Auribacterota
Les "Candidatus Auribacterota" forment un phylum candidat (ou embranchement, ou encore division) du règne des Bacteria. Son nom provient de "Candidatus Auribacter" qui est le genre type de ce phylum.
Historique
modifierCe phylum est proposé en 2017 par Lily Momper sous le nom de "candidatus Aureabacteria" pour contenir les bactéries non cultivables du groupe "SURF-CP-2"[1].
Taxonomie
modifierLe premier nom proposé pour ce phylum est celui de "Candidatus Aureabacteria" en 2017, le nom de ce phylum est considéré comme publié de manière non valide d'où les guillemets autour de son nom. Au regard du code de nomenclature bactérienne (le nom du phylum devant être dérivé de celui de son genre type par adjonction du suffixe -ota conformément à une décision de l'ICSP en 2021[2]), or aucun nom de genre type n'a alors été proposé. Ensuite la publication de Williams et al. propose un nouveau nom "Candidatus Auribacterota" selon les règles de nomenclature et d'après un genre type "Candidatus Auribacter" non cultivable aussi. Ce nouveau nom est considéré comme le nom préféré et non pas le nom correct entre autres, car il a été publié de manière non valide[3].
Étymologie
modifierL'étymologie du nom de phylum Auribacterota est une correction orthographique du nom Aureabacteria sans changer le sens du nom d'origine qui veut dire "bactérie venant d'une mine d'or"[4].
Liste des classes
modifierSelon la base de nomenclature LPSN (07/08/2023)[5], ce phylum contient quatre classe candidates:
- "Candidatus Ancaeobacteria" Williams et al. 2022 nom préféré (nom non correct)
- "Candidatus Auribacteria" Williams et al. 2022 nom préféré (nom non correct)
- "Candidatus Erginobacteria" Williams et al. 2022 nom préféré (nom non correct)
- "Candidatus Tritonobacteria" Williams et al. 2022 nom préféré (nom non correct)
Notes et références
modifier- Momper et et al. 2018, p. 279.
- (en) A et al. Oren, « Emendation of Rules 5b, 8, 15 and 22 of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes to include the rank of phylum », Int J Syst Evol Microbiol., vol. 71, no 6, , p. 004851 (lire en ligne)
- « Phylum "Candidatus Auribacterota" », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le )
- Williams 2022, p. 2577.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 07/08/2023
Bibliographie
modifier- Publication originale Lily Momper, Sean P Jungbluth, Michael D Lee et Jan P Amend, « Energy and carbon metabolisms in a deep terrestrial subsurface fluid microbial community », The ISME Journal, Elsevier GmbH, vol. 11, , p. 2319–2333 (DOI 10.1038/ismej.2017.94)
- (en) Timothy J. Williams, Michelle A. Allen, Pratibha Panwar et Ricardo Cavicchioli, « Into the darkness: the ecologies of novel 'microbial dark matter' phyla in an Antarctic lake. », Environ Microbiol, vol. 24, no 5, , p. 2576-2603 (DOI 10.1111/1462-2920.16026)
Liens externes
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- Ressource relative au vivant :