Fondato nel 1934, il Maccabi Netanya è uno dei club storici di Israele, con alle spalle oltre 40 stagioni in prima divisione, 5 titoli nazionali e 1 Coppa di Stato. Il club dominò la scena nazionale tra gli anni settanta e la prima metà degli anni ottanta, ove si collocano tutti i suoi principali successi.
Gli anni a seguire sono stati assai meno ricchi di successi per i "diamanti" (come sono soprannominati i calciatori del Maccabi, che ha un diamante nel proprio stemma). Ultimamente l'acquisto della società da parte di Daniel Jammer, uomo d'affari ebreo-tedesco, ha riportato lustro al Maccabi, che grazie ai nuovi acquisti ha colto un beneaugurante secondo posto nella Ligat ha'Al2006-07.
Nella UEFA Conference League 2022-2023, dove la squadra parte dal secondo turno, incontrano i quotati turchi dell'Istanbul Basakhseir; all'andata riescono a pareggiare 1-1, segnando dopo soli 2 minuti, ma al ritorno perdono 0-1 e vengono eliminati comunque a testa alta.