发明内容
本发明的一个方面,提供了一种具有SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的单子叶植物启动子。在本发明中,所述启动子的具体碱基序列长度为2927个碱基,如SEQ ID NO:1所示:
GTCAGCCCCTTCTCGCTCATTCTGCTCCTCCTCCGGCTGCCAAGTCTCATCCTTCTCTAGATCTTGGCAGCGGAAGCAAGCTAGCATCGGCGGCGCCGTCGGAGGCGGACCTCGCGCAGCTCTCGACGGTGAGGAGGTGCACGGGGAGGAGCGGCCTGCGGTAAGGTGAGCAAGGACCTGATCCATGGCGGCGATGGCGCACTGTGTTGTCCTAGTGCCTGTCCTCGTCATCGCCTCCTCCCTTGTTGCGGCGGCGTACGGGGCGGCCTTGCGTTCGCTCAGTGCCAACGAAGGCAAGGGAGAGGTCAACACCGACACCGCCGTCGACCTCATCACCACCAGCCGAACCTCAACACTGACGCAGGGTGGTCTCGCCAGAGCCGTGGCCATCGTTAGGTTGGTCTCACCTTTGTCTCCTTTTTTTTTAATCCCTGCGAAGTCCACCTTCGATGCCCCGATGCCACGATTGACGTTGCCGCGTCGCTGGTTGATTTCGTCGCTAAGATTTGGAGAAGGAGGCTGTGACGGCCGGAGGAGGAAAAGGAGAGGGGAGGGGCTGACGGGTAGGGTCCTCATTGATTTCCACACGGGCACACCACGATGACATGTCACGTAGGCAAGAGTGACAAATAGTTAAGAAATCATCTATCTCCAGTGGTAAATTATTAAGCGTAAATCTAAGAGGGGTATTTGGATAATTGCCAAATCTAAAAGTAGTAAATAGTTAAATTCCCCAGATTAGATTGGGGATGCGTGAAGTTCAGGCGAGCAAGGCATGTAAACACTGACGCAAATCGCAATCACGCAATACATCACTACAGCAGCAGCGGATCAAAGATCAACAACTCCATTTCCCAAAATTTAATCCATAATGAAAGACATACACTGATATACAAGAGCCTAAACATTTACTAATCATCAACAAAAGATAGCTAGGAATTAATTAAATAATACAGCTACGCCAACAGTGCGTACGTCAGCACCATTCACCCCACGCTTTTTTAGCGCAATGTGTAGCCACCCAGCGGCATTGTCAGAAAAAGTTGAGGGCTTTTTTGGTGCAGCCTTGGAGTGTTGGACTACAACAACTCAGTGCGCGAACGAAAACTTTTAGCGTGTTATATGGATATTAATTTAAAGTATTAAATGTAGACTAATAATAAAAATAAATTATAAATTTTGTCTGAAAACTACGTGACGAATTTATTAAGTCTAGTTAATCTGTTATTAGCAAATATTTACTGTAGCACCATATTGTTAAATCATAGAGCAGTTAGGTTTAAAATATCCGTATCGCAATCTACACGTAATCTGTGTAATTAGTTTTTTTATATATTTAATACTTCATGTACGGATGTGACAGGGTGAAAAATTATTGTTTAGAAACTAAACAGGCTCTAAATTATAAGCACCGCGATATTATCAGAGGTTTGATGATGAAGTCGATGGTCATCATCATAATCTCTCTCAACGTGCCTGCGAGTCTCATTGCCCCCCAACTCCCCCGCCCACGAAATGATTCCCCTGCTCGCCGGCGTATGTCGCAAGCAACACAGCGATCCAACAACGAGCCTCGCGCCCTCGCGGCTCCACCACCTGCGCACCGCCGCATCTGCGTTTTCTCCGTGCTCCGAACCCGACATCCTTCGCCACCGGGTCCGACCGGCCGGCCCGTACCCAAAAAGTCAATTTTCCCGGGCCCCACATGTCAGTGAGGTACCAGCCCATCCCCCGGTCCTAAACAACTTAACCACCGGTGAACAACTGAGCACCGATGCCCCACCTCGCAGAGATAATTATAAAGTATTAGGGCCTCTTTGAATCGCAGGATTGAGAAAACGTAGGAATAGGAAAAACGTAGGATTTTAATAGGAATGTAAGTTTAAAACAGAGGATTGCAAAACACAGGAAAAACATAGGAATGACCGTTTGATTGAACGGTGAGAGAGAGACTTAAAGGAAAGTTAGCAAGAGGTTGAAGCTCTTGCTAAGGGCCTCTTTGAATCGCAGGGTAGAAAAAAACGGAGAAATAAGAAAAACGCAGGATTCTGACAAGAATTGAAGTGTAAAACAGAGGATTGCAAAACACAGGAAAAACACATGAATGGTCGTTTGATTGGAGCGCAGGAAAAACGCAGGAATCGGATAAGAGAGATAGACTCAAAGGAAATTTTCCAAGAGGTTGGAGCTCTTGCTAAATTTCCTCCAAAATCCACATGCAATGTGTCA TTCCATACGAATTTCATAGGATTTGGAAAGCTTCAATCCTTTGAATCAAAGGCCCAAATAGGAAAATTTCCTATAGGATTTAAATCCTATGAAATTTCTACATAAATCCTTTGATTTAAAGGGGCCCTAAATTTCCTCCAAAATCTCTATAGGATTGTCCATTCCATATGAATTTCAAAGAATTGGATAGGATTTAATCCTTTGTTTTAAAGGGCTTTATAGGAAATTTTCCTATAGGATTGAAATACTCTAAAATTCCTGTGTTTTCCTCCAAATCTAAGGAGCCCTTAACCGGGGAAATCGCTACCTAATCTGGCCTAACCGAGGTAATTATCGAGTGGGATTAACCTTCGTTCGGGGCGGTGCTCGGGTCGGGCGTCCAGATCTCGGGCTCGCTGAGCTGTCGCCATCGACCCGGAGTCCCTCCCGCACCAGCTAACCTTTGCTTCCGTTGGAAGCGCCAGCCAGCGCTCGCCGTTGTCACCTGTCACACTGCGTTGCACGGATTATCGTTTTTAATTAATCGTCACCAGATTGTTTTTTTTCTTTCTTTTTGCAAATCTCGCTTCGCTTTTGGAGTGGGAGGAATTAATTGTGGAGTTGGGTAGATCGATCAGGGGCAGCGCGAGCGAGGCCCGGTTGGTAGCAGTCGGTGCGTGTTTGTGCGTGTGCGCGCTGCTTCTGCTTGCATCGTGGTG(SEQ ID NO:1)
在本发明中,将SEQ ID NO:1所示的启动子序列称为启动子BgIosP556,或简称为P556启动子。
该启动子为组成型启动子,带有该启动子和GUS的水稻愈伤组织经GUS染色实验后,所述水稻愈伤组织变为蓝色。
本发明的又一方面,涉及具有与SEQ ID NO:1所示核苷酸序列互补的序列的启动子。
本发明的又一方面,还涉及SEQ ID NO:1所示单子叶植物启动子的具有启动子功能的选自如下的变体:
1)在高等严紧条件下与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,
2)对SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸序列,和
3)与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有至少90%的序列同一性的核苷酸序列。
典型地,“杂交条件”根据测量杂交时所用条件的“严紧性”程度来分类。严紧性程度可以以例如核酸结合复合物或探针的解链温度(Tm)为依据。例如,“最大严紧性”典型地发生在约Tm-5℃(低于探针Tm 5℃);“高等严紧性”发生在Tm以下约5-10℃;“中等严紧性”发生在探针Tm以下约10-20℃;“低严紧性”发生在Tm以下约20-25℃。作为替代,或者进一步地,杂交条件可以以杂交的盐或离子强度条件和/或一或多次的严紧性洗涤为依据。例如,6×SSC=极低严紧性;3×SSC=低至中等严紧性;1×SSC=中等严紧性;0.5×SSC=高等严紧性。从功能上说,可以采用最大严 紧性条件确定与杂交探针严紧同一或近严紧同一的核酸序列;而采用高等严紧性条件确定与该探针有约80%或更多序列同一性的核酸序列。
对于要求高选择性的应用,典型地期望采用相对严紧的条件来形成杂交体,例如,选择相对低的盐和/或高温度条件。Sambrook等(Sambrook,J.等(1989)分子克隆,实验室手册,Cold Spring Harbor Press,Plainview,N.Y.)提供了包括中等严紧性和高等严紧性在内的杂交条件。
为便于说明,用于检测本发明的多核苷酸与其它多核苷酸杂交的合适的中度严紧条件包括:用5×SSC、0.5%SDS、1.0mM EDTA(pH8.0)溶液预洗;在50-65℃下在5×SSC中杂交过夜;随后用含0.1%SDS的2×、0.5×和0.2×SSC在65℃下各洗涤两次20分钟。本领域技术人员应当理解,能容易地操作杂交严紧性,如改变杂交溶液的含盐量和/或杂交温度。例如,在另一个实施方案中,合适的高度严紧杂交条件包括上述条件,不同之处在于杂交温度升高到例如60-65℃或65-70℃。
在本发明中,所述在高等严紧条件下与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,其具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列相同或相似的启动子活性。
在本发明中,所述对SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列进行一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸序列,是指分别或同时在所述核苷酸序列的5’端和/或3’端,和/或序列内部进行例如不超过2-45个,或者不超过2-30个,或者不超过3-20个,或者不超过4-15个,或者不超过5-10个,或者不超过6-8个的分别用逐个连续整数表示的碱基的取代、缺失、添加修饰。
在本发明中,所述对SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列进行如上述一个或多个碱基的取代、缺失、添加修饰的核苷酸序列具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列相同或相似的启动子活性。
通过一种多核苷酸进行说明,其所具有的核苷酸序列例如与SEQ ID NO:1的参考核苷酸序列至少具95%的“同一性”是指:在SEQ ID NO:1的参考核苷酸序列之每100个核苷酸中,该多核苷酸的核苷酸序列除了含有多达5个核苷酸的不同外,该多核苷酸之核苷酸序列与参考序列相同。换句话说,为了获得核苷酸序列与参考核苷酸序列至少95%相同的多核苷酸,参考序列中多达5%的核苷酸可被删除或被另一核苷酸替代;或可将一些核苷酸插入参考序列中,其中插入的核苷酸可多达参考序列之总核苷酸的5%;或在一些核苷酸中,存在删除、插入和替换的组合,其中所述核苷酸多达参考序 列之总核苷酸的5%。参考序列的这些突变可发生在参考核苷酸序列的5或3末端位置,或在这些末端位置之间的任意地方,它们或单独散在于参考序列的核苷酸中,或以一个或多个邻近的组存在于参考序列中。
在本发明中,用于确定序列同一性和序列相似性百分数的算法是例如BLAST和BLAST 2.0算法,它们分别描述在Altschul等(1977)Nucl.Acid.Res.25:3389-3402和Altschul等(1990)J.Mol.Biol.215:403-410。采用例如文献中所述或者默认参数,BLAST和BLAST 2.0可以用于确定本发明的核苷酸序列同一性百分数。执行BLAST分析的软件可以通过国立生物技术信息中心为公众所获得。
在本发明中,所述与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有至少90%的序列同一性的核苷酸序列包括与SEQ ID NO:1所公开序列基本同一的多核苷酸序列,例如当采用本文所述方法(例如采用标准参数的BLAST分析)时,与本发明多核苷酸序列相比含有至少90%序列同一性、优选至少91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%或更高的序列同一性的那些序列。
在本发明中,所述与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有至少90%的序列同一性的核苷酸序列具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列相同或相似的启动子活性。
本发明中,所述的启动子来源于单子叶植物,具体的,所述单子叶植物为水稻,例如所述水稻为日本晴(Oryza sativa L.ssp.japonica cv.Nipponbare)。
本发明的又一方面,还涉及一种含有本发明所述单子叶植物启动子的重组载体。所述重组载体可以通过将上述启动子插入到克隆载体或表达载体而得到。
适于构建本发明所述重组载体的克隆载体包括但不限于,例如:pUC18、pUC19、pUC118、pUC119、pMD19-T、pMD20-T、pMD18-T Simple Vecter、pMD19-T Simple Vecter等。
适于构建本发明所述的表达载体包括但不限于,例如:pBI121、p13W4、pGEM等。
在本发明的一个实施方案中,所述重组载体为p8+P556重组载体。
本发明的又一方面,还涉及含有本发明所述单子叶植物启动子的所述重组载体的重组细胞。所述重组细胞可以通过将含有本发明所述单子叶植物启动子的所述重组载体转化至宿主细胞而得到。
适于构建本发明所述重组细胞的宿主细胞包括但不限于,例如:根癌农杆菌细胞LBA4404、EHA105、GV3101等。
在本发明的一个实施方案中,所述重组细胞为重组根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)EHA105-P556。
本发明的又一方面,还涉及一种单子叶植物愈伤组织,所述愈伤组织转化有本发明所述的启动子。在本发明的一个实施方案中,所述单子叶植物为水稻。所述水稻包括但不限于,日本晴、中花9、中花10、中花11、台北309、丹江8号、云稻2号、汕优63、汕优608、丰优22,黔优88、II优416、II优107、II优128、II优718、准两优527、川农1号、杂0152、皖稻88、皖稻90、皖稻92、皖稻94、皖稻96、皖稻185、皖稻187、皖稻189、皖稻191、皖稻193、皖稻195、皖稻197、皖稻199、皖稻201、皖稻203、皖稻205、皖稻207,以及津原101等(上述水稻品种均可购自安徽徽商农家福有限公司)。在本发明的又一实施方案中,所述水稻为日本晴。
本发明的又一方面,还涉及一种制备本发明所述启动子的方法,包括如下步骤:
1)根据SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,设计PCR扩增引物对,
2)以水稻日本晴基因组DNA为模板,使用步骤1)中所设计的PCR扩增引物对进行PCR扩增。
本领域技术人员周知,可以根据待扩增的目的核苷酸序列按照碱基互补原则设计相应的PCR扩增引物对。在本发明的一个实施方案中,所述PCR扩增引物对如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。
本发明的又一方面,还涉及一种调控单子叶植物中目的基因表达的方法,所述方法包括用本发明所述单子叶植物启动子转化单子叶植物的愈伤组织的步骤。在本发明的一个实施方案中,所述单子叶植物愈伤组织的转化利用了含有本发明所述单子叶植物启动子的重组细胞。在本发明的一个具体实施方案中,所述单子叶植物的愈伤组织为水稻愈伤组织,具体地,所述水稻为日本晴。
在本发明中,可采用植物基因转化技术将目的基因插入到植物基因组中,包括农杆菌介导转化、病毒介导的转化、显微注射、粒子轰击、基因枪转化和电穿孔等。本领域周知,农杆菌介导的基因转化常被用于单子叶植物和双子叶植物的基因转化,但其它转化技术也可用于本发明所述单子叶植物的基因转化。当然,适于本发明的转化单子叶植物的另一种方法是粒子轰击(显微金或钨粒子包覆转化的DNA)胚性愈伤组织或胚胎开发。另外,还可以采用的转化单子叶植物的方法是原生质体转化。基因转化后,采用通用的方法来筛选和再生整合有表达单元的植株。
本发明中,可利用所述单子叶植物启动子调控目的基因表达的所述单子叶植物包括但不限于,例如:水稻、小麦、玉米、小米、甘蔗、高粱、大麦等。
本发明的又一方面,还涉及本发明所述单子叶植物启动子在单子叶植物中调控目的基因表达的应用。在本发明的一个实施方案中,利用本发明所述启动子调控的目的基因是GUS。在本发明的一个实施方案中,所述单子叶植物为水稻,具体的所述水稻为日本晴。
为实现上述调控目的基因表达的目的,本发明所述启动子可以以单拷贝和/或多拷贝的形式应用,也可以与现有技术中已知的启动子联用。
本发明的又一方面,涉及本发明所述启动子在水稻育种中的用途。所述水稻为日本晴、中花9、中花10、中花11、台北309、丹江8号、云稻2号、汕优63、汕优608、丰优22,黔优88、II优416、II优107、II优128、II优718、准两优527、川农1号、杂0152、皖稻88、皖稻90、皖稻92、皖稻94、皖稻96、皖稻185、皖稻187、皖稻189、皖稻191、皖稻193、皖稻195、皖稻197、皖稻199、皖稻201、皖稻203、皖稻205、皖稻207,以及津原101。在本发明的一个实施方案中,所述水稻为日本晴。
本发明的启动子可成为一种新的启动子作为单子叶植物、尤其是水稻转基因的工具启动子,为开展低表达基因转化苗筛选、植物花器官败育等分子育种研究提供便利,从而极大的缩短优良品种的选育时间。本发明的启动子可广泛用于培育水稻、小麦、玉米、小米、甘蔗、高粱、大麦等单子叶植物。
发明的有益效果
为了寻找新的单子叶植物启动子,用于调控单子叶植物目的基因表达,同时为研究单子叶植物基因表达提供新的工具和选择,本发明人通过生物信息学研究获得,并采用生物学实验验证了所述启动子BgIosP556的功能。具体地,所述启动子能够在水稻中调控GUS基因表达。
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述,但是本领域技术人员将会理解,下列实施例仅用于说明本发明,而不应视为限定本发明的范围。实施例中未注明具体技术或条件者,按照本领域内的文献所描述的技术或条件(例如参考J.萨姆布鲁克等著,黄培堂等译的《分子克隆实验指南》,第三版,科学出版社)或者按照产品说明书进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市购获得的常规产品。
实施例1P556启动子片段的PCR扩增和pMD18-T+P556重组载体的构建
PCR扩增
使用植物基因组DNA提取试剂盒(TIANGEN新型植物基因组DNA提取试剂盒,目录号:DP320-02)提取水稻日本晴种子(2009年12月18日保藏于湖北省武汉市武昌珞珈山武汉大学保藏中心,即中国典型培养物保藏中心(CCTCC),保藏编号为CCTCCNo:P200910)的基因组DNA,根据该启动子在水稻日本晴gDNA中的序列,分别在首尾设计一对PCR特异性扩增引物(上游引物F1,加限制性酶切位点EcoR I和保护碱基,下游引物R1,加限制性酶切位点Sbf I和保护碱基)。以上述提取的水稻日本晴的gDNA为模板,高保真Ex TaqTM(TaKaRa,DRR100B)聚合酶进行PCR扩增。如表1所示。
表1基因启动子扩增的PCR体系
PCR扩增程序为:94℃预变性5mi n,然后以94℃变性45s,55℃退火50s,72℃延伸90s,进行35个反应循环,最后72℃延伸7min。
其中,上游引物F1:GgaattcGTCAGCCCCTTCTCGCTCA(SEQ ID NO:2),其中小写字母代表EcoR I酶切位点。
下游引物R1:TGcctgcaggCACCACGATGCAAGCAGAAGC(SEQ ID NO:3),其中小写字母代表Sbf I酶切位点。
PCR扩增产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳分离,得到大小为2944bp的条带(图1),使用TIANGEN琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(目录号:DP209-03)进行纯化回收。
pMD18-T+P556重组载体的构建
将上述得到的PCR扩增产物进行T/A克隆(pMD18-T质粒,TaKaRa,D103A),转化大肠杆菌,挑取阳性克隆测序(如SEQ ID NO:4所示),证明准确。
其中,T/A克隆的连接条件如下:
T/A连接体系: 10μl
pMD18-T 1μl
2*solution I 5μl
PCR扩增产物(回收插入片段)10ng~20ng,根据其浓度定
ddH2O 补齐至10μl
于16℃在节能型智能恒温槽(宁波新芝,SDC-6)中连接8h以上,得到pMD18-T+P556重组载体。将经过上述连接后的产物按照如下方法转化大肠杆菌:
从超低温冰箱中取出按照《分子克隆实验指南》(第三版,科学出版社)所示氯化钙法制备的感受态细胞100μl DH5α(中国科学院昆明动物研究所董杨提供;或者可从例如:上海生工购得),冰上融化后,加入10μl如上所得的连接产物,即pMD18-T+P556重组载体,轻轻搅匀,冰浴30min,42℃热激60s,冰浴5min,加 入600μl 4℃预冷的SOC培养基(具体配方详见《分子克隆实验指南》,第三版,科学出版社),37℃220rpm复苏45min,8000rpm离心30s,去上清,留取150μl,用剩下的150μl上清重悬沉淀后的混合物,轻轻吹匀,玻璃珠涂布LB(卡那霉素)平板(具体配方详见《分子克隆实验指南》,第三版,科学出版社),37℃倒置培养16h~24h。获得含有pMD18-T+P556克隆载体的重组大肠杆菌,命名为DH5α-P556。深圳华大基因科技股份有限公司对pMD18-T+P556克隆载体中的P556进行测序,结果如下:
G
GAATTC TTCTGCTCCTCCTCCGGCTGCCAAGTCTCATCCTTCTCTAGATCTTGGCAGCGGAAGCAAGCTAGCATCGGCGGCGCCGTCGGAGGCGGACCTCGCGCAGCTCTCGACGGTGAGGAGGTGCACGGGGAGGAGCGGCCTGCGGTAAGGTGAGCAAGGACCTGATCCATGGCGGCGATGGCGCACTGTGTTGTCCTAGTGCCTGTCCTCGTCATCGCCTCCTCCCTTGTTGCGGCGGCGTACGGGGCGGCCTTGCGTTCGCTCAGTGCCAACGAAGGCAAGGGAGAGGTCAACACCGACACCGCCGTCGACCTCATCACCACCAGCCGAACCTCAACACTGACGCAGGGTGGTCTCGCCAGAGCCGTGGCCATCGTTAGGTTGGTCTCACCTTTGTCTCCTTTTTTTTTAATCCCTGCGAAGTCCACCTTCGATGCCCCGATGCCACGATTGACGTTGCCGCGTCGCTGGTTGATTTCGTCGCTAAGATTTGGAGAAGGAGGCTGTGACGGCCGGAGGAGGAAAAGGAGAGGGGAGGGGCTGACGGGTAGGGTCCTCATTGATTTCCACACGGGCACACCACGATGACATGTCACGTAGGCAAGAGTGACAAATAGTTAAGAAATCATCTATCTCCAGTGGTAAATTATTAAGCGTAAATCTAAGAGGGGTATTTGGATAATTGCCAAATCTAAAAGTAGTAAATAGTTAAATTCCCCAGATTAGATTGGGGATGCGTGAAGTTCAGGCGAGCAAGGCATGTAAACACTGACGCAAATCGCAATCACGCAATACATCACTACAGCAGCAGCGGATCAAAGATCAACAACTCCATTTCCCAAAATTTAATCCATAATGAAAGACATACACTGATATACAAGAGCCTAAACATTTACTAATCATCAACAAAAGATAGCTAGGAATTAATTAAATAATACAGCTACGCCAACAGTGCGTACGTCAGCACCATTCACCCCACGCTTTTTTAGCGCAATGTGTAGCCACCCAGCGGCATTGTCAGAAAAAGTTGAGGGCTTTTTTGGTGCAGCCTTGGAGTGTTGGACTACAACAACTCAGTGCGCGAACGAAAACTTTTAGCGTGTTATATGGATATTAATTTAAAGTATTAAATGTAGACTAATAATAAAAATAAATTATAAATTTTGTCTGAAAACTACGTGACGAATTTATTAAGTCTAGTTAATCTGTTATTAGCAAATATTTACTGTAGCACCATATTGTTAAATCATAGAGCAGTTAGGTTTAAAATATCCGTATCGCAATCTACACGTAATCTGTGTAATTAGTTTTTTTATATATTTAATACTTCATGTACGGATGTGACAGGGTGAAAAATTATTGTTTAGAAACTAAACAGGCTCTAAATTATAAGCACCGCGATATTATCAGAGGTTTGATGATGAAGTCGATGGTCATCATCATAATCTCTCTCAACGTGCCTGCGAGTCTCATTGCCCCCCAACTCCCCCGCCCACGAAATGATTCCCCTGCTCGCCGGCGTATGTCGCAAGCAACACAGCGATCCAACAACGAGCCTCGCGCCCTCGCGGCTCCACCACCTGCGCACCGCCGCATCTGCGTTTTCTCCGTGCTCCGAACCCGACATCCTTCGCCACCGGGTCCGACCGGCCGGCCCGTACCCAAA AAGTCAATTTTCCCGGGCCCCACATGTCAGTGAGGTACCAGCCCATCCCCCGGTCCTAAACAACTTAACCACCGGTGAACAACTGAGCACCGATGCCCCACCTCGCAGAGATAATTATAAAGTATTAGGGCCTCTTTGAATCGCAGGATTGAGAAAACGTAGGAATAGGAAAAACGTAGGATTTTAATAGGAATGTAAGTTTAAAACAGAGGATTGCAAAACACAGGAAAAACATAGGAATGACCGTTTGATTGAACGGTGAGAGAGAGACTTAAAGGAAAGTTAGCAAGAGGTTGAAGCTCTTGCTAAGGGCCTCTTTGAATCGCAGGGTAGAAAAAAACGGAGAAATAAGAAAAACGCAGGATTCTGACAAGAATTGAAGTGTAAAACAGAGGATTGCAAAACACAGGAAAAACACATGAATGGTCGTTTGATTGGAGCGCAGGAAAAACGCAGGAATCGGATAAGAGAGATAGACTCAAAGGAAATTTTCCAAGAGGTTGGAGCTCTTGCTAAATTTCCTCCAAAATCCACATGCAATGTGTCATTCCATACGAATTTCATAGGATTTGGAAAGCTTCAATCCTTTGAATCAAAGGCCCAAATAGGAAAATTTCCTATAGGATTTAAATCCTATGAAATTTCTACATAAATCCTTTGATTTAAAGGGGCCCTAAATTTCCTCCAAAATCTCTATAGGATTGTCCATTCCATATGAATTTCAAAGAATTGGATAGGATTTAATCCTTTGTTTTAAAGGGCTTTATAGGAAATTTTCCTATAGGATTGAAATACTCTAAAATTCCTGTGTTTTCCTCCAAATCTAAGGAGCCCTTAACCGGGGAAATCGCTACCTAATCTGGCCTAACCGAGGTAATTATCGAGTGGGATTAACCTTCGTTCGGGGCGGTGCTCGGGTCGGGCGTCCAGATCTCGGGCTCGCTGAGCTGTCGCCATCGACCCGGAGTCCCTCCCGCACCAGCTAACCTTTGCTTCCGTTGGAAGCGCCAGCCAGCGCTCGCCGTTGTCACCTGTCACACTGCGTTGCACGGATTATCGTTTTTAATTAATCGTCACCAGATTGTTTTTTTTCTTTCTTTTTGCAAATCTCGCTTCGCTTTTGGAGTGGGAGGAATTAATTGTGGAGTTGGGTAGATCGATCAGGGGCAGCGCGAGCGAGGCCCGGTTGGTAGCAGTCGGTGCGTGTTTGTGCGTGTGCGCGCT
CCTGCAGGCA(SEQ ID NO:4)
上面的序列中,带下划线的为酶切位点(EcoRI和Sbf I),带方框的为引物序列。
测序结果表明,获得的pMD18-T+P556克隆载体中P556启动子序列正确。
实施例2p8+P556重组载体的构建
按照TIANGEN普通质粒小提试剂盒(目录号:DP103-03)的操作手册,从实施例1构建的转化有启动子P556的大肠杆菌DH5α-P556中提取带有本发明P556启动子序列的克隆载体pMD18-T+P556;纯化后用相应的限制性内切酶EcoR I(NEB)和Sbf I(NEB)进行酶切,回收相应的启动子插入片段,并分别与p8质粒用相同的限制性内切酶酶切后回收的载体大片段进行连接。
将所得连接产物p8+P556重组载体转化按照《分子克隆实验指南》(第三版,科学出版社)所示氯化钙法制备的感受态细胞DH5α,37℃倒置培养16~24h,待转化子长出菌落后,挑取单克隆进行PCR检测和酶切鉴定。
p8质粒构建
本发明中所使用的p8质粒是由pCAMBIA-1301质粒(中国科学院昆明动物研究所董杨提供;或者可从例如上海国瑞基因科技有限公司购得,该公司的pCAMBIA-1301质粒的原始来源是The CAMBIA Bios(biological open source)Licensee,Australia)按照如下方式改造并构建的,具体说明如下:
用Kpn I/Nco I(NEB)双酶切质粒pCAMBIA-1301(参见图2),回收大片段。根据所采用的限制性内切酶位点合成如下序列:GGTACCAAGCTTACTAGTCCTGCAGGTCTAGAGGATCCGTCGACCATGG(SEQ ID NO:5)(包含的酶切位点是Kpn I/HindIII/Spe I/Sbf I/Pst I/Xba I/BamH I/Sal I/Nco I),用Kpn I/Nco I双酶切后回收,与上述所回收的大片段连接后转化t op10细胞(中国科学院昆明动物研究所董杨提供;或者可从例如:北京索莱宝科技有限公司购得)。用引物GCTTCCGGCTCGTATGTTGT(SEQ ID NO:6)/GAGTCGTCGGTTCTGTAAC(SEQ ID NO:7)筛选转化子,通过PCR检测方法,带有扩增片段为350bp的转化子即为含有需要构建的多克隆位点及GUS序列的p8质粒的转化子(参见图4)。
所述p8质粒中的多克隆位点和GUS序列的长度2353碱基,如SEQ ID NO:8所示(参见图3):
GTTGGCAAGCTGCTCTAGCCAATACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAATGCAGCTGGCACGACAGGTTTCCCGACTGGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTAGCTCACTCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTAT
GTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGACCATGATTAC
GAGCTC AAGCTT C G GGATCC C (SEQ IDNO:8)
如上序列所示本发明中所构建的p8质粒,其多克隆位点中的EcoR I/Sac I/KpnI/Hind III/Spe I/Sbf I/Pst I/Xba I/BamH I/Sal I/Nco I限制性酶切位点分别用加框和下划线表示,筛选转化子所用的引物GCTTCCGGCTCGTATGTTGT/GAGTCGTCGGTTCTGTA AC(即SEQ ID NO:6和7)用双下划线表示,GUS序列用斜体表示,其内含子序列分别用斜体加底纹示出。
重组载体p8+P556的构建
根据限制性内切酶EcoR I(NEB)和Sbf I(NEB)操作说明,按照如下条件处理实施例1中所得到的克隆载体pMD18-T+P556,以及如上所述构建的p8质粒。
其中,克隆载体pMD18-T+P556及p8质粒的酶切条件如下:
酶切体系: 50μl
无菌水 34.8μl
10*buffer H 5μl
EcoR I 0.1μl(10U)
Sbf I 0.1μl(10U)
克隆载体pMD1g-T+P556或p8质粒 10μl(<1000ng)
使用TIANGEN琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒(目录号:DP209-03)分别回收经酶切的p8质粒,以及启动子P556插入片段,根据T4连接酶(TaKaRa,D2011A)操作说明,按照如下条件进行连接:
连接体系: 10μl
10*T4buffer 1μl
酶切后的p8质粒 1μl(20ng)
回收的启动子P556插入片段 10-20ng,根据其浓度定
无菌水 补齐至9.5μl
T4ligase(TaKaRa,D2011A) 0.5μl
T4buffer冰上融化,酶切后的p8质粒载体加入量约20ng,本发明中的P556片段加10-20ng。于16℃在节能型智能恒温槽(宁波新芝,SDC-6)中连接8h以上。
将100μl氯化钙法制得的感受态细胞DH5从超低温冰箱取出,冰上融化后,加入10μl上面的连接产物,轻轻搅匀,冰浴30min,42℃热激60s,冰浴5min,加入600μl 4℃预冷的SOC,37℃下220rpm复苏45min,8000rpm离心30s,去上清,留取150μl,轻轻吹匀,玻璃珠涂布LB(kan),37℃倒置培养16~24h。得到重组载体p8+P556。
分别以F1(SEQ ID NO:2)和R1(SEQ ID NO:3)为引物对所得重组载体p8+P556进行PCR检测,以确证所得重组载体p8+P556中含有所需启动子P556。通过EcoR I/SbfI酶切筛选含有重组载体p8+P556转化子。
实施例3重组根癌农杆菌EHA105-P556细胞的制备
将如实施例2所述方法构建的p8+P556重组载体和作为对照的p8质粒分别转化按照《分子克隆实验指南》(第三版,科学出版社)中所述氯化钙方法制备的根癌农杆菌EHA105 Agrobacterium tumefaciens EHA105(2009年12月24日保藏于湖北省武汉市武昌珞珈山武汉大学保藏中心,即中国典型培养物保藏中心(CCTCC),保藏编号为CCTCC No:M 209315)的感受态细胞,具体方法如下:
将根癌农杆菌感受态细胞EHA105于超低温冰箱中取出,至于冰上解冻。融化后,分别加入5μl的p8+P556重组载体和p8质粒以及作为对照的p8空载体,轻轻混匀,冰浴10min,放入液氮中冷冻5min,37℃解冻5min,加入800μl常温的LB液体培养基,28℃160rpm复苏3h,8000rpm离心30s,吸去上清,留下200μl吹匀,涂布于加有kan-rif(卡那霉素-利福平)双抗的YM培养基平板上(50mg/l Kan,10mg/l Rif,具体配方参见表4)。28℃倒置培养2-3天。
以F1(SEQ ID NO:2)和R1(SEQ ID NO:3)为引物进行PCR检测和通过EcoRI/Sbf I酶切筛选转化子。
PCR扩增出约2944bp条带和酶切出约2937bp条带的为重组载体p8+P556的重组根癌农杆菌。
本发明中,按照如上述方法得到的带有重组载体p8+P556的重组农杆菌,命名为重组根癌农杆菌EHA105-P556。
按照本发明所述方法,得到的带有p8质粒的对照重组农杆菌,命名为重组根癌农杆菌EHA105-p8。
实施例4水稻愈伤组织的诱导和转化
按照如下步骤诱导水稻愈伤组织,并分别用重组根癌农杆菌EHA105-P556和重组根癌农杆菌EHA105-p8转化所述愈伤组织。
1)将水稻日本晴种子去壳,70%乙醇表面消毒30s,然后用有效氯1.5%的次氯酸钠消毒30min,期间剧烈摇动,消毒后用灭菌水清洗5次;将消毒后的种子置于N6D培养基(具体配方参见表2)上,用封口膜封口;29.5℃光照培养3-4周;
2)选取活跃生长的愈伤组织(黄白色,干燥,直径1-3mm),在新N6D培养基上29.5℃光照培养3天;
3)分别挑取如实施例3所构建的重组根癌农杆菌单菌落(重组根癌农杆菌EHA105-P556或重组根癌农杆菌EHA105-p8),于添加抗生素(50mg/l Kan,10mg/lRif)的YM培养基(具体配方参见表3、表4)上划线培养3天,培养温度28℃;分别刮取上述重组根癌农杆菌置于添加了30μl 100mM的AS(Acetosyringone,乙酰丁香酮)的30ml AAM培养基(具体配方参见表5)中,温和重悬所述重组根癌农杆菌细胞(重组根癌农杆菌EHA105-P556或重组根癌农杆菌EHA105-p8);
4)将继代培养的愈伤组织置于灭菌培养皿中;将如步骤3制备的重组根癌农杆菌悬液倒入培养皿中,将愈伤组织浸入其中15min;
5)倒掉重组根癌农杆菌悬液,将愈伤组织用灭菌吸水纸吸掉多余的液体;于N6-AS培养基(配方参见表6)上放一张灭菌滤纸,加1ml如上述含AS的AAM培养基,将愈伤组织转移至滤纸上;密封培养皿,28℃暗培养48-60h;
6)将受感染的愈伤组织置于50ml灭菌管中,用灭菌水摇动清洗,直至上清液变澄清;将愈伤组织浸泡于含500mg/l羧苄青霉素(Cb)的无菌水中以杀死重组根癌农杆菌;用灭菌吸水纸除去愈伤组织上多余的水分,然后将其转移至含1mg/l潮霉素B(HmB)和50mg/l Carb的N6-AS培养基上;用封口膜密封培养皿,29.5℃光照培养3-4周。
实施例5水稻愈伤组织中的GUS的表达
为检测经过实施例4所述转化的水稻愈伤组织中目的基因GUS的表达情况,按照Chen S Y等在Journal of Integrative Plant Biology,2008,50(6):742-751所述的方法,对分别用重组根癌农杆菌EHA105-P556或重组农杆菌EHA105-p8转化的水稻愈伤组织进行染色。
GUS染色液的配方(1ml):610μl 0.2M Na2HPO4溶液(pH=7.0);390μl 0.2M NaH2PO4溶液和10μl 0.1M X-gluc。
将分别用重组根癌农杆菌EHA105-P556或重组根癌农杆菌EHA105-p8转化的水稻愈伤组织浸泡在GUS染色液中,37℃保温至出现蓝色,拍照记录,结果如图5所示,经含有启动子的p8+P556重组载体的重组根癌农杆菌介导转化的水稻愈伤组织(图5左)经染色后呈现蓝色,经不含有启动子的p8质粒重组根癌农杆菌介导转化的水稻愈伤组织(作为对照,图5右)经GUS染色后颜色未发生变化。结果显示,本发明的P556启动子对GUS基因表达具有调控作用。
本发明实施例中所使用的相关培养基配方说明如下:
以下有关培养基中所称的“常规灭菌”是指如下条件的灭菌:121℃下蒸气灭菌20分钟。
表2N6D培养基
用1N氢氧化钾调节pH值到5.8,封口后按常规方法灭菌。
N6macro母液(20X):硝酸钾56.60g,磷酸二氢钾8.00g,硫酸铵9.26g,硫酸镁3.70g,氯化钙3.32g,蒸馏水定容至1L,4℃保存备用。
N6micro母液(1000X):碘化钾0.80g,硼酸1.60g,硫酸锰3.33g,硫酸锌1.50g,蒸馏水定容至1L,4℃保存备用。
铁盐(Fe2EDTA)贮存液(100X):将3.73g乙二铵四乙酸二钠(Na2EDTA·2H2O)和2.78g FeSO4.7H2O分别溶解,混合并用。用蒸馏水定容至1000ml,70℃温浴2h,冷却后4℃保存不超过1个月。
N6维生素贮存液(1000X):维生素B10.10g,维生素B60.05g,烟酸0.05g,甘氨酸0.20g,加蒸馏水定容至100ml,过滤除菌,4℃保存不超过1周。
表3YM液体培养基(含有50mg/L Kan,10mg/L Rif):
常规灭菌,冷却至室温后加入加入
表4YM固体培养基(含有50mg/L Kan,10mg/L Rif):
表5AAM培养基
加1N氢氧化钾调节pH值至5.2,常规灭菌。
AAM macro(10X):2.5g七水硫酸镁(MgSO4·7H2O),1.5g二水氯化钙(CaCl2·2H2O),1.33g二水磷酸二氢钠(NaH2PO4.2H2O),蒸馏水定容至1L,4℃保存备用。
AAM micro(100X):0.7g单水硫酸锰(MnSO4·H2O),0.2g七水硫酸锌(ZnSO4·7H2O),0.075g碘化钾(KI),0.3g硼酸(H3BO3),25mg二水钼酸钠(Na2MoO4.2H2O),2.5mg五水硫酸铜(CuSO4.5H2O),2.5mg六水氯化钴(CoCl2.6H2O),蒸馏水定容至1L,4℃保存备用。
AAM有机(1000X):0.75g甘氨酸(Glycine),0.1g烟酸(Nicotinic acid),0.1g VB6(Pyridoxine),1g VB1(Thiamine),蒸馏水定容至100ml,4℃保存备用。
铁盐(Fe2EDTA)贮存液(100X):见表2。
表6N6-AS共培养基
调pH至5.2。
N6macro母液(20X),N6micro母液(1000X),铁盐(Fe2EDTA)贮存液(100X),N6维生素贮存液(1000X):均见表2。
尽管本发明的具体实施方式已经得到详细的描述,本领域技术人员将会理解。根据已经公开的所有教导,可以对那些细节进行各种修改和替换,这些改变均在本发明的保护范围之内。本发明的全部范围由所附权利要求及其任何等同物给出。
SEQUENCE LISTING
<110>深圳华大基因科技有限公司
<120>一种启动子BgIosP556、其制备方法及用途
<130>P2009-1-0014
<160>8
<170>PatentIn version 3.5
<210>1
<211>2927
<212>DNA
<213>水稻日本晴(Oryza sativa L.ssp.japonica cv.)
<400>1
gtcagcccct tctcgctcat tctgctcctc ctccggctgc caagtctcat ccttctctag 60
atcttggcag cggaagcaag ctagcatcgg cggcgccgtc ggaggcggac ctcgcgcagc 120
tctcgacggt gaggaggtgc acggggagga gcggcctgcg gtaaggtgag caaggacctg 180
atccatggcg gcgatggcgc actgtgttgt cctagtgcct gtcctcgtca tcgcctcctc 240
ccttgttgcg gcggcgtacg gggcggcctt gcgttcgctc agtgccaacg aaggcaaggg 300
agaggtcaac accgacaccg ccgtcgacct catcaccacc agccgaacct caacactgac 360
gcagggtggt ctcgccagag ccgtggccat cgttaggttg gtctcacctt tgtctccttt 420
ttttttaatc cctgcgaagt ccaccttcga tgccccgatg ccacgattga cgttgccgcg 480
tcgctggttg atttcgtcgc taagatttgg agaaggaggc tgtgacggcc ggaggaggaa 540
aaggagaggg gaggggctga cgggtagggt cctcattgat ttccacacgg gcacaccacg 600
atgacatgtc acgtaggcaa gagtgacaaa tagttaagaa atcatctatc tccagtggta 660
aattattaag cgtaaatcta agaggggtat ttggataatt gccaaatcta aaagtagtaa 720
atagttaaat tccccagatt agattgggga tgcgtgaagt tcaggcgagc aaggcatgta 780
aacactgacg caaatcgcaa tcacgcaata catcactaca gcagcagcgg atcaaagatc 840
aacaactcca tttcccaaaa tttaatccat aatgaaagac atacactgat atacaagagc 900
ctaaacattt actaatcatc aacaaaagat agctaggaat taattaaata atacagctac 960
gccaacagtg cgtacgtcag caccattcac cccacgcttt tttagcgcaa tgtgtagcca 1020
cccagcggca ttgtcagaaa aagttgaggg cttttttggt gcagccttgg agtgttggac 1080
tacaacaact cagtgcgcga acgaaaactt ttagcgtgtt atatggatat taatttaaag 1140
tattaaatgt agactaataa taaaaataaa ttataaattt tgtctgaaaa ctacgtgacg 1200
aatttattaa gtctagttaa tctgttatta gcaaatattt actgtagcac catattgtta 1260
aatcatagag cagttaggtt taaaatatcc gtatcgcaat ctacacgtaa tctgtgtaat 1320
tagttttttt atatatttaa tacttcatgt acggatgtga cagggtgaaa aattattgtt 1380
tagaaactaa acaggctcta aattataagc accgcgatat tatcagaggt ttgatgatga 1440
agtcgatggt catcatcata atctctctca acgtgcctgc gagtctcatt gccccccaac 1500
tcccccgccc acgaaatgat tcccctgctc gccggcgtat gtcgcaagca acacagcgat 1560
ccaacaacga gcctcgcgcc ctcgcggctc caccacctgc gcaccgccgc atctgcgttt 1620
tctccgtgct ccgaacccga catccttcgc caccgggtcc gaccggccgg cccgtaccca 1680
aaaagtcaat tttcccgggc cccacatgtc agtgaggtac cagcccatcc cccggtccta 1740
aacaacttaa ccaccggtga acaactgagc accgatgccc cacctcgcag agataattat 1800
aaagtattag ggcctctttg aatcgcagga ttgagaaaac gtaggaatag gaaaaacgta 1860
ggattttaat aggaatgtaa gtttaaaaca gaggattgca aaacacagga aaaacatagg 1920
aatgaccgtt tgattgaacg gtgagagaga gacttaaagg aaagttagca agaggttgaa 1980
gctcttgcta agggcctctt tgaatcgcag ggtagaaaaa aacggagaaa taagaaaaac 2040
gcaggattct gacaagaatt gaagtgtaaa acagaggatt gcaaaacaca ggaaaaacac 2100
atgaatggtc gtttgattgg agcgcaggaa aaacgcagga atcggataag agagatagac 2160
tcaaaggaaa ttttccaaga ggttggagct cttgctaaat ttcctccaaa atccacatgc 2220
aatgtgtcat tccatacgaa tttcatagga tttggaaagc ttcaatcctt tgaatcaaag 2280
gcccaaatag gaaaatttcc tataggattt aaatcctatg aaatttctac ataaatcctt 2340
tgatttaaag gggccctaaa tttcctccaa aatctctata ggattgtcca ttccatatga 2400
atttcaaaga attggatagg atttaatcct ttgttttaaa gggctttata ggaaattttc 2460
ctataggatt gaaatactct aaaattcctg tgttttcctc caaatctaag gagcccttaa 2520
ccggggaaat cgctacctaa tctggcctaa ccgaggtaat tatcgagtgg gattaacctt 2580
cgttcggggc ggtgctcggg tcgggcgtcc agatctcggg ctcgctgagc tgtcgccatc 2640
gacccggagt ccctcccgca ccagctaacc tttgcttccg ttggaagcgc cagccagcgc 2700
tcgccgttgt cacctgtcac actgcgttgc acggattatc gtttttaatt aatcgtcacc 2760
agattgtttt ttttctttct ttttgcaaat ctcgcttcgc ttttggagtg ggaggaatta 2820
attgtggagt tgggtagatc gatcaggggc agcgcgagcg aggcccggtt ggtagcagtc 2880
ggtgcgtgtt tgtgcgtgtg cgcgctgctt ctgcttgcat cgtggtg 2927
<210>2
<211>26
<212>DNA
<213>人工序列
<400>2
ggaattcgtc agccccttct cgctca 26
<210>3
<211>31
<212>DNA
<213>人工序列
<400>3
tgcctgcagg caccacgatg caagcagaag c 31
<210>4
<211>2944
<212>DNA
<213>人工序列
<400>4
ggaattcgtc agccccttct cgctcattct gctcctcctc cggctgccaa gtctcatcct 60
tctctagatc ttggcagcgg aagcaagcta gcatcggcgg cgccgtcgga ggcggacctc 120
gcgcagctct cgacggtgag gaggtgcacg gggaggagcg gcctgcggta aggtgagcaa 180
ggacctgatc catggcggcg atggcgcact gtgttgtcct agtgcctgtc ctcgtcatcg 240
cctcctccct tgttgcggcg gcgtacgggg cggccttgcg ttcgctcagt gccaacgaag 300
gcaagggaga ggtcaacacc gacaccgccg tcgacctcat caccaccagc cgaacctcaa 360
cactgacgca gggtggtctc gccagagccg tggccatcgt taggttggtc tcacctttgt 420
ctcctttttt tttaatccct gcgaagtcca ccttcgatgc cccgatgcca cgattgacgt 480
tgccgcgtcg ctggttgatt tcgtcgctaa gatttggaga aggaggctgt gacggccgga 540
ggaggaaaag gagaggggag gggctgacgg gtagggtcct cattgatttc cacacgggca 600
caccacgatg acatgtcacg taggcaagag tgacaaatag ttaagaaatc atctatctcc 660
agtggtaaat tattaagcgt aaatctaaga ggggtatttg gataattgcc aaatctaaaa 720
gtagtaaata gttaaattcc ccagattaga ttggggatgc gtgaagttca ggcgagcaag 780
gcatgtaaac actgacgcaa atcgcaatca cgcaatacat cactacagca gcagcggatc 840
aaagatcaac aactccattt cccaaaattt aatccataat gaaagacata cactgatata 900
caagagccta aacatttact aatcatcaac aaaagatagc taggaattaa ttaaataata 960
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gtagccaccc agcggcattg tcagaaaaag ttgagggctt ttttggtgca gccttggagt 1080
gttggactac aacaactcag tgcgcgaacg aaaactttta gcgtgttata tggatattaa 1140
tttaaagtat taaatgtaga ctaataataa aaataaatta taaattttgt ctgaaaacta 1200
cgtgacgaat ttattaagtc tagttaatct gttattagca aatatttact gtagcaccat 1260
attgttaaat catagagcag ttaggtttaa aatatccgta tcgcaatcta cacgtaatct 1320
gtgtaattag tttttttata tatttaatac ttcatgtacg gatgtgacag ggtgaaaaat 1380
tattgtttag aaactaaaca ggctctaaat tataagcacc gcgatattat cagaggtttg 1440
atgatgaagt cgatggtcat catcataatc tctctcaacg tgcctgcgag tctcattgcc 1500
ccccaactcc cccgcccacg aaatgattcc cctgctcgcc ggcgtatgtc gcaagcaaca 1560
cagcgatcca acaacgagcc tcgcgccctc gcggctccac cacctgcgca ccgccgcatc 1620
tgcgttttct ccgtgctccg aacccgacat ccttcgccac cgggtccgac cggccggccc 1680
gtacccaaaa agtcaatttt cccgggcccc acatgtcagt gaggtaccag cccatccccc 1740
ggtcctaaac aacttaacca ccggtgaaca actgagcacc gatgccccac ctcgcagaga 1800
taattataaa gtattagggc ctctttgaat cgcaggattg agaaaacgta ggaataggaa 1860
aaacgtagga ttttaatagg aatgtaagtt taaaacagag gattgcaaaa cacaggaaaa 1920
acataggaat gaccgtttga ttgaacggtg agagagagac ttaaaggaaa gttagcaaga 1980
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cacatgcaat gtgtcattcc atacgaattt cataggattt ggaaagcttc aatcctttga 2280
atcaaaggcc caaataggaa aatttcctat aggatttaaa tcctatgaaa tttctacata 2340
aatcctttga tttaaagggg ccctaaattt cctccaaaat ctctatagga ttgtccattc 2400
catatgaatt tcaaagaatt ggataggatt taatcctttg ttttaaaggg ctttatagga 2460
aattttccta taggattgaa atactctaaa attcctgtgt tttcctccaa atctaaggag 2520
cccttaaccg gggaaatcgc tacctaatct ggcctaaccg aggtaattat cgagtgggat 2580
taaccttcgt tcggggcggt gctcgggtcg ggcgtccaga tctcgggctc gctgagctgt 2640
cgccatcgac ccggagtccc tcccgcacca gctaaccttt gcttccgttg gaagcgccag 2700
ccagcgctcg ccgttgtcac ctgtcacact gcgttgcacg gattatcgtt tttaattaat 2760
cgtcaccaga ttgttttttt tctttctttt tgcaaatctc gcttcgcttt tggagtggga 2820
ggaattaatt gtggagttgg gtagatcgat caggggcagc gcgagcgagg cccggttggt 2880
agcagtcggt gcgtgtttgt gcgtgtgcgc gctgcttctg cttgcatcgt ggtgcctgca 2940
ggca 2944
<210>5
<211>49
<212>DNA
<213>人工序列
<400>5
ggtaccaagc ttactagtcc tgcaggtcta gaggatccgt cgaccatgg 49
<210>6
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列
<400>6
gcttccggct cgtatgttgt 20
<210>7
<211>19
<212>DNA
<213>人工序列
<400>7
gagtcgtcgg ttctgtaac 19
<210>8
<211>2353
<212>DNA
<213>人工序列
<400>8
gttggcaagc tgctctagcc aatacgcaaa ccgcctctcc ccgcgcgttg gccgattcat 60
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tacgaattcg agctcggtac caagcttact agtcctgcag gtctagagga tccgtcgacc 300
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ttctcttttt atttttttga gctttgatct ttctttaaac tgatctattt tttaattgat 420
tggttatggt gtaaatatta catagcttta actgataatc tgattacttt atttcgtgtg 480
tctatgatga tgatgatagt tacagaaccg acgactcgtc cgtcctgtag aaaccccaac 540
ccgtgaaatc aaaaaactcg acggcctgtg ggcattcagt ctggatcgcg aaaactgtgg 600
aattgatcag cgttggtggg aaagcgcgtt acaagaaagc cgggcaattg ctgtgccagg 660
cagttttaac gatcagttcg ccgatgcaga tattcgtaat tatgcgggca acgtctggta 720
tcagcgcgaa gtctttatac cgaaaggttg ggcaggccag cgtatcgtgc tgcgtttcga 780
tgcggtcact cattacggca aagtgtgggt caataatcag gaagtgatgg agcatcaggg 840
cggctatacg ccatttgaag ccgatgtcac gccgtatgtt attgccggga aaagtgtacg 900
tatcaccgtt tgtgtgaaca acgaactgaa ctggcagact atcccgccgg gaatggtgat 960
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aatccatcgc agcgtaatgc tctacaccac gccgaacacc tgggtggacg atatcaccgt 1080
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cactagcggg actttgcaag tggtgaatcc gcacctctgg caaccgggtg aaggttatct 1260
ctatgaactc gaagtcacag ccaaaagcca gacagagtct gatatctacc cgcttcgcgt 1320
cggcatccgg tcagtggcag tgaagggcca acagttcctg attaaccaca aaccgttcta 1380
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acaggcgatt aaagagctga tagcgcgtga caaaaaccac ccaagcgtgg tgatgtggag 1740
tattgccaac gaaccggata cccgtccgca aggtgcacgg gaatatttcg cgccactggc 1800
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