ES2242314T3 - Subtisilina proteasa mutada. - Google Patents
Subtisilina proteasa mutada.Info
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Abstract
SE PRESENTAN UNAS ENZIMAS PRODUCIDAS POR MUTACION DE LOS GENES DE UNA SERIE DE PROTEASAS DE SUBTILISINA Y EXPRESANDO LOS GENES MUTADOS EN HUESPEDES ADECUADOS. LAS ENZIMAS MUESTRAN UN RENDIMIENTO MEJORADO PARA EL LAVADO EN COMPARACION CON SUS ENZIMAS MATRICES DEL TIPO SILVESTRE. LAS ENZIMAS SON MUY ADECUADAS PARA SU USO EN COMPOSICIONES DETERGENTES.
Description
Subtisilina proteasa mutada.
Esta invención se refiere a métodos para preparar
nuevas enzimas mutantes o variantes de enzimas útiles para formular
composiciones de detergentes, que muestran un rendimiento de lavado
mejorado.
En la industria de los detergentes se han
utilizado enzimas desde hace más de 20 años en las formulaciones de
lavado. Entre las enzimas empleadas en dichas composiciones se
encuentran las proteasas, las lipasas, las amilasas, las celulasas,
así como otras enzimas o mezclas de las mismas. Las proteasas son
las más importantes comercialmente.
Aunque se han utilizado las proteasas en la
industria de los detergentes desde hace más de 20 años, todavía no
se sabe exactamente qué características físicas o químicas son las
responsables del buen rendimiento en el lavado o de la capacidad de
una proteasa.
Las proteasas que se emplean hoy en día fueron
halladas aislando las proteasas de su entorno natural y probándolas
en las composiciones de detergentes.
Las enzimas que interrumpen los enlaces de la
amida en los substratos de la proteína se clasifican como proteasas
o peptidasas (intercambiables) (véase Walsh, 1979, Enzymatic
Reaction Mechanisms. W.H. Freeman and Company, San Francisco,
Capítulo 3). Las bacterias de la especie Bacillus segregan dos
especies extracelulares de proteasa, una neutra, o
metaloproteinasa, y una proteasa alcalina que es funcionalmente una
serina endopeptidasa, a la que se hace referencia como subtilisina.
Se ha relacionado la secreción de estas proteasas con el ciclo de
crecimiento bacteriano, con una mayor expresión de la proteasa
durante la fase estacionaria, cuando también se produce la
esporulación. Joliffe et al. (1980, J. Bacteria) 141:1199
1208) ha sugerido que las proteasas de Bacillus funcionan en la
renovación de la membrana celular.
Una serina proteasa es una enzima que cataliza la
hidrólisis de los enlaces péptidos y en la que hay un residuo
esencial de serina en el centro activo (White, Handler and Smith,
1973 "Principies of Biochemistry", Quinta Edición,
McGraw-Hill Book Company, NY, págs.
271-272).
Las serina proteasas bacterianas tienen un peso
molecular en la gama de 20.000 a 45.000. Son inhibidas por el
diisopropilfluorofosfato, pero a diferencia de las metaloproteasas
son resistentes al ácido etileno diamino tetraacético (EDTA)
(aunque los iones de calcio las estabilizan a altas temperaturas).
Éstas hidrolizan los ésteres terminales simples y tienen una
actividad similar a la quimiotripsina eucariótica, que también es
una serina proteasa. Un término menos amplio, la proteasa alcalina,
que abarca un subgrupo, refleja el pH alto óptimo de algunas serina
proteasas, desde un pH 9.0 a 11.0 (para revisión, véase Priest,
1977, Bacteriological Rev. 41:711-753).
En relación con la presente invención, una
subtilisina es una serina proteasa producida por bacterias u hongos
gram-positivos. Se ha identificado una amplia
variedad de subtilisinas y se ha determinado la secuencia de
aminoácidos de varias subtilisinas. Éstas incluyen al menos seis
subtilisinas de las cepas de Bacillus, es decir, la
subtilisina 168, la subtilisina BPN', la subtilisina Carlsberg, la
subtilisina DY, la subtilisina amylosacchariticus y la
mesentericopeptidasa (Kurihara et al., 1972, J.Biol.Chem.
247:5629-5631; Wells et al., 1983, Nucleic
Acids Res. 11:7911-7925; Stahl and Ferrari, 1984,
J.Bacteriol. 159:811-819, Jacobs et al.,
1985, Nucl. Acids Res. 13:8913-8926; Nedkov et
al., 1985,
Biol. Chem. Hoppe Seyler 366:421 430, Svendsen et al., 1986, FEBS Lett 196:228 232), una subtilisina de un actino-
micetalo, la termitasa de Thermoactinomyces vulgaris (Meloun et al., 1985, FEBS Lett. 1983: 195-200), y una subtili-
sina micótica, la proteinasa K de Tritirachium album (Jany and Mayer, 1985, Biol.Chem. Hoppe Seyler 366:584 492).
Biol. Chem. Hoppe Seyler 366:421 430, Svendsen et al., 1986, FEBS Lett 196:228 232), una subtilisina de un actino-
micetalo, la termitasa de Thermoactinomyces vulgaris (Meloun et al., 1985, FEBS Lett. 1983: 195-200), y una subtili-
sina micótica, la proteinasa K de Tritirachium album (Jany and Mayer, 1985, Biol.Chem. Hoppe Seyler 366:584 492).
Las subtilisinas están bien caracterizadas
físicamente y químicamente. Junto con un conocimiento de la
estructura primaria (secuencia de aminoácidos) de estas enzimas, se
han determinado más de 50 estructuras de la subtilisina por
rayos-X de alta resolución que trazan la unión del
substrato, el estado de transición, los productos, como mínimo tres
inhibidores de la proteasa diferentes y definen las consecuencias
estructurales de una variación natural (Kraut, 1977,
Ann.Rev.Biochem. 46:331-358).
En el contexto de la presente invención, una
variante de la subtilisina o una subtilisina proteasa mutada
significa una subtilisina que ha sido producida por un organismo que
está expresando un gen mutante derivado de un microorganismo padre
que poseía un gen original o padre y que produjo una enzima madre
correspondiente, dicho gen padre ha sido mutado con el objetivo de
producir el gen mutante a partir del cual se produce dicha
subtilisina proteasa mutada cuando se expresa en el huésped
adecuado.
Tanto las mutaciones aleatorias como las
dirigidas del gen de la subtilisina han surgido del conocimiento de
la propiedades físicas y químicas de la enzima y de la información
aportada en relación a la actividad catalítica de la subtilisina, a
la especificidad del substrato, a la estructura terciaria, etc.
(Wells et al., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci. E.E.U.U.. 84;
1219-1223; Wells et al., 1986, Phil. Trans.
R. Soc. Lond. A. 317:415-423: Hwang and Warshel,
1987, Biochem. 26:2669-2673; Rao et al.,
1987, Nature 328:551 554).
En especial, la mutagénesis dirigida de los genes
de la subtilisina ha atraído mucha atención y se describen varias
mutaciones en las solicitudes de patente y patentes siguientes:
Publicación de EP nº 130756 (GENENTECH)
(correspondiente a la patente de Estados Unidos nº 4,760,025
(GENENCOR)) en relación a mutaciones específicas o generadas aleatoriamente en las "carbonil hidrolasas" y el cribaje subsiguiente de las enzimas mutadas para conseguir propiedades diferentes, como la proporción k_{cat}/K_{m}, el perfil de actividad del pH y la estabilidad de la oxidación. Además de revelar que la mutación dirigida es posible y que la mutación de la subtilisina BPN' en determinadas posiciones específicas, como ^{-1}Tyr, ^{32}Asp, ^{155}Asn, ^{104}Tyr, ^{222}Met, ^{166}Gly, ^{64}His, ^{169}Gly, ^{189}Phe, ^{33}Ser, ^{221}Ser, ^{217}Tyr, ^{156}Glu o ^{152}Ala, provee enzimas que poseen propiedades alteradas, esta solicitud no contribuye a resolver el problema de decidir dónde se deben introducir las mutaciones para obtener enzimas con las propiedades deseadas.
(GENENCOR)) en relación a mutaciones específicas o generadas aleatoriamente en las "carbonil hidrolasas" y el cribaje subsiguiente de las enzimas mutadas para conseguir propiedades diferentes, como la proporción k_{cat}/K_{m}, el perfil de actividad del pH y la estabilidad de la oxidación. Además de revelar que la mutación dirigida es posible y que la mutación de la subtilisina BPN' en determinadas posiciones específicas, como ^{-1}Tyr, ^{32}Asp, ^{155}Asn, ^{104}Tyr, ^{222}Met, ^{166}Gly, ^{64}His, ^{169}Gly, ^{189}Phe, ^{33}Ser, ^{221}Ser, ^{217}Tyr, ^{156}Glu o ^{152}Ala, provee enzimas que poseen propiedades alteradas, esta solicitud no contribuye a resolver el problema de decidir dónde se deben introducir las mutaciones para obtener enzimas con las propiedades deseadas.
La publicación de EP nº 214435 (HENKEL) en
relación a la clonación y la expresión de la subtilisina Carlsberg
y dos mutantes de la misma. En esta solicitud no se establece
ninguna razón para que se lleve a cabo la mutación de ^{158}Asp
en ^{158}Ser y de ^{161}Ser en ^{161}Asp.
En la publicación de patente internacional nº WO
87/04461 (AMGEN) se propone reducir el número de secuencias
Asn-Gly presentes en la enzima madre con el objetivo
de obtener enzimas mutadas que tengan mejor pH y
termoestabilidades. En la solicitud se insiste en eliminar, mutar, o
modificar los residuos ^{109}Asn y ^{218}Asn en la subtilisina
BPN'.
La publicación de patente internacional nº WO
87/05050 (GENEX) expone la mutación aleatoria y el cribaje
subsiguiente de un gran número de mutantes de la subtilisina BPN'
para conseguir propiedades mejoradas. En la solicitud se describen
las mutaciones en las posiciones ^{218}Asn, ^{131}Gly,
^{254}Thr, ^{166}Gly, ^{116}Ala, ^{188}Ser, ^{126}Leu y
^{53}Ser.
En la solicitud de EP nº 87303761 (GENENTECH) se
describe cómo se pueden aplicar las consideraciones de homología
tanto en el nivel estructural primario como en el terciario para
identificar residuos aminoácidos equivalentes tanto si se conservan
como si no. Esta información, junto con los conocimientos de los
inventores sobre la estructura terciaria de la subtilisina BPN',
lleva a los inventores a seleccionar varias posiciones susceptibles
de mutar con la esperanza de obtener mutantes con propiedades
alteradas. Las posiciones se identifican como sigue: ^{124}Met,
^{222}Met, ^{104}Tyr, ^{152}Ala, ^{156}Glu, ^{166}Gly,
^{169}Gly, ^{189}Phe, ^{217}Tyr. También las posiciones
^{155}Asn, ^{21}Tyr, ^{22}Thr, ^{24}Ser, ^{32}Asp,
^{33}Ser, ^{36}Asp, ^{46}Gly, ^{48}Ala, ^{49}Ser,
^{50}Met, ^{77}Asn, ^{87}Ser, ^{94}Lys, ^{95}Val,
^{96}Leu, ^{107}Ile, ^{110}Gly, ^{170}Lys ^{171}Tyr,
^{172}Pro, ^{197}Asp, ^{199}Met, ^{204}Ser, ^{213}Lys y
^{221}Ser, se espera que estas posiciones influyan en las
diferentes propiedades de la enzima. Asimismo, se pone como ejemplo
varias mutaciones para reforzar estas sugerencias. Junto con las
mutaciones simples en estas posiciones, los inventores también
llevaron a cabo varias mutaciones múltiples. Además los inventores
califican como interesantes ^{215}Gly, ^{67}His, ^{126}Leu,
^{135}Leu y los residuos aminoácidos dentro de los segmentos
97-103, 126-129,
213-215, y 152-172, pero no se
presentan ejemplos de las mutaciones en ninguna de estas
posi-
ciones.
ciones.
La publicación de EP nº 260105 (GENENCOR)
describe las modificaciones de determinadas propiedades en enzimas
que contienen una tríada catalítica mediante la selección de un
residuo aminoácido dentro de aproximadamente 15 A de la tríada
catalítica y susbtituye el residuo aminoácido por otro residuo. Se
dice que, concretamente, las enzimas del tipo de la subtilisina
descritas en la presente descripción pertenecen a la clase de
enzimas que contienen una tríada catalítica. Las posiciones de las
subtilisinas 222 y 217 vienen indicadas como las posiciones
preferidas para la sustitución.
La publicación de patente internacional nº WO
88/06624 (GIST-BROCADES NV) presenta las secuencias
de ADN y de aminoácidos de una proteasa subtilisina llamada PB92
homóloga casi en un 100% en la secuencia de aminoácidos a la
secuencia de aminoácidos de la Subtilisina 309
La publicación de patente internacional nº WO
88/07578 (GENENTECH) reivindica enzimas mutadas derivadas de una
enzima precursora mediante la sustitución o la modificación de, al
menos, un grupo catalítico de un residuo aminoácido. Los inventores
afirman que haciendo esto se obtiene una enzima mutada que resulta
reactiva con substratos que contienen el grupo catalítico
modificado o sustituido (catálisis asistida de substrato).
La teoría general se basa en la subtilisina de
B. amyloliquefaciens (BPN'), en la que se han descrito
modificaciones en las posiciones ^{64}His que fue modificada en
^{64}Ala sola o combinada con una mutación "coadyuvante" de
Ser-24-Cys. También se sugieren
modificaciones en los residuos aminoácidos ^{32}Asp, y
^{221}Ser y una mutación "coadyuvante" de
Ala-48-Glu.
La publicación de patente internacional nº WO
88/08028 (GENEX) presenta la ingeniería genética en torno a
emplazamientos de unión del ion metálico para la estabilización de
proteínas. Esta publicación también utiliza la Subtilisina BPN'
como ejemplo y señala los siguientes residuos aminoácidos como
candidatos a ser sustituidos ^{172}Pro (P172D, P172E), ^{131}Gly
(G131D), ^{76}Asn (N76D; N76D+P172D(E), ^{78}Ser (S78D).
Además, se hacen sugerencias sobre los mutantes combinados
N76D+S78D+G131 D+P172D(E); N76D+G131 D; S78D+G131 D;
S78D+P172D(E) Y S78D+G131 D+P172D(E).
La publicación de patente internacional nº WO
88/08033 (AMGEN) presenta varios análogos de la subtilisina que
tienen un sitio de unión del calcio modificado y sustituye bien Asn
o Gly en cualquier secuencia de Asn-Gly presente en
la molécula obteniendo así enzimas que cuentan con una mejor
estabilidad térmica y del pH. Se ha descrito uno de los sitios de
unión de calcio que incluye los residuos aminoácidos ^{41}Asp,
^{75}Leu, ^{76}Asn, ^{77}Asn, ^{78}Ser, ^{79}Ile,
^{80}Gly, ^{81}Val, ^{208}Thr y ^{214}Tyr; otros sitios de
unión de calcio potenciales se sugieren en ^{140}Asp y
^{172}Pro; ^{14}Pro y ^{271}Gln; y ^{172}Pro y 1^{195}Glu
o ^{197}Asp. También se sugiere la mutación de las posiciones
^{109}Asn y ^{218}Asn. Los mutantes producidos son N109S,
N109S+N218S, N76D+N109S+N218S, N76D+N77D+N 109S+N218S, N76D+I79E+N
109S+N218S.
La publicación de patente internacional nº WO
88/08164 (GENEX) describe un método para identificar residuos en
una proteína que puede sustituirse por una cisteína para permitir
la formación de enlaces de disulfuro potencialmente estabilizantes.
El método se basa en el conocimiento detallado de tres estructuras
dimensionales de la proteína y emplea un ordenador para seleccionar
las posiciones. En relación con las subtilisina proteasas, se
utilizó la Subtilisina BPN' como sistema modelo. Al emplear el
método en la Subtilisina BPN' se obtuvo la propuesta de 11
candidatos para introducir enlaces de disulfuro (1:T22C+S87C,
2:V26C+L235C, 3:G47C+P57C, 4:M50C+N109C, 5:E156C+T164C,
6:V165C+K170C, 7:V165C+S191C, 8:Q206C+A216C, 9:A230C+V270C,
10:1234C+A274C, 11:H238C+W241C). De éstos se produjeron 4 (1, 2, 4,
y 8) de los cuales 2 no conllevaron ningún efecto estabilizador (2
y 4). Se produjeron más mutantes al combinar dos de estos mutantes
entre sí y uno con otra mutación, a saber, T22C+S87C+N218S y
T22C+S87C+Q206C+A216C. También se produjeron varios mutantes que no
tuvieron éxito, a saber, Al C+S78C, S24C+S87C, K27C+S89C,
A85C+A232C, 1122C+V147C, S249C+A273C y T253C+A273C.
Asimismo, Tomás, Russell y Fersht, Nature 318,
375-376(1985) han demostrado que el cambio
de ^{99}Asp a ^{99}Ser en la subtilisina BPN' modifica la
dependencia de pH de la enzima.
En un artículo posterior J. Mol. Biol.
(1987)193, 803-813, los mismos autores
también abordan el tema de la sustitución de ^{156}Ser en lugar de
^{156}Glu.
Ambas mutaciones se encuentran dentro de una
distancia de aproximadamente 15 \ring{A} del ^{64}His
activo.
En Nature 328,
496-500(1987) Russel y Fersht comentan los
resultados de sus experimentos y presentan reglas para cambiar los
perfiles de actividad de pH mutando una enzima para obtener
modificaciones en la carga superficial.
El punto isoeléctrico, pl_{o}, se define como
el valor de pH en el que el complejo molecular de la enzima (con
metales u otros iones asociados opcionalmente) es neutro, es decir,
que la suma de cargas electroestáticas (carga electroestática de la
red =NEC) en el complejo es igual a cero. En esta suma, por
supuesto, debe tenerse en cuenta la naturaleza positiva o negativa
de las cargas electroestáticas individuales.
El punto isoeléctrico se calcula convenientemente
empleando cantidades de equilibrio que utilizan valores de pK para
los diferentes residuos cargados en la enzima en cuestión y a
continuación encuentran por iteración el valor de pH en el que la
NEC de la molécula de la enzima es igual a cero.
Un problema que se presenta en este cálculo es
que los valores de pK para los residuos cargados dependen de su
entorno y, consecuentemente, están sujetos a variación. Sin
embargo, se pueden obtener muy buenos resultados al asignar
determinados valores de pK aproximados a los residuos cargados
independientemente del valor real. También resulta posible hacer los
cálculos más sofisticados, teniendo en cuenta en parte el
entorno.
El pl_{o} también puede determinarse
experimentalmente mediante la focalización isoeléctrica o mediante
la titración de una solución que contenga la enzima. Además, los
diferentes valores de pK para los residuos cargados pueden
determinarse experimentalmente mediante titración.
Las proteasas como las subtilisinas han resultado
ser de mucha utilidad en la industria, particularmente en las
composiciones de detergentes, debido a que son útiles para eliminar
las manchas proteínicas.
Actualmente las siguientes proteasas resultan
conocidas y muchas de éstas se comercializan en grandes cantidades
en muchos países del mundo.
La Subtilisina BPN' o Novo, comercializada por,
p. ej., SIGMA, St. Louis, E.E.U.U.
\newpage
La subtilisina Carlsberg, comercializada por
Novo-Nordisk A/S (Dinamarca) como ALCALASE® y por
IBIS (Holanda) como MAXATASE®;
La subtilisina de Bacillus lentus,
comercializada por NOVO INDUSTRI A/S (Dinamarca) como
SAVINASE®;
Enzimas que se asemejan mucho a SAVINASE® como
MAXACAL.®, comercializada por IBIS, y OPTICLEAN® comercializada por
MILES KALI CHEMIE (FRG);
La subtilisina de Bacillus lentus,
comercializada por Novo-Nordisk A/S (Dinamarca)
como ESPERASE®;
KAZUSASE® comercializada por SHOWA DENKO
(Japón)
Sin embargo, para que dichas enzimas resulten
eficaces no sólo deben mostrar actividad bajo condiciones de
lavado, sino que también deben ser compatibles con otros
componentes del detergente durante la producción y almacenamiento
de dicho detergente.
Por ejemplo, las subtilisinas se pueden utilizar
en combinación con otras enzimas que sean activas frente a otros
substratos y la subtilisina seleccionada debe poseer estabilidad
ante tales enzimas; asimismo, la subtilisina seleccionada
preferentemente no catalizará la degradación de las otras enzimas.
Además, la subtilisina elegida deberá ser resistente a la acción de
otros componentes en la composición de detergentes, como los
blanqueadores, los agentes oxidantes, etc. Concretamente una enzima
que se va a emplear en la composición de un detergente debería ser
estable con respecto al poder de los agentes oxidantes, las
propiedades de enlace del calcio y las condiciones de pH
establecidas por los componentes no enzimáticos del detergente
durante el almacenamiento y en la solución de lavado durante el
lavado.
A menudo se hace referencia a la capacidad de una
enzima para catalizar la degradación de varios substratos que se
dan de forma natural en los objetos que hay que limpiar durante, p.
ej., el lavado, como su capacidad de lavado, su lavabilidad, su
detergencia o rendimiento de lavado. En toda esta solicitud el
término rendimiento de lavado se usará de manera que englobe esta
propiedad.
Se ha descubierto que las subtilisinas que se dan
de forma natural poseen propiedades que son altamente variables en
relación con su poder o capacidad de lavado cuando se dan
variaciones en los parámetros como el pH. Varias de las proteasas
utilizadas en los detergentes comercializados descritas arriba
tienen, de hecho, un mejor rendimiento que los que se
comercializaban hace aproximadamente 20 años, pero para llegar a su
rendimiento óptimo cada enzima tiene unas condiciones específicas
propias en lo que concierne a la composición y a las condiciones de
lavado, p. ej., el pH, la temperatura, la fuerza iónica (=I), el
sistema activo (agentes de superficie, surfactantes, blanqueador,
etc.), los adyuvantes, etc.
Como consecuencia se descubre que una enzima que
posee propiedades deseables con un pH bajo y con un I bajo puede
resultar menos interesante bajo condiciones más alcalinas y un I
alto, o una enzima que presenta propiedades adecuadas con un pH
alto y un I alto puede resultar menos interesante con unas
condiciones de pH bajo, I
bajo.
bajo.
El descubrimiento y desarrollo de las técnicas de
ADN recombinante tiene una vasta influencia sobre el campo de la
química de las proteínas.
Se ha pronosticado que estas técnicas permitirán
diseñar péptidos y proteínas, como las enzimas y las hormonas,
según las condiciones deseadas, permitiendo así la producción de
compuestos que presenten las propiedades desea-
das.
das.
Hoy en día resulta posible construir enzimas que
tengan las secuencias de aminoácidos deseadas y, como se ha
indicado anteriormente, gran parte de las investigaciones se ha
consagrado a las subtilisinas diseñadas con propiedades alteradas.
Entre las propuestas, la técnica de producción y cribaje de un gran
número de enzimas mutadas tal y como se describe en la publicación
europea nº 130756 (GENENTECH) (Patente Estadounidense nº 4,760,025
(GENENCOR)) y en la publicación de patente internacional nº WO
87/05050 (GENEX) corresponde al método clásico de aislamiento de
enzimas originales y cribaje según sus propiedades, pero resulta
más eficaz con el conocimiento de la presencia de un gran número de
enzimas mutantes diferentes.
Puesto que una enzima subtilisina normalmente
comprende 275 residuos aminoácidos, y cada uno puede ser 1 de 20
aminoácidos posibles que se dan naturalmente, un inconveniente muy
serio en el procedimiento sería el número tan grande de mutaciones
generadas que han de ser sometidas a un cribaje preliminar antes de
seguir probando los mutantes seleccionados que muestren
características interesantes en el primer cribaje, puesto que no se
ofrece ninguna orientación a la hora de determinar qué residuos
aminoácidos cambiar para obtener la enzima deseada con propiedades
mejoradas para el empleo en cuestión, como es, en este caso, la
formulación de composiciones de detergentes que presenten un
rendimiento de lavado mejorado bajo condiciones específicas de la
solución de lava-
do.
do.
\newpage
Por lo tanto, un procedimiento como el que se
perfila en estas solicitudes de patentes sólo será ligeramente
mejor que los procedimientos de mutación aleatorios tradicionales
que se conocen desde hace años.
El resto de técnicas conocidas se refieren al
hecho de cambiar propiedades específicas, como el nivel de
transesterificación y de hidrólisis (publicación de EP nº 260105
(GENENCOR), el perfil de la actividad de pH (Tomás, Russell, and
Fersht, supra) y la especificidad del substrato (publicación
de patente internacional nº WO 88/07578
(GENENTECH). Ninguna de estas publicaciones hace referencia al cambio en el rendimiento de lavado de las
enzimas.
(GENENTECH). Ninguna de estas publicaciones hace referencia al cambio en el rendimiento de lavado de las
enzimas.
Otra técnica que ha evolucionado consiste en
emplear la información detallada sobre las tres estructuras
dimensionales de las proteínas para analizar las consecuencias
potenciales de la sustitución de ciertos aminoácidos. Este enfoque
se ha utilizado y se describe en EP 260105 (GENENCOR), WO 88/07578
(GENENTECH), WO 88/08028 (GENEX), WO 88/08033 (AMGEN) y WO 88/08164
(GENEX).
Por lo tanto, como se ha indicado anteriormente,
aún no se ha identificado ninguna relación entre las propiedades
bien definidas de una enzima como las que se mencionan arriba y el
rendimiento de lavado de una enzima.
En la solicitud de patente internacional inédita
nº PCT/DK 88/00002 (NOVO INDUSTRI A/S) se propone emplear el
concepto de comparación de homología para determinar qué posiciones
de los aminoácidos deberían ser seleccionadas para la mutación y
qué aminoácidos deberían ser sustituidos en estas posiciones para
obtener el cambio deseado en el rendimiento de lavado.
Utilizando un procedimiento como éste la tarea
del cribaje se ve reducida drásticamente, puesto que el número de
mutantes generados es mucho más pequeño, pero con este
procedimiento sólo se prevé que se puedan obtener las enzimas que
presentan las propiedades útiles combinadas de la enzima madre y la
enzima utilizada en la compara-
ción.
ción.
El problema parece radicar en que, a pesar de que
se ha dirigido gran parte de las investigaciones a revelar el
mecanismo de la actividad enzimática, aún se sabe poco sobre los
factores que afectan a la estructura y la combinación de los
residuos aminoácidos que determina las propiedades de las enzimas
con respecto a su rendimiento de
lavado.
lavado.
En consecuencia, sigue existiendo la necesidad de
seguir mejorando y confeccionando enzimas para sistemas de lavado,
así como un mejor entendimiento del mecanismo de acción de la
proteasa en el uso práctico de las composiciones utilizadas en la
limpieza o en los detergentes. Un entendimiento como éste podría
tener como resultado reglas que puedan aplicarse a la hora de
seleccionar las mutaciones que, con un grado razonable de certeza,
den como resultado una enzima que presente un rendimiento de lavado
mejorado bajo condiciones específicas en una solución de
lavado.
lavado.
Otras investigaciones sobre estos problemas han
demostrado sorprendentemente que uno de los factores fundamentales
en el empleo de enzimas subtilisina en las composiciones de
detergentes es la adsorción de la enzima al substrato, es decir, el
material que ha de ser eliminado de los textiles, superficies duras
u otros materiales que haya que limpiar.
En consecuencia, la presente invención se refiere
a mutaciones del gen de subtilisina dando como resultado
propiedades cambiadas de la enzima subtilisina mutante expresada
por este gen mutado, por lo que dicha enzima subtilisina mutante
muestra un comportamiento mejorado en las composiciones de
detergentes. Las mutaciones se generan en los ácidos nucléicos
específicos en el gen padre de subtilisina responsable de la
expresión de los aminoácidos específicos en posiciones específicas
de la enzima subtilisina.
La presente invención también hace referencia a
métodos de selección de las posiciones y los aminoácidos que deben
mutar y, de ese modo, los ácidos nucleicos que se deben cambiar
mutatis mutandis en el gen de la subtilisina en
cuestión.
Según la invención, se proporciona un método para
preparar una subtilisina proteasa mutante según está dispuesto en
las reivindicaciones anexas.
La invención trata en parte, pero sin intención
de limitarse a ello, las mutaciones de los genes de subtilisina 309
y de subtilisina Carlsberg y derivados de las enzimas subtilisina
309 mutante y Carlsberg, que presentan un rendimiento de lavado
mejorado en las diferentes composiciones de detergentes, dando como
resultado soluciones de lavado con diferentes valores de pH.
\newpage
A = Ala = Alanina
V = Val = Valina
L = Leu = Leucina
I = Ile = Isoleucina
P = Pro = Prolina
F = Phe = Fenilalanina
W = Trp = Triptófano
M = Met = Metionina
G = Gly = Glicina
S= Ser = Serina
T = Thr = Treonina
C = Cys = Cisteína
Y = Tyr = Tirosina
N = Asn = Asparagina
Q = Gln = Glutamina
D = Asp = Ácido Aspártico
E = Glu = Ácido Glutámico
K = Lys = Lisina
R = Arg = Arginina
H = His = Histidina
A = Adenina
G = Guanina
C = Citosina
T = Timina (sólo en ADN)
U = Uracilo (sólo en ARN)
Al describir los diferentes mutantes producidos o
contemplados según la invención, se adaptaron las siguientes
nomenclaturas para facilitar la referencia:
Aminoácido(s) sustituido(s) en
la(s) posición(es) original(es) del (de los)
aminoácido(s)
Según esto, la sustitución del ácido glutámico
por glicina en la posición 195 se designa con:
- Gly 195 Glu o G195E
una deleción de la glicina en la misma posición
es:
- Gly 195 * o G195*
y la inserción de un residuo aminoácido adicional
como la lisina es:
- Gly 195 GlyLys o G195GK
En aquellos casos en los que aparece indicada una
deleción en la tabla 1 o en los que aparece presente en una
subtilisina no indicada en la tabla 1, la inserción en dicha
posición se indica con:
- *36 Asp o *36D
para la inserción de un ácido aspártico en la
posición 36
Las mutaciones múltiples se separan mediante el
símbolo de adición, es decir:
- Arg 170 Tyr + Gly 195 Glu o R170Y+G195E
que representan las mutaciones en las posiciones
170 y 195 sustituyendo la tirosina y el ácido glutámico por
arginina y glicina, respectivamente.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
- a =
- subtilisina BNP' (Wells et al, 1983, supra)
- b =
- subtilisina amylosacchariticus (Kurihara et al, 1972, supra)
- c =
- subtilisina 168 (Stahl and Ferrari, 1984, supra)
- d =
- subtilisina mesentericopeptidasa (Svendsen et al, 1986, supra)
- e =
- subtilisina DY (Nedkov et al, 1985, supra)
- f =
- subtilisina Carlsberg (Smith et al, 1968, supra)
- g =
- subtilisina Carlsberg (Jacobs et al, 1985, supra)
- h =
- subtilisina 309 (solicitud de patente internacional nº PCT/ DK 88/ 00002)
- i =
- subtilisina 147 (solicitud de patente internacional nº PTC/ DK 88/ 00002)
- j =
- termitasa (Meloun et al, 1985, supra)
- k =
- proteinasa K (Betzel et al, 1988, Eur. J. Biochem. 178: 155 ff), y Gunkel et al, 1989, Eur. J. Biochem. 179: 185 ff)
- l =
- aqualisina (Kwon et al, 1988, Eur. J. Biochem. 173: 491 ff)
- m =
- proteasa PB92 de Bacillus (publicación de patente europea nº 0 283 075)
- n =
- proteasa TW7 (Tritirachium album) (solicitud de patente internacional nº PCT/ US88/ 01040)
- o =
- proteasa TW3 (Tritirachium album) (solicitud de patente internacional nº PCT/ US88/ 01040
- * =
- deleción asignada
Arriba se establece que la invención introduce
subtilisinas mutadas en las que se ha cambiado la secuencia de
aminoácidos mediante la mutación del gen de la enzima subtilisina,
que se desea modificar, en los codones responsables de la expresión
de los aminoácidos localizados en o cerca de la superficie de la
enzima resultante.
En el contexto de esta invención, una subtilisina
se define como una serina proteasa producida por hongos o bacterias
gram-positivas. En un sentido menos amplio,
aplicable a muchas formas de realización de la invención, una
subtilisina también es una serina proteasa de bacterias
gram-positivas. Según otra definición, una
subtilisina es una serina proteasa en la que el orden relativo de
los residuos aminoácidos en la tríada catalítica es
Asp-His-Ser (posiciones 32, 64 y
221). En un sentido todavía más específico, muchas de las formas de
realización de la invención se refieren a serina proteasas de
bacterias gram-positivas que se pueden trasladar a
una homología substancialmente no ambigua en su estructura
primaria, con las subtilisinas que aparecen en la tabla 1
anterior.
Empleando el sistema de numeración que se deriva
de la secuencia de aminoácidos de subtilisina BPN' que se muestra
en la Tabla 1 anterior junto con la secuencia de aminoácidos de
otras subtilisinas conocidas, resulta posible indicar la posición
de un residuo aminoácido en una enzima subtilisina de forma no
ambigua. A las posiciones anteriores al residuo aminoácido númerol
en la subtilisina BPN' se les asigna un número negativo, como por
ejemplo -6 para el N-terminal Y en la termitasa, o
0, como por ejemplo para el N-terminal A en la
proteinasa K. Se numeran los residuos aminoácidos que son
inserciones en relación con la subtilisina BPN' mediante la adición
de letras en orden alfabético al número de la subtilisina BPN'
precedente, como por ejemplo 12a, 12b, 12c, 12d, 12e para la
"inserción"
S-T-S-P-G
en la proteinasa K entre ^{12}Ser y ^{13}Thr.
Utilizando el sistema de numeración establecido
arriba las posiciones de interés son:
1, 2, 3, 4, 6, 9, 10, 12, 14, 15, 17, 18, 19, 20,
21, 22, 24, 25, 27, 36, 37, 38, 40, 41, 43, 44, 45, 46, 49, 50, 51,
52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 75, 76, 77, 78, 79, 87,
89, 91, 94, 97, 98, 99, 100, 101, 103, 104, 105, 106, 107, 108,
109, 112, 113, 115, 116, 117, 118, 120, 126, 128, 129, 130, 131,
133, 134, 136, 137, 140, 141, 143, 144, 145, 146, 155, 156, 158,
159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 170, 171, 172, 173,
181, 182, 183, 184, 185, 186, 188, 189, 191, 192, 194, 195, 197,
204, 206, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 235,
236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 247, 248, 249,
251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 259, 260, 261, 262, 263, 265,
269, 271, 272, 275.
Si partimos del hecho de que el substrato bajo
condiciones de lavado tiene una carga electroestática opuesta a la
de la enzima, cabría esperar que la adsorción y, por lo tanto, el
rendimiento de lavado de la enzima al substrato mejoraría mediante
el aumento de la carga electroestática de la red, NEC, de la
enzima.
Sin embargo, se halló sorprendentemente que la
disminución de la NEC de la enzima bajo tales circunstancias podría
dar como resultado un rendimiento de lavado de la enzima
mejorado.
Lo que es lo mismo, se descubrió que al cambiar
el punto isoeléctrico, pl_{o}, de la enzima en una dirección para
acercarse a un pH más bajo, también variaba el pH del rendimiento
de lavado óptimo de la enzima hasta alcanzar un valor inferior, lo
que significa que para poder diseñar una enzima para una solución
de lavado con un pH bajo, en la que la enzima debe ser activa, se
puede obtener una mejora en el rendimiento de lavado de una enzima
subtilisina conocida mediante la mutación del gen de forma que la
enzima subtilisina conocida obtuviera una enzima mutante que
contara con un pl_{o} más bajo.
Este hallazgo condujo a experimentos que
demostraban que lo contrario también era posible. Esto significa
que también se puede diseñar una enzima subtilisina conocida para
su utilización en detergentes con un pH alto variando su plo de
forma que adquiera valores más altos, cambiando así el pH óptimo
del rendimiento de lavado de la enzima hasta alcanzar mayores
valores de pH.
La presente invención se refiere a un método para
preparar subtilisina proteasas mutadas, en las que se ha cambiado
la carga electroestática de la red en comparación con la proteasa
madre con el mismo pH, y en las cuales hay, con respecto a dicha
proteasa madre, residuo(s) aminoácido(s) con menos o
más carga positiva y/o residuo(s) aminoácido(s) con
más o menos carga negativa, o residuo(s)
aminoácido(s) con más o menos carga positiva y/o
residuo(s) aminoácido(s) con menos o más carga
negativa, entre los residuos aminoácidos en la posición 252, y en
los que dicha subtilisina proteasa mutada tiene un pH isoeléctrico
(pl_{o}) menor o mayor, respectivamente, que el de dicha proteasa
madre.
En otra forma de realización la invención se
refiere subtilisina proteasas mutadas, en las que se ha modificado
la carga electroestática de la red en comparación con la proteasa
madre con el mismo pH, y en las que hay, con respecto a dicha
proteasa madre, residuo(s) aminoácido(s) con menos o
más carga positiva y/o residuo(s) aminoácido(s) con
más o menos carga negativa, o residuo(s)
aminoácido(s) con más o menos carga positiva y/o
residuo(s) aminoácido(s) con menos o más carga
negativa, entre los residuos aminoácidos en la posición 252, y al
menos una mutación adicional que afecta a un residuo aminoácido que
ocupa una posición elegida entre el grupo de posiciones:
1, 2, 3, 4, 6, 9, 10, 12, 14, 15, 17, 18, 19, 20,
21, 22, 24, 25, 36, 37, 38, 40, 41, 43, 44, 45, 46, 49, 50, 51, 52,
53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 75, 76, 77, 78, 79, 87, 89,
91, 94, 97, 98, 99, 100, 101, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109,
112, 113, 115, 116, 117, 118, 120, 126, 128, 129, 130, 131, 133,
134, 136, 137, 140, 141, 143, 144, 145, 146, 155, 156, 158, 159,
160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 170, 171, 172, 173, 181,
182, 183, 184, 185, 186, 188, 189, 191, 192, 194, 195, 197, 204,
206, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 235, 236,
237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 247, 248, 249, 251,
252, 253, 254, 255, 256, 257, 259, 260, 261, 262, 263, 265, 269,
271, 272, 275
y en los que dicha subtilisina
proteasa tiene un pH isoeléctrico (pl_{o}) menor o mayor,
respectivamente, que el de dicha proteasa
madre.
En estos aspectos, la invención, en pocas
palabras, hace referencia a las proteasas mutantes en las que el
pl_{o} de la proteasa mutante es más bajo que el pl_{o} de la
proteasa madre y en las que el pH para conseguir un rendimiento de
lavado óptimo es también más bajo que el pH óptimo de la proteasa
madre; o proteasas en las que el pl_{o} de la proteasa mutante es
más alto que el pl_{o} de la proteasa madre y en las que el pH
para conseguir un rendimiento de lavado óptimo es también más alto
que el pH óptimo de la proteasa madre.
Por lo general se cree que (Tomás, Russell, and
Fersht, arriba) los cambios en la carga electroestática de
superficie próxima al centro activo de la enzima pueden influir en
las propiedades cinéticas, pero ahora se ha descubierto
sorprendentemente que los cambios en las propiedades cinéticas de
una enzima también pueden producirse modificando las cargas de
superficie alejadas del centro activo.
En consecuencia, la invención comprende métodos
para producir enzimas subtilisina mutantes, donde se ha cambiado
uno o más residuos de aminoácidos en una distancia superior a
15\ring{A} de la tríada catalítica de dicho enzima en comparación
con la secuencia de aminoácidos de su enzima madre, y de tal manera
que proporcione una proteasa mutante que tiene un punto
isoeléctrico (=pl_{o}) variado en la misma dirección que se desee
variar el pH para conseguir un rendimiento de lavado óptimo de la
enzima, este pH óptimo debería ser el más próximo posible al pH de
la solución de lavado, en la que se vaya a usar dicha proteasa
mutante.
Según la invención, se sigue prefiriendo que la
enzima subtilisina mutante represente una mutación de una enzima
madre seleccionada a partir de subtilisina BPN', subtilisina
amylosacchariticus, subtilisina 168, subtilisina
mesentericopeptidasa, subtilisina Carlsberg, subtilisina DY,
subtilisina 309, subtilisina 147, termitasa, proteasa PB92 de
Bacillus y proteinasa K, preferiblemente subtilisina 309,
subtilisina 147, subtilisina Carlsberg, aqualisina, proteasa PB92de
Bacillus, Proteasa TW7 o Proteasa TW3.
\newpage
Las subtilisina proteasas mutadas usadas en los
ejemplos, como referencia, incluyen una o más de las
mutaciones:
- S001) G195E
- S002) G195D
- S003) R170Y
- S004) R170Y+G195E
- S005) K251E
- S006) H120D
- S008) H120D+G195E
- S009) T71D
- S010) T71D+G195E
- S011) R170Y+K251 E
- S012) R170Y+G195E+K251E
- S013) T71 D+R170Y+K251E
- S014) T71 D+R170i+G195E+K251E
- S015) K235L
- S016) H120D+K235L
- S017) H 120D+G195E+K235L
- S234) Q206D
- S235) *36D+N76D
- S242) *36Q+N76D+H120D+G195E+K235L
- C001) D14K
- C002) D120K
- C003) D140K
- C004) D14K+D120K
- C005) K27D
- C006) K27D+D120K
- C008) D172K
- C009) D14K+D120K+D140K
- C010) D14K+D120K+D140K+D172K
- C013) N97D
- C014) S98D
- C015) T213D
- C017) S156E
- C018) N97D+S98D
- C019) N97D+T213D
- C022) S98D+T213D
- C028) N218D
- C100) V51D
- C101) E54T
- C102) E54Y
Las observaciones anteriores acerca del pl_{o}
pueden ser también utilizadas en un método para determinar o
seleccionar la(s) posición(es) y el(los)
aminoácid(os) que debe(n) ser sustituido(s)
para el(los) aminoácido(s) en una enzima madre, por
lo que la selección se realiza de tal modo que la carga calculada
de la red electroestática (=NEC) en una enzima mutante resultante
haya sido cambiada en comparación con la NEC de la enzima madre
elegida calculada con el mismo valor de pH.
Otra forma de expresión de este principio
establecido por la invención es que la(s)
posición(es) y el(los) aminoáci-
do(s) que se debe(n) sustituir para conseguir el(los) aminoácido(s) en dicha enzima madre se selecciona(n) mediante un método por el cual el número total de cargas o el contenido total de la carga (=TCC) y/o la NEC de una enzima mutante resultante se cambia de modo que se obtenga una proteasa mutante que tenga un punto isoeléctrico (=pl_{o}) variado en la dirección deseada para modificar el pH para conseguir un rendimiento de lavado óptimo de la enzima, este pH óptimo debe ser lo más próximo posible al pH de la solución de lavado, en la que se va a emplear dicha proteasa mutante.
do(s) que se debe(n) sustituir para conseguir el(los) aminoácido(s) en dicha enzima madre se selecciona(n) mediante un método por el cual el número total de cargas o el contenido total de la carga (=TCC) y/o la NEC de una enzima mutante resultante se cambia de modo que se obtenga una proteasa mutante que tenga un punto isoeléctrico (=pl_{o}) variado en la dirección deseada para modificar el pH para conseguir un rendimiento de lavado óptimo de la enzima, este pH óptimo debe ser lo más próximo posible al pH de la solución de lavado, en la que se va a emplear dicha proteasa mutante.
Como se ha indicado anteriormente, el pl_{o} de
una macromolécula como, por ejemplo, una enzima se calcula como el
pH cuando la NEC de la molécula es igual a cero. El procedimiento
está ejemplificado en los ejemplos que siguen, pero los principios
se describen con más detalle aquí.
Los valores de pK se asignan a cada residuo
aminoácido potencialmente cargado. A continuación la proporción de
incidencia de un residuo aminoácido en un pH dado en forma cargada
o no cargada (cargada/no cargada, C/U(i)) se calcula tanto
para la carga negativa como para la positiva, empleando las
fórmulas Ia y Ib:
(Ia)C/U(i) =
exp(In_{10}(pH-pK_{i}))(carga
negativa)
(Ib)C/U(i) =
exp(In_{10}(pK_{i} -pH))(carga
positiva)
respectivamente.
A partir de las fórmulas Ia y Ib se observa que
con un mismo pH para pK_{i}, C/U(i) es igual a 1.
A continuación la carga relativa,
Q_{r}(i) o la aportación de carga asignada a cada residuo
cargado se calcula mediante las fórmulas IIa y IIb:
(IIa)Q_{r}(i) =
C/U(i)/(1+C/U(i))(carga
negativa)
(IIb)Q_{r}(i) =
-C/U(i)/(1+C/U(i))(carga
positiva)
El valor del pH en el que la suma de todas las
aportaciones de carga de los residuos cargados es igual a cero se
halla mediante la iteración o a través de la interpolación en una
tabla de suma de cargas de pH lo suficientemente densa.
La presente invención también comprende el empleo
de las enzimas mutantes de la invención en composiciones para la
limpieza y de detergentes y dichas composiciones incluyen las
enzimas subtilisina mutantes.
Dichas composiciones comprenden, junto a
cualquiera de una o más de las enzimas subtilisina mutantes de
acuerdo con cualquiera de los aspectos precedentes de la invención,
cualquiera de los componentes usuales solos o en combinación
incluidos en dichas composiciones que son bien conocidas por los
expertos en la técnica.
Entre estos componentes se encuentran adyuvantes,
como los adyuvantes de fosfato o de zeolita, surfactantes, como los
surfactantes aniónicos, catiónicos o no iónicos, polímeros, como
los polímeros acrílicos o equivalentes, agentes decolorantes, como
los precursores o activadores decolorantes que contienen perborato o
amino, estructurantes, como los estructurantes de silicato, alcali
o ácido para ajustar el pH, humectantes y/o sales inorgánicas
neutras.
Las composiciones de detergentes pueden estar
formuladas de la manera siguiente:
a) Una composición de detergente formulada como
un detergente en polvo que contiene un adyuvante de fosfato, un
surfactante aniónico, surfactante no iónico, un polímero acrílico o
equivalente, un precursor decolorante de perborato, un activador
decolorante que contiene amino, un silicato u otro estructurante,
alcali para conseguir el pH deseado para su empleo y sal inorgánica
neutra.
b) Una composición de detergente formulada como
un detergente en polvo que contiene un adyuvante de zeolita,
partículas atenuantes actantes aniónicas, un surfactante no iónico,
un polímero acrílico o equivalente, un precursor decolorante de
perborato, un activador decolorante que contiene aminos, silicato u
otro estructurante, para conseguir el pH deseado para su empleo y
sal inorgánica neutra.
c) Una composición de detergente formulada como
un detergente líquido acuoso que incluye un surfactante aniónico,
un surfactante no fónico, un humectante, ácido orgánico, alcali
cáustico, con un pH ajustado a un valor entre 9 y 10.
d) Una composición de detergente formulada como
un detergente líquido no acuoso que incluye un surfactante no
iónico líquido que consiste esencialmente en alcohol primario
alcoxilado lineal, triacetina, trifosfato de sodio, alcali
cáustico, precursor decolorante de monohidrato de perborato y
activador decolorante de amina terciaria, con un pH ajustado a un
valor entre aproximadamente 9 y 10.
e) Una composición de detergente formulada como
un detergente en polvo en forma granulada que tiene una densidad
aparente de al menos 550 g/l, p. ej., al menos 600 g/l, que
contiene surfactantes aniónicos y no iónicos, p. ej., surfactante
aniónico y una mezcla de surfactantes no iónicos con grados de
alcoxilación respectivos de aproximadamente 7 y aproximadamente 3,
sal inorgánica neutra baja o sustancialmente cero, adyuvante de
fosfato, precursor decolorante de perborato, activador decolorante
de amina terciaria, silicato de sodio y auxiliares y humedad.
f) Una composición de detergente formulada como
un detergente en polvo en forma granulada que tiene una densidad
aparente de al menos 600 g/l, que contiene surfactante aniónico y
una mezcla de surfactantes no fónicos con sus grados de
alcoxilación respectivos de aproximadamente 7 y aproximadamente 3,
sal inorgánica neutra baja o sustancialmente cero, adyuvante de
zeolita, precursor decolorante de perborato, activador decolorante
de amina terciaria, silicato de sodio y auxiliares y humedad.
g) Una composición de detergente formulada como
un detergente en polvo que contiene surfactante aniónico,
surfactante no iónico, polímero acrílico, jabón de ácido graso,
carbonato sódico, sulfato sódico, partículas de arcilla con o sin
aminas, precursor decolorante de perborato, activador decolorante
de amina terciaria, silicato de sodio y auxiliares y humedad.
h) Una composición de detergente formulada como
una pastilla de detergente (jabón) que contiene jabón basado en una
mezcla de cristalizadores saponificados de sebo y aceite de coco,
neutralizado con ácido ortofosfórico, mezclado con proteasa,
también mezclado con formato de sodio, borax, propilenoglicol y
sulfato sódico y a continuación se introduce lentamente en una
cadena de producción de jabón.
j) Una composición enzimática detergente
formulada para dar como resultado un pH de la solución de lavado de
9 o inferior cuando se emplea en una proporción correspondiente a
la de un surfactante de 0,4-0,8 g/l.
k) Una composición enzimática detergente
formulada para dar como resultado un pH de la solución de lavado de
8.5 o mayor cuando se emplea en una proporción correspondiente a la
de un surfactante de 0,4-0,8 g/l.
l) Una composición enzimática detergente
formulada para dar como resultado una fuerza fónica de la solución
de lavado de 0,03 o inferior, p. ej., 0,02 o inferior, cuando se
emplea en una proporción correspondiente a la de un surfactante de
0,4-0,8 g/l.
m) Una composición enzimática detergente
formulada para dar como resultado una fuerza iónica de la solución
de lavado de 0,01 o mayor, p. ej., 0,02 o mayor, cuando se emplea
en una proporción correspondiente a la de un surfactante de
0,4-0,8 g/l.
Sorprendentemente se ha descubierto que una
disminución en el punto isoeléctrico, pl y, por lo tanto, en la
carga de red de una proteasa del tipo subtilisina bajo unas
condiciones de lavado, puede dar como resultado no sólo un
rendimiento de lavado mejorado de la enzima sino también una
compatibilidad mejorada con la lipasa.
También se ha descubierto sorprendentemente que
la compatibilidad de la proteasa con la lipasa no sólo se ve
influida por el pl sino también por las posiciones en las que se
sitúan las cargas con respecto al centro activo de la proteasa: la
introducción de una carga negativa o la eliminación de una carga
positiva más cercana al centro activo da como resultado una mayor
mejora de la compatibilidad de la proteasa con la lipasa.
Los mutantes de enzimas producidos según el
método de la invención pueden ser usados en composiciones
enzimáticas detergentes, que comprenden lipasa y que también
comprenden la subtilisina proteasa mutada, donde se modifica la
carga molecular electroestática de red de la proteasa mutada
mediante la inserción, eliminación o sustitución de los residuos
aminoácidos en comparación con la proteasa madre, y donde, en dicha
proteasa, hay, con respecto a dicha proteasa madre,
residuo(s) aminoácido(s) con menos carga positiva y/o
residuo(s) aminoácido(s) con más carga negativa, por
lo que dicha subtilisina proteasa tiene un pH isoeléctrico
(pl_{o}) más bajo que el de dicha proteasa madre.
Una clase preferida de lipasas para este empleo
tiene su origen en bacterias gram-negativas e
incluye, p. ej., enzimas lipasa de los grupos definidos en la EP 0
205 208 y 0 206 390 (ambas de Unilever), que contienen lipasas
inmunológicamente relacionadas con aquellas de cepas de Ps.
fluorescens, P. gladioli y Chromobacter.
Las formas de realización preferidas de la enzima
subtilisina proteasa mutante su uso junto con la lipasa como se ha
mencionado anteriormente poseen una o más mutaciones en el centro
de un residuo aminoácido situado dentro del intervalo de
aproximadamente 15A-20A del centro activo,
especialmente, por ejemplo, en las posiciones 170, 120, o 195.
Se puede añadir la lipasa de manera útil en forma
de una composición granulada, (o en forma de una solución o una
emulsión), de enzima lipolítica con el material de soporte (p. ej.,
como en la EP 258068 (Novo Nordisk A/S) y la Savinase® y la
Lipolase® (productos de Novo Nordisk A/S).
Se puede escoger la cantidad añadida de lipasa
dentro de unos límites amplios, por ejemplo, de 50 a 30.000 LU/g
por gramo del sistema surfactante o de la composición de
detergente, p. ej., a menudo como mínimo 100 LU/g, de forma muy
útil como mínimo 500 LU/g, a veces preferiblemente más de 1000, por
encima de 2000 LU/g o más de 4000 LU/g o más, muy a menudo dentro
del margen de 50-4000 LU/g y posiblemente dentro
del margen de 200-1000 LU/g. En esta descripción
las unidades de lipasa se definen como en la EP 258068.
Se puede escoger la enzima lipolítica de entre un
amplia gama de lipasas: concretamente las lipasas descritas, por
ejemplo, en las siguientes descripciones de patente, EP 214761
(Novo Nordisk A/S), EP 0 258 068 y, en especial, las lipasas que
muestran una reacción cruzada inmunológica con los antisueros
establecidos en contra de la lipasa de Thermomyces
lanuginosus ATCC 22070, EP 0 205 208 y EP 0 206 390 y
especialmente las lipasas que muestran una reacción cruzada
inmunológica con antisueros establecidos en contra de la lipasa de
Chromobacter viscosum var lipolvticum NRRL B 3673, o en
contra de la lipasa de Alcaligenes PL 679, ATCC 31371 y
FERM-P 3783, también las lipasas descritas en las
descripciones WO 87/00859 (Gist-Brocades) y EP 0
204 284 (Sapporo Breweries). Resultan especialmente adecuados, por
ejemplo, los siguientes preparados con lipasa comercialmente
disponibles: Novo Lipolase®, lipasas Amano CE, P, B, AP, M AP, AML,
y CES, y lipasas Meito MY 30, De y PL, también Esterase® MM,
Lipozym®, SP225, SP285, lipasa Saiken, lipasa Enzeco, lipasa Toyo
Jozo y lipasa Diosynth (marcas comerciales).
Se puede conseguir la ingeniería genética de las
enzimas mediante la extracción del gen de lipasa apropiado, p. ej.,
el gen para la lipasa de Thermomyces lanuginosus o de un mutante
derivado de éste y mediante la introducción y la expresión del gen
o de un derivado del mismo en un organismo productor adecuado como
un Aspergillus. Se pueden aplicar y adaptar las técnicas descritas
en WO 88/02775 (Novo Nordisk A/S), EP 0 243 338 (Labofina), EP 0 268
452 (Genencor) y notablemente en la EP 0 305 216 (Novo Nordisk A/S)
o en la EP 0 283 075 (Gist-Brocades).
Se aplican consideraciones similares mutatis
mutandis en el caso de otras enzimas, que también pueden estar
presentes. Sin limitación: por ejemplo, se puede utilizar la
amilasa cuando se encuentre en una cantidad de entre
aproximadamente 1 y aproximadamente 100 MU (unidades de maltosa)
por gramo de composición de detergente, (o
0,014-1,4, p. ej., 0,07-0,7, KNU/g
(unidades Novo). Por ejemplo, se puede utilizar la celulasa cuando
se encuentre en una cantidad de entre aproximadamente 0,3 y
aproximadamente 35 unidades CEVU por gramo de composición de
detergente.
Las composiciones de detergentes pueden incluir,
además, los siguientes ingredientes de detergentes usuales en las
cantidades usuales. Éstos pueden estar predefinidos o sin
predefinir y pueden ser del tipo cero-P (es decir,
que no comprendan ningún tipo de adyuvantes que contengan fósforo).
Así, la composición puede contener en total, por ejemplo, de
1-50%, p.ej., como mínimo aproximadamente un 5% y a
menudo hasta aproximadamente de un 35-40% por peso,
de uno o más adyuvantes orgánicos y/o inorgánicos. Entre los
ejemplos típicos de este tipo de adyuvantes se encuentran los
mencionados arriba y, en un sentido más amplio, son orto, piro y
tripolifosfatos de metal alcalino, carbonatos de metal alcalino,
bien solos o junto con calcita, citratos de metal alcalino,
nitriltriacetatos de metal alcalino, carboximetiloxisuccinatos,
zeolitas, poliacetalcarboxilatos, etc.
Lo que es más, las composiciones de detergentes
pueden contener de un 1-35% de agente decolorante o
precursor de la decoloración o un sistema que incluya un agente y/o
precursor decolorante con un activador del mismo. Otros
ingredientes opcionales son supresores de espuma, inhibidores de
espuma, agentes anticorrosivos, agentes de suspensión de la
suciedad, agentes secuestrantes, agentes de antiredeposición de
suciedad, perfumes, tintes, estabilizantes para las enzimas
etc.
Se pueden utilizar las composiciones para lavar
materiales textiles, especialmente, aunque sin limitarse a, tejidos
a base de algodón y poliéster y mezclas derivadas de éstos.
Resultan especialmente adecuados, por ejemplo, los procesos de
lavado realizados a temperaturas de entre aproximadamente
60-65 grados C o menos, p. ej., de aproximadamente
30 grados C a 35 grados C o menos. Podría resultar muy conveniente
emplear las composiciones dentro de un margen que resulte
suficiente para proporcionar aproximadamente, p. ej.,
0,4-0,8 g/l de surfactante en la solución de lavado,
aunque, por supuesto, resulta posible emplear concentraciones
mayores o menores si se desea. Por ejemplo, se puede afirmar sin
limitación que un nivel de empleo de entre aproximadamente 3 g/l y
aproximadamente 6 g/l de la composición de detergente resulta
adecuado para el uso en caso de que las formulaciones sean iguales
a las de los Ejemplos.
Son muy conocidos en la técnica muchos de los
métodos utilizados para introducir mutaciones en los genes. Tras un
breve comentario sobre la clonación de genes de subtilisina, se
tratarán métodos para generar mutaciones tanto en lugares
aleatorios como en lugares específicos, dentro del gen de
subtilisina.
El gen que codifica la subtilisina es susceptible
de ser clonado a partir de cualquier bacteria u hongo
gram-positivos mediante diferentes métodos bien
conocidos en la técnica. En primer lugar, se debe construir una
biblioteca genómica y/o una biblioteca de ADNc de ADN utilizando
ADN cromosómico o ARN mensajero del organismo que produce la
subtilisina que va a ser estudiada. A continuación, si se conoce la
secuencia de aminoácidos de la subtilisina, se pueden sintetizar y
utilizar las sondas de oligonucleótidos homólogos y marcados para
identificar los clones que codifican la subtilisina a partir de una
biblioteca genómica de ADN bacteriano o de una biblioteca de ADNc
micótico. Alternativamente, se puede utilizar una sonda de
oligonucleótidos marcados que contenga secuencias homólogas a la
subtilisina de otra cepa de bacterias u hongos como sonda para
identificar los clones que codifican la subsitilina usando unas
condiciones de hibridación y de lavado de una estringencia
inferior.
Otro método para identificar clones que producen
subtilisina podría consistir en la inserción de fragmentos de ADN
genómico en un vector de expresión, como puede ser un plásmido, la
transformación de las bacterias de proteasas negativas con la
biblioteca de ADN genómico resultante y a continuación el
recubrimiento de las bacterias transformadas en un agar que
contenga un substrato de subtilisina, como la leche desnatada. Estas
bacterias que contienen un plásmido portador de la subtilisina
producirán colonias rodeadas por un halo de agar claro, debido a la
digestión de la leche desnatada por la subtilisina excretada.
Una vez clonado el gen de subtilisina en el
vector adecuado, como puede ser un plásmido, se pueden aplicar
diferentes métodos para introducir mutaciones aleatorias en el
gen.
Un método podría ser incorporar el gen clonado de
subtilisina como parte de un vector recuperable en la cepa mutágena
de Eschericia coli.
Otro método puede comprender la generación de una
forma monocatenaria del gen de subtilisina y, a continuación,
templar el fragmento de ADN que contiene el gen de subtilisina con
otro fragmento de ADN de manera que una porción del gen de la
subtilisina siga siendo monocatenario. Esta región monocatenaria
diferenciada podría entonces estar expuesta a cualquiera de los
diferentes agentes mutagenizantes, entre los que se encuentran, pero
sin limitarse, sodio bisulfito, hidroxilamina, ácido nitroso, ácido
fórmico o hidralacina. Shortle y Nathans (1978, Proc. Natl. Acad.
Sci. E.E.U.U., 75: 2170-2174) describen un
ejemplo específico de este método para generar mutaciones
aleatorias. Según el método de Shortle y Nathans, el plásmido
portador del gen de subtilisina podría ser cortado por una enzima de
restricción que partiría el gen. Este corte se ensancharía hasta
formar un hueco empleando la acción de la exonucleasa de la ADN
polimerasa I. El hueco monocatenario resultante podría entonces ser
mutagenizado utilizando cualquiera de los agentes mutagenizantes
mencionados anteriormente.
Alternativamente, se podría clonar el gen de
subtilisina de una especie de Bacillus, incluyendo el promotor
natural y otras secuencias de control, en un vector plásmido que
contenga replicones tanto de E. coli como de B.
subtilis, un marcador fenotípico seleccionable y el origen M13
de la replicación para la producción de ADN de plásmido
monocatenario tras la superinfección con el fago ayudante IR1. El
ADN del plásmido monocatenario que contiene el gen clonado de
subtilisina se aísla y se templa con un fragmento de ADN que
contiene secuencias del vector pero no la región de codificación de
subtilisina, lo que da como resultado una molécula dúplex
discontinua. Se introducen mutaciones en el gen de subtilisina bien
con sodio bisulfito, con ácido nitroso o con ácido fórmico o bien
por replicación en una cepa mutágena de E. coli como se
describe arriba. Puesto que el sodio bisulfito reacciona
exclusivamente con citosina en un ADN monocatenario, las mutaciones
creadas con este mutágeno se ven restringidas sólo a las regiones
de codificación. El tiempo de reacción y la concentración de
bisulfito varían en los diferentes experimentos de manera que se
crea una media de una a cinco mutaciones por gen de subtilisina. La
incubación de 10 mg de ADN dúplex interrumpido en 4 M de
Na-bisulfito, con un pH de 6.0, durante 9 minutos a
37 grados C en un volumen de reacción de 400 ml, produce una
desaminación de aproximadamente un 1% de citosinas en la zona
monocatenaria. La región de codificación de la subtilisina madura
contiene aproximadamente 200 citosinas, dependiendo de la cadena de
ADN. Afortunadamente, el tiempo de reacción varía desde
aproximadamente 4 minutos (para producir una frecuencia de mutación
aproximadamente de una de 200) hasta cerca de 20 minutos
(aproximadamente 5 de 200).
Tras la mutagénesis se trata las moléculas
discontinuas in vitro con ADN polimerasa I (fragmento
Klenow) para producir moléculas completamente bicatenarias y fijar
las mutaciones. El E. coli competente se transforma a
continuación con el ADN mutagenizado para producir una biblioteca
ampliada de subtilisinas mutantes. Las bibliotecas de mutantes
ampliadas también pueden ser producidas desarrollando el ADN
plásmido en una cepa Mut D de E. coli lo que aumenta el
margen de mutaciones debido a la tendencia al error de la ADN
polimerasa.
También se puede utilizar el ácido nitroso y el
ácido fórmico de los mutágenos para producir bibliotecas de
mutantes. Ya que estos productos químicos no son tan específicos
para el ADN monocatenario como el sodio bisulfito, las reacciones
de la mutagénesis se llevan a cabo según el procedimiento que sigue
a continuación. Se clona la porción codificada del gen de
subtilisina en el fago M13 mediante los métodos estándar y mediante
el ADN del fago monocatenario preparado. El ADN monocatenario
reacciona a continuación con 1 M de ácido nitroso con un pH de 4,3
durante 15-60 minutos a 23 grados C o con 2,4 M de
ácido fórmico durante 1-5 minutos a 23 grados C.
Estas variaciones en los tiempos de reacción producen una frecuencia
de mutación que oscila entre 1 de 1000 hasta 5 de 1000. Tras la
mutagénesis, se templa un cebador universal al ADN M13 y se
sintetiza el ADN dúplex empleando el ADN monocatenario mutagenizado
a modo de plantilla de forma que la porción codificada del gen de
subtilisina sea completamente bicatenaria. En este punto la región
de codificación puede ser extraída del vector M13 mediante enzimas
de restricción y puede unirse a un vector de expresión no
mutagenizado de modo que las mutaciones sólo se den en el fragmento
restrictivo. (Myers et al., Science 229:242 257 (1985)).
Una vez que se ha clonado el gen de subtilisina y
se han identificado los lugares deseables para que se lleve a cabo
la mutación, se pueden introducir dichas mutaciones empleando
oligonucleótidos sintéticos. Estos oligonucleótidos contienen
secuencias nucleótidas que flanquean los lugares deseados para que
se lleve a cabo la mutación; se insertan los nucleótidos mutantes
durante la síntesis del oligonucleótido. En un método preferido, el
hueco monocatenario del ADN, que conecta el gen de subtilisina, se
crea en un vector portador del gen de subtilisina. A continuación,
se templa el nucleótido sintético, que hace de soporte de la
mutación deseada, a una porción homóloga de ADN monocatenario. El
hueco restante se rellena entonces con ADN polimerasa I (fragmento
Klenow) y se une la construcción empleando la ligasa T4. Un ejemplo
específico de este método se describe en Morinaga et al.,
(1984, Biotechnology 2:646 639). Según Morinaga et al., se
elimina un fragmento del interior del gen utilizando una
endonucleasa restrictiva. El vector/gen, que ahora contiene el
hueco, se desnaturaliza y se hibrida junto con un vector/gen que,
en lugar de contener el hueco, ha sido partido con otra
endonucleasa restrictiva en un lugar externo al área implicada en el
hueco. Una región monocatenaria del gen queda entonces disponible
para que se lleve a cabo la hibridación con oligonucleótidos
mutados, el hueco restante se rellena con el fragmento Klenow de
ADN polimerasa I, se unen las inserciones con ADN ligasa T4 y, tras
un ciclo de replicación, se produce un plásmido bicatenario
portador de la mutación deseada. El método de Morinaga evita la
manipulación adicional de los nuevos lugares de restricción de la
construcción y, por lo tanto, facilita la generación de mutaciones
en lugares múltiples. Según la patente estadounidense Nº 4,760,025,
de Estell et al., publicada el 26 de Julio de 1988, se
pueden introducir oligonucleótidos portadores de mutaciones
múltiples realizando alteraciones menores en el cassette. Sin
embargo, se puede introducir una variedad aún mayor de mutaciones
en cualquier momento mediante el método de Morinaga debido a que se
pueden introducir una multitud de oligonucleótidos de longitudes
diferentes.
Según la invención, un gen de subtilisina mutado
producido mediante los métodos descritos anteriormente o mediante
cualquiera de los métodos alternativos conocidos en la materia
puede expresarse en forma de enzima, empleando un vector de
expresión. El vector de expresión generalmente se engloba bajo la
definición de un vector de donación, puesto que el vector de
expresión normalmente incluye los componentes de un vector de
donación típico, a saber, un elemento que permite una replicación
autónoma del vector en un microorganismo independiente del genoma
del microorganismo y uno o más marcadores fenotípicos con objetivos
de selección. Un vector de expresión incluye secuencias de control
que codifican un promotor, un operador, un lugar de unión del
ribosoma, una señal de iniciación de la traducción y,
opcionalmente, un gen represor o varios genes activadores. Para
permitir la secreción de la proteína expresada, se pueden insertar
los nucleótidos que codifican una "secuencia señal" antes de
la secuencia de codificación del gen. Para conseguir la expresión
bajo la dirección de las secuencias de control, el gen blanco que
tendrá que ser tratado según se establece en la invención es
vinculado operativamente a las secuencias de control en el marco de
lectura apropiado. Las secuencias promotoras que pueden ser
incorporadas a los vectores plásmidos y que pueden soportar la
transcripción del gen mutante de la subtilisina, incluyen, aunque
no sin limitarse a ellos, el promotor procariótico
13-lactamasa (Villa-Kamaroff, et
al., 1978, Proc. Natl. Acad. Sci. E.E.U.U.
75:3727-3731) y el promotor tac (DeBoer, et
al., 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. E.E.U.U.
80:21-25). Se pueden encontrar más
referencias en "Useful proteins from recombinant bacteria" en
Scientific American, 1980, 242:74-94.
Según una forma de realización, se transforma
B. subtilis con un vector de expresión que lleva el ADN
mutado. Si la expresión debe tener lugar en un microorganismo de
secreción como B. subtilis, una secuencia señal puede seguir
a la señal de iniciación de la traducción y preceder a la secuencia
de ADN que interesa. La secuencia señal actúa para transportar el
producto de expresión a la membrana celular donde se separa del
producto tras la secreción. El término "secuencias de control"
tal como se ha definido anteriormente pretende incluir una
secuencia señal, cuando esté presente.
Varios ejemplos emplean mutantes que no son
ejemplos de la invención aunque sí la ilustran.
B. subtilis 309 y 147 son variedades de
Bacillus lentus, depositadas en el NCIB y a las que se ha
concedido los números de registro NCIB 10147 y NCIB 10309 y están
descritas en la patente estadounidense Nº 3,723,250, publicada el
27 de marzo de1973.
B. subtilis DN 497 aparece descrita en la
publicación estadounidense Nº 039,298 publicada el 17 de abril de
1987, correspondiente a la publicación de EP Nº 242 220, y que es
un aro^{+} transformante de RUB 200 con ADN cromosómico de SL
438, una cepa de esporulación y carente de proteasa obtenida por el
Dr. Kim Hardy de Biogen.
E. coli MC 1000 r^{-m}+ (Casadaban, M.J.
and Cohen, S.N. (1980), J. Mol. Biol.
138:179-207), fue transformada en r^{-m}+
mediante métodos convencionales y también aparece descrita en la
publicación estadounidense Nº 039,298.
B. subtilis DB105 aparece descrita en:
Kawamura, F., Doi, R.H. (1984), Construction of a Bacillus
subtilis double mutant deficient in extracelular alkaline and
neutral proteases, J.Bacteriol. 160 (2),
442-444.
pSX50 (descrito en la publicación de solicitud de
patente estadounidense Nº 039,298) es un derivado de plásmido pDN
1050 que incluye el promotor-operador P_{1}
O_{1}, el gen xyn B de B. pumilus y el gen xyl R de B.
subtilis.
pSX62 (descrito en la publicación de solicitud de
patente estadounidense Nº 039,298, supra) es un derivado de
pSX52 (ibid), que comprende un gen de fusión entre el gen de
proquimosina de ternera y el gen xyn B de B. pumilus
insertado en el pSX50 (supra). Se generó pSX62 al insertar el
terminador rrn B de E. coli en pSX52 detrás del gen de
proquimosina.
pSX65 (descrito en la publicación de solicitud de
patente estadounidense Nº 039,298, supra) es un derivado del
plásmido pDN 1050, que incluye el promotor-operador
P_{2}O_{2}, el gen xyn B de B. pumilus, y el gen xyl R de
B. subtilis.
pSX88 (descrito en la solicitud de patente
internacional Nº PCT/DK 88/00002 (NOVO INDUSTRI A/S)) es un
derivado de pSX50 que incluye el gen de subtilisina 309.
pSX92 se produjo clonando la subtilisina 309 en
plásmido pSX62 (supra) seccionado en Cla 1 y Hind III, y Cla
1 rellenado antes de la inserción de los fragmentos
Dral-Nhel y Nhel-Hind III del gen
clonado de subtilisina 309.
pSX93, mostrado en la figura 3, es el pUC13
(Vieira and Messing, 1982, Gene 19::259 268) que incluye un
fragmento de 0,7kb de Xbal-Hind III del gen de
subtilisina 309 que incluye el terminador insertado en una secuencia
poliligadora.
pSX119 (descrito en la solicitud de patente
internacional Nº PCT/DK 88/00002 (Novo INDUSTRI A/S)) es un pUC13
que alberga un fragmento de EcoRI-Xbal del gen de
subtilisina 309 insertado en el poliligador.
pSX120 es un plásmido en el que el fragmento de
HpaI-HindIII junto con el gen de subtilisina 309 a
partir de pSX88 se inserta dentro de EcoRV-HindIII
en pDN 1681, de manera que se expresa el gen de la proteasa mediante
los promotores amy M y amy Q. pDN 1681 se obtiene a partir de pDN
1380 (Diderichsen, B. and Christiansen, L.: 1988, FEMS Microbiology
Letters 56: 53-60) con un fragmento de Clal de 2,85
bp insertado de B. amyloliquefaciens que lleva el gen amy Q
con el promotor (Takkinen et al.: 1983, J. Biol. Chem. 258:
1007ff.)
pUC13 aparece descrito en: Vieira, J. and
Messing, J.: 1982, Gene 19: 259-268.
pUC19 aparece descrito en:
Yanisch-Perron, C. and Vieira, J. Messing, J.,
1985, Gene 33:103-119.
pUB110 aparece descrito en: Lacey,R.W., Chopra,J.
(1974), Genetic studies of a multiresistant strain of
Staphvlococcus aureus, J. Med.Microbiol. 7, 285-297, y en: Zyprian,E., Matzura,H. (1986), Characterization of
signais promoting gene expression on the Staphvlococcus aureus plasmid pUB110 and developement of a Gram-positive expression vector system, DNA 5 (3), 219-225.
Staphvlococcus aureus, J. Med.Microbiol. 7, 285-297, y en: Zyprian,E., Matzura,H. (1986), Characterization of
signais promoting gene expression on the Staphvlococcus aureus plasmid pUB110 and developement of a Gram-positive expression vector system, DNA 5 (3), 219-225.
Los genes para las diversas subtilisinas se
obtuvieron tal y como aparece en la bibliografía mencionada arriba.
Concretamente, los genes para las enzimas subtilisina 309 y 147 se
obtuvieron como se describe en la solicitud inédita de patente
internacional nº PCT/DK 88/00002 (NOVO INDUSTRI A/S).
Se diseñó un gen sintético basado en la secuencia
de codificación de la proteasa de subtilisina Carlsberg madura y en
su terminador de transcripción (Jacobs, M. Eliasson,M., Uhlen,M.,
Flock,J.-I. (1985), Cloning, sequencing and expression of
Subtilisin Carlsberg from Bacillus licheniformis. Nucleic
Acids Res. 13 (24), 8913-8926), ligadas a las
secuencias de codificación pre y pro de la proteasa de subtilisina
BPN' (Wells, J.A., Ferrari, E., Henner, D.J., Estell, D.A., Chen,
E.Y. (1983), Cloning, sequencing and secretion of Bacillus
ámvloliquefaciens subtilisin in
Bacillus subtilis, Nucleic Acids Res. 11 (22), 7911-7925). Se subdividió el gen en siete fragmentos con una longitud que oscilaba entre 127 y 313 pares de bases, cada fragmento se construyó a partir de oligos sintetizados químicamente con de 16 a 77 nucleótidos. La superposición entre los oligos de ambas cadenas se optimizó con el objetivo de facilitar un templado de una sola fase para cada fragmento (Mullenbach, G.T., Tabrizi, Un., Blacher, R.W., Steimer,K.S. (1986), Chemical synthesys and expression in Yeast of a gene coding connective tissue activating peptide III, J.Biol. Chem. 261 (2), 719-722). Se ensambló y se clonó cada fragmento en un vector de clonación y secuenciación de E. coli. Se llevó a cabo el análisis de la secuencia de estos fragmentos clonados para confirmar que la secuencia de cada fragmento era correcta. Después, se ensamblaron y clonaron todos los fragmentos en el vector pUB110 (Lacey,R.W., Chopra,J. (1974), Genetic studies of a multiresistant strain of Staphvlococcus aureus, J. Med.Microbiol. 7, 285-297) y se trasladaron a B. subtilis DB105 (Kawamura,F., Doi, R.H. (1984), Construction of a Bacillus subtilis double mutant deficient in extracelular alkaline and neutral proteases, J.Bacteriol. 160 (2), 442 444). Se inició la transcripción del gen mediante el promotor HpaII del vector plásmido pUB110 (Zyprian,E., Matzura,H. (1986), Chracterization of
signais promoting gene expression on the Staphylococcus aureus plasmid pUB110 and development of a Gram-positive expression vector system, DNA 5 (3), 219-225). En el proceso de construcción del gen resultó que el fragmento más largo (#5; 313 pares de bases de longitud) necesitaba más fragmentación (fragmentos #8 y #9) para evitar problemas con el ensamblaje de este fragmento más bien largo.
Bacillus subtilis, Nucleic Acids Res. 11 (22), 7911-7925). Se subdividió el gen en siete fragmentos con una longitud que oscilaba entre 127 y 313 pares de bases, cada fragmento se construyó a partir de oligos sintetizados químicamente con de 16 a 77 nucleótidos. La superposición entre los oligos de ambas cadenas se optimizó con el objetivo de facilitar un templado de una sola fase para cada fragmento (Mullenbach, G.T., Tabrizi, Un., Blacher, R.W., Steimer,K.S. (1986), Chemical synthesys and expression in Yeast of a gene coding connective tissue activating peptide III, J.Biol. Chem. 261 (2), 719-722). Se ensambló y se clonó cada fragmento en un vector de clonación y secuenciación de E. coli. Se llevó a cabo el análisis de la secuencia de estos fragmentos clonados para confirmar que la secuencia de cada fragmento era correcta. Después, se ensamblaron y clonaron todos los fragmentos en el vector pUB110 (Lacey,R.W., Chopra,J. (1974), Genetic studies of a multiresistant strain of Staphvlococcus aureus, J. Med.Microbiol. 7, 285-297) y se trasladaron a B. subtilis DB105 (Kawamura,F., Doi, R.H. (1984), Construction of a Bacillus subtilis double mutant deficient in extracelular alkaline and neutral proteases, J.Bacteriol. 160 (2), 442 444). Se inició la transcripción del gen mediante el promotor HpaII del vector plásmido pUB110 (Zyprian,E., Matzura,H. (1986), Chracterization of
signais promoting gene expression on the Staphylococcus aureus plasmid pUB110 and development of a Gram-positive expression vector system, DNA 5 (3), 219-225). En el proceso de construcción del gen resultó que el fragmento más largo (#5; 313 pares de bases de longitud) necesitaba más fragmentación (fragmentos #8 y #9) para evitar problemas con el ensamblaje de este fragmento más bien largo.
La secuencia de aminoácidos deducida de la
secuencia nucleótida difiere de la secuencia de subtilisina
Carlsberg publicada anteriormente en las posiciones 129, 157, 161 y
212 (Smith,E.L., DeLange,R.J., Evans,W.H., Landon,W., Markland,F.S.
(1968), Subtilisin Carlsberg V. The complete sequence: comparison
with subtilisin BPN'; evolutionary relationships., J.Biol.Chem. 243
(9), 2184-2191). No se ha podido confirmar la quinta
alteración a la que hace referencia Jacobs et al. (1985) en
el clon del gen Carlsberg descrito en la presente solicitud.
El cálculo del punto isoeléctrico de la enzima
subtilisina 309 de tipo salvaje (S000) aparece ejemplificado más
abajo con el objetivo de demostrar el procedimiento utilizado. El
mismo procedimiento también se puede aplicar, naturalmente, al
cálculo de cualquier enzima, tanto si se trata de una enzima
mutante como si no.
Se asignaron valores de pK a cada residuo
aminoácido potencialmente cargado (Tyr, Asp, Glu, Cys, Arg, Su,
Lys, N-terminal, C-terminal,
Cae^{2+}). En este caso se tuvo en cuenta el ambiente por lo que
se emplean valores de pK diferentes en el mismo residuo aminoácido
dependiendo de sus vecinos. Los valores asignados aparecen
indicados en la Tabla II.
A continuación, se calculó el índice de
incidencia de un residuo aminoácido con un determinado pH en forma
cargada o sin cargar (cargada/sin cargar, C/U(i)) tanto para
la carga negativa como para la positiva, empleando las fórmulas Ia
y Ib, respectivamente. En la Tabla II esta proporción sólo viene
indicada para un pH igual a pl_{o}.
Posteriormente se calculó la carga relativa,
Q_{r} (i) o aportación de carga situada en cada residuo cargado
mediante las fórmulas IIa y IIb:
Se halló por iteración el valor de pH en el que
la suma de todas las aportaciones de carga de los residuos cargados
es igual a cero.
Como se ha indicado anteriormente y en la Tabla
II el valor de pK asignado a cada aminoácido era diferente teniendo
en cuenta las variaciones locales en el entorno. Esto sólo tiene
como resultado una precisión realzada del cálculo, pero la
experiencia ha demostrado que los valores de pK constantes
estimados son de ayuda a la hora de mostrar la dirección en la que
se moverá el pl_{o} para una enzima mutante dada en comparación
con el pl_{o} de la enzima madre. Esto aparece indicado en la
Tabla III, donde se indican los valores de pl_{o} para los
valores de pK estimados.
Con el objetivo de comparar las diversas enzimas
y las enzimas mutantes se han llevado a cabo las pruebas de lavado
descritas con detalle más abajo. En la Tabla III que aparece abajo
se han tabulado los resultados de estas pruebas que emplean la
enzima madre y las enzimas mutantes de subtilisina 309 (designada
S000, etc.) y subtilisina Carlsberg (designada 0000, etc.) con el
objetivo de demostrar la correlación entre el pl_{o} y el
rendimiento de lavado con diferentes valores de pH de la solución
de lavado utilizada. En las pruebas de lavado se utilizó una
composición de detergente líquida de baja salinidad con un pH de
8.3 según el ejemplo del detergente D7 y un detergente en polvo de
salinidad normal con un pH de 10.2 según el ejemplo del detergente
D2.
En la Tabla III se indican los resultados como
resultados relativos en comparación con las enzimas de tipo salvaje
(S000 y C000, respectivamente). También se indican los pl_{o}
calculados y observados para las enzimas.
A partir de la tabla III se puede observar que al
variar el pl_{o} hasta alcanzar valores más bajos
(series-S) se proporciona una mejora en el
rendimiento de lavado con un pH bajo (pH=8.3), mientras que una
variación ascendente en el pl_{o} (serie-C)
proporciona una mejora en el rendimiento de lavado con un pH alto
(pH=10.2).
Se ha averiguado que el concepto de punto
isoeléctrico resulta muy útil a la hora de seleccionar las
posiciones de los aminoácidos en la enzima madre que se deben
cambiar.
Por lo general se ha descubierto que las
mutaciones deberían de llevarse a cabo en codones que correspondan
a los aminoácidos situados en o cerca de la superficie de la
molécula de la enzima manteniendo así en la medida de posible, la
estructura interna de la enzima madre.
El procedimiento hace referencia a una depuración
típica de una fermentación a escala de 10 litros de la enzima
Subtilisina 147, la enzima Subtilisina 309 o mutantes derivados de
éstas.
Se centrifugaron aproximadamente 8 litros de
caldo de fermentación a 5000 rpm durante 35 minutos en vasos para
análisis de 1 litro. Se ajustaron los sobrenadantes a un pH de 6.5
empleando un 10% de ácido acético y se filtraron con placas de
filtro de Seitz Supra S100.
Se concentraron las filtraciones hasta
aproximadamente 400 ml empleando una unidad Amicon CH2A UF equipada
con un cartucho Amicon SIY10 UF. Se centrifugó y se filtró el
concentrado UF antes de que tuviera lugar la absorción a
temperatura ambiente sobre una columna de afinidad de bacitracina
con un pH de 7. Se eluyó la proteasa de la columna de bacitracina a
temperatura ambiente utilizando un 25% de 2-propanol
y 1 M de cloruro sódico en la solución tampón con un 0,01 de ácido
dimetilglutárico, 0,1 M de ácido bórico y 0,002 M de cloruro de
calcio ajustado a un pH de 7.
Se combinaron las fracciones con actividad de
proteasa de la fase de depuración de Bacitracina y se aplicaron a
una columna Sephadex G25 de 750 ml (5 cm de dia.) equilibrada con
un tampón con un contenido de 0,01 de ácido dimetilglutárico, 0,2 M
de ácido bórico y 0,002 M de cloruro de calcio ajustado a un pH de
6.5.
Se combinaron las fracciones con actividad
proteolítica de la columna de Sephadex G25 y se aplicaron a una
columna de intercambio catiónico de CM Sefarosa CL 6B de 150 ml (5
cm dia.) equilibrada con un tampón con un contenido de 0,01 M de
ácido dimetilglutárico, 0,2 M de ácido bórico y 0,002 M de cloruro
de calcio ajustado a un pH de 6.5.
Se eluyó la proteasa empleando un gradiente
lineal de 0-0,1 M de cloruro sódico en 2 litros del
mismo tampón (0-0,2 M de cloruro sódico en caso de
sub 147).
En una última fase de depuración, se combinó la
proteasa con un contenido de fracciones de la columna de CM
sefarosa y se concentró en una célula de ultrafiltración Amicon
equipada con una membrana GR81 PP (de Danish Sugar Factories
Inc.).
La Subtilisina 309 y los mutantes
- Gly 195 Glu (G195E (SO01):
- Arg 170 Tyr (R170Y (S003):
- Arg 170 Tyr + Gly 195 Glu (R17OY+G195E (S004):
- Lys 251 Glu (K251E (S005):
- His 120 Asp (H120D (S006):
- Arg 170 Tyr + Gly 195 Glu + Lys 251 Glu (R170Y+G195E+K251E (S012):
- Lys 235 Leu (K235L (S015):
- His 120 Asp + Gly 195 Glu + Lys 235 Leu (H120D+G195E+K235L (S017)):
- His 120 Asp + Arg 170 Tyr + Gly 195 Glu + Lys 235 Leu (H120D+R170Y+G195E+K235L (S019) :
- His 120 Asp + Arg 170 Tyr + Gly 195 Glu + Lys 235 Leu + Lys 251 Glu (H120D+R170Y+G195E+K235L+K251E (S020):
fueron depurados mediante este procedimiento.
Los medios de fermentación se aplicaron sea
directamente sobre una columna de afinidad de bacitracina (5 cm
diam * 15 cm; equilibrada con un tampón de 10 mM de Tris/HCl con un
pH de 7.9; nivel de flujo aproximado de 500 ml/h) sea concentrados
hasta 500 ml mediante un dializador Nephross Andante H.F. (Organon
Technika) empleando una contrapresión de 10-12
p.s.i. y agua desmineralizada en el circuito externo. En el último
caso, la proteasa se precipita a partir del concentrado añadiendo
600 g/l de sulfato de amonio. Se recoge el precipitado mediante
centrifugado y se disuelve en aproximadamente 500 ml de agua
desmineralizada. Se extrae el sulfato de amonio de la solución de
proteasa utilizando el mismo dializador que se describe arriba. El
volumen final fue aproximadamente de 300 ml, mientras que se ajustó
el pH a un pH de 6.0. Se eluyó la proteasa de las columnas de
bacitracina (mencionadas arriba) empleando un tampón Tris de 10 mM
(pH 7.9) que contenía 2,7 M de NaCl e isopropanol al 18%.
Después de la diálisis del material de la
proteasa depurada con bacitracinas o proteasa concentrada se
realizó otra depuración mediante la aplicación sobre una columna de
intercambio iónico de CM-Trisacryl (5 cm. diam * 15
cm; equilibrada con 0,03M de fosfato de sodio con un pH de 6.0)
utilizando un nivel de flujo de 200 ml/h. Se eluyó la proteasa de la
columna con un gradiente lineal de entre 0 y 0,3 M de NaCI (2 * 500
ml) en el tampón de fosfato. Se agruparon las fracciones que
contenían actividad de proteasa y se almacenaron a 20 grados C en
presencia de sales tampón tras la liofilización.
Se sintetizaron todos los cebadores desapareados
en un sintetizador de ADN de Applied Biosystems 380 y se depuraron
mediante electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE).
La actividad proteolítica de las enzimas mutantes
fue evaluada con el objetivo de determinar hasta qué punto se
retuvo la actividad catalítica de la enzima. Se llevaron a cabo las
determinaciones mediante el método de dimetil caseína (DMC)
descrito en la Publicación de NOVO AF 220-gb (o en
posteriores ediciones), disponible en Novo-Nordisk
A/S, Bagsvaerd, Dinamarca.
A:
Se produjeron telas de prueba (2,2 cm x 2,2 cm),
aproximadamente de 0,1 g) pasando telas de algodón (100% algodón,
DS 71) desencoladas a través del recipiente en un Mathis Washing
and Drying Unit de tipo TH (Werner Mathis AG, Zurich, Suiza) que
contenía manchas de hierba.
Finalmente se secó la tela en una corriente de
aire fuerte a temperatura ambiente, se almacenó a temperatura
ambiente durante 3 semanas y, posteriormente, se mantuvo a -18ºC
antes de usarla.
Todas las pruebas se llevaron a cabo en un
sistema de minilavado modelo. En este sistema se lavaron 6 telas de
prueba en un vaso de precipitados de 150 ml que contenía 60 ml de
solución detergente. Los vasos de precipitados se manturvieron en
un baño de agua con el termostato a 30ºC con agitación
magnética.
Como detergente se utilizó el siguiente
detergente líquido estándar:
AE, Berol 160 | 15% |
LAS, Nasa 1169/P | 10% |
Ácido graso de coco | 9% |
Ácido oleico | 1% |
Trietanolamina | 9% |
Glicerol | 10,5% |
Etanol | 1,5% |
TrixNaxCitratx2H_{2}O | 8% |
CaCl_{2}x2H_{2}O | 0,1% |
NaOH | 1% |
Agua a partir de LAS | 23,3% |
Agua a partir de Glicerol | 1,5% |
Agua añadida | 34,9% |
Los porcentajes que se facilitan son los
porcentajes de contenido activo.
Se ajustó el pH con 1 N de NaOH a 8.14. El agua
empleada era de aprox. 6 grados dH (dureza alemana).
Las pruebas se llevaron a cabo con
concentraciones enzimáticas de: 0, 1.0 mg de proteína enzimática/l
y 10,0 mg de proteína enzimática/l y se llevaron a cabo dos tandas
independientes de pruebas para cada uno de los mutantes. Los
resultados mostrados a continuación son promedios de estas
pruebas.
Los lavados duraron 60 minutos y tras el lavado
se pusieron a remojo las telas en un cubo con agua corriente del
grifo durante 25 minutos.
A continuación, se secaron las telas al aire
durante la noche (protegidas de la luz solar) y la remisión, R, se
determinó en un fotómetro ELREPHO 2000 de Datacolor S.A.,
Dietkikon, Suiza a 460 nm.
Como medida del rendimiento de lavado se utilizó
la remisión diferencial, delta R, de forma que resultaba igual a la
remisión después del lavado con la enzima añadida menos la remisión
tras el lavado sin enzima añadida.
B:
Se sometió a prueba el rendimiento de lavado de
varios mutantes en comparación con telas de algodón manchadas de
hierba según el método descrito anteriormente.
Se utilizaron 2,0 g/l de un detergente líquido
comercializado en los Estados Unidos.
Se disolvió el detergente en un tampón de 0,005 M
de etanolamina en agua con intercambio iónico. Se ajustó el pH a un
pH de 8.0, 9.0, 10.0 y 11.0 respectivamente con NaOH/HCl.
Se mantuvo la temperatura a 30ºC de forma
isotérmica durante 10 minutos.
Cada uno de los mutantes fue dosificado a 0,25 mg
de proteína enzimática/l.
C:
Las pruebas de lavado en las que se emplean las
composiciones de detergentes que se muestran en los ejemplos de
detergentes que aparecen a continuación se llevaron a cabo en una
mini lavadora utilizando telas de prueba a base de algodón que
contenían pigmentos, grasa y proteína (caseína). Las condiciones
fueron:
a) 2 g/l de detergente D3 en agua a 6º fH (dureza
francesa) con un pH de 8.3, o
b) 5 g/l de detergente D2 en agua a 15º fH con un
pH de 10.2.
Después del enjuague y del secado se calculó la
reflexión a 460 nm.
Se calculó el factor de mejora a partir de una
curva de respuesta a la dosis y se hizo referencia a la cantidad de
enzima necesaria para obtener un valor delta R dado en comparación
con la enzima de tipo salvaje en cuestión (S000 y C000), lo que
significa que un factor de mejora de 2 indica que sólo se necesita
la mitad de la cantidad enzimática para obtener el mismo valor delta
R.
Los resultados de estas pruebas se muestran en la
tabla III anterior.
D:
Las pruebas experimentales sobre la estabilidad
de la lipasa se realizaron, por ejemplo, empleando los materiales
siguientes:
Se incubó 1 LU/ml de lipasa de Pseudomonas
cepacia en solución de lavado de cada uno de los dos tipos, O y
W (descritos abajo). Se tomaron alícuotas a intervalos y fueron
evaluadas para calcular la actividad lipasa. Se realizaron
incubaciones paralelas sin proteasas o con proteasas de diferentes
tipos como se establece abajo, para comprobar el efecto de la
proteasa en la retención de la actividad lipasa. Se evaluaron las
proteasas de tipo salvaje a 20 GU/ml, las proteasas mutadas fueron
evaluadas a 0,5 microgramos/ml.
Detergente
D1
Se formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención que contiene un adyuvante de fosfato
para que contenga: aproximadamente un 16% de detergente total
activo, aproximadamente un 9% de detergente aniónico,
aproximadamente un 6% de detergente no fónico, aproximadamente un
20% de adyuvante que contenga fosfato, aproximadamente un 3,5% de
polímero acrílico o equivalente, (alternativamente hasta
aproximadamente un 2%), aproximadamente entre un
6-18% de precursor decolorante de perborato,
alternativamente cerca de entre un 15-20%,
aproximadamente un 2% de activador decolorante que contenga amino,
aproximadamente un 3,5% de silicato u otro estructurante,
alternativamente hasta cerca de un 8%, enzimas de aproximadamente 8
unidades de glicina/mg de actividad, con alcali para conseguir el pH
que se desea para su uso y sal inorgánica neutra y enzimas (cerca
de un 0,5% por cada enzima).
El detergente aniónico es una mezcla de sulfonato
de dodecil benceno sódico, alternativamente
alquil-benceno-sulfonato de sodio
lineal, al 6%, y sulfato de alquilo primario al 3%. El detergente
no fónico es un etoxilato de un alcohol primario de aproximadamente
C13-C15 con 7 residuos de etoxilato por mol. El
adyuvante de fosfato es tripolifosfato de sodio. El polímero es
ácido poliacrílico, alternativamente un copolímero
acrílico/maléico. El precursor decolorante de perborato es
tetrahidrato o monohidrato de tetraborato sódico. El activador es
tetra-acetil-etileno-diamina.
El estructurante es silicato de sodio. La sal inorgánica neutra es
sulfato de sodio.
Las enzimas comprenden proteasas según el Mutante
SO01, alternativamente la proteasa S003, S004, S005, C001, C002,
C003, C004, C005, C008, S015, S017, S021, S226, S223, S224, o
S225.
Detergente
D1a
Se formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención que contiene un adyuvante de fosfato
para que contenga: aproximadamente un 15% de detergente total
activo, aproximadamente un 7% de detergente aniónico,
aproximadamente un 6% de detergente no iónico, aproximadamente un
25% de adyuvante que contenga fosfato, aproximadamente un 0,5% de
polímero acrílico o equivalente, aproximadamente un 10% de
precursor decolorante de perborato, aproximadamente un 2% de
activador decolorante que contenga amino, aproximadamente un 6% de
silicato u otro estructurante, enzima proteasa con un grado de
aproximadamente 8 unidades de glicina/mg, con alcali para conseguir
el pH que se desea para su uso y sal inorgánica neutra así como
enzimas (aproximadamente un 0,5% por cada enzima).
El detergente aniónico es
alquil-benceno-sulfonato de sodio
lineal. El detergente no fónico es un etoxilato de un alcohol
primario de aproximadamente C13-C15 con 7 residuos
de etoxilato por mol o una mezcla de éste con el etoxilato de
alcohol correspondiente a la extensión de 3 residuos por mol. El
constructor de fosfato es tripolifosfato de sodio. El precursor
decolorante de perborato o perácido es tetrahidrato de tetraborato
sódico. El activador es
tetra-acetil-etileno-diamina.
El estructurante es silicato de sodio. La sal inorgánica neutra es
sulfato de sodio. Las enzimas comprenden la proteasa según el
mutante S001, alternativamente S003, S004, S005, 0001, C002, C003,
C004, C005, C008, S015, S017, S021, o S226.
Detergente
D2
Se formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención que contiene un adyuvante de zeolita
para que contenga: aproximadamente un 16% de detergente total
activo, aproximadamente un 9% de detergente aniónico,
aproximadamente un 6% de detergente no iónico, aproximadamente un
20% de adyuvante que contenga zeolita, aproximadamente un 3,5% de
polímero acrílico o equivalente, aproximadamente un
6-18% de precursor decolorante de perborato,
aproximadamente un 2% de activador decolorante que contenga amino,
aproximadamente un 3,5% de silicato u otro estructurante,
alternativamente hasta cerca de un 2,5%, de enzimas de
aproximadamente 8 (alternativamente cerca de 15) unidades de
glicina/mg de calidad, con alcali para conseguir el pH que se desea
para su uso y sal inorgánica neutra así como enzimas
(aproximadamente 0,5% por cada enzima).
El detergente aniónico es una mezcla de sulfonato
dodecil-benceno de sodio, alternativamente
alquil-benceno-sulfonato de sodio
lineal, al 6% y sulfato de alquilo primario al 3%. El detergente no
fónico es un etoxilato de alcohol primario de aproximadamente
C13-C15 con 7 residuos de etoxilato por mol. El
adyuvante de zeolita es zeolita del tipo A. El polímero es ácido
poliacrílico. El precursor decolorante de perborato es tetrahidrato
o monohidrato de tetraborato sódico. El activador es
tetraacetil-etilenodiamina. El estructurante es
silicato de sodio. La sal inorgánica neutra es sulfato de sodio. Las
enzimas comprenden la proteasa según el Mutante S001,
alternativamente S003, S004, S005, 0001, C002, C003, C004, C005,
C008, S015, S017, S021, o S226.
Detergente
D2a
Se formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención que contiene un adyuvante de zeolita
para que contenga: aproximadamente un 14% de detergente total
activo, aproximadamente un 7% de detergente aniónico,
aproximadamente un 7% de detergente no iónico, aproximadamente un
25% de constructor que contenga zeolita, aproximadamente un 3% de
polímero acrílico o equivalente, aproximadamente un 10% de
precursor decolorante de perborato o de perácido, aproximadamente
un 2% de activador decolorante que contenga amino, aproximadamente
un 0,5% de silicato u otro estructurante, enzimas con un grado de
cerca de 6 unidades de glicina/mg, con alcali para conseguir el pH
que se desea para su uso y sal inorgánica neutra así como enzimas
(aproximadamente un 0,5% por cada enzima).
El detergente aniónico es
alquil-benceno-sulfonato de sodio
lineal, el detergente no fónico es una mezcla de etoxilatos de
alcohol primario de aproximadamente C13-C15 con 7 y
3 residuos de etoxilato respectivamente por mol. El adyuvante de la
zeolita es zeolita del tipo A. El polímero es un copolímero
acrílico/maléico. El precursor decolorante de perborato es
monohidrato de tetraborato sódico. El activador es
tetra-acetil-etileno-diamina.
El estructurante es silicato de sodio. La sal inorgánica neutra es
sulfato de sodio. Las enzimas comprenden proteasas según el mutante
S001, alternativamente S003, S004, S005, C001, C002, C003, C004,
C005, C008, S015, S017, S021, o S226.
Detergente
D3
Se formula un detergente líquido acuoso según una
forma de realización de la invención para que contenga: un 16% de
ácido dodecilbenceno sulfónico, etoxilato de alcohol lineal
C12-C15 condensado con 7 mol/mol de óxido de
etileno al 7%, un 2% de monoetanolamina, un 6,5% de ácido cítrico,
un 6% de sodio xilensulfonato, aproximadamente un 4,1% de hidróxido
sódico, un 0,5% de proteasa, auxiliares y agua hasta el 100%. El pH
se ajusta a un valor entre 9 y 10. La enzima es una proteasa según
el Mutante S020, alternativamente S019, S012, S004, S001, S003,
S005, S015, S017, S021, S022, S025, S035, S201, S223, S226 o
S235.
Detergente
D4
Se formula un detergente líquido no acuoso según
una forma de realización de la invención empleando un 38,5% de
etoxilato de alcohol primario lineal C13-C15
alcoxilado con 4,9 mol/mol de óxido de etileno y 2,7 mol/mol de
óxido de propileno, un 5% de triacetina, un 30% de trifosfato de
sodio, un 4% de carbonato de sodio, un 15,5% de monohidrato de
perborato de sodio que contenga una proporción menor de oxoborato,
un 4% de TAED, un 0,25% de EDTA del cual un 0,1% es ácido
fosfónico, un 0,6% de Aerosil, un 1% de SCMC y un 0,6% de proteasa.
El pH se ajusta a un valor entre 9 y 10, p. ej., de aproximadamente
9.8. La enzima comprende la proteasa según el Mutante S001,
alternativamente S003, S004, S021, S035, S201, S225, S226, o
S235.
Detergente
D5
Se formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención en forma granulada que cuenta con
una densidad aparente de al menos 600 g/l, con un contenido de
aproximadamente un 20% en peso de surfactante del cual
aproximadamente un 10% es dodecilbenceno sulfonato de sodio y el
resto es una mezcla de Synperonic A7 y Synperonic A3
(aproximadamente de entre un 5,5% y un 4,5%) y sal inorgánica neutra
cero (p. ej., sulfato de sodio), más un 33% aproximadamente de
adyuvante de fosfato, aproximadamente un 16% de tetrahidrato de
perborato de sodio, aproximadamente un 4,5% de activador de TAED,
aproximadamente un 6% de silicato de sodio, y auxiliares que
incluyen aproximadamente un 2% de carbonato de sodio y un contenido
de humedad de aproximadamente un 10%. También se incluyen las
enzimas (aproximadamente un 0,5% por cada enzima). La enzima
incluye la proteasa según el Mutante S001, alternativamente S003,
S004, S005, C001, C002, C003, C004, C005, C008, S223, S224, S225,
S226, o S235.
Detergente
D6
De formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención en forma granulada que tiene una
densidad aparente de al menos 600 g/l, alternativamente de
aproximadamente 550 g/l, con un contenido de aproximadamente un
20%, alternativamente hasta cerca de un 16% en peso de surfactantes
de los cuales aproximadamente un 9%, alternativamente cerca de un
7%, es dodecilbenceno sulfonato de sodio, alternativamente alquil
benceno sulfonato de sodio lineal, y el resto es una mezcla de
Synperonic A7 y Synperonic A3 (o etoxilatos similares)
(respectivamente aproximadamente entre un 5% y un 6%,
alternativamente cerca de un 4% y un 7%), y sal inorgánica neutra
cero (p. ej., sulfato de sodio), más un 30% aproximadamente de
adyuvante de zeolita, alternativamente cerca de un 25%, tetrahidrato
de perborato de sodio, alternativamente monohidrato,
aproximadamente un 14% o un 15%, aproximadamente un 3,6% de
activador de TAED, y auxiliares que incluyen aproximadamente un 9%
de carbonato de sodio, o hasta un 15%, aproximadamente un 0,7% de
Dequest® 2047 y un contenido de humedad de cerca de un 10%. También
se incluyen las enzimas (cerca del 0,5% por cada enzima, o cerca
del 0,2% de lipasas y cerca del 0,7% de proteasas). La enzima
incluye la proteasa según el Mutante S001, alternativamente S003,
S004, S005, C001, C002, C003, C004, C005, C008, S223, S224, S225,
S226, o S235.
Detergente
D6a
Se formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención en forma granulada que tiene una
densidad aparente de al menos 600 g/l, que contiene aproximadamente
un 15% en peso de surfactantes de los cuales aproximadamente un 7%
es alquil benceno sulfonato de sodio lineal, un 2% de sulfato de
alcohol primario, y el resto Synperonic A7 o etoxilatos similares y
sal inorgánica neutra cero (p. ej., sulfato de sodio), más un 22%
aproximadamente de adyuvante de zeolita, aproximadamente un 15% de
tetrahidrato de perborato sódico, aproximadamente un 7% de activador
de TAED y auxiliares que incluyen aproximadamente un 15% de
carbonato de sodio, aproximadamente un 0,7% de Dequest® 2047 y un
contenido de aproximadamente un 10% de humedad. Las enzimas
(aproximadamente un 1,2%) incluyen la proteasa según el Mutante
S001, alternativamente S003, S004, S005, C001, C002, C003, C004,
C005, C008, S223,S224, S225, S226, o S235.
Detergente
D7
Se formula un detergente en polvo según una forma
de realización de la invención para que contenga: un 6% de ácido
dodecilbencenosulfónico, un 5% de óxido de etileno con 7 mol/mol de
etoxilato de alcohol lineal condensado C12-C15, un
3% de jabón de ácido graso, un 3% del polímero CP5 Sokolan®, un 22%
de zeolita A, un 10% de carbonato de sodio, un 17% de sulfato de
sodio, un 8% de partículas de arcilla, un 13% de tetrahidrato de
perborato de sodio, un 2% de
tetraacetil-etilenodiamina, un 0,5% de proteasa,
auxiliares y agua hasta el 100%. El pH se ajusta a un valor entre 9
y 10. La enzima proteasa comprende la proteasa según el Mutante
S001, alternativamente S003, S004, S005, C001, C002, C003, C004,
C005, C008, S223, S224, S225, S226, o S235.
Detergente
D8
Se formula un detergente (jabón) en pastilla
según una forma de realización de la invención de la manera
siguiente: jabón basado en un 82% de sebo saponificado, un 18% de
aceite de coco, un 0,15% de ácido ortofosfórico neutralizado,
mezclado con proteasa (aproximadamente 8 GU/mg de la composición de
la pastilla) y mezclado con formato de sodio al 2%, un 2% de borax,
un 2% de propilenoglicol y un 1% de sulfato de sodio, todo esto se
pasa lentamente por una cadena de producción de jabón. La enzima
proteasa comprende la proteasa según el Mutante S001,
alternativamente S003, S004, S005, C001, C002, C003, C004, C005,
C008, S021, S025, S035, S201, S202, S223, S224, S225, S226, o
S235.
Detergente
D9
Los detergentes líquidos estructurados pueden,
por ejemplo, contener además de una proteasa como la que se
describe aquí, un 2-15% de surfactante no iónico,
un 5-40% de surfactante total, incluyendo el
surfactante no iónico y, opcionalmente, el aniónico, un
5-35% de un adyuvante que contenga o que no contenga
fosfato, un 0,2-0,8% de espesante polimérico, p.
ej., un polímero acrílico reticulado con peso molecular de
aproximadamente 10^{6}, al menos un 10% de silicato de sodio, p.
ej., como el vidrio soluble neutro, alcali (p. ej., alcali que
contenga potasio) para ajustar el pH deseado, preferiblemente
dentro del margen de 9-10 o superior, p. ej., un pH
por encima de 11, con un catión de sodio proporcionado: un anión de
silicato (como el sílice libre) (en peso) inferior a 0,7:1 y una
viscosidad de 0,3-30 Pas (a 20 grados C y
20s-1).
Los ejemplos apropiados contienen aproximadamente
un 5% de alcohol C13-15 de surfactante no iónico
alcoxilado con aproximadamente 5 grupos EO por mol y con cerca de
2,7 grupos PO por mol, un 15-23% de vidrio soluble
neutro con una proporción de peso de 3,5 entre el óxido de sílice y
de sodio, un 13-19% de KOH, un
8-23% de STTP, un
0-11% de carbonato de sodio, un 0,5% de Carbopol® 941.
0-11% de carbonato de sodio, un 0,5% de Carbopol® 941.
La proteasa se puede incorporar, por ejemplo, en
un 0,5% de proteasa según el Mutante S001, alternativamente S021,
S025, S035, S201, S202, S223, S224, S225, S226, o S235.
Detergente
D10
Se formula un detergente líquido acuoso,
estructurado, viscoso y adecuado para hacer la colada como se
muestra a continuación (% en peso):
\vskip1.000000\baselineskip
Acido cítrico | 2,5 |
Borax (10aq) | 4 |
NaOH | 2 |
Glicerol | 5 |
Aquil-benceno-sulfonato lineal C14-C15 o sulfato de alcohol primario C14-C15 | 6,5 |
Synperonic A3 no fónico C12-C15 3EO | 1,2 |
Synperonic A7 no iónico C12-C15 7EO | 3,6 |
Zeolita | 20 |
Proteasa | 0,5 |
Amilasa (Teramyl® 300LDX) | 0,2 |
Auxiliares y agua | hasta 100% |
\vskip1.000000\baselineskip
Se puede ajustar el pH a un valor entre 9 y 10.
La enzima es una proteasa según el Mutante S020. En otras versiones
alternativas de este detergente, la enzima se selecciona de entre
S019, S012, S004, S001, S003, S005, S021, S035, S201, S223, S224,
S225, S226, o S235.
\newpage
Detergente
D11
Se formula un detergente líquido acuoso,
isotrópico y adecuado para su empleo en la colada como se muestra a
continuación (% en peso):
Acido cítrico | 2 |
Acido bórico | 1 |
NaOH | 3 |
KOH | 4,5 |
Glicerol | 10 |
Etanol | 6,5 |
Surfactante no fónico (grupos de C12-alcohol 6,5 EO etoxilato o sulfato de alcohol | |
primario sódico | 10 |
Acido oleico | 16 |
Jabón de aceite de coco (C12) | 11 |
Proteasa | 0,5 |
Auxiliares y agua | hasta 100% |
Se puede ajustar el pH a un valor entre 9 y 10.
La enzima es una proteasa según el Mutante S020. En otras versiones
alternativas de este detergente, la enzima se selecciona de entre
S019, S012, S004, S001, S003, S005, S021, S025, S035, S201, S223,
S224, S225, S226, o S235.
Detergente
D12
Se formula un detergente líquido acuoso para que
contenga:
Alquil-benceno-sulfonato de sodio | 14,5 |
Jabón sódico C18 | 2 |
Detergente no fónico (C12-15 6EO) | 9 |
Acido graso (ácido oleico) | 4,5 |
Alquenil succinato de sodio | 11 |
Propanodiol | 1,5 |
Etanol | 3,6 |
Citrato sódico | 3,2 |
Agente complejante, p. ej., Dequest 2060 | 0,7 |
Proteasa | 0,5 |
Amilasa | 0,1 |
Cloruro de sodio | 0,5 |
Auxiliares y agua | hasta 100% |
Se puede ajustar el pH a un valor entre 9 y 10.
La enzima es una proteasa según el Mutante S020. En otras versiones
alternativas de este detergente, la enzima se selecciona de entre
S019, S012, S004, S001, S003, S005, S021, S025, S035, S201, S202,
S223, S224, S225, S226, o S235.
Detergente
D13
Se formula un detergente líquido acuoso para que
contenga:
alquil-benceno-sulfonato de sodio | 8 |
detergente no fónico 6.5EO | 10 |
dietilamida oléica | 10 |
Ácido graso (C12/C18 75:25) | 18 |
Citrato de sodio | 1 |
Trietanolamina | 5 |
Propanol | 7 |
Etanol | 5 |
(Continuación)
Dequest 2060 | 0,5 |
Proteasa | 0,5 |
Amilasa | 0,1 |
Auxiliares y agua | hasta 100% |
\vskip1.000000\baselineskip
Se puede ajustar el pH a un valor entre 9 y 10.
La enzima es una proteasa según el mutante S020. En otras versiones
alternativas de este detergente, la enzima se selecciona de entre
S019, S012, S004, S001, S003, S005, S021, S025, S035, S201, S202,
S223, S224, S225, S226, o S235.
Detergente
D14
Se formula un detergente líquido no acuoso para
que contenga (% en peso):
Detergente líquido no iónico (C12/C18 75:25) | 41% |
Triacetina | 5 |
Ácido alquilbencenosulfónico lineal | 6 |
Estabilizador del óxido de magnesio | 1 |
Adyuvante/Base del carbonato de sodio | 18 |
Adyuvante del carbonato de calcio | 8 |
Activador decolorante TAED | 3,5 |
Precursor decolorante de monohidrato de perborato | 10,5 |
Sílice parcialmente hidrofóbico | 2 |
Proteasa | 0,4 |
Auxiliares de Lipasa (Lipolase®) o adicional | 3 |
surfactante líquido no fónico (sin agua) | hasta 100% |
\vskip1.000000\baselineskip
Para formular esta composición, se añade primero
el surfactante no iónico líquido y la triacetina, seguidos del
óxido de magnesio y, a continuación, el resto de ingredientes
excepto la enzima. Se muele la mezcla en un molinillo coloidal y se
enfría y, finalmente, se agrega la(s) enzima(s) y
cualquier otro auxiliar termosensible.
La enzima es una proteasa según el Mutante S020.
En otras versiones alternativas de este detergente, la enzima se
selecciona entre S019, S012, S004, S001, S003, S005, S021, S025,
S035, S201, S202, S223, S224, S225, S226, o S235.
También se puede utilizar cualquier otra
formulación de detergente de las descritas y ejemplificadas en la
EP 0 342 177 junto con los mutantes utilizados en el Detergente
D3.
Las mutaciones puntuales se llevaron a cabo según
el método de Morinaga et al. (Biotechnology, supra).
Se utilizaron los siguientes oligonucleótidos para introducir las
mutaciones:
\vskip1.000000\baselineskip
a) Gly 195 Glu (G195E (S001):
Un cebador desapareado 27-mer,
Nor-237, que también genera un nuevo lugar de
restricción SacI:
\newpage
b) Arg 170 Tyr (R170Y (S003):
Un cebador desapareado 25-mer,
Nor 577, que destruye un lugar HaeIII:
\vskip1.000000\baselineskip
c) His 120 Asp (H120D (S006)):
Un cebador desapareado 32-mer,
Nor 735, que destruye un lugar SphI:
\vskip1.000000\baselineskip
d) Lys 251 Glu (K251 E (S005):
Un cebador desapareado 32-mer,
Nor 736, que genera un lugar XhoI:
\vskip1.000000\baselineskip
e) Lys 235 Leu (K235L (S015):
Un cebador desapareado 24-mer,
Nor77-856, que genera un lugar PStI:
\vskip1.000000\baselineskip
f) Arg 170 Tyr; Gly 195 Glu (R170Y;G195E
(S004)):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-577 y Nor-237 en analogía con
lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
g) Gly 195 Glu; Lys 251 Glu (G195E;K251E
(S018)):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-237 y Nor-736 en analogía con
lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
h) Arq 170 Tyr; Lys 251 Glu (R170Y;K251E
(S011)):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-577 y Nor-736 en analogía con
lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
i) Arg 170 Tyr; Gly 195 Glu; Lys 251 Glu
(R170Y;G195E;K251 E (S012)):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-577, Nor-237 y
Nor-736 en analogía con lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
j) Gly 195 Glu; Lys 235 Leu
(G195E;K235L):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-237 y Nor-856 en analogía con
lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
k) Arg 170 Tyr; Gly 195 Glu; Lys 235 Leu
(R170Y;G195E;K235L):
Se levó a cabo una combinación de
Nor-577, Nor-237 y
Nor-856 en analogía con lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
l) His 120 Asp; Lys 235 Leu (H120D;K235L
(S016):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-735 y Nor-856 en analogía con
lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
m) His 120 Asp; Gly 195 Glu; Lys 235 Leu
(H120D;G195E;K235L (S017):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-735, Nor-237 y
Nor-856 en analogía con lo anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
n) His 120 Asp; Arq 170 Tyr; Gly 195 Glu; Lys
235 Leu (H120D;R17OY;G195E;K235L (S019)):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-735, Nor-577,
Nor-237 y Nor-856 en analogía con lo
anterior.
\vskip1.000000\baselineskip
o) His 120 Asp; Arq 170 Tyr; Gly 195 Glu; Lys
235 Leu; Lys 251 Glu (H120D;R170Y;G195E;K235L;K251 E
(S020):
Se llevó a cabo una combinación de
Nor-735, Nor-577,
Nor-237, Nor-856 y
Nor-736 en analogía con lo anterior.
Se llevó a cabo una mutagénesis dúplex
interrumpida empleando los plásmidos pSX93, pSX119, y pSX120 como
plantillas. Se muestra el pSX93 en la figura 3 y es un pUC13
(Vieira, J. and Messing, J.: 1982, Gene 19:
259-268) que alberga un fragmento de
HindIII-XbaI de 0,7 kb del gen de subtilisina 309
que incluye el terminador insertado en el poliligador.
Para la introducción de mutaciones en la parte
del terminal-N de la enzima, se utilizó el plásmido
pSX119. El pSX119 es pUC13 que alberga un fragmento de
EcoRI-XbaI del gen de subtilisina 309 insertado en
el poliligador. Las plantillas pSX 93 y pSX119 cubren, así, por
completo el gen de subtilisina 309.
El plásmido pSX120 es un plásmido en el que el
fragmento HpaI-HindIII con el gen de subtilisina 309
a partir de pSX88 se inserta dentro de EcoRV-HindIII
en pDN 1681, de modo que el gen de proteasa viene expresado por los
promotores amy M y amy Q. El pDN 1681 se obtiene a partir de pDN
1380 (Diderichsen, B. and Christiansen, L.: 1988, FEMS Microbiology
Letters 56: 53-60) con un fragmento ClaI de 2,85 bp
insertado a partir de B. amyloliquefaciens portador del gen
amy Q junto con el promotor (Takkinen et al.: 1983, J. Biol.
Chem. 258: 1007ff.). La construcción de pSX120 aparece resumida en
la figura 1, donde se muestra que el pDN1681 se corta junto con
EcoRV y HindIII y el pSX88 con HindIII y HpaI y a continuación la
ligadura da como resultado un pSX120 regulado por los promotores
amy M y amy Q.
Se crearon otros cuatro plásmidos pSX170, pSX172,
pSX173 y pSX186 para conseguir la mutagénesis dúplex discontinua
del gen de subtilisina 309:
- pSX170: SphI-KpnI, 700 bp a
partir de pSX120 insertado en pUC 19 SphI-KpnI, a
partir del residuo aminoácido 170 en subtilisina 309 madura hasta
el terminador.
- pSX172: EcoRI-SphI, 1360 bp a
partir de pSX120 insertado en pUC 19 EcoRI-SphI,
desde el promotor hasta el residuo aminoácido 170 en subtilisina
309 madura. pSX173: como pSX170, pero con G195E.
- pSX186: PvuII-EcoRI, 415 bp a
partir de pSX120 insertado en pUC 19 HincI-EcoRI,
desde el residuo aminoácido 15 hasta el residuo aminoácido 206 en
subtilisina 309 madura.
La Figura 2 muestra un mapa de restricciones un
tanto detallado de pSX120 en el que se indica los fragmentos que se
emplearon para la construcción de los plásmidos pSX170, pSX172,
pSX173 y pSX186.
La mutación a) se llevó a cabo cortando pSX93 con
XbaI y ClaI como se indica en la Figura 3 y se describe en la
sección "Generación de mutaciones dirigidas en el gen de
subtilisina" y en la solicitud de patente internacional nº
PCT/DK 88/00002 (NOVO INDUSTRI A/S).
Las mutaciones b), d) y e) se llevaron a cabo
correspondientemente al cortar el pSX170 mediante SphI y KpnI.
Las mutaciones f) y g) se llevaron a cabo como en
los supuestos anteriores, pero con el pSX173 en vez de con el
pSX170.
La mutación c) se llevó a cabo de manera
correspondiente cortando el pSX186 mediante PstI y EcoRI.
Las mutaciones h) a o) se construyeron combinando
fragmentos de ADN con las mutaciones de b) a g) simples o dobles
utilizando los lugares de restricción NheI, XbaI, ClaI, AvaII y
KpnI dependiendo de lo que resulte apropiado.
Se produjeron otros mutantes empleando métodos
similares o métodos generales que se conocen a partir de la
bibliografía.
A partir de determinados ejemplos de mutaciones
en subtilisina Carlsberg mencionados en esta descripción se
introdujeron los siguientes cambios en la secuencia de nucleótidos
del gen:
Asp 14 Lys (D14K (C001)) (GAT > AAG)
Asp 120 Lys (D120K (C002)) (GAT > AAA)
Asp 140 Lys (D140K (C003)) (GAC > AAA)
Asp 14 Lys + Asp 120 Lys (D14K+D120K (C004))
Lys 27 Asp (K27D (C005)) (AAA > GAT)
Lys 27 Asp + Asp 120 Lys (K27D+D120K (C006))
Asp 172 Lys (D172K (C008)) (GAC > AAA)
Asp 14 Lys + Asp 120 Lys + Asp 140 Lys + Asp 172
Lys (D14K + D120K + D140K + D172K (C010))
Val 51 Asp (V51 D (C100))
Glu 54 Thr (E54T (C101)) (GGG > ACA)
Glu 54 Tyr (E54Y (C102)) (GGG > TAT)
Estos cambios se introdujeron modificando los
oligos correspondientes en los fragmentos implicados. La corrección
de las nuevas secuencias se confirmó después de que los oligos
originales fueran reemplazados por estas nuevas secuencias y se
ensamblaran en los nuevos fragmentos de ADN. Finalmente, se
volvieron a ensamblar los fragmentos con el nuevo gen de
subtilisina Carlsberg.
Tras la confirmación de que la secuencia de
mutación es correcta, los fragmentos de ADN mutado se insertaron en
los plásmidos pSX92 o pSX120, que se emplearon para producir los
mutantes.
El plásmido pSX92 se muestra en la Figura 4 y se
produjo mediante la clonación del gen de Sub 309 en el plásmido
pSX62 cortado en ClaI, relleno con el fragmento Klenow de ADN
polimerasa I y cortado con HindIII antes de la inserción de los
fragmentos Dra-NheI y NheI-HindIII
del gen clonado de Sub 309.
Para expresar los mutantes, los fragmentos
mutados (XbaI-ClaI, XbaI-HindIII o
EcoRI-XbaI) fueron escindidos del plásmido de
mutaciones apropiado pSX93, pSX119, pSX170, pSX172, pSX173, y
pSX186, respectivamente, y fueron insertados en pSX92 o en pSX120
para obtener plásmidos capaces de expresar los diferentes
mutantes.
El pSX92 o pSX120 mutado se utilizó entonces para
transformar DN497 de B. subtilis.
Las células transformadas se distribuyeron
entonces sobre placas de agar LB con 10 mM de fosfato, un pH de 7,6
mg/ml de cloranfenicol y un 0,2% de xilosa para inducir el promotor
xyn en el plásmido. Las placas también contenían un 1% de leche
desnatada de manera que la proteasa que produce los transformantes
pudiera ser detectada por el halo claro en el que se haya degradado
la leche desnatada.
Tras el crecimiento adecuado, se recuperaron y se
depuraron las enzimas mutadas.
\newpage
Con el objetivo de producir una enzima proteasa
sobre la base de los microorganismos que llevan genes mutantes para
BPN' como se describe arriba, se utilizó de manera general una
fermentedora Chemoferm del tipo Rushton con una turbina de ocho
cuchillas planas y un volumen de trabajo de 8 litros. La
configuración de la fermentadora se preparó conforme a las
reglamentaciones sobre la seguridad para VMT y que consistían
en:
a) Un controlador de presión (tipo
4-3122, Bell & Howell) que corta el suministro
de aire por encima de 0,1 bar de sobrepresión. Esto se hace para
impedir que se atasquen los filtros de aire.
b) Un colector de espuma en la salida de gas
compuesto por un recipiente de succión de 20 l que tiene una capa
anti espuma en el fondo.
c) Una envoltura de agua de enfriamiento sin
juntas herméticas para evitar la contaminación del agua de
enfriamiento o del drenaje del agua del grifo.
d) Se utiliza un filtro contra la evacuación
absoluta (Gelman acro 50, 0,45 micra).
e) Muestreo a través de un dispositivo de bombeo
del muestreo con un volumen interno pequeño.
Se controlaron las corrientes de gases utilizando
medidores de flujo-masa (Brooks, tipo 5852, gama de
0-10 l).
Se controló el pH empleando un transmisor
Hartmann & Braun y un controlador Philips (Witromat). Se
utilizó NaOH (3M) concentrado como neutralizador.
Se analizaron los gases evacuados usando un Unor
4 N (CO2) y un Oxygor 7 N (O2) de Maihak, Westinghouse. Se
determinó la presión de oxígeno en el medio empleando una sonda de
oxígeno esterilizable polarográfica industrial (tipo Ingold
322756702).
Se controló la temperatura del medio mediante un
sensor PT100 y un controlador de temperatura Honeywell (clase 84).
La formación de espuma se mantuvo en un nivel aceptable empleando
un electrodo de contacto, mientras un conmutador de nivel activaba
una bomba de dosificación antiespuma.
Todos los controles externos se pusieron bajo el
control de un microordenador de Hewlett Packard (HP220).
Se prepararon los inoculos incubando un cultivo
de frasco de agitación a 30ºC durante 16 h a 250 rpm en un agitador
giratorio (fermentación LH, tipo MKx). Se utilizaron 300 ml de
inoculo para acondicionar 8 L de medio en las condiciones de
fermentación reales (pH de 7.0, 30ºC, flujo de aire de 3,5 l/min,
agitador a 1000-1500 rpm). Se mantuvo la
concentración de oxígeno disuelto al 25% por encima de la
saturación del aire. El agente antiespuma empleado fue un material
basado en aceite de silicona (Rhodorsil R426, Rhone Poulenc).
Se produjeron las proteasas (mutantes) empleando
la cepa DB105 de B. subtilis que contenía el gen mutante tal
y como se describe en el apartado de construcción del gen. El medio
de cultivo consiste en: 8 g/l de NH4Cl; 4 g/l de KH2PO4; 4 g/l de
K2HPO4; 2 g/l de NaCl; 1 g/l de MgSO4.2H20; 10 g/l de extracto de
levadura; 40 g/l de sacarosa; un pH de 7.0 y esterilizado durante 45
minutos a 120ºC. Tras la esterilización se añadieron 25 mg/l de
triptófano; 20 mg/l de neomicina. Se detuvieron las fermentaciones
tras 20-30 horas. Los medios se despejaron de
células mediante el centrifugado.
Se comprobó la actividad proteolítica de varios
mutantes frente a la caseína como substrato proteínico, según el
método DMC supra. En la tabla IV se presentan los
resultados.
Actividad proteolítica de las subtilisinas mutantes | |
Mutante | Actividad relativa |
Ninguno (S000) | 100 |
S001 | 95 |
S003 | 90 |
S004 | 85 |
S005 | 105 |
S006 | 100 |
S012 | 80 |
S017 | 90 |
S019 | 70 |
S020 | 75 |
S024 | 70 |
A:
Se probó el rendimiento de lavado de varios
mutantes en Detergente estándar líquido con un pH de 8.14 en un
sistema modelo contra manchas de hierba según los métodos detallados
arriba. En la tabla V se presentan los resultados.
A partir de la tabla se puede observar que todos
los mutantes sometidos a prueba mostraban un rendimiento de lavado
mejorado o igual en comparación con la enzima madre de tipo
salvaje. El rendimiento de lavado de los mutantes S019 y S020 es
mejorado de modo que 1,0 mg/l de estas enzimas, en términos
generales, sean capaces de sustituir 10,0 mg/l de la enzima madre
de tipo salvaje, indicando con ello una mejora substancial en el
rendimiento de lavado de las enzimas mutantes de la invención.
B:
En la tabla VI se muestran los resultados de las
pruebas de algunas variantes de las enzimas de la invención en el
detergente líquido modificado comercializado en los Estados Unidos
con valores de pH diferentes en un sistema modelo.
\vskip1.000000\baselineskip
Los resultados muestran claramente que si se
modifica el pl de una enzima donde se desea que varíe el pH óptimo
para el rendimiento de lavado de la enzima de manera que éste se
aproxime al pH de la solución de lavado se mejora el rendimiento de
lavado de la enzima.
D:
Se comprobó el rendimiento de lavado de varios
mutantes en tela de algodón con manchas de hierba según el método
descrito en el Ensayo A.
Se utilizaron 2,0 g/l de un detergente líquido
(detergente D3). Se disolvió el detergente en agua con intercambio
iónico. Se ajustó el pH a 9.1 con NaOH/HCl.
La temperatura se mantuvo a 20ºC de forma
isotérmica durante 10 minutos.
Se dosificaron los mutantes a 0,25; 0,5; 1,0;
2,0; 5,0; y 10,0 mg de proteína enzimática/l cada uno.
Se determinó la estabilidad de los mutantes
examinados midiendo la temperatura de desnaturalización (capacidad
máxima de calor excesivo) por calorimetría de análisis diferencial,
DSC. El nivel de calentamiento fue de 0,5ºC/min.
Se comprobó la estabilidad en una solución que
contenía aproximadamente 2 mg/ml del mutante en un 91% de
detergente líquido estándar, cuya composición se describe en el
Ensayo A. Se obtuvo la solución mezclando 100 ml de solución
enzimática (aproximadamente 20 mg de enzima/ml en un tampón de 0,01
M de ácido dimetilglutárico, 0,002 M de CaCl_{2}, 0,2 M de
H_{3}BO_{3} y 0 0,1 M de NaCl con un pH de 6.5) con 1000 ml de
detergente líquido estándar.
Dentro del grupo de mutantes de Subtilisina 309,
los resultados de estabilidad obtenidos mediante DSC resultan
coherentes con los resultados de estabilidad obtenidos mediante las
pruebas de estabilidad de almacenamiento tradicionales.
El rendimiento de lavado de los diferentes
mutantes en el detergente líquido se presenta en la tabla VII. Los
resultados se muestran como factores de mejora con respecto a la
enzima madre de tipo salvaje. El factor de mejora aparece definido
como en el Ensayo C.
En la tabla VII también se muestra la temperatura
de desnaturalización en detergente estándar líquido por DSC y la
diferencia entre la temperatura de desnaturalización de la enzima
madre de tipo salvaje y la del mutante en cuestión.
\vskip1.000000\baselineskip
A partir de la tabla VII se puede observar que
todos los mutantes evaluados muestran un rendimiento de lavado
mejorado en comparación con la enzima madre de tipo salvaje. El
mejor rendimiento de lavado se consigue mediante los mutantes que
tienen un pl_{o} igual o ligeramente inferior al pH de la
solución de lavado.
La temperatura de desnaturalización obtenida
mediante DSC muestra que la estabilidad de los mutantes
individuales S 021 (*36D) y S 201 (N76D) aumenta en 4,0ºC y 4,2ºC
respectivamente con respecto a la enzima madre de tipo salvaje.
Junto con las mutaciones que se incorporan a uno
o más de los mutantes catalogados en la tabla VII, se ha demostrado
que las mutaciones R170Y y K251 E desestabilizan el mutante con
respecto a la enzima madre de tipo salvaje, mientras que las
mutaciones H120D, G195E y K235L son insensibles con respecto a la
estabilidad.
Se puede observar a partir de la tabla VII que
los mutantes que contienen una mutación desestabilizante se
desestabilizan, incluso en aquellos casos en los que se incluye una
mutación estabilizadora.
Los efectos estabilizantes de *36D y N76D son
aditivos. Esto se observa en los mutantes S 025 y S 035. S 025
contiene tres mutaciones que se mantienen insensibles ante la
estabilidad y ante la mutación estabilizadora *36D. La temperatura
de desnaturalización para el S 025 aumenta en 3,9ºC con respecto a
la enzima madre de tipo salvaje, que resulta igual al aumento
calculado en los mutantes individuales *36D, S 021. S 035 contiene
la misma mutación N76D. La temperatura de desnaturalización para S
035 aumenta en 7,3ºC con respecto a la enzima madre de tipo
salvaje, que, dentro del error experimental, resulta igual a la
suma del aumento calculado en los mutantes individuales *36D, S 021
y N76D, S 201.
E:
Se evaluó el rendimiento de lavado de los tres
mutantes en tela de algodón con manchas de hierba según el método
descrito en el Ensayo A.
Se utilizaron 2,0 g/l de detergente líquido D3.
Se disolvió el detergente en agua con intercambio iónico. Se ajustó
el pH a 9.1 con NaOH/HCl.
Se mantuvo la temperatura a 30ºC de forma
isotérmica durante 10 minutos. Se dosificaron los mutantes a 1,0 y
10,0 mg de proteína enzimática/l cada uno.
Se evaluó el rendimiento de lavado de los tres
mutantes en un detergente líquido comercializado en Estados Unidos
contra las manchas de hierba. Los resultados se muestran en la
tabla VIII.
A partir de la tabla VIII se puede observar que
todos los mutantes muestran un rendimiento de lavado mejorado con
respecto a la enzima madre de tipo salvaje. También se puede
observar que el mejor rendimiento se consigue con el mutante que
tiene un pl_{o} más cercano al pH de la solución de lavado.
F:
Se evaluó el rendimiento de lavado de dos
mutantes en tela de algodón con manchas de hierba según las
condiciones descritas en el Ejemplo E.
Se evaluó el rendimiento de lavado de los dos
mutantes en detergente D3 con respecto a tela de algodón con
manchas de hierba. Los resultados se muestran en la tabla IX.
A partir de la Tabla IX se puede observar que
todos los mutantes muestran un rendimiento de lavado mejorado con
respecto a la enzima madre de tipo salvaje. También se puede
observar que el mejor rendimiento se consigue con el mutante que
tiene un pl_{o} más cercano al pH de la solución de lavado.
G:
Se evaluó el rendimiento de lavado de varios
mutantes en tela de algodón con manchas de hierba según el método
descrito en el Ensayo A.
Se utilizaron 2,0 g/l de detergente D3.
El detergente se disolvió en un tampón (0,0025 M
de ácido bórico y 0,001 M de fosfato de hidrógeno disodio preparado
en agua con intercambio iónico). Se ajustó el pH a 7.0, 8.0, 9.0, y
10,0 respectivamente con NaOH/HCl. Se mantuvo la temperatura a 30ºC
de forma isotérmica durante 10 minutos.
Se dosificaron los mutantes a 0,2 mg de proteína
enzimática/l cada uno.
En la tabla X se muestra el rendimiento de lavado
de algunas de las variantes de las enzimas de la invención con
diferentes valores de pH en un sistema modelo.
Los resultados de la tabla X muestran claramente
que variando el pl de una proteasa de forma que se acerque al pH de
la solución de lavado mejora el rendimiento de lavado de la
proteasa.
Los resultados también muestran que todas las
variantes evaluadas tienen un rendimiento mejorado en comparación
con la enzima madre de tipo salvaje con un pH por debajo de
10.0.
H:
Se evaluó el rendimiento de lavado de varios
mutantes en tela de algodón con manchas de hierba según el método
descrito en el Ensayo A.
Se emplearon 2,0 g/l del detergente líquido D3.
Se disolvió el detergente en 0,005 M de glicina preparada en agua
con intercambio fónico). Se ajustó el pH a 10.0, 10.25, 10.50,
10.75, 11.0, 11.5, y 12.0, respectivamente, con NaOH. Se mantuvo la
temperatura a 30ºC de forma isotérmica durante 10 minutos.
Se dosificaron los mutantes a 0,2 mg de proteína
enzimática/l cada uno.
En la tabla XI se muestra el rendimiento de
lavado de algunas variantes de la enzima de la invención con
diferentes valores de pH en un sistema modelo. En este caso, se
investigaron las variantes con un pl ligeramente más elevado que el
de la enzima madre de tipo salvaje. Se investigó el intervalo de pH
de un pH de 10.0 a 12.0 más detalladamente que en ejemplos
anteriores.
\vskip1.000000\baselineskip
Los datos de la Tabla XI muestran que con valores
de pH altos se puede conseguir un rendimiento máximo con valores de
pH un poco por encima del pl calculado. Además, aumentando el pl de
la proteasa se tiende a aumentar el pH del rendimiento máximo. Los
efectos no son tan pronunciados como se observa con valores de pH
bajos (ensayos B y G).
I:
Con el objetivo de visualizar la correlación
entre el punto isoeléctrico de la proteasa y el pH en el que la
proteasa tiene su rendimiento máximo, se utilizan los resultados de
los ejemplos B, G y H para encontrar el pH en el que cada una de
las variantes sometidas a investigación (y la enzima madre de tipo
salvaje) tienen su rendimiento máximo. En la figura 5 se muestra
este pH_{max} como función del pl_{o} calculado.
Teniendo en cuenta que se investiga el intervalo
de pH en etapas con un valor de pH de 1.0, la correlación resulta
obvia.
En lo que se refiere a la combinación entre los
mutantes de la invención con la lipasa, los resultados
experimentales condujeron a las siguientes conclusiones
prácticas:
La lipasa se mantuvo estable durante una hora en
solución de lavado de tipo O a 37ºC. La presencia de Savinase®
condujo a una desactivación rápida. La Kazusase® condujo a una
inactivación substancialmente inferior de la lipasa durante el
período de prueba.
Se observó que la proteinasa K era menos agresiva
para la lipasa que la Savinase®, pero más que la Kazusase®. Sin
embargo, la subtilisina BPN' no inactivó la lipasa en absoluto bajo
estas condiciones.
Las proteasas preferidas para su uso, p. ej.,
junto con la lipasa en composiciones para el lavado representadas
por el tipo O son los mutantes S001, S003, S004, S012, S019, S020,
S021, S025, S035, y S235.
La solución de lavado del tipo O era una solución
de 5 g/l a 37ºC derivada de la formulación detergente siguiente (%
en peso):
Surfactante aniónico | 6 |
Surfactante no fónico | 5 |
Ácido graso | 2,8 |
Polímero acrílico | 3 |
Zeolita | 22 |
Carbonato | 10 |
Sulfato | 17,5 |
Arcilla | 8 |
Amina terciaria | 2 |
Monohidrato de perborato | 13 |
Auxiliares y agua | hasta 100. |
El tipo W de la solución de lavado era una
solución de 2 g/l de un detergente líquido con la composición
siguiente (% en peso):
Surfactante aniónico | 16 |
Surfactante no fónico | 7 |
Hidrótropo | 6 |
Ácido cítrico | 6,5 |
NaOH | 4,1 |
Monoetanolamina | 2 |
Auxiliares y agua | hasta 100. |
Claims (6)
1. Una subtilisina proteasa mutada en la que la
carga electroestática de la red ha sido modificada en comparación
con la proteasa madre con el mismo pH, de manera que, en dicha
proteasa hay, con respecto a dicha proteasa madre,
residuo(s) aminoácido(s) con menos o más carga
positiva y/o residuo(s) aminoácido(s) con más o menos
carga negativa, en el que la proteasa madre está seleccionada entre
subtilisina BPN', subtilisina amylosacchariticus, subtilisina 168,
subtilisina mesentericopeptidasa, subtilisina Carlsberg,
subtilisina DY, subtilisina 309, subtilisina 147, termitasa,
aqualisina, proteasa PB92 de Bacillus y proteinasa K, Proteasa TW7
o Proteasa TW3 caracterizada por el hecho de que se lleva a
cabo una mutación en una posición correspondiente a la posición 252
en la subtilisina BPN' por sustitución, de manera que dicha
subtilisina proteasa mutada tiene un punto isoeléctrico (pl_{o})
más bajo o más alto que el de dicha proteasa madre y el pl_{o} de
la subtilisina proteasa mutada es más cercano al pH de la solución
de lavado formado por la composición de detergente que el pl_{o}
de la proteasa madre, de tal manera que la subtilisina proteasa
mutada muestre un rendimiento de lavado mejorado con respecto a la
proteasa madre en dicha solución de lavado.
2. El método según la reivindicación 1,
caracterizado por el hecho de que la proteasa tiene al menos
una mutación adicional que afecta al residuo aminoácido que ocupa
una posición elegida entre el grupo de posiciones:
1, 2, 3, 4, 6, 9, 10, 12, 14, 15, 17, 18, 19, 20,
21, 22, 24, 25, 36, 37, 38, 40, 41, 43, 44, 45, 46, 49, 50, 51, 52,
53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 75, 76, 77, 78, 79, 87, 89,
91, 94, 97, 98, 99, 100, 101, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109,
112, 113, 115, 116, 117, 118, 120, 126, 128, 129, 130, 131, 133,
134, 136, 137, 140, 141, 143, 144, 145, 146, 155, 156, 158, 159,
160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 170, 171, 172, 173, 181,
182, 183, 184, 185, 186, 188, 189, 191, 192, 194, 195, 197, 204,
206, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 235, 236,
237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 247, 248, 249, 251,
253, 254, 255, 256, 257, 259, 260, 261, 262, 263, 265, 269, 271,
272, 275
donde dicha subtilisina proteasa
mutada tiene un punto isoeléctrico (pl_{o}) más bajo o más alto
que el de dicha proteasa madre y el pl_{o} de la subtilisina
proteasa mutada es más cercano al pH de la solución de lavado
formada por la composición de detergente que el pl_{o} de la
proteasa madre, de tal manera que la subtilisina proteasa muestre un
rendimiento de lavado mejorado con respecto a la proteasa madre en
la dicha solución de
lavado.
3. El método según las reivindicaciones 1 ó 2,
caracterizado por el hecho de que la subtilisina madre es la
subtilisina 309.
4. El método según las reivindicaciones 1 ó 2,
caracterizado por el hecho de que la subtilisina madre es la
subtilisina 147.
5. El método según las reivindicaciones 1 ó 2,
caracterizado por el hecho de que la subtilisina madre es la
subtilisina Carlsberg.
6. El método según las reivindicaciones 1 ó 2,
caracterizado por el hecho de que la subtilisina madre es la
proteasa PB92 de Bacillus.
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