ES2687951T3 - Anticuerpos anti-HtrA1 y procedimientos de uso - Google Patents
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Abstract
Un anticuerpo monoclonal aislado que se une a HtrA1 e inhibe su actividad serina proteasa para uno o mas sustratos para HtrA1, en el que el anticuerpo comprende una secuencia de VH que comprende la SEQ ID NO: 32 y una secuencia de VL que comprende la SEQ ID NO: 31.
Description
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DESCRIPCION
Anticuerpos anti-HtrA1 y procedimientos de uso Campo de la invención
La presente invención se refiere a anticuerpos anti-HtrA1 y a procedimientos de uso de los mismos.
Antecedentes
La serina proteasa HtrA1 (PRSS11, Clan PA, familia S1) pertenece a una familia evolutivamente conservada de proteínas HtrA (Clausen, T., et al., Nat Rev Mol Cell Biol 12:152-62 (2011); Clausen, T., et al., Mol Cell 10:443-55 (2002)). En seres humanos, HtrA1, 3 y 4 comparten la misma arquitectura de dominio: un módulo similar a IGFBP N terminal y un módulo similar a Kazal, un dominio proteasa con pliegue similar a tripsina y un dominio PDZ C terminal. La pertinencia fisiológica de HtrA1 se ha establecido firmemente mediante la identificación de mutaciones humanas con pérdida de función que provocan microangiopatía cerebral isquémica hereditaria (Hara, K., et al., N Engl J Med 360:1729-39 (2009)). El mecanismo molecular implica una inhibición insuficiente de TGF-p por HtrA1 que da como resultado una señalización de TGF-p incrementada (Hara et al., 2009). La señalización de TGF-p con regulación errónea mediante la expresión anómala de HtrA1 también puede contribuir a la enfermedad artrítica (Oka, C., et al., Development 131:1041-53 (2004); Tsuchiya, A., et al., Bone 37:323-36 (2005)), quizás junto con la degradación mediada por HtrA1 de diversos componentes de la matriz extracelular (Chamberland et al., J Biol Chem 284:27352-9 (2009); Grau, S., et al., J Biol Chem 281:6124-9 (2006); Hadfield, K.D., et al., J Biol Chem 283:5928-38 (2008); Tocharus, J., et al., Dev Growth Differ 46:257-74 (2004); Tsuchiya et al., 2005)) o indirectamente por medio de la regulación por incremento de las metaloproteasas de la matriz (Grau et al., 2006). Además, los estudios genéticos en seres humanos identificaron una fuerte correlación entre la progresión de la degeneración macular senil y un SNP en la región promotora de HtrA1, que da como resultado niveles de transcritos de HtrA1 incrementados (Dewan, A., et al., Science 314:989-92 (2006); Yang, Z., etal., Science 314:992-3 (2006)). Se divulgan anticuerpos policlonales frente a HtrA1 en el documento WO 2009/046405. Por lo tanto, la inhibición de la función enzimática de HtrA1 es un enfoque terapéutico atractivo, por ejemplo, en la degeneración macular senil y en la enfermedad artrítica.
Sumario
La invención proporciona anticuerpos anti-HtrA1 y procedimientos de uso de los mismos para fines terapéuticos como se define en las reivindicaciones. La invención se dirige a un anticuerpo monoclonal aislado que se une a HtrA1 e inhibe su actividad serina proteasa para uno o más sustratos para HtrA1, en el que el anticuerpo comprende una secuencia de VH que comprende la SEQ ID NO: 32 y una secuencia de VL que comprende la SEQ ID NO: 31.
En un aspecto, la divulgación proporciona un anticuerpo aislado que se une a HtrA1 que tiene una o más de las siguientes propiedades: (i) una Clso de menos de 50 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 15 nM, 10 nM, 5 nM, 3 nM, 2,5 nM, 2 nM, 1 nM o menos para uno o más sustratos para HtrA1; (¡i) se une a HtrA1 con una proporción de 1 dominio variable a una subunidad de un trímero de HtrA1 (por ejemplo, un Fab se une a un trímero de HtrA1 con una proporción de 3 Fab a 1 trímero de HtrA1 y una IgG se une a un trímero de HtrA1 con una proporción de 3 IgG a 2 trímeros de HtrA1), (i¡¡) para los anticuerpos que comprenden dos dominios variables, se une a HtrA1 de una manera que da como resultado la formación de una “jaula” similar a la mostrada en la fig. 9, (iv) no previene la formación de trímeros de HtrA1, (v) se une a uno o más residuos en el bucle C de la proteína HtrA1, (vi) se une al dominio proteasa de HtrA1, (vii) se une a un epítopo que comprende uno o ambos de los aminoácidos N224 o K248 de SEQ ID NO: 13, o aminoácidos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente (por ejemplo, los aminoácidos N224 y K248 de SEQ ID NO: 14, véanse las figs. 10A y B); (viii) se une a un epítopo que comprende uno o más de los siguientes residuos de N224, K248, V201, T223, K243, K225, E247 y H220 de SEQ ID NO: 13, o aminoácidos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente; (ix) reacciona de manera cruzada con HtrA1 murina; (x) no reacciona de manera cruzada con HtrA2, HtrA3 y/o HtrA4; (xi) se une de manera competitiva a HtrA1 con un anticuerpo que comprende una secuencia de VH de SEQ ID NO: 8 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 7, (xii) se une a HtrA1 con una constante de disociación de <500 nM o (xiii) inhibe la formación de complejos entre HtrA1 y a1 antitripsina (A1AT).
En otro aspecto, la divulgación proporciona un anticuerpo aislado que se une a HtrA1, en el que el anticuerpo (i) se une a un epítopo que incluye N224, K248, o ambos, de HtrA1 e (¡i) inhibe HtrA1 con una Clso de < 30 nM. En determinados modos de realización, el epítopo incluye además uno o más de los siguientes residuos de HtrA1: V201, T223, K243, K225, E247 y H220. En determinados modos de realización, el anticuerpo puede comprender además una o más de las siguientes propiedades: (i) se une a HtrA1 con una proporción de 1 dominio variable a una subunidad de un trímero de HtrA1 o (¡i) no previene la formación de trímeros de HtrA1. En determinados modos de realización, se determina la Clso usando un ensayo con serina proteasa con un sustrato que tiene la SEQ ID NO: 12, por ejemplo, tal como el ensayo de FRET descrito en el presente documento.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento no reacciona de manera cruzada con uno o más de HtrA2, HtrA3 y HtrA4.
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En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento tiene una constante de disociación de <500 nM. La constante de disociación se puede determinar, por ejemplo, mediante BIAcore usando un Fab.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento es un anticuerpo humano, humanizado o quimérico.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento es un fragmento de anticuerpo que se une a HtrA1.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6 y (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende además (a) HVR- L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 18; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19, o el anticuerpo descrito en el presente documento comprende además (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22. En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende además una secuencia estructural (FR2) del dominio variable de la cadena pesada de SEQ ID NO: 17.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende (a) una secuencia de VH que tiene al menos un 95 % de identidad de secuencia con respecto a la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 8; (b) una secuencia de VL que tiene al menos un 95 % de identidad de secuencia con respecto a la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 7.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende una secuencia de VH que comprende la SEQ ID NO: 32 y una secuencia de VL que comprende la SEQ ID NO: 31.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende una secuencia de VH de SEQ ID NO: 8 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 7.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende una secuencia de VH de SEQ ID NO: 30 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 28.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento comprende una secuencia de VH de SEQ ID NO: 30 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 29.
En determinados modos de realización, un anticuerpo descrito en el presente documento es un anticuerpo lgG1 o lgG4 de longitud completa.
En otro aspecto, se proporciona un ácido nucleico aislado que codifica un anticuerpo anti-HtrA1 descrito en el presente documento.
En otro aspecto, se proporciona una célula huésped que comprende un ácido nucleico aislado que codifica un anticuerpo anti-HtrA1 descrito en el presente documento.
En otro aspecto, se proporciona un procedimiento de producción de un anticuerpo. El procedimiento puede comprender cultivar una célula huésped que comprende un ácido nucleico aislado que codifica un anticuerpo anti- HtrA1 en condiciones adecuadas para la expresión del ácido nucleico que codifica el anticuerpo anti-HtrA1. El procedimiento puede comprender además recuperar el anticuerpo anti-HtrA1 del cultivo de células huésped, purificar el anticuerpo anti-HtrA1 o formular el anticuerpo anti-HtrA1 con un excipiente farmacéuticamente aceptable.
En otro aspecto, se proporciona un inmunoconjugado que comprende un anticuerpo anti-HtrA1 y un agente citotóxico.
En otro aspecto, se proporciona una formulación farmacéutica que comprende un anticuerpo anti-HtrA1 y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
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En otro aspecto, la solicitud proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso como medicamento, por ejemplo, para su uso en el tratamiento de la degeneración macular senil (DMS, húmeda o seca), atrofia geográfica (AG), retinopatía diabética (RD), retinopatía de la prematuridad (RP) o vasculopatía coroidea polipoidea (VCP), para inhibir la degeneración de las células de la retina o fotorreceptoras o para inhibir la actividad proteasa de HtrA1 en un ojo.
En otro aspecto, la solicitud proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso del tratamiento de un individuo que tiene degeneración macular senil (húmeda o seca), atrofia geográfica, retinopatía diabética, retinopatía de la prematuridad o vasculopatía coroidea polipoidea, que comprende administrar al individuo una cantidad eficaz de un anticuerpo anti- HtrA1 como se describe en el presente documento.
En otro aspecto, la solicitud proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en la inhibición de la degeneración de las células de la retina o fotorreceptoras en un individuo que comprende administrar al individuo una cantidad eficaz de un anticuerpo anti-HtrA1 como se describe en el presente documento para inhibir la degeneración de las células de la retina o fotorreceptoras.
En otro aspecto, la solicitud proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en la inhibición de la actividad serina proteasa de HtrA1 en un ojo de un individuo que comprende administrar al individuo una cantidad eficaz de un anticuerpo anti-HtrA1 como se describe en el presente documento para inhibir la actividad serina proteasa de HtrA1 en el ojo.
Breve descripción de las figuras
Figs. 1A-B. La fig. 1A muestra la secuencia de dominio variable de la cadena ligera del anticuerpo 94 anti-HtrA1 (YW505.94) (SEQ ID NO: 7). La fig. 1B muestra la secuencia de dominio variable de la cadena pesada del anticuerpo 94 anti-HtrA1 (YW505.94) (SEQ ID NO: 8). Los residuos se numeran de acuerdo con el sistema de numeración de Kabat (Kabat, E.A., et al., 1991, en: Sequences of proteins of immunological interest, quinta edición. National Institutes of Health, Bethesda, MD). La secuencia de dominio variable de la cadena ligera de YW505.94 se alinea con la secuencia consenso de la cadena ligera Kappa I humana (SEQ ID NO: 9) y la secuencia de dominio variable de la cadena pesada de YW505.94 se alinea con la secuencia de la cadena pesada del subgrupo III humana (SEQ ID NO: 10). Las secuencias encerradas en cuadros son CDR de acuerdo con las definiciones de Kabat. Las diferencias de secuencia entre anti-HtrA1 (YW505.94) y las secuencias consenso aparecen sombreadas.
Fig. 2. Cribado del panel de 13 anticuerpos derivados de fago (IgG). Se incubaron concentraciones únicas (0,08- 0,28 mg/ml final) de IgG con HuHtrAI o HuHtrA1_PD y se midió la actividad enzimática en el ensayo de FRET. De los 13 anticuerpos sometidos a prueba, los anticuerpos YW503.57, YW504.57, YW504.61 e YW505.94 (también denominado Ab94 o lgG94) inhibieron fuertemente las actividades tanto de HuHtrAI como de HuHtrA1_PD.
Fig. 3. Inhibición de HuHtrAI por lgG94 y Fab94. Se incubó HuHtrAI con lgG94 y Fab94 durante 20 min a 37 °C. Se midió la actividad enzimática frente al sustrato peptídico H2-Opt y se calcularon las actividades fracciónales (v¡/v0) a partir de las velocidades lineales determinadas. lgG94 a 300 nM no inhibió la hidrólisis de H2-Opt por tripsina (1 nM) o elastasa (1 nM).
Fig. 4. lgG94 inhibe la hidrólisis de caseína marcada con tinte fluorescente (BODIPY FL) por HuHtrAI y MuHtrAl. Se incubaron HuHtrAI y MuHtrAl con lgG94 durante 15 min a 37 °C. Se midió la hidrólisis del reactivo BODIPY FL de caseína en un lector de microplacas a 37 °C y se determinaron las tasas lineales del incremento de fluorescencia y se expresaron como un porcentaje de tasas no inhibidas (% de control).
Fig. 5. Especificidad de lgG94. Se incubaron MuHtrA1_PD, MuHtrA3_PD y MuHtrA4_PD con concentraciones crecientes de lgG94 y se determinaron las actividades enzimáticas frente al sustrato peptídico H2-Opt (panel superior) o reactivo BODIPY FL de caseína (panel inferior) y se expresaron como un porcentaje de actividades enzimáticas no inhibidas (% de control).
Fig. 6. Inhibición por lgG94 de la escisión de sustratos macromoleculares mediada por HuHtrAI Se incubaron concentraciones crecientes de lgG94 (2,3-150 nM para (3-caseína, 2-125 nM para decorina, 2,3-150 nM para biglucano) con HuHtrAI (10 nM para (3-caseína, 125 nM para decorina, 75 nM para biglucano) durante 15 min a 37 °C. Se añadieron los sustratos (3-caseína, decorina y biglucano (50 pg/ml) y se incubaron durante 2-14 h. Después de la adición de tampón de muestra de SDS, se analizaron los hidrolizados mediante SDS-PAGE (condiciones no reductoras) y se tiñeron mediante SirnplyBlue Safestain.
Figs. 7A-C. Cartografía del epítopo funcional de lgG94 en HuHtrA1_PD. La fig. 7 A muestra los resultados de un ELISA que mide la unión de lgG94 a los mutantes de HuHtrA1_PD con sustituciones de alanina de los residuos circundantes al sitio activo. Las filas sombreadas indican sustituciones de alanina que dieron como resultado una disminución de la unión superior a 5 veces. La fig. 7B muestra la estructura de HuHtrA1_PD (PDB 3NWU) (Clausen, T., et al., Nat Rev Mol Cell Biol. 12:152-62 (2011)) con residuos mutados indicados. El sombreado en gris medio muestra mutaciones sin pérdida de unión a lgG94 en experimentos iniciales; el sombreado en gris oscuro muestra un subconjunto de
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residuos con pérdida > 5 veces de la afinidad de unión. Los tres monómeros que forman el trímero del dominio proteasa, mostrados en la representación superficial, están sombreados en gris claro. Los residuos de la tríada catalítica D250 y S328 están subrayados. La fig. 7C muestra una vista en primer plano de los bucles que albergan los residuos N224 y K248 del epítopo en un monómero (gris claro, en diagrama en colores) de HuHtrA1_PD (PDB 3NWU). También se incluye el residuo catalítico H220.
Figs. 8A-B. SEC-MALLS (cromatografía de exclusión por tamaño-dispersión de luz láser de ángulo múltiple) del complejo Fab94:HuHtrA1_PD (S328A) (fig. 8A) y del complejo lgG94:HuHtrA1_PD (S328A) (fig. 8B). Se muestran los picos de elución mediante SEC (eje x) y las masas de proteínas y complejos individuales (eje y, líneas de puntos a lo largo de los picos de elución).
Fig. 9. Hipotético ‘modelo de jaula’ del complejo lgG:HuHtrA1-PD.
Figs. 10A-B. Alineación de HtrA1 humana (SEQ ID NO: 13), HtrA1 murina (SEQ ID NO: 14), HtrA3 murina (SEQ ID NO: 15) y HtrA4 murina (SEQ ID NO: 16).
Fig. 11. La expresión de ARNm de HtrA1 se incrementa en la retina en un modelo murino de exposición a la luz constante (panel superior izquierdo). Los niveles de HtrA2 no varían significativamente en el mismo modelo (panel superior derecho). La expresión de HtrA1 es significativamente más alta que los niveles de expresión de HtrA2, HtrA3 y HtrA4 en la retina de ratón en el punto de referencia (panel inferior).
Fig. 12. Respuestas incrementadas de las células bipolares/glías de Müller en ausencia de expresión de HtrA1 en un modelo murino de exposición a la luz constante.
Fig. 13. Preservación de la retina en ausencia de expresión de HtrA1 en un modelo murino de exposición a la luz constante.
Fig. 14. Preservación de las células fotorreceptoras de la capa nuclear externa (CNE) en ausencia de expresión de HtrA1 en un modelo murino de exposición a la luz constante.
Fig. 15. Secuencias de HVR de la cadena ligera para variantes mejoradas en afinidad del anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.
Fig. 16. Secuencias de HVR de la cadena pesada para variantes mejoradas en afinidad del anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.
Fig. 17. Resultados de un ensayo de competición con fago que demuestra la unión de variantes mejoradas en afinidad de YW505.94a frente a HuHtrAI.
Fig. 18. Resultados de un ensayo de competición con fago que demuestra la unión de variantes mejoradas por afinidad de YW505.94a frente a MuHtrAl
Figs. 19A-C. Resultados del ensayo de ELISA que muestran los niveles de proteína HtrA1 en tejidos de rata (fig. 19A), líquido ocular de ratón (fig. 19B) y tejido de la retina de ratón (fig. 19C).
Descripción detallada de los modos de realización de la invención
I. Definiciones
Una “estructura humana aceptora” para los fines en el presente documento es una estructura que comprende la secuencia de aminoácidos de una estructura del dominio variable de la cadena ligera (VL) o una estructura del dominio variable de la cadena pesada (VH) derivada de una estructura de inmunoglobulina humana o una estructura consenso humana, como se define a continuación. Una estructura humana aceptora “derivada de” una estructura de inmunoglobulina humana o una estructura consenso humana puede comprender la misma secuencia de aminoácidos de la misma o puede contener cambios en la secuencia de aminoácidos. En algunos modos de realización, el número de cambios de aminoácidos es 10 o menos, 9 o menos, 8 o menos, 7 o menos, 6 o menos, 5 o menos, 4 o menos, 3 o menos o 2 o menos. En algunos modos de realización, la estructura humana aceptora de VL es idéntica en secuencia a la secuencia estructural de inmunoglobulina humana de VL o a la secuencia estructural consenso humana.
“Afinidad” se refiere a la fuerza de la suma total de las interacciones no covalentes entre un único sitio de unión de una molécula (por ejemplo, un anticuerpo) y su ligando (por ejemplo, un antígeno). A menos que se indique de otro modo, como se usa en el presente documento, “afinidad de unión” se refiere a la afinidad de unión intrínseca que refleja una interacción 1:1 entre los miembros de un par de unión (por ejemplo, anticuerpo y antígeno). La afinidad de una molécula X por su ligando Y se puede representar, en general, mediante la constante de disociación (Kd). La afinidad se puede medir mediante procedimientos comunes conocidos en la técnica, incluyendo los descritos en el presente documento. Los modos de realización ilustrativos y ejemplares específicos para medir la afinidad de unión
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se describen a continuación.
Un anticuerpo “con maduración de la afinidad” se refiere a un anticuerpo con una o más alteraciones en una o más regiones hipervariables (HVR), en comparación con un anticuerpo original que no posee dichas alteraciones, dando como resultado dichas alteraciones una mejora en la afinidad del anticuerpo por el antígeno.
Los términos “anticuerpo anti-HtrA1” y “un anticuerpo que se une a HtrA1” se refieren a un anticuerpo que se puede unir a HtrA1 con una afinidad suficiente, de tal manera que el anticuerpo sea útil como agente de diagnóstico y/o terapéutico en la selección como diana de HtrA1. En un modo de realización, el grado de unión de un anticuerpo anti- HtrA1 a una proteína distinta de HtrA1 no relacionada es de menos de aproximadamente un 10 % de la unión del anticuerpo a HtrA1 como se mide, por ejemplo, mediante un radioinmunoensayo (RIA). En determinados modos de realización, un anticuerpo que se une a HtrA1 tiene una constante de disociación (Kd) de < 1 pM, < 100 nM, < 10 nM, < 1 nM, < 0,1 nM, < 0,01 nM o < 0,001 nM (por ejemplo, 10 8 M o menos, por ejemplo, desde 10 8 M a 1013 M, por ejemplo, desde 10'9 M a 10'13 M). En determinados modos de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 se une a un epítopo de HtrA1 que está conservado entre HtrA1 de especies diferentes.
Se usa el término “anticuerpo” en el presente documento en el sentido más amplio y abarca diversas estructuras de anticuerpos, que incluyen, pero no se limitan a, anticuerpos monoclonales, anticuerpos policlonales, anticuerpos multiespecíficos (por ejemplo, anticuerpos biespecíficos) y fragmentos de anticuerpo siempre que presenten la actividad de unión a antígeno deseada.
Un “fragmento de anticuerpo” se refiere a una molécula distinta de un anticuerpo inalterado que comprende una porción de un anticuerpo inalterado que se une al antígeno al que se une el anticuerpo inalterado. Los ejemplos de fragmentos de anticuerpo incluyen, pero no se limitan a, Fv, Fab, Fab’, Fab’-SH, F(ab’)2¡ diacuerpos; anticuerpos lineales; moléculas de anticuerpos monocatenarios (por ejemplo, scFv) y anticuerpos multiespecíficos formados a partir de fragmentos de anticuerpo.
Un “anticuerpo que se une al mismo epítopo” que un anticuerpo de referencia se refiere a un anticuerpo que bloquea la unión del anticuerpo de referencia a su antígeno en un ensayo de competición en un 50 % o más y, a la inversa, el anticuerpo de referencia bloquea la unión del anticuerpo a su antígeno en un ensayo de competición en un 50 % o más. En el presente documento se proporciona un ensayo de competición ejemplar.
El término anticuerpo “quimérico” se refiere a un anticuerpo en el que una porción de la cadena pesada y/o ligera deriva de una fuente o especie particular, mientras que el resto de la cadena pesada y/o ligera deriva de una fuente o especie diferente.
La “clase” de un anticuerpo se refiere al tipo de dominio constante o región constante que posee su cadena pesada. Hay cinco clases principales de anticuerpos: IgA, IgD, IgE, IgG e IgM, y varias de estas se pueden dividir además en subclases (¡sotipos), por ejemplo, IgG-i, lgG2, lgG3, lgG4, IgAi e lgA2. Los dominios constantes de la cadena pesada que se corresponden a las diferentes clases de inmunoglobulinas se llaman a, 5, £, y y p, respectivamente.
El término “agente citotóxico” como se usa en el presente documento se refiere a una sustancia que inhibe o previene una función celular y/o provoca la muerte o destrucción celular. Los agentes citotóxicos incluyen, pero no se limitan a, isótopos radioactivos (por ejemplo, At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 e isótopos radioactivos de Lu); agentes o fármacos quimioterápicos (por ejemplo, metotrexato, adriamicina, alcaloides de la vinca (vincristina, vinblastina, etopósido), doxorrubicina, melfalán, mitomicina C, clorambucilo, daunorrubicina u otros agentes intercalantes); agentes inhibidores del crecimiento; enzimas y fragmentos de las mismas, tales como enzimas nucleolíticas; antibióticos; toxinas, tales como toxinas de micromoléculas o toxinas enzimáticamente activas de origen bacteriano, fúngico, vegetal o animal, incluyendo fragmentos y/o variantes de las mismas; y los diversos agentes antineoplásicos o antitumorales divulgados a continuación.
“Funciones efectoras” se refieren a las actividades biológicas atribuibles a la región Fe de un anticuerpo, que varían con el ¡sotipo del anticuerpo. Los ejemplos de funciones efectoras de anticuerpo incluyen: unión a C1q y citotoxicidad dependiente del complemento (CDC); unión al receptor Fe; citotoxicidad mediada por células dependiente de anticuerpos (ADCC); fagocitosis; la regulación por disminución de receptores de la superficie celular (por ejemplo, el receptor de linfocitos B); y activación de linfocitos B.
Una “cantidad eficaz” de un agente, por ejemplo, una formulación farmacéutica, se refiere a una cantidad eficaz, en las dosificaciones y durante periodos de tiempo necesarios, para lograr el resultado terapéutico o profiláctico deseado.
El término “región Fe” se usa en el presente documento para definir una región C terminal de una cadena pesada de inmunoglobulina que contiene al menos una porción de la región constante. El término incluye regiones Fe y regiones Fe variantes de secuencia natural. En un modo de realización, una región Fe de la cadena pesada de IgG humana se extiende desde Cys226, o desde Pro230, al extremo carboxílico de la cadena pesada. Sin embargo, la lisina C terminal (Fys447) de la región Fe puede o no estar presente. A menos que se especifique de otro modo en el presente documento, la numeración de los residuos de aminoácido en la región Fe o región constante se realiza de acuerdo
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con el sistema de numeración EU, también llamado índice EU, como se describe en Kabat etal., Sequences ofProteins of Immunological Interest, 5.a ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991.
“Región estructural” o “FR” se refiere a los residuos del dominio variable distintos de los residuos de la región hipervariable (HVR). La FR de un dominio variable consiste, en general, en cuatro dominios de FR: FR1, FR2, FR3 y FR4. En consecuencia, las secuencias de HVR y FR aparecen, en general, en la siguiente secuencia en VH (o VL): FR1-H1(L1 )-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.
Los términos “anticuerpo de longitud completa”, “anticuerpo inalterado” y “anticuerpo completo” se usan en el presente documento de manera intercambiable para referirse a un anticuerpo que tiene una estructura sustancialmente similar a una estructura de anticuerpo natural o que tiene cadenas pesadas que contienen una región Fe como se define en el presente documento.
Los términos “célula huésped”, “línea de células huésped” y “cultivo de células huésped” se usan de manera intercambiable y se refieren a células en las que se ha introducido ácido nucleico exógeno, incluyendo la descendencia de dichas células. Las células huésped incluyen “transformantes” y “células transformadas”, que incluyen la célula transformada primaria y la descendencia derivada de la misma independientemente del número de pases. La descendencia puede que no sea completamente idéntica en el contenido de ácido nucleico a una célula original, sino que puede contener mutaciones. La descendencia mutante que tiene la misma función o actividad biológica que la cribada o seleccionada en la célula transformada originalmente se incluye en el presente documento.
Un “anticuerpo humano” es uno que posee una secuencia de aminoácidos que se corresponde con la de un anticuerpo producido por un ser humano o una célula humana o derivado de una fuente no humana que utiliza repertorios de anticuerpos humanos u otras secuencias que codifican anticuerpos humanos. Esta definición de un anticuerpo humano excluye específicamente un anticuerpo humanizado que comprende residuos de unión a antígeno no humanos.
Una “estructura consenso humana” es una estructura que representa los residuos de aminoácido que se producen más comúnmente en una selección de secuencias estructurales de VL o VH de inmunoglobulina humana. En general, la selección de secuencias de VL o VH de inmunoglobulina humana es a partir de un subgrupo de secuencias de dominio variable. En general, el subgrupo de secuencias es un subgrupo como en Kabat et al., Sequences ofProteins of Immunological Interest, quinta edición, publicación del NIH 91-3242, Bethesda MD (1991), vols. 1-3. En un modo de realización, para el VL, el subgrupo es el subgrupo kappa I como en Kabat etal., supra. En un modo de realización, para el VH, el subgrupo es el subgrupo III como en Kabat et al., supra.
Un anticuerpo “humanizado” se refiere a un anticuerpo quimérico que comprende residuos de aminoácido de HVR no humanas y residuos de aminoácido de FR humanas. En determinados modos de realización, un anticuerpo humanizado comprenderá sustancialmente todos de al menos un dominio variable, y típicamente dos, en el que/en los que todas o sustancialmente todas las HVR (por ejemplo, CDR) se corresponden con las de un anticuerpo no humano y todas o sustancialmente todas las FR se corresponden con las de un anticuerpo humano. Un anticuerpo humanizado puede comprender opcionalmente al menos una porción de una región constante de anticuerpo derivada de un anticuerpo humano. Una “forma humanizada” de un anticuerpo, por ejemplo, un anticuerpo no humano, se refiere a un anticuerpo que se ha sometido a humanización.
El término “región hipervariable” o “HVR” como se usa en el presente documento se refiere a cada una de las regiones de un dominio variable de anticuerpo que son de secuencia hipervariable y/o forman bucles definidos estructuralmente (“bucles hipervariables”). En general, los anticuerpos tetracatenarios naturales comprenden seis HVR; tres en el VH (H1, H2, H3) y tres en el VL (L1, L2, L3). Las HVR comprenden, en general, residuos de aminoácido de los bucles hipervariables y/o de las “regiones determinantes de la complementariedad” (CDR), siendo las últimas las de variabilidad de secuencia más alta y/o estando implicadas en el reconocimiento antigénico. Una región HVR como se usa en el presente documento comprende cualquier número de residuos localizados dentro de las posiciones 24-36 (para L1), 46-56 (para L2), 89-97 (para L3), 26-35B (para H1), 47-65 (para H2) y 93-102 (para H3). Por lo tanto, una HVR incluye residuos en las posiciones descritas previamente:
A) 24-34 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (H2) y 96-101 (H3) (Chothia y Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987);
B) 24-34 de L1, 50-56 de L2, 89-97 de L3, 31-35B de H1, 50-65 de H2 y 95-102 de H3 (Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5.a ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991).
C) 30-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35 (H1), 47-58 (H2), 93-100a-j (H3) (MacCallum etal. J. Mol. Biol. 262:732- 745 (1996).
Con la excepción de CDR1 en VH, las CDR comprenden, en general, los residuos de aminoácido que forman los bucles hipervariables. Las CDR también comprenden “residuos determinantes de la especificidad” o “SDR”, que son los residuos que entran en contacto con el antígeno. Los SDR están contenidos dentro de regiones de las CDR, llamadas CDR abreviadas o a-CDR. Las a-CDR ejemplares (a-CDR-L1, a-CDR-L2, a-CDR-L3, a-CDR-H1, a-CDR-H2
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y a-CDR-H3) se producen en los residuos de aminoácido 31-34 de L1, 50-55 de L2, 89-96 de L3, 31-35B de H1, 50- 58 de H2 y 95-102 de H3. (Véase Almagro y Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008).) A menos que se indique de otro modo, los residuos de HVR y otros residuos en el dominio variable (por ejemplo, los residuos de FR) se numeran en el presente documento de acuerdo con Kabat et al., supra.
Un “inmunoconjugado” es un anticuerpo conjugado a una o más molécula(s) heterógena(s) que incluyen, pero no se limitan a, un agente citotóxico.
Un “individuo” o “sujeto” es un mamífero. Los mamíferos incluyen, pero no se limitan a, animales domesticados (por ejemplo, vacas, ovejas, gatos, perros y caballos), primates (por ejemplo, seres humanos y primates no humanos, tales como monos), conejos y roedores (por ejemplo, ratones y ratas). En determinados modos de realización, el individuo o sujeto es un ser humano.
Un anticuerpo “aislado” es uno que se ha separado de un componente de su entorno natural. En algunos modos de realización, un anticuerpo se purifica a más de un 95 % o 99 % de pureza determinada, por ejemplo, mediante electroforesis (por ejemplo, SDS-PAGE, isoelectroenfoque (IEF), electroforesis capilar) o cromatografía (por ejemplo, intercambio iónico o HPLC de fase inversa). Para obtener una revisión de los procedimientos para evaluar la pureza de los anticuerpos, véase, por ejemplo, Flatman et al., J. Chromatogr. B 848:79-87 (2007).
Un ácido nucleico “aislado” se refiere a una molécula de ácido nucleico que se ha separado de un componente de su entorno natural. Un ácido nucleico aislado incluye una molécula de ácido nucleico contenida en células que contienen habitualmente la molécula de ácido nucleico, pero la molécula de ácido nucleico está presente de manera extracromosómica en una localización cromosómica que es diferente de su localización cromosómica natural o contiene solo secuencias codificantes.
“Ácido nucleico aislado que codifica un anticuerpo anti-HtrA1” se refiere a una o más moléculas de ácido nucleico que codifican las cadenas pesada y ligera de anticuerpo (o fragmentos de las mismas), incluyéndose dicha(s) molécula(s) de ácido nucleico en un único vector o en vectores separados, y estando dicha(s) molécula(s) de ácido nucleico presente(s) en una o más localizaciones en una célula huésped.
El término “anticuerpo monoclonal” como se usa en el presente documento se refiere a un anticuerpo obtenido a partir de una población de anticuerpos sustancialmente homogéneos, es decir, los anticuerpos individuales que comprenden la población son idénticos y/o se unen al mismo epítopo, excepto por posibles anticuerpos variantes, por ejemplo, que contienen mutaciones naturales o surgen durante la producción de una preparación de anticuerpos monoclonales, estando presentes, en general, dichas variantes en cantidades insignificantes. A diferencia de las preparaciones de anticuerpos policlonales, que típicamente incluyen diferentes anticuerpos dirigidos frente a diferentes determinantes (epítopos), cada anticuerpo monoclonal de una preparación de anticuerpos monoclonales se dirige frente a un único determinante en un antígeno. Por tanto, el modificador “monoclonal” indica el carácter del anticuerpo por haberse obtenido a partir de una población sustancialmente homogénea de anticuerpos, y no se debe interpretar como que requiere la producción del anticuerpo mediante ningún procedimiento particular. Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales que se van a usar de acuerdo con la presente invención se pueden preparar mediante una variedad de técnicas, que incluyen, pero no se limitan al procedimiento de hibridoma, procedimientos de ADN recombinante, procedimientos de presentación en fagos y procedimientos que utilizan animales transgénicos que contienen todos o parte de los locus de inmunoglobulina humana; estando descritos en el presente documento dichos procedimientos y otros procedimientos ejemplares para preparar anticuerpos monoclonales.
Un “anticuerpo no marcado” se refiere a un anticuerpo que no está conjugado a un resto heterógeno, (por ejemplo, un resto citotóxico) o radiomarcador. El anticuerpo no marcado puede estar presente en una formulación farmacéutica.
“Anticuerpos naturales” se refieren a moléculas de inmunoglobulina natural con estructuras variables. Por ejemplo, los anticuerpos IgG naturales son glucoproteínas heterotetraméricas de aproximadamente 150.000 Dalton, compuestas de dos cadenas ligeras idénticas y dos cadenas pesadas idénticas que están unidas con puentes disulfuro. Desde el extremo N al C, cada cadena pesada tiene una región variable (VH), también llamada dominio pesado variable o dominio variable de la cadena pesada, seguida de tres dominios constantes (CH1, CH2 y CH3). De forma similar, desde el extremo N al C, cada cadena ligera tiene una región variable (VL), también llamada dominio ligero variable o dominio variable de la cadena ligera, seguida de un dominio ligero constante (CL). La cadena ligera de un anticuerpo se puede asignar a uno de dos tipos, llamados kappa (k) y lambda (A), basándose en la secuencia de aminoácidos de su dominio constante.
El término “prospecto del envase” se usa para hacer referencia a las instrucciones incluidas habitualmente en los envases comerciales de productos terapéuticos, que contienen información sobre las indicaciones, uso, dosificación, administración, politerapia, contraindicaciones y/o advertencias con respecto al uso de dichos productos terapéuticos.
“Porcentaje (%) de identidad de secuencia de aminoácidos” con respecto a una secuencia polipeptídica de referencia se define como el porcentaje de residuos de aminoácido de una secuencia candidata que son idénticos a los residuos de aminoácido de secuencia polipeptídica de referencia, después de alinear las secuencias e introducir huecos, si
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fuera necesario, para lograr el máximo porcentaje de identidad de secuencia, y sin tener en consideración ninguna sustitución conservadora como parte de la identidad de secuencia. Se puede lograr la alineación para fines de determinación del porcentaje de identidad de secuencia de aminoácidos de diversas maneras que se encuentran dentro de la experiencia en la técnica, por ejemplo, usando un programa informático disponible al público, tal como el programa informático BLAST, BLAST-2, ALIGN o Megalign (DNASTAR). Los expertos en la técnica pueden determinar los parámetros apropiados para alinear secuencias, incluyendo cualquier algoritmo necesario para lograr la alineación máxima sobre la longitud completa de las secuencias que se comparan. Para los fines en el presente documento, sin embargo, los valores del % de identidad de secuencia de aminoácidos se generan usando el programa de ordenador de comparación de secuencias ALIGN-2. El programa de ordenador de comparación de secuencias ALIGN-2 se creó por Genentech, Inc., y el código fuente se ha presentado con la documentación de usuario en la Oficina de Derechos de Autor de EE. UU., Washington DC, 20559, en la que se ha registrado con el n.° de registro de derechos de autor de EE. UU. TXU510087. El programa ALIGN-2 está disponible al público de Genentech, Inc., South San Francisco, California, o se puede compilar a partir del código fuente. El programa ALIGN-2 se debe compilar para su uso en un sistema operativo UNIX, incluyendo UNIX V4.0D digital. Todos los parámetros de comparación de secuencias se establecen por el programa ALIGN-2 y no varían.
En situaciones en las que se emplea ALIGN-2 para las comparaciones de secuencias de aminoácidos, el % de identidad de secuencia de aminoácidos de una secuencia de aminoácidos dada A con respecto a, con o frente a una secuencia de aminoácidos dada B (que, de forma alternativa, se puede parafrasear como una secuencia de aminoácidos dada A que tiene o comprende un determinado % de identidad de secuencia de aminoácidos con respecto a, con o frente a una secuencia de aminoácidos dada B) se calcula como sigue:
100 veces la fracción X/Y
en la que X es el número de residuos de aminoácido puntuados como emparejamientos idénticos mediante el programa de alineación de secuencias ALIGN-2 en esa alineación del programa de A y B, y en la que Y es el número total de residuos de aminoácido en B. Se apreciará que si la longitud de la secuencia de aminoácidos A no es igual a la longitud de la secuencia de aminoácidos B, el % de identidad de secuencia de aminoácidos de A con respecto a B no igualará el % de identidad de secuencia de aminoácidos de B con respecto a A. A menos que se indique específicamente de otro modo, todos los valores del % de identidad de secuencia de aminoácidos usados en el presente documento se obtienen como se describe en el párrafo inmediatamente precedente usando el programa de ordenador ALIGN-2.
El término “formulación farmacéutica” se refiere a una preparación que está en tal forma que permite la actividad biológica de un ingrediente activo contenido en la misma para que sea eficaz, y que no contiene ningún componente adicional que sea inaceptablemente tóxico para un sujeto al que se administrará la formulación.
Un “vehículo farmacéuticamente aceptable” se refiere a un ingrediente en una formulación farmacéutica, distinto de un ingrediente activo, que no sea tóxico para un sujeto. Un vehículo farmacéuticamente aceptable incluye, pero no se limita a, un tampón, excipiente, estabilizante o conservante.
El término “A asociada a alto requerimiento de temperatura” o “HtrA1”, como se usa en el presente documento, se refiere a cualquier HtrA1 natural de cualquier fuente de vertebrado, incluyendo mamíferos tales como primates (por ejemplo, seres humanos) y roedores (por ejemplo, ratones y ratas), a menos que se indique de otro modo. El término abarca la HtrA1 no procesada “de longitud completa”, así como cualquierforma de HtrA1 que resulte del procesamiento en la célula. El término también abarca variantes naturales de HtrA1, por ejemplo, variantes de empalme o variantes alélicas. Se muestra la secuencia de aminoácidos de una HtrA1 ejemplar en la SEQ ID NO: 13. Los fragmentos ejemplares de HtrA1 humana incluyen fragmentos que comprenden, que consisten esencialmente en, o que consisten en Q23-P480 o P161-K379 de aminoácido.
Como se usa en el presente documento, “tratamiento” (y las variaciones gramaticales del mismo, tales como “tratar” o “que trata”) se refiere a la intervención clínica en un intento de alterar la evolución natural del individuo que se trata, y que se puede realizar para la profilaxis o bien durante la evolución de una patología clínica. Los efectos deseables del tratamiento incluyen, pero no se limitan a, la prevención de la aparición o recidiva de la enfermedad, el alivio de los síntomas, la disminución de cualquier consecuencia patológica directa o indirecta de la enfermedad, la prevención de la metástasis, la disminución de la tasa de progresión de la enfermedad, la mejora o atenuación de la enfermedad y la remisión o el pronóstico mejorado. En algunos modos de realización, se usan los anticuerpos de la invención para retrasar el desarrollo de una enfermedad o para ralentizar la progresión de una enfermedad.
El término “región variable” o “dominio variable” se refiere al dominio de una cadena pesada o ligera de anticuerpo que está implicado en la unión del anticuerpo al antígeno. Los dominios variables de la cadena pesada y de la cadena ligera (VH y VL, respectivamente) de un anticuerpo natural, en general, tienen estructuras similares, comprendiendo cada dominio cuatro regiones estructurales (FR) conservadas y tres regiones hipervariables (HVR). (Véase, por ejemplo, Kindt et al. Kuby Immunology, 6.a ed., W.H. Freeman and Co., página 91 (2007)). Un único dominio VH o VL puede ser suficiente para conferir especificidad de unión a antígeno. Además, los anticuerpos que se unen a un antígeno particular se pueden aislar usando un dominio VH o VL de un anticuerpo que se une al antígeno para cribar
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una colección de dominios VL o VH complementarios, respectivamente. Véase, por ejemplo, Portolano et al., J. Immunol. 150:880-887 (1993); Clarkson et al., Nature 352:624-628 (1991).
El término “vector”, como se usa en el presente documento, se refiere a una molécula de ácido nucleico que puede propagar otro ácido nucleico al que se enlaza. El término incluye el vector como una estructura de ácido nucleico autorreplicante, así como el vector incorporado en el genoma de una célula huésped en la que se ha introducido. Determinados vectores pueden dirigir la expresión de los ácidos nucleicos a los que se enlazan funcionalmente. Dichos vectores se denominan en el presente documento “vectores de expresión”.
II. Composiciones y procedimientos
En un aspecto, la invención se basa, en parte, en el descubrimiento de que una reducción de la actividad de HtrA1 tiene efectos protectores sobre las células fotorreceptoras en el ojo, la capa nuclear externa y sobre la funcionalidad del electrorretinograma. En determinados modos de realización, se proporcionan anticuerpos que se unen a HtrA1. Los anticuerpos de la invención son útiles, por ejemplo, para el diagnóstico o tratamiento de diversas enfermedades asociadas a la actividad de HtrA1, incluyendo trastornos oculares, tales como degeneración macular senil o atrofia geográfica.
A. Anticuerpos anti-Htra1 ejemplares
La invención se dirige a un anticuerpo monoclonal aislado que se une a HtrA1 e inhibe su actividad serina proteasa para uno o más sustratos para HtrA1, en el que el anticuerpo comprende una secuencia de VH que comprende la SEQ ID NO: 32 y una secuencia de VL que comprende la SEQ ID NO: 31. Un anticuerpo anti-HtrA1 puede tener una o más de las siguientes propiedades: (i) tiene una CI50 de menos de 50 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 15 nM, 10 nM, 5 nM, 3 nM, 2,5 nM, 2 nM, 1 nM o menos para uno o más sustratos para HtrA1; (ii) se une a HtrA1 con una proporción de 1 dominio variable a una subunidad de un trímero de HtrA1 (por ejemplo, un Fab se une a un trímero de HtrA1 con una proporción de 3 Fab a 1 trímero de HtrA1 y una IgG se une a un trímero de HtrA1 con una proporción de 3 IgG a 2 trímeros de HtrA1), (iii) para los anticuerpos que comprenden dos dominios variables, se une a HtrA1 de una manera que da como resultado la formación de una “jaula” similar a la mostrada en la fig. 9, (iv) no previene la formación de trímeros de HtrA1, (v) se une a uno o más residuos en el bucle C de la proteína HtrA1, (vi) se une al dominio proteasa de HtrA1, (vii) se une a un epítopo que comprende uno o ambos de los aminoácidos N224 o K248 de SEQ ID NO: 13, o aminoácidos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente (por ejemplo, los aminoácidos N224 y K248 de SEQ ID NO: 14, véanse las figs. 10A-B); (viii) se une a un epítopo que comprende uno o más de los residuos N224, K248, V201, T223, K243, K225, E247 y H220 de SEQ ID NO: 13, o aminoácidos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente; (ix) reacciona de manera cruzada con HtrA1 murina; (x) no reacciona de manera cruzada con HtrA2, HtrA3 y/o HtrA4; (xi) se une de manera competitiva a HtrA1 con un anticuerpo que comprende una secuencia de VH de SEQ ID NO: 8 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 7 o (xii) se une a HtrA1 con una constante de disociación de <500 nM o (xiii) inhibe la formación de complejos entre HtrA1 y a1 antitripsina (A1AT).
Se divulga un anticuerpo anti-HtrA1 que comprende al menos una, dos, tres, cuatro, cinco o seis HVR seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 87; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 88; (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 85; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 58; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 86. En un modo de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 que comprende al menos una, dos, tres, cuatro, cinco o seis HVR seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 25; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 26; (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 23; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 24. En un modo de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 que comprende al menos una, dos, tres, cuatro, cinco o seis HVR seleccionadas de (a) HVR- H1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 4, 20, 47-51 y 75-80; (b) HVR-H2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 5, 52 y 81-82; (c) HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 6, 53 y 83-84; (d) HVR-L1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 1, 18, 21, 33 y 54-57; (e) HVR-L2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 2 y 58; y (f) HVR-L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO:3, 19, 22, 34-46 y 59-74. En un modo de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 que comprende al menos una, dos, tres, cuatro, cinco o seis HVR seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 18; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3. En un modo de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 que comprende al menos una, dos, tres, cuatro, cinco o seis HVR seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos
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de SEQ ID NO: 18; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19. En un modo de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 que comprende al menos una, dos, tres, cuatro, cinco o seis HVR seleccionadas de (a) HVR- H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR- L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22.
En un aspecto, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 87; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 88; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89. En un modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89. En otro modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89, y HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 86. En otro modo realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89, HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 86, y HVR- H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 88. En otro modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 87; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 88; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89.
En un aspecto, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 25; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 26; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27. En un modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27. En otro modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27, y HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 24. En otro modo realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27, HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 24, y HVR- H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 26. En otro modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 25; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 26; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27.
En un modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 4, 20, 47-51 y 75-80; (b) HVR-H2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 5, 52 y 81-82; y (c) HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 6, 53 y 83-84. En un modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 6 y 53. En otro modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 6, 53 y 83-84, y HVR-L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 3, 19, 22, 34-46 y 59-74. En otro modo realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 6, 53 y 83-84, HVR- L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 3, 19, 22, 34-46 y 59-74, y HVR-H2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 5, 52 y 81-82. En otro modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 4, 20, 47-51 y 75-80; (b) HVR-H2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 5, 52 y 81-82; y (c) HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 6, 53 y 83-84.
En un modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6. En un modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6. En otro modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6, y HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3. En otro modo realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6, HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3, y HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5. En otro modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6.
En un modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6. En un modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20. En otro modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que
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comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20, y HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19. En otro modo realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20, HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19, y HVR- H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5. En otro modo de realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20, y HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22. En otro modo realización, el anticuerpo comprende HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20, HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22, y HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5. En otro modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6.
En otro aspecto, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 85; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 58; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 86. En un modo de realización, la invención proporciona un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 23; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 24. En un modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 85; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 58; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 86. En un modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 23; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 24.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (a) HVR-L1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 1, 18, 21, 33 y 54-57; (b) HVR-L2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 2 y 58; y (c) HVR-L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 3, 19, 22, 34-46 y 59-74. En un modo de realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-L1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 1, 18, 21, 33 y 54-57; (b) HVR-L2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 2 y 58; y (c) HVR-L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 3, 19, 22, 34-46 y 59-74.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3. En un modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 18; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19. En un modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 18; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 21; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22. En un modo realización, el anticuerpo comprende (a) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 21; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22.
En otro aspecto, un anticuerpo comprende (a) un dominio VH, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (i) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 87, (ii) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 88, e (iii) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89; y (b) un dominio VL, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (i) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 85, (ii) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 58, y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 86. En un modo de realización, un anticuerpo comprende (a) un dominio VH, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (i) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 25, (ii) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 26, e (iii) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27; y (b) un dominio VL, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas
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de (i) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 23, (ii) HVR-L2, que comprende el secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2, y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 24.
En otro modo de realización, un anticuerpo comprende (a) un dominio VH, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (i) HVR-H1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 4, 20, 47-51 y 75-80, (ii) HVR-H2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 5, 52 y 81-82, e (iii) HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 6, 53 y 83-84; y (b) un dominio VL, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (i) HVR-L1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 1, 18, 21, 33 y 54-57, (ii) HVR-L2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 2 y 58, y (c) HVR-L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 3, 19, 22, 34-46 y 59-74.
En otro modo de realización, un anticuerpo comprende (a) un dominio VH, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (i) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4, (ii) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5, e (iii) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; y (b) un dominio VL, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (i) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1, (ii) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2, y (c) HVR- L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3.
En otro modo de realización, un anticuerpo comprende (a) un dominio VH, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (i) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20, (ii) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5, e (iii) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; y (b) un dominio VL, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (i) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 18, (ii) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2, y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19.
En otro aspecto, un anticuerpo comprende (a) un dominio VH, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VH seleccionadas de (i) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20, (ii) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5, e (iii) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; y (b) un dominio VL, que comprende al menos una, al menos dos o las tres secuencias de HVR de VL seleccionadas de (i) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 21, (ii) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2, y (c) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22.
En otro aspecto, se divulga un anticuerpo que comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 87; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 88; (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 89; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 85; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 58; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 86. En un modo de realización, la invención proporciona un anticuerpo que comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 25; (b) HVR- H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 26; (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 27; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 23; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 24.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende (a) HVR-H1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 4, 20, 47-51 y 75-80; (b) HVR-H2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 5, 52 y 81-82; (c) HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 6, 53 y 83-84; (d) HVR-L1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 1, 18, 21, 33 y 54-57; (e) HVR-L2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 2 y 58; y (f) HVR-L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 3, 19, 22, 34-46 y 59-74.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; (c) HVR- H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR- L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; (c) HVR- H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de
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aminoácidos de SEQ ID NO: 18; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19.
En otro modo de realización, se divulga un anticuerpo que comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; (c) HVR- H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22.
En cualquiera de los modos de realización anteriores, se humaniza un anticuerpo anti-HtrA1. En un modo de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 comprende HVR como en cualquiera de los modos de realización anteriores, y comprende además una estructura humana aceptara, por ejemplo, una estructura de inmunoglobulina humana o una estructura consenso humana. En otro modo de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 comprende HVR como en cualquiera de los modos de realización anteriores, y comprende además un VH que comprende una secuencia FR2 de SEQ ID NO:17.
En otro aspecto, un anticuerpo anti-HtrA1 comprende una secuencia de dominio variable de la cadena pesada (VH) que tiene al menos un 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % o 100 % de identidad de secuencia con respecto a la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de SEQ ID NO: 8 o 29. En determinados modos de realización, una secuencia de VH que tiene al menos un 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % o 99 % de identidad contiene sustituciones (por ejemplo, sustituciones conservadoras), inserciones o deleciones en relación con la secuencia de referencia, pero un anticuerpo anti-HtrA1 que comprenda esa secuencia retiene la capacidad de unirse a HtrA1. En determinados modos de realización, se han sustituido, insertado y/o delecionado un total de 1 a 10 aminoácidos en la SEQ ID NO: 8 o 29. En determinados modos de realización, las sustituciones, inserciones o deleciones se producen en regiones fuera de las HVR (es decir, en las FR). Opcionalmente, el anticuerpo anti-HtrA1 comprende la secuencia de VH en la SEQ ID NO: 8, 29 o 32, que incluye modificaciones postraduccionales de esa secuencia. En un modo de realización particular, el VH comprende una, dos o tres HVR seleccionadas de: (a) HVR-H1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: SEQ ID NO: 4, 20, 25 y 47-51, (b) HVR- H2, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 5, 26 y 52, y (c) HVR-H3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 6, 27 y 53.
En otro aspecto, se proporciona un anticuerpo anti-HtrA1, en el que el anticuerpo comprende un dominio variable de la cadena ligera (VL), que tiene al menos un 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 %, 99 % o 100 % de identidad de secuencia con respecto a la secuencia de aminoácidos de una cualquiera de SEQ ID NO: 7, 28 o 30. En determinados modos de realización, una secuencia de VL que tiene al menos un 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % o 99 % de identidad contiene sustituciones (por ejemplo, sustituciones conservadoras), inserciones o deleciones en relación con la secuencia de referencia, pero un anticuerpo anti-HtrA1 que comprenda esa secuencia retiene la capacidad de unirse a HtrA1. En determinados modos de realización, se han sustituido, insertado y/o delecionado un total de 1 a 10 aminoácidos en la SEQ ID NO: 7, 28 o 30. En determinados modos de realización, las sustituciones, inserciones o deleciones se producen en regiones fuera de las HVR (es decir, en las FR). Opcionalmente, el anticuerpo anti-HtrA1 comprende la secuencia de VL en la SEQ ID NO: 7, 28, 30 o 31, que incluye modificaciones postraduccionales de esa secuencia. En un modo de realización particular, el VL comprende una, dos o tres HVR seleccionadas de (a) HVR-L1, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 1, 18, 21,23 y 33; (b) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (c) HVR- L3, que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de SEQ ID NO: 3, 19, 22, 24 y 34-36.
En otro aspecto, se proporciona un anticuerpo anti-HtrA1, en el que el anticuerpo comprende un VH como en cualquiera de los modos de realización proporcionados anteriormente y un VL como en cualquiera de los modos de realización proporcionados anteriormente. En un modo de realización, el anticuerpo comprende las secuencias de VH y VL en la SEQ ID NO: 32 y SEQ ID NO: 31, respectivamente, que incluyen modificaciones postraduccionales de esas secuencias. En un modo de realización, el anticuerpo comprende las secuencias de VH y VL en la SEQ ID NO: 8 y SEQ ID NO: 7, respectivamente, que incluyen modificaciones postraduccionales de esas secuencias. En un modo de realización, el anticuerpo comprende las secuencias de VH y VL en la SEQ ID NO: 29 y SEQ ID NO: 28, respectivamente, que incluyen modificaciones postraduccionales de esas secuencias. En un modo de realización, el anticuerpo comprende las secuencias de VH y VL en la SEQ ID NO: 29 y SEQ ID NO: 30, respectivamente, que incluyen modificaciones postraduccionales de esas secuencias.
En otro aspecto, se divulga un anticuerpo que se une al mismo epítopo que un anticuerpo anti-HtrA1 proporcionado en el presente documento. Por ejemplo, en determinados modos de realización, se proporciona un anticuerpo que se une al mismo epítopo que un anticuerpo anti-HtrA1 que comprende una secuencia de VH de SEQ ID NO: 8 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 7. En determinados modos de realización, se proporciona un anticuerpo que se une a un epítopo de HtrA1 que contiene el residuo N224, K248, o ambos, de SEQ ID NO: 13, o residuos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente. En determinados modos de realización, el epítopo de HtrA1 comprende además uno o más de los siguientes residuos V201, T223, K243, K225, E247 y H220 de SEQ ID NO: 13, o aminoácidos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente. En determinados modos de realización, se proporciona un anticuerpo que se une a un epítopo de HtrA1 que contiene uno o más de los residuos N224, K248
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y V201 o todos de los anteriores de SEQ ID NO: 13, o residuos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente. En determinados modos de realización, se proporciona un anticuerpo que se une a un epítopo de HtrA1 que contiene uno o más de los residuos N224, K248, V201, T223 y K243 o todos de los anteriores de SEQ ID NO: 13, o residuos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente. En determinados modos de realización, se proporciona un anticuerpo que se une a un epítopo de HtrA1 que contiene uno o más de los residuos N224, K248, V201, T223, K243, K225, E247 y H22A o todos de los anteriores de SEQ ID NO: 13, o residuos equivalentes a los mismos en una secuencia de HtrA1 diferente. En determinados modos de realización, el epítopo es un epítopo lineal. En otros modos de realización, el epítopo es un epítopo conformacional.
En otro aspecto de la invención, un anticuerpo anti-HtrA1 de acuerdo con cualquiera de los modos de realización anteriores es un anticuerpo monoclonal, que incluye un anticuerpo quimérico, humanizado o humano. En un modo de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 es un fragmento de anticuerpo, por ejemplo, un fragmento Fv, Fab, Fab’, scFv, diacuerpo o F(ab’)2. En otro modo de realización, el anticuerpo es un anticuerpo de longitud completa, por ejemplo, un anticuerpo lgG1 inalterado u otra clase o isotipo de anticuerpo como se define en el presente documento.
En determinados modos de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 de acuerdo con cualquiera de los modos de realización anteriores no es un anticuerpo que tiene una secuencia de VH de SEQ ID NO: 8 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 7.
En otro aspecto, un anticuerpo anti-HtrA1 de acuerdo con cualquiera de los modos de realización anteriores puede incorporar cualquiera de las características, individualmente o en combinación, como se describen en las secciones 1-7 a continuación:
1. Afinidad del anticuerpo
En determinados modos de realización, un anticuerpo proporcionado en el presente documento tiene una constante de disociación (Kd) de < 1 pM, < 100 nM, < 10 nM, < 1 nM, < 0,1 nM, < 0,01 nM o < 0,001 nM (por ejemplo, 10'8 M o menos, por ejemplo, desde 10'8 M a 10'13 M, por ejemplo, desde 10'9 M a 10'13 M).
En un modo de realización, se mide la Kd mediante un ensayo de unión a antígeno radiomarcado (RIA) realizado con la versión Fab de un anticuerpo de interés y su antígeno como se describe mediante el siguiente ensayo. Se mide la afinidad de unión en solución de los Fab por el antígeno equilibrando los Fab con una concentración mínima de antígeno marcado con (125l) en presencia de una serie de valoraciones de antígeno no marcado, capturando, entonces, el antígeno unido con una placa recubierta con anticuerpo anti-Fab (véase, por ejemplo, Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881(1999)). Para establecer las condiciones para el ensayo, se recubren placas de múltiples pocilios MICROTITER® (Thermo Scientific) durante la noche con 5 pg/ml de un anticuerpo anti-Fab de captura (Cappel Labs) en carbonato de sodio 50 mM (pH 9,6) y posteriormente se bloquea con seroalbúmina bovina al 2 % (p/v) en PBS durante de dos a cinco horas a temperatura ambiente (aproximadamente 23 °C). En una placa no adsorbente (Nunc n.° 269620), se mezcla [125l]-antígeno 100 pM o 26 pM con diluciones en serie de un Fab de interés (por ejemplo, consistente con la evaluación del anticuerpo anti-VEGF, Fab-12, en Presta et al., Cáncer Res. 57:4593-4599 (1997)). Entonces, el Fab de interés se incuba durante la noche; sin embargo, la incubación puede continuar durante un periodo más largo (por ejemplo, de aproximadamente 65 horas) para garantizar que se alcanza el equilibrio. A continuación, se transfieren las mezclas a la placa de captura para su incubación a temperatura ambiente (por ejemplo, durante una hora). Entonces, se elimina la solución y la placa se lava ocho veces con polisorbato 20 (TWEEN-20®) al 0,1 % en PBS. Cuando las placas se hayan secado, se añaden 150 pl/pocillo de centelleador (MICROSCINT-20™; Packard) y las placas se cuentan en un contador gamma TOPCOUNT™ (Packard) durante diez minutos. Las concentraciones de cada Fab que dan menos que o igual a un 20 % de unión máxima se eligen para su uso en ensayos de unión competitiva.
De acuerdo con otro modo de realización, se mide la Kd usando ensayos de resonancia de plasmón superficial usando un dispositivo BIACORE®-2000 o uno BIACORE®-3000 (BIAcore, Inc., Piscataway, NJ) a 25 °C con matrices CM5 de antígeno inmovilizado a ~10 unidades de respuesta (UR). En resumen, se activan matrices de biosensor de dextrano carboximetilado (CM5, BIACORE, Inc) con clorhidrato de A/-etil-A/’-(3-dimetilaminopropil)carbodiimida (EDC) y N- hidroxisuccinimida (NHS) de acuerdo con las instrucciones del proveedor. El antígeno se diluye con acetato de sodio 10 mM, pH 4,8, en 5 pg/ml (—0,2 pM) antes de su inyección a un caudal de 5 pl/minuto para lograr aproximadamente 10 unidades de respuesta (UR) de proteína acoplada. Después de la inyección del antígeno, se inyecta etanolamina 1 M para bloquear los grupos sin reaccionar. Para las mediciones cinéticas, se inyectan diluciones en serie de dos veces de Fab (0,78 nM a 500 nM) en PBS con tensioactivo polisorbato 20 (TWEEN-20™) (PBST) al 0,05 % a 25 °C a un caudal de aproximadamente 25 pl/min. Se calculan las tasas de asociación (kon) y tasas de disociación (k0ff) usando un simple modelo de unión uno a uno de Langmuir (programa informático de evaluación de BIACORE®, versión 3.2) ajustando simultáneamente los sensogramas de asociación y disociación. La constante de disociación en equilibrio (Kd) se calcula como la proporción k0ff/k0n. Véase, por ejemplo, Chen et al., J. Mol. Biol. 293:865-881 (1999). Si la tasa de asociación excede 10® M V mediante el ensayo de resonancia de plasmón superficial anterior, entonces, se puede determinar la tasa de asociación usando una técnica de extinción fluorescente que mide el incremento o disminución de la intensidad de emisión de fluorescencia (excitación=295 nm; emisión=340 nm, paso de banda de 16 nm) a 25 °C de un anticuerpo anti-antígeno 20 nM (forma Fab) en PBS, pH 7,2, en presencia de concentraciones crecientes de
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antígeno medida en un espectrómetro, tal como un espectrofotómetro equipado con detención de flujo (Aviv Instruments) o un espectrofotómetro SLM-AMINCO™ de la serie 8000 (ThermoSpectronic) con una cubeta agitada.
2. Fragmentos de anticuerpo
En determinados modos de realización, un anticuerpo proporcionado en el presente documento es un fragmento de anticuerpo. Los fragmentos de anticuerpo incluyen, pero no se limitan a, los fragmentos Fab, Fab’, Fab’-SH, F(ab’)2, Fv y scFv, y otros fragmentos descritos a continuación. Para obtener una revisión de determinados fragmentos de anticuerpo, véase Hudson etal. Nat. Med. 9:129-134 (2003). Para obtener una revisión de los fragmentos scFv, véase, por ejemplo, Pluckthun, en The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, eds. Rosenburg y Moore, (Springer- Verlag, Nueva York), pp. 269-315 (1994); véase también el documento WO 93/16185; y las patentes de EE. UU. n.°s 5.571.894 y 5.587.458. Para obtener un análisis de los fragmentos Faby F(ab’)2 que comprenden residuos de epítopos de unión al receptor de rescate y que tienen una semivida in vivo incrementada, véase la patente de EE. UU. n.° 5.869.046.
Los diacuerpos son fragmentos de anticuerpo con dos sitios de unión a antígeno que pueden ser bivalentes o biespecíficos. Véase, por ejemplo, el documento EP 404,097; el documento WO 1993/01161; Hudson etal., Nat. Med. 9:129-134 (2003); y Hollinger et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 90: 6444-6448 (1993). Los triacuerpos y tetracuerpos también se describen en Hudson et al., Nat. Med. 9:129-134 (2003).
Los anticuerpos de único dominio son fragmentos de anticuerpo que comprenden todo o una porción del dominio variable de la cadena pesada o todo o una porción del dominio variable de la cadena ligera de un anticuerpo. En determinados modos de realización, un anticuerpo de único dominio es un anticuerpo de único dominio humano (Domantis, Inc., Waltham, MA; véase, por ejemplo, la patente de EE. UU. n.° 6.248.516 B1).
Se pueden preparar fragmentos de anticuerpo mediante diversas técnicas que incluyen, pero no se limitan a, digestión proteolítica de un anticuerpo inalterado, así como la producción mediante células huésped recombinantes (por ejemplo, E. coli o fago), como se describe en el presente documento.
3. Anticuerpos quiméricos y humanizados
En determinados modos de realización, un anticuerpo proporcionado en el presente documento es un anticuerpo quimérico. Se describen determinados anticuerpos quiméricos, por ejemplo, en la patente de EE. UU. n.° 4.816.567; y Morrison etal., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984)). En un ejemplo, un anticuerpo quimérico comprende una región variable no humana (por ejemplo, una región variable derivada de un ratón, rata, hámster, conejo o primate no humano, tal como un mono) y una región constante humana. En otro ejemplo, un anticuerpo quimérico es un anticuerpo de “clase cambiada” en el que se ha cambiado la clase o subclase de la del anticuerpo original. Los anticuerpos quiméricos incluyen fragmentos de unión a antígeno de los mismos.
En determinados modos de realización, un anticuerpo quimérico es un anticuerpo humanizado. Típicamente, se humaniza un anticuerpo no humano para reducir la inmunogenia en los seres humanos, al mismo tiempo que se retienen la especificidad y afinidad del anticuerpo no humano original. En general, un anticuerpo humanizado comprende uno o más dominios variables en los que las HVR, por ejemplo, las CDR (o porciones de las mismas), derivan de un anticuerpo no humano y las FR (o porciones de las mismas) derivan de secuencias de anticuerpos humanos. Un anticuerpo humanizado también comprenderá opcionalmente al menos una porción de una región constante humana. En algunos modos de realización, se sustituyen algunos residuos de FR en un anticuerpo humanizado con los residuos correspondientes de un anticuerpo no humano (por ejemplo, el anticuerpo del que derivan los residuos de HVR), por ejemplo, para restablecer o mejorar la especificidad o afinidad del anticuerpo.
Los anticuerpos humanizados y los procedimientos de preparación de los mismos se revisan, por ejemplo, en Almagro y Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008), y se describen además, por ejemplo, en Riechmann et al., Nature 332:323-329 (1988); Queen et al., Proc. Nati Acad. Sci. USA 86:10029-10033 (1989); las patentes de EE. UU. n.°s 5.821.337, 7.527.791,6.982.321 y 7.087.409; Kashmiri et al, Methods 36:25-34 (2005) (que describe el injerto de SDR (a-CDR)); Padlan, Mol. Immunol. 28:489-498 (1991) (que describe el “revestimiento”); Dall’Acqua et al., Methods 36:43-60 (2005) (que describe el “reordenamiento de FR”); y Osbourn et al., Methods 36:61-68 (2005) y Klimka et al., Br. J. Cáncer, 83:252-260 (2000) (que describen el enfoque de “selección guiada” con respecto al reordenamiento de FR).
Las regiones estructurales humanas que se pueden usar para la humanización incluyen, pero no se limitan a: regiones estructurales seleccionadas usando el procedimiento de “mejor ajuste” (véase, por ejemplo, Sims et al. J. Immunol. 151:2296 (1993)); regiones estructurales derivadas de la secuencia consenso de anticuerpos humanos de un subgrupo particular de las regiones variables de la cadena ligera o pesada (véase, por ejemplo, Cárter et al. Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 89:4285 (1992); y Presta et al. J. Immunol., 151:2623 (1993)); regiones estructurales (mutadas de manera somática) maduras humanas o regiones estructurales de la estirpe germinal humana (véase, por ejemplo, Almagro y Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008)); y regiones estructurales derivadas del cribado de colecciones de FR (véase, por ejemplo, Baca et al., J. Biol. Chem. 272:10678-10684 (1997) y Rosok et al., J. Biol. Chem. 271:22611-
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4. Anticuerpos humanos
En determinados modos de realización, un anticuerpo proporcionado en el presente documento es un anticuerpo humano. Se pueden producir anticuerpos humanos usando diversas técnicas conocidas en la técnica. Los anticuerpos humanos se describen, en general, en van Dijk y van de Winkel, Curr. Opin. Pharmacol. 5: 368-74 (2001) y Lonberg, Curr. Opin. Immunol. 20:450-459 (2008).
Se pueden preparar anticuerpos humanos administrando un inmunógeno a un animal transgénico que se ha modificado para producir anticuerpos humanos inalterados o anticuerpos inalterados con regiones variables humanas en respuesta a la exposición a antígeno. Dichos animales típicamente contienen todos o una porción de los locus de inmunoglobulina humana, que remplazan a los locus de inmunoglobulina endógena, o que están presentes de manera extracromosómica o integrados aleatoriamente en los cromosomas del animal. En dichos ratones transgénicos, los locus de inmunoglobulina endógena, en general, se han inactivado. Para obtener una revisión de los procedimientos para obtener anticuerpos humanos a partir de animales transgénicos, véase Lonberg, Nat. Biotech. 23:1117-1125 (2005). Véase también, por ejemplo, las patentes de EE. UU. n.°s 6.075.181 y 6.150.584 que describen la tecnología XENOMOUSE™; la patente de EE. UU. n.° 5.770.429 que describe la tecnología HuMAB®; la patente de EE. UU. n.° 7.041.870 que describe la tecnología K-M MOUSE® y la publicación de solicitud de patente de EE. UU. n.° US 2007/0061900, que describe la tecnología VelociMouse®). Las regiones variables humanas de anticuerpos inalterados generados por dichos animales se pueden modificar adicionalmente, por ejemplo, mediante combinación con una región constante humana diferente.
También se pueden preparar anticuerpos humanos mediante procedimientos basados en hibridoma. Se han descrito líneas de células de mieloma humano y de heteromieloma humano-murino para la producción de anticuerpos monoclonales humanos. (Véase, por ejemplo, Kozbor J. Immunol., 133: 3001 (1984); Brodeur et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., Nueva York, 1987); y Boemer etal., J. Immunol., 147: 86 (1991)). Los anticuerpos humanos generados por medio de tecnología de hibridoma de linfocitos B humanos también se describen en L¡ et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 103:3557-3562 (2006). Los procedimientos adicionales incluyen aquellos descritos, por ejemplo, en la patente de EE. UU. n.° 7.189.826 (que describe la producción de anticuerpos IgM humanos monoclonales a partir de líneas de células de hibridoma) y Ni, Xiandai Mianyixue, 26(4):265-268 (2006) (que describe hibridomas humanos-humanos). La tecnología de hibridoma humano (tecnología de trioma) también se describe en Vollmers y Brandlein, Histology and Histopathology, 20(3):927-937 (2005) y Vollmers y Brandlein, Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology, 27(3): 185-91 (2005).
También se pueden generar anticuerpos humanos aislando secuencias de dominio variable del clon Fv seleccionadas de colecciones de presentación en fagos derivadas de seres humanos. Entonces, se pueden combinar dichas secuencias de dominio variable con un dominio constante humano deseado. Las técnicas para seleccionar anticuerpos humanos a partir de colecciones de anticuerpos se describen a continuación.
5. Anticuerpos derivados de colecciones
Se pueden aislar los anticuerpos de la invención cribando colecciones combinatorias para determinar los anticuerpos con la actividad o las actividades deseada(s). Por ejemplo, se conoce una variedad de procedimientos en la técnica para generar colecciones de presentación en fagos y cribar dichas colecciones para determinar los anticuerpos que poseen las características de unión deseadas. Dichos procedimientos se revisan, por ejemplo, en Hoogenboom et al. en Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O’Brien etal., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001) y se describen además, por ejemplo, en McCafferty et al., Nature 348:552-554; Clackson et al., Nature 352: 624-628 (1991); Marks et al., J. Mol. Biol. 222: 581-597 (1992); Marks y Bradbury, en Methods in Molecular Biology 248:161-175 (Lo, ed., Human Press, Totowa, NJ, 2003); Sidhu etal., J. Mol. Biol. 338(2): 299-310 (2004); Lee etal., J. Mol. Biol. 340(5): 1073-1093 (2004); Fellouse, Proc. Nati. Acad. Sci. USA 101(34): 12467-12472 (2004); y Lee et al., J. Immunol. Methods 284(1- 2): 119-132 (2004).
En determinados procedimientos de presentación en fagos, los repertorios de genes de VH y VL se clonan por separado mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y se recombinan aleatoriamente en colecciones de fagos, que, entonces, se pueden cribar para determinar el fago de unión a antígeno como se describe en Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12: 433-455 (1994). Los fagos típicamente presentan fragmentos de anticuerpo, como fragmentos Fv monocatenarios (scFv) o bien como fragmentos Fab. Las colecciones de fuentes inmunizadas proporcionan anticuerpos de afinidad alta con respecto al inmunógeno sin el requerimiento de construcción de hibridomas. De forma alternativa, se puede clonar el repertorio sin exposición previa (por ejemplo, de un ser humano) para proporcionar una única fuente de anticuerpos para una amplia gama de antígenos propios y también no propios sin ninguna inmunización como se describe por Griffiths et al., EMBO J, 12: 725-734 (1993). Finalmente, también se pueden preparar de manera sintética colecciones sin exposición previa clonando segmentos génicos V no reordenados a partir de células madre y usando cebadores de PCR que contienen secuencias aleatorias para codificar las regiones CDR3 altamente variables y conseguir el reordenamiento in vitro, como se describe por Hoogenboom y Winter, J. Mol. Biol., 227: 381-388 (1992). Las publicaciones de patente que describen colecciones de fagos de anticuerpos humanos
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incluyen, por ejemplo: la patente de EE. UU. n.° 5.750.373 y las publicaciones de patente de EE. UU. n.°s 2005/0079574, 2005/0119455, 2005/0266000, 2007/0117126, 2007/0160598, 2007/0237764, 2007/0292936 y 2009/0002360.
Los anticuerpos o fragmentos de anticuerpo aislados de colecciones de anticuerpos humanos se consideran anticuerpos humanos o fragmentos de anticuerpo humanos en el presente documento.
6. Anticuerpos multiespecíficos
En determinados modos de realización, un anticuerpo proporcionado en el presente documento es un anticuerpo multiespecífico, por ejemplo, un anticuerpo biespecífico. Los anticuerpos multiespecíficos son anticuerpos monoclonales que tienen especificidades de unión por al menos dos sitios diferentes. En determinados modos de realización, una de las especificidades de unión es para HtrA1 y la otra es para cualquier otro antígeno. En determinados modos de realización, los anticuerpos biespecíficos se pueden unir a dos epítopos diferentes de HtrA1. También se pueden usar anticuerpos biespecíficos para localizar agentes citotóxicos con respecto a las células que expresen HtrA1. Se pueden preparar anticuerpos biespecíficos como anticuerpos de longitud completa o fragmentos de anticuerpo.
Las técnicas para preparar anticuerpos multiespecíficos incluyen, pero no se limitan a, la coexpresión recombinante de dos pares de cadena pesada-cadena ligera de ¡nmunoglobulina que tengan especificidades diferentes (véase Milstein y Cuello, Nature 305: 537 (1983)), el documento WO 93/08829 y Traunecker et al., EMBOJ. 10: 3655 (1991)) y la genomodificación “botón en ojal” (véase, por ejemplo, la patente de EE. UU. n.° 5.731.168). También se pueden preparar anticuerpos multiespecíficos genomodificando los efectos de conducción electrostática para preparar moléculas heterodiméricas de Fe de anticuerpo (documento WO 2009/089004); reticulando dos o más anticuerpos o fragmentos (véanse, por ejemplo, la patente de EE. UU. n.° 4.676.980 y Brennan et al., Science, 229: 81 (1985)); usando cremalleras de leucinas para producir anticuerpos biespecíficos (véase, por ejemplo, Kostelny et al., J. Immunol., 148(5): 1547-1553 (1992)); usando la tecnología de “diacuerpos” para preparar fragmentos de anticuerpo biespecífico (véase, por ejemplo, Hollinger et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)); y usando dímeros de Fv monocatenarios (sFv) (véase, por ejemplo, Gruber et al., J. Immunol., 152:5368 (1994)); y preparando anticuerpos triespecíficos como se describe, por ejemplo, en Tutt et al. J. Immunol. 147: 60 (1991).
También se incluyen en el presente documento anticuerpos genomodificados con tres o más sitios de unión a antígeno funcionales, incluyendo los “anticuerpos pulpo” (véase, por ejemplo, el documento US 2006/0025576A1).
El anticuerpo o fragmento en el presente documento también incluye un “Fab de doble acción” o “DAF” que comprende un sitio de unión a antígeno que se une al HtrA1, así como otro antígeno diferente (véase, el documento US 2008/0069820, por ejemplo).
7. Variantes de anticuerpo
En determinados modos de realización, se contemplan variantes de secuencia de aminoácidos de los anticuerpos proporcionados en el presente documento. Por ejemplo, puede ser deseable mejorar la afinidad de unión y/u otras propiedades biológicas del anticuerpo. Las variantes de secuencia de aminoácidos de un anticuerpo se pueden preparar introduciendo modificaciones apropiadas en la secuencia de nucleótidos que codifica el anticuerpo o mediante síntesis de péptidos. Dichas modificaciones incluyen, por ejemplo, deleciones de y/o inserciones en y/o sustituciones de residuos dentro de las secuencias de aminoácidos del anticuerpo. Se puede realizar cualquier combinación de deleción, inserción y sustitución para llegar a la construcción final, siempre que la construcción final posea las características deseadas, por ejemplo, unión a antígeno.
a) Variantes de sustitución, inserción v deleción
En determinados modos de realización, se proporcionan variantes de anticuerpo que tienen una o más sustituciones de aminoácidos. Los sitios de interés para la mutagénesis de sustitución incluyen las HVR y las FR. En la tabla 1 se muestran sustituciones conservadoras bajo el encabezado “sustituciones conservadoras”. Se proporcionan cambios más sustanciales en la tabla 1 bajo el encabezamiento de “sustituciones ejemplares” y como se describe además a continuación en referencia a las clases de cadena lateral de los aminoácidos. Se pueden introducir sustituciones de aminoácidos en un anticuerpo de interés y cribar los productos para determinar una actividad deseada, por ejemplo, unión a antígeno retenida/mejorada, inmunogenia disminuida, o ADCC o CDC mejorada.
TABLA 1
- Residuo original
- Sustituciones ejemplares Sustituciones preferentes
- Ala (A)
- Val; Leu; lie Val
- Arg (R)
- Lys; Gln; Asn Lys
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- Asn (N)
- Gln; His; Asp, Lys; Arg Gln
- Asp (D)
- Glu; Asn Glu
- Cys (C)
- Ser; Ala Ser
- Gln (Q)
- Asn; Glu Asn
- Glu (E)
- Asp; Gln Asp
- Gly (G)
- Ala Ala
- His (H)
- Asn; Gln; Lys; Arg Arg
- He (I)
- Leu; Val; Met; Ala; Phe; Norleucina Leu
- Leu (L)
- Norleucina; lie; Val; Met; Ala; Phe lie
- Lys (K)
- Arg; Gin; Asn Arg
- Met (M)
- Leu; Phe; lie Leu
- Phe (F)
- Trp; Leu; Val; lie; Ala; Tyr Tyr
- Pro (P)
- Ala Ala
- Ser (S)
- Thr Thr
- Thr (T)
- Val; Ser Ser
- Trp (W)
- Tyr; Phe Tyr
- Tyr (Y)
- Trp; Phe; Thr; Ser Phe
- Val (V)
- lie; Leu; Met; Phe; Ala; Norleucina Leu
Los aminoácidos se pueden agrupar de acuerdo con las propiedades comunes de cadena lateral:
(1) hidrófobos: norleucina, Met, Ala, Val, Leu, lie;
(2) hidrófilos neutros: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) ácidos: Asp, Glu;
(4) básicos: His, Lys, Arg;
(5) residuos que influyen en la orientación de la cadena: Gly, Pro;
(6) aromáticos: Trp, Tyr, Phe.
Las sustituciones no conservadoras supondrán el intercambiar un miembro de una de estas clases por otra clase.
Un tipo de variante de sustitución implica sustituir uno o más residuos de la región hipervariable de un anticuerpo original (por ejemplo, un anticuerpo humanizado o humano). En general, la(s) variante(s) resultante(s) seleccionada(s) para su estudio adicional tendrán modificaciones (por ejemplo, mejoras) en determinadas propiedades biológicas (por ejemplo, afinidad incrementada, inmunogenia reducida) en relación con el anticuerpo original y/o habrán retenido sustancialmente determinadas propiedades biológicas del anticuerpo original. Una variante de sustitución ejemplar es un anticuerpo con maduración de la afinidad, que se puede generar convenientemente, por ejemplo, usando técnicas de maduración de la afinidad basadasen presentación en fagos, tales como las descritas en el presente documento. En resumen, se mutan uno o más residuos de HVR y los anticuerpos variantes se presentan en fagos y se criban para determinar una actividad biológica particular (por ejemplo, la afinidad de unión).
Se pueden realizar alteraciones (por ejemplo, sustituciones) en las HVR, por ejemplo, para mejorar la afinidad del anticuerpo. Se pueden realizar dichas alteraciones en “puntos calientes” de la HVR, es decir, residuos codificados por codones que se someten a una mutación con alta frecuencia durante el proceso de maduración somática (véase, por ejemplo, Chowdhury, Methods Mol. Biol. 207:179-196 (2008)), y/o en los SDR (las a-CDR), sometiendo a prueba el VH o VL variante resultante para determinar su afinidad de unión. La maduración de la afinidad construyendo y seleccionando de nuevo a partir de colecciones secundarias se ha descrito, por ejemplo, en Hoogenboom et al. en Methods in Molecular Biology 178:1-37 (O’Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, (2001)). En algunos modos de realización de la maduración de la afinidad, se introduce la diversidad en los genes variables elegidos para su maduración mediante cualquiera de una variedad de procedimientos (por ejemplo, PCR propensa a error,
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reordenamiento de cadenas o mutagénesis dirigida por oligonucleótidos). Entonces, se crea una segunda colección. Entonces, se criba la colección para identificar cualquier variante de anticuerpo con la afinidad deseada. Otro procedimiento para introducir diversidad implica enfoques dirigidos a HVR, en los que se aleatorizan varios residuos de HVR (por ejemplo, 4-6 residuos a la vez). Se pueden identificar específicamente los residuos de HVR implicados en la unión a antígeno, por ejemplo, usando modelado o mutagénesis por barrido de alanina. A menudo se seleccionan como dianas en particular CDR-H3 y CDR-L3.
En determinados modos de realización, se pueden producir sustituciones, inserciones o deleciones en una o más HVR, siempre que dichas alteraciones no reduzcan sustancialmente la capacidad del anticuerpo de unirse al antígeno. Por ejemplo, se pueden realizar alteraciones conservadoras (por ejemplo, sustituciones conservadoras como se proporciona en el presente documento) que no reduzcan sustancialmente la afinidad de unión en las HVR. Dichas alteraciones pueden estar fuera de los “puntos calientes” de la HVR o de los SDR. En determinados modos de realización de las secuencias de VH y VL variantes proporcionadas anteriormente, cada HVR está inalterada o bien no contiene más de una, dos o tres sustituciones de aminoácidos.
Un procedimiento útil para la identificación de residuos o regiones de un anticuerpo que se pueden seleccionar como dianas para la mutagénesis se llama “mutagénesis por barrido de alanina” como se describe por Cunningham y Wells (1989) Science, 244:1081-1085. En este procedimiento, se identifica un residuo o grupo de residuos diana (por ejemplo, residuos cargados, tales como arg, asp, his, lys y glu) y se remplazan por un aminoácido neutro o cargado negativamente (por ejemplo, alanina o polialanina) para determinar si la interacción del anticuerpo con el antígeno se ve afectada. Se pueden introducir otras sustituciones en las localizaciones de aminoácidos que demuestren sensibilidad funcional a las sustituciones iniciales. De forma alternativa, o adicionalmente, una estructura cristalina de un complejo antígeno-anticuerpo para identificar los puntos de contacto entre el anticuerpo y el antígeno. Dichos residuos de contacto y residuos adyacentes se pueden seleccionar como diana o eliminar como candidatos para la sustitución. Las variantes se pueden cribar para determinar si contienen las propiedades deseadas.
Las inserciones en la secuencia de aminoácidos incluyen fusiones amino y/o carboxiterminales que varían en longitud desde un residuo a polipéptidos que contienen cien residuos o más, así como inserciones intrasecuenciales de residuos de aminoácido únicos o múltiples. Los ejemplos de inserciones terminales incluyen un anticuerpo con un residuo de metionilo N terminal. Otras variantes de inserción de la molécula de anticuerpo incluyen la fusión al extremo N o C del anticuerpo a una enzima (por ejemplo, para ADEPT) o un polipéptido que incremente la semivida en suero del anticuerpo.
b) Variantes de qlucosilación
En determinados modos de realización, se altera un anticuerpo proporcionado en el presente documento para incrementar o disminuir el grado en el que el anticuerpo se glucosila. La adición o deleción de sitios de glucosilación a un anticuerpo se puede conseguir convenientemente alterando la secuencia de aminoácidos de tal manera que se cree o elimine uno o más sitios de glucosilación.
Cuando el anticuerpo comprende una región Fe, se puede alterar el hidrato de carbono fijado a la misma. Los anticuerpos naturales producidos por células de mamífero típicamente comprenden un oligosacárido biantenario ramificado que se fija, en general, mediante un enlace de N a Asn297 del dominio CH2 de la región Fe. Véase, por ejemplo, Wright et al. TIBTECH 15:26-32 (1997). El oligosacárido puede incluir diversos hidratos de carbono, por ejemplo, mañosa, N-acetilglucosamina (GIcNAc), galactosa y ácido siálico, así como una fucosa fijada a una GIcNAc en el “tallo” de la estructura de oligosacárido biantenario. En algunos modos de realización, se pueden realizar modificaciones del oligosacárido en un anticuerpo de la invención a fin de crear variantes de anticuerpo con determinadas propiedades mejoradas.
En un modo de realización, se proporcionan variantes de anticuerpo que tienen una estructura glucídica que carece de fucosa fijada (directa o indirectamente) a una región Fe. Por ejemplo, la cantidad de fucosa en dicho anticuerpo puede ser desde un 1 % a un 80 %, desde un 1 % a un 65 %, desde un 5 % a un 65 % o desde un 20 % a un 40 %. La cantidad de fucosa se determina calculando la cantidad promedio de fucosa dentro de la cadena glucídica en Asn297, en relación con la suma de todas las glucoestructuras fijadas a Asn297 (por ejemplo, estructuras complejas, híbridas y de alto contenido en mañosa) como se mide mediante espectrometría de masas MALDI-TOF, como se describe, por ejemplo, en el documento WO 2008/077546. Asn297 se refiere al residuo de asparagina localizado en aproximadamente la posición 297 en la región Fe (numeración EU de los residuos de la región Fe); sin embargo, también se puede localizar Asn297 aproximadamente ± 3 aminoácidos en dirección 5' o en dirección 3' de la posición 297, es decir, entre las posiciones 294 y 300, debido a variaciones de secuencia insignificantes en los anticuerpos. Dichas variantes de fucosilación pueden tener una función ADCC mejorada. Véase, por ejemplo, la publicación de patente de EE. UU. n.°s US 2003/0157108 (Presta, L); US 2004/0093621 (Kyowa Hakko KogyoCo., Ltd). Los ejemplos de publicaciones relacionadas con variantes de anticuerpo “desfucosilado” o “deficitario en fucosa” incluyen: los documentos US 2003/0157108; WO 2000/61739; WO 2001/29246; US 2003/0115614; US 2002/0164328; US 2004/0093621; US 2004/0132140; US 2004/0110704; US 2004/0110282; US 2004/0109865; WO 2003/085119; WO 2003/084570; WO 2005/035586; WO 2005/035778; W02005/053742; W02002/031140; Okazaki et al. J. Mol. Biol. 336:1239-1249 (2004); Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004). Los ejemplos de líneas de células que
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pueden producir anticuerpos desfucosilados incluyen células CHO Lec13 deficitarias en fucosilación de proteínas (Ripka et al. Arch. Biochem. Biophys. 249:533-545 (1986); solicitud de pat. de EE. UU. n.° US 2003/0157108 A1, Presta, L; y el documento WO 2004/056312 A1, Adams et al., especialmente en el ejemplo 11) y líneas de células con genes inactivados, tales como células CHO con genes inactivados, como el gen alfa-1,6-fucosiltransferasa, FUT8 (véase, por ejemplo, Yamane-Ohnuki et al. Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004); Kanda, Y. et al., Biotechnol. Bioeng., 94(4):680-688 (2006); y el documento W02003/085107).
Se pueden proporcionar además variantes de anticuerpo con oligosacáridos bisecados, por ejemplo, en las que un oligosacárido biantenario fijado a la región Fe del anticuerpo se biseca mediante GIcNAc. Dichas variantes de anticuerpo pueden tener una fucosilación reducida y/o función ADCC mejorada. Los ejemplos de dichas variantes de anticuerpo se describen, por ejemplo, en el documento WO 2003/011878 (Jean-Mairet et al.y, la patente de EE. UU. n.° 6.602.684 (Umana et al.y y el documento US 2005/0123546 (Umana et al.). También se proporcionan variantes de anticuerpo con al menos un residuo de galactosa en el oligosacárido fijado a la región Fe. Dichas variantes de anticuerpo pueden tener una función CDC mejorada. Dichas variantes de anticuerpo se describen, por ejemplo, en el documento WO 1997/30087 (Patel et al.): el documento WO 1998/58964 (Raju, S.); y el documento WO 1999/22764 (Raju, S.).
c) Variantes de la región Fe
En determinados modos de realización, se pueden introducir una o más modificaciones de aminoácidos en la región Fe de un anticuerpo proporcionado en el presente documento, generando de este modo una variante de la región Fe. La variante de la región Fe puede comprender una secuencia de la región Fe humana (por ejemplo, una región Fe de lgG1, lgG2, lgG3 o lgG4 humana) que comprende una modificación de aminoácidos (por ejemplo, una sustitución) en una o más posiciones de aminoácido.
En determinados modos de realización, la invención contempla una variante de anticuerpo que posee algunas, pero no todas, las funciones efectoras, que le convierten en un candidato deseable para aplicaciones en las que la semivida del anticuerpo in vivo es importante, aun así, determinadas funciones efectoras (tales como el complemento y la ADCC) son innecesarias o perjudiciales. Se pueden realizar ensayos de citotoxicidad in vitroylo in vivo para confirmar la reducción/disminución de las actividades CDC y/o ADCC. Por ejemplo, se pueden realizar ensayos de unión al receptor Fe (FcR) para garantizar que el anticuerpo carezca de unión a FcyR (de ahí que sea probable que carezca de actividad ADCC), pero retenga su capacidad de unión a FcRn. Las células primarias para mediar en la ADCC, los linfocitos NK, solo expresan FcyRIII, mientras que los monocitos expresan FcyRI, FcyRII y FcyRIII. La expresión de FcR en células hematopoyéticas se resume en la tabla 3 en la página 464 de Ravetch y Kinet, Annu. Rev. Immunol. 9:457-492 (1991). Los ejemplos no limitantes de ensayos in vitro para evaluar la actividad ADCC de una molécula de interés se describen en la patente de EE. UU. n.° 5.500.362 (véase, por ejemplo, Hellstrom, I. et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 83:7059-7063 (1986)) y Hellstrom, I et al., Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 82:1499-1502 (1985); el documento 5.821.337 (véase Bruggemann, M. et al., J. Exp. Med. 166:1351-1361 (1987)). De forma alternativa, se pueden emplear procedimientos de ensayo no radiactivo (véase, por ejemplo, el ensayo de citotoxicidad no radiactivo ACTI™ para citometría de flujo (CellTechnology, Inc. Mountain View, CA; y el ensayo de citotoxicidad no radiactivo CytoTox 96® (Promega, Madison, Wl). Las células efectoras útiles para dichos ensayos incluyen células mononucleares de sangre periférica (PBMC) y linfocitos citolíticos naturales (NK). De forma alternativa, o adicionalmente, se puede evaluar in vivo la actividad ADCC de la molécula de interés, por ejemplo, en un modelo animal tal como el divulgado en Clynes et al. Proc. Nat'l Acad. Sci. USA 95:652-656 (1998). También se pueden llevar a cabo ensayos de unión a C1q para confirmar que el anticuerpo no se puede unir a C1q y, de ahí que carezca de actividad CDC. Véase, por ejemplo, ELISA de unión a C1q y C3c en los documentos WO 2006/029879 y WO 2005/100402. Para evaluar la activación del complemento, se puede realizar un ensayo de CDC (véanse, por ejemplo, Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996); Cragg, M.S. et al., Blood 101:1045-1052 (2003); y Cragg, M.S. y M.J. Glennie, Blood 103:2738-2743 (2004)). También se pueden realizar la unión al FcRn y las determinaciones del aclaramiento/semivida in vivo usando procedimientos conocidos en la técnica (véase, por ejemplo, Petkova, S.B. et al., Int'l. Immunol. 18(12): 1759-1769 (2006)).
Los anticuerpos con función efectora reducida incluyen aquellos con sustitución de uno o más de los residuos de la región Fe 238, 265, 269, 270, 297, 327 y 329 (patente de EE. UU. n.° 6.737.056). Dichos mutantes de Fe incluyen mutantes de Fe con sustituciones en dos o más de las posiciones de aminoácido 265, 269, 270, 297 y 327, incluyendo el llamado mutante de Fe “DANA” con la sustitución de los residuos 265 y 297 a alanina (patente de EE. UU. n.° 7.332.581).
Se describen determinadas variantes de anticuerpo con unión mejorada o disminuida a los FcR. (Véase, por ejemplo, la patente de EE. UU. n.° 6.737.056; el documento WO 2004/056312 y Shields et al., J. Biol. Chem. 9(2): 6591-6604 (2001)).
En determinados modos de realización, una variante de anticuerpo comprende una región Fe con una o más sustituciones de aminoácidos que mejoran la ADCC, por ejemplo, sustituciones en las posiciones 298, 333 y/o 334 de la región Fe (numeración EU de residuos).
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En algunos modos de realización, las alteraciones se hacen en la región Fe, que dan como resultado una unión a C1q y/o una citotoxicidad dependiente del complemento (CDC) alteradas (es decir, mejoradas o disminuidas), por ejemplo, como se describe en la patente de EE. UU. n.° 6.194.551, el documento WO 99/51642 y Idusogie et al. J. Immunol. 164: 4178-4184 (2000).
En el documento US 2005/0014934 (Hinton et al.) se describen anticuerpos con semividas incrementadas y unión mejorada al receptor Fe neonatal (FcRn), que es responsable de la transferencia de las IgG maternas al feto (Guyer et al., J. Immunol. 117:587 (1976) y Kim et al., J. Immunol. 24:249 (1994)). Esos anticuerpos comprenden una región Fe con una o más sustituciones en la misma que mejoran la unión de la región Fe al FcRn. Dichas variantes de Fe incluyen aquellas con sustituciones en uno o más residuos de la región Fe: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 o 434, por ejemplo, sustitución del residuo 434 de la región Fe (patente de EE. UU. n.° 7.371.826).
Véase también Duncan & Winter, Nature 322:738-40 (1988); la patente de EE. UU. n.° 5.648.260; la patente de EE. UU. n.° 5.624.821; y el documento WO 94/29351 con respecto a otros ejemplos de variantes de la región Fe.
d) Variantes de anticuerpo genomodificado con cisterna
En determinados modos de realización, puede ser deseable crear anticuerpos genomodificados con cisteína, por ejemplo, “thioMAb”, en los que uno o más residuos de un anticuerpo se sustituyen con residuos de cisteína. En modos de realización particulares, los residuos sustituidos se producen en sitios accesibles del anticuerpo. Sustituyendo esos residuos con cisteína, los grupos tiol reactivos se posicionan de este modo en sitios accesibles del anticuerpo y se pueden usar para conjugar el anticuerpo a otros restos, tales como restos de fármaco o restos de conector-fármaco, para crear un inmunoconjugado, como se describe adicionalmente en el presente documento. En determinados modos de realización, se puede sustituir uno cualquiera o más de los siguientes residuos con cisteína: V205 (numeración de Kabat) de la cadena ligera; A118 (numeración EU) de la cadena pesada; y S400 (numeración EU) de la región Fe de la cadena pesada. Se pueden generar anticuerpos genomodificados con cisteína como se describe, por ejemplo, en la patente de EE. UU. n.° 7.521.541.
e) Derivados de anticuerpo
En determinados modos de realización, un anticuerpo proporcionado en el presente documento se puede modificar adicionalmente para que contenga restos no proteicos adicionales que se conocen en la técnica y están fácilmente disponibles. Los restos adecuados para la derivatización del anticuerpo incluyen, pero no se limitan a, polímeros solubles en agua. Los ejemplos no limitantes de polímeros solubles en agua incluyen, pero no se limitan a, polietilenglicol (PEG), copolímeros de etilenglicol/propilenglicol, carboximetilcelulosa, dextrano, poli(alcohol vinílico), polivinilpirrolidona, poli-1,3-dioxolano, poli-1,3,6-trioxano, copolímero de etileno/anhídrido maleico, poliaminoácidos (homopolímeros o bien copolímeros aleatorios) y dextrano o poli(n-vinilpirrolidona)/polietilenglicol, homopolímeros de propropilenglicol, copolímeros de poli(óxido de propileno)/óxido de etileno, polioles polioxietilados (por ejemplo, glicerol), poli(alcohol vinílico) y mezclas de los mismos. El propionaldehído de polietilenglicol puede tener ventajas en su fabricación debido a su estabilidad en agua. El polímero puede ser de cualquier peso molecular, y puede estar ramificado o no ramificado. El número de polímeros fijados al anticuerpo puede variar, y si se fija más de un polímero, pueden ser moléculas iguales o diferentes. En general, se puede determinar el número y/o tipo de polímeros usados para la derivatización basándose en consideraciones, que incluyen, pero no se limitan a, las propiedades o funciones particulares del anticuerpo que se va a mejorar, independientemente de si el derivado de anticuerpo se usará en un tratamiento en condiciones definidas, etc.
En otro modo de realización, se proporcionan conjugados de un anticuerpo y un resto no proteico que se pueden calentar de forma selectiva mediante exposición a la radiación. En un modo de realización, el resto no proteico es un nanotubo de carbono (Kam et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 102: 11600-11605 (2005)). La radiación puede ser de cualquier longitud de onda e incluye, pero no se limita a, las longitudes de onda que no dañan a las células normales, pero que calientan el resto no proteico a una temperatura en la que se destruyen las células proximales al anticuerpo- resto no proteico.
B. Procedimientos y composiciones recombinantes
Se pueden producir anticuerpos usando procedimientos y composiciones recombinantes, por ejemplo, como se describe en la patente de EE. UU. n.° 4.816.567. En un modo de realización, se proporciona un ácido nucleico aislado que codifica un anticuerpo anti-HtrA1 descrito en el presente documento. Dicho ácido nucleico puede codificar una secuencia de aminoácidos que comprende el VL y/o una secuencia de aminoácidos que comprende el VH del anticuerpo (por ejemplo, las cadenas ligera y/o pesada del anticuerpo). En otro modo de realización, se proporcionan uno o más vectores (por ejemplo, vectores de expresión) que comprenden dicho ácido nucleico. En otro modo de realización, se proporciona una célula huésped que comprende dicho ácido nucleico. En uno de dichos modos de realización, una célula huésped comprende (por ejemplo, se ha transformado con): (1) un vector que comprende un ácido nucleico que codifica una secuencia de aminoácidos que comprende el VL del anticuerpo y una secuencia de aminoácidos que comprende el VH del anticuerpo, o (2) un primer vector que comprende un ácido nucleico que codifica
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una secuencia de aminoácidos que comprende el VL del anticuerpo y un segundo vector que comprende un ácido nucleico que codifica una secuencia de aminoácidos que comprende el VH del anticuerpo. En un modo de realización, la célula huésped es eucariota, por ejemplo, una célula de ovario de hámster chino (CHO) o una célula linfocítica (por ejemplo, célula YO, NS0, Sp20). En un modo de realización, se proporciona un procedimiento de preparación de un anticuerpo anti-HtrA1, en el que el procedimiento comprende cultivar una célula huésped que comprende un ácido nucleico que codifica el anticuerpo, como se proporciona anteriormente, en condiciones adecuadas para la expresión del anticuerpo y, opcionalmente, recuperar el anticuerpo de la célula huésped (o medio de cultivo de células huésped).
Para la producción recombinante de un anticuerpo anti-HtrA1, el ácido nucleico que codifica un anticuerpo, por ejemplo, como se describe anteriormente, se aísla e inserta en uno o más vectores para su clonación y/o expresión adicional en una célula huésped. Dicho ácido nucleico se puede aislar y secuenciar fácilmente usando procedimientos convencionales (por ejemplo, usando sondas de oligonucleótidos, que se pueden unir específicamente a genes que codifican las cadenas pesada y ligera del anticuerpo).
Las células huésped adecuadas para la clonación o la expresión de vectores que codifican el anticuerpo incluyen las células procariotas o eucariotas descritas en el presente documento. Por ejemplo, los anticuerpos se pueden producir en bacterias, en particular, cuando no se necesitan glucosilación ni la función efectora de Fe. Para la expresión de los fragmentos de anticuerpo y polipéptidos en bacterias, véase, por ejemplo, las patentes de EE. UU. n.°s 5.648.237, 5.789.199 y 5.840.523. (Véase también Charlton, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ, 2003), pp. 245-254, que describe la expresión de fragmentos de anticuerpo en E. coli). Después de la expresión, el anticuerpo se puede aislar de la pasta de células bacterianas en una fracción soluble y se puede purificar adicionalmente.
Además de los procariotas, los microbios eucariotas, tales como los hongos filamentosos o levaduras, son huéspedes de clonación o expresión adecuados para vectores que codifican anticuerpos, incluyendo cepas de hongos y levaduras en las que sus vías de glucosilación se han “humanizado”, dando como resultado la producción de un anticuerpo con un patrón de glucosilación parcial o completamente humano. Véanse Gerngross, Nat. Biotech. 22:1409-1414 (2004) y Li et al., Nat. Biotech. 24:210-215 (2006).
Las células huésped adecuadas para la expresión del anticuerpo glucosilado también derivan de organismos multicelulares (invertebrados y vertebrados). Los ejemplos de células de invertebrado incluyen células vegetales y de insectos. Se han identificado numerosas cepas de baculovirus, que se pueden usar en conjunto con células de insecto, en particular, para la transfección de células de Spodoptera frugiperda.
También se pueden utilizar cultivos de células vegetales como huéspedes. Véase, por ejemplo, las patentes de EE. UU. n.°s 5.959.177, 6.040.498, 6.420.548, 7.125.978 y 6.417.429 (que describen la tecnología PLANTIBODIES™ para producir anticuerpos en vegetales transgénicos).
También se pueden usar células de vertebrado como huéspedes. Por ejemplo, pueden ser útiles líneas de células de mamífero que se adapten para crecer en suspensión. Otros ejemplos de líneas de células huésped de mamífero útiles son la línea de riñón de mono CV1 transformada por SV40 (COS-7); la línea de riñón embrionario humano (células 293 o 293 como se describe, por ejemplo, en Graham et al., J. Gen Viro!. 36:59 (1977)); células de riñón de cría de hámster (BHK); células de Sertoli de ratón (células TM4, como se describe, por ejemplo, en Mather, Biol. Reprod. 23:243-251 (1980)); células de riñón de mono (CV1); células de riñón de mono verde africano (VERO-76); células de carcinoma de cuello uterino humanas (HELA); células de riñón canino (MDCK); células de hígado de rata búfalo (BRL 3A); células de pulmón humanas (W138); células de hígado humanas (Hep G2); tumor de mama de ratón (MMT 060562); célulasTRI, comose describe, por ejemplo, en Mather ef a/., Annals N. Y. Acad. Sci. 383:44-68(1982); células MRC 5; y células FS4. Otras líneas de células huésped de mamífero útiles incluyen células de ovario de hámster chino (CHO), incluyendo células CHO DHFR' (Urlaub etal., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)); y líneas de células de mieloma, tales como YO, NS0 y Sp2/0. Para obtener una revisión de determinadas líneas de células huésped de mamífero adecuadas para la producción de anticuerpos, véase, por ejemplo, Yazaki y Wu, Methods in Molecular Biology, vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ), pp. 255-268 (2003).
C. Ensayos
Los anticuerpos anti-HtrA1 proporcionados en el presente documento se pueden identificar, cribar o caracterizar para determinar sus propiedades físicas/químicas y/o sus actividades biológicas mediante diversos ensayos conocidos en la técnica.
1. Ensayos de unión y otros ensayos
En un aspecto, un anticuerpo de la invención se somete a prueba para determinar su actividad de unión a antígeno, por ejemplo, mediante procedimientos conocidos, tales como ELISA, inmunoelectrotransferencia, etc.
En otro aspecto, se pueden usar ensayos de competición para identificar un anticuerpo que compite con Fab94 o lgG94 por su unión a HtrA1. En determinados modos de realización, dicho anticuerpo competidor se une al mismo
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epítopo (por ejemplo, un epítopo lineal o uno conformacional) que se une mediante Fab94 o lgG94. Se proporcionan procedimientos ejemplares detallados para cartografiar un epítopo al que se une un anticuerpo en Morris (1996) “Epitope Mapping Protocols,” en Methods in Molecular Biologyvo\. 66 (Humana Press, Totowa, NJ).
En un ensayo de competición ejemplar, se incuba HtrA1 inmovilizada en una solución que comprende un primer anticuerpo marcado que se une a HtrA1 (por ejemplo, Fab94 o lgG94) y un segundo anticuerpo no marcado que se somete a prueba para determinar su capacidad de competir con el primer anticuerpo por su unión a HtrA1. El segundo anticuerpo puede estar presente en un sobrenadante de hibridoma. Como control, se incuba HtrA1 inmovilizada en una solución que comprende el primer anticuerpo marcado, pero no el segundo anticuerpo no marcado. Después de la incubación, en condiciones que permitan la unión del primer anticuerpo a HtrA1, se elimina el anticuerpo no unido en exceso y se mide la cantidad de marcador asociado a HtrA1 inmovilizada. Si se reduce sustancialmente la cantidad de marcador asociado a HtrA1 inmovilizada en la muestra de prueba en relación con la muestra de control, entonces eso indica que el segundo anticuerpo está compitiendo con el primer anticuerpo por su unión a HtrA1. Véase Harlow y Lañe (1988) Antibodies: A Laboratory Manual ch.14 (Coid Spring Harbor Laboratory, Coid Spring Harbor, NY).
2. Ensayos de actividad
En un aspecto, se proporcionan ensayos para identificar anticuerpos anti-HtrA1 que tengan actividad biológica. La actividad biológica puede incluir, por ejemplo, bloquear, antagonizar, suprimir, interferir, modular y/o reducir una o más actividades biológicas de HtrA1. También se proporcionan anticuerpos que tienen dicha actividad biológica in vivo y/o in vitro.
En determinados modos de realización, un anticuerpo de la invención se somete a prueba para determinar dicha actividad biológica. En determinados modos de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 se une a HtrA1 y reduce o inhibe su actividad serina proteasa para uno o más sustratos para HtrA1, incluyendo, por ejemplo, los sustratos de péptido H2-Opt, (3-caseína o BODIPY FL-caseína como se describe en los ejemplos a continuación o cualquier otro sustrato para HtrA1 adecuado. En determinados modos de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 inhibe la actividad serina proteasa de HtrA1 con una Clso de menos de 50 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 15 nM, 10 nM, 5 nM, 3 nM, 2,5 nM, 2 nM, 1 nM o menos para uno o más sustratos para HtrA1. En determinados modos de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 protege a las células fotorreceptoras de su degradación, protege al grosor de la capa nuclear externa o protege a la actividad funcional del electrorretinograma en un modelo de enfermedad ocular, tal como el modelo murino con exposición a la luz constante descrito en los ejemplos a continuación.
D. Inmunoconjugados
La invención también proporciona inmunoconjugados que comprenden un anticuerpo anti-HtrA1 en el presente documento conjugado a uno o más agentes citotóxicos, tales como agentes o fármacos quimioterápicos, agentes inhibidores del crecimiento, toxinas (por ejemplo, toxinas proteicas, toxinas activas enzimáticamente de origen bacteriano, fúngico, vegetal o animal o fragmentos de las mismas) o isótopos radiactivos.
En un modo de realización, un inmunoconjugado es un conjugado anticuerpo-fármaco (ADC) en el que un anticuerpo se conjuga a uno o más fármacos, que incluyen, pero no se limitan a, un maitansinoide (véanse las patentes de EE. UU. n.°s 5.208.020, 5.416.064 y la patente europea EP 0 425 235 B1); una auristatina, tal como los restos del fármaco monometilauristatina DE y DF (MMAE y MMAF) (véanse las patentes de EE. UU. n.°s 5.635.483 y 5.780.588 y 7.498.298.); una dolastatina; una caliqueamicina o derivado de la misma (véanse las patentes de EE. UU. n.°s 5.712.374, 5.714.586, 5.739.116, 5.767.285, 5.770.701,5.770.710, 5.773.001 y 5.877.296; Hinman etal., Cáncer Res. 53:3336-3342 (1993); y Lode et al., Cáncer Res. 58:2925-2928 (1998)); una antraciclina, tal como daunomicina o doxorrubicina (véase Kratz et al., Current Med. Chem. 13:477-523 (2006); Jeffrey et al., Bioorganic & Med. Chem. Letters 16:358-362 (2006); Torgov et al., Bioconj. Chem. 16:717-721 (2005); Nagy et al., Proc. Nati. Acad. Sci. USA 97:829-834 (2000); Dubowchik et al., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12:1529-1532 (2002); King et al., J. Med. Chem. 45:4336-4343 (2002); y la patente de EE. UU. n.° 6.630.579); metotrexato; vindesina; un taxano, tal como docetaxel, paclitaxel, larotaxel, tesetaxel y ortataxel; un tricoteceno; y CC1065.
En otro modo de realización, un inmunoconjugado comprende un anticuerpo como se describe en el presente documento conjugado a una toxina enzimáticamente activa o fragmento de la misma, que incluye, pero no se limita a, la cadena A de difteria, fragmentos activos que no se unen de la toxina diftérica, la cadena A de exotoxina (de Pseudomonas aeruginosa), la cadena A de ricina, la cadena A de abrina, la cadena A de modeccina, alfa-sarcina, proteínas de Aleurites fordii, proteínas de diantina, proteínas de Phytolaca americana (PAPI, PAPII y PAP-S), inhibidor de Momordica charanda, curcina, crotina, inhibidor de Saponaria officinalis, gelonina, mitogelina, restrictocina, fenomicina, enomicina y los tricotecenos.
En otro modo de realización, un inmunoconjugado comprende un anticuerpo como se describe en el presente documento conjugado a un átomo radioactivo para formar un radioconjugado. Están disponibles una variedad de isótopos radioactivos para la producción de radioconjugados. Los ejemplos incluyen At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 e isótopos radioactivos de Lu. Cuando se usa el radioconjugado para la detección, puede comprender un átomo radioactivo para estudios gammagráficos, por ejemplo, Tc"m o I123, o un marcador de espín
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para resonancia magnética nuclear (RMN) (también conocida como resonancia magnética, RM), tal como yodo-123 de nuevo, yodo-131, indio-111, flúor-19, carbono-13, nitrógeno-15, oxígeno-17, gadolinio, manganeso o hierro.
Se pueden preparar conjugados de un anticuerpo y agente citotóxico usando una variedad de agentes de acoplamiento de proteínas bifuncionales, tales como 3-(2-pi ridilditiojpropionato de N-succinimidilo (SPDP), 4-(N-
male¡m¡domet¡l)c¡clohexano-1-carbox¡lato de succinimidilo (SMCC), iminotiolano (IT), derivados bifuncionales de imidoésteres (tales como clorhidrato de adipimidato de dimetilo), ásteres activos (tales como suberato de disuccinimidilo), aldehidos (tales como glutaraldehído), compuestos de bis-azido (tales como bis(p- azidobenzoiljhexanodiamina), derivados de bis-diazonio (tales como bis-(p-d¡azon¡obenzo¡l)-et¡lend¡am¡na), diisocianatos (tales como toluen-2,6-diisoc¡anato) y compuestos de flúor bis-activos (tales como 1,5-difluoro-2,4- dinitrobenceno). Por ejemplo, se puede preparar una inmunotoxina de ricina como se describe en Vitetta etal., Science 238:1098 (1987). El ácido l-isotiocianatobencil-3-metildietilentriaminopentaacético (MX-DTPA) marcado con carbono 14 es un agente quelante ejemplar para la conjugación del radionúclido al anticuerpo. Véase el documento WO94/11026. El conector puede ser un “conector escindible” que facilite la liberación de un fármaco citotóxico en la célula. Por ejemplo, se puede usar un conector lábil en ácido, conector sensible a la peptidasa, conector fotolábil, conector de dimetilo o conector que contiene disulfuro (Chari et al., Cáncer Res. 52:127-131 (1992); patente de EE. UU. n.° 5.208.020).
Los inmunoconjugados o ADC en el presente documento contemplan expresamente, pero no se limitan a, dichos conjugados preparados con reactivos de reticulación, incluyendo, pero no limitados a, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, sulfo-EMCS, sulfo-GMBS, sulfo-KMUS, sulfo-MBS, sulfo-SlAB, sulfo-SMCC y sulfo-SMPB y SVSB ((4-vinilsulfona)benzoato de succinimidilo), que están disponibles comercialmente (por ejemplo, de Pierce Biotechnology, Inc., Rockford, IL., EE. UU.).
E. Procedimientos y composiciones para el diagnóstico y la detección
En determinados modos de realización, cualquiera de los anticuerpos anti-HtrA1 proporcionados en el presente documento es útil para detectar la presencia de HtrA1 en una muestra biológica. El término “detectar” como se usa en el presente documento abarca la detección cuantitativa o cualitativa. En determinados modos de realización, una muestra biológica comprende una célula o tejido, tal como una muestra que comprende células fotorreceptoras, células del epitelio pigmentario de la retina, células de la capa nuclear externa, de la capa nuclear interna, glías de Müller, epitelio ciliar o tejido de la retina.
En un modo de realización, se proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en un procedimiento de diagnóstico o detección. En otro aspecto, se proporciona un procedimiento de detección de la presencia de HtrA1 en una muestra biológica. En determinados modos de realización, el procedimiento comprende poner en contacto la muestra biológica con un anticuerpo anti-HtrA1 como se describe en el presente documento en condiciones que permitan la unión del anticuerpo anti-HtrA1 a HtrA1, y detectar si se forma un complejo entre el anticuerpo anti-HtrA1 y HtrA1. Dicho procedimiento puede ser un procedimiento in vitro o in vivo. En un modo de realización, se usa un anticuerpo anti- HtrA1 para seleccionar sujetos ¡dóneos para su tratamiento con un anticuerpo anti-HtrA1, por ejemplo, cuando HtrA1 es un biomarcador para la selección de pacientes.
En determinados modos de realización, se puede identificar un paciente adecuado para su tratamiento con un anticuerpo anti-HtrA1 detectando uno o más polimorfismos en el gen HtrA1 o secuencia de control de HtrA1, tal como el polimorfismo en el promotor de HtrA1, rs11200638(G/A) (véase, por ejemplo, A. DeWan, et al., Science 314: 989- 992 (2006)).
Los trastornos ejemplares que se pueden diagnosticar usando un anticuerpo de la invención incluyen trastornos oculares, tales como, por ejemplo, degeneración macular senil (DMS) húmeda, degeneración macular senil seca, atrofia geográfica (AG), retinopatía diabética (RD), retinopatía de la prematuridad (RP) o vasculopatía conoidea polipoidea (VCP).
En determinados modos de realización, se proporcionan anticuerpos anti-HtrA1 marcados. Los marcadores incluyen, pero no se limitan a, marcadores o restos que se detectan directamente (tales como marcadores fluorescentes, cromóforos, electrodensos, quimioluminiscentes y radioactivos), así como restos, tales como enzimas o ligandos, que se detectan indirectamente, por ejemplo, a través de una reacción enzimática o interacción molecular. Los marcadores ejemplares incluyen, pero no se limitan a, los radioisótopos 32P, 14C, 125l, 3H y 131l, fluoróforos, tales como quelatos de tierras raras o fluoresceína y sus derivados, rodamina y sus derivados, dansilo, umbeliferona, luciferasas, por ejemplo, luciferasa de luciérnaga y luciferasa bacteriana (patente de EE. UU. n.° 4.737.456), luciferina, 2,3- dihidroftalazindionas, peroxidasa de rábano picante (HRP), fosfatasa alcalina, (3-galactosidasa, glucoamilasa, lisozima, oxidasas de sacáridos, por ejemplo, glucosa oxidasa, galactosa oxidasa y glucosa 6-fosfato deshidrogenasa, oxidasas heterocíclicas, tales como uricasa y xantina oxidasa, que se acoplan con una enzima que emplea peróxido de hidrógeno para oxidar un precursor de tinte, tal como HRP, lactoperoxidasa o microperoxidasa, biotina/avidina, marcadores de espín, marcadores de bacteriófagos, radicales libres estables y similares.
F. Formulaciones farmacéuticas
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Las formulaciones farmacéuticas de un anticuerpo anti-HtrA1 como se describe en el presente documento se preparan mezclando dicho anticuerpo que tiene el grado deseado de pureza con uno o más vehículos farmacéuticamente aceptables opcionales (Remington's Pharmaceutical Sciences 16.a edición, Osol, A. Ed. (1980)), en forma de formulaciones liofilizadas o soluciones acuosas. Los vehículos farmacéuticamente aceptables, en general, no son tóxicos para los destinatarios a las dosificaciones y concentraciones empleadas e incluyen, pero no se limitan a: tampones, tales como fosfato, citrato y otros ácidos orgánicos; antioxidantes, que incluyen ácido ascórbico y metionina; conservantes (tales como cloruro de octadecildimetilbencilamonio; cloruro de hexametonio; cloruro de benzalconio, cloruro de bencetonio; fenol, alcohol butílico o bencílico; alquilparabenos, tales como metil- o propilparabeno; catecol; resorcinol; ciclohexanol; 3-pentanol; y m-cresol); polipéptidos de bajo peso molecular (menos de aproximadamente 10 residuos); proteínas, tales como seroalbúmina, gelatina o inmunoglobulinas; polímeros hidrófilos, tales como polivinilpirrolidona; aminoácidos, tales como glicina, glutamina, asparagina, histidina, arginina o lisina; monosacáridos, disacáridos y otros hidratos de carbono, que incluyen glucosa, mañosa o dextrinas; agentes quelantes, tales como EDTA; glúcidos, tales como sacarosa, manitol, trehalosa o sorbitol; contraiones formadores de sales, tales como sodio; complejos de metal (por ejemplo, complejos Zn-proteína) y/o tensioactivos no iónicos, tales como polietilenglicol (PEG). Los vehículos farmacéuticamente aceptables ejemplares en el presente documento incluyen además agentes de dispersión intersticial de fármacos, tales como glucoproteínas de hialuronidasa activa a pH neutro soluble (sHASEGP), por ejemplo, glucoproteínas de hialuronidasa PH-20 soluble humana, tales como rHuPH20 (HYLENEX®, Baxter International, Inc.). Se describen determinadas sHASEGP ejemplares y procedimientos de uso, incluyendo rHuPH20, en las publicaciones de patente de EE. UU. n.°s 2005/0260186 y 2006/0104968. En un aspecto, se combina una sHASEGP con una o más glucosaminoglucanasas adicionales, tales como condroitinasas.
Se describen formulaciones de anticuerpos liofilizadas ejemplares en la patente de EE. UU. n.° 6.267.958. Las formulaciones de anticuerpos acuosas incluyen las descritas en la patente de EE. UU. n.° 6.171.586 y el documento WO 2006/044908, incluyendo las últimas formulaciones un tampón histidina-acetato.
La formulación en el presente documento también puede contener más de un ingrediente activo según sea necesario para la indicación particular que se trate, preferentemente aquellos con actividades complementarias que no se ven afectadas de manera adversa entre sí. Por ejemplo, para tratar una neovascularización no deseada asociada a un trastorno ocular, tal como DMS húmeda, puede ser deseable proporcionar además un tratamiento antiangiogénico, tal como un tratamiento anti-VEGF como LUCENTIS™ (ranibizumab). Dichos ingredientes activos están presentes adecuadamente en combinación en cantidades que son eficaces para el fin pretendido. En otros modos de realización, el tratamiento de una enfermedad o trastorno asociado a una neovascularización ocular no deseable puede implicar una combinación de un anticuerpo anti-HtrA1 y tratamiento fotodinámico (por ejemplo, con MACUGEN™ o VISUDYNE™).
Los ingredientes activos se pueden atrapar en microcápsulas preparadas, por ejemplo, mediante técnicas de coacervación o mediante polimerización interfacial, por ejemplo, microcápsulas de hidroximetilcelulosa o de gelatina y microcápsulas de polijmetacrilato de metilo), respectivamente, en sistemas de administración de fármacos coloidales (por ejemplo, liposomas, microesferas de albúmina, microemulsiones, nanopartículas y nanocápsulas) o en macroemulsiones. Dichas técnicas se divulgan en Remington's Pharmaceutical Sciences 16.a edición, Osol, A. Ed. (1980).
Se pueden preparar preparaciones de liberación mantenida. Los ejemplos adecuados de preparaciones de liberación mantenida incluyen matrices semipermeables de polímeros hidrófobos sólidos que contienen el anticuerpo, estando dichas matrices en forma de artículos conformados, por ejemplo, películas o microcápsulas.
Las formulaciones que se van a usar para su administración in vivo son, en general, estériles. La esterilidad se puede conseguir fácilmente, por ejemplo, mediante filtración a través de membranas de filtración estériles.
G. Procedimientos y composiciones terapéuticos
Se puede usar cualquiera de los anticuerpos anti-HtrA1 proporcionados en el presente documento en procedimientos terapéuticos.
En determinados modos de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 es útil para inhibir la degeneración de las células de la retina (tales como, por ejemplo, las células del epitelio pigmentario de la retina (EPR)) o células fotorreceptoras en un ojo de un paciente que padece o está en riesgo de desarrollar un trastorno ocular (por ejemplo, un paciente que tiene un polimorfismo en HtrA1, expresión de HtrA1 incrementada en el ojo o drusas en al menos un ojo). En determinados modos de realización, se puede usar un anticuerpo anti-HtrA1 para ralentizar la progresión a atrofia geográfica en etapa tardía o degeneración macular senil seca en un ojo de un paciente que tiene drusas en el ojo que se va a tratar. En determinados modos de realización, se puede identificar un paciente adecuado para su tratamiento con un anticuerpo anti-HtrA1 detectando la aparición de la enfermedad en al menos un ojo del paciente. Por ejemplo, se pueden seleccionar determinados pacientes detectando drusas, atrofia geográfica o neovascularización coroidea en un ojo, mientras que el otro ojo no presenta síntomas. Dichos pacientes pueden ser buenos candidatos para el tratamiento preventivo en el ojo sin síntomas, por ejemplo, para retrasar la aparición o reducir la gravedad de dichos
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síntomas (por ejemplo, drusas, atrofia geográfica y/o neovascularización coroidea) en el ojo sin síntomas. De forma alternativa, se puede tratar el ojo sintomático, o tanto el ojo sintomático como el ojo sin síntomas se pueden tratar de acuerdo con los procedimientos descritos en el presente documento. En consecuencia, se puede usar un anticuerpo anti-HtrA1 para prevenir o inhibir la progresión de un trastorno ocular en un ojo del paciente, en el que el paciente ha desarrollado drusas, DMS húmeda o atrofia geográfica en el otro ojo, pero el ojo que se trata todavía no es sintomático. De forma alternativa, se trata el ojo sintomático, o se tratan tanto el ojo sintomático como el ojo sin síntomas.
En otro modo de realización, un anticuerpo anti-HtrA1 es útil para tratar la artritis.
En un aspecto, se proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso como un medicamento. En otros aspectos, se proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en el tratamiento de una enfermedad o trastorno ocular, tal como, por ejemplo, DMS (húmeda o seca), AG, RD, VCP o RP. En determinados modos de realización, se proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en un procedimiento de tratamiento. En determinados modos de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en un procedimiento de tratamiento de un individuo que tiene una enfermedad o trastorno ocular, que comprende administrar al individuo una cantidad eficaz del anticuerpo anti-HtrA1. En uno de dichos modos de realización, el procedimiento comprende además administrar al individuo una cantidad eficaz de al menos un agente terapéutico adicional, por ejemplo, como se describe a continuación. En otros modos de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en la inhibición de la degeneración de las células de la retina (tales como, por ejemplo, células del EPR) o de las células fotorreceptoras en un ojo de un paciente. En determinados modos de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en un procedimiento de inhibición de la degeneración de las células de la retina o fotorreceptoras en un individuo que comprende administrar al individuo una cantidad eficaz del anticuerpo anti-HtrA1 para inhibir la degeneración de las células de la retina o fotorreceptoras. En otros modos de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en la inhibición de la actividad serina proteasa de HtrA1 en un ojo de un paciente. En determinados modos de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en un procedimiento de inhibición de la actividad serina proteasa de HtrA1 en un ojo de un individuo que comprende administrar al individuo una cantidad eficaz del anticuerpo anti-HtrA1 para inhibir la actividad serina proteasa de HtrA1 en el ojo. Un “individuo” de acuerdo con cualquiera de los modos de realización anteriores es preferentemente un ser humano. En otros modos de realización, la invención proporciona un anticuerpo anti-HtrA1 para su uso en la inhibición de la VCP en un paciente que lo necesita, por ejemplo, un paciente que tiene redes vasculares coroideas con dilataciones aneurismáticas similares a pólipo.
Un “individuo” de acuerdo con cualquiera de los modos de realización anteriores puede ser un ser humano.
Se puede medir la eficacia del tratamiento de un trastorno ocular usando un anticuerpo anti-HtrA1 mediante diversos criterios de valoración usados comúnmente en la evaluación de las enfermedades infraoculares, tales como, por ejemplo, realizar un examen ocular, medir la presión infraocular, evaluar la agudeza visual, medir la presión con lámpara de hendidura, evaluar la inflamación infraocular, medir el tamaño de la NVC, medir la extravasación de la NVC (por ejemplo, mediante angiografía con fluoresceína), medir la cantidad de drusas, medir la localización de las drusas, etc. En determinados modos de realización, se puede evaluar la pérdida de visión, por ejemplo, midiendo el cambio medio en la mejor agudeza visual corregida (MAVC) a partir del punto de referencia a un punto de tiempo deseado (por ejemplo, cuando la MAVC se basa en una tabla de agudeza visual según el estudio de retinopatía diabética de tratamiento temprano (ETDRS) y una evaluación a una distancia de prueba de 4 metros), midiendo la proporción de sujetos que pierden menos de 15 letras en agudeza visual en un punto de tiempo deseado en comparación con el punto de referencia, midiendo la proporción de sujetos que ganan más de o igual a 15 letras en agudeza visual en un punto de tiempo deseado en comparación con el punto de referencia, midiendo la proporción de sujetos con una agudeza visual de Snellen equivalente a 20/2000 o peor en un punto de tiempo deseado o midiendo el cuestionario de funcionamiento visual del NEI.
En otro aspecto, la invención proporciona formulaciones farmacéuticas que comprenden cualquiera de los anticuerpos anti-HtrA1 proporcionados en el presente documento, por ejemplo, para su uso en cualquiera de los procedimientos terapéuticos anteriores. En un modo de realización, una formulación farmacéutica comprende cualquiera de los anticuerpos anti-HtrA1 proporcionados en el presente documento y un vehículo farmacéuticamente aceptable. En otro modo de realización, una formulación farmacéutica comprende cualquiera de los anticuerpos anti-HtrA1 proporcionados en el presente documento y al menos un agente terapéutico adicional, por ejemplo, como se describe a continuación.
Los anticuerpos de la invención se pueden usar solos o bien en combinación con otros agentes en un tratamiento. Por ejemplo, un anticuerpo de la invención se puede coadministrar con al menos un agente terapéutico adicional. En determinados modos de realización, un agente terapéutico adicional es un agente terapéutico adecuado para el tratamiento de un trastorno ocular asociado a neovascularización no deseable en el ojo, tal como, por ejemplo, DMS húmeda. Los agentes terapéuticos adecuados incluyen, por ejemplo, tratamientos antiangiogénicos, tales como un tratamiento anti-VEGF como LUCENTIS™ (ranibizumab).
Dichas politerapias indicadas anteriormente abarcan la administración combinada (en la que se incluyen dos o más agentes terapéuticos en la misma formulación o en formulaciones separadas) y la administración separada, en cuyo
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caso, la administración del anticuerpo de la invención se puede producir antes, simultáneamente y/o después de la administración del agente terapéutico y/o adyuvante adicional. También se pueden usarlos anticuerpos de la invención en combinación con un tratamiento fotodinámico (por ejemplo, con MACUGEN™ o VISUDYNE™).
Un anticuerpo de la invención (y cualquier agente terapéutico adicional) se puede administrar mediante cualquier medio adecuado, incluyendo administración parenteral, intrapulmonar e intranasal y, si se desea para el tratamiento local, intralesional. Las infusiones parenterales incluyen administración intramuscular, intravenosa, intrarterial, intraperitoneal o subcutánea. En un modo de realización ejemplar, se puede administrar un anticuerpo de la invención (y cualquier agente terapéutico adicional) mediante inyección intravítrea. La dosificación puede ser mediante cualquier vía adecuada, por ejemplo, mediante inyecciones, tales como inyecciones intravenosas, intravítreas o subcutáneas, dependiendo, en parte, de si la administración es breve o prolongada. En el presente documento se contemplan diversas pautas posológicas que incluyen, pero no se limitan a, administraciones únicas o múltiples en diversos puntos de tiempo, administración de inyección intravenosa rápida e infusión de inyección intravenosa con administración prolongada.
Los anticuerpos de la invención se formularán, dosificarán y administrarán de una forma consistente con las prácticas médicas correctas. Los factores que se deben tener en consideración en este contexto incluyen el trastorno particular que se trata, el mamífero particular que se trata, el estado clínico del paciente individual, la causa del trastorno, el sitio de administración del agente, el procedimiento de administración, la pauta de administración y otros factores conocidos por los médicos. Aunque no se necesita, el anticuerpo se formula opcionalmente con uno o más agentes usados actualmente para prevenir o tratar el trastorno en cuestión. La cantidad eficaz de dichos otros agentes depende de la cantidad de anticuerpo presente en la formulación, del tipo de trastorno o tratamiento y de otros factores analizados anteriormente. Estos se usan, en general, en las mismas dosificaciones y por las vías de administración que se describen en el presente documento, o aproximadamente desde un 1 a un 99 % de las dosificaciones descritas en el presente documento, o en cualquier dosificación y mediante cualquier vía que se determine empíricamente/clínicamente que sea apropiada.
Para la prevención o tratamiento de la enfermedad, la dosificación apropiada de un anticuerpo de la invención (cuando se usa solo o en combinación con uno o más de otros agentes terapéuticos adicionales) dependerá del tipo de enfermedad que se va a tratar, del tipo de anticuerpo, de la gravedad y la evolución de la enfermedad, ya sea si el anticuerpo se administra para fines preventivos o terapéuticos, del tratamiento previo, de la anamnesis del paciente y de la respuesta al anticuerpo y del criterio del médico adjunto. El anticuerpo se administra adecuadamente al paciente de una vez o durante una serie de tratamientos. Dependiendo del tipo y de la gravedad de la enfermedad, de aproximadamente 1 pg/kg a 15 mg/kg (por ejemplo, de 0,1 mg/kg a 10 mg/kg) de anticuerpo puede ser una dosificación inicial candidata para su administración al paciente, ya sea, por ejemplo, mediante una o más administraciones separadas o mediante infusión continua. Una dosificación diaria típica puede variar desde aproximadamente 1 pg/kg a 100 mg/kg o más, dependiendo de los factores mencionados anteriormente. Para administraciones repetidas durante varios días o más, dependiendo de la afección, el tratamiento, en general, se mantendrá hasta que se produzca una supresión deseada de los síntomas de la enfermedad. Una dosificación ejemplar del anticuerpo estaría en el intervalo desde aproximadamente 0,05 mg/kg a aproximadamente 10 mg/kg. Por tanto, se pueden administrar al paciente una o más dosis de aproximadamente 0,5 mg/kg, 2,0 mg/kg, 4,0 mg/kg o 10 mg/kg (o cualquier combinación de las mismas). Dichas dosis se pueden administrar intermitentemente, por ejemplo, cada semana o cada tres semanas (por ejemplo, de tal manera que el paciente reciba desde aproximadamente dos a aproximadamente veinte o, por ejemplo, aproximadamente seis dosis del anticuerpo). Se puede administrar una dosis de carga inicial más alta, seguida de una o más dosis más bajas.
Se entiende que se puede llevar a cabo cualquiera de las formulaciones o procedimientos terapéuticos anteriores usando un inmunoconjugado de la invención en lugar de o además de un anticuerpo anti-HtrA1.
H. Artículos de fabricación
En otro aspecto de la invención, se proporciona un artículo de fabricación que contiene materiales útiles para el tratamiento, la prevención y/o el diagnóstico de los trastornos descritos anteriormente. El artículo de fabricación comprende un recipiente y una etiqueta o prospecto del envase en o asociado al recipiente. Los recipientes adecuados incluyen, por ejemplo, frascos, viales, jeringas, bolsas de solución i.v., etc. Los recipientes se pueden formar a partir de una variedad de materiales, tales como vidrio o plástico. El recipiente contiene una composición que es, por sí misma o combinada con otra composición eficaz para tratar, prevenir y/o diagnosticar la afección y que puede tener un orificio de acceso estéril (por ejemplo, el recipiente puede ser una bolsa de solución intravenosa o un vial que tenga un tapón perforable mediante una aguja de inyección hipodérmica). Al menos un agente activo de la composición es un anticuerpo de la invención. La etiqueta o prospecto del envase indica que la composición se usa para tratar la afección de elección. Además, el artículo de fabricación puede comprender (a) un primer recipiente con una composición contenida en el mismo, en el que la composición comprende un anticuerpo de la invención; y (b) un segundo recipiente con una composición contenida en el mismo, en el que la composición comprende un agente citotóxico o de otro modo terapéutico adicional. El artículo de fabricación en este modo de realización de la invención puede comprender además un prospecto del envase que indique que las composiciones se pueden usar para tratar una afección particular. De forma alternativa, o adicionalmente, el artículo de fabricación puede comprender además
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un segundo (o tercer) recipiente que comprenda un tampón farmacéuticamente aceptable, tal como agua bacteriostática para inyectables (BWFI), solución salina tamponada con fosfato, solución de Ringer y solución de dextrosa. Puede incluir además otros materiales deseables desde un punto de vista comercial y del usuario, incluyendo otros tampones, diluyentes, filtros, agujas y jeringas.
Se entiende que cualquiera de los artículos de fabricación anteriores puede incluir un inmunoconjugado de la invención en lugar de o además de un anticuerpo anti-HtrA1.
Identificador de secuencias
HVR de la cadena ligera para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94 HVR L1: RASQDVSTAVA (SEQ ID NO: 1)
HVR L2: SASFLYS (SEQ ID NO: 2)
HVR L3: QQSYTTPPT (SEQ ID NO: 3)
HVR de la cadena pesada para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94 HVR H1: GFNISGYYIH (SEQ ID NO: 4)
HVR H2: WIDPYGGDTNYADSVKG (SEQ ID NO: 5)
HVR H3: GTFLTSWGHYFDY (SEQ ID NO: 6)
VR de la cadena ligera para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94
DIOMTOSPSSLSASVGPRVTHCRASODVSTAVAWYOOKPGKAPKLL1YSASFLYSGVP SRFSGSGSGTDFTLTISSLOPEDFATYYCOOSYTTPPTFGOGTKVEIKR (SEQ ID NO: 7)
VR de la cadena pesada para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94
EVOLVESGGGLVOPGGSLRLSCAASGrXISGYYIHWVROAPGKGLEWVGWIDPYGGD TNYADSVKGRITISADTSKNTAYLOMNSLRAEPTAV’YYCARGTFLTSWGHYFDYWG QGT (SEQ ID NO: 8)
HtrA1 humana (secuencia de longitud completa en mayúsculas, el dominio proteasa está subrayado, los residuos N224 y K248 están sombreados)
mqipraallpIlllllaapasaQLSRAGRSAPLAAGCPDRCFPARCPPQPFFICFGGRARDACGOCE VCGAPEGAACG LQ BGPC G EG LQC WPFGVPA S A TVRRRA QAGLCVCASSEPVCGSDA NTVANLCOLRAASRRSERLHRFFVlVLORGACGOCiOFDPNSLKHKYNrJADVVEKlAF AVVHIELFRKLPFSKREVPVASGSGFIVSEDGLIVTNAHVVTNKi IKYKVLLKNGATYE AKfKDVDKKADIAI IKIDIiOGKl.PV],L1 .GRSSF] RPOFI VVAlGSPi-'SLONTVTíOlVSTI ORGGKFIjGLRNSDMDY IQTDATINYGNSOOPEVXLrXinVlGl VFLK VTAGLSrAfPSDKl KKFLTESMDROAKGKAnKKKYlGlRVIMSLTSSKAKEl KnRHRDFPDViSGAYnJiVIPD TPAEAGGLKENDVfTSlNGQSVVSANDVSDVÍKRESTLNMWRRGNEDIMrrvtPEETDP (SEQ ID NO: U)
HtrA1 murina (secuencia de longitud completa en mayúsculas, el dominio proteasa está subrayado)
mqsIrttthJUlItoapSlaiPStjTGRSAPAATVCPEHCDPIltCAPPPTDCEGGRVRDACGCCEVC G ALEG A ACG LQEGPCG EG LQC V V PFG V PASATVRRRAQAGLCVCASSEPV CGS D A KT YT NI.CQl-RAASRRSEKLR QPP VIVI.QRG ACG OG QEDPN 51 -R1TK YN Ff A D VVE K í A P A V
VI
KDV D|■ RADIAL! K1DÍIOGKLPVLLLGRSSIJ JÍPCEFVVAIGSPFSLON1 'VTTG1VSTTOR (_ ¡(¡KE.I.r-J.RNsDMDYlO 'I DAIINYCA^G £ ¡P I.VM.I ÍGP.YIGIYI l.k\. [ \GKÍ Al E.fS! ^KJ.KK KLTHSHDRQAKGK A VTKK K Y1GIR M MSLTSS KAKELKDRHRDFPDVLSGAYIJEVIPDT PAÉAGGLKÉNDVDSINGQSWTANDVSDVIFCKENI LNMWRRGNÉDlVnrVlPEElDP
(SEQ ID NO: 14)
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HtrA3 murina (el dominio proteasa está subrayado)
MQARALLPATLA1LATLAVLALAREPPAAPCPARCDVSRCPSPRCPGOYVPDLCNCCL VCAASEGEPCGRPLDSPCGDSLEC VRG VCRCRWTHTVCGTTX3 HTYADVC ALQAAS R R A LQ V SGTPVRQLQKÜ AC TSGLHOLTSPK YKFNHAPVVEKIAPAVVHIEEFLRMPLKi ftNVPLSSGSGEIMSEAGLIVTNAHVVSSSS ] ASGROOLKVQLONGDAYEATIODIDKKS tílA rtVlHPKKKLHVU .l.üHSADl .KPOEFVVAtGSPFALONTVTI GIVSTAORIX rKELUI. RDSPMPYlQTPAIlNYGNSGGFLVNLPGEVlGlNTLkVAAGjSFAlPSDRITRFLSElONK HVKD WKKRF1GIRMRTÍTPS L V EELKAANPDFP A V SSG1YV QEV VFN5PSQRGG 1QDG DI fVKVNGRPLADSS ELQEAVLNESSLLLEV RRG N D0LLFS1IPEVVM (SRQ jDB :NO: 15)
HtrA4 murina (el dominio proteasa está subrayado)
MSFQRLWAVRTQFLLLWLLLPAVPVPWAEARRSRVSLPCPDACDPTRCPTLPTCSAGL APVPDRCGCCRVCAAAEGQECCiGARGRPCAPRLRCGAPFSRDPSGGAWIjGTCCiCAE G AED A V VCGSDG RT YP$LG A LR KEN R A A RQROALPA V PVQKG AC EE AGTTRAGRLR RKYNFÍAAVVEKVAPSVVKLOLFRRSPLTNOEIFSSSCjSGFIVSEDGLIVTNAIIVLTNOO KlOVTLOSCrAR YEATVKD1DI fKI.DI.ALÍKir.PDTEI ■PYi.l.l.GRSSDl.RACiEFYYAIXjSPF SLON1'VTAGJVSTTORGGRELC]LKNSDlDYIQ J DA 11M1GN SGGPLVNLDGDVJC¡ 1NTLK V I AGISFAIPSDRIRGI 1 t;n^i [ Ií!RQLKGKAPLQKKYLGLRMLPLTLNLLQEMKRQDPEF PD V SSG V hA'Y E VIQG íi A A A S i LR DH D VIV SINGQP VTTTTD VIE A V KDN DFLÜ11VL RG SQTLhETVTPEIIN (Stg ID NO: 15)
YW505.95 HC FR2
WVRQAPGKCiLFAVVG (SEQ ID NO: 17)
HVR de la cadena ligera para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.28 HVR L1: RASQSINTYLA (SEQ ID NO: 18)
HVR L2: SASFLYS (SEQ ID NO: 2)
HVR L3: QQSDDTPPT (SEQ ID NO: 19)
HVR de la cadena pesada para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.28 HVR H1: GFSISGYYIH (SEQ ID NO: 20)
HVR H2: WIDPYGGDTNYADSVKG (SEQ ID NO: 5)
HVR H3: GTFLTSWGHYFDY (SEQ ID NO: 6)
VR de la cadena ligera para anticuerpo anti-Htr1 YW505.94a.28
DIOMTOSPSSLSASVGDRVTITCRASOSINTYLAWYOOKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPS RF.SGSGSGTDFTLTISSI.OPF.DFATYYCOOSDDTPPTFGOGTKVEIKR (SEQ ID NO: 28)
VR de la cadena pesada para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.28
EVOLVESGGGLVOPGGSLRLSCAASGFSISGYYnTWVROAPGKGLEWVGWTDPYGGD TNYADSVKGRFT1SADTSKNTAYLOMNSLRAEDTAVYYCARGTFLTSWGHYFDYWG QGT (SEQ ID NO: 29)
HVR de la cadena ligera para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.54 HVR L1: RASQVVGNYLA (SEQ ID NO: 21)
HVR L2: SASFLYS (SEQ ID NO: 2)
HVR L3: QQSDDHPPT (SEQ ID NO: 22)
HVR de la cadena pesada para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.54
HVR H1: GFSISGYYIH (SEQ ID NO: 20)
HVR H2: WIDPY GGDTNYADSVKG (SEQ ID NO: 5)
5
HVR H3: GTFLTSWGHYFDY (SEQ ID NO: 6)
VR de la cadena ligera para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.54
DIOMTOSPSSLSASYGDRVTITCRASOVVGNYLAWYOOKPGKAPKLLrySASFLYSGV F5RFSGSOSGTDFTLTI5SLOFEDRATY VCOOS DDHPPTFGQG'IKVE1KR (SEQ ED NO: 30)
10
VR de la cadena pesada para anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94a.54
EVOLVESGGGLVOPGGSLRLSCAASGFSISGYYnrWVROAPGKGLEWyGWIDPYGGD TNYADSVKGRFT1SADTSKNTAYLOMNSLRAEDTAVYYCARGTFLTSWGHYFDYWG QGT (SEQ II) NO: 29)
Secuencias consenso de HVR de la cadena ligera 15
HVR L1: RASQXaXbXcXdXeXfA, en la que Xa es D, S o V; Xb es V o I; Xc es S, N o G; Xd es T o N; Xe es A o Y; y Xf es V o L (SEQ ID NO: 23);
HVR L2: SASFLYS (SEQ ID NO: 2)
20
HVR L3: QQXgXhX¡XjPXkT, en la que Xg es S, V o D; Xh es Y, D o S; X¡ es T, S, A, D o N; X, es T, H, N, S, A, L o R; y Xk es P, T, A o S (SEQ ID NO: 24);
Secuencias consenso de HVR de la cadena pesada 25
HVR H1: GFXiXmXnYYIH, en la que Xi es N, S o T; Xm es S, D, Y o A; y Xn es G o D (SEQ ID NO: 25);
HVR H2: WIDPYGGDTXoYADSVKG, en la que Xo es N o D (SEQ ID NO: 26);
30 HVR H3: GTFLTXpWGHYFDY, en la que XP es S o T (SEQ ID NO: 27).
VR de la cadena ligera consenso
[)lOMTOSPSSLSASVGPRVTlTCRASOX.Xl,X,X,iX,XrAWYOOKPGKAPKEEIYSASrLYS GVPSRrSGSGSGTDrTLTISSLOPEDnATYYCOOXoXhX XiPXiTrGOGTKVEIKR. en la
que Xa es D, S o V; Xb es V o I; Xc es S, N o G; Xd es T o N; Xe es A o Y; Xf es V o L; Xg es S, V o D; Xh es Y, D o S; 35 X¡ es T, S, A, D o N; Xj es T, H, N, S, A, L o R; y Xk es P, T, A o S; (SEQ ID NO: 31)
VR de la cadena pesada consenso
EVOLVE$GGGLVOPGGSLRLSCAA$GFXiIX„.XnYYlH\VVROAPGKGLEWVGWIDPYG
GI)TX,YAI)SVKGRiriSAI)TSKNTAYLOMNSI.RAi:i)TAVYYCARGTFl.TXPWGHYID
YWGQGT en |a que X| es N, S o T; Xm es S, D, Y o A; Xn es G o D; Xo es N o D; y XP es S o T (SEQ ID NO: 32)
40
YW505.94a51 HVR L1: RASQDVGTYLA (SEQ ID NO: 33)
YW505.94a.1 HVR L3: QQVYSHPPT (SEQ ID NO: 34)
45 YW505.94a.7 HVR L3: QQSYTNPPT (SEQ ID NO: 35)
YW505.94a.22 HVR L3: QQSYATPTT (SEQ ID NO: 36)
YW505.94a.37 HVR L3: QQSYSSPAT (SEQ ID NO: 37)
50
YW505.94a.39 HVR L3: QQVYTTPPT (SEQ ID NO: 38)
YW505.94a.40 HVR L3: QQVYATPST (SEQ ID NO: 39)
55 YW505.94a.42 HVR L3: QQSYNSPAT (SEQ ID NO: 40)
YW505.94a.46 HVR L3: QQSYSTPAT (SEQ ID NO: 41)
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YW505.94a.50 HVR L3: QQSYTAPTT (SEQ ID NO: 42)
YW505.94a.51 HVR L3: QQDSTLPPT (SEQ ID NO: 43)
YW505.94a.52 HVR L3: QQSDAAPPT (SEQ ID NO: 44)
YW505.94a.78 HVR L3: QQSYSTPPT (SEQ ID NO: 45)
YW505.94a.89 HVR L3: QQSYTRPPT (SEQ ID NO: 46)
YW505.94a.7 HVR H1: GFSISDYYIH (SEQ ID NO: 47)
YW505.94a.26 HVR H1: GFSIDGYYIH (SEQ ID NO: 48)
YW505.94a.38 HVR H1: GFTIYDYYIH (SEQ ID NO: 49)
YW505.94a.78 HVR H1: GFSIAGYYIH (SEQ ID NO: 50)
YW505.94a.82 HVR H1: GFTISDYYIH (SEQ ID NO: 51)
YW505.94A.42 HVR H2: WIDPYGGDTDYADSVKG (SEQ ID NO: 52)
YW505.94A.46 HVR H3: GTFLTTWGHYFDY (SEQ ID NO: 53)
Tabla A. Secuencias de HVR y de dominio variable para el anticuerpo anti-HtrA1 YW505.94 y variantes mejoradas en afinidad del mismo.
- SEQ ID NO
- H1 H2 H3 L1 L2 L3 VR de la HC VR de la HC
- Consenso
- 25 26 27 23 2 24 32 31
- YW505.94
- 4 5 6 1 2 3 8 7
- YW505.94a
- 20 5 6 1 2 3 29 7
- YW505.94a.28
- 20 5 6 18 2 19 29 28
- YW505.94a.54
- 20 5 6 21 2 22 29 30
- YW505.94a.1
- 20 5 6 1 2 34
- YW505.94a.7
- 47 5 6 1 2 35
- YW505.94a.22
- 20 5 6 1 2 36
- YW505.94a.26
- 48 5 6 1 2 3
- YW505.94a.37
- 47 5 6 1 2 37
- YW505.94a.38
- 49 5 6 1 2 3
- YW505.94a.39
- 20 5 6 1 2 38
- YW505.94a.40
- 20 5 6 1 2 39
- YW505.94a.42
- 20 52 6 1 2 40
- YW505.94a.46
- 20 5 53 1 2 41
- YW505.94a.47
- 20 52 6 1 2 3
- YW505.94a.50
- 47 5 6 1 2 42
- YW505.94a.51
- 20 5 6 33 2 43
- YW505.94a.52
- 20 5 6 1 2 44
- YW505.94a.77
- 20 5 53 1 2 3
- YW505.94a.78
- 50 5 6 1 2 45
- YW505.94a.82
- 51 5 6 1 2 3
- YW505.94a.89
- 20 52 6 1 2 46
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III. Ejemplos
Ejemplo 1: Generación de anticuerpos anti-HtrA1
Presentación en fagos. Las colecciones de anticuerpos sintéticos presentaron fragmentos Fab bivalentes en el fago M13 y se generó la diversidad mediante el uso de mutagénesis dirigida por oligonucleótidos en tres regiones determinantes de la complementariedad (CDR) de la cadena pesada. Los detalles de las colecciones de Fab se describieron previamente (Lee, C.V., et al., J Mol Biol. 340:1073-93 (2004); Lee, C.V., et al., J Immunol Methods. 284:119-32 (2004)). Se recubrieron durante la noche inmunoplacas Maxisorp de 96 pocilios de Nunc a 4o C con MuHtrA1_PD (10 pg/ml) y, entonces, se bloquearon durante 1 h a temperatura ambiente con tampón de bloqueo de fagos (PBS, BSA al 1% (p/v), Tween 20 al 0,05 % (v/v)). Las colecciones de anticuerpos en fagos se añadieron a las placas recubiertas con MuHtrA1_PD y se incubaron durante la noche a temperatura ambiente. Las placas se lavaron con PBS, tampón Tween-20 al 0,05 % (v/v) y el fago unido se eluyó con HCI 50 mM-NaCI 500 mM durante 30 min y se neutralizó con un volumen equivalente de tris-HCI 1 M, pH 7,5. Se amplificó el fago recuperado en células de E. coli XL-1-Blue. Durante las tandas de selección posteriores, la incubación del anticuerpo en fago con las placas recubiertas con antígeno se redujo a 2-3 horas y la restricción del lavado de placa se incrementó gradualmente. Se reformatearon 13 clones identificados a IgG (como se describe a continuación para Fab94), se expresaron en 293 células y se purificaron mediante cromatografía de afinidad con proteína A. Las 13 IgG purificadas se unieron a MuHtrA1_PD en un ELISA de unión.
Expresión y purificación de anti-HtrA1 Fab94 e lgG94. Las regiones variables de tanto las cadenas pesada como ligera de Fab94 (YW505.94) se subclonaron en un vector de expresión de Fab de E. coli (AEP1). El plásmido resultante se transformó en la cepa 34B8 de E. coli. La única colonia se cultivó durante la noche a 37 °C en 30 mi de medio LB enriquecido con 50 pg/ml de carbenicilina. Se inocularon cinco mi del cultivo en 500 mi de medio C.R.A.P. completo (Simmons, L.C., et al., J Immunol Methods. 263:133-47 (2002)) enriquecido con carbenicilina (50 pg/ml) y se cultivó a 30 °C durante 24 h. Se purificó la proteína Fab94 usando resina de agarosa de proteína A.
Los dominios variables de tanto la cadena ligera como de la cadena pesada de Fab94 se clonaron en un plásmido basado en pRK5 con el dominio constante de la cadena ligera o de la cadena pesada humana (lgG1 humana) para su expresión transitoria en células de ovario de hámster chino (CHO). La proteína lgG94 se purificó mediante el uso de cromatografía de agarosa con proteína A.
Las secuencias de aminoácidos para la región variable de la cadena ligera y la región variable de la cadena pesada para Fab94 (YW505.94) se muestran en las figs. 1Ay 1B, respectivamente.
Ejemplo 2: Producción de proteínas HtrA1
Construcciones de proteínas. Se clonaron HtrA1 humana de longitud completa (HuHtrAI) (Q23-P480) y HtrA1 murina de longitud completa (MuHtrAI) (P24-P480) mediante amplificación por PCR a partir de clones de longitud completa usando Taq polimerasa. Los cebadores contenían los nucleótidos requeridos para añadir porciones de los sitios de restricción BamHI y EcoRI a los productos de PCR resultantes. Los fragmentos de PCR se fijaron a un vector de transferencia de baculovirus pAcGP67 (BD Pharmingen) modificado que contenía una secuencia HÍS6 (SEQ ID NO: 90) en dirección 5' del sitio de restricción BamHI, dando como resultado un marcador HÍS6 N terminal (SEQ ID NO: 90) en las proteínas HtrA1.
El dominio proteasa de HtrA1 humana (HtrA1_PD) que carece del dominio N y del dominio PDZ (por ejemplo, que contiene los residuos D161-K379) se clonó mediante amplificación por PCR. El ADN amplificado se insertó en un vector pET modificado, dando como resultado un marcador HÍS6 N terminal (SEQ ID NO: 90) y un sitio de escisión de trombina fusionado en dirección 5' del codón D161 de HtrA1. Los mutantes de HtrA1_PD Ala se generaron usando el kit de mutagénesis dirigida a sitio QuikChange XL de acuerdo con el protocolo del fabricante (Agilent Technologies, Santa Clara, CA). Las construcciones se verificaron mediante secuenciación de ADN. Los dominios proteasa de HtrA1 murina (MuHtrA1_PD) (G156-S367), HtrA3 murina (MuHtrA3_PD) (P133-F350) y HtrA4 murina (MuHtrA4_PD) (E159- Y371) se clonaron a partir de clones de longitud completa usando Pfu polimerasa (Agilent). Los cebadores contenían los nucleótidos requeridos para añadir los sitios de restricción Not I y Stu I a los productos de PCR resultantes. Los fragmentos de PCR se fijaron a pST23 de un vector de expresión con un promotor de phoA. Este vector de expresión contiene las secuencias de aminoácidos MK(HQ)6MHQSTAA (SEQ ID NO: 11) en dirección 5' del sitio de restricción Not I, dando como resultado la fusión N terminal del marcador de unienzima a los dominios proteasa.
Como se describe en el presente documento, se preparan los residuos de aminoácido de huHtrAI, muHtrAI, muHtrA3 y muHtrA4 con referencia a las SEQ ID NO: 13-16, respectivamente. Las posiciones de aminoácidos se especifican mediante el código de aminoácidos de una letra seguido de su posición dentro de una de las SEQ ID NO: 13-16. Por ejemplo, huHtrAI de longitud completa comprende una secuencia que comienza en glutamina en la posición 23 de SEQ ID NO: 13 y termina en prolina en la posición 480 de SEQ ID NO: 13, por ejemplo, Q23-P480. De forma similar, las mutaciones en una posición particular dentro de una proteína HtrA se designan por el aminoácido de partida,
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seguido de la posición dentro de una de las SEQ ID NO: 13-16, seguido del aminoácido sustituido. Por ejemplo, una mutación de Usina en la posición 248 de HuHtrAI (SEQ ID NO: 13) a alanina se denomina K248A.
Expresión y purificación de proteínas. HuHtrAI y MuHtrAI se expresaron en células de insecto Trichoplusia ni (Expression Systems LLC, Woodland, CA). Los medios de células de insecto obtenidos (después de que el pH se ajustara a 6,8) tenían NiCb, CaCh y NaCI añadidos a las concentraciones finales de 1,0, 2,5 y 150 mM, respectivamente.
Las construcciones de HuHtrA1_PD (natural y S328A mutante) se expresaron en E. coli BL21 (Stratagene). Los cultivos de E. coli se cultivaron a 37 °C en medio LB que contenía 50 pg/ml de carbenicilina hasta que A6oo alcanzó de 0,8 a 1,0 y, entonces, se indujo con IPTG 0,4 mM y se cultivó a 16 °C durante 24 h. Los sedimentos de células bacterianas se resuspendieron en 1/10-ésimo de volumen de cultivo de tris 50 mM, pH 8,0, NaCI 500 mM y se rompieron usando un microfluidizador. Los Usados se centrifugaron a 30.000 x g durante 30 min.
HuHtrAI, MuHtrAI, HuHtrA1_PD y HuHtrA1_PD (S328A) se purificaron usando resina de níquel-nitrilo-ácido triacético (Qiagen). Después de cargar los medios de células de insecto o Usados de E. coli, las columnas se lavaron con 10 volúmenes de columna (VC) de tris 50 mM, pH 8,0, NaCI 500 mM seguido de 10 VC de tris 50 mM, pH 8,0, NaCI 1 M, imidazol 20 mM. Las proteínas se eluyeron con tris 50 mM, pH 8,0, NaCI 200 mM, glicerol al 10 %, CHAPS al 0,25 %, imidazol 300 mM. Las fracciones combinadas se purificaron adicionalmente mediante cromatografía de exclusión por tamaño en una columna S-200 (GE Healthcare) y se obtuvieron las fracciones de los picos correspondientes a las formas de proteína triméricas. La pureza de la proteína fue mayor de un 90 % como se evaluó mediante SDS-PAGE y las concentraciones de proteínas se determinaron usando el ensayo de proteínas BCA™ (Pierce, Rockford, IL).
Los mutantes de Ala de HuHtrA1_PD (panel de 15 mutantes excepto S328A) se expresaron como se describe para la forma natural de HuHtrA1_PD (véase anteriormente). Se añadió tampón de lisis (PopCulture, EMD Chemical, San Diego CA) a los sedimentos de células bacterianas a 50 mi de tampón de lisis/500 mi de sedimento. El sedimento se suspendió completamente en tampón de lisis con un politrón y se agitó a temperatura ambiente durante 30 min. El Usado celular se centrifugó (Beckman, rotor LA-16.250) a 33.700 x g durante 30 min a 4o C y el sobrenadante resultante se filtró a través de una unidad de filtro de 0,22 pm (Nalgene). El sobrenadante filtrado se cargó en una columna de Ni-NTA (3 mi, Qiagen) preequilibrada con tris 50 mM, NaCI 300 mM, imidazol 10 mM, glicerol al 10 %, pH 8,0 (tampón A). Una vez cargada, la columna se lavó con 12 VC de tampón A seguido de 20 VC de tampón A + Tritón X-114 al 0,1 %. La columna se lavó, de nuevo, con 15 VC de tampón A para eliminar el detergente. Las proteínas se eluyeron con tampón A + imidazol 200 mM, CHAPS al 0,25 %. Las fracciones combinadas se purificaron adicionalmente con Superdex 200 (H¡ load 16/60, 120 mi, GE Healthcare) equilibrada con tris 50 mM, pH 8,0, NaCI 200 mM, glicerol al 10 %, CHAPS al 0,25 %. Las fracciones correspondientes al pico del trímero de HtrA1_PD se combinaron. La pureza de la proteína fue mayor de un 90 % como se evaluó mediante SDS-PAGE y las concentraciones de proteínas se determinaron mediante el uso del ensayo de proteínas BCA™ (Pierce, Rockford, IL).
MuHtrA1_PD, MuHtrA3_PD y MuHtrA4_PD se expresaron en E. coli 58F3 (Szeto, W., et al., Cáncer Res. 61:4197-205 (2001)). Los cultivos durante la noche de E. coli, cultivados a 30 °C en medio LB que contenía 50 pg/ml de carbenicilina se diluyeron (1/100 vol) para dar un cultivo más grande que contenía medio C.R.A.P. (Simmons, L.C., etal., J Immunol Methods. 263:133-47 (2002)) enriquecido con carbenicilina 50 pg/ml de carbenicilina. Después de la inoculación, se cultivó E. coli durante aproximadamente 20 h a 30 °C. MuHtrA1_PD se purificó como se describe para HuHtrA1_PD (véase anteriormente). Para la purificación de MuHtrA3_PD y MuHtrA4_PD, se añadió tampón de lisis (tris 50 mM, pH 8,5, NaCI 500 mM, imidazol 10 mM, glicerol al 10%) al sedimento de células bacterianas. El sedimento se homogeneizó en tampón de lisis con un politrón y las células se homogeneizaron con un microfluidizador. El Usado celular se centrifugó y el sobrenadante resultante se filtró a través de una unidad de filtro de 0,22 pm (Nalgene). El sobrenadante filtrado se cargó en una columna de 3 mi de Ni-NTA (Qiagen) preequilibrada con tris 25 mM, pH 8,5, NaCI 500 mM, imidazol 20 mM, glicerol al 10 % (tampón B). Después de su carga, la columna se lavó con 12 VC de tampón B seguido de 20 VC de tampón B + Tritón X-114 al 0,1 %. La columna se lavó de nuevo con 15 VC de tampón B para eliminar el detergente. Las proteínas se eluyeron con tris 25 mM, pH 8,5, NaCI 500 mM, imidazol 250 mM, glicerol al 10 %, CHAPS al 0,25 %. Las fracciones combinadas se purificaron adicionalmente en una Superdex 75 de 120 mi (GE Healthcare) equilibrada con tris 25 mM, pH 8,5, glicerol al 10 %, TCEP 0,5 mM, CHAPS al 0,25 %. Las fracciones correspondientes al pico del trímero de proteasa se combinaron. La pureza de la proteína fue mayor de un 90 % como se evaluó mediante SDS-PAGE.
Ejemplo 3: Determinación de la actividad inhibidora de anticuerpos anti-HtrA1 usando un ensayo de FRET
Síntesis del sustrato peptídico. El péptido H2-Opt (Mca-IRRVSYSF(Dnp)KK) (SEQ ID NO: 12), descrito originalmente como un sustrato para HtrA2 (Martins, L.M., et al., J Biol Chem. 278:49417-27 (2003)), se sintetizó en resina Fmoc- Lys(Boc)-wang usando procedimientos de acoplamiento estándar con HBTU. Se incorporó Fmoc-Lys(DNP)-OH (Anaspec) a la posición P5’. El péptido se sintetizó hasta P5 (Mea, 7-metoxi-cumarina, Aldrich) y, entonces, se escindió del soporte sólido usando ácido trifluoroacético, triisopropilsilano y agua durante 2 horas a temperatura ambiente. El péptido se precipitó a partir de éter etílico, se extrajo con ácido acético, acetonitrilo, agua y se liofilizó. El péptido marcado en bruto se disolvió y se purificó en una columna C18 de fase inversa preparativa usando acetonitrilo/agua. Las fracciones purificadas se combinaron, liofilizaron y analizaron mediante cromatografía de líquidos/espectrometría
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de masas (Ph/Sciex) y se descubrió que eran consistentes con sus masas calculadas.
Ensayos enzimáticos con sustrato peptídico. Se incubó HtrA1 en placas de fondo óptico de color negro de 96 pocilios (Nalge Nunc Int., Rochester, NY) con lgG94 o Fab94 diluidos en serie en tris-HCI 50 mM, pH 8,0, NaCI 200 mM, CHAPS al 0,25 % (tampón de ensayo) durante 20 min a 37 °C. Para las pruebas ¡nidales, se incubó un panel de 13 anticuerpos anti-HtrA1 derivados de fago, concentraciones únicas de IgG (concentraciones finales de 0,16 mg/ml- 0,28 mg/ml) con HuHtrAI o HuHtrA1_PD. Se diluyó una solución madre 10 mM del sustrato peptídico Mca- IRRVSYSF(Dnp)KK (SEQ ID NO: 12) (H2-Opt) en DMSO en agua a 12,5 pM, se precalentó a 37 °C y, entonces, se añadió a la mezcla de reacción. Las concentraciones finales de los reactivos fueron: HuHtrAI o MuHtrAI 5 nM, lgG94 0,005-300 nM, Fab94 0,02-900 nM, H2-Opt 2,5 pM. El incremento de la señal de fluorescencia (excitación a 328 nm, emisión a 393 nm) se midió en un lector de microplacas SPECTRAmax M5 (Molecular Devices, Sunnyvale, CA) y se determinaron las tasas lineales de escisión de H2-Opt (mRFU/min). Se llevaron a cabo experimentos con inhibición por lgG94 de tripsina (Roche) y elastasa (MP Biomedicals) de manera idéntica, excepto en que las concentraciones de enzimas finales fueron de 1 nM, la concentración de lgG94 fue de 300 nM y el tiempo de incubación fue de 15 min.
Como se muestra en la fig. 2, se incubó un panel de 13 anticuerpos (IgG) derivados de fago con HuHtrAI o HuHtrA1_PD y se midió la actividad enzimática. De los 13 anticuerpos sometidos a prueba, los anticuerpos YW503.57, YW504.57, YW504.61 e YW505.94 (también denominado Fab94, anticuerpo 94, Ab94 o lgG94) inhibieron fuertemente las actividades de tanto HuHtrAI como de HuHtrA1_PD.
Como se muestra en la fig. 3, lgG94 inhibió la actividad enzimática de HuHtrAI frente al sustrato H2-Opt de una forma dependiente de la concentración con un valor de Clso de 1,8 nM. La inhibición completa se logró por encima de 30 nM de lgG94. Por el contrario, otros dos miembros de la familia de serina proteasas similares a tripsina, tripsina y elastasa, no se inhibieron por lgG94 a 300 nM, lo que indica que lgG94 tiene especificidad frente a HuHtrAI Fab94 también inhibió HuHtrAI de una manera dependiente de la concentración, pero de manera menos potente que lgG94 como se indica mediante el valor de Clso de 29,1 nM. Estos resultados concuerdan de manera excelente con el valor de Kd de 31,1 nM determinado mediante experimentos de resonancia de plasmón superficial (véase la tabla 1 a continuación). Los resultados muestran que lgG94 y Fab94 pueden neutralizar completamente la actividad enzimática de HuHtrAI frente a un sustrato peptídico sintético pequeño y que esta actividad es específica. Además, el incremento de aproximadamente 16 veces de la potencia de lgG94 frente a Fab94 es consistente con los efectos de avidez predichos a partir del complejo lgG94:HtrA1 ‘similar a jaula’ basándose en el análisis de masas (véanse, por ejemplo, la tabla 2 y la figura 9).
También se determinaron las potencias inhibidoras de las variantes mejoradas en afinidad del anticuerpo YW505.94a.28 usando el ensayo descrito anteriormente con el sustrato peptídico H2-Opt con extinción de fluorescencia y 1,0 nM de HuHtrAI o 1,5 nM de HuHtrA1_PD. Los resultados se muestran a continuación.
- Formato de YW505.94a.28
- HuHtrA1_PD HuHtrAI
- Clso nM Clso nM
- IgG
- 0,229 0,335
- Fab
- 2,03 1,95
Ejemplo 4: Determinación de la actividad inhibidora de anticuerpos anti-HtrA1 usando sustratos macromoleculares
Se volvió a purificar la (3-caseína bovina (Sigma-Aldrich) en una columna de intercambio iónico MonoQ para producir material altamente purificado. Se incubó HuHtrAI en tubos Eppendorf junto con concentraciones crecientes de lgG94 en tampón de ensayo durante 15 min a 37 °C, después de lo cual se añadieron sustratos macromoleculares. Para la digestión con (3-caseína, la concentración final de reactivos fue: HuHtrAI 10 nM, 50 pg/ml de (3-caseína, lgG94 2,3- 150 nM. Para la decorina, las concentraciones finales fueron: HuHtrAI 125 nM, 50 pg/ml de decorina (R & D Systems), lgG94 2-125 nM. Para biglucano, las concentraciones finales fueron: HuHtrAI 75 nM, 50 pg/ml de biglucano (R & D Systems), lgG94 2,3-150 nM. Después de la incubación a 37 °C (2 h para (3-caseína, 14 h para decorina, 6 h para biglucano), se añadió tampón de muestra de SDS y las muestras se hirvieron y analizaron mediante SDS-PAGE (no reductora).
Se llevó a cabo la hidrólisis de caseína marcada con tinte fluorescente, BODIPY FL-caseína (Invitrogen), en placas de fondo óptico de color negro de 96 pocilios (Nalge Nunc Int., Rochester, NY). Se incubaron HuHtrAI o MuHtrAI con lgG94 diluido en serie en tampón de ensayo durante 15 min a 37 °C. Después de la adición de BODIPY FL en el tampón de ensayo, las concentraciones de reactivos fueron como sigue: HuHtrAI 30 nM, MuHtrAI 30 nM, 5 pg/ml de BODIPY FL, lgG94 0,24-250 nM. El incremento de la señal de fluorescencia (excitación a 484 nm, emisión a 535 nm) se midió en un lector de microplacas SPECTRAmax M5 (Molecular Devices, Sunnyvale, CA) y se determinaron las tasas lineales de escisión de BODIPY FL (mRFU/min) y se expresaron como un porcentaje de tasas no inhibidas (control).
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Como se muestra en la fig. 6, HuHtrAI degrada los sustratos macromoleculares (3-caseína, decorina y biglucano (carril 2). En ausencia de HuHtrAI, los sustratos permanecieron inalterados durante el periodo experimental (fig. 6, carril 1). La preincubación de HuHtrAI con concentraciones crecientes de lgG94 (fig. 6, carril 9-carril 3) dio como resultado una inhibición dependiente de la concentración de la degradación del sustrato. A las concentraciones de lgG94 más altas sometidas a prueba, se previno completamente la degradación de (3-caseína, decorina y biglucano (fig. 6, carril 3). Los resultados muestran que lgG94 inhibió potente y eficazmente la actividad de HuHtrAI frente a tres sustratos macromoleculares.
Como se muestra en la fig. 4, lgG94 inhibió de una manera dependiente de la concentración la hidrólisis de BODIPY FL mediante tanto HuHtrAI como MuHtrAI con valores de Clso de 8,3 nM y 5,4 nM, respectivamente. Los resultados muestran que lgG94 reconoce y neutraliza completamente las actividades enzimáticas de tanto HuHtrAI como de MuHtrAI frente al sustrato macromolecular BODIPY FL.
Ejemplo 5: Determinación de la especificidad de los anticuerpos anti-Htra1 frente a Htral
Se evaluó la especificidad de lgG94 midiendo su actividad para inhibir muHtrA1_PD en comparación con su capacidad de inhibir las proteasas relacionadas estructuralmente MuHtrA3_PD y MuHtrA4_PD (véase la fig. 5). Se determinó la especificidad usando el ensayo de FRET como se describe anteriormente en el ejemplo 3, excepto en que las concentraciones de MuHtrA1_PD, MuHtrA3_PD y MuHtrA4_PD fueron de 6 nM, 20 nM y 20 nM, respectivamente, y el intervalo de concentraciones de lgG94 fue de 0,2-400 nM. También se analizó la especificidad usando el sustrato BODIPY FL-caseína como se describe anteriormente en el ejemplo 4, excepto en que la concentración de MuHtrA1_PD, MuHtrA3_PD y MuHtrA4_PD fue de 50 nM y el intervalo de concentraciones de lgG94 fue de 1,4- 1000 nM. lgG94 inhibió la escisión de H2-Opt (fig. 5, panel superior) y BODIPY FL (fig. 5, panel inferior) por MuHtrA1_PD, pero no inhibió la escisión de los mismos sustratos por MuHtrA3_PD y MuHtrA4_PD hasta concentraciones de 400 nM y 1000 nM para los sustratos H2-Opt y BODIPY FL, respectivamente. Los resultados sugieren que lgG94 tiene una especificidad excelente y no afecta a las actividades de las proteasas relacionadas.
Ejemplo 6: Determinación de la afinidad del anticuerpo mediante BIAcore
Para determinar la afinidad de unión de Fab94 mediante cinética de un solo ciclo, se usó la medición de resonancia de plasmón superficial (SRP) con un instrumento BIAcore™ T100. En resumen, se activó la matriz CM5 de sensor de la serie S con los reactivos EDO y NHS de acuerdo con las instrucciones del proveedor, y se acopló estreptavidina (Pierce) para lograr aproximadamente 2000 unidades de respuesta (UR), seguido de grupos de bloqueo sin reaccionar con etanolamina 1 M.
Para las mediciones cinéticas, se inyectaron en primer lugar HuHtrA1_PD o MuHtrA1_PD biotinilada a un caudal de 10pil/min para capturar aproximadamente 100 UR en 3 cubetas de lectura (CL) diferentes, excepto para CL1 (cubeta de referencia), y, entonces, se inyectaron diluciones en serie de 5 veces de Fab94 (0,48 nM-300 nM) en HEPES 0,01 M, pH 7,4, NaCI 0,15 M, tensioactivo P20 al 0,005 % (caudal: 30 pl/min) sin regeneración entre inyecciones. Los sensogramas se registraron y evaluaron mediante el programa informático de evaluación de BIAcore™ T100 (versión 2.0) después de restar la señal de la cubeta de referencia. Las tasas de asociación (tan) y las tasas de disociación (taff) se calcularon usando un simple modelo de unión uno a uno de Langmuir. La constante de disociación de equilibrio (Kd) se calculó como la proporción taff/tan (véase la tabla 1 a continuación). La cinética de unión de Fab94 a HuHtrA1_PD y a MuHtrA1_PD fue muy similar. Los valores de Kd fueron 31,1 nMy28,9nM, respectivamente.
Tabla 1. Afinidades de unión de Fab94 a HuHtrA1_PD y MuHtrA1_PD mediante resonancia de plasmón superficial.
- kon taff Kd
- (105 M'V) (104 s-1) (nM)
- HuHtrA1_PD
- 3,5 109,0 31,1
- MuHtrA1_PD
- 4,5 129,0 28,9
Ejemplo 7: Cartografía de epítopos de lgG94 en HuHtrA1_PD
Para identificar el epítopo de unión funcional de lgG94, se generó un panel de mutantes de HuHtrA1_PD con mutaciones de alanina individuales para los experimentos de unión. La mayoría de los residuos mutados se localizan en bucles superficiales circundantes al sitio activo y también incluyen la serina catalítica (S328) y el aspartato (D250). Los mutantes se expresaron en E. coli y los trímeros se purificaron mediante cromatografía de exclusión por tamaño como se describe en el ejemplo 2. Se determinó la unión usando un ensayo de ELISA, que se realizó usando una placa de microvaloración MAXISORP™ recubierta con mutantes de HuHtrA1_PD a 2 pg/ml en PBS durante 1 h, seguido de bloqueo con tampón PBST (BSA al 0,5 % y Tween 20 al 0,05 % en PBS) durante 1 h a temperatura ambiente. Se añadió Ig94 diluido en serie 5 veces (de 50 nM a 0,0006 nM) en tampón PBST y se incubó durante 30 min. Las placas se lavaron con tampón PBT (Tween 20 al 0,05 % en PBS) y se añadió anti-lgG humana de cabra conjugada a HRP (H+L) (Invitrogen) (1:5000 en tampón PBST) y se incubó durante 1 h. Las placas se lavaron con
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tampón PBT y se desarrollaron añadiendo sustrato de tetrametilbencidina (Kirkegaard and Perry Laboratories, Gaithersburg, MD). La absorbancia a 450 nm se representó como una función de la concentración de anticuerpos en solución para determinar los valores de CEso. Entonces, se cartografió la localización de los mutantes que efectúan la unión en la estructura de HtrA1.
En el ELISA de unión, lgG94 mostró la mayor reducción en la unión a los mutantes de HuHtrA1_PD(N224A) y HuHtrA1_PD(K248A) (véase la fig. 7A). Tras la repetición del experimento usando una concentración más baja de HtrA1 para recubrir las placas (1 pg/ml) y un tiempo de incubación acortado (reducido desde 1 hora a 20 minutos de incubación), lgG94 también mostró al menos una reducción de 5 veces de la unión a los mutantes de HuHtrAI V201 A, H220A, T223A, K225A, K243Ay E247A (véase la fig. 7A). Los resultados indican que lgG94 se une a un epítopo que incluye los residuos N224 y K248, que se localizan en el bucle B y bucle C (véanse las figs. 7B y 7C). En serina proteasas similares a tripsina, se sabe que estos bucles son parte de la región determinante de la especificidad que interacciona con sustratos. K248 (bucle C) está muy cerca del D250 catalítico y N224 del H220 catalítico. Por lo tanto, la unión de lgG94 a estos residuos puede afectar al acceso del sustrato a la hendidura catalítica mediante impedimento estérico directo o mediante un mecanismo alostérico indirecto como se descubrió para neutralizar anticuerpos anti- HGFA que también reconocen residuos en el bucle C (Ganesan, R., et al., Structure 17:1614-1624 (2009); Wu, Y., et al., Proc Nati Acad Sci USA 104:19784-9 (2007)). De forma alternativa, la unión al anticuerpo puede inhibir la catálisis influyendo directamente en los residuos de la tríada catalítica D250 y/o H220.
Ejemplo 8: Estequiometría de los complejos de HtrA1_PD con Fab94 e lgG94 mediante cromatografía de exclusión por tamaño-dispersión de luz de ángulo múltiple (SEC-MALLS)
Se usó una forma inactiva catalíticamente de HuHtrA1_PD(S328A) para la formación de complejos. Los complejos Fab94:HuHtrA1_PD(S328A) e lgG94:HuHtrA1_PD(S328A) se formaron en tampón tris (tris-HCI 50 mM, pH 8,0, NaCI 200 mM, glicerol al 10 %, CHAPS al 0,25 %). Los complejos y los componentes individuales solos se incubaron a 4 °C durante la noche y, entonces, se inyectaron y resolvieron en una columna S200 Superdex 10/300 GL (GE Healthcare) en tampón tris con un caudal de 0,5 ml/min. Los datos se obtuvieron con un detector de dispersión de luz de 18 ángulos (Dawn Helios II con QELS) y un detector del índice de refracción (Optilab reX) de Wyatt Technologies. El análisis se hizo con el programa informático Astra 5 para producir la masa molar independientemente del tiempo de elución. La normalización se realizó con una IgG de control.
Los experimentos de SEC-MALLS muestran que Fab94 e lgG94 forman complejos con HuHtrA1_PD(S328A), que tienen masas distintas. Las masas determinadas y la estequiometría deducida de los complejos se muestran en la tabla 2.
Tabla 2. Estequiometría de HuHtrA1_PD(S328A) en complejo con Fab94 e lgG94 determinada mediante SEC-MALLS.
- Componentes*
- Masa mediante MALLS (Da)** Estequiometría de mejor ajuste8. Masa esperada (Da) Diferencia de masa (%)
- HtrA1_PD
- 76.755 - - -
- Fab94
- 47.400 - - -
- lgG94
- 151.200 - - -
- Fab94:HtrA1_PD
- 210.100 3:1 218.955 4,2
- lgG94: HtrA1_PD
- 618.600 3:2 607.110 1,9
* HuHtrA1_PD era HuHtrA1_PD con la serina catalítica mutada a alanina (HuHtrA1_PD(S328A)); la masa representa el trímero
" Promedio de dos experimentos independientes & Proporción de anticuerpo:trímero de proteasa
La masa determinada del complejo Fab94:HtrA1_PD(S328A) de 210.100 Da es consistente con un complejo de 3 Fab que se une a un trímero de HuHtrA1_PD(S328A) (complejo 3:1). La diferencia entre las masas experimentales y teóricas de dicho complejo 3:1 es solo de un 4,2 %. Por lo tanto, un Fab se puede unir a cada monómero de HuHtrA1_PD(S328A) dentro de un homotrímero de HtrA1.
La masa determinada del complejo lgG94:HtrA1_PD(S328A) de 618.600 Da se ajusta bien a una estequiometría 3:2, en la que 3 moléculas de IgG se unen a dos trímeros de HuHtrA1_PD(S328A). La diferencia entre la masa experimental
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y teórica de dicho complejo 3:2 es solo de un 1,9 %.
Las estequiometrías explicadas concuerdan con los hallazgos de que Fab94 e lgG94 pueden inhibir completamente la actividad de HtrA1, en tanto que cada monómero dentro de un trímero de HtrA1 se une a un Fab o a un brazo Fab de una IgG. Por tanto, en estos complejos no hay monómero de HtrA1 ‘libre’ disponible, concordando con la inhibición completa de la actividad enzimática de HtrA1 por Fab94 e lgG94. Se propone un modelo de ‘jaula’ para el complejo lgG94:HtrA1_PD(S328A) en el que los brazos Fab de las 3 IgG unen con puentes dos trímeros, uniéndose cada brazo Fab a un monómero (véase la fig. 9). El modelo también explica la potencia incrementada de aproximadamente 16 veces de lgG94 sobre Fab94 en ensayos enzimáticos (véase, por ejemplo, la fig. 3) en tanto que lgG94 se beneficia fuertemente de los efectos de avidez en su unión a los trímeros de HtrA1_PD.
Ejemplo 9: Maduración de la afinidad de YW505.94
Colecciones de construcciones para la maduración de la afinidad de anti-HtrA1. El clon YW505.94a se derivó de YW505.94 [Ab94] cambiando el residuo de Kabat N28 a serina dentro de H1 de CDR a fin de eliminar un sitio de glucosilación enlazado a N potencial. El fagémido pW0703, derivado del fagémido pV0350-2b (Lee et al., J Mol. Biol 340, 1073-1093 (2004)), que contiene un codón finalizador (TAA) en todas las posiciones de CDR-L3 y presenta un Fab monovalente en la superficie del bacteriófago M13, sirvió como molde de colección para injertar el dominio variable de la cadena pesada (Vh) del clon YW505.94a para la maduración de la afinidad. Se usaron estrategias de aleatorización tanto completa como parcial para la maduración de la afinidad. Para la aleatorización completa, se aleatorizó una colección de la cadena ligera (L1/L2/L3 completa) con posiciones seleccionadas en tres CDR de la cadena ligera usando aminoácidos diseñados para imitar a un anticuerpo humano natural y la redundancia de ADN diseñada fue como se describe (Lee et al., 2004). Para la aleatorización parcial, se seleccionaron como diana para la aleatorización los residuos seleccionados en las posiciones de Kabat 91, 92, 93, 94 y 96 de CDR-L3, 28-35 de CDR- H1, 50-58 de CDR-H2 y 95-100 de CDR-H3 con dos combinaciones diferentes de bucles CDR, L3/H1 parcial, L3/H2 parcial y L3/H3 parcial. Para lograr las condiciones de aleatorización parcial, que introducen una tasa de mutación de aproximadamente un 50 % en las posiciones seleccionadas, se sintetizó el ADN mutágeno con mezclas 70-10-10-10 de bases que favorecen a los nucleótidos naturales (Gallop et al., J. ofMed. Chem. 37, 1233-1251 (1994)).
Estrategia de clasificación de fagos para aislar variantes mejoradas en afinidad. Para la selección de la mejora en afinidad, las colecciones de fagos se sometieron a clasificación de placas para la primera tanda, seguida de cuatro tandas de clasificación de soluciones. Para la primera tanda de clasificación de placas, se clasificaron por separado cuatro colecciones (L1/L2/L3 completa, L3/H1 parcial, L3/H2 parcial y L3/H3 parcial) frente a una placa recubierta con HtrA1 humana (HuHtrAI) (placa Maxisorp de NUNC) con entrada de fagos de aproximadamente 3 DO/ml en BSA al 1 % y Tween 20 al 0,05 % durante 1 hora a temperatura ambiente (TA). Después de la primera tanda de clasificación de placas, se realizaron cuatro tandas de clasificación de soluciones para incrementar la restricción de la selección. Para la clasificación de soluciones, se incubaron 1 DO/ml de fago propagado de la primera tanda de clasificación de placas con 500 nM de HuHtrAI biotinilada en 100 ul de tampón que contenía Superblock (Pierce biotechnology) al 1 % y Tween20 al 0,05 % durante al menos 1 hora a temperatura ambiente (TA). La mezcla se diluyó adicionalmente 10X con Superblock al 1 % y se aplicó 100 ul/pocillo a pocilios recubiertos con neutravidina (10 ug/ml) durante 15 min a TA con agitación suave para que la HuHtrAI biotinilada se pudiera unir al fago. Los pocilios se lavaron diez veces con PBS-Tween20 al 0,05 %. Para determinar la unión de fondo, se capturaron pocilios de control que contenían fago sin selección de HuHtrAI biotinilada en placas recubiertas con neutravidina. El fago unido se eluyó con HCI 0,1 N durante 20 min, se neutralizó mediante 1/10 de volumen de tris 1 M, pH 11, se valoró y se propagó para la siguiente tanda. Luego se llevaron a cabo simultáneamente tres tandas más de clasificación de soluciones usando dos procedimientos de incremento de la restricción de la selección. El primer procedimiento, que es para la selección de tasa de asociación, disminuye la concentración de proteínas diana biotiniladas desde 10 nM a 0,1 nM. El segundo procedimiento, que es para la selección de tasa de disociación, añade cantidades en exceso de proteína HuHtrAI no biotinilada (100-1000 veces más) para competir frente a los aglutinantes más débiles. Además, se disminuyó la entrada de fagos (0,1-0,5 DO/ml) para reducir la unión a fago de fondo.
ELISA de cribado de afinidades de alto rendimiento (competición en un único punto). Las colonias se recogieron de la quinta tanda de cribado y se cultivaron durante la noche a 37 °C en 350 ul/pocillo de medios 2YT con carbenicilina 50 ug/ml y K07 1e 10/ml en bloque de 96 pocilios (QIAgene). De la misma placa, se escogió una colonia de fago original infectado en XL-1 como control. Se recubrieron placas Maxisorp de Nunc de 96 pocilios con 100 ul/pocillo de proteína HuHtrAI (2 ug/ml) en PBS a TA durante 2 horas. Las placas se bloquearon con 100 ul de BSA al 0,5 % y Tween al 0,05 % en PBS (tampón PBST) durante una hora.
El sobrenadante de fago se diluyó 1:5 en tampón PBST con o sin HuHtrAI 5 nM en 100 ul de volumen total y se incubó al menos 1 hora a TA. Entonces, se transfirieron 75 ul de mezcla a placas recubiertas con HuHtrAI. La placa se agitó suavemente durante 15 min para permitir la captura del fago no unido a la placa recubierta con HuHtrAI. La placa se lavó cinco veces con Tween20 al 0,05 % en PBS (tampón PBT). La unión se cuantificó añadiendo anticuerpo anti-M13 conjugado a peroxidasa de rábano picante (HRP) en tampón de ELISA (1:5000) y se incubó durante 30 min a TA. Las placas se lavaron cinco veces con tampón PBT. A continuación, se añadieron 100 ul/pocillo de una proporción 1:1 de sustrato de 3,3',5,5'-tetrametilbenc¡d¡na (TMB) para peroxidasa y solución de peroxidasa B (H2O2) (Kirkegaard-Perry Laboratories (Gaithersburg, MD)) al pocilio y se incubó durante 5 minutos a TA. La reacción se detuvo añadiendo
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100 ul de ácido fosfórico 1 M (H3PO4) a cada pocilio y se dejó incubar durante 5 minutos a TA. Se determinó la DO de cada pocilio usando un lector de placas para ELISA estándar a 450 nm. Se calculó la reducción de DO (%) mediante la siguiente ecuación:
reducción de DO450 nm (%) = [(DO450 nm de pocilios con competidor) / (DO450 nm de pocilio sin competidor)] *100
En comparación con la reducción de la DO450 nm (%) del pocilio del fago original (100 %), se escogieron clones que tenían una reducción de DO450 nm (%) más baja que un 50 % para el análisis de secuencias (véanse las figs. 15 y 16). Se seleccionaron clones únicos para la preparación de fagos para determinar la afinidad de unión (CI50 de fago) mediante ELISA de competición con fago (véanse las figs. 17 y 18). Entonces, se reformatearon los clones más mejorados en afinidad (YW505.94a.28 e YW505.94a.54) a lgG1 humana para la producción de anticuerpos y posterior análisis cinético de unión por BIAcore.
ELISA de competición con fago para determinar la CI50. Se recubrieron placas de microvaloración MAXISORP™ con HuHtrAI a 2 pg/ml en PBS durante 2 h a TA y, entonces, se bloquearon con tampón PBST durante otra hora a TA. Se incubó el fago purificado a partir de los sobrenadantes de cultivo con HuHtrAI o MuHtrAI diluido en serie en tampón PBST en una placa de microvaloración de cultivo de tejidos durante una hora, después de lo cual se transfirieron 80 pl de la mezcla a los pocilios recubiertos con HuHtrAI durante 15 minutos para capturar el fago no unido. La placa se lavó con tampón PBT y se añadió anti-M13 conjugado a HRP (Amersham Pharmacia Biotech) (1:5000 en tampón PBST) durante una hora. La placa se lavó con tampón PBT y se desarrolló añadiendo sustrato de tetrametilbencidina (Kirkegaard and Perry Laboratories, Gaithersburg, MD). La absorbancia a 450 nm se representó como una función de la concentración de HuHtrAI o MuHtrAI en solución para determinar la CI50 de fago. Esto se usó como una estimación de la afinidad para el clon Lab que se presenta en la superficie del fago. La fig. 17 muestra los resultados de un ensayo de competición con fago que demuestra la unión de variantes mejoradas en afinidad de YW505.94a frente a HuHtrAI. La fig. 18 muestra los resultados de un ensayo de competición con fago que demuestra la unión de variantes mejoradas en afinidad de YW505.94a frente a MuHtrAI.
Determinaciones de la afinidad del anticuerpo mediante BIAcore. Para determinar la afinidad de unión de los anticuerpos frente a HtrA1 mediante cinética de un solo ciclo, se usó la medición de resonancia de plasmón superficial (SRP) con un instrumento BIAcore™ T100. En resumen, se activó una matriz CM5 de sensor de la serie S con los reactivos EDC y NHS de acuerdo con las instrucciones del proveedor, y se acopló estreptavidina (Pierce) para lograr aproximadamente 2000 unidades de respuesta (UR), seguido de grupos de bloqueo sin reaccionar con etanolamina 1 M.
Para las mediciones cinéticas, se inyectó en primer lugar HtrA1 humana o murina biotinilada a un caudal de 10 pl/min para capturar aproximadamente 100 UR en 3 cubetas de lectura (CL) diferentes, excepto para CL1 (referencia), y, entonces, se inyectaron diluciones en serie de 5 veces de Fab anti-HtrA1 en tampón HBS-P (HEPES 0,01 M, pH 7,4, NaCI 0,15 M, tensioactivo P20 al 0,005 %) desde baja (0,48 nM) a alta (300 nM) [5 puntos] (caudal: 30 pl/min) una después de la otra en el mismo ciclo sin regeneración entre inyecciones. El sensograma se registró y se sometió a la resta de la referencia y el tampón antes de la evaluación mediante el programa informático de evaluación de BIAcore™ T100 (versión 2.0). Las tasas de asociación (kon) y las tasas de disociación (koff) se calcularon usando un simple modelo de unión uno a uno de Langmuir. La constante de disociación en equilibrio (Kd) se calculó como la proporción koff/kon. Los resultados se muestran en la tabla 3 a continuación.
Tabla 3. Afinidades de unión de Fab con maduración de la afinidad en comparación con el Fab original.
- HuHtrAI MuHtrAI
- Fab
- /ion koff Kd /ion koff Kd
- (M-V) (s-1) (nM) (M-V) (s-1) (nM)
- YW505.94
- 3,51e5 109e-4 31,1 4,47e5 129e-4 28,9
- YW505.94a
- 8,13e5 4,48e-2 55 1,48e6 8,56e-2 58
- YW505.94a.28
- 1,69e6 5,74e-3 3,4 2,02e6 9,3e-3 4,6
- YW505.94a.54
- 2,97e6 7,84e-3 2,6 2,82e6 4,55e-3 1,6
Ejemplo 10: Preservación de foto r recepto res, capa nuclear externa (CNE) y respuestas funcionales en ausencia de HtrA1 después de la exposición a la luz constante
Construcción de ratón con genes inactivados de HtrA1. Para generar células madre embrionarias de HtrA1 (+/-), el ADN del vector de selección de dianas linealizado se insertó por electroporación en embriocitoblastos de fondo Balb/c para introducir sitios Flox en la región 5’ del exón 1 y 3’ del exón 1 y un gen de resistencia a neomicina introducido (Neo). Se seleccionaron clones de embriocitoblastos resistentes a neomicina y se escindió el exón 1 más el casete de
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neomicina mediante electroporación de los embriocitoblastos con un plásmido de expresión que expresaba ere recombinasa. La recombinación homologa se confirmó mediante la secuenciación del locus de HtrA1 completo y la región promotora en dirección 5' en el embriocitoblasto seleccionado como diana. Los clones seleccionados como diana se inyectaron en blastocistos C57BL/6 para generar ratones quiméricos machos de transmisión en estirpe germinal. El entrecruzamiento de ratones +/- hembra y +/- macho se realizó para generar ratones con HtrA1 -/- hembra o -/- macho en un fondo Balb/c. La deleción con éxito de HtrA1 se confirmó mediante RT-PCR de ovarios de ratones con HtrA1 wt y ko.
Modelo de exposición a la luz constante. Los ratones macho con Htral wt/wt o ko/ko en Balb/c, de 8-13 semanas de edad, están en un alojamiento normal (<100 lux en la jaula) hasta el inicio de la exposición a la luz constante (ELC). Para iniciar la ELC, los ratones se alojan individualmente en jaulas normales cubiertas solo con una rejilla de alambre, sin un filtro superior. Los granos de alimento e hidrogeles se disponen en la parte inferior de la jaula, y no en la parte superior con alambre, para la nutrición, a fin de no impedir que la luz penetre en la jaula. Se disponen diez jaulas en una rejilla Metro equipada con luces fluorescentes y encerrada en paneles blancos para suministrar -1200 lux a los ratones durante hasta 14 días. Las jaulas se giran diariamente en sentido antihorario alrededor de la rejilla durante la ELC para garantizar la misma exposición a la luz. Si se usan múltiples estantes, las jaulas también se giran entre estantes para garantizar la misma exposición a la luz.
Tomografía de coherencia óptica. La tomografía de coherencia óptica (TCO) se realiza 4-7 días antes de la exposición a la luz para proporcionar una medición en el punto de referencia del grosor de la retina. La TCO se realiza usando una cámara Spectralis HRA+OCT de Heidelberg. Los animales se anestesian con 70-80 mg/kg de cetamina/15 mg/kg de xilacina en 150-300 ul de solución salina estéril, los ojos se dilatan con gotas de tropicamida al 1 % y se mide el grosor de la retina mediante TCO. Se usan lágrimas artificiales para mantener los ojos húmedos para prevenir las cataratas. Después de la TCO, se deja que los animales se recuperen de la anestesia y regresen a sus jaulas y rejilla iluminada.
Electrorretinograma. Se realizan electrorretinogramas (ERG) 7 días antes de la exposición a la luz y a los 15 días tras la ELC. Los ERG se realizan y registran usando un sistema de electrofisiología visual Diagnosys LLC Espión 2 y un Colordome de escritorio Ganzfeld como fuente de luz. Los ratones se adaptan a la oscuridad durante la noche en una habitación oscura para equilibrar los fotorreceptores. Una vez que están adaptados a la oscuridad, todos los procedimientos posteriores se realizan en la oscuridad con solo una luz roja para la iluminación. Los animales se anestesian con cetamina, 75-80 mg/kg y xilacina, 7,5-15 mg/kg, IP en 200-300 ul de PBS. La temperatura corporal del ratón se mantiene a 37 °C usando una placa homeotérmica conectada a su unidad de control. Las pupilas se dilatan con tropicamida al 1 %. Los ERG de ambos ojos se registrarán simultáneamente con electrodos Burian-Allen de bucle de alambre de plata o platino. Los ratones se disponen en una plataforma, un electrodo de referencia se inserta por vía subcutánea a través de la frente, y un electrodo de tierra se inserta por vía subcutánea en la base de la cola. Se dispone solución de hipermelosa de Gonak en la córnea para establecer un contacto eléctrico entre la córnea y el electrodo y proteger a los ojos del secado durante el experimento. Los electrodos se disponen en los ojos izquierdo y derecho y el ratón se inserta en un estimulador de luz ColorDome. Los ojos se estimularán con luz blanca (7 intensidades de destello 4e-5, 2e-5, 0,5, 2, 5, 10, 20 cd.s/m2) y las señales se filtrarán con paso de banda a 0,15- 1000 Hz y se tomarán muestras a 2 kHz.
Determinación de los niveles de ARNm de HtrA en la retina y ovario de ratón. Se enuclearon los ojos enteros, se eliminó la retina y se dispuso en tampón RLT (Qiagen) y se congeló a -80 °C hasta su homogeneización. Las retinas se homogeneizaron y trituraron mediante tubos gentleMACS M (Miltinyi Biotec). De manera similar a la retina, se aislaron los ovarios de ratones hembra wt, het y ko con HtrA1 y se homogeneizaron como se describe para la retina. Se aisló ARN usando el kit Plus RNeasy de Qiagen; se generó ADNc con un kit de High Capacity cDNA (Applied Biosystem); se realizó Taqman qPCR usando 20 ug de ADNc, Taqman Gene Expression Master Mix (Applied Biosystem), y cebadores de Taqman Gene Expression Assay (Applied Biosystem) para el exón 1-2 (retina y ovario), exón 3-4 (ovario) y exón 5-6 (ovario) y se efectuó en un sistema de PCR en tiempo real ABI 7500 (Applied Biosystem). La expresión de HtrA se normalizó a la expresión de 18s (cebador de Applied Biosystem).
Como se muestra en la fig. 11, la expresión de ARNm de HtrA1 se incrementa en un modelo murino de exposición a la luz constante. Sin embargo, en el mismo modelo, los niveles de HtrA2 no se incrementan en la retina. Además, los niveles de HtrA1 son significativamente más altos que los niveles de HtrA2, HtrA3 y HtrA4 en la retina de un ratón no expuesto.
Además, se descubrió que los ratones que carecían de la expresión de HtrA1 muestran una preservación de los fotorreceptores (fig. 13), la capa nuclear externa (CNE) (fig. 14) y respuestas funcionales (ERG) (fig. 12) en un modelo murino de degeneración inducida por la luz.
Ejemplo 11: Efectos de un anticuerpo anti-HtrA1 en un modelo de rata de exposición a la luz constante
Las ratas se someterán a una exposición a la luz constante como se describe anteriormente para los ratones. Se evaluará la eficacia de un anticuerpo anti-HtrA1 para proteger al ojo de la rata de la degeneración provocada por la exposición a la luz. Los ojos de la rata se someterán a inyecciones intravítreas de un anticuerpo anti-HtrA1 a una dosis
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y frecuencia adecuadas para mantener una concentración eficaz del anticuerpo anti-HtrA1 en el ojo durante el transcurso del experimento. Los ojos de la rata se supervisarán después de la exposición a la luz para determinar el grosor de la retina mediante TCO y la funcionalidad mediante ERG, como se describe anteriormente para el modelo murino.
Ejemplo 12: La expresión de HtrA1 es abundante en el humor vitreo de rata y se acumula en el líquido ocular y tejido ocular de ratón tras la agresión por la luz
Ensayo de ELISA. Para el análisis de los tejidos de rata, se diluyó un anticuerpo policlonal anti-muHtrA1 de conejo (Genentech) a 125 ng/ml, mientras que para el análisis del líquido ocular y el tejido de retina de ratón, se diluyó un anticuerpo monoclonal anti-huHtrA1 de ratón (Genentech) a 250 ng/ml, ambos en PBS, y se recubrieron sobre placas de ELISA de 384 pocilios (Nunc; Neptune, NJ) durante una incubación durante la noche a 4 °C. Las placas se lavaron con PBS más Tween-20 al 0,05 % y se bloquearon durante una incubación de dos horas con PBS más seroalbúmina bovina al 0,5 % (BSA). Esta y todas las incubaciones posteriores se realizaron a temperatura ambiente con agitación suave. Se diluyeron el patrón de HtrA1 murina recombinante (Genentech) y muestras de tejidos murinos o de rata en tampón de dilución de muestra/patrón (PBS, BSA al 0,5 %, 15 ppm de Proclin, Tween 20 al 0,05 %, CHAPS al 0,25 %, BgG al 0,2 %, EDTA 5 mM, NaCI al 0,35 M, (pH 7,4)), se añadieron a las placas lavadas y se incubaron durante 1,5- 2 horas. Se detectó HtrA1 unida a placa durante una incubación de 1 hora con un anticuerpo policlonal anti-muHtrA1 de conejo biotinilado (Genentech) diluido a 100 ng/ml para tejidos de rata, y para el líquido ocular y el tejido de retina de ratón, se diluyó el anticuerpo monoclonal anti-huHtrA1 de ratón biotinilado (Genentech) a 200 ng/ml, ambos en tampón de ensayo (PBS, BSA al 0,5 %, 15 ppm de Proclin, Tween 20 al 0,05 %), seguido de una etapa de lavado y una incubación de 30 minutos con estreptavidina-HRP (GE Healthcare; Piscataway, NJ), también diluidas en tampón de ensayo (1:20.000). Después de un lavado final, se añadió tetrametilbencidina (KPL, Gaithersburg, MD), se desarrolló el color durante 10-15 minutos y la reacción se detuvo con ácido fosfórico 1 M. Las placas se leyeron a 450 nm con una referencia de 620 nm usando un lector de microplacas. Las concentraciones de HtrA1 de rata o murina se calcularon a partir de un ajuste de cuatro parámetros de la curva patrón de muHtrAI.
Como se muestra en la fig. 19A, la expresión de HtrA1 fue baja en el ovario, cerebro, bazo y tejido ocular total de rata en comparación con los niveles de expresión de HtrA1 en el humor vitreo de rata. Como se muestra en la fig. 19B, el nivel de HtrA1 en el líquido ocular de ratón se incrementó en un modelo de exposición a la luz constante en comparación con un control. Como se muestra en la fig. 19C, el nivel de HtrA1 en el tejido de retina de ratón se incrementó en un modelo de exposición a la luz constante en comparación con un control.
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LISTADO DE SECUENCIAS
- <110>
- GENENTECH, INC. ETAL.
- <120>
- ANTICUERPOS ANTI-HTRA1 Y PROCEDIMIENTOS DE USO
- <130> <140> <141 >
- P4761R1-WO
- <150> <151 >
- 61/547.649
- <160>
- 90
- <170>
- Patentln versión 3.5
- <210> <211 > <212> <213>
- 1 11 PRT Secuencia artificial
- <220> <223>
- Descripción de secuencia artificial: péptido sintético
<400> 1
Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala Val Ala
- 1
- 5 10
- <210> <211 > <212> <213>
- 2 7 PRT Secuencia artificial
- <220> <223>
- Descripción de secuencia artificial: péptido sintético
<400> 2
Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser
- 1
- 5
- <210> <211 > <212> <213>
- 3 9 PRT Secuencia artificial
- <220> <223>
- Descripción de secuencia artificial: péptido sintético
<400> 3
Gln Gln Ser Tyr Thr Thr Pro Pro Thr
- 1
- 5
- <210> <211 > <212> <213>
- 4 10 PRT Secuencia artificial
- <220> <223>
- Descripción de secuencia artificial: péptido sintético
- <400>
- 4
- Gly Phe A3n lie Ser Gly Tyr Tyr lie His
- 1 5 10
- <210> 5
- <211 > 17
- 5
- <212> PRT
- <213> Secuencia artificial
- <220> <223> Descripción de secuencia artificial: péptido sintético
- 10
- <400> 5
- Trp lie Asp Pro Tyr Gly Gly Asp Thr Asn Tyr Ala Asp Ser val
- 1 5 10 15
- Gly
- <210> 6
- 15
- <211 > 13
- <212> PRT
- <213> Secuencia artificial
- <220>
- 20
- <223> Descripción de secuencia artificial: péptido sintético
- <400> 6
- Gly Thr Phe Leu Thr Ser Trp Gly His Tyr Phe Asp Tyr
- 1 5 10
- 25
- <210> 7
- <211 > 108
- <212> PRT
- <213> Secuencia artificial
- 30
- <220>
- <223> Descripción de secuencia artificial: poli péptido sintético
- <400> 7
- Asp lie Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val
- 1 5 10 15
- Asp Arg Val Thr lie Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr
- 20 25 30
- val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu
- 35 40 45
- Tyr
- Ser Ala Ser Phe Leu
- Tyr
- 50 55
- Ser
- Gly Ser Gly Thr Asp Phe
- 65
- 70
- Glu
- Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr
- 85
- Thr
- Phe Gly Gln Gly Thr Lys
100
<210> 8 <211> 116 <212> PRT
<213> Secuencia artificial <220>
<223> Descripción de secuencia artificial: <400> 8
- Glu
- Val Gln Leu Val Glu Ser
- 1
- 5
- Ser
- Leu Arg Leu Ser Cys Ala
- 20
- Tyr
- lie His Trp Val Arg Gln
- 35
- Gly
- Trp lie Asp Pro Tyr
- Gly
- 50 55
- Lys
- Gly Arg Phe Thr Lie Ser
- 65
- 70
- Leu
- Gln Met Asn Ser Leu Arg
- 85
- Ala
- Arg Gly Thr Phe Leu Thr
- 100
- Gly
- Gln Gly Thr
- 115
<210> 9 <211> 108 <212> PRT
<213> Secuencia artificial
Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 60
Thr lie Ser Ser Leu Gln Pro 75 80
Gln Ser Tyr Thr Thr Pro Pro 90 95
lie Lys Arg
sintético
Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 10 15
Gly Phe Asn He Ser Gly Tyr 30
Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 45
Thr Asn Tyr Ala Asp Ser Val 60
Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 75 SO
Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 90 95
Gly Hie Tyr Phe Asp Tyr Trp 110
Ser Gly
Thr Leu
Cys Gln
Val Glu
105
poli péptido
Gly Gly
Ala Ser
25
Ala Pro
40
Gly Asp
Ala Asp
Ala Glu
Ser Trp
105
<223> Descripción de secuencia artificial: polipéptido sintético <400> 9
- Asp
- lie Gln Met Thr Gln Ser Pro
- 1
- 5
- Asp
- Arg Val Thr lie Thr Cys Arg
- 20
- Leu
- Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro
- 35 40
- Tyr
- Ala Ala Ser Ser Leu Glu Ser
- 50 55
- Ser
- Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
- 65
- 70
- Glu
- Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys
- 85
- Thr
- Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val
100
<210> 10 <211> 107
<212> PRT
10 <213> Secuencia artificial
Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 10 15
Ala Ser Gln Ser lie Ser Asn Tyr 25 30
Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie 45
Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 60
Leu Thr lie Ser Ser Leu Gln Pro 75 80
Gln Gln Tyr Asn Ser Leu Pro Trp 90 95
Glu lie Lys Arg 105
<220>
<223> Descripción de secuencia artificial: poli péptido sintético 15 <400> 10
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 15 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr 20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45
Ser Val lie Ser Gly Asp Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 65 70 75 80
5
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20
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30
35
40
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95
Ala Arg Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr 100 105
<210> 11 <211> 21 <212> PRT
<213> Secuencia artificial <220>
<223> Descripción de secuencia artificial: péptido sintético <400> 11
Met Ly& His Gln Hls Gln His Gln His Gln His Gln His Gln Met His 15 10 15
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<213> Secuencia artificial <220>
<223> Descripción de secuencia artificial: péptido sintético <220>
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- 20 25 30
Claims (25)
- 51015202530354045505560651. Un anticuerpo monoclonal aislado que se une a HtrA1 e inhibe su actividad serina proteasa para uno o más sustratos para HtrA1, en el que el anticuerpo comprende una secuencia de VH que comprende la SEQ ID NO: 32 y una secuencia de VL que comprende la SEQ ID NO: 31.
- 2. El anticuerpo de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo se une a un epítopo que comprende uno o ambos de los aminoácidos N224 o K248 de SEQ ID NO: 13.
- 3. El anticuerpo de la reivindicación 1, en el que el anticuerpo comprende además una o más de las siguientes propiedades: (i) se une a HtrA1 con una proporción de 1 dominio variable a una subunidad de un trímero de HtrA1 o (ii) no previene la formación de trímeros de HtrA1.
- 4. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en el que el anticuerpo no reacciona de manera cruzada con uno o más de HtrA2, HtrA3 y HtrA4.
- 5. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-5, en el que el anticuerpo tiene una constante de disociación de <500 nM como se determina mediante BIAcore usando un Fab a 25 °C.
- 6. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-5, que es un anticuerpo humano, humanizado o quimérico, o un fragmento de anticuerpo que se une a HtrA1.
- 7. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 4; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 1; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 3.
- 8. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 18; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 19.
- 9. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-6, en el que el anticuerpo comprende (a) HVR-H1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 20; (b) HVR-H2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 5; y (c) HVR-H3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6; (d) HVR-L1, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 21; (e) HVR-L2, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 2; y (f) HVR-L3, que comprende la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 22.
- 10. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-9, que comprende una secuencia de VH que tiene al menos un 95 % de identidad de secuencia con respecto a la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 8 y una secuencia de VL que tiene al menos un 95 % de identidad de secuencia con respecto a la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 7.
- 11. El anticuerpo de la reivindicación 1, que comprende una secuencia de VH de SEQ ID NO: 8 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 7, una secuencia de VH de SEQ ID NO: 29 y una secuencia de VL de SEQ ID NO: 28 o una secuencia de VL de SEQ ID NO: 30 y una secuencia de VH de SEQ ID NO: 29.
- 12. El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-11, que es un anticuerpo lgG1 o lgG4 de longitud completa.
- 13. Un ácido nucleico aislado que codifica el anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-12.
- 14. Una célula huésped que comprende el ácido nucleico de la reivindicación 13.
- 15. Un procedimiento de producción de un anticuerpo que comprende cultivar la célula huésped de la reivindicación 14 en condiciones adecuadas para la expresión del ácido nucleico que codifica el anticuerpo anti-HtrA1.
- 16. El procedimiento de la reivindicación 15, que comprende además recuperar el anticuerpo anti-HtrA1 del cultivo de células huésped.
- 17. Un inmunoconjugado que comprende el anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-12 y un agentecitotóxico.
-
- 18.
- Una formulación farmacéutica que comprende el anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-12 y un vehículo farmacéuticamente aceptable.
-
- 5 19.
- El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-12 para su uso como un medicamento.
-
- 20.
- El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-12 para su uso en el tratamiento de la degeneración macular senil, atrofia geográfica, retinopatía diabética, retinopatía de la prematuridad o vasculopatía coroidea
- 10
- polipoidea.
-
- 21.
- El anticuerpo de la reivindicación 20, para su uso en el tratamiento de la degeneración macular senil seca.
-
- 22. 15
- El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-12 para su uso en la inhibición de la degeneración de las células de la retina o fotorreceptoras.
-
- 23.
- El anticuerpo de una cualquiera de las reivindicaciones 1-17 para su uso en la inhibición de la actividad proteasa de HtrA1 en un ojo.
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- L345A
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