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- Commentarii in Aristophanis comoedias, Bände 3–9 der Aristophanes-Ausgabe von Invernitz und Beck (Aristophanis Comoediae auctoritate libri praeclarissimi saeculi decimi emendatae a Philippo Invernizio. Acc. criticae animadversiones, scholia Gr. indices et virorum doctorum adnotationes, Leipzig 1809–1834)
- Band 5 (1820) Commentarii in Acharnenses et Vespas
- Band 6 (1821) Commentarii in Lysistratam et Thesmophoriazusas et indices in commentarios interpretum complexum curavit G. Dindorfius
- Band 7,1 (1822) Supplementa commentariorum collegit, digessit, auxit Guil. Dindorfius
- Band 7,2 (1834) Commentarii in Aristophanis comoedias collegit, digessit, auxit Guilielmus Dindorfius
- Grammatici Graeci, Band 1 (mehr nicht erschienen), Leipzig 1823 Google, Google
- Platonis Convivium. In usum scholarum curavit, Leipzig 1823 Google
- Scholia Graeca in Aristophanis comoedias, drei Bände, Leipzig 1825–1826
- Iulii Pollucis onomasticon cum annotationibus interpretum curavit, Leipzig 1824 IA
- Xenophontis Commentarii. Cum mss. Vistorii varietatibus edidit, Leipzig 1824
- Iōannu Alexandreōs tonika paraggelmata. Ailiu Hērōdianu peri schēmatōn, Leipzig 1825
- Stephanus Byzantinus cum notis Holstenii, Berkleii et Pinedo, vier Bände, Leipzig 1825
- Homeri Carmina Ad Optimorum Librorum Fidem Expressa, drei Bände, Leipzig 1826–1828. Leipzig ³1852. Leipzig 41855–1856
- Isocratis Panegyricus. Cum Mori suisque annotationibus edidit, Leipzig 1826 Google
- Athenaeus ex recensione Guilielmi Dindorfii, drei Bände, Leipzig 1827
- Corpus scriptorum historiae byzantinae. Editio emendatior et copiosior, consilio B. G. Niebuhrii. Georgius Syncellus et Nicephorus CP. Ex recensione Guilielmi Dindorfii. Volumen I/II. Bonna, 1829. Band 1: Google Google; Band 2: Google (vgl. Corpus scriptorum historiae byzantinae)
- De Aristophanis fragmentis dissertatio I, Leipzig 1829
- Aristophanis Fragmenta ex recensione Guilielmi Dindorfii, Leipzig 1829
- Aristides ex Recensione Guilielmi Dindorfii, Leipzig 1829
- Aristophanes: Comoediae. Ex recognitione et cum annotationibus Gulielmi Dindorfii, zwei Bände, Leipzig 1830
- Poetae scenici Graeci. Accedunt perditarum fabularum fragmenta. Recognovit et praefatus est Guil. Dindorfius, Leipzig 1830 Google, Google
- Vierte, verbesserte Auflage unter dem Titel: Poetarum scenicorum Graecorum Aeschyli, Sophoclis, Euripidis et Aristophanis fabulae superstites et perditarum fragmenta ex recensione et cum prolegomenis Guilelmi Dindorfii, Leipzig 1869
- Themistius: Orationes duae, ex codice Mediolanensi emendatae, Leipzig 1830
- Aeschyli Tragoediae superstites et deperditarum fragmenta, drei Bände, Oxford 1832–1851. Leipzig 41869
- Band 1 (1832)
- Band 2 (1841) Annotationes
- Band 3 (1851) Scholia Graeca ex codicibus aucta et emendata
- Themistii orationes: ex codice Mediolanensi emendatae a Guilielmo Dindorfio, Leipzig 1832
- Sophoclis tragoediae superstites et deperditarum fragmenta, zwei Bände, Oxford 1832–1836. Zweite, verbesserte Auflage, Oxford 1849. Dritte, verbesserte Auflage in acht Bänden, Oxford 1860
- Euripidis tragoediae superstites et deperditarum fragmenta ex recensione G. Dindorfii, drei Bände, Oxford 1832–1841
- Band 1 (1832) Google
- Band 2 (1833)
- Band 3,1 (1839) Annotationes
- Band 3,2 (1840) Annotationes Google
- Procopius ex recensione Guilelmi Dindorfii, drei Bände, Bonn 1833–1838
- Euripidis Alcestis ad codicem Vaticanum recensuit, Oxford 1834 Google
- Aristophanis comoediae. Accedunt perditarum fabularum fragmenta ex recensione G. Dindorfii, vier Bände, Oxford 1835–1838
- Band 1 (1835)
- Band 2 (1835)
- Band 3 in zwei Teilen (1837) Annotationes
- Band 4 in drei Teilen (1838) Scholia Graeca ex codicibus aucta et emendata
- Luciani Samosatensis Opera ex recensione Guil. Dindorfii, Paris 1840
- Metra Aeschyli, Sophoclis, Euripidis et Aristophanis. Accedit Chronologia scenica, descripta a Guilelmo Dindorfio, Oxford 1842
- Herodoti historiarum libri IX recognovit et commentationem de dialecto Herodoti praemisit Guil. Dindorf., Paris 1844
- Flavii Josephi Opera. Graece et latine. Recognovit Guilelmus Dindorfius. Paris, 1845–1847
- Band 1 (1845), Volumen primum. Accedunt indices nominum et rerum locupletissimi: Google
- Band 2 (1847), Volumen secundum. Accedunt eclogae photianae quae pertinent ad historiam judaeorum. Subjecti sunt indices plenissimi et fragmenta nova Polybii, Dionysii, Dexippi, Eusebii: Google Google Google
- Demosthenes ex recensione Guilelmi Dindorfii, neun Bände, Oxford 1846–1851
- Band 1 (1846)
- Band 2 (1846)
- Band 3 (1846)
- Band 4 (1846)
- Band 5 (1849) Annotationes interpretum ad I–XIX
- Band 6 (1849) Annotationes interpretum ad XX–XXVI
- Band 7 (1849) Annotationes interpretum ad XXVII–LXII. Epist.
- Band 8 (1851) Scholia Graeca ex codicibus aucta et emendata
- Band 9 (1851) Scholia Graeca ex codicibus aucta et emendata
- Scholia in Sophoclis tragoedias septem, Band 2, Oxford 1852 (Band 1, 1825 von Peter Elmsley)
- Harpocrationis Lexicon in decem oratores Atticos ex recensione Guilelmi Dindorfii, zwei Bände, Oxford 1853
- Band 1 (1853)
- Band 2 (1853) Annotationes interpretum
- Scholia Graeca in Aeschinem et Isocratem, Oxford 1853
- Demosthenis orationes ex recensione Guil. Dindorfii, editio tertia correctior, drei Bände, Leipzig 1855
- Scholia Graeca in Homeri Odysseam, zwei Bände, Oxford 1855
- Athanasii Alexandrini praecepta ad Antiochum ad codices duos recensuit Guilielmus Dindorfius, Leipzig 1857
- Epiphanii Episcopi Constantiae opera ed. G. Dindorfius, fünf Bände in sieben Teilen, Leipzig 1859–1862
- Band 1 (1859) Anonymi vita Epiphanii. Ancoratus. Anacephalaeosis. Panarii libri I Tomus I
- Band 2 (1860) Panarii libri I. Tomi II et III. et libri II. Tomus I
- Band 3,1 (1861) Panarii libri II. Tomus II et libri III. Tomi I. II
- Band 3,2 (1862) Annotationes ad Panarium
- Band 4,1 (1862) De mensuris et ponderibus. De gemmis
- Band 4,2 (1862) Pseudo-Epiphanii homiliae
- Band 5 (1859) D. Petavii animadversiones
- Scholia Graeca in Euripidis tragoedias, vier Bände, Oxford 1863
- Eusebii Caesariensis Opera, drei Bände, Leipzig 1867
- Clementis Alexandrini opera ex recensione Gulielmi Dindorfii, vier Bände, Oxford 1869
- Band 1 (1869) Protrepticus. Paedagogus Internet Archive, IA = Google
- Band 2 (1869) Stromatum I–IV
- Band 3 (1869) Stromatum V–VIII; Scripta Minora; Fragmenta IA = Google
- Band 4 (1869) Annotationes interpretum
- Lexicon Sophocleum, Leipzig 1870
- Ueber die venetianische Handschrift des Athenaeus und deren Abschriften, Leipzig 1870
- Lexicon Aeschyleum, Leipzig 1873
- Scholia Graeca in Homeri Iliadem, sechs Bände, Oxford 1875
