Dominio LIM
Los dominios LIM son dominios estructurales de proteínas compuestos de dos motivos de dedos de zinc contiguos, unidos por una región de unión hidrofóbica compuesta de dos aminoácidos.[1] La denominación LIM proviene de las iniciales de las primeras proteínas en las que se hallaron este tipo de dominios: Lin11, Isl-1 y Mec-3.[2] Las proteínas que contienen dominios LIM han demostrado jugar un importante papel en la organización del citoesqueleto, la organogénesis y la oncogénesis. Los dominios LIM interacciones proteína:proteína que son cruciales para el correcto funcionamiento de determinados procesos celulares.
| Dominio LIM | ||
|---|---|---|
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| Identificadores | ||
| Símbolo | LIM | |
| Pfam | PF00412 | |
| InterPro | IPR001781 | |
| PROSITE | PDOC00382 | |
| SCOP | 1ctl | |
Los diversos dominios LIM existentes presentan una alta divergencia en sus secuencias, aparte de ciertos residuos clave que se han mantenido conservados a lo largo de la evolución. Las secuencias divergentes permiten una gran flexibilidad en cuanto a los sitios de unión que pueden reconocer estos dominios. Los residuos conservados con aquellos implicados en el sitio de unión de zinc o en el núcleo hidrofóbico de la proteína. La secuencia consenso típica de los dominios LIM es la siguiente:
[C]-[X]2-4-[C]-[X]13-19-[W]-[H]-[X]2-4-[C]-[F]-[LVI]-[C]-[X]2-4-[C]-[X]13-20-C-[X]2-4-[C]
Los dominios LIM suelen aparecer en las proteínas en número superior a uno, tal y como sucede con las proteínas TES y LMO4, y también pueden acoplarse a otros dominios con el fin de conferir la función de unir o marcar la proteína, como en el caso de las LIM-quinasas.
Referencias
editar- ↑ Kadrmas JL, Beckerle MC (2004). «The LIM domain: from the cytoskeleton to the nucleus». Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 5 (11): 920-31. PMID 15520811. doi:10.1038/nrm1499.
- ↑ Bach I (2000). «The LIM domain: regulation by association». Mech. Dev. 91 (1-2): 5-17. PMID 10704826. doi:10.1016/S0925-4773(99)00314-7.
Enlaces externos
editar- Base de datos DBD para la predicción de factores de transcripción Archivado el 4 de diciembre de 2008 en Wayback Machine.
- Clasificación de factores de transcripción de acuerdo a la base de datos Transfac
Datos: Q24722007
Multimedia: LIM domain / Q24722007