Michael Spencer Waterman (né le 28 juin 1942) est professeur de biologie, de mathématiques et d'informatique à l'université de Californie du Sud (USC) où il est titulaire d'une chaire d'associé en sciences biologiques, mathématiques et informatique. Il a auparavant[Quand ?] occupé des postes au Laboratoire national de Los Alamos et à l'université d'État de l'Idaho.