CZ20002315A3 - Novel receptor coupled with G-protein - Google Patents
Novel receptor coupled with G-protein Download PDFInfo
- Publication number
- CZ20002315A3 CZ20002315A3 CZ20002315A CZ20002315A CZ20002315A3 CZ 20002315 A3 CZ20002315 A3 CZ 20002315A3 CZ 20002315 A CZ20002315 A CZ 20002315A CZ 20002315 A CZ20002315 A CZ 20002315A CZ 20002315 A3 CZ20002315 A3 CZ 20002315A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- seq
- protein
- leu
- drr
- amino acid
- Prior art date
Links
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Nový receptor spřažený s G-proteinemNew G-protein coupled receptor
Description
Oblast technikyTechnical field
Předkládaný vynález se týká oblasti biologických receptorů a různého využití takových receptorů. Přesněji se vynález týká nukleových kyselin kódujících nové receptory spřažené s G-proteinem a receptorů samotných.The present invention relates to the field of biological receptors and the various uses of such receptors. More specifically, the invention relates to nucleic acids encoding novel G-protein coupled receptors and the receptors themselves.
Dosavadní stav technikyBACKGROUND OF THE INVENTION
Receptory spřažené s G-proteinem (GPCR) tvoří rodinu proteinů majících společnou strukturální organizaci charakterizovanou extracelulárním N-terminálním koncem, sedmi hydrofobními alfa-šroubovicemi, které patrně tvoří transmembránové domény a intracelulární C-terminální doménou. GPCR váže různé ligandy, které spouštějí intracelulární signály aktivací přenašečových G-proteinů (Caron et al., Rec. Prog. Horm. Res. 48: 277-290 (1993); Freedman et al., Rec. Prog. Horm. Res. 51: 319-353 (1996)).G-protein coupled receptors (GPCRs) are a family of proteins having a common structural organization characterized by an extracellular N-terminal end, seven hydrophobic alpha-helices that appear to form transmembrane domains and an intracellular C-terminal domain. GPCR binds various ligands that trigger intracellular signals by activating carrier G-proteins (Caron et al., Rec. Prog. Horm. Res. 48: 277-290 (1993); Freedman et al., Rec. Prog. Horm. Res. 51: 319-353 (1996)).
Dosud bylo klonováno více než 300 GPCR a předpokládá se, že existuje více než 1000 takových receptorů. Přibližně 50-60% klinicky relevantních léků působí přes ovlivňování funkcí různých GPCR (Cudermann et al., J. Mol. Med. 73: 51-63 (1995)). Zejména významné jsou receptory umístěné v gangliích zadních kořenů míšních. Tento region centrálního nervového systému je hustě inervován primárními nebo aferentními sensorickými neurony účastícími se na přenosu, modulaci a vnímání bolesti. Proto mohou být receptory z této oblasti použity v testech pro identifikaci nových činidel pro anestesii a analgesii.To date, more than 300 GPCRs have been cloned and it is believed that there are more than 1000 such receptors. Approximately 50-60% of clinically relevant drugs act through influencing the functions of various GPCRs (Cudermann et al., J. Mol. Med. 73: 51-63 (1995)). Of particular importance are receptors located in the posterior spinal cord ganglia. This region of the central nervous system is densely innervated by primary or afferent sensory neurons involved in the transmission, modulation and perception of pain. Therefore, receptors in this field can be used in assays to identify novel agents for anesthesia and analgesia.
Podstata vynálezuSUMMARY OF THE INVENTION
Předkládaný vynález je založen na objevu nového receptoru spřaženého s G-proteinem, který se liší od dříve popsaných receptorů ve své struktuře a v tom, že je přednostně exprimován v gangliích zadních kořenů míšních. Jeden receptor ganglií zadních kořenů míšních (DRR) byl izolován a sekvencován od krys a šest receptorů ganglií zadních kořenů míšních bylo izolováno a sekvencováno od člověka. Krysí receptor byl označen rDRR-1 a jeho aminokyselinová sekvence je uvedena v SEQ ID NO: 1. Lidské receptory byly označeny jako:The present invention is based on the discovery of a novel G-protein coupled receptor that differs from the previously described receptors in its structure and is preferably expressed in the posterior spinal cord ganglia. One dorsal root ganglia receptor (DRR) was isolated and sequenced from rats and six dorsal root ganglia receptors were isolated and sequenced from humans. The rat receptor was designated rDRR-1 and its amino acid sequence is set forth in SEQ ID NO: 1. The human receptors were designated as:
Pokud není uvedeno jinak, označuje termín DRR, jak je zde použit, všechny receptory, jak lidské, tak krysí.Unless otherwise indicated, the term DRR as used herein refers to all receptors, both human and rat.
V prvním aspektu se vynález týká proteinů, s výjimkou přirozených proteinů, obsahujících aminokyselinovou sekvenci funkčního krysího nebo lidského DRR, jak jsou uvedeny v SEQ ID NO: 1, 3, 5, 7, 9, 11 nebo 13. Termín obsahující funkční sekvenci zahrnuje jakýkoliv receptorový protein, v jehož sekvenci byly provedeny adice, delece nebo substituce, které nemění významným způsobem funkční charakteristiky receptoru. Tak vynález zahrnuje proteiny mající v podstatě stejnou aminokyselinovou sekvenci, jak je uvedena v seznamu sekvencí, stejně jako proteiny s odlišnostmi, které nejsou zásadní, protože nemění základní, kvalitativní vazebné charakteristiky DRR receptoru. Vynález dále zahrnuje v podstatě čisté proteiny skládající se v podstatě z DRR • · aminokyselinové sekvence, protilátky, které se specificky váží na DRR (t.j. které mají alespoň 100-krát vyšší afinitu k DRR než k jakémukoliv jinému non-DRR proteinu) a protilátky připravené injekcí farmaceuticky přijatelných přípravků takových proteinů zvířeti, které je schopné produkce protilátek. Ve výhodném provedení je monoklonální protilátka k lidskému nebo krysímu DRR připravena injekcí farmaceuticky přijatelného přípravku receptoru myši a potom fúsí buněk myší sleziny s myelomovými buňkami.In a first aspect, the invention relates to proteins, excluding natural proteins, comprising the amino acid sequence of a functional rat or human DRR as set forth in SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 7, 9, 11 or 13. The term comprising the functional sequence includes any a receptor protein in which additions, deletions, or substitutions have been made that do not significantly alter the functional characteristics of the receptor. Thus, the invention encompasses proteins having substantially the same amino acid sequence as listed in the Sequence Listing, as well as proteins with differences that are not essential as they do not alter the basic, qualitative binding characteristics of the DRR receptor. The invention further encompasses substantially pure proteins consisting essentially of the DRR's amino acid sequence, antibodies that specifically bind to DRRs (ie having at least 100-fold higher affinity for DRR than any other non-DRR protein), and antibodies prepared injecting pharmaceutically acceptable formulations of such proteins into an animal capable of producing antibodies. In a preferred embodiment, the monoclonal antibody to human or rat DRR is prepared by injecting a pharmaceutically acceptable preparation of the mouse receptor and then fusing mouse spleen cells with myeloma cells.
Předkládaný vynález také obsahuje v podstatě čistý polynukleotid kódující protein skládající se z aminokyselinové sekvence složené z funkční sekvence krysího DRR (jak je uvedena v SEQ ID NO: 1) nebo lidského DRR (jak jsou uvedeny v SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, li nebo 13). Tento aspekt vynálezu zahrnuje polynukleotidy kódující proteiny skládající se v podstatě z aminokyselinových sekvencí uvedených v seznamu sekvencí, expresní vektory obsahující takové polynukleotidy a hostitelské buňky transformované takovými vektory. Tento aspekt také zahrnuje rekombinantní krysí a lidské DRR proteiny produkované hostitelskými buňkami získanými tímto způsobem.The present invention also comprises a substantially pure polynucleotide encoding a protein consisting of an amino acid sequence consisting of a functional sequence of a rat DRR (as set forth in SEQ ID NO: 1) or a human DRR (as set forth in SEQ ID NOs: 3, 5, 7, 9, 11 or 13). This aspect of the invention includes polynucleotides encoding proteins consisting essentially of the amino acid sequences set forth in the Sequence Listing, expression vectors comprising such polynucleotides, and host cells transformed with such vectors. This aspect also includes recombinant rat and human DRR proteins produced by the host cells obtained by this method.
Výhodně má polynukleotid kódující krysí DRR nukleotidovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 2a polynukleotid kódující lidský DRR má nukleotidovou sekvenci uvedenou v SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, nebo 13. Je také výhodné, aby vektory a hostitelské buňky použité pro expresi DRR obsahovaly tyto konkrétní polynukleotidy.Preferably, the polynucleotide encoding the rat DRR has the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 2a and the polynucleotide encoding the human DRR has the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, or 13. It is also preferred that the vectors and host cells used for these particular polynucleotides contained the expression of DRR.
V jiném aspektu se předkládaný vynález týká způsobu pro testování schopnosti sloučeniny vázat se na krysí nebo lidský DRR Způsob obsahuje inkubaci zdroje DRR s ligandem, o kterém je známo že se váže na receptor, a s testovanou sloučeninou. Zdroj DRR by měl být v podstatě prostý jiných typů receptorů spřažených s G-proteinem, t.j. více než 85% takových obsažených receptorů by « · ··« · » « « » • ··· · ·· · · · · · • ·····«· · ····· · · · • · · · · ·· ·· ·· mělo odpovídat DRR. Po dokončení inkubace se schopnost vazby testované sloučeniny na DRR stanoví podle rozsahu nahrazení vazby ligandu. Krysí DRR by měl, výhodně, odpovídat rDRR-1, jak je uveden v SEQ ID NO: 1. Lidský receptor by měl výhodně být hDRR-1 (SEQ ID NO: 3); hDRR-2 (SEQ ID NO: 5); hDRR-3 (SEQ ID NO: 7); hDRR-4 (SEQ ID NO: 9); hDRR-5 (SEQ ID NO: 11); nebo hDRR-6 (SEQ ID NO: 13) . V takových testech mohou být použity transformované buňky exprimující rekombinantní DRR nebo membrány připravené z takových buněk. Ačkoliv to není zásadní, může test také obsahovat stanovení aktivace dráhy druhého posla, jako je například dráha adenylatcyklasy. Toto může napomoci stanovit to, zda sloučenina, která se váže na DRR, působí jako agonista nebo jako antagonista.In another aspect, the present invention relates to a method for testing the ability of a compound to bind to a rat or human DRR The method comprises incubating a source of DRR with a ligand known to bind to a receptor and a test compound. The DRR source should be substantially devoid of other types of G protein-coupled receptors, ie, more than 85% of such contained receptors would be free of other G-protein coupled receptors. ···· «· ····· · · · · · · · ·········································· DRR. Upon completion of incubation, the ability of the test compound to bind to DRR is determined by the extent of ligand binding replacement. The rat DRR should, preferably, correspond to rDRR-1 as set forth in SEQ ID NO: 1. The human receptor should preferably be hDRR-1 (SEQ ID NO: 3); hDRR-2 (SEQ ID NO: 5); hDRR-3 (SEQ ID NO: 7); hDRR-4 (SEQ ID NO: 9); hDRR-5 (SEQ ID NO: 11); or hDRR-6 (SEQ ID NO: 13). Transformed cells expressing recombinant DRR or membranes prepared from such cells may be used in such assays. Although not essential, the assay may also include determining activation of a second messenger pathway, such as an adenylate cyclase pathway. This may help to determine whether a compound that binds to DRR acts as an agonist or antagonist.
Alternativním způsobem pro stanovení toho, zda je testovaná sloučenina agonista jakéhokoliv zde popsaného DRR, je použití testu buněčné signalizace, například testu měřícího buď intracelulární aktivitu adenylatcyklasy, nebo intracelulární koncentraci vápníku. Testovaná sloučenina je inkubována s buňkami exprimujícími DRR, ale v podstatě neobsahujícími jiné receptory spřažené s G-proteinem, obvykle s buňkami transfektovánými expresním vektorem kódujícím DRR. Testované sloučeniny, které jsou agonisty, jsou identifikovány podle toho, že způsobují statisticky významnou změnu výsledků získaných v testu buněčné signalizace ve srovnání s kontrolními transfektanty nevystavenými působení testované sloučeniny. Například, buňky vystavené působení testované sloučeniny mohou vykazovat významné zvýšení aktivity adenylat-cyklasy nebo zvýšení intracelulární koncentrace vápníku.An alternative method for determining whether a test compound is an agonist of any of the DRRs described herein is to use a cell signaling assay, for example, an assay measuring either intracellular adenylate cyclase activity or intracellular calcium concentration. The test compound is incubated with cells expressing DRR but substantially free of other G-protein coupled receptors, usually cells transfected with an expression vector encoding DRR. Test compounds that are agonists are identified by causing a statistically significant change in the results obtained in the cell signaling assay compared to control transfectants not exposed to the test compound. For example, cells exposed to a test compound may exhibit a significant increase in adenylate cyclase activity or an increase in intracellular calcium concentration.
Předkládaný vynález také obsahuje způsob pro stanovení toho, zda je testovaná sloučenina antagonista DRR, který spočívá ve známé aktivaci receptorů spřažených s G-proteinem, ke které dochází tehdy, jsou-li takové receptory exprimovány ve velkých množstvích. Tento způsob vyžaduje, aby byla DNA kódující receptor • · • · • ♦ · ···· ··· • ··· · ·· · · « · · inkorporována do expresního vektoru tak, že je operativně navázaná na promotor a tento vektor je potom použit pro transfekci vhodného hostitele. Pro produkci dostatečného množství receptoru pro konstitutivní aktivaci receptoru (t.j. aktivaci za nepřítomnosti přirozeného ligandu) jsou přednostně použity expresní systémy schopné produkce kopií proteinu, například může být DRR DNA operativně navázaná na CMV promotor a exprimována v COS nebo HEK293 buňkách. Po transfekci jsou buňky s aktivovanými receptory selektovány podle toho, jestli vykazují zvýšenou aktivitu v testu buněčné signalizace ve srovnání s buňkami, které buď nebyly transfektovány, nebo které byly transfektovány vektorem, který není schopen exprese funnkčních DRR. Obvykle budou takové buňky selektovány buď podle toho, zda vykazují statisticky signifikantní zvýšení intracelulární aktivity adenyl-cyklasy, nebo podle toho, zda vykazují statisticky signifikantní zvýšení intracelulární koncentrace vápníku. Selektované buňky jsou kontaktovány s testovanou sloučeninou a test buněčné signalizace je opakován pro stanovení toho, zda tato sloučenina způsobuje snížení aktivity vzhledem ke kontrolním buňkám nekontaktovaným s testovanou sloučeninou. Například, statisticky významné snížení buď aktivity adenyl-cyklasy, nebo koncentrace vápníku, vzhledem ke kontrolním buňkám, naznačuje, že testovaná sloučenina je antagonistou DRR. v těchto testech může být použit jakýkoliv zde popsaný DRR.The present invention also encompasses a method for determining whether a test compound is a DRR antagonist which consists in the known activation of G-protein coupled receptors that occurs when such receptors are expressed in large amounts. This method requires that the DNA encoding the receptor be incorporated into an expression vector so that it is operably linked to a promoter and this vector. is then used to transfect a suitable host. Preferably, expression systems capable of producing copies of the protein are used to produce sufficient receptors for constitutive receptor activation (i.e., activation in the absence of a natural ligand), for example, DRR DNA can be operably linked to a CMV promoter and expressed in COS or HEK293 cells. After transfection, activated receptor cells are selected according to whether they exhibit increased activity in the cell signaling assay compared to cells that have either not been transfected or that have been transfected with a vector that is unable to express functional DRRs. Typically, such cells will be selected either by showing a statistically significant increase in the intracellular activity of adenyl cyclase or by showing a statistically significant increase in the intracellular calcium concentration. The selected cells are contacted with the test compound and the cell signaling assay is repeated to determine whether the compound causes a decrease in activity relative to control cells not contacted with the test compound. For example, a statistically significant decrease in either adenyl cyclase activity or calcium concentration relative to control cells suggests that the test compound is a DRR antagonist. any of the DRRs described herein may be used in these assays.
Testy na sloučeniny interagující s DRR mohou být provedeny inkubací zdroje obsahujícího DRR, ale v podstatě neobsahujícího jiné receptory spřažené s G-proteinem (například stabilně transformovaných buněk) s angiotensinem II nebo III jak za přítomnosti, tak za nepřítomnosti testované sloučeniny, a potom měřením modulace intracelulární koncentrace vápníku. Statisticky významné zvýšení nebo snížení angiotensinem stimulované změny koncentrace vápníku v odpovědi na testovanou sloučeninu ukazuje na interakci s DRR. Mezi receptory, které mohou být použity v tomto • » • · · · · · · * · · · • ··· · ·· · · · · · • ······· · ····· ·· · •· · ♦· · · ·· ·· testu, patří krysí DDR-1 a lidské DRR-1, DRR-2, DRR-3, DRR-4, DRR-5 a DRR-6.Assays for DRR interacting compounds can be performed by incubating a source containing DRR but substantially free of other G-protein coupled receptors (e.g., stably transformed cells) with angiotensin II or III in the presence and absence of the test compound, and then measuring modulation intracellular calcium concentration. A statistically significant increase or decrease in angiotensin-stimulated changes in calcium concentration in response to a test compound indicates an interaction with DRR. Among the receptors that can be used in this are the receptors that can be used in this. The test includes rat DDR-1 and human DRR-1, DRR-2, DRR-3, DRR-4, DRR-5, and DRR-6.
V jiném aspektu je předkládaný vynález zaměřen na způsob testování sloučenin na jejich schopnost alterovat expresi krysího nebo lidského DRR. Tento způsob je proveden kultivací buněk exprimujících DRR, ale v podstatě neobsahujících jiné receptory spřažené s G-proteinem, za přítomnosti testované sloučeniny. Buňky jsou potom získány z kultury a exprese DRR je srovnávána s expresí DRR v kontrolních buňkách kultivovaných za v podstatě stejných podmínek, ale za nepřítomnosti testované sloučeniny. Krysí receptor je výhodně rDDR-1 a lidský receptor je výhodně DRR-1, DRR-2, DRR-3, DRR-4, DRR-5 nebo DRR-6.In another aspect, the present invention is directed to a method of testing compounds for their ability to alter the expression of rat or human DRR. This method is performed by culturing cells expressing DRR but substantially free of other G-protein coupled receptors in the presence of a test compound. The cells are then recovered from the culture and the expression of DRR is compared to that of DRR in control cells cultured under essentially the same conditions but in the absence of the test compound. The rat receptor is preferably rDDR-1 and the human receptor is preferably DRR-1, DRR-2, DRR-3, DRR-4, DRR-5 or DRR-6.
Výhodnou testovanou sloučeninou je oligonukleotid délky alespoň 15 nukleotidů obsahující sekvenci komplementární k sekvenci DRR použitého v testu.A preferred test compound is an oligonucleotide of at least 15 nucleotides in length containing a sequence complementary to the DRR sequence used in the assay.
Popis obrázků na připojených výkresechDescription of the figures in the attached drawings
Obr. 1. Nukleotidová sekvence rDRR-1: klon 3B-32, kódující rDRR-1, byl izolován z krysí genomové knihovny za použití Promotor Finder Walking Kit (viz Metody, Clontech).Giant. 1. Nucleotide sequence of rDRR-1: clone 3B-32, encoding rDRR-1, was isolated from the rat genomic library using the Promotor Finder Walking Kit (see Methods, Clontech).
Klon byl uložen v mezinárodní instituci pro skladování mikroorganismů Deutsche Sammlung Von Mikroorganismen Und Zellkulturen GmbH, adresa Mascheroder Weg IB, D-3300 Braunschweig, Germany. Uložení bylo provedeno 27.11.1997 pod přírůstkovým číslem DSM 11877.The clone was deposited with the International Microorganism Storage Institute Deutsche Sammlung Von Microorganisms Und Zellkulturen GmbH, address Mascheroder Weg IB, D-3300 Braunschweig, Germany. Storage was performed on 27/11/1997 under accession number DSM 11877.
Obr. 2. Odvozená aminokyselinová sekvence DRR-l: klon 3B-32 kóduje protein obsahující 337 aminokyselin. Aminokyselinová sekvence začíná prvním ATG v nukleotidové sekvenci.Giant. 2. Derived amino acid sequence DRR-1: clone 3B-32 encodes a protein of 337 amino acids. The amino acid sequence begins with the first ATG in the nucleotide sequence.
► · · » · · · · <► · »· <<
> ·····«· < I · · · I • · · · ·> ····· «· <I · · · I · · · · ·
Obr. 3. Seřazení odvozené aminokyselinové sekvence klonu 3B-32 (rDRR-1) s pěti nejvíce homologickými sekvencemi. Zbytky v rámečkách a vybarvené zbytky jsou zbytky identické se zbytky v rDRR-1 sekvenci.Giant. 3. Alignment of the derived amino acid sequence of clone 3B-32 (rDRR-1) with the five most homologous sequences. The frame residues and the stained residues are identical to the residues in the rDRR-1 sequence.
Obr. 4. Seřazení aminokyselin lidských DRR homologů: jsou seřazeny aminokyselinová sekvence všech 6 lidských homologů rDRR-1 (hDRR-1; hDRR-2; hDRR-3; hDRR-4, hDRR-5 a hDRR-6). Aminokyselinové zbytky lišící se od klonu 36 (HUMAN36.PR) jsou v rámečkách. Stupeň identity mezi těmito sekvencemi je v rozsahu od 77% do téměř 100%.Giant. 4. amino acid sequence of human DRR homologs: the amino acid sequences of all 6 human rDRR-1 homologues (hDRR-1; hDRR-2; hDRR-3; hDRR-4, hDRR-5 and hDRR-6) are aligned. Amino acid residues differing from clone 36 (HUMAN36.PR) are boxed. The degree of identity between these sequences ranges from 77% to nearly 100%.
DefiniceDefinition
Následující popis využívá mnoha termínů, které se týkají technologie rekombinantní DNA. Pro jasné pochopení předkládaného vynálezu a patentových nároků, včetně rozsahu daných takovými termíny, jsou uvedeny následující definice.The following description uses many terms relating to recombinant DNA technology. For a clear understanding of the present invention and claims, including the scope given by such terms, the following definitions are set forth.
Klonovací vektor: Plasmidová nebo fágová DNA nebo jiná DNA sekvence, která je schopná autonomní replikace v hostitelské buňce, a která je charakterizována jedním nebo malým počtem míst rozpoznávaných restrikční endonukleasou. Fragment cizorodé DNA může být vložen do vektoru v těchto místech, aby se dosáhlo replikace a klonování fragmentu. Vektor může obsahovat markér vhodný pro použití v identifikaci transformovaných buněk.Cloning vector: Plasmid or phage DNA or other DNA sequence that is capable of autonomous replication in a host cell and which is characterized by one or a small number of sites recognized by restriction endonuclease. The foreign DNA fragment can be inserted into the vector at these sites to effect replication and cloning of the fragment. The vector may contain a marker suitable for use in identifying transformed cells.
Například může markér způsobovat resistenci na tetracyklin nebo ampicilin.For example, the marker may confer resistance to tetracycline or ampicillin.
Expresní vektor: Vektor podobný klonovacímu vektoru, který může indukovat expresi DNA, která byla klonována do vektoru, po jeho transformaci do hostitele. Klonovaná DNA je obvykle umístěna (například operativně navázána na) pod kontrolu určitých regulačních sekvencí, jako jsou promotory a zesilovače « · transkripce. Promotorové sekvence mohou být konstitutivní, indukovatelné nebo reprimovatelné.Expression Vector: A vector similar to a cloning vector that can induce expression of DNA that has been cloned into a vector after its transformation into a host. The cloned DNA is usually placed (for example, operably linked to) under the control of certain regulatory sequences, such as promoters and enhancers. Promoter sequences can be constitutive, inducible, or repressible.
V podstatě čistý: Jak je zde použit, označuje termín v podstatě čistý to, že vybraný materiál je v podstatě prostý kontaminující buněčných složek. V podstatě čistý protein nebo nukleová kyselina obvykle tvoří alespoň 85% vzorku, lépe ještě vyšší procento. Mezi kontaminující složky patří proteiny, uhlovodany nebo lipidy. Jednou metodou pro stanovení čistoty proteinu nebo nukleové kyseliny je elektroforesa přípravku v matrici, jako je například polyakrylamid nebo agarosa. Čistota je potvrzena detekcí jediného proužku po barvení. Jinými metodami pro stanovení čistoty jsou chromatografie a analytická centrifugace.Substantially pure: As used herein, the term substantially pure means that the material selected is substantially free of contaminating cellular components. A substantially pure protein or nucleic acid typically makes up at least 85% of the sample, preferably an even higher percentage. Contaminants include proteins, carbohydrates, or lipids. One method for determining purity of a protein or nucleic acid is by electrophoresis of the preparation in a matrix, such as polyacrylamide or agarose. Purity is confirmed by detecting a single strip after staining. Other methods for determining purity are chromatography and analytical centrifugation.
Hostitel: Jakákoliv prokaryotická nebo eukaryotická buňka, která je příjemcem replikovatelného expresního vektoru nebo klonovacího vektoru, je hostitelem pro vektor. Termín zahrnuje prokaryotické nebo eukaryotické buňky, které byly zpracované tak, aby inkorporovaly vybraný gen do svého chromosomu nebo do svého genomu. Příklady buněk, které mohou sloužit jako hostitelé, jsou dobře známé v oboru, stejně jako techniky pro transformaci buněk (viz například Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2. vydání, Cold Spring Harbor (1989)).Host: Any prokaryotic or eukaryotic cell that is a recipient of a replicable expression vector or cloning vector is a host for the vector. The term includes prokaryotic or eukaryotic cells that have been engineered to incorporate a selected gene into their chromosome or into their genome. Examples of cells that can serve as hosts are well known in the art, as are cell transformation techniques (see, for example, Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor (1989)).
Promotor: DNA sekvence, která je obvykle umístěna v 5' regionu genu, proximálně vzhledem ke start kodonu. Transkripce je iniciována v promotoru. Pokud je promotor indukovatelný, tak se rychlost transkripce zvyšuje v odpovědi na indukční činidlo.Promoter: A DNA sequence that is usually located in the 5 'region of the gene, proximal to the start codon. Transcription is initiated in the promoter. If the promoter is inducible, the rate of transcription increases in response to the inducing agent.
Komplementární nukleotidová sekvence: Termín komplementární nukleotidová sekvence, jak je zde použit, označuje sekvenci, která vzniká při normálním párování baží. Například, nukleotidová sekvence 5-AGAC-3 bude mít komplementární sekvenci 5-GTCT-3.Complementary Nucleotide Sequence: The term "complementary nucleotide sequence" as used herein refers to a sequence that results from normal base pairing. For example, the nucleotide sequence of 5-AGAC-3 will have the complementary sequence of 5-GTCT-3.
• · · · · · ·• · · · · · · ·
Exprese: Exprese je proces, který je produkován polypeptid z DNA. Proces vyžaduje transkripci genu na mRNA a translaci této mRNA na polypeptid.Expression: Expression is the process by which a polypeptide is produced from DNA. The process requires the gene to be transcribed to mRNA and the mRNA to be translated into a polypeptide.
Předkládaný vynález je zaměřen na DRR receptorové proteiny, genetické sekvence kódující receptory, způsoby pro testování sloučenin na vazbu na DRR receptory a způsoby pro testování sloučenin na jejich schopnost alterovat expresi DRR. Receptory a jejich nukleové kyseliny jsou definovány svou strukturou (jak je uvedena na obr. 1, 2 a 4; a v SEQ ID NO: 1-14).The present invention is directed to DRR receptor proteins, genetic sequences encoding receptors, methods for testing compounds for binding to DRR receptors, and methods for testing compounds for their ability to alter DRR expression. The receptors and their nucleic acids are defined by their structure (as shown in Figures 1, 2 and 4; and in SEQ ID NOS: 1-14).
Je třeba si uvědomit, že předkládaný vynález zahrnuje nejen sekvence identické se sekvencemi uvedenými na obrázcích a v seznamu sekvencí, ale také sekvence, které jsou v podstatě stejné a sekvence, které jsou významně podobné a které si zachovávají vazebné charakteristiky k receptoru, které jsou vlastní DRR. Například, je dobře známo, že techniky, jako je místně cílená mutagenese, mohou být použity pro vložení variací do struktury proteinu. Variace v DRR proteinu vložené tímto nebo jiným podobným způsobem jsou také obsaženy v předkládaném vynálezu, s podmínkou, že vzniklý receptor si zachovává základní kvalitativní vazebné charakteristiky nealterovaného DRR. Proto se vynález týká proteinů skládajících se z funkční sekvence SEQ ID NO: 1 (krysí) a SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, 11 a 14 (lidské).It will be appreciated that the present invention encompasses not only sequences identical to those shown in the figures and sequence listing, but also sequences that are substantially the same and sequences that are significantly similar and that retain receptor binding characteristics that are intrinsic DRR. For example, it is well known that techniques such as site-directed mutagenesis can be used to introduce variations into the protein structure. Variations in the DRR protein introduced by this or other similar method are also included in the present invention, with the proviso that the resulting receptor retains the basic qualitative binding characteristics of the unaltered DRR. Therefore, the invention relates to proteins consisting of a functional sequence of SEQ ID NO: 1 (rat) and SEQ ID NO: 3, 5, 7, 9, 11 and 14 (human).
I. Sekvence nukleových kyselin kódující DRRI. DRR encoding nucleic acid sequences
DNA sekvence kódující DRR jsou exprimovány exklusivně, nebo alespoň značně přednostně, v gangliích zadních kořenů míšních, a tyto ganglia mohou sloužit jako zdroj pro izolování nukleových kyselin kódujících receptory. Dále, buňky a buněčné linie, které exprimují krysí nebo lidské DRR, mohou být zdrojem nukleových • ·The DNA sequences encoding the DRRs are expressed exclusively, or at least very preferably, in the posterior spinal cord ganglia, and these ganglia may serve as a source for isolating the nucleic acids encoding the receptors. In addition, cells and cell lines that express rat or human DRR may be a source of nucleic acids.
kyselin. Může se jednat o netransformované kultivované buňky, nebo o buněčné linie, které byly specificky zpracovány tak, aby exprimovaly rekombinantní DRR.of acids. They may be untransformed cultured cells, or cell lines that have been specifically processed to express recombinant DRRs.
Ve všech případech je póly A+ mRNA izolována z ganglií zadních kořenů míšních, je reverzně transkribována a je klonována. Takto připravená knihivna cDNA může být potom vyšetřována za použití sond odvozených od sekvencí uvedených v připojeném seznamu sekvencí jako SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12 nebo 14, podle toho, který konkrétní DRR je izolován. Sondy mají obvykle délku alespoň 14 baží a měly by být odvozeny od části DRR sekvence, která je málo konzervovaná {viz obr. 3 a 4). Vyšetřování může být také provedeno za použití genomových knihoven s jedním DRR genem, nebo částí genu, jako sondou pro izolování jiných DRR genů. Například, kompletní rDRR-1 může být označen a použit pro vyšetřování lidské genomové knihovny pro izolaci hDRR-1, hDRR-2 atd. (viz příklady provedení vynálezu).In all cases, the A + mRNA poles are isolated from the posterior spinal cord ganglia, reverse transcribed, and cloned. The cDNA library thus prepared can then be screened using probes derived from the sequences listed in the appended sequence listing as SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, or 14, depending on which particular DRR is isolated. Probes are typically at least 14 bases in length and should be derived from a portion of the DRR sequence that is poorly conserved (see Figures 3 and 4). Screening can also be performed using genomic libraries with one DRR gene, or part of a gene, as a probe to isolate other DRR genes. For example, complete rDRR-1 can be labeled and used to screen a human genomic library for isolation of hDRR-1, hDRR-2, etc. (see Examples).
Alternativně mohou být genomové DNA knihovny použity pro izolování DRR genů tak, že se provede PCR amplifikace za použití primerů umístěných na jednom z konců genů {popis postupu je uveden v příkladech provedení vynálezu). Například, lidská genomová DNA může být amplifikována za použití primerů:Alternatively, genomic DNA libraries can be used to isolate DRR genes by PCR amplification using primers located at one end of the genes (a description of the procedure is given in the Examples). For example, human genomic DNA can be amplified using primers:
5'-GCAAGCTTTCTGAGCATGGATCCAACCGTC, a5'-GCAAGCTTTCTGAGCATGGATCCAACCGTC, a
5'-CCCTCAGATCTCCAATTTGCTTCCCGACAG.5'-CCCTCAGATCTCCAATTTGCTTCCCGACAG.
Tyto primery mohou být použity pro amplifikaci všech šesti lidských DRR genů identifikovaných zde jako hDRR-1; hDRR-2; hDRR-3; hDRR-4; hDRR-5; a hDRR-6. Tyto geny mohou být potom klonovány do vhodného vektoru, například pGEM-T (Promega), pro analýzu sekvence DNA.These primers can be used to amplify all six human DRR genes identified herein as hDRR-1; hDRR-2; hDRR-3; hDRR-4; hDRR-5; and hDRR-6. These genes can then be cloned into a suitable vector, for example pGEM-T (Promega), for DNA sequence analysis.
• ·• ·
II. Protilátky ke krysím a lidským DRRII. Antibodies to rats and human DRRs
Předkládaný vynález obsahuje také protilátky, které se specificky váží na krysí nebo lidské DRR a způsobů pro přípravu takových protilátek. Protilátky, které se specificky váží na DRR jsou definovány jako ty protilátky, které mají alespoň 100-krát vyšší afinitu k DRR než k jakémukoliv jinému proteinu. Způsob pro přípravu takových protilátek může vyžadovat bud' injekci DRR proteinu samotného vhodnému zvířeti, nebo lépe injekci krátkých peptidů odpovídajících různým regionům DRR. Peptidy by měly mít délku alespoň 5 aminokyselin a měly by být vybrány z regionů, o kterých se předpokládá, že jsou jedinečné pro konkrétní DRR protein, proti kterému má být protilátka zaměřena. Proto obvykle nejsou vysoce konzervované transmembránové regiony použity jako peptidy pro přípravu protilátek. Způsoby pro přípravu a detekci protilátek jsou dobře známé v oboru a jsou popsány ve standardních pracích (např. Harlow et al., Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (1988); Klein, Imunology: The Science of Self-Nonself Discrimination (1982); Kennett et al., Monoclonal Antibodies and Hybridomas: A New Dimension in Biological Analyses (1980); a Campbell, Monoclonal Antibody Technology, v Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology (1984)).The present invention also includes antibodies that specifically bind to rat or human DRR and methods for preparing such antibodies. Antibodies that specifically bind to DRR are defined as those having at least 100-fold higher affinity for DRR than any other protein. The method for preparing such antibodies may require either injecting the DRR protein alone into a suitable animal, or more preferably injecting short peptides corresponding to different regions of the DRR. The peptides should be at least 5 amino acids in length and selected from regions believed to be unique to the particular DRR protein to which the antibody is to be directed. Therefore, highly conserved transmembrane regions are generally not used as peptides for the production of antibodies. Methods for preparing and detecting antibodies are well known in the art and are described in standard papers (e.g., Harlow et al., Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, NY (1988); Klein, Immunology: The Science of Self-). Nonself Discrimination (1982), Kennett et al., Monoclonal Antibodies and Hybridomas: A New Dimension in Biological Analyzes (1980) and Campbell, Monoclonal Antibody Technology, in Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology (1984).
Termín protilátka, jak je zde použit, označuje jak intaktní molekulu, tak její fragmenty, které si zachovávají schopnost vazby na antigen (například Fab a F(ab)2 fragmenty). Tyto fragmenty jsou obvykle připraveny proteolytickým štěpením intaktních protilátek za použití enzymů jako je papain (pro přípravu Fab fragmentů) nebo pepsin (pro přípravu F(ab)2 fragmentů). Termín protilátka také označuje monoklonální i polyklonální protilátky. Polyklonální protilátky jsou získány ze séra zvířat imunizovaných antigenem. Monoklonální protilátky mohou být připraveny technikou hybridomů • · « 4 (Kohler et al., Nátuře 256: 495 (1975); Hammerling et al., v Monoclonal Antibodies and T-cell Hybridomas, Elsevier, M.Y., str. 563-681 (1981)). Obecně, tato technika vyžaduje imunizaci zvířete, obvykle myši, buď intaktním DRR, nebo fragmentem odvozeným od DRR. Splenocyty imunizovaného zvířete jsou extrahovány a jsou fúsovány s vhodnými myelomovými buňkami, například s SP2O buňkami. Po fúsi jsou výsledné hybridní buňky selektivně udržovány v HAT mediu a potom jsou klonovány limitním ředěním (Wands et al.,The term antibody as used herein refers to both an intact molecule and fragments thereof that retain the ability to bind to an antigen (e.g., Fab and F (ab) 2 fragments). These fragments are usually prepared by proteolytic cleavage of intact antibodies using enzymes such as papain (to prepare Fab fragments) or pepsin (to prepare F (ab) 2 fragments). The term antibody also refers to both monoclonal and polyclonal antibodies. Polyclonal antibodies are obtained from the serum of animals immunized with antigen. Monoclonal antibodies can be prepared by the hybridoma technique (Kohler et al., Nature 256: 495 (1975); Hammerling et al., In Monoclonal Antibodies and T-cell Hybridomas, Elsevier, MY, pp. 563-681 (1981) )). Generally, this technique requires immunization of an animal, usually a mouse, with either an intact DRR or a DRR-derived fragment. The splenocytes of the immunized animal are extracted and fused with suitable myeloma cells, for example SP2O cells. After fusion, the resulting hybrid cells are selectively maintained in HAT medium and then cloned by limiting dilution (Wands et al.,
Gastroenterology 80: 225-232 (1981)). Buňky získané takovou selekcí jsou potom testovány pro identifikaci klonů, které secernují protilátky schopné vazby na DRR.Gastroenterology 80: 225-232 (1981)). The cells obtained by such selection are then screened to identify clones that secrete antibodies capable of binding to DRR.
Protilátky, nebo fragmenty protilátek, podle předkládaného vynálezu mohou být použity pro detekci přítomnosti DRR proteinu za použití jakéhokoliv z mnoha imunotestů. Například, protilátky mohou být použity v radioimunotestech nebo v imunometrických testech, které jsou též známé jako dvou-místné nebo sandwichové testy (viz Chard, T., An Introduction toThe antibodies, or antibody fragments, of the present invention can be used to detect the presence of a DRR protein using any of a variety of immunoassays. For example, antibodies can be used in radioimmunoassays or immunometric assays, also known as two-digit or sandwich assays (see Chard, T., An Introduction to
Radioimmune Assay and Related Techniques, v Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology, North Holland Publishing Co., N.Y. (1978)). V typickém imunometrickém testu je množství neznačené protilátky navázáno na pevný nosič, který je nerozpustný v testované kapalině, například v krvi, lymfě, buněčných extraktech a podobně. Po počáteční vazbě antigenu na imobilizovanou protilátku se přidá množství detekovatelně značené sekundární protilátky (která může, ale nemusí být stejná jako první protilátka) pro detekci a/nebo kvantifikaci navázaného antigenu (viz např. Radioimmune Assay Method, Kirkham et al., ed., str. 199-206, E. and S. Livingstone, Edinburg (1970)). V oboru je známo mnoho variant těchto typů testů a tyto varianty mohou být použity pro detekci DRR.Radioimmune Assay and Related Techniques, in Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology, North Holland Publishing Co., N.Y. (1978)). In a typical immunometric assay, the amount of unlabeled antibody is bound to a solid carrier that is insoluble in the test liquid, such as blood, lymph, cell extracts, and the like. After the initial binding of the antigen to the immobilized antibody, an amount of detectably labeled secondary antibody (which may or may not be the same as the first antibody) is added to detect and / or quantify the bound antigen (see, eg, Radioimmune Assay Method, Kirkham et al., Ed. pp. 199-206, E. and S. Livingstone, Edinburgh (1970)). Many variants of these types of assays are known in the art, and these variants can be used to detect DRR.
Protilátky ke krysímu nebo k lidským DRR mohou být také použity • ·Antibodies to rat or human DRRs may also be used.
pro přečištění intaktních receptorů nebo fragmentů receptorů (obecně viz Dean et al., Affinity Chromatography, A Practical Approach, IRL Press (1986)). Obvykle je protilátka imobilizovaná na koloně a přípravek obsahující DRR prochází kolonou za podmínek podporujících vazbu, například za podmínek nízké koncetrace solí. Kolona je potom promyta a navázaný DRR je eluován za použití pufru, který způsobuje disociaci DRR z protilátky, například pufru majícího jiné pH nebo koncentraci solí. Eluovaný DRR může být přenesen do vybraného pufru, například dialýzou, a potom může skladován nebo přímo použit.for purification of intact receptors or receptor fragments (generally see Dean et al., Affinity Chromatography, A Practical Approach, IRL Press (1986)). Typically, the antibody is immobilized on the column and the DRR-containing composition passes through the column under conditions promoting binding, for example under low salt concentration conditions. The column is then washed and bound DRR is eluted using a buffer that causes the DRR to dissociate from the antibody, for example a buffer having a different pH or salt concentration. The eluted DRR can be transferred to a selected buffer, for example by dialysis, and then stored or used directly.
III. Radioligandový test vazby na receptorIII. Radioligand receptor binding assay
Jedním z hlavních využití DRR nukleových kyselin a rekombinantních proteinů je použití v testech navržených pro identifikaci činidel schopných vazby na DRR receptory. Taková činidla mohou být bud' agonistická, napodobující normální účinky vazby na receptor, nebo antagonistická, inhibující normální účinky vazby na receptor. Zejména významná je identifikace činidel, které se váží na DRR a modulují aktivitu adenyl-cyklasy v buňkách. Tato činidla mají potenciální terapeutické použití jako analgetika a anestetika.One of the major uses of DRR nucleic acids and recombinant proteins is the use in assays designed to identify agents capable of binding to DRR receptors. Such agents may be either agonistic, mimicking the normal effects of receptor binding, or antagonistic, inhibiting the normal effects of receptor binding. Of particular interest is the identification of agents that bind to DRR and modulate adenyl cyclase activity in cells. These agents have potential therapeutic use as analgesics and anesthetics.
V radioligandovém vazebném testu je zdroj DRR inkubován s ligandem, o kterém je známo, že se váže na receptor, a se sloučeninou, která je testována na vazebnou aktivitu. Výhodným zdrojem DRR je buňka, výhodně savčí buňka, transformovaná tak, aby rekombinantně exprimovala receptor. Vybraná buňka by neměla exprimovat významná množství jiných receptorů spřažených s G-proteinem, které se mohou vázán na ligand a které mohou zkreslovat výsledky. Toto může být snadno stanoveno provedením vazebných testů na buňkách získaných ze stejné tkáně nebo buněčné linie jako buňky rekombinantně exprimující DRR, které však nebyly • · • · • · • · · · · · · • · · · · * · · • ······· · ··· • · · · 9 · • · · · 4 · · • · · · • · · · • · · · • · · · • · · · • · · · transformovány.In a radioligand binding assay, a source of DRR is incubated with a ligand known to bind to the receptor and a compound that is tested for binding activity. A preferred source of DRR is a cell, preferably a mammalian cell, transformed to recombinantly express the receptor. The selected cell should not express significant amounts of other G-protein coupled receptors that can bind to the ligand and which can misrepresent the results. This can be readily determined by performing cell binding assays on cells obtained from the same tissue or cell line as cells recombinantly expressing DRR, but which were not. · 9 · · 4 · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · Transformed.
Test může být proveden za použití intaktních buněk nebo za použití membrán připravených z buněk (viz Wang et al., Proč. Nati. Acad. Sci. USA 90: 10230-10234 (1993)). Membrány jsou inkubovány s ligandy specifickými pro DRR receptor a s přípravkem testované sloučeniny. Po dokončení vazby je receptor separován od roztoku obsahujícího ligand a testovanou sloučeninu, například filtrací, a stanoví se množství vazby. Výhodně je použitý ligand detekovatelně značen radioaktivním izotopem, jako je I12S. Nicméně, pokud je to nutné, může být místo izotopu použito fluorescenční nebo chemiluminiscenční činidlo. Mezi nejčastěji používané fluorescenční značící sloučeniny patří fluoresceinisothiocynat, rhodamin, fykoerythrin, fykocyanin, alofykocyanin, o-ftaldehyd a fluorescamin. Mezi použitlné chemiluminiscenční sloučeniny patří luminol, isoluminol, theromatický ester akridinia, imidazol, sůl acridinia a oxalatový ester. Jakékoliv z těchto činidel může být použito pro přípravu ligandu vhodného pro tento test.The assay can be performed using intact cells or membranes prepared from cells (see Wang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 10230-10234 (1993)). Membranes are incubated with ligands specific for DRR receptor and test compound preparation. Upon completion of binding, the receptor is separated from the solution containing the ligand and test compound, for example by filtration, and the amount of binding is determined. Preferably, the ligand used is detectably labeled with a radioactive isotope such as 12S . However, if necessary, a fluorescent or chemiluminescent agent may be used instead of the isotope. The most commonly used fluorescent labeling compounds include fluorescein isothiocyne, rhodamine, phycoerythrin, phycocyanine, allophycocyanine, o-phthaldehyde and fluorescamine. Useful chemiluminescent compounds include luminol, isoluminol, a theromatic acridinium ester, imidazole, acridinium salt, and oxalate ester. Any of these reagents can be used to prepare a ligand suitable for this assay.
Nespecifická vazba může být provedena vazebnou reakcí za přítomnosti velkého nadbytku neznačeného ligandu. Například, značený ligand může být inkubován s receptorem a testovanou sloučeninou v přítomnosti tisícinásobného nadbytku neznačeného ligandu. Nespecifická vazba by měla být odečtena od celkové vazby, t.j. vazby za nepřítomnosti neznačeného ligandu, pro získání specifické vazby pro každý testovaný vzorek. Pokud je to nutné, může test obsahovat další kroky, jako je promytí, míšení, třepání, filtrování a podobně. Obvykle je promytí provedeno po separaci ligandu navázaného na membránu od ligandu zůstávajícího v roztoku a před kvantifikací množství navázaného radioligandu, například pomocí stanovení radioaktivního izotopu. Specifická vazba získaná za přítomnosti testované sloučeniny je srovnávána s vazbou získanou za přítomnosti značeného ligandu samotného pro stanovení rozsahu vazby testované sloučeniny na receptor.Non-specific binding can be performed by a coupling reaction in the presence of a large excess of unlabeled ligand. For example, the labeled ligand may be incubated with the receptor and test compound in the presence of a 1000-fold excess of unlabeled ligand. Non-specific binding should be subtracted from total binding, i.e. binding in the absence of unlabeled ligand, to obtain specific binding for each test sample. If necessary, the assay may include additional steps such as washing, mixing, shaking, filtering and the like. Typically, the washing is performed after separating the membrane-bound ligand from the ligand remaining in solution and before quantifying the amount of bound radioligand, for example by means of a radioactive isotope assay. The specific binding obtained in the presence of the test compound is compared to the binding obtained in the presence of the labeled ligand itself to determine the extent of binding of the test compound to the receptor.
Při provádění vazebných testů musí být věnována pozornost vyloučení artefaktů, které mohou způsobit zdánlivou interakci testované sloučeniny s DRR receptorem, ačkoliv ve skutečnosti je vazba inhibována nějakými jinými mechanismy. Například, testované sloučeniny by měly být v pufru, který sám o sobě významně neinhibuje vazb ligandu na DRR a měly by být testovány v několika různých koncentracích. Přípravky testované sloučeniny by měly být také vyšetřovány na proteolytickou aktivitu a je žádoucí, aby testy obsahovaly antiproteasy. Konečně, je vysoce žádoucí, aby sloučeniny, které byly identifikovány jako sloučeniny vytěsňující ligand z vazby na DRR receptor, byly znovu vyšetřovány v rozmezí koncentrací dostatečném pro provedení Scatchardovi analýzy výsledků. Tento typ analýzy je dobře známý v oboru a ,ůže být použit pro stanovení afinity testovaných sloučenin pro receptor (viz například Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, 11.2.1-11.2.19 (1993); Laboratory Techniques and Biochemistry and Molecular Biology, Work et al., ed., N.Y. (1978), atd.). Počítačové programy mohou být použity pro usnadnění analýzy výsledků (viz například Munson, P., Methods Enzymol., 92: 543-577 (1983); McPherson, G.A., Kinetic, EBDA Ligand. Lowry-A Collection of Radioligand Binding Analysisi Programs, Elsevier-Biosoft, U.K. (1985)) .When performing binding assays, care should be taken to avoid artifacts that may cause the test compound to appear to interact with the DRR receptor, although in fact binding is inhibited by some other mechanism. For example, test compounds should be in a buffer that does not significantly inhibit ligand binding to DRR by itself and should be tested at several different concentrations. Formulations of the test compound should also be screened for proteolytic activity and it is desirable that the assays contain antiproteases. Finally, it is highly desirable that compounds which have been identified as ligand displacement compounds for binding to the DRR receptor be re-examined at a concentration range sufficient to perform Scatchard analysis of the results. This type of assay is well known in the art and can be used to determine the affinity of test compounds for the receptor (see, for example, Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, 11.2.1-11.2.19 (1993); Laboratory Techniques and Biochemistry and Molecular Biology, Work et al., Eds., NY (1978), etc.). Computer programs can be used to facilitate analysis of results (see, e.g., Munson, P., Methods Enzymol., 92: 543-577 (1983); McPherson, GA, Kinetic, EBDA Ligand. Lowry-A Collection of Radioligand Binding Analysis Programs, Elsevier). Biosoft, UK (1985)).
Aktivace receptoru vazbou ligandu může být monitorována za použití mnoha různých testů. Například, testy na adenyl-cyklasu mohou být provedeny kultivací buněk v jamkách mikrotitrační plotny a potom inkubací různých jamek za přítomnosti nebo za nepřítomnosti testované sloučeniny. cAMP může být extrahován v ethanolu, může být lyofilizován a resuspendován v testovacím pufru. Stanovení takto získaného cAMP může být provedeno za použití jakékoliv techniky pro stanovení koncentrace cAMP, * · · <r« • » · · · · • · · * · « · • ······· ♦ například Biotrack cAMP Enzyme-Immunoassay System (Amersham) nebo Cyclic AMP (3H) Assay System (Amersham). Obvykle budou testy na adenyl-cyklasu provedeny odděleně od vazebných testů, ale je také možné provést vazebný test a test na adenyl-cyklasu na jediném přípravku buněk. Další testy buněčné signalizace, které mohou být použity pro monitorování aktivity receptoru, jsou popsány dále.Receptor activation by ligand binding can be monitored using a variety of assays. For example, adenyl cyclase assays may be performed by culturing the cells in the wells of a microtiter plate and then incubating the various wells in the presence or absence of the test compound. cAMP can be extracted in ethanol, lyophilized and resuspended in assay buffer. The determination of the cAMP thus obtained can be carried out using any technique for determining the concentration of cAMP, for example a Biotrack cAMP Enzyme-Immunoassay. System (Amersham) or Cyclic AMP (3 H) Assay System (Amersham). Typically, the adenyl cyclase assays will be performed separately from the binding assays, but it is also possible to perform the binding and adenyl cyclase assays on a single cell preparation. Other cell signaling assays that can be used to monitor receptor activity are described below.
IV. Identifikace DRR agonistů a antagonistů za použití testů buněčné signalizaceIV. Identification of DRR agonists and antagonists using cell signaling assays
DRR mohou být také použity pro vyhledávání kandidátů na léky za použití testů buněčné signalizace. Pro identifikaci agonistů DRR je DNA kódující receptor inkorporována do expresního vektoru a potom je transfektována do vhodného hostitele. Tranformované buňky jsou potom kontaktovány se sérií testovaných sloučenin a je sledován efekt každé sloučeniny. Mezi testy, které mohou být použity, patří testy měřící produkci cAMP (viz výše), testy měřící aktivaci reporterového genu, nebo testy měřící modulaci vazby GTP-gamma-S.DRRs can also be used to screen drug candidates using cell signaling assays. To identify DRR agonists, the DNA encoding the receptor is incorporated into an expression vector and then transfected into a suitable host. The transformed cells are then contacted with a series of test compounds and the effect of each compound is monitored. Assays that may be used include assays measuring cAMP production (see above), assays measuring activation of the reporter gene, or assays measuring modulation of GTP-gamma-S binding.
Testy buněčné signalizace mohou být také použity pro identifikaci antagonistů DRR. Receptory spřažené s G-proteinem mohou být uvedeny do aktivovaného stavu i za absence jejich ligandu tím, že jsou exprimovány ve velmi -vysokých koncentracích v heterologním systému. Například, receptor může být nadměrně exprimován za použití bakulovirové infekce hmyzích Sf9 buněk nebo může být DRR gen operativně navázán na CMV promotor a může být exprimován v COS nebo HEK293 buňkách. V tomto aktivovaném konstitutivním stavu může být antagonista receptoru identifikován za absence ligandu měření schopnosti testované sloučeniny inhibovat konstitutivní buněčnou signalizační aktitvitu. Vhodnými testy pro tento účel jsou, opět, cAMP testy, testy aktivace * · ♦ «· 9 9 tf' «« •·· ·*·· · · « a • · * · · »· * 9 » > • »»···«· « *>«»·· - « «Cell signaling assays can also be used to identify DRR antagonists. G-protein coupled receptors can be activated even in the absence of their ligand by being expressed at very high concentrations in a heterologous system. For example, the receptor may be overexpressed using baculovirus infection of insect Sf9 cells, or the DRR gene may be operably linked to a CMV promoter and may be expressed in COS or HEK293 cells. In this activated constitutive state, a receptor antagonist can be identified in the absence of a ligand to measure the ability of the test compound to inhibit constitutive cellular signaling activity. Appropriate assays for this are, again, cAMP assays, activation ♦ * · «· 9 9 tf '« «* • ·· ·· · · ·" and • * · · · »· 9 *»> • »» ··· «· * *» »
-i«7 r»é ····«»# x / ** · · · 9 9 · · · * · reporterového genu nebo testy měřící vazbu GTP-gamma-S.Reporter gene or GTP-gamma-S binding measurement assays.
Jeden výhodný test buněčné signalizace je založen na pozorování, že buňky stabilně transfektováné DRR vykazují změny v intracelulární koncentraci vápníku v reakci na inkubaci v přítomnosti angiotensinu II nebo III (viz příklad 5). Tak je postup, který může být použit pro identifikaci DRR agonistů nebo antagonistů, podobný radioreceptorovému testu popsanému výše s tou výjimkou, že místo značeného ligandu je použit angiotensin II nebo III a místo navázané radioaktivity je měřena koncentrace vápníku. Koncentrace vápníku za přítomnosti testované sloučeniny a angiotensinu II nebo III je srovnávána s koncentrací za přítomnosti pouze angiotensinu II nebo III pro stanovení toho, zda interaguje testovaná sloučenina s DRR receptorem. Statisticky významné zvýšení intracelulárního vápníku v reakci na testovanou sloučeninu naznačuje, že testovaná sloučenina působí jako agonista, zatímco statisticky významné snížení intracelulárního vápníku v reakci na testovanou sloučeninu naznačuje, že testovaná sloučenina působí jako antagonista.One preferred cell signaling assay is based on the observation that cells stably transfected with DRR show changes in intracellular calcium concentration in response to incubation in the presence of angiotensin II or III (see Example 5). Thus, the procedure that can be used to identify DRR agonists or antagonists is similar to the radioreceptor assay described above except that angiotensin II or III is used instead of labeled ligand and calcium concentration is measured instead of bound radioactivity. The concentration of calcium in the presence of the test compound and angiotensin II or III is compared to the concentration in the presence of only angiotensin II or III to determine whether the test compound interacts with the DRR receptor. A statistically significant increase in intracellular calcium in response to the test compound indicates that the test compound acts as an agonist, while a statistically significant decrease in intracellular calcium in response to the test compound indicates that the test compound acts as an antagonist.
V. Testy na schopnost modulace exprese DRRV. Assays for the ability to modulate DRR expression
Jednou cestou pro zvýšení nebo snížení biologických účinků DRR je alterace exprese receptorů v buňkách. Proto jsou významné testy identifikující sloučeniny, které inhibují nebo zesilují expresi receptorů. Tyto testy jsou provedeny kultivací buněk exprimujících DRR za přítomnosti testované sloučeniny a potom srovnáním exprese receptorů v těchto buňkách s expresí receptorů v buňkách kultivovaných za v podstatě identických podmínek, ale za absence testované sloučeniny. Stejně jako ve vazbených testech popsaných výše je žádoucí, aby buňky v podstatě neobsahovaly kompetující receptory spřažené s G-proteinem. Jednou cestou pro kvantifikaci exprese receptorů je fúsování DRR sekvence na sekvenci kódujícíOne way to increase or decrease the biological effects of DRR is by altering the expression of receptors in cells. Therefore, assays identifying compounds that inhibit or enhance receptor expression are significant. These assays are performed by culturing cells expressing DRR in the presence of a test compound and then comparing the expression of the receptors in these cells with the expression of the receptors in cells cultured under substantially identical conditions but in the absence of the test compound. As in the binding assays described above, it is desirable for the cells to be substantially free of competing G-protein coupled receptors. One way to quantify receptor expression is by fusing the DRR sequence to the coding sequence
4 ««· 4 · 4 4 ···· « 4 4 4 4 4 4 · 4 · * » « 44444·· 4 ····· *4 « ··· 4 4 4 *4444 «« · 4 · 4 4 ···· 4 4 4 4 4 4 · 4 · * »44 44444 ·· 4 ····· * 4 · · 4 4 4 * 444
4 44 44 ·· 4 * peptid nebo protein, který může být snadno kvantifikován.A 4 * peptide or protein that can be easily quantified.
Například, DRR sekvence může být ligována na sekvenci kódující haemaglutinin, jak je popsána v příkladu 5, a tato sekvence může být použita pro stabilní transfekci buněk. Po inkubaci s testovanou sloučninou může být komplex haemaglutinin/receptor zpracován imunosrážením nebo westernovým přenosem s protilátkou proti haemaglutininu. Alternativně může být provedena Scatchardova analýza vazebných testů se značeným ligandem pro stanovení počtu receptorů. Vazebné testy mohou být provedeny způsobem popsaným výše a přednostně budou využívat buňky, které byly zpracovány tak, aby rekombinantně exprimovaly DRR.For example, a DRR sequence can be ligated to a sequence encoding haemagglutinin as described in Example 5, and this sequence can be used for stable transfection of cells. After incubation with the test compound, the haemagglutinin / receptor complex may be processed by immunoprecipitation or Western blotting with an anti-haemagglutinin antibody. Alternatively, Scatchard analysis of labeled ligand binding assays can be performed to determine the number of receptors. Binding assays can be performed as described above and will preferably utilize cells that have been engineered to recombinantly express DRR.
Výhodná skupina testovaných sloučenin pro použití v testech exprese DRR se skládá z oligonukleotidů komplementárních k různým segmentům sekvence DRR nukleové kyseliny. Tyto oligonukleotidy by měly být alespoň 15 baží dlouhé a měly by být odvozeny od nekonzervovaných regionů sekvence nukleové kyseliny receptoru. Sekvence mohou být odvozeny od sekvencí uvedených jako SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12 nebo 14.A preferred group of test compounds for use in DRR expression assays consists of oligonucleotides complementary to different segments of the DRR nucleic acid sequence. These oligonucleotides should be at least 15 bases long and be derived from the non-conserved regions of the receptor nucleic acid sequence. The sequences may be derived from the sequences shown as SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12 or 14.
Oligonukleotidy, o kterých bylo zjištěno, že snižují expresi receptoru, mohou být derivatizovány nebo konjugovány pro další zvýšení své účinnosti. Například, nukleosid-fosforothioaty mohou být substituovány za své přirozené protějšky (viz Cohen, J., Oligodeoxynucleotides, Antisense Inhibitors of Gene Expresion, CRC Press (1989)). Oligonukleotidy mohou být podány pacientovi in vivo za účelem inhibice exprese DRR. Pokud je prováděno toto podání, tak je výhodné, aby byl oligonukleotid podán ve formě, která zvyšuje jeho vychytávání buňkami. Například, oligonukleotid může být podán v liposomech nebo může být konjugován na peptid, který je tráven buňkami (viz například U.S. patenty č. 4897355 a 4394448; viz též non-US patentové přihlášky WO 8903849 a EP 0263740) . Jiné způsoby pro zvýšení účinnosti podání • · • · • · • · · « · · · • * · · · · · • ····· ·· ♦ oligonukleotidů jsou dobře známé v oboru a jsou také použitelné v předkládaném vynálezu.Oligonucleotides that have been found to reduce receptor expression can be derivatized or conjugated to further enhance their potency. For example, nucleoside phosphorothioates may be substituted for their natural counterparts (see Cohen, J., Oligodeoxynucleotides, Antisense Inhibitors of Gene Expression, CRC Press (1989)). Oligonucleotides may be administered to a patient in vivo to inhibit DRR expression. When such administration is performed, it is preferred that the oligonucleotide be administered in a form that enhances uptake by the cells. For example, the oligonucleotide may be administered in liposomes or may be conjugated to a peptide that is digested by cells (see, for example, U.S. Patent Nos. 4897355 and 4394448; see also non-US patent applications WO 8903849 and EP 0263740). Other methods for increasing the efficiency of administration of oligonucleotides are well known in the art and are also useful in the present invention.
Po předešlém popisu předkládaného vynálezu bude tento vynález dále vysvětlen v následujících příkladech, které jsou uvedeny pouze pro dokreslení vynálezu a nijak neomezují jeho rozsah.Having previously described the present invention, the present invention will be further elucidated in the following examples, which are provided to illustrate the invention in no way limiting its scope.
Příklady provedení vynálezuDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
Příklad 1: Klonování krysího DRR-1Example 1: Cloning of Rat DRR-1
Izolace cDNA fragmentuIsolation of the cDNA fragment
Byly syntetizovány degenerované oligonukleotidy k vysoce konzervovaným regionům receptorů spřažených s G-proteinem (transmembránové překlenující domény 2 a 7) s následujícími sekvencemi nukleotidů:Degenerate oligonucleotides were synthesized to highly conserved regions of G-protein coupled receptors (transmembrane bridging domains 2 and 7) with the following nucleotide sequences:
5’ GG CCG TCG ACT TCA TCG TC(A/T) (A/C)(T/C)C TI(G/T) CI(T/C) TIG C(A/C/G/T)G 3’ (TM2: kóduj ící) SEQ ID NO: 15; a5 'GG CCG TCG TCA TCG TC (A / T) (A / C) (T / C) C TI (G / T) CI (T / C) TIG C (A / C / G / T) G 3 (TM2: encoding) SEQ ID NO: 15; and
5’ (A/G)(C/A/T)(A/T) (A/G)CA (A/G)TA IATIATIGG (A/G)TT 3’ (TM7:protismyslná) SEQ ID NO: 16.5 '(A / G) (C / A / T) (A / G) (A / G) TA IATIATIGG (A / G) TT 3' (TM7: antisense) SEQ ID NO: 16 .
Póly A+ mRNA byla izolována z kultivovaných fetálních krysích ganglií zadních kořenů míšních (Sprague-Dawley). mRNA byla reverzně transkribována za použití First strand cDNA Synthesis kitu (Pharmacia Biotech), byla amplifikována polymerasovou řetězovou reakcí (PCR) za použití Ampli-Taq DNA (Perkin-Elmer Cetus) polymerasy za následujících podmínek: 3 minuty při 94 °C, 40 cyklů o 1 minutě při 94 °C, 45 °C a 72 °C. Byl izolován cDNA PCR fragment odpovídající přibližně 650 bp a tento fragment byl subklonován do pGEM-T-vektoru (Promega Corporation). Nukleotidová • · sekvence rekombinantního klonu byla určena za použití T7-dideoxy Chain termination sekvencovacího kitu {Pharmacia Biotech) a při průzkumu Genbank/EMBL databází bylo zjištěno, že je jedinečná.A + mRNA poles were isolated from cultured fetal rat spinal ganglion ganglia (Sprague-Dawley). mRNA was reverse transcribed using First strand cDNA Synthesis kit (Pharmacia Biotech), was amplified by polymerase chain reaction (PCR) using Ampli-Taq DNA (Perkin-Elmer Cetus) polymerase under the following conditions: 3 minutes at 94 ° C, 40 cycles by 1 minute at 94 ° C, 45 ° C and 72 ° C. A cDNA PCR fragment corresponding to approximately 650 bp was isolated and this fragment was subcloned into the pGEM-T-vector (Promega Corporation). The nucleotide sequence of the recombinant clone was determined using the T7-dideoxy Chain termination sequencing kit (Pharmacia Biotech) and was found to be unique in a Genbank / EMBL database search.
Kompletní krysí DRR-1 sekvence byla získána z krysí genomové DNA za použití 650 bp fragmentu a Promotor Finder DNA Walking kitu (Clontech, katal. č. K1806-1). Kit obsahuje pět knihoven neklonovaných, na adaptor navázaných fragmentů genomové DNA.The complete rat DRR-1 sequence was obtained from rat genomic DNA using a 650 bp fragment and the Promotor Finder DNA Walking Kit (Clontech, Cat. No. K1806-1). The kit contains five libraries of uncloned, adapter-coupled genomic DNA fragments.
Postup vyžaduje dvě postupné PCR reakce. Obě reakce byly provedeny za použití Advantage tth Polymerasa Mix, která byla také získána od Clontech, podle postupu doporučovaného výrobcem. První PCR reakce byla provedena za použití zevního adaptorového primeru (API) obsaženého v kitu a zevního, genově specifického primeru (GSPl) odvozeného od sekvence DRR-1 PCR fragmentu. Primární PCR směsi byly ředěny a byly použity jako templáty pro sekundární (nested) PCR reakci s nested adaptorovým primerem (AP2) a (nested) genově specifickým primerem (GSP2). Pro získání sekvence krysího DRR-1 genu před sekvencí původního PCR fragmentu byly použity následující oligonukleotidy:The procedure requires two sequential PCR reactions. Both reactions were performed using Advantage tth Polymerase Mix, which was also obtained from Clontech, according to the manufacturer's recommended procedure. The first PCR reaction was performed using an external adapter primer (API) contained in the kit and an external gene specific primer (GSP1) derived from the DRR-1 PCR fragment sequence. Primary PCR mixtures were diluted and used as templates for the secondary (nested) PCR reaction with nested adapter primer (AP2) and (nested) gene specific primer (GSP2). The following oligonucleotides were used to obtain the sequence of the rat DRR-1 gene before the original PCR fragment sequence:
GSPl: oligo YF3B59-B, 5‘-CGCAGATGAGGTAGTACAGCATCAC SEQ ID NO: 17GSP1: oligo YF3B59-B, 5‘-CGCAGATGAGGTAGTACAGCATCAC of SEQ ID NO: 17
GSPl: oligo MML-R.1, 5‘- CTGTGAGAGAGATGGTAACATACAG SEQ ID NO: 18GSP1: oligo MML-R.1,5‘- CTGTGAGAGAGATGGTAACATACAG SEQ ID NO: 18
Z první knihovny byl získán fragment AP2-MMLR1 velikosti 1,9 kb a ze třetí knihovny byl získán fragment velikosti přibližně 1,0 kb. Pro získání sekvence za známou sekvencí byly použity následující primery:The 1.9 kb AP2-MMLR1 fragment was obtained from the first library and the approximately 1.0 kb fragment was obtained from the third library. The following primers were used to obtain the sequence after the known sequence:
GSPl: oligo YF3B59-F2, 5‘-GCATCCTTGACTGGTTCTTCTCAG SEQ ID NO: 19 GSP2: oligo MML-F1, 5 GGGTGAGACTCATCATCATTTGTGG. SEQ ID N0:20 • ·GSP1: YF3B59-F2 oligo, 5‘-GCATCCTTGACTGGTTCTTCTCAG SEQ ID NO: 19 GSP2: MML-F1 oligo, 5 GGGTGAGACTCATCATCATTTGTGG. SEQ ID NO: 20
Fragment MMLF1-AP2 velikosti přibližně 1 kb byl získán z první knihovny a fragment velikosti přibližně 600 bp byl získán ze třetí knihovny. Složená sekvence velikosti 1154 nukleotidů obsahující kompletní předpokládaný otevřený čtecí rámec DRR-1 je uvedena na obr. 1. Otevřený čtecí rámec kóduje protein obsahující 337 aminokyselin (obr. 2) s předpokládanou molekulovou hmotností 38,7 kDa. Proteinová sekvence obsahuje všechny charakteristické vlastnosti receptorů spřažených s G-proteinem: sedm hydrofobních šroubovic pravděpodobně představujících transmebránové domény, potenciální glykosylační místo na N-terminální extracelulární doméně (pozice 30) a konzervovanou NPXXY sekvenci v pozici 285-289.An approximately 1 kb MMLF1-AP2 fragment was obtained from the first library, and an approximately 600 bp fragment was obtained from the third library. A composite sequence of 1154 nucleotides containing the complete putative open reading frame of DRR-1 is shown in Figure 1. The open reading frame encodes a protein of 337 amino acids (Figure 2) with an estimated molecular weight of 38.7 kDa. The protein sequence contains all the characteristic properties of G-protein coupled receptors: seven hydrophobic helices probably representing transmebrane domains, a potential glycosylation site at the N-terminal extracellular domain (position 30), and a conserved NPXXY sequence at position 285-289.
Příklad 2: Klonování genů pro lidské DRR receptoryExample 2: Cloning of genes for human DRR receptors
Dva přístupy byly použity pro identifikaci a klonování nových lidských DNA sekvencí homologických a/nebo příbuzných s krysím DRR-1 genem. V prvním přístupu byla lidská genomová knihovna vyšetřována v lambda vektoru, Fix II (STratagene katal. č.Two approaches were used to identify and clone new human DNA sequences homologous and / or related to the rat DRR-1 gene. In the first approach, the human genomic library was screened in a lambda vector, Fix II (STratagene cat.
946203) . Přibližně 106 lidských genomových klonů bylo umístěno na plotny a přeneseno na nitrocelulosové membrány pro hybridizaci s kompletní, 32P-značenou krysí DRR-1 sekvencí jako sondou. Hybridizace byla provedena při 42 °C přes noc. Filtry byly promyty při teplotě okolí při nízké přísnosti (IX SSC/0,1% SDS) pro umožnění detekce příbuzných, ale ne nutně identických sekvencí.946203). Approximately 10 6 human genomic clones were plated and transferred to nitrocellulose membranes for hybridization with the complete, 32 P-labeled rat DRR-1 sequence as a probe. Hybridization was performed at 42 ° C overnight. The filters were washed at ambient temperature at low stringency (1X SSC / 0.1% SDS) to allow detection of related but not necessarily identical sequences.
Insertovaná lidská DNA přítomná v pozitivních fágách byla amplifikována PCR za použití Expand PCR kitu od Boehringer Mannheim za podmínek umožňujících přesnou amplifikaci velmi velkých fragmentů DNA. Tyto dlouhé fragmenty DNA byly tráveny různými restrikčními enzymy a byly subklonovány do plasmidového vektoru. Části těchto klonů, které hybridizovaly s krysí DRR-1 genovou sondou, byly sekvencovány za použití ABI cycle • · • · · · · • · ·* sekvencovacího kitu.The inserted human DNA present in the positive phages was amplified by PCR using an Expand PCR kit from Boehringer Mannheim under conditions allowing accurate amplification of very large DNA fragments. These long DNA fragments were digested with various restriction enzymes and were subcloned into a plasmid vector. Portions of these clones that hybridized to the rat DRR-1 gene probe were sequenced using an ABI cycle sequencing kit.
Druhý přístup pro identifikaci nových lidských sekvencí příbuzných k DRR-1 spočívá v použití polymerasové řetězové reakce (PCR) provedené na celkové lidské DNA. Primery byly syntetizovány podle lidských genomových klonů popsaných výše a měly následující sekvence:A second approach for identifying new human DRR-1 related sequences is to use a polymerase chain reaction (PCR) performed on total human DNA. The primers were synthesized according to the human genomic clones described above and had the following sequences:
HML.H, 5’-GCAAGCTTTCTGAGCATGGATCCAACCGTC, SEQ ID 21 a HML.Bg, 5’-CCCTCAGATCTCCAATTTGCTTCCCGACAG. SEQ ID NO:22.HML.H, 5'-GCAAGCTTTCTGAGCATGGATCCAACCGTC, SEQ ID 21 and HML.Bg, 5'-CCCTCAGATCTCCAATTTGCTTCCCGACAG. SEQ ID NO: 22.
Po amplifikaci se získaly fragmenty velikosti přibližně 1 kb obsahující celou kódující sekvenci lidských genů. Tyto získané fragmenty byly subklonovány do pGEM-T (Promega) vektoru pro analýzu sekvence DNA.After amplification, approximately 1 kb fragments were obtained containing the entire coding sequence of human genes. These obtained fragments were subcloned into pGEM-T (Promega) DNA sequence analysis vector.
Za použití výše uvedených strategií bylo izolováno šest lidských klonů:Six human clones were isolated using the above strategies:
Žádný z těchto klonů neobsahoval introny a jejich seřazení je uvedeno na obr. 3.None of these clones contained introns and their alignment is shown in Figure 3.
Na aminokyselinové úrovni je krysí DRR-1 klon ze 47% až 49% identický s lidskými klony.At the amino acid level, the rat DRR-1 clone is 47% to 49% identical to human clones.
Na úrovni nukleových kyselin je krysí DRR-1 klon z 56% až 58% • · • · • · · 4 · ··· «··· · · » « ···· ···· ···· • ······· · ····· · « * ··· · · · ···· • 4 · ·· · « ·« »· identický s lidskými klony. Hladina identity sekvence mezi lidskými klony (7, 18, 23, 24, 36, 40) je velmi vysoká, od 77% do 98% na úrovni aminokyselin. Všechny lidské sekvence byly použity jako vzory pro vyhledáváni homologických sekvencí v publikovaných databázích (Genbank, Swissprot, EST). Nebyly zjištěny žádné identické sekvence. Nejvíce příbuznými sekvencemi byly proteiny rodiny mas onkogenu. Celková homologie aminokyselinové sekvence mezi krysím DRR-1 a jakýmkoliv z izolovaných lidských genů se pohybovala od 47% do 50%. Nicméně, určité úseky vykazovaly mnohem vyšší homologii sekvence, zejména regiony kódující domnělou transmembránovou doménu III a VII (TM3 a TM7) a intracelulární smyčky 2 a 3, kde byly homologie mezi krysí sekvencí a lidským homologem přibližně 80%.At the nucleic acid level, the rat DRR-1 clone is from 56% to 58%. · Identical to human clones. · · 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 identical to human clones. The level of sequence identity between human clones (7, 18, 23, 24, 36, 40) is very high, from 77% to 98% at the amino acid level. All human sequences were used as templates to search for homologous sequences in published databases (Genbank, Swissprot, EST). No identical sequences were detected. The most related sequences were proteins of the oncogene mass family. The overall amino acid sequence homology between rat DRR-1 and any of the isolated human genes ranged from 47% to 50%. However, certain regions showed much higher sequence homology, especially regions encoding putative transmembrane domains III and VII (TM3 and TM7) and intracellular loops 2 and 3, where the homologies between the rat sequence and the human homologue were approximately 80%.
Příklad 3: Pokusy s hybridizací in šituExample 3: In situ hybridization experiments
Příprava tkáně: Samci dospělých Sprague-Dawley krys (přibližně 300 g, Charles River, S. Constant, Quebec) byly usmrceni dekapitací. Byly odebrány mozky a míchy s ganglii zadních kořenů, byly rychle zmrazený v isopentanu při -40 °C během 20 sekund a byly uskladněny při -80 °C. Zmrazené lidské mozky, míchy a ganglia zadních kořenů míšních byly získány od Brain and Tissue Bank for Devolopmental Disorders, University of Maryland v Baltimore, v souladu s přísnými etickými předpisi. Zmrazená tkáň byla nařezána v 14 m na Microm HM 500 M kryostatu (Germany) a byla v roztátém stavu umístěna na ProbeOn Plus sklíčka (Fisher Scientifics, Montreal, Quebec). Řezy byly uloženy při -80 °C do hybridizace in šitu.Tissue Preparation: Male adult Sprague-Dawley rats (approximately 300 g, Charles River, S. Constant, Quebec) were sacrificed by decapitation. Brains and spinal cord with posterior root ganglia were removed, were rapidly frozen in isopentane at -40 ° C for 20 seconds and stored at -80 ° C. Frozen human brains, spinal cord and posterior spinal ganglion were obtained from the Brain and Tissue Bank for Devolopmental Disorders, University of Maryland, Baltimore, in accordance with strict ethical regulations. The frozen tissue was sectioned at 14 m on a Microm HM 500 M cryostat (Germany) and was thawed on ProbeOn Plus slides (Fisher Scientifics, Montreal, Quebec). Sections were stored at -80 ° C until in situ hybridization.
Syntéza ribosond: Plasmid pGemT-3b32 GPCR byl linearizován za použití bud' SacII, nebo Notl restrikčního enzymu. Kódující a protismyslné DRR ribosondy byly transkribovány in vitro za použití buď T7, nebo SP6 RNA polymerasy (Pharmacia Biotech), v příslušném « * ·Ribon probe synthesis: Plasmid pGemT-3b32 GPCR was linearized using either SacII or NotI restriction enzyme. The coding and antisense DRR ribosondes were transcribed in vitro using either T7 or SP6 RNA polymerase (Pharmacia Biotech), in the appropriate.
pořadí, v přítomnosti (35S)UTP (přibližně 800 Ci/mmol; Amersham, Oakville, Ontario). Plasmid pGemT-Clone 36 GPCR byl linearizován za použití restrikčních enzymů SacII a Pstl. Kódující a protismyslné Clon36 ribosondy byly transkribovány in vitro za použití buď SP6, nebo T7 RNA polymerasy (Pharmacia Biotech), v příslušném pořadí, v přítomnosti (35S)UTP. Po transkripci byl DNA templát tráven DNAsou I {Pharmacia). Ribosondy byly přečištěny fenol/chloroform/isoamyl/alkoholovou extrakcí a byly vysráženy v 70% ethanolu obsahujícím octan amonný a tRNA. Kvalita značených ribosond byla potvrzena elektroforesou na polyakrylamidovém-močovinovém gelu.order, in the presence of (35S) UTP (approximately 800 Ci / mmol; Amersham, Oakville, Ontario). Plasmid pGemT-Clone 36 GPCR was linearized using the restriction enzymes SacII and PstI. The coding and antisense Clon36 ribosondes were transcribed in vitro using either SP6 or T7 RNA polymerase (Pharmacia Biotech), respectively, in the presence of (35S) UTP. After transcription, the DNA template was digested with DNAse I (Pharmacia). Ribosondes were purified by phenol / chloroform / isoamyl / alcohol extraction and were precipitated in 70% ethanol containing ammonium acetate and tRNA. The quality of the labeled ribosondes was confirmed by polyacrylamide-urea gel electrophoresis.
Hybridizace in šitu: Řezy byly post-fixovány ve 4% paraformaldehydu (BDH, Poole, England) v 0,1 M fosfátovém pufru (pH 7,4) po dobu 10 minut při teplotě okolí a byly vymyty třikrát 2X standardním citratovým pufrem (SSC; 0,15 M NaCl, 0,015 M citrát sodný, pH 7,0) . Řezy byly potom uvedeny do rovnováhy v 0,1 M triethanolaminu, byly zpracovány 0,25% anhydridem kyseliny octové v triethanolaminu, byly vypláchnuty ve 2X SSC a byly dehydratovány v ethanolové sérii (50-100%). Hybridizace byla provedena v pufru obsahujícím 75% formamid (Sigma, St. Louis, MO) , 600 mM NaCl, 10 mM Tris (pH 7,5), 1 mM EDTA, IX Denhartova roztoku (Sigma), 50 g/ml denaturované lososí spermatické DNA (Sigma) , 50/*g/ml kvasinkové tRNA (Sigma), 10% dextran síran (Sigma), 20 mM dithiothreitol a (35S)UTP-značené cRNA sondy (10 x 106cpm/ml) při 55 °C během 18 hodin ve zvlhčované komůrce. Po hybridizaci byla sklíčka promyta ve 2X SSC při teplotě okolí, byla zpracovávána 20 g/ml RNAsy IA (Pharmacia) v RNAsovém pufru (10 ml Tris, 500 mM NaCl, 1 mM EDTA, pH 7,5) po dobu 45 minut a byla promyta na konečnou přísnost 0,lxSSC při 65 °C. Řezy byly potom dehydratovány a exponovány na Kodak Biomax MR filmu po dobu 21 dnů a/nebo ponořeny do Kodak NTB2 emulse ředěné 1:1 destilovanou vodou a exponovány po dobu 4-6 týdnů při 4 °C před vyvíjením a • · • · • · • · · • · · ···· · • · · · ···· · • ······· · ·«··· • · · · · · · · · ·· kontrastním barvením cresyl-violeť-acetatem (Sigma).In situ hybridization: Sections were post-fixed in 4% paraformaldehyde (BDH, Poole, England) in 0.1 M phosphate buffer (pH 7.4) for 10 minutes at ambient temperature and were washed three times with 2X standard citrate buffer (SSC). 0.15 M NaCl, 0.015 M sodium citrate, pH 7.0). The sections were then equilibrated in 0.1 M triethanolamine, treated with 0.25% acetic anhydride in triethanolamine, rinsed in 2X SSC and dehydrated in ethanol series (50-100%). Hybridization was performed in a buffer containing 75% formamide (Sigma, St. Louis, MO), 600 mM NaCl, 10 mM Tris (pH 7.5), 1 mM EDTA, 1X Denhart's solution (Sigma), 50 g / ml denatured salmon sperm DNA (Sigma), 50 µg / ml yeast tRNA (Sigma), 10% dextran sulfate (Sigma), 20 mM dithiothreitol and ( 35 S) UTP-labeled cRNA probes (10 x 10 6 cpm / ml) at 55 ° C for 18 hours in a humidified chamber. After hybridization, slides were washed in 2X SSC at ambient temperature, treated with 20 g / ml RNAse IA (Pharmacia) in RNAse buffer (10 ml Tris, 500 mM NaCl, 1 mM EDTA, pH 7.5) for 45 minutes and was washed to a final stringency of 0.1xSSC at 65 ° C. Sections were then dehydrated and exposed to Kodak Biomax MR film for 21 days and / or immersed in Kodak NTB2 emulsion diluted 1: 1 with distilled water and exposed for 4-6 weeks at 4 ° C prior to development and treatment. • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • -acetate (Sigma).
Výsledky: Ze všech regionů vyšetřovaných v nervovém systému krys byla DRR-1 mRNA exprimována výlučně v gangliích zadních kořenů míšních. Emulsní autoradiografie s vysokou rozlišovací schopností ukázala akumulaci stříbrných zrn výlučně v neuronech s malou a střední velikostí. Tento jedinečný a vysoce omezený charakter distribuce DRR-1 byl potvrzen v krysím embryu. Sagitální řez E17 krysím plodem ukázal, že DRR-1 mRNA je omezena na ganglia zadních kořenů míšních. V žádných dalších strukturách krysího embrya nebyl detekován žádný specifický hybridizační signál, což potvrzuje -vysoce selektivní charakter exprese DRR-1.Results: Of all regions examined in the nervous system of rats, DRR-1 mRNA was expressed exclusively in the posterior root ganglia. Emulsive autoradiography with high resolution showed the accumulation of silver grains exclusively in small and medium size neurons. This unique and highly restricted character of the DRR-1 distribution was confirmed in the rat embryo. A rat fetal sagittal section of E17 showed that DRR-1 mRNA is restricted to the posterior spinal cord ganglia. No specific hybridization signal was detected in any other rat embryo structures, confirming the highly selective pattern of DRR-1 expression.
Exprese receptoru lidského klonu 36 byla přítomná ve fetálních gangliích zadních kořenů míšních, ale nikoliv v míše. Specifický hybridizační signál pro klon 36 nebyl detekován v žádné dosud vyšetřované lidské dospělé tkáni CNS. Mezi tyto vyšetřované tkáně patří mícha, kůra mozková, hippocampus, thalamus, substantia nigra a periaquaductální šedá hmota (data nejsou uvedena). Přítomnost mRNA klonu 36 v gangliích zadních kořenů míšních dospělých jedinců musí být ještě vyšetřena. Standardní kontroly, ve kterých byly další řezy míchou s gangliemi zadních kořenů hybridizovány s DRR-1 protismyslnými nebo klon 36 kódujícími sondami značenými 35S, neukázaly žádný specifický hybridizační signál.Expression of the human clone 36 receptor was present in the fetal ganglia of the posterior spinal cord, but not in the spinal cord. The specific hybridization signal for clone 36 was not detected in any human adult CNS tissue examined so far. These tissues include spinal cord, cerebral cortex, hippocampus, thalamus, substantia nigra and periaquaductal gray matter (data not shown). The presence of clone 36 mRNA in the posterior root ganglia of spinal cord adults has yet to be investigated. Standard controls in which additional sections of the spinal cord ganglion were hybridized with DRR-1 antisense or clone 36 coding probes labeled with 35 S showed no specific hybridization signal.
Příklad 4: Northemové přenosyExample 4: Northem transmissions
Komerční krysí a lidské membrány pro northernové přenosy obsahující 2 g póly A RNA z různých tkání (Clontech) byly použity pro stanovení exprese a distribuce krysí DRR-1 mRNA a jejích lidských homologů. Radioaktivně značené sondy byly připraveny následujícím způsobem:25 ng 650 bp 3b-32 PCR fragmentu získaného z krysího DRR-1 viz příklad 1) nebo lidského kolnu 36 bylo náhodně • · · • · · · • · · v · • ·····«· • · « · • · · · · značeno za použití Ready-to-Go DNA značkovacího kitu (Pharmacia Biotech) a (32P)CTP (3000 Ci/mmol/Amersham). Membrána byla prehybridizována po dobu 1 hodiny při 68 °C za použití Expresshyb (Clontech) a potom byla provedena hybridizace (2x106 cpm/ml sondy) po dobu 1 hodiny za použití stejných podmínek. Membrány byly promyty při teplotě okolí ve 2X SSC, 0,05% SDS po dobu 30 minut a potom byly provedeny 3 promytí ve 0,2X SSC, 1% SDS při 50 °C po dobu 60 minut a membrány byly exponovány při -80 °C na Kodak Biomax filmu po dobu 6 dnů.Commercial rat and human Northern blot membranes containing 2 g poles of A RNA from various tissues (Clontech) were used to determine expression and distribution of rat DRR-1 mRNA and its human homologs. Radiolabeled probes were prepared as follows: 25 ng of the 650 bp 3b-32 PCR fragment obtained from rat DRR-1 (see Example 1) or human knee 36 was randomized. Labeled using a Ready-to-Go DNA labeling kit (Pharmacia Biotech) and ( 32 P) CTP (3000 Ci / mmol / Amersham). The membrane was prehybridized for 1 hour at 68 ° C using Expresshyb (Clontech) and then hybridized (2x10 6 cpm / ml probe) for 1 hour using the same conditions. The membranes were washed at ambient temperature in 2X SSC, 0.05% SDS for 30 minutes and then 3 washes were performed in 0.2X SSC, 1% SDS at 50 ° C for 60 minutes and the membranes were exposed at -80 ° C on Kodak Biomax film for 6 days.
Exprese a distribuce krysího DRR-1: Všechny studované krysí tkáně (srdce, mozek, slezina, plíce, kosterní sval, ledviny a varlata) byly negativní na expresi DRR-1 po 2 týdenní expozici, zatímco southernová analýza krysího genomu ukázala 1,1 kb proužek při sondování stejným cDNA fragmentem.Rat DRR-1 Expression and Distribution: All rat rats (heart, brain, spleen, lung, skeletal muscle, kidney and testes) were negative for DRR-1 expression after 2 weeks exposure, whereas southern analysis of the rat genome showed 1.1 kb band when probed with the same cDNA fragment.
Exprese a distribuce lidského klonu 36: Northernové membrány obsahující RNA z různých lidských tkání byly sondovány radioaktivně značeným DNA fragmentem z klonu 36. Všechny studované lidské tkáně (lidský fetální mozek, plíce, játra a ledviny a dospělý lidský mozeček, mozková kůra, prodloužená mícha, okcipitální lalok, frontální lalok, temporální lalok, putamen, mícha, amygdala, nucleus caudatus, corpus callosum, hippocampus, celý mozek, subtalamické jádro a thalamus) byly negativní z hlediska exprese tohoto receptorů po 2 týdenní expozici.Expression and distribution of human clone 36: Northern membranes containing RNA from various human tissues were probed with radiolabeled DNA fragment from clone 36. All human tissues studied (human fetal brain, lung, liver and kidney and adult human cerebellum, cerebral cortex, spinal cord, occipital lobe, frontal lobe, temporal lobe, putamen, spinal cord, amygdala, caudatus nucleus, callosum corpus, hippocampus, whole brain, subtalamic nucleus and thalamus) were negative for expression of this receptor after 2 weeks exposure.
Příklad 5: Vápníková signalizace v odpovědi na angiotensin I-IIIExample 5: Calcium signaling in response to angiotensin I-III
Kódující sekvence lidského klonu 24 byla přenesena do pcDNA3 vektoru a byla modifikována tak, aby přidávala haemaglutininovou koncovku na C-konec sekvence receptorů. Tento klon, označený pcDNA3-HML-HA24, byl transfektován do HEK293 buněk za použití modifikované CaCl2 metody (Maniatis, Molecular Cloning: A • · e ·The coding sequence of human clone 24 was transferred to the pcDNA3 vector and was modified to add the haemagglutinin terminal to the C-terminus of the receptor sequence. This clone, designated pcDNA3-HML-HA24, was transfected into HEK293 cells using a modified CaCl 2 method (Maniatis, Molecular Cloning:
Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)). Buňky byly kultivovány v kultivačním mediu při 37 °C, 5% C02 a byly ředěny 10-krát každé 3 dny.Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)). Cells were cultured in culture medium at 37 ° C, 5% CO 2 and were diluted 10-fold every 3 days.
Buňky byly naočkovány na 90 mm tkáňové kultivační disky (5 x 105 buněk na nádobu) v Dulbeccově modifikovaném esenciálním mediu (DMEM, Gibco BRL) doplněném 10% fetálním hovězím sérem (FBS), 100 U/ml penicilinu, 100 g/ml streptomycinu a 0,25 g/ml fungizonu. Jeden den po naočkování byly buňky dočasně transfektovány 30 g plasmidové DNA na disk. Buňky byly sklízeny 48 hodin po transfekci a byly analyzovány. Exprese genu byla nejprve potvrzena imunoprecipitací a westernovým přenosem s anti-haemaglutininovou protilátkou. Protein velikosti přibližně 43 kD byl detekován ve stabilně, stejně jako v přechodně transfektovaných HEK293 buňkách, ale nikoliv v kontrolních buňkách.Cells were plated on 90 mm tissue culture discs (5 x 10 5 cells per flask) in Dulbecco's modified essential medium (DMEM, Gibco BRL) supplemented with 10% fetal bovine serum (FBS), 100 U / ml penicillin, 100 g / ml streptomycin and 0.25 g / ml fungizone. One day after seeding, cells were transiently transfected with 30 g of plasmid DNA per disc. Cells were harvested 48 hours after transfection and analyzed. Gene expression was first confirmed by immunoprecipitation and western blotting with an anti-haemagglutinin antibody. A protein of approximately 43 kD was detected in stable as well as transiently transfected HEK293 cells, but not in control cells.
Stabilně transfektováné HEK293 buňky byly získány po přibližně 21 dnech selekce v kultivačním mediu obsahujícím 800 g/ml G418. Měření vápníkové signalizace bylo provedeno za použití jedné z těchto stabilně transfektovaných buněčných linií,Stably transfected HEK293 cells were obtained after approximately 21 days of selection in culture medium containing 800 g / ml G418. Measurement of calcium signaling was performed using one of these stably transfected cell lines,
293/pcDNA3-HML-HA24. Buňky byly kultivovány na 24 mm okrouhlých sklíčkách do 50-70% konfluence. Po promytí buněk 1,8 NBS pufrem (135 mM Naci, 5 mM KC1, 1,2 mM MgCl2, 1,8 mM CaCl2, 5 mM glukosa a 10 mM HEPES, pH 7,3) byly buňky inkubovány po dobu 1 hodiny při teplotě okolí za přítomnosti 0,5 ml 3,5 M FURA-2AM (Molecular Probe, F-1221) ředěné v 1,8 NBS. Buňky byly potom třikrát promyty 1,8 NBS a byly inkubovány po dobu dalších 30 minut při teplotě okolí. Odstraňování vápníku bylo měřeno za použití PTI (Photon Technology International) D 104 fotometru vybaveného PTI Delta RAM High Speed osvětlovacím přístrojem s mnoha vlnovými délkami, PTI SC500 Shutter kontrolním zařízením, PTI LPS220 ARC zdrojem světla a PTI FELIX softwarem, v. 1.2. Byly vybrány skupiny 2 až 8 buněk a byly izolovány za použití membrány fotometru. Buňky byly vystaveny • · • · 4 4 4 44 44 ••4 · 4 4 · 4 4 · 4293 / pcDNA3-HML-HA24. Cells were cultured on 24 mm round slides to 50-70% confluency. After washing the cells with 1.8 NBS buffer (135 mM Naci, 5 mM KCl, 1.2 mM MgCl 2 , 1.8 mM CaCl 2 , 5 mM glucose and 10 mM HEPES, pH 7.3), the cells were incubated for 1 hour. hours at ambient temperature in the presence of 0.5 ml of 3.5 M FURA-2AM (Molecular Probe, F-1221) diluted in 1.8 NBS. The cells were then washed three times with 1.8 NBS and incubated for an additional 30 minutes at ambient temperature. Calcium removal was measured using a PTI (Photon Technology International) D104 photometer equipped with a PTI Delta RAM High Speed Illuminator with multiple wavelengths, a PTI SC500 Shutter Controller, a PTI LPS220 ARC light source, and a PTI FELIX software, v. 1.2. Groups of 2 to 8 cells were selected and isolated using a photometer membrane. Cells were exposed. • 4 4 44 44 •• 4 · 4 4 · 4 4 · 4
44» 4 44 4 ····44 »4 44 4 ····
4944944 4 44444 94 4 •4 4 94 4 444»4944944 4 44444 94 4 • 4 4 94 4 444
4 94 44 44 »4 světlu 340 a 380 nm a světlo vlnové délky 510 nm emitované buňkami bylo snímáno. Angiotensin I, II a II byly postupně přidávány - v různém pořadí v různých pokusech - a potom byl jako pozitivní kontrola přidán bradykinin. Při stimulaci angiotensinem II a III byla získána významná odpověď. Přidání angiotensinu I nevyvolalo žádou odpověď.No. 4,944,444, 4 light 340 and 380 nm and light of 510 nm wavelengths emitted by the cells were sensed. Angiotensin I, II and II were gradually added - in different order in different experiments - and then bradykinin was added as a positive control. A significant response was obtained with angiotensin II and III stimulation. The addition of angiotensin I produced no response.
Všechny zde citované publikace jsou zde uvedeny jako odkazy. Z úplného popisu vynálezu bude odborníkům v oboru jasné, že vynález může být prováděn za použití různých podmínek, parametrů a podobně, bez toho, že by byl narušen rozsah vynálezu nebo jakéhokoliv jeho provedení.All publications cited herein are hereby incorporated by reference. From the complete description of the invention, it will be apparent to those skilled in the art that the invention may be practiced using various conditions, parameters, and the like without departing from the scope of the invention or any embodiment thereof.
• · • · · ·· ·· · · • · · · · · · · « · · • · · · · ·· · * «· · • · ···· · · · ··· · · · · · ·· · · · · · · · ··· · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ·· · · · · · · · ·
Seznam sekvencí (1) Obecné informace (i) Přihlašovatel: Astra Pharma lne., Kanada (ii) Název vynálezu: Nový receptor spřažený s G-proteinem (iii) Počet sekvencí: 22 (iv) Adresa pro korespondenci:List of Sequences (1) General Information (i) Applicant: Astra Pharma Inc, Canada (ii) Title of the invention: New G-protein coupled receptor (iii) Number of sequences: 22 (iv) Mailing address:
(A) Adresa: Astra AB, Patent Department (B) Ulice: S-151 85 Sodertalje (C) Město: Sodertalje (D) Země:(A) Address: Astra AB, Patent Department (B) Street: S-151 85 Sodertalje (C) City: Sodertalje (D) Country:
(E) Stát: Švédsko (F) ZIP: ne (v) Počítačová čtecí forma:(E) Country: Sweden (F) ZIP: no (v) Computer read form:
(A) Typ media: Floppy disk (B) Počítač: IBM PC kompatibilní (C) Operační systém: PC-DOS/MS-DOS (D) Software: Patentln Release #1.0, verse #1.30 (vi) Data^současné přihlášky:(A) Media Type: Floppy Disk (B) Computer: IBM PC Compatible (C) Operating System: PC-DOS / MS-DOS (D) Software: PatentIn Release # 1.0, Version # 1.30 (vi) Data ^ Current Applications:
(A) Číslo přihlášky:(A) Application Number:
(B) Datum podání:(B) Filing Date:
(C) Klasifikace:(C) Classification:
(ix) Telekomunikační informace:(ix) Telecommunication Information:
(A) Telefon: 46-8 553 26000 (B) Telefax: 46-8 553 28820 (2) Informace pro SEQ ID NO: 1:(A) Telephone: 46-8 553 26000 (B) Telephone: 46-8 553 28820 (2) Information for SEQ ID NO: 1:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 337 aminokyselin (B) Typ: aminokyselinová (C) Řetězec: není relevantní (D) Topologie: není relevantní (ii) Typ molekuly: protein (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 1:(A) Length: 337 amino acids (B) Type: amino acid (C) Chain: not relevant (D) Topology: not relevant (ii) Molecule type: protein (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Description SEQ ID NO: 1:
• · • · • · · · · • · · · · 9 · · · · • · · · ·· · · 99 · • ···· · · · ··· · * · · ·· · · · · · · · ► · · ·· ·· · · · ·• 9 • 99 • 99 • 99 • • 99 · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ·
MeC Val Cys Val Leu Arg Asp Thr Thr Gly Arg Phe Val Ser Met AspMeC Val Cys Val Phu Val Thu Thr Thr Thr Thr Thr Gly Arg Phe Val Ser Met Asp
10 1510 15
Pro Thr Ile Ser Ser .Leu Ser Thr Glu Ser Thr Thr Leu Asn Lys ThrPro Thr Ile Ser Ser. Leu Ser Thr Glu Ser Thr Thr Leu Asn Lys Thr
25 3025 30
Gly His Pro Ser Cys Arg Pro Ile Leu Thr Leu Ser Phe Leu Val ProGly His Pro Ser Cys Arg Pro Ile Leu Thr Leu Ser Phe Leu Val Pro
40 4540 45
Ile Ile Thr Leu Leu Gly Leu Ala Gly Asn Thr Ile Val Leu Trp LeuIle Ile Thr Leu Gly Leu Ala Gly Asn Thr Ile Val Leu Trp Leu
55 6055 60
Leu Gly Phe Arg Met Arg Arg Lys Ala Ile Ser Val Tyr Val Leu AsnLeu Gly Phe Arg Met Arg Arg Lys Ala Ile Val Val Tyr Val Leu Asn
70 15 8071 15 80
Leu Ser Leu Ala Asp Ser Phe Phe Leu Cys Cys His Phe Ile Asp SerLeu Ser Leu Ala Asp Ser Phe Phe Leu Cys His Phe Ile Asp Ser
90 9590 95
Leu Met Arg Ile Met Asn Phe Tyr Gly Ile Tyr Ala His Lys Leu SerLeu Met Arg Asle Phe Tyr Gly Ile Tyr Ala His Lys Leu Ser
100 105 110100 105 110
Lys Glu Ile Leu Gly Asn Val Ala Phe Ile Pro Tyr Ile Ser Gly LeuLys Glu Leu Gly Asn Val Ala Phe Ile For Tyr Ile Ser Gly Leu
115 120 125115 120 125
Ser Ile Leu Ser Ala Ile Ser Thr Glu Arg Cys Leu Ser Val Leu TrpSer Ile Leu Ser Ilu Ser Thr Glu Arg Cys Leu Ser Val Leu Trp
130130
135135
140 • ·140 • ·
Pro Ile Trp Tyr His Cys His ArgPro Ile Trp His Cys His Arg
145 150145 150
Cys Val Leu Ile Trp Val Leu SerCys Val Leu Ile Trp Val Leu Ser
165165
Phe Phe Ser Gly Phe Leu Gly GluPhe Phe Ser Gly Phe Leu Gly Glu
180180
Val Asp Phe Ile Val Thr Ala PheVal Thr Ala Phe
195 200195 200
Phe Gly Ser Ser Leu Ala Leu LeuPhe Gly Ser Ser Leu Ala Leu Leu
210 215210 215
Arg Lys Pro Leu Ser Arg Leu TyrArg Lys For Leu Ser
225 230225 230
Val Tyr Leu Ile Cys Gly Leu ProVal Tyr Leu Ile Cys
245245
Tyr Trp Phe Gly Ile His Leu HisTyr Trp Phe Gly
260260
Val Thr Val Leu Leu Ser Cys ValVal Thr Val Val Leu Ser Cys Val
Pro Arg Asn Met Ser Ala Ile IleFor Arg Asn Met Ser Ala Ile Ile
155 160155 160
Phe Leu Met Gly Ile Leu Asp TrpPhe Leu Met Gly lele Leu Asp Trp
170 175170 175
Thr His His His Leu Trp Lys AsnThr His His His Leu Trp Lys Asn
185 190185 190
Leu Ile Phe Leu Phe Met Leu LeuLeu Ile Phe Leu
205205
VaL Arg Ile Leu Cys Gly Ser ArgVaL Ile Leu Cys Gly Ser Arg
220220
Val Thr Ile Ser Leu Thr Val MetVal Thr Ile Ser Leu Thr Val Met
235 240235 240
Leu Gly Leu Tyr Leu Phe Leu LeuLeu Gly Leu
250 255250 255
Tyr Pro Phe Cys His Ile Tyr GinTyr Pro Phe Cys. His Ile Tyr Gin
265 270265 270
Asn Ser Ser Ala Asn Pro Ile IleAsn Ser Ser Ala Asn For Ile Ile
275275
280280
2B5 »· 4 4 42B5 »4 4 4
Tyr Phe Leu Val Gly Ser Phe Arg His Arg Lys Lys His Arg Ser LeuTyr Phe Leu Val Gly Ser
290 295 300290 295 300
Lys Met Val Leu Lys Arg Ala Leu Glu Glu Thr Pro Glu Glu Asp GluLys Met Val Leu Lys Arg Glu Glu Glu Thr Pro Glu Glu Asp Glu
305 310 315 320305 310 315 320
Tyr Thr Asp Ser His Val Gin Lys Pro Thr Glu Ile Ser Glu Arg ArgTyr Thr Asp Ser Val Val Gin Lys Pro Thr Glu Arg Arg
325 330 335 (2) Informace pro SEQ ID NO: 2:325 330 335 (2) Information for SEQ ID NO: 2:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 1011 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 2:(A) Length: 1011 base pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: double (D) Topology: linear (ii) Molecule type: DNA (genomic) (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no ( (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 2:
• · ··· · · · · ···· • ··· · ·· · · ·· ·• · ··· · · · ··· · ··· · ···
(2) Informace pro SEQ ID NO: 3:(2) Information for SEQ ID NO: 3:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 322 aminokyselin (B) Typ: aminokyselinová (C) Řetězec: není relevantní (D) Topologie: není relevantní • · • · · · • · β · · • ·«····» • · ♦ · • · · •· ·« ·· • · · · · . .(A) Length: 322 amino acids (B) Type: amino acid (C) String: not relevant (D) Topology: not relevant β · · · • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · .
• · · · · · « ····♦· .. β • · · · ♦ · • · · · · · (ii) Typ molekuly: protein (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 3:• · · · · · «· ···· .. ♦ β • · · ♦ · • · · · · · (ii) MOLECULE TYPE: protein (iii) HYPOTHETICAL: NO (iv) antisense: no (xi) Sequence Description: SEQ ID NO: 3:
Met Asp Pro Thr Ile Pro Val Leu Gly Thr Lys Leu Thr Pro Ile AsnMet Asp For Thr Ile For Val Leu Gly Thr Lys Leu Thr For Ile Asn
5 10 155 10 15
Gly Arg Glu Glu Thr Pro cys Tyr Asn Gin Thr Leu ser Phe Thr GlyGly Arg Glu Glu Thr Pro Cys Tyr Asn Gin Thr Leu Phe Thr Gly
25 3025 30
Leu Thr Cys Ile Ile Ser Leu Val Ala Leu Thr Gly Asn Ala Val ValLeu Thr Cys Ile Ile Ser
40 4540 45
Leu Trp Leu Leu Gly Cys Arg Met Arg Arg Asn Ala Val Ser Ile TyrLeu Trp Leu Gly Cys Arg Arg Arg Arg Asn Ala Val Ser Ile Tyr
55 6055 60
Ile Leu Asn Leu Val Ala Ala Asn Phe Leu Phe Leu Ser Gly His IleIle Leu Asn Leu Val Ala Ala Asn Phe Leu Phe Leu Ser Gly His Ile
70 75 8070
Ile Phe Ser Pro Leu Pro Leu Ile Asn Ile Arg His Pro Ile Ser LysIle Phe Ser Pro Leu Pro Leu Ile Asn Ile Arg His Pro Ile Ser Lys
90 9590 95
Ile Leu Ser Pro Val Mec Thr Phe Pro Tyr Phe Ile Gly Leu Ser MetIle Leu Ser Thr Phe Thr Phe Ile Gly Leu Ser Met
100100 ALIGN!
105105
110110
Leu Ser Ala Ile Ser Thr Glu Arg Cys LeuLeu Ser Ala Ile
115 120115 120
Trp Tyr His Cys Arg Arg Pro Arg Tyr LeuTrp Tyr His Cys Arg For Arg Tyr Leu
130 135130 135
Leu Leu Trp Ala Leu Ser Leu Leu Arg SerLeu Leu Trp Ala Leu Ser
145 150145 150
Cys Asp Phe Leu Phe Ser Gly Ala Asn SerCys Asp Phe Leu Phe Ser Gly Ala Asn Ser
165 170165 170
Asp Phe Ile Thr Ile Ala Trp Leu Val PheAsp Phe Ile Thr. Ile Ala Trp Leu Val Phe
180 185180 185
Gly Ser Ser Leu Val Leu Leu Val Arg IleGly Ser Ser Leu Val Leu Val Arg Ile
195 200195 200
Met Pro Leu Thr Arg Leu Tyr Val Thr IleMet Leu Thr Arg Leu Thr Val Thr Ile
210 215210 215
Phe Leu Leu Cys Gly Leu Pro Phe Gly IlePhe Leu Cys Gly Leu For Phe Gly Ile
225 230225 230
Arg Ile His Leu Asp Trp Lys Val Leu PheArg Ile His Leu Php
245 250245 250
Ser Ile Phe Leu Ser Ala Leu Asn Ser Ser *·· ·» · · ♦ · · · • · · · · · · ·««· • ·»· · · · · · « · v • ·*····· · ····· · * · ·· » · · · ···· • · · ·· ·· ·· · ·Ser Ile Phe Leu Ser Ala Leu Asn Ser Ser * · Ser Ser Ser · Ser Ser v v v v v v v v v v v v v v v ···························
Ser Ile Leu Trp Pro IleSer Ile Leu Trp For Ile
125125
Ser Ser Val Met Cys ValSer Cys Val Cys Val
140140
Ile Leu Glu Trp Met PheIle Leu Glu
155 160155 160
Val Trp Cys Glu Thr SerVal Trp, Cys Glu Thr Ser
175175
Leu Cys Val Val Leu CysLeu Cys Val Val Leu Cys
190190
Leu Cys Gly Ser Arg LysLeu Cys - Gly Ser Arg Lys
205205
Leu Leu Thr Val Leu ValLeu Val Le Th Val Val Le Val
220220
Gin Trp Ala Leu Phe SerGin Trp Ala Leu Ph. Ser
235 240235 240
Cys His Val His Leu Val 255 Cys His Val His Leu Val 255
Ala Asn Pro Ile Ile TyrAla Asn For Ile Ile Tyr
260260
265265
270 • · » · · • · · · • · · · · • ······· • · ·270 • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ·
Phe Phe Val Gly Ser Phe Arg Gin Arg Gin Asn Arg Gin Asn Leu Lys 275 280 285 Phe Phe Val Gly Ser Phe Arg Gin As G Arg As G Arg As G Leu Lys 275 280 285
Leu Val Leu Gin Arg Ala Leu Gin Asp Thr Pro Glu Val Asp Glu Gly 290 295 800 Leu Val Le Gin Arg Ala Leu Gin Glu Glu 290 295 800
Gly Gly Trp Leu Pro Gin Glu Thr Leu Glu Leu Ser Gly Ser Lys Leu 305 31° 315 320 Gly Gly Trp Leu Glu Glu Thr Leu Glu Leu Ser Gly Ser Lys Leu 305 31 ° 315 320
Glu Gin (2) Informace pro SEQ ID NO: 4:Glu Gin (2) Information for SEQ ID NO: 4:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 969 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 4:(A) Length: 969 bp (B) Type: nucleic acid (C) String: double (D) Topology: linear (ii) Molecule type: DNA (genomic) (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no ( (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 4:
ATGGATCCAA CCATCCCAGT CTTGGGTACA AAACTGACAC CAATCAACGG ACGTGAGGAG 50ATGGATCCAA CCATCCCAGT CTTGGGTACA AAACTGACAC CAATCAACGG ACGTGAGGAG 50
ACTCGTTGCT ACAACCAAAC CCTGAGCTTC ACGGGGCTGA CGTGCATCAT TTCCCTTGTC 120ACTCGTTGCT ACAACCAAAC CCTGAGCTTC ACGGGGCTGA CGTGCATCAT TTCCCTTGTC 120
GCGCTGACAG GAAACGCGGT TGTGCTCTGG CTCCTGGGCT GCCGCATGCG CAGGAACGCT 180GCGCTGACAG GAAACGCGGT TGTGCTCTGG CTCCTGGGCT GCCGCATGCG CAGGAACGCT 180
GTCTCCATCT ACATCCTCAA CCTGGTCGCG GCCAACTTCC TCTTCCTTAG CGGCCACATT 240 • · · · · ♦ • ·GTCTCCATCT ACATCCTCAA CCTGGTCGCG GCCAACTTCC TCTTCCTTAG CGGCCACATT 240
GAGCAGTGAGAGCAGTGA
969 »· · »· »· ·· ··· · -» » · «Oř,.969 »-» - - - - -
» · · · ··«« β • ······· i · · · » · r • · · · « · ·*·>· Β β β i i i i i i i i i i i i i
*r · ·’ ·· ·· (2) Informace pro SEQ ID NO: 5:* · R '·· ·· (2) Information for SEQ ID NO: 5:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 322 aminokyselin (B) Typ: aminokyselinová (C) Řetězec: není relevantní (D) Topologie: není relevantní (ii) Typ molekuly: protein (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne(A) Length: 322 amino acids (B) Type: amino acid (C) Chain: not relevant (D) Topology: not relevant (ii) Molecule type: protein (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no
100100 ALIGN!
105105
110 «110 «
·· · • # » • » * • · · · • · • · • * 9 - φ « β # 9 - φ « β
Leu Asn. Ala Ile Ser Thr Glu Arg Cys Leu Ser Ile Leu Trp Pro IleLeu Asn. Ala Ile Ser Thr Glu Cys Leu Ser Ile Leu Trp Pro Ile
115 120 125115 120 125
Trp Tyr His Cys Arg Arg Pro Arg Tyr Leu Ser Ser Val Met Cys ValTrp Tyr His Cys Arg Arg
130 135 140130
Leu Leu Trp Ala Pro Ser Leu Leu Arg Ser Ile Leu Glu Trp Met PheLeu Leu Trp Ala Ser Ser Leu Leu Arg Ser Ile Leu Glu Trp Met Phe
145 150 155 160145 150 155 160
Cys Asp Phe Leu Phe Ser Gly Ala Asp Ser Val Arg Cys Glu Thr SerCys Asp Phe Leu Phe Ser Cly Glu Thr Ser
165 170 175165 170 175
Asp Phe Ile Thr Ile Ala Trp Leu Val Phe Leu Arg Val Val Leu CysAsp Phe Ile Thr Ile Ala Trp Phu Leu Phu Leu Arg Val Leu Cys
180 185 190180 185 190
Gly Ser Ser Leu Val Leu Leu Val Arg Ile Leu Cys Gly Ser Arg LysGly Ser Ser Lys Ile Leu Cys Gly Ser Lys
195 200 205195 200 205
Met Pro Leu Thr Arg Leu Tyr Val Thr Ile Leu Leu Thr Val Leu ValMet Leu Thr Arg Leu Thr Val Thr Ile Leu Thr Val Leu Thr
210 215 220210 215 220
Phe Leu Leu Cys Gly Leu Pro Phe Gly Ile Gin Trp Ala Leu Phe Ser 225 230 235 240Phe Leu Cys Gly Leu Pro Phe Gly Ile Gin Trp Ala Leu Phe Ser 225 230 235 240
Arg Ile His Leu Asp Trp Lys Val Leu Phe Cys His Val His Leu ValArg Ile His Leu Asp Trp
245245
250250
255 • · • · • · * · · · · · · · · *··· ··*» ···« • ······» · · · · · · · · · *0* · · · · · · · ·’ ♦ «... ....255 · • 0 * 0 255 0 0 0 0 0 0 0 0 · · · · · · ♦ «... ....
iand
Ser Ile Phe Leu Ser Ala Leu Asn Ser Ser Ala Asn Pro Ile Ile Tvr !Ser Ile Phe Leu Ser Ala Leu As Ser Ser Ala Asn For Ile Ile Tvr!
iand
250 265 270250 265 270
Phe Phe Mec Gly Ser Phe Arg Gin Leu Gin Asn Arg Lys Thr Leu LysPhe Phe Mec Gly Ser Phe Gin Leu Gin Asn Arg Lys Thr Leu Lys
275 280 285275 280 285
Leu Val Leu Gin Arg Asp Leu Gin Asp Thr Pro Glu Val Asp Glu GlyLeu Gin Glu Asp Leu Gin Glu Thr For Glu Glu Glu
290 295 300290 295 300
Gly Trp Trp Leu Pro Gin Glu Thr Leu Glu Leu Ser Gly Ser Lys LeuGly Trp Trp Leu Glu Glu Thr Leu Glu Leu Ser Gly Ser Lys Leu
305 310 315 320305 310 315 320
Glu Ile (2) Informace pro SEQ ID NO: 6:Glu Ile (2) Information for SEQ ID NO: 6:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 969 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 6:(A) Length: 969 bp (B) Type: nucleic acid (C) String: double (D) Topology: linear (ii) Molecule type: DNA (genomic) (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no ( (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 6:
ATGGATCCAA CCGTCCCAGT CTTGGGTACA GAACTGACAC CAATCAACGG ACGTGAGGAG 60ATGGATCCAA CCGTCCCAGT CTTGGGTACA GAACTGACAC CAATCAACGG ACGTGAGGAG 60
ACTCCTTGCT ACAAGCAGAC CCTGAGCTTC ACGGGGCTGA CGTGCATCGT TTCCCTTGTC 120ACTCCTTGCT ACAAGCAGAC CCTGAGCTTC ACGGGGCTGA CGTGCATCGT TTCCCTTGTC 120
GCGCTGACAG GAAACGCGGT TGTGCTCTGG CTCCTGGGCT GCCGCATGCG CAGGAACGCT 180GCGCTGACAG GAAACGCGGT TGTGCTCTGG CTCCTGGGCT GCCGCATGCG CAGGAACGCT 180
GTCTCCATCT acatcctcaa CCTGGTCGCG GCCGACTTCC TCTTCCTTAG CGGCCACATT 240GTCTCCATCT acatcctcaa CCTGGTCGCG GCCGACTTCC TCTTCCTTAG CGGCCACATT 240
ATATGTTCGC CGTTACGCCT CATCAATATC AGCCATCCCA TCTCCAAAAT CCTCAGTCCT 300ATATGTTCGC CGTTACGCCT CATCAATATC AGCCATCCCA TCTCCAAAAT CCTCAGTCCT 300
GTGATGACCT TTCCCTACTT TATAGGCCTA AGCATGCTGA ACGCCATCAG CACCGAGCGC 360 • ·GTGATGACCT TTCCCTACTT TATAGGCCTA AGCATGCTGA ACGCCATCAG CACCGAGCGC 360
GAGA7C7GA 969 (2) Informace pro SEQ ID NO: 7:GAGA7C7GA 969 (2) Information for SEQ ID NO: 7:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 322 aminokyselin (B) Typ: aminokyselinová (C) Řetězec: není relevantní (D) Topologie: není relevantní • · « · · ···· ··· • ··· · · · · · ·« • ·····»· · · · · · * · * (ii) Typ molekuly: protein (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 7:(A) Length: 322 amino acids (B) Type: amino acid (C) String: not relevant (D) Topology: not relevant • · «· · ······· · ··· (Ii) Type of molecule: protein (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 7:
Mac Asp Pro Thr Val Ser Thr Leu Asp Thr Glu Leu Thr Pro lis AsnMac Asp Thr Val Ser Thr Leu Asp Thr Glu Leu Thr Pro Press Asn
10 1510 15
Gly Thr Glu Glu Thr Leu Cys Tyr Lys Gin Thr Leu Ser Leu Thr ValGlu Thr Glu Glu Thr Leu Cys Tyr Lys
25 3025 30
Leu Thr Cys Xle Val Ser Leu Val Gly Leu Thr Gly Asn Ala Val ValLeu Thr Cys Xle Val Ser
40 4540 45
Leu Trp Leu Leu Gly Cys Arg Met Arg Arg Asn Ala Phe Ser Ile TyrLeu Trp Leu Gly Cys Arg Arg Arg Arg Asn Ala Phe Ser Ile Tyr
S0 55 60S0 55 60
Ile Leu Asn Leu Ala Ala Ala Asp Phe Leu Phe Leu Ser Gly Arg LeuIle Leu Asn Leu
70 75 8070
Ile Tyr Ser Leu Leu Ser Phe Ile Ser Ile Pro His Thr Ile Ser LysIle Tyr Ser Leu Leu Ser Phe Ile Ser Ile For His Thr Ile Ser Lys
90 9590 95
Ile Leu Tyr Pro Val Met Met Phe Ser Tyr Phe Ala Gly Leu Asn PheIle Leu Tyr For Val Met Met Phe Ser Tyr Phe Ala Gly Leu Asn Phe
100 105 110100 105 110
Leu Ser Ala Val Ser Thr Asp Arg Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro IleLeu Ser Val Val Thr Asp Arg Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro Ile
115 120 125115 120 125
Trp Tyr Arg Cys His Arg Pro Thr His Leu Ser Ala Val Val Cys ValTrp Tyr Arg Cys His Arg
130130
135135
140 • · · « · · • · · · * · · · « · • · « • · ·140 · · · · · · · · · · · · · · · · · ·
Leu Leu Trp Ala Leu Ser Leu LeuLeu Leu Trp Ala Leu
145 150145 150
Cys Gly Phe Leu Phe Ser Gly AlaCys Gly Phe Leu
165165
Asp Phe Ile Thr Val Ala Trp LeuAsp Phe Ile Thr
ISOISO
Gly Ser Ser Leu Val Leu Leu IleGly Ser Ser Leu Val Leu Leu Ile
195 200195 200
Arg Ser Ile Leu Glu Trp Mec LeuArg Ile Leu Glu Trp Mec Leu
155 160155 160
Asp Ser Ala Trp Cys Gin Thr SerAsp Ser Ala Trp, Cys Gin Thr Ser
170 _ 175170 _ 175
Ile Phe Leu Cys Val Val Leu CysIle Phe Leu Cys
185 190185 190
Arg Ile Leu Cys Gly Ser Arg LysArg Ile Leu
205205
Ile Pro Leu Thr Arg Leu Tyr Val Thr Ile Leu Leu Thr Val Leu ValIle Leu Le Thr Arg Leu Le Thr Ile Leu Le Thr Val Leu Val
210 215 220210 215 220
Phe Leu Leu Cys Gly Leu Pro Phe Gly Ile Gin Phe Phe Leu Phe LeuPhe Leu Cys Gly Leu Phe Leu Phe Leu Phe Leu
225 230 235 240(+420) 225 230 235 240
Trp Ile His Val Asp Arg Glu Val Leu Phe Cys His Val His Leu ValTrp Ile His Val
245 250 255245 250 255
Ser Ile Phe Leu Ser Ala Leu Asn Ser Ser Ala Asn Pro Ile Ile TyrSer Ile Phe Leu Ser Ala Leu As Ser Ser Ala Asn For Ile Ile Tyr
250 265 270250 265 270
Phe Phe Val Gly Ser Leu Arg Gin Arg Gin Asn Arg Gin Asn Leu LysPhe Phe Val Gly Ser. Leu Arg Gin Arg Gin Asn Arg Gin Asn Leu Lys
275 280 285 • · • ·275 280 285
Leu Val Leu Gin Arg Ala Leu Gin Asp Thr Pro Glu Val Asp Glu Gly 290 295 300Leu Val Le Gin Arg Ala Leu Gin Glu Glu 290 295 300
Gly Gly Trp Leu Pro Gin Glu Thr Leu Glu Leu Ser Gly Ser Arg LeuGly Gly Trp Leu For Gin Glu Thr Leu Glu Leu Ser Gly Ser Arg Leu
305305
310310
320320
Glu Gin (2) Informace pro SEQ ID NO: 8:Glu Gin (2) Information for SEQ ID NO: 8:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 969 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 8:(A) Length: 969 base pairs (B) Type: nucleic acid (C) Chain: double (D) Topology: linear (ii) Molecule type: DNA (genomic) (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no ( (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 8:
ATGGATCCAA CCGTCTCAAC CTTGGACACA GAACTGACAC CAATCAACGG AACTGAGGAGATGGATCCAA CCGTCTCAAC CTTGGACACA GAACTGACAC CAATCAACGG AACTGAGGAG
ACTCTTTGCT ACAAGCAGAC CTTGAGCCTC ACGGTGCTGA CGTGCATCGT TTCCCTTGTCACTCTTTGCT ACAAGCAGAC CTTGAGCCTC ACGGTGCTGA CGTGCATCGT TTCCCTTGTC
GGGCTGACAG GAAACGCAGT TGTACTCTGG CTCCTGGGCT GCCGCATGCG CAGGAACGCG 130GGGCTGACAG GAAACGCAGT TGTACTCTGG CTCCTGGGCT GCCGCATGCG CAGGAACGCG 130
TTCTCCATCT ACATCCTCAA CTTGGCCGCA GCAGACTTCG TCTTCCTCAG CGGCCGCCTT 240TTCTCCATCT ACATCCTCAA CTTGGCCGCA GCAGACTTCG TCTTCCTCAG CGGCCGCCTT 240
ATATATTCCC TGTTAAGCTT CATCAGTATC CCCCATACCA TCTCTAAAAT CCTCTATCCT 300ATATATTCCC TGTTAAGCTT CATCAGTATC CCCCATACCA TCTCTAAAAT CCTCTATCCT 300
GTGATGATGT TTTCCTACTT TGCAGGCCTG AACTTTCTGA GTGCCGTGAG CACCGATCGG 3ó0GTGATGATGT TTTCCTACTT TGCAGGCCTG AACTTTCTGA GTGCCGTGAG CACCGATCGG 3o0
TGCCTGTCCG TCGTGTGGCC CATCTGGTAC CGCTGCCACC GCCCCACACA CCTGTCAGCG 420TGCCTGTCCG TCGTGTGGCC CATCTGGTAC CGCTGCCACC GCCCCACACA CCTGTCAGCG 420
GTGGTGTGTG TCCTGCTCTG GGCCCTGTCC CTGCTGCGGA GCATCCTGGA ATGGATGTTA 480 • · • · • · ··· ···· · · · a ·*·· · · · · ···· • ······· · ····· · · »GTGGTGTGTG TCCTGCTCTG GGCCCTGTCC CTGCTGCGGA GCATCCTGGA ATGGATGTTA 480 · · · · · ··· ···· · · · · ···· · ······ · ······ · ······ · · »
TGTGGCTTCC TGTTCAGTGG TGCTGATTCT GCTTGGTGTC AAACATCAGA TTTCATCACA 540TGTGGCTTCC TGTTCAGTGG TGCTGATTCT GCTTGGTGTC AAACATCAGA TTTCATCACA 540
GTCGCGTGGC TGATTTTTTT ATGTGTGGTT CTCTGTGGGT CCAGCCTGGT CCTGCTGATC 600GTCGCGTGGC TGATTTTTTT ATGTGTGGTT CTCTGTGGGT CCAGCCTGGT CCTGCTGATC 600
AGGATTCTCT GTGGATCCCG GAAGATACCG CTGACCAGGC TGTACGTGAC CATCCTGCTC 660AGGATTCTCT GTGGATCCCG GAAGATACCG CTGACCAGGC TGTACGTGAC CATCCTGCTC 660
ACAGTACTGG TCTTCCTCCT CTGTGGCCTG CCCTTTGGCA TTCAGTTTTT CCTATTTTTA '20ACAGTACTGG TCTTCCTCCT CTGTGGCCTG CCCTTTGGCA TTCAGTTTTT CCTATTTTTA '20
TGGATCCACG TGGACAGGGA AGTCTTATTT TGTCATGTGC ATCTAGTTTC CATTTTCCTG 780TGGATCCACG TGGACAGGGA AGTCTTATTT TGTCATGTGC ATCTAGTTTC CATTTTCCTG 780
TCCGCTCTTA ACAGCAGTGC CAACCCCATC ATTTACTTCT TCGTGGGCTC CCTTAGGCAG 840TCCGCTCTTA ACAGCAGTGC CAACCCCATC ATTTACTTCT TCGTGGGCTC CCTTAGGCAG 840
CGTCAAAATA GGCAGAACCT GAAGCTGGTT CTCCAGAGGG CTCTGCAGGA CACGCCTGAG 900CGTCAAAATA GGCAGAACCT GAAGCTGGTT CTCCAGAGGG CTCTGCAGGA CACGCCTGAG 900
GTGGATGAAG GTGGAGGGTG GCTTCCTCAG GAAACCCTGG AGCTGTCGGG AAGCAGATTG 960GTGGATGAAG GTGGAGGGTG GCTTCCTCAG GAAACCCTGG AGCTGTCGGG AAGCAGATTG 960
GAGCAGTGA 969 (2) Informace pro SEQ ID NO: 9:GAGCAGTGA 969 (2) Information for SEQ ID NO: 9:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 322 aminokyselin (B) Typ: aminokyselinová (C) Řetězec: není relevantní (D) Topologie: není relevantní (ii) Typ molekuly: protein (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 9:(A) Length: 322 amino acids (B) Type: amino acid (C) Chain: not relevant (D) Topology: not relevant (ii) Molecule type: protein (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Description SEQ ID NO: 9:
• · · * · • ♦ • · • · « ·• · · · ««
Met Asp Pro Thr Val Ser Thr Leu Asp Thr Glu Leu Thr Pro Ile AsnMet Thr Glu Le Ser Thr Glu Leu Thr Pro Ile Asn
10 1510 15
Gly Thr Glu Glu Thr Leu Cys Tyr Lys Gin Thr Leu Ser Leu Thr ValGlu Thr Glu Glu Thr Leu Cys Tyr Lys
Leu Thr Cys Ile Val Ser Leu Val Gly Leu Thr Gly Asn Ala Val ValLeu Thr Cys Ile Val Ser
40 4540 45
Leu Trp Leu Leu Gly Cys Arg Met Arg Arg Asn Ala Phe Ser Ile TyrLeu Trp Leu Gly Cys Arg Arg Arg Arg Asn Ala Phe Ser Ile Tyr
55 6055 60
Ile Leu Asn Leu Ala Ala Ala Asp Phe Leu Phe Leu Ser Gly Arg LeuIle Leu Asn Leu
70 75 8070
Ile Tyr Ser Leu Leu Ser Phe Ile Ser Ile Pro His Thr Ile Ser LysIle Tyr Ser Leu Leu Ser Phe Ile Ser Ile For His Thr Ile Ser Lys
90 9590 95
Ile Leu Tyr Pro Val Met Met Phe Ser Tyr Phe Ala Gly Leu Ser PheIle Leu Tyr For Val Met Met Phe Ser Tyr Phe Ala Gly Leu Ser Phe
100 105 110100 105 110
Leu Ser Ala Val Ser Thr Glu Arg Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro IleLeu Ser Ala Val Ser Thr Glu Arg Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro Ile
115 120 125115 120 125
Trp Tyr Arg Cys His Arg Pro Thr His Leu Ser Ala Val Val Cys ValTrp Tyr Arg Cys His Arg
130 135 140130
Leu Leu Trp Ala Leu Ser Leu Leu Arg Ser Ile Leu Glu Trp Met LeuLeu Leu Trp Ala Leu Ser Leu Leu Arg Ile Leu Glu Trp Met Leu
145 150 155 160145 150 155 160
Cys Gly Phe Leu Phe Ser Gly Ala Asp Ser Ala Trp Cys Gin Thr SerCys Gin Phr Leu Phe Ser Gly Ala Asp Ser Ala Trp Cys Gin Thr Ser
165165
170170
175175
305 310 <«· 4 4 4 · · » ♦ ♦ «··« · 4 · · »··« • 4 4 4 4 4 «· · 4 4 4 4 4 ·· · • 4 » 4 4 · 4 4·· • · * 4 4 4 · ·· · ·305 310 <4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 ·· · · 4 4 4 · ·· · ·
Cys Val Val Leu Cys iVal Val Leu Cys i
190190
Cys Gly Ser Arg LysCys Gly Ser Arg Lys
205205
Leu Thr Val Leu ValLeu Val Leu Val
220220
Phe Phe Leu Phe LeuPhe Phu Leu Phe Phu Leu
240240
His Val His Leu ValHis Val His Leu Val
255255
Asn Pro Ile Ile TyrAsn Pro Ile Ile Tyr
270270
Arg Gin Asn Leu LysArg Gin Asn Leu Lys
285285
Glu Val Asp Glu GlyGlu Val Asp
300300
Ser Gly Ser Arg LeuSer Gly Ser Arg Leu
320320
Glu Gin • · • 4 • « • 4 · ···< ···« « · · · · ·* · · · * β • ······· · ····« ·· · ·' · ··’ ·· ·· *··* (2) Informace pro SEQ ID NO: 10:Glu Gin 4 «4 4 · <4 β (2) Information for SEQ ID NO: 10:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 969 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 10:(A) Length: 969 bp (B) Type: nucleic acid (C) String: double (D) Topology: linear (ii) Molecule type: DNA (genomic) (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no ( (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 10:
• · • · • ·• • •
GAGCAGTGA 959 (2) Informace pro SEQ ID NO: 11:GAGCAGTGA 959 (2) Information for SEQ ID NO: 11:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 322 aminokyselin (B) Typ: aminokyselinová (C) Řetězec: není relevantní (D) Topologie: není relevantní (ii) Typ molekuly: protein (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 11:(A) Length: 322 amino acids (B) Type: amino acid (C) Chain: not relevant (D) Topology: not relevant (ii) Molecule type: protein (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Description SEQ ID NO: 11:
Mec Asp Pro Thr Val Pro Val Leu Gly Thr Lys Leu Thr Pro Ile AsnMec Asp Pro Thr Lys Leu Thr Pro Ile Asn
I 5 10 .15I 5 10 .15
Gly Arg Glu Glu Thr Pro Cys Tyr Lys Gin Thr Leu Ser Phe Thr Val • · • · · ··«· ···· ···· ···· · · · · • ······· · ····· « · · ······«··· ·· · ♦· ·· ·· ··Gly Arg Glu Glu Thr For Cys Tyr Lys Gin Thr Leu Ser Phe Thr Val · · · · ··· · ··············· · · ····· · · ·····················
Leu Thr Cys Ile Ile Ser Leu Val Gly Leu Thr Gly Asn Ala Val valLeu Thr Cys Asle Ala Val val
40 4540 45
Leu Trp Leu Leu Gly Cys Arg Met Arg Arg Asn Ala Val Ser Ile TyrLeu Trp Leu Gly Cys Arg Arg Arg Arg Asn Ala Val Ser Ile Tyr
55 6055 60
Ile Leu Asn Leu Ala Ala Ala Asp Phe Leu Phe Leu Ser Phe Gin IleIle Leu Asn Leu Ala Ala. Asp Phe Leu Phe Leu Ser Phe Gin Ile
70 5 8070 5 80
Ile Cys Arg Pro Leu Arg Leu Ile Asn Ile Ser His Leu Ile Arg LysIle Arg For Leu Arg Leu Ile Asn Ile Ser His Leu Ile Arg Lys
90 9590 95
Ile Leu Val Ser Val Met Thr Phe Pro Tyr Phe Thr Gly Leu Ser MetIle Leu Val Ser Thr Phe Pro Tyr Phe Thr Gly Leu Ser Met
100 105 110100 105 110
Leu Ser Ala Ile Ser Thr Glu Arg Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro IleLeu Ser Ala Ile Ser Thr Glu Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro Ile
115 120 125115 120 125
Trp Tyr Arg Cys Arg Arg Pro Thr His Leu Ser Ala Val Val Cys ValTrp Tyr Arg. Cys Arg Arg
130 135 140130
Leu Leu Trp Ala Gly Leu Leu Leu Phe Ser Met Leu Glu Trp Are PheLeu Leu Leu Leu Leu Leu Leu Le Phe Ser Met Leu Glu Trp Are Phe
1^5 ISO 155 ISO1 ^ 5 ISO 155 ISO
Cys Asp Phe Leu Phe Ser Gly Ala Asp Ser Ser Trp Cys Glu Thr SerCys Asp Phe Leu Phe Ser Gly Ala Ser Ser Trp Cys Glu Thr Ser
165 170 175165 170 175
Asp Phe Ile Pro Val Ala Trp Leu Ile Phe Leu Cys Val Val Leu CysAsp Phe Ile For Val Ala Trp Leu Ile Phe Le Cys Val Val Leu Cys
130130
185185
190 • *190 • *
Val Ser Ser Leu Val Leu Leu Val Arg Ile Leu Cys Gly Ser Arg LysVal Ser Ser Leu Val Ser Leu Val Ser Ile Leu Cys Gly Ser Arg Lys
195 200 205195 200 205
Met Pro Leu Thr Arg Leu Tyr Val Thr Ile Leu Leu Thr Val Leu ValMet Leu Thr Arg Leu Thr Val Thr Ile Leu Thr Val Leu Thr
210 215 220210 215 220
Phe Leu Leu Cys Gly Leu Pro Phe Gly Ile Leu Gly Ala Leu Ile TyrPhy Leu Cys Gly Leu Phe Gly Leu Gly Ala Leu Ile Tyr
225 230 235 240(+420) 225 230 235 240
Arg Met His Leu Asn Leu Glu Val Leu Tyr Cys His Val Tyr Leu ValArg Met Leu Asn Leu Glu Val Leu Tyr Cys His Val Tyr Leu Val
245 250 255245 250 255
Cys Met Ser Leu Ser Ser Leu Asn Ser Ser Ala Asn Pro Ile Ile TyrCys Met Ser Leu Ser Ser Leu Asn Ser Ser Ala Asn For Ile Ile Tyr
260 265 270260 265 270
Phe Phe Val Gly Ser Phe Arg Gin Arg Gin Asn Arg Gin Asn Leu LysPhe Phe Val Gly Phu Phe Arg Gin Arg Gin Asn Arg Gin Asn Leu Lys
275 280 285275 280 285
Leu Val Leu Gin Arg Ala Leu Gin Asp Lys Pro Glu Val Asp Lys GlyLeu Val Le Gin Arg Ala Leu Gin Asp Lys For Glu Val Asp Lys Gly
290 295 300290 295 300
Glu Gly Gin Leu Pro Glu Glu Ser Leu Glu Leu Ser Gly Arg Arg LeuGlu Gly Gin Leu Glu Glu Ser Leu Glu Leu Ser Gly Arg Arg Leu
305 310 315 320305 310 315 320
Gly Pro (2) Informace pro SEQ ID NO: 12:Gly Pro (2) Information for SEQ ID NO: 12:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 969 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý • · « · · · · • · · ···· ··«· ···· ···· ···· • ······· · ····· · · · (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 12:(A) Length: 969 pairs of basses (B) Type: nucleic acid (C) String: double • · «· · · · · · ···························· (D) Topology: linear (ii) Molecule type: DNA (genomic) (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Description SEQ ID NO: 12:
• ·• ·
GGGCCATGA (2) Informace pro SEQ ID NO: 13:GGGCCATGA (2) Information for SEQ ID NO: 13:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 322 aminokyselin (B) Typ: aminokyselinová (C) Řetězec: není relevantní (D) Topologie: není relevantní (ii) Typ molekuly: protein (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 13:(A) Length: 322 amino acids (B) Type: amino acid (C) Chain: not relevant (D) Topology: not relevant (ii) Molecule type: protein (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Description SEQ ID NO: 13:
Mec Asp Pro Thr Val Pro Val Phe Gly Thr Lys Leu Thr Pro Ile AsnMec Asp Pro Thr Lys Leu Thr Pro Ile Asn
5 10 155 10 15
Gly Arg Glu Glu Thr Pro Cys Tyr Asn Gin Thr Leu Ser Phe Thr ValGly Arg Glu Glu Glu Thr Pro Cys Tyr Gn Thr Leu Ser Phe Thr Val
25 3025 30
Leu Thr Cys Ile Ile Ser Leu Val Gly Leu Thr Gly Asn Ala Val ValLeu Thr Cys Asle Ala Val Val
40 4540 45
Leu Trp Leu Leu Gly Tyr Arg Mec Arg Arg Asn Ala Val Ser Ile Tyr • ·Leu Trp Leu Gly Tyr Arg Mec Arg Arg Asn Ala Val Ser Ile Tyr · ·
>♦ ·· ·· ·· • ·· · · · * · • · · · · · · · • · ····· ·· · • · · · · · · • · · · ·· ··> ♦ ·· ·· ···································
Ile Leu Asn Leu Ala Ala Ala Asp Phe Leu Phe Leu Ser Phe Gin IleIle Leu Asn Leu Ala Ala. Asp Phe Leu Phe Leu Ser Phe Gin Ile
70 75 8070
Ile Arg Ser Pro Leu Arg Leu Ile Asn Ile Ser His Leu Ile Arg LysIle Arg Ser Leu Arg Leu Ile Asn Ile Ser His Leu Ile Arg Lys
90 9590 95
Ile Leu Val Ser Val Met Thr Phe Pro Tyr Phe Thr Gly Leu Ser MetIle Leu Val Ser Thr Phe Pro Tyr Phe Thr Gly Leu Ser Met
100 105 110100 105 110
Leu Ser Ala Ile Ser Thr Glu Arg Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro IleLeu Ser Ala Ile Ser Thr Glu Cys Leu Ser Val Leu Trp Pro Ile
115 120 125115 120 125
Trp Tyr Arg Cys Arg Arg Pro Thr His Leu Ser Ala Val Val Cys ValTrp Tyr Arg. Cys Arg Arg
130 135 140130
Leu Leu Trp Gly Leu Ser Leu Leu Phe Ser Met Leu Glu Trp Arg PheLeu Leu Trp Gly Leu Leu Leu Phe Ser Met Leu Glu Trp Arg Phe
145 150 155 160145 150 155 160
Cys Asp Phe Leu Phe Ser Gly Ala Asp Ser Ser Trp Cys Glu Thr SerCys Asp Phe Leu Phe Ser Gly Ala Ser Ser Trp Cys Glu Thr Ser
165 170 175165 170 175
Asp Phe Ile Pro Val Val Trp Leu Ile Phe Leu Cys Val Val Leu CysAsp Phe Ile For Val Val Trp Leu Ile Phe Le Cys Val Val Leu Cys
180 185 190180 185 190
Val Ser Ser Leu Val Leu Leu Val Arg Ile Leu Cys Gly Ser Arg LysVal Ser Ser Leu Val Ser Leu Val Ser Ile Leu Cys Gly Ser Arg Lys
195 200 205195 200 205
Met Pro Leu Thr Arg Leu Tyr Val Thr Ile Leu Leu Thr Val Leu ValMet Leu Thr Arg Leu Thr Val Thr Ile Leu Thr Val Leu Thr
210210
215215
220 >· ·»220>
Phe Leu Leu Cys Gly Leu Pro Phe Gly Ile Leu Gly Ala Leu Ile TyrPhy Leu Cys Gly Leu Phe Gly Leu Gly Ala Leu Ile Tyr
215 230 235 240215 230 235 240
Arg Met His Leu Asn Leu Glu Val Leu Tyr Cys His Val Tyr Leu ValArg Met Leu Asn Leu Glu Val Leu Tyr Cys His Val Tyr Leu Val
245 250 _ 255245 250 _ 255
Cys Met Ser Leu Ser Ser Leu Asn Ser Ser Ala Asn Pro Ile Ile TyrCys Met Ser Leu Ser Ser Leu Asn Ser Ser Ala Asn For Ile Ile Tyr
250 265 270250 265 270
Phe Phe Val Gly Ser Phe Arg Gin Arg Gin Asn Arg Gin Asn Leu LysPhe Phe Val Gly Phu Phe Arg Gin Arg Gin Asn Arg Gin Asn Leu Lys
275 2B0 235275 2B0 235
Leu Val Leu Gin Arg Ala Leu Gin Asp Lys Pro Glu Val Asp Lys GlyLeu Val Le Gin Arg Ala Leu Gin Asp Lys For Glu Val Asp Lys Gly
290 295 300290 295 300
Glu Gly Gin Leu Pro Glu Glu Ser Leu Glu Leu Ser Gly Ser Lys LeuGlu Gly Gin Leu For Glu Glu Ser Leu Glu Leu Ser Gly Ser Lys Leu
305 310 315 320305 310 315 320
Gly Pro (2) Informace pro SEQ ID NO: 14:Gly Pro (2) Information for SEQ ID NO: 14:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 969 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: dvojitý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: DNA (genomová) (iii) Hypotetická: ne • · · · · 99 99 99 • · · ♦ · · 9 · 9 9 9 ··· · ·· · « · · · • 99999»· 9 ····· »9 · ··· ·· 9 9999 ·· 9 ·· 99 99 99 (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 14:(A) Length: 969 bp (B) Type: nucleic acid (C) String: double (D) Topology: linear (ii) Molecule type: DNA (genomic) (iii) Hypothetical: no • 99 99 99 9 9 9 9 9 9 9 99999 9 9 9 9999 9 99 99 99 (Iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 14:
• · · · · • · · · · • · · · · · • · · · · · · • ··»···· ·· · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ·
TCCTCTCTAA ACAGTAGTGC CAACCCCATC ATTTACTTCT TCGTGGGCTC CTTTAGGCAG 840TCCTCTCTAA ACAGTAGTGC CAACCCCATC ATTTACTTCT TCGTGGGCTC CTTTAGGCAG 840
CGTCAAAATA GGCAGAACCT GAAGCTGGTT CTCCAAAGGG CTCTGCAGGA CAAGCCTGAG 900CGTCAAAATA GGCAGAACCT GAAGCTGGTT CTCCAAAGGG CTCTGCAGGA CAAGCCTGAG 900
GTGGATAAAG GTGAAGGGCA GCTTCCTGAG GAAAGCCTGG AGCTGTCGGG AAGCAAATTG 960GTGGATAAAG GTGAAGGGCA GCTTCCTGAG GAAAGCCTGG AGCTGTCGGG AAGCAAATTG 960
GGGCCATGA 969 (2) Informace pro SEQ ID NO: 15:GGGCCATGA 969 (2) Information for SEQ ID NO: 15:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 35 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 15:(A) Length: 35 pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 15:
GGCCGTCGAC TTCA7CGTCW MYCTIKCIYT IGCNG 35 (2) Informace pro SEQ ID NO: 16:GGCCGTCGAC TTCA7CGTCW IGCNG MYCTICCIYT 35 (2) Information for SEQ ID NO: 16:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 15 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne • · · · · (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 16:(A) Length: 15 pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 16:
RHWRCARTAI ATIAT 15 (2) Informace pro SEQ ID NO: 17:RHWRCARTAI ATIAT 15 (2) Information for SEQ ID NO: 17:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 25 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 17:(A) Length: 25 pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 17:
CGCAGATGAG GTAGTACAGC ATCAC 2:CGCAGATGAG GTAGTACAGC ATCAC 2:
(2) Informace pro SEQ ID NO: 18:(2) Information for SEQ ID NO: 18:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 25 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 18:(A) Length: 25 pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 18:
CTGTGAGAGA GATGGTAACA TACAG 22 (2) Informace pro SEQ ID NO: 19:CTGTGAGAGA GATGGTAACA TACAG 22 (2) Information for SEQ ID NO: 19:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 24 párů baží « 4· 4»(A) Length: 24 pairs «4 · 4»
4 » « 4 • 4 * Μ » 44 4 9 - »» »!··«»· 4 4 ť a 4 4 (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 19:4 4 4 4 4 (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule Type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 19:
GCATCCTTGA CTGGTTCTTC TCAG 24 (2) Informace pro SEQ ID NO: 20:GCATCCTTGA CTGGTTCTTC TCAG 24 (2) Information for SEQ ID NO: 20:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 25 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 20:(A) Length: 25 pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 20:
GGGTGAGACT CATCATCATT TGTGG (2) Informace pro SEQ ID NO: 21:GGGTGAGACT CATCATCATT TGTGG (2) Information for SEQ ID NO: 21:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 30 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne • · · • · · (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 21:(A) Length: 30 pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 21:
GCAAGCTTTC TGAGCATGGA TCCAACCGTC (2) Informace pro SEQ ID NO: 22:GCAAGCTTTC TGAGCATGGA TCCAACCGTC (2) Information for SEQ ID NO: 22:
(i) Charakteristika sekvence:(i) Sequence characteristics:
(A) Délka: 30 párů baží (B) Typ: nukleová kyselina (C) Řetězec: jednoduchý (D) Topologie: lineární (ii) Typ molekuly: jiná nukleová kyselina (A) Popis: /popis = syntetický PCR primer (iii) Hypotetická: ne (iv) Protismyslná: ne (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 22:(A) Length: 30 pairs (B) Type: nucleic acid (C) String: single (D) Topology: linear (ii) Molecule type: other nucleic acid (A) Description: / description = synthetic PCR primer (iii) Hypothetical: no (iv) Antisense: no (xi) Sequence description: SEQ ID NO: 22:
CCCTCAGATC TCCAATTTGC TTCCCGACAGCCCTCAGATC TCCAATTTGC TTCCCGACAG
Claims (47)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CZ20002315A CZ20002315A3 (en) | 1998-12-16 | 1998-12-16 | Novel receptor coupled with G-protein |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CZ20002315A CZ20002315A3 (en) | 1998-12-16 | 1998-12-16 | Novel receptor coupled with G-protein |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ20002315A3 true CZ20002315A3 (en) | 2001-01-17 |
Family
ID=5471094
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ20002315A CZ20002315A3 (en) | 1998-12-16 | 1998-12-16 | Novel receptor coupled with G-protein |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CZ (1) | CZ20002315A3 (en) |
-
1998
- 1998-12-16 CZ CZ20002315A patent/CZ20002315A3/en unknown
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US6696257B1 (en) | G protein-coupled receptors from the rat and human | |
EP1071714B1 (en) | A novel g-protein coupled receptor | |
EP0647275B1 (en) | Cloning and expression of gonadotropin-releasing hormone receptor | |
EP0912610B1 (en) | A novel galanin receptor | |
US6927041B2 (en) | Human neuropeptide Y-like G protein-coupled receptor | |
CZ20002315A3 (en) | Novel receptor coupled with G-protein | |
EP1200473B1 (en) | G-Protein coupled RECEPTOR | |
US20020053091A1 (en) | Isolated human G-protein coupled receptors, nucleic acid molecules encoding human GPCR proteins, and uses thereof | |
EP1278839A2 (en) | Isolated human g-protein coupled receptors, nucleic acid molecules encoding human gpcr proteins, and uses thereof | |
CA2352569A1 (en) | Novel g protein-coupled receptor | |
EP1278774A2 (en) | Human g-protein coupled receptors | |
US20030139589A1 (en) | G protein coupled receptor A4 | |
US20030233668A1 (en) | Isolated human G-protein coupled receptors, nucleic acid molecules encoding human GPCR proteins, and uses thereof | |
CA2451058A1 (en) | Novel nucleic acids, polypeptides, methods of making, and uses thereof | |
WO2004009631A2 (en) | Human gnrh (type 2) receptor |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |