PREGUNTAS MACROMOLÉCULAS. 4/05/2021.

1. Indica cuál de los siguientes enlaces forman un plano (no pueden rotar) en una
cadena polipeptídica:
a) Enlaces Calfa-C
b) Enlaces C-N
c) Enlaces N-Calfa
d) Enlaces Calfa-Calfa

2. El nivel estructural proteico que describe todos los aspectos del plegamiento
tridimensional de un polipéptido se refiere a la:
a) Estructura cuaternaria
b) Estructura secundaria
c) Estructura primaria
d) Estructura terciaria

3. Las proteínas EF-1 alfa de eucariotas y EF-Tu de bacterias tienen secuencia y función
similar. ¿Qué puedes concluir acerca de la relación entre EF-1 alfa y EF-Tu?
a) Que son las proteínas heterólogas.
b) Que son proteínas ortólogas.
c) Que tienen diferentes orígenes ancestrales.
d) Que son proteínas parálogas.

4. Una proteína está en su conformación nativa cuando:

a) Presenta la mayor superficie solvatada.
b) Tiene la mayor energía de Gibbs.
c) Esta en alguno de sus estados plegados funcionales.
d) Esta desplegada.

5. Las proteínas fibrosas difieren de las proteínas globulares en que:

a) Las proteínas fibrosas tienen generalmente funciones estructurales, mientras que las
proteínas globulares son frecuentemente enzimas.
b) Las proteínas fibrosas pueden contener a menudo varios tipos de estructura
secundaria, mientras que las proteínas globulares usualmente están compuestas por
un solo tipo de estructura secundaria.
c) Las proteínas globulares son insolubles en agua, mientras que las proteínas fibrosas
son usualmente solubles.
d) Las proteínas globulares suelen tener una estructura cuaternaria más elaborada en
comparación con las proteínas fibrosas.

6. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a la diferencia entre las

proteínas con simetría rotacional y las proteínas con simetría helicoidal?
a) Las proteínas de las cápsides virales solo pueden tener simetría helicoidal.
b) Las proteínas icosaédricas tienen simetría helicoidal en ligar de simetría rotacional
c) Las proteínas con simetría rotacional tienden a formar una estructura cerrada,
mientras que las proteínas con simetría helicoidal tienden a formar una estructura
abierta.
d) Las proteínas con simetría rotacional suelen ser más grandes en comparación con las
que tienen simetría helicoidal.

7. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a los dominios de las

proteínas?
a) Los dominios proteicos pierden su estructura tridimensional cuando son separados del
resto de la cadena polipeptídica.
b) Los dominios proteicos pierden su función cuando son separados del resto de la
cadena polipeptídica
c) Los dominios proteicos a menudo se pliegan formando unidades globulares estables.
d) Unas proteína tiene que tener más de un dominio para ser funcional.

8. ¿Cuál es la fuerza principal responsable de la estabilización de la estructura terciaria

de las proteínas globulares?
a) El efecto hidrofóbico.
b) Las interacciones de Van der Waals.
c) Los puentes de hidrogeno.
d) Las interacciones iónicas.

9. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a la escisión de los

polímeros de reserva de glucosa?
a) La mayoría de los animales no pueden usar el almidón como fuente de energía porque
carecen de las enzimas necesarias para hidrolizarlo.
b) El almidón y el glucógeno son escindidos empezando por las ramas externas.
c) Cuando el almidón y el glucógeno son escindidos para la producción de energía, los
residuos de glucosa son liberados a partir del extremo reductor.
d) Los residuos de glucosa del almidón y el glucógeno son liberados mediante una
reacción de condensación espontanea.

10. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta acerca de los proteoglicanos?

a) Son de pequeño tamaño.
b) Están presentes en la matriz extracelular.
c) Forman las paredes celulares de las bacterias.
d) Son glicolípidos.

11. Las lectinas son:

a) Carbohidratos que pueden enlazar proteínas.
b) Proteínas unidas a carbohidratos.
c) Proteínas que pueden enlazar carbohidratos
d) Los motivos oligosacaridicos de las glicoproteínas

12. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a los enlaces en el ADN?
a) Enlaces fosfomonoester unen sucesivos nucleótidos en los ácidos nucleicos.
b) Encales fosfoanhidricos unen sucesivos nucleótidos en los ácidos nucleicos
c) El ARN y el ADN de simple cadena no forman enlaces de hidrogeno
d) Los enlaces de hidrogeno se pueden forman en el ADN tríplex.

13. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a las diferencias entre las
estructuras de las formas B, A y Z del ADN?
a) La forma A es la estructura más favorecida cuando aumenta la humedad relativa.
b) La forma Z es una doble hélice enrollada la izquierda
c) En comparación con la forma B, la forma Z es más ancha.
d) En comparación con la forma B, la forma A tiene un paso de rosca mayor.
14. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es incorrecta acerca de los ADNs de dos especies
estrechamente relacionadas?
a) Es más probable que tengan curvas de desnaturalización similares en comparación con
los ADN de dos especies no relacionadas
b) Es más probable que formen dúplex híbridos en comparación con los ADN de dos
especies no relacionadas.
c) Es más probable que tenga una composición de bases similares en comparación con
los ADN de dos especies no relacionadas.
d) Es más probable que tengan proporciones similares de purina respecto a pirimidina en
comparación con los ADN de dos especies no relacionadas.

15. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto al ADN superenrollado?

a) El ADN superenrollado está en su estado relajado.
b) Solo las moléculas de ADN circulares cerradas pueden superenrollarse
c) Las moléculas de ADN circulares superenrolladas, cuando se purifican y se liberan de
las proteínas celulares, pierden su superenrollamiento.
d) El ADN se superenrrolla cuando el eje de la doble hélice del ADN se enrolla sobre sí
mismo.

16. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a todas las

topoisomerasas?
a) Las topoisomerasas relajan el ADN.
b) Las topoisomerasas subenrollan el ADN.
c) Las topoisomerasas cambian el número de torsión (Tw).
d) Las topoisomerasas catalizan la ruptura y sellada de enlaces fosfodiéster.

17. La separación de las cadenas en un fragmento de una molécula de ADN bicatenaria

circular cerrada relajada provocara:
a) Un aumento del número de torsión.
b) Una disminución del número de enlace (Lk) de la molécula de ADN
c) Que la molécula adopte supervueltas negativas
d) Que el resto de la molécula desenrolle espontáneamente sus dos cadenas
18. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta respecto a la DNA girasa?
a) Puede subenrollar el ADN.
b) Se encuentra tanto en procariotas como eucariotas.
c) Es una topoisomerasa de tipo I.
d) Introduce superenrollamiento positivo.

19. Si se aíslan moléculas de ADN circulares unidas a histonas, y se eliminan dichas

proteínas, ¿que pasara con la moléculas de ADN?
a) Adoptará una topología relajada.
b) Permanecerá con superenrollamiento negativo.
c) Adquirirá superenrollamiento selenoidal.
d) Disminuirá su superenrollamiento

20. Luego de eliminar todas las unidades sacarídicas de un gangliósido, ¿Qué molécula
queda?
a) Esfingosina
b) Ceramida
c) Glicerol
d) Fosfato

21. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta de los glicerofosfolípidos?

a) Tienen una cabeza hidrofóbica
b) Tienen un grupo cabeza unido por enlace fosfodiéster.
c) Son usados como fuente de energía
d) Derivan a partir de los glicolípidos

22. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta acerca de la función de los

eicosanoides?
a) Sirven como pigmentos.
b) Son hormonas.
c) Son moléculas de señalización.
d) Son lípidos de membrana.
 Test 1
1. Indica si las afirmaciones son verdaderas o falsas:
a. En las láminas beta-paralelas y antiparalelas, la distancia axial entre aminoácidos
adyacentes es la misma. Falso
b. Las proteínas monoméricas son aquellas que tienen un solo dominio en su
estructura cuaternaria. Falso
c. Los puentes disulfuro pueden estabilizar la estructura cuaternaria de las proteínas.
Verdadero
d. La cadena lateral de una fenilalanina en una proteína puede formar puentes de
hidrógeno dependiendo de si se encuentra en la superficie de la proteína o
enterrada en el núcleo hidrofóbico de la estructura proteica. Verdadero
e. De acuerdo al diagrama de Ramachandran, los valores de Ψ y φ para la hélice alfa
con giro a la derecha son siempre negativos, mientras que en las láminas beta son
positivos. Falso
f. Los aminoácidos prolina e hidroxiprolina son abundantes en el colágeno.
Verdadero
g. Un polipéptido no podría formar estructuras terciarias globular si tiene pocos
aminoácidos con cadenas laterales polares, necesarios para la formación de un
núcleo hidrófobo. Verdadero
h. En el colágeno ayudan los entrecruzamientos a través de cadenas laterales de
lisina. Verdadero
i. Las chaperonas moleculares ayudan a la proteína a evitar su plegamiento
incorrecto en el entorno celular. Verdadero
j. En el RNA, al igual que en el DNA, prevalece la configuración C2’-endo de la
pentosa con respecto a la C3’-endo. Falso
k. El núcleo de histonas del nucleosoma está formado por H3, H4, H2A y H2B: de
forma ordenada. Verdadero
l. La heterocromatina puede pasar al estado menos condensado de la cromatina en
función del tejido y del estado de desarrollo. Verdadero
m. Los agentes intercalantes alteran la topología del DNA, variando su movilidad
electroforética. Verdadero
n. Las topoisomerasas son enzimas que generan superenrollamiento en el DNA. Falso
o. A pesar de la presencia del hidroxilo del carbono 2’ que altera la conformación del
anillo de ribosa, en ocasiones el RNA bicatenario forma dobles hélices de tipo A
análogas al DNA-A. Verdadero
p. Los ácidos teicoicos se encuentran presentes en las paredes celulares de las
bacterias Gram negativas. Falso
q. Las glicoproteínas poseen un núcleo proteico unido a glucosaminoglicanos. Falso
r. Las proteínas de membrana no pueden pasar de una capa a otra de la bicapa, es
decir, no pueden hacer flip-flop. Verdadero
s. Las IDL y las LDL son lipoproteínas formadas por la degradación de las HDL. Falso
t. Los quilomicrones poseen un mayor contenido de triacilglicéridos en comparación
con lipoproteínas de alta densidad. Verdadero
 2. Explica la frase: “Las proteínas fibrosas suelen tener largas hélices o extensas hojas
plegadas”.

Las proteínas fibrosas son elásticas y actúan como soporte mecánico y estructural de las células
en el organismo. Están fromadas por una unidad repetitiva simple que se ensambla para formar
fibras, por ello suelen estar formadas por largas hélices o extensas hojas plegadas.

3. ¿Por qué las proteínas se pliegan más rápido ‘in vivo’ que ‘in vitro’?

Esto se debe a que ‘in vivo’ hay una serie de enzima denominadas chaperonas moleculares que
facilitan el plegamiento de las proteínas y ayudan a corregir el plegamiento de las proteínas mal
plegadas. Mientras que las proteínas ‘ in vitro’ carecen de esta actividad (a no ser que se incluyan
chaperonas).

4. Comente cómo las proteínas interactúan específicamente con el DNA, es decir, cómo
distinguen entre diferentes pares de bases.

5. Exponga los distintos métodos por los cuales se consigue la asimetría transversal de
las proteínas.
 Test 2
1. Indique si las siguientes cuestiones son verdaderas o falsas:
a. La presencia de residuos con carga positiva cerca del extremo N-terminal de una
hélice alfa estabiliza este tipo de estructura. Falso
b. Las interacciones no covalentes son las principales responsables de la estabilización
de la estructura cuaternaria de las proteínas. Verdadero
c. Si se elimina la urea y se reduce lentamente, la RNAasa al desnaturalizarse,
renaturaliza y recupera la actividad enzimática. Verdadero
d. Las fuerzas entrópicas desfavorecen el plegamiento de las proteínas. Verdadero
e. Los agentes caotrópicos al interactuar débilmente con el agua, estabilizan el
entramado de los puentes de hidrógeno del agua, disminuyendo el número de
moléculas de agua libres que compiten con los puentes de hidrógeno dentro de la
proteína. Falso
f. La mayoría de las proteínas que presentan puentes disulfuro son intracelulares.
Falso
g. La amilopectina y el glucógeno son homopolisacáridos ramificados formados por la
unión de glucosas que constituyen material de reserva energética en vegetales y
animales respectivamente. Verdadero
h. Los proteoglicanos están compuestos por un núcleo proteico al que se le encuentran
unidos de forma covalente los glucosaminoglicanos. Verdadero
i. La triple hélice DNA mantiene una conformación general del tipo B, con las pentosas
en conformación C2’-endo. Verdadero
j. El DNA-Z es la conformación nativa que adoptan las fibras de DNA en condiciones
de elevada humedad relativa. Falso
k. Una densidad superhelicoidal facilita la apertura de la doble hélice del DNA.
l. La estructura secundaria del tRNA presenta 4 o 5 brazos en función de la longitud
del tRNA. Verdadero
m. La estructura terciaria del tRNA se forma mediante puentes de hidrógeno
intracatenarios entre bases distantes en la secuencia de nucleótidos. Verdadero
n. En el nucleosoma el DNA presenta superenrollamiento selenoide dextrógiro
alrededor del núcleo de histonas. Falso
o. Las proteínas periféricas de la membrana se unen a esta mediante interacciones
electrostáticas y/o puentes de hidrógeno que establecen con otros protolípidos.
Verdadero
p. El colesterol se encuentra en mayor proporción en la membrana plasmática con
respecto a las membranas subcelulares. Verdadero
q. Mientras que las flipasas y las flopasas son dependientes de ATP, las escramblasas
no lo son porque catalizan la translocación de los fosfolípidos de membrana a favor
de gradiente de concentración. Verdadero
r. Los quilomicrones son las lipoproteínas de mayor densidad, por su alto contenido
de proteínas. Verdadero
s. El colágeno tiene superenrollamiento levógiro. Falso
 2. Dada la siguiente rueda helicoidal que corresponde a un
fragmento de una hélice alfa de una proteína soluble, diga:
a. Secuencia primaria de este fragmento que comienza en el R1.

Val-Ala-Arg-Glu-Ile-Ala-Asp-Arg-Phe-Asn-Lys-Ile-Gly-Gln-Glu-Phe-Ala-Gly

b. Número de vueltas de este fragmento.

18 𝑎𝑚𝑖𝑛𝑜á𝑐𝑖𝑑𝑜𝑠
= 5 𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎𝑠
3,6 𝑎𝑚𝑖𝑛𝑜á𝑐𝑖𝑑𝑜𝑠 𝑝𝑜𝑟 𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎
c. Región (marque los residuos) que quedaría hacia el interior de un haz de 4 hélices.

La parte polar queda expuesta al exterior interaccionando con el agua y la apolar al interior,
formando un núcleo hidrofóbico.

d. Tipo de interacciones intracatenarias que estabilizan la región del apartado

anterior.

Van der Waals, puentes de hidrógeno.

e. Tipo de hélice alfa.

Es una hélice alfa anfipática al tener un lado polar y otro apolar.

3. Características de los glucosaminoglicanos.

Los GAG son heteropolisacáridos lineales muy abundantes en animales y bacterias. Presentan
una alta densidad de carga negativa debido a la presencia de grupos sulfato y carbonilato. De
modo que pueden ser reconocibles de manera específica por una proteína mediante
interacciones electrostáticas. Generalmente están formados por: aminoazúcares y ácido
urónico.

4. Comente las interacciones que estabilizan la doble hélice del DNA. Explique cuáles de
estas afecta a:

Las interacciones que estabilizan el DNA son:

- Los puentes de H entre las bases enfrentadas de las dos cadenas polinucleotídicas.
Aunque individualmente son débiles, hay un número extremadamente grande a lo largo
de la cadena, teniendo un papel importante en la estabilización de la doble hélice.
- Las interacciones de Van der Waals entre las bases adyacentes de la misma cadena
polinucleotídica (apilamiento de bases). Son fuerzas muy potentes y las que mejor
estabilizan la estructura.
- Las interacciones electrostáticas de los grupos fosfatos con el agua. Estabilizan el DNA
en el entorno que se encuentra.

La estabilidad de la doble hélice depende de factores tanto internos como externos:

- Grado de polaridad del solvente: así, la doble hélice es más estable cuánto más polar
sea el medio porque un medio polar favorece las interacciones de Van der Waals entre
los anillos hidrofóbicos de las bases adyacentes de la misma cadena, es decir, el
apilamiento entre las bases (por el efecto hidrofóbico), y favorece además las
interacciones electrostáticas de los grupos fosfatos con el medio.
 - Tipo y concentración de iones: la estabilidad también aumenta mientras mayor sea la
concentración de cationes en el medio, fundamentalmente divalentes como el Mg2+,
pero también monovalentes como el Na+ , porque la repulsión entre las cargas negativas
de los grupos fosfato cercanos, una fuerza potencialmente desestabilizadora, se
minimiza.
- El pH: por otro lado, a pH neutro, o ligeramente ácido, la doble hélice es más estable
porque a pH extremo se afectan los puentes de H, por la formación de lactimas, a pH
ácido, o la desprotonación de las bases a pH básico.
- La temperatura: además, al aumentar la T disminuye la estabilidad porque se rompen
los puentes de hidrógenos entre las bases.
- El porcentaje de pares G-C frente a A-T: por último, cuanto mayor sea la proporción de
G + C, mayor será la estabilidad porque la unión de G con C se realiza a través de tres
puentes de hidrógeno, mientras que la unión A‐T sólo tiene dos.

a. Descenso de la concentración de cationes en el medio.

Si desciende la concentración de cationes, la repulsión de cargas negativas por los grupos fosfato
cercanos que contrarestaban los cationes se pierde, haciendo que el DNA se desestabilice.

b. Aumento de la temperatura.

Se rompen los puentes de H entre las bases, disminuyendo la estabilidad y pudiendo

desnaturalizar el DNA.

c. Exposición a la luz UV.

Se produce daño en el DNA que puede ocasionar mutaciones.

d. Descenso de la polaridad del medio.

la doble hélice es más estable cuánto más polar sea el medio porque un medio polar favorece
las interacciones de Van der Waals entre los anillos hidrofóbicos de las bases adyacentes de la
misma cadena. Así que, un descenso de la polaridad desestabiliza el DNA.

5. Un DNA de doble cadena de 3003 pb se encuentra en una solución en la que no hay

absolutamente ninguna proteína contaminante. Este DNA presenta en promedio un
giro entre pares de bases adyacentes de 34,29º y la densidad superhelicoidal de -0.059.
Se añaden núcleos de histonas y se encuentra experimentalmente lo siguiente: A
✓ A cada molécula de DNA en la solución se unen exactamente 15 núcleos de
histonas.
✓ 15 segmentos de DNA de 145 pb realizan cada uno exactamente 2
supervueltas negativas alrededor de cada núcleo de histonas.
Considerando 10,5 pb por vuelta en ambos casos. Calcular:
a. Los valores iniciales del número de enlace (L), número de retorcimiento (W) y del
número de torsión (T) globales para este DNA.
1 𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎
3003 𝑝𝑏 · = 286 = 𝐿0
10,5 𝑝𝑏
𝑊=0
𝑇 = 286
 𝐿 − 𝐿0 𝐿 − 286
σ = −0,059 = = → 𝐿 = 269,126
𝐿0 286
𝐿 = 𝑇 + 𝑊 → 269,126 = 286 + 𝑊 → 𝑊 = −16,89

b. Los valores finales globales de estos parámetros, luego de unirse a los núcleos de
histonas. Tanto del DNA histónico como del no histónico, que tiene un
superenrollamiento no restringido.

2 𝑠𝑢𝑝𝑒𝑟𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎𝑠 𝑛𝑒𝑔𝑎𝑡𝑖𝑣𝑎𝑠 (𝑖𝑧𝑞𝑢𝑖𝑒𝑟𝑑𝑎) · 15 ℎ𝑖𝑠𝑡𝑜𝑛𝑎𝑠 = 30

En el caso del DNA unido a histonas (toroidal) las vueltas a la izquierda serán de valor
negativo:
𝑊 = −16,89 − 30 = −46,89
En el caso del DNA no histónico (plectonémico) las vueltas a la izquierda serán de valor
positivo:
𝑊 = −16,89 + 30 = 13,11
 Test 3
1. Indica si las siguientes afirmaciones son verdaderas o falsas:
a. Las IDL y las LDL son lipoproteínas formadas por la degradación de las HDL. Falso
b. Los quilomicrones poseen un mayor contenido de triacilglicéridos en comparación
con lipoproteínas de alta densidad. Verdadero
c. A pesar de la presencia del hidroxilo del carbono 2’ que altera la conformación del
anillo de ribosa, en ocasiones en RNA bicatenario forma dobles hélices de tipo A
análogas al DNA-A. Verdadero
d. La presencia de residuos con carga negativa cerca del extremo C-terminal de una
hélice alfa estabiliza este tipo de estructura. Falso
e. Las interacciones no covalentes son las principales responsables de la estabilización
de la estructura cuaternaria de las proteínas. Verdadero
f. Los agentes caotrópicos, al interaccionar débilmente con el agua, rompen el
entramado de los puentes de hidrógeno del agua, disminuyendo el número de
moléculas de agua libres que compiten con los puentes de hidrógeno dentro de la
proteína. Falso
g. La amilopectina y el glucógeno son homopolisacáridos ramificados formados por la
unión de glucosas que constituyen material de reserva energética en vegetales y
animales, respectivamente. Falso
h. Los proteoglicanos están compuestos por un núcleo proteico al que se le encuentran
unidos de forma no covalente los glucosaminoglicanos. Falso (todos menos el ácido
hialurónico).
i. La estructura terciaria del tRNA se forma mediante puentes de hidrógeno
intracatenarios entre bases distantes en la secuencia de nucleótidos. Verdadero
j. En el nucleosoma el DNA presenta superenrollamiento selenoide dextrógiro
alrededor del núcleo de histonas. Falso
k. Las proteínas periféricas de la membrana se unen a esta mediante interacciones
electrostáticas y/o de puentes de hidrógeno que establecen con otros protolípidos.
Verdadero
l. El colesterol se encuentra en mayor proporción en la membrana plasmática con
respecto a las membranas subcelulares. Verdadero
m. Mientras que las flipasas y las flopasas son dependientes de ATP, las escramblasas
no lo son porque catalizan la translocación de los fosfolípidos de membrana a favor
de gradiente de concentración. Verdadero
n. Las hélices alfa y las láminas beta pueden ser anfipáticas. Verdadero
o. Un monómero es una unidad semi-independiente de la estructura proteica en
términos de plegamiento y función. Verdadero
p. Los giros se suelen encontrar en el interior de las proteínas. Falso
q. La cooperatividad de la transición desde el estado nativo al desnaturalizado es causa
del gran número de interacciones débiles que estabilizan el estado nativo.
Verdadero
r. La hélice pi tiene un número de aminoácidos por vuelta intermedio entre la alfa y la
3. Falso
2. Completa las siguientes cuestiones:
a. Los rafts (balsas lipídicas) son microdominios de la membrana plasmática que
tienen distintas propiedades físicas y que están compuestos por proteínas
importantes para las vías de señalización de la célula.
b. El GAG que no contiene grupos sulfato es el ácido hialurónico.
c. Los ácidos teicoicos y lipoteicoicos son polímeros de ribitol fosfato y glicerol fosfato
unidos por enlaces fosfodiéster.
d. Las cadenas laterales de la hélice alfa se exponen hacia el exterior en un ángulo de
100º.
e. El ángulo del enlace peptídico se simboliza con la letra griega omega y tiene un
ángulo de 180º.
f. Ácido graso poliinsaturado a partir del cual se forman los eicosanoides: ácido
araquidónico.
g. Ácido graso cuya nomenclatura es 18:3 (9, 12, 15): ácido α‐ linolénico.
h. Los fosfolípidos más abundantes en las biomembranas son: fosfatidilcolina (PC) y la
fosfatidiletanolamina (PE).
i. Los lípidos más comunes en las biomembranas son: fosfolípidos.
j. Las proteínas O-glicosiladas se unen a la proteína a través de un residuo de Ser/Thr.
Los aminoácidos que suelen estar presentes en la secuencia son Ala y Thr.
k. Según los monosacáridos que se unan a la proteína, las N-glicoproteínas pueden ser
ricas en manosa, complejas e híbridas.
l. Los giros suelen ser ricos en residuos de prolina y glicina.
m. La fibroína de la seda es rica en alanina y glicina.
n. Las queratinas forman superhélices son superenrollamiento levógiro.
o. Los motivos de dedos de zinc para el RNA de cadena simple son CCCH y CCHC y para
el RNA de doble cadena son CCHH.
p. Las fases del plegamiento de proteínas en orden cronológico son logarítmica,
intermedia y lenta.
q. El agar es un heteropolímero estructural formado por agarosa y agaropectina.
r. El polisacárido estructural formado por N-acetilglucosamina unidas por enlaces beta
(1-4) es la quitina.
s. El ácido graso que se une a una cisteína interna de la proteína en la cara interna de
la membrana es ácido palmítico.
t. La apolipoproteína que permite el reconocimiento de la forma remanente de los
quilomicrones por el hígado es la ApoE.
u. El glucosaminoglucano que no contiene ácido urónico es el keranato sulfato.
v. En las láminas beta los puentes de hidrógeno quedan perpendiculares con respceto
al eje de la cadena y en la hélice alfa son paralelos.
w. Los tres tipos de simetría rotatoria de las proteínas son cíclicas, diédricas e
icosaédricas.
x. Las secuencias camaleónicas son aquellas que pueden tener diferente estructura
secundaria según las condiciones.
y. Los dextranos constituyen homopolisacáridos de reserva en levaduras y bacterias.
z. La estructura terciaria del tRNA tiene forma de L. En los extremos de la L están
presentes los brazos aceptor y anticodón, y en las esquinas los brazos D, T-psi-C.
 3. Explica por qué las N-glucosilaciones sirven como marca del registro de tiempo de las
proteínas en la sangre.

La N‐glicosilación actúa como marca de registro del tiempo de circulación de las proteínas en la
sangre. La sucesiva eliminación de los residuos monosacarídicos de las N‐glicoproteínas que
circulan en la sangre, sirve como señal para la degradación de estas por el organismo.

El hígado contiene receptores específicos que reconocen y se unen a las glicoproteínas que están
listas para ser degradadas y recicladas. Las N‐glicoproteínas del suero que han sido recién
sintetizadas tienen una estructura en la cual residuos de ácido siálico (uno por cadena) protegen
los extremos no reductores de las cadenas oligosacarídicas, y bloquean el reconocimiento de los
residuos interiores que, por lo general, son galactosas. En la medida que estas glicoproteínas
circulan por la sangre, enzimas de las paredes de los vasos sanguíneos eliminan estos residuos
de ácido siálico, exponiendo los residuos de galactosa. En el hígado, el receptor de
asialoglicoproteína se une a los residuos de galactosa expuestos de las glicoproteínas con una
alta afinidad. El complejo del receptor y la glicoproteína es endocitado por el hepatocito, donde
la glicoproteína es degradada en los lisosomas. La unión de mayor afinidad de la glicoproteína
al receptor de asialoglicoproteína, requiere todos los residuos de galactosa libre. Las
glicoproteínas con uno o dos residuos de galactosa expuestos son unidas con menor afinidad.
Este mecanismo sirve para que el organismo pueda mantener un registro del tiempo de
circulación de las proteínas en la sangre. Al cabo de un tiempo, que puede variar desde horas a
semanas en función de la proteína (con diferente número de glicosilaciones), todos los residuos
de ácido siálico serán eliminados uno por uno y la proteína se degradará completamente en el
hígado.

4. Compara el colágeno y la fibroína de la seda en términos de:

a. Estructura secundaria: el colágeno se forma por alfa-hélices levógiras y la fibroína
de seda por hojas beta antiparalelas.
b. Aminoácidos por vuelta: la fibroína de la seda al estar compuesta por hojas beta no
presenta vueltas, mientras que el colágeno presenta 3 aminoácidos por vuelta.
c. Signo de n en el diagrama de Ramachandran: el colágeno presenta unos ángulos
positivos en el caso de las hélices levógiras, aunque cuando forma el tropocolágeno
presenta el ángulo phi negativo. La fibroína de la seda presenta ángulo psi positivo
y phi negativo.
d. Soluble en medio acuoso: ninguna de estas estructuras es soluble en agua.
e. Interacciones que estabilizan la estructura cuaternaria: el colágeno forma
tropocolágeno, que se estabiliza por puentes de hidrógeno. Y en la fibroína de la
seda todos los H de las Gly están a un lado de cada fragmento de la hoja plegada
formando puentes de H, mientras que los CH3 de las Ala están del otro lado del
fragmento, y se asocian mediante interacciones de Van der Waals a las Ala de otra
hoja plegada antiparalela.

5. Un DNA de doble cadena de 3003 pares de bases se encuentra en una solución en la

que su densidad superhelicoidal es de -0,05944 y presenta 10,5 pb por vuelta. Se
añaden 5 núcleos de histonas y se encuentra que el DNA realiza exactamente dos
supervueltas negativas alrededor de cada núcleo de histonas, no viéndose alterado el
número de pases por vuelta. Con estos datos calcula:
 a. El número de supervueltas que tiene el DNA en el momento inicial.
1 𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎
3003 𝑝𝑏 · = 286 = 𝐿0
10,5 𝑝𝑏
𝑊=0
𝑇 = 286
𝐿 − 𝐿0 𝐿 − 286
σ = −0,05944 = = → 𝐿 = 269
𝐿0 286
𝐿 = 𝑇 + 𝑊 → 269 = 286 + 𝑊 → 𝑊 = −17

b. El número de supervueltas después de unirse a las histonas del DNA que tiene
superenrollamiento no restringido (del DNA que no está unido a histonas).

2 𝑠𝑢𝑝𝑒𝑟𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎𝑠 𝑛𝑒𝑔𝑎𝑡𝑖𝑣𝑎𝑠 (𝑖𝑧𝑞𝑢𝑖𝑒𝑟𝑑𝑎) · 5 ℎ𝑖𝑠𝑡𝑜𝑛𝑎𝑠 = 10

En el caso del DNA no histónico (plectonémico) las vueltas a la izquierda serán de valor
positivo:

𝑊 = −17 + 10 = −7
 Test 4
1. Verdadero o falso:
a. Las HDL son lipoproteínas de mayor densidad por su alto contenido en proteína.
Verdadero
b. Las proteínas de membrana no pueden realizar movimiento flip-flop. Verdadero
c. La heterocromatina puede pasar al estado menos condensado de eucromatina en
función del tipo de tejido y estadio del desarrollo. Verdadero
d. En RNA, al igual que DNA, prevalece la configuración C2’-endo sobre C3’-endo. Falso
e. La estructura secundaria del tRNA presenta 4 o 5 brazos, según su longitud.
Verdadero
f. Los agentes intercalantes alteran la topología del DNA, variando su movilidad
electroforética. Verdadero
g. La densidad superhelicoidal negativa facilita la apertura de la doble hélice.
Verdadero
h. El DNA-Z es la conformación nativa que adoptan las fibras de DNA a alta humedad
relativa. Falso (es el DNA-B)
i. La triple hélice de DNA mantiene la conformación general B, con las pentosas en
C2’-endo. Verdadero
j. Las glicoproteínas están compuestas por un núcleo proteico al que se unen
covalentemente glucosaminoglicanos. Falso
k. Los ácidos teicoicos forman parte de las paredes celulares de bacterias Gram
negativas. Falso (es en Gram positivas)
l. La agarosa es un homopolisacárido estructural formado por N-acetil-D-
galactosamina. Falso
m. En el colágeno abundan los entrecruzamientos entre lisinas. Verdadero
n. Las fuerzas entrópicas conformacionales desfavorecen el plegamiento de proteínas.
Verdadero
o. Un polipéptido no formaría una estructura globular con pocos aminoácidos polares,
necesarios para formar un núcleo hidrofóbico. Verdadero
p. Se se elimina la urea y se reduce lentamente, la RNAasa se renaturaliza y recupera
su actividad enzimática. Verdadero
q. Los puentes disulfuro estabilizan la estructura cuaternaria. Verdadero
r. Las proteínas monoméricas son aquellas que solo tienen un dominio. Falso
s. La prolina y la hidroxiprolina son particularmente abundantes en el colágeno.
Verdadero
t. Según el diagrama de Ramachandran, phi y psi son siempre negativos para hélices
alfa dextrógiras y negativos para láminas beta. Falso

2. Relaciona cada glucosaminoglicano con la propiedad que corresponda:

1. Sulfato de condroitina: el más abundante
2. Heparina: mayor densidad de carga negativa
3. Ácido hialurónico: es el más largo
4. Sulfato de queratano: contiene D-galactosa
5. Sulfato de dermatano: contiene L-iduronato
 3. Completa la tabla:

O-glicoproteínas N-glicoproteínas
Aminoazúcar de puente N-acetilgalactosamina, Dos residuos de N-
manosa o galactosa acetilglucosamina unidos a
una triada ramificada de
manosas
Tipo de enlace O-glucosídico N-glucosídico
Grupo y residuos a los que Al grupo hidroxilo de una Ser Al nitrógeno del grupo amida
se une o Thr de un residuo de Asn
Secuencia aminoacídica Serina/Treonina Asn-X-Ser/Thr (X: cualquier
consenso (si la hay) aminoácido menos Pro)
Abundancia relativa Menos abundantes, en las Son 5 veces más abundantes
superficies celulares y en las que las O-glicoproteínas
mucinas

4. Completa la tabla con la diferentes conformaciones del DNA:

Menor valor Mayor valor

Diámetro DNA-Z (18 Å) DNA-A (25 Å)
Pares de bases por vuelta DNA-B (10) DNA-Z (12)
Paso de rosca DNA-A (25 Å) DNA-Z (45 Å)
Profundidad del surco mayor DNA-Z DNA-A
Profundidad del surco menor DNA-A DNA-Z

5. Un DNA circular cerrado tiene L=300 en estado relajado. Cuando se le añade bromuro
de etidio se producen 16 vueltas superhelicoidales hacia la izquierda. Calcula:
a. La longitud del DNA en pares de bases.
10,5 𝑝𝑏
300 𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎𝑠 · = 3150 𝑝𝑏
1 𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎
b. El número de pares de bases por vuelta al añadir el bromuro de etidio.

𝑊=0 𝑇 = 300 𝐿 = 300

Al añadir bromuro de etidio:

𝑊 =↑ 𝑇 =↓ 𝐿 = 𝑐𝑡𝑒.
𝑊 = 16 𝑇 = 284 𝐿 = 300
3150 𝑝𝑏
= 11,092 𝑝𝑏/𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎
284 𝑣𝑢𝑒𝑙𝑡𝑎𝑠