JP7167088B2 - インフルエンザウイルスワクチンおよびその使用 - Google Patents
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Description
テムドメインポリペプチド、ヘマグルチニンステムドメインポリペプチドを提供する方法
、それを含む組成物、それを含むワクチンならびに特にインフルエンザの検出、予防およ
び/または治療におけるそれらの使用方法が提供される。
得る原発性ウイルス肺炎まで重症度に幅がある呼吸器疾患(一般に「インフルエンザ(i
nfluenza)」または「インフルエンザ(the flu)」と称される)を引き
起こす。感染の臨床効果は、インフルエンザ株の病原性ならびに宿主の曝露、既往歴、年
齢、および免疫状態により変動する。毎年、世界中で約10億人の人々がインフルエンザ
ウイルスによる感染を受け、3~5百万症例の重病および推定300,000から500
,000のインフルエンザ関連死をもたらすことが推定されている。これらの感染の大部
分は、H1またはH3ヘマグルチニン亜型を担持するインフルエンザAウイルスに起因し
得、インフルエンザBウイルスからの寄与は小さく、したがって、3つ全ての代表物は季
節性ワクチンに含まれる。現在の予防接種実施は、有効な季節性インフルエンザワクチン
の適時産生を可能とするための循環インフルエンザウイルスの早期同定に依存する。次の
季節の間に優性となる株の予測の固有の困難性とは別に、抗ウイルス耐性および免疫回避
も、現在のワクチンが罹患および死亡を予防することができない一因である。これに加え
、病原体保有動物から生じ、ヒトからヒトへの拡散を増加させるようにリアソートされた
高度に病原性のウイルス株により引き起こされる流行病の可能性は、グローバルヘルスに
とって顕著で現実的な脅威となる。
感染し得る。インフルエンザウイルスは、オルトミクソウイルス科(Orthomyxo
viridae)の科に属するエンベロープRNAウイルスである。これらのゲノムは、
11の異なるタンパク質、1つの核タンパク質(NP)、3つのポリメラーゼタンパク質
(PA、PB1、およびPB2)、2つのマトリックスタンパク質(M1およびM2)、
3つの非構造タンパク質(NS1、NS2、およびPB1-F2)、および2つの外部糖
タンパク質:ヘマグルチニン(HA)およびノイラミニダーゼ(NA)をコードする8つ
の一本鎖RNAセグメントからなる。ウイルスは、HAおよびNAタンパク質の抗原構造
の差に基づき分類され、それらの異なる組合せは、規定のインフルエンザウイルス株にさ
らに分類されるユニークなウイルス亜型を表す。全ての公知の亜型は鳥類において見出す
ことができるが、現在循環するヒトインフルエンザA亜型は、H1N1およびH3N2で
ある。系統発生分析は、ヘマグルチニンの2つの主群への下位分類を実証した:とりわけ
系統発生グループ1におけるH1、H2、H5およびH9亜型およびとりわけ系統発生グ
ループ2におけるH3、H4およびH7亜型。
株内のHAにおける抗原変異は、A型株内で観察されるものよりも小さい。2つの遺伝的
および抗原的に区別されるインフルエンザBウイルスの系統は、B/Yamagata/
16/88(B/Yamagataとも称される)およびB/Victoria/2/8
7(B/Victoria)系統により表わされるとおり、ヒトにおいて循環している(
Ferguson et al.,2003)。インフルエンザBウイルスにより引き起
こされる疾患のスペクトルは、インフルエンザAウイルスにより引き起こされるものより
も一般に軽度であるが、インフルエンザB感染について入院を要する重病が依然として頻
繁に観察される。
ことは公知である。ヘマグルチニンまたはHAは、ウイルスコートにアンカリングされ、
二重の機能を有する三量体糖タンパク質であり:それは細胞表面受容体シアル酸への結合
を担い、取り込み後、それはウイルスおよびエンドソーム膜の融合を媒介し、細胞の細胞
質ゾル中でのウイルスRNAの放出をもたらす。HAは、大型の頭部ドメインおよびより
小型のステムドメインを含む。ウイルス膜への付着は、ステムドメインに連結されたC末
端アンカリング配列により媒介される。タンパク質は、特定のループで翻訳後開裂されて
2つのポリペプチドHA1およびHA2を生じさせる(全配列は、HA0と称される)。
膜遠位頭部領域は、主としてHA1に由来し、膜近位ステム領域は、主としてHA2に由
来する(図1)。
スの大きい変異性である。ヘマグルチニン分子において、この変異は、抗原ドリフトおよ
びシフトが多数の異なるバリアントをもたらした頭部ドメイン中で特に顕在化される。こ
れは、免疫優性の区域でもあるため、ほとんどの中和抗体はこのドメインに対して指向さ
れ、受容体結合を妨げることにより作用する。頭部ドメインの免疫優性および大きい変異
の組合せは、なぜ特定の株による感染が他の株に対する免疫をもたらさないかも説明し:
第1の感染により誘発される抗体は、一次感染のウイルスと密接に関連する限定数の株を
認識するにすぎない。
くインフルエンザヘマグルチニンステムドメインポリペプチドが記載されており、ステム
ドメインポリペプチドの1つ以上の保存エピトープに対する免疫応答を生成するために使
用されている。ステムドメインポリペプチドのエピトープは、球状頭部ドメインの高度に
免疫原性の領域よりも免疫原性でなく、したがってステムドメインポリペプチド中の球状
頭部ドメインの不存在がステムドメインポリペプチドの1つ以上のエピトープに対する免
疫応答の発現を許容し得ると考えられている(Steel et al.,2010)。
したがって、Steel et al.は、A/Puerto Rico/8/1934
(H1N1)およびA/HongKong/1968(H3N2)株のHA1のアミノ酸
残基53から276をHA一次配列から欠失させ、これを短いフレキシブル結合配列GG
GGにより置き換えることにより新規分子を作出した。H3HK68構築物によるマウス
のワクチン接種は、グループ1のHAと交差反応性の抗血清を誘発しなかった。さらに、
PCT/EP2012/073706において示されるとおり、ステムドメインポリペプ
チドは高度に不安定であり、ステム領域中の保存エピトープに結合することが示された抗
体の結合の欠落により証明されるとおり、正確な立体構造を採用しなかった。
1~172、7アミノ酸リンカー(GSAGSAG)、HA1のアミノ酸残基7~46、
6アミノ酸リンカーGSAGSAに続くHA1の残基290~321を、HA1中の突然
変異V297T、I300E、Y302TおよびC305Tとともに含むHA2ベースポ
リペプチドを記載した。設計は、H3HA(A/HongKong/1968)の配列を
ベースとした。このポリペプチドは、H3亜型内の別のインフルエンザウイルス株に対す
る交差保護を提供したにすぎなかった(A/Phil/2/82に対して提供したが、H
1亜型(A/PR/8/34に対しては提供しなかった)。Bommakanti et
al(2012)によるより近年の論文において、H1N1A/Puerto Ric
o/8/1934からのHAをベースとするステムドメイン配列(H1HA0HA6)が
記載されている。このポリペプチドにおいて、残基55から302の相当物が欠失してお
り、突然変異I311T、V314T、I316N、C319S、F406D、F409
T、およびL416Dが作製されている。H3およびHAベースポリペプチドの両方が、
大腸菌(E.coli)中で発現され、したがって、天然HAタンパク質の一部であるグ
リカンを欠く。大腸菌(E.coli)中で発現される場合、ポリペプチドは、主として
高分子量凝集物および微量単量体分画として回収される。ポリペプチドは、9および0.
2μMの2つの見かけの解離定数でCR6261に結合する。著者らは、マウスが、10
0μgのCpG7909がアジュバント添加された20μgのタンパク質による免疫化(
2回、4週間の間隔)後、1LD90の同種H1N1A/Puerto Rico/8/
1934ウイルスによるチャレンジを生存し得ることを示す。著者らは、A/Hong
Kong/1/1968由来ポリペプチドについて上記のものと同等の環状に並べ替えら
れたポリペプチドも記載する。これらのポリペプチドは、H1N1A/Puerto R
ico/8/1934、H1N1A/North Carolina/20/99または
H1N1A/California/07/2009からのHAに由来し、H1N1A/
Puerto Rico/8/1934(すなわち、同一亜型内)のマウスにおける軽度
チャレンジ(1LD90)モデルの部分的保護を提供し得る。これらのポリペプチドによ
り免疫化されたモルモットからの血清は、中和アッセイにおいて試験された場合に検出可
能レベルの中和を示さなかった。
5/2009のHAに由来する可溶性ステムドメインポリペプチドを記載した。最終設計
において、残基54~303(配列番号1による番号付与)の相当物が欠失しており(リ
ーダー配列、残基1~17も存在しない)、2つの突然変異がタンパク質のBループ、す
なわち、F407D、およびL413D中に導入されている。さらに、ポリペプチドは、
C末端三量体化ドメイン(foldon)を含有した。さらに、2つの単量体間ジスルフ
ィド架橋が、三量体foldonドメインの区域中に1つ、ならびに430および431
位に1つ導入された。ポリペプチドは、大腸菌(E.coli)ベース無細胞系中で産生
され(したがって、天然HAタンパク質の一部であるグリカンを欠く)、使用前にリフォ
ールドさせる必要がある変性形態で回収される。インフルエンザチャレンジデータから免
疫学的または保護は示されなかった。
ドメインポリペプチドを報告している。この設計において、H1N1A/Puerto
Rico/8/1934からのHAをベースとして、HA1配列の大部分が欠失している
だけでなく(残基42から289、配列番号1による番号付与)、HA2のNおよびC末
端配列の大部分も欠失している(それぞれ、残基344から383、および457から5
65)。ポリペプチドは、C末端におけるfoldon三量体化ドメインを含有し、大腸
菌(E.coli)中でも産生されるため、ウイルスHA上の天然グリカンを欠く。ポリ
ペプチドは、広域中和抗体CR6261、F10およびFI6v3に結合する。ポリペプ
チドは、インフルエンザチャレンジモデル(1LD90のH1N1A/Puerto R
ico/8/1934)においても試験され、マウスを死亡から保護し得た。H1N1A
/New Caledonia/20/1999およびH1N1A/Californi
a/04/2009のHAに由来する相当ポリペプチドも、部分的に保護し得た。H5N
1A/Viet Nam/1203/2004に由来するポリペプチドは、このチャレン
ジモデルにおいて限定された保護を与えたにすぎなかった。さらに、使用されるチャレン
ジモデルは、比較的低い投与用量(1~2LD90)で軽度である。
ルエンザウイルス株(季節性および流行性の両方)に対する保護を提供する、特にインフ
ルエンザの有効な予防および治療のために系統発生グループ1および/またはグループ2
内の1つ以上のインフルエンザAウイルス亜型に対する保護を提供する安全で有効なユニ
バーサルワクチンが依然として必要とされている。
ムドメインポリペプチドを提供する方法、それを含む組成物、それを含むワクチンおよび
それらの使用方法が提供される。
と称される、インフルエンザヘマグルチニンステムドメインを含み、球状頭部を欠く新規
免疫原性ポリペプチドを提供する。ポリペプチドは、対象、特にヒト対象に投与された場
合に免疫応答を誘導し得る。本発明のポリペプチドは、膜近位ステムドメインHA分子の
保存エピトープを、膜遠位頭部ドメイン中に存在する優性エピトープの不存在下で免疫系
に提示する。この目的のため、頭部ドメインを構成するHA0タンパク質の一次配列の一
部を除去し、残留アミノ酸配列を直接的にまたは、一部の実施形態において、短いフレキ
シブル結合配列(「リンカー」)を導入することにより再連結させてアミノ酸鎖の連続性
を回復させる。得られた配列を、HA0分子の残留部分の天然三次元構造を安定化する規
定の突然変異を導入することによりさらに改変する。免疫原性ポリペプチドは、インフル
エンザウイルスの全長HA1ドメインを含まない。
(a)HA1C末端ステムセグメントに0~50アミノ酸残基の結合配列により共有結合
しているHA1N末端ステムセグメントを含むインフルエンザヘマグルチニンHA1ドメ
インを含み、前記HA1C末端セグメントは、(b)インフルエンザヘマグルチニンHA
2ドメインに結合しており、HA1およびHA2ドメインは、H1亜型のHAを含むイン
フルエンザAウイルス亜型に由来し;
(c)HA1ドメインおよびHA2ドメイン間の連結部におけるプロテアーゼ開裂部位を
含まず;
(d)前記HA1N末端セグメントは、HA1のアミノ酸1~x、好ましくは、HA1の
アミノ酸p~xを含み、HA1C末端ステムセグメントは、HA1のアミノ酸y~C末端
アミノ酸を含み、x=配列番号1の52位(または別のヘマグルチニン中の相当位置)上
のアミノ酸であり、p=配列番号1の18位(または別のヘマグルチニン中の相当位置)
上のアミノ酸であり、y=配列番号1の321位(または別のヘマグルチニン中の相当位
置)上のアミノ酸であり;
(e)アミノ酸残基402~418を含む領域は、アミノ酸X1NTQX2TAX3GK
EX4N(H/K)X5E(K/R)(配列番号8)を含み:
X1は、M、E、K、V、RおよびTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X2は、F、I、N、T、H、LおよびY、好ましくは、I、LまたはYからなる群から
選択されるアミノ酸であり、
X3は、V、A、G、I、R、FおよびS、好ましくは、A、IまたはFからなる群から
選択されるアミノ酸であり、
X4は、F、I、N、S、T、Y、E、K、M、およびV、好ましくは、I、Y、Mまた
はVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X5は、L、H、I、N、R、好ましくは、Iからなる群から選択されるアミノ酸であり
;
(f)337位(HA1ドメイン)上のアミノ酸残基は、I、E、K、V、A、およびT
からなる群から選択され、
340位(HA1ドメイン)上のアミノ酸残基は、I、K、R、T、F、N、SおよびY
からなる群から選択され、
352位(HA2ドメイン)上のアミノ酸残基は、D、V、Y、A、I、N、S、および
Tからなる群から選択され、
353位(HA2ドメイン)上のアミノ酸残基は、K、R、T、E、G、およびVからな
る群から選択され;
(g)324位上のアミノ酸および436位上のアミノ酸間のジスルフィド架橋をさらに
含み;
(h)さらに、アミノ酸配列RMKQIEDKIEEIESK(配列番号20)が419
~433位において導入されており、または配列RMKQIEDKIEEIESKQK(
配列番号21)が417~433位において導入されている
ポリペプチドを提供する。
インおよび細胞内配列を含むHA2ドメインを含む。ある実施形態において、HA2ドメ
インは、トランケートされている。したがって、ある実施形態において、本発明のポリペ
プチドは、HAの細胞内配列および膜貫通ドメインを含有しない。ある実施形態において
、HA2ドメインの514、515、516、517、518、519、520、521
、522、523、524、525、526、527、526、528、529、または
530位(またはその相当物)からHA2ドメインのC末端のアミノ酸配列が除去されて
いる。
のN末端アミノ酸に結合しており、したがって、HA1およびHA2ドメイン間の連結部
を形成する。本発明のポリペプチドは、HA1およびHA2ドメイン間の連結部における
プロテアーゼ開裂部位を含まない。ある実施形態において、HA1C末端ステムセグメン
トのC末端アミノ酸残基(配列番号1のアミノ酸343)は、アルギニン(R)またはリ
ジン(K)以外の任意のアミノ酸、好ましくは、グルタミン(Q)である。
の全てまたは実質的に全てを欠く。好ましくは、免疫原性ポリペプチドは、360アミノ
酸長以下、好ましくは、350、340、330、320、310、305、300、2
95、290、285、280、275、または270アミノ酸長以下である。ある実施
形態において、免疫原性ポリペプチドは、約250から約350、好ましくは、約260
から約340、好ましくは、約270から約330、好ましくは、約270から約330
アミノ酸長である。
/028946号パンフレットに開示)および/または抗体CR9114(国際公開第2
013/007770号パンフレットに記載)、グループ1およびグループ2インフルエ
ンザAウイルスの両方、ならびにインフルエンザBウイルスに結合し、中和し得る抗体の
保存ステムドメインエピトープを含む。したがって、HAステムドメインポリペプチドで
あって、前記ポリペプチドへの前記1つまたは複数の抗体の結合により示されるとおり、
抗体CR6261および/またはCR9114のエピトープを安定的に提示するポリペプ
チドを提供することは、本発明の別の態様である。一実施形態において、ポリペプチドは
、H3インフルエンザウイルスのみに結合するモノクローナル抗体であるCR8020お
よびCR8057(国際公開第2010/130636号パンフレットに記載)に結合し
ない。
つまたは複数のインフルエンザウイルスAおよび/またはB株、特にH1亜型のインフル
エンザウイルスに対する免疫応答を生成し得る免疫原性組成物(例えば、ワクチン)にお
ける使用に好適である。一実施形態において、インフルエンザヘマグルチニンステムドメ
インポリペプチドは、系統発生グループ1および/またはグループ2のインフルエンザA
ウイルス株、特に系統発生グループ1およびグループ2の両方のインフルエンザウイルス
株に対する免疫応答を生成し得る。一実施形態において、ポリペプチドは、同種インフル
エンザウイルス株に対する免疫応答を生成し得る。一実施形態において、ポリペプチドは
、同一およびまたは異なる亜型の異種インフルエンザウイルス株に対する免疫応答を生成
し得る。さらなる実施形態において、ポリペプチドは、系統発生グループ1およびグルー
プ2の両方のインフルエンザウイルス株ならびにインフルエンザBウイルス株に対する免
疫応答を生成し得る。
プ1もしくは2インフルエンザAウイルスおよび/もしくはインフルエンザBウイルスに
より引き起こされる疾患または病態のスタンドアロン療法および/もしくは予防および/
もしくは診断において、または他の予防および/もしくは治療処置、例えば、(既存また
は将来の)ワクチン、抗ウイルス剤および/もしくはモノクローナル抗体との組合せで使
用することができる。
コードする核酸分子を提供する。さらに別の態様において、本発明は、免疫原性ポリペプ
チドをコードする核酸を含むベクターを提供する。
象に本発明によるポリペプチドおよび/または核酸分子および/またはベクターを投与す
ることを含む方法を提供する。
および/またはベクターを含む組成物を提供する。組成物は好ましくは免疫原性組成物で
ある。本明細書に提供される組成物は、対象、例えば、マウス、フェレットまたはヒトへ
の組成物の投与を可能とする任意の形態であり得る。具体的な実施形態において、組成物
は、ヒト投与に好適である。ポリペプチド、核酸分子および組成物は、インフルエンザウ
イルス疾患を予防および/もしくは治療する方法において、ならびに/または診断目的に
使用することができる。組成物は、薬学的に許容可能な担体または賦形剤をさらに含み得
る。ある実施形態において、本明細書に記載の組成物は、アジュバントを含み、またはア
ジュバントとの組合せで投与される。
またはベクターを提供する。本発明は、特に、系統発生グループ1および/もしくは2の
インフルエンザウイルスA亜型ならびに/またはインフルエンザBウイルスにより引き起
こされる疾患または病態、特にH1亜型のHAを含むインフルエンザウイルスにより引き
起こされる疾患または病態において予防および/または治療においてワクチンとして使用
される免疫原性ポリペプチド、核酸、および/またはベクターに関する。
から明確になる。
本発明において使用される用語の定義を以下に挙げる。
ト、例えば、D-プロリン(プロリンのD-エナンチオマー)など、またはタンパク質に
天然に見出されない任意のバリアント、例えば、ノルロイシンなどのいずれかであり得る
。標準アミノ酸は、それらの特性に基づきいくつかのグループに分割することができる。
重要な因子は、電荷、親水性または疎水性、サイズおよび官能基である。これらの特性は
、タンパク質構造およびタンパク質-タンパク質相互作用にとって重要である。一部のア
ミノ酸は、特別な特性を有し、例えば、システインは、他のシステイン残基への共有ジス
ルフィド結合(またはジスルフィド架橋)を形成し得、プロリンは、ポリペプチド骨格へ
の周期性を形成し、グリシンは、他のアミノ酸よりもフレキシブルである。表5は、標準
アミノ酸の略語および特性を示す。
ミノ酸配列間の同一性または類似性の程度を指す。同一性パーセントは、同一(すなわち
、アラインメント中の所与の位置におけるアミノ酸残基は、同一残基である)または類似
(すなわち、アラインメント中の所与の位置におけるアミノ酸置換は、以下に論じる保存
的置換である)の候補配列中のアミノ酸残基と、配列をアラインし、必要に応じてギャッ
プを導入して最大パーセント配列相同性を達成した後のペプチド中の対応するアミノ酸残
基との割合である。配列相同性、例として配列同一性および類似性の割合は、当分野にお
いて周知の配列アラインメント技術を使用して、例えば、目視調査および数学的計算によ
り決定され、またはより好ましくは、比較は、コンピュータプログラムを使用して配列情
報を比較することにより行われる。例示的な好ましいコンピュータプログラムは、Gen
etics Computer Group(GCG;Madison,Wis.)Wi
sconsinパッケージバージョン10.0プログラム、「GAP」(Devereu
x et al.(1984))である。
す。特定の実施形態において、保存的置換は、本発明のポリペプチドの構造もしくは機能
、またはその両方を変化させない。保存的置換の目的のためのアミノ酸のクラスには、疎
水性(例えば、Met、Ala、Val、Leu)、中性親水性(例えば、Cys、Se
r、Thr)、酸性(例えば、Asp、Glu)、塩基性(例えば、Asn、Gln、H
is、Lys、Arg)、立体構造破壊物質(例えば、Gly、Pro)および芳香族(
例えば、Trp、Tyr、Phe)が含まれる。
ために互換的に使用される。一部の実施形態において、病態は、ウイルス感染、特にイン
フルエンザウイルス感染である。具体的な実施形態において、用語「疾患」は、細胞もし
くは対象におけるウイルスの存在から生じ、またはウイルスによる細胞もしくは対象の侵
襲による病理的状態を指す。ある実施形態において、病態は、免疫原性組成物の投与を介
して対象において免疫応答を誘導することにより重症度が減少される対象における疾患で
ある。
予防および/または治療効果を有する治療物の量を指す。ある実施形態において、治療物
を対象に投与する文脈における「有効量」は、インフルエンザウイルス感染、それに伴う
疾患もしくは症状の重症度の低減もしくは改善、例えば、限定されるものではないが、イ
ンフルエンザウイルス感染、それに伴う疾患もしくは症状の持続時間の低減、インフルエ
ンザウイルス感染、それに伴う疾患もしくは症状の進行の予防、インフルエンザウイルス
感染、それに伴う疾患もしくは症状の発現もしくは発症もしくは再発の予防、ある対象か
ら別の対象へのインフルエンザウイルスの拡散の予防もしくは低減、対象の入院および/
もしくは入院期間の低減、インフルエンザウイルス感染もしくはそれに伴う疾患を有する
対象の生存率の増加、インフルエンザウイルス感染もしくはそれに伴う疾患の排除、イン
フルエンザウイルス複製の阻害もしくは低減、インフルエンザウイルス力価の低減;およ
び/または別の治療物の予防もしくは治療効果の向上および/もしくは改善を達成するた
めに十分な治療物の量を指す。ある実施形態において、有効量は、インフルエンザウイル
ス疾患からの完全な保護をもたらさないが、未治療対象と比較してより低い力価または低
減数のインフルエンザウイルスをもたらす。インフルエンザウイルスの力価、数または総
負荷の低減の利益には、限定されるものではないが、より軽度の感染症状、より少ない感
染症状および感染に伴う疾患の期間の低減が含まれる。
ーまたは発現ベクターが導入された生物または細胞を指すものとする。生物または細胞は
、原核または真核であり得る。好ましくは、宿主は、単離宿主細胞、例えば、培養物中の
宿主細胞を含む。用語「宿主細胞」は、細胞が本発明のポリペプチドの(過剰)発現のた
めに改変されていることを単に意味するにすぎない。宿主という用語は、特定の対象生物
または細胞を指すだけでなく、そのような生物または細胞の子孫も同様に指すものとする
ことを理解すべきである。ある改変が突然変異または環境的影響のいずれかに起因して後
続世代において生じ得るため、そのような子孫は、事実上、親生物または細胞と同一であ
り得ないが、依然として本明細書において使用される用語「宿主」の範囲内に含まれる。
されるものではないが」が続くものとみなされる。
および/または存在による侵襲を意味する。一実施形態において、感染は、「活性」感染
、すなわち、ウイルスが細胞または対象において複製しているものである。このような感
染は、ウイルスにより最初に感染された細胞、組織、および/または器官から他の細胞、
組織、および/または器官へのウイルスの拡散を特徴とする。感染は、潜伏感染、すなわ
ち、ウイルスが複製していないものでもあり得る。ある実施形態において、感染は、細胞
もしくは対象中のウイルスの存在から生じ、またはウイルスによる細胞もしくは対象の侵
襲による病理学的状態を指す。
る。本明細書において使用される用語「インフルエンザウイルス亜型」は、ヘマグルチニ
ン(H)およびノイラミニダーゼ(N)ウイルス表面タンパク質の組合せを特徴とするイ
ンフルエンザAウイルスバリアントを指す。本発明によれば、インフルエンザウイルス亜
型は、それらのH番号、例えば、「H3亜型のHAを含むインフルエンザウイルス」、「
H3亜型のインフルエンザウイルス」または「H3インフルエンザ」など、またはH番号
およびN番号の組合せ、例えば、「インフルエンザウイルス亜型H3N2」もしくは「H
3N2」などにより称することができる。用語「亜型」には、具体的には、通常、突然変
異から生し、異なる病原プロファイルを示すそれぞれの亜型内の全ての個々の「株」、例
として、天然分離株および人工突然変異体またはリアソータントなどが含まれる。このよ
うな株は、ウイルス亜型の種々の「分離株」と称することもできる。したがって、本明細
書において使用される用語「株」および「分離株」は、互換的に使用することができる。
ヒトインフルエンザウイルス株または分離株についての現在の命名法には、ウイルスの型
(属)、すなわち、A、BまたはC、最初の分離の地理的場所、株番号および分離年度に
通常括弧内に挙げられるHAおよびNAの抗原の記載が含まれ、例えば、A/Mosco
w/10/00(H3N2)である。非ヒト株には、命名法において起源の宿主も含まれ
る。インフルエンザAウイルス亜型は、それらの系統発生グループを参照することにより
さらに分類することができる。系統分析は、ヘマグルチニンの2つの主要グループへの下
位分類を実証した:とりわけ系統発生グループ1におけるH1、H2、H5およびH9亜
型(「グループ1」インフルエンザウイルス)およびとりわけ系統発生グループ2におけ
るH3、H4、H7およびH10亜型(「グループ2」インフルエンザウイルス」)。
象中のインフルエンザウイルス、例えば、インフルエンザAもしくはBウイルスの存在ま
たはインフルエンザウイルスによる細胞もしくは対象の侵襲から生じる病理学的状態を指
す。具体的な実施形態において、この用語は、インフルエンザウイルスにより引き起こさ
れる呼吸器疾病を指す。
ゲノムDNA)およびRNA分子(例えば、mRNA)ならびにヌクレオチドアナログを
使用して生成されたDNAまたはRNAのアナログが含まれるものとする。核酸は、一本
鎖または二本鎖であり得る。核酸分子は、化学的もしくは生化学的に改変することができ
、または非天然もしくは誘導体化ヌクレオチド塩基を含有し得、それは当業者により容易
に認識される。このような改変には、例えば、標識、メチル化、アナログによる天然ヌク
レオチドの1つ以上の置換、ヌクレオチド間改変、例えば、未荷電結合(例えば、メチル
ホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホラミデート、カルバメートなど)、荷電結合
(例えば、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエートなど)、懸垂部分(例えば、ポリ
ペプチド)、挿入剤(例えば、アクリジン、プソラレンなど)、キレート化剤、アルキル
化剤、および改変結合(例えば、アルファアノマー核酸など)が含まれる。核酸配列への
言及は、特に記載のない限り、その相補物を包含する。したがって、特定の配列を有する
核酸分子への言及は、その相補的配列を有するその相補鎖を包含すると理解すべきである
。相補鎖も、例えばアンチセンス療法、ハイブリダイゼーションプローブおよびPCRプ
ライマーに有用である。
野生型インフルエンザウイルスのHA0中のアミノ酸の番号付与、例えば、H1N1イン
フルエンザ株A/Brisbane/59/2007(配列番号1)のアミノ酸の番号付
与に基づく。したがって、本発明において使用される語「HA中の「x」位におけるアミ
ノ酸」は、特定の野生型インフルエンザウイルス、例えば、A/Brisbane/59
/2007(配列番号1;HA2ドメインのアミノ酸をイタリックで示した)のHA0中
のx位におけるアミノ酸に対応するアミノ酸を意味する。他のインフルエンザウイルス株
および/または亜型中の相当アミノ酸を多重配列アラインメントにより決定することがで
きることが当業者により理解される。本出願全体にわたり使用される番号付与系において
、1は、未成熟HA0タンパク質(配列番号1)のN末端アミノ酸を指すことに留意され
たい。成熟配列は、例えば、配列番号1の18位上で開始する。産生の間にタンパク質の
輸送を指向するリーダー配列(またはシグナル配列)(例えば、配列番号1のアミノ酸1
~17に対応)は一般に、例えば、ワクチンにおいて使用される最終ポリペプチド中に存
在しないことが当業者により理解される。したがって、ある実施形態において、本発明に
よるポリペプチドは、リーダー配列を有さないアミノ酸配列を含み、すなわち、アミノ酸
配列は、シグナル配列を有さないHA0のアミノ酸配列をベースとする。
合体を指す。本明細書において使用されるこの用語は、共有アミド結合により結合してい
る単一ポリペプチド鎖を指し得る。この用語は、非共有相互作用、例えば、イオン接触、
水素結合、ファン・デル・ワールス接触および疎水性接触により会合している複数のポリ
ペプチド鎖も指し得る。当業者は、この用語には、例えば、翻訳後プロセシング、例えば
、シグナルペプチド開裂、ジスルフィド結合形成、グリコシル化(例えば、N結合および
O結合グリコシル化)、プロテアーゼ開裂および脂質改変(例えば、S-パルミトイル化
)により改変されたポリペプチドが含まれることを認識する。
ステムドメインを構成する1つ以上のポリペプチド鎖を含むポリペプチドを指す。典型的
には、ステムドメインポリペプチドは、単一ポリペプチド鎖(すなわち、ヘマグルチニン
HA0ポリペプチドのステムドメインに対応)または2つのポリペプチド鎖(すなわち、
ヘマグルチニンHA2ポリペプチドと会合しているヘマグルチニンHA1ポリペプチドの
ステムドメインに対応)である。本発明によれば、ステムドメインポリペプチドは、野生
型HA分子と比較して1つ以上の突然変異を含み、特に野生型HAの1つ以上のアミノ酸
残基が特定の野生型HA中の対応位置上で天然に生じない他のアミノ酸により置換されて
いてよい。本発明によるステムドメインポリペプチドは、下記の1つ以上の結合配列をさ
らに含み得る。
2の核酸分子を挿入することができる核酸分子を示す。換言すると、ベクターは、それが
結合した核酸分子を輸送し得る。クローニングおよび発現ベクターは、本明細書において
使用される用語「ベクター」により企図される。ベクターには、限定されるものではない
が、プラスミド、コスミド、細菌人工染色体(BAC)および酵母人工染色体(YAC)
ならびにバクテリオファージまたは植物または動物(例として、ヒト)ウイルスに由来す
るベクターが含まれる。ベクターは、提示される宿主により認識される複製起源および発
現ベクターの場合、宿主により認識されるプロモーターおよび他の調節領域を含む。ある
ベクターは、それらが導入された宿主中で自律複製し得る(例えば、細菌の複製起源を有
するベクターは、細菌中で複製し得る)。他のベクターは宿主中への導入時に宿主のゲノ
ム中に組み込むことができ、それによりベクターは宿主ゲノムに沿って複製される。
り、天然に循環し、典型的な疾患の蔓延を発生させているインフルエンザウイルスを指す
。
インフルエンザウイルスは、世界規模の公衆衛生に対して顕著な影響を及ぼし、毎年数
百万の重病の症例、数千人の死亡、およびかなりの経済的損失を引き起こす。現在の三価
インフルエンザワクチンは、ワクチン株および密接に関連する分離株に対する強力な中和
抗体応答を誘発するが、ある亜型内のより分岐した株または他の亜型に及ぶことはほとん
どない。さらに、適切なワクチン株の選択は多くの困難を提示し、準最適保護を頻繁にも
たらす。さらに、次の流行性ウイルスの亜型の予測は、それがいつどこで生じるかを含め
、現在では不可能である。
らの主要なエンベロープ糖タンパク質である。ヘマグルチニンは、流入プロセスの間の2
つの主要な機能を有する。第1に、ヘマグルチニンは、シアル酸受容体との相互作用を介
して標的細胞の表面へのウイルスの付着を媒介する。第2に、ウイルスのエンドサイトー
シス後、ヘマグルチニンは、続いてウイルスおよびエンドソーム膜の融合を生んでそのゲ
ノムを標的細胞の細胞質中に放出させる。HAは、宿主由来酵素により開裂されてジスル
フィド結合により結合したままの2つのポリペプチドを生成する約500アミノ酸の大型
エクトドメインを含む。大多数のN末端断片(HA1、320~330アミノ酸)は、受
容体結合部位およびウイルス中和抗体により認識されるほとんどの抗原決定基を含有する
膜遠位球状ドメインを形成する。より小型のC末端部分(HA2、約180アミノ酸)は
、球状ドメインを細胞またはウイルス膜にアンカリングするステム様構造を形成する。亜
型間の配列相同性の程度は、HA1ポリペプチド(34%~59%の亜型間相同性)がH
A2ポリペプチド(51~80%の相同性)よりも小さい。ほとんどの保存領域は、開裂
部位周囲の配列、特にHA2N末端23アミノ酸であり、それは全てのインフルエンザA
ウイルス亜型で保存される(Lorieau et al.,2010)。この領域の一
部は、HA前駆体分子(HA0)中で表面ループとして曝露されるが、HA0がHA1お
よびHA2に開裂された場合に接近不可能になる。
付着を妨げる。これらのループは高度に変異性であるため、それらの領域を標的化するほ
とんどの抗体は、株特異的であり、なぜ現在のワクチンがそのような限定された株特異的
免疫を誘発するかを説明する。しかしながら、近年、広域交差中和効力を有するインフル
エンザウイルスヘマグルチニンに対する完全ヒトモノクローナル抗体が生成された。機能
および構造分析は、それらの抗体が膜融合プロセスを妨げ、インフルエンザHAタンパク
質のステムドメイン中の高度に保存されたエピトープに対して指向されることを明らかに
した(Throsby et al.,2008;Ekiert et al.2009
、国際公開第2008/028946号パンフレット、国際公開第2010/13063
6号パンフレット、国際公開第2013/007770号パンフレット)。
属特許出願PCT/EP2012/073706号明細書に記載されている。本明細書に
記載のステムドメインポリペプチドの少なくとも一部は、CR6261および/またはC
R9114のエピトープを安定的に提示し、マウスにおいて免疫原性である。CR626
1および/またはCR9114のエピトープを安定的に提示する追加の免疫原性ステムド
メインポリペプチドは、同時係属特許出願PCT/EP2014/060997号明細書
に記載されている。
ドが設計された。これらのポリペプチドを使用して広範囲のインフルエンザ株に対する保
護を誘導するユニバーサルエピトープベースワクチンを作出することができる。既に記載
されたステムドメインポリペプチドにおいて同様、高度に変異性の免疫優性部分、すなわ
ち、頭部ドメインを最初に全長HA分子から除去してmini-HAとも称されるステム
ドメインポリペプチドを作出して免疫応答を広域中和抗体についてのエピトープが局在す
るステムドメインに再指向する。上記の広域中和抗体は、新たな作出された分子の正確な
フォールディングを調べるため、および中和エピトープの存在を確認するために使用され
る。
(PCT/EP2012/073706号明細書およびPCT/EP2014/0609
97号明細書)への抗体の結合と比較して抗体、特にCR6261および/またはCR9
114の結合の増加、および/または多量体化する傾向の増加および安定性の増加を示す
。
ープを、膜遠位頭部ドメイン中に存在する優性エピトープの不存在下で免疫系に提示し得
る。この目的のため、頭部ドメインを構成するHA0タンパク質の一次配列の一部を除去
し、直接的に、または一部の実施形態において、短いフレキシブル結合配列(「リンカー
」)を導入することにより再連結させてポリペプチド鎖の連続性を回復させる。得られた
ポリペプチド配列を、HA0分子の残留部分の天然三次元構造を安定化する規定の突然変
異を導入することによりさらに改変する。
、
(a)HA1C末端ステムセグメントに0~50アミノ酸残基の結合配列により共有結合
しているHA1N末端ステムセグメントを含むインフルエンザヘマグルチニンHA1ドメ
インを含み、前記HA1C末端セグメントは、
(b)インフルエンザヘマグルチニンHA2ドメインに結合しており、HA1およびHA
2ドメインは、H1亜型のHAを含むインフルエンザAウイルス亜型に由来し;
(c)HA1ドメインおよびHA2ドメイン間の連結部におけるプロテアーゼ開裂部位を
含まず;
(d)前記HA1N末端セグメントは、HA1のアミノ酸1~x、好ましくは、HA1の
アミノ酸p~xを含み、HA1C末端ステムセグメントは、HA1のアミノ酸y~C末端
アミノ酸を含み、x=配列番号1の52位(または別のインフルエンザウイルス株のヘマ
グルチニン中の相当位置)上のアミノ酸であり、p=配列番号1の18位(または別のイ
ンフルエンザウイルスのヘマグルチニン中の相当位置)上のアミノ酸であり、y=配列番
号1の321位(または別のヘマグルチニン中の相当位置)上のアミノ酸であり;
(e)アミノ酸残基402~418を含む領域は、アミノ酸X1NTQX2TAX3GK
EX4N(H/K)X5E(K/R)(配列番号8)を含み:
X1は、M、E、K、V、RおよびTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X2は、F、I、N、T、H、LおよびY、好ましくは、I、LまたはYからなる群から
選択されるアミノ酸であり、
X3は、V、A、G、I、R、FおよびS、好ましくは、A、IまたはFからなる群から
選択されるアミノ酸であり、
X4は、F、I、N、S、T、Y、E、K、M、およびV、好ましくは、I、Y、Mまた
はVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X5は、L、H、I、N、R、好ましくは、Iからなる群から選択されるアミノ酸であり
;
(f)337位(HA1ドメイン)上のアミノ酸残基は、I、E、K、V、A、およびT
からなる群から選択され、
340位(HA1ドメイン)上のアミノ酸残基は、I、K、R、T、F、N、SおよびY
からなる群から選択され、
352位(HA2ドメイン)上のアミノ酸残基は、D、V、Y、A、I、N、S、および
Tからなる群から選択され、
353位(HA2ドメイン)上のアミノ酸残基は、K、R、T、E、G、およびVからな
る群から選択され;
(g)324位上のアミノ酸および436位上のアミノ酸間のジスルフィド架橋をさらに
含み;
(h)アミノ酸配列RMKQIEDKIEEIESK(配列番号20)が419~433
位において導入されており、または配列RMKQIEDKIEEIESKQK(配列番号
21)が417~433位において導入されている
ポリペプチドを提供する。
安定なヘマグルチニンステムドメインポリペプチドを提供する。
は実質的に全てのHAの球状頭部を欠く。好ましくは、免疫原性ポリペプチドは、360
アミノ酸長以下、好ましくは、350、340、330、320、310、305、30
0、295、290、285、280、275、または270アミノ酸長以下である。あ
る実施形態において、免疫原性ポリペプチドは、約250から約350、好ましくは、約
260から約340、好ましくは、約270から約330、好ましくは、約270から約
330アミノ酸長である。
A)分子のHA1ドメインのアミノ末端部分に対応するポリペプチドセグメントを指す。
HA1N末端ポリペプチドセグメントは、HA1ドメインの1位からx位のアミノ酸を含
み、x位上のアミノ酸は、HA1内のアミノ酸残基である。用語「HA1C末端セグメン
ト」は、インフルエンザヘマグルチニンHA1ドメインのカルボキシ末端部分に対応する
ポリペプチドセグメントを指す。HA1C末端ポリペプチドセグメントは、HA1ドメイ
ンのy位からC末端アミノ酸(そのアミノ酸を含む)のアミノ酸を含み、y位上のアミノ
酸は、HA1内のアミノ酸残基である。本発明によれば、yは、xよりも大きく、したが
って、HA1N末端セグメントおよびHA1C末端セグメント間、すなわち、HA1のx
位上のアミノ酸およびy位上のアミノ酸間のHA1ドメインのセグメントが欠失しており
、一部の実施形態において、結合配列により置き換えられている。したがって、ある実施
形態において、HA1セグメントの欠失は、x+1位におけるアミノ酸からy-1位にお
けるアミノ酸(そのアミノ酸を含む)のアミノ酸配列を含む。
実施形態において、HA1N末端セグメントは、HA1のアミノ酸p~xを含み、pは、
成熟HA分子の最初のアミノ酸である(例えば、配列番号1の場合、p=18)。当業者
は、他のヘマグルチニン中の相当アミノ酸を決定し、HA1ドメインのx位までシグナル
ペプチド(例えば、配列番号1のアミノ酸1~17または他のH1インフルエンザウイル
ス株(例えば、表2参照)中の相当位置を有さない本明細書に記載のポリペプチドを調製
することができる。
しくは、p~xを含み、配列番号1においてx=52であり、p=18であり、またはH
1亜型の他のHA配列中の相当アミノ酸位置である。
からC末端アミノ酸(そのアミノ酸を含む)のアミノ酸を含み、yは、321またはH1
亜型の他のHA配列中の相当アミノ酸位置である。
基1~52、好ましくは、HA1のアミノ酸残基18~52を含み、HA1C末端ステム
セグメントは、HA1のアミノ酸残基321~343を含む。ある実施形態において、H
A1N末端ステムセグメントは、HA1のアミノ酸残基1~52、好ましくは、HA1の
アミノ酸残基18~52からなり、HA1C末端ステムセグメントは、HA1のアミノ酸
残基321~343からなる。
ロテアーゼ開裂部位を含まない。したがって、ヘマグルチニンステムドメインポリペプチ
ドは、HA1およびHA2間の連結部におけるプロテアーゼ開裂に耐性である。HA1お
よびHA2に及ぶArg(R)~Gly(G)配列(すなわち、配列番号1のアミノ酸位
置343および344)がトリプシンおよびトリプシン様プロテアーゼについての認識部
位であり、典型的には、ヘマグルチニン活性化のために開裂されることは当業者に公知で
ある。本明細書に記載のHAステムドメインポリペプチドは活性化すべきでないため、本
発明のインフルエンザヘマグルチニンステムドメインポリペプチドは、プロテアーゼ開裂
に耐性である。したがって、本発明によれば、プロテアーゼ開裂部位は、HA1およびH
A2ドメイン間の開裂部位におけるポリペプチドの開裂を防止するために除去されている
。ある実施形態において、プロテアーゼ開裂部位は、プロテアーゼ開裂に耐性である配列
を得るためにC末端HA1セグメントのC末端アミノ酸の突然変異および/またはHA2
ドメインのN末端アミノ酸の突然変異により除去されている。ある実施形態において、あ
る実施形態におけるHA1およびHA2間の開裂部位の除去は、P1位におけるR(わず
かな場合においてK)からQへの突然変異により達成することができる(例えば、開裂部
位(配列番号1の343位)の命名法の説明については、Sun et al,2010
参照)。したがって、ある実施形態において、HA1C末端ステムセグメントのC末端ア
ミノ酸残基は、アルギニン(R)またはリジン(K)以外の任意のアミノ酸である。ある
実施形態において、HA1C末端アミノ酸は、グルタミン(Q)、セリン(S)、トレオ
ニン(T)、アスパラギン(N)、アスパラギン酸(D)またはグルタミン酸(E)であ
る。ある実施形態において、HA1C末端ステムセグメントのC末端アミノ酸残基は、グ
ルタミン(Q)である。
イルスからのアミノ酸配列を含むHAに由来し、またはそれをベースとする。特定の実施
形態において、ポリペプチドは、例えば、下記のインフルエンザウイルスA/Brisb
ane/59/2007(H1N1)(配列番号1)からの、H1亜型のHAを含むイン
フルエンザAウイルスのHAからの、またはそれをベースとするヘマグルチニンステムド
メインを含む。H1亜型のHAを含む他のインフルエンザAウイルスを本発明により使用
することができることも当業者により理解される。ある実施形態において、ポリペプチド
は、表2から選択されるインフルエンザAH1ウイルスのHAに由来し、またはそれをベ
ースとするヘマグルチニンステムドメインを含む。「に由来する」または「をベースとす
る」は、HA1ドメインおよび/またはHA2ドメインのN末端セグメント、および/ま
たはC末端セグメントが、当業者に公知のまたは後に発見されるH1亜型の天然インフル
エンザヘマグルチニンのHA1および/またはHA2ドメインの対応するN末端および/
またはC末端セグメントと少なくとも70%、75%、80%、85%、90%、95%
、96%、97%、98%、または99%のアミノ酸配列同一性を有することを意味する
。
末端残基に連結するHA2アミノ酸配列中の1つ以上の突然変異を含む(図1)。ヘリッ
クスAのC末端残基およびヘリックスCDのN末端残基を連結するH1HA2アミノ酸配
列は、インフルエンザHAの残基402~418を含むアミノ酸配列を含み(配列番号1
による番号付与)、アミノ酸配列MNTQFTAVGKEFN(H/K)LE(K/R)
(配列番号7)を含む。
結するアミノ酸配列、すなわち、血清型H1のインフルエンザHAのアミノ酸残基402
~418(配列番号1による番号付与)を含む領域は、アミノ酸配列X1NTQX2TA
X3GKEX4N(H/K)X5E(K/R)(配列番号8)を含む。
番号1を指す)上のアミノ酸の1つ以上、すなわち、アミノ酸X1、X2、X3、X4お
よびX5の1つ以上は突然変異しており、すなわち、ステムポリペプチドがベースとする
野生型インフルエンザウイルス中のそれらの位置において生じないアミノ酸を含む。
K、V、RおよびTからなる群から選択されるアミノ酸である。
N、T、H、LおよびY、好ましくは、I、LまたはYからなる群から選択されるアミノ
酸である。
G、I、R、FおよびS、好ましくは、A、IまたはFからなる群から選択されるアミノ
酸である。
N、S、T、Y、E、K、M、およびV、好ましくは、I、Y、MまたはVからなる群か
ら選択されるアミノ酸である。
I、N、R、好ましくは、Iからなる群から選択されるアミノ酸である。
であり、X5はSである。
1および/またはHA2ドメイン、すなわち、ステムポリペプチドがベースとするインフ
ルエンザウイルスのアミノ酸配列と比較してHA1ドメインおよび/またはHA2ドメイ
ン中の1つ以上の追加の突然変異、すなわち、アミノ酸置換を含む。
アミノ酸残基が突然変異している。ある実施形態において、配列番号1の337、340
、352、もしくは353位または他のインフルエンザウイルス中の相当位置上のアミノ
酸残基の1つ以上が突然変異しており、すなわち、ステムポリペプチドがベースとする野
生型インフルエンザウイルスのHAのアミノ酸配列中の対応する位置において生じないア
ミノ酸により置換されている。表6は、天然アミノ酸変異を示す。
のインフルエンザウイルスの相当位置上の少なくとも1つの突然変異を含む。
のインフルエンザウイルスの相当位置上の少なくとも1つの突然変異を含む。
のインフルエンザウイルスの相当位置上の少なくとも1つの突然変異を含む。
のインフルエンザウイルスの相当位置上の少なくとも1つの突然変異を含む。
、E、K、V、A、およびTからなる群から選択される。
、K、R、T、F、N、SおよびYからなる群から選択される。
、V、Y、A、I、N、S、およびTからなる群から選択される。
、R、T、E、G、およびVからなる群から選択される。
のように配列中のコンセンサスN-グリコシル化、例えば、N-X-T/S(Xは、Pを
除く任意の天然アミノ酸である)を導入する。
ノ酸である。
である。
である。
である。
である。
、H1N1インフルエンザ株A/Brisbane/59/2007(配列番号1)のア
ミノ酸の番号付与をベースとすることがここでも留意される。当業者は、他のインフルエ
ンザウイルスのHA中の相当(または対応する)アミノ酸を決定することができ、したが
って、相当の突然変異を決定することができ、例えば、異なるH1インフルエンザウイル
スの配列アラインメントについては表2参照。
間のジスルフィド架橋をさらに含む。したがって、本発明によれば、少なくとも1つのジ
スルフィド架橋がステムドメインポリペプチド中で、好ましくは、H1A/Brisba
ne/59/2007(配列番号1)中の324および436位(またはその相当物)の
アミノ酸間に導入されている。したがって、ある実施形態において、ポリペプチドは、H
A1ドメイン中の突然変異R324CおよびHA2ドメイン中のT436Cをさらに含む
。相当位置は、当業者が好適なアルゴリズム、例えば、Clustal、Muscleな
どを使用して配列をアラインすることにより容易に決定することができる。遺伝子操作ジ
スルフィド架橋は、少なくとも一方(他方が既にシステインである場合)、しかし通常、
空間的に近い2つの残基をシステインに突然変異させ、それが自発的にまたは活性酸化に
よりそれらの残基の硫黄原子間の共有結合を形成することにより作出される。
のアミノ酸配列と比較してHA1および/またはHA2ドメイン中の1つ以上の追加の突
然変異をさらに含む。したがって、ステムポリペプチドの安定性がさらに増加する。
際公開第2008/028946号パンフレットに記載のCR6261)および一部がグ
ループ2インフルエンザウイルスについて特異的(例えば、国際公開第2010/130
636号パンフレットに記載のCR8020)であったワクチン接種された個体からの一
次ヒトB細胞から単離された広域中和抗体を既に同定している。これらのモノクローナル
抗体の詳細なエピトープの分析により、それらの特異的抗体の交差反応性の欠落の理由が
明らかになった。両方の場合、異なる位置上のグループ1またはグループ2HA分子中の
グリカンの存在により、抗体がグループ特異的である事実が少なくとも部分的に説明され
た。以下に記載の多くのグループ1および2HA分子と交差反応するCR9114様抗体
の同定により、ヒト免疫系がインフルエンザウイルスに対する極めて広域の中和抗体を誘
発することが可能であることが明らかになった。しかしながら、毎年のワクチン接種スキ
ームの必要性を考慮すると、それらの抗体は、亜型H1および/またはH3の(季節性)
インフルエンザウイルスによる感染後にもワクチン接種後にも明らかに誘発されず、また
は極めて低い程度に誘発されるにすぎない。
し、例えば、単独で、または他の予防および/もしくは治療的治療との組合せでインビボ
で投与された場合、交差中和抗体を誘発するために免疫原性ポリペプチドとして使用する
ことができるポリペプチドが提供される。「交差中和抗体」は、少なくとも2つ、好まし
くは、少なくとも3つ、4つ、もしくは5つの系統発生グループ1のインフルエンザAウ
イルスの異なる亜型、および/または少なくとも2つ、好ましくは、少なくとも3つ、4
つ、もしくは5つの系統発生グループ2のインフルエンザAウイルスの異なる亜型、およ
び/または少なくとも2つのインフルエンザBウイルスの異なる亜型、特に、CR626
1およびCR9114により中和される少なくとも全てのウイルス株を中和し得る抗体を
意味する。
たはCR9114のエピトープを含む。したがって、ある実施形態において、ポリペプチ
ドは、抗体CR6261および/またはCR9114に選択的に結合する。ある実施形態
において、本発明のポリペプチドは、抗体CR8020および/またはCR8057に結
合しない。本発明において使用されるCR6261は、配列番号9のアミノ酸配列を含む
重鎖可変領域および配列番号10のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含み;CR911
4は、配列番号11のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号12のアミノ酸配
列を含む軽鎖可変領域を含む。CR8057は、配列番号13のアミノ酸配列を含む重鎖
可変領域および配列番号14のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。CR8020は
、配列番号17のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域および配列番号18のアミノ酸配列を
含む軽鎖可変領域を含む。
基の結合配列により共有結合しているHA1N末端ステムセグメントを含むインフルエン
ザヘマグルチニンHA1ドメインを含む。結合配列は、存在する場合、天然HAにおいて
も野生型HAにおいても生じない。ある実施形態において、リンカーは、1つのアミノ酸
残基、2つ以下のアミノ酸残基、3つ以下のアミノ酸残基、4つ以下のアミノ酸残基、5
つ以下のアミノ酸残基、10以下のアミノ酸残基、15以下のアミノ酸残基、または20
以下のアミノ酸残基または30以下のアミノ酸残基または40以下のアミノ酸残基または
50以下のアミノ酸残基を含むペプチドである。具体的な実施形態において、結合配列は
、G、GS、GGG、GSG、GSA、GSGS、GSAG、GGGG、GSAGS、G
SGSG、GSAGSA、GSAGSAG、およびGSGSGSGからなる群から選択さ
れる配列である。
合しており、すなわち、ポリペプチドは、結合配列を含まない。
ある実施形態において、細胞内および膜貫通配列は、分泌(可溶性)ポリペプチドが細胞
中での発現後に産生されるように除去されている。HAの分泌エクトドメインを発現させ
、精製する方法は記載されている(例えば、Dopheide et al 2009;
Ekiert et al 2009,2011;Stevens et al 200
4,2006;Wilson et al 1981参照)。当業者は、これらの方法を
本発明のステムドメインポリペプチドに直接適用して分泌(可溶性)ポリペプチドの発現
を達成することもできることを理解する。したがって、これらのポリペプチドも本発明に
包含される。
貫通および細胞内配列を含む。他の実施形態において、本発明のポリペプチドは、HAの
細胞内配列および膜貫通ドメインを含まない。ある実施形態において、ポリペプチドは、
トランケートHA2ドメインを含む。ある実施形態において、細胞内および膜貫通配列、
例えば、HA2ドメインの514、515、516、517、518、519、520、
521、522、523、524、525、526、527、526、528、529、
または530位(またはその相当物)からHA2ドメインのC末端(配列番号1による番
号付与)のアミノ酸配列は、細胞中での発現後に可溶性ポリペプチドが産生されるように
除去されている。
欠失されている。さらなる実施形態において、530位からC末端アミノ酸のHA2ドメ
インのC末端部分が欠失されている。
配列番号16))を、精製目的のために(場合により、トランケートされた)HA2ドメ
インに場合によりリンカーを介して連結させて結合させることができる。場合により、リ
ンカーは、精製後にhisタグを酵素的に除去するためのタンパク質分解開裂部位を含有
し得る。
なわち、GYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL(配列番号3)をH
A2のC末端において場合によりリンカーを介して連結させて導入することによりさらに
安定化される。したがって、ある実施形態において、HA2ドメインのC末端部分は、場
合によりリンカーを介して連結しているアミノ酸配列GYIPEAPRDGQAYVRK
DGEWVLLSTFL(配列番号3)により置き換えられている。リンカーは、場合に
より、当業者に周知のプロトコルに従って後でプロセシングするための開裂部位を含有し
得る。可溶性形態の精製を容易にするため、タグ配列、例えば、hisタグ(HHHHH
H(配列番号15)またはHHHHHHH(配列番号16))またはFLAGタグ(DY
KDDDDK)(配列番号22)またはそれらの組合せを場合により短いリンカーを介し
て連結させて付加することができる。リンカーは、場合により、当業者に周知のプロトコ
ルに従って後でプロセシングするためのタンパク質分解開裂部位(の一部)、例えば、I
EGR(配列番号24)(第X因子)またはLVPRGS(配列番号23)(トロンビン
)を含有し得る。プロセシングされたタンパク質も本発明に包含される。
おり(配列番号1による番号付与)、SGRDYKDDDDKLVPRGSPGSGYI
PEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLGHHHHHH(配列番号4)により
置き換えられている。
おり(配列番号1による番号付与)、SGRDYKDDDDKLVPRGSPGSGYI
PEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLGHHHHHH(配列番号4)により
置き換えられている。
体間の相互作用のほとんどは、頭部ドメイン中に局在する一方、ステムドメインにおいて
、三量体化は三量体コイルドコイルモチーフの形成により媒介される。頭部の除去後、三
次構造は脱安定化され、したがって、タンパク質安定化を増加させるための改変が必要と
される。ヘリックスCDのヘリカル傾向を強化することにより、より安定なタンパク質を
作出することができる。
いて、酵母転写アクチベータータンパク質GCN4に由来し、三量体化することが公知の
配列MKQIEDKIEEIESKQ(配列番号5)が419~433位(の相当物)に
おけるCDヘリックス中で導入された。この配列は、ヘリカル二次構造を形成する高い傾
向を有し、こうして本発明のポリペプチドの全安定性を向上させ得る。
明のポリペプチドの一次配列中のGCN4由来配列の正確な局在および配列に依存的であ
ることが示された。
が419~433位(配列番号1による番号付与)において導入されており、または配列
RMKQIEDKIEEIESKQK(配列番号21)が417~433位において導入
されている。
、同時係属特許出願PCT/EP2014/060997号明細書に記載のs74H9(
配列番号65)、s127H1(配列番号66)、s71H2(配列番号71)、s86
B4(配列番号67)、s115A1(配列番号70)、s2201C9(配列番号77
)、s55G7(配列番号68)、s113E7(配列番号78)、s6E12(配列番
号69)、s181H9(配列番号76)を改変して419~433位における配列RM
KQIEDKIEEIESK(配列番号20)を含有する配列s74H9-t2(配列番
号93)、s127H1-t2(配列番号91)、s71H2-t2(配列番号97)、
s86B4-t2(配列番号92)、s115A1-t2(配列番号96)、s220C
9-t2(配列番号99)、s55G7-t2(配列番号95)、s113E7-t2(
配列番号100)、s6E12-t2(配列番号94)、s181H9-t2(配列番号
98)を作出した。
QK(配列番号21)を含有するポリペプチドs74H9-t3(配列番号123)、s
127H1-t3(配列番号121)、s71H2-t3(配列番号127)、s86B
4-t3(配列番号122)、s115A1-t3(配列番号126)、s2201C9
-t3(配列番号129)、s55G7-t3(配列番号125)、s113E7-t3
(配列番号130)、s6E12-t3(配列番号124)、s181H9-t3(配列
番号128)を作出した。
2/073706号明細書およびPCT/EP2014/060997号明細書)と比較
してインフルエンザ抗体、特にCR6261および/またはCR9114の結合の増加、
および/または多量体化する傾向の増加および/または安定性の増加を示す。
X1は、E、I、K、V、A、およびTからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X2は、I、K、R、T、F、N、SおよびYからなる群から選択されるアミノ酸であり
;
X3は、D、F、V、Y、A、I、N、S、およびTからなる群から選択されるアミノ酸
であり;
X4は、I、K、R、T、E、GおよびVからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X5は、M、E、K、V、R、Tからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X6は、F、I、N、S、T、Y、H、およびLからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X7は、A、G、I、R、T、V、F、およびSからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X8は、F、I、N、S、T、Y、G、E、K、M、およびVからなる群から選択される
アミノ酸であり;
X9は、H、I、L、N、R、およびSからなる群から選択されるアミノ酸である。
X1は、E、I、K、V、A、およびTからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X2は、I、K、R、T、F、N、SおよびYからなる群から選択されるアミノ酸であり
;
X3は、D、F、V、Y、A、I、N、S、およびTからなる群から選択されるアミノ酸
であり;
X4は、I、K、R、T、E、GおよびVからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X5は、M、E、K、V、R、Tからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X6は、F、I、N、S、T、Y、H、およびLからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X7は、A、G、I、R、T、V、F、およびSからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X8は、F、I、N、S、T、Y、G、E、K、M、およびVからなる群から選択される
アミノ酸であり;
X9は、H、I、L、N、R、およびSからなる群から選択されるアミノ酸である。
X1は、E、I、K、V、A、およびTからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X2は、I、K、R、T、F、N、SおよびYからなる群から選択されるアミノ酸であり
;
X3は、D、F、V、Y、A、I、N、S、およびTからなる群から選択されるアミノ酸
であり;
X4は、I、K、R、T、E、GおよびVからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X5は、M、E、K、V、R、Tからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X6は、F、I、N、S、T、Y、H、およびLからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X7は、A、G、I、R、T、V、F、およびSからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X8は、F、I、N、S、T、Y、G、E、K、MおよびVからなる群から選択されるア
ミノ酸であり;
X9は、H、I、L、N、R、およびSからなる群から選択されるアミノ酸である。
X1は、E、I、K、V、A、およびTからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X2は、I、K、R、T、F、N、SおよびYからなる群から選択されるアミノ酸であり
;
X3は、D、F、V、Y、A、I、N、S、およびTからなる群から選択されるアミノ酸
であり;
X4は、I、K、R、T、E、GおよびVからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X5は、M、E、K、V、R、Tからなる群から選択されるアミノ酸であり;
X6は、F、I、N、S、T、Y、H、およびLからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X7は、A、G、I、R、T、V、F、およびSからなる群から選択されるアミノ酸であ
り;
X8は、F、I、N、S、T、Y、G、E、K、MおよびVからなる群から選択されるア
ミノ酸であり;
X9は、H、I、L、N、R、およびSからなる群から選択されるアミノ酸である。
であり、X3はFであり、X4はTであり、X5はMであり、X6はYであり、X7はI
であり、X8はYであり、X9はSである。
れる任意の技術、例として、下記の技術に従って調製することができる。
りDNA配列として合成し、当分野において公知の好適な制限酵素および方法を使用して
クローニングし、続いてインビトロまたはインビボで発現させることができる。したがっ
て、本発明はまた、上記のポリペプチドをコードする核酸分子に関する。本発明はさらに
、本発明のポリペプチドをコードする核酸を含むベクターに関する。ある実施形態におい
て、本発明による核酸分子は、ベクター、例えば、プラスミドの一部である。このような
ベクターは、当業者に周知の方法により容易に操作することができ、例えば、原核および
/または真核細胞中で複製し得るように設計することができる。さらに、多くのベクター
は、直接的に、またはそれから単離された所望の断片の形態で真核細胞の形質転換に使用
することができ、全部または一部としてそのような細胞のゲノム中に組み込まれ、所望の
核酸をゲノム中に含む安定な宿主細胞をもたらす。使用されるベクターは、DNAのクロ
ーニングに好適であり、関心対象の核酸の転写に使用することができる任意のベクターで
あり得る。宿主細胞が使用される場合、ベクターは組込みベクターであることが好ましい
。あるいは、ベクターは、エピソーム複製ベクターであり得る。
できる。ポリペプチドをコードする核酸配列の発現を得るため、発現を駆動し得る配列を
、ポリペプチドをコードする核酸配列に機能的に結合させ、タンパク質またはポリペプチ
ドを発現可能なフォーマットでコードする組換え核酸分子をもたらすことができることは
当業者に周知である。一般に、プロモーター配列が、発現させるべき配列の上流に配置さ
れる。多くの発現ベクターが当分野において利用可能であり、例えば、Invitrog
enのpcDNAおよびpEFベクター系、BD SciencesからのpMSCVお
よびpTK-Hyg、StratageneからのpCMV-Scriptなどであり、
それらを使用して好適なプロモーターおよび/または転写終結配列、ポリA配列などを得
ることができる。関心対象のポリペプチドをコードする配列が、コードされるポリペプチ
ドの転写および翻訳を支配する配列に関して適切に挿入される場合、得られる発現カセッ
トは、関心対象のポリペプチドを産生するために有用であり、それは発現と称される。発
現を駆動する配列には、プロモーター、エンハンサーなど、およびそれらの組合せが含ま
れ得る。これらは、宿主細胞中で機能し得、それによりそれらに機能的に結合している核
酸配列の発現を駆動し得るべきである。当業者は、宿主細胞中での遺伝子の発現を得るた
めに種々のプロモーターを使用することができることを把握する。プロモーターは、構成
的または調節的であり得、種々の資源、例として、ウイルス、原核、もしくは真核資源か
ら得ることができ、または人工的に設計することができる。関心対象の核酸の発現は、天
然プロモーターもしくはその誘導体から、または完全に異種のプロモーター(Kaufm
an,2000)からのものであり得る。一部の周知で、真核細胞中での発現にかなり使
用されるプロモーターは、ウイルス、例えば、アデノウイルスに由来するプロモーター、
例えば、E1Aプロモーター、サイトメガロウイルス(CMV)に由来するプロモーター
、例えば、CMV前初期(IE)プロモーター(本発明においてCMVプロモーターと称
される)(例えば、pcDNA、Invitrogenから得られる)、シミアンウイル
ス40(SV40)に由来するプロモーター(Das et al,1985)などを含
む。好適なプロモーターは、真核細胞からも由来し得、例えば、メタロチオネイン(MT
)プロモーター、伸長因子1α(EF-1α)プロモーター(Gill et al.,
2001)、ユビキチンCまたはUB6プロモーター(Gill et al.,200
1)、アクチンプロモーター、免疫グロブリンプロモーター、熱ショックプロモーターな
どである。プロモーター機能およびプロモーターの強度についての試験は、当業者の定型
事項であり、一般に、例えば、試験遺伝子、例えば、プロモーター配列後方のlacZ、
ルシフェラーゼ、GFPなどのクローニング、および試験遺伝子の発現試験を包含し得る
。無論、プロモーターは、その配列の欠失、付加、突然変異により変え、機能性について
試験して新たな、減衰した、または改善されたプロモーター配列を見出すことができる。
本発明によれば、最適な真核細胞中で高い転写レベルを付与する強力なプロモーターが好
ましい。
物細胞)または大腸菌(E.coli)などの好適な原核発現系中に形質移入することが
できる。一部の場合、好適な「タグ」配列(例えば、限定されるものではないが、his
、myc、strep、またはflagタグなど)または完全タンパク質(例えば、限定
されるものではないが、マルトース結合タンパク質またはグルタチオンSトランスフェラ
ーゼなど)を本発明の配列に付加して細胞または上清からのポリペプチドの精製および/
または同定を可能とすることができる。場合により、特異的タンパク質分解部位を含有す
る配列を含めて後でタグをタンパク質分解消化により除去することができる。
リエ変換赤外分光法およびNMR分光法またはX線結晶分析法)により分析してへリック
スおよびベータシートなどの所望の構造の存在を調査することができる。以前に記載され
た広域中和抗体(CR6261、CR9114、CR8057)への本発明のポリペプチ
ドの結合を調査するためにELISA、OctetおよびFACSなどを使用することが
できる。したがって、正確な立体構造を有する本発明によるポリペプチドを選択すること
ができる。
も1つを含む免疫原性組成物に関する。免疫原性組成物は、好ましくは、薬学的に許容可
能な担体をさらに含む。本文脈において、用語「薬学的に許容可能な」は、担体が用いら
れる投与量および濃度において、それが投与される対象中で不所望な効果も有害効果も引
き起こさないことを意味する。このような薬学的に許容可能な担体および賦形剤は、当分
野において周知である(Remington’s Pharmaceutical Sc
iences,18th edition,A.R.Gennaro,Ed.,Mack
Publishing Company[1990];Pharmaceutical
Formulation Development of Peptides and
Proteins,S.Frokjaer and L.Hovgaard,Eds.
,Taylor & Francis[2000];およびHandbook of P
harmaceutical Excipients,3rd edition,A.K
ibbe,Ed.,Pharmaceutical Press[2000]参照)。用
語「担体」は、組成物がともに投与される希釈剤、補助剤、賦形剤、またはビヒクルを指
す。生理食塩溶液および水性デキストローズおよびグリセロール溶液は、例えば、特に注
射溶液のための液体担体として用いることができる。正確な配合は、投与の様式に適合す
べきである。ポリペプチドおよび/または核酸分子は、好ましくは、滅菌溶液として配合
および投与される。滅菌溶液は、滅菌濾過により、または当分野において自体公知の他の
方法により調製される。次いで、溶液は、凍結乾燥または医薬投与容器中に充填すること
ができる。溶液のpHは、一般に、pH3.0から9.5、例えば、pH5.0から7.
5の範囲である。
チド、核酸分子および/または免疫原性組成物を投与することを含む方法に関する。本発
明による対象は、好ましくは、感染性疾患惹起作用物質、特にインフルエンザウイルスに
より感染され得、またはそうでなければ免疫応答の誘導から利益を受け得る哺乳動物であ
り、そのような対象は、例えば、げっ歯類、例えば、マウス、フェレット、または家庭も
しくは農場動物、または非ヒト霊長類、またはヒトである。好ましくは、対象は、ヒト対
象である。したがって、本発明は、特にグループ1および/もしくはグループ2インフル
エンザAウイルス、例えば、H1、H2、H3、H4、H5、H7および/もしくはH1
0亜型のHAを含むインフルエンザウイルス、ならびに/またはインフルエンザBウイル
スのインフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)に対する免疫応答を、本明細書に記
載のポリペプチド、核酸および/または免疫原性組成物を利用する対象において誘導する
方法を提供する。一部の実施形態において、本発明は、本明細書に記載のポリペプチド、
核酸および/または免疫原性組成物を利用して対象においてH1亜型のHAを含むインフ
ルエンザウイルスに対する免疫応答を誘導する方法を提供する。
プ2インフルエンザAウイルス亜型ならびに/またはインフルエンザBウイルスにより引
き起こされるインフルエンザウイルス感染を予防および/または治療するために有効であ
る。一部の実施形態において、本明細書に記載のポリペプチド、核酸および/または免疫
原性組成物により誘導される免疫応答は、インフルエンザAウイルスの2、3、4、5も
しくは6つの亜型および/またはインフルエンザBウイルスにより引き起こされるインフ
ルエンザAおよび/またはBウイルス感染を予防および/または治療するために有効であ
る。一部の実施形態において、誘導される免疫応答は、H1亜型のHAを含むインフルエ
ンザウイルスにより引き起こされるインフルエンザウイルス感染を予防および/または治
療するために有効である。
はないことが周知であるため、アジュバントを添加することによりポリペプチドおよび/
または核酸分子の免疫原性を増加させることが必要であり得る。ある実施形態において、
本明細書に記載の免疫原性組成物は、アジュバントを含み、またはそれとの組合せで投与
される。本明細書に記載の組成物との組合せ投与のためのアジュバントは、前記組成物の
投与前、投与と同時に、または投与後に投与することができる。好適なアジュバントの例
には、アルミニウム塩、例えば、水酸化アルミニウムおよび/またはリン酸アルミニウム
;油-エマルション組成物(または水中油型組成物)、例として、スクアレン-水エマル
ション、例えば、MF59(例えば、国際公開第90/14837号パンフレット参照)
;サポニン配合物、例えば、QS21および免疫刺激複合体(ISCOM)など(例えば
、米国特許第5,057,540号明細書;国際公開第90/03184号パンフレット
、国際公開第96/11711号パンフレット、国際公開第2004/004762号パ
ンフレット、国際公開第2005/002620号パンフレット参照);細菌または微生
物誘導体が含まれ、その例は、モノホスホリルリピドA(MPL)、3-O-脱アシル化
MPL(3dMPL)、CpG-モチーフ含有オリゴヌクレオチド、ADP-リボシル化
細菌毒素またはその突然変異体、例えば、大腸菌(E.coli)熱不安定エンテロトキ
シンLT、コレラ毒素CT、百日咳毒素PT、または破傷風トキソイドTT、Matri
x M(Isconova)である。さらに、公知の免疫強化技術、例えば、免疫応答を
向上させることが当分野において公知のタンパク質(例えば、破傷風トキソイド、CRM
197、rCTB、細菌性フラジェリンなど)への本発明のポリペプチドの融合またはビ
ロソーム中へのポリペプチドの包含、またはそれらの組合せを使用することができる。使
用することができる他の非限定的な例は、例えば、Coffman et al.(20
10)により開示されている。
チドは、ウイルス様粒子(VLP)ベクター中に取り込まれる。VLPは、一般に、典型
的には、ウイルスの構造タンパク質に由来するウイルスポリペプチドを含む。好ましくは
、VLPは、複製し得ない。ある実施形態において、VLPは、ウイルスの全ゲノムを欠
き得、またはウイルスのゲノムの一部を含み得る。一部の実施形態において、VLPは、
細胞に感染し得ない。一部の実施形態において、VLPは、それらの表面上で当業者に公
知のウイルス(例えば、ウイルス表面糖タンパク質)または非ウイルス(例えば、抗体ま
たはタンパク質)標的化部分の1つ以上を発現させる。
本発明によるポリペプチドを含有するビロソームは、当業者に公知の技術を使用して産生
することができる。例えば、ビロソームは、精製ウイルスを破壊し、ゲノムを抽出し、粒
子をウイルスタンパク質(例えば、インフルエンザヘマグルチニンステムドメインポリペ
プチド)および脂質とリアソートさせてウイルスタンパク質を含有する脂質粒子を形成す
ることにより産生することができる。
ける免疫応答を誘導するための上記のポリペプチド、核酸および/または免疫原性組成物
に関する。したがって、インフルエンザヘマグルチニンステムドメインポリペプチド、そ
のようなポリペプチドをコードする核酸、またはそのような核酸を含むベクターまたは本
明細書に記載のポリペプチドは、インフルエンザウイルスに対する、例えば、インフルエ
ンザウイルスヘマグルチニンのステム領域に対する中和抗体を誘発させるために使用する
ことができる。本発明は特に、系統発生グループ1および/もしくは系統発生グループ2
のインフルエンザAウイルスならびに/またはインフルエンザBウイルスにより引き起こ
される疾患または病態の予防および/または治療においてワクチンとして使用される上記
のポリペプチド、核酸、および/または免疫原性組成物に関する。一実施形態において、
ワクチンは、系統発生グループ1および/または2の2、3、4、5、6もしくはそれよ
り多い異なる亜型ならびに/またはインフルエンザBウイルスにより引き起こされる疾患
の予防および/または治療において使用することができる。一実施形態において、ワクチ
ンは、H1亜型のHAを含むインフルエンザウイルスにより引き起こされるインフルエン
ザ感染の予防および/または治療において使用することができる。
、細菌および真核細胞中で使用することができ、またはインビボでそれが必要とされる対
象中で、免疫原性ポリペプチドをコードする核酸を発現させることにより発現させること
ができる。このような核酸ワクチンは、任意の形態、例として、ネイキッドDNA、プラ
スミド、またはウイルスベクター、例として、アデノウイルスベクターを取り得る。
的な投与経路を使用して実施することができる。非限定的な例には、非経口投与、例えば
、静脈内、皮内、経皮、筋肉内、皮下など、または粘膜投与、例えば、鼻腔内、経口など
が含まれる。当業者は、本発明によるポリペプチド、核酸分子、および/または免疫原性
組成物を投与して免疫応答を誘導する種々の可能性を決定することができる。ある実施形
態において、ポリペプチド、核酸分子、および/または免疫原性組成物(またはワクチン
)は、2回以上、すなわち、いわゆる同種プライムブーストレジメンで投与される。ポリ
ペプチド、核酸分子、および/または免疫原性組成物が2回以上投与されるある実施形態
において、第2の用量の投与は、例えば、第1の用量の投与後1週間以上の時間間隔後、
第1の用量の投与後2週間以上、第1の用量の投与後3週間以上、第1の用量の投与後1
ヵ月以上、第1の用量の投与後6週間以上、第1の用量の投与後2ヵ月以上、第1の用量
の投与後3ヵ月以上、第1の用量の投与後4ヵ月以上など、ポリペプチド、核酸分子、お
よび/または免疫原性組成物の第1の用量の投与後数年まで実施することができる。ワク
チンを第1のプライミング投与後に2回以上のブースト投与が続くように3回以上、例え
ば、3回、4回など投与することも可能である。他の実施形態において、本発明によるポ
リペプチド、核酸分子、および/または免疫原性組成物は、1回のみ投与される。
のいずれかとして、異種プライム-ブーストレジメンで投与することもできる。
においてインフルエンザウイルス疾患を予防および/または治療する方法をさらに提供す
る。具体的な実施形態において、対象においてインフルエンザウイルス疾患を予防および
/または治療する方法は、それが必要とされる対象に有効量の上記のポリペプチド、核酸
および/または免疫原性組成物を投与することを含む。治療有効量は、グループ1もしく
は2インフルエンザAウイルス、および/またはインフルエンザBウイルスによる感染か
ら生じる疾患または病態、特にH1亜型のHAを含むインフルエンザAウイルスの感染に
より引き起こされる疾患の予防、改善および/または治療に有効な本明細書に定義のポリ
ペプチド、核酸、および/または組成物の量を指す。予防は、インフルエンザウイルスの
拡散の阻害もしくは低減またはインフルエンザウイルスによる感染に伴う症状の1つ以上
の発症、発現もしくは進行の阻害もしくは低減を包含する。本明細書において使用される
改善は、可視もしくは知覚疾患症状、ウイルス血症、または任意の他の計測可能なインフ
ルエンザ感染の症候の低減を指し得る。
、またはインフルエンザBウイルスによる感染から生じた病態により既に苦痛を受ける者
、およびインフルエンザウイルスによる感染を予防すべき者が含まれる。したがって、本
発明のポリペプチド、核酸および/または組成物は、未投薬の対象、すなわち、インフル
エンザウイルス感染により引き起こされる疾患を有さない、もしくはインフルエンザウイ
ルス感染により感染されたことがなく、現在も感染されていない対象、またはインフルエ
ンザウイルスにより既に感染され、および/または感染されたことのある対象に投与する
ことができる。
やすい患者群において標的化することができる。このような患者群には、限定されるもの
ではないが、例えば、高齢(例えば、≧50歳、≧60歳、好ましくは、≧65歳)、若
年(例えば、≦5歳、≦1歳)、入院患者および抗ウイルス化合物により治療されたが、
不適切な抗ウイルス応答を示した患者が含まれる。
1つ以上の他の活性剤、例えば、既存または将来のインフルエンザワクチン、モノクロー
ナル抗体および/または抗ウイルス剤、および/または抗菌剤、および/または免疫調節
剤との組合せで投与することができる。1つ以上の他の活性剤は、インフルエンザウイル
ス疾患の治療および/または予防において有益であり得、またはインフルエンザウイルス
疾患に伴う症状または病態を改善し得る。一部の実施形態において、1つ以上の他の活性
剤は、鎮痛剤、抗発熱薬、または呼吸を緩和もしくは補助する治療物である。
例えば、治療応答)を提供するように調整することができる。好適な投与量範囲は、例え
ば、0.1~100mg/kg体重、好ましくは、1~50mg/kg体重、好ましくは
、0.5~15mg/kg体重であり得る。用いるべきポリペプチドおよび/または核酸
分子の正確な投与量は、例えば、投与経路、および感染またはそれにより引き起こされる
疾患の重症度に依存し、医師の判断および各対象の状況に従って決定すべきである。例え
ば、有効用量は、患者の標的部位、生理学的状態(例として、年齢、体重、健康)に応じ
て変動し、治療が予防的または治療的であるかを問わない。通常、患者は、ヒトであるが
、非ヒト哺乳動物、例として、トランスジェニック哺乳動物を治療することもできる。治
療投与量は、安全性および効力を最適化するように最適に力価測定される。
結合を確認するために使用することもできる。さらに、本発明のポリペプチドは、診断ツ
ールとして、例えば、本発明のポリペプチドに結合し得るそのような個体の血清中の抗体
が存在するか否かを確認することにより個体の免疫状態を試験するために使用することが
できる。したがって、本発明はまた、患者におけるインフルエンザ感染の存在を検出する
インビトロ診断法であって、a)前記患者から得られた生物学的試料を本発明によるポリ
ペプチドと接触させるステップ;およびb)抗体-抗原複合体の存在を検出するステップ
を含む方法に関する。
えば、モノクローナル抗体および抗ウイルス剤を改善するために使用することもできる。
決して限定するものではない。
チド
PCT/EP2012/073706号明細書は、インフルエンザヘマグルチニンステ
ムドメインポリペプチド、組成物およびワクチンならびにインフルエンザの予防および/
または治療の分野におけるそれらの使用方法を開示している。PCT/EP2014/0
60997号明細書は、H1-mini2-cluster1+5+6-GCN4(配列
番号2)の部位特異的突然変異により得られ、CR6261(Throsby et a
l,2009;Ekiert et al 2010)および/またはCR9114の広
域中和エピトープをさらに安定的に提示したH1N1A/Brisbane/59/20
07(配列番号1)の全長HAに由来するステムドメインポリペプチドの付加配列を開示
している。
A/Brisbane/59/2007(配列番号1)の全長HAから以下のステップを
利用することにより導いた:
1.HA0の開裂部位を除去すること。この部位における野生型HAの開裂は、HA1お
よびHA2をもたらす。除去は、P1位におけるRからQへの突然変異により達成するこ
とができる(例えば、開裂部位(配列番号1の343位)の命名法の説明については、S
un et al,2010参照)。
2.配列番号1からアミノ酸53から320を欠失させることにより頭部ドメインを除去
すること。配列の残りのNおよびC末端部分は、4残基フレキシブルリンカーGGGGに
より結合させた。
3.H1A/Brisbane/59/2007(配列番号1)中の残基402から41
8(の相当物)により形成されるループ(AへリックスおよびCDへリックス間)の溶解
度を増加させて融合前立体構造の安定性を増加させ、改変HAの融合後立体構造を脱安定
化させること。H1-mini2-cluster1+5+6-GCN4(配列番号2)
において、突然変異F406S、V409T、F413GおよびL416S(番号付与は
、配列番号1を指す)を導入した。
4.H1A/Brisbane/59/2007中の324および436位におけるアミ
ノ酸間のジスルフィド架橋を導入すること;これは、突然変異R324CおよびY436
C(番号付与は、配列番号1を指す)を導入することにより達成される。
5.三量体化することが公知のGCN4由来配列MKQIEDKIEEIESKQ(配列
番号5)を419~433位(番号付与は配列番号1を指す)において導入すること。
ように、膜貫通および細胞内ドメインの配列は、HA2の514、515、516、51
7、518、519、520、521、522、523、524、525、526、52
6、527、528、529、または530位(または配列アラインメントから決定して
その相当物)からHA2のC末端(配列番号1による番号付与)まで欠失されている。可
溶性ポリペプチドは、三量体構造を形成することが公知の配列、すなわち、foldon
配列GYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL(配列番号3)を、場合
により上記の短いリンカーを介して連結させて導入することによりさらに安定化させた。
リンカーは、場合により、当業者に周知のプロトコルに従って後でプロセシングするため
の開裂部位を含有し得る。可溶性形態の精製および検出を容易にするため、タグ配列、例
えば、ヒスチジンタグ(HHHHHH(配列番号15)もしくはHHHHHHH(配列番
号16)またはFLAGタグ(DYKDDDDK;配列番号22)またはそれらの組合せ
を場合により短いリンカーを介して連結させて場合により付加することができる。リンカ
ーは、場合により、当業者に周知のプロトコルに従って後でプロセシングするためのタン
パク質分解開裂部位(の一部)、例えば、LVPRGS(配列番号23)(トロンビン)
またはIEGR(配列番号24)(第X因子)を含有し得る。プロセシングされたタンパ
ク質も本発明に包含される。
このようなC末端配列の一例は、配列番号4のFLAG-thrombin-foldo
n-Hisである。この配列をH1-mini2-cluster1+5+6-GCN4
(配列番号2)配列の可溶性形態と組み合わせて親配列(配列番号6)を作出し、それを
使用して突然変異導入により本発明の新規ポリペプチドを作出した。この配列は、配列番
号1および2のアミノ酸1~17に対応するリーダー配列を含有しない。
書および上記に記載のとおり分子の頭部ドメインをコードするヘマグルチニン配列の一部
を欠失させ、配列のNおよびC末端部分を欠失の両側でリンカーを介して再連結させるこ
とにより作出した。頭部ドメインの除去は、水性溶媒から既に保護された分子の一部を曝
露されたままとし、本発明のポリペプチドの構造を潜在的に脱安定化させる。この理由の
ため、Bループ中の残基(特にアミノ酸残基406(配列番号1および2のそれぞれFお
よびS)、409(VおよびT)413(FおよびG)および416(LおよびS)を、
親配列の配列番号6を出発点として使用して種々の組合せにおいて突然変異させた。配列
番号6は、H1-mini2-cluster1+5+6-GCN4(配列番号2)から
、リーダー配列を除去し、残基520~565をFlag-thrombin-fold
on--his配列(配列番号4)により置き換えることにより作出した。
ことは、天然全長HAとは異なり、ポリペプチドが開裂され得ず、タンパク質内部に疎水
性融合ペプチドを埋め込む関連立体構造変化を受ける事実により引き起こされる。この問
題に対処するため、配列番号2の残基I337、I340、F352およびI353の一
部または全部も突然変異させた。
H1(配列番号55)、71H2(配列番号61)、86B4(配列番号56)、115
A1(配列番号60)、2201C9(配列番号63)、55G7(配列番号59)、1
13E7(配列番号64)、6E12(配列番号58)、181H9(配列番号62)を
作出した。
ア・パストリス(Pichia pastoris)中に形質転換させ、またはHEK2
93F細胞中に形質移入した。哺乳動物細胞中の発現に使用される構築物は、HAリーダ
ー配列(配列番号1および2の残基1~17)を含有した一方、ピキア・パストリス(P
.pastoris)中の発現に使用される構築物において、HAリーダー配列を酵母ア
ルファ因子リーダー配列(配列番号7)により置き換えた。このように発現タンパク質を
細胞培養培地に指向させ、したがって、本発明のポリペプチドのさらなる精製なしで結合
および発現の決定を可能とした。全ての配列は、FLAG-foldon-HIS C末
端配列(配列番号4)を含有した。
0)は、ELISAにより決定した。この目的のため、ELISAプレートを2μg/m
lのモノクローナル抗体溶液(20μl/ウェル)により4℃において一晩処理した。抗
体溶液の除去後、残留表面を脱脂粉乳のPBS中4%溶液により室温において少なくとも
1時間ブロッキングした。プレートを洗浄した後、20μlの細胞培養培地(無希釈また
は希釈)をそれぞれのウェルに添加し、室温において少なくとも1時間インキュベートし
た。次いで、ELISAプレートを洗浄し、20μlの抗FLAG-HRP抗体溶液(S
igma A8952、PBS-Tween中4%の脱脂粉乳中2000倍希釈)を添加
した。インキュベーション(室温において1時間)後、プレートを再度1回洗浄し、20
μlの発光基質(Thermoscientific C#34078)を添加してシグ
ナルを発現させた。あるいは、比色検出法を使用してシグナルを発現させることができる
。
例えば、Degorce et al.,Curr.Chem.Genomics 20
09 3:22-32参照)から決定することができる。この目的のため、テルル(Tb
)標識抗FLAGモノクローナル抗体(ドナー)およびAlexa488標識抗Hisモ
ノクローナル抗体(アクセプター)の混合物(HTRF溶液)は、210.5μlの抗F
LAG-TB(原液26μg/ml)および1.68mlの抗HIS-488(原液50
μg/ml)を培養培地および50mMのHEPES+0.1%のBSAの80mlの1
対1混合物に添加することにより調製した。19μlのHTRF溶液をELISAプレー
トのそれぞれのウェルに添加し、1μlの培養培地を添加した。励起時および他の化合物
(タンパク質、培地構成要素など)から生じる短期寿命バックグラウンドシグナルの減衰
を可能にするための遅延後、520および665nmにおける蛍光発光の比を決定した。
これは、試料中の総タンパク質含有率の尺度であり、異なる実験間のmAb結合シグナル
を正規化するために使用する。
パストリス(P.Pastoris)中で発現させた。培養培地を回収し、ステムドメイ
ンポリペプチドのCR6261結合への結合および発現を上記のとおり決定した。結合ア
ッセイにおける応答は発現タンパク質の濃度に対応するため、それぞれの発現配列につい
てのHTRFアッセイにおけるシグナルに対する結合シグナルの比を比較することにより
ELISA結合シグナルをタンパク質発現について正規化した。全ての発現ポリペプチド
は、配列番号6の親配列と比較して高いHTRFシグナルとCR6261結合との比を示
す。
ついて計算された比と比較した。結果を表3および4の第5列に列記し;全ての発現タン
パク質は、より高い比を示し、上記ステムポリペプチドがCR6261の結合の増加を示
すことを示す。
本発明のポリペプチドは、酵母転写アクチベータータンパク質GCN4に由来する配列
RMKQIEDKIEEIESK(配列番号20)またはRMKQIEDKIEEIES
KQK(配列番号21)をCDヘリックス中で含有する。この配列は、ヘリカル二次構造
を形成する高い傾向を有し、こうして本発明のポリペプチドの全安定性を向上させ得る。
驚くべきことに、本発明によれば、本発明のポリペプチドの安定性および凝集状態が本発
明のポリペプチドの一次配列中のGCN4由来配列の正確な局在および配列に依存的であ
ることが見出された。
20)が419~433位において導入されており(配列番号1による番号付与;例えば
、配列番号81から110)または配列RMKQIEDKIEEIESKQK(配列番号
21)が417~433位において導入されている(例えば、配列番号111から140
)本発明のポリペプチドの新規セットを記載する。
プチド、すなわち、74H9(配列番号57)、127H1(配列番号55)、71H2
(配列番号61)、86B4(配列番号56)、115A1(配列番号60)、2201
C9(配列番号63)、55G7(配列番号59)、113E7(配列番号64)、6E
12(配列番号58)、181H9(配列番号62)を改変して419~433位におけ
る配列RMKQIEDKIEEIESK(配列番号20)を含有する配列74H9-t2
(配列番号83)、127H1-t2(配列番号81)、71H2-t2(配列番号87
)、86B4-t2(配列番号82)、115A1-t2(配列番号86)、220C9
-t2(配列番号89)、55G7-t2(配列番号85)、113E7-t2(配列番
号90)、6E12-t2(配列番号84)、181H9-t2(配列番号88)を作出
した。
QK(配列番号21)を含有する配列74H9-t3(配列番号113)、127H1-
t3(配列番号111)、71H2-t3(配列番号117)、86B4-t3(配列番
号112)、115A1-t3(配列番号116)、2201C9-t3(配列番号11
9)、55G7-t3(配列番号115)、113E7-t3(配列番号120)、6E
12-t3(配列番号114)、181H9-t3(配列番号118)を作出した。
とができる。例えば、配列番号149~155は、H1N1A/California/
07/09株のHA配列をベースとする本発明のポリペプチドを記載する。
、520、521、522、523、524、525、526、527、526、528
、529、または530からHA2ドメインのC末端(配列番号1による番号付与)のH
Aベース配列のC末端部分を除去することにより作出することができる。
RDGQAYVRKDGEWVLLSTFL(配列番号3)を場合によりリンカーを介し
て連結させて導入することによりさらに安定化させることができる。リンカーは、場合に
より、当業者に周知のプロトコルに従って後でプロセシングするための開裂部位を含有し
得る。可溶性形態の精製を容易にするため、タグ配列、例えば、hisタグ(HHHHH
HH(配列番号16)もしくはHHHHHH(配列番号15))またはFLAGタグ(D
YKDDDDK)(配列番号22)またはそれらの組合せを場合により短いリンカーを介
して連結させて付加することができる。リンカーは、場合により、当業者に周知のプロト
コルに従って後でプロセシングするためのタンパク質分解開裂部位(の一部)、例えば、
IEGR(配列番号24)(第X因子)またはLVPRGS(配列番号23)(トロンビ
ン)を含有し得る。プロセシングされたタンパク質も本発明に包含される。
65(番号付与は配列番号1を指す)の相当物を、改変トロンビン開裂部位および6ヒス
チジンタグ(配列番号15)の両方を含有する配列RSLVPRGSPGHHHHHHに
より置き換えることにより作出し、当業者に周知のプロトコルに従ってHEK293F細
胞中で発現させた。
52)およびH1-mini2-cluster1+5+6-GCN4t3(配列番号5
3)の可溶性形態。培養培地を回収し、CR6261、CR9114への結合は、サンド
イッチELISAにより、培養培地から直接本発明のポリペプチドを捕捉するためのコー
トmAbのCR6261またはCR9114および検出目的のためのC末端hisタグに
対して指向されるセイヨウワサビペルオキシダーゼ(HRP)コンジュゲート抗体を使用
して検出した。あるいは、ビオチン化CR9114を、HRPコンジュゲートストレプト
アビジンとの組合せで、サンドイッチELISAにおけるCR9114により捕捉された
本発明のポリペプチドの検出に使用した。このフォーマットは、本発明のポリペプチドの
多量体形態の存在の検出を可能とする。試験された本発明の全てのポリペプチドは、EL
ISAにより決定されたとおりCR9114(図2AおよびB、図3AおよびBならびに
図4AおよびB)およびCR6261(図2CおよびD、図3CおよびD、図4Cおよび
D)に結合し得た。CR9114捕捉-ビオチン化CR9114検出サンドイッチELI
SAにより検出される多量体化のレベルの増加は、図2EおよびF、図3EおよびFなら
びに図4EおよびFに示されるとおりs55G7-t2(配列番号95)、s86B4-
t2(配列番号92)、s115A1-t2(配列番号96)、s127H1-t2(配
列番号91)、s113E7-t2(配列番号100)、s220C9-t2(配列番号
99)、s71H2-t3(配列番号127)、s127H1-t3(配列番号121)
、s74H9-t3(配列番号123)について観察された。
EK293F細胞に、127H1-t2(配列番号81)、86B4-t2(配列番号8
2)および55G7-t2(配列番号85)の可溶性形態をコードする遺伝子を含有する
発現ベクターpcDNA2004を形質移入した。産生の間にタンパク質の輸送を指向す
るリーダー配列(またはシグナル配列)(配列番号1のアミノ酸1~17に対応)が分泌
最終ポリペプチド中に存在しないことが当業者により理解される。
300gにおいて5分間スピンダウンさせ、SF1000フラスコを介して300mLの
予備加温Freestyle(商標)培地中で再懸濁することにより1.0*106vc
/mLを播種した。この培養物をmultitronインキュベーター中で37℃、10
%のCO2、110rpmにおいて1時間インキュベートした。1時間後、プラスミドD
NAを9.9mLのOptimem培地中で300mLの培養容量中1.0μg/mLの
濃度にピペッティングした。並行して、440μLの293fectin(登録商標)を
9.9mLのOptimem培地中でピペッティングし、室温において5分間インキュベ
ートした。5分後、プラスミドDNA/Optimem混合物を293fectin(登
録商標)/Optimem混合物に添加し、室温において20分間インキュベートした。
インキュベーション後、プラスミドDNA/293fectin(登録商標)混合物を細
胞懸濁液に滴加した。形質移入培養物をmultitronインキュベーター中で37℃
、10%のCO2および110rpmにおいてインキュベートした。7日目、細胞を培養
培地から遠心分離(3000gにおいて30分間)により分離した一方、本発明の可溶性
ポリペプチドを含有する上清をさらなる処理のために0.2μmボトルトップフィルター
上で濾過した。
t2)、および2400ml(s55G7_t2)の培養上清を、洗浄緩衝液(20mM
のTRIS、500mMのNaCl、pH7.8)中で予備平衡化された24mlのNi
Sepharose HPカラムにアプライした。洗浄緩衝液中10mMのイミダゾー
ルによる洗浄ステップ後、結合した本発明のポリペプチドを、洗浄緩衝液中300mMの
イミダゾールの段階的勾配により溶出させた。溶出ピークを回収し、濃縮し、さらなる精
製のためのサイズ排除カラム(Superdex 200)にアプライした。溶出プロフ
ァイルを図5に示す。55G7-t2および127H1-t2について、分画を回収し、
図面に示されるとおりプールし、SDS-PAGE(図6)、ELISAおよび分析サイ
ズ排除クロマトグラフィーと多角度光散乱との組合せ(SEC-MALS)より分析して
分子質量を推定した。ELISA結果は、CR6261およびCR9114への本発明の
ポリペプチドの結合を裏付けたが、CR8020への結合は裏付けなかった。SEC-M
ALS結果を表8にまとめる。
びs86B4-t2と比較して高い収量(1lの培養上清当たり約30mgのタンパク質
)を有することを示す。タンパク質の大多数は、単量体または二量体について予測される
ものの間である62kDaの分子量を示す。タンパク質の凝集状態を裏付けるため、SE
C-MALS実験をCR6261、CR9114およびCR8020に由来するFab断
片の存在下で繰り返した。結果を図7に示し、表8にまとめる。
びCR9114からのFab断片の存在下で複合体(SECクロマトグラム中のピークの
シフトにより証明)を形成することを示すが、CR8020からのFab断片の存在下で
は示さない。これは、Fab断片の結合反応の特異性と一致する。それというのも、CR
6261およびCR9114はグループ1に由来するHAに結合する一方、CR8020
は結合しないためである。複合体のサイズを表8に列記し、これは、ポリペプチドs12
7H1-t2が1から2つのFab断片に結合することを示し、本発明の精製ポリペプチ
ドs127H1-t2の集団の少なくとも一部が二量体形態であることを示す。
の間の結合反応をさらに分析するため、ならびにCR6261およびCR9114の立体
構造エピトープの存在を裏付けるため、精製タンパク質とのそれらの抗体の複合体化をバ
イオレイヤー干渉法(Octet Red384,Forte Bio)により試験した
。この目的のため、ビオチン化CR6261、CR9114およびCR8020をストレ
プトアビジンコートセンサ上に固定化し、続いてそれを最初に精製された本発明のポリペ
プチドの溶液に曝露させて会合速度を計測し、次いで洗浄溶液に曝露させて解離速度を計
測した。結果を図8に示す。
への曝露後の明らかな応答により証明されるとおり本発明のポリペプチドを認識する(図
8)。結合相互作用についての解離定数を推定するため、2倍希釈系列を使用して力価測
定を実施した。固定化CR6261またはCR9114を含有するセンサを、40、20
、10、5、2.5、1.3および0.63nMの濃度における可溶性s127H1-t
2溶液にそれぞれ曝露させ、6600秒後の最終応答を記録した。応答をステムドメイン
ポリペプチド濃度の関数としてプロットし、定常状態1:1結合モデルへのフィットを実
施し、CR6261/ステムドメインポリペプチド複合体について3.5nMおよびCR
9114複合体について2.3nMの解離定数Kdを生じさせた(図8)。
れ、広域中和モノクローナル抗体CR6261およびCR9114に高い親和性で結合し
得、このステムドメインポリペプチド中の対応中和エピトープの存在を裏付ける。ポリペ
プチドは、二量体構造を形成する傾向を有する。
力の評価
致死インフルエンザチャレンジモデルにおける本発明のポリペプチドs127H1-t
2(配列番号91)の保護効力を評価するため、10匹の雌BALB/cマウス(6~8
週齢)の群をアジュバント無添加、または10μgのMatrix-Mがアジュバント添
加された10μgの精製s127H1-t2により3週間の間隔において3回免疫化した
。チャレンジモデルのための陽性対照として、広域中和抗体モノクローナル抗体CR62
61(15mg/kg)をチャレンジ1日前に筋肉内投与した一方、PBSによる免疫化
が陰性対照として機能した。最後の免疫化から4週間後、マウスを25×LD50の異種
チャレンジウイルス(H1N1A/Puerto Rico/8/34)によりチャレン
ジし、3週間毎日モニタリングした(生存率、体重、臨床スコア)。プレチャレンジ血清
を、免疫化に使用された本発明のポリペプチドs127H1-t2への結合(正確な免疫
化を確認するため)、可溶性H1N1A/Brisbane/59/07全長HAへの結
合(全長HAの認識を確認するため)および全長HAへの結合についての広域中和抗体モ
ノクローナル抗体CR9114との競合(誘導された抗体が広域中和CR9114エピト
ープに近接して結合するか否かを決定するため)についてELISAアッセイにおいて試
験する。結果を図9~12に示す。
マウスはチャレンジ後7日目に感染により死亡する一方、陽性対照群(15mg/kgの
CR6261、チャレンジ1日前)は完全に保護されるためである(図9)。PBS処理
マウスとは対照的に、本発明のアジュバント無添加ポリペプチドs127H1-t2(配
列番号91)により免疫化されたマウスの10匹のうち3匹および本発明のアジュバント
添加ポリペプチドにより免疫化されたマウスの10匹のうち10匹が、致死チャレンジを
生存する(図10参照)。PBS対照群と比較して、生存比率の増加、生存時間の増加お
よび臨床スコアの低減が、本発明のポリペプチドs127H1-t2により免疫化された
群について観察される。差は、本発明のアジュバント添加ポリペプチドを受けた群につい
て最も顕著であるが、アジュバント無添加ポリペプチドを受けた群についても観察される
。
本発明のポリペプチドs127H1が免疫原性であり、アジュバントの使用にかかわらず
全長HAを認識し得る抗体を誘導することを示す(図11AおよびB)。
この目的のため、プレート結合全長HAを段階希釈された血清試料とインキュベートし、
その後に所定の力価測定濃度におけるCR9114-ビオチンを添加する。さらなるイン
キュベーション後、当分野において周知のプロトコルに従ってストレプトアビジンコンジ
ュゲートセイヨウワサビペルオキシダーゼを使用して結合CR9114-ビオチンの量を
定量する。「傾きOD」(ΔOD/10倍率希釈)と表現される対数希釈に対するODの
線形回帰を使用してデータを分析する。データは、広域中和抗体CR9114と結合につ
いて競合し得る検出可能なレベルの抗体が本発明のアジュバント添加ポリペプチドによる
免疫化により誘導されることを示し、図12Aに観察される競合のレベルの上昇により示
されるとおりである。比較として、非標識CR9114(すなわち、自己競合)ならびに
非結合モノクローナル抗体CR8020およびCR-JB(両方とも5μg/mlの出発
濃度から段階希釈)により誘導されるレベルを別個のグラフに示す。
)による免疫化がインフルエンザによる致死感染に対してマウスを保護し得ることを示し
た。ポリペプチドは、免疫原性であり、全長HAに結合し得る抗体を誘導する。本発明の
ポリペプチドをアジュバントとの組合せで使用する場合、誘導される検出可能な抗体の少
なくとも一部が、モノクローナル抗体CR9114の広域中和エピトープのエピトープに
結合し、またはその近くに結合する。
力の評価
致死インフルエンザチャレンジモデルにおける本発明のポリペプチドs127H1-t
2(配列番号91)の保護効力をさらに評価するため、10匹の雌BALB/cマウス(
6~8週齢)の群を、10μgのMatrix-Mがアジュバント添加された30μgの
精製s127H1-t2により3週間の間隔において1、2および3回免疫化した。チャ
レンジモデルのための陽性対照として、広域中和抗体モノクローナル抗体CR6261(
15mg/kg)をチャレンジ1日前に静脈内投与した一方、PBSによる免疫化が陰性
対照として機能した。最後の免疫化から4週間後、マウスを25×LD50の異種チャレ
ンジウイルス(H1N1A/Puerto Rico/8/34)によりチャレンジし、
3週間毎日モニタリングした(生存率、体重、臨床スコア)。最後の免疫化から4週間後
に得られたプレチャレンジ血清を、免疫化に使用された本発明のポリペプチドs127H
1-t2への結合(正確な免疫化を確認するため)、可溶性H1N1A/Brisban
e/59/07全長HAへの結合(全長HAの認識を確認するため)および全長HAへの
結合についての広域中和モノクローナル抗体CR9114との競合(誘導された抗体が広
域中和抗体CR9114エピトープに近接して結合するか否かを決定するため)について
ELISAアッセイにおいて試験した。結果を図13~18に示す。
マウスはチャレンジ後7日目に感染により死亡する一方、陽性対照群(15mg/kgの
CR6261、チャレンジ1日前)は完全に保護されるためである(図13A)。s12
7H1-t2(配列番号91)により1回免疫化されたマウスは、7および9日目の間に
感染により全て死亡した(図14A)。対照的に、2回の免疫化後、10匹のマウスのう
ち8匹が生存し、3回の免疫化後、全てのマウス(10匹のうち10匹)が致死チャレン
ジを生存した(図14B、C)。複数回免疫化された群について、体重損失も低減し、3
回免疫化された動物について最小の割合が観察された(図15B、C)。PBS対照群と
比較して、統計的に有意な生存比率の増加、生存時間の増加、体重損失の低減および臨床
スコアの低減(図16B、C参照)が、本発明のポリペプチドs127H1-t2により
2または3回免疫化された群について観察された。
する最後の免疫化から4週間後のプレチャレンジ時点からのELISAデータは、本発明
のポリペプチドs127H1が免疫原性であり、1回の免疫化後でさえ全長HAを認識し
得る抗体を誘導することを示すが、レベルは、2および3回の免疫化後に有意に高い。上
記CR9114競合結合アッセイを使用して、広域中和抗体CR9114と結合について
競合し得る検出可能レベルの抗体が、本発明のポリペプチドs127H1-t2(配列番
号91)による2および3回の免疫化後に誘導された(図18A)。比較として、非標識
CR9114(すなわち、自己競合)ならびに非結合モノクローナル抗体CR8020お
よびCR-JB(両方とも5μg/mlの出発濃度から段階希釈)により誘導されるレベ
ルを別個のグラフに示す(図18B)。
)による2および3回の免疫化がインフルエンザによる致死感染に対してマウスを保護し
得ることを示した。ポリペプチドは、免疫原性であり、全長HAに結合し得る抗体を誘導
する。誘導される抗体の少なくとも一部が、モノクローナル抗体CR9114の広域中和
エピトープのエピトープに結合し、またはその近くで結合する。
ペプチドの保護効力の評価
致死H5N1インフルエンザチャレンジモデルにおける本発明のポリペプチドs127
H1-t2-(配列番号91)の保護効力をさらに評価するため、8~12匹の雌BAL
B/cマウス(6~8週齢)の群を、10μgのMatrix-Mがアジュバント添加さ
れた30μgの精製s127H1-t2により3週間の間隔において3回免疫化した。チ
ャレンジモデルのための陽性対照として、広域中和抗体モノクローナル抗体CR6261
(15mg/kg)をチャレンジ1日前に静脈内投与した一方、PBSによる免疫化が陰
性対照として機能した。最後の免疫化から4週間後、マウスを12.5×LD50の異種
亜型チャレンジウイルス(H5N1A/Hong Kong/156/97)によりチャ
レンジし、3週間毎日モニタリングした(生存率、体重、臨床スコア)。
マウスはチャレンジ後8~10日目の間に感染により死亡する一方、陽性対照群(15m
g/kgのCR6261、チャレンジ1日前)は完全に保護されるためである(図19A
)。s127H1-t2(配列番号91)により免疫化された10匹のうち8匹(80%
)のマウスが、致死チャレンジを生存する(図19B)。平均体重損失は9日目において
約15%であるが、生存動物は回復し、増量する(図19C)。生存マウスについて臨床
スコア中央値は3~6日目において1.5であるが、8日目以降、臨床症状は観察されな
かった(図19D)。PBS対照群と比較して、統計的有意な生存比率の増加、生存時間
の増加、体重損失の減少および臨床スコアの低減が、本発明のポリペプチドs127H1
-t2により免疫化された群について観察される。まとめると、本発明者らは、本発明の
ポリペプチドs127H1-t2(配列番号91)による免疫化が、異種亜型H5N1イ
ンフルエンザ株による致死感染に対してマウスを保護し得ることを示した。
実施例5に記載の3回免疫化されたマウスからのプレチャレンジ血清を、いくつかの他
のグループ1(H1、H5およびH9)およびグループ2(H3およびH7)インフルエ
ンザ株からの全長HAに対する結合についても、ELISAにより当分野において周知の
プロトコルに従って試験した(図20)。結果は、本発明のポリペプチドs127H1-
t2(配列番号91)により誘導された抗体が、FL HAの天然配列中に存在するエピ
トープを効率的に認識すること、および抗体が結合するエピトープが、H1、H5および
H9HAを含む異なるグループ1インフルエンザ株間で保存されることを実証する。
ジモデルにおける本発明のポリペプチドの保護効力の評価
致死H1N1インフルエンザチャレンジモデルにおけるs127H1-t2(配列番号
91)の保護効力をさらに評価するため、8~18匹の雌BALB/cマウス(6~8週
齢)の群を、10μgのMatrix-Mがアジュバント添加された30μgの精製s1
27H1-t2により3週間の間隔において3回免疫化した。チャレンジモデルのための
陽性対照として、広域中和抗体モノクローナル抗体CR6261(15mg/kg)をチ
ャレンジ1日前に静脈内投与した一方、PBSによる免疫化が陰性対照として機能した。
最後の免疫化から4週間後、マウスを12.5×LD50のチャレンジウイルス(H1N
1A/Brisbane/59/2007)によりチャレンジし、3週間毎日モニタリン
グした(生存率、体重、臨床スコア)。
マウスはチャレンジ後7~10日目の間に感染により死亡する一方、陽性対照群(15m
g/kgのCR6261、チャレンジ1日前)は完全に保護されるためである(図21A
)。s127H1-t2(配列番号91)により免疫化された10匹のうち10匹のマウ
スが、致死チャレンジを生存する(図21B)。さらに、体重損失は、感染後5日目にお
いて平均して約20%である(図21C)が、動物は21日間のフォローアップ期間以内
に完全に回復する。臨床スコア中央値は、感染後2から9日目の間で3の値においてピー
クであるが、感染後16日目以降、ベースラインレベル(0)に戻る(図21D)。PB
S対照群と比較して、統計的有意な生存比率の増加、生存時間の増加、体重損失の減少お
よび臨床スコアの低減が、本発明のポリペプチドs127H1-t2により免疫化された
群について観察される。
)による免疫化が、H1N1A/Brisbane/59/2007による致死感染に対
してマウスを保護し得ることを示した。
和抗体の存在の評価
インフルエンザに対する保護における役割を担う抗体媒介エフェクター機序をさらに調
査するため、プレチャレンジ血清を、下記のH5N1A/Vietnam/1194/0
4に由来する偽粒子を使用する偽粒子中和アッセイ(Alberini et al 2
009)において試験した。
FL HAを発現する偽粒子を既に記載のとおり生成した(Temperton et
al.,2007)。既に記載のとおり(Alberini et al 2009)
(わずかに改変)、ルシフェラーゼレポーター遺伝子をコードするH5A/Vietna
m/1194/04偽粒子によるHEK293細胞の単一形質導入ラウンドを使用して中
和抗体を決定した。手短に述べると、熱不活性化(56℃において30分間)プレチャレ
ンジ血清試料を成長培地(2mMのL-グルタミン(Lonza)、1%の非必須アミノ
酸溶液(Lonza)、100U/mlのペニシリン/ストレプトマイシン(Lonza
)および10%のFBS(Euroclone,Pero,Italy)が補給されたE
BSSを有するMEM Eagle(Lonza,Basel,Switserland
))中で、96ウェル平底培養プレート中で3つ組で3倍段階希釈し、力価測定数のH5
A/Vietnam/1194/04偽粒子(感染後に106の相対発光単位(RLU)
を生じさせる)を添加した。37℃、5%のCO2における1時間のインキュベーション
後、ウェル当たり104個のHEK293細胞を添加した。37℃、5%のCO2におけ
る48時間のインキュベーション後、ルシフェラーゼ基質(Britelie Plus
,Perkin Elmer,Waltham,MA)を添加し、ルミノメーター(Mi
thras LB 940,Berthold Technologies,Germa
ny)を製造業者の説明書に従って使用して発光を計測した。
91)により免疫化された動物から得られたプレチャレンジ血清は、偽粒子中和アッセイ
を使用して高い血清濃度において検出可能な中和を示した(図22)。これは、免疫原と
して使用される場合に広域中和抗体を誘発する本発明のポリペプチドの能力を実証する。
DCC)および抗体依存性細胞食作用(ADCP)が、インフルエンザに対する保護に実
質的に寄与し、ステム指向bnAbはそれらの機序において特に有効である(DiLil
lo et al.,2014)。本発明のポリペプチドs127H1-t2l18lo
ng(配列番号186)による免疫化後に誘発された抗体がADCCを誘導し得るか否か
を試験するため、本発明者らは、下記のとおりマウスについて適合させたADCC代理ア
ッセイ(Parekh et al.,2012;Schneuriger et al
.,2012;Cheng et al.,2014)を使用してプレチャレンジ血清を
試験した。
ヒト肺癌由来A549上皮細胞(ATCC CCL-185)を、10%の熱不活性化
ウシ胎仔血清が補給されたダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)培地中で37℃、1
0%のCO2において維持した。実験2日前、Opti-MEM(Invitrogen
)中でLipofectamine 2000(Invitrogen)を使用してA5
49細胞にH5A/Hong Kong/156/97 HAまたはH1A/Brisb
ane/59/2007 HAをコードするプラスミドDNAを形質移入した。アッセイ
1日前、形質移入細胞をハーベストし、ADCCのために白色96ウェルプレート(Co
star)中で、およびイメージングのために黒色透明底96ウェルプレート(BD F
alcon)中で播種した。24時間後、試料をアッセイ緩衝液(RPMI1640(G
ibco)中4%の超微量IgG FBS(Gibco))中で希釈し、56℃において
30分間熱不活性化し、次いでアッセイ緩衝液中で段階希釈した。ADCCバイオアッセ
イのため、A549細胞に新たなアッセイ緩衝液を補充し、抗体希釈物およびマウスFc
ガンマ受容体IVを発現するADCC Bioassay Jurkatエフェクター細
胞(FcγRIV;Promega)を細胞に添加し、1:4.5の標的-エフェクター
比において37℃において6時間インキュベートした。細胞を室温に15分間平衡化して
からBio-Glo Luciferase System基質(Promega)を添
加した。発光をSynergy Neo(Biotek)上で10分後にリードアウトし
た。データを血清の不存在下のシグナルの誘導倍率として表現する。
7H1-t2(配列番号91)により免疫化された動物から得られたプレチャレンジ血清
を、抗原の資源としてのH5N1A/Hong Kong/156/97またはH1N1
A/Brisbane/59/07からのFL HAが形質移入された標的細胞を使用し
てFcγRIVシグナリング活性について試験した(図23)。両方の場合において、試
験された最大血清濃度において30倍の誘導が観察され、マウスにおいてADCC/AD
CPエフェクター機能を示すFcγRIVシグナリングを活性化させる抗体を誘発する本
発明のポリペプチドの能力を実証する。
t2(配列番号91)の能力がステム標的化、中和およびADCC媒介抗体を誘発し、同
種、異種および異種亜型グループIインフルエンザ株による致死チャレンジに対してマウ
スを保護し得ることを示す。
H5N1A/Hong Kong/156/97による致死チャレンジからの保護
観察された保護に対する本発明のポリペプチドにより誘導された抗体の寄与を決定する
ため、移植試験を実施した。この試験の目的は、アジュバント(Matrix-M)の存
在下でs127H1-t2(配列番号91)および追加のHisタグを含有するs127
H1-t2long(配列番号101)により3回免疫化されたマウスからの血清の受身
伝達(複数回投与)が、H5N1インフルエンザA/Hong Kong/156/97
による致死チャレンジに対する保護を付与するか否かを評価することであった。
ジュバント添加された30μgのs127H1-t2(配列番号91)、C末端Hisタ
グを含有するs127H1-t2long(配列番号101)またはPBSにより3週間
の間隔において3回免疫化した。最後の免疫化から4週間後(70日目)、血清を単離し
、群ごとにプールし、レシピエントマウス(雌BALB/c、6-8週齢、1群当たりn
=10)中に移植した。それぞれのマウスは、400μlの血清を、チャレンジ前に3日
間連続(-3、-2および-1日目)で腹腔内で受けた。チャレンジモデルのための陽性
対照として、CR6261(15mg/kg)をチャレンジ1日前に投与した一方(n=
8)、PBSによる注射が陰性対照として機能した(n=8)。0日目において、マウス
を12.5×LD50のチャレンジウイルスによりチャレンジし、3週間モニタリングし
た(生存率、体重、臨床スコア)。
中への血清の移植後にHA特異的抗体レベルを評価するため、ドナーマウスの末梢血のプ
ール血清試料(70日目)、血清移入前のナイーブレシピエントマウスのプール血清試料
(-4日目)およびチャレンジ直前の3回血清移入後のレシピエントマウスの個々の血清
試料(0日目)を、H1N1A/Brisbane/59/07からのFL HAへの結
合についてELISAにおいて試験した。
チャレンジ
- 実験は有効であった;PBS対照群における全てのマウスはチャレンジ後13日目以
前(中央値9.5日)に感染により死亡する一方、陽性対照群(15mg/kgのCR6
261、チャレンジ1日前)は完全に保護される(p<0.001)。
- 本発明のMatrix-Mアジュバント添加ポリペプチド配列番号91により免疫化
されたマウスからの血清のナイーブレシピエントマウス中への3回血清移入は、PBS血
清移入対照群と比較して有意な生存時間の増加(p=0.007)および臨床スコアの低
減(p=0.012)をもたらす(図24)。
- 本発明のMatrix-Mアジュバント添加ポリペプチド配列番号101により免疫
化されたマウスからの血清のナイーブレシピエントマウス中への3回血清移入は、PBS
血清移入対照群と比較して有意な生存比率の増加(p=0.002)、生存時間の増加(
p<0.001)、体重損失の減少(p=0.002)および臨床スコアの低減(p<0
.001)をもたらす(図24)。
- 本発明のポリペプチドについて、3回血清移入後の試験されたFL HA A/Br
isbane/59/07特異的抗体力価は、活性免疫化後に得られたレベルと類似した
(図25)。
Matrix-Mアジュバント添加の本発明のポリペプチド配列番号91および101
による3回の免疫化により誘導された血清構成要素(抗体である可能性が最も高い)は、
H5N1A/Hong Kong/156/97による致死チャレンジからマウスを保護
し得る(生存割合は、それぞれ30および78%である)。
本発明のポリペプチドのインビボ保護効力
PBS対照群と比較した、H1N1A/NL/602/09チャレンジモデルにおける
Matrix-Mを有する本発明のポリペプチドs127H1-t2(配列番号91)お
よび追加のHisタグを含有するs127H1-t2long(配列番号101)の保護
効力を決定した。
有する30μgの本発明のポリペプチドにより3週間の間隔において3回免疫化した。チ
ャレンジモデルのための陽性対照として、CR6261(15mg/kg)をチャレンジ
1日前に投与した一方(n=8)、PBSによる注射が陰性対照として機能した(n=1
8)。最後の免疫化から4週間後、マウスを12.5×LD50のチャレンジウイルスに
よりチャレンジし、3週間モニタリングした(生存率、体重、臨床スコア)。
、H1N1A/Brisbane/59/07からのFL HAへの結合についてELI
SAアッセイにおいて試験した。誘導された抗体がCR9114エピトープに近接して結
合するか否かを決定するため、CR9114競合ELISAを実施した。競合データを、
応答を定量し得る傾きODを使用して表現した。
- 実験は有効であった;PBS対照群における全てのマウスはチャレンジ後8日目以前
(中央値5日)に感染により死亡する一方、陽性対照群(15mg/kgのCR6261
、チャレンジ1日前)は完全に保護される(p<0.001)。
- Matrix-Mアジュバント添加のs127H1-t2(配列番号91)および追
加のHisタグを含有するs127H1-t2long(配列番号101)による3回の
免疫化は、PBS対照群と比較して有意な生存比率の増加(p<0.001)、生存時間
の増加(p<0.001)および臨床スコアの低減(p<0.001)をもたらす(図2
6)。
- Matrix-Mアジュバント添加のH1 mini-HAバリアントs127H1
-t2(配列番号91)による3回の免疫化は、PBS対照群と比較して有意な体重の減
少(p<0.001)をもたらす(図26)。
- 本発明のポリペプチドにより誘導されたH1N1A/Brisbane/59/07
FL HAに対するIgG抗体力価は、試験された全てのH1H1 mini-HAバ
リアントについてPBSと比較して有意に高い(p<0.001)(図27A)。
- H1 mini-HAバリアントs127H1-t2(配列番号91)は、追加のH
isタグを含有するs127H1-t2long(配列番号101)と比較して有意に高
いH1N1A/Brisbane/59/07FL HAに対するIgG抗体力価を有す
る(p=0.021)(図27A)。
- 試験された全ての本発明のMatrix-Mアジュバント添加ポリペプチドは、PB
Sと比較して有意に高いCR9114競合力価を有する(p<0.001)(図27B)
。
本発明のMatrix-Mアジュバント添加ポリペプチドs127H1-t2(配列番
号91)および追加のHisタグを含有するs127H1-t2long(配列番号10
1)は、H1N1A/NL/602/09による致死チャレンジに対する保護を付与し、
生存比率、生存期間の増加および臨床スコアの低減として確認される。さらに、Matr
ix-Mアジュバント添加のs127H1-t2(配列番号91)は、H1N1A/NL
/602/09による致死チャレンジ後に体重損失の低減ももたらした。
PCT/EP2012/073706号明細書は、インフルエンザヘマグルチニンステ
ムドメインポリペプチド、組成物およびワクチンならびにインフルエンザの予防および/
または治療の分野におけるそれらの使用方法を開示している。ここで、本発明者らは、H
1N1A/Brisbane/59/2007(配列番号1)の全長HAに由来するステ
ムドメインポリペプチドの付加配列を記載する。ステムドメインポリペプチドは、H1-
mini2-cluster1+5+6-GCN4t2(配列番号52)の部位特異的突
然変異により得られ、CR6261(Throsby et al,2009;Ekie
rt et al 2010)および/またはCR9114の広域インフルエンザ中和エ
ピトープを提示する。
1N1A/Brisbane/59/2007(配列番号1)の全長HAから以下のステ
ップを利用することにより導いた:
- HA0の開裂部位を除去すること。この部位における野生型HAの開裂は、HA1お
よびHA2をもたらす。除去は、P1位におけるRからQへの突然変異により達成するこ
とができる(例えば、開裂部位(配列番号1の343位)の命名法の説明については、S
un et al,2010参照。
- 配列番号1からアミノ酸53から320を欠失させることにより頭部ドメインを除去
すること。配列の残りのNおよびC末端部分は、4残基フレキシブルリンカーGGGGに
より結合させた。
- H1A/Brisbane/59/2007(配列番号1)中の残基402から41
8(の相当物)により形成されるループ(AへリックスおよびCDへリックス間)の溶解
度を増加させて融合前立体構造の安定性を増加させ、改変HAの融合後立体構造を脱安定
化させること。H1-mini2-cluster1+5+6-GCN4(配列番号2)
において、突然変異F406S、V409T、F413GおよびL416S(番号付与は
、配列番号1を指す)を導入した。
- H1A/Brisbane/59/2007中の324および436位におけるアミ
ノ酸間のジスルフィド架橋を導入すること;これは、突然変異R324CおよびY436
C(番号付与は、配列番号1を指す)を導入することにより達成される。
- 三量体化することが公知のGCN4由来配列RMKQIEDKIEEIESK(配列
番号20)を419~433位(番号付与は配列番号1を指す)において導入すること。
インを含有する。他の実施形態において、分泌(可溶性)ポリペプチドが細胞中での発現
後に産生されるように、膜貫通および細胞内ドメインの配列は、HA2の519、520
、521、522、523、524、525、526、526、527、528、529
、または530位(または配列アラインメントから決定してその相当物)からHA2のC
末端(配列番号1による番号付与)まで欠失されている。可溶性ポリペプチドは、三量体
構造を形成することが公知の配列、すなわち、foldon配列AYVRKDGEWVL
L(配列番号3)を場合により上記の短いリンカーを介して連結させて導入することによ
りさらに安定化させることができる。リンカーは、場合により、当業者に周知のプロトコ
ルに従って後でプロセシングするための開裂部位を含有し得る。可溶性形態の精製および
検出を容易にするため、タグ配列、例えば、ヒスチジンタグ(HHHHHHH(配列番号
16)もしくはHHHHHH(配列番号15)またはFLAGタグ(DYKDDDDK;
配列番号22)またはそれらの組合せを場合により短いリンカーを介して連結させて場合
により付加することができる。リンカーは、場合により、当業者に周知のプロトコルに従
って後でプロセシングするためのタンパク質分解開裂部位(の一部)、例えば、LVPR
GS(配列番号23)(トロンビン)またはIEGR(配列番号24)(第X因子)を含
有し得る。プロセシングされたタンパク質も本発明に包含される。
このようなC末端配列の一例は、配列番号4のFLAG-thrombin-foldo
n-Hisである。この配列をH1-mini2-cluster1+5+6-GCN4
t2(配列番号51)配列の可溶性形態と組み合わせて親配列(配列番号156)を作出
し、それを使用して突然変異導入により本発明の新規ポリペプチドを作出した。この配列
は、配列番号1および2のアミノ酸1~17に対応するリーダー配列を含有しない。
に記載のとおり分子の頭部ドメインをコードするヘマグルチニン配列の一部を欠失させ、
配列のNおよびC末端部分を欠失の両側でリンカーを介して再連結させることにより作出
する。頭部ドメインの除去は、水性溶媒から既に保護された分子の一部を曝露されたまま
とし、本発明のポリペプチドの構造を潜在的に脱安定化させる。この理由のため、Bルー
プ中の残基(特にアミノ酸残基406(配列番号1および2のそれぞれFおよびS)、4
09(VおよびT)413(FおよびG)および416(LおよびS)を、親配列の配列
番号156を出発点として使用して種々の組合せにおいて突然変異させた。配列番号15
6は、H1-mini2-cluster1+5+6-GCN4t2(配列番号52)か
ら、リーダー配列を除去し、残基520~565をFlag-thrombin-fol
don--his配列(配列番号4)により置き換えることにより作出した。
ことは、天然全長HAとは異なり、本発明のポリペプチドが開裂され得ず、タンパク質内
部に疎水性融合ペプチドを埋め込む関連立体構造変化を受ける事実により引き起こされる
。この問題に対処するため、配列番号156の残基I337、I340、F352および
I353の一部または全部も突然変異させた。
これらのポリペプチドは、419~433位における配列番号20を含有する(番号付与
は、配列番号1を指す)。
419~433位における配列番号20を含有する実施例11に記載のポリペプチドの
ライブラリー(セット1およびセット2)を作出した。HEK293F細胞ならびに多量
体(CR9114サンドイッチELISA)、CR6261結合(ELISA)およびタ
ンパク質発現(HTRFアッセイ)のためのスクリーン培養培地中への単一クローンを、
個々に形質移入した。CR9114サンドイッチアッセイ、CR9114、CR6261
、およびCR8020ELISA、ならびにHTRFアッセイに基づくヒットを確認し、
順位付けした。
S-PAGE(下記参照)により多量体化を評価した。広範な多量体化のため、C末端F
lag-Foldon-His(FFH)タグ配列をトロンビン開裂部位およびhisタ
グ配列(TCShis)により置き換えた。続いて、TCS-his含有配列の多量体化
(CR9114サンドイッチアッセイ、BS3架橋)を再確認し、クローンを順位付けし
、選択した。選択クローンを発現させ、精製し、特性決定した。
・架橋剤BS3(ビス(スルホスクシンイミジル)スベレート)を培養培地に直接添加す
る
・室温において30分間インキュベートする。
・培地を回収し、還元(R、5mMのDTT)および非還元(NR)条件下でSDS-P
AGE/ウエスタンブロットにより分析する
・還元条件下、BS3架橋種のみが共有結合したままである
・hisタグ特異的mAbを使用するウエスタンブロッティングを介してmini-HA
を検出する
1.419~433位における配列番号20および予測配列変異(>97%のランダム化
)を含有する高品質(補正ORFの>90%)の2つのライブラリーを、良好に作出した
2.合計10472クローン(セット1および2からそれぞれ5544および4928)
を初回スクリーンにおいて評価した(図28)
3.FL HA発現の>50%の発現およびFL HAについて観察されたシグナルの>
80%のCR6261への結合シグナルを示すクローンをヒットとみなし;この手順は7
03のヒット(ライブラリー1および2からそれぞれ596および107)を生じさせた
4.703のヒットのうち658が、確認スクリーン後に保持された
5.上位20%のヒット(111)の架橋アッセイは、三量体種の精製を潜在的に干渉し
得るより高次の多量体の存在を示した。
6.上位20%の確認されたヒット(111)を良好にクローニングしてFFHC末端を
TCS-his配列により置き換え、次いでCR9114サンドイッチELISAおよび
架橋アッセイにより評価した
7.架橋アッセイは、最も有望な三量体候補とみなされた9つのクローンを生じさせた(
配列番号158から166、表11)。CR9114サンドイッチELISA(図29)
に基づき、3つの候補(2つはTCS-hisを有し、1つはFFH C末端を有する)
を発現および精製のために選択した
8.選択候補の2つは十分に発現せず、精製を続行しなかった。候補GW1.5E2.F
FH(配列番号158)を、実施例4に記載の手順に従って均一に精製した(7.6mg
の総タンパク質;純度>95%、HP-SEC)。
9.SEC-MALS分析によるGW1.5E2.FFH(配列番号158)の特性決定
は、溶液中の三量体形成を示し、三量体当たりCR9114またはCR6261の3つの
Fab断片が結合する(図30および以下の表10)。バイオレイヤー干渉計測法(Oc
tet)から決定されたKd appは、CR6261およびCR9114の両方について
1nMである。予測されるとおり、いずれの方法によってもCR8020(陰性対照)の
結合を検出することができなかった。
結合する本発明の非共有結合三量体ポリペプチド(GW1.5E2.FFH、配列番号1
58)が同定された。
ポリペプチドsH1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号158)の保
護効力
PBS対照群と比較した、H1N1A/Brisbane/59/07チャレンジモデ
ルにおけるMatrix-Mがアジュバント添加されたsH1 mini-HA GW1
.5E2-FFH(配列番号158)の保護効力を決定した。
アジュバント添加された30μgのsH1mini-HA GW1.5E2-FFH(配
列番号158)により3週間の間隔において3回免疫化した。チャレンジモデルのための
陽性対照として、CR6261(15mg/kg)をチャレンジ1日前に投与した一方(
n=8)、PBSによる注射が陰性対照として機能した(n=16)。最後の免疫化から
4週間後、マウスを12.5×LD50のチャレンジウイルスによりチャレンジし、3週
間モニタリングした(生存率、体重、臨床スコア)。
認するため、プレチャレンジ血清(-1日目)を、H1N1A/Brisbane/59
/07からのFL HAへの結合についてELISAアッセイにおいて試験した。本発明
のポリペプチドsH1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号158)誘
導抗体がCR9114エピトープに近接して結合するか否かを決定するため、CR911
4競合ELISAを実施した。競合データを「%競合」として可視化し、(A-P)/A
×100)として定義し、式中、Aは、血清が存在しない場合のFL HAへのCR91
14結合の最大ODシグナルであり、Pは、所与の希釈における血清存在下のFL HA
へのCR9114結合のODシグナルであり、または応答を定量し得る傾きOD計量値を
使用して表現し;参照のためにCR9114およびCR8020(出発濃度5mg/ml
)溶液を含めた。
- 実験は有効であった;PBS対照群(n=16)における全てのマウスはチャレンジ
後10日目以前(中央値8日)に感染により死亡する一方、陽性対照群(n=8、15m
g/kgのCR6261、チャレンジ1日前)は完全に保護される(p<0.001)。
- Matrix-Mがアジュバント添加されたsH1 mini-HA GW1.5E
2-FFH(配列番号158)による3回の免疫化は、PBS対照群と比較して有意な生
存比率の増加(p<0.001)、生存時間の増加(p<0.001)、体重損失の減少
(p<0.001)および臨床スコアの低減(p<0.001)をもたらす(図31)。
- sH1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号158)により誘導さ
れたH1N1A/Brisbane/59/07FL HAに対するプレチャレンジIg
G抗体力価は、PBSと比較して有意に高い(p≦0.001)(図32A)。
- H1N1A/Brisbane/59/07FL HAに対するIgG抗体力価は、
2回の免疫化後にプラトーになる(図示せず)。
- 本発明のMatrix-Mアジュバント添加ポリペプチドsH1 mini-HA
GW1.5E2-FFH(配列番号158)は、PBSと比較して有意に高いCR911
4競合力価を誘導する(p<0.001)(図32B)。
A GW1.5E2-FFH(配列番号158)は、H1N1A/Brisbane/5
9/07による致死チャレンジに対する保護を付与する。
明のポリペプチドsH1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号158)
の保護効力
PBS対照群と比較した、H5N1A/Hong Kong/156/97チャレンジ
モデルにおけるMatrix-Mがアジュバント添加された優れたH1 mini-HA
バリアントの保護効力を決定した。
アジュバント添加された30μgの本発明のポリペプチドsH1 mini-HA GW
1.5E2-FFH(配列番号158)により3週間の間隔において3回免疫化した。チ
ャレンジモデルのための陽性対照として、CR6261(15mg/kg)をチャレンジ
1日前に投与した一方(n=8)、PBSによる注射が陰性対照として機能した(n=1
6)。最後の免疫化から4週間後、マウスを12.5×LD50のチャレンジウイルスに
よりチャレンジし、3週間モニタリングした(生存率、体重、臨床スコア)。
58)の免疫原性を確認するため、プレチャレンジ血清(-1日目)を、H1N1A/B
risbane/59/07からのFL HAへの結合についてELISAアッセイにお
いて試験した。mini-HA誘導抗体がCR9114エピトープに近接して結合するか
否かを決定するため、CR9114競合ELISAを実施した。競合データを「%競合」
として可視化し、(A-P)/A×100)として定義し、式中、Aは、血清が存在しな
い場合のFL HAへのCR9114結合の最大ODシグナルであり、Pは、所与の希釈
における血清存在下のFL HAへのCR9114結合のODシグナルであり、または応
答を定量し得る傾きOD計量値を使用して表現し;参照のためにCR9114およびCR
8020(出発濃度5μg/ml)溶液を含めた。
- 実験は有効であった;PBS対照群における16匹のうち15匹のマウスはチャレン
ジ後9日目以前(中央値9日)に感染により死亡する一方、陽性対照群(n=8、15m
g/kgのCR6261、チャレンジ1日前)は完全に保護される(p<0.001)。
- Matrix-Mがアジュバント添加されたsH1 mini-HA GW1.5E
2-FFH(配列番号158)による3回の免疫化は、PBS対照群と比較して有意な生
存比率の増加(p<0.001)、生存時間の増加(p<0.001)、体重損失の減少
(p<0.001)および臨床スコアの低減(p<0.001)をもたらす(図33)。
- 本発明のポリペプチドsH1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号
158)により誘導されたH1N1A/Brisbane/59/07FL HAに対す
るプレチャレンジIgG抗体力価は、PBSと比較して有意に高い(p≦0.001)(
図34A)。
- 本発明のMatrix-Mアジュバント添加ポリペプチドsH1 mini-HA
GW1.5E2-FFH(配列番号158)は、PBSと比較して有意に高いCR911
4競合力価を誘導する(p<0.001)(図34B)。
A GW1.5E2-FFH(配列番号158)は、H5N1A/Hong Kong/
156/97による致死チャレンジに対する異種亜型保護を付与する。
明のポリペプチドsH1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号158)
の保護効力
PBS対照群と比較した、H1N1A/Puerto Rico/8/1934チャレ
ンジモデルにおけるMatrix-Mがアジュバント添加された本発明のポリペプチドs
H1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号158)の保護効力を決定し
た。
アジュバント添加された30μgの本発明のポリペプチドsH1 mini-HA GW
1.5E2-FFH(配列番号158)により3週間の間隔において3回免疫化した。チ
ャレンジモデルのための陽性対照として、CR6261(15mg/kg)をチャレンジ
1日前に投与した一方(n=8)、PBSによる3回の免疫化が陰性対照として機能した
(n=16)。最後の免疫化から4週間後、マウスを25×LD50のチャレンジウイル
スによりチャレンジし、3週間モニタリングした(生存率、体重、臨床スコア)。
58)の免疫原性を確認するため、プレチャレンジ血清(-1日目)をH1N1A/Br
isbane/59/07からのFL HAへの結合についてELISAアッセイにおい
て試験した。mini-HA誘導抗体がCR9114エピトープに近接して結合するか否
かを決定するため、CR9114競合ELISAを実施した。競合データを「%競合」と
して可視化し、(A-P)/A×100)として定義し、式中、Aは、血清が存在しない
場合のFL HAへのCR9114結合の最大ODシグナルであり、Pは、所与の希釈に
おける血清存在下のFL HAへのCR9114結合のODシグナルであり、または応答
を定量し得る傾きOD計量値を使用して表現し;参照のためにCR9114およびCR8
020(出発濃度5μg/ml)溶液を含めた。
- 実験は有効である;PBS対照群(n=16)における全てのマウスはチャレンジ後
9日目以前(中央値8日)に感染により死亡する一方、陽性対照群(n=8、15mg/
kgのCR6261、チャレンジ1日前)は完全に保護される(p<0.001)。
- Matrix-Mがアジュバント添加された本発明のポリペプチドsH1 mini
-HA GW1.5E2-FFH(配列番号158)による3回の免疫化は、PBS対照
群と比較して有意な生存比率の増加(p<0.001)、生存時間の増加(p<0.00
1)、体重損失の減少(p<0.001)および臨床スコアの低減(p<0.001)を
もたらす(図35)。
- 本発明のポリペプチドsH1 mini-HA GW1.5E2-FFH(配列番号
158)により誘導されたH1N1A/Brisbane/59/07FL HAに対す
るプレチャレンジIgG抗体力価は、PBSと比較して有意に高い(p<0.001)(
図36A)。
- 本発明のMatrix-Mアジュバント添加ポリペプチドsH1 mini-HA
GW1.5E2-FFH(配列番号158)は、PBSと比較して有意に高いCR911
4競合力価を誘導する(p<0.001)(図36B)。
A GW1.5E2-FFH(配列番号158)は、H1N1A/Puerto Ric
o/8/34による致死チャレンジに対する保護を付与する。
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また、本発明は以下を提供する。
[1]
インフルエンザヘマグルチニンステムドメインポリペプチドであって、
(a)HA1C末端ステムセグメントに0~50アミノ酸残基の結合配列により共有結合しているHA1N末端ステムセグメントを含むインフルエンザヘマグルチニンHA1ドメインを含み、前記HA1C末端セグメントは、
(b)インフルエンザヘマグルチニンHA2に結合しており、前記HA1およびHA2ドメインは、H1亜型のHAを含むインフルエンザAウイルス亜型に由来し;
(c)前記HA1ドメインおよびHA2ドメイン間の連結部におけるプロテアーゼ開裂部位を含まず;
(d)前記HA1N末端セグメントは、HA1のアミノ酸1~x、好ましくは、HA1のアミノ酸p~xを含み、前記HA1C末端ステムセグメントは、HA1のアミノ酸y~C末端アミノ酸を含み、x=配列番号1の52位(または別のインフルエンザウイルス株のヘマグルチニン中の相当位置)上のアミノ酸であり、p=配列番号1の18位(または別のインフルエンザウイルスのヘマグルチニン中の相当位置)上のアミノ酸であり、y=配列番号1の320位(または別のヘマグルチニン中の相当位置)上のアミノ酸であり;
(e)アミノ酸残基402~418を含む領域は、アミノ酸配列X 1 NTQX 2 TAX 3 GKEX 4 N(H/K)X 5 E(K/R)(配列番号8)を含み、
X 1 は、M、E、K、V、RおよびTからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X 2 は、F、I、N、T、H、LおよびY、好ましくは、I、LまたはYからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X 3 は、V、A、G、I、R、FおよびS、好ましくは、A、IまたはFからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X 4 は、F、I、N、S、T、Y、E、K、M、およびV、好ましくは、I、Y、MまたはVからなる群から選択されるアミノ酸であり、
X 5 は、L、H、I、N、R、好ましくは、Iからなる群から選択されるアミノ酸であり;
(f)337位(HA1ドメイン)上のアミノ酸残基は、I、E、K、V、A、およびTからなる群から選択され、
340位(HA1ドメイン)上のアミノ酸残基は、I、K、R、T、F、N、SおよびYからなる群から選択され、
352位(HA2ドメイン)上のアミノ酸残基は、D、V、Y、A、I、N、S、およびTからなる群から選択され、
353位(HA2ドメイン)上のアミノ酸残基は、K、R、T、E、G、およびVからなる群から選択され;
(g)324位上のアミノ酸および436位上のアミノ酸間のジスルフィド架橋をさらに含み;
(h)さらに、アミノ酸配列RMKQIEDKIEEIESK(配列番号20)が、419~433位において導入されており、または配列RMKQIEDKIEEIESKQK(配列番号21)が417~433位において導入されている
ポリペプチド。
[2]
前記HA2ドメインが、トランケートされている、[1]に記載のポリペプチド。
[3]
519位からC末端アミノ酸までの前記HA2ドメインのC末端部分が欠失されている、[1]または[2]に記載のポリペプチド。
[4]
530位からC末端アミノ酸までの前記HA2ドメインのC末端部分が欠失されている、[1]または[2]に記載のポリペプチド。
[5]
前記HA2ドメインのC末端部分が、場合によりリンカーを介して連結しているアミノ酸配列GYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL(配列番号3)により置き換えられている、[3]または[4]に記載のポリペプチド。
[6]
前記HA1C末端ステムセグメントのC末端アミノ酸残基が、アルギニン(R)またはリジン(K)以外の任意のアミノ酸、好ましくは、グルタミン(Q)である、[1]~[5]のいずれか一項に記載のポリペプチド。
[7]
前記HA1ドメインおよび/または前記HA2ドメイン中の1つ以上のさらなる突然変異を含む、[1]~[6]のいずれか一項に記載のポリペプチド。
[8]
抗体CR6261および/またはCR9114に選択的に結合する、[1]~[7]のいずれか一項に記載のポリペプチド。
[9]
抗体CR8020および/またはCR8057に結合しない、[1]~[8]のいずれか一項に記載のポリペプチド。
[10]
[1]~[9]のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸分子。
[11]
[10]に記載の核酸分子を含むベクター。
[12]
[1]~[9]のいずれか一項に記載のポリペプチドおよび/または[10]に記載の核酸分子を含む組成物。
[13]
医薬品として使用される、[1]~[9]のいずれか一項に記載のポリペプチド、[10]に記載の核酸分子、および/または[11]に記載のベクター。
[14]
インフルエンザウイルスに対する免疫応答の誘導において使用される、[1]~[9]のいずれか一項に記載のポリペプチド、[10]に記載の核酸分子、および/または[11]に記載のベクター。
[15]
ワクチンとして使用される、[1]~[9]のいずれか一項に記載のポリペプチド、[10]に記載の核酸分子、および/または[11]に記載のベクター。
Claims (13)
- 抗体CR6261および/またはCR9114に選択的に結合する、請求項1に記載のポリペプチド。
- 配列番号81、91および101からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1または2に記載のポリペプチド。
- 請求項1、2または3に記載のポリペプチドをコードする核酸分子。
- 請求項4に記載の核酸分子を含むベクター。
- 請求項1、2または3に記載のポリペプチドを含む組成物。
- 請求項4に記載の核酸分子を含む発現ベクターを含む組成物。
- 医薬品の調製における、請求項1、2または3に記載のポリペプチドの使用。
- 医薬品の調製における、請求項5に記載のベクターの使用であって、前記ベクターが発現ベクターである、使用。
- インフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘導するための医薬品の調製における、請求項1、2または3に記載のポリペプチドの使用。
- インフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘導するための医薬品の調製における、請求項5に記載のベクターの使用であって、前記ベクターが発現ベクターである、使用。
- ワクチンの調製における、請求項1、2または3に記載のポリペプチドの使用。
- ワクチンの調製における、、請求項5に記載のベクターの使用であって、前記ベクターが発現ベクターである、使用。
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