โนบิตะบอกกับไจแอนท์ว่าจะออกตามหาสมบัติ โดราเอมอนเลยนำของวิเศษ แผนที่หาสมบัติ ออกมา จุดที่ชี้ในแผนที่เตือนว่าที่นี่มีสมบัติอยู่ ซึ่งก็คือมหาสมทุรแปซิฟิก จากนั้นเหล่าเพื่อนๆจึงเดินทางด้วยเรือ "โนบีตาโอร่า" แต่ก็ถูกกลุ่มโจรสลัดโจมตีตอนที่กำลังลงจอดเรือที่เกาะ หลังจากหนีก็ได้เจอกับเด็กชายชื่อ ฟล็อค ผู้มาพร้อมกับหุ่นยนต์นกแก้ว ควิซ ฟล็อคเป็นเด็กชายช่างเรือผู้รู้ความลับของเกาะมหาสมบัติเขาได้หนีออกมาจากเรือโจรสลัดเพราะเหตุใดกัน และโนบิตะจะช่วยชิซุกะให้รอดพ้นจากเงื้อมมือโจรสลัดได้หรือไม่ แล้วความลับของเกาะมหาสมบัติที่หลับไหลอยู่คืออะไรกันแน่?!!