【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、魚由来のトランスグル
タミナーゼ活性を保持するポリペプチドをコードする遺
伝子を有するDNA断片、該DNAを組み込んだ組換え
プラスミド、該プラスミドが導入された形質転換体、及
び該形質転換体を培養することを特徴とする、魚由来の
トランスグルタミナーゼ活性を有するポリペプチドの製
造法に関する。
【0002】
【従来の技術】トランスグルタミナーゼは、ペプチド鎖
内にあるグルタミン残基のγ−カルボキシアミド基のア
シル転移反応を触媒する酵素である。このトランスグル
タミナーゼはアシル受容体としてタンパク質中リジン残
基のε−アミノ基が作用すると、分子内及び分子間にε
−(γ−Gln)−Lys架橋結合が形成され、また、アシル
受容体としてアミノ酸、アミノ酸誘導体などの一級アミ
ンが存在した時は、それがタンパク質に導入される。そ
して水がアシル受容体として機能するときは、グルタミ
ン残基が脱アミド化されグルタミン酸残基になる反応を
進行させる酵素である。
【0003】トランスグルタミナーゼはゲル状食品、ゲ
ル状化粧料をはじめとしてヨーグルト、ゼリー及びチー
ズ等を製造する際に用いられている(特公平1ー5038
2)。更に、熱に安定 なマイクロカプセルの素材、固定
化酵素等の担体等を製造する際にも利用されている。
【0004】トランスグルタミナーゼは微生物由来のも
のとして、ストレプトベルチシリウム属の菌からカルシ
ウム(Ca2+)非依存性のトランスグルタミナーゼが発
見されている。同属菌の具体例としては、ストレプトベ
ルチシリウム・グリセオカルネウム(Streptoverticill
ium griseocarneum)IFO 12776, ストレプトベルチシ
リウム・シナモネウム・ サブ・エスピー・シナモネウ
ム(Streptoverticillium cinnamoneum sub sp. cinnam
oneum)IFO 12852, ストレプトベルチシリウム・モバ
ラエンス(Streptoverticillium mobaraense) IFO1381
9 等があげられる(特開昭64ー27471号参照)。
【0005】更にトランスグルタミナーゼは、ほ乳類動
物由来のものも知られている。例えば、モルモットの肝
臓由来のもの[Connellan, et al., Journal of Biolog
icalChemistry 246巻4号, 1093〜1098頁(1971)]、ヒ
ト及び牛の血管内皮細胞由来のもの[Gentile, et al.,
Journal of Biological Chemistry 266巻、478〜483頁
(1991)、及 び Nakanishi, et al., European Journal
of Biochemistry 202巻、15〜21頁(1991)]、ヒトの血液
凝固因子XIII[Takahashi, et al., Proc. Natl. A
cad. Sci. USA 83巻、8019〜8023頁(1986)]等である。
【0006】
【発明が解決しようとする課題】従来のトランスグルタ
ミナーゼの工業的利用のための酵素供給源は、ほ乳類動
物や細菌類であった。しかしながら、日常、我々が馴れ
親しんでいるトランスグルタミナーゼの作用産物は、蒲
鉾を代表とする水産加工品であり[関ら、NipponSuisan
Gakkaishi 56巻、125〜132頁(1990)]、当然ながら、
そこに作用しているトランスグルタミナーゼは、魚由来
の酵素である。
【0007】食品タンパク質の改質用の遺伝子組換え型
トランスグルタミナーゼとしてはモルモット由来のもの
があげられる。現在入手可能で比較検討できるものとし
て、これをとりあげ、魚由来のトランスグルタミナーゼ
がこれに対して、産業利用上優位である点として、以下
の項目が考えられる。
【0008】A)魚は、特に、生であっても人類が永年
食してきた生物であり、従って、本生物中に存在するト
ランスグルタミナーゼも永年食しているという事にな
り、他の生物起源のトランスグルタミナーゼに比べ、そ
の安全上の心配は、全くないといえよう。
【0009】B)魚と、他のほ乳類由来のトランスグル
タミナーゼにおける酵素特性の違いとして、特に水産練
り製品への応用を考えた場合、まず、酵素の反応性のよ
さ、作用させる酵素の失活条件の違いによる生産コスト
(これについては、以下の実施例に記す)への影響や、
反応産物の自然な食感、歯ごたえ(弾力性発現)等の質
的効果の違いがあることが充分に考えられる。実際に、
魚トランスグルタミナーゼは、魚のアクトミオシンへの
反応性が高いことが判明した(実施例参照)。
【0010】C)遺伝子組み換え型トランスグルタミナ
ーゼの微生物を用いた時の生産性の違いも、トランスグ
ルタミナーゼの実用化を考えた場合、重要な問題とな
る。モルモット由来トランスグルタミナーゼの大腸菌を
用いた生産について既にIkuraらは報告している(文
献、Eur. J. Biochem., vol.187, 705-711, 1990 )
が、その生産量はきわめて低いものであり、つまりはト
ランスグルタミナーゼの生産菌の抽出液中のトランスグ
ルタミナーゼは、それに対する抗体を用いて、検出でき
る程度であった(培地1リットルあたり約2.6mg相
当のトランスグルタミナーゼ生産量)。これに対して、
本魚由来トランスグルタミナーゼは、例えば、大腸菌を
宿主として生産させた場合、本酵素は宿主大腸菌由来SD
S可溶性タンパク質の10%〜15%相当の生産性を示
し、モルモットトランスグルタミナーゼの約100倍以
上の発現量を達成するに至り、本魚由来トランスグルタ
ミナーゼは遺伝子組換え型の生産に適した遺伝子構造を
有している可能性も高い。(以下の実施例にて説明)
【0011】以上の魚由来トランスグルタミナーゼのも
つ諸特性は、トランスグルタミナーゼの産業への応用、
特に食品タンパク質の改質を考えた場合、大きなメリッ
トとなるであろう。また、近年の漁獲海域の200海里
規制や総漁獲高制限による、水産資源の品不足は水産加
工製品の原材料コスト高となり大きな問題となっている
が、例えば、本酵素の使用により、他の食品タンパク質
との併用により加工品中のすり身原材料の濃度を低減さ
せる事、および低利用魚資源の有効利用を増大させる事
なども可能となる。
【0012】一方、微生物由来のトランスグルタミナー
ゼ(以下、BTGと略す)との比較においては、全く構
造的にも、反応機構的にも魚由来トランスグルタミナー
ゼは異なったものである。例えば、その酵素機能発現に
対して、BTGがカルシウムイオンを必要としない事な
どは、本発明で得られた魚由来トランスグルタミナーゼ
とは、その利用したい目的タンパク質により、それらの
使い分けが必要となろう。
【0013】BTGとの差別化では次の事が言えよう。
魚由来トランスグルタミナーゼは、例えば、酵素を基質
に反応させたい時、反応停止させたい時の切り替え時
に、このカルシウムイオン依存性を利用することで、反
応時間や反応性を制御できる可能性がある。また、BT
Gに比べ、魚由来トランスグルタミナーゼは熱安定性が
低いので、比較的低温で、加熱失活させることができ、
このことは高温加熱を好まない食品加工に有利であると
いえる。
【0014】魚類のトランスグルタミナーゼ遺伝子に関
しては、従来、全く知られていない。また、魚トランス
グルタミナーゼを安価に製造することが可能となれば、
トランスグルタミナーゼの工業的利用範囲が増すばかり
ではなく、より天然に近い酵素利用水産加工製品の提供
が可能となり、また、それら商品の製造コストを、使用
原材料すり身濃度の低減化などにより下げることができ
る。この様に、魚類由来トランスグルタミナーゼの安価
な供給体制の確立のためには、魚トランスグルタミナー
ゼの遺伝子取得、解析、発現等の課題があった。
【0015】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、上記課題
を解決すべく鋭意研究した結果、魚類のトランスグルタ
ミナーゼをコードする遺伝子を有するDNA断片を取得
し、その塩基配列を決定することに成功した。この成果
に基づいて、遺伝子工学的手法により大腸菌、枯草菌、
酵母、カビ等の微生物を用いて該遺伝子を発現させるこ
とが可能となり、魚類由来トランスグルタミナーゼの効
率的大量生産への途を開くことができた。
【0016】すなわち本願発明は魚類由来のトランスグ
ルタミナーゼ活性を保持するポリペプチドをコードする
DNA断片、該DNAを組み込んだ組換えプラスミド、
該プラスミドが導入された形質転換体、該形質転換体を
培養することを特徴とする当該ポリペプチドの製造法、
及び該製造法により得られる当該ポリペプチドである。
【0017】本願発明である魚由来のトランスグルタミ
ナーゼ活性を保持するポリペプチドをコードする遺伝子
を有するDNA断片の取得方法として、本願発明者らは
モルモットのトランスグルタミナーゼの活性中心付近の
合成DNA断片(配列表配列番号10)をプローブとし
てcDNAより目的DNA断片をハイブリダイゼーショ
ンにより単離する方法を採用した。これまでモルモット
のトランスグルタミナーゼ自身あるいはその遺伝子と、
魚のトランスグルタミナーゼ自身あるいはその遺伝子と
が高い相同性を有するとの知見は全くなく、この手法に
より目的DNA断片が取得できたことは意外である。
【0018】上記の他に、本願発明である魚由来のトラ
ンスグルタミナーゼ活性を保持するポリペプチドをコー
ドする遺伝子を有するDNA断片の取得方法としては以
下のものが掲げられる。A)魚由来のトランスグルタミ
ナーゼ活性を保持するポリペプチドを単離精製し決定さ
れるアミノ酸配列を基に全塩基配列を化学合成する。
B)決定されたアミノ酸配列を基に塩基配列の一部を合
成してこれをプローブにしてcDNAバンクあるいはゲ
ノミックバンクよりクローニングを行う。クローニング
方法は、ハイブリダイゼーション法でも良いが、PCR
法を用いても良い。C)あるいはmRNAをホウィート
ジャームあるいはウサギ網状赤血球のイン・ビトロ翻訳
系に供し、トランスグルタミナーゼ活性を有するポリペ
プチドをコードするmRNAが存在する画分を決定し、
そこより目的のcDNA断片を作製、取得することもで
きる。
【0019】本願発明である魚由来のトランスグルタミ
ナーゼ活性を保持するポリペプチドをコードする遺伝子
を有するDNA断片としては、配列表の配列番号2、
3、6、7、43、44記載のポリペプチドをコードす
るものがあげられる。
【0020】かかるDNA断片は、遺伝子コドンの縮重
を考慮すると、種々の塩基配列を包含し得るものであ
る。これらの塩基配列は、遺伝子発現系の諸要素、例え
ば宿主細胞の種類等に応じた優先コドンの使用、転写さ
れたRNAに形成される高次構造の回避等によって、当
業者が容易に選択し得るものである。具体例として、天
然塩基配列の一例を配列表中の配列番号4、8、45に
示し、また、天然塩基配列の一部を人為的に変換した例
を配列表中の配列番号12、13、14、15、16、
17、18、19に示す。さらに、かかるDNA塩基配
列は自然界からクローニングしたものであっても、人為
的に化学合成したDNAであってもよい。
【0021】更に、かかるDNA断片は、魚の個体差や
遺伝子の多コピー化に基づく変異や各器官、組織の違い
に基づく塩基配列の置換、欠失、挿入等に由来する変異
を有するが、しかしながら、依然としてトランスグルタ
ミナーゼ活性を発現しうる、本質的に同等なDNA断片
を包含しえるものである。これらの存在は下記の実施例
中に記載した。
【0022】本発明はまた、魚由来のトランスグルタミ
ナーゼを遺伝子組換え技術で改変した微生物により発現
させ、本酵素の供給を可能にする。この時に用いる組換
えプラスミドは、所望の発現系に応じた公知の発現ベク
ターに、魚由来のトランスグルタミナーゼをコードする
遺伝子を有するDNA断片を従来公知の方法によって、
挿入することにより調製することが可能である。大腸菌
用の発現ベクターとしては、T7gene10とリンカーペプチ
ドとの融合タンパク質を高発現する発現ベクタープラス
ミド(インビトロジェン社製:商品名Xpress SystemT
M)や、グルタチオン−S−トランスフェラーゼとの融
合タンパク質を高発現する発現ベクタープラスミド(フ
ァルマシアLKB社製:商品名pGEK系プラスミド)など
がある。より好ましい発現ベクターはpBSF2−SD
7、pT13sNcoである。一方、パン酵母での発現
ベクターとしては、ガラクトカイネースをコードする遺
伝子であるGAL1のプロモーターを外来遺伝子の発現
に利用できるpYES2(INVITROGEN社)な
どがある。
【0023】また、本発明は、トランスグルタミナーゼ
遺伝子を搭載する発現ベクターを導入することにより得
られた形質転換された種々の形質転換体に関する。形質
転換体となりうる生物には、大腸菌、枯草菌等の原核細
胞並びに酵母、カビ等の真核細胞が考えられるが、より
好ましい生物は大腸菌および酵母であり、更に好ましく
はE.coliHB101株およびSaccharomyces cerevisiae
INVSC2株である。これら形質転換体は、導入さ
れたトランスグルタミナーゼ遺伝子から該酵素を細胞内
または培地中へ産生、蓄積させることを可能にする。
【0024】最後に、本発明は、上記の形質転換体を培
養することにより、トランスグルタミナーゼ活性を有す
るポリペプチドを製造する方法に関する。培養条件は、
形質転換体の種類に応じて当業者が適宜決定し得るもの
である。また、発現され細胞内に蓄積または培地中へ分
泌された該酵素は、従来公知の種々の方法で単離、精製
することが可能であるが、天然型の魚由来トランスグル
タミナーゼの精製方法と同様の手法により、遺伝子組換
え型トランスグルタミナーゼの精製もできる。また、天
然型の魚由来トランスグルタミナーゼには糖鎖が付加さ
れているという報告はないが、大腸菌を宿主として製造
した遺伝子組換え型トランスグルタミナーゼには糖鎖は
付加されず、一方、酵母を宿主とした場合には、酵母細
胞内のグリコシレーション機能に応じて、糖鎖の付与も
考えられる。
【0025】以下、実施例を参照しつつ、本発明を更に
詳しく説明する。
【0026】
【実施例】
〔1.マダイのトランスグルタミナーゼをコードする遺
伝子を有するDNA断片〕マダイの肝臓1.3gを4M
グアニジンチオシアネート、1%β−メルカプトエタノ
ールの溶液(20ml)中で、ポリトロン、そしてテフ
ロンホモジナイザーを用いて破砕した。この細胞懸濁液
に0.5%ソディウムラウリルザルコシネートを加え溶
解させた後、この溶液を23ゲージの注射針に10回通
すことで、染色体DNAを細断化した。次に、この溶液
を4℃下、5000rpm、20分間遠心処理し、上清
を採取した。更に常法に従い、上清よりCsClの密度
勾配遠心操作を経て、全RNAを精製した(Sambrook e
t al., Molecular Cloning:a laboratory manual, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Pres
s (1989) 参照)。得られた全RNA量は3.8mgで
あった。この内の1.3mgをオリゴ(dT)ーセルロ
ースカラムを用いたmRNA精製キット(Clontech)に
かけ、mRNA分子を精製し、約20μgを得た。
【0027】得られたmRNAの内、8μgをcDNA
作製のための鋳型として用いた。cDNA合成には、ラ
ンダムプライマーを用い、2本鎖cDNAを合成するY
ou−prime cDNA合成キット(Pharma
cia)を用いた。得られたcDNAはλファージベク
ターλZapII(Stratagene)の制限酵素切
断部位EcoRIに組み込んだ後、GIGAPACKII
GOLD(Stratagene)のパッケージングキ
ットを用いて、ファージタンパク質中に取り込まれた形
で、マダイのcDNAライブラリーとして作製し、取得
した。なお、本ライブラリーのタイターは1.2X10
6pfu/μgベクターであった。
【0028】上記のマダイcDNAライブラリーから
6.0X104pfuに相当するファージを宿主細胞X
L1-Blueに感染させた後、直径150mmの寒天
プレート4枚に、プレート当り1.5X104pfuと
なるようにまいた。これを37℃で約9.5時間培養し
た後、プレート上に形成されたファージプラークをナイ
ロンメンブラン(Amersham製Hibond−
N)に転写した。次に、転写されたナイロンメンブラン
をアルカリで処理し、DNAを変性させ、中和、洗浄し
た。その後、メンブランを80℃で3時間処理すること
でDNAをメンブラン上に固定した。
【0029】得られたナイロンメンブランに対して42
℃で2時間、プレハイブリダイゼーションを行い、つい
で、42℃で16時間のハイブリダイゼーションを行っ
た。なお、プレハイブリダイゼーションの溶液の組成
は、6XSSC(1XSSCの組成は、0.15M NaCl, 0.
015M クエン酸ナトリウム,pH7.0)、5XDenhardt's溶液(1X
Denhardt's溶液の組成は、0.02% BSA, 0.02% Ficoll,
0.02% ポリビニルピロリドン)、20%フォルムアミ
ド、100μg/mlのニシン精巣DNA、0.1%SD
Sからなる。また、ハイブリダイゼーションの際、DN
Aプローブとして、モルモットのトランスグルタミナー
ゼの活性中心付近の合成DNA断片(5’ーGTCAA
GTACGGCCAGTGCTGGGTCTTCGC−
3’;Ikura et al., Biochemistry 27, 2898-2905 (1
988):配列番号10)を[γ-32P] ATPで末端ラベ
ルしたものを用いた。このスクリーニングにより得られ
た陽性クローンの候補株に対して、更に二次、三次スク
リーニングを行うことにより、最終的に4個の陽性クロ
ーンを取得した。
【0030】上記の4個の陽性クローンを保持する感染
細胞に、ヘルパーファージ(R408)を感染させるこ
とで、各陽性クローンに由来するcDNAをファージミ
ドベクターpBluescriptSK−に組み込まれ
た形態へと変換した。各 4クローンの挿入cDNAの
長さは、約0.5kbp(キロ塩基対)、1.5kb
p、2.5kbp、1.0kbpであった。そして、そ
れぞれpSLTG2,pSLTG4,pSLTG5,及
びpSLTG6と命名した。
【0031】次に、各cDNAクローンの制限酵素地図
の作成及び、pSLTG5の挿入cDNAをプローブと
したサザンブロッティング解析を行った結果、pSLT
G5(挿入cDNA長2.5kbpのもの)が、他の3
個のcDNAクローンを含んでいることが明らかになっ
たので、pSLTG5の挿入cDNAについてそのDN
A塩基配列を決定した。塩基配列の解析には、シーケネ
ースバージョン2.0(U.S.B.社)キットを用い
る従来公知の方法で行った。
【0032】その結果、配列表中の配列番号5に示す2
520塩基対の配列を含むDNA配列が明らかになっ
た。また、pSLTG5の制限酵素地図は図1に示し
た。この配列中には、本発明者らが用いたDNAプロー
ブと極めて高い相同性を示す部分が存在した。また、こ
の塩基配列から翻訳されるアミノ酸配列を配列表中の配
列番号2に示す。このアミノ酸配列中には、モルモット
肝臓由来のトランスグルタミナーゼやヒトの血液凝固因
子XIII中に共通して存在する8アミノ酸残基の活性中心
配列、Tyr-Gly-Gln-CysーTrp-Val-Phe-Ala(配列番号1
1)[ Nakanishi etal., Eur. J. Biochem. 202, 15-21
(1991)] が存在した。なお、以上の様にして取得した
マダイのトランスグルタミナーゼcDNAを含むDNA
プラスミドpSLTG5を保持する大腸菌株(AJ1267
3)、Escherichia coli XL1-Blue / pSLTG5 は微工研菌
寄第4114号(FERM BP-4114) として寄託されている。
【0033】〔2.スケソウダラのトランスグルタミナ
ーゼをコードする遺伝子を有するDNA断片〕スケソウ
ダラの肝臓2.3gを4Mグアニジンチオシアネート、
1%β−メルカプトエタノールの溶液(20ml)中
で、ポリトロン、そしてテフロンホモジナイザーを用い
て破砕した。この細胞懸濁液に0.5%ソディウムラウ
リルザルコシネートを加え溶解させた後、この溶液を2
3ゲージの注射針に10回通すことで、染色体DNAを
細断化した。次に、この溶液を4℃下、10000rp
m、20分間遠心処理し、上清を採取した。更に常法に
従い、上清よりCsClの密度勾配遠心操作を経て、全
RNAを精製した(Sambrook et al., Molecular Cloni
ng: a laboratory manual, Cold Spring Harbor Labora
tory, Cold SpringHarbor Press (1989) 参照)。得ら
れた全RNA量は7.2mgであった。この内の2.3
mgをオリゴ(dT)ーセルロースカラムを用いたmR
NA精製キット(Clontech)にかけ、mRNA分子を精
製し、約23μgを得た。
【0034】得られたmRNAの内、4μgをcDNA
作製のための鋳型として用いた。cDNA合成には、ラ
ンダムプライマーを用い、2本鎖cDNAを合成するY
ou−prime cDNA合成キット(Pharma
cia)を用いた。得られたcDNAはλファージベク
ターλZapII(Stratagene)の制限酵素切
断部位EcoRIに組み込んだ後、GIGAPACKII
GOLD(Stratagene)のパッケージングキ
ットを用いて、ファージタンパク質中に取り込まれた形
で、スケソウダラのcDNAライブラリーとして作製
し、取得した。なお、本ライブラリーのタイターは4.
1X105pfu/μgベクターであった。
【0035】上記のスケソウダラcDNAライブラリー
から5.8X104pfuに相当するファージを宿主細
胞XL1-Blueに感染させた後、直径150mmの
寒天プレート4枚に、プレート当り1.5X104pf
uとなるようにまいた。これを37℃で約9.5時間培
養した後、プレート上に形成されたファージプラークを
ナイロンメンブラン(Amersham製Hibond
−N)に転写した。次に、転写されたナイロンメンブラ
ンをアルカリで処理し、DNAを変性させ、中和、洗浄
した。その後、メンブランを80℃で3時間処理するこ
とでDNAをメンブラン上に固定した。
【0036】得られたナイロンメンブランに対して42
℃で2時間、プレハイブリダイゼーションを行い、つい
で、42℃で16時間のハイブリダイゼーションを行っ
た。なお、プレハイブリダイゼーションの溶液の組成
は、6XSSC(1XSSCの組成は、0.15M NaCl, 0.
015M クエン酸ナトリウム,pH7.0)、5XDenhardt's溶液(1X
Denhardt's溶液の組成は、0.02% BSA, 0.02% Ficoll,
0.02% ポリビニルピロリドン)、20%フォルムアミ
ド、100μg/mlのニシン精巣DNA、0.1%SD
Sからなる。また、ハイブリダイゼーションの際、DN
Aプローブとして、配列表配列番号4記載のマダイ肝臓
トランスグルタミナーゼのcDNAのうち、制限酵素C
laIとBamHIとで切り出せる約300塩基対のD
NA断片(活性中心付近のアミノ酸配列を含む領域をコ
ードしうるDNA)を[α-32P]dCTPでランダム
ラベルしたものを用いた。このスクリーニングにより得
られた陽性クローンの候補株に対して、更に二次、三次
スクリーニングを行うことにより、最終的に8個の陽性
クローンを取得した。
【0037】上記の8個の陽性クローンを保持する感染
細胞に、ヘルパーファージ(R408)を感染させるこ
とで、各陽性クローンに由来するcDNAをファージミ
ドベクターpBluescriptSK−に組み込まれ
た形態へと変換した。各8クローンの名称を、各々、p
ALTG1,pALTG2、pALTG3,pALTG
6、pALTG7,pALTG8、pALTG9,pA
LTG10とした。このうち、pALTG1、3、6、
8、について、挿入cDNAの長さを検定し、制限酵素
地図を作成、並びに5’端及び3’端のcDNA塩基配
列の解析をすることにより、図2に示した各クローンの
相関を得た。この際、塩基配列の解析には、蛍光プライ
マー・サイクル・シーケンシング・キット(A.B.I
社製)を用いた。
【0038】次に得られたcDNAの一部塩基配列を基
に合成プライマー(20塩基)を作製し、pALTG8
の挿入cDNAの全塩基配列を決定した。塩基配列の解
析には、シーケネースバージョン2.0(U.S.B.
社)キットを用いる従来公知の方法で行った。その結
果、配列表中の配列番号9に示す2921塩基対のDN
A配列が明らかになった。また、このcDNA塩基配列
から翻訳されるアミノ酸配列を配列表中の配列番号6に
示す。このアミノ酸配列中にはモルモット肝臓由来のト
ランスグルタミナーゼやヒトの血液凝固第XIII因子
に共通して存在する8アミノ酸残基の活性中心配列、T
yr−Gly−Gln−Cys−Trp−Val−Ph
e−Ala(配列番号11)が存在した。なお、以上の
ようにして取得したスケソウダラのトランスグルタミナ
ーゼcDNAを含むプラスミドpALTG8を保持する
大腸菌株(AJ 12709)、Escherichia coli XLI-Blue/pA
LTG8は微工研菌寄第4115号(FERM BP-4115)として寄託
されている。
【0039】一方、スケソウダラの肝臓以外の組織中で
発現しているトランスグルタミナーゼについても検討し
た。そこで、筋肉組織からのトランスグルタミナーゼc
DNAのクローニングを行うことを試みた。
【0040】スケソウダラの筋肉11.5gを4Mグア
ニジンチオシアネート、1%β−メルカプトエタノール
の溶液(80ml)中で、ポリトロン、そしてテフロン
ホモジナイザーを用いて破砕した。この細胞懸濁液に
0.5%ソディウムラウリルザルコシネートを加え溶解
させた後、この溶液を23ゲージの注射針に7回、続い
て25ゲージの注射針に7回通すことで、染色体DNA
を細断化した。次に、この溶液を4℃下、10000r
pm、20分間遠心処理し、上清を採取した。更に常法
に従い、上清よりCsClの密度勾配遠心操作を経て、
全RNAを精製した(Sambrook et al., Molecular Clo
ning: a laboratory manual, Cold SpringHarbor Labor
atory, Cold Spring Harbor Press (1989) 参照)。得
られた全RNA量は2.1mgであった。この内の1.
7mgをオリゴ(dT)ーセルロースカラムを用いたm
RNA精製キット(Clontech)にかけ、mRNA分子を
精製し、約21μgを得た。
【0041】得られたmRNAの内、3.2μgをcD
NA作製のための鋳型として用いた。cDNA合成に
は、ランダムプライマーを用い、2本鎖cDNAを合成
するTimeSaver cDNA合成キット(Pha
rmacia)を用いた。
【0042】本cDNAライブラリーを用いて、上記の
実施例の様な実験手法で、プラークハイブリダイゼーシ
ョンを行ったが、陽性cDNAクローンを取得出来なか
った。そこで、以下に記述する手法により、cDNA断
片の取得を行った。
【0043】作製したスケソウダラ筋肉cDNA群を鋳
型に、スケソウダラ肝臓由来トランスグルタミナーゼの
遺伝子塩基配列を基に合成したオリゴヌクレオチドをプ
ライマーとして、Amplitaq DNA Poly
merase(宝酒造)を用いたPCR法(ポリメラー
ゼチェインリアクション法)にて、スケソウダラ筋肉ト
ランスグルタミナーゼのcDNA断片を特異的に遺伝子
増幅させた。
【0044】図10に示したが、予想されるスケソウダ
ラの筋肉由来トランスグルタミナーゼcDNA構造の
内、5’端領域(N末側コード領域)は、cDNA断片
の合成用プライマーとして、Pr.10 (配列番号65 5'-TT
GGAAGCTTGTAAGAGCAACTCTTGGAAA-3')及び Pr.970 (配
列番号66 5'-TTGTACACTCGATCGATGGAGAGGT-3')を使用し
た。PCRの後、約980bpのDNA断片が増幅できた。
次に、この断片の末端をDNA Blunting K
it(宝酒造)にて平滑化した後、pUC18ベクター
の制限酵素HincII切断部位に組み込んだ。
【0045】中央領域の遺伝子増幅には、合成オリゴヌ
クレオチドプライマーとして、Pr.620 (配列番号67 5'
-TCTGCTTTGGGATCCTTGACCGCT-3')及び Pr.2000 (配列
番号68 5'-TGAAGGAGAGCTCCACAGACACA-3')を用いた。こ
れらのプライマー中には制限酵素BamHI、そしてS
acIの切断認識部位を人為的に組み入れた。そこで、
PCRの後、増幅された約1.4KbpのDNA断片を調製
し、これを上記制限酵素にて切断したDNA断片をpB
luescriptIISK−の同制限酵素部位へ組み
込み、cDNAクローンを得た。
【0046】更に、3’端領域(C末側コード領域)の
cDNA断片増幅には、まずPCR用プライマー Pr.10
-1F (配列番号69 5'-ATGATGTCAAAGGCTGTCAC-3')並び
に Pr.8-1R (配列番号70 5'-TCTTACCATATAAGTTGTAA-
3')で目的領域を増幅させた。しかし、これらのプライ
マーでは、目的DNA断片以外の小断片の増幅もみられ
たため、この増幅したDNA群を鋳型として同プライマ
ー Pr.10-1F と新たなプライマーである Pr.3-2F2R
(配列番号71 5'-ATTGATTAACAACAAAATGG-3')を用いて
再度遺伝子増幅を行った。その結果、約800bpのDNA
断片が増幅できた。本cDNA断片も上記のごとく両末
端を平滑化した後、pBluescriptIISK−
の制限酵素EcoRV部位に組み込んだ。
【0047】上記の3種類の領域を有するcDNA断片
を保持するプラスミドを大腸菌XL1−Blueにそれ
ぞれ形質転換することにより、N末端側クローンとし
て、No.N−3、N−4、N−5を、中央領域を含む
ものとして、クローンNo.SB−4、SB−5、SB
−21、SB−22、SB−30を、また、C末端側を
もつクローンとして、クローンNo.C−6、C−9、
C−13を得た。次に以上11個のDNAクローンの塩
基配列を、アプライドバイオシステムス社のTaq D
yeDeoxy Terminator Cycle
Sequencing Kitを用いた公知の方法にて
解析を行い、その結果、配列表中の配列番号51に示す
DNA配列と、配列番号8に示されているスケソウダラ
肝臓に由来するトランスグルタミナーゼcDNAと同一
の構造をもつDNA配列との2種類が明らかになった。
【0048】以上のことから、配列番号6に示すトラン
スグルタミナーゼは、臓器の種類を越えて発現している
スケソウダラのトランスグルタミナーゼであり、また、
配列番号49に示すトランスグルタミナーゼについて
は、完全長のcDNAということでは取得できなかった
が、肝臓由来トランスグルタミナーゼと比べて、その構
造遺伝子内にわずかな塩基置換と12bpの塩基欠失、
および3bpの塩基挿入がみられるのみであり、両遺伝
子および両遺伝子産物は極めて相同性の高いものである
ことが判明した。
【0049】なお、以上のようにして取得したスケソウ
ダラの筋肉由来トランスグルタミナーゼcDNA断片
(配列番号51)の一部を含むプラスミドN3 を保持す
る大腸菌株(AJ12790)、Escherichia coli XLI
-Blue/N3 は微工研菌寄第4147号(FERM BP
−4147)、そしてプラスミドN5 を保持する大腸菌
株(AJ12791)、Escherichia coli XLI-Blue/N5
は微工研菌寄第4148号(FERM BP−414
8)、プラスミドSB4 を保持する大腸菌株(AJ127
92)、Escherichia coli XLI-Blue/SB4 は微工研菌寄
第4149号(FERM BP−4149)、プラスミ
ドSB5 を保持する大腸菌株(AJ12793)、Escher
ichia coli XLI-Blue/SB5 は微工研菌寄第4150号
(FERMBP−4150)、プラスミドSB21 を保持
する大腸菌株(AJ12794)、Escherichia coli X
LI-Blue/SB21 は微工研菌寄第4151号(FERM
BP−4151)、プラスミドSB22 を保持する大腸菌
株(AJ12795)、Escherichia coli XLI-Blue/SB
22 は微工研菌寄第4152号(FERM BP−41
52)として寄託されている。
【0050】〔3.マダイのトランスグルタミナーゼ遺
伝子を発現するプラスミドpIL6TG1の構築、大腸
菌への導入と生理活性発現の検定〕上記の実施例により
作製したマダイトランスグルタミナーゼ遺伝子(cDN
A)を含むプラスミドpSLTG5を、図3に示すよう
に、制限酵素XbaIとEcoRVで消化し、トランス
グルタミナーゼcDNAを含むDNA断片を得た。一
方、トリプトファンプロモーター及びtrpAターミネ
ーターを有する発現ベクターpBSF2−SD7はBa
mHIで消化し、次にクレノウ酵素でDNA切断端を平
滑化した後に、XbaIで処理を行い、トリプトファン
プロモーターを有する大きいDNA断片を得た。なお、
発現プラスミドpBSF2−SD7はBio/Technology 8
p1036-p1040 (1990) に記載のプラスミドである。
【0051】上記のごとく処理し、得られた2つのDN
A断片をT4DNAリガーゼにより連結し、マダイトラ
ンスグルタミナーゼcDNA発現プラスミドpIL6T
G1を得た。本pIL6TG1のDNA塩基配列を検定
したところ、BamHI切断部位の一塩基Gが欠失して
おり、従って本プラスミド中のtrpAターミネーター
上流にはEcoRI部位が存在することがわかった。p
IL6TG1は公知の方法により大腸菌HB101に導
入し、形質転換体、Escherichia coli HB101 /pIL6TG1,
(AJ12730) を作製した。なお、AJ12730は微工研菌寄第
4116号(FERMBP-4116)として寄託されている。
【0052】取得した形質転換体のコロニーを、アンピ
シリン200μg/mlを含む寒天プレート上に塗布し、
30℃で一晩培養した後、このプレート上の菌体約2c
m2をアンピシリン200μg/mlを含むM9カザミノ
酸培地(Na2HPO4・12H2O 6g/l,KH2PO4 3g/l, NaCl 0.5g
/l, NH4Cl 1g/l, カサ゛ミノ酸 2g/l, L-Leu 0.2g/l, L-Pro
0.2g/l, Thiamin・HCl 2mg/l, MgSO4・7H2O 0.5g/l, Ca
Cl2・2H2O 0.015g/l,Glucose 2g/l)100mlを含む
坂口フラスコへ接種した。これを、30℃で約16時間
培養、菌体を集菌した。
【0053】集菌した菌体に、0.5M EDTA 溶液を0.3m
l、20mM Tris-HCl,30mM NaCl 混液を 30ml 添加し、
懸濁した。さらに、4mg/ml リゾチーム溶液を1ml添
加し、撹拌後、0℃にて1時間放置した。その後、菌体
懸濁液を超音波破砕し、これを遠心(8000rpmで10分
間)し、菌体破砕上清を調製した。また、同様に、トラ
ンスグルタミナーゼcDNAを有しないプラスミドを保
持する大腸菌(菌株名 E.coli HB101/pBSF2-SD7)から
も、菌体破砕物の遠心上清液を調製した。
【0054】各々の上清液のトランスグルタミナーゼ活
性を、モノダンシルカダベリンのメチル化カゼインへの
結合による蛍光強度(350nmの励起波長光による4
80nmの蛍光強度)の変化を指標とした活性検出法に
て検定した。本活性検出法はNippon Suisan Gakkaishi
(1991年)の第57巻、ページ1203から1210に記載されてい
る方法を基に、若干の修正を加えたものである。即ち、
メチル化カゼイン1mg/ml、モノダンシルカダベリン15
μM、CaCl2 5mM, Tris-HCl(pH7.5) 50mM, DTT 3mM の組
成よりなる溶液(サンプル添加後、2.5mlになるよう
調製)に各検定サンプルを150μl添加し、撹拌後、37
℃で30分間保温した。反応後、EDTA溶液を終濃度10mM
となるように添加し、各反応溶液の蛍光強度を蛍光強度
計(島津RF−520)により測定した。
【0055】
【表1】
【0056】その結果、表1に見られるように上記実施
例で得られたトランスグルタミナーゼcDNAを含む発
現プラスミドを保持する大腸菌の菌体抽出液には、明ら
かにトランスグルタミナーゼ活性が存在することが判明
した。このことより、我々の取得したcDNAがトラン
スグルタミナーゼをコードしうるものであることが明ら
かになった。
【0057】〔4.マダイのトランスグルタミナーゼ遺
伝子を発現するプラスミドpTTG2−22の構築、大
腸菌への導入と生理活性発現の検定〕次に、更に多くの
トランスグルタミナーゼを得るために、トランスグルタ
ミナーゼ発現プラスミドの改良を行うことにした。それ
について、以下説明する。
【0058】実施例3で得られたトランスグルタミナー
ゼ発現プラスミドpIL6TG1によるトランスグルタ
ミナーゼの発現量は少なかったため、更にpIL6TG
1よりも多くのトランスグルタミナーゼを発現しうるプ
ラスミドを構築するために、鋭意研究を行い、本トラン
スグルタミナーゼ遺伝子の翻訳効率を上げるための工夫
を施すこととした。
【0059】その工夫は、天然のトランスグルタミナー
ゼ遺伝子の一部のDNA塩基配列を化学合成DNAによ
り置換し、コードするアミノ酸配列は変えずに、塩基配
列を改変し、大腸菌で本トランスグルタミナーゼ遺伝子
が効率よく発現できるようデザインすることであった。
つまり、図4に示したように、本トランスグルタミナー
ゼのアミノ末端メチオニンから32番目のロイシンまで
をコードする領域(大腸菌で好まれるコドン等を選択し
ている)およびその上流にコンセンサスSD(シャイン
-ダルガルノ)配列(5’−TAAGGAGGT−
3’)が存在するよう にデザインした化学合成DNA
断片を作製し(配列表配列番号12〜19)、これを、
天然のトランスグルタミナーゼ遺伝子へ組み込むことを
計画して、以下の手順でこれを行った。
【0060】図4に示した化学合成DNA−1を構成す
るDNAオリゴマー8本(配列表配列番号12〜19)
を、合成DNA装置(A.B.I社製)で作製した。こ
れらのオリゴマーは通常の公知の方法、つまり、アニー
リング及びT4DNAリガーゼにより合体、連結し、化
学合成DNA−1を作製した。次に、制限酵素EcoR
I及びHindIIIで消化したpUC19へ、本DN
A断片をクローニングし、pFTGN6を構築した(図
5)。また、本プラスミドを用い、DNA塩基配列検定
を行い、作製したDNAが意図した配列であることを確
認した。
【0061】プラスミドpFTGN6を制限酵素Cla
I、HindIIIで消化し、更に、これを制限酵素H
aeIIで処理し、ClaI切断端とHaeII切断端
を有するDNA断片C(約110塩基対)を得た(図
6)。
【0062】一方、マダイトランスグルタミナーゼをコ
ードするcDNAを含むプラスミドpSLTG5をEc
oRI、HaeII及びNcoIで処理し、トランスグ
ルタミナーゼのcDNAの一部を有する約1.44kb
p(キロ塩基対)のDNA断片(DNA断片B)を得た
(図6)。
【0063】トリプトファンプロモーター及びtrpA
ターミネーターを有する発現ベクターpT13sNco
(本プラスミドは, J. Biochem. 104, 30-34 に記載さ
れている)を、NcoI、及びBamHIで消化し、ク
レノウ酵素により各々の切断端を平滑化した後、大きい
DNA断片取得した。これを更に、T4DNAリガーゼ
により自己連結することによりpTTNcoを得た。次
に、本pTTNcoをClaI,NcoIで消化後、切
断端をアルカリ性フォスファターゼにより脱燐酸化処理
し、トリプトファンプロモーター及びターミネーターを
有する大きいDNA断片(DNA断片A)を調製した
(図6)。
【0064】各々のDNA断片A,B,CをT4DNA
リガーゼにより連結することで、プラスミドpTTG1
を構築した(図7)。図7、8では以降の理解を容易に
するため、図6で「白ぬきバー」で表示されていたDN
A断片Bを「黒ぬきバー」で表示している。
【0065】次に、構築したプラスミドpTTG1をB
amHIで処理し、クレノウ酵素により切断端を平滑化
した後、SacIで消化し、図8に示す大きいDNA断
片を得た。また、pSLTG5を制限酵素SacI及び
EcoRVで処理し、小さいDNA断片を調製した。こ
れらのDNA断片をT4DNAリガーゼにより連結する
ことで、発現プラスミドpTTG2−22を構築した
(図8)。pTTG2−22は公知の方法により大腸菌
HB101に導入し、形質転換体、Escherichiacoli HB
101 / pTTG2-22, (AJ12742) を作製した。なお、AJ1274
2は微工研菌寄第4117号(FERM BP-4117)として寄託さ
れている。
【0066】取得した形質転換体のコロニーを、アンピ
シリン200μg/mlを含む寒天プレート上に塗布し、
30℃で一晩培養した後、このプレート上の菌体約2cm
2を上記3のM 9カザミノ酸培地(アンピシリン200
μg/mlを含む)100mlを含む坂口フラスコへ接種
した。これを、30℃で約16時間培養、菌体を集菌し
た。
【0067】集菌した菌体から、上記3と同様にして菌
体破砕上清を調製した。また、同様に、トランスグルタ
ミナーゼcDNAを有しないプラスミドを保持する大腸
菌(E.coli HB101/pTTNco)からも、菌体破砕物の遠心上
清液を調製した。
【0068】各々の上清液(50μl)のトランスグルタミ
ナーゼ活性を上記3と同様にして、モノダンシルカダベ
リンのメチル化カゼインへの結合による蛍光強度(35
0nmの励起波長光による480nmの蛍光強度)の変
化を指標とした活性検出法にて検定した(表2)。その
結果、上記実施例で得られたトランスグルタミナーゼc
DNAを含む発現プラスミド(pTTG2-22)を保持する大腸
菌の菌体抽出液には、明らかにトランスグルタミナーゼ
活性が存在することが判明した。このことは、更に、我
々の取得したcDNAがトランスグルタミナーゼをコー
ドしうるものであることが明らかになった。
【0069】
【表2】
【0070】次に、上記菌体抽出液がスケソウダラ由来
ミオシンB溶液をゲル化しえるかどうかを検定した。基
質としてのスケソウダラ由来ミオシンB(約6mg/ml)
溶液1.0mlに対して、50mM CaCl2 を471μl添加、ある
いは無添加条件で、上記のトランスグルタミナーゼ活性
を検出した大腸菌粗抽出液を100μl添加したもの、ある
いは無添加の標品を作製し、撹拌後、室温にて約16時
間放置した。
【0071】ミオシンBのゲル化は、反応させた容器で
ある試験管を倒置し、反応内容物が落下するか、あるい
は、固まっているかで判定した。その結果、表3に示し
たように、塩化カルシウム存在下で、トランスグルタミ
ナーゼ活性を示した大腸菌抽出液を加えた標品のみゲル
化が認められ、本発明により取得したcDNAはまさ
に、トランスグルタミナーゼをコードする遺伝子である
ことが判明した。
【0072】
【表3】
【0073】〔5.マダイのトランスグルタミナーゼ遺
伝子を発現するプラスミドpYSTG 1の構築、パン
酵母 Saccharomyces cerevisiae への導入と生理活性発
現の検定〕マダイトランスグルタミナーゼをコードする
cDNAを含むプラスミドpSLTG5を制限酵素Ec
oRI、XbaIで処理し、トランスグルタミナーゼの
cDNAを有する約2.5kbp(キロ塩基対)のDN
A断片を得た。
【0074】一方、パン酵母での発現ベクターとして
は、ガラクトカイネースをコードする遺伝子であるGA
L1のプロモーターを外来遺伝子の発現に利用できるp
YES2(INVITROGEN社)を用いた。これを
同制限酵素EcoRI、XbaIで処理し、約5.8k
bpのDNA断片を調製した。
【0075】上記の2つのDNA断片を常法に従い、T
4DNAリガーゼにて連結反応を行い、これを、大腸菌
HB101のコンピテントセル(宝酒造製)へ常法に従
い、形質転換した。形質転換体の選別には、抗生物質ア
ンピシリンを100μg/mlの濃度で含むL−寒天プ
レートを用いた。続いて、そこに生育してきた大腸菌の
コロニーの内から6株を滅菌したつまようじにて拾い、
アンピシリン100μg/mlを含む3mlのL−培地
へそれぞれ植菌し、30℃にて16時間振盪培養した。
【0076】各培養菌体2mlから、アルカリSDS法
に従いプラスミドDNAを調製し、制限酵素による切断
パターンをアガロースゲル電気泳動により解析したとこ
ろ、4株より得られたプラスミドが目的どおりのプラス
ミドであることが判明し、これをpYSTG1と名付け
た。さらに、本プラスミド構築の際の連結部分につい
て、DNA塩基配列の解析を行い、それらの塩基配列が
正しいことを確認した。
【0077】上記のごとく構築したpYSTG1を、ア
ルカリカチオン法(Bio101社製フナコシ(株)より購入)
による酵母形質転換方法に従って、酵母Saccharomyces
cerevisiae INVSC2 株(MATα, his3-Δ200, ura3-16
7) に導入した。なお、選択プレートにはヒスチジン20
mg/lを含むYNB培地(組成は 0.67%Yeast Nitrogen
Base w/o Amino acids (Difco製), 2% ク゛ルコース, 2% 寒
天)を用いた。こうして形質転換体、Saccharomyces ce
revisiae INVSC2 / pYSTG1, (AJ14679) を取得した。な
お、AJ14679は微工研菌寄第 BP-4085 号(FERM BP-408
5)として寄託されている。
【0078】上記のヒスチジン20mg/lを含むYNB培地
プレート上に生育させた形質転換体酵母をYPD培地
(組成は1%酵母エキス、2%バクトペプトン、2%グ
ルコース)100mlに接種し、30℃にて一昼夜振盪
培養した。その後、これを遠心集菌し、菌体を1%酵母
エキスで洗浄した後、同溶液10mlに懸濁した。続い
て、本懸濁液の半分である5mlを1%酵母エキス、2
%バクトペプトン、2%ガラクトースの組成からなる培
地95mlへ添加し、30℃にて18時間振盪培養し
た。ガラクトース含有培地で組換え体酵母を培養するこ
とで、GAL1プロモーターからの転写を誘導した。そ
して、残りの懸濁液5mlは、液体YPD培地95ml
へ同様に接種し、GAL1プロモーターからの転写を誘
導しない条件にて培養した。
【0079】一方、プラスミドを有しない宿主酵母INVS
C2株も、YPD培地プレート上に生育させ、同様に液体
YPD培地100mlに接種し、30℃にて培養した。
続いて上記のごとく操作し、得られた懸濁液5ml分を
液体YPD培地95mlへ接種し、培養した。
【0080】トランスグルタミナーゼ活性測定に供した
サンプル調製は次のように行った。培地100mlで培
養してきた酵母を遠心集菌した後、そこへ30mM塩化
ナトリウムを含む20mMトリス塩酸緩衝液(pH7.
5)を15ml加え、菌体を懸濁した。ここに、0.5
MのEDTAを0.25ml添加し撹拌後、本懸濁液に
ほぼ等容量のガラスビーズ(直径0.75mm)を加
え、4分間強く撹拌処理をした。その後、6000rp
mで10分間遠心し、不溶物を除去し、その上清をトラ
ンスグルタミナーゼ活性測定用サンプルとした。
【0081】各々の菌体破砕の上清液(50μlあるい
は150μl)のトランスグルタミナーゼ活性を上記実
施例3と同様にして、モノダンシルカダベリンのジメチ
ル化カゼインへの結合による蛍光強度(350nmの励
起波長光による480nm波長光の蛍光強度)の変化を
指標とした活性検定法にて検定した(表4)。なお、プ
ラスミドを保持しない酵母INVSC2株の菌体破砕液を本活
性測定溶液に添加した時の蛍光強度値を0とした。その
結果、本発明により得られたトランスグルタミナーゼc
DNAを含む発現プラスミド(pYSTG1)を保持
し、GAL1プロモーターの転写誘導を行った酵母の菌
体破砕抽出液には、明らかにトランスグルタミナーゼ活
性が存在することが判明した。また、予め酵素反応液へ
EDTAの添加を行い、カルシウムイオンを除去した場
合には、当然ながらトランスグルタミナーゼ活性を検出
しなかった。このことより、更に我々の取得したcDN
Aがトランスグルタミナーゼをコードするものであるこ
とが明かとなった。
【0082】
【表4】
【0083】〔6.ヒラメのトランスグルタミナーゼを
コードする遺伝子を有するDNA断片〕ヒラメの肝臓
1.5gを4Mグアニジンチオシアネート、1%β−メ
ルカプトエタノールの溶液(20ml)中で、ポリトロ
ン、そしてテフロンホモジナイザーを用いて破砕した。
この細胞懸濁液に0.5%ソディウムラウリルザルコシ
ネートを加え溶解させた後、この溶液を25ゲージの注
射針に8回通すことで、染色体DNAを細断化した。次
に、この溶液を4℃下、10000rpm、20分間遠
心処理し、上清を採取した。更に常法に従い、上清より
CsClの密度勾配遠心操作を経て、全RNAを精製し
た(Sambrook et al., Molecular Cloning:a laborator
y manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spri
ng Harbor Press (1989) 参照)。得られた全RNA量
は4.7mgであった。この内の1.6mgをオリゴ
(dT)ーセルロースカラムを用いたmRNA精製キッ
ト(Clontech)にかけ、mRNA分子を精製し、約23
μgを得た。
【0084】得られたmRNAの内、4.4μgをcD
NA作製のための鋳型として用いた。cDNA合成に
は、ランダムプライマーを用い、2本鎖cDNAを合成
するTimeSaver cDNA合成キット(Pha
rmacia)を用いた。得られたcDNAはλファー
ジベクターλZapII(Stratagene)の制限
酵素切断部位EcoRIに組み込んだ後、GIGAPA
CKIIGOLD(Stratagene)のパッケージ
ングキットを用いて、ファージタンパク質中に取り込ま
れた形で、ヒラメのcDNAライブラリーとして作製
し、取得した。なお、本ライブラリーのタイターは2.
0X105pfu/μgベクターであった。
【0085】上記のヒラメcDNAライブラリーから
2.2X105pfuに相当す るファージを宿主細胞X
L1-Blueに感染させた後、直径150mmの寒天
プレート11枚に、プレート当り2X104pfuとな
るようにまいた。これ を37℃で約6時間培養した
後、プレート上に形成されたファージプラークをナイロ
ンメンブラン(Amersham製Hibond−N)
に転写した。次に、転写されたナイロンメンブランをア
ルカリで処理し、DNAを変性させ、中和、洗浄した。
その後、メンブランを80℃で2.5時間処理すること
でDNAをメンブラン上に固定した。
【0086】得られたナイロンメンブランに対して42
℃で2時間、プレハイブリダイゼーションを行い、つい
で、42℃で16時間のハイブリダイゼーションを行っ
た。なお、プレハイブリダイゼーションの溶液の組成
は、6XSSC(1XSSCの組成は、0.15M NaCl, 0.
015M クエン酸ナトリウム,pH7.0)、5XDenhardt's溶液(1X
Denhardt's溶液の組成は、0.02% BSA, 0.02% Ficoll,
0.02% ポリビニルピロリドン)、20%フォルムアミ
ド、100μg/mlのニシン精巣DNA、0.1%SD
Sからなる。また、ハイブリダイゼーションの際、DN
Aプローブとして、配列表配列番号4記載のマダイ肝臓
トランスグルタミナーゼのcDNAのうち、制限酵素C
laIとBamHIとで切り出せる約300塩基対のD
NA断片(活性中心付近のアミノ酸配列を含む領域をコ
ードしうるDNA)を[α-32P]dCTPでランダム
ラベルしたものを用いた。このスクリーニングにより得
られた陽性クローンの候補株に対して、更に二次、三次
スクリーニングを行うことにより、最終的に10個の陽
性クローンを取得した。
【0087】上記の10個の陽性クローンを保持する感
染細胞に、ヘルパーファージ(R408)を感染させる
ことで、各陽性クローンに由来するcDNAをファージ
ミドベクターpBluescriptSK−に組み込ま
れた形態へと変換した。次に、これらのクローンの内、
5クローン(pFLTG10、12、16、17、21
とそれぞれ命名)について、挿入cDNAの長さを検定
し、制限酵素地図を作成、並びに5’端及び3’端のc
DNA塩基配列の解析をした。この際、塩基配列の解析
には、蛍光プライマー・サイクル・シーケンシング・キ
ット(A.B.I社製)を用いた。その結果、上記の各
クローンは、トランスグルタミナーゼ遺伝子の中央部を
コードしているcDNA断片であることが判明した。
【0088】そこで、上記5クローンによっては得られ
なかったトランスグルタミナーゼのC末端側をコードし
うるクローンを得るために、上記のヒラメcDNAライ
ブラリーをもう一度、下記の様にスクリーニングした。
【0089】スクリーニングのDNAプローブとして、
今回はクローンpFLTG21より制限酵素EcoRI
で切り出せる約300塩基対のDNA断片、及びpFL
TG17より制限酵素SalI、PstIで処理して切
り出せる約500塩基対のDNA断片を[α-32P]d
CTPでランダムラベルしたものを用いた。その他の条
件は上記に記載の方法で行った。その結果、本スクリー
ニングにより陽性クローンが得られ、最終的に、2次、
3次スクリーニングにより10個の陽性クローンを得
た。
【0090】上記の10個の陽性クローンの内、4個の
cDNAクローンについて、それらのベクターをpBl
uescriptSK−に変換し、挿入cDNAの各相
関を解析した。なお、本4クローンは、pFLTG4
4、51、55、63とした。
【0091】更に、トランスグルタミナーゼのN末端側
をコードしうるクローンを得るため、pFLTG12の
挿入cDNA5’端の塩基配列を基に作製した合成DN
Aプライマー(19塩基より構成され、配列は5’−A
CACTGCCGGTCCATCGAA−3’)を用い
て、新たにヒラメのcDNAライブラリーを作製した。
cDNA合成の鋳型には上記記載のmRNAサンプルを
2μg使用した。なお、ここで得られたライブラリーの
タイターは1.5X104pfu/μgベクターであっ
た。
【0092】次に、上記cDNAライブラリーから6X
103pfuに相当するファージを宿主大腸菌XL1−
Blueに感染させ、上記に記載した方法で、スクリー
ニングを行った。但し、ハイブリダイゼーションの際の
プローブとしては上記のクローンpFLTG21より制
限酵素EcoRIで切り出せる約300塩基対のDNA
断片、及びpFLTG17より制限酵素SalI、Ps
tIで処理して切り出せる約500塩基対のDNA断片
を[α-32P]dCTPでランダムラベルしたものを用
いた。このスクリーニングにより得られた陽性クローン
の候補株に対して、更に2次、3次スクリーニングを行
うことにより、最終的に1個の陽性cDNAクローンを
得た。
【0093】本クローンのベクターを上記の記載した方
法により、pBluescriptSK−に変換し、本
クローンをpFLTG60と命名した。次に、本クロー
ンの挿入cDNAの長さを検定し、制限酵素地図を作
成、並びに5’端及び3’端のcDNA塩基配列の解析
を行った。
【0094】上記のごとく取得し、解析した10個のc
DNAクローンの内、pFLTG21、55、60、6
3、及びpFLTG17の挿入cDNAの内、制限酵素
SalI切断部位から3’端までの塩基配列解析を行っ
た。その結果、配列表中の配列番号45、および47に
示したDNA配列が明らかになった。この両塩基配列の
違いは、1854番目の塩基の違いである。但し、この
変異により、コードされるアミノ酸の変化はない。これ
らの塩基配列から翻訳されるアミノ酸配列を配列表中の
配列番号43、44に示す。更にそれらの各クローン間
の相互関係は図11に示した。
【0095】なお、以上のようにして取得したヒラメ由
来トランスグルタミナーゼcDNA断片(配列番号4
5)の一部を含むプラスミドpFLTG21 を保持する大腸菌
株(AJ12798)、Escherichia coli XLI-Blue/pF
LTG21 は微工研菌寄第4154号(FERM BP−4
154)、そしてプラスミドpFLTG55 を保持する大腸菌
株(AJ12799)、Escherichia coli XLI-Blue/pF
LTG55 は微工研菌寄第4155号(FERM BP−4
155)、プラスミドpFLTG60 を保持する大腸菌株(A
J12800)、Escherichia coli XLI-Blue/pFLTG60
は微工研菌寄第4156号(FERM BP−415
6)、プラスミドpFLTG63 を保持する大腸菌株(AJ1
2801)、Escherichia coli XLI-Blue/pFLTG63 は微
工研菌寄第4157号(FERM BP−4157)、
プラスミドpFLTG17 中cDNA断片の制限酵素SalIから
下流域のcDNAクローン断片を有するプラスミド pFL
TG17Sを保持する大腸菌株(AJ12797)、Escheri
chia coli XLI-Blue/pFLTG17SalI は微工研菌寄第41
53号(FERM BP−4153)として寄託されて
いる。また、各ヒラメ由来トランスグルタミナーゼcD
NA断片を有するプラスミドは図12に示した。
【0096】上記のごとく得られた各cDNA断片は、
公知の方法により容易に、トランスグルタミナーゼのコ
ード領域を完全に含む一つのDNA断片に変換できる。
それには、例えば、pFLTG17Sを制限酵素 PstI で切断
し、得られる大きいDNA断片と、pFLTG63を同様に Ps
tI にて消化し、得られるトランスグルタミナーゼのC
末端側をコードするDNA断片とを、T4DNAリガーゼに
て連結し、トランスグルタミナーゼのコード領域がつな
がったプラスミド(pFLTG1-Cと命名)を構築する。
【0097】一方、pFLTG21を制限酵素 BglII、PstI に
て切断し、得られる大きいDNA断片と、pFLTG60 を同
様に制限酵素 BglII、PstI にて消化し、得られるトラ
ンスグルタミナーゼのN末端側をコードするDNA断片
とを、T4DNAリカ゛ーセ゛にて連結し、トランスグルタミナー
ゼのコード領域がつながったプラスミド(pFLTG1-Nと命
名)を構築する。次に、これをEcoRIにて消化後、ベク
ターDNA断片の両端を脱リン酸化酵素により脱リン酸
し、そこにもう一度、pFLTG1-Nのトランスグルタミナー
ゼcDNA断片を加え、ライゲーションすることで、pF
LTG1-N上でのcDNA断片の向きとは反対の向きにcD
NA断片が挿入されたプラスミド pFLTG2-N を構築す
る。
【0098】次に、プラスミドpFLTG2-N を制限酵素 Sa
lI で消化することで、トランスグルタミナーゼのN末
端側をコードするcDNA断片を取得することができ
る。この断片を、制限酵素 SalI で処理した pFLTG1-C
へライゲーションすることで、トランスグルタミナーゼ
の全コード領域が連結したcDNA断片が構築できる。
【0099】また、一方、大腸菌株 recBC, sbcA に対
して、重複するcDNA領域を有するふたつのcDNA
断片(例えば、pFLTG60 とpFLTG21、pFLTG21 とpFLTG1
7、 pFLTG17 とpFLTG63の各プラスミド上のcDNA断
片)を両端とする一本鎖化されたプラスミドDNAを形
質転換することで、宿主大腸菌内の組み替え機構により
極めて容易に、それらcDNA断片内の重複部位で組み
替えが起こり、順次連続したcDNA断片が構築される
に至り、これを繰り返せば、目的の完全長cDNAが得
られる。このような、組み替え機能を利用し、数々のキ
メラ遺伝子も構築されている(Ogawa ら、Journal of Mo
lecular Biology, Vol.226, 651-660, 1992)。
【0100】また、本発明者らは上記のマダイ、スケソ
ウダラ、ヒラメに由来するトランスグルタミナーゼcD
NAを取得し、翻訳されるアミノ酸配列を解析したとこ
ろ、魚類のトランスグルタミナーゼを構成するアミノ酸
配列間に共通したアミノ酸配列の存在を見いだした。こ
れらを配列表中の配列番号53、54、55、56、5
7、58、59、60、61、62、63、64に示し
た。但し、特定なアミノ酸残基でないアミノ酸はXaaで
示した。
【0101】〔7.取得したマダイトランスグルタミナ
ーゼcDNAと相同な遺伝子が多くの他の魚種に存在し
ているかどうかの検討〕本発明者らが、上記の実施例の
如く取得したマダイに由来するトランスグルタミナーゼ
遺伝子と非常に相同性の高い遺伝子が、他の魚種にも存
在するのかどうかについて、検討した。
【0102】検討対象のサンプルには、アジ、ハマチ、
イワシ、カツオ、サンマ、サバ、サケの肝臓、フグの卵
巣を、また、対照サンプルとして、枯草菌の染色体を使
用した。各魚の組織約3gを細かく切断した後、氷冷し
たTN緩衝液(組成は0.1M塩化ナトリウムを含む20mMト
リス塩酸緩衝液(pH7.5))を30ml加え、テフロンホモ
ジナイザーにてすりつぶした。
【0103】懸濁した試料を遠心チューブにいれ、冷却
遠心機にて5℃、1500rpmで5分間遠心し、沈澱画分を
得た。ここに、氷冷TNE緩衝液(組成は1mM EDTA を
含むTN緩衝液)を5ml添加し、よく懸濁した後、更
に氷冷TNE緩衝液を15ml加え、混和した。その後、
10% SDS を1ml加え室温にて30分間振とうし、次に
20mg/mlのプロテアーゼK溶液を100μl添加し、50
℃にて一晩反応させた。
【0104】反応後、各サンプルの水溶液に対して、フ
ェノール処理、フェノールクロロフォルム処理、そして
クロロフォルム処理を行い、除タンパク質操作をした。
その後、各サンプルにその1/50容量の5M塩化ナトリウム
と2.5倍容量のエタノールを加え、核酸を析出させ、回
収し、最終的に1mlのTE緩衝液(組成は1mM E
DTAを含む10mMトリス塩酸緩衝液(pH7.6))に溶
解させた。
【0105】次に、各サンプルのDNA約10μgを200
ユニットの制限酵素HindIIIまたはHincII と EcoRIで消
化し、これを1%アガロースゲルを用いて、電気泳動し
た。ゲルをエチジウムブロマイドで染色し、各サンプル
の泳動DNA量がほぼ一定であることを確認した後、ゲ
ルを、0.25N 塩酸に浸し、続いて0.6M塩化ナトリウム
を含む0.4N水酸化ナトリウム溶液にて処理を行った。
その後、ゲルを1.5M 塩化ナトリウムを含む0.5Mトリス
塩酸緩衝液(pH7.5)にて中和し、10XSSC(組成は
1.5M塩化ナトリウム、0.15M クエン酸三ナトリウム)
で、ゲル中の核酸をナイロンメンブラン(GeneScreen Pl
us) に写し取った。
【0106】核酸を吸着させたメンブランを、0.6M 塩
化ナトリウムを含む 0.4N 水酸化ナトリウム、続いて1.
5M 塩化ナトリウムを含む0.5M トリス塩酸緩衝液(pH7.
5)にて処理後、2XSSC溶液に浸した。その後、メン
ブランを室温にて30分間放置後80℃で2時間乾燥さ
せた。
【0107】得られたナイロンメンブランに対して65
℃で3時間、プレハイブリダイゼーションを行い、つい
で、60℃で16時間のハイブリダイゼーションを行っ
た。なお、プレハイブリダイゼーションの溶液の組成
は、5XSSC(1XSSCの組成は、0.15M NaCl, 0.
015M クエン酸ナトリウム,pH7.0)、1XDenhardt's溶液(1X
Denhardt's溶液の組成は、0.02% BSA, 0.02% Ficoll,
0.02% ポリビニルピロリドン)、1%SDSからな
る。また、ハイブリダイゼーションの際の溶液組成は0.
75M塩化ナトリウム、20mMトリス塩酸(pH8.0)、0.25mM E
DTA、1% SDS、1XDenhardt's溶液、50μg/mlの大腸
菌ゲノム溶液であった。そして、下記の如く作製したD
NAプローブを、2X105 cpm/ml の濃度で用い
た。
【0108】DNAプローブとしては、モルモットのト
ランスグルタミナーゼcDNA断片と、本発明者らが取
得したマダイのトランスグルタミナーゼcDNA断片を
それぞれ鋳型にして、ランダムプライマーにて放射能標
識したDNA断片を用いた。なお、モルモットのトラン
スグルタミナーゼcDNA断片は、それを有するプラス
ミドpKTG1(Ikuraら、Eur. J. Biochem、187巻、705-71
1、1990年に記載されている)を制限酵素StuIで処理し
て得られるトランスグルタミナーゼcDNA断片であ
る。また、マダイの場合は、取得したcDNAクローン
pSLTG5を制限酵素ApaI, SacI で切断し、得られるトラ
ンスグルタミナーゼcDNA断片を鋳型とした。
【0109】上記の如く、ハイブリダイゼージョンを行
ったメンブランを60℃で、0.1XSSC、0.1% SDS溶
液にて洗浄し、乾燥後、オートラジオグラフィーを取っ
た。その結果、本実験条件において、モルモット由来の
DNAプローブは、全ての実験サンプルの核酸とは対合
しなかったが、マダイに由来するDNAプローブは、枯
草菌の染色体DNAとは全く対合しなかったが、アジ、
ハマチ、サバ、カツオ、フグ由来の核酸とは強く、そし
て、イワシ、サンマ、サケ由来の核酸とは弱くではある
が、対合することが判明した。
【0110】以上の事実により、本発明者らが取得した
トランスグルタミナーゼ遺伝子と相同性の高い遺伝子
が、他の魚種においても存在していることが示されたと
同時に、本取得トランスグルタミナーゼをDNAプロー
ブとすることで、極めて容易に、マダイ、スケソウダ
ラ、ヒラメ以外の魚種においても、トランスグルタミナ
ーゼ遺伝子の取得ができることを初めて示すことができ
た。
【0111】〔8.スケソウダラ肝臓のトランスグルタ
ミナーゼの部分アミノ酸配列解析〕上記の如く取得でき
たスケソウダラ由来トランスグルタミナーゼ遺伝子が、
実際に発現しているトランスグルタミナーゼ酵素を発現
しうるものであることを示す為に、本酵素を精製、純化
し、その構造を明らかにすることを行った。なお、トラ
ンスグルタミナーゼ活性は、モノダンシルカダベリンの
ジメチル化カゼインへの結合による蛍光強度変化を指標
とした、上記に記載の活性検出法を基に検定した。
【0112】スケソウダラ肝臓15gに10mM NaCl, 5mM ED
TA, 2mM ジチオスレイトールを含む20mM トリス塩酸緩
衝液(pH8.3)30mlを加え、ホモジナイザーにより破
砕した。この破砕液を4℃において3,000rpm、10分の遠
心分離(日立製 Himac CR 20B2、ローター RPR20-2)を行っ
た。次いで上清をさらに4℃において37,000rpm、1時間
遠心分離(日立製 70P-72、ローター RP-70T)を行い、上清
を0.45μmのフィルター(GL サイエンス製 GLクロマトテ゛ィスク)に
かけ粗抽出液24mlを得た。
【0113】本溶液のタンパク質濃度を、BioRad社製の
プロテインアッセイキットにて測定したところ、約8.6m
g/mlであった。また、本粗抽出液の5μlを用いてトラ
ンスグルタミナーゼ活性を調べたところ、全活性849ユ
ニットであり、従って、比活性は4.10ユニト/mgタンパ
ク質であった。
【0114】次に粗抽出液を同緩衝液で平衡化したQ-セ
ファロース充填カラム(ファルマシア製 φ1.6cm x 10c
m)に通液したところ、トランスグルタミナーゼは吸着
された。NaCl濃度勾配によりトランスグルタミナーゼの
溶出を試みたところ、NaCl濃度約100mMで溶出された。
得られたトランスグルタミナーゼ活性画分(10ml)を
同緩衝液に一晩透析し、再度Q-セファロース充填カラム
に通液し、同一条件で溶出させトランスグルタミナーゼ
活性画分(9.5ml)を得た。
【0115】本活性画分のタンパク質濃度は約0.73mg/
mlであった。またトランスグルタミナーゼの全活性は
249ユニットであり、比活性は36.1ユニット/mgタンパク
質であった。
【0116】次に得られた活性画分を50mM NaCl, 2mM E
DTA, 0.5mM ジチオスレイトールを含む酢酸ナトリウム
(pH6.45)に一晩透析し、同緩衝液で平衡化したS-セフ
ァロース充填カラム(ファルマシア製 φ1.6cm x 10c
m)に通液したところ、トランスグルタミナーゼは吸着
された。NaCl濃度勾配によりトランスグルタミナーゼ
は、NaCl濃度約200mMで溶出(6.0ml)した。
【0117】本活性画分のタンパク質濃度は約56μg/m
lであった。また、トランスグルタミナーゼ全活性は20
1ユニットであり、比活性は591.2ユニット/mgタンパク
質であった。
【0118】この画分中には、下に記したように電気泳
動上に分子量約77,000の単一バンドを示すタンパク質の
みが存在し、ここにスケソウダラ肝臓由来のトランスグ
ルタミナーゼを精製し、取得した。得られた精製溶液の
比活性は、粗抽出液の143倍であり、回収率は23.7%で
あった。
【0119】a)電気泳動分析
精製トランスグルタミナーゼを30μlとり、同量の10%
メルカプトエタノール,4%SDS,20%グリセリン,0.002%
ブロムフェノールブルーを含む0.125Mトリス塩酸緩衝液
(pH6.8)を加え、沸騰浴中で1分加熱し、泳動試料とし
た。泳動試料40μlをアトー(株)製5-20%ポリアクリ
ルアミド既成ゲルに供し、0.1%SDSを含む0.025Mトリス
グリシン緩衝液で40mA、約2時間泳動を行った。泳動終
了後50%メタノール,7%酢酸を含む0.12%クマシーブリ
リアントブルー溶液で一晩染色し、50%メタノールを含
む7%酢酸溶液にて脱色を行った。その結果、分子量約7
7,000の位置に単一バンドを得た。
【0120】b)スケソウダラ肝臓由来トランスグルタ
ミナーゼの部分アミノ酸配列
精製したトランスグルタミナーゼ約80μgを含むS-セフ
ァロース画分約4mlを透析チューブに入れ、0.001mM E
DTAを含む5mM トリス塩酸緩衝液(pH8.3)に対して、6
時間透析をした後、再度同溶液に12時間透析し、トラン
スグルタミナーゼ酵素標品中のアルカリ金属イオンを除
去した。これを遠心濃縮により乾固させ、蒸留水0.8m
lを加え、37℃、30分攪拌し、再溶解させた。これにト
リプシン(シグマ製 11,700ユニット/mg)を16μg添加
し、37℃で12時間反応させ、ペプチド断片へと分解し
た。反応はギ酸を1滴滴下し終了した。
【0121】次に、本反応液を逆相HPLC(Inertsil Pre
p-ODS φ6.0mm x 250mm GLサイエンス製)に供し、溶媒
は0.05% TFA(トリフルオロ酢酸)として、アセトニト
リルの濃度勾配による溶出条件下にて、各ペプチド断片
を分離し、取得した。
【0122】取得したペプチド断片をプロテインシーク
エンサー(MilliGen Biosearch製 6400/6600)に供し、
それらのアミノ酸配列を分析したところ、次の6つの配
列が得られた。すなわち、Xaa-Ala-Gly-Gly-Ser-Gly-As
p(配列番号20)、 Trp-Trp-Leu-His-Gln-Gln-Ser
(配列番号21)、Met-Tyr-Leu-Leu-Phe-Asn-Pro(配
列番号22)、Trp-Gln-Glu-Pro-Tyr-Thr-Gly-Gly(配
列番号23)、 Phe-Asp-Val-Pro-Phe-Val-Phe-Ala-Glu
-Val-Asn-Ala-Asp(配列番号24)、Ser-Xaa-Tyr-Ser-
Asn-Gluであった(配列番号25)。但し、Xaaは未同定
アミノ酸残基を表す。
【0123】以上の6つのアミノ酸配列は、既に本発明
者らが取得したcDNAの塩基配列から予測されるアミ
ノ酸配列(配列番号6、7)の一部と完全に一致してお
り、このことは、取得したcDNAは、まさに実際にス
ケソウダラの生体内で発現し、活性の有しているトラン
スグルタミナーゼをコードしているものであることを示
した。
【0124】〔9.マダイ肝臓のトランスグルタミナー
ゼの部分アミノ酸配列解析〕一方、上記の如く取得でき
たマダイ由来トランスグルタミナーゼ遺伝子が、実際に
マダイ中で発現しているトランスグルタミナーゼ酵素を
発現しうるものであることを示す為に、本酵素を精製、
純化し、その構造を明らかにすることを行った。なお、
トランスグルタミナーゼ活性は、スケソウダラの場合と
同様に、モノダンシルカダベリンのジメチル化カゼイン
への結合による蛍光強度変化を指標とした、上記に記載
の活性検出法を基に検定した。
【0125】マダイ肝臓20g に 10mM NaCl, 5mM EDTA,
2mM ジチオスレイトールを含む20mMトリス塩酸緩衝
液(pH8.3) 46ml を加え、ホモジナイザー
により破砕した。この破砕液を遠心チューブに入れ、4
℃にて50,000rpm、45分の遠心分離(日立製 70P-72
ローター RP-65T)を行い、この上清液部分を0.45μmの
フィルター(アドバンテック DISMIC-25 ディスポーザ
ブルシリンジフィルターユニット)に通し、不溶性高分
子を除去した。その結果、赤く着色した抽出液30mlを
得た。次に、本抽出液に氷冷した5mMトリス塩酸緩衝液
(pH8.3)をほぼ等量(30ml)加え、溶液のイオン強度を
下げ、これをマダイ肝臓の粗抽出液(60ml)とした。
【0126】本溶液のタンパク質濃度を、BioRad社製の
プロテインアッセイキットにて測定したところ、約8.4m
g/mlであった。また、本粗抽出液の5μlを用いてトラ
ンスグルタミナーゼ活性を調べたところ、総活性2088ユ
ニットであり、従って、比活性は4.14ユニット/mgタン
パク質であった。
【0127】続いて、本粗抽出液を 5mM NaCl, 2.5mM E
DTA 0.5mM ジチオスレイトールを含む10mMトリス塩酸緩
衝液(pH8.3)で平衡化したDEAE-セファセル充填カラム
(ファルマシア製 φ2.6cm X 11cm)に通液したところ、
トランスグルタミナーゼは本イオン交換体に吸着される
ことがわかった。そこで、NaClの塩濃度勾配による本カ
ラムからの溶出を試みたところ、NaCl濃度約100mMで、
トランスグルタミナーゼ活性を有する画分が溶出でき、
これをDEAE画分とした(約59ml)。
【0128】本活性画分のタンパク質濃度は約145μg/
mlであった。またトランスグルタミナーゼの全活性は
1045ユニットであり、比活性は122ユニット/mgであっ
た。
【0129】DEAE-セファセル樹脂により分画されたト
ランスグルタミナーゼ活性画分を、次に透析チューブに
入れ、2mM EDTA, 0.5mM ジチオスレイトールを含む20mM
酢酸ナトリウム緩衝液(pH6.25)に一晩透析した。その
後、本標品を、同緩衝液にて平衡化したCM-セファロー
ス充填カラム(ファルマシア製 φ1.6cm X 10cm)に通
液したところ、トランスグルタミナーゼは本カラムに吸
着した。そこで、NaClの塩濃度勾配により本カラムから
酵素の溶出を試みたところ、NaCl濃度約200mMで、トラ
ンスグルタミナーゼ活性画分が溶出され、それを取得し
(約35ml)、これをCM画分とした。
【0130】本活性画分のタンパク質濃度は約20μg/m
lであった。また、トランスグルタミナーゼ全活性は約
530.6ユニットであり、比活性は758ユニット/mgタンパ
ク質であった。
【0131】CMーセファロース樹脂により分画されたト
ランスグルタミナーゼ活性画分を、再び、透析チューブ
に入れ、50mM NaCl, 2mM EDTA, 0.5mM ジチオスレイト
ールを含む20mM 酢酸ナトリウム緩衝液(pH6.45)に対し
て、一晩透析し、トランスグルタミナーゼ溶液の塩濃度
を下げた。これを同緩衝液にて平衡化したヘパリンーセ
ファロース充填カラム(ファルマシア製 Hi-Trapアフィ
ニティーカラム 容量1ml)に通液したところ、トラン
スグルタミナーゼは同樹脂に吸着された。NaClの塩濃度
勾配をかけることにより、トランスグルタミナーゼはヘ
パリンカラムより、NaCl濃度約200mMで溶出し、これを
取得した(約12.5ml)。これをヘパリン画分とした。
【0132】本活性画分のタンパク質濃度は約32μg/m
lであった。また、トランスグルタミナーゼ全活性は約
290.5ユニットであり、比活性は807ユニット/mgタンパ
ク質であった。
【0133】本ヘパリン画分を、SDS-ポリアクリルアミ
ドゲル電気泳動にかけ、電気泳動後、ゲルをクマシーブ
リリアントブルーにて染色を行ったところ、分子量約7
7,000の位置にのみ染色される単一バンドを確認でき
た。ここに、マダイ肝臓由来のトランスグルタミナーゼ
を精製し、取得することができた。得られたマダイトラ
ンスグルタミナーゼの精製溶液の比活性は、粗抽出液の
約195倍であり、回収率は約14%であった。
【0134】そこで、マダイ肝臓由来トランスグルタミ
ナーゼの部分アミノ酸配列を解析した。精製したトラン
スグルタミナーゼ約100μgを含むヘパリン画分約4ml
を透析チューブに入れ、0.1mM EDTA, 0.01mM ジチオス
レイトールを含む20mMトリス塩酸緩衝液(pH8.3)に対し
て、13時間透析をした後、続いて、0.001mM EDTA を含
む20mMトリス塩酸緩衝液(pH8.3)に再度、透析し、トラ
ンスグルタミナーゼ酵素標品中のアルカリ金属イオンを
除去した。これに尿素480mgを添加し37℃で30分間処理
した後、リシルエンドペプチダーゼ(和光純薬工業)7.
5μg(0.02ユニット(アミダーゼ活性))を添加し、更
に37℃で12時間酵素処理を施して、トランスグルタミナ
ーゼをペプチド断片化した。処理後、反応溶液に10%濃
度のTFA(トリフルオロ酢酸)溶液を40μl添加し(終濃
度0.1%)、撹拌した。
【0135】次に、本反応液を、逆相HPLC(Vydac製C4
カラム、φ4.6mm X 250mm)に供し、溶媒は0.1%TFAと
して、アセトニトリルの濃度勾配による溶出条件下に
て、各ペプチド断片を分離し、取得した。
【0136】取得したペプチド断片を、プロテインシー
ケンサー(アプライドバイオシステムズ製 470A)に供
し、それらのアミノ酸配列をシークエンス分析機(アプ
ライドバイオシステム製 120A)にて分析したところ、
次の配列が得られた。即ち、His-His-Leu-Glu-Leu-Val-
Leu-Xaa-Leu-Gly(配列番号26)、Xaa-Xaa-Phe-Asn-G
ln-Gln-Gly-Ala-Gln-Asp-Glu-Ile-Leu-Leu-Thr-Leu-His
(配列番号27)、 Ile-Ser-Phe-His-Met-Leu-Phe-Asn
-Pro(配列番号28)、Leu-Gln-Glu-Tyr-Val-Met-Asn-
Glu-Asp-Gly-Val-Ile-Tyr-Met-Gly-Thr(配列番号2
9)、 Asn-Ser-Glu-Met-Asp-Ile-Glu-His-Arg-Ser-As
p-Pro-Val-Tyr-Val-Gly-Arg-Thr(配列番号30)、 Ty
r-Asp-Ala-Pro-Phe-Val-Phe-Ala-Glu-Val-Asn-Ala-Asp-
Thr-Ile-Tyr(配列番号31)、Ser-Val-Tyr-Gly-Asn-H
is-Arg-Glu-Asp-Val-Thr-Leu-His-Tyr(配列番号3
2)、Ala-Gly-Arg-Arg-Val-Thr-Glu-Pro-Ser-Asn-Glu-
Ile-Ala-Glu-Gln-Gly-Arg-Leu(配列番号33)、Xaa-A
la-Gln-Pro-Val-Phe-Gly-Thr-Asp-Phe-Asp-Val-Ile-Val
-Glu(配列番号34)、 Asn-Glu-Gly-Gly-Arg-Asp-Al
a-His-Ala-Gln-Leu-Thr-Xaa-Leu-Ala-Xaa-Ala(配列番
号35)、Thr-Ile-Ser-Val-Thr-Val-Pro-Ala-His(配
列番号36)、 Ala-Val-Val-Xaa-Glu-Pro-Leu-Thr-Ala
(配列番号37)、 Gly-Gly-Val-Phe-Thr-Leu-Glu-gly
-Ala-Gly-Leu-Leu-Ser-Ala-Thr-Gln-Ile-His(配列番号
38)、 Leu-Ser-Phe-Ser-Pro-Met-Arg-Thr-Gly-Val-
Arg(配列番号39)、 Leu-Leu-Val-Asp-Phe-Asp-Ser
-Asp-Arg-Leu(配列番号40)、Gly-Val-Thr-Thr-Val-
Val-Val-His(配列番号41)、Tyr-Arg-Ser-Leu-Ile-T
hr-Gly-Leu-His-Thr-Asp (配列番号42)であった。
但し、Xaaは未同定アミノ酸残基を表す。
【0137】これらのアミノ酸配列は、上記の実施例で
得たcDNA配列から考えられるアミノ酸配列(配列番
号2、3)中に存在するものであり、このことはまさ
に、実際にマダイの生体中で機能しているトランスグル
タミナーゼの活性を示す酵素を、本取得cDNAはコー
ドするものであることを示している。
【0138】〔10.モルモット由来トランスグルタミ
ナーゼと魚由来トランスグルタミナーゼの酵素特性比
較〕魚由来トランスグルタミナーゼ(以後、FTGと略
す)の酵素的特性を、モルモット由来トランスグルタミ
ナーゼ(以後MTGと略す)との比較で、検定し、FT
Gの産業利用上での優位性について検討した。
【0139】a)比活性
上記の実施例にて、精製、純化したスケソウダラのトラ
ンスグルタミナーゼと市販されているMTGの、蛍光法
を用いた時の酵素比活性について比較検討した。MTG
は、宝酒造(株)製のものと、シグマ社製のものを使用
した。なお、宝酒造製のMTGは純度95%であり、ま
た、シグマ社製MTGも同等な純度であった。
【0140】上記3つのトランスグルタミナーゼ標品を
同等の酵素濃度(BioRad社製プロテインアッセイキット
でのタンパク質濃度測定による)となるように調製し、
それぞれに至適pH近傍のpH8.5にて、トランスグルタミ
ナーゼ活性を測定したところ、FTGはMTG(宝酒造
製)の10倍、シグマ社製MTGの20倍の比活性を示
す事が判明した。
【0141】また、上記3つの濃度調製したトランスグ
ルタミナーゼ標品を、SDS−PAGEにて展開し、ク
マシーブリリアントブルー染色し、デンシトメーター
(LKB社製、Ultro scan XL Lase
r Densitometer)にて、各トランスグル
タミナーゼ量を検定したところ、FTGは、MTGの約
4倍の濃度あることが示された。この事実を考慮して
も、FTGの蛍光法によるトランスグルタミナーゼ比活
性はMTGの2.5〜5倍であることが判明した。
【0142】上記の如く、MTGの比活性に比べて、F
TGの高比活性特性は、その産業への利用において、同
一効果の発現量に対する使用トランスグルタミナーゼ量
の低減化となるため、製品製造のコストダウンに、より
寄与できると思われる。
【0143】b)熱安定性
次に、熱失活のしやすさをFTGとMTGとで比較検討
した。使用酵素量は、共に、同程度の活性を示しうる量
を用いた。各トランスグルタミナーゼ標品を、まず、ト
リス塩酸緩衝液(pH8.5)(組成は、0.5Mトリス塩酸緩
衝液(pH8.5)250μl、100mM DTT 80μl、1mM モノダンシ
ルカダベリン 37μl、水 1300からなる溶液)中に入
れ、0℃、または20℃、25℃、30℃、37℃、4
0℃、42℃、50℃、60℃で10分間処理し、その
後、3分間氷冷し、各温度処理を停止した。次に、そこ
へ10mg/mlのジメチル化カゼイン溶液250μl、および5
0mMの塩化カルシウム溶液500μl を添加し、37℃にて
60分間反応させた。その後、各反応液に0.5M EDTA を
100μl添加し、酵素反応を停止させた。
【0144】上記の如く、調製した反応液の蛍光強度測
定をし、各酵素の熱安定性について調べた。その結果、
図13に示したように、残存活性50%を与える処理温
度は、FTGのほうがMTGよりも、約9℃低いことが
明らかになった。このことはFTGはMTGよりも、失
活させ易いことを示しており、上記a)の結果と合わせる
と、FTGは酵素反応しやすく、また、反応産物へのわ
ずかな加熱処理によって失活させることができると言え
る。
【0145】c)アクトミオシンに対する反応性
アクトミオシン(AM)の調製は、以下のように行っ
た。まず、スケソウダラの冷凍すり身(大洋漁業(株)
製SA級)約30gに対して0.5M塩化ナトリウムを
含む20mMトリス塩酸緩衝液(pH7.5)を約60
ml加え、エクセルオートホモジナイザー(日製産業
(株)製)にてホモジナイズした。これを次に1000
0rpmで30秒間、3回遠心し(日立製HimacC
R20B2型遠心機及びローターRPR20−2を用い
て)、不溶物を除去した。上清溶液を透析チューブ(S
eamless cellulose tubing、
輸入元は三光純薬(株))に入れ、これを0.5M塩化
ナトリウムを含む20mMトリス塩酸緩衝液(pH7.
5)に対して、3時間、そして16時間透析した。
【0146】その後、透析した溶液を14000rpm
で60分間遠心し、その上清を取得した後、ガーゼにて
濾過することで、アクトミオシン溶液(約27ml)を
調製した。なお、本溶液のタンパク質濃度はBioRad製の
プロテインアッセイキットにて測定したところ、26.
1mg/mlであった。
【0147】上記のごとく調製したアクトミオシンを用
いて、ミオシンタンパク質の重合化に及ぼすMTGとF
TGの作用効果を比較した。なお、ミオシンの重合化、
多量化は蒲鉾の弾力性発揮機能など、水産練り製品の”
おいしさ”と密接な関連をもつ指標となっている(沼倉
ら、日本水産学会誌 第51巻 第9号、1559-1565、(198
5)、関ら、日本水産学会誌 第56巻 第1号、125-132、
(1990))。
【0148】0.5M塩化ナトリウムを含む20mMト
リス塩酸緩衝液(pH7.5)にて、上記のごとく調製
したアクトミオシンを濃度10mg/mlになるよう調
整し、これを試験管(テルモ製、洗浄試験管ラルボ、1
5.5X100mm)に1mlづつ用意した。これに5
0mM塩化カルシウムを200μl添加、撹拌した後、
別途調製したFTG、あるいはMTG(蛍光活性測定で
同活性分)を200μlづつ添加し、充分に撹拌した。
なお、MTGはシグマ社製のものを用いた。
【0149】各トランスグルタミナーゼを添加後、37
℃にて15分、30分、45分そして60分反応させ
た。それぞれの反応後、反応液100μlを試験管から
抜取り、そこへ8M尿素、2%SDS、2%β−メルカ
プトエタノールを含む20mMトリス塩酸(pH8.
5)を100μlずつ添加し、反応を停止させた。次
に、4%SDS、10%β−メルカプトエタノール、2
0%グリセリン、0.002%ブロモフェノールブルー
を含む125mMトリス塩酸緩衝液(pH6.8)を更
にそこへ300μlずつ添加した後、これらのサンプル
を100℃にて1分間加熱し、SDS−PAGE用のサ
ンプルとした。
【0150】以上の各サンプル5μlをSDS−PAG
Eに供し、電気泳動後、クマシーブリリアントブルー染
色し、ミオシンH鎖の単量体量をデンシトメーター(L
KB社製、Ultro scan XL Laser
Densitometer)にて測定し、各トランスグ
ルタミナーゼのミオシンタンパク質の重合化、多量化に
及ぼす効果を解析した。その結果を図14に示すがFT
Gのほうが、MTGよりも速やかに、ミオシンタンパク
質を重合化することが判明した。このことは、更に、水
産練り製品へのトランスグルタミナーゼの応用におい
も、MTGよりもFTGの方が、製造コストダウンに寄
与しやすいことを示唆するものである。
【0151】
【発明の効果】従来、使用できるトランスグルタミナー
ゼの供給由来源としては、放線菌やモルモットのもので
あったが、本発明により、伝統的に蒲鉾等の水産食品加
工時にテクスチャーの保持、補強などの機能を発現し、
天然物中での作用が知られている魚由来のトランスグル
タミナーゼの遺伝子を有するDNA断片の提供を可能に
した。本発明により得られた魚トランスグルタミナーゼ
の遺伝子に遺伝子組換え技術を応用することでトランス
グルタミナーゼの大量生産が可能であり、該産生酵素を
応用することで、食品タンパク質の物性改変や栄養価の
改善が可能となる。さらに、本酵素は食品以外にも、医
薬品や化成品への応用も期待できるものである。
【0152】
【配列表】
配列番号:1
配列の長さ:25
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
起源
生物名:真鯛 肝臓
配列
Val Lys Tyr Gly Gln Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr
1 5 10 15
Val Leu Arg Cys Leu Gly Ile Pro Thr Arg
16 20 25
配列番号:2
配列の長さ:694
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:真鯛 肝臓
配列
Ala Ser Tyr Lys Gly Leu Ile Val Asp Val Asn Gly Arg Ser His
1 5 10 15
Glu Asn Asn Leu Ala His Arg Thr Arg Glu Ile Asp Arg Glu Arg
20 25 30
Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Ser Ile Thr Leu Gln Cys
35 40 45
Ser Asp Ser Leu Pro Pro Lys His His Leu Glu Leu Val Leu His
50 55 60
Leu Gly Lys Arg Asp Glu Val Val Ile Lys Val Gln Lys Glu His
65 70 75
Gly Ala Arg Asp Lys Trp Trp Phe Asn Gln Gln Gly Ala Gln Asp
80 85 90
Glu Ile Leu Leu Thr Leu His Ser Pro Ala Asn Ala Val Ile Gly
95 100 105
His Tyr Arg Leu Ala Val Leu Val Met Ser Pro Asp Gly His Ile
110 115 120
Val Glu Arg Ala Asp Lys Ile Ser Phe His Met Leu Phe Asn Pro
125 130 135
Trp Cys Arg Asp Asp Met Val Tyr Leu Pro Asp Glu Ser Lys Leu
140 145 150
Gln Glu Tyr Val Met Asn Glu Asp Gly Val Ile Tyr Met Gly Thr
155 160 165
Trp Asp Tyr Ile Arg Ser Ile Pro Trp Asn Tyr Gly Gln Phe Glu
170 175 180
Asp Tyr Val Met Asp Ile Cys Phe Glu Val Leu Asp Asn Ser Pro
185 190 195
Ala Ala Leu Lys Asn Ser Glu Met Asp Ile Glu His Arg Ser Asp
200 205 210
Pro Val Tyr Val Gly Arg Thr Ile Thr Ala Met Val Asn Ser Asn
215 220 225
Gly Asp Arg Gly Val Leu Thr Gly Arg Trp Glu Glu Pro Tyr Thr
230 235 240
Asp Gly Val Ala Pro Tyr Arg Trp Thr Gly Ser Val Pro Ile Leu
245 250 255
Gln Gln Trp Ser Lys Ala Gly Val Arg Pro Val Lys Tyr Gly Gln
260 265 270
Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu
275 280 285
Gly Ile Pro Thr Arg Pro Ile Thr Asn Phe Ala Ser Ala His Asp
290 295 300
Val Asp Gly Asn Leu Ser Val Asp Phe Leu Leu Asn Glu Arg Leu
305 310 315
Glu Ser Leu Asp Ser Arg Gln Arg Ser Asp Ser Ser Trp Asn Phe
320 325 330
His Cys Trp Val Glu Ser Trp Met Ser Arg Glu Asp Leu Pro Glu
335 340 345
Gly Asn Asp Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Leu
350 355 360
Ser Asp Gly Glu Phe Cys Cys Gly Pro Cys Pro Val Ala Ala Ile
365 370 375
Lys Glu Gly Asn Leu Gly Val Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Val Phe
380 385 390
Ala Glu Val Asn Ala Asp Thr Ile Tyr Trp Ile Val Gln Lys Asp
395 400 405
Gly Gln Arg Arg Lys Ile Thr Glu Asp His Ala Ser Val Gly Lys
410 415 420
Asn Ile Ser Thr Lys Ser Val Tyr Gly Asn His Arg Glu Asp Val
425 430 435
Thr Leu His Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Gln Lys Glu Arg Glu
440 445 450
Val Tyr Lys Lys Ala Gly Arg Arg Val Thr Glu Pro Ser Asn Glu
455 460 465
Ile Ala Glu Gln Gly Arg Leu Gln Leu Ser Ile Lys His Ala Gln
470 475 480
Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val Glu Val Lys Asn
485 490 495
Glu Gly Gly Arg Asp Ala His Ala Gln Leu Thr Met Leu Ala Met
500 505 510
Ala Val Thr Tyr Asn Ser Leu Arg Arg Gly Glu Cys Gln Arg Lys
515 520 525
Thr Ile Ser Val Thr Val Pro Ala His Lys Ala His Lys Glu Val
530 535 540
Met Arg Leu His Tyr Asp Asp Tyr Val Arg Cys Val Ser Glu His
545 550 555
His Leu Ile Arg Val Lys Ala Leu Leu Asp Ala Pro Gly Glu Asn
560 565 570
Gly Pro Ile Met Thr Val Ala Asn Ile Pro Leu Ser Thr Pro Glu
575 580 585
Leu Leu Val Gln Val Pro Gly Lys Ala Val Val Trp Glu Pro Leu
590 595 600
Thr Ala Tyr Val Ser Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu Lys
605 610 615
Gly Gly Val Phe Thr Leu Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser Ala Thr
620 625 630
Gln Ile His Val Asn Gly Ala Val Ala Pro Ser Gly Lys Val Ser
635 640 645
Val Lys Leu Ser Phe Ser Pro Met Arg Thr Gly Val Arg Lys Leu
650 655 660
Leu Val Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Lys Asp Val Lys Gly Val
665 670 675
Thr Thr Val Val Val His Lys Lys Tyr Arg Ser Leu Ile Thr Gly
680 685 690
Leu His Thr Asp
配列番号:3
配列の長さ:695
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:真鯛 肝臓
配列
Met Ala Ser Tyr Lys Gly Leu Ile Val Asp Val Asn Gly Arg Ser
1 5 10 15
His Glu Asn Asn Leu Ala His Arg Thr Arg Glu Ile Asp Arg Glu
20 25 30
Arg Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Ser Ile Thr Leu Gln
35 40 45
Cys Ser Asp Ser Leu Pro Pro Lys His His Leu Glu Leu Val Leu
50 55 60
His Leu Gly Lys Arg Asp Glu Val Val Ile Lys Val Gln Lys Glu
65 70 75
His Gly Ala Arg Asp Lys Trp Trp Phe Asn Gln Gln Gly Ala Gln
80 85 90
Asp Glu Ile Leu Leu Thr Leu His Ser Pro Ala Asn Ala Val Ile
95 100 105
Gly His Tyr Arg Leu Ala Val Leu Val Met Ser Pro Asp Gly His
110 115 120
Ile Val Glu Arg Ala Asp Lys Ile Ser Phe His Met Leu Phe Asn
125 130 135
Pro Trp Cys Arg Asp Asp Met Val Tyr Leu Pro Asp Glu Ser Lys
140 145 150
Leu Gln Glu Tyr Val Met Asn Glu Asp Gly Val Ile Tyr Met Gly
155 160 165
Thr Trp Asp Tyr Ile Arg Ser Ile Pro Trp Asn Tyr Gly Gln Phe
170 175 180
Glu Asp Tyr Val Met Asp Ile Cys Phe Glu Val Leu Asp Asn Ser
185 190 195
Pro Ala Ala Leu Lys Asn Ser Glu Met Asp Ile Glu His Arg Ser
200 205 210
Asp Pro Val Tyr Val Gly Arg Thr Ile Thr Ala Met Val Asn Ser
215 220 225
Asn Gly Asp Arg Gly Val Leu Thr Gly Arg Trp Glu Glu Pro Tyr
230 235 240
Thr Asp Gly Val Ala Pro Tyr Arg Trp Thr Gly Ser Val Pro Ile
245 250 255
Leu Gln Gln Trp Ser Lys Ala Gly Val Arg Pro Val Lys Tyr Gly
260 265 270
Gln Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys
275 280 285
Leu Gly Ile Pro Thr Arg Pro Ile Thr Asn Phe Ala Ser Ala His
290 295 300
Asp Val Asp Gly Asn Leu Ser Val Asp Phe Leu Leu Asn Glu Arg
305 310 315
Leu Glu Ser Leu Asp Ser Arg Gln Arg Ser Asp Ser Ser Trp Asn
320 325 330
Phe His Cys Trp Val Glu Ser Trp Met Ser Arg Glu Asp Leu Pro
335 340 345
Glu Gly Asn Asp Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu
350 355 360
Leu Ser Asp Gly Glu Phe Cys Cys Gly Pro Cys Pro Val Ala Ala
365 370 375
Ile Lys Glu Gly Asn Leu Gly Val Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Val
380 385 390
Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp Thr Ile Tyr Trp Ile Val Gln Lys
395 400 405
Asp Gly Gln Arg Arg Lys Ile Thr Glu Asp His Ala Ser Val Gly
410 415 420
Lys Asn Ile Ser Thr Lys Ser Val Tyr Gly Asn His Arg Glu Asp
425 430 435
Val Thr Leu His Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Gln Lys Glu Arg
440 445 450
Glu Val Tyr Lys Lys Ala Gly Arg Arg Val Thr Glu Pro Ser Asn
455 460 465
Glu Ile Ala Glu Gln Gly Arg Leu Gln Leu Ser Ile Lys His Ala
470 475 480
Gln Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val Glu Val Lys
485 490 495
Asn Glu Gly Gly Arg Asp Ala His Ala Gln Leu Thr Met Leu Ala
500 505 510
Met Ala Val Thr Tyr Asn Ser Leu Arg Arg Gly Glu Cys Gln Arg
515 520 525
Lys Thr Ile Ser Val Thr Val Pro Ala His Lys Ala His Lys Glu
530 535 540
Val Met Arg Leu His Tyr Asp Asp Tyr Val Arg Cys Val Ser Glu
545 550 555
His His Leu Ile Arg Val Lys Ala Leu Leu Asp Ala Pro Gly Glu
560 565 570
Asn Gly Pro Ile Met Thr Val Ala Asn Ile Pro Leu Ser Thr Pro
575 580 585
Glu Leu Leu Val Gln Val Pro Gly Lys Ala Val Val Trp Glu Pro
590 595 600
Leu Thr Ala Tyr Val Ser Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu
605 610 615
Lys Gly Gly Val Phe Thr Leu Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser Ala
620 625 630
Thr Gln Ile His Val Asn Gly Ala Val Ala Pro Ser Gly Lys Val
635 640 645
Ser Val Lys Leu Ser Phe Ser Pro Met Arg Thr Gly Val Arg Lys
650 655 660
Leu Leu Val Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Lys Asp Val Lys Gly
665 670 675
Val Thr Thr Val Val Val His Lys Lys Tyr Arg Ser Leu Ile Thr
680 685 690
Gly Leu His Thr Asp
695
配列番号:4
配列の長さ:2085
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:真鯛 肝臓
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..2085
特徴を決定した方法:P
配列
GCCAGCTACA AGGGGTTGAT TGTTGATGTG AATGGGAGAA GTCATGAAAA CAACTTGGCT 60
CACCGCACCA GGGAGATTGA TCGGGAGCGC CTGATCGTCC GCAGAGGTCA ACCCTTCTCC 120
ATCACTTTGC AGTGCTCTGA CTCTCTGCCG CCCAAACACC ACCTGGAGCT GGTCCTGCAC 180
CTCGGTAAGA GAGACGAGGT GGTGATCAAG GTTCAGAAGG AACATGGGGC CAGAGACAAG 240
TGGTGGTTTA ACCAGCAGGG AGCTCAGGAT GAAATACTGC TGACTCTGCA CAGCCCAGCG 300
AACGCTGTCA TTGGCCACTA CCGTCTGGCT GTGTTGGTGA TGTCACCAGA TGGTCACATC 360
GTAGAGAGGG CAGACAAAAT TAGCTTCCAC ATGCTCTTCA ACCCGTGGTG CAGAGATGAT 420
ATGGTTTACC TCCCTGATGA GAGTAAGCTC CAGGAGTATG TCATGAATGA AGATGGAGTG 480
ATTTACATGG GGACCTGGGA TTACATCAGA AGTATACCCT GGAATTATGG ACAGTTTGAG 540
GACTATGTGA TGGACATCTG TTTTGAAGTC TTGGACAACT CCCCAGCTGC CTTGAAAAAC 600
TCAGAGATGG ACATTGAGCA CAGATCAGAC CCCGTCTATG TCGGCAGGAC AATCACTGCA 660
ATGGTGAACT CTAACGGTGA CAGGGGTGTG TTGACTGGTC GCTGGGAGGA GCCGTACACT 720
GATGGGGTCG CACCGTATCG ATGGACCGGC AGCGTGCCGA TCCTCCAACA GTGGAGCAAG 780
GCCGGGGTGA GGCCGGTCAA ATATGGCCAG TGCTGGGTGT TTGCTGCCGT CGCCTGCACA 840
GTGCTGCGCT GCCTGGGAAT CCCAACACGC CCCATCACCA ACTTCGCTTC AGCCCATGAT 900
GTCGATGGTA ACCTCTCGGT AGACTTCCTG CTGAATGAGA GACTGGAGAG CTTGGACAGT 960
AGACAGAGAA GTGACAGTAG CTGGAACTTC CACTGTTGGG TTGAATCCTG GATGAGCAGA 1020
GAGGATCTCC CTGAAGGAAA TGATGGCTGG CAGGTTTTGG ATCCCACCCC TCAAGAACTG 1080
AGTGATGGTG AGTTTTGCTG TGGTCCGTGT CCAGTGGCGG CCATCAAGGA GGGAAATCTG 1140
GGAGTGAAGT ACGACGCCCC CTTTGTATTC GCTGAGGTGA ACGCTGACAC CATCTACTGG 1200
ATCGTCCAAA AAGATGGCCA ACGACGGAAG ATCACAGAGG ACCATGCTAG TGTGGGGAAG 1260
AACATCAGCA CAAAAAGCGT TTACGGCAAC CACAGAGAAG ATGTCACTCT GCACTACAAA 1320
TATCCTGAAG GCTCCCAGAA GGAGAGGGAA GTGTACAAGA AGGCGGGACG CCGGGTCACA 1380
GAGCCATCCA ACGAGATCGC AGAACAAGGA AGACTTCAGC TGTCAATCAA GCATGCCCAG 1440
CCTGTATTTG GGACAGACTT TGATGTGATT GTTGAGGTGA AGAATGAAGG AGGCAGAGAT 1500
GCTCATGCTC AGCTGACCAT GCTGGCCATG GCAGTAACTT ACAATTCTCT CCGCCGGGGG 1560
GAGTGCCAGA GAAAAACAAT CAGTGTGACT GTGCCCGCTC ACAAAGCCCA CAAGGAGGTT 1620
ATGCGTCTGC ACTACGACGA CTATGTCAGG TGTGTCTCTG AGCATCACCT GATCAGGGTG 1680
AAAGCGCTCT TAGACGCTCC AGGGGAGAAC GGGCCCATCA TGACCGTGGC CAACATCCCA 1740
CTGAGCACGC CTGAACTCCT TGTACAGGTG CCTGGGAAGG CTGTTGTATG GGAACCACTG 1800
ACAGCCTACG TCTCCTTCAC CAATCCTCTG CCAGTTCCTC TGAAGGGTGG CGTTTTCACT 1860
TTGGAGGGTG CTGGCCTGCT GTCTGCCACT CAGATCCATG TTAATGGTGC TGTAGCTCCA 1920
AGTGGGAAAG TGTCTGTCAA GCTCTCTTTC TCCCCCATGC GCACCGGGGT GAGGAAGCTC 1980
CTGGTGGACT TTGACTCTGA CAGACTGAAG GACGTGAAGG GTGTCACCAC CGTGGTTGTC 2040
CACAAGAAAT ACAGATCTCT AATTACTGGA CTTCACACAG ACTAA 2085
配列番号:5
配列の長さ:2520
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:真鯛
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:34..2121
特徴を決定した方法:P
配列
CTTTAACAGA CTTTGATAGG AAGAAGATCT GCG ATG GCC AGC TAC AAG GGG 51
Met Ala Ser Tyr Lys Gly
1 5
TTG ATT GTT GAT GTG AAT GGG AGA AGT CAT GAA AAC AAC TTG GCT 96
Leu Ile Val Asp Val Asn Gly Arg Ser His Glu Asn Asn Leu Ala
10 15 20
CAC CGC ACC AGG GAG ATT GAT CGG GAG CGC CTG ATC GTC CGC AGA 141
His Arg Thr Arg Glu Ile Asp Arg Glu Arg Leu Ile Val Arg Arg
25 30 35
GGT CAA CCC TTC TCC ATC ACT TTG CAG TGC TCT GAC TCT CTG CCG 186
Gly Gln Pro Phe Ser Ile Thr Leu Gln Cys Ser Asp Ser Leu Pro
40 45 50
CCC AAA CAC CAC CTG GAG CTG GTC CTG CAC CTC GGT AAG AGA GAC 231
Pro Lys His His Leu Glu Leu Val Leu His Leu Gly Lys Arg Asp
55 60 65
GAG GTG GTG ATC AAG GTT CAG AAG GAA CAT GGG GCC AGA GAC AAG 276
Glu Val Val Ile Lys Val Gln Lys Glu His Gly Ala Arg Asp Lys
70 75 80
TGG TGG TTT AAC CAG CAG GGA GCT CAG GAT GAA ATA CTG CTG ACT 321
Trp Trp Phe Asn Gln Gln Gly Ala Gln Asp Glu Ile Leu Leu Thr
85 90 95
CTG CAC AGC CCA GCG AAC GCT GTC ATT GGC CAC TAC CGT CTG GCT 366
Leu His Ser Pro Ala Asn Ala Val Ile Gly His Tyr Arg Leu Ala
100 105 110
GTG TTG GTG ATG TCA CCA GAT GGT CAC ATC GTA GAG AGG GCA GAC 411
Val Leu Val Met Ser Pro Asp Gly His Ile Val Glu Arg Ala Asp
115 120 125
AAA ATT AGC TTC CAC ATG CTC TTC AAC CCG TGG TGC AGA GAT GAT 456
Lys Ile Ser Phe His Met Leu Phe Asn Pro Trp Cys Arg Asp Asp
130 135 140
ATG GTT TAC CTC CCT GAT GAG AGT AAG CTC CAG GAG TAT GTC ATG 501
Met Val Tyr Leu Pro Asp Glu Ser Lys Leu Gln Glu Tyr Val Met
145 150 155
AAT GAA GAT GGA GTG ATT TAC ATG GGG ACC TGG GAT TAC ATC AGA 546
Asn Glu Asp Gly Val Ile Tyr Met Gly Thr Trp Asp Tyr Ile Arg
160 165 170
AGT ATA CCC TGG AAT TAT GGA CAG TTT GAG GAC TAT GTG ATG GAC 591
Ser Ile Pro Trp Asn Tyr Gly Gln Phe Glu Asp Tyr Val Met Asp
175 180 185
ATC TGT TTT GAA GTC TTG GAC AAC TCC CCA GCT GCC TTG AAA AAC 636
Ile Cys Phe Glu Val Leu Asp Asn Ser Pro Ala Ala Leu Lys Asn
190 195 200
TCA GAG ATG GAC ATT GAG CAC AGA TCA GAC CCC GTC TAT GTC GGC 681
Ser Glu Met Asp Ile Glu His Arg Ser Asp Pro Val Tyr Val Gly
205 210 215
AGG ACA ATC ACT GCA ATG GTG AAC TCT AAC GGT GAC AGG GGT GTG 726
Arg Thr Ile Thr Ala Met Val Asn Ser Asn Gly Asp Arg Gly Val
220 225 230
TTG ACT GGT CGC TGG GAG GAG CCG TAC ACT GAT GGG GTC GCA CCG 771
Leu Thr Gly Arg Trp Glu Glu Pro Tyr Thr Asp Gly Val Ala Pro
235 240 245
TAT CGA TGG ACC GGC AGC GTG CCG ATC CTC CAA CAG TGG AGC AAG 816
Tyr Arg Trp Thr Gly Ser Val Pro Ile Leu Gln Gln Trp Ser Lys
250 255 260
GCC GGG GTG AGG CCG GTC AAA TAT GGC CAG TGC TGG GTG TTT GCT 861
Ala Gly Val Arg Pro Val Lys Tyr Gly Gln Cys Trp Val Phe Ala
265 270 275
GCC GTC GCC TGC ACA GTG CTG CGC TGC CTG GGA ATC CCA ACA CGC 906
Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu Gly Ile Pro Thr Arg
280 285 290
CCC ATC ACC AAC TTC GCT TCA GCC CAT GAT GTC GAT GGT AAC CTC 951
Pro Ile Thr Asn Phe Ala Ser Ala His Asp Val Asp Gly Asn Leu
295 300 305
TCG GTA GAC TTC CTG CTG AAT GAG AGA CTG GAG AGC TTG GAC AGT 996
Ser Val Asp Phe Leu Leu Asn Glu Arg Leu Glu Ser Leu Asp Ser
310 315 320
AGA CAG AGA AGT GAC AGT AGC TGG AAC TTC CAC TGT TGG GTT GAA 1041
Arg Gln Arg Ser Asp Ser Ser Trp Asn Phe His Cys Trp Val Glu
325 330 335
TCC TGG ATG AGC AGA GAG GAT CTC CCT GAA GGA AAT GAT GGC TGG 1086
Ser Trp Met Ser Arg Glu Asp Leu Pro Glu Gly Asn Asp Gly Trp
340 345 350
CAG GTT TTG GAT CCC ACC CCT CAA GAA CTG AGT GAT GGT GAG TTT 1131
Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Leu Ser Asp Gly Glu Phe
355 360 365
TGC TGT GGT CCG TGT CCA GTG GCG GCC ATC AAG GAG GGA AAT CTG 1176
Cys Cys Gly Pro Cys Pro Val Ala Ala Ile Lys Glu Gly Asn Leu
370 375 380
GGA GTG AAG TAC GAC GCC CCC TTT GTA TTC GCT GAG GTG AAC GCT 1221
Gly Val Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Val Phe Ala Glu Val Asn Ala
385 390 395
GAC ACC ATC TAC TGG ATC GTC CAA AAA GAT GGC CAA CGA CGG AAG 1266
Asp Thr Ile Tyr Trp Ile Val Gln Lys Asp Gly Gln Arg Arg Lys
400 405 410
ATC ACA GAG GAC CAT GCT AGT GTG GGG AAG AAC ATC AGC ACA AAA 1311
Ile Thr Glu Asp His Ala Ser Val Gly Lys Asn Ile Ser Thr Lys
415 420 425
AGC GTT TAC GGC AAC CAC AGA GAA GAT GTC ACT CTG CAC TAC AAA 1356
Ser Val Tyr Gly Asn His Arg Glu Asp Val Thr Leu His Tyr Lys
430 435 440
TAT CCT GAA GGC TCC CAG AAG GAG AGG GAA GTG TAC AAG AAG GCG 1401
Tyr Pro Glu Gly Ser Gln Lys Glu Arg Glu Val Tyr Lys Lys Ala
445 450 455
GGA CGC CGG GTC ACA GAG CCA TCC AAC GAG ATC GCA GAA CAA GGA 1446
Gly Arg Arg Val Thr Glu Pro Ser Asn Glu Ile Ala Glu Gln Gly
460 465 470
AGA CTT CAG CTG TCA ATC AAG CAT GCC CAG CCT GTA TTT GGG ACA 1491
Arg Leu Gln Leu Ser Ile Lys His Ala Gln Pro Val Phe Gly Thr
475 480 485
GAC TTT GAT GTG ATT GTT GAG GTG AAG AAT GAA GGA GGC AGA GAT 1536
Asp Phe Asp Val Ile Val Glu Val Lys Asn Glu Gly Gly Arg Asp
490 495 500
GCT CAT GCT CAG CTG ACC ATG CTG GCC ATG GCA GTA ACT TAC AAT 1581
Ala His Ala Gln Leu Thr Met Leu Ala Met Ala Val Thr Tyr Asn
505 510 515
TCT CTC CGC CGG GGG GAG TGC CAG AGA AAA ACA ATC AGT GTG ACT 1626
Ser Leu Arg Arg Gly Glu Cys Gln Arg Lys Thr Ile Ser Val Thr
520 525 530
GTG CCC GCT CAC AAA GCC CAC AAG GAG GTT ATG CGT CTG CAC TAC 1671
Val Pro Ala His Lys Ala His Lys Glu Val Met Arg Leu His Tyr
535 540 545
GAC GAC TAT GTC AGG TGT GTC TCT GAG CAT CAC CTG ATC AGG GTG 1716
Asp Asp Tyr Val Arg Cys Val Ser Glu His His Leu Ile Arg Val
550 555 560
AAA GCG CTC TTA GAC GCT CCA GGG GAG AAC GGG CCC ATC ATG ACC 1761
Lys Ala Leu Leu Asp Ala Pro Gly Glu Asn Gly Pro Ile Met Thr
565 570 575
GTG GCC AAC ATC CCA CTG AGC ACG CCT GAA CTC CTT GTA CAG GTG 1806
Val Ala Asn Ile Pro Leu Ser Thr Pro Glu Leu Leu Val Gln Val
580 585 590
CCT GGG AAG GCT GTT GTA TGG GAA CCA CTG ACA GCC TAC GTC TCC 1851
Pro Gly Lys Ala Val Val Trp Glu Pro Leu Thr Ala Tyr Val Ser
595 600 605
TTC ACC AAT CCT CTG CCA GTT CCT CTG AAG GGT GGC GTT TTC ACT 1896
Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu Lys Gly Gly Val Phe Thr
610 615 620
TTG GAG GGT GCT GGC CTG CTG TCT GCC ACT CAG ATC CAT GTT AAT 1941
Leu Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser Ala Thr Gln Ile His Val Asn
625 630 635
GGT GCT GTA GCT CCA AGT GGG AAA GTG TCT GTC AAG CTC TCT TTC 1986
Gly Ala Val Ala Pro Ser Gly Lys Val Ser Val Lys Leu Ser Phe
640 645 650
TCC CCC ATG CGC ACC GGG GTG AGG AAG CTC CTG GTG GAC TTT GAC 2031
Ser Pro Met Arg Thr Gly Val Arg Lys Leu Leu Val Asp Phe Asp
655 660 665
TCT GAC AGA CTG AAG GAC GTG AAG GGT GTC ACC ACC GTG GTT GTC 2076
Ser Asp Arg Leu Lys Asp Val Lys Gly Val Thr Thr Val Val Val
670 675 680
CAC AAG AAA TAC AGA TCT CTA ATT ACT GGA CTT CAC ACA GAC TAA 2121
His Lys Lys Tyr Arg Ser Leu Ile Thr Gly Leu His Thr Asp
685 690 695
AATAGACATA TCTTATATTA TGTGATTTTG TGACATTTCC TAGATGTGAG 2171
GTGGAGGTGA TGTATAAGGT AGATGATATC AACCGCTCAG TGTTATAACA 2221
GTTTATAATG CAAATAAGTT CCACTTAAAT GATACTGTAG CTATGTCCAC 2271
GAAGAAAATT CTTGACACAG TGTTAGTTTG ATTACCTTAA AGCCTTAAAG 2321
CCACTGTATG TCAGATGTGA ACTTGTCTGG CTTTGCATTA AAACCTGGCA 2371
CATGTTGCTC ACATGGAAAT GCACAGAAGC ACAACAGGTG ACGGCCTCTA 2421
GATGGAAAAT ATGTGCGTTT TGTTTCTGTT ACTCCTCTGT TTTATTGCCA 2471
AATTCAAGAT GCTTCCTTCT GTCTTCATTC CAAATGACTG CTGGTTTTT 2520
配列番号:6
配列の長さ:695
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:スケソウタラ 肝臓
配列
Ala His Thr Asn Arg Leu Ile Ala Gly Val Asp Leu Arg Ser Gln
1 5 10 15
Glu Asn Asn Arg Glu His Arg Thr Glu Glu Ile Asp Arg Lys Arg
20 25 30
Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Ala Phe Ser Leu Thr Val His Leu
35 40 45
Ser Asp Pro Leu Gln Ser Gly His Glu Leu Ala Leu Val Leu Lys
50 55 60
Gln Asp Lys Asn Asn Asp Asp Ile Val Ile Arg Gln Arg Thr Ala
65 70 75
Gly Gly Ser Gly Asp Lys Trp Trp Leu His Gln Gln Ser Ala Arg
80 85 90
Asn Glu Leu Leu Leu Thr Val Tyr Ser Pro Ala Arg Ala Ala Val
95 100 105
Gly Glu Tyr Arg Leu Ala Val Glu Leu Met Ser Gly Asn Lys Leu
110 115 120
Leu Glu Arg Thr Asp Phe Thr Lys Met Tyr Leu Leu Phe Asn Pro
125 130 135
Trp Cys Lys Asp Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Ser Leu Leu
140 145 150
Lys Glu Tyr Ile Met Asn Glu Asn Gly Arg Ile Phe Thr Gly Ser
155 160 165
Ala Asp Trp Met Ser Gly Leu Pro Trp Asn Phe Gly Gln Phe Glu
170 175 180
Asp Asn Val Met Asp Ile Cys Phe Glu Ile Leu Asp Arg Phe Lys
185 190 195
Pro Ala Arg Ser Asp Pro Pro Asn Asp Met Arg Gln Arg Trp Asp
200 205 210
Pro Val Tyr Ile Ser Arg Ala Val Val Ala Met Val Asn Ala Asn
215 220 225
Asp Asp Gly Gly Val Leu Val Gly Lys Trp Gln Glu Pro Tyr Thr
230 235 240
Gly Gly Val Gln Pro Thr Lys Trp Met Ser Ser Val Pro Ile Leu
245 250 255
Glu Lys Trp Ser Lys Ser Lys Ser Gly Val Lys Tyr Gly Gln Cys
260 265 270
Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu Gly
275 280 285
Ile Pro Thr Arg Cys Ile Thr Asn Phe Glu Ser Ala His Asp Thr
290 295 300
Asp Gly Asn Leu Ser Ile Asp Arg Val Tyr Asn Thr His Arg Gln
305 310 315
Ser Val Asn His Ala Asp Ser Ile Trp Asn Phe His Cys Trp Ile
320 325 330
Glu Ser Tyr Met Gln Arg Glu Asp Leu Pro Glu Gly Tyr Gly Gly
335 340 345
Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Arg Ser Ser Gly Met
350 355 360
Phe Arg Cys Gly Pro Cys Pro Leu Lys Ala Ile Lys Glu Gly Asp
365 370 375
Leu Asn Val Lys Phe Asp Val Pro Phe Val Phe Ala Glu Val Asn
380 385 390
Ala Asp Ile Ile Asn Trp Glu Ile Arg Pro Asp Gly Gln Arg Met
395 400 405
Arg Leu Ser Ser Asn Ser Ala Lys Val Gly Arg Asn Ile Ser Thr
410 415 420
Lys Ser Pro Tyr Ser Asn Glu Arg Glu Asp Ile Thr Leu Gln Tyr
425 430 435
Lys Tyr Gln Glu Gly Ser Ala Lys Glu Arg Glu Val Tyr Asn Lys
440 445 450
Ala Gly Arg Arg Ile Ser Gly Pro Asp Arg Glu Glu Glu Ser Lys
455 460 465
Pro Ala Asn Glu Pro Gly Asn Val Gln Leu Glu Ile Arg Tyr Ala
470 475 480
Lys Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Phe Glu Leu Glu
485 490 495
Asn Met Gly Asp Glu Glu Val Ser Cys Lys Leu Asn Met Met Ser
500 505 510
Lys Ala Val Thr Tyr Asn Ser Val His Leu Gly Glu Cys Gln Asn
515 520 525
Ser Thr Val Asn Val Val Ile Pro Ala His Lys Val His Arg Glu
530 535 540
Thr Val Arg Leu Leu Tyr Thr Lys Tyr Ala Ser Cys Val Ser Glu
545 550 555
His Asn Ile Ile Arg Val Val Gly Val Ala Arg Val Ser Gly Gln
560 565 570
Glu Lys Ser Ile Leu Glu Met Val Asn Ile Pro Leu Ser Lys Pro
575 580 585
Lys Leu Ser Ile Lys Val Pro Gly Trp Val Ile Leu Asn Arg Lys
590 595 600
Ile Thr Thr Val Ile Thr Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu
605 610 615
Asn Arg Gly Val Phe Thr Val Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser Thr
620 625 630
Lys Glu Ile Arg Ile Ser Gly Ser Ile Ala Pro Gly Gln Arg Val
635 640 645
Ser Val Glu Leu Ser Phe Thr Pro Met Arg Ala Gly Val Arg Glu
650 655 660
Phe Leu Val Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Gln Asp Val Lys Gly
665 670 675
Val Ala Thr Leu Val Val Arg Lys Thr Ser Pro Ser Tyr Phe Pro
680 685 690
Met Pro Tyr Thr Leu
695
配列番号:7
配列の長さ:696
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:スケソウタラ 肝臓
配列
Met Ala His Thr Asn Arg Leu Ile Ala Gly Val Asp Leu Arg Ser
1 5 10 15
Gln Glu Asn Asn Arg Glu His Arg Thr Glu Glu Ile Asp Arg Lys
20 25 30
Arg Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Ala Phe Ser Leu Thr Val His
35 40 45
Leu Ser Asp Pro Leu Gln Ser Gly His Glu Leu Ala Leu Val Leu
50 55 60
Lys Gln Asp Lys Asn Asn Asp Asp Ile Val Ile Arg Gln Arg Thr
65 70 75
Ala Gly Gly Ser Gly Asp Lys Trp Trp Leu His Gln Gln Ser Ala
80 85 90
Arg Asn Glu Leu Leu Leu Thr Val Tyr Ser Pro Ala Arg Ala Ala
95 100 105
Val Gly Glu Tyr Arg Leu Ala Val Glu Leu Met Ser Gly Asn Lys
110 115 120
Leu Leu Glu Arg Thr Asp Phe Thr Lys Met Tyr Leu Leu Phe Asn
125 130 135
Pro Trp Cys Lys Asp Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Ser Leu
140 145 150
Leu Lys Glu Tyr Ile Met Asn Glu Asn Gly Arg Ile Phe Thr Gly
155 160 165
Ser Ala Asp Trp Met Ser Gly Leu Pro Trp Asn Phe Gly Gln Phe
170 175 180
Glu Asp Asn Val Met Asp Ile Cys Phe Glu Ile Leu Asp Arg Phe
185 190 195
Lys Pro Ala Arg Ser Asp Pro Pro Asn Asp Met Arg Gln Arg Trp
200 205 210
Asp Pro Val Tyr Ile Ser Arg Ala Val Val Ala Met Val Asn Ala
215 220 225
Asn Asp Asp Gly Gly Val Leu Val Gly Lys Trp Gln Glu Pro Tyr
230 235 240
Thr Gly Gly Val Gln Pro Thr Lys Trp Met Ser Ser Val Pro Ile
245 250 255
Leu Glu Lys Trp Ser Lys Ser Lys Ser Gly Val Lys Tyr Gly Gln
260 265 270
Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu
275 280 285
Gly Ile Pro Thr Arg Cys Ile Thr Asn Phe Glu Ser Ala His Asp
290 295 300
Thr Asp Gly Asn Leu Ser Ile Asp Arg Val Tyr Asn Thr His Arg
305 310 315
Gln Ser Val Asn His Ala Asp Ser Ile Trp Asn Phe His Cys Trp
320 325 330
Ile Glu Ser Tyr Met Gln Arg Glu Asp Leu Pro Glu Gly Tyr Gly
335 340 345
Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Arg Ser Ser Gly
350 355 360
Met Phe Arg Cys Gly Pro Cys Pro Leu Lys Ala Ile Lys Glu Gly
365 370 375
Asp Leu Asn Val Lys Phe Asp Val Pro Phe Val Phe Ala Glu Val
380 385 390
Asn Ala Asp Ile Ile Asn Trp Glu Ile Arg Pro Asp Gly Gln Arg
395 400 405
Met Arg Leu Ser Ser Asn Ser Ala Lys Val Gly Arg Asn Ile Ser
410 415 420
Thr Lys Ser Pro Tyr Ser Asn Glu Arg Glu Asp Ile Thr Leu Gln
425 430 435
Tyr Lys Tyr Gln Glu Gly Ser Ala Lys Glu Arg Glu Val Tyr Asn
440 445 450
Lys Ala Gly Arg Arg Ile Ser Gly Pro Asp Arg Glu Glu Glu Ser
455 460 465
Lys Pro Ala Asn Glu Pro Gly Asn Val Gln Leu Glu Ile Arg Tyr
470 475 480
Ala Lys Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Phe Glu Leu
485 490 495
Glu Asn Met Gly Asp Glu Glu Val Ser Cys Lys Leu Asn Met Met
500 505 510
Ser Lys Ala Val Thr Tyr Asn Ser Val His Leu Gly Glu Cys Gln
515 520 525
Asn Ser Thr Val Asn Val Val Ile Pro Ala His Lys Val His Arg
530 535 540
Glu Thr Val Arg Leu Leu Tyr Thr Lys Tyr Ala Ser Cys Val Ser
545 550 555
Glu His Asn Ile Ile Arg Val Val Gly Val Ala Arg Val Ser Gly
560 565 570
Gln Glu Lys Ser Ile Leu Glu Met Val Asn Ile Pro Leu Ser Lys
575 580 585
Pro Lys Leu Ser Ile Lys Val Pro Gly Trp Val Ile Leu Asn Arg
590 595 600
Lys Ile Thr Thr Val Ile Thr Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro
605 610 615
Leu Asn Arg Gly Val Phe Thr Val Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser
620 625 630
Thr Lys Glu Ile Arg Ile Ser Gly Ser Ile Ala Pro Gly Gln Arg
635 640 645
Val Ser Val Glu Leu Ser Phe Thr Pro Met Arg Ala Gly Val Arg
650 655 660
Glu Phe Leu Val Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Gln Asp Val Lys
665 670 675
Gly Val Ala Thr Leu Val Val Arg Lys Thr Ser Pro Ser Tyr Phe
680 685 690
Pro Met Pro Tyr Thr Leu
695
配列番号:8
配列の長さ:2088
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:スケソウタラ 肝臓
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..2088
特徴を決定した方法:P
配列
GCCCACACAA ACCGTTTAAT TGCTGGTGTT GATCTGAGAA GCCAGGAAAA CAACCGGGAA 60
CACCGAACTG AGGAGATTGA TAGGAAGCGT TTGATTGTTC GGCGGGGACA AGCCTTCTCC 120
CTGACGGTGC ACCTCTCCGA CCCGCTGCAG TCCGGCCATG AGCTGGCCCT GGTCTTAAAG 180
CAGGATAAGA ACAACGATGA TATTGTGATC AGACAGCGAA CGGCTGGAGG GTCTGGTGAC 240
AAGTGGTGGT TACACCAGCA GAGCGCGAGG AACGAATTAC TGCTGACTGT GTACAGTCCT 300
GCCCGTGCTG CCGTTGGCGA GTACCGCTTG GCTGTTGAAC TGATGTCAGG GAATAAACTT 360
CTGGAGAGGA CGGACTTTAC CAAAATGTAC TTGCTGTTTA ATCCCTGGTG CAAAGATGAT 420
GCTGTGTACC TCCCTGATGA AAGTCTGCTC AAGGAATACA TTATGAACGA GAATGGTCGC 480
ATTTTCACTG GGAGTGCGGA TTGGATGAGT GGGTTGCCAT GGAATTTCGG ACAGTTTGAA 540
GACAATGTGA TGGACATCTG CTTTGAGATC CTTGACCGCT TTAAGCCAGC AAGGTCAGAC 600
CCCCCAAACG ACATGCGTCA GCGATGGGAC CCTGTCTACA TCAGCAGGGC AGTCGTTGCC 660
ATGGTGAATG CCAACGATGA CGGTGGAGTC TTGGTGGGGA AATGGCAGGA ACCTTACACA 720
GGTGGAGTAC AGCCAACCAA ATGGATGAGC AGTGTGCCCA TCCTGGAGAA GTGGAGCAAA 780
TCAAAGTCTG GAGTGAAGTA TGGCCAATGC TGGGTGTTTG CAGCCGTGGC CTGCACAGTG 840
CTGCGATGCC TGGGCATCCC CACACGCTGC ATCACCAACT TTGAGTCAGC CCATGACACA 900
GACGGAAACC TCTCCATCGA CCGAGTGTAC AACACACATA GGCAGAGTGT TAACCATGCT 960
GACAGCATCT GGAACTTTCA TTGTTGGATC GAGTCTTACA TGCAGAGAGA AGATCTACCT 1020
GAAGGATATG GTGGCTGGCA AGTCTTGGAC CCCACACCTC AGGAGAGGAG TAGTGGTATG 1080
TTTCGCTGTG GCCCATGTCC ATTGAAGGCC ATTAAAGAAG GGGACCTCAA TGTGAAGTTT 1140
GATGTTCCAT TTGTCTTTGC TGAGGTGAAT GCAGACATCA TCAATTGGGA AATCAGACCA 1200
GACGGTCAGC GAATGCGGCT TTCATCCAAC TCCGCAAAAG TGGGGAGGAA CATTAGCACC 1260
AAAAGTCCTT ACAGTAACGA GAGGGAAGAT ATAACCCTTC AGTACAAGTA CCAAGAAGGT 1320
TCAGCCAAGG AGCGGGAGGT GTACAACAAG GCAGGGCGGC GCATCTCCGG GCCGGATAGA 1380
GAAGAGGAAT CAAAACCAGC CAATGAACCA GGAAACGTGC AGCTGGAGAT CAGATACGCC 1440
AAGCCTGTGT TCGGGACCGA CTTTGACGTC ATCTTTGAGT TGGAGAACAT GGGAGACGAA 1500
GAAGTCAGCT GCAAATTGAA CATGATGTCA AAGGCTGTCA CGTATAACTC GGTCCACCTG 1560
GGAGAGTGCC AGAATAGCAC AGTCAATGTT GTCATTCCTG CTCACAAAGT CCACAGGGAG 1620
ACGGTGCGTC TACTCTACAC TAAGTATGCA TCGTGCGTCA GCGAACACAA CATCATCCGG 1680
GTGGTAGGGG TGGCAAGAGT GTCCGGCCAG GAAAAATCCA TCCTGGAGAT GGTCAACATC 1740
CCACTGAGCA AGCCCAAACT CAGTATTAAG GTTCCTGGCT GGGTGATTTT AAATAGGAAA 1800
ATCACCACCG TCATCACCTT CACCAATCCA TTGCCAGTGC CACTGAACCG AGGAGTGTTC 1860
ACTGTTGAAG GGGCTGGCCT ACTTTCAACC AAAGAGATCC GCATTTCTGG TAGCATCGCT 1920
CCAGGCCAGC GTGTGTCTGT GGAGCTGTCC TTCACACCCA TGAGGGCGGG GGTCAGGGAG 1980
TTCCTGGTGG ACTTTGACTC CGACAGGCTC CAGGACGTGA AGGGAGTCGC CACACTGGTG 2040
GTCCGCAAGA CTTCACCCTC CTATTTTCCC ATGCCCTACA CGTTGTGA 2088
配列番号:9
配列の長さ:2921
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:スケソウタラ 肝臓
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:32..2122
特徴を決定した方法:P
配列
AGCAACTCTT GGAAAGAATT TAGCAAAGAT A ATG GCC CAC ACA AAC 46
Met Ala His Thr Asn
1 5
CGT TTA ATT GCT GGT GTT GAT CTG AGA AGC CAG GAA AAC AAC CGG 91
Arg Leu Ile Ala Gly Val Asp Leu Arg Ser Gln Glu Asn Asn Arg
10 15 20
GAA CAC CGA ACT GAG GAG ATT GAT AGG AAG CGT TTG ATT GTT CGG 136
Glu His Arg Thr Glu Glu Ile Asp Arg Lys Arg Leu Ile Val Arg
25 30 35
CGG GGA CAA GCC TTC TCC CTG ACG GTG CAC CTC TCC GAC CCG CTG 181
Arg Gly Gln Ala Phe Ser Leu Thr Val His Leu Ser Asp Pro Leu
40 45 50
CAG TCC GGC CAT GAG CTG GCC CTG GTC TTA AAG CAG GAT AAG AAC 226
Gln Ser Gly His Glu Leu Ala Leu Val Leu Lys Gln Asp Lys Asn
55 60 65
AAC GAT GAT ATT GTG ATC AGA CAG CGA ACG GCT GGA GGG TCT GGT 271
Asn Asp Asp Ile Val Ile Arg Gln Arg Thr Ala Gly Gly Ser Gly
70 75 80
GAC AAG TGG TGG TTA CAC CAG CAG AGC GCG AGG AAC GAA TTA CTG 316
Asp Lys Trp Trp Leu His Gln Gln Ser Ala Arg Asn Glu Leu Leu
85 90 95
CTG ACT GTG TAC AGT CCT GCC CGT GCT GCC GTT GGC GAG TAC CGC 361
Leu Thr Val Tyr Ser Pro Ala Arg Ala Ala Val Gly Glu Tyr Arg
100 105 110
TTG GCT GTT GAA CTG ATG TCA GGG AAT AAA CTT CTG GAG AGG ACG 406
Leu Ala Val Glu Leu Met Ser Gly Asn Lys Leu Leu Glu Arg Thr
115 120 125
GAC TTT ACC AAA ATG TAC TTG CTG TTT AAT CCC TGG TGC AAA GAT 451
Asp Phe Thr Lys Met Tyr Leu Leu Phe Asn Pro Trp Cys Lys Asp
130 135 140
GAT GCT GTG TAC CTC CCT GAT GAA AGT CTG CTC AAG GAA TAC ATT 496
Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Ser Leu Leu Lys Glu Tyr Ile
145 150 155
ATG AAC GAG AAT GGT CGC ATT TTC ACT GGG AGT GCG GAT TGG ATG 541
Met Asn Glu Asn Gly Arg Ile Phe Thr Gly Ser Ala Asp Trp Met
160 165 170
AGT GGG TTG CCA TGG AAT TTC GGA CAG TTT GAA GAC AAT GTG ATG 586
Ser Gly Leu Pro Trp Asn Phe Gly Gln Phe Glu Asp Asn Val Met
175 180 185
GAC ATC TGC TTT GAG ATC CTT GAC CGC TTT AAG CCA GCA AGG TCA 631
Asp Ile Cys Phe Glu Ile Leu Asp Arg Phe Lys Pro Ala Arg Ser
190 195 200
GAC CCC CCA AAC GAC ATG CGT CAG CGA TGG GAC CCT GTC TAC ATC 676
Asp Pro Pro Asn Asp Met Arg Gln Arg Trp Asp Pro Val Tyr Ile
205 210 215
AGC AGG GCA GTC GTT GCC ATG GTG AAT GCC AAC GAT GAC GGT GGA 721
Ser Arg Ala Val Val Ala Met Val Asn Ala Asn Asp Asp Gly Gly
220 225 230
GTC TTG GTG GGG AAA TGG CAG GAA CCT TAC ACA GGT GGA GTA CAG 766
Val Leu Val Gly Lys Trp Gln Glu Pro Tyr Thr Gly Gly Val Gln
235 240 245
CCA ACC AAA TGG ATG AGC AGT GTG CCC ATC CTG GAG AAG TGG AGC 811
Pro Thr Lys Trp Met Ser Ser Val Pro Ile Leu Glu Lys Trp Ser
250 255 260
AAA TCA AAG TCT GGA GTG AAG TAT GGC CAA TGC TGG GTG TTT GCA 856
Lys Ser Lys Ser Gly Val Lys Tyr Gly Gln Cys Trp Val Phe Ala
265 270 275
GCC GTG GCC TGC ACA GTG CTG CGA TGC CTG GGC ATC CCC ACA CGC 901
Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu Gly Ile Pro Thr Arg
280 285 290
TGC ATC ACC AAC TTT GAG TCA GCC CAT GAC ACA GAC GGA AAC CTC 946
Cys Ile Thr Asn Phe Glu Ser Ala His Asp Thr Asp Gly Asn Leu
295 300 305
TCC ATC GAC CGA GTG TAC AAC ACA CAT AGG CAG AGT GTT AAC CAT 991
Ser Ile Asp Arg Val Tyr Asn Thr His Arg Gln Ser Val Asn His
310 315 320
GCT GAC AGC ATC TGG AAC TTT CAT TGT TGG ATC GAG TCT TAC ATG 1036
Ala Asp Ser Ile Trp Asn Phe His Cys Trp Ile Glu Ser Tyr Met
325 330 335
CAG AGA GAA GAT CTA CCT GAA GGA TAT GGT GGC TGG CAA GTC TTG 1081
Gln Arg Glu Asp Leu Pro Glu Gly Tyr Gly Gly Trp Gln Val Leu
340 345 350
GAC CCC ACA CCT CAG GAG AGG AGT AGT GGT ATG TTT CGC TGT GGC 1126
Asp Pro Thr Pro Gln Glu Arg Ser Ser Gly Met Phe Arg Cys Gly
355 360 365
CCA TGT CCA TTG AAG GCC ATT AAA GAA GGG GAC CTC AAT GTG AAG 1171
Pro Cys Pro Leu Lys Ala Ile Lys Glu Gly Asp Leu Asn Val Lys
370 375 380
TTT GAT GTT CCA TTT GTC TTT GCT GAG GTG AAT GCA GAC ATC ATC 1216
Phe Asp Val Pro Phe Val Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp Ile Ile
385 390 395
AAT TGG GAA ATC AGA CCA GAC GGT CAG CGA ATG CGG CTT TCA TCC 1261
Asn Trp Glu Ile Arg Pro Asp Gly Gln Arg Met Arg Leu Ser Ser
400 405 410
AAC TCC GCA AAA GTG GGG AGG AAC ATT AGC ACC AAA AGT CCT TAC 1306
Asn Ser Ala Lys Val Gly Arg Asn Ile Ser Thr Lys Ser Pro Tyr
415 420 425
AGT AAC GAG AGG GAA GAT ATA ACC CTT CAG TAC AAG TAC CAA GAA 1351
Ser Asn Glu Arg Glu Asp Ile Thr Leu Gln Tyr Lys Tyr Gln Glu
430 435 440
GGT TCA GCC AAG GAG CGG GAG GTG TAC AAC AAG GCA GGG CGG CGC 1396
Gly Ser Ala Lys Glu Arg Glu Val Tyr Asn Lys Ala Gly Arg Arg
445 450 455
ATC TCC GGG CCG GAT AGA GAA GAG GAA TCA AAA CCA GCC AAT GAA 1441
Ile Ser Gly Pro Asp Arg Glu Glu Glu Ser Lys Pro Ala Asn Glu
460 465 470
CCA GGA AAC GTG CAG CTG GAG ATC AGA TAC GCC AAG CCT GTG TTC 1486
Pro Gly Asn Val Gln Leu Glu Ile Arg Tyr Ala Lys Pro Val Phe
475 480 485
GGG ACC GAC TTT GAC GTC ATC TTT GAG TTG GAG AAC ATG GGA GAC 1531
Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Phe Glu Leu Glu Asn Met Gly Asp
490 495 500
GAA GAA GTC AGC TGC AAA TTG AAC ATG ATG TCA AAG GCT GTC ACG 1576
Glu Glu Val Ser Cys Lys Leu Asn Met Met Ser Lys Ala Val Thr
505 510 515
TAT AAC TCG GTC CAC CTG GGA GAG TGC CAG AAT AGC ACA GTC AAT 1621
Tyr Asn Ser Val His Leu Gly Glu Cys Gln Asn Ser Thr Val Asn
520 525 530
GTT GTC ATT CCT GCT CAC AAA GTC CAC AGG GAG ACG GTG CGT CTA 1666
Val Val Ile Pro Ala His Lys Val His Arg Glu Thr Val Arg Leu
535 540 545
CTC TAC ACT AAG TAT GCA TCG TGC GTC AGC GAA CAC AAC ATC ATC 1711
Leu Tyr Thr Lys Tyr Ala Ser Cys Val Ser Glu His Asn Ile Ile
550 555 560
CGG GTG GTA GGG GTG GCA AGA GTG TCC GGC CAG GAA AAA TCC ATC 1756
Arg Val Val Gly Val Ala Arg Val Ser Gly Gln Glu Lys Ser Ile
565 570 575
CTG GAG ATG GTC AAC ATC CCA CTG AGC AAG CCC AAA CTC AGT ATT 1801
Leu Glu Met Val Asn Ile Pro Leu Ser Lys Pro Lys Leu Ser Ile
580 585 590
AAG GTT CCT GGC TGG GTG ATT TTA AAT AGG AAA ATC ACC ACC GTC 1846
Lys Val Pro Gly Trp Val Ile Leu Asn Arg Lys Ile Thr Thr Val
595 600 605
ATC ACC TTC ACC AAT CCA TTG CCA GTG CCA CTG AAC CGA GGA GTG 1891
Ile Thr Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu Asn Arg Gly Val
610 615 620
TTC ACT GTT GAA GGG GCT GGC CTA CTT TCA ACC AAA GAG ATC CGC 1936
Phe Thr Val Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser Thr Lys Glu Ile Arg
625 630 635
ATT TCT GGT AGC ATC GCT CCA GGC CAG CGT GTG TCT GTG GAG CTG 1981
Ile Ser Gly Ser Ile Ala Pro Gly Gln Arg Val Ser Val Glu Leu
640 645 650
TCC TTC ACA CCC ATG AGG GCG GGG GTC AGG GAG TTC CTG GTG GAC 2026
Ser Phe Thr Pro Met Arg Ala Gly Val Arg Glu Phe Leu Val Asp
655 660 665
TTT GAC TCC GAC AGG CTC CAG GAC GTG AAG GGA GTC GCC ACA CTG 2071
Phe Asp Ser Asp Arg Leu Gln Asp Val Lys Gly Val Ala Thr Leu
670 675 680
GTG GTC CGC AAG ACT TCA CCC TCC TAT TTT CCC ATG CCC TAC ACG 2116
Val Val Arg Lys Thr Ser Pro Ser Tyr Phe Pro Met Pro Tyr Thr
685 690 695
TTG TGATCAAACC TATAGCTGTC AACAGGGCTC TGGCACTCAT TCTTATACTA 2169
Leu
696
ACAAATATAT TTAGCAAAGT CAAGCAAGGG TTTCACTTTT CTTAATATAC 2219
CATGATGTGT AGCGCTGATT CAATTAATGA ATAAATTAAT TTCAATTAAT 2269
GTGAAGAAAA TGCAAACATT GCCTTAATTC TTTGCAATGT CACAGGAATA 2319
GCGTAAATCA TGGCTCATTG ATATTAAATG TAGTATTGAC ATATATCCAT 2369
GCATTTTGCA CTTCTGCAAA TCACCATTTT GTTGTTAATC AATGTTTTAC 2419
CACGATTTTT GCATCTATTC TTGTTTAATT GTAATCAAGA CATTTACATG 2469
ATTGTGGGGG CCAAAGTATA TAGATGTTGT GGTTGGGAAA TGGGGCAATA 2519
ATAGGGGAAG GGTTAATTAT AGGGTCAGTG TTAGTAATTG GTTAAGGTTA 2569
CTAATAGGGT AAGTGTTACA GTGTAAAGAT AAGCCTTTGA TTTTGTTAAA 2619
TTTATTATGC CTTTCATCAA CAGTGGTTTG GGGTTTTATA ACAACAATTA 2669
AAGTGCTTAA CTACTGGTGA ACGACGTTGC AGAACGTATA TGGTACAAGT 2719
TTGTGTTGAT CGCATGGAAA AGGGAATAAC CAGTTACAAC TTATATGGTA 2769
AGAGCCTGGT AATACCATGG AAACAAACGA GGCTTCCTTT TACAGTACAG 2819
TTTCAGCGTC ATGAATATTT GGCCTGTTAA GCCCTTTGAG ACTGTAATGG 2869
TGATTAAGGG CTATACAAAT AAAATTGAAT TGAATTGAAT TAAAAAAAAA 2919
AA 2921
配列番号:10
配列の長さ:29
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA配列
GTCAAGTACG GCCAGTGCTG GGTCTTCGC
29
配列番号:11
配列の長さ:8
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
配列
Tyr Gly Gln Cys Trp Val Phe Ala 8
配列番号:12
配列の長さ:30
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列の特徴
特徴を表す記号:RBS
存在位置:15..23
特徴を決定した方法:S
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
理想的RBSの導入
配列
AATTCATCGA TTAGTAAGGA GGTTTAAAAT 30
配列番号:13
配列の長さ:30
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..30
特徴を決定した方法:P
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
真鯛トランスグルタミナーゼのN末端領域をコード
配列番号12の下流塩基配列を構成
配列
GGCTTCTTAT AAAGGTCTGA TTGTTGATGT 30
配列番号:14
配列の長さ:32
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..32
特徴を決定した方法:P
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
真鯛トランスグルタミナーゼのN末端領域をコード
配列番号13の下流塩基配列を構成
配列
TAATGGTCGT TCTCATGAAA ACAACCTGGC AC 32
配列番号:15
配列の長さ:33
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..33
特徴を決定した方法:P
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
真鯛トランスグルタミナーゼのN末端領域をコード
配列番号14の下流塩基配列を構成
配列
ATCGTACGCG TGAAATCGAC CGTGAGCGCC TGA 33
配列番号:16
配列の長さ:30
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
配列番号12の相補鎖的役割
配列
AGCCATTTTA AACCTCCTTA CTAATCGATG 30
配列番号:17
配列の長さ:30
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
配列番号13の相補鎖的役割
配列
ATTAACATCA ACAATCAGAC CTTTATAAGA 30
配列番号:18
配列の長さ:32
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
配列番号14の相補鎖的役割
配列
CGATGTGCCA GGTTGTTTTC ATGAGAACGA CC 32
配列番号:19
配列の長さ:33
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
意図した機能:明細書内、図4中の化学合成DNA-1を構
成
配列番号15の相補鎖的役割
配列
AGCTTCAGGC GCTCACGGTC GATTTCACGC GTA 33
【0153】配列番号:20
配列の長さ:7
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:Teragra chalcogramma
組織の種類:肝臓
配列番号:21
配列の長さ:7
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:Teragra chalcogramma
組織の種類:肝臓
配列番号:22
配列の長さ:7
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:Teragra chalcogramma
組織の種類:肝臓
配列番号:23
配列の長さ:8
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:Teragra chalcogramma
組織の種類:肝臓
配列番号:24
配列の長さ:13
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:Teragra chalcogramma
組織の種類:肝臓
配列
Phe Asp Val Pro Phe Val Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp
1 5 10
配列番号:25
配列の長さ:6
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:Teragra chalcogramma
組織の種類:肝臓
配列番号:26
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:27
配列の長さ:
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Xaa Xaa Phe Asn Gln Gln Gly Ala Gln Asp Glu Ile Leu Leu Thr
1 5 10 15
Leu His
配列番号:28
配列の長さ:9
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:29
配列の長さ:16
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Leu Gln Glu Tyr Val Met Asn Glu Asp Gly Val Ile Tyr Met Gly
1 5 10 15
Thr
配列番号:30
配列の長さ:18
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Asn Ser Glu Met Asp Ile Glu His Arg Ser Asp Pro Val Tyr Val
1 5 10 15
Gly Arg Thr
配列番号:31
配列の長さ:16
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Tyr Asp Ala Pro Phe Val Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp Thr Ile
1 5 10 15
Tyr
配列番号:32
配列の長さ:14
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Ser Val Tyr Gly Asn His Arg Glu Asp Val Thr Leu His Tyr
1 5 10
配列番号:33
配列の長さ:18
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Ala Gly Arg Arg Val Thr Glu Pro Ser Asn Glu Ile Ala Glu Gln
1 5 10 15
Gly Arg Leu
配列番号:34
配列の長さ:15
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Xaa Ala Gln Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val Glu
1 5 10 15
配列番号:35
配列の長さ:17
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Asn Glu Gly Gly Arg Asp Ala His Ala Gln Leu Thr Xaa Leu Ala
1 5 10 15
Xaa Ala
配列番号:36
配列の長さ:9
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:37
配列の長さ:9
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:38
配列の長さ:18
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列
Gly Gly Val Phe Thr Leu Glu Gly Ala Gly Leu Leu Ser Ala Thr
1 5 10 15
Gln Ile His
配列番号:39
配列の長さ:11
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:40
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:41
配列の長さ:8
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:42
配列の長さ:11
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメントの型:中間型フラグメント
起源
生物名:Pagrus major
組織の種類:肝臓
配列番号:43
配列の長さ:687
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:ヒラメ 肝臓
配列
Asp Asn Gln Asn Ile Pro Ile Thr Asp Val Asp Val Arg Ser His
1 5 10 15
Glu Asn Asn Leu Ala His Arg Thr Arg Glu Ile Asp Arg Glu Arg
20 25 30
Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Ser Ile Ser Leu Gln Cys
35 40 45
Cys Asp Ser Leu Thr Arg Asn His His Leu Glu Leu Ser Leu His
50 55 60
Leu Gly Lys Lys Asp Glu Val Val Ile Lys Val His Asn Glu Pro
65 70 75
Glu Ala Gly Gly Lys Trp Trp Phe Asn His Gln Lys Val Gln Asp
80 85 90
Glu Ile Leu Leu Thr Leu His Ser Pro Ala Asp Ala Ile Ile Gly
95 100 105
Glu Tyr His Leu Thr Val Leu Ile Lys Ser Pro Asp Gly His Phe
110 115 120
Val Lys Lys Thr Lys Asn Ile Gly Phe His Leu Leu Phe Asn Pro
125 130 135
Trp Cys Lys Asp Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Arg Met Leu
140 145 150
Asp Glu Tyr Val Met Asn Glu Glu Gly Ile Ile Tyr Arg Gly Thr
155 160 165
Ser Asn His Ile Ser Ser Ile Pro Trp Asn Tyr Gly Gln Phe Glu
170 175 180
Asp Tyr Val Met Asp Ile Cys Phe Gln Val Leu Asp Asn Ser Lys
185 190 195
Glu Ala Leu Lys Asn Ser Lys Met Asp Ile Glu Lys Arg Ser Asp
200 205 210
Pro Val Tyr Val Ser Arg Met Ile Thr Ala Met Val Asn Ser Asn
215 220 225
Gly Asp Arg Gly Val Leu Thr Gly Gln Trp His Glu Pro Tyr Thr
230 235 240
Gly Gly Phe Ser Pro Leu Arg Trp Thr Gly Ser Val Pro Ile Leu
245 250 255
Arg Lys Trp Ser Lys Ala Glu Val Arg Ala Val Lys Tyr Gly Gln
260 265 270
Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu
275 280 285
Gly Ile Pro Thr Arg Asn Ile Thr Asn Phe Asn Ser Ala His Asp
290 295 300
Val Asp Gly Asn Leu Ser Val Asp Ile Val Leu Asn Lys Glu Met
305 310 315
Glu Ser Val Gly Lys Lys Asp Ser Ser Trp Asn Phe His Cys Trp
320 325 330
Ile Glu Ser Trp Met Arg Arg Asp Asp Leu Ser Lys Gly Asn Asp
335 340 345
Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Leu Ser Asp Gly
350 355 360
Glu Tyr Cys Cys Gly Pro Cys Pro Val Thr Ala Ile Lys Glu Gly
365 370 375
Asn Leu Ser Val Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Ile Phe Ala Glu Val
380 385 390
Asn Ala Asp Ile Ile Tyr Trp Met Ala Gly Pro Gly Gly Glu Arg
395 400 405
Lys Lys Ile Asp Val Asp Gln Ser Gly Val Gly Lys Asn Ile Ser
410 415 420
Thr Lys Ser Leu Tyr Gly Asp Tyr Arg Glu Asp Val Thr Leu His
425 430 435
Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Lys Lys Glu Arg Glu Val Tyr Gln
440 445 450
Lys Ala Gly His Arg Ile Lys Glu Gln Ile Cys Glu Asn Lys Gly
455 460 465
Pro Gln Gln Leu Gln Leu Ser Val Lys His Gly Lys Pro Val Phe
470 475 480
Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val Glu Val Lys Asn Glu Gly Gln
485 490 495
Lys Asp Thr Ser Pro Gln Leu Leu Ile Val Val Met Ala Val Thr
500 505 510
Tyr Asn Ser Ile Asn Gln Gly Glu Cys Gln Arg Lys Ala Thr Ile
515 520 525
Val Thr Val Pro Ala Arg Lys Thr His Lys Glu Val Leu Arg Leu
530 535 540
Arg Tyr Asp Asp Tyr Val Lys Cys Val Ser Glu His His Leu Ile
545 550 555
Arg Val Lys Ala Leu Met Glu Val Pro Gly Asp Asn Lys Pro Val
560 565 570
Met Ser Val Ala Asn Ile Pro Leu Ser Met Pro Glu Leu Leu Val
575 580 585
Glu Val Pro Gly Ser Ile Ile Val Gln Glu Lys Val Thr Ala Phe
590 595 600
Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Thr Val Pro Leu Lys Arg Gly Met
605 610 615
Phe Thr Val Glu Gly Ser Gly Leu Leu Ser Ala Ser Glu Ile Tyr
620 625 630
Val Lys Gly Asp Ile Ala Pro Gly Gln Lys Val Ser Val Lys Ile
635 640 645
Thr Phe Thr Pro Met Arg Val Gly Val Arg Lys Leu Leu Val Asp
650 655 660
Phe Asp Ser Asp Arg Leu Lys Asp Val Lys Gly Val Thr Thr Val
665 670 675
Val Val Arg Lys Lys Ser Cys Phe Ile Arg Cys Pro
680 685
配列番号:44
配列の長さ:688
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:ヒラメ 肝臓
配列
Met Asp Asn Gln Asn Ile Pro Ile Thr Asp Val Asp Val Arg Ser
1 5 10 15
His Glu Asn Asn Leu Ala His Arg Thr Arg Glu Ile Asp Arg Glu
20 25 30
Arg Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro Phe Ser Ile Ser Leu Gln
35 40 45
Cys Cys Asp Ser Leu Thr Arg Asn His His Leu Glu Leu Ser Leu
50 55 60
His Leu Gly Lys Lys Asp Glu Val Val Ile Lys Val His Asn Glu
65 70 75
Pro Glu Ala Gly Gly Lys Trp Trp Phe Asn His Gln Lys Val Gln
80 85 90
Asp Glu Ile Leu Leu Thr Leu His Ser Pro Ala Asp Ala Ile Ile
95 100 105
Gly Glu Tyr His Leu Thr Val Leu Ile Lys Ser Pro Asp Gly His
110 115 120
Phe Val Lys Lys Thr Lys Asn Ile Gly Phe His Leu Leu Phe Asn
125 130 135
Pro Trp Cys Lys Asp Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Arg Met
140 145 150
Leu Asp Glu Tyr Val Met Asn Glu Glu Gly Ile Ile Tyr Arg Gly
155 160 165
Thr Ser Asn His Ile Ser Ser Ile Pro Trp Asn Tyr Gly Gln Phe
170 175 180
Glu Asp Tyr Val Met Asp Ile Cys Phe Gln Val Leu Asp Asn Ser
185 190 195
Lys Glu Ala Leu Lys Asn Ser Lys Met Asp Ile Glu Lys Arg Ser
200 205 210
Asp Pro Val Tyr Val Ser Arg Met Ile Thr Ala Met Val Asn Ser
215 220 225
Asn Gly Asp Arg Gly Val Leu Thr Gly Gln Trp His Glu Pro Tyr
230 235 240
Thr Gly Gly Phe Ser Pro Leu Arg Trp Thr Gly Ser Val Pro Ile
245 250 255
Leu Arg Lys Trp Ser Lys Ala Glu Val Arg Ala Val Lys Tyr Gly
260 265 270
Gln Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Leu Arg Cys
275 280 285
Leu Gly Ile Pro Thr Arg Asn Ile Thr Asn Phe Asn Ser Ala His
290 295 300
Asp Val Asp Gly Asn Leu Ser Val Asp Ile Val Leu Asn Lys Glu
305 310 315
Met Glu Ser Val Gly Lys Lys Asp Ser Ser Trp Asn Phe His Cys
320 325 330
Trp Ile Glu Ser Trp Met Arg Arg Asp Asp Leu Ser Lys Gly Asn
335 340 345
Asp Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Leu Ser Asp
350 355 360
Gly Glu Tyr Cys Cys Gly Pro Cys Pro Val Thr Ala Ile Lys Glu
365 370 375
Gly Asn Leu Ser Val Lys Tyr Asp Ala Pro Phe Ile Phe Ala Glu
380 385 390
Val Asn Ala Asp Ile Ile Tyr Trp Met Ala Gly Pro Gly Gly Glu
395 400 405
Arg Lys Lys Ile Asp Val Asp Gln Ser Gly Val Gly Lys Asn Ile
410 415 420
Ser Thr Lys Ser Leu Tyr Gly Asp Tyr Arg Glu Asp Val Thr Leu
425 430 435
His Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Lys Lys Glu Arg Glu Val Tyr
440 445 450
Gln Lys Ala Gly His Arg Ile Lys Glu Gln Ile Cys Glu Asn Lys
455 460 465
Gly Pro Gln Gln Leu Gln Leu Ser Val Lys His Gly Lys Pro Val
470 475 480
Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val Glu Val Lys Asn Glu Gly
485 490 495
Gln Lys Asp Thr Ser Pro Gln Leu Leu Ile Val Val Met Ala Val
500 505 510
Thr Tyr Asn Ser Ile Asn Gln Gly Glu Cys Gln Arg Lys Ala Thr
515 520 525
Ile Val Thr Val Pro Ala Arg Lys Thr His Lys Glu Val Leu Arg
530 535 540
Leu Arg Tyr Asp Asp Tyr Val Lys Cys Val Ser Glu His His Leu
545 550 555
Ile Arg Val Lys Ala Leu Met Glu Val Pro Gly Asp Asn Lys Pro
560 565 570
Val Met Ser Val Ala Asn Ile Pro Leu Ser Met Pro Glu Leu Leu
575 580 585
Val Glu Val Pro Gly Ser Ile Ile Val Gln Glu Lys Val Thr Ala
590 595 600
Phe Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Thr Val Pro Leu Lys Arg Gly
605 610 615
Met Phe Thr Val Glu Gly Ser Gly Leu Leu Ser Ala Ser Glu Ile
620 625 630
Tyr Val Lys Gly Asp Ile Ala Pro Gly Gln Lys Val Ser Val Lys
635 640 645
Ile Thr Phe Thr Pro Met Arg Val Gly Val Arg Lys Leu Leu Val
650 655 660
Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Lys Asp Val Lys Gly Val Thr Thr
665 670 675
Val Val Val Arg Lys Lys Ser Cys Phe Ile Arg Cys Pro
680 685
配列番号:45
配列の長さ:2054
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:ヒラメ 肝臓
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..2054
特徴を決定した方法:P
配列
GACAATCAGA ACATTCCGAT CACTGATGTG GATGTGAGAA GTCATGAAAA CAACTTGGCT 60
CACCGCACCA GGGAGATTGA TCGGGAGCGC TTGATCGTCC GCAGGGGTCA ACCCTTCTCC 120
ATATCTCTGC AGTGCTGCGA CTCGCTGACC CGGAATCACC ATCTGGAACT GTCCCTGCAC 180
CTCGGTAAGA AAGATGAGGT GGTGATTAAG GTGCACAATG AGCCTGAGGC TGGAGGCAAG 240
TGGTGGTTTA ACCATCAGAA AGTGCAGGAT GAAATTCTGC TGACTCTACA CAGTCCAGCG 300
GACGCCATAA TTGGCGAGTA CCACCTGACT GTGTTGATCA AGTCACCGGA TGGACACTTT 360
GTGAAGAAGA CTAAGAACAT TGGATTCCAC CTGCTCTTTA ACCCCTGGTG CAAAGATGAT 420
GCTGTGTACC TCCCTGATGA AAGGATGCTC GACGAGTATG TTATGAATGA GGAGGGGATC 480
ATTTACAGGG GAACCTCGAA TCACATCAGT AGCATACCCT GGAATTACGG ACAGTTTGAG 540
GACTATGTGA TGGACATCTG TTTTCAAGTT CTGGACAACT CCAAGGAAGC CCTGAAGAAT 600
TCAAAGATGG ACATTGAGAA GAGATCTGAC CCTGTCTATG TCAGCAGGAT GATCACTGCG 660
ATGGTGAACT CTAACGGTGA CAGGGGTGTG CTGACTGGTC AGTGGCACGA GCCATACACT 720
GGCGGGTTCT CACCACTTCG ATGGACCGGC AGCGTGCCCA TCCTCCGGAA GTGGAGCAAG 780
GCCGAGGTCA GGGCGGTCAA ATATGGCCAG TGCTGGGTGT TTGCTGCTGT CGCCTGCACA 840
GTGCTGCGTT GTCTGGGAAT CCCAACACGC AACATCACTA ACTTCAATTC AGCACATGAT 900
GTCGATGGAA ACCTCTCCGT CGACATCGTG TTGAACAAAG AAATGGAGAG CGTTGGCAAG 960
AAGGACAGTA GCTGGAACTT CCACTGTTGG ATCGAGTCCT GGATGAGGAG AGACGACCTC 1020
TCTAAAGGAA ATGACGGCTG GCAGGTTTTG GACCCCACCC CTCAAGAACT GAGTGATGGT 1080
GAGTATTGCT GCGGCCCGTG TCCAGTCACC GCCATCAAGG AGGGAAATCT GAGTGTGAAG 1140
TACGACGCTC CGTTTATCTT CGCTGAGGTG AACGCTGACA TCATCTACTG GATGGCTGGA 1200
CCAGGAGGCG AACGGAAGAA GATCGATGTG GACCAGAGTG GTGTGGGGAA GAACATCAGC 1260
ACCAAAAGTC TTTATGGCGA CTACAGGGAG GATGTCACTC TGCACTACAA ATACCCCGAA 1320
GGCTCCAAGA AGGAGAGAGA GGTGTACCAG AAGGCCGGAC ACCGAATCAA AGAGCAGATC 1380
TGTGAAAACA AAGGTCCACA ACAACTGCAG CTGTCAGTCA AGCACGGGAA ACCTGTATTT 1440
GGCACTGACT TCGATGTGAT AGTTGAGGTG AAGAATGAAG GACAGAAAGA CACCAGTCCA 1500
CAGCTGCTGA TTGTGGTCAT GGCCGTGACC TACAATTCCA TCAATCAAGG GGAGTGTCAG 1560
AGGAAGGCGA CCATAGTGAC CGTGCCGGCT CGCAAAACCC ACAAGGAAGT GCTGCGTCTG 1620
CGCTACGACG ACTATGTCAA ATGTGTCTCT GAGCACCATC TGATCAGGGT GAAAGCGCTC 1680
ATGGAGGTTC CAGGGGACAA CAAACCCGTC ATGAGTGTGG CCAACATTCC ACTGAGCATG 1740
CCTGAGCTCC TGGTAGAGGT ACCTGGGAGC ATCATTGTTC AGGAGAAGGT GACAGCCTTC 1800
ATCTCCTTCA CAAATCCTCT AACTGTCCCA CTGAAGCGTG GCATGTTCAC CGTTGAGGGG 1860
TCCGGACTAC TGTCTGCCTC TGAGATCTAT GTGAAAGGGG ACATTGCTCC AGGCCAGAAG 1920
GTTTCTGTCA AGATCACCTT CACGCCCATG AGGGTCGGGG TGAGGAAGCT CCTGGTGGAC 1980
TTTGACTCTG ACAGGCTGAA GGATGTGAAA GGAGTCACGA CAGTGGTCGT CCGCAAGAAA 2040
TCCTGTTTTA TTAGGTGTCC TTAA 2054
配列番号:46
配列の長さ:2148
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:ヒラメ 肝臓
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:26..2092
特徴を決定した方法:P
配列
GAGAAGACGA GGAAAAAGGT CTGCG ATG GAC AAT CAG AAC ATT CCG ATC ACT 52
Met Asp Asn Gln Asn Ile Pro Ile Thr
1 5
GAT GTG GAT GTG AGA AGT CAT GAA AAC AAC TTG GCT CAC CGC ACC 97
Asp Val Asp Val Arg Ser His Glu Asn Asn Leu Ala His Arg Thr
10 15 20
AGG GAG ATT GAT CGG GAG CGC TTG ATC GTC CGC AGG GGT CAA CCC 142
Arg Glu Ile Asp Arg Glu Arg Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro
25 30 35
TTC TCC ATA TCT CTG CAG TGC TGC GAC TCG CTG ACC CGG AAT CAC 187
Phe Ser Ile Ser Leu Gln Cys Cys Asp Ser Leu Thr Arg Asn His
40 45 50
CAT CTG GAA CTG TCC CTG CAC CTC GGT AAG AAA GAT GAG GTG GTG 232
His Leu Glu Leu Ser Leu His Leu Gly Lys Lys Asp Glu Val Val
55 60 65
ATT AAG GTG CAC AAT GAG CCT GAG GCT GGA GGC AAG TGG TGG TTT 277
Ile Lys Val His Asn Glu Pro Glu Ala Gly Gly Lys Trp Trp Phe
70 75 80
AAC CAT CAG AAA GTG CAG GAT GAA ATT CTG CTG ACT CTA CAC AGT 322
Asn His Gln Lys Val Gln Asp Glu Ile Leu Leu Thr Leu His Ser
85 90 95
CCA GCG GAC GCC ATA ATT GGC GAG TAC CAC CTG ACT GTG TTG ATC 367
Pro Ala Asp Ala Ile Ile Gly Glu Tyr His Leu Thr Val Leu Ile
100 105 110
AAG TCA CCG GAT GGA CAC TTT GTG AAG AAG ACT AAG AAC ATT GGA 412
Lys Ser Pro Asp Gly His Phe Val Lys Lys Thr Lys Asn Ile Gly
115 120 125
TTC CAC CTG CTC TTT AAC CCC TGG TGC AAA GAT GAT GCT GTG TAC 457
Phe His Leu Leu Phe Asn Pro Trp Cys Lys Asp Asp Ala Val Tyr
130 135 140
CTC CCT GAT GAA AGG ATG CTC GAC GAG TAT GTT ATG AAT GAG GAG 502
Leu Pro Asp Glu Arg Met Leu Asp Glu Tyr Val Met Asn Glu Glu
145 150 155
GGG ATC ATT TAC AGG GGA ACC TCG AAT CAC ATC AGT AGC ATA CCC 547
Gly Ile Ile Tyr Arg Gly Thr Ser Asn His Ile Ser Ser Ile Pro
160 165 170
TGG AAT TAC GGA CAG TTT GAG GAC TAT GTG ATG GAC ATC TGT TTT 592
Trp Asn Tyr Gly Gln Phe Glu Asp Tyr Val Met Asp Ile Cys Phe
175 180 185
CAA GTT CTG GAC AAC TCC AAG GAA GCC CTG AAG AAT TCA AAG ATG 637
Gln Val Leu Asp Asn Ser Lys Glu Ala Leu Lys Asn Ser Lys Met
190 195 200
GAC ATT GAG AAG AGA TCT GAC CCT GTC TAT GTC AGC AGG ATG ATC 682
Asp Ile Glu Lys Arg Ser Asp Pro Val Tyr Val Ser Arg Met Ile
205 210 215
ACT GCG ATG GTG AAC TCT AAC GGT GAC AGG GGT GTG CTG ACT GGT 727
Thr Ala Met Val Asn Ser Asn Gly Asp Arg Gly Val Leu Thr Gly
220 225 230
CAG TGG CAC GAG CCA TAC ACT GGC GGG TTC TCA CCA CTT CGA TGG 772
Gln Trp His Glu Pro Tyr Thr Gly Gly Phe Ser Pro Leu Arg Trp
235 240 245
ACC GGC AGC GTG CCC ATC CTC CGG AAG TGG AGC AAG GCC GAG GTC 817
Thr Gly Ser Val Pro Ile Leu Arg Lys Trp Ser Lys Ala Glu Val
250 255 260
AGG GCG GTC AAA TAT GGC CAG TGC TGG GTG TTT GCT GCT GTC GCC 862
Arg Ala Val Lys Tyr Gly Gln Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala
265 270 275
TGC ACA GTG CTG CGT TGT CTG GGA ATC CCA ACA CGC AAC ATC ACT 907
Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu Gly Ile Pro Thr Arg Asn Ile Thr
280 285 290
AAC TTC AAT TCA GCA CAT GAT GTC GAT GGA AAC CTC TCC GTC GAC 952
Asn Phe Asn Ser Ala His Asp Val Asp Gly Asn Leu Ser Val Asp
295 300 305
ATC GTG TTG AAC AAA GAA ATG GAG AGC GTT GGC AAG AAG GAC AGT 997
Ile Val Leu Asn Lys Glu Met Glu Ser Val Gly Lys Lys Asp Ser
310 315 320
AGC TGG AAC TTC CAC TGT TGG ATC GAG TCC TGG ATG AGG AGA GAC 1042
Ser Trp Asn Phe His Cys Trp Ile Glu Ser Trp Met Arg Arg Asp
325 330 335
GAC CTC TCT AAA GGA AAT GAC GGC TGG CAG GTT TTG GAC CCC ACC 1087
Asp Leu Ser Lys Gly Asn Asp Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr
340 345 350
CCT CAA GAA CTG AGT GAT GGT GAG TAT TGC TGC GGC CCG TGT CCA 1132
Pro Gln Glu Leu Ser Asp Gly Glu Tyr Cys Cys Gly Pro Cys Pro
355 360 365
GTC ACC GCC ATC AAG GAG GGA AAT CTG AGT GTG AAG TAC GAC GCT 1177
Val Thr Ala Ile Lys Glu Gly Asn Leu Ser Val Lys Tyr Asp Ala
370 375 380
CCG TTT ATC TTC GCT GAG GTG AAC GCT GAC ATC ATC TAC TGG ATG 1222
Pro Phe Ile Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp Ile Ile Tyr Trp Met
385 390 395
GCT GGA CCA GGA GGC GAA CGG AAG AAG ATC GAT GTG GAC CAG AGT 1267
Ala Gly Pro Gly Gly Glu Arg Lys Lys Ile Asp Val Asp Gln Ser
400 405 410
GGT GTG GGG AAG AAC ATC AGC ACC AAA AGT CTT TAT GGC GAC TAC 1312
Gly Val Gly Lys Asn Ile Ser Thr Lys Ser Leu Tyr Gly Asp Tyr
415 420 425
AGG GAG GAT GTC ACT CTG CAC TAC AAA TAC CCC GAA GGC TCC AAG 1357
Arg Glu Asp Val Thr Leu His Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Lys
430 435 440
AAG GAG AGA GAG GTG TAC CAG AAG GCC GGA CAC CGA ATC AAA GAG 1402
Lys Glu Arg Glu Val Tyr Gln Lys Ala Gly His Arg Ile Lys Glu
445 450 455
CAG ATC TGT GAA AAC AAA GGT CCA CAA CAA CTG CAG CTG TCA GTC 1447
Gln Ile Cys Glu Asn Lys Gly Pro Gln Gln Leu Gln Leu Ser Val
460 465 470
AAG CAC GGG AAA CCT GTA TTT GGC ACT GAC TTC GAT GTG ATA GTT 1492
Lys His Gly Lys Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val
475 480 485
GAG GTG AAG AAT GAA GGA CAG AAA GAC ACC AGT CCA CAG CTG CTG 1537
Glu Val Lys Asn Glu Gly Gln Lys Asp Thr Ser Pro Gln Leu Leu
490 495 500
ATT GTG GTC ATG GCC GTG ACC TAC AAT TCC ATC AAT CAA GGG GAG 1582
Ile Val Val Met Ala Val Thr Tyr Asn Ser Ile Asn Gln Gly Glu
505 510 515
TGT CAG AGG AAG GCG ACC ATA GTG ACC GTG CCG GCT CGC AAA ACC 1627
Cys Gln Arg Lys Ala Thr Ile Val Thr Val Pro Ala Arg Lys Thr
520 525 530
CAC AAG GAA GTG CTG CGT CTG CGC TAC GAC GAC TAT GTC AAA TGT 1672
His Lys Glu Val Leu Arg Leu Arg Tyr Asp Asp Tyr Val Lys Cys
535 540 545
GTC TCT GAG CAC CAT CTG ATC AGG GTG AAA GCG CTC ATG GAG GTT 1717
Val Ser Glu His His Leu Ile Arg Val Lys Ala Leu Met Glu Val
550 555 560
CCA GGG GAC AAC AAA CCC GTC ATG AGT GTG GCC AAC ATT CCA CTG 1762
Pro Gly Asp Asn Lys Pro Val Met Ser Val Ala Asn Ile Pro Leu
565 570 575
AGC ATG CCT GAG CTC CTG GTA GAG GTA CCT GGG AGC ATC ATT GTT 1807
Ser Met Pro Glu Leu Leu Val Glu Val Pro Gly Ser Ile Ile Val
580 585 590
CAG GAG AAG GTG ACA GCC TTC ATC TCC TTC ACA AAT CCT CTA ACT 1852
Gln Glu Lys Val Thr Ala Phe Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Thr
595 600 605
GTC CCA CTG AAG CGT GGC ATG TTC ACC GTT GAG GGG TCC GGA CTA 1897
Val Pro Leu Lys Arg Gly Met Phe Thr Val Glu Gly Ser Gly Leu
610 615 620
CTG TCT GCC TCT GAG ATC TAT GTG AAA GGG GAC ATT GCT CCA GGC 1942
Leu Ser Ala Ser Glu Ile Tyr Val Lys Gly Asp Ile Ala Pro Gly
625 630 635
CAG AAG GTT TCT GTC AAG ATC ACC TTC ACG CCC ATG AGG GTC GGG 1987
Gln Lys Val Ser Val Lys Ile Thr Phe Thr Pro Met Arg Val Gly
640 645 650
GTG AGG AAG CTC CTG GTG GAC TTT GAC TCT GAC AGG CTG AAG GAT 2032
Val Arg Lys Leu Leu Val Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Lys Asp
655 660 665
GTG AAA GGA GTC ACG ACA GTG GTC GTC CGC AAG AAA TCC TGT TTT 2077
Val Lys Gly Val Thr Thr Val Val Val Arg Lys Lys Ser Cys Phe
670 675 680
ATT AGG TGT CCT TAAAAACAGA CGGACACGTA TTAAAGTGTG AGATAACCTG 2129
Ile Arg Cys Pro
685
AGAGGTGTAA CTCCCCTGT 2148
配列番号:47
配列の長さ:2054
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:ヒラメ 肝臓
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..2054
特徴を決定した方法:P
配列
GACAATCAGA ACATTCCGAT CACTGATGTG GATGTGAGAA GTCATGAAAA CAACTTGGCT 60
CACCGCACCA GGGAGATTGA TCGGGAGCGC TTGATCGTCC GCAGGGGTCA ACCCTTCTCC 120
ATATCTCTGC AGTGCTGCGA CTCGCTGACC CGGAATCACC ATCTGGAACT GTCCCTGCAC 180
CTCGGTAAGA AAGATGAGGT GGTGATTAAG GTGCACAATG AGCCTGAGGC TGGAGGCAAG 240
TGGTGGTTTA ACCATCAGAA AGTGCAGGAT GAAATTCTGC TGACTCTACA CAGTCCAGCG 300
GACGCCATAA TTGGCGAGTA CCACCTGACT GTGTTGATCA AGTCACCGGA TGGACACTTT 360
GTGAAGAAGA CTAAGAACAT TGGATTCCAC CTGCTCTTTA ACCCCTGGTG CAAAGATGAT 420
GCTGTGTACC TCCCTGATGA AAGGATGCTC GACGAGTATG TTATGAATGA GGAGGGGATC 480
ATTTACAGGG GAACCTCGAA TCACATCAGT AGCATACCCT GGAATTACGG ACAGTTTGAG 540
GACTATGTGA TGGACATCTG TTTTCAAGTT CTGGACAACT CCAAGGAAGC CCTGAAGAAT 600
TCAAAGATGG ACATTGAGAA GAGATCTGAC CCTGTCTATG TCAGCAGGAT GATCACTGCG 660
ATGGTGAACT CTAACGGTGA CAGGGGTGTG CTGACTGGTC AGTGGCACGA GCCATACACT 720
GGCGGGTTCT CACCACTTCG ATGGACCGGC AGCGTGCCCA TCCTCCGGAA GTGGAGCAAG 780
GCCGAGGTCA GGGCGGTCAA ATATGGCCAG TGCTGGGTGT TTGCTGCTGT CGCCTGCACA 840
GTGCTGCGTT GTCTGGGAAT CCCAACACGC AACATCACTA ACTTCAATTC AGCACATGAT 900
GTCGATGGAA ACCTCTCCGT CGACATCGTG TTGAACAAAG AAATGGAGAG CGTTGGCAAG 960
AAGGACAGTA GCTGGAACTT CCACTGTTGG ATCGAGTCCT GGATGAGGAG AGACGACCTC 1020
TCTAAAGGAA ATGACGGCTG GCAGGTTTTG GACCCCACCC CTCAAGAACT GAGTGATGGT 1080
GAGTATTGCT GCGGCCCGTG TCCAGTCACC GCCATCAAGG AGGGAAATCT GAGTGTGAAG 1140
TACGACGCTC CGTTTATCTT CGCTGAGGTG AACGCTGACA TCATCTACTG GATGGCTGGA 1200
CCAGGAGGCG AACGGAAGAA GATCGATGTG GACCAGAGTG GTGTGGGGAA GAACATCAGC 1260
ACCAAAAGTC TTTATGGCGA CTACAGGGAG GATGTCACTC TGCACTACAA ATACCCCGAA 1320
GGCTCCAAGA AGGAGAGAGA GGTGTACCAG AAGGCCGGAC ACCGAATCAA AGAGCAGATC 1380
TGTGAAAACA AAGGTCCACA ACAACTGCAG CTGTCAGTCA AGCACGGGAA ACCTGTATTT 1440
GGCACTGACT TCGATGTGAT AGTTGAGGTG AAGAATGAAG GACAGAAAGA CACCAGTCCA 1500
CAGCTGCTGA TTGTGGTCAT GGCCGTGACC TACAATTCCA TCAATCAAGG GGAGTGTCAG 1560
AGGAAGGCGA CCATAGTGAC CGTGCCGGCT CGCAAAACCC ACAAGGAAGT GCTGCGTCTG 1620
CGCTACGACG ACTATGTCAA ATGTGTCTCT GAGCACCATC TGATCAGGGT GAAAGCGCTC 1680
ATGGAGGTTC CAGGGGACAA CAAACCCGTC ATGAGTGTGG CCAACATTCC ACTGAGCATG 1740
CCTGAGCTCC TGGTAGAGGT ACCTGGGAGC ATCATTGTTC AGGAGAAGGT GACAGCCTTC 1800
ATCTCCTTCA CAAATCCTCT AACTGTCCCA CTGAAGCGTG GCATGTTCAC CGTGGAGGGG 1860
TCCGGACTAC TGTCTGCCTC TGAGATCTAT GTGAAAGGGG ACATTGCTCC AGGCCAGAAG 1920
GTTTCTGTCA AGATCACCTT CACGCCCATG AGGGTCGGGG TGAGGAAGCT CCTGGTGGAC 1980
TTTGACTCTG ACAGGCTGAA GGATGTGAAA GGAGTCACGA CAGTGGTCGT CCGCAAGAAA 2040
TCCTGTTTTA TTAGGTGTCC TTAA 2054
配列番号:48
配列の長さ:2148
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:ヒラメ 肝臓
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:26..2092
特徴を決定した方法:P
配列
GAGAAGACGA GGAAAAAGGT CTGCG ATG GAC AAT CAG AAC ATT CCG ATC ACT 52
Met Asp Asn Gln Asn Ile Pro Ile Thr
1 5
GAT GTG GAT GTG AGA AGT CAT GAA AAC AAC TTG GCT CAC CGC ACC 97
Asp Val Asp Val Arg Ser His Glu Asn Asn Leu Ala His Arg Thr
10 15 20
AGG GAG ATT GAT CGG GAG CGC TTG ATC GTC CGC AGG GGT CAA CCC 142
Arg Glu Ile Asp Arg Glu Arg Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Pro
25 30 35
TTC TCC ATA TCT CTG CAG TGC TGC GAC TCG CTG ACC CGG AAT CAC 187
Phe Ser Ile Ser Leu Gln Cys Cys Asp Ser Leu Thr Arg Asn His
40 45 50
CAT CTG GAA CTG TCC CTG CAC CTC GGT AAG AAA GAT GAG GTG GTG 232
His Leu Glu Leu Ser Leu His Leu Gly Lys Lys Asp Glu Val Val
55 60 65
ATT AAG GTG CAC AAT GAG CCT GAG GCT GGA GGC AAG TGG TGG TTT 277
Ile Lys Val His Asn Glu Pro Glu Ala Gly Gly Lys Trp Trp Phe
70 75 80
AAC CAT CAG AAA GTG CAG GAT GAA ATT CTG CTG ACT CTA CAC AGT 322
Asn His Gln Lys Val Gln Asp Glu Ile Leu Leu Thr Leu His Ser
85 90 95
CCA GCG GAC GCC ATA ATT GGC GAG TAC CAC CTG ACT GTG TTG ATC 367
Pro Ala Asp Ala Ile Ile Gly Glu Tyr His Leu Thr Val Leu Ile
100 105 110
AAG TCA CCG GAT GGA CAC TTT GTG AAG AAG ACT AAG AAC ATT GGA 412
Lys Ser Pro Asp Gly His Phe Val Lys Lys Thr Lys Asn Ile Gly
115 120 125
TTC CAC CTG CTC TTT AAC CCC TGG TGC AAA GAT GAT GCT GTG TAC 457
Phe His Leu Leu Phe Asn Pro Trp Cys Lys Asp Asp Ala Val Tyr
130 135 140
CTC CCT GAT GAA AGG ATG CTC GAC GAG TAT GTT ATG AAT GAG GAG 502
Leu Pro Asp Glu Arg Met Leu Asp Glu Tyr Val Met Asn Glu Glu
145 150 155
GGG ATC ATT TAC AGG GGA ACC TCG AAT CAC ATC AGT AGC ATA CCC 547
Gly Ile Ile Tyr Arg Gly Thr Ser Asn His Ile Ser Ser Ile Pro
160 165 170
TGG AAT TAC GGA CAG TTT GAG GAC TAT GTG ATG GAC ATC TGT TTT 592
Trp Asn Tyr Gly Gln Phe Glu Asp Tyr Val Met Asp Ile Cys Phe
175 180 185
CAA GTT CTG GAC AAC TCC AAG GAA GCC CTG AAG AAT TCA AAG ATG 637
Gln Val Leu Asp Asn Ser Lys Glu Ala Leu Lys Asn Ser Lys Met
190 195 200
GAC ATT GAG AAG AGA TCT GAC CCT GTC TAT GTC AGC AGG ATG ATC 682
Asp Ile Glu Lys Arg Ser Asp Pro Val Tyr Val Ser Arg Met Ile
205 210 215
ACT GCG ATG GTG AAC TCT AAC GGT GAC AGG GGT GTG CTG ACT GGT 727
Thr Ala Met Val Asn Ser Asn Gly Asp Arg Gly Val Leu Thr Gly
220 225 230
CAG TGG CAC GAG CCA TAC ACT GGC GGG TTC TCA CCA CTT CGA TGG 772
Gln Trp His Glu Pro Tyr Thr Gly Gly Phe Ser Pro Leu Arg Trp
235 240 245
ACC GGC AGC GTG CCC ATC CTC CGG AAG TGG AGC AAG GCC GAG GTC 817
Thr Gly Ser Val Pro Ile Leu Arg Lys Trp Ser Lys Ala Glu Val
250 255 260
AGG GCG GTC AAA TAT GGC CAG TGC TGG GTG TTT GCT GCT GTC GCC 862
Arg Ala Val Lys Tyr Gly Gln Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala
265 270 275
TGC ACA GTG CTG CGT TGT CTG GGA ATC CCA ACA CGC AAC ATC ACT 907
Cys Thr Val Leu Arg Cys Leu Gly Ile Pro Thr Arg Asn Ile Thr
280 285 290
AAC TTC AAT TCA GCA CAT GAT GTC GAT GGA AAC CTC TCC GTC GAC 952
Asn Phe Asn Ser Ala His Asp Val Asp Gly Asn Leu Ser Val Asp
295 300 305
ATC GTG TTG AAC AAA GAA ATG GAG AGC GTT GGC AAG AAG GAC AGT 997
Ile Val Leu Asn Lys Glu Met Glu Ser Val Gly Lys Lys Asp Ser
310 315 320
AGC TGG AAC TTC CAC TGT TGG ATC GAG TCC TGG ATG AGG AGA GAC 1042
Ser Trp Asn Phe His Cys Trp Ile Glu Ser Trp Met Arg Arg Asp
325 330 335
GAC CTC TCT AAA GGA AAT GAC GGC TGG CAG GTT TTG GAC CCC ACC 1087
Asp Leu Ser Lys Gly Asn Asp Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr
340 345 350
CCT CAA GAA CTG AGT GAT GGT GAG TAT TGC TGC GGC CCG TGT CCA 1132
Pro Gln Glu Leu Ser Asp Gly Glu Tyr Cys Cys Gly Pro Cys Pro
355 360 365
GTC ACC GCC ATC AAG GAG GGA AAT CTG AGT GTG AAG TAC GAC GCT 1177
Val Thr Ala Ile Lys Glu Gly Asn Leu Ser Val Lys Tyr Asp Ala
370 375 380
CCG TTT ATC TTC GCT GAG GTG AAC GCT GAC ATC ATC TAC TGG ATG 1222
Pro Phe Ile Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp Ile Ile Tyr Trp Met
385 390 395
GCT GGA CCA GGA GGC GAA CGG AAG AAG ATC GAT GTG GAC CAG AGT 1267
Ala Gly Pro Gly Gly Glu Arg Lys Lys Ile Asp Val Asp Gln Ser
400 405 410
GGT GTG GGG AAG AAC ATC AGC ACC AAA AGT CTT TAT GGC GAC TAC 1312
Gly Val Gly Lys Asn Ile Ser Thr Lys Ser Leu Tyr Gly Asp Tyr
415 420 425
AGG GAG GAT GTC ACT CTG CAC TAC AAA TAC CCC GAA GGC TCC AAG 1357
Arg Glu Asp Val Thr Leu His Tyr Lys Tyr Pro Glu Gly Ser Lys
430 435 440
AAG GAG AGA GAG GTG TAC CAG AAG GCC GGA CAC CGA ATC AAA GAG 1402
Lys Glu Arg Glu Val Tyr Gln Lys Ala Gly His Arg Ile Lys Glu
445 450 455
CAG ATC TGT GAA AAC AAA GGT CCA CAA CAA CTG CAG CTG TCA GTC 1447
Gln Ile Cys Glu Asn Lys Gly Pro Gln Gln Leu Gln Leu Ser Val
460 465 470
AAG CAC GGG AAA CCT GTA TTT GGC ACT GAC TTC GAT GTG ATA GTT 1492
Lys His Gly Lys Pro Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Val
475 480 485
GAG GTG AAG AAT GAA GGA CAG AAA GAC ACC AGT CCA CAG CTG CTG 1537
Glu Val Lys Asn Glu Gly Gln Lys Asp Thr Ser Pro Gln Leu Leu
490 495 500
ATT GTG GTC ATG GCC GTG ACC TAC AAT TCC ATC AAT CAA GGG GAG 1582
Ile Val Val Met Ala Val Thr Tyr Asn Ser Ile Asn Gln Gly Glu
505 510 515
TGT CAG AGG AAG GCG ACC ATA GTG ACC GTG CCG GCT CGC AAA ACC 1627
Cys Gln Arg Lys Ala Thr Ile Val Thr Val Pro Ala Arg Lys Thr
520 525 530
CAC AAG GAA GTG CTG CGT CTG CGC TAC GAC GAC TAT GTC AAA TGT 1672
His Lys Glu Val Leu Arg Leu Arg Tyr Asp Asp Tyr Val Lys Cys
535 540 545
GTC TCT GAG CAC CAT CTG ATC AGG GTG AAA GCG CTC ATG GAG GTT 1717
Val Ser Glu His His Leu Ile Arg Val Lys Ala Leu Met Glu Val
550 555 560
CCA GGG GAC AAC AAA CCC GTC ATG AGT GTG GCC AAC ATT CCA CTG 1762
Pro Gly Asp Asn Lys Pro Val Met Ser Val Ala Asn Ile Pro Leu
565 570 575
AGC ATG CCT GAG CTC CTG GTA GAG GTA CCT GGG AGC ATC ATT GTT 1807
Ser Met Pro Glu Leu Leu Val Glu Val Pro Gly Ser Ile Ile Val
580 585 590
CAG GAG AAG GTG ACA GCC TTC ATC TCC TTC ACA AAT CCT CTA ACT 1852
Gln Glu Lys Val Thr Ala Phe Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Thr
595 600 605
GTC CCA CTG AAG CGT GGC ATG TTC ACC GTG GAG GGG TCC GGA CTA 1897
Val Pro Leu Lys Arg Gly Met Phe Thr Val Glu Gly Ser Gly Leu
610 615 620
CTG TCT GCC TCT GAG ATC TAT GTG AAA GGG GAC ATT GCT CCA GGC 1942
Leu Ser Ala Ser Glu Ile Tyr Val Lys Gly Asp Ile Ala Pro Gly
625 630 635
CAG AAG GTT TCT GTC AAG ATC ACC TTC ACG CCC ATG AGG GTC GGG 1987
Gln Lys Val Ser Val Lys Ile Thr Phe Thr Pro Met Arg Val Gly
640 645 650
GTG AGG AAG CTC CTG GTG GAC TTT GAC TCT GAC AGG CTG AAG GAT 2032
Val Arg Lys Leu Leu Val Asp Phe Asp Ser Asp Arg Leu Lys Asp
655 660 665
GTG AAA GGA GTC ACG ACA GTG GTC GTC CGC AAG AAA TCC TGT TTT 2077
Val Lys Gly Val Thr Thr Val Val Val Arg Lys Lys Ser Cys Phe
670 675 680
ATT AGG TGT CCT TAAAAACAGA CGGACACGTA TTAAAGTGTG AGATAACCTG 2129
Ile Arg Cys Pro
685
AGAGGTGTAA CTCCCCTGT 2148
【0154】配列番号:49
配列の長さ:640
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:スケソウタラ 筋肉
配列
Ala His Thr Asn Arg Leu Ile Ala Gly Val Asp Leu Arg Ser Gln
1 5 10 15
Glu Asn Asn Arg Glu His Arg Thr Glu Glu Ile Asp Arg Lys Arg
20 25 30
Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Ala Phe Ser Leu Thr Val His Leu
35 40 45
Ser Asp Pro Leu Gln Ser Gly His Glu Leu Ala Leu Val Leu Lys
50 55 60
Gln Asp Lys Ile Asn Asp Asp Ile Val Ile Arg Gln Arg Thr Thr
65 70 75
Gly Gly Ser Gly Asp Lys Trp Trp Leu His Gln Gln Ser Ala Asn
80 85 90
Asn Glu Leu Leu Leu Thr Val Tyr Ser Pro Ala Arg Ala Ala Val
95 100 105
Gly Glu Tyr Arg Leu Ala Val Glu Leu Met Ser Gly Asn Lys Leu
110 115 120
Leu Glu Arg Thr Asp Phe Thr Lys Met Tyr Leu Leu Phe Asn Pro
125 130 135
Trp Cys Lys Glu Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Cys Leu Leu
140 145 150
Lys Glu Tyr Ile Met Asn Glu Asn Gly Arg Ile Phe Thr Gly Ser
155 160 165
Ala Asp Trp Met Ser Gly Leu Pro Trp Asn Phe Gly Gln Phe Glu
170 175 180
Asp Asn Val Met Asp Ile Cys Phe Glu Ile Leu Asp Arg Phe Asn
185 190 195
Pro Ala Arg Ser Asp Pro Pro Ser Asp Met Leu Gln Arg Trp Asp
200 205 210
Pro Val Tyr Ile Ser Arg Ala Val Val Ala Met Val Asn Ala Asn
215 220 225
Asp Asp Asp Gly Gly Val Val Val Gly Arg Trp Gln Glu Pro Tyr
230 235 240
Thr Gly Gly Val Gln Pro Thr Lys Trp Met Ser Ser Val Pro Ile
245 250 255
Leu Glu Glu Trp Ser Lys Ser Lys Ser Gly Val Lys Tyr Gly Gln
260 265 270
Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Met Arg Cys Leu
275 280 285
Gly Ile Pro Thr Arg Cys Ile Thr Asn Phe Gln Ser Ala His Asp
290 295 300
Thr Asp Gly Asn Leu Ser Ile Asp Arg Val Tyr Asn Ile His Arg
305 310 315
Gln Leu Val Asp Gly Asp Asp Ser Ile Trp Asn Phe His Cys Trp
320 325 330
Ile Glu Ser Tyr Met Gln Arg Glu Asp Leu Pro Glu Gly Tyr Gly
335 340 345
Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Arg Ser Ser Gly
350 355 360
Met Phe Arg Cys Gly Pro Cys Pro Leu Lys Ala Ile Lys Glu Gly
365 370 375
Asp Leu Asn Val Lys Phe Asp Val Pro Phe Val Phe Ala Glu Val
380 385 390
Asn Ala Asp Ile Ile Asn Trp Glu Ile Arg Pro Asp Gly Gln Arg
395 400 405
Lys Arg Leu Ser Ser Asn Ser Ala Asn Val Gly Arg Asn Ile Ser
410 415 420
Thr Lys Ser Pro Tyr Gly Asn Glu Arg Glu Asp Ile Thr His Gln
425 430 435
Tyr Lys Tyr Gln Glu Gly Ser Ala Lys Glu Arg Glu Val Tyr Asn
440 445 450
Lys Ala Gly Arg Arg Ile Ser Gly Pro Asp Gly Glu Glu Glu Ser
455 460 465
Lys Pro Gly Asn Val Gln Leu Glu Ile Lys His Ala Lys Pro Val
470 475 480
Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Phe Glu Leu Glu Asn Met Gly
485 490 495
Asp Lys Glu Val Ser Cys Lys Leu Asn Met Met Ser Glu Ala Val
500 505 510
Thr Tyr Asn Ser Val His Leu Gly Arg Phe Gln Asn Ser Thr Val
515 520 525
Asn Val Val Ile Pro Ala His Lys Val His Ser Glu Thr Val Arg
530 535 540
Leu Leu Tyr Thr Lys Tyr Ala Ser Val Val Ser Glu His Asn Ile
545 550 555
Ile Arg Val Thr Gly Val Ala Glu Val Ser Gly Gln Glu Lys Ser
560 565 570
Ile Leu Glu Met Val Asn Ile Pro Leu Ser Lys Pro Lys Leu Ser
575 580 585
Ile Lys Val Pro Gly Trp Val Ile Leu Asn Arg Lys Ile Thr Thr
590 595 600
Phe Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu Asn Arg Gly
605 610 615
Val Phe Thr Val Glu Gly Ala Gly Leu Leu Pro Thr Lys Glu Ile
620 625 630
Arg Ile Ser Gly Ser Ile Ala Pro Gly Gln
635 640
配列番号:50
配列の長さ:641
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:タンパク質
起源
生物名:スケソウタラ 筋肉
配列
Met Ala His Thr Asn Arg Leu Ile Ala Gly Val Asp Leu Arg Ser
1 5 10 15
Gln Glu Asn Asn Arg Glu His Arg Thr Glu Glu Ile Asp Arg Lys
20 25 30
Arg Leu Ile Val Arg Arg Gly Gln Ala Phe Ser Leu Thr Val His
35 40 45
Leu Ser Asp Pro Leu Gln Ser Gly His Glu Leu Ala Leu Val Leu
50 55 60
Lys Gln Asp Lys Ile Asn Asp Asp Ile Val Ile Arg Gln Arg Thr
65 70 75
Thr Gly Gly Ser Gly Asp Lys Trp Trp Leu His Gln Gln Ser Ala
80 85 90
Asn Asn Glu Leu Leu Leu Thr Val Tyr Ser Pro Ala Arg Ala Ala
95 100 105
Val Gly Glu Tyr Arg Leu Ala Val Glu Leu Met Ser Gly Asn Lys
110 115 120
Leu Leu Glu Arg Thr Asp Phe Thr Lys Met Tyr Leu Leu Phe Asn
125 130 135
Pro Trp Cys Lys Glu Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Cys Leu
140 145 150
Leu Lys Glu Tyr Ile Met Asn Glu Asn Gly Arg Ile Phe Thr Gly
155 160 165
Ser Ala Asp Trp Met Ser Gly Leu Pro Trp Asn Phe Gly Gln Phe
170 175 180
Glu Asp Asn Val Met Asp Ile Cys Phe Glu Ile Leu Asp Arg Phe
185 190 195
Asn Pro Ala Arg Ser Asp Pro Pro Ser Asp Met Leu Gln Arg Trp
200 205 210
Asp Pro Val Tyr Ile Ser Arg Ala Val Val Ala Met Val Asn Ala
215 220 225
Asn Asp Asp Asp Gly Gly Val Val Val Gly Arg Trp Gln Glu Pro
230 235 240
Tyr Thr Gly Gly Val Gln Pro Thr Lys Trp Met Ser Ser Val Pro
245 250 255
Ile Leu Glu Glu Trp Ser Lys Ser Lys Ser Gly Val Lys Tyr Gly
260 265 270
Gln Cys Trp Val Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Met Arg Cys
275 280 285
Leu Gly Ile Pro Thr Arg Cys Ile Thr Asn Phe Gln Ser Ala His
290 295 300
Asp Thr Asp Gly Asn Leu Ser Ile Asp Arg Val Tyr Asn Ile His
305 310 315
Arg Gln Leu Val Asp Gly Asp Asp Ser Ile Trp Asn Phe His Cys
320 325 330
Trp Ile Glu Ser Tyr Met Gln Arg Glu Asp Leu Pro Glu Gly Tyr
335 340 345
Gly Gly Trp Gln Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Arg Ser Ser
350 355 360
Gly Met Phe Arg Cys Gly Pro Cys Pro Leu Lys Ala Ile Lys Glu
365 370 375
Gly Asp Leu Asn Val Lys Phe Asp Val Pro Phe Val Phe Ala Glu
380 385 390
Val Asn Ala Asp Ile Ile Asn Trp Glu Ile Arg Pro Asp Gly Gln
395 400 405
Arg Lys Arg Leu Ser Ser Asn Ser Ala Asn Val Gly Arg Asn Ile
410 415 420
Ser Thr Lys Ser Pro Tyr Gly Asn Glu Arg Glu Asp Ile Thr His
425 430 435
Gln Tyr Lys Tyr Gln Glu Gly Ser Ala Lys Glu Arg Glu Val Tyr
440 445 450
Asn Lys Ala Gly Arg Arg Ile Ser Gly Pro Asp Gly Glu Glu Glu
455 460 465
Ser Lys Pro Gly Asn Val Gln Leu Glu Ile Lys His Ala Lys Pro
470 475 480
Val Phe Gly Thr Asp Phe Asp Val Ile Phe Glu Leu Glu Asn Met
485 490 495
Gly Asp Lys Glu Val Ser Cys Lys Leu Asn Met Met Ser Glu Ala
500 505 510
Val Thr Tyr Asn Ser Val His Leu Gly Arg Phe Gln Asn Ser Thr
515 520 525
Val Asn Val Val Ile Pro Ala His Lys Val His Ser Glu Thr Val
530 535 540
Arg Leu Leu Tyr Thr Lys Tyr Ala Ser Val Val Ser Glu His Asn
545 550 555
Ile Ile Arg Val Thr Gly Val Ala Glu Val Ser Gly Gln Glu Lys
560 565 570
Ser Ile Leu Glu Met Val Asn Ile Pro Leu Ser Lys Pro Lys Leu
575 580 585
Ser Ile Lys Val Pro Gly Trp Val Ile Leu Asn Arg Lys Ile Thr
590 595 600
Thr Phe Ile Ser Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu Asn Arg
605 610 615
Gly Val Phe Thr Val Glu Gly Ala Gly Leu Leu Pro Thr Lys Glu
620 625 630
Ile Arg Ile Ser Gly Ser Ile Ala Pro Gly Gln
635 640
配列番号:51
配列の長さ:1921
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:スケソウタラ 筋肉
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..
特徴を決定した方法:P
配列
GCCCACACAA ACCGTTTAAT TGCTGGTGTT GATCTGAGAA GCCAGGAAAA CAACCGGGAA 60
CACCGAACTG AGGAGATTGA TAGGAAGCGT TTGATTGTTC GGCGGGGACA AGCCTTCTCC 120
CTGACGGTGC ACCTCTCCGA CCCGCTGCAG TCCGGCCATG AGCTGGCCCT GGTCTTAAAG 180
CAGGATAAAA TCAACGATGA TATTGTGATC AGACAGCGAA CGACTGGAGG GTCCGGTGAC 240
AAGTGGTGGT TACACCAGCA GAGCGCGAAC AACGAATTAC TGCTGACTGT GTACAGTCCC 300
GCCCGTGCTG CCGTTGGCGA GTACCGCTTG GCTGTTGAAC TGATGTCAGG GAATAAACTT 360
CTGGAGAGGA CGGACTTTAC CAAAATGTAC TTGCTGTTTA ATCCCTGGTG CAAAGAAGAT 420
GCCGTGTACC TCCCTGATGA GTGTCTGCTC AAGGAATACA TTATGAACGA GAATGGTCGC 480
ATTTTCACTG GGAGTGCGGA TTGGATGAGT GGGTTGCCAT GGAATTTCGG ACAGTTTGAA 540
GATAATGTGA TGGACATCTG CTTTGAGATC CTTGACCGCT TTAACCCAGC GAGGTCAGAC 600
CCCCCAAGCG ACATGCTTCA GCGATGGGAC CCTGTCTACA TCAGCAGGGC AGTCGTTGCC 660
ATGGTGAATG CCAACGATGA TGACGGTGGA GTCGTGGTGG GTCGATGGCA GGAACCTTAC 720
ACAGGTGGAG TACAGCCAAC CAAATGGATG AGCAGTGTGC CCATCCTGGA AGAGTGGAGC 780
AAATCAAAGT CTGGAGTGAA ATATGGCCAA TGCTGGGTGT TTGCAGCCGT GGCCTGCACA 840
GTGATGCGAT GCCTGGGCAT CCCCACACGC TGCATCACCA ACTTTCAGTC GGCCCATGAC 900
ACAGACGGAA ACCTCTCCAT CGACCGAGTG TACAACATAC ATAGGCAGCT AGTTGACGGT 960
GATGACAGTA TCTGGAACTT TCATTGTTGG ATCGAGTCTT ACATGCAGAG AGAAGATCTA 1020
CCTGAAGGAT ATGGTGGCTG GCAAGTCTTG GACCCCACAC CTCAGGAGAG GAGTAGTGGT 1080
ATGTTTCGCT GTGGCCCATG TCCTTTGAAG GCCATTAAAG AAGGGGACCT CAATGTGAAG 1140
TTTGATGTTC CATTTGTCTT TGCTGAGGTG AATGCAGACA TCATCAATTG GGAAATCAGA 1200
CCAGACGGTC AGCGAAAGCG GCTTTCATCC AACTCTGCAA ATGTGGGGAG GAACATTAGC 1260
ACCAAAAGTC CTTATGGTAA CGAGAGGGAA GATATAACCC ATCAGTACAA GTACCAAGAA 1320
GGTTCAGCCA AGGAGCGGGA GGTGTACAAC AAGGCAGGGC GGCGCATCTC CGGGCCGGAT 1380
GGAGAAGAGG AATCAAAACC AGGAAACGTG CAGCTGGAGA TCAAGCACGC CAAACCTGTG 1440
TTCGGGACCG ACTTTGACGT CATCTTTGAG TTGGAGAACA TGGGAGACAA AGAAGTCAGC 1500
TGCAAATTAA ACATGATGTC AGAGGCTGTC ACCTATAACT CAGTTCACCT TGGACGGTTC 1560
CAGAACAGCA CGGTCAATGT TGTCATTCCT GCTCACAAAG TCCACAGTGA GACGGTGCGT 1620
CTACTCTACA CTAAGTATGC CTCAGTTGTC AGCGAGCACA ACATCATCCG GGTGACAGGG 1680
GTGGCGGAAG TGTCCGGCCA GGAAAAATCC ATCCTGGAGA TGGTCAACAT CCCACTGAGC 1740
AAGCCCAAAC TCAGTATTAA GGTTCCTGGC TGGGTGATTT TAAATAGGAA AATCACCACC 1800
TTCATCTCCT TCACCAATCC ATTGCCAGTG CCACTGAACC GAGGAGTGTT CACTGTTGAA 1860
GGGGCTGGCC TACTTCCCAC CAAAGAGATC CGCATTTCTG GTAGCATCGC TCCAGGCCAG 1920
C 1921
配列番号:52
配列の長さ:1962
配列の型:核酸
鎖の数:二本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:cDNA to mRNA
起源
生物名:スケソウタラ 筋肉
配列の特徴
特徴を表す記号:CDS
存在位置:1..
特徴を決定した方法:P
配列
TTGTAAGAGC AACTCTTGGA AAGAATTTAG CAAAGATA ATG GCC CAC ACA 50
Met Ala His Thr
1
AAC CGT TTA ATT GCT GGT GTT GAT CTG AGA AGC CAG GAA AAC AAC 95
Asn Arg Leu Ile Ala Gly Val Asp Leu Arg Ser Gln Glu Asn Asn
5 10 15
CGG GAA CAC CGA ACT GAG GAG ATT GAT AGG AAG CGT TTG ATT GTT 140
Arg Glu His Arg Thr Glu Glu Ile Asp Arg Lys Arg Leu Ile Val
20 25 30
CGG CGG GGA CAA GCC TTC TCC CTG ACG GTG CAC CTC TCC GAC CCG 185
Arg Arg Gly Gln Ala Phe Ser Leu Thr Val His Leu Ser Asp Pro
35 40 45
CTG CAG TCC GGC CAT GAG CTG GCC CTG GTC TTA AAG CAG GAT AAA 230
Leu Gln Ser Gly His Glu Leu Ala Leu Val Leu Lys Gln Asp Lys
50 55 60
ATC AAC GAT GAT ATT GTG ATC AGA CAG CGA ACG ACT GGA GGG TCC 275
Ile Asn Asp Asp Ile Val Ile Arg Gln Arg Thr Thr Gly Gly Ser
65 70 75
GGT GAC AAG TGG TGG TTA CAC CAG CAG AGC GCG AAC AAC GAA TTA 320
Gly Asp Lys Trp Trp Leu His Gln Gln Ser Ala Asn Asn Glu Leu
80 85 90
CTG CTG ACT GTG TAC AGT CCC GCC CGT GCT GCC GTT GGC GAG TAC 365
Leu Leu Thr Val Tyr Ser Pro Ala Arg Ala Ala Val Gly Glu Tyr
95 100 105
CGC TTG GCT GTT GAA CTG ATG TCA GGG AAT AAA CTT CTG GAG AGG 410
Arg Leu Ala Val Glu Leu Met Ser Gly Asn Lys Leu Leu Glu Arg
110 115 120
ACG GAC TTT ACC AAA ATG TAC TTG CTG TTT AAT CCC TGG TGC AAA 455
Thr Asp Phe Thr Lys Met Tyr Leu Leu Phe Asn Pro Trp Cys Lys
125 130 135
GAA GAT GCC GTG TAC CTC CCT GAT GAG TGT CTG CTC AAG GAA TAC 500
Glu Asp Ala Val Tyr Leu Pro Asp Glu Cys Leu Leu Lys Glu Tyr
140 145 150
ATT ATG AAC GAG AAT GGT CGC ATT TTC ACT GGG AGT GCG GAT TGG 545
Ile Met Asn Glu Asn Gly Arg Ile Phe Thr Gly Ser Ala Asp Trp
155 160 165
ATG AGT GGG TTG CCA TGG AAT TTC GGA CAG TTT GAA GAT AAT GTG 590
Met Ser Gly Leu Pro Trp Asn Phe Gly Gln Phe Glu Asp Asn Val
170 175 180
ATG GAC ATC TGC TTT GAG ATC CTT GAC CGC TTT AAC CCA GCG AGG 635
Met Asp Ile Cys Phe Glu Ile Leu Asp Arg Phe Asn Pro Ala Arg
185 190 195
TCA GAC CCC CCA AGC GAC ATG CTT CAG CGA TGG GAC CCT GTC TAC 680
Ser Asp Pro Pro Ser Asp Met Leu Gln Arg Trp Asp Pro Val Tyr
200 205 210
ATC AGC AGG GCA GTC GTT GCC ATG GTG AAT GCC AAC GAT GAT GAC 725
Ile Ser Arg Ala Val Val Ala Met Val Asn Ala Asn Asp Asp Asp
215 220 225
GGT GGA GTC GTG GTG GGT CGA TGG CAG GAA CCT TAC ACA GGT GGA 770
Gly Gly Val Val Val Gly Arg Trp Gln Glu Pro Tyr Thr Gly Gly
230 235 240
GTA CAG CCA ACC AAA TGG ATG AGC AGT GTG CCC ATC CTG GAA GAG 815
Val Gln Pro Thr Lys Trp Met Ser Ser Val Pro Ile Leu Glu Glu
245 250 255
TGG AGC AAA TCA AAG TCT GGA GTG AAA TAT GGC CAA TGC TGG GTG 860
Trp Ser Lys Ser Lys Ser Gly Val Lys Tyr Gly Gln Cys Trp Val
260 265 270
TTT GCA GCC GTG GCC TGC ACA GTG ATG CGA TGC CTG GGC ATC CCC 905
Phe Ala Ala Val Ala Cys Thr Val Met Arg Cys Leu Gly Ile Pro
275 280 285
ACA CGC TGC ATC ACC AAC TTT CAG TCG GCC CAT GAC ACA GAC GGA 950
Thr Arg Cys Ile Thr Asn Phe Gln Ser Ala His Asp Thr Asp Gly
290 295 300
AAC CTC TCC ATC GAC CGA GTG TAC AAC ATA CAT AGG CAG CTA GTT 995
Asn Leu Ser Ile Asp Arg Val Tyr Asn Ile His Arg Gln Leu Val
305 310 315
GAC GGT GAT GAC AGT ATC TGG AAC TTT CAT TGT TGG ATC GAG TCT 1040
Asp Gly Asp Asp Ser Ile Trp Asn Phe His Cys Trp Ile Glu Ser
320 325 330
TAC ATG CAG AGA GAA GAT CTA CCT GAA GGA TAT GGT GGC TGG CAA 1085
Tyr Met Gln Arg Glu Asp Leu Pro Glu Gly Tyr Gly Gly Trp Gln
335 340 345
GTC TTG GAC CCC ACA CCT CAG GAG AGG AGT AGT GGT ATG TTT CGC 1130
Val Leu Asp Pro Thr Pro Gln Glu Arg Ser Ser Gly Met Phe Arg
350 355 360
TGT GGC CCA TGT CCT TTG AAG GCC ATT AAA GAA GGG GAC CTC AAT 1175
Cys Gly Pro Cys Pro Leu Lys Ala Ile Lys Glu Gly Asp Leu Asn
365 370 375
GTG AAG TTT GAT GTT CCA TTT GTC TTT GCT GAG GTG AAT GCA GAC 1220
Val Lys Phe Asp Val Pro Phe Val Phe Ala Glu Val Asn Ala Asp
380 385 390
ATC ATC AAT TGG GAA ATC AGA CCA GAC GGT CAG CGA AAG CGG CTT 1265
Ile Ile Asn Trp Glu Ile Arg Pro Asp Gly Gln Arg Lys Arg Leu
395 400 405
TCA TCC AAC TCT GCA AAT GTG GGG AGG AAC ATT AGC ACC AAA AGT 1310
Ser Ser Asn Ser Ala Asn Val Gly Arg Asn Ile Ser Thr Lys Ser
410 415 420
CCT TAT GGT AAC GAG AGG GAA GAT ATA ACC CAT CAG TAC AAG TAC 1355
Pro Tyr Gly Asn Glu Arg Glu Asp Ile Thr His Gln Tyr Lys Tyr
425 430 435
CAA GAA GGT TCA GCC AAG GAG CGG GAG GTG TAC AAC AAG GCA GGG 1400
Gln Glu Gly Ser Ala Lys Glu Arg Glu Val Tyr Asn Lys Ala Gly
440 445 450
CGG CGC ATC TCC GGG CCG GAT GGA GAA GAG GAA TCA AAA CCA GGA 1445
Arg Arg Ile Ser Gly Pro Asp Gly Glu Glu Glu Ser Lys Pro Gly
455 460 465
AAC GTG CAG CTG GAG ATC AAG CAC GCC AAA CCT GTG TTC GGG ACC 1490
Asn Val Gln Leu Glu Ile Lys His Ala Lys Pro Val Phe Gly Thr
470 475 480
GAC TTT GAC GTC ATC TTT GAG TTG GAG AAC ATG GGA GAC AAA GAA 1535
Asp Phe Asp Val Ile Phe Glu Leu Glu Asn Met Gly Asp Lys Glu
485 490 495
GTC AGC TGC AAA TTA AAC ATG ATG TCA GAG GCT GTC ACC TAT AAC 1580
Val Ser Cys Lys Leu Asn Met Met Ser Glu Ala Val Thr Tyr Asn
500 505 510
TCA GTT CAC CTT GGA CGG TTC CAG AAC AGC ACG GTC AAT GTT GTC 1625
Ser Val His Leu Gly Arg Phe Gln Asn Ser Thr Val Asn Val Val
515 520 525
ATT CCT GCT CAC AAA GTC CAC AGT GAG ACG GTG CGT CTA CTC TAC 1670
Ile Pro Ala His Lys Val His Ser Glu Thr Val Arg Leu Leu Tyr
530 535 540
ACT AAG TAT GCC TCA GTT GTC AGC GAG CAC AAC ATC ATC CGG GTG 1715
Thr Lys Tyr Ala Ser Val Val Ser Glu His Asn Ile Ile Arg Val
545 550 555
ACA GGG GTG GCG GAA GTG TCC GGC CAG GAA AAA TCC ATC CTG GAG 1760
Thr Gly Val Ala Glu Val Ser Gly Gln Glu Lys Ser Ile Leu Glu
560 565 570
ATG GTC AAC ATC CCA CTG AGC AAG CCC AAA CTC AGT ATT AAG GTT 1805
Met Val Asn Ile Pro Leu Ser Lys Pro Lys Leu Ser Ile Lys Val
575 580 585
CCT GGC TGG GTG ATT TTA AAT AGG AAA ATC ACC ACC TTC ATC TCC 1850
Pro Gly Trp Val Ile Leu Asn Arg Lys Ile Thr Thr Phe Ile Ser
590 595 600
TTC ACC AAT CCA TTG CCA GTG CCA CTG AAC CGA GGA GTG TTC ACT 1895
Phe Thr Asn Pro Leu Pro Val Pro Leu Asn Arg Gly Val Phe Thr
605 610 615
GTT GAA GGG GCT GGC CTA CTT CCC ACC AAA GAG ATC CGC ATT TCT 1940
Val Glu Gly Ala Gly Leu Leu Pro Thr Lys Glu Ile Arg Ile Ser
620 625 630
GGT AGC ATC GCT CCA GGC CAG C 1962
Gly Ser Ile Ala Pro Gly Gln
635 640
配列番号:53
配列の長さ:4
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:54
配列の長さ:6
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:55
配列の長さ:6
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:56
配列の長さ:7
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:57
配列の長さ:12
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:58
配列の長さ:7
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:59
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:60
配列の長さ:10
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:61
配列の長さ:6
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:62
配列の長さ:6
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:63
配列の長さ:4
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:64
配列の長さ:9
配列の型:アミノ酸
トポロジー:直鎖状
配列の種類:ペプチド
フラグメント型:中間型フラグメント
起源
生物名:魚類
配列番号:65
配列の長さ:30
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
TTGGAAGCTT GTAAGAGCAA CTCTTGGAAA 30
配列番号:66
配列の長さ:25
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
TTGTACACTC GATCGATGGA GAGGT 25
配列番号:67
配列の長さ:24
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
TCTGCTTTGG GATCCTTGAC CGCT 24
配列番号:68
配列の長さ:23
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
TGAAGGAGAG CTCCACAGAC ACA 23
配列番号:69
配列の長さ:20
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
ATGATGTCAA AGGCTGTCAC 20
配列番号:70
配列の長さ:20
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
TCTTACCATA TAAGTTGTAA 20
配列番号:71
配列の長さ:20
配列の型:核酸
鎖の数:一本鎖
トポロジー:直鎖状
配列の種類:他の核酸 合成DNA
配列
ATTGATTAAC AACAAAATGG 20
【図面の簡単な説明】
【図1】 取得したマダイのトランスグルタミナーゼを
コードする遺伝子を有するcDNAを保持するプラスミ
ドpSLTG5の制限酵素地図
【図2】 スケソウダラのトランスグルタミナーゼをコ
ードする遺伝子を有するcDNAクローン間の相関関係
及びcDNAの制限酵素地図
【図3】 マダイトランスグルタミナーゼcDNAの発
現プラスミドpIL6TG1の構築工程図及び制限酵素
図
【図4】 化学合成DNA−1の塩基配列表示図大腸菌
のコンセンサスSD(シャイン-ダルガルノ)配列及
び、マダイトランスグ ルタミナーゼのアミノ末端であ
るメチオニンから32番目のロイシンまでをコードする
DNA塩基配列を示す。
【図5】 マダイトランスグルタミナーゼcDNAの発
現プラスミドpTTG2ー22の構築のためのプラスミ
ドpFTGN6の構築工程図
【図6】 マダイトランスグルタミナーゼcDNAの発
現プラスミドpTTG2ー22の構築のためのDNA断
片A、B,Cの取得工程図
【図7】 プラスミドpTTG1の構築工程図
【図8】 マダイトランスグルタミナーゼcDNAの発
現プラスミドpTTG2ー22の構築工程図
【図9】 マダイトランスグルタミナーゼcDNAの酵
母での発現プラスミドpYSTG1の構築工程図
【図10】スケソウダラ筋肉由来トランスグルタミナー
ゼcDNAクローンの制限酵素地図
【図11】ヒラメトランスグルタミナーゼをコードする
cDNAの制限酵素地図
【図12】ヒラメトランスグルタミナーゼをコードする
cDNA断片を有するプラスミド
【図13】 スケソウダラ由来トランスグルタミナーゼ
(FTG)とモルモット由来トランスグルタミナーゼ
(MTG)の温度安定性比較
○−○、FTGの相対残存活性 ●−●、MTGの相
対残存活性
【図14】 スケソウダラ由来トランスグルタミナーゼ
(FTG)とモルモット由来トランスグルタミナーゼ
(MTG)のミオシンH鎖重合化反応における反応性比
較
△−△、FTG ○−○、MTG ●−●、無添加
対照
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(51)Int.Cl.7 識別記号 FI
C12N 9/10 C12R 1:19
C12P 21/02 C12N 15/00 ZNAA
//(C12N 9/10 5/00 A
C12R 1:19)
(72)発明者 松井 裕
神奈川県川崎市川崎区鈴木町1−1 味
の素株式会社 中央研究所内
(56)参考文献 Chemical Abstract
s,Vol.113,No.21(1990),
abstract no.189898q
(58)調査した分野(Int.Cl.7,DB名)
C12N 15/00 - 15/54
C12N 9/10
GenBank/EMBL/DDBJ/G
eneSeq
SwissProt/PIR/GeneS
eq