SYPRO Red

SYPRO Red ist ein Fluoreszenzfarbstoff vom Merocyanin-Typ,^[1] der zur Färbung von Proteinen im Zuge einer Proteincharakterisierung verwendet wird,^[2] meistens in einer SDS-PAGE.^[3][4]

SYPRO Red bindet wie auch sein Analogon SYPRO Orange selektiv an Proteine über 6,5 Kilodalton (auch Glykoproteine) in SDS-Micellen,^[1] nicht jedoch an DNA oder Lipopolysaccharide.^[5][6] Die Mutagenität, Reproduktionstoxizität und Karzinogenität von SYPRO Red ist unbekannt.^[5] Die Absorptionsmaxima liegen bei λ = 300 nm und 550 nm, die Emission ist bei λ = 630 nm maximal.^[5] Die Sensitivität bei SDS-PA-Gelen liegt mit SYPRO Red bei etwa 4–8 ng Protein,^[5][7] also etwas schlechter als bei der Silberfärbung. Aufgrund der Fluoreszenz besitzt die SYPRO Red-Färbung bei einer Mengenabschätzung im Vergleich zur Silberfärbung oder Coomassie einen größeren linearen dynamischen Bereich, d. h. eine bessere Korrelation zwischen der Proteinmenge und der Signalintensität.^[5] SYPRO Red eignet sich nicht zur Färbung von Proteinen auf Western Blots, 2D-Gelen oder IEF-Gelen.^[5] Im Gegensatz zur Silber- und Coomassie-Färbung werden zur Fixierung vor einer Färbung zwar Essigsäure verwendet, jedoch keine Alkohole wie Methanol oder Ethanol, da SYPRO Red zur Färbung auf die Anwesenheit von SDS angewiesen ist.^[7]

1. ↑ ^{a b c} Aleksandr Petrovich Demchenko: Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology III: Applications in Sensing and Imaging Band 3 von Advanced Fluorescence Reporters in Chemistry and Biology. Springer 2011. ISBN 9783642180354. S. 179ff.
2. ↑ ^{a b} Patent EP0774122B1: Protein-Färbung mittels Merocyanin Farbstoffe. Angemeldet am 20. Mai 1996, veröffentlicht am 19. August 2009, Anmelder: Molecular Probes Inc, Erfinder: Richard P. Haugland et al.‌
3. ↑ T. H. Steinberg, L. J. Jones, R. P. Haugland, V. L. Singer: SYPRO orange and SYPRO red protein gel stains: one-step fluorescent staining of denaturing gels for detection of nanogram levels of protein. In: Analytical biochemistry. Band 239, Nummer 2, August 1996, S. 223–237, ISSN 0003-2697. doi:10.1006/abio.1996.0319. PMID 8811914.
4. ↑ S. Gallagher, D. Chakavarti: Staining proteins in gels. In: Journal of visualized experiments : JoVE. Nummer 17, 2008, S. , ISSN 1940-087X. doi:10.3791/760. PMID 19066521. PMC 3253607 (freier Volltext).
5. ↑ ^{a b c d e f} Datenblatt SYPRO Red Protein Gel Stain bei Sigma-Aldrich, abgerufen am 28. November 2013 (PDF).
6. ↑ T. H. Steinberg, R. P. Haugland, V. L. Singer: Applications of SYPRO orange and SYPRO red protein gel stains. In: Analytical biochemistry. Band 239, Nummer 2, August 1996, S. 238–245, ISSN 0003-2697. doi:10.1006/abio.1996.0320. PMID 8811917.
7. ↑ ^{a b} Molecular Probes / Life Technologies: SYPRO Orange and SYPRO Red Protein Gel Stains. 2003. PDF.