Il suo primo torneo WTA lo ha giocato con una wild card a Klagenfurt nel 2000. In questo torneo perse contro la tedesca Andrea Glass. Nel 2001 non ha giocato perché ha messo al mondo una bambina, Tina. Nel 2002 ha vinto 3 titoli ITF: Grenoble, Mostar e Innsbruck. Nel 2003 vinse altri quattro tornei ITF è ha cominciato a giocare Fed Cup per l'Austria.[1] Nel 2005 era entrata nei top 100 e si era qualificata per l'US Open, dove perse al primo turno contro Martina Suchá. A Calcutta, Bammer raggiunse i quarti di finale e a Linz raggiunse anche i quarti, battendo Virginie Razzano e Vera Duševina. Bammer è la prima tennista austriaca dopo Barbara Schett di raggiungere i quarti a Linz. Nel 2006 raggiunse il terzo turno all'Australian Open. Due settimane dopo, raggiunse la semifinale di Pattaya, perdendo contro la futura vincitrice Shahar Peer. A Indian Wells raggiunse il terzo turno, perdendo contro Martina Hingis. A Charleston perse al secondo turno contro Justine Henin-Hardenne.Dopo aver perso al terzo turno di Berlino contro Svetlana Kuznecova, raggiunse i top 50. A Wimbledon perse al terzo turno. A Bangkok era arrivata ai quarti di finale battendo Nathalie Dechy e perdendo contro Tamarine Tanasugarn. Finisce l'anno alla posizione 53, la sua migliore fino adesso.
All'Open di Francia vinse al primo turno contro la francese Nathalie Dechy ma perse al secondo turno contro Melinda Czink 6-4 3-6 8-10. Al doppio misto raggiunse i quarti di finale con Łukasz Kubot. A Wimbledon perse al primo turno contro Melanie Oudin. All'US Open perse anche al primo turno contro María José Martínez Sánchez 2-6 6-4 1-6.