EC 3.5
Apparence
Le groupe EC3.5 rassemble des enzymes appartenant à la famille des hydrolases. Elles ont pour particularité de catalyser des réactions d'hydrolyse dans des molécules possédant un carbone et un azote liés par liaison simple, double ou triple.
À la différence des peptidases (groupe EC3.4), ces enzymes n'interviennent pas sur les liaisons peptidiques mais sur les groupements attachés à un atome d'azote non peptidique ou sur des bases nucléotidiques. Elles jouent un rôle principalement dans la régulation de la biosynthèse des protéines et dans le métabolisme de certains acides aminés.
On les divise en quatre groupes.
R-CO-NH-R' + H2O ⇌ R-COOH + R'-NH2
- Les déiminases qui catalysent les réactions
R-C(=NH)-NH2 + H2O R-H + NH2-CO-NH2
ou R-C(=NH)-NH2 + H2O R-CH(-NH2)-COOH + NH3
ou R-C(=NH)-NH2 + H2O R-CH(-NH2)-COOH + NH3
- Les désaminases qui catalysent la réaction
R-C(-NH2)=NH-R' + H2O R-CO-NH-R' + NH3
- Les nitrilases qui catalysent la réaction
R-C≡N + 2 H2O R-COOH + NH3
Classification des enzymes du groupe EC3.5
[modifier | modifier le code]EC 3.5.1 : Enzymes spécifiques des amides linéaires (liaison C-N linéaire)
[modifier | modifier le code]Liste des enzymes du groupe EC3.5.1
- EC 3.5.1.1 : asparaginase
- EC 3.5.1.2 : glutaminase
- EC 3.5.1.3 : ω-amidase
- EC 3.5.1.4 : amidase
- EC 3.5.1.5 : uréase
- EC 3.5.1.6 : β-uréidopropionase
- EC 3.5.1.7 : ureidosuccinase
- EC 3.5.1.8 : formylaspartate-déformylase
- EC 3.5.1.9 : arylformamidase
- EC 3.5.1.10 : formyltétrahydrofolate-déformylase
- EC 3.5.1.11 : pénicilline-amidase
- EC 3.5.1.12 : biotinidase
- EC 3.5.1.13 : aryl-acylamidase
- EC 3.5.1.14 : aminoacylase
- EC 3.5.1.15 : aspartoacylase
- EC 3.5.1.16 : acétylornithine-déacétylase
- EC 3.5.1.17 : acyl-lysine-déacylase
- EC 3.5.1.18 : succinyl-diaminopimélate-désuccinylase
- EC 3.5.1.19 : nicotinamidase
- EC 3.5.1.20 : citrullinase
- EC 3.5.1.21 : N-acétyl-β-alanine-déacétylase
- EC 3.5.1.22 : pantothénase
- EC 3.5.1.23 : céramidase
- EC 3.5.1.24 : choloylglycine-hydrolase
- EC 3.5.1.25 : N-acétylglucosamine-6-phosphate-déacétylase
- EC 3.5.1.26 : N4-(β-N-acétylglucosaminyl)-L-asparaginase
- EC 3.5.1.27 : N-formylméthionylaminoacyl-ARNt-déformylase
- EC 3.5.1.28 : N-acétylmuramoyl-L-alanine-amidase
- EC 3.5.1.29 : 2-(acétamidométhylène)succinate-hydrolase
- EC 3.5.1.30 : 5-aminopentanamidase
- EC 3.5.1.31 : formylméthionine-déformylase
- EC 3.5.1.32 : hippurate-hydrolase
- EC 3.5.1.33 : N-acétylglucosamine-déacétylase
- EC 3.5.1.34 : supprimée (transférée vers EC 3.4.13.5)
- EC 3.5.1.35 : D-glutaminase
- EC 3.5.1.36 : N-méthyl-2-oxoglutaramate-hydrolase
- EC 3.5.1.37 : supprimée (transférée vers EC 3.5.1.26)
- EC 3.5.1.38 : glutamine-asparaginase
- EC 3.5.1.39 : alkylamidase
- EC 3.5.1.40 : acylagmatine-amidase
- EC 3.5.1.41 : chitine-déacétylase
- EC 3.5.1.42 : nicotinamide-nucléotide-amidase
- EC 3.5.1.43 : peptidyl-glutaminase
- EC 3.5.1.44 : protéine-glutamine-glutaminase
- EC 3.5.1.45 : transférée vers EC 6.3.4.6
- EC 3.5.1.46 : 6-aminohexanoate-dimère-hydrolase
- EC 3.5.1.47 : N-acétyldiaminopimélate-déacétylase
- EC 3.5.1.48 : acétylspermidine-déacétylase
- EC 3.5.1.49 : formamidase
- EC 3.5.1.50 : pentanamidase
- EC 3.5.1.51 : 4-acétamidobutyryl-CoA-déacétylase
- EC 3.5.1.52 : peptide-N4-(N-acétyl-β-glucosaminyl)asparagine-amidase
- EC 3.5.1.53 : N-carbamoylputrescine-amidase
- EC 3.5.1.54 : allophanate-hydrolase
- EC 3.5.1.55 : acide gras à longue chaîne-glutamate-déacylase
- EC 3.5.1.56 : N,N-diméthylformamidase
- EC 3.5.1.57 : tryptophanamidase
- EC 3.5.1.58 : N-benzyloxycarbonylglycine-hydrolase
- EC 3.5.1.59 : N-carbamoylsarcosine-amidase
- EC 3.5.1.60 : N-acyléthanolamine à longue chaîne-déacylase
- EC 3.5.1.61 : mimosinase
- EC 3.5.1.62 : acétylputrescine-déacétylase
- EC 3.5.1.63 : 4-acétamidobutyrate-déacétylase
- EC 3.5.1.64 : Nα-benzyloxycarbonylleucine-hydrolase
- EC 3.5.1.65 : théanine-hydrolase
- EC 3.5.1.66 : 2-(hydroxyméthyl)-3-(acétamidométhylène)succinate-hydrolase
- EC 3.5.1.67 : 4-méthylèneglutaminase
- EC 3.5.1.68 : N-formylglutamate-déformylase
- EC 3.5.1.69 : glycosphingolipide-déacylase
- EC 3.5.1.70 : aculéacine A-déacylase
- EC 3.5.1.71 : N-féruloylglycine-déacylase
- EC 3.5.1.72 : D-benzoylarginine-4-nitroanilide-amidase
- EC 3.5.1.73 : carnitinamidase
- EC 3.5.1.74 : chénodésoxycholoyltaurine-hydrolase
- EC 3.5.1.75 : uréthanase
- EC 3.5.1.76 : arylalkyl-acylamidase
- EC 3.5.1.77 : N-carbamoyl-D-aminoacide-hydrolase
- EC 3.5.1.78 : glutathionylspermidine-amidase
- EC 3.5.1.79 : phthalyl-amidase
- EC 3.5.1.80 : supprimée (transférée vers EC 3.5.1.25)
- EC 3.5.1.81 : N-acyl-D-aminoacide-déacylase
- EC 3.5.1.82 : N-acyl-D-glutamate-déacylase
- EC 3.5.1.83 : N-acyl-D-aspartate-déacylase
- EC 3.5.1.84 : biuret-amidohydrolase
- EC 3.5.1.85 : (S)-N-acétyl-1-phényléthylamine-hydrolase
- EC 3.5.1.86 : mandélamide-amidase
- EC 3.5.1.87 : N-carbamoyl-L-aminoacide-hydrolase
- EC 3.5.1.88 : peptide-déformylase
- EC 3.5.1.89 : N-acétylglucosaminylphosphatidylinositol-déacétylase
- EC 3.5.1.90 : adénosylcobinamide-hydrolase
- EC 3.5.1.91 : formamide N-substituée-déformylase
- EC 3.5.1.92 : pantéthéine-hydrolase
- EC 3.5.1.93 : acide glutaryl-7-aminocéphalosporanique-acylase
- EC 3.5.1.94 : γ-glutamyl-γ-aminobutyrate-hydrolase
- EC 3.5.1.95 : N-malonylurée-hydrolase
- EC 3.5.1.96 : succinylglutamate-désuccinylase
- EC 3.5.1.97 : acyl-homosérine-lactone-acylase
- EC 3.5.1.98 : histone-déacétylase
- EC 3.5.1.99 : amide d'acide gras-hydrolase
- EC 3.5.1.100 : (R)-amidase
- EC 3.5.1.101 : L-prolinamide-hydrolase
EC 3.5.2 : Enzymes spécifiques des amides cycliques (liaison C-N cyclique)
[modifier | modifier le code]Liste des enzymes du groupe EC3.5.2
- EC 3.5.2.1 : barbiturase
- EC 3.5.2.2 : dihydropyrimidinase
- EC 3.5.2.3 : dihydroorotase
- EC 3.5.2.4 : carboxyméthylhydantoïnase
- EC 3.5.2.5 : allantoïnase
- EC 3.5.2.6 : β-lactamase
- EC 3.5.2.7 : imidazolonepropionase
- EC 3.5.2.8 : supprimée (incluse dans EC 3.5.2.6)
- EC 3.5.2.9 : 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysante)
- EC 3.5.2.10 : créatininase
- EC 3.5.2.11 : L-lysine-lactamase
- EC 3.5.2.12 : 6-aminohexanoate-dimère cyclique-hydrolase
- EC 3.5.2.13 : 2,5-dioxopipérazine-hydrolase
- EC 3.5.2.14 : N-méthylhydantoïnase (ATP-hydrolysante)
- EC 3.5.2.15 : acide cyanurique-amidohydrolase
- EC 3.5.2.16 : maléimide-hydrolase
- EC 3.5.2.17 : hydroxyisourate-hydrolase
- EC 3.5.2.18 : énamidase
EC 3.5.3 : Déiminases (enzymes spécifiques des amidines linéaires) (liaison C=N linéaire)
[modifier | modifier le code]Liste des enzymes du groupe EC3.5.3
- EC 3.5.3.1 : arginase
- EC 3.5.3.2 : guanidinoacétase
- EC 3.5.3.3 : créatinase
- EC 3.5.3.4 : allantoïcase
- EC 3.5.3.5 : formiminoaspartate-déiminase
- EC 3.5.3.6 : arginine-déiminase
- EC 3.5.3.7 : guanidinobutyrase
- EC 3.5.3.8 : formimidoylglutamase
- EC 3.5.3.9 : allantoate-déiminase
- EC 3.5.3.10 : D-arginase
- EC 3.5.3.11 : agmatinase
- EC 3.5.3.12 : agmatine-déiminase
- EC 3.5.3.13 : formiminoglutamate-déiminase
- EC 3.5.3.14 : amidinoaspartase
- EC 3.5.3.15 : protéine-arginine-déiminase
- EC 3.5.3.16 : méthylguanidinase
- EC 3.5.3.17 : guanidinopropionase
- EC 3.5.3.18 : diméthylargininase
- EC 3.5.3.19 : uréidoglycolate-hydrolase
- EC 3.5.3.20 : diguanidinobutanase
- EC 3.5.3.21 : méthylènediurée-désaminase
- EC 3.5.3.22 : proclavaminate-amidinohydrolase
- EC 3.5.3.23 : N-succinylarginine-dihydrolase
EC 3.5.4 : Enzymes spécifiques des amidines cycliques (liaison C=N cyclique)
[modifier | modifier le code]Liste des enzymes du groupe EC3.5.4
- EC 3.5.4.1 : cytosine-désaminase
- EC 3.5.4.2 : adénine-désaminase
- EC 3.5.4.3 : guanine-désaminase
- EC 3.5.4.4 : adénosine désaminase
- EC 3.5.4.5 : cytidine-désaminase
- EC 3.5.4.6 : AMP-désaminase
- EC 3.5.4.7 : ADP-désaminase
- EC 3.5.4.8 : aminoimidazolase
- EC 3.5.4.9 : méthényltétrahydrofolate-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.10 : IMP-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.11 : ptérine-désaminase
- EC 3.5.4.12 : dCMP-désaminase
- EC 3.5.4.13 : dCTP-désaminase
- EC 3.5.4.14 : désoxycytidine-désaminase
- EC 3.5.4.15 : guanosine-désaminase
- EC 3.5.4.16 : GTP-cyclohydrolase I
- EC 3.5.4.17 : adénosine-phosphate-désaminase
- EC 3.5.4.18 : ATP-désaminase
- EC 3.5.4.19 : phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.20 : pyrithiamine-désaminase
- EC 3.5.4.21 : créatinine-désaminase
- EC 3.5.4.22 : 1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate-désaminase
- EC 3.5.4.23 : blasticidine S-désaminase
- EC 3.5.4.24 : sépiaptérine-désaminase
- EC 3.5.4.25 : GTP-cyclohydrolase II
- EC 3.5.4.26 : diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine-désaminase
- EC 3.5.4.27 : méthényltétrahydrométhanoptérine-cyclohydrolase
- EC 3.5.4.28 : S-adénosylhomocystéine-désaminase
- EC 3.5.4.29 : GTP-cyclohydrolase IIa
- EC 3.5.4.30 : dCTP-désaminase (formatrice de dUMP)
EC 3.5.5 : Nitrilases (enzymes spécifiques des nitriles) (liaison C≡N)
[modifier | modifier le code]Liste des enzymes du groupe EC3.5.5
- EC 3.5.5.1 : nitrilase
- EC 3.5.5.2 : ricinine-nitrilase
- EC 3.5.5.3 : transférée vers EC 4.3.99.1
- EC 3.5.5.4 : cyanoalanine-nitrilase
- EC 3.5.5.5 : arylacétonitrilase
- EC 3.5.5.6 : bromoxynil-nitrilase
- EC 3.5.5.7 : nitrilase aliphatique
- EC 3.5.5.8 : thiocyanate-hydrolase
EC 3.5.99 : Autres enzymes
[modifier | modifier le code]Liste des enzymes du groupe EC3.5.99
- EC 3.5.99.1 : riboflavinase
- EC 3.5.99.2 : thiaminase
- EC 3.5.99.3 : hydroxydéchloroatrazine-éthylaminohydrolase
- EC 3.5.99.4 : N-isopropylammélide-isopropylaminohydrolase
- EC 3.5.99.5 : 2-aminomuconate-désaminase
- EC 3.5.99.6 : glucosamine-6-phosphate-désaminase
- EC 3.5.99.7 : 1-aminocyclopropane-1-carboxylate-désaminase
Références
[modifier | modifier le code]- Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology