신경과학 정보 프레임워크
Neuroscience Information Framework | |
|---|---|
| 내용 | |
| 설명 | 웹 기반 신경 과학 리소스: 데이터, 재료 및 도구 |
| 데이터 유형 발동. | 신경과학 |
| 연락처 | |
| 작가들 | M.E. M.M.E. |
| 출시일자 | 2008 |
| 접근 | |
| 데이터 형식 | html, xml, json, csv |
| 웹사이트 | http://www.neuinfo.org/ |
| 웹 서비스 URL | http://neuinfo.org/developers |
| 스파르ql 끝점 | http://neurolex.org/ 쿼리 sarlql 끝점 |
| 잡다한 | |
| 면허증 |  Creative Commons Attribution 3.0 |
| 버전 지정 | 6.2 |
| 데이터 릴리스 빈도수 | 주간 |
| 큐레이션 정책 | 인간과 기계의 연속. |
신경과학 정보 프레임워크는 실험, 임상 및 번역 신경과학 데이터베이스, 지식 기반, 아틀라세, 유전자/유전자 자원을 포함한 글로벌 신경과학 웹 자원의 보고로서 위키피디아의 신경과학 포털 전반에 걸쳐 권위 있는 많은 연계를 제공한다.null
설명
NIF(Neuro Science Information Framework)는 국립보건원이 2004년 수립한 NIH Neuro Science Research의 시책이다.[1]null
NIF의 개발은 2008년 캘리포니아 주립대 샌디에이고 의과대학이 NIH 계약을 체결하면서 "과학자와 학생이 인터넷에 연결된 어떤 컴퓨터를 통해서도 접근할 수 있는 웹 기반 신경과학 데이터, 자원, 도구의 동적 목록"을 만들고 유지하게 되면서 시작되었다.[2][3]이 프로젝트는 UC 샌디에이고에 본사를 두고 있는 다학제 생물시스템연구센터(CRBS)의 일부인 국립 현미경영상연구센터(National Center for Microcopy and Imaging Research, NCMIR)의 공동 소장인 메리안 마르톤이 맡고 있다.마르톤은 제프리 S. 그레티, 아마르나트 굽타 공동 연구원과 함께 예일대, 캘리포니아 공과대학, 조지 메이슨대, 하버드대, 워싱턴대 연구원이 참여하는 전국적인 협업을 이끌고 있다.null
목표들
일반 검색 엔진과는 달리, NIF는 신경 과학과 관련된 집중적인 자원, 신경 과학에 맞춘 검색 전략, 웹 검색 엔진으로부터 전통적으로 "숨겨져 있는" 콘텐츠에 대한 접근을 훨씬 더 깊게 제공한다.NIF는 신경과학 데이터베이스의 동적 목록이며, 주석을 달고 생명 의학 용어의 통일된 시스템(즉, NeuroElex)과 통합된다.NIF는 생물학적 구조의 여러 척도와 생물학적 기능의 여러 수준에 걸쳐 개념 기반 쿼리를 지원하여 결과를 보다 쉽게 검색하고 이해할 수 있도록 한다.NIF는 또한 자원 제공자들이 신경 과학 연구와 관련된 자원의 가용성을 공개할 수 있는 등록부를 제공할 것이다.NIF는 창고나 리포지토리 그 자체를 목적으로 하는 것이 아니라 웹을 통해 이용 가능한 다른 곳에 자원을 공개하고 위치시키는 수단이다.null
NIFSTD 또는 NIF 표준 온톨로지에는 신경 과학에 유용한 용어, 동의어, 약어는 물론, 신경전달물질에 의한 뉴런이나 국립 약물 남용 연구소에 의한 회로 역할이나 약물들에 의한 다양한 성질에 기초한 정의된 세포 클래스와 같은 동적 범주가 많이 포함되어 있다.모든 용어(관련 동의어 포함) 또는 동적 범주(동의어 포함 모든 용어)를 사용하여 NIF가 현재 인덱싱하고 있는 모든 데이터를 동시에 쿼리할 수 있다. 아래에서 몇 가지 예를 찾아보십시오.
- 동의어를 포함한 해마에 대한 사용 가능한 데이터
- 마비 아지탄과 같은 고대 동의어를 포함한 파킨슨병에 대한 데이터
- 신구질 뉴런 동적 범주는 신피질의 어떤 부분에 세포소마를 가진 모든 뉴런을 포함한다.
내용
NIF 컨텐츠는 카탈로그(NIF 레지스트리) 및 심층 데이터베이스 검색(NIF Data Federation)으로 생각할 수 있다.
- NIF 카탈로그에는 과학 데이터베이스, 소프트웨어 도구, 실험 시약 및 도구, 지식 기반 및 포털, 신경 과학 연구 커뮤니티에 의해 식별된 기타 실체를 포함하여 NIH가 지원하는 신경 과학 관련 자원이 가장 많이 수록되어 있다.
현재 리소스의 목록은 www.neuinfo.org/registry에서 확인할 수 있다.
- 그 NIF 데이터 연맹:다양한 미국 국가 생물 공학 센터 데이터베이스뿐만 아니라 뭔가 젬마(신경 시스템에서 미세 배열 데이터), CCDB 및 포함한 신경 과학을 해야 할 크고 작은 여러 데이터베이스(PubMed, Gensat, Entrez 진, Homologene, GEO), 150명 이상이 데이터베이스를 포함한 깊은 데이터베이스 콘텐츠 검색하는 뉴런들과 astrocyte의 CIL(사진들이다.s, mainly), GeneNetwork, EagingGenesDB, XNAT, 1000 Functional Connectoms.'완료' 목록(2013년 4월 기준)은 아래 표에서 확인할 수 있다.업데이트된 목록은 데이터 연합 페이지에서 찾을 수 있다.
- 또한 매우 유사한 유형의 데이터를 가진 많은 데이터베이스들이 '가상 데이터베이스'로 통합되어 많은 데이터베이스를 하나의 표로 결합하였다.예를 들어 항체 레지스트리는 200개 이상의 벤더의 데이터를 결합하고, NIF 통합 브레인제네 익스프레션(BrainGeneExpression)은 겐사트, 앨런 브레인, 마우스 게놈 정보학(Mouse Genome Informatics)의 유전자 표현 데이터를 결합하며, Connectivity 뷰는 신경계 연결에 관한 진술을 가진 6개의 데이터베이스를 결합하고, Integrated Animal 뷰는 실험에 관한 데이터를 결합한다.유전자이전 또는 유전성 벌레, 제브라피쉬, 쥐, 쥐로부터 연구자들이 이용할 수 있는 동물 카탈로그.데이터가 등록되어 있으므로 이 페이지를 다시 확인하여 현재 내용을 확인하십시오.
- NIF에 등록된 데이터베이스 및 데이터셋의 전체 최신 목록은 이 페이지 www.neurolex.org을 참조하십시오.아래 표는 2013년 4월 9일에 업데이트되었다.
| 데이터 집합 또는 데이터베이스 이름 | 유형 |
|---|---|
| ZFIN | 데이터베이스, 데이터 저장소, 이미지 컬렉션 |
| 제브라피시 국제자원센터 | 바이오소재 공급자원, 항체공급자, 바이오소재 분석서비스, 유기물공급자, 자재창고 |
| XNAT Central | 데이터베이스, 이미지 컬렉션, 데이터 저장소 |
| 웜베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스, 소프트웨어 리소스 |
| 와이어드 사이언스 블로그 | 블로그, 설명 리소스 |
| 와이어드 사이언스 | 블로그 |
| 위키패스웨이즈 | 위키 |
| VMD | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| 비시오메 플랫폼 | 데이터베이스, 비디오 리소스, 주제 포털, 소프트웨어 저장소, 데이터 저장소, 이미지 |
| 유니프로트KB | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 시각신경과학 UCSF 실험실 | 실험실 포털, 이미지, 비디오 리소스 |
| UCLA 다중 연결 데이터베이스 | 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스, 데이터베이스 |
| 과학계의 이번 주 | 팟캐스트 |
| TheScienceJobs.com | 작업 리소스, 미팅 리소스, 워크샵 |
| 가디언:사이언스 위클리 | 팟캐스트 |
| 가디언:사이언스 비디오 | 비디오 리소스 |
| 가디언:과학 | 블로그, 설명 리소스 |
| 데일리 스캔 | 설명 리소스, 블로그 |
| 셀: 이미지 라이브러리 | 비디오 리소스, 이미지, 데이터 저장소 |
| 시간적 로베:해마 - 쥐의 파라히포캄팔 신경절제술 | 데이터베이스 |
| 타에어 | 데이터베이스, 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스, 실험 프로토콜 |
| T3DB | 데이터베이스 |
| 시냅스 웹 | Atlas, 이미지 컬렉션, 교육 자료 |
| SumsDB(표면 관리 시스템 데이터베이스) 및 WebCaret 온라인 시각화 | Atlas, 데이터베이스, 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스 |
| Simtk.org | 주제 포털, 소프트웨어 리소스, 데이터 세트, 소프트웨어 저장소 |
| SGN | 데이터베이스, 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스, 소스 코드 |
| SGD | 데이터베이스, 데이터 저장소, 표준 사양, 데이터 분석 서비스 |
| SfN 브레인브리핑 | 서술적 자원 |
| SFARI 유전자:AutoDB | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 사이언로그스 | 블로그 |
| 과학적인 미국 관찰 | 블로그 |
| Scientific American 게스트 블로그 | 블로그 |
| 사이언티픽 아메리칸 크로스 체크 | 블로그 |
| 사이언티픽 아메리칸 베링 인 마인드 | 블로그 |
| 사이언스NOW | 서술적 자원 |
| ScienceBlogs: 의학과 건강 | 블로그 |
| 사이언스블로그: 생명과학 | 블로그 |
| ScienceBlogs: 뇌와 행동 | 블로그 |
| 사이언스 토크 | 팟캐스트 |
| 사이언스 팟캐스트 | 팟캐스트, 설명 리소스 |
| 사이언스 커리어스 | 작업 리소스, 설명 리소스 |
| 스크리블즈 | 블로그 |
| 왕립 정신과의사 대학 팟캐스트 | 팟캐스트 |
| RGD | 데이터 저장소, 웹 액세스 가능 데이터베이스, 데이터베이스, 데이터 분석 서비스, 유기체 공급업체 |
| 수축Watch.com | 블로그 |
| 레티나 프로젝트 | 공간적으로 참조되는 데이터 집합, 이미지 컬렉션 |
| 리서치크로스로드 | 자금 지원 리소스, 데이터 저장소 |
| 리서치 블로깅 | 블로그, 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 리액텀 | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스, 웹 서비스, 책 |
| 퀘스트 | 설명 리소스, 커뮤니티 빌딩 포털, 팟캐스트, 아웃리치 프로그램, 교육 자료, 교육 리소스, 비디오 리소스 |
| 퍼브메드 헬스 | 데이터베이스 |
| 펍켐 | 웹 액세스 가능한 데이터베이스, 데이터베이스, 서비스 리소스, 데이터 저장소, 3D 공간 이미지 |
| 정신 활동 약물 검사 프로그램 키 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| Phyomonas 게놈 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| 프로토콜 온라인 - 검사실 참조서 | 실험 프로토콜 |
| 폼베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 폴리게닉블로그 | 블로그 |
| PLoS 블로그 | 블로그 |
| 물리오방크 | 데이터베이스 |
| 제약GKB | 웹 액세스 가능한 데이터베이스, 데이터베이스, 데이터 저장소, 웹 서비스, 데이터 세트 |
| PDB | 데이터베이스, 3D 공간 이미지, 웹 서비스, 데이터 분석 서비스, 데이터 저장소 |
| 옥스퍼드 사이언스 블로그 | 블로그 |
| 이미지 스터디의 개방형 액세스 시리즈 | 아틀라스, 데이터베이스 |
| One Mind Biospeciform Bank 목록 | 조직 뱅크, 셀 저장소, 브레인 뱅크, 데이터 저장소 |
| 오밈 | 데이터베이스 |
| 후각 수용체 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스, 데이터 저장소 |
| 후각 전구 냄새 지도 DataBase(OdorMapDB) | 아틀라스, 데이터베이스 |
| 이제 NEJM에서 | 블로그 |
| 노버스 바이오시스 | 항체 공급업체, 바이오 소재 제조, 재료 리소스, 서비스 리소스 |
| NITRC-IR | 이미지 수집, 데이터 저장소 |
| 니트RC | 커뮤니티 빌딩 포털, 소프트웨어 저장소 |
| NIMH 화학합성 및 의약품 공급 프로그램 | 시약 제조, 시약 공급업체 |
| NIH 비디오캐스팅 | 비디오 리소스, 팟캐스트, 데이터 저장소 |
| NIH 신경과학 마이크로어레이 컨소시엄 | 데이터 분석 서비스, 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| NIGMS 인간 유전자 세포 저장소 | 셀 리포지토리, 바이오시멘 리포지토리 |
| NIF 레지스트리 자동 크롤 데이터 | 데이터 세트 |
| NIF 레지스트리 | 데이터베이스 |
| NIF 통합 비디오 보기 | 비디오 리소스 |
| NIF 통합 소프트웨어 보기 | 소프트웨어 리소스 |
| NIF 통합 팟캐스트 보기 | 팟캐스트 |
| NIF 통합 신경 시스템 연결 보기 | 데이터베이스 |
| NIF 통합 추출 주석 | 데이터 세트 |
| NIF 통합 작업 | 작업 리소스 |
| NIF 통합 유전자-질소 상호작용 | 데이터베이스 |
| NIF 통합 질병 보기 | 데이터베이스 |
| NIF 통합 임상 시험 | 데이터베이스 |
| NIF 통합 뇌 유전자 표현 보기 | 데이터베이스 |
| NIF 통합 블로그 | 블로그, 설명 리소스 |
| NIF 통합 자동 추출 주석 | 데이터 세트 |
| NIF 통합 동물 뷰 | 유기물공급자 |
| 뉴욕 타임즈 - 글쎄 | 블로그 |
| 뉴 사이언티스트 잡스 | 작업 리소스, 박사 후 프로그램 리소스 |
| 신경세포 | 블로그 |
| 뉴로팟 | 팟캐스트 |
| 뉴런DB | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| 신경 모르포조직 | 데이터 저장소, 데이터베이스, 이미지 컬렉션 |
| 뉴로마브 | 항체공급업체 |
| 신경학 팟캐스트 | 팟캐스트 |
| 뉴로피드 | 인력 자원 |
| 신경전극 | 데이터베이스 |
| Neurodatabase.org | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| NCBI 단백질 | 데이터베이스 |
| 엔씨비 진 | 웹 액세스 가능한 데이터베이스, 데이터베이스 |
| 엔씨비 | 데이터 저장소, 데이터 분석 소프트웨어 |
| 네이처잡스 | 작업 리소스, 설명 리소스 |
| 네이처 팟캐스트 | 팟캐스트 |
| 네이처 네트워크 블로그 | 블로그 |
| 자연 선택됨 | 블로그 |
| 국립보건원 줄기세포표 | 데이터 세트 |
| 국립보건연구원 포트폴리오 온라인 보고 도구 | 데이터베이스 |
| 국립과학아카데미 팟캐스트 | 팟캐스트 |
| MPO | 온톨로지 |
| 쥐 게놈 정보전달물질 | 반구조적 지식 |
| 몬스터 | 작업 리소스 |
| 모델DB | 시뮬레이션 소프트웨어, 데이터베이스, 데이터 저장소, 소스 코드 |
| MNI 팟캐스트 | 팟캐스트 |
| 마인드 해크스 | 블로그, 책 |
| MGI | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 랩스페이스 | 서술적 자원, 블로그, 커뮤니티 빌딩 포털, 실험 프로토콜 |
| 카와사키 병 데이터 세트2 | 데이터 세트 |
| 카와사키 병 데이터 세트1 | 데이터 세트 |
| 시각화 실험 저널 | 저널, 비디오 리소스, 실험 프로토콜 |
| 신경항체 비교 데이터베이스 저널 | 데이터베이스 |
| jobs.ac.uk | 작업 리소스 |
| JCVI CMR | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| iSCSI 데이터 집합 | 데이터 세트, 이미지 수집 |
| It Take 30 | 블로그, 작업 리소스 |
| 인터넷 브레인 볼륨 데이터베이스 | 데이터베이스, 웹 서비스, 데이터 분석 서비스 |
| 국제 마우스 스트레인 리소스 | 유기체 공급업체, 데이터 저장소 |
| 과연 | 작업 리소스 |
| 면역 에피토프 데이터베이스 및 분석 리소스 | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스, 웹 서비스 |
| 휴먼 브레인 아틀라스 | Atlas, 비디오 리소스, 교육 리소스 |
| 호몰로제네 | 웹 액세스 가능한 데이터베이스, 데이터베이스, 서비스 리소스 |
| Health.Data.gov | 데이터베이스, 소프트웨어 리소스, 구조화된 지식 |
| 헤이스 | 작업 리소스, 서비스 리소스 |
| H2SO4허츠 | 블로그 |
| 그레이 머터스 | 팟캐스트, 설명 리소스 |
| Grants.gov | 자금자원 |
| 그라민 | 데이터베이스, 웹 서비스, 데이터 분석 서비스 |
| 인지적 | 교육 자료, 비디오 리소스, 평가 테스트 공급자 |
| 바둑 | Ontology, 국제 표준 사양, 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 활공 반응 아카이브 | 데이터베이스, 이미지 수집, 데이터 분석 서비스 |
| GENSAT - 유전자 표현 신경계 아틀라스 | Atlas, 유기물 공급업체, 바이오 소재 제조, 바이오 소재 공급 자원 |
| 지놈 언지프 | 블로그, 데이터 세트, 소스 코드 |
| 유전자 분석 소프트웨어 | 데이터 세트, 소프트웨어 리소스, 소프트웨어 저장소 |
| 진네트워크 | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 진DB 트브루체이 | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| 진디브 팰시파룸 | 데이터베이스 |
| 진DB Lmajor | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| 진 위버 | 웹 액세스 가능 데이터베이스, 데이터 분석 서비스, 데이터 저장소 |
| Gene Ontology 도구 | 데이터 세트, 소프트웨어 저장소, 레지스트리 |
| 진 표현 옴니버스 | 데이터베이스, 데이터 저장소, 서비스 리소스, 데이터 세트 |
| 젬마 | 데이터베이스, 데이터 처리 소프트웨어, 데이터 저장소 |
| 파킨슨병의 걸음걸이 | 데이터베이스 |
| 신경퇴행성질환 데이터 베이스의 보행역학 | 데이터베이스, 웹 액세스 가능 데이터베이스 |
| 플라이베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소, 유기체 관련 포털, 데이터 분석 서비스 |
| F1000 포스터 | 스토리지 서비스 리소스, 설명 리소스, 분석 서비스 리소스 |
| 마모셋의 표현 아틀라스 | 데이터 세트, 표현식 지도 |
| EU 임상시험 등록부 | 데이터베이스 |
| EEG베이스 | 데이터 저장소, 데이터베이스 |
| 에코사이크 | 데이터베이스 |
| 드러그뱅크 | 데이터베이스 |
| 약물 관련 유전자 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 국립 신경 장애 및 뇌졸중 연구소의 장애 지수(NINDS) | 데이터 세트 |
| 디스커버 매거진 | 설명 리소스, 블로그, 팟캐스트, 이미지 컬렉션 |
| 디스코 | 소프트웨어 리소스, 서비스 리소스 |
| 딕티베이스 | 데이터베이스, Biospeciment 저장소 |
| 대담한 핵 모험 - 진득 | 블로그 |
| CRCNS | 데이터 세트, 데이터 저장소, 자금 조달 리소스 |
| 독성유전체학 비교 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| CoCoMac(Macaque Brain의 연결 데이터 결합) | 데이터베이스, 데이터 시각화 소프트웨어, 데이터 저장소, 참고 문헌 목록 |
| Clinicaltrials.gov: 국립보건원 서비스 | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 임상 시험 네트워크(CTN) 데이터 공유 | 데이터 세트 |
| 켐블DB | 웹 액세스 가능한 데이터베이스, 데이터베이스 |
| 체비 | 데이터베이스, 온톨로지 |
| 소뇌 플랫폼 | 데이터베이스, 소프트웨어 저장소, 데이터 저장소, 데이터 분석 소프트웨어 |
| 센트럴 사이언스 | 블로그 |
| 셀 중심 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소, 이미지 컬렉션 |
| 카산드라스 티어스 | 블로그 |
| 칸디다 게놈 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스 |
| 새너하브디트 유전학 센터 | 유기농 공급업체, Biospeciment 저장소, 표준 사양, 셀 저장소 |
| 브레데 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| BrainSpan: 유전자로 요약된 RNA-Seq exons | 표현 지도책 |
| 뇌경간: RNA-Seq exons | 표현 지도책 |
| BrainSpan: 프로브 세트에 요약된 Exon 마이크로 어레이 | 표현 지도책 |
| BrainSpan: 유전자로 요약된 Exon 마이크로 어레이 | 표현 지도책 |
| 브레인팟 | 팟캐스트 |
| BrainMaps.org: 고해상도 브레인아틀라즈 | Atlas, 데이터 분석 서비스 |
| 브레인인포 | Atlas, Database, Topical Portal, Standard 사양 |
| 뇌과학 팟캐스트 | 팟캐스트, 설명 리소스 |
| 뇌건축관리시스템 | 데이터베이스, 온톨로지, 데이터 저장소 |
| BMI(Brain Machine Interface) 플랫폼 | 데이터 저장소, 데이터베이스, 서지학, 소프트웨어 저장소 |
| 블루밍턴 드로필라 스톡 센터 | 유기물 공급업체, 재료 저장 저장소 |
| 바이오포트폴리오 | 설명 리소스, 블로그, 작업 리소스, 데이터베이스, 포털 |
| 바이오NOT | 데이터베이스 |
| 생체 상호작용 | 교육 리소스, 비디오 리소스, 팟캐스트, 교육 자료 |
| 바이오그리드 | 데이터베이스, 웹 서비스, 소프트웨어 리소스, 데이터 저장소 |
| 바이오콤파레 | 데이터베이스, 항체 공급업체 |
| 베타 셀 생물 컨소시엄 | 데이터베이스, 시약 공급업체 |
| BAMS 중첩 영역 | 데이터베이스 |
| BAMS 연결 | 데이터베이스 |
| BAMS 셀 | 데이터베이스 |
| 조류 뇌 회로 데이터베이스 | 공간적으로 참조되는 데이터 집합, 데이터 저장소, 이미지 |
| ASPGD | 데이터베이스, 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스 |
| 가급적 빨리. | 데이터베이스, 데이터 저장소, 데이터 분석 서비스 |
| 항체 레지스트리 | 데이터베이스 |
| 아미고 | 소프트웨어 애플리케이션, 데이터베이스, 데이터 분석 서비스 |
| 미국 정신의학 저널 팟캐스트 | 팟캐스트 |
| 앨런 마우스 뇌 연결 지도 | 공간 참조 데이터 집합 |
| 앨런 마우스 브레인 아틀라스 | 아틀라스, 데이터베이스 |
| 올 인 더 마인드 | 팟캐스트 |
| 노화 유전자와 중재 데이터베이스 | 데이터베이스, 데이터 저장소 |
| 애드진 | 주제 포털, Biospeciment 리포지토리, Biomaterial 공급 자원 |
| Access-ScienceJobs.co.uk | 작업 리소스, 설명 리소스 |
| 레이디 사이언티스트 | 블로그 |
| 60초 마인드 | 팟캐스트 |
웹 서비스를 통한 데이터
NIF의 아이디어는 과학 데이터베이스는 인터페이스가 많고, 꽤 복잡하지만, 그것들을 보고 검색할 수 있는 균일한 방법이 있어야 한다는 것이다.이러한 획일적인 검색 아이디어는 개발자들이 NIF 인터페이스를 통해 이용 가능한 모든 데이터에 접근함으로써 NIF에서 수행된 작업을 이용하여 자신의 애플리케이션을 향상시킬 수 있도록 서비스로 확장되었다.null
NIF를 통해 데이터가 공개되면 웹 서비스를 통해 데이터를 즉시 사용할 수 있게 된다.이러한 RESTful 웹 서비스는 다른 애플리케이션에 내장될 수 있는 프로그래밍 기능으로 생각할 수 있다.현재는 XML 피드로 데이터를 쿼리하여 가져올 수 있으며, 현재 DOMO와 이글 i를 비롯한 여러 사이트에서 서비스를 통해 NIF 데이터를 추출하고 있다.개발자는 http://neuinfo.org/developers에서 제공되는 WADL 파일을 보고 데이터에 액세스하는 방법을 배울 수 있다.
아래는 학생들이 접근하거나 건축 애플리케이션에서 사용할 수 있는 몇 가지 공공 RESTful 서비스들이다.
- 다음 URL을 사용하여 텍스트에 주석 달기:
* http://nif-services.neuinfo.org/servicesv1/v1/annotate?content=The%20cerebellum%20is%20a%20wonderful%20thing&longestOnly=true
url에는 주석을 달고 싶은 텍스트, 즉 "소뇌는 멋진 것이다"라는 입력이 포함되어 있다.이 항목을 변경하려면 다른 텍스트를 사용하십시오.이 서비스의 출력은 소뇌라는 용어를 인식했으며 해부학적_구조물의 한 유형임을 나타내는 SPAN 태그로 문장을 반환한다.인식되지 않는 용어는 스팬 태그 없이 반환된다.참고로 가장 긴 매개변수는 선택사항이며, 이 예에서 가장 긴 항 집합만이 인식된다는 것을 의미하며, 그것은 차이를 보이지 않지만, 해마 뉴런과 같은 용어는 하나의 반응만 반환한다.null
개발자는 식별자가 고유하고 정의, 동의어, 기타 뇌 영역 및 일부 경우 영상에 연결되기 때문에 인식된 용어에 대한 정보를 가져오기 위해 스팬 태그를 사용할 수 있다.사람이 읽을 수 있는 버전은 을 참조하십시오.
* http://neurolex.org/wiki/Birnlex_1489
컴퓨터 읽기 가능한 버전은 을 참조하십시오.
* http://nif-services.neuinfo.org/ontoquest/concepts/Birnlex_1489?get_super=true
- 예를 들어, 신경 과학 자동 완성 제안 검색
* http://nif-services.neuinfo.org/servicesv1/v1/vocabulary?prefix=hippocampu
위의 예는 "hippocampu"에 대한 완료라는 용어를 나타내지만, URL에 다른 문자 집합을 입력해 볼 수 있다.서비스 반환은 다음을 포함하여 이 문자열과 일치하는 용어 집합이다.해마와 많은 해마 세포.null
- 검색어와 일치하는 레지스트리 항목 검색:
* http://nif-services.neuinfo.org/servicesv1/v1/federation/data/nlx_144509-1?q=miame
NIF 레지스트리는 데이터 원본이며 이 서비스는 특정 검색어와 일치하는 레지스트리의 모든 항목을 반환한다.이 경우 용어는 miame 표준에서와 같이 miame이다.이 데이터 검색 기능을 사용하려면 miame이라는 용어와 함께 또는 대신 이 URL의 끝에 쿼리 용어를 입력하십시오.이것은 검색 상자에 용어를 입력하는 것과 같은 방식으로 작동한다.
* https://neuinfo.org/mynif/search.php?q=hippocampus&t=registry
참고: 데이터 출처에 대한 약관을 반드시 확인하십시오. NIF에서는 약관이 제공되지만, 애플리케이션에 통합하고자 하는 개별 출처를 통해 확인할 수도 있습니다, 위에서 설명한 모든 데이터는 NIF 소유이며 Creative Commons Accounting 라이센스에 따라 적용되므로,자유롭게 분배되고 공유될 수 있다.null
참고 및 참조
- ^ Wayback Machine에 보관된 NIH Neuro Science Research 2009-01-30은 기초 및 임상 연구 모두에서 신경 과학자를 지원하기 위한 새로운 도구, 훈련 기회 및 기타 자원의 개발을 지원한다.
- ^ NIDA가 관리하는 NIH로부터 HHSN271200577531C 계약에 따라
- ^ 캘리포니아 대학교 보도 자료