| dbo:abstract
|
- El Protein Data Bank (PDB) (Banc de dades de proteïnes), és un dipòsit d'estructures 3-D de proteïnes i àcids nucleics. Aquesta informació, obtinguda bàsicament per cristal·lografia de raigs X i ressonància magnètica nuclear, és incorporada per biòlegs, químics i bioquímics d'arreu del món, és de domini públic i pot ser emprada lliurement. (ca)
- بنك بيانات البروتين (بالإنجليزية: Protein Data Bank (PDB)) وهو مستودع للبيانات الهيكلية ثلاثي الأبعاد للجزيئات البيولوجية الكبيرة، مثل البروتينات والأحماض النووية. ويمكن للبيانات، وعادة ما يتم الحصول عليها عن طريق البلوريات بالأشعة السينية أو مطياف الرنين المغناطيسي النووي، والذي قدمه علماء الأحياء والكيمياء الحيوية من مختلف أنحاء العالم، يمكن الوصول إليها على شبكة الانترنت. والمصرف يشرف على تنظيم جميع أنحاء العالم. (ar)
- Protein Data Bank (zkráceně PDB) je primární databáze 3-D struktur makromolekul jako např. proteinů, nukleových kyselin. PDB je důležitý zdroj bioinformatických dat pro molekulární biologii, medicínu a farmacii. Všechny uložené struktury a data jsou volně dostupné. Může je vkládat kdokoliv, není tedy zajištěna bezchybnost uveřejněných záznamů. Zdrojem dat bývá experimentální měření metodami NMR a X-ray krystalografie. V roce 2003 byla založena organizace wwPDB (Worldwide Protein Data Bank), která zajišťuje chod celé online databáze, její anotaci a sleduje její vývoj. Financování databáze je umožněno díky vládním příspěvkům a uživatelským poplatkům. (cs)
- Η Βάση Δεδομένων Πρωτεϊνών (PDB) είναι μια βάση δεδομένων για τα τρισδιάστατα δομικά δεδομένα μεγάλων βιολογικών μορίων, όπως οι πρωτεΐνες και τα νουκλεϊκά οξέα. Τα δεδομένα, που λαμβάνονται συνήθως με κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ, φασματοσκοπία NMR ή, ολοένα και περισσότερο, κρυοηλεκτρονική μικροσκοπία, και υποβάλλονται από βιολόγους και βιοχημικούς από όλο τον κόσμο, είναι ελεύθερα προσβάσιμα στο Διαδίκτυο μέσω των ιστοσελίδων των οργανισμών μελών του (PDBe, PDBj, RCSB, και BMRB). Το PDB εποπτεύεται από έναν οργανισμό που ονομάζεται Worldwide Protein Data Bank, wwPDB. Το PDB είναι βασικό σε τομείς της δομικής βιολογίας, όπως η δομική γονιδιωματική. Τα περισσότερα μεγάλα επιστημονικά περιοδικά και ορισμένοι φορείς χρηματοδότησης απαιτούν τώρα από τους επιστήμονες να υποβάλουν τα δεδομένα δομής τους στο PDB. Πολλές άλλες βάσεις δεδομένων χρησιμοποιούν πρωτεϊνικές δομές που έχουν κατατεθεί στο PDB. Για παράδειγμα, το SCOP και το CATH ταξινομούν τις πρωτεϊνικές δομές, ενώ το PDBsum παρέχει μια γραφική επισκόπηση των καταχωρήσεων PDB χρησιμοποιώντας πληροφορίες από άλλες πηγές, όπως η οντολογία γονιδίων. (el)
- Die Protein Data Bank (PDB) ist eine Open AccessDatenbank für 3D-Strukturdaten von großen biologischen Molekülen. Über ein Internet-Informationsportal und ein herunterladbares Datenarchiv bietet die PDB Zugang zu 3D-Strukturdaten für Proteine, DNA und RNA. Sie ist heute eine weltweit führende Ressource für experimentelle Daten, die für wissenschaftliche Entdeckungen von zentraler Bedeutung sind. Die Kenntnis der 3D-Struktur eines biologischen Makromoleküls ist wesentlich für das Verständnis seiner Funktion. Die Strukturdaten wurden üblicherweise durch Kristallstrukturanalyse oder NMR-Spektroskopie gewonnen. Das Archiv der Proteindatenbank (PDB) enthält derzeit über 158.000 Einträge (Stand 2019) als 3D-Strukturen von Biomolekülen auf atomarer Ebene. Die PDB wurde 1971 als erste frei zugängliche, digitale Datenquelle in der Biologie eingerichtet und die Rechenzentren werden von der "Research Collaboratory for Structural Bioinformatics" (RCSB PDB) betrieben. Sie stellt PDB-Daten allen Datenkonsumenten kostenlos und ohne Nutzungseinschränkungen (Policies) zur Verfügung. Die RCSB-PDB wird an den Standorten Rutgers, der State University of New Jersey und dem University of California San Diego/San Diego SupercomputerCenter betrieben. Durch eine einzigartige Vereinbarung werden PDB-Daten auch von anderen Partnern der Worldwide Protein Data Bank (einschließlich der Protein Data Bank Europe (PDBe)), Protein Data Bank Japan und der Biological Magnetic Resonance Bank zur Verfügung gestellt. Das RCSB-PDB-Team (das an der Rutgers University und der University of CaliforniaSan Diego tätig ist) ist jedoch der wwPDB-Archivbetreuer und ist auch für die Datenintegrität und die Notfallwiederherstellung verantwortlich. Die Betriebskosten des RCSB-PDB, einschließlich der Kosten für die Datenerstellung und ‑speicherung sowie andere Ausgaben belaufen sich auf insgesamt 6,9 Millionen US-Dollar pro Jahr. (de)
- Protein Data Bank (PDB) (Banco de Datos de Proteínas) es una base de datos de la estructura tridimensional de las proteínas y ácidos nucleicos. Estos datos, generalmente obtenidos mediante cristalografía de rayos X o resonancia magnética nuclear, son enviados por biólogos y bioquímicos de todo el mundo. Están bajo el dominio público y pueden ser usados libremente. El PDB está supervisado por una organización llamada Worldwide Protein Data Bank (wwPDB). (es)
- Protein Data Bank (PDB) adalah suatu basis data bagi data struktur tiga dimensi dari molekul biologis berukuran besar, seperti protein dan asam nukleat. Data tersebut, biasanya diperoleh dari kristalografi sinar-X, spektroskopi NMR, atau, yang terbaru melalui , kemudian diunggah oleh para ahli biologi dan biokimiawan dari seluruh dunia, dapat diakses secara bebas di internet melalui situs web organisasi anggotanya (PDBe, PDBj, dan RCSB). PDB diawasi oleh suatu organisasi yang disebut dengan , wwPDB. PDB merupakan basis data yang sangat penting dalam bidang biologi struktur, seperti . Sebagian besar jurnal ilmiah utama, dan beberapa agensi pendanaan, saat ini mengharuskan ilmuwan untuk menyerahkan data struktur hasil penelitian mereka pada PDB. Banyak basis data lainnya yang menggunakan struktur protein yang tersimpan di PDB. Misalnya, dan mengelompokkan struktur protein, sementara menyediakan ikhtisar grafis dari entri PDB menggunakan informasi dari sumber lain, seperti . (in)
- The Protein Data Bank (PDB) is a database for the three-dimensional structural data of large biological molecules, such as proteins and nucleic acids. The data, typically obtained by X-ray crystallography, NMR spectroscopy, or, increasingly, cryo-electron microscopy, and submitted by biologists and biochemists from around the world, are freely accessible on the Internet via the websites of its member organisations (PDBe, PDBj, RCSB, and BMRB). The PDB is overseen by an organization called the Worldwide Protein Data Bank, wwPDB. The PDB is a key in areas of structural biology, such as structural genomics. Most major scientific journals and some funding agencies now require scientists to submit their structure data to the PDB. Many other databases use protein structures deposited in the PDB. For example, SCOP and CATH classify protein structures, while PDBsum provides a graphic overview of PDB entries using information from other sources, such as Gene ontology. (en)
- La banque de données sur les protéines ou BDP du Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, plus communément appelée Protein Data Bank ou PDB est une collection mondiale de données sur la structure tridimensionnelle (ou structure 3D) de macromolécules biologiques : protéines, essentiellement, et acides nucléiques. Ces structures sont essentiellement déterminées par cristallographie aux rayons X ou par spectroscopie RMN. Ces données expérimentales sont déposées dans la PDB par des biologistes et des biochimistes du monde entier et appartiennent au domaine public. Leur consultation est gratuite et peut se faire directement depuis les sites internet de la banque :
* Europe : PDBe ;
* Japon : PDBj ;
* États-Unis : RCSB PDB. La PDB est la principale source de données de biologie structurale et permet en particulier d’accéder à des structures 3D de protéines d’intérêt pharmaceutique. (fr)
- Il Protein Data Bank (PDB) è un archivio per dati di struttura in 3-D di proteine e acidi nucleici. Questi dati, ottenuti soprattutto grazie alla cristallografia ai raggi X o alla spettrografia NMR, depositati da biologi e biochimici di tutto il mondo, sono di pubblico dominio e sono accessibili gratuitamente. Il database è il deposito centrale dei dati biologici di struttura. (it)
- 단백질 정보 은행(蛋白質情報銀行, Protein Data Bank)은 브루크하벤 국립 연구소에 의해 1971년 세워졌으며, 단백질 정보 은행의 관리는 1998년 구조적 생물정보학을 위한 공동연구소 (RCSB)로 옮겨졌다. 전 세계 단백질 정보 은행(wwPDB)는 PDB 정보를 처리하고, 분배, 폐기하는 기관으로 작동하고 있다. wwPDB의 목적은 거대분자의 구조에 대한 각각 PDB의 기록을 보존하고, 전지구적 공동체에게 자유롭게 이용할 수 있도록 하는 것이다. 단백질정보은행은 구조생물학의 핵심 출처이며, 구조유전학의 최근 작업에 결정적인 기여를 해 왔다. 무수한 파생 데이터베이스와 프로젝트들이 PDB를 단백질의 구조, 단백질의 역할, 단백질의 진화의 표현으로 통합하고, 분류하기 위해 발전되어 왔다. (ko)
- 蛋白質構造データバンク（たんぱくしつこうぞうデータバンク，PDB: Protein Data Bank）は，蛋白質（タンパク質），核酸，糖鎖など生体高分子の3次元構造の原子座標（立体配座）を蓄積している国際的な公共のデータベースである。PDBに蓄積されている構造データは，結晶解析法，核磁気共鳴法（NMR法），クライオ電子顕微鏡法の3つの検証可能な手法によって実験的に決定されたデータである。なお，理論的な予測（蛋白質構造予測）で推定されたデータは蓄積していない。 世界中の構造生物学者が決定した構造情報は，論文発表前にPDBに登録することが義務付けられており，論文発表と同時にPDBへ登録済みの構造データが一般公開される仕組みになっている。PDBの運営は日米欧の各拠点機関が国際的に協力することで成り立っており，南北アメリカとオセアニア地区で解析されたデータは米国で，欧州とアフリカ地区からのデータは欧州で，アジア・中東地区で解析されたデータは日本でデータ登録処理が行われる。日本の拠点活動は，大阪大学蛋白質研究所のProtein Data Bank Japan（PDBj）が担当している。PDBに登録されたデータは，事前に日米欧の各拠点間でデータ交換され，パブリックドメインのもとで完全に同一なデータとして一般公開される。 PDBは，生命科学研究の中心的なデータベースのひとつである。構造生物学をはじめとする基礎研究のみならず，創薬や食品工学，細胞工学などの応用分野でも欠かせない情報源となっている。バイオインフォマティクスの研究でも，PDBに代表される3次元分子構造データベースは重要な研究対象である。PDBから派生したデータベースとプロジェクトは非常に多く，蛋白質の構造・機能・進化のそれぞれの側面から，PDBの構造データの統合や分類が行われている。 (ja)
- Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych. Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów. Na dzień 26 października 2020 r. baza PDB zawierała 170 171 następujących struktur: (pl)
- De Protein Data Bank (PDB) is een vrij toegankelijke databank met gegevens van grote biomoleculen zoals eiwitten en nucleïnezuren. De PDB wordt beheerd door de organisatie Worldwide Protein Data Bank (wwPDB). De gegevens in de databank zijn voornamelijk afkomstig van röntgendiffractie en NMR-spectroscopie door wetenschappers over de hele wereld. De PDB is een belangrijke bron voor onder meer de verschillende takken van de systeembiologie, zoals structurele genomica. De meeste belangrijke journals en organisaties, zoals de National Institutes of Health in de Verenigde Staten, eisen van wetenschappers dat ze hun structuurgegevens op de PDB plaatsen. Andere databanken maken gebruik van de gegevens in de PDB om eiwitten te classificeren volgens bepaalde patronen. Zo verdelen bijvoorbeeld SCOP en CATH de structuren onder in groepen volgens het type structuur en de veronderstelde evolutionaire relaties; Gene Ontology categoriseert de structuren op basis van genen. (nl)
- Protein Data Bank (PDB) är en biodatabas som samlar 3D-strukturer för biologiskt viktiga molekyler, så som proteiner och nukleinsyror. Informationen bygger oftast på experiment utförda med hjälp av röntgenkristallografi eller NMR-spektroskopi. All data läggs in av forskare över hela världen och är fritt tillgänglig över internet. PDB är ett ofta använt verktyg inom områdena och . Många vetenskapliga tidskrifter och även flera finansiera organisationer, så som amerikanska NIH, kräver att strukturdata ska publiceras i PDB. (sv)
- Банк даних білків (англ. Protein Data Bank, PDB) — сховище для тривимірних структурних даних білків і нуклеїнових кислот. Ці дані, зазвичай отримані методами рентгеноструктурного аналізу і ЯМР-спектроскопії, постачаються біологами і біохіміками зі всього світу. В цій базі даних вони знаходяться у публічному домені та можуть використовуватися безкоштовно. (uk)
- O PDB (Protein Data Bank; em português: Banco de Dados de Proteínas) é um banco de dados em 3D de proteínas e ácidos nucléicos. Esses dados, geralmente obtidos através da difração de raios X, ressonância magnética nuclear e crio-microscopia eletrônica são enviados por físicos, biólogos e bioquímicos de todo o mundo. Disponíveis em domínio público, podem ser usados livremente. (pt)
- 蛋白質資料庫（Protein Data Bank，简称PDB）是一個專門收錄蛋白質及核酸的三維結構資料的数据庫。由Worldwide Protein Data Bank监管。PDB可以经由网络免费访问，是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威，各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。在PDB的基础上，还发展出来若干依据不同原则对PDB结构数据进行分类的数据库，例如GO将PDB中的数据按基因进行了分类。這些資料和數據一般是世界各地的结构生物学家經由X射線晶體學或NMR光譜學實驗所得，並釋放到公有領域供公众免費使用。 (zh)
- Protein Data Bank, PDB — банк данных трёхмерных структур белков и нуклеиновых кислот. Информация, полученная методами рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии, и, всё чаще, методом криоэлектронной микроскопии вносится в базу данных биологами и биохимиками со всего мира, и доступна бесплатно через интернет сайты организаций-членов (PDBe, PDBj, RCSB). PDB является одним из важнейших ресурсов для учёных, работающих в области структурной биологии. Большинство научных журналов и некоторые фонды финансирования исследований, например, NIH в США требуют от авторов статей и получателей грантов, чтобы все структурные данные были размещены в PDB. Protein Data Bank содержит в основном первичные данные о структуре биологических молекул, в то время как существуют сотни других банков данных, категоризирующих первичные данные или выявляющие закономерности между строением молекул и эволюционным родством. (ru)
|
| rdfs:comment
|
- El Protein Data Bank (PDB) (Banc de dades de proteïnes), és un dipòsit d'estructures 3-D de proteïnes i àcids nucleics. Aquesta informació, obtinguda bàsicament per cristal·lografia de raigs X i ressonància magnètica nuclear, és incorporada per biòlegs, químics i bioquímics d'arreu del món, és de domini públic i pot ser emprada lliurement. (ca)
- بنك بيانات البروتين (بالإنجليزية: Protein Data Bank (PDB)) وهو مستودع للبيانات الهيكلية ثلاثي الأبعاد للجزيئات البيولوجية الكبيرة، مثل البروتينات والأحماض النووية. ويمكن للبيانات، وعادة ما يتم الحصول عليها عن طريق البلوريات بالأشعة السينية أو مطياف الرنين المغناطيسي النووي، والذي قدمه علماء الأحياء والكيمياء الحيوية من مختلف أنحاء العالم، يمكن الوصول إليها على شبكة الانترنت. والمصرف يشرف على تنظيم جميع أنحاء العالم. (ar)
- Protein Data Bank (zkráceně PDB) je primární databáze 3-D struktur makromolekul jako např. proteinů, nukleových kyselin. PDB je důležitý zdroj bioinformatických dat pro molekulární biologii, medicínu a farmacii. Všechny uložené struktury a data jsou volně dostupné. Může je vkládat kdokoliv, není tedy zajištěna bezchybnost uveřejněných záznamů. Zdrojem dat bývá experimentální měření metodami NMR a X-ray krystalografie. V roce 2003 byla založena organizace wwPDB (Worldwide Protein Data Bank), která zajišťuje chod celé online databáze, její anotaci a sleduje její vývoj. Financování databáze je umožněno díky vládním příspěvkům a uživatelským poplatkům. (cs)
- Protein Data Bank (PDB) (Banco de Datos de Proteínas) es una base de datos de la estructura tridimensional de las proteínas y ácidos nucleicos. Estos datos, generalmente obtenidos mediante cristalografía de rayos X o resonancia magnética nuclear, son enviados por biólogos y bioquímicos de todo el mundo. Están bajo el dominio público y pueden ser usados libremente. El PDB está supervisado por una organización llamada Worldwide Protein Data Bank (wwPDB). (es)
- Il Protein Data Bank (PDB) è un archivio per dati di struttura in 3-D di proteine e acidi nucleici. Questi dati, ottenuti soprattutto grazie alla cristallografia ai raggi X o alla spettrografia NMR, depositati da biologi e biochimici di tutto il mondo, sono di pubblico dominio e sono accessibili gratuitamente. Il database è il deposito centrale dei dati biologici di struttura. (it)
- 단백질 정보 은행(蛋白質情報銀行, Protein Data Bank)은 브루크하벤 국립 연구소에 의해 1971년 세워졌으며, 단백질 정보 은행의 관리는 1998년 구조적 생물정보학을 위한 공동연구소 (RCSB)로 옮겨졌다. 전 세계 단백질 정보 은행(wwPDB)는 PDB 정보를 처리하고, 분배, 폐기하는 기관으로 작동하고 있다. wwPDB의 목적은 거대분자의 구조에 대한 각각 PDB의 기록을 보존하고, 전지구적 공동체에게 자유롭게 이용할 수 있도록 하는 것이다. 단백질정보은행은 구조생물학의 핵심 출처이며, 구조유전학의 최근 작업에 결정적인 기여를 해 왔다. 무수한 파생 데이터베이스와 프로젝트들이 PDB를 단백질의 구조, 단백질의 역할, 단백질의 진화의 표현으로 통합하고, 분류하기 위해 발전되어 왔다. (ko)
- Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych. Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów. Na dzień 26 października 2020 r. baza PDB zawierała 170 171 następujących struktur: (pl)
- Protein Data Bank (PDB) är en biodatabas som samlar 3D-strukturer för biologiskt viktiga molekyler, så som proteiner och nukleinsyror. Informationen bygger oftast på experiment utförda med hjälp av röntgenkristallografi eller NMR-spektroskopi. All data läggs in av forskare över hela världen och är fritt tillgänglig över internet. PDB är ett ofta använt verktyg inom områdena och . Många vetenskapliga tidskrifter och även flera finansiera organisationer, så som amerikanska NIH, kräver att strukturdata ska publiceras i PDB. (sv)
- Банк даних білків (англ. Protein Data Bank, PDB) — сховище для тривимірних структурних даних білків і нуклеїнових кислот. Ці дані, зазвичай отримані методами рентгеноструктурного аналізу і ЯМР-спектроскопії, постачаються біологами і біохіміками зі всього світу. В цій базі даних вони знаходяться у публічному домені та можуть використовуватися безкоштовно. (uk)
- O PDB (Protein Data Bank; em português: Banco de Dados de Proteínas) é um banco de dados em 3D de proteínas e ácidos nucléicos. Esses dados, geralmente obtidos através da difração de raios X, ressonância magnética nuclear e crio-microscopia eletrônica são enviados por físicos, biólogos e bioquímicos de todo o mundo. Disponíveis em domínio público, podem ser usados livremente. (pt)
- 蛋白質資料庫（Protein Data Bank，简称PDB）是一個專門收錄蛋白質及核酸的三維結構資料的数据庫。由Worldwide Protein Data Bank监管。PDB可以经由网络免费访问，是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威，各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。在PDB的基础上，还发展出来若干依据不同原则对PDB结构数据进行分类的数据库，例如GO将PDB中的数据按基因进行了分类。這些資料和數據一般是世界各地的结构生物学家經由X射線晶體學或NMR光譜學實驗所得，並釋放到公有領域供公众免費使用。 (zh)
- Η Βάση Δεδομένων Πρωτεϊνών (PDB) είναι μια βάση δεδομένων για τα τρισδιάστατα δομικά δεδομένα μεγάλων βιολογικών μορίων, όπως οι πρωτεΐνες και τα νουκλεϊκά οξέα. Τα δεδομένα, που λαμβάνονται συνήθως με κρυσταλλογραφία ακτίνων Χ, φασματοσκοπία NMR ή, ολοένα και περισσότερο, κρυοηλεκτρονική μικροσκοπία, και υποβάλλονται από βιολόγους και βιοχημικούς από όλο τον κόσμο, είναι ελεύθερα προσβάσιμα στο Διαδίκτυο μέσω των ιστοσελίδων των οργανισμών μελών του (PDBe, PDBj, RCSB, και BMRB). Το PDB εποπτεύεται από έναν οργανισμό που ονομάζεται Worldwide Protein Data Bank, wwPDB. (el)
- Die Protein Data Bank (PDB) ist eine Open AccessDatenbank für 3D-Strukturdaten von großen biologischen Molekülen. Über ein Internet-Informationsportal und ein herunterladbares Datenarchiv bietet die PDB Zugang zu 3D-Strukturdaten für Proteine, DNA und RNA. Sie ist heute eine weltweit führende Ressource für experimentelle Daten, die für wissenschaftliche Entdeckungen von zentraler Bedeutung sind. Die Kenntnis der 3D-Struktur eines biologischen Makromoleküls ist wesentlich für das Verständnis seiner Funktion. Die Strukturdaten wurden üblicherweise durch Kristallstrukturanalyse oder NMR-Spektroskopie gewonnen. (de)
- The Protein Data Bank (PDB) is a database for the three-dimensional structural data of large biological molecules, such as proteins and nucleic acids. The data, typically obtained by X-ray crystallography, NMR spectroscopy, or, increasingly, cryo-electron microscopy, and submitted by biologists and biochemists from around the world, are freely accessible on the Internet via the websites of its member organisations (PDBe, PDBj, RCSB, and BMRB). The PDB is overseen by an organization called the Worldwide Protein Data Bank, wwPDB. (en)
- La banque de données sur les protéines ou BDP du Research Collaboratory for Structural Bioinformatics, plus communément appelée Protein Data Bank ou PDB est une collection mondiale de données sur la structure tridimensionnelle (ou structure 3D) de macromolécules biologiques : protéines, essentiellement, et acides nucléiques. Ces structures sont essentiellement déterminées par cristallographie aux rayons X ou par spectroscopie RMN. Ces données expérimentales sont déposées dans la PDB par des biologistes et des biochimistes du monde entier et appartiennent au domaine public. Leur consultation est gratuite et peut se faire directement depuis les sites internet de la banque : (fr)
- Protein Data Bank (PDB) adalah suatu basis data bagi data struktur tiga dimensi dari molekul biologis berukuran besar, seperti protein dan asam nukleat. Data tersebut, biasanya diperoleh dari kristalografi sinar-X, spektroskopi NMR, atau, yang terbaru melalui , kemudian diunggah oleh para ahli biologi dan biokimiawan dari seluruh dunia, dapat diakses secara bebas di internet melalui situs web organisasi anggotanya (PDBe, PDBj, dan RCSB). PDB diawasi oleh suatu organisasi yang disebut dengan , wwPDB. (in)
- 蛋白質構造データバンク（たんぱくしつこうぞうデータバンク，PDB: Protein Data Bank）は，蛋白質（タンパク質），核酸，糖鎖など生体高分子の3次元構造の原子座標（立体配座）を蓄積している国際的な公共のデータベースである。PDBに蓄積されている構造データは，結晶解析法，核磁気共鳴法（NMR法），クライオ電子顕微鏡法の3つの検証可能な手法によって実験的に決定されたデータである。なお，理論的な予測（蛋白質構造予測）で推定されたデータは蓄積していない。 世界中の構造生物学者が決定した構造情報は，論文発表前にPDBに登録することが義務付けられており，論文発表と同時にPDBへ登録済みの構造データが一般公開される仕組みになっている。PDBの運営は日米欧の各拠点機関が国際的に協力することで成り立っており，南北アメリカとオセアニア地区で解析されたデータは米国で，欧州とアフリカ地区からのデータは欧州で，アジア・中東地区で解析されたデータは日本でデータ登録処理が行われる。日本の拠点活動は，大阪大学蛋白質研究所のProtein Data Bank Japan（PDBj）が担当している。PDBに登録されたデータは，事前に日米欧の各拠点間でデータ交換され，パブリックドメインのもとで完全に同一なデータとして一般公開される。 (ja)
- De Protein Data Bank (PDB) is een vrij toegankelijke databank met gegevens van grote biomoleculen zoals eiwitten en nucleïnezuren. De PDB wordt beheerd door de organisatie Worldwide Protein Data Bank (wwPDB). De gegevens in de databank zijn voornamelijk afkomstig van röntgendiffractie en NMR-spectroscopie door wetenschappers over de hele wereld. (nl)
- Protein Data Bank, PDB — банк данных трёхмерных структур белков и нуклеиновых кислот. Информация, полученная методами рентгеновской кристаллографии или ЯМР-спектроскопии, и, всё чаще, методом криоэлектронной микроскопии вносится в базу данных биологами и биохимиками со всего мира, и доступна бесплатно через интернет сайты организаций-членов (PDBe, PDBj, RCSB). (ru)
|