody light chain gene (SEQ ID NO: 158, variable region; SEQ ID NO: 141, constant region) with the antibody heavy chain gene IC17HdK-G4d, which is obtained by combining the heavy chain variable region gene IC17HdK (SEQ ID NO: 152) with the G4d gene (SEQ ID NO: 159) from which Gly and Lys at the C-terminus have been removed human IgG4 heavy chain constant region. These control antibodies were used in Example 5.
(7-4) Оценка связывания рецептора Fcy человека вариантов с повышенным показателем pI путем аминокислотной модификации константной области.(7-4) Assessment of human Fcy receptor binding of variants with increased pI by amino acid modification of the constant region.
Программное обеспечение Biacore T200 (фирма GE Healthcare) используют для оценки связывающей активности с соответствующим рецептором Fcy человека (далее именуемым FcyR). Измерение выполняют при 25°C с использованием буфера, включающего 50 мМ фосфата, 150 мМ NaCl, 0,05 мас./об.% - Р20, рН 7,4. Около 1000 RU антитела захвачено сенсорным чипом, иммобилизованным с Capture Select™ Human Fab-lambda Kinetics Biotin Conjugate (фирма Thermo Fisher Scientific) в качестве молекулы для захвата лиганда. FcyR человека разбавляют до 8 нМ для FcYRIa и 1000 нМ для другого FcyR в буфере для измерения, после чего он взаимодействует с захваченным антителом. Связывающую активность каждого антитела с FcyR оценивают путем расчета связывающего количества FcyR (RU) на единицу количества антитела с использованием Biacore T200 Evaluation Software 2,0.Biacore T200 software (GE Healthcare) is used to evaluate binding activity to the corresponding human Fcy receptor (hereinafter referred to as FcyR). The measurement is performed at 25°C using a buffer containing 50 mM phosphate, 150 mM NaCl, 0.05 w/v% - P20, pH 7.4. Approximately 1000 RU of antibody is captured on a sensor chip immobilized with Capture Select™ Human Fab-lambda Kinetics Biotin Conjugate (Thermo Fisher Scientific) as the ligand capture molecule. Human FcyR is diluted to 8 nM for FcYRIa and 1000 nM for other FcyR in measurement buffer, after which it is reacted with captured antibody. The FcyR binding activity of each antibody was assessed by calculating the FcyR binding amount (RU) per unit amount of antibody using Biacore T200 Evaluation Software 2.0.
Внеклеточный домен FcyR получают описанными ниже методами. Во-первых, генный синтез внеклеточного домена FcyR осуществляют методом, известным специалистам в данной области. При этом последовательности FcyR получают на основе данных, зарегистрированных NCBI. В частности, последовательность FcyRI получают на основе последовательности из базы данных NCBI NM_000566.3, последовательность FcYRIIa на основе последовательности из базы данных NCBI NM_001136219.1, последовательности FcYRIIb на основе последовательности из базы данных NCBI NM_004001.3 и последовательности FcYRIIIa на основе последовательности из базы данных NCBI NM_001127593.1; и его тег был к их С-концам добавлена метка His. Полиморфный сайт FcYRIIa получают со ссылкой на публикацию J. Exp. Med., 172, 1990, 19-25; и полиморфный сайт FcYRIIIa получают со ссылкой на публикацию J. Clin. Invest., 100, 1997, 1059-1070. Полученные в результате фрагменты генов инсертируют в вектор экспрессии клеток животных для получения векторов экспрессии. Полученные векторы экспрессии временно вводят в клетки FreeStyle293, полученные из клеток эмбриональной почки человека (фирма Invitrogen), после чего экспрессируются представляющие интерес белки. Культуральные супернатанты собирают, пропускают через фильтр с порами 0,22 мкм и очищали в основном за четыре этапа, описанные ниже. Первый этап выполняют с помощью катионообменной колоночной хроматографии (SP Sepharose FF), второй этап - с помощью аффинной колоночной хроматографии (HisTrap HP) для His-метки, третий этап - с помощью гель-фильтрационной колоночной хроматографии (Superdex200), a четвертый этап - с помощью стерилизующей фильтрации. Однако для FcyRI на первом этапе проводят анионообменную колоночную хроматографию с Q Sepharose FF. Концентрации очищенных белков рассчитывают путем измерения адсорбции при 280 нм с помощью спектрофотометра, а коэффициенты адсорбции рассчитывают из полученных значений методами РАСЕ с соавт. (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).The extracellular domain of FcyR is obtained by the methods described below. First, gene synthesis of the extracellular domain of FcyR is carried out by a method known to those skilled in the art. In this case, the FcyR sequences are obtained based on the data registered by NCBI. In particular, the FcyRI sequence is obtained based on the sequence from the NCBI database NM_000566.3, the FcYRIIa sequence based on the sequence from the NCBI database NM_001136219.1, the FcYRIIb sequence based on the sequence from the NCBI database NM_004001.3 and the FcYRIIIa sequence based on the sequence from the database NCBI data NM_001127593.1; and its tag had a His tag added to their C-termini. The polymorphic site of FcYRIIa is obtained with reference to the publication J. Exp. Med., 172, 1990, 19-25; and the FcYRIIIa polymorphic site are obtained with reference to the publication of J. Clin. Invest., 100, 1997, 1059-1070. The resulting gene fragments are inserted into an animal cell expression vector to produce expression vectors. The resulting expression vectors are transiently introduced into FreeStyle293 cells derived from human embryonic kidney cells (Invitrogen), after which the proteins of interest are expressed. Culture supernatants were collected, passed through a 0.22 μm pore filter, and purified in essentially four steps described below. The first step is performed using cation exchange column chromatography (SP Sepharose FF), the second step using affinity column chromatography (HisTrap HP) for His tag, the third step using gel filtration column chromatography (Superdex200), and the fourth step using using sterilizing filtration. However, for FcyRI, the first step is anion exchange column chromatography with Q Sepharose FF. Purified protein concentrations were calculated by measuring adsorption at 280 nm using a spectrophotometer, and adsorption coefficients were calculated from the obtained values using the methods of PACE et al. (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).
Табл. 53 показывает связывающееся количество на единицу количества антитела, а также количество относительно связывающегося количества A375-G1T3/B167-Lamlib. Все антитела в табл. 53 показывают большее связывающее количество с FcYRIIb человека на единицу количества антитела, чем у A375G1T3/B167-Lamlib, и относительное значение составляет 2,85-14,26, тогда как связывающееся количество А375-G1T3/Значение B167-Lamlib с FcYRIIb человека установлено равным 1,0. Количество FcYRIIb человека, связывающееся с единицей количества антитела, и относительные связывающиеся количества были аналогичными в присутствии или в отсутствие аминокислотных модификаций для увеличения pI константной области. Кроме того, связывающееся количество антител, содержащих модификацию L235W, с hFcgRIa снижено по сравнению с таковым для A375-TT14/B167-Lamlib.Table 53 shows the binding amount per unit amount of antibody, as well as the amount relative to the binding amount of A375-G1T3/B167-Lamlib. All antibodies in the table. 53 show a higher binding amount to human FcYRIIb per unit amount of antibody than A375G1T3/B167-Lamlib, and the relative value is 2.85-14.26, while the binding amount of A375-G1T3/B167-Lamlib to human FcYRIIb is set to be 1.0. The amount of human FcYRIIb binding per unit amount of antibody and the relative amounts bound were similar in the presence or absence of amino acid modifications to increase the pI of the constant region. In addition, the binding amount of antibodies containing the L235W modification to hFcgRIa is reduced compared to that for A375-TT14/B167-Lamlib.
- 142 046075- 142 046075
Таблица 53Table 53
Связывающая активность каждого из FcyR человекаBinding activity of each human FcyR
- 143 046075- 143 046075
(7-5) Оценка связывания FcRn человека у вариантов с увеличенной pI путем аминокислотной модификации константной области.(7-5) Assessment of human FcRn binding in variants with increased pI by amino acid modification of the constant region.
Программное обеспечение Biacore T200 (фирма GE Healthcare) используют для оценки связывающей активности с FcRn человека. Измерения выполняют при 25°C с использованием буфера, включающего 50 мМ фосфата, 150 мМ NaCl, 0,05 мас./об.% - Р20, рН 6,0. Белки FcRn человека, используемые для этого определения, получены в соответствии с процедурой, описанной в WO 2010107110. Около 400 RU антитела захвачено с использованием иммобилизованного CaptureSelect ™ Human Fab-lambda Kinetics Biotin Conjugate сенсорного чипа (фирма Thermo Fisher Scientific) в качестве молекулы для захвата лиганда с последующим связыванием FcRn человека, разведенного в буфере для измерений. Активность соответствующих антител по связыванию FcRn оценивают путем расчета KD (моль/л) с помощью стационарной модели с использованием Biacore T200 Evaluation Software 2,0. Значения KD были близкими в присутствии или в отсутствие аминокислотных модификаций для увеличения pI константной области. В табл. 54 представлена величина KD (моль/л) соответствующих антител к FcRn человека.Biacore T200 software (GE Healthcare) was used to assess human FcRn binding activity. Measurements are performed at 25°C using a buffer containing 50 mM phosphate, 150 mM NaCl, 0.05 w/v% - P20, pH 6.0. The human FcRn proteins used for this determination are prepared according to the procedure described in WO 2010107110. Approximately 400 RU of antibody is captured using the immobilized CaptureSelect™ Human Fab-lambda Kinetics Biotin Conjugate sensor chip (Thermo Fisher Scientific) as the capture molecule ligand followed by binding of human FcRn diluted in measurement buffer. The FcRn binding activity of the respective antibodies is assessed by calculating the KD (mol/L) using a steady-state model using Biacore T200 Evaluation Software 2.0. KD values were similar in the presence or absence of amino acid modifications to increase the pI of the constant region. In table 54 shows the KD value (mol/l) of the corresponding antibodies to human FcRn.
- 144 046075- 144 046075
Таблица 54Table 54
Пример 8. Получение кинуренин (Куп)-зависимых антител против CD137.Example 8. Preparation of kynurenine (Kup)-dependent antibodies against CD137.
(8-1) Получение антител с кинуренин-зависимой связывающей активности в отношении CD137 человека из рационально разработанной библиотеки антител.(8-1) Generation of antibodies with kynurenine-dependent binding activity against human CD137 from a rationally designed antibody library.
Антитела, проявляющие связывающую активность с CD137 человека в присутствии кинуренина и не проявляющие связывающей активности в отсутствие кинуренина, получены из рационально разработанной библиотеки фагового дисплея антител (библиотеки кинуренина) для получения кинуренинпереключаемых антител, используя пэннинг против кинуренина, которые сконструированы, как описано в WO 2015/083764. Для получения биотинилированные антигены, связанные фагами в присутствии кинуренина, улавливаются гранулами, и извлекают фаги, презентирующие антитела, которые проявляют связывающую активность по отношению к антигенам в присутствии кинуренина. Затем фаги собирают из элюатов, полученных с гранул.Antibodies exhibiting binding activity to human CD137 in the presence of kynurenine and no binding activity in the absence of kynurenine are derived from a rationally designed phage display antibody library (kynurenine library) to generate kynurenine-switchable antibodies using anti-kynurenine panning that are constructed as described in WO 2015 /083764. To obtain biotinylated antigens bound by phages in the presence of kynurenine, beads are captured, and phages presenting antibodies that exhibit antigen binding activity in the presence of kynurenine are recovered. Phages are then collected from the eluates obtained from the beads.
Фаги получают обычным образом из клеток Е. coli, несущих сконструированную методом фагового дисплея фагмиду. В частности, клетки E.coli, несущие сконструированный фагмидный вектор, инфицируют фагом Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (обозначенным как гиперфаг) (фирма PROGEN Biotechnik) и после культивирования в течение ночи при 30°C фаги выделяют из супернатантов. Раствор фаговой библиотеки получают разбавлением популяции фагов, осажденных добавлением 2,5 М NaCl/10% PEG к культуре E.coli, в которой выработку фагов осуществляют с помощью трис-буферного солевого раствора (TBS, Tris Buffered Saline). Затем к раствору фаговой библиотекой добавляют БСА до конечной концентрации 4%. Пэннинг проводят с использованием антигена, иммобилизованного на магнитных гранулах. В качестве магнитных шариков использовали Sera-Mag SpeedBeads с покрытием NeutrAvidin (фирма Thermo Fisher Scientific), шарики FG NeutrAvidin (фирма Tamakawa Seminator) или Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (фирма Life Technologies). Гранулы с покрытием Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated (фирма Thermo Fisher Scientific), FG гранулы NeutrAvidin (фирма Tamakawa Seminator) или гранулы Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (фирма Life Technologies) применяют в качестве магнитных гранул. В качестве антигена используют биотинилированный hCD137-Fc (hCD137-Fc-Bio), полученный, как описано в примере 1-3 (получение биотинилированного Fc-слитого CD137 человека).Phages are produced in the usual manner from E. coli cells carrying a phagemid constructed by the phage display method. In particular, E. coli cells carrying the constructed phagemid vector are infected with phage Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (designated hyperphage) (PROGEN Biotechnik) and after culturing overnight at 30°C, the phages are isolated from the supernatants. A phage library solution is prepared by diluting the phage population precipitated by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to an E. coli culture in which phage production is carried out using Tris Buffered Saline (TBS). BSA is then added to the phage library solution to a final concentration of 4%. Panning is carried out using antigen immobilized on magnetic beads. The magnetic beads used were Sera-Mag SpeedBeads coated with NeutrAvidin (Thermo Fisher Scientific), FG NeutrAvidin beads (Tamakawa Seminator), or Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (Life Technologies). Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated (Thermo Fisher Scientific), FG NeutrAvidin beads (Tamakawa Seminator), or Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (Life Technologies) are used as magnetic beads. The antigen used is biotinylated hCD137-Fc (hCD137-Fc-Bio), obtained as described in example 1-3 (preparation of biotinylated human CD137 Fc-fusion).
- 145 046075- 145 046075
Пэннинг проводят для эффективного получения низкомолекулярных переключаемых антител, которые зависят от небольшой молекулы, которая может играть переключающую роль в раковых тканях. В частности, пэннинг для обогащения антителами, которые связываются с антигенами в присутствии кинуренина, который является небольшой молекулой, и которые не связывают антигены в отсутствие кинуренина, выполняют со ссылкой на методы, описанные в предыдущем патенте WO 2015/083764. В 1 раунде пэннинг выполняют на hCD137-Fc-Bio или биотинилированных кинуренинах (bio-Kyn) (соединение 028 (представлено [формулой 28]), 029 (представлено [формулой 29]) и 036 (представлено [формулой 36]), как описано в WO 2015/083764). Пэннинг для hCD137-Fc-Bio выполняют путем добавления раствора фага к антигену с последующим выделением фага, связанного с антигеном, с помощью магнитных гранул; и пэннинг для bio-Kyn выполняют таким образом, что добавляют приготовленный раствор фаговой библиотеки после первой иммобилизации биотинилированного антигена на магнитных гранулах. Для Bio-Kyn пэннинг для обогащения антител, способных связываться с антигеном в отсутствие кинуренина в виде небольшой молекулы, выполняют со ссылкой на методы, описанные в вышеупомянутом патенте WO 2015/083764. Для hCD137-Fc-Bio добавляют 4 нмоль небиотинилированной области Fc IgG1 человека для удаления антител, которые связываются с областью Fc. Восстановленные фаги добавляют к штамму Е. coli ER2738 для заражения фагами Е. coli, затем выделенные клетки Е. coli инфицируют гиперфагами, и фаги выделяют из супернатантов после культивирования в течение ночи при 30°C.Panning is performed to efficiently produce small molecule switchable antibodies that rely on a small molecule that may play a switching role in cancerous tissues. In particular, panning to enrich for antibodies that bind antigens in the presence of kynurenine, which is a small molecule, and that do not bind antigens in the absence of kynurenine, is performed with reference to the methods described in the previous patent WO 2015/083764. In Round 1, panning is performed on hCD137-Fc-Bio or biotinylated kynurenines (bio-Kyn) (compound 028 (represented by [Formula 28]), 029 (represented by [Formula 29]) and 036 (represented by [Formula 36]), as described in WO 2015/083764). Panning for hCD137-Fc-Bio is performed by adding a phage solution to an antigen, followed by isolating the phage bound to the antigen using magnetic beads; and panning for bio-Kyn is performed in such a way that the prepared phage library solution is added after the first immobilization of the biotinylated antigen on the magnetic beads. For Bio-Kyn, panning to enrich antibodies capable of binding to antigen in the absence of small molecule kynurenine is performed with reference to the methods described in the aforementioned patent WO 2015/083764. For hCD137-Fc-Bio, 4 nmol of non-biotinylated human IgG1 Fc region is added to remove antibodies that bind to the Fc region. Reconstituted phages are added to E. coli strain ER2738 to infect E. coli phages, then the isolated E. coli cells are infected with hyperphages and phages are isolated from the supernatants after overnight culture at 30°C.
После второго раунда пэннинг для обогащения антител, которые связываются с антигенами в присутствии кинуренина и не связываются с антигенами в отсутствие кинуренина, выполняют на hCD137Fc-Bio со ссылкой на методы, показанные в предыдущем патенте WO 2015/083764. В обоих случаях добавляют 4 нМ небиотинилированной области Fc IgG1 человека для удаления антител, которые связываются с областью Fc для hCD137-Fc-Bio. Подобный пэннинг повторяют до пятого раунда для обогащения представляющих интерес последовательностей антител.After the second round of panning to enrich for antibodies that bind to antigens in the presence of kynurenine and do not bind to antigens in the absence of kynurenine, is performed on hCD137Fc-Bio with reference to the methods shown in the previous patent WO 2015/083764. In both cases, 4 nM non-biotinylated human IgG1 Fc region is added to remove antibodies that bind to the Fc region of hCD137-Fc-Bio. Similar panning is repeated until the fifth round to enrich antibody sequences of interest.
(8-2) Получение антител, связывающих hCD137 в присутствии кинуренина, из библиотеки антител. (8-2-1) Получение hCD137p12-FX-Fc-Bio.(8-2) Generation of antibodies that bind hCD137 in the presence of kynurenine from an antibody library. (8-2-1) Preparation of hCD137p12-FX-Fc-Bio.
Получение hCD137p12-FX-Fc-Bio осуществляют методом, известным специалистам в данной области. В частности, фрагмент гена, кодирующий расщепляемую фактором Ха последовательность, и фрагмент гена, кодирующий константную область антитела, присоединены ниже по цепи от фрагмента гена, кодирующего область внеклеточного домена CD137 человека. Фрагмент гена, кодирующий белок (hCD137p12-FX-Fc-Bio, SEQ ID NO: 160), в котором связаны внеклеточная часть CD137 человека, расщепляемая фактором Ха последовательность и константная область антитела, включают в вектор экспрессии животного. Сконструированный плазмидный вектор вводят в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen) с использованием 293-фектина (фирма Invitrogen). Одновременно вводят плазмидный вектор, содержащий гены, экспрессирующие BirA и EBNA1 (SEQ ID NO: 88). В культуру добавляют биотин. Клетки, трансдуцированные генами в соответствии с вышеупомянутыми процедурами, культивируют при 37°C, 8% CO2, и hCD137p12-FX-Fc-Bio секретируется в супернатант культуры. Этот культуральный супернатант собирают. Белок А используют для очистки hCD137p12-FX-Fc-Bio из культурального супернатанта.The preparation of hCD137p12-FX-Fc-Bio is carried out by a method known to those skilled in the art. In particular, a gene fragment encoding a factor Xa cleavage sequence and a gene fragment encoding an antibody constant region are fused downstream of a gene fragment encoding a human CD137 extracellular domain region. A gene fragment encoding a protein (hCD137p12-FX-Fc-Bio, SEQ ID NO: 160) in which the extracellular portion of human CD137, the factor Xa cleavage sequence and the antibody constant region are linked is included in an animal expression vector. The constructed plasmid vector was introduced into FreeStyle293 cells (Invitrogen) using 293-Fectin (Invitrogen). At the same time, a plasmid vector containing genes expressing BirA and EBNA1 (SEQ ID NO: 88) is introduced. Biotin is added to the culture. Cells transduced with genes according to the above procedures are cultured at 37°C, 8% CO 2 , and hCD137p12-FX-Fc-Bio is secreted into the culture supernatant. This culture supernatant is collected. Protein A is used to purify hCD137p12-FX-Fc-Bio from the culture supernatant.
При использовании рационально разработанной библиотеки считают, что путем пэннинга антител, проявляющих антигенсвязывающую активность только в присутствии небольшой молекулы, можно получить переключаемые низкомолекулярными соединениями антитела, проявляющие антигенсвязывающую активность в присутствии малых молекул. То есть из библиотеки кинуренина, созданной способом, описанным в международной публикации WO 2015/083764, были извлечены фаги, презентирующие антитела, которые проявляют связывающую активность в присутствии кинуренина по отношению к hCD137, захваченному на гранулах. В настоящем методе получения биотинилированный hCD137-Fc (hCD137-Fc-Bio), полученный, как описано в примере 1-3 (получение меченного биотином Fc-слитого CD137 человека), или hCD137p12-FX-Fc-Bio используют в качестве антигенов.By using a rationally designed library, it is believed that by panning antibodies that exhibit antigen-binding activity only in the presence of a small molecule, small molecule-switchable antibodies that exhibit antigen-binding activity in the presence of small molecules can be obtained. That is, from a kynurenine library generated by the method described in international publication WO 2015/083764, phages presenting antibodies that exhibit binding activity in the presence of kynurenine to hCD137 captured on beads were recovered. In the present production method, biotinylated hCD137-Fc (hCD137-Fc-Bio) prepared as described in Example 1-3 (Preparation of biotin-labeled human CD137 Fc-fusion) or hCD137p12-FX-Fc-Bio are used as antigens.
Бактерию Е. coli, несущую фагмидный вектор для фагового дисплея, сконструированный, как описано в международной публикации WO 2015/083764, инфицируют Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (гиперфагом) (фирма PROGEN Biotechnik), и фаги выделяют из супернатантов после культивирования в течение ночи при 30°C. Раствор библиотеки фагов с поливалентным дисплеем антител получают разбавлением TBS популяции фагов, осажденных путем добавления 2,5 М NaCl/10% PEG к культуре Е. coli, в которой размножали фаг. Затем к раствору фаговой библиотеки добавляют БСА до конечной концентрации 4%. Проводят пэннинг с иммобилизованным на магнитных гранулах антигеном. Гранулы FG NeutrAvidin (фирма Tamakawa Seminator) или Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (фирма Life Technologies) используют в качестве магнитных гранул.An E. coli bacterium carrying a phagemid vector for phage display, constructed as described in international publication WO 2015/083764, is infected with Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (hyperphage) (Progen Biotechnik), and phages are isolated from the supernatants after overnight cultivation at 30°C. A polyvalent antibody display phage library solution is prepared by diluting the TBS population of phages precipitated by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to the E. coli culture in which the phage was propagated. BSA is then added to the phage library solution to a final concentration of 4%. Panning is carried out with antigen immobilized on magnetic beads. FG NeutrAvidin beads (Tamakawa Seminator) or Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (Life Technologies) are used as magnetic beads.
В первом раунде пэннинга проводят обогащение фагов, способных связываться с антигеном, в присутствии кинуренина. В частности, фаговую библиотеку контактируют с антигеном и кинуренином в течение одного часа при комнатной температуре путем добавления 0,8 мл приготовленного раствора фаговой библиотеки, при конечной концентрации кинуренина 500 мкМ и 4 нмоль небиотинилированной области Fc IgG1 человека (hFC) с 125 пМ меченного биотином антигена. Добавляют блокированные БСА магнитные гранулы (гранулы FG NeutrAvidin) и позволяют антиген-фаговым комплексам связываться сIn the first round of panning, phages capable of binding to the antigen are enriched in the presence of kynurenine. Specifically, the phage library is contacted with antigen and kynurenine for one hour at room temperature by adding 0.8 ml of the prepared phage library solution, at a final concentration of 500 μM kynurenine and 4 nmol of non-biotinylated human IgG1 Fc region (hFC) with 125 pM biotin-labeled antigen. Add BSA-blocked magnetic beads (FG NeutrAvidin beads) and allow antigen-phage complexes to bind to
- 146 046075 магнитными гранулами в течение 15 мин при комнатной температуре. Гранулы дважды промывают 0,5 мл кинуренина/TBST и один раз кинуренином/TBS. Затем к смеси добавляют 0,5 мл раствора трипсина с концентрацией 1 мг/мл. После суспендирования смеси при комнатной температуре в течение 15 мин раствор фага выделяют из гранул, которые сразу же отделяют с помощью магнитной платформы. Восстановленные фаги добавляют к 20 мл штамма Е. coli ER2738 в логарифмической фазе роста (OD600 0,4-0,7). Е. coli инфицируют фагами путем культивирования Е. coli при 37°C в течение одного часа при осторожном перемешивании. Инфицированные клетки Е. coli высевают в чашки размером 225 ммх225 мм. Затем готовят библиотеки фагов, презентирующих моновалентные антитела, путем инфицирования культур диссеминированных Е. coli фагом M13KO7TC (WO 2015046554 A1) (фагом-помощником) (фирма Takara) и собирают фаги из супернатантов, культивируемых в течение ночи при 30°C.- 146 046075 magnetic beads for 15 minutes at room temperature. The beads are washed twice with 0.5 ml kynurenine/TBST and once with kynurenine/TBS. Then 0.5 ml of trypsin solution with a concentration of 1 mg/ml is added to the mixture. After suspending the mixture at room temperature for 15 min, the phage solution is released from the beads, which are immediately separated using a magnetic platform. Reconstituted phages are added to 20 ml of E. coli strain ER2738 in logarithmic growth phase (OD600 0.4-0.7). E. coli is infected with phages by culturing E. coli at 37°C for one hour with gentle agitation. Infected E. coli cells are seeded into 225 mm x 225 mm dishes. Libraries of phage presenting monovalent antibodies are then prepared by infecting disseminated E. coli cultures with phage M13KO7TC (WO 2015046554 A1) (helper phage) (Takara) and phages are collected from supernatants cultured overnight at 30°C.
Для второго раунда пэннинга фаговую библиотеку контактируют с антигеном и кинуренином в течение одного часа при комнатной температуре путем добавления 0,8 мл приготовленного раствора фаговой библиотеки до конечной концентрации 500 мкМ кинуренина и 4 нМ немеченной биотином области Fc IgG1 человека вместе с 40 пМ меченного биотином антигена. Добавляют блокированные БСА магнитные гранулы (Dynabeads MyOne Streptavidin T1) и допускают антиген-фаговым комплексам связываться с магнитными гранулами в течение 15 мин при комнатной температуре. Гранулы дважды промывают 0,5 мл кинуренина/TBST и один раз кинуренином/TBS. Затем к смеси добавляют 0,5 мл раствора трипсина с концентрацией 1 мг/мл. После суспендирования смеси при комнатной температуре в течение 15 мин раствор фага выделяют из гранул, которые сразу же отделяют с помощью магнитной платформы. Затем готовят раствор библиотеки фагов для моновалентного дисплея антител таким же образом, как и в первом раунде, описанном выше.For the second round of panning, the phage library is contacted with antigen and kynurenine for one hour at room temperature by adding 0.8 ml of the prepared phage library solution to a final concentration of 500 μM kynurenine and 4 nM biotin-unlabeled human IgG1 Fc region along with 40 pM biotin-labeled antigen . Add BSA-blocked magnetic beads (Dynabeads MyOne Streptavidin T1) and allow antigen-phage complexes to bind to the magnetic beads for 15 min at room temperature. The beads are washed twice with 0.5 ml kynurenine/TBST and once with kynurenine/TBS. Then 0.5 ml of trypsin solution with a concentration of 1 mg/ml is added to the mixture. After suspending the mixture at room temperature for 15 min, the phage solution is released from the beads, which are immediately separated using a magnetic platform. A phage library solution is then prepared for monovalent antibody display in the same manner as in the first round described above.
Для раунда 3 пэннинга фаговую библиотеку контактируют с антигеном и кинуренином в течение одного часа при комнатной температуре путем добавления 0,8 мл приготовленного раствора фаговой библиотеки, при конечной концентрации кинуренина 500 мкМ и 4 нМ немеченной биотином области Fc IgG1 человека наряду с 10 пМ меченного биотином антигена. Добавляют блокированные БСА магнитные гранулы (гранулы FG NeutrAvidin) и допускают антиген-фаговым комплексам связываться с магнитными гранулами в течение 15 мин при комнатной температуре. Гранулы трижды промывают 0,5 мл кинуренина/TBST и дважды - кинуренина/TBS. Затем к смеси добавляют 0,5 мл раствора трипсина с концентрацией 1 мг/мл. После суспендирования смеси при комнатной температуре в течение 15 мин раствор фага выделяли из гранул, которые сразу же отделяют с помощью магнитной платформы. Затем готовят раствор библиотеки фагового дисплея моновалентных антител таким же образом, как и в первом раунде, описанном выше. В течение 4-го раунда пэннинг осуществляют в условиях, сходных с условиями 3-го раунда пэннинга. Однако в качестве магнитных гранул применяют Dynabeads MyOne Streptavidin T1.For round 3 panning, the phage library is contacted with antigen and kynurenine for one hour at room temperature by adding 0.8 ml of the prepared phage library solution, with a final concentration of 500 μM kynurenine and 4 nM biotin-unlabeled human IgG1 Fc region along with 10 pM biotin-labeled antigen. Add BSA-blocked magnetic beads (FG NeutrAvidin beads) and allow the antigen-phage complexes to bind to the magnetic beads for 15 minutes at room temperature. The granules are washed three times with 0.5 ml kynurenine/TBST and twice with kynurenine/TBS. Then 0.5 ml of trypsin solution with a concentration of 1 mg/ml is added to the mixture. After suspending the mixture at room temperature for 15 min, the phage solution was isolated from the beads, which were immediately separated using a magnetic platform. A monovalent antibody phage display library solution is then prepared in the same manner as in the first round described above. During the 4th round, panning is carried out under conditions similar to the conditions of the 3rd round of panning. However, Dynabeads MyOne Streptavidin T1 are used as magnetic beads.
(8-3) Получение антител, которые связываются с CD137 человека в присутствии кинуренина, из библиотек антител с использованием SS-биотинилированных антигенов и методов отрицательной селекции.(8-3) Generation of antibodies that bind to human CD137 in the presence of kynurenine from antibody libraries using SS-biotinylated antigens and negative selection methods.
(8-3-1) Получение hCD137p12-FX-Fc.(8-3-1) Preparation of hCD137p12-FX-Fc.
hCD137p12-FX-Fc получают способом, известным специалистам в данной области. В частности, фрагмент гена, кодирующий последовательность расщепления фактором Ха, и фрагмент гена, кодирующий константную область антитела, присоединены ниже по цепи от фрагмента гена, кодирующего область внеклеточного домена CD137 человека. Фрагмент гена, кодирующий белок, в котором связаны внеклеточная часть CD137 человека, последовательность расщепления FactorXa и константная область антитела (hCD137p12-FX-Fc, SEQ ID NO: 160), включен в вектор экспрессии животного. Сконструированный плазмидный вектор вводят в клетки FreeStyle293 (фирма Invitrogen) с использованием 293фектина (фирма Invitrogen). Одновременно вводят плазмидный вектор, содержащий гены, экспрессирующие EBNA1 (SEQ ID NO: 88). Клетки, трансдуцированные генами в соответствии с вышеупомянутыми процедурами, культивируют при 37°C, 8% CO2, и hCD137p12-FX-Fc-Bio секретируется в супернатант культуры. Белок А используют для очистки hCD137p12-FX-Fc-Bio из этого супернатанта клеточной культуры.hCD137p12-FX-Fc is prepared in a manner known to those skilled in the art. Specifically, a gene fragment encoding a factor Xa cleavage sequence and a gene fragment encoding an antibody constant region are fused downstream of a gene fragment encoding a human CD137 extracellular domain region. A gene fragment encoding a protein that links the extracellular portion of human CD137, the FactorXa cleavage sequence, and the antibody constant region (hCD137p12-FX-Fc, SEQ ID NO: 160) is included in an animal expression vector. The constructed plasmid vector was introduced into FreeStyle293 cells (Invitrogen) using 293fectin (Invitrogen). At the same time, a plasmid vector containing genes expressing EBNA1 (SEQ ID NO: 88) is introduced. Cells transduced with genes according to the above procedures are cultured at 37°C, 8% CO 2 , and hCD137p12-FX-Fc-Bio is secreted into the culture supernatant. Protein A is used to purify hCD137p12-FX-Fc-Bio from this cell culture supernatant.
(8-3-2) Получение антител, связывающих CD137 человека в присутствии кинуренина, из библиотеки антител с использованием SS-биотинилированных антигенов и метода отрицательной селекции.(8-3-2) Generation of antibodies that bind human CD137 in the presence of kynurenine from an antibody library using SS-biotinylated antigens and a negative selection method.
При получении низкомолекулярных переключаемых антител, которые проявляют антигенсвязывающую активность в присутствии небольшой молекулы, считалось, что после фагового дисплея антител, которые связываются с антигеном с помощью магнитных гранул, захватываются с использованием антигена, биотинилированного (SS-биотинилированного) через линкер с дисульфидной связью (SSсвязь), только антигенсвязывающее антитело по методу фагового дисплея может быть элюировано с гранул с использованием дитиотреитола (DTT) или подобного соединения для расщепления SS-связей в восстанавливающих условиях. Библиотеку кинуренина, сконструированную, как описано в международной публикации WO 2015/083764, подвергают скринингу на антитела, которые проявляют связывающую активность с антигенами в присутствии кинуренина. Для скрининга библиотеку фагового дисплея антител сначала приводят в контакт с меченными биотином антиген-магнитными гранулами в отсутствие кинуренина, и фаги, демонстрирующие антитела, которые обладают антигенсвязывающей активностью даже в отсутствие кинуренина, удаляют. Последующий скрининг на антитела с антигенсвязывающейIn the production of small molecule switchable antibodies that exhibit antigen binding activity in the presence of a small molecule, it was thought that after phage display, antibodies that bind to the antigen using magnetic beads are captured using the antigen biotinylated (SS-biotinylated) through a disulfide bonded linker (SS-linked ), only phage display antigen binding antibody can be eluted from the beads using dithiothreitol (DTT) or a similar compound to cleave the SS bonds under reducing conditions. A kynurenine library constructed as described in international publication WO 2015/083764 is screened for antibodies that exhibit antigen binding activity in the presence of kynurenine. For screening, a phage antibody display library is first contacted with biotin-labeled antigen magnetic beads in the absence of kynurenine, and phages displaying antibodies that have antigen-binding activity even in the absence of kynurenine are removed. Subsequent screening for antibodies with antigen-binding
- 147 046075 активностью проводят только в присутствии кинуренина, аналогичным образом проводя пэннинг в присутствии кинуренина. В этом методе меченный биотином антиген (SS-биотинилированный антиген) используют в качестве антигена в соответствии с прилагаемыми протоколами с использованием hCD137Fc, полученного согласно описанию в примере 1-4, или hCD137p12-FX-Fc, полученного в (8-3-1), и набор Sulfo-NHS-SS-Biotinylation EZ-Link (фирма Thermo Fisher Scientific). Следует отметить, что hCD137Fc-Bio, полученный по описанию примера 1-3, или hCD137p12-FX-Fc-Bio, полученный в (8-2-1), используют для отрицательной селекции.- 147 046075 activity is carried out only in the presence of kynurenine, similarly carrying out panning in the presence of kynurenine. In this method, biotin-labeled antigen (SS-biotinylated antigen) is used as the antigen according to the attached protocols using hCD137Fc prepared as described in Example 1-4 or hCD137p12-FX-Fc prepared in (8-3-1) , and Sulfo-NHS-SS-Biotinylation EZ-Link kit (Thermo Fisher Scientific). It should be noted that hCD137Fc-Bio obtained as described in Example 1-3 or hCD137p12-FX-Fc-Bio obtained in (8-2-1) is used for negative selection.
Клетки Е. coli, несущие фагмидный вектор фагового дисплея, сконструированный согласно описанию WO 2015/083764, инфицированы Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (гиперфагом) (фирма PROGEN Biotechnik), и после культивирования в течение ночи при 30°C фаги выделяют из супернатантов. Библиотеки фагового дисплея поливалентных антител получают разбавлением TBS популяции фагов, осажденных путем добавления 2,5 М NaCl/10% PEG к культуре Е. coli, в которой производили наработку фага. Затем к раствору библиотеки фагов добавляют БСА до конечной концентрации 4%. Осуществляют пэннинг с иммобилизованным на магнитных гранулах антигеном. В качестве магнитных гранул используют Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated (фирма Thermo Fisher Scientific), гранулы FG NeutrAvidin (фирма Tamakawa Seminator) или гранулы Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (фирма Life Technologies).E. coli cells carrying a phagemid phage display vector constructed as described in WO 2015/083764 are infected with Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (hyperphage) (PROGEN Biotechnik), and after overnight cultivation at 30°C, phages are isolated from the supernatants. Phage display libraries of polyvalent antibodies are prepared by diluting the TBS population of phages precipitated by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to the E. coli culture in which the phage was produced. BSA is then added to the phage library solution to a final concentration of 4%. Panning is carried out with antigen immobilized on magnetic beads. The magnetic beads used are Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated (Thermo Fisher Scientific), FG NeutrAvidin beads (Tamakawa Seminator), or Dynabeads MyOne Streptavidin T1 (Life Technologies).
В первом раунде пэннинга проводят обогащение фагов, способных связываться с антигеном в присутствии кинуренина, применяя метод отрицательной селекции. В частности, 800 пмоль hCD137-Fc-Bio или hCD137pl2-FX-Fc-Bio добавляют к гранулам Sera-Mag SpeedBeads, покрытым нейтравидином, блокированным обезжиренным молоком, которое предварительно инкубировали со стрептавидином (фирма Roche) и допускают связывание в течение 15 мин при комнатной температуре. Гранулы трижды промывают TBST и добавляют 0,8 мл раствора библиотеки фагов, блокированных БСА чтобы была возможность связаться в течение одного часа при комнатной температуре. Разделяя гранулы на магнитной платформе, собирают антигены и фаги, которые не связались с гранулами.In the first round of panning, phages capable of binding to the antigen in the presence of kynurenine are enriched using a negative selection method. Specifically, 800 pmol of hCD137-Fc-Bio or hCD137pl2-FX-Fc-Bio is added to Sera-Mag SpeedBeads coated with skim milk-blocked neutravidin that has been preincubated with streptavidin (Roche) and allowed to bind for 15 min at room temperature. The beads are washed three times with TBST and 0.8 ml of BSA-blocked phage library solution is added to allow binding for one hour at room temperature. By separating the beads on a magnetic platform, antigens and phages that have not bound to the beads are collected.
Затем 225 пМ SS-биотинилированного hCD137-Fc или 450 пМ SS-биотинилированного hCD137p12FX-Fc-Bio добавляют к гранулам FG NeutrAvidin, блокированным обезжиренным молоком, которое инкубировали со стрептавидином (фирма Roche), и допускают связывание в течение 15 мин при комнатной температуре. Гранулы трижды промывают TBST, и вместе с выделенными фагами добавляют до конечной концентрации 0,2 мМ кинуренина и 4 нМ hFc; фаговую библиотеку приводят в контакт с антигеном, а также с кинуренином, в течение одного часа при комнатной температуре. Гранулы дважды промывают 0,5 мл кинуренина/TBST (0,2 мМ кинуренин, 0,1% Tween20, TBS, pH 7,4) и один раз кинуренином/TBS (0,2 мМ кинуренин, TBS, рН 7,4). Затем добавляют 500 мкл раствора TBS, содержащего в конечной концентрации 25 мМ DTT, и после пяти минут перемешивания при комнатной температуре фаги выделяют из отделенных гранул с использованием магнитной платформы. Затем к смесям добавляют трипсин до конечной концентрации 1 мг/мл. Смесь перемешивают при комнатной температуре в течение 15 мин перед извлечением фагов из отделенных шариков с помощью магнитной платформы. Восстановленные фаги добавляют к 20 мл штамма Е. coli ER2738 в логарифмической фазе роста (OD600 0,4-0,7). Е. coli инфицируют фагами путем культивирования Е. coli при 37°C в течение одного часа при осторожном перемешивании. Инфицированные клетки Е. coli высевают в чашки размером 225 мм х 225 мм. Затем получают библиотеку фагов с дисплеем поливалентных антител путем инфицирования культур диссеминированных Е. coli гиперфагами и извлечения фагов из супернатантов после культивирования в течение ночи при 30°C.225 pM SS-biotinylated hCD137-Fc or 450 pM SS-biotinylated hCD137p12FX-Fc-Bio was then added to FG NeutrAvidin beads blocked with skim milk that had been incubated with streptavidin (Roche) and allowed to bind for 15 minutes at room temperature. The beads are washed three times with TBST, and the isolated phages are added to a final concentration of 0.2 mM kynurenine and 4 nM hFc; the phage library is brought into contact with the antigen, as well as kynurenine, for one hour at room temperature. The beads are washed twice with 0.5 ml kynurenine/TBST (0.2 mM kynurenine, 0.1% Tween20, TBS, pH 7.4) and once with kynurenine/TBS (0.2 mM kynurenine, TBS, pH 7.4) . 500 μl of TBS solution containing a final concentration of 25 mM DTT is then added and after five minutes of stirring at room temperature, phages are isolated from the separated beads using a magnetic platform. Trypsin is then added to the mixtures to a final concentration of 1 mg/ml. The mixture is stirred at room temperature for 15 min before the phages are recovered from the separated beads using a magnetic platform. Reconstituted phages are added to 20 ml of E. coli strain ER2738 in logarithmic growth phase (OD600 0.4-0.7). E. coli is infected with phages by culturing E. coli at 37°C for one hour with gentle agitation. Infected E. coli cells are plated in 225 mm x 225 mm dishes. A polyvalent antibody-displaying phage library is then prepared by infecting disseminated E. coli cultures with hyperphages and recovering phages from the supernatants after overnight culture at 30°C.
Для второго раунда пэннинга 400 пМ hCD137-Fc-Bio или hCD137p12-FX-Fc-Bio добавляют к гранулам к Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin, покрытым нейтральным авидином, блокированным обезжиренным молоком, предварительно инкубированным со стрептавидином (фирма Roche), и дают возможность связываться в течение 15 мин при комнатной температуре. К гранулам, трижды промытым TBST, добавляют 0,4 мл раствора библиотеки фагов, блокированных БСА, и дают возможность связываться в течение одного часа при комнатной температуре. Путем разделения гранул с помощью магнитной платформы, извлекают антиген и фаги, которые не связались с гранулами. Извлеченные фаги снова инкубируют с гранулами Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin, покрытыми нейтральным авидином, которые инкубировали с 400 пМ hCD137-Fc-Bio или hCD137p12-FX-Fc-Bio по аналогичной процедуре, а затем антигены и фаги, которые не связывались с гранулами, собирают на магнитной платформе.For the second round of panning, 400 pM hCD137-Fc-Bio or hCD137p12-FX-Fc-Bio is added to Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin beads coated with neutral avidin, blocked with skim milk, pre-incubated with streptavidin (Roche), and allowed to bind for 15 minutes at room temperature. 0.4 ml of BSA-blocked phage library solution was added to the beads washed three times with TBST and allowed to bind for one hour at room temperature. By separating the beads using a magnetic platform, antigen and phages that are not bound to the beads are recovered. The recovered phages were again incubated with Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin coated with neutral avidin, which had been incubated with 400 pM hCD137-Fc-Bio or hCD137p12-FX-Fc-Bio in a similar procedure, followed by antigens and phages that did not bind to the beads. collected on a magnetic platform.
56,3 пМ SS-биотинилированного hCD137-Fc или 113 пМ SS-биотинилированного hCD137p12-FXFc добавляют к гранулам FG NeutrAvidin, блокированным обезжиренным молоком, которое предварительно инкубируют со стрептавидином (фирма Roche), и дают возможность связать в течение 15 мин при комнатной температуре. Гранулы трижды промывают TBST, и вместе с выделенными фагами добавляют до конечной концентрации 0,2 мМ кинуренина и 4 нМ небиотинилированной области Fc IgG1 человека; фаговую библиотеку приводят в контакт с антигеном, а также кинуренином, в течение одного часа при комнатной температуре. Гранулы трижды промывают 0,5 мл кинуренина/TBST (0,2 мМ кинуренин, 0,1% Tween20, TBS, pH 7,4) и дважды кинуренином/TBS (0,2 мМ кинуренин, TBS, рН 7,4). Затем добавляют 500 мкл раствора TBS, содержащего в конечной концентрации 25 мМ DTT, и после 5 мин перемешива56.3 pM SS-biotinylated hCD137-Fc or 113 pM SS-biotinylated hCD137p12-FXFc was added to FG NeutrAvidin beads blocked with skim milk that had been pre-incubated with streptavidin (Roche) and allowed to bind for 15 min at room temperature . The beads are washed three times with TBST, and 0.2 mM kynurenine and 4 nM non-biotinylated human IgG1 Fc region are added along with the isolated phages to a final concentration; the phage library is brought into contact with the antigen, as well as kynurenine, for one hour at room temperature. The beads are washed three times with 0.5 ml kynurenine/TBST (0.2 mM kynurenine, 0.1% Tween20, TBS, pH 7.4) and twice with kynurenine/TBS (0.2 mM kynurenine, TBS, pH 7.4). Then add 500 μl of TBS solution containing a final concentration of 25 mM DTT, and after 5 min mix
- 148 046075 ния при комнатной температуре фаги выделяют из отделенных гранул с использованием магнитной платформы. Затем готовят раствор библиотеки фагов с многовалентным дисплеем антител таким же образом, как в первом раунде, описанном выше.- 148 046075 at room temperature, phages are isolated from separated granules using a magnetic platform. A multivalent antibody display phage library solution is then prepared in the same manner as in the first round described above.
Для третьего раунда пэннинга 200 пМ hCD137-Fc-Bio или hCD137p12-FX-Fc-Bio добавляют к покрытым нейтральным авидином гранулам Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin, блокированным обезжиренным молоком Sera-Mag SpeedBeads, предварительно инкубированным со стрептавидином (фирма Roche), и дают возможность связать при комнатной температуре в течение 15 мин. Гранулы трижды промывают TBST и добавляют 0,2 мл раствора библиотеки фагов, блокированных БСА, и дают возможность связываться в течение одного часа при комнатной температуре. Разделив гранулы с помощью магнитной платформы извлекают антигены и фаги, которые не связались с гранулами. Извлеченные фаги снова инкубируют с Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin, которые инкубировали с 200 пМ hCD137-Fc-Bio или hCD137p12-FX-Fc-Bio по аналогичной процедуре, затем антигены и фаги, которые не связывались с гранулами, восстанавливают с помощью магнитной платформы.For the third round of panning, 200 pM hCD137-Fc-Bio or hCD137p12-FX-Fc-Bio is added to Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin-coated beads blocked with Sera-Mag SpeedBeads skim milk pre-incubated with streptavidin (Roche) and fed ability to bind at room temperature for 15 minutes. The beads are washed three times with TBST and 0.2 ml of BSA-blocked phage library solution is added and allowed to bind for one hour at room temperature. By separating the granules using a magnetic platform, antigens and phages that are not bound to the granules are removed. The recovered phages are again incubated with Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin, which were incubated with 200 pM hCD137-Fc-Bio or hCD137p12-FX-Fc-Bio in a similar procedure, then antigens and phages that did not bind to the beads are recovered using a magnetic platform.
12,5 пМ SS-биотинилированного hCD137-Fc или 25 пмоль SS-биотинилированного hCD137p12-FXFc добавляют к гранулам FG NeutrAvidin NeutrAvidin, блокированным обезжиренным молоком, который инкубировали со стрептавидином (фирма Roche), и дают возможность связываться при комнатной температуре в течение 15 мин. Гранулы трижды промывают TBST, и вместе с выделенными фагами добавляют до конечной концентрации 0,2 мМ кинуренина и 4 нМ небиотинилированной области Fc IgG1 человека; фаговую библиотеку приводят в контакт с антигеном, а также кинуренином, в течение одного часа при комнатной температуре.12.5 pM SS-biotinylated hCD137-Fc or 25 pmol SS-biotinylated hCD137p12-FXFc was added to FG NeutrAvidin NeutrAvidin skim milk-blocked beads that had been incubated with streptavidin (Roche) and allowed to bind at room temperature for 15 min. . The beads are washed three times with TBST, and 0.2 mM kynurenine and 4 nM non-biotinylated human IgG1 Fc region are added along with the isolated phages to a final concentration; the phage library is brought into contact with the antigen, as well as kynurenine, for one hour at room temperature.
Гранулы пять раз промывают 0,5 мл кинуренина/TBST (0,2 мМ кинуренин, 0,1% Tween20, TBS, pH 7,4) и пять раз кинуренином/TBS (0,2 мМ кинуренин, TBS, рН 7,4). Затем добавляют 500 мкл раствора TBS, содержащего в конечной концентрации 25 мМ DTT, и после 5 мин перемешивания при комнатной температуре фаги выделяют из отделенных гранул с использованием магнитной платформы. Затем готовят раствор библиотеки фагов с многовалентным дисплеем антител таким же образом, как в первом раунде, описанном выше. В течение четвертого раунда пэннинг осуществляют в условиях, аналогичных условиям третьего раунда пэннинга. Однако применяют в качестве магнитных гранул гранулы Dynabeads MyOne Streptavidin T1 вместо гранул FG beads NeutrAvidin. For пятого раунда пэннинг осуществляют в условиях, близких к условиям третьего раунда.The beads are washed five times with 0.5 ml kynurenine/TBST (0.2 mM kynurenine, 0.1% Tween20, TBS, pH 7.4) and five times with kynurenine/TBS (0.2 mM kynurenine, TBS, pH 7.4 ). Then, 500 μl of TBS solution containing a final concentration of 25 mM DTT is added, and after 5 min of stirring at room temperature, phages are isolated from the separated beads using a magnetic platform. A multivalent antibody display phage library solution is then prepared in the same manner as in the first round described above. During the fourth round, panning is carried out under conditions similar to the conditions of the third round of panning. However, Dynabeads MyOne Streptavidin T1 beads are used as magnetic beads instead of FG beads NeutrAvidin beads. For the fifth round, panning is carried out under conditions close to those of the third round.
(8-4) Оценка кинуренин-зависимых анти-CD137 антител, идентифицированных с помощью фагового дисплея.(8-4) Evaluation of kynurenine-dependent anti-CD137 antibodies identified by phage display.
(8-4-1) Экспрессия и очистка переключаемых антител, которые изменяют свое связывание с антигенами за счет присутствия/отсутствия кинуренина.(8-4-1) Expression and purification of switchable antibodies that change their binding to antigens due to the presence/absence of kynurenine.
Гены, кодирующие вариабельные области антител, полученных из кинурениновых библиотек, описанных в настоящем изобретении, инсертируют в экспрессирующие плазмиды животных, имеющие IgG1 человека или модифицированный IgG1 человека (Р253) и цепи каппа. Обозначения клонов и порядковые номера перечислены в табл. 55.The genes encoding the variable regions of antibodies derived from the kynurenine libraries described in the present invention are inserted into animal expression plasmids having human IgG1 or modified human IgG1 (P253) and kappa chains. Clone designations and serial numbers are listed in table. 55.
Таблица 55Table 55
Результаты анализа клоновClone analysis results
Антитела экспрессируют и очищают с использованием методов, известных специалистам в данной области. Спектрофотометры использовали для измерения абсорбции раствора очищенных антител при 280 нм. Из полученных измеренных значений рассчитывают концентрации очищенных антител с использованием коэффициентов экстинкции, рассчитанных методом РАСЕ (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).Antibodies are expressed and purified using methods known to those skilled in the art. Spectrophotometers were used to measure the absorbance of the purified antibody solution at 280 nm. From the obtained measured values, the concentrations of purified antibodies are calculated using extinction coefficients calculated by the PACE method (Protein Science, 4, 1995, 2411-2423).
(8-4-2) Оценка влияния кинуренина на связывание CD137 человека с помощью метода поверхностного плазмонного резонанса.(8-4-2) Evaluation of the effect of kynurenine on human CD137 binding using surface plasmon resonance technique.
Программное обеспечение Biacore T200 (фирма GE Healthcare) используют для оценки взаимодействия по связывающей активности анти-CD137 антитела и hCD137-His-BAP (SEQ ID NO: 87). Чип сенсора CM3 (фирма GE Healthcare), иммобилизованный с соответствующими количествами белка А путемBiacore T200 software (GE Healthcare) was used to evaluate the binding activity interaction between the anti-CD137 antibody and hCD137-His-BAP (SEQ ID NO: 87). CM3 sensor chip (GE Healthcare), immobilized with appropriate amounts of protein A by
- 149 046075 иммобилизации по аминогруппе, захватывается aHTu-CD137 антителом для взаимодействия с hCD137His-BAP, полученным в примере 1-1. TBS используют в качестве подвижного буфера, а 10 мМ глицинHCl (рН 1,5) и 25 мМ NaOH используют в качестве раствора для регенерации.- 149 046075 immobilization at the amino group, captured by aHTu-CD137 antibody to interact with hCD137His-BAP obtained in example 1-1. TBS is used as the running buffer, and 10 mM glycineHCl (pH 1.5) and 25 mM NaOH is used as the regeneration solution.
После захвата анти-CD137 антитела, суспендированного в TBS, 500 нМ hCD137-His-BAP вводят в каждую проточную ячейку при скорости потока 10 мкл/мин в течение 3 мин. Этот 3-минутный период является фазой связывания для hCD137-His-BAP, а после завершения фазы связывания наступает 5минутный период переключения на подвижный буфер для фазы диссоциации для hCD137-His-BAP. После завершения фазы диссоциации регенерирующий раствор впрыскивают со скоростью 30 мкл/мин в течение 10 с. Приведенное выше описание является циклом измерения связывающей активности антиCD137 антител. Связывающееся количество hCD137-His-BAP, которое взаимодействовало с анти-CD137 антителом в фазе связывания, анализируют с помощью Biacore T200 Evaluation Software Version 2.0, как показано в табл. 56.After capturing the anti-CD137 antibody suspended in TBS, 500 nM hCD137-His-BAP was injected into each flow cell at a flow rate of 10 μL/min for 3 min. This 3-minute period is the binding phase for hCD137-His-BAP, and after completion of the binding phase, there is a 5-minute period of switching to the running buffer for the dissociation phase of hCD137-His-BAP. After completion of the dissociation phase, the regenerating solution is injected at a rate of 30 μl/min for 10 s. The above description is a cycle for measuring the binding activity of anti-CD137 antibodies. The binding amount of hCD137-His-BAP that interacted with the anti-CD137 antibody in the binding phase was analyzed using Biacore T200 Evaluation Software Version 2.0, as shown in Table. 56.
Таблица 56Table 56
Количество связываемого антигена в присутствии кинуренинаAmount of antigen bound in the presence of kynurenine
(8-4-3) Оценка связывающей активности полученных антител по отношению к частям последовательностей CD137.(8-4-3) Evaluation of the binding activity of the resulting antibodies towards parts of the CD137 sequences.
(8-4-3-1) Получение антигенов с частями последовательностей CD137.(8-4-3-1) Production of antigens with parts of CD137 sequences.
Антигены с частями последовательностей CD137 получают методами, известными специалистам в данной области. В частности, фрагмент гена, кодирующий константную область антитела, был связан ниже по цепи после фрагмента гена, кодирующего часть внеклеточной области CD137 человека. Фрагмент гена, кодирующий белок (табл. 57), в котором часть внеклеточного домена CD137 человека и константная область антитела связаны, включают в экспрессирующий вектор животного. Сконструированный плазмидный вектор вводят в клетки Expi293 (фирма Invitrogen) с использованием ExpiFectamine293 (фирма Invitrogen), и представляющий интерес белок секретируется в супернатант культуры. Белок А используют для очистки представляющего интерес белка из супернатанта культуры.Antigens with portions of the CD137 sequences are produced by methods known to those skilled in the art. Specifically, a gene fragment encoding the antibody constant region was linked downstream of a gene fragment encoding part of the extracellular region of human CD137. A gene fragment encoding a protein (Table 57) in which part of the extracellular domain of human CD137 and the antibody constant region are linked is included in an animal expression vector. The constructed plasmid vector is introduced into Expi293 cells (Invitrogen) using ExpiFectamine293 (Invitrogen), and the protein of interest is secreted into the culture supernatant. Protein A is used to purify the protein of interest from the culture supernatant.
Таблица 57Table 57
Антигены с частичными последовательностями CD137Antigens with partial CD137 sequences
(8-4-3-2) Подтверждение связывания.(8-4-3-2) Binding confirmation.
Связываются ли полученные антитела с антигенами, имеющими частичную последовательность CD137, оценивают методом ELISA. Сначала различные антигены, полученные в примере 1 или примере 8-4-3-1, иммобилизуют на планшетах для микротитрования Maxisorp 384. После удаления из планшетов несвязавшихся антигенов промыванием каждой лунки промывочным буфером лунки блокируют 50 мкл блокирующего буфера (TBS, содержащего BlockAce) в течение одного часа или более. В каждую из лунок, из которых удален блокирующий буфер, добавляют 10 мкл очищенных антител, приготовленных в концентрации 10 мкг/мл в TBS с конечной концентрацией 500 мкМ L-кинуренина или TBS с конечной концентрацией 500 мкМ кинуренина, и планшет оставляют в покое на один час. АР-конъюгированные антитела против каппа человека (фирма BIOSOURCE), разведенные в TBS с конечной концентрацией 500 мкМ кинуренина, добавляют в каждую лунку после промывания промывочным буфером, содержащим конечную концентрацию кинуренина 500 мкМ (TBS с 0,1% Tween20). После 1 ч инкубации добав- 150 046075 ляют фосфатный субстрат BluePhos (KPL) после промывания промывочным буфером, содержащим 500 мкМ кинуренина. Развитие цвета раствора в каждой лунке измеряют по абсорбции при 620 нм после того, как реакцию проявления цвета раствора в каждой лунке останавливают добавлением стоп-раствора BluePhos. Показан коэффициент абсорбции путем установки значений в лунках с концентрацией антител от 0 до 1 мкг/мл. Судя по связыванию с коэффициентом абсорбции больше или равным 2, предполагают, что оцениваемые клоны включают антитела, которые проявляют отличающиеся связывающие свойства.Whether the resulting antibodies bind to antigens having a partial sequence of CD137 is assessed by ELISA. First, the various antigens obtained in Example 1 or Example 8-4-3-1 are immobilized on Maxisorp 384 microtiter plates. After removing unbound antigens from the plates by washing each well with wash buffer, the wells are blocked with 50 μl of blocking buffer (TBS containing BlockAce) in for one hour or more. To each of the wells from which the blocking buffer has been removed, add 10 μl of purified antibodies prepared at a concentration of 10 μg/ml in TBS with a final concentration of 500 μM L-kynurenine or TBS with a final concentration of 500 μM kynurenine, and the plate is left alone. hour. AP-conjugated anti-human kappa antibodies (BIOSOURCE), diluted in TBS with a final concentration of 500 μM kynurenine, are added to each well after washing with wash buffer containing a final concentration of 500 μM kynurenine (TBS with 0.1% Tween20). After 1 hour of incubation, BluePhos phosphate substrate (KPL) is added after washing with wash buffer containing 500 µM kynurenine. The color development of the solution in each well is measured by absorbance at 620 nm after the color development reaction of the solution in each well is stopped by adding BluePhos stop solution. The absorption coefficient is shown by setting the values in wells with antibody concentrations from 0 to 1 μg/ml. Based on binding with an absorbance coefficient greater than or equal to 2, it is assumed that the clones evaluated include antibodies that exhibit different binding properties.
(8-5) In vitro оценка активности полученных антител Клеточную линию GloResponseTM NF-kBLuc2/4-1BB Jurkat (фирма Promega) используют для измерения активности антител in vitro. В каждую лунку 384-луночных планшетов добавляют 10 мкл клеток FcyRIIB CHO-K1, приготовленных в концентрации 2х106/мл со средой для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Растворы антител с кинуренином или без кинуренина добавляют в каждую лунку по 10 мкл. Затем в каждую лунку добавляли 10 мкл клеточной линии GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat, приготовленной в концентрации 2х106/мл в среде для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Конечная концентрация кинуренина составляет 500 мкМ. Планшеты оставляют на шесть часов при 37°C в инкубаторе в атмосфере 5% CO2, затем выдерживают 15 мин при комнатной температуре и добавляют 30 мкл реагента Bio-Glo в каждую лунку. Для реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат). Впоследствии люминесценцию каждой лунки измеряют с помощью планшет-ридера. Значение люминесценции каждой лунки, деленное на величину люминесценции лунки без добавленного антитела, представляет кратность люминесценции и служит индикатором для оценки активности каждого антитела.(8-5) In vitro assessment of the activity of the resulting antibodies The GloResponseTM NF-kBLuc2/4-1BB Jurkat cell line (Promega) was used to measure the activity of antibodies in vitro. Add 10 μl of FcyRIIB CHO-K1 cells, prepared at a concentration of 2x10 6 /ml with assay medium (99% RPMI, 1% PBS), to each well of 384-well plates. Antibody solutions with or without kynurenine are added to each well in 10 μl. Then, 10 μl of the GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line, prepared at a concentration of 2x10 6 /ml in assay medium (99% RPMI, 1% PBS), was added to each well. The final concentration of kynurenine is 500 µM. The plates are left for six hours at 37°C in a 5% CO 2 incubator, then incubated for 15 minutes at room temperature and 30 μl of Bio-Glo reagent added to each well. For the Bio-Glo reagent, use the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). Subsequently, the luminescence of each well is measured using a plate reader. The luminescence value of each well divided by the luminescence value of the well without added antibody represents the luminescence fold and serves as an indicator for assessing the activity of each antibody.
Полученные результаты показаны на фиг. 57.The results obtained are shown in Fig. 57.
Кратность люминесценции была выше, когда концентрация L-кинуренина составляла 500 мкМ, чем когда она составляла 0 мкМ, что указывает на то, что активность агониста изменялась в зависимости от концентрации или присутствия кинуренина.The luminescence fold was higher when the concentration of L-kynurenine was 500 μM than when it was 0 μM, indicating that agonist activity varied depending on the concentration or presence of kynurenine.
Пример 9. Получение АТФ- и АМФ-зависимых CD137-связывающих антител путем двойного раунда отбора.Example 9. Preparation of ATP- and AMP-dependent CD137-binding antibodies by double round selection.
(9-1) Получение антител, связывающихся с антигенами в присутствии АТФ и АМФ, соответственно, из рационально разработанной библиотеки методом двойного раунда отбора.(9-1) Obtaining antibodies that bind to antigens in the presence of ATP and AMP, respectively, from a rationally designed library by double-round selection.
Получены антитела, которые проявляют связывающую активность с антигеном в присутствии определенной небольшой молекулы, но никогда не сообщалось о получении антител, которые проявляют связывающую активность с антигеном в присутствии множества различных малых молекул. Один из путей решения этой проблему является рассмотрение возможности чередования пэннинга, который меняет небольшую молекулу, используемую для каждого раунда пэннинга, например, АТФ и АМФ. Однако в этом случае существует проблема, заключающаяся в том, что давление отбора применяют в отношении небольшой молекуле в каждом раунде, и, таким образом, давление отбора не может применяться одинаково для обеих небольших молекул одновременно. Для решения этой проблемы был реализован метод двойного раунда отбора. Метод двойного раунда отбора является процедурой, при которой два цикла пэннинга выполняют на одном антигене за один раунд пэннинга (J Mol Biol., 226(3), 1992, 889896). В настоящем изобретении, например, в случае метода фагового дисплея, один раунд относится к этапу выделения фагов из Е. coli для повторного инфицирования Е. coli фагами после пэннинга; а в слуAntibodies have been produced that exhibit antigen binding activity in the presence of a particular small molecule, but antibodies that exhibit antigen binding activity in the presence of a variety of different small molecules have never been reported. One way to address this problem is to consider alternating panning, which changes the small molecule used for each round of panning, such as ATP and AMP. However, in this case, there is a problem that the selection pressure is applied to the small molecule in each round, and thus the selection pressure cannot be applied equally to both small molecules at the same time. To solve this problem, a double round selection method was implemented. The double round selection method is a procedure in which two rounds of panning are performed on the same antigen in one round of panning (J Mol Biol., 226(3), 1992, 889896). In the present invention, for example, in the case of the phage display method, one round refers to the step of isolating phages from E. coli to re-infect E. coli with phages after panning; and in the service
- 151 046075 чае метода рибосомального дисплея один раунд относится к этапу от транскрипции in vitro до амплификации гена с методом ПЦР. Хотя сообщалось о двойном цикле отбора для одного типа антигена, нет сообщений о применении метода для получения антител, зависимых от малых молекул, и, соответственно, нет сообщений о применении метода для получения антител, которые проявляют зависимость от нескольких отдельных разных малых молекул. Модифицируя метод двойного раунда отбора и применяя селективное давление как на АТФ, так и на АМФ в одном цикле, авторы настоящего изобретения полагают, что можно получить антитела, которые проявляют антигенсвязывающую активность АТФ- и АМФ-зависимым образом более эффективно.- 151 046075 In the case of the ribosomal display method, one round refers to the stage from in vitro transcription to gene amplification with the PCR method. Although a double round of selection has been reported for one type of antigen, there are no reports of the method being used to generate antibodies that are dependent on small molecules, and accordingly, there are no reports of using the method to generate antibodies that exhibit dependence on several separate different small molecules. By modifying the double-round selection method and applying selective pressure on both ATP and AMP in a single round, the present inventors believe that it is possible to obtain antibodies that exhibit antigen-binding activity in an ATP- and AMP-dependent manner more efficiently.
Антитела, проявляющие антигенсвязывающую активность в присутствии АТФ и AMP, получают из рационально разработанной библиотеки фагового дисплея антител, созданной в предыдущем патенте WO 2015/083764. Условия пэннинга показаны в табл. 59. Условия 1 и 2 применены к условию обычного пэннинга и вышеуказанному переменному условию пэннинга; в то время как условие 3 применено к вышеупомянутому методу двойного раунда отбора. В настоящем изобретении двойной раунд отбора проведен в раунде 2 и раунде 3. Биотинилированный hCD137-Fc используют в качестве антигена.Antibodies exhibiting antigen binding activity in the presence of ATP and AMP are obtained from a rationally designed antibody phage display library created in the previous patent WO 2015/083764. Panning conditions are shown in Table. 59. Conditions 1 and 2 are applied to the normal panning condition and the above variable panning condition; while condition 3 is applied to the above double round selection method. In the present invention, a double round of selection is carried out in round 2 and round 3. Biotinylated hCD137-Fc is used as the antigen.
В табл. 59 АТФ обозначает пэннинг с использованием АТФ, АМФ обозначает пэннинг с использованием АМФ, обозначение Двойной означает пэннинг с использованием двойного раунда отбора.In table 59 ATP denotes panning using ATP, AMP denotes panning using AMP, and the designation Dual denotes panning using a double round of selection.
Таблица 59Table 59
Фаги получают обычным образом из клеток Е. coli, несущих сконструированную фагмиду фагового дисплея. В частности, штамм Е. coli, несущий сконструированный фагмидный вектор, инфицируют фагами M13KO7TC (WO 2015046554 A1) или Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (гиперфагом) (фирма PROGEN Biotechnik), и фаги выделяют из супернатантов после культивирования в течение ночи при 30°C. Библиотеки фаговых дисплеев антител получают разбавлением TBS, популяции фагов, осажденных добавлением 2,5 М NaCl/10% PEG к культуре Е. coli, в которой производили получение фагов.Phages are produced in the usual manner from E. coli cells carrying an engineered phage display phagemid. Specifically, an E. coli strain carrying the constructed phagemid vector is infected with phages M13KO7TC (WO 2015046554 A1) or Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (hyperphage) (PROGEN Biotechnik), and the phages are isolated from the supernatants after overnight cultivation at 30°C. Phage antibody display libraries are prepared by diluting TBS, a population of phages precipitated by adding 2.5 M NaCl/10% PEG to the E. coli culture from which the phages were produced.
Затем к раствору фаговой библиотеки добавляют БСФ до конечной концентрации 4%. Пэннинг проводят с использованием антигена, иммобилизованного на магнитных гранулах. В качестве магнитных гранул используют гранулы NeutrAvidin (фирма TAMAGAWA SEIKI) или Dynabeads MyOne StreptAvidin T1 (фирма Thermo Fisher Scientific).BSF is then added to the phage library solution to a final concentration of 4%. Panning is carried out using antigen immobilized on magnetic beads. NeutrAvidin beads (TAMAGAWA SEIKI) or Dynabeads MyOne StreptAvidin T1 (Thermo Fisher Scientific) are used as magnetic beads.
В приготовленный раствор фаговой библиотеки добавляют биотинилированный hCD137-Fc и АТФ в конечной концентрации 1 мМ и проводят реакцию при комнатной температуре в течение 60 мин. Блокированные магнитные гранулы добавляют к реакционному раствору фага и антигена, и они реагируют при комнатной температуре в течение 15 мин. Гранулы дважды или трижды промывают буфером TBS/0,1% Tween20, содержащим 1 мМ АТФ, и один или два раза TBS, содержащим 1 мМ АТФ. Гранулы, к которым впоследствии добавляют TBS, суспендируют при комнатной температуре, и раствор фага выделяют из гранул, разделенных с использованием магнитной платформы. После двух повторений этой процедуры элюированный раствор фага перемешивают. К полученному раствору фага добавляют трипсин в конечной концентрацию 1 мг/мл. Восстановленные фаги добавляют к 20 мл штамма Е. coli ER2738 в логарифмической фазе роста (OD600 0,4-0,7). Культуру Е. coli инфицируют фагами путем культивирования Е. coli в течение одного часа при 37°C при перемешивании. Е. coli высевают в чашки размером 225 мм х 225 мм. Е. coli инфицируют M13KO7TC (WO 2015046554 A1) или Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (называемым гиперфагом) (фирма PROGEN Biotechnik) и культивируют в течение ночи при 30°C; фаги выделяют из супернатантов. При условии 1 эту процедуру повторяют три раза. При условии 2, после того, как вышеупомянутая процедура была выполнена один раз, АТФ заменяют на АМФ, и вышеупомянутую процедуру была выполняют снова (раунд 2), а затем вышеупомянутую процедура выполняют заново с АТф (раунд 3).Biotinylated hCD137-Fc and ATP at a final concentration of 1 mM are added to the prepared phage library solution and the reaction is carried out at room temperature for 60 min. The blocked magnetic beads are added to the phage and antigen reaction solution and they react at room temperature for 15 min. The beads are washed two or three times with TBS/0.1% Tween20 buffer containing 1 mM ATP and once or twice with TBS containing 1 mM ATP. The beads to which TBS is subsequently added are suspended at room temperature and the phage solution is recovered from the beads separated using a magnetic platform. After repeating this procedure twice, the eluted phage solution is mixed. Trypsin is added to the resulting phage solution at a final concentration of 1 mg/ml. Reconstituted phages are added to 20 ml of E. coli strain ER2738 in logarithmic growth phase (OD600 0.4-0.7). The E. coli culture is infected with phages by culturing the E. coli for one hour at 37°C with agitation. E. coli is sown in 225 mm x 225 mm dishes. E. coli is infected with M13KO7TC (WO 2015046554 A1) or Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (called hyperphage) (PROGEN Biotechnik) and cultured overnight at 30°C; phages are isolated from supernatants. Under condition 1, this procedure is repeated three times. Under condition 2, after the above procedure was performed once, ATP is replaced with AMP and the above procedure was performed again (round 2), and then the above procedure was performed again with ATP (round 3).
С другой стороны, в соответствии с условием 3, после того, как описанную выше процедуру выполняют один раз, двойной раунд отбора выполняют в раундах 2 и 3. В частности, в приготовленный раствор фаговой библиотеки сначала добавляют биотинилированный hCD137-Fc и AMP в конечной концентрации 1 мМ, и они реагируют при комнатной температуре в течение 60 мин. Блокированные магнитные гранулы добавляют к реакционному раствору фага и антигена, и они реагируют при комнатной температуре в течение 15 мин. Гранулы дважды или трижды промывают буфером TBS/0,1% Tween20, содержащим 1 мМ АМФ, и один или два раза буфер TBS, содержащий 1 мМ АМФ. Гранулы, к которым впоследствии добавляют TBS, суспендируют при комнатной температуре, и раствор фага выделяют из гранул, разделенных с использованием магнитной платформы. После двух повторений этой процедуры элюированный раствор фага перемешивают. Кроме того, в раствор восстановленной фаговой библиотеки затем добавляют биотинилированный hCD137-Fc и АТФ в конечной концентрации 1 мМ, и они реагируют при комнатной температуре в течение 60 мин. Блокированные магнитные гранулы добавляют к реакционному раствору фага и антигена, и они реагируют при комнатной температуре в течение 15 мин.On the other hand, according to condition 3, after the above procedure is performed once, a double round of selection is performed in rounds 2 and 3. Specifically, biotinylated hCD137-Fc and AMP at a final concentration are first added to the prepared phage library solution 1 mM and they react at room temperature for 60 min. The blocked magnetic beads are added to the phage and antigen reaction solution and they react at room temperature for 15 min. The beads are washed two or three times with TBS/0.1% Tween20 buffer containing 1 mM AMP and once or twice with TBS buffer containing 1 mM AMP. The beads to which TBS is subsequently added are suspended at room temperature and the phage solution is recovered from the beads separated using a magnetic platform. After repeating this procedure twice, the eluted phage solution is mixed. In addition, biotinylated hCD137-Fc and ATP at a final concentration of 1 mM were then added to the reconstituted phage library solution and reacted at room temperature for 60 min. The blocked magnetic beads are added to the phage and antigen reaction solution and they react at room temperature for 15 min.
- 152 046075- 152 046075
Гранулы дважды или трижды промывают буфером TBS/0,1% Tween20, содержащим 1 мМ АТФ, и один или два раза TBS, содержащим 1 мМ АТФ. Гранулы, к которым впоследствии добавляют TBS, суспендируют при комнатной температуре, и раствор фага выделяют из гранул, разделенных с использованием магнитной платформы. После двух повторений этой процедуры элюированный раствор фага перемешивают. К полученному раствору фага добавляют трипсин в конечной концентрации 1 мг/мл. Восстановленные фаги добавляют к 20 мл суспензии штамма Е. coli ER2738 в логарифмической фазе роста (OD600 0,4-0,7). Е. coli инфицируют фагами путем культивирования Е. coli в течение одного часа при 37°C при перемешивании. Е. coli высевают в чашки размером 225 мм х 225 мм. Е. coli инфицируют фагами M13KO7TC (WO 2015046554 A1) или Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (называемым гиперфагом) (фирма PROGEN Biotechnik) и культивируют в течение ночи при 30°C; фаги выделяют из супернатантов.The beads are washed two or three times with TBS/0.1% Tween20 buffer containing 1 mM ATP and once or twice with TBS containing 1 mM ATP. The beads to which TBS is subsequently added are suspended at room temperature and the phage solution is recovered from the beads separated using a magnetic platform. After repeating this procedure twice, the eluted phage solution is mixed. Trypsin is added to the resulting phage solution at a final concentration of 1 mg/ml. The recovered phages are added to 20 ml of a suspension of E. coli strain ER2738 in logarithmic growth phase (OD600 0.4-0.7). E. coli is infected with phages by culturing E. coli for one hour at 37°C with agitation. E. coli is sown in 225 mm x 225 mm dishes. E. coli is infected with phages M13KO7TC (WO 2015046554 A1) or Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (called hyperphage) (PROGEN Biotechnik) and cultured overnight at 30°C; phages are isolated from supernatants.
(9-2) Оценка связывающей активности в присутствии и в отсутствие АТФ или АМФ методом фагового ELISA.(9-2) Evaluation of binding activity in the presence and absence of ATP or AMP by phage ELISA.
Из отдельных колоний Е. coli, полученных описанными выше методами, отбирают супернатанты фагосодержащих культур с использованием обычного метода (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (фирма MACHEREY-NAGEL) используют для ультрафильтрации собранного культурального супернатанта. Проток удаляют центрифугированием (4500 g, 45 мин) NucleoFast 96, в который вносят по 100 мкл супернатанта культуры в каждую лунку. NucleoFast 96, в котором по 100 мкл H2O добавляют в каждую лунку, снова промывают центрифугированием (4500 g, 30 мин). В итоге добавляют от по 100 мкл TBS и собирают раствор фага, содержащийся в супернатантах 96-луночных планшетов NucleoFast, которые оставляли стоять при комнатной температуре в течение 5 мин.From individual E. coli colonies obtained by the methods described above, supernatants of phage-containing cultures are collected using the usual method (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (MACHEREY-NAGEL) is used to ultrafiltrate the collected culture supernatant. The duct is removed by centrifugation (4500 g, 45 min) with NucleoFast 96, into which 100 μl of culture supernatant is added to each well. NucleoFast 96, in which 100 μl of H2O is added to each well, is washed again by centrifugation (4500 g, 30 min). Finally, 100 μl of TBS was added and the phage solution contained in the supernatants of 96-well NucleoFast plates, which were left to stand at room temperature for 5 min, was collected.
TBS, 1 мМ АМФ/TBS или 1 мМ АТФ/TBS добавляют к очищенным фагам, которые затем подвергают методу ELISA с помощью процедуры, описанной ниже. 384-луночные микропланшеты, покрытые стрептавидином (greiner, 781990), покрывают в течение ночи 100 мкл TBS, содержащего биотинилированный hCD137-Fc, полученный в примере 1. После удаления несвязавшихся антигенов из планшетов промыванием каждой лунки TBST лунки блокируют 250 мкл 0,4% Block Асе, 1% БСА, 0,02% Tween, 0,05% ProClin 300-TBS в течение одного часа или более. Затем допускают, чтобы фаги, презентирующие антитела, связывались с антигеном, присутствующим в каждой лунке, в отсутствие и в присутствии АТФ или АМФ, выдерживая планшеты с подготовленными очищенными фагами, добавленными в каждую лунку при 37°C в течение одного часа. Каждую лунку промывают TBST, 1 мМ ATP/TBST или 1 мМ AMP/TBST и дополняют HRP-конъюгированным антителом против М13 (фирма Amersham Pharmacia Biotech), разведенным в TBS, 1 мМ АМФ/TBS или 1 мМ АТФ/TBS и инкубируют в течение одного часа. После промывания TBST, 1 мМ АТФ/TBST или 1 мМ АМФ/TBST, окрашивание раствора в каждой лунке, в которую был добавлен единственный раствор ТМВ (фирма ZYMED), останавливают добавлением серной кислоты, а затем проявление окрашивания измеряют по абсорбции при 450 нм.TBS, 1 mM AMP/TBS or 1 mM ATP/TBS are added to the purified phages, which are then subjected to ELISA using the procedure described below. Streptavidin-coated 384-well microplates (Greiner, 781990) are coated overnight with 100 μl of TBS containing biotinylated hCD137-Fc prepared in Example 1. After removing unbound antigens from the plates by washing each well with TBST, the wells are blocked with 250 μl of 0.4% Block Ace, 1% BSA, 0.02% Tween, 0.05% ProClin 300-TBS for one hour or more. Antibody presenting phages are then allowed to bind to the antigen present in each well in the absence and presence of ATP or AMP by incubating the prepared purified phage plates added to each well at 37°C for one hour. Each well is washed with TBST, 1 mM ATP/TBST or 1 mM AMP/TBST and supplemented with HRP-conjugated anti-M13 antibody (Amersham Pharmacia Biotech) diluted in TBS, 1 mM AMP/TBS or 1 mM ATP/TBS and incubated for one hour. After washing with TBST, 1 mM ATP/TBST or 1 mM AMP/TBST, the color of the solution in each well to which a single TMB solution (ZYMED) was added was stopped by adding sulfuric acid, and then the development of color was measured by absorbance at 450 nm.
Результаты фагового ELISA представлены в табл. 60.The results of phage ELISA are presented in table. 60.
В настоящем изобретении клоны с отношением поглощения S/N (сигнал/шум) больше 2 в присутствии АТФ (отношение поглощения в присутствии антигена к поглощению в отсутствие антигена), были оценены как положительные по связыванию, а клоны с коэффициентом поглощения 3 или выше в присутствии/отсутствии АТФ или АМФ были расценены как клоны с антигенсвязывающей активностью, зависящей от АТФ или АМФ (переключаемые клоны). В результате для hCD137-Fc большинство клонов, полученных по условию 1, показывают связывание в присутствии АТФ, но не показывают связывания в присутствии АМФ. Среди клонов, которые проявляют связывание в присутствии АТФ и в отсутствие связывания в отсутствие АТФ, полученных по условию 2, есть несколько антител, которые показывают связывание даже в присутствии АМФ, но процентное соотношение равно 50% или менее. С другой стороны, по условию 3, согласно которому проведен двойной отбор, 65% или более клонов, показывающих связывание в присутствии АТФ и отсутствие связывания в отсутствие АТФ, способны проявлять связывание даже в присутствии АМФ.In the present invention, clones with an absorbance ratio S/N (signal to noise) greater than 2 in the presence of ATP (the ratio of absorbance in the presence of antigen to absorbance in the absence of antigen) were scored as positive for binding, and clones with an absorbance ratio of 3 or higher in the presence of /absence of ATP or AMP were regarded as clones with antigen binding activity dependent on ATP or AMP (switched clones). As a result, for hCD137-Fc, most clones obtained under condition 1 show binding in the presence of ATP, but do not show binding in the presence of AMP. Among the clones that show binding in the presence of ATP and in the absence of binding in the absence of ATP obtained under condition 2, there are several antibodies that show binding even in the presence of AMP, but the percentage is 50% or less. On the other hand, under condition 3, which is a double selection, 65% or more of the clones that show binding in the presence of ATP and no binding in the absence of ATP are able to show binding even in the presence of AMP.
Для полученных клонов амплифицированные гены тяжелой цепи секвенируют с использованием специфических праймеров pBAD-F и G1seq-R.For the resulting clones, the amplified heavy chain genes were sequenced using the specific primers pBAD-F and G1seq-R.
В результате при условии 3, при котором выполняют двойной раунд отбора, полученные последовательности тяжелой цепи антитела, показывающие связывание CD137 человека, зависящее как от АТФ, так и от АМФ, которое в 3 раза больше, чем при условии 1, и которое выполняли только с АТФ, и примерно в 1,5 раза раз больше, чем при условии 2, при котором поочередно используют АТФ и АМФ. Это указывает на то обстоятельство, что двойной круговой отбор является более ценным подходом к получению антител, которые проявляют антигенсвязывающую активность, зависящую от множества отдельных небольших молекул.As a result, condition 3, in which a double round of selection was performed, produced antibody heavy chain sequences showing both ATP- and AMP-dependent human CD137 binding that was 3 times greater than condition 1, which was performed with only ATP, and about 1.5 times more than condition 2, in which ATP and AMP are used alternately. This indicates that double round-robin selection is a more valuable approach to obtaining antibodies that exhibit antigen-binding activity dependent on multiple individual small molecules.
- 153 046075- 153 046075
Таблица 60Table 60
Пример 10. Получение АТФ-зависимых антител против CTLA4 мыши из наивной библиотеки.Example 10. Preparation of ATP-dependent antibodies against mouse CTLA4 from a naive library.
(10-1) Получение антител, которые связываются с CTLA4 мыши в присутствии малых молекул, из библиотеки наивных антител человека с помощью пэннинга на гранулах.(10-1) Generate antibodies that bind to mouse CTLA4 in the presence of small molecules from a naïve human antibody library using bead panning.
Библиотека фагового дисплея антител человека, состоящая из множества фагов, презентирующих домены Fab различных последовательностей антител человека, была сконструирована в соответствии с методами, известными специалистам в данной области, с использованием поли(А) РНК, полученной из МКПК человека, коммерчески доступной поли(А) человека РНК, или такой как матрица.A human antibody phage display library, consisting of a variety of phages presenting the Fab domains of various human antibody sequences, was constructed according to methods known to those skilled in the art using poly(A) RNA derived from human PBMCs, commercially available poly(A) ) human RNA, or such as a template.
Из созданной библиотеки фагового дисплея наивных антител человека проводят скрининг антител, проявляющих связывающую активность с внеклеточным доменом CTLA4 мыши (mCTLA4) в присутствии малых молекул. То есть собирают фаги, презентирующие антитела, которые проявляют связывающую активность с mCTLA4, захваченными гранулами, в присутствии малых молекул. Фаги выделяют из фаговых элюатов, элюированных с гранул, в отсутствие малых молекул. Биотинилированный mCTLA4 (mCTLA4-His-Biotin) в этом методе используют в качестве антигена. Получают mCTLA4-His-Biotin путем биотинилирования (фирма PIERCE, номер в каталоге 21329) mCTLA4-His (фирма Sino Biologics Inc. 50503-M08H, номер в каталоге NP_033973.2) методом соединения через амин, которое осуществляют слиянием His-метки с внеклеточным доменом mCTLA4.From the generated naïve human antibody phage display library, antibodies exhibiting binding activity to the extracellular domain of mouse CTLA4 (mCTLA4) in the presence of small molecules are screened. That is, phages are collected that present antibodies that exhibit binding activity to mCTLA4 captured beads in the presence of small molecules. Phages are isolated from phage bead-eluted phages in the absence of small molecules. Biotinylated mCTLA4 (mCTLA4-His-Biotin) is used as the antigen in this method. mCTLA4-His-Biotin is obtained by biotinylation (PIERCE, catalog number 21329) mCTLA4-His (Sino Biologics Inc. 50503-M08H, catalog number NP_033973.2) by the amine coupling method, which is carried out by fusion of the His tag with the extracellular mCTLA4 domain.
Фаги, полученные из клеток Е. coli, несущих сконструированные фагмиды фагового дисплея, очищают известными методами. Затем раствор фаговой библиотеки получают диализом против TBS. Проводят пэннинг с иммобилизованным на магнитных гранулах антигеном. В качестве магнитных гранул используют гранулы, покрытые нейтравидином (Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin) или гранулы, покрытые стрептавидином (Dynabeads M-280 Streptavidin).Phages obtained from E. coli cells carrying engineered phage display phagemids are purified by known methods. The phage library solution is then dialyzed against TBS. Panning is carried out with antigen immobilized on magnetic beads. The magnetic beads used are neutravidin-coated beads (Sera-Mag SpeedBeads NeutrAvidin) or streptavidin-coated beads (Dynabeads M-280 Streptavidin).
Для эффективного получения переключаемых низкомолекулярными соединениями антител, которые зависят от малой молекулы, способной играть переключающую роль в раковых тканях, пэннинг для обогащения антител, которые связываются с антигенами в присутствии аденозинтрифосфата (аденозин5'-трифосфат; АТФ) и метаболитами АТФ, которые не связывают антигены в отсутствие АТФ, выполняют со ссылкой на методы, описанные в предыдущем патенте WO 2013/180200.To efficiently produce small molecule switching antibodies that depend on a small molecule capable of playing a switching role in cancer tissues, panning to enrich antibodies that bind antigens in the presence of adenosine triphosphate (adenosine 5'-triphosphate; ATP) and ATP metabolites that do not bind antigens in the absence of ATP, is carried out with reference to the methods described in the previous patent WO 2013/180200.
В частности, в приготовленный раствор фаговой библиотеки добавляют биотинилированный mCTLA4 и АТФ, а также метаболиты АТФ, в конечной концентрации 1 мМ для осуществления реакции при комнатной температуре в течение 60 мин. Блокированные магнитные гранулы добавляют к реакционному раствору фага и антигена, и они реагируют при комнатной температуре в течение 15 мин. Гранулы дважды или трижды промывают буфером TBS/0,1% Tween20, содержащим 1 мМ АТФ, и один или два раза TBS, содержащим 1 мМ АТФ. Гранулы, к которым впоследствии добавляют TBS, суспендируют при комнатной температуре, и раствор фага выделяют из гранул, разделенных с использованием магнитной платформы. Затем к гранулам добавляют трипсин в конечной концентрации 1 мг/мл в 1-м раунде и TBS во 2-м раунде и далее, и их суспендируют при комнатной температуре; растворы фагов извлекают из гранул, разделенных с помощью магнитной платформы. Если используют TBS, эту процедуру повторяют дважды, после чего перемешивают элюированный раствор фага и добавляют к полученному раствору фага трипсин в конечной концентрации 1 мг/мл. Извлеченные фаги добавляют к 10 мл штамма Е. coli ER2738 в логарифмической фазе роста (OD600 0,4-0,7). Е. coli инфицируют фагами путем культивирования Е. coli в течение одного часа при 37°C при перемешивании. Е. coli высевают в чашки размером 225 мм х 225 мм. Е. coli инфицируют M13KO7TC (WO 2015046554 A1) или Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (называемым гиперфагом) (фирма PROGEN Biotechnik) и культивируют в течение ночи при 30°C; фаги выделяют из супернатантов. Во время культивирования для индукции экспрессии генов Fab с промотора lac используют условие добавления 100 мкМ IPTG и условие отсутствия добавления IPTG. Эту процедуру повторяют четыре раза.In particular, biotinylated mCTLA4 and ATP, as well as ATP metabolites, are added to the prepared phage library solution at a final concentration of 1 mM to carry out the reaction at room temperature for 60 min. The blocked magnetic beads are added to the phage and antigen reaction solution and they react at room temperature for 15 min. The beads are washed two or three times with TBS/0.1% Tween20 buffer containing 1 mM ATP and once or twice with TBS containing 1 mM ATP. The beads to which TBS is subsequently added are suspended at room temperature and the phage solution is recovered from the beads separated using a magnetic platform. Trypsin is then added to the beads at a final concentration of 1 mg/ml in round 1 and TBS in round 2 onwards and suspended at room temperature; phage solutions are recovered from beads separated using a magnetic platform. If TBS is used, this procedure is repeated twice, after which the eluted phage solution is mixed and trypsin is added to the resulting phage solution at a final concentration of 1 mg/ml. The extracted phages are added to 10 ml of E. coli strain ER2738 in logarithmic growth phase (OD600 0.4-0.7). E. coli is infected with phages by culturing E. coli for one hour at 37°C with agitation. E. coli is sown in 225 mm x 225 mm dishes. E. coli is infected with M13KO7TC (WO 2015046554 A1) or Μ13ΚΟ7ΔρΙΙΙ (called hyperphage) (PROGEN Biotechnik) and cultured overnight at 30°C; phages are isolated from supernatants. During cultivation, a 100 μM IPTG addition condition and a no IPTG addition condition were used to induce the expression of Fab genes from the lac promoter. This procedure is repeated four times.
(10-2) Оценка связывающей активности в присутствии и в отсутствие малых молекул методом фагового иммуноферментного анализа (ELISA).(10-2) Assessment of binding activity in the presence and absence of small molecules by phage enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA).
- 154 046075- 154 046075
Из отдельных колоний Е. coli, полученных в примере 10-1, отбирают супернатанты фагосодержащих культур с использованием обычного метода (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (фирма MACHEREY-NAGEL) используют для ультрафильтрации собранных культуральных супернатантов. По 100 мкл каждого культурального супернатанта вносят в каждую лунку планшета NucleoFast 96 и центрифугируют в режиме 4500 g в течение 45 мин для удаления протока. По 100 мкл H2O добавляют в каждую лунку, снова промывают центрифугированием (4500 g, 30 мин). В итоге добавляют по 100 мкл TBS и оставляют при комнатной температуре в течение 5 мин, затем выделяют раствор фага из супернатантов.Phage culture supernatants were collected from individual E. coli colonies obtained in Example 10-1 using the conventional method (Methods Mol. Biol., 178, 2002, 133-145). NucleoFast 96 (MACHEREY-NAGEL) is used to ultrafiltrate the collected culture supernatants. 100 μl of each culture supernatant is added to each well of a NucleoFast 96 plate and centrifuged at 4500 g for 45 min to remove the duct. 100 µl of H2O is added to each well and washed again by centrifugation (4500 g, 30 min). Finally, 100 μl of TBS is added and left at room temperature for 5 minutes, then the phage solution is isolated from the supernatants.
TBS добавляют к очищенным фагам, которые затем подвергают анализу методом ELISA с помощью процедуры, описанной ниже. Планшеты для микротитрования StreptaWell 96 (фирма Roche) покрывают в течение ночи 100 мкл TBS, содержащего mCTLA4-His-Biotin. После удаления несвязанного mCTLA4-His- Biotin из планшетов промыванием каждой лунки TBST, лунки блокируют 250 мкл 2% обезжиренного молока-TBS в течение более чем одного часа. Затем допускают связывание антителопрезентирующих фагов с mCTLA4-His-Biotin, присутствующим в каждой лунке в отсутствие и в присутствии АТФ, путем удаления 2% обезжиренного молока-TBS с последующим хранением планшетов с подготовленными очищенными фагами, добавленными в каждую лунку, при комнатной температуре в течение одного часа. Каждую лунку промывают TBST или ATP/TBST и дополняют HRPконъюгированным антителом против М13 (фирма Amersham Pharmacia Biotech), разведенным в TBS или ATP/TBS, и инкубируют в течение одного часа. После промывания TBST или ATP/TBST развитие окраски раствора в каждой лунке, в которую был добавлен отдельный раствор ТМВ (фирма ZYMED), остановлено добавлением серной кислоты, а затем проявление цвета измеряют по абсорбции при 450 нм. В результате подтверждают, что несколько антител связываются с mCTLA4 только в присутствии АТФ.TBS is added to purified phages, which are then subjected to ELISA analysis using the procedure described below. StreptaWell 96 microtiter plates (Roche) are coated overnight with 100 μl of TBS containing mCTLA4-His-Biotin. After removing unbound mCTLA4-His-Biotin from the plates by washing each well with TBST, the wells are blocked with 250 μl of 2% skim milk-TBS for over one hour. Antibody-presenting phages are then allowed to bind to the mCTLA4-His-Biotin present in each well in the absence and presence of ATP by removing 2% skim milk-TBS, followed by storing the prepared purified phage plates added to each well at room temperature for one hour. Each well is washed with TBST or ATP/TBST and supplemented with HRP-conjugated anti-M13 antibody (Amersham Pharmacia Biotech) diluted in TBS or ATP/TBS and incubated for one hour. After washing with TBST or ATP/TBST, the color development of the solution in each well to which a separate TMB solution (ZYMED) was added was stopped by adding sulfuric acid, and then the color development was measured by absorbance at 450 nm. The results confirm that several antibodies bind to mCTLA4 only in the presence of ATP.
Результаты анализа методом фагового ELISA представлены в табл. 61.The results of the analysis using the phage ELISA method are presented in table. 61.
В настоящем изобретении клоны с абсорбцией более 0,2 в присутствии АТФ признают положительными, а клоны с абсорбцией более 2 в присутствии /в отсутствие АТФ оценивают как клоны с АТФзависимой антигенсвязывающей активностью (переключаемые клоны).In the present invention, clones with absorbance greater than 0.2 in the presence of ATP are considered positive, and clones with absorbance greater than 2 in the presence/absence of ATP are assessed as clones with ATP-dependent antigen-binding activity (switched clones).
Т аблица 61Table 61
Вышеупомянутое изобретение подробно описано с примерами и иллюстрациями в целях содействия ясному пониманию, и приведенное описание и иллюстрации не следует истолковывать как ограничивающие объем настоящего изобретения. Сущность всех патентов и научной литературы, цитируемых в настоящем изобретении, включена в него в виде ссылок.The above invention has been described in detail with examples and illustrations in order to facilitate a clear understanding, and the above description and illustrations should not be construed as limiting the scope of the present invention. The substance of all patents and scientific literature cited in the present invention is incorporated herein by reference.
Пример 11. Оценка in vitro АТФ- и АДФ-зависимой CD137 агонистической активности модифицированных антител против CD137 человека с использованием анализа репортерного гена 4-1ВВ Jurkat.Example 11. In vitro assessment of ATP- and ADP-dependent CD137 agonist activity of modified anti-human CD137 antibodies using the 4-1BB Jurkat reporter gene assay.
GloResponse™ NF-кВ Luc2/4-1BB Jurkat линию клеток (фирма Promega, CS196004) используют для применения in vitro активности вариантов, полученных в примере 7-2 (табл. 52). В каждую лунку 384луночных планшетов добавляют по 10 мкл каждой из клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), приготовленных в концентрации 4х105/мл в среде для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Затем в каждую лунку добавляют 10 мкл раствора антитела, содержащего АДФ, или раствора антитела, содержащего АТФ, или раствора антитела без АТФ или без АДФ. Затем в каждую лунку добавляют 10 мкл клеточной линии GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat, приготовленной в концентрации 2х106/мл в среде для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Конечная концентрация АДФ составляет 10 мкМ, конечная концентрация АТФ составляет 10 мкМ. Планшеты оставляют на 6 ч при 37°C в инкубаторе с 5% CO2 и 15 мин при комнатной температуре; 30 мкл реагента Bio-Glo добавляют в каждую лунку. Для реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат). Затем количество люминесценции в каждой лунке измеряют с помощью планшет-ридера. Величину люминесценции каждой лунки, деленную на величину люминесценции лунки без добавления антитела, определяют как относительную световую единицу (кратная индукция), которая служит индикатором оценки агонистической активности в отношении CD137 каждого антитела.The GloResponse™ NF-κB Luc2/4-1BB Jurkat cell line (Promega, CS196004) was used to apply the in vitro activity of the variants obtained in Example 7-2 (Table 52). Add 10 μl of each FcyRIIB CHO-K1 cell (Promega) prepared at a concentration of 4x105/ml in assay medium (99% RPMI, 1% PBS) to each well of 384-well plates. Then, 10 μl of an antibody solution containing ADP, or an antibody solution containing ATP, or an antibody solution without ATP or without ADP, is added to each well. Then 10 μl of the GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line, prepared at a concentration of 2x10 6 /ml in assay medium (99% RPMI, 1% PBS), is added to each well. The final concentration of ADP is 10 µM, the final concentration of ATP is 10 µM. The plates are left for 6 hours at 37°C in a 5% CO2 incubator and 15 minutes at room temperature; 30 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. For the Bio-Glo reagent, use the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The amount of luminescence in each well is then measured using a plate reader. The luminescence value of each well divided by the luminescence value of the well without the addition of antibody is determined as the relative light unit (fold induction), which serves as an indicator for assessing the CD137 agonistic activity of each antibody.
Результаты представлены на фиг. 58. На фиг. 58 приводят подтверждение, что A375-P587/B167-LamLib, A551-P587/B256-LamLib, A551-P587/B379-LamLib, A375-SCF041aPh/B167-LamLib, A551-SCF041aPh/B256LamLib, A551-SCF041aPh/B379-LamLib, A375-SCF043aPh/B167-LamLib, A551-SCF043aPh/B256-LamLib, A551-SCF043aPh/B379-LamLib, A375-SCF057aPh/B167-LamLib, A551-SCF057aPh/B256-LamLib и A551SCF057aPh/B379-LamLib проявляют агонистическую активность в отношении CD137 человека АТФ- и АДФThe results are presented in Fig. 58. In FIG. 58 provide confirmation that A375-P587/B167-LamLib, A551-P587/B256-LamLib, A551-P587/B379-LamLib, A375-SCF041aPh/B167-LamLib, A551-SCF041aPh/B256LamLib, A551-SCF041 aPh/B379-LamLib , A375-SCF043aPh/B167-LamLib, A551-SCF043aPh/B256-LamLib, A551-SCF043aPh/B379-LamLib, A375-SCF057aPh/B167-LamLib, A551-SCF057aPh/B256-LamLib and A5 51SCF057aPh/B379-LamLib exhibit agonistic activity in against human CD137 ATP- and ADP
- 155 046075 зависимым образом.- 155 046075 in a dependent manner.
Пример 12. Измерение уровня внеклеточного АТФ в участках опухоли.Example 12 Measurement of extracellular ATP levels at tumor sites.
Антитело, переключаемое АТФ, связывается с молекулой-мишенью в присутствии АТФ и проявляет лекарственную эффективность. Оценку внеклеточного уровня АТФ в участках опухолевой ткани проводят с использованием клеток P2Y11 split Luc/HEK293. Клетки получают с применением ProbeX с использованием технологии компании сплит-люциферазы. Клетки экспрессируют С-концевой белок люциферазы, связанный с пуринергическим рецептором P2Y11 (номер доступа AF030335) с АТФ в качестве лиганда, и N-концевой белок люциферазы, связанный с изоформой в-аррестина-2 (номер доступа NM_004313). Активную люциферазу вырабатывают путем объединения двух фрагментов люциферазы, которые отдельно присутствуют в клетках, путем стимуляции АТФ, и может быть получена люминесценция с использованием люциферина в качестве субстрата.An ATP-switched antibody binds to a target molecule in the presence of ATP and exhibits drug efficacy. The assessment of extracellular ATP levels in areas of tumor tissue is carried out using P2Y11 split Luc/HEK293 cells. Cells are produced using ProbeX using the company's split-luciferase technology. The cells express C-terminal luciferase protein associated with the purinergic receptor P2Y11 (accession number AF030335) with ATP as a ligand, and N-terminal luciferase protein associated with β-arrestin-2 isoform (accession number NM_004313). Active luciferase is produced by combining two luciferase fragments that are separately present in cells by stimulation with ATP, and luminescence can be produced using luciferin as a substrate.
(12-1) Чувствительность к АТФ расщепленных P2Y11 клеток Luc/HEK293.(12-1) ATP sensitivity of P2Y11-cleaved Luc/HEK293 cells.
Клетки P2Y11 split Luc/HEK293 культивируют и поддерживают в среде Игла, модифицированной Дульбекко (Dulbecco's Modified Eagle's Medium с высоким содержанием глюкозы: D5796/Sigma-Aldrich), содержащей 10% фетальной сыворотки теленка, 0,8 мг/мл G418 (Geneticin™) и 0,05 мг/мл флеомицина D1 (Zeocin™) для пассажей. Клетки P2Y11 split Luc/HEK293 помещают в 96-луночный микропланшет ^CLEAR™, WHITE, CELLSTAR™/фирма Greiner Bio-One) в количестве 30000 клеток/лунку, культивируют в течение ночи и затем раствор культуры забирают из каждой лунки и заменяют 0,18 мл раствора культуры, содержащего 0,5 мг/мл люциферина (VivoGlo™ Luciferin, In Vivo Grade/фирма Promega). Для достижения конечных концентраций 0, 0,125, 0,25, 0,5, 1,0 и 2,0 мМ добавляют 0,02 мл раствора аденозина, АМФ, АДФ или АТФ и измеряют значения люминесценции на планшет-ридере EnVision (фирма Perkin Elmer) после 30 мин инкубации в инкубаторе с CO2 (37°C, в атмосфере 5% CO2).P2Y11 split Luc/HEK293 cells were cultured and maintained in Dulbecco's Modified Eagle's Medium high glucose: D5796/Sigma-Aldrich containing 10% fetal calf serum, 0.8 mg/ml G418 (Geneticin™) and 0.05 mg/ml phleomycin D1 (Zeocin™) for passages. P2Y11 split Luc/HEK293 cells are plated in a 96-well microplate (CLEAR™, WHITE, CELLSTAR™/Greiner Bio-One) at 30,000 cells/well, cultured overnight and then the culture solution is withdrawn from each well and replaced with 0. 18 ml of culture solution containing 0.5 mg/ml luciferin (VivoGlo™ Luciferin, In Vivo Grade/Promega). To achieve final concentrations of 0, 0.125, 0.25, 0.5, 1.0 and 2.0 mM, add 0.02 ml of adenosine, AMP, ADP or ATP solution and measure luminescence values on an EnVision plate reader (Perkin Elmer ) after 30 min of incubation in a CO 2 incubator (37°C, 5% CO 2 atmosphere).
Результаты показаны на фиг. 59. Клетки P2Y11 split Luc/HEK293 увеличивают свою люминесценцию АТФ-специфическим образом в зависимости от концентрации лиганда.The results are shown in Fig. 59. P2Y11 split Luc/HEK293 cells increase their luminescence in an ATP-specific manner depending on the ligand concentration.
(12-2) Оценка концентрации внеклеточного АТФ в участках опухолевой ткани.(12-2) Assessment of the concentration of extracellular ATP in areas of tumor tissue.
Клетки P2Y11 split Luc/HEK293 отделяют от культуральных колб с помощью буфера для диссоциации клеток, не содержащего ферментов, и ФСБ (фирма Thermo Fisher Scientific), промывают HBSS и затем получают суспензию клеток в HBSS, которую используют для измерения уровня внеклеточного АТФ in vivo.P2Y11 split Luc/HEK293 cells were separated from culture flasks using enzyme-free cell dissociation buffer and PBS (Thermo Fisher Scientific), washed with HBSS, and then a cell suspension in HBSS was prepared, which was used to measure extracellular ATP levels in vivo.
(12-2-1) Получение калибровочной кривой АТФ in vivo.(12-2-1) Establishment of an in vivo ATP calibration curve.
0,2 мл суспензии клеток, содержащей фиксированную концентрацию АТФ, 1 мг/мл люциферина (VivoGlo, фирма Promega) и 1,0x107 клеток/мл (клеток P2Y11 split Luc/HEK293), трансплантируют подкожно в вентральную область мышей C3H/HeN, и через 20 мин измеряют люминесцентную визуализацию под анестезией изофлураном с помощью устройства визуализации in vivo IVIS Spectrum СТ. Полученные изображения проанализированы с помощью программного обеспечения Living Image Software, и выстраивают калибровочную кривую АТФ в условиях измерения in vivo на основе рассчитанных значений люминесценции и концентраций добавленного АТФ.0.2 ml of cell suspension containing a fixed concentration of ATP, 1 mg/ml luciferin (VivoGlo, Promega) and 1.0 x 107 cells/ml (P2Y11 split Luc/HEK293 cells) is transplanted subcutaneously into the ventral region of C3H/HeN mice, and after 20 min, fluorescence imaging is measured under isoflurane anesthesia using an IVIS Spectrum CT in vivo imaging device. The resulting images were analyzed using Living Image Software, and an ATP calibration curve was generated under in vivo measurement conditions based on the calculated luminescence values and added ATP concentrations.
На фиг. 60 показаны результаты. Клетки P2Y11 split Luc/HEK293 обладают люминесценцией, зависящей от концентрации АТФ, даже в условиях in vivo при подкожной трансплантации мышам C3H/HeN; эти результаты можно преобразовать в калибровочную кривую для оценки уровней АТФ in vivo.In fig. Figure 60 shows the results. P2Y11 split Luc/HEK293 cells exhibit ATP concentration-dependent luminescence even in vivo when transplanted subcutaneously into C3H/HeN mice; these results can be converted into a calibration curve to estimate in vivo ATP levels.
(12-2-2) Оценка уровня внеклеточного АТФ в участках опухолевой ткани 0,2 мл суспензии клеток, содержащей 1 мг/мл люциферина (VivoGlo, фирма Promega) и 1,0x107 клеток/мл (клеток P2Y11 split Luc/HEK293), трансплантируют подкожно в участок опухоли мышей с опухолью FM3A (объем опухоли 200-300 мм3) и измеряют люминесцентную визуализацию через 20 мин под анестезией изофлураном с помощью устройства визуализации in vivo IVIS Spectrum СТ. Полученные изображения анализируют с помощью программного обеспечения Living Image Software, уровень АТФ рассчитывают по величине люминесценции участка опухоли с использованием калибровочной кривой АТФ, полученной in vivo, который рассматривают как уровень внеклеточного АТФ в участке опухоли.(12-2-2) Assessment of the level of extracellular ATP in areas of tumor tissue of 0.2 ml of cell suspension containing 1 mg/ml luciferin (VivoGlo, Promega) and 1.0x107 cells/ml (P2Y11 split Luc/HEK293 cells), transplanted subcutaneously into the tumor site of FM3A tumor-bearing mice (tumor volume 200-300 mm 3 ) and fluorescence imaging measured after 20 min under isoflurane anesthesia using an IVIS Spectrum CT in vivo imaging device. The resulting images are analyzed using Living Image Software, and the ATP level is calculated from the luminescence value of the tumor site using an in vivo ATP calibration curve, which is considered as the extracellular ATP level in the tumor site.
Результаты измерения люминесцентной визуализации показаны на фиг. 61, а уровни внеклеточного АТФ на участке опухоли, рассчитанные по калибровочной кривой АТФ, показаны в табл. 62. Уровень люминесценции на участке ткани опухоли (мышь с опухолью FM3A) выше, чем на фоне (нормальный участок), и уровень внеклеточного АТФ на участке опухолевой ткани в модели трансплантации FM3A рассчитывают как среднее значение 1,31 мМ на подготовленной in vivo калибровочной кривой АТФ.The results of the luminescence imaging measurements are shown in FIG. 61, and the levels of extracellular ATP at the tumor site, calculated from the ATP calibration curve, are shown in Table. 62. The level of luminescence in the tumor tissue area (mouse with FM3A tumor) is higher than in the background (normal area), and the level of extracellular ATP in the tumor tissue area in the FM3A transplantation model is calculated as the average value of 1.31 mM on the prepared in vivo calibration curve ATP.
Таблица 62Table 62
Пример 13. АТФ-зависимая противоопухолевая активность анти-hIL6R антител, обладающих АТФзависимыми связывающими свойствами.Example 13. ATP-dependent antitumor activity of anti-hIL6R antibodies with ATP-dependent binding properties.
(13-1) Получение анти-hIL6R антител, имеющих АТФ-зависимые связывающие свойства.(13-1) Production of anti-hIL6R antibodies having ATP-dependent binding properties.
Ссылаясь на методы, описанные в WO 2015/083764 и WO 2013/180200, полученные антитела оптиReferring to the methods described in WO 2015/083764 and WO 2013/180200, the resulting antibodies were
- 156 046075 мизируют для получения антител против рецептора интерлейкина 6 человека (hIL6R), обладающих АТФзависимыми связывающими свойствами. Тяжелые цепи и легкие цепи объединяют, как показано в табл. 63, для экспрессии и очистки антител против hIL6R методом, известным специалистам в данной области.- 156 046075 are modified to produce antibodies against human interleukin 6 receptor (hIL6R), which have ATP-dependent binding properties. Heavy chains and light chains are combined as shown in Table. 63, for the expression and purification of anti-hIL6R antibodies by a method known to those skilled in the art.
Таблица 63Table 63
Комбинации тяжелых цепей и легких цепей антителCombinations of heavy chains and light chains of antibodies
hIL6R (SEQ ID NO: 200) синтезируют генетически в качестве антигена и инсертируют в плазмиду для экспрессии в животных, затем его вводят в клетки СНО, и, таким образом, в результате клонирования получают стабильную линию экспрессии (hIL6R-CHO), которая конститутивно экспрессирует антиген. Антигенный белок экспрессируют и очищают с использованием описанных ниже методов. Линию клеток hIL6R-CHO суспендируют при подходящей плотности клеток, высевают и культивируют в колбах, а антиген очищали из супернатанта культуры способом, известным специалистам в данной области. Спектрофотометры используют для измерения абсорбции очищенного раствора антигена при 280 нм. Концентрации очищенного антигена рассчитывают по полученным значениям измерений с использованием коэффициентов абсорбции, рассчитанных методом РАСЕ (Protein Science 4, 1995, 2411-2423).hIL6R (SEQ ID NO: 200) is genetically synthesized as an antigen and inserted into a plasmid for expression in animals, then it is introduced into CHO cells, and thus, as a result of cloning, a stable expression line (hIL6R-CHO) is obtained that constitutively expresses antigen. The antigenic protein is expressed and purified using the methods described below. The hIL6R-CHO cell line is suspended at an appropriate cell density, seeded and cultured in flasks, and the antigen is purified from the culture supernatant in a manner known to those skilled in the art. Spectrophotometers are used to measure the absorbance of a purified antigen solution at 280 nm. Purified antigen concentrations are calculated from the measured values using absorption coefficients calculated by the PACE method (Protein Science 4, 1995, 2411-2423).
(13-2) Расчет зависимых от концентрации АТФ значений KD антител против hIL6R.(13-2) Calculation of ATP concentration-dependent KD values of anti-hIL6R antibodies.
Анализ аффинности для hIL6R в присутствии каждой из концентраций АТФ 0, 1, 10 и 100 мкМ проводят с помощью Biacore T200 с использованием антител, описанных в табл. 63. Измерения проводят при скорости потока 10 мкл/мин, время взаимодействия 1 мин, время диссоциации 1 мин и кинетика одного цикла при 37°C. Используют буфер 20 мМ ACES, 150 мМ NaCl, 2 мМ MgCl2 и 0,05% Tween20, рН 7,4, содержащие различные концентрации (0, 1, 10 и 100 мкМ) АТФ. Дополнительное программное обеспечение Biacore Evaluation Software от Biacore T200 используют для анализа, а модель связывания Ленгмюра 1:1 используют для модели соразмерности. Результаты анализа представлены в табл. 64 и на фиг. 62.Affinity analysis for hIL6R in the presence of each of the ATP concentrations of 0, 1, 10 and 100 μM was carried out using Biacore T200 using the antibodies described in table. 63. Measurements are carried out at a flow rate of 10 µl/min, reaction time 1 min, dissociation time 1 min and one cycle kinetics at 37°C. A buffer of 20 mM ACES, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl 2 and 0.05% Tween20, pH 7.4, containing various concentrations (0, 1, 10 and 100 μM) of ATP was used. The optional Biacore Evaluation Software from Biacore T200 is used for analysis and the 1:1 Langmuir binding model is used for the proportionality model. The results of the analysis are presented in table. 64 and in FIG. 62.
Таблица 64Table 64
Расчет величин KD (M) анти-hIL6R антител, зависящих от концентрации АТФ (М)Calculation of KD (M) values of anti-hIL6R antibodies depending on the ATP concentration (M)
* Образцы с комментарием кинетические константы не могут быть однозначно определены в анализе Biacore и расценены как отклоненные, а результаты показаны как нет данных.*Samples with commented kinetic constants cannot be clearly determined in the Biacore assay and are considered rejected and the results are shown as no data.
Результаты показывают, что KD для hIL6R MRAH-G4T1/MRAL-k0 не зависит от концентрации АТФ в анализе, но KD для hIL6R H0002-G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1 и Н0052G4T1/L1083-lam1 становится меньше при более высокой концентрацией АТФ в анализе. То есть, чем выше концентрация АТФ в анализе, тем сильнее становится связывающая активность. Результаты подтверждают, что H0002-G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1 hH0052-G4T1 /L1083-lam1 обладают АТФ-зависимой hIL6R-связывающей активностью.The results show that the KD for hIL6R MRAH-G4T1/MRAL-k0 is independent of the ATP concentration in the assay, but the KD for hIL6R H0002-G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1 and H0052G4T1/L1083-lam1 becomes smaller with higher concentration of ATP in the assay. That is, the higher the concentration of ATP in the assay, the stronger the binding activity becomes. The results confirm that H0002-G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1 hH0052-G4T1/L1083-lam1 have ATP-dependent hIL6R-binding activity.
В дальнейшем антитело, антигенсвязывающая активность которого не зависит от концентрации АТФ, такое как MRAH-G4T1/MRAL-k0, может называться непереключаемым антителом, а антитело, антигенсвязывающая активность которого зависит от концентрации АТФ, такое как H0002-G4T1/L1058lam1, H0041-G4T1/L1088-lam1 и H0052-G4T1/L1083-lam1, может быть обозначена как переключаемое антитело.In the following, an antibody whose antigen-binding activity does not depend on the ATP concentration, such as MRAH-G4T1/MRAL-k0, can be called a non-switchable antibody, and an antibody whose antigen-binding activity depends on the ATP concentration, such as H0002-G4T1/L1058lam1, H0041-G4T1 /L1088-lam1 and H0052-G4T1/L1083-lam1, can be designated as switchable antibody.
(13-3) Расчет зависимых от концентрации АДФ и АМФ значений KD антител против hIL6R.(13-3) Calculation of ADP and AMP concentration-dependent KD values of anti-hIL6R antibodies.
- 157 046075- 157 046075
Затем антитела, описанные в табл. 63, используют для анализа аффинности hIL6R в присутствии 10 и 100 мкМ АДФ или АМФ вместо АТФ с использованием Biacore T200 в соответствии с условиями, описанными выше. Результаты анализа измерения с использованием АДФ показаны в табл. 65 и на фиг. 63, а результаты анализа измерения с использованием АМФ показаны в табл. 66 и на фиг. 64. Антитела с ответом 10 RU или менее во время измерения рассматривают как не анализируемые и обозначают в таблице как нет данных.Then the antibodies described in table. 63 was used to assay hIL6R affinity in the presence of 10 and 100 μM ADP or AMP instead of ATP using Biacore T200 according to the conditions described above. The results of the measurement analysis using ADF are shown in Table. 65 and in FIG. 63, and the results of the measurement analysis using AMF are shown in table. 66 and in FIG. 64. Antibodies with a response of 10 RU or less at the time of measurement are considered not analyzed and are indicated in the table as not available.
Таблица 65Table 65
Расчет величин KD (M) анти-hIL6R антител, зависящих от концентрации АДФ (М)Calculation of KD (M) values of anti-hIL6R antibodies depending on the concentration of ADP (M)
Таблица 66Table 66
Расчет величин KD (М) анти-hIL6R антител, зависящих от концентрации АМФ (М)Calculation of KD (M) values of anti-hIL6R antibodies depending on the concentration of AMP (M)
Результаты показывают, что в анализе на KD для hIL6R MRAH-G4T1/MRAL-k0 не влияют концентрации АДФ и АМФ, но, как и в случае АТФ, более высокие концентрации АДФ или АМФ в анализе сопровождаются меньшими значениями KD для hIL6R H0002-G4T1/L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088lam1 и H0052-G4T1/L1083-lam1, т.е. они обладают более сильной связывающей активностью. Результаты подтверждают, что H0002-G4T1/L1058-lam1, №041^4^/11088-^1 и H0052-G4T1/L1083-lam1 обладают АДФ- и АМФ-зависимой связывающей активностью по отношению к hIL6R.The results show that the KD for hIL6R MRAH-G4T1/MRAL-k0 is not affected by ADP and AMP concentrations in the assay, but as with ATP, higher ADP or AMP concentrations in the assay are accompanied by lower KD values for hIL6R H0002-G4T1/ L1058-lam1, H0041-G4T1/L1088lam1 and H0052-G4T1/L1083-lam1, i.e. they have stronger binding activity. The results confirm that H0002-G4T1/L1058-lam1, #041^4^/11088-^1 and H0052-G4T1/L1083-lam1 have ADP- and AMP-dependent binding activity towards hIL6R.
(13-4) Оценка активности ADCC антител против hIL6R, зависящей от концентрации АТФ.(13-4) Assessment of ATP concentration-dependent ADCC activity of anti-hIL6R antibodies.
Антитела получают методом, известным специалистам в данной области, как показано в табл. 67, путем изменения константных областей тяжелой цепи указанных выше антител на mFa55 (SEQ ID NO: 184), в которых активность ADCC усиливают путем добавления модификаций mIgG2a, усиливающих связывание FcyRIV, и путем изменения константной области легкой цепи с цепи человека на цепь мыши. Кроме того, KLH-mFa55 (IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1) получают в качестве отрицательного контроля.Antibodies are obtained by a method known to specialists in this field, as shown in table. 67, by changing the heavy chain constant regions of the above antibodies to mFa55 (SEQ ID NO: 184), in which ADCC activity is enhanced by adding mIgG2a modifications that enhance FcyRIV binding, and by changing the light chain constant region from a human chain to a mouse chain. In addition, KLH-mFa55 (IC17Hdk-mFa55/IC17L-mk1) was prepared as a negative control.
Таблица 67Table 67
Комбинации тяжелых цепей и легких цепей антителCombinations of heavy chains and light chains of antibodies
Эти антитела используют для оценки ADCC против Hepa1-6 (hIL6R-Hepa1-6), линии гепатомы мыши, которая экспрессирует полноразмерный hIL6R (SEQ ID NO: 213), полученный методами, известными специалистам в данной области, описанными ниже.These antibodies are used to evaluate ADCC against Hepa1-6 (hIL6R-Hepa1-6), a mouse hepatoma line that expresses full-length hIL6R (SEQ ID NO: 213), obtained by methods known to those skilled in the art, described below.
Для измерений, приведенных ниже, используют mFcyRIV ADCC Reporter Bioassay, Core Kit (фирма Promega). В каждую лунку 96-луночного планшета добавляют 100 мкл hIL6R-Hepa1-6, приготовленного в среде с концентрацией клеток 2х105/мл, и оставляют планшет при 37°C в течение 21 ч. В качестве питательной среды используют 90% DMEM, 10% ФСБ, 600 мкг генетицина и 500 мкг зеоцина. После центрифугирования планшета в течение пяти мин в режиме 200 х g, 4°C, супернатант из каждой лунки удаляют. Раствор антител, описанных в табл. 67, разбавленный в буфере для анализа до конечной концентрации 0,2 мкг/мл, раствор АТФ, разбавленный в буфере для анализа до конечной концентрации 0, 1, 10 и 100 мкМ, и 25 мкл раствора, приготовленного путем добавления 0,69 мл набора вспомогательных эффекторных клеток к 3,82 мл буфера для анализа, смешивают до общего объема 75 мкл, смеси добавляют в каждую лунку и оставляют выстаиваться при 37°C в течение шести часов. В качестве буфера для анаFor the measurements below, mFcyRIV ADCC Reporter Bioassay, Core Kit (Promega) is used. Add 100 μl of hIL6R-Hepa1-6, prepared in a medium with a cell concentration of 2x10 5 /ml, to each well of a 96-well plate, and leave the plate at 37°C for 21 hours. 90% DMEM, 10% PBS, 600 µg geneticin and 500 µg zeocin. After centrifuging the plate for five minutes at 200 x g, 4°C, the supernatant from each well is removed. A solution of antibodies described in table. 67 diluted in assay buffer to a final concentration of 0.2 µg/ml, ATP solution diluted in assay buffer to final concentrations of 0, 1, 10 and 100 µM, and 25 µl of a solution prepared by adding 0.69 ml of kit auxiliary effector cells to 3.82 ml of assay buffer, mixed to a total volume of 75 µl, the mixtures were added to each well and allowed to stand at 37°C for six hours. As a buffer for ana
- 158 046075 лиза используют 1,5 мл вспомогательной сыворотки с низким уровнем IgG из набора, которые добавляют к 36 мл среды RPMI 1640. Затем планшет оставляют при комнатной температуре на 15 мин, и в каждую лунку добавляют 75 мкл реагента Bio-Glo. Для реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-glo (буфер и субстрат). Затем измеряют люминесценцию в каждой лунке с помощью планшет-ридера. Значение люминесценции в каждой лунке, деленное на величину люминесценции в лунке без добавления антител, является показателем кратности индукции, и она служила индикатором для оценки ADCC каждого антитела.- 158 046075 lyse use 1.5 ml of low IgG booster serum from the kit, which is added to 36 ml of RPMI 1640 medium. The plate is then left at room temperature for 15 minutes and 75 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. For the Bio-Glo reagent, use the Bio-glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The luminescence in each well is then measured using a plate reader. The luminescence value in each well divided by the luminescence value in the well without the addition of antibodies is an indicator of the fold induction, and it served as an indicator for assessing the ADCC of each antibody.
Полученные результаты показаны на фиг. 65. На этой фигуре кратность индукции обозначена как относительная световая единица (RLU, relative light unit).The results obtained are shown in Fig. 65. In this figure, the induction factor is designated as a relative light unit (RLU, relative light unit).
Результаты показывают, что на ADCC непереключаемого антитела MRAH-mFa55/MRAL-mk0 не влияет на экспрессирующие hIL6R клеток в зависимости от концентрации АТФ, a ADCC переключаемых антител H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 становится сильнее при более высокой концентрацией АТФ в анализе. Результаты подтверждают, что H0002mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 обладают АТФ-зависимой цитотоксической активностью в отношении hIL6R.The results show that the ADCC of the non-switchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 does not affect hIL6R-expressing cells depending on the ATP concentration, but the ADCC of the switchable antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55 /L1083-ml0 becomes stronger at higher ATP concentrations in the assay. The results confirm that H0002mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 have ATP-dependent cytotoxic activity against hIL6R.
(13-5) Оценка противоопухолевой активности антител против hIL6R in vivo После подтверждения ADCC каждого антитела проводят тест для оценки противоопухолевой активности этих антител in vivo на несущей опухоль модели мышей C57BL/6 с hIL6R-Hepa1-6 согласно приведенным ниже методам.(13-5) Evaluation of Antitumor Activity of Anti-hIL6R Antibodies in Vivo After confirming the ADCC of each antibody, a test was performed to evaluate the antitumor activity of these antibodies in vivo in a tumor-bearing hIL6R-Hepa1-6 C57BL/6 mouse model according to the methods below.
Анти-asialo GM1 антитело (фирма Wako Pure Chemical Industries) растворяют в 1 мл дистиллированной воды (фирма Otsuka Pharmaceutical Factory), и затем разбавляют 4 мл ФСБ. Полученное таким образом анти-asialo GM1 антитело вводят внутрибрюшинно 100 мышам C57BL/6 в дозе 0,1 мл на мышь. Через день готовят смешанный раствор, к которому добавлен равный объем Matrigel Matrix (фирма Corning), вносят в клеточную суспензию hIL6R-Hepa1-6 ститром 1х108/мл в сбалансированном солевом растворе Хэнкса (фирма Sigma). Смешанный раствор вводят подкожно 100 мышам C57BL/6 в дозе 0,2 мл на мышь и имплантируют клетки. Диаметр опухоли мышей измеряют штангенциркулем, а объем опухоли определяют как (большая ось) х (малая ось) х (малая ось) х (1/2). Измерение диаметра опухоли проводит индивидуум, не знающий о составе раствора лекарственного средства, вводимого каждой мыши. Диаметр опухоли и вес тела 100 из указанных выше мышей C57BL/6 измеряют на 11-й день после трансплантации клеток. На основании полученных значений рандомизируют мышей, которых разделяют в общей сложности на пять групп: четыре группы по 10 животных в каждой и одна группа из 8 животных; в каждой группе животным вводят через хвостовую вену раствор антител, показанных в табл. 67. В группе из 8 животных животные получают H0002-mFa55/L1058-ml0. Доза (мл) введенного раствора антитела составляет (0,01 (мл/г)) х (масса тела (г) каждой мыши). Диаметр опухоли и массу тела мышей C57BL/6, сгруппированных выше, измеряют таким же образом на 14, 18, 21 и 25 день после трансплантации. На 18-й день после трансплантации растворы антител, показанных в табл. 67, вводят животным в соответствующей группе через хвостовую вену в дозировке, определенной с помощью той же формулы расчета, которая описана выше, на основе данных измерения массы тела. Был рассчитан средний объем опухоли в каждой группе лечения антителом в каждый день измерения, и он является показателем для оценки противоопухолевой активности in vivo каждого антитела.Anti-asialo GM1 antibody (Wako Pure Chemical Industries) was dissolved in 1 ml of distilled water (Otsuka Pharmaceutical Factory), and then diluted with 4 ml of PBS. The anti-asialo GM1 antibody thus obtained was administered intraperitoneally to 100 C57BL/6 mice at a dose of 0.1 ml per mouse. Every other day, a mixed solution is prepared, to which an equal volume of Matrigel Matrix (Corning) is added, and added to a cell suspension of hIL6R-Hepa1-6 with 1x10 8 /ml in Hanks' balanced salt solution (Sigma). The mixed solution is injected subcutaneously into 100 C57BL/6 mice at a dose of 0.2 ml per mouse and cells are implanted. The tumor diameter of the mice was measured with a caliper, and the tumor volume was determined as (major axis) x (minor axis) x (minor axis) x (1/2). The measurement of tumor diameter is carried out by an individual who is unaware of the composition of the drug solution administered to each mouse. Tumor diameter and body weight of 100 of the above C57BL/6 mice were measured on day 11 after cell transplantation. Based on the obtained values, mice are randomized and divided into a total of five groups: four groups of 10 animals each and one group of 8 animals; In each group, animals are injected through the tail vein with a solution of the antibodies shown in Table. 67. In a group of 8 animals, animals receive H0002-mFa55/L1058-ml0. The dose (ml) of the administered antibody solution is (0.01 (ml/g)) x (body weight (g) of each mouse). Tumor diameter and body weight of the C57BL/6 mice grouped above were measured in the same manner at days 14, 18, 21, and 25 posttransplantation. On the 18th day after transplantation, solutions of antibodies shown in table. 67 is administered to the animals in the respective group via the tail vein at a dosage determined using the same calculation formula as described above based on body weight measurements. The average tumor volume in each antibody treatment group on each measurement day was calculated and is an indicator to evaluate the in vivo antitumor activity of each antibody.
Полученные результаты показаны на фиг. 66.The results obtained are shown in Fig. 66.
Среди переключаемых антител, для которых подтверждена АТФ-зависимая ADCC, подтверждено, что H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 проявляют противоопухолевую активность в отношении клеток, экспрессирующих hIL6R, в той же степени, что и MRAH-mFa55/MRAL- mk0, которое не является непереключаемым антителом согласно приведенным выше результатов. Результаты показывают, что внеклеточный АТФ в непосредственной близости от опухолей присутствовал на уровне концентрации, при котором H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 функционируют схожим образом с MRAH-mFa55/MRAL-mk0.Among the switch antibodies for which ATP-dependent ADCC has been confirmed, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 have been confirmed to exhibit antitumor activity against hIL6R-expressing cells to the same extent as MRAH-mFa55 /MRAL- mk0, which is not a non-switchable antibody according to the above results. The results indicate that extracellular ATP in the vicinity of tumors was present at a concentration level at which H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 function in a similar manner to MRAH-mFa55/MRAL-mk0.
Пример 14. Оценка системных эффектов анти-hIL6R антител, обладающих АТФ-зависимыми связывающими свойствами.Example 14. Evaluation of the systemic effects of anti-hIL6R antibodies having ATP-dependent binding properties.
Чтобы оценить в нормальных тканях эффекты антител против hIL6R, обладающих АТФзависимыми связывающими свойствами, нормальных мышей (C57BL/6) и трансгенных мышей с системной сверхэкспрессией hIL6R (hIL6R-tgm) (Proc Natl Acad Sci USA, 92 (11), 1995, 4862-4866) используют для оценки кинетики антител в плазме. Для этой оценки антитела, описанные в табл. 67, вводят нормальным мышам (C57BL/6) и трансгенным мышам hIL6R-tgm, и сравнивают их кинетику в плазме. Сообщалось, что в hIL6R-tgm обычные антитела, которые связываются с hIL6R, исчезают через hIL6R мембранного типа в результате связывания с системно экспрессируемым hIL6R мембранного типа hIL6R (Nature Biotechnology, 28, 2010, 1203-1207).To evaluate in normal tissues the effects of anti-hIL6R antibodies having ATP-dependent binding properties, normal mice (C57BL/6) and transgenic mice with systemic overexpression of hIL6R (hIL6R-tgm) (Proc Natl Acad Sci USA, 92 (11), 1995, 4862- 4866) is used to assess the kinetics of antibodies in plasma. For this assessment, the antibodies described in Table. 67 were administered to normal mice (C57BL/6) and hIL6R-tgm transgenic mice and their plasma kinetics were compared. In hIL6R-tgm, conventional antibodies that bind to hIL6R have been reported to disappear through membrane-type hIL6R as a result of binding to systemically expressed membrane-type hIL6R (Nature Biotechnology, 28, 2010, 1203-1207).
мг/мл MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 или H0052mFa55/L1083-ml0 вводят внутривенно нормальным мышам и hIL6R-tgm за один раз в дозе 10 мл/кг. У нормальных мышей кровь собирают через 5 мин, 7, 24, 48, 72 и 168 ч после введения во всех группах: группе MRAH-mFa55/MRAL-mk0, группе H0002-mFa55/L1058-ml0, группе H0041-mFa55/L1088-ml0 иmg/ml MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 or H0052mFa55/L1083-ml0 was administered intravenously to normal and hIL6R-tgm mice at a single dose of 10 ml/kg. From normal mice, blood was collected at 5 min, 7, 24, 48, 72 and 168 h after administration in all groups: MRAH-mFa55/MRAL-mk0 group, H0002-mFa55/L1058-ml0 group, H0041-mFa55/L1088- group ml0 and
- 159 046075 группе H0052-mFa55/L1083-ml0. У мышей hIL6R-tgm кровь собирают через 5 мин, 7, 24, 48, 52, 55, 72 и 168 ч после введения в группе MRAH-mFa55/MRAL-mk0 и через 5 мин, 7, 24, 48, 72. и через 168 ч после введения в группе H0002-mFa55/L1058-ml0, группе Н0041-щFa55/L1088-ml0 и группе H0052mFa55/L1083-ml0. Полученную кровь быстро центрифугировали при 4°C в режиме 12000 об/мин, 10 мин; плазму отделяют. Плазму хранят в морозильной камере, установленной на -20°C или ниже, до проведения измерения.- 159 046075 group H0052-mFa55/L1083-ml0. In hIL6R-tgm mice, blood was collected at 5 min, 7, 24, 48, 52, 55, 72, and 168 h post-administration in the MRAH-mFa55/MRAL-mk0 group and at 5 min, 7, 24, 48, 72. and 168 hours after administration in the H0002-mFa55/L1058-ml0 group, the H0041-mFa55/L1088-ml0 group and the H0052mFa55/L1083-ml0 group. The resulting blood was quickly centrifuged at 4°C at 12,000 rpm for 10 min; the plasma is separated. Plasma is stored in a freezer set at -20°C or lower until measurement is performed.
Концентрацию каждого антитела в плазме измеряют методом электрохемилюминесценции (ECL, electrochemiluminescence). Раствор hIL6R добавляют в планшет MULTI-ARRAY PR (фирма Meso Scale Diagnostics, LLCs), оставляют выстаиваться при 37°C в течение одного часа, и hIL6R иммобилизуют на планшете. Для калибровочной кривой получают MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 при концентрациях в плазме 8, 4, 2, 1, 0,5, 0,25 и 0,125 мкг/мл; и H0002-mFa55 / L1058-ml0 получают при концентрациях в плазме 64, 32, 16, 8, 4, 2 и 1 мкг/мл. После добавления 1 М раствора трис-HCl, рН 8,0, содержащего 0,05% Tween20 и 1% БСА, на планшет с иммобилизованным hIL6R, образцы плазмы, разбавленные в 250 раз в 0,3 М растворе уксусной кислоты, а также образцы калибровочной кривой быстро добавляют, а затем добавляют раствор АТФ и перемешивают. После того, как планшет оставляют выстаиваться в течение одного часа при комнатной температуре, добавляют меченное биотином антитело против IgG мыши (фирма Southern Biotechnology Associates, Inc) и оставляют при комнатной температуре на один час. Затем добавляют стрептавидин SULFO-TAG Labeled (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC) и оставляют при комнатной температуре на один час, после чего добавляют буфер считывания Т (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC), и реакцию измеряют с помощью считывателя электрохимической люминесценции SECTOR Imager 6000 (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Программу SOFTmax PRO (фирма Molecular Devices) используют для расчета концентрации каждого антитела в плазме мыши.The concentration of each antibody in plasma is measured by electrochemiluminescence (ECL, electrochemiluminescence). The hIL6R solution is added to the MULTI-ARRAY PR plate (Meso Scale Diagnostics, LLCs), left to stand at 37°C for one hour, and hIL6R is immobilized on the plate. For the calibration curve, MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 are obtained at plasma concentrations of 8, 4, 2, 1, 0.5, 0.25 and 0.125 µg/ ml; and H0002-mFa55/L1058-ml0 are obtained at plasma concentrations of 64, 32, 16, 8, 4, 2 and 1 μg/ml. After adding 1 M Tris-HCl, pH 8.0, containing 0.05% Tween20 and 1% BSA to the hIL6R-immobilized plate, plasma samples diluted 250-fold in 0.3 M acetic acid, and samples The calibration curve is quickly added, and then the ATP solution is added and mixed. After the plate was allowed to stand for one hour at room temperature, biotin-labeled anti-mouse IgG antibody (Southern Biotechnology Associates, Inc) was added and left at room temperature for one hour. SULFO-TAG Labeled Streptavidin (Meso Scale Diagnostics, LLC) is then added and left at room temperature for one hour, after which Reading Buffer T (Meso Scale Diagnostics, LLC) is added and the reaction is measured using a SECTOR Imager 6000 Electrochemical Luminescence Reader. (Meso Scale Diagnostics, LLC). The SOFTmax PRO program (Molecular Devices) was used to calculate the concentration of each antibody in mouse plasma.
Концентрацию растворимого антигена в плазме измеряют методом ECL. Разбавленные в 50 раз образцы плазмы мышей смешивают с SULFO-TAG (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC)-меченным антителом против IL6R человека (фирма R&D Systems), биотин-меченным антителом против IL6R человека (фирма R&D Systems) и избыточным количеством антитела против IL6R человека тоцилизумаба (продукт получают сами авторы настоящего изобретения) и смесь инкубируют в течение ночи при 37°C. После добавления смеси в стандартный 96-луночный блокированный планшет, покрытый стрептавидином (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC), с последующим добавлением буфера для считывания результатов, реакцию измеряют на SECTOR Imager 6000 (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Программное обеспечение SOFTmax PRO (фирма Molecular Devices) используют для расчета концентраций растворимого антигена в плазме мышей.The concentration of soluble antigen in plasma is measured by the ECL method. Mouse plasma samples diluted 50-fold are mixed with SULFO-TAG (Meso Scale Diagnostics, LLC)-labeled anti-human IL6R antibody (R&D Systems), biotin-labeled anti-human IL6R antibody (R&D Systems), and excess anti-IL6R antibody. human tocilizumab (the product is prepared by the inventors themselves) and the mixture is incubated overnight at 37°C. After adding the mixture to a standard 96-well streptavidin-coated blocking plate (Meso Scale Diagnostics, LLC), followed by the addition of readout buffer, the reaction is measured on a SECTOR Imager 6000 (Meso Scale Diagnostics, LLC). SOFTmax PRO software (Molecular Devices) is used to calculate soluble antigen concentrations in mouse plasma.
Результаты сравнения уровней MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 в крови у нормальных мышей и hIL6R-tgm представлены на фиг. 67, фиг. 68, фиг. 69 и фиг. 70, соответственно.The results of comparison of the blood levels of MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 in normal and hIL6R-tgm mice are presented in Fig. 67, fig. 68, fig. 69 and fig. 70, respectively.
Непереключаемое антитело MRAH-mFa55/MRAL-mk0 быстрее выводится у мышей hIL6R-tgm, которые системно экспрессируют hIL6R, чем у нормальных мышей (фиг. 67). Этот результат, по-видимому, вызван тем обстоятельством, что непереключаемое антитело связывается с hIL6R мембранного типа, экспрессируемым в нормальных тканях всего организма, и исчезает через hIL6R.The nonswitchable antibody MRAH-mFa55/MRAL-mk0 is cleared more rapidly in hIL6R-tgm mice that systemically express hIL6R than in normal mice (FIG. 67). This result appears to be caused by the fact that the non-switchable antibody binds to the membrane-type hIL6R expressed in normal tissues throughout the body and disappears through hIL6R.
С другой стороны, для переключаемых антител H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 в трансгенных мышах hIL6R-tgm не наблюдают резкого снижения концентраций антител по сравнению с нормальными мышами. Результаты означают, что, в отличие от результата с непереключаемым антителом, переключаемые антитела не связываются с системно экспрессируемым hIL6R мембранного типа и не вызывают опосредованную hIL6R элиминацию.On the other hand, for the switch antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 in hIL6R-tgm transgenic mice, no dramatic decrease in antibody concentrations was observed compared to normal mice. The results indicate that, in contrast to the result with the non-switched antibody, the switched antibodies do not bind to systemically expressed membrane-type hIL6R and do not cause hIL6R-mediated elimination.
По сравнению с переключаемыми антителами H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0, только антитело H0052-mFa55/L1083-ml0, демонстрирующее более сильное связывание при низких концентрациях АТФ, приводит к ускоренной потере антитела в hIL6R-tgm по сравнению с нормальными мышами.Compared to the switch antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0, only the H0052-mFa55/L1083-ml0 antibody, which exhibits stronger binding at low ATP concentrations, results in accelerated loss of antibody in hIL6R-tgm compared to normal mice.
Эти результаты позволяют предположить, что внеклеточные концентрации АТФ в нормальных тканях являются недостаточными для переключения антител на связывание с hIL6R.These results suggest that extracellular ATP concentrations in normal tissues are insufficient to switch antibodies to hIL6R binding.
Затем концентрации в плазме растворимого hIL6R у мышей hIL6R-tgm сравнивают после введения соответствующих антител. Результаты показаны на фиг. 71.Plasma concentrations of soluble hIL6R in hIL6R-tgm mice are then compared after administration of the corresponding antibodies. The results are shown in Fig. 71.
По сравнению с концентрациями растворимого hIL6R у мышей, получающих изотипический контроль IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, концентрации растворимого hIL6R у мышей, получающих непереключаемое антитело, MRAH-mFa55/MRAL-mk0, по данным наблюдений накапливается. Считают, что это вызвано связыванием непереключаемого антитела с растворимой формой hIL6R, что препятствует нормальным метаболическим путям.Compared with soluble hIL6R concentrations in mice receiving the isotype control IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, soluble hIL6R concentrations in mice receiving the nonswitchable antibody, MRAH-mFa55/MRAL-mk0, were observed to accumulate. This is thought to be caused by the non-switchable antibody binding to the soluble form of hIL6R, interfering with normal metabolic pathways.
С другой стороны, у мышей, получавших переключаемые антитела Н0002-щFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0, не наблюдают значительного накопления антигена, подобного накоплению в случае введения непереключаемого антитела. При сравнении переключаемых антител H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 наблюдают тенOn the other hand, mice treated with the switchable antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 do not exhibit significant antigen accumulation similar to that observed in the case of administration of a non-switchable antibody. When comparing the switchable antibodies H0002-mFa55/L1058-ml0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0, ten
- 160 046075 денцию по накоплению антигена для антител, демонстрирующих более сильное связывание при низких концентрациях АТФ.- 160 046075 dent in antigen accumulation for antibodies demonstrating stronger binding at low ATP concentrations.
Эти результаты позволяют предположить, что внеклеточные концентрации АТФ в нормальных тканях и крови являются низкими для переключения антител на связывание с мембраной и растворимыми формами hIL6R.These results suggest that extracellular ATP concentrations in normal tissues and blood are low to switch antibodies to membrane binding and soluble forms of hIL6R.
Пример 15. Одновременная оценка противоопухолевых эффектов и системных эффектов антител против hIL6R, обладающих АТФ-зависимыми связывающими свойствами.Example 15: Simultaneous assessment of antitumor effects and systemic effects of anti-hIL6R antibodies with ATP-dependent binding properties.
Противоопухолевые эффекты и системные эффекты одновременно оценивают для выявления системных эффектов анти-ЫL6R антител, обладающих АТФ-зависимыми связывающими свойствами, в присутствии опухоли. Для этой оценки используют модель hIL6R-tgm с трансплантированным hIL6RHepa1-6 и вводят антитела, описанные в табл. 67.Antitumor effects and systemic effects are simultaneously assessed to determine the systemic effects of anti-L6R antibodies having ATP-dependent binding properties in the presence of a tumor. For this evaluation, the hIL6R-tgm model with transplanted hIL6RHepa1-6 is used and the antibodies described in Table 1 are administered. 67.
Анти-asialo GM1 антитело (фирма Wako Pure Chemical Industries) растворяют в 1 мл дистиллированной воды (фирма Otsuka Pharmaceutical Factory), а затем разбавляют 4 мл ФСБ. Полученное таким образом анти-asialo GM1 антитело вводят внутрибрюшинно 83 мышам hIL6R-tgm в дозе 0,1 мл на мышь. Через день получают смешанный раствор, в который добавляют такой же объем Matrigel Matrix (фирма Corning) к клеточной суспензии hIL6R-Hepa1-6, суспендированной до титра 1х108/мл в сбалансированном солевом растворе Хэнкса (фирма Sigma). Смешанный раствор вводят подкожно 83 трансгенным мышам hIL6R-tgm в дозе 0,2 мл на мышь, в результате чего клетки имплантируются. Диаметр опухоли мышей измеряют штангенциркулем, а объем опухоли определяют как:Anti-asialo GM1 antibody (Wako Pure Chemical Industries) was dissolved in 1 ml of distilled water (Otsuka Pharmaceutical Factory) and then diluted with 4 ml of PBS. The anti-asialo GM1 antibody thus obtained was administered intraperitoneally to 83 hIL6R-tgm mice at a dose of 0.1 ml per mouse. Every other day, a mixed solution is prepared, to which the same volume of Matrigel Matrix (Corning) is added to the hIL6R-Hepa1-6 cell suspension suspended to a titer of 1x10 8 /ml in Hanks' balanced salt solution (Sigma). The mixed solution was injected subcutaneously into 83 hIL6R-tgm transgenic mice at a dose of 0.2 ml per mouse, resulting in cell implantation. The tumor diameter of mice is measured with a caliper, and the tumor volume is determined as:
(большая ось) х (малая ось) х (малая ось) х (1/2)(major axis) x (minor axis) x (minor axis) x (1/2)
Измерение диаметра опухоли проводит индивидуум, не знающий о составе раствора лекарственного средства, вводимого каждой мыши. Диаметр опухоли и вес тела 83 указанных выше мышей hIL6R-tgm измеряют на 10-й день после трансплантации клеток. На основании полученных значений рандомизируют мышей, которых разделяют в общей сложности на четыре группы по 10 животных, в каждой группе животным вводят через хвостовую вену соответствующий раствор антитела из числа антител, показанных в табл. 67, за исключением H0052-mFa55/L1083-ml0. Доза (мл) введенного раствора антитела составляет (0,01 (мл/г)) х (масса тела (г) каждой мыши). Впоследствии диаметры опухоли и массу тела hIL6R-tgm, сгруппированных указанным выше образом, измеряют таким же образом на 13, 17 и 20 день после трансплантации. На 17-й день после трансплантации растворы четырех антител, показанных в табл. 67, за исключением H0052-mFa55/L1083-ml0, вводят животным в соответствующей группе через хвостовую вену в дозировке, определенной с помощью той же формулы расчета, которая описана выше, на основе данных по измерению массы тела. Рассчитывали средний объем опухоли в каждой группе лечения антителом и в каждый день измерения, которые является показателем для оценки противоопухолевой активности in vivo для каждого антитела.The measurement of tumor diameter is carried out by an individual who is unaware of the composition of the drug solution administered to each mouse. Tumor diameter and body weight of the 83 above hIL6R-tgm mice were measured on day 10 after cell transplantation. Based on the obtained values, mice are randomized, which are divided into a total of four groups of 10 animals, in each group the animals are injected through the tail vein with the appropriate antibody solution from among the antibodies shown in table. 67, with the exception of H0052-mFa55/L1083-ml0. The dose (ml) of the administered antibody solution is (0.01 (ml/g)) x (body weight (g) of each mouse). Subsequently, tumor diameters and body weights of hIL6R-tgm grouped as above were measured in the same manner on days 13, 17 and 20 after transplantation. On the 17th day after transplantation, solutions of the four antibodies shown in Table. 67, with the exception of H0052-mFa55/L1083-ml0, are administered to animals in the corresponding group through the tail vein at a dosage determined using the same calculation formula as described above, based on body weight measurements. The average tumor volume in each antibody treatment group and on each measurement day was calculated, which is an indicator to evaluate the in vivo antitumor activity for each antibody.
В вышеупомянутых экспериментах берут на анализ кровь у мышей hIL6R-tgm, разделенных на указанные выше группы, под анестезией изофлураном через один час, 1, 2, 3 и 7 дней после первоначального введения растворов антител. Образцы крови переносят в серии из восьми пробирок с индивидуальным номером и оставляют на льду. После центрифугирования серий из восьми пробирок в режиме 1900 х g в течение 10 мин при 4°C супернатант после центрифугирования получают в виде компонента плазмы и переносят в другую серию из восьми пробирок с индивидуальным номером, которые хранят при -30°C.In the above experiments, blood was collected from hIL6R-tgm mice divided into the above groups under isoflurane anesthesia at one hour, 1, 2, 3 and 7 days after the initial administration of antibody solutions. Blood samples are transferred into a series of eight individually numbered tubes and kept on ice. After a series of eight tubes are centrifuged at 1900 x g for 10 min at 4°C, the centrifugation supernatant is recovered as a plasma component and transferred to another series of eight individually numbered tubes, which are stored at -30°C.
Концентрацию каждого антитела в плазме измеряют методом электрохемилюминесценции (ECL). Раствор hIL6R добавляют в планшет MULTI-ARRAY PR (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC) и оставляют при 37°C в течение одного часа, hIL6R иммобилизуется на планшете. Для калибровочной кривой готовят растворы MRAH-mFa55/MRAL-mk0 и H0041-mFa55/L1088-ml0 в плазме с концентрациями 8, 4, 2, 1, 0,5, 0,25 и 0,125 мкг/мл; H0002-mFa55/L1058-ml0 получают с концентрациях в плазме 64, 32, 16, 8, 4, 2 и 1 мкг/мл. После добавления 1 М раствора трис-HCl, рН 8,0, содержащего 0,05% Tween20 и 1% БСА, в планшет с иммобилизованным hIL6R, образцы плазмы разбавляют в 250 раз в 0,3 М растворе уксусной кислоты, а также быстро добавляют образцы для калибровочной кривой и раствор АТФ и перемешивают. После того, как планшет оставляли в течение одного часа при комнатной температуре, добавляют меченое биотином антитело против IgG мыши (фирма Southern Biotechnology Associates, Inc) и оставляли стоять при комнатной температуре в течение одного часа. Впоследствии добавляют меченый стрептавидином SULFO-TAG (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC), и планшет оставляют при комнатной температуре в течение одного часа с последующим добавлением буфера для считывания результатов Т (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC) и реакцию измеряют с помощью SECTOR Imager 6000 (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). SOFTmax PRO (фирма Molecular Devices) используют для расчета уровней антител в плазме мышей.The plasma concentration of each antibody is measured by electrochemiluminescence (ECL). The hIL6R solution is added to the MULTI-ARRAY PR plate (Meso Scale Diagnostics, LLC) and left at 37°C for one hour, hIL6R is immobilized on the plate. For the calibration curve, solutions of MRAH-mFa55/MRAL-mk0 and H0041-mFa55/L1088-ml0 in plasma are prepared with concentrations of 8, 4, 2, 1, 0.5, 0.25 and 0.125 μg/ml; H0002-mFa55/L1058-ml0 was prepared at plasma concentrations of 64, 32, 16, 8, 4, 2, and 1 μg/ml. After adding 1 M Tris-HCl, pH 8.0, containing 0.05% Tween20 and 1% BSA to the hIL6R-immobilized plate, plasma samples are diluted 250-fold in 0.3 M acetic acid and quickly added samples for the calibration curve and the ATP solution and mix. After the plate was left for one hour at room temperature, biotin-labeled anti-mouse IgG antibody (Southern Biotechnology Associates, Inc) was added and allowed to stand at room temperature for one hour. Streptavidin-labeled SULFO-TAG (Meso Scale Diagnostics, LLC) is subsequently added and the plate is left at room temperature for one hour followed by the addition of Reading Buffer T (Meso Scale Diagnostics, LLC) and the reaction is measured using a SECTOR Imager 6000 (Meso Scale Diagnostics, LLC). SOFTmax PRO (Molecular Devices) is used to calculate antibody levels in mouse plasma.
Аналогичным образом анти-asialo GM1 антитело (фирма Wako Pure Chemical Industries) растворяют в 1 мл дистиллированной воды (фирма Otsuka Pharmaceutical Factory), а затем разбавляют 4 мл ФСБ. Полученное таким образом анти-asialo GM1 антитело вводят внутрибрюшинно в 91 мыши hIL6R-tgm в дозе 0,1 мл на мышь. Через день получают смешанный раствор, в котором такой же объем Matrigel Matrix (фирма Corning) добавлен к клеточной суспензии hIL6R-Hepa1-6, суспендированной до 1х 108 клеток/млSimilarly, anti-asialo GM1 antibody (Wako Pure Chemical Industries) was dissolved in 1 ml of distilled water (Otsuka Pharmaceutical Factory) and then diluted with 4 ml of PBS. The anti-asialo GM1 antibody thus obtained was administered intraperitoneally into 91 hIL6R-tgm mice at a dose of 0.1 ml per mouse. Every other day, a mixed solution is obtained in which the same volume of Matrigel Matrix (Corning) is added to the hIL6R-Hepa1-6 cell suspension, suspended to 1x 108 cells/ml
- 161 046075 в сбалансированном солевом растворе Хэнкса (фирма Sigma). Смешанный раствор вводят подкожно в 91 мышь hIL6R-tgm в дозе 0,2 мл на мышь и клетки имплантируют. Диаметр опухоли мышей измеряли штангенциркулем, а объем опухоли определяли как:- 161 046075 in Hanks' balanced salt solution (Sigma). The mixed solution was injected subcutaneously into 91 hIL6R-tgm mice at a dose of 0.2 ml per mouse and the cells were implanted. The tumor diameter of the mice was measured with a caliper, and the tumor volume was determined as:
(большая ось) х (малая ось) х (малая ось) х (1/2)(major axis) x (minor axis) x (minor axis) x (1/2)
Измерение диаметра опухоли проводит индивид, не знающий о составе раствора лекарственного средства, вводимого каждой мыши. Диаметр опухоли и вес тела 91 указанной выше мыши hIL6R-tgm измеряют на 10-й день после трансплантации клеток. На основании полученных значений рандомизируют мышей, которых разделяют в общей сложности на четыре группы по 6 животных, в каждой группе животным вводят через хвостовую вену соответствующий раствор антитела из числа антител, показанных в табл. 67, за исключением H0052-mFa55/L1083-ml0. Доза (мл) введенного раствора антитела составляет (0,01 (мл/г)) х (масса тела (г) каждой мыши). Впоследствии диаметры опухоли и массу тела мышей hIL6R-tgm, сгруппированных указанным выше образом, измеряют таким же образом на 13, 17 и 20 день после трансплантации. На 17-й день после трансплантации четыре раствора антител из растворов антител, представленных в табл. 67, за исключением H0002-mFa55/L1058-ml0, вводят мышам соответствующих групп через хвостовую вену в дозировке, определенной по формуле расчета, описанной выше, на основе измеренных данных о массе тела. Рассчитан средний объем опухоли в каждой группе лечения антителом в каждый день измерения, и на основе полученных данных оценивают противоопухолевую активность in vivo каждого антитела.The tumor diameter is measured by an individual who is unaware of the composition of the drug solution administered to each mouse. Tumor diameter and body weight of 91 above hIL6R-tgm mice were measured on day 10 after cell transplantation. Based on the obtained values, mice are randomized, which are divided into a total of four groups of 6 animals, in each group the animals are injected through the tail vein with the appropriate antibody solution from among the antibodies shown in table. 67, with the exception of H0052-mFa55/L1083-ml0. The dose (ml) of the administered antibody solution is (0.01 (ml/g)) x (body weight (g) of each mouse). Subsequently, tumor diameters and body weights of hIL6R-tgm mice grouped as above were measured in the same manner at days 13, 17 and 20 post-transplantation. On the 17th day after transplantation, four antibody solutions from the antibody solutions presented in Table. 67, with the exception of H0002-mFa55/L1058-ml0, are administered to mice of the respective groups through the tail vein at a dosage determined by the calculation formula described above based on measured body weight data. The average tumor volume in each antibody treatment group on each measurement day was calculated, and the in vivo antitumor activity of each antibody was assessed based on the data obtained.
В вышеупомянутых экспериментах кровь собирают путем взятия пробы крови из орбитального синуса мышей hIL6R-tgm, разделенных на указанные выше группы, под анестезией изофлураном через один час, 3 и 7 дней после первоначального введения растворов антител. Собранную кровь переносят в серию из восьми пробирок с индивидуальным номером и оставляют на льду. После центрифугирования серий из восьми пробирок с индивидуальным номером в режиме 1900xg в течение 10 мин при 4°C получают супернатант в качестве компонента плазмы и переносят в другие серии из восьми пробирок с индивидуальным номером и хранят при -30°C.In the above experiments, blood is collected by collecting a blood sample from the orbital sinus of hIL6R-tgm mice divided into the above groups under isoflurane anesthesia at one hour, 3 and 7 days after the initial administration of antibody solutions. The collected blood is transferred into a series of eight individually numbered tubes and left on ice. After centrifuging a series of eight individually numbered tubes at 1900xg for 10 min at 4°C, the supernatant is obtained as a plasma component and transferred to another series of eight individually numbered tubes and stored at -30°C.
Концентрацию каждого антитела в плазме измеряют методом электрохемилюминесценции (ECL). Раствор hIL6R добавляют в планшет MULTI-ARRAY PR (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC) и выстаивают при 37°C в течение одного часа, в результате чего hIL6R иммобилизуется на планшете. Для калибровочной кривой готовят MRAH-mFa55/MRAL-mk0, Н0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0 в плазме с концентрациями 8, 4, 2, 1, 0,5, 0,25 и 0,125 мкг/мл. После добавления 1 М раствора трис-HCl, рН 8,0, содержащего 0,05% Tween20 и 1% БСА, в планшет с иммобилизованным hIL6R, образцы плазмы разбавляют в 250 раз в 0,3 М растворе уксусной кислоты, а также быстро добавляют образцы для калибровочной кривой и затем раствор АТФ и перемешивают. После того, как планшет оставляли в течение одного часа при комнатной температуре, добавляют меченое биотином антитело против IgG мыши (фирма Southern Biotechnology Associates, Inc) и оставляют стоять при комнатной температуре в течение одного часа. Впоследствии добавляют меченый стрептавидином SULFO-TAG (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC), и планшет оставляют при комнатной температуре в течение одного часа с последующим добавлением буфера для считывания результатов Т (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC) и реакцию измеряют с помощью SECTOR Imager 6000 (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). SOFTmax PRO (фирма Molecular Devices) используют для расчета уровней антител в плазме мышей.The plasma concentration of each antibody is measured by electrochemiluminescence (ECL). The hIL6R solution is added to the MULTI-ARRAY PR plate (Meso Scale Diagnostics, LLC) and left at 37°C for one hour, whereby hIL6R is immobilized on the plate. For the calibration curve, prepare MRAH-mFa55/MRAL-mk0, Н0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 in plasma with concentrations of 8, 4, 2, 1, 0.5, 0.25 and 0.125 μg/ ml. After adding 1 M Tris-HCl, pH 8.0, containing 0.05% Tween20 and 1% BSA to the hIL6R-immobilized plate, plasma samples are diluted 250-fold in 0.3 M acetic acid and quickly added samples for the calibration curve and then the ATP solution and mix. After the plate was left for one hour at room temperature, biotin-labeled anti-mouse IgG antibody (Southern Biotechnology Associates, Inc) was added and allowed to stand at room temperature for one hour. Streptavidin-labeled SULFO-TAG (Meso Scale Diagnostics, LLC) is subsequently added and the plate is left at room temperature for one hour followed by the addition of Reading Buffer T (Meso Scale Diagnostics, LLC) and the reaction is measured using a SECTOR Imager 6000 (Meso Scale Diagnostics, LLC). SOFTmax PRO (Molecular Devices) is used to calculate antibody levels in mouse plasma.
Концентрацию растворимого антигена в плазме измеряют методом электрохемилюминесценции (ECL). Образцы плазмы мыши, разведенные в 50 раз, смешивают с SULFO-TAG (фирма Meso Scale Diagnostics, LLQ-меченым антителом против IL6R человека (фирма R&D Systems), биотин-меченым антителом против IL6R человека (фирма R&D Systems) и избытком антитела против IL6R человека толизумамом (полученным авторами настоящего изобретения), смесь инкубируют в течение ночи при 37°C. После добавления смеси в стандартный 96-луночный блокированный планшет, покрытый стрептавидином (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC), с последующим добавлением буфера для считывания результатов, реакцию измеряют на SECTOR Imager 6000 (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Программное обеспечение SOFTmax PRO (фирма Molecular Devices) используют для расчета концентраций растворимого антигена в плазме мышей.The concentration of soluble antigen in plasma is measured by electrochemiluminescence (ECL). Mouse plasma samples, diluted 50-fold, were mixed with SULFO-TAG (Meso Scale Diagnostics), LLQ-labeled anti-human IL6R antibody (R&D Systems), biotin-labeled anti-human IL6R antibody (R&D Systems), and excess anti-IL6R antibody. human tolizumam (prepared by the present inventors), the mixture is incubated overnight at 37° C. After adding the mixture to a standard 96-well streptavidin-coated blocked plate (Meso Scale Diagnostics, LLC), followed by the addition of readout buffer, the reaction measured on a SECTOR Imager 6000 (Meso Scale Diagnostics, LLC) SOFTmax PRO software (Molecular Devices) was used to calculate soluble antigen concentrations in mouse plasma.
Сначала сравнивают противоопухолевые эффекты, концентрации антител в плазме и концентрации антигена в плазме IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0002-mFa55/L1058-ml0 и H0041-mFa55/L1088-ml0. Результаты показаны на рисунках 72, 73 и 74 соответственно.First, the antitumor effects, plasma antibody concentrations, and plasma antigen concentrations of IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0002-mFa55/L1058-ml0, and H0041-mFa55/L1088-ml0 were compared. The results are shown in Figures 72, 73 and 74, respectively.
В настоящем изобретении по сравнению с группой, получавшей изотипический контроль IC17HdKmFa55/IC17L-mk1, группы, получавшие MRAH-mFa55/MRAL-mk0 и H0002-mFa55/L1058-ml0, не показывают более высоких показателей ингибирования роста опухоли (TGI). С другой стороны, больший показатель TGI наблюдают в группе, получавшей переключаемое антитело H0041-mFa55/L1088-ml0 (фиг. 72). Слабее эффективность препарата наблюдают в группе мышей, получавших MRAHmFa55/MRAL-mk0, по сравнению с таковой H0041-mFa55/L1088-ml0, что позволяет предположить, что MRAH-mFa55/MRAL-mk0 выводится быстрее, чем H0041-mFa55/L1088-ml0, и он не может поддерживать концентрацию, достаточную для демонстрации эффективности лекарственного средства (фиг. 73).In the present invention, compared with the isotype control group IC17HdKmFa55/IC17L-mk1, the groups treated with MRAH-mFa55/MRAL-mk0 and H0002-mFa55/L1058-ml0 do not show higher tumor growth inhibition (TGI) scores. On the other hand, a higher TGI was observed in the group treated with the H0041-mFa55/L1088-ml0 switch antibody (FIG. 72). Weaker drug efficacy was observed in the group of mice treated with MRAHmFa55/MRAL-mk0 compared to that of H0041-mFa55/L1088-ml0, suggesting that MRAH-mFa55/MRAL-mk0 is cleared faster than H0041-mFa55/L1088-ml0 , and it cannot maintain a concentration sufficient to demonstrate the effectiveness of the drug (Fig. 73).
- 162 046075- 162 046075
Также накопления растворимого hIL6R не наблюдают в группе, обработанной H0002-mFa55/L1058ml0. В группе, обработанной H0041-mFa55/L1083-ml0, накопление растворимого IL6R происходит в меньшем количестве, чем в группе, обработанной MRAH-mFa55/MRAL-mk0 (фиг. 74).Also, accumulation of soluble hIL6R was not observed in the H0002-mFa55/L1058ml0 treated group. In the H0041-mFa55/L1083-ml0-treated group, soluble IL6R accumulation occurs to a lesser extent than in the MRAH-mFa55/MRAL-mk0-treated group (FIG. 74).
Затем сравнивают противоопухолевые эффекты, концентрации антител в плазме и концентрации антигена в плазме IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0. Результаты показаны на фиг. 75, 76 и 77 соответственно.Antitumor effects, plasma antibody concentrations, and plasma antigen concentrations of IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0041-mFa55/L1088-ml0, and H0052-mFa55/L1083-ml0 were then compared. The results are shown in Fig. 75, 76 and 77 respectively.
В настоящем исследовании по сравнению с группой, получавшей изотипический контроль IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, группы, получавшие MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0041-mFa55/L1088-ml0 и H0052-mFa55/L1083-ml0, показывают более высокие показатели ингибирования роста опухоли (TGI) (фиг. 75). С другой стороны, при сравнении их концентраций в плазме MRAH-mFa55/MRAL-mk0 демонстрирует более быстрое выведение, чем H0052-mFa55/L1083-ml0, и пониженную концентрацию в крови (фиг. 76).In the present study, compared with the group treated with the isotype control IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1, the groups treated with MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0041-mFa55/L1088-ml0 and H0052-mFa55/L1083-ml0 show higher rates tumor growth inhibition (TGI) (Fig. 75). On the other hand, when comparing their plasma concentrations, MRAH-mFa55/MRAL-mk0 shows faster clearance than H0052-mFa55/L1083-ml0 and a lower blood concentration (FIG. 76).
Кроме того, по сравнению с MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0052-mFa55/L1083-ml0 только накапливает меньше растворимого IL6R (фиг. 77).In addition, compared to MRAH-mFa55/MRAL-mk0, H0052-mFa55/L1083-ml0 only accumulates less soluble IL6R (Fig. 77).
Эти результаты позволяют предположить, что у мышей с опухолью переключаемые антитела обладают аналогичным или более сильным противоопухолевым действием, чем непереключаемые антитела; однако, в отличие от непереключаемых антител, переключаемые антитела не связываются с hIL6R в нормальных тканях. Результаты показывают, что даже если рак присутствовал, внеклеточные концентрации АТФ в нормальных тканях и крови недостаточно повышены, чтобы стимулировать связывание переключаемых антител.These results suggest that in tumor-bearing mice, switchable antibodies have similar or stronger antitumor effects than nonswitchable antibodies; however, unlike nonswitchable antibodies, switchable antibodies do not bind to hIL6R in normal tissues. The results show that even if cancer was present, extracellular ATP concentrations in normal tissues and blood are not elevated enough to stimulate the binding of switched antibodies.
Пример 16. АТФ-зависимая нейтрализующая активность анти-PD1 антител, обладающих АТФзависимыми связывающими свойствамиExample 16. ATP-dependent neutralizing activity of anti-PD1 antibodies having ATP-dependent binding properties
Тяжелые цепи и легкие цепи объединяют, как показано в табл. 68, для экспрессии и очистки антиPD-1 антител методами, известными специалистам в данной области.Heavy chains and light chains are combined as shown in Table. 68, for the expression and purification of anti-PD-1 antibodies by methods known to those skilled in the art.
Таблица 68Table 68
Комбинации тяжелых цепей и легких цепей антителCombinations of heavy chains and light chains of antibodies
Нейтрализующую активность антител, описанных в табл. 68, для взаимодействия PDL1-PD1 оценивают в соответствии с методами, приведенными ниже.Neutralizing activity of the antibodies described in table. 68, PDL1-PD1 interaction was assessed according to the methods below.
Первоначально антигены mPD1-G1CH2 (SEQ ID NO: 209) и mPDL1-G1dCH2His (SEQ ID NO: 210) были генетически синтезированы и инсертированы в плазмиды для экспрессии в животных. Антигенные белки экспрессируют и очищают описанными ниже методами. Полученные плазмиды вводят методом липофекции в линию FreeStyle 293-F (фирма Invitrogen), полученную из фетальных клеток почки человека (фирма Invitrogen), суспендированную в среде для экспрессии FreeStyle 293 (фирма Invitrogen) при соответствующей плотности, и высевают в колбы. Антигены очищают из культуральных супернатантов клеток, культивируемых в CO2-инкубаторе (37°C, 8% СО2, 125 об/мин) в течение четырех дней методом, известным специалистам в данной области. Спектрофотометры используют для измерения абсорбции очищенных растворов антигенов при 280 нм. Концентрации очищенных антигенов рассчитывают с использованием коэффициентов абсорбции, рассчитанных методом РАСЕ на основе полученных измеренных значений (Protein Science 4, 1995, 2411-2423).Initially, the mPD1-G1CH2 (SEQ ID NO: 209) and mPDL1-G1dCH2His (SEQ ID NO: 210) antigens were genetically synthesized and inserted into plasmids for expression in animals. Antigenic proteins are expressed and purified using the methods described below. The resulting plasmids are introduced by lipofection into the FreeStyle 293-F line (Invitrogen), obtained from human fetal kidney cells (Invitrogen), suspended in FreeStyle 293 expression medium (Invitrogen) at the appropriate density, and seeded in flasks. Antigens are purified from culture supernatants of cells cultured in a CO 2 incubator (37°C, 8% CO 2 , 125 rpm) for four days by a method known to those skilled in the art. Spectrophotometers are used to measure the absorbance of purified antigen solutions at 280 nm. Concentrations of purified antigens are calculated using absorption coefficients calculated by the PACE method from the measured values obtained (Protein Science 4, 1995, 2411-2423).
mPD1-G1CH2 (SEQ ID NO: 209), который представляет собой Fc-слитый PD1 мыши, разбавляют до 5 мкг/мл (55 нМ) раствором 0,1 М NaHCO3, 0,05% NaN3, и 100 мкл разбавленного раствора добавляют в 96-луночный планшет, оставляют на ночь при 4°C и иммобилизуют на поверхности планшета. После трехкратной промывки лунок ФСБ и 0,1% Tween20 в каждую лунку добавляли 250 мкл раствора БСА, разбавленного до 2% ФСБ, для блокирования поверхностей планшета. Затем трижды промывают. mPDL1-G1dCH2His (SEQ ID NO: 210), который представляет собой PDL1 мыши, слитый с Fc антитела и His-меткой, разводят в ФСБ до конечной концентрации 55 нМ; раствор антител, описанных в табл. 68, разбавленный до конечных концентраций 6,25, 1,56, 0,390, 0,0977, 0,0061 и 0 мкг/мл; и раствор АТФ, разбавленный до конечных концентраций 0, 1, 10 и 100 мкМ, смешивают до общего количества 100 мкл. Затем смесь добавляют в каждую лунку и оставляют при 37°C в течение одного часа. Затем каждую лунку трижды промывают 0,1% Tween20 и ФСБ, которые приготовлены с такой же концентрацией АТФ, что и концентрация АТФ в растворах, добавленных в каждую лунку. Анти-His-tag mAb-HRP-Direct (фирма MBL Life Science) разводят в 10000 раз в блокирующем буфере, чтобы он содержал ту же концентрацию АТФ, что и концентрация АТФ в растворах, добавленных в каждую лунку, из которых 100 мкл добавляют в каждую лунку, и оставляют при 37°C в течение одного часа. Затем каждую лунку трижды промыmPD1-G1CH2 (SEQ ID NO: 209), which is an Fc-fusion of mouse PD1, is diluted to 5 μg/ml (55 nM) with a solution of 0.1 M NaHCO 3 , 0.05% NaN 3 , and 100 μl diluted solution added to a 96-well plate, left overnight at 4°C and immobilized on the surface of the plate. After washing the wells three times with PBS and 0.1% Tween20, 250 μl of BSA solution diluted to 2% PBS was added to each well to block the plate surfaces. Then wash three times. mPDL1-G1dCH2His (SEQ ID NO: 210), which is mouse PDL1 fused to an Fc antibody and a His tag, is diluted in PBS to a final concentration of 55 nM; solution of antibodies described in table. 68, diluted to final concentrations of 6.25, 1.56, 0.390, 0.0977, 0.0061, and 0 μg/ml; and ATP solution diluted to final concentrations of 0, 1, 10, and 100 μM are mixed to a total amount of 100 μL. The mixture is then added to each well and left at 37°C for one hour. Each well is then washed three times with 0.1% Tween20 and PBS, which are prepared with the same concentration of ATP as the ATP concentration in the solutions added to each well. Anti-His-tag mAb-HRP-Direct (MBL Life Science) is diluted 10,000-fold in blocking buffer to contain the same ATP concentration as the ATP concentration in the solutions added to each well, of which 100 µl is added to each well and left at 37°C for one hour. Then wash each well three times
- 163 046075 вают 0,1% Tween20 и ФСБ, которые приготовлены с такой же концентрацией АТФ, что и концентрация АТФ в растворах, добавленных в каждую лунку. Затем в каждую лунку добавляли 100 мкл раствора ТМВ, и планшет оставляют при 37°C в течение одного часа, и в каждую лунку добавляют 50 мкл 1М H2SO4 для остановки реакции. Затем определяют абсорбцию в каждой лунки при 450 нм на микропланшетном ридере оптической плотности (фирма Wako Sunrise).- 163 046075 contain 0.1% Tween20 and PBS, which are prepared with the same ATP concentration as the ATP concentration in the solutions added to each well. Then, 100 μl of TMB solution was added to each well, and the plate was left at 37°C for one hour, and 50 μl of 1 M H 2 SO 4 was added to each well to stop the reaction. The absorbance of each well was then determined at 450 nm using a microplate absorbance reader (Wako Sunrise).
Величину абсорбции в лунке, свободной от антител, при тех же условиях концентрации АТФ устанавливают как 100% связывания PD1-PDL1, и оценивают степень, до которой скорость связывания снижается при добавлении антитела. Результаты показаны на фиг. 78 и 79.The amount of absorbance in an antibody-free well under the same ATP concentration conditions is set as 100% PD1-PDL1 binding, and the extent to which the rate of binding is reduced by the addition of antibody is assessed. The results are shown in Fig. 78 and 79.
Результаты показывают, что на нейтрализующую активность mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 при взаимодействии PD1/PDL-1 не влияют концентрации АТФ, тогда как нейтрализующая активность H5029-mFa31/L3021-ml0 и H5041-mFa31/L3021- ml0 становится сильнее при более высокой концентрации АТФ в анализах. Результаты подтвердили, что H5029-mFa31/L3021-ml0 и H5041-mFa31/L3021-ml0 обладают АТФ-зависимой связывающей активностью и нейтрализующей активностью.The results show that the neutralizing activity of mPD1F2VH-mF18/mPD1F2VL-mk1 upon PD1/PDL-1 interaction is not affected by ATP concentrations, whereas the neutralizing activity of H5029-mFa31/L3021-ml0 and H5041-mFa31/L3021-ml0 becomes stronger at higher ATP concentrations in analyses. The results confirmed that H5029-mFa31/L3021-ml0 and H5041-mFa31/L3021-ml0 have ATP-dependent binding activity and neutralization activity.
Систему анализа люциферазы (фирма Promega) используют для измерения нейтрализующей активности in vitro. Для эффекторной клетки используют вспомогательные клетки hPDL1-CHO для биотеста блокады PD-1/PD-L1, Core Kit (фирма Promega). В качестве клетки-мишени используют клетки JurkatNFAT-Luc2-mPD1, полученные авторами настоящего изобретения. Сначала ген гибридного белка внеклеточного mPD1 и внутриклеточного hPD1 (SEQ ID NO: 214) вводят в клетки Jurkat-NFAT-Luc2 (фирма Promega) методом, известным специалистам в данной области, для получения клеток Jurkat-NFAT-Luc2mPD1. Взаимодействие hPDL1 на hPDL1-CHO со слитым белком внеклеточного mPD1 и внутриклеточного hPDl на Jurkat-NFAT-Luc2-mPDl используют в качестве взаимодействия PD-1/PDL-1 для оценки нейтрализующей активности in vitro.The Luciferase Assay System (Promega) was used to measure neutralizing activity in vitro. For the effector cell, hPDL1-CHO auxiliary cells are used for the PD-1/PD-L1 blockade bioassay, Core Kit (Promega). JurkatNFAT-Luc2-mPD1 cells obtained by the authors of the present invention are used as the target cell. First, the extracellular mPD1 and intracellular hPD1 fusion protein gene (SEQ ID NO: 214) is introduced into Jurkat-NFAT-Luc2 cells (Promega) by a method known to those skilled in the art to obtain Jurkat-NFAT-Luc2mPD1 cells. The interaction of hPDL1 on hPDL1-CHO with the fusion protein of extracellular mPD1 and intracellular hPDl on Jurkat-NFAT-Luc2-mPDl is used as a PD-1/PDL-1 interaction to evaluate neutralizing activity in vitro.
В каждую лунку 96-луночного планшета добавляют 100 мкл из вспомогательного набора hPDL1CHO, который приготовлен до концентрации клеток 4х105/мл в среде, и планшет оставляют на ночь при 37°C. Для культуральной среды, 90% Ham's F-12, 10% ФСБ, применяют 250 мкг генетицина и 200 мкг гигромицина. Супернатанты удаляют из каждой лунки; 20 мкл раствора антител, описанных в табл. 68, разбавляют буфером для анализа до конечной концентрации 7,5 мкг/мл, смешивают с 20 мкл раствора АМФ, разбавленного буфером для анализа до конечных концентраций 0, 1, 10 и 100 мкМ, и 40 мкл раствора клеток NFAT-Luc2-hPD1-mPD1-Jurkat, приготовленного с буфером для анализа, для достижения количества клеток 5х104/лунку. Смесь добавляют в каждую лунку и оставляют при 37°C в течение четырех часов. В качестве буфера для анализа используют 98% RPMI 1640 и 2% ФСТ. Затем планшеты оставляют при комнатной температуре в течение 10 мин и в каждую лунку добавляют по 80 мкл реагента BioGlo. Для реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-glo (буфер и субстрат). Затем измеряют люминесценцию в каждой лунке с помощью планшет-ридера.To each well of a 96-well plate, add 100 μl of the hPDL1CHO accessory kit, which is prepared to a cell concentration of 4 x 10 5 /ml in the medium, and the plate is left overnight at 37°C. For the culture medium, 90% Ham's F-12, 10% PBS, 250 μg of geneticin and 200 μg of hygromycin were used. Supernatants are removed from each well; 20 µl of a solution of antibodies described in table. 68, diluted with assay buffer to a final concentration of 7.5 μg/ml, mixed with 20 μl of AMP solution diluted with assay buffer to final concentrations of 0, 1, 10 and 100 μM, and 40 μl of NFAT-Luc2-hPD1- cell solution mPD1-Jurkat prepared with assay buffer to achieve a cell count of 5 x 10 4 /well. The mixture is added to each well and left at 37°C for four hours. 98% RPMI 1640 and 2% FST are used as assay buffer. The plates are then left at room temperature for 10 minutes and 80 µl of BioGlo reagent is added to each well. For the Bio-Glo reagent, use the Bio-glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The luminescence in each well is then measured using a plate reader.
Величину люминесценции в каждой лунке при каждой концентрации АМФ, деленное на величину люминесценции лунки, свободной от антител, представляет собой кратность индукции, и она служит показателем активности каждого антитела по нейтрализации взаимодействия PD-1/PDL-1. Результаты показаны на фиг. 80. На фигуре кратность индукции обозначена как относительная световая единица (RLU).The amount of luminescence in each well at each AMP concentration divided by the amount of luminescence in the antibody-free well represents the fold induction and is an indication of the activity of each antibody in neutralizing the PD-1/PDL-1 interaction. The results are shown in Fig. 80. In the figure, the induction factor is designated as relative light unit (RLU).
АТФ тестируют так же, как АМФ, и 100 мл hPDL1-CHO, приготовленного в концентрации 4х 105/мл в среде, добавляют в каждую лунку 96-луночного планшета, и планшет оставляют при 37°C на ночь. В качестве питательной среды используют 90% Ham's F-12, 10% ФСБ, 250 мкг генетицина и 200 мкг гигромицина. Супернатанты удаляют из каждой лунки аспирацией; 20 мкл раствора антител, описанных в табл. 68, разбавляют буфером для анализа до конечной концентрации 10 мкг/мл, смешивают с 20 мкл раствора АТФ, разбавленного буфером для анализа до конечных концентраций 0, 12,5 и 125 мкМ, и 40 мкл суспензии клеток NFAT-Luc2-hPD1-mPD1-Jurkat, приготовленной с буфером для анализа для достижения количества клеток 5х104/лунку. Смесь добавляют в каждую лунку и оставляют при 37°C на четыре часа. В качестве буфера для анализа используют 98% RPMI 1640 и 2% ФСТ. Затем планшеты оставляют при комнатной температуре в течение 10 мин и в каждую лунку добавляют по 80 мкл реагента BioGlo. Для реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-glo (буфер и субстрат). Затем измеряют люминесценцию в каждой лунке с помощью планшет-ридера.ATP is tested in the same way as AMP, and 100 ml of hPDL1-CHO, prepared at a concentration of 4x 105/ml in medium, is added to each well of a 96-well plate, and the plate is left at 37°C overnight. The nutrient medium used is 90% Ham's F-12, 10% PBS, 250 μg of geneticin and 200 μg of hygromycin. Supernatants are removed from each well by aspiration; 20 µl of a solution of antibodies described in table. 68, diluted with assay buffer to a final concentration of 10 μg/ml, mixed with 20 μl of ATP solution diluted with assay buffer to final concentrations of 0, 12.5 and 125 μM, and 40 μl of NFAT-Luc2-hPD1-mPD1- cell suspension Jurkat, prepared with assay buffer to achieve a cell count of 5 x 10 4 /well. The mixture is added to each well and left at 37°C for four hours. 98% RPMI 1640 and 2% FST are used as assay buffer. The plates are then left at room temperature for 10 minutes and 80 µl of BioGlo reagent is added to each well. For the Bio-Glo reagent, use the Bio-glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The luminescence in each well is then measured using a plate reader.
Значение люминесценции в каждой лунке при каждой концентрации АМФ, деленное на величину люминесценции в лунке, свободной от антител, представляет собой кратность индукции, и она служит в качестве показателя для оценки активности каждого антитела по нейтрализации взаимодействия PD1/PDL-1. Результаты показаны на фиг. 81. На рисунке кратность индукции обозначена как относительная световая единица (RLU).The luminescence value in each well at each AMP concentration divided by the luminescence value in the antibody-free well represents the fold induction and serves as a metric for assessing the activity of each antibody in neutralizing the PD1/PDL-1 interaction. The results are shown in Fig. 81. In the figure, the induction factor is designated as relative luminous unit (RLU).
Пример 17. АТФ-зависимая ADCC-опосредованная противоопухолевая активность анти-PD1 антител, обладающих АТФ-зависимыми связывающими свойствами.Example 17. ATP-dependent ADCC-mediated antitumor activity of anti-PD1 antibodies having ATP-dependent binding properties.
Тяжелые цепи и легкие цепи объединяют, как показано в табл. 69, для экспрессии и очистки антиPD-1 антител методами, известными специалистам в данной области.Heavy chains and light chains are combined as shown in Table. 69, for the expression and purification of anti-PD-1 antibodies by methods known to those skilled in the art.
- 164 046075- 164 046075
Таблица 69Table 69
Комбинации тяжелых цепей и легких цепей антителCombinations of heavy chains and light chains of antibodies
Константные области тяжелой цепи этих антител модифицированы до mFa55, который усиливает активность ADCC путем добавления модификаций, усиливающих связывание FcyRIV с mIgG2a. Следовательно, считают возможным проявить активность ADCC в отношении клеток, экспрессирующих PD-1, и удалить клетки, экспрессирующие PD-1. Антитела используют для оценки противоопухолевой активности in vivo и для оценки элиминации клеток, экспрессирующих PD-1, в соответствии с приведенными ниже методами.The heavy chain constant regions of these antibodies are modified to mFa55, which enhances ADCC activity by adding modifications that enhance FcyRIV binding to mIgG2a. Therefore, it is considered possible to exert ADCC activity on cells expressing PD-1 and to remove cells expressing PD-1. Antibodies are used to assess antitumor activity in vivo and to assess the elimination of cells expressing PD-1, in accordance with the methods below.
Линию колоректального рака мыши Colon38 (NCI) имплантируют в количестве 5х106 с Matrigel (фирма Corning) подкожно в правую часть живота мышей C57BL/6J (фирма Japan Charles River) для образования солидных опухолей. На четырнадцатый день после имплантации IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1 вводят внутривенно (в/в) в дозе 15 мг/кг, mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL-mk1 в дозе 1,5, 5 и 15 мг/кг и H5041-mFa55/L3023-ml0 в дозе 25,5 и 100 мг/кг, соответственно (n=7 на группу). Кроме того, на 17-й день после трансплантации в группе H5041-mFa55/L3023-ml0 мышам вводят те же антитела внутривенно (в/в) в дозах 25,5 и 100 мг/кг, соответственно. В результате противоопухолевый эффект наблюдают во всех группах введения антител, за исключением группы отрицательного контроля (фиг. 82).The mouse colorectal cancer line Colon38 (NCI) was implanted at 5x10 6 with Matrigel (Corning) subcutaneously into the right abdomen of C57BL/6J mice (Japan Charles River) to form solid tumors. On the fourteenth day after implantation, IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1 was administered intravenously (IV) at a dose of 15 mg/kg, mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL-mk1 at a dose of 1.5, 5 and 15 mg/kg and H5041-mFa55/ L3023-ml0 at a dose of 25.5 and 100 mg/kg, respectively (n=7 per group). In addition, on day 17 after transplantation, mice in the H5041-mFa55/L3023-ml0 group were administered the same antibodies intravenously (IV) at doses of 25.5 and 100 mg/kg, respectively. As a result, the antitumor effect was observed in all groups of antibody administration, with the exception of the negative control group (Fig. 82).
Элиминацию PD1-экспрессирующих клеток в опухолевой ткани после введения соответствующих антител оценивают с помощью жидкостной цитометрии. Солидным опухолям Colon38 дают возможность сформироваться, как описано выше, и на 14-й день после имплантации IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1 (изотипический контроль) вводят внутривенно (в/в) в дозе 15 мг/кг, mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL-mk1 в дозе 1,5, 5 и 15 мг/кг, и H5041-mFa55/L3023-ml0 в дозе 25,5 и 100 мг/кг, соответственно (n=3 на группу). Ткани селезенки и опухоли каждой мыши собирают через три дня после введения антитела. Селезенки измельчают пинцетом, добавляют 10% ФСБ-дополненную среду RPMI 1640 и центрифугируют при 400 х g в течение 5 мин, после чего супернатант удаляют. Добавляют 2 мл лизирующего буфера ACK (фирма Thermo Fisher Scientific) и оставляют при комнатной температуре на 2,5 мин, гемолизированный образец используют в качестве клеток селезенки для анализа методом жидкостной цитометрии. Ткань опухоли измельчают ножницами с последующим добавлением ферментов в соответствии с протоколом набора для диссоциации опухолей Tumor Dissociation Kit (фирма Miltenyi), а затем измельчают с помощью мягкого диссоциатора MACS (фирма Miltenyi Biotec). С добавлением 10% ФСБ-дополненной среды RPMI 1640 ее центрифугируют при 400 х g в течение 5 мин, супернатант удаляют и используют для анализа методом жидкостной цитометрии в качестве опухолевых клеток. Клетки селезенки и опухолевые клетки переносят в планшет с V-образным дном (фирма Corning), центрифугируют при 400 х g в течение 5 мин и супернатант удаляют. Клетки ресуспендируют в 100 мкл реагента, блокирующего FcR (фирма Miltenyi Biotec), разведенного в 10 раз в ФСБ (буфер FACS), содержащем 1% ФСТ и 2 мМ EDTA (фирма Sigma). После инкубирования клеток при комнатной температуре в течение 10 мин, 0,4 мкл BUV737 Anti-Mouse CD3e (фирма BD), 0,1 мкл Zombie Aqua (фирма Biolegend), 0,4 мкл PerCP/Cy5.5 Anti-Mouse CD8a (фирма Biolegend), 0,4 мкл РЕ/Су7 Anti-Mouse CD4 (фирма Biolegend), 0, 2 мкл APCR700 против CD45 мыши (фирма BD), 0,4 мкл FITC против CD278 человека/мыши/крысы (фирма Biolegend), 0,4 мкл АРС/FireTM 750 против CD25 мыши (фирма Biolegend) и 0,4 мкл АРС антимышиного CD279 (фирма Biolegend), который, как уже было подтверждено, не конкурирует с каждым из введенных антител PD1, добавляют в каждую лунку, и буфер FACS добавляют по 20 мкл/лунку. Через 30 мин инкубирования при 4°C добавляют 100 мкл буфера FACS, центрифугируют в режиме 400 xg в течение 5 мин и удаляют супернатант. В соответствии с протоколом из набора буферов для окрашивания Foxp3/транскрипционного фактора (фирма eBioscience), концентрат фиксации/проницаемости и разбавитель фиксации/проницаемости смешивают и по 200 мкл смеси вносят в каждое лунку. После инкубации при 4°C в течение 30 мин и центрифугирования при 400 х g в течение 5 мин супернатант удаляют. Добавляют буфер для пермеабилизации в количестве 200 мкл и после центрифугирования в режиме 400xg в течение 5 мин супернатант удаляют. Эту процедуру промывки повторяют еще раз. eFluor450 AntiMouse/Rat Foxp3 (фирма eBioscience) в количестве 0,4 мкл и РЕ Anti-Mouse CD152 (фирма BD) в концентрации 0,4 мкл добавляют в каждую лунку, буфер FACS добавляют в количестве 20 мкл/лунку. После инкубации при 4°C в течение 30 мин добавляют 100 мкл буфера FACS и после центрифугирования при 400 х g в течение 5 мин супернатант удаляют. Буфер для пермеабилизации добавляют в каждую лунку на 200 мкл, и после центрифугирования при 400 х g в течение 5 мин супернатант удаляют. Образцы ресуспендируют в 200 мкл буфера FACS и измеряют в жидкостном цитометре FACS Fortessa (фирма BD). ДляElimination of PD1-expressing cells in tumor tissue after administration of appropriate antibodies is assessed using liquid cytometry. Solid Colon38 tumors are allowed to form as described above, and on day 14 after implantation, IC17HdK-mFa55/IC17L-mk1 (isotype control) is administered intravenously (IV) at a dose of 15 mg/kg, mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL- mk1 at a dose of 1.5, 5 and 15 mg/kg, and H5041-mFa55/L3023-ml0 at a dose of 25.5 and 100 mg/kg, respectively (n=3 per group). Spleen and tumor tissues from each mouse were collected three days after antibody administration. The spleens are crushed with tweezers, 10% PBS-supplemented RPMI 1640 medium is added and centrifuged at 400 x g for 5 min, after which the supernatant is removed. Add 2 ml of lysis buffer ACK (Thermo Fisher Scientific) and leave at room temperature for 2.5 minutes, the hemolyzed sample is used as spleen cells for liquid cytometry analysis. The tumor tissue is minced with scissors followed by the addition of enzymes according to the protocol of the Tumor Dissociation Kit (Miltenyi) and then minced using a MACS soft dissociator (Miltenyi Biotec). With the addition of 10% PBS-supplemented RPMI 1640 medium, it is centrifuged at 400 x g for 5 minutes, the supernatant is removed and used for liquid cytometry analysis as tumor cells. Spleen cells and tumor cells are transferred to a V-bottom plate (Corning), centrifuged at 400 x g for 5 minutes, and the supernatant is removed. Cells are resuspended in 100 μl of FcR blocking reagent (Miltenyi Biotec), diluted 10 times in PBS (FACS buffer) containing 1% FST and 2 mM EDTA (Sigma). After incubating the cells at room temperature for 10 min, 0.4 µl BUV737 Anti-Mouse CD3e (BD), 0.1 µl Zombie Aqua (Biolegend), 0.4 µl PerCP/Cy5.5 Anti-Mouse CD8a ( Biolegend), 0.4 µl PE/Cy7 Anti-Mouse CD4 (Biolegend), 0.2 µl APCR700 anti-mouse CD45 (BD), 0.4 µl FITC anti-human/mouse/rat CD278 (Biolegend), 0.4 μl of anti-mouse CD25 APC/FireTM 750 (Biolegend) and 0.4 μl of anti-mouse CD279 APC (Biolegend), which has already been confirmed not to compete with each of the administered PD1 antibodies, are added to each well, and FACS buffer is added at 20 μl/well. After 30 min of incubation at 4°C, add 100 μl of FACS buffer, centrifuge at 400 xg for 5 min, and remove the supernatant. According to the protocol from the Foxp3/transcription factor staining buffer kit (eBioscience), fixation/permeabilization concentrate and fixation/permeabilization diluent were mixed and 200 μl of the mixture was added to each well. After incubation at 4°C for 30 min and centrifugation at 400 x g for 5 min, the supernatant was removed. Permeabilization buffer is added in an amount of 200 μl and after centrifugation at 400xg for 5 minutes, the supernatant is removed. This washing procedure is repeated again. eFluor450 AntiMouse/Rat Foxp3 (eBioscience) in an amount of 0.4 μl and PE Anti-Mouse CD152 (BD) in a concentration of 0.4 μl are added to each well, FACS buffer is added in an amount of 20 μl/well. After incubation at 4°C for 30 min, 100 μl of FACS buffer was added and after centrifugation at 400 x g for 5 min, the supernatant was removed. Permeabilization buffer is added to each well at 200 μl, and after centrifugation at 400 x g for 5 min, the supernatant is removed. Samples are resuspended in 200 μl FACS buffer and measured in a FACS Fortessa liquid cytometer (BD). For
- 165 046075 анализа экспрессии используют программное обеспечение FlowJo. CD4-положительные клетки, проходящие в популяции клеток, подлежат анализу, для анализа экспрессии Foxp3 и PD1. Уровень экспрессии PD1 в популяции клеток CD4+ Foxp3- рассчитывают по интенсивности флуоресценции. В результате уровень экспрессии PD1 как в клетках селезенки, так и в опухолевых клетках проявляет тенденцию к снижению в группах, в которых мышам вводили 5 и 15 мг/кг mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL-mk1, но не в группах, в которых вводили 25,5 и 100 мг/кг H5041-mFa55/L3023-ml0, где уровень экспрессии PD1 имел тенденцию к снижению только в опухолевых клетках (фиг. 83А и Б). Подтверждают, что все переключаемые антитела, которые связываются с PD1 АТФ-зависимым образом, проявляют лекарственную эффективность против опухоли, в то время как системный ответ (снижение уровня экспрессии PD1) не происходит, и было подтверждено, что переключаемые антитела способны проявлять специфическую активность в участке опухоли.- 165 046075 expression analysis using FlowJo software. CD4-positive cells passing through the cell population are analyzed to analyze the expression of Foxp3 and PD1. The level of PD1 expression in the CD4 + Foxp3 − cell population is calculated from fluorescence intensity. As a result, the expression level of PD1 in both spleen cells and tumor cells tended to decrease in groups in which mice were administered 5 and 15 mg/kg mPD1F2VH-mFa55/mPD1F2VL-mk1, but not in groups in which mice were administered 25. 5 and 100 mg/kg H5041-mFa55/L3023-ml0, where the expression level of PD1 tended to decrease only in tumor cells (Fig. 83A and B). All switch antibodies that bind to PD1 in an ATP-dependent manner were confirmed to exhibit drug efficacy against the tumor while systemic response (downregulation of PD1 expression) did not occur, and switch antibodies were confirmed to be able to exhibit site-specific activity tumors.
Пример 18. Анализ кристаллической структуры hIL6R-связывающих антител, обладающих АТФзависимыми связывающими свойствами.Example 18. Analysis of the crystal structure of hIL6R-binding antibodies having ATP-dependent binding properties.
Проводят рентгеноструктурный анализ комплекса АТФ, внеклеточного домена hIL6R (shIL6R) и фрагмента Fab антитела H0041L1088, связывающегося с рецептором человека IL6 (hIL6R) (переключатель АТФ), полученного в примере 13.X-ray diffraction analysis of the ATP complex, the extracellular domain of hIL6R (shIL6R) and the Fab fragment of the antibody H0041L1088 binding to the human IL6 receptor (hIL6R) (ATP switch) obtained in Example 13 was carried out.
(18-1) Получение антител H0041L1088 полной длины.(18-1) Preparation of full-length antibody H0041L1088.
Получение и очистка антител полной длины H0041L1088 (VH: SEQ ID NO: 194; СН: SEQ ID NO: 217, VL: SEQ ID NO: 195, CL: SEQ ID NO: 189), имеющих формат IgG1 человека, выполняют методами, известные специалистам в данной области.Preparation and purification of full-length antibodies H0041L1088 (VH: SEQ ID NO: 194; CH: SEQ ID NO: 217, VL: SEQ ID NO: 195, CL: SEQ ID NO: 189), having the human IgG1 format, is performed by methods known specialists in this field.
(18-2) Получение фрагментов Fab H0041L1088.(18-2) Preparation of Fab H0041L1088 fragments.
Образец антитела полной длины H0041L1088 фрагментируют на Fab и Fc с использованием папаина (фирма SIGMA-ALDRICH, 10108014001) в условиях 35°C, примерно в течение 18 ч, а затем подвергают очистке на колонке на HiTrap SP HP 1 мл (фирма GE Healthcare) и HiTrap MabSelect SuRe 1 мл (фирма GE Healthcare), а также очистке SEC с помощью HiLoad 16/600 Superdex 200 пг (фирма GE Healthcare) для получения образцов Fab.Full length antibody sample H0041L1088 is fragmented into Fab and Fc using papain (SIGMA-ALDRICH, 10108014001) at 35°C for approximately 18 hours and then purified on a HiTrap SP HP 1 ml column (GE Healthcare) and HiTrap MabSelect SuRe 1 ml (GE Healthcare), and SEC purification using HiLoad 16/600 Superdex 200 pg (GE Healthcare) to obtain Fab samples.
(18-3) Получение shIL6R.(18-3) Preparation of shIL6R.
Основываясь на аминокислотной последовательности UniProtKB: P08887 (IL6RA_HUMAN) (SEQ ID NO: 213), его домены 2 и 3 (аминокислоты 111-320) были получены генетически и включены в векторы экспрессии. Для синтеза гена сигнальная последовательность для экспрессии секреции добавлена на N-конце, метки FLAG tag + Hisx8 tag добавлены на С-конце для очистки, и была введена модификация C193S для устранения несовершенства пар Cys-Cys. который является результатом удаления домена 1. Экспрессию белка с помощью системы экспрессии Expi293TM (фирма Thermo Fisher Scientific) выполняют в присутствии кифуненсина (фирма Santa Cruz Biotechnology) с использованием полученных плазмид экспрессии и супернатанта культуры экспрессии, содержащего исследуемый белок. Из этого образца shIL6R получают путем аффинной очистки с помощью колонки для очистки cOmplete™ His-Tag Purification объемом 5 мл (фирма SIGMA-ALDRICH), а также очистки SEC с помощью HiLoad 16/600 Superdex 200 пг (фирма GE Healthcare).Based on the amino acid sequence of UniProtKB: P08887 (IL6RA_HUMAN) (SEQ ID NO: 213), its domains 2 and 3 (amino acids 111-320) were genetically generated and included in expression vectors. For gene synthesis, a secretion expression signal sequence is added at the N-terminus, a FLAG tag + Hisx8 tag is added at the C-terminus for purification, and a C193S modification was introduced to eliminate the imperfection of Cys-Cys pairs. which results from the removal of domain 1. Protein expression using the Expi293TM expression system (Thermo Fisher Scientific) is performed in the presence of kifunensin (Santa Cruz Biotechnology) using the resulting expression plasmids and the expression culture supernatant containing the protein of interest. From this sample, shIL6R was prepared by affinity purification using a 5 mL cOmplete™ His-Tag Purification column (SIGMA-ALDRICH) and SEC purification using a HiLoad 16/600 Superdex 200 pg (GE Healthcare).
(18-4) Получение тройного комплекса H0041L1088 Fab-shIL6R-АТФ.(18-4) Preparation of the H0041L1088 Fab-shIL6R-ATP ternary complex.
В образец shIL6R добавляют эндогликозидазу F1 (EndoF1) для расщепления цепи сахара N-типа и энтерокиназу (фирма SIGMA-ALDRICH, 11334115001) для отщепления метки Hisx8 tag, оставляют стоять при комнатной температуре в течение одного дня и затем проводят сквозную обработку в колонке HisTrap EXCEL объемом 1 мл (фирма GE Healthcare) и SEC очистку Superdex 200 Increase 10/300 GL (фирма GE Healthcare). После добавления образца Fab H0041L1088 полученную очищенную фракцию обогащают ультрафильтрацией и очисткой SEC с помощью Superdex 200 Increase 10/300 GL (фирма GE Healthcare) с использованием 20 мМ HEPES, рН 7,3, 100 мМ NaCl, 0,5 мМ АТФ в качестве буфера для подготовки сложных (комплексных) образцов. Комплексные образцы для кристаллизации получают путем обогащения ультрафильтрацией полученных очищенных фракций.Endoglycosidase F1 (EndoF1) is added to the shIL6R sample to cleave the N-type sugar chain and enterokinase (SIGMA-ALDRICH, 11334115001) to cleave the Hisx8 tag, left to stand at room temperature for one day and then run-through on a HisTrap EXCEL column. volume 1 ml (GE Healthcare) and SEC purification Superdex 200 Increase 10/300 GL (GE Healthcare). After addition of Fab H0041L1088 sample, the resulting purified fraction was enriched by ultrafiltration and SEC purification using Superdex 200 Increase 10/300 GL (GE Healthcare) using 20 mM HEPES, pH 7.3, 100 mM NaCl, 0.5 mM ATP buffer for the preparation of complex (complex) samples. Complex samples for crystallization are obtained by ultrafiltration enrichment of the resulting purified fractions.
(18-5) Получение кристаллов тройного комплекса H0041L1088 Fab-shIL6R-АТФ.(18-5) Preparation of crystals of the H0041L1088 Fab-shIL6R-ATP ternary complex.
Кристаллизацию методом диффузии паров в сидячей капле проводят при температуре 21°C с использованием комплексных образцов для кристаллизации в резервуарных условиях в растворе 60 мМ Трис, рН 7,5, 12,0% мас./об. полиэтиленгликоля 1500 (полиэтиленгликоль 1500), 60 мМ сульфата аммония; были получены кристаллы, пригодные для рентгеноструктурного анализа.Sessile drop vapor diffusion crystallization was performed at 21°C using complex tank crystallization samples in 60 mM Tris, pH 7.5, 12.0% w/v. polyethylene glycol 1500 (polyethylene glycol 1500), 60 mM ammonium sulfate; Crystals suitable for X-ray diffraction analysis were obtained.
(18-6) Измерение данных дифракции рентгеновских лучей от кристаллов тройного комплекса FabshIL6R-ATP H0041L1088 и определение кристаллических структур.(18-6) Measurement of X-ray diffraction data from crystals of the FabshIL6R-ATP H0041L1088 ternary complex and determination of crystal structures.
Полученные кристаллы погружают в раствор 68 мМ Трис, рН 7,5, 13,6% мас./об. полиэтиленгликоля 1500 (полиэтиленгликоль 1500), 68 мМ сульфата аммония, 14,6% этиленгликоля и 0,375 мМ АТФ, и затем замораживали в жидком азоте. Данные рентгеновской дифрактометрии измеряют в установке радиационного света Научно-исследовательской организации по ускорителям высоких энергий (High Energy Accelerator Research Organization), Photon Factory BL-17A. Во время измерения кристаллы постоянно помещали в поток азота с температурой -178°C для поддержания замороженного состояния. ПолученныеThe resulting crystals are immersed in a solution of 68 mM Tris, pH 7.5, 13.6% w/v. polyethylene glycol 1500 (polyethylene glycol 1500), 68 mM ammonium sulfate, 14.6% ethylene glycol and 0.375 mM ATP, and then frozen in liquid nitrogen. X-ray diffraction data are measured in the High Energy Accelerator Research Organization radiation light facility, Photon Factory BL-17A. During measurements, the crystals were continuously placed in a nitrogen stream at -178°C to maintain a frozen state. Received
- 166 046075 дифрагированные изображения обрабатывают с помощью autoPROC ((Acta Cryst. D67, 2011, 293-302) и получают данные по интенсивности дифракции с разрешением до 2,76 Ангстрем.- 166 046075 diffracted images are processed using autoPROC ((Acta Cryst. D67, 2011, 293-302) and diffraction intensity data is obtained with a resolution of up to 2.76 Angstroms.
Используя полученные данные интенсивности дифракции рентгеновских лучей, исходную структуру определяют методом молекулярного замещения с использованием Phaser (J. Appl. Cryst., 40, 2007', 658-674), используя кристаллические структуры известных Fab и shIL6R PDB. ID=1N26 как поисковые модели. Впоследствии построение и уточнение модели с помощью coot (Acta Cryst. D66, 2010, 486-501) и refmac5 (Acta Cryst. D67, 2011, 355-367), a также phenix.refine (Acta Cryst. D68, 2012, 352- 367) повторяют, что приводит к окончательному уточнению координат. Кристаллографическая статистика представлена в табл. 70. Следует отметить, что среди координат кристаллической структуры, номера остатков аминокислот в Fab даны по схеме нумерации Kabat, а номера остатков аминокислот в антигене, shIL6R, даны, чтобы соответствовать номерам остатков аминокислот в UniProtKB: P08887 (IL6RA_HUMAN). Хотя есть два комплекса в асимметричных единицах этого кристалла, в домене 2 shIL6R наблюдают специализированную димеризацию, называемую перестановкой доменов. Такие димеры не обнаруживаются в кристаллических структурах shIL6R PDB ID=1N26, что делает их уникальными для используемых в настоящем изобретении конструкций shIL6R.Using the obtained X-ray diffraction intensity data, the parent structure is determined by molecular displacement using Phaser (J. Appl. Cryst., 40, 2007', 658-674), using the crystal structures of the known Fab and shIL6R PDB. ID=1N26 as search models. Subsequently, building and refining the model using coot (Acta Cryst. D66, 2010, 486-501) and refmac5 (Acta Cryst. D67, 2011, 355-367), as well as phenix.refine (Acta Cryst. D68, 2012, 352- 367) are repeated, which leads to the final clarification of the coordinates. Crystallographic statistics are presented in table. 70. It should be noted that among the crystal structure coordinates, the amino acid residue numbers in Fab are given according to the Kabat numbering scheme, and the amino acid residue numbers in the antigen, shIL6R, are given to correspond to the amino acid residue numbers in UniProtKB: P08887 (IL6RA_HUMAN). Although there are two complexes in the asymmetric units of this crystal, a specialized dimerization called domain shuffling is observed in domain 2 of shIL6R. Such dimers are not found in the crystal structures of shIL6R PDB ID=1N26, making them unique to the shIL6R constructs used in the present invention.
Таблица 70Table 70
(18-7) Взаимодействие между H0041L1088 и АТФ.(18-7) Interaction between H0041L1088 and ATP.
На фиг. 84, АТФ распознается в первую очередь тяжелой цепью антитела. В частности, часть аденинового кольца АТФ распознается каждой боковой цепью CDR1 тяжелой цепи антитела: T33, CDR3: Y95, L98, N100B и W100C, а также каждой основной цепью G96, L100A и W100C. В частности, водородные связи образуются между карбонильным кислородом основной цепи G96 и L100A и NH2 в положении 6 NH2 АТФ, а также между NH группой амида основной цепи W100C и N положением 1 АТФ; и взаимодействия, такие как СН-пи (π) и π-π образуется между боковыми цепями Y95, L98 и W100C и остатком аденинового кольца. Антитело надежно распознает фрагмент аденинового кольца АТФ. Фрагмент рибозы распознается ван-дер-ваальсовыми взаимодействиями с соответствующими боковыми цепями CDR1 тяжелой цепи: T33 и CDR2: Н56 и Y58. Фрагмент трифосфорной группы распознается боковыми цепями CDR2 тяжелой цепи: S52, S52A, Y55 и Н56, а также основной цепью S52A и Q53. В частности, боковая цепь S52 и боковая цепь S52A, а также NH-группа основной цепи и NH-группа основной цепи Q53 образуют плотную сеть водородных связей с фрагментом трифосфорной группы, которые играют решающую роль в распознавании фрагментов трифосфорной группы.In fig. 84, ATP is recognized primarily by the antibody heavy chain. Specifically, the adenine ring portion of ATP is recognized by each side chain of the antibody heavy chain CDR1: T33, CDR3: Y95, L98, N100B, and W100C, and each of the main chains of G96, L100A, and W100C. Specifically, hydrogen bonds are formed between the backbone carbonyl oxygen of G96 and L100A and the NH2 at position 6 of NH 2 ATP, as well as between the NH group of the backbone amide W100C and the N position 1 of ATP; and interactions such as CH-pi (π) and π-π are formed between the side chains of Y95, L98 and W100C and the adenine ring residue. The antibody reliably recognizes a fragment of the adenine ring of ATP. The ribose moiety is recognized by van der Waals interactions with the corresponding side chains of the heavy chain CDR1: T33 and CDR2: H56 and Y58. The triphosphate moiety is recognized by the heavy chain CDR2 side chains: S52, S52A, Y55, and H56, as well as the main chain, S52A and Q53. In particular, the side chain of S52 and the side chain of S52A, as well as the main chain NH group and the main chain NH group of Q53 form a dense network of hydrogen bonds with the triphosphor group moiety, which play a crucial role in the recognition of triphosphor group moieties.
- 167 046075 (18-8) Взаимодействие между H0041L1088 и hIL6R.- 167 046075 (18-8) Interaction between H0041L1088 and hIL6R.
На основании настоящей кристаллической структуры аминокислотные остатки shIL6R, содержащие один или несколько неводородных атомов, расположенных на расстояниях в пределах 4,2 Ангстрем от Fab или АТФ H0041L1088, выбраны в качестве остатков эпитопа, и они показаны на аминокислотной последовательности shIL6R. (фиг. 85). Детали взаимодействий этих остатков эпитопа с антителом показаны на фиг. 86 и 87. Эти остатки эпитопа образуют ван-дер-ваальсовы взаимодействия, водородные связи, электростатические взаимодействия и т.д. с остатками CDR1 легкой цепи: D27B, G28, D29, А31 и Y32, и CDR3: R91, S92, Р93, G94 и Р95, и CDR2 тяжелой цепи: Н56 и Y58 и CDR3: L98, Y99, N100B и W100C антитела; и они прочно связаны с антителом.Based on the present crystal structure, amino acid residues of shIL6R containing one or more non-hydrogen atoms located at distances within 4.2 Angstroms from Fab or ATP H0041L1088 were selected as epitope residues, and they are shown in the amino acid sequence of shIL6R. (Fig. 85). Details of the interactions of these epitope residues with the antibody are shown in FIG. 86 and 87. These epitope residues form van der Waals interactions, hydrogen bonds, electrostatic interactions, etc. with light chain CDR1 residues: D27B, G28, D29, A31 and Y32, and CDR3: R91, S92, P93, G94 and P95, and heavy chain CDR2: H56 and Y58 and CDR3: L98, Y99, N100B and W100C antibodies; and they are tightly bound to the antibody.
(18-9) АТФ-зависимый антигенсвязывающий механизм Кроме того, при связывании Fab-shIL6R H0041L1088, как показано на фиг. 86 и 87, образуется большой межмолекулярный контакт между F298 shIL6R и АТФ, который связывается с Fab H0041L1088. Поскольку это взаимодействие теряется в АТФнесвязанном состоянии, предполагают, что это прямое взаимодействие между антигеном и АТФ, который связывается с Fab H0041L1088, является основным фактором АТФ-зависимого связывания. Полагают, что структурно АТФ способствует структурной стабилизации CDR3 тяжелой цепи за счет водородных связей и ван-дер-ваальсовых взаимодействий с остатками CDR3 тяжелой цепи. Полагают, что стабилизация структуры CDR3 тяжелой цепи в ее антиген-связанной форме путем связывания АТФ приводит к значительному усилению прямого взаимодействия CDR3: L98 или Y99 тяжелой цепи с shIL6R, тем самым внося вклад в АТФ-зависимое связывание.(18-9) ATP-Dependent Antigen-Binding Mechanism Additionally, upon binding of Fab-shIL6R H0041L1088, as shown in FIG. 86 and 87, a large intermolecular contact is formed between F298 shIL6R and ATP, which binds to Fab H0041L1088. Because this interaction is lost in the ATP-unbound state, it is proposed that this direct interaction between the antigen and ATP that binds to Fab H0041L1088 is the primary driver of ATP-dependent binding. Structurally, ATP is believed to contribute to the structural stabilization of heavy chain CDR3 through hydrogen bonding and van der Waals interactions with heavy chain CDR3 residues. It is believed that stabilization of the heavy chain CDR3 structure in its antigen-bound form by ATP binding results in a significant enhancement of the direct interaction of the heavy chain CDR3:L98 or Y99 with shIL6R, thereby contributing to ATP-dependent binding.
Пример 19. Повышение агонистической активности модифицированными анти-CD137 антителами. (19-1) Получение антител для оценки.Example 19. Enhancement of agonistic activity by modified anti-CD137 antibodies. (19-1) Obtaining antibodies for evaluation.
Что касается случая, когда различные модификации аминокислот для увеличения pI были введены в константную область тяжелой цепи с повышенной активностью связывания с FcYRIIb, оценивают влияние таких модификаций аминокислот на активность агониста CD137 и на кинетику плазмы и эффективность лекарственного средства в hCD137KI/mFcYR2bKO/hFcYR2bTg # 90. Во-первых, как описано в примере 7-1, примере 7-2 и примере 7-3, получают A375-MY201aPh/B167-Lamlib, A375-SCF041aPh/B167Lamlib, A375-SCF057aPh/B167-Lamlib и IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0.Regarding the case where various amino acid modifications to increase pI were introduced into the heavy chain constant region with increased FcYRIIb binding activity, the effect of such amino acid modifications on CD137 agonist activity and on plasma kinetics and drug efficacy in hCD137KI/mFcYR2bKO/hFcYR2bTg #90 is assessed. First, as described in Example 7-1, Example 7-2 and Example 7-3, A375-MY201aPh/B167-Lamlib, A375-SCF041aPh/B167Lamlib, A375-SCF057aPh/B167-Lamlib and IC17HdK-MY201aPh/ are prepared. IC17L-k0.
(19-2) Оценка in vitro АТФ-зависимой агонистической активности CD137 модифицированных антител против CD137 человека с использованием анализа репортерного гена 4-1ВВ Jurkat.(19-2) In vitro assessment of the ATP-dependent CD137 agonist activity of modified anti-human CD137 antibodies using the 4-1BB Jurkat reporter gene assay.
Что касается случая, когда различные модификации аминокислот для увеличения pI введены в константную область тяжелой цепи с повышенной активностью связывания с FcYRIIb, чтобы оценить влияние таких модификаций аминокислот на активность агониста CD137 оценивают активность агониста CD137 A375-MY201aPh/B167-Lamlib, A375-SCF041aPh/B167-Lamlib, A375-SCF057aPh/B167-Lamlib и IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0.Regarding the case where various amino acid modifications to increase pI are introduced into the constant region of the heavy chain with increased binding activity to FcYRIIb, in order to evaluate the effect of such amino acid modifications on the activity of the CD137 agonist, the activity of the CD137 agonist A375-MY201aPh/B167-Lamlib, A375-SCF041aPh/ is assessed. B167-Lamlib, A375-SCF057aPh/B167-Lamlib and IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0.
Клеточную линию GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat (фирма Promega, CS196004) используют для измерения активности вырабатываемых антител in vitro. В каждую лунку 96-луночного планшета добавляют 200 мкл клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), приготовленных в концентрации 5х104/мл с культуральной средой, и планшет оставляют на ночь в инкубаторе в атмосфере 5% CO2 при 37°C. В качестве питательной среды используют культуральную среду СНО (90% Ham's F12, 10% ФСБ). Затем всю культуральную среду удаляют отсасыванием, после чего 25 мкл клеточной линии GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat, приготовленной с концентрацией 2х106 клеток/мл со средой для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ) добавляют в каждую лунку. Затем добавляют 25 мкл каждого из растворов антител, разбавленных аналитической средой до конечной концентрации 0, 0,001, 0,01, 0,1, 1 и 10 мкг/мл. Потом добавляют 25 мкл раствора АТФ, разбавленного аналитической средой до конечной концентрации 250 мкМ. Планшет оставляют на 6 ч в инкубаторе в атмосфере 5% CO2 при 37°C, а затем оставляют на 15 мин при комнатной температуре, и в каждую лунку добавляют 75 мкл реагента Bio-Glo. Для реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат). После этого с помощью планшет-ридера определяют относительную световую единицу каждой лунки. Величину люминесценции в каждой лунке, деленную на величину люминесценции в лунке без добавления антител, определяют как относительную световую единицу, и она служит индикатором для оценки активности агониста CD137 каждого антитела.The GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line (Promega, CS196004) was used to measure antibody activity in vitro. 200 μl of FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega), prepared at a concentration of 5x10 4 /ml with culture medium, are added to each well of a 96-well plate, and the plate is left overnight in an incubator under an atmosphere of 5% CO2 at 37°C. CHO culture medium (90% Ham's F12, 10% PBS) is used as a nutrient medium. All culture medium is then removed by suction, after which 25 µl of GloResponseTM NF-kB-Luc2/4-1BB Jurkat cell line, prepared at a concentration of 2x10 6 cells/ml with assay medium (99% RPMI, 1% PBS) is added to each well . Then add 25 μl of each of the antibody solutions diluted in the assay medium to final concentrations of 0, 0.001, 0.01, 0.1, 1 and 10 μg/ml. Then add 25 μl of ATP solution diluted with analytical medium to a final concentration of 250 μM. The plate is left for 6 hours in an incubator under 5% CO2 at 37°C and then left for 15 minutes at room temperature, and 75 µl of Bio-Glo reagent is added to each well. For the Bio-Glo reagent, use the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The relative light unit of each well is then determined using a plate reader. The amount of luminescence in each well divided by the amount of luminescence in the well without added antibody is determined as a relative light unit and serves as an indicator for assessing the CD137 agonist activity of each antibody.
Результаты показаны на фиг. 88. Результаты показывают, что агонистическая активность CD137 увеличивается путем введения различных модификаций аминокислот для увеличения pI.The results are shown in Fig. 88 The results show that the agonist activity of CD137 is increased by introducing various amino acid modifications to increase the pI.
(19-3) Фармакокинетическое исследование на мышах модифицированных антител против CD137 человека.(19-3) Pharmacokinetic study in mice of modified anti-human CD137 antibodies.
(19-3-1) Получение мыши hCD137KI/mFcYR2bKO/hFcYR2bTg#90.(19-3-1) Generation of hCD137KI/mFcYR2bKO/hFcYR2bTg#90 mouse.
Сначала получают мышь с нокином CD137 человека, в которой ген CD137 мыши заменен геном CD137 человека, путем введения вектора замены гена CD137 человека в эмбриональные стволовые клетки мыши (ES-клетки) вместе с нуклеазой цинкового пальца (ZFN), который нацелен на CD137 мыши. Затем мРНК ZFN, нацеленную на ген Fcgr2b мыши, путем микроинъекции вводят оплодотворенным яйцеклеткам мышей, и мышей с нокаутом Fcgr2b получают путем отбора мышей, которым была введенаFirst, a human CD137 knockin mouse is generated in which the mouse CD137 gene is replaced with a human CD137 gene by introducing a human CD137 gene replacement vector into mouse embryonic stem cells (ES cells) together with a zinc finger nuclease (ZFN) that targets mouse CD137. ZFN mRNA targeting the mouse Fcgr2b gene is then microinjected into fertilized mouse eggs, and Fcgr2b knockout mice are generated by selecting mice that have been injected
- 168 046075 мутация в целевой сайт. Кроме того, вектор ВАС, в котором клонирован ген FCGR2B человека, путем микроинъекции вводят оплодотворенным яйцеклеткам мышей, и путем отбора из мышей, полученных из этих клеток, тех, у которых была введена область генома гена FCGR2B человека, получают трансгенную мышь с FCGR2B человека (Iwayanagi. с соавт., J Immunol, 195, 2015, 3198-3205).- 168 046075 mutation to the target site. In addition, a BAC vector in which the human FCGR2B gene is cloned is microinjected into fertilized mouse eggs, and by selecting from mice derived from these cells those in which the genomic region of the human FCGR2B gene has been introduced, a human FCGR2B transgenic mouse is obtained ( Iwayanagi et al., J Immunol, 195, 2015, 3198-3205).
Путем скрещивания мышей трех вышеуказанных линий получают трансгенную мышь с нокином Fcgr2b CD137 человека и нокаутом FCGR2B человека. Эту мышь обозначают как мышь hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90.By crossing mice of the three above strains, a transgenic mouse with human Fcgr2b CD137 knockin and human FCGR2B knockout is obtained. This mouse is designated hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90 mouse.
(19-3-2) Измерение концентрации антитела против CD137 человека в плазме модельных мышей hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90(19-3-2) Measurement of the concentration of anti-human CD137 antibody in the plasma of the hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90 mouse model
Соответствующие антитела против CD137 человека вводят внутривенно в виде однократной дозы мышам hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90, как показано в табл. 71. Кровь собирают несколько раз в течение времени от 5 мин до 28 дней после введения. Полученную кровь центрифугируют для отделения плазмы. Плазму хранят в морозильной камере при температуре ниже -20°C до проведения измерения.The corresponding anti-human CD137 antibodies were administered intravenously as a single dose to hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90 mice, as shown in Table 1. 71. Blood is collected several times over a period of time from 5 minutes to 28 days after administration. The resulting blood is centrifuged to separate the plasma. Plasma is stored in a freezer at a temperature below -20°C until measurement.
Таблица 71Table 71
Концентрацию в плазме каждого антитела против CD137 человека измеряют методом электрохемилюминесценции (ECL, electrochemiluminescence). hCD137 (фирма Sino Biological Inc.) разбавляют ФСБ () и добавляют в 96-луночный планшет MULTI-ARRAY (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Планшет с добавлением hCD137 встряхивают в течение 1 ч при комнатной температуре, и hCD137 иммобилизуют на планшете. Затем для блокирования добавляют раствор ФСБ, содержащий 1 мМ АДФ, 1% БСА и 0,05% Tween-20, и планшет встряхивают в течение 1 ч при комнатной температуре. Калибровочные кривые для соответствующих антител против CD137 человека были построены при концентрациях в плазме 640, 320, 160, 80, 40, 20 и 10 нг/мл. Образцы плазмы, разбавленные раствором ФСБ, содержащим 1 мМ АДФ, 1% БСА и 0,05% Tween-20, и образцы для калибровочной кривой добавляют в планшет с иммобилизованным hCD137. Затем планшет встряхивают в течение 1 ч при комнатной температуре, а затем в качестве вторичного антитела добавляют антитело, описанное в WO 2019112027, которое специфически распознает константные области антител против CD137 человека. Планшет дополнительно встряхивают в течение 1 ч при комнатной температуре и затем добавляют в него меченые SULFO-TAG козьи антикроличьи антитела (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Планшет дополнительно встряхивают в течение 1 ч при комнатной температуре и затем добавляют к нему меченые SULFO-TAG козьи анти-кроличьи антитела (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC), разведенные двукратно и добавляют 1 мМ АДФ. Концентрацию каждого антитела в плазме мыши измеряют путем обнаружения SULFO-TAG с помощью SECTOR Imager (фирма Meso Scale Diagnostics, LLC). Концентрацию каждого антитела в плазме мыши рассчитывали с помощью SOFTmax PRO (фирма Molecular Devices).The plasma concentration of each anti-human CD137 antibody is measured by electrochemiluminescence (ECL, electrochemiluminescence). hCD137 (Sino Biological Inc.) is diluted with PBS () and added to a 96-well MULTI-ARRAY plate (Meso Scale Diagnostics, LLC). The plate containing hCD137 is shaken for 1 hour at room temperature, and hCD137 is immobilized on the plate. PBS solution containing 1 mM ADP, 1% BSA, and 0.05% Tween-20 is then added to block, and the plate is shaken for 1 h at room temperature. Calibration curves for the corresponding anti-human CD137 antibodies were generated at plasma concentrations of 640, 320, 160, 80, 40, 20, and 10 ng/mL. Plasma samples diluted with PBS containing 1 mM ADP, 1% BSA and 0.05% Tween-20 and samples for the calibration curve are added to the hCD137 immobilized plate. The plate is then shaken for 1 hour at room temperature, and then the antibody described in WO 2019112027, which specifically recognizes the constant regions of anti-human CD137 antibodies, is added as a secondary antibody. The plate is shaken for an additional 1 hour at room temperature and then SULFO-TAG-labeled goat anti-rabbit antibodies (Meso Scale Diagnostics, LLC) are added. The plate is additionally shaken for 1 hour at room temperature and then SULFO-TAG-labeled goat anti-rabbit antibodies (Meso Scale Diagnostics, LLC), diluted twofold, are added to it and 1 mM ADP is added. The concentration of each antibody in mouse plasma is measured by detecting SULFO-TAG using a SECTOR Imager (Meso Scale Diagnostics, LLC). The concentration of each antibody in mouse plasma was calculated using SOFTmax PRO (Molecular Devices).
Результаты показаны на фиг. 89. A375-SCF041aPh/B167-Lamlib демонстрирует более быструю элиминацию чем A375-MY201aPh/B167-Lamlib. Считается, что это связано с тем, что константная область тяжелой цепи А375-SCF041aPh/B167-Lamlib введена с аминокислотными модификациями, которые увеличивают pI.The results are shown in Fig. 89. A375-SCF041aPh/B167-Lamlib shows faster elimination than A375-MY201aPh/B167-Lamlib. This is believed to be due to the fact that the A375-SCF041aPh/B167-Lamlib heavy chain constant region is introduced with amino acid modifications that increase the pI.
(19-4) Оценка лекарственной эффективности модифицированных анти-CD137 человека антител у мышей.(19-4) Evaluation of the drug efficacy of modified anti-human CD137 antibodies in mice.
(19-4-1) Получение клеточных линий и мышиной модели, трансплантированной сингенной опухолевой линией.(19-4-1) Generation of cell lines and mouse model transplanted with a syngeneic tumor line.
Используют клон LLC1/OVA/GPC3 линии клеток С5 (LLC1/OVA/GPC3), полученных путем интродукции плазмид экспрессии куриного овальбумина (OVA) и человеческого глипикана-3 (GPC3) в клетки рака легких мыши, полученные из клеток клеточной линии LLC1 [LL/2 (обозначение: LLC1), дистрибьютор: фирма АТСС, номер в каталоге: CRL-1642]. Использовали мышь hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90 (возраст 11 недель, самка), описанную выше в (19-3-1). Клеточную линию LLC1/OVA/GPC3 поддерживают и пассируют в среде RPMI1640 (фирма Sigma-Aldrich, Co. LLC), содержащей 9,8% фетальной бычьей сыворотки (фирма Sigma-Aldrich, Co. LLC), 0,44 мг/мл G418 (фирма Nacalai Tesque, Inc.) и 0,88 мг/мл зеоцина (фирма Thermo Fisher Scientific, Inc.). Клеточную линию LLC1/OVA/GPC3 трансплантируют подкожно в брюшную полость мыши, и считают, что модель сформировалась, когда объем опухоли достигал примерно 250-500 мм3. После формирования модели мышей с трансплантированной клеточной линией LLC1/OVA/GPC3 группируют и затем вводят носитель и соответствующие антит-CD137 человека антитела.Clone LLC1/OVA/GPC3 of the C5 cell line (LLC1/OVA/GPC3) was used, obtained by introducing expression plasmids of chicken ovalbumin (OVA) and human glypican-3 (GPC3) into mouse lung cancer cells obtained from cells of the LLC1 cell line [LL /2 (designation: LLC1), distributor: ATCC company, catalog number: CRL-1642]. The hCD137KI/mFcyR2bKO/hFcyR2bTg#90 mouse (11 weeks old, female) described above in (19-3-1) was used. The LLC1/OVA/GPC3 cell line was maintained and passaged in RPMI1640 medium (Sigma-Aldrich, Co. LLC) containing 9.8% fetal bovine serum (Sigma-Aldrich, Co. LLC), 0.44 mg/ml G418 (Nacalai Tesque, Inc.) and 0.88 mg/ml Zeocin (Thermo Fisher Scientific, Inc.). The LLC1/OVA/GPC3 cell line was transplanted subcutaneously into the peritoneal cavity of a mouse, and the model was considered to be established when the tumor volume reached approximately 250-500 mm 3 . Once the model is established, mice transplanted with the LLC1/OVA/GPC3 cell line are grouped and then administered vehicle and appropriate anti-human CD137 antibodies.
(19-4-2) Приготовление и введение фармацевтических агентов для введения и измерения опухолей.(19-4-2) Preparation and administration of pharmaceutical agents for the administration and measurement of tumors.
A375-MY201aPh/B167-Lamlib или A375-SCF041aPh /B167-Lamlib, приготовленные в дозировках, указанных в таблице 72, с ФСБ, содержащим 0,05% Tween-20, вводят в модель с трансплантированнойA375-MY201aPh/B167-Lamlib or A375-SCF041aPh/B167-Lamlib, prepared at the dosages indicated in Table 72, with PBS containing 0.05% Tween-20, is administered to the transplant model
- 169 046075 клеточной линией LLC1/OVA/GPC3 на 11-е и 14-е сутки после трансплантации опухоли. ФСБ, содержащий 0,05% Tween-20, вводят в группе контроля. Приготовленную жидкость для введения вводят в дозе 10 мл/кг в хвостовую вену.- 169 046075 cell line LLC1/OVA/GPC3 on the 11th and 14th days after tumor transplantation. PBS containing 0.05% Tween-20 was administered to the control group. The prepared liquid for administration is injected at a dose of 10 ml/kg into the tail vein.
Таблица 72Table 72
Измерение противоопухолевого действия в модели трансплантации клеточной линии LLC1/OVA/GPC3Measuring antitumor effects in the LLC1/OVA/GPC3 cell line transplantation model
Для оценки противоопухолевого эффекта объем опухоли измеряют 1-2 раза в неделю. Объем опухоли рассчитывают по следующему уравнению:To assess the antitumor effect, tumor volume is measured 1-2 times a week. Tumor volume is calculated using the following equation:
объем опухоли (мм3) = длина (мм) х ширина (мм) х ширина (мм)/2tumor volume (mm 3 ) = length (mm) x width (mm) x width (mm)/2
Таким образом, результаты примера (19-3-2) показывают, что изменение концентрации в крови у мышей, которым вводили A375-SCF041aPh/B167-Lamlib, меньше по сравнению с таковым для A375MY201aPh/B167-Lamlib; однако A375-SCF041aPh/B167-Lamlib проявляет более сильный противоопухолевый эффект, чем A375-MY201aPh/B167-Lamlib (фиг. 90).Thus, the results of Example (19-3-2) show that the change in blood concentration in mice administered A375-SCF041aPh/B167-Lamlib is less compared to that of A375MY201aPh/B167-Lamlib; however, A375-SCF041aPh/B167-Lamlib exhibited a stronger antitumor effect than A375-MY201aPh/B167-Lamlib (Fig. 90).
Основываясь на приведенных выше результатах на данной мышиной модели, противоопухолевый эффект анти-CD137 человека антитела увеличивают путем введения модификаций аминокислот, которые увеличивают pI в константной области тяжелой цепи.Based on the above results in this mouse model, the antitumor effect of human anti-CD137 antibodies is enhanced by introducing amino acid modifications that increase the pI in the heavy chain constant region.
Пример 20. Повышение агонистической активности модифицированными антителами против CD3 человека.Example 20. Enhancement of agonist activity by modified anti-human CD3 antibodies.
Исследуют повышение агонистической активности анти-CD3 антитела путем комбинирования аминокислотных модификаций для увеличения pI и константной области тяжелой цепи с повышенной связывающей активностью в отношении FcyRIIb.Enhancement of the agonist activity of the anti-CD3 antibody is explored by combining amino acid modifications to increase the pI and heavy chain constant region with increased binding activity for FcyRIIb.
Используют SCF057aPh, который получают путем введения аминокислотной модификации Q311R/P343R для увеличения pI до MY201aPh и MY201aPh, которые представляют собой константные области тяжелой цепи с повышенной связывающей активностью в отношении FcyRIIb, полученного в примере 7-1. Кроме того, в качестве константной области нативного IgG1 человека используют G1T6 (SEQ ID NO: 223). Соответствующие анти-CD3 человека антитела получают с использованием TR01H113 (SEQ ID NO: 224) в качестве вариабельной области тяжелой цепи; MY201aPh, SCF057aPh или G1T6 в качестве константной области тяжелой цепи; и L0011-k0 (SEQ ID NO: 225) в качестве легкой цепи анти-CD3 человека антитела. IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0 используют в качестве отрицательного контроля.SCF057aPh is used, which is obtained by introducing the amino acid modification Q311R/P343R to increase the pI to MY201aPh and MY201aPh, which are heavy chain constant regions with increased binding activity for FcyRIIb obtained in Example 7-1. In addition, G1T6 (SEQ ID NO: 223) is used as the constant region of native human IgG1. The corresponding anti-human CD3 antibodies are prepared using TR01H113 (SEQ ID NO: 224) as the heavy chain variable region; MY201aPh, SCF057aPh, or G1T6 as the heavy chain constant region; and L0011-k0 (SEQ ID NO: 225) as the light chain of an anti-human CD3 antibody. IC17HdK-MY201aPh/IC17L-k0 was used as a negative control.
Bioassay (NFAT) (фирма Promega, CS176401) используют для активации Т-клеток для измерения in vitro активности продуцируемых антител. В каждую лунку 96-луночного планшета добавляют по 200 мкл клеток FcyRIIB CHO-K1 (фирма Promega), приготовленных в концентрации 5х104/мл в культуральной среде, и планшет оставляют на ночь в инкубаторе в атмосфере 5% CO2 при 37°C. В качестве питательной среды используют культуральную среду СНО (90% Ham's F12, 10% ФСБ). Затем всю культуральную среду удаляют отсасыванием, затем в каждую лунку добавляют по 25 мкл суспензии клеток NFAT-RE-Luc2, приготовленных в концентрацией 2х106/мл со средой для анализа (99% RPMI, 1% ФСБ). Затем добавляют по 25 мкл каждого раствора антител, разбавленного аналитической средой, до конечной концентрации 0, 0,0001, 0,001, 0,01, 0,1, 1 и 10 мкг/мл. Планшет оставили на 6 ч в инкубаторе в атмосфере 5% CO2 при 37°C, затем оставляли на 15 мин при комнатной температуре, потом в каждую лунку добавляли 75 мкл реагента Bio-Glo. Для реагента Bio-Glo используют систему анализа люциферазы Bio-Glo (буфер и субстрат). После этого с помощью планшет-ридера определяют относительную световую единицу каждой лунки. Величину люминесценции каждой лунки, деленную на величину люминесценции лунки без добавления антител, определяют как относительную световую единицу, и она служит индикатором для оценки активности агониста CD3 каждого антитела.Bioassay (NFAT) (Promega, CS176401) is used to activate T cells to measure in vitro activity of the antibodies produced. 200 μl of FcyRIIB CHO-K1 cells (Promega), prepared at a concentration of 5x104/ml in culture medium, are added to each well of a 96-well plate, and the plate is left overnight in an incubator under an atmosphere of 5% CO2 at 37°C. CHO culture medium (90% Ham's F12, 10% PBS) is used as a nutrient medium. Then all the culture medium is removed by suction, then 25 μl of NFAT-RE-Luc2 cell suspension prepared at a concentration of 2x10 6 /ml with assay medium (99% RPMI, 1% PBS) is added to each well. Then add 25 µl of each antibody solution diluted in assay medium to final concentrations of 0, 0.0001, 0.001, 0.01, 0.1, 1 and 10 µg/ml. The plate was left for 6 hours in an incubator in an atmosphere of 5% CO 2 at 37°C, then left for 15 minutes at room temperature, then 75 μl of Bio-Glo reagent was added to each well. For the Bio-Glo reagent, use the Bio-Glo Luciferase Assay System (buffer and substrate). The relative light unit of each well is then determined using a plate reader. The luminescence value of each well divided by the luminescence value of the well without added antibody is determined as a relative light unit and serves as an indicator for assessing the CD3 agonist activity of each antibody.
Результаты показаны на фиг. 91. По сравнению с TR01H113-G1T6/L0011-k0, имеющим константную область нативного IgG1 человека, TR01H113-MY201aPh/L0011-k0, который имеет повышенное связывание с FcyRIIb, показал более высокую активность агониста CD3. TR01H113-SCF057aPh/L0011-k0 с произведенными аминокислотными модификациями, которые увеличивают pI, показал более высокую агонистическую активность CD3 по сравнению с TR01H113-MY201aPh/L0011-k0 до введения аминокислотных модификаций.The results are shown in Fig. 91. Compared with TR01H113-G1T6/L0011-k0, which has the constant region of native human IgG1, TR01H113-MY201aPh/L0011-k0, which has increased binding to FcyRIIb, showed higher CD3 agonist activity. TR01H113-SCF057aPh/L0011-k0 with amino acid modifications that increase pI showed higher CD3 agonist activity compared to TR01H113-MY201aPh/L0011-k0 before amino acid modifications.
Промышленное применениеIndustrial Application
Описанные анти-CD137 антигенсвязывающие молекулы и способы их использования применимы для разработки, получения, поставки и применения фармацевтических препаратов, которые обладаютThe anti-CD137 antigen-binding molecules described and methods for their use are applicable to the development, preparation, supply and use of pharmaceuticals that have
- 170 046075 эффектом активации иммунных клеток, цитотоксическим действием или противоопухолевым действием, но оказывают слабое воздействие на неопухолевые ткани, такие как нормальные ткани, и вызывают незначительное число побочных эффектов.- 170 046075 immune cell activation effect, cytotoxic effect or antitumor effect, but have little effect on non-tumor tissues such as normal tissues and cause few side effects.
Claims (8)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2018-152126 | 2018-08-10 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA046075B1 true EA046075B1 (en) | 2024-02-05 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
KR102709693B1 (en) | Anti-myostatin antibodies, polypeptides containing variant fc regions, and methods of use | |
KR102456739B1 (en) | Anti-myostatin antibodies and methods of use | |
KR102650420B1 (en) | Anti-myostatin antibodies, polypeptides containing variant fc regions, and methods of use | |
JP6718560B1 (en) | Anti-CD137 antigen binding molecule and uses thereof | |
US20230272099A1 (en) | Anti-cd137 antigen-binding molecule for use in cancer treatment | |
RU2829536C2 (en) | Anti-cd137 antigen-binding molecules and use thereof | |
TWI852243B (en) | Anti-CD137 antigen binding molecules and their use | |
EA046075B1 (en) | ANTI-CD137 ANTIGEN-BINDING MOLECULES AND THEIR APPLICATIONS |