La Dzūkija è situata nel sud della Lituania. A nord della Dzūkija c'è la regione dell'Aukštaitija, mentre la Sudovia (Sūduva o Suvalkija in lituano) sorge ad ovest. Grandi parti della Dzūkija sono coperte da foreste e nelle aree più scarsamente popolate, la densità di popolazione è inferiore a 4 persone per km². Qui è situata la principale zona paludosa della Lituania, la palude di Čepkelių.

A causa delle sue caratteristiche di regione remota, piena di foreste e paludi, nell'area è molto sviluppata la crescita di funghi e bacche selvatiche; la raccolta di questi prodotti è da secoli una tradizione del popolo della Dzūkija, e continua anche oggi. In estate ed autunno, ci sono molti abitanti che vendono funghi e altri prodotti nei mercati o sulle principali strade.

In Lituania esiste il seguente detto: "Jei ne grybai ir ne uogos, dzūkų mergos būtų nuogos" ("Se non fosse per funghi e bacche, le ragazze della Dzūkija andrebbero in giro nude").

Due dei cinque parchi nazionali della Lituania si trovano nella Dzūkija: