NL1008139C2 - Antimicrobiële peptiden. - Google Patents
Antimicrobiële peptiden. Download PDFInfo
- Publication number
- NL1008139C2 NL1008139C2 NL1008139A NL1008139A NL1008139C2 NL 1008139 C2 NL1008139 C2 NL 1008139C2 NL 1008139 A NL1008139 A NL 1008139A NL 1008139 A NL1008139 A NL 1008139A NL 1008139 C2 NL1008139 C2 NL 1008139C2
- Authority
- NL
- Netherlands
- Prior art keywords
- amino acids
- peptide
- peptides according
- domain
- amino acid
- Prior art date
Links
- 102000044503 Antimicrobial Peptides Human genes 0.000 title description 3
- 108700042778 Antimicrobial Peptides Proteins 0.000 title description 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 171
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 99
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 77
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 claims abstract description 7
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 80
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 80
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 claims description 11
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 8
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 7
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 239000003429 antifungal agent Substances 0.000 claims description 7
- 206010017533 Fungal infection Diseases 0.000 claims description 5
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 claims description 5
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-Ornithine Chemical compound NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 5
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 5
- AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N Orn-delta-NH2 Natural products NCCCC(N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N Ornithine Natural products OC(=O)C(C)CCCN UTJLXEIPEHZYQJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims description 5
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 5
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 claims description 5
- VZQHRKZCAZCACO-PYJNHQTQSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]propanoyl]amino]prop-2-enoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)C(=C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N VZQHRKZCAZCACO-PYJNHQTQSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims description 4
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 4
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 4
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 claims description 4
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 claims description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 4
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 4
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 claims description 4
- 229940121375 antifungal agent Drugs 0.000 claims description 4
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 claims description 4
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 claims description 4
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 claims description 4
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 claims description 4
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims description 4
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 claims description 2
- 208000031888 Mycoses Diseases 0.000 claims description 2
- 125000003158 alcohol group Chemical group 0.000 claims description 2
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 claims description 2
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 claims description 2
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 claims description 2
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 claims description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 claims description 2
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 claims description 2
- 239000007937 lozenge Substances 0.000 claims description 2
- 239000002674 ointment Substances 0.000 claims description 2
- 239000007921 spray Substances 0.000 claims description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims 2
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 abstract 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 11
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 11
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 description 9
- 101000898505 Homo sapiens Histatin-3 Proteins 0.000 description 9
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 9
- KSXBMTJGDUPBBN-VPKNIDFUSA-N histatin 5 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C1=CN=CN1 KSXBMTJGDUPBBN-VPKNIDFUSA-N 0.000 description 9
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 9
- 102400000777 His3-(20-43)-peptide Human genes 0.000 description 8
- GHXZTYHSJHQHIJ-UHFFFAOYSA-N Chlorhexidine Chemical compound C=1C=C(Cl)C=CC=1NC(N)=NC(N)=NCCCCCCN=C(N)N=C(N)NC1=CC=C(Cl)C=C1 GHXZTYHSJHQHIJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 description 6
- 229960003260 chlorhexidine Drugs 0.000 description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 6
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 6
- 241000194019 Streptococcus mutans Species 0.000 description 5
- 241000194023 Streptococcus sanguinis Species 0.000 description 5
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 5
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 5
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 5
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 5
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 5
- -1 m-maleimidobenzoyl Chemical group 0.000 description 5
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 5
- 239000008057 potassium phosphate buffer Substances 0.000 description 5
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 5
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 4
- 241000194024 Streptococcus salivarius Species 0.000 description 4
- APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N amphotericin B Chemical compound O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/C=C/[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-INPOYWNPSA-N 0.000 description 4
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 4
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 4
- 230000001332 colony forming effect Effects 0.000 description 4
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 4
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 4
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 4
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 4
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 4
- OILXMJHPFNGGTO-UHFFFAOYSA-N (22E)-(24xi)-24-methylcholesta-5,22-dien-3beta-ol Natural products C1C=C2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(C)C=CC(C)C(C)C)C1(C)CC2 OILXMJHPFNGGTO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- RQOCXCFLRBRBCS-UHFFFAOYSA-N (22E)-cholesta-5,7,22-trien-3beta-ol Natural products C1C(O)CCC2(C)C(CCC3(C(C(C)C=CCC(C)C)CCC33)C)C3=CC=C21 RQOCXCFLRBRBCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OQMZNAMGEHIHNN-UHFFFAOYSA-N 7-Dehydrostigmasterol Natural products C1C(O)CCC2(C)C(CCC3(C(C(C)C=CC(CC)C(C)C)CCC33)C)C3=CC=C21 OQMZNAMGEHIHNN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- APKFDSVGJQXUKY-KKGHZKTASA-N Amphotericin-B Natural products O[C@H]1[C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@H]1C=CC=CC=CC=CC=CC=CC=C[C@H](C)[C@@H](O)[C@@H](C)[C@H](C)OC(=O)C[C@H](O)C[C@H](O)CC[C@@H](O)[C@H](O)C[C@H](O)C[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]2C(O)=O)O[C@H]2C1 APKFDSVGJQXUKY-KKGHZKTASA-N 0.000 description 3
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 3
- DNVPQKQSNYMLRS-NXVQYWJNSA-N Ergosterol Natural products CC(C)[C@@H](C)C=C[C@H](C)[C@H]1CC[C@H]2C3=CC=C4C[C@@H](O)CC[C@]4(C)[C@@H]3CC[C@]12C DNVPQKQSNYMLRS-NXVQYWJNSA-N 0.000 description 3
- 241000222126 [Candida] glabrata Species 0.000 description 3
- 229960003942 amphotericin b Drugs 0.000 description 3
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 3
- 239000006161 blood agar Substances 0.000 description 3
- DNVPQKQSNYMLRS-SOWFXMKYSA-N ergosterol Chemical compound C1[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@H](CC[C@]3([C@H]([C@H](C)/C=C/[C@@H](C)C(C)C)CC[C@H]33)C)C3=CC=C21 DNVPQKQSNYMLRS-SOWFXMKYSA-N 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 3
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 2
- 241000186046 Actinomyces Species 0.000 description 2
- 241000186045 Actinomyces naeslundii Species 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- 241000222173 Candida parapsilosis Species 0.000 description 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 2
- 241000605986 Fusobacterium nucleatum Species 0.000 description 2
- 108010019494 Histatins Proteins 0.000 description 2
- 102000006492 Histatins Human genes 0.000 description 2
- 241000588748 Klebsiella Species 0.000 description 2
- 241000218588 Lactobacillus rhamnosus Species 0.000 description 2
- 101800004819 PGLa Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000605861 Prevotella Species 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001148135 Veillonella parvula Species 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 2
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 238000009343 monoculture Methods 0.000 description 2
- 210000000214 mouth Anatomy 0.000 description 2
- 238000007747 plating Methods 0.000 description 2
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 239000012064 sodium phosphate buffer Substances 0.000 description 2
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 2
- 229920003002 synthetic resin Polymers 0.000 description 2
- 239000000057 synthetic resin Substances 0.000 description 2
- MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N vancomycin Natural products O1C(C(=C2)Cl)=CC=C2C(O)C(C(NC(C2=CC(O)=CC(O)=C2C=2C(O)=CC=C3C=2)C(O)=O)=O)NC(=O)C3NC(=O)C2NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CC(C)C)NC)C(O)C(C=C3Cl)=CC=C3OC3=CC2=CC1=C3OC1OC(CO)C(O)C(O)C1OC1CC(C)(N)C(O)C(C)O1 MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N (+/-)-DABA Natural products NCCC(N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JPOKAKNGULMYHZ-UILVTTEASA-N (2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-[[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-6-amino-2-[[(2s)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]hexanoyl]amino]hexanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]hexanoyl]amino]-3-(4-hydroxyp Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(N)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N)C1=CC=C(O)C=C1 JPOKAKNGULMYHZ-UILVTTEASA-N 0.000 description 1
- VYMHBQQZUYHXSS-UHFFFAOYSA-N 2-(3h-dithiol-3-yl)pyridine Chemical compound C1=CSSC1C1=CC=CC=N1 VYMHBQQZUYHXSS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MUSGYEMSJUFFHT-UWABRSFTSA-N 2-[(4R,7S,10S,13S,19S,22S,25S,28S,31S,34R)-34-[[(2S,3S)-2-[[(2R)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-3-methylpentanoyl]amino]-4-[[(2S,3S)-1-amino-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]-methylcarbamoyl]-25-(3-amino-3-oxopropyl)-7-(3-carbamimidamidopropyl)-10-(1H-imidazol-5-ylmethyl)-19-(1H-indol-3-ylmethyl)-13,17-dimethyl-28-[(1-methylindol-3-yl)methyl]-6,9,12,15,18,21,24,27,30,33-decaoxo-31-propan-2-yl-1,2-dithia-5,8,11,14,17,20,23,26,29,32-decazacyclopentatriacont-22-yl]acetic acid Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](N)Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](Cc2cnc[nH]2)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN(C)C(=O)[C@H](Cc2c[nH]c3ccccc23)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@H](Cc2cn(C)c3ccccc23)NC(=O)[C@@H](NC1=O)C(C)C)C(=O)N(C)[C@@H]([C@@H](C)CC)C(N)=O MUSGYEMSJUFFHT-UWABRSFTSA-N 0.000 description 1
- OEBIVOHKFYSBPE-UHFFFAOYSA-N 4-Benzyloxybenzyl alcohol Chemical compound C1=CC(CO)=CC=C1OCC1=CC=CC=C1 OEBIVOHKFYSBPE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SLXKOJJOQWFEFD-UHFFFAOYSA-N 6-aminohexanoic acid Chemical compound NCCCCCC(O)=O SLXKOJJOQWFEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930183010 Amphotericin Natural products 0.000 description 1
- QGGFZZLFKABGNL-UHFFFAOYSA-N Amphotericin A Natural products OC1C(N)C(O)C(C)OC1OC1C=CC=CC=CC=CCCC=CC=CC(C)C(O)C(C)C(C)OC(=O)CC(O)CC(O)CCC(O)C(O)CC(O)CC(O)(CC(O)C2C(O)=O)OC2C1 QGGFZZLFKABGNL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000605909 Fusobacterium Species 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N Glutamic acid Natural products OC(=O)C(N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000285963 Kluyveromyces fragilis Species 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- FORGMRSGVSYZQR-YFKPBYRVSA-N L-leucinamide Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(N)=O FORGMRSGVSYZQR-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 102000003752 Lipocalin 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010057281 Lipocalin 1 Proteins 0.000 description 1
- RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N Methicillin Chemical compound COC1=CC=CC(OC)=C1C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N 0.000 description 1
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000000968 Parkia biglobosa Species 0.000 description 1
- 241000235645 Pichia kudriavzevii Species 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 241001135221 Prevotella intermedia Species 0.000 description 1
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M Propionate Chemical compound CCC([O-])=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 1
- 102000018968 Salivary Cystatins Human genes 0.000 description 1
- 108010026774 Salivary Cystatins Proteins 0.000 description 1
- 102000001848 Salivary Proteins and Peptides Human genes 0.000 description 1
- 108010029987 Salivary Proteins and Peptides Proteins 0.000 description 1
- 241000607142 Salmonella Species 0.000 description 1
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- 108010059993 Vancomycin Proteins 0.000 description 1
- 241000607734 Yersinia <bacteria> Species 0.000 description 1
- 241000607447 Yersinia enterocolitica Species 0.000 description 1
- 230000009435 amidation Effects 0.000 description 1
- 238000007112 amidation reaction Methods 0.000 description 1
- 229940009444 amphotericin Drugs 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000000843 anti-fungal effect Effects 0.000 description 1
- 230000001857 anti-mycotic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000656 anti-yeast Effects 0.000 description 1
- 238000011482 antibacterial activity assay Methods 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 239000002543 antimycotic Substances 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000032343 candida glabrata infection Diseases 0.000 description 1
- 229940055022 candida parapsilosis Drugs 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 230000000855 fungicidal effect Effects 0.000 description 1
- 229960003692 gamma aminobutyric acid Drugs 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 235000013922 glutamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000004220 glutamic acid Substances 0.000 description 1
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 1
- 230000002949 hemolytic effect Effects 0.000 description 1
- 229910052588 hydroxylapatite Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 231100000053 low toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 238000000034 method Methods 0.000 description 1
- 229960003085 meticillin Drugs 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D pentacalcium;hydroxide;triphosphate Chemical compound [OH-].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O XYJRXVWERLGGKC-UHFFFAOYSA-D 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 1
- 108010005636 polypeptide C Proteins 0.000 description 1
- 239000003910 polypeptide antibiotic agent Substances 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N thioanisole Chemical compound CSC1=CC=CC=C1 HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000001974 tryptic soy broth Substances 0.000 description 1
- 108010050327 trypticase-soy broth Proteins 0.000 description 1
- 229960003165 vancomycin Drugs 0.000 description 1
- MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N vancomycin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C(O)=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)[C@H](O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-N 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940098232 yersinia enterocolitica Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K7/00—Peptides having 5 to 20 amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
- C07K7/04—Linear peptides containing only normal peptide links
- C07K7/08—Linear peptides containing only normal peptide links having 12 to 20 amino acids
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/10—Antimycotics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4723—Cationic antimicrobial peptides, e.g. defensins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
- Medicinal Preparation (AREA)
Description
ANTIMICROBIËLE PEPTIDEN
De onderhavige uitvinding heeft betrekking op nieuwe peptiden met een antimicrobiële werking. De anti-microbiële werking richt zich met name op bacteriën, schimmels en gisten.
5 Het gebruik van de bekende antibiotica is in steeds meer gevallen niet meer afdoende voor het behandelen van infecties. Vele bacteriestammen hebben resistenties tegen de bekende klassen antibiotica verworven en in de laatste dertig jaar zijn er geen nieuwe klassen 10 antibiotica meer ontdekt. Gezien het bovenstaande is een nieuwe klasse van antimicrobiële middelen zeer gewenst.
In het speeksel worden basische peptiden en eiwitten aangetroffen, die in vitro een bacteriocide en fungicide activiteit hebben. Histatinen vormen een bekende familie 15 van dergelijke speekselpeptiden. Echter, om ook klinisch toepasbaar te zijn is het wenselijk dat de antimicrobiële activiteit nog hoger is. Een hogere activiteit compenseert de proteolytische afbraak van het middel, welke in meer of mindere mate steeds optreedt. Verder is een ten 20 opzichte van de natuurlijk voorkomende peptiden verminderde proteolytische afbraak gewenst. Uit economisch oogpunt voor wat betreft de productie van de peptiden heeft het tenslotte de voorkeur dat antimicrobiële middelen relatief klein zijn.
25 Het is het doel van de onderhavige uitvinding nieuwe antibacteriële en antifungale middelen te verschaffen, die bovengenoemde nadelen niet hebben en zoveel mogelijk voldoen aan de voorkeurseisen.
Dit wordt door de uitvinding bereikt door 30 peptiden, die bestaan uit een aminozuurketen, welke een domein van 10 tot 25 aminozuren bevatten, waarbij de meerderheid van de aminozuren van de ene helft van het domein positief geladen aminozuren zijn en de meerderheid van de andere helft van het domein ongeladen aminozuren 35 zijn.
De opbouw van deze peptiden kent een aantal variaties. Ten eerste kan het domein een or-helix vormen, waarvan tenminste een meerderheid van de posities 1, 2, 1008139 2 5, 6, 9 (12, 13, 16, 19, 20, 23 en 24) een positief geladen aminozuur bevat, positie 8 een positief of een ! ongeladen aminozuur is en tenminste een meerderheid van 1 de posities 3, 4, 7, 10, (11, 14, 15, 17, 18, 21, 22, 25) 5 een ongeladen aminozuur bevat. Deze peptiden hebben een laterale amfipathiciteit, dat wil zeggen een maximaal hydrofoob moment bij 100°. Eenvoudig gezegd, zijn deze peptiden aan de linkerzijde hydrofoob en aan de rechterzijde hydrofiel of omgekeerd. Deze peptiden worden hierin 10 "type I" genoemd.
Verder kan het domein een α-helix vormen, waarvan tenminste een meerderheid van de posities 1, 2, 5, 6, 9 (12, 13, 16, 19, 20, 23 en 24) een ongeladen aminozuur bevat, positie 8 een positief of een ongeladen aminozuur 15 is en tenminste een meerderheid van de posities 3, 4, 7, 10, (11, 14, 15, 17, 18, 21, 22, 25) een positief geladen aminozuur bevat. Deze peptiden hebben een laterale amfi-pathiciteit, dat wil zeggen een maximaal hydrofoob moment bij 100°. Eenvoudig gezegd, zijn deze peptiden aan de 20 rechterzijde hydrofoob en aan de linkerzijde hydrofiel of omgekeerd. Deze peptiden worden hierin "type II" genoemd en zijn in principe de spiegelbeelden van type I peptiden .
Daarnaast kan het domein een α-helix vormen, 25 waarbij tenminste een meerderheid van de posities 1 tot en met 6 (of 7 of 8 of 9 of 10 of 11 of 12) een ongeladen aminozuur bevat, en op positie 7 (of 8 of 9 of 10 of ll of 12 of 13) tot en met 25 een positief geladen aminozuur voorkomt. Deze peptiden hebben een langsgerichte amfipa-30 thiciteit, dat wil zeggen een minimaal hydrofoob moment bij 100°. Deze peptiden zijn aan hun "bovenkant" hydrofoob en aan hun "onderkant" hydrofiel. Dergelijke peptiden worden met "type III" aangeduid.
Omgekeerd kan het domein een α-helix vormen, 35 waarbij tenminste een meerderheid van de posities 1 tot en met 6 (of 7 of 8 of 9 of 10 of 11 of 12) een positief geladen aminozuur bevat, en op positie 7 (of 8 of 9 of 10 of 11 of 12 of 13) tot en met 25 een ongeladen aminozuur f Hl · f: 1 H 9 3 voorkomt. Deze peptiden hebben eveneens een langsgerichte amfipathiciteit, en dus een minimaal hydrofoob moment bij 100°. Deze peptiden zijn aan hun "onderkant" hydrofoob en aan hun "bovenkant" hydrofiel. Dergelijke peptiden worden 5 met "type IV" aangeduid.
Tenslotte kan het domein een zogeheten β-strand vormen en op tenminste een meerderheid van de posities 1, 3, 5, 7, 9 (11, 13, 15, 17, 19, 21, 23 en 25) een positief geladen aminozuur bevatten, en op tenminste een 10 meerderheid van de posities 2, 4, 6, 8, 10, (12, 14, 16, 18, 20, 22, 24) een ongeladen aminozuur. Een dergelijke β-strand is lateraal amfipathisch en heeft een maximaal hydrofoob moment bij 180°. De β-strand structuur is vlakker dan de α-helix en is eenvoudig gezegd links 15 hydrofoob en rechts hydrofiel of omgekeerd. Dit zijn "type V"-peptiden.
De positief geladen aminozuren worden bij voorkeur gekozen uit de groep, die bestaat uit ornithine (0), lysine (K), arginine (R) en histidine (Η), terwijl 20 de ongeladen aminozuren bij voorkeur worden gekozen uit de groep, die bestaat uit de alifatische aminozuren glycine (G), alanine (A), valine (V), leucine (L), isoleucine (I), de aminozuren met een dipolaire zijketen methionine (M), asparagine (N), glutamine (Q), serine 25 (S), threonine (T), de aminozuren met een aromatische zijketen phenylalanine (F), tyrosine (Y), tryptofaan (W). Aminozuren op de grens tussen hydrofiel en hydrofoob kunnen uit beide groepen of uit de overige aminozuren gekozen worden.
30 In principe is er nauwelijks verschil in acti viteit waar te nemen wanneer een van de positieve aminozuren en/of een van de ongeladen aminozuren is vervangen door een willekeurig aminozuur. De meerderheid van de positief geladen aminozuren is derhalve bij voorkeur het 35 totale aantal positief geladen aminozuren minus 1 en de meerderheid van de ongeladen aminozuren is bij voorkeur het totale aantal ongeladen aminozuren minus 1.
λ λ f) o i τ Q
4 I Het domein kan een onderdeel zijn van een groter peptide, maar kan ook zelf het gehele peptide uitmaken. Wanneer het domein onderdeel uitmaakt van een groter peptide kunnen de C-terminale en/of N-terminale 5 aminozuren, die dan extra aanwezig zijn willekeurige aminozuren zijn.
De bijzondere voorkeur gaat uit naar de volgende peptiden van het type I: KRLFKELKFSLRKY (peptide 3) 10 KRLFKELLFSLRKY (peptide 4) KRLFKELKKSLRKY (peptide 5) KRLFKELLKSLRKY (peptide 6 OOLFOELOOSLOOY (peptide 7) OOLFOELLOSLOOY (peptide 8) 15 KRLFKKLKFSLRKY (peptide 9) KRLFKKLLFSLRKY (peptide 10)
Een voorkeurspeptide van het type III heeft de volgende aminozuurvolgorde: LLLFLLKKRKKRKY (peptide 11) 20 De peptiden volgens de uitvinding kunnen verder nog modificaties bevatten. Deze modificaties zijn bijvoorbeeld een N-terminale amidering, bijvoorbeeld met azijnzuuranhydride, of een alternatieve afsplitsing van de synthesehars, waardoor de C-terminus gemodificeerd 25 wordt. Voor dit laatste kan gedacht worden aan een vervanging van de C-terminale carbonzuurgroep door een amide-, ester-, keton-, aldehyde- of alcoholgroep. Peptiden met een dergelijke modificatie zijn bijvoorbeeld: KRLFKELKFSLRKY-amide (peptide 12) 30 KRLFKELLFSLRKY-amide (peptide 13)
Naast enkelvoudige peptiden kunnen ook oligome-ren worden gemaakt. Dit zijn bij voorkeur lineaire oligo-meren van de peptiden volgens de uitvinding. De koppeling kan zowel kop-kop als staart-staart als kop-staart zijn, 35 hetzij door directe synthese hetzij door postsynthetische enzymatische koppeling. Voor de vorming van een transmembraan porie is een minimale peptidenlengte vereist. Oligomeren van de peptiden volgens de uitvinding zijn ; /r; ·' " ·· .·· y o 5 dubbel lang en daardoor in principe beter in staat de gehele fosfolipide dubbellaag van de bacteriële celmem-braan in een keer te overspannen. Hierdoor zou de werking van het peptide nog verder kunnen verbeteren. Daarnaast 5 geeft verlenging van de peptiden een stabilisatie van de helixconformatie. Meestal dient een spacer te worden ingevoegd. Bij directe synthese van kop-staart gekoppelde oligomeren kan een spacer op maat worden ingebouwd door het gebruik van een keten van onnatuurlijke aminozuren 10 van de juiste lengte, bijvoorbeeld S-alanine, γ-aminobo-terzuur, e-aminocapronzuur, etc. Ook kunnen heterodi-functionele koppelingsreagentia, zoals die commercieel verkrijgbaar zijn om peptide-antigenen aan dragereiwitten te koppelen (bijvoorbeeld l-ethyl-3-[3-dimethylaminopro-15 pyl]carbodiimide (EDC), m-maleimidobenzoyl)-N- hydroxy-succinimide ester (MBS), N-succinimidyl 3 -[pyridyldithi-olpropionaat (SPDD) etc. gebruikt worden om lineaire oligomeren met een tussengevoegde spacer te maken. Voor kop-kop en staart-staartkoppelingen kunnen driewaardige 20 aminozuren worden gebruikt, zoals asparaginezuur (D), glutaminezuur (E), ornithine (0), lysine (K), serine (S), cysteine. Dergelijke oligomeren zijn bijvoorbeeld: KRKFHEKHHSHRGY C-CYGRHSHHKEHFKRK (peptide 14) YGRHSHHKEHFKRKC-CKRKFHEKHHSHRGY (peptide 15) 25 “N, EN-(KRKFHEKHHSHRGY) 2K-amide (peptide 16) “N, £N- (KRLFKELKFSLRKY) 2K-amide (peptide 17) aN, £N-(KRLFKKLKFSLRKY) 2K-amide (peptide 18)
Peptiden 14 en 15 zijn verkregen door synthese van peptide 2 met een additionele C-terminale, respectievelijk N-30 terminale cysteine, waarna het oligomeer verkregen is door luchtoxidatie. Peptiden 16, 17 en 18 zijn verkregen door gebruikmaking van de Multi-Antigen Peptide (MAP) strategie, waarbij als eerste aminozuur een lysine met zowel op de a- als op de e-aminogroep een Fmoc bescher-35 ming als eerste aminozuur aan de synthesehars werd gebruikt, waardoor gelijktijdig twee identieke aminozuurke-tens (peptiden 2, 3 en 9) op één lysinemolecuul werden gesynthetiseerd.
1003139 6
De hierin beschreven peptiden hebben geen of nauwelijks hemolytische activiteit in fysiologische buffers, zoals PBS (fosfaatgebufferde zoutoplossing). Een lage activiteit tegen erytrocyten van humane oorsprong is 5 een indicatie voor lage toxiciteit. Deze selectiviteit is essentieel voor het gebruik van deze peptiden als antibiotica .
De peptiden volgens de uitvinding kunnen worden gebruikt in of als een antibacterieel middel, in of als 10 een antifungaal middel en in of als een middel tegen infectie door gisten. Hun activiteit zal in de begeleidende voorbeelden verder worden geïllustreerd.
De uitvinding betreft derhalve verder de peptiden voor gebruik als antibacterieel middel, voor gebruik 15 als antifungaal middel en voor gebruik als antimycotisch middel.
Tevens onderdeel van de uitvinding is het gebruik van de peptiden voor de vervaardiging van een geneesmiddel voor de behandeling van bacteriële infecties 20 en voor de vervaardiging van een geneesmiddel voor de behandeling van schimmelinfecties en/of infectie door gisten.
De peptiden volgens de uitvinding kunnen toegepast worden in verschillende farmaceutische toedienings-25 vormen. De bijzondere voorkeur gaat uit naar spray, zalf, gel en zuigtabletten. Deze toedieningsvormen kunnen worden gebruikt voor bestrijding van gisten, zoals Candida, bacteriën in de mondholte, op de huid, bij vee of in voeding, en schimmels.
30 De uitvinding wordt verder geïllustreerd in de begeleidende voorbeelden, die slechts gegeven zijn ter illustratie en niet om de uitvinding op enigerlei wijze te beperken.
; ; v 7 VOORBEELDEN VOORBEELD 1
Peptidensynthese
Peptiden volgens de uitvinding werden chemisch 5 gesynthetiseerd zoals beschreven door Van 't Hof et al. (1991) en Helmerhorst et al. (1997). Peptiden werden gesynthetiseerd met behulp van de T-bag-methode, die werd aangepast voor 9-fluorenylmethoxycarbonyl ((Fmoc)-chemie) . p-Benzyloxybenzyl-alcoholharsen waaraan de eerste 10 N-Fmoc-beschermde aminozuren reeds gekoppeld zijn, werden opgenomen in de T-bags. De koppelingsreacties werden uitgevoerd in N.N-dimethylformamide. Na voltooiing van de aminozuurketen werd deze afgesplitst van de hars en werden tegelijkertijd de zijketen-beschermingsgroepen 15 verwijderd met een mengsel van 5% thioanisol, 5% fenol, 5% water en 85% trifluorazijnzuur. Zuiverheidsanalyses werden uitgevoerd door omgekeerde fase HPLC en toonden één enkele piek met slechts weinig verontreinigingen (minder dan 5%).
20 Alle peptiden werden opgelost in 10 mM kalium- fosfaatbuffer (PPB), pH 7,0, tot een concentratie van 2 mg/ml en bewaard bij -80°C. De eind-pH van de stock-oplossing was 6,0. De exacte peptidenconcentraties die gebruikt werden in de antibacteriële bepalingen werden 25 bepaald door aminozuuranalyse.
Tabel 1 geeft een overzicht van de peptiden 2 tot 13 die op deze wijze gemaakt werden. Peptiden l en 2 uit deze tabel geven respectievelijk het histatine 5 en het C-terminale deel daarvan weer. Vetgedrukte aminozuren 30 zijn veranderingen ten opzichte van peptide 2.
VOORBEELD 2
Antibacteriële activiteit tegen monoculturen in vitro 35 Monoculturen van de bacteriën Streptococcus mutans (R9), Streptococcus sanguis (SB 179), Streptococcus salivarius (SS 196), Actinomyces naeslundii (WVU 627), Fusobacterium nucleatum (ATCC 10953), Prevotella a o '-V ^ v .,, 8 intermedia (T588) en Veillonella parvula (ATCC 17745) werden gekweekt tot een late logfase in BHI (Difco), drie maal gewassen in 10 mM kaliumfosfaatbuffer (PPB) en verdund tot een suspensie van 106 CFU/ml. In polypropyleen 5 eppendorfvaatjes (Costar) werd 250 μΐ van deze suspensie gemengd met 250 μΐ van een antimicrobiële peptidenoplossing volgens de uitvinding in tweevoud (de uiteindelijke peptidenconcentratie was 100 μg/ml) en gedurende een half uur bij 37°C geïncubeerd onder aërobe omstandigheden. De 10 controlebehandeling werd uitgevoerd in 10 mM PPB zonder peptide.
Na incubatie werden de monsters afgedraaid, 400 μΐ van het supernatant werd verwijderd en 400 μΐ PBS (9 mM natriumfosfaat, pH 7,0 in 150 mM NaCl), waarin de 15 peptiden inactief zijn, werd toegevoegd. De monsters werden verder verdund in PBS en 50 μΐ van tienvoudige en duizendvoudige verdunningen werden uitgeplaat op bloed-agar (Difco) om levensvatbaarheidstellingen uit te voeren .
20 Het resultaat van de proeven wordt getoond in tabel 2. Hieruit blijkt dat de peptiden volgens de uitvinding een duidelijk hogere activiteit hebben dan het natuurlijk voorkomende histatine 5.
25 Tabel 1
Peptide Sequentie
1 DSHAKRHHGYKRKFHEKHHSHRGY
2 KRKFHEKHHSHRGY
3 KRLFKELKFSLRKY
30 4 KRLFKELLFSLRKY
5 KRLFKELKKSLRKY
6 KRLFKELLKSLRKY
7 00LF0EL00SL00Y
j 8 OOLFOELLOSLOOY
1008139.
9
9 KRLFKKLKPSLRKY
10 KRLFRKLLFSLRKY
11 LLLFLLKKRKKRKY
12 KRLFKELKFSLRKY-amide 5 13 KRLFKELLFSLRKY-amide
14 KRKFHEKHHSHRGYC-CYGRHSHHKEHFKRK
15 YGRHSHHKEHFKRKC-CKRKFHEKHHSHRGY
16 "N, fN- (KRKFHEKHHSHRGY) 2K-amide 17 "N, *N- (KRLFKELKFSLRKY) 2K-amide 10 18 "N, fN- (KRLFKKLKFSLRKY) 2K - amide
Tabel 2 % reductie in levensvatbaarheidsteiiingen bacteriën buffer1 histatine 5 peptide 3 peptide 10 positieve controle- peptide 15 S. mutans 0,00 (22,6) -49,5 (68,5) >99,9* >99,9* >99,9 S. sanguis 0,00 (49,4) 69,5 (4.5) 99,6 (0,30)* >99,9* >99.9* S. Mlivarius 0.00 (36,3) 38,3 (44,1) >99,9* >99,9* >99,9* A. naeslundii 0,00 (23,7) -11,6 (3,9) >99,9* >99,9* >99,9* V, parvula 0,00 (16,7) 26,9 (49,3) >99,9* >99,9* >99,9* 20 F. nucleatum 0,00 (15,9) 49,3 (4,5)* 92,9 (3,00)* 99,2 (0,84)* >99,9* P. intermedia 0,00 (4,69) -235 (196) -57,8 (77,9) 81,0 (21,4)* 98,0 (1,0)* 1 De behandeling met buffer werd genormaliseerd op 0,00% doding. De standaardafwijking van het gemiddelde staat 25 tussen haakjes, significant hogere doding dan de monsters, die slechts buffer kregen toegediend - . ·· , .· , Λ i Vf ··.,· ;··. ! . r 10 VOORBEELD 3 i Groeiremminct
De groei van de gist Candida albicans. Torulop-! sis glabrata en methycilline resistente Staphylococcus 5 aureus (MRSA) werd getest door ze te groeien op agar waarop 10 μg van elk van de peptiden volgens de uitvinding werd gespot. Tabel 3 geeft het resultaat. "+" staat voor volledige groeiremming, staat voor partiële remming, en betekent geen remming.
10
Tabel 3
peptide C. albicans T. glabrata MRSA
histatine 5 - dh-5 - 15 peptide 3 + + +/- peptide 4 + + + /- peptide 5 + + n.d.* peptide 6 + + n.d.
peptide 7 + + n.d.
20 peptide 8 + + n.d.
peptide 9 + + + peptide 10 + + + peptide 11 + + + peptide 12 + + n.d.
25 peptide 13 + + n.d.
niet uitgevoerd 11 VOORBEELD 4
Remming van melkzuurproductie
Alle peptiden volgens de uitvinding werden getest op hun vermogen de melkzuurproductie van de bacte-5 riën Streptococcus sanguis. Streptococcus mutans, Streptococcus salivarius en Lactobacillus rhamnosus te remmen. De vorming van melkzuur is een maat voor de metabolische activiteit.
Hiertoe werden kweken van bacteriecellen gedu-10 rende l uur geïncubeerd in 10 mM PPB met 0,5 glucose en verschillende concentraties van de peptiden. De vorming van melkzuur werd gevolgd door middel van spectrofoto-metrie. Tabel 4 geeft het resultaat. "+" staat voor volledige remming bij 4-20 /zg/ml peptide, betekent 15 geen remming van melkzuurvorming bij > 100 μg/ml peptide.
Tabel 4 peptide S. sanguis S. mutans S. salivarius L. rhamnosus histatine 5 2 0 dh-5 - peptide 3 + + + + peptide 4 + + + + peptide 5 + + + + peptide 6 + + + + 2 5 peptide 7 + + + + peptide 8 + + + + peptide 9 + + + + peptide 10 + + + + peptide 11 + + + 3 0 peptide 12 + + + + peptide 13 + + + + 1003139 12 VOORBEELD 5
Doding van gisten i 5 * 106 cellen van Candida pseudotrooicalis.
| Candida albicans 10231, Crvptococcus neoformans, Candida 5 krusei, Candida parapsilosis. Candida glabrata en Candida albicans 32354 en een ergosterol deficiënte mutant daarvan werden gedurende anderhalf uur geïncubeerd bij 37°C in de aanwezigheid van een verdunningsreeks van een peptide volgens de uitvinding of amphotericine B in 1 mM 10 kalium fosfaatbuffer, pH 7,0. De levensvatbaarheid werd bepaald door uitplateren. Als positieve controle werd synthetisch PGLa ("Protein beginning with Glycine and ending with Leucin-amide", met de aminozuursequentie GMASKGAIAGKIAKVALKAL-amide) gebruikt. De negatieve con-15 trole was een peptide dat bestond uit de residuen 1 tot 14 van synthetisch cystatine S (SSSKEENRIIPGGI). Amphotericine is een bekend antimycotisch geneesmiddel. Er is echter één Candida albicans-mutant (van stam 32354), die geen ergosterol in zijn celmembraan heeft en die resis-2 0 tent is tegen amphotericine B. IC50-waarden zijn peptidenconcentraties waarbij 50% van het inoculum gedood wordt. Tabel 5 geeft het resultaat.
Tabel 5 2 5 ICso-waarden (pg/ml) peptide 10 positieve negatieve amphotericine B controle controle i_____ C. pseudotropicalis 2 1 >67 8 C. albicans 10231 1 1 >67 1
Cr. neoformans 1 0,5 >67 1 3 0 C. krusei 0,3 1 >67 >70 C. parapsilosis 2 1 >67 6 C. glabrata 2 9 >67 2 C. albicans 32354 0.5 1 n.d. 2 ! -i i J 0 t $ 5 13 C. alhicans 32354, 1 3 n.d. >70 ergosterol deficiënte mutant VOORBEELD 6
Antibacteriele activiteit in een kunstmatige orale biofilm
Een kunstmatige orale biofilm werd vervaardigd 10 door hydroxyapatiet schijven gedurende vijf dagen in een continu kweeksysteem van zeven orale aërobe en anaërobe bacteriesoorten (Streptococcus mutans. Streptococcus sanguis, Streptococcus salivarius. Actinomyces naeslundi-i, Veillonella parvula. Prevotella intermedia en Fusobac-15 terium nucleatum) te plaatsen.
Vervolgens werden de schijven met de daarop gevormde biofilm gedurende een half uur geïncubeerd met verschillende concentraties peptide in 10 mM kaliumfos-faatbuffer, pH 7,0. De biofilm werd daarna van de schij-20 ven afgesonificeerd, verdund in PBS en op semi-selectieve agarplaten uitgeplateerd. Op aëroob geïncubeerde bloedag-arplaten werden totaal anaërobe counts geteld (Streptococci + Actinomyces), op vancomycine-bevattende platen de totaal Gram-negatieve counts (Veilonella, Fusobacterium 25 en Prevotella) en op de anaëroob geïncubeerde bloedagar de totale counts. Als negatieve controle werd een inactief peptide van het Von Ebner's Gland Protein (VEGh, 3-21: LLASDEEIQDVSGTWYLKA) gebruikt.
De resultaten staan in tabel 6. Hierin betekent 30 dat de doding significant hoger is dan van de nega tieve controle (p < 0,05)
Tabel 6 14 % verlaging in levensvatbaarheidstellingen behandeling concentratie totaal aëroob totaal anaëroob totaal Gram- gemiddelde gemiddelde negatief gemid- (s.d.) (s.d.) delde (s.d.) buffer 0,00 (70,7) 0,00 (57,2) 0,00 (50,4) 5 peptide 9 10 pg/ml -67,4 (134,4) -66,2 (143,6) 51,0 (32,0)* 100 pg/ml 78,7 (25,6)* 51,2 (53,9)* 30,6 (104,4)* 250 pg/ml 64,8 (48,4)* 61,2 (49,2)* 53,3 (70,7) 500 pg/ml 96,6 (4,0)* 93,2 (4,1)* 96,9 (0,85)* peptide 10 10 pg/ml 29,9 (53,4) 54,3 (15,6)* 59,3 (41,0)* 100 pg/ml 71,4 (26,7)* 42,5 (52,3)* 47,8 (50,0)* negatieve con- 100 pg/ml -96,6 (62,4) -71,7 (40,0) -81,5 (183,6) trolepeptide
Chloorhexidine 35 ppm 39,0 (71,8) 38,4 (63,2) 68,3 (19,6)* 200 ppm 99,9 (0,00)* 99,9 (0,00)* 99,9 (0,00)* 10 VOORBEELD 7
Antimicrobiële activiteit op orale bacteriën
Om te bepalen of de peptiden volgens de uitvin-15 ding ook actief zijn tegen bacteriën, zoals die in de mond worden aangetroffen, werd bacteriën uit speeksel en plaque verzameld. Speeksel werd geschud op een vortex-mixer en gecentrifugeerd. Het pellet werd gewassen met 10 mM kalium fosfaatbuffer en gedurende een half uur geïncu-20 beerd bij 37°C met buffer (negatieve controle), peptide 10 (100μg/ml; uitvinding), PGLa (100μg/ml; positieve controle) en chloorhexidine (50 ppm). Tabel 7 geeft het resultaat.
1008139
Tabel 7 15 % verlaging in levensvatbaarheidstellingen bacteriën behandeling totaal aëroob totaal anaëroob totaal Gram- gemiddelde gemiddelde negatief ge- (s.d.) (s d.) middelde (s.d.) speeksel buffer 0,00 (27,7) 0,00 (37,1) 0,00 (23,3) peptide 10 51,2 (31,5)* 71,8 (20,8)* 92,5 (9,15)* positieve controlepeptide 60,1 (30,0)* 73,2 (12,6)* 97,7 (1,52)*
Chloorhexidine >99,9* >99,9* >99,9* 5 plaque buffer 0,00 (63,4) 0,00 (45,7 ) 0,00 (90,4) pept.de 10 66,7 (7,17) 53,6 (30,6) 96,1 (3,02)* positieve controlepeptide 58,5 (18,7) 51,5 (44,9) 84,0 (11,0)*
Chloorhexidine 99,7 (0,3)* 99,7 (0,2)* 99,7 (0,3)* verstoorde buffer 0,00 (46,0) 0,00 (52,4) 0,00 (42,7) plaque peptide 10 66,9 (17,3) 57,5 (38,9)* 80,8 (24,7)* positieve controlepeptide 41,7 (54,4) 68,5 (31,9)* 45,9 (77,2)*
Chloorhexidine 99,7 (0,3)* 99,0 (1,42)* >99,9* gekweekte buffer 0,00 (25,7) 0,00 (61,5) 0,00 (45,7) plaque peptide 10 30,7 (50,7) 84,5 (8,75)* 28,3 (46,7) positieve controlepeptide 20,6 (77,4) 87,2 (9,87)* 83,7 (7,30)*
Chloorhexidine >99,9* >99,9* >99,9* 10 VOORBEELD 8
Doding van bacteriën door peptide 10 in vergelijking met histatine 5
15 106 bacteriën van de soorten Klebsiella (ATCC
43816) en Pseudomonas aeruginosa (PA01, klinisch isolaat) werden gedurende 1 uur geïncubeerd bij 37°C in 10 mM natriumfosfaatbuffer met 1% tryptic soy broth (pH 7,4) in aanwezigheid van 25 of 50 /xg/ml histatine 5, 3,12, 6,25, 20 12,5, 25 of 50 μg/ml peptide 10, 10 μg/ml protegrine (positieve controle), 50 μg/ml peptide 4 of geen peptide (beide negatieve controles), Verder werd een blanco meegenomen, die niet gedurende een uur geïncubeerd was
* 0 0 Q ΐ Λ7 O
16 bij 37°C (t = O min). Vervolgens werden van elk monster de kolonievormende eenheden bepaald door middel van uitplaten op DST (Diagnostic Sensitivity Test).
Figuur IA geeft een staafdiagram van het aantal 5 kolonievormende eenheden (colony forming units, CFU) van elk monster met Klebsiella. In figuur 1B staan de resultaten voor Pseudomonas.
VOORBEELD 9 10 Doding van Candida albicans door peptide 10 in vergelijking met histatine 5 met verschillende incubatietijden ' 106 Candida albicans werden gedurende 1 of 3 uur 1 geïncubeerd bij 37°C in 10 mM natriumfosfaatbuffer met 1%
Sabouraud (pH 7,4) in aanwezigheid van 25, 50 of 100 15 μg/ml histatine 5, 3,12, 6,25, 12,5, 25, 50 of 100 μg/ml peptide 10, 10 μg/ml protegrine (positieve controle), 50 Mg/ml peptide 4 of geen peptide (beide negatieve controles) . Verder werd een blanco meegenomen, die niet gedurende eem uur geïncubeerd was bij 37°C (t = 0 min).
20 Vervolgens werden van elk monster de kolonievormende eenheden bepaald zoals boven beschreven met Sabouraud platen.
Figuur 2A geeft een staafdiagram van het aantal kolonievormende eenheden (colony forming units, CFU) van 25 elk monster na 1 uur incubatie. In figuur 2B staan de resultaten voor 3 uur incubatie.
VOORBEELD 10 30 Doding van Salmonella en Yersinia species door peptide 10
Aan een kweek met 106 Salmonella typhimurium bacteriën werd peptide 10 toegevoegd in een concentratie van 50 μg/ml. Ter controle werd als blanco een kweek meegenomen, waaraan niets werd toegevoegd. Het aantal CFU 35 werd bepaald op de tijdstippen 0, 1, 2 en 3 uur. Hetzelfde werd gedaan met Yersinia enterocolitica (PYv+). Uit de figuren 3A, respectievelijk 3B blijkt dat door toevoeging ; t Si '\.1 . ^ r,l 'f 17 van peptide 10 het aantal bacteriën daalde tot onder de detectiegrens.
Zoals uit de bovenstaande voorbeelden blijkt hebben de 5 peptide volgens de uitvinding een aanzienlijk hogere antibacteriële, antimycotische en antifungale werking dan het in de natuur voorkomende histatine 5. Ook blijken bepaalde peptiden dodend te werken op micro-organismen, die resistent zijn tegen thans gebruikte antimicrobiële 10 middelen 10 0 8 1 3 9
Claims (39)
1. Peptiden met antimicrobiële activiteit, bestaande uit een aminozuurketen, welke een domein van 10 tot 25 aminozuren bevatten, waarbij de meerderheid van de aminozuren van de ene helft van het domein positief gela- 5 den aminozuren zijn en de meerderheid van de aminozuren van de andere helft van het domein ongeladen aminozuren zijn.
2. Peptiden volgens conclusie 1, met het kenmerk, dat de het domein een a-helix vormt en tenminste 10 een meerderheid van de posities 1, 2, 5, 6, 9 (12, 13, 16, 19, 20, 23 en 24) een positief geladen aminozuur, op positie 8 een positief of een ongeladen aminozuur en op tenminste een meerderheid van de posities 3, 4, 7, 10, (11, 14, 15, 17, 18, 21, 22, 25) een ongeladen aminozuur 15 bevat.
3. Peptiden volgens conclusie 2, met het kenmerk, dat de positief geladen aminozuren zijn gekozen uit de groep, die bestaat uit ornithine (O), lysine (K), arginine (R) en histidine (H).
4. Peptiden volgens conclusie 2 of 3, met het kenmerk, dat de ongeladen aminozuren zijn gekozen uit de groep, die bestaat uit de alifatische aminozuren glycine (G), alanine (A), valine (V), leucine (L), isoleucine (I), de aminozuren met een dipolaire zijketen methionine 25 (M), asparagine (N), glutamine (Q), serine (S), threonine (T), de aminozuren met een aromatische zijketen phenylalanine (F), tyrosine (Y), tryptofaan (W).
5. Peptiden volgens conclusies 2-4, met het kenmerk, dat de meerderheid van de positief geladen 30 aminozuren het totale aantal positief geladen aminozuren minus 1 is.
6. Peptiden volgens conclusies 2-5, met het kenmerk, dat de meerderheid van de ongeladen aminozuren het totale aantal ongeladen aminozuren minus 1 is.
7. Peptiden volgens conclusies 2-6, met het kenmerk, dat het domein het gehele peptide uitmaakt. I ·' ‘s ) -'7 * 1 Q
8. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: KRLFKELKFSLRKY (peptide 3).
9. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het 5 domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: KRLFKELLFSLRKY (peptide 4).
10. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: KRLFKELKKSLRKY (peptide 5). 10 li. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: KRLFKELLKSLRKY (peptide 6).
12. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het domein de volgende aminozuurvolgorde heeft:
15 OOLFOELOOSLOOY (peptide 7).
13. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: OOLFOELLOSLOOY (peptide 8).
14. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het 20 domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: KRLFKKLKFSLRKY (peptide 9).
15. Peptide volgens conclusies 2-7, waarvan het domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: KRLFKKLLFSLRKY (peptide 10).
16. Peptiden volgens conclusie 1, met het ken merk, dat het domein een α-helix vormt en tenminste een meerderheid van de posities 1 tot en met 6 (of 7 of 8 of 9 of 10 of 11 of 12) een ongeladen aminozuur bevat, en op positie 7 (of 8 of 9 of 10 of 11 of 12 of 13) tot en met 30 25 een positief geladen aminozuur.
17. Peptiden volgens conclusie 1, met het kenmerk, dat het domein een α-helix vormt en tenminste een meerderheid van de posities 1 tot en met 6 (of 7 of 8 of 9 of 10 of 11 of 12) een positief geladen aminozuur 35 bevat, en op positie 7 (of 8 of 9 of 10 of 11 of 12 of 13. tot en met 25 een ongeladen aminozuur.
18. Peptiden volgens conclusie 16 of 17, met het kenmerk, dat de positief geladen aminozuren zijn ' ' '' Ί >'* gekozen uit de groep, die bestaat uit ornithine (O), lysine (K), arginine (R) en histidine (H).
19. Peptiden volgens conclusie 16, 17 of 18, met het kenmerk, dat de ongeladen aminozuren zijn gekozen 5 uit de groep, die bestaat uit de alifatische aminozuren glycine (G), alanine (A), valine (V), leucine (L), isoleucine (I), de aminozuren met een dipolaire zijketen methionine (M), asparagine (N), glutamine (Q), serine (S), threonine (T), de aminozuren met een aromatische 10 zijketen phenylalanine (F), tyrosine (Y), tryptofaan (W).
20. Peptiden volgens conclusies 16-19, met het kenmerk, dat de meerderheid van de positief geladen aminozuren het totale aantal positief geladen aminozuren minus 1 is.
21. Peptiden volgens conclusies 16-20, met het kenmerk, dat de meerderheid van de ongeladen aminozuren het totale aantal ongeladen aminozuren minus 1 is.
22. Peptiden volgens conclusies 16-21, met het kenmerk, dat het domein het gehele peptide uitmaakt.
23. Peptide volgens conclusies 16 en 18-22, waarvan het domein de volgende aminozuurvolgorde heeft: LLLFLLKKRKKRKY (peptide 11).
24. Peptide volgens conclusie 1, met het kenmerk, dat het domein een zogeheten β-strand vormt en op 25 tenminste een meerderheid van de posities 1, 3, 5, 7, 9 (11, 13, 15, 17, 19, 21, 23 en 25) een positief geladen aminozuur bevat, en op tenminste een meerderheid van de posities 2, 4, 6, 8, 10, (12, 14, 16, 18, 20, 22, 24) een ongeladen aminozuur.
25. Peptiden volgens conclusie 24, met het ken merk, dat de positief geladen aminozuren zijn gekozen uit de groep, die bestaat uit ornithine (O), lysine (K), arginine (R) en histidine (H).
26. Peptiden volgens conclusie 24, met het ken-35 merk, dat de ongeladen aminozuren zijn gekozen uit de groep, die bestaat uit de alifatische aminozuren glycine (G), alanine (A), valine (V), leucine (L), isoleucine (I), de aminozuren met een dipolaire zijketen methionine 1008139 (Μ), asparagine (Ν), glutamine (Q), serine (S), threonine (Τ), de aminozuren met een aromatische zijketen phenylalanine (F), tyrosine (Y), tryptofaan (W).
27. Peptiden volgens conclusies 24-26, met het 5 kenmerk, dat de meerderheid van de positief geladen aminozuren het totale aantal positief geladen aminozuren minus 1 is.
28. Peptiden volgens conclusies 24-27, met het kenmerk, dat de meerderheid van de ongeladen aminozuren 10 het totale aantal ongeladen aminozuren minus 1 is.
29. Peptiden volgens conclusies 24-28, met het kenmerk, dat het domein het gehele peptide uitmaakt.
30. Peptiden volgens conclusies 1-29, waarbij de N-terminus geamideerd is.
31. Peptiden volgens conclusies 1-30, waarbij de C-terminale carbonzuurgroep is vervangen door een amide-, ester-, keton-, aldehyde- of alcoholgroep.
32. Peptiden volgens een der conclusies 1-31 voor gebruik als antibacterieel middel.
33. Peptiden volgens een der conclusies 1-31 voor gebruik als antifungaal middel.
34. Peptiden volgens een der conclusies 1-31 voor gebruik als antimycotisch middel.
35. Gebruik van peptiden volgens conclusies 1- 25 31 voor de vervaardiging van een geneesmiddel voor de behandeling van bacteriële infecties.
36. Gebruik van peptiden volgens conclusies 1-31 voor de vervaardiging van een geneesmiddel voor de behandeling van schimmelinfecties.
37. Gebruik van peptiden volgens conclusies 1- 31 voor de vervaardiging van een geneesmiddel voor de behandeling van infecties door gisten.
38. Farmaceutische samenstelling omvattende een of meer peptiden volgens conclusies 1-31 en een of meer 35 geschikte excipientia.
39. Farmaceutische samenstelling volgens conclusie 38 in de vorm van een spray, zalf, gel of zuigta-blet. "? ü v, ·. $
Priority Applications (10)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| NL1008139A NL1008139C2 (nl) | 1998-01-27 | 1998-01-27 | Antimicrobiële peptiden. |
| DE69920877T DE69920877T2 (de) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Antimikrobiell wirksame peptide |
| US09/601,124 US6638531B1 (en) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Antimicrobial peptides |
| AT99902926T ATE278710T1 (de) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Antimikrobiell wirksame peptide |
| EP99902926A EP1051433B1 (en) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Antimicrobial peptides |
| JP2000528598A JP2003524578A (ja) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | 抗微生物性ペプチド |
| AU23014/99A AU759026B2 (en) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Antimicrobial peptides |
| PCT/NL1999/000045 WO1999037678A2 (en) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Antimicrobial peptides |
| ES99902926T ES2229669T3 (es) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Peptidos antimicrobianos. |
| CA002319094A CA2319094C (en) | 1998-01-27 | 1999-01-26 | Antimicrobial peptides |
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| NL1008139A NL1008139C2 (nl) | 1998-01-27 | 1998-01-27 | Antimicrobiële peptiden. |
| NL1008139 | 1998-01-27 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| NL1008139C2 true NL1008139C2 (nl) | 1999-07-28 |
Family
ID=19766423
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| NL1008139A NL1008139C2 (nl) | 1998-01-27 | 1998-01-27 | Antimicrobiële peptiden. |
Country Status (10)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US6638531B1 (nl) |
| EP (1) | EP1051433B1 (nl) |
| JP (1) | JP2003524578A (nl) |
| AT (1) | ATE278710T1 (nl) |
| AU (1) | AU759026B2 (nl) |
| CA (1) | CA2319094C (nl) |
| DE (1) | DE69920877T2 (nl) |
| ES (1) | ES2229669T3 (nl) |
| NL (1) | NL1008139C2 (nl) |
| WO (1) | WO1999037678A2 (nl) |
Families Citing this family (21)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| ES2186377T3 (es) * | 1998-07-02 | 2003-05-01 | Stichting Skeletal Tissue Engi | Cemento para huesos peptidos antimicrobianos. |
| NL1010692C2 (nl) * | 1998-12-01 | 2000-06-06 | Stichting Tech Wetenschapp | Antivirale peptiden. |
| EP1174027A1 (en) * | 2000-07-17 | 2002-01-23 | HOM Consultancy B.V. | Uses of antimicrobial peptides |
| US7550558B2 (en) * | 2001-06-01 | 2009-06-23 | Fundacao De Ampara A Pesquiso Do Estado De Sao Paolo (Fapesp) | Antimicrobial peptides and methods for identifying and using such peptides |
| WO2005019241A2 (en) * | 2003-08-18 | 2005-03-03 | E.I. Dupont De Nemours And Company | Cationic antimicrobial peptides and compositions thereof |
| JP2005350424A (ja) * | 2004-06-14 | 2005-12-22 | Kyocera Chemical Corp | 固形製剤および固形製剤の製造方法 |
| EP3384938A1 (en) | 2011-09-12 | 2018-10-10 | Moderna Therapeutics, Inc. | Engineered nucleic acids and methods of use thereof |
| CN108949772A (zh) | 2012-04-02 | 2018-12-07 | 现代泰克斯公司 | 用于产生与人类疾病相关的生物制剂和蛋白质的修饰多核苷酸 |
| US9192651B2 (en) | 2012-04-02 | 2015-11-24 | Moderna Therapeutics, Inc. | Modified polynucleotides for the production of secreted proteins |
| US8963676B1 (en) * | 2013-03-12 | 2015-02-24 | XP Power Limited | Configurable transformer module |
| US9556226B2 (en) | 2013-03-15 | 2017-01-31 | The Board Of Trustees Of The University Of Arkansas | Peptides with antifungal activity and methods of using the peptides |
| ES2808780T3 (es) | 2015-06-30 | 2021-03-01 | Chain Antimicrobials Oy | Nuevos péptidos antimicrobianos, sus variantes y usos |
| JP6788173B2 (ja) | 2015-06-30 | 2020-11-25 | チェイン アンチマイクロバイアルズ オイＣｈａｉｎ Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂｉａｌｓ Ｏｙ | 新規な抗菌ペプチド、その変異体及び使用 |
| US10457710B2 (en) | 2015-06-30 | 2019-10-29 | Chain Antimicrobials Oy | Antimicrobial peptides, their variants and uses |
| WO2017083515A2 (en) | 2015-11-10 | 2017-05-18 | Visterra, Inc. | Antibody molecule-drug conjugates and uses thereof |
| JP6658265B2 (ja) * | 2016-04-26 | 2020-03-04 | ライオン株式会社 | インビトロバイオフィルムモデルの製造方法、ならびに評価方法及び口腔用組成物を選定する方法 |
| EP3571223B1 (en) | 2017-01-18 | 2024-09-18 | Visterra, Inc. | Antibody molecule-drug conjugates and uses thereof |
| CA3087569A1 (en) | 2018-01-09 | 2019-07-18 | Synthetic Biologics, Inc. | Alkaline phosphatase agents for treatment of neurodevelopmental disorders |
| US11638699B2 (en) | 2018-03-20 | 2023-05-02 | Theriva Biologics, Inc. | Intestinal alkaline phosphatase formulations |
| CA3094174A1 (en) | 2018-03-20 | 2019-09-26 | Synthetic Biologics, Inc. | Alkaline phosphatase agents for treatment of radiation disorders |
| KR20240085798A (ko) | 2020-04-03 | 2024-06-17 | 비스테라, 인크. | 항체 분자-약물 접합체 및 이의 용도 |
Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1991012815A1 (en) * | 1990-02-23 | 1991-09-05 | Bristol-Myers Squibb Company | COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING INFECTIONS CAUSED BY ORGANISMS SENSITIVE TO β-LACTAM ANTIBIOTICS |
| WO1992001462A1 (en) * | 1990-07-19 | 1992-02-06 | The Scripps Research Institute | Amphiphilic peptide compositions and analogues thereof |
| WO1993024138A1 (en) * | 1992-06-01 | 1993-12-09 | Magainin Pharmaceuticals, Inc. | Biologically active peptides having n-terminal substitutions |
| WO1996008270A2 (en) * | 1994-09-13 | 1996-03-21 | Magainin Pharmaceuticals Inc. | Method for inhibiting sexually transmitted diseases using magaining antimicrobials or squalamine compounds |
| WO1996040251A1 (en) * | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Ophidian Pharmaceuticals, Inc. | Prevention and treatment of sepsis |
-
1998
- 1998-01-27 NL NL1008139A patent/NL1008139C2/nl not_active IP Right Cessation
-
1999
- 1999-01-26 CA CA002319094A patent/CA2319094C/en not_active Expired - Fee Related
- 1999-01-26 WO PCT/NL1999/000045 patent/WO1999037678A2/en active IP Right Grant
- 1999-01-26 JP JP2000528598A patent/JP2003524578A/ja active Pending
- 1999-01-26 AU AU23014/99A patent/AU759026B2/en not_active Ceased
- 1999-01-26 US US09/601,124 patent/US6638531B1/en not_active Expired - Fee Related
- 1999-01-26 AT AT99902926T patent/ATE278710T1/de not_active IP Right Cessation
- 1999-01-26 ES ES99902926T patent/ES2229669T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1999-01-26 DE DE69920877T patent/DE69920877T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1999-01-26 EP EP99902926A patent/EP1051433B1/en not_active Expired - Lifetime
Patent Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1991012815A1 (en) * | 1990-02-23 | 1991-09-05 | Bristol-Myers Squibb Company | COMPOSITIONS AND METHODS FOR TREATING INFECTIONS CAUSED BY ORGANISMS SENSITIVE TO β-LACTAM ANTIBIOTICS |
| WO1992001462A1 (en) * | 1990-07-19 | 1992-02-06 | The Scripps Research Institute | Amphiphilic peptide compositions and analogues thereof |
| WO1993024138A1 (en) * | 1992-06-01 | 1993-12-09 | Magainin Pharmaceuticals, Inc. | Biologically active peptides having n-terminal substitutions |
| WO1996008270A2 (en) * | 1994-09-13 | 1996-03-21 | Magainin Pharmaceuticals Inc. | Method for inhibiting sexually transmitted diseases using magaining antimicrobials or squalamine compounds |
| WO1996040251A1 (en) * | 1995-06-07 | 1996-12-19 | Ophidian Pharmaceuticals, Inc. | Prevention and treatment of sepsis |
Non-Patent Citations (8)
| Title |
|---|
| AOYAGI H ET AL: "SYNTHESIS OF ANTIBACTERIAL PEPTIDES, GRAMICIDIN S ANALOGS AND DESIGNED AMPHIPHILIC OLIGOPEPTIDES", TETRAHEDRON, vol. 44, no. 3, 1 January 1988 (1988-01-01), pages 877 - 886, XP000574054 * |
| CHEMICAL ABSTRACTS, vol. 103, no. 19, 11 November 1985, Columbus, Ohio, US; abstract no. 160837, SASAKI, TOORU ET AL: "Syntheses and properties of H-[Orn-Leu]n-OH (n = 1-12) and cyclo[Orn-Leu-]n (n = 2-8)" XP002083173 * |
| CHEMICAL ABSTRACTS, vol. 106, no. 25, 22 June 1987, Columbus, Ohio, US; abstract no. 214352, MIHARA, HISAKAZU ET AL: "Design and synthesis of basic amphiphilic peptides possessing antimicrobial activity and their interaction with lipids" XP002083172 * |
| MIHARA, HISAKAZU ET AL: "Design and synthesis of amphiphilic basic peptides with antibacterial activity and their interaction with model membrane", BULL. CHEM. SOC. JPN. (1987), 60(2), 697-706 CODEN: BCSJA8;ISSN: 0009-2673, 1987, XP002083171 * |
| PEPT. CHEM. (1985), VOLUME DATE 1984, 22ND, 361-6 CODEN: PECHDP;ISSN: 0388-3698, 1985 * |
| PEPT. CHEM. (1986), VOLUME DATE 1985, 23RD, 223-8 CODEN: PECHDP;ISSN: 0388-3698, 1986 * |
| TAKAHASHI, SHO ET AL: "Synthesis of.alpha.-helices having a positively charged random coil-block on either N- or C-terminal", BULL. CHEM. SOC. JPN. (1988), 61(7), 2467-71 CODEN: BCSJA8;ISSN: 0009-2673, 1988, XP002083167 * |
| TOSSI, ALESSANDRO ET AL: "Identification and characterization of a primary antibacterial domain in CAP18, a lipopolysaccharide binding protein from rabbit leukocytes", FEBS LETT. (1994), 339(1-2), 108-12 CODEN: FEBLAL;ISSN: 0014-5793, 1994, XP002083170 * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| DE69920877T2 (de) | 2005-02-03 |
| AU759026B2 (en) | 2003-04-03 |
| WO1999037678A3 (en) | 1999-10-14 |
| ATE278710T1 (de) | 2004-10-15 |
| DE69920877D1 (de) | 2004-11-11 |
| ES2229669T3 (es) | 2005-04-16 |
| WO1999037678A2 (en) | 1999-07-29 |
| JP2003524578A (ja) | 2003-08-19 |
| EP1051433A2 (en) | 2000-11-15 |
| AU2301499A (en) | 1999-08-09 |
| CA2319094A1 (en) | 1999-07-29 |
| CA2319094C (en) | 2009-03-17 |
| US6638531B1 (en) | 2003-10-28 |
| EP1051433B1 (en) | 2004-10-06 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| NL1008139C2 (nl) | Antimicrobiële peptiden. | |
| US8680058B2 (en) | Selectively targeted antimicrobial peptides and the use thereof | |
| US7723468B2 (en) | Antimicrobial peptide, compositions, and uses therefor | |
| DE102007036128A1 (de) | Antibiotische Peptide | |
| US10174081B2 (en) | Antimicrobial peptides and uses therefore | |
| KR101896927B1 (ko) | 흰점박이꽃무지에서 유래한 항균 펩타이드 프로테티아마이신 1 및 그의 조성물 | |
| JP2003524578A5 (nl) | ||
| US5885965A (en) | Anti-fungal D-amino acid histatin-based peptides | |
| Zhang et al. | Pleurocidin congeners demonstrate activity against Streptococcus and low toxicity on gingival fibroblasts | |
| EP2750689B1 (de) | Modifizierte apidaecinderivate als antibiotische peptide | |
| KR20180052181A (ko) | 흰점박이꽃무지에서 유래한 항균 펩타이드 프로테티아마이신 2 및 그의 조성물 | |
| US7348402B2 (en) | Antimicrobial peptide, its analogs and antimicrobial composition comprising them | |
| KR20180117793A (ko) | 왕귀뚜라미에서 유래한 항균 펩타이드 테레오그릴루신 2 및 그의 조성물 | |
| CA2491011A1 (fr) | Peptides lineaires cationiques ayant des proprietes antibacteriennes et/ou antifongiques | |
| US10150795B2 (en) | Peptide having antimicrobial activity against pathogens and antimicrobial peptide composition comprising the same | |
| US5969098A (en) | Yeast-toxin-related protein for antimicrobial vaccine and sterilizing preservative use | |
| SE2151338A1 (en) | Truncated peptides | |
| JP3488133B2 (ja) | 抗菌性ペプチド | |
| IT202100029738A1 (it) | Peptide ad attività antimicotica e antibatterica | |
| US20090149391A1 (en) | Novel antimicrobial bolisin peptides | |
| WO2013064633A1 (de) | Oncopeltus-peptidderivate als antimikrobielle peptide | |
| DE10160170A1 (de) | Neue antimikrobielle Bolisinpeptide |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| SD | Assignments of patents |
Owner name: AM-PHARMA B.V. |
|
| VD1 | Lapsed due to non-payment of the annual fee |
Effective date: 20040801 |