Deinococcota

Deinococci

Les Deinococcota (Deinococcobactéries ou anciennement Deinococcobacteria ou groupe Deinococcus-Thermus) sont un petit phylum de bactéries composée de coques très résistantes aux risques environnementaux. Elle comprend la classe des Deinococci, elle-même divisée en deux ordres.

Historique

Décrit en 1989 sous le nom de groupe Deinococcus-Thermus par Weisburg et al. mais publié de manière non valide^[2], ce taxon a été republié en 2021 pour se conformer aux règles de nomenclature de l'ICSP et rebaptisé Deinococcota en maintenant l'autorité d'invention à Weisburg mais avec la date de validation de 2021^[1].

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de Deinococcota est la suivante : Dei.no.coc.co’ta N.L. masc. n. Deinococcus, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Deinococcota, le phylum des Deinococcus^[1]^,^[3].

Liste des classes

Selon NCBI (12 novembre 2022)^[4], le phylum Deinococcota ne compte qu'une seule classe :

Deinococci Garrity et Holt 2002

Les Deinococcales

famille Deinococcaceae
- Deinobacter
- Deinococcus
famille Trueperaceae
- Truepera

Deinococcus est composé de plusieurs espèces résistantes aux radiations. Ils sont devenus célèbres pour leur capacité à ingérer des déchets nucléaires et autres matières toxiques, de survivre dans le vide de l'espace et à des températures extrêmes.

Les Thermales

famille Thermaceae
- Marinithermus
- Meiothermus
- Oceanithermus
- Thermus
- Vulcanithermus

Les Thermales comprennent plusieurs genres résistant à la chaleur. Thermus aquaticus est important dans le développement de la réaction en chaîne par polymérase où les cycles répétés de chauffage près de l'ADN font bouillir celui-ci qui utilise une enzyme thermo-stable vis-à-vis de l'ADN polymérase. Ces bactéries ont une épaisseur de parois cellulaires qui donnent des taches gram-positives, mais elles comprennent une deuxième membrane et sont donc plus proches de la structure Gram-negative. Cavalier-Smith appelle ce clade Hadobacteria (de Hadès, le souterrain).

Références

↑ ^{a b et c} Oren et Garrity 2021, p. 3.
↑ Weisburg, Giovannoni et Woese 1989, p. 128.
↑ (en) « Phylum Deinococcota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le 12 novembre 2022)
↑ NCBI, consulté le 12 novembre 2022

Bibliographie

(en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, n^o 10,‎ 2021, p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)
(en) WG Weisburg, SJ Giovannoni et CR Woese, « The Deinococcus-Thermus phylum and the effect of rRNA composition on phylogenetic tree construction », Syst Appl Microbiol, vol. 11,‎ 1989, p. 128-134 (DOI 10.1016/S0723-2020(89)80051-7)