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CN110272483B - 识别sage1抗原短肽的t细胞受体 - Google Patents

识别sage1抗原短肽的t细胞受体 Download PDF

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CN110272483B CN201810210760.3A CN201810210760A CN110272483B CN 110272483 B CN110272483 B CN 110272483B CN 201810210760 A CN201810210760 A CN 201810210760A CN 110272483 B CN110272483 B CN 110272483B
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Abstract

本发明提供了一种能够特异性结合衍生自SAGE1抗原的短肽ATIIHNLREEK的T细胞受体(TCR),具体地,所述抗原短肽ATIIHNLREEK可与HLA A1101形成复合物并一起被呈递到细胞表面,本发明提供了一种能够特异性地与ATIIHNLREEK‑HLA‑A1101复合物结合的T细胞受体(TCR)。本发明还提供了编码所述TCR的核酸分子序列以及包含所述核酸分子序列的载体。此外,本发明还提供了转导本发明TCR的细胞。

Description

识别SAGE1抗原短肽的T细胞受体
技术领域
本发明涉及识别SAGE1抗原短肽的T细胞受体,本发明还涉及转导上述TCR来获得的SAGE1特异性的T细胞,及他们在预防和治疗SAGE1抗原蛋白相关疾病中的用途。
背景技术
SAGE1作为一种内源性肿瘤抗原蛋白,在细胞内表达后会被降解成小分子多肽,并与MHC(主组织相容性复合体)分子结合形成复合物后被呈递到细胞表面。研究显示,ATIIHNLREEK是衍生自SAGE1抗原蛋白的短肽。SAGE1抗原在黑色素瘤、膀胱癌、肝癌、表皮样癌、非小细胞肺癌和鳞状细胞癌等肿瘤组织中均有表达,而在除睾丸外的多数正常组织中不表达(Martelange V1,De Smet C,De Plaen E,Lurquin C,Boon T.Cancer Res.2000;60(14):3848-55;Atanackovic D,etal.,Cancer BiolTher.2006;5(9):1218-25)。对于上述疾病的治疗,可以采用化疗和放射性治疗等方法,但都会对自身的正常细胞造成损害。
T细胞过继免疫治疗是将对靶细胞抗原具有特异性的反应性T细胞转入病人体内,使其针对靶细胞发挥作用。T细胞受体(TCR)是T细胞表面的一种膜蛋白,其能够识别相应的靶细胞表面的抗原短肽。在免疫系统中,通过抗原短肽特异性的TCR与短肽-主组织相容性复合体(pMHC复合物)的结合引发T细胞与抗原呈递细胞(APC)直接的物理接触,然后T细胞及APC两者的其他细胞膜表面分子就发生相互作用,引起一系列后续的细胞信号传递和其他生理反应,从而使得不同抗原特异性的T细胞对其靶细胞发挥免疫效应。因此,本领域技术人员致力于分离出对SAGE1抗原短肽具有特异性的TCR,使其发挥作用,或者将该TCR转导T细胞来获得对SAGE1抗原短肽具有特异性的T细胞,从而使他们在细胞免疫治疗中发挥作用。
发明内容
本发明的目的在于提供一种识别SAGE1抗原短肽的T细胞受体。
本发明第一方面提供了一种T细胞受体(TCR),所述TCR能够与ATIIHNLREEK-HLA-A1101复合物结合。
在另一优选例中,所述TCR包含TCRα链可变域和TCRβ链可变域,所述TCRα链可变域的CDR3的氨基酸序列为AESPPDNYGQNFV(SEQ ID NO:13);和/或所述TCRβ链可变域的CDR3的氨基酸序列为ASSPVAGELF(SEQ ID NO:10)。
在另一优选例中,所述TCRα链可变域的3个互补决定区(CDR)为:
αCDR1-DSSSTY(SEQ ID NO:6)
αCDR2-IFSNMDM(SEQ ID NO:7)
αCDR3-AESPPDNYGQNFV(SEQ ID NO:13);和/或
所述TCRβ链可变域的3个互补决定区为:
βCDR1-KGHSH(SEQ ID NO:5)
βCDR2-LQKENI(SEQ ID NO:8)
βCDR3-ASSPVAGELF(SEQ ID NO:10)。
在另一优选例中,所述TCR包含TCRα链可变域和TCRβ链可变域,所述TCRα链可变域为与SEQ ID NO:1具有至少90%序列相同性的氨基酸序列;和/或所述TCRβ链可变域为与SEQ ID NO:2具有至少90%序列相同性的氨基酸序列。
在另一优选例中,所述TCR包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。
在另一优选例中,所述TCR包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:2。
在另一优选例中,所述TCR为αβ异质二聚体,其包含TCRα链恒定区TRAC*01和TCRβ链恒定区TRBC1*01或TRBC2*01。
在另一优选例中,所述TCR的α链氨基酸序列为SEQ ID NO:3、15和/或所述TCR的β链氨基酸序列为SEQ ID NO:4、16。
在另一优选例中,所述TCR的α链核苷酸序列为SEQ ID NO.:12、23和/或所述TCR的β链核苷酸序列为SEQ ID NO.:14、24。
在另一优选例中,所述TCR是可溶的。
在另一优选例中,所述TCR包括(a)除跨膜结构域以外的全部或部分TCRα链;以及(b)除跨膜结构域以外的全部或部分TCRβ链;
并且(a)和(b)各自包含功能性可变结构域,或包含功能性可变结构域和所述TCR链恒定结构域的至少一部分。
在另一优选例中,所述TCR为单链。
在另一优选例中,TCR是由α链可变域与β链可变域通过连接肽序列连接而成。
在另一优选例中,半胱氨酸残基在所述TCR的α和β链恒定域之间形成人工二硫键。
在另一优选例中,在所述TCR中形成人工二硫键的半胱氨酸残基取代了选自下列的一组或多组位点:
TRAC*01外显子1的Thr48和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser57;
TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser77;
TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser17;
TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Asp59;
TRAC*01外显子1的Ser15和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu15;
TRAC*01外显子1的Arg53和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser54;
TRAC*01外显子1的Pro89和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ala19;和
TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu20。
在另一优选例中,所述TCR的α链氨基酸序列为SEQ ID NO:3、15和/或所述TCR的β链氨基酸序列为SEQ ID NO:4、16。
在另一优选例中,所述单链TCRα链的氨基酸序列为SEQ ID NO.:25和/或所述单链TCRβ链的氨基酸序列为SEQ ID NO.:27。
在另一优选例中,所述单链TCRα链的核苷酸序列为SEQ ID NO.:26和/或所述单链TCRβ链的核苷酸序列为SEQ ID NO.:28。
在另一优选例中,所述TCR的α链可变区与β链恒定区之间含有人工链间二硫键。
在另一优选例中,所述TCR包含α链可变域和β链可变域以及除跨膜结构域以外的全部或部分β链恒定域,但其不包含α链恒定域,所述TCR的α链可变域与β链形成异质二聚体。
在另一优选例中,所述TCR的α链和/或β链的C-或N-末端结合有偶联物。
在另一优选例中,与所述T细胞受体结合的偶联物为可检测标记物、治疗剂、PK修饰部分或任何这些物质的组合。
在另一优选例中,所述治疗剂为抗-CD3抗体。
本发明第二方面提供了一种多价TCR复合物,其包含至少两个TCR分子,并且其中的至少一个TCR分子为本发明第一方面所述的TCR。
本发明第三方面提供了一种核酸分子,所述核酸分子包含编码本发明第一方面所述的TCR分子的核酸序列或其互补序列。
在另一优选例中,所述核酸分子包含编码TCRα链可变域的核苷酸序列SEQ ID NO:9。
在另一优选例中,所述的核酸分子包含编码TCRβ链可变域的核苷酸序列SEQ IDNO:11。
在另一优选例中,所述核酸分子包含编码TCRα链的核苷酸序列SEQ ID NO:12、23和/或包含编码TCRβ链的核苷酸序列SEQ ID NO:14、24。
本发明第四方面提供了一种载体,所述的载体含有本发明第三方面所述的核酸分子;优选地,所述的载体为病毒载体;更优选地,所述的载体为慢病毒载体。
本发明第五方面提供了一种分离的宿主细胞,所述的宿主细胞中含有本发明第四方面所述的载体或基因组中整合有外源的本发明第三方面所述的核酸分子。
本发明第六方面提供了一种细胞,所述细胞转导本发明第三方面所述的核酸分子或本发明第四方面所述的载体;优选地,所述细胞为T细胞或干细胞。
本发明第七方面提供了一种药物组合物,所述组合物含有药学上可接受的载体以及本发明第一方面所述的TCR、本发明第二方面所述的TCR复合物、本发明第三方面所述的核酸分子、本发明第四方面所述的载体、或本发明第六方面所述的细胞。
本发明第八方面提供了本发明第一方面所述的T细胞受体、或本发明第二方面所述的TCR复合物、本发明第三方面所述的核酸分子、本发明第四方面所述的载体、或本发明第六方面所述的细胞的用途,用于制备治疗肿瘤或自身免疫疾病的药物。
本发明第九方面提供了一种治疗疾病的方法,包括给需要治疗的对象施用适量的本发明第一方面所述的T细胞受体、或本发明第二方面所述的TCR复合物、本发明第三方面所述的核酸分子、本发明第四方面所述的载体、或本发明第六方面所述的细胞、或本发明第七方面所述的药物组合物;
在另一优选例中,所述的疾病为肿瘤。
在另一优选例中,所述肿瘤选自下组:黑色素瘤、胃癌、肺癌(如,肺鳞状细胞癌)、食道癌、膀胱癌、头颈部肿瘤(如,头颈部鳞状细胞癌)、前列腺癌、乳腺癌、结肠癌、卵巢癌、肾细胞癌、霍杰金氏淋巴瘤、肉瘤、成神经管细胞瘤、白血病、或其组合。
在另一优选例中,所述肿瘤选自下组:黑色素瘤、膀胱癌、肝癌、表皮样癌、非小细胞肺癌、鳞状细胞癌、或其组合。
应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。
附图说明
图1a、图1b、图1c、图1d、图1e和图1f分别为TCRα链可变域氨基酸序列、TCRα链可变域核苷酸序列、TCRα链氨基酸序列、TCRα链核苷酸序列、具有前导序列的TCRα链氨基酸序列以及具有前导序列的TCRα链核苷酸序列。
图2a、图2b、图2c、图2d、图2e和图2f分别为TCRβ链可变域氨基酸序列、TCRβ链可变域核苷酸序列、TCRβ链氨基酸序列、TCRβ链核苷酸序列、具有前导序列的TCRβ链氨基酸序列以及具有前导序列的TCRβ链核苷酸序列。
图3为单克隆细胞的CD8+及四聚体-PE双阳性染色结果。
图4a和图4b分别为可溶性TCRα链的氨基酸序列和核苷酸序列。
图5a和图5b分别为可溶性TCRβ链的氨基酸序列和核苷酸序列。
图6为纯化后得到的可溶性TCR的胶图。最左侧泳道为还原胶,中间泳道为分子量标记(marker),最右侧泳道为非还原胶。
图7为本发明可溶性TCR与ATIIHNLREEK-HLA A1101复合物结合的Biacore动力学图谱。
图8为四聚体染色TCR转导的原代T细检测结果。
图9为ELISPOT试验检测结果。
图10为本发明TCR转导的T细胞对特异性靶细胞的杀伤作用结果。
具体实施方式
本发明人经过广泛而深入的研究,找到了能够与SAGE1抗原短肽ATIIHNLREEK(SEQID NO:29)特异性结合的TCR,所述抗原短肽ATIIHNLREEK可与HLA-A1101形成复合物并一起被呈递到细胞表面。本发明还提供了编码所述TCR的核酸分子序列以及包含所述核酸分子序列的载体。另外,本发明还提供了转导本发明TCR的细胞。
术语
MHC分子是免疫球蛋白超家族的蛋白质,可以是Ⅰ类或Ⅱ类MHC分子。因此,其对于抗原的呈递具有特异性,不同的个体有不同的MHC,能呈递一种蛋白抗原中不同的短肽到各自的APC细胞表面。人类的MHC通常称为HLA基因或HLA复合体。
T细胞受体(TCR),是呈递在主组织相容性复合体(MHC)上的特异性抗原肽的唯一受体。在免疫系统中,通过抗原特异性的TCR与pMHC复合物的结合引发T细胞与抗原呈递细胞(APC)直接的物理接触,然后T细胞及APC两者的其他细胞膜表面分子就发生相互作用,这就引起了一系列后续的细胞信号传递和其他生理反应,从而使得不同抗原特异性的T细胞对其靶细胞发挥免疫效应。
TCR是由α链/β链或者γ链/δ链以异质二聚体形式存在的细胞膜表面的糖蛋白。在95%的T细胞中TCR异质二聚体由α和β链组成,而5%的T细胞具有由γ和δ链组成的TCR。天然αβ异质二聚TCR具有α链和β链,α链和β链构成αβ异源二聚TCR的亚单位。广义上讲,α和β各链包含可变区、连接区和恒定区,β链通常还在可变区和连接区之间含有短的多变区,但该多变区常视作连接区的一部分。各可变区包含嵌合在框架结构(framework regions)中的3个CDR(互补决定区),CDR1、CDR2和CDR3。CDR区决定了TCR与pMHC复合物的结合,其中CDR3由可变区和连接区重组而成,被称为超变区。TCR的α和β链一般看作各有两个“结构域”即可变域和恒定域,可变域由连接的可变区和连接区构成。TCR恒定域的序列可以在国际免疫遗传学信息系统(IMGT)的公开数据库中找到,如TCR分子α链的恒定域序列为“TRAC*01”,TCR分子β链的恒定域序列为“TRBC1*01”或“TRBC2*01”。此外,TCR的α和β链还包含跨膜区和胞质区,胞质区很短。
在本发明中,术语“本发明多肽”、“本发明的TCR”、“本发明的T细胞受体”可互换使用。
天然链间二硫键与人工链间二硫键
在天然TCR的近膜区Cα与Cβ链间存在一组二硫键,本发明中称为“天然链间二硫键”。在本发明中,将人工引入的,位置与天然链间二硫键的位置不同的链间共价二硫键称为“人工链间二硫键”。
为方便描述二硫键的位置,本发明中TRAC*01与TRBC1*01或TRBC2*01氨基酸序列的位置编号按从N端到C端依次的顺序进行位置编号,如TRBC1*01或TRBC2*01中,按从N端到C端依次的顺序第60个氨基酸为P(脯氨酸),则本发明中可将其描述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Pro60,也可将其表述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸,又如TRBC1*01或TRBC2*01中,按从N端到C端依次的顺序第61个氨基酸为Q(谷氨酰胺),则本发明中可将其描述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Gln61,也可将其表述为TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第61位氨基酸,其他以此类推。本发明中,可变区TRAV与TRBV的氨基酸序列的位置编号,按照IMGT中列出的位置编号。如TRAV中的某个氨基酸,IMGT中列出的位置编号为46,则本发明中将其描述为TRAV第46位氨基酸,其他以此类推。本发明中,其他氨基酸的序列位置编号有特殊说明的,则按特殊说明。
发明详述
如本文所用,术语“SAGE1TCR-T”指可以针对本发明的SAGE1抗原肽起反应,但对其他抗原肽是没有反应的细胞。
如本文所用,术语“非SAGE1TCR转导的T细胞”、“Non-SAGE1TCR-T”可互换使用,均指表达其他TCR的T细胞,也可以理解为是针对本发明的SAGE1抗原肽,但功能不好的TCR,这些T细胞与本发明的SAGE1抗原肽加在一起并不能引起反应。
TCR分子
在抗原加工过程中,抗原在细胞内被降解,然后通过MHC分子携带至细胞表面。T细胞受体能够识别抗原呈递细胞表面的肽-MHC复合物。因此,本发明的第一方面提供了一种能够结合ATIIHNLREEK-HLA-A1101复合物的TCR分子。优选地,所述TCR分子是分离的或纯化的。该TCR的α和β链各具有3个互补决定区(CDR)。
在本发明的一个优选地实施方式中,所述TCR的α链包含具有以下氨基酸序列的CDR:
αCDR1-DSSSTY(SEQ ID NO:6)
αCDR2-IFSNMDM(SEQ ID NO:7)
αCDR3-AESPPDNYGQNFV(SEQ ID NO:13);和/或
所述TCRβ链可变域的3个互补决定区为:
βCDR1-KGHSH(SEQ ID NO:5)
βCDR2-LQKENI(SEQ ID NO:8)
βCDR3-ASSPVAGELF(SEQ ID NO:10)。
可以将上述本发明的CDR区氨基酸序列嵌入到任何适合的框架结构中来制备嵌合TCR。只要框架结构与本发明的TCR的CDR区兼容,本领域技术人员根据本发明公开的CDR区就能够设计或合成出具有相应功能的TCR分子。因此,本发明TCR分子是指包含上述α和/或β链CDR区序列及任何适合的框架结构的TCR分子。本发明TCRα链可变域为与SEQ ID NO:1具有至少90%,优选地95%,更优选地98%序列相同性的氨基酸序列;和/或本发明TCRβ链可变域为与SEQ ID NO:2具有至少90%,优选地95%,更优选地98%序列相同性的氨基酸序列。
在本发明的一个优选例中,本发明的TCR分子是由α与β链构成的异质二聚体。具体地,一方面所述异质二聚TCR分子的α链包含可变域和恒定域,所述α链可变域氨基酸序列包含上述α链的CDR1(SEQ ID NO:6)、CDR2(SEQ ID NO:7)和CDR3(SEQ ID NO:13)。优选地,所述TCR分子包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。更优选地,所述TCR分子的α链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:1。另一方面,所述异质二聚TCR分子的β链包含可变域和恒定域,所述β链可变域氨基酸序列包含上述β链的CDR1(SEQ ID NO:5)、CDR2(SEQ ID NO:8)和CDR3(SEQ ID NO:10)。优选地,所述TCR分子包含β链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:2。更优选地,所述TCR分子的β链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:2。
在本发明的一个优选例中,本发明的TCR分子是由α链的部分或全部和/或β链的部分或全部组成的单链TCR分子。有关单链TCR分子的描述可以参考文献Chung et al(1994)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 91,12654-12658。根据文献中所述,本领域技术人员能够容易地构建包含本发明CDRs区的单链TCR分子。具体地,所述单链TCR分子包含Vα、Vβ和Cβ,优选地按照从N端到C端的顺序连接。
所述单链TCR分子的α链可变域氨基酸序列包含上述α链的CDR1(SEQ ID NO:6)、CDR2(SEQ ID NO:7)和CDR3(SEQ ID NO:13)。优选地,所述单链TCR分子包含α链可变域氨基酸序列SEQ ID NO:1。更优选地,所述单链TCR分子的α链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:1。所述单链TCR分子的β链可变域氨基酸序列包含上述β链的CDR1(SEQ ID NO:5)、CDR2(SEQID NO:8)和CDR3(SEQ ID NO:10)。优选地,所述单链TCR分子包含β链可变域氨基酸序列SEQID NO:2。更优选地,所述单链TCR分子的β链可变域氨基酸序列为SEQ ID NO:2。
在本发明的一个优选例中,本发明的TCR分子的恒定域是人的恒定域。本领域技术人员知晓或可以通过查阅相关书籍或IMGT(国际免疫遗传学信息系统)的公开数据库来获得人的恒定域氨基酸序列。例如,本发明TCR分子α链的恒定域序列可以为“TRAC*01”,TCR分子β链的恒定域序列可以为“TRBC1*01”或“TRBC2*01”。IMGT的TRAC*01中给出的氨基酸序列的第53位为Arg,在此表示为:TRAC*01外显子1的Arg53,其他以此类推。优选地,本发明TCR分子α链的氨基酸序列为SEQ ID NO:3、15,和/或β链的氨基酸序列为SEQ ID NO:4、16。
天然存在的TCR是一种膜蛋白,通过其跨膜区得以稳定。如同免疫球蛋白(抗体)作为抗原识别分子一样,TCR也可以被开发应用于诊断和治疗,这时需要获得可溶性的TCR分子。可溶性的TCR分子不包括其跨膜区。可溶性TCR有很广泛的用途,它不仅可用于研究TCR与pMHC的相互作用,也可用作检测感染的诊断工具或作为自身免疫病的标志物。类似地,可溶性TCR可以被用来将治疗剂(如细胞毒素化合物或免疫刺激性化合物)输送到呈递特异性抗原的细胞,另外,可溶性TCR还可与其他分子(如,抗-CD3抗体)结合来重新定向T细胞,从而使其靶向呈递特定抗原的细胞。本发明也获得了对SAGE1抗原短肽具有特异性的可溶性TCR。
为获得可溶性TCR,一方面,本发明TCR可以是在其α和β链恒定域的残基之间引入人工二硫键的TCR。半胱氨酸残基在所述TCR的α和β链恒定域间形成人工链间二硫键。半胱氨酸残基可以取代在天然TCR中合适位点的其他氨基酸残基以形成人工链间二硫键。例如,取代TRAC*01外显子1的Thr48和取代TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser57的半胱氨酸残基来形成二硫键。引入半胱氨酸残基以形成二硫键的其他位点还可以是:TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser77;TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser17;TRAC*01外显子1的Thr45和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Asp59;TRAC*01外显子1的Ser15和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu15;TRAC*01外显子1的Arg53和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ser54;TRAC*01外显子1的Pro89和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Ala19;或TRAC*01外显子1的Tyr10和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的Glu20。即半胱氨酸残基取代了上述α与β链恒定域中任一组位点。可在本发明TCR恒定域的一个或多个C末端截短最多50个、或最多30个、或最多15个、或最多10个、或最多8个或更少的氨基酸,以使其不包括半胱氨酸残基来达到缺失天然二硫键的目的,也可通过将形成天然二硫键的半胱氨酸残基突变为另一氨基酸来达到上述目的。
如上所述,本发明的TCR可以包含在其α和β链恒定域的残基间引入的人工二硫键。应注意,恒定域间含或不含上文所述的引入的人工二硫键,本发明的TCR均可含有TRAC恒定域序列和TRBC1或TRBC2恒定域序列。TCR的TRAC恒定域序列和TRBC1或TRBC2恒定域序列可通过存在于TCR中的天然二硫键连接。
为获得可溶性TCR,另一方面,本发明TCR还包括在其疏水芯区域发生突变的TCR,这些疏水芯区域的突变优选为能够使本发明可溶性TCR的稳定性提高的突变,如在公开号为WO2014/206304的专利文献中所述。这样的TCR可在其下列可变域疏水芯位置发生突变:(α和/或β链)可变区氨基酸第11,13,19,21,53,76,89,91,94位,和/或α链J基因(TRAJ)短肽氨基酸位置倒数第3,5,7位,和/或β链J基因(TRBJ)短肽氨基酸位置倒数第2,4,6位,其中氨基酸序列的位置编号按国际免疫遗传学信息系统(IMGT)中列出的位置编号。本领域技术人员知晓上述国际免疫遗传学信息系统,并可根据该数据库得到不同TCR的氨基酸残基在IMGT中的位置编号。
本发明中疏水芯区域发生突变的TCR可以是由一柔性肽链连接TCR的α与β链的可变域而构成的稳定性可溶单链TCR。应注意,本发明中柔性肽链可以是任何适合连接TCRα与β链可变域的肽链。
另外,对于稳定性而言,专利文献PCT/CN2016/077680还公开了在TCR的α链可变区与β链恒定区之间引入人工链间二硫键能够使TCR的稳定性显著提高。因此,本发明的高亲和力TCR的α链可变区与β链恒定区之间还可以含有人工链间二硫键。具体地,在所述TCR的α链可变区与β链恒定区之间形成人工链间二硫键的半胱氨酸残基取代了:TRAV的第46位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸;TRAV的第47位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的61位氨基酸;TRAV的第46位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第61位氨基酸;或TRAV的第47位氨基酸和TRBC1*01或TRBC2*01外显子1的第60位氨基酸。优选地,这样的TCR可以包含(ⅰ)除其跨膜结构域以外的全部或部分TCRα链,和(ⅱ)除其跨膜结构域以外的全部或部分TCRβ链,其中(ⅰ)和(ⅱ)均包含TCR链的可变域和至少一部分恒定域,α链与β链形成异质二聚体。更优选地,这样的TCR可以包含α链可变域和β链可变域以及除跨膜结构域以外的全部或部分β链恒定域,但其不包含α链恒定域,所述TCR的α链可变域与β链形成异质二聚体。
本发明的TCR也可以多价复合体的形式提供。本发明的多价TCR复合体包含两个、三个、四个或更多个本发明TCR相结合而形成的多聚物,如可以用p53的四聚结构域来产生四聚体,或多个本发明TCR与另一分子结合而形成的复合物。本发明的TCR复合物可用于体外或体内追踪或靶向呈递特定抗原的细胞,也可用于产生具有此类应用的其他多价TCR复合物的中间体。
本发明的TCR可以单独使用,也可与偶联物以共价或其他方式结合,优选以共价方式结合。所述偶联物包括可检测标记物(为诊断目的,其中所述TCR用于检测呈递ATIIHNLREEK-HLA-A1101复合物的细胞的存在)、治疗剂、PK(蛋白激酶)修饰部分或任何以上这些物质的组合结合或偶联。
用于诊断目的的可检测标记物包括但不限于:荧光或发光标记物、放射性标记物、MRI(磁共振成像)或CT(电子计算机X射线断层扫描技术)造影剂、或能够产生可检测产物的酶。
可与本发明TCR结合或偶联的治疗剂包括但不限于:1.放射性核素(Koppe等,2005,癌转移评论(Cancer metastasis reviews)24,539);2.生物毒(Chaudhary等,1989,自然(Nature)339,394;Epel等,2002,癌症免疫学和免疫治疗(Cancer Immunology andImmunotherapy)51,565);3.细胞因子如IL-2等(Gillies等,1992,美国国家科学院院刊(PNAS)89,1428;Card等,2004,癌症免疫学和免疫治疗(Cancer Immunology andImmunotherapy)53,345;Halin等,2003,癌症研究(Cancer Research)63,3202);4.抗体Fc片段(Mosquera等,2005,免疫学杂志(The Journal Of Immunology)174,4381);5.抗体scFv片段(Zhu等,1995,癌症国际期刊(International Journal of Cancer)62,319);6.金纳米颗粒/纳米棒(Lapotko等,2005,癌症通信(Cancer letters)239,36;Huang等,2006,美国化学学会杂志(Journal of the American Chemical Society)128,2115);7.病毒颗粒(Peng等,2004,基因治疗(Gene therapy)11,1234);8.脂质体(Mamot等,2005,癌症研究(Cancer research)65,11631);9.纳米磁粒;10.前药激活酶(例如,DT-心肌黄酶(DTD)或联苯基水解酶-样蛋白质(BPHL));11.化疗剂(例如,顺铂)或任何形式的纳米颗粒等。
另外,本发明的TCR还可以是包含衍生自超过一种物种序列的杂合TCR。例如,有研究显示鼠科TCR在人T细胞中比人TCR能够更有效地表达。因此,本发明TCR可包含人可变域和鼠的恒定域。这一方法的缺陷是可能引发免疫应答。因此,在其用于过继性T细胞治疗时应当有调节方案来进行免疫抑制,以允许表达鼠科的T细胞的植入。
应理解,本文中氨基酸名称采用国际通用的单英文字母或三英文字母表示,氨基酸名称的单英文字母与三英文字母的对应关系如下:Ala(A)、Arg(R)、Asn(N)、Asp(D)、Cys(C)、Gln(Q)、Glu(E)、Gly(G)、His(H)、Ile(I)、Leu(L)、Lys(K)、Met(M)、Phe(F)、Pro(P)、Ser(S)、Thr(T)、Trp(W)、Tyr(Y)、Val(V)。
核酸分子
本发明的第二方面提供了编码本发明第一方面TCR分子或其部分的核酸分子,所述部分可以是一个或多个CDR,α和/或β链的可变域,以及α链和/或β链。
编码本发明第一方面TCR分子α链CDR区的核苷酸序列如下:
αCDR1-gacagctcctccacctac(SEQ ID NO:17)
αCDR2-attttttcaaatatggacatg(SEQ ID NO:18)
αCDR3-gcagagagtccgcctgataactatggtcagaattttgtc(SEQ ID NO:19)。
编码本发明第一方面TCR分子β链CDR区的核苷酸序列如下:
βCDR1-aaaggacacagtcat(SEQ ID NO:20)
βCDR2-ctccagaaagaaaatatc(SEQ ID NO:21)
βCDR3-gccagctcaccggttgccggggagctgttt(SEQ ID NO:22)。
因此,编码本发明TCRα链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:17、SEQID NO:18和SEQ ID NO:19,和/或编码本发明TCRβ链的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22。
本发明核酸分子的核苷酸序列可以是单链或双链的,该核酸分子可以是RNA或DNA,并且可以包含或不包含内含子。优选地,本发明核酸分子的核苷酸序列不包含内含子但能够编码本发明多肽,例如编码本发明TCRα链可变域的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQ ID NO:9和/或编码本发明TCRβ链可变域的本发明核酸分子的核苷酸序列包括SEQID NO:11。更优选地,本发明核酸分子的核苷酸序列包含SEQ ID NO:12和/或SEQ ID NO:14。
应理解,由于遗传密码的简并,不同的核苷酸序列可以编码相同的多肽。因此,编码本发明TCR的核酸序列可以与本发明附图中所示的核酸序列相同或是简并的变异体。以本发明中的其中一个例子来说明,“简并的变异体”是指编码具有SEQ ID NO:1的蛋白序列,但与SEQ ID NO:9的序列有差别的核酸序列。
核苷酸序列可以是经密码子优化的。不同的细胞在具体密码子的利用上是不同的,可以根据细胞的类型,改变序列中的密码子来增加表达量。哺乳动物细胞以及多种其他生物的密码子选择表是本领域技术人员公知的。
本发明的核酸分子全长序列或其片段通常可以用但不限于PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。目前,已经可以完全通过化学合成来得到编码本发明TCR(或其片段,或其衍生物)的DNA序列。然后可将该DNA序列引入本领域中已知的各种现有的DNA分子(或如载体)和细胞中。DNA可以是编码链或非编码链。
载体
本发明还涉及包含本发明的核酸分子的载体,包括表达载体,即能够在体内或体外表达的构建体。常用的载体包括细菌质粒、噬菌体和动植物病毒。
病毒递送系统包括但不限于腺病毒载体、腺相关病毒(AAV)载体、疱疹病毒载体、逆转录病毒载体、慢病毒载体、杆状病毒载体。
优选地,载体可以将本发明的核苷酸转移至细胞中,例如T细胞中,使得该细胞表达SAGE1抗原特异性的TCR。理想的情况下,该载体应当能够在T细胞中持续高水平地表达。
细胞
本发明还涉及用本发明的载体或编码序列经基因工程产生的宿主细胞。所述宿主细胞中含有本发明的载体或染色体中整合有本发明的核酸分子。宿主细胞选自:原核细胞和真核细胞,例如大肠杆菌、酵母细胞、CHO细胞等。
另外,本发明还包括表达本发明的TCR的分离的细胞,特别是T细胞。该T细胞可衍生自从受试者分离的T细胞,或者可以是从受试者中分离的混合细胞群,诸如外周血淋巴细胞(PBL)群的一部分。如,该细胞可以分离自外周血单核细胞(PBMC),可以是CD4+辅助T细胞或CD8+细胞毒性T细胞。该细胞可在CD4+辅助T细胞/CD8+细胞毒性T细胞的混合群中。一般地,该细胞可以用抗体(如,抗-CD3或抗-CD28的抗体)活化,以便使它们能够更容易接受转染,例如用包含编码本发明TCR分子的核苷酸序列的载体进行转染。
备选地,本发明的细胞还可以是或衍生自干细胞,如造血干细胞(HSC)。将基因转移至HSC不会导致在细胞表面表达TCR,因为干细胞表面不表达CD3分子。然而,当干细胞分化为迁移至胸腺的淋巴前体(lymphoid precursor)时,CD3分子的表达将启动在胸腺细胞的表面表达该引入的TCR分子。
有许多方法适合于用编码本发明TCR的DNA或RNA进行T细胞转染(如,Robbins等.,(2008)J.Immunol.180:6116-6131)。表达本发明TCR的T细胞可以用于过继免疫治疗。本领域技术人员能够知晓进行过继性治疗的许多合适方法(如,Rosenberg等.,(2008)Nat RevCancer8(4):299-308)。
SAGE1抗原相关疾病
本发明还涉及在受试者中治疗和/或预防与SAGE1抗原蛋白相关疾病的方法,其包括过继性转移SAGE1特异性T细胞至该受试者的步骤。该SAGE1特异性T细胞可识别ATIIHNLREEK-HLA-A1101复合物。
本发明的SAGE1特异性的T细胞可用于治疗任何呈递SAGE1抗原短肽ATIIHNLREEK-HLA-A1101复合物的SAGE1抗原蛋白相关疾病,包括但不限于肿瘤,如黑色素瘤,以及其他实体肿瘤如胃癌、肺癌、食道癌、膀胱癌、头颈部鳞状细胞癌、前列腺癌、乳腺癌、结肠癌、卵巢癌等。
治疗方法
可以通过分离患有与SAGE1抗原相关疾病的病人或志愿者的T细胞,并将本发明的TCR导入上述T细胞中,随后将这些基因工程修饰的细胞回输到病人体内来进行治疗。因此,本发明提供了一种治疗SAGE1相关疾病的方法,包括将分离的表达本发明TCR的T细胞,优选地,该T细胞来源于病人本身,输入到病人体内。一般地,包括(1)分离病人的T细胞,(2)用本发明核酸分子或能够编码本发明TCR分子的核酸分子体外转导T细胞,(3)将基因工程修饰的T细胞输入到病人体内。分离、转染及回输的细胞的数量可以由医师决定。
本发明的主要优点包括:
(1)本发明的TCR能够与SAGE1抗原短肽复合物ATIIHNLREEK-HLA-A1101特异性结合,同时转导了本发明TCR的细胞能够被特异性激活并且对靶细胞具有很强的特异性杀伤作用。
下面的具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,例如(Sambrook和Russell等人,分子克隆:实验室手册(Molecular Cloning-A LaboratoryManual)(第三版)(2001)CSHL出版社)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明,否则百分比和份数按重量计算。除非另外说明,否则百分比和份数按重量计算。以下实施例中所用的实验材料和试剂如无特别说明均可从市售渠道获得。
实施例1克隆SAGE1抗原短肽特异性T细胞
利用合成短肽SAGE1 388-398ATIIHNLREEK(南京金斯康生物科技有限公司)刺激来自于基因型为HLA-A1101的健康志愿者的外周血淋巴细胞(PBL)。将SAGE1 388-398ATIIHNLREEK短肽与带有生物素标记的HLA-A*1101复性,制备pHLA单倍体。这些单倍体与用PE标记的链霉亲和素(BD公司)组合成PE标记的四聚体,分选该四聚体及抗-CD8-APC双阳性细胞。扩增分选的细胞,并按上述方法进行二次分选,随后用有限稀释法进行单克隆培养。单克隆细胞用四聚体染色,筛选到的双阳性克隆如图3所示。
实施例2获取SAGE1抗原短肽特异性T细胞克隆的TCR基因与载体的构建
用Quick-RNATMMiniPrep(ZYMO research)抽提实施例1中筛选到的SAGE1 388-398特异性、HLA-A1101限制性的T细胞克隆的总RNA。cDNA的合成采用clontech的SMART RACEcDNA扩增试剂盒,采用的引物是设计在在人类TCR基因的C端保守区。将序列克隆至T载体(TAKARA)上进行测序。经测序,该双阳性克隆表达的TCR的α链和β链序列结构分别如图1和图2所示,图1a、图1b、图1c和图1d分别为TCRα链可变域氨基酸序列、TCRα链可变域核苷酸序列、TCRα链氨基酸序列和TCRα链核苷酸序列;图2a、图2b、图2c和图2d分别为TCRβ链可变域氨基酸序列、TCRβ链可变域核苷酸序列、TCRβ链氨基酸序列和TCRβ链核苷酸序列。
经鉴定,α链包含具有以下氨基酸序列的CDR:
αCDR1-DSSSTY(SEQ ID NO:6)
αCDR2-IFSNMDM(SEQ ID NO:7)
αCDR3-AESPPDNYGQNFV(SEQ ID NO:13)
β链包含具有以下氨基酸序列的CDR:
βCDR1-KGHSH(SEQ ID NO:5)
βCDR2-LQKENI(SEQ ID NO:8)
βCDR3-ASSPVAGELF(SEQ ID NO:10)。
通过重叠(overlap)PCR分别将TCRα链和β链的全长基因克隆至慢病毒表达载体pLenti(addgene)。具体为:用overlap PCR将TCRα链和TCRβ链的全长基因进行连接得到TCRα-2A-TCRβ片段。将慢病毒表达载体及TCRα-2A-TCRβ酶切连接得到pLenti-SAGE1TRA-2A-TRB-IRES-NGFR质粒。作为对照用,同时也构建表达eGFP的慢病毒载体pLenti-eGFP。之后再用293T/17包装假病毒。
实施例3本发明抗原短肽特异性可溶TCR的表达、重折叠和纯化
为获得可溶的TCR分子,本发明的TCR分子的α和β链可以分别只包含其可变域及部分恒定域,并且α和β链的恒定域中分别引入了一个半胱氨酸残基以形成人工链间二硫键,引入半胱氨酸残基的位置分别为TRAC*01外显子1的Thr48和TRBC2*01外显子1的Ser57;其α链的氨基酸序列与核苷酸序列分别如图4a和图4b所示,其β链的氨基酸序列与核苷酸序列分别如图5a和图5b所示,引入的半胱氨酸残基以加粗和加下划线字母表示。通过《分子克隆实验室手册》(Molecular Cloning a Laboratory Manual)(第三版,Sambrook和Russell)中描述的标准方法将上述TCRα和β链的目的基因序列经合成后分别插入到表达载体pET28a+(Novagene),上下游的克隆位点分别是NcoI和NotI。插入片段经过测序确认无误。
将TCRα和β链的表达载体分别通过化学转化法转化进入表达细菌BL21(DE3),细菌用LB培养液生长,于OD600=0.6时用终浓度0.5mM IPTG诱导,TCR的α和β链表达后形成的包涵体通过BugBuster Mix(Novagene)进行提取,并且经BugBuster溶液反复多次洗涤,包涵体最后溶解于6M盐酸胍,10mM二硫苏糖醇(DTT),10mM乙二胺四乙酸(EDTA),20mMTris(pH8.1)中。
溶解后的TCRα和β链以1:1的质量比快速混合于5M尿素,0.4M精氨酸,20mM Tris(pH 8.1),3.7mM cystamine,6.6mMβ-mercapoethylamine(4℃)中,终浓度为60mg/mL。混合后将溶液置于10倍体积的去离子水中透析(4℃),12小时后将去离子水换成缓冲液(20mMTris,pH 8.0)继续于4℃透析12小时。透析完成后的溶液经0.45μM的滤膜过滤后,通过阴离子交换柱(HiTrap Q HP,5ml,GE Healthcare)纯化。洗脱峰含有复性成功的α和β二聚体的TCR通过SDS-PAGE胶确认。TCR随后通过凝胶过滤层析(HiPrep 16/60,Sephacryl S-100HR,GE Healthcare)进一步纯化。纯化后的TCR纯度经过SDS-PAGE测定大于90%,浓度由BCA法测定。本发明得到的可溶性TCR的SDS-PAGE胶图如图6所示。
实施例4结合表征
BIAcore分析
本实施例证明了可溶性的本发明TCR分子能够与ATIIHNLREEK-HLA A1101复合物特异性结合。
使用BIAcore T200实时分析系统检测实施例3中得到的TCR分子与ATIIHNLREEK-HLA A1101复合物的结合活性。将抗链霉亲和素的抗体(GenScript)加入偶联缓冲液(10mM醋酸钠缓冲液,pH 4.77),然后将抗体流过预先用EDC和NHS活化过的CM5芯片,使抗体固定在芯片表面,最后用乙醇胺的盐酸溶液封闭未反应的活化表面,完成偶联过程,偶联水平约为15,000RU。
使低浓度的链霉亲和素流过已包被抗体的芯片表面,然后将ATIIHNLREEK-HLAA1101复合物流过检测通道,另一通道作为参比通道,再将0.05mM的生物素以10μL/min的流速流过芯片2min,封闭链霉亲和素剩余的结合位点。
上述ATIIHNLREEK-HLA A1101复合物的制备过程如下:
a.纯化
收集100ml诱导表达重链或轻链的E.coli菌液,于4℃8000g离心10min后用10mlPBS洗涤菌体一次,之后用5ml BugBuster Master Mix Extraction Reagents(Merck)剧烈震荡重悬菌体,并于室温旋转孵育20min,之后于4℃,6000g离心15min,弃去上清,收集包涵体。
将上述包涵体重悬于5ml BugBuster Master Mix中,室温旋转孵育5min;加30ml稀释10倍的BugBuster,混匀,4℃6000g离心15min;弃去上清,加30ml稀释10倍的BugBuster重悬包涵体,混匀,4℃6000g离心15min,重复两次,加30ml 20mMTris-HCl pH 8.0重悬包涵体,混匀,4℃6000g离心15min,最后用20mMTris-HCl 8M尿素溶解包涵体,SDS-PAGE检测包涵体纯度,BCA试剂盒测浓度。
b.复性
将合成的短肽ATIIHNLREEK(南京金斯康生物科技有限公司)溶解于DMSO至20mg/ml的浓度。轻链和重链的包涵体用8M尿素、20mMTris pH 8.0、10mM DTT来溶解,复性前加入3M盐酸胍、10mM醋酸钠、10mM EDTA进一步变性。将ATIIHNLREEK肽以25mg/L(终浓度)加入复性缓冲液(0.4M L-精氨酸、100mMTris pH 8.3、2mM EDTA、0.5mM氧化性谷胱甘肽、5mM还原型谷胱甘肽、0.2mM PMSF,冷却至4℃),然后依次加入20mg/L的轻链和90mg/L的重链(终浓度,重链分三次加入,8h/次),复性在4℃进行至少3天至完成,SDS-PAGE检测能否复性成功。
c.复性后纯化
用10体积的20mMTris pH 8.0作透析来更换复性缓冲液,至少更换缓冲液两次来充分降低溶液的离子强度。透析后用0.45μm醋酸纤维素滤膜过滤蛋白质溶液,然后加载到HiTrap Q HP(GE通用电气公司)阴离子交换柱上(5ml床体积)。利用Akta纯化仪(GE通用电气公司),20mMTris pH 8.0配制的0-400mMNaCl线性梯度液洗脱蛋白,pMHC约在250mMNaCl处洗脱,收集诸峰组分,SDS-PAGE检测纯度。
d.生物素化
用Millipore超滤管将纯化的pMHC分子浓缩,同时将缓冲液置换为20mMTris pH8.0,然后加入生物素化试剂0.05M Bicine pH 8.3、10mM ATP、10mMMgOAc、50μM D-Biotin、100μg/ml BirA酶(GST-BirA),室温孵育混合物过夜,SDS-PAGE检测生物素化是否完全。
e.纯化生物素化后的复合物
用Millipore超滤管将生物素化标记后的pMHC分子浓缩至1ml,采用凝胶过滤层析纯化生物素化的pMHC,利用Akta纯化仪(GE通用电气公司),用过滤过的PBS预平衡HiPrepTM16/60S200HR柱(GE通用电气公司),加载1ml浓缩过的生物素化pMHC分子,然后用PBS以1ml/min流速洗脱。生物素化的pMHC分子在约55ml时作为单峰洗脱出现。合并含有蛋白质的组分,用Millipore超滤管浓缩,BCA法(Thermo)测定蛋白质浓度,加入蛋白酶抑制剂cocktail(Roche)将生物素化的pMHC分子分装保存在-80℃。利用BIAcore Evaluation软件计算动力学参数,得到本发明可溶性的TCR分子与复合物结合的动力学图谱如图7所示。
实施例5SAGE1特异性T细胞受体慢病毒包装与原代T细胞转导SAGE1TCR
(a)通过293T/17细胞的快速介导瞬时转染(Express-In-mediated transienttransfection)制备慢病毒
利用第三代慢病毒包装系统包装含有编码所需TCR的基因的慢病毒。利用快速介导瞬时转染(Express-In-mediated transient transfection)(开放生物系统公司(OpenBiosystems))用4种质粒(含有实施例2所述pLenti-SAGE1TRA-2A-TRB-IRES-NGFR的一种慢病毒载体,以及含有构建传染性但非复制型慢病毒颗粒所必需的其他组分的3种质粒)转染293T/17细胞。
为进行转染,第0天种细胞,在15厘米培养皿,种上1.7×107个293T/17细胞,使细胞均匀分布在培养皿上,汇合度略高于50%。第1天转染质粒,包装pLenti-SAGE1TRA-2A-TRB-IRES-NGFR和pLenti-eGFP假病毒,将以上表达质粒与包装质粒pMDLg/pRRE,pRSV-REV和pMD.2G混匀,一个15厘米直径平皿的用量如下:15微克:5微克:5微克:5微克。转染试剂PEI-MAX与质粒的比例是2:1,每个平皿的使用量为60微克。具体操作为:把表达质粒与包装质粒加入1800微升OPTI-MEM((吉布可公司(Gibco),目录号31985-070)培养基中混合均匀,室温静置5分钟成为DNA混合液;取相应量PEI与1800微升OPTI-MEM培养基混合均匀,室温静置5分钟成为PEI混合液。把DNA混合液和PEI混合液混合在一起并在室温静置30分钟,再添加3150微升OPTI-MEM培养基,混合均匀后加入到已经转换成11.25毫升OPTI-MEM的293T/17细胞中,轻轻晃动培养皿,使培养基混合均匀,37℃/5%CO2下培养。转染5-7小时,去除转染培养基,换成含有10%胎牛血清的DMEM((吉布可公司(Gibco),目录号C11995500bt))完全培养基,37℃/5%CO2下培养。第3和第4天收集含有包装的慢病毒的培养基上清。为收获包装的慢病毒,把所收集到的培养上清3000g离心15分钟去除细胞碎片,再经0.22微米过滤器(默克密理博(Merck Millipore),目录号SLGP033RB)过滤,最后用50KD截留量的浓缩管(默克密理博(Merck Millipore),目录号UFC905096)进行浓缩,除去大部分上清液,最后浓缩到1毫升,等分分装后-80℃冻存。取假病毒样品进行病毒滴度测定,步骤参照p24ELISA(Clontech,目录号632200)试剂盒说明书。作为对照用,同时也包转pLenti-eGFP的假病毒。
(b)用含有SAGE1特异性T细胞受体基因的慢病毒转导原代T细胞
从健康志愿者的血液中分离到CD8+T细胞,再用包装的慢病毒转导。计数这些细胞,在48孔板中,在含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的含10%FBS(吉布可公司(Gibco),目录号C10010500BT)的1640(吉布可公司(Gibco),目录号C11875500bt)培养基中以1×106个细胞/毫升(0.5毫升/孔)与预洗涤的抗CD3/CD28抗体-包被小珠(T细胞扩增物,lifetechnologies,目录号11452D)共孵育过夜刺激,细胞:珠=2:1。
刺激过夜后,根据p24ELISA试剂盒所测到的病毒滴度,按MOI=10的比例加入已浓缩的SAGE1特异性T细胞受体基因的慢病毒,32℃,900g离心感染1小时。感染完毕后去除慢病毒感染液,用含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的含10%FBS的1640培养基重悬细胞,37℃/5%CO2下培养3天。转导3天后计数细胞,稀释细胞至0.5×106个细胞/毫升。每两天计数一次细胞,替换或加入含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的新鲜培养基,维持细胞在0.5×106-1×106个细胞/毫升。从第3天开始通过流式细胞术分析细胞,从第5天开始用于功能试验(例如,IFN-γ释放的ELISPOT和非放射性细胞毒性检测)。从第10天开始或在细胞减缓分裂和尺寸变小之时,冷冻储存等分细胞,至少4×106个细胞/管(1×107个细胞/毫升,90%FBS/10%DMSO)。
(c)四聚体染色TCR转导的原代T细胞
SAGE1 388-398ATIIHNLREEK短肽与带有生物素标记的HLA-A*1101复性,制备pHLA单倍体。这些单倍体用PE标记的链霉亲和素(BD)组合成PE标记的四聚体,称为SAGE1-tetramer-PE。此四聚体能把表达了SAGE1特异性T细胞受体基因的T细胞标记为阳性细胞。把(b)中经转染的T细胞样品与SAGE1-tetramer-PE在冰上孵育30分钟,然后加入anti-小鼠β链-APC(biolegend)抗体,继续冰上孵育15分钟。样品用含有2%FBS的PBS清洗2次后用BDCalibur或BD Arial检测或分选表达了SAGE1特异性T细胞受体基因的SAGE1-tetramer-PE和CD8双阳性的T细胞,数据分析采用CellQuest软件(BD)或者FlowJo软件(Tree Star Inc,Ashland,OR)分析。
经检测分析,结果如图8所示,用SAGE1-tetramer-PE和抗小鼠β链抗体染色后,未经TCR慢病毒感染的空白对照组T细胞很少SAGE1-tetramer-PE和抗小鼠β链-APC双阳性细胞,而经TCR慢病毒感染的T细胞出现表达TCR的SAGE1-tetramer-PE和抗小鼠β链-APC双阳性细胞,当用非SAGE1-tetramer-PE的其他tetramer-PE染色时只有少量非特异性的双阳性细胞。
实施例6验证SAGE1特异性TCR功能
4.1ELISPOT方案
进行以下试验以证明TCR-转导的T细胞对靶细胞特异性地起反应的激活。利用ELISPOT试验检测的IFN-γ产量作为T细胞激活的读出值。
试剂
试验培养基:10%FBS(吉布可公司(Gibco),目录号16000-044),RPMI1640(吉布可公司(Gibco),目录号C11875500bt)
洗涤缓冲液:0.01M PBS/0.05%吐温20
PBS(吉布可公司(Gibco),目录号C10010500BT)
PVDF ELISPOT 96孔板(默克密理博(Merck Millipore),目录号MSIPS4510)
人IFN-γELISPOT PVDF-酶试剂盒(BD)装有所需的所有其他试剂(捕捉和检测抗体,链霉亲和素-碱性磷酸酶和BCIP/NBT溶液)
方法
靶细胞制备
本实施例的靶细胞为Epstein-Barr病毒(EBV)转化的永生化淋巴母细胞系(LCL)。B95-8细胞经十四酰乙酸佛波醇酯(TPA)诱导生产含有EBV的培养基上清,4℃/600g离心10分钟去除杂质,然后过0.22微米过滤器,等分分装-70℃保存。从基因型为HLA-A11/A02/A24(包括纯合子和杂合子)的健康志愿者的外周血淋巴细胞(PBL),取10毫升浓度为2×107/毫升的PBL悬浮液于25平方厘米的培养瓶中,加入环孢霉素后在37℃/CO2培养箱中孵育1小时,快速解冻一份EBV,按1/10稀释加入到上述细胞中,轻轻摇匀并把培养瓶直立置于37℃/CO2培养箱中培养。培养12天后添加10毫升培养基继续培养,约30天后进一步扩大培养并进行流式检测,其中CD19+CD23hiCD58+为永生化淋巴母细胞系(LCL)。本ELISPOT试验以HLA-A11/02为靶细胞。
效应细胞制备
本试验的效应细胞(T细胞)是实施例3中经流式细胞术分析表达SAGE1特异性TCR的CD8+T细胞,并以同一志愿者的CD8+T作为阴性对照效应细胞。用抗CD3/CD28包被珠(T细胞扩增物,life technologies)刺激T细胞,用携带SAGE1特异性TCR基因的慢病毒转导(依据实施例3),在含有50IU/ml IL-2和10ng/ml IL-7的含10%FBS的1640培养基扩增直至转导后9-12天,然后将这些细胞置于试验培养基中,300g常温离心10分钟进行洗涤。然后将细胞以2×所需终浓度重悬在试验培养基中。同样处理阴性对照效应细胞。
ELISPOT
按照生产商提供的说明书,如下所述准备孔板:以每块板10毫升无菌PBS按1:200稀释抗人IFN-γ捕捉抗体,然后将100微升的稀释捕捉抗体等分加入各孔。4℃下孵育孔板过夜。孵育后,洗涤孔板以除去多余的捕捉抗体。加入100微升/孔含有10%FBS的RPMI 1640培养基并在室温下温育孔板2小时以封闭孔板。然后从孔板中洗去培养基,通过在纸上轻弹和轻拍ELISPOT孔板以除去任何残余的洗涤缓冲液。
SAGE1TCR-T细胞(SAGE1TCR转导的T细胞,效应细胞)、非SAGE1TCR转导的T细胞(Non-SAGE1TCR-T,表达其他TCR的效应细胞)和LCLs-A11/02(靶细胞)依据实施例3所述制备,并在相应实验组加入对应短肽,其中PSAGE1为SAGE1 388-398ATIIHNLREEK短肽,PA02和PA11为非SAGE1TCR特异结合短肽。
然后采用以下顺序将试验的诸组分加入ELISPOT孔板:
130微升靶细胞154000个细胞/毫升(得到总共约20000个靶细胞/孔)。
50微升效应细胞(2000个SAGE1TCR-T细胞)。
20微升10-4摩尔/升的SAGE1PX251 388-398ATIIHNLREEK/PA02/PA11短肽溶液(终浓度为10-6摩尔/升)。
所有孔一式三份制备添加。
然后温育孔板过夜(37℃/5%CO2)第二天,弃培养基,用双蒸水洗涤孔板2次,再用洗涤缓冲液洗涤3次,在纸巾上轻拍以除去残余的洗涤缓冲液。然后用含有10%FBS的PBS稀释检测一抗,按100微升/孔加入各孔。室温下温育孔板2小时,再用洗涤缓冲液洗涤3次,在纸巾上轻拍孔板以除去过量的洗涤缓冲液。
用含有10%FBS的PBS按1:10000稀释链霉亲和素-碱性磷酸酶,将100微升稀释的链霉亲和素-碱性磷酸酶加入各孔并在室温下温育孔板1小时。然后用洗涤缓冲液洗涤3次PBS洗涤2次,在纸巾上轻拍孔板以除去过量的洗涤缓冲液和PBS。洗涤完毕后加入试剂盒提供的BCIP/NBT溶液100微升/孔进行显影。在显影期间用锡箔纸覆盖孔板避光,静置5-15分钟。在此期间常规检测显影孔板的斑点,确定终止反应的最佳时间。去除BCIP/NBT溶液并用双蒸水冲洗孔板以中止显影反应,甩干,然后将孔板底部去除,在室温下干燥孔板直至每个孔完全干燥,再利用免疫斑点平板计数计(CTL,细胞技术有限公司(Cellular TechnologyLimited))计数孔板内底膜形成的斑点。
结果
通过ELISPOT试验(如上所述)检验SAGE1TCR转导的T细胞对负载SAGE1388-398ATIIHNLREEK短肽的靶细胞和非特异性短肽的靶细胞起反应的IFN-γ释放。利用Graphpad prism6绘制各孔中观察到的ELSPOT斑点数量。
实验结果如图9所示,单独的SAGE1TCR-T细胞(效应细胞)或LCL细胞(靶细胞)添加相应短肽无IFN-γ释放。
SAGE1TCR-T细胞(效应细胞)能与负载PSAGE1的LCLs-A11/02细胞起反应释放出较多IFN-γ。
SAGE1TCR-T细胞(效应细胞)对负载PA11或PA02的LCLs-A11/02细胞的IFN-γ释放很少。
非SAGE1TCR转导的T细胞(Non-SAGE1TCR-T,表达其他TCR的效应细胞)对负载PSAGE1的LCLs-A11/02细胞的IFN-γ释放很少,即非SAGE1TCR对SAGE1388-398ATIIHNLREEK短肽无识别作用。
4.2非放射性细胞毒性试验方案
该试验是51Cr释放细胞毒性试验的比色替代试验,定量测定细胞裂解后释放的乳酸脱氢酶(LDH)。采用30分钟偶联的酶反应来检测释放在培养基中的LDH,在酶反应中LDH可使一种四唑盐(INT)转化为红色的甲臜(formazan)。生成的红色产物的量与裂解的细胞数成正比。可以用标准的96孔读板计收集490nm可见光吸光值数据。
材料
CytoTox
Figure BDA0001597193560000241
非放射性细胞毒性检测(普罗迈格公司,G1780)含有底物混合物、试验缓冲液、裂解溶液和终止缓冲液。
试验培养基:10%FBS(热灭活的,吉布可公司,目录号16000-044),含酚红的90%RPMI 1640(吉布可公司(Gibco),目录号C11875500bt),1%青霉素/链霉素(吉布可公司,目录号15070-063)。
微孔圆底96孔组织培养板(纽克公司(Nunc),目录号163320)
96孔免疫平板Maxisorb(纽克公司(Nunc),目录号442404)
方法
靶细胞制备
该试验所用的靶细胞LCLs与前述ELISPOT方案中的靶细胞制备方法一样。在试验培养基中制备靶细胞:靶细胞浓度调至3×105个/毫升,每孔取50微升从而得1.5×104个细胞/孔。
效应细胞制备
本试验的效应细胞(T细胞)是实施例3中经流式细胞术分析表达SAGE1特异性TCR的CD8+T细胞(SAGE1TCR-T)。以表达非SAGE1短肽特异的其他TCR为对照组。
效应细胞与靶细胞之比采用1:1和2:1,其中靶细胞为定量(3×105个/毫升,每孔取50微升从而得1.5×104个细胞/孔),效应细胞根据效靶比变化。
短肽溶液制备
SAGE1 388-398ATIIHNLREEK(或PX1和PX2两种非特异短肽)短肽用含5%FBS的RPMI1640培养基通过10倍稀释法稀释成10-6M的工作液,使其加入到实验组后最终浓度在10-6M。
(a)通过靶细胞负载不同浓度的短肽检测效应细胞杀伤能力
试验准备
采用以下顺序将试验的诸组分加入微孔圆底96孔组织培养板:
-80ul靶细胞(如上所述制备)加入各孔
-100ul效应细胞(如上所述制备)加入各孔
-20ul短肽溶液加入各孔(不负载短肽实验组直接补20ul培养基)。
如下所述制备对照组:
-不负载短肽实验组:含有100ul效应细胞和100ul靶细胞。
-效应细胞自发释放:仅有100ul效应细胞。
-靶细胞自发释放:仅有100ul靶细胞。
-靶细胞最大释放:仅有100ul靶细胞。
-试剂培养基对照:仅有200ul培养基。
所有孔一式三份制备,终体积为200ul(不够的用培养基补足)。
37℃温育24小时。收集所有孔上清前,将靶细胞最大释放对照孔在-70℃放置细胞大约30分钟,再在37℃融化15分钟,以使靶细胞全部裂解。
在250g离心平板4分钟。将试验平板各孔的50ul上清液转移至96孔免疫平板Maxisorb板的相应孔。利用试验缓冲液(12ml)重建底物混合物,然后加50ul至平板各孔。平板盖上盖子后在阴暗处室温温育30分钟。将50ul终止溶液加入平板各孔以终止反应。加入终止溶液后1小时内计数记录490nm的吸光度。
计算结果
从实验组、靶细胞自发释放组和效应细胞自释放组的所有吸光度值中扣除培养基背景的吸光度值。
将上述中获得的经过校正的值带入下面公式,计算每个效靶比所产生的细胞毒性百分比。
%细胞毒性=100×(实验-效应细胞自发-靶细胞自发)/(靶细胞最大-靶细胞自发)
结果
通过非放射性细胞毒性检测(如上所述)检验SAGE1TCR-T细胞对负载SAGE1 388-398ATIIHNLREEK短肽和非特异性短肽的靶细胞起反应的LDH释放。利用Graphpad prism6绘制各孔中490nm可见光吸光值。
实验数据统计结果如图10所示,负载10-6M的短肽浓度下,SAGE1TCR-T细胞对靶细胞LCLs-A11/02的杀伤作用随着效应细胞和靶细胞比例的升高逐渐增强;对不负载短肽或负载PX1/PX2非特异性短肽的靶细胞LCLs-A11/02无杀伤作用。
对照组非SAGE1TCR转导的T细胞(Non-SAGE1TCR-T,表达其他TCR的效应细胞)对负载PSAGE1的LCLs-A11/02细胞的无溶解作用,可见非SAGE1TCR细胞对SAGE1 388-398ATIIHNLREEK短肽无识别作用。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考,就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解,在阅读了本发明的上述讲授内容之后,本领域技术人员可以对本发明作各种改动或修改,这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
序列表
<110> 中国科学院广州生物医药与健康研究院
<120> 识别SAGE1抗原短肽的T细胞受体
<130> P2017-2276
<160> 29
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 114
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 1
Gly Glu Asp Val Glu Gln Ser Leu Phe Leu Ser Val Arg Glu Gly Asp
1 5 10 15
Ser Ser Val Ile Asn Cys Thr Tyr Thr Asp Ser Ser Ser Thr Tyr Leu
20 25 30
Tyr Trp Tyr Lys Gln Glu Pro Gly Ala Gly Leu Gln Leu Leu Thr Tyr
35 40 45
Ile Phe Ser Asn Met Asp Met Lys Gln Asp Gln Arg Leu Thr Val Leu
50 55 60
Leu Asn Lys Lys Asp Lys His Leu Ser Leu Arg Ile Ala Asp Thr Gln
65 70 75 80
Thr Gly Asp Ser Ala Ile Tyr Phe Cys Ala Glu Ser Pro Pro Asp Asn
85 90 95
Tyr Gly Gln Asn Phe Val Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Ser Val Leu
100 105 110
Pro Tyr
<210> 2
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 2
Asn Ala Gly Val Met Gln Asn Pro Arg His Leu Val Arg Arg Arg Gly
1 5 10 15
Gln Glu Ala Arg Leu Arg Cys Ser Pro Met Lys Gly His Ser His Val
20 25 30
Tyr Trp Tyr Arg Gln Leu Pro Glu Glu Gly Leu Lys Phe Met Val Tyr
35 40 45
Leu Gln Lys Glu Asn Ile Ile Asp Glu Ser Gly Met Pro Lys Glu Arg
50 55 60
Phe Ser Ala Glu Phe Pro Lys Glu Gly Pro Ser Ile Leu Arg Ile Gln
65 70 75 80
Gln Val Val Arg Gly Asp Ser Ala Ala Tyr Phe Cys Ala Ser Ser Pro
85 90 95
Val Ala Gly Glu Leu Phe Phe Gly Glu Gly Ser Arg Leu Thr Val Leu
100 105 110
<210> 3
<211> 254
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 3
Gly Glu Asp Val Glu Gln Ser Leu Phe Leu Ser Val Arg Glu Gly Asp
1 5 10 15
Ser Ser Val Ile Asn Cys Thr Tyr Thr Asp Ser Ser Ser Thr Tyr Leu
20 25 30
Tyr Trp Tyr Lys Gln Glu Pro Gly Ala Gly Leu Gln Leu Leu Thr Tyr
35 40 45
Ile Phe Ser Asn Met Asp Met Lys Gln Asp Gln Arg Leu Thr Val Leu
50 55 60
Leu Asn Lys Lys Asp Lys His Leu Ser Leu Arg Ile Ala Asp Thr Gln
65 70 75 80
Thr Gly Asp Ser Ala Ile Tyr Phe Cys Ala Glu Ser Pro Pro Asp Asn
85 90 95
Tyr Gly Gln Asn Phe Val Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Ser Val Leu
100 105 110
Pro Tyr Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp Ser
115 120 125
Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser Gln
130 135 140
Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp Lys
145 150 155 160
Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala Val
165 170 175
Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn Asn
180 185 190
Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser Cys
195 200 205
Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr Asp Thr Asn Leu Asn
210 215 220
Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile Leu Leu Leu Lys Val
225 230 235 240
Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu Trp Ser Ser
245 250
<210> 4
<211> 291
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 4
Asn Ala Gly Val Met Gln Asn Pro Arg His Leu Val Arg Arg Arg Gly
1 5 10 15
Gln Glu Ala Arg Leu Arg Cys Ser Pro Met Lys Gly His Ser His Val
20 25 30
Tyr Trp Tyr Arg Gln Leu Pro Glu Glu Gly Leu Lys Phe Met Val Tyr
35 40 45
Leu Gln Lys Glu Asn Ile Ile Asp Glu Ser Gly Met Pro Lys Glu Arg
50 55 60
Phe Ser Ala Glu Phe Pro Lys Glu Gly Pro Ser Ile Leu Arg Ile Gln
65 70 75 80
Gln Val Val Arg Gly Asp Ser Ala Ala Tyr Phe Cys Ala Ser Ser Pro
85 90 95
Val Ala Gly Glu Leu Phe Phe Gly Glu Gly Ser Arg Leu Thr Val Leu
100 105 110
Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu Pro
115 120 125
Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu
130 135 140
Ala Thr Gly Phe Tyr Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val Asn
145 150 155 160
Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln Pro Leu Lys
165 170 175
Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser Ser Arg Leu
180 185 190
Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His Phe Arg Cys
195 200 205
Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln Asp
210 215 220
Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly Arg
225 230 235 240
Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Glu Ser Tyr Gln Gln Gly Val Leu Ser
245 250 255
Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr Leu Tyr Ala
260 265 270
Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys Arg Lys Asp
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<211> 5
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
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<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 6
Asp Ser Ser Ser Thr Tyr
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<210> 7
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 7
Ile Phe Ser Asn Met Asp Met
1 5
<210> 8
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 8
Leu Gln Lys Glu Asn Ile
1 5
<210> 9
<211> 342
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 9
ggagaggatg tggagcagag tcttttcctg agtgtccgag agggagacag ctccgttata 60
aactgcactt acacagacag ctcctccacc tacttatact ggtataagca agaacctgga 120
gcaggtctcc agttgctgac gtatattttt tcaaatatgg acatgaaaca agaccaaaga 180
ctcactgttc tattgaataa aaaggataaa catctgtctc tgcgcattgc agacacccag 240
actggggact cagctatcta cttctgtgca gagagtccgc ctgataacta tggtcagaat 300
tttgtctttg gtcccggaac cagattgtcc gtgctgccct at 342
<210> 10
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 10
Ala Ser Ser Pro Val Ala Gly Glu Leu Phe
1 5 10
<210> 11
<211> 336
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 11
aatgccggcg tcatgcagaa cccaagacac ctggtcagga ggaggggaca ggaggcaaga 60
ctgagatgca gcccaatgaa aggacacagt catgtttact ggtatcggca gctcccagag 120
gaaggtctga aattcatggt ttatctccag aaagaaaata tcatagatga gtcaggaatg 180
ccaaaggaac gattttctgc tgaatttccc aaagagggcc ccagcatcct gaggatccag 240
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<212> DNA
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<400> 12
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aactgcactt acacagacag ctcctccacc tacttatact ggtataagca agaacctgga 120
gcaggtctcc agttgctgac gtatattttt tcaaatatgg acatgaaaca agaccaaaga 180
ctcactgttc tattgaataa aaaggataaa catctgtctc tgcgcattgc agacacccag 240
actggggact cagctatcta cttctgtgca gagagtccgc ctgataacta tggtcagaat 300
tttgtctttg gtcccggaac cagattgtcc gtgctgccct atatccagaa ccctgaccct 360
gccgtgtacc agctgagaga ctctaaatcc agtgacaagt ctgtctgcct attcaccgat 420
tttgattctc aaacaaatgt gtcacaaagt aaggattctg atgtgtatat cacagacaaa 480
actgtgctag acatgaggtc tatggacttc aagagcaaca gtgctgtggc ctggagcaac 540
aaatctgact ttgcatgtgc aaacgccttc aacaacagca ttattccaga agacaccttc 600
ttccccagcc cagaaagttc ctgtgatgtc aagctggtcg agaaaagctt tgaaacagat 660
acgaacctaa actttcaaaa cctgtcagtg attgggttcc gaatcctcct cctgaaagtg 720
gccgggttta atctgctcat gacgctgcgg ctgtggtcca gc 762
<210> 13
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 13
Ala Glu Ser Pro Pro Asp Asn Tyr Gly Gln Asn Phe Val
1 5 10
<210> 14
<211> 873
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 14
aatgccggcg tcatgcagaa cccaagacac ctggtcagga ggaggggaca ggaggcaaga 60
ctgagatgca gcccaatgaa aggacacagt catgtttact ggtatcggca gctcccagag 120
gaaggtctga aattcatggt ttatctccag aaagaaaata tcatagatga gtcaggaatg 180
ccaaaggaac gattttctgc tgaatttccc aaagagggcc ccagcatcct gaggatccag 240
caggtagtgc gaggagattc ggcagcttat ttctgtgcca gctcaccggt tgccggggag 300
ctgttttttg gagaaggctc taggctgacc gtactggagg acctgaaaaa cgtgttccca 360
cccgaggtcg ctgtgtttga gccatcagaa gcagagatct cccacaccca aaaggccaca 420
ctggtgtgcc tggccacagg cttctacccc gaccacgtgg agctgagctg gtgggtgaat 480
gggaaggagg tgcacagtgg ggtcagcaca gacccgcagc ccctcaagga gcagcccgcc 540
ctcaatgact ccagatactg cctgagcagc cgcctgaggg tctcggccac cttctggcag 600
aacccccgca accacttccg ctgtcaagtc cagttctacg ggctctcgga gaatgacgag 660
tggacccagg atagggccaa acctgtcacc cagatcgtca gcgccgaggc ctggggtaga 720
gcagactgtg gcttcacctc cgagtcttac cagcaagggg tcctgtctgc caccatcctc 780
tatgagatct tgctagggaa ggccaccttg tatgccgtgc tggtcagtgc cctcgtgctg 840
atggccatgg tcaagagaaa ggattccaga ggc 873
<210> 15
<211> 275
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 15
Met Lys Thr Phe Ala Gly Phe Ser Phe Leu Phe Leu Trp Leu Gln Leu
1 5 10 15
Asp Cys Met Ser Arg Gly Glu Asp Val Glu Gln Ser Leu Phe Leu Ser
20 25 30
Val Arg Glu Gly Asp Ser Ser Val Ile Asn Cys Thr Tyr Thr Asp Ser
35 40 45
Ser Ser Thr Tyr Leu Tyr Trp Tyr Lys Gln Glu Pro Gly Ala Gly Leu
50 55 60
Gln Leu Leu Thr Tyr Ile Phe Ser Asn Met Asp Met Lys Gln Asp Gln
65 70 75 80
Arg Leu Thr Val Leu Leu Asn Lys Lys Asp Lys His Leu Ser Leu Arg
85 90 95
Ile Ala Asp Thr Gln Thr Gly Asp Ser Ala Ile Tyr Phe Cys Ala Glu
100 105 110
Ser Pro Pro Asp Asn Tyr Gly Gln Asn Phe Val Phe Gly Pro Gly Thr
115 120 125
Arg Leu Ser Val Leu Pro Tyr Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr
130 135 140
Gln Leu Arg Asp Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr
145 150 155 160
Asp Phe Asp Ser Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val
165 170 175
Tyr Ile Thr Asp Lys Thr Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys
180 185 190
Ser Asn Ser Ala Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala
195 200 205
Asn Ala Phe Asn Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser
210 215 220
Pro Glu Ser Ser Cys Asp Val Lys Leu Val Glu Lys Ser Phe Glu Thr
225 230 235 240
Asp Thr Asn Leu Asn Phe Gln Asn Leu Ser Val Ile Gly Phe Arg Ile
245 250 255
Leu Leu Leu Lys Val Ala Gly Phe Asn Leu Leu Met Thr Leu Arg Leu
260 265 270
Trp Ser Ser
275
<210> 16
<211> 310
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 16
Met Asp Thr Arg Leu Leu Cys Cys Ala Val Ile Cys Leu Leu Gly Ala
1 5 10 15
Gly Leu Ser Asn Ala Gly Val Met Gln Asn Pro Arg His Leu Val Arg
20 25 30
Arg Arg Gly Gln Glu Ala Arg Leu Arg Cys Ser Pro Met Lys Gly His
35 40 45
Ser His Val Tyr Trp Tyr Arg Gln Leu Pro Glu Glu Gly Leu Lys Phe
50 55 60
Met Val Tyr Leu Gln Lys Glu Asn Ile Ile Asp Glu Ser Gly Met Pro
65 70 75 80
Lys Glu Arg Phe Ser Ala Glu Phe Pro Lys Glu Gly Pro Ser Ile Leu
85 90 95
Arg Ile Gln Gln Val Val Arg Gly Asp Ser Ala Ala Tyr Phe Cys Ala
100 105 110
Ser Ser Pro Val Ala Gly Glu Leu Phe Phe Gly Glu Gly Ser Arg Leu
115 120 125
Thr Val Leu Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val
130 135 140
Phe Glu Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu
145 150 155 160
Val Cys Leu Ala Thr Gly Phe Tyr Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp
165 170 175
Trp Val Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Ser Thr Asp Pro Gln
180 185 190
Pro Leu Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Cys Leu Ser
195 200 205
Ser Arg Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asn Pro Arg Asn His
210 215 220
Phe Arg Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp
225 230 235 240
Thr Gln Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala
245 250 255
Trp Gly Arg Ala Asp Cys Gly Phe Thr Ser Glu Ser Tyr Gln Gln Gly
260 265 270
Val Leu Ser Ala Thr Ile Leu Tyr Glu Ile Leu Leu Gly Lys Ala Thr
275 280 285
Leu Tyr Ala Val Leu Val Ser Ala Leu Val Leu Met Ala Met Val Lys
290 295 300
Arg Lys Asp Ser Arg Gly
305 310
<210> 17
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 17
gacagctcct ccacctac 18
<210> 18
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 18
attttttcaa atatggacat g 21
<210> 19
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 19
gcagagagtc cgcctgataa ctatggtcag aattttgtc 39
<210> 20
<211> 15
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 20
aaaggacaca gtcat 15
<210> 21
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 21
ctccagaaag aaaatatc 18
<210> 22
<211> 30
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 22
gccagctcac cggttgccgg ggagctgttt 30
<210> 23
<211> 825
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 23
atgaagacat ttgctggatt ttcgttcctg tttttgtggc tgcagctgga ctgtatgagt 60
agaggagagg atgtggagca gagtcttttc ctgagtgtcc gagagggaga cagctccgtt 120
ataaactgca cttacacaga cagctcctcc acctacttat actggtataa gcaagaacct 180
ggagcaggtc tccagttgct gacgtatatt ttttcaaata tggacatgaa acaagaccaa 240
agactcactg ttctattgaa taaaaaggat aaacatctgt ctctgcgcat tgcagacacc 300
cagactgggg actcagctat ctacttctgt gcagagagtc cgcctgataa ctatggtcag 360
aattttgtct ttggtcccgg aaccagattg tccgtgctgc cctatatcca gaaccctgac 420
cctgccgtgt accagctgag agactctaaa tccagtgaca agtctgtctg cctattcacc 480
gattttgatt ctcaaacaaa tgtgtcacaa agtaaggatt ctgatgtgta tatcacagac 540
aaaactgtgc tagacatgag gtctatggac ttcaagagca acagtgctgt ggcctggagc 600
aacaaatctg actttgcatg tgcaaacgcc ttcaacaaca gcattattcc agaagacacc 660
ttcttcccca gcccagaaag ttcctgtgat gtcaagctgg tcgagaaaag ctttgaaaca 720
gatacgaacc taaactttca aaacctgtca gtgattgggt tccgaatcct cctcctgaaa 780
gtggccgggt ttaatctgct catgacgctg cggctgtggt ccagc 825
<210> 24
<211> 930
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 24
atggacacca gactactctg ctgtgcggtc atctgtcttc tgggggcagg tctctcaaat 60
gccggcgtca tgcagaaccc aagacacctg gtcaggagga ggggacagga ggcaagactg 120
agatgcagcc caatgaaagg acacagtcat gtttactggt atcggcagct cccagaggaa 180
ggtctgaaat tcatggttta tctccagaaa gaaaatatca tagatgagtc aggaatgcca 240
aaggaacgat tttctgctga atttcccaaa gagggcccca gcatcctgag gatccagcag 300
gtagtgcgag gagattcggc agcttatttc tgtgccagct caccggttgc cggggagctg 360
ttttttggag aaggctctag gctgaccgta ctggaggacc tgaaaaacgt gttcccaccc 420
gaggtcgctg tgtttgagcc atcagaagca gagatctccc acacccaaaa ggccacactg 480
gtgtgcctgg ccacaggctt ctaccccgac cacgtggagc tgagctggtg ggtgaatggg 540
aaggaggtgc acagtggggt cagcacagac ccgcagcccc tcaaggagca gcccgccctc 600
aatgactcca gatactgcct gagcagccgc ctgagggtct cggccacctt ctggcagaac 660
ccccgcaacc acttccgctg tcaagtccag ttctacgggc tctcggagaa tgacgagtgg 720
acccaggata gggccaaacc tgtcacccag atcgtcagcg ccgaggcctg gggtagagca 780
gactgtggct tcacctccga gtcttaccag caaggggtcc tgtctgccac catcctctat 840
gagatcttgc tagggaaggc caccttgtat gccgtgctgg tcagtgccct cgtgctgatg 900
gccatggtca agagaaagga ttccagaggc 930
<210> 25
<211> 208
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 25
Met Gly Glu Asp Val Glu Gln Ser Leu Phe Leu Ser Val Arg Glu Gly
1 5 10 15
Asp Ser Ser Val Ile Asn Cys Thr Tyr Thr Asp Ser Ser Ser Thr Tyr
20 25 30
Leu Tyr Trp Tyr Lys Gln Glu Pro Gly Ala Gly Leu Gln Leu Leu Thr
35 40 45
Tyr Ile Phe Ser Asn Met Asp Met Lys Gln Asp Gln Arg Leu Thr Val
50 55 60
Leu Leu Asn Lys Lys Asp Lys His Leu Ser Leu Arg Ile Ala Asp Thr
65 70 75 80
Gln Thr Gly Asp Ser Ala Ile Tyr Phe Cys Ala Glu Ser Pro Pro Asp
85 90 95
Asn Tyr Gly Gln Asn Phe Val Phe Gly Pro Gly Thr Arg Leu Ser Val
100 105 110
Leu Pro Tyr Ile Gln Asn Pro Asp Pro Ala Val Tyr Gln Leu Arg Asp
115 120 125
Ser Lys Ser Ser Asp Lys Ser Val Cys Leu Phe Thr Asp Phe Asp Ser
130 135 140
Gln Thr Asn Val Ser Gln Ser Lys Asp Ser Asp Val Tyr Ile Thr Asp
145 150 155 160
Lys Cys Val Leu Asp Met Arg Ser Met Asp Phe Lys Ser Asn Ser Ala
165 170 175
Val Ala Trp Ser Asn Lys Ser Asp Phe Ala Cys Ala Asn Ala Phe Asn
180 185 190
Asn Ser Ile Ile Pro Glu Asp Thr Phe Phe Pro Ser Pro Glu Ser Ser
195 200 205
<210> 26
<211> 624
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 26
atgggtgaag atgttgaaca gagtcttttc ctgagtgtcc gagagggaga cagctccgtt 60
ataaactgca cttacacaga cagctcctcc acctacttat actggtataa gcaagaacct 120
ggagcaggtc tccagttgct gacgtatatt ttttcaaata tggacatgaa acaagaccaa 180
agactcactg ttctattgaa taaaaaggat aaacatctgt ctctgcgcat tgcagacacc 240
cagactgggg actcagctat ctacttctgt gcagagagtc cgcctgataa ctatggtcag 300
aattttgtct ttggtcccgg aaccagattg tccgtgctgc cctatatcca gaaccctgac 360
cctgccgtgt accagctgag agactctaag tcgagtgaca agtctgtctg cctattcacc 420
gattttgatt ctcaaacaaa tgtgtcacaa agtaaggatt ctgatgtgta tatcacagac 480
aaatgtgtgc tagacatgag gtctatggac ttcaagagca acagtgctgt ggcctggagc 540
aacaaatctg actttgcatg tgcaaacgcc ttcaacaaca gcattattcc agaagacacc 600
ttcttcccca gcccagaaag ttcc 624
<210> 27
<211> 243
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 27
Met Asn Ala Gly Val Met Gln Asn Pro Arg His Leu Val Arg Arg Arg
1 5 10 15
Gly Gln Glu Ala Arg Leu Arg Cys Ser Pro Met Lys Gly His Ser His
20 25 30
Val Tyr Trp Tyr Arg Gln Leu Pro Glu Glu Gly Leu Lys Phe Met Val
35 40 45
Tyr Leu Gln Lys Glu Asn Ile Ile Asp Glu Ser Gly Met Pro Lys Glu
50 55 60
Arg Phe Ser Ala Glu Phe Pro Lys Glu Gly Pro Ser Ile Leu Arg Ile
65 70 75 80
Gln Gln Val Val Arg Gly Asp Ser Ala Ala Tyr Phe Cys Ala Ser Ser
85 90 95
Pro Val Ala Gly Glu Leu Phe Phe Gly Glu Gly Ser Arg Leu Thr Val
100 105 110
Leu Glu Asp Leu Lys Asn Val Phe Pro Pro Glu Val Ala Val Phe Glu
115 120 125
Pro Ser Glu Ala Glu Ile Ser His Thr Gln Lys Ala Thr Leu Val Cys
130 135 140
Leu Ala Thr Gly Phe Tyr Pro Asp His Val Glu Leu Ser Trp Trp Val
145 150 155 160
Asn Gly Lys Glu Val His Ser Gly Val Cys Thr Asp Pro Gln Pro Leu
165 170 175
Lys Glu Gln Pro Ala Leu Asn Asp Ser Arg Tyr Ala Leu Ser Ser Arg
180 185 190
Leu Arg Val Ser Ala Thr Phe Trp Gln Asp Pro Arg Asn His Phe Arg
195 200 205
Cys Gln Val Gln Phe Tyr Gly Leu Ser Glu Asn Asp Glu Trp Thr Gln
210 215 220
Asp Arg Ala Lys Pro Val Thr Gln Ile Val Ser Ala Glu Ala Trp Gly
225 230 235 240
Arg Ala Asp
<210> 28
<211> 729
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 28
atgaatgcag gtgttatgca gaatccaaga cacctggtca ggaggagggg acaggaggca 60
agactgagat gcagcccaat gaaaggacac agtcatgttt actggtatcg gcagctccca 120
gaggaaggtc tgaaattcat ggtttatctc cagaaagaaa atatcataga tgagtcagga 180
atgccaaagg aacgattttc tgctgaattt cccaaagagg gccccagcat cctgaggatc 240
cagcaggtag tgcgaggaga ttcggcagct tatttctgtg ccagctcacc ggttgccggg 300
gagctgtttt ttggagaagg ctctaggctg accgtactgg aggacctgaa aaacgtgttc 360
ccacccgagg tcgctgtgtt tgagccatca gaagcagaga tctcccacac ccaaaaggcc 420
acactggtgt gcctggccac cggtttctac cccgaccacg tggagctgag ctggtgggtg 480
aatgggaagg aggtgcacag tggggtctgc acagacccgc agcccctcaa ggagcagccc 540
gccctcaatg actccagata cgctctgagc agccgcctga gggtctcggc caccttctgg 600
caggaccccc gcaaccactt ccgctgtcaa gtccagttct acgggctctc ggagaatgac 660
gagtggaccc aggatagggc caaacccgtc acccagatcg tcagcgccga ggcctggggt 720
agagcagac 729
<210> 29
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列(artificial sequence)
<400> 29
Ala Thr Ile Ile His Asn Leu Arg Glu Glu Lys
1 5 10

Claims (11)

1.一种T细胞受体(TCR),其特征在于,所述TCR能够与ATIIHNLREEK-HLA-A1101复合物结合,所述TCR包含TCRα链可变域和TCRβ链可变域,所述TCRα链可变域的3个互补决定区为:
αCDR1-DSSSTY (SEQ ID NO:6)
αCDR2-IFSNMDM (SEQ ID NO:7)
αCDR3-AESPPDNYGQNFV (SEQ ID NO:13);和
所述TCRβ链可变域的3个互补决定区为:
βCDR1-KGHSH (SEQ ID NO:5)
βCDR2-LQKENI (SEQ ID NO:8)
βCDR3-ASSPVAGELF (SEQ ID NO:10)。
2.如权利要求1所述的T细胞受体,其特征在于,所述TCR包含α链可变域氨基酸序列SEQID NO:1。
3.如权利要求1所述的T细胞受体,其特征在于,所述TCR包含β链可变域氨基酸序列SEQID NO:2。
4.如权利要求1所述的T细胞受体,其特征在于,所述TCR的α链氨基酸序列为SEQ IDNO:3、15和所述TCR的β链氨基酸序列为SEQ ID NO:4、16。
5.一种多价TCR复合物,其特征在于,其包含至少两个TCR分子,并且其中的至少一个TCR分子为权利要求1所述的TCR。
6.一种核酸分子,其特征在于,所述核酸分子包含编码权利要求1所述的TCR分子的核酸序列或其互补序列。
7.一种载体,其特征在于,所述的载体含有权利要求6所述的核酸分子。
8.一种分离的宿主细胞,其特征在于,所述的宿主细胞中含有权利要求7所述的载体或基因组中整合有外源的权利要求6所述的核酸分子。
9.一种细胞,其特征在于,所述细胞转导权利要求6所述的核酸分子或权利要求7所述的载体。
10.一种药物组合物,其特征在于,所述组合物含有药学上可接受的载体以及权利要求1所述的TCR、权利要求5所述的TCR复合物、权利要求6所述的核酸分子、权利要求7所述的载体、或权利要求9所述的细胞。
11.权利要求1所述的T细胞受体、或权利要求5所述的TCR复合物、权利要求6所述的核酸分子、权利要求7所述的载体、或权利要求9所述的细胞的用途,其特征在于,用于制备治疗肿瘤或自身免疫疾病的药物。
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Citations (2)

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CN106478797A (zh) * 2015-12-10 2017-03-08 广州市香雪制药股份有限公司 源自于sage1的肿瘤抗原短肽
WO2017203526A1 (en) * 2016-05-23 2017-11-30 Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. Methods of diagnosing cancer using cancer testis antigens

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