C15orf15
| C15orf15 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | RSL24D1 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 613262 MGI: 2681840 HomoloGene: 9462 GeneCards: RSL24D1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 15: 55.18 – 55.2 Mb | Chr 9: 73.02 – 73.03 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Vjerovatni protein RLP24 ribosomske biogeneze je protein koji je kod ljudi kodiran genom RSL24D1.[5][6][7] Patricia Hartz (2010) mapirala je gen RSL24D1 na hromosomu 15, sekvenca q21.3, na osnovu poravnanja sekvence (AF201949) sa genomskom sekvencom (GRCh37).[8] Ovaj gen kodira protein koji ima nizak nivo sličnosti sekvence s ljudskim ribosomskim proteinom L24. Iako se ovaj gen u bazama podataka o sekvencama naziva RPL24, L30 i 60S ribosomski protein L30, razlikuje se od ljudskih gena koji su službeno nazvani RPL24 (koji je i sam naveden kao ribosomski protein L30) i RPL30. Funkcija ovog gena još nije poznata. Ovaj gen koristi alternativne poliadenilacijske signale.[7]
Kloniranje i ekspresija
[uredi | uredi izvor]Traženjem ortologa kvasca Rlp24, Saveanu et al. (2003) identificirali su čovjeka RSL24D1, kojeg su nazvali RLP24.
Funkcija gena
[uredi | uredi izvor]Saveanu et al. (2003) otkrili su da je kvašćev Rlp24 bio uključen u biogenezu ranih ribonukleopartikula prije 60S. Rlp24 se pridružio čestici pre-60S u jedarcetu i održavao ovu povezanost nakon eksporta pre-60S u citoplazmu. Iscrpljivanje Rlp24 rezultiralo je nestabilnim kompleksom.[9]
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]Dužina polipeptidnog lanca je 163 aminokiselina, a molekulska težina 19.621 Da [10]
1020304050 MRIEKCYFCSGPIYPGHGMMFVRNDCKVFRFCKSKCHKNFKKKRNPRKVR WTKAFRKAAGKELTVDNSFEFEKRRNEPIKYQRELWNKTIDAMKRVEEIK QKRQAKFIMNRLKKNKELQKVQDIKEVKQNIHLIRAPLAGKGKQLEEKMV QQLQEDVDMEDAP
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137876 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032215 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Saveanu C, Namane A, Gleizes PE, Lebreton A, Rousselle JC, Noaillac-Depeyre J, Gas N, Jacquier A, Fromont-Racine M (Jun 2003). "Sequential protein association with nascent 60S ribosomal particles". Mol Cell Biol. 23 (13): 4449–60. doi:10.1128/MCB.23.13.4449-4460.2003. PMC 164837. PMID 12808088.
- ^ Saveanu C, Bienvenu D, Namane A, Gleizes PE, Gas N, Jacquier A, Fromont-Racine M (Nov 2001). "Nog2p, a putative GTPase associated with pre-60S subunits and required for late 60S maturation steps". EMBO J. 20 (22): 6475–84. doi:10.1093/emboj/20.22.6475. PMC 125736. PMID 11707418.
- ^ a b "Entrez Gene: C15orf15 chromosome 15 open reading frame 15".
- ^ Hartz, P. A. Personal Communication. Baltimore, Md. 2/19/2010.
- ^ Saveanu, C., Namane, A., Gleizes, P.-E., Lebreton, A., Rousselle, J.-C., Noaillac-Depeyre, J., Gas, N., Jacquier, A., Fromont-Racine, M. Sequential protein association with nascent 60S ribosomal particles. Molec. Cell. Biol. 23: 4449-4460, 2003. PubMed: 12808088
- ^ "UniProt, Q9UHA3". Pristupljeno 12. 7. 2021.
Dopunska literatura
[uredi | uredi izvor]- Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). "Functional proteomic analysis of human nucleolus". Mol. Biol. Cell. 13 (11): 4100–9. doi:10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038/ng1285. PMID 14702039.
- Lehner B, Sanderson CM (2004). "A protein interaction framework for human mRNA degradation". Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10.1101/gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). "Nucleolar proteome dynamics". Nature. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Natur.433...77A. doi:10.1038/nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Vanjski linkovi
[uredi | uredi izvor]- Lokacija ljudskog genoma RPL24 i stranica sa detaljima o genu RPL24 u UCSC Genome Browseru.
- Lokacija ljudskog genoma RSL24D1 i stranica sa detaljima o genu RSL24D1 u UCSC Genome Browseru.