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T3. Generalidades de Infecciones Microbianas - Capítulo 4
T3. Generalidades de Infecciones Microbianas - Capítulo 4
T3. Generalidades de Infecciones Microbianas - Capítulo 4
Generalidades de infecciones
microbianas - Capítulo 4
El capítulo 4 trata sobre el trabajo de laboratorio para el diagnóstico de infecciones (la profe
no quiere que sepamos toda la microbiología de laboratorio, pero sí las definiciones y
conceptos básicos que permitan entender casos clínicos y diferentes patologías, y tener claro
cómo se diagnostican las diferentes infecciones).
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Dra. Ana Castro Grupo 2 Lunes 4 de abril 2022
El cuerpo humano puede estar colonizado en cualquier parte por microbiota, excepto el
cerebro y sangre, sin embargo, muchos sitios pueden ser sujetos de infecciones, aunque no
estén colonizados por microbiota, debido a esto en el laboratorio hay muchas muestras que
pueden ser utilizadas para identificar los microorganismos causantes de la infección. Por
ejemplo, muestras de sangre, que permiten identificar el microorganismo que causa la
patología a nivel sanguíneo, también las muestras de heces para identificar infecciones
intestinales. Pueden presentarse patologías a nivel superficial, para estas se toman raspados
de piel, sobre todo en infecciones de tejidos blando y piel, más que todo en infecciones
bacterianas y fúngicas, de acá se podría obtener frotis epidérmicos que permitan observar el
patógeno. También las infecciones urinarias, se diagnostican con muestras de orina
recolectadas con un tarrito que se presenta en laboratorio, o también se recolecta de paciente
con sonda. También se pueden realizar hisopados en piel, en abscesos o nasofaríngeos
(identificación del COVID). En cuanto al cerebro se utiliza una muestra de líquido
cefalorraquídeo. En algunos casos hay lesiones que pueden causar abscesos, pústulas o
algún tipo de cambio histológico a nivel tisular, para lo que se realizan aspirados.
Hay una gran variedad de patologías microbianas, y así de diversas son las muestras, que
normalmente recolectan los médicos, aunque el laboratorio también las puede recolectar. En
infecciones del SNC no se toman muestras de tejido, sino de líquido cefalorraquídeo, estas
muestras son muy sensibles y de mucho cuidado al trabajarlas, por lo que hay que dedicarse
bastante al hacerlo, ya que de la muestra depende el diagnóstico del paciente. También
pueden hacer infecciones a nivel cutáneo, de las cuales se toman raspados que se envían al
laboratorio para el respectivo análisis, igualmente en las infecciones oncóticas, que las toman
normalmente en el laboratorio. En casos de úlceras o abscesos se hacen punciones, pero
estas las toma el médico.
¿De qué depende que manden a hacer una prueba diagnóstica, ya que no siempre las
solicitan? ¿Es algo que está mal o es por algún criterio que les permite saber si es necesario
o no solicitar la prueba?
- Hay ciertas guías de manejo y de tratamiento que dicen “si la epidemiología se lo dice
y tiene una franca sospecha puede iniciar tratamiento sin toma de muestra”, que no es lo más
correcto. También ocurre que muchos médicos no siempre siguen las guías, ni solicitan las
muestras que son realmente importantes. Hay casos en que las guias si lo recomiendan tomar
la muestra y en otros casos que recomiendan dar el tratamiento, luego tomar la muestra y
luego iniciar el tratamiento
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- Esto es importante porque también hay patologías muy sensibles que requieren un
diagnóstico muy rápido para poder dar el tratamiento, y no siempre el resultado de laboratorio
es inmediato. “Tampoco nos podemos quedar esperando para decirle al paciente tiene tal
microorganismo ya ahora si le mandamos el tratamiento”
- Depende del microbiólogo, pero se prefiere almacenar por aparte para luego durante el
análisis se pueda determinar si es un solo microorganismo o una infección mixta.
En el libro se mencionan los diferentes tipos de muestras, luego de que el clínico evalúa al
paciente decide el tipo de muestra y la envía al laboratorio, sobre todo en casos donde son
más quirúrgicas las toman ellos. Si por ejemplo es un lugar al cual se tiene acceso directo,
como por ejemplo la sangre, se toma una muestra de sangre venosa, y en esta muestra se
obtiene el microorganismo de manera directa.
- Realmente no llega al laboratorio, ya que lo hacen los patólogos, y hay varios tipos de
muestras.
- En realidad, los papanicolaous son una citología, o sea una recolección de células por
lo que no hay que raspar, hay unos que son como un cepillito que con solo pasarlo recolecta
las células.
También hay muestras con flora normal, en las muestras indirectas solo hay microorganismos
patógenos, por lo que es más sencillo al analizar en el laboratorio. Como se vio en la clase
anterior se mencionó que en la piel hay flora normal, por lo que al analizar muestras de
lesiones con flora normal es muy importante que el médico agregue información
epidemiológica, edad, la condición, factores de riesgo, si tenía sonda, en tratamiento con
antibióticos para analizar qué es flora normal, que no lo es, y si la flora normal en ese caso
actúa como patógeno o solo es flora normal y no se le hace caso. Todas estas partes del
laberinto se unen para formar un diagnóstico y dar un diagnóstico.
Por ejemplo, una de las muestras que se observan en el laboratorio y con bastante frecuencia
en el laboratorio es un hisopado vaginal, se observan muchas bacterias y el microbiota, se
ven bacilos y otros tipos de bacterias, pero se buscan las bacterias que generan infecciones
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vaginales, entonces se descarta el ruido de fondo (flora normal)y se buscan los patógenos
que se piensan que puedan estar. Hay también formas de cultivar los organismos que se
conocen como patógenos comunes.
- En la muestra con flora normal se toma donde siempre va a haber flora normal, en la
indirecta, como el caso del pulmón no se puede llegar con una torunda a menos de que sean
vías respiratorias superiores, por lo que se utiliza un medio indirecto para barrer los
microorganismos del alveolo, es indirecto porque no se obtiene de forma directa, como sí
ocurriría en el ejemplo que con una aguja se toma la muestra de sangre, en la que se obtiene
de forma directa la muestra con el microorganismo, mientras que en el indirecto se utiliza un
método para llegar al sitio anatómico de difícil acceso, y este puede o no tener flora normal.
Cuando es sin técnica se espera que salga de todo, ya que al no limpiar la zona y puede
aparecer flora normal. No es tan fácil categorizar cada una de las muestras porque hay que
considerar las condiciones en que se está haciendo, pero la imagen lo que pretende mostrar
es que hay varias formas de tomar las muestras, que hay muestras más limpias que otras,
por ejemplo, si se toma líquido cefalorraquídeo este se aspira, jamás se le va a introducir al
paciente solución salina en el cerebro para poder tomar la muestra, este tipo de muestra se
considera directa y posteriormente se analiza para buscar la presencia de un microorganismo.
Una indirecta utiliza alguna solución que se agrega al tejido y posteriormente se aspira,
indirectamente se está lavando el tejido para tomar la muestra con el microorganismo.
● La muestra con flora normal puede ser directa o indirecta, pero se coloca aparte para
indicar que hay sitios que no son estériles y que definitivamente por la forma de tomar
la muestra puede venir con flora.
● Cuando se hacen los análisis el laboratorio tiene que saber muy bien del lugar viene
esa muestra.
Si es un aspirado de una herida quirúrgica, es decir que con una aguja aspiraron la herida
con muy buena técnica (el médico probablemente usó guantes), la muestra estaría limpia. Si
usó un hisopado mediante una torunda, la coloca por la piel del paciente recolectando todo
lo que hay (sin técnica).
Hay muestras más limpias que otras, puede que no haya ni flora normal.
¿La prueba PCR es una muestra con flora normal? Depende de la prueba PCR, pero puede
usarse para cualquier tipo de muestra, podría ser de heces y definitivamente tendríamos flora
normal o muestra de líquido cefalorraquídeo donde no hay flora normal.
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Calidad de la muestra
¿Qué pasaría si tomamos una torunda, hacemos un hisopado al paciente y la dejamos ahí?
Se podría secar la torunda y cuando se hace el análisis no hay nada.
El laboratorio indica que no tiene COVID, pero hace tres días estaba tosiendo y todo el mundo
se enferma alrededor, pero en el laboratorio le dijeron que no tenía nada. Esa es una mala
gestión para la muestra.
Correspondía hacer:
o una buena recolección.
o mantener un medio de mantenimiento por el tiempo en que se iba a hacer el análisis,
para poder identificarlo.
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Análisis bacteriológico
Como vimos hay muchos tipos de muestra, en el caso de la imagen era un paciente que tenía
un absceso y se le tomó un hisopado. El hisopado llega al laboratorio como se ve en la
imagen, aislado porque en el mundo hay más microorganismos y podrían crecer otras cosas
contaminando la muestra. Si sucede se reporta y no pueden diagnosticar al paciente.
De la muestra del hisopado se coloca un parte en la placa de Petri y otra parte en el frotis y
pueden hacerse dos cosas:
1. El frotis (arriba): Se tiñe.
2. Placa de Petri (abajo): Se realiza el rayado donde hay diferentes agares, en 4 zonas
realizando una es una dilución de la cantidad de microorganismos para poder separar
en unidades de formadores de colonia.
a. Las unidades formadoras de colonias son grupos de
bacterias que están formando colonias (los puntitos) y se
pueden caracterizar ya que entre sí son diferentes, tienen
diferentes colores, son hemolíticas (hacen una hemolisis
alrededor de la colonia). Lo anterior provee de una
sospecha, un diagnóstico presuntivo, que orienta para
ver qué pruebas va a ser adicionalmente, pero no es
definitivo y se le puede comunicar al médico para enviar tratamiento.
Tiempos de análisis
Cuando llega la muestra, se hace el frotis, se tiñe y se ve al microscopio y eso toma diez
minutos, obteniendo mucha información que orienta a qué tipo de microorganismo hay, si es
una bacteria, hongo, levadura, parásito.
Cuando es un paciente que tiene una infección y está muy grave, llaman al
laboratorio de bacteriología (para preguntar por lo que vieron); por ejemplo,
bacilos gramnegativos, el médico adquiere criterio para el tratamiento-
diagnóstico del paciente.
El aislamiento toma 1-2 días para obtener la colonia pura y para poder hacer los análisis
bioquímicos, para terminar de clasificar.
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Análisis en micología
Tiempos de análisis
Por ejemplo, llegó una persona con una lesión en piel que tiene escamas, tiene un hongo,
toma un raspado y se coloca en una lámina para el microscopio.
Es una prueba muy rápida (10 minutos) y se concluye prueba por hongos positiva porque se
encuentra un micelio, se reporta ese mismo día como “micelio positivo”, se le valida y el
médico lo puede ver.
También se utilizan placas de Petri, pero con medios que son especiales para hongos
únicamente, pero se tardan ±15 días porque los hongos son de crecimiento más lento.
Hasta 15 días se brinda el diagnóstico definitivo al paciente que tenía una uña fracturada y
con la pérdida de su estructura normal, para que obtenga el tratamiento específico enviado
por el médico.
¿Cómo saber qué tipo de rayado se hace la placa de Petri? Hay sólo dos tipos
de rayados:
● Si uno lo que quiere con una muestra original de un paciente que tiene
un absceso y usted quiere aislar el microorganismo, lo único que
utilizamos es este (imagen).
● El rayado para pruebas de susceptibilidad a los antibióticos.
Análisis parasitológico
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Porque con solo verle huevecillos o las formas tisulares, ya eso es suficiente para para poder
dar macroorganismo.
Se coloca como frotis, se agrega tanto solución salina como el lubol, pone un muy poquito
de la muestra de heces (como el tamaño de un grano de arroz) y lo vemos al microscopio de
nuevo. En diez minutos, se vieron los huevecillos de Ascaris lumbricoides que tiene el niño
y se envía el resultado para el tratamiento específico del parásito.
En el libro les ponen otro ejemplo (imagen) es otro parasito
diferente, cuyo huevecillo es ovalado, tiene operáculo, se
determina el nombre y apellido, finalmente se reporta que el
paciente tiene esta infección Clonorchis sinensis.
Análisis directo
Se realizan esos frotis para ver las bacterias. Pero ¿cómo las vamos a ver? Para eso se
utilizan tinciones y hay gran variedad. Por ejemplo, tenemos una tinción muy básica, que es
la tinción de Gram. La tinción de Gram lo que permite es observar las bacterias y
caracterizarlas en dos grupos principales:
1. Gram positivas.
2. Gram negativas.
3. Tenemos otras que son las acidorresistentes, que son bacterias diferentes que la
tinción usual no les va a funcionar, se utiliza un químico mucho más resistente a la
decoración que se hace con el ácido.
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Ejemplos de tinciones
Estos son algunos ejemplos, no debemos conocerlos, pero debemos saber que existe una
gran variedad de tinciones.
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Rayado
Por medio de la automatización para hemocultivos (aquellas bacterias que están en sangre).
La muestra se toma directamente y se ingresa en un equipo.
Permite dar perfiles de cómo están funcionando esas bacterias y gracias a eso podemos decir
cuál microorganismo.
Se determina con porcentajes, por ejemplo, un 99% va a ser una Pseudomonas aeruginosa
o 80% podría ser un Staphylococcus aureus. La pericia del microbiólogo es importante ya que
debe saber cuál microorganismo observa y así informar al clínico que es lo que tiene el
paciente.
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¿Qué significa el tamaño del halo de inhibición? Tenemos aquí el disquito del antibiótico, el
antibiótico a difundir en el agar. El halo de inhibición tiene diferentes concentraciones del
antibiótico a lo largo de su área. Específicamente en la circunferencia del halo se encuentra
la concentración que ya no logra inhibir el crecimiento y conocida como la concentración
mínima inhibitoria, es decir es la concentración mínima del antibiótico que inhibió el
crecimiento de la bacteria.
Si el halo de inhibición fue más pequeño quiere decir que es una concentración alta de
antibiótico, porque difundió. Si es un halo muy grande todavía concentraciones muy bajas del
antibiótico logran inhibir el crecimiento.
Espectrometría de masas
Como el laboratorio de bacteriología dura bastante, dos días para decir cuál microorganismo
es, se está empezando a usar espectrometría de masas, que es un método mucho más
rápido.
Obtiene el resultado en 1 hora en comparación a las 48 horas, es preciso y se utiliza para la
identificación de todos estos diferentes microorganismos por el patrón de péptidos en ellos.
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Cultivo viral
Inicialmente se aislaban eran en huevos, se veían en las placas de Dulbecco donde iban
causando la crisis de las células y cuántas de estas había para ver el título de la cantidad de
virus que se tenía y también se hacían cultivos celulares. Era bastante engorroso y poco útil
(pensar en la pandemia).
● También podemos inmortalizarlo a partir de las células tumorales, que esas van a
ser líneas de crecimiento ilimitado.
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Prueba de Aglutinación
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Dato de la Dra Loría: Muchas veces antes de tener los cultivos del microorganismo (que
pueden durar hasta 24-48 horas en obtener los resultados) en casos urgentes donde el
paciente necesita tratamiento, se puede iniciar con un medicamento que por estudios de
epidemiología concuerda con lo que presenta el paciente.
Diagnóstico molecular
El diagnóstico molecular es una técnica que ha sido muy utilizada en la pandemia.
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Pruebas rápidas
Funcionan similar a las pruebas de embarazo, lo que se tiene es
la muestra de suero del paciente y se coloca en la “plaquita” que
trae la prueba y se podrán observar “rayitas”, así se conocerá si
el paciente tiene IgM, IgG o ambas.
Una prueba que se usa actualmente en los laboratorios, es la del
Helicobacter pylori (casi el 80% de la población en Costa Rica lo
tiene). En este caso, se realiza una suspensión con heces y se
coloca en la placa, si al final se tienen 2 rayas significa que está
positivo, si solo tiene 1 está negativo (el control siempre debe
marcar, sino la prueba es inválida)
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Detección de toxinas
Estas son pruebas sencillas para toxinas bacterianas, como en el caso del clostridium
perfringens que es la toxina quien está involucrada en la patología. Lo que se realiza es una
suspensión y si la prueba da positiva, se dice que el paciente tiene la toxina.
Prueba de Elisa
Esta prueba es como un “sandwich” de anticuerpos, puede ser que
un anticuerpo identifica a una bacteria y luego otro anticuerpo que
emite la señal y esta es la señal que se mida. Actualmente los
equipos automatizados funcionan con pruebas de Elisa.
Si tenemos una infección aguda lo primero que va a aumentar son las pruebas de inhibición
de la hemaglutinina y las pruebas de neutralización. En la parte final lo que va a aumentar es
la fijación del complemento.
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