SLC35C2

SLC35C2
Ідентифікатори
Символи	SLC35C2, BA394O2.1, C20orf5, CGI-15, OVCOV1, solute carrier family 35 member C2
Зовнішні ІД	MGI: 2385166 HomoloGene: 6581 GeneCards: SLC35C2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• antiporter activity; • GO:0022891 transmembrane transporter activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cis-Golgi network; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; • мембрана; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; • нуклеоплазма; • комплекс Ґольджі;
Біологічний процес	• protein O-linked fucosylation; • fucosylation; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of Notch signaling pathway; • UDP-glucose transmembrane transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51006
	228875
	ENSG00000080189
	ENSMUSG00000017664
	Q9NQQ7
	Q8VCX2
NM_001281457; NM_001281458; NM_001281459; NM_001281460; NM_015945;
	NM_173073; NM_173179
NM_001252573; NM_001252574; NM_001252575; NM_144893; NM_001363015;
	NM_001363016
NP_001268386; NP_001268387; NP_001268388; NP_001268389; NP_057029;
	NP_775096; NP_775271
NP_001239502; NP_001239503; NP_001239504; NP_659142; NP_001349944;
	NP_001349945
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SLC35C2 (англ. Solute carrier family 35 member C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 432^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRWALDVAF	LWKAVLTLGL	VLLYYCFSIG	ITFYNKWLTK	SFHFPLFMTM
LHLAVIFLFS	ALSRALVQCS	SHRARVVLSW	ADYLRRVAPT	ALATALDVGL
SNWSFLYVTV	SLYTMTKSSA	VLFILIFSLI	FKLEELRAAL	VLVVLLIAGG
LFMFTYKSTQ	FNVEGFALVL	GASFIGGIRW	TLTQMLLQKA	ELGLQNPIDT
MFHLQPLMFL	GLFPLFAVFE	GLHLSTSEKI	FRFQDTGLLL	RVLGSLFLGG
ILAFGLGFSE	FLLVSRTSSL	TLSIAGIFKE	VCTLLLAAHL	LGDQISLLNW
LGFALCLSGI	SLHVALKALH	SRGDGGPKAL	KGLGSSPDLE	LLLRSSQREE
GDNEEEEYFV	AQGQQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lu L., Hou X., Shi S., Korner C., Stanley P. (2010). Slc35c2 promotes Notch1 fucosylation and is required for optimal Notch signaling in mammalian cells. J. Biol. Chem. 285: 36245—36254. PMID 20837470 DOI:10.1074/jbc.M110.126003
Leach R.E., Duniec-Dmuchowski Z.M., Tanaka T.S., Ko M.S.H., Krawetz S.A. (2001). Assignment of OVCOV1 (alias CGI-15) to human chromosome 20 band q13.1-->q13.2 by fluorescent in situ hybridization. Cytogenet. Cell Genet. 94: 252—253. PMID 11856893

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17117 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NQQ7 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17117 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NQQ7 (англ.) . Архів оригіналу за 31 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

SLC35C2

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук