힘장 구현 비교
Comparison of force-field implementations이것은 분자역학 힘장을 구현하는 주목할 만한 컴퓨터 프로그램들의 표입니다.
프로그램. | OPLS | 오렌지 | 문자 | GAFF | MMFF | QVBMM | UFF | 평. |
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전복 | UA | 94, 96, 99SB, 03, GS, ii, 자동 FF[1] 제너레이터 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | UFF-Dreiding 유사 필드 | 단백질, DNA, 리간드의 경우 |
오렌지 | 네. | 네. | v11 이후 챔버 공구 경유 | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | |
아스칼라프 디자이너 | UA | 94, 99SB, 03 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | |
아보가드로 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 94, 94s | 아니요. | 네. | |
풍선 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 94 | 아니요. | 아니요. | MMFF94와 같은 |
보스 | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | |
문자 | 네* | 네* | 네* | CHARMM-GUI[2] 경유 | MMFF94는 풀 MMFF94이지만 코드는 유지되지 않은 채 소문났습니다. | 아니요. | 아니요. | * 표준 분포의 경우 |
가브디트 | 아니요. | 네. | 아니요. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | |
가우스 mm 유틸리티 | 아니요. | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 네. | 드리딩 필드 사용 가능 |
그로맥스 | 네. | 네* | 네* | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | * v4.5.0 이후 표준 배포판 |
모. | AA | 89, 94, 99 (확장 휘켈 이론 포함) | 22, 27 | 아니요. | 94(s) | 아니요. | 아니요. | |
남 | 네. | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | |
Q | 네. | 네. | 네. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 생체 고분자용 |
팅커 | UA, AA, AA/L | 94, 96, 98, 99 | 19, 27 | 아니요. | 94 | 아니요. | 아니요. | 단백질의 경우, 유기 분자 |
토우히 | UA, AA | 86 | 19, 22, 27 | 아니요. | 94 | 아니요. | 네. | 몬테카를로 |
야사라 | 아니요. | 94, 96, 99, 03 | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 아니요. | 또한 고용자를 위한 맞춤 필드도 제공 |