JP2013535970A - Fabグリコシル化抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、抗体の分野に関する。特に、高度にシアリル化されたグリカンをそれらのFab部分に結合させた抗体が提供される。さらに、本発明は、それらのFabシアリル化を介して、抗体の循環半減期を制御する方法も提供する。
今日、抗体は、医療および研究の分野で広く用いられる薬剤である。医療では、抗体が、多くの異なる分野で適用されている。例えば、抗体は、疾患の診断および/もしくは予後診断、または例えば、特定のホルモンの存在もしくは濃度など、特定の体内パラメータの決定を可能とする特定のマーカーを検出するための標識化薬剤として用いられている。
(a)循環半減期を延長するために、
(a1)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖(carbohydrate)中のシアル酸量を増大させるステップ、および/あるいは
(a2)抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する1またはそれより多くのグリコシル化部位を除去するステップ、および/あるいは
(a3)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のフリーのガラクトース単位量を減少させるステップ、あるいは
(b)循環半減期を短縮するために、
(b1)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を減少させるステップ、および/あるいは
(b2)抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に1またはそれより多くのグリコシル化部位を導入するステップ、および/あるいは
(b3)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のフリーのガラクトース単位量を増大させるステップ
を含む方法を対象とする。
本明細書で用いられる通り、以下の表現は一般に、それらが用いられる文脈が他の内容を示す場合を除き、以下に示す意味を有することが好ましいことを意図する。
本発明は、(先行技術の教示とは対照的に)そのFab部分にグリコシル化部位を有する抗体のFab部分に付いている糖鎖中のシアル酸残基量が、前記抗体の循環半減期に対して決定的であり、したがって、前記抗体のバイオアベイラビリティーに対して決定的であるという知見に基づく。特に、Fab部分のシアリル化が高度であると、患者の循環内で、抗体の半減期が結果として延長される。同様に、Fab部分のシアリル化が低度であると、循環半減期が短縮される。しかしまた、抗体のFab部分におけるグリコシル化部位を除去し、これにより、Fabのグリコシル化を全て解除すると、抗体の循環半減期が、Fab部分のシアリル化度が中程度である〜高い抗体の循環半減期と同等になることも判明した。したがって、シアリル化が低度な抗体の循環半減期は、シアル酸量を増大させることにより延長しうるだけでなく、それぞれのグリコシル化部位が存在する場合、その抗体のFab部分におけるグリコシル化部位を除去することによってもまた延長することができる。さらに、本発明者らは、驚くべきことに、Fab部分のグリコシル化部位におけるシアル酸含量を調整することが、抗体の抗原結合または抗原特異性に影響を及ぼさないことが多く、さらにまた、そのADCC活性およびCDC活性など、抗体の下流における生物学的活性に対しても負の影響を及ぼさないことも見出した。シアル酸含量の変化が、抗原結合に負の影響を及ぼす場合はまた、Fab部分におけるグリコシル化部位を除去して、循環半減期を延長することも可能であり、かつ/またはさらなるグリコシル化部位を、Fab部分における別の位置に導入し、この新規に導入されたFabのグリコシル化部位のシアル酸含量を、本明細書で教示する通りに調整することもできる。本発明者らにより見出されたさらなる利点は、Fab部分のグリコシル化部位におけるシアリル化を増大させながら、同時に、Fc部分におけるシアリル化は最小限度に保つ可能性である。したがってまた、抗体のADCC活性およびCDC活性が、Fab部分のシアリル化を増大させることにより影響を受けることもない。
これらの知見に照らして、本発明は、抗体組成物における抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の循環半減期を制御する方法であって、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分において存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を調整するステップ、および/あるいは1またはそれより多くのグリコシル化部位を、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分において除去または導入するステップを含む方法を提供する。したがってまた、抗体の意図される使用との関連で調整される循環半減期をもたらすことも可能である。これにより、化学修飾(PEGまたはHESなど)または融合タンパク質を用いる必要なしに、抗体の循環半減期を調整するための柔軟性がもたらされる。
(a)循環半減期を延長するために、
(a1)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を増大させるステップ、および/あるいは
(a2)抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する1またはそれより多くのグリコシル化部位を除去するステップ、および/あるいは
(a3)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のフリーのガラクトース単位量を減少させるステップ、あるいは
(b)循環半減期を短縮するために、
(b1)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を減少させるステップ、および/あるいは
(b2)抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に1またはそれより多くのグリコシル化部位を導入するステップ、および/あるいは
(b3)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のフリーのガラクトース単位量を増大させるステップ
を含む方法を提供する。
本発明による抗体またはその断片もしくは誘導体の循環半減期を延長するためには、組成物中に含まれる抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分における1またはそれより多くのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を増大させることができる。
本発明による抗体またはその断片もしくは誘導体の循環半減期を短縮するためには、組成物中に存在する抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分における1またはそれより多くのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を減少させることができる。
抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在するか、またはこのFab部分に導入されるかもしくはこのFab部分から除去される、1またはそれより多くのグリコシル化部位は、N−グリコシル化部位および/またはO−グリコシル化部位であり、好ましくはN−グリコシル化部位であり、より好ましくは、アミノ酸配列Asn Xaa Ser/Thrを有し、この場合、Xaaが、好ましくはPro以外の任意のアミノ酸である、N−グリコシル化部位である。グリコシル化部位は、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分のいずれに位置させることもできる。しかし、グリコシル化部位は、重鎖可変領域または軽鎖可変領域、好ましくは重鎖可変領域に位置させることが好ましい。特に、グリコシル化部位は、重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域のフレームワーク領域および/またはCDR、好ましくはフレームワーク領域に存在させることができる。しかし、1またはそれより多くのグリコシル化部位はまた、Fab部分の定常領域、特に、重鎖定常領域1に位置させることもできる。
本発明による方法において用いられる抗体は、天然抗体、ポリクローナル抗体もしくはモノクローナル抗体、操作抗体、キメラ抗体、またはヒト化抗体を含め、任意の抗体でありうる。それは、ヒト抗体、マウス抗体、ラット抗体、ヤギ抗体、霊長動物抗体、またはラクダ抗体でありうる。抗体は、ヒト抗体、キメラ抗体、またはヒト化抗体であることが好ましい。抗体は、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、またはIgA2など、任意のサブクラスを含めた、IgG、IgE、IgA、IgD、およびIgMなど、任意のクラスの抗体でありうる。抗体は、IgG抗体であることが好ましく、IgG1抗体またはIgG2抗体であることがより好ましく、IgG1抗体であることが最も好ましい。
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸85位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含むキメラまたはヒト化抗EGFR抗体でありうる。
(i)配列番号7のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号9のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号11のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号12のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸54位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む、キメラまたはヒト化抗TA−Muc1抗体でありうる。
(i)配列番号15のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号16のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号17のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号19のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号20のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる重鎖可変領域のうちのアミノ酸60位のFab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位のFc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗CD52抗体でありうる。
(i)配列番号21のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号22のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号23のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号24のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号25のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号26のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸55位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗Aβ抗体でありうる。
(i)重鎖および軽鎖の各々のうちの可変領域および第1の定常ドメインからなる一価断片であるFab断片、
(ii)ヒンジ領域においてジスルフィド架橋により連結された2つのFab断片を含む二価断片であるF(ab)2断片、
(iii)重鎖の可変領域および第1の定常ドメインCH1からなるFd断片、
(iv)抗体の単一のアームの重鎖可変領域および軽鎖可変領域からなるFv断片、
(v)単一のポリペプチド鎖からなるFv断片であるscFv断片、
(vi)共有結合的に連結された2つのFv断片からなる(Fv)2断片、
(vii)重鎖可変ドメイン、および
(viii)重鎖可変領域と軽鎖可変領域との会合が、分子間だけで生じることが可能であり、分子内で生じることは可能でない形で共有結合的に連結された、重鎖可変領域および軽鎖可変領域からなる多重抗体と
からなる群から選択される。
好ましい実施形態では、その循環半減期が本発明による方法を介して制御され、それが本発明による抗体組成物中に含まれる、抗体またはその断片もしくは誘導体が、この抗体またはその断片もしくは誘導体に特定の所望の特性をもたらす、さらなるグリコシル化特徴を有する。
本発明の好ましい実施形態では、循環半減期を延長した抗体は、生物学的活性も加えて増強されている。この点における抗体の生物学的活性には、例えば、ADCCおよびCDCが含まれる。生物学的活性の増強は、主に、グリコシル化パターンの最適化、特に、抗体のFc部分におけるグリコシル化パターンの最適化により達成される。例えば、IgG型の抗体のADCC活性は、抗体の、そのFc部分によるFcγ受容体、特に、FcγRIIIaへの結合により媒介される。FcγRIIIaは、ナチュラルキラー(NK)細胞およびマクロファージにおいて発現し、抗体により活性化されると、サイトカインおよび細胞傷害性顆粒の放出を誘導し、この結果として、抗体が結合した標的細胞のアポトーシスをもたらす。抗体のFcγ受容体に対する結合アフィニティーは、抗体のFc部分におけるグリコシル化部位に付いている糖による影響を受ける。したがって、抗体のFc部分におけるグリコシル化パターンを最適化すると、結果として、FcγRIIIaへのより強力な結合がもたらされ、このため、ADCC活性の増強がもたらされる。
第二の態様では、本発明が、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む抗体組成物であって、抗体またはその断片もしくは誘導体が、それらのFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位を含むことを特徴とし、組成物において、抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に付いている糖のうちの少なくとも65%が、少なくとも1つの末端シアル酸残基を保有し、かつ/あるいは抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に付いている糖のうちの35%未満が、少なくとも2つのフリーのガラクトース単位を保有することを特徴とする抗体組成物を提供する。抗体組成物の好ましい特徴、および、特に、好ましいグリコシル化パターンは、グリコシル化パターンと共に上記で記載されており、下記でも記載される。
(i)抗体が、Kabatの番号付けによる重鎖可変領域のうちのアミノ酸85位のFab部分に存在するグリコシル化部位を含み、組成物において、Fab部分に存在する前記グリコシル化部位に付いている糖のうちの少なくとも65%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも75%、より好ましくは少なくとも80%が、少なくとも1つの末端シアル酸残基を保有すること、または
(ii)抗体が、Fab部分においてグリコシル化部位を含まないこと
を特徴とする抗体組成物を提供する。
(i)配列番号15のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号16のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号17のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号19のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号20のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸60位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗CD52抗体でありうる。
(i)配列番号21のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号22のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号23のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号24のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号25のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号26のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸55位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗Aβ抗体でありうる。
(a)Fab部分においてグリコシル化部位を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体(基準抗体)をコードする核酸を供給するステップと、
(b)コードされた抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体のFab部分におけるグリコシル化部位が除去されるように、変異を核酸へと導入するステップと
を含む方法を提供する。
(a)Fab部分においてグリコシル化部位を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体(基準抗体)をコードする核酸を供給するステップと、
(b)コードされた抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体のFab部分におけるグリコシル化部位が除去されるように、変異を核酸へと導入するステップと、
(c)ステップ(b)において得られた核酸を宿主細胞において発現させて、Fab部分においてグリコシル化部位を含まず、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の循環半減期が、Fab部分においてグリコシル化部位を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体より長い、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体をもたらすステップと
を含む方法を提供する。
(a)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体(基準抗体)をコードする核酸を供給するステップと、
(b)コードされた抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体のFab部分に少なくとも1つのさらなるグリコシル化部位が導入されるように、変異を核酸へと導入するステップと
を含む方法をさらに提供する。
(a)抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体(基準抗体)をコードする核酸を供給するステップと、
(b)コードされた抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体のFab部分に少なくとも1つのさらなるグリコシル化部位が導入されるように、変異を核酸へと導入するステップと、
(c)ステップ(b)において得られる核酸を宿主細胞において発現させて、Fab部分において少なくとも1つのさらなるグリコシル化部位を有し、Fab部分において前記少なくとも1つのさらなるグリコシル化部位を有さない抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体より循環半減期が短い抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体をもたらすステップと
を含む方法も提供する。
上記で記載された抗体および抗体組成物、ならびに、特に、上記で記載された抗EGFR抗体組成物および抗Muc1抗体組成物は、グリコシル化パターンが最適化されており、これにより、半減期が延長され、ADCC活性が増大し、ヒト免疫系との適合性が増大しているので、特に有利である。特に、キメラまたはヒト化抗EGFR抗体を含む、本発明による抗体組成物における抗EGFR抗体は、マウスSP2/0細胞において発現させた抗EGFR抗体であるCetuximab(Erbitux)より循環半減期が長く、ADCC活性が大きい。さらに、特に、Galili構造が存在しないため、有害な副作用が軽減されている。このように有利な特徴を組み合わせることにより、有効な処置に必要な抗体用量を低減することがさらに可能となり、これによりまた、有害な副作用の危険性を軽減することも可能となる。さらに、グリコシル化パターンを最適化することにより患者スペクトルが拡張され、これにより、F/FアロタイプおよびF/Vアロタイプの患者を含め、全てのFcγIII受容体型の患者の処置が可能となる。したがって、本発明は、治療プロファイルが改善された抗体組成物、および、特に、治療プロファイルが改善された抗EGFR抗体組成物を提供する。
さらなる態様では、本発明が、所望の循環半減期を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む抗体組成物を生成する方法であって、宿主細胞において抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を発現させるステップを含み、本発明による抗体またはその断片もしくは誘導体の半減期を制御する方法を、前記方法のステップ(a1)、ステップ(a3)、ステップ(b1)、もしくはステップ(b3)を用いて実施し、かつ/または宿主細胞が、ステップ(a2)もしくは(b2)を用いて本発明による抗体またはその断片もしくは誘導体の半減期を制御する方法により得られる抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を発現する方法を提供する。
糖鎖プロファイリング
抗EGFR抗体
ヒト不死化血液細胞系であるGT−5s(Fuc+)に由来するFuc−細胞系において発現させた抗EGFR抗体であるCetuximab、またはマウス細胞系であるSP2/0において発現させた抗EGFR抗体であるCetuximab(Erbitux)のグリコシル化パターンをより詳細に特徴づけるため、糖鎖プロファイリング研究を実施した。ヒト/マウスキメラIgG抗体であるCetuximabは、重鎖可変領域のフレームワーク領域3において1つのN−グリコシル化部位を含み、重鎖定常領域2において1つのN−グリコシル化部位を含む。
同様の糖鎖プロファイリングを、GT−5s細胞において発現させたTA−Muc−1抗体であるPankomab、およびGT−5s細胞に由来するFuc−細胞系において発現させたPankomabについても実施した。重鎖可変領域のCDR2にN−グリコシル化部位を有し、重鎖定常領域2にもN−グリコシル化部位を有する、IgG抗体のヒト化形であるPankomab(hPM)を用いた。
抗原結合研究
抗原ELISA
Maxisorp 96ウェルプレート上に固定化された市販抗原のEGFRにより、抗EGFR抗体であるCetuximabについて特異的な抗原ELISA(酵素免疫測定アッセイ)を開発した。コーティングされたウェルは、PBS中2%のBSAでブロッキングして、抗体の非特異的な結合を防止した。1%のBSA/PBS中で希釈した抗EGFR抗体を、固定化された抗原へとインキュベートして結合させ、酵素で標識された抗ヒトIgG二次抗体により検出した。酵素であるPODにより、基質であるTMBを色素へと転換し、これを、希硫酸による酸性化の後に、450nmにおける測光法により定量した。
センサーチップであるCM5を、アミン結合を介して、市販されるEGFRの細胞外ドメインにより共有結合的にコーティングした。マウスSP2/0細胞において発現させたCetuximab(Erbitux、シアリル化度が低い)と、本発明によりグリコシル化されたCetuximabの2つの調製物とを、リガンド密度を異にしてコーティングした2つのフローセル上を同時に流動させた結果、それぞれ、約25RUおよび100RUのRmaxが得られた。抗EGFR抗体を、広範な濃度(2nM〜1μM)にわたり注入して、結合反応速度を計算した。抗体は2つの結合部位を有するので、二価評価モデルを用いた。結果を表5に示す。Biacore製のシミュレーションソフトウェアであるBIASimulation 2.1において示されうる通り、会合定数ka1および解離定数kd1が、関与性の定数である。したがって、これらの2つの定数を用いて、アフィニティー定数であるKDを計算した。コーティングが極めて低度であるフローセルおよびコーティングがやや高度なフローセルによる全ての実験結果をまとめると、いずれのCetuximab変化形についてのKDも同等であるが、本発明によるCetuximab変化形のKDが、なおわずかに良好であった(KD値が低ければ、より強力な抗原結合が示される)。
フローサイトメトリーにより複数のEGR受容体陽性細胞系を解析して、本発明によりグリコシル化された抗EGFR抗体であるCetuximabの結合特性と、シアリル化度が低いCetuximab(マウスSP2/0細胞において発現させた)の結合特性とを探索し、比較した。略述すると、標的細胞を採取し、濃度の異なる抗EGFR抗体と共にインキュベートした。細胞を洗浄し、暗所、4℃で、Cy3をコンジュゲートした抗ヒトIgG二次抗体と共にインキュベートした。細胞を再度洗浄し、フローサイトメーターであるFACS Canto II(Becton Dickinson)により解析した。生細胞を、それらの散乱特性に基づいてゲーティングし、FACSDiva Software(Becton Dickinson)を用いて陽性細胞の百分率を計算した。
2つの因子:腫瘍細胞における抗体のアフィニティーおよび結合部位数が、抗体の治療的適切性に特に重要である。
結論として述べると、上記の実験は、本発明による抗体のグリコシル化パターンの改善、特に、抗体のFab部分におけるシアリル化度の増大が、その抗原結合特性に負の影響を及ぼさないことを裏付ける。
グリコシル化の異なる抗体の循環半減期
グリコシル化の異なる抗体の循環半減期を調べるため、薬物動態アッセイを実施した。
グリコシル化が異なる抗EGFR抗体によるEGF受容体の阻害
天然リガンド(例えば、EGFまたはTNFアルファ)によりEGFRを活性化すると、受容体の二量体化、細胞内キナーゼドメインの刺激およびリン酸化がもたらされる。核内で誘導されるシグナル伝達カスケードは、これにより細胞増殖を活性化させる。抗EGFR抗体であるCetuximabの1つの作用機構は、EGFRの細胞内キナーゼドメインのEGFにより誘導されるリン酸化の防止であり、これにより、核におけるシグナル伝達が途絶する。これらは、結果として、EGFR陽性細胞系がEGFにより誘導されて増殖することを阻害する。
グリコシル化の異なるCetuximab抗体の、EGFRリン酸化に対する効果を解析するために、EGFRリン酸化アッセイを実施した。略述すると、A431細胞(外陰のヒト類表皮がん細胞系)またはLS174T細胞(ヒト結腸上皮がん細胞)を、24時間にわたる血清枯渇によりEGF飢餓させた。細胞を、異なる濃度の異なるCetuximab変化形(0.1〜10μg/ml)と共に、4時間にわたりインキュベートし、0.1μg/mlのEGFにより15分間にわたり刺激した。細胞の溶解物を調製し、全EGFRおよびリン酸化EGFR(p−EGFR)の含量を、同じウェル内でEGFRとリン酸化されたEGFRとを同時に検出しうる市販のp−EGFR/全EGFRキット(Mesoscale discoveries)を製造元のプロトコールに従って用いて決定した。p−EGFR/全EGFRキットでは、プレートを、ウェルの1つのスポットでは、リン酸化EGFRに特異的な抗体(Tyr1173)であらかじめコーティングし、同じウェルの別のスポットでは、リン酸化EGFRおよび非リン酸化EGFR(全EGFR)を認識する抗体であらかじめコーティングする。ブロッキングおよび洗浄の後、プレートを、溶解物と共にインキュベートし、プレートを洗浄し、結合したEGFRを、Sulfoタグで標識した二次抗体により検出した。SectorImager SI6000(Mesoscale discoveries)により、各スポットについて、電気化学発光を個別に測定した。pEGFRスポットにおけるシグナルの百分率を、全EGFRスポット(同じウェルの)におけるシグナルと比較して計算した。
EGF受容体の細胞外ドメインにCetuximabが結合すると、結果として、リガンド結合が阻害され、これにより、腫瘍細胞のEGF依存的な増殖が低減される。グリコシル化の異なるCetuximab変化形についてこの作用機構を解析するため、A431細胞(外陰のヒト類表皮がん細胞系)の増殖を、異なる濃度(0.1〜100μg/ml)の、本発明によりグリコシル化されたCetuximab、およびマウスSP2/0細胞において発現させたCetuximab(Erbitux(Merck))によるMTTアッセイにおいて測定した。MTTアッセイとは、生細胞のミトコンドリアにおけるデヒドロゲナーゼによる、可溶性で黄色のテトラゾリウム塩であるMTT(3−[4,5−ジメチルチアゾール−2−イル]−2,5−ジフェニルテトラゾリウムブロミド、チアゾリルブルー)の切断に基づく非放射性アッセイである。これは、紫色のホルマザンの形成を結果としてもたらし、これは、570nmにおけるELISAリーダーにより測定することができる。吸収シグナルは、培養物中の生細胞についての直接的な測定である。
グリコシル化の異なる抗体によるアポトーシスおよび標的細胞溶解の誘導
アポトーシスの誘導
アポトーシスの誘導は、抗体が、抗腫瘍活性を媒介しうるさらなる機構である。単量体抗体によるアポトーシスの直接的な誘導がしばしば無効であるのに対し、抗ヒト免疫グロブリンまたはプロテインGによる抗体の架橋形成は、この作用機構を喚起する。インビボでは、抗体の架橋形成が、Fc受容体保有細胞により誘導されうる。
抗体の異なるグリコシル化パターンのADCCに対する影響を決定するため、ユーロピウム放出アッセイを実施した。
構成的に活性なK−Ras変異を有する標的細胞の、本発明による抗EGFR抗体による溶解
本発明によりグリコシル化パターンを最適化した抗EGFR抗体が、ADCCを介して、構成的に活性なK−Ras変異を有する標的細胞の溶解を誘導する能力を裏付けるため、ユーロピウム放出アッセイを実施した。
グリコシル化の異なる抗体変異体の循環半減期
IgG抗体のシアリル化に対する半減期の依存性を調べるため、Cetuximabを、GT−5s細胞に由来するFuc−細胞において発現させ(Cetuximab(発明))、電荷の異なるアイソタイプに由来する調製物を生成した。マウスにおける薬物動態研究を実施した。
グリコシル化の異なる抗体の抗腫瘍活性
A431細胞による異種移植モデルにおける抗EGFR抗体
グリコシル化の異なる抗体を比較するために、A431外陰類表皮がん細胞を用いて、マウス異種移植モデルを準備した。この細胞系は、EGFRタンパク質を高度に発現する。
加えて、Cetuximab(発明)のインビボにおける有効性を、DU145ヒト前立腺がん異種移植細胞を保有する無胸腺ヌードマウスにおいて研究した。DU145細胞系は、EGFR陽性であり、DU145細胞による異種移植モデルは、Erbitux(登録商標)による処置に対して感受性であることが報告されている。
さらなる研究では、異なる細胞系における発現により得られる、シアリル化度の異なるPankomabの抗腫瘍有効性について探索した。両方の抗体の治療的可能性を、ZR−75−1細胞による異種移植ヌードマウスにおいて探索した。ZR−75−1腫瘍細胞を皮下注射し、約0.1cm3の平均サイズまで成長させた。GT−5s細胞において発現させたシアリル化Pankomab(Pankomab シアリル化+)、またはシアリル化欠損ヒト骨髄腫瘍細胞系において発現させた非シアリル化Pankomab(Pankomab シアリル化−)を、毎週2回ずつ4週間にわたりマウス8匹の群に静脈内投与した。各マウスに0.5mg/kgずつの用量を適用し、PBSを対照として用いた。体重および腫瘍成長をモニタリングした。結果として、0.5mg/kgという低用量のシアリル化Pankomabが、腫瘍成長を阻害するのに高度に有効であるのに対し、非シアリル化Pankomabは有意に有効ではなかった。図19は、相対腫瘍体積に基づく結果を示す。全ての結果は、平均±平均の標準誤差として表した。処置期間および抗体濃度の影響を調べるために、相対腫瘍体積についての二元配置ANOVAを実施した(GraphPad Prismソフトウェアv5.02、GraphPad Software、USA)。p値を0.05とするボンフェローニによる事後検定を用いて、群の対間における差違の統計学的有意性を評価した。
異なる患者に由来する腫瘍に対する抗腫瘍活性
この研究では、本発明によりグリコシル化されたCetuximab(Cetuximab(発明))のインビボにおける有効性を、ヒト患者のNSCLC(非小細胞肺がん)およびCRC(結腸直腸がん)に由来する異種移植がん細胞を保有する免疫不全マウスにおいて評価した。患者に由来する腫瘍細胞の異種移植モデルは、腫瘍細胞系より元の組織への類似性がなおより大きく、したがって、臨床的関与性が大きいと考えられる。腫瘍モデルは、免疫組織化学により評価された、それらの陽性のEGFR発現状態によるほか、それらのK−Ras遺伝子の変異状態によっても選択した。NSCLC #7466モデルおよびCRC #8397モデルのいずれも、高度なEGFR発現を示すが、NSCLC #7466モデルが、野生型のK−Ras遺伝子を含むのに対し、CRC #8397モデルは、発がん性で常に活性な、K−Ras遺伝子のG12D変異体を保有する。
毒性学的研究
カニクイザルにおける4週間にわたる反復投与毒性研究およびカニクイザルにおける2週間にわたる用量範囲発見研究を実施した。これらの毒性研究に基づくと、本発明によりグリコシル化されたCetuximab(Cetuximab(発明))の安全性プロファイルにより、モノクローナル抗体による候補薬物の忍容性が十分であり、したがって、選択された患者集団の処置も安全であることの十分な重みのある証拠がもたらされる。ヒトにおける抗EGFR抗体の使用を押しとどめる、異常であるかまたは警告的な毒性の指標は観察されなかった。
Claims (42)
- 抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の循環半減期を制御するための方法であって、
(a)循環半減期を延長することについては、
(a1)該抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を増大させるステップ、および/あるいは
(a2)該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する1またはそれより多くのグリコシル化部位を除去するステップ、および/あるいは
(a3)該抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のフリーのガラクトース単位量を減少させるステップ、あるいは
(b)循環半減期を短縮することについては、
(b1)該抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を減少させるステップ、および/あるいは
(b2)該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に1またはそれより多くのグリコシル化部位を導入するステップ、および/あるいは
(b3)該抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のフリーのガラクトース単位量を増大させるステップ
を含む方法。 - ステップ(a1)が、以下の特徴:
(i)前記組成物において、前記Fab部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖のうちの少なくとも50%が、少なくとも1つのシアル酸残基を含むように、シアル酸量を増大させること、
(ii)前記組成物において、前記Fab部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖における糖鎖1本当たりの平均シアル酸残基量が、少なくとも0.8となるように、シアル酸量を増大させること、
(iii)前記Fab部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖中のシアル酸量を増大させる一方で、前記組成物において、前記抗体またはその断片もしくは誘導体のFc部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖のうちの20%未満、好ましくは10%未満が、少なくとも1つのシアル酸を含むこと、および
(iv)シアル酸量を増大させるステップが、前記抗体またはその断片もしくは誘導体を、細胞または細胞系において、該細胞または細胞系が高いシアリル化活性を有する条件下で発現させるステップを包含すること
のうちの1またはそれより多くを含む、請求項1に記載の方法。 - ステップ(a2)が、以下の特徴:
(i)前記1またはそれより多くのグリコシル化部位を、前記抗体またはその断片もしくは誘導体をコードする核酸配列を変化させることにより除去すること、
(ii)除去される少なくとも1つのグリコシル化部位が、前記抗体またはその断片もしくは誘導体の重鎖可変領域内または軽鎖可変領域内、好ましくは重鎖可変領域内、より好ましくはそのフレームワーク領域内に存在すること、
(iii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体の前記Fab部分に存在する全てのグリコシル化部位を除去すること、
(iv)前記1またはそれより多くのグリコシル化部位の除去が、前記抗体またはその断片もしくは誘導体の抗原結合および/または抗原特異性を有意に低減しないかまたは消失させないこと、ならびに
(v)抗原結合アフィニティーを、20%を超えて、好ましくは15%を超えて、10%を超えて、または5%を超えて低下させることがないこと
のうちの1またはそれより多くを含む、請求項1または2に記載の方法。 - ステップ(a3)が、以下の特徴:
(i)前記組成物において、前記Fab部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖のうちの50%未満が、少なくとも2つのフリーのガラクトース単位を含むように、フリーのガラクトース単位量を減少させること、および
(ii)フリーのガラクトース単位量を減少させるステップが、前記抗体またはその断片もしくは誘導体を、細胞または細胞系において、前記細胞または細胞系が高いシアリル化活性を有する条件下で発現させるステップを包含すること
のうちの1またはそれより多くを含む、請求項1から3のいずれか一項に記載の方法。 - ステップ(b1)が、以下の特徴:
(i)前記組成物において、前記Fab部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖のうちの50%未満が、少なくとも1つのシアル酸残基を含むように、シアル酸量を減少させること、
(ii)前記組成物において、前記Fab部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖における糖鎖1本当たりの平均シアル酸残基量が、0.5未満となるように、シアル酸量を減少させること、および
(ii)シアル酸量を減少させるステップが、前記抗体またはその断片もしくは誘導体を、細胞または細胞系において、該細胞または細胞系が低いシアリル化活性を有するかまたはシアリル化活性を有さない条件下で発現させるステップを包含すること
のうちの1またはそれより多くを含む、請求項1に記載の方法。 - ステップ(b2)が、以下の特徴:
(i)正確に1つ、少なくとも2つ、または少なくとも3つのグリコシル化部位が、前記抗体またはその断片もしくは誘導体の前記Fab部分に導入されること、
(ii)前記1またはそれより多くのグリコシル化部位が、前記抗体またはその断片もしくは誘導体をコードする核酸配列を変化させることにより導入されること、
(iii)少なくとも1つのグリコシル化部位が、前記抗体またはその断片もしくは誘導体の重鎖可変領域内または軽鎖可変領域内、好ましくは重鎖可変領域内、より好ましくはそのフレームワーク領域内に導入されること、
(iv)少なくとも1つのグリコシル化部位が重鎖定常領域1または軽鎖定常領域に導入されること、
(v)前記抗体またはその断片もしくは誘導体が、前記1またはそれより多くのグリコシル化部位を導入する前に、そのFab部分にグリコシル化部位を含有しないこと、
(vi)前記Fab部分に導入された前記グリコシル化部位のうちの少なくとも1つが、配列Asn Xaa Ser/Thrを有し、この場合、Xaaが、好ましくはPro以外の、任意のアミノ酸であること、
(vii)前記1もしくはそれより多くの導入されたグリコシル化部位、および/または該グリコシル化部位に付いている糖が、前記抗体またはその断片もしくは誘導体の抗原結合および/または抗原特異性を有意に低減しないかまたは消失させないこと、ならびに
(viii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記1またはそれより多くの導入されたグリコシル化部位に付いている糖のうちの50%未満が、少なくとも1つのシアル酸残基を含むこと
のうちの1またはそれより多くを含む、請求項1または5に記載の方法。 - ステップ(b3)が、以下の特徴:
(i)前記組成物において、前記Fab部分に存在する前記少なくとも1つのグリコシル化部位に付いている糖のうちの少なくとも50%が、少なくとも2つのフリーのガラクトース単位を含むように、フリーのガラクトース単位量を増大させること、および
(ii)シアル酸量を増大させるステップが、前記抗体またはその断片もしくは誘導体を、細胞または細胞系において、前記細胞または細胞系が低いシアリル化活性を有するか、またはシアリル化活性を有さない条件下で発現させるステップを包含すること
のうちの1またはそれより多くを含む、請求項1、5、および6のいずれか一項に記載の方法。 - 前記抗体またはその断片もしくは誘導体の前記Fab部分に存在する前記グリコシル化部位のうちの少なくとも1つが、重鎖可変領域内または軽鎖可変領域内、好ましくは重鎖可変領域内、より好ましくは可変領域のフレームワーク領域内に存在する、請求項1から7のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記抗体またはその断片もしくは誘導体のうちの少なくとも50%が、前記Fab部分においてグリコシル化されている、請求項1から8のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその断片もしくは誘導体が、Fc部分、好ましくはCH2領域、より好ましくはアミノ酸Asn297において、少なくとも1つのグリコシル化部位を含む、請求項1から9のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体またはその断片もしくは誘導体が、以下の特徴:
(i)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記抗体またはその断片もしくは誘導体のうちの少なくとも50%が、前記Fc部分においてグリコシル化されていること、
(ii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%が、フコース残基を保有しないこと、
(iii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも80%、好ましくは少なくとも90%が、シアル酸残基を保有しないこと、および
(iv)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも5%が、二分枝状N−アセチルグルコサミン残基を保有すること
のうちの1またはそれより多くを有する、請求項10に記載の方法。 - 前記抗体またはその断片もしくは誘導体が、以下の特徴:
(i)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖のうちの少なくとも70%が、少なくとも1つのガラクトース残基を保有すること、
(ii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体が、ヒトグリコシル化パターンを有すること、
(iii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖が、構造Galα(1→3)Galβ(1→4)GlcNAcを有するGaliliエピトープを含まないこと、
(iv)前記抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖が、N−グリコリルノイラミン酸(NeuGc)残基を含まないこと、
(v)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖中のシアル酸のうちの少なくとも40%が、2,6結合により連結されていること、
(vi)前記抗体またはその断片もしくは誘導体を含む組成物において、前記抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖のうちの少なくとも23%が、二分枝状N−アセチルグルコサミン(ビスGlcNAc)残基を保有すること、
(vii)前記抗体が、IgG抗体、IgE抗体、IgA抗体、IgD抗体、またはIgM抗体、好ましくはIgG1抗体またはIgG2抗体、より好ましくはIgG1抗体であること、
(viii)前記抗体が、ヒト抗体、マウス抗体、ラット抗体、ヤギ抗体、霊長動物抗体、またはラクダ抗体であること、および
(ix)前記抗体が、操作された抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、またはヒト化抗体であること
のうちの1またはそれより多くを有する、請求項1から11のいずれか一項に記載の方法。 - 前記抗体の前記断片または誘導体が、以下の特徴:
(i)該抗体の該断片または誘導体が、該抗体のうちの少なくとも重鎖可変領域を含み、場合によって、該抗体の該断片または誘導体が、該抗体の重鎖定常領域1、および/または該抗体の軽鎖可変領域、および/または該抗体の軽鎖定常領域をさらに含むこと、
(ii)該抗体の該断片または誘導体が、
(a)重鎖および軽鎖の各々のうちの可変領域および第1の定常ドメインからなる一価断片であるFab断片、
(b)ヒンジ領域においてジスルフィド架橋により連結された2つのFab断片を含む二価断片であるF(ab)2断片、
(c)重鎖の可変領域および第1の定常ドメインCH1からなるFd断片、
(d)抗体の単一のアームの重鎖可変領域および軽鎖可変領域からなるFv断片、
(e)単一のポリペプチド鎖からなるFv断片であるscFv断片、
(f)共有結合的に連結された2つのFv断片からなる(Fv)2断片、
(g)重鎖可変ドメイン、および
(h)重鎖可変領域と軽鎖可変領域との会合が、分子間だけで生じることが可能であり、分子内で生じることは可能でない形で共有結合的に連結された、前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域からなる多重抗体
からなる群から選択されること、ならびに
(iii)該抗体の該断片または誘導体が、該抗体と同じ抗原、好ましくは同じエピトープに結合することが可能であること
のうちの1またはそれより多くを有する、請求項1から12のいずれか一項に記載の方法。 - 前記組成物において、前記抗体またはその断片もしくは誘導体の前記Fab部分に付いている糖のうちの少なくとも50%、好ましくは少なくとも60%、より好ましくは少なくとも70%が、ビスGlcNAcを保有する、請求項1から13のいずれか一項に記載の方法。
- 前記抗体が、
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、該重鎖可変領域のうちのアミノ酸85位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む、キメラまたはヒト化抗EGFR抗体である、請求項1から14のいずれか一項に記載の方法。 - 前記抗体が、
(i)配列番号7のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号9のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号11のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号12のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、該重鎖可変領域のうちのアミノ酸54位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む、キメラまたはヒト化抗TA−Muc1抗体である、請求項1から14のいずれか一項に記載の方法。 - 抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む抗体組成物であって、該抗体またはその断片もしくは誘導体が、それらのFab部分に存在する少なくとも1つのグリコシル化部位を含むことを特徴とし、該組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体の該Fab部分に付いている糖のうちの少なくとも65%が、少なくとも1つの末端シアル酸残基を保有し、かつ/あるいは該抗体またはその断片もしくは誘導体の該Fab部分に付いている糖のうちの35%未満が、少なくとも2つのフリーのガラクトース単位を保有することを特徴とする抗体組成物。
- 前記抗体またはその断片もしくは誘導体が、請求項2、4、および8から16のいずれか一項に記載の特徴のうちの1またはそれより多くを有する、請求項17に記載の抗体組成物。
- 前記抗体またはその断片もしくは誘導体が、以下の特徴:
(i)前記組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のうちの少なくとも50%が、前記Fab部分においてグリコシル化されていること、
(ii)前記組成物において、Fab部分に付いている糖のうちの少なくとも70%、好ましくは少なくとも75%が、少なくとも1つの末端シアル酸残基を保有すること、
(iii)該抗体またはその断片もしくは誘導体が、それらのFc部分において、好ましくはCH2領域において、より好ましくはアミノ酸Asn297において、少なくとも1つのグリコシル化部位を含むこと、
(iv)前記組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のうちの少なくとも50%が、前記Fc部分においてグリコシル化されていること、
(v)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも80%が、フコース残基を保有しないこと、
(vi)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも70%、好ましくは少なくとも80%が、シアル酸残基を保有しないこと、
(vii)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも5%が、二分枝状N−アセチルグルコサミン残基を保有すること、
(viii)前記組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖のうちの少なくとも70%が、少なくとも1つのガラクトース残基を保有すること、
(ix)該抗体またはその断片もしくは誘導体が、ヒトグリコシル化パターンを有すること、
(x)該抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖が、構造Galα(1→3)Galβ(1→4)GlcNAcを有するGaliliエピトープを含まないこと、
(xi)該抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖が、N−グリコリルノイラミン酸(NeuGc)残基を含まないこと、
(xii)前記組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖中のシアル酸のうちの少なくとも40%が、2,6結合により連結されていること、
(xiii)前記組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体に付いている糖のうちの少なくとも23%が、二分枝状のN−アセチルグルコサミン(ビスGlcNAc)残基を保有すること、
(xiv)前記組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に付いている糖のうちの少なくとも50%、好ましくは少なくとも60%、より好ましくは少なくとも70%が、ビスGlcNAcを保有すること、
(xiv)該抗体が、IgG抗体、IgE抗体、IgA抗体、IgD抗体、またはIgM抗体、好ましくはIgG1抗体またはIgG2抗体、より好ましくはIgG1抗体であること、
(xv)該抗体が、ヒト抗体、マウス抗体、ラット抗体、ヤギ抗体、霊長動物抗体、またはラクダ抗体であること、
(xvi)該抗体が、操作された抗体、モノクローナル抗体、キメラ抗体、またはヒト化抗体であること、
(xvii)該抗体の該断片または誘導体が、該抗体のうちの少なくとも重鎖可変領域を含み、Fab部分において前記グリコシル化部位を含むこと、
(xviii)該断片または誘導体が、
(a)重鎖および軽鎖の各々の可変領域および第1の定常ドメインからなる一価断片であるFab断片、
(b)ヒンジ領域においてジスルフィド架橋により連結された2つのFab断片を含む二価断片であるF(ab)2断片、
(c)重鎖の可変領域および第1の定常ドメインCH1からなるFd断片、
(d)抗体の単一のアームの重鎖可変領域および軽鎖可変領域からなるFv断片、
(e)単一のポリペプチド鎖からなるFv断片であるscFv断片、
(f)共有結合的に連結された2つのFv断片からなる(Fv)2断片、
(g)重鎖可変ドメイン、および
(h)重鎖可変領域と軽鎖可変領域との会合が、分子間だけで生じることが可能であり、分子内で生じることは可能でない形で共有結合的に連結された、該重鎖可変領域および該軽鎖可変領域からなる多重抗体
からなる群から選択されること、
(xix)該断片または誘導体が、該抗体と同じ抗原、好ましくは同じエピトープに結合することが可能であること、ならびに
(xx)該抗体が、Cetuximabなどの抗EGFR抗体、Karomabなどの抗TF抗体、Pankomabなどの抗Muc1抗体、Trastuzumabなどの抗HER2抗体、およびRituximabなどの抗CD20抗体からなる群から選択されること
のうちの1またはそれより多くを有する、請求項17または18に記載の抗体組成物。 - 配列番号1のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域とを含むキメラまたはヒト化抗EGFR抗体を含む抗体組成物であって、
(i)該抗体が、Kabatの番号付けによる、該重鎖可変領域のうちのアミノ酸85位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位を含み、該組成物において、該Fab部分に存在する該グリコシル化部位に付いている糖のうちの少なくとも65%が、少なくとも1つの末端シアル酸残基を保有し、かつ/もしくは該Fab部分に存在する該グリコシル化部位に付いている糖のうちの35%未満が、少なくとも2つのフリーのガラクトース単位を保有すること、または
(ii)該抗体が、Fab部分においてグリコシル化部位を含まないこと
を特徴とする抗体組成物。 - 前記抗体が、以下の特徴:
(i)該抗体が、Fc部分に存在するグリコシル化部位を含むこと、
(ii)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも80%が、フコース残基を保有しないこと、
(iii)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも70%、好ましくは少なくとも80%が、シアル酸残基を保有しないこと、
(iv)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも10%が、二分枝状N−アセチルグルコサミン残基を保有すること、
(v)前記組成物において、該抗体に付いている糖のうちの少なくとも70%が、少なくとも1つのガラクトース残基を保有すること、
(vi)該抗体に付いている糖が、構造Galα(1→3)Galβ(1→4)GlcNAcを有するGaliliエピトープを含まないこと、および
(vii)該抗体に付いている糖が、N−グリコリルノイラミン酸(NeuGc)残基を含まないこと、
(viii)場合によって、前記組成物において、該抗体またはその断片もしくは誘導体のFab部分に付いている糖のうちの好ましくは少なくとも50%、好ましくは少なくとも60%、より好ましくは少なくとも70%が、ビスGlcNAcを保有すること
の全てを有する、請求項20に記載の抗体組成物。 - 配列番号7のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号9のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号11のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号12のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域とを含むキメラまたはヒト化抗Muc1抗体を含む抗体組成物であって、該抗体が、Kabatの番号付けによる、該重鎖可変領域のうちのアミノ酸54位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位を含み、該組成物において、該Fab部分に存在する該グリコシル化部位に付いている糖のうちの少なくとも65%が、少なくとも1つの末端シアル酸残基を保有し、かつ/または該Fab部分に存在する該グリコシル化部位に付いている糖のうちの35%未満が、少なくとも2つのフリーのガラクトース単位を保有することを特徴とする抗体組成物。
- 前記抗体が、以下の特徴:
(i)該抗体が、Fc部分に存在するグリコシル化部位を含むこと、
(ii)場合によって、前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも80%が、フコース残基を保有しないこと、
(iii)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも80%が、シアル酸残基を保有しないこと、
(iv)前記組成物において、Fc部分に付いている糖のうちの少なくとも5%が、二分枝状N−アセチルグルコサミン残基を保有すること、
(v)前記組成物において、該抗体に付いている糖のうちの少なくとも70%が、少なくとも1つのガラクトース残基を保有すること、
(vi)該抗体に付いている糖が、構造Galα(1→3)Galβ(1→4)GlcNAcを有するGaliliエピトープを含まないこと、
(vii)該抗体に付いている糖が、N−グリコリルノイラミン酸(NeuGc)残基を含まないこと、
の全てを有する、請求項22に記載の抗体組成物。 - 医療、好ましくはがんの処置において使用するための、請求項17から23のいずれか一項に記載の抗体組成物。
- 医薬組成物である、請求項17から24のいずれか一項に記載の抗体組成物。
- FcγRIIIa−158Fをコードする少なくとも1つの対立遺伝子を有する患者におけるがんの処置において使用するための、請求項20から23のいずれか一項に記載の抗体組成物。
- Erbituxによる処置が不成功であった後のがんの処置において使用するための、請求項20または21に記載の抗体組成物。
- 腫瘍細胞が、EGFRによるシグナル伝達経路における少なくとも1つの活性化変異を含む、がんの処置において使用するための、請求項20または21に記載の抗体組成物。
- 前記活性化変異が、構成的に活性なK−Ras変異体、構成的に活性なPI 3キナーゼ変異体、またはRafキナーゼの過剰発現を結果としてもたらす、請求項28に記載の抗体組成物。
- 所望の循環半減期を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む抗体組成物を生成するための方法であって、該抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を宿主細胞において発現させるステップを含み、ここで、請求項1に記載の抗体またはその断片もしくは誘導体の半減期を制御するための方法が、該方法のステップ(a1)、ステップ(a3)、ステップ(b1)、もしくはステップ(b3)を用いて実施され、かつ/または該宿主細胞が、ステップ(a2)もしくは(b2)を用いる請求項1に記載の方法により得られる抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を発現する方法。
- 請求項2から16のいずれか一項に記載の方法が実施されるかまたは実施された、請求項30に記載の方法。
- 前記抗体組成物が、請求項2から25のうちの1またはそれより多くに記載の特徴のうちの1またはそれより多くを有する、請求項30または31に記載の方法。
- 抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体であって、該抗体またはその断片もしくは誘導体のうちの少なくとも1つのCDRのアミノ酸配列が、Fab部分において少なくとも1つのグリコシル化部位を含む基準抗体に由来し、該抗体またはその断片もしくは誘導体が、Fab部分においてグリコシル化部位を含まず、該抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体が、該基準抗体より長い循環半減期を有する、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体。
- 以下の特徴:
(i)前記抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体が、前記基準抗体と同じエピトープに結合すること、
(ii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体の重鎖可変領域の3つのCDR全てのアミノ酸配列が、前記基準抗体に由来すること、
(iii)前記抗体またはその断片もしくは誘導体の軽鎖可変領域の3つのCDR全てのアミノ酸配列が、前記基準抗体に由来すること、
(iv)前記抗体またはその断片もしくは誘導体の重鎖可変領域のアミノ酸配列全体、および/または軽鎖可変領域のアミノ酸配列全体が、前記基準抗体に由来すること、
(v)前記抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の抗原結合アフィニティーが、前記基準抗体の抗原結合アフィニティーと同様であるか、またはこれより高いこと、
(vi)前記抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の循環半減期が、前記基準抗体の循環半減期より少なくとも5%、好ましくは、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、または少なくとも25%長いこと、
(vii)前記抗原結合アフィニティーが、20%を超えて、好ましくは15%を超えて、10%を超えて、または5%を超えて低下しないこと、
(viii)前記基準抗体が、CetuximabまたはCetuximabと同じエピトープに結合する抗体などの抗EGFR抗体、PankomabまたはPankomabと同じエピトープに結合する抗体などの抗MUC1抗体、SolanezumabまたはSolanezumabと同じエピトープに結合する抗体などの抗Aβ抗体、およびAlemtuzumabまたはAlemtuzumabと同じエピトープに結合する抗体などの抗CD52抗体からなる群から選択されること、ならびに
(ix)前記基準抗体のFab部分におけるグリコシル化部位が、好ましくはアミノ酸配列Asn Xaa Ser/Thrを有するN−グリコシル化部位であり、この場合、Xaaが、好ましくはPro以外の任意のアミノ酸であること
のうちの1またはそれより多くを有する、請求項33に記載の抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体。 - 前記基準抗体が、
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号4のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸85位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗EGFR抗体であるか、または
前記基準抗体が、
(i)配列番号7のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号9のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号10のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号11のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号12のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸54位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗TA−Muc1抗体であるか、または
前記基準抗体が、
(i)配列番号15のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号16のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号17のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号18のアミノ酸配列を有するCDRL1、配列番号19のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号20のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)場合によって、Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸60位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗CD52抗体であるか、または
前記基準抗体が、
(i)配列番号21のアミノ酸配列を有するCDRH1、配列番号22のアミノ酸配列を有するCDRH2、および配列番号23のアミノ酸配列を有するCDRH3を含む重鎖可変領域と、
(ii)場合によって、配列番号24のアミノ酸配列を有するCDRL1と、配列番号25のアミノ酸配列を有するCDRL2、および配列番号26のアミノ酸配列を有するCDRL3を含む軽鎖可変領域と、
(iii)場合によって、Kabatの番号付けによる、重鎖可変領域のうちのアミノ酸55位の、Fab部分に存在するグリコシル化部位と、
(iv)場合によって、重鎖定常領域2のうちのアミノ酸297位の、Fc部分に存在するグリコシル化部位と
を含む抗Aβ抗体である、
請求項33または34に記載の抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体。 - (i)前記基準抗体のFab部分におけるグリコシル化部位が、重鎖可変領域内または軽鎖可変領域内にあり、そして
(ii)前記抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の重鎖可変領域または軽鎖可変領域のアミノ酸配列が、該重鎖可変領域内または軽鎖可変領域内のグリコシル化部位が除去されるように、少なくとも1つのアミノ酸において、該基準抗体の対応するアミノ酸配列とは異なる、
請求項33から35のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体。 - 延長された循環半減期を有する、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体をコードする核酸を生成するための方法であって、
(a)Fab部分においてグリコシル化部位を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体をコードする核酸を供給するステップと、
(b)該コードされた抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の該Fab部分における該グリコシル化部位が除去されるように、変異を該核酸へと導入するステップと
を含む方法。 - 請求項37に記載の方法により得ることが可能な核酸。
- 延長された循環半減期を有する、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を生成するための方法であって、
(a)Fab部分においてグリコシル化部位を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体をコードする核酸を供給するステップと、
(b)該コードされた抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体の該Fab部分における該グリコシル化部位が除去されるように、変異を該核酸へと導入するステップと、
(c)ステップ(b)において得られる核酸を発現させて、前記Fab部分においてグリコシル化部位を含まず、かつ、Fab部分においてグリコシル化部位を有する抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体よりも長い循環半減期を有する、抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を生成するステップと
を含む方法。 - 請求項39に記載の方法により得ることが可能な抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体。
- 請求項33から36のうちの1またはそれより多くに記載の抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体を含む抗体組成物。
- 前記組成物における前記抗体またはその機能的な断片もしくは誘導体が、Fc部分において、請求項11および/または12に記載のグリコシル化パターンを有する、請求項41に記載の抗体組成物。
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