JP2019527246A - 生体分子をコンジュゲートするためのアズラクトン官能化基材 - Google Patents
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Abstract
Description
タンパク質および抗体マイクロアレイなどの測定アッセイまたはプラットフォームでは、標的分子の高い忠実度(例えば、感度および特異性)を達成することは、非常に重要である。アッセイにおけるサンプルは、核酸、タンパク質、生物学的細胞および小分子などの生体分子、血液、血清、唾液および尿などの他のヒト体液に加えて、さらにはミルク、ベビーフードまたは水などの消耗品であり得る。サンプルとは無関係に、アッセイの基材への標的分子の効率的なコンジュゲーションは、これらのアッセイにおいてより高い忠実度を達成するのに役立ち得る。
によって表され得る。
本発明の特定の例示的な実施形態の概要を以下に記載する。これらの態様は、これらの特定の実施形態の簡単な概要を読者に提供するために提示されているにすぎず、これらの態様は、本発明の範囲を限定するものではないことが理解されるべきである。実際に、本発明は、以下に記載されていない様々な態様を包含し得る。
乾燥ジクロロメタン(DCM)中の、N3−PEG1K−CO2H(200mg、0.20ミリモル、1.0当量)、1−エチル−3−[3−ジメチルアミノプロピル]カルボジイミド塩酸塩(EDC)(37mg、0.24ミリモル、1.2当量)およびヨードアニリン(52mg、0.24ミリモル、1.2当量)の混合物を、アルゴン下にて室温で12時間撹拌した。反応を水でクエンチし、有機層を分離した。水層をDCMで3回抽出し、かつ合わせた有機部分を硫酸マグネシウム(MgSO4)で乾燥させた。溶液を減圧下で濃縮して粗油状物を得て、これをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(0〜10%のメタノール/DCM)で精製すると、柔らかい白色固体(225mg、82%)が得られた。
薄層クロマトグラフィー(TLC)における生成物の保持係数(Rf)は、以下の通りである:TLC Rf=0.5(10%のMeOH/DCM)。
パラジウム触媒「Quin2Pd」を、Cuiら、”Pd(quinoline-8-carboxylate)2 as a Low-Priced, Phosphine-Free Catalyst for Heck and Suzuki Reactions”, Journal of Organic Chemistry, 72:9342(2007年)に記載されているような手順に従って合成した。
薄層クロマトグラフィーにおける生成物の保持係数は、以下の通りである:TLC Rf=0.4(10%のMeOH/DCM)。
5mLのジメチルスルホキシド(DMSO)および5mLの脱イオン(DI)水中のアジド−PEG−アズラクトンの溶液(3mg/mL)に、0.52mLの1.0mMのクリックケミストリーのストック溶液(1.5mgのCuSO4・5H2O、6mgのアスコルビン酸ナトリウム、4μLのトリエチルアミン、3mLのDMSO、および3mLのDI水)を添加した。アルキン基で官能化されたスライドを、この溶液中に、室温で12時間穏やかに振とうしながら浸漬した。PEG化スライドをDI水ですすぎ、スピン乾燥させた。
以下に図示するように、多糖を酸化して、アズラクトンとのさらなる官能化に適したカルボン酸基を生成した。多糖鎖(構造7)上の第一級アルコールの一部を、白金上の酸素を用いて、または触媒としてTEMPO((2,2,6,6−テトラメチルピペリジン−1−イル)オキシルもしくは(2,2,6,6−テトラメチルピペリジン−1−イル)オキシダニル)および塩基性pHの次亜塩素酸ナトリウム(NaOCl)を用いてのいずれかで、カルボン酸基に変換すると、構造(8)が得られた(Cumpstey, I., ISRN Organic Chemistry, Article ID 417672(2013年)を参照)。次に、カルボン酸基を、ハロゲン化(臭化またはヨウ化)アリールまたはビニル官能基に変換し、構造9を得て、続いてビニルジアルキルアズラクトンを、パラジウム触媒カップリングによって結合させると、所望のアズラクトン官能化材料(構造10)が生成した。
リン酸緩衝生理食塩水(PBS)中に0.1%のポリビニルアルコールを含有する緑色蛍光タンパク質(GFP)の200mg/mL溶液を、室温および相対湿度55%でピン印刷法を用いて基材上にスポットした。スポットをデシケーター中で12時間乾燥させ、次いでスライドをPBS−TweenおよびPBSですすぎ、結合していないタンパク質を除去した。基材に共有結合したGFPの相対量を、表面上のタンパク質の蛍光強度を測定することによって求めた。アズラクトン官能化スライドの蛍光強度は、NHSエステル官能化スライドと比較して2.5倍高かった(図4を参照)。蛍光強度でスポット全体を見ることにより、スライドのモルホロジーを比較した。アズラクトン官能化表面上のタンパク質のスポットは均一である(図5B)のに対し、NHS官能化表面上のスポットは特徴的なコーヒーリングモルホロジーを示した(図5Aを参照)。
表面上に同じ密度の官能基を含むアジド−PEG−アズラクトンおよびアジド−PEG−NHSで官能化されたガラス基材を、pH7.4でリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中の免疫グロブリンG(IgG)の溶液に最大6時間曝した。この溶液を除去し、PBS−TweenおよびPBSでスライドをすすいだ後、これらの基材に共有結合したIgGの相対量を、表面上のタンパク質の蛍光強度を測定することによって求めた。6時間のインキュベーション後、アズラクトン官能化スライドの蛍光強度は、NHSエステル官能化スライドの蛍光強度と比較して5倍高かった(図6を参照のこと)。
200 被覆基材、 202 基材、 204 ポリマー層、 206 第1のポリマー、 208 アズラクトン官能基、 210 アジド基、 212 リンカー基、
300 マイクロアレイ、 302 基材、 304 ポリマー層、 306 1つ以上のポリマー、 308 アズラクトン官能基、 310 アジド基、 312 リンカー基、 314 個別領域、
16 NHS官能化表面、 17 中間構造、 18 アズラクトン官能化表面、
19 アルデヒド官能化表面、 20 アズラクトン官能化表面
Claims (27)
- 二官能性ポリマーであって、
(a)アジド、カルボン酸、チオール、アミン、ヒドロキシル、ヒドラジン、シリル、ホスホネート、アルキン、カテコール、およびリジンからなる群から選択されるアンカー基;
(b)ポリエチレングリコールまたは多糖を含む1つ以上の第1のポリマーを含む、ポリマーブロック;
(c)フェニル、ビニル、ベンジル、およびアルキルからなる群から選択されるリンカー基;および
(d)R1およびR2を有し、ここで、R1およびR2が、それぞれ独立して、水素、アルキル、およびアリールからなる群から選択されるアズラクトン末端基
を含む、前記二官能性ポリマー。 - 前記1つ以上の第1のポリマーは、ポリリジン、ポリオキサゾリン、ポリメチルメタクリレート、ポリ−N−イソプロピルアクリルアミド、ポリドーパミン、ポリアルカン、およびN−置換グリシンポリマーからなる群から選択される第2のポリマーとのコポリマーである、請求項1記載の二官能性ポリマー。
- 被覆基材であって、
(a)基材;および
(b)1つ以上の第1のポリマーと、前記1つ以上の第1のポリマーのそれぞれの第1の末端に結合された1つ以上のアズラクトン官能基と、前記1つ以上の第1のポリマーのそれぞれの第2の末端に結合された1つ以上のアジド基とを含む、ポリマー層、ここで、前記1つ以上のアジド基は、前記ポリマー層を前記基材に結合させる
を含む、前記被覆基材。 - 前記基材は、ガラス、シリカ、プラスチック、炭素、金属、および金属酸化物からなる群から選択される、請求項3記載の被覆基材。
- 前記ポリマー層は、線状ポリマー、マルチアームポリマー、ブラシポリマー、またはナノ粒子を含む、請求項3記載の被覆基材。
- 前記1つ以上の第1のポリマーは、ポリエチレングリコールまたは多糖を含む、請求項3記載の被覆基材。
- 前記1つ以上の第1のポリマーは、ポリリジン、ポリオキサゾリン、ポリメチルメタクリレート、ポリ−N−イソプロピルアクリルアミド、ポリドーパミン、ポリアルカン、およびN−置換グリシンポリマーからなる群から選択される第2のポリマーとのコポリマーである、請求項6記載の被覆基材。
- 複数の個別領域を含み、前記個別領域がそれぞれ被覆基材を有するマイクロアレイであって、前記被覆基材は、
(a)基材;および
(b)1つ以上のポリマーと、前記1つ以上のポリマーのそれぞれの第1の末端に結合された1つ以上のアズラクトン官能基と、前記1つ以上のポリマーのそれぞれの第2の末端に結合された1つ以上のアジド基とを含むポリマー層、ここで、前記1つ以上のアジド基は、前記ポリマー層を前記基材に結合させる
を含む、前記マイクロアレイ。 - 二官能性ポリマーの製造方法であって、
(a)ポリマーを準備すること、ここで、前記ポリマーは、前記ポリマーの第1の末端に結合された1つ以上のカルボン酸基または活性化エステル基と、前記ポリマーの第2の末端に結合された1つ以上のアジド基とを有する;
(b)少なくとも1つのカルボン酸基または活性化エステル基を、ハロゲン化アリール基またはハロゲン化ビニル基に変換すること;および
(c)ビニルジアルキルアズラクトンを、前記ハロゲン化アリール基またはハロゲン化ビニル基に結合すること
を含む、二官能性ポリマーの製造方法。 - 前記ポリマーが、ポリエチレングリコールである、請求項9記載の方法。
- 前記ビニルジアルキルアズラクトンを、パラジウム触媒、1種以上の溶媒、および塩基を用いてカップリング反応によって結合させる、請求項9記載の方法。
- 前記パラジウム触媒は、パラジウム(II)キノリン−8−カルボキシレート、パラジウム(II)クロリド、パラジウム(II)ブロミド、パラジウム(II)アセテート、パラジウム(II)アセトアセテート、ビス(ジベンジリデンアセトン)パラジウム(0)、トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム(0)、パラジウム(II)トリフルオロアセテート、アリルパラジウム(II)クロリドダイマー、ビス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(II)ジクロリド、ジクロロビス(トリシクロヘキシルホスフィン)パラジウム(II)、および[1,1’−ビス(ジ−tert−ブチルホスフィノ)フェロセン]ジクロロパラジウム(II)からなる群から選択される、請求項11記載の方法。
- 前記1種以上の溶媒は、ジメチルホルムアミド、ジメチルスルホキシド、トルエン、テトラヒドロフラン、ジオキサン、ジクロロメタン、アセトニトリル、およびアルコールからなる群から選択される、請求項11記載の方法。
- 前記塩基は、炭酸カリウム、炭酸ナトリウム、トリエチルアミン、N,N−ジイソプロピルエチルアミン、4−(ジメチルアミノ)ピリジン、カリウムtert−ブトキシド、およびナトリウムtert−ブトキシドからなる群から選択される、請求項11記載の方法。
- 二官能性ポリマーを基材に結合させる方法であって、
(a)アルキン官能基を含む基材を準備すること;
(b)前記二官能性ポリマー、1種以上の溶媒、触媒、塩基、および還元剤を含む混合物を準備すること;および
(c)前記基材を前記混合物と接触させること
を含み、
ここで、前記二官能性ポリマーは、ポリマー、前記ポリマーの第1の末端に結合された1つ以上のアズラクトン官能基、および前記ポリマーの第2の末端に結合された1つ以上のアジド基を含む、前記方法。 - 前記ポリマーは、ポリエチレングリコールである、請求項15記載の方法。
- 前記1種以上の溶媒は、ジメチルホルムアミド、ジメチルスルホキシド、トルエン、テトラヒドロフラン、ジオキサン、アセトニトリル、および水からなる群から選択される、請求項15記載の方法。
- 前記触媒は、銅(II)塩または銅(I)塩を含む、請求項15記載の方法。
- 前記触媒は、硫酸銅、臭化銅、およびヨウ化銅からなる群から選択される、請求項18記載の方法。
- 前記触媒は、ルテニウム触媒を含む、請求項15記載の方法。
- 前記触媒は、ペンタメチルシクロペンタジエニルビス(トリフェニルホスフィン)ルテニウム(II)クロリド、ペンタメチルシクロペンタジエニル(シクロオクタジエニル)ルテニウム(II)クロリド、およびペンタメチルシクロペンタジエニル(ノルボルナジエン)ルテニウム(II)クロリドからなる群から選択される、請求項20記載の方法。
- 前記塩基は、トリエチルアミン、N,N−ジイソプロピルエチルアミン、4−(ジメチルアミノ)ピリジン、ピリジン、キノロン、フェナントロリン、およびイミダゾールからなる群から選択される、請求項15記載の方法。
- 前記還元剤は、アスコルビン酸ナトリウム、トリス(トリアゾール)アミン、およびヒドロキノン類からなる群から選択される、請求項15記載の方法。
- 対象の生体分子を単離する方法であって、
(a)基材と、1つ以上のポリマーと、前記1つ以上のポリマーのそれぞれの第1の末端に結合された1つ以上のアズラクトン基と、前記1つ以上のポリマーのそれぞれの第2の末端に結合された1つ以上のアジド基とを含む官能化基材を準備すること、ここで、前記1つ以上のアジド基は、前記1つ以上のポリマーのそれぞれを前記基材に結合させる;
(b)水溶液を準備すること、ここで、前記水溶液は、前記対象の生体分子を含有する;ならびに
(c)前記官能化基材を前記水溶液と期間にわたって接触させ、ここで、前記期間の間に、前記対象の生体分子を前記アズラクトン基に結合させること
を含む、前記方法。 - 前記水溶液は、さらに添加剤を含み、前記添加剤は、グリセロール、オリゴエチレングリコール、ポリエチレングリコール、界面活性剤、ポリビニルアルコール、糖、有機溶媒、および無機塩からなる群から選択される、請求項24記載の方法。
- 前記水溶液のpHレベルは、約2〜約10の範囲にある、請求項24記載の方法。
- 前記官能化基材と前記水溶液との前記接触は、ジェット印刷、ピン印刷、クイル印刷、バイオロジカルレーザー印刷、キャピラリーに基づくフルイディクス、または浸漬によって達成される、請求項24記載の方法。
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